chr1 840753 841210 840812 Y NA NA NA NA NA NA NOC2L 51479 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 945769 946034 945890 Y CCNL2,ATAD3B ISG15,AGRN NA NA NA NA ISG15 769 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 1004646 1004986 1004766 Y NA C1orf159 NA NA NA NA C1orf159 44755 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr1 1265677 1265980 1265829 Y NA PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1 NA NA NA NA GLTPD1 7541 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 1609619 1609864 1609850 Y NA CDK11B,CDK11A NA NA NA NA CDK11B 21146 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 1611804 1612115 1611960 Y NA CDK11B,CDK11A NA NA NA NA CDK11B 23331 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 1708824 1709349 1708980 Y NA NADK NA NA NA NA NADK 547 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 1772108 1772256 1772158 Y TMEM88B,ATAD3C,CALML6,PRKCZ GNB1 NA NA NA NA GNB1 48239 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 1803114 1803303 1803274 Y NA GNB1,TMEM52 NADK IMR90 Hi-C 24141950 GNB1 17192 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 1814762 1815124 1815035 Y SKI,C1orf86,MIB2 GNB1,TMEM52 NA NA NA NA GNB1 5371 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 1840449 1840835 1840668 Y SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD GNB1,TMEM52 NA NA NA NA TMEM52 7877 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 2232428 2232896 2232683 Y SKI,TNFRSF14 NA NA NA NA NA MORN1 88250 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 2574079 2574144 2574101 Y NA NA NA NA NA NA FAM213B 58149 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 2574343 2574764 2574705 Y MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1 NA NA NA NA NA FAM213B 58413 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 3373716 3374006 3373818 Y NA NA NA NA NA NA RP11-46F15.2 165301 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 3581269 3581645 3581600 Y WRAP73,TP73 RP11-46F15.2,TPRG1L,TP73,WRAP73 NA NA NA NA WRAP73 13944 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 3817648 3818071 3817969 Y LRRC47 CEP104,DFFB,C1orf174 NA NA NA NA C1orf174 2791 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 6088225 6088518 6088328 Y TNFRSF25,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2 KCNAB2,NPHP4 NA NA NA NA NPHP4 37692 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 6221566 6221669 6221628 Y PLEKHG5,CHD5 RPL22 NA NA NA NA RPL22 45780 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 8343223 8343590 8343363 Y NA NA ERRFI1,RERE IMR90 Hi-C 24141950 ERRFI1 258855 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 8487656 8487917 8487791 Y RERE NA NA NA NA NA RERE 387785 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr1 8499087 8499228 8499177 Y NA NA NA NA NA NA RERE 376474 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 8686491 8686867 8686745 Y RERE NA NA NA NA NA RERE 188835 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 8712702 8713010 8712859 Y NA NA NA NA NA NA RERE 162692 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 8953388 8953557 8953428 Y NA ENO1 NA NA NA NA ENO1 16080 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 9486434 9486788 9486620 Y NA NA H6PD,SPSB1,SLC25A33,MIR34A IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 110753 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 9488839 9489227 9489154 Y NA NA SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 108314 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.40536027741361 chr1 9840833 9841244 9840865 Y NA CLSTN1 NA NA NA NA CLSTN1 41340 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 10496880 10497075 10496978 Y KIF1B PGD,APITD1,APITD1-CORT,PEX14,DFFA NA NA NA NA APITD1,APITD1-CORT 8721 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 11559549 11559947 11559917 Y NA PTCHD2 NA NA NA NA PTCHD2 22326 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 11791882 11792060 11791938 Y NA MAD2L2,AGTRAP AGTRAP IMR90 Hi-C 24141950 AGTRAP 2081 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 11841016 11841080 11841048 Y NA AGTRAP,CLCN6 NA NA NA NA CLCN6 23127 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 11968510 11969143 11969021 Y MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP KIAA2013,PLOD1 NA NA NA NA KIAA2013 15342 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 12124472 12125118 12124763 Y MIIP,TNFRSF8 MIIP NA NA NA NA MIIP 46949 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 12493313 12493712 12493478 Y NA NA NA NA NA NA VPS13D 205189 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 12533412 12533678 12533545 Y NA NA NA NA NA NA VPS13D 245288 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 12544374 12544691 12544532 Y NA NA NA NA NA NA VPS13D 256250 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 15738146 15738632 15738365 Y SPEN,PLEKHM2,EFHD2,CASP9 EFHD2 NA NA NA NA EFHD2 3755 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 15946733 15946892 15946831 Y EFHD2,CASP9,ZBTB17,SPEN,DDI2 RP4-680D5.2,CHCHD2P6,DDI2 NA NA NA NA DDI2 4738 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 16087189 16087372 16087266 Y EPHA2,FBLIM1 NA NA NA NA NA PLEKHM2 78362 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 16175691 16176294 16176100 Y NA SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3049 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 16209325 16209770 16209445 Y NA SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 36683 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 16212759 16213091 16212941 Y EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 40117 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr1 16277350 16278224 16277618 Y CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17 ZBTB17 NA NA NA NA ZBTB17 22403 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 16339360 16339596 16339414 Y NA ZBTB17 NA NA NA NA ZBTB17 38733 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 16696032 16696399 16696223 Y NA FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 19083 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA NA SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 60166 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 17231253 17231704 17231392 Y PADI4,PADI2 NA CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP13A2 104719 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA NA CROCC K562 ChIA-PET 22265404 ATP13A2 95640 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.54589630515498 chr1 17353741 17353845 17353793 Y NA ATP13A2,SDHB ATP13A2 K562 ChIA-PET 22265404 ATP13A2 17318 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 17746173 17746585 17746297 Y NA RCC2 NA NA NA NA RCC2 17635 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 20204786 20204981 20204970 Y OTUD3 OTUD3 NA NA NA NA OTUD3 2025 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 20514084 20514586 20514511 Y UBXN10 RP3-340N1.2,UBXN10,UBXN10-AS1 NA NA NA NA UBXN10-AS1 3105 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 20993397 20993558 20993485 Y NA PINK1,DDOST NA NA NA NA DDOST 7397 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.54589630515498 chr1 21084820 21085159 21084988 Y NA HP1BP3 NA NA NA NA HP1BP3 26657 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 21428050 21428147 21428101 Y NA RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 29804 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 21510856 21510968 21510912 Y ECE1,ECE1 EIF4G3 EIF4G3,DDOST,KIF17,HP1BP3,SH2D5 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF4G3 9479 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 22002610 22002786 22002701 Y NA NA RAP1GAP K562 ChIA-PET 22265404 USP48 105313 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 22089036 22089375 22089206 Y NA USP48 RAP1GAP IMR90 Hi-C 24141950 USP48 18724 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 22236410 22236692 22236686 Y NA RP11-26H16.1,HSPG2 NA NA NA NA RP11-26H16.1 3819 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 22345590 22345859 22345703 Y ZBTB40,CDC42 LINC00339,CDC42 NA NA NA NA LINC00339 3822 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 22366226 22366841 22366516 Y USP48,ZBTB40 LINC00339,CDC42 CDC42 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42 10279 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 23881180 23881765 23881497 Y NA E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 2520 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chr1 23888678 23889201 23888997 Y ID3 E2F2,ID3 NA NA NA NA ID3 4393 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 23918101 23918449 23918188 Y SRSF10,CNR2,E2F2 ID3 E2F2,ID3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID3 33816 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 23925201 23925342 23925271 Y NA ID3 TCEB3,HNRNPR,ASAP3,TCEA3,E2F2,ID3,MDS2,LOC100506963,ZNF436 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID3 40916 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 23961555 23961694 23961621 Y NA NA NA NA NA NA RPL11 54575 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 24063897 24064210 24064053 Y PNRC2,RPL11 RPL11,TCEB3,PITHD1 RPL11 IMR90 Hi-C 24141950 TCEB3 3435 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 24516156 24516343 24516260 Y PNRC2,GRHL3,IL28RA NA NA NA NA NA RP11-4M23.7 183147 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 24691833 24692082 24691893 Y PNRC2,GRHL3 NIPAL3 NA NA NA NA NIPAL3 48202 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr1 26201699 26201757 26201716 Y SEPN1 RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1 NA NA NA NA RP1-125I3.2 17595 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 26615016 26615421 26615346 Y SH3BGRL3,ARID1A,UBXN11,UBXN11 SH3BGRL3,CD52,UBXN11 NA NA NA NA SH3BGRL3 11349 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 26615527 26615997 26615758 Y FAM54B,SH3BGRL3,RPS6KA1,HMGN2,ARID1A,UBXN11,UBXN11,CD52 SH3BGRL3,CD52,UBXN11 NA NA NA NA SH3BGRL3 11860 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 26616527 26617019 26616745 Y ARID1A,UBXN11,UBXN11 SH3BGRL3,CD52,UBXN11 NA NA NA NA SH3BGRL3 12860 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 26642014 26642169 26642069 Y FAM54B,SH3BGRL3,RPS6KA1,HMGN2,UBXN11,UBXN11,CD52 SH3BGRL3,CD52,UBXN11 NA NA NA NA CD52 279 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 26827232 26827869 26827508 Y PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A RP3-476K8.4,HMGN2,RPS6KA1 HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RPS6KA1 26383 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.8269683606377 chr1 26907862 26908015 26907938 Y SH3BGRL3,UBXN11 NA NA NA NA NA RPS6KA1 53610 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 26946837 26947249 26947076 Y CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 73275 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 26947342 26948198 26947481 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72326 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr1 27021406 27021810 27021509 Y NA ARID1A NA NA NA NA ARID1A 882 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 27024638 27025138 27024825 Y SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV ARID1A NA NA NA NA ARID1A 4114 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 27112764 27112917 27112859 Y WDTC1,SLC9A1,ZNF683,RPS6KA1,ZDHHC18,ARID1A ZDHHC18 NA NA NA NA ZDHHC18 38284 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 27160002 27160387 27160288 Y WDTC1,SLC9A1,RPS6KA1,ARID1A,PIGV,ZDHHC18 ZDHHC18 NA NA NA NA ZDHHC18 8801 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 27165490 27165816 27165600 Y NA ZDHHC18,GPN2 NA NA NA NA ZDHHC18 14289 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA GPN2 22861 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 3.23232863805131 chr1 27527451 27527688 27527509 Y NA SLC9A1,WDTC1 WDTC1,SLC9A1,C1orf172 IMR90 Hi-C 24141950 WDTC1 31319 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr1 27626897 27627231 27626926 Y NA TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1 NA NA NA NA TMEM222 19420 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 27691785 27692261 27692091 Y TMEM222,MAP3K6 TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,GPR3 NA NA NA NA MAP3K6 402 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr1 27762936 27763307 27763206 Y WASF2,STX12,FGR,FGR,FGR,C1orf38 GPR3 NA NA NA NA GPR3 45788 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 27848725 27849287 27848935 Y WDTC1,SYTL1,FAM76A WASF2 NA NA NA NA WASF2 34056 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 27853337 27854089 27853858 Y NA WASF2 NA NA NA NA WASF2 38668 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr1 27854575 27854919 27854692 Y SYTL1,FGR,FGR,FGR,FAM76A,C1orf38 WASF2 NA NA NA NA WASF2 39906 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 27907931 27908052 27907995 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 20890 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 27916292 27916674 27916513 Y XKR8,AHDC1 AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 12268 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 27924204 27924421 27924302 Y XKR8,AHDC1 AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 4521 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 27986111 27986384 27986268 Y EYA3,SYTL1,WASF2,XKR8,STX12,FAM76A,C1orf38,FGR,FGR,FGR IFI6 NA NA NA NA IFI6 10345 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 28318645 28318992 28318812 Y FAM76A XKR8 NA NA NA NA XKR8 34672 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 28417819 28418026 28417886 Y FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,DNAJC8,EYA3 EYA3 NA NA NA NA EYA3 4612 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 28573636 28574084 28573917 Y NA DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 9954 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr1 28970474 28970729 28970677 Y NA TAF12,RNU11,GMEB1 NA NA NA NA RNU11 2383 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 29504261 29504387 29504317 Y YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4 SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2112 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 29517304 29517322 29517313 Y NA SRSF4,MECR NA NA NA NA SRSF4 10805 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 31233848 31234393 31233970 Y LAPTM5 LAPTM5 MATN1,LOC100129196,LAPTM5,SDC3,PUM1,SNORD103A IMR90 Hi-C 24141950 LAPTM5 5181 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 31430605 31430735 31430670 Y NA NA NA NA NA NA PUM1 106103 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 31504221 31504603 31504488 Y NA PUM1 NA NA NA NA PUM1 32235 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 31537719 31538012 31537814 Y LAPTM5,PUM1 PUM1 NA NA NA NA PUM1 881 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 90728 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr1 31628220 31628457 31628359 Y NA NA PUM1,NKAIN1,SERINC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 91382 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 31737918 31737951 31737935 Y NA SNRNP40,ZCCHC17 NA NA NA NA SNRNP40 29711 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 31950057 31950263 31950160 Y NA RP11-439L8.3 SERINC2,SNRNP40,HCRTR1,NKAIN1,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-439L8.3 19578 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 32250836 32250955 32250895 Y IQCC BAI2 NA NA NA NA BAI2 22342 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 32732571 32732683 32732626 Y LCK EIF3I,TMEM234,LCK,HDAC1 NA NA NA NA LCK 17731 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 32966228 32966602 32966575 Y FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A ZBTB8A NA NA NA NA ZBTB8A 36426 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 33082385 33082406 33082394 Y ZBTB8B,ZBTB8A ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 32098 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 33446816 33447482 33446950 Y RNF19B RNF19B RNF19B,AK2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF19B 18530 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 33457914 33458607 33458311 Y RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 29628 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 33622437 33622835 33622675 Y PHC2,TRIM62 TRIM62 NA NA NA NA TRIM62 22825 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 36555347 36555633 36555606 Y STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2 ADPRHL2,COL8A2 NA NA NA NA ADPRHL2 2871 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 36592352 36592554 36592389 Y NA ADPRHL2,COL8A2,TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA COL8A2 3531 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 36626561 36626969 36626609 Y STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2,MAP7D1,THRAP3 COL8A2,TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 7381 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 36627717 36628369 36628068 Y STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3 COL8A2,TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 8537 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 37942874 37943354 37943027 Y YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA ZC3H12A 4721 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 38739267 38739533 38739400 Y NA NA POU3F1 IMR90 Hi-C 24141950 UTP11L 266337 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 38958971 38959191 38959076 Y AKIRIN1 NA NA NA NA NA RRAGC 364304 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 39552835 39552967 39552907 Y MACF1 MACF1 NA NA NA NA MACF1 7847 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 39662647 39663006 39662738 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 117659 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 39874208 39874673 39874342 Y KIAA0754 KIAA0754 NA NA NA NA KIAA0754 57 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 40264988 40265120 40265045 Y NA NA HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIT1 82063 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chr1 40779203 40779606 40779400 Y NA SMAP2 NA NA NA NA SMAP2 28916 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 40851431 40851768 40851472 Y CAP1,RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2,SMAP2 SMAP2 NA NA NA NA SMAP2 42909 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 40860574 40860824 40860661 Y NFYC,NFYC,CAP1,PPT1,RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2,SMAP2 NA NA NA NA NA SMAP2 52052 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 41005233 41005440 41005262 Y RLF RP11-656D10.3,ZNF684 NA NA NA NA ZNF684 10000 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 41633074 41633562 41633301 Y SCMH1,SCMH1,SCMH1 NA NA NA NA NA SCMH1 72264 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 41825927 41826139 41826062 Y NA FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 333 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 41826642 41826952 41826745 Y NA FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 1048 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 41914594 41914877 41914736 Y HIVEP3,SCMH1,SCMH1 NA SCMH1,EDN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXO6 89000 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 41915297 41915638 41915514 Y HIVEP3 NA EDN2 MCF7 ChIA-PET 22265404 FOXO6 89703 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 42127851 42128791 42128091 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 302257 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 6.60519330384399 chr1 42774668 42774801 42774679 Y CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3 FOXJ3 NA NA NA NA FOXJ3 24747 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 42934748 42935131 42934805 Y CCDC30,RIMKLA PPCS,ZMYND12,CCDC30,TMSB4XP1 NA NA NA NA CCDC30 7747 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 43389220 43390772 43390027 Y NA SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 31758 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 43402778 43403133 43403049 Y ERMAP,SZT2 SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 19397 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 43426742 43427095 43427089 Y CLDN19,SLC2A1 SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 4212 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 43884019 43884040 43884030 Y ST3GAL3,MPL,SZT2 MED8,SZT2,HYI NA NA NA NA SZT2 30466 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 44150815 44151139 44150977 Y ST3GAL3,SLC6A9,IPO13 KDM4A,ST3GAL3 NA NA NA NA ST3GAL3 18356 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 44302297 44302456 44302338 Y NA NA NA NA NA NA RP11-7O11.3 107767 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr1 44331438 44331658 44331560 Y NA NA NA NA NA NA RP11-7O11.3 78565 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 44452990 44453115 44453039 Y NA RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9 NA NA NA NA CCDC24 1916 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 44495684 44496307 44495779 Y NA CCDC24,SLC6A9 B4GALT2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC6A9 545 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 44951424 44951733 44951502 Y TCTEX1D4,PLK3,BTBD19,SLC6A9,RNF220 NA NA NA NA NA RNF220 82558 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 46111666 46112048 46111975 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 3450 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 46528388 46528566 46528496 Y NA NA NA NA NA NA PIK3R3 111594 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 46573980 46574380 46574180 Y TSPAN1,PIK3R3,PIK3R3 NA NA NA NA NA PIK3R3 65780 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 47729037 47729382 47729210 Y NA TAL1,STIL TAL1 K562 ChIA-PET 22265404 TAL1 33145 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 48710829 48711034 48710934 Y NA NA NA NA NA NA SPATA6 224811 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr1 48935854 48936015 48935919 Y NA SPATA6 NA NA NA NA SPATA6 9 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 51056997 51057361 51057215 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 366574 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 51102056 51102361 51102067 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 321574 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 51261727 51261870 51261800 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 162065 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 51302197 51302583 51302391 Y FAF1 NA NA NA NA NA FAF1 121352 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 51809780 51810107 51809799 Y NA NA NA NA NA NA RNF11 109837 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 52173889 52173954 52173921 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL9 133038 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 52885344 52885737 52885540 Y ZCCHC11 ORC1,PRPF38A NA NA NA NA PRPF38A 17108 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 53168640 53169047 53168726 Y NA ZYG11B SELRC1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ZYG11B 21079 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 53702100 53702340 53702220 Y NA CPT2,C1orf123 NA NA NA NA MAGOH 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 54260217 54260562 54260390 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 93845 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 54286238 54286401 54286368 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 68006 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 54441729 54442008 54441915 Y NA HSPB11,LRRC42 NA NA NA NA LRRC42 31979 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 54700132 54700688 54700499 Y NA CYB5RL NA NA NA NA CYB5RL 36423 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 54804829 54805209 54805022 Y NA NA NA NA NA NA SSBP3 71943 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 54953784 54954325 54954090 Y SSBP3,SSBP3 NA TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP3 76632 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 58225769 58226165 58225967 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P15 293987 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 59369049 59370138 59369602 Y FGGY NA NA NA NA NA RP4-794H19.4 113921 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 59522982 59523218 59523118 Y NA RP4-794H19.4 FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-794H19.4 38923 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 59524373 59524568 59524471 Y NA RP4-794H19.4 FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-794H19.4 40314 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 60144543 60144796 60144669 Y FGGY NA NA NA NA NA FGGY 384233 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 61415107 61415301 61415257 Y NA NA NA NA NA NA NFIA 86176 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 61543611 61543877 61543752 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA NFIA 214680 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 61579491 61579639 61579512 Y NA NA NA NA NA NA NFIA 250560 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 61649786 61650305 61649984 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA NFIA 320855 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 61707460 61707670 61707565 Y NA NA NA NA NA NA NFIA 378529 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 62416847 62417238 62417043 Y INADL,USP1,KANK4 NA NA NA NA NA INADL 210698 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 62609116 62609459 62609128 Y NA NA NA NA NA NA USP1 290509 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 62928310 62928608 62928459 Y KANK4,USP1,USP1,ATG4C USP1 NA NA NA NA USP1 28342 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 63886654 63886800 63886727 Y NA NA NA NA NA NA ALG6 55393 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 65383044 65383557 65383225 Y JAK1 JAK1 NA NA NA NA JAK1 46630 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 65507944 65508037 65507991 Y NA RP4-535B20.1 NA NA NA NA RP4-535B20.1 23383 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 65639675 65639734 65639705 Y NA AK4 NA NA NA NA AK4 28443 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 65701792 65701883 65701838 Y NA DNAJC6 NA NA NA NA DNAJC6 10019 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 65891768 65892129 65891951 Y NA LEPR,LEPROT NA NA NA NA LEPROT 7498 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 66724458 66724790 66724562 Y PDE4B NA NA NA NA NA PDE4B 468261 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 66815726 66816360 66815919 Y PDE4B NA NA NA NA NA PDE4B 559529 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 66867932 66868143 66868076 Y NA NA PDE4B IMR90 Hi-C 24141950 WDR78 520427 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 66910997 66911424 66911351 Y MIER1,PDE4B NA PDE4B,SGIP1 IMR90 Hi-C 24141950 WDR78 477146 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 67460593 67460710 67460683 Y NA NA NA NA NA NA SLC35D1 57072 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 67494221 67494361 67494358 Y SLC35D1,MIER1 SLC35D1 NA NA NA NA SLC35D1 23421 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 67883059 67883215 67883204 Y NA SERBP1 NA NA NA NA SERBP1 10883 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 68234822 68235039 68234951 Y NA NA NA NA NA NA GNG12 62111 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 69786542 69786803 69786694 Y NA NA NA NA NA NA LRRC7 245278 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr1 70237887 70238124 70238005 Y LRRC7 NA NA NA NA NA LRRC7 205806 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 70418678 70418852 70418759 Y LRRC7 NA NA NA NA NA LRRC40 250451 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 70709017 70709466 70709138 Y NA LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4 NA NA NA NA RP4-677H15.4 24311 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 70746826 70747040 70746993 Y ANKRD13C NA NA NA NA NA RP4-677H15.4 62120 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 72073753 72074154 72073955 Y NA NA NA NA NA NA ZRANB2-AS2 528746 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 75043793 75044067 75043929 Y NA NA NA NA NA NA TYW3 152769 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 76581893 76581954 76581924 Y NA NA NA NA NA NA SNORD45A 330319 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 77595980 77596376 77595997 Y NA RP4-706A16.3 NA NA NA NA RP4-706A16.3 3212 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 77879256 77879430 77879369 Y NA NA NA NA NA NA AK5 133520 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 77891343 77891690 77891394 Y AK5,AK5,ZZZ3,FAM73A NA NA NA NA NA AK5 145607 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 78067790 78068312 78068066 Y NA NA NA NA NA NA ZZZ3 78792 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 78196845 78197195 78197020 Y NA ZZZ3,USP33,RP4-706L14.2,FAM73A NA NA NA NA USP33 26342 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 78214350 78214750 78214605 Y NA USP33,RP4-706L14.2,FAM73A NA NA NA NA USP33 8787 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 78240205 78240392 78240373 Y NA USP33,RP4-706L14.2,FAM73A USP33,ZZZ3,FAM73A IMR90 Hi-C 24141950 RP4-706L14.2 1656 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 78404062 78404594 78404354 Y NA FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA FUBP1 38200 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 78423142 78423521 78423473 Y NA FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA FUBP1 19273 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 78557346 78557710 78557476 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 114487 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 78957462 78957762 78957688 Y PTGFR NA NA NA NA NA IFI44 155719 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 79215772 79216132 79215819 Y NA NA NA NA NA NA IFI44 102291 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr1 84710038 84710507 84710127 Y NA NA NA NA NA NA RPF1 232435 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 85643319 85643587 85643547 Y NA NA MIR4423 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf52 79768 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 87171187 87171726 87171422 Y SH3GLB1 SH3GLB1 NA NA NA NA SH3GLB1 2928 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 87799623 87799998 87799801 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 7472 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 87800631 87801610 87800748 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 8480 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr1 89339924 89340210 89340169 Y PKN2 GTF2B NA NA NA NA GTF2B 15417 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 89382528 89382593 89382561 Y NA GTF2B NA NA NA NA GTF2B 26901 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 90101821 90102213 90101853 Y ZNF326,LRRC8D,GBP4,GBP5,LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C LRRC8C NA NA NA NA LRRC8C 5190 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 90190139 90190909 90190374 Y GBP5,LRRC8B,LRRC8C,ZNF326 NA NA NA NA NA LRRC8C 93508 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 90321378 90321621 90321467 Y LRRC8C,ZNF326 LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 36805 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 91472225 91472812 91472773 Y NA ZNF644 NA NA NA NA ZNF644 13017 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 92037669 92037899 92037765 Y NA NA TGFBR3,HSP90B3P,EPHX4,CDC7 IMR90 Hi-C 24141950 CDC7 73261 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr1 92183243 92183457 92183382 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR3 186435 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 92218581 92218971 92218958 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR3 150921 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 92725087 92725311 92725273 Y RPAP2,GLMN RPAP2,GLMN NA NA NA NA RPAP2 37211 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 93003662 93004045 93003868 Y RPAP2,GLMN,RPL5,GFI1 NA NA NA NA NA GFI1 53229 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.68643233289634 chr1 93427945 93428408 93428079 Y MTF2,DR1,FAM69A FAM69A NA NA NA NA FAM69A 2888 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 93634565 93634982 93634927 Y MTF2 CCDC18,TMED5 NA NA NA NA CCDC18 8494 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 93669062 93669462 93669176 Y NA CCDC18,TMED5 NA NA NA NA TMED5 24777 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 93806739 93807078 93807070 Y NA DR1 NA NA NA NA DR1 2367 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 94007993 94008357 94008092 Y FNBP1L,BCAR3 NA NA NA NA NA FNBP1L 96305 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 94021310 94021626 94021469 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 109622 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 94023703 94024059 94023930 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 112015 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 94145547 94146118 94145739 Y NA NA NA NA NA NA MIR760 164270 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 94158127 94158185 94158167 Y GCLM,DNTTIP2 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR760 152203 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 94158601 94159338 94158654 Y GCLM,DNTTIP2,BCAR3 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR760 151050 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.96750438837906 chr1 94168203 94168325 94168229 Y NA NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR760 142063 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 94189333 94189558 94189472 Y FNBP1L NA BCAR3,MIR760 IMR90 Hi-C 24141950 MIR760 120830 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 94216472 94216879 94216807 Y NA NA BCAR3,MIR760,FNBP1L IMR90 Hi-C 24141950 MIR760 93509 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chr1 94557832 94558157 94557998 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP29 180467 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr1 94891778 94892070 94891849 Y NA ABCD3 NA NA NA NA ABCD3 9845 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 94996582 94996830 94996792 Y NA NA NA NA NA NA ABCD3 114649 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 95221261 95221551 95221307 Y NA NA F3,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 ALG14 314950 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 95264854 95265185 95265083 Y F3 NA F3,ABCD3,ABCA4,CNN3,LOC729970,ALG14,SLC44A3 IMR90 Hi-C 24141950 ALG14 271316 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 98011760 98012364 98012119 Y NA SEC63P1 NA NA NA NA SEC63P1 2503 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 98070725 98071007 98070866 Y NA NA NA NA NA NA SEC63P1 61468 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 100858865 100858991 100858930 Y SLC35A3,HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 50281 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 101469727 101469819 101469773 Y NA RP11-421L21.3,DPH5 NA NA NA NA RP11-421L21.3 19615 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 101577594 101578108 101577808 Y SLC30A7,SLC30A7,S1PR1 NA SLC30A7,EXTL2 IMR90 Hi-C 24141950 DPH5 87950 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 101853882 101854194 101853980 Y NA NA NA NA NA NA S1PR1 153438 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 101875946 101876333 101876212 Y NA NA NA NA NA NA S1PR1 175502 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr1 104641680 104641698 104641690 Y NA NA NA NA NA NA RNPC3 575367 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 108439709 108440134 108439910 Y VAV3 NA NA NA NA NA VAV3-AS1 64931 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 108485606 108485639 108485621 Y NA VAV3-AS1,VAV3 NA NA NA NA VAV3-AS1 19426 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 109079557 109079899 109079743 Y NA FAM102B NA NA NA NA FAM102B 20812 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 109127044 109127234 109127073 Y STXBP3,PRPF38B,FAM102B FAM102B NA NA NA NA FAM102B 26333 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 109246671 109246905 109246843 Y FAM102B,TMEM167B,PRPF38B HENMT1,PRPF38B,STXBP3 NA NA NA NA PRPF38B 13726 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 109467804 109468470 109468110 Y GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1 AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 35636 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 109515208 109515609 109515409 Y NA AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA CLCC1 11097 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 109677264 109677321 109677293 Y NA TMEM167B,SCARNA2 NA NA NA NA SCARNA2 36449 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 109913179 109913623 109913457 Y SORT1 SORT1 NA NA NA NA SORT1 24950 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 110320163 110320291 110320225 Y NA NA CSF1,AHCYL1,CYB561D1,ATXN7L2,GPR61,GNAI3,AMIGO1,AMPD2,GNAT2,GSTM4,GSTM5,EPS8L3,FAM40A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GSTM1 91727 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 110927812 110928210 110927883 Y CD53,FAM40A,RBM15 RBM15,LAMTOR5-AS1 NA NA NA NA LAMTOR5-AS1 4371 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 111251861 111252073 111251987 Y LRIF1,CD53 NA NA NA NA NA CD53 161702 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 111329904 111330079 111330010 Y KCNA2 NA KCNA2 IMR90 Hi-C 24141950 CD53 83696 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 111417921 111418422 111417947 Y NA CD53 NA NA NA NA CD53 4146 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 112013331 112014031 112013881 Y C1orf183,C1orf183,RAP1A,C1orf162 ATP5F1,WDR77 NA NA NA NA WDR77 23333 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 112058803 112059167 112059005 Y C1orf183,C1orf183,RAP1A,C1orf162,ADORA3 RAP1A NA NA NA NA RAP1A 23673 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 113675675 113676049 113675887 Y NA RP11-389O22.4 NA NA NA NA RP11-389O22.4 33567 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 113949729 113949849 113949733 Y NA MAGI3,RP11-512F24.1 NA NA NA NA MAGI3 18358 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 114244987 114245321 114245197 Y NA NA NA NA NA NA PHTF1 54790 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 115052481 115052766 115052572 Y BCAS2,TRIM33 TRIM33 NA NA NA NA TRIM33 700 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 115055314 115055514 115055414 Y NA TRIM33 NA NA NA NA TRIM33 3533 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 115296637 115296935 115296808 Y NA NRAS,CSDE1,SIKE1 NA NA NA NA CSDE1 2362 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 115920870 115920887 115920879 Y NA NA NGF IMR90 Hi-C 24141950 RP4-666F24.3 280577 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 117051576 117051921 117051802 Y CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58 NA NA NA NA NA CD58 59740 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 117359174 117359463 117359379 Y TTF2,CD2 NA NA NA NA NA IGSF3 150799 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 119668351 119668628 119668490 Y WARS2 RP11-418J17.1,WARS2 NA NA NA NA RP11-418J17.1 12391 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 120255895 120256325 120256050 Y ADAM30 NA NA NA NA NA PHGDH 55474 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 144941125 144941602 144941408 Y NA NA NA NA NA NA NBPF9 131381 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 145009158 145009716 145009503 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 64470 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 145023690 145024549 145024240 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP PDE4DIP NA NA NA NA PDE4DIP 49637 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 145090155 145090603 145090483 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP PDE4DIP,SEC22B NBPF9,LOC653513,PDE4DIP,NOTCH2NL,SEC22B,LOC728875,NBPF10 IMR90 Hi-C 24141950 SEC22B 3617 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 145106553 145106772 145106662 Y NA PDE4DIP,SEC22B NA NA NA NA SEC22B 12333 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNVU1-6 16003 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 145435103 145435641 145435221 Y CD160,TXNIP,ANKRD34A TXNIP,POLR3GL,LIX1L NA NA NA NA TXNIP 828 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr1 145437595 145437817 145437681 Y CD160,TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A TXNIP,POLR3GL,LIX1L NA NA NA NA TXNIP 1126 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 147010961 147011177 147011069 Y NA BCL9 ACP6 IMR90 Hi-C 24141950 BCL9 5 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 147011538 147012039 147011713 Y NA BCL9 ACP6 IMR90 Hi-C 24141950 BCL9 356 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 147080043 147080251 147080097 Y PRKAB2,CHD1L,BCL9 NA NA NA NA NA ACP6 60367 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr1 147806841 147807184 147807140 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 1955 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 4.21608083224084 chr1 149816287 149817606 149817166 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 3037 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 149820361 149820952 149820609 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 150135231 150135764 150135536 Y PRPF3,MCL1,PLEKHO1 PLEKHO1 NA NA NA NA PLEKHO1 15858 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 150185878 150186128 150186012 Y HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E ANP32E,RNU2-17P NA NA NA NA ANP32E 20376 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 150539630 150541082 150540777 Y NA MCL1 NA NA NA NA MCL1 8984 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 150577042 150577503 150577391 Y CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 22585 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 151172142 151172526 151172243 Y FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4 TNFAIP8L2,SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 3717 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 151172620 151173197 151172669 Y TMOD4 TNFAIP8L2,SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 4195 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 153095466 153095607 153095484 Y NA NA NA NA NA NA S100A6 411113 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 153845025 153845089 153845058 Y NA GATAD2B NA NA NA NA GATAD2B 48362 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 153853385 153853782 153853590 Y NA GATAD2B NA NA NA NA GATAD2B 39669 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 153936554 153936861 153936642 Y UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4 GATAD2B,DENND4B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9 NA NA NA NA CREB3L4 1149 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 154299137 154299452 154299353 Y UBAP2L,ATP8B2,IL6R ATP8B2 NA NA NA NA ATP8B2 3108 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 154577703 154577929 154577737 Y NA UBE2Q1,ADAR NA NA NA NA ADAR 20546 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 154731745 154732111 154731910 Y IL6R,ADAR NA NA NA NA NA KCNN3 108645 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 154910155 154910399 154910216 Y ADAR,PBXIP1,MTX1 PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1 NA NA NA NA PMVK 2688 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 154914634 154915296 154915191 Y RUSC1-AS1,RUSC1,RUSC1,CLK2,ADAR,KCNN3,KCNN3,PMVK PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1 NA NA NA NA PMVK 7167 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 154957258 154957622 154957425 Y NA PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B NA NA NA NA FLAD1 3444 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 154972628 154972915 154972668 Y CLK2,DPM3,DPM3,PYGO2,FLAD1 PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 212 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 154973036 154973200 154973120 Y CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1 PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 155052148 155052357 155052334 Y NA ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1 NA NA NA NA EFNA3 17924 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 155066604 155066635 155066620 Y NA ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3 DPM3,KRTCAP2,EFNA1,TRIM46,SLC50A1 IMR90 Hi-C 24141950 EFNA1 31301 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 155164183 155164959 155164537 Y NA KRTCAP2,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA NA NA NA NA MIR92B 1215 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 155443130 155443303 155443253 Y NA NA NA NA NA NA ASH1L 87295 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 155904830 155905033 155904931 Y NA RIT1,KIAA0907 NA NA NA NA KIAA0907 2639 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 155945743 155946196 155946108 Y C1orf182,ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2 KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 RXFP4,KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 28665 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 155946363 155946660 155946476 Y ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2 KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 RXFP4,KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 28201 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr1 156251648 156251762 156251690 Y RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44 BGLAP,SMG5,TMEM79,C1orf85 NA NA NA NA TMEM79 922 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 156426931 156427503 156427197 Y ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 41117 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 156461502 156461819 156461755 Y MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6801 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 156474686 156475018 156474923 Y SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6066 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr1 156494222 156494678 156494359 Y RRNAD1,MEF2D MEF2D,IQGAP3 NA NA NA NA MEF2D 25602 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 158370656 158370973 158370778 Y CD1B,CD1E,OR6N1,OR6K3,OR10T2,OR10K1 NA NA NA NA NA KIRREL 409593 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 158982200 158982857 158982480 Y AIM2,PYHIN1,IFI16 IFI16 NA NA NA NA IFI16 14442 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 159886226 159886307 159886250 Y NA CCDC19,TAGLN2 NA NA NA NA TAGLN2 7215 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 160202735 160202981 160202855 Y SLAMF6,CD48,FCRL6,DCAF8 PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8 NA NA NA NA RP11-574F21.2 26553 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 160537909 160538272 160538136 Y ATP1A4,CD48,SLAMF6,CD84 CD84 NA NA NA NA CD84 9034 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 160641547 160642117 160641798 Y NA SLAMF1,CD48 NA NA NA NA SLAMF1 26462 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 160674845 160675222 160675181 Y SLAMF7,CD244,ARHGAP30,CD48 CD48 NA NA NA NA CD48 4419 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 160680120 160680523 160680299 Y NA CD48 NA NA NA NA CD48 479 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 160807359 160807588 160807459 Y SLAMF6,CD48,USF1,CD244,ARHGAP30,LY9 LY9 NA NA NA NA LY9 43495 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 160881277 160881698 160881498 Y NA RP11-312J18.5 CD244,ITLN1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-312J18.5 18507 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 161002043 161002401 161002222 Y NA F11R,TSTD1,USF1,ARHGAP30 NA NA NA NA TSTD1 4379 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 161037907 161038726 161038256 Y FCGR3A,FCGR3A,CD48,CD244,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30 F11R,TSTD1,USF1,ARHGAP30,KLHDC9,NIT1,PFDN2 NA NA NA NA ARHGAP30 147 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 161320542 161320880 161320598 Y FCRLB,ATF6,CD244,FCER1G SDHC NA NA NA NA SDHC 38495 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 161348767 161349231 161349047 Y NDUFS2 NA NA NA NA NA SDHC 66720 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 161359666 161360218 161359899 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 77619 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr1 161369073 161369991 161369486 Y NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 87026 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.8269683606377 chr1 161500608 161500899 161500816 Y USF1,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A,ATF6,HSPA6,FCGR3B,FCGR3A,FCGR3A FCGR2A NA NA NA NA FCGR2A 27388 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 162709795 162709973 162709884 Y NOS1AP,DDR2 NA NA NA NA NA UAP1 180472 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 162967342 162967569 162967443 Y RGS4,RGS4,RGS4,RGS4 NA RGS4,C1orf110,RGS5 IMR90 Hi-C 24141950 NUF2 266797 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 164340132 164340494 164340313 Y NA HMGB3P6 NA NA NA NA HMGB3P6 16128 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 165797615 165798367 165798308 Y UCK2 UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 2623 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr1 165823413 165823808 165823568 Y NA UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 28421 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 166828089 166828463 166828188 Y POU2F1,POGK POGK,TADA1 NA NA NA NA TADA1 15101 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 166954369 166954473 166954424 Y ILDR2,MAEL ILDR2 ILDR2,GPA33 IMR90 Hi-C 24141950 ILDR2 11650 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 167191021 167191933 167191618 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 2955 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 167192959 167193266 167193111 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 4893 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 167313306 167313474 167313390 Y MAEL,POU2F1 NA NA NA NA NA POU2F1 125240 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 167586596 167587245 167587123 Y POU2F1,POU2F1,CD247,RCSD1 RCSD1 RCSD1 IMR90 Hi-C 24141950 RCSD1 10085 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 3.93500877675812 chr1 167602083 167602470 167602201 Y POU2F1,POU2F1,CD247,RCSD1 RCSD1 NA NA NA NA RCSD1 4753 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr1 167615681 167615774 167615728 Y NA RCSD1 NA NA NA NA RCSD1 18351 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 167683554 167683813 167683605 Y POU2F1,CREG1 MPZL1 NA NA NA NA MPZL1 4616 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 167722412 167722527 167722511 Y NA MPZL1 NA NA NA NA MPZL1 33983 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 167772811 167773182 167772825 Y CREG1 RP1-313L4.4 NA NA NA NA RP1-313L4.4 14304 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 170042588 170042670 170042627 Y C1orf112 KIFAP3 NA NA NA NA KIFAP3 9679 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 172150201 172150456 172150219 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 260774 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 172631926 172632270 172632095 Y C1orf9,C1orf9,FASLG NA NA NA NA NA PIGC 220696 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 172978915 172979201 172979058 Y NA NA NA NA NA NA PRDX6 465204 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 173382392 173382663 173382522 Y NA NA NA NA NA NA PRDX6 61742 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 173384654 173384941 173384742 Y NA NA NA NA NA NA PRDX6 59464 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 4.77822494320629 chr1 173447359 173447668 173447399 Y PRDX6 PRDX6 NA NA NA NA PRDX6 2954 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 173909740 173909938 173909924 Y RC3H1,ZBTB37 NA NA NA NA NA GAS5 73720 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 174122877 174123205 174123041 Y NA RABGAP1L NA NA NA NA RABGAP1L 3343 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 174220636 174220943 174220783 Y RABGAP1L NA NA NA NA NA RABGAP1L 94088 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 174375242 174375457 174375350 Y NA NA NA NA NA NA RABGAP1L 248694 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 174788416 174788807 174788447 Y NA NA NA NA NA NA CACYBP 177493 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 174937322 174937525 174937409 Y KIAA0040,KIAA0040 CACYBP NA NA NA NA CACYBP 28775 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 175145439 175145838 175145619 Y KIAA0040,KIAA0040 KIAA0040 NA NA NA NA KIAA0040 14297 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 175158150 175158288 175158209 Y KIAA0040,KIAA0040 KIAA0040 NA NA NA NA KIAA0040 1847 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 179279883 179280253 179280030 Y AXDND1,TOR3A,ABL2,SOAT1 SOAT1 NA NA NA NA SOAT1 18958 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 180237101 180237317 180237140 Y NA NA NA NA NA NA QSOX1 115132 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 180508329 180508738 180508530 Y NA ACBD6 MR1,XPR1,KIAA1614 IMR90 Hi-C 24141950 ACBD6 38240 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 180727103 180727211 180727157 Y NA NA NA NA NA NA XPR1 127963 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 181056649 181057124 181056887 Y STX6,MR1,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 1011 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 181104473 181105818 181105427 Y STX6,MR1,IER5 IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48835 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 181130674 181130808 181130711 Y STX6,MR1,IER5 NA STX6,KIAA1614,MR1,XPR1,ACBD6,IER5 IMR90 Hi-C 24141950 IER5 75036 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 181459512 181459699 181459606 Y NA NA NA NA NA NA IER5 403874 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 181998739 181999134 181998891 Y GLUL,GLUL NA ZNF648 MCF7 ChIA-PET 22265404 GLUL 360207 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr1 182538682 182538808 182538746 Y NA RNASEL,RGS16 NA NA NA NA RNASEL 17583 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 182580570 182580950 182580946 Y NA RNASEL,RGS16 NA NA NA NA RGS16 9027 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 182682922 182683008 182682965 Y DHX9 NA RGS8,RNASEL IMR90 Hi-C 24141950 NPL 73420 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 182998797 182999044 182998924 Y NA LAMC1 NA NA NA NA LAMC1 8202 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 183178797 183178927 183178861 Y NA NA NA NA NA NA LAMC1 188202 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 183549376 183549721 183549479 Y NCF2,NCF2,ARPC5 NA NA NA NA NA ARPC5 53171 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 183811794 183811833 183811814 Y NCF2,NCF2 NA NA NA NA NA TSEN15 206978 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 184005350 184005919 184005662 Y RGL1,GLT25D2 TSEN15 RGL1 IMR90 Hi-C 24141950 TSEN15 12892 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 184033703 184034036 184033838 Y NA TSEN15 NA NA NA NA TSEN15 14892 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr1 185250433 185250655 185250484 Y HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP IVNS1ABP NA NA NA NA IVNS1ABP 33806 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 185796352 185796554 185796468 Y HMCN1 NA NA NA NA NA IVNS1ABP 511891 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 192216449 192216576 192216513 Y NA NA NA NA NA NA RGS1 326281 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 192507991 192508486 192508241 Y NA RGS1 UCHL5,RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 RGS1 34371 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 192542752 192542937 192542856 Y RGS1 NA NA NA NA NA RGS1 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 192583467 192583478 192583473 Y RGS1 RGS1 UCHL5 IMR90 Hi-C 24141950 RGS1 40610 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 192597587 192597787 192597711 Y RGS1,RGS13 NA NA NA NA NA RGS1 54730 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 192924608 192924823 192924716 Y NA NA RGS2 IMR90 Hi-C 24141950 RN7SKP126 81493 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 198128112 198128944 198128293 Y PTPRC,DENND1B NEK7 NA NA NA NA NEK7 4019 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 198590109 198590618 198590184 Y NEK7,PTPRC RP11-553K8.2,PTPRC NA NA NA NA PTPRC 15183 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr1 198633275 198633927 198633600 Y PTPRC PTPRC NA NA NA NA PTPRC 27474 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 198648160 198648499 198648177 Y PTPRC PTPRC NA NA NA NA PTPRC 42359 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 198650930 198651643 198651116 Y PTPRC PTPRC NA NA NA NA PTPRC 45129 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.54589630515498 chr1 198845240 198845523 198845521 Y NA NA NA NA NA NA RP11-16L9.3 142643 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr1 198850238 198850638 198850585 Y PTPRC NA NA NA NA NA RP11-16L9.3 137528 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 198884632 198885024 198884962 Y NA NA NA NA NA NA RP11-16L9.3 103142 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 198893258 198893473 198893399 Y PTPRC NA NA NA NA NA RP11-16L9.3 94693 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 198894891 198894966 198894922 Y NA NA NA NA NA NA RP11-16L9.3 93200 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 198898987 198899513 198899179 Y PTPRC NA NA NA NA NA RP11-16L9.3 88653 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 198901469 198901869 198901786 Y PTPRC NA NA NA NA NA RP11-16L9.3 86297 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 198903935 198904934 198904858 Y PTPRC NA NA NA NA NA RP11-16L9.3 83232 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 198979759 198979985 198979807 Y NA RP11-16L9.3 NA NA NA NA RP11-16L9.3 8181 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 3.09179261030995 chr1 198989111 198989545 198989378 Y NA RP11-16L9.3 NA NA NA NA RP11-16L9.3 945 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr1 198990965 198991222 198991166 Y NA RP11-16L9.3 NA NA NA NA RP11-16L9.3 2799 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 199151722 199151828 199151775 