chr1 956563 956812 956665 Y UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA AGRN 3060 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr1 1114183 1114310 1114246 Y NA NA NA NA NA NA SDF4 51101 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 1294735 1294982 1294877 Y NA CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20 NA NA NA NA MXRA8 175 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 1611804 1612115 1611960 Y NA CDK11B,CDK11A NA NA NA NA CDK11B 23331 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 1793829 1793862 1793845 Y CDK11B,CDK11A GNB1 NA NA NA NA GNB1 26633 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 1840449 1840835 1840668 Y SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD GNB1 NA NA NA NA GNB1 19954 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 1952050 1952360 1952259 Y C1orf70,PRKCZ,GABRD NA NA NA NA NA GNB1 131555 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 2574343 2574764 2574705 Y MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1 NA NA NA NA NA FAM213B 58413 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 3229711 3230157 3229865 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF16 138833 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 3231556 3231634 3231595 Y PRDM16 NA NA NA NA NA ARHGEF16 137356 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 3420761 3421065 3420920 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF16 51771 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 3459907 3460197 3460078 Y NA NA NA NA NA NA MEGF6 65862 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 3817648 3818071 3817969 Y LRRC47 CEP104,DFFB,C1orf174 NA NA NA NA C1orf174 2791 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 4004990 4005219 4005105 Y WRAP73,TP73 NA NA NA NA NA C1orf174 190133 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 6566323 6566594 6566485 Y NA PLEKHG5,NOL9 NA NA NA NA PLEKHG5 11527 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 6943772 6944262 6943813 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 100388 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 7531062 7531540 7531160 Y PARK7 NA NA NA NA NA VAMP3 297789 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 7764543 7764931 7764717 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 64398 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 7843556 7843653 7843585 Y PER3 VAMP3,PER3 NA NA NA NA PER3 1176 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 8121436 8121582 8121497 Y ERRFI1 ERRFI1,RP11-431K24.1 RERE,ERRFI1,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 36638 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 8157417 8157780 8157543 Y NA NA ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 72619 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 8257762 8258040 8257906 Y NA RNU1-7P ERRFI1,RERE,PARK7,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-7P 6617 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 8445817 8446112 8445964 Y RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 69931 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 8720526 8720683 8720608 Y NA NA NA NA NA NA RERE 155019 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 8721734 8722143 8721896 Y NA NA NA NA NA NA RERE 153559 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 8964053 8964236 8964145 Y ENO1 ENO1-IT1,ENO1 ENO1-AS1,ENO1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ENO1 26745 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 9127395 9127559 9127485 Y NA NA NA NA NA NA GPR157 59670 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 9223907 9224260 9224149 Y SPSB1 GPR157,RP3-510D11.2 SLC2A7,SLC25A33,MIR34A IMR90 Hi-C 24141950 RP3-510D11.2 16003 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 9224991 9225286 9225137 Y NA GPR157,RP3-510D11.2 SLC2A7,SLC25A33,MIR34A IMR90 Hi-C 24141950 RP3-510D11.2 14977 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 9488839 9489227 9489154 Y NA NA SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 108314 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 10269964 10270260 10269995 Y RBP7,PGD,KIF1B KIF1B NA NA NA NA KIF1B 1101 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 10960432 10960567 10960498 Y NA NA PEX14,CASZ1,C1orf127,TARDBP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CASZ1 105725 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 12546528 12546819 12546674 Y DHRS3 NA NA NA NA NA DHRS3 128918 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 12600525 12600853 12600637 Y DHRS3 NA DHRS3,VPS13D K562 ChIA-PET 22265404 DHRS3 74884 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 12609717 12610039 12609907 Y DHRS3 NA NA NA NA NA DHRS3 65698 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 12674513 12674729 12674684 Y NA DHRS3 NA NA NA NA DHRS3 1008 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 15032293 15032599 15032446 Y KAZN NA NA NA NA NA KAZN 109093 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 15664307 15664455 15664338 Y NA NA EFHD2,CTRC,CELA2A,CELA2B IMR90 Hi-C 24141950 EFHD2 69936 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 16030221 16030623 16030258 Y NA PLEKHM2,RP11-169K16.4 NA NA NA NA PLEKHM2 21394 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 16087189 16087372 16087266 Y EPHA2,FBLIM1 RP11-169K16.4,FBLIM1 NA NA NA NA FBLIM1 6087 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 16125579 16125747 16125670 Y FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2 FBLIM1,RP11-169K16.8,SPEN NA NA NA NA RP11-169K16.8 26977 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 16175691 16176294 16176100 Y NA RP11-169K16.8,SPEN NA NA NA NA SPEN 3332 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 16212759 16213091 16212941 Y EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN SPEN NA NA NA NA SPEN 40400 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 16470181 16470602 16470563 Y NA RP11-276H7.2,EPHA2 NA NA NA NA RP11-276H7.2 9104 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 16499761 16499895 16499826 Y SPEN,EPHA2 RP11-276H7.2,EPHA2 CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHA2 19179 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 16502532 16502678 16502612 Y C1orf64 RP11-276H7.2,EPHA2 CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHA2 21950 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 16508402 16508642 16508565 Y FBLIM1 RP11-276H7.2,EPHA2 NA NA NA NA EPHA2 27820 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 16677236 16677843 16677569 Y ZBTB17,FBXO42 FBXO42 RSG1 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO42 287 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 16696032 16696399 16696223 Y NA FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 19083 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA NA SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 60166 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 17229862 17230229 17230053 Y NA RP11-108M9.4 CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-108M9.4 15718 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 17231253 17231704 17231392 Y PADI4,PADI2 RP11-108M9.4 CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-108M9.4 17109 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA RP11-108M9.4 CROCC K562 ChIA-PET 22265404 RP11-108M9.4 26044 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 17454855 17455288 17455072 Y PADI4 PADI2 PADI2,PADI1,PADI3 IMR90 Hi-C 24141950 PADI2 10907 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 17518130 17518260 17518142 Y NA RP11-380J14.1 NBPF1,PADI1,PADI2,PADI3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-380J14.1 3852 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 18042899 18043112 18043006 Y RCC2 NA NA NA NA NA ARHGEF10L 178569 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 19253034 19253391 19253292 Y UBR4,IFFO2 ALDH4A1,IFFO2 ALDH4A1 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH4A1 25759 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 19277155 19277462 19277361 Y UBR4,IFFO2 ALDH4A1,IFFO2 NA NA NA NA IFFO2 3718 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 19336477 19336714 19336579 Y NA NA UBR4,IFFO2,ALDH4A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFFO2 55297 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 19337577 19337942 19337698 Y NA NA UBR4,IFFO2,ALDH4A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFFO2 56397 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 19796024 19796128 19796080 Y NA CAPZB NA NA NA NA CAPZB 13938 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 21651763 21652284 21651923 Y NA ECE1 NA NA NA NA ECE1 17713 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 21895072 21895699 21895173 Y NA NA NA NA NA NA NBPF3 130451 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 22266159 22266438 22266333 Y HSPG2 RP11-26H16.1,HSPG2 NA NA NA NA HSPG2 4369 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 23076914 23077145 23077061 Y NA EPHB2 NA NA NA NA EPHB2 41582 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 23523350 23523682 23523502 Y LUZP1,HTR1D LUZP1 NA NA NA NA LUZP1 21049 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 23888678 23889201 23888997 Y ID3 E2F2,ID3 NA NA NA NA ID3 4393 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 23903714 23904323 23904234 Y ID3 E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 19429 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 23961555 23961694 23961621 Y NA NA NA NA NA NA RPL11 54575 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 24229023 24229388 24229190 Y NA FUCA1,RP11-4M23.4 NA NA NA NA FUCA1 36239 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 24349340 24349488 24349411 Y NA RP11-4M23.7 LYPLA2,SRSF10,MYOM3,PNRC2,SRRM1,HMGCL,IL22RA1,LOC100506963,TCEB3,GALE,FUCA1,CNR2,IL28RA,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-4M23.7 16331 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 24970685 24970736 24970725 Y NA SRRM1 NA NA NA NA SRRM1 14478 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 25051079 25051208 25051162 Y NA CLIC4 RUNX3,CLIC4,SRRM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIC4 18640 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 25559638 25560067 25559796 Y RUNX3,SYF2,C1orf63 SYF2 NA NA NA NA SYF2 2645 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 26201699 26201757 26201716 Y SEPN1 RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1 NA NA NA NA RP1-125I3.2 17595 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 26452850 26453250 26452988 Y FAM54B,RPS6KA1,HMGN2,CEP85,CD52,PDIK1L PDIK1L,ZNF593 NA NA NA NA PDIK1L 17186 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 26735858 26736255 26735942 Y NA DHDDS,RP3-476K8.4 NA NA NA NA DHDDS 20518 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 26827232 26827869 26827508 Y PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A RP3-476K8.4,HMGN2 HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HMGN2 30291 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 26946837 26947249 26947076 Y CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 73275 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 26947342 26948198 26947481 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72326 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 27024638 27025138 27024825 Y SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV ARID1A NA NA NA NA ARID1A 4114 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA SFN 3753 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 27321452 27321840 27321632 Y TMEM222,TRNP1,FAM46B C1orf172,RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B NA NA NA NA TRNP1 3254 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 27336678 27336931 27336804 Y NA RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B NA NA NA NA FAM46B 396 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 27527451 27527688 27527509 Y NA SLC9A1,WDTC1 WDTC1,SLC9A1,C1orf172 IMR90 Hi-C 24141950 WDTC1 31319 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 27561705 27561803 27561716 Y NA WDTC1 NA NA NA NA WDTC1 2698 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 27625914 27626081 27626007 Y TRNP1,MAP3K6,TMEM222 TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1 NA NA NA NA TMEM222 20570 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 27691785 27692261 27692091 Y TMEM222,MAP3K6 TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,GPR3 NA NA NA NA MAP3K6 402 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 27772061 27772370 27772216 Y NA WASF2 NA NA NA NA WASF2 42299 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 27863218 27863465 27863342 Y NA WASF2 NA NA NA NA WASF2 48549 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 27893697 27893957 27893851 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 34985 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 27907931 27908052 27907995 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 20890 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 27916292 27916674 27916513 Y XKR8,AHDC1 AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 12268 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 27922522 27922947 27922946 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 5995 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 28268335 28268431 28268383 Y NA RPA2,SMPDL3B,XKR8 NA NA NA NA SMPDL3B 8831 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 28431716 28431884 28431798 Y FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,SESN2,PTAFR,PTAFR,EYA3 EYA3 PTAFR,EYA3,FAM76A,LOC653566,DNAJC8,ATPIF1,SESN2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EYA3 18509 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 28485616 28486049 28485996 Y STX12,C1orf38,XKR8,EYA3,SESN2,MED18,PTAFR,PTAFR,DNAJC8 NA NA NA NA NA DNAJC8 71487 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 28573636 28574084 28573917 Y NA DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 9954 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 28641770 28641993 28641852 Y C1orf38,XKR8,EYA3,PTAFR,PTAFR,TAF12,GMEB1,SESN2,MED18 MED18 MED18 MCF7 ChIA-PET 22265404 MED18 11520 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 29451057 29451462 29451431 Y TMEM200B,TMEM200B TMEM200B NA NA NA NA TMEM200B 2610 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 29503706 29504118 29503928 Y NA SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2381 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 29504261 29504387 29504317 Y YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4 SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2112 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 29513219 29513546 29513454 Y NA SRSF4,MECR,PTPRU NA NA NA NA SRSF4 6720 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 29563709 29564430 29563877 Y PTPRU MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 2681 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 29598339 29598546 29598399 Y NA MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 37311 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 31241795 31242280 31242065 Y LAPTM5 NA PUM1,SNORD103A,LAPTM5,MATN1,LOC100129196,SDC3 IMR90 Hi-C 24141950 SDC3 137328 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 31320336 31320627 31320524 Y NA NA SDC3 K562 ChIA-PET 22265404 SDC3 58981 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 31483120 31483355 31483250 Y NA NA NA NA NA NA PUM1 53483 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 31537719 31538012 31537814 Y LAPTM5,PUM1 PUM1 NA NA NA NA PUM1 881 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 90728 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 3.94003785379688 chr1 31628220 31628457 31628359 Y NA NA PUM1,NKAIN1,SERINC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 91382 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.18890991877604 chr1 31904621 31905133 31905124 Y NA SERINC2 NA NA NA NA SERINC2 24209 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 31947490 31947850 31947648 Y NA NA SERINC2,SNRNP40,NKAIN1,ZCCHC17,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1,PEF1,SPOCD1,HCRTR1 IMR90 Hi-C 24141950 SERINC2 67078 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 32015159 32015590 32015321 Y NA TINAGL1 FABP3,SERINC2,LOC284551,PEF1,HCRTR1,NKAIN1,TINAGL1 IMR90 Hi-C 24141950 TINAGL1 24526 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 32166698 32166999 32166824 Y COL16A1 NA NA NA NA NA PEF1 58201 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 32227408 32227911 32227671 Y NA BAI2 NA NA NA NA BAI2 583 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 32405536 32405898 32405618 Y NA PTP4A2 NA NA NA NA PTP4A2 2559 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 32420307 32420572 32420414 Y TMEM234,PEF1,PTP4A2,PTP4A2 PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A2 11850 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 32421622 32422096 32421696 Y MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1 PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A2 13165 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 32966228 32966602 32966575 Y FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A ZBTB8B,ZBTB8A NA NA NA NA ZBTB8A 36426 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 33077721 33078012 33077949 Y FNDC5 ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 36492 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr1 33182280 33182513 33182368 Y KIAA1522 SYNC,KIAA1522 SYNC,S100PBP,BSDC1,ZBTB8B,RBBP4,KIAA1522,YARS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SYNC 15083 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 33225777 33226084 33225890 Y TMEM54,KIAA1522 KIAA1522 NA NA NA NA KIAA1522 20291 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 33457914 33458607 33458311 Y RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 29628 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 33526192 33526234 33526216 Y NA AK2,ADC AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC IMR90 Hi-C 24141950 AK2 18363 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 33564918 33565286 33565197 Y NA AK2,ADC NA NA NA NA ADC 20213 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 33804092 33804324 33804199 Y NA AL513327.1 NA NA NA NA AL513327.1 41117 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 35294449 35294485 35294467 Y NA NA NA NA NA NA GJB5 75801 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 35892196 35892421 35892350 Y NA NA NA NA NA NA NCDN 128653 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 36103028 36103196 36103152 Y NA PSMB2 TFAP2E IMR90 Hi-C 24141950 PSMB2 2249 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 36183411 36183689 36183588 Y C1orf216 C1orf216,CLSPN NA NA NA NA C1orf216 338 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 36555347 36555633 36555606 Y STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2 ADPRHL2 NA NA NA NA ADPRHL2 2871 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 36592352 36592554 36592389 Y NA ADPRHL2,TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA TRAPPC3 20544 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 36616485 36616868 36616577 Y STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1 TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 2312 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr1 36617554 36617914 36617691 Y STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3 TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 1266 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 36815580 36815775 36815719 Y NA SH3D21,STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 33722 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 36817040 36817280 36817137 Y NA SH3D21,STK40,LSM10 SH3D21,FAM176B K562 ChIA-PET 22265404 STK40 32217 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 36839449 36839891 36839558 Y EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 9606 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 36840093 36840535 36840445 Y EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 8962 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 36849527 36849580 36849557 Y EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 30 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 37932554 37932910 37932770 Y NA LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA LINC01137 5102 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 37937293 37937526 37937471 Y YRDC,MTF1,C1orf122,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA LINC01137 486 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 37942874 37943354 37943027 Y YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA ZC3H12A 4721 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 38009784 38010404 38010149 Y SNIP1,MTF1,ZC3H12A MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,DNALI1,GNL2 MEAF6 IMR90 Hi-C 24141950 SNIP1 7499 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 38466019 38466413 38466271 Y NA SF3A3,FHL3,UTP11L,POU3F1 NA NA NA NA FHL3 2865 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 38573869 38574225 38574173 Y EPHA10,MANEAL,POU3F1 NA NA NA NA NA POU3F1 63419 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 39644229 39644606 39644401 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 99241 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 39651405 39651741 39651429 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 106417 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 39736190 39736575 39736327 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0754 137576 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 39874208 39874673 39874342 Y KIAA0754 KIAA0754 NA NA NA NA KIAA0754 57 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr1 40264988 40265120 40265045 Y NA BMP8B HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BMP8B 12455 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 40504860 40505165 40505013 Y ZNF684,ZNF642,DEM1,BMP8B,PPT1,CAP1 CAP1 NA NA NA NA CAP1 955 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 40561233 40561752 40561648 Y SMAP2,RLF NA NA NA NA NA PPT1 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 41178788 41178979 41178866 Y ZMPSTE24,SMAP2,SMAP2,ZNF642,DEM1,ZNF684,CITED4,NFYC,NFYC RIMS3,NFYC KCNQ4 IMR90 Hi-C 24141950 NFYC 23468 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 41495531 41495820 41495676 Y NA NA NA NA NA NA CITED4 169513 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 41501440 41501773 41501639 Y NA NA NA NA NA NA CITED4 175422 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 41501908 41501999 41501966 Y SCMH1 NA NA NA NA NA CITED4 175890 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 41826642 41826952 41826745 Y NA FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 1048 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 41952015 41952273 41952132 Y EDN2 NA NA NA NA NA FOXO6 126421 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 41961925 41962146 41962029 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 136331 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr1 42127851 42128791 42128091 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 302257 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 42366364 42366624 42366514 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 132972 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 42774668 42774801 42774679 Y CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3 FOXJ3 NA NA NA NA FOXJ3 24747 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 43389220 43390772 43390027 Y NA SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 31758 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 43402778 43403133 43403049 Y ERMAP,SZT2 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 19397 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 43406108 43407009 43406836 Y YBX1,ERMAP,SZT2 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 15521 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 43429290 43429917 43429491 Y CCDC23,ERMAP,SLC2A1 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1-AS1 6570 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 43432863 43433109 43432938 Y CCDC30,SLC2A1 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1-AS1 10143 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 43884019 43884040 43884030 Y ST3GAL3,MPL,SZT2 MED8,SZT2,HYI NA NA NA NA SZT2 30466 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 44162019 44162313 44162287 Y NA KDM4A,ST3GAL3 NA NA NA NA ST3GAL3 7182 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 45283789 45284126 45283958 Y NA RPS8,SNORD55,RPS15AP11,PLK3,TCTEX1D4,BTBD19,RNU5E-6P NA NA NA NA RNU5E-6P 120 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 46111666 46112048 46111975 Y NA TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA TMEM69 38838 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 46268583 46268737 46268651 Y NA MAST2 NA NA NA NA MAST2 17924 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 46902512 46902655 46902542 Y NA FAAH NA NA NA NA FAAH 44575 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 46999025 46999241 46999126 Y ATPAF1-AS1 NA NA NA NA NA MKNK1 81274 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 47800262 47800514 47800436 Y NA STIL,CMPK1 NA NA NA NA CMPK1 2793 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 48429188 48429510 48429349 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-61P 482098 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 48935854 48936015 48935919 Y NA RNU4-61P,SPATA6 NA NA NA NA SPATA6 9 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 49061851 49062028 49061979 Y NA NA NA NA NA NA SPATA6 126006 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 50619908 50620155 50620032 Y NA NA NA NA NA NA ELAVL4 108222 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 51097851 51098184 51098018 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 325751 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 51198410 51198537 51198468 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 225398 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 51302197 51302583 51302391 Y FAF1 NA NA NA NA NA FAF1 121352 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 52173889 52173954 52173921 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL9 133038 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 52999324 52999688 52999506 Y NA ZCCHC11 PRPF38A,ORC1 IMR90 Hi-C 24141950 ZCCHC11 17471 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 53168640 53169047 53168726 Y NA ZYG11B SELRC1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ZYG11B 21079 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr1 53588397 53588520 53588474 Y PODN,PODN NA PODN IMR90 Hi-C 24141950 PODN 62543 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 53589395 53589613 53589415 Y PODN,PODN NA PODN,SCP2 IMR90 Hi-C 24141950 PODN 63541 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 54260217 54260562 54260390 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 93845 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 54261078 54261111 54261098 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 93296 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 54286238 54286401 54286368 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 68006 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 54873075 54873515 54873406 Y SSBP3,SSBP3 SSBP3 NA NA NA NA SSBP3 3637 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 54953784 54954325 54954090 Y SSBP3,SSBP3 NA TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP3 76632 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 54965120 54965643 54965198 Y NA NA TCEANC2,SSBP3,MRPL37,CYB5RL,CDCP2,YIPF1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4,ACOT11,FAM151A IMR90 Hi-C 24141950 SSBP3 87968 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 55894779 55895033 55894906 Y NA NA PPAP2B IMR90 Hi-C 24141950 USP24 215993 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 56184456 56184884 56184686 Y NA NA PRKAA2,PPAP2B IMR90 Hi-C 24141950 USP24 505670 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 59050239 59050578 59050488 Y NA DAB1,OMA1 MYSM1,FGGY,OMA1 IMR90 Hi-C 24141950 OMA1 39765 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 59221049 59221462 59221387 Y NA JUN,LINC01135 FGGY,HSD52,LOC100131060,JUN,MIR4711 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JUN 26323 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 59228706 59229186 59229035 Y NA JUN,LINC01135 NA NA NA NA JUN 18599 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 59229881 59230252 59230003 Y NA JUN,LINC01135 NA NA NA NA JUN 17533 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 59281873 59282217 59282125 Y MYSM1,FGGY,JUN JUN,LINC01135 NA NA NA NA LINC01135 33050 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 59369049 59370138 59369602 Y FGGY NA NA NA NA NA RP4-794H19.4 113921 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 59522982 59523218 59523118 Y NA RP4-794H19.4 FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-794H19.4 38923 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 59608045 59608421 59608204 Y NA NA NA NA NA NA RP4-794H19.4 123986 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 59608749 59609120 59609039 Y NA NA NA NA NA NA RP4-794H19.4 124690 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 59616706 59617089 59616861 Y NA NA HSD52,FGGY,JUN,LOC100131060,MIR4711 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-794H19.4 132647 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 59756067 59756566 59756452 Y FGGY FGGY LOC100131060,HSD52,FGGY IMR90 Hi-C 24141950 FGGY 3744 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 59910700 59911009 59910820 Y NA NA NA NA NA NA FGGY 150390 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 59986893 59986899 59986896 Y NA NA NA NA NA NA FGGY 226583 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 60062084 60062408 60062209 Y NA NA NA NA NA NA HOOK1 216050 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 60142118 60142218 60142180 Y FGGY NA NA NA NA NA HOOK1 136240 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 60144543 60144796 60144669 Y FGGY NA NA NA NA NA HOOK1 133662 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 60172811 60173111 60172976 Y NA NA NA NA NA NA HOOK1 105347 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 61543611 61543877 61543752 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA NFIA 214680 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 61649786 61650305 61649984 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA NFIA 320855 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 61768031 61768305 61768169 Y NA NA NA NA NA NA TM2D1 420790 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 62208815 62209373 62208933 Y NA TM2D1,INADL NA NA NA NA INADL 2666 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 62605206 62605403 62605332 Y NA NA NA NA NA NA KANK4 177682 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 63022251 63022602 63022448 Y NA NA NA NA NA NA USP1 122283 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 64051806 64051915 64051861 Y NA PGM1,ITGB3BP NA NA NA NA PGM1 5032 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 64127998 64128504 64128154 Y ROR1 NA NA NA NA NA ITGB3BP 70606 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 65292575 65293034 65292898 Y NA NA NA NA NA NA RAVER2 83797 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 65398951 65399446 65399123 Y LEPROT,LEPROT,LEPR,JAK1 JAK1 NA NA NA NA JAK1 30741 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 65888047 65888596 65888066 Y LEPR,LEPROT,LEPR,LEPROT LEPR,LEPROT NA NA NA NA LEPROT 3777 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 65946125 65946479 65946302 Y NA NA NA NA NA NA LEPROT 61855 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 66930584 66930841 66930604 Y NA NA PDE4B IMR90 Hi-C 24141950 WDR78 457729 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 67374841 67375185 67375111 Y SGIP1,WDR78 WDR78,MIER1 NA NA NA NA WDR78 13385 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 67847773 67848018 67847895 Y NA SERBP1 NA NA NA NA SERBP1 46080 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 68000341 68000585 68000456 Y SLC35D1 NA GNG12,DIRAS3,LOC100289178,GADD45A,WLS IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERBP1 106243 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 68036173 68036524 68036291 Y NA NA GADD45A,GNG12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GADD45A 112220 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 68077196 68077460 68077328 Y NA NA GADD45A,GNG12 IMR90 Hi-C 24141950 GADD45A 71284 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 68084470 68084693 68084593 Y NA NA GADD45A,GNG12 IMR90 Hi-C 24141950 GADD45A 64051 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 68257383 68257657 68257565 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 39493 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 21.4513172040052 chr1 68285768 68286070 68285946 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 11080 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 68572958 68573227 68573176 Y NA NA NA NA NA NA WLS 123576 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 68961350 68961555 68961472 Y NA DEPDC1 NA NA NA NA DEPDC1 446 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 70017370 70017628 70017440 Y NA LRRC7 NA NA NA NA LRRC7 14453 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 3.94003785379688 chr1 70034819 70036254 70034877 Y NA LRRC7 NA NA NA NA LRRC7 2738 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 70207294 70207355 70207325 Y LRRC7 NA DEPDC1 IMR90 Hi-C 24141950 LRRC7 175213 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 70238650 70238794 70238722 Y LRRC7 NA NA NA NA NA LRRC7 206569 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 70418678 70418852 70418759 Y LRRC7 NA NA NA NA NA LRRC40 250451 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 70709017 70709466 70709138 Y NA LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4 NA NA NA NA RP4-677H15.4 24311 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 70746826 70747040 70746993 Y ANKRD13C NA NA NA NA NA RP4-677H15.4 62120 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 72656240 72656592 72656532 Y NA NA NA NA NA NA NEGR1 89825 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 72715442 72715840 72715642 Y NA NEGR1 NA NA NA NA NEGR1 30577 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 72749220 72749791 72749447 Y NEGR1 NEGR1 NA NA NA NA NEGR1 2803 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr1 72750417 72750888 72750606 Y NA NEGR1 NA NA NA NA NEGR1 4000 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 75182913 75182976 75182918 Y NA TYW3,CRYZ NA NA NA NA TYW3 13860 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 75694572 75694736 75694622 Y NA NA NA NA NA NA ACADM 493300 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 77977128 77977445 77977326 Y NA NA NA NA NA NA ZZZ3 169659 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 77980165 77980378 77980255 Y AK5 NA NA NA NA NA ZZZ3 166726 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 78002564 78002920 78002661 Y NA NA ZZZ3 IMR90 Hi-C 24141950 ZZZ3 144184 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 78171350 78171363 78171357 Y NA ZZZ3 NA NA NA NA ZZZ3 24246 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 78196845 78197195 78197020 Y NA ZZZ3,USP33,RP4-706L14.2,FAM73A NA NA NA NA USP33 26342 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 78557346 78557710 78557476 Y NA NA NA NA NA NA GIPC2 114120 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 78957462 78957762 78957688 Y PTGFR NA NA NA NA NA IFI44L 125845 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 79215772 79216132 79215819 Y NA NA NA NA NA NA IFI44 102291 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 82026431 82026771 82026601 Y NA NA NA NA NA NA ST13P20 158607 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 84710038 84710507 84710127 Y NA NA NA NA NA NA PRKACB 168293 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 84971050 84971209 84971115 Y MCOLN2,GNG5 RPF1,GNG5 NA NA NA NA GNG5 802 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 85038681 85038996 85038864 Y MCOLN2,GNG5,CTBS CTBS NA NA NA NA CTBS 518 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 85049005 85049203 85049109 Y NA CTBS RPF1,GNG5 IMR90 Hi-C 24141950 CTBS 10842 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 85320078 85320332 85320201 Y GNG5,MCOLN2,C1orf52,BCL10 LPAR3 NA NA NA NA LPAR3 36564 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 85744584 85744829 85744751 Y BCL10 C1orf52,BCL10 NA NA NA NA BCL10 3811 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 85791287 85791404 85791348 Y NA NA NA NA NA NA BCL10 50514 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 85794698 85795078 85794848 Y CYR61 NA NA NA NA NA BCL10 53925 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 85796595 85797055 85796822 Y CYR61 NA NA NA NA NA BCL10 55822 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 86035824 86036171 86035900 Y NA DDAH1,CYR61 NA NA NA NA DDAH1 5762 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 86072885 86073441 86073156 Y CYR61 DDAH1,CYR61 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90 Hi-C 24141950 CYR61 28441 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 86077578 86077925 86077749 Y DDAH1,CYR61 DDAH1,CYR61 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYR61 33134 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 86078461 86078819 86078680 Y DDAH1,CYR61 DDAH1,CYR61 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYR61 34017 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 87171187 87171726 87171422 Y SH3GLB1 SH3GLB1 NA NA NA NA SH3GLB1 2928 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 87203929 87204214 87204072 Y NA SH3GLB1 NA NA NA NA SH3GLB1 35670 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 87800631 87801610 87800748 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 8480 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 88150561 88150732 88150650 Y NA NA LMO4 IMR90 Hi-C 24141950 LMO4 358410 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 88442110 88442273 88442258 Y NA NA LMO4,LOC339524 IMR90 Hi-C 24141950 LMO4 649959 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 90309838 90310280 90310072 Y LRRC8C,ZNF326 LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 25265 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 91034804 91034815 91034810 Y NA NA NA NA NA NA RP4-665J23.1 280392 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 91644220 91644316 91644268 Y NA NA NA NA NA NA ZNF644 158391 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 92270160 92270686 92270504 Y RPAP2,GLMN NA NA NA NA NA TGFBR3 99206 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 92549605 92549624 92549615 Y NA BTBD8 NA NA NA NA BTBD8 5743 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 93003662 93004045 93003868 Y RPAP2,GLMN,RPL5,GFI1 NA NA NA NA NA GFI1 53229 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 93773027 93773315 93773230 Y NA DR1,RP4-717I23.3 NA NA NA NA DR1 36130 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 93806739 93807078 93807070 Y NA DR1,RP4-717I23.3 NA NA NA NA DR1 2367 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 94093325 94093611 94093590 Y NA NA NA NA NA NA RP11-488P3.1 145389 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 94127789 94128026 94127840 Y GCLM,TMED5,DNTTIP2 NA NA NA NA NA RP11-488P3.1 110974 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 94145547 94146118 94145739 Y NA NA NA NA NA NA RP11-488P3.1 92882 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 94158601 94159338 94158654 Y GCLM,DNTTIP2,BCAR3 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488P3.1 79662 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.84558289440885 chr1 94161111 94161471 94161388 Y GCLM,DNTTIP2 NA BCAR3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-488P3.1 77529 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 94167175 94167520 94167394 Y BCAR3 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488P3.1 71480 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 94203705 94204234 94204026 Y NA RP11-488P3.1 BCAR3,MIR760,DR1,DNTTIP2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-488P3.1 34766 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 94474816 94474984 94474873 Y NA NA NA NA NA NA GCLM 101850 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 94489765 94490012 94489884 Y NA NA NA NA NA NA GCLM 116799 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 94560274 94560395 94560335 Y NA NA NA NA NA NA RP11-148B18.1 151069 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 94684511 94684818 94684682 Y NA RP11-148B18.1 NA NA NA NA RP11-148B18.1 26646 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 94701813 94701865 94701839 Y ARHGAP29 RP11-148B18.1,ARHGAP29 NA NA NA NA RP11-148B18.1 9599 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 94712395 94712617 94712502 Y ARHGAP29 RP11-148B18.1,ARHGAP29 ABCA4,ARHGAP29,ABCD3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-148B18.1 931 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 94788386 94788592 94788436 Y ARHGAP29,F3 ARHGAP29,RP11-148B18.3 ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM IMR90 Hi-C 24141950 RP11-148B18.3 8231 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr1 94792807 94793133 94793077 Y ARHGAP29 RP11-148B18.3 ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM IMR90 Hi-C 24141950 RP11-148B18.3 3690 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 94795618 94795987 94795955 Y NA RP11-148B18.3 ARHGAP29,ABCA4,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-148B18.3 836 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 95113814 95114327 95114013 Y F3 NA F3,ABCD3,SLC44A3 IMR90 Hi-C 24141950 F3 108458 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 95193393 95193837 95193667 Y NA NA F3,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 90000 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 95451299 95451544 95451422 Y NA NA NA NA NA NA RP4-639F20.1 60177 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 96444068 96444298 96444183 Y NA NA NA NA NA NA EEF1A1P11 466188 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 96828119 96828533 96828302 Y NA NA PTBP2 IMR90 Hi-C 24141950 EEF1A1P11 81953 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 96939460 96939794 96939627 Y NA EEF1A1P11 NA NA NA NA EEF1A1P11 28974 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 97596064 97596178 97596116 Y PTBP2 NA NA NA NA NA PTBP2 410843 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 97994700 97995088 97995052 Y NA SEC63P1 NA NA NA NA SEC63P1 14169 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 98011760 98012364 98012119 Y NA SEC63P1 NA NA NA NA SEC63P1 2503 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 98437572 98437739 98437700 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 52967 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 98494244 98494658 98494592 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 109639 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 4.81560182130729 chr1 98518546 98518920 98518639 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 133941 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 98677142 98677181 98677162 Y NA RP5-1070A16.1 NA NA NA NA RP5-1070A16.1 2839 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 98788970 98789228 98789135 Y NA NA MIR137HG,MIR2682,LOC729987,DPYD IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1070A16.1 114667 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 99935284 99935512 99935398 Y LPPR5,LPPR4,AGL,AGL,AGL NA NA NA NA NA PALMD 173987 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 100858865 100858991 100858930 Y SLC35A3,HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 50281 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 101485385 101485713 101485528 Y NA RP11-421L21.3,DPH5 NA NA NA NA RP11-421L21.3 3721 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 101486133 101486158 101486151 Y NA RP11-421L21.3,DPH5 NA NA NA NA RP11-421L21.3 3276 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 108661190 108661332 108661267 Y FAM102B NA NA NA NA NA SLC25A24 80139 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 108695322 108695861 108695595 Y FAM102B SLC25A24 NA NA NA NA SLC25A24 45610 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 109104473 109104583 109104556 Y PRPF38B,FAM102B FAM102B NA NA NA NA FAM102B 3762 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 109189516 109189718 109189617 Y TMEM167B,STXBP3,PRPF38B,HENMT1 HENMT1,PRPF38B NA NA NA NA HENMT1 12430 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 109467804 109468470 109468110 Y GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1 AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 35636 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 109499781 109500180 109500079 Y NA AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 3926 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 109928106 109928152 109928114 Y NA SORT1,PSMA5 NA NA NA NA SORT1 10421 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 110142749 110143055 110142903 Y PSRC1,GNAT2 AMPD2 NA NA NA NA AMPD2 13671 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 110333273 110333688 110333592 Y GNAI3,AMPD2,AMPD2,CSF1 NA CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GSTM3 50889 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 110334849 110335164 110334977 Y NA NA CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GSTM3 52465 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 110364881 110365302 110365225 Y GNAI3,AMPD2,CSF1 NA CSF1,AHCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 GSTM3 82497 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 110435112 110435421 110435324 Y SORT1,SORT1 CSF1 CSF1,EPS8L3,SORT1,PSMA5,GSTM3,AHCYL1,GNAI3,GSTM4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CSF1 15443 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 110476602 110476703 110476653 Y NA CSF1,AHCYL1 NA NA NA NA CSF1 25738 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 110778589 110778756 110778673 Y NA KCNC4 NA NA NA NA KCNC4 26624 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 111489179 111489247 111489213 Y NA LRIF1 NA NA NA NA LRIF1 15454 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 111677638 111678032 111677835 Y NA CEPT1,DRAM2 NA NA NA NA CEPT1 2217 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 112013331 112014031 112013881 Y C1orf183,C1orf183,RAP1A,C1orf162 ATP5F1,WDR77 NA NA NA NA WDR77 23333 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 112050044 112050594 112050328 Y C1orf183,C1orf183,CEPT1,DRAM2,RAP1A,C1orf162,ADORA3 RAP1A NA NA NA NA RAP1A 32246 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 112918897 112919196 112919049 Y NA CTTNBP2NL WNT2B,ST7L,DDX20 IMR90 Hi-C 24141950 CTTNBP2NL 17607 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 114245723 114246101 114246018 Y NA NA NA NA NA NA PHTF1 54010 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 114326143 114326379 114326237 Y HIPK1,HIPK1,HIPK1,AP4B1,PHTF1,RSBN1,PTPN22 PHTF1,RP5-1073O3.2,RSBN1 NA NA NA NA PHTF1 26032 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 115052481 115052766 115052572 Y BCAS2,TRIM33 TRIM33 NA NA NA NA TRIM33 700 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 115605190 115605611 115605404 Y BCAS2,SIKE1 TSPAN2 NA NA NA NA TSPAN2 24510 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr1 115722074 115722498 115722181 Y NGF NA NGF IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN2 91953 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 115732772 115733197 115732900 Y NGF NA NGF IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN2 102651 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 116038305 116038519 116038336 Y NA NA NGF,TSPAN2 IMR90 Hi-C 24141950 VANGL1 144055 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 116039640 116039989 116039911 Y NA NA NGF,TSPAN2 IMR90 Hi-C 24141950 VANGL1 142585 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 116088478 116088732 116088606 Y NA NA NGF,VANGL1,SYCP1 IMR90 Hi-C 24141950 VANGL1 93842 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr1 116588429 116588746 116588471 Y NA NA NA NA NA NA SLC22A15 71310 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 116918925 116919548 116919274 Y SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1 ATP1A1,ATP1A1OS NA NA NA NA ATP1A1 5635 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 117030831 117031034 117030889 Y ATP1A1,ATP1A1 NAP1L4P1 ATP1A1,ATP1A1OS,SLC22A15,MAB21L3,CD58 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NAP1L4P1 43680 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 117032033 117032296 117032175 Y ATP1A1,ATP1A1,CD58 NAP1L4P1 ATP1A1,SLC22A15,MAB21L3,ATP1A1OS,CD58 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NAP1L4P1 42418 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 117110819 117111247 117111136 Y NA NAP1L4P1,CD58 NA NA NA NA CD58 414 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 117359174 117359463 117359379 Y TTF2,CD2 NA NA NA NA NA PTGFRN 91216 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 117363043 117363386 117363270 Y NA NA NA NA NA NA PTGFRN 87293 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 117421623 117422020 117421974 Y TTF2 PTGFRN PTGFRN,TTF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PTGFRN 28659 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 117533270 117533527 117533328 Y CD58,CD101 NA NA NA NA NA RP11-27K13.3 66585 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 118153815 118153988 118153913 Y FAM46C FAM46C NA NA NA NA FAM46C 7259 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 118174879 118175156 118175081 Y NA FAM46C NA NA NA NA FAM46C 28323 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 118208639 118208762 118208709 Y MAN1A2 NA FAM46C K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM46C 62083 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 118302292 118302520 118302372 Y NA NA GDAP2,FAM46C,MAN1A2,TRIM45 IMR90 Hi-C 24141950 FAM46C 155736 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 118653984 118654263 118654124 Y NA NA NA NA NA NA SPAG17 71583 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 120147764 120147961 120147863 Y HSD3B1 GAPDHP33,ZNF697 NA NA NA NA GAPDHP33 9962 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 120519934 120520272 120520095 Y NA NA NA NA NA NA NOTCH2 89968 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 120525502 120525838 120525670 Y NOTCH2,ZNF697,NBPF7 NA NA NA NA NA NOTCH2 84402 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 121485082 121485212 121485187 Y NA NA NA NA NA NA EMBP1 225939 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 142538903 142539547 142539454 Y NA NA NA NA NA NA NBPF8 1605261 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 144533627 144534178 144533764 Y PDE4DIP RNU1-59P PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNU1-59P 1589 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 144912694 144913065 144913005 Y NA NA NA NA NA NA NBPF9 102950 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 144941125 144941602 144941408 Y NA NA NA NA NA NA NBPF9 131381 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 145009158 145009716 145009503 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 64470 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 145012331 145013054 145012678 Y NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 61132 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 145036432 145036531 145036463 Y NA PDE4DIP NA NA NA NA PDE4DIP 37655 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 145044480 145044713 145044599 Y NA PDE4DIP,SEC22B LOC728875,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL IMR90 Hi-C 24141950 PDE4DIP 29473 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 145067412 145067676 145067614 Y NA PDE4DIP,SEC22B NOTCH2NL,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9,LOC728875,PFN1P2,NBPF10 IMR90 Hi-C 24141950 PDE4DIP 6510 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 145092450 145092883 145092733 Y SEC22B,PDE4DIP PDE4DIP,SEC22B NBPF9,LOC653513,PDE4DIP,NOTCH2NL,SEC22B,LOC728875,NBPF10 IMR90 Hi-C 24141950 SEC22B 1337 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr1 145093258 145093700 145093462 Y NA PDE4DIP,SEC22B NA NA NA NA SEC22B 520 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNVU1-6 16003 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr1 145455122 145455741 145455465 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L,RBM8A NA NA NA NA POLR3GL 12647 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr1 145627337 145627622 145627480 Y NA NUDT17,POLR3C,RNF115 NA NA NA NA RNF115 18301 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 145702718 145703106 145702912 Y NA PDZK1 NA NA NA NA PDZK1 21812 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 147072641 147072971 147072883 Y NA NA NA NA NA NA BCL9 61459 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 147080043 147080251 147080097 Y PRKAB2,CHD1L,BCL9 NA NA NA NA NA ACP6 60367 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 147806841 147807184 147807140 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 1955 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr1 149029458 149029500 149029498 Y NA NA NA NA NA NA PFN1P12 83155 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 149138053 149138113 149138087 Y NA PFN1P12 NA NA NA NA PFN1P12 25398 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 149215297 149215704 149215586 Y NA RNU1-92P NA NA NA NA RNU1-92P 1997 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 149816287 149817606 149817166 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2BC 2733 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 150135231 150135764 150135536 Y PRPF3,MCL1,PLEKHO1 PLEKHO1 NA NA NA NA PLEKHO1 15858 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr1 150159099 150159241 150159135 Y PRPF3,MCL1,PLEKHO1 PLEKHO1,ANP32E,RNU2-17P HIST2H2AC,HIST2H2BE,HIST2H2AB K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 PLEKHO1 39726 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 150185878 150186128 150186012 Y HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E ANP32E,RNU2-17P NA NA NA NA ANP32E 20376 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 150510569 150510713 150510587 Y NA ECM1,LINC00568,ADAMTSL4,MCL1 NA NA NA NA ADAMTSL4 9171 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 150949569 150950014 150949933 Y ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A CERS2,ANXA9,FAM63A,PRUNE NA NA NA NA ANXA9 2479 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 151168297 151168505 151168391 Y BNIPL,TUFT1,SCNM1 SCNM1,LYSMD1,VPS72 NA NA NA NA PIP5K1A 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 151168916 151169086 151168995 Y NA SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 491 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 151172142 151172526 151172243 Y FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4 SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 3717 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 151172620 151173197 151172669 Y TMOD4 SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 4195 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 151580936 151581099 151580976 Y NA SNX27,RP11-404E16.1 RIIAD1,CELF3 IMR90 Hi-C 24141950 SNX27 1442 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 151868154 151868386 151868273 Y NA THEM4 NA NA NA NA THEM4 11898 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 151877533 151877895 151877666 Y THEM4 THEM4 NA NA NA NA THEM4 2389 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 151960875 151961433 151961102 Y S100A11,S100A10 S100A10,NBPF18P NA NA NA NA S100A10 3433 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 151961675 151962369 151962069 Y S100A11,S100A10 S100A10,NBPF18P NA NA NA NA S100A10 2497 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 152006910 152007460 152006991 Y SNX27,S100A11 S100A10,NBPF18P,S100A11 NA NA NA NA S100A11 10923 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 152022022 152022514 152022379 Y SNX27,S100A10,S100A11 S100A11 THEM4 MCF7 ChIA-PET 22265404 S100A11 3639 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 152140379 152140745 152140485 Y NA FLG-AS1 NA NA NA NA FLG-AS1 1778 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 153541018 153541368 153541269 Y PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13 S100A6,S100A5,S100A3,S100A4,S100A2,S100A16 NA NA NA NA S100A2 2652 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 153583449 153583810 153583692 Y PGLYRP3,PGLYRP4,S100A7A,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13 S100A2,CHTOP,S100A13,SNAPIN NA NA NA NA S100A16 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 153584539 153584862 153584750 Y NA S100A2,S100A16,CHTOP,S100A13,SNAPIN NA NA NA NA S100A16 918 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr1 153702935 153703414 153703046 Y NA INTS3,SLC27A3 NA NA NA NA INTS3 4392 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 153936554 153936861 153936642 Y UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4 GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9 NA NA NA NA CREB3L4 1149 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.97001892689844 chr1 154699087 154699216 154699140 Y NA NA NA NA NA NA ADAR 100612 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 7.88007570759375 chr1 154957258 154957622 154957425 Y NA PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B NA NA NA NA FLAD1 3444 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 154973036 154973200 154973120 Y CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1 PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 154973335 154973935 154973656 Y ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 208 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 155164183 155164959 155164537 Y NA TRIM46,KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA NA NA NA NA MIR92B 1215 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr1 155433776 155433971 155433878 Y MTX1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1 NA NA NA NA NA ASH1L-AS1 95850 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 155620238 155620623 155620432 Y NA DAP3,YY1AP1 NA NA NA NA DAP3 35128 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 156095033 156095181 156095051 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA MEX3A,LMNA NA NA NA NA LMNA 44669 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 156403490 156403714 156403646 Y NA NA IQGAP3,RHBG,C1orf182,C1orf61,CCT3,TTC24,MEF2D,BCAN,APOA1BP,GPATCH4,HAPLN2 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2D 64906 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 156426931 156427503 156427197 Y ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 41117 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 156468556 156468776 156468632 Y MEF2D NA NA NA NA NA MEF2D 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 156472693 156472952 156472780 Y LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 4073 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.62669190253125 chr1 156474686 156475018 156474923 Y SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6066 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 156480721 156480806 156480764 Y NA MEF2D NA NA NA NA MEF2D 12101 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 156679562 156679883 156679727 Y NA NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC NA NA NA NA CRABP2 5954 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 156718467 156719136 156718868 Y C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1 CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF NA NA NA NA PRCC 65 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 156719450 156719815 156719708 Y ETV3,ETV3,RRNAD1 CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF NA NA NA NA PRCC 1048 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 157076072 157076782 157076408 Y RRNAD1,ETV3,ETV3 KRT8P45,ETV3 NA NA NA NA ETV3 29484 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 157532312 157532617 157532460 Y FCRL5 NA NA NA NA NA ETV3 426046 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 157966753 157967127 157966789 Y NA KIRREL NA NA NA NA KIRREL 5690 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 157980631 157980890 157980708 Y KIRREL KIRREL NA NA NA NA KIRREL 19568 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.84558289440885 chr1 157989414 157989935 157989469 Y KIRREL KIRREL NA NA NA NA KIRREL 28351 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 157990877 157991211 157991044 Y NA KIRREL NA NA NA NA KIRREL 29814 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 158075201 158075434 158075415 Y NA NA NA NA NA NA CD1D 72303 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 158119500 158119689 158119553 Y NA CD1D LOC646268,KIRREL,AIM2 IMR90 Hi-C 24141950 CD1D 28048 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 158147244 158147839 158147743 Y NA NA NA NA NA NA CD1D 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 158217835 158218199 158218078 Y OR10T2,CD1D,CD1E,CD1C,CD1B NA NA NA NA NA CD1D 70098 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 158983439 158983572 158983497 Y NA IFI16 NA NA NA NA IFI16 15681 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 159859603 159860031 159859945 Y SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2 C1orf204,CCDC19,TAGLN2 C1orf204,SLAMF8 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC19 7922 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 159892447 159892988 159892803 Y NCSTN,TAGLN2 CCDC19,TAGLN2,IGSF9,LINC01133 NA NA NA NA TAGLN2 534 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 160737478 160737714 160737604 Y CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7 SLAMF7 NA NA NA NA SLAMF7 30441 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 160881277 160881698 160881498 Y NA RP11-312J18.5 CD244,ITLN1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-312J18.5 18507 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 160982920 160983992 160983766 Y CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30 F11R,TSTD1,USF1 NA NA NA NA F11R 5146 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr1 160989381 160990254 160990012 Y NDUFS2,ADAMTS4,F11R F11R,TSTD1,USF1 NA NA NA NA F11R 243 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 161359666 161360218 161359899 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 77619 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr1 161369073 161369991 161369486 Y NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 87026 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 161582212 161582506 161582417 Y HSPA6,FCGR3A NA NA NA NA NA FCRLB 106847 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 161847357 161847565 161847361 Y NA NA NA NA NA NA ATF6 113273 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 161973003 161973384 161973069 Y NA OLFML2B NA NA NA NA OLFML2B 18260 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 162508612 162508929 162508802 Y UAP1 UHMK1,UAP1 NA NA NA NA UAP1 20394 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 162511455 162511984 162511719 Y UAP1,UHMK1 UHMK1,UAP1 NA NA NA NA UAP1 17339 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr1 162709795 162709973 162709884 Y NOS1AP,DDR2 NA NA NA NA NA DDR2 110632 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 162830850 162831244 162831104 Y NA C1orf110 NA NA NA NA C1orf110 5361 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 162954567 162954830 162954669 Y RGS4,RGS4,RGS4,RGS4 NA RGS4,RGS5,C1orf110 IMR90 Hi-C 24141950 RGS4 81735 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 163005587 163006022 163005933 Y UAP1,DDR2,RGS4,RGS4,RGS4,RGS4 RGS4 C1orf110 IMR90 Hi-C 24141950 RGS4 30543 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 164580985 164581415 164581219 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 58164 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 164717528 164717907 164717706 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 194707 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 165797615 165798367 165798308 Y UCK2 UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 2623 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 165868061 165868423 165868295 Y NA NA NA NA NA NA TMCO1 73069 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 167722412 167722527 167722511 Y NA MPZL1 NA NA NA NA MPZL1 33983 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 168338134 168338331 168338175 Y NA NA NA NA NA NA TBX19 89856 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 171712214 171712716 171712399 Y FMO4,PRRC2C VAMP4,METTL13 NA NA NA NA VAMP4 2827 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 172291507 172291926 172291559 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 119304 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 172507125 172507604 172507262 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 95895 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 172606833 172606931 172606882 Y FASLG,C1orf9 NA C1orf9,FASLG IMR90 Hi-C 24141950 PIGC 195603 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr1 172608229 172608375 172608255 Y NA NA C1orf9,FASLG IMR90 Hi-C 24141950 PIGC 196999 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 172788027 172788361 172788212 Y NA NA CENPL,DARS2,TNFSF4,LOC100506023,RC3H1,SERPINC1,TNFSF18 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 229742 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 172790579 172790978 172790769 Y NA NA CENPL,DARS2,TNFSF4,LOC100506023,RC3H1,SERPINC1,TNFSF18 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 227125 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 172853063 172853400 172853301 Y NA NA LOC100506023,TNFSF18,TNFSF4 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 164703 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 172863432 172863838 172863572 Y TNFSF4,C1orf9,C1orf9,FASLG NA TNFSF4 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 154265 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 172878579 172879356 172878831 Y TNFSF18 NA TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,SNORD81,GAS5,SNORD75,SNORD47,SNORD79,LOC100506046,SNORD77,DARS2,SNORD78,SNORD80,ZBTB37,SNORD44,SNORD76 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 138747 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 172900674 172900969 172900756 Y TNFSF18 NA TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,DARS2,CENPL,ZBTB37,GAS5 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 117134 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 172972573 172972790 172972603 Y PRDX6 TNFSF18 NA NA NA NA TNFSF18 45313 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 173167258 173167319 173167289 Y NA TNFSF4 NA NA NA NA TNFSF4 7133 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 174220636 174220943 174220783 Y RABGAP1L NA NA NA NA NA RABGAP1L 94088 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 176058824 176059044 176058987 Y NA NA NA NA NA NA RFWD2 115585 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 177896186 177896486 177896298 Y NA NA NA NA NA NA SEC16B 54952 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 178901109 178901308 178901215 Y NA NA NA NA NA NA FAM20B 91631 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 178995927 178996290 178996175 Y AXDND1,RALGPS2,TOR3A FAM20B NA NA NA NA FAM20B 2988 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 179110934 179111289 179111201 Y AXDND1,SOAT1,TOR3A,ABL2 NA NA NA NA NA TOR3A 62422 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 181042855 181043067 181042961 Y NA MR1,IER5 NA NA NA NA IER5 12571 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 181060502 181060611 181060567 Y STX6,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 4864 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 181068595 181069000 181068732 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 12957 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 181074349 181074924 181074645 Y XPR1,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 18711 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 181082184 181082367 181082268 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 26546 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 181104265 181104352 181104277 Y NA IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48627 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 181104473 181105818 181105427 Y STX6,MR1,IER5 IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48835 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr1 181634022 181634294 181634141 Y NA NA NA NA NA NA IER5 578384 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 181998739 181999134 181998891 Y GLUL,GLUL NA ZNF648 MCF7 ChIA-PET 22265404 GLUL 360207 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 182274457 182274562 182274517 Y NA NA GLUL K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GLUL 84779 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 182854499 182854851 182854644 Y NA DHX9 NA NA NA NA DHX9 47995 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 183129116 183129507 183129296 Y LAMC2 LAMC2 LAMC2 IMR90 Hi-C 24141950 LAMC2 23866 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 183132366 183132749 183132653 Y LAMC2 LAMC2 NA NA NA NA LAMC2 20624 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 183133608 183133779 183133664 Y LAMC2 LAMC2 NA NA NA NA LAMC2 19594 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 183149947 183150219 183150157 Y LAMC2 LAMC2 NA NA NA NA LAMC2 3154 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 183239968 183240242 183240112 Y LAMC1 NA LAMC2 IMR90 Hi-C 24141950 LAMC2 86595 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr1 183241451 183241867 183241650 Y LAMC1 NA LAMC2 IMR90 Hi-C 24141950 LAMC2 88078 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 183248987 183249454 183249212 Y NCF2,NCF2,ARPC5,LAMC1 NA NA NA NA NA LAMC2 95614 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 183594812 183595033 183594923 Y NA NCF2,ARPC5,RGL1 NA NA NA NA ARPC5 7859 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 183877295 183877615 183877384 Y NCF2,NCF2,ARPC5 NA NA NA NA NA TSEN15 141196 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 184161714 184161954 184161834 Y NA NA C1orf21 IMR90 Hi-C 24141950 TSEN15 142903 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 185346055 185346679 185346575 Y FAM129A,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP NA IVNS1ABP,LOC100288079 IMR90 Hi-C 24141950 IVNS1ABP 61594 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 185372140 185372184 185372162 Y NA NA NA NA NA NA IVNS1ABP 87679 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 186090860 186091020 186090873 Y HMCN1 NA NA NA NA NA TPR 251805 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 186818021 186818219 186818132 Y PTGS2,PLA2G4A PLA2G4A NA NA NA NA PLA2G4A 21936 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 187996792 187997117 187996893 Y NA NA NA NA NA NA RP11-373J16.2 1103306 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 192216449 192216576 192216513 Y NA NA NA NA NA NA MIR4426 466737 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 192915458 192915787 192915575 Y NA NA NA NA NA NA TROVE2 110765 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 197513718 197513772 197513745 Y CRB1,DENND1B NA NA NA NA NA DENND1B 229054 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 198090244 198090551 198090353 Y NA NEK7 PTPRC,NEK7,C1orf53,LHX9 IMR90 Hi-C 24141950 NEK7 33542 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 198127475 198127965 198127580 Y NA NEK7 NA NA NA NA NEK7 3382 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 198128112 198128944 198128293 Y PTPRC,DENND1B NEK7 NA NA NA NA NEK7 4019 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 198465277 198465448 198465363 Y NA NA PTPRC,ATP6V1G3 IMR90 Hi-C 24141950 NEK7 341184 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 198488746 198489088 198489022 Y PTPRC NA NA NA NA NA NEK7 364653 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 198625518 198626374 198625745 Y PTPRC NA NA NA NA NA NEK7 501425 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 198650930 198651643 198651116 Y PTPRC NA NA NA NA NA NEK7 526837 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 199826452 199826640 199826531 Y NA NA C1orf98 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-532L16.1 469649 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 200321353 200321596 200321470 Y DDX59,ZNF281 RP11-532L16.1 NA NA NA NA RP11-532L16.1 25064 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 201431088 201431253 201431176 Y NA PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA PHLDA3 5112 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 201472589 201472996 201472808 Y LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1 PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA RP11-134G8.7 1373 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 201508517 201509575 201509484 Y NA RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA CSRP1 31933 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 201572031 201572237 201572112 Y NA NAV1 NAV1,IPO9 IMR90 Hi-C 24141950 NAV1 18174 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 201619383 201619798 201619705 Y SHISA4,GPR37L1,NAV1 NAV1 NA NA NA NA NAV1 28972 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 201682596 201682901 201682784 Y ARL8A NA NA NA NA NA NAV1 92185 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 201683757 201684240 201683949 Y NA NA NA NA NA NA NAV1 93346 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 201684946 201685300 201685285 Y ARL8A NA NA NA NA NA NAV1 94535 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 201717535 201717792 201717621 Y NA NA IPO9 IMR90 Hi-C 24141950 IPO9 78477 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 202003479 202003610 202003599 Y NA NA NA NA NA NA RNPEP 53979 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 203294985 203295146 203295066 Y NA BTG2,FMOD NA NA NA NA BTG2 22366 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 203481982 203482534 203482093 Y BTG2,ATP2B4 PRELP NA NA NA NA PRELP 39026 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.40780091065365 chr1 203526746 203526853 203526757 Y NA NA ATP2B4,PRELP,LAX1,ZC3H11A,OPTC,FMOD IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B4 66836 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 204255998 204256379 204256352 Y NA NA NA NA NA NA GOLT1A 74778 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 204289566 204289863 204289752 Y SOX13,PPP1R15B NA NA NA NA NA PLEKHA6 54930 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 204386444 204387188 204386898 Y PPP1R15B PLEKHA6,PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 7525 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr1 204684045 204684323 204684297 Y NA NA NFASC,LRRN2 IMR90 Hi-C 24141950 MDM4 200534 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 205218253 205218732 205218517 Y NA NA NA NA NA NA SNRPGP10 99643 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 207064076 207064429 207064213 Y NA RP11-564A8.4 NA NA NA NA RP11-564A8.4 14535 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 208415648 208415868 208415811 Y NA NA NA NA NA NA CD46 492246 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 209556903 209557123 209556922 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587 NA MIR205HG MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP5G2P1 117335 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 209557331 209557442 209557421 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587 NA MIR205HG MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP5G2P1 117763 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 209571959 209572357 209572220 Y LAMB3 NA MIR205HG MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP5G2P1 132391 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 209578512 209578819 209578654 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,HSD11B1,LOC642587 NA NA NA NA NA ATP5G2P1 138944 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 209827285 209827712 209827546 Y LOC642587,IRF6,HSD11B1,LAMB3,LAMB3 G0S2,HSD11B1 NA NA NA NA G0S2 19053 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 209915892 209916078 209915980 Y NA C1orf74 NA NA NA NA C1orf74 39826 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 209996933 209997272 209996990 Y NA C1orf74,IRF6,DIEXF DIEXF,IRF6,C1orf74 K562 ChIA-PET 22265404 DIEXF 2080 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 210058060 210058292 210058164 Y LAMB3 NA DIEXF,SYT14 IMR90 Hi-C 24141950 DIEXF 58708 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 211035320 211035533 211035504 Y NA NA NA NA NA NA KCNH1 269924 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr1 211590216 211590571 211590445 Y NA LINC00467 NA NA NA NA LINC00467 36071 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 212484976 212485048 212485012 Y NA PPP2R5A,RP11-384C4.3 TMEM206 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-384C4.3 4116 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 212643548 212643711 212643612 Y NA NENF ATF3 K562 ChIA-PET 22265404 NENF 39319 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 212731490 212732709 212732386 Y NA ATF3 ATF3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ATF3 3967 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.40780091065365 chr1 212923712 212923837 212923822 Y NA NSL1,TATDN3 NA NA NA NA NSL1 39287 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 214601098 214601566 214601506 Y PTPN14 NA NA NA NA NA PTPN14 122226 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 214612784 214613126 214613017 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 110666 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 214620076 214620672 214620502 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 103120 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 218338759 218338973 218338866 Y NA NA ESRRG IMR90 Hi-C 24141950 RRP15 117656 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 218382752 218383112 218382930 Y NA NA NA NA NA NA RRP15 73517 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 218633382 218633612 218633512 Y NA NA NA NA NA NA TGFB2 115805 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 218636802 218637167 218637004 Y NA NA NA NA NA NA TGFB2 119225 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 218671989 218672275 218672071 Y NA NA TGFB2,LOC643723,LOC728463 IMR90 Hi-C 24141950 TGFB2 154412 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 218847947 218848245 218848113 Y NA NA NA NA NA NA TGFB2 330370 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 219259195 219259565 219259379 Y NA NA NA NA NA NA LYPLAL1 85621 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 220347108 220347461 220347410 Y NA NA NA NA NA NA MORF4L1P1 77451 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 221143804 221143903 221143854 Y NA NA NA NA NA NA HLX 94105 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 221916049 221916599 221916319 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 2531 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 222638782 222639204 222638963 Y NA NA DUSP10,MIA3,AIDA,BROX IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HHIPL2 80241 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 223964690 223965055 223964731 Y TP53BP2,FBXO28 NA NA NA NA NA TP53BP2 66619 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr1 224730441 224730985 224730669 Y NA NA CNIH3 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 107706 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 225613143 225613456 225613257 Y LBR,LBR LBR NA NA NA NA LBR 1171 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 225654906 225655584 225655524 Y TMEM63A,LBR,LBR LBR NA NA NA NA LBR 40279 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 225843222 225843438 225843341 Y NA ENAH,RP11-145A3.1 NA NA NA NA ENAH 4378 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 225845408 225845613 225845516 Y ENAH ENAH,RP11-145A3.1 NA NA NA NA ENAH 6564 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 226297611 226298113 226297674 Y NA NA ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H3F3A 50059 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr1 226298813 226299157 226299132 Y NA NA ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H3F3A 51261 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 226361229 226361382 226361305 Y NA ACBD3 NA NA NA NA ACBD3 11049 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 226890865 226891416 226891300 Y ITPKB ITPKB NA NA NA NA ITPKB 33608 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 228783266 228783899 228783495 Y C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU NA NA NA NA NA RNF187 110504 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 230240540 230240902 230240735 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 49004 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 230631666 230631872 230631760 Y NA NA URB2 IMR90 Hi-C 24141950 COG2 144363 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 231531271 231531676 231531476 Y NA EGLN1 NA NA NA NA EGLN1 27114 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 231868761 231869568 231868969 Y NA NA NA NA NA NA TSNAX 206362 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 232671774 232671885 232671830 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-74P 294048 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 199806 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr1 234686100 234686288 234686192 Y NA NA LOC100506795,IRF2BP2 IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BP2 56983 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 234746093 234747674 234747395 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 2822 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 234748100 234748931 234748566 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4829 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 234752255 234752429 234752320 Y NA IRF2BP2 ARID4B,LOC100506795,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506810 IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BP2 8984 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 234754264 234754665 234754337 Y NA IRF2BP2 ARID4B,LOC100506795,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506810 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2BP2 10993 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 234757412 234757805 234757606 Y NA IRF2BP2 LOC100506810 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 IRF2BP2 14141 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 234767593 234767925 234767750 Y TARBP1 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 24322 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 234908151 234908764 234908277 Y IRF2BP2 NA IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRF2BP2 164880 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr1 235097868 235098070 235097979 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 16481 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 235110834 235111403 235111103 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 3148 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 235120162 235120433 235120341 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 5611 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 235133014 235133422 235133155 Y NA RP11-443B7.3 LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 18463 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 235246558 235246857 235246620 Y ARID4B,ARID4B SNORA14B,TOMM20 IRF2BP2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SNORA14B 42395 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 235390754 235391125 235391097 Y NA NA NA NA NA NA RBM34 67982 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 235668656 235669018 235668830 Y RBM34,ARID4B,ARID4B B3GALNT2 NA NA NA NA B3GALNT2 2875 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 235835688 235836968 235835896 Y NA GNG4 NA NA NA NA GNG4 23634 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 235927486 235927702 235927520 Y NA NA NA NA NA NA GNG4 115432 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 236022682 236022818 236022763 Y GPR137B,LYST LYST NA NA NA NA LYST 22122 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 236080566 236081247 236080933 Y LYST,GPR137B LYST B3GALNT2,LYST,NID1 IMR90 Hi-C 24141950 LYST 35626 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 236162583 236163199 236162893 Y GPR137B NA NA NA NA NA NID1 63263 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 236764383 236764568 236764551 Y NA HEATR1 NA NA NA NA HEATR1 1236 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 236856658 236857048 236856853 Y ACTN2 ACTN2 NA NA NA NA ACTN2 8904 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 238811242 238811567 238811347 Y NA NA NA NA NA NA LINC01139 163919 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 240306165 240306375 240306208 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 25080 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 240306412 240306787 240306695 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 24668 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 240306890 240307603 240307416 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23852 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr1 240307621 240308162 240308005 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23293 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 240308207 240308537 240308375 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22918 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 240308546 240308862 240308776 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22593 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 243997018 243997244 243997154 Y NA AKT3 NA NA NA NA AKT3 15137 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 244210956 244211944 244211575 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 198575 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 244373439 244373613 244373526 Y NA NA AKT3,ZNF238,SDCCAG8,LOC339529 IMR90 Hi-C 24141950 ADSS 239823 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 244763140 244763529 244763408 Y ADSS,EFCAB2 NA NA NA NA NA C1orf101 147461 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 246038342 246038749 246038555 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 629865 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr1 246591935 246592203 246592010 Y SMYD3 NA NA NA NA NA SMYD3 76411 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 247035132 247035504 247035470 Y CNST,ZNF669,AHCTF1 NA NA NA NA NA AHCTF1 57776 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 247325578 247326237 247325673 Y NA MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 37125 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr1 247326566 247327229 247326989 Y NA MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 36133 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr1 248894360 248894532 248894495 Y NA NA NA NA NA NA SH3BP5L 224300 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 10.9445495938802 chr1 249157308 249157673 249157562 Y OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692 SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2 NA NA NA NA ZNF692 5965 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr10 729218 729515 729367 Y NA DIP2C NA NA NA NA DIP2C 4168 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 916611 916806 916707 Y NA NA NA NA NA NA LARP4B 58758 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 1541138 1541906 1541672 Y WDR37,ADARB2 NA NA NA NA NA WDR37 447660 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 3028046 3028193 3028123 Y NA NA LINC00200 IMR90 Hi-C 24141950 PFKP 78332 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr10 3088088 3088382 3088199 Y NA PFKP PFKP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFKP 18143 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 3509617 3509911 3509759 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 296614 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr10 3511181 3511689 3511507 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 298178 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 3524547 3524820 3524727 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 300653 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 3710838 3711066 3710976 Y KLF6 NA KLF6 K562 ChIA-PET 22265404 KLF6 114407 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 3853393 3854169 3853583 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 27920 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 3867491 3867713 3867639 Y NA KLF6 LOC338588,LOC100216001,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 42018 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 3868851 3869035 3868973 Y KLF6 KLF6 LOC338588,LOC100216001,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 43378 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 3928866 3929216 3928980 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 103393 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 3929991 3930887 3930290 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 104518 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 3984866 3985563 3985082 Y KLF6 NA KLF6,LOC100216001,LOC338588 IMR90 Hi-C 24141950 KLF6 159393 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 4283808 4284356 4284092 Y NA NA KLF6,LOC100216001,LOC338588 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00702 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 4685784 4686138 4685885 Y NA LINC00704 NA NA NA NA LINC00704 32208 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 4705159 4705783 4705486 Y NA LINC00704 NA NA NA NA LINC00704 12563 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 4713647 4713873 4713697 Y NA LINC00704 NA NA NA NA LINC00704 4473 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr10 5577499 5577735 5577573 Y NA NA NA NA NA NA RP13-463N16.6 58346 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 5587810 5588190 5587923 Y NA RP13-463N16.6 NA NA NA NA RP13-463N16.6 47891 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 5590010 5590295 5590293 Y NET1,CALML3 RP13-463N16.6 NA NA NA NA RP13-463N16.6 45786 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 5590959 5591270 5591035 Y NET1 RP13-463N16.6 NA NA NA NA RP13-463N16.6 44811 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr10 5593718 5593999 5593816 Y NET1,CALML3 RP13-463N16.6 NET1 IMR90 Hi-C 24141950 RP13-463N16.6 42082 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 5606066 5606314 5606283 Y NA RP13-463N16.6 NET1,CALML5 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP13-463N16.6 29767 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr10 5606609 5606845 5606776 Y NA RP13-463N16.6 NET1,CALML5 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP13-463N16.6 29236 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 5607602 5608000 5607781 Y CALML3 RP13-463N16.6 NET1,CALML5 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP13-463N16.6 28081 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 5638863 5639270 5639216 Y NET1,CALML3 RP13-463N16.6 NET1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RP13-463N16.6 2782 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr10 5986377 5986825 5986602 Y NA RP11-536K7.3,IL15RA NA NA NA NA RP11-536K7.3 514 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 6206285 6206560 6206485 Y NA PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 21404 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 6240292 6240352 6240319 Y IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 55411 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 6243287 6243821 6243659 Y PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 58406 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 6245814 6246792 6246043 Y PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 60933 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 6339022 6339139 6339081 Y NA NA NA NA NA NA PFKFB3 154141 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 6443408 6443712 6443449 Y PFKFB3,PFKFB3 NA IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFKFB3 258527 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 8098940 8099487 8099174 Y TAF3,GATA3 GATA3 NA NA NA NA GATA3 5373 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 10754108 10754441 10754195 Y CELF2,CELF2 NA LOC254312,CELF2 IMR90 Hi-C 24141950 SFTA1P 80502 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 10757050 10757431 10757172 Y NA NA LOC254312,CELF2 IMR90 Hi-C 24141950 SFTA1P 77512 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 10914098 10914350 10914196 Y NA NA NA NA NA NA SFTA1P 79155 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 11667101 11667345 11667206 Y CELF2,USP6NL USP6NL USP6NL K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 USP6NL 15348 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 11746687 11746940 11746814 Y USP6NL ECHDC3 USP6NL,ECHDC3 IMR90 Hi-C 24141950 ECHDC3 35425 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 12195131 12195251 12195172 Y CAMK1D SEC61A2,CDC123,NUDT5 NA NA NA NA SEC61A2 25495 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 12497927 12498063 12497995 Y NA NA NA NA NA NA CAMK1D 108446 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 12749537 12749904 12749742 Y NA NA NA NA NA NA CAMK1D 360056 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 13096152 13096416 13096284 Y NA OPTN,CCDC3 CAMK1D,SEC61A2,NUDT5,CDC123,LOC283070,CCDC3 IMR90 Hi-C 24141950 OPTN 43033 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 13142941 13143287 13143115 Y NA OPTN,CCDC3 NA NA NA NA CCDC3 3289 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr10 13390886 13391219 13391148 Y NA PHYH,SEPHS1 NA NA NA NA SEPHS1 2589 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 13754952 13755339 13755135 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 128025 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 13800483 13800712 13800626 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 173556 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr10 13829023 13829481 13829176 Y PRPF18 NA NA NA NA NA PRPF18 202096 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr10 13908290 13908478 13908416 Y NA NA NA NA NA NA RP11-397C18.2 205805 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr10 14040258 14040270 14040265 Y FRMD4A NA NA NA NA NA RP11-397C18.2 74013 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 14051386 14052060 14051814 Y PRPF18 NA NA NA NA NA RP11-397C18.2 62223 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 14215783 14216000 14215795 Y NA NA NA NA NA NA RP11-397C18.2 101500 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 14438165 14438288 14438234 Y NA NA FRMD4A,MIR1265 IMR90 Hi-C 24141950 FRMD4A 63853 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 14447046 14447458 14447244 Y NA NA FRMD4A,FAM107B IMR90 Hi-C 24141950 FRMD4A 54683 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr10 14458446 14458565 14458455 Y NA FRMD4A FRMD4A,MIR1265,FAM107B IMR90 Hi-C 24141950 FRMD4A 43576 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr10 14518978 14519126 14519049 Y NA FRMD4A FRMD4A IMR90 Hi-C 24141950 FRMD4A 16837 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr10 14601403 14601956 14601622 Y DCLRE1C NA NA NA NA NA FRMD4A 99262 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 14624029 14624329 14624184 Y DCLRE1C NA NA NA NA NA FRMD4A 121888 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 14647138 14647588 14647478 Y NA NA NA NA NA NA FRMD4A 144997 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 14689846 14690850 14690697 Y RPP38,HSPA14,DCLRE1C,CDNF,C10orf111 NA NA NA NA NA FAM107B 124046 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 15157630 15158203 15157954 Y NA ACBD7,RPP38 NA NA NA NA RPP38 20451 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 15165954 15166084 15166019 Y NA ACBD7,RPP38,NMT2 NA NA NA NA RPP38 28775 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 15178441 15178844 15178745 Y NA ACBD7,RPP38,NMT2 NA NA NA NA NMT2 29848 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 15191044 15191371 15191092 Y MEIG1,NMT2,C10orf111 NMT2 NA NA NA NA NMT2 17321 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.97001892689844 chr10 15278281 15278573 15278465 Y NA NA NA NA NA NA NMT2 69589 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 15411341 15411434 15411388 Y NA FAM171A1 NA NA NA NA FAM171A1 280 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 17028207 17028677 17028581 Y NA NA NA NA NA NA RSU1 170680 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 17105178 17105416 17105257 Y NA NA NA NA NA NA TRDMT1 136637 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 17215777 17215793 17215785 Y NA TRDMT1 NA NA NA NA TRDMT1 26260 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 17389950 17390239 17390096 Y ST8SIA6 NA NA NA NA NA ST8SIA6 104090 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 20219970 20220256 20220113 Y NA NA NA NA NA NA PLXDC2 116802 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 21333319 21333508 21333415 Y NEBL,C10orf113 NA NA NA NA NA NEBL 127608 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 21816029 21816444 21816223 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 4650 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr10 22025175 22025497 22025336 Y NA NA NA NA NA NA RN7SKP37 194575 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 22535612 22535856 22535691 Y NA NA ARMC3,LOC100130992 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COMMD3 67047 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 22628998 22629520 22629110 Y EBLN1 COMMD3,BMI1 NA NA NA NA BMI1 20858 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 22629825 22629981 22629966 Y DNAJC1 COMMD3,BMI1 NA NA NA NA BMI1 21685 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 22725331 22726270 22725901 Y NA NA NA NA NA NA BMI1 117191 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.62669190253125 chr10 22726811 22727194 22727116 Y NA NA NA NA NA NA BMI1 118671 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 22890368 22890535 22890414 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 110949 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 22932460 22932672 22932594 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 68812 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 22932994 22933290 22933224 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 68194 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 24745312 24745555 24745448 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 265042 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 24746901 24747210 24747047 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 263387 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 24754185 24754590 24754306 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 256007 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 24772710 24773084 24772822 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 237513 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 24925603 24925785 24925693 Y ARHGAP21 NA NA NA NA NA ARHGAP21 84812 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 24996902 24997348 24997071 Y NA ARHGAP21 NA NA NA NA ARHGAP21 13249 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 26289899 26290095 26289999 Y GAD2 NA NA NA NA NA MYO3A 68703 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 26775274 26775560 26775412 Y APBB1IP,PDSS1,ABI1 NA NA NA NA NA PDSS1 209028 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 29948331 29948643 29948337 Y NA NA NA NA NA NA PTCHD3P1 252000 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 31892273 31892723 31892643 Y NA NA ZEB1 IMR90 Hi-C 24141950 ZEB1-AS1 284897 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 32048872 32049424 32049213 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 166318 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 32611846 32612286 32612204 Y EPC1 NA NA NA NA NA EPC1 53440 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 33269452 33269916 33269602 Y C10orf68 ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 22804 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr10 33562254 33562552 33562425 Y ITGB1,ITGB1,NRP1 NA NA NA NA NA NRP1 60638 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 35739762 35740277 35740119 Y CREM,CREM,CREM,CREM,CREM,CCNY NA NA NA NA NA CCNY 205809 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 42391693 42392005 42391916 Y NA NA NA NA NA NA CCNYL2 573683 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 43600895 43601120 43601049 Y RASGEF1A CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 30814 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 43633157 43633403 43633253 Y RASGEF1A CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 1223 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 43950893 43951349 43951098 Y NA HNRNPF,RP11-517P14.2 NA NA NA NA RP11-517P14.2 36707 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr10 44185196 44185271 44185205 Y NA ZNF32 NA NA NA NA ZNF32 42892 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 45439361 45439737 45439549 Y NA RASSF4,C10orf10 NA NA NA NA RASSF4 13118 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 45470476 45470795 45470517 Y NA RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25 NA NA NA NA C10orf10 1463 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr10 45914844 45915133 45915015 Y NA NA NA NA NA NA MARCH8 173221 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 47057375 47057652 47057526 Y NA NA GPRIN2,ZNF488,LOC643650,SYT15,ANTXRL IMR90 Hi-C 24141950 SYT15 87975 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr10 47080536 47081217 47080878 Y GPRIN2 NA NA NA NA NA SYT15 111136 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 47092943 47093271 47093193 Y NA NA NA NA NA NA SYT15 123543 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 47093518 47093811 47093665 Y NA NA NA NA NA NA SYT15 124118 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr10 47129494 47129670 47129546 Y SYT15,PPYR1 NA NA NA NA NA SYT15 160094 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr10 47655672 47656071 47655889 Y NA NA AGAP7 MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM25HP 82259 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 48323344 48323752 48323648 Y NA RP11-463P17.1,ZNF488 SYT15,GPRIN2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-463P17.1 6445 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 48578049 48578301 48578195 Y NA NA SYT15,GPRIN2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF488 225025 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 49678205 49678472 49678354 Y NA NA NA NA NA NA MAPK8 165507 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 49820546 49821434 49821281 Y NA ARHGAP22 NA NA NA NA ARHGAP22 40876 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 50006443 50006792 50006603 Y NA NA NA NA NA NA WDFY4 115522 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 50742859 50743547 50743006 Y NA PGBD3,ERCC6 NA NA NA NA PGBD3 1539 