Y NA NA LOC100131234 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-16L9.3 163556 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 201449602 201449822 201449716 Y LAD1 PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 PHLDA3 IMR90 Hi-C 24141950 PHLDA3 13237 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 201508517 201509575 201509484 Y NA RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA CSRP1 31933 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 202216987 202217221 202217073 Y UBE2T NA NA NA NA NA LGR6 55958 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 202217450 202217807 202217629 Y NA NA NA NA NA NA LGR6 56421 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr1 202737599 202737762 202737681 Y NA RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6 NA NA NA NA RP11-480I12.2 3053 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 202872285 202872308 202872297 Y NA RP11-480I12.5,RABIF,HNRNPA1P59,KLHL12 RABIF MCF7 ChIA-PET 22265404 HNRNPA1P59 6632 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 203101073 203101246 203101163 Y NA ADORA1,MYBPH NA NA NA NA MYBPH 41695 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.40536027741361 chr1 203247590 203248072 203247769 Y BTG2 LINC01136,BTG2 NA NA NA NA LINC01136 24365 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 203258547 203259334 203258830 Y RABIF,KLHL12,BTG2 LINC01136,BTG2 NA NA NA NA LINC01136 13103 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr1 203259429 203259985 203259729 Y RABIF,KLHL12,ADIPOR1,ADIPOR1,BTG2 LINC01136,BTG2 NA NA NA NA LINC01136 12452 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 203289937 203290406 203290261 Y BTG2 LINC01136,BTG2 NA NA NA NA BTG2 17318 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr1 203293246 203293605 203293363 Y ZBED6,TMEM183A,TMEM183B,BTG2 LINC01136,BTG2 NA NA NA NA BTG2 20627 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 203294160 203294623 203294393 Y RABIF,KLHL12,BTG2 LINC01136,BTG2 NA NA NA NA BTG2 21541 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 203294985 203295146 203295066 Y NA LINC01136,BTG2 NA NA NA NA BTG2 22366 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 203296328 203297068 203296686 Y LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2 LINC01136,BTG2 NA NA NA NA BTG2 23709 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 204254999 204255106 204255048 Y PIK3C2B,PLEKHA6 NA NA NA NA NA PPP1R15B 123813 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 204386444 204387188 204386898 Y PPP1R15B PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 7525 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 204449745 204450007 204449876 Y NA PIK3C2B,MDM4 NA NA NA NA PIK3C2B 11845 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr1 204675739 204675945 204675909 Y NA NA LRRN2,NFASC K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MDM4 192228 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 204684045 204684323 204684297 Y NA NA NFASC,LRRN2 IMR90 Hi-C 24141950 MDM4 200534 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr1 205253892 205254222 205253971 Y NUAK2 NA NA NA NA NA TMCC2 58588 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 205257253 205257766 205257562 Y RAB7L1,RBBP5,NUAK2,DSTYK NA NA NA NA NA SNRPGP10 60609 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 205410224 205410578 205410325 Y DSTYK,TMCC2 NA NA NA NA NA CDK18 61145 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 205709805 205710150 205710085 Y NA NUCKS1,RAB7L1 NA NA NA NA NUCKS1 7254 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 206640538 206640724 206640631 Y NA IKBKE NA NA NA NA IKBKE 1067 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 206832398 206832801 206832527 Y DYRK3 EIF2D,DYRK3,MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 23488 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr1 206859136 206859493 206859328 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 2847 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 206859748 206860259 206859963 Y IKBKE,RASSF5,FAIM3,FAIM3,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 3459 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 206890641 206891001 206890773 Y NA MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 34352 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 206897147 206897463 206897235 Y RASSF5,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 40858 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 206910483 206910789 206910591 Y RASSF5,FAIM3,FAIM3,MAPKAPK2 NA NA NA NA NA MAPKAPK2 54194 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 206921953 206922243 206922101 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2 NA NA NA NA NA MAPKAPK2 65664 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 207551040 207551052 207551045 Y NA NA NA NA NA NA CD55 58187 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 208412497 208412696 208412591 Y PLXNA2 NA NA NA NA NA C1orf132 372002 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 210425971 210426288 210426079 Y NA NA NA NA NA NA HHAT 73308 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 211035320 211035533 211035504 Y NA NA NA NA NA NA RP11-543B16.1 309286 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 211349385 211349483 211349480 Y NA RP11-543B16.1 HHAT IMR90 Hi-C 24141950 RP11-543B16.1 4566 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 211500826 211501119 211501083 Y TRAF5,TRAF5 TRAF5 NA NA NA NA TRAF5 2869 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 212256975 212257253 212257095 Y DTL,INTS7 RPL21P28 NA NA NA NA RPL21P28 33604 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 212429433 212429795 212429457 Y LPGAT1,PPP2R5A,ATF3,PPP2R5A PPP2R5A DTL IMR90 Hi-C 24141950 PPP2R5A 27084 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 212458080 212458253 212458113 Y INTS7,PPP2R5A,PPP2R5A PPP2R5A,RP11-384C4.3 NA NA NA NA PPP2R5A 1201 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 212731490 212732709 212732386 Y NA ATF3 ATF3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ATF3 3967 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr1 212923712 212923837 212923822 Y NA NSL1,TATDN3 NA NA NA NA NSL1 39287 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 213160414 213160619 213160568 Y VASH2 VASH2,ANGEL2 NA NA NA NA ANGEL2 26549 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 213500745 213500914 213500832 Y RPS6KC1 NA PROX1 IMR90 Hi-C 24141950 RPS6KC1 278156 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 214601098 214601566 214601506 Y PTPN14 NA NA NA NA NA SMYD2 148653 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 215198285 215198630 215198297 Y KCNK2,KCNK2 NA NA NA NA NA GAPDHP24 156208 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 218647012 218647232 218647162 Y NA NA TGFB2,LOC728463,RRP15 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RRP15 190383 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 221899063 221899285 221899220 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 14233 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 221983045 221983456 221983167 Y DUSP10,DUSP10 NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 69527 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 222638782 222639204 222638963 Y NA NA DUSP10,MIA3,AIDA,BROX IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-378J18.3 121963 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 222767372 222767396 222767384 Y NA RP11-378J18.3,TAF1A,MIA3 NA NA NA NA TAF1A 6097 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 222828361 222828786 222828451 Y TLR5 MIA3 NA NA NA NA MIA3 38933 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 224025511 224025803 224025713 Y NA TP53BP2 NA NA NA NA TP53BP2 5871 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 3.23232863805131 chr1 224633276 224633598 224633406 Y NA WDR26 WDR26,FBXO28,CNIH4 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 10541 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 225654906 225655584 225655524 Y TMEM63A,LBR,LBR LBR NA NA NA NA LBR 40279 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr1 226007337 226007385 226007361 Y NA SRP9,EPHX1 NA NA NA NA EPHX1 11543 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 226084943 226085104 226084975 Y LBR,H3F3A,C1orf55,TMEM63A TMEM63A,LEFTY1,PYCR2 TMEM63A,LEFTY1,PYCR2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 LEFTY1 11978 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 226163769 226163979 226163848 Y NA NA NA NA NA NA PYCR2 53791 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 226190534 226190731 226190643 Y H3F3A,C1orf55 NA NA NA NA NA H3F3A 56821 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 226297611 226298113 226297674 Y NA NA ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H3F3A 50059 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 226435130 226435332 226435236 Y PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A NA NA NA NA NA LIN9 60238 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 226864749 226865297 226865095 Y ITPKB ITPKB-IT1 NA NA NA NA ITPKB-IT1 3981 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 226867580 226868182 226867972 Y ITPKB ITPKB-IT1 NA NA NA NA ITPKB-IT1 6812 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 226890865 226891416 226891300 Y ITPKB ITPKB-IT1,ITPKB NA NA NA NA ITPKB-IT1 30097 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr1 227499470 227499818 227499796 Y NA CDC42BPA NA NA NA NA CDC42BPA 4357 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 228782602 228782886 228782775 Y NA NA NA NA NA NA RNF187 109840 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr1 228783266 228783899 228783495 Y C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU NA NA NA NA NA RNF187 110504 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 228973832 228974198 228974019 Y RHOU NA RHOU,RAB4A IMR90 Hi-C 24141950 RNF187 301070 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 230212552 230213069 230212856 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 21016 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 230220164 230220401 230220223 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 28628 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 230240540 230240902 230240735 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 49004 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 230248068 230248475 230248108 Y NA NA NA NA NA NA GALNT2 56532 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr1 230282048 230282189 230282138 Y NA NA NA NA NA NA GALNT2 90512 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 230407650 230408034 230407910 Y NA NA NA NA NA NA GALNT2 216114 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 230561990 230562633 230562303 Y NA NA NA NA NA NA COG2 213602 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr1 230563874 230563977 230563915 Y NA NA NA NA NA NA COG2 212258 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 230889321 230889962 230889601 Y NA NA NA NA NA NA COG2 113086 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 231038131 231038454 231038293 Y COG2,TTC13,GNPAT,C1orf131 C1orf198 NA NA NA NA C1orf198 34796 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 231083969 231084208 231084171 Y NA TTC13,ARV1 NA NA NA NA TTC13 28413 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 231428201 231428315 231428258 Y NA EXOC8 NA NA NA NA EXOC8 43283 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 231564657 231564985 231564821 Y NA EGLN1 NA NA NA NA EGLN1 5867 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 231665787 231666093 231665981 Y EXOC8,C1orf124,TSNAX RP11-295G20.2,TSNAX NA NA NA NA TSNAX 3388 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 231913853 231914038 231913997 Y NA NA NA NA NA NA DISC1 153292 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 232726496 232726761 232726608 Y SIPA1L2 NA TSNAX-DISC1,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 239172 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 232735038 232735290 232735230 Y NA NA TSNAX-DISC1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 230643 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 199806 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr1 234001133 234001179 234001156 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827C21.1 489708 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 234450953 234451201 234451130 Y IRF2BP2 RP5-827C21.1 NA NA NA NA RP5-827C21.1 39686 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 234548581 234548830 234548706 Y NA RP5-827C21.4 NA NA NA NA RP5-827C21.4 41242 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 234658291 234658851 234658374 Y NA TARBP1 NA NA NA NA TARBP1 45442 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr1 234659231 234659760 234659519 Y IRF2BP2 TARBP1 NA NA NA NA TARBP1 46382 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 234738546 234738834 234738624 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4437 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 234746093 234747674 234747395 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 2822 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 234748100 234748931 234748566 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4829 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr1 234908151 234908764 234908277 Y IRF2BP2 NA IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRF2BP2 164880 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr1 235096560 235096855 235096619 Y ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 17696 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 235114050 235115068 235114636 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 235668656 235669018 235668830 Y RBM34,ARID4B,ARID4B B3GALNT2 NA NA NA NA B3GALNT2 2875 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 236323296 236323699 236323519 Y LYST,GPR137B,LGALS8 GPR137B NA NA NA NA GPR137B 19464 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 236430059 236430250 236430155 Y NA ERO1LB NA NA NA NA ERO1LB 13069 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 236431064 236431243 236431072 Y LGALS8,ERO1LB ERO1LB NA NA NA NA ERO1LB 12076 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 236447659 236448000 236447830 Y NA ERO1LB NA NA NA NA ERO1LB 4340 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 237634251 237634535 237634324 Y NA NA NA NA NA NA RPL35P1 491614 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 240306890 240307603 240307416 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23852 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 240308546 240308862 240308776 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22593 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 241714901 241715765 241715555 Y KMO FH,KMO NA NA NA NA KMO 21467 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 241771916 241772216 241772151 Y KMO NA NA NA NA NA OPN3 66462 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 241781298 241781471 241781421 Y NA NA NA NA NA NA OPN3 57207 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 241790752 241791037 241791008 Y NA OPN3 NA NA NA NA OPN3 47641 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 243428005 243428394 243428166 Y CEP170,SDCCAG8 CEP170,SDCCAG8 NA NA NA NA SDCCAG8 10685 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 243451071 243451374 243451087 Y CEP170,SDCCAG8 CEP170,SDCCAG8 NA NA NA NA SDCCAG8 33751 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 244210956 244211944 244211575 Y NA NA NA NA NA NA ADSS 401492 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 244212276 244213430 244213047 Y NA NA NA NA NA NA ADSS 400006 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 244215508 244215901 244215527 Y AKT3,ZNF238,ZNF238 NA NA NA NA NA ADSS 397535 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 244466323 244466598 244466461 Y NA NA AKT3,SDCCAG8,LOC339529,C1orf100,ADSS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ADSS 146838 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 244613820 244614139 244614120 Y NA ADSS NA NA NA NA ADSS 384 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 245544255 245544624 245544440 Y NA NA NA NA NA NA EFCAB2 413248 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 246042512 246042669 246042578 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 625945 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 246061196 246061440 246061372 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 607174 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 246086594 246086610 246086602 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 582004 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 246436053 246436378 246436216 Y SMYD3,SMYD3 NA NA NA NA NA SMYD3 232236 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 246588477 246588670 246588563 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 79944 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 246751015 246751281 246751184 Y NA TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 23269 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 246862505 246862699 246862612 Y SCCPDH SCCPDH NA NA NA NA SCCPDH 22650 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr1 247035132 247035504 247035470 Y CNST,ZNF669,AHCTF1 NA NA NA NA NA AHCTF1 57776 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr1 247093396 247093478 247093437 Y NA AHCTF1 NA NA NA NA AHCTF1 116 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 247295865 247296225 247296038 Y ZNF695,ZNF670,ZNF669 ZNF669 NA NA NA NA ZNF669 30191 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 247326566 247327229 247326989 Y NA MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 36133 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr1 249117788 249118228 249118121 Y SH3BP5L MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692 NA NA NA NA MIR3124 348 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 307117 307186 307176 Y NA NA NA NA NA NA ZMYND11 128712 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.40536027741361 chr10 354662 355000 354689 Y NA NA NA NA NA NA ZMYND11 176257 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 587865 588161 588097 Y NA NA NA NA NA NA RP11-809C18.3 84417 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 897995 898234 898074 Y NA NA NA NA NA NA LARP4B 77330 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 1351911 1352187 1351989 Y NA NA NA NA NA NA ADARB2-AS1 214645 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 1531414 1531624 1531519 Y NA ADARB2-AS1 NA NA NA NA ADARB2-AS1 35208 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chr10 1698787 1699160 1698974 Y NA NA NA NA NA NA ADARB2 78510 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 3497590 3497951 3497729 Y NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 PITRM1 284587 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 3524547 3524820 3524727 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 300653 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 3526849 3527147 3526890 Y NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 298326 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 3889000 3889222 3889111 Y NA NA KLF6,LOC100216001,LOC338588 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF6 63527 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 4173688 4174411 4173937 Y KLF6 NA KLF6 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLF6 348215 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 4967017 4967162 4967090 Y NA NA NA NA NA NA ASB13 739396 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 5359534 5359986 5359835 Y GDI2 NA NA NA NA NA ASB13 346572 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 5504427 5504665 5504478 Y NA NA NA NA NA NA ASB13 201893 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 5883027 5883237 5883157 Y NA GDI2,FBXO18,ANKRD16 NA NA NA NA GDI2 932 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 6074786 6074988 6074887 Y IL15RA,PFKFB3,PFKFB3,RBM17,RBM17,IL2RA NA NA NA NA NA RBM17 53962 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 6110274 6110558 6110524 Y GDI2,IL15RA,PFKFB3,PFKFB3,IL2RA,RBM17,RBM17 RBM17 IL2RA,LOC399715,RBM17 IMR90 Hi-C 24141950 RBM17 18392 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 6111181 6111591 6111307 Y IL2RA RBM17 IL2RA,LOC399715,RBM17 IMR90 Hi-C 24141950 RBM17 17359 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 6206285 6206560 6206485 Y NA PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 21404 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 6389510 6390540 6390147 Y IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 204629 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr10 6424082 6424357 6424201 Y PFKFB3,PFKFB3 NA LOC399715,RBM17,PFKFB3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKCQ 195906 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 6970148 6970192 6970158 Y SFMBT2,SFMBT2 NA LOC100507127,SFMBT2 IMR90 Hi-C 24141950 PRKCQ 349885 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 7275320 7275743 7275581 Y NA NA NA NA NA NA SFMBT2 175707 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 7362038 7362350 7362337 Y SFMBT2,SFMBT2 NA NA NA NA NA SFMBT2 89100 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 7518032 7518150 7518125 Y SFMBT2,SFMBT2 RP5-1031D4.2 NA NA NA NA RP5-1031D4.2 6128 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr10 7523024 7523295 7523219 Y SFMBT2 RP5-1031D4.2 NA NA NA NA RP5-1031D4.2 11120 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 8098275 8098603 8098313 Y NA GATA3 NA NA NA NA GATA3 4708 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 8103293 8103465 8103334 Y TAF3,GATA3 GATA3 NA NA NA NA GATA3 9726 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 8662161 8662543 8662250 Y NA NA NA NA NA NA GATA3 568594 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 8909152 8909331 8909243 Y NA NA TAF3,GATA3,FLJ45983 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GATA3 815585 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 9115735 9116358 9115988 Y NA NA GATA3,FLJ45983 MCF7 ChIA-PET 22265404 GATA3 1022168 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 11205067 11205773 11205317 Y CELF2 NA NA NA NA NA CELF2 159808 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 11211427 11212417 11211529 Y NA NA NA NA NA NA CELF2 166168 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 11220579 11221039 11220795 Y CELF2 NA NA NA NA NA CELF2 175320 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr10 11222222 11222709 11222492 Y CELF2 NA NA NA NA NA CELF2 176963 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr10 11651765 11651937 11651850 Y USP6NL,USP6NL USP6NL NA NA NA NA USP6NL 12 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 12195131 12195251 12195172 Y CAMK1D SEC61A2,CDC123,NUDT5 NA NA NA NA SEC61A2 25495 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 12261469 12261671 12261570 Y NA CDC123,NUDT5 NA NA NA NA NUDT5 25326 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 12306536 12306777 12306588 Y UPF2,UPF2,SEC61A2,CAMK1D NA NA NA NA NA NUDT5 70393 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 12307693 12308050 12307912 Y UPF2,UPF2,SEC61A2,CAMK1D NA NA NA NA NA NUDT5 71550 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 12751328 12751588 12751334 Y CAMK1D NA NA NA NA NA CAMK1D 361847 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 13390886 13391219 13391148 Y NA PHYH,SEPHS1 NA NA NA NA SEPHS1 2589 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr10 13829023 13829481 13829176 Y PRPF18 NA NA NA NA NA PRPF18 202096 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 14602319 14602604 14602483 Y NA NA NA NA NA NA FAM107B 212292 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 14659750 14660164 14660026 Y NA NA NA NA NA NA FAM107B 154732 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 15178441 15178844 15178745 Y NA ACBD7,RPP38,C10orf111,NMT2 NA NA NA NA NMT2 29848 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 15300658 15300993 15300826 Y ACBD7,FAM171A1 NA NA NA NA NA NMT2 91966 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 16557217 16557368 16557293 Y NA NA NA NA NA NA PTER 80275 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 17105178 17105416 17105257 Y NA NA NA NA NA NA TRDMT1 136637 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 17215777 17215793 17215785 Y NA TRDMT1 NA NA NA NA TRDMT1 26260 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 17470783 17471060 17470983 Y TRDMT1,STAM,ST8SIA6 NA NA NA NA NA PTPLA 186316 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 17755362 17755412 17755398 Y SLC39A12 NA NA NA NA NA STAM 71238 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 18860767 18861138 18861132 Y NA RP11-499P20.2 NA NA NA NA RP11-499P20.2 28187 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr10 21816029 21816444 21816223 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 4650 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr10 21816987 21817223 21817104 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 3871 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 21991974 21992366 21992143 Y NA NA NA NA NA NA MLLT10 170880 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 22519481 22519667 22519580 Y BMI1,EBLN1 NA COMMD3-BMI1,PIP4K2A,ARMC3,DNAJC1,LOC100499489 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COMMD3 83236 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 22628998 22629520 22629110 Y EBLN1 COMMD3,BMI1 NA NA NA NA BMI1 20858 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 22629825 22629981 22629966 Y DNAJC1 COMMD3,BMI1 NA NA NA NA BMI1 21685 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 22725331 22726270 22725901 Y NA NA NA NA NA NA BMI1 117191 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 4.21608083224084 chr10 22870490 22870524 22870509 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 130960 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 22921960 22922313 22922139 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 79171 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 24996902 24997348 24997071 Y NA ARHGAP21 NA NA NA NA ARHGAP21 13249 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 25640550 25640656 25640570 Y NA NA NA NA NA NA THNSL1 336963 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 26191189 26191209 26191199 Y NA NA NA NA NA NA APBB1IP 533923 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 26289899 26290095 26289999 Y GAD2 NA NA NA NA NA APBB1IP 435037 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 26737474 26738103 26737807 Y ABI1,APBB1IP APBB1IP NA NA NA NA APBB1IP 12342 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 26770961 26771542 26771263 Y APBB1IP,ABI1 APBB1IP NA NA NA NA APBB1IP 45829 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 26789137 26789225 26789181 Y APBB1IP NA NA NA NA NA APBB1IP 64005 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 27028326 27028583 27028339 Y MASTL,PDSS1,ABI1 PDSS1 NA NA NA NA PDSS1 43738 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 27147453 27147834 27147772 Y YME1L1,MASTL,ACBD5,APBB1IP,PDSS1,ABI1 ABI1 NA NA NA NA ABI1 182 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 27531769 27532240 27532024 Y ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5 ACBD5 NA NA NA NA ACBD5 2710 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 2.38911247160314 chr10 29944854 29945090 29945003 Y SVIL NA NA NA NA NA MTPAP 716287 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 30994223 30994518 30994467 Y NA NA ZEB1,ARHGAP12,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K8 273357 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr10 31107978 31108144 31108047 Y NA NA ZEB1,ARHGAP12,ZNF438,KIF5B,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 210722 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 31422679 31422989 31422772 Y ZNF438,ZNF438 NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 103813 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr10 31423488 31423889 31423800 Y NA NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 104622 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 31770032 31770371 31770202 Y NA NA NA NA NA NA ZEB1-AS1 162656 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 31892273 31892723 31892643 Y NA NA ZEB1 IMR90 Hi-C 24141950 ZEB1-AS1 284897 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 32048872 32049424 32049213 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 166318 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr10 32100174 32100489 32100483 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP12 115253 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 32301568 32301771 32301670 Y NA KIF5B NA NA NA NA KIF5B 41588 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 32335843 32336217 32336161 Y NA KIF5B NA NA NA NA KIF5B 7142 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 32460264 32460451 32460341 Y NA NA ARHGAP12,EPC1 IMR90 Hi-C 24141950 RPS4XP11 70043 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 32611846 32612286 32612204 Y EPC1 NA NA NA NA NA EPC1 53440 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 32639699 32640002 32639940 Y NA EPC1 EPC1,C10orf68 IMR90 Hi-C 24141950 EPC1 25724 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 33269452 33269916 33269602 Y C10orf68 ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 22804 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 33425212 33425871 33425404 Y NA NA ITGB1 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB1 132492 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 33798158 33798349 33798267 Y NA NA PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB1 505438 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 34421241 34421398 34421321 Y NA NA NA NA NA NA RP11-8L18.3 529631 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 35070002 35070125 35070067 Y CREM PARD3 NA NA NA NA PARD3 32128 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr10 35438214 35438795 35438573 Y CREM,CREM CREM NA NA NA NA CREM 24495 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 35768783 35768937 35768860 Y NA NA NA NA NA NA CCNY 234830 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 42400063 42400397 42400233 Y NA NA NA NA NA NA CCNYL2 565291 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 43249715 43249807 43249770 Y NA BMS1 NA NA NA NA BMS1 26442 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 43633157 43633403 43633253 Y RASGEF1A CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 1223 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 43800197 43800376 43800318 Y CSGALNACT2,HNRNPF,HNRNPF NA ZNF487P IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPF 102238 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 43905259 43905708 43905446 Y HNRNPF,HNRNPF,HNRNPF HNRNPF,RP11-517P14.2 NA NA NA NA HNRNPF 2645 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 43950893 43951349 43951098 Y NA HNRNPF,RP11-517P14.2 NA NA NA NA RP11-517P14.2 36707 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr10 45420922 45421327 45420936 Y ALOX5,TMEM72 RASSF4 NA NA NA NA RASSF4 31528 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 45470476 45470795 45470517 Y NA RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25 NA NA NA NA C10orf10 1463 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 45868742 45869084 45868822 Y ANUBL1,OR13A1,ALOX5 ALOX5 NA NA NA NA ALOX5 1081 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr10 45914192 45914546 45914348 Y FAM21C,ALOX5,MARCH8 ALOX5 NA NA NA NA ALOX5 46531 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 45914844 45915133 45915015 Y NA ALOX5 NA NA NA NA ALOX5 47183 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 45925929 45926006 45925968 Y FAM21C,ANUBL1,ALOX5,MARCH8 NA NA NA NA NA ALOX5 58268 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 45965771 45965877 45965832 Y NA NA NA NA NA NA ALOX5 98110 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 47588936 47589404 47589197 Y NA NA LOC643650,SYT15,PPYR1 IMR90 Hi-C 24141950 ANTXRLP1 53389 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr10 47655672 47656071 47655889 Y NA ANTXRLP1 AGAP7 MCF7 ChIA-PET 22265404 ANTXRLP1 12879 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr10 49876110 49876652 49876470 Y WDFY4 WDFY4 ARHGAP22,WDFY4,C10orf71,ERCC6 IMR90 Hi-C 24141950 WDFY4 14269 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 49879351 49879455 49879403 Y NA WDFY4 ARHGAP22,WDFY4,C10orf71,ERCC6 IMR90 Hi-C 24141950 WDFY4 11466 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 49879628 49879846 49879754 Y NA WDFY4 ARHGAP22,WDFY4,C10orf71,ERCC6 IMR90 Hi-C 24141950 WDFY4 11075 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 49891983 49892370 49892073 Y NA WDFY4 NA NA NA NA WDFY4 1062 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.68643233289634 chr10 50138824 50138968 50138896 Y WDFY4 NA NA NA NA NA WDFY4 247903 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 50342582 50342632 50342591 Y LRRC18,FAM170B,C10orf128 NA NA NA NA NA C10orf128 51998 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 51039519 51039692 51039605 Y NA NA NA NA NA NA ERCC6 293935 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 51045236 51045418 51045327 Y NA NA NA NA NA NA ERCC6 299652 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 52037840 52038115 52037944 Y SGMS1 DYNC1I2P1 SGMS1 IMR90 Hi-C 24141950 DYNC1I2P1 15102 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 52261858 52262194 52262143 Y NA NA NA NA NA NA SGMS1 120729 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 55357540 55358018 55357746 Y NA NA NA NA NA NA RP11-556E13.1 844371 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 61645173 61645419 61645305 Y NA CCDC6 NA NA NA NA CCDC6 18995 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 62674070 62674082 62674076 Y NA NA NA NA NA NA RHOBTB1 85116 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 63663540 63663817 63663641 Y ARID5B NA NA NA NA NA RTKN2 362649 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 63701578 63701680 63701630 Y NA NA NA NA NA NA RTKN2 324786 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 63839926 63839992 63839961 Y NA NA NA NA NA NA RTKN2 186474 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr10 63859069 63859192 63859131 Y ARID5B NA NA NA NA NA RTKN2 167274 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 64024468 64024613 64024559 Y ARID5B RTKN2 NA NA NA NA RTKN2 1853 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 64291559 64291877 64291687 Y ZNF365 NA NA NA NA NA RTKN2 265093 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 64300187 64300318 64300222 Y EGR2,EGR2 NA NA NA NA NA ADO 262198 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 64399010 64399243 64399150 Y NA NA NA NA NA NA ADO 163273 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr10 65033384 65033629 65033527 Y NRBF2,JMJD1C NA NA NA NA NA NRBF2 142334 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 65269177 65269730 65269542 Y NA JMJD1C,REEP3 REEP3,JMJD1C,LOC84989 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 REEP3 9393 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 65274637 65275000 65274913 Y NA REEP3 JMJD1C,REEP3 IMR90 Hi-C 24141950 REEP3 4123 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 65389747 65390882 65390384 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 110624 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 65930110 65930546 65930307 Y NA NA NA NA NA NA RP11-170M17.2 269105 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 69582490 69582752 69582621 Y DNAJC12 DNAJC12 NA NA NA NA DNAJC12 13172 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 69609160 69609390 69609211 Y NA DNAJC12,SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 DNAJC12 13236 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr10 69658139 69658146 69658142 Y HNRNPH3,SIRT1,SIRT1 SIRT1 HERC4 IMR90 Hi-C 24141950 SIRT1 15712 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 70782889 70783013 70782952 Y NA KIAA1279 NA NA NA NA KIAA1279 36402 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 70884620 70884824 70884718 Y DDX21,SUPV3L1,SRGN SRGN,VPS26A NA NA NA NA VPS26A 3352 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 71928097 71928630 71928606 Y NA AIFM2,TYSND1 TYSND1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SAR1A 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr10 71984000 71984297 71984282 Y NA PPA1 NA NA NA NA PPA1 7370 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 72253805 72253950 72253868 Y NA NA NA NA NA NA EIF4EBP2 91670 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr10 73454502 73454799 73454537 Y NA NA NA NA NA NA PSAP 154327 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 73744363 73744592 73744410 Y NA NA NA NA NA NA PSAP 135237 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr10 74032298 74032943 74032475 Y NA DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 620 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 74056833 74058104 74057179 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 25155 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 74063512 74063738 74063656 Y NA DDIT4,DNAJB12 ANAPC16,DDIT4 IMR90 Hi-C 24141950 DDIT4 31834 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 74079380 74080359 74079580 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 32629 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 74080430 74080993 74080646 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 31995 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr10 74091661 74092150 74091920 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DNAJB12 NA NA NA NA DNAJB12 20838 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr10 74289425 74289733 74289722 Y NA NA NA NA NA NA MICU1 94166 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 74453097 74453245 74453141 Y CCDC109A MCU NA NA NA NA MCU 3208 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 74877758 74878048 74877901 Y NA P4HA1,NUDT13,FAM149B1,ECD NA NA NA NA NUDT13 9541 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 74990824 74990933 74990931 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA DNAJC9 15687 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 75222632 75223003 75222818 Y NA RP11-345K20.2,RP11-137L10.6,PPP3CB NA NA NA NA RP11-137L10.6 30280 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 75654322 75654573 75654437 Y ANXA7,NDST2 CAMK2G,PLAU NA NA NA NA PLAU 12362 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 75887856 75888019 75887938 Y NA AP3M1,ADK NA NA NA NA AP3M1 20802 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 76916394 76916800 76916595 Y MYST4,SAMD8 NA NA NA NA NA VDAC2 51112 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 79119995 79120222 79120109 Y NA NA NA NA NA NA DLG5 564156 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 80062995 80063366 80063293 Y NA NA ZMIZ1,RPS24,LOC283050,LOC100132987,POLR3A IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 271477 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 80626499 80626705 80626607 Y NA NA LOC283050,ZMIZ1,RPS24,LOC100132987,POLR3A IMR90 Hi-C 24141950 ZMIZ1 200087 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 80732492 80734123 80733460 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 92669 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 80943996 80944377 80944135 Y NA NA NA NA NA NA ZMIZ1 117204 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 81028676 81029041 81028720 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 76184 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 81086644 81087006 81086940 Y NA PPIF NA NA NA NA PPIF 18219 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 82214819 82214901 82214871 Y TSPAN14 FAM213A,TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 2897 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 82260440 82261008 82260524 Y TSPAN14 TSPAN14,RP11-137H2.4 NA NA NA NA RP11-137H2.4 32690 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr10 82296466 82296516 82296492 Y NA RP11-137H2.4 NA NA NA NA RP11-137H2.4 2768 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr10 82299421 82299771 82299678 Y SH2D4B,SH2D4B RP11-137H2.4 NA NA NA NA RP11-137H2.4 5723 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chr10 82417026 82417142 82417084 Y NA NA NA NA NA NA RP11-137H2.4 123328 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 83813687 83814033 83813708 Y NA NA NA NA NA NA NRG3 180617 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 84112610 84112657 84112652 Y NRG3,NRG3 NA NA NA NA NA NRG3 479540 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 84417350 84417459 84417363 Y NA NA NA NA NA NA NRG3 784280 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 85937530 85937952 85937586 Y NA GHITM NA NA NA NA GHITM 40334 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 88470805 88471213 88471023 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP8 81420 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chr10 89826660 89827052 89826872 Y KLLN,PTEN NA PTEN,RNLS,KLLN IMR90 Hi-C 24141950 RP11-380G5.3 123401 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 90704546 90704848 90704768 Y NA FAS NA NA NA NA FAS 43566 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 90846894 90847268 90847248 Y LIPA,CH25H NA CH25H,LIPA IMR90 Hi-C 24141950 FAS 98480 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 91189163 91189205 91189186 Y SLC16A12 IFIT1,LIPA,IFIT5 NA NA NA NA IFIT5 16820 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 91647685 91647987 91647742 Y NA NA NA NA NA NA SNRPD2P1 88487 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 92923893 92924265 92924064 Y NA NA RPP30,NUDT9P1,PCGF5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PCGF5 53643 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 94351391 94351691 94351485 Y CPEB3 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 348 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 2.10804041612042 chr10 94459466 94459797 94459609 Y HHEX HHEX NA NA NA NA HHEX 13521 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 94516915 94517155 94517045 Y HHEX,EXOC6 NA EXOC6,KIF11,HHEX IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HHEX 70970 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 94608884 94609046 94608952 Y NA EXOC6 NA NA NA NA EXOC6 19949 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 97054774 97055369 97055126 Y ENTPD1,PDLIM1 PDLIM1 PDLIM1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PDLIM1 5993 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 97308667 97309047 97308880 Y NA SORBS1 NA NA NA NA SORBS1 10124 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 97313430 97313789 97313690 Y NA SORBS1 NA NA NA NA SORBS1 5382 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 97319295 97319590 97319525 Y C10orf129,SORBS1,SORBS1 SORBS1 NA NA NA NA SORBS1 124 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 97640254 97640658 97640438 Y ENTPD1,ENTPD1 NA NA NA NA NA RP11-248J23.5 117342 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 97809134 97809259 97809196 Y NA CCNJ,ENTPD1-AS1 NA NA NA NA CCNJ 7983 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr10 98032542 98032692 98032630 Y ZNF518A,BLNK BLNK,DNTT NA NA NA NA BLNK 3198 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 4.07554480449948 chr10 98064908 98065029 98064942 Y C10orf131,CCNJ,ZNF518A,BLNK,DNTT BLNK,DNTT NA NA NA NA DNTT 2823 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr10 98090079 98090468 98090086 Y NA DNTT NA NA NA NA DNTT 27994 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 98407335 98407523 98407430 Y LCOR,C10orf12,PIK3AP1,TM9SF3 NA NA NA NA NA TM9SF3 62126 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 98464941 98465141 98465037 Y LCOR,C10orf12,TM9SF3,PIK3AP1 PIK3AP1,RPL13AP5 NA NA NA NA PIK3AP1 13130 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 98507799 98508110 98507962 Y LCOR,PIK3AP1 PIK3AP1 PIK3AP1,SLIT1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL13AP5 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 100993810 100993952 100993927 Y NA NA NA NA NA NA GOT1 194429 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 101381465 101381554 101381515 Y NA SLC25A28,ENTPD7 NA NA NA NA SLC25A28 3099 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 101382479 101382644 101382575 Y SLC25A28 SLC25A28,ENTPD7 NA NA NA NA SLC25A28 4113 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 101475394 101475766 101475528 Y NA CUTC,COX15 NA NA NA NA COX15 14091 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr10 101537826 101537964 101537919 Y ABCC2 COX15 NA NA NA NA COX15 47969 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 101666342 101666477 101666411 Y NA NA NA NA NA NA DNMBP 101199 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 101774105 101774391 101774304 Y NA DNMBP CUTC,COX15,ABCC2,DNMBP,DNMBP-AS1,CPN1 IMR90 Hi-C 24141950 DNMBP 6429 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 101780024 101780319 101780173 Y CUTC,WNT8B DNMBP DNMBP MCF7 ChIA-PET 22265404 DNMBP 12348 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.68643233289634 chr10 102030171 102030375 102030254 Y SEC31B CHUK,RP11-316M21.6,SNORA12,CWF19L1,BLOC1S2 NA NA NA NA CWF19L1 4734 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 102284617 102284981 102284927 Y NA HIF1AN,SEC31B,NDUFB8 NA NA NA NA HIF1AN 1848 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 103238536 103238713 103238625 Y NA NA NA NA NA NA BTRC 126716 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 103876632 103876931 103876782 Y NA LDB1,PPRC1,NOLC1 NA NA NA NA LDB1 1279 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 103877464 103877788 103877718 Y MGEA5,TMEM180,SUFU,PSD,FBXL15,C10orf76,LDB1 LDB1,PPRC1,NOLC1 NA NA NA NA LDB1 422 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr10 104618482 104618835 104618659 Y NA C10orf32,AS3MT NA NA NA NA C10orf32 6502 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 105519063 105519154 105519109 Y NA NA NA NA NA NA OBFC1 156809 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr10 105532054 105532211 105532109 Y NA NA NA NA NA NA OBFC1 143752 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 106085298 106085504 106085412 Y SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147 ITPRIP,CCDC147-AS1 NA NA NA NA ITPRIP 10658 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 106096287 106096870 106096611 Y SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147 ITPRIP,CCDC147-AS1 ITPRIP,GSTO1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ITPRIP 125 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 106383721 106383738 106383730 Y NA NA NA NA NA NA CCDC147-AS1 272388 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 108717725 108717784 108717755 Y NA NA NA NA NA NA CCDC147-AS1 2606392 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 111650301 111650520 111650491 Y NA XPNPEP1 NA NA NA NA XPNPEP1 30791 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 111971446 111971590 111971518 Y NA MXI1 NA NA NA NA MXI1 6083 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 112010766 112010816 112010791 Y NA MXI1 SMNDC1 IMR90 Hi-C 24141950 MXI1 45403 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 112220227 112220521 112220467 Y SMC3,DUSP5 NA DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 SMC3 104928 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 112432258 112432673 112432308 Y PDCD4 NA PDCD4,LOC282997 IMR90 Hi-C 24141950 SMC3 106809 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 112624355 112624707 112624540 Y SHOC2,PDCD4,BBIP1,BBIP1 PDCD4,PDCD4-AS1 NA NA NA NA PDCD4 4858 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 112668159 112668425 112668161 Y NA PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 8607 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 113639834 113639959 113639897 Y NA NA NA NA NA NA GPAM 333176 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 115022033 115022434 115022235 Y NA NA VTI1A IMR90 Hi-C 24141950 TCF7L2 314024 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 115027855 115028243 115028038 Y TCF7L2 NA VTI1A IMR90 Hi-C 24141950 TCF7L2 319846 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 115033380 115033572 115033427 Y TCF7L2 NA TECTB,GUCY2GP,VTI1A IMR90 Hi-C 24141950 TCF7L2 325371 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 115070178 115070533 115070251 Y TCF7L2 NA VTI1A IMR90 Hi-C 24141950 TCF7L2 362169 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 115080077 115080348 115080162 Y CASP7,TCF7L2 NA VTI1A IMR90 Hi-C 24141950 CASP7 356594 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr10 115122408 115122600 115122509 Y TCF7L2 NA VTI1A IMR90 Hi-C 24141950 CASP7 314342 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 115141716 115142302 115141804 Y TCF7L2 NA VTI1A,ZDHHC6,ACSL5,TCF7L2 IMR90 Hi-C 24141950 CASP7 294640 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 115223609 115223817 115223724 Y NA NA VTI1A IMR90 Hi-C 24141950 CASP7 213125 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 115440649 115440877 115440799 Y CASP7 CASP7 NA NA NA NA CASP7 3707 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 118034123 118034494 118034359 Y GFRA1,GFRA1,GFRA1 GFRA1 NA NA NA NA GFRA1 3144 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 119021882 119022152 119021944 Y NA NA NA NA NA NA PDZD8 110826 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 119107774 119108099 119107936 Y NA PDZD8 NA NA NA NA PDZD8 24879 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 120072477 120072945 120072874 Y NA FAM204A NA NA NA NA FAM204A 26895 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 121028416 121028802 121028728 Y EIF3A,GRK5 NA NA NA NA NA PRDX3 92071 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 121065390 121065964 121065436 Y NA NA NA NA NA NA PRDX3 129045 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 121249100 121249168 121249139 Y NA NA NA NA NA NA RGS10 51052 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 121412148 121412380 121412196 Y BAG3 RP11-179H18.5,BAG3 NA NA NA NA BAG3 3266 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 121544240 121544543 121544312 Y NA NA MCMBP IMR90 Hi-C 24141950 MCMBP 105525 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 121829686 121829950 121829715 Y NA NA NA NA NA NA NACAP2 74465 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 126029584 126030073 126029818 Y CHST15 NA HMX3 IMR90 Hi-C 24141950 OAT 75472 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 126329186 126329692 126329619 Y CHST15,ZRANB1,FAM53B NA NA NA NA NA FAM53B 101146 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 126336359 126336702 126336537 Y CHST15,ZRANB1,FAM53B NA NA NA NA NA FAM53B 94136 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 126382372 126382711 126382460 Y ZRANB1,FAM53B FAM53B NA NA NA NA FAM53B 48127 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 126429723 126430192 126430042 Y FAM53B FAM53B,METTL10 NA NA NA NA FAM53B 646 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 126445536 126445891 126445571 Y ZRANB1 FAM53B,METTL10,FAM175B NA NA NA NA FAM53B 14698 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 127576052 127576450 127576389 Y NA DHX32,FANK1 NA NA NA NA DHX32 6555 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 129816655 129817081 129816870 Y PTPRE NA NA NA NA NA MKI67 105568 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 129893841 129894010 129893942 Y NA MKI67 NA NA NA NA MKI67 28639 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 131436691 131436981 131436883 Y MGMT NA NA NA NA NA MGMT 173243 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 131438209 131438380 131438294 Y NA NA NA NA NA NA MGMT 174761 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 132099901 132100191 132100002 Y NA NA NA NA NA NA GLRX3 167238 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 132429890 132430021 132429956 Y NA NA NA NA NA NA GLRX3 497227 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 133763722 133764008 133763747 Y NA BNIP3 NA NA NA NA BNIP3 29427 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 133794080 133794414 133794353 Y NA BNIP3 PPP2R2D IMR90 Hi-C 24141950 BNIP3 645 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 134260341 134260546 134260485 Y C10orf91 NA NA NA NA NA INPP5A 88778 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 134349556 134349919 134349753 Y JAKMIP3,NKX6-2,C10orf92,INPP5A INPP5A NA NA NA NA INPP5A 232 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 134364689 134365427 134365071 Y INPP5A INPP5A NA NA NA NA INPP5A 15365 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr10 134368659 134369026 134368959 Y PWWP2B,INPP5A INPP5A NA NA NA NA INPP5A 19335 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 134549634 134549842 134549793 Y KNDC1,GPR123,NKX6-2 NA NA NA NA NA INPP5A 200310 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr10 135191872 135192182 135191943 Y NA ECHS1,PAOX,MTG1 NA NA NA NA PAOX 1177 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 268826 269269 268945 Y TMEM80,TALDO1,SIGIRR,IRF7,IRF7,DEAF1,IFITM2,IFITM1,ATHL1 PSMD13,SIRT3,NLRP6,ATHL1,IFITM2 NA NA NA NA NLRP6 7096 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr11 269337 269903 269511 Y TMEM80,TALDO1,SIGIRR,DEAF1,IFITM2,IFITM1,ATHL1 PSMD13,SIRT3,NLRP6,ATHL1,IFITM2 NA NA NA NA NLRP6 6462 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.54589630515498 chr11 355877 356724 356385 Y NA NA IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 IFITM2 50246 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr11 840856 841090 840896 Y NA SLC25A22,RPLP2,PIDD,PNPLA2,CD151,AP006621.8,POLR2L,TSPAN4 NA NA NA NA TSPAN4 48 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 944711 944765 944751 Y NA CHID1,AP2A2 NA NA NA NA AP2A2 21817 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 1015139 1015297 1015218 Y NA NA NA NA NA NA AP2A2 92245 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 1982665 1983112 1982762 Y TH,IGF2,IGF2 MRPL23 NA NA NA NA MRPL23 16157 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr11 2717684 2718130 2717946 Y TSSC4,TRPM5,KCNQ1 KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 1094 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 2913617 2913951 2913751 Y NA CDKN1C,SLC22A18 NA NA NA NA SLC22A18 5000 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 3742975 3743362 3743342 Y NA NA NA NA NA NA PGAP2 73592 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr11 3918054 3918451 3918253 Y NA STIM1,AC090587.4 NA NA NA NA AC090587.4 44212 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 4476733 4477061 4476821 Y TRIM21 NA NA NA NA NA TRIM21 63807 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 6222114 6222511 6222298 Y TPP1,FAM160A2 FAM160A2 NA NA NA NA FAM160A2 31430 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 6224718 6224948 6224898 Y TPP1,FAM160A2 FAM160A2 NA NA NA NA FAM160A2 28993 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 8727919 8728019 8727969 Y ASCL3 RPL27A NA NA NA NA RPL27A 25961 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 9240746 9240917 9240841 Y NA DENND5A NA NA NA NA DENND5A 44020 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 9385760 9386326 9386092 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 17843 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chr11 9590279 9590748 9590469 Y WEE1,WEE1 WEE1 LOC644656,ZNF143 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 WEE1 2480 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 9635436 9636077 9635827 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1,SWAP70 WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WEE1 42208 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 10913909 10914033 10913978 Y AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,ZBED5 ZBED5 NA NA NA NA ZBED5 35566 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 11899555 11899888 11899585 Y NA USP47 NA NA NA NA USP47 38585 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 12181262 12181458 12181363 Y MICALCL,MICAL2 NA MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 MICAL2 67719 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 14443887 14444060 14443964 Y RRAS2 NA RRAS2,COPB1,SPON1 IMR90 Hi-C 24141950 RRAS2 59835 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 14600110 14600431 14600207 Y CYP2R1,PSMA1,PDE3B NA NA NA NA NA PSMA1 60220 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 16055828 16056182 16056005 Y NA NA NA NA NA NA C11orf58 576497 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 16121256 16121272 16121264 Y NA NA NA NA NA NA C11orf58 511407 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 17335831 17335998 17335921 Y NA NA NA NA NA NA KCNJ11 72880 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 17374298 17375700 17374969 Y RPS13,B7H6 KCNJ11 NA NA NA NA KCNJ11 33178 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr11 17929463 17929485 17929474 Y NA NA NA NA NA NA SERGEF 103224 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 18404883 18405218 18405078 Y LDHA LDHA,AC084117.3 NA NA NA NA LDHA 8717 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 18426412 18426598 18426470 Y NA LDHA,AC084117.3 NA NA NA NA AC084117.3 1256 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr11 18649925 18650050 18650045 Y NA UEVLD,SPTY2D1 NA NA NA NA SPTY2D1 4288 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 24448444 24448604 24448524 Y NA NA LOC100500938 IMR90 Hi-C 24141950 SVIP 1598599 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 27217576 27217737 27217656 Y NA NA LGR4 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC34 165678 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 27715832 27716154 27716086 Y NA NA NA NA NA NA RP11-587D21.1 114605 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 28010741 28010769 28010755 Y NA NA BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1033A18.1 100161 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 28128920 28129110 28128941 Y METTL15 METTL15,KIF18A NA NA NA NA KIF18A 1065 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr11 30494476 30494761 30494619 Y NA NA NA NA NA NA MPPED2 111658 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 30510063 30510254 30510126 Y FSHB,MPPED2,MPPED2 NA NA NA NA NA MPPED2 96165 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr11 32728667 32728946 32728768 Y NA NA NA NA NA NA EIF3M 125323 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 32915475 32916456 32915913 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 2751 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr11 33096691 33097088 33096864 Y NA TCP11L1 NA NA NA NA TCP11L1 37728 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 33313001 33313236 33313097 Y NA HIPK3 NA NA NA NA HIPK3 36783 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 33778086 33778269 33778178 Y FBXO3 CD59,FBXO3 NA NA NA NA FBXO3 15820 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 34084271 34084310 34084291 Y NA CAPRIN1,NAT10 NA NA NA NA CAPRIN1 13041 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 34125347 34125667 34125520 Y NA NAT10 NA NA NA NA NAT10 198 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 34931457 34931889 34931828 Y NA PDHX,APIP NA NA NA NA PDHX 3487 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr11 35080761 35080936 35080869 Y CD44 NA CD44,SLC1A2,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 APIP 144715 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 35099118 35099616 35099383 Y CD44 NA CD44,PDHX,APIP,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 APIP 163072 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 35109319 35109885 35109545 Y CD44 NA CD44,PDHX,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 APIP 173273 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr11 36052486 36052576 36052531 Y NA NA NA NA NA NA LDLRAD3 88955 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr11 36590672 36591010 36590800 Y RAG1,RAG2 RAG2 NA NA NA NA RAG2 26819 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr11 36617876 36618263 36618224 Y RAG1,RAG2 RAG2 NA NA NA NA RAG2 47 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr11 36640986 36641224 36641190 Y PRR5L,RAG1,RAG2 RAG2 NA NA NA NA RAG2 23157 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr11 36730903 36730935 36730919 Y PRR5L NA NA NA NA NA RAG2 113074 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 40246809 40247104 40246957 Y LRRC4C NA NA NA NA NA RP11-124G5.1 1310880 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 44359184 44359364 44359336 Y ALX4 NA EXT2 IMR90 Hi-C 24141950 CD82 224613 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 44963197 44963482 44963283 Y NA TP53I11 NA NA NA NA TP53I11 7358 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 45047638 45048022 45047830 Y TSPAN18 NA NA NA NA NA TP53I11 76798 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 45101852 45102069 45101953 Y TSPAN18 NA NA NA NA NA TP53I11 131012 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 46004522 46004898 46004712 Y NA NA NA NA NA NA GYLTL1B 63350 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 46058881 46059222 46059206 Y NA NA NA NA NA NA PHF21A 81763 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 46090973 46091088 46091031 Y NA PHF21A NA NA NA NA PHF21A 49897 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 46135373 46135563 46135504 Y PHF21A,AMBRA1 PHF21A NA NA NA NA PHF21A 5422 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 46143609 46143973 46143928 Y NA PHF21A NA NA NA NA PHF21A 2624 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr11 46264726 46265198 46265009 Y NA CREB3L1 DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 32014 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr11 47173206 47173550 47173416 Y NA ARFGAP2,PACSIN3 NA NA NA NA ARFGAP2 23126 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 47208524 47208884 47208580 Y PACSIN3,PACSIN3,NR1H3 ARFGAP2,PACSIN3,DDB2 NA NA NA NA PACSIN3 2530 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr11 47414531 47414922 47414826 Y MADD,MADD,MADD,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1 SPI1,SLC39A13,PSMC3 SPI1,SLC39A13 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC39A13 11761 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 47421735 47422128 47421819 Y MADD,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1 SPI1,SLC39A13,PSMC3 SLC39A13 IMR90 Hi-C 24141950 SLC39A13 4555 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 47531687 47531996 47531879 Y SPI1,PTPRJ,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1 NA RAPSN IMR90 Hi-C 24141950 NDUFS3 52892 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 47787265 47787534 47787400 Y SPI1,CELF1,CELF1,CELF1,PTPRJ,FNBP4 FNBP4 NA NA NA NA FNBP4 270 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 47799022 47799247 47799135 Y NA FNBP4 NA NA NA NA FNBP4 12027 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 47891173 47891544 47891408 Y OR4C45,OR4B1,OR4C3,OR4X2,OR4S1 NUP160,RP11-793I11.1 PTPRJ,FNBP4 IMR90 Hi-C 24141950 NUP160 23066 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 47939528 47939960 47939626 Y OR4B1,OR4S1,NUP160 RP11-793I11.1 PTPRJ,NUP160 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-793I11.1 14369 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr11 48028073 48028508 48028179 Y CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ PTPRJ NA NA NA NA PTPRJ 27960 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 57333685 57333973 57333758 Y SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,ZDHHC5,UBE2L6 TIMM10 NA NA NA NA UBE2L6 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 59057020 59057574 59057371 Y GLYATL1,DTX4,OSBP RP11-1036E20.7 DTX4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1036E20.7 2061 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr11 59331910 59331948 59331929 Y OR5AN1,OR4D6,OR4D11 OSBP NA NA NA NA OSBP 49669 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 60679748 60680120 60679877 Y CD5,CD6 PRPF19,TMEM109,TMEM132A NA NA NA NA TMEM109 402 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 61600948 61601213 61601130 Y CYBASC3 FEN1,FADS2,FADS1 NA NA NA NA FADS1 6158 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 61602064 61602538 61602257 Y INCENP,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,FEN1 FEN1,FADS2,FADS1 NA NA NA NA FADS1 7274 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr11 62413039 62413428 62413234 Y NA MTA2,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,C11orf83,C11orf48,UBXN1 NA NA NA NA GANAB 935 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 62586827 62586893 62586843 Y NA TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA STX5 10667 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 63334518 63335083 63334716 Y RARRES3,OTUB1 RARRES3 NA NA NA NA RARRES3 32237 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 63705603 63705837 63705685 Y NA RCOR2,NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1 NA NA NA NA NAA40 1172 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 63949132 63949273 63949224 Y NA MACROD1,STIP1,FERMT3,NUDT22,TRPT1,DNAJC4 NA NA NA NA STIP1 1471 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr11 64215709 64215895 64215775 Y OTUB1,FERMT3,SF1,SF1,RASGRP2,RASGRP2,EHD1,CCDC88B NA SLC22A12,NRXN2,SLC22A11,RASGRP2 IMR90,K562,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 RPS6KA4 91089 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr11 65184888 65185395 65184991 Y FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 SLC25A45,FRMD8,NEAT1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 2850 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 65185589 65187086 65186338 Y NA SLC25A45,FRMD8,NEAT1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 1159 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr11 65187297 65188198 65187553 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 SLC25A45,FRMD8,NEAT1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 47 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 4.21608083224084 chr11 65323331 65323567 65323509 Y FOSL1 SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1 NA NA NA NA LTBP3 834 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr11 65420425 65420654 65420491 Y TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 7911 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 65656792 65657262 65656985 Y NA MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA CCDC85B 917 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 65894211 65894464 65894385 Y NA NA RAB1B,KLC2 IMR90 Hi-C 24141950 PACS1 58377 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr11 66047866 66048291 66048031 Y NA KLC2,RAB1B,CNIH2,YIF1A,RP11-867G23.13,CD248 NA NA NA NA CNIH2 4205 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 66093813 66094193 66094103 Y NA YIF1A,RP11-867G23.13,CD248,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2 NA NA NA NA RIN1 8118 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 66374477 66374855 66374526 Y NA CTSF,CCS,CCDC87,RBM14,RBM14-RBM4,RBM4 RBM14-RBM4 IMR90 Hi-C 24141950 RBM14 7198 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 66494345 66494720 66494567 Y NA C11orf80 C11orf80 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 C11orf80 15202 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 66494780 66495327 66494982 Y SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2 C11orf80 C11orf80 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 C11orf80 14595 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr11 67037275 67037527 67037373 Y TBC1D10C,RAD9A,PITPNM1,KDM2A,ADRBK1,ANKRD13D ADRBK1,ANKRD13D NA NA NA NA ADRBK1 5394 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 67253659 67253853 67253760 Y PTPRCAP,NUDT8,AIP CORO1B,TMEM134,AIP,PITPNM1,CDK2AP2 NA NA NA NA AIP 5147 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr11 68049630 68050030 68049692 Y NA C11orf24,LRP5 NDUFS8,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,C11orf24,LRP5,PPP6R3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C11orf24 12161 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 68596165 68596440 68596230 Y MTL5,CPT1A CPT1A NA NA NA NA CPT1A 13438 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 68611298 68611611 68611498 Y NA CPT1A NA NA NA NA CPT1A 1420 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr11 68873890 68874116 68874013 Y NA NA NA NA NA NA TPCN2 59525 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 69818525 69818834 69818617 Y NA NA ANO1,ORAOV1,FGF4,FGF19 IMR90 Hi-C 24141950 FADD 228435 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr11 71650610 71650763 71650692 Y NA RP11-849H4.2,RNF121 NUMA1,IL18BP IMR90 Hi-C 24141950 RNF121 12863 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 71704625 71704847 71704670 Y NA IL18BP NA NA NA NA IL18BP 2740 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr11 71990969 71991411 71991180 Y NA NA NA NA NA NA INPPL1 58224 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 72450733 72450835 72450765 Y P2RY2,P2RY2,ATG16L2,PDE2A,ARAP1,ARAP1 NA NA NA NA NA ARAP1 51809 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 72808468 72808618 72808564 Y NA FCHSD2 NA NA NA NA FCHSD2 42688 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 72854261 72854849 72854638 Y PDE2A,ARAP1,ATG16L2,RELT,RELT,FCHSD2 FCHSD2 NA NA NA NA FCHSD2 2955 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 73088357 73088912 73088439 Y NA RELT NA NA NA NA RELT 3048 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr11 73490470 73490918 73490608 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 5443 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 73706184 73706513 73706422 Y LIPT2,C2CD3,UCP2 UCP2 UCP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 UCP2 13832 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr11 73722792 73723138 73723056 Y LIPT2,C2CD3,UCP2 UCP2 UCP2 K562 ChIA-PET 22265404 UCP2 30440 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 73736954 73737107 73737038 Y NA UCP2 NA NA NA NA UCP2 44602 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 74578028 74578161 74578096 Y OR2AT4,XRRA1,RNF169 NA NA NA NA NA XRRA1 80084 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 74608675 74608873 74608772 Y NA XRRA1,SPCS2 NA NA NA NA XRRA1 49372 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 74609863 74609988 74609926 Y NA XRRA1,SPCS2 NA NA NA NA XRRA1 48257 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 75051761 75052000 75051847 Y UVRAG,SPCS2,NEU3,DGAT2,ARRB1 ARRB1 NA NA NA NA ARRB1 8873 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 75061558 75062072 75061823 Y NA ARRB1,RPS3 NA NA NA NA ARRB1 685 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 75781411 75781582 75781473 Y NA NA NA NA NA NA UVRAG 257199 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 75946013 75946323 75946187 Y NA NA C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKRIR 143692 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 75946917 75947052 75946991 Y NA NA C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKRIR 142963 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 76574228 76574537 76574458 Y OMP,ACER3 ACER3 NA NA NA NA ACER3 4317 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 76721586 76721786 76721728 Y ACER3 NA NA NA NA NA ACER3 151675 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 76802149 76802401 76802277 Y NA NA NA NA NA NA ACER3 232238 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr11 77938673 77938848 77938785 Y NA USP35,KCTD21 NA NA NA NA KCTD21 40805 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 83312125 83312420 83312330 Y DLG2 NA NA NA NA NA CCDC90B 316675 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 84093911 84093923 84093916 Y NA NA NA NA NA NA CCDC90B 1098461 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 85894125 85894474 85894278 Y PICALM,PICALM NA PICALM,EED,C11orf73,CCDC83,SYTL2 IMR90 Hi-C 24141950 EED 59112 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 88071526 88071793 88071707 Y NA CTSC NA NA NA NA CTSC 2571 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 94987550 94987767 94987639 Y NA SESN3 NA NA NA NA SESN3 23845 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 95448832 95449445 95449173 Y FAM76B NA SESN3,ENDOD1 IMR90 Hi-C 24141950 CEP57 71684 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr11 95525355 95525734 95525518 Y NA CEP57,FAM76B NA NA NA NA FAM76B 3782 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 95557234 95557451 95557366 Y NA CEP57,FAM76B NA NA NA NA FAM76B 35661 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr11 95610217 95610530 95610374 Y NA MTMR2 NA NA NA NA MTMR2 45949 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 95745158 95745721 95745455 Y FAM76B,MAML2,CCDC82 NA NA NA NA NA MTMR2 88679 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 95746570 95746792 95746680 Y FAM76B NA NA NA NA NA MTMR2 90091 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr11 95906618 95906816 95906767 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 167528 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 95940732 95941197 95941091 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 133147 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 95976157 95976737 95976478 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 97607 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr11 95987343 95987574 95987537 Y FAM76B,MAML2,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 86770 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr11 96047326 96047750 96047695 Y MAML2 MAML2 NA NA NA NA MAML2 26594 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 102297400 102297813 102297636 Y BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123 TMEM123 BIRC2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 41302 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 102430698 102430798 102430749 Y BIRC3,MMP20 NA NA NA NA NA TMEM123 91583 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 103117200 103117534 103117367 Y NA NA NA NA NA NA DCUN1D5 156256 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 103491610 103491679 103491645 Y NA NA DYNC2H1,PDGFD IMR90 Hi-C 24141950 DCUN1D5 530666 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 107727726 107727971 107727842 Y NA RP11-832N8.1 NA NA NA NA RP11-832N8.1 49175 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 109855730 109855951 109855840 Y ZC3H12C NA ZC3H12C IMR90 Hi-C 24141950 RDX 309496 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 110326620 110326859 110326678 Y NA FDX1 NA NA NA NA FDX1 28013 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 111560054 111560414 111560322 Y NA NA PPP2R1B IMR90 Hi-C 24141950 PPP2R1B 74737 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 111929773 111930099 111929899 Y DIXDC1 DLAT,C11orf57,PIH1D2,TIMM8B,SDHD NA NA NA NA C11orf57 12711 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 113945404 113945849 113945581 Y ZBTB16,ZBTB16 NA NA NA NA NA USP28 201112 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 114309073 114309125 114309098 Y NA RBM7,C11orf71,REXO2 NA NA NA NA REXO2 965 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 115927374 115927450 115927387 Y NA NA NA NA NA NA BUD13 714254 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 116061103 116061309 116061204 Y NA NA CADM1,FAM55B IMR90 Hi-C 24141950 BUD13 580395 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 116802235 116802679 116802498 Y SIK3,PCSK7 NA NA NA NA NA ZNF259 145469 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 116864339 116864649 116864442 Y SIK3,PCSK7 NA NA NA NA NA SIK3 102504 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 117050933 117051273 117050997 Y SIDT2 PAFAH1B2,SIDT2,PCSK7 NA NA NA NA SIDT2 3484 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 118187372 118187677 118187544 Y DDX6,UBE4A,MLL,MPZL3,CD3E,CD3G,CD3D UBE4A NA NA NA NA UBE4A 40623 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 118663387 118663780 118663691 Y NA DDX6 NA NA NA NA DDX6 3529 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr11 118740767 118741727 118741016 Y MLL,VPS11,RPS25,CXCR5,CXCR5,CCDC84,CCDC153,CBL,DDX6 NA DDX6,CXCR5,BCL9L,MIR4492 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BCL9L 52590 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 118800245 118800827 118800413 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84 BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5928 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr11 120895811 120895984 120895886 Y GRIK4,TBCEL,TBCEL,TECTA TBCEL NA NA NA NA TBCEL 3030 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr11 121289334 121289764 121289479 Y SORL1 SORL1 SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 31148 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr11 121353016 121353670 121353326 Y SORL1 SORL1 NA NA NA NA SORL1 32104 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr11 121448904 121449244 121449069 Y SORL1 NA NA NA NA NA SORL1 127992 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 121526040 121526695 121526415 Y NA NA NA NA NA NA SORL1 205128 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 122527331 122527938 122527906 Y UBASH3B UBASH3B NA NA NA NA UBASH3B 2948 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr11 122568426 122568832 122568574 Y UBASH3B UBASH3B NA NA NA NA UBASH3B 44043 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chr11 122584764 122585535 122585367 Y NA NA NA NA NA NA UBASH3B 60381 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 122587982 122588633 122588143 Y NA NA NA NA NA NA UBASH3B 63599 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 122614600 122615453 122614815 Y NA NA NA NA NA NA UBASH3B 90217 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.54589630515498 chr11 122888881 122889273 122889127 Y NA RPL34P23,SNORD14C,HSPA8 NA NA NA NA RPL34P23 15302 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 123002865 123003144 123002952 Y NA NA NA NA NA NA HSPA8 70927 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 123234100 123234303 123234163 Y NA NA NA NA NA NA AP000783.1 64755 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.68643233289634 chr11 123352361 123352657 123352509 Y OR8D4,OR6M1 NA CLMP IMR90 Hi-C 24141950 AP000783.1 53303 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 123415728 123416106 123415962 Y NA NA NA NA NA NA AP000783.1 116670 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 123605051 123605192 123605122 Y NA ZNF202 NA NA NA NA ZNF202 5191 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 123941712 123941923 123941829 Y OR8B12,OR8G2 VWA5A PANX3,OR8B2,VWA5A,OR8A1 IMR90 Hi-C 24141950 VWA5A 42146 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 124611800 124612504 124612072 Y NA SIAE,NRGN,RP11-677M14.2,RP11-677M14.3,ESAM NA NA NA NA RP11-677M14.2 1729 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 125985079 125985242 125985162 Y CDON,ST3GAL4 NAP1L1P1 HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 NAP1L1P1 49645 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr11 125985923 125986168 125986013 Y NA NA HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 NAP1L1P1 50489 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr11 126032961 126033284 126033106 Y PATE2,PATE3 FAM118B,RPUSD4 CDON,DDX25,HYLS1,PUS3 IMR90 Hi-C 24141950 FAM118B 46025 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr11 126084365 126084425 126084397 Y NA FAM118B,RPUSD4 NA NA NA NA RPUSD4 4778 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr11 126347815 126348099 126347972 Y NA NA NA NA NA NA ST3GAL4 124280 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 128422991 128423282 128423121 Y ETS1 ETS1 NA NA NA NA ETS1 32171 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr11 128480883 128481272 128481046 Y ETS1,FLI1,FLI1 ETS1 ETS1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 25430 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 128579282 128579748 128579400 Y FLI1,FLI1 FLI1 NA NA NA NA FLI1 24852 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 128584156 128584534 128584279 Y NA FLI1 NA NA NA NA FLI1 29726 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 128596798 128597188 128596845 Y FLI1,FLI1 FLI1 NA NA NA NA FLI1 42368 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 129871629 129871941 129871631 Y NA PRDM10,TCEB2P2 NA NA NA NA PRDM10 899 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 130253238 130253357 130253298 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS15 63512 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 130969081 130969230 130969156 Y NA NA NTM IMR90 Hi-C 24141950 SNX19 184677 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 131629109 131629340 131629225 Y NA NA NA NA NA NA NTM 390736 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr11 134124453 134124658 134124640 Y NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2 VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8 NA NA NA NA ACAD8 3064 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 685193 685500 685436 Y NA NA NA NA NA NA RP11-218M22.1 52557 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 860254 860664 860544 Y RAD52,NINJ2,WNK1 WNK1 NA NA NA NA WNK1 495 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 1314182 1314497 1314340 Y NA NA LOC100292680 IMR90 Hi-C 24141950 ERC1 216507 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 1387073 1387485 1387229 Y ERC1 NA NA NA NA NA ERC1 289398 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 1698560 1698670 1698614 Y FBXL14 FBXL14 NA NA NA NA FBXL14 2661 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 1770869 1771337 1771069 Y LRTM2,ADIPOR2 ADIPOR2 NA NA NA NA ADIPOR2 24403 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 3334572 3334968 3334768 Y NA RP11-543P15.1 NA NA NA NA RP11-543P15.1 15476 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr12 4252128 4252433 4252201 Y EFCAB4B,PARP11,CCND2,C12orf4 NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf5 175938 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr12 4378284 4379414 4378568 Y PARP11,C12orf4,CCND2,C12orf5 C12orf5 PARP11 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf5 48957 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 4543974 4544184 4544124 Y NA NA NA NA NA NA C12orf4 101490 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 4938668 4939292 4938830 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA9 182407 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr12 6311406 6311775 6311432 Y NA CD9 NA NA NA NA CD9 4525 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 6325035 6325634 6325452 Y NA CD9 NA NA NA NA CD9 18154 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 6445143 6445640 6445507 Y VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A TNFRSF1A NA NA NA NA TNFRSF1A 3640 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 6616640 6616858 6616680 Y NA VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH,IFFO1 NA NA NA NA SCARNA10 530 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 6741558 6741663 6741593 Y VAMP1,LAG3,LPAR5,LPAR5 CHD4,LPAR5,ACRBP,ING4 NA NA NA NA LPAR5 1950 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr12 6901334 6901468 6901401 Y NA PTMS,MLF2,CD4 NA NA NA NA CD4 7310 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 7040569 7040832 7040702 Y NA SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,PTPN6,EMG1,PHB2 NA NA NA NA ATN1 8943 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 8059074 8059227 8059161 Y NA SLC2A3 NA NA NA NA SLC2A3 27644 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 8123169 8123746 8123395 Y CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3 SLC2A3 SLC2A3,FOXJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC2A3 36298 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 8179132 8179551 8179335 Y NA FOXJ2 PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 3748 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 8310487 8310665 8310587 Y NA NA NA NA NA NA NECAP1 77680 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 8797579 8797828 8797667 Y NA SCARNA11,RIMKLB NA NA NA NA RIMKLB 34368 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 8840377 8840836 8840579 Y RIMKLB RIMKLB RIMKLB MCF7 ChIA-PET 22265404 RIMKLB 8181 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 9802084 9802505 9802358 Y CLECL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D RP11-705C15.4,CLEC2D NA NA NA NA RP11-705C15.4 3479 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 9803369 9803672 9803507 Y KLRF1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D RP11-705C15.4,CLEC2D NA NA NA NA RP11-705C15.4 4764 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 9804148 9804385 9804240 Y CLECL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D RP11-705C15.4,CLEC2D NA NA NA NA RP11-705C15.4 5543 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 9855016 9855380 9855049 Y KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2B,CLECL1,CD69 CLEC2D NA NA NA NA CLEC2D 39451 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 9874465 9874635 9874556 Y CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2B,CLECL1 CD69 NA NA NA NA CD69 36862 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 9884485 9884690 9884558 Y OLR1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CLECL1,CD69 CD69 NA NA NA NA CD69 26807 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 9917181 9917686 9917498 Y KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D,OLR1,KLRF1,GABARAPL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CD69 CD69 NA NA NA NA CD69 5684 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 10515405 10515669 10515567 Y NA KLRK1 NA NA NA NA KLRK1 26804 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 10517487 10517775 10517755 Y NA KLRK1 NA NA NA NA KLRK1 24698 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 11926847 11927297 11927011 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 126059 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 11951921 11952163 11952067 Y ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 151133 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 11987992 11988316 11988087 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 187204 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 12032964 12033203 12033084 Y BCL2L14 NA NA NA NA NA RP11-267J23.4 228894 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 12889732 12889911 12889754 Y LOH12CR1,DUSP16,GPR19,CDKN1B,APOLD1 CDKN1B NA NA NA NA CDKN1B 23740 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 13251588 13252400 13252038 Y EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 56370 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 13253893 13254547 13254171 Y CDKN1B,EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 58675 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chr12 13332644 13332915 13332868 Y NA NA EMP1,KIAA1467 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1467 137426 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 14410616 14411017 14410842 Y PLBD1 NA ATF7IP IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATF7IP 105593 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 15110831 15110963 15110879 Y NA ARHGDIB ERP27 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGDIB 1699 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 15899366 15899730 15899546 Y PTPRO NA NA NA NA NA STRAP 133595 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 16553699 16554214 16553898 Y NA NA NA NA NA NA DERA 491593 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr12 18511225 18511610 18511392 Y NA NA NA NA NA NA RP11-871F6.2 959892 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 19566135 19566181 19566158 Y NA AEBP2,EEF1A1P4 NA NA NA NA AEBP2 11156 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 22779557 22779668 22779574 Y NA ETNK1 NA NA NA NA ETNK1 3548 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 24062598 24062930 24062672 Y SOX5 NA NA NA NA NA BCAT1 1037463 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 24873069 24873359 24873202 Y NA NA SOX5,LINC00477 IMR90 Hi-C 24141950 BCAT1 227034 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 25086735 25086929 25086817 Y NA BCAT1 NA NA NA NA BCAT1 13464 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 25099512 25100288 25099550 Y BCAT1 BCAT1,C12orf77 NA NA NA NA BCAT1 105 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 25380896 25381137 25381017 Y NA CASC1,LYRM5,KRAS NA NA NA NA KRAS 20733 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 25402760 25403150 25403054 Y LRMP,CASC1,KRAS KRAS NA NA NA NA KRAS 890 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 25445837 25446089 25445962 Y BCAT1 KRAS NA NA NA NA KRAS 43967 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 25538390 25538869 25538521 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 136520 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 137212 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 8.0105535812576 chr12 26658315 26658658 26658486 Y NA NA NA NA NA NA ITPR2 325473 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 27006268 27006662 27006518 Y NA ITPR2 ITPR2,TM7SF3 IMR90 Hi-C 24141950 ITPR2 22137 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 29256492 29256711 29256590 Y NA FAR2 NA NA NA NA FAR2 43325 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 29312653 29312987 29312866 Y NA FAR2 FAR2 IMR90 Hi-C 24141950 FAR2 12617 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 29317763 29317994 29317897 Y NA FAR2 NA NA NA NA FAR2 17727 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 30570849 30571198 30571024 Y NA NA NA NA NA NA IPO8 275722 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 31469690 31470116 31469962 Y NA FAM60A NA NA NA NA FAM60A 7876 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 31905440 31905706 31905591 Y AMN1,H3F3C AMN1,H3F3C NA NA NA NA AMN1 25332 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr12 31909925 31910440 31910295 Y AMN1,H3F3C AMN1,H3F3C AMN1 K562 ChIA-PET 22265404 AMN1 29817 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 32426821 32426960 32426892 Y NA NA NA NA NA NA BICD1 169052 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 39766876 39767120 39766998 Y NA NA NA NA NA NA RPL30P13 693272 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 41680022 41680168 41680092 Y PDZRN4 NA NA NA NA NA YAF2 949983 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 45703000 45703363 45703138 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA8P1 95176 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 45820263 45820702 45820515 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA8P1 212439 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 46272544 46272693 46272552 Y ARID2,SLC38A1,SCAF11 NA NA NA NA NA SCAF11 111210 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 46603605 46603977 46603918 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A1 57823 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 46614251 46614418 46614333 Y NA SLC38A1 NA NA NA NA SLC38A1 47382 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 46809510 46809878 46809694 Y NA SLC38A2,RP11-96H19.1 SLC38A4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 34048 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 47057089 47057400 47057270 Y NA NA SLC38A2,SLC38A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 281627 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 47185736 47186095 47186020 Y NA NA NA NA NA NA RP11-96H19.1 410274 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 47596373 47596459 47596419 Y NA PCED1B-AS1 NA NA NA NA PCED1B-AS1 11780 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 47606052 47606349 47606300 Y FAM113B PCED1B-AS1 NA NA NA NA PCED1B-AS1 1890 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 47787801 47788194 47788086 Y NA NA AMIGO2,RPAP3 IMR90 Hi-C 24141950 PCED1B-AS1 179562 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 48579978 48580344 48580161 Y OR8S1,OR10AD1 ASB8,C12orf68 NA NA NA NA C12orf68 4612 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 49276307 49276420 49276362 Y OR8S1,RND1 DDX23,RND1,CCDC65,FKBP11 RND1,CACNB3,DDX23,ARF3,WNT10B,FKBP11,DDN,WNT1,PRKAG1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RND1 18626 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 49508076 49508435 49508256 Y NA RHEBL1,LMBR1L,RP11-386G11.10,TUBA1B NA NA NA NA LMBR1L 5393 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 49628278 49628526 49628405 Y LMBR1L,TUBA1A TUBA1C,TUBA1A DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1A 47171 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr12 50056796 50057319 50056974 Y TMBIM6,NCKAP5L,FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 42189 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 50092156 50092464 50092310 Y FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 7044 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 50932147 50932418 50932300 Y SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,DIP2B DIP2B NA NA NA NA DIP2B 35379 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 51768324 51768713 51768389 Y NA NA BIN2,CELA1 IMR90 Hi-C 24141950 SMAGP 105650 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 52279748 52280043 52279838 Y NR4A1 NA NA NA NA NA ACVR1B 63408 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr12 52426547 52427164 52426822 Y NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP GRASP,NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 11931 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 52950129 52950435 52950283 Y KRT82 NA NA NA NA NA KRT80 366345 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 53264136 53264576 53264217 Y PFDN5 NA KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85,KRT80,KRT18,KRT8 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EIF4B 133366 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 53267781 53268340 53268093 Y PFDN5 NA KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404 MCF7 ChIA-PET 22265404 EIF4B 129602 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 53312254 53312405 53312393 Y NA NA NA NA NA NA EIF4B 85537 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 53615195 53615822 53615501 Y CSAD,SP1,PRR13,PFDN5 ZNF740,CSAD,ITGB7,RARG,MFSD5,ESPL1 NA NA NA NA RARG 8942 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 53731844 53731991 53731931 Y NA PFDN5,C12orf10,RP11-680A11.5,AAAS,SP1 NA NA NA NA AAAS 15196 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 54133160 54133497 54133297 Y ATF7,ATP5G2 CALCOCO1,SNORD81 ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5 IMR90 Hi-C 24141950 CALCOCO1 13631 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr12 54145140 54145515 54145243 Y NA CALCOCO1,SNORD81 ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5,HOXC8,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,HNRNPA1,HOXC10 IMR90 Hi-C 24141950 CALCOCO1 25611 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 54147716 54148178 54147916 Y ESPL1,HOXC4 CALCOCO1,SNORD81 ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5,HOXC8,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,HNRNPA1,HOXC10 IMR90 Hi-C 24141950 CALCOCO1 28187 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 54149784 54149995 54149877 Y PCBP2,ATP5G2,HOXC13,HOXC11 CALCOCO1,SNORD81 ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5,HOXC8,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,HNRNPA1,HOXC10,HOXC11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALCOCO1 30255 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 54198975 54199124 54199050 Y NA SNORD81 HOXC12,HOXC13,SMUG1,HOTAIR,HOXC11,HOXC8,HOXC9,MIR196A2,HOXC10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNORD81 15886 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 54589708 54589846 54589777 Y CALCOCO1,NCKAP1L,GPR84 SMUG1 SMUG1,HOXC4,HOXC9 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SMUG1 8930 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 54610828 54611089 54611007 Y NA SMUG1 NA NA NA NA SMUG1 30050 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr12 54752671 54753884 54753119 Y NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84 NA NA NA NA NA ITGA5 57360 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 54949338 54949510 54949424 Y NA NA NA NA NA NA NCKAP1L 59843 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 54999697 54999798 54999745 Y NCKAP1L,PPP1R1A NA NA NA NA NA NCKAP1L 110202 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 55807914 55808439 55808095 Y NA NA NA NA NA NA BLOC1S1,RP11-644F5.10 299381 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 56132069 56132385 56132308 Y OR6C4,OR10P1,SMARCC2,IKZF4 BLOC1S1,RP11-644F5.10,ITGA7,RP11-644F5.11,CD63,GDF11 NA NA NA NA GDF11 2679 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 56219844 56220081 56219962 Y OR6C3 SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14 NA NA NA NA TMEM198B 1448 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 57026164 57026397 57026368 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 2203 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr12 57073427 57073817 57073648 Y NA BAZ2A,ATP5B,PTGES3,NACA NA NA NA NA PTGES3 6342 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 57077806 57078249 57078184 Y COQ10A,PAN2,PAN2 BAZ2A,ATP5B,PTGES3,NACA NA NA NA NA PTGES3 1910 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr12 57094657 57094840 57094721 Y STAT2,STAT6,NAB2 PTGES3,NACA,PRIM1 NA NA NA NA PTGES3 14498 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 57458942 57459239 57459094 Y NA TMEM194A,NAB2 TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM194A 20607 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 57512672 57512926 57512798 Y NAB2 TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6 TMEM194A,STAT6,LRP1,STAC3,SHMT2,NDUFA4L2 IMR90 Hi-C 24141950 LRP1 7350 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 57520981 57521279 57521090 Y NA TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6 NA NA NA NA LRP1 705 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 57813803 57814254 57814252 Y NA R3HDM2,INHBE,GLI1 NA NA NA NA R3HDM2 8534 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 58168960 58169095 58169042 Y TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM TSPAN31,AGAP2,MARCH9,CDK4,METTL21B,METTL1,RP11-571M6.15,TSFM NA NA NA NA RP11-571M6.15 4149 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 58349067 58349080 58349075 Y XRCC6BP1 RP11-620J15.3,XRCC6BP1 NA NA NA NA XRCC6BP1 15743 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 59426251 59426629 59426440 Y LRIG3,LRIG3 NA NA NA NA NA SLC16A7 561219 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 63026443 63026842 63026744 Y NA RP11-631N16.2,MIRLET7I NA NA NA NA MIRLET7I 30977 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 63149457 63149757 63149616 Y NA NA NA NA NA NA MIRLET7I 153991 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 65005842 65006280 65005896 Y GNS,C12orf66,TBK1,RASSF3 RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 3549 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 66570433 66570548 66570504 Y NA RP11-745O10.2,LLPH,TMBIM4 TMBIM4,IRAK3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TMBIM4 8581 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 66628292 66629290 66628922 Y TMBIM4,IRAK3,HELB NA NA NA NA NA HELB 65035 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 68758917 68759565 68759229 Y IFNG,RAP1B MDM1 RAP1B,NUP107,LOC100507250 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MDM1 34756 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr12 69163885 69164101 69163897 Y SLC35E3 SLC35E3,MDM2 NA NA NA NA SLC35E3 25999 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 69200663 69200867 69200763 Y CPSF6,CPM,CPM,MDM1,RAP1B,NUP107,SLC35E3,MDM2 MDM2 NA NA NA NA MDM2 707 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 69227269 69227544 69227345 Y SLC35E3 MDM2 NA NA NA NA MDM2 27313 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr12 69305634 69305702 69305668 Y RAP1B,LYZ,CPM,CPM NA NA NA NA NA CPM 57648 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 69724869 69725108 69724964 Y LYZ RP11-1143G9.2,LYZ,YEATS4 YEATS4 K562 ChIA-PET 22265404 LYZ 15013 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr12 70603919 70603997 70603958 Y NA CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA CNOT2 30777 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 70633612 70633702 70633681 Y NA CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA CNOT2 1072 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 70644560 70644959 70644584 Y NA CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA RP11-611E13.2 9420 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 71697189 71697197 71697193 Y NA NA NA NA NA NA LGR5 134353 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 75878955 75879237 75879096 Y NA KRR1 NA NA NA NA KRR1 24179 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 76178520 76178723 76178659 Y NA NA PHLDA1,KRR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHLDA1 246989 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr12 76209246 76209451 76209339 Y NA NA PHLDA1,NAP1L1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PHLDA1 216261 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 76849053 76849336 76849202 Y OSBPL8 NA NA NA NA NA OSBPL8 102253 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 77456593 77456922 77456786 Y E2F7 E2F7 NA NA NA NA E2F7 438 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr12 79325321 79325633 79325477 Y SYT1 NA NA NA NA NA RP11-84G21.1 1001048 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 79526323 79526826 79526502 Y SYT1 NA NA NA NA NA RP11-84G21.1 799855 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 80305277 80305475 80305376 Y NA RP11-84G21.1,PPP1R12A NA NA NA NA RP11-84G21.1 21206 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 80327802 80327850 80327826 Y NA RP11-84G21.1,PPP1R12A NA NA NA NA PPP1R12A 562 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 88527986 88528043 88528042 Y NA CEP290,TMTC3 NA NA NA NA CEP290 5950 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 88703962 88704349 88704186 Y NA NA KITLG IMR90 Hi-C 24141950 TMTC3 169889 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 89560213 89560727 89560437 Y POC1B,DUSP6,ATP2B1 NA POC1B,LOC728084 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP6 184321 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 89740084 89740418 89740292 Y POC1B,ATP2B1,DUSP6 DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 4630 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 89747699 89748479 89748073 Y NA DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 2651 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 92469930 92470196 92470132 Y BTG1 NA NA NA NA NA RP11-796E2.4 67153 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 92474192 92474586 92474423 Y BTG1 NA NA NA NA NA RP11-796E2.4 62763 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 92839025 92839432 92839153 Y BTG1,C12orf74,CLLU1OS NA NA NA NA NA BTG1 301352 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 92896154 92896581 92896501 Y BTG1,CLLU1 NA LOC256021 MCF7 ChIA-PET 22265404 BTG1 358481 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 92899278 92900031 92899712 Y EEA1,BTG1 NA NA NA NA NA BTG1 361605 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 92932983 92933476 92933230 Y EEA1,BTG1 NA NA NA NA NA EEA1 387631 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 92933886 92934489 92934178 Y BTG1 NA NA NA NA NA EEA1 386618 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 93277124 93277496 93277306 Y NA EEA1 NA NA NA NA EEA1 43611 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 93762169 93762549 93762358 Y NA NUDT4 NA NA NA NA NUDT4 7110 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 93987803 93987940 93987870 Y NA SOCS2,SOCS2-AS1 NA NA NA NA SOCS2-AS1 24259 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr12 94178297 94178734 94178344 Y CRADD NA NA NA NA NA CRADD 109146 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 94241673 94241891 94241710 Y NA NA NA NA NA NA CRADD 172522 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr12 94598751 94598891 94598845 Y TMCC3,PLXNC1 NA NA NA NA NA PLXNC1 58252 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 94773845 94774167 94774046 Y PLXNC1,TMCC3 NA NA NA NA NA CCDC41 77597 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 94817703 94818348 94818256 Y NA CCDC41 NA NA NA NA CCDC41 33416 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 94919144 94919451 94919150 Y NA NA PLXNC1 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC41 67380 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 94954640 94954945 94954835 Y NA NA NA NA NA NA TMCC3 87393 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr12 95043067 95043319 95043087 Y TMCC3 TMCC3 NA NA NA NA TMCC3 729 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chr12 95115043 95115252 95115128 Y NA NA PLXNC1 IMR90 Hi-C 24141950 TMCC3 72705 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr12 95404686 95404921 95404803 Y NA NDUFA12 NA NA NA NA NDUFA12 9140 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 96589359 96589977 96589479 Y LTA4H,ELK3 ELK3 NA NA NA NA ELK3 3199 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 96637849 96638243 96638007 Y LTA4H,ELK3,CDK17 NA NA NA NA NA ELK3 51689 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 96642925 96643253 96643074 Y CDK17 NA NA NA NA NA ELK3 56765 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 96650909 96650966 96650937 Y NA NA NA NA NA NA ELK3 64749 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 96794959 96795305 96795211 Y CDK17 CDK17 NA NA NA NA CDK17 2621 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 97419019 97419389 97419102 Y NA NA NA NA NA NA NEDD1 120018 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 98424926 98425154 98425040 Y NA NA NA NA NA NA TMPO 482136 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 98934224 98934627 98934333 Y NA TMPO,TMPO-AS1 NA NA NA NA TMPO-AS1 26024 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 99103586 99103986 99103782 Y NA NA NA NA NA NA APAF1 66667 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 102215696 102215835 102215766 Y NA GNPTAB NA NA NA NA GNPTAB 6881 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 104330398 104330552 104330475 Y NA HSP90B1,C12orf73,TDG NA NA NA NA HSP90B1 8513 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 104693849 104694220 104693862 Y NA RPL18AP3 NA NA NA NA RPL18AP3 36793 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 104791559 104791875 104791716 Y TXNRD1 NA CHST11,SLC41A2,C12orf45 IMR90 Hi-C 24141950 CHST11 55198 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 104872178 104872670 104872343 Y HCFC2,EID3,CHST11 CHST11 NA NA NA NA CHST11 25105 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr12 105032549 105032903 105032843 Y CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 185476 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 105038686 105039023 105038871 Y CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 191613 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 105089120 105089756 105089331 Y CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 242047 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 107153976 107154194 107154103 Y RFX4,RIC8B RIC8B NA NA NA NA RIC8B 12179 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr12 108103294 108103307 108103300 Y PRDM4 PWP1,PRDM4 NA NA NA NA PWP1 25785 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 108783050 108783376 108783111 Y NA NA WSCD2,CMKLR1 IMR90 Hi-C 24141950 FICD 123586 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 108989761 108990124 108989943 Y NA SART3,ISCU,RP11-689B22.2,SELPLG NA NA NA NA TMEM119 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 109030971 109031245 109031128 Y NA TMEM119,RP11-689B22.2,SELPLG NA NA NA NA SELPLG 5236 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 109032155 109032517 109032383 Y NA TMEM119,RP11-689B22.2,SELPLG ISCU,TMEM119,SELPLG IMR90 Hi-C 24141950 SELPLG 6420 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 109035890 109036155 109035901 Y NA TMEM119,RP11-689B22.2,SELPLG NA NA NA NA SELPLG 10155 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 109083720 109083964 109083780 Y SSH1 CORO1C NA NA NA NA CORO1C 39408 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 109117977 109118365 109118310 Y SELPLG,SSH1,CORO1C CORO1C NA NA NA NA CORO1C 5007 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 110540205 110540443 110540322 Y NA C12orf76,IFT81 ANKRD13A,C12orf76,IFT81,ATP2A2,ANAPC7,ARPC3,GPN3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFT81 19697 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 110707461 110707714 110707625 Y NA ATP2A2 ANKRD13A,ATP2A2,C12orf76,GIT2,IFT81 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP2A2 8847 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 110750652 110751139 110750939 Y NA ATP2A2 NA NA NA NA ATP2A2 34091 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 111016111 111016444 111016311 Y PPTC7,ARPC3 PPTC7,TCTN1 NA NA NA NA PPTC7 2681 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 111023118 111023488 111023332 Y ARPC3,PPTC7 PPTC7,TCTN1 RAD9B IMR90 Hi-C 24141950 PPTC7 3993 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 111028698 111029042 111028796 Y ARPC3,PPTC7,HVCN1 PPTC7,TCTN1 PPTC7,GPN3,FAM216A,VPS29,RAD9B,PPP1CC,TCTN1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPTC7 9573 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 111043428 111043840 111043517 Y ARPC3,PPTC7,HVCN1,HVCN1 PPTC7,TCTN1 GPN3,FAM216A,RAD9B,PPTC7,C12orf76,TCTN1,ARPC3,VPS29,HVCN1,PPP1CC IMR90 Hi-C 24141950 TCTN1 5992 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 111842634 111842962 111842759 Y NA FAM109A,SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 882 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr12 111866764 111867021 111866784 Y ALDH2,SH2B3 SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 25012 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 111875686 111876044 111875771 Y BRAP,SH2B3 SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 33934 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 111904763 111905142 111904953 Y ALDH2,ATXN2 NA NA NA NA NA SH2B3 63011 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 112545862 112545946 112545885 Y NA NAA25,TRAFD1 NA NA NA NA NAA25 1036 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 112554455 112554606 112554536 Y ALDH2,TRAFD1 NAA25,TRAFD1 TRAFD1,NAA25 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TRAFD1 6699 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 112633664 112633952 112633817 Y NA NA TRAFD1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAFD1 72359 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 112741741 112742068 112741904 Y NA NA NA NA NA NA PTPN11 112087 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 113490228 113490419 113490324 Y DTX1 DTX1 NA NA NA NA DTX1 2095 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chr12 113513069 113513377 113513212 Y DTX1,DDX54 DTX1 NA NA NA NA DTX1 20555 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 113524315 113524473 113524399 Y DTX1 DTX1,RASAL1 NA NA NA NA DTX1 31801 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr12 114200256 114200532 114200390 Y NA NA NA NA NA NA RBM19 201644 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 115865739 115865767 115865753 Y NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 847376 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 116661909 116662288 116662266 Y NA NA NA NA NA NA MED13L 50855 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 116701070 116701373 116701314 Y MAP1LC3B2,MED13L MED13L NA NA NA NA MED13L 11770 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 117241332 117241427 117241370 Y C12orf49,HRK NA NA NA NA NA RNFT2 67236 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 117255942 117256291 117256058 Y NA NA NA NA NA NA HRK 60955 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.40536027741361 chr12 117988619 117988948 117988784 Y NOS1,NOS1 NA NA NA NA NA FBXO21 362283 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 118313927 118314150 118314016 Y NA NA NA NA NA NA KSR2 90638 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 118632324 118632442 118632383 Y NA RPS2P5 PEBP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPS2P5 49435 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 118795182 118795561 118795499 Y TAOK3 TAOK3,SUDS3 NA NA NA NA TAOK3 13189 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 118815733 118815925 118815736 Y TAOK3 TAOK3,SUDS3 NA NA NA NA SUDS3 3548 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 119079795 119080190 119079993 Y NA NA LOC144742 IMR90 Hi-C 24141950 SNORA38 244179 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 120179533 120179605 120179597 Y NA NA NA NA NA NA PRKAB1 75975 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 120426531 120426889 120426594 Y NA NA NA NA NA NA CIT 113436 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 120639993 120640274 120640078 Y NA GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1 NA NA NA NA PXN-AS1 2899 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 120906143 120906276 120906236 Y RAB35 COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1 NA NA NA NA DYNLL1 490 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 120956227 120956384 120956265 Y COQ5 RNF10,COQ5 NA NA NA NA RNF10 12899 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 121268399 121268878 121268839 Y NA NA NA NA NA NA SPPL3 71296 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 121533843 121533975 121533917 Y NA P2RX7 ACADS,UNC119B,P2RX4,POP5,CABP1,MLEC,SPPL3,C12orf43,OASL,P2RX7,CAMKK2 IMR90 Hi-C 24141950 P2RX7 34647 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 121715307 121715461 121715407 Y OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2 CAMKK2 NA NA NA NA CAMKK2 18650 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 121838748 121839039 121838846 Y SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 2904 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 121839154 121839422 121839290 Y C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 3310 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr12 121864200 121864449 121864234 Y NA ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 28356 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 121904317 121904475 121904368 Y SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B NA RNF34 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF34 68473 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 121976471 121976819 121976719 Y NA RP13-941N14.1,KDM2B NA NA NA NA RP13-941N14.1 39878 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 122020162 122020238 122020212 Y RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3242 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr12 122028609 122028883 122028798 Y RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1 RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 KDM2B K562 ChIA-PET 22265404 KDM2B 11689 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 122227826 122228273 122227974 Y CAMKK2,KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF RHOF,AC084018.1,SETD1B NA NA NA NA RHOF 11036 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 122444524 122444823 122444769 Y BCL7A BCL7A NA NA NA NA BCL7A 10505 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 122462187 122462386 122462358 Y BCL7A BCL7A,AC156455.1 NA NA NA NA BCL7A 6859 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr12 122462417 122462775 122462615 Y BCL7A BCL7A,AC156455.1 NA NA NA NA BCL7A 7089 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 122517490 122517922 122517629 Y RSRC2,KDM2B,SETD1B,MLXIP AC156455.1,MLXIP NA NA NA NA MLXIP 2862 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr12 122518432 122518585 122518507 Y MLXIP AC156455.1,MLXIP NA NA NA NA MLXIP 3804 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 122519763 122520228 122519936 Y ZCCHC8,RSRC2,ORAI1,SETD1B,MLXIP AC156455.1,MLXIP NA NA NA NA MLXIP 5135 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.40536027741361 chr12 122908043 122908483 122908329 Y ZCCHC8,DENR,CLIP1 CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 2864 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.40536027741361 chr12 123352500 123352698 123352696 Y VPS37B HIP1R,VPS37B NA NA NA NA VPS37B 26293 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 123616405 123617083 123616761 Y ABCB9,MPHOSPH9,C12orf65,C12orf65,C12orf65 PITPNM2 PITPNM2,ARL6IP4,ABCB9,OGFOD2,LOC100507091,MPHOSPH9 IMR90 Hi-C 