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 50776206 50776746 50776485 Y PGBD3,ERCC6,CHAT,SLC18A3 PGBD3,ERCC6,SLC18A3 NA NA NA NA ERCC6 30622 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr10 50787572 50787883 50787845 Y NA PGBD3,ERCC6,SLC18A3 NA NA NA NA SLC18A3 28464 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 4.37781983755208 chr10 50866815 50867027 50866949 Y SLC18A3,CHAT,CHAT NA NA NA NA NA SLC18A3 50468 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 52385542 52385659 52385602 Y NA SGMS1 NA NA NA NA SGMS1 2619 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 54078280 54078480 54078433 Y NA DKK1 NA NA NA NA DKK1 6224 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr10 54078781 54079176 54078966 Y NA DKK1 NA NA NA NA DKK1 6725 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 54203068 54203427 54203228 Y NA RP11-346D6.6 LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-346D6.6 24866 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 54203502 54203868 54203680 Y DKK1 RP11-346D6.6 LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-346D6.6 24425 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 54208151 54208375 54208306 Y NA RP11-346D6.6 LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-346D6.6 19918 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 54211545 54211936 54211751 Y NA RP11-346D6.6 LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-346D6.6 16357 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 54246557 54246950 54246727 Y DKK1 RP11-346D6.6 DKK1,LOC100506939,PRKG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-346D6.6 18264 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr10 54293866 54294084 54293893 Y DKK1 NA LOC100506939,DKK1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-346D6.6 65573 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr10 54412187 54412602 54412476 Y NA NA NA NA NA NA RP11-346D6.6 183894 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 61664562 61664999 61664893 Y CCDC6 CCDC6 NA NA NA NA CCDC6 148 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 63156989 63157303 63157037 Y NA NA NA NA NA NA TMEM26 53905 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 63596779 63597177 63597154 Y NA NA RHOBTB1,C10orf107,ARID5B IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID5B 61882 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 63657527 63657737 63657668 Y ARID5B ARID5B C10orf107,ARID5B IMR90 Hi-C 24141950 ARID5B 1322 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 63778860 63779091 63779011 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 119801 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 63814731 63815034 63814907 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 155672 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 63913852 63914076 63913964 Y NA NA RTKN2,ARID5B,ZNF365 IMR90 Hi-C 24141950 RTKN2 112390 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 64320064 64320236 64320175 Y NA NA NA NA NA NA ZNF365 188113 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 64324371 64324598 64324504 Y NA NA NA NA NA NA ZNF365 192420 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 64342532 64342939 64342724 Y EGR2,EGR2 NA NA NA NA NA ZNF365 210581 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 64344076 64344405 64344274 Y NA NA NA NA NA NA ZNF365 212125 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 64373293 64373504 64373411 Y EGR2,EGR2 NA NA NA NA NA ADO 189012 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 65269177 65269730 65269542 Y NA JMJD1C,REEP3 REEP3,JMJD1C,LOC84989 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 REEP3 9393 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 65274637 65275000 65274913 Y NA REEP3 JMJD1C,REEP3 IMR90 Hi-C 24141950 REEP3 4123 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 65389747 65390882 65390384 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 110624 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 65930110 65930546 65930307 Y NA NA NA NA NA NA RP11-170M17.2 269105 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr10 68721315 68721864 68721513 Y LRRTM3 LRRTM3 NA NA NA NA LRRTM3 37551 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 68802540 68803252 68802892 Y LRRTM3 NA NA NA NA NA LRRTM3 118776 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 69523880 69524330 69524240 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC12 71594 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 69609160 69609390 69609211 Y NA DNAJC12,SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 DNAJC12 13236 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr10 69621525 69621936 69621738 Y NA DNAJC12,SIRT1 SIRT1,MYPN,HERC4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIRT1 20491 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 69778500 69778679 69778642 Y NA NA NA NA NA NA HERC4 54426 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 69854882 69855277 69855187 Y HERC4 HERC4,MYPN ATOH7,HNRNPH3,PBLD,MYPN,HERC4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYPN 8635 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr10 69913307 69913725 69913572 Y SIRT1,PBLD,HNRNPH3 MYPN NA NA NA NA MYPN 49395 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 69947860 69948185 69948022 Y RUFY2,RUFY2,MYPN NA NA NA NA NA MYPN 83948 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 71626507 71626840 71626632 Y COL13A1 NA NA NA NA NA COL13A1 66863 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 72239929 72240682 72240087 Y KIAA1274 NA NA NA NA NA EIF4EBP2 77794 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 73526437 73526878 73526654 Y CDH23,C10orf54,C10orf105 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 4377 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 73526896 73527242 73527133 Y CDH23,C10orf54,C10orf105 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 4013 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 73528339 73528873 73528813 Y CDH23,SPOCK2,C10orf54,C10orf105 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 2382 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 73531831 73532355 73532130 Y C10orf105,CDH23,PSAP,C10orf54 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 576 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 73734357 73734754 73734458 Y NA CHST3 NA NA NA NA CHST3 12234 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 74055686 74056073 74056016 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 24008 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 74056833 74058104 74057179 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 25155 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr10 74079380 74080359 74079580 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 32629 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 74080430 74080993 74080646 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 31995 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 74081865 74082262 74082021 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DNAJB12 NA NA NA NA DNAJB12 30726 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 74436264 74436425 74436399 Y CCDC109A,ASCC1,ASCC1 HMGN2P34,MCU MICU1,OIT3,PLA2G12B,MCU IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MCU 13464 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 74925047 74925060 74925055 Y ANXA7,ECD FAM149B1,ECD NA NA NA NA FAM149B1 864 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 75240023 75240096 75240089 Y NA RP11-137L10.6,PPP3CB NA NA NA NA RP11-137L10.6 13187 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 75648556 75649146 75648996 Y ANXA7,NDST2 CAMK2G,PLAU SEC24C,FUT11,LOC100507331,CAMK2G,NDST2,KIAA0913,VCL,PLAU,C10orf55,AP3M1,ADK IMR90 Hi-C 24141950 CAMK2G 16213 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 75725888 75726135 75726026 Y NA VCL CAMK2G,AP3M1,VCL,NDST2,C10orf55,PLAU,ADK IMR90 Hi-C 24141950 VCL 29737 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 76916394 76916800 76916595 Y MYST4,SAMD8 NA NA NA NA NA VDAC2 51112 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 78271231 78271613 78271422 Y NA NA NA NA NA NA C10orf11 912233 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 78939227 78939377 78939300 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA KCNMA1 456976 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 78954967 78955278 78955208 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 441075 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 79176142 79176460 79176291 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 219893 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr10 79261142 79261358 79261250 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 134995 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 79265772 79266169 79265902 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA KCNMA1 130184 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 79268227 79268357 79268284 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 127996 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 79284063 79284455 79284320 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 111898 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 79633336 79633510 79633397 Y NA NA NA NA NA NA DLG5 50868 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 79636555 79636603 79636579 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 47775 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 79685177 79685609 79685373 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 799 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr10 80015725 80016226 80016048 Y RPS24 NA NA NA NA NA RPS24 224207 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 80062995 80063366 80063293 Y NA NA ZMIZ1,RPS24,LOC283050,LOC100132987,POLR3A IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 271477 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 80516479 80516892 80516667 Y ZMIZ1 NA LOC283050,RPS24,ZMIZ1,POLR3A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZMIZ1 309900 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 80732492 80734123 80733460 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 92669 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 80734291 80734943 80734463 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 91849 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 80830818 80831199 80831077 Y ZMIZ1 ZMIZ1 NA NA NA NA ZMIZ1 4026 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 80911539 80911799 80911619 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 84747 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 80912242 80912363 80912303 Y NA NA NA NA NA NA ZMIZ1 85450 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr10 80917330 80917751 80917473 Y NA NA NA NA NA NA ZMIZ1 90538 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 81159335 81159579 81159503 Y ZCCHC24 ZCCHC24 NA NA NA NA ZCCHC24 43804 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 81959510 81960003 81959818 Y TSPAN14,SH2D4B,ANXA11 ANXA11,EIF5AP4 NA NA NA NA ANXA11 3325 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 82224459 82224735 82224582 Y NA TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 12537 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 82258642 82258780 82258737 Y TSPAN14 TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 46720 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 86089822 86090305 86090054 Y FAM190B NA NA NA NA NA GHITM 192626 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 86093705 86094297 86093848 Y NA NA NA NA NA NA GHITM 196509 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 88160011 88160294 88160175 Y NA NA WAPAL MCF7 ChIA-PET 22265404 WAPAL 119278 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 88470805 88471213 88471023 Y NA LDB3,BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 43194 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr10 88471302 88471860 88471725 Y LDB3,LDB3,LDB3 LDB3,BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 42547 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 89602886 89603081 89603056 Y NA CFL1P1,ATAD1,PTEN NA NA NA NA ATAD1 3786 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 90495559 90495751 90495657 Y NA NA NA NA NA NA STAMBPL1 141740 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 90600778 90601250 90600926 Y LIPN,IFIT3,IFIT3,IFIT2,ANKRD22 STAMBPL1 NA NA NA NA STAMBPL1 36241 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 90711253 90711764 90711560 Y LIPF,CH25H,ACTA2 FAS,ACTA2 NA NA NA NA FAS 36650 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 92676361 92676755 92676735 Y NA RPP30,ANKRD1 NA NA NA NA ANKRD1 2278 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 92690903 92691268 92691118 Y NA ANKRD1 ANKRD1,PCGF5 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD1 11870 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 92921990 92922253 92922075 Y HECTD2 NA ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PCGF5 55655 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 92974122 92974225 92974155 Y NA PCGF5 NA NA NA NA PCGF5 3683 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 93373465 93373915 93373562 Y PPP1R3C PPP1R3C NA NA NA NA PPP1R3C 16896 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr10 93432082 93432315 93432239 Y NA PPP1R3C LOC100188947,HECTD2,TNKS2,RPP30,PPP1R3C IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R3C 41271 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 93647022 93647304 93647153 Y FGFBP3 BTAF1 NA NA NA NA BTAF1 34222 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 94351391 94351691 94351485 Y CPEB3 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 348 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr10 95136235 95136595 95136450 Y MYOF NA NA NA NA NA RP11-624L12.1 93920 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 95195782 95196689 95196040 Y MYOF MYOF NA NA NA NA MYOF 43385 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 95196959 95197603 95197264 Y NA MYOF NA NA NA NA MYOF 42471 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 95198614 95198817 95198708 Y NA MYOF NA NA NA NA MYOF 41257 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr10 95218561 95218998 95218660 Y MYOF MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 21076 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr10 95225325 95225770 95225711 Y MYOF MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 14304 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr10 95228207 95228553 95228471 Y MYOF,CEP55,CEP55 MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 11521 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.40780091065365 chr10 96943397 96943661 96943560 Y SORBS1,SORBS1 NA C10orf129,SORBS1 IMR90 Hi-C 24141950 PDLIM1 105120 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 97020432 97020603 97020519 Y NA PDLIM1 NA NA NA NA PDLIM1 28178 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 97054774 97055369 97055126 Y ENTPD1,PDLIM1 PDLIM1 PDLIM1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PDLIM1 5993 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 97809290 97809583 97809571 Y NA CCNJ,ENTPD1-AS1 NA NA NA NA CCNJ 8139 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 98468328 98468564 98468493 Y LCOR,C10orf12,TM9SF3,PIK3AP1 RPL13AP5 NA NA NA NA RPL13AP5 39481 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 99174702 99174858 99174830 Y ZFYVE27,PI4K2A,RRP12 RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16 RRP12 K562 ChIA-PET 22265404 PGAM1 9059 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 99302007 99302242 99302124 Y RRP12,PI4K2A MMS19,UBTD1,HOGA1,PI4K2A HOGA1,ANKRD2 IMR90 Hi-C 24141950 HOGA1 39838 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 99302907 99303185 99303057 Y RRP12,PI4K2A MMS19,UBTD1,HOGA1,PI4K2A HOGA1,ANKRD2 IMR90 Hi-C 24141950 HOGA1 38895 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr10 100120877 100121283 100120897 Y PYROXD2,LOXL4 NA PYROXD2,C10orf28,LOXL4,HPS1 IMR90 Hi-C 24141950 PYROXD2 51658 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr10 101539519 101539906 101539726 Y NA COX15 NA NA NA NA COX15 49662 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 101765990 101766360 101766233 Y NA DNMBP NA NA NA NA DNMBP 1316 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr10 101767938 101768201 101768028 Y NA DNMBP NA NA NA NA DNMBP 262 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 102130336 102130669 102130535 Y NA SCD,LINC00263 NA NA NA NA LINC00263 703 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 103124623 103124787 103124739 Y FBXW4 BTRC DPCD,POLL IMR90 Hi-C 24141950 BTRC 12803 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 103699141 103699397 103699242 Y NA NA NA NA NA NA C10orf76 114553 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 103876632 103876931 103876782 Y NA LDB1,PPRC1,NOLC1 NA NA NA NA LDB1 1279 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 104387544 104387817 104387672 Y GBF1,CUEDC2,ACTR1A TRIM8 NA NA NA NA TRIM8 14436 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.97001892689844 chr10 104406463 104406725 104406695 Y NFKB2,NFKB2,TRIM8 TRIM8 NA NA NA NA TRIM8 4210 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 104953975 104954222 104954115 Y C10orf26,C10orf32,NT5C2 NT5C2 NA NA NA NA NT5C2 2919 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 104990991 104991184 104991120 Y NA NT5C2,INA SFXN2,C10orf32-AS3MT,CYP17A1,NT5C2,CNNM2,LOC729020 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5C2 39935 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 105409078 105409369 105409249 Y NA NA NA NA NA NA CALHM2 198418 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 105456300 105456542 105456434 Y NA NA NA NA NA NA SH3PXD2A 156759 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr10 105725440 105725838 105725745 Y NA OBFC1,SLK NA NA NA NA SLK 481 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 106440718 106441002 106440778 Y NA NA NA NA NA NA ITPRIP 344556 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 110360095 110360471 110360395 Y NA RP11-163F15.1 NA NA NA NA RP11-163F15.1 40522 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr10 111766410 111766784 111766651 Y ADD3 ADD3 NA NA NA NA ADD3 12284 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 112158460 112158738 112158533 Y DUSP5 NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 95751 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 114531236 114531374 114531260 Y NA NA NA NA NA NA TCF7L2 176635 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 114847181 114847492 114847280 Y TCF7L2 NA NA NA NA NA TCF7L2 139172 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 114929772 114930211 114930015 Y TCF7L2 NA NA NA NA NA TCF7L2 221763 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 114981509 114981664 114981587 Y TCF7L2 NA VTI1A IMR90 Hi-C 24141950 TCF7L2 273500 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 116163429 116163722 116163475 Y AFAP1L2 AFAP1L2 NA NA NA NA AFAP1L2 914 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 117502747 117502760 117502754 Y NA NA NA NA NA NA GFRA1 528219 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 118714609 118714623 118714617 Y NA NA NA NA NA NA RP11-539I5.1 106893 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 119046334 119046783 119046648 Y NA NA NA NA NA NA PDZD8 86195 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 120072477 120072945 120072874 Y NA FAM204A NA NA NA NA FAM204A 26895 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 120692616 120692979 120692798 Y NA NA NA NA NA NA NANOS1 94249 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 123219385 123219723 123219573 Y NA NA NA NA NA NA RP11-159H3.1 328148 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 123340054 123340398 123340080 Y FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2 NA NA NA NA NA ATE1-AS1 345429 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 123626359 123626403 123626376 Y NA NA NA NA NA NA ATE1-AS1 59424 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr10 124254349 124254758 124254614 Y NA HTRA1 NA NA NA NA HTRA1 35308 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 4.15892884567448 chr10 124613518 124613778 124613722 Y NA FAM24B,RP11-564D11.3 NA NA NA NA FAM24B 23379 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 125188443 125188580 125188505 Y C10orf88 NA NA NA NA NA BUB3 276650 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 125994221 125994735 125994322 Y CHST15,FAM175B NA NA NA NA NA OAT 110810 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 126377488 126377718 126377625 Y FAM53B NA NA NA NA NA FAM53B 53120 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 127824574 127824998 127824837 Y NA NA NA NA NA NA FANK1 241466 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 127932254 127933051 127932680 Y ADAM12 NA FANK1 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM12 141973 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 127936160 127936570 127936368 Y NA NA NA NA NA NA ADAM12 138454 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 131436691 131436981 131436883 Y MGMT NA NA NA NA NA MGMT 173243 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 131819686 131819939 131819817 Y NA NA NA NA NA NA EBF3 59581 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 133879247 133879524 133879406 Y NA NA BNIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BNIP3 85812 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr10 134122010 134122092 134122081 Y NA STK32C,LRRC27 DPYSL4 IMR90 Hi-C 24141950 STK32C 21259 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 134260341 134260546 134260485 Y C10orf91 NA NA NA NA NA PWWP2B 51669 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 134266616 134267060 134266753 Y LRRC27,LRRC27,PWWP2B,INPP5A,C10orf92 NA NA NA NA NA PWWP2B 57944 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 134330832 134331178 134331005 Y NA INPP5A INPP5A,ADAM8,C10orf91 IMR90 Hi-C 24141950 INPP5A 18146 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 135072735 135073128 135072895 Y TUBGCP2,ADAM8 ADAM8,ZNF511 NA NA NA NA ADAM8 15244 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 135074691 135075148 135074934 Y TUBGCP2,ADAM8 ADAM8,ZNF511,TUBGCP2 NA NA NA NA ADAM8 13224 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr10 135092117 135092276 135092147 Y ADAM8,TUBGCP2 ADAM8,ZNF511,TUBGCP2 NA NA NA NA ADAM8 3745 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 355877 356724 356385 Y NA IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3 IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 B4GALNT4 11072 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 1147842 1148157 1148045 Y NA NA MUC5B MCF7 ChIA-PET 22265404 TOLLIP 180727 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 1331682 1331784 1331733 Y NA TOLLIP NA NA NA NA TOLLIP 2798 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 1568333 1568421 1568379 Y BRSK2,KRTAP5-3,DUSP8 DUSP8 NA NA NA NA DUSP8 22729 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 1879618 1879880 1879749 Y NA TNNI2 NA NA NA NA TNNI2 21399 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 2465201 2465287 2465244 Y INS TSSC4 NA NA NA NA TSSC4 45483 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 2643944 2644417 2644202 Y NA NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 74807 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 2655024 2655339 2655183 Y TRPM5,KCNQ1 NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 63885 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 2669931 2670236 2670070 Y INS,ASCL2,TRPM5 KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 48988 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr11 2847272 2847432 2847347 Y NA NA NA NA NA NA CDKN1C 57679 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 2847671 2847794 2847733 Y CDKN1C NA NA NA NA NA CDKN1C 57317 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 3742975 3743362 3743342 Y NA NA NA NA NA NA PGAP2 73592 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 8723535 8723638 8723587 Y STK33 RPL27A NA NA NA NA RPL27A 21577 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 9385760 9386326 9386092 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 17843 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr11 9587499 9588027 9587720 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1 ZNF143,LOC644656 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 WEE1 5201 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 9590279 9590748 9590469 Y WEE1,WEE1 WEE1 LOC644656,ZNF143 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 WEE1 2480 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 9635436 9636077 9635827 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1,SWAP70 WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WEE1 42208 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr11 9781782 9782109 9781859 Y NA SBF2-AS1 NA NA NA NA SBF2-AS1 3943 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 9786985 9787566 9787311 Y NA SBF2-AS1 NA NA NA NA SBF2-AS1 9146 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr11 10614045 10614168 10614107 Y AMPD3,AMPD3,AMPD3 NA NA NA NA NA RNF141 53268 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 10921943 10922208 10922068 Y AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,EIF4G2,ZBED5 ZBED5 NA NA NA NA ZBED5 43600 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 11998818 11999068 11999003 Y MICALCL DKK3 NA NA NA NA DKK3 30248 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr11 12097914 12098716 12098251 Y PARVA,MICALCL,MICAL2 MICAL2 MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 MICAL2 14827 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 12101706 12102070 12101803 Y DKK3,DKK3,PARVA,MICALCL,MICAL2 MICAL2 MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 MICAL2 11473 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 12109558 12109847 12109697 Y PARVA,MICALCL,MICAL2 MICAL2 MICAL2,TEAD1,MICALCL,DKK3,USP47 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MICAL2 3696 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr11 12132692 12132808 12132735 Y MICAL2 MICAL2 NA NA NA NA MICAL2 19149 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 12148184 12148552 12148402 Y NA MICAL2 NA NA NA NA MICAL2 34641 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 12180569 12180722 12180645 Y MICAL2 NA MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 MICAL2 67026 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 12181262 12181458 12181363 Y MICALCL,MICAL2 NA MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 MICAL2 67719 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 12188567 12188982 12188726 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 75024 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 12197316 12197738 12197633 Y MICAL2,MICALCL NA NA NA NA NA MICAL2 83773 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 12199343 12199732 12199431 Y NA NA MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 MICAL2 85800 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 12204138 12204505 12204342 Y MICAL2,MICALCL NA NA NA NA NA MICAL2 90595 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr11 12204570 12205016 12204699 Y MICAL2 NA NA NA NA NA MICAL2 91027 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 12218036 12218499 12218053 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 104493 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 12309352 12309734 12309588 Y TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL NA NA NA NA NA PARVA 86998 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr11 13238046 13238305 13238120 Y NA NA ARNTL,BTBD10,LOC100506305 IMR90 Hi-C 24141950 ARNTL 57894 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 13244798 13244951 13244872 Y NA NA ARNTL,BTBD10 IMR90 Hi-C 24141950 ARNTL 51248 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 13359856 13360227 13360061 Y ARNTL NA NA NA NA NA ARNTL 63657 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 14356156 14356413 14356247 Y NA RRAS2 NA NA NA NA RRAS2 27639 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 14436782 14437066 14436859 Y NA NA RRAS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RRAS2 52730 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 14443887 14444060 14443964 Y RRAS2 NA RRAS2,COPB1,SPON1 IMR90 Hi-C 24141950 RRAS2 59835 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 16625688 16626709 16626131 Y SOX6,SOX6 C11orf58 SOX6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C11orf58 5970 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 17230717 17231092 17230803 Y NA PIK3C2A,NUCB2 NA NA NA NA NUCB2 3017 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 18404883 18405218 18405078 Y LDHA LDHA NA NA NA NA LDHA 8717 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 18405328 18405801 18405464 Y HPS5,TSG101,SPTY2D1 LDHA NA NA NA NA LDHA 8134 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 19649981 19650160 19650072 Y NAV2 NA NA NA NA NA NAV2 279710 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 19736892 19737150 19737126 Y NAV2 NA NA NA NA NA NAV2 366621 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 20134058 20134420 20134284 Y NA NA NA NA NA NA HTATIP2 248811 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 27235010 27235184 27235094 Y NA NA LIN7C,LGR4,CCDC34,BDNF-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC34 148231 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 27255766 27256168 27256011 Y NA NA NA NA NA NA CCDC34 127247 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 27693843 27694020 27693988 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF BDNF NA NA NA NA BDNF 47585 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr11 27715832 27716154 27716086 Y NA BDNF NA NA NA NA BDNF 25451 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 27725050 27725226 27725138 Y NA BDNF NA NA NA NA BDNF 16379 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 27739901 27740316 27740092 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF BDNF NA NA NA NA BDNF 1289 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr11 27955713 27956134 27955920 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF RP11-1033A18.1 BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1033A18.1 45133 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 27956455 27956618 27956527 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF RP11-1033A18.1 BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1033A18.1 45875 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 28128920 28129110 28128941 Y METTL15 METTL15,KIF18A NA NA NA NA KIF18A 1065 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 28764751 28764902 28764829 Y NA RP11-115J23.1 BDNF-AS1,BDNF,KIF18A,METTL15 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 42589 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 28776161 28776492 28776325 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF,KIF18A,METTL15 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 53999 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 28778513 28778891 28778701 Y NA NA BDNF,BDNF-AS1,KIF18A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 56351 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 28779294 28779601 28779473 Y NA NA BDNF,BDNF-AS1,KIF18A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 57132 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr11 28792909 28793103 28792913 Y NA NA BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 70747 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 28855204 28855664 28855372 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 133042 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr11 28856336 28856685 28856610 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 134174 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 28857853 28858464 28857991 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 135691 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr11 28864582 28864807 28864697 Y NA NA BDNF,BDNF-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 142420 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr11 29141601 29141895 29141706 Y NA NA BDNF,BDNF-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 419439 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr11 29207165 29207501 29207312 Y NA NA BDNF,BDNF-AS1,KIF18A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 485003 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 29302148 29302272 29302237 Y NA NA BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 579986 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr11 29321986 29322293 29322123 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 599824 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 31630096 31630156 31630127 Y PAX6 NA NA NA NA NA ELP4 100799 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 32109882 32110285 32110029 Y NA NA NA NA NA NA PAX6 272373 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 32915475 32916456 32915913 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 2751 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 33668919 33669067 33668993 Y NA NA NA NA NA NA CD59 86924 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 33711808 33712191 33712002 Y CD59 CD59 NA NA NA NA CD59 43800 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 33713598 33714029 33713919 Y CD59 CD59 NA NA NA NA CD59 41962 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr11 35088540 35088910 35088827 Y NA NA CD44,PDHX,APIP IMR90 Hi-C 24141950 CD44 69507 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 35103874 35105511 35104330 Y CD44 NA CD44,PDHX,APIP,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 CD44 52906 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 35165614 35166208 35165794 Y CD44 CD44 NA NA NA NA CD44 7197 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 35188303 35189153 35188420 Y CD44 CD44 NA NA NA NA CD44 29886 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr11 35204984 35205337 35205050 Y CD44 CD44 NA NA NA NA CD44 46567 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 36530791 36531124 36530883 Y NA TRAF6 NA NA NA NA TRAF6 969 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 41412531 41412544 41412538 Y NA NA NA NA NA NA API5 1918969 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 43360196 43360553 43360375 Y TTC17 API5,TTC17 NA NA NA NA TTC17 17929 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 43569506 43569887 43569721 Y C11orf96 HSD17B12 NA NA NA NA HSD17B12 6099 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 44123492 44123510 44123502 Y NA ACCS,EXT2 NA NA NA NA EXT2 8393 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 44596231 44596678 44596336 Y CD82 CD82 NA NA NA NA CD82 12254 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 44987541 44987892 44987717 Y PRDM11 TP53I11 LOC221122,CD82,TP53I11,PRDM11,SYT13 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TP53I11 16701 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 45201958 45202605 45202216 Y NA NA NA NA NA NA SYT13 103265 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 46143609 46143973 46143928 Y NA PHF21A NA NA NA NA PHF21A 2624 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 46258702 46259233 46258865 Y DGKZ CTD-2589M5.4,CREB3L1 PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2589M5.4 34865 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr11 46264726 46265198 46265009 Y NA CTD-2589M5.4,CREB3L1 DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2589M5.4 28900 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr11 46270167 46270467 46270346 Y CREB3L1 CTD-2589M5.4,CREB3L1 CREB3L1,PHF21A,DGKZ IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2589M5.4 23631 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 46312210 46312394 46312323 Y NA CTD-2589M5.4,CREB3L1,DGKZ NA NA NA NA CREB3L1 14998 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 46423430 46423619 46423525 Y NA MDK NA NA NA NA MDK 23124 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 47215723 47215949 47215852 Y NA ARFGAP2,PACSIN3,DDB2 PACSIN3 MCF7 ChIA-PET 22265404 PACSIN3 9729 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 47370641 47370657 47370649 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A13 56026 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 47573563 47574025 47573747 Y NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1 NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4 NA NA NA NA NDUFS3 10863 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr11 47789923 47790126 47789984 Y NA FNBP4 NA NA NA NA FNBP4 2928 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 47867685 47867881 47867783 Y OR4X1 NUP160 NA NA NA NA NUP160 226 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 47939528 47939960 47939626 Y OR4B1,OR4S1,NUP160 RP11-793I11.1 PTPRJ,NUP160 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-793I11.1 14369 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr11 48077375 48077584 48077563 Y FNBP4,PTPRJ NA NA NA NA NA PTPRJ 77262 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 57200214 57200547 57200409 Y SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3 SLC43A3,RTN4RL2 SSRP1,TNKS1BP1,P2RX3,PRG3,PRG2,SLC43A3,TIMM10,SLC43A1,UBE2L6,SMTNL1,ZDHHC5 IMR90 Hi-C 24141950 SLC43A3 7161 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 57546018 57546724 57546105 Y MED19,C11orf31 C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 27303 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 58340867 58341571 58341167 Y OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF NA NA NA NA LPXN 2122 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 60789194 60789499 60789348 Y SDHAF2,CD5,CD6 NA NA NA NA NA SLC15A3 71192 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 61266317 61266637 61266368 Y LRRC10B NA NA NA NA NA SDHAF2 70803 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 61394263 61394463 61394368 Y NA RPLP0P2 NA NA NA NA RPLP0P2 13755 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 61467819 61468013 61467906 Y CYBASC3,SDHAF2,FTH1,DAGLA DAGLA NA NA NA NA DAGLA 21914 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 61565191 61565522 61565357 Y NA FEN1,TMEM258,FADS2,FADS1 NA NA NA NA FADS2 6739 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 61738760 61739751 61739487 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 5628 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 62211626 62212261 62212170 Y FTH1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK NA NA NA NA NA RP11-864I4.4 99210 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr11 62248272 62248499 62248283 Y NA NA NA NA NA NA RP11-864I4.4 62972 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 62312037 62312397 62312245 Y WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1 NA NA NA NA RP11-864I4.4 566 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr11 62320979 62321244 62321106 Y NA RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 NA NA NA NA AHNAK 463 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr11 62413039 62413428 62413234 Y NA MTA2,ROM1,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,SNORA57,C11orf83,C11orf48,UBXN1,LRRN4CL NA NA NA NA GANAB 935 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 62586827 62586893 62586843 Y NA TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA STX5 10667 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 62625165 62625549 62625272 Y TUT1,METTL12,HNRNPUL2,SLC3A2 STX5,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA SLC3A2 3647 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 63288306 63288408 63288365 Y NA RARRES3 NA NA NA NA RARRES3 13873 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 63337722 63338129 63338119 Y NA RARRES3,PLA2G16 NA NA NA NA RARRES3 35441 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 63705603 63705837 63705685 Y NA RCOR2,NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1 NA NA NA NA NAA40 1172 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 63949132 63949273 63949224 Y NA MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4 NA NA NA NA STIP1 1471 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 64125464 64125650 64125510 Y MARK2,NUDT22,FKBP2,PPP1R14B,PLCB3,BAD,ESRRA,TRMT112,PRDX5,CDC42BPG,RPS6KA4 TRMT112,PRDX5,RPS6KA4 NA NA NA NA RPS6KA4 844 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 65058176 65058598 65058417 Y EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2 NA NA NA NA CDC42EP2 21691 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 65059737 65059988 65059827 Y EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2 NA NA NA NA CDC42EP2 20301 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 65185589 65187086 65186338 Y NA SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 1159 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 65187297 65188198 65187553 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 47 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr11 65239550 65239870 65239751 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1 TIGD3,SCYL1 K562 ChIA-PET 22265404 AP000769.1 18822 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 4.81560182130729 chr11 65246279 65246484 65246387 Y SCYL1,LTBP3,EFEMP2 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 16749 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 65254949 65255610 65255242 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 7623 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 65256318 65257363 65256982 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612,POLA2,DPF2,SLC25A45,TIGD3,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 5870 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 65259930 65260851 65260542 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 2382 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 65261229 65261625 65261527 Y CDC42EP2 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 1608 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr11 65263684 65264604 65263856 Y SNX32 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 451 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr11 65323331 65323567 65323509 Y FOSL1 SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1 NA NA NA NA LTBP3 834 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 65333490 65333816 65333671 Y SLC25A45,SIPA1,SIPA1,EIF1AD,CTSW,PCNXL3 SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3 NA NA NA NA SSSCA1 2085 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 65419981 65420225 65420142 Y CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 8340 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 65537213 65537543 65537499 Y NA NA NA NA NA NA RNASEH2C 50795 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 65656792 65657262 65656985 Y NA MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA CCDC85B 917 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 65666492 65667203 65666864 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 448 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr11 65679250 65679576 65679373 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1 EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 5012 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 65683105 65683625 65683322 Y NA EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 963 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr11 65782974 65783337 65783107 Y FOSL1 BANF1,EIF1AD,CATSPER1,SF3B2 NA NA NA NA CATSPER1 8651 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 65894211 65894464 65894385 Y NA NA RAB1B,KLC2 IMR90 Hi-C 24141950 PACS1 58377 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 66094685 66094783 66094735 Y CFL1,FIBP,DRAP1,YIF1A,CD248 YIF1A,CD248,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2 NA NA NA NA RIN1 7528 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 66494780 66495327 66494982 Y SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2 C11orf80 C11orf80 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 C11orf80 14595 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr11 66801218 66801427 66801323 Y SYT12,SYT12 RHOD NA NA NA NA RHOD 20862 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 67028976 67029390 67029158 Y NA ADRBK1,ANKRD13D,SSH3 NA NA NA NA ADRBK1 2491 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 67121988 67122388 67122127 Y POLD4,CLCF1 POLD4,AP003419.11,RAD9A NA NA NA NA POLD4 55 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 67138852 67139479 67139267 Y NA POLD4,RAD9A,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 67139742 67140272 67140082 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 687 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr11 67146992 67147327 67147282 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA,RPS6KB2 NA NA NA NA AP003419.11 7937 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 67955066 67955423 67955397 Y TCIRG1,SUV420H1 SUV420H1 NA NA NA NA SUV420H1 23872 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr11 68121765 68121884 68121804 Y ALDH3B1,C11orf24 LRP5 NA NA NA NA LRP5 43688 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 68776292 68776545 68776410 Y MRGPRF MRGPRF,TPCN2 MRGPRD IMR90 Hi-C 24141950 MRGPRF 2332 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 68778534 68778789 68778694 Y MRGPRF MRGPRF,TPCN2 NA NA NA NA MRGPRF 88 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 69069522 69069665 69069598 Y TPCN2 IFITM9P NA NA NA NA IFITM9P 248 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 69182957 69183170 69183095 Y ORAOV1,CCND1,MYEOV NA CCND1,MYEOV MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AP000439.2 74341 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 69235389 69235576 69235517 Y NA AP000439.2 MYEOV,ORAOV1,CCND1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP000439.2 21935 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr11 69258094 69258432 69258217 Y CCND1 AP000439.2 CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP000439.2 583 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr11 69451342 69451588 69451394 Y NA CCND1,ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 2267 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 70090856 70091139 70091025 Y NA FADD,PPFIA1 PPFIA1,FADD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPFIA1 23667 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 70245269 70246141 70245676 Y ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN CTTN,AP000487.5 NA NA NA NA AP000487.5 2675 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr11 71650610 71650763 71650692 Y NA RP11-849H4.2,RNF121 NUMA1,IL18BP IMR90 Hi-C 24141950 RNF121 12863 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 71892346 71892672 71892509 Y NA INPPL1 RNF121,NUMA1,LRTOMT,LAMTOR1,C11orf51,FOLR3,FOLR1 IMR90 Hi-C 24141950 INPPL1 40073 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 72968455 72968625 72968568 Y NA ARHGEF17 P2RY6 MCF7 ChIA-PET 22265404 ARHGEF17 48709 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 73014768 73014913 73014905 Y NA ARHGEF17 NA NA NA NA ARHGEF17 2421 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 73088357 73088912 73088439 Y NA RELT NA NA NA NA RELT 3048 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 73490242 73490316 73490279 Y NA RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 6045 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 73490470 73490918 73490608 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 5443 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 74465903 74466299 74466070 Y POLD3,RNF169 RP11-864N7.2,RNF169 XRRA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF169 7990 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 74565092 74565468 74565281 Y NA NA NA NA NA NA XRRA1 92777 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 75265416 75265853 75265464 Y SERPINH1 GDPD5,SERPINH1 RPS3,GDPD5,KLHL35 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINH1 5248 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 76463883 76464042 76463970 Y NA RP11-21L23.4,TSKU,RP11-21L23.3 ACER3,TSKU,B3GNT6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-21L23.4 13225 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 77156016 77156186 77156101 Y PAK1 PAK1 NA NA NA NA PAK1 27494 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 77696711 77696891 77696801 Y NA INTS4 C11orf67,RSF1 IMR90 Hi-C 24141950 INTS4 6833 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 79130045 79130391 79130200 Y NA NA NA NA NA NA NARS2 846126 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 79148505 79148822 79148543 Y NA NA NA NA NA NA NARS2 864586 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr11 79794635 79795000 79794859 Y NA NA NA NA NA NA NARS2 1510716 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr11 83396793 83397083 83396942 Y DLG2 NA NA NA NA NA CCDC90B 401343 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 85419491 85419865 85419792 Y SYTL2 CREBZF,CCDC89 NA NA NA NA CCDC89 24171 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 86195168 86195425 86195393 Y NA NA NA NA NA NA C11orf73 183915 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 86454484 86454767 86454607 Y NA PRSS23 PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 45334 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 86664236 86664677 86664307 Y NA NA NA NA NA NA FZD4,RP11-736K20.6 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 87043104 87043447 87043253 Y NA NA NA NA NA NA TMEM135 296218 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 87133739 87133898 87133788 Y NA NA GRM5,FZD4,LOC100506368 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM135 386853 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr11 91980380 91980674 91980445 Y FAT3 NA NA NA NA NA SLC36A4 948456 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 93863761 93864262 93864073 Y MED17,FUT4,PANX1 PANX1 NA NA NA NA PANX1 3667 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr11 95888064 95888524 95888506 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 185820 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 95982466 95982894 95982863 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 91450 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 96040167 96040456 96040282 Y MAML2 MAML2 NA NA NA NA MAML2 33888 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 96047326 96047750 96047695 Y MAML2 MAML2 NA NA NA NA MAML2 26594 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr11 101881929 101882102 101882031 Y NA C11orf70 NA NA NA NA C11orf70 34072 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 102042993 102043398 102043047 Y C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1 NA NA NA NA NA YAP1 63801 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 102176886 102177264 102177169 Y NA BIRC3,BIRC2 MMP7,BIRC2,BIRC3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BIRC3 8951 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 102216514 102216961 102216815 Y TMEM123,BIRC3,BIRC2 BIRC3,BIRC2 NA NA NA NA BIRC2 572 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 102283995 102284326 102284226 Y BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123 NA BIRC2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 54789 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 104576314 104576795 104576668 Y CARD17,CASP5,CARD16,CASP4,CASP4 NA GRIA4 IMR90 Hi-C 24141950 CASP4 261368 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 107818531 107818875 107818638 Y NA RP11-832N8.1,SLC35F2 NA NA NA NA SLC35F2 21512 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 107827878 107828153 107827943 Y RAB39 SLC35F2,CUL5 NA NA NA NA SLC35F2 30859 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 108741188 108741366 108741295 Y NA NA NA NA NA NA DDX10 207436 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 110367857 110368312 110368149 Y ZC3H12C,RDX,FDX1 NA FDX1,POU2AF1,LOC100132078,C11orf53,BTG4,ARHGAP20 IMR90 Hi-C 24141950 FDX1 69250 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 111402540 111402739 111402658 Y NA LAYN NA NA NA NA LAYN 6266 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 111692318 111692670 111692505 Y NA NA PPP2R1B IMR90 Hi-C 24141950 C11orf1 54989 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 112028082 112028533 112028265 Y IL18 IL18,BCO2 NA NA NA NA IL18 4307 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 112397478 112397666 112397572 Y IL18 NA NCAM1,LOC100288346 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-356J5.12 258006 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr11 112655698 112656077 112655902 Y NA NA NCAM1 IMR90 Hi-C 24141950 NCAM1 173920 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 113020811 113021147 113020979 Y NA NA NA NA NA NA RP11-839D17.3 162012 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 113708252 113709087 113708915 Y CLDN25 USP28 NA NA NA NA USP28 35205 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 113945404 113945849 113945581 Y ZBTB16,ZBTB16 NA NA NA NA NA NNMT 180660 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr11 114152118 114152374 114152253 Y ZBTB16,NNMT NNMT NNMT IMR90 Hi-C 24141950 NNMT 25609 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 114162155 114162496 114162247 Y NA NNMT NA NA NA NA NNMT 35646 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 114162916 114163328 114163238 Y NA NNMT NA NA NA NA NNMT 36407 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 115636671 115636982 115636754 Y NA NA CADM1 IMR90 Hi-C 24141950 CADM1 262996 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 115741521 115741886 115741709 Y NA NA CADM1 IMR90 Hi-C 24141950 CADM1 367846 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr11 117015877 117016035 117015996 Y SIK3,PAFAH1B2 SIK3,PAFAH1B2,SIDT2 NA NA NA NA PAFAH1B2 2894 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 117016262 117016599 117016456 Y NA SIK3,PAFAH1B2,SIDT2 NA NA NA NA PAFAH1B2 3279 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 118481750 118482023 118481896 Y PHLDB1 ARCN1,IFT46,PHLDB1 NA NA NA NA PHLDB1 6595 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 118489703 118490017 118489779 Y NA ARCN1,IFT46,PHLDB1 NA NA NA NA PHLDB1 14548 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 118490168 118490609 118490335 Y PHLDB1 ARCN1,IFT46,PHLDB1 NA NA NA NA PHLDB1 15013 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr11 118493849 118494041 118493911 Y NA PHLDB1 NA NA NA NA PHLDB1 18694 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 118663387 118663780 118663691 Y NA DDX6 NA NA NA NA DDX6 3529 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 118782911 118783378 118783221 Y SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 3494 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr11 118794621 118795305 118795013 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 304 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr11 118800245 118800827 118800413 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5928 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 118800879 118801266 118801161 Y MLL,DDX6,VPS11,CBL,CXCR5,CXCR5,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 6562 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 119454963 119455433 119455083 Y NA KRT8P7 TRIM29,USP2,LOC100499227 IMR90 Hi-C 24141950 KRT8P7 17585 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 119612950 119613345 119613188 Y NA PVRL1 PVRL1,TRIM29 IMR90 Hi-C 24141950 PVRL1 15156 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr11 121107211 121107513 121107369 Y SC5DL,SC5DL NA SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 213399 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr11 121337416 121337512 121337466 Y NA SORL1 NA NA NA NA SORL1 16504 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 121353016 121353670 121353326 Y SORL1 SORL1 NA NA NA NA SORL1 32104 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 121526794 121527145 121526879 Y NA NA NA NA NA NA SORL1 205882 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 122049218 122049681 122049522 Y NA MIRLET7A2,MIR100 NA NA NA NA MIR100 28202 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr11 122059856 122060218 122060121 Y NA MIRLET7A2,MIR100 NA NA NA NA MIR100 38840 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 122063445 122063834 122063519 Y NA MIRLET7A2,MIR100 NA NA NA NA MIR100 42429 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 122080743 122080920 122080836 Y NA NA SORL1,BLID,MIR125B1,MIR100HG IMR90 Hi-C 24141950 MIR100 59727 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 122086038 122086153 122086090 Y NA NA SORL1,BLID,MIR125B1,MIR100HG IMR90 Hi-C 24141950 MIR100 65022 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 123036966 123037072 123037020 Y NA CLMP NA NA NA NA CLMP 26917 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 123345048 123345386 123345163 Y NA AP000783.1,GRAMD1B CLMP,MIR4493 IMR90 Hi-C 24141950 AP000783.1 45990 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 123394284 123394590 123394437 Y NA NA NA NA NA NA GRAMD1B 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 123468998 123469339 123469251 Y NA NA NA NA NA NA SCN3B 54613 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 124668888 124669222 124669022 Y NA NA NA NA NA NA RP11-677M14.2 54655 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 125696963 125697011 125697006 Y NA NA NA NA NA NA HYLS1 54498 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 126084365 126084425 126084397 Y NA FAM118B,RPUSD4 NA NA NA NA RPUSD4 4778 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 128291574 128291714 128291646 Y NA NA ETS1,FLI1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 163739 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 128377315 128377487 128377422 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 77966 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 128419505 128419554 128419521 Y NA ETS1 NA NA NA NA ETS1 35899 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 128579282 128579748 128579400 Y FLI1,FLI1 FLI1 NA NA NA NA FLI1 24852 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 128605969 128606121 128606047 Y ETS1,FLI1,FLI1 NA NA NA NA NA FLI1 51539 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 129871629 129871941 129871631 Y NA PRDM10,TCEB2P2 NA NA NA NA PRDM10 899 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr11 130113792 130113937 130113867 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB44 68644 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 130450344 130450649 130450537 Y NA NA ADAMTS15 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS15 133475 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr11 131922402 131922802 131922508 Y NTM NA NA NA NA NA SNX19 1137998 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 131942118 131942474 131942248 Y NTM NA NA NA NA NA SNX19 1157714 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 131995649 131996509 131995944 Y NTM NA NA NA NA NA SNX19 1211245 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 132162191 132162572 132162312 Y NA NA NA NA NA NA SNX19 1377787 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 133017323 133017551 133017437 Y NA NA NA NA NA NA IGSF9B 807329 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 133903772 133904156 133904071 Y NA RP11-713P17.3 NA NA NA NA RP11-713P17.3 3605 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr11 134708086 134708460 134708277 Y NA NA LOC283177 IMR90 Hi-C 24141950 GLB1L2 508318 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 680187 680377 680237 Y NA NA NA NA NA NA RP11-218M22.1 57680 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 1583254 1583583 1583419 Y NA NA LOC100292680 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5B 53474 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 1642572 1643085 1642916 Y NA WNT5B ERC1,LOC100292680,FBXL14 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5B 5515 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 1643252 1643620 1643470 Y NA WNT5B ERC1,LOC100292680,FBXL14 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5B 6195 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 1698560 1698670 1698614 Y FBXL14 FBXL14 NA NA NA NA FBXL14 2661 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 1769649 1770205 1769686 Y NA ADIPOR2 NA NA NA NA ADIPOR2 25535 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 1770869 1771337 1771069 Y LRTM2,ADIPOR2 ADIPOR2 NA NA NA NA ADIPOR2 24403 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 2467815 2468125 2467879 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1096D14.6 355983 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 3563518 3563854 3563701 Y NA NA NA NA NA NA RP11-543P15.1 244422 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 4274113 4274463 4274167 Y CCND2 NA NA NA NA NA C12orf5 153908 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 4396260 4396408 4396285 Y NA C12orf5 NA NA NA NA C12orf5 31963 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 5566178 5566568 5566311 Y NTF3 NTF3 NA NA NA NA NTF3 26900 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 6193943 6194225 6194059 Y NA NA NA NA NA NA CD9 112656 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 6202352 6202551 6202452 Y CD9,ANO2 NA NA NA NA NA CD9 104330 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 6276499 6276627 6276569 Y VAMP1,TNFRSF1A CD9 VWF,CD9,PLEKHG6 IMR90 Hi-C 24141950 CD9 30254 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 6325035 6325634 6325452 Y NA CD9 NA NA NA NA CD9 18154 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 6404239 6404667 6404531 Y NA TNFRSF1A VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2 IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF1A 44613 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 6539566 6540029 6539921 Y NA RP1-102E24.9,TAPBPL,VAMP1 NA NA NA NA RP1-102E24.9 5635 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 6616640 6616858 6616680 Y NA VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH,IFFO1 NA NA NA NA SCARNA10 530 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 6717352 6717716 6717682 Y SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP NOP2,CHD4,ACRBP NA NA NA NA CHD4 2710 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 6962211 6962407 6962304 Y GAPDH,COPS7A,COPS7A,COPS7A,COPS7A,LEPREL2,USP5,USP5,TPI1,TPI1 LEPREL2,CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2 NA NA NA NA USP5 2919 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr12 7000184 7000641 7000294 Y PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6 CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57 NA NA NA NA SPSB2 3662 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 7034730 7034838 7034794 Y ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1 SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2 NA NA NA NA ATN1 3104 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 7104040 7104360 7104246 Y NA EMG1,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3 NA NA NA NA C1S 9689 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 7592182 7592797 7592685 Y PEX5,NANOG RP11-157G21.2,CD163L1 NA NA NA NA RP11-157G21.2 1596 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 8123169 8123746 8123395 Y CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3 SLC2A3 SLC2A3,FOXJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC2A3 36298 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 8179132 8179551 8179335 Y NA FOXJ2 PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 3748 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr12 9185999 9186130 9186065 Y CLEC4E,M6PR,KLRG1 NA NA NA NA NA M6PR 85448 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 9917181 9917686 9917498 Y KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D,OLR1,KLRF1,GABARAPL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CD69 NA NA NA NA NA CLEC2B 103049 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 10409972 10410105 10410016 Y NA GABARAPL1 NA NA NA NA GABARAPL1 46915 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 10514396 10514426 10514411 Y NA NA NA NA NA NA GABARAPL1 151339 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 10515405 10515669 10515567 Y NA NA NA NA NA NA GABARAPL1 152348 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr12 10517487 10517775 10517755 Y NA NA NA NA NA NA GABARAPL1 154430 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 10794413 10794704 10794528 Y NA MAGOHB,STYK1 NA NA NA NA MAGOHB 30191 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 10869298 10869573 10869459 Y NA STYK1 NA NA NA NA STYK1 44381 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 11893113 11893308 11893155 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 92325 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 11911642 11913422 11912121 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 110854 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 11975144 11975300 11975239 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 174356 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 11976145 11976420 11976223 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 175357 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 11983185 11983541 11983219 Y NA NA NA NA NA NA ETV6 182397 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 12872470 12873013 12872652 Y MANSC1,LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B,APOLD1 CDKN1B NA NA NA NA CDKN1B 6478 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 12956264 12956405 12956396 Y GPRC5A,DDX47 DDX47 NA NA NA NA DDX47 7845 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 12957478 12957757 12957559 Y GPRC5A DDX47 NA NA NA NA DDX47 6493 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 12991466 12991515 12991491 Y NA DDX47,RPL13AP20 NA NA NA NA DDX47 27216 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 13025126 13025347 13025203 Y NA RPL13AP20,GPRC5A,MIR614 NA NA NA NA RPL13AP20 1086 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 5.0344928131849 chr12 13034551 13034650 13034602 Y DDX47,GPRC5A RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6 NA NA NA NA GPRC5A 7066 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr12 13049170 13049423 13049295 Y DUSP16 RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6 NA NA NA NA GPRC5A 7454 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 13124934 13124993 13124963 Y NA RP11-392P7.6,HTR7P1,HEBP1 GPRC5D IMR90 Hi-C 24141950 HTR7P1 25819 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 13247337 13247745 13247512 Y EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 52119 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 13292095 13292429 13292230 Y NA NA EMP1,HTR7P1,KIAA1467,GSG1 IMR90 Hi-C 24141950 EMP1 55221 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 13325962 13326157 13326075 Y EMP1 EMP1 HTR7P1,EMP1,HEBP1,KIAA1467,GSG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EMP1 21493 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 13357534 13357828 13357577 Y NA EMP1 NA NA NA NA EMP1 9884 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 13359236 13359687 13359415 Y EMP1 EMP1 NA NA NA NA EMP1 11586 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 14413561 14413925 14413703 Y NA NA ATF7IP IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATF7IP 102685 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr12 16554253 16554721 16554664 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 56177 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 18511225 18511610 18511392 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA5 769038 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 19048962 19049238 19049131 Y NA NA PIK3C2G IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHA5 231410 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 19260911 19261231 19261176 Y NA PLEKHA5 PIK3C2G IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHA5 19417 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 19566135 19566181 19566158 Y NA AEBP2,EEF1A1P4 NA NA NA NA AEBP2 11156 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 19932429 19932596 19932501 Y NA NA PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-146P 57060 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 20099675 20099840 20099742 Y PDE3A NA LOC100506393,PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-146P 224306 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 20975224 20975562 20975349 Y NA NA NA NA NA NA PDE3A 455045 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.40780091065365 chr12 22482741 22482768 22482755 Y NA NA NA NA NA NA CMAS 285633 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 22779557 22779668 22779574 Y NA ETNK1 NA NA NA NA ETNK1 3548 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 24549320 24549550 24549435 Y NA NA NA NA NA NA BCAT1 550843 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 25538390 25538869 25538521 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 136520 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 137212 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.40780091065365 chr12 26427494 26428032 26427844 Y NA RP11-283G6.5 SSPN,BHLHE41,ITPR2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-283G6.5 42621 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 26658315 26658658 26658486 Y NA NA NA NA NA NA RP11-283G6.5 187662 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 27346815 27347118 27346987 Y NA STK38L STK38L,REP15,PPFIBP1,C12orf71 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STK38L 47783 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 27484254 27484540 27484416 Y FGFR1OP2,STK38L ARNTL2 NA NA NA NA ARNTL2 467 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 27678444 27678624 27678473 Y PPFIBP1 PPFIBP1 NA NA NA NA PPFIBP1 4080 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 27702695 27702969 27702865 Y NA PPFIBP1 NA NA NA NA PPFIBP1 28331 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 27745630 27745707 27745691 Y NA NA NA NA NA NA PPFIBP1 71266 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 30945631 30945953 30945771 Y NA CAPRIN2,RP11-77I22.2,LINC00941 NA NA NA NA LINC00941 24 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 30949517 30949896 30949519 Y CAPRIN2 CAPRIN2,RP11-77I22.2,LINC00941 NA NA NA NA LINC00941 3540 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 31523025 31523181 31523129 Y METTL20,FAM60A,FAM60A FAM60A NA NA NA NA FAM60A 45033 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 31671759 31672031 31671827 Y NA NA NA NA NA NA DENND5B 70000 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 31902136 31902566 31902240 Y C12orf35,AMN1,H3F3C AMN1,H3F3C AMN1 K562 ChIA-PET 22265404 AMN1 22028 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 32738766 32738845 32738790 Y NA NA NA NA NA NA DNM1L 91289 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 32842101 32842415 32842258 Y NA DNM1L,RP11-278C7.1 NA NA NA NA DNM1L 11967 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 33044985 33045279 33045082 Y NA PKP2 NA NA NA NA PKP2 2495 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 33072560 33072656 33072597 Y PKP2 PKP2 NA NA NA NA PKP2 24786 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr12 33137070 33137259 33137186 Y PKP2 NA NA NA NA NA PKP2 89296 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 33149945 33150082 33150013 Y NA NA NA NA NA NA PKP2 102171 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 34500403 34500725 34500579 Y NA NA NA NA NA NA RP13-7D7.1 99987 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 38493611 38493806 38493706 Y NA NA NA NA NA NA ALG10B 214574 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 39104065 39104215 39104143 Y CPNE8 NA NA NA NA NA CPNE8 195017 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 39539251 39539539 39539453 Y NA NA NA NA NA NA CPNE8 240019 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 42598855 42599145 42599001 Y YAF2,YAF2,YAF2 YAF2,PPHLN1 NA NA NA NA YAF2 31006 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 43506983 43507174 43507167 Y ADAMTS20 NA NA NA NA NA RP11-25I15.1 436057 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 45627812 45628672 45628351 Y ANO6,ANO6 ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 19988 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 46381876 46382270 46382256 Y SLC38A2,SCAF11 SCAF11 NA NA NA NA SCAF11 1633 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 46824163 46824471 46824386 Y NA RP11-96H19.1 SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 48701 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 46866769 46866797 46866784 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 91307 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 46888080 46888552 46888358 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 112618 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr12 46917975 46918280 46918143 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 142513 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 16.4168243908203 chr12 46943558 46944140 46943794 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 168096 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 46949913 46950236 46950181 Y NA NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 174451 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 46951455 46951753 46951519 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 175993 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 46956686 46956942 46956800 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 181224 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 47474423 47475249 47474825 Y NA AMIGO2 NA NA NA NA AMIGO2 2689 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 3.28336487816406 chr12 47583701 47583845 47583774 Y NA NA NA NA NA NA AMIGO2 111967 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 47701468 47701752 47701723 Y NA NA AMIGO2,MIR4698,LOC100233209,FAM113B IMR90 Hi-C 24141950 AMIGO2 229734 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 48277511 48277819 48277750 Y NA NA NA NA NA NA HDAC7 52596 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 49276307 49276420 49276362 Y OR8S1,RND1 DDX23,RND1,CCDC65,FKBP11 RND1,CACNB3,DDX23,ARF3,WNT10B,FKBP11,DDN,WNT1,PRKAG1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RND1 18626 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 49592771 49592915 49592838 Y NA TUBA1C,TUBA1A TUBA1B,PRPH,TUBA1A,TUBA1C,LMBR1L,DHH K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TUBA1A 11664 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 49628278 49628526 49628405 Y LMBR1L,TUBA1A TUBA1C,TUBA1A DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1A 47171 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr12 50020601 50020960 50020800 Y FMNL3,PRPF40B NA NA NA NA NA PRPF40B 60600 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 50056796 50057319 50056974 Y TMBIM6,NCKAP5L,FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 42189 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 50067341 50067888 50067543 Y TUBA1A,NCKAP5L,FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 31620 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 50221084 50221421 50221231 Y NCKAP5L NCKAP5L,BCDIN3D NA NA NA NA NCKAP5L 551 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 50460197 50460562 50460363 Y NA RACGAP1,SMARCD1 NA NA NA NA SMARCD1 16193 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 50784153 50784384 50784269 Y NA NA NA NA NA NA LARP4 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 50924450 50924587 50924549 Y NA DIP2B NA NA NA NA DIP2B 27682 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 51180627 51180997 51180727 Y SMAGP ATF1 TMPRSS12 IMR90 Hi-C 24141950 ATF1 25134 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr12 51536826 51537135 51537116 Y CSRNP2 RP11-416A17.1,TFCP2 NA NA NA NA TFCP2 27791 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 51787794 51788248 51788116 Y SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,CSRNP2,DAZAP2,GALNT6 SLC4A8,GALNT6 NA NA NA NA GALNT6 3143 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 51986166 51986575 51986504 Y NA SCN8A NA NA NA NA SCN8A 4116 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr12 52540964 52541526 52541224 Y KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44 KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 42258 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.62669190253125 chr12 52542210 52542726 52542513 Y KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44 KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 41058 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.97001892689844 chr12 52557711 52558022 52557822 Y NA KRT80 NA NA NA NA KRT80 25762 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr12 52575658 52575765 52575707 Y NA KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 8019 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 52580785 52580889 52580797 Y NA KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 2895 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr12 52582905 52583052 52582979 Y ACVR1B,NR4A1 KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 732 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 52587798 52588065 52587861 Y ACVRL1,ACVRL1 KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 4014 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 52588987 52589174 52589068 Y ACVR1B,NR4A1 KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 5203 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 52596076 52596423 52596243 Y NA KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 12292 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 52596776 52597514 52597151 Y NR4A1 KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 12992 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 52609215 52609817 52609526 Y NA KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT7 14487 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 52624014 52624394 52624158 Y KRT7 KRT80 NA NA NA NA KRT7 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 52629756 52630207 52629959 Y NA KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT7 5452 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 52674043 52674518 52674247 Y NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80 KRT7,KRT81 NA NA NA NA KRT81 8800 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 52674655 52675081 52674843 Y C12orf44,KRT80,KRT7 KRT81 NA NA NA NA KRT81 8237 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr12 52890343 52890794 52890475 Y C12orf44,KRT7,KRT18,KRT18,KRT6A,KRT5 NA NA NA NA NA KRT81 207025 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 53229080 53229305 53229193 Y NA NA NA NA NA NA KRT18 111350 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 53267781 53268340 53268093 Y PFDN5 NA KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT18 72315 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 53288883 53289427 53289224 Y NA NA NA NA NA NA KRT18 51228 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 53318665 53319069 53319016 Y NA KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 21586 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr12 53339346 53339557 53339459 Y EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18 KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 1098 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 53359181 53359363 53359294 Y PCBP2,AMHR2,KRT8,KRT18,KRT18 KRT18,KRT8,EIF4B NA NA NA NA KRT8 17443 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 53365695 53366044 53365885 Y NA KRT18,KRT8,EIF4B NA NA NA NA KRT8 23957 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 53615195 53615822 53615501 Y CSAD,SP1,PRR13,PFDN5 ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1 NA NA NA NA RARG 8942 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 53885903 53886227 53886219 Y NA MAP3K12,TARBP2 NA NA NA NA MAP3K12 5620 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 53890170 53890360 53890251 Y MFSD5 MAP3K12,TARBP2 NA NA NA NA MAP3K12 1487 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 53891661 53891873 53891767 Y NA TARBP2 NA NA NA NA MAP3K12 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 54411861 54412590 54411908 Y COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4 HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC8 11029 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr12 54610828 54611089 54611007 Y NA SMUG1 NA NA NA NA SMUG1 30050 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 54700865 54701198 54701063 Y NCKAP1L,NFE2,NFE2,ZNF385A CBX5,HNRNPA1,NFE2,COPZ1 COPZ1,CBX5,HNRNPA1,NFE2,ITGA5,ZNF385A MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 COPZ1 7879 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 54752671 54753884 54753119 Y NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84 NA NA NA NA NA ITGA5 57360 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 54777021 54777369 54777117 Y NA ITGA5 NA NA NA NA ITGA5 33875 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 55808460 55808880 55808766 Y NA NA NA NA NA NA METTL7B 264450 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 56150085 56150369 56150213 Y OR6C6,IKZF4 BLOC1S1,ITGA7,RP11-644F5.11,CD63,GDF11 NA NA NA NA GDF11 15021 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 56218960 56219310 56218990 Y OR6C3,OR6C65,OR6C2,OR6C4,OR10P1,IKZF4 SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14,MMP19,RNU1-69P NA NA NA NA TMEM198B 2219 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 56752579 56752932 56752841 Y ZC3H10,RNF41,RNF41,STAT2,IL23A RP11-977G19.10,CNPY2,PAN2,IL23A,STAT2 NA NA NA NA STAT2 640 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.18890991877604 chr12 57512672 57512926 57512798 Y NAB2 TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6 TMEM194A,STAT6,LRP1,STAC3,SHMT2,NDUFA4L2 IMR90 Hi-C 24141950 LRP1 7350 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 57520981 57521279 57521090 Y NA TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6 NA NA NA NA LRP1 705 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 58238225 58238735 58238639 Y AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,XRCC6BP1,CTDSP2 RP11-620J15.2 NA NA NA NA CTDSP2 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 58923778 58923975 58923913 Y LRIG3,LRIG3 NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG3 388328 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 59300729 59300915 59300862 Y LRIG3,LRIG3 LRIG3 NA NA NA NA LRIG3 11388 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 62315906 62316041 62315972 Y NA KRT8P19 NA NA NA NA KRT8P19 44807 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 62525889 62526278 62526197 Y MON2,FAM19A2 NA NA NA NA NA USP15 125841 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 62772980 62773240 62773147 Y MON2,USP15 NA NA NA NA NA MON2 85357 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 62796049 62796447 62796072 Y NA NA NA NA NA NA MON2 62150 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 62970708 62971108 62970733 Y NA RP11-631N16.2,C12orf61,MIRLET7I NA NA NA NA RP11-631N16.2 23424 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 63025271 63025629 63025492 Y NA RP11-631N16.2,C12orf61,MIRLET7I NA NA NA NA MIRLET7I 29805 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr12 63124974 63125146 63125033 Y C12orf61 NA NA NA NA NA MIRLET7I 129508 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 63126917 63127025 63126971 Y C12orf61 NA NA NA NA NA MIRLET7I 131451 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 63149457 63149757 63149616 Y NA NA NA NA NA NA MIRLET7I 153991 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 63179567 63180349 63179723 Y NA NA NA NA NA NA PPM1H 146468 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 64310301 64310738 64310490 Y NA NA NA NA NA NA SRGAP1 74228 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 64482177 64482504 64482346 Y SRGAP1,TBK1,C12orf66 NA NA NA NA NA C12orf66 131572 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 65074143 65074354 65074186 Y RASSF3,LEMD3 NA NA NA NA NA RASSF3 71850 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 65077868 65077886 65077879 Y RASSF3,LEMD3 NA NA NA NA NA GNS 73341 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 66606907 66607172 66607042 Y IRAK3 TMBIM4,IRAK3,RBMS1P1 NA NA NA NA RBMS1P1 19842 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 66628292 66629290 66628922 Y TMBIM4,IRAK3,HELB IRAK3,RBMS1P1 NA NA NA NA RBMS1P1 1278 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 67828762 67829103 67828960 Y NA NA DYRK2 MCF7 ChIA-PET 22265404 CAND1 167701 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 68221654 68222227 68222103 Y NA NA DYRK2 IMR90 Hi-C 24141950 DYRK2 181536 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 68758917 68759565 68759229 Y IFNG,RAP1B MDM1 RAP1B,NUP107,LOC100507250 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MDM1 34756 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr12 70488262 70488278 70488270 Y NA NA PTPRB IMR90 Hi-C 24141950 CNOT2 146496 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 70937766 70937789 70937778 Y NA NA NA NA NA NA KCNMB4 179710 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 71055637 71055848 71055742 Y NA NA NA NA NA NA KCNMB4 297581 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 71085208 71085379 71085280 Y NA NA NA NA NA NA KCNMB4 327152 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 72341450 72341874 72341635 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D15 109963 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 72430811 72430977 72430894 Y TPH2,TRHDE TRHDE NA NA NA NA TRHDE 48069 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 72728711 72729061 72728940 Y TPH2,TRHDE NA NA NA NA NA TRHDE-AS1 62024 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 76034915 76034997 76034960 Y NA NA PHLDA1 IMR90 Hi-C 24141950 KRR1 131499 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 76371613 76372127 76371872 Y NA NA OSBPL8,PHLDA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHLDA1 53585 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 76414369 76415079 76414685 Y NA PHLDA1 NA NA NA NA PHLDA1 10633 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 77456593 77456922 77456786 Y E2F7 E2F7 NA NA NA NA E2F7 438 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr12 79817950 79818263 79818028 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 264614 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr12 79848111 79848561 79848284 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 234316 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 79918085 79918441 79918422 Y NA NA SYT1 IMR90 Hi-C 24141950 PAWR 164436 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 79941021 79941361 79941199 Y PAWR NA SYT1,PAWR,PPP1R12A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAWR 141516 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 79943391 79943637 79943513 Y NA NA SYT1,PPP1R12A,PAWR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAWR 139240 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 79994209 79994302 79994256 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 88575 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 80974115 80974384 80974233 Y MYF5 NA NA NA NA NA PTPRQ 176341 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 82155346 82155393 82155380 Y NA NA NA NA NA NA CCDC59 595191 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 83183951 83184023 83183988 Y NA NA NA NA NA NA TMTC2 105292 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 84468037 84468125 84468045 Y NA NA NA NA NA NA SLC6A15 837269 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 85344886 85345065 85345044 Y NA SLC6A15 NA NA NA NA SLC6A15 39492 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 85389492 85389695 85389594 Y NA LRRIQ1 NA NA NA NA LRRIQ1 38397 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 86051841 86052071 86051956 Y NA NA NA NA NA NA RASSF9 176277 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 87130786 87131140 87131095 Y MGAT4C NA NA NA NA NA RASSF9 902438 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 87822808 87822965 87822871 Y NA NA NA NA NA NA C12orf29 602658 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 89747699 89748479 89748073 Y NA DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 2651 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 91527742 91527993 91527846 Y NA LUM,DCN NA NA NA NA LUM 24134 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 92172749 92173207 92172879 Y BTG1 NA LOC256021 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-796E2.4 364142 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 94179016 94179409 94179114 Y NA NA NA NA NA NA CRADD 109865 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 94493473 94493774 94493548 Y NA NA CRADD,LOC144481,SOCS2,MRPL42,UBE2N IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBMS2P1 322971 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 94495978 94496358 94496187 Y NA NA CRADD,LOC144481,SOCS2,MRPL42,UBE2N IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBMS2P1 320387 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 94817703 94818348 94818256 Y NA RBMS2P1,CCDC41 NA NA NA NA RBMS2P1 958 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr12 95594660 95595399 95595279 Y FGD6 FGD6,VEZT NA NA NA NA FGD6 13859 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 95680646 95681018 95680718 Y NA NA NA NA NA NA VEZT 71124 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 96589359 96589977 96589479 Y LTA4H,ELK3 ELK3 NA NA NA NA ELK3 3199 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 96593675 96593812 96593739 Y NA ELK3 NA NA NA NA ELK3 7515 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 96613519 96613922 96613765 Y NA ELK3 NA NA NA NA ELK3 27359 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 98818500 98818672 98818666 Y NA RNU4-41P LOC100128191,TMPO MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU4-41P 8684 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 99043983 99044295 99044139 Y NA IKBIP,APAF1 NA NA NA NA APAF1 7064 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 99103586 99103986 99103782 Y NA NA NA NA NA NA APAF1 66667 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 99541793 99542207 99542018 Y NA NA NA NA NA NA APAF1 504874 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 101692271 101692665 101692300 Y NA UTP20 NA NA NA NA UTP20 20384 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 102930045 102930144 102930098 Y NA NA PARPBP,IGF1 IMR90 Hi-C 24141950 IGF1 57622 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 103359249 103359470 103359411 Y NA NA NA NA NA NA IGF1 486826 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 104613052 104613575 104613267 Y CHST11,TXNRD1,TXNRD1 TXNRD1,RPL18AP3 NA NA NA NA TXNRD1 5495 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 104613868 104614024 104613970 Y CHST11,TXNRD1,TXNRD1 TXNRD1,RPL18AP3 NA NA NA NA TXNRD1 6311 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 104658660 104659046 104658853 Y NA RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3 NA NA NA NA RPL18AP3 1604 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 104675995 104676292 104676137 Y GLT8D2,TXNRD1 RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3 NA NA NA NA RP11-818F20.5 3495 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 104693849 104694220 104693862 Y NA RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3 NA NA NA NA EID3 1297 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr12 108297283 108297694 108297638 Y NA NA NA NA NA NA PRDM4 144234 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr12 108783050 108783376 108783111 Y NA NA WSCD2,CMKLR1 IMR90 Hi-C 24141950 FICD 123586 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 108877904 108878160 108878033 Y SSH1,SELPLG,SELPLG FICD NA NA NA NA FICD 28802 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr12 109117977 109118365 109118310 Y SELPLG,SSH1,CORO1C CORO1C NA NA NA NA CORO1C 5007 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 109232143 109232504 109232328 Y FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 16862 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 109249958 109250678 109250397 Y NA SSH1 NA NA NA NA SSH1 592 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 109900309 109900503 109900403 Y KCTD10 UBE3B,KCTD10 NA NA NA NA UBE3B 12704 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr12 109900993 109901418 109901152 Y KCTD10 UBE3B,KCTD10 NA NA NA NA UBE3B 11789 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 110750652 110751139 110750939 Y NA ATP2A2 NA NA NA NA ATP2A2 34091 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 112018937 112019235 112019073 Y NA ATXN2 NA NA NA NA ATXN2 16245 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 112529504 112529724 112529616 Y NA NAA25,TRAFD1 NA NA NA NA NAA25 15102 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 112554455 112554606 112554536 Y ALDH2,TRAFD1 NAA25,TRAFD1 TRAFD1,NAA25 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TRAFD1 6699 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 112759768 112760224 112759930 Y NA NA NA NA NA NA PTPN11 93931 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 113630509 113630869 113630677 Y NA DDX54,TPCN1 NA NA NA NA DDX54 9225 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 115791856 115792156 115792052 Y NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 671887 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 116362516 116362609 116362584 Y MED13L NA NA NA NA NA MED13L 350534 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 116530359 116530538 116530483 Y NA NA NA NA NA NA MED13L 182605 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 116561417 116561596 116561452 Y MED13L,MAP1LC3B2 NA NA NA NA NA MED13L 151547 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 116661909 116662288 116662266 Y NA NA NA NA NA NA MED13L 50855 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr12 116701070 116701373 116701314 Y MAP1LC3B2,MED13L MED13L NA NA NA NA MED13L 11770 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 116821073 116821333 116821156 Y NA NA MED13L,LINC00173,MIR4472-2,MAP1LC3B2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MED13L 107930 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 118263351 118263381 118263366 Y NA NA NA NA NA NA RFC5 186012 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 120153680 120153798 120153737 Y NA NA NA NA NA NA PRKAB1 50122 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 120426531 120426889 120426594 Y NA NA NA NA NA NA CIT 113436 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 120668258 120668871 120668569 Y RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1 NA NA NA NA PXN-AS1 31164 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr12 121838748 121839039 121838846 Y SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 2904 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 121904317 121904475 121904368 Y SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B NA RNF34 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF34 68473 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 122517490 122517922 122517629 Y RSRC2,KDM2B,SETD1B,MLXIP AC156455.1,MLXIP NA NA NA NA MLXIP 2862 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 122771781 122771848 122771815 Y NA VPS33A NA NA NA NA VPS33A 22713 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 122908043 122908483 122908329 Y ZCCHC8,DENR,CLIP1 CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 2864 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr12 123233355 123233499 123233417 Y CLIP1,HCAR2,HCAR3 DENR CCDC62 IMR90 Hi-C 24141950 DENR 1822 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 124716985 124717336 124717220 Y NA NA NA NA NA NA FAM101A 261197 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr12 124717911 124718282 124718055 Y NA NA NA NA NA NA FAM101A 262123 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 124907545 124908050 124907792 Y NA NA NA NA NA NA NCOR2 142085 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr12 124926476 124926613 124926576 Y NA NA NA NA NA NA NCOR2 123522 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 125026162 125026505 125026332 Y NA NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 23630 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 125050856 125051375 125051213 Y UBC,NCOR2 NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 721 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr12 125353523 125353887 125353860 Y NA SCARB1,UBC NA NA NA NA SCARB1 11327 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 125400956 125401141 125401046 Y UBC SCARB1,UBC,RPL22P19 NA NA NA NA UBC 1042 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 125423202 125423335 125423285 Y NA UBC,RPL22P19,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 RPL22P19 4761 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 125425237 125425455 125425374 Y NA UBC,RPL22P19,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 RPL22P19 6796 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 125565000 125565015 125565008 Y AACS AACS NA NA NA NA AACS 17075 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 127567979 127568114 127568034 Y NA NA NA NA NA NA RP11-575F12.2 60963 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 127770941 127771084 127771022 Y NA NA NA NA NA NA AC079949.1 122269 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 132293483 132293821 132293495 Y NA MMP17 NA NA NA NA MMP17 17117 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 132345340 132345736 132345589 Y SFSWAP,ULK1 MMP17,ULK1 NA NA NA NA ULK1 31460 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr12 133021534 133022956 133022670 Y POLE,DDX51,FBRSL1 FBRSL1 LOC100507055,FBRSL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FBRSL1 41181 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr12 133701272 133701384 133701332 Y ZNF605,ZNF605,ZNF26,ZNF84,ZNF84,ZNF268,ZNF268,ZNF10 ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268 NA NA NA NA ZNF891 3675 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 21571909 21572149 21572029 Y NA RNU4-9P NA NA NA NA RNU4-9P 38657 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 21607254 21607660 21607524 Y NA RNU4-9P,LATS2 NA NA NA NA RNU4-9P 3146 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 22243438 22243610 22243458 Y FGF9 RPS7P10 NA NA NA NA FGF9 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 23471356 23471597 23471410 Y NA NUS1P2 NA NA NA NA NUS1P2 16193 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 24133122 24133556 24133337 Y NA TNFRSF19 MIPEP,TNFRSF19 IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF19 8953 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 24613267 24613398 24613318 Y SPATA13 NA SPATA13 IMR90 Hi-C 24141950 SPATA13 61323 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 27557231 27557465 27557334 Y USP12,RPL21,RASL11A NA RASL11A,USP12,RPL21,MTIF3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP12 186568 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr13 28025291 28025563 28025486 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA MTIF3 2552 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr13 30969684 30969817 30969776 Y USPL1 LINC01058 LINC00426,KATNAL1,USPL1,UBL3,HMGB1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01058 24557 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr13 30982567 30982782 30982669 Y NA LINC01058 KATNAL1,LINC00426,USPL1,UBL3,HMGB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC01058 11592 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr13 31314202 31314673 31314362 Y USPL1,ALOX5AP,ALOX5AP ALOX5AP NA NA NA NA ALOX5AP 6557 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr13 31444557 31445090 31444788 Y C13orf26 NA NA NA NA NA ALOX5AP 136912 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 31447062 31447451 31447297 Y NA NA NA NA NA NA ALOX5AP 139417 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 31483566 31483936 31483755 Y NA NA NA NA NA NA ALOX5AP 175921 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 33858244 33858802 33858357 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 63965 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr13 34116442 34117241 34116673 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 193675 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr13 34253090 34253722 34253494 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 136464 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr13 34296005 34296236 34296099 Y NA NA STARD13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RFC3 93950 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 34727619 34727920 34727781 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 337433 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr13 34729958 34730262 34730146 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 339772 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr13 34730516 34730744 34730573 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 340330 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr13 34731212 34731445 34731362 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 341026 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 36918283 36918673 36918579 Y NA CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2,SPG20 NA NA NA NA SPG20 23644 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr13 40918553 40918852 40918807 Y NA NA NA NA NA NA FOXO1 319882 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 41591294 41591779 41591504 Y C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1 WBP4,ELF1 NA NA NA NA WBP4 41631 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 42269057 42269475 42269218 Y C13orf15,DGKH NA NA NA NA NA NAA16 385716 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr13 42422497 42422720 42422629 Y C13orf15,DGKH NA NA NA NA NA AKAP11 421569 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 43632661 43632965 43632672 Y NA DNAJC15 NA NA NA NA DNAJC15 37322 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr13 43727960 43728297 43728107 Y NA NA ENOX1,DNAJC15,CCDC122,LACC1 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJC15 132621 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 44446151 44446617 44446342 Y NA LACC1,CCDC122 NA NA NA NA LACC1 4803 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 44542732 44543742 44543446 Y SERP2 NA SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC122 90905 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 44842198 44842383 44842274 Y NA NA SERP2,TSC22D1,NUFIP1,LINC00284 IMR90 Hi-C 24141950 SERP2 103418 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr13 45333095 45333256 45333140 Y NA NA TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 183812 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 45496701 45496835 45496770 Y NA NA NA NA NA NA NUFIP1 64783 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 45813210 45813281 45813243 Y NA KCTD4 NA NA NA NA KCTD4 40035 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 46736375 46736487 46736423 Y ZC3H13,C13orf18,LCP1 LRRC63 NA NA NA NA LRRC63 47596 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 46915187 46915832 46915630 Y LCP1 NA NA NA NA NA KIAA0226L 94493 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 47128564 47128952 47128887 Y LCP1,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 3261 