24141950 PITPNM2 15479 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 123636095 123636496 123636485 Y NA PITPNM2 NA NA NA NA PITPNM2 3533 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 123762972 123763139 123763056 Y RILPL2 C12orf65,MPHOSPH9,RP11-282O18.3,CDK2AP1 NA NA NA NA CDK2AP1 8091 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 124198913 124199092 124199012 Y ATP6V0A2 TCTN2,ATP6V0A2 NA NA NA NA ATP6V0A2 4048 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 124916261 124916578 124916546 Y NA NA NA NA NA NA NCOR2 133557 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 124951666 124951729 124951686 Y NA NA NA NA NA NA NCOR2 98406 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 125201534 125201787 125201608 Y UBC NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 NCOR2 151399 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 125353523 125353887 125353860 Y NA SCARB1,UBC NA NA NA NA SCARB1 11327 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 125369233 125369624 125369429 Y NA SCARB1,UBC UBC K562 ChIA-PET 22265404 SCARB1 4019 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 125400956 125401141 125401046 Y UBC SCARB1,UBC NA NA NA NA UBC 1042 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 125403508 125403991 125403767 Y UBC SCARB1,UBC NCOR2,SCARB1,UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 3594 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 125424077 125424667 125424516 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 24163 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr12 125550830 125551017 125550923 Y NA AACS NA NA NA NA AACS 2905 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 129296403 129296565 129296505 Y SLC15A4,GLT1D1 SLC15A4 NA NA NA NA SLC15A4 9963 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 129314364 129314712 129314516 Y SLC15A4,GLT1D1 SLC15A4 SLC15A4 K562 ChIA-PET 22265404 SLC15A4 7836 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 131058824 131059096 131058850 Y NA NA RIMBP2 IMR90 Hi-C 24141950 STX2 262715 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr12 131401405 131401729 131401507 Y NA RAN NA NA NA NA RAN 46981 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chr12 131513179 131513358 131513281 Y GPR133 NA NA NA NA NA RAN 158755 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr12 131707348 131707723 131707417 Y NA NA NA NA NA NA RAN 352924 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr12 132293483 132293821 132293495 Y NA NA NA NA NA NA ULK1 83375 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chr12 133016189 133016370 133016267 Y FBRSL1 FBRSL1 GALNT9,EP400NL,POLE,P2RX2 IMR90 Hi-C 24141950 FBRSL1 47767 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr12 133414550 133414990 133414881 Y NA RPS11P5,GOLGA3 GOLGA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GOLGA3 11106 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr12 133701272 133701384 133701332 Y ZNF605,ZNF605,ZNF26,ZNF84,ZNF84,ZNF268,ZNF268,ZNF10 ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268 NA NA NA NA ZNF891 3675 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr13 20624080 20624132 20624092 Y NA NA NA NA NA NA ZMYM2 93270 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr13 20644269 20644474 20644387 Y ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2 NA NA NA NA NA ZMYM2 113459 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 20693405 20693544 20693484 Y CRYL1 NA NA NA NA NA ZMYM2 162595 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr13 20993930 20994321 20994126 Y NA NA NA NA NA NA CRYL1 103675 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 21015788 21016178 21015983 Y NA NA NA NA NA NA CRYL1 81818 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 22135396 22135683 22135678 Y EFHA1 NA NA NA NA NA RPS7P10 65471 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 22242983 22243087 22242992 Y NA RPS7P10,FGF9 NA NA NA NA FGF9 435 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr13 22243438 22243610 22243458 Y FGF9 RPS7P10 NA NA NA NA FGF9 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr13 22249294 22249707 22249608 Y FGF9 RPS7P10,FGF9 NA NA NA NA FGF9 5772 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr13 23458655 23458830 23458775 Y NA NA NA NA NA NA FTH1P7 189942 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 23733450 23734509 23733658 Y NA HMGA1P6 NA NA NA NA HMGA1P6 27137 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 24365850 24365860 24365855 Y NA NA NA NA NA NA C1QTNF9B-AS1 95168 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 24841578 24841694 24841650 Y PARP4 NA NA NA NA NA PARP4 243254 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 25115809 25116061 25115886 Y RNF17 PARP4 NA NA NA NA PARP4 30861 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 25880585 25880813 25880618 Y MTMR6,NUPL1 MTMR6,NUPL1 NA NA NA NA NUPL1 6923 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 26760531 26760858 26760712 Y WASF3 RNF6 WASF3,RNF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF6 33933 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr13 28005406 28005795 28005597 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA GTF3A 8725 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 28006253 28006341 28006297 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA GTF3A 9572 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr13 28010544 28010826 28010685 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA MTIF3 11913 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 28762730 28762825 28762778 Y NA EEF1A1P3 NA NA NA NA EEF1A1P3 23825 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 28787263 28787277 28787270 Y NA EEF1A1P3 NA NA NA NA EEF1A1P3 613 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 30808184 30808483 30808334 Y NA NA NA NA NA NA PRDX2P1 59801 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 30982567 30982782 30982669 Y NA LINC00426,LINC01058 KATNAL1,LINC00426,USPL1,UBL3,HMGB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC01058 11592 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 31264554 31264674 31264586 Y USPL1,ALOX5AP,ALOX5AP ALOX5AP HMGB1,USPL1,ALOX5AP,TEX26-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ALOX5AP 42971 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr13 32620673 32620873 32620777 Y N4BP2L2,N4BP2L2,N4BP2L1,BRCA2,FRY NA NA NA NA NA EEF1DP3 201695 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 33925449 33925669 33925575 Y NA STARD13 NA NA NA NA STARD13 2682 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 33927374 33927704 33927592 Y NA STARD13 NA NA NA NA STARD13 4607 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 34116442 34117241 34116673 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 193675 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr13 40467096 40467440 40467155 Y NA NA NA NA NA NA COG6 239332 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 40962857 40963140 40963012 Y FOXO1 NA NA NA NA NA FOXO1 275594 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 41155313 41155672 41155493 Y NA NA NA NA NA NA FOXO1 83062 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr13 41187555 41187952 41187790 Y ELF1,ELF1,FOXO1 NA NA NA NA NA FOXO1 50782 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr13 41202839 41203181 41203053 Y NA FOXO1 NA NA NA NA FOXO1 35553 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr13 41226066 41226446 41226348 Y NA FOXO1 NA NA NA NA FOXO1 12288 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 41468341 41468634 41468483 Y NA SUGT1P3 NA NA NA NA SUGT1P3 25276 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 41574237 41574406 41574394 Y FOXO1,NAA16,ELF1,ELF1 NA NA NA NA NA WBP4 59004 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 41581586 41581700 41581679 Y NA NA NA NA NA NA WBP4 51710 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr13 41591294 41591779 41591504 Y C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1 WBP4,ELF1 NA NA NA NA WBP4 41631 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 41651625 41651882 41651685 Y NA WBP4,ELF1 NA NA NA NA ELF1 18049 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 42219317 42219744 42219583 Y NAA16,C13orf15 NA NA NA NA NA NAA16 335976 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 42228867 42229175 42229114 Y NAA16,C13orf15 NA NA NA NA NA NAA16 345526 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 42509903 42509914 42509909 Y NA NA NA NA NA NA AKAP11 334375 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 42855017 42855240 42855076 Y AKAP11 AKAP11 NA NA NA NA AKAP11 10728 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr13 43632661 43632965 43632672 Y NA NA NA NA NA NA ENOX1 726079 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 43912615 43912772 43912726 Y NA NA NA NA NA NA ENOX1 446272 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 44028316 44028697 44028507 Y NA NA NA NA NA NA ENOX1 330347 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 44446151 44446617 44446342 Y NA CCDC122 NA NA NA NA CCDC122 5210 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 44542732 44543742 44543446 Y SERP2 NA SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC122 90905 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr13 44848357 44848873 44848719 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA SERP2,NUFIP1,TSC22D1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 300410 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr13 45492137 45492940 45492235 Y TSC22D1 NA NA NA NA NA NUFIP1 68678 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr13 46557145 46557532 46557508 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H13 67362 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 46750972 46751177 46751169 Y ZC3H13,C13orf18,LCP1 LCP1,LRRC63 NA NA NA NA LCP1 32829 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 47128078 47128394 47128310 Y LCP1,C13orf18,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 2775 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 47128564 47128952 47128887 Y LCP1,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 3261 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 47149300 47149814 47149489 Y NA LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 23997 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 48526121 48526135 48526130 Y MED4,SUCLA2 NA NA NA NA NA NUDT15 83568 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr13 48762461 48762855 48762658 Y NA ITM2B NA NA NA NA ITM2B 42439 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr13 48907859 48907955 48907897 Y NA LINC00441,RB1 NA NA NA NA RB1 31972 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 49145630 49145973 49145846 Y FNDC3A,RB1,LPAR6,RCBTB2 RCBTB2 RB1,LPAR6,RCBTB2,ITM2B IMR90 Hi-C 24141950 RCBTB2 40261 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 49153192 49153804 49153517 Y FNDC3A,ITM2B,RB1,LPAR6,RCBTB2 RCBTB2 ITM2B,RB1 IMR90 Hi-C 24141950 RCBTB2 47823 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 49433672 49433840 49433729 Y RCBTB2,FNDC3A NA FNDC3A,MLNR IMR90 Hi-C 24141950 PSME2P2 90408 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 49563041 49563333 49563220 Y RCBTB2,CYSLTR2,SETDB2,SETDB2,CDADC1,FNDC3A FNDC3A NA NA NA NA FNDC3A 14993 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 49615947 49616340 49616144 Y SETDB2,PHF11,PHF11,CAB39L,FNDC3A NA NA NA NA NA FNDC3A 67899 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 49761885 49761908 49761899 Y NA NA NA NA NA NA CDADC1 58139 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 50217217 50217337 50217325 Y SETDB2,SETDB2,PHF11,PHF11,ARL11 ARL11,EBPL NA NA NA NA ARL11 16782 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 50661413 50661685 50661628 Y NA MIR16-1,DLEU1,DLEU2 NA NA NA NA DLEU1 7106 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 51167597 51167659 51167628 Y RNASEH2B NA DLEU2,DLEU1,DLEU7 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 233698 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr13 51168515 51168827 51168588 Y RNASEH2B NA DLEU2,DLEU1,DLEU7 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 234616 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr13 51466138 51466579 51466443 Y RNASEH2B RNASEH2B,RNASEH2B-AS1 DLEU2,GUCY1B2,DLEU1 IMR90 Hi-C 24141950 RNASEH2B 15235 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr13 51467789 51467990 51467889 Y RNASEH2B RNASEH2B,RNASEH2B-AS1 DLEU2,DLEU1 IMR90 Hi-C 24141950 RNASEH2B 13824 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr13 51486183 51486653 51486377 Y RNASEH2B RNASEH2B,RNASEH2B-AS1 NA NA NA NA RNASEH2B-AS1 3335 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 51491068 51491415 51491243 Y RNASEH2B RNASEH2B,RNASEH2B-AS1 NA NA NA NA RNASEH2B-AS1 8220 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 51508208 51508301 51508255 Y NA RNASEH2B,RNASEH2B-AS1 NA NA NA NA RNASEH2B-AS1 25360 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 52406665 52407091 52406817 Y NA DHRS12,RP11-327P2.5 NA NA NA NA RP11-327P2.5 30232 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 52505834 52506318 52505967 Y NA NA NA NA NA NA ALG11 78216 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 53028749 53028807 53028779 Y NA VPS36,CKAP2 NA NA NA NA CKAP2 1185 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 53190916 53191040 53191000 Y NA HNRNPA1L2,MRPS31P4,SUGT1 NA NA NA NA MRPS31P4 1223 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 60580804 60581154 60581101 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 154967 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 60723538 60723946 60723707 Y NA DIAPH3 NA NA NA NA DIAPH3 12175 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr13 67146891 67147210 67147207 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 655258 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 67568177 67568566 67568563 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 233902 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr13 71340580 71340843 71340601 Y NA NA NA NA NA NA H3F3BP1 906356 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 72419778 72420070 72419973 Y DACH1 NA NA NA NA NA H3F3BP1 172579 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr13 73118273 73118475 73118375 Y PIBF1 NA NA NA NA NA RPL21P110 157356 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 74339681 74339964 74339912 Y KLF12 NA NA NA NA NA KLF12 366430 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr13 74508678 74508943 74508854 Y KLF12 NA NA NA NA NA KLF12 197451 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 74708897 74709334 74709161 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 2503 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 74709487 74710034 74709735 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 3093 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr13 75904010 75904233 75904150 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 150017 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 75939473 75939484 75939479 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 114766 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 75966064 75966537 75966363 Y TBC1D4 NA NA NA NA NA TBC1D4 87713 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 76521620 76521634 76521627 Y NA NA NA NA NA NA UCHL3 400001 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 77897670 77898015 77897832 Y NA MYCBP2 NA NA NA NA MYCBP2 1170 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 78090399 78090658 78090529 Y NA NA NA NA NA NA SLAIN1 179365 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 80743577 80743798 80743732 Y NA NA NA NA NA NA SPRY2 169288 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 80916096 80916414 80916232 Y NA SPRY2 NA NA NA NA SPRY2 3010 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr13 84711549 84711699 84711638 Y NA NA NA NA NA NA SPRY2 3798463 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr13 86215974 86216092 86216056 Y NA NA NA NA NA NA SPRY2 5302888 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 93096966 93097333 93097096 Y NA NA NA NA NA NA RNU4ATAC3P 386869 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 95201580 95202169 95201893 Y NA TGDS,GPR180 NA NA NA NA TGDS 44342 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 95932787 95933077 95933010 Y NA ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 18610 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 95951518 95951672 95951596 Y ABCC4 ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 15 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 99161455 99162128 99161863 Y NA NA NA NA NA NA STK24 66066 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 99562711 99562955 99562841 Y GPR183,STK24 NA NA NA NA NA CALM2P4 271218 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr13 99874246 99874352 99874282 Y NA UBAC2-AS1,UBAC2,H2AFZP3,GPR18 NA NA NA NA H2AFZP3 8234 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr13 99880215 99880463 99880360 Y GPR183 UBAC2-AS1,UBAC2,H2AFZP3,GPR18 NA NA NA NA H2AFZP3 14203 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 99931812 99933023 99932107 Y GPR183 GPR18 NA NA NA NA GPR18 19814 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr13 100278698 100278861 100278780 Y NA CLYBL NA NA NA NA CLYBL 21779 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 102341558 102341578 102341569 Y NA NA NA NA NA NA TPP2 905775 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 102827333 102827727 102827645 Y FGF14 NA NA NA NA NA TPP2 419626 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 102942302 102942617 102942588 Y NA NA NA NA NA NA TPP2 304736 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 103244790 103245125 103245073 Y ERCC5,TPP2 TPP2 TPP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TPP2 2228 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 103249969 103250343 103250155 Y ERCC5,TPP2 TPP2 NA NA NA NA TPP2 2616 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 103250853 103251030 103250900 Y NA TPP2 NA NA NA NA TPP2 3500 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 106753025 106753272 106753030 Y ARGLU1 NA EFNB2 IMR90 Hi-C 24141950 ARGLU1 465240 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 109597213 109597584 109597276 Y NA NA NA NA NA NA ABHD13 728486 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 110274718 110274736 110274728 Y IRS2 NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 130879 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 110322109 110322425 110322268 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 83190 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr13 110352571 110352699 110352636 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 52916 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr13 110359460 110359633 110359542 Y IRS2 AL162497.1 MYO16,IRS2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AL162497.1 45982 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr13 111039905 111040155 111040082 Y NA NA NA NA NA NA RAB20 171925 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 111124207 111124408 111124318 Y RAB20,ING1,ING1,ANKRD10 NA NA NA NA NA RAB20 87672 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 111176913 111177121 111177092 Y ING1,ING1,ANKRD10,RAB20 RAB20 NA NA NA NA RAB20 34959 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 2.10804041612042 chr13 111526935 111527249 111527195 Y RAB20 ANKRD10 NA NA NA NA ANKRD10 38167 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 111544033 111544176 111544105 Y ING1,ING1 ANKRD10 NA NA NA NA ANKRD10 21240 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 111564894 111565358 111565241 Y RAB20,ING1,ING1,ARHGEF7,ANKRD10 ANKRD10 NA NA NA NA ANKRD10 58 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 111589420 111590157 111589779 Y NA ANKRD10 ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 24004 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.40536027741361 chr13 111594578 111594832 111594693 Y RAB20,ANKRD10 ANKRD10 ANKRD10,ARHGEF7 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 29162 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 111976415 111976735 111976477 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF7 211509 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr13 113946276 113946648 113946334 Y NA LAMP1 LAMP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 LAMP1 2908 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 114064803 114065029 114064948 Y NA NA NA NA NA NA DCUN1D2 78238 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 114068135 114068518 114068472 Y ADPRHL1 NA NA NA NA NA DCUN1D2 74749 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr13 114127046 114127213 114127130 Y GRTP1,DCUN1D2 DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA DCUN1D2 16054 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 114875113 114875384 114875282 Y RASA3 RASA3 NA NA NA NA RASA3 20702 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr13 114892702 114892820 114892783 Y NA RASA3 NA NA NA NA RASA3 3266 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr13 114908513 114908833 114908657 Y RASA3 RASA3 NA NA NA NA RASA3 12427 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 20895931 20896136 20896054 Y RNASE3,RNASE6,TEP1,TMEM55B,PNP TEP1,OSGEP,APEX1,TMEM55B,PNP NA NA NA NA TEP1 16343 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 21150605 21151121 21150987 Y TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40 RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 269 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 21151333 21151694 21151411 Y NA RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 997 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 23222866 23223018 23222950 Y NA OXA1L,CTD-2555K7.2 NA NA NA NA OXA1L 10713 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 23357263 23357473 23357436 Y NA LRP10,RBM23,PRMT5-AS1,PRMT5 NA NA NA NA LRP10 18441 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 23358205 23358555 23358381 Y NA LRP10,RBM23,PRMT5-AS1,PRMT5 NA NA NA NA LRP10 19383 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr14 24014427 24014724 24014635 Y DHRS4L2,DHRS4L2,BCL2L2,BCL2L2,PABPN1,SLC22A17,SLC22A17,CMTM5,ZFHX2,THTPA,JPH4 THTPA,ZFHX2,AP1G2 NA NA NA NA THTPA 8492 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 24058094 24058646 24058322 Y NA THTPA,ZFHX2,AP1G2,DHRS2 NA NA NA NA AP1G2 22815 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 24454112 24454320 24454216 Y DHRS4L2,DHRS4L2 DHRS4,DHRS4L2 NA NA NA NA DHRS4L2 16964 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 24481106 24481351 24481229 Y NA DHRS4L2,LRRC16B NA NA NA NA LRRC16B 37855 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 24861663 24861718 24861669 Y IPO4,RABGGTA,RABGGTA NFATC4,NYNRIN,KHNYN,SDR39U1 NA NA NA NA NYNRIN 4274 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 29229981 29230346 29230164 Y NA NA NA NA NA NA RPL26P3 272865 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 31360303 31360625 31360494 Y NA NA NA NA NA NA RP11-829H16.2 71678 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 31455672 31455729 31455709 Y NA AP4S1,STRN3 NA NA NA NA AP4S1 36583 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 31905446 31905450 31905448 Y NA HEATR5A NA NA NA NA HEATR5A 17658 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 32670916 32671247 32671221 Y NA NA NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP5-AS1 126917 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 32672212 32672871 32672506 Y ARHGAP5 NA NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP5-AS1 128213 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 33194193 33194559 33194238 Y AKAP6,NPAS3 NA NA NA NA NA ARHGAP5-AS1 650194 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 34261027 34261291 34261159 Y NA NA NA NA NA NA SPTSSA 668271 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 34801443 34801630 34801553 Y NA NA SPTSSA MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 127932 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 35084533 35084797 35084665 Y EAPP RPS19P3,SNX6 NA NA NA NA SNX6 12592 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 35628271 35628433 35628369 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA KIAA0391 38516 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr14 35754543 35755119 35754804 Y BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,NFKBIA,PSMA6 PSMA6 NA NA NA NA PSMA6 8704 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr14 35755529 35755685 35755573 Y BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,NFKBIA,PSMA6 PSMA6 NA NA NA NA PSMA6 9690 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 35755957 35756376 35756177 Y BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,NFKBIA,PSMA6 PSMA6 NA NA NA NA PSMA6 10118 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 35810635 35811251 35810911 Y BAZ1A,FAM177A1,RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1 PPP2R3C,KIAA0391,PSMA6,NFKBIA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-561B11.1 45024 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 35816738 35817044 35816815 Y NA RP11-561B11.1 KIAA0391,PPP2R3C,PSMA6 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-561B11.1 39231 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 35836736 35837242 35837045 Y NA RP11-561B11.1,NFKBIA PSMA6,SNX6,PPP2R3C,KIAA0391,NFKBIA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-561B11.1 19033 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 36235126 36235268 36235197 Y NA RALGAPA1 NA NA NA NA RALGAPA1 41242 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr14 38542945 38543074 38543011 Y NA NA NA NA NA NA CLEC14A 180500 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 38755298 38755650 38755474 Y NA CLEC14A CLEC14A IMR90 Hi-C 24141950 CLEC14A 31724 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 39559553 39559840 39559693 Y NA SEC23A,GEMIN2 NA NA NA NA SEC23A 17010 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 39958924 39958943 39958934 Y NA NA NA NA NA NA FBXO33 59220 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 42980587 42980987 42980723 Y NA NA NA NA NA NA C14orf28 2383511 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 45714299 45714525 45714379 Y NA MIS18BP1 NA NA NA NA MIS18BP1 6218 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 45721298 45721397 45721336 Y KLHL28,PRPF39,FANCM,MIS18BP1 MIS18BP1 NA NA NA NA MIS18BP1 555 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr14 50328432 50328642 50328440 Y METTL21D,ARF6,RPL36AL,DNAAF2 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 10511 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.96750438837906 chr14 50334846 50335244 50334992 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 16925 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr14 50528497 50528810 50528555 Y NA NA NA NA NA NA SOS2 167466 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 50531720 50532221 50531875 Y RPL36AL,ARF6,C14orf182 NA NA NA NA NA SOS2 164055 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 50562564 50562863 50562716 Y RPL36AL,DNAAF2,NEMF,ARF6,ATP5S,C14orf182,METTL21D NA NA NA NA NA SOS2 133413 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 50648447 50648735 50648723 Y NA SOS2 NA NA NA NA SOS2 47541 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 50799629 50799645 50799635 Y NA ATP5S,L2HGDH NA NA NA NA L2HGDH 22363 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 50926261 50926342 50926322 Y MAP4K5,ATL1,ATL1,CDKL1 CDKL1 NA NA NA NA CDKL1 45082 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 52069018 52069473 52069211 Y NA NA NA NA NA NA FRMD6 115200 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 52726227 52726468 52726407 Y NA PTGDR PTGDR,TXNDC16 IMR90 Hi-C 24141950 PTGDR 5963 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 52733578 52733826 52733624 Y NA PTGDR,PTGER2 NA NA NA NA PTGDR 1147 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr14 52778296 52778738 52778457 Y GNG2,PTGER2 PTGDR,PTGER2 NA NA NA NA PTGER2 285 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 53257268 53257587 53257438 Y NA GNPNAT1 NA NA NA NA GNPNAT1 882 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 53385393 53385542 53385402 Y DDHD1 FERMT2 NA NA NA NA FERMT2 31611 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 53575786 53575939 53575850 Y DDHD1 DDHD1 NA NA NA NA DDHD1 42061 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr14 54833964 54834357 54834051 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 27210 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 55094268 55094954 55094583 Y GMFB,MAPK1IP1L,GCH1 NA NA NA NA NA SAMD4A 62453 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 55173516 55173842 55173679 Y SAMD4A NA NA NA NA NA SAMD4A 141701 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 55302493 55302656 55302575 Y NA NA NA NA NA NA GCH1 64914 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 55439267 55439511 55439438 Y NA NA NA NA NA NA WDHD1 52312 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr14 55541499 55541595 55541574 Y NA WDHD1,SOCS4,MAPK1IP1L NA NA NA NA MAPK1IP1L 25150 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 56047594 56047945 56047904 Y NA KTN1,KTN1-AS1 NA NA NA NA KTN1-AS1 2766 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 56595447 56595666 56595543 Y NA PELI2 NA NA NA NA PELI2 12915 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 58637905 58638297 58638125 Y NA UBA52P3,ACTR10 NA NA NA NA ACTR10 26501 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 58705309 58705629 58705462 Y ARID4A ACTR10,PSMA3 NA NA NA NA PSMA3 3920 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 58911911 58912089 58912000 Y KIAA0586 KIAA0586,TIMM9 NA NA NA NA TIMM9 19579 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 59656513 59656908 59656842 Y DAAM1 DAAM1 NA NA NA NA DAAM1 3149 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 2.67018452708587 chr14 60061321 60061594 60061405 Y DAAM1,RTN1,C14orf38,RTN1 NA NA NA NA NA JKAMP 112160 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 60618583 60618767 60618659 Y PPM1A,C14orf135,DHRS7 DHRS7 NA NA NA NA DHRS7 15807 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 60679186 60679974 60679676 Y NA DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2 NA NA NA NA PPM1A 30496 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr14 61865216 61865457 61865337 Y PRKCH NA NA NA NA NA PRKCH 212939 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 64109095 64109326 64109156 Y SYNE2,WDR89,WDR89 HSPE1P2,WDR89 NA NA NA NA WDR89 2516 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 64320785 64320937 64320842 Y PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2 SYNE2 NA NA NA NA SYNE2 3102 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 64705009 64705329 64705170 Y PLEKHG3,SYNE2 NA NA NA NA NA MTHFD1 147420 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 65229015 65229197 65229106 Y SPTB,PLEKHG3 NA NA NA NA NA CHURC1 149882 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 65231601 65231863 65231701 Y NA NA NA NA NA NA CHURC1 147216 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 65524481 65524844 65524562 Y PLEKHG3 MAX NA NA NA NA MAX 42569 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 65641048 65641253 65641171 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90 Hi-C 24141950 MAX 73635 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 65710565 65711133 65711131 Y NA NA LOC645431,FUT8 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAX 143152 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 66126309 66126626 66126333 Y NA NA NA NA NA NA FUT8 250999 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 66516389 66516661 66516525 Y NA NA NA NA NA NA GPHN 455464 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 67478288 67478352 67478320 Y NA NA NA NA NA NA MPP5 227474 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 67562927 67563276 67562937 Y TMEM229B,PLEKHH1 NA NA NA NA NA MPP5 142550 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 67809024 67809296 67809169 Y RDH12,MPP5,PLEKHH1 EIF2S1,ATP6V1D NA NA NA NA EIF2S1 15418 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 68033590 68034347 68033627 Y NA PIGH NA NA NA NA PIGH 30657 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 68161499 68161767 68161616 Y PLEK2 VTI1B,RDH11 NA NA NA NA RDH11 968 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 68420679 68421053 68420830 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 136183 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 68431145 68431760 68431180 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 146649 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 68529528 68529897 68529655 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 245032 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 68555311 68555805 68555391 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 270815 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 68555905 68556402 68556038 Y PIGH NA NA NA NA NA RAD51B 271409 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 68734990 68735182 68735089 Y ZFYVE26 NA NA NA NA NA PPIAP6 151731 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 68750140 68750526 68750392 Y RAD51L1 NA NA NA NA NA PPIAP6 136387 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr14 68868650 68868995 68868704 Y NA PPIAP6 NA NA NA NA PPIAP6 17918 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 68943032 68943562 68943135 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 56119 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 68974359 68974746 68974485 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 87446 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 69047219 69047274 69047247 Y ZFP36L1 NA NA NA NA NA PPIAP6 160306 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 69076965 69077322 69077310 Y NA NA NA NA NA NA ZFP36L1 183868 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 69544472 69544808 69544638 Y NA NA NA NA NA NA DCAF5 73059 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 69851262 69851639 69851451 Y NA SLC39A9,ERH NA NA NA NA SLC39A9 11093 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 70099072 70099485 70099117 Y DCAF5,SRSF5,SRSF5,KIAA0247 KIAA0247 NA NA NA NA KIAA0247 22759 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 70105047 70105358 70105300 Y DCAF5,SRSF5,SRSF5,KIAA0247 KIAA0247 NA NA NA NA KIAA0247 28734 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 70447892 70448065 70447949 Y SMOC1 NA NA NA NA NA SRSF5 256275 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 70844763 70845165 70845114 Y NA COX16,SYNJ2BP-COX16,SYNJ2BP NA NA NA NA COX16 20315 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 71838643 71839069 71838909 Y PCNX,SIPA1L1 NA SIPA1L1 IMR90 Hi-C 24141950 SIPA1L1 53477 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 72021992 72022911 72022768 Y SIPA1L1 NA NA NA NA NA SIPA1L1 236826 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 73824884 73825148 73825019 Y ZFYVE1,ZFYVE1,RBM25,PSEN1,NUMB NA NA NA NA NA NUMB 103200 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 74220862 74221204 74221002 Y NUMB,ZNF410,C14orf43,C14orf43 PNMA1 NA NA NA NA PNMA1 41734 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr14 74224982 74225468 74225101 Y NA PNMA1 NA NA NA NA PNMA1 45854 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 74237437 74237571 74237504 Y ZNF410,C14orf43 NA NA NA NA NA PNMA1 58309 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 74741846 74742137 74741995 Y FCF1 ABCD4 NA NA NA NA ABCD4 25622 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 75521336 75521721 75521672 Y MLH3,ACYP1 MLH3,ACYP1 NA NA NA NA MLH3 5101 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 75697272 75697400 75697329 Y NA RP11-293M10.2,FOS TMED10,NEK9,LOC731223,ZC2HC1C,FOS,BATF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-293M10.2 26714 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 75800922 75801146 75801057 Y FOS,JDP2,FLVCR2,BATF NA JDP2,BATF IMR90 Hi-C 24141950 FOS 57445 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 76513976 76514095 76514005 Y NA NA NA NA NA NA IFT43 147497 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 77386302 77386621 77386483 Y IRF2BPL RP11-488C13.1,RP11-7F17.1 IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488C13.1 35209 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr14 77428060 77428442 77428341 Y NA RP11-7F17.1 IRF2BPL MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.1 4584 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 77466876 77467234 77466958 Y ZDHHC22,NGB,VASH1,KIAA1737,IRF2BPL RP11-7F17.1,IRF2BPL NA NA NA NA IRF2BPL 25800 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr14 77499482 77500543 77500476 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL IRF2BPL KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 6448 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr14 77500544 77500911 77500765 Y NA IRF2BPL KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 7510 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 77508586 77508871 77508699 Y IRF2BPL IRF2BPL IRF2BPL IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BPL 15552 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 77587859 77588005 77587963 Y IRF2BPL TMEM63C NA NA NA NA TMEM63C 6948 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 78836271 78836672 78836374 Y NA NA NA NA NA NA NRXN3 129537 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 79406333 79406507 79406344 Y NA NA NA NA NA NA NRXN3 699599 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 79502772 79503033 79502836 Y NA NA NA NA NA NA NRXN3 796038 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 SNORA79,DYNLL1P1 NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 3.6539367212754 chr14 85398952 85399308 85399126 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2341M24.1 999746 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 89257931 89258017 89257974 Y NA TTC8 NA NA NA NA TTC8 30480 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 89895882 89896217 89896119 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 187276 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 89935615 89935871 89935745 Y NA NA NA NA NA NA FOXN3 147622 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 89950912 89951066 89950980 Y FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 132427 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 89959649 89959712 89959681 Y TDP1,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 123781 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 90049518 90049848 90049714 Y TDP1,FOXN3 FOXN3 NA NA NA NA FOXN3 33645 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 90081839 90081992 90081916 Y FOXN3,FOXN3 FOXN3 NA NA NA NA FOXN3 1501 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 90083286 90083622 90083526 Y TDP1,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr14 90167936 90168219 90168049 Y TDP1,FOXN3,FOXN3 NA FOXN3,LOC400236,PRO1768,EFCAB11 IMR90 Hi-C 24141950 FOXN3 84443 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 90187217 90187585 90187327 Y FOXN3,FOXN3,TDP1 NA EFCAB11,LOC400236,FOXN3,PRO1768 IMR90 Hi-C 24141950 FOXN3 103724 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr14 90240398 90240621 90240510 Y FOXN3,TDP1 NA FOXN3,PRO1768,EFCAB11,TTC8,LOC400236 IMR90 Hi-C 24141950 FOXN3 156905 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 91020743 91021035 91020793 Y CALM1 NA NA NA NA NA CALM1 159897 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 91406372 91406636 91406631 Y NA NA NA NA NA NA CTD-3035D6.2 113900 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 91528012 91528136 91528074 Y SMEK1,CCDC88C,RPS6KA5 C14orf159,RPS6KA5 NA NA NA NA RPS6KA5 3032 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 91683304 91683542 91683359 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KA5 158324 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 91752749 91752962 91752855 Y NA NA NA NA NA NA CCDC88C 129226 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 91814664 91814951 91814783 Y RPS6KA5,C14orf159,SMEK1,CCDC88C NA NA NA NA NA CCDC88C 67237 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 91863961 91864070 91864025 Y C14orf159,CCDC88C CCDC88C NA NA NA NA CCDC88C 18118 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 93540905 93541183 93541053 Y MOAP1,KIAA1409,C14orf109,C14orf109,BTBD7,ITPK1 ITPK1 NA NA NA NA ITPK1 39482 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 93569992 93570233 93570210 Y KIAA1409,C14orf109,C14orf109 ITPK1 NA NA NA NA ITPK1 10432 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 94016026 94016414 94016228 Y NA NA NA NA NA NA BTBD7 218588 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 94429465 94429837 94429620 Y SERPINA1,DDX24 NA NA NA NA NA OTUB2 60838 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 94851152 94851609 94851362 Y SERPINA1 NA NA NA NA NA PPP4R4 240687 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 95691488 95691499 95691495 Y NA NA NA NA NA NA DICER1 69141 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 95758765 95759186 95759057 Y CLMN CLMN NA NA NA NA CLMN 25057 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 95861859 95861987 95861923 Y NA NA NA NA NA NA CLMN 77616 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 95946356 95946810 95946552 Y NA RP11-1070N10.3 NA NA NA NA RP11-1070N10.3 33663 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 95947097 95947214 95947185 Y NA RP11-1070N10.3 NA NA NA NA RP11-1070N10.3 33259 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 95961978 95962170 95962099 Y CLMN RP11-1070N10.3,GLRX5,SCARNA13,SNHG10 NA NA NA NA RP11-1070N10.3 18303 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 95981456 95981771 95981695 Y NA RP11-1070N10.3,GLRX5,SCARNA13,SNHG10 NA NA NA NA RP11-1070N10.3 983 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr14 96570939 96571330 96571109 Y BDKRB2,BDKRB1 NA NA NA NA NA C14orf132 67278 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 96592738 96593055 96592891 Y ATG2B NA C14orf49,ATG2B,AK7,BDKRB2,BDKRB1 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf132 89077 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 98086982 98087081 98087062 Y NA NA NA NA NA NA VRK1 825341 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 99439262 99439638 99439565 Y NA NA NA NA NA NA BCL11B 296223 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr14 99492806 99493078 99493020 Y NA NA NA NA NA NA BCL11B 242783 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr14 99735950 99736476 99736276 Y BCL11B BCL11B NA NA NA NA BCL11B 89 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 99739493 99739630 99739557 Y BCL11B BCL11B NA NA NA NA BCL11B 3632 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 99827366 99827674 99827539 Y NA NA NA NA NA NA BCL11B 91505 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 100071651 100072022 100071781 Y NA CCDC85C,RP11-543C4.1 NA NA NA NA RP11-543C4.1 2758 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr14 100534854 100535453 100535220 Y YY1,EVL NA NA NA NA NA EVL 99068 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 100633368 100633655 100633513 Y YY1 NA NA NA NA NA YY1 68980 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 100659173 100659604 100659490 Y NA YY1,RP11-638I2.4 DEGS2,YY1,EVL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 43031 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr14 100687969 100688087 100687996 Y NA YY1,RP11-638I2.4 YY1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 YY1 14548 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr14 100751761 100751840 100751790 Y NA YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29 NA NA NA NA SLC25A29 19044 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 101029795 101030067 101029931 Y NA NA NA NA NA NA DLK1 159975 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 102172620 102172772 102172676 Y WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C NA PPP2R5C,DYNC1H1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2R5C 53363 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 102342938 102343183 102343098 Y PPP2R5C,WDR20,PPP2R5C NA NA NA NA NA DYNC1H1 85682 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 2.95125658256859 chr14 102530459 102530762 102530662 Y NA NA NA NA NA NA WDR20 73078 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 102554875 102555215 102555129 Y HSP90AA1 WDR20,HSP90AA1 NA NA NA NA WDR20 48625 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 102991831 102991939 102991900 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 17695 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr14 103577206 103577606 103577492 Y C14orf153 NA NA NA NA NA CDC42BPB 55407 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 103889614 103889901 103889771 Y TNFAIP2,EIF5,EIF5,MARK3 MARK3 NA NA NA NA MARK3 39885 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 104583053 104583460 104583371 Y NA KIF26A NA NA NA NA KIF26A 19600 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 104860252 104860616 104860549 Y NA NA NA NA NA NA RP11-260M19.2 172331 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr14 105144100 105144955 105144117 Y GPR132,AKT1 INF2 NA NA NA NA INF2 8988 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.40536027741361 chr14 105434660 105434907 105434734 Y INF2,KIAA0284,C14orf79 PLD4,C14orf79 PLD4 MCF7 ChIA-PET 22265404 C14orf79 15205 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 105500263 105500628 105500453 Y NA CDCA4,GPR132 NA NA NA NA CDCA4 14778 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 105527058 105527513 105527190 Y PLD4,GPR132 CDCA4,GPR132 NA NA NA NA GPR132 2269 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 105760670 105760918 105760811 Y C14orf80,C14orf80,C14orf80,GPR132,BRF1 BTBD6,PACS2,BRF1 NA NA NA NA PACS2 3982 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 105947921 105948133 105948082 Y NA C14orf80 NA NA NA NA C14orf80 6059 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 105948139 105949025 105948432 Y NA C14orf80 NA NA NA NA C14orf80 5167 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.96750438837906 chr14 106164516 106164556 106164555 Y NA NA NA NA NA NA IGHM 155767 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 106324206 106324758 106324477 Y TEX22 IGHM,IGHJ6 NA NA NA NA IGHJ6 2710 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr14 107252931 107253417 107253022 Y NA NA NA NA NA NA IGHV3-72 55460 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 3.6539367212754 chr14 107253494 107254031 107253700 Y NA NA NA NA NA NA IGHV3-72 56023 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 5.76197713739582 chr14 107254436 107254688 107254673 Y NA NA NA NA NA NA IGHV3-72 56965 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr15 20547295 20547641 20547374 Y NA NA LOC348120,REREP3,POTEB IMR90 Hi-C 24141950 TUBGCP5 2283754 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 20570096 20570220 20570180 Y NA NA REREP3,POTEB,LOC348120,NF1P2,CHEK2P2 IMR90 Hi-C 24141950 TUBGCP5 2261175 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr15 21914435 21914569 21914482 Y OR4N4 NA NA NA NA NA TUBGCP5 916826 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 22449488 22449632 22449579 Y NA NA HERC2P3 IMR90 Hi-C 24141950 TUBGCP5 381763 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 22450316 22450421 22450369 Y OR4N4 NA HERC2P3 IMR90 Hi-C 24141950 TUBGCP5 380974 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 22505419 22505543 22505535 Y OR4M2,OR4N4 NA NF1P2,LOC348120,NBEAP1 IMR90 Hi-C 24141950 TUBGCP5 325852 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 25563100 25563402 25563110 Y SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 118726 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr15 25564293 25564526 25564383 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 117602 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr15 25565589 25566847 25566046 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 115281 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr15 25577365 25577592 25577422 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 104536 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr15 26327449 26327665 26327505 Y NA NA ATP10A,LOC100128714 IMR90 Hi-C 24141950 UBE3A 645321 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.68643233289634 chr15 26341798 26342124 26341961 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 659670 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 33153988 33154297 33154060 Y GREM1 NA NA NA NA NA ARHGAP11A 248643 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 33188603 33188636 33188634 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP11A 283258 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 33418806 33419006 33418854 Y NA NA FMN1,SCG5,ARHGAP11A,GREM1 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP11A 513461 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 33502141 33502453 33502281 Y NA NA TMCO5B IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP11A 596796 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr15 34807090 34807442 34807248 Y NA NA NA NA NA NA GOLGA8B 71262 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 35384953 35385239 35385081 Y NA NA ATPBD4 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 106465 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 35590731 35591134 35590845 Y NA RP11-150L8.4 ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-150L8.4 1090 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 35788754 35789006 35788880 Y NA NA NA NA NA NA RP11-150L8.4 199113 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 38750000 38750177 38750089 Y NA FAM98B NA NA NA NA FAM98B 5672 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr15 38751078 38751316 38751209 Y NA FAM98B NA NA NA NA FAM98B 6750 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 38814347 38814382 38814365 Y C15orf53,RASGRP1 RASGRP1 NA NA NA NA RASGRP1 41394 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 38853240 38853506 38853363 Y C15orf53,RASGRP1 RASGRP1 NA NA NA NA RASGRP1 2270 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 38855450 38855620 38855537 Y C15orf53,RASGRP1 RASGRP1 NA NA NA NA RASGRP1 156 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 38944064 38944182 38944113 Y RASGRP1,C15orf53 NA FAM98B,RASGRP1 IMR90 Hi-C 24141950 RASGRP1 88288 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 39361992 39362177 39362006 Y NA NA FSIP1,C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 RASGRP1 506216 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 39432291 39432412 39432368 Y THBS1 NA THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1 IMR90 Hi-C 24141950 RASGRP1 576515 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 40164744 40164978 40164948 Y NA GPR176 NA NA NA NA GPR176 46115 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 40180090 40180249 40180216 Y NA GPR176,EIF2AK4 FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR176 30844 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 40210900 40211252 40211013 Y GPR176 EIF2AK4 FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR176 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 40391032 40391342 40391133 Y PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 7751 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 40463815 40464014 40463832 Y NA BUB1B NA NA NA NA BUB1B 12591 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 41139695 41139794 41139738 Y NA ZFYVE19,DNAJC17,SPINT1,RHOV,VPS18 NA NA NA NA SPINT1 5479 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 41199675 41199878 41199759 Y DLL4 RHOV,VPS18,DLL4,CHAC1 DLL4 IMR90 Hi-C 24141950 VPS18 15047 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr15 41220555 41220912 41220794 Y NUSAP1,DLL4 VPS18,DLL4,CHAC1 NA NA NA NA DLL4 1017 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr15 41254301 41254691 41254494 Y NA DLL4,CHAC1 NA NA NA NA CHAC1 11141 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr15 41581854 41582095 41581909 Y NA OIP5-AS1,OIP5,NUSAP1 NA NA NA NA OIP5-AS1 7666 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 41953918 41954236 41954127 Y EHD4,MGA MGA MAPKBP1 IMR90 Hi-C 24141950 MGA 42496 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr15 42226984 42227301 42227216 Y LTK,MGA,JMJD7,VPS39,TMEM87A,EHD4 EHD4 NA NA NA NA EHD4 35475 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 42535686 42535733 42535710 Y NA VPS39,GANC,TMEM87A NA NA NA NA GANC 27698 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 42699224 42699321 42699233 Y NA NA NA NA NA NA SNAP23 82110 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 42723209 42723609 42723409 Y NA NA NA NA NA NA SNAP23 57822 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 42786035 42786158 42786098 Y SNAP23 SNAP23 NA NA NA NA SNAP23 4604 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 42792289 42792533 42792361 Y NA SNAP23,LRRC57,HAUS2 LRRC57,HAUS2 IMR90 Hi-C 24141950 SNAP23 10858 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 43232186 43232306 43232267 Y TTBK2 TTBK2 TTBK2 IMR90 Hi-C 24141950 TTBK2 21179 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 43415014 43415563 43415337 Y NA UBR1,RPS3AP47,TMEM62 NA NA NA NA TMEM62 1537 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr15 44073726 44074107 44073917 Y NA PDIA3,CATSPER2P1,SERF2,ELL3,MFAP1,WDR76 NA NA NA NA ELL3 5985 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 44524937 44524986 44524960 Y NA NA CTDSPL2,WDR76,FRMD5,CASC4 IMR90 Hi-C 24141950 CASC4 53941 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 44954800 44955080 44954968 Y CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11 SPG11,PATL2,B2M NA NA NA NA SPG11 924 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 45004703 45005017 45004887 Y CASC4,CTDSPL2,SPG11,PATL2,B2M,TRIM69 PATL2,B2M,TRIM69 NA NA NA NA B2M 3028 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 45016631 45017046 45016657 Y SPG11,B2M,TRIM69 PATL2,B2M,TRIM69 NA NA NA NA TRIM69 2140 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 45746745 45747578 45747238 Y SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN NA NA NA NA NA SPATA5L1 54216 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr15 45892726 45892758 45892742 Y NA NA NA NA NA NA SLC30A4 79721 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 45930863 45931040 45930963 Y C15orf48,PLDN,SQRDL NA NA NA NA NA SLC30A4 117858 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 50345341 50345603 50345432 Y USP8,GABPB1 NA NA NA NA NA CTD-2647E9.1 260898 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 50793550 50793719 50793635 Y USP8,TRPM7 NA NA NA NA NA USP8 78973 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 51179096 51179478 51179366 Y USP8,TRPM7,SPPL2A AP4E1 TRPM7,SPPL2A,USP50,AP4E1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP4E1 19391 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 51212270 51212627 51212449 Y NA AP4E1 NA NA NA NA AP4E1 13401 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 51358266 51358334 51358300 Y GLDN NA NA NA NA NA AP4E1 159397 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 51921191 51921424 51921391 Y NA DMXL2 DMXL2,LYSMD2,TMOD2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DMXL2 8161 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 52587042 52587046 52587044 Y NA MYO5C NA NA NA NA MYO5C 1047 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 52851602 52851989 52851853 Y NA MYO5A,ARPP19 NA NA NA NA ARPP19 8091 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 52975108 52975296 52975173 Y KIAA1370 FAM214A FAM214A K562 ChIA-PET 22265404 FAM214A 24718 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 53063704 53063805 53063755 Y NA ONECUT1 NA NA NA NA ONECUT1 17468 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 55463152 55463211 55463182 Y NA RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 24054 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 55487267 55487658 55487506 Y NA RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 2 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 55487983 55488563 55488357 Y RAB27A,PIGB,RSL24D1 RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 718 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 56127522 56127639 56127539 Y NA NA NA NA NA NA NEDD4 156305 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 56475345 56475479 56475412 Y RFX7 NA NA NA NA NA RFX7 58004 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 58739563 58739748 58739656 Y AQP9 LIPC NA NA NA NA LIPC 38795 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 58807975 58808464 58808137 Y AQP9,SLTM,RNF111,ADAM10 NA NA NA NA NA LIPC 107207 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr15 58810481 58810649 58810568 Y AQP9,SLTM,RNF111,ADAM10 NA NA NA NA NA LIPC 109713 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 59019191 59019406 59019394 Y NA ADAM10,FAM63B NA NA NA NA ADAM10 20771 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 59461586 59461962 59461756 Y ADAM10,SLTM,RNF111 NA NA NA NA NA CCNB2 66309 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 59592534 59592835 59592690 Y BNIP2,RNF111,MYO1E NA NA NA NA NA FAM81A 70057 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 60142100 60142185 60142180 Y NA NA NA NA NA NA RPS3AP6 83557 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 60337265 60337365 60337315 Y NA NA NA NA NA NA RPS3AP6 278722 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 60835043 60835413 60835301 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 65666 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 60881604 60881753 60881652 Y RORA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 112227 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 61113423 61113507 61113465 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 344046 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 62207321 62207567 62207441 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 143105 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 62215780 62216024 62215899 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 134648 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 62906049 62906061 62906055 Y NA NA TLN2,MGC15885 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 225324 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 63432131 63432432 63432186 Y USP3,RAB8B,LACTB LACTB,RPS27L,RAB8B NA NA NA NA RPS27L 15788 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 63602976 63602991 63602984 Y NA APH1B NA NA NA NA APH1B 36759 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 63771566 63772233 63772016 Y HERC1,USP3 USP3 APH1B,RAB8B,CA12,USP3,HERC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP3 22560 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 63780953 63781101 63781024 Y LACTB,RAB8B,USP3 USP3 APH1B,RAB8B,CA12,USP3,LOC100130855,FBXL22 IMR90 Hi-C 24141950 USP3 13692 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 63792570 63793348 63792650 Y NA USP3 NA NA NA NA USP3 1445 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 63795379 63795825 63795543 Y NA USP3 NA NA NA NA USP3 586 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr15 63989218 63989619 63989416 Y USP3,HERC1,DAPK2 NA NA NA NA NA USP3-AS1 97430 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 64385169 64385477 64385384 Y NA FAM96A,SNX1 NA NA NA NA SNX1 847 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 65186654 65187183 65187027 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16 ANKDD1A NA NA NA NA ANKDD1A 14918 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr15 65403116 65403434 65403296 Y ANKDD1A,PDCD7 PDCD7 UBAP1L,KBTBD13,OSTBETA,RASL12 IMR90 Hi-C 24141950 PDCD7 20740 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 65596702 65597188 65596889 Y DENND4A RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5746 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr15 65823475 65823857 65823545 Y IGDCC4 DPP8,PTPLAD1 NA NA NA NA PTPLAD1 2719 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr15 65951559 65951691 65951625 Y NA SLC24A1 NA NA NA NA SLC24A1 49855 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 66060795 66060948 66060877 Y NA RAB11A,DENND4A NA NA NA NA DENND4A 21683 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 66162838 66163256 66163114 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80207 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr15 66163349 66163534 66163463 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80718 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 66177095 66177419 66177152 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 94464 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 66446289 66446658 66446570 Y DIS3L,DIS3L NA NA NA NA NA MEGF11 97427 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 66985415 66985517 66985466 Y NA SMAD6 SMAD6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD6 7049 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 66993287 66993569 66993487 Y MAP2K1,SMAD6 SMAD6 NA NA NA NA SMAD6 721 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr15 67373443 67373710 67373534 Y SMAD3 SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 19342 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 67385827 67386130 67385989 Y SMAD3 SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 31726 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 67442347 67443164 67443030 Y SMAD3 NA NA NA NA NA RPS24P16 79620 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 67867550 67867820 67867663 Y NA MAP2K5 NA NA NA NA MAP2K5 34503 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 68075765 68075963 68075889 Y NA RP11-34F13.3 NA NA NA NA RP11-34F13.3 47100 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr15 68441418 68441688 68441529 Y NA NA NA NA NA NA PIAS1 96901 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 68894151 68894553 68894360 Y CORO2B,CORO2B,CORO2B CORO2B NA NA NA NA CORO2B 24843 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr15 69376017 69376173 69376096 Y NA NA NA NA NA NA GLCE 74750 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 70073189 70073508 70073349 Y TLE3 NA NA NA NA NA RPLP1 330066 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 70551432 70551570 70551488 Y TLE3 NA LOC145837,C15orf50 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 502362 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 72198564 72199008 72198773 Y PARP6,MYO9A,CELF6,CELF6,CELF6 NA NA NA NA NA SENP8 205591 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr15 72213908 72214290 72214099 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 190309 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 72518614 72519346 72519221 Y ARIH1,PKM2 NA NA NA NA NA MYO9A 109696 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 72520083 72520441 72520217 Y ARIH1,PKM2,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6 NA NA NA NA NA MYO9A 111165 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 72824073 72824405 72824125 Y NA NA NA NA NA NA ARIH1 59406 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 72832767 72832969 72832868 Y PKM2,CELF6,CELF6,ADPGK,ARIH1 NA NA NA NA NA ARIH1 68100 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 73032689 73032951 73032815 Y PARP6,CELF6,ARIH1,ADPGK ADPGK NA NA NA NA ADPGK 43236 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 74258069 74258363 74258216 Y C15orf59 STOML1,PML NA NA NA NA STOML1 26600 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 74412993 74413248 74413104 Y STRA6,CCDC33,C15orf59,TBC1D21 NA NA NA NA NA PML 127979 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr15 74908840 74909023 74908946 Y NA CLK3 NA NA NA NA CLK3 19999 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr15 74930641 74931010 74930809 Y ARID3B,CSK CLK3 NA NA NA NA CLK3 41800 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 75079224 75079407 75079399 Y ARID3B,CLK3,SCAMP2,C15orf39,CSK CSK NA NA NA NA CSK 6826 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 75081771 75082003 75081872 Y ARID3B,CLK3,C15orf39,CSK CSK NA NA NA NA CSK 9373 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 75384189 75384549 75384318 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,C15orf39 NA NA NA NA NA PPCDC 70293 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 75744907 75745094 75744993 Y C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1089 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr15 75745296 75745530 75745399 Y PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 653 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 75746315 75746749 75746512 Y PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 132 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr15 75747348 75747533 75747407 Y RPP25,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1165 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 75867013 75867354 75867182 Y C15orf39,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,UBE2Q2,ODF3L1 PTPN9,SNUPN NA NA NA NA PTPN9 2276 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 76050803 76051078 76050853 Y NA DNM1P35 NA NA NA NA DNM1P35 21839 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr15 77055500 77055901 77055892 Y NA NA NA NA NA NA SCAPER 139884 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 78183206 78183429 78183318 Y DNAJA4,DNAJA4,DNAJA4 NA NA NA NA NA TBC1D2B 184637 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 80211933 80212232 80212185 Y NA MTHFS,C15ORF37,ST20 NA NA NA NA C15ORF37 1275 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 80260488 80260810 80260723 Y MTHFS,MTHFS,ST20-MTHFS,ST20,ZFAND6,BCL2A1 C15ORF37,ST20 NA NA NA NA ST20 46444 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 80880322 80880600 80880404 Y ARNT2 NA NA NA NA NA MESDC2 399619 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 81607386 81607689 81607446 Y MESDC1,IL16,IL16,STARD5 STARD5,RP11-761I4.3 NA NA NA NA STARD5 6835 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr15 83412156 83412209 83412183 Y NA RP11-752G15.6 NA NA NA NA RP11-752G15.6 5107 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 83479679 83480264 83480017 Y WHAMM WHAMM HOMER2 IMR90 Hi-C 24141950 WHAMM 3299 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr15 83761220 83761490 83761347 Y TM6SF1 BTBD1,TM6SF1 BTBD1,MIR4515 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM6SF1 12669 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 83777211 83777631 83777545 Y NA BTBD1,TM6SF1 NA NA NA NA TM6SF1 3052 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.54589630515498 chr15 83815089 83815145 83815117 Y NA TM6SF1 NA NA NA NA TM6SF1 40930 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 83817881 83818018 83817954 Y NA TM6SF1 NA NA NA NA TM6SF1 43722 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 83857531 83857848 83857643 Y AP3B2,HDGFRP3 HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 16922 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 85131508 85131753 85131631 Y PDE8A ZSCAN2 NA NA NA NA ZSCAN2 10464 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr15 85141478 85141773 85141626 Y NA ZSCAN2 NA NA NA NA ZSCAN2 444 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 85725231 85725336 85725284 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS7P4 146229 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 86233947 86234070 86233985 Y NA NA NA NA NA NA KLHL25 102191 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 87686750 87686803 87686776 Y NA NA NTRK3,LOC283738 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00052 431357 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 88945727 88945917 88945804 Y NA NA NA NA NA NA MRPL46 62733 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr15 89878895 89879173 89879043 Y NA POLG NA NA NA NA POLG 2803 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr15 90418263 90418454 90418325 Y NA AP3S2,C15orf38-AP3S2 NA NA NA NA AP3S2 17120 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 90574620 90575072 90574763 Y ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1 ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 31996 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 90577561 90577868 90577654 Y AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1 ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 34937 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 90602725 90603219 90603002 Y ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1 IDH2 NA NA NA NA IDH2 40517 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 90958026 90958305 90958134 Y ZNF710,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 28576 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 91208661 91208996 91208948 Y NA RP11-387D10.2,BLM NA NA NA NA RP11-387D10.2 49376 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 91541068 91541209 91541180 Y NA RCCD1,PRC1,VPS33B NA NA NA NA PRC1 4209 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 92293461 92293635 92293548 Y NA NA NA NA NA NA NPM1P5 533436 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 93363497 93364154 93363735 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 NA ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 CHD2 60372 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.40536027741361 chr15 93365801 93366193 93365997 Y NA NA ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 CHD2 58333 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 93374780 93375598 93375185 Y NA CHD2 CHD2,LOC100507217,ASB9P1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD2 48928 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chr15 93542371 93542660 93542397 Y NA NA NA NA NA NA RGMA 87773 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 94830973 94831315 94831184 Y MCTP2 NA MCTP2,NMUR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 MCTP2 58206 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 95029258 95029308 95029272 Y NA NA NA NA NA NA MCTP2 256491 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 98400609 98400736 98400673 Y NA NA NA NA NA NA ARRDC4 60048 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 98545444 98546413 98546248 Y NA NA NA NA NA NA ARRDC4 84660 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 99090927 99091248 99091140 Y NA NA IGF1R,SYNM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IGF1R 98952 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 99270923 99271213 99270975 Y IGF1R NA NA NA NA NA IGF1R 80723 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 99298945 99299364 99299005 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 108745 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 99395486 99396002 99395689 Y IGF1R NA NA NA NA NA IGF1R 205286 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 99409834 99409977 99409865 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 219634 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr15 99525654 99525915 99525785 Y NA NA NA NA NA NA LRRC28 263652 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 100026499 100026994 100026794 Y MEF2A,MEF2A MEF2A MEF2A,LRRC28,LYSMD4 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 11129 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr15 100040568 100040700 100040632 Y MEF2A MEF2A LRRC28,MEF2A IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 25198 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr15 100049015 100049413 100049233 Y MEF2A MEF2A MEF2A,LRRC28,TTC23 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 33645 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr15 101546574 101546638 101546606 Y NA NA NA NA NA NA LRRK1 89154 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 101564329 101564758 101564573 Y PCSK6 NA NA NA NA NA LRRK1 106909 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 101739961 101740273 101740216 Y TM2D3,CHSY1 CHSY1 NA NA NA NA CHSY1 49864 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr15 101783359 101783726 101783540 Y CHSY1 CHSY1,SNRPA1 NA NA NA NA CHSY1 6411 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr16 651803 652154 651979 Y NA PIGQ,NHLRC4,RAB40C,C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90 NA NA NA NA RAB40C 14446 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 729341 729555 729445 Y NA C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,METRN,FAM173A,HAGHL,CCDC78 NA NA NA NA STUB1 1117 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 1519780 1519909 1519802 Y SEPX1,MAPK8IP3,CLCN7 C16orf91,CLCN7,TELO2 NA NA NA NA CLCN7 3672 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 1698080 1698287 1698168 Y CLCN7 IFT140,CRAMP1L,HN1L NA NA NA NA HN1L 27970 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 2209355 2209786 2209516 Y NPW RAB26,SNORD60,TRAF7,MLST8 NA NA NA NA TRAF7 5656 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr16 2657653 2657823 2657765 Y NA NA NA NA NA NA ERVK13-1 63622 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr16 2743231 2743530 2743363 Y NA ERVK13-1,KCTD5 NA NA NA NA KCTD5 12755 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 2917931 2918273 2918246 Y NA FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FLYWCH2 12914 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr16 2955389 2955781 2955669 Y NA FLYWCH2,FLYWCH1 NA NA NA NA FLYWCH1 4157 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 20841 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr16 3200393 3200919 3200597 Y NA ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 22615 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 3763227 3763392 3763351 Y NA TRAP1 NA NA NA NA TRAP1 2206 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 4321625 4322178 4321908 Y ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4 TFAP4 NA NA NA NA TFAP4 549 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr16 4357393 4358110 4357824 Y CORO7 TFAP4,PAM16 ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 36317 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 4451383 4451509 4451446 Y UBN1,UBN1,MGRN1,GLYR1,CORO7 PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3 NA NA NA NA CORO7 22197 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 4587360 4587817 4587427 Y HMOX2,PPL,C16orf5,C16orf5 NMRAL1 NA NA NA NA NMRAL1 43596 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 4666118 4666710 4666381 Y NA MGRN1 NA NA NA NA MGRN1 1624 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr16 4713771 4714092 4713866 Y CORO7,NAGPA,GLYR1,MGRN1 MGRN1,NUDT16L1 NA NA NA NA NUDT16L1 27603 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 4818680 4818913 4818758 Y C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI ANKS3,ZNF500,ROGDI NA NA NA NA ZNF500 3055 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 8931520 8931573 8931545 Y NA TMEM186,CARHSP1 NA NA NA NA CARHSP1 29293 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 8939360 8939674 8939516 Y USP7 TMEM186,CARHSP1 NA NA NA NA CARHSP1 21192 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr16 9055639 9056008 9055791 Y C16orf72,USP7 USP7 NA NA NA NA USP7 363 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 9843836 9844157 9843968 Y GRIN2A,GRIN2A NA NA NA NA NA ATF7IP2 574134 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 10374011 10374360 10374211 Y NA ATF7IP2 NA NA NA NA ATF7IP2 43931 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 10962462 10962962 10962665 Y NUBP1,SOCS1,CIITA CIITA NA NA NA NA CIITA 6093 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 10965041 10965252 10965110 Y NUBP1,SOCS1,CIITA CIITA NA NA NA NA CIITA 3803 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 10982517 10982862 10982662 Y NUBP1,SOCS1,CLEC16A,CIITA CIITA NA NA NA NA CIITA 13462 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 11024597 11024619 11024608 Y NA DEXI,CLEC16A NA NA NA NA DEXI 9698 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 11032093 11032474 11032340 Y NA DEXI,CLEC16A NA NA NA NA DEXI 1843 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 11188261 11188580 11188312 Y NA NA NA NA NA NA CLEC16A 151916 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 11319095 11319543 11319384 Y LITAF,CLEC16A,SOCS1 RMI2,SOCS1 CLEC16A,SOCS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RMI2 21933 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 11345704 11346020 11345999 Y NA RMI2,SOCS1 NA NA NA NA SOCS1 2016 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 11422424 11422652 11422552 Y NA NA CLEC16A,PRM2,PRM3,TNP2,RMI2,TXNDC11 IMR90 Hi-C 24141950 SOCS1 74388 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 11591931 11591962 11591945 Y NA NA SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF IMR90 Hi-C 24141950 LITAF 136275 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 11782918 11783419 11783221 Y SOCS1,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN SNN NA NA NA NA SNN 22648 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 11968147 11968344 11968329 Y ZC3H7A RSL1D1,GSPT1 RSL1D1 IMR90 Hi-C 24141950 RSL1D1 24705 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 12008398 12008797 12008598 Y NA GSPT1,TNFRSF17 NA NA NA NA GSPT1 459 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr16 12541943 12542343 12542144 Y RUNDC2A NA NA NA NA NA CPPED1 353531 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 14379572 14379808 14379698 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 216394 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 15169609 15169763 15169686 Y NA NTAN1 NA NA NA NA NTAN1 21688 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 16081407 16081580 16081462 Y NDE1 ABCC1 NA NA NA NA ABCC1 39973 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 16198084 16198445 16198250 Y NA NA NA NA NA NA ABCC1 156650 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 17257893 17258025 17257960 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 304713 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 17267039 17267537 17267379 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 295201 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 17436977 17437203 17437056 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 125535 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 17460967 17461087 17461050 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 101651 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 17463561 17463824 17463658 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 98914 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr16 17510624 17510767 17510687 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 51971 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 17510902 17511071 17510985 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 51667 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 17542654 17543047 17542953 Y XYLT1 XYLT1 NA NA NA NA XYLT1 19691 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr16 17545858 17546183 17546022 Y NA XYLT1 NA NA NA NA XYLT1 16555 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 18811720 18812078 18811899 Y SMG1,COQ7,COQ7 RPS15A,ARL6IP1 NA NA NA NA ARL6IP1 720 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 19106464 19106699 19106563 Y NA COQ7 NA NA NA NA COQ7 29543 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 21313038 21313456 21313158 Y NA CRYM-AS1 NA NA NA NA CRYM-AS1 2868 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 21566198 21566360 21566279 Y DNAH3 SLC7A5P2,CTD-2547E10.2,METTL9 METTL9,IGSF6 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2547E10.2 36433 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 21622558 21622759 21622643 Y CRYM,IGSF6,METTL9 METTL9 NA NA NA NA METTL9 16019 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 21637887 21638686 21638408 Y CRYM,METTL9,IGSF6 METTL9 NA NA NA NA METTL9 31348 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 21656930 21657029 21656972 Y CRYM,METTL9,IGSF6 NA NA NA NA NA METTL9 50391 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 22202596 22202946 22202679 Y POLR3E,CDR2 EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 12657 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr16 22207042 22207397 22207176 Y NA EEF2K POLR3E,EEF2K,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 8206 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 22227582 22228085 22227763 Y EEF2K EEF2K NA NA NA NA EEF2K 11979 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 22229382 22229580 22229448 Y NA EEF2K NA NA NA NA EEF2K 13779 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 23309711 23310080 23309897 Y NA NA SCNN1B MCF7 ChIA-PET 22265404 USP31 151120 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 23419986 23420351 23420270 Y NA COG7 NA NA NA NA COG7 42150 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 23508487 23508934 23508786 Y GGA2 COG7,GGA2 NA NA NA NA GGA2 22382 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 23531974 23532033 23532005 Y NA GGA2,UBFD1,EARS2 NA NA NA NA GGA2 658 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 23874863 23875389 23875220 Y GGA2,PRKCB NA NA NA NA NA PLK1 187886 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 25069852 25070174 25070015 Y NA ARHGAP17 NA NA NA NA ARHGAP17 44865 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 27180980 27181298 27181194 Y KIAA0556,IL21R,JMJD5,JMJD5 NA HS3ST4,LOC283888,IL21R,JMJD5,IL4R IMR90 Hi-C 24141950 NSMCE1 96817 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 27192533 27192714 27192624 Y NA NA HS3ST4,IL21R,NSMCE1,LOC283888 IMR90 Hi-C 24141950 NSMCE1 85401 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 27240450 27240772 27240769 Y NA NSMCE1 NA NA NA NA NSMCE1 37343 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.54589630515498 chr16 27242037 27242327 27242262 Y NA NSMCE1 NA NA NA NA NSMCE1 35788 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.40536027741361 chr16 27248798 27249418 27249027 Y KIAA0556,IL4R,IL21R NSMCE1 NA NA NA NA NSMCE1 28697 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 27265638 27265791 27265719 Y KIAA0556,IL4R NSMCE1 NA NA NA NA NSMCE1 12324 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 27278659 27278775 27278715 Y JMJD5 NSMCE1,IL4R NA NA NA NA NSMCE1 544 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 27386500 27386691 27386620 Y C16orf82,IL21R,IL4R IL21R NA NA NA NA IL21R 24792 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr16 27533512 27533805 27533694 Y JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1 GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 25429 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 27542863 27543251 27543051 Y NA GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 15983 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 27546889 27546978 27546937 Y NA GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 12256 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 28108728 28108802 28108745 Y APOBR,XPO6 NA NA NA NA NA XPO6 112439 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 28179891 28180117 28180009 Y SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6 XPO6 NA NA NA NA XPO6 41124 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 28186234 28186473 28186328 Y SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6 XPO6 NA NA NA NA XPO6 34768 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 28839972 28840187 28840086 Y CCDC101,LAT,LAT,SH2B1,SH2B1,SH2B1,NFATC2IP ATXN2L,TUFM,SH2B1 NA NA NA NA ATXN2L 7616 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 28871082 28871475 28871117 Y NA ATXN2L,TUFM,SH2B1 NA NA NA NA SH2B1 15161 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 29954900 29955228 29955066 Y NA KCTD13,TMEM219,TAOK2,INO80E MVP,KCTD13,ZG16,PRRT2,MAZ,KIF22,C16orf54,LOC440356,ASPHD1,SEZ6L2,CDIPT,TMEM219,TAOK2,HIRIP3,INO80E,ALDOA IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM219 4694 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 30427925 30428543 30428281 Y HIRIP3,ZNF48 TBC1D10B,ZNF48,SEPT1,ZNF771,SNORA42,DCTPP1,SEPHS2 NA NA NA NA SNORA42 537 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 2.67018452708587 chr16 30726552 30726958 30726731 Y ZNF668,ZNF646,STX4,MYST1,FUS SRCAP,PHKG2,RNF40,C16orf93 RNF40,PHKG2,C16orf93 IMR90 Hi-C 24141950 SRCAP 19022 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr16 30825606 30826012 30825883 Y NA ZNF629 ZNF629,RNF40,MIR4519 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF629 29083 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 30855963 30856257 30856110 Y NA MIR4519,BCL7C CTF1,BCL7C,MIR762,FBXL19,FBXL19-AS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 MIR4519 28387 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 30885980 30886229 30886174 Y ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668 MIR4519,BCL7C,FBXL19,FBXL19-AS1 NA NA NA NA MIR4519 1336 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr16 31129616 31130225 31129940 Y ARMC5,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8 NA NA NA NA KAT8 4541 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 31223480 31223547 31223514 Y ZNF629 FUS,PYCARD NA NA NA NA PYCARD 10709 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 31888684 31889219 31888998 Y ARMC5,ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 5605 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 33509690 33509798 33509723 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 1626611 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 46671518 46671564 46671541 Y NA SHCBP1,VPS35,ORC6 NA NA NA NA SHCBP1 17980 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 46823783 46824029 46823881 Y NA C16orf87 NA NA NA NA C16orf87 39294 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 47454284 47454574 47454519 Y NA PHKB,ITFG1 NA NA NA NA PHKB 38460 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 47526942 47527306 47527022 Y PHKB PHKB,ITFG1 NA NA NA NA ITFG1 30882 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr16 47669133 47669265 47669199 Y NA NA NA NA NA NA ITFG1 173073 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 48373783 48374217 48374017 Y LONP2,N4BP1,SIAH1 NA NA NA NA NA LONP2 97576 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 48593216 48593689 48593553 Y NA NA NA NA NA NA N4BP1 58370 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 49053950 49054007 49053977 Y NA NA NA NA NA NA N4BP1 401891 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 49497599 49497828 49497682 Y NA NA NA NA NA NA HEATR3 600024 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 51186041 51186738 51186313 Y NA NA NA NA NA NA CYLD 412080 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr16 51187930 51188326 51188194 Y NA NA NA NA NA NA CYLD 413969 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 51250029 51250326 51250178 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPA1P48 427341 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 53086726 53087108 53087065 Y NA NA NA NA NA NA CHD9 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 53089565 53089820 53089729 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 2620 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 53125869 53126178 53125948 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 38924 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 53165497 53165808 53165602 Y NA NA NA NA NA NA CHD9 78552 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 53552731 53552904 53552850 Y LOC643802,RBL2,AKTIP AKTIP NA NA NA NA AKTIP 16408 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr16 54415438 54415695 54415567 Y NA NA NA NA NA NA IRX3 96763 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 56890645 56890781 56890713 Y NA NA NA NA NA NA HERPUD1 73179 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 56945707 56946108 56945896 Y NLRC5,HERPUD1 HERPUD1 NA NA NA NA HERPUD1 17852 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 57294233 57294672 57294611 Y CPNE2,GPR56 ARL2BP NA NA NA NA ARL2BP 17223 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 57717053 57717380 57717096 Y FAM192A,ZNF319,GPR97 CCDC135 NA NA NA NA CCDC135 9325 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.68643233289634 chr16 58447315 58447494 58447380 Y NA NA NA NA NA NA SETD6 99889 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 58455011 58455230 58455100 Y NA NA NA NA NA NA SETD6 92153 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.68643233289634 chr16 58460815 58461210 58460990 Y NDRG4,NDRG4,NDRG4 NA NA NA NA NA SETD6 86173 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 58493284 58493520 58493447 Y NDRG4,NDRG4,NDRG4 NA NA NA NA NA SETD6 53863 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 58555953 58556233 58556187 Y NA SETD6 NA NA NA NA SETD6 8570 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr16 59002662 59002836 59002667 Y NA NA NA NA NA NA GOT2 236401 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 66508767 66508904 66508846 Y NA NA NA NA NA NA LINC00920 68340 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 66557840 66558108 66558016 Y CKLF TK2,CKLF,CKLF-CMTM1 NA NA NA NA TK2 26339 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 66784501 66784840 66784671 Y NA DYNC1LI2 NA NA NA NA DYNC1LI2 800 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 66906996 66907469 66907329 Y SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2 NAE1,PDP2 NA NA NA NA NAE1 1837 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr16 67186810 67187094 67186952 Y NA C16orf70,B3GNT9,FBXL8,TRADD,HSF4,NOL3,KIAA0895L,E2F4 NA NA NA NA B3GNT9 3693 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 67250789 67251131 67250954 Y NA NOL3,KIAA0895L,E2F4,LRRC29,TMEM208,FHOD1 NA NA NA NA LRRC29 7820 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 67435763 67435871 67435819 Y NA NA NA NA NA NA ATP6V0D1 77269 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr16 67565199 67565482 67565398 Y C16orf70,LRRC29,LRRC29,FHOD1,PSMB10,DPEP2,DDX28,ATP6V0D1,FAM65A FAM65A,CTCF NA NA NA NA FAM65A 14878 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 67581625 67581971 67581838 Y RLTPR,CTCF FAM65A,CTCF NA NA NA NA CTCF 12339 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chr16 67597304 67597932 67597899 Y THAP11,RLTPR,ACD FAM65A,CTCF NA NA NA NA CTCF 2994 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 67689330 67689673 67689514 Y NA ACD,PARD6A,C16orf86 NA NA NA NA ACD 3040 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 68271348 68271876 68271591 Y TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2 PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA PLA2G15 5331 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 68320188 68320357 68320233 Y RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7 PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7 NA NA NA NA SLC7A6OS 22492 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr16 68320405 68320913 68320608 Y ZFP90,SMPD3 PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7 NA NA NA NA SLC7A6OS 21936 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 68418958 68419037 68419019 Y NA NA NA NA NA NA PRMT7 76081 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr16 69121214 69121414 69121257 Y NA CHTF8,CIRH1A HAS3 IMR90 Hi-C 24141950 CHTF8 30917 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 69506405 69506529 69506498 Y NA CYB5B NA NA NA NA CYB5B 49977 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 69556739 69556897 69556827 Y HAS3,TERF2 NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2 IMR90 Hi-C 24141950 NFAT5 40100 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.68643233289634 chr16 70771415 70771759 70771684 Y EXOSC6 NA NA NA NA NA MTSS1L 53446 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 71753676 71753893 71753785 Y HPR,PHLPP2 PHLPP2 NA NA NA NA PHLPP2 2711 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 71931018 71931097 71931057 Y DHX38,ATXN1L,KIAA0174 ZNF821 NA NA NA NA ZNF821 3779 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 72257967 72258413 72258290 Y NA NA HPR IMR90 Hi-C 24141950 TXNL4B 131637 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 72459158 72459630 72459377 Y NA NA NA NA NA NA TXNL4B 332828 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr16 74353064 74353398 74353241 Y FA2H PSMD7,RP11-252A24.2 NA NA NA NA PSMD7 24391 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 74610751 74610842 74610827 Y NA GLG1 NA NA NA NA GLG1 28170 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 74701397 74701877 74701440 Y RFWD3 RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 2618 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr16 75108938 75109127 75108974 Y NA NA NA NA NA NA ZFP1 71263 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 75109200 75109655 75109345 Y TMEM170A,ZNRF1 NA NA NA NA NA ZFP1 70735 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 75359436 75359702 75359569 Y NA NA BCAR1 IMR90 Hi-C 24141950 CFDP1 105681 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 77322301 77322413 77322334 Y NA NA NA NA NA NA SYCE1L 91007 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 78564720 78564924 78564822 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 433410 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 79363124 79363335 79363273 Y MAF NA WWOX,DYNLRB2 IMR90 Hi-C 24141950 WWOX 1231814 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 81026963 81027197 81027054 Y NA CENPN,ATMIN NA NA NA NA CENPN 10906 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 81512608 81512902 81512703 Y PLCG2,CMIP,CMIP CMIP NA NA NA NA CMIP 35833 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 81831837 81832216 81831920 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 61135 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 81832236 81832757 81832339 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 61534 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 81855087 81855491 81855343 Y PLCG2 NA NA NA NA NA PLCG2 84385 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr16 81856913 81857368 81857087 Y CMIP,CMIP,PLCG2 NA NA NA NA NA PLCG2 86211 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr16 81865379 81865629 81865509 Y CMIP,CMIP,PLCG2 NA NA NA NA NA PLCG2 94677 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 81871176 81871311 81871248 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 100474 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 81875278 81875726 81875461 Y PLCG2 NA NA NA NA NA PLCG2 104576 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 82667775 82667948 82667787 Y NA NA NA NA NA NA MPHOSPH6 465944 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 83953538 83953937 83953606 Y NA MLYCD,OSGIN1 NA NA NA NA MLYCD 22807 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 84545075 84545257 84545139 Y NA NA COTL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 COTL1 104426 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 84677292 84677600 84677448 Y NA COTL1,KLHL36 KIAA1609,COTL1,USP10,KLHL36,ZDHHC7 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL36 2531 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr16 84866899 84867167 84866969 Y CRISPLD2 CRISPLD2 NA NA NA NA CRISPLD2 15309 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 85339922 85340091 85340012 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 280547 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 85343472 85343805 85343554 Y KIAA0513 NA KIAA0513,FAM92B,LOC400548,LINC00311,LOC727710,KIAA0182,GINS2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA0513 284097 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 85346294 85346686 85346622 Y FAM92B NA KIAA0513,FAM92B,LOC400548,LINC00311,LOC727710,KIAA0182,GINS2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA0513 286919 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 85428961 85429169 85429067 Y NA NA LOC727710,LINC00311,GINS2,KIAA0182,FAM92B IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 292510 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 85497347 85497685 85497518 Y KIAA0182,GINS2 NA KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 223994 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.54589630515498 chr16 85522483 85522579 85522531 Y NA NA KIAA0182,FAM92B,KIAA0513,LOC727710 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 199100 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 85586399 85586765 85586561 Y KIAA0182,KIAA0182,GINS2 NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134914 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr16 85623714 85624085 85623926 Y NA NA LOC727710,LOC400548,LINC00311,KIAA0182,C16orf74 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 97594 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 85678973 85679150 85679027 Y NA GINS2 GINS2 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 42529 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 85903471 85903703 85903566 Y NA NA IRF8,COX4I1,FOXF1,LOC400550,MTHFSD,FLJ30679 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-568J23.1 55329 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 85947297 85947673 85947421 Y COX4I1,IRF8 NA NA NA NA NA RP11-568J23.1 99155 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr16 85958354 85958601 85958447 Y IRF8 NA NA NA NA NA RP11-568J23.1 110212 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 86609499 86609840 86609550 Y FOXC2 MTHFSD NA NA NA NA MTHFSD 22658 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 87378694 87379151 87378934 Y FBXO31 C16orf95,MAP1LC3B,FBXO31 NA NA NA NA C16orf95 29672 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 87421939 87422407 87422148 Y NA MAP1LC3B,FBXO31 NA NA NA NA FBXO31 1341 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 87428114 87428209 87428177 Y NA MAP1LC3B,FBXO31 NA NA NA NA FBXO31 4366 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 87756631 87757179 87757021 Y KLHDC4 KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 40419 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr16 87758673 87759076 87758907 Y KLHDC4 KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 38522 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 87780321 87780693 87780507 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 16905 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 87812654 87813065 87812978 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 15056 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 87843209 87843416 87843290 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 45611 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 87886258 87886670 87886593 Y MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 14424 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 88102746 88103509 88103226 Y BANP,BANP NA NA NA NA NA BANP 121896 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr16 88323760 88323914 88323837 Y BANP NA BANP,ZNF469,CA5A,KLHDC4 IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 193811 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 88520905 88521327 88521137 Y ZC3H18,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZFPM1 ZFPM1 NA NA NA NA ZFPM1 3180 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 88544681 88544835 88544758 Y ZFPM1 ZFPM1 NA NA NA NA ZFPM1 26956 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 88700249 88701257 88700631 Y ACSF3,ZFPM1,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,CBFA2T3,ZC3H18,CYBA CYBA,MVD,SNAI3 NA NA NA NA CYBA 14303 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 88837093 88837695 88837443 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 11924 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 88865592 88865963 88865778 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA CDT1 1658 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 88866491 88866710 88866640 Y ACSF3,CBFA2T3 PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA CDT1 911 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 88988977 88989104 88989054 Y NA NA TRAPPC2L,GALNS MCF7 ChIA-PET 22265404 CBFA2T3 52508 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 89049819 89050070 89049961 Y CBFA2T3 CBFA2T3 NA NA NA NA CBFA2T3 8207 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 89050259 89050442 89050349 Y CBFA2T3,CBFA2T3 CBFA2T3 NA NA NA NA CBFA2T3 8647 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 89181535 89182183 89181777 Y CYBA,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,CBFA2T3,CBFA2T3,RPL13,RPL13,ACSF3 ACSF3 NA NA NA NA ACSF3 28752 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.68643233289634 chr16 89184955 89185230 89185162 Y CYBA,RNF166,RNF166,CBFA2T3 ACSF3 LINC00304,LOC400558,CDH15 IMR90 Hi-C 24141950 ACSF3 32172 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 89451016 89451317 89451295 Y CBFA2T3,ACSF3,ZNF778,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPG7,SPATA2L,ANKRD11 NA NA NA NA NA ANKRD11 103652 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 89555521 89555997 89555713 Y ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 196 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr16 89557852 89558189 89558050 Y NA ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 2527 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 89564919 89565211 89565067 Y NA ANKRD11,SPG7 ANKRD11,SPG7 IMR90 Hi-C 24141950 SPG7 9594 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr16 89571786 89572109 89572034 Y ACSF3,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 16461 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr16 89579992 89580270 89580045 Y ACSF3,ZNF778,DBNDD1,ZNF276,SPG7 ANKRD11,SPG7,RPL13,SNORD68 NA NA NA NA SPG7 24667 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 89672117 89672737 89672683 Y NA RPL13,SNORD68,CPNE7,CHMP1A NA NA NA NA CPNE7 31941 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.54589630515498 chr16 89879863 89880236 89880053 Y NA FANCA NA NA NA NA FANCA 829 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr16 90024486 90024764 90024610 Y NA CENPBD1,AFG3L1P NA NA NA NA CENPBD1 12178 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 574639 574965 574941 Y NA RPS4XP17,VPS53 NA NA NA NA RPS4XP17 15852 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 576455 576740 576580 Y NA RPS4XP17,VPS53 NA NA NA NA RPS4XP17 17668 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 872760 873162 873150 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 7848 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 1171565 1171808 1171610 Y WDR81,PITPNA,ABR,ABR NA NA NA NA NA YWHAE 129864 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 1391218 1391783 1391434 Y NA CRK,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA INPP5K 26399 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 1926126 1926449 1926286 Y NA RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA RTN4RL1 190 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 7.02680138706807 chr17 1953067 1954207 1953327 Y TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1 RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 1241 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 1970904 1971232 1971070 Y HIC1 RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 15456 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 1992717 1993096 1992933 Y SLC43A2,SCARF1,WDR81 OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 37269 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 2026015 2026378 2026080 Y SERPINF2,SERPINF2 NA NA NA NA NA HIC1 70567 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 2166387 2166805 2166676 Y METTL16,SMG6,SMG6 SRR,SMG6 NA NA NA NA SRR 37872 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 2302108 2302510 2302261 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT NA NA NA NA NA MNT 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 2302778 2303366 2303033 Y SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT MNT NA NA NA NA MNT 366 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 2719284 2719546 2719376 Y NA RAP1GAP2 NA NA NA NA RAP1GAP2 40934 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 3864052 3864295 3864184 Y CTNS,ZZEF1,P2RX1,ATP2A3 P2RX1,ATP2A3 NA NA NA NA ATP2A3 1441 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 4204226 4204625 4204419 Y CAMKK1 ANKFY1 NA NA NA NA ANKFY1 38952 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 4668066 4668242 4668231 Y MINK1,C17orf87,C17orf107,ARRB2,CXCL16,ZMYND15,ZMYND15 MED11,CXCL16,VMO1,PSMB6,PLD2 NA NA NA NA VMO1 19486 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 4704497 4704876 4704590 Y ZNF232,KIF1C VMO1,PSMB6,PLD2,MINK1 NA NA NA NA PLD2 3515 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 4753672 4753828 4753714 Y UBE2G1,ARRB2,CXCL16,ZMYND15,ZMYND15,MINK1,RNF167,C17orf107 PLD2,MINK1 NA NA NA NA MINK1 18989 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 4811647 4812042 4811731 Y NA RNF167,SLC25A11,PFN1 NA NA NA NA RNF167 29261 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 7233457 7233867 7233744 Y WRAP53,POLR2A,DNAH2,DLG4,EIF5A EIF5A,GPS2,NEURL4,ACAP1,KCTD11 NA NA NA NA NEURL4 2745 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 7389589 7389989 7389739 Y C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A CHRNB1,ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA POLR2A 3904 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 18450 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.40536027741361 chr17 7745337 7745870 7745591 Y NA CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 13194 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 11508 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 2.24857644386178 chr17 7790181 7790340 7790322 Y POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3 CYB5D1,CHD3,LSMD1,KCNAB3,CNTROB,TRAPPC1 NA NA NA NA LSMD1 3625 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 8029074 8029494 8029268 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107 NA NA NA NA HES7 3664 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 8029634 8030116 8029995 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107 NA NA NA NA HES7 4224 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 4.77822494320629 chr17 8041932 8042438 8042328 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 15386 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr17 8057335 8058055 8057702 Y KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59 HES7,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 8090038 8090540 8090163 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 1024 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 8090795 8091158 8090849 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 406 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 8095551 8095762 8095658 Y KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2 PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 3987 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 8103328 8103700 8103595 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1 NA NA NA NA AURKB 8218 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 8531412 8531868 8531658 Y NA MYH10 NA NA NA NA MYH10 211 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 8532647 8532776 8532657 Y KRBA2 MYH10 NA NA NA NA MYH10 568 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 8649167 8649702 8649446 Y ODF4,SPDYE4,MFSD6L,CCDC42 NA NA NA NA NA MYH10 117088 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 8762126 8762262 8762190 Y PIK3R5,PIK3R6 PIK3R6 NA NA NA NA PIK3R6 6732 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 8802326 8802717 8802613 Y NDEL1,PIK3R5,PIK3R5 PIK3R6 NA NA NA NA PIK3R6 33332 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 8824079 8824459 8824269 Y NDEL1,PIK3R5,PIK3R5 PIK3R5 NA NA NA NA PIK3R5 42570 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 8825548 8827035 8825911 Y NDEL1,PIK3R5,PIK3R5 PIK3R5 NA NA NA NA PIK3R5 39994 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 8855312 8855901 8855659 Y PIK3R5,PIK3R5 PIK3R5 NA NA NA NA PIK3R5 11128 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 9916757 9917097 9916900 Y GAS7,GAS7 NA NA NA NA NA RPS27AP1 242982 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 9921805 9922130 9921895 Y GAS7,GAS7 NA NA NA NA NA RPS27AP1 237949 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 9924626 9924875 9924814 Y NA NA NA NA NA NA RPS27AP1 235204 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 9953965 9954309 9954075 Y GAS7,GAS7 NA NA NA NA NA RPS27AP1 205770 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 10075017 10075299 10075198 Y MYH4,GAS7 NA NA NA NA NA RPS27AP1 84780 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 10702124 10702347 10702289 Y NA NA NA NA NA NA RP11-963H4.2 54264 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 14206970 14207459 14207274 Y HS3ST3B1 HS3ST3B1 NA NA NA NA HS3ST3B1 4570 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 14331583 14331800 14331731 Y HS3ST3B1 NA NA NA NA NA HS3ST3B1 129183 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 15787021 15787553 15787332 Y ZSWIM7,TTC19,ADORA2B NA NA NA NA NA ADORA2B 58678 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr17 15923170 15923610 15923287 Y FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 22139 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 15925706 15925935 15925791 Y FAM18B2,PIGL,NCOR1,TTC19,ZSWIM7 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 24675 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 15959345 15959465 15959410 Y FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA NA ZSWIM7 58314 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 16319642 16320463 16320033 Y NA UBB,TRPV2 NA NA NA NA TRPV2 2786 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 16355497 16355695 16355534 Y TTC19,PIGL TRPV2,FAM211A NA NA NA NA FAM211A 37772 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 16438910 16439232 16439111 Y NA FAM211A NA NA NA NA FAM211A 45443 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr17 16944636 16944769 16944688 Y NA MPRIP NA NA NA NA MPRIP 777 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 17302391 17302480 17302436 Y NA RPL13P12 MED9,SMCR9,SREBF1,TOM1L2,PEMT,RAI1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL13P12 17065 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 17574123 17574282 17574192 Y NA RAI1 RAI1,NT5M,TOM1L2,PEMT,MED9,SMCR5,SREBF1,COPS3 IMR90 Hi-C 24141950 RAI1 8505 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr17 17597479 17598220 17598134 Y ALKBH5,FLCN,COPS3 RAI1 NA NA NA NA RAI1 14692 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr17 17655489 17655938 17655636 Y DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9 NA NA NA NA NA RAI1 72702 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.8269683606377 chr17 17677876 17678068 17678030 Y NA NA NA NA NA NA SREBF1 60257 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 17687276 17687668 17687631 Y NA NA NA NA NA NA SREBF1 50657 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 17743258 17743857 17743527 Y SMCR8 SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 4933 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr17 20688064 20688832 20688343 Y NA OLA1P2,SCDP1 NA NA NA NA SCDP1 2106 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 20943914 20944165 20944106 Y NA USP22 NA NA NA NA USP22 908 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr17 21002403 21002809 21002523 Y KCNJ18 DHRS7B USP22,C17orf103 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHRS7B 21868 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr17 21003151 21003338 21003245 Y NA DHRS7B USP22,C17orf103 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHRS7B 21339 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 21179100 21179414 21179208 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 6570 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr17 21188812 21189500 21189174 Y MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 NA NA NA NA MAP2K3 2828 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 25409900 25410125 25410078 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208977 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 25410571 25410806 25410743 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208296 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 25620233 25620423 25620280 Y NA WSB1 NA NA NA NA WSB1 1131 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr17 26368091 26368384 26368254 Y NA NLK NA NA NA NA NLK 1328 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 26894495 26894823 26894797 Y NA UNC119,PIGS,ALDOC,SPAG5-AS1,SPAG5 NA NA NA NA PIGS 2067 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 27116093 27116114 27116106 Y NA TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 47091 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr17 27118575 27118718 27118697 Y NA TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 49573 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 27189702 27189769 27189736 Y NA ERAL1,FLOT2,DHRS13 NA NA NA NA ERAL1 9746 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 27475765 27476166 27476073 Y NEK8,PHF12 MYO18A NA NA NA NA MYO18A 29264 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 27619094 27619880 27619581 Y TAOK1 NA NA NA NA NA NUFIP2 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr17 27791459 27791862 27791696 Y NA NA NA NA NA NA MIR4523 75779 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 27890961 27891203 27891032 Y SSH2,ABHD15 ABHD15,ANKRD13B,GIT1 NA NA NA NA TP53I13 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 28009923 28010244 28010118 Y SSH2 NA NA NA NA NA CORO6 61998 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 28049478 28050072 28049903 Y NUFIP2,TAOK1,SSH2 NA NA NA NA NA CORO6 101553 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr17 28258246 28258478 28258304 Y NA SSH2 NA NA NA NA SSH2 2952 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr17 28928053 28928382 28928251 Y NA SMURF2P1 NA NA NA NA SMURF2P1 2239 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 29115484 29115559 29115508 Y NA CRLF3,CTD-2349P21.1,ATAD5 NA NA NA NA CRLF3 34235 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 29136069 29136242 29136166 Y CRLF3 CRLF3,CTD-2349P21.1,ATAD5 NA NA NA NA CRLF3 13552 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr17 29212303 29212381 29212342 Y OMG,NF1,C17orf42 TEFM NA NA NA NA TEFM 19457 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 29637373 29637640 29637434 Y CRLF3,EVI2A EVI2B,EVI2A NA NA NA NA EVI2B 1490 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 3.37286466579267 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 160050 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr17 30724674 30725107 30724769 Y RHOT1 C17orf75,ZNF207,PSMD11 NA NA NA NA PSMD11 44172 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 30837973 30838187 30838080 Y CDK5R1 CDK5R1 NA NA NA NA CDK5R1 26336 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 30886393 30886627 30886490 Y NA NA NA NA NA NA CDK5R1 74756 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 33673458 33673662 33673550 Y ZNF830,RFFL,SLFN14,SLFN11,SLFN5 SLFN11 NA NA NA NA SLFN11 25058 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 33787408 33787803 33787736 Y ZNF830,SLFN5,CCL5,SLFN12L NA NA NA NA NA SLFN11 88688 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr17 33867743 33868178 33867841 Y RFFL,SLFN5,SLFN11,CCL5,CCL23 AP2B1,PEX12 NA NA NA NA AP2B1 34887 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 33923571 33923796 33923685 Y NA AP2B1,PEX12 NA NA NA NA PEX12 19689 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 34160214 34160648 34160302 Y NA MMP28,TAF15 NA NA NA NA TAF15 25755 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 34875469 34875747 34875679 Y NA ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2 NA NA NA NA PIGW 13100 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 35492690 35492856 35492817 Y NA NA NA NA NA NA AATF 188515 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 36134421 36134864 36134540 Y DDX52 NA DDX52,HNF1B,SYNRG IMR90 Hi-C 24141950 DDX52 132928 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 36208825 36209240 36208956 Y NA NA NA NA NA NA DDX52 207332 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 36480536 36480738 36480637 Y NA MRPL45,SOCS7 NA NA NA NA SOCS7 25373 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 36597301 36597559 36597449 Y NA ARHGAP23 NA NA NA NA ARHGAP23 14639 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 36748013 36748410 36748212 Y NA NA ARHGAP23 IMR90 Hi-C 24141950 C17orf96 80777 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 36758537 36758835 36758687 Y NA NA NA NA NA NA C17orf96 70352 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 37323832 37324052 37323944 Y NA CACNB1,RPL19 NA NA NA NA CACNB1 27904 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 37366071 37366159 37366135 Y STAC2 CACNB1,RPL19 