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 47369610 47369907 47369759 Y NA ESD NA NA NA NA ESD 243 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 50534396 50534668 50534593 Y NA SPRYD7,TRIM13,MIR3613 NA NA NA NA SPRYD7 25770 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 50704264 50704590 50704561 Y NA DLEU1,DLEU2 DLEU7,DLEU1,DLEU2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DLEU2 6408 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 51103280 51103738 51103647 Y NA NA DLEU1,DLEU2,EBPL,TRIM13,MIR3613 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL34P26 169381 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr13 52303239 52303556 52303323 Y WDFY2 NA NA NA NA NA DHRS12 72737 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr13 53336765 53337066 53336916 Y NA NA NA NA NA NA SUGT1 111921 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 53775107 53775689 53775457 Y NA NA NA NA NA NA SUGT1 550263 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 54129981 54130096 54130039 Y NA NA NA NA NA NA SUGT1 905137 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 55208577 55208909 55208656 Y NA NA NA NA NA NA SUGT1 1983733 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 56150088 56150466 56150451 Y NA NA NA NA NA NA SUGT1 2925244 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 64491531 64491783 64491579 Y NA NA NA NA NA NA LINC00355 156361 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 64596462 64596642 64596562 Y NA NA NA NA NA NA LINC00355 51502 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 64623751 64624068 64623941 Y NA LINC00355 NA NA NA NA LINC00355 24076 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 70561834 70562171 70562003 Y KLHL1 NA NA NA NA NA H3F3BP1 1685028 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 72206339 72206570 72206525 Y DACH1 H3F3BP1 NA NA NA NA H3F3BP1 40629 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 72881015 72881216 72881116 Y NA NA NA NA NA NA RPL21P110 394615 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 73011619 73011852 73011740 Y NA NA NA NA NA NA RPL21P110 263979 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 74467154 74467532 74467385 Y NA NA NA NA NA NA KLF12 238862 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 74508678 74508943 74508854 Y KLF12 NA NA NA NA NA KLF12 197451 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr13 74708897 74709334 74709161 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 2503 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 74709487 74710034 74709735 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 3093 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr13 75939887 75940324 75940051 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 113926 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 76256605 76256814 76256659 Y NA NA NA NA NA NA LMO7 64035 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 76290964 76291186 76291007 Y NA NA NA NA NA NA LMO7 98394 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 80510902 80511186 80511006 Y NA NA SPRY2 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY2 401900 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr13 80822359 80822707 80822533 Y NA NA NA NA NA NA SPRY2 90379 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 80916799 80917232 80917156 Y NA SPRY2 NA NA NA NA SPRY2 3713 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 84480650 84480755 84480723 Y NA NA NA NA NA NA SPRY2 3567564 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 88211990 88212263 88212129 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 3785811 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 91580553 91580648 91580601 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 417426 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 93915220 93915506 93915338 Y NA GPC6 NA NA NA NA GPC6 38125 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 95201580 95202169 95201893 Y NA TGDS,GPR180 NA NA NA NA TGDS 44342 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 97728548 97728640 97728594 Y NA NA NA NA NA NA MBNL2 143048 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 97879082 97879401 97879140 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 7394 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 97991476 97991911 97991864 Y MBNL2 NA NA NA NA NA RAP2A 92565 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 99033515 99033578 99033537 Y NA NA NA NA NA NA STK24 194616 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 99161455 99162128 99161863 Y NA NA NA NA NA NA STK24 66066 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 99772014 99772367 99772137 Y GPR18 DOCK9 MIR548AN,UBAC2 IMR90 Hi-C 24141950 DOCK9 35135 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 99934075 99934613 99934350 Y GPR183 NA NA NA NA NA H2AFZP3 68063 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 100013491 100013836 100013585 Y DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL NA NA NA NA NA TM9SF2 137835 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 100033242 100033451 100033337 Y DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL NA NA NA NA NA TM9SF2 118220 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 102143126 102143433 102143292 Y NA ITGBL1 NA NA NA NA ITGBL1 40160 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 102341558 102341578 102341569 Y NA NA NA NA NA NA ITGBL1 238592 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 103205925 103205941 103205933 Y NA TPP2 NA NA NA NA TPP2 41412 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 105274622 105274796 105274721 Y NA NA NA NA NA NA LINC00460 1752115 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 107078443 107078580 107078574 Y NA NA NA NA NA NA LINC00460 51532 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr13 108103235 108103615 108103559 Y NA NA NA NA NA NA FAM155A 413468 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 108310994 108311341 108311278 Y NA NA NA NA NA NA FAM155A 205742 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr13 109568044 109568430 109568179 Y NA NA NA NA NA NA ABHD13 699317 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 109807507 109807975 109807755 Y NA NA NA NA NA NA AL162497.1 597640 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr13 109808669 109809037 109808800 Y NA NA NA NA NA NA AL162497.1 596578 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr13 109895773 109895899 109895836 Y NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 509716 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 109921804 109922211 109922051 Y NA NA IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 483404 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 110426988 110427362 110427201 Y NA AL162497.1,IRS2 NA NA NA NA IRS2 9553 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 110521819 110522258 110522077 Y NA NA MYO16,IRS2,COL4A1 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 84904 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 110669788 110670084 110669997 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 232873 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr13 110790027 110791241 110790617 Y RAB20,IRS2 NA NA NA NA NA COL4A2 164918 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 110969695 110970088 110969892 Y NA COL4A2,COL4A1 NA NA NA NA COL4A1 12199 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 111464605 111464817 111464711 Y NA NA ING1,CARS2,CARKD,RAB20,ANKRD10,LINC00346,COL4A2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00346 55345 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 111526935 111527249 111527195 Y RAB20 LINC00346,ANKRD10 NA NA NA NA LINC00346 6773 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 111544033 111544176 111544105 Y ING1,ING1 LINC00346,ANKRD10 NA NA NA NA ANKRD10 21240 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 111589420 111590157 111589779 Y NA ANKRD10 ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 24004 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 111594578 111594832 111594693 Y RAB20,ANKRD10 ANKRD10 ANKRD10,ARHGEF7 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 29162 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr13 111616634 111616920 111616701 Y NA NA LINC00346,ING1,ANKRD10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD10 51218 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 111659256 111659421 111659366 Y NA NA ANKRD10,ARHGEF7 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 93840 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 113312485 113312628 113312557 Y NA ATP11A NA NA NA NA ATP11A 30015 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr13 113377120 113377559 113377252 Y NA ATP11A NA NA NA NA ATP11A 34477 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr13 114119812 114119949 114119881 Y NA DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA DCUN1D2 23318 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 114147699 114148153 114147800 Y F7,F10,PROZ,GRTP1 DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA TMCO3 4389 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 114565478 114566323 114565869 Y GAS6,GAS6,GAS6 GAS6 NA NA NA NA GAS6 432 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr13 114600157 114600520 114600358 Y GAS6 GAS6 NA NA NA NA GAS6 35111 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr13 114611317 114611637 114611421 Y NA GAS6 NA NA NA NA GAS6 46271 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 114770181 114770639 114770503 Y NA NA NA NA NA NA RASA3 125447 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 3.72114686191927 chr13 114830489 114831626 114831334 Y RASA3 NA NA NA NA NA RASA3 64460 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr13 114875113 114875384 114875282 Y RASA3 RASA3 NA NA NA NA RASA3 20702 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr13 114884280 114884926 114884814 Y NA RASA3 NA NA NA NA RASA3 11160 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr13 114894223 114894969 114894576 Y RASA3 RASA3 NA NA NA NA RASA3 1117 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 21150605 21151121 21150987 Y TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40 RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 269 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 23293879 23294567 23294288 Y RBM23,C14orf119,SLC7A7,SLC7A7 SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10 REM2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC7A7 2462 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 23307440 23308274 23307581 Y SLC7A8,PSMB5,PSMB5,LRP10,MRPL52,MMP14 SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10 NA NA NA NA MMP14 3674 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr14 23449151 23449315 23449234 Y MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93 NA NA NA NA AJUBA 536 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr14 23449757 23450231 23450060 Y MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB MIR4707,HAUS4,C14orf93 NA NA NA NA AJUBA 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr14 23643589 23643907 23643656 Y NA NA NA NA NA NA ACIN1 80766 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 31400109 31400220 31400192 Y NA NA NA NA NA NA COCH 58389 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 32672212 32672871 32672506 Y ARHGAP5 NA NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP5-AS1 128213 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 32953597 32954289 32954012 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 1591 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr14 32979007 32979394 32979291 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 27001 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 33178444 33178576 33178508 Y AKAP6,NPAS3 NA NA NA NA NA RP11-320M16.1 226438 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 34529400 34529785 34529476 Y EGLN3 NA EGLN3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 399777 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 35120187 35120582 35120411 Y SNX6,SNX6 SNX6 SNX6,BAZ1A,CFL2,PPP2R3C IMR90 Hi-C 24141950 SNX6 22798 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr14 35628271 35628433 35628369 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA KIAA0391 38516 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 35805683 35806194 35806003 Y BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA NA NA NA NA NA RP11-561B11.1 50081 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 35865196 35865330 35865211 Y RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1,NFKBIA NA NA NA NA NFKBIA 6625 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr14 36642326 36642612 36642534 Y NKX2-8,NKX2-1,NKX2-1,MBIP NA SFTA3 IMR90 Hi-C 24141950 MBIP 145270 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 36644066 36644508 36644470 Y NKX2-8,NKX2-1,NKX2-1,MBIP NA SFTA3 IMR90 Hi-C 24141950 MBIP 143374 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 39892906 39893200 39893154 Y FBXO33 FBXO33 NA NA NA NA FBXO33 6504 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 49979013 49979291 49979168 Y C14orf182 NA NA NA NA NA RPS29 84117 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr14 50090977 50091033 50091007 Y METTL21D,ARF6,RPS29,NEMF,KLHDC2,RPL36AL,MGAT2,KLHDC1,DNAAF2 RPS29,LRR1,RPL36AL,MGAT2,DNAAF2 NA NA NA NA MGAT2 5488 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr14 50334846 50335244 50334992 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 16925 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr14 50406046 50406061 50406054 Y NA ARF6 NA NA NA NA ARF6 48236 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 50475850 50475934 50475889 Y ARF6,C14orf182 C14orf182 NA NA NA NA C14orf182 3612 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 50528497 50528810 50528555 Y NA NA NA NA NA NA C14orf182 56259 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 50681069 50681448 50681362 Y NA SOS2 NA NA NA NA SOS2 14828 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 51834333 51834594 51834461 Y NA RP11-255G12.3 NA NA NA NA RP11-255G12.3 27259 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 51837532 51837771 51837653 Y FRMD6 RP11-255G12.3 NA NA NA NA RP11-255G12.3 24082 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 51862095 51862490 51862300 Y FRMD6,FRMD6 RP11-255G12.3 LOC283553,FRMD6,FRMD6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-255G12.3 242 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr14 51909639 51909898 51909736 Y NA RP11-255G12.3,FRMD6 FRMD6-AS1,FRMD6,LOC283553,GNG2 IMR90 Hi-C 24141950 FRMD6 43920 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 51915852 51916182 51915957 Y NA FRMD6 FRMD6,LOC283553,GNG2,FRMD6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 FRMD6 37636 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr14 51999901 52000168 52000035 Y NA FRMD6 NA NA NA NA FRMD6 46083 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr14 52006399 52006758 52006578 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 52581 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 52076708 52076858 52076794 Y NA NA NA NA NA NA FRMD6 122890 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 52104818 52105424 52105148 Y NA NA NA NA NA NA FRMD6 151000 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 52110768 52111053 52110947 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 156950 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 52119936 52120349 52120008 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 166118 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr14 52163680 52163849 52163765 Y FRMD6 NA NA NA NA NA GNG2 127064 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 54443717 54444101 54443910 Y NA BMP4 NA NA NA NA BMP4 20238 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 54900763 54901015 54900977 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 39196 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 54954614 54954684 54954648 Y NA GMFB,CGRRF1 NA NA NA NA GMFB 700 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 55569733 55570176 55570087 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 18652 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.40780091065365 chr14 55570845 55571098 55571012 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L LGALS3 LGALS3,MAPK1IP1L,DLGAP5 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 17730 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 55596570 55597156 55596587 Y NA LGALS3 NA NA NA NA LGALS3 7742 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 55770530 55770967 55770803 Y GCH1,MAPK1IP1L,LGALS3,FBXO34,FBXO34 FBXO34 NA NA NA NA FBXO34 34509 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 56045964 56046135 56045995 Y NA KTN1,KTN1-AS1 NA NA NA NA KTN1-AS1 1136 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 56047594 56047945 56047904 Y NA KTN1,KTN1-AS1 NA NA NA NA KTN1-AS1 2766 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 57265508 57265854 57265681 Y NA NA NA NA NA NA EXOC5 467872 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 57343255 57343511 57343375 Y OTX2,OTX2 NA NA NA NA NA EXOC5 390215 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 58544876 58545175 58545024 Y C14orf37 NA NA NA NA NA UBA52P3 60822 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr14 58748134 58748542 58748422 Y ARID4A PSMA3,RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A NA NA NA NA RP11-349A22.5 14310 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 59744882 59745126 59745004 Y NA NA NA NA NA NA DAAM1 91518 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 60679186 60679974 60679676 Y NA DHRS7,PPM1A NA NA NA NA PPM1A 30496 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr14 61612107 61612325 61612234 Y SIX1 NA SLC38A6,SIX1,SIX4,MNAT1,TRMT5 IMR90 Hi-C 24141950 TRMT5 166031 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 61978878 61979019 61978952 Y PRKCH,HIF1A NA NA NA NA NA HIF1A 181212 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 62032593 62032996 62032785 Y HIF1A NA NA NA NA NA HIF1A 127235 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 62040859 62041355 62041035 Y NA NA NA NA NA NA HIF1A 118876 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 62219407 62219640 62219496 Y HIF1A,SNAPC1 RP11-618G20.1,HIF1A-AS2,SNAPC1 NA NA NA NA HIF1A-AS2 3592 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr14 64912318 64912487 64912430 Y ESR2,ZBTB25,ZBTB1,AKAP5 AKAP5 NA NA NA NA AKAP5 17730 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 65175295 65175757 65175503 Y SYNE2,ZBTB1,MAX,CHURC1,PLEKHG3 PLEKHG3 NA NA NA NA PLEKHG3 6475 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 65469693 65469823 65469758 Y NA RAB15 NA NA NA NA RAB15 32199 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 65637410 65637773 65637587 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAX 69997 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 65691594 65691779 65691731 Y NA NA FUT8,LOC645431,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAX 124181 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 65710565 65711133 65711131 Y NA NA LOC645431,FUT8 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAX 143152 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 65749378 65749653 65749574 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90 Hi-C 24141950 FUT8 125657 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr14 65905118 65905243 65905181 Y NA FUT8 NA NA NA NA FUT8 29808 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 66126309 66126626 66126333 Y NA NA NA NA NA NA FUT8 250999 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 67763359 67763655 67763501 Y NA NA NA NA NA NA MPP5 57533 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 68033590 68034347 68033627 Y NA TMEM229B,PIGH NA NA NA NA PIGH 30657 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 68161499 68161767 68161616 Y PLEK2 VTI1B,RDH11 NA NA NA NA RDH11 968 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 68408350 68408505 68408421 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 123854 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr14 68555311 68555805 68555391 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 270815 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 68555905 68556402 68556038 Y PIGH NA NA NA NA NA RAD51B 271409 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr14 68571232 68571846 68571404 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 286736 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr14 68604521 68604895 68604639 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 282018 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr14 68607037 68607479 68607161 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 279434 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 68610058 68610732 68610311 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 276181 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 68658646 68658820 68658748 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 228093 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 68666573 68666719 68666628 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 220194 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr14 68699331 68699744 68699520 Y ZFYVE26 NA NA NA NA NA PPIAP6 187169 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 68712620 68712855 68712738 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 174058 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr14 68844207 68844566 68844276 Y NA PPIAP6 NA NA NA NA PPIAP6 42347 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 68882312 68882693 68882503 Y NA PPIAP6 NA NA NA NA PPIAP6 4220 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 69010932 69011443 69011159 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 124019 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 69013502 69013901 69013730 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 126589 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 69014304 69014714 69014453 Y ACTN1 NA NA NA NA NA PPIAP6 127391 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr14 69161300 69161452 69161356 Y NA NA ZFP36L1,RAD51B IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L1 99738 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 69162018 69162337 69162187 Y NA NA ZFP36L1,RAD51B IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L1 98853 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 69246726 69246992 69246942 Y DCAF5 ZFP36L1 NA NA NA NA ZFP36L1 14198 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr14 69281323 69281785 69281441 Y DCAF5 ZFP36L1 RAD51B,ZFYVE26 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L1 20133 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 71797093 71797681 71797289 Y PCNX SIPA1L1,RP1-261D10.2 SIPA1L1,LOC145474 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-261D10.2 10562 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 73110081 73110359 73110171 Y NA NA RGS6,DPF3,DCAF4 IMR90 Hi-C 24141950 DPF3 248450 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 73131912 73132517 73132075 Y NA NA NA NA NA NA DPF3 226292 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr14 74981330 74981609 74981543 Y NPC2 MIR4709,ISCA2,NPC2 NA NA NA NA NPC2 22450 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 75033495 75033781 75033700 Y NA LTBP2,CTD-2207P18.2 NA NA NA NA LTBP2 43525 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr14 75041346 75041756 75041610 Y NPC2 LTBP2,CTD-2207P18.2 ISCA2,NPC2 IMR90 Hi-C 24141950 LTBP2 35550 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 75406513 75406633 75406575 Y NA RPS6KL1 NA NA NA NA RPS6KL1 18414 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 75716219 75717010 75716484 Y YLPM1,NEK9,FOS FOS TMED10,LOC731223,NEK9,ZC2HC1C,FOS,BATF,JDP2,RPS6KL1,EIF2B2 IMR90 Hi-C 24141950 FOS 26467 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 75920164 75920191 75920178 Y JDP2 JDP2 NA NA NA NA JDP2 27745 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr14 76843326 76843356 76843341 Y NA NA NA NA NA NA RP11-187O7.1 256648 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr14 77428060 77428442 77428341 Y NA RP11-7F17.1 IRF2BPL MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.1 4584 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 77499482 77500543 77500476 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL IRF2BPL KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 6448 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr14 77503944 77504718 77504558 Y NA IRF2BPL IRF2BPL IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BPL 10910 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr14 77640033 77640278 77640160 Y NA NA C14orf166B,ZDHHC22,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,TMEM63C,NGB,MIR1260A,TMED8 IMR90 Hi-C 24141950 GSTZ1,POMT2 144949 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 78194844 78195080 78194962 Y NA ALKBH1,SLIRP,SNW1 NA NA NA NA SLIRP 22430 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 79941274 79941440 79941360 Y NA NA NA NA NA NA DIO2 910660 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 80051183 80051363 80051265 Y NA NA NA NA NA NA DIO2 800737 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 81442169 81442534 81442345 Y TSHR CEP128 NA NA NA NA CEP128 18308 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 DYNLL1P1 NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr14 81977973 81978150 81978054 Y NA SEL1L NA NA NA NA SEL1L 20055 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 85881762 85881957 85881956 Y FLRT2 NA NA NA NA NA RP11-497E19.1 112375 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr14 85938388 85938484 85938398 Y NA NA NA NA NA NA RP11-497E19.1 55848 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 89895882 89896217 89896119 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA CAP2P1 139944 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 89897229 89897488 89897403 Y FOXN3 NA NA NA NA NA CAP2P1 141291 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 90378938 90379536 90379158 Y FOXN3,FOXN3,KCNK13 EFCAB11,TDP1 NA NA NA NA EFCAB11 39585 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 91683304 91683542 91683359 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KA5 158324 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 93510584 93510744 93510686 Y NA NA NA NA NA NA ITPK1 69921 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 94860948 94861396 94861133 Y SERPINA1 NA SERPINA1 IMR90 Hi-C 24141950 PPP4R4 250483 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 95239496 95239653 95239575 Y SERPINA12 GSC NA NA NA NA GSC 4934 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 95724003 95724377 95724190 Y DICER1,DICER1,CLMN NA NA NA NA NA CLMN 59866 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 97043507 97043643 97043575 Y NA NA NA NA NA NA PAPOLA 77737 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 99439262 99439638 99439565 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 505578 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 99827366 99827674 99827539 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 117542 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 100071651 100072022 100071781 Y NA CCDC85C,RP11-543C4.1,HHIPL1 NA NA NA NA RP11-543C4.1 2758 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 100495518 100495795 100495680 Y NA NA EVL,YY1,DEGS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 206840 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 100751761 100751840 100751790 Y NA YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29 NA NA NA NA SLC25A29 19044 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 101151381 101151698 101151540 Y RTL1,DLK1 NA NA NA NA NA WARS 310239 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 101155057 101155401 101155388 Y NA NA NA NA NA NA WARS 313915 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 3.28336487816406 chr14 102746257 102746658 102746398 Y NA MOK,ZNF839 NA NA NA NA MOK 22879 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 103557952 103558007 103557980 Y NA CDC42BPB,TNFAIP2 CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,EIF5,LOC100131366,MARK3 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TNFAIP2 29772 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 103672017 103672095 103672056 Y NA NA LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP2 84238 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 103673427 103673966 103673589 Y CDC42BPB NA LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP2 85648 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 3.28336487816406 chr14 103828242 103828602 103828384 Y TNFAIP2,EIF5,EIF5,MARK3 EIF5,MARK3 NA NA NA NA MARK3 21127 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 105144100 105144955 105144117 Y GPR132,AKT1 RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1 NA NA NA NA RP11-982M15.6 528 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr14 105327046 105327788 105327205 Y NA NA NA NA NA NA AKT1 66958 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 105330138 105330246 105330192 Y NA NA NA NA NA NA AKT1 70050 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 105399879 105400289 105400091 Y NA AHNAK2,C14orf79 NA NA NA NA AHNAK2 42405 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 105434660 105434907 105434734 Y INF2,KIAA0284,C14orf79 AHNAK2,C14orf79 PLD4 MCF7 ChIA-PET 22265404 AHNAK2 7787 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr14 105438668 105438757 105438725 Y KIAA0284,JAG2,CDCA4,C14orf79,AHNAK2 AHNAK2,C14orf79,CDCA4 NA NA NA NA AHNAK2 3937 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr14 105439556 105439771 105439692 Y INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2 AHNAK2,C14orf79,CDCA4 PLD4 MCF7 ChIA-PET 22265404 AHNAK2 2923 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr14 105557924 105558306 105558075 Y NA NA BTBD6,BRF1,JAG2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDCA4 72439 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr15 26327449 26327665 26327505 Y NA NA ATP10A,LOC100128714 IMR90 Hi-C 24141950 ATP10A 219132 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr15 29407243 29407640 29407337 Y FAM189A1 NA NA NA NA NA NDNL2 152393 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 31689645 31689781 31689725 Y MTMR10,KLF13 NA NA NA NA NA KLF13 72587 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 33133022 33133309 33133285 Y GREM1 NA GREM1 IMR90 Hi-C 24141950 GREM1 124847 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 33162710 33163027 33162926 Y NA NA NA NA NA NA GREM1 154535 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 33418806 33419006 33418854 Y NA NA FMN1,SCG5,ARHGAP11A,GREM1 IMR90 Hi-C 24141950 GREM1 410631 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 34290038 34290177 34290053 Y NA AVEN NA NA NA NA AVEN 39200 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 34421770 34422050 34421910 Y NA PGBD4 NA NA NA NA PGBD4 29496 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 35590731 35591134 35590845 Y NA NA ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-323I15.2 208049 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr15 35599049 35599138 35599102 Y NA NA ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-323I15.2 216367 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr15 35803904 35804280 35804092 Y NA NA NA NA NA NA RP11-323I15.2 421222 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 38751078 38751316 38751209 Y NA FAM98B NA NA NA NA FAM98B 6750 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 38784019 38784367 38784201 Y RASGRP1 FAM98B NA NA NA NA FAM98B 39691 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr15 38987694 38987941 38987780 Y SPRED1,RASGRP1,C15orf53 NA NA NA NA NA FAM98B 243366 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 39110575 39110868 39110718 Y NA NA THBS1,FSIP1,C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 FAM98B 366247 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr15 39174117 39174200 39174140 Y C15orf53 NA FSIP1,THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf54 366685 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr15 39175462 39175521 39175492 Y NA NA FSIP1,THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf54 365364 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr15 39182577 39182723 39182628 Y NA NA THBS1,FSIP1,C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf54 358162 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 39361992 39362177 39362006 Y NA NA FSIP1,C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf54 178708 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr15 39371433 39371559 39371496 Y NA NA C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf54 169326 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 39432291 39432412 39432368 Y THBS1 NA THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf54 108473 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr15 39524753 39525004 39524927 Y THBS1 C15orf54 C15orf54 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf54 15881 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 39527316 39527429 39527373 Y NA C15orf54 C15orf54 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf54 13456 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 39540453 39540799 39540512 Y THBS1,C15orf54 C15orf54 NA NA NA NA C15orf54 86 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr15 39559889 39560120 39560079 Y NA C15orf54 NA NA NA NA C15orf54 19004 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 39561378 39561942 39561743 Y THBS1 C15orf54 NA NA NA NA C15orf54 20493 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 4.81560182130729 chr15 39563210 39563560 39563357 Y THBS1 C15orf54 NA NA NA NA C15orf54 22325 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 39722195 39722553 39722498 Y THBS1,C15orf54 RP11-624L4.1 C15orf53,FSIP1,THBS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-624L4.1 4799 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr15 40397040 40397227 40397203 Y BUB1B,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 1866 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr15 41139695 41139794 41139738 Y NA ZFYVE19,DNAJC17,SPINT1,VPS18 NA NA NA NA SPINT1 5479 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 41581854 41582095 41581909 Y NA OIP5-AS1,OIP5,NUSAP1 NA NA NA NA OIP5-AS1 7666 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 41953918 41954236 41954127 Y EHD4,MGA NA MAPKBP1 IMR90 Hi-C 24141950 TYRO3 106045 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 42091432 42091661 42091502 Y NA MAPKBP1,JMJD7,PLA2G4B,JMJD7-PLA2G4B NA NA NA NA JMJD7,PLA2G4B 26622 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 42236399 42236774 42236695 Y NA EHD4 SPTBN5 IMR90 Hi-C 24141950 EHD4 26002 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 42535686 42535733 42535710 Y NA VPS39,GANC,TMEM87A NA NA NA NA GANC 27698 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 44161980 44162105 44162047 Y NA MFAP1,WDR76,PIN4P1 NA NA NA NA PIN4P1 4337 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 44837233 44837387 44837300 Y CTDSPL2,PATL2 EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 9978 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 45748469 45749175 45748989 Y SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN C15orf48 NA NA NA NA C15orf48 27742 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr15 48104672 48105061 48104769 Y NA NA SEMA6D IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2270N23.1 83540 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 48785600 48785984 48785868 Y NA NA NA NA NA NA FBN1 150062 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 48851315 48851882 48851845 Y NA NA NA NA NA NA FBN1 84164 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 50634288 50634665 50634477 Y NA GABPB1-AS1,GABPB1 NA NA NA NA GABPB1-AS1 10860 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 52028351 52028526 52028483 Y MAPK6,DMXL2,LYSMD2 TMOD2,LYSMD2 NA NA NA NA TMOD2 13232 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 52148809 52148818 52148812 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 28984 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 52369278 52369628 52369325 Y MAPK6 NA GNB5,BCL2L10,MYO5C IMR90 Hi-C 24141950 LEO1 107275 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 52975108 52975296 52975173 Y KIAA1370 NA FAM214A K562 ChIA-PET 22265404 ARPP19 115028 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 56201661 56201754 56201731 Y NEDD4 NA NA NA NA NA NEDD4 82190 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 57329893 57330048 57329971 Y NA NA NA NA NA NA TCF12 121072 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 57529031 57529296 57529123 Y NA NA NA NA NA NA CGNL1 136869 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 57844002 57844282 57844063 Y NA GCOM1,MYZAP,POLR2M NA NA NA NA GCOM1 37824 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 58568513 58568584 58568545 Y NA NA LIPC,ADAM10,FAM63B,SLTM IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1A2 219481 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 59144484 59144794 59144639 Y LIPC RNF111 NA NA NA NA RNF111 10580 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 59576201 59576407 59576333 Y GCNT3,MYO1E NA NA NA NA NA FAM81A 86485 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr15 60699729 60699909 60699819 Y NA ANXA2,RP11-745A24.2 NA NA NA NA RP11-745A24.2 5067 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 60874514 60874871 60874792 Y RORA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 105137 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 61264927 61265345 61265257 Y NA NA NARG2 IMR90 Hi-C 24141950 RORA 254173 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 62130295 62130308 62130301 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 220364 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 62410713 62410981 62410834 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 60041 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 62683990 62684402 62684060 Y NA TLN2 TLN2,MGC15885 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 3265 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 63386917 63387072 63386993 Y RPS27L,TPM1 LACTB NA NA NA NA LACTB 24927 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr15 63427902 63428515 63428147 Y USP3,RAB8B,LACTB LACTB,RPS27L NA NA NA NA LACTB 15903 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 63795379 63795825 63795543 Y NA USP3 NA NA NA NA USP3 586 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 64166922 64167102 64167012 Y NA HERC1 DAPK2,HERC1 IMR90 Hi-C 24141950 HERC1 42781 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 64385169 64385477 64385384 Y NA DAPK2,FAM96A,SNX1 NA NA NA NA SNX1 847 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 64589107 64589162 64589135 Y NA NA NA NA NA NA CSNK1G1 57280 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 64991554 64991938 64991797 Y NA OAZ2 NA NA NA NA OAZ2 1542 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 65185651 65186463 65186157 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21 ANKDD1A NA NA NA NA ANKDD1A 15638 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr15 65187630 65188212 65188050 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21 ANKDD1A NA NA NA NA ANKDD1A 13889 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr15 65189466 65189943 65189728 Y OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21 ANKDD1A SPG21 IMR90 Hi-C 24141950 ANKDD1A 12158 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr15 65596702 65597188 65596889 Y DENND4A RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5746 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr15 65951559 65951691 65951625 Y NA SLC24A1 NA NA NA NA SLC24A1 49855 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 66162838 66163256 66163114 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80207 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr15 66163349 66163534 66163463 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80718 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 66726545 66726855 66726700 Y NA TIPIN,MAP2K1 NA NA NA NA MAP2K1 49390 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 66993287 66993569 66993487 Y MAP2K1,SMAD6 SMAD6 NA NA NA NA SMAD6 721 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr15 67095524 67095803 67095671 Y NA NA NA NA NA NA SMAD6 102958 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr15 67134448 67134928 67134631 Y NA NA SMAD6,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 141882 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr15 67341124 67341334 67341261 Y NA RP11-798K3.2,SMAD3 SMAD3,IQCH,LOC100506686,AAGAB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-798K3.2 8257 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr15 67359902 67360303 67360058 Y NA RP11-798K3.2,SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 5801 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.97001892689844 chr15 67399103 67399775 67399548 Y SMAD3 RP11-798K3.2,SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 45002 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr15 67413336 67413759 67413492 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 59235 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 67426476 67426864 67426547 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 72375 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr15 67440675 67441024 67440815 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 86574 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr15 67926783 67927143 67926830 Y NA NA NA NA NA NA MAP2K5 93736 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 68564194 68564543 68564236 Y NA CLN6,FEM1B FEM1B,CLN6,ANP32A,CORO2B,ITGA11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FEM1B 3598 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 70006588 70006856 70006758 Y TLE3 NA C15orf50,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 RPLP1 263465 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 71084406 71084742 71084644 Y UACA,LARP6 UACA UACA,LARP6,LRRC49 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 30474 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 71336506 71336742 71336642 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 153382 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 71373131 71373408 71373250 Y NA NA LRRC49,THSD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THAP10 190007 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 71571390 71571701 71571551 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 388266 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 72617371 72617435 72617389 Y MYO9A,SENP8,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6 HEXA NA NA NA NA HEXA 49382 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 72824073 72824405 72824125 Y NA NA NA NA NA NA ARIH1 59406 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 74221354 74221537 74221415 Y NA LOXL1 NA NA NA NA LOXL1 5024 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 74226590 74227025 74226821 Y NA LOXL1 NA NA NA NA LOXL1 10260 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 74249257 74249448 74249278 Y NA LOXL1,STOML1,PML NA NA NA NA LOXL1 32927 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr15 74332904 74333192 74333031 Y NA STOML1,PML NA NA NA NA PML 47890 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 74346326 74346621 74346416 Y NA NA NA NA NA NA PML 61312 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 74492868 74493054 74492979 Y NA NA NA NA NA NA PML 207854 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 74666695 74666987 74666837 Y CLK3,ARID3B NA NA NA NA NA SEMA7A 57821 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 74699762 74699966 74699869 Y LOXL1,STOML1 SEMA7A NA NA NA NA SEMA7A 24842 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 75018665 75019349 75018947 Y SCAMP2,C15orf39,CYP1A1 EDC3,CYP1A1 NA NA NA NA CYP1A1 2714 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 75744907 75745094 75744993 Y C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1089 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr15 75746315 75746749 75746512 Y PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 132 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 75747348 75747533 75747407 Y RPP25,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1165 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 75867013 75867354 75867182 Y C15orf39,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,UBE2Q2,ODF3L1 PTPN9,SNUPN NA NA NA NA PTPN9 2276 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 75959061 75959441 75959310 Y SNX33 SNUPN,SNX33,IMP3,CSPG4 NA NA NA NA IMP3 20014 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr15 76050803 76051078 76050853 Y NA CSPG4,ODF3L1,DNM1P35 NA NA NA NA DNM1P35 21839 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr15 78598854 78599004 78598959 Y NA WDR61 WDR61,IDH3A,DNAJA4,IREB2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WDR61 8718 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 79216586 79216987 79216944 Y RASGRF1 CTSH NA NA NA NA CTSH 22929 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 79280826 79281229 79281127 Y CTSH CTSH NA NA NA NA CTSH 40910 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr15 80211506 80211893 80211588 Y NA MTHFS,C15ORF37,ST20,BCL2A1 NA NA NA NA C15ORF37 1614 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 80766771 80766941 80766889 Y NA NA NA NA NA NA ARNT2 72079 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr15 80773280 80773702 80773515 Y KIAA1199 NA NA NA NA NA ARNT2 78588 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 80776414 80776800 80776607 Y NA NA NA NA NA NA ARNT2 81722 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 80786706 80787081 80786777 Y KIAA1199 NA NA NA NA NA ARNT2 92014 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr15 80816171 80816419 80816261 Y ARNT2,KIAA1199 NA NA NA NA NA ARNT2 121479 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 80841630 80841706 80841692 Y NA NA NA NA NA NA ARNT2 146938 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 80880322 80880600 80880404 Y ARNT2 NA NA NA NA NA ARNT2 185630 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 81069569 81069760 81069666 Y MESDC1,KIAA1199 NA NA NA NA NA KIAA1199 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr15 81082693 81083043 81082764 Y KIAA1199 KIAA1199 NA NA NA NA KIAA1199 13009 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr15 81099060 81099288 81099113 Y NA KIAA1199 NA NA NA NA KIAA1199 29376 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr15 81125183 81125474 81125331 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1199 55499 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 81197356 81197718 81197537 Y NA NA NA NA NA NA MESDC2 82501 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr15 81217313 81217615 81217464 Y NA NA NA NA NA NA MESDC2 62604 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 81277111 81277444 81277389 Y STARD5,MESDC1 MESDC2,MESDC1 NA NA NA NA MESDC2 2775 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 82203414 82203711 82203543 Y NA NA NA NA NA NA MEX3B 132771 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 83680959 83681167 83681099 Y NA HOMER2,FAM103A1,C15orf40 NA NA NA NA C15orf40 2566 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr15 83683180 83683566 83683373 Y NA HOMER2,FAM103A1,C15orf40 NA NA NA NA C15orf40 4787 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr15 83731534 83731663 83731576 Y WHAMM,BTBD1 BTBD1 NA NA NA NA BTBD1 2443 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 83815089 83815145 83815117 Y NA NA NA NA NA NA HDGFRP3 59625 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 83857531 83857848 83857643 Y AP3B2,HDGFRP3 HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 16922 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 83954950 83955303 83955151 Y BNC1 BNC1 NA NA NA NA BNC1 3484 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 84048302 84048583 84048506 Y BNC1 NA SH3GL3,BNC1 IMR90 Hi-C 24141950 SH3GL3 65397 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 85455479 85455863 85455740 Y SLC28A1 NA NA NA NA NA PDE8A 65808 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr15 85458286 85458507 85458420 Y NA NA NA NA NA NA PDE8A 63164 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 85861581 85861931 85861753 Y PDE8A,AKAP13 NA AKAP13 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP13 59871 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 85956762 85957097 85956878 Y AKAP13,PDE8A AKAP13 NA NA NA NA AKAP13 34960 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 86020857 86021180 86020870 Y KLHL25 NA NA NA NA NA AKAP13 99055 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 86211201 86211615 86211423 Y AKAP13,KLHL25 NA NA NA NA NA KLHL25 124646 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 88877677 88878020 88877849 Y NA NA NA NA NA NA NTRK3 79678 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 89856537 89857272 89856853 Y NA POLG NA NA NA NA POLG 18820 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 90371902 90372049 90371963 Y ZNF710,CIB1,ANPEP,AP3S2 ANPEP NA NA NA NA ANPEP 15269 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr15 90379956 90380186 90379992 Y NA ANPEP NA NA NA NA ANPEP 23323 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr15 90418263 90418454 90418325 Y NA AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38 NA NA NA NA AP3S2 17120 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 90547619 90547737 90547660 Y ANPEP,IQGAP1,ZNF710 ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 4995 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 90701535 90701765 90701609 Y ZNF710,SEMA4B,IQGAP1,CIB1 SEMA4B IDH2,ZNF710,C15orf58,TTLL13,NGRN,SEMA4B,IQGAP1,CIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEMA4B 71 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 90708840 90709227 90709106 Y NA SEMA4B CIB1,C15orf58,SEMA4B,ZNF710,IDH2,TTLL13,NGRN IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEMA4B 7004 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 91190174 91190180 91190177 Y NA NA NA NA NA NA RP11-387D10.2 68192 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 91331328 91331736 91331526 Y NA NA NA NA NA NA BLM 72770 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 91973345 91973515 91973430 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA VPS33B 409512 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 92481402 92481730 92481524 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA SLCO3A1 86477 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 92612839 92613223 92613006 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA NPM1P5 213848 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 92614363 92614588 92614456 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA NPM1P5 212483 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 93347056 93347810 93347183 Y CHD2 FAM174B NA NA NA NA FAM174B 3304 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr15 93363497 93364154 93363735 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 FAM174B ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 FAM174B 12383 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr15 93374780 93375598 93375185 Y NA FAM174B,CHD2 CHD2,LOC100507217,ASB9P1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM174B 23666 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr15 96739448 96739540 96739494 Y NA NA NA NA NA NA NR2F2 127627 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 96807705 96807805 96807755 Y NA NA LOC400456 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F2 59362 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 96867031 96867104 96867071 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3 NA NA NA NA NR2F2 63 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr15 96872860 96873000 96872921 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3 NA NA NA NA NR2F2-AS1 4270 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 96898438 96898666 96898552 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3 NA NA NA NA RP11-522B15.3 2972 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 96900187 96900329 96900243 Y NR2F2,NR2F2 NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3 NA NA NA NA RP11-522B15.3 4721 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 99091450 99092159 99091603 Y NA NA IGF1R,SYNM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IGF1R 98041 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 99193577 99194531 99194069 Y IGF1R IGF1R NA NA NA NA IGF1R 3377 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr15 99395486 99396002 99395689 Y IGF1R NA NA NA NA NA IGF1R 205286 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr15 99396507 99396665 99396608 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 206307 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr15 99397047 99397167 99397105 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 206847 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 99409255 99409515 99409377 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 219055 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 99416036 99416369 99416103 Y IGF1R NA NA NA NA NA SYNM 220051 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr15 99444571 99445210 99444854 Y NA NA NA NA NA NA SYNM 191210 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr15 99450086 99450215 99450157 Y IGF1R NA NA NA NA NA SYNM 186205 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 99992993 99993428 99993097 Y MEF2A,MEF2A MEF2A MEF2A,LRRC28 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 21942 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr15 99995215 99995527 99995307 Y MEF2A,MEF2A MEF2A MEF2A,LRRC28 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 19843 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 100026499 100026994 100026794 Y MEF2A,MEF2A MEF2A MEF2A,LRRC28,LYSMD4 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 11129 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 100651295 100651582 100651483 Y NA NA NA NA NA NA LYSMD4 379529 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 101261253 101261648 101261594 Y NA NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINS 119818 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr15 101261855 101262549 101262221 Y NA NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINS 120420 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr15 101499118 101499600 101499493 Y LRRK1 LRRK1 NA NA NA NA LRRK1 41698 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr15 101787304 101787467 101787386 Y NA CHSY1,SNRPA1 NA NA NA NA CHSY1 2670 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr15 102202329 102202647 102202484 Y OR4F15 TM2D3 NA NA NA NA TM2D3 11735 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 121563 121849 121614 Y TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA RHBDF1 2505 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 124533 124922 124605 Y NA SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA MPG 84 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 151121 151408 151265 Y NA POLR3K,RHBDF1,MPG,NPRL3 NA NA NA NA MPG 26115 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 381616 381944 381764 Y NHLRC4,HAGHL,AXIN1 AXIN1,MRPL28 NA NA NA NA AXIN1 18729 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 575519 575832 575766 Y NHLRC4 PIGQ,NHLRC4 NA NA NA NA PIGQ 39163 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 578748 579156 578911 Y LUC7L PIGQ,NHLRC4 NA NA NA NA PIGQ 35839 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr16 729341 729555 729445 Y NA C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,METRN,FAM173A,HAGHL NA NA NA NA STUB1 1117 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 1133120 1133226 1133175 Y RAB40C,RAB40C,FAM195A,WDR90,CACNA1H,SSTR5 NA NA NA NA NA UBE2I 220322 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 1522812 1522824 1522818 Y MAPK8IP3,CLCN7 C16orf91,CLCN7,TELO2 NA NA NA NA CLCN7 757 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 2057211 2057401 2057386 Y NA NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 NA NA NA NA ZNF598 423 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 2057818 2059084 2058234 Y TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598 SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 NA NA NA NA ZNF598 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 2478608 2478672 2478640 Y RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2 CCNF,C16orf59,TBC1D24 NA NA NA NA CCNF 1213 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 2845811 2846048 2845884 Y OR1F1,ZNF200,ZNF200,ZNF200,MEFV,ATP6V0C,ATP6V0C,PDPK1,SRRM2 SRRM2,TCEB2 NA NA NA NA TCEB2 20513 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 2917931 2918273 2918246 Y NA FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FLYWCH2 12914 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr16 3053798 3054225 3053960 Y NA PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1,MMP25 NA NA NA NA TNFRSF12A 12221 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 3156056 3156304 3156227 Y PAQR4,OR2C1,CLUAP1,OR1F1 IL32,ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 4257 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 IL32,ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 3624 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr16 3200393 3200919 3200597 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 22615 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr16 3414643 3415237 3414919 Y NA MTRNR2L4,ZNF174 NA NA NA NA MTRNR2L4 5046 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 3996199 3996445 3996330 Y NA NA NA NA NA NA CREBBP 67472 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.62669190253125 chr16 4010667 4011135 4010934 Y CORO7 NA NA NA NA NA CREBBP 81940 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 4063476 4063638 4063556 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 100548 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 4233647 4234082 4234013 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 69461 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.97001892689844 chr16 4321625 4322178 4321908 Y ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4 TFAP4 NA NA NA NA TFAP4 549 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr16 4349200 4349352 4349284 Y NA TFAP4 ADCY9,TFAP4,CREBBP,VASN,CORO7-PAM16 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 28124 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr16 4357393 4358110 4357824 Y CORO7 TFAP4,PAM16 ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 36317 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr16 4426208 4426420 4426289 Y NA PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3 NA NA NA NA VASN 6359 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 4427155 4427449 4427262 Y NA PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3 NA NA NA NA VASN 7306 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 4587360 4587817 4587427 Y HMOX2,PPL,C16orf5,C16orf5 NMRAL1 NA NA NA NA NMRAL1 43596 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 4666118 4666710 4666381 Y NA MGRN1 NA NA NA NA MGRN1 1624 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr16 4818680 4818913 4818758 Y C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI NA NA NA NA ZNF500 3055 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr16 4985283 4985359 4985321 Y NA PPL NA NA NA NA PPL 23383 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 6560507 6560798 6560653 Y NA NA NA NA NA NA FAM86A 1414698 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 9141634 9142026 9141729 Y NA C16orf72 USP7,C16orf72 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C16orf72 41479 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 9162231 9162510 9162397 Y NA C16orf72 USP7,C16orf72 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C16orf72 20995 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr16 9171086 9171431 9171335 Y C16orf72,USP7 C16orf72 USP7,C16orf72 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C16orf72 12074 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr16 10071725 10072061 10071929 Y GRIN2A,GRIN2A,GRIN2A NA NA NA NA NA ATF7IP2 346230 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 11318108 11318467 11318211 Y NA RMI2,SOCS1 CLEC16A,SOCS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RMI2 23009 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 11409407 11409806 11409472 Y NA NA CLEC16A IMR90 Hi-C 24141950 SOCS1 61371 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 11890330 11890418 11890367 Y LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A ZC3H7A NA NA NA NA ZC3H7A 1207 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr16 11968147 11968344 11968329 Y ZC3H7A RSL1D1,GSPT1 RSL1D1 IMR90 Hi-C 24141950 RSL1D1 24705 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 12008398 12008797 12008598 Y NA GSPT1 NA NA NA NA GSPT1 459 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 14097024 14097356 14097296 Y NA NA MKL2,ERCC4,MIR193B IMR90 Hi-C 24141950 MKL2 65822 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 14397958 14398068 14398015 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 234780 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 14402100 14402342 14402181 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 238922 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 14423689 14423899 14423743 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 260511 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 15140552 15140757 15140655 Y NA NTAN1 NA NA NA NA NTAN1 7164 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 17463561 17463824 17463658 Y XYLT1 NA NA NA NA NA NOMO3 1139209 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 19707699 19708034 19707815 Y NA IQCK NA NA NA NA IQCK 17744 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 19710173 19710469 19710241 Y NA IQCK NA NA NA NA IQCK 15309 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 19894494 19895110 19894762 Y CCP110,GPRC5B GPRC5B NA NA NA NA GPRC5B 379 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 20877631 20877934 20877768 Y NA LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA LYRM1 31256 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 21295163 21295477 21295440 Y NA NA NA NA NA NA TMEM159 127465 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 22202219 22202462 22202295 Y NA EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 13141 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 22202596 22202946 22202679 Y POLR3E,CDR2 EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 12657 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr16 22406960 22407340 22407096 Y NA CDR2 POLR3E,CDR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDR2 39146 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 22767811 22767852 22767832 Y NA NA NA NA NA NA CDR2 321325 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 22835932 22836289 22836111 Y HS3ST2 NA NA NA NA NA USP31 322302 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 25060889 25061147 25061001 Y NA ARHGAP17 NA NA NA NA ARHGAP17 35902 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 25430499 25430826 25430663 Y NA NA NA NA NA NA ZKSCAN2 163247 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 27264934 27265064 27264995 Y IL4R NSMCE1 NA NA NA NA NSMCE1 13051 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 27338285 27338559 27338369 Y KIAA0556,IL4R IL4R NA NA NA NA IL4R 15296 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 27533512 27533805 27533694 Y JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1 GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 25429 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 27546889 27546978 27546937 Y NA GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 12256 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 27577101 27577365 27577280 Y NA GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA KIAA0556 17647 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 28169506 28169747 28169662 Y SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6 NA NA NA NA NA XPO6 51494 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 29283104 29283213 29283156 Y SPNS1 NA NA NA NA NA SPNS1 299562 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 29796508 29796713 29796645 Y KCTD13,C16orf92,ALDOA KIF22,MAZ,PRRT2,MVP NA NA NA NA KIF22 3327 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 30427925 30428543 30428281 Y HIRIP3,ZNF48 TBC1D10B,ZNF48,ZNF771,SNORA42,DCTPP1,SEPHS2 NA NA NA NA SNORA42 537 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 4.15892884567448 chr16 30825606 30826012 30825883 Y NA ZNF629 ZNF629,RNF40,MIR4519 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF629 29083 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 30855963 30856257 30856110 Y NA MIR4519,BCL7C,CTF1 CTF1,BCL7C,MIR762,FBXL19,FBXL19-AS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 MIR4519 28387 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 31005740 31006063 31006002 Y ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,ITGAX,ITGAM,FUS,STX4 ORAI3,SETD1A,HSD3B7,STX1B,STX4 NA NA NA NA HSD3B7 11221 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 31129616 31130225 31129940 Y ARMC5,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8 NA NA NA NA KAT8 4541 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 31888684 31889219 31888998 Y ARMC5,ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 5605 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 31905713 31906088 31906002 Y ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 22634 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 33948799 33949141 33948910 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 2065720 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 33959236 33959284 33959270 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 2076157 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 34377841 34378195 34377988 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 2494762 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 46823783 46824029 46823881 Y NA C16orf87 NA NA NA NA C16orf87 39294 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr16 47176557 47176930 47176742 Y NETO2 NETO2 NA NA NA NA NETO2 649 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 48373783 48374217 48374017 Y LONP2,N4BP1,SIAH1 NA NA NA NA NA LONP2 97576 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 49900569 49900918 49900744 Y NA NA NA NA NA NA HEATR3 196934 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 52854151 52854308 52854232 Y NA NA NA NA NA NA RP11-297L17.6 166935 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 53077641 53077824 53077723 Y NA CHD9 CHD9 IMR90 Hi-C 24141950 CHD9 9121 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 53086726 53087108 53087065 Y NA NA NA NA NA NA CHD9 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr16 53089565 53089820 53089729 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 2620 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 53124874 53125001 53124924 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 37929 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 53125869 53126178 53125948 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 38924 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 53465709 53465843 53465769 Y NA RBL2 NA NA NA NA RBL2 46 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 55544017 55544378 55544293 Y MMP2,LPCAT2 LPCAT2 NA NA NA NA LPCAT2 3107 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 56581201 56581558 56581471 Y MT3,GNAO1,BBS2 BBS2 MT1X,MT4,MT1B,NUP93,MT2A,MT1IP,MT1G,MT1H,OGFOD1,BBS2,MT3,AMFR,NUDT21,MT1A,MT1DP IMR90 Hi-C 24141950 BBS2 29006 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 56640479 56640669 56640573 Y NA MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A,MT1F NA NA NA NA MT2A 368 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 56641054 56641530 56641359 Y MT2A,MT1E MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A,MT1F NA NA NA NA MT2A 943 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 56644047 56644457 56644379 Y NLRC5,HERPUD1 MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A,MT1F NA NA NA NA MT2A 3936 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 56645516 56645845 56645554 Y MT2A,MT1M,MT1E,MT1A MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A,MT1F NA NA NA NA MT1L 3543 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 56882732 56883304 56883026 Y NA NA MIR138-2 IMR90 Hi-C 24141950 HERPUD1 80656 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 57048506 57048777 57048701 Y HERPUD1,NLRC5 NLRC5 NA NA NA NA NLRC5 27109 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 57717053 57717380 57717096 Y FAM192A,ZNF319,GPR97 NA NA NA NA NA KATNB1 50262 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 57841964 57842337 57842236 Y NA NA NA NA NA NA KIFC3 52620 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 57927623 57928192 57928041 Y GPR97,ZNF319 KIFC3 NA NA NA NA KIFC3 32666 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 65036446 65036851 65036669 Y NA NA NA NA NA NA CDH11 121164 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 65153548 65154160 65153979 Y CDH11 CDH11 NA NA NA NA CDH11 3855 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 66165018 66165370 66165247 Y NA NA LOC283867,CDH11 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00920 275057 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 66440915 66440994 66440955 Y CMTM3,CMTM3 LINC00920,BEAN1 NA NA NA NA LINC00920 488 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 66709355 66709374 66709366 Y DYNC1LI2 CMTM4 NA NA NA NA CMTM4 19236 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 66906996 66907469 66907329 Y SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2 NAE1,PDP2 NA NA NA NA NAE1 1837 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 66960903 66961306 66961106 Y PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD RRAD,FAM96B,CES2,CES3 NA NA NA NA RRAD 3356 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 66962213 66962449 66962329 Y PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD RRAD,FAM96B,CES2,CES3 NA NA NA NA FAM96B 3877 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 67561753 67561884 67561820 Y HSF4,SLC9A5,TPPP3,FAM65A ATP6V0D1,FAM65A,CTCF NA NA NA NA FAM65A 11432 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 67565199 67565482 67565398 Y C16orf70,LRRC29,LRRC29,FHOD1,PSMB10,DPEP2,DDX28,ATP6V0D1,FAM65A FAM65A,CTCF NA NA NA NA FAM65A 14878 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 67597304 67597932 67597899 Y THAP11,RLTPR,ACD FAM65A,CTCF NA NA NA NA CTCF 2994 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 68104327 68104520 68104459 Y ACD,NFATC3 DDX28,NFATC3 NA NA NA NA NFATC3 12134 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 68271348 68271876 68271591 Y TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2 ESRP2,PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA ESRP2 1343 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 3.94003785379688 chr16 68306774 68307131 68306843 Y RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7 ESRP2,PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7 NA NA NA NA SLC7A6 10341 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 68320405 68320913 68320608 Y ZFP90,SMPD3 PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P NA NA NA NA SLC7A6OS 21936 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 68503731 68504029 68503905 Y NA SMPD3 PRMT7,SMPD3 IMR90 Hi-C 24141950 SMPD3 23140 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 68532985 68533160 68533073 Y NA ZFP90,RNU4-36P SMPD3,CDH1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP90 28833 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 68544131 68544336 68544235 Y NA ZFP90,RNU4-36P SMPD3,CDH1,PRMT7,CDH3 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP90 17657 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 69432325 69432475 69432421 Y TERF2 TERF2,CYB5B NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TERF2 7999 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 69506405 69506529 69506498 Y NA CYB5B NA NA NA NA CYB5B 49977 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 69563572 69563696 69563627 Y NA NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFAT5 33301 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr16 69564577 69564882 69564731 Y WWP2 NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFAT5 32115 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr16 69603393 69603628 69603450 Y NA NFAT5 NA NA NA NA NFAT5 6396 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 69790083 69790481 69790284 Y NA NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA NOB1 3240 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.62669190253125 chr16 70461908 70462625 70462132 Y ST3GAL2 ST3GAL2,FUK NA NA NA NA ST3GAL2 8515 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 70727989 70728270 70728171 Y NA MTSS1L MTSS1L MCF7 ChIA-PET 22265404 MTSS1L 10020 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 70740989 70741599 70741286 Y NA MTSS1L NA NA NA NA MTSS1L 23020 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 70780634 70780961 70780786 Y MTSS1L NA NA NA NA NA VAC14 52103 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 70980057 70980287 70980181 Y NA NA NA NA NA NA VAC14 146993 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr16 71072056 71072175 71072116 Y NA NA NA NA NA NA VAC14 238992 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 71734305 71734386 71734346 Y PHLPP2 PHLPP2 NA NA NA NA PHLPP2 22218 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 72235988 72236216 72236077 Y AP1G1,ATXN1L,KIAA0174,DHX38 NA HPR,PMFBP1,LOC100506172 IMR90 Hi-C 24141950 TXNL4B 109658 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 72671878 72672163 72672013 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 419434 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 73023566 73023933 73023728 Y ZFHX3 NA NA NA NA NA ZFHX3 67664 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 73053285 73053647 73053466 Y NA ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 37950 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 73099840 73099940 73099875 Y ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3 IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 8243 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 73104505 73104770 73104567 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 12908 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 73159100 73159118 73159110 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 67503 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 74494901 74495019 74494960 Y NA NA NA NA NA NA RP11-252A24.2 94763 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 74777612 74777799 74777727 Y NA MLKL NA NA NA NA MLKL 44754 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 75034413 75034614 75034514 Y FA2H,ZFP1,BCAR1,BCAR1,ZNRF1 ZNRF1,WDR59 NA NA NA NA WDR59 2342 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 75045854 75046060 75045918 Y TMEM170A,MLKL ZNRF1,WDR59 NA NA NA NA WDR59 13783 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 75278988 75279894 75279594 Y CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1 BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 20057 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 75454988 75455069 75455029 Y NA CFDP1,TMEM170A NA NA NA NA CFDP1 10314 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr16 75636745 75636762 75636754 Y NA TMEM231,GABARAPL2,ADAT1,TERF2IP,KARS NA NA NA NA ADAT1 18436 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 76269107 76269317 76269211 Y NA RPL18P13 NA NA NA NA RPL18P13 1586 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 77619345 77619555 77619482 Y ADAMTS18 NA CLEC3A,ADAMTS18,VAT1L IMR90 Hi-C 24141950 NUDT7 134856 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 78090271 78090541 78090406 Y NA WWOX NA NA NA NA WWOX 40769 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 80208286 80208441 80208438 Y NA NA NA NA NA NA DYNLRB2 364190 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr16 80401381 80401567 80401473 Y NA NA WWOX IMR90 Hi-C 24141950 DYNLRB2 171064 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 80838768 80839127 80839024 Y CENPN,C16orf61,ATMIN,CDYL2 CDYL2 NA NA NA NA CDYL2 2542 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 81434776 81434850 81434813 Y NA CMIP NA NA NA NA CMIP 41925 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 81439497 81439896 81439576 Y NA CMIP NA NA NA NA CMIP 36879 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 81555726 81556034 81555821 Y CMIP NA NA NA NA NA CMIP 78951 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 81560583 81561027 81560837 Y PLCG2,CMIP,CMIP NA NA NA NA NA CMIP 83808 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 81617620 81618040 81617835 Y NA NA NA NA NA NA CMIP 140845 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 81659842 81660553 81660320 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 110149 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 82661526 82661961 82661896 Y CDH13 CDH13 NA NA NA NA CDH13 3118 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 82689057 82689347 82689181 Y NA CDH13 NA NA NA NA CDH13 30649 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr16 83069400 83069774 83069647 Y NA NA NA NA NA NA CDH13 410992 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 83480656 83480733 83480694 Y NA NA NA NA NA NA HSBP1 358715 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 83953538 83953937 83953606 Y NA MLYCD,OSGIN1 NA NA NA NA MLYCD 22807 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 84545075 84545257 84545139 Y NA NA COTL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 COTL1 104426 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 84676809 84677221 84677048 Y KIAA1609 COTL1,KLHL36 KIAA1609,COTL1,USP10,KLHL36,ZDHHC7 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL36 2910 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr16 84784930 84785133 84785062 Y KIAA0513,COTL1 NA CRISPLD2,ZDHHC7 IMR90 Hi-C 24141950 USP10 53346 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 84862837 84863219 84863017 Y CRISPLD2 CRISPLD2 NA NA NA NA CRISPLD2 11247 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 84869763 84870234 84870125 Y CRISPLD2 CRISPLD2 NA NA NA NA CRISPLD2 18173 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 85037797 85037883 85037799 Y NA ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA ZDHHC7 5258 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 85038009 85038299 85038256 Y NA ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA ZDHHC7 4842 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr16 85202555 85203049 85202710 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 143180 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 3.72114686191927 chr16 85586938 85587370 85587020 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134309 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 85623714 85624085 85623926 Y NA NA LOC727710,LOC400548,LINC00311,KIAA0182,C16orf74 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 97594 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 85648720 85648939 85648787 Y NA NA NA NA NA NA GINS2 72740 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 86417419 86417805 86417701 Y NA NA LOC400550,LOC732275,LOC146513 IMR90 Hi-C 24141950 FOXF1 124328 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 86421149 86421325 86421222 Y FOXF1,FOXC2 NA LOC400550,LOC732275,LOC146513,FOXF1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXF1 120808 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr16 86609499 86609840 86609550 Y FOXC2 MTHFSD,FOXC2,FOXL1 NA NA NA NA FOXL1 1525 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 86653031 86653193 86653112 Y NA FOXL1 FOXL1,FOXC2 IMR90 Hi-C 24141950 FOXL1 45057 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 86698129 86698417 86698281 Y NA NA FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,FOXC2,C16orf95,FBXO31 IMR90 Hi-C 24141950 FOXL1 90155 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr16 86698644 86698785 86698699 Y FOXL1 NA FOXL1,C16orf95,MTHFSD,FLJ30679,FOXC2 IMR90 Hi-C 24141950 FOXL1 90670 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 86962886 86963146 86962899 Y NA NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679 IMR90 Hi-C 24141950 FOXL1 354912 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 86964858 86965748 86965178 Y NA NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 FOXL1 356884 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.18890991877604 chr16 86985410 86985767 86985608 Y FOXC2,FOXL1 NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 FOXL1 377436 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr16 87773499 87773902 87773849 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 23696 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 87812654 87813065 87812978 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 15056 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 87839693 87840050 87839856 Y SLC7A5 KLHDC4 SLC7A5 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLHDC4 42095 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 87886258 87886670 87886593 Y MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 14424 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 88771579 88772211 88771675 Y ACSF3,ZFPM1,ZC3H18,CYBA,GALNS,CBFA2T3,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166 MVD,RNF166,CTU2 NA NA NA NA CTU2 708 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 89241276 89241597 89241419 Y NA ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 40521 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 89268043 89268411 89268231 Y NA ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 13707 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr16 89313669 89314138 89313993 Y ZNF276,ZNF778 ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 31551 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 89380978 89381130 89380989 Y ZNF276,ZNF276,SPATA2L,ANKRD11,ZNF778 NA NA NA NA NA ZNF778 98860 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 89388621 89389157 89388908 Y ZNF276,C16orf7 NA NA NA NA NA ZNF778 106503 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 89392350 89392997 89392648 Y NA NA NA NA NA NA ZNF778 110232 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr16 89451016 89451317 89451295 Y CBFA2T3,ACSF3,ZNF778,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPG7,SPATA2L,ANKRD11 NA NA NA NA NA ANKRD11 103652 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 89571786 89572109 89572034 Y ACSF3,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 16461 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr16 90143699 90144065 90143926 Y C16orf55,SPATA2L,ZNF276,C16orf7,ZNF276,TCF25 NA LOC100130015,GAS8 MCF7 ChIA-PET 22265404 DBNDD1 59163 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 424170 424290 424251 Y FAM101B,VPS53 NA NA NA NA NA RPS4XP17 134497 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 594616 594984 594846 Y NA RPS4XP17,VPS53,FAM57A NA NA NA NA VPS53 27973 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr17 595370 595681 595607 Y NA RPS4XP17,VPS53,FAM57A NA NA NA NA VPS53 27276 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 597415 597783 597745 Y NA RPS4XP17,VPS53,FAM57A NA NA NA NA VPS53 25174 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 872261 872610 872409 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 8400 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 1157102 1157245 1157179 Y NA ABR ABR,YWHAE,PITPNA,INPP5K,LOC100306951,SCARF1,RILP,TUSC5,BHLHA9,CRK,SLC43A2 IMR90 Hi-C 24141950 ABR 26787 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 1171565 1171808 1171610 Y WDR81,PITPNA,ABR,ABR ABR NA NA NA NA ABR 41250 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr17 1390195 1390341 1390268 Y MYO1C,MYO1C,MYO1C CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 3765 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.18890991877604 chr17 1391218 1391783 1391434 Y NA CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 2323 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr17 1521068 1521369 1521308 Y CRK,WDR81,HIC1,PITPNA,SLC43A2,SCARF1 SLC43A2 NA NA NA NA SLC43A2 8811 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr17 1620806 1621089 1620895 Y PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81 PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG NA NA NA NA MIR22HG 2338 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.97001892689844 chr17 1863470 1863779 1863610 Y SGSM2,SGSM2,RTN4RL1 NA NA NA NA NA DPH1 67625 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 1953067 1954207 1953327 Y TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1 DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 1241 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr17 1974774 1975359 1974921 Y SCARF1,HIC1,HIC1 DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 19326 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 1994416 1994643 1994603 Y HIC1,HIC1 HIC1 NA NA NA NA HIC1 38968 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 2040718 2040966 2040824 Y PAFAH1B1,SCARF1,WDR81 NA NA NA NA NA HIC1 85270 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 2075592 2075724 2075696 Y HIC1 NA NA NA NA NA HIC1 120144 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 2077546 2077639 2077593 Y NA NA NA NA NA NA HIC1 122098 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 2084621 2084734 2084671 Y NA NA NA NA NA NA SRR 119943 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 2095819 2096093 2095903 Y WDR81 NA NA NA NA NA SRR 108584 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 2300026 2300553 2300288 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 1859 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 2302778 2303366 2303033 Y SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT MNT NA NA NA NA MNT 366 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 2305266 2305571 2305415 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 2854 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 2409124 2409453 2409310 Y NA METTL16 NA NA NA NA METTL16 3732 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 2627618 2628097 2628087 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 133114 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 2771532 2771614 2771573 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 277028 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 3289388 3289823 3289641 Y SPATA22,SPATA22,SPATA22,SPATA22,SPATA22,ASPA,ASPA NA NA NA NA NA TRPV3 169466 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 3434973 3435247 3435131 Y ASPA,ASPA,CAMKK1,CAMKK1,TRPV1 TRPV3 NA NA NA NA TRPV3 24042 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 3672212 3672474 3672258 Y NA GSG2,ITGAE P2RX5-TAX1BP3 IMR90 Hi-C 24141950 ITGAE 30063 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 3791812 3792145 3792008 Y GSG2 C17orf85,CAMKK1 NA NA NA NA CAMKK1 4040 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 4811647 4812042 4811731 Y NA RNF167,SLC25A11,PFN1 NA NA NA NA RNF167 29261 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 6542489 6542952 6542608 Y NA TXNDC17,KIAA0753,MED31,C17orf100 NA NA NA NA KIAA0753 242 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 6655808 6656203 6655969 Y RNASEK,GABARAP,XAF1 XAF1 XAF1,MIR4520A,ALOX15P1,MIR4520B,MED31,C17orf100,FBXO39,TEKT1 IMR90 Hi-C 24141950 XAF1 563 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 6822767 6822872 6822855 Y NA NA NA NA NA NA AC027763.2 90796 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 6938707 6938851 6938779 Y NA AC027763.2,RNASEK,C17orf49,SLC16A13 NA NA NA NA SLC16A13 1313 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 7456067 7456382 7456285 Y ACAP1,WRAP53,CD68,CD68,TNFSF12 TNFSF12,TNFSF12-TNFSF13,SENP3,EIF4A1,SNORD10,CD68,MPDU1,AC113189.5,SOX15 NA NA NA NA TNFSF12-TNFSF13 5651 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 608 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.97001892689844 chr17 7745337 7745870 7745591 Y NA KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4115 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr17 7745915 7746944 7746139 Y NA KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4693 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 5769 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr17 8029634 8030116 8029995 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107 NA NA NA NA HES7 4224 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 8090038 8090540 8090163 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB NA NA NA NA C17orf59 1024 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 8095551 8095762 8095658 Y KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2 PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB NA NA NA NA C17orf59 3987 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 8103328 8103700 8103595 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,PFAS,CTC1 NA NA NA NA AURKB 8218 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr17 8600572 8600969 8600801 Y MYH10 NA MYH10,RPL26,RNF222 IMR90 Hi-C 24141950 MYH10 68493 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 8649167 8649702 8649446 Y ODF4,SPDYE4,MFSD6L,CCDC42 NA NA NA NA NA MYH10 117088 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 11928413 11928725 11928507 Y NA ZNF18,MAP2K4 NA NA NA NA MAP2K4 6272 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 13249594 13249869 13249742 Y HS3ST3A1 NA HS3ST3B1,HS3ST3A1 IMR90 Hi-C 24141950 HS3ST3A1 253375 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 13460367 13460669 13460622 Y HS3ST3A1 HS3ST3A1 NA NA NA NA HS3ST3A1 42575 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr17 14206072 14206436 14206180 Y HS3ST3B1 HS3ST3B1 NA NA NA NA HS3ST3B1 3672 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 14212324 14213048 14212775 Y HS3ST3B1 HS3ST3B1 NA NA NA NA HS3ST3B1 9924 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 14276548 14276781 14276600 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST3B1 74148 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 15153959 15154348 15154277 Y NA PMP22 NA NA NA NA PMP22 12295 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 15368147 15368483 15368202 Y NA NA NA NA NA NA CDRT1 152343 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 15849102 15849709 15849209 Y ZSWIM7,TTC19,ADORA2B ADORA2B NA NA NA NA ADORA2B 2871 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 15895023 15895192 15895111 Y NA ADORA2B,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA TTC19 5502 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 16319642 16320463 16320033 Y NA UBB NA NA NA NA UBB 37530 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 16375722 16375971 16375775 Y TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV NA NA NA NA NA UBB 93610 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 16438910 16439232 16439111 Y NA ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 31288 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.62669190253125 chr17 16440164 16440317 16440266 Y ZNF624,CCDC144A ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 30203 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr17 16487545 16487788 16487743 Y NA ZNF287,AC005822.1 NA NA NA NA ZNF287 17025 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 17597479 17598220 17598134 Y ALKBH5,FLCN,COPS3 RAI1 NA NA NA NA RAI1 14692 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 17655489 17655938 17655636 Y DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9 NA NA NA NA NA RAI1 72702 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.40780091065365 chr17 17743258 17743857 17743527 Y SMCR8 SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 4933 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr17 18865012 18865259 18865128 Y NA FAM83G NA NA NA NA FAM83G 40858 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 19398359 19398685 19398615 Y NA SLC47A1 SLC47A2,B9D1,EPN2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC47A1 1661 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 19411188 19411542 19411351 Y NA SLC47A1 EPN2,SLC47A2,B9D1,ALDH3A2,ALDH3A1,ULK2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC47A1 14490 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 19656390 19656618 19656531 Y MAPK7,MAPK7 NA NA NA NA NA ALDH3A2 106941 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 21002403 21002809 21002523 Y KCNJ18 DHRS7B USP22,C17orf103 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHRS7B 21868 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 21179100 21179414 21179208 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 6570 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr17 21189600 21190105 21189864 Y MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 NA NA NA NA MAP2K3 3616 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 25659975 25660361 25659997 Y NA WSB1 NA NA NA NA WSB1 40873 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.97001892689844 chr17 26277984 26278379 26278193 Y SEBOX NA NA NA NA NA NLK 88384 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 26718724 26718918 26718801 Y FOXN1,C17orf63,SEBOX,SARM1 POLDIP2,TMEM199,SARM1,VTN,SLC46A1 NA NA NA NA SLC46A1 13297 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 27072804 27073286 27072989 Y TRAF4 PROCA1,RAB34,RPL23A,NEK8,TLCD1,TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 3802 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 27475765 27476166 27476073 Y NEK8,PHF12 MYO18A NA NA NA NA MYO18A 29264 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr17 27482450 27482602 27482543 Y NA MYO18A NA NA NA NA MYO18A 22828 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr17 27506307 27506816 27506504 Y TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A MYO18A NA NA NA NA MYO18A 877 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr17 27568035 27568215 27568131 Y NA NA NA NA NA NA NUFIP2 50921 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 27824938 27824945 27824941 Y TIAF1,MYO18A,TAOK1,EFCAB5,ANKRD13B NA NA NA NA NA TP53I13 66125 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 27966112 27966641 27966332 Y NA GIT1,CORO6 NA NA NA NA CORO6 18187 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 28009923 28010244 28010118 Y SSH2 NA NA NA NA NA CORO6 61998 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 28041165 28041459 28041338 Y NA NA NA NA NA NA CORO6 93240 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 28258246 28258478 28258304 Y NA SSH2 NA NA NA NA SSH2 2952 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 29423002 29423667 29423241 Y NA NF1 NA NA NA NA NF1 3057 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 29596751 29597032 29596911 Y NA EVI2B,EVI2A NA NA NA NA EVI2B 42098 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 160050 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr17 29886835 29887094 29886884 Y EVI2A NA MIR4725,MIR365B IMR90 Hi-C 24141950 RAB11FIP4 170193 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 29887922 29888057 29887990 Y NA NA MIR4725,MIR365B IMR90 Hi-C 24141950 RAB11FIP4 171280 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 29895600 29896010 29895781 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 178958 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 29923737 29923924 29923895 Y EVI2A NA NA NA NA NA RAB11FIP4 207095 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 30208094 30208307 30208201 Y NA UTP6 NA NA NA NA UTP6 18477 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 30778136 30778420 30778202 Y ZNF207 PSMD11,CDK5R1 NA NA NA NA PSMD11 8857 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 30846365 30846870 30846526 Y NA CDK5R1 NA NA NA NA CDK5R1 34728 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 30954292 30954689 30954451 Y CDK5R1 NA NA NA NA NA CDK5R1 142655 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 32579434 32580053 32579676 Y CCL8,CCL7 CCL2 NA NA NA NA CCL2 251 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 32586301 32586443 32586414 Y NA CCL2 NA NA NA NA CCL2 5997 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 33349623 33350064 33349994 Y SLFN5,SLFN12L,CCT6B,ZNF830,RFFL LIG3,CCT6B NA NA NA NA CCT6B 43526 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 33572314 33572864 33572356 Y NA SLFN5 NA NA NA NA SLFN5 4259 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 33673458 33673662 33673550 Y ZNF830,RFFL,SLFN14,SLFN11,SLFN5 SLFN11 NA NA NA NA SLFN11 25058 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 34160214 34160648 34160302 Y NA MMP28,TAF15,CCL5 NA NA NA NA TAF15 25755 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 34446451 34446573 34446501 Y CCL5 NA NA NA NA NA RDM1 190674 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 35078576 35079010 35078700 Y NA NA LHX1,AATF,ACACA,MRM1,DHRS11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRM1 122575 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 35278050 35278157 35278104 Y MRM1 RP11-445F12.1,AATF LHX1,AATF MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-445F12.1 13803 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 35292129 35292558 35292512 Y ACACA,LHX1,AATF RP11-445F12.1,AATF NA NA NA NA RP11-445F12.1 169 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr17 35492690 35492856 35492817 Y NA NA NA NA NA NA AATF 188515 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 35608489 35608691 35608590 Y NA NA NA NA NA NA ACACA 156218 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 36008623 36009017 36008727 Y NA SYNRG,DDX52 SYNRG,DDX52,HNF1B,LOC284100 IMR90 Hi-C 24141950 DDX52 7130 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 36062721 36062883 36062777 Y DDX52,HNF1B NA NA NA NA NA DDX52 61228 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 36103612 36103841 36103732 Y HNF1B NA NA NA NA NA DDX52 102119 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 36412216 36412471 36412263 Y NA RP11-1407O15.2,MRPL45 NA NA NA NA RP11-1407O15.2 7387 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr17 36571646 36572076 36571709 Y C17orf96 ARHGAP23 NA NA NA NA ARHGAP23 10586 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 36859613 36860666 36860145 Y NA C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3 NA NA NA NA MLLT6 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr17 37027781 37027987 37027914 Y FBXO47,CWC25 CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1 NA NA NA NA LASP1 3669 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr17 37056956 37057300 37057070 Y NA SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1 NA NA NA NA LASP1 32844 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 37896808 37897181 37897022 Y GRB7,GRB7,GRB7,GRB7 PGAP3,MIEN1,GRB7 NA NA NA NA GRB7 4628 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 37910411 37911394 37910787 Y FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3 MIEN1,GRB7 NA NA NA NA GRB7 18231 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr17 38085522 38085789 38085697 Y ERBB2,IKZF3,ORMDL3 ORMDL3,PSMD3 NA NA NA NA ORMDL3 3668 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 38264417 38264842 38264667 Y WIPF2,RARA,RARA,NR1D1 MED24,NR1D1,MSL1,CASC3 NA NA NA NA NR1D1 9439 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 38601076 38601487 38601191 Y GJD3,IGFBP4 TOP2A,IGFBP4 NA NA NA NA IGFBP4 3374 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 38674878 38675250 38674921 Y TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4 NA IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IGFBP4 77176 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 39218168 39218609 39218458 Y NA KRTAP1-5 NA NA NA NA KRTAP1-5 36714 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 39653134 39653351 39653234 Y NA KRT19 NA NA NA NA KRT19 29209 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 39683248 39683750 39683386 Y NA KRT19 NA NA NA NA KRT19 688 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 39686458 39686891 39686666 Y KRT19 KRT19 NA NA NA NA KRT19 3898 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr17 39703664 39703881 39703736 Y NA KRT19 NA NA NA NA KRT19 21104 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 39703962 39704520 39704217 Y NA KRT19 NA NA NA NA KRT19 21402 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 39705098 39705383 39705310 Y NA KRT19 NA NA NA NA KRT19 22538 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 39822130 39822941 39822323 Y NA EIF1 KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 20196 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 39949517 39949745 39949566 Y KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP JUP,LEPREL4,FKBP10 NA NA NA NA JUP 8334 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 40155760 40155995 40155877 Y STAT5A CNP,NKIRAS2,DNAJC7 NA NA NA NA NKIRAS2 5405 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 40573451 40573881 40573544 Y AOC3,GHDC,PLEKHH3,NAGLU,PTRF STAT3,ATP6V0A1 NA NA NA NA PTRF 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 40670495 40670831 40670653 Y WNK4,RAB5C,PTRF AC067852.1,NAGLU,COASY,MLX NA NA NA NA AC067852.1 905 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 40671173 40671319 40671240 Y PTRF AC067852.1,NAGLU,COASY,MLX NA NA NA NA AC067852.1 417 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr17 40805539 40806065 40805782 Y NA TUBG1,FAM134C,TUBG2,PLEKHH3,CNTNAP1 NA NA NA NA TUBG2 3258 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 41409196 41409569 41409556 Y TMEM106A TMEM106A IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM106A 47342 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 41656262 41656390 41656311 Y G6PC3 ETV4 DHX8,MIR2117,MPP2 IMR90 Hi-C 24141950 ETV4 1274 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr17 41669625 41669874 41669775 Y NA ETV4 LOC100130581,ARL4D,DHX8,ETV4,DUSP3,SOST,C17orf105,MEOX1 IMR90 Hi-C 24141950 ETV4 14637 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 41778909 41778996 41778931 Y NA NA MPP2,LOC100130581,MPP3,MEOX1,DUSP3,DHX8,ARL4D,MIR2117,ETV4,C17orf105,SOST,CD300LG IMR90 Hi-C 24141950 DUSP3 75360 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 42173050 42173151 42173101 Y TMEM101,G6PC3 LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25919 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 3.28336487816406 chr17 42620927 42621257 42621090 Y FZD2 GPATCH8,FZD2 GPATCH8,FZD2,ITGA2B,DBF4B,C17orf104,CCDC43 IMR90 Hi-C 24141950 FZD2 11668 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 42624253 42624886 42624582 Y TMUB2,TMUB2,GRN GPATCH8,FZD2 GPATCH8,FZD2,ITGA2B,DBF4B,C17orf104,CCDC43 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FZD2 8039 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr17 42634020 42634172 42634095 Y TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2 FZD2 NA NA NA NA FZD2 1095 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr17 42797981 42798248 42798116 Y CCDC43 CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1 NA NA NA NA RP11-1072C15.1 2016 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr17 43018379 43018606 43018493 Y NA CCDC103,EFTUD2,FAM187A,KIF18B,C1QL1 NA NA NA NA KIF18B 4476 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 43201428 43201633 43201517 Y NA ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2 NA NA NA NA ACBD4 6334 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr17 43302645 43302970 43302880 Y NA FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 5834 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 43305165 43306978 43306453 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 8354 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 43398309 43398621 43398414 Y NA MAP3K14 LOC100133991,FMNL1,MAP3K14,TEX34,ARHGAP27 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K14 5895 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 43449108 43449433 43449167 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K14 56694 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 44113965 44114105 44114069 Y KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA PLEKHM1 547850 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 44155479 44155559 44155517 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHM1 589364 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 44198056 44198387 44198212 Y STH,KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA RPS7P11 599146 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 44240473 44240874 44240856 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 556659 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 44344171 44344471 44344293 Y NA NA KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RPS7P11 453062 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr17 44848812 44849347 44849259 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 51279 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr17 45356357 45357027 45356891 Y NA ITGB3 NA NA NA NA ITGB3 27094 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 45609469 45609601 45609554 Y NA NPEPPS NA NA NA NA NPEPPS 11161 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr17 45717975 45718065 45718017 Y NA KPNB1 NA NA NA NA KPNB1 6777 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 46289129 46289412 46289274 Y NA NA NA NA NA NA SNX11 110410 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 46643791 46644035 46643913 Y NA HOXB-AS1,HOXB2,HOXB4,HOXB6,HOXB8 NA NA NA NA HOXB4 11438 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 46647653 46647800 46647722 Y HOXB5,HOXB2,HOXB4,HOXB3 HOXB-AS1,HOXB2,HOXB4,HOXB6,HOXB8 NA NA NA NA HOXB4 7673 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr17 46648538 46649382 46648794 Y NA HOXB-AS1,HOXB2,HOXB4,HOXB6,HOXB8 NA NA NA NA HOXB4 6091 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr17 46654606 46654947 46654902 Y NA HOXB-AS1,HOXB2,HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB9 NA NA NA NA HOXB4 526 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr17 46662223 46662405 46662377 Y NA HOXB-AS1,HOXB2,HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7 NA NA NA NA HOXB4 6750 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 46680378 46680812 46680678 Y NA HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17 NA NA NA NA HOXB6 24 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 47049793 47049986 47049890 Y IGF2BP1,SNF8 SNF8,RNU1-42P,IGF2BP1 IGF2BP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IGF2BP1 22788 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.40780091065365 chr17 47081384 47081547 47081466 Y NA IGF2BP1 NA NA NA NA IGF2BP1 8610 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 47270202 47270509 47270359 Y CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3 PHOSPHO1 NA NA NA NA PHOSPHO1 35619 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr17 47913501 47913854 47913589 Y TMEM92 KAT7,FAM117A,RP11-613C6.4 NA NA NA NA RP11-613C6.4 42796 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 48105016 48105270 48105136 Y XYLT2,LRRC59,ITGA3 DLX3,ITGA3 LOC284080,ITGA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 ITGA3 26062 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 48139711 48140314 48140012 Y XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3 ITGA3,PDK2 NA NA NA NA ITGA3 8379 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 48228924 48229616 48229504 Y SPATA20,SAMD14 SAMD14,PPP1R9B,COL1A1 NA NA NA NA PPP1R9B 2933 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 48251038 48251269 48251124 Y XYLT2,LRRC59,COL1A1 SAMD14,PPP1R9B,COL1A1 NA NA NA NA PPP1R9B 25047 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 48255388 48256117 48255676 Y NA PPP1R9B,COL1A1 NA NA NA NA COL1A1 20876 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 48282931 48283079 48283012 Y COL1A1,TMEM92 COL1A1 SGCA,HILS1 IMR90 Hi-C 24141950 COL1A1 5938 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 48290532 48290619 48290576 Y NA COL1A1 PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2 IMR90 Hi-C 24141950 COL1A1 13539 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 48294109 48294288 48294184 Y NA COL1A1 XYLT2,ITGA3,PDK2,PPP1R9B,HILS1,SGCA,COL1A1,LOC284080,SAMD14,TMEM92 IMR90 Hi-C 24141950 COL1A1 17116 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 48647987 48648149 48648104 Y NA SPATA20 NA NA NA NA SPATA20 29568 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 48716257 48716537 48716480 Y NA ABCC3 NA NA NA NA ABCC3 6119 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr17 49031638 49031879 49031784 Y NA NA NA NA NA NA TOB1 88299 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 49196679 49197214 49196965 Y NA SPAG9,NME1,NME1-NME2,NME2 NA NA NA NA SPAG9 453 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 50177703 50178036 50177905 Y CA10 NA NA NA NA NA UTP18 841814 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 53017345 53017570 53017451 Y TOM1L1 TOM1L1,STXBP4,COX11 NA NA NA NA STXBP4 26518 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 54263832 54264049 54263912 Y NA NA NA NA NA NA NOG 405011 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 54558441 54558834 54558449 Y ANKFN1 NA NA NA NA NA NOG 110226 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 54947312 54947763 54947640 Y SCPEP1,TRIM25 DGKE,C17orf67,TRIM25 NA NA NA NA C17orf67 33178 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 54987224 54987877 54987630 Y SCPEP1,TRIM25 TRIM25,COIL NA NA NA NA TRIM25 1522 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 54993018 54993544 54993286 Y SCPEP1,TRIM25 TRIM25,COIL DGKE MCF7 ChIA-PET 22265404 TRIM25 3619 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 55801190 55801558 55801374 Y NA NA MSI2,AKAP1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS23 123859 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 55912487 55912699 55912681 Y NA MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 12718 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 55970352 55970806 55970481 Y SUPT4H1,VEZF1 MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 44935 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 56023350 56023692 56023525 Y NA CUEDC1,VEZF1 CUEDC1,VEZF1 IMR90 Hi-C 24141950 CUEDC1 6992 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 56413212 56413667 56413409 Y VEZF1,MPO,MTMR4,SUPT4H1 SUPT4H1 NA NA NA NA SUPT4H1 14787 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 56600012 56600151 56600118 Y DYNLL2,OR4D2,SEPT4,SEPT4 MTMR4 NA NA NA NA MTMR4 6746 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 57231102 57231481 57231293 Y C17orf71 TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA PRR11 242 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 57502934 57503327 57503130 Y YPEL2 NA YPEL2 IMR90 Hi-C 24141950 YPEL2 95884 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 57505453 57505591 57505508 Y YPEL2 NA YPEL2,GDPD1 IMR90 Hi-C 24141950 YPEL2 98403 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 57831888 57832338 57832062 Y VMP1,RNFT1 VMP1,PTRH2 NA NA NA NA PTRH2 48901 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr17 57839956 57840355 57840071 Y RNFT1 NA NA NA NA NA PTRH2 56969 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 57841314 57841767 57841379 Y NA NA NA NA NA NA PTRH2 58327 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 57860256 57860659 57860446 Y DHX40,VMP1,CA4 NA NA NA NA NA MIR21 55968 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 57862470 57862813 57862554 Y NA NA NA NA NA NA MIR21 53814 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 57863159 57864676 57863979 Y NA NA NA NA NA NA MIR21 51951 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.18890991877604 chr17 57902814 57903248 57902913 Y YPEL2,VMP1,RNFT1 MIR21 NA NA NA NA MIR21 13379 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 57906379 57907270 57906882 Y RNFT1 MIR21 NA NA NA NA MIR21 9357 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.40780091065365 chr17 57907420 57907736 57907558 Y NA MIR21 NA NA NA NA MIR21 8891 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr17 57908316 57908645 57908515 Y NA MIR21 NA NA NA NA MIR21 7982 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 57922999 57923843 57923122 Y PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6 MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 6372 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 57929068 57929265 57929192 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 12441 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.97001892689844 chr17 57962596 57962816 57962625 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA TUBD1 5488 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 59391895 59392060 59391978 Y NA NA NA NA NA NA TBX2 83197 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 59473431 59474098 59473741 Y TBX2,C17orf82 TBX2 NA NA NA NA TBX2 1159 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 59843979 59844190 59844083 Y NA NA NA NA NA NA BRIP1 94692 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 60085676 60086036 60086030 Y NACA2,MED13 NA NA NA NA NA MED13 54607 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 60868640 60868941 60868827 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 165878 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 60897286 60897580 60897414 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 194524 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 61043121 61043648 61043243 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 340359 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 61299362 61299669 61299468 Y MAP3K3 NA MIR548W,DCAF7,MARCH10 IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 222070 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 62339620 62339793 62339707 Y CEP95 TEX2 NA NA NA NA TEX2 959 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 62534383 62534677 62534525 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA DDX5 32066 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 62675748 62676312 62676051 Y SMURF2 SMURF2 SMURF2,LOC146880 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMURF2 19562 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 62703261 62703596 62703473 Y SMURF2 SMURF2 SMURF2 IMR90 Hi-C 24141950 SMURF2 47075 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 62705157 62705447 62705234 Y SMURF2 SMURF2 SMURF2 IMR90 Hi-C 24141950 SMURF2 48971 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 63038886 63039290 63039133 Y GNA13 GNA13 NA NA NA NA GNA13 11667 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 63119249 63119621 63119552 Y GNA13 NA RGS9,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNA13 68292 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 63572001 63572117 63572059 Y NA NA NA NA NA NA GNA13 521044 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 63639930 63640399 63640359 Y NA NA NA NA NA NA CEP112 545803 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 63645833 63645846 63645840 Y NA NA NA NA NA NA CEP112 540356 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 64194072 64194322 64194164 Y NA CEP112 NA NA NA NA CEP112 7870 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 64301184 64301397 64301241 Y NA PRKCA NA NA NA NA PRKCA 4430 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 64455929 64456369 64456061 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 159175 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 64463185 64463416 64463350 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 166431 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 64503657 64504241 64503882 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 206903 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 64536278 64536639 64536325 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 239524 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 65516763 65517072 65516877 Y PITPNC1 NA NOL11 IMR90 Hi-C 24141950 PITPNC1 145188 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr17 66016382 66016768 66016696 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 12867 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 66452519 66452682 66452605 Y SLC16A6,WIPI1 WIPI1 NA NA NA NA WIPI1 865 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 66509186 66509763 66509535 Y SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A PRKAR1A NA NA NA NA PRKAR1A 3265 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 68118896 68119283 68118909 Y NA NA NA NA NA NA MAP2K6 710057 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 68340579 68340874 68340665 Y KCNJ2 NA NA NA NA NA MAP2K6 931740 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 69068010 69068257 69068112 Y NA NA NA NA NA NA LOC124685 546862 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 69617489 69617539 69617508 Y NA LOC124685 LOC100499467 IMR90 Hi-C 24141950 LOC124685 2370 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 70147771 70147892 70147832 Y NA SOX9 SOX9,LOC100499467 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SOX9 32610 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 70587266 70587776 70587444 Y NA RPL32P33 NA NA NA NA RPL32P33 33594 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 70610080 70610203 70610142 Y NA RPL32P33 LOC100499467 MCF7 ChIA-PET 22265404 RPL32P33 11167 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 70680022 70680249 70680147 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 58652 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 71139042 71139706 71139380 Y NA SSTR2,COG1 SLC39A11,COG1 IMR90 Hi-C 24141950 SSTR2 19445 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 71227425 71227646 71227536 Y NA COG1,C17orf80,FAM104A NA NA NA NA C17orf80 1053 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 71301216 71301553 71301269 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 4761 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 71304431 71304616 71304518 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 1698 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 71305759 71306422 71306099 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP4 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 71338137 71338558 71338458 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 31823 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr17 71339324 71339501 71339471 Y SSTR2,CDC42EP4 CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 33010 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 72686594 72686880 72686692 Y TTYH2,CD300A,CD300LB,CD300C,CD300LD,TMEM104,SLC16A5,CD300E,CD300LF NA NA NA NA NA SLC9A3R1 55911 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 72978355 72978661 72978434 Y KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CDR2L 3066 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr17 73007918 73008254 73008160 Y RAB37,GRIN2C,FADS6,C17orf28,CDR2L,SUMO2,KCTD2,ARMC7 CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H NA NA NA NA ICT1 1153 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 73009835 73009966 73009891 Y NA CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H NA NA NA NA ICT1 3070 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 73074678 73074996 73074848 Y LLGL2,C17orf28,ARMC7 KCTD2,ATP5H,SLC16A5,ARMC7 NA NA NA NA SLC16A5 6826 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 73426423 73426691 73426652 Y MRPS7 GRB2,KIAA0195 NA NA NA NA KIAA0195 8549 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 73641652 73641951 73641723 Y CASKIN2,LLGL2,FOXJ1,EVPL,LOC100130933 SAP30BP,RECQL5 NA NA NA NA SAP30BP 19245 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 73696530 73696897 73696707 Y SAP30BP,ITGB4,ITGB4 SAP30BP,RECQL5,ITGB4 NA NA NA NA ITGB4 18511 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 73868951 73869202 73869040 Y TRIM47 WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38 NA NA NA NA TRIM47 3454 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 74186019 74186269 74186124 Y NA ATF4P3,RNF157 NA NA NA NA ATF4P3 34618 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 74705254 74705618 74705431 Y MXRA7 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA MXRA7 156 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr17 74865730 74865894 74865782 Y CYGB,MGAT5B MGAT5B NA NA NA NA MGAT5B 3192 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 75086431 75086552 75086490 Y NA LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 5633 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 75120383 75120864 75120582 Y JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 39585 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 75251434 75251777 75251766 Y NA NA SEPT9,SRSF2,METTL23,MFSD11,SEC14L1,MGAT5B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00338,SEC14L1 170636 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 75281811 75282557 75281917 Y SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 201013 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr17 75284936 75285118 75285041 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 204138 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 75318595 75318736 75318679 Y SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 237797 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 75319028 75319523 75319372 Y SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 238230 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 75319670 75320031 75319742 Y MGAT5B,SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 238872 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr17 75321712 75322201 75321955 Y SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 240914 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 75387909 75388384 75388205 Y SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 307111 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 75667082 75667363 75667223 Y NA NA TNRC6C,FLJ45079,LOC100507351 IMR90 Hi-C 24141950 SYNGR2 495276 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA NA TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SYNGR2 207843 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 4.81560182130729 chr17 76312866 76313241 76313131 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3 SOCS3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SOCS3 40917 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 76337607 76338208 76338068 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 15950 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 76338337 76338836 76338651 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 15322 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 76348964 76349371 76349046 Y USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 4787 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr17 76408553 76408928 76408780 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 PGS1 NA NA NA NA PGS1 35832 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 76412850 76413399 76413170 Y CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1 PGS1 NA NA NA NA PGS1 40129 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 76879876 76880180 76879977 Y NA USP36,TIMP2 NA NA NA NA TIMP2 39289 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 76930060 76930674 76930419 Y NA TIMP2,LGALS3BP TIMP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TIMP2 10591 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 76992140 76992468 76992317 Y NA LGALS3BP,CANT1,C1QTNF1 NA NA NA NA CANT1 11481 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 77032690 77033106 77032818 Y CYTH1,ENGASE CANT1,C1QTNF1,ENGASE NA NA NA NA C1QTNF1 15794 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 77034665 77035262 77034914 Y CYTH1,USP36,ENGASE CANT1,C1QTNF1,ENGASE NA NA NA NA C1QTNF1 17769 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 77776510 77776898 77776679 Y CCDC40 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 3028 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr17 77778056 77778248 77778123 Y CBX2,CBX8 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 4574 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 77787297 77787609 77787349 Y NA CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 13815 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV NA NA NA NA ENDOV 41238 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 3.72114686191927 chr17 78735331 78735538 78735429 Y NA NA NA NA NA NA RPTOR 218712 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 78763390 78763671 78763525 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 199727 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 78806684 78807307 78807121 Y C17orf56 NA NA NA NA NA CHMP6 156091 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr17 78830209 78830686 78830492 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 132712 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 78901796 78901941 78901869 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 61457 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 79017666 79018027 79017910 Y AZI1,BAIAP2 BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 10718 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr17 79024187 79024380 79024262 Y BAIAP2 BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 17239 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr17 79068878 79069252 79068906 Y C17orf56 NA NA NA NA NA BAIAP2 61930 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 79228717 79229006 79228862 Y NA AZI1,C17orf89,SLC38A10 NA NA NA NA C17orf89 17678 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 79319325 79319648 79319507 Y FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 51978 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr17 79319812 79320225 79320116 Y FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 52465 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 79360408 79361324 79361141 Y ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10 NA NA NA NA NA SLC38A10 93061 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 79369574 79370687 79370597 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A10 102227 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 79370754 79371569 79371407 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A10 103407 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 79397073 79397461 79397298 Y MAFG,MAFG,NPLOC4,HGS NA NA NA NA NA RP13-766D20.1 80628 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 79979263 79979824 79979465 Y NA ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR,GPS1,RFNG,DUS1L NA NA NA NA LRRC45 85 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 80056613 80056910 80056718 Y C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 2405 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr17 80132206 80132561 80132393 Y NA CCDC57 NA NA NA NA CCDC57 36145 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 80199457 80199968 80199484 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA SLC16A3 15184 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 80245965 80246238 80246057 Y MAFG,MAFG,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1 CSNK1D,SECTM1 CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1D 16358 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr17 80454894 80455238 80455175 Y LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 20351 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr17 81066773 81067186 81066924 Y NA METRNL NA NA NA NA METRNL 31206 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr17 81067352 81067511 81067418 Y NA METRNL NA NA NA NA METRNL 31785 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr18 781638 782117 782009 Y NA RNU1-109P,YES1 NA NA NA NA RNU1-109P 14019 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 2302701 2302761 2302738 Y NA NA NA NA NA NA METTL4 266747 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr18 3594733 3596177 3595596 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 185127 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 3623872 3624258 3624140 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214266 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 3624338 3624601 3624482 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214732 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr18 3624841 3625119 3625035 Y MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 215235 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr18 3625326 3625427 3625380 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 215720 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 3639477 3639730 3639610 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 229871 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 5895274 5895803 5895585 Y TMEM200C NA L3MBTL4 IMR90 Hi-C 24141950 EPB41L3 266575 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr18 8948545 8948913 8948824 Y TWSG1 NA CCDC165 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 151715 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr18 8949015 8949649 8949122 Y TWSG1 NA CCDC165 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 150979 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 9604214 9604566 9604459 Y NA PPP4R1 NA NA NA NA PPP4R1 8672 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 9613164 9613539 9613352 Y NA NA NA NA NA NA PPP4R1 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 9771568 9771961 9771765 Y RAB31 NA NA NA NA NA RAB31 65406 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 9828298 9828524 9828428 Y RALBP1,PPP4R1,VAPA,RAB31 NA TXNDC2,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 83475 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 9914998 9915501 9915128 Y PPP4R1,RAB31,VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 2999 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr18 10528233 10528593 10528264 Y NA NAPG NA NA NA NA NAPG 4331 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 10708268 10708433 10708298 Y NA NA NA NA NA NA NAPG 184366 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 10766591 10766813 10766750 Y NA NA NA NA NA NA NAPG 242689 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 11005597 11005922 11005792 Y NA NA NA NA NA NA NAPG 481695 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr18 11947272 11947721 11947412 Y CHMP1B MPPE1,IMPA2 IMPA2,GNAL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IMPA2 31303 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr18 12288068 12288497 12288213 Y NA TUBB6 TUBB6 IMR90 Hi-C 24141950 TUBB6 17171 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr18 12347442 12347507 12347473 Y CEP76,AFG3L2 TUBB6,AFG3L2 NA NA NA NA AFG3L2 27806 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 12679329 12679437 12679359 Y NA SPIRE1,PSMG2,CEP76 NA NA NA NA CEP76 21339 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 15197632 15197837 15197824 Y NA NA NA NA NA NA FAM210A 1472970 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 18511418 18511662 18511487 Y NA NA NA NA NA NA ROCK1 178150 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr18 18512291 18512341 18512327 Y NA NA NA NA NA NA ROCK1 177471 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr18 18517849 18518397 18517887 Y NA NA NA NA NA NA ROCK1 171415 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 19746222 19746392 19746310 Y GATA6 GATA6 NA NA NA NA GATA6 1012 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr18 19774212 19774351 19774284 Y GATA6 GATA6 NA NA NA NA GATA6 26808 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 19862450 19862773 19862669 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 GATA6 115046 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 20046739 20046926 20046743 Y GATA6 NA GATA6,CTAGE1 IMR90 Hi-C 24141950 GATA6 299335 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 20139802 20140256 20140003 Y GATA6 NA CTAGE1,GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 235968 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr18 20247997 20248388 20248215 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 127836 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr18 20274994 20275099 20275066 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 101125 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr18 20855209 20855599 20855401 Y NA NA NA NA NA NA CABLES1 142681 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr18 21153994 21154335 21154180 Y NA NPC1 NA NA NA NA NPC1 10527 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 21228672 21228807 21228737 Y LAMA3,ANKRD29 ANKRD29 NA NA NA NA ANKRD29 12042 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr18 21337339 21337459 21337412 Y C18orf45 NA NA NA NA NA ANKRD29 96490 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 21417655 21417852 21417722 Y NPC1,LAMA3 NA NA NA NA NA TTC39C 152885 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr18 21780839 21781231 21781002 Y OSBPL1A NA NA NA NA NA CABYR 63897 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 25502058 25502147 25502103 Y CDH2 NA NA NA NA NA CDH2 253263 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr18 25623626 25623889 25623758 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 131521 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 25645418 25645770 25645581 Y CDH2 NA NA NA NA NA CDH2 109640 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 26744101 26744374 26744185 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 988691 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 29092491 29092685 29092630 Y DSC3,DSC2,DSG1,DSG2 DSG2 NA NA NA NA DSG2 16485 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 29599439 29599921 29599769 Y RNF138,RNF138,TRAPPC8,RNF125 NA NA NA NA NA TRAPPC8 68340 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 32239709 32239834 32239782 Y MAPRE2,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA NA NA NA NA NA DTNA 168455 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 32990022 32990156 32990089 Y NA ZNF396 GALNT1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF396 34721 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr18 33038926 33039146 33039052 Y NA INO80C NA NA NA NA INO80C 36809 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 33042995 33043415 33043130 Y MAPRE2 INO80C NA NA NA NA INO80C 32540 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 33093148 33093751 33093628 Y GALNT1 INO80C NA NA NA NA INO80C 17193 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr18 33275532 33275916 33275719 Y NA NA NA NA NA NA GALNT1 116451 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 33311016 33311295 33311162 Y NA NA NA NA NA NA GALNT1 151935 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 35063649 35063942 35063793 Y NA NA NA NA NA NA TPGS2 656491 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 38655284 38655543 38655423 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C3 877628 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 43363455 43363582 43363533 Y NA NA SIGLEC15,EPG5,SLC14A1,SLC14A2 IMR90 Hi-C 24141950 EPG5 181658 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr18 43407687 43408063 43407797 Y PSTPIP2,EPG5 NA NA NA NA NA EPG5 137177 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr18 43542357 43542726 43542619 Y PSTPIP2,C18orf25,EPG5 EPG5 NA NA NA NA EPG5 2514 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 43543003 43543287 43543010 Y PSTPIP2,EPG5 EPG5 NA NA NA NA EPG5 1953 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 44931810 44931838 44931816 Y TCEB3B NA NA NA NA NA IER3IP1 231065 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 45687716 45687836 45687757 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232201 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 45688048 45688324 45688110 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232533 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 46066779 46067121 46067052 Y CTIF CTIF NA NA NA NA CTIF 3362 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr18 46074456 46074621 46074556 Y NA CTIF NA NA NA NA CTIF 11039 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 46428346 46428737 46428479 Y NA SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 46344 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 46455103 46455621 46455353 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 19460 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 46456597 46456819 46456703 Y SMAD7,SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 18262 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr18 46465508 46465942 46465798 Y SMAD7,SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 9139 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr18 46502180 46502412 46502333 Y SMAD7 SMAD7 SMAD7,CTIF MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SMAD7 27099 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 46520518 46520924 46520659 Y NA SMAD7 CTIF,SMAD7,DYM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD7 45437 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 47252630 47252839 47252704 Y LIPG NA ACAA2,SCARNA17,MYO5B,LIPG IMR90 Hi-C 24141950 ACAA2 85491 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr18 48721492 48722312 48721913 Y SMAD4,MEX3C MEX3C NA NA NA NA MEX3C 20362 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 51013905 51013920 51013913 Y NA NA NA NA NA NA MBD2 735238 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 53060777 53060994 53060923 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 269024 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 53072982 53073437 53073370 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 256581 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 53204965 53205096 53205075 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 124922 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 55105190 55105288 55105239 Y ST8SIA3,ONECUT2 NA NA NA NA NA FECH 146716 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 55448232 55448442 55448350 Y NA ATP8B1 NA NA NA NA ATP8B1 19891 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 55513608 55513807 55513708 Y NA ATP8B1 ATP8B1,NEDD4L,ALPK2 IMR90 Hi-C 24141950 ATP8B1 45275 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 55922134 55922493 55922309 Y NA NA NA NA NA NA NEDD4L 212535 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 56159165 56159246 56159180 Y NA NA NA NA NA NA SNORD28 106617 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 56161690 56161866 56161857 Y MALT1 NA NA NA NA NA SNORD28 103997 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 56193191 56193601 56193321 Y MALT1 NA NA NA NA NA SNORD28 72262 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr18 56206749 56207237 56207038 Y MALT1 NA NA NA NA NA SNORD28 58626 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 56248728 56248836 56248808 Y NA SNORD28,ALPK2 NA NA NA NA SNORD28 17027 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 57552932 57553277 57553219 Y PMAIP1 PMAIP1 PMAIP1 K562 ChIA-PET 22265404 PMAIP1 11903 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 60193382 60194139 60194065 Y KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 5142 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr18 61121848 61122109 61121956 Y SERPINB10,SERPINB12,SERPINB5 VPS4B,SERPINB5 NA NA NA NA SERPINB5 19885 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr18 61642248 61642613 61642430 Y NA HMSD,SERPINB8 NA NA NA NA SERPINB8 7089 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 65781416 65781525 65781473 Y NA NA TMX3 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC102B 598921 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 67957012 67957306 67957264 Y NA SOCS6 NA NA NA NA SOCS6 2875 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 70535937 70536272 70536159 Y NA NETO1 NA NA NA NA NETO1 2556 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 72782580 72783607 72783115 Y ZNF407,ZADH2,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 135696 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 73201827 73202008 73201925 Y NA NA ZNF407,TSHZ1 IMR90 Hi-C 24141950 TSHZ1 281117 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr18 74277239 74277430 74277301 Y NA NA NA NA NA NA RP11-17M16.1 71762 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 74292470 74292738 74292612 Y NA NA NA NA NA NA RP11-17M16.1 86993 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr18 74779066 74780013 74779875 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 246503 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 74823541 74824614 74824455 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 290978 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 74830215 74830809 74830560 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 297652 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr18 76831132 76831674 76831321 Y NFATC1,NFATC1,ATP9B ATP9B NA NA NA NA ATP9B 3847 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr18 77218531 77218849 77218576 Y NFATC1,CTDP1 NA NA NA NA NA NFATC1 64675 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 290136 290651 290316 Y RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C PPAP2C NA NA NA NA PPAP2C 743 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 678997 679265 679214 Y HCN2,PALM POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM NA NA NA NA FSTL3 4605 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 752652 753043 752777 Y PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21 PALM,PTBP1,MIR4745 NA NA NA NA PTBP1 42032 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 753188 753320 753238 Y C19orf20 PALM,PTBP1,MIR4745 NA NA NA NA PTBP1 41755 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 778993 779222 779048 Y GPX4,BSG,CNN2 PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 15853 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 782330 783005 782707 Y NA PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 12070 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 6.56672975632813 chr19 933164 933556 933549 Y NA MED16,R3HDM4,KISS1R,ARID3A,WDR18 NA NA NA NA ARID3A 9383 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 1028160 1028923 1028240 Y SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7 WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7 NA NA NA NA CNN2 3862 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 1101850 1102062 1101942 Y C19orf6,MIDN,HMHA1,SBNO2,SBNO2 POLR2E NA NA NA NA GPX4 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 1140329 1140530 1140433 Y NA POLR2E,GPX4,SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 31752 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 1169743 1170349 1170015 Y NA SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 1933 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 1171933 1172315 1172045 Y NA STK11 NA NA NA NA SBNO2 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr19 1172839 1173266 1172915 Y CFD,ATP5D,GPX4,GPX4 SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 557 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 1183874 1184237 1184064 Y SBNO2 SBNO2,STK11 ATP5D,MIDN,SBNO2,STK11,GPX4 MCF7 ChIA-PET 22265404 STK11 3169 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 1189532 1189666 1189566 Y NA SBNO2,STK11,C19orf26 NA NA NA NA STK11 2126 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 1262305 1262850 1262469 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA CIRBP 4921 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 1266359 1266798 1266589 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA C19orf24 6228 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 1408607 1408695 1408655 Y CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15 NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 3039 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 1445282 1445452 1445336 Y C19orf26,EFNA2,MUM1,APC2 GAMT,DAZAP1,RPS15,C19orf25,REEP6 NA NA NA NA RPS15 8924 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 1942393 1942508 1942451 Y OAZ1,DOT1L,C19orf35,MOBKL2A,MKNK2,REXO1,KLF16,CSNK1G2 SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2 NA NA NA NA CSNK1G2 3205 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 2056461 2056895 2056707 Y OAZ1,C19orf35,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 7218 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 2061356 2061737 2061654 Y SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 12113 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr19 2524971 2525260 2525066 Y NA NA NA NA NA NA GADD45B 50851 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 2540691 2541097 2540881 Y TIMM13 NA NA NA NA NA GADD45B 66571 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr19 2599036 2599584 2599134 Y DOT1L,GADD45B NA NA NA NA NA DIRAS1 119832 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 3035530 3035851 3035686 Y NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2 AES NA NA NA NA AES 25254 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 3154006 3154458 3154241 Y GNA15,FZR1,S1PR4 NCLN NA NA NA NA NCLN 29103 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 3367171 3367852 3367502 Y NFIC,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 9610 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 3369394 3369884 3369615 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 11833 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 3555158 3555442 3555300 Y C19orf28 HMG20B,MFSD12,TBXA2R NA NA NA NA HMG20B 15333 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 3562421 3562565 3562489 Y NA HMG20B,MFSD12,TBXA2R NA NA NA NA HMG20B 8210 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 3655813 3656105 3655965 Y NA PIP5K1C NA NA NA NA PIP5K1C 42372 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr19 4008398 4008778 4008498 Y MATK,ZFR2,ATCAY DAPK3,SNORD37,EEF2,PIAS4 NA NA NA NA PIAS4 2754 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 4053092 4053572 4053301 Y CCDC94,ZBTB7A PIAS4,ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 11371 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 4059877 4060289 4060128 Y SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6 ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 4654 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 4064154 4064453 4064218 Y SEMA6B,MATK ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 490 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 4067781 4068111 4067963 Y SEMA6B,ATCAY,ZBTB7A ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 2838 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 4456385 4456784 4456737 Y UBXN6,UBXN6 UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 566 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr19 4575288 4575908 4575613 Y CCDC94,TICAM1,SEMA6B LRG1 EBI3,CCDC94,ANKRD24,TNFAIP8L1,C19orf10 IMR90 Hi-C 24141950 LRG1 36802 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr19 4636294 4636441 4636384 Y ANKRD24,SH3GL1,SH3GL1,SEMA6B,TICAM1,TNFAIP8L1,TNFAIP8L1 TNFAIP8L1,C19orf10 NA NA NA NA TNFAIP8L1 1089 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 4870294 4870493 4870397 Y SEMA6B,TICAM1 TICAM1,PLIN3,UHRF1 NA NA NA NA PLIN3 4514 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 5505612 5505767 5505690 Y PTPRS,NRTN NA PTPRS,ZNRF4,PLAC2 IMR90 Hi-C 24141950 SAFB 115279 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 6066698 6067208 6066827 Y SLC25A41,TMEM146,PRR22,DUS3L,RFX2,ACSBG2 NA NA NA NA NA RANBP3 90545 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 6189136 6189412 6189274 Y NA RFX2 NA NA NA NA RFX2 8171 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 6271729 6272422 6272353 Y NDUFA11,MLLT1 MLLT1 NA NA NA NA MLLT1 5537 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 6577471 6577956 6577654 Y DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70 TNFSF9,CD70 NA NA NA NA CD70 24158 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 6587274 6587651 6587637 Y DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70 CD70 NA NA NA NA CD70 14463 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 6589429 6589697 6589573 Y PSPN,TNFSF9,CD70 CD70 NA NA NA NA CD70 12417 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 6801116 6801467 6801221 Y SH2D3A,VAV1 SH2D3A NA NA NA NA SH2D3A 35517 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 7402747 7403030 7402887 Y FCER2 NA INSR,ZNF557 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 54969 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 8488784 8489136 8488939 Y PRAM1,MYO1F RAB11B,MARCH2,HNRNPM NA NA NA NA MARCH2 12630 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 8674150 8674979 8674636 Y ADAMTS10 ADAMTS10 NA NA NA NA ADAMTS10 530 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 9128934 9129115 9129008 Y NA NA NA NA NA NA ZNF317 119941 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 9381001 9381218 9381129 Y ZNF177 NA NA NA NA NA ZNF559 51230 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 9783821 9783976 9783959 Y NA ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 45 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 10056236 10056512 10056406 Y ZNF846,COL5A3,OLFM2 NA NA NA NA NA PIN1 112303 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 10928296 10928707 10928651 Y NA TMED1 NA NA NA NA TMED1 16287 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 11253262 11253482 11253341 Y TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6 SPC24 NA NA NA NA SPC24 11002 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 11404382 11404791 11404593 Y ACP5,ACP5,C19orf38,LPPR2,CCDC159 CCDC159 NA NA NA NA CCDC159 48569 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 11592904 11593323 11593025 Y ZNF491,ZNF441,CCDC151,ELAVL3,ZNF653 PRKCSH,CCDC151,ZNF653,CTC-398G3.2,ECSIT NA NA NA NA ZNF653 21415 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 11691804 11692141 11691953 Y CCDC159,ACP5,ACP5 CNN1,ELOF1,ZNF627 NA NA NA NA ZNF627 23615 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 11878639 11879058 11878901 Y NA ZNF823,ZNF441,ZNF491,ZNF440 NA NA NA NA ZNF441 2824 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 12404552 12404928 12404719 Y ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44 CTD-2666L21.3,ZNF44,ZNF563 NA NA NA NA ZNF44 850 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 12892961 12894040 12893343 Y ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 6270 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 12899457 12901460 12900777 Y NA PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 13123653 13124120 13123822 Y WDR83,TNPO2,TNPO2,NFIX,CACNA1A NFIX NA NA NA NA NFIX 19231 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 13133010 13133371 13133241 Y FBXW9,NFIX NFIX NA NA NA NA NFIX 28588 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 13137197 13137461 13137217 Y NA NFIX NA NA NA NA NFIX 32775 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 13164647 13164970 13164763 Y NA LYL1 NA NA NA NA LYL1 47005 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr19 13166882 13167358 13167036 Y NA LYL1 NA NA NA NA LYL1 44617 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr19 13238145 13238217 13238180 Y NA LYL1,TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA NACC1 11228 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr19 13266326 13267156 13266576 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 7097 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr19 13273540 13274187 13273840 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 14311 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 13274586 13275096 13274696 Y GADD45GIP1,NACC1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 15357 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 13278382 13278991 13278445 Y BEST2,JUNB,LYL1,STX10 STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 19153 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 13907523 13907866 13907763 Y NA MRI1,C19orf53,ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 3249 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr19 13917794 13918010 13917903 Y RFX1,ZSWIM4,NANOS3 MRI1,C19orf53,ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 13520 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 13972364 13973309 13972780 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4 CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 41705 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 14545997 14546246 14546106 Y NA DDX39A,PKN1,PTGER1 NA NA NA NA PKN1 4132 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 14732511 14733275 14733016 Y SYDE1 NA NA NA NA NA NDUFB7 51637 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 15334094 15334476 15334286 Y SLC1A6,WIZ NA NA NA NA NA ILVBL 99498 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 15505627 15505808 15505718 Y NA AKAP8,AKAP8L NA NA NA NA AKAP8 17018 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 15947617 15948119 15947980 Y AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1 UCA1 NA NA NA NA UCA1 9846 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 15974006 15974442 15974280 Y NA UCA1 NA NA NA NA UCA1 36235 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr19 16188924 16190024 16189835 Y TPM4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 13093 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr19 16482225 16482879 16482589 Y MED26,KLF2 KLF2 NA NA NA NA KLF2 48597 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 17246297 17246722 17246423 Y SLC27A1,PGLS,OCEL1,MYO9B NA NA NA NA NA MYO9B 61706 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 18133045 18133309 18133130 Y FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2 NA NA NA NA NA MAST3 73294 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 18264934 18265291 18265179 Y NA PIK3R2,IFI30,MPV17L2,RAB3A NA NA NA NA PIK3R2 2966 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 18315989 18316123 18316056 Y NA IFI30,MPV17L2,RAB3A NA NA NA NA RAB3A 3105 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 18393747 18393881 18393780 Y NA JUND,MIR3188,LSM4 NA NA NA NA MIR3188 2860 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 18402387 18403564 18402535 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1 JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA MIR3188 11500 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 18414244 18414595 18414365 Y NA JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 17489 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 18415031 18416060 18415513 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 16024 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr19 18439179 18439536 18439334 Y NA JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1,GDF15 PGPEP1 K562 ChIA-PET 22265404 LSM4 7095 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr19 18485152 18485556 18485412 Y ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25 PGPEP1,GDF15,SSBP4 NA NA NA NA GDF15 1611 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 18526337 18526644 18526408 Y CCDC124,IFI30,KLHL26,CRLF1,C19orf60,C19orf50,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 1030 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr19 18527231 18527472 18527362 Y LSM4,SSBP4,ISYNA1,ISYNA1 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 202 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr19 18527701 18528040 18527800 Y KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 27 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 18528263 18528792 18528577 Y UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 589 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 18600936 18601077 18601043 Y NA ELL NA NA NA NA ELL 29860 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 18793678 18793914 18793817 Y PDE4C KLHL26,CRTC1 NA NA NA NA CRTC1 1191 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 19600012 19600395 19600260 Y RFXANK,MAU2,GATAD2A,PBX4,GMIP NDUFA13,TSSK6,YJEFN3,CILP2 NA NA NA NA NDUFA13 24150 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 20162886 20163252 20163139 Y ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682 AC006539.2 ZNF682,LOC284440 MCF7 ChIA-PET 22265404 AC006539.2 26096 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 23732304 23732710 23732386 Y NA NA NA NA NA NA ZNF675 135312 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr19 28170167 28170385 28170313 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1532063 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 28197525 28198373 28198039 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1504075 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr19 28252920 28253113 28253061 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1449335 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 28265126 28266155 28265940 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1436293 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 28917737 28917979 28917845 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 784469 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 29702850 29703471 29703365 Y NA UQCRFS1 NA NA NA NA UQCRFS1 402 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 29875607 29875962 29875787 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 173159 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 30206961 30207337 30207149 Y NA C19orf12 NA NA NA NA C19orf12 2597 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 31371885 31372199 31372043 Y NA NA NA NA NA NA TSHZ3 466254 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 31841682 31842327 31842237 Y NA TSHZ3 NA NA NA NA TSHZ3 3229 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 32165629 32165816 32165723 Y THEG5 NA NA NA NA NA TSHZ3 327176 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 33538325 33538659 33538479 Y RHPN2,GPATCH1,NUDT19,CEP89,C19orf40 RHPN2,GPATCH1 NA NA NA NA RHPN2 15135 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 34625713 34625998 34625854 Y PDCD2L LSM14A CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD IMR90 Hi-C 24141950 LSM14A 35411 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 34746041 34746169 34746166 Y KIAA0355 KIAA0355 NA NA NA NA KIAA0355 2599 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 34850085 34850642 34850351 Y ZNF599,ZNF302,ZNF181 GPI,PDCD2L NA NA NA NA GPI 1700 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 34992713 34992833 34992773 Y NA WTIP NA NA NA NA WTIP 22839 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 35453242 35453666 35453504 Y ZNF792 ZNF792,GRAMD1A NA NA NA NA ZNF792 289 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 35643836 35643967 35643905 Y FFAR3,USF2,MAG,HPN,LGI4 FXYD5 NA NA NA NA FXYD5 203 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 35708277 35708472 35708387 Y FXYD5,FXYD5,FXYD5,FFAR3,FFAR2,USF2 LSR,USF2 NA NA NA NA LSR 28761 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 37795242 37795359 37795301 Y ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF829,ZNF568,ZNF420,ZNF585B,ZNF793,ZNF781,ZNF607,ZNF607,ZNF573,ZNF570,ZNF569,ZNF540,ZNF527,HKR1 HKR1 NA NA NA NA HKR1 6380 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 37822125 37822150 37822138 Y NA HKR1,ZNF527 NA NA NA NA HKR1 20386 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 38433320 38433698 38433507 Y ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1 SIPA1L3 NA NA NA NA SIPA1L3 37452 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 38490005 38490506 38490269 Y YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3 NA NA NA NA NA SIPA1L3 94137 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 38493976 38494435 38494152 Y YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3 NA NA NA NA NA SIPA1L3 98108 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr19 38727709 38727942 38727826 Y NA DPF1,SPINT2,PPP1R14A NA NA NA NA SPINT2 4733 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 38807798 38808031 38807971 Y MAP4K1,EIF3K,RASGRP4,FAM98C C19orf33,YIF1B,KCNK6,CATSPERG NA NA NA NA KCNK6 453 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 39148533 39148920 39148613 Y C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4 EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 12244 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 39149253 39149575 39149354 Y SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4 EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 12964 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 39175000 39175365 39175141 Y NFKBIB,HNRNPL,EIF3K ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 38711 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 39182594 39182977 39182723 Y PAK4,ACTN4 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 46305 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr19 39184148 39184440 39184342 Y C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 47859 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 39564346 39564568 39564426 Y ZFP36,HNRNPL,NFKBIB FBXO27,PAK4 PAPL,SAMD4B,GMFG,LRFN1 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO27 42921 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 39645312 39645609 39645461 Y LGALS7B PAK4 NA NA NA NA PAK4 30902 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 39863077 39863463 39863179 Y NA SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2 NA NA NA NA PAF1 16372 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 40049753 40049944 40049858 Y PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,EID2 EID2B,EID2 DLL3,EID2,EID2B,LGALS16,LGALS17A,CLC,LEUTX,ZNF780A IMR90 Hi-C 24141950 EID2 20883 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 40315090 40315548 40315357 Y NA DYRK1B,FBL NA NA NA NA DYRK1B 7293 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 40939716 40940068 40940022 Y SERTAD1 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB NA NA NA NA SERTAD3 8544 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 41169097 41169273 41169245 Y NA NUMBL NA NA NA NA NUMBL 25604 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 41681944 41682199 41682187 Y NA RPL36P16,CYP2S1,AXL CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8 IMR90 Hi-C 24141950 RPL36P16 8178 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 41729438 41729579 41729517 Y ATP5SL,ATP5SL,AXL CYP2S1,AXL,HNRNPUL1 NA NA NA NA AXL 6330 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 41731541 41731893 41731762 Y NA CYP2S1,AXL,HNRNPUL1 NA NA NA NA AXL 8433 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 41771602 41771660 41771636 Y CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1 AXL,HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA HNRNPUL1 5201 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 41827649 41828097 41827915 Y HNRNPUL1,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 NA NA NA NA CCDC97 13555 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 41831643 41832527 41831971 Y CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA CCDC97 17549 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 42429105 42429824 42429205 Y DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1 ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 31718 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 42772295 42772768 42772477 Y NA ZNF526,GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 ERF 14986 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr19 42772804 42773312 42773020 Y CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 ERF 15495 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 42774379 42774759 42774668 Y CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 ERF 17070 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr19 42775992 42776735 42776352 Y NA GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 NA NA NA NA ERF 18683 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr19 42784527 42784991 42784716 Y ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA PRR19 19259 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr19 42785500 42785936 42785827 Y NA GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA PRR19 18314 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 42954515 42954747 42954627 Y CEACAM1,LIPE NA CXCL17 IMR90 Hi-C 24141950 CEACAM1 108639 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 43469411 43469727 43469501 Y NA PSG6 PSG2 IMR90 Hi-C 24141950 PSG6 47696 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 43525971 43526126 43526036 Y NA NA NA NA NA NA PSG6 104256 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 43624762 43624964 43624855 Y NA NA PSG5,PSG9 IMR90 Hi-C 24141950 PSG5 63724 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr19 44249305 44249426 44249352 Y IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61 SMG9,KCNN4 NA NA NA NA SMG9 7716 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 44269192 44269953 44269534 Y IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4 SMG9,KCNN4 NA NA NA NA SMG9 12050 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 44288540 44288860 44288798 Y NA SMG9,KCNN4,LYPD5,ZNF283 NA NA NA NA KCNN4 5131 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 44711538 44711905 44711597 Y NA ZNF226,ZNF227,ZNF233 NA NA NA NA ZNF227 1838 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 44824668 44825027 44825022 Y NA ZNF235 NA NA NA NA ZNF235 17469 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 45195366 45195649 45195556 Y RELB,CLASRP,BCL3 NA NA NA NA NA PVR 50268 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 45221919 45222313 45222185 Y NA BCL3 NA NA NA NA BCL3 26649 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 45228436 45228775 45228695 Y IGSF23,RELB,APOE,APOC4,APOC2,BCL3 BCL3 NA NA NA NA BCL3 20187 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 45248499 45249479 45248793 Y NA NA NA NA NA NA BCL3 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr19 45350775 45351289 45350997 Y BCL3,PVRL2,RELB BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 3343 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr19 45393623 45393866 45393750 Y ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40 PVRL2,TOMM40,APOE NA NA NA NA TOMM40 1797 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 45803954 45804164 45804074 Y NA KLC3 NA NA NA NA KLC3 30528 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 45879605 45879880 45879744 Y NA KLC3,ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L NA NA NA NA ERCC2 7429 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 45946690 45947113 45946759 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,ERCC1,PPM1N ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ERCC1 32973 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 45953764 45954783 45954182 Y NA CD3EAP,PPP1R13L,ERCC1,PPM1N FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERCC1 25303 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 46011701 46012269 46011904 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP ERCC1,PPM1N,VASP NA NA NA NA VASP 3864 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 46012498 46012899 46012640 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP ERCC1,PPM1N,VASP NA NA NA NA VASP 4661 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 46683956 46684315 46684191 Y NA NA NA NA NA NA IGFL3 58025 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.18890991877604 chr19 46877153 46877367 46877269 Y NA PPP5C,CCDC8 NA NA NA NA PPP5C 28902 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 47062362 47062544 47062453 Y NA GAPDHP38,CALM3 NA NA NA NA GAPDHP38 2464 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 47269374 47269772 47269575 Y LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5 FKRP,STRN4,SLC1A5 NA NA NA NA SLC1A5 20079 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 47363167 47364689 47363471 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 AP2S1 SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 10918 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 47600896 47601033 47600983 Y NA SAE1,ZC3H4 NA NA NA NA SAE1 13498 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 47776748 47776969 47776841 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1 BBC3,CCDC9 NA NA NA NA CCDC9 19511 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.18890991877604 chr19 47926520 47926706 47926665 Y NA MEIS3 NA NA NA NA MEIS3 5740 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 48016569 48017036 48016994 Y GLTSCR2,ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,DHX34,GLTSCR1,NAPA KPTN,NAPA NA NA NA NA NAPA 72 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 48102180 48102576 48102418 Y NA NA SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAPA 85683 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 48103581 48103982 48103689 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA GLTSCR1,NAPA MCF7 ChIA-PET 22265404 NAPA 87084 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.18890991877604 chr19 48222362 48222481 48222377 Y SEPW1,PLA2G4C,MEIS3,SLC8A2 EHD2,GLTSCR2 NA NA NA NA EHD2 7762 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr19 49057128 49057239 49057162 Y NA NA NA NA NA NA SPHK2 63309 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 49315464 49315783 49315738 Y NA BCAT2 NA NA NA NA BCAT2 3178 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr19 49495555 49495708 49495609 Y SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4 BAX,FTL,GYS1,RUVBL2,CGB5 NA NA NA NA RUVBL2 850 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 49521043 49521282 49521101 Y NA GYS1,RUVBL2,CGB5 NA NA NA NA CGB5 23859 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 49836983 49837445 49837293 Y SNRNP70,IRF3,FLT3LG,FLT3LG,BCL2L12,ALDH16A1,CD37 CTC-301O7.4,TEAD2 NA NA NA NA CTC-301O7.4 4420 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 50141205 50141513 50141452 Y AKT1S1,TRPM4,RCN3,AP2A1,RRAS NOSIP,PRR12,SCAF1,BCL2L12,IRF3,PRMT1 NA NA NA NA RRAS 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 50414628 50414884 50414779 Y RPS11,FCGRT,NR1H2,IL4I1,NUP62,NUP62,NUP62,NUP62,IL4I1,ATF5 PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62 NA NA NA NA ATF5 15075 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 50417620 50417965 50417778 Y NA PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62 NA NA NA NA ATF5 11994 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 50872495 50872846 50872654 Y NA NR1H2,POLD1 NA NA NA NA POLD1 12615 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 51930485 51930778 51930623 Y SIGLEC9,CD33,SIGLEC14,FPR3,FPR2,FPR1 NA NA NA NA NA ETFB 62813 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 52049983 52050318 52050095 Y ZNF615,SIGLEC7,CD33,SIGLEC8,SIGLEC6,ZNF175 ZNF175 ZNF175,CEACAM18 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF175 22233 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 52192085 52192767 52192400 Y ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577 MIRLET7E NA NA NA NA MIRLET7E 1272 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr19 52193633 52193945 52193814 Y ZNF836,ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC8,SIGLEC6,FPR2,FPR2,FPR1 MIRLET7E NA NA NA NA MIRLET7E 94 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 52194056 52194504 52194155 Y ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1 MIRLET7E NA NA NA NA MIRLET7E 17 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 52302339 52303044 52302768 Y ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC12,SIGLEC12,SIGLEC14,FPR1,FPR2,FPR3 FPR3,FPR1 NA NA NA NA FPR1 2319 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 52303612 52304072 52303819 Y SIGLEC8,SIGLEC12,SIGLEC12,SIGLEC6,ZNF175,FPR3 FPR3,FPR1 NA NA NA NA FPR1 1291 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 52734516 52734674 52734594 Y ZNF610 PPP2R1A,ZNF766 NA NA NA NA ZNF766 36150 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 53129559 53129725 53129643 Y ZNF160,ZNF616,ZNF766,ZNF808,ZNF701,ZNF611,ZNF611,ZNF83 NA NA NA NA NA ZNF83 62024 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 53150651 53150972 53150733 Y NA ZNF83 ZNF137P IMR90 Hi-C 24141950 ZNF83 40777 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 53237186 53237523 53237297 Y ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611 ZNF83,ZNF611 NA NA NA NA ZNF611 860 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 53727403 53727861 53727738 Y NA ZNF665,ZNF677 NA NA NA NA ZNF677 28290 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 54049099 54049989 54049424 Y ZNF160,ZNF845,ZNF761,ZNF813,NLRP12,ZNF331,ZNF331 NA NA NA NA NA ZNF813 80110 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 54465243 54465494 54465291 Y TFPT,PRPF31,NDUFA3,MYADM,CACNG7,CACNG8 CACNG8 NA NA NA NA CACNG8 949 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr19 55619280 55619321 55619308 Y NA RDH13,PPP1R12C,TNNT1 NA NA NA NA PPP1R12C 7606 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 55626810 55627228 55626935 Y ZNF865,PPP1R12C RDH13,TNNT1 NA NA NA NA PPP1R12C 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 55627475 55627790 55627718 Y LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C RDH13,PPP1R12C,TNNT1 NA NA NA NA PPP1R12C 548 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 55699968 55700281 55700219 Y NA TNNT1 NA NA NA NA TNNT1 41246 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr19 55917170 55917359 55917333 Y U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA UBE2S 25 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 55983917 55984059 55984005 Y RDH13,HSPBP1,ISOC2 ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D ZNF628,ISOC2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF628 1640 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr19 55985101 55985287 55985184 Y ISOC2,SSC5D ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D NA NA NA NA ZNF628 412 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 55988531 55988605 55988568 Y NAT14 ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D NA NA NA NA ZNF628 2832 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 4872 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 56789143 56789486 56789342 Y NA NA NA NA NA NA ZNF542 87982 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 56810811 56811236 56810900 Y NA NA NA NA NA NA ZNF542 66232 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 57020241 57020583 57020445 Y ZNF582,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF835,ZIM2,PEG3,PEG3,LOC147670,ZNF471,ZNF71,ZNF470,ZFP28 ZNF667,ZNF471 NA NA NA NA ZNF471 3029 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 57976528 57976751 57976646 Y NA ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773 NA NA NA NA ZNF772 10187 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 58162762 58163096 58162801 Y NA ZNF134,ZNF211,ZNF551 NA NA NA NA ZNF211 23001 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr19 58501905 58502197 58501915 Y ZNF8,ZNF132,ZNF773,ZNF549,ZNF550,ZNF416,ZIK1,ZNF134,ZSCAN4,ZNF154,ZNF671,ZNF776,ZNF814,ZNF417,ZNF418,ZSCAN18,ZNF329,ZNF256,ZSCAN1,ZNF606,ZNF135 ZNF256,CTD-2368P22.1,ZNF606 NA NA NA NA CTD-2368P22.1 9232 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 58673997 58674222 58674118 Y ZSCAN4 ZSCAN18,ZNF329,ZNF274 ZNF416,ZNF274 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF329 9520 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr19 58742086 58742094 58742090 Y NA ZNF274,ZNF544,ZNF8 NA NA NA NA ZNF544 4126 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr19 59087419 59087864 59087514 Y NA ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1 NA NA NA NA MZF1 4477 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 393939 394227 394175 Y SH3YL1 NA NA NA NA NA SH3YL1 129541 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 628526 628919 628630 Y NA TMEM18 FAM150B IMR90 Hi-C 24141950 TMEM18 46520 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 1609558 1609866 1609667 Y PXDN NA NA NA NA NA PXDN 136758 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 1659182 1659769 1659438 Y NA NA NA NA NA NA PXDN 86855 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 1722150 1722351 1722236 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 24273 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 1725053 1725311 1725239 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 21313 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 2617084 2617480 2617333 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 762173 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 3508183 3508316 3508315 Y NA ADI1 NA NA NA NA ADI1 13191 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 3583560 3583858 3583796 Y NA AC108488.4,RNASEH1-AS1,RNASEH1,RPS7 NA NA NA NA AC108488.4 1097 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 7965738 7966104 7965909 Y NA NA LINC00299 IMR90 Hi-C 24141950 AC011747.4 755818 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 9142736 9142998 9142867 Y NA MBOAT2 NA NA NA NA MBOAT2 794 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 9427801 9428115 9428020 Y YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2 NA NA NA NA NA ASAP2 82907 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 9678248 9678641 9678477 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 15280 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 9705660 9705808 9705714 Y NA ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 11739 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 9893339 9893657 9893442 Y ADAM17,KLF11,KLF11 NA YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1 IMR90 Hi-C 24141950 TAF1B 87826 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr2 10075100 10075410 10075131 Y TAF1B GRHL1 GRHL1 IMR90 Hi-C 24141950 GRHL1 7931 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 10258344 10258406 10258377 Y NA CYS1,RRM2 NA NA NA NA RRM2 2049 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 10418251 10419155 10418675 Y NA HPCAL1 RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HPCAL1 21860 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 10423423 10423670 10423576 Y NA HPCAL1 RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HPCAL1 17345 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 10550434 10550795 10550555 Y HPCAL1,HPCAL1 ODC1,RP11-320M2.1 ODC1 IMR90 Hi-C 24141950 ODC1 35835 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 11352501 11352895 11352887 Y NA NA NA NA NA NA PQLC3 59177 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 11514785 11514933 11514926 Y NA ROCK2 ROCK2,E2F6,PQLC3,PDIA6,C2orf50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ROCK2 28329 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 11547236 11547448 11547321 Y NA NA ROCK2,PQLC3,C2orf50 IMR90 Hi-C 24141950 E2F6 56849 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 11884050 11884543 11884432 Y NA NA NA NA NA NA AC106875.1 64464 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 15700375 15700622 15700454 Y DDX1,NBAS NBAS,DDX1 NA NA NA NA NBAS 921 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 16831579 16831850 16831761 Y FAM49A FAM49A NA NA NA NA FAM49A 13749 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 17728036 17728340 17728188 Y NA NA NA NA NA NA GEN1 204785 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 18481222 18481335 18481279 Y NA NA NA NA NA NA RDH14 258611 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 19548078 19548301 19548191 Y NA OSR1 NA NA NA NA OSR1 8113 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 19813910 19814220 19814076 Y NA NA NA NA NA NA OSR1 257496 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 20385260 20385778 20385600 Y TTC32,HS1BP3 SDC1 NA NA NA NA SDC1 37416 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr2 20534195 20534238 20534216 Y NA PUM2 NA NA NA NA PUM2 15757 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 20709880 20710074 20709978 Y NA NA HS1BP3,RHOB IMR90 Hi-C 24141950 RHOB 65045 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 20793103 20793496 20793437 Y APOB NA HS1BP3,RHOB,PUM2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HS1BP3 55353 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr2 20811186 20811439 20811262 Y NA HS1BP3 NA NA NA NA HS1BP3 37410 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 23631132 23631189 23631161 Y NA KLHL29 NA NA NA NA KLHL29 25044 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 23743180 23743526 23743353 Y NA NA NA NA NA NA KLHL29 137092 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 24491972 24492409 24492370 Y NA NA NA NA NA NA RPL36AP13 62972 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 24512394 24512744 24512638 Y NA RPL36AP13 NA NA NA NA RPL36AP13 42637 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 24713346 24713697 24713476 Y DNAJC27,ITSN2 NA CENPO,NCOA1 IMR90 Hi-C 24141950 ITSN2 131763 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 24852047 24852369 24852206 Y NA NA NA NA NA NA CENPO 161636 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 25352140 25352468 25352150 Y DNAJC27,EFR3B,DNMT3A,DNMT3A NA NA NA NA NA DNAJC27 159177 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 25499637 25500641 25499751 Y DNAJC27 NA NA NA NA NA DNMT3A 62818 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 26521727 26522029 26521734 Y NA EPT1,GPR113 NA NA NA NA EPT1 7386 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 26522632 26522929 26522714 Y NA EPT1,GPR113 NA NA NA NA EPT1 6486 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 27304052 27304486 27304234 Y CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1 AGBL5,OST4,KHK,CGREF1,ABHD1 NA NA NA NA KHK 3129 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 27557346 27557529 27557503 Y DPYSL5,C2orf16 MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513 NA NA NA NA MPV17 10799 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 27878874 27879165 27879028 Y SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L NA NA NA NA SLC4A1AP 5173 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 27958320 27958698 27958604 Y NA MRPL33 BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL33 33886 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.18890991877604 chr2 28021914 28022357 28022176 Y RBKS MRPL33 NA NA NA NA MRPL33 29330 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 28513236 28513438 28513331 Y RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 NA NA NA NA NA FOSL2 99877 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 28903940 28904347 28904218 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB NA PPP1CB,SPDYA,PLB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP1CB 68159 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 29060448 29060640 29060540 Y PPP1CB,PPP1CB TRMT61B NA NA NA NA TRMT61B 30527 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 29339148 29339698 29339489 Y NA CLIP4 NA NA NA NA CLIP4 20577 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 30887906 30888094 30887998 Y NA NA NA NA NA NA LCLAT1 219814 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 33805444 33805464 33805454 Y RASGRP3 FAM98A NA NA NA NA FAM98A 16985 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 34402780 34402960 34402870 Y NA NA NA NA NA NA FAM98A 580331 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 36584242 36585529 36584872 Y FEZ2,CRIM1 CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 3173 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr2 36599325 36599532 36599405 Y NA CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 18256 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 36688353 36688868 36688635 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 107284 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 36712578 36712925 36712822 Y CRIM1,FEZ2 NA NA NA NA NA CRIM1 131509 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 36713753 36714120 36713762 Y CRIM1,VIT,FEZ2 NA NA NA NA NA CRIM1 132684 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 36790074 36790520 36790216 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 80710 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 36934290 36934412 36934353 Y NA VIT NA NA NA NA VIT 12457 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr2 37116938 37117262 37117216 Y NA NA NA NA NA NA STRN 74353 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 37617673 37618124 37617783 Y CDC42EP3,EIF2AK2 NA NA NA NA NA PRKD3 67722 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 37788822 37789049 37788928 Y EIF2AK2,CDC42EP3 NA CDC42EP3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 174562 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 37800677 37800820 37800749 Y CDC42EP3 NA QPCT,CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 162791 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 37815586 37815764 37815605 Y EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3 NA CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 147847 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 37881606 37881960 37881783 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP3 81651 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 37884022 37884434 37884213 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP3 79177 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 37897080 37897760 37897461 Y QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 65851 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 37938546 37938819 37938725 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 24792 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 37989393 37989693 37989581 Y QPCT,CDC42EP3 CDC42EP3 CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 25782 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 38003207 38003253 38003231 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3,PRKD3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 39596 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 38007638 38007650 38007644 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3,PRKD3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 44027 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 38008241 38008581 38008345 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3,PRKD3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 44630 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr2 38012034 38012184 38012091 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3,PRKD3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 48423 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 38333760 38333892 38333836 Y CDC42EP3,CYP1B1 CYP1B1 FAM82A1,CYP1B1,CYP1B1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 CYP1B1 1152 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 38373682 38374230 38374188 Y CDC42EP3,CYP1B1 CYP1B1 NA NA NA NA CYP1B1 38638 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr2 38417790 38418062 38417924 Y CYP1B1 RPL7P12,AC009229.5 NA NA NA NA RPL7P12 38648 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 38472288 38472516 38472419 Y FAM82A1 RPL7P12,AC009229.5 FAM82A1,CYP1B1-AS1,CYP1B1 IMR90 Hi-C 24141950 AC009229.5 7556 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 39079289 39079498 39079407 Y SRSF7,ARHGEF33 DHX57,MORN2 NA NA NA NA DHX57 21577 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 39665108 39665339 39665266 Y NA AC007246.3,MAP4K3 NA NA NA NA MAP4K3 2655 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 41736624 41736708 41736667 Y NA NA NA NA NA NA PKDCC 536452 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 42149327 42149700 42149496 Y PKDCC NA NA NA NA NA PKDCC 123460 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 42328958 42329862 42329543 Y NA NA EML4 IMR90 Hi-C 24141950 PKDCC 55798 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 42329971 42330163 42329978 Y NA NA EML4 IMR90 Hi-C 24141950 PKDCC 56811 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 42696554 42696964 42696742 Y NA COX7A2L,MTA3 NA NA NA NA MTA3 22745 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 43037224 43037999 43037611 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC025750.7 278642 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 43038629 43038924 43038876 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO,PLEKHH2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC025750.7 280047 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 43265724 43265951 43265843 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L2 185797 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 43269026 43269323 43269208 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 182425 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 43273834 43273859 43273847 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L2 177889 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 43355812 43355984 43355857 Y NA NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 95764 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 43385938 43386506 43386186 Y OXER1,ZFP36L2 NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 65242 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr2 43496273 43496611 43496398 Y NA ZFP36L2 NA NA NA NA ZFP36L2 44525 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 43532812 43532954 43532932 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZFP36L2 81064 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 44601254 44601363 44601309 Y NA PREPL,CAMKMT NA NA NA NA CAMKMT 14165 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 45160746 45160936 45160765 Y SIX3 NA NA NA NA NA AC012354.8 60616 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 45237112 45237533 45237325 Y SIX2 AC012354.8,SIX2 NA NA NA NA SIX2 2543 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 45464369 45464490 45464416 Y NA NA NA NA NA NA SIX2 229800 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 45811183 45811373 45811272 Y NA SRBD1 NA NA NA NA SRBD1 25931 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 46561811 46562247 46561970 Y SOCS5,SOCS5 EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 43005 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 46928465 46928698 46928588 Y MCFD2,MCFD2,SOCS5,SOCS5 SOCS5 NA NA NA NA SOCS5 4374 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 47076896 47077421 47077187 Y SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2 NA NA NA NA NA TTC7A 63875 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 47077976 47078245 47078111 Y SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2 NA NA NA NA NA TTC7A 63051 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr2 47089688 47089819 47089748 Y NA NA NA NA NA NA TTC7A 51477 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 47213827 47213985 47213928 Y NA MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 46833 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 47229826 47230084 47229931 Y TTC7A NA NA NA NA NA MCFD2 62832 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 47270774 47271231 47270943 Y NA NA NA NA NA NA MCFD2 103780 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 48559553 48559778 48559608 Y FOXN2 FOXN2,RNU4-49P NA NA NA NA RNU4-49P 6187 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 51092337 51092826 51092639 Y NRXN1 NA NA NA NA NA STON1 2337815 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 52975138 52975144 52975141 Y NA NA NA NA NA NA CHAC2 1017785 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 53502591 53502613 53502603 Y NA NA NA NA NA NA CHAC2 490316 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 54714209 54714329 54714214 Y NA SPTBN1 NA NA NA NA SPTBN1 32787 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 54786900 54787386 54787056 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 105478 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr2 54787503 54787764 54787623 Y RTN4,SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 106081 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr2 54799241 54799892 54799606 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 117819 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 54801406 54802103 54801693 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 119984 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 54861793 54862155 54861956 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 180371 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 55212013 55212317 55212165 Y CCDC88A NA NA NA NA NA RTN4 125440 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 55249584 55250267 55249993 Y NA NA NA NA NA NA RTN4 87490 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 55320625 55320761 55320684 Y RTN4 RTN4 C2orf63,EML6,RTN4 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 16996 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr2 55338983 55339153 55339057 Y CCDC88A,RTN4,RTN4 RTN4 C2orf63,RTN4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 1226 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 55450545 55450658 55450592 Y CCDC88A,EML6,RTN4 RPS27A,MTIF2 NA NA NA NA RPS27A 6381 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 56083172 56083316 56083296 Y EFEMP1 NA NA NA NA NA EFEMP1 65958 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 56968776 56968885 56968798 Y NA NA NA NA NA NA AC007743.1 557871 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 57623387 57623716 57623641 Y NA NA NA NA NA NA VRK2 509070 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 58002154 58002414 58002211 Y NA NA NA NA NA NA VRK2 130372 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 58271974 58272513 58272036 Y NA NA NA NA NA NA VRK2 139188 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 58334895 58335527 58335141 Y VRK2,VRK2,VRK2 NA NA NA NA NA FANCL 130980 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 59983827 59983888 59983858 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-32P 625852 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 61140048 61140151 61140100 Y REL REL NA NA NA NA REL 33392 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 61464355 61464721 61464539 Y NA NA NA NA NA NA AHSA2 61802 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 61757728 61758222 61758112 Y NA XPO1 NA NA NA NA XPO1 5539 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 61921641 61922071 61921953 Y NA NA NA NA NA NA FAM161A 157207 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 87618 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 62492233 62492490 62492397 Y B3GNT2 NA COMMD1 IMR90 Hi-C 24141950 B3GNT2 70985 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 63840978 63841207 63841026 Y NA MDH1 NA NA NA NA MDH1 27235 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 63842322 63842740 63842368 Y UGP2 MDH1 NA NA NA NA MDH1 28579 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 64836549 64836646 64836605 Y SLC1A4,PELI1,SERTAD2,AFTPH NA NA NA NA NA AFTPH 87084 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 64879120 64879608 64879340 Y NA NA LOC339807 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 96531 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 64879615 64879792 64879667 Y SERTAD2 NA LOC339807 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 96347 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 64978173 64978610 64978385 Y CEP68 SERTAD2 SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 2034 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 64994926 64995226 64995021 Y SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 18787 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr2 64995321 64996019 64995711 Y SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 19182 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 65058327 65058875 65058618 Y AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 82188 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 65086968 65087262 65087080 Y AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 110829 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 65093958 65094266 65094153 Y NA NA SERTAD2,AFTPH,LOC339807 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SERTAD2 117819 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 65303160 65303240 65303200 Y SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A CEP68 NA NA NA NA CEP68 21660 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 65583296 65583698 65583484 Y NA NA NA NA NA NA SPRED2 74073 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 66385770 66386089 66385930 Y NA NA NA NA NA NA MEIS1 272495 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 67067097 67067512 67067390 Y NA AC009474.2 LOC644838,MEIS1 IMR90 Hi-C 24141950 AC009474.2 38842 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr2 67680448 67680810 67680629 Y NA NA MEIS1 IMR90 Hi-C 24141950 ETAA1 57997 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 67883850 67884178 67884174 Y NA NA MEIS1 IMR90 Hi-C 24141950 ETAA1 261399 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 68472906 68473226 68473141 Y PPP3R1 PPP3R1 NA NA NA NA PPP3R1 8143 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 69163712 69163881 69163761 Y NA GKN1 NA NA NA NA GKN1 35824 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 69424670 69425029 69424849 Y NA NA NA NA NA NA ANTXR1 186360 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 69533941 69534050 69534019 Y ANTXR1 NA NA NA NA NA GFPT1 78332 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 69811685 69812001 69811856 Y MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA NA ANXA4 57556 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 70004336 70004726 70004528 Y NA NA NA NA NA NA GMCL1 50048 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 70161598 70161791 70161659 Y PCBP1,C2orf42,MXD1,ASPRV1 SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA ASPRV1 25606 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 70335985 70336314 70336204 Y AAK1,C2orf42,PCBP1 PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 8302 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 70363059 70363462 70363144 Y MXD1,C2orf42,PCBP1 PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 35376 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 70823463 70823663 70823562 Y TGFA TGFA NA NA NA NA TGFA 44138 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 72372444 72372716 72372574 Y CYP26B1 NA NA NA NA NA EXOC6B 678454 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 72789461 72789923 72789792 Y EXOC6B NA NA NA NA NA EXOC6B 261247 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 73233755 73233809 73233782 Y NA NA EMX1 IMR90 Hi-C 24141950 SFXN5 66938 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 74647656 74647929 74647851 Y SLC4A5,SLC4A5,DCTN1,C2orf81 DCTN1,C2orf81,WDR54,RTKN,INO80B,WBP1,MOGS NA NA NA NA WDR54 851 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 74804828 74804964 74804881 Y MOBKL1B,DOK1 AUP1,DOK1,LOXL3 NA NA NA NA LOXL3 24011 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 75912574 75912759 75912685 Y NA MRPL19,GCFC2 NA NA NA NA GCFC2 23356 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 78632836 78632912 78632895 Y NA NA NA NA NA NA AC105399.2 619328 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 85057054 85057454 85057405 Y NA NA NA NA NA NA TMSB10 73295 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 85116002 85116322 85116077 Y C2orf89,TMSB10 TMSB10 TMSB10 MCF7 ChIA-PET 22265404 TMSB10 14427 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr2 85147093 85147556 85147171 Y TMSB10 TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 16344 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 85151844 85152193 85152004 Y NA TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 21095 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 85154234 85154422 85154323 Y NA TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 23485 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 85173188 85173797 85173736 Y TMSB10 TMSB10,KCMF1 KCMF1,TMSB10 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KCMF1 22419 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr2 85267777 85267839 85267811 Y NA NA NA NA NA NA LSM3P3 59978 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 85492413 85492544 85492479 Y SH2D6 NA NA NA NA NA TGOLN2 61004 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 85664544 85665596 85664830 Y KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6 CAPG NA NA NA NA CAPG 20989 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 85673142 85673285 85673214 Y NA CAPG NA NA NA NA CAPG 29587 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 85982713 85983043 85983025 Y NA RNU1-38P,ATOH8 NA NA NA NA ATOH8 6246 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 86120990 86121249 86121122 Y NA ST3GAL5,AC105053.4 ST3GAL5,POLR1A IMR90 Hi-C 24141950 AC105053.4 6587 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 86224309 86224458 86224357 Y NA NA NA NA NA NA POLR1A 106820 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 86225018 86225303 86225260 Y NA NA NA NA NA NA POLR1A 105975 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 86225783 86226050 86225999 Y NA NA NA NA NA NA POLR1A 105228 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 86284876 86285205 86285126 Y NA POLR1A,PTCD3 NA NA NA NA POLR1A 46073 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 86307060 86307219 86307140 Y GNLY,KDM3A,KDM3A POLR1A,PTCD3 NA NA NA NA POLR1A 24059 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 91821438 91821799 91821741 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 2758114 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 95982487 95982780 95982632 Y TRIM43B,KCNIP3 KCNIP3 NA NA NA NA KCNIP3 21435 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 95982962 95983225 95982998 Y PROM2 KCNIP3 NA NA NA NA KCNIP3 21910 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 97151625 97152085 97151839 Y ASTL,DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,ARID5A ARID5A NA NA NA NA ARID5A 48395 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 97291626 97292008 97291852 Y NA KANSL3 NA NA NA NA KANSL3 14516 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 97330891 97331185 97331060 Y TMEM127,ARID5A,KIAA1310 KANSL3 NA NA NA NA KANSL3 24367 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 97522669 97523105 97522935 Y NA CNNM3,ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C NA NA NA NA ANKRD39 837 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 98367978 98368166 98368128 Y TMEM131,ANKRD36B,ZAP70,ZAP70 NA NA NA NA NA RNU4-8P 88784 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 98443211 98443622 98443475 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-8P 164017 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 98465985 98466159 98466067 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 144229 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr2 99213145 99213306 99213215 Y INPP4A COA5,UNC50 NA NA NA NA COA5 9672 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 100323852 100324185 100324151 Y NA NA NA NA NA NA REV1 219355 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 100484034 100484497 100484368 Y NA NA NA NA NA NA REV1 379537 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 100496681 100496959 100496872 Y NA NA NA NA NA NA REV1 392184 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 100630312 100630613 100630507 Y AFF3 NA NA NA NA NA CHST10 401505 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 100937334 100937484 100937407 Y LONRF2 NA NA NA NA NA CHST10 94634 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 101923239 101923757 101923472 Y RPL31,MAP4K4,MAP4K4,RNF149 RNF149 NA NA NA NA RNF149 76 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 102133779 102134093 102133972 Y MAP4K4,MAP4K4 NA MAP4K4,RFX8,CREG2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP4K4 177219 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 102332970 102333042 102333006 Y MAP4K4,MAP4K4 MAP4K4 NA NA NA NA MAP4K4 21658 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 102399741 102400097 102399970 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K4 88429 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 102649919 102650192 102650054 Y IL1RL2,IL1R1,IL18RAP,IL18R1,MAP4K4,MAP4K4,IL1R2 IL1R1 NA NA NA NA IL1R1 28812 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 103104673 103104833 103104753 Y IL1R2,IL1R1,IL18R1,IL18RAP NA NA NA NA NA MFSD9 246514 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 103280963 103281189 103281017 Y IL1RL2,SLC9A2 NA NA NA NA NA MFSD9 70158 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 105655685 105655967 105655739 Y NA MRPS9 NA NA NA NA MRPS9 3244 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 105973379 105973614 105973553 Y NA TGFBRAP1,C2orf49 NA NA NA NA C2orf49 21563 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 106008939 106009297 106009286 Y NA FHL2 NA NA NA NA FHL2 43673 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr2 106009982 106010344 106010250 Y FHL2,FHL2 FHL2 NA NA NA NA FHL2 42626 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr2 106020017 106020290 106020154 Y NA FHL2 NA NA NA NA FHL2 32680 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 106020631 106021071 106020783 Y FHL2,FHL2 FHL2 NA NA NA NA FHL2 31899 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 106022630 106022770 106022732 Y GPR45 FHL2 NA NA NA NA FHL2 30200 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr2 106026144 106026496 106026333 Y GPR45,FHL2 FHL2 NA NA NA NA FHL2 26474 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 109209973 109210484 109210252 Y LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1 NA NA NA NA NA LIMS1 61116 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr2 109210699 109211038 109210811 Y LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1 NA NA NA NA NA LIMS1 61842 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr2 109789769 109790041 109789880 Y NA NA NA NA NA NA CCDC138 388556 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 110318153 110318301 110318244 Y NA NA NA NA NA NA SEPT10 51482 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 110859077 110859497 110859213 Y NA NA NA NA NA NA NPHP1 101146 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr2 113058633 113059002 113058901 Y NA ZC3H8,ZC3H6 NA NA NA NA ZC3H6 27462 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr2 113380153 113380493 113380323 Y IL1A CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1 NA NA NA NA AC079922.2 2409 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 113384986 113385271 113385131 Y NA CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1 NA NA NA NA AC079922.2 7242 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr2 113388786 113388926 113388836 Y NA CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1 NA NA NA NA AC079922.2 11042 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 113398370 113398650 113398523 Y NA AC079922.2,SLC20A1 NA NA NA NA SLC20A1 2784 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 