NA NA NA NA RPL19 11535 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr17 37910411 37911394 37910787 Y FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3 MIEN1 NA NA NA NA MIEN1 25371 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr17 37912171 37912498 37912435 Y FBXL20,CDK12,WIPF2,ORMDL3,IKZF3 MIEN1 NA NA NA NA MIEN1 27131 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 38084566 38084955 38084762 Y NA ORMDL3 NA NA NA NA ORMDL3 2712 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 38226807 38227182 38226872 Y NA THRA,MED24,NR1D1,MSL1 NA NA NA NA MED24 11339 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 38365489 38365514 38365502 Y NA WIPF2 NA NA NA NA WIPF2 8042 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 38674878 38675250 38674921 Y TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4 NA IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IGFBP4 77176 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr17 38689625 38689996 38689764 Y NA NA NA NA NA NA IGFBP4 91923 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 38703564 38704159 38703879 Y SMARCE1,MED24,CASC3,TOP2A,CCR7 NA NA NA NA NA SMARCE1 98601 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 38754802 38755132 38754943 Y NA SMARCE1 KRT14,KRT42P,KRT26,GJD3,TOP2A,TNS4,KRT27,KRT28,RARA,CDC6,IGFBP4,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT9,LOC147093,KRT17 IMR90 Hi-C 24141950 SMARCE1 47628 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 38755372 38755931 38755592 Y KRTAP3-2,CASC3,WIPF2,RARA,RARA,CCR7 SMARCE1 KRT14,KRT42P,KRT26,GJD3,TOP2A,TNS4,KRT27,KRT28,RARA,CDC6,IGFBP4,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT9,LOC147093,KRT17 IMR90 Hi-C 24141950 SMARCE1 46829 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 39956975 39957353 39957171 Y KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17,JUP JUP,LEPREL4,FKBP10 NA NA NA NA LEPREL4 9503 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 40071903 40071935 40071919 Y NA ACLY,TTC25,CNP NA NA NA NA ACLY 12860 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 40608913 40609089 40609017 Y NA NA NA NA NA NA STAT3 70327 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 42173050 42173151 42173101 Y TMEM101,G6PC3 LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25919 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 42173326 42173627 42173470 Y NA LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25443 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 42245888 42246083 42245988 Y NA HDAC5,C17orf53,TMUB2,ATXN7L3 NA NA NA NA TMUB2 16255 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 2.67018452708587 chr17 42404001 42404290 42404282 Y C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39 SLC25A39,GRN,FAM171A2 NA NA NA NA SLC25A39 3763 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr17 42425585 42425836 42425708 Y TMUB2,TMUB2,GRN SLC25A39,GRN,FAM171A2 NA NA NA NA GRN 4971 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 42634020 42634172 42634095 Y TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2 FZD2 NA NA NA NA FZD2 1095 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr17 42797981 42798248 42798116 Y CCDC43 CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1 NA NA NA NA RP11-1072C15.1 2016 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr17 43018379 43018606 43018493 Y NA CCDC103,EFTUD2,FAM187A,KIF18B NA NA NA NA KIF18B 4476 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr17 43249989 43250354 43250021 Y ADAM11,HIGD1B,GFAP,DCAKD ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2,FMNL1 NA NA NA NA HEXIM2 13922 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 43302645 43302970 43302880 Y NA FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 5834 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 43303050 43303852 43303644 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 6239 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr17 43660811 43661173 43660906 Y ACBD4,FMNL1,PLEKHM1 RPS26P8 NA NA NA NA RPS26P8 22736 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 44271977 44272219 44272147 Y KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA RPS7P11 525314 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 44344171 44344471 44344293 Y NA NA KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RPS7P11 453062 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr17 45282976 45283116 45283053 Y NA CDC27 MYL4 K562 ChIA-PET 22265404 CDC27 18188 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 45317390 45317724 45317566 Y TBKBP1 NA NA NA NA NA CDC27 52602 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 45609469 45609601 45609554 Y NA NPEPPS NA NA NA NA NPEPPS 11161 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 45717975 45718065 45718017 Y NA KPNB1 NA NA NA NA KPNB1 6777 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 45771013 45771467 45771041 Y NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1 KPNB1 NA NA NA NA KPNB1 46171 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr17 46034209 46034446 46034327 Y NA AC003665.1,PNPO,CDK5RAP3 NA NA NA NA CDK5RAP3 8730 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 46289129 46289412 46289274 Y NA NA NA NA NA NA SNX11 110410 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr17 46517436 46517771 46517529 Y CDK5RAP3,SKAP1 NA SKAP1,HOXB3,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB6 IMR90 Hi-C 24141950 HOXB-AS3 107221 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 47270202 47270509 47270359 Y CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3 ABI3,GNGT2,PHOSPHO1 NA NA NA NA ABI3 15080 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 47465642 47465862 47465766 Y ZNF652,ZNF652,MYST2,FAM117A ZNF652,PHB,AC004797.1 NA NA NA NA PHB 24384 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 47467973 47468124 47468044 Y ABI3,PHOSPHO1,ZNF652,ZNF652,SPOP,MYST2,FAM117A ZNF652,PHB,AC004797.1 NA NA NA NA PHB 22122 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 47816909 47817569 47817208 Y ZNF652,ZNF652,PPP1R9B,MYST2,FAM117A SLC35B1,KAT7,FAM117A NA NA NA NA SLC35B1 32533 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr17 47818299 47818938 47818569 Y NA SLC35B1,KAT7,FAM117A NA NA NA NA SLC35B1 33923 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 48228924 48229616 48229504 Y SPATA20,SAMD14 PPP1R9B NA NA NA NA PPP1R9B 2933 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 48942663 48943085 48943016 Y NA TOB1 NA NA NA NA TOB1 254 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 48996944 48997365 48997235 Y UTP18,RSAD1,TOB1 NA LOC400604,TOB1,WFIKKN2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOB1 53605 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 49008376 49008926 49008868 Y NA NA WFIKKN2,TOB1,LOC400604,LINC00483,ANKRD40,SPAG9 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOB1 65037 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 49027288 49027482 49027366 Y NA NA NA NA NA NA TOB1 83949 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 49324611 49324828 49324669 Y MBTD1 MBTD1,UTP18 NA NA NA NA MBTD1 10696 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 49727164 49727246 49727242 Y NA NA NA NA NA NA UTP18 391275 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr17 51041886 51041892 51041889 Y NA NA NA NA NA NA RPS2P48 791339 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 51059537 51059872 51059705 Y NA NA NA NA NA NA RPS2P48 773359 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 53315618 53315983 53315841 Y HLF NA STXBP4,HLF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MMD 181370 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 53394900 53394943 53394922 Y NA NA NA NA NA NA MMD 102410 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 53497202 53497618 53497598 Y NA NA NA NA NA NA MMD 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 54890834 54891042 54890937 Y NA DGKE,C17orf67 NA NA NA NA DGKE 18418 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 55210991 55211279 55211077 Y NA NA NA NA NA NA AKAP1 50538 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 55517850 55518075 55517943 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 186638 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr17 55628691 55629280 55629007 Y MSI2,MSI2 NA NA NA NA NA MRPS23 296137 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 3.37286466579267 chr17 55763716 55764071 55763861 Y MSI2,MSI2 NA NA NA NA NA MRPS23 161346 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 55801190 55801558 55801374 Y NA NA MSI2,AKAP1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS23 123859 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr17 55951789 55952442 55952113 Y SRSF1,MKS1,MKS1,BZRAP1,MRPS23 MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 26372 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr17 55992933 55993227 55993168 Y NA CUEDC1 VEZF1,CUEDC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUEDC1 37457 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 56161643 56161969 56161895 Y VEZF1,MTMR4 DYNLL2 NA NA NA NA DYNLL2 2867 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 56230515 56230722 56230586 Y MTMR4,HSF5 NA NA NA NA NA MKS1 64244 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 56362029 56362418 56362266 Y SRSF1,MPO,BZRAP1 BZRAP1,MIR142,MIR4736 NA NA NA NA BZRAP1 41734 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 56391648 56391970 56391957 Y NA BZRAP1,MIR142,MIR4736,SUPT4H1 NA NA NA NA BZRAP1 12182 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 56410599 56410851 56410735 Y RAD51C,SRSF1,MPO,MTMR4,SUPT4H1 BZRAP1,MIR142,MIR4736,SUPT4H1 NA NA NA NA MIR4736 532 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 56411173 56411562 56411307 Y SRSF1,MTMR4,BZRAP1 BZRAP1,MIR142,SUPT4H1 NA NA NA NA MIR4736 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chr17 56412418 56413089 56412537 Y SRSF1,MPO,MTMR4,BZRAP1,SUPT4H1 BZRAP1,MIR142,MIR4736,SUPT4H1 NA NA NA NA MIR4736 1035 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 56413212 56413667 56413409 Y VEZF1,MPO,MTMR4,SUPT4H1 BZRAP1,MIR142,MIR4736,SUPT4H1 NA NA NA NA MIR4736 1829 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 2.10804041612042 chr17 56417498 56417914 56417645 Y MTMR4,HSF5 BZRAP1,MIR142,MIR4736,SUPT4H1 NA NA NA NA MIR4736 6115 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 56419503 56419633 56419507 Y OR4D2 BZRAP1,MIR142,MIR4736,SUPT4H1 NA NA NA NA MIR4736 8120 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 56428194 56428499 56428372 Y VEZF1,MTMR4,SUPT4H1 BZRAP1,MIR142,MIR4736 NA NA NA NA SUPT4H1 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 56705180 56705300 56705276 Y NA RNU1-60P,RNU1-85P SEPT4,MTMR4 K562 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 29366 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 56706902 56707296 56707107 Y MKS1,MKS1,RAD51C RNU1-60P,RNU1-85P SEPT4,MTMR4,C17orf47 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 27370 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr17 56736656 56737064 56736885 Y MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E RNU1-60P,RNU1-85P,RAD51C SEPT4,C17orf47 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 1990 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr17 57200500 57200626 57200599 Y GDPD1 AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA TRIM37 18218 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 57231530 57231848 57231723 Y NA AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA PRR11 670 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 57409690 57409997 57409875 Y YPEL2 YPEL2 NA NA NA NA YPEL2 2640 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 57831888 57832338 57832062 Y VMP1,RNFT1 VMP1,PTRH2 NA NA NA NA PTRH2 48901 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 57869540 57869779 57869705 Y RNFT1 MIR21 NA NA NA NA MIR21 46848 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 57904186 57904344 57904253 Y VMP1,CA4 MIR21 NA NA NA NA MIR21 12283 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 58212242 58212405 58212344 Y NA NA C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEATR6 57950 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr17 58220284 58220524 58220391 Y VMP1,USP32,PPM1D,CA4 NA HEATR6,PPM1D,USP32,APPBP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 HEATR6 65992 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 58678620 58678973 58678714 Y PPM1D PPM1D NA NA NA NA PPM1D 3076 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 60085676 60086036 60086030 Y NACA2,MED13 NA NA NA NA NA MED13 54607 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 60557252 60557333 60557299 Y NA RP11-464D20.2 MRC2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-464D20.2 34795 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 60973132 60973339 60973182 Y TLK2 NA NA NA NA NA MRC2 270370 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 61639369 61639739 61639552 Y NA DCAF7,TACO1 NA NA NA NA DCAF7 13547 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 61779039 61779508 61779383 Y NA LIMD2,STRADA NA NA NA NA LIMD2 2507 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 61796482 61796787 61796636 Y NA LIMD2,STRADA NA NA NA NA LIMD2 19950 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 61920991 61921115 61921104 Y NA PSMC5,FTSJ3,SMARCD2 NA NA NA NA SMARCD2 2566 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr17 62004883 62005036 62004961 Y CD79B CD79B NA NA NA NA CD79B 2678 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 62159440 62159790 62159613 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 46389 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 62258830 62259200 62259015 Y SCN4A SNORD104 NA NA NA NA SNORD104 37387 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 62484790 62485162 62485096 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA POLG2 5992 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr17 62491373 62491767 62491605 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA POLG2 219 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 62586168 62586194 62586181 Y NA NA NA NA NA NA SMURF2 69992 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 62981100 62981441 62981419 Y DDX5,CEP95,LRRC37A3,RGS9,GNA13 NA AMZ2P1,GNA13 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 LRRC37A3 67502 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 62981858 62982486 62982198 Y DDX5,CEP95,GNA13 NA AMZ2P1,GNA13 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 LRRC37A3 68260 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr17 62982515 62982842 62982748 Y DDX5,CEP95,GNA13 NA AMZ2P1,GNA13 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 GNA13 68115 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 63050573 63051275 63051229 Y NA NA AMZ2P1 IMR90 Hi-C 24141950 GNA13 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 63119249 63119621 63119552 Y GNA13 RGS9 RGS9,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RGS9 11928 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr17 63175905 63176048 63175964 Y RGS9 RGS9 NA NA NA NA RGS9 44356 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 63639930 63640399 63640359 Y NA NA NA NA NA NA RGS9 508381 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr17 63654769 63655153 63655091 Y NA NA NA NA NA NA RGS9 523220 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 63752923 63753189 63753062 Y NA NA NA NA NA NA CEP112 433013 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 64194072 64194322 64194164 Y NA CEP112 NA NA NA NA CEP112 7870 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 64708077 64708220 64708107 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 411323 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 65389377 65389540 65389482 Y HELZ,BPTF,PITPNC1 PSMD12,PITPNC1 NA NA NA NA PITPNC1 17802 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 65485462 65485785 65485684 Y HELZ,BPTF NA NA NA NA NA PITPNC1 113887 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 65897183 65897370 65897273 Y NA NA NA NA NA NA BPTF 77543 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 66030294 66030564 66030453 Y NA C17orf58,KPNA2 NA NA NA NA KPNA2 659 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 66315636 66315845 66315767 Y BPTF,SLC16A6 SLC16A6 NA NA NA NA SLC16A6 30228 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 66380161 66380700 66380381 Y SLC16A6 NA NA NA NA NA WIPI1 70954 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 66452519 66452682 66452605 Y SLC16A6,WIPI1 WIPI1 NA NA NA NA WIPI1 865 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 66973403 66973581 66973492 Y NA NA NA NA NA NA ABCA5 347804 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 70023919 70023934 70023927 Y SOX9 NA NA NA NA NA LOC124685 408800 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 70417215 70417683 70417549 Y SOX9 NA NA NA NA NA RPL32P33 203687 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 70878407 70878514 70878507 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A11 208337 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 70924179 70924389 70924230 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A11 162462 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 71024945 71025268 71025108 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A11 61583 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 71148354 71148746 71148516 Y NA COG1 SLC39A11,COG1 IMR90 Hi-C 24141950 COG1 38383 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 72426026 72426159 72426078 Y DNAI2,GPRC5C NA NA NA NA NA TTYH2 218373 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 72637081 72637207 72637142 Y TTYH2,TTYH2,CD300A,CD300LB,CD300C,CD300LD,TMEM104,SLC16A5,CD300E,CD300LF NA C17orf77,CD300LD,RAB37,CD300LF,CD300E IMR90 Hi-C 24141950 CD300LF 69910 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 72782605 72783105 72782848 Y CD300A,CD300LB,CD300C,CD300E,CD300LF,RAB37,RAB37,SLC9A3R1,SLC16A5,GGA3,TMEM104 SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA TMEM104 11983 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 73304838 73305233 73305159 Y UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19 MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1 NA NA NA NA AC011933.1 8177 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 73337527 73337917 73337722 Y NA AC011933.1 NA NA NA NA AC011933.1 24117 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 73860608 73860975 73860910 Y NA UNC13D,WBP2,TRIM65,MRPL38 UNC13D,UNK,WBP2 IMR90 Hi-C 24141950 WBP2 10020 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 73868951 73869202 73869040 Y TRIM47 UNC13D,WBP2,TRIM65,MRPL38 NA NA NA NA WBP2 18363 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 73891396 73891618 73891569 Y NA WBP2,TRIM65,MRPL38,FBF1 NA NA NA NA TRIM65 312 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 73992927 73993207 73992957 Y NA TEN1,ACOX1,CDK3,EVPL NA NA NA NA CDK3 1780 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 74025620 74025914 74025713 Y H3F3B,TRIM47,EVPL CDK3,EVPL,SRP68 NA NA NA NA EVPL 4087 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 74264426 74264836 74264522 Y NA ATF4P3 NA NA NA NA ATF4P3 43539 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr17 74413626 74413718 74413672 Y NA PRPSAP1,UBE2O NA NA NA NA UBE2O 33570 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 74692944 74693312 74693210 Y NA MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA MXRA7 11786 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 74696685 74696955 74696820 Y NA MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA MXRA7 8143 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 74723995 74724371 74724344 Y FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA METTL23 3083 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.54589630515498 chr17 74954315 74954497 74954426 Y AANAT,MGAT5B NA NA NA NA NA MGAT5B 91777 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 3.6539367212754 chr17 74994156 74994635 74994367 Y SRSF2 NA MFSD11,MGAT5B,SEC14L1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00338,SEC14L1 86163 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr17 75120383 75120864 75120582 Y JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 39585 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr17 75402047 75402301 75402134 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 127396 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 75405377 75405733 75405639 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 130726 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 75421302 75421687 75421325 Y SEPT9,SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA SEPT9 146651 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 75461802 75462176 75461947 Y SEC14L1,SEC14L1 NA NA NA NA NA SEPT9 187151 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 75567632 75567995 75567917 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 292981 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 75953939 75954304 75954190 Y TMEM235,TMC8,TMC6,TMC6,SOCS3,PGS1,TNRC6C NA TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMC8 170547 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA NA TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMC8 170055 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 13.3509226354293 chr17 76662391 76662551 76662479 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 NA NA NA NA NA CYTH1 113828 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 76775899 76776536 76776049 Y USP36,ENGASE,CYTH1 NA NA NA NA NA CYTH1 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 77146048 77146259 77146101 Y RBFOX3 NA NA NA NA NA ENGASE 77027 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 77778056 77778248 77778123 Y CBX2,CBX8 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 4574 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 77787297 77787609 77787349 Y NA CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 13815 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 77788517 77788922 77788877 Y NA CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 15035 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 77967532 77967765 77967641 Y CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 39882 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.68643233289634 chr17 78134342 78134588 78134495 Y NA EIF4A3 EIF4A3,CARD14,SGSH,SLC26A11 IMR90 Hi-C 24141950 EIF4A3 15360 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 78134790 78135293 78135090 Y NA EIF4A3 EIF4A3,CARD14,SGSH,SLC26A11 IMR90 Hi-C 24141950 EIF4A3 15808 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 78238527 78238862 78238699 Y GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213 RNF213 NA NA NA NA RNF213 5862 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 78387431 78387634 78387516 Y NA ENDOV NA NA NA NA ENDOV 466 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV NA NA NA NA ENDOV 41238 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr17 78459744 78459968 78459843 Y RPTOR NA NA NA NA NA RPL32P31 54035 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 78860029 78860371 78860098 Y C17orf56 NA NA NA NA NA CHMP6 103027 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr17 79319812 79320225 79320116 Y FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 52465 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 79365060 79367456 79365203 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A10 97713 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 79368790 79369424 79369000 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A10 101443 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 79369574 79370687 79370597 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A10 102227 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr17 79399639 79399699 79399664 Y GCGR,BAHCC1 NA NA NA NA NA RP13-766D20.1 78390 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 79421564 79421842 79421610 Y NA NA NA NA NA NA RP13-766D20.1 56247 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 7.58894549803352 chr17 79448388 79448678 79448571 Y NPB,AATK,AZI1,BAHCC1 RP13-766D20.1,ACTG1 NA NA NA NA RP13-766D20.1 29411 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.8269683606377 chr17 79450324 79450444 79450386 Y NA RP13-766D20.1,ACTG1 NA NA NA NA RP13-766D20.1 27645 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr17 79451287 79451558 79451462 Y AATK,AZI1,BAHCC1 RP13-766D20.1,ACTG1 NA NA NA NA RP13-766D20.1 26531 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr17 80052713 80052821 80052782 Y MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN GPS1,RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 1387 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr17 80056613 80056910 80056718 Y C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 2405 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr17 80068190 80068440 80068326 Y NA DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 13982 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 80255798 80256475 80256187 Y SIRT7,MAFG,MAFG,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,HEXDC,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7 CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 26191 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 80454894 80455238 80455175 Y LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 20351 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr17 80817363 80817528 80817446 Y HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF,NARF NA NA NA NA NA TBCD 109423 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 4.91876097094765 chr17 80817904 80818262 80818042 Y C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL NA NA NA NA NA TBCD 109964 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr17 80821463 80821609 80821520 Y NA NA NA NA NA NA TBCD 113523 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr17 80821746 80822299 80821973 Y HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF NA NA NA NA NA TBCD 113806 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 80829054 80829460 80829235 Y HEXDC,C17orf62,C17orf62 NA NA NA NA NA TBCD 121114 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr17 80830952 80831086 80831038 Y HEXDC,C17orf62,C17orf62 NA NA NA NA NA TBCD 123012 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr17 81103238 81103635 81103449 Y METRNL NA METRNL MCF7 ChIA-PET 22265404 B3GNTL1 95552 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 221277 221425 221379 Y THOC1,ENOSF1,ENOSF1 THOC1 NA NA NA NA THOC1 44625 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr18 235900 236290 236249 Y NA THOC1 NA NA NA NA THOC1 29760 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 666183 666708 666437 Y THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 9843 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr18 668283 668526 668405 Y THOC1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11943 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 711356 711474 711397 Y ENOSF1,ENOSF1 ENOSF1 NA NA NA NA ENOSF1 680 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 830446 830703 830580 Y NA RNU1-109P,YES1 CLUL1,ENOSF1,YES1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YES1 19899 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr18 2641738 2642012 2641797 Y METTL4,EMILIN2,SMCHD1 CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA CBX3P2 11382 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 2656589 2657177 2656999 Y NA CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA SMCHD1 2852 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 2797990 2798254 2798233 Y NA EMILIN2 NA NA NA NA EMILIN2 46774 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 2893280 2893456 2893355 Y NA EMILIN2 NA NA NA NA EMILIN2 48252 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 2972158 2972493 2972361 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,MYL12B,SMCHD1,EMILIN2 LPIN2 NA NA NA NA LPIN2 38820 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 3251422 3251674 3251471 Y MYOM1 MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12A 5943 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 3276279 3276423 3276302 Y NA MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12B 16372 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 5515409 5515548 5515483 Y EPB41L3 NA NA NA NA NA EPB41L3 113151 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 8803155 8803225 8803221 Y NA NA NA NA NA NA RAB12 195712 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 8912604 8912903 8912754 Y NA NA CCDC165 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 187725 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr18 8916965 8917035 8917006 Y NA NA CCDC165 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 183593 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 8948545 8948913 8948824 Y TWSG1 NA CCDC165 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 151715 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr18 8949015 8949649 8949122 Y TWSG1 NA CCDC165 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 150979 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 3.51340069353403 chr18 8949988 8950319 8950097 Y NA NA CCDC165,RAB12 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 150309 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.68643233289634 chr18 9128926 9129321 9129124 Y NDUFV2,ANKRD12,ANKRD12 NDUFV2,ANKRD12 ANKRD12 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD12 4905 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 9758210 9758472 9758414 Y PPP4R1,VAPA,RAB31 NA TXNDC2,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 RAB31 52048 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 9762577 9762794 9762699 Y RAB31 NA TXNDC2,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 RAB31 56415 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 10213578 10213746 10213662 Y VAPA NA APCDD1 IMR90 Hi-C 24141950 APCDD1 238879 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 10476562 10476712 10476630 Y NAPG,APCDD1 APCDD1,NAPG NA NA NA NA APCDD1 23937 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 10528233 10528593 10528264 Y NA NAPG NA NA NA NA NAPG 4331 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 10766591 10766813 10766750 Y NA NA NA NA NA NA NAPG 242689 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 10950842 10951271 10951171 Y NA NA NA NA NA NA NAPG 426940 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 12317654 12318000 12317871 Y CHMP1B NA NA NA NA NA AFG3L2 57313 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 12679329 12679437 12679359 Y NA SPIRE1,PSMG2,CEP76 NA NA NA NA CEP76 21339 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr18 12864190 12864369 12864245 Y NA NA NA NA NA NA PTPN2 63273 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 12880036 12880906 12880743 Y NA PTPN2 NA NA NA NA PTPN2 46736 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 13137958 13138425 13138153 Y NA NA NA NA NA NA CEP192 148597 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr18 13217020 13217525 13217240 Y NA NA NA NA NA NA CEP192 227659 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chr18 13219693 13219734 13219713 Y NA NA NA NA NA NA CEP192 230332 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr18 13220671 13221282 13220939 Y NA NA NA NA NA NA CEP192 231310 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 13274084 13274183 13274139 Y RNMT,PTPN2,CEP192 NA NA NA NA NA CEP192 284723 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr18 13313521 13313917 13313675 Y NA NA NA NA NA NA CEP192 324160 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 13408431 13408818 13408626 Y C18orf1,C18orf1 NA NA NA NA NA RNMT 315841 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 13539098 13539457 13539245 Y RNMT,C18orf1,C18orf1 NA NA NA NA NA RNMT 185202 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 13542199 13542509 13542255 Y NA NA NA NA NA NA RNMT 182150 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 13613726 13614123 13613906 Y RNMT,C18orf1 NA NA NA NA NA RNMT 110536 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr18 13893492 13893726 13893609 Y MC5R,MC2R NA NA NA NA NA FAM210A 168830 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 18512291 18512341 18512327 Y NA NA NA NA NA NA ROCK1 177471 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 18517030 18517512 18517393 Y NA NA NA NA NA NA ROCK1 172300 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 19373794 19374099 19373861 Y NA NA NA NA NA NA MIB1 90876 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 20128581 20128874 20128764 Y NA NA CTAGE1,GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 247350 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 21002815 21003000 21002900 Y RBBP8,RBBP8,NPC1,C18orf8 TMEM241,RIOK3 NA NA NA NA TMEM241 12925 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 21417655 21417852 21417722 Y NPC1,LAMA3 NA NA NA NA NA TTC39C 152885 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 21945811 21945986 21945899 Y NA OSBPL1A NA NA NA NA OSBPL1A 29858 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 22677788 22677963 22677875 Y ZNF521 NA NA NA NA NA OSBPL1A 701944 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 23836366 23836416 23836389 Y TAF4B TAF4B NA NA NA NA TAF4B 32466 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 23943332 23943387 23943360 Y KCTD1 NA NA NA NA NA TAF4B 139432 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 25695112 25695346 25695270 Y CDH2 NA NA NA NA NA KCTD1 1459747 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 29542474 29542964 29542885 Y RNF138 TRAPPC8 NA NA NA NA TRAPPC8 11375 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 32829674 32829781 32829775 Y ZNF397,ZSCAN30 ZNF397,ZSCAN30,ZNF271 NA NA NA NA ZNF397 10680 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 33042995 33043415 33043130 Y MAPRE2 INO80C NA NA NA NA INO80C 32540 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr18 33057648 33057699 33057650 Y MAPRE2,MAPRE2,ZNF24,ZNF396,INO80C INO80C NA NA NA NA INO80C 18256 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 33185452 33185527 33185471 Y ZNF397,GALNT1 GALNT1 NA NA NA NA GALNT1 26371 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 33275532 33275916 33275719 Y NA NA NA NA NA NA GALNT1 116451 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 33311016 33311295 33311162 Y NA NA NA NA NA NA GALNT1 151935 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr18 33737531 33737917 33737788 Y NA SLC39A6,ELP2 NA NA NA NA ELP2 30124 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 34406593 34406898 34406790 Y NA KIAA1328,TPGS2 NA NA NA NA KIAA1328 171 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 39021552 39021652 39021602 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C3 511519 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 40703718 40704009 40703864 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C3 1170547 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 43830546 43830877 43830624 Y EPG5,PSTPIP2 NA NA NA NA NA RNF165 73895 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 44372138 44372406 44372272 Y RNF165,PIAS2 NA NA NA NA NA KATNAL2 123049 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 44675442 44676177 44675810 Y NA HDHD2,IER3IP1 NA NA NA NA HDHD2 551 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 45509504 45509774 45509639 Y SMAD2 NA ZBTB7C IMR90 Hi-C 24141950 SMAD2 53989 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 45534549 45534809 45534718 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 79034 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 46324397 46324797 46324645 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 260980 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 46349762 46350033 46349891 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 286345 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 46459367 46459671 46459607 Y SMAD7,SMAD7 NA NA NA NA NA CTIF 395950 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 46460097 46460351 46460248 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 396680 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 46465508 46465942 46465798 Y SMAD7,SMAD7,SMAD7 NA NA NA NA NA CTIF 402091 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 46551540 46551802 46551640 Y NA NA NA NA NA NA DYM 433915 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr18 46579464 46579684 46579624 Y DYM NA NA NA NA NA DYM 406033 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr18 46582084 46582553 46582428 Y SMAD7,DYM NA NA NA NA NA DYM 403164 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr18 47834061 47834491 47834223 Y CCDC11,MBD1,MBD1 MBD1,CXXC1 CCDC11,CXXC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXXC1 21387 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 48721492 48722312 48721913 Y SMAD4,MEX3C MEX3C NA NA NA NA MEX3C 20362 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 51699489 51699550 51699520 Y NA MBD2 NA NA NA NA MBD2 49608 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr18 53041931 53042230 53042160 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 287788 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr18 53087708 53087819 53087727 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 242199 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr18 53107364 53107398 53107375 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 222620 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr18 53180110 53180413 53180343 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 149605 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr18 53204965 53205096 53205075 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 124922 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr18 54487568 54487957 54487622 Y NA NA NA NA NA NA TXNL1 170737 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 56325382 56325774 56325680 Y MALT1 MALT1 ALPK2,MALT1 IMR90 Hi-C 24141950 MALT1 10844 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 60193382 60194139 60194065 Y KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 5142 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.96750438837906 chr18 60805787 60806310 60806122 Y VPS4B,SERPINB12,BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 179051 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr18 60809118 60809336 60809215 Y VPS4B,BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 176025 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 60819978 60820314 60820030 Y SERPINB12,BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 165047 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 60825418 60825658 60825570 Y NA NA NA NA NA NA BCL2 159703 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 60857192 60857346 60857314 Y NA NA NA NA NA NA BCL2 128015 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 60864454 60864795 60864596 Y VPS4B,BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 120566 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr18 60873001 60873358 60873117 Y BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 112003 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 60874386 60874946 60874584 Y VPS4B,BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 110415 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 60886280 60886709 60886627 Y BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 98652 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 60903050 60903417 60903276 Y VPS4B NA NA NA NA NA BCL2 81944 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 60984165 60984609 60984519 Y BCL2 BCL2,KDSR NA NA NA NA BCL2 752 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 70535937 70536272 70536159 Y NA NA NA NA NA NA TIMM21 1277474 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 70536769 70537080 70536861 Y CBLN2,NETO1,NETO1 NA NA NA NA NA TIMM21 1276666 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 71777290 71777591 71777505 Y NA TIMM21 NA NA NA NA TIMM21 36155 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 72676291 72676559 72676424 Y ZNF407,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 242744 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 72706946 72707254 72707048 Y ZNF407,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 212049 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 72782580 72783607 72783115 Y ZNF407,ZADH2,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 135696 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr18 72919988 72920296 72920123 Y ZADH2,TSHZ1 ZADH2,TSHZ1 NA NA NA NA TSHZ1 414 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 74204839 74205357 74205296 Y NA RP11-17M16.1 NA NA NA NA ZNF516 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr18 74205649 74206020 74205889 Y NA ZNF516,RP11-17M16.1 NA NA NA NA RP11-17M16.1 172 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr18 74767591 74768136 74768025 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 235028 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr18 74803559 74803662 74803615 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 270996 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 74816269 74816488 74816400 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 283706 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 74829789 74830209 74830033 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 297226 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr18 74837664 74837983 74837939 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 305101 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 74840150 74840705 74840388 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 307587 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr18 74921028 74921148 74921053 Y MBP NA MBP IMR90 Hi-C 24141950 ZNF236 388465 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr18 75688457 75688848 75688673 Y NA NA NA NA NA NA ATP9B 1138437 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr18 77245359 77245518 77245445 Y NA NA NA NA NA NA CTDP1 192283 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr18 77615182 77615571 77615218 Y KCNG2 NA KCNG2,CTDP1,PQLC1 IMR90 Hi-C 24141950 PQLC1 94093 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr19 604629 604764 604680 Y THEG BSG,POLRMT NA NA NA NA POLRMT 26833 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 662216 662510 662281 Y HMHA1,GZMM,C19orf6,C19orf22,ABCA7,RNF126 POLRMT,RNF126,PALM NA NA NA NA RNF126 939 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 1069175 1069494 1069467 Y C19orf22,C19orf6,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2 RNU6-2,CNN2,ABCA7,HMHA1,POLR2E,GPX4 NA NA NA NA HMHA1 5253 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 1085284 1085426 1085350 Y C19orf22,ARID3A,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2 ABCA7,HMHA1,POLR2E,GPX4 NA NA NA NA POLR2E 8172 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 1101850 1102062 1101942 Y C19orf6,MIDN,HMHA1,SBNO2,SBNO2 HMHA1,POLR2E NA NA NA NA GPX4 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 1133542 1133865 1133752 Y C19orf22,ARID3A,C19orf6,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2 POLR2E,GPX4,SBNO2 NA NA NA NA GPX4 31606 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr19 1408607 1408695 1408655 Y CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15 NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 3039 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 1445282 1445452 1445336 Y C19orf26,EFNA2,MUM1,APC2 GAMT,DAZAP1,RPS15,C19orf25,PCSK4,REEP6 NA NA NA NA RPS15 8924 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 1453873 1454140 1454045 Y C19orf26,MUM1,APC2 DAZAP1,RPS15,C19orf25,PCSK4,REEP6 NA NA NA NA RPS15 17515 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 1651371 1651730 1651556 Y NA UQCR11,TCF3 NA NA NA NA TCF3 767 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr19 1672372 1672532 1672504 Y NA TCF3 TCF3,ONECUT3,REXO1,LOC100288123,ATP8B3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TCF3 21768 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 1855247 1855761 1855485 Y SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3 ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3 NA NA NA NA KLF16 5806 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 3.51340069353403 chr19 1856794 1856864 1856840 Y NA ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3 NA NA NA NA KLF16 4703 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 1857160 1857480 1857446 Y NA ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3 NA NA NA NA KLF16 4087 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 2059605 2060167 2060113 Y REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2 BTBD2,MKNK2,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 10362 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 2061356 2061737 2061654 Y SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 12113 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 2165096 2165788 2165320 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 2632 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 2287726 2288039 2287937 Y KLF16,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A,DOT1L,OAZ1,C19orf35 OAZ1,SPPL2B,LSM7 NA NA NA NA OAZ1 20241 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 2524971 2525260 2525066 Y NA NA NA NA NA NA GADD45B 50851 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 2543618 2543970 2543682 Y DOT1L,GADD45B NA NA NA NA NA GADD45B 69498 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 2544084 2544261 2544159 Y NA NA NA NA NA NA GADD45B 69964 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 2588002 2588286 2588143 Y LINGO3,GNG7,DIRAS1 NA NA NA NA NA GNG7 112421 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 2624614 2624929 2624757 Y GNG7,DIRAS1 NA NA NA NA NA GNG7 75778 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 2695163 2695542 2695477 Y LINGO3,GNG7 GNG7,SLC39A3 NA NA NA NA GNG7 5165 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 2804437 2804563 2804500 Y NA SGTA,THOP1,ZNF554,ZNF555 NA NA NA NA ZNF554 13309 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.54589630515498 chr19 2888802 2889178 2888846 Y NA ZNF555,ZNF57 NA NA NA NA ZNF57 9718 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr19 3035530 3035851 3035686 Y NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2 TLE2,AES NA NA NA NA TLE2 9782 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 3124672 3124910 3124852 Y GNA15 GNA11,GNA15,S1PR4 NA NA NA NA GNA15 9281 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 3131132 3131258 3131157 Y NA GNA11,GNA15,S1PR4 NA NA NA NA GNA15 2933 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr19 3133345 3133760 3133513 Y FZR1,GNA15 GNA11,GNA15,S1PR4,NCLN NA NA NA NA GNA15 431 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 3154006 3154458 3154241 Y GNA15,FZR1,S1PR4 GNA15,S1PR4,NCLN NA NA NA NA S1PR4 15886 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 3360183 3360356 3360294 Y TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 2622 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 3360896 3361804 3361247 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 3335 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 3387730 3388119 3388011 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 30169 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 3812391 3812689 3812466 Y CCDC94,FZR1,APBA3,MATK,ZBTB7A NA MATK K562 ChIA-PET 22265404 MRPL54 51729 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 4089506 4089868 4089573 Y ZBTB7A ZBTB7A,MAP2K2 NA NA NA NA ZBTB7A 24563 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 4456035 4456301 4456168 Y NA UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 216 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 4567148 4567365 4567215 Y TICAM1,SEMA6B NA NA NA NA NA TNFAIP8L1 70165 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 4677231 4677531 4677381 Y NA TNFAIP8L1,C19orf10,DPP9 NA NA NA NA C19orf10 8849 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 4912030 4912419 4912247 Y NA PLIN3,UHRF1 NA NA NA NA UHRF1 10938 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 4976440 4976890 4976638 Y TICAM1,KDM4B KDM4B NA NA NA NA KDM4B 9315 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr19 5287522 5287818 5287647 Y NA RPL32P34 NA NA NA NA RPL32P34 11777 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 5624052 5624252 5624226 Y VMAC,RFX2,DUS3L,SAFB2,SAFB SAFB,SAFB2,RPL36 NA NA NA NA SAFB2 1995 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 5804044 5804378 5804211 Y NA DUS3L NDUFA11,DUS3L,NRTN,LONP1,CATSPERD,RANBP3,LOC100128568,FUT6,VMAC,PRR22,FUT3,RFX2,FUT5,CAPS K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DUS3L 14795 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 5940860 5941142 5941001 Y NA FUT5,NDUFA11,VMAC,RANBP3 NA NA NA NA RANBP3 35011 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 6189136 6189412 6189274 Y NA RFX2 NA NA NA NA RFX2 8171 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 6228782 6229121 6229035 Y NA RFX2,MLLT1 NA NA NA NA RFX2 31199 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 6516969 6517178 6517079 Y NA DENND1C,TUBB4A,TNFSF9 TNFSF9 K562 ChIA-PET 22265404 TNFSF9 11832 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 6577471 6577956 6577654 Y DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70 TNFSF9,CD70 NA NA NA NA CD70 24158 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr19 6587274 6587651 6587637 Y DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70 CD70 NA NA NA NA CD70 14463 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr19 6674780 6675150 6675080 Y DENND1C,TNFSF9,VAV1,EMR1,TNFSF14 NA NA NA NA NA GPR108 60464 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 6773738 6774101 6773933 Y DENND1C,ZNF557,EMR1,GPR108,VAV1 GPR108,TRIP10,SH2D3A,VAV1 NA NA NA NA VAV1 3013 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 7196747 7197124 7196928 Y KIAA1543,INSR NA NA NA NA NA INSR 94921 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 7197339 7197547 7197388 Y NA NA NA NA NA NA INSR 94498 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 7402747 7403030 7402887 Y FCER2 NA INSR,ZNF557 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 54969 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 7410848 7411007 7410905 Y ZNF557,FCER2,ARHGEF18 ARHGEF18 ZNF557,INSR IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 46992 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 7414639 7414850 7414793 Y NA ARHGEF18 ZNF557,INSR IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 43149 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 7427436 7427895 7427614 Y ZNF557,XAB2,STXBP2,PNPLA6,LOC100131801,ARHGEF18 ARHGEF18 INSR,ARHGEF18,PNPLA6,MCOLN1,ZNF358,C19orf45,CD209,CLEC4G IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 30104 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 7547905 7548376 7548024 Y STXBP2,CD209,PEX11G,MCOLN1 ZNF358,MCOLN1,PNPLA6 NA NA NA NA ZNF358 29802 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 8115456 8115774 8115631 Y PRAM1,STXBP2,C19orf59 ELAVL1 NA NA NA NA ELAVL1 46913 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 8226134 8226320 8226231 Y NA CERS4 FBN3,TIMM44 IMR90 Hi-C 24141950 CERS4 43300 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 8580278 8580518 8580443 Y PRAM1,MYO1F ZNF414 NA NA NA NA ZNF414 3230 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 9783821 9783976 9783959 Y NA ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 45 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 9902440 9902843 9902543 Y ZNF699,ZNF266,ICAM1,ZNF846 FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA FBXL12 33649 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 10352370 10352740 10352555 Y KRI1,ILF3,PPAN,RAVER1,MRPL4,DNMT1 S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM1,ICAM4,ICAM5 MRPL4,ICAM1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL4 7837 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 10515339 10515636 10515481 Y PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 3125 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 10529596 10529758 10529677 Y NA TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 17382 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 10713789 10714290 10714179 Y ICAM1,ICAM3,TYK2,PDE4A,DNM2,C19orf38,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2 KRI1,CDKN2D,SLC44A2,ILF3 NA NA NA NA SLC44A2 2656 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr19 10714716 10715205 10715003 Y ICAM1,ICAM3,TYK2,PDE4A,PDE4A,DNM2,C19orf38,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2 KRI1,CDKN2D,SLC44A2,ILF3 NA NA NA NA SLC44A2 3583 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 10715339 10715596 10715546 Y ICAM3,TYK2,PDE4A,DNM2,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2 KRI1,CDKN2D,SLC44A2,ILF3 NA NA NA NA SLC44A2 4206 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 10949257 10949551 10949405 Y CDC37,KEAP1,KRI1,ILF3,QTRT1,DNM2,SPC24,SMARCA4,SMARCA4 TMED1,CARM1 NA NA NA NA TMED1 4263 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 11202212 11202837 11202668 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 4174 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 11205696 11206011 11205901 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 7658 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 11253991 11254271 11254206 Y PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6 SPC24 NA NA NA NA SPC24 10213 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 11804467 11804940 11804795 Y ZNF878,ZNF823,ZNF491 HNRNPA1P10,ZNF823 NA NA NA NA HNRNPA1P10 28622 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr19 13233224 13233603 13233413 Y WDR83,JUNB LYL1,TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA NACC1 6307 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr19 13273540 13274187 13273840 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 14311 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 13274586 13275096 13274696 Y GADD45GIP1,NACC1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 15357 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 13783472 13783589 13783575 Y NA NA CACNA1A IMR90 Hi-C 24141950 CCDC130 56985 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 13917794 13918010 13917903 Y RFX1,ZSWIM4,NANOS3 MRI1,C19orf53,ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 13520 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 13944359 13944683 13944571 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15 ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 40085 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 13957204 13959386 13957586 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM4 52930 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr19 14249278 14249642 14249460 Y NA SAMD1,PRKACA,ASF1B NA NA NA NA ASF1B 3510 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 14414232 14414293 14414263 Y NA NA NA NA NA NA LPHN1 99233 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 14474119 14474280 14474154 Y ZNF333,RFX1,PKN1,CD97 NA CD97,DDX39A K562 ChIA-PET 22265404 DDX39A 53912 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 14485924 14486626 14486057 Y NA DDX39A DDX39A K562 ChIA-PET 22265404 DDX39A 41566 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 14528800 14529217 14529142 Y ZNF333,EMR2,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,CD97,DDX39A DDX39A,PKN1 NA NA NA NA DDX39A 608 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 14661096 14661426 14661346 Y NA TECR,DNAJB1,NDUFB7 NA NA NA NA NDUFB7 19448 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 14665322 14665552 14665478 Y SLC1A6 TECR,DNAJB1,NDUFB7 NA NA NA NA NDUFB7 15322 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 15947617 15948119 15947980 Y AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1 NA NA NA NA NA CYP4F12 166050 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr19 16188924 16190024 16189835 Y TPM4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 13093 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr19 16229373 16229857 16229589 Y NA RAB8A,HSH2D NA NA NA NA RAB8A 8934 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 16453203 16453340 16453316 Y NWD1,MED26,KLF2 KLF2 NA NA NA NA KLF2 19575 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 16998454 16998573 16998467 Y NA F2RL3 NA NA NA NA F2RL3 783 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 17131732 17132248 17131919 Y NA CPAMD8 NA NA NA NA CPAMD8 3377 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 17200566 17201240 17200825 Y MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 15975 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 17371801 17372164 17371849 Y NXNL1,GTPBP3 USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1,ANKLE1,MRPL34,DDA1,ABHD8 NR2F6 K562 ChIA-PET 22265404 BABAM1 3995 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 17866765 17867157 17866984 Y NA MAP1S,FCHO1 NA NA NA NA FCHO1 10238 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 18059806 18059879 18059816 Y UNC13A,KCNN1 CCDC124 NA NA NA NA CCDC124 17981 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 18131070 18131394 18131314 Y FCHO1,PDE4C,ARRDC2,MAST3 NA NA NA NA NA MAST3 75209 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 18133045 18133309 18133130 Y FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2 NA NA NA NA NA MAST3 73294 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 4.07554480449948 chr19 18134654 18135106 18134872 Y MAP1S,LRRC25,JUND,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1 NA NA NA NA NA MAST3 71497 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr19 18315989 18316123 18316056 Y NA IFI30,MPV17L2,RAB3A NA NA NA NA RAB3A 3105 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 18414244 18414595 18414365 Y NA KIAA1683,JUND,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 17489 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr19 18415031 18416060 18415513 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND KIAA1683,JUND,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 16024 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 18439179 18439536 18439334 Y NA JUND,LSM4,PGPEP1 PGPEP1 K562 ChIA-PET 22265404 LSM4 7095 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 