113448603 113448987 113448785 Y IL36B,IL36G,IL1RN,IL1B,IL1A SLC20A1 POLR1B,CHCHD5,SLC20A1,CKAP2L,FLJ42351 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC20A1 47169 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 113450039 113450435 113450231 Y IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A SLC20A1 SLC20A1,FLJ42351 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC20A1 48605 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 113450750 113451037 113450852 Y NA SLC20A1 SLC20A1,FLJ42351 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC20A1 49316 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 113571813 113572166 113571903 Y NA IL1A,IL1B NA NA NA NA IL1B 20314 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 113581693 113582026 113582010 Y NA IL1A,IL1B NA NA NA NA IL1B 10454 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 114082449 114082815 114082523 Y NA NA PAX8,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4782 394130 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 114469366 114469830 114469722 Y SLC35F5 MIR4782,SLC35F5 NA NA NA NA MIR4782 7115 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 114649026 114649412 114649076 Y CBWD2,ACTR3 ACTR3 NA NA NA NA ACTR3 3489 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 118722673 118722961 118722817 Y NA CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 46748 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 119067655 119067950 119067737 Y NA NA NA NA NA NA AC093901.1 125693 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 120996274 120996566 120996498 Y NA TMEM185B,RALB EPB41L5,RALB,TMEM185B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RALB 634 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 121523492 121523901 121523763 Y GLI2 GLI2 GLI2 IMR90 Hi-C 24141950 GLI2 32293 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 121624920 121625080 121625001 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 133721 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 3.28336487816406 chr2 122226715 122226882 122226860 Y NA NA NA NA NA NA RNU4ATAC 59575 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 123566430 123566580 123566535 Y NA NA NA NA NA NA TSN 1073751 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 127915404 127915435 127915422 Y NA NA CYP27C1,BIN1,MAP3K2 IMR90 Hi-C 24141950 BIN1 52473 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 129252189 129252574 129252389 Y HS6ST1 NA NA NA NA NA HS6ST1 178038 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 129393218 129393341 129393276 Y NA NA UGGT1,HS6ST1 IMR90 Hi-C 24141950 HS6ST1 319067 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 131058181 131058640 131058440 Y NA AC068137.13,IMP4,CCDC115 NA NA NA NA AC068137.13 8786 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 131149333 131149678 131149410 Y FAM123C,FAM123C,FAM123C PTPN18 NA NA NA NA PTPN18 37753 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 131485043 131485533 131485339 Y NA NA NA NA NA NA FAM168B 363500 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 133111183 133111270 133111216 Y NA NA NA NA NA NA GPR39 60877 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 133803546 133803723 133803632 Y NA NA NA NA NA NA LYPD1 376394 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 134570885 134571181 134570989 Y NA NA NCKAP5 IMR90 Hi-C 24141950 MGAT5 304373 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 134575786 134576043 134575915 Y NA NA NCKAP5 IMR90 Hi-C 24141950 MGAT5 299511 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 134878523 134878632 134878609 Y MGAT5 MGAT5 NA NA NA NA MGAT5 2969 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 135437323 135437554 135437491 Y TMEM163 NA NA NA NA NA CCNT2 236251 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 137083684 137083912 137083814 Y CXCR4 NA NA NA NA NA CXCR4 209949 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 141193779 141194149 141193964 Y NA NA NA NA NA NA NXPH2 1657861 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 142137791 142137799 142137795 Y NA NA NA NA NA NA KYNU 1495268 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 143697269 143697638 143697450 Y KYNU NA NA NA NA NA KYNU 64202 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 143908003 143908197 143908077 Y ARHGAP15 NA NA NA NA NA KYNU 274936 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 143962821 143963156 143962989 Y ARHGAP15 NA NA NA NA NA KYNU 329754 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 144160000 144160383 144160097 Y ARHGAP15 NA NA NA NA NA KYNU 526933 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 145116388 145116823 145116635 Y NA GTDC1 ZEB2,ARHGAP15,GTDC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTDC1 28253 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 145582914 145583268 145583062 Y ZEB2 NA NA NA NA NA TEX41 159380 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 145785805 145786034 145785921 Y NA NA NA NA NA NA TEX41 362271 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 148394087 148394646 148394415 Y ACVR2A NA NA NA NA NA ACVR2A 205440 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 148640468 148640547 148640483 Y NA ACVR2A NA NA NA NA ACVR2A 40382 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 151330104 151330756 151330441 Y NA NA NA NA NA NA RND3 62769 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 151500998 151501151 151501067 Y NA NA MMADHC,RBM43 IMR90 Hi-C 24141950 RND3 107473 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 152493697 152493937 152493847 Y RBM43,NMI NA NA NA NA NA ARL5A 189069 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 153057173 153057360 153057266 Y FMNL2 STAM2 FMNL2 IMR90 Hi-C 24141950 STAM2 26667 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 154379200 154379581 154379374 Y NA RPRM NA NA NA NA RPRM 45878 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 154729073 154729474 154729153 Y NA GALNT13 NA NA NA NA GALNT13 2647 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 157190328 157191531 157191235 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 5329 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr2 158067838 158068005 158067865 Y NA GALNT5 NA NA NA NA GALNT5 44105 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 158118717 158119062 158118890 Y GALNT5 GALNT5 NA NA NA NA GALNT5 6607 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 158325907 158326296 158326106 Y CYTIP NA NA NA NA NA GALNT5 213797 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 159251786 159251944 159251889 Y NA NA NA NA NA NA PKP4 59532 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 160491864 160492115 160492090 Y NA BAZ2B BAZ2B K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BAZ2B 20661 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 160646880 160647090 160646985 Y NA CD302 NA NA NA NA CD302 5663 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 161064664 161064880 161064794 Y NA NA ITGB6,RBMS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PLA2R1 147543 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 161065805 161066369 161066265 Y CD302 NA ITGB6,RBMS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PLA2R1 148684 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 161071101 161071394 161071301 Y ITGB6 NA ITGB6,RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 PLA2R1 153980 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr2 161078300 161078513 161078433 Y ITGB6 NA RBMS1,ITGB6,TANK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLA2R1 161179 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 161080666 161080905 161080769 Y NA NA ITGB6,RBMS1,TANK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLA2R1 163545 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 161083916 161084239 161083958 Y CD302,ITGB6 NA ITGB6,TANK,RBMS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLA2R1 166795 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 161085071 161085550 161085302 Y NA NA ITGB6,TANK,RBMS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLA2R1 167950 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 161086140 161086681 161086297 Y NA NA ITGB6,TANK,RBMS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLA2R1 169019 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 161098241 161098623 161098428 Y ITGB6 NA TANK,ITGB6,RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4785 163770 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 161232354 161232597 161232498 Y NA MIR4785 NA NA NA NA MIR4785 29796 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 161348201 161348679 161348535 Y RBMS1 NA NA NA NA NA RBMS1 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 161979819 161979978 161979936 Y TANK,TANK TANK PLA2R1,RBMS1,LY75-CD302,TANK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TANK 11441 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 162197345 162197490 162197464 Y NA PSMD14,AC009299.5 NA NA NA NA AC009299.5 1508 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr2 165430240 165430431 165430256 Y NA GRB14 NA NA NA NA GRB14 45927 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 165640958 165641192 165641060 Y NA NA NA NA NA NA COBLL1 56997 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 165683192 165683287 165683237 Y NA COBLL1 NA NA NA NA COBLL1 14902 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 165777057 165777208 165777083 Y NA NA NA NA NA NA COBLL1 78868 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 166796102 166796135 166796119 Y NA TTC21B NA NA NA NA TTC21B 12218 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 170219794 170220267 170220091 Y LRP2 NA NA NA NA NA BBS5 113421 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 171623254 171623407 171623331 Y NA EIF2S2P4,AC007405.4,AC007405.6,GAD1 NA NA NA NA AC007405.4 1869 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 171830049 171830396 171830113 Y NA GORASP2 NA NA NA NA GORASP2 47075 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 172959536 172959659 172959591 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 5969 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr2 172960097 172960530 172960322 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 5098 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr2 172961367 172961608 172961457 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 4020 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr2 172961678 172962145 172962061 Y NA DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 3483 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 173114788 173114930 173114869 Y NA NA ITGA6 IMR90 Hi-C 24141950 DLX2 149160 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 173117910 173118399 173118084 Y NA NA ITGA6 IMR90 Hi-C 24141950 DLX2 152282 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 173796243 173796588 173796342 Y NA NA NA NA NA NA RAPGEF4 198241 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 174016358 174016802 174016556 Y ZAK NA NA NA NA NA CDCA7 200746 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 174896632 174897390 174896767 Y SP3,SP3 NA SP3,OLA1,CDCA7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP3 68202 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr2 175837054 175837318 175837218 Y NA CHN1 NA NA NA NA CHN1 30779 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 178261376 178261686 178261570 Y NA AGPS,NFE2L2 NA NA NA NA NFE2L2 5951 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 178670849 178671197 178671023 Y NA NA NA NA NA NA TTC30A 189155 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 180044911 180045098 180045020 Y SESTD1 NA NA NA NA NA SESTD1 82419 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 187409105 187409391 187409239 Y ITGAV,ITGAV ITGAV ITGAV MCF7 ChIA-PET 22265404 ITGAV 43401 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 188404228 188404596 188404560 Y TFPI TFPI NA NA NA NA TFPI 23891 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 189064441 189064772 189064607 Y NA NA GULP1 IMR90 Hi-C 24141950 GULP1 89624 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 189994721 189995040 189994923 Y NA COL5A2 NA NA NA NA COL5A2 47565 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 190025289 190025449 190025364 Y COL3A1 COL5A2 NA NA NA NA COL5A2 17156 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 190043432 190043827 190043588 Y DIRC1,COL3A1,COL5A2 COL5A2 NA NA NA NA COL5A2 827 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr2 190151091 190151337 190151257 Y NA NA COL5A2,GULP1,COL3A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A2 108486 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 190272344 190272674 190272405 Y NA WDR75 COL5A2,GULP1,COL3A1,MIR1245B,WDR75,DIRC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WDR75 31485 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 190729809 190730106 190729887 Y OSGEPL1,PMS1 C2orf88 NA NA NA NA C2orf88 12229 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 190741113 190741271 190741187 Y NA C2orf88 NA NA NA NA C2orf88 1064 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 191075616 191075973 191075872 Y NA NA NA NA NA NA INPP1 130223 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 191492626 191492865 191492683 Y INPP1,STAT1,NAB1 NAB1 MFSD6 IMR90 Hi-C 24141950 NAB1 16607 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 191706618 191706816 191706674 Y GLS GLS GLS,STAT1,NAB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLS 36737 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 191706974 191707041 191707034 Y GLS GLS GLS,STAT1,NAB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLS 36512 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr2 191711355 191711777 191711579 Y GLS GLS GLS,STAT1,NAB1 IMR90 Hi-C 24141950 GLS 31776 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 191810388 191810629 191810413 Y GLS AC067945.3 STAT1 IMR90 Hi-C 24141950 AC067945.3 45664 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 191815156 191815612 191815322 Y GLS AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 40681 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 191876857 191877189 191877023 Y NA AC067945.3,STAT1 NA NA NA NA STAT1 6497 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 192071077 192071476 192071425 Y STAT4 MYO1B MYO1B,STAT4 IMR90 Hi-C 24141950 MYO1B 36435 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 192447130 192447364 192447247 Y NA NA OBFC2A K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AC098617.1 261901 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 192482352 192482618 192482501 Y OBFC2A NA OBFC2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC098617.1 226647 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 192500525 192500897 192500643 Y NA NA OBFC2A K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AC098617.1 208368 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 192562556 192562918 192562693 Y NA NA NA NA NA NA AC098617.1 146347 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 196018640 196018983 196018812 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A10 419718 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 196478695 196478993 196478847 Y NA SLC39A10 SLC39A10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC39A10 39994 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 197195800 197196140 197196081 Y NA NA NA NA NA NA STK17B 156573 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 197466180 197466534 197466307 Y NA HECW2,CCDC150 CCDC150,HECW2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HECW2 9764 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 197934286 197934620 197934500 Y NA NA NA NA NA NA PGAP1 143766 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 198158784 198159350 198159060 Y SF3B1,MOBKL3,MOBKL3,MOBKL3,COQ10B,ANKRD44 ATP5G2P3 NA NA NA NA ATP5G2P3 32949 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 198350765 198350931 198350852 Y NA COQ10B,HSPE1,MOB4,HSPD1 NA NA NA NA HSPE1 11787 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 198702876 198702992 198702942 Y NA PLCL1 NA NA NA NA PLCL1 35450 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 200800298 200800427 200800328 Y SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69 AC073043.1,C2orf69,C2orf47,TYW5 NA NA NA NA C2orf47 17613 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 201167757 201168004 201167857 Y SPATS2L,SPATS2L SPATS2L NA NA NA NA SPATS2L 600 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 201270357 201270484 201270442 Y CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1 NA NA NA NA NA SPATS2L 101753 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 201289842 201289940 201289893 Y NA NA NA NA NA NA SGOL2 82791 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 201652202 201652395 201652320 Y NA BZW1 BZW1 IMR90 Hi-C 24141950 BZW1 20922 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 201990242 201990732 201990460 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 11415 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 201992378 201992654 201992500 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 13551 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 201995421 201995893 201995513 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR,CASP10 NA NA NA NA CFLAR 16594 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 202078581 202078959 202078777 Y CASP10 CASP10,CASP8 NA NA NA NA CASP8 17207 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 202723656 202723936 202723797 Y NA NA NA NA NA NA CDK15 70472 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 202802147 202802175 202802161 Y NA NA ALS2,CDK15,FZD7,NOP58 IMR90 Hi-C 24141950 FZD7 95135 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 202898182 202898685 202898353 Y TMEM237,FZD7 FZD7 NA NA NA NA FZD7 872 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.97001892689844 chr2 203292079 203292309 203292231 Y NA NA NA NA NA NA BMPR2 52420 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 204311629 204311925 204311741 Y NBEAL1,CYP20A1,ABI2 NA NA NA NA NA RAPH1 86208 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 204548440 204549024 204548878 Y NA NA RAPH1,CD28 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 150307 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 204553496 204553837 204553643 Y NA NA RAPH1,CD28 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 155363 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 204676480 204676691 204676598 Y NA NA RAPH1,CD28,NBEAL1,CYP20A1 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 278347 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 205530118 205530314 205530216 Y NA NA NA NA NA NA PARD3B 121602 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 206005178 206005232 206005204 Y NA NA NA NA NA NA NRP2 539482 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 206571507 206572136 206571741 Y NRP2,INO80D NRP2 NA NA NA NA NRP2 26793 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 208027980 208028625 208028335 Y CREB1,KLF7 KLF7 NA NA NA NA KLF7 1366 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 3.28336487816406 chr2 208028732 208029438 208029179 Y METTL21A,CREB1,KLF7 KLF7 NA NA NA NA KLF7 553 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 208198821 208199856 208199157 Y KLF7 NA KLF7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC007879.7 96447 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 208202390 208203219 208202610 Y NA NA KLF7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC007879.7 100016 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 208368128 208368502 208368141 Y CREB1 CREB1 KLF7,CREB1,METTL21A,CCNYL1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB1 23959 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 208369274 208369395 208369347 Y NA CREB1 KLF7,CREB1,METTL21A,CCNYL1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB1 23066 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 208882565 208882782 208882664 Y CREB1,PIKFYVE,PLEKHM3 PLEKHM3 NA NA NA NA PLEKHM3 5502 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 211404935 211405006 211404955 Y CPS1 NA NA NA NA NA LANCL1 64559 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 214053041 214053239 214053088 Y NA NA NA NA NA NA SPAG16 93874 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 216223263 216223304 216223303 Y NA ATIC NA NA NA NA ATIC 48723 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 216473974 216474094 216474034 Y NA NA NA NA NA NA AC012462.1 174998 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 217204686 217204947 217204817 Y MARCH4 MARCH4 NA NA NA NA MARCH4 29803 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 217556283 217557311 217557110 Y NA NA NA NA NA NA IGFBP2 60732 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 218038981 218039219 218039100 Y NA NA DIRC3,IGFBP5,TNP1,IGFBP2 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP2 543430 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 219270976 219271406 219271230 Y CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1 AC021016.6,CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 9997 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 219336861 219337006 219336933 Y NA NA NA NA NA NA CTDSP1 75882 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 219596297 219596622 219596516 Y TMBIM1,PNKD,SLC11A1,USP37,TTLL4,CYP27A1 TTLL4,CYP27A1 NA NA NA NA TTLL4 22729 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 219760047 219760178 219760137 Y WNT10A WNT10A NA NA NA NA WNT10A 16962 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 219761045 219761550 219761369 Y USP37,ZNF142,ZFAND2B,TUBA4A,CNPPD1,ANKZF1,ANKZF1,WNT10A WNT10A NA NA NA NA WNT10A 17960 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 219773515 219774011 219773826 Y USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A WNT10A,CDK5R2 NA NA NA NA WNT10A 30430 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr2 219827943 219828258 219828078 Y USP37,STK36,PTPRN,PTPRN,CDK5R2,FEV CDK5R2,CRYBA2 NA NA NA NA CDK5R2 5566 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 220138813 220139187 220138862 Y INHA,CCDC108,ATG9A,GLB1L ATG9A,ANKZF1,STK16,TUBA4A,DNAJB2 NA NA NA NA TUBA4A 1705 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr2 220317654 220318040 220317775 Y GMPPA,GMPPA SPEG,GMPPA NA NA NA NA SPEG 20086 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 220385870 220386219 220385945 Y ACCN4 GMPPA,TMEM198,CHPF,INHA,OBSL1 NA NA NA NA TMEM198 20166 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr2 221093432 221093609 221093525 Y NA NA EPHA4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC4A3 603383 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr2 222242662 222242904 222242783 Y NA NA NA NA NA NA EPHA4 194018 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 222356179 222356366 222356273 Y NA NA NA NA NA NA EPHA4 80556 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 223447202 223447309 223447256 Y NA NA NA NA NA NA FARSB 71747 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 224325508 224325708 224325596 Y WDFY1 NA SCG2,AP1S3 IMR90 Hi-C 24141950 SCG2 139513 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 224413942 224414282 224414142 Y NA NA NA NA NA NA SCG2 50939 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr2 224751909 224752110 224752042 Y WDFY1 NA NA NA NA NA AP1S3 51165 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 224808298 224808709 224808400 Y WDFY1 WDFY1,MRPL44 NA NA NA NA WDFY1 194 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 224852422 224852838 224852675 Y NA WDFY1,MRPL44,SERPINE2 NA NA NA NA MRPL44 32301 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 225905656 225906528 225906251 Y CUL3,DOCK10 DOCK10 NA NA NA NA DOCK10 494 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 225965618 225965990 225965841 Y NA NA DOCK10 IMR90 Hi-C 24141950 DOCK10 60456 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 227015814 227016273 227016071 Y NA NA NA NA NA NA IRS1 646202 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 227665859 227666449 227665964 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 3384 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 228522025 228522410 228522050 Y CCL20,AGFG1 NA NA NA NA NA SLC19A3 58318 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 229922941 229923063 229923002 Y NA NA NA NA NA NA PID1 210938 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 230106282 230106638 230106611 Y NA PID1 NA NA NA NA PID1 27363 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 230177949 230179205 230178556 Y PID1 PID1 NA NA NA NA PID1 43948 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 230273013 230273684 230273347 Y PID1 NA NA NA NA NA PID1 139012 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 230330508 230330630 230330569 Y NA NA NA NA NA NA PID1 196507 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 231276384 231276790 231276706 Y NA SP100 NA NA NA NA SP100 1867 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 231658746 231658958 231658902 Y SP140L,SP100,SP100 NA NA NA NA NA ITM2C 68396 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 232055335 232055819 232055722 Y NA ARMC9 NA NA NA NA ARMC9 5441 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 232229850 232230117 232229960 Y NA B3GNT7 NA NA NA NA B3GNT7 28137 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 232276597 232276762 232276665 Y B3GNT7 B3GNT7,SNORD82 NA NA NA NA B3GNT7 18343 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 232277113 232277443 232277206 Y C2orf72 B3GNT7,SNORD82 NA NA NA NA B3GNT7 18859 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 232468888 232470128 232469532 Y DIS3L2,PTMA,NMUR1 NA NA NA NA NA LINC00471 91838 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 232478392 232478857 232478528 Y DIS3L2,PTMA NA NA NA NA NA PTMA 90748 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 232478879 232479328 232479053 Y NA NA NA NA NA NA PTMA 90277 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr2 232526700 232527324 232527119 Y DIS3L2 PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 42281 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 232530920 232531416 232531295 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 38189 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.97001892689844 chr2 232537656 232538064 232537748 Y NA PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 31541 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 232545684 232546083 232545868 Y COPS7B PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 23522 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 232580827 232581056 232580891 Y NA PTMA NA NA NA NA PTMA 11222 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 233283707 233283952 233283753 Y ALPPL2 NA NA NA NA NA EIF4E2 128810 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 234465976 234466363 234466311 Y HJURP USP40 NA NA NA NA USP40 7065 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr2 234614877 234615153 234615015 Y NA UGT1A7,UGT1A6 NA NA NA NA UGT1A6 16624 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 234615498 234615635 234615567 Y NA UGT1A7,UGT1A6 NA NA NA NA UGT1A6 17245 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr2 234670163 234670438 234670239 Y NA NA NA NA NA NA UGT1A6 71910 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr2 234673088 234673246 234673167 Y NA NA NA NA NA NA UGT1A6 74835 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.62669190253125 chr2 234764859 234765061 234764972 Y HJURP HJURP NA NA NA NA HJURP 3647 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 234882862 234883245 234883019 Y NA NA NA NA NA NA HJURP 121650 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 235905010 235905389 235905297 Y SH3BP4 SH3BP4 NA NA NA NA SH3BP4 46393 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 235952893 235953060 235952916 Y NA NA NA NA NA NA SH3BP4 94276 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 235959667 235960159 235959834 Y NA NA NA NA NA NA SH3BP4 101050 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 236562836 236563015 236562857 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 162103 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 237073092 237073409 237073337 Y NA AC079135.1 NA NA NA NA AC079135.1 681 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr2 237246448 237246491 237246461 Y IQCA1 NA NA NA NA NA IQCA1 167694 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 237247429 237247691 237247614 Y IQCA1 NA NA NA NA NA IQCA1 166494 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 238038460 238038824 238038818 Y NA COPS8,AC105760.2 COPS8,COL6A3,MLPH,PRLH,RAB17,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 46000 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 238066036 238066584 238066320 Y MLPH,COL6A3 NA COL6A3,COPS8,MLPH,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 73576 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 238080117 238080402 238080307 Y COL6A3 NA COL6A3,MLPH IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 87657 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr2 238092955 238093156 238093082 Y NA NA COL6A3,MLPH,LRRFIP1,RAB17,PRLH IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 100495 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 26.0480280334349 chr2 238105646 238105797 238105721 Y COL6A3 NA COL6A3,LRRFIP1,MLPH IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 113186 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.97001892689844 chr2 238131951 238132217 238132070 Y COL6A3 NA COL6A3,PRLH,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 139491 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr2 238136450 238136659 238136506 Y COL6A3 NA COL6A3,PRLH,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 143990 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr2 238168767 238169127 238169034 Y NA NA NA NA NA NA COL6A3 151891 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 238173251 238173336 238173294 Y COL6A3 NA NA NA NA NA COL6A3 147682 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 238188791 238189175 238189021 Y COL6A3 NA MLPH,COL6A3,COPS8 IMR90 Hi-C 24141950 COL6A3 131843 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr2 238190645 238190921 238190759 Y NA NA MLPH,COL6A3,COPS8,RAB17,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 COL6A3 130097 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 238199102 238199242 238199209 Y COL6A3 NA COL6A3,COPS8,MLPH,LRRFIP1,PRLH,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 COL6A3 121776 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr2 238214858 238215064 238214960 Y NA NA NA NA NA NA COL6A3 105954 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 238223884 238224369 238224058 Y COL6A3 NA NA NA NA NA COL6A3 96649 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr2 238292882 238293292 238292932 Y COPS8,LRRFIP1,COL6A3 COL6A3,AC112721.1,AC112721.2 NA NA NA NA COL6A3 27726 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 238299841 238300132 238300017 Y COPS8,LRRFIP1,COL6A3 COL6A3,AC112721.1,AC112721.2 NA NA NA NA COL6A3 20886 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 238320410 238321055 238320789 Y COL6A3 AC112721.1,AC112721.2 NA NA NA NA COL6A3 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 238321382 238321708 238321611 Y COL6A3 COL6A3,AC112721.1,AC112721.2 NA NA NA NA COL6A3 364 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 238374283 238374521 238374346 Y COL6A3 AC112721.1,AC112721.2,MLPH LRRFIP1,MLPH,PRLH,COL6A3,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 MLPH 17550 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 238384383 238384688 238384583 Y LRRFIP1 AC112721.2,MLPH LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MLPH 7383 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 238508822 238509122 238509050 Y RAB17,LRRFIP1 RAB17,LRRFIP1 NA NA NA NA RAB17 565 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 238512238 238512938 238512467 Y LRRFIP1 RAB17,LRRFIP1 LRRFIP1,MLPH,PRLH,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 RAB17 3981 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 238876433 238876638 238876539 Y LRRFIP1,UBE2F UBE2F NA NA NA NA UBE2F 2964 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 239347857 239348510 239348285 Y ASB1 ASB1 NA NA NA NA ASB1 14474 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr2 239593183 239593431 239593307 Y NA NA LOC151171 IMR90 Hi-C 24141950 TWIST2 161242 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 239755854 239755907 239755878 Y TWIST2 TWIST2 NA NA NA NA TWIST2 1181 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 239772979 239773251 239773061 Y NA TWIST2 NA NA NA NA TWIST2 18306 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr2 240196255 240196671 240196554 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 124459 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 240196933 240197336 240197049 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 123794 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 240920223 240920529 240920311 Y NA NDUFA10 NA NA NA NA NDUFA10 42290 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 241190569 241190767 241190645 Y NA NA GPC1,ANKMY1,PP14571 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYEOV2 116345 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 241309624 241309945 241309791 Y GPC1 NA PP14571,GPC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPC1 63143 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr2 241313615 241314182 241313884 Y NA NA GPC1 IMR90 Hi-C 24141950 GPC1 58906 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr2 241373489 241373922 241373594 Y GPC1 GPC1 NA NA NA NA GPC1 401 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr2 241374162 241374480 241374229 Y GPC1 GPC1 NA NA NA NA GPC1 1074 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 241995888 241996280 241996083 Y AQP12A,SNED1 MTERFD2 NA NA NA NA MTERFD2 43467 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 242050705 242051124 242050885 Y NA MTERFD2,PPP1R7,PASK NA NA NA NA MTERFD2 10958 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 242262018 242262304 242262161 Y NA SEPT2,HDLBP,FARP2 NA NA NA NA HDLBP 7542 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 242425566 242425726 242425646 Y NA STK25 NA NA NA NA STK25 21419 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 242480531 242480899 242480752 Y NA STK25,BOK NA NA NA NA BOK 15237 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr2 242484648 242485001 242484705 Y NA STK25,BOK NA NA NA NA BOK 11135 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 3.94003785379688 chr2 242485030 242485360 242485049 Y NA STK25,BOK NA NA NA NA BOK 10776 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 247683 247718 247701 Y NA C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1 NA NA NA NA C20orf96 21672 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 290672 290826 290757 Y SOX12,NRSN2 C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4 NA NA NA NA SOX12 13381 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr20 447394 447636 447634 Y NA TBC1D20 NA NA NA NA TBC1D20 6197 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 1258531 1258969 1258603 Y NA SNPH FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495 IMR90 Hi-C 24141950 SNPH 13571 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr20 1307828 1308261 1308086 Y SDCBP2 NA NA NA NA NA SNPH 62868 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 1372355 1372517 1372472 Y NA FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 549 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 1790289 1790734 1790591 Y NA NA SIRPA,STK35 IMR90 Hi-C 24141950 SIRPA 82420 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr20 3472887 3473113 3473000 Y NA ATRN NA NA NA NA ATRN 23200 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 3779808 3780100 3779895 Y PANK2,PANK2,CDC25B C20orf27,CENPB,CDC25B,MAVS NA NA NA NA CDC25B 14230 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 3788108 3788452 3788409 Y NA C20orf27,CENPB,CDC25B,MAVS NA NA NA NA CDC25B 22530 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 4065883 4066158 4066005 Y PANK2,RNF24,RNF24 SMOX RNF24,PANK2,MAVS,MIR103B2,LOC728228 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMOX 33469 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 5127563 5128387 5127720 Y GPCPD1,PRNP,PRNP,SLC23A2 PCNA,CDS2 NA NA NA NA CDS2 22131 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr20 5512444 5512652 5512587 Y CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1 NA NA NA NA NA GPCPD1 77020 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 5717960 5718260 5718168 Y C20orf196 C20orf196 NA NA NA NA C20orf196 10779 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 6015657 6015992 6015825 Y NA CRLS1,LRRN4 NA NA NA NA LRRN4 16703 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 7058177 7058257 7058218 Y NA NA NA NA NA NA TMX4 940219 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 8412863 8413194 8412910 Y TMX4,PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 302039 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 8464613 8464952 8464618 Y PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 353789 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 9013530 9013651 9013594 Y PLCB4 PLCB4 PLCB4,PLCB1 IMR90 Hi-C 24141950 PLCB4 33759 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr20 9032235 9032553 9032394 Y NA PLCB4 PLCB1,PLCB4 IMR90 Hi-C 24141950 PLCB4 14857 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 9181393 9181497 9181455 Y PLCB4,PLCB4,PLCB4 NA NA NA NA NA PLCB4 133983 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr20 9384292 9384675 9384295 Y PLCB4,PLCB4,PLCB4 NA NA NA NA NA PLCB4 336882 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 10472654 10473100 10472965 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 59784 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 10482481 10482747 10482670 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 69611 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 11242212 11242292 11242265 Y NA NA NA NA NA NA JAG1 617198 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 11831025 11831188 11831107 Y BTBD3 BTBD3 NA NA NA NA BTBD3 38183 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 12250218 12250236 12250226 Y NA NA NA NA NA NA BTBD3 380847 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 17830512 17830807 17830760 Y NA NA BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD17 110782 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr20 17830949 17831353 17831268 Y NA NA BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD17 110236 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 17876337 17876490 17876431 Y NA NA BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5,C20orf72 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNORD17 65099 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr20 18686203 18686430 18686281 Y NA NA NA NA NA NA DTD1 119666 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 19005334 19005751 19005629 Y NA NA NA NA NA NA DTD1 438797 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 19716018 19716528 19716293 Y NA RP1-122P22.2 NA NA NA NA RP1-122P22.2 19824 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 19797665 19798070 19797910 Y RIN2,RIN2 NA RIN2,SLC24A3,NAA20 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-122P22.2 61313 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 19804713 19804972 19804782 Y NA NA RIN2,SLC24A3,NAA20 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-122P22.2 68361 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 19860938 19861220 19861002 Y NA NA SLC24A3,RIN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP1-122P22.2 124586 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 21417020 21417216 21417107 Y NA NA XRN2 IMR90 Hi-C 24141950 XRN2 135078 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr20 21490493 21490731 21490612 Y NA NA NA NA NA NA XRN2 208551 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 21967491 21967519 21967505 Y NA NA NA NA NA NA XRN2 685549 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 22744166 22744500 22744407 Y THBD NA THBD,NXT1,NAPB IMR90 Hi-C 24141950 NXT1 584873 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr20 23008232 23008345 23008289 Y NA NA NA NA NA NA NXT1 321028 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 23160683 23160807 23160718 Y CSTL1,CST9L,CST8 NA THBD,SSTR4,CD93,NXT1 IMR90 Hi-C 24141950 NXT1 168566 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 24451680 24451884 24451790 Y TMEM90B NA NA NA NA NA ACSS1 585732 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 25214082 25214352 25214216 Y ENTPD6,PYGB ENTPD6,PYGB NA NA NA NA PYGB 12353 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 25218471 25218756 25218634 Y NA ENTPD6,PYGB NA NA NA NA PYGB 7949 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 25229395 25229593 25229494 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 2690 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 25671297 25671837 25671511 Y NA ZNF337 NA NA NA NA ZNF337 3640 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 25842208 25842444 25842317 Y ZNF337 NA NA NA NA NA RP13-401N8.1 112354 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr20 25846181 25846562 25846485 Y ZNF337 NA NA NA NA NA RP13-401N8.1 116327 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr20 30175524 30175854 30175562 Y NA ID1 NA NA NA NA ID1 15232 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 30182515 30183026 30182914 Y NA ID1 HM13 MCF7 ChIA-PET 22265404 ID1 8060 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 30183712 30184220 30184085 Y ID1 ID1 HM13 MCF7 ChIA-PET 22265404 ID1 6866 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr20 30190743 30190994 30190797 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 92 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 30191850 30192346 30192159 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 764 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr20 30196293 30196740 30196417 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 5207 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr20 30249247 30249862 30249570 Y TTLL9 NA NA NA NA NA ID1 58161 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 30262675 30263005 30262853 Y HCK,BCL2L1 BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 46787 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 30300504 30300973 30300648 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 8819 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr20 30307720 30308274 30308104 Y POFUT1 BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 1518 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr20 30482952 30483213 30483055 Y NA DUSP15 NA NA NA NA DUSP15 26402 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 31063072 31063625 31063366 Y NA NA ASXL1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf112 107251 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 3.50225587004167 chr20 31998840 31999088 31998873 Y C20orf185 CDK5RAP1,SNTA1 CDK5RAP1 IMR90 Hi-C 24141950 CDK5RAP1 11473 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 32142835 32143155 32142948 Y C20orf186,CDK5RAP1,CHMP4B NA NA NA NA NA CBFA2T2 66954 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 32690137 32690399 32690268 Y NA EIF2S2,RPS2P1 NA NA NA NA EIF2S2 7739 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 32803456 32803920 32803688 Y NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 93688 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.18890991877604 chr20 32989671 32989803 32989744 Y NA ITCH NA NA NA NA ITCH 40630 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 33064297 33064587 33064427 Y ACSS2 FDX1P1,DYNLRB1 NA NA NA NA FDX1P1 2018 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 33735973 33736225 33736096 Y TRPC4AP,EDEM2 PROCR NA NA NA NA PROCR 21651 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 33896147 33896435 33896303 Y EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 NA NA NA NA EIF6 25359 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 33906285 33906606 33906471 Y GSS,EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 35497 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr20 33907745 33907913 33907842 Y MMP24,GDF5 EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 36957 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 33908268 33908438 33908376 Y NA EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 37480 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr20 34217204 34217560 34217502 Y NA SPAG4,CPNE1,RBM12 NA NA NA NA SPAG4 15390 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 34303643 34304038 34303890 Y NA ROMO1,NFS1,RBM39,RPF2P1 NA NA NA NA NFS1 18362 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr20 34356129 34356371 34356208 Y SPAG4,CPNE1,RBM39,SCAND1,PHF20 RBM39,RPF2P1,PHF20 NA NA NA NA PHF20 1525 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr20 34357066 34357356 34357208 Y NA RBM39,RPF2P1,PHF20 NA NA NA NA PHF20 540 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr20 34471781 34472424 34472101 Y NA RNU4-40P NA NA NA NA RNU4-40P 1157 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr20 34652590 34653055 34652672 Y NA EPB41L1 LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EPB41L1 24371 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr20 35234952 35235695 35235080 Y NA TGIF2,C20orf24 NA NA NA NA C20orf24 2815 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 35464098 35464342 35464182 Y RBL1,DSN1,DSN1 NA NA NA NA NA DSN1 63877 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 4.15892884567448 chr20 36041191 36041579 36041445 Y NA RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 30357 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 36132626 36132893 36132840 Y NA BLCAP NA NA NA NA BLCAP 21440 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 36135409 36135682 36135567 Y NA BLCAP NA NA NA NA BLCAP 18651 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 36534418 36534720 36534476 Y NA VSTM2L NA NA NA NA VSTM2L 4919 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 36763112 36763416 36763201 Y NA TGM2 NA NA NA NA TGM2 29564 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr20 36772576 36772945 36772677 Y RPRD1B,BPI TGM2 NA NA NA NA TGM2 20035 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 36899646 36899868 36899757 Y BPI KIAA1755 NA NA NA NA KIAA1755 12472 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 38647723 38647728 38647726 Y NA NA NA NA NA NA MAFB 668152 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 39632234 39632572 39632465 Y MAFB,TOP1 RNU2-52P,TOP1 PLCG1,TOP1,ZHX3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU2-52P 18273 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 39785946 39786458 39785968 Y CHD6,PLCG1 PLCG1 NA NA NA NA PLCG1 22346 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 39826598 39826945 39826630 Y CHD6 NA NA NA NA NA PLCG1 62998 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 39878072 39878223 39878164 Y NA NA NA NA NA NA ZHX3 66089 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 39958158 39958419 39958360 Y NA ZHX3,LPIN3 PLCG1,ZHX3,LPIN3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LPIN3 9141 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr20 42286061 42286420 42286177 Y SRSF6,L3MBTL1,MYBL2 MYBL2 MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 7334 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr20 42381187 42381490 42381296 Y C20orf111 NA TOX2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 87433 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 42780306 42780638 42780459 Y NA JPH2 NA NA NA NA JPH2 33580 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr20 42938917 42939166 42938990 Y NA FITM2 GDAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 FITM2 1108 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 42955373 42955435 42955404 Y NA FITM2 NA NA NA NA FITM2 17564 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 43272652 43273023 43272879 Y C20orf111,STK4,ADA ADA,RP11-445H22.3 NA NA NA NA ADA 5851 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 43321614 43322020 43321838 Y WISP2,KCNK15 ADA,RP11-445H22.3 LOC79015,YWHAB,WISP2,SERINC3,TTPAL,PKIG,ADA,KCNK15,RIMS4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-445H22.3 717 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr20 43596220 43596403 43596301 Y SERINC3,YWHAB,SYS1,STK4 TOMM34,STK4 NA NA NA NA STK4 3105 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 43767332 43767709 43767669 Y NA NA STK4,MATN4,RBPJL IMR90 Hi-C 24141950 SLPI 113496 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 43965327 43965544 43965453 Y SDC4 SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 9520 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 44410242 44410504 44410445 Y NA DNTTIP1,UBE2C,SNX21 NA NA NA NA DNTTIP1 8072 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 45858819 45859007 45858915 Y NA NA NA NA NA NA RP4-569M23.2 120298 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 45944502 45944683 45944617 Y NA RP4-569M23.2,ZMYND8 NA NA NA NA RP4-569M23.2 34622 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr20 45946049 45946481 45946179 Y NA RP4-569M23.2,ZMYND8 NA NA NA NA RP4-569M23.2 32824 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr20 45962816 45963214 45963054 Y NA RP4-569M23.2,ZMYND8 NA NA NA NA RP4-569M23.2 16091 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 45989347 45989834 45989660 Y SULF2 RP4-569M23.2,ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 5780 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr20 46653872 46653986 46653882 Y NA NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 NCOA3 525271 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr20 47750965 47751079 47750977 Y ZNFX1 NA NA NA NA NA STAU1 51825 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 47961628 47961789 47961714 Y NA NA B4GALT5 IMR90 Hi-C 24141950 ZNFX1 68665 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 48065517 48065771 48065626 Y NA NA NA NA NA NA PTGIS 116912 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 48165703 48166239 48166052 Y PTGIS PTGIS NA NA NA NA PTGIS 16444 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 48174087 48174267 48174236 Y NA PTGIS NA NA NA NA PTGIS 8416 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr20 48179009 48179108 48179059 Y NA PTGIS NA NA NA NA PTGIS 3575 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr20 48190419 48190797 48190608 Y PTGIS PTGIS KCNB1,PTGIS,SLC9A8,B4GALT5,ZNFX1-AS1,ZNFX1 IMR90 Hi-C 24141950 PTGIS 7736 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 48200445 48200486 48200453 Y NA PTGIS ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 PTGIS 17762 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 48221158 48221415 48221229 Y PTGIS PTGIS ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 PTGIS 38475 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr20 48315836 48316073 48315912 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 12342 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 48388811 48389348 48388940 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC9A8 37902 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 48865015 48865181 48865091 Y NA NA PTPN1,CEBPB,FAM65C,MIR645,LOC284751,PARD6B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CEBPB 59639 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 48868757 48869061 48868987 Y NA NA PTPN1,FAM65C,MIR645,CEBPB,LOC284751,PARD6B IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CEBPB 63381 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 48903106 48903611 48903352 Y NA NA LOC284751,PARD6B,PTPN1,FAM65C,MIR645,CEBPB IMR90 Hi-C 24141950 CEBPB 97730 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr20 48924890 48925591 48925260 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA NA NA NA NA CEBPB 119514 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 49067387 49067853 49067497 Y SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C,MIR645,PARD6B IMR90 Hi-C 24141950 PTPN1 57038 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 49134968 49135201 49135019 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 NA NA NA NA PTPN1 10077 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr20 49407275 49407470 49407371 Y MOCS3 BCAS4 ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCAS4 1961 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr20 49838536 49838841 49838768 Y NA NA KCNG1 IMR90 Hi-C 24141950 KCNG1 200870 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 49976918 49977375 49977162 Y NFATC2 NA NA NA NA NA KCNG1 339252 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 49982609 49983533 49983215 Y KCNG1 NA NA NA NA NA KCNG1 344943 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr20 50383575 50384083 50383723 Y ATP9A RP5-827A12.2,ATP9A NA NA NA NA ATP9A 402 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr20 50665033 50665229 50665099 Y NA NA ATP9A,NFATC2,SALL4,ZFP64 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP64 153618 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 51110889 51111034 51110969 Y NA NA NA NA NA NA ZFP64 292042 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 51648602 51648709 51648656 Y NA NA NA NA NA NA ZNF217 575737 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 52196593 52196861 52196746 Y TSHZ2,ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 27585 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr20 52201463 52201802 52201714 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 22644 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 52213211 52213282 52213247 Y NA ZNF217 BMP7,SUMO1P1,BCAS1,CYP24A1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF217 11164 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 52239995 52240318 52240062 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BMP7,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 15549 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr20 52294676 52294905 52294769 Y NA NA BMP7,SUMO1P1,BCAS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF217 70230 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 52323078 52323315 52323172 Y NA NA SUMO1P1,ZNF217 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 98632 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 52390351 52390640 52390407 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 165905 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 52391089 52391563 52391364 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 166643 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr20 52445043 52445455 52445100 Y NA NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 220597 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 52445816 52446339 52446069 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 221370 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr20 52482655 52483054 52482957 Y NA NA NA NA NA NA ZNF217 258209 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 52532315 52532889 52532591 Y ZNF217 NA SUMO1P1,BMP7,ZNF217 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYP24A1 255623 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 52550838 52551665 52551067 Y ZNF217 NA NA NA NA NA CYP24A1 236847 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 52749873 52750284 52750109 Y NA CYP24A1 NA NA NA NA CYP24A1 38228 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 52753645 52754029 52753762 Y NA CYP24A1 NA NA NA NA CYP24A1 34483 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr20 54997703 54998108 54997901 Y NA AURKA,CSTF1 NA NA NA NA CSTF1 32276 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr20 55014874 55015273 55015037 Y CASS4,CASS4,C20orf43 AURKA,CSTF1 NA NA NA NA CSTF1 49447 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr20 55363467 55363682 55363577 Y NA NA TFAP2C MCF7 ChIA-PET 22265404 PTMAP6 88897 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 56273255 56273697 56273462 Y PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1 PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 10895 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 56293544 56293843 56293665 Y NA PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 8952 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 57198784 57199334 57199089 Y NA STX16,STX16-NPEPL1 NA NA NA NA STX16 24994 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 57585788 57586041 57585915 Y NA CTSZ,ATP5E,SLMO2 NA NA NA NA CTSZ 5486 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 60095984 60096281 60096088 Y CDH4 NA NA NA NA NA CDH4 270502 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 60500389 60500694 60500636 Y NA NA NA NA NA NA TAF4 138172 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 60719468 60719634 60719593 Y SS18L1,GTPBP5 LSM14B,PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 2646 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 60934143 60934390 60934309 Y TAF4,PSMA7,SS18L1,RPS21,NTSR1,CABLES2,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5 LAMA5,RPS21,CABLES2 ADRM1 K562 ChIA-PET 22265404 LAMA5 5978 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr20 61187660 61187821 61187741 Y NA NA NA NA NA NA SLCO4A1 83976 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 61192605 61193059 61192901 Y NA NA NA NA NA NA SLCO4A1 78738 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 61283206 61283870 61283565 Y OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1 SLCO4A1 NA NA NA NA SLCO4A1 11409 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr20 61560348 61560848 61560731 Y NA DIDO1,SLC17A9 NA NA NA NA DIDO1 6456 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 61687989 61688195 61688101 Y NA NA NA NA NA NA SLC17A9 105937 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 62313782 62314225 62314041 Y NA STMN3,RTEL1,ZGPAT,ARFRP1 NA NA NA NA ZGPAT 22592 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 5.47227479694011 chr20 62609214 62609358 62609321 Y SAMD10 UCKL1,SAMD10,PRPF6 NA NA NA NA SAMD10 3 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr20 62887659 62888425 62887862 Y SAMD10,PCMTD2 PCMTD2 NA NA NA NA PCMTD2 2565 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr21 11130122 11130404 11130162 Y NA BAGE2 BAGE5 IMR90 Hi-C 24141950 BAGE2 33142 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 16064365 16064765 16064448 Y HSPA13,SAMSN1,NRIP1 NA NA NA NA NA SAMSN1 110642 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 16129964 16130277 16130229 Y NA NA NA NA NA NA SAMSN1 176241 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 16368229 16368687 16368553 Y NRIP1 NA NA NA NA NA NRIP1 66634 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr21 17906909 17907886 17907248 Y NA NA NA NA NA NA USP25 806565 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 17959400 17959753 17959559 Y NA NA NA NA NA NA USP25 859056 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 17960667 17961305 17960883 Y NA NA NA NA NA NA USP25 860323 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 22545026 22545343 22545185 Y NA NA NA NA NA NA NCAM2 176393 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr21 23121365 23121760 23121563 Y NA NA NA NA NA NA NCAM2 752732 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 26762963 26763092 26762975 Y NA NA NA NA NA NA MIR155HG 169129 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 26952057 26952278 26952105 Y JAM2 MIR155HG,MRPL39 NA NA NA NA MIR155HG 19836 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 27370700 27370785 27370725 Y NA NA NA NA NA NA APP 170661 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 28218728 28219247 28219071 Y ADAMTS5,ADAMTS1 ADAMTS1 NA NA NA NA ADAMTS1 3000 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr21 28221663 28222017 28221832 Y NA ADAMTS1 LINC00113 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS1 5935 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 28288547 28289033 28288781 Y ADAMTS5,ADAMTS1 ADAMTS5 NA NA NA NA ADAMTS5 47799 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 28319364 28319698 28319531 Y CYYR1 ADAMTS5 NA NA NA NA ADAMTS5 17134 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 28942187 28942353 28942343 Y NA NA ADAMTS1,ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS5 605355 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 28942556 28942990 28942803 Y NA NA ADAMTS1,ADAMTS5,MIR4759 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS5 605724 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr21 28943005 28943182 28943085 Y NA NA ADAMTS1,ADAMTS5,MIR4759 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS5 606173 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 29660800 29661042 29660922 Y NA NA ADAMTS1,ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 594651 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 30005077 30005224 30005162 Y NA NA ADAMTS1,LINC00161 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 250469 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr21 30006167 30006692 30006407 Y NA NA ADAMTS1,LINC00161 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 249001 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 30009773 30009970 30009799 Y NA NA ADAMTS1,LINC00161 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 245723 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr21 30590117 30590529 30590261 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,BACH1 NA NA NA NA BACH1 25725 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 33893754 33894020 33893930 Y C21orf63 NA NA NA NA NA C21orf59 89156 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 34511790 34511958 34511923 Y NA NA OLIG1 IMR90 Hi-C 24141950 IFNAR2 88248 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 34836293 34836479 34836379 Y OLIG2,OLIG1,CRYZL1,TMEM50B TMEM50B,DNAJC28 NA NA NA NA TMEM50B 13839 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 35057919 35058071 35057938 Y NA ITSN1,CRYZL1 NA NA NA NA CRYZL1 43687 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 35750965 35751183 35751074 Y KCNE1 NA NA NA NA NA RCAN1 234258 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 35925582 35925949 35925790 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 59492 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr21 36203156 36203348 36203246 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 217715 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 36234553 36234896 36234857 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 249112 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr21 36257911 36258724 36258067 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 272470 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 36356108 36356416 36356285 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 370667 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr21 36457286 36457490 36457388 Y NA NA RUNX1 IMR90 Hi-C 24141950 RCAN1 471845 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 36458819 36458923 36458887 Y NA NA RUNX1 IMR90 Hi-C 24141950 RCAN1 473378 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr21 36577614 36577815 36577724 Y NA NA RUNX1,SETD4,CLIC6,LOC100506385 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RCAN1 592173 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr21 37009808 37010026 37009922 Y NA NA RUNX1,CLIC6,LINC00160,LOC100506385 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1 364939 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 37712607 37712952 37712729 Y NA MORC3,CHAF1B NA NA NA NA MORC3 22120 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr21 37850474 37850838 37850572 Y NA AP000695.6 NA NA NA NA AP000695.6 49816 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr21 38232574 38232719 38232637 Y NA NA NA NA NA NA AP000704.5 104093 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr21 38235070 38235202 38235136 Y TTC3,HLCS NA NA NA NA NA AP000704.5 101610 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 38630405 38630786 38630710 Y DYRK1A,DYRK1A AP001432.14,DSCR3 NA NA NA NA DSCR3 7476 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 38935728 38936411 38936235 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 199636 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 3.28336487816406 chr21 38936686 38937128 38936852 Y DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 200594 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 40527943 40528201 40528072 Y NA PSMG1 NA NA NA NA PSMG1 25576 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 40753076 40753485 40753292 Y WRB HMGN1,WRB NA NA NA NA WRB 2906 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 42543184 42543509 42543444 Y BACE2 BACE2 NA NA NA NA BACE2 5456 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 43062216 43062499 43062352 Y MX1 NA PRDM15,RIPK4 IMR90 Hi-C 24141950 RIPK4 122767 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr21 43460613 43461088 43460825 Y C2CD2,SLC37A1 NA NA NA NA NA C2CD2 88614 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr21 43758079 43758185 43758132 Y NA NA NA NA NA NA SLC37A1 155933 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 44614192 44614410 44614235 Y NA NA HSF2BP,LINC00313,SIK1 IMR90 Hi-C 24141950 U2AF1 88495 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr21 44753292 44753457 44753456 Y NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 91551 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 44816664 44817004 44816885 Y NA SIK1 NA NA NA NA SIK1 28004 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr21 44942511 44942810 44942777 Y PDXK NA NA NA NA NA SIK1 97503 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 45015260 45015643 45015451 Y NA NA NA NA NA NA HSF2BP 61731 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 45020604 45020960 45020754 Y NA NA NA NA NA NA HSF2BP 56414 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 5.2533838050625 chr21 45023085 45023419 45023272 Y TRAPPC10,PDXK,CSTB,U2AF1 NA NA NA NA NA HSF2BP 53955 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 45080522 45080871 45080626 Y TRAPPC10,PWP2,SIK1,RRP1B HSF2BP,RRP1B NA NA NA NA RRP1B 3093 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 45187861 45188442 45188176 Y ICOSLG,PDXK,CSTB CSTB,RRP1 NA NA NA NA CSTB 5884 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr21 45590858 45591062 45590983 Y PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG C21orf33 C21orf33,PWP2,ICOSLG K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C21orf33 39371 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 45623766 45623798 45623779 Y TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG ICOSLG PFKL,AIRE MCF7 ChIA-PET 22265404 ICOSLG 35051 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 46302536 46302756 46302646 Y NA PTTG1IP,ITGB2 PTTG1IP MCF7 ChIA-PET 22265404 PTTG1IP 10784 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 46495480 46495526 46495490 Y KRTAP10-12,ADARB1 ADARB1 NA NA NA NA ADARB1 3712 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 46550297 46550615 46550364 Y ITGB2 NA NA NA NA NA ADARB1 58529 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 46737459 46737695 46737585 Y COL18A1 POFUT2 COL18A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 POFUT2 31646 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 46738832 46739011 46738964 Y COL18A1 POFUT2 COL18A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 POFUT2 33019 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr21 46739517 46739788 46739671 Y NA POFUT2 COL18A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 POFUT2 33704 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr21 46749941 46750271 46750188 Y NA POFUT2 COL18A1,LINC00315,LOC642852,POFUT2,COL18A1-AS1,LOC100129027,PCBP3,ADARB1,SLC19A1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 POFUT2 44128 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 46783934 46784395 46784118 Y NA COL18A1 ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COL18A1 38657 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr21 46786853 46787266 46786994 Y COL18A1,POFUT2 COL18A1 ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL18A1 35786 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 46831544 46831752 46831652 Y NA COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 8492 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 46891281 46891413 46891347 Y NA NA SLC19A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL18A1 68229 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 47010868 47011351 47011033 Y NA SLC19A1,AL133493.2 PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AL133493.2 217 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 47240506 47240853 47240623 Y NA NA NA NA NA NA COL6A1 158798 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 47295042 47295436 47295304 Y NA NA NA NA NA NA COL6A1 104215 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 47394030 47394545 47394409 Y LSS,COL6A2,C21orf56,COL6A1 COL6A1 COL6A1 K562 ChIA-PET 22265404 COL6A1 5106 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr21 47395087 47395227 47395108 Y COL6A2,COL6A1 COL6A1 COL6A1 K562 ChIA-PET 22265404 COL6A1 4424 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 47469357 47469652 47469491 Y COL6A1,COL6A2 COL6A2 COL6A2,FTCD,PCBP3,COL6A1,LSS,MCM3AP-AS1,C21orf56 IMR90 Hi-C 24141950 COL6A2 46359 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 47480637 47481027 47480832 Y COL6A1,COL6A2 COL6A2 COL6A2,FTCD,C21orf56,MCM3AP-AS1,MCM3AP,COL6A1,LSS IMR90 Hi-C 24141950 COL6A2 34984 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr21 47543656 47544056 47543951 Y NA COL6A2 NA NA NA NA COL6A2 27645 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr21 47563985 47564239 47564071 Y NA COL6A2 NA NA NA NA COL6A2 47974 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr22 17306294 17306463 17306397 Y IL17RA,CECR1 NA NA NA NA NA TPTEP1 225517 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr22 17652206 17652871 17652785 Y NA CECR5-AS1,CECR5,AC005300.5 NA NA NA NA CECR5 8029 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr22 18162976 18163469 18163294 Y NA NA NA NA NA NA BCL2L13 53355 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 3.06447388628646 chr22 19930770 19931097 19930953 Y ZDHHC8,COMT COMT,TXNRD2 NA NA NA NA TXNRD2 3429 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr22 19983308 19983423 19983389 Y NA ARVCF NA NA NA NA ARVCF 18908 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 20287043 20287283 20287165 Y NA RTN4R,DGCR6L NA NA NA NA RTN4R 18274 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 20772547 20772776 20772578 Y PI4KA ZNF74,SCARF2 NA NA NA NA SCARF2 17370 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 20863506 20864089 20863850 Y MED15 KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 15306 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr22 21285744 21286048 21285865 Y NA CRKL,XXbac-B135H6.15,LZTR1 NA NA NA NA CRKL 16030 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr22 21925144 21925370 21925257 Y NA SCARNA17,UBE2L3 NA NA NA NA UBE2L3 23408 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 22011632 22012115 22011859 Y NA YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 7073 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr22 24255997 24256450 24256302 Y C22orf43,CABIN1,CABIN1 MIF NA NA NA NA MIF 21806 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 24603797 24604355 24604162 Y GGT1,ADORA2A SUSD2 NA NA NA NA SUSD2 28570 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 24870306 24870552 24870389 Y GGT1 NA NA NA NA NA ADORA2A 58459 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr22 25381840 25382180 25381995 Y NA NA KIAA1671 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD56 86659 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 25458331 25458606 25458444 Y NA NA NA NA NA NA SNORD56 163150 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 27041081 27041748 27041447 Y SEZ6L,ASPHD2 CTA-211A9.5 MIAT IMR90 Hi-C 24141950 CTA-211A9.5 24982 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 27501495 27502092 27501824 Y NA NA PITPNB,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1172A22.1 116596 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 27503626 27504166 27503976 Y NA NA PITPNB,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1172A22.1 114522 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 27506238 27506397 27506317 Y NA NA PITPNB,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1172A22.1 112291 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 27508990 27509624 27509325 Y NA NA PITPNB,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1172A22.1 109064 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 27527504 27527688 27527616 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1172A22.1 91000 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 27530003 27530818 27530508 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1172A22.1 87870 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr22 27637752 27637979 27637866 Y NA RP5-1172A22.1 MIAT,MN1 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1172A22.1 19064 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 27872779 27873029 27872871 Y NA NA PITPNB,TTC28,TTC28-AS1,MN1,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1172A22.1 254091 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr22 28065247 28065726 28065530 Y PITPNB,MN1 NA MIAT,MN1 IMR90 Hi-C 24141950 MN1 129760 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 28114157 28114741 28114406 Y PITPNB,MN1 NA NA NA NA NA MN1 80745 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 28122669 28123242 28122949 Y PITPNB,MN1 NA NA NA NA NA MN1 72244 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 28314180 28314595 28314448 Y PITPNB TTC28-AS1,PITPNB NA NA NA NA PITPNB 58 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 29209751 29210048 29209892 Y CCDC117,XBP1 CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6 CHEK2,HSCB,C22orf31,ZNRF3,KREMEN1,TTC28,TTC28-AS1,EMID1,CCDC117,XBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTA-292E10.6 15080 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 29261004 29261197 29261109 Y ZNRF3 ZNRF3 TTC28,ZNRF3,KREMEN1,C22orf31,EMID1,EWSR1,RHBDD3 IMR90 Hi-C 24141950 ZNRF3 16383 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 29469912 29470391 29470070 Y XBP1,KREMEN1 KREMEN1 NA NA NA NA KREMEN1 2846 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 29705410 29705600 29705517 Y GAS2L1 EWSR1,RHBDD3,GAS2L1 NA NA NA NA GAS2L1 4838 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 30014203 30014547 30014300 Y NA NIPSNAP1,NF2 NA NA NA NA NF2 16658 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 30178140 30178286 30178234 Y NA ZMAT5,UQCR10 NA NA NA NA UQCR10 16782 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 30604572 30605275 30604996 Y NA LIF HORMAD2,LIF,GATSL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIF 35565 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr22 30653574 30654311 30654075 Y RNF215,GAL3ST1 LIF,GATSL3 LIF IMR90 Hi-C 24141950 LIF 12734 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr22 31005316 31005631 31005442 Y SMTN,OSM,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1,DUSP18,SLC35E4 PES1,SLC35E4 NA NA NA NA PES1 4246 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 31229455 31229575 31229536 Y NA NA NA NA NA NA MORC2 132709 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 31639418 31639541 31639442 Y NA LIMK2,PIK3IP1 NA NA NA NA LIMK2 33193 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 31639719 31639839 31639804 Y LIMK2 LIMK2,PIK3IP1 NA NA NA NA LIMK2 33494 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 31639861 31640267 31640177 Y NA LIMK2,PIK3IP1 NA NA NA NA LIMK2 33636 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 32048774 32049039 32049031 Y NA PISD SFI1,EIF4ENIF1,DEPDC5,YWHAH,C22orf24,C22orf28,LOC339666,RFPL3-AS1,PRR14L GM12878,K562,IMR90 5C,Hi-C 22955621,24141950 PISD 7379 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 32928366 32928835 32928615 Y NA NA NA NA NA NA FBXO7 59703 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 33091404 33091880 33091552 Y TIMP3,SYN3 NA NA NA NA NA TIMP3 103807 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 33199078 33199894 33199157 Y NA TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 3391 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 34073272 34073505 34073390 Y NA NA NA NA NA NA TIMP3 877585 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 36385915 36386246 36386112 Y NA RBFOX2 NA NA NA NA RBFOX2 36227 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 36727482 36728450 36727733 Y APOL3 NA NA NA NA NA MYH9 53613 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 36765300 36765605 36765487 Y APOL3,NCF4,MYH9 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 16458 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 36766615 36766810 36766723 Y NCF4,MYH9 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 15253 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr22 36806147 36806450 36806256 Y NA MYH9,RP4-633O19__A.1 MYH9,FOXRED2,TXN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP4-633O19__A.1 23476 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr22 36858236 36858440 36858372 Y MYH9 TXN2,FOXRED2 NA NA NA NA TXN2 17637 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 37518077 37518635 37518386 Y MFNG,MFNG,RAC2,IL2RB NA NA NA NA NA KCTD17 72298 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 37582993 37583226 37583109 Y NA C1QTNF6,Z82188.1 NA NA NA NA C1QTNF6 10199 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 37638328 37638951 37638750 Y SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4 C1QTNF6,Z82188.1,CYTH4 NA NA NA NA RAC2 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr22 37942064 37942352 37942192 Y KCTD17,TRIOBP,POLR2F,MICALL1,LGALS1,ANKRD54,CARD10,CDC42EP1 CARD10,CDC42EP1 ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC42EP1 12102 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr22 37942978 37943343 37943114 Y NA CARD10,CDC42EP1 ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC42EP1 11111 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 38139873 38139989 38139967 Y NA TRIOBP H1F0,GCAT IMR90 Hi-C 24141950 TRIOBP 48862 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 38148564 38148886 38148725 Y CDC42EP1 NA NA NA NA NA H1F0 50228 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 39541576 39542088 39541730 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7 CBX7 NA NA NA NA CBX7 4591 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 39570711 39571096 39570941 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,PDGFB,APOBEC3G,APOBEC3H CBX7 PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CBX7 24032 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 39610460 39610820 39610697 Y NA PDGFB NA NA NA NA PDGFB 27936 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr22 41047729 41047883 41047796 Y NA MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17023 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 41417973 41418366 41418067 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39690 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr22 41418482 41418837 41418726 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39219 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr22 41460471 41460696 41460583 Y NA RP11-12M9.3,RP11-12M9.4,EP300 RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-12M9.3 2415 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 41684313 41684541 41684479 Y PPPDE2,RANGAP1 RANGAP1,ZC3H7B NA NA NA NA RANGAP1 4058 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr22 41776948 41777130 41776981 Y NA TEF NA NA NA NA TEF 15611 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr22 41840300 41840792 41840564 Y NA TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 235 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr22 42331053 42331125 42331089 Y SHISA8 CENPM,SEPT3 NA NA NA NA CENPM 10043 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 43116155 43116318 43116237 Y CYB5R3,A4GALT A4GALT NA NA NA NA A4GALT 851 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr22 43165805 43166293 43166166 Y NFAM1,ARFGAP3 NA ARFGAP3,PACSIN2,CYB5R3 IMR90 Hi-C 24141950 A4GALT 50501 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr22 43387243 43387305 43387274 Y PACSIN2,PACSIN2 PACSIN2 NA NA NA NA PACSIN2 21846 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 45081354 45081559 45081463 Y NA PRR5,PRR5-ARHGAP8,ARHGAP8 PARVB,KIAA1644,SAMM50 IMR90 Hi-C 24141950 PRR5-ARHGAP8 14554 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 45403389 45403735 45403573 Y KIAA0930,PHF21B,PHF21B,PHF21B NA NA NA NA NA NUP50 153987 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 45543738 45543876 45543815 Y PHF21B,NUP50,NUP50 NUP50 NA NA NA NA NUP50 13846 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 45553376 45553664 45553597 Y NA NUP50 NA NA NA NA NUP50 4058 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 45944996 45945587 45945178 Y NA FBLN1 NA NA NA NA FBLN1 48878 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr22 46041491 46041960 46041628 Y NA ATXN10 ATXN10,WNT7B,FAM118A,SMC1B,FBLN1,LOC730668,LOC100271722,MIRLET7BHG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATXN10 23718 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 46330758 46331082 46331012 Y NA WNT7B NA NA NA NA WNT7B 39927 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 46374858 46375446 46375153 Y NA WNT7B NA NA NA NA WNT7B 3849 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr22 46455003 46455485 46455192 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4 NA NA NA NA C22orf26 6979 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 46464940 46465203 46464976 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 1169 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr22 46467914 46468476 46468052 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 4143 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr22 46472616 46472825 46472697 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 8845 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 46474643 46475112 46474791 Y C22orf26 RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 10872 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 46480881 46481264 46481017 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 17110 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr22 46495432 46495673 46495573 Y C22orf26 RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B,PPARA NA NA NA NA MIR4763 11773 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 46957537 46957704 46957620 Y NA CELSR1,GRAMD4 TRMU,CELSR1,GRAMD4 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 12205 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 46973801 46973805 46973803 Y NA CELSR1,GRAMD4 TRMU,GRAMD4,CELSR1 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 3892 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 47149923 47150411 47150155 Y NA CERK,TBC1D22A CERK MCF7 ChIA-PET 22265404 TBC1D22A 6107 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 47150443 47150659 47150583 Y CERK,TBC1D22A CERK,TBC1D22A CERK MCF7 ChIA-PET 22265404 TBC1D22A 5859 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 47338470 47338938 47338889 Y CERK,TBC1D22A NA NA NA NA NA TBC1D22A 181952 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 47848340 47848433 47848387 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 691822 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 49768624 49768992 49768711 Y NA NA NA NA NA NA C22orf34 280198 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 50327730 50328489 50328002 Y TRABD,SELO,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1 CRELD2,ALG12,PIM3 NA NA NA NA ALG12 17624 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 50345940 50346570 50346146 Y NA CRELD2,ALG12,PIM3 PLXNB2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PIM3 5591 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr22 50364350 50364715 50364589 Y NA PIM3 NA NA NA NA PIM3 12189 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr22 50554222 50554639 50554443 Y NA MOV10L1 NA NA NA NA MOV10L1 27914 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 50667232 50667412 50667320 Y NA TRABD,SELO,TUBGCP6,HDAC10,MAPK12,MAPK11 NA NA NA NA TUBGCP6 14009 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 50742925 50743370 50743124 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 686 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr22 50743986 50744741 50744427 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr22 50744748 50744986 50744827 Y PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 692 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr22 51051274 51051666 51051314 Y NA CHKB-CPT1B,MAPK8IP2,CHKB,ARSA NA NA NA NA ARSA 12941 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 4783422 4783695 4783523 Y EDEM1,BHLHE40,ARL8B EGOT NA NA NA NA EGOT 7579 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 4793961 4794169 4794077 Y EDEM1,BHLHE40 EGOT NA NA NA NA EGOT 2687 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 4861560 4861757 4861659 Y NA NA NA NA NA NA AC018816.3 65220 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 4909917 4910799 4910503 Y ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B AC018816.3 NA NA NA NA AC018816.3 16178 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 5027453 5027635 5027574 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 7807 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 5028534 5029013 5028702 Y ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 8888 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 5036570 5037120 5036867 Y NA BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 16924 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr3 5054958 5055470 5055112 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 BHLHE40 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 BHLHE40-AS1 35312 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 5065036 5065378 5065161 Y BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40-AS1 45390 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 5067974 5068590 5068209 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40-AS1 48328 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 5341169 5341433 5341324 Y NA NA NA NA NA NA EDEM1 113838 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 8524896 8525313 8525187 Y LMCD1 LMCD1 NA NA NA NA LMCD1 16080 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 8807929 8808317 8808062 Y OXTR OXTR NA NA NA NA OXTR 997 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 8906303 8906783 8906429 Y NA NA NA NA NA NA RAD18 96674 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 8911307 8911734 8911565 Y OXTR NA NA NA NA NA RAD18 91723 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 8978841 8979048 8978945 Y NA RAD18 NA NA NA NA RAD18 24409 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 9721492 9721576 9721535 Y IL17RC,IL17RC,CIDEC,CIDEC MTMR14,BRPF1 NA NA NA NA MTMR14 32375 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 9926228 9926446 9926367 Y LOC401052,ARPC4,TADA3,RPUSD3,CIDEC,CIDEC,CIDEC,JAGN1,IL17RE,IL17RE,IL17RC,IL17RC RPUSD3,JAGN1,IL17RE,IL17RC,CRELD1 IL17RE,IL17RC,JAGN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 JAGN1 3792 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr3 10234749 10235085 10234824 Y ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 30200 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 10247090 10247317 10247193 Y VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2,TATDN2 NA NA NA NA TATDN2 40390 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 10479008 10479279 10479081 Y TATDN2 NA NA NA NA NA SEC13 118146 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 11138272 11138477 11138338 Y NA HRH1 HRH1,ATG7 IMR90 Hi-C 24141950 HRH1 38302 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 11261398 11261658 11261529 Y HRH1 NA NA NA NA NA ATG7 50337 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 11632872 11633201 11633091 Y SYN2,VGLL4 NA NA NA NA NA VGLL4 127019 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 12350153 12350305 12350183 Y NA PPARG NA NA NA NA PPARG 23286 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 12917586 12917878 12917745 Y NA RPL32 IQSEC1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL32 36499 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 13035460 13035932 13035883 Y CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1 NA NA NA NA NA IQSEC1 76685 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr3 13493281 13493606 13493395 Y NA NUP210,HDAC11,HDAC11-AS1 IQSEC1,NUP210 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HDAC11 25618 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 13549267 13549563 13549350 Y NA HDAC11,HDAC11-AS1,FBLN2 NA NA NA NA FBLN2 22261 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 13884272 13884624 13884569 Y WNT7A NA NA NA NA NA CHCHD4 279746 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 13936849 13937176 13936976 Y NA NA C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CHCHD4 227194 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr3 14167210 14167731 14167391 Y TMEM43,XPC CHCHD4,TMEM43,AC093495.4 NA NA NA NA TMEM43 2770 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr3 15285479 15285699 15285585 Y NR2C2,ZFYVE20,SH3BP5,CAPN7 CAPN7 NA NA NA NA CAPN7 39820 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 15351984 15352244 15352145 Y NA SH3BP5 NA NA NA NA SH3BP5 28631 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 15352253 15352542 15352441 Y NA SH3BP5 NA NA NA NA SH3BP5 28333 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 15901875 15902313 15902310 Y METTL6,ANKRD28 ANKRD28 NA NA NA NA ANKRD28 2597 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 16351640 16351656 16351648 Y RFTN1,OXNAD1 DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 46934 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 16402746 16402862 16402794 Y DAZL,DAZL NA NA NA NA NA OXNAD1 98040 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 17248138 17248312 17248225 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 405979 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 17506581 17506846 17506713 Y TBC1D5 NA NA NA NA NA PLCL2 664422 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 18013789 18014053 18013921 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 470256 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA RAD23BP1 NA NA NA NA RAD23BP1 2077 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 19379484 19379512 19379499 Y KCNH8 NA NA NA NA NA EFHB 607005 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 19993428 19993925 19993635 Y KAT2B,RAB5A EFHB,RAB5A,RNU4-85P NA NA NA NA RAB5A 6857 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 23935594 23935945 23935770 Y NA RPL15,NR1D2 NA NA NA NA RPL15 20091 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 25790563 25790933 25790768 Y NA OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 31475 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 27448684 27449023 27448831 Y NA NA NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 74888 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 27524458 27524952 27524717 Y NA SLC4A7 NA NA NA NA SLC4A7 547 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA AC098614.2 SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 AC098614.2 2140 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr3 28367464 28367703 28367584 Y NA AZI2,ZCWPW2 NA NA NA NA AZI2 20915 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 29412640 29413015 29412700 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 92167 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 29725037 29725420 29725261 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 404564 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 29736457 29736614 29736535 Y RBMS3 NA NA NA NA NA RBMS3 415984 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 29800986 29801236 29801157 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 480513 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 30389148 30389362 30389271 Y TGFBR2 NA TGFBR2 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBR2 256632 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 31207703 31207815 31207739 Y STT3B NA GADL1 IMR90 Hi-C 24141950 STT3B 364315 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 31690891 31691368 31691073 Y ZNF860,OSBPL10 NA NA NA NA NA STT3B 118761 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr3 31924742 31925048 31924896 Y NA NA NA NA NA NA ZNF860 96215 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 32434248 32434406 32434345 Y NA CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 3085 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 32443431 32443555 32443473 Y CMTM7 CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 12268 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 32453477 32453643 32453560 Y NA CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 22314 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 32461951 32462075 32462013 Y CMTM7 CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 30788 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 32535422 32535827 32535806 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 7073 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 32549205 32549429 32549313 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 6305 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 33837400 33837658 33837523 Y CLASP2,PDCD6IP PDCD6IP NA NA NA NA PDCD6IP 186 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 37240480 37240740 37240610 Y NA LRRFIP2,GOLGA4,AC097359.1 LRRFIP2,MLH1,GOLGA4 IMR90 Hi-C 24141950 LRRFIP2 17300 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 37901883 37902306 37902042 Y CTDSPL AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 432 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr3 39192381 39192719 39192586 Y WDR48,CSRNP1 TTC21A,GORASP1,CSRNP1 NA NA NA NA CSRNP1 1334 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr3 39399859 39400185 39399921 Y CCR8,SLC25A38 SLC25A38,RPSA NA NA NA NA SLC25A38 22654 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 39712999 39713450 39713220 Y NA NA NA NA NA NA RPSA 266819 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 42103073 42103570 42103397 Y NA TRAK1 ZNF621,ZNF620,TRAK1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 49779 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 42220925 42221235 42221114 Y TRAK1 NA NA NA NA NA CCK 84464 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 42922564 42922793 42922612 Y C3orf39 ZNF662 NA NA NA NA ZNF662 22430 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 43298650 43298841 43298752 Y CCDC13,ABHD5,SNRK SNRK HIGD1A,CCDC13,ANO10 IMR90 Hi-C 24141950 SNRK 27163 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 44040259 44040834 44040651 Y NA NA ANO10 IMR90 Hi-C 24141950 ANO10 309173 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr3 44621262 44622718 44622436 Y NA ZNF660,ZNF197 NA NA NA NA ZNF197 1662 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 44972207 44972481 44972421 Y NA EXOSC7,ZDHHC3 NA NA NA NA EXOSC7 42252 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 45157727 45158120 45157925 Y CDCP1 CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 27794 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 45175300 45175656 45175542 Y NA CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 10258 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 45209101 45209416 45209191 Y LIMD1 CDCP1,RPS24P8 LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS24P8 9434 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr3 46228445 46228784 46228752 Y CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1 NA NA NA NA NA FYCO1 193129 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 46546407 46546628 46546504 Y CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2 NA NA NA NA NA LRRC2 72961 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 46600040 46600219 46600077 Y NA LRRC2 NA NA NA NA LRRC2 19370 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 3.50225587004167 chr3 46670526 46670816 46670674 Y NA NA NA NA NA NA LRRC2 50937 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 46671101 46671453 46671216 Y CCDC12,PRSS45 NA NA NA NA NA LRRC2 51512 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 47201175 47201471 47201342 Y CSPG5,SETD2 SETD2 NA NA NA NA SETD2 1986 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 47704557 47705253 47705047 Y SETD2 NA NA NA NA NA SMARCC1 116343 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 47898226 47898293 47898260 Y NA NA NA NA NA NA DHX30 55827 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 49123301 49123671 49123633 Y NA QRICH1,QARS,USP19,LAMB2 NA NA NA NA QRICH1 6125 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 50264852 50265230 50265012 Y TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2 GNAI2,SEMA3B NA NA NA NA GNAI2 3128 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 50274525 50274666 50274593 Y RASSF1,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2 GNAI2,SEMA3B NA NA NA NA GNAI2 12801 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 50302065 50302532 50302296 Y SEMA3B GNAI2,SEMA3B,IFRD2,NAT6,HYAL3 NA NA NA NA SEMA3B 458 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 51377903 51378233 51378113 Y NA MANF,RBM15B NA NA NA NA MANF 42245 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 51573530 51573858 51573781 Y VPRBP,RAD54L2 VPRBP NA NA NA NA VPRBP 41520 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr3 52080287 52080923 52080751 Y NT5DC2,TWF2,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 7643 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 52121101 52121264 52121190 Y NA DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 32535 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 52334165 52334539 52334405 Y NA GLYCTK,WDR82 NA NA NA NA WDR82 14129 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 52652258 52652629 52652403 Y GLYCTK,MUSTN1,GLT8D1 NA NA NA NA NA GNL3 60543 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 53106812 53106929 53106871 Y TMEM110,SFMBT1 SFMBT1 NA NA NA NA SFMBT1 28046 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 53200960 53201293 53201179 Y PBRM1,GLT8D1,TKT,DCP1A,PRKCD RFT1,PRKCD NA NA NA NA PRKCD 12935 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 53270281 53270430 53270371 Y PRKCD,DCP1A,TKT TKT NA NA NA NA TKT 17638 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr3 53272912 53273168 53273085 Y TMEM110,PRKCD,DCP1A TKT NA NA NA NA TKT 14900 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 53304049 53304491 53304265 Y PRKCD,DCP1A,TKT TKT NA NA NA NA TKT 15981 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr3 53362706 53362961 53362819 Y NA DCP1A NA NA NA NA DCP1A 16693 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 53380883 53380907 53380896 Y TMEM110,PRKCD,DCP1A DCP1A NA NA NA NA DCP1A 1229 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 54389983 54390168 54390067 Y NA NA NA NA NA NA RPS15P5 268074 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 55364571 55364745 55364625 Y NA NA CACNA2D3,WNT5A,ERC2,C3orf51 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5A 157228 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 55517501 55517653 55517577 Y NA WNT5A NA NA NA NA WNT5A 4320 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 56818012 56818198 56818042 Y CCDC66,C3orf63,ARHGEF3 NA NA NA NA NA FAM208A 102747 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 56895897 56895912 56895905 Y ASB14 NA NA NA NA NA FAM208A 180632 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 57874517 57874643 57874579 Y NA NA NA NA NA NA FLNB 117484 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 57945627 57945950 57945779 Y PDE12 FLNB FLNB,ARF4 IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 46177 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 57960548 57960842 57960815 Y FLNB FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 31285 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr3 57995654 57995894 57995762 Y NA FLNB NA NA NA NA FLNB 3527 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 58035006 58035314 58035102 Y FLNB FLNB NA NA NA NA FLNB 42879 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 58038147 58038335 58038213 Y FLNB FLNB NA NA NA NA FLNB 46020 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 58335663 58335765 58335715 Y PXK RPP14,PXK NA NA NA NA PXK 19056 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 61548977 61549431 61549203 Y NA PTPRG NA NA NA NA PTPRG 3734 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 62572991 62573174 62573036 Y NA NA NA NA NA NA PTPRG-AS1 219986 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 63946118 63946531 63946303 Y NA NA LOC100507062 IMR90 Hi-C 24141950 PSMD6 61127 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 66021951 66022397 66022084 Y NA MAGI1 NA NA NA NA MAGI1 112 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 66491612 66491762 66491706 Y NA NA NA NA NA NA LRIG1 57925 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 66546176 66546348 66546214 Y NA LRIG1 NA NA NA NA LRIG1 3339 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 69135158 69135511 69135504 Y NA TMF1,UBA3,ARL6IP5 NA NA NA NA ARL6IP5 3063 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr3 69338000 69338210 69338108 Y MITF NA NA NA NA NA ARL6IP5 205905 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 69789363 69789667 69789441 Y MITF MITF NA NA NA NA MITF 2777 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 69790676 69790712 69790690 Y MITF MITF NA NA NA NA MITF 4090 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 70898973 70899254 70899114 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 731886 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 71490469 71490633 71490551 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 140507 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 71588104 71588187 71588146 Y NA FOXP1 NA NA NA NA FOXP1 42953 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 71628829 71629563 71629383 Y EIF4E3 FOXP1 NA NA NA NA FOXP1 1577 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 72936024 72936237 72936180 Y RYBP,EBLN2 SHQ1,GXYLT2,FTH1P23 NA NA NA NA GXYLT2 800 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 73806539 73806557 73806550 Y NA NA PDZRN3 IMR90 Hi-C 24141950 PPP4R2 762603 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 75199894 75200047 75199971 Y NA NA NA NA NA NA FAM86DP 282214 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 77239163 77239286 77239225 Y ROBO2,ROBO2 NA NA NA NA NA RP11-550F7.1 757994 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 77273270 77273652 77273462 Y ROBO2,ROBO2 NA NA NA NA NA RP11-550F7.1 792101 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 85318532 85318917 85318639 Y NA NA NA NA NA NA CADM2 312400 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 86842931 86843272 86843115 Y VGLL3 NA VGLL3 IMR90 Hi-C 24141950 VGLL3 194997 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 86972169 86972375 86972272 Y VGLL3 NA NA NA NA NA VGLL3 65894 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 86999128 86999300 86999212 Y CHMP2B VGLL3 NA NA NA NA VGLL3 38969 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 89163442 89163800 89163560 Y NA EPHA3 NA NA NA NA EPHA3 8768 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr3 96336052 96336669 96336607 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPKP4 269654 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr3 97509307 97509490 97509360 Y NA ARL6 NA NA NA NA ARL6 27942 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 98505158 98505735 98505540 Y ST3GAL6 NA NA NA NA NA DCBLD2 112798 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 98625177 98625421 98625283 Y DCBLD2 DCBLD2 DCBLD2 K562 ChIA-PET 22265404 DCBLD2 6644 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 98848000 98848317 98848116 Y DCBLD2 NA COL8A1,MIR548G IMR90 Hi-C 24141950 LINC00973 150098 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 99367111 99367532 99367193 Y NA COL8A1 NA NA NA NA COL8A1 11792 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 99579150 99579217 99579184 Y FILIP1L NA NA NA NA NA COL8A1 223831 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 99584293 99584813 99584482 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 228974 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 99596957 99597300 99597045 Y TBC1D23 NA NA NA NA NA FILIP1L 234057 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 99751196 99751332 99751292 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 80025 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 99752092 99752383 99752194 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 78974 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 99761045 99761306 99761215 Y TMEM45A NA TMEM30C IMR90 Hi-C 24141950 FILIP1L 70051 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 99944403 99944723 99944568 Y NA TBC1D23 C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D23 33121 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 100054250 100054545 100054496 Y NA NIT2 NA NA NA NA NIT2 2705 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 100755056 100755464 100755248 Y NA ABI3BP ABI3BP IMR90 Hi-C 24141950 ABI3BP 44697 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr3 100784871 100785104 100785043 Y ABI3BP NA ABI3BP IMR90 Hi-C 24141950 ABI3BP 74512 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 101403455 101403770 101403678 Y SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24 ZBTB11,CEP97 NA NA NA NA RPL24 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr3 101598551 101599071 101598955 Y NFKBIZ,NFKBIZ NA NA NA NA NA NFKBIZ 53716 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 104241726 104241855 104241791 Y NA NA NA NA NA NA ALCAM 841898 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 105087492 105087848 105087688 Y NA ALCAM NA NA NA NA ALCAM 3739 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr3 105088270 105088514 105088471 Y ALCAM ALCAM NA NA NA NA ALCAM 4517 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 105722948 105723182 105723045 Y CBLB NA NA NA NA NA CBLB 136552 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 106146787 106146897 106146851 Y NA NA CBLB IMR90 Hi-C 24141950 CBLB 560391 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 106253153 106253480 106253317 Y NA NA CBLB IMR90 Hi-C 24141950 CBLB 666757 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 106276246 106276374 106276310 Y NA NA NA NA NA NA LINC00883 681165 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 106407541 106407884 106407714 Y NA NA NA NA NA NA LINC00883 549655 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 107085712 107085944 107085942 Y NA NA LOC344595,LOC100302640 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00883 128173 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 107706134 107706639 107706380 Y NA NA MYH15,IFT57,CD47,LOC285205 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD47 101233 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 111420857 111420932 111420895 Y NA PLCXD2,PHLDB2 PHLDB2,CD96,ABHD10 IMR90 Hi-C 24141950 PHLDB2 28412 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 111449138 111449249 111449194 Y NA PHLDB2 NA NA NA NA PHLDB2 95 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 111480028 111480653 111480348 Y NA PHLDB2 NA NA NA NA PHLDB2 30684 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 111623667 111623869 111623803 Y NA NA NA NA NA NA ABHD10 71988 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 112076380 112076550 112076391 Y NA CD200 NA NA NA NA CD200 27186 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 112109657 112110558 112110278 Y CD200 NA CD200,C3orf52,GCET2,BTLA,ATG3 IMR90 Hi-C 24141950 CD200 60463 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 112366095 112366266 112366169 Y NA CCDC80 CCDC80,CD200R1L,GTPBP8,CD200R1,C3orf17 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CCDC80 111 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr3 112370377 112370712 112370567 Y CCDC80 CCDC80 CCDC80 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC80 4000 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr3 112372486 112372667 112372577 Y NA CCDC80 CCDC80,CD200R1L IMR90 Hi-C 24141950 CCDC80 6109 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 112395778 112395997 112395824 Y CCDC80 CCDC80 CCDC80 MCF7 ChIA-PET 22265404 CCDC80 29401 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 112404368 112404581 112404378 Y CCDC80 CCDC80 NA NA NA NA CCDC80 37991 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 113638745 113638778 113638762 Y NA NA NA NA NA NA QTRTD1 83902 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 113701770 113701838 113701802 Y KIAA1407,DRD3,ZDHHC23 QTRTD1 NA NA NA NA QTRTD1 20842 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 114212122 114212387 114212225 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1407 438662 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 115502758 115503253 115502970 Y NA NA NA NA NA NA GAP43 162587 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 116444477 116444635 116444556 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 298910 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 116782726 116783163 116783012 Y NA PTMAP8 NA NA NA NA PTMAP8 39181 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 117632292 117632433 117632362 Y NA NA NA NA NA NA LSAMP 81662 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 119147570 119147724 119147648 Y NA TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 37953 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 119238487 119238668 119238501 Y NA TIMMDC1 NA NA NA NA TIMMDC1 23108 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 119356620 119357543 119356968 Y GSK3B,ARHGAP31,ADPRH,COX17 RP11-190C22.1,COX17 NA NA NA NA RP11-190C22.1 3623 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 119369915 119370223 119370069 Y NR1I2 RP11-190C22.1,COX17 NA NA NA NA RP11-190C22.1 16918 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 119758013 119758347 119758179 Y NA NA NA NA NA NA GSK3B 52917 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 119864415 119864682 119864534 Y COX17,GSK3B NA NA NA NA NA RP11-18H7.1 52673 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 120040705 120041102 120040904 Y NA GPR156,LRRC58 NA NA NA NA LRRC58 25084 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 120120515 120120873 120120694 Y FSTL1 FSTL1 NA NA NA NA FSTL1 47227 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 120167583 120167922 120167648 Y NA FSTL1 NA NA NA NA FSTL1 178 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.62669190253125 chr3 120277715 120278240 120277932 Y NA NDUFB4 FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB4 34916 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 120492875 120493095 120492951 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33035 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 120493479 120494008 120493729 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33639 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 121820339 121820854 121820540 Y HCLS1,EAF2,PARP9,PARP9,PARP9,DTX3L,CD86,CD86 NA NA NA NA NA CSTA 221237 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 122201925 122202222 122202174 Y NA KPNA1 NA NA NA NA KPNA1 29570 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 122464996 122465160 122465078 Y PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2 HSPBAP1,DIRC2 NA NA NA NA HSPBAP1 45511 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 122467278 122467457 122467368 Y NA HSPBAP1,DIRC2 NA NA NA NA HSPBAP1 43214 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 123304962 123305362 123305193 Y PTPLB PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA MYLK-AS1 2573 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr3 123324068 123324437 123324253 Y PTPLB PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA MYLK-AS1 21679 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 123388051 123388291 123388171 Y NA NA NA NA NA NA MYLK-AS1 85662 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 123469666 123469916 123469803 Y MYLK NA NA NA NA NA MYLK-AS1 167277 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 123476863 123477567 123477241 Y MYLK NA NA NA NA NA MYLK-AS1 174474 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 123511748 123512001 123511875 Y NA NA NA NA NA NA CCDC14 166563 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 123526629 123526951 123526787 Y NA NA NA NA NA NA CCDC14 151613 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 123587912 123588093 123588031 Y ADCY5 NA NA NA NA NA CCDC14 90471 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 124773884 124774020 124773942 Y NA HEG1 NA NA NA NA HEG1 1082 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 124779995 124780351 124780112 Y ITGB5,HEG1 HEG1 NA NA NA NA HEG1 7193 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr3 124781797 124782117 124781832 Y NA HEG1 NA NA NA NA HEG1 8995 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 124786089 124786383 124786283 Y NA HEG1 NA NA NA NA HEG1 13287 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 124823348 124823728 124823623 Y OSBPL11 NA HEG1 IMR90 Hi-C 24141950 HEG1 50546 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 125709142 125709481 125709414 Y ZXDC,CCDC37 NA NA NA NA NA FAM86JP 75679 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 125986265 125986571 125986320 Y NA NA KLF15,ZXDC,ALDH1L1,CCDC37 IMR90 Hi-C 24141950 SLC41A3 167861 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 126702933 126703224 126703109 Y NA NA CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CHCHD6 281870 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 126721076 126721245 126721142 Y PLXNA1 NA NA NA NA NA CHCHD6 300013 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 126945431 126945830 126945484 Y MCM2 NA NUP210P1 IMR90 Hi-C 24141950 MCM2 369236 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr3 126945882 126946306 126946211 Y MCM2 NA NUP210P1 IMR90 Hi-C 24141950 MCM2 368760 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr3 127453672 127453937 127453742 Y TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL NA NA NA NA NA ABTB1 63894 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 127494264 127494411 127494370 Y NA MGLL NA NA NA NA MGLL 45640 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 127886942 127887322 127887108 Y NA EEFSEC,RUVBL1 NA NA NA NA RUVBL1 16185 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 128216520 128216923 128216625 Y EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2 RP11-475N22.4 GATA2,C3orf27,RUVBL1,EEFSEC,DNAJB8,DNAJB8-AS1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-475N22.4 10465 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 128336521 128336831 128336572 Y DNAJB8 NA NA NA NA NA RPN1 61087 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 128366732 128367045 128366901 Y NA RPN1 NA NA NA NA RPN1 30873 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 128475272 128475670 128475352 Y RAB7A,ISY1,CNBP RAB7A,FTH1P4 NA NA NA NA FTH1P4 6191 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 128745839 128746109 128746044 Y NA NA NA NA NA NA RAB43 93535 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 129346331 129346490 129346427 Y PLXND1 PLXND1 NA NA NA NA PLXND1 22670 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 130637982 130638444 130638066 Y NA NA NA NA NA NA ATP2C1 70543 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 131197540 131197572 131197556 Y NA MRPL3 NA NA NA NA MRPL3 22255 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 131854898 131855187 131855050 Y NA NA CPNE4 IMR90 Hi-C 24141950 RPL7P16 105922 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 132138974 132139193 132139084 Y NA DNAJC13 NA NA NA NA DNAJC13 4604 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 132164768 132165015 132164817 Y DNAJC13 DNAJC13 NA NA NA NA DNAJC13 30398 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 133289121 133289251 133289178 Y SRPRB CDV3 CDV3 MCF7 ChIA-PET 22265404 CDV3 1323 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 133596347 133596652 133596615 Y NA RAB6B NA NA NA NA RAB6B 16028 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 133646484 133646682 133646583 Y NA RAB6B NA NA NA NA RAB6B 33804 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 134034499 134034569 134034531 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5 ANAPC13,C3orf36,SLCO2A1,AMOTL2,CEP63 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-200A1.1 4081 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr3 134045700 134046050 134045958 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RP11-200A1.1 15282 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr3 134047160 134047394 134047241 Y ANAPC13,ANAPC13,ANAPC13,AMOTL2 RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RP11-200A1.1 16742 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 134050159 134050571 134050486 Y AMOTL2 RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RP11-200A1.1 19741 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr3 134051149 134051359 134051254 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RP11-200A1.1 20731 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 134082893 134083489 134083439 Y AMOTL2 RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA AMOTL2 8832 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr3 135615560 135615771 135615666 Y NA NA NA NA NA NA PPP2R3A 66744 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 136153802 136154197 136154172 Y NA NA NA NA NA NA PCCB 186654 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 136571906 136572239 136572061 Y TMEM22 RP11-85F14.5,NCK1 NA NA NA NA RP11-85F14.5 6657 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 137990064 137990319 137990141 Y NA NA NA NA NA NA MRAS 74220 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 138582294 138582582 138582441 Y MRPS22 PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 30514 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr3 139018358 139018692 139018412 Y FOXL2,C3orf72 NA BPESC1 IMR90 Hi-C 24141950 COPB2 87882 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.40780091065365 chr3 139028849 139029030 139028940 Y NA NA BPESC1,FOXL2,C3orf72,MRPS22,COPB2 IMR90 Hi-C 24141950 COPB2 77544 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 139064285 139064552 139064299 Y NA COPB2,RP11-319G6.1 NA NA NA NA COPB2 42022 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 139253953 139254145 139254018 Y NA RBP1 NA NA NA NA RBP1 2526 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr3 141050524 141051086 141050761 Y NA ZBTB38 NA NA NA NA ZBTB38 9469 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 141126018 141126305 141126087 Y NA NA NA NA NA NA RASA2 77584 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 141131172 141131505 141131226 Y SLC25A36,RASA2 NA NA NA NA NA RASA2 72384 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 141319185 141319480 141319327 Y RASA2 NA NA NA NA NA RASA2 115296 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 141610914 141611173 141610928 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 17948 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 143352573 143352896 143352700 Y NA NA NA NA NA NA SLC9A9 212477 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr3 144785670 144785716 144785693 Y NA NA NA NA NA NA RPL21P39 754810 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 145785304 145785639 145785521 Y NA RP11-274H2.3 NA NA NA NA RP11-274H2.3 332 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 145883195 145883481 145883360 Y PLOD2,PLSCR4 PLOD2 PLOD2,PLSCR4,PLSCR1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PLOD2 3755 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 145959602 145959992 145959865 Y PLSCR4 PLSCR4 NA NA NA NA PLSCR4 6974 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 146031799 146032049 146031857 Y PLSCR4 NA PLOD2 IMR90 Hi-C 24141950 PLSCR4 64833 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 147137005 147137222 147137047 Y ZIC4,ZIC4,ZIC4,ZIC1 ZIC4 NA NA NA NA ZIC4 14358 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 147140808 147141337 147141213 Y NA ZIC4 NA NA NA NA ZIC4 18161 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 147663875 147664087 147663997 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPA1P20 218998 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 148899476 148899525 148899501 Y AGTR1,AGTR1,TM4SF4,CP NA NA NA NA NA HPS3 54105 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 149104739 149105065 149104981 Y COMMD2,TM4SF1 TM4SF1 GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM4SF1 11087 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 149657313 149657850 149657694 Y TSC22D2,RNF13 ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 26322 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 149865143 149865465 149865344 Y NA NA RNF13,LOC646903,PFN2,TSC22D2 IMR90 Hi-C 24141950 PFN2 98568 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 149953459 149953819 149953634 Y NA NA TSC22D2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 170303 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 149966255 149966555 149966407 Y NA NA TSC22D2,RNF13,PFN2,TM4SF1,TM4SF4,LOC646903,EIF2A,SERP1 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D2 157567 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 150089534 150090066 150089791 Y NA TSC22D2 TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 34056 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr3 151263826 151263968 151263832 Y NA NA NA NA NA NA GPR87 231086 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 151975130 151975682 151975593 Y NA MBNL1,MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 9662 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 151996540 151996946 151996646 Y NA MBNL1,MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 11196 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 152878171 152878732 152878352 Y P2RY1,RAP2B RAP2B NA NA NA NA RAP2B 142 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr3 154788699 154789128 154788815 Y NA MME MME IMR90 Hi-C 24141950 MME 48786 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 156361646 156361882 156361788 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1 TIPARP,TIPARP-AS1 TIPARP,TIPARP-AS1,LEKR1,LOC100498859,LOC339894 IMR90 Hi-C 24141950 TIPARP 27142 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 156402848 156403019 156402937 Y LEKR1,LEKR1,CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP TIPARP,TIPARP-AS1 NA NA NA NA TIPARP-AS1 12681 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 156432757 156433079 156432845 Y CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP TIPARP,TIPARP-AS1 NA NA NA NA TIPARP-AS1 42590 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 156444390 156444661 156444493 Y NA NA NA NA NA NA TIPARP-AS1 54223 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 156506058 156506346 156506123 Y SSR3 PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA PA2G4P4 20175 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr3 156529352 156529637 156529452 Y NA PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA PA2G4P4 2831 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 156846039 156846735 156846192 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1,CCNL1 CCNL1,RP11-550I24.2 NA NA NA NA CCNL1 29814 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr3 156847368 156847750 156847738 Y NA CCNL1,RP11-550I24.2 NA NA NA NA CCNL1 28799 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 159175843 159176214 159175971 Y NA NA NA NA NA NA RARRES1 727358 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr3 159465414 159465509 159465463 Y NA NA NA NA NA NA C3orf80 475914 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 159647586 159647883 159647684 Y NA NA IQCJ-SCHIP1,IL12A,IFT80,SMC4 IMR90 Hi-C 24141950 C3orf80 293540 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 160014353 160014630 160014494 Y NA NA NA NA NA NA C3orf80 72930 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 160267928 160268193 160268163 Y NA SCARNA7,KPNA4 NA NA NA NA KPNA4 13183 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 167737805 167738014 167737910 Y NA NA NA NA NA NA GOLIM4 73749 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 168930237 168930275 168930257 Y NA NA NA NA NA NA MECOM 449131 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 169377431 169377952 169377740 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 1454 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 169379831 169380308 169379976 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 425 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 169482089 169482431 169482154 Y NA TERC,MYNN,LRRC34 NA NA NA NA TERC 1241 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr3 169502698 169502873 169502785 Y GPR160,MYNN,LRRC34 TERC,MYNN,LRRC34 NA NA NA NA MYNN 14079 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 170137645 170137870 170137713 Y SLC7A14,CLDN11,CLDN11 CLDN11 NA NA NA NA CLDN11 2992 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr3 170138195 170138413 170138223 Y NA CLDN11 NA NA NA NA CLDN11 3542 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr3 170420897 170421107 170421029 Y CLDN11 RP11-373E16.4 SLC7A14,CLDN11,PRKCI,SKIL IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 36047 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr3 170430208 170430671 170430337 Y CLDN11 RP11-373E16.4 CLDN11,SLC7A14 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 26483 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 170431417 170431656 170431537 Y NA RP11-373E16.4 CLDN11,SLC7A14 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 25498 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 170442364 170442688 170442585 Y CLDN11 RP11-373E16.4 CLDN11,SLC7A14 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 14466 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 170444418 170445820 170444586 Y CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2 RP11-373E16.4 CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 11334 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr3 170446657 170446914 170446737 Y NA RP11-373E16.4 CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 10240 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 170452581 170452786 170452684 Y CLDN11,CLDN11 RP11-373E16.4 CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 4368 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 170463049 170463502 170463289 Y CLDN11 RP11-373E16.4 SLC7A14,CLDN11,PRKCI,SKIL IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 5895 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 170469010 170469069 170469037 Y CLDN11,CLDN11,EIF5A2 RP11-373E16.4 SLC7A14,CLDN11,SKIL IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 11856 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr3 170527099 170527304 170527203 Y EIF5A2 NA SLC7A14,CLDN11,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 58968 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 170527835 170528013 170527928 Y NA NA SLC7A14,CLDN11,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 58259 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr3 170584649 170585013 170584680 Y NA RPL22L1,EIF5A2 NA NA NA NA RPL22L1 1259 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 170972971 170973298 170973238 Y NA NA NA NA NA NA TNIK 202899 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 171146057 171146176 171146159 Y NA TNIK NA NA NA NA TNIK 30021 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 171531632 171532210 171532036 Y FNDC3B,PLD1 PLD1 PLD1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PLD1 4892 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 171870963 171871593 171871291 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 115545 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 171954526 171954782 171954635 Y FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA BZW1P1 188097 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 172086059 172086253 172086084 Y NA NA NA NA NA NA BZW1P1 56626 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 172234609 172234750 172234680 Y FNDC3B,TNFSF10,TNFSF10 TNFSF10 NA NA NA NA TNFSF10 4547 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 172280796 172281206 172280981 Y TNFSF10,TNFSF10 TNFSF10 NCEH1 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF10 41499 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 172467147 172467552 172467259 Y NA NCEH1,ECT2,RNU4-4P NCEH1,ECT2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ECT2 675 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 173650294 173650720 173650491 Y NA NA NA NA NA NA RP11-393N4.2 442314 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 174157357 174157932 174157609 Y NA NAALADL2 NAALADL2 IMR90 Hi-C 24141950 NAALADL2 2994 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 174493498 174493729 174493615 Y NA NA NA NA NA NA NAALADL2 339135 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 174988288 174988312 174988303 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-91P 336955 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 175695899 175696046 175695968 Y NA NA NLGN1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V1P2 261441 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 177075253 177075542 177075439 Y NA NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 161992 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 177623365 177623625 177623388 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-91K9.1 90712 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 178231751 178231896 178231824 Y NA NA KCNMB2 IMR90 Hi-C 24141950 ZMAT3 556171 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 178532692 178532946 178532777 Y NA NA NA NA NA NA ZMAT3 255121 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 178671519 178671916 178671775 Y NA NA KCNMB2 IMR90 Hi-C 24141950 ZMAT3 116151 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 178699167 178699475 178699434 Y NA NA NA NA NA NA ZMAT3 88592 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 178752797 178753279 178753036 Y NA ZMAT3 NA NA NA NA ZMAT3 34788 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 178754661 178754788 178754723 Y KCNMB3 ZMAT3 NA NA NA NA ZMAT3 33279 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 178755149 178755598 178755383 Y NA ZMAT3 NA NA NA NA ZMAT3 32469 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr3 178787910 178788066 178787991 Y ZMAT3 ZMAT3 NA NA NA NA ZMAT3 1 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 178978348 178978737 178978528 Y PIK3CA,MFN1,GNB4 LRRFIP1P1 NA NA NA NA LRRFIP1P1 1287 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr3 179161841 179162229 179161903 Y NA GNB4 NA NA NA NA GNB4 5149 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 179165833 179166212 179166067 Y NA GNB4 NA NA NA NA GNB4 1166 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 179244857 179244994 179244926 Y NA ACTL6A GNB4 IMR90 Hi-C 24141950 ACTL6A 33674 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 179309053 179309431 179309273 Y NA ACTL6A,MRPL47,NDUFB5 NA NA NA NA MRPL47 11011 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 179687230 179687579 179687379 Y PEX5L NA NA NA NA NA USP13 318687 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 182645862 182646115 182645990 Y MCF2L2,MCCC1 NA NA NA NA NA DCUN1D1 55626 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 183003579 183004143 183003750 Y ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 34547 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr3 184504548 184504615 184504585 Y NA VPS8 VPS8,EPHB3,EIF4G1,POLR2H,THPO,CHRD IMR90 Hi-C 24141950 VPS8 23316 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 184727770 184727947 184727859 Y NA NA NA NA NA NA C3orf70 140855 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 187086881 187087203 187087089 Y BCL6,RTP4 RTP4 NA NA NA NA RTP4 2761 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 187457681 187458370 187457991 Y RTP4,BCL6,BCL6,BCL6 BCL6 NA NA NA NA BCL6 3145 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 187983465 187984215 187983993 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 113620 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 188535836 188535994 188535916 Y NA NA NA NA NA NA TPRG1-AS1 127434 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 189544866 189545241 189545054 Y NA NA NA NA NA NA LEPREL1-AS1 291512 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 190062904 190063381 190063085 Y LEPREL1,CLDN1,CLDN16 CLDN1 LEPREL1,CLDN1,CLDN16 IMR90 Hi-C 24141950 CLDN1 24640 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 190251387 190251779 190251471 Y CLDN1 IL1RAP NA NA NA NA IL1RAP 21547 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr3 190284228 190284576 190284349 Y NA NA NA NA NA NA IL1RAP 54388 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 192604773 192605048 192605023 Y NA MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 28902 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 192608372 192608637 192608617 Y NA MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 25313 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 192634153 192634990 192634777 Y MB21D2 MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 203 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr3 192873675 192873788 192873739 Y NA NA NA NA NA NA HRASLS 83126 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 193689142 193689560 193689382 Y ATP13A3,OPA1 NA NA NA NA NA HES1 162374 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 193858651 193858843 193858731 Y NA HES1 NA NA NA NA HES1 6717 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 193859199 193859624 193859359 Y TMEM44 HES1 NA NA NA NA HES1 7265 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 194210438 194211060 194210799 Y HES1,ATP13A3 ATP13A3 NA NA NA NA ATP13A3 6033 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 194282077 194282468 194282283 Y NA TMEM44-AS1 ATP13A3,TMEM44,LRRC15,CPN2,FLJ34208,XXYLT1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM44-AS1 20272 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 194298758 194299295 194298977 Y NA TMEM44-AS1 ATP13A3,FLJ34208 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM44-AS1 3445 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 194299958 194300402 194300090 Y NA TMEM44-AS1 ATP13A3,FLJ34208 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM44-AS1 2338 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 194871039 194871493 194871089 Y FAM43A,C3orf21 XXYLT1-AS2 NA NA NA NA XXYLT1-AS2 4439 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 194909017 194909237 194909137 Y NA XXYLT1-AS2 NA NA NA NA XXYLT1-AS2 42417 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 195573980 195574341 195574135 Y MUC20,MUC4 NA NA NA NA NA TFRC 232719 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 195871770 195871934 195871856 Y NA NA NA NA NA NA TFRC 64710 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr3 196047617 196047878 196047747 Y NA PCYT1A,TCTEX1D2,TM4SF19 NA NA NA NA TCTEX1D2 4447 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 196255741 196255873 196255820 Y NA RNF168,FBXO45,WDR53 UBXN7,MUC20,RNF168,C3orf43,PCYT1A,TM4SF19-TCTEX1D2,WDR53,FBXO45,CEP19 IMR90 Hi-C 24141950 RNF168 27102 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 196696811 196697020 196696957 Y LRRC33,PIGZ NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1 NA NA NA NA PIGZ 2880 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr3 197121526 197121880 197121703 Y DLG1 NA DLG1,LOC100507086,BDH1 IMR90 Hi-C 24141950 DLG1 97355 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr3 197190389 197190580 197190458 Y NA NA DLG1,BDH1,LOC100507086,MFI2,MFI2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 BDH1 107614 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr3 197214864 197215009 197214889 Y NA NA DLG1,LOC100507086,BDH1,MFI2 IMR90 Hi-C 24141950 BDH1 83185 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr3 197216995 197217339 197217145 Y DLG1 NA NA NA NA NA BDH1 80855 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr3 197439165 197439566 197439302 Y IQCG,LRCH3,KIAA0226 MIR922,FYTTD1,KIAA0226 NA NA NA NA FYTTD1 22484 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 330052 330352 330160 Y NA ZNF141 NA NA NA NA ZNF141 449 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 693278 693552 693364 Y GAK,MFSD7,PCGF3 MYL5,ATP5I,MFSD7,PCGF3 NA NA NA NA PCGF3 3985 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 770204 770556 770391 Y ZNF141 RP11-440L14.1,CPLX1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 3081 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 1027686 1027967 1027729 Y FGFRL1,FGFRL1,FGFRL1 DGKQ,IDUA,FGFRL1 NA NA NA NA FGFRL1 25962 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr4 1037465 1037841 1037534 Y MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,GAK,IDUA FGFRL1 NA NA NA NA FGFRL1 35741 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr4 1875191 1875366 1875328 Y NA LETM1,WHSC1 NA NA NA NA WHSC1 4040 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 2538945 2539718 2539367 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 76998 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 3085381 3085754 3085447 Y NA HTT NA NA NA NA HTT 10973 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 3203733 3204143 3203890 Y SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,HTT NA NA NA NA NA RGS12 88612 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 3293872 3294174 3294028 Y NA RGS12 RGS12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RGS12 1117 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 3303883 3304472 3304061 Y NA RGS12 RGS12,HTT,HGFAC IMR90 Hi-C 24141950 RGS12 11128 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 3438789 3438989 3438900 Y NA NA NA NA NA NA LRPAP1 93297 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr4 4542716 4543043 4542880 Y ZBTB49,STX18 STX18-AS1,STX18 NA NA NA NA STX18 643 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 4577048 4577566 4577357 Y NA STX18-AS1,STX18 NA NA NA NA STX18 34975 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 5640113 5640289 5640201 Y NA NA NA NA NA NA EVC2 68986 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 6734442 6734743 6734533 Y KIAA0232 MRFAP1L1,KIAA0232 NA NA NA NA MRFAP1L1 24835 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr4 7012933 7013112 7013014 Y NA TADA2B,CCDC96 NA NA NA NA TADA2B 28514 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 7326521 7326781 7326651 Y NA NA NA NA NA NA SORCS2 134256 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 7834057 7834311 7834184 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 105342 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 7846072 7846237 7846145 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 93416 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 7858938 7859554 7859231 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 80099 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 7962509 7962775 7962724 Y NA AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 22856 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 7969878 7969938 7969908 Y SH3TC1 AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 30225 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 7972368 7972631 7972565 Y NA AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 32715 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 7974971 7975417 7975298 Y AFAP1 AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 35318 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 7975985 7976228 7976096 Y NA AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 36332 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr4 7978189 7978377 7978271 Y NA AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 38536 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 9154755 9155069 9154900 Y NA FAM86KP NA NA NA NA FAM86KP 1733 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 10182678 10183260 10182921 Y WDR1 NA WDR1,CLNK,ZNF518B K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WDR1 66105 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 11029361 11029726 11029544 Y NA NA NA NA NA NA MIR572 338725 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 13613048 13613249 13613164 Y NA NA NA NA NA NA NKX3-2 68374 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 13922430 13922925 13922628 Y NA NA LOC441009,CPEB2,C1QTNF7 IMR90 Hi-C 24141950 NKX3-2 377756 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 13923595 13923747 13923678 Y NA NA LOC441009,CPEB2,C1QTNF7 IMR90 Hi-C 24141950 NKX3-2 378921 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 15297006 15297030 15297019 Y NA NA C1QTNF7 IMR90 Hi-C 24141950 CC2D2A 172459 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 15590411 15590648 15590624 Y FBXL5 NA NA NA NA NA FAM200B 90637 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 15594702 15595080 15594956 Y FBXL5 NA NA NA NA NA FAM200B 86205 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 15651682 15652058 15651870 Y NA FAM200B,FBXL5 NA NA NA NA FAM200B 29227 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 15655935 15656313 15656300 Y FBXL5,BST1 FAM200B,FBXL5,BST1 NA NA NA NA FAM200B 24972 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 15684115 15684561 15684231 Y FBXL5,FAM200B,BST1 FAM200B,FBXL5,BST1,RP11-115L11.1 NA NA NA NA FBXL5 2813 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 15757957 15758240 15758119 Y FBXL5,TAPT1,CD38 RP11-115L11.1,CD38 C1QTNF7,CD38,FGFBP2,PROM1,CC2D2A IMR90 Hi-C 24141950 CD38 19658 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 15915213 15915572 15915412 Y FGFBP1 FGFBP1 NA NA NA NA FGFBP1 22791 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 15922988 15923279 15923080 Y FGFBP1 FGFBP1 NA NA NA NA FGFBP1 15084 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 16629750 16630155 16629855 Y NA NA NA NA NA NA LDB2 268277 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr4 17938692 17938903 17938798 Y NA NA NA NA NA NA LCORL 82596 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 17979858 17980211 17980206 Y CLRN2,LCORL LCORL NA NA NA NA LCORL 41288 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 20197125 20197285 20197196 Y NA NA NA NA NA NA SLIT2 55598 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 23890635 23890864 23890849 Y NA NA NA NA NA NA DHX15 693309 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 24599702 24600087 24599863 Y NA DHX15 SOD3,CCDC149 IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 15529 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 24660007 24660225 24660117 Y NA ATP5LP3 CCDC149,MIR573 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5LP3 2009 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 26123354 26123506 26123386 Y NA RBPJ RBPJ,STIM2 IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 39571 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 26198985 26199293 26199235 Y RBPJ,RBPJ RBPJ RBPJ IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 35908 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 26290055 26290515 26290382 Y RBPJ,RBPJ NA RBPJ IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 126978 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 26347905 26348036 26347971 Y NA NA NA NA NA NA CCKAR 142048 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 26689488 26689564 26689526 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D19 113429 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 35022631 35023155 35023089 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 1220976 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr4 35027106 35027343 35027234 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 1216788 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr4 35366903 35367060 35367024 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 877071 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 37581972 37582372 37582240 Y NA NA NA NA NA NA RELL1 103626 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 38102941 38103486 38103298 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 142885 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 38147438 38147709 38147590 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 187382 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 38859134 38859762 38859410 Y KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6 TLR1,TLR6,FAM114A1 NA NA NA NA TLR1,TLR6 2696 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr4 40519982 40520039 40520011 Y RBM47 NA NA NA NA NA NSUN7 229875 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 40747894 40747905 40747900 Y NA NSUN7 NA NA NA NA NSUN7 2009 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 41000829 41000972 41000906 Y RBM47 NA NA NA NA NA APBB2 215759 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 41162074 41162440 41162321 Y APBB2 NA NA NA NA NA APBB2 54291 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 41197133 41197282 41197239 Y NA APBB2 NA NA NA NA APBB2 19449 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 41363966 41364137 41364015 Y LIMCH1,LIMCH1 LIMCH1 NA NA NA NA LIMCH1 4342 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 41999139 41999467 41999284 Y NA SLC30A9 NA NA NA NA SLC30A9 8650 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 53985720 53986039 53985931 Y NA NA NA NA NA NA SCFD2 244203 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 54507359 54507623 54507423 Y NA NA LNX1,FIP1L1,SCFD2 IMR90 Hi-C 24141950 FIP1L1 265549 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 54958023 54958135 54958077 Y NA CHIC2 SCFD2,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 29166 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr4 55093767 55093987 55093860 Y NA PDGFRA NA NA NA NA PDGFRA 503 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 56323586 56323848 56323646 Y NA NA NA NA NA NA TMEM165 63462 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 57831930 57832208 57832081 Y NA POLR2B,NOA1 NA NA NA NA POLR2B 9680 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 57940962 57941225 57941094 Y NA IGFBP7-AS1,IGFBP7 NA NA NA NA IGFBP7-AS1 32703 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 57947514 57947824 57947684 Y NA IGFBP7-AS1,IGFBP7 NA NA NA NA IGFBP7-AS1 26104 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 57985357 57985541 57985449 Y IGFBP7 IGFBP7-AS1,IGFBP7 NA NA NA NA IGFBP7 10806 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 65475793 65476032 65475913 Y NA NA NA NA NA NA RP11-204H9.2 181166 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 67438719 67438955 67438878 Y NA NA NA NA NA NA RP11-396M11.1 480875 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 68264537 68264852 68264695 Y NA NA NA NA NA NA UBA6 300045 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 69813796 69814179 69814033 Y UGT2B15,UGT2B10,UGT2B7,UGT2A3 NA NA NA NA NA YTHDC1 599989 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 75409847 75410209 75409849 Y NA NA EREG MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MTHFD2L 431956 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 75859868 75860329 75860092 Y BTC,PARM1 PARM1 NA NA NA NA PARM1 3563 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 76750745 76750859 76750802 Y NA NA NA NA NA NA USO1 102968 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 76963504 76963670 76963541 Y NAAA,CXCL9,CXCL10,CXCL11 CXCL11 NA NA NA NA CXCL11 2936 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 77511406 77511861 77511558 Y ANKRD56,SHROOM3 NA NA NA NA NA SHROOM3 157153 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 77543952 77543974 77543961 Y NA NA NA NA NA NA SHROOM3 189699 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 77665499 77665596 77665548 Y STBD1,SEPT11 NA NA NA NA NA SOWAHB 151406 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 77705263 77705447 77705355 Y NA NA NA NA NA NA SOWAHB 111555 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 77724798 77724936 77724862 Y NA NA NA NA NA NA SOWAHB 92066 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 77752154 77752315 77752229 Y NA NA SHROOM3,SEPT11,SOWAHB IMR90 Hi-C 24141950 SOWAHB 64687 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 78096687 78096796 78096741 Y NA CCNG2 NA NA NA NA CCNG2 20383 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 78977894 78978171 78977912 Y FRAS1 FRAS1 NA NA NA NA FRAS1 1170 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 79859042 79859275 79859190 Y PAQR3 PAQR3 NA NA NA NA PAQR3 450 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 81199073 81199101 81199087 Y NA FGF5 NA NA NA NA FGF5 13320 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 81229160 81229644 81229481 Y NA FGF5,C4orf22 NA NA NA NA C4orf22 25230 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 84034119 84034423 84034342 Y THAP9,LIN54,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,COQ2,PLAC8,PLAC8 PLAC8 NA NA NA NA PLAC8 21805 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr4 84398625 84398990 84398638 Y NA HELQ,MRPS18C,FAM175A NA NA NA NA MRPS18C 23540 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 85420434 85420908 85420714 Y NA NA NA NA NA NA CDS1 81224 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 87700627 87700837 87700672 Y PTPN13 NA NA NA NA NA AFF1 153317 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 87835479 87835856 87835675 Y NA AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA AFF1 18298 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 88128179 88128500 88128218 Y NA KLHL8 NA NA NA NA KLHL8 30966 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 88463051 88463413 88463109 Y NA NA NA NA NA NA NUDT9 121317 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 89302401 89302730 89302543 Y HERC6,HERC5 HERC6 NA NA NA NA HERC6 4510 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 89455158 89455345 89455247 Y NA HERC3,PIGY NA NA NA NA PIGY 14218 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 95373822 95374139 95373960 Y PDLIM5 PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 2785 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 95469761 95469962 95469859 Y HPGDS,PDLIM5 NA NA NA NA NA PDLIM5 98724 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 99319477 99319794 99319573 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GDS1 138942 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 99580316 99580421 99580372 Y NA TSPAN5 NA NA NA NA TSPAN5 2536 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 102254740 102255090 102255043 Y NA AP001816.1,PPP3CA NA NA NA NA AP001816.1 11847 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 103605742 103606270 103606017 Y NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA NA NA NA NA NA MANBA 73881 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 103608721 103609347 103609253 Y NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA NA NA NA NA NA MANBA 70804 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 103750426 103750532 103750434 Y NHEDC1,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3 RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2 NA NA NA NA RP11-10L12.4 3214 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 111086740 111086853 111086804 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 31502 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 111117471 111117868 111117585 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 487 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr4 114023484 114023505 114023495 Y ANK2,ANK2 NA NA NA NA NA ANK2 286219 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 114355245 114355627 114355568 Y NA RNU1-138P NA NA NA NA RNU1-138P 15766 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr4 117519495 117520605 117520296 Y NA ACTN4P1 NA NA NA NA ACTN4P1 2178 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr4 118247810 118248052 118247931 Y NA NA NA NA NA NA TRAM1L1 243074 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 119756174 119756657 119756269 Y NA SEC24D NA NA NA NA SEC24D 1181 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 120437308 120437708 120437606 Y NA NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 63362 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 120439031 120439404 120439161 Y PDE5A,PDE5A NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 65085 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 120444503 120444790 120444647 Y NA NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 70557 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 120458820 120459280 120459019 Y PDE5A,PDE5A,PDE5A NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 84874 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 122606332 122606884 122606598 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 9384 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 122632771 122633033 122632919 Y NA ANXA5 ANXA5,BBS7,CCNA2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ANXA5 16503 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 123685251 123685615 123685333 Y FGF2 CETN4P,BBS12 NA NA NA NA BBS12 33394 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 123704519 123704897 123704616 Y FGF2 FGF2 FGF2,NUDT6,SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 FGF2 40966 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 123719302 123719557 123719375 Y FGF2 FGF2 FGF2,NUDT6,BBS12 IMR90 Hi-C 24141950 FGF2 26306 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr4 123751494 123751575 123751556 Y FGF2 FGF2 NA NA NA NA FGF2 5631 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 123776087 123776259 123776177 Y NA FGF2 NA NA NA NA FGF2 30224 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 123792983 123793156 123793069 Y NA FGF2,NUDT6,SPATA5 NA NA NA NA FGF2 47120 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 128990801 128990842 128990822 Y NA LARP1B NA NA NA NA LARP1B 10378 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 129088221 129088417 129088319 Y NA NA NA NA NA NA LARP1B 107798 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 129244135 129244496 129244419 Y NA PGRMC2,RP11-420A23.1 PGRMC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-420A23.1 32229 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr4 129254148 129254471 129254310 Y NA PGRMC2,RP11-420A23.1 PHF17,LARP1B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-420A23.1 42242 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 129438976 129439122 129439055 Y NA NA PHF17,LARP1B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-420A23.1 227070 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 129474102 129474409 129474120 Y NA NA PGRMC2,PHF17,LARP1B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-420A23.1 262196 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 131206560 131206886 131206723 Y NA NA NA NA NA NA SCLT1 1193796 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 134077378 134077602 134077486 Y NA RP11-9G1.3,PCDH10 NA NA NA NA PCDH10 8908 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr4 138974806 138975089 138974892 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A11 186414 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 138975341 138975477 138975408 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A11 186026 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 139173167 139173319 139173175 Y NA SLC7A11 SLC7A11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC7A11 11664 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 140003738 140004448 140004114 Y CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2 NA CCRN4L K562 ChIA-PET 22265404 CCRN4L 68795 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 140096766 140097018 140096889 Y CCRN4L,RAB33B,ELF2 ELF2 ELF2,NAA15 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ELF2 394 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 140278994 140279360 140279178 Y NA NA NA NA NA NA NDUFC1 57289 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr4 140321405 140321719 140321434 Y ELF2,NAA15,RAB33B NA NA NA NA NA RAB33B 50667 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 141013693 141013823 141013696 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 59515 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 141287573 141287758 141287638 Y NA RP11-425I13.1 NA NA NA NA RP11-425I13.1 1558 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 141859083 141859381 141859282 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D9 183809 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 144271294 144271615 144271412 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA5 161001 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 145956046 145956369 145956259 Y NA NA NA NA NA NA ABCE1 60715 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 146655718 146656086 146655845 Y NA NA NA NA NA NA MMAA 118303 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 146656396 146656737 146656614 Y NA NA NA NA NA NA MMAA 118981 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 146725275 146725660 146725360 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 132127 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 146764373 146764705 146764540 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 93082 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 146856855 146857112 146856936 Y NA ZNF827 NA NA NA NA ZNF827 675 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 150756513 150756641 150756613 Y NA NA NA NA NA NA DCLK2 240785 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr4 151146456 151146697 151146576 Y DCLK2 NA NA NA NA NA DCLK2 149030 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 153165200 153165300 153165250 Y NA NA FAM160A1,FBXW7 IMR90 Hi-C 24141950 FBXW7 289953 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 153717992 153718074 153718038 Y NA TIGD4,ARFIP1 NA NA NA NA ARFIP1 18903 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 153894415 153894544 153894479 Y NA RP11-206F17.2,FHDC1 NA NA NA NA FHDC1 38911 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr4 154035952 154036270 154036100 Y KIAA0922,TIGD4 NA KIAA0922,ARFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 FHDC1 180448 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 154170296 154170804 154170469 Y TIGD4,KIAA0922 NA NA NA NA NA MND1 92997 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 157397521 157397868 157397695 Y NA NA GRIA2,PDGFC,GLRB IMR90 Hi-C 24141950 PDGFC 492678 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 157692679 157692824 157692748 Y NA NA NA NA NA NA PDGFC 197722 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 157863056 157863372 157863345 Y PDGFC PDGFC NA NA NA NA PDGFC 27174 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 157868046 157868334 157868214 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 22212 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 157889828 157890031 157889884 Y PDGFC PDGFC NA NA NA NA PDGFC 515 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 159742407 159742876 159742571 Y PPID,RAPGEF2,FNIP2 NA NA NA NA NA FNIP2 54117 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 159746098 159746434 159746194 Y PPID,RAPGEF2,FNIP2 NA NA NA NA NA FNIP2 57808 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 159925060 159925429 159925240 Y FNIP2 NA NA NA NA NA FNIP2 236770 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr4 161240057 161240222 161240140 Y NA NA NA NA NA NA RP11-6C14.1 543121 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 164464203 164464350 164464219 Y NPY1R,NPY5R,MARCH1 NA NA NA NA NA NPY1R 200219 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 164471489 164471679 164471583 Y NA NA NA NA NA NA NPY1R 207505 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 164583865 164584289 164584179 Y MARCH1 NA NA NA NA NA NPY1R 319881 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 168818156 168818524 168818473 Y NA NA NA NA NA NA ANXA10 193142 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 169408175 169408648 169408311 Y DDX60,DDX60L PALLD,DDX60L DDX60,DDX60L,PALLD IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PALLD 7569 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 169479701 169480223 169479961 Y NA DDX60L NA NA NA NA DDX60L 22764 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 169555491 169556032 169555691 Y NA NA NA NA NA NA DDX60L 98554 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 169559850 169560019 169559874 Y NA NA NA NA NA NA DDX60L 102913 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 170096424 170096523 170096474 Y NA NA NA NA NA NA SH3RF1 93733 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 173077271 173077317 173077294 Y NA NA NA NA NA NA GALNT7 1010587 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr4 173707273 173707572 173707424 Y NA NA NA NA NA NA GALNT7 380332 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 174337339 174338040 174337759 Y SAP30 SAP30 HMGB2,GALNT7,SAP30 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SAP30 48219 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 174443845 174444302 174443959 Y HAND2 HAND2 NA NA NA NA HAND2 5078 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 174958102 174958199 174958151 Y NA NA NA NA NA NA CEP44 244629 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 177715411 177715680 177715585 Y VEGFC VEGFC NA NA NA NA VEGFC 3530 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr4 177760403 177760587 177760468 Y NA VEGFC VEGFC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 VEGFC 48522 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 177931617 177931727 177931725 Y NA NA VEGFC IMR90 Hi-C 24141950 VEGFC 219736 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr4 178849873 178850023 178850005 Y NA NA NA NA NA NA AGA 488216 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 179336968 179337246 179337206 Y NA NA NA NA NA NA AGA 975311 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 181844755 181844937 181844843 Y NA NA NA NA NA NA AC108142.1 1219465 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 182070656 182070725 182070691 Y NA NA NA NA NA NA AC108142.1 993677 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 183161464 183161792 183161628 Y ODZ3 NA ODZ3 IMR90 Hi-C 24141950 AC108142.1 97062 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 183568083 183568352 183568218 Y NA NA NA NA NA NA DCTD 268737 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 183935008 183935168 183935057 Y NA NA WWC2,FAM92A3,ODZ3,CLDN24 IMR90 Hi-C 24141950 WWC2 83278 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 185205400 185205552 185205478 Y NA NA IRF2,CCDC111,MLF1IP,LOC728175,CASP3 IMR90 Hi-C 24141950 IRF2 188182 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 185338413 185338600 185338537 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 55134 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 186495067 186495245 186495187 Y NA PDLIM3 NA NA NA NA PDLIM3 40301 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 187590427 187590811 187590747 Y NA NA NA NA NA NA FAT1 55065 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 187948547 187948771 187948688 Y NA NA LOC339975 IMR90 Hi-C 24141950 FAT1 302671 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 189144165 189144266 189144216 Y NA NA NA NA NA NA TRIML2 115408 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr4 189329642 189330099 189329860 Y NA NA TRIML1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIML2 300885 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr4 189361062 189361328 189361166 Y NA NA NA NA NA NA TRIML2 332305 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr4 190936592 190936699 190936668 Y NA NA NA NA NA NA FRG1 76649 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.84558289440885 chr4 190942271 190942591 190942322 Y NA NA NA NA NA NA FRG1 82328 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr5 53990 54174 54063 Y PLEKHG4B,C5orf55 NA LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA IMR90 Hi-C 24141950 CCDC127 162156 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 373695 374160 373984 Y EXOC3 NA NA NA NA NA C5orf55 67098 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr5 399875 400445 400189 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 40813 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 413817 414070 413960 Y NA C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 27188 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 784651 785023 784908 Y ZDHHC11,TPPP NA NA NA NA NA TRIP13 105735 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr5 963791 964176 964051 Y NA NKD2 SLC12A7,TRIP13,BRD9,LOC100506688 IMR90 Hi-C 24141950 NKD2 42768 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 1525802 1526000 1525905 Y NA LPCAT1 NA NA NA NA LPCAT1 3710 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 3304230 3304631 3304430 Y NA NA NA NA NA NA IRX1 289537 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr5 5423578 5423857 5423693 Y KIAA0947 KIAA0947 NA NA NA NA KIAA0947 4801 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA SRD5A1 81417 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 3.06447388628646 chr5 10422961 10423316 10423021 Y NA ROPN1L NA NA NA NA ROPN1L 16320 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 10551479 10551871 10551616 Y NA ANKRD33B MARCH6,ANKRD33B,ROPN1L IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD33B 10571 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 10692588 10692818 10692805 Y NA NA NA NA NA NA DAP 66566 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 10733059 10733302 10733226 Y NA DAP NA NA NA NA DAP 26082 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 11035965 11036506 11036174 Y NA NA NA NA NA NA DAP 276581 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 12099131 12099529 12099330 Y NA NA NA NA NA NA DAP 1339747 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 14011107 14011342 14011264 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 68455 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 14035955 14036534 14036234 Y TRIO NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 93303 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 14036813 14036909 14036843 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 94161 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 14037561 14037744 14037653 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 94909 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr5 14038478 14038912 14038655 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 95826 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr5 14039774 14040034 14039980 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 97122 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr5 14109130 14109647 14109337 Y NA TRIO TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIO 32164 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 14142332 14142650 14142445 Y NA TRIO NA NA NA NA TRIO 521 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 14142803 14143164 14142969 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 992 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr5 14154284 14154671 14154327 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 12473 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.84558289440885 chr5 14174472 14174896 14174531 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 32661 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 14178655 14179133 14178814 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 36844 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 14185691 14186191 14185984 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 43880 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr5 14186205 14186627 14186374 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 44394 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr5 14204877 14205144 14204973 Y FAM105B NA NA NA NA NA TRIO 63066 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 14208272 14208510 14208423 Y FAM105B NA NA NA NA NA TRIO 66461 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 14264855 14265210 14264930 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 123044 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 3.72114686191927 chr5 14268390 14268821 14268476 Y NA NA NA NA NA NA TRIO 126579 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr5 14404233 14404452 14404428 Y TRIO NA NA NA NA NA FAM105A 175432 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr5 14742718 14742956 14742837 Y NA NA NA NA NA NA RBBP4P1 53553 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 15008718 15008950 15008809 Y ANKH NA FAM105B,ANKH,LOC100130744 IMR90 Hi-C 24141950 ANKH 138831 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 16539355 16539674 16539525 Y FAM134B NA NA NA NA NA ZNF622 75454 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 16735791 16735955 16735874 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 120624 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 17154796 17154999 17154850 Y BASP1 NA NA NA NA NA BASP1 91089 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 17224986 17225514 17225115 Y BASP1 NA NA NA NA NA FTH1P10 127219 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 17282496 17282827 17282587 Y BASP1 NA NA NA NA NA FTH1P10 69906 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 17284953 17285194 17285064 Y BASP1 NA NA NA NA NA FTH1P10 67539 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 18299452 18299668 18299545 Y NA NA LOC285696,BASP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL36AP21 251793 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 25910581 25911176 25910785 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 721816 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 3.72114686191927 chr5 26847119 26847280 26847167 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 1658354 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 29758752 29759069 29758903 Y NA NA NA NA NA NA RPL19P11 1292603 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 30099812 30100097 30099950 Y NA NA NA NA NA NA RPL19P11 951575 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr5 31894536 31894834 31894609 Y NA CTD-2206G10.2 NA NA NA NA CTD-2206G10.2 26639 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 32083300 32083310 32083305 Y PDZD2 NA NA NA NA NA GOLPH3 89146 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 32982024 32982196 32982110 Y NA NA NA NA NA NA RP11-36C20.1 178089 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 33312073 33312323 33312255 Y NA CTD-2066L21.3 NPR3,LOC340113 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2066L21.3 16057 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 33442170 33442454 33442303 Y NA CTD-2203K17.1,TARS NA NA NA NA TARS 3368 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 33807297 33807469 33807384 Y ADAMTS12 NA NA NA NA NA ADAMTS12 82828 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 33834348 33834761 33834680 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS12 55536 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 33892874 33893172 33893071 Y NA ADAMTS12 NA NA NA NA ADAMTS12 2577 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 34571432 34571721 34571601 Y NA NA RAI14,TTC23L IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 82621 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 34949030 34949157 34949062 Y NA BRIX1,RAD1,DNAJC21 NA NA NA NA DNAJC21 21332 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 35673129 35673344 35673237 Y SPEF2,IL7R NA NA NA NA NA SPEF2 57183 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 35859478 35859884 35859711 Y NA IL7R NA NA NA NA IL7R 8681 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 35924372 35924674 35924571 Y NA NA NA NA NA NA IL7R 73575 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 36151218 36151404 36151252 Y C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA SKP2 1127 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 36690488 36690876 36690655 Y NIPBL CTD-2353F22.1 NA NA NA NA CTD-2353F22.1 32421 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr5 37771819 37772240 37771999 Y NA NA NA NA NA NA GDNF 65548 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 37838047 37838605 37838394 Y GDNF,GDNF,GDNF GDNF NA NA NA NA GDNF 259 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 38538245 38538619 38538432 Y LIFR MIR3650 NA NA NA NA MIR3650 17044 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 38660472 38660667 38660594 Y LIFR NA EGFLAM,LIFR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIFR 54016 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 38680372 38680698 38680535 Y LIFR NA EGFLAM,LIFR IMR90 Hi-C 24141950 LIFR 73916 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 38872248 38872554 38872396 Y NA CTD-2127H9.1,OSMR NA NA NA NA OSMR 28288 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 38968924 38969094 38969009 Y NA NA NA NA NA NA RICTOR 103416 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 39177066 39177486 39177327 Y RICTOR NA NA NA NA NA FYB 95144 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 39256594 39256894 39256792 Y RICTOR,FYB FYB NA NA NA NA FYB 15736 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 39411101 39411451 39411362 Y NA C9,DAB2 NA NA NA NA C9 11519 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 40735267 40735522 40735406 Y NA TTC33 NA NA NA NA TTC33 18555 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 41084074 41084331 41084322 Y NA NA NA NA NA NA C7 176720 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 41113994 41114275 41114076 Y NA NA C7,C6 IMR90 Hi-C 24141950 C7 206640 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 41845041 41845055 41845050 Y OXCT1,FBXO4 OXCT1 NA NA NA NA OXCT1 23566 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 42468582 42468751 42468671 Y NA NA NA NA NA NA SEPP1 416743 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 42505068 42505257 42505244 Y NA NA NA NA NA NA SEPP1 380237 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 42994649 42995346 42995172 Y NA AC025171.1 NA NA NA NA AC025171.1 44331 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 43007637 43008177 43007831 Y NA AC025171.1 NA NA NA NA AC025171.1 31500 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 43008201 43008438 43008332 Y NA AC025171.1 NA NA NA NA AC025171.1 31239 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 43020658 43020829 43020797 Y ZNF131,C5orf39 AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA AC025171.1 18848 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 43051482 43051716 43051600 Y NA AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA ZNF131 11562 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 43773427 43773527 43773474 Y NA NA NA NA NA NA NNT-AS1 172095 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 44943814 44943963 44943889 Y NA NA NA NA NA NA MRPS30 136787 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 49719324 49719499 49719409 Y PARP8 EMB NA NA NA NA EMB 17583 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 53298305 53298413 53298402 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 305999 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr5 53317506 53317866 53317808 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 286546 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 53879713 53879860 53879787 Y NA NA SNX18 IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 68124 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 53886377 53886761 53886569 Y SNX18,SNX18 NA SNX18 IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 74788 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 54120977 54121197 54121092 Y NA NA SNX18 IMR90 Hi-C 24141950 ESM1 195302 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 54472215 54472598 54472476 Y NA GPX8 NA NA NA NA GPX8 18269 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 55199167 55199571 55199365 Y NA NA NA NA NA NA IL31RA 53960 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 55289605 55289989 55289924 Y IL6ST IL6ST,CTD-2031P19.3 NA NA NA NA CTD-2031P19.3 610 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 55555067 55555385 55555210 Y NA NA ANKRD55,IL6ST,MAP3K1 IMR90 Hi-C 24141950 AC022431.1 243514 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 55575946 55576115 55576004 Y NA NA MAP3K1,MIER3 IMR90 Hi-C 24141950 AC022431.1 222784 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 55655118 55655221 55655151 Y NA NA MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC022431.1 143678 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 55737283 55737549 55737459 Y MAP3K1 NA MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC022431.1 61350 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 56738135 56738571 56738168 Y ACTBL2 ACTBL2 PLK2,ACTBL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 38065 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr5 56790461 56790772 56790742 Y NA ACTBL2 ACTBL2,PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 13825 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr5 57076259 57076553 57076406 Y NA NA PLK2,GPBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTBL2 299623 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr5 57099848 57100234 57100012 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 323212 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 57111915 57112364 57112128 Y ACTBL2 NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 335279 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 57112814 57113117 57112881 Y ACTBL2 NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 336178 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 57117655 57118000 57117917 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 341019 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr5 57120821 57121296 57121146 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 344185 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr5 57133445 57133721 57133581 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 356809 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 57137483 57137861 57137645 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 360847 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 57537303 57537570 57537449 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 PLK2 216517 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 59086263 59086677 59086406 Y PDE4D NA NA NA NA NA PDE4D 729270 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 60315642 60315784 60315678 Y NA NA NA NA NA NA NDUFAF2 76686 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 60597691 60598057 60597813 Y NA ZSWIM6 ZSWIM6,C5orf43 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZSWIM6 28043 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr5 60600910 60601202 60601013 Y ZSWIM6 ZSWIM6 ZSWIM6,C5orf43,NDUFAF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZSWIM6 24898 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 60736184 60736544 60736365 Y NA NA NA NA NA NA RPL3P6 50486 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 61661747 61661797 61661772 Y NA DIMT1,IPO11 NA NA NA NA DIMT1 35969 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 64331292 64332267 64331637 Y NA NA NA NA NA NA CWC27 268535 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr5 64358648 64358799 64358710 Y NA NA ADAMTS6,CWC27 IMR90 Hi-C 24141950 CWC27 295891 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 64398874 64399506 64398924 Y NA NA ADAMTS6,CWC27,PPWD1,CENPK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CWC27 336117 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 64459611 64459838 64459685 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS6 315909 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 64486221 64486631 64486280 Y ADAMTS6 NA NA NA NA NA ADAMTS6 289116 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 64505244 64505511 64505327 Y ADAMTS6 NA NA NA NA NA ADAMTS6 270236 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 65228217 65228394 65228309 Y NA ERBB2IP NA NA NA NA ERBB2IP 7914 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 65814686 65814967 65814740 Y MAST4 NA NA NA NA NA MAST4 75209 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 66145750 66145926 66145797 Y NA NA CD180 IMR90 Hi-C 24141950 MAST4 255574 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 67242397 67242498 67242448 Y NA NA NA NA NA NA PIK3R1 267050 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 67875476 67875860 67875665 Y PIK3R1 NA NA NA NA NA PIK3R1 365928 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 71045616 71045849 71045733 Y NA NA MCCC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 MCCC2 164501 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 71404360 71404518 71404455 Y MAP1B MAP1B NA NA NA NA MAP1B 3299 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 71659094 71659472 71659166 Y NA PTCD2,MRPS27 NA NA NA NA MRPS27 44621 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 71706819 71707003 71706885 Y NA NA ZNF366,PTCD2,TNPO1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS27 92346 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 72118223 72118546 72118402 Y TNPO1 TNPO1 NA NA NA NA TNPO1 8084 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 72511984 72512100 72512037 Y FOXD1 NA FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM171 97865 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 73612322 73612454 73612340 Y NA NA RGNEF,ENC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEXB 321394 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 74163639 74163858 74163748 Y NA FAM169A GFM2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM169A 2863 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 74862624 74863010 74862882 Y ANKRD31,COL4A3BP,POLK,COL4A3BP,POC5 NA NA NA NA NA COL4A3BP 56661 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 74883919 74884208 74884013 Y NA NA NA NA NA NA COL4A3BP 77956 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 76086514 76086772 76086643 Y F2R F2RL1 NCRUPAR,F2R,IQGAP2 IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 25986 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 76102045 76102389 76102284 Y F2RL1 F2RL1 F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 10369 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 76103019 76103387 76103332 Y F2RL1 F2RL1 F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 9371 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 76110007 76110333 76110205 Y NA F2RL1 NA NA NA NA F2RL1 2425 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 77822722 77823939 77823093 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 168383 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 77890894 77891278 77891114 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA LHFPL2 172566 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 77940704 77941073 77940964 Y NA NA NA NA NA NA LHFPL2 122771 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 78204289 78204572 78204406 Y NA NA NA NA NA NA ARSB 75338 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 78270986 78271091 78271032 Y NA ARSB NA NA NA NA ARSB 8819 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 79543086 79543324 79543242 Y ZFYVE16,SERINC5 SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 6574 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 80564528 80564843 80564784 Y NA CKMT2-AS1,ZCCHC9 NA NA NA NA CKMT2-AS1 30536 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 81074673 81075064 81074862 Y NA SSBP2 SSBP2,ZCCHC9,ATG10 IMR90 Hi-C 24141950 SSBP2 29057 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 81147637 81148063 81147790 Y NA CTD-2249K22.1 ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2249K22.1 2217 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr5 82307578 82308063 82307728 Y NA NA NA NA NA NA XRCC4 63254 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 82769254 82769739 82769524 Y VCAN VCAN NA NA NA NA VCAN 3970 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 82770174 82770695 82770300 Y NA VCAN NA NA NA NA VCAN 4890 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr5 83018086 83018575 83018426 Y NA HAPLN1 NA NA NA NA HAPLN1 2654 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr5 83214867 83215139 83214962 Y HAPLN1 NA NA NA NA NA RNU4-11P 117494 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 83545538 83546053 83545791 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2269F5.1 132192 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 83585889 83586179 83586107 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2269F5.1 92066 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 83670446 83670810 83670539 Y EDIL3 CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 7435 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 83677578 83677928 83677708 Y EDIL3 CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 317 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr5 84744146 84744237 84744174 Y NA NA NA NA NA NA EDIL3 1065535 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 87956632 87957169 87956907 Y MEF2C,MEF2C NA NA NA NA NA MEF2C 240753 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 88063737 88063896 88063817 Y NA NA NA NA NA NA MEF2C 134026 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 88109262 88109325 88109294 Y MEF2C,MEF2C NA NA NA NA NA MEF2C 88597 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 88609683 88609884 88609784 Y MEF2C NA NA NA NA NA MEF2C 411761 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 92593669 92593984 92593827 Y NA NA FLJ42709 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F1 323059 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 95048086 95048445 95048385 Y NA RHOBTB3,CTD-2154I11.2 RHOBTB3,ARSK,SPATA9,RFESD IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOBTB3 860 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 95063779 95063897 95063838 Y NA RHOBTB3,CTD-2154I11.2 NA NA NA NA CTD-2154I11.2 2102 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 95064673 95064837 95064747 Y ELL2 RHOBTB3,CTD-2154I11.2 NA NA NA NA CTD-2154I11.2 1162 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 95113820 95114121 95113969 Y NA CTD-2154I11.2,GLRX NA NA NA NA GLRX 42588 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr5 95170246 95170624 95170377 Y GLRX,ELL2 GLRX RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 13537 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 95403711 95404019 95403912 Y ELL2 RP11-254I22.1 ELL2,CAST,MIR583,C5orf27 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-254I22.1 19892 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr5 95414896 95415105 95415065 Y GLRX,ELL2 RP11-254I22.1 NA NA NA NA RP11-254I22.1 31077 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 95594948 95595289 95595074 Y ELL2 NA ELL2,RFESD,GLRX IMR90 Hi-C 24141950 RP11-254I22.1 211129 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 95873123 95873359 95873236 Y LNPEP,CAST,CAST CAST ELL2,PCSK1,CAST IMR90 Hi-C 24141950 CAST 14152 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 97790785 97791036 97790856 Y RGMB NA FLJ35946,RGMB IMR90 Hi-C 24141950 CH17-12M21.1 118337 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 99382569 99383254 99382906 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 485712 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr5 99387251 99388845 99388529 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 480121 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr5 103559627 103559775 103559695 Y NA NA NA NA NA NA NUDT12 663133 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 106900103 106900354 106900202 Y NA NA NA NA NA NA FBXL17 815445 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 108137615 108137706 108137661 Y NA NA NA NA NA NA FER 56092 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 108391550 108391948 108391605 Y NA NA NA NA NA NA FER 310027 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 109820642 109820933 109820788 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A46 250904 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 110865894 110866475 110866210 Y STARD4 STARD4 NA NA NA NA STARD4 19606 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr5 111018976 111019194 111019085 Y C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13 NA NA NA NA NA STARD4 172688 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 111054290 111054596 111054444 Y C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13 NA NA NA NA NA STARD4 208002 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 112218687 112219263 112218745 Y APC SRP19,REEP5 NA NA NA NA SRP19 23768 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 112219334 112219897 112219506 Y NA SRP19,REEP5 NA NA NA NA SRP19 24415 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 114847596 114847935 114847760 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 30656 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr5 114959651 114959879 114959766 Y COMMD10 AC010226.4,TMED7 NA NA NA NA TMED7-TICAM2,TICAM2 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 115276815 115277206 115277011 Y LOC644100 NA NA NA NA NA ATG12 101260 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 115855956 115855969 115855965 Y NA CTB-118N6.1 NA NA NA NA CTB-118N6.1 40289 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 117452118 117452132 117452125 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP2 855359 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 118257403 118257748 118257576 Y NA PTMAP2 NA NA NA NA PTMAP2 49743 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 118368421 118368671 118368600 Y TNFAIP8,TNFAIP8,DMXL1 DTWD2,DMXL1,CTB-161M19.4 TNFAIP8,DMXL1 IMR90 Hi-C 24141950 DMXL1 2796 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 118626064 118626362 118626186 Y DMXL1,TNFAIP8 TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 23677 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 118670685 118671156 118670901 Y TNFAIP8 NA NA NA NA NA TNFAIP8 68298 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 118677194 118677610 118677495 Y DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8 NA NA NA NA NA TNFAIP8 74807 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 118747047 118747470 118747128 Y DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8 HSD17B4 NA NA NA NA HSD17B4 38668 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 119016321 119016356 119016339 Y NA NA NA NA NA NA HSD17B4 230183 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 119440031 119440114 119440073 Y NA NA NA NA NA NA PRR16 357859 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 119940626 119940961 119940736 Y NA NA NA NA NA NA PRR16 142653 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 121506435 121506655 121506507 Y NA ZNF474,CTC-441N14.2 NA NA NA NA CTC-441N14.2 17884 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 121516793 121517196 121516968 Y LOX,LOX CTC-441N14.2 NA NA NA NA CTC-441N14.2 28242 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 121519182 121519443 121519230 Y NA CTC-441N14.2 NA NA NA NA CTC-441N14.2 30631 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 122322384 122322589 122322416 Y NA PPIC NA NA NA NA PPIC 47847 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 122765811 122765999 122765906 Y NA CEP120 CEP120 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CEP120 8525 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 123987356 123987539 123987440 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 94961 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 123996464 123996708 123996619 Y NA NA NA NA NA NA ZNF608 85792 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 123997171 123997561 123997207 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 84939 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 124085012 124085124 124085092 Y NA ZNF608 ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 2512 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 125709518 125709709 125709633 Y GRAMD3 GRAMD3 NA NA NA NA GRAMD3 15694 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 125721947 125722154 125722072 Y NA GRAMD3 NA NA NA NA GRAMD3 28123 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 126199771 126199925 126199848 Y NA NA NA NA NA NA LMNB1 89456 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 126478879 126479210 126479043 Y NA NA NA NA NA NA C5orf63 71695 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 126847905 126848122 126848004 Y NA PRRC1 PRRC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 PRRC1 3179 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 131108111 131108375 131108174 Y NA FNIP1 NA NA NA NA FNIP1 22335 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 131430055 131430830 131430575 Y RAPGEF6,FNIP1,SLC22A4,IRF1 NA NA NA NA NA PDLIM4 160534 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 131594769 131595694 131595371 Y PDLIM4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA PDLIM4 3405 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 131629178 131629624 131629352 Y FNIP1,IRF1,SLC22A4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 170 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 131832561 131832909 131832704 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 IRF1 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 IRF1 8071 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr5 131833441 131833717 131833513 Y IRF1 IRF1 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 IRF1 8951 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 132576270 132576709 132576388 Y AFF4,ZCCHC10 NA NA NA NA NA HSPA4 190616 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 132851323 132851715 132851519 Y NA NA NA NA NA NA C5orf15 450763 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 133463152 133463566 133463254 Y PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7 TCF7,SKP1 NA NA NA NA TCF7 14750 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 133562679 133563046 133562870 Y NA MIR3661,PPP2CA NA NA NA NA PPP2CA 2846 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 133801466 133801754 133801589 Y NA NA PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 55877 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 133802349 133802592 133802584 Y PPP2CA,SEC24A,UBE2B NA PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 56760 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 133839310 133839404 133839346 Y NA NA PHF15,PPP2CA,CDKL3,CDKN2AIPNL,SAR1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 93721 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 133847692 133847829 133847767 Y NA NA PHF15,CDKN2AIPNL,CDKL3,UBE2B,SKP1,PPP2CA IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 102103 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 133863130 133863560 133863438 Y NA NA NA NA NA NA CDKN2AIPNL 117541 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr5 133864116 133864195 133864168 Y NA NA NA NA NA NA SEC24A 118284 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 133890161 133890536 133890268 Y TCF7,PPP2CA,CDKL3,UBE2B,SEC24A,CAMLG,PHF15 NA NA NA NA NA SEC24A 91943 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 133890594 133890960 133890666 Y PPP2CA,UBE2B,SEC24A NA NA NA NA NA SEC24A 91519 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 133891612 133892163 133891823 Y PPP2CA,UBE2B,SEC24A NA NA NA NA NA SEC24A 90316 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461 NA NA NA NA MTND5P11 246 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11 NA NA NA NA MTND4P12,MIR4461 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr5 134733668 134734080 134733976 Y H2AFY H2AFY NA NA NA NA H2AFY 64 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 135341804 135342193 135341990 Y FBXL21,TGFBI TGFBI TGFBI,VTRNA2-1,FBXL21 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBI 20391 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 135342387 135342803 135342527 Y TGFBI TGFBI TGFBI,VTRNA2-1,FBXL21 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBI 19781 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 135356057 135356513 135356322 Y NA TGFBI VTRNA2-1,TGFBI,FBXL21,LECT2,SMAD5 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBI 6071 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 135359253 135359579 135359414 Y NA TGFBI LECT2,TGFBI IMR90 Hi-C 24141950 TGFBI 3005 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 135416297 135416409 135416350 Y NA NA NA NA NA NA SMAD5 50125 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 136450174 136450503 136450334 Y NA NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 258857 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 136833088 136833480 136833319 Y KLHL3,SPOCK1 NA NA NA NA NA SPOCK1 98588 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 137172827 137173063 137172946 Y KLHL3,MYOT PKD2L2,RP11-381K20.2 NA NA NA NA PKD2L2 48594 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 137370531 137370718 137370637 Y PKD2L2,KDM3B,FAM53C,FAM53C,FAM13B,NME5 FAM13B PKD2L2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM13B 14932 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 137870529 137870619 137870574 Y FAM53C,KDM3B,ETF1 ETF1,HSPA9 NA NA NA NA ETF1 6370 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 138397430 138397825 138397750 Y NA NA NA NA NA NA MATR3 209616 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 138786651 138786712 138786682 Y NA SPATA24,DNAJC18 NA NA NA NA DNAJC18 8471 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 138965572 138965797 138965632 Y NA NA NA NA NA NA CXXC5 59087 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 139023017 139023340 139023136 Y NA CXXC5 CXXC5 IMR90 Hi-C 24141950 CXXC5 1544 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 139040519 139041115 139040855 Y PAIP2 CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 15635 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 139076374 139076603 139076510 Y CXXC5 NA NA NA NA NA CXXC5 51490 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 139488718 139489038 139488945 Y NA PURA NRG2,CYSTM1,IGIP IMR90 Hi-C 24141950 PURA 3356 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 139636160 139636260 139636251 Y SRA1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 44446 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 140090601 140091006 140090806 Y NA WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3 NA NA NA NA VTRNA1-1 1741 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 141311332 141311399 141311366 Y NA KIAA0141,RNF14 NA NA NA NA KIAA0141 9959 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 141615988 141616150 141616110 Y NA NA FGF1,NDFIP1,SPRY4 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY4 87870 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 141825669 141826086 141825870 Y SPRY4 NA NDFIP1,SPRY4,FGF1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY4 121649 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 142357164 142357537 142357332 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 209215 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 142362111 142362403 142362189 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP26 214162 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 142461616 142461728 142461672 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P21 248442 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 142534225 142534485 142534355 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P21 175685 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 142562980 142563339 142563259 Y NR3C1 NA NA NA NA NA RPL7P21 146831 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 142580387 142580630 142580509 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P21 129540 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 142584878 142585235 142585051 Y ARHGAP26 NA NA NA NA NA RPL7P21 124935 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 142623562 142623962 142623719 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P21 86208 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.40780091065365 chr5 142625760 142626024 142625785 Y ARHGAP26,NR3C1,NR3C1 NA NA NA NA NA RPL7P21 84146 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 142916050 142916194 142916130 Y NA NA ARHGAP26,NR3C1 IMR90 Hi-C 24141950 NR3C1 102973 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr5 143078144 143078385 143078261 Y NA NA ARHGAP26 IMR90 Hi-C 24141950 NR3C1 265067 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 143267812 143268155 143268024 Y NA NA ARHGAP26,NR3C1,YIPF5 IMR90 Hi-C 24141950 YIPF5 280123 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 143300463 143300651 143300509 Y NA NA ARHGAP26,NR3C1 IMR90 Hi-C 24141950 YIPF5 247627 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 143567299 143567675 143567503 Y NA YIPF5,KCTD16 NA NA NA NA KCTD16 18903 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr5 143569314 143569909 143569557 Y KCTD16 YIPF5,KCTD16 NA NA NA NA KCTD16 20918 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr5 144566580 144566678 144566629 Y NA NA KCTD16,PRELID2 IMR90 Hi-C 24141950 PRELID2 646254 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 144741919 144742138 144742043 Y NA NA KCTD16,SH3RF2 IMR90 Hi-C 24141950 PRELID2 470794 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr5 145827727 145827826 145827802 Y NA TCERG1 GPR151 IMR90 Hi-C 24141950 TCERG1 2853 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 146200379 146200464 146200463 Y PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B NA NA NA NA NA PPP2R2B 261883 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 146832241 146832308 146832261 Y JAKMIP2,DPYSL3 NA NA NA NA NA DPYSL3 55311 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 146834939 146835189 146835093 Y DPYSL3,DPYSL3 NA NA NA NA NA DPYSL3 52430 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 146915248 146915516 146915371 Y DPYSL3 DPYSL3 DPYSL3 IMR90 Hi-C 24141950 DPYSL3 27629 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 146952297 146952481 146952389 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL3 64678 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 147024840 147025034 147024978 Y DPYSL3,JAKMIP2 NA NA NA NA NA JAKMIP2 135304 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 147572374 147572821 147572603 Y FBXO38 NA NA NA NA NA RP11-373N22.3 188525 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 147738650 147738787 147738783 Y SPINK14 RP11-373N22.3,FBXO38 NA NA NA NA RP11-373N22.3 22559 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 148591795 148592037 148591918 Y ABLIM3 NA NA NA NA NA AFAP1L1 57397 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 148832906 148833066 148832986 Y NA NA NA NA NA NA CSNK1A1 95941 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr5 148835583 148835880 148835720 Y NA NA NA NA NA NA CSNK1A1 93127 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr5 149267173 149267449 149267330 Y NA NA NA NA NA NA SLC26A2 70851 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 149339062 149339484 149339111 Y CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3 SLC26A2,HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA SLC26A2 762 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 149518246 149518623 149518550 Y NA PDGFRB NA NA NA NA PDGFRB 14812 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.97001892689844 chr5 149522462 149523132 149522666 Y NA PDGFRB NA NA NA NA PDGFRB 10303 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr5 149838456 149838698 149838517 Y SYNPO,ZNF300,SLC6A7 CD74,RPS14,NDST1,CTC-367J11.1 NDST1,MYOZ3,SYNPO,RPS14 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS14 11137 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 149852669 149852742 149852704 Y NA RPS14,NDST1,CTC-367J11.1 SYNPO,MYOZ3,C5orf62,RPS14,NDST1,DCTN4,RBM22 IMR90 Hi-C 24141950 NDST1 10639 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 149853688 149853975 149853788 Y NA RPS14,NDST1,CTC-367J11.1 SYNPO,MYOZ3,C5orf62,RPS14,NDST1,DCTN4,RBM22 IMR90 Hi-C 24141950 NDST1 9406 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 150021479 150021575 150021527 Y NA SYNPO NA NA NA NA SYNPO 42837 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 150161319 150161633 150161505 Y ANXA6,C5orf62 DCTN4 NA NA NA NA DCTN4 24648 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 150169826 150170319 150169982 Y CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62 DCTN4 NA NA NA NA DCTN4 33155 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 150403932 150404163 150404140 Y NA GPX3 NA NA NA NA GPX3 5808 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 150464543 150466084 150465220 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 5054 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 150505089 150505277 150505181 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,TNIP1,CCDC69,ANXA6 TNIP1,ANXA6 TNIP1 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA6 30166 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 150873344 150873758 150873456 Y NA NA NA NA NA NA SLC36A1 58737 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 151078700 151079028 151078874 Y ATOX1,SPARC SPARC SPARC,ATOX1 IMR90 Hi-C 24141950 SPARC 13974 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 151119916 151120243 151119990 Y NA RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1 SPARC IMR90 Hi-C 24141950 RP11-54C4.1 23696 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 151129219 151129502 151129338 Y SLC36A1 RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1 NA NA NA NA RP11-54C4.1 14437 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 151213355 151213633 151213423 Y NA NA NA NA NA NA ATOX1 63262 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 154205315 154205569 154205444 Y KIF4B,GEMIN5 CNOT8 NA NA NA NA CNOT8 29544 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 154274946 154275114 154275030 Y NA CNOT8,GEMIN5,MRPL22 NA NA NA NA CNOT8 39833 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 156939273 156939536 156939403 Y NA NA NA NA NA NA ADAM19 61247 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 157029541 157029807 157029692 Y HAVCR2,NIPAL4,ADAM19 ADAM19 CYFIP2,FNDC9,NIPAL4,ADAM19,SOX30,C5orf52,THG1L,LSM11 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM19 28758 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 157097652 157097963 157097872 Y NA NA NA NA NA NA THG1L 58242 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 157257409 157257732 157257678 