18504645 18504988 18504829 Y UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,UBA52,ELL,LRRC25 ISYNA1 NA NA NA NA ISYNA1 42123 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 18811913 18812040 18811994 Y UPF1,SLC25A42,JUND,FKBP8,UBA52,CRTC1 CRTC1 NA NA NA NA CRTC1 19426 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 19027750 19028071 19027900 Y MAU2 COPE,DDX49,HOMER3 NA NA NA NA COPE 135 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 19143307 19143510 19143378 Y DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6 ARMC6,SUGP2,SLC25A42 NA NA NA NA SUGP2 475 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.96750438837906 chr19 19623798 19624201 19624001 Y NA NDUFA13,TSSK6,YJEFN3 NA NA NA NA NDUFA13 344 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 20110963 20111092 20111018 Y TSSK6 ZNF682 NA NA NA NA ZNF682 37223 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 20337633 20337845 20337749 Y ZNF93,ZNF682,ZNF682,ZNF90,ZNF486 NA NA NA NA NA ZNF486 61596 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 21689202 21689645 21689487 Y ZNF430,ZNF708,ZNF493,ZNF100,ZNF429 ZNF429 NA NA NA NA ZNF429 11718 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 23416597 23416606 23416602 Y NA ZNF724P NA NA NA NA ZNF724P 14586 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 27732785 27733191 27732992 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1969257 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 29702850 29703471 29703365 Y NA UQCRFS1 NA NA NA NA UQCRFS1 402 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 30336581 30336824 30336781 Y C19orf2,C19orf2 CCNE1 NA NA NA NA CCNE1 35776 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 30447917 30448294 30448014 Y NA URI1 NA NA NA NA URI1 35366 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 33668108 33668528 33668227 Y SLC7A10,LRP3 LRP3 NA NA NA NA LRP3 1599 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 34311417 34311691 34311576 Y KCTD15 KCTD15 NA NA NA NA KCTD15 26579 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 34396925 34397389 34397012 Y NA NA KCTD15 MCF7 ChIA-PET 22265404 KCTD15 112087 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 34625713 34625998 34625854 Y PDCD2L LSM14A CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD IMR90 Hi-C 24141950 LSM14A 35411 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr19 34664379 34664787 34664699 Y SCGBL,KIAA0355,LSM14A LSM14A NA NA NA NA LSM14A 2970 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 34746041 34746169 34746166 Y KIAA0355 KIAA0355 NA NA NA NA KIAA0355 2599 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 34760936 34761338 34761013 Y LSM14A,KIAA0355 KIAA0355 NA NA NA NA KIAA0355 17494 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 34841130 34841321 34841272 Y LSM14A,KIAA0355 GPI NA NA NA NA GPI 7064 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 35464346 35464465 35464376 Y FFAR3,FFAR2,USF2,FXYD5,FXYD5,FXYD5,GRAMD1A ZNF792,GRAMD1A GRAMD1A,LOC100128675,ZNF599,ZNF30,ZNF792,HPN,SCN1B,FXYD1,FXYD3,FXYD7,LGI4,FXYD5 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF792 11393 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 35491833 35492367 35492256 Y FFAR3,FFAR2,USF2,FXYD5,FXYD5,FXYD5,GRAMD1A ZNF792,GRAMD1A,SCN1B NA NA NA NA GRAMD1A 8145 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 35557782 35557965 35557875 Y MAG,SCGBL,ZNF302,ZNF181,ZNF30,HPN,LGI4 SCN1B NA NA NA NA SCN1B 38194 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 35643836 35643967 35643905 Y FFAR3,USF2,MAG,HPN,LGI4 FXYD7,FXYD5 NA NA NA NA FXYD5 203 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 35701711 35701918 35701833 Y ZNF792,FXYD5,FXYD5,FXYD5,FFAR3 NA NA NA NA NA USF2 55963 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 35702745 35703411 35703060 Y ZNF792,FXYD5,FXYD5,FXYD5 NA NA NA NA NA USF2 54470 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr19 35763871 35764402 35764192 Y FXYD1,FXYD1,HAMP USF2,CD22 NA NA NA NA USF2 5990 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 35809679 35810380 35810036 Y GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,IGFLR1,FFAR3 CD22 NA NA NA NA CD22 1515 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 35821239 35821740 35821574 Y USF2,ZBTB32,CD22 CD22 NA NA NA NA CD22 13075 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 36193251 36193562 36193412 Y USF2,CD22,FFAR1,HAUS5,ETV2,WDR62,HCST,ZBTB32,U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,ARHGAP33 IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37 MLL4,ZBTB32 K562 ChIA-PET 22265404 ZBTB32 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 36618643 36619171 36618835 Y NA TBCB,POLR2I,CAPNS1 NA NA NA NA CAPNS1 9306 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 37953316 37953327 37953324 Y NA ZNF569 NA NA NA NA ZNF569 4850 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 38539760 38540070 38539905 Y RASGRP4,ZNF571 NA NA NA NA NA SIPA1L3 143892 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 38719187 38719304 38719247 Y ZNF573,DPF1,PPP1R14A,DPF1 DPF1,SPINT2 NA NA NA NA DPF1 833 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 38807798 38808031 38807971 Y MAP4K1,EIF3K,RASGRP4,FAM98C YIF1B,KCNK6,CATSPERG NA NA NA NA KCNK6 453 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr19 39755176 39755398 39755266 Y ZFP36 NA NA NA NA NA GMFG 75614 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 39891902 39892845 39892340 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,RPS16,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H NA NA NA NA ZFP36 2608 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 39894353 39894945 39894613 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H NA NA NA NA ZFP36 508 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 40849279 40849406 40849342 Y NA PLD3,C19orf47 NA NA NA NA PLD3 2957 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 40923099 40923282 40923196 Y SHKBP1,EGLN2,EGLN2,C19orf54 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4 NA NA NA NA PRX 5826 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 41108162 41108528 41108432 Y NA SHKBP1,LTBP4 NA NA NA NA LTBP4 11373 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 41109606 41110134 41110046 Y SERTAD1,ITPKC,EGLN2,EGLN2,C19orf54,ADCK4,SHKBP1 SHKBP1,LTBP4 NA NA NA NA LTBP4 12817 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 41120897 41121111 41120992 Y NA SHKBP1,LTBP4 NA NA NA NA LTBP4 24108 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 41169097 41169273 41169245 Y NA NUMBL NA NA NA NA NUMBL 25604 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 41267029 41267391 41267210 Y NA ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2 NA NA NA NA MIA 8162 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 41695552 41695583 41695568 Y NA RPL36P16 NA NA NA NA RPL36P16 21786 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 41771602 41771660 41771636 Y CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1 HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA HNRNPUL1 5201 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 41795419 41795640 41795447 Y CYP2A13,B9D2,HNRNPUL1 HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA CCDC97 18454 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 41803374 41803837 41803699 Y B9D2,HNRNPUL1 HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA CCDC97 10257 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 41804006 41804567 41804366 Y TGFB1,B9D2,HNRNPUL1 HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA CCDC97 9527 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 41831643 41832527 41831971 Y CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA CCDC97 17549 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 41849661 41849907 41849784 Y HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA TMEM91 4909 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 41915515 41915996 41915671 Y ARHGEF1,HNRNPUL1,TGFB1 B9D2,BCKDHA,EXOSC5,ATP5SL NA NA NA NA EXOSC5 14131 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 42028325 42028365 42028354 Y NA CEACAM21 CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 CEACAM21 25521 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 42037922 42038313 42037990 Y CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1 CEACAM21 LOC100505495 IMR90 Hi-C 24141950 CEACAM21 15573 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 14.7562829128429 chr19 42052659 42053071 42052864 Y HNRNPUL1,CCDC97,B9D2,CEACAM21,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1 CEACAM21 LOC100505495 IMR90 Hi-C 24141950 CEACAM21 815 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 42404902 42404963 42404932 Y NA RPS19,CD79A,ARHGEF1 NA NA NA NA ARHGEF1 19674 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 42493914 42494230 42494205 Y TMEM145,MEGF8,GRIK5,ATP1A3 RABAC1,ATP1A3 NA NA NA NA ATP1A3 5419 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr19 42514619 42514744 42514681 Y ATP1A3 ATP1A3 NA NA NA NA ATP1A3 14970 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 42772295 42772768 42772477 Y NA ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 1606 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr19 42772804 42773312 42773020 Y CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 2115 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr19 42774379 42774759 42774668 Y CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 3690 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr19 42775992 42776735 42776352 Y NA GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3,TMEM145 NA NA NA NA CIC 5303 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 42784527 42784991 42784716 Y ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13838 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 42789863 42790090 42789919 Y CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,DEDD2,CIC GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA PAFAH1B3 15608 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 42924318 42924497 42924408 Y NA NA NA NA NA NA MEGF8 96557 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 43835548 43835842 43835742 Y NA NA TEX101 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF575 191807 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 44066872 44067293 44067141 Y ZNF230,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61,IRGQ ZNF575,ETHE1,XRCC1,IRGQ,ZNF576,SRRM5 NA NA NA NA XRCC1 15332 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 44281524 44282142 44281780 Y IRGQ,ZNF230,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4 SMG9,KCNN4,ZNF283 NA NA NA NA KCNN4 1267 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 44284114 44284247 44284152 Y TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4 SMG9,KCNN4,ZNF283 NA NA NA NA KCNN4 705 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 44287065 44287299 44287223 Y NA SMG9,KCNN4,ZNF283 NA NA NA NA KCNN4 3656 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr19 44294757 44295133 44294844 Y NA SMG9,KCNN4,ZNF283 NA NA NA NA KCNN4 11348 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 44711538 44711905 44711597 Y NA ZNF226,ZNF227 NA NA NA NA ZNF227 1838 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 44824668 44825027 44825022 Y NA ZNF235 NA NA NA NA ZNF235 17469 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 45256546 45257099 45256742 Y ZNF296,RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3 NA NA NA NA NA BCAM 53229 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 45279679 45279961 45279836 Y CEACAM19,CBLC,BCAM BCAM NA NA NA NA BCAM 30367 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 45393623 45393866 45393750 Y ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40 PVRL2,TOMM40,APOE NA NA NA NA TOMM40 1797 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 45604142 45604476 45604278 Y FOSB ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37 NA NA NA NA PPP1R37 11488 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 45844650 45844836 45844820 Y FBXO46,PPP1R13L CKM,ERCC2 NA NA NA NA CKM 20415 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 45945937 45946679 45946251 Y GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22574 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 45946690 45947113 45946759 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22140 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 45953764 45954783 45954182 Y NA CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2 FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 14470 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 2.67018452708587 chr19 45954905 45955186 45955133 Y GIPR,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,BLOC1S3,PPM1N,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2 FOSB IMR90 Hi-C 24141950 FOSB 14067 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 46133845 46134220 46134022 Y NANOS2,IGFL4,NKPD1,EXOC3L2 OPA3,EML2 NA NA NA NA EML2 12667 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 46361761 46362096 46361929 Y NA SYMPK,IRF2BP1,MYPOP NA NA NA NA SYMPK 2452 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 46688176 46688573 46688180 Y PTGIR NA NA NA NA NA PPP5C 159678 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 46853988 46854113 46854077 Y PRKD2 PPP5C NA NA NA NA PPP5C 5737 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 46877153 46877367 46877269 Y NA PPP5C NA NA NA NA PPP5C 28902 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 47220951 47221042 47220998 Y ZC3H4,PRKD2 PRKD2,FKRP,STRN4 NA NA NA NA PRKD2 2567 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 47269374 47269772 47269575 Y LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5 FKRP,STRN4,SLC1A5 NA NA NA NA SLC1A5 20079 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 47363167 47364689 47363471 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 AP2S1 SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 10918 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 47611153 47611400 47611382 Y NA SAE1,ZC3H4 TMEM160,NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 SAE1 3131 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 47613231 47613789 47613256 Y PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4 SAE1,ZC3H4 TMEM160,NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 SAE1 742 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 47613894 47614902 47614503 Y PTGIR,PRKD2,NAPA,GPR77,GLTSCR1,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4 ZC3H4 NA NA NA NA SAE1 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 47662714 47662828 47662771 Y NA SAE1,ZC3H4 NA NA NA NA ZC3H4 47705 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 47776748 47776969 47776841 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1 BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA PRR24 606 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr19 47886542 47886975 47886851 Y GLTSCR2,ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34 DHX34 NA NA NA NA DHX34 36004 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 47890403 47890638 47890521 Y ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,DHX34 DHX34 NA NA NA NA DHX34 39865 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 48103581 48103982 48103689 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA GLTSCR1,NAPA MCF7 ChIA-PET 22265404 NAPA 87084 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 48642255 48642637 48642446 Y NA LIG1 NA NA NA NA LIG1 29223 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 48927915 48927964 48927940 Y NA KDELR1,GRWD1,CYTH2 NA NA NA NA GRWD1 19066 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 48996099 48996379 48996219 Y NA GRWD1,CYTH2 NA NA NA NA CYTH2 25810 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 49092091 49092636 49092297 Y BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11 SPHK2,RPL18,DBP NA NA NA NA SPHK2 27912 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 49315464 49315783 49315738 Y NA BCAT2,HSD17B14 NA NA NA NA BCAT2 3178 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 49386525 49386775 49386581 Y CD37,PPP1R15A HSD17B14,PPP1R15A,NUCB1,DHDH NA NA NA NA PPP1R15A 12876 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 49832847 49832906 49832877 Y PTH2 CD37 NA NA NA NA CD37 3522 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 50004159 50004640 50004502 Y PNKP,SNRNP70,C19orf73,CD37,PRR12,IRF3,BCL2L12,ALDH16A1,FLT3LG,FLT3LG,RPL13A,RPS11 ALDH16A1,PIH1D1,FLT3LG,RPL13A,SNORD32A,SNORD33,SNORD34,RPS11,SNORD35B,MIR150,FCGRT NA NA NA NA MIR150 2034 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr19 50835948 50836015 50835982 Y IL4I1,NR1H2,KCNC3 NR1H2,NAPSB,POLD1 NA NA NA NA NR1H2 5038 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 50872495 50872846 50872654 Y NA NR1H2,NAPSB,POLD1,SPIB NA NA NA NA POLD1 12615 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 50993680 50994951 50994565 Y NA JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 17659 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 51010284 51010518 51010437 Y KLK4,ACPT,SYT3,SHANK1,LOC342918 JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 2092 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 51059944 51060288 51060130 Y NA JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 47334 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 51166998 51167396 51167198 Y KLK4,KLK6,KLK14,SYT3,LOC342918 C19orf81,SYT3 NA NA NA NA SYT3 2255 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 51182448 51182932 51182864 Y NA C19orf81,SYT3,SHANK1,CLEC11A NA NA NA NA SYT3 12797 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr19 51197974 51198378 51198356 Y NA C19orf81,SYT3,SHANK1,CLEC11A NA NA NA NA SHANK1 22329 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 51221435 51221859 51221691 Y KCNC3,ASPDH,LRRC4B,SYT3,SYT3,SHANK1 SHANK1,CLEC11A NA NA NA NA SHANK1 728 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 51224129 51224276 51224235 Y C19orf48,C19orf48,SHANK1,CLEC11A SHANK1,CLEC11A NA NA NA NA CLEC11A 310 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 51287900 51288107 51288100 Y NA C19orf48 NA NA NA NA C19orf48 18079 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr19 51796169 51796569 51796297 Y NA NA CD33,IGLON5 IMR90 Hi-C 24141950 CD33 69849 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 52194594 52195259 52195000 Y ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1 NA NA NA NA NA ZNF175 122043 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 52697339 52697517 52697506 Y ZNF350,ZNF432,ZNF836,ZNF83,ZNF808,ZNF766 ZNF836,PPP2R1A NA NA NA NA PPP2R1A 6047 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 53129559 53129725 53129643 Y ZNF160,ZNF616,ZNF766,ZNF808,ZNF701,ZNF611,ZNF611,ZNF83 NA NA NA NA NA ZNF83 62024 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 53150651 53150972 53150733 Y NA ZNF83 ZNF137P IMR90 Hi-C 24141950 ZNF83 40777 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 53237186 53237523 53237297 Y ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611 ZNF83,ZNF611 NA NA NA NA ZNF611 860 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 53426305 53426488 53426354 Y ZNF765,ZNF468,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 17366 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr19 53444729 53445104 53444918 Y ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 875 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 53592651 53593387 53593361 Y NA ZNF160 NA NA NA NA ZNF160 11302 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 53727403 53727861 53727738 Y NA NA NA NA NA NA ZNF845 107141 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 54373735 54373974 54373935 Y VSTM1,TFPT,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,CNOT3,ZNF765,ZNF761,ZNF813,NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM MYADM NA NA NA NA MYADM 6258 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr19 54707641 54707712 54707644 Y NA LENG1,MBOAT7,TSEN34,RPS9 NA NA NA NA RPS9 5031 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 54786591 54786876 54786666 Y NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR2,LAIR1,RPS9,LILRB3,LILRA6,LILRB2 LILRB2 NA NA NA NA LILRB2 3552 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 54885175 54886148 54885583 Y VSTM1,OSCAR,LILRB3,LILRA6,LILRB2,KIR3DL3,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR2,FCAR,LILRA3,LILRA3,LILRA5,LAIR1 LAIR1 PRKCG,CACNG7,CACNG6,VSTM1,TSEN34,MBOAT7,RPS9 K562,HELA 5C 22955621 LAIR1 5010 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 54894976 54895239 54895053 Y VSTM1,TARM1,OSCAR,LILRB3,LILRB2,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR2,FCAR,LILRA3,LILRA3,LILRA5,LAIR1 LAIR1 NA NA NA NA LAIR1 14811 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 55627475 55627790 55627718 Y LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C RDH13,PPP1R12C NA NA NA NA PPP1R12C 548 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 55880979 55881171 55881094 Y ZNF579,NAT14,COX6B2,IL11 SUV420H2,TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA TMEM238 12795 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 55917170 55917359 55917333 Y U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA UBE2S 25 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 56061327 56061704 56061673 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1 SGK110 K562 ChIA-PET 22265404 ZNF579 28507 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 56097081 56097467 56097273 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581 SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF579 6870 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chr19 56098668 56099098 56098905 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581 SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF579 8457 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 4872 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.68643233289634 chr19 56117286 56117783 56117722 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 5950 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 56621885 56622165 56622061 Y NA ZNF787,ZNF444 NA NA NA NA ZNF787 8484 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 56623049 56623274 56623140 Y NA ZNF787,ZNF444 NA NA NA NA ZNF787 7375 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 56623811 56623981 56623918 Y ZNF865,EPN1 ZNF787,ZNF444 NA NA NA NA ZNF787 6668 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr19 56831287 56831644 56831534 Y ZSCAN5A ZSCAN5A NA NA NA NA ZSCAN5A 46108 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 57781316 57781665 57781442 Y ZSCAN4,ZNF154,ZNF460 ZNF805,ZNF460,ZNF543 NA NA NA NA ZNF460 7754 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 57944833 57945004 57944919 Y NA ZNF548,ZNF17,ZNF749,ZNF772 NA NA NA NA ZNF749 136 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 58218479 58218613 58218485 Y ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,VN1R1,ZNF772,ZNF419,ZNF773,ZNF549,ZNF416,ZIK1,ZNF134,ZSCAN4,ZNF551,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF814,ZNF606,ZNF418,ZNF256,ZNF135,LOC100293516,ZNF671,ZNF586,ZNF154 ZNF551,ZNF671,ZNF776 NA NA NA NA ZNF671 18379 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 58237757 58238155 58237774 Y NA ZNF551,ZNF671,ZNF776,ZNF586 ZNF154 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF671 765 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 58315114 58315751 58315446 Y ZNF543,ZNF549,ZNF418,ZNF135,ZNF154,ZNF552 ZNF586,ZNF552,ZNF587 NA NA NA NA ZNF552 8530 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 58673997 58674222 58674118 Y ZSCAN4 ZSCAN18,ZNF329,ZNF274 ZNF416,ZNF274 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF329 9520 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 58784706 58785064 58784920 Y NA ZNF544,ZNF8,ERVK3-1 NA NA NA NA ZNF8 3254 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 58788473 58788748 58788728 Y NA ZNF8,ERVK3-1,ZSCAN22 NA NA NA NA ZNF8 155 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 58824678 58824957 58824818 Y ZNF256 ZNF8,ERVK3-1,ZSCAN22,A1BG-AS1,A1BG,ZNF497 NA NA NA NA ERVK3-1 9963 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr19 59029635 59029989 59029796 Y NA SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M SLC27A5 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC27A5 7855 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr19 59049687 59049971 59049795 Y ZNF135,ZSCAN18,ZNF544,ZNF8,ZNF497,ZNF324B,ZNF324,UBE2M,TRIM28 SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1 NA NA NA NA ZBTB45 1409 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr19 59050036 59050316 59050176 Y ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,ZNF132,ZNF324B,ZNF324,TRIM28,MZF1 SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1 NA NA NA NA ZBTB45 1758 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr2 1115244 1115256 1115249 Y SNTG2 NA NA NA NA NA TMEM18 439805 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 1608037 1608218 1608215 Y NA NA NA NA NA NA PXDN 138406 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 1659182 1659769 1659438 Y NA NA NA NA NA NA PXDN 86855 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 1719023 1719384 1719170 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 27240 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr2 1722150 1722351 1722236 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 24273 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 1735614 1736022 1735851 Y PXDN PXDN NA NA NA NA PXDN 10602 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 2850815 2851100 2850821 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 528553 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 3072634 3072961 3072804 Y NA NA TSSC1 IMR90 Hi-C 24141950 TSSC1 306692 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 3340825 3341028 3341010 Y NA TSSC1,TRAPPC12 NA NA NA NA TSSC1 38625 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr2 8274361 8274658 8274538 Y NA NA NA NA NA NA AC011747.3 438973 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 8369680 8369964 8369925 Y ID2 NA NA NA NA NA AC011747.3 343667 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 8617164 8617264 8617232 Y NA NA LOC100506274,LINC00299,LOC339788 IMR90 Hi-C 24141950 AC011747.3 96367 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 8627879 8628725 8628434 Y NA NA LOC339788,LOC100506274,LINC00299 IMR90 Hi-C 24141950 AC011747.3 84906 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 8712879 8713177 8712998 Y NA AC011747.3,AC011747.4 LOC100506274,ID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC011747.3 454 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 9686288 9686554 9686518 Y NA ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 7367 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 10075100 10075410 10075131 Y TAF1B GRHL1 GRHL1 IMR90 Hi-C 24141950 GRHL1 7931 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 10258344 10258406 10258377 Y NA RRM2 NA NA NA NA RRM2 2049 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 10260365 10260994 10260486 Y ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2 NA NA NA NA NA RRM2 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.96750438837906 chr2 10274411 10274722 10274506 Y TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48 RRM2 NA NA NA NA RRM2 13956 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 10330449 10330626 10330557 Y NA NA NA NA NA NA RRM2 69994 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 10341486 10341905 10341708 Y KLF11 NA NA NA NA NA RRM2 81031 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 10950898 10951279 10951023 Y NA PDIA6 ATP6V1C2 IMR90 Hi-C 24141950 PDIA6 24824 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 12309855 12310149 12310048 Y LPIN1 NA TRIB2,LOC100506474 IMR90 Hi-C 24141950 AC106875.1 490269 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 12596433 12596805 12596535 Y NA NA LPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 258210 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 13333265 13333515 13333402 Y NA NA NA NA NA NA TRIB2 478250 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 15561739 15562014 15561765 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 137440 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 16049929 16050062 16050061 Y NA RP11-120J4.1 NA NA NA NA RP11-120J4.1 41866 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 16594582 16594881 16594738 Y NA NA NA NA NA NA FAM49A 250718 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 17043778 17044033 17043919 Y FAM49A NA NA NA NA NA FAM49A 198179 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 17967823 17967867 17967845 Y MSGN1 GEN1,SMC6 NA NA NA NA SMC6 11642 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 17999208 17999271 17999240 Y NA SMC6 NA NA NA NA SMC6 19699 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 20544740 20544866 20544805 Y NA PUM2 PUM2,HS1BP3 IMR90 Hi-C 24141950 PUM2 5129 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 20674316 20674523 20674398 Y NA RHOB RHOB,HS1BP3 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RHOB 29481 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 21478990 21479244 21479098 Y NA NA NA NA NA NA C2orf43 458108 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 21518335 21518607 21518471 Y NA NA NA NA NA NA C2orf43 497453 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 21553806 21554151 21553979 Y NA NA NA NA NA NA C2orf43 532924 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 23275216 23275518 23275368 Y NA NA NA NA NA NA ATAD2B 872466 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 23743180 23743526 23743353 Y NA NA NA NA NA NA ATAD2B 404458 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 24944371 24944796 24944454 Y NA NA NA NA NA NA CENPO 69209 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 26522632 26522929 26522714 Y NA EPT1,GPR113 NA NA NA NA EPT1 6486 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 27304052 27304486 27304234 Y CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1 AGBL5,OST4,KHK,CGREF1 NA NA NA NA KHK 3129 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr2 27557346 27557529 27557503 Y DPYSL5,C2orf16 MPV17,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513 NA NA NA NA MPV17 10799 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 27614467 27614499 27614483 Y EIF2B4,EIF2B4 GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1 NA NA NA NA FTH1P3 233 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 27878874 27879165 27879028 Y SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L NA NA NA NA SLC4A1AP 5173 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 28496743 28497020 28496828 Y RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 NA NA NA NA NA FOSL2 116295 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 29026080 29026331 29026243 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB NA NA NA NA NA PPP1CB 53574 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 29050679 29050871 29050775 Y NA TRMT61B NA NA NA NA TRMT61B 40296 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 29075660 29075992 29075826 Y TRMT61B TRMT61B,WDR43 NA NA NA NA TRMT61B 15175 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 30559982 30560170 30560070 Y YPEL5 NA LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 AC104698.1 80789 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 31442526 31442753 31442658 Y NA NA NA NA NA NA GALNT14 66458 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 36584242 36585529 36584872 Y FEZ2,CRIM1 CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 3173 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 36712578 36712925 36712822 Y CRIM1,FEZ2 NA NA NA NA NA CRIM1 131509 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 36713753 36714120 36713762 Y CRIM1,VIT,FEZ2 NA NA NA NA NA CRIM1 132684 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 36761840 36762400 36762263 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 108830 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 36790527 36791707 36791646 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 79523 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 37043619 37043714 37043667 Y NA NA NA NA NA NA STRN 147901 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 37883470 37883595 37883540 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP3 80016 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 38049848 38050212 38050057 Y QPCT,CDC42EP3 NA CDC42EP3,LOC100505876,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 86237 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 38949741 38950194 38950072 Y HNRPLL,SRSF7 SRSF7,GEMIN6 NA NA NA NA SRSF7 26442 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 39695061 39695250 39695144 Y NA MAP4K3 NA NA NA NA MAP4K3 32608 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 40264573 40264733 40264653 Y NA NA NA NA NA NA THUMPD2 260166 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 40506084 40506414 40506221 Y NA NA NA NA NA NA SLC8A1 329779 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 40676285 40676532 40676459 Y NA NA NA NA NA NA SLC8A1 159661 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 43037224 43037999 43037611 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC025750.7 278642 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 43334152 43334550 43334471 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L2 117198 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 43421229 43421631 43421263 Y HAAO,THADA,THADA ZFP36L2 ZFP36L2,LOC100129726,THADA K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFP36L2 30117 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.8269683606377 chr2 43422005 43422472 43422185 Y THADA,THADA,ZFP36L2 ZFP36L2 ZFP36L2,LOC100129726,THADA K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFP36L2 29276 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 43686078 43686091 43686085 Y NA NA NA NA NA NA THADA 135094 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 44212195 44212421 44212308 Y NA LRPPRC NA NA NA NA LRPPRC 8723 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr2 44542790 44543096 44543052 Y SLC3A1 PREPL,CAMKMT NA NA NA NA PREPL 43905 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 44944979 44944991 44944986 Y NA NA NA NA NA NA AC012354.8 276561 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 45176497 45176546 45176522 Y NA AC012354.8 NA NA NA NA AC012354.8 45006 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 45881346 45881543 45881445 Y NA SRBD1,PRKCE NA NA NA NA PRKCE 4862 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 45955611 45956065 45955689 Y NA NA NA NA NA NA PRKCE 79127 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 45968952 45969144 45969027 Y PRKCE NA NA NA NA NA PRKCE 92468 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 46265425 46265774 46265513 Y NA NA NA NA NA NA EPAS1 253032 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 46578990 46579175 46579103 Y EPAS1 NA NA NA NA NA EPAS1 60184 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 46825586 46825695 46825639 Y NA CRIPT,PIGF NA NA NA NA CRIPT 15860 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 47194379 47194775 47194547 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 27385 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 47206692 47207332 47207009 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 39698 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 47210404 47210621 47210509 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 43410 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chr2 47282124 47282371 47282214 Y NA NA NA NA NA NA MCFD2 115130 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 47306951 47307378 47307182 Y NA NA NA NA NA NA CALM2 94362 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 47926766 47926950 47926857 Y NA AC079250.1,MSH6 KCNK12 IMR90 Hi-C 24141950 MSH6 6097 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 47946812 47947044 47946928 Y NA AC079250.1,MSH6 KCNK12 IMR90 Hi-C 24141950 MSH6 26143 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 48373241 48373406 48373298 Y FOXN2 NA FOXN2,PPP1R21 IMR90 Hi-C 24141950 FOXN2 166370 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 52785437 52785822 52785630 Y NA NA NA NA NA NA CHAC2 1207107 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 54022416 54022710 54022562 Y NA CHAC2,ERLEC1 NA NA NA NA ERLEC1 10235 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 54165408 54165630 54165519 Y NA ACYP2,PSME4 NA NA NA NA ACYP2 30345 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 54786900 54787386 54787056 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 105478 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr2 54787503 54787764 54787623 Y RTN4,SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 106081 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.8269683606377 chr2 54796924 54797237 54797074 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 115502 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr2 54799241 54799892 54799606 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 117819 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 54801406 54802103 54801693 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 119984 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 54816609 54817000 54816923 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA EML6 131636 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 54845847 54845943 54845895 Y NA NA NA NA NA NA EML6 102693 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 54861793 54862155 54861956 Y NA NA NA NA NA NA EML6 86481 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 54900806 54901065 54900960 Y NA EML6 NA NA NA NA EML6 47571 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 55450545 55450658 55450592 Y CCDC88A,EML6,RTN4 RPS27A,MTIF2 NA NA NA NA RPS27A 6381 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 55558772 55559057 55558882 Y NA NA NA NA NA NA MTIF2 64289 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 56112478 56112793 56112711 Y NA NA NA NA NA NA PNPT1 193433 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 57861899 57862248 57862095 Y NA NA NA NA NA NA VRK2 270538 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 58985129 58985505 58985273 Y NA NA NA NA NA NA FANCL 518622 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 60133192 60133207 60133200 Y NA NA NA NA NA NA AC007381.3 444944 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 60327078 60327537 60327382 Y NA NA NA NA NA NA AC007381.3 250614 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr2 60694839 60695290 60695042 Y PAPOLG,BCL11A NA NA NA NA NA BCL11A 83412 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr2 60712095 60712413 60712305 Y NA NA NA NA NA NA BCL11A 66289 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 60742807 60743148 60742962 Y REL BCL11A NA NA NA NA BCL11A 35554 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 60757464 60757761 60757646 Y NA BCL11A NA NA NA NA BCL11A 20941 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr2 60776650 60777166 60776879 Y REL,BCL11A BCL11A NA NA NA NA BCL11A 1536 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 60778604 60778787 60778696 Y REL,BCL11A NA NA NA NA NA BCL11A 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 60779041 60779656 60779263 Y REL,BCL11A BCL11A NA NA NA NA BCL11A 339 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 60784320 60784652 60784428 Y REL,BCL11A BCL11A NA NA NA NA BCL11A 5618 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 61126778 61127091 61126822 Y REL REL NA NA NA NA REL 20122 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 61207503 61207627 61207564 Y NA PEX13,PUS10 NA NA NA NA PEX13 34733 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 61428317 61428371 61428344 Y USP34,AHSA2 AHSA2 NA NA NA NA AHSA2 25764 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 61466894 61467158 61467026 Y NA NA NA NA NA NA AHSA2 64341 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 61580039 61580318 61580309 Y NA NA NA NA NA NA USP34 115586 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 61748471 61748954 61748828 Y NA XPO1 NA NA NA NA XPO1 14807 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 61757728 61758222 61758112 Y NA XPO1 NA NA NA NA XPO1 5539 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 61766465 61766637 61766569 Y AHSA2,USP34 XPO1 NA NA NA NA XPO1 2704 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr2 61921641 61922071 61921953 Y NA NA NA NA NA NA FAM161A 157207 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 87618 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 2.10804041612042 chr2 62342790 62343015 62342903 Y NA NA NA NA NA NA B3GNT2 78233 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 62375163 62375426 62375211 Y B3GNT2 B3GNT2 NA NA NA NA B3GNT2 45822 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 63446182 63446204 63446197 Y NA NA NA NA NA NA OTX1 170990 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr2 63601034 63601048 63601041 Y NA NA NA NA NA NA MDH1 212695 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 64364775 64365257 64365170 Y NA AC074289.1,PELI1 NA NA NA NA AC074289.1 3116 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 64367846 64368162 64368149 Y NA AC074289.1,PELI1 NA NA NA NA AC074289.1 211 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 64879120 64879608 64879340 Y NA NA LOC339807 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 96531 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 64894012 64894430 64894356 Y NA NA SERTAD2,AFTPH K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SERTAD2 81709 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 64957479 64957902 64957679 Y NA SERTAD2 SERTAD2,AFTPH,LOC339807 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 18237 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 64978173 64978610 64978385 Y CEP68 SERTAD2 SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 2034 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 64994926 64995226 64995021 Y SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 18787 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 65067098 65067261 65067167 Y SLC1A4,RAB1A NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 90959 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr2 65086968 65087262 65087080 Y AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 110829 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 65173308 65173867 65173558 Y AFTPH,SERTAD2 SLC1A4 SERTAD2,AFTPH,LOC339807,LOC400958,SLC1A4,CEP68,ACTR2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC1A4 39744 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr2 65214378 65214996 65214823 Y NA SLC1A4 NA NA NA NA SLC1A4 767 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 65657861 65658229 65658008 Y SLC1A4,SPRED2,SPRED2 SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 90 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr2 67688929 67689189 67689059 Y NA NA MEIS1,ETAA1 IMR90 Hi-C 24141950 ETAA1 66478 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 68278313 68278683 68278526 Y NA NA NA NA NA NA C1D 57397 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 68472906 68473226 68473141 Y PPP3R1 PPP3R1 NA NA NA NA PPP3R1 8143 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 68917276 68917507 68917390 Y PPP3R1,APLF,ARHGAP25,ARHGAP25,PROKR1 ARHGAP25 PROKR1,APLF,ARHGAP25,BMP10,FBXO48 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP25 12543 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 68994705 68995199 68995002 Y FBXO48,ARHGAP25,ARHGAP25 NA BMP10 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP25 89972 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 69040869 69041120 69040946 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP25 136136 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 69989990 69990667 69990520 Y NA NA GMCL1 IMR90 Hi-C 24141950 GMCL1 64107 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 70048617 70048893 70048741 Y ANXA4 GMCL1 NA NA NA NA GMCL1 5881 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 70145725 70146134 70145771 Y NA SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA MXD1 22905 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 70202880 70203539 70203203 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 ASPRV1 NA NA NA NA ASPRV1 15483 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 70363059 70363462 70363144 Y MXD1,C2orf42,PCBP1 PCBP1-AS1,AC016700.4,AC016700.3 NA NA NA NA AC016700.3 34707 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 70667389 70667575 70667482 Y NA NA NA NA NA NA FAM136A 140167 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 71228347 71228418 71228366 Y ANKRD53 TEX261 TEX261 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TEX261 8272 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 73402910 73403369 73403123 Y SFXN5 RAB11FIP5,SMYD5 EMX1,RAB11FIP5,SFXN5,NOTO,PRADC1,CCT7,SMYD5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB11FIP5 21061 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 73613683 73613856 73613817 Y DUSP11,ALMS1 ALMS1 NA NA NA NA ALMS1 2797 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 74152201 74152400 74152268 Y NA DGUOK NA NA NA NA DGUOK 248 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 74264843 74264997 74264882 Y NA NA TET3,ACTG2,DGUOK,STAMBP,MOB1A,BOLA3-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 AC073046.25 54584 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 75102185 75102665 75102322 Y HK2 HK2 NA NA NA NA HK2 43077 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 75114636 75114786 75114714 Y NA NA NA NA NA NA HK2 55528 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 75141745 75142080 75142074 Y NA POLE4 NA NA NA NA POLE4 41539 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 85034355 85034669 85034421 Y NA NA NA NA NA NA TMSB10 96080 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 85116002 85116322 85116077 Y C2orf89,TMSB10 TMSB10 TMSB10 MCF7 ChIA-PET 22265404 TMSB10 14427 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 85151844 85152193 85152004 Y NA TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 21095 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 85154234 85154422 85154323 Y NA TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 23485 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 85567649 85568034 85567918 Y NA TGOLN2,ELMOD3,RETSAT TGOLN2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ELMOD3 11483 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 85664544 85665596 85664830 Y KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6 NA NA NA NA NA RETSAT 84801 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr2 85764802 85765239 85764815 Y SH2D6,USP39 MAT2A,GGCX,VAMP5 NA NA NA NA MAT2A 514 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 85887180 85887589 85887391 Y SH2D6,SFTPB C2orf68 NA NA NA NA C2orf68 49991 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 85993562 85993638 85993601 Y NA RNU1-38P NA NA NA NA RNU1-38P 40102 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 86221169 86221618 86221314 Y NA NA POLR1A,ST3GAL5,LOC284950 IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL5 107032 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 86224674 86224821 86224747 Y NA NA NA NA NA NA POLR1A 106457 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 86262586 86262681 86262652 Y NA NA NA NA NA NA POLR1A 68597 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 86452715 86452898 86452804 Y RNF103,RMND5A IMMT,MRPL35 NA NA NA NA MRPL35 28237 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 86722974 86723324 86723287 Y NA NA NA NA NA NA KDM3A 57204 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 88899554 88899981 88899832 Y EIF2AK3 EIF2AK3 NA NA NA NA EIF2AK3 25113 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 89053744 89054153 89053865 Y EIF2AK3 NA NA NA NA NA RPIA 64582 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 96822944 96823234 96823089 Y ARID5A,DUSP2 DUSP2,STARD7 DUSP2,STARD7,LOC285033,ADRA2B,SNRNP200,TMEM127,CIAO1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DUSP2 13765 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 96995983 96996007 96995995 Y ITPRIPL1,ITPRIPL1 SNRNP200,AC021188.4,ITPRIPL1,NCAPH NA NA NA NA NCAPH 3518 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 97204407 97205263 97204568 Y NA NEURL3,ARID5A NA NA NA NA ARID5A 3927 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr2 97579294 97579390 97579355 Y NA SEMA4C NA NA NA NA SEMA4C 44800 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 98364129 98364314 98364298 Y TMEM131,ZAP70,ZAP70 ZAP70 NA NA NA NA ZAP70 36106 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 98389575 98389609 98389594 Y NA NA NA NA NA NA ZAP70 61552 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 98443211 98443622 98443475 Y NA NA NA NA NA NA ZAP70 115188 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 98598628 98598759 98598694 Y NA TMEM131 NA NA NA NA TMEM131 11629 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 99064911 99065194 99064955 Y MGAT4A,MGAT4A,INPP4A INPP4A NA NA NA NA INPP4A 5594 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 99072105 99072338 99072215 Y TMEM131,MGAT4A,MGAT4A,INPP4A INPP4A NA NA NA NA INPP4A 12788 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 99081402 99081780 99081544 Y TMEM131,UNC50,MGAT4A,INPP4A INPP4A UNC50,COA5 IMR90 Hi-C 24141950 INPP4A 22085 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 99104168 99104367 99104271 Y TMEM131,INPP4A INPP4A NA NA NA NA INPP4A 44851 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 99118904 99119212 99119061 Y NA NA NA NA NA NA INPP4A 59587 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 99173119 99173416 99173284 Y INPP4A COA5,UNC50 UNC50,COA5 IMR90 Hi-C 24141950 COA5 49562 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 100036640 100036800 100036773 Y NA NA NA NA NA NA REV1 67697 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 100323852 100324185 100324151 Y NA NA NA NA NA NA REV1 219355 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 100484034 100484497 100484368 Y NA NA NA NA NA NA AFF3 272704 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 100654601 100654935 100654768 Y NA NA NA NA NA NA AFF3 102266 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 101197262 101197669 101197547 Y RPL31 PDCL3 NA NA NA NA PDCL3 20110 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 101712877 101712902 101712892 Y NA NA NA NA NA NA RPL31 96700 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 101946998 101947171 101947106 Y MAP4K4,MAP4K4,RNF149 RNF149 NA NA NA NA RNF149 23835 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 102238768 102239154 102238913 Y RNF149,MAP4K4,MAP4K4 NA RFX8,MAP4K4,CREG2 IMR90 Hi-C 24141950 MAP4K4 72158 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 102327240 102327383 102327307 Y NA MAP4K4 NA NA NA NA MAP4K4 15928 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 102332970 102333042 102333006 Y MAP4K4,MAP4K4 MAP4K4 NA NA NA NA MAP4K4 21658 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 102399741 102400097 102399970 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K4 88429 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 105430210 105430587 105430504 Y NA LINC01158 NA NA NA NA LINC01158 37054 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 105463453 105463711 105463684 Y GPR45,POU3F3 LINC01158 NA NA NA NA LINC01158 3930 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 105489803 105490153 105490078 Y GPR45,POU3F3 LINC01158 NA NA NA NA LINC01158 22162 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 105505799 105505908 105505854 Y NA LINC01158 NA NA NA NA LINC01158 38158 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 105655685 105655967 105655739 Y NA MRPS9 NA NA NA NA MRPS9 3244 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 105676474 105676490 105676482 Y NA MRPS9 NA NA NA NA MRPS9 24033 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 106474357 106474542 106474414 Y NA NA NA NA NA NA NCK2 115003 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 106809174 106809856 106809272 Y UXS1 UXS1 NA NA NA NA UXS1 379 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 109855106 109855410 109855221 Y NA NA NA NA NA NA CCDC138 453893 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 110097588 110097865 110097829 Y NA NA NA NA NA NA RGPD5 450470 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 110318153 110318301 110318244 Y NA NA NA NA NA NA RGPD5 230034 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 113551784 113552157 113551927 Y IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L,IL1B CKAP2L,IL37,IL1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CKAP2L 31530 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 113576216 113576532 113576373 Y IL36G,PSD4,IL1RN,IL1A,IL1B IL1B NA NA NA NA IL1B 15948 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 113657771 113658101 113657937 Y NA NA CKAP2L,IL1A,IL37,IL1B IMR90 Hi-C 24141950 IL1B 65291 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 113693868 113694223 113694055 Y IL1A,IL1B,IL36B,IL36RN,IL1RN,IL36G NA NA NA NA NA IL1B 101388 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 114082449 114082815 114082523 Y NA NA PAX8,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 PAX8-AS1 115350 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 114649026 114649412 114649076 Y CBWD2,ACTR3 ACTR3 NA NA NA NA ACTR3 3489 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 118741787 118742055 118741993 Y CCDC93 CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 27654 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 119498698 119498987 119498818 Y NA NA NA NA NA NA C2orf76 623417 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 120971736 120972136 120971936 Y NA TMEM185B,RALB NA NA NA NA TMEM185B 6848 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 122226715 122226882 122226860 Y NA NA NA NA NA NA RNU4ATAC 59575 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 122275440 122275469 122275455 Y NA RNU4ATAC NA NA NA NA RNU4ATAC 10988 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 122456992 122457582 122457167 Y CLASP1 TSN NA NA NA NA TSN 35097 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 122536391 122536587 122536559 Y NA TSN NA NA NA NA TSN 43712 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 128173465 128174362 128173731 Y SFT2D3,AMMECR1L,MAP3K2,PROC MAP3K2 NA NA NA NA MAP3K2 29424 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 128207199 128207568 128207384 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K2 63158 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 128283052 128283292 128283172 Y MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L IWS1 NA NA NA NA IWS1 590 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 128469057 128469300 128469179 Y NA SFT2D3 NA NA NA NA SFT2D3 12460 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 128587553 128587803 128587688 Y MAP3K2,WDR33 WDR33,POLR2D NA NA NA NA WDR33 20792 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 128773511 128773726 128773583 Y NA SAP130 NA NA NA NA SAP130 9968 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 129073927 129074235 129074112 Y NA NA NA NA NA NA HS6ST1 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 129248071 129248194 129248123 Y NA NA NA NA NA NA HS6ST1 173920 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr2 130201021 130201117 130201085 Y NA NA NA NA NA NA AC079776.4 494673 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 2.24857644386178 chr2 134878523 134878632 134878609 Y MGAT5 MGAT5 NA NA NA NA MGAT5 2969 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 134878887 134879265 134878997 Y NA MGAT5 NA NA NA NA MGAT5 3333 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 135495364 135495623 135495509 Y MGAT5,RAB3GAP1,CCNT2 NA NA NA NA NA CCNT2 178182 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 136217422 136217690 136217556 Y NA NA NA NA NA NA ZRANB3 69116 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 136268329 136268541 136268430 Y NA ZRANB3,R3HDM1 NA NA NA NA ZRANB3 18265 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 136389932 136390301 136390118 Y NA NA NA NA NA NA R3HDM1 102907 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 136404449 136404849 136404497 Y R3HDM1 NA NA NA NA NA UBXN4 92340 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 136632932 136633416 136633308 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 MCM6 NA NA NA NA MCM6 936 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr2 136651588 136651672 136651630 Y NA MCM6 NA NA NA NA MCM6 19592 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 136888890 136889365 136889195 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 CXCR4 CXCR4 K562 ChIA-PET 22265404 CXCR4 15155 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 136889520 136890641 136889759 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 CXCR4 CXCR4 K562 ChIA-PET 22265404 CXCR4 15785 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 136891695 136892258 136891914 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 CXCR4 NA NA NA NA CXCR4 17960 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 136893434 136894485 136893919 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 CXCR4 NA NA NA NA CXCR4 19699 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr2 136963288 136963406 136963338 Y UBXN4,CXCR4 NA NA NA NA NA CXCR4 89553 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 136964188 136964556 136964428 Y CXCR4,CXCR4 NA NA NA NA NA CXCR4 90453 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr2 136964808 136965228 136964922 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 NA NA NA NA NA CXCR4 91073 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr2 136969217 136969545 136969360 Y NA NA NA NA NA NA CXCR4 95482 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 4.49715288772356 chr2 136996318 136996892 136996519 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 NA NA NA NA NA CXCR4 122583 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr2 137003597 137004126 137003957 Y CXCR4,CXCR4 NA NA NA NA NA CXCR4 129862 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 137133886 137134003 137133945 Y CXCR4 NA NA NA NA NA CXCR4 