Y NA CLINT1 NA NA NA NA CLINT1 26451 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 158611896 158612266 158612182 Y IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145 CTB-11I22.1,RNF145 NA NA NA NA CTB-11I22.1 22663 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr5 158876999 158877252 158877089 Y NA NA NA NA NA NA UBLCP1 188910 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 159402452 159402764 159402629 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 31356 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 159414162 159414427 159414404 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 19693 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr5 159592107 159592427 159592336 Y NA PWWP2A,FABP6 TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FABP6 19947 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr5 159592617 159593055 159592885 Y NA PWWP2A,FABP6 TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FABP6 19319 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 159596316 159596619 159596472 Y NA FABP6 TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2,C5orf54 IMR90 Hi-C 24141950 FABP6 15755 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 162202155 162202531 162202344 Y NA NA NA NA NA NA RP11-541P9.3 659801 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 167001995 167002057 167002026 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 714599 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 167126470 167126930 167126675 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 589726 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 167157088 167157552 167157214 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 559104 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 167171330 167171561 167171437 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 545095 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 167241894 167242222 167242118 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 474434 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 167243466 167243587 167243564 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 473069 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 168588352 168588495 168588423 Y NA NA NA NA NA NA SLIT3 137638 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 169078080 169078216 169078155 Y DOCK2 DOCK2 NA NA NA NA DOCK2 15829 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr5 169215174 169215454 169215255 Y DOCK2 NA NA NA NA NA DOCK2 152923 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 169404223 169404546 169404350 Y FAM196B FAM196B NA NA NA NA FAM196B 1198 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 169578231 169578535 169578387 Y NA NA KCNIP1,KCNMB1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM196B 172487 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 170906599 170906797 170906698 Y NA NA NA NA NA NA NPM1 94479 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 171094849 171095086 171094946 Y NA NA FBXW11,FGF18 IMR90 Hi-C 24141950 NPM1 282729 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr5 171431879 171432256 171432181 Y UBTD2,STK10 FBXW11 NA NA NA NA FBXW11 2 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 171602273 171602685 171602548 Y STK10 STK10 NA NA NA NA STK10 10705 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 171788471 171789086 171788773 Y DUSP1,STK10,UBTD2 NA NA NA NA NA UBTD2 79396 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 172160207 172160396 172160286 Y NA DUSP1 ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 35802 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 172160417 172160946 172160788 Y ATP6V0E1 DUSP1 ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 35252 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr5 172200337 172200842 172200639 Y UBTD2,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 4139 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 172234136 172234644 172234380 Y NA DUSP1,ERGIC1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERGIC1 24634 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 172283530 172283741 172283563 Y NA ERGIC1 NA NA NA NA ERGIC1 24252 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 172288216 172288483 172288386 Y DUSP1,C5orf41,ERGIC1 ERGIC1 NA NA NA NA ERGIC1 28938 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 172329840 172330200 172330006 Y DUSP1,C5orf41,ATP6V0E1,ERGIC1 NA NA NA NA NA RPL26L1 53532 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 172370220 172370579 172370385 Y ERGIC1,ATP6V0E1 RPL26L1,ATP6V0E1 NA NA NA NA RPL26L1 13153 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 172882283 172882785 172882503 Y NA NA LOC285593,STC2,BOD1,NKX2-5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STC2 127777 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 172883833 172884047 172883943 Y CPEB4 NA LOC285593,STC2,BOD1,NKX2-5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STC2 129327 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 172922247 172922290 172922269 Y NA NA STC2,LOC285593,BNIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BOD1 119373 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 173738914 173739193 173739170 Y HMP19 RP11-267A15.1 BOD1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-267A15.1 22105 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 173765324 173765497 173765445 Y MSX2 RP11-267A15.1 HMP19,MIR4634,MSX2,FLJ16171 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-267A15.1 4026 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr5 173811612 173811806 173811713 Y NA NA NA NA NA NA RP11-267A15.1 50314 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 173846140 173846257 173846227 Y NA NA MSX2,MIR4634 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-267A15.1 84842 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 174670280 174670302 174670292 Y NA NA DRD1 IMR90 Hi-C 24141950 SFXN1 231763 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 175302369 175302773 175302579 Y DRD1,CPLX2,C5orf25,CPLX2 NA NA NA NA NA HRH2 219336 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 176973275 176973657 176973542 Y NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3 DDX41,FAM193B,TMED9 NA NA NA NA FAM193B 5885 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 177042588 177043196 177042926 Y NSD1,FAM193B TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 17487 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 178052813 178053238 178053128 Y AGXT2L2,CLK4 CLK4 COL23A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLK4 2378 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 178259703 178260206 178260005 Y ZNF879 ZNF354B,RNU1-39P ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF354B 24748 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr5 178692524 178692976 178692825 Y ADAMTS2 NA NA NA NA NA ADAMTS2 77455 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 179718006 179718384 179718320 Y NA MAPK9 NA NA NA NA MAPK9 907 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 180611137 180611357 180611292 Y MGAT1 CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 5567 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr5 180634441 180634803 180634658 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM7 4148 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 422827 423098 422962 Y DUSP22,IRF4 NA NA NA NA NA DUSP22 133197 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 435145 435499 435323 Y HUS1B NA IRF4 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP22 145515 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 1798121 1798343 1798232 Y NA NA NA NA NA NA FOXC1 189440 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 2330490 2330806 2330587 Y NA NA NA NA NA NA GMDS-AS1 86508 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 2790944 2791090 2791014 Y NA WRNIP1,SERPINB1 SERPINB1 IMR90 Hi-C 24141950 WRNIP1 27296 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 3163246 3163428 3163368 Y NA BPHL,TUBB2A NA NA NA NA TUBB2A 7486 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 3166310 3166878 3166542 Y NA BPHL,TUBB2A NA NA NA NA TUBB2A 10550 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 3209395 3209963 3209634 Y SERPINB9 PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA PSMG4 19674 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 3238745 3238826 3238788 Y NA PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 8781 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 3248062 3248427 3248198 Y SLC22A23,TUBB2A,TUBB2B PSMG4,TUBB2B TUBB2A,BPHL,RIPK1,LOC100507194,TUBB2B IMR90 Hi-C 24141950 TUBB2B 18098 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 3797931 3798162 3798051 Y NA PXDC1,FAM50B SLC22A23,FAM50B,TUBB2B,RIPK1,BPHL IMR90 Hi-C 24141950 PXDC1 47671 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 3826272 3826513 3826435 Y C6orf145 FAM50B SLC22A23,TUBB2B IMR90 Hi-C 24141950 FAM50B 21107 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr6 3987035 3987350 3987158 Y NA PRPF4B SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194 IMR90 Hi-C 24141950 PRPF4B 32151 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 4582137 4582541 4582469 Y NA NA CDYL,RPP40 IMR90 Hi-C 24141950 CDYL 121852 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 6151506 6151793 6151650 Y F13A1 NA NA NA NA NA FARS2 892229 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 6407628 6407920 6407729 Y LY86 NA NA NA NA NA RREB1 697910 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 6851413 6851674 6851488 Y NA NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 254156 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 7052517 7053280 7052961 Y LY86 NA RREB1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RREB1 52550 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 7137966 7138068 7138020 Y RIOK1,RIOK1,CAGE1,RREB1,RREB1 RREB1 NA NA NA NA RREB1 32136 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 7261407 7261720 7261663 Y NA NA NA NA NA NA SSR1 83959 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 7505623 7505742 7505694 Y RREB1,DSP DSP DSP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DSP 34066 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 8083649 8083837 8083720 Y NA EEF1E1 NA NA NA NA EEF1E1 16974 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 9037386 9037741 9037564 Y NA NA NA NA NA NA SLC35B3 603592 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 9516527 9516706 9516607 Y NA NA LOC100130275,TFAP2A,LINC00518 IMR90 Hi-C 24141950 TFAP2A 901186 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr6 10383571 10383981 10383824 Y TFAP2A,TFAP2A TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 33911 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.97001892689844 chr6 10403752 10404250 10404030 Y TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 13642 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 10407698 10407754 10407725 Y PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 10138 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 10441526 10441791 10441655 Y TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,GCNT2,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A,GCNT2 NA NA NA NA TFAP2A 23634 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 11243333 11243432 11243383 Y MAK,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 137149 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 11586757 11587121 11586877 Y NA NA NA NA NA NA TMEM170B 50819 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 11650418 11650889 11650652 Y NA NA HIVEP1,EDN1,ADTRP IMR90 Hi-C 24141950 TMEM170B 114480 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 11750046 11750450 11750402 Y NA NA NA NA NA NA TMEM170B 214108 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 11769423 11769725 11769659 Y HIVEP1 NA NA NA NA NA TMEM170B 233485 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 11772710 11773287 11772940 Y NEDD9,TMEM170B,HIVEP1 NA NA NA NA NA HIVEP1 233708 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 12113688 12114092 12113700 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP1 106693 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 12472967 12473281 12473124 Y NA RPL15P3 NA NA NA NA RPL15P3 39061 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 12484193 12484504 12484246 Y EDN1 RPL15P3 EDN1,TMEM170B,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL15P3 27838 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr6 12573441 12573699 12573559 Y NA NA EDN1,TMEM170B IMR90 Hi-C 24141950 RPL15P3 61099 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 13391107 13391478 13391293 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D7 64292 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 13649579 13649948 13649702 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 36020 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 14890476 14890661 14890625 Y NA NA JARID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JARID2 353866 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 15589107 15589675 15589446 Y JARID2,DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 71614 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 16607418 16607798 16607611 Y NA NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 151571 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 16741302 16741617 16741570 Y NA RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 17752 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 17418097 17418389 17418210 Y NA CAP2 NA NA NA NA CAP2 26650 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 17864491 17864751 17864619 Y NA NA NA NA NA NA KIF13A 121103 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 18150871 18151234 18151053 Y NUP153,KDM1B NHLRC1,TPMT,KDM1B NA NA NA NA TPMT 2071 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 18407685 18408142 18407784 Y RNF144B RNF144B NA NA NA NA RNF144B 40906 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 19298680 19298958 19298819 Y NA NA NA NA NA NA RP4-625H18.2 504025 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 20418274 20418752 20418425 Y NA E2F3 NA NA NA NA E2F3 17876 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 21022706 21023638 21022736 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 490018 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 21587723 21589288 21589205 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2684 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 3.50225587004167 chr6 21589338 21589711 21589681 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2261 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 21987708 21987959 21987863 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 395736 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 22475595 22475903 22475749 Y NA NA SOX4,LINC00340 IMR90 Hi-C 24141950 SOX4 883623 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 24313904 24313964 24313914 Y DCDC2,KAAG1,DCDC2 DCDC2 NA NA NA NA DCDC2 42316 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 24323980 24324360 24324286 Y DCDC2,KAAG1,DCDC2 DCDC2 NA NA NA NA DCDC2 31920 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 24743891 24744276 24743998 Y TDP2,C6orf62 C6orf62,GMNN GMNN,CMAHP,C6orf62 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C6orf62 24827 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 24951869 24952437 24952321 Y ALDH5A1,KIAA0319,KIAA0319,TDP2,C6orf62 NA FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 FAM65B 87801 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 25009821 25010191 25010012 Y NA FAM65B FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 FAM65B 30047 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 25094713 25094741 25094729 Y NA NA NA NA NA NA FAM65B 54475 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 25511627 25511972 25511799 Y NA NA NA NA NA NA LRRC16A 234321 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2 NA NA NA NA HIST1H1A 22967 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr6 26126352 26126787 26126533 Y HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD NA NA NA NA HIST1H2AC 3979 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 26521003 26521206 26521108 Y HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1 HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HCG11 927 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 26536966 26537248 26536997 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 333 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 27136362 27136689 27136526 Y NA HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 NA NA NA NA HIST1H2AH 23501 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 27145585 27145720 27145705 Y FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 31303 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 27145729 27146130 27146023 Y ZNF184 HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 30893 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr6 27156271 27156423 27156401 Y NA HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 20600 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr6 27640311 27640352 27640335 Y NA NA ZNF391,PRSS16 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BL 133357 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 27655687 27656083 27655918 Y NA NA LOC100507173 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HIST1H2BL 117626 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 27706104 27706357 27706299 Y NA NA NA NA NA NA HIST1H2BL 67352 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 27740489 27740807 27740621 Y NA HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J NA NA NA NA HIST1H2BL 32902 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 27798416 27798741 27798578 Y NA HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L NA NA NA NA HIST1H4K 1111 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 27863298 27863662 27863535 Y ZKSCAN3,ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZNF323,ZNF193,ZNF192,ZKSCAN4,PGBD1,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 4095 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 28072476 28072872 28072543 Y HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192 ZNF165,ZSCAN16 NA NA NA NA ZSCAN16 17466 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 28188130 28188520 28188276 Y ZNF193 ZKSCAN4 NA NA NA NA ZKSCAN4 36491 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 28302002 28302386 28302196 Y NA ZKSCAN3 NA NA NA NA ZKSCAN3 13305 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 28414953 28415259 28415025 Y NA ZSCAN12,ZSCAN23 NA NA NA NA ZSCAN23 5674 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 28457225 28458028 28457315 Y NA ZSCAN23 NA NA NA NA ZSCAN23 47946 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 3.06447388628646 chr6 28834475 28834586 28834545 Y NA NA NA NA NA NA TRIM27 55180 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 28956602 28956848 28956725 Y NA HCG15,ZNF311 NA NA NA NA HCG15 4622 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 30068638 30068845 30068662 Y NA ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11 NA NA NA NA PPP1R11 36152 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 30069810 30070038 30069951 Y HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39 ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11 NA NA NA NA PPP1R11 37324 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 30247447 30247451 30247450 Y NA HLA-L,TRIM39,HCG18 NA NA NA NA HLA-L 22086 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 30254050 30254472 30254356 Y NA HLA-L,TRIM39,HCG18 NA NA NA NA HLA-L 28689 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 30649746 30650798 30650074 Y TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949 C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB NA NA NA NA PPP1R18 2874 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr6 30651242 30651620 30651357 Y TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949 C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB NA NA NA NA PPP1R18 2052 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 30716597 30717062 30716912 Y IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20 PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1 IMR90 Hi-C 24141950 IER3 6266 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 30720004 30720713 30720325 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20 DPCR1,NRM,PPP1R18,MDC1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,VARS2,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 9673 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 30737456 30737900 30737560 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3 FLOT1,IER3,HCG20 DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A,MRPS18B,PPP1R10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HCG20 4854 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 30811913 30812084 30812025 Y NA DDR1 FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,C6orf15,PSORS1C1 IMR90 Hi-C 24141950 DDR1 30114 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 31702368 31703528 31702658 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5,VWA7 NA NA NA NA CLIC1 2012 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 31705604 31706142 31705906 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1,VWA7 NA NA NA NA MSH5 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 31789098 31789184 31789146 Y TNF,HSPA1L,HSPA1A,NEU1,HSPA1B VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 4328 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 3244 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr6 32072186 32072277 32072232 Y C2,TNXB ATF6B,FKBPL,PPT2,PRRT1 NA NA NA NA ATF6B 21753 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 34191726 34192136 34191830 Y C6orf1,HMGA1 CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2 RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1 MCF7 ChIA-PET 22265404 CYCSP55 6510 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 35149645 35149913 35149805 Y NA SCUBE3 UHRF1BP1,ANKS1A,SCUBE3,ZNF76,TCP11 IMR90 Hi-C 24141950 SCUBE3 30277 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 35453228 35453566 35453395 Y NA FANCE,RPL10A,TEAD3 NA NA NA NA TEAD3 9287 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 36318512 36318897 36318687 Y CPNE5 RP1-50J22.4,ETV7 NA NA NA NA RP1-50J22.4 33711 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 36391024 36391283 36391227 Y SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,PXT1 RP1-50J22.4,ETV7,KCTD20,PXT1 NA NA NA NA KCTD20 17261 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 36404249 36404468 36404378 Y MAPK14,PNPLA1,STK38 KCTD20,PXT1 ETV7 IMR90 Hi-C 24141950 KCTD20 4076 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 36547678 36548077 36547769 Y PI16,MTCH1 STK38,SRSF3 STK38,SRSF3,KCTD20,PXT1,MIR3925 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRSF3 12068 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 37070053 37070857 37070460 Y CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2 NA PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 65122 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 37102324 37102775 37102642 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 33204 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 37104908 37105418 37105405 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 30561 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 37210217 37210497 37210343 Y TMEM217,TMEM217 TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TBC1D22B 13051 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 37210643 37210874 37210721 Y TMEM217,TMEM217 TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TBC1D22B 12674 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 37271813 37272101 37271931 Y PIM1,TBC1D22B TBC1D22B,TMEM217,RNF8 NA NA NA NA RNF8 47647 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 37366071 37366087 37366081 Y NA RNF8 NA NA NA NA RNF8 46323 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 37673638 37673745 37673684 Y NA NA MDGA1 K562 ChIA-PET 22265404 ZFAND3 111530 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 37752102 37752667 37752552 Y MDGA1 ZFAND3 BTBD9,ZFAND3,FTSJD2,CCDC167,MDGA1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND3 32608 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 38033139 38033395 38033278 Y ZFAND3 NA NA NA NA NA ZFAND3 247864 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 38514218 38514357 38514288 Y NA NA NA NA NA NA BTBD9 91567 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 39850347 39850811 39850571 Y NA MOCS1 NA NA NA NA MOCS1 49479 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr6 40132230 40132456 40132336 Y NA NA NA NA NA NA RP1-278E11.3 207658 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 40904550 40904902 40904649 Y UNC5CL NA APOBEC2,C6orf130,TSPO2,UNC5CL IMR90 Hi-C 24141950 NFYA 133782 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 40964511 40964818 40964666 Y NA NA NA NA NA NA NFYA 73866 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 40965087 40965613 40965406 Y NA NA NA NA NA NA NFYA 73071 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 41286601 41286824 41286755 Y NFYA,TFEB,TREML4,TREM1 NA C6orf130 K562 ChIA-PET 22265404 FOXP4 225340 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 41350827 41350931 41350885 Y NA NA MDFI,FOXP4,TFEB,USP49 IMR90,H1ESC,K562,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 FOXP4 161233 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 41456339 41456683 41456511 Y NA NA FOXP4,TFEB,MDFI IMR90,H1ESC,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 FOXP4 55481 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 41471691 41471833 41471786 Y NA FOXP4,RP11-328M4.2 FOXP4 IMR90 Hi-C 24141950 FOXP4 40331 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 41649853 41650127 41649990 Y NA NA NA NA NA NA TFEB 51870 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 41889955 41890338 41890119 Y FRS3 USP49,MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 3029 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 41996341 41996754 41996467 Y NA CCND3,TAF8 NA NA NA NA CCND3 19341 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 42219475 42219699 42219588 Y NA MRPS10 NA NA NA NA MRPS10 35872 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 42283764 42284050 42283900 Y NA NA NA NA NA NA MRPS10 100161 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 42375139 42375533 42375327 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 42256 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 42413186 42413554 42413522 Y NA TRERF1 GUCA1B,MRPS10 IMR90 Hi-C 24141950 TRERF1 4235 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 42420719 42421067 42420926 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 2930 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr6 42694331 42694739 42694439 Y KLC4,KLC4,CUL9,TRERF1,C6orf226,PRPH2,TBCC TBCC NA NA NA NA TBCC 17819 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 43058034 43058580 43058415 Y NA CUL7,MRPL2,PTK7 NA NA NA NA PTK7 16028 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 44009201 44009753 44009484 Y SLC35B2,MRPL14 RP5-1120P11.3 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1120P11.3 29897 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 44011946 44012485 44012109 Y NA RP5-1120P11.3 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1120P11.3 27165 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 44021972 44022127 44022048 Y SLC35B2 RP5-1120P11.3 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1120P11.3 17523 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 44022822 44022968 44022901 Y NA RP5-1120P11.3 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP5-1120P11.3 16682 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 44026121 44027353 44026480 Y NFKBIE,MAD2L1BP RP5-1120P11.3 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP5-1120P11.3 12297 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 44070488 44070804 44070651 Y NA RP5-1120P11.3,TMEM63B,MRPL14 NA NA NA NA TMEM63B 21847 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 44205272 44205504 44205346 Y NFKBIE SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE NA NA NA NA HSP90AB1 7320 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 44230828 44231731 44231363 Y NFKBIE SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,AARS2 NA NA NA NA NFKBIE 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 44627574 44627760 44627625 Y NA NA CLIC5,RUNX2,SUPT3H,CDC5L IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 274312 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 44634916 44635472 44635214 Y NA NA CLIC5,SUPT3H,RUNX2 IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 281654 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 45083481 45083547 45083514 Y NA NA NA NA NA NA RUNX2 210347 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 45390987 45391259 45391097 Y RUNX2 SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 47297 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 45404651 45404813 45404715 Y RUNX2 NA NA NA NA NA SUPT3H 60961 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 45618234 45618676 45618425 Y RUNX2 NA RUNX2,SUPT3H,CLIC5 IMR90 Hi-C 24141950 SUPT3H 274544 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr6 45623562 45623937 45623654 Y NA NA RUNX2,SUPT3H,CLIC5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SUPT3H 279872 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr6 45665421 45665594 45665503 Y NA NA RUNX2,CDC5L,CLIC5 IMR90 Hi-C 24141950 SUPT3H 321731 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 46096116 46096332 46096231 Y ENPP4 RP1-8B1.4,ENPP4,ENPP5 NA NA NA NA ENPP4 386 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 48794608 48794845 48794713 Y NA NA NA NA NA NA MUT 634059 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 50818020 50818494 50818241 Y NA RPS17P5 NA NA NA NA RPS17P5 4881 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 52261634 52261809 52261784 Y EFHC1 PAQR8,EFHC1 NA NA NA NA EFHC1 21297 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 52377018 52377269 52377212 Y GSTA5,TRAM2 NA NA NA NA NA TRAM2 62444 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 52382425 52382779 52382512 Y NA NA NA NA NA NA TRAM2 56934 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 52416321 52416567 52416441 Y NA TRAM2 EFHC1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAM2 23146 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 52416960 52417092 52417044 Y GSTA5,PAQR8 TRAM2 NA NA NA NA TRAM2 22621 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 53191249 53191636 53191614 Y NA ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 20311 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 53205102 53205427 53205266 Y NA ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 6520 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 53224045 53224723 53224315 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 12098 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr6 55706850 55707208 55707026 Y NA NA NA NA NA NA FAM83B 997281 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 56573677 56574046 56573938 Y NA NA DST,BEND6,ZNF451 IMR90 Hi-C 24141950 DST 243380 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 56578288 56578394 56578341 Y NA NA DST IMR90 Hi-C 24141950 DST 239032 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr6 56594458 56594846 56594652 Y NA NA DST,BEND6,KIAA1586,PRIM2 IMR90 Hi-C 24141950 DST 222580 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 57288314 57288720 57288442 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 110711 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 57389697 57390070 57389732 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 212094 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 58776280 58777091 58777029 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 521711 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr6 58777244 58778438 58777771 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 522675 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 58778631 58779245 58778717 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 524062 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 64151294 64151779 64151706 Y NA NA NA NA NA NA PTP4A1 77887 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 64386722 64387357 64386973 Y PHF3 PHF3 NA NA NA NA PHF3 42997 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 64629183 64629230 64629207 Y NA NA NA NA NA NA PHF3 285458 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 64813713 64813775 64813744 Y NA NA NA NA NA NA PHF3 469988 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 65390704 65390953 65390803 Y NA NA NA NA NA NA EYS 1024165 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 68340064 68340094 68340079 Y NA NA NA NA NA NA EYS 1924946 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 70808594 70808991 70808795 Y NA NA NA NA NA NA LMBRD1 303591 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 71817586 71817689 71817638 Y B3GAT2 NA NA NA NA NA LYPLA1P3 55090 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 71906987 71907342 71907159 Y NA LYPLA1P3 OGFRL1,MIR30A IMR90 Hi-C 24141950 LYPLA1P3 34208 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 71958276 71958301 71958290 Y NA OGFRL1 OGFRL1 IMR90 Hi-C 24141950 OGFRL1 38205 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 72092992 72093394 72093291 Y NA LINC00472 NA NA NA NA LINC00472 35078 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 72114373 72114910 72114587 Y NA LINC00472 NA NA NA NA LINC00472 13562 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 72188537 72188902 72188719 Y NA NA OGFRL1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00472 60065 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 72294841 72295504 72295148 Y NA KRT19P1 RIMS1 IMR90 Hi-C 24141950 KRT19P1 2417 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr6 72683550 72683736 72683643 Y RIMS1 NA NA NA NA NA KRT19P1 391126 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 73329727 73330142 73329822 Y NA KCNQ5 NA NA NA NA KCNQ5 207 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 73867627 73867898 73867877 Y NA NA NA NA NA NA RP11-398K22.12 103040 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 73987583 73987923 73987651 Y NA RP11-398K22.12,KHDC1 KHDC1L IMR90 Hi-C 24141950 RP11-398K22.12 16645 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 74289769 74290568 74290415 Y MB21D1,SLC17A5,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA EEF1A1 58249 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 74295249 74295764 74295450 Y MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA EEF1A1 63729 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 74295823 74296227 74295840 Y MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA EEF1A1 64303 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 77981127 77981489 77981308 Y NA NA NA NA NA NA HTR1B 190001 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 78014950 78015339 78015145 Y NA NA NA NA NA NA HTR1B 156151 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 78176276 78176348 78176306 Y NA HTR1B NA NA NA NA HTR1B 4786 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 79773928 79774085 79774072 Y NA PHIP NA NA NA NA PHIP 11868 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 80207886 80208176 80208031 Y NA LCA5 NA NA NA NA LCA5 36999 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 80777050 80777287 80777243 Y NA BCKDHB NA NA NA NA BCKDHB 37077 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 81167165 81167315 81167240 Y NA NA FAM46A IMR90 Hi-C 24141950 BCKDHB 352801 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 81253590 81253803 81253687 Y NA NA NA NA NA NA BCKDHB 439226 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr6 82422345 82422435 82422390 Y NA FAM46A NA NA NA NA FAM46A 38056 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 82547816 82548067 82547911 Y FAM46A NA FAM46A MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM46A 87325 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 82648128 82648420 82648330 Y NA NA NA NA NA NA FAM46A 187637 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 82854780 82854947 82854862 Y NA NA NA NA NA NA IBTK 100524 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 83893224 83893469 83893362 Y RWDD2A,PGM3,PGM3 RWDD2A,PGM3 NA NA NA NA RWDD2A 7629 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 85087981 85088261 85088229 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1009 152628 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 85334002 85334301 85334152 Y NA NA NA NA NA NA TBX18 137936 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 86113432 86113601 86113525 Y NT5E NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 NT5E 44208 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 86114496 86114829 86114663 Y NT5E NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 NT5E 42980 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr6 88213981 88214157 88214070 Y GJB7 SLC35A1 NA NA NA NA SLC35A1 35640 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 89744998 89746016 89745827 Y UBE2J1,PNRC1 PNRC1 PNRC1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PNRC1 42454 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 90550185 90550523 90550354 Y NA MDN1,CASP8AP2 NA NA NA NA CASP8AP2 12572 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 91121051 91121489 91121257 Y BACH2,BACH2 NA BACH2,MIR4464 IMR90 Hi-C 24141950 BACH2 116424 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 94494942 94495122 94494946 Y NA NA NA NA NA NA EPHA7 367677 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 94860177 94860339 94860258 Y NA NA NA NA NA NA EPHA7 732912 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 95244699 95244909 95244803 Y NA NA NA NA NA NA MANEA 778510 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 95887569 95887862 95887716 Y NA NA NA NA NA NA MANEA 135557 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 99280317 99280875 99280652 Y POU3F2 NA NA NA NA NA FBXL4 112974 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 100584000 100584312 100584155 Y NA NA SIM1,ASCC3 IMR90 Hi-C 24141950 SIM1 326493 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 100676865 100677032 100676949 Y NA NA SIM1 IMR90 Hi-C 24141950 SIM1 233773 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 101311437 101311450 101311446 Y NA ASCC3 NA NA NA NA ASCC3 15798 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 102948586 102948935 102948701 Y NA NA NA NA NA NA ASCC3 1621338 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 105073456 105073750 105073604 Y LIN28B NA NA NA NA NA HACE1 232044 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 105388915 105389637 105389155 Y HACE1 NA NA NA NA NA HACE1 83121 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 105613649 105613734 105613671 Y BVES BVES,POPDC3 NA NA NA NA POPDC3 12136 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 106049296 106049799 106049571 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 200337 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 106217867 106218170 106217999 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 314025 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 106335541 106335714 106335627 Y PRDM1 NA PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 196481 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 106442778 106443178 106442990 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 89017 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 106540002 106540199 106540101 Y PRDM1 PRDM1 NA NA NA NA PRDM1 7807 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 107014040 107014053 107014047 Y BEND3,RTN4IP1 NA NA NA NA NA AIM1 56310 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 107306631 107306860 107306745 Y NA C6orf203 NA NA NA NA C6orf203 40547 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 108883670 108884545 108884024 Y OSTM1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 4632 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 109218749 109218814 109218782 Y NA RP11-249L21.4 NA NA NA NA RP11-249L21.4 8262 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 109637041 109637243 109637127 Y NA NA NA NA NA NA CD164 64519 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 110812850 110813232 110813170 Y NA NA NA NA NA NA DDO 78085 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 111727743 111727975 111727836 Y SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L NA NA NA NA NA REV3L 74943 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 111776910 111777281 111777179 Y NA REV3L NA NA NA NA REV3L 25637 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 111784023 111784230 111784203 Y NA REV3L NA NA NA NA REV3L 18688 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 111841823 111842197 111842010 Y NA REV3L NA NA NA NA REV3L 38905 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 111924339 111924647 111924531 Y TRAF3IP2 TRAF3IP2 NA NA NA NA TRAF3IP2 834 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 111925507 111925888 111925538 Y REV3L,TRAF3IP2 TRAF3IP2 NA NA NA NA TRAF3IP2 26 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 112163238 112163349 112163330 Y NA FYN NA NA NA NA FYN 29306 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 112192236 112192610 112192499 Y REV3L,FYN,FYN,FYN FYN NA NA NA NA FYN 45 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 112523729 112524008 112523937 Y LAMA4 NA NA NA NA NA LAMA4 50133 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 112525181 112525504 112525289 Y LAMA4 LAMA4 NA NA NA NA LAMA4 48637 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 112535932 112536093 112536020 Y NA LAMA4 NA NA NA NA LAMA4 38048 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 112618415 112618437 112618426 Y NA LAMA4 LAMA4 IMR90 Hi-C 24141950 LAMA4 44274 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 112619249 112619579 112619380 Y LAMA4 LAMA4 LAMA4 IMR90 Hi-C 24141950 LAMA4 45108 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 113505450 113505765 113505678 Y NA NA FLJ34503,MARCKS,HDAC2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-367G18.1 463511 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 113673815 113673995 113673934 Y NA NA LAMA4,FLJ34503,MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 RP11-367G18.1 295281 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 113680929 113681231 113681080 Y NA NA FLJ34503,MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 RP11-367G18.1 288045 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 113786299 113786716 113786378 Y MARCKS NA MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 RP11-367G18.1 182560 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 113882209 113882518 113882322 Y NA NA FLJ34503,MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 RP11-367G18.1 86758 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 113966016 113966399 113966296 Y MARCKS RP11-367G18.1 MARCKS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-367G18.1 2877 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 113966975 113967088 113966980 Y MARCKS RP11-367G18.1 MARCKS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-367G18.1 2188 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 113975639 113976185 113975774 Y MARCKS RP11-367G18.1 MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 RP11-367G18.1 6363 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 114005806 114006016 114005966 Y NA RP11-367G18.1 NA NA NA NA RP11-367G18.1 36530 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 114084486 114084718 114084651 Y MARCKS NA LAMA4 IMR90 Hi-C 24141950 MARCKS 91823 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 114085047 114085453 114085192 Y MARCKS NA LAMA4 IMR90 Hi-C 24141950 MARCKS 91088 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 114176108 114176553 114176196 Y MARCKS NA NA NA NA NA MARCKS 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr6 114662111 114662444 114662262 Y NA NA NA NA NA NA HDAC2 331639 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 115163170 115163515 115163320 Y NA NA NA NA NA NA HDAC2 832698 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 116708579 116708861 116708730 Y ZUFSP,DSE,FAM26F NA NA NA NA NA TSPYL1 109513 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 116988703 116988966 116988944 Y DSE,ZUFSP,KPNA5 ZUFSP,KPNA5 NA NA NA NA ZUFSP 746 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 117585963 117586004 117585985 Y NA VGLL2 NA NA NA NA VGLL2 1242 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 117785630 117785714 117785673 Y NA DCBLD1 DCBLD1,GOPC,ROS1 IMR90 Hi-C 24141950 DCBLD1 12650 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 118009013 118009297 118009155 Y NA NUS1 NA NA NA NA NUS1 14348 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 118858717 118859027 118858876 Y PLN NA NA NA NA NA CEP85L 170211 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 118964875 118965125 118965000 Y MCM9,C6orf204 NA NA NA NA NA CEP85L 64113 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 119468463 119468799 119468540 Y FAM184A NA NA NA NA NA FAM184A 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 121758280 121758805 121758450 Y GJA1 GJA1,RNU4-35P NA NA NA NA GJA1 3442 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.62669190253125 chr6 122016612 122016787 122016747 Y NA NA GJA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-35P 243345 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 123111983 123112340 123112183 Y PKIB,SMPDL3A SMPDL3A NA NA NA NA SMPDL3A 3668 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 125335634 125335813 125335724 Y NA NA NA NA NA NA RNF217 53943 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 125420883 125421200 125421024 Y NA TPD52L1 NA NA NA NA TPD52L1 16995 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 126241150 126241321 126241235 Y NCOA7 HINT3 NA NA NA NA HINT3 34606 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 126267356 126267782 126267584 Y NCOA7 HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 8145 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr6 126271537 126271736 126271680 Y NA HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 4191 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 126279126 126279509 126279187 Y NCOA7 HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 3199 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 127907573 127907629 127907601 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 152792 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 127980874 127981174 127981075 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 226093 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 128496365 128496708 128496537 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 343162 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 128793943 128794334 128794205 Y NA PTPRK NA NA NA NA PTPRK 45536 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 128830157 128830356 128830243 Y NA PTPRK NA NA NA NA PTPRK 9514 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 129250577 129251100 129251039 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 410707 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 129661219 129661453 129661336 Y LAMA2 NA NA NA NA NA ARHGAP18 367917 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 129855341 129855708 129855581 Y ARHGAP18 NA NA NA NA NA ARHGAP18 173662 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr6 129994496 129994751 129994657 Y ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 34619 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 130001069 130001170 130001133 Y NA ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 28200 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 130005105 130005433 130005370 Y L3MBTL3,ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 23937 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 130029433 130029625 130029566 Y NA ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 63 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 130030425 130030727 130030721 Y ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 1055 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 130342212 130342458 130342393 Y SAMD3,SAMD3,L3MBTL3 L3MBTL3 NA NA NA NA L3MBTL3 9368 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 131929733 131930009 131929873 Y NA MED23,RNU4-18P NA NA NA NA MED23 17360 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 132787299 132787948 132787832 Y NA STX7 NA NA NA NA STX7 44389 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 133077551 133077890 133077782 Y STX7,VNN2,VNN2,VNN2 NA NA NA NA NA RPS12 55690 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 133133336 133133580 133133458 Y NA SNORD101 NA NA NA NA RPS12 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 134085872 134085913 134085879 Y NA NA TCF21,MGC34034 IMR90 Hi-C 24141950 TBPL1 185395 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 134616841 134617592 134617239 Y SGK1,SGK1,SGK1 SGK1 NA NA NA NA SGK1 19658 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 134669516 134669878 134669820 Y NA SGK1 SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 32266 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 134679459 134679725 134679553 Y SGK1,SGK1 SGK1 SGK1,ALDH8A1,LOC154092 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 42209 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 134742048 134742399 134742278 Y SGK1,SGK1 NA SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 104798 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 134743944 134744382 134744175 Y SGK1,SGK1,SGK1 NA SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 106694 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 135503898 135504621 135504156 Y HBS1L,AHI1,MYB NA NA NA NA NA HBS1L 81704 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 135636764 135637196 135637190 Y NA NA NA NA NA NA LINC00271 179293 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 136316549 136316741 136316613 Y NA NA NA NA NA NA PDE7B 145715 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 136336050 136336507 136336258 Y NA NA NA NA NA NA PDE7B 165216 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 136932850 136933097 136932905 Y NA NA NA NA NA NA MAP7 62893 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 137545116 137545441 137545236 Y MAP3K5,IFNGR1 IFNGR1 NA NA NA NA IFNGR1 6530 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 138056622 138056809 138056720 Y TNFAIP3 NA TNFAIP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 129542 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 138132277 138133056 138132650 Y TNFAIP3 NA TNFAIP3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 53295 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 138148087 138148219 138148190 Y TNFAIP3 TNFAIP3 TNFAIP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 38132 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 138151863 138152166 138152043 Y TNFAIP3 TNFAIP3 TNFAIP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 34185 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 138194322 138194912 138194642 Y TNFAIP3 TNFAIP3 NA NA NA NA TNFAIP3 7971 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 139209045 139209410 139209228 Y NA NA NA NA NA NA REPS1 97988 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 139350632 139351255 139350885 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 43234 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 139642501 139642749 139642625 Y TXLNB NA ECT2L,TXLNB IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 51008 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 139854911 139854985 139854931 Y HECA,CITED2,CITED2,CITED2 NA LOC100132735,CITED2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 161154 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 139909356 139909574 139909434 Y NA NA CITED2,LOC645434,LOC100132735,MIR3668 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CITED2 215599 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 140161065 140161313 140161148 Y NA NA NA NA NA NA CITED2 467308 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 140262103 140262492 140262357 Y NA NA CITED2,HECA IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 568346 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 140858869 140859245 140859045 Y NA NA LOC100132735 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 1165112 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 140984884 140985153 140985121 Y NA NA LOC100132735 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 1291127 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 141300848 141301178 141301014 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 1165189 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 141804737 141805118 141804969 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 661249 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 141805925 141806152 141806020 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 660215 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 142091291 142091499 142091406 Y VTA1 NA NA NA NA NA VTA1 374868 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 142508557 142508921 142508635 Y NA VTA1 NA NA NA NA VTA1 42190 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 142698366 142698689 142698587 Y NA NA NA NA NA NA GPR126 77375 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 143124343 143124671 143124507 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 139667 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 143247398 143248213 143248022 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 16125 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 143248323 143248614 143248469 Y NA HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 15724 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 144126999 144127192 144127105 Y PHACTR2,PLAGL1,LTV1 RP3-468K18.5,LTV1 NA NA NA NA RP3-468K18.5 770 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 144585551 144585700 144585606 Y NA NA UTRN IMR90 Hi-C 24141950 TPT1P4 65449 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr6 144587251 144587368 144587331 Y NA NA UTRN,STX11 IMR90 Hi-C 24141950 TPT1P4 67149 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 144931961 144932452 144932213 Y NA NA NA NA NA NA TPT1P4 411859 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 144975415 144975576 144975532 Y NA NA NA NA NA NA TPT1P4 455313 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 147235088 147235549 147235197 Y RAB32,STXBP5 NA NA NA NA NA STXBP5 288012 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 148588961 148589218 148589102 Y UST SASH1 SASH1 IMR90 Hi-C 24141950 SASH1 2222 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 148651197 148651450 148651307 Y SASH1 NA NA NA NA NA SASH1 59757 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 149537612 149537784 149537698 Y NA NA NA NA NA NA TAB2 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 149657882 149658028 149657899 Y NA NA NA NA NA NA TAB2 120105 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 150958103 150958422 150958105 Y PLEKHG1 PLEKHG1 NA NA NA NA PLEKHG1 39104 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 151178145 151178545 151178467 Y MTHFD1L MTHFD1L NA NA NA NA MTHFD1L 6140 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 151178746 151179109 151178841 Y NA MTHFD1L NA NA NA NA MTHFD1L 5576 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 151701197 151701769 151701451 Y C6orf97,ZBTB2 ZBTB2 NA NA NA NA ZBTB2 8914 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 152085145 152085342 152085266 Y ESR1,ESR1,ESR1,ESR1 NA NA NA NA NA ESR1 109319 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 152634983 152635621 152635105 Y NA NA NA NA NA NA SYNE1 321315 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr6 153400065 153400072 153400069 Y NA NA NA NA NA NA RGS17 50312 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 154441744 154441825 154441785 Y OPRM1,OPRM1 NA NA NA NA NA CNKSR3 387968 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 154589736 154589946 154589797 Y NA NA NA NA NA NA CNKSR3 239847 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 154830409 154830718 154830573 Y CNKSR3 CNKSR3 NA NA NA NA CNKSR3 616 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 155347473 155347806 155347688 Y NA NA TIAM2 IMR90 Hi-C 24141950 TIAM2 195642 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 155510213 155510600 155510317 Y SCAF8 NA NA NA NA NA RP11-477D19.2 65258 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 155545212 155545590 155545426 Y SCAF8 RP11-477D19.2 NA NA NA NA RP11-477D19.2 30268 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 155590165 155590417 155590245 Y NA RP11-477D19.2,TFB1M NA NA NA NA RP11-477D19.2 14307 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 157007979 157008724 157008580 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88339 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr6 157096939 157097165 157097038 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 157097774 157098131 157097933 Y NA ARID1B NA NA NA NA ARID1B 711 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 157101566 157102083 157101700 Y ARID1B ARID1B NA NA NA NA ARID1B 4503 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 157160663 157161314 157160954 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 63600 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 157542479 157542718 157542566 Y NA NA NA NA NA NA TMEM242 199915 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr6 158254729 158255396 158255020 Y NA SNX9 NA NA NA NA SNX9 12433 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 158424430 158424803 158424679 Y SYNJ2 SYNJ2 NA NA NA NA SYNJ2 23542 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 158452388 158452885 158452569 Y SNX9 NA NA NA NA NA SYNJ2 51500 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 158463343 158463878 158463391 Y SNX9,SYNJ2 NA NA NA NA NA SYNJ2 62455 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 158468247 158468495 158468433 Y NA NA NA NA NA NA SYNJ2 67359 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 158478416 158478907 158478642 Y NA NA NA NA NA NA SYNJ2 77528 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 158481547 158481708 158481650 Y SNX9 NA NA NA NA NA SYNJ2 80659 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 158595666 158595874 158595793 Y NA SERAC1,GTF2H5 NA NA NA NA GTF2H5 8282 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 158981403 158981866 158981661 Y NA NA NA NA NA NA DYNLT1 81905 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 159141436 159141829 159141621 Y TAGAP,DYNLT1,SYTL3,C6orf99,EZR,EZR NA NA NA NA NA SYTL3 72390 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 159237852 159238517 159238245 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR NA NA NA NA NA EZR 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 159270971 159271326 159271104 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR,C6orf99 NA NA NA NA C6orf99 17645 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr6 159271429 159272000 159271674 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR,C6orf99 NA NA NA NA C6orf99 16971 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 159273925 159274893 159274526 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR,C6orf99 NA NA NA NA C6orf99 14078 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 159284894 159285253 159285074 Y NA EZR,C6orf99 OSTCP1 K562 ChIA-PET 22265404 C6orf99 3718 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 159489988 159490179 159490120 Y TAGAP NA NA NA NA NA RSPH3 70769 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 159535033 159535374 159535294 Y TAGAP NA NA NA NA NA FNDC1 53055 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 161607618 161607817 161607715 Y AGPAT4 NA NA NA NA NA AGPAT4 85276 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 161855398 161855535 161855440 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT4 162305 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 161865712 161865782 161865740 Y AGPAT4 NA NA NA NA NA AGPAT4 172619 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 162691567 162691813 162691690 Y NA NA NA NA NA NA PARK2 454990 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 163833938 163834442 163834340 Y NA QKI NA NA NA NA QKI 906 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 166901571 166901917 166901742 Y SFT2D1,RNASET2 NA NA NA NA NA SFT2D1 147492 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 167461087 167461406 167461193 Y RNASET2,GPR31,CCR6 NA NA NA NA NA FGFR1OP 50417 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 169470702 169471012 169470790 Y THBS2 NA WDR27,PHF10,FAM120B,THBS2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 90007 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 169473606 169473776 169473633 Y THBS2 NA WDR27,PHF10,FAM120B,THBS2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 87243 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr6 169546204 169546599 169546528 Y NA RP11-417E7.1 NA NA NA NA RP11-417E7.1 14420 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 169568038 169568505 169568172 Y NA RP11-417E7.1 C6orf70,THBS2,PHF10,WDR27 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 7019 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr6 169572627 169572772 169572742 Y NA RP11-417E7.1 THBS2,WDR27 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 11608 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr6 169573934 169574190 169574061 Y NA RP11-417E7.1 THBS2,WDR27 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 12915 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr6 169588480 169588865 169588804 Y NA RP11-417E7.1 WDR27,THBS2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 27461 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 169827902 169828288 169828095 Y NA NA NA NA NA NA THBS2 175763 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 170054470 170055295 170054892 Y TCTE3 WDR27,C6orf120 NA NA NA NA WDR27 44864 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.97001892689844 chr6 170449336 170449548 170449442 Y NA NA DLL1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM120B 148243 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr6 170600439 170600921 170600644 Y NA FAM120B NA NA NA NA FAM120B 2648 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 89354 89662 89513 Y NA NA FAM20C,HEATR2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM20C 101307 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr7 90518 90816 90667 Y NA NA FAM20C,HEATR2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM20C 100153 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 577876 578141 578015 Y PRKAR1B,PRKAR1B,HEATR2,GET4,PDGFA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 19943 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 579426 579712 579625 Y PRKAR1B,PRKAR1B,GET4,PDGFA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 21493 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr7 1139272 1139516 1139401 Y SUN1,TMEM184A C7orf50 NA NA NA NA C7orf50 36380 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 1571273 1571500 1571366 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 2923 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 1572262 1572844 1572636 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 3912 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 1945683 1945719 1945693 Y NA NA NA NA NA NA AC074389.9 165756 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 1970944 1971123 1971068 Y NA NA NA NA NA NA AC074389.9 191017 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 1975652 1975765 1975709 Y NA NA NA NA NA NA AC074389.9 195725 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 2738537 2739051 2738765 Y LFNG,CARD11 AMZ1 GNA12 IMR90 Hi-C 24141950 AMZ1 21381 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 2843425 2843709 2843567 Y NA AC006028.11,GNA12 NA NA NA NA AC006028.11 29546 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 2861620 2861774 2861696 Y LFNG,GNA12 AC006028.11,GNA12 NA NA NA NA AC006028.11 11481 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 2903227 2903785 2903462 Y LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12 AC006028.11,GNA12 GNA12 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNA12 21269 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 4681329 4681565 4681443 Y MMD2 NA SDK1,FOXK1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXK1 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr7 4764796 4765177 4765030 Y KIAA0415 NA NA NA NA NA FOXK1 83408 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr7 4784652 4785031 4784763 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 103264 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 5594554 5594977 5594837 Y WIPI2 FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 6438 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 5595490 5596184 5595557 Y CCZ1,ACTB FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 5231 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr7 5596196 5596581 5596543 Y CCZ1,ACTB FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 4834 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 5609541 5610012 5609880 Y SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 8126 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 5634980 5635411 5634989 Y AIMP2,FBXL18,ACTB,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216 IMR90 Hi-C 24141950 FSCN1 4541 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 5635420 5636238 5635862 Y NA ACTB,FSCN1 NA NA NA NA FSCN1 4981 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 5724329 5724708 5724518 Y NA NA NA NA NA NA FSCN1 93890 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 6145406 6145878 6145682 Y USP42 EIF2AK1,AC004895.4,USP42 NA NA NA NA USP42 2891 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 6676235 6676334 6676285 Y NA C7orf26,ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 1282 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 6677371 6677641 6677424 Y DAGLB,ZNF12,C7orf26 C7orf26,ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 2418 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 6682292 6682670 6682512 Y C7orf26 ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 7339 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 6741580 6741996 6741754 Y C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12 ZNF12,PMS2CL NA NA NA NA ZNF12 2558 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 8300852 8301132 8300960 Y ICA1,ICA1,ICA1 AC007009.1,ICA1 NA NA NA NA ICA1 535 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 8550473 8550803 8550530 Y NA NA NA NA NA NA ICA1 250156 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 12755276 12755712 12755432 Y VWDE,ARL4A ARL4A NA NA NA NA ARL4A 30795 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 16961680 16961908 16961842 Y NA NA AGR2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TSPAN13 170520 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 17094571 17094955 17094779 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AHR 241291 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 17409796 17409963 17409863 Y AHR NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC003075.4 72815 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 17412000 17412058 17412028 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC003075.4 75019 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 18285971 18286293 18286132 Y SNX13,HDAC9,HDAC9,HDAC9 NA NA NA NA NA HDAC9 161399 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 19017733 19017917 19017790 Y TWIST1 NA NA NA NA NA TWIST1 137378 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 19146147 19146774 19146493 Y FERD3L,TWIST1 TWIST1 NA NA NA NA TWIST1 8521 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 19409277 19409527 19409387 Y NA NA HDAC9 IMR90 Hi-C 24141950 TWIST1 253982 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 20547767 20548194 20547808 Y ITGB8 NA NA NA NA NA ITGB8 179442 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 20837430 20837819 20837731 Y SP8 SP8,RPL23P8 SP8 K562 ChIA-PET 22265404 SP8 12925 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 21395079 21395235 21395151 Y SP4 NA NA NA NA NA SP4 70417 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 22409424 22409487 22409456 Y NA NA NA NA NA NA EEF1A1P6 140131 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 22616988 22617783 22617407 Y IL6 NA NA NA NA NA STEAP1B 52761 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 22631710 22632105 22631870 Y IL6 STEAP1B NA NA NA NA STEAP1B 38439 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 23229571 23229876 23229614 Y NA NUPL2,GPNMB NA NA NA NA NUPL2 10125 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 23348040 23348443 23348292 Y KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3 NA NA NA NA NA GPNMB 74454 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 23375804 23376081 23376055 Y IGF2BP3 NA NA NA NA NA GPNMB 102218 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 23510676 23511223 23510889 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2590 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr7 23513815 23514383 23514045 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 MALSU1 K562 ChIA-PET 22265404 IGF2BP3 5729 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 24006556 24006902 24006729 Y NPY NA NA NA NA NA AC006026.13 288151 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 24092646 24092866 24092724 Y NPY NA NA NA NA NA AC006026.13 374241 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 24626460 24626850 24626473 Y NA MPP6 NA NA NA NA MPP6 15573 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 24739704 24740021 24739930 Y DFNA5,DFNA5 NA NA NA NA NA DFNA5 67223 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 24947142 24947425 24947387 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL3 71828 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 25009429 25009748 25009721 Y NA OSBPL3 NA NA NA NA OSBPL3 9505 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 25064852 25065012 25064919 Y NA OSBPL3 OSBPL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OSBPL3 45599 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr7 25894654 25894946 25894846 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 294914 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr7 25896245 25896461 25896419 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 293399 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr7 25896515 25897081 25896801 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 292779 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 25897167 25897316 25897282 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 292544 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 25901745 25902114 25902023 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 287746 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 25990725 25991211 25991018 Y NA NA NA NA NA NA NFE2L3 198649 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 26193570 26193972 26193862 Y SNX10,SNX10,HNRNPA2B1 NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1 NA NA NA NA NFE2L3 3710 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 26355868 26356236 26355954 Y NA AC010677.5,SNX10 NA NA NA NA SNX10 26327 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 26523285 26523306 26523295 Y NA NA NA NA NA NA AC004540.5 87072 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 26888997 26889313 26889155 Y NA NA NA NA NA NA SKAP2 143545 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 27143635 27143783 27143725 Y NA HOTAIRM1,HOXA1,HOXA2,HOXA-AS2,HOXA-AS3,HOXA4,HOXA5,HOXA6,HOXA3 NA NA NA NA HOXA-AS2 1613 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr7 27152655 27152825 27152741 Y NA HOTAIRM1,HOXA1,HOXA2,HOXA-AS2,HOXA-AS3,HOXA4,HOXA5,HOXA6,HOXA3,HOXA7 NA NA NA NA HOXA-AS2 7259 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 27573880 27573985 27573933 Y NA NA NA NA NA NA EIF4HP1 77412 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 27717680 27717897 27717733 Y NA HIBADH HOTTIP,HOXA13,HIBADH,TAX1BP1,JAZF1 IMR90 Hi-C 24141950 HIBADH 17066 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 28076890 28077172 28076964 Y CREB5 NA NA NA NA NA JAZF1-AS1 140769 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.97001892689844 chr7 28094781 28094986 28094893 Y HIBADH NA NA NA NA NA JAZF1-AS1 122955 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr7 28172246 28172388 28172317 Y NA JAZF1-AS1,JAZF1 NA NA NA NA JAZF1-AS1 45553 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 28175314 28175565 28175485 Y NA JAZF1-AS1,JAZF1 NA NA NA NA JAZF1-AS1 42376 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 28190212 28190323 28190268 Y NA JAZF1-AS1,JAZF1 NA NA NA NA JAZF1-AS1 27618 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 29645878 29645994 29645936 Y NA PRR15 PRR15 MCF7 ChIA-PET 22265404 PRR15 44451 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 30514545 30514933 30514653 Y NA NOD1 NA NA NA NA NOD1 1467 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 30636092 30636194 30636111 Y NA GGCT,GARS NA NA NA NA GARS 3795 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 32026855 32027150 32027002 Y NA NA NA NA NA NA PDE1C 309791 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 32929600 32929824 32929751 Y NA KBTBD2 NA NA NA NA KBTBD2 1919 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 34019230 34019836 34019529 Y NA NA NA NA NA NA BMPER 76707 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 34026970 34027411 34027080 Y BMPER NA NA NA NA NA BMPER 84447 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 34173056 34173436 34173156 Y BMPER NA NA NA NA NA BMPER 230533 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 35075861 35076697 35076367 Y NA NA NA NA NA NA DPY19L2P1 147237 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 35629037 35629048 35629043 Y NA NA NA NA NA NA HERPUD2 104133 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 36248787 36249072 36248912 Y EEPD1 NA NA NA NA NA EEPD1 58029 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 38371416 38371642 38371578 Y STARD3NL,TARP NA NA NA NA NA STARD3NL 155592 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 40755655 40755948 40755803 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 768019 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 40756959 40757193 40757114 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 769323 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 40867151 40867518 40867335 Y NA NA NA NA NA NA INHBA 873188 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 40952368 40952631 40952468 Y NA NA C7orf10,INHBA,LOC285954 IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 788075 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 40961938 40962183 40962107 Y NA NA C7orf10,INHBA,LOC285954 IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 778523 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 41025919 41026252 41026112 Y NA NA C7orf10,LOC285954,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 714454 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 41919848 41920138 41920006 Y INHBA NA LOC285954,C7orf10,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 179142 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 41924805 41925034 41925028 Y NA NA LOC285954,C7orf10,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 184099 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 41925856 41926073 41926056 Y INHBA NA LOC285954,C7orf10,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 185150 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 42896548 42896903 42896642 Y NA NA GLI3 IMR90 Hi-C 24141950 C7orf25 53001 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 42927750 42928726 42928340 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 NA NA NA NA C7orf25 21178 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr7 43117230 43117632 43117554 Y NA NA HECW1,MRPL32,PSMA2 IMR90 Hi-C 24141950 PSMA2 147408 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 43204376 43204667 43204548 Y NA NA NA NA NA NA PSMA2 234554 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 43593728 43593915 43593801 Y NA STK17A NA NA NA NA STK17A 26442 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 43644873 43645023 43645002 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 24516 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 43654812 43655175 43654945 Y POLM,DBNL,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 34455 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 43658377 43658532 43658408 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 38020 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 43659947 43660692 43660336 Y DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 39590 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 43676905 43677264 43677045 Y POLM,DBNL,STK17A,URGCP NA NA NA NA NA STK17A 56548 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 43912365 43912715 43912516 Y NA MRPS24 NA NA NA NA MRPS24 4873 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 43996825 43996925 43996859 Y NA URGCP,UBE2D4 NA NA NA NA UBE2D4 32788 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 44127636 44127736 44127679 Y YKT6,AEBP1 DBNL,POLM,AEBP1,POLD2 PGAM2,POLM,AEBP1,POLD2,GCK,YKT6,CAMK2B IMR90 Hi-C 24141950 POLM 7497 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 44426024 44426371 44426281 Y NA NA NA NA NA NA AC004453.8 79070 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 44677628 44678244 44677873 Y ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH OGDH ZMIZ2 IMR90 Hi-C 24141950 OGDH 33457 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 44678622 44679047 44678972 Y ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH OGDH NA NA NA NA OGDH 34451 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr7 44679392 44679514 44679453 Y ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH OGDH NA NA NA NA OGDH 35221 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 44954682 44954978 44954822 Y DDX56,OGDH,ZMIZ2,MYO1G,CCM2,PURB PURB OGDH,H2AFV,NACAD,PURB,TMED4,DDX56,MYO1G,SNHG15 IMR90 Hi-C 24141950 PURB 31722 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 46184955 46185274 46185142 Y NA NA NA NA NA NA IGFBP3 225482 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 46972513 46972753 46972628 Y NA NA IGFBP3,IGFBP1 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 647403 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 47237063 47237452 47237258 Y NA NA IGFBP3,IGFBP1 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 382704 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 47293209 47293414 47293276 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 326742 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 47390589 47390737 47390670 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 229419 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 47391456 47391672 47391564 Y C7orf65 NA NA NA NA NA TNS3 228484 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 47518819 47519136 47519085 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 101020 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 47521562 47522093 47521877 Y HUS1 NA NA NA NA NA TNS3 98063 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 47554592 47554957 47554775 Y C7orf65 NA NA NA NA NA TNS3 65199 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 47573930 47574208 47574136 Y NA TNS3 NA NA NA NA TNS3 45948 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 47588229 47588393 47588311 Y NA TNS3 NA NA NA NA TNS3 31763 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 47611156 47611689 47611507 Y C7orf69,TNS3 TNS3 NA NA NA NA TNS3 8467 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr7 47612587 47612873 47612749 Y NA TNS3 NA NA NA NA TNS3 7283 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 47620098 47620164 47620135 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 47631233 47631542 47631345 Y C7orf69,TNS3 TNS3 TNS3,LINC00525,C7orf69,PKD1L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS3 11077 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr7 47641076 47641289 47641172 Y NA TNS3 TNS3,C7orf65,LINC00525,PKD1L1,C7orf69 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS3 20920 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 47641950 47642196 47642073 Y NA TNS3 TNS3,C7orf65,C7orf69,PKD1L1,LINC00525 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS3 21794 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 47644474 47644665 47644612 Y NA TNS3 TNS3,C7orf65,C7orf69,PKD1L1,LINC00525 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 24318 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 47675013 47675155 47675094 Y TNS3 NA TNS3,C7orf69,PKD1L1,C7orf65,LINC00525 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS3 54857 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr7 47688297 47688502 47688400 Y NA NA TNS3,PKD1L1,LINC00525,C7orf69 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 68141 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 47691174 47691510 47691360 Y C7orf69,TNS3,C7orf65 NA TNS3,PKD1L1,LINC00525,C7orf69 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 71018 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 47797544 47797859 47797606 Y NA C7orf69 NA NA NA NA C7orf69 35030 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 47823605 47823820 47823740 Y TNS3 C7orf69 NA NA NA NA C7orf69 9069 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr7 47826128 47826596 47826342 Y NA C7orf69 NA NA NA NA C7orf69 6293 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 50948563 50948792 50948678 Y GRB10 NA NA NA NA NA GRB10 89404 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 53130490 53130791 53130640 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-14P 300960 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 55132578 55133258 55132929 Y SEC61G,EGFR EGFR NA NA NA NA EGFR 47864 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr7 55198488 55198937 55198616 Y SEC61G NA NA NA NA NA EGFR 113774 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 55200352 55201043 55200686 Y SEC61G,EGFR NA NA NA NA NA EGFR 115638 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr7 55201472 55201858 55201601 Y SEC61G NA NA NA NA NA EGFR 116758 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 55529793 55530311 55530129 Y ZNF713,VOPP1 NA NA NA NA NA LANCL2 98652 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 55638699 55638887 55638779 Y VOPP1 VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 18 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 56606357 56606502 56606382 Y LOC389493 NA NA NA NA NA CHCHD2 434088 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 64196878 64197130 64197096 Y NA NA NA NA NA NA ZNF138 55636 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 65761130 65761447 65761274 Y RABGEF1,KCTD7 NA NA NA NA NA TPST1 92944 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 66152523 66152575 66152558 Y RABGEF1,KCTD7 RP4-756H11.3,RABGEF1 KCTD7,LOC493754,RABGEF1 IMR90 Hi-C 24141950 RABGEF1 7372 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 68171287 68171584 68171440 Y NA NA NA NA NA NA RP5-859M6.1 67502 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 69215481 69215818 69215531 Y NA NA NA NA NA NA AUTS2 153576 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 70113143 70113470 70113265 Y NA NA NA NA NA NA AUTS2 1051238 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr7 73236868 73237278 73236968 Y CLDN3,CLDN4 WBSCR27 NA NA NA NA WBSCR27 17587 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 73265870 73266203 73266092 Y BCL7B WBSCR27 NA NA NA NA WBSCR27 11005 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 73314080 73314324 73314199 Y NA NA NA NA NA NA WBSCR27 59215 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 73866647 73867033 73866768 Y LAT2 GTF2IRD1 NA NA NA NA GTF2IRD1 527 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 73897037 73897256 73897156 Y NA GTF2IRD1 NA NA NA NA GTF2IRD1 30917 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr7 74001829 74001994 74001904 Y NA NA GTF2I IMR90 Hi-C 24141950 GTF2I 68000 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 74064444 74064957 74064539 Y GTF2IRD2B,LAT2 GTF2I NA NA NA NA GTF2I 5037 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 75199057 75199167 75199108 Y POR PMS2P3 NA NA NA NA PMS2P3 43579 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 75354773 75355120 75354947 Y NA HIP1 NA NA NA NA HIP1 11160 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 75465283 75465439 75465360 Y MDH2 CCL26,RHBDD2 STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR IMR90 Hi-C 24141950 RHBDD2 4481 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 75546128 75546229 75546156 Y NA POR STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 POR 19610 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 75795833 75796053 75795969 Y RHBDD2,POR NA SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 MDH2 120464 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 75923846 75924306 75924205 Y HSPB1 HSPB1 NA NA NA NA HSPB1 5555 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr7 75947305 75947626 75947472 Y RHBDD2,SRRM3 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 17444 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr7 75993529 75993613 75993570 Y POR YWHAG,ZP3 YWHAG MCF7 ChIA-PET 22265404 YWHAG 7181 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 76009173 76009680 76009431 Y POR YWHAG,ZP3 NA NA NA NA ZP3 15155 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr7 78922771 78923130 78923056 Y MAGI2 NA NA NA NA NA MAGI2-AS3 157068 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr7 80399893 80400101 80400015 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3C 149574 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 81233474 81233832 81233648 Y NA NA HGF,CACNA2D1 IMR90 Hi-C 24141950 HGF 163922 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr7 81247788 81247966 81247912 Y NA NA HGF IMR90 Hi-C 24141950 HGF 149788 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 87389107 87389401 87389254 Y NA ABCB1 NA NA NA NA ABCB1 48496 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 89975005 89975165 89975035 Y NA GTPBP10,CLDN12 NA NA NA NA GTPBP10 12468 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 90600966 90601241 90601095 Y NA NA NA NA NA NA FZD1 290542 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 92227351 92227620 92227450 Y CDK6,CDK6 FAM133B FAM133B K562 ChIA-PET 22265404 FAM133B 9643 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 92271044 92271426 92271360 Y SAMD9 NA NA NA NA NA FAM133B 53336 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 92271612 92271814 92271678 Y SAMD9 NA NA NA NA NA FAM133B 53904 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 92439060 92439368 92439205 Y PEX1,C7orf64,FAM133B,SAMD9 AC002454.1,CDK6 NA NA NA NA AC002454.1 24429 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 92673041 92673276 92673159 Y NA NA CDK6,FAM133B IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SAMD9 72060 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 92745192 92745375 92745297 Y SAMD9 SAMD9L NA NA NA NA SAMD9 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr7 93812688 93813130 93812921 Y NA NA TFPI2,BET1,GNGT1 IMR90 Hi-C 24141950 BET1 180994 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 93926616 93927074 93926886 Y SGCE,COL1A2 NA COL1A2,GNG11 IMR90 Hi-C 24141950 COL1A2 94799 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr7 93930998 93931300 93931121 Y NA NA COL1A2,GNG11 IMR90 Hi-C 24141950 COL1A2 90573 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 94003622 94003870 94003684 Y NA COL1A2 NA NA NA NA COL1A2 18003 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 94004729 94005413 94005273 Y NA COL1A2 NA NA NA NA COL1A2 16460 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 94021237 94021945 94021560 Y NA NA NA NA NA NA COL1A2 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr7 95070230 95070589 95070236 Y PON1,PON3,PDK4 PON2 PON2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PON2 7720 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 95546532 95546890 95546577 Y NA NA NA NA NA NA DYNC1I1 146666 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 95674465 95674690 95674578 Y DYNC1I1,FLJ42280 NA NA NA NA NA DYNC1I1 274599 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 96642423 96642668 96642630 Y NA DLX6,DLX5 NA NA NA NA DLX6 9563 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 96694369 96694759 96694746 Y NA DLX5,ACN9 DYNC1I1 IMR90 Hi-C 24141950 DLX5 41960 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 97915595 97916070 97915699 Y LMTK2,BRI3 TECPR1,BRI3 NA NA NA NA BRI3 35904 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 98739351 98739615 98739543 Y NA SMURF1 NA NA NA NA SMURF1 108 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 98970307 98970479 98970399 Y PTCD1,CPSF4 ARPC1A,ARPC1B,BUD31,PDAP1 NA NA NA NA ARPC1B 435 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 98973055 98973209 98973129 Y ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B ARPC1B,BUD31,PDAP1 NA NA NA NA ARPC1B 3183 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 99962576 99962959 99962740 Y MCM7,C7orf43,ZCWPW1,TSC22D4,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,GIGYF1,PILRB,PILRA PILRB,PMS2P1 PILRA IMR90 Hi-C 24141950 PMS2P1 25045 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 100042030 100042585 100042239 Y COPS6,EPHB4 MEPCE,ZCWPW1,PPP1R35,TSC22D4 NA NA NA NA PPP1R35 9842 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 100143295 100143664 100143516 Y NA AGFG2,LRCH4 NA NA NA NA AGFG2 8461 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr7 100144113 100144628 100144364 Y NA AGFG2,LRCH4 NA NA NA NA AGFG2 9279 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr7 100743461 100743946 100743576 Y GNB2,TRIM56 TRIM56,SERPINE1 SERPINE1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM56 16741 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 100752309 100752636 100752570 Y NA TRIM56,SERPINE1,AP1S1 NA NA NA NA SERPINE1 15734 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 100760673 100761017 100760905 Y GNB2,EPHB4,ZNHIT1,PLOD3,AP1S1,SERPINE1 TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF AP1S1,VGF MCF7 ChIA-PET 22265404 SERPINE1 7353 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 100761754 100762006 100761835 Y NA TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF AP1S1,VGF MCF7 ChIA-PET 22265404 SERPINE1 6364 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr7 100772573 100772742 100772614 Y SERPINE1 TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF NA NA NA NA SERPINE1 4203 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr7 101372678 101373024 101372861 Y NA NA CUX1,EMID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUX1 83935 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 101377148 101377442 101377338 Y NA NA CUX1,EMID2,SH2B2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUX1 79517 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 101672273 101672589 101672281 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 215314 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 101775527 101775981 101775908 Y CUX1,CUX1,SH2B2,ORAI2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 226338 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72006 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 102516226 102516619 102516429 Y LRRC17 NA FAM185A IMR90 Hi-C 24141950 FAM185A 128808 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 104585458 104586124 104585640 Y MLL5 NA LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC01004 65367 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 104603312 104603563 104603438 Y MLL5 LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 47928 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 104626890 104627731 104627241 Y MLL5 LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 23760 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 105459888 105460220 105459903 Y NA CTA-351J1.1 NA NA NA NA CTA-351J1.1 1950 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 105711914 105712310 105712244 Y NA SYPL1 NA NA NA NA SYPL1 38712 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 111024464 111024780 111024739 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 175793 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 111200844 111201149 111201059 Y NA IMMP2L NA NA NA NA IMMP2L 271 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 112414156 112414445 112414299 Y NA TMEM168 NA NA NA NA TMEM168 14202 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 115326798 115327008 115326857 Y NA NA FOXP2 IMR90 Hi-C 24141950 TFEC 470942 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 115912136 115912451 115912327 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 CAV2 NA NA NA NA CAV2 12983 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 115955390 115955624 115955546 Y NA CAV2,AC073130.3 CAV1,CAV2,TES,CAPZA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC073130.3 10326 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 115957025 115957120 115957073 Y NA CAV2,AC073130.3 CAV1,CAV2,TES,CAPZA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC073130.3 8830 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 115957232 115957778 115957588 Y NA CAV2,AC073130.3 CAV1,CAV2,TES,CAPZA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC073130.3 8172 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 115995232 115995555 115995330 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 AC073130.3 CAV2,CAV1,TES,MET IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC073130.3 29282 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 116058055 116058274 116058222 Y NA NA CAV2,TES,MET,CAV1 IMR90,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 AC073130.3 92105 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 116083167 116083483 116083344 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 NA TES,CAV2,CAV1,MET IMR90,MCF7,HELA Hi-C,ChIA-PET,5C 24141950,22265404,22955621 CAV1 79356 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 116168216 116168790 116168273 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 CAV1 NA NA NA NA CAV1 5377 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 116217100 116217359 116217210 Y CAV1,CAV1 NA NA NA NA NA CAV1 54261 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 116223147 116223399 116223366 Y CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 NA TES,MET,CAV2,CAV1 GM12878,H1ESC,IMR90 5C,Hi-C 22955621,24141950 CAV1 60308 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 116328034 116328226 116328184 Y ST7,CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,MET MET NA NA NA NA MET 17590 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 116332814 116332936 116332875 Y CAPZA2,TES MET NA NA NA NA MET 22370 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 116356493 116356879 116356812 Y NA MET NA NA NA NA MET 46049 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 116793573 116793925 116793605 Y NA NA NA NA NA NA ST7-AS1 201185 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 117953120 117953279 117953191 Y NA NA NA NA NA NA NAA38 131034 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 119435371 119435694 119435534 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN12 1060762 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 120724784 120725242 120725000 Y C7orf58 NA NA NA NA NA ING3 135981 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 120942380 120942663 120942460 Y NA NA NA NA NA NA FAM3C 91755 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 121783025 121783385 121783205 Y PTPRZ1,AASS AASS NA NA NA NA AASS 691 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 126214480 126214602 126214539 Y NA NA NA NA NA NA ZNF800 855376 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 126341155 126341491 126341268 Y NA NA NA NA NA NA ZNF800 728487 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 127455662 127455822 127455742 Y NA NA NA NA NA NA SND1 165428 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 5.69116578881771 chr7 128383172 128383597 128383318 Y NA CALU,CCDC136 NA NA NA NA CALU 5826 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 128468302 128468509 128468385 Y FLNC CCDC136,ATP6V1F NA NA NA NA FLNC 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr7 128471531 128472043 128471766 Y FLNC CCDC136,FLNC,ATP6V1F NA NA NA NA FLNC 3100 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr7 128552783 128552840 128552812 Y FLNC IRF5 NA NA NA NA IRF5 22826 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 129419118 129419176 129419138 Y NA NA UBE2H,NRF1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 169563 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 129419876 129420343 129420085 Y NA NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 170321 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr7 129460659 129460706 129460683 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 130083 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 129464915 129465297 129464948 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 125492 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 129469996 129470292 129470140 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 120497 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 129590044 129590333 129590306 Y NA UBE2H NA NA NA NA UBE2H 456 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 129609674 129609888 129609791 Y NA UBE2H AHCYL2,ZC3HC1,SMO,UBE2H IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2H 18885 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 130013597 130013906 130013823 Y CPA2,CPA1 NA NA NA NA NA CEP41 66368 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 130151792 130152099 130151899 Y NA MEST,MIR335 NA NA NA NA MIR335 17840 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 130530611 130530821 130530670 Y NA NA MEST,KLHDC10,MIR29A,MIR29B1,ZC3HC1,C7orf45,CPA5,LOC646329 IMR90 Hi-C 24141950 COPG2 179013 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 130571851 130572495 130572306 Y MKLN1,MKLN1 NA NA NA NA NA COPG2 220253 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 130575591 130576512 130576394 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 216343 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr7 130581597 130582393 130581985 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 210462 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 130586004 130586434 130586371 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 206421 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 130588239 130588699 130588531 Y MKLN1,MKLN1 NA MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MKLN1 204156 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 130593505 130595916 130594870 Y NA NA MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MKLN1 196939 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr7 130601178 130601963 130601463 Y MKLN1,MKLN1 NA FLJ43663 IMR90 Hi-C 24141950 MKLN1 190892 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr7 130602337 130602820 130602733 Y MKLN1,MKLN1 NA FLJ43663 IMR90 Hi-C 24141950 MKLN1 190035 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 130644314 130644883 130644570 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 147972 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 130645057 130645459 130645325 Y MKLN1,MKLN1 NA NA NA NA NA MKLN1 147396 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 130675334 130675529 130675395 Y MKLN1 NA NA NA NA NA MKLN1 117326 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 130720133 130720826 130720768 Y MKLN1,MKLN1 NA NA NA NA NA MKLN1 72029 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 130920397 130920794 130920689 Y MKLN1,MKLN1 AC009362.2 NA NA NA NA AC009362.2 4555 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 131581821 131581890 131581855 Y NA NA PLXNA4 IMR90 Hi-C 24141950 PODXL 340845 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 132607236 132607300 132607268 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD3 157548 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 134117156 134117311 134117298 Y NA AKR1B1 NA NA NA NA AKR1B1 24725 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr7 134378159 134378392 134378229 Y AKR1B1,CALD1 BPGM,CALD1 NA NA NA NA BPGM 48599 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 134397020 134397253 134397193 Y NA CALD1 CALD1,BPGM IMR90 Hi-C 24141950 CALD1 29750 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 134422783 134423192 134423006 Y NA CALD1 CALD1,BPGM IMR90 Hi-C 24141950 CALD1 3811 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 134427779 134428168 134427974 Y CALD1 CALD1 CALD1,BPGM IMR90 Hi-C 24141950 CALD1 776 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 134469498 134469802 134469635 Y CALD1 CALD1 NA NA NA NA CALD1 42495 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 134475089 134475514 134475151 Y CALD1 CALD1 NA NA NA NA CALD1 48086 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 134514825 134515095 134514960 Y STRA8 NA NA NA NA NA CALD1 87822 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 134540961 134541304 134541061 Y CALD1 NA NA NA NA NA CALD1 113958 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 134555607 134555837 134555722 Y CALD1,STRA8 NA NA NA NA NA AGBL3 113422 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 134836004 134836265 134836096 Y WDR91,CNOT4,TMEM140 TMEM140,C7orf49 NA NA NA NA TMEM140 5180 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 135120473 135120740 135120725 Y NA NA NA NA NA NA CNOT4 72135 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 135430585 135430983 135430863 Y FAM180A FAM180A NA NA NA NA FAM180A 611 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr7 135443440 135443607 135443468 Y FAM180A FAM180A C7orf73,SLC13A4 IMR90 Hi-C 24141950 FAM180A 11846 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr7 135665513 135665767 135665568 Y NA MTPN NA NA NA NA MTPN 5412 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 137346296 137346315 137346306 Y PTN NA NA NA NA NA PTN 319685 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 137387266 137387617 137387499 Y NA NA NA NA NA NA CREB3L2 297196 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 137418965 137419308 137419135 Y NA NA NA NA NA NA CREB3L2 265505 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 137544616 137544738 137544677 Y NA NA NA NA NA NA CREB3L2 140075 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 137932803 137932964 137932893 Y NA AC008155.2 AKR1D1,SVOPL IMR90 Hi-C 24141950 AC008155.2 48265 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 137942214 137942717 137942409 Y TRIM24 AC008155.2 NA NA NA NA AC008155.2 38512 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 138802981 138803298 138803094 Y UBN2,ZC3HAV1 ZC3HAV1,TTC26 KIAA1549,ZC3HAV1L,ZC3HAV1,TTC26,LUC7L2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZC3HAV1 10516 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 139365521 139365926 139365718 Y NA NA NA NA NA NA HIPK2 109651 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr7 139367160 139367381 139367316 Y NA NA NA NA NA NA HIPK2 108196 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr7 139420496 139420947 139420749 Y TBXAS1,JHDM1D,HIPK2 NA NA NA NA NA HIPK2 54630 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 139498127 139498170 139498155 Y TBXAS1 HIPK2 NA NA NA NA HIPK2 22550 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 139615919 139616013 139615969 Y TBXAS1,JHDM1D NA NA NA NA NA HIPK2 140342 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 139616229 139616509 139616457 Y NA NA NA NA NA NA HIPK2 140652 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 140807032 140807954 140807105 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-74P 56983 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 140911836 140912120 140911978 Y WEE2 NA NA NA NA NA RNU4-74P 161787 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 141285767 141286195 141285861 Y TAS2R38,AGK AGK NA NA NA NA AGK 36778 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr7 141371952 141372250 141372100 Y CLEC5A KIAA1147 NA NA NA NA KIAA1147 27703 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 142191082 142191483 142191195 Y NA NA NA NA NA NA EPHB6 359309 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 142505354 142505882 142505518 Y GSTK1,CASP2 EPHB6 NA NA NA NA EPHB6 44910 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 143083267 143084129 143083354 Y TAS2R40,FAM131B,FAM131B AC093673.5,ZYX NA NA NA NA ZYX 7094 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr7 143856214 143856503 143856359 Y NA NA NA NA NA NA FAM115A 258923 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 144515686 144515816 144515751 Y NOBOX,TPK1 TPK1 NA NA NA NA TPK1 15672 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 147109889 147110169 147110008 Y NA NA NA NA NA NA AC005229.5 1165324 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA NA EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZH2 58860 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr7 148684338 148684706 148684475 Y NA PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 39027 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr7 148788414 148788490 148788418 Y CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398 ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2540 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 148788628 148788884 148788863 Y ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398 ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2754 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 149468740 149469267 149468803 Y NA ZNF467 NA NA NA NA ZNF467 172 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 151184518 151184840 151184768 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 30366 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 151384772 151384923 151384848 Y NA NA NA NA NA NA RHEB 169566 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr7 152065077 152065428 152065152 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 305822 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 152160343 152160554 152160402 Y ACTR3B NA NA NA NA NA XRCC2 210696 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 210057 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr7 152330696 152330805 152330751 Y NA XRCC2 NA NA NA NA XRCC2 40445 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 154999343 155001070 155000829 Y NA NA INSIG1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 INSIG1 86416 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr7 155006028 155006426 155006187 Y NA NA NA NA NA NA INSIG1 81060 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 155754558 155754796 155754722 Y NA NA LOC285889 IMR90 Hi-C 24141950 AC009403.2 318659 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 156444597 156444947 156444772 Y NA C7orf13 NA NA NA NA C7orf13 13249 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 156544134 156544345 156544262 Y NA NA NA NA NA NA C7orf13 112786 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 157405982 157406183 157406105 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 279907 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 158145128 158145561 158145413 Y NA NA NA NA NA NA PTPRN2 232919 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr7 158808159 158808606 158808258 Y VIPR2 NA NA NA NA NA WDR60 160890 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 479972 480137 480087 Y NA NA NA NA NA NA FBXO25 125544 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 637812 637858 637835 Y NA ERICH1 NA NA NA NA ERICH1 48248 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 638062 638589 638348 Y ZNF596,ZNF596,ERICH1 ERICH1 NA NA NA NA ERICH1 47517 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 1321281 1321540 1321454 Y NA NA DLGAP2 IMR90 Hi-C 24141950 CLN8 380404 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 1693574 1694042 1693752 Y CLN8 CLN8,CTD-2336O2.1 ARHGEF10,CLN8,MIR596,KBTBD11,ZNF596 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLN8 7902 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 1780723 1781665 1781560 Y NA ARHGEF10 NA NA NA NA ARHGEF10 10581 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 3007689 3007702 3007698 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF10 1237547 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 4381774 4382111 4382011 Y NA NA NA NA NA NA PAICSP4 260743 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 6275449 6275723 6275483 Y NA MCPH1 NA NA NA NA MCPH1 13336 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 6536860 6537447 6537204 Y NA CTD-2541M15.1,AGPAT5 LOC100287015,MCPH1,ANGPT2 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2541M15.1 26283 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 6663567 6663735 6663651 Y NA XKR5 NA NA NA NA XKR5 27431 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 8153597 8154098 8153801 Y NA NA MFHAS1,SGK223,CLDN23,FLJ10661 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SGK223 87910 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 8241572 8241733 8241653 Y NA SGK223 NA NA NA NA SGK223 275 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 8247461 8247709 8247494 Y NA SGK223 NA NA NA NA SGK223 5453 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 10573649 10573859 10573801 Y SOX7 NA NA NA NA NA SOX7 121498 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 11312887 11313950 11313920 Y NA FAM167A NA NA NA NA FAM167A 16274 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 4.37781983755208 chr8 11314255 11315026 11314813 Y XKR6,MTMR9,FAM167A FAM167A NA NA NA NA FAM167A 15198 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr8 11315246 11315781 11315560 Y XKR6,MTMR9 FAM167A NA NA NA NA FAM167A 14443 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 11337266 11337614 11337440 Y FAM167A FAM167A C8orf12,BLK IMR90 Hi-C 24141950 FAM167A 7042 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr8 11367839 11367991 11367915 Y BLK FAM167A NA NA NA NA FAM167A 37615 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 11368445 11368737 11368558 Y FAM167A FAM167A NA NA NA NA FAM167A 38221 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr8 11373324 11373814 11373559 Y FAM167A FAM167A NA NA NA NA FAM167A 43100 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr8 11735335 11735756 11735393 Y CTSB CTSB CTSB,BLK,FDFT1,FAM167A IMR90 Hi-C 24141950 CTSB 10378 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 11744810 11745247 11745024 Y NA CTSB CTSB,FAM167A,BLK,NEIL2,GATA4,FDFT1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTSB 19853 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 12975034 12975328 12975181 Y NA NA NA NA NA NA LONRF1 363452 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 13224231 13224684 13224410 Y NA NA NA NA NA NA DLC1 146483 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr8 13562833 13563206 13563027 Y NA NA NA NA NA NA C8orf48 140481 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 16479323 16479556 16479440 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC2 531982 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 16609902 16609923 16609912 Y VPS37A NA TUSC3,MSR1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC2 401615 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 16629867 16630175 16630011 Y ZDHHC2 NA TUSC3,MSR1,SGCZ,ZDHHC2 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC2 381363 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 18951503 18951869 18951728 Y NA PSD3 LOC100128993,CSGALNACT1,INTS10,PSD3 IMR90 Hi-C 24141950 PSD3 11263 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 18991999 18992391 18992140 Y NA NA PSD3,LOC100128993 IMR90 Hi-C 24141950 PSD3 51759 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 18993184 18993532 18993372 Y NA NA LOC100128993,PSD3 IMR90 Hi-C 24141950 PSD3 52944 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 18998257 18998415 18998308 Y NA NA PSD3,LOC100128993 IMR90 Hi-C 24141950 PSD3 58017 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 19156262 19156568 19156346 Y SH2D4A,SH2D4A SH2D4A PSD3,LOC100128993,SH2D4A,CSGALNACT1 IMR90 Hi-C 24141950 SH2D4A 12560 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 19436473 19436611 19436572 Y NA NA NA NA NA NA CSGALNACT1 176929 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 20125746 20125979 20125927 Y NA LZTS1 DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1 IMR90 Hi-C 24141950 LZTS1 33495 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 20126353 20126692 20126612 Y NA LZTS1 DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1 IMR90 Hi-C 24141950 LZTS1 32782 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 21867707 21867918 21867811 Y PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2 NA NA NA NA NA FAM160B2 76752 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 21999982 22000221 22000101 Y POLR3D NUDT18,REEP4,BMP1 NA NA NA NA REEP4 2518 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 22468597 22468907 22468752 Y TNFRSF10C,EGR3,PDLIM2,PDLIM2,BIN3 PDLIM2,C8orf58 NA NA NA NA C8orf58 13483 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 22513437 22513754 22513670 Y NA BIN3 NA NA NA NA BIN3 10907 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 23138717 23138953 23138815 Y LOXL2 CHMP7,R3HCC1 NA NA NA NA R3HCC1 13084 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr8 23202733 23203217 23203148 Y LOXL2 NA NA NA NA NA R3HCC1 77100 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 23210314 23210863 23210698 Y NA NA NA NA NA NA LOXL2 69978 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 23245818 23245947 23245883 Y NA LOXL2 NA NA NA NA LOXL2 34894 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 23353842 23353942 23353892 Y TNFRSF10C,SLC25A37 ENTPD4,SLC25A37 NKX3-1,SLC25A37,NKX2-6 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A37 30376 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 23396383 23397127 23396699 Y TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4,SLC25A37 SLC25A37 NA NA NA NA SLC25A37 12065 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 24799462 24799718 24799592 Y NEFL NEFL NA NA NA NA NEFL 12906 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 24857844 24858008 24857898 Y NA NEFL NA NA NA NA NEFL 45220 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 24858208 24858485 24858356 Y NA NEFL NA NA NA NA NEFL 45584 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 26008929 26009154 26009015 Y NA NA PPP2R2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2R2A 137853 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 26306627 26307336 26307213 Y NA NA BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PNMA2 62272 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 26466894 26467238 26467101 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL2 97103 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 26498541 26498935 26498595 Y NA NA NA NA NA NA RP11-384C12.1 128372 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 27209291 27209793 27209526 Y PTK2B,PTK2B TRIM35,PTK2B NA NA NA NA PTK2B 42292 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 27219743 27220043 27219778 Y PTK2B,PTK2B NA NA NA NA NA PTK2B 52744 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 27474556 27474730 27474657 Y NA CLU,SCARA3 SCARA3,TRIM35,CLU,CCDC25,ESCO2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CLU 4008 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 28269273 28269920 28269515 Y ZNF395 ZNF395 NA NA NA NA ZNF395 11055 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 28890628 28890717 28890674 Y KIF13B CTD-2647L4.4 NA NA NA NA CTD-2647L4.4 20735 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 28923074 28923318 28923180 Y NA CTD-2647L4.4 NA NA NA NA CTD-2647L4.4 11622 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 29595040 29595214 29595121 Y KIF13B,DUSP4,DUSP4,TMEM66,LEPROTL1 NA NA NA NA NA TMEM66 343509 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 29631359 29631483 29631421 Y DUSP4 NA C8orf75,LOC286135 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM66 307240 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 29758918 29759047 29759036 Y NA NA DUSP4,LOC286135,C8orf75 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM66 179676 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 30015593 30015700 30015665 Y NA RPS15AP24,DCTN6 NA NA NA NA DCTN6 3780 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 32084575 32084724 32084674 Y NRG1,NRG1 NA NA NA NA NA NRG1 589673 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 32191944 32192171 32192069 Y NRG1 NA NA NA NA NA NRG1 697042 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 32240573 32240939 32240756 Y NRG1 NA NA NA NA NA NRG1 745671 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 32490865 32491103 32490993 Y NRG1,NRG1 NA NA NA NA NA FUT10 837837 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 32553058 32553329 32553194 Y NA NA NA NA NA NA FUT10 775611 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 35145147 35145255 35145201 Y UNC5D NA NA NA NA NA LSM12P1 236026 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA LSM12P1 NA NA NA NA LSM12P1 1527 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 3.50225587004167 chr8 37000181 37000618 37000483 Y NA NA KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-962G15.1 365499 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 37002327 37002551 37002443 Y NA NA KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-962G15.1 367645 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr8 37005639 37005772 37005739 Y NA NA KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-150O12.6 366767 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 37372940 37373020 37372980 Y NA RP11-150O12.6,RP11-150O12.1 KCNU1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-150O12.6 401 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 37376212 37376482 37376355 Y NA RP11-150O12.6,RP11-150O12.1 KCNU1,ERLIN2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-150O12.6 3673 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr8 37928414 37928535 37928451 Y ADRB3,WHSC1L1 EIF4EBP1,ASH2L NA NA NA NA ASH2L 32225 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 37939512 37939733 37939625 Y NA ASH2L ASH2L,PROSC,GPR124,BRF2,RAB11FIP1,GOT1L1,EIF4EBP1,STAR,DDHD2,WHSC1L1,LETM2,FGFR1,TACC1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ASH2L 21027 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 37961561 37961954 37961758 Y NA ASH2L NA NA NA NA ASH2L 801 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 38262735 38263237 38262894 Y TACC1,PLEKHA2,C8orf86 WHSC1L1,LETM2 NA NA NA NA LETM2 21010 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr8 38313401 38313535 38313485 Y NA FGFR1 NA NA NA NA FGFR1 10817 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 38523213 38523472 38523342 Y C8orf86 NA C8orf86,FGFR1,WHSC1L1,RNF5P1,PPAPDC1B IMR90 Hi-C 24141950 TACC1 60232 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 38627692 38628125 38628027 Y LETM2,LETM2,C8orf86,PLEKHA2,TACC1 TACC1 NA NA NA NA TACC1 43988 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 38762883 38763134 38762941 Y TACC1,PLEKHA2 PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 6130 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 38794203 38794537 38794324 Y TACC1,PLEKHA2 PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 37450 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 38794582 38795442 38794757 Y TACC1,PLEKHA2 PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 37829 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 38816649 38817007 38816807 Y NA TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA TM2D2 35336 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 38856419 38857534 38856583 Y NA TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA ADAM9 4031 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 38867572 38867594 38867583 Y C8orf86 TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA ADAM9 15184 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 38895649 38895937 38895811 Y TACC1,PLEKHA2,HTRA4 TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA ADAM9 43261 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 39976615 39976841 39976744 Y IDO1 NA C8orf4 IMR90 Hi-C 24141950 IDO1 218821 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 40049035 40049230 40049136 Y NA NA GOLGA7,C8orf4,ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 CTA-392C11.1 149691 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 41649689 41649828 41649744 Y NKX6-3 NA NA NA NA NA RP11-360L9.4 215802 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 48434780 48435210 48435108 Y CEBPD NA NA NA NA NA RP11-697N18.2 67961 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 49229155 49229573 49229245 Y NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 65577 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 49282720 49283033 49282877 Y NA RPL29P19 SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 12117 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 49320367 49320668 49320511 Y NA RPL29P19 SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 25217 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 49321645 49321846 49321764 Y NA RPL29P19 SNAI2,MCM4,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 26495 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 49344700 49344905 49344800 Y NA RPL29P19 SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 49550 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 49426952 49427328 49427172 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 131802 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr8 49427546 49427722 49427633 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 132396 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr8 49467466 49467648 49467542 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 172316 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 49701443 49701572 49701502 Y NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 EFCAB1 55573 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr8 50899489 50899738 50899608 Y SNTG1 NA NA NA NA NA SNAI2 1067190 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 51268916 51268984 51268951 Y NA NA NA NA NA NA RP11-119N19.1 1077178 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 53188453 53188874 53188470 Y NA NA NA NA NA NA RP11-110G21.1 378568 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr8 54659884 54660111 54659998 Y NA NA NA NA NA NA ATP6V1H 94007 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 56753076 56753403 56753291 Y NA LYN NA NA NA NA LYN 36969 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 56818311 56818706 56818376 Y NA LYN NA NA NA NA LYN 27939 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 59310594 59310634 59310626 Y SDCBP,UBXN2B UBXN2B NA NA NA NA UBXN2B 11189 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 60042677 60043119 60042763 Y NA RP11-25K19.1,TOX NA NA NA NA TOX 12910 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 61626654 61626933 61626781 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 37317 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 61627150 61627529 61627187 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 37813 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 61664874 61665035 61664955 Y NA NA NA NA NA NA CHD7 75537 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 61850490 61850754 61850677 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261153 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 61850776 61851191 61851141 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261439 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 62634023 62634407 62634126 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA MIR4470 8676 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 63051600 63051694 63051612 Y NA NA NA NA NA NA NKAIN3 107456 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 63162204 63162589 63162538 Y NA NKAIN3 NA NA NA NA NKAIN3 3054 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 64133013 64133210 64133061 Y NA NA NA NA NA NA YTHDF3 53901 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 65778039 65778194 65778187 Y NA NA NA NA NA NA CYP7B1 68721 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 67032130 67032353 67032272 Y NA NA NA NA NA NA PDE7A 279573 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 67035997 67036639 67036283 Y NA NA NA NA NA NA PDE7A 283440 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 67419818 67420060 67419977 Y NA NA NA NA NA NA ADHFE1 79398 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr8 67424340 67424761 67424541 Y C8orf45 NA NA NA NA NA ADHFE1 83920 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 67425057 67425564 67425100 Y NA NA NA NA NA NA ADHFE1 84637 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 67433991 67434613 67434592 Y NA NA NA NA NA NA MYBL1 89869 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr8 67434763 67435122 67434951 Y NA NA NA NA NA NA MYBL1 89360 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 67445791 67446197 67446047 Y ADHFE1,VCPIP1,MYBL1 NA NA NA NA NA MYBL1 78285 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 68105132 68105308 68105276 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 111114 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 68147841 68148210 68148008 Y NA NA NA NA NA NA ARFGEF1 105702 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 69672075 69672426 69672227 Y NA NA NA NA NA NA SULF1 704433 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr8 69837388 69837920 69837570 Y NA NA NA NA NA NA SULF1 538939 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 69986351 69986702 69986619 Y NA NA NA NA NA NA SULF1 390157 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 70033144 70033349 70033247 Y NA NA NA NA NA NA SULF1 343510 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 70310732 70311124 70310931 Y NA NA C8orf34 IMR90 Hi-C 24141950 SULF1 65735 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr8 70404093 70404306 70404271 Y NA SULF1 NA NA NA NA SULF1 27234 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 71149519 71149670 71149631 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 135105 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 71503238 71503393 71503365 Y NA TRAM1,RP11-382J12.1 NA NA NA NA TRAM1 15229 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 71522610 71523035 71522826 Y NA TRAM1,RP11-382J12.1 NA NA NA NA RP11-382J12.1 3798 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 72753377 72753463 72753388 Y NA RP11-383H13.1,MSC NA NA NA NA MSC 1240 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 73008234 73008433 73008334 Y NA TRPA1 TRPA1,LOC100132891 IMR90 Hi-C 24141950 TRPA1 22382 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 73559096 73559368 73559359 Y KCNB2 NA NA NA NA NA TERF1 359731 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 73690966 73691186 73691160 Y NA NA NA NA NA NA TERF1 227913 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 74276592 74276996 74276782 Y C8orf84,RDH10 NA STAU2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL7 70568 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 74371877 74372089 74371987 Y RDH10 NA NA NA NA NA RPL7 165853 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 74432524 74433240 74432853 Y C8orf84,RDH10 NA NA NA NA NA STAU2 224703 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 74792402 74792821 74792506 Y NA UBE2W,GYG1P1 NA NA NA NA UBE2W 3257 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 74926613 74926741 74926708 Y UBE2W,TMEM70,LY96 TCEB1,TMEM70,RP11-367E12.4,LY96 NA NA NA NA LY96 25026 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 75515244 75515546 75515314 Y NA RP11-730G20.2 NA NA NA NA RP11-730G20.2 765 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 77469082 77469378 77469240 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX4 122076 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.97001892689844 chr8 77585675 77585844 77585753 Y ZFHX4 ZFHX4,ZFHX4-AS1 NA NA NA NA ZFHX4 5610 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 77589671 77589739 77589705 Y NA ZFHX4,ZFHX4-AS1 NA NA NA NA ZFHX4 1715 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 77590079 77590470 77590424 Y ZFHX4 ZFHX4,ZFHX4-AS1 NA NA NA NA ZFHX4 984 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr8 77729936 77730258 77730097 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX4-AS1 136423 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 80701258 80701483 80701350 Y HEY1 NA HEY1,MRPS28 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS28 239041 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 80720328 80720556 80720442 Y NA NA NA NA NA NA MRPS28 219968 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 80996547 80996769 80996670 Y TPD52 NA NA NA NA NA MRPS28 56023 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 82203488 82203770 82203698 Y PAG1 FABP5,RP11-363E6.3 NA NA NA NA RP11-363E6.3 11807 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 84996950 84997281 84997116 Y NA NA NA NA NA NA LRRCC1 1020101 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 87475103 87475472 87475288 Y NA CPNE3,SLC2A3P4 NA NA NA NA CPNE3 19587 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 87650704 87651077 87650891 Y NA NA NA NA NA NA SLC2A3P4 136884 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 87673960 87674305 87674138 Y CNGB3 NA NA NA NA NA SLC2A3P4 160140 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr8 90105251 90105649 90105450 Y NA NA NA NA NA NA RP11-37B2.1 662306 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 90901747 90901955 90901807 Y RIPK2,OSGIN2 OSGIN2 OSGIN2,RIPK2 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 OSGIN2 10132 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 94728357 94728657 94728477 Y NA FAM92A1,RBM12B,TMEM67 NA NA NA NA FAM92A1 19568 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 94850124 94850307 94850200 Y PDP1,PDP1,PDP1,PDP1,GEM PDP1 NA NA NA NA PDP1 17728 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 94892570 94892797 94892694 Y NA PDP1 TMEM67,PDP1,MIR378D2 IMR90 Hi-C 24141950 PDP1 24535 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 94928107 94928427 94928252 Y NA NA NA NA NA NA PDP1 60072 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 96102684 96103088 96102778 Y PLEKHF2 PLEKHF2 NA NA NA NA PLEKHF2 40944 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 96180882 96181195 96181039 Y PLEKHF2 PLEKHF2 NA NA NA NA PLEKHF2 36850 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 97272793 97273157 97272974 Y NA UQCRB,MTERFD1,PTDSS1 NA NA NA NA PTDSS1 850 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 99478821 99479039 99478921 Y NA NA NA NA NA NA NIPAL2 174200 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 99952283 99952358 99952318 Y OSR2 STK3,OSR2 NA NA NA NA STK3 697 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr8 99953302 99954000 99953407 Y STK3,OSR2 STK3,OSR2 NA NA NA NA STK3 247 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 101431382 101431773 101431578 Y NA NA SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471,CMTM7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404,19890323 RNF19A 84936 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 101455424 101455703 101455525 Y PABPC1,SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A NA SPAG1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF19A 108978 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 101801288 101801504 101801352 Y NA NA PABPC1,SNX31 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PABPC1 68251 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr8 101920723 101921107 101920870 Y NA RPS26P6,YWHAZ NA NA NA NA RPS26P6 14749 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 102015928 102016078 102016021 Y NA NA FLJ42969,YWHAZ,ZNF706 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 52312 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr8 102171817 102172037 102171960 Y YWHAZ,ZNF706,ZNF706 ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 44384 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 102388506 102388737 102388522 Y NA NA NA NA NA NA ZNF706 172085 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 102879018 102879156 102879087 Y NCALD,NCALD NA NA NA NA NA RRM2B 370190 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 103411260 103411483 103411351 Y UBR5 UBR5 NA NA NA NA UBR5 11586 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 103549220 103549421 103549330 Y NA KB-1980E6.3 UBR5,ODF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KB-1980E6.3 10252 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 103669513 103669869 103669680 Y AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10 KLF10 NA NA NA NA KLF10 3383 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 103669922 103670289 103670129 Y ATP6V1C1,KLF10,KLF10 KLF10 NA NA NA NA KLF10 3792 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 103741796 103742226 103742065 Y NA NA KLF10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF10 75666 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 103757592 103757997 103757773 Y NA NA KLF10,UBR5 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF10 91462 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 103766474 103766656 103766574 Y NA NA KLF10,UBR5 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF10 100344 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 103801151 103801773 103801337 Y NA NA KLF10,UBR5,ODF1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KB-1507C5.2 72755 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 103803215 103803631 103803453 Y AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10 NA KLF10,UBR5,ODF1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KB-1507C5.2 70897 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 103822630 103823284 103823186 Y NA NA NA NA NA NA KB-1507C5.2 51244 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 103918538 103918841 103918687 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 ATP6V1C1,AZIN1 IMR90 Hi-C 24141950 AZIN1 14446 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 103998014 103998369 103998120 Y KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1 ATP6V1C1 ATP6V1C1,AZIN1,CTHRC1 IMR90 Hi-C 24141950 ATP6V1C1 32922 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 104059632 104059708 104059689 Y NA ATP6V1C1 NA NA NA NA ATP6V1C1 28341 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr8 104117409 104117806 104117725 Y KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1,SLC25A32 NA FZD6,BAALC,SLC25A32,LOC100499183,ATP6V1C1,C8orf56,DCAF13,RIMS2,CTHRC1 IMR90 Hi-C 24141950 ATP6V1C1 86118 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 107709391 107709773 107709582 Y NA TAGLN2P1 NA NA NA NA TAGLN2P1 1150 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 107870700 107870850 107870776 Y NA NA ANGPT1 IMR90 Hi-C 24141950 TAGLN2P1 162459 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 109230205 109230491 109230349 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 215071 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 111381887 111381916 111381903 Y NA NA NA NA NA NA SYBU 679867 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 115322659 115322858 115322759 Y NA NA NA NA NA NA RP11-709P2.1 935761 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 116068457 116069128 116068655 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 750771 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 117664503 117664654 117664532 Y NA NA NA NA NA NA UTP23 112088 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 118778404 118778792 118778598 Y NA NA EXT1 IMR90 Hi-C 24141950 MED30 247452 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 118885059 118885357 118885328 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 236735 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 119323544 119323883 119323714 Y SAMD12 NA NA NA NA NA EXT1 201452 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 119345117 119345386 119345219 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 223025 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 119419771 119420080 119419851 Y NA NA NA NA NA NA SAMD12 212154 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 119485123 119485454 119485409 Y NA NA NA NA NA NA SAMD12 146780 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 3.06447388628646 chr8 119536200 119536581 119536442 Y NA NA NA NA NA NA SAMD12 95653 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 119808728 119809168 119808881 Y TNFRSF11B RPS26P35 TNFRSF11B IMR90 Hi-C 24141950 RPS26P35 36288 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 120066342 120066835 120066563 Y NA NA SAMD12,SAMD12-AS1,TNFRSF11B IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF11B 103903 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 120609076 120609341 120609202 Y NA NA NA NA NA NA ENPP2 74352 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 120656261 120656532 120656398 Y NA ENPP2 ENPP2 IMR90 Hi-C 24141950 ENPP2 27161 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 124248679 124249062 124248866 Y NA C8orf76,ZHX1 NA NA NA NA C8orf76 2576 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 124301303 124301534 124301414 Y NA C8orf76,ZHX1 ATAD2,ZHX1-C8ORF76 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZHX1 15522 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 124462485 124463022 124462596 Y NA ATAD2,WDYHV1 NA NA NA NA WDYHV1 35520 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 124478396 124478824 124478461 Y NA NA FBXO32,ANXA13,FAM91A1 IMR90 Hi-C 24141950 WDYHV1 51431 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 124642629 124642836 124642770 Y NA NA NA NA NA NA FBXO32 91183 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 124645197 124645433 124645315 Y NA NA NA NA NA NA FBXO32 93751 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 125302460 125302812 125302637 Y TMEM65,RNF139 NA NA NA NA NA TMEM65 80121 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 125513273 125513673 125513472 Y NA RNF139-AS1,RNF139,NDUFB9,TATDN1 NA NA NA NA RNF139 28294 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 125878645 125879203 125878949 Y RNF139,MTSS1,ZNF572,NSMCE2,KIAA0196 LINC00964 MTSS1,NDUFB9,TATDN1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00964 19666 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 126193275 126193543 126193371 Y NA NA TRIB1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0196 91193 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 126283499 126283849 126283769 Y NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 156714 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 127592246 127592475 127592298 Y NA FAM84B FAM84B IMR90 Hi-C 24141950 FAM84B 23608 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 128099457 128099542 128099514 Y NA NA NA NA NA NA FAM84B 530819 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 128464193 128464263 128464228 Y NA NA NA NA NA NA MYC 281417 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 128821272 128821652 128821500 Y MYC PVT1 NA NA NA NA PVT1 16493 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 128825013 128825274 128825028 Y MYC PVT1 NA NA NA NA PVT1 20234 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 128919831 128920544 128920233 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 100313 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 128930937 128931257 128931067 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 89600 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 128961875 128962320 128962073 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 58537 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 129121216 129121486 129121350 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 100359 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 129139934 129140421 129140284 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 119077 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 129180743 129180870 129180780 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 159886 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 129195465 129196052 129195562 Y NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 174608 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 129198186 129198490 129198306 Y NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 177329 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 129552751 129552881 129552850 Y NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 531894 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 130566808 130567296 130566886 Y FAM49B NA NA NA NA NA FAM49B 460079 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 131054431 131054834 131054758 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 27056 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr8 131134027 131134054 131134041 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 106652 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 131260848 131261137 131260957 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 192769 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 131454495 131454885 131454765 Y NA ASAP1 NA NA NA NA ASAP1 589 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 131515414 131515718 131515576 Y NA NA ASAP1 IMR90 Hi-C 24141950 ASAP1 61508 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 133461387 133461544 133461488 Y NA NA NA NA NA NA LRRC6 224294 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 133508104 133508400 133508366 Y NA NA KCNQ3,LRRC6 IMR90 Hi-C 24141950 LRRC6 177438 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 133958787 133959149 133958918 Y TG NA NA NA NA NA PHF20L1 173169 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 135352426 135352442 135352435 Y NA NA NA NA NA NA ZFAT 370850 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 135515802 135516060 135515897 Y NA NA NA NA NA NA ZFAT 207232 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 139925414 139925432 139925424 Y NA NA NA NA NA NA KCNK9 787867 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 141110302 141110773 141110688 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 355905 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 141886994 141887102 141887066 Y PTK2 NA NA NA NA NA PTK2 123213 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 142033227 142033651 142033460 Y NA PTK2 PTK2,DENND3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTK2 22912 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 142047873 142048201 142048171 Y PTK2 PTK2 PTK2,DENND3,SLC45A4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTK2 37558 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 142278857 142279200 142279029 Y NA SLC45A4 DENND3,SLC45A4,PTK2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC45A4 37204 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 143353648 143353818 143353814 Y TSNARE1,BAI1 NA NA NA NA NA TSNARE1 128783 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 143679272 143679401 143679335 Y NA ARC NA NA NA NA ARC 15432 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 143897219 143897551 143897306 Y LY6E,GLI4 NA LY6D,LYNX1,PSCA,JRK,C8orf55,LOC100288181,SLURP1,LY6E,LOC100133669 MCF7 ChIA-PET 22265404 LY6K 117690 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr8 144108350 144108468 144108378 Y NA LY6E,RP11-273G15.2,C8orf31 NA NA NA NA C8orf31 10158 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 144684263 144684410 144684337 Y NA NAPRT1,TIGD5,EEF1D,PYCRL,TSTA3,ZNF623 NA NA NA NA EEF1D 4552 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 144948428 144948782 144948624 Y EPPK1 PUF60,NRBP2,EPPK1 NRBP2 IMR90 Hi-C 24141950 EPPK1 1850 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 144959402 144959607 144959478 Y C8orf73,MAPK15,EPPK1 PUF60,NRBP2,EPPK1 PLEC,NRBP2,PUF60 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPPK1 8770 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 145002494 145002937 145002709 Y SPATC1,PLEC PLEC NA NA NA NA PLEC 45965 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 145015768 145015971 145015849 Y FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 32931 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr8 145022492 145023108 145022824 Y PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 25794 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr8 145025737 145026802 145026365 Y ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10 PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 22100 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr8 146010487 146010786 146010731 Y NA ZNF251,RPL8,ZNF7 NA NA NA NA ZNF34 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr8 146125688 146125902 146125777 Y ZNF250 COMMD5,ZNF250,ZNF16 NA NA NA NA ZNF250 135 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 442373 442547 442460 Y NA KANK1 NA NA NA NA KANK1 25744 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 545729 545758 545741 Y NA NA NA NA NA NA KANK1 77438 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 677967 678108 678032 Y DOCK8,C9orf66,KANK1 NA NA NA NA NA KANK1 209676 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 694779 695236 694990 Y DOCK8,C9orf66,KANK1 NA NA NA NA NA KANK1 226488 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 749759 749963 749884 Y NA NA NA NA NA NA KANK1 281468 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 972038 972418 972053 Y NA NA NA NA NA NA DMRT2 75936 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 1665313 1665337 1665325 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA2 348005 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 2241944 2242239 2242031 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA2 228602 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr9 2279055 2279418 2279226 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA2 265713 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 2281532 2281772 2281628 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA2 268190 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr9 2623377 2623723 2623671 Y NA VLDLR NA NA NA NA VLDLR 3543 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 2875811 2876206 2875956 Y NA KIAA0020 NA NA NA NA KIAA0020 33570 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr9 3879857 3880094 3879976 Y NA NA NA NA NA NA RP11-509J21.1 355134 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 4086123 4086410 4086330 Y NA NA NA NA NA NA GLIS3 259982 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 4137159 4137519 4137339 Y NA NA NA NA NA NA GLIS3 208873 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 5509549 5510003 5509837 Y C9orf46,CD274,PDCD1LG2 PDCD1LG2 NA NA NA NA PDCD1LG2 1004 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr9 5553244 5553515 5553396 Y NA PDCD1LG2 NA NA NA NA PDCD1LG2 44699 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 5582977 5583121 5583054 Y NA KIAA1432 NA NA NA NA KIAA1432 43904 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 5843832 5844207 5843936 Y NA ERMP1 ERMP1 IMR90 Hi-C 24141950 ERMP1 12715 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 5879621 5879741 5879699 Y NA ERMP1 ERMP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ERMP1 48504 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 6384866 6385180 6385056 Y NA UHRF2 NA NA NA NA UHRF2 25971 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr9 6485944 6485989 6485946 Y NA NA NA NA NA NA UHRF2 74793 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 6564380 6564534 6564488 Y NA NA NA NA NA NA RP11-106A1.2 72605 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 6680895 6681975 6681336 Y UHRF2,KDM4C RP11-106A1.2,GLDC,RP11-390F4.6,KDM4C KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 36888 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.62669190253125 chr9 6788210 6788382 6788241 Y NA NA NA NA NA NA KDM4C 69347 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 7320258 7320407 7320333 Y NA NA NA NA NA NA RPL4P5 155913 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 8428728 8429036 8428967 Y NA NA NA NA NA NA RP11-134K1.2 282275 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 8973007 8973018 8973013 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P3 115858 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 9842303 9842691 9842629 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P3 753427 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 11065025 11065362 11065124 Y NA NA NA NA NA NA PTPRD 454302 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 5.0344928131849 chr9 11108347 11108452 11108393 Y NA NA NA NA NA NA PTPRD 497624 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 13082855 13083077 13082983 Y NA NA NA NA NA NA MPDZ 194512 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 13268477 13268830 13268663 Y NA MPDZ NA NA NA NA MPDZ 8759 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 13278024 13278458 13278161 Y NA MPDZ NFIB IMR90 Hi-C 24141950 MPDZ 435 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 14096603 14096776 14096679 Y NA NA NA NA NA NA RP11-120J1.1 218308 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 14322295 14322910 14322674 Y ZDHHC21,NFIB RP11-120J1.1 NA NA NA NA RP11-120J1.1 7211 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr9 15300887 15301166 15301002 Y TTC39B TTC39B NA NA NA NA TTC39B 4192 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 16203449 16203717 16203596 Y NA NA BNC2,C9orf93 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-62F24.2 521095 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr9 16344409 16344763 16344480 Y NA NA BNC2,C9orf93 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-62F24.2 380049 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 16506213 16506544 16506471 Y NA NA NA NA NA NA RP11-62F24.2 218268 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 16710736 16710820 16710819 Y NA RP11-62F24.2 NA NA NA NA RP11-62F24.2 13992 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 16869534 16869976 16869661 Y BNC2 BNC2 NA NA NA NA BNC2 693 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 16985936 16986021 16986007 Y NA NA BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 BNC2 117095 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 17798214 17798411 17798313 Y NA NA NA NA NA NA SH3GL2 221134 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 18437501 18437903 18437771 Y NA ADAMTSL1 FAM154A,ADAMTSL1 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTSL1 33989 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 18474958 18475225 18475032 Y ADAMTSL1 ADAMTSL1 NA NA NA NA ADAMTSL1 3066 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr9 18478894 18479067 18478986 Y ADAMTSL1 ADAMTSL1 NA NA NA NA ADAMTSL1 7002 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 18490587 18490949 18490797 Y ADAMTSL1 ADAMTSL1 NA NA NA NA ADAMTSL1 18695 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr9 18547624 18547850 18547739 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTSL1 75732 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 18718417 18718817 18718751 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTSL1 246525 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr9 18768460 18768476 18768467 Y ADAMTSL1 NA NA NA NA NA RP11-296P7.4 256414 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 19184256 19184894 19184463 Y PLIN2 PLIN2 HAUS6,ACER2,DENND4C,PLIN2 IMR90 Hi-C 24141950 PLIN2 36968 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 19252213 19252529 19252372 Y NA NA NA NA NA NA PLIN2 104925 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 19633870 19634262 19634172 Y ACER2,SLC24A2 NA NA NA NA NA ACER2 226945 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 20552301 20552464 20552406 Y MLLT3 NA NA NA NA NA ACER2 1145376 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 21695810 21696232 21696052 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 UBA52P6 313922 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 26260192 26260607 26260418 Y NA NA NA NA NA NA TUSC1 583336 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr9 26265141 26265461 26265258 Y NA NA NA NA NA NA TUSC1 588285 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 26946072 26946289 26946254 Y PLAA,IFT74,IFT74 IFT74,PLAA NA NA NA NA PLAA 611 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 27117778 27117984 27117879 Y NA TEK NA NA NA NA TEK 10639 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 28649799 28650020 28649948 Y LINGO2 NA NA NA NA NA C9orf72 1077935 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 29213900 29214394 29214154 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 1472709 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 31347195 31347362 31347281 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P2 516972 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 32437038 32437275 32437091 Y NA NA NA NA NA NA ACO1 54420 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 32453982 32454272 32454141 Y NA NA NA NA NA NA DDX58 70050 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 32461734 32461764 32461747 Y DDX58 NA NA NA NA NA DDX58 62558 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 32524178 32524624 32524592 Y DDX58 TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 33023891 33023961 33023926 Y NA APTX,DNAJA1 NA NA NA NA DNAJA1 682 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 33028063 33028460 33028077 Y NA APTX,DNAJA1,SMU1 NA NA NA NA DNAJA1 4854 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 33158582 33158891 33158872 Y NA B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 6463 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 33159697 33160189 33160012 Y NA B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 5165 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 33160944 33161390 33161236 Y DNAJA1,SMU1,B4GALT1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 3964 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr9 33165457 33166051 33165900 Y DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 103 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 33942829 33943199 33943013 Y NA NA NA NA NA NA UBAP2 103748 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 34454815 34455060 34454916 Y NA DNAI1 NA NA NA NA DNAI1 352 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 34681857 34682174 34682025 Y ARID3C,IL11RA,IL11RA SIGMAR1,GALT,IL11RA,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5 NA NA NA NA RP11-195F19.5 17748 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 34986458 34986973 34986609 Y KIAA1539,DNAJB5 DNAJB5 NA NA NA NA DNAJB5 665 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 35114116 35114547 35114222 Y DNAJB5,KIAA1539 VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B NA NA NA NA FAM214B 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 35490989 35491345 35491127 Y NA RUSC2 NA NA NA NA RUSC2 2865 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 35491656 35492052 35492019 Y OR13J1,TPM2,CREB3,CCDC107,RUSC2 RUSC2 NA NA NA NA RUSC2 3532 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 35492185 35492605 35492350 Y RUSC2 RUSC2 NA NA NA NA RUSC2 4061 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 35516545 35516820 35516591 Y NA RUSC2 NA NA NA NA RUSC2 28421 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 35518041 35518590 35518314 Y CREB3,VCP,STOML2,RUSC2 RUSC2 NA NA NA NA RUSC2 29917 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 35520478 35520852 35520494 Y NA RUSC2 NA NA NA NA RUSC2 32354 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.18890991877604 chr9 35603992 35604628 35604112 Y TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2 TESK1 NA NA NA NA TESK1 625 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr9 35726275 35726587 35726326 Y NA TPM2,CREB3,TLN1,RGP1,GBA2,MSMP NA NA NA NA CREB3 3745 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 35798752 35798996 35798852 Y NA MSMP,NPR2,SPAG8,TMEM8B,HINT2 NA NA NA NA NPR2 8601 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 35907858 35908401 35908282 Y OR2S2,OR13J1,HRCT1 NDUFA5P4,HRCT1 NA NA NA NA HRCT1 3669 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 35914292 35914707 35914657 Y NA NDUFA5P4,HRCT1 NA NA NA NA HRCT1 10103 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 35924004 35924206 35924105 Y NA HRCT1,YBX1P10 NA NA NA NA HRCT1 19815 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 35924357 35924707 35924422 Y NA HRCT1,YBX1P10 NA NA NA NA HRCT1 20168 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 35971862 35972364 35972237 Y NA YBX1P10 C9orf128,HRCT1,LOC158376,FP588,RECK IMR90 Hi-C 24141950 YBX1P10 1547 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 36037997 36038326 36038187 Y NA RECK NA NA NA NA RECK 3567 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 36040345 36040403 36040371 Y NA RECK NA NA NA NA RECK 5915 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr9 36166552 36166755 36166690 Y CREB3,TLN1 GLIPR2,CLTA NA NA NA NA CLTA 22098 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr9 36232965 36233105 36233040 Y NA CLTA,RNU4-53P,GNE NA NA NA NA RNU4-53P 32675 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 36471008 36471193 36471156 Y NA RNF38 RNF38,MELK IMR90 Hi-C 24141950 RNF38 14352 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 37036641 37037011 37036829 Y ZCCHC7,ZBTB5,PAX5 NA NA NA NA NA ZCCHC7 81525 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 37270797 37270994 37270913 Y PAX5 NA NA NA NA NA GRHPR 149669 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 37773119 37773290 37773253 Y FRMPD1 DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA DCAF10 25209 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 37835930 37836292 37836154 Y NA DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA EXOSC3 36496 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 37914600 37914735 37914730 Y NA NA NA NA NA NA EXOSC3 115166 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 37930298 37930375 37930337 Y NA NA NA NA NA NA EXOSC3 130864 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 37938183 37938323 37938277 Y SHB NA NA NA NA NA RP11-613M10.9 128361 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 38016375 38016730 38016641 Y NA RP11-613M10.9 NA NA NA NA RP11-613M10.9 49954 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 38017265 38017614 38017440 Y SHB RP11-613M10.9,SHB NA NA NA NA RP11-613M10.9 49070 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 38066980 38067628 38067261 Y SHB RP11-613M10.9 NA NA NA NA SHB 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr9 38437570 38437747 38437611 Y NA ALDH1B1,IGFBPL1 TOMM5,IGFBPL1,ALDH1B1 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBPL1 15126 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.53223694314323 chr9 68377347 68377469 68377407 Y NA NA NA NA NA NA RP11-764K9.4 75906 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 68417391 68418146 68417579 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 35229 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 68419808 68420298 68419990 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 33077 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 1886 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 71728196 71728449 71728285 Y NA TJP2 NA NA NA NA TJP2 5760 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 71784003 71784073 71784064 Y TJP2 TJP2 NA NA NA NA TJP2 49794 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 71789916 71790363 71790201 Y TJP2 NA NA NA NA NA TJP2 55707 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 71991675 71991950 71991811 Y NA NA NA NA NA NA TJP2 257466 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 72101775 72101805 72101790 Y NA NA NA NA NA NA PTAR1 271070 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 72591131 72591428 72591305 Y NA NA MAMDC2,LOC100507299,LOC100507244,SMC5,TRPM3,TJP2 IMR90 Hi-C 24141950 MAMDC2 65069 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 72717148 72717358 72717253 Y NA NA NA NA NA NA MAMDC2 60651 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 72731610 72732001 72731807 Y MAMDC2 NA NA NA NA NA MAMDC2 75113 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 72805213 72805492 72805447 Y SMC5 NA NA NA NA NA SMC5 66445 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 72871058 72871439 72871223 Y NA SMC5 NA NA NA NA SMC5 498 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 72923580 72923722 72923651 Y SMC5 NA NA NA NA NA SMC5 51643 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 73025885 73026723 73026293 Y KLF9 KLF9 NA NA NA NA KLF9 817 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 9.41231265073698 chr9 73035561 73035945 73035863 Y KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8021 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.97001892689844 chr9 73036465 73036957 73036835 Y KLF9 KLF9 TRPM3,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8925 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 73168765 73169157 73169115 Y NA NA NA NA NA NA KLF9 141225 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 3.06447388628646 chr9 73196795 73197009 73196903 Y NA NA NA NA NA NA KLF9 169255 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 73203378 73203385 73203382 Y TRPM3 NA NA NA NA NA KLF9 175838 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 73215942 73217043 73216172 Y KLF9 NA NA NA NA NA KLF9 188402 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.62669190253125 chr9 73569162 73569421 73569277 Y NA NA NA NA NA NA TRPM3 490399 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr9 73701762 73702162 73701962 Y TRPM3 NA NA NA NA NA TRPM3 357658 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 75106254 75106475 75106392 Y NA NA TMC1,ZFAND5 IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND5 128091 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 75155526 75155660 75155598 Y ZFAND5 NA NA NA NA NA ZFAND5 177363 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 75747117 75747734 75747349 Y ANXA1 ANXA1 ANXA1 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA1 16939 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr9 75791521 75791823 75791639 Y NA ANXA1 NA NA NA NA ANXA1 26848 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 75879617 75879852 75879722 Y ANXA1 NA RORB IMR90 Hi-C 24141950 ANXA1 114944 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 78883173 78883418 78883296 Y NA NA NA NA NA NA RFK 124015 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 79191243 79191544 79191412 Y NA AL161626.1 NA NA NA NA AL161626.1 6512 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 80136147 80136388 80136268 Y NA NA NA NA NA NA VPS13A 345878 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 80911003 80911373 80911119 Y PSAT1 PSAT1 NA NA NA NA PSAT1 944 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 81341677 81341857 81341765 Y NA NA NA NA NA NA PSAT1 431618 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 81480672 81480887 81480778 Y NA NA TLE4 IMR90 Hi-C 24141950 PSAT1 570613 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 81486579 81486867 81486725 Y NA NA TLE4 IMR90 Hi-C 24141950 PSAT1 576520 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 81600122 81600487 81600176 Y NA NA NA NA NA NA TLE4 584201 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 81637955 81638246 81638090 Y NA NA NA NA NA NA TLE4 546442 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 81641483 81641834 81641545 Y NA NA NA NA NA NA TLE4 542854 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 82213229 82213622 82213243 Y NA TLE4 NA NA NA NA TLE4 28541 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 83933520 83933761 83933604 Y NA NA NA NA NA NA TLE1 368459 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 87466967 87467081 87467024 Y NA NA NA NA NA NA RMI1 873341 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 88264467 88264715 88264594 Y NA NA NA NA NA NA AGTPBP1 90229 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 88294983 88295025 88294997 Y NA NA NA NA NA NA AGTPBP1 59919 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 88358353 88358730 88358394 Y AGTPBP1 AGTPBP1 NA NA NA NA AGTPBP1 3409 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 88935508 88935794 88935577 Y NA ISCA1,ZCCHC6 NA NA NA NA ZCCHC6 31575 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 89149741 89149976 89149837 Y NA NA GAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZCCHC6 182372 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 89626902 89626982 89626949 Y NA CDC20P1 NA NA NA NA CDC20P1 2335 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 89699545 89699882 89699714 Y NA NA NA NA NA NA CDC20P1 74978 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 90182587 90182864 90182726 Y NA RP11-40C6.2 NA NA NA NA RP11-40C6.2 44370 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 90328172 90328868 90328486 Y DAPK1,CTSL1 NA CTSL1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-40C6.2 189955 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr9 90407699 90408115 90407854 Y DAPK1,CTSL1 NA NA NA NA NA CDK20 179553 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 91146731 91147178 91146985 Y NA NXNL2 NA NA NA NA NXNL2 838 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 91148176 91148373 91148274 Y NA NXNL2 NA NA NA NA NXNL2 160 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 91150927 91151269 91151097 Y NA NXNL2 NA NA NA NA NXNL2 2911 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 91795136 91795669 91795494 Y C9orf47,SHC3 SHC3 NA NA NA NA SHC3 3454 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr9 92276961 92277319 92277054 Y NA NA NA NA NA NA SEMA4D 165916 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 92296049 92296284 92296165 Y NA NA NA NA NA NA SEMA4D 185004 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 96901972 96902054 96902023 Y NA NA NA NA NA NA CYCSP24 103660 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 96928143 96928630 96928259 Y NA NA NA NA NA NA ZNF169 90963 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA NA NA NA NA NA ZNF169 90183 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.97001892689844 chr9 97411409 97411895 97411585 Y ZNF169,HIATL1,FBP1,C9orf3 FBP1 FBP1,FANCC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FBP1 10878 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr9 97629577 97629759 97629671 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 142594 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 97630074 97630491 97630387 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 143091 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr9 97631649 97631973 97631839 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 144666 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr9 97633078 97633398 97633277 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 146095 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 97684288 97685133 97684708 Y NA NA FANCC IMR90 Hi-C 24141950 C9orf3 197305 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr9 97699905 97700054 97699963 Y NA NA FANCC IMR90 Hi-C 24141950 C9orf3 212922 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 97895370 97895760 97895554 Y NA NA NA NA NA NA FANCC 182231 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 97966578 97966817 97966786 Y NA NA NA NA NA NA FANCC 111174 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 98273012 98273438 98273114 Y C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1 PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 3901 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 98629500 98629569 98629535 Y NA LINC00476 NA NA NA NA LINC00476 6690 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 99106686 99107122 99106995 Y NA SLC35D2 NA NA NA NA SLC35D2 36870 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 99132173 99132333 99132255 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367 NA NA NA NA SLC35D2 11659 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 99181547 99181719 99181643 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA ZNF367 2936 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 99182775 99182932 99182834 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA ZNF367 4164 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 100565577 100566264 100565821 Y CORO2A,FOXE1 NA FOXE1,C9orf156 IMR90 Hi-C 24141950 XPA 107938 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 100931425 100931550 100931485 Y C9orf156 CORO2A NA NA NA NA CORO2A 21372 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 100985595 100985973 100985751 Y TBC1D2 CORO2A,TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 29942 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 101002580 101002910 101002849 Y C9orf156,NANS,TBC1D2 CORO2A,TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 13005 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 101137509 101137713 101137616 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D2 121594 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 101372669 101373069 101372768 Y NA NA NA NA NA NA ANKS6 184178 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 101973951 101974336 101974174 Y NA ALG2,SEC61B NA NA NA NA ALG2 7902 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 102001733 102002034 102001876 Y ALG2 ALG2,SEC61B NA NA NA NA SEC61B 19387 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 103173830 103174136 103174107 Y NA TMEFF1 C9orf30-TMEFF1,TEX10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEFF1 28424 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 104137974 104138033 104138006 Y NA MRPL50,ZNF189 NA NA NA NA MRPL50 20863 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 106717687 106717746 106717717 Y NA NA NA NA NA NA SMC2 136795 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 107668768 107669725 107669153 Y SLC44A1,OR13C3 ABCA1 NA NA NA NA ABCA1 18793 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 107730510 107730878 107730708 Y SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1 ABCA1 ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA1 41992 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 107755412 107756258 107755691 Y ABCA1 NA ABCA1,SLC44A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ABCA1 66894 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 108284643 108284789 108284719 Y NA FKTN NA NA NA NA FKTN 33622 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 109626456 109627144 109627032 Y NA ZNF462 NA NA NA NA ZNF462 3078 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 109627297 109627657 109627483 Y NA ZNF462 NA NA NA NA ZNF462 3919 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 111773643 111773659 111773652 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 150 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 111774521 111775173 111774726 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 712 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr9 112091755 112092133 112091802 Y PTPN3 EPB41L4B EPB41L4B MCF7 ChIA-PET 22265404 EPB41L4B 10511 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 112578765 112579213 112578950 Y PALM2 PALM2-AKAP2,AKAP2 NA NA NA NA AKAP2 37996 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 112669829 112670129 112670003 Y NA NA NA NA NA NA AKAP2 129060 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 112811971 112812606 112812251 Y AKAP2 NA NA NA NA NA TXN 204314 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 113412585 113412772 113412669 Y NA NA LPAR1,KIAA0368,SVEP1,MUSK,OR2K2,DNAJC25-GNG10 IMR90 Hi-C 24141950 LPAR1 386209 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 113504925 113505178 113505015 Y NA NA NA NA NA NA LPAR1 293803 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 113507067 113507395 113507232 Y NA NA NA NA NA NA LPAR1 291586 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 113680597 113681099 113680790 Y NA NA NA NA NA NA LPAR1 117882 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 114705587 114705765 114705623 Y NA UGCG NA NA NA NA UGCG 48541 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 114720285 114720825 114720474 Y UGCG NA C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGCG 63239 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.97001892689844 chr9 114721832 114722310 114722097 Y UGCG NA C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGCG 64786 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 114774761 114774976 114774762 Y UGCG NA NA NA NA NA UGCG 117715 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr9 114783014 114783329 114783192 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 125968 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 114792518 114792641 114792625 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 135472 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 114805021 114805139 114805071 Y NA NA NA NA NA NA SUSD1 130549 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 114808602 114808743 114808666 Y PTGR1,PTGR1,UGCG NA NA NA NA NA SUSD1 126945 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr9 114809786 114810087 114810015 Y GNG10 NA NA NA NA NA SUSD1 125601 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 114811444 114811737 114811486 Y UGCG NA NA NA NA NA SUSD1 123951 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr9 114812315 114812544 114812429 Y NA NA NA NA NA NA SUSD1 123144 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 114812842 114813221 114813099 Y NA NA NA NA NA NA SUSD1 122467 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 114823556 114823978 114823803 Y GNG10,SUSD1 NA NA NA NA NA SUSD1 111710 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 114831912 114832228 114831995 Y GNG10,SUSD1 NA NA NA NA NA SUSD1 103460 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr9 114836654 114837091 114837061 Y PTGR1,PTGR1,UGCG NA NA NA NA NA SUSD1 98597 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 115031676 115032066 115031959 Y KIAA1958 NA NA NA NA NA PTBP3 61881 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 115110736 115110930 115110781 Y NA PTBP3,HSDL2 NA NA NA NA PTBP3 16789 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 115981344 115981857 115981657 Y SNX30,SLC46A2,RGS3,SLC31A2,FKBP15 NA NA NA NA NA FKBP15,SLC31A1 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 116281787 116282895 116282664 Y NA NA NA NA NA NA RGS3 76776 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 116341254 116341479 116341362 Y RGS3 NA NA NA NA NA RGS3 136243 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 116385277 116385518 116385372 Y RGS3 NA NA NA NA NA RGS3 180266 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 116437693 116438045 116437945 Y BSPRY,ZNF618 NA RGS3,POLE3,C9orf43 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF618 198517 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 116450183 116450673 116450525 Y BSPRY,ZNF618 NA WDR31,BSPRY,ZNF618 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF618 185889 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 117040965 117041219 117041139 Y NA NA NA NA NA NA AKNA 113466 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 117247262 117247587 117247370 Y TNFSF8,TNFSF15,ATP6V1G1,DFNB31 DFNB31 NA NA NA NA DFNB31 18143 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 118358577 118359027 118358666 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 480041 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr9 118367467 118367735 118367565 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 488931 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 118403305 118403595 118403372 Y NA NA PAPPA,ASTN2,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 510488 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 118412488 118412760 118412588 Y NA NA PAPPA,ASTN2,LOC100128505,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 501323 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.75112793502083 chr9 118430899 118431573 118430988 Y NA NA PAPPA,ASTN2,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 482510 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 118434933 118435213 118435118 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 478870 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 118435271 118435690 118435488 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 478393 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 118436011 118436199 118436119 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 477884 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 118701397 118701694 118701515 Y NA NA ASTN2,LINC00474,PAPPA IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 212389 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 118704303 118704501 118704353 Y NA NA ASTN2,LINC00474,PAPPA IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 209582 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 118758811 118759033 118758921 Y NA NA PAPPA IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 155050 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 118789906 118790104 118789991 Y NA NA LINC00474,PAPPA,ASTN2 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 123979 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 118914445 118914679 118914506 Y PAPPA PAPPA NA NA NA NA PAPPA 362 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 118917854 118918405 118917899 Y PAPPA PAPPA NA NA NA NA PAPPA 3771 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 118953256 118953446 118953306 Y PAPPA PAPPA NA NA NA NA PAPPA 39173 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 119018286 119018486 119018325 Y PAPPA PAPPA-AS2 NA NA NA NA PAPPA-AS2 30562 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 119311432 119311888 119311785 Y NA NA NA NA NA NA TRIM32 135693 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 119466124 119466469 119466162 Y NA TRIM32 NA NA NA NA TRIM32 18543 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 121771632 121771910 121771804 Y NA NA NA NA NA NA TLR4 1307022 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 123478444 123478636 123478538 Y NA MEGF9 NA NA NA NA MEGF9 3696 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 124031340 124031517 124031432 Y GSN RAB14 NA NA NA NA RAB14 48048 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 124361597 124361984 124361689 Y NA NA NA NA NA NA STOM 231066 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 124599801 124600198 124600000 Y TTLL11,DAB2IP NA NA NA NA NA TTLL11 253687 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 124739149 124739438 124739243 Y NA NA NA NA NA NA TTLL11 114447 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 124815475 124815645 124815560 Y NA TTLL11 NA NA NA NA TTLL11 38240 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr9 126632279 126632299 126632291 Y NA NA NA NA NA NA DENND1A 58132 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 127059883 127060148 127059983 Y NA NEK6 NA NA NA NA NEK6 41998 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr9 127156535 127156658 127156597 Y DENND1A PSMB7 NA NA NA NA PSMB7 19065 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 127475055 127475439 127475319 Y NA NA NA NA NA NA MIR181A2HG 56309 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 128170862 128170906 128170878 Y NA NA PBX3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GAPVD1 148789 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 128592115 128592428 128592308 Y PBX3 NA NA NA NA NA PBX3 84491 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 129485609 129485808 129485757 Y FAM125B,ZBTB34 NA NA NA NA NA ZBTB43 79477 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 130283548 130283912 130283802 Y SH2D3C,SH2D3C,SH2D3C,PTRH1,FPGS,FPGS,FAM129B,ENG NA NA NA NA NA FAM129B 55356 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 130304237 130304411 130304308 Y FAM129B,FAM129B FAM129B NA NA NA NA FAM129B 34857 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 130308766 130308904 130308855 Y NA FAM129B NA NA NA NA FAM129B 30364 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 130319753 130319894 130319823 Y ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,FPGS,FPGS,FAM129B FAM129B NA NA NA NA FAM129B 19374 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 130329548 130329691 130329605 Y PTRH1,FPGS,FPGS,ENG,CDK9,FAM129B,FAM129B FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 9577 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 130335827 130336224 130335842 Y TOR2A,CDK9,FAM129B FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 3044 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 130600573 130601245 130600861 Y FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS FPGS,ENG,AK1 NA NA NA NA ENG 13790 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 130764123 130764312 130764223 Y FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS FAM102A FAM102A,DPM2,PIP5KL1,SLC25A25,NAIF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM102A 23331 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 131673839 131674187 131673982 Y PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,LRRC8A,LRRC8A LRRC8A,CCBL1,PHYHD1,DOLK,NUP188 NA NA NA NA PHYHD1 6987 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 131908135 131908616 131908494 Y METTL11A PPP2R4,CRAT,IER5L NA NA NA NA IER5L 29924 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 131929415 131929566 131929473 Y METTL11A,C9orf106 IER5L NA NA NA NA IER5L 8974 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr9 131930457 131930532 131930510 Y PRRX2 IER5L NA NA NA NA IER5L 8008 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 131937094 131937487 131937262 Y PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L IER5L NA NA NA NA IER5L 1053 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chr9 131988173 131988389 131988342 Y NA IER5L LOC100506190,IER5L,METTL11A,PPP2R4,ASB6,SH3GLB2,CRAT,C9orf106,C9orf50 IMR90,K562,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 IER5L 49633 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr9 132168772 132168919 132168823 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 74811 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 67404 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.40780091065365 chr9 132249112 132249430 132249268 Y CRAT,IER5L,PRRX2 LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 5382 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 132249735 132250094 132249903 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 6005 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 132257886 132258547 132258348 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 14156 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chr9 132330921 132331424 132331168 Y IER5L,C9orf50 NA FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB6 71020 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 132331590 132331738 132331651 Y CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L NA FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB6 70706 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 132359283 132359664 132359324 Y CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L,PTGES,METTL11A,ASB6 ASB6 NA NA NA NA ASB6 42780 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr9 132369856 132370376 132370136 Y CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107 ASB6 NA NA NA NA ASB6 32068 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 132372165 132372686 132372524 Y NA ASB6 NA NA NA NA ASB6 29758 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 132373475 132373922 132373518 Y NA ASB6 NA NA NA NA ASB6 28522 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 132460473 132461091 132460806 Y ASB6,PRRX2 NA NA NA NA NA PTGES 52235 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 132539303 132540203 132539702 Y C9orf106,FNBP1,TOR1B PTGES,TOR1B,TOR1A PPP2R4,PRRX2,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20,TOR1B,TOR1A,FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,GPR107 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOR1B 23229 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 132646480 132646964 132646831 Y ASB6,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1 NA NA NA NA NA C9orf78 50338 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 132802902 132803300 132803100 Y ASB6,USP20,USP20,FNBP1 FNBP1,GPR107 NA NA NA NA FNBP1 173 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 133721311 133721454 133721341 Y NA NA NA NA NA NA FIBCD1 91219 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 134131602 134132161 134131829 Y RAPGEF1,PRRC2B,QRFP,NUP214,FAM78A NA NA NA NA NA NUP214 132654 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 134157961 134158264 134158112 Y NA NA NUP214,FAM78A,PPAPDC3,PRRC2B IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 109216 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chr9 134532379 134532786 134532611 Y FAM78A,PRRC2B,RAPGEF1,RAPGEF1 NA NA NA NA NA RAPGEF1 80675 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 134908976 134909021 134908999 Y NA MED27 NA NA NA NA MED27 44274 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 135481058 135481229 135481144 Y CEL NA NA NA NA NA GTF3C4 62193 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 136284309 136284583 136284382 Y C9orf96 SURF4,C9orf96,REXO4 NA NA NA NA REXO4 3145 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 136576519 136576779 136576603 Y SURF4 SARDH NA NA NA NA SARDH 26298 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 7.00451174008333 chr9 136579870 136580130 136580087 Y NA SARDH NA NA NA NA SARDH 22947 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 136580491 136580641 136580566 Y NA SARDH NA NA NA NA SARDH 22436 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 136856624 136856782 136856656 Y VAV2 VAV2,LINC00094 NA NA NA NA VAV2 898 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 137252796 137253042 137252967 Y NA RXRA NA NA NA NA RXRA 45852 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 137264490 137265116 137264820 Y RXRA NA NA NA NA NA RXRA 57546 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 137305745 137306050 137305907 Y RXRA NA NA NA NA NA RXRA 98801 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 137394714 137394986 137394879 Y NA NA COL5A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A1 136634 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 137483960 137484781 137484422 Y NA COL5A1 RXRA,COL5A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A1 46839 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chr9 137536549 137536868 137536739 Y COL5A1 COL5A1 NA NA NA NA COL5A1 4929 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 138233554 138233668 138233594 Y NA NA OLFM1 IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R26 135257 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 138348639 138348707 138348673 Y NA PPP1R26,MRPS2,C9orf116 NA NA NA NA PPP1R26 20218 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 138666183 138666357 138666270 Y NA NA NA NA NA NA CAMSAP1 130717 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 138884665 138885093 138884961 Y NA UBAC1 NA NA NA NA UBAC1 33439 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 139462526 139462651 139462613 Y C9orf69 NOTCH1,RP11-611D20.2 MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-611D20.2 23862 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chr9 140023271 140023604 140023504 Y EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,MIR3621 NA NA NA NA DPP7 15642 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7,MIR3621 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 8.53674868322656 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 15308 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 2.40780091065365 chr9 140169154 140169348 140169240 Y NA TUBB4B,NRARP NA NA NA NA NRARP 25355 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chr9 140306093 140306345 140306289 Y NRARP EXD3,NOXA1 NA NA NA NA EXD3 9369 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 3732842 3733263 3733002 Y PRKX NA NA NA NA NA PRKX 103193 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chrX 3870962 3871082 3871022 Y NA NA NA NA NA NA PRKX 241313 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 4628683 4629054 4628903 Y NA NA NA NA NA NA RP11-555H23.1 594115 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chrX 9536624 9537203 9536862 Y TBL1X,TBL1X NA NA NA NA NA TBL1X 107289 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 10133570 10133893 10133819 Y NA CLCN4 NA NA NA NA CLCN4 10546 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 10585706 10585772 10585735 Y NA NA NA NA NA NA MID1 264001 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 10712546 10712862 10712704 Y NA NA NA NA NA NA MID1 136911 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 11810786 11811173 11810822 Y NA MSL3 NA NA NA NA MSL3 36508 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 12228582 12228906 12228588 Y NA NA NA NA NA NA FRMPD4 73997 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chrX 12390298 12390694 12390463 Y NA NA NA NA NA NA FRMPD4 235713 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chrX 12968289 12968795 12968434 Y TMSB4X,TLR7,TLR8 TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 22432 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 12974184 12974672 12974538 Y TMSB4X,TLR7,TLR8 TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 16555 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chrX 13002969 13003378 13003273 Y TLR7,TMSB4X TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 11742 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 13119924 13120175 13120039 Y NA NA TMSB4X MCF7 ChIA-PET 22265404 TMSB4X 128697 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chrX 14262210 14262757 14262259 Y NA NA NA NA NA NA GEMIN8 216198 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 15769418 15769925 15769650 Y PIGA,CA5B,ZRSR2 ZRSR2 NA NA NA NA ZRSR2 36670 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 17395556 17395647 17395622 Y NHS NHS NA NA NA NA NHS 4013 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 18693104 18693424 18693141 Y PHKA2,CDKL5 NA NA NA NA NA CDKL5 251401 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 18904688 18905149 18904995 Y PHKA2 NA NA NA NA NA PHKA2 95567 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 21950501 21951081 21950869 Y NA SMS SMS K562 ChIA-PET 22265404 SMS 5610 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 23368174 23368523 23368350 Y NA NA NA NA NA NA PRDX4 311856 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 23390523 23390925 23390723 Y PTCHD1 NA NA NA NA NA PRDX4 289454 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 23922308 23922544 23922448 Y NA APOO NA NA NA NA APOO 1513 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 26656235 26656312 26656257 Y NA NA NA NA NA NA RP11-12D5.5 1223698 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chrX 29678122 29678339 29678241 Y NA NA NA NA NA NA MAGEB1 581508 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.09445495938802 chrX 29699916 29700254 29699978 Y NA NA NA NA NA NA MAGEB1 559593 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 30631885 30632229 30631971 Y GK,CXorf21 FTLP2,GK NA NA NA NA FTLP2 14186 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 30840604 30840871 30840738 Y CXorf21,GK NA NA NA NA NA TAB3 150330 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 34673205 34673457 34673369 Y NA NA NA NA NA NA TMEM47 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 38742577 38742732 38742665 Y MID1IP1 NA MID1IP1 IMR90 Hi-C 24141950 MID1IP1 83892 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chrX 39646201 39646652 39646229 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 811 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chrX 39872499 39873023 39872596 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 161559 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 39873339 39874259 39873676 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 160323 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chrX 39965558 39965902 39965820 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 68680 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chrX 39968308 39968728 39968376 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65854 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chrX 40005202 40005365 40005305 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 29217 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 40011614 40011816 40011787 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 22766 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 40012729 40012965 40012840 Y BCOR,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 21617 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 40017598 40017727 40017669 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 16855 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 40030956 40031200 40030978 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2 BCOR NA NA NA NA BCOR 3382 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 40034694 40035505 40035056 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 112 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chrX 40633117 40633446 40633258 Y ATP6AP2,MED14 MED14-AS1,MED14 USP9X,MED14 IMR90 Hi-C 24141950 MED14 40007 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 40869896 40870061 40869955 Y ATP6AP2 NA MED14,USP9X IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP9X 72827 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 40902136 40902158 40902147 Y NA USP9X MED14 IMR90 Hi-C 24141950 USP9X 40730 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 40943673 40944218 40943773 Y CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X USP9X NA NA NA NA USP9X 785 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 41413588 41413590 41413589 Y NA NA NA NA NA NA DDX3X 222937 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 43888590 43889088 43888779 Y EFHC2 NA NA NA NA NA FUNDC1 511159 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chrX 44733657 44734406 44734027 Y KDM6A KDM6A NA NA NA NA KDM6A 2900 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 45376807 45376988 45376867 Y NA RP11-245M24.1 MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-245M24.1 14174 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 45480900 45481410 45481103 Y NA NA MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-245M24.1 118267 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 45493055 45493058 45493057 Y NA NA NA NA NA NA MIR221 110636 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 45617544 45618196 45618069 Y NA MIR221,MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR222 13014 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 45626471 45627108 45626806 Y NA MIR221,MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR222 21941 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 45631125 45631239 45631172 Y NA MIR221,MIR222 NA NA NA NA MIR222 26595 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 45648299 45648762 45648585 Y NA MIR221,MIR222 NA NA NA NA MIR222 43769 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 45666059 45666529 45666404 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 42391 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chrX 46182516 46182747 46182636 Y NA RP1-30G7.2 NA NA NA NA RP1-30G7.2 2333 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 46278987 46279293 46279130 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 18856 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 46496839 46496883 46496861 Y NA NA NA NA NA NA CHST7 65620 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 46989082 46989431 46989227 Y NA RBM10,NDUFB11 NA NA NA NA RBM10 12837 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 47701110 47701161 47701136 Y NA ZNF81 NA NA NA NA ZNF81 6809 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 47880817 47881226 47880903 Y SYN1 ZNF182,ZNF630 NA NA NA NA ZNF182 19440 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 48345811 48346195 48345963 Y WAS,RBM3,PQBP1,PQBP1,PQBP1,OTUD5 FTSJ1,PORCN,EBP,TBC1D25 NA NA NA NA FTSJ1 13270 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 48390158 48390246 48390210 Y NA PORCN,EBP,TBC1D25,RBM3 NA NA NA NA TBC1D25 5599 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 49012442 49012818 49012676 Y NA GPKOW,PLP2,PRICKLE3 MAGIX,PLP2 IMR90 Hi-C 24141950 PLP2 13455 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 49139256 49139619 49139438 Y FOXP3,PPP1R3F CCDC22,PPP1R3F NA NA NA NA PPP1R3F 14950 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 52964244 52964539 52964367 Y TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 45908 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chrX 53110126 53110560 53110260 Y NA GPR173,TSPYL2,LINC01155 NA NA NA NA TSPYL2 577 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 53155305 53155690 53155322 Y XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2 TSPYL2,LINC01155 KDM5C IMR90 Hi-C 24141950 LINC01155 33978 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 53467837 53468052 53468003 Y KDM5C SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA HSD17B10 8517 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 53745141 53745273 53745207 Y NA HUWE1 HUWE1 MCF7 ChIA-PET 22265404 HUWE1 33468 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 54207583 54207867 54207725 Y NA NA NA NA NA NA FAM120C 0 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 64255385 64255512 64255449 Y ZC4H2 ZC4H2 NA NA NA NA ZC4H2 2792 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chrX 64520324 64520642 64520384 Y NA NA NA NA NA NA LAS1L 232013 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 64821176 64821755 64821551 Y MSN MSN MSN IMR90 Hi-C 24141950 MSN 14919 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 64888338 64888720 64888577 Y MSN NA NA NA NA NA MSN 82081 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 67352579 67352916 67352601 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 298839 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 68004355 68004677 68004478 Y NA SERBP1P1,EFNB1 NA NA NA NA SERBP1P1 3040 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chrX 68215899 68216039 68215946 Y NA NA NA NA NA NA PJA1 167597 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 69653784 69653948 69653832 Y NA DLG3 NA NA NA NA DLG3 8763 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 69654278 69654566 69654417 Y DLG3 DLG3 NA NA NA NA DLG3 8145 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chrX 70401853 70402134 70401993 Y IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO NA NA NA NA NA MED12 65447 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chrX 70640504 70640913 70640718 Y NA NA NA NA NA NA TAF1 56390 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 73250242 73250558 73250399 Y NA NA NA NA NA NA JPX 88083 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 73507125 73507445 73507287 Y NA FTX NA NA NA NA FTX 3964 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 73755621 73755953 73755678 Y RLIM NA NA NA NA NA RLIM 76499 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chrX 74370869 74370931 74370900 Y NA ABCB7 NA NA NA NA ABCB7 3636 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 79830053 79830147 79830110 Y NA NA NA NA NA NA BRWD3 233040 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 81984585 81984817 81984685 Y NA NA NA NA NA NA ATG4AP1 266890 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 85278748 85279124 85278988 Y CHM CHM NA NA NA NA CHM 21442 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 85294512 85294785 85294645 Y CHM CHM NA NA NA NA CHM 5781 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 85339971 85340972 85340615 Y NA CHM NA NA NA NA CHM 39405 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chrX 92479084 92479478 92479382 Y NA RP13-88F20.1 NA NA NA NA RP13-88F20.1 1070 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 93615949 93615975 93615962 Y NA NA NA NA NA NA FAM133A 688937 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 101914784 101914936 101914847 Y BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1 NA NA NA NA NA GPRASP2 50168 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.875563967510417 chrX 105809036 105809195 105809116 Y NA CXorf57 NA NA NA NA CXorf57 43965 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 106595667 106595822 106595802 Y NA NA NA NA NA NA NUP62CL 147997 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 1.31334595126563 chrX 106920003 106920801 106920325 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 50266 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chrX 107639720 107640073 107639886 Y COL4A6 COL4A6,COL4A5 NA NA NA NA COL4A6 40654 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 108883543 108883897 108883721 Y NA NA NA NA NA NA ACSL4 90735 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 109083180 109083422 109083333 Y ACSL4 NA ACSL4 IMR90 Hi-C 24141950 ACSL4 108548 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 109091814 109092062 109091940 Y NA NA ACSL4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACSL4 117182 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 109382352 109382583 109382468 Y NA NA NA NA NA NA TMEM164 138493 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 115239457 115239782 115239623 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 156035 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 115364202 115364338 115364320 Y NA NA SLC6A14 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-761E20.1 280780 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 119619289 119619732 119619620 Y ZBTB33,ZBTB33 LAMP2 LAMP2 K562 ChIA-PET 22265404 LAMP2 18069 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 119619980 119620335 119620161 Y NA LAMP2 LAMP2 K562 ChIA-PET 22265404 LAMP2 18760 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 120331489 120331718 120331553 Y NA NA NA NA NA NA C1GALT1C1 569484 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chrX 122898767 122899176 122898998 Y NA THOC2 NA NA NA NA THOC2 33861 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 4.59671082942969 chrX 129065451 129065820 129065554 Y NA UTP14A,BCORL1 NA NA NA NA UTP14A 27354 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 129118011 129118370 129118054 Y NA BCORL1 BCORL1,UTP14A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCORL1 4928 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 129245756 129246153 129246006 Y NA ELF4 NA NA NA NA ELF4 3065 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 129400519 129400680 129400638 Y NA ZNF280C NA NA NA NA ZNF280C 193 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chrX 133305762 133306165 133305903 Y PHF6,CCDC160 NA NA NA NA NA CCDC160 62912 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 135285010 135285467 135285237 Y FHL1,FHL1,FHL1,FHL1 NA NA NA NA NA MAP7D3 51174 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chrX 135927542 135927922 135927796 Y NA RBMX ARHGEF6 IMR90 Hi-C 24141950 RBMX 33001 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 139847313 139847514 139847421 Y NA NA NA NA NA NA LDOC1 421796 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chrX 149084401 149084780 149084588 Y NA LINC00894,CXorf40B NA NA NA NA LINC00894 20066 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 149371061 149371452 149371207 Y MAMLD1 NA MIR2114,LOC100272228 IMR90 Hi-C 24141950 MAMLD1 156237 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 149862815 149863170 149863006 Y MTMR1 MTMR1 NA NA NA NA MTMR1 3380 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 149863384 149863571 149863479 Y NA MTMR1 NA NA NA NA MTMR1 3949 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 149865562 149865927 149865671 Y NA MTMR1 NA NA NA NA MTMR1 6127 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 150047001 150047063 150047035 Y NA CD99L2 NA NA NA NA CD99L2 18226 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 150152595 150153067 150152778 Y NA HMGB3,RPL19P21 NA NA NA NA HMGB3 5613 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 150957656 150957864 150957760 Y NA NA NA NA NA NA GABRE 183288 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chrX 152127371 152127756 152127434 Y NA NA NA NA NA NA NSDHL 129860 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chrX 152980497 152980777 152980637 Y NA SLC6A8,BCAP31,ABCD1,PLXNB3 NA NA NA NA BCAP31 7375 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 153166203 153166850 153166548 Y ABCD1,PLXNB3,MECP2,ATP6AP1,RENBP L1CAM,ARHGAP4,NAA10 NA NA NA NA L1CAM 5827 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 153596671 153598676 153598064 Y NA FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1 NA NA NA NA FLNA 2330 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 153600469 153600779 153600667 Y NA FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1 NA NA NA NA FLNA 227 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 153755432 153755621 153755566 Y NA LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD FAM3A MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 IKBKG 11793 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 153828728 153829141 153828914 Y NA AF277315.19 NA NA NA NA AF277315.19 2970 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chrX 153829365 153829583 153829391 Y NA AF277315.19 NA NA NA NA AF277315.19 2528 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrX 153963988 153964279 153964176 Y F8 GAB3,DKC1 CTAG2 IMR90 Hi-C 24141950 GAB3 13579 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrY 2872046 2872325 2872195 Y RPS4Y1,ZFY,ZFY NA NA NA NA NA ZFY 70934 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrY 7637940 7638259 7638201 Y NA NA NA NA NA NA PRKY 497927 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.656672975632813 chrY 13254353 13254589 13254477 Y NA NA NA NA NA NA GYG2P1 1275666 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrY 14775457 14775545 14775476 Y NA TTTY15 NA NA NA NA TTTY15 3192 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chrY 15207344 15207441 15207401 Y NA NA NA NA NA NA DDX3Y 193325 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.437781983755208 chrY 18611855 18612137 18611996 Y NA NA NA NA NA NA AGKP1 1862879 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604 chrY 28555183 28555400 28555298 Y NA NA NA NA NA NA EIF1AY 5819572 CAGE Mero-48a hg19 FANTOM5 0.218890991877604