260151 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 139112246 139112514 139112380 Y NA NA NA NA NA NA AC097721.2 144754 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 139226248 139226635 139226522 Y NA AC097721.2,SPOPL NA NA NA NA AC097721.2 30633 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 139260181 139260311 139260246 Y SPOPL AC097721.2,SPOPL NA NA NA NA SPOPL 2810 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 143400236 143400580 143400366 Y KYNU NA KYNU IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP15 446351 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 143720663 143721004 143720729 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP15 125927 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 143852347 143852525 143852358 Y NA ARHGAP15 NA NA NA NA ARHGAP15 5416 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 144013747 144014085 144013828 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP15 166816 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 144499811 144499873 144499842 Y NA NA NA NA NA NA GTDC1 588262 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 145116388 145116823 145116635 Y NA GTDC1 ZEB2,ARHGAP15,GTDC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTDC1 28253 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 145122623 145122802 145122719 Y GTDC1,ZEB2 GTDC1 NA NA NA NA GTDC1 34488 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 145136238 145136489 145136344 Y ZEB2 GTDC1 NA NA NA NA GTDC1 48103 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 145202638 145202856 145202713 Y NA NA NA NA NA NA ZEB2-AS1 70808 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 145214152 145214623 145214350 Y GTDC1,GTDC1,ZEB2 NA NA NA NA NA ZEB2-AS1 59041 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 145378950 145379319 145379044 Y ZEB2 NA NA NA NA NA ZEB2 98803 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 145420866 145421073 145420998 Y ZEB2 NA ZEB2 K562 ChIA-PET 22265404 ZEB2 140719 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 145461218 145461913 145461584 Y GTDC1,ZEB2 NA NA NA NA NA ZEB2 181071 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 146510109 146510425 146510227 Y NA NA DKFZp686O1327,ZEB2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL6P5 417311 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 148089200 148089222 148089211 Y NA NA NA NA NA NA AC009480.4 476693 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 149403654 149404182 149403820 Y NA EPC2 NA NA NA NA EPC2 3645 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr2 149566291 149566547 149566419 Y NA NA NA NA NA NA EPC2 166282 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 150222263 150222576 150222421 Y NA NA NA NA NA NA MMADHC 219754 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 152493697 152493937 152493847 Y RBM43,NMI NA NA NA NA NA ARL5A 189069 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 152971717 152971973 152971845 Y NA CACNB4 NA NA NA NA CACNB4 18124 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 153356449 153356753 153356698 Y NA NA NA NA NA NA FMNL2 166698 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 157257270 157257340 157257305 Y NA GPD2 NR4A2,GALNT5,GPD2 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GPD2 32462 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 160106082 160106269 160106215 Y MARCH7 WDSUB1 NA NA NA NA WDSUB1 35041 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 160350650 160351006 160350912 Y MARCH7,CD302,BAZ2B AC009506.2 NA NA NA NA AC009506.2 32883 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr2 160411225 160411529 160411489 Y NA NA NA NA NA NA AC009506.1 58278 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 161607616 161608069 161607675 Y TANK,TANK NA RBMS1,ITGB6 IMR90 Hi-C 24141950 RBMS1 259311 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 162540076 162540145 162540111 Y TBR1 NA NA NA NA NA PSMD14 377527 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 164425693 164425701 164425698 Y FIGN NA NA NA NA NA GCA 1252343 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 166161416 166161745 166161474 Y SCN2A,SCN2A NA NA NA NA NA TTC21B 646608 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 166462925 166463090 166463060 Y TTC21B,SCN3A,SCN2A,CSRNP3,CSRNP3 NA NA NA NA NA TTC21B 345263 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 169347640 169347834 169347737 Y NA CERS6 NA NA NA NA CERS6 37268 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 170441657 170442069 170441908 Y NA FASTKD1,PPIG NA NA NA NA PPIG 2807 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 171093453 171093713 171093583 Y NA NA NA NA NA NA UBR3 411485 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 171786835 171787228 171786978 Y TLK1 GORASP2 NA NA NA NA GORASP2 3861 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 172287168 172287529 172287349 Y TLK1 DCAF17,METTL8 NA NA NA NA DCAF17 1198 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 173302497 173302807 173302540 Y NA ITGA6 NA NA NA NA ITGA6 12415 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 173544545 173544661 173544603 Y NA NA PDK1,RAPGEF4 IMR90 Hi-C 24141950 AC093818.1 125221 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 174046612 174047013 174046770 Y NA NA NA NA NA NA CDCA7 170535 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 175085975 175086128 175086062 Y NA OLA1 NA NA NA NA OLA1 25298 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 175357852 175358109 175357976 Y WIPF1,CIR1 GPR155,AC010894.3 GPR155 K562 ChIA-PET 22265404 AC010894.3 7735 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 175458304 175458790 175458407 Y CIR1,GPR155,WIPF1 NA NA NA NA NA WIPF1 86854 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 175459812 175460479 175460357 Y CIR1,GPR155,WIPF1 NA NA NA NA NA WIPF1 85165 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr2 175463861 175463949 175463936 Y CIR1,WIPF1 NA NA NA NA NA WIPF1 81695 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 175464337 175464570 175464451 Y CIR1,WIPF1 NA NA NA NA NA WIPF1 81074 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 176866139 176866392 176866261 Y KIAA1715 KIAA1715 NA NA NA NA KIAA1715 572 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 177423330 177423334 177423332 Y NA NA HOXD1,HOXD-AS1,HOXD-AS2,HOXD8 IMR90 Hi-C 24141950 MTX2 291207 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 178131060 178131559 178131324 Y NA MIR3128 NA NA NA NA MIR3128 12322 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 179056084 179056225 179056143 Y NA OSBPL6 MIR548N IMR90 Hi-C 24141950 OSBPL6 983 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr2 179471296 179471384 179471314 Y TTN NA NA NA NA NA TTN-AS1 87386 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 180098781 180098979 180098880 Y NA SESTD1 NA NA NA NA SESTD1 28538 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 180560876 180561013 180560945 Y ZNF385B NA NA NA NA NA CWC22 308827 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 180579667 180579746 180579673 Y ZNF385B,ZNF385B NA NA NA NA NA CWC22 290094 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 180585338 180585678 180585637 Y ZNF385B,ZNF385B NA NA NA NA NA CWC22 284162 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 182170258 182170790 182170550 Y ITGA4 NA NA NA NA NA ITGA4 149139 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 182171392 182171973 182171732 Y ITGA4 NA NA NA NA NA ITGA4 147956 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 182367881 182368047 182367964 Y ITGA4 ITGA4 NA NA NA NA ITGA4 47952 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 184619513 184619865 184619689 Y NA NA NA NA NA NA CACYBPP2 148666 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 186832070 186832214 186832142 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 516669 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 187263813 187264095 187263899 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 84788 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 188464486 188464724 188464607 Y NA NA GULP1 IMR90 Hi-C 24141950 ITGAV 1011694 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 189168145 189168606 189168510 Y NA NA NA NA NA NA WDR75 1135553 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 190073490 190073745 190073639 Y NA NA COL5A2,WDR75 IMR90 Hi-C 24141950 WDR75 230414 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 190739727 190739922 190739832 Y NA NA NA NA NA NA PMS1 92620 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 190741113 190741271 190741187 Y NA NA NA NA NA NA PMS1 94006 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 191075616 191075973 191075872 Y NA NA NA NA NA NA INPP1 130223 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 191540578 191540944 191540683 Y NA NAB1 NA NA NA NA NAB1 31106 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 191815156 191815612 191815322 Y GLS AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 40681 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 191826753 191827142 191827070 Y NA AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 29151 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 192544982 192545232 192545125 Y OBFC2A NA NA NA NA NA MYO1B 437071 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 196547563 196547821 196547646 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A10 108862 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 197047464 197047675 197047511 Y STK17B STK17B NA NA NA NA STK17B 8237 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 197097649 197097961 197097892 Y NA NA NA NA NA NA STK17B 58422 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 197098625 197098768 197098634 Y STK17B NA NA NA NA NA STK17B 59398 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 197099483 197099689 197099603 Y STK17B NA NA NA NA NA STK17B 60256 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 197104380 197104716 197104446 Y STK17B NA NA NA NA NA STK17B 65153 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 197264939 197265165 197265058 Y STK17B NA NA NA NA NA STK17B 225712 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 197529863 197529926 197529879 Y NA CCDC150 NA NA NA NA CCDC150 27585 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 197962665 197962866 197962743 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G2P3 162969 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 197974548 197974560 197974555 Y ANKRD44 NA NA NA NA NA ATP5G2P3 151275 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 197986813 197986938 197986876 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G2P3 138897 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 198986639 198986799 198986719 Y PLCL1 NA NA NA NA NA MARS2 418552 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 200468498 200468920 200468798 Y NA NA NA NA NA NA SATB2 134509 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 200800298 200800427 200800328 Y SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69 AC073043.1,C2orf69,C2orf47,TYW5 NA NA NA NA C2orf47 17613 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 200920785 200921432 200920926 Y NA NA SPATS2L,KCTD18 IMR90 Hi-C 24141950 TYW5 102326 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 201403171 201403461 201403317 Y NA SGOL2,KCTD18 NA NA NA NA KCTD18 20664 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 201411222 201411458 201411252 Y PPIL3,NIF3L1,NIF3L1,SGOL2 SGOL2,KCTD18 NA NA NA NA KCTD18 28715 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr2 201794314 201794594 201794537 Y BZW1,BZW1,BZW1,CASP10,CLK1,CLK1 PPIL3,NIF3L1,AC005037.3,ORC2 NA NA NA NA AC005037.3 31392 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 201829288 201829721 201829590 Y KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2 AC005037.3,ORC2 NA NA NA NA ORC2 2885 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 201830040 201830326 201830203 Y KCTD18,FAM126B,CASP8,CLK1,CLK1 AC005037.3,ORC2 NA NA NA NA ORC2 3637 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 202078581 202078959 202078777 Y CASP10 CASP10,CASP8 NA NA NA NA CASP8 17207 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 202079360 202079680 202079556 Y CLK1,CLK1,CFLAR,CASP10 CASP10,CASP8 NA NA NA NA CASP8 16486 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 202296875 202297065 202296939 Y ALS2 STRADB,TRAK2 NA NA NA NA TRAK2 17237 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 202898182 202898685 202898353 Y TMEM237,FZD7 NA NA NA NA NA PSMA2P3 143335 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 203159775 203160145 203159798 Y NA NOP58 NA NA NA NA NOP58 31336 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 203503987 203504299 203504102 Y NOP58,ALS2CR8,ALS2CR8,FAM117B FAM117B NA NA NA NA FAM117B 6086 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 203815351 203815558 203815462 Y NA NA NA NA NA NA WDR12 61963 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 206571507 206572136 206571741 Y NRP2,INO80D NRP2 NA NA NA NA NRP2 26793 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 206944485 206944991 206944704 Y NA AC007383.3,INO80D NA NA NA NA AC007383.3 2338 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 206948392 206948813 206948647 Y NA AC007383.3,INO80D NA NA NA NA INO80D 214 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr2 208007936 208008436 208008192 Y METTL21A,METTL21A,KLF7,CREB1 KLF7 NA NA NA NA KLF7 21555 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 208395422 208395980 208395659 Y PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1 CREB1,AC007879.5 NA NA NA NA AC007879.5 2903 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr2 208622865 208623146 208623006 Y NA CCNYL1,FZD5 NA NA NA NA FZD5 9141 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 208839036 208839224 208839180 Y CREB1,FZD5,PIKFYVE,PLEKHM3 PLEKHM3 NA NA NA NA PLEKHM3 49060 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 210547424 210547820 210547680 Y MAP2,MAP2,UNC80 NA NA NA NA NA MAP2 260642 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 210872654 210873081 210872784 Y C2orf67 RPE NA NA NA NA RPE 7365 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 211404935 211405006 211404955 Y CPS1 NA NA NA NA NA LANCL1 64559 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 213842063 213842076 213842069 Y IKZF2,IKZF2 AC079610.1 NA NA NA NA AC079610.1 42193 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 214094712 214094811 214094765 Y LOC100130451 NA NA NA NA NA SPAG16 52302 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 215735917 215736192 215736055 Y NA NA NA NA NA NA BARD1 63489 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 216224117 216224404 216224261 Y NA ATIC NA NA NA NA ATIC 49577 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 216867934 216868318 216868147 Y TMEM169 MREG NA NA NA NA MREG 28501 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 217312390 217312696 217312543 Y NA SMARCAL1,RPL37A,AC098820.3 NA NA NA NA SMARCAL1 37253 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 217487227 217487455 217487235 Y NA PSMB3P2,IGFBP2 DIRC3,IGFBP2,XRCC5,RPL37A,IGFBP5,RUFY4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IGFBP2 8096 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr2 217556283 217557311 217557110 Y NA NA NA NA NA NA IGFBP2 60732 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 222305020 222305156 222305087 Y NA NA NA NA NA NA EPHA4 131766 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 222376122 222376296 222376209 Y NA NA NA NA NA NA EPHA4 60626 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 222382501 222382744 222382664 Y EPHA4 NA NA NA NA NA EPHA4 54178 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 222826690 222827411 222827014 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 EPHA4 389768 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 223229015 223229587 223229151 Y SGPP2 NA NA NA NA NA FARSB 289469 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 223429708 223429962 223429836 Y FARSB NA NA NA NA NA FARSB 89094 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 223439256 223439394 223439332 Y NA NA NA NA NA NA FARSB 79662 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 225621293 225621621 225621457 Y NA NA NA NA NA NA CUL3 173183 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 226986846 226987128 226987011 Y NA NA IRS1,LOC646736 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRS1 675347 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 227110529 227110615 227110572 Y NA NA IRS1,RHBDD1 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 551860 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 227656309 227656561 227656437 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 5914 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr2 227822351 227822632 227822559 Y NA NA NA NA NA NA RHBDD1 124054 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 231227266 231227536 231227388 Y NA SP140L NA NA NA NA SP140L 37367 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 231276384 231276790 231276706 Y NA SP100 NA NA NA NA SP100 1867 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr2 231322204 231322520 231322312 Y SP110,SP110,SP140,SP140L,CAB39,CAB39,SP100,SP100 SP100 NA NA NA NA SP100 43547 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 231901045 231901225 231901135 Y NA PSMD1 NA NA NA NA PSMD1 18353 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 232256793 232257091 232256822 Y PTMA,NMUR1,B3GNT7 AC017104.6 NA NA NA NA AC017104.6 5106 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr2 232277113 232277443 232277206 Y C2orf72 AC017104.6,SNORD82 NA NA NA NA AC017104.6 25426 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 232468888 232470128 232469532 Y DIS3L2,PTMA,NMUR1 NA NA NA NA NA LINC00471 91838 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr2 232470282 232470477 232470427 Y NA NA NA NA NA NA LINC00471 93232 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 232478392 232478857 232478528 Y DIS3L2,PTMA NA NA NA NA NA PTMA 90748 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr2 232478879 232479328 232479053 Y NA NA NA NA NA NA PTMA 90277 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr2 232479434 232479727 232479552 Y NA NA NA NA NA NA PTMA 89878 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 232507409 232507767 232507481 Y NA NA PDE6D IMR90 Hi-C 24141950 PTMA 61838 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 232526700 232527324 232527119 Y DIS3L2 PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 42281 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr2 232530920 232531416 232531295 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 38189 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 232536483 232536778 232536606 Y DIS3L2,PTMA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 32827 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr2 232537231 232537488 232537452 Y DIS3L2,PTMA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 32117 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr2 232537656 232538064 232537748 Y NA PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 31541 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr2 232545684 232546083 232545868 Y COPS7B PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 23522 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 232547138 232547293 232547212 Y PTMA PTMA PTMA,PDE6D K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTMA 22312 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr2 232548018 232548333 232548221 Y NPPC PTMA PTMA,PDE6D K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTMA 21272 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 232549031 232549446 232549147 Y NA PTMA PTMA,PDE6D K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTMA 20159 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr2 232551717 232552221 232552147 Y NPPC PTMA PTMA,PDE6D K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTMA 17384 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr2 232580827 232581056 232580891 Y NA PTMA NA NA NA NA PTMA 11222 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 232582048 232582308 232582138 Y NCL,PTMA PTMA NA NA NA NA PTMA 12443 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr2 233876295 233876308 233876302 Y NEU2,NGEF INPP5D NA NA NA NA INPP5D 46369 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 236299191 236299376 236299366 Y NA NA AGAP1 IMR90 Hi-C 24141950 AGAP1 101357 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 236489079 236489125 236489102 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 88346 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 236547901 236548387 236548201 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 147168 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 236562836 236563015 236562857 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 162103 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr2 237482983 237483115 237483021 Y NA NA NA NA NA NA COPS8 508840 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 238383141 238383356 238383272 Y NA NA LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRRFIP1 150863 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr2 238508822 238509122 238509050 Y RAB17,LRRFIP1 LRRFIP1 NA NA NA NA LRRFIP1 25097 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr2 238512238 238512938 238512467 Y LRRFIP1 LRRFIP1 LRRFIP1,MLPH,PRLH,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 LRRFIP1 21281 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.54589630515498 chr2 238582267 238582825 238582560 Y LRRFIP1 LRRFIP1 NA NA NA NA LRRFIP1 48048 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 238583352 238583931 238583637 Y UBE2F,LRRFIP1 LRRFIP1 NA NA NA NA LRRFIP1 49133 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr2 238596328 238596696 238596497 Y LRRFIP1 NA NA NA NA NA LRRFIP1 62109 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 238700596 238700726 238700660 Y NA NA NA NA NA NA LRRFIP1 166377 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 238832423 238832667 238832502 Y NA UBE2F NA NA NA NA UBE2F 40802 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 240145548 240145836 240145702 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 175294 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 240884529 240884700 240884591 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA10 78119 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr2 242267084 242267405 242267274 Y MTERFD2 SEPT2,HDLBP,FARP2 NA NA NA NA HDLBP 12608 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr2 242365047 242365293 242365170 Y NA NA NA NA NA NA FARP2 71389 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 268547 268840 268655 Y NA C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12 NA NA NA NA C20orf96 550 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 321375 321752 321587 Y NA ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3 NA NA NA NA NRSN2 3674 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 447394 447636 447634 Y NA TBC1D20 NA NA NA NA TBC1D20 6197 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 483361 483443 483402 Y NA TBC1D20,CSNK2A1 NA NA NA NA CSNK2A1 39022 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 1119535 1119804 1119673 Y NA PSMF1,TMEM74B NA NA NA NA PSMF1 27629 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 1757792 1758093 1758078 Y NA NA NA NA NA NA NSFL1C 305305 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 2450025 2450398 2450237 Y NA SNORD119,SNRPB NA NA NA NA SNRPB 526 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 2771027 2771047 2771039 Y NA CPXM1,VPS16 NA NA NA NA CPXM1 8236 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr20 2780319 2780470 2780455 Y NA CPXM1,VPS16 NA NA NA NA CPXM1 1036 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr20 3286864 3286977 3286928 Y NA NA NA NA NA NA SLC4A11 69028 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 3932717 3933076 3932937 Y NA NA MIR103B2,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF24 61153 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 4018656 4019040 4018859 Y PANK2,PANK2,PANK2,RNF24,RNF24 RNF24,FTLP3 RNF24,CENPB,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 FTLP3 16104 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 4063526 4063882 4063813 Y NA SMOX RNF24,PANK2,MAVS IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMOX 35745 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr20 4794672 4795153 4795057 Y SLC23A2,CDS2,RASSF2,RASSF2 RASSF2 NA NA NA NA RASSF2 7138 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 5512444 5512652 5512587 Y CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1 NA NA NA NA NA GPCPD1 77020 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 5553446 5553705 5553635 Y NA GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 35967 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 5589880 5590681 5590650 Y CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 208 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 7905442 7905630 7905536 Y HAO1 NA NA NA NA NA RP5-971N18.3 92240 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 8380615 8380981 8380808 Y PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 269791 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr20 10090179 10090302 10090295 Y PAK7 NA NA NA NA NA MKKS 322568 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 10466571 10466854 10466711 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 53701 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 10477280 10477577 10477381 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 64410 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 10486121 10486184 10486148 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 73251 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 10735371 10735385 10735378 Y NA NA NA NA NA NA JAG1 110357 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 13142278 13142281 13142280 Y NA NA NA NA NA NA ISM1 58137 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 15889669 15890127 15890029 Y NA NA NA NA NA NA KIF16B 661951 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 16562251 16562551 16562401 Y NA KIF16B KIF16B K562 ChIA-PET 22265404 KIF16B 10173 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 17637776 17637930 17637851 Y BANF2 RRBP1 NA NA NA NA RRBP1 23010 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 17946136 17946538 17946496 Y SNX5,SNX5 SNORD17,SNX5,PTMAP3 NA NA NA NA SNX5 1085 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 18881983 18882215 18882099 Y NA NA LOC100128496,DTD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00493 335919 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 19716018 19716528 19716293 Y NA RP1-122P22.2 NA NA NA NA RP1-122P22.2 19824 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr20 19731566 19731887 19731646 Y NA RP1-122P22.2 SLC24A3,RIN2,C20orf26,CRNKL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP1-122P22.2 4465 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 19837391 19837690 19837414 Y NA NA RIN2 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-122P22.2 101039 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 20009163 20009558 20009361 Y NA NAA20,CRNKL1 NA NA NA NA NAA20 13403 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 20393384 20393773 20393731 Y INSM1 NA NA NA NA NA RALGAPA2 297358 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 20724152 20724406 20724200 Y RALGAPA2 RALGAPA2 RALGAPA2 IMR90 Hi-C 24141950 RALGAPA2 33021 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr20 21155323 21155529 21155428 Y NA NA NA NA NA NA PLK1S1 50699 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 22555806 22556424 22556290 Y NA NA NA NA NA NA NXT1 772949 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 22744166 22744500 22744407 Y THBD NA THBD,NXT1,NAPB IMR90 Hi-C 24141950 NXT1 584873 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 23437165 23437374 23437259 Y NXT1 NAPB NA NA NA NA NAPB 37040 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 24129031 24129453 24129271 Y NA NA NA NA NA NA CST5 270644 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 24947572 24947946 24947787 Y NA CST7 NA NA NA NA CST7 19706 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 25227226 25227454 25227251 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 521 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 25227906 25228088 25227908 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 1201 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 25671297 25671837 25671511 Y NA ZNF337 NA NA NA NA ZNF337 3640 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 25842208 25842444 25842317 Y ZNF337 NA NA NA NA NA ZNF337 166731 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 30249247 30249862 30249570 Y TTLL9 NA NA NA NA NA ID1 58161 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 30262675 30263005 30262853 Y HCK,BCL2L1 BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 46787 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr20 30263216 30263335 30263276 Y NA BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 46457 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 31560072 31560429 31560192 Y CDK5RAP1 NA NA NA NA NA MAPRE1 154373 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr20 32803456 32803920 32803688 Y NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 93688 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 32989671 32989803 32989744 Y NA ITCH NA NA NA NA ITCH 40630 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr20 33064297 33064587 33064427 Y ACSS2 FDX1P1,DYNLRB1 NA NA NA NA FDX1P1 2018 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr20 33653192 33653349 33653271 Y NA TRPC4AP NA NA NA NA TRPC4AP 25325 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 33906285 33906606 33906471 Y GSS,EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 35497 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 34566043 34566286 34566130 Y RBM39 SCAND1 NA NA NA NA SCAND1 20649 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 35464098 35464342 35464182 Y RBL1,DSN1,DSN1 NA NA NA NA NA DSN1 63877 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.40536027741361 chr20 35616902 35617278 35617001 Y GHRH,RBL1,SLA2,SAMHD1 SAMHD1 NA NA NA NA SAMHD1 38656 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr20 35633884 35634240 35634054 Y NA NA NA NA NA NA SAMHD1 55638 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 35723463 35723698 35723601 Y NA RBL1 NA NA NA NA RBL1 1275 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 35821029 35821195 35821110 Y NA RPN2 GHRH IMR90 Hi-C 24141950 RPN2 16216 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 36135409 36135682 36135567 Y NA BLCAP NA NA NA NA BLCAP 18651 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 37302978 37303466 37303191 Y ACTR5,SLC32A1 NA ARHGAP40,ACTR5,SLC32A1,PPP1R16B IMR90 Hi-C 24141950 ACTR5 71619 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 37398577 37398739 37398665 Y NA ACTR5,PPP1R16B NA NA NA NA ACTR5 23492 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 37435852 37436332 37436112 Y RALGAPB,DHX35,ACTR5,PPP1R16B PPP1R16B NA NA NA NA PPP1R16B 3504 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr20 37504064 37504454 37504244 Y RALGAPB,ACTR5,PPP1R16B,DHX35 FAM83D NA NA NA NA FAM83D 48501 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr20 37678805 37678873 37678867 Y SLC32A1,PPP1R16B NA NA NA NA NA DHX35 89863 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr20 38844790 38845079 38844935 Y NA NA NA NA NA NA MAFB 470801 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 39620099 39620424 39620302 Y MAFB,TOP1 TOP1 TOP1,PLCG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOP1 35034 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr20 39787054 39787387 39787188 Y NA PLCG1 NA NA NA NA PLCG1 23454 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 40193452 40193754 40193691 Y NA NA NA NA NA NA CHD6 51379 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 40321359 40321668 40321514 Y NA NA CHD6 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD6 76226 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr20 41800157 41800257 41800214 Y NA NA NA NA NA NA SRSF6 284311 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 42096541 42096705 42096586 Y NA SRSF6,L3MBTL1 NA NA NA NA SRSF6 11973 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 42286061 42286420 42286177 Y SRSF6,L3MBTL1,MYBL2 RPL27AP,MYBL2 MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL27AP 6898 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr20 43214306 43214431 43214386 Y C20orf111 NA NA NA NA NA PKIG 55880 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr20 43238683 43239068 43238831 Y NA ADA NA NA NA NA ADA 39806 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr20 43239191 43239604 43239345 Y C20orf111,STK4,ADA ADA NA NA NA NA ADA 39270 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 43273413 43273648 43273594 Y C20orf111,STK4 ADA,RP11-445H22.3 NA NA NA NA ADA 5226 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 43582253 43582415 43582335 Y NA PABPC1L,TOMM34,STK4 NA NA NA NA TOMM34 4712 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 43689990 43690348 43690045 Y NA NA NA NA NA NA STK4 96875 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 43767332 43767709 43767669 Y NA NA STK4,MATN4,RBPJL IMR90 Hi-C 24141950 STK4 174217 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 43816698 43816928 43816817 Y NA NA NA NA NA NA SYS1 171649 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 44001576 44001658 44001579 Y WFDC11,KCNS1,TP53TG5,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2 SYS1,SYS1-DBNDD2,PIGT NA NA NA NA SYS1-DBNDD2 11736 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 44056635 44056652 44056644 Y NA PIGT NA NA NA NA PIGT 13918 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 45870109 45870518 45870490 Y ZMYND8,NCOA3 NA NA NA NA NA ZMYND8 113049 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 46057073 46057256 46057165 Y NA NA NCOA3,EYA2,ZMYND8 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA3 71345 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 46097168 46097722 46097476 Y NA NCOA3 NCOA3,ZMYND8,EYA2 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA3 30879 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 46316176 46316372 46316269 Y NA NA NA NA NA NA NCOA3 187575 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 46356086 46356757 46356412 Y SULF2,SULF2 NA NA NA NA NA NCOA3 227485 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr20 46618615 46619022 46618889 Y NA NA SULF2,CMTM7,BCAS1 MCF7 ChIA-PET 22265404,19890323 LINC00494 367671 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 47337131 47337315 47337224 Y NA NA NA NA NA NA PREX1 105105 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 47339273 47339687 47339536 Y PREX1 NA NA NA NA NA PREX1 102733 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr20 47355645 47355720 47355673 Y NA NA NA NA NA NA PREX1 86700 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 47398613 47398905 47398757 Y ZNFX1,PREX1 PREX1 NA NA NA NA PREX1 43515 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 47443501 47443751 47443699 Y NA PREX1 NA NA NA NA PREX1 1081 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 47750965 47751079 47750977 Y ZNFX1 NA NA NA NA NA STAU1 51825 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 48236919 48237304 48237112 Y SPATA2 NA NA NA NA NA B4GALT5 91111 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 48293445 48293839 48293746 Y NA B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 34576 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 48327368 48328064 48327696 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 351 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 48615959 48616196 48616096 Y B4GALT5,SLC9A8,TMEM189,CEBPB,RNF114,SNAI1 SNAI1 NA NA NA NA SNAI1 18423 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 48726581 48727101 48726820 Y SPATA2,SPATA2 UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189 NA NA NA NA UBE2V1 3395 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr20 49100027 49100544 49100221 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 24347 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr20 49432002 49432389 49432365 Y NA BCAS4 NA NA NA NA BCAS4 22571 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr20 49574418 49574471 49574465 Y PTPN1,ADNP ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA MOCS3 1055 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 52239995 52240318 52240062 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BMP7,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 15549 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr20 52323078 52323315 52323172 Y NA NA SUMO1P1,ZNF217 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 98632 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 52346173 52346470 52346387 Y NA NA ZNF217 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 121727 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 2.24857644386178 chr20 52356771 52357178 52357063 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 132325 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr20 52367753 52368082 52368002 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 143307 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr20 52371075 52371265 52371223 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 146629 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 52392953 52393088 52393021 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 168507 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 52407558 52407732 52407573 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 183112 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 52456095 52456522 52456189 Y NA NA ZNF217,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 231649 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr20 52458727 52459116 52459036 Y NA NA ZNF217,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 234281 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 52481702 52482101 52481977 Y NA NA NA NA NA NA ZNF217 257256 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 52483715 52484176 52483911 Y NA NA NA NA NA NA ZNF217 259269 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr20 52489475 52489586 52489523 Y NA NA NA NA NA NA ZNF217 265029 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr20 52530834 52531236 52530898 Y ZNF217 NA SUMO1P1,BMP7,ZNF217 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFDN4 291150 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 52543055 52543571 52543250 Y ZNF217 NA NA NA NA NA PFDN4 278815 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr20 52550838 52551665 52551067 Y ZNF217 NA NA NA NA NA PFDN4 270721 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 53116440 53116542 53116504 Y DOK5 NA NA NA NA NA PFDN4 294054 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 53262462 53262813 53262618 Y DOK5 NA NA NA NA NA RPL12P4 426342 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 55964119 55964506 55964297 Y ZBP1,MTRNR2L3,RBM38 RAE1,MTRNR2L3,RP4-800J21.3 NA NA NA NA RBM38 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr20 55965649 55965902 55965759 Y NA RAE1,MTRNR2L3,RBM38,RP4-800J21.3 NA NA NA NA RP4-800J21.3 216 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 55976268 55976716 55976350 Y RBM38,ZBP1,PMEPA1 MTRNR2L3,RBM38,RP4-800J21.3 NA NA NA NA RP4-800J21.3 10150 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr20 56008066 56008273 56008156 Y ZBP1 RBM38,RP4-800J21.3 NA NA NA NA RP4-800J21.3 41948 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 56027077 56027304 56027131 Y NA HMGB1P1 MIR5095 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HMGB1P1 34779 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 56203164 56203608 56203205 Y RBM38,ZBP1 NA NA NA NA NA PMEPA1 80984 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr20 56255217 56255759 56255498 Y ZBP1,PMEPA1 PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 28833 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.54589630515498 chr20 57117234 57117634 57117435 Y NA NA NA NA NA NA STX16 106694 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 57236406 57236742 57236622 Y RAB22A,STX16 STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1 NA NA NA NA STX16-NPEPL1 11916 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 57694611 57694956 57694784 Y NA NA NA NA NA NA SLMO2 78647 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr20 57697718 57697916 57697753 Y STX16,ZNF831 NA GNAS,GNAS-AS1,ZNF831 IMR90 Hi-C 24141950 SLMO2 81754 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 57698182 57698583 57698410 Y STX16,ZNF831 NA GNAS,GNAS-AS1,ZNF831 IMR90 Hi-C 24141950 SLMO2 82218 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 5.62144110965446 chr20 57699228 57699623 57699600 Y ZNF831 NA GNAS,GNAS-AS1,ZNF831 IMR90 Hi-C 24141950 SLMO2 83264 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr20 57735475 57736078 57735576 Y TUBB1,ZNF831 NA NA NA NA NA SLMO2 119511 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr20 57738628 57739096 57738774 Y ZNF831 NA NA NA NA NA SLMO2 122664 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 58044917 58045137 58045090 Y NA NA EDN3 IMR90 Hi-C 24141950 SLMO2 428953 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.40536027741361 chr20 58045316 58045704 58045415 Y NA NA EDN3 IMR90 Hi-C 24141950 SLMO2 429352 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 5.62144110965446 chr20 58225793 58225841 58225817 Y ZNF831,PHACTR3,PHACTR3,CDH26,PHACTR3 NA NA NA NA NA PPP1R3D 287511 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 58451421 58451787 58451564 Y SYCP2,PPP1R3D,C20orf177,C20orf177 NA NA NA NA NA PPP1R3D 61565 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 58632319 58632618 58632585 Y SYCP2,PPP1R3D,C20orf177,C20orf197 C20orf197 NA NA NA NA C20orf197 3339 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 60247024 60247153 60247088 Y CDH4,SS18L1 NA NA NA NA NA RP11-429E11.2 80959 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 60328357 60328661 60328509 Y NA RP11-429E11.2 NA NA NA NA RP11-429E11.2 245 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr20 60719468 60719634 60719593 Y SS18L1,GTPBP5 LSM14B,PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 2646 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 60758632 60758689 60758683 Y GATA5,CABLES2 PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 41810 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr20 60874912 60875240 60875071 Y NA NA NA NA NA NA ADRM1 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 60914790 60915105 60914838 Y NA ADRM1,LAMA5,RPS21 NA NA NA NA LAMA5 25263 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 60935306 60935741 60935523 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 ADRM1 K562 ChIA-PET 22265404 LAMA5 4627 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 61192605 61193059 61192901 Y NA NA NA NA NA NA SLCO4A1 78738 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 61553883 61554120 61553955 Y DIDO1 DIDO1,SLC17A9 NA NA NA NA DIDO1 13184 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr20 62709200 62709458 62709264 Y GMEB2,ZGPAT,LIME1,PCMTD2,RGS19,RGS19,OPRL1 ZNF512B,TCEA2 NA NA NA NA RGS19 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr20 62887659 62888425 62887862 Y SAMD10,PCMTD2 PCMTD2 NA NA NA NA PCMTD2 2565 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 10852099 10852403 10852350 Y NA NA NA NA NA NA MIR3648 1028267 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 16064365 16064765 16064448 Y HSPA13,SAMSN1,NRIP1 NA NA NA NA NA SAMSN1 110642 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 16368229 16368687 16368553 Y NRIP1 NA NA NA NA NA NRIP1 66634 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 16886196 16886753 16886663 Y NA NA NA NA NA NA USP25 213591 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chr21 17103695 17103792 17103750 Y USP25 USP25 NA NA NA NA USP25 3351 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 17153700 17154031 17153865 Y NA NA NA NA NA NA USP25 53356 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 17568022 17568137 17568068 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 86952 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr21 17672058 17672352 17672205 Y NA SNORD74 NA NA NA NA SNORD74 16969 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 17678130 17678559 17678221 Y NA SNORD74 NA NA NA NA SNORD74 23041 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 17906909 17907886 17907248 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 251820 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 18891260 18891546 18891459 Y NA NA NA NA NA NA BTG3 91719 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 22545026 22545343 22545185 Y NA NA NA NA NA NA TUBAP 2234105 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 26800874 26801226 26801090 Y NA NA NA NA NA NA MRPL39 176603 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 27275894 27276232 27276045 Y NA NA NA NA NA NA ATP5J 169910 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 27335144 27335525 27335335 Y APP NA NA NA NA NA APP 205921 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 27867729 27867957 27867835 Y NA NA NA NA NA NA APP 326283 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 3.93500877675812 chr21 30579515 30579904 30579685 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,BACH1 NA NA NA NA BACH1 15123 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 32878321 32878337 32878329 Y TIAM1,SOD1 NA NA NA NA NA AP000251.3 51221 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 34451403 34451550 34451500 Y SON,IL10RB,IFNGR2,IFNAR1,GART,GART,SYNJ1,SYNJ1,IFNAR2,OLIG2,OLIG1 NA NA NA NA NA IFNAR2 148656 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 34587985 34588369 34588051 Y NA IFNAR2,IL10RB IFNAR2,TMEM50B,IFNGR2 IMR90 Hi-C 24141950 IFNAR2 11837 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 34671462 34671931 34671597 Y OLIG2,OLIG1,IFNAR2,SON,IFNGR2,GART,GART,IL10RB,IFNAR1 IL10RB,IFNAR1 NA NA NA NA IFNAR1 22803 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 34718616 34718973 34718794 Y OLIG2,OLIG1 IFNAR1 NA NA NA NA IFNAR1 23882 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr21 34736733 34736848 34736790 Y OLIG1,IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2 IFNAR1,IFNGR2 NA NA NA NA IFNGR2 36354 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 34836293 34836479 34836379 Y OLIG2,OLIG1,CRYZL1,TMEM50B TMEM50B,DNAJC28 NA NA NA NA TMEM50B 13839 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 35310348 35310699 35310436 Y GART,GART,SON LINC00649,ATP5O NA NA NA NA ATP5O 24064 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 35366297 35366465 35366369 Y NA NA LOC100506334,MRPS6 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS6 77059 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 36143971 36144119 36144107 Y NA NA NA NA NA NA SLC5A3 700101 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 36167928 36168243 36168166 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA SLC5A3 724058 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 36179679 36180279 36179996 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA SLC5A3 735809 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 36233216 36233747 36233583 Y NA NA NA NA NA NA SLC5A3 789346 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 36281882 36282257 36282001 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA SLC5A3 838012 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 36297204 36297617 36297417 Y KCNE1,RCAN1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA SLC5A3 853334 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 36336896 36337096 36337005 Y NA NA NA NA NA NA SLC5A3 893026 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 36339843 36340239 36340159 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA SLC5A3 895973 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 36349860 36350141 36349984 Y NA NA NA NA NA NA SLC5A3 905990 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 36355491 36355634 36355586 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA SLC5A3 911621 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 36392735 36393025 36392943 Y RUNX1 NA NA NA NA NA SLC5A3 948865 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 36423642 36423856 36423739 Y RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RUNX1 951109 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 36577614 36577815 36577724 Y NA NA RUNX1,SETD4,CLIC6,LOC100506385 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RUNX1 797150 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 37222964 37223324 37223144 Y NA NA RUNX1,LOC100506385,LINC00160,CLIC6 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1 151641 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 37529889 37530052 37529971 Y DOPEY2 CBR3,DOPEY2 NA NA NA NA DOPEY2 2809 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr21 37712607 37712952 37712729 Y NA MORC3,CHAF1B NA NA NA NA MORC3 22120 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr21 38434187 38434580 38434547 Y NA PIGP,TTC3 NA NA NA NA PIGP 8890 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 38590434 38590491 38590485 Y NA AP001432.14,DSCR3 NA NA NA NA AP001432.14 1229 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 38630405 38630786 38630710 Y DYRK1A,DYRK1A AP001432.14,DSCR3 NA NA NA NA DSCR3 7476 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr21 38801876 38802213 38802018 Y DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A NA NA NA NA NA DYRK1A 65784 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 38935728 38936411 38936235 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 199636 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.54589630515498 chr21 39568176 39568479 39568328 Y NA NA KCNJ6 IMR90 Hi-C 24141950 ERG 463225 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 39845079 39845092 39845088 Y NA NA NA NA NA NA ERG 186612 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr21 39848171 39848499 39848471 Y ERG NA NA NA NA NA ERG 183205 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr21 39849020 39849402 39849146 Y ETS2 NA NA NA NA NA ERG 182302 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 39851933 39852258 39852096 Y ETS2 NA NA NA NA NA ERG 179446 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 39863643 39864017 39863843 Y ERG NA NA NA NA NA ERG 167687 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 39866663 39867062 39866792 Y NA NA NA NA NA NA ERG 164642 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 39867622 39867911 39867841 Y ERG NA NA NA NA NA ERG 163793 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.54589630515498 chr21 40011652 40011749 40011697 Y NA ERG NA NA NA NA ERG 19955 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 40182920 40183779 40183392 Y ETS2 ETS2 NA NA NA NA ETS2 7689 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 40277371 40277733 40277541 Y NA NA ETS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ETS2 102140 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 40357017 40357242 40357141 Y ETS2 NA ETS2,WRB,LINC00114 IMR90,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 ETS2 181786 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 40357559 40358114 40357780 Y ETS2 NA ETS2,WRB,LINC00114 IMR90,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 ETS2 182328 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr21 40361689 40362112 40361935 Y NA NA ETS2,WRB,LINC00114 IMR90,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 ETS2 186458 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr21 40376938 40377126 40376993 Y NA NA ETS2,LINC00114 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 176651 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr21 40389005 40389356 40389205 Y NA NA ETS2,LINC00114 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 164421 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr21 40690087 40690386 40690238 Y NA BRWD1,HMGN1 NA NA NA NA BRWD1 1099 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 41729839 41730224 41730032 Y NA NA NA NA NA NA BACE2 807504 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 42122707 42122949 42122828 Y DSCAM NA NA NA NA NA BACE2 414779 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 42693256 42693286 42693271 Y NA MX2 NA NA NA NA MX2 38584 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 43214290 43214658 43214474 Y NA NA NA NA NA NA PRDM15 82933 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr21 43431472 43431831 43431677 Y NA UMODL1 NA NA NA NA UMODL1 49237 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 43615416 43615758 43615654 Y ZNF295,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1 ABCG1 ABCG1 K562 ChIA-PET 22265404 ABCG1 2041 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 43653155 43654253 43653819 Y NA ABCG1 TFF3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCG1 35356 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr21 43654635 43655282 43654967 Y NA ABCG1 TFF3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCG1 36836 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr21 43944597 43944892 43944856 Y NA SLC37A1,RSPH1 NA NA NA NA RSPH1 30133 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr21 44166782 44167013 44166806 Y UBASH3A,PKNOX1 NA NA NA NA NA WDR4 130665 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr21 44395482 44395891 44395810 Y NA PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 2862 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 44395922 44396228 44396080 Y WDR4,U2AF1,CBS PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 3302 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr21 44425410 44425661 44425536 Y NA PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 32790 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr21 44831891 44832268 44832005 Y SIK1 SIK1 NA NA NA NA SIK1 12740 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 44876530 44876883 44876692 Y NA SIK1 NA NA NA NA SIK1 31522 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 45065485 45065706 45065596 Y NA HSF2BP,RRP1B NA NA NA NA HSF2BP 11668 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 45080522 45080871 45080626 Y TRAPPC10,PWP2,SIK1,RRP1B HSF2BP,RRP1B NA NA NA NA RRP1B 3093 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 45235037 45235392 45235184 Y NA CSTB,RRP1,AGPAT3 NA NA NA NA RRP1 27643 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 45566076 45566451 45566257 Y TRAPPC10,ICOSLG,C21orf2 PWP2,C21orf33 NA NA NA NA C21orf33 14589 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 45592447 45593398 45592771 Y PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG C21orf33 PWP2,ICOSLG IMR90 Hi-C 24141950 C21orf33 40960 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 45601467 45601803 45601706 Y PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG C21orf33 ICOSLG,PWP2,DNMT3L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C21orf33 49980 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 45616099 45616530 45616288 Y PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG ICOSLG AIRE,PFKL,C21orf33,PWP2,ICOSLG MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ICOSLG 42319 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr21 45661962 45662435 45662161 Y TRAPPC10,PWP2,C21orf2,ICOSLG ICOSLG NA NA NA NA ICOSLG 3113 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr21 45663780 45664167 45664129 Y TRAPPC10,PWP2,C21orf2,ICOSLG ICOSLG NA NA NA NA ICOSLG 4931 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 46097395 46097576 46097539 Y KRTAP10-7,KRTAP10-12 NA NA NA NA NA UBE2G2 122358 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr21 47554885 47555152 47555043 Y FTCD NA NA NA NA NA LSS 91586 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 17091097 17091180 17091141 Y IL17RA NA NA NA NA NA IL17RA 472664 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr22 17305568 17305779 17305755 Y NA NA NA NA NA NA IL17RA 258065 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr22 17652206 17652871 17652785 Y NA CECR5-AS1,CECR5,AC005300.5,CECR1 NA NA NA NA CECR5 8029 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 18264435 18264847 18264620 Y CECR2,ATP6V1E1,BCL2L13,USP18,BID,BID BID,LINC00528 NA NA NA NA LINC00528 6347 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 3.6539367212754 chr22 19337870 19338225 19337898 Y NA NA NA NA NA NA CLTCL1 60631 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 19400101 19400223 19400162 Y NA MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39 NA NA NA NA MRPL40 17202 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 19410653 19410889 19410838 Y HIRA MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39 NA NA NA NA MRPL40 6536 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 19427862 19428165 19428014 Y NA MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39,UFD1L,CDC45 NA NA NA NA HIRA 5059 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr22 19874514 19874924 19874610 Y TRMT2A,C22orf29,GNB1L C22orf29,GNB1L GNB1L MCF7 ChIA-PET 22265404 GNB1L 34052 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 19930770 19931097 19930953 Y ZDHHC8,COMT COMT,TXNRD2 NA NA NA NA TXNRD2 3429 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 20232624 20232972 20232704 Y TRMT2A RTN4R NA NA NA NA RTN4R 35797 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr22 20287043 20287283 20287165 Y NA RTN4R,DGCR6L NA NA NA NA RTN4R 18274 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr22 20850844 20851071 20850923 Y PI4KA,AIFM3,AIFM3 KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 2644 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 22011632 22012115 22011859 Y NA YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 7073 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chr22 22170870 22171333 22171102 Y HIC2,PPM1F,MAPK1 MAPK1 NA NA NA NA MAPK1 48637 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 4.77822494320629 chr22 22204010 22204393 22204300 Y NA MAPK1 NA NA NA NA MAPK1 15577 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 22219429 22219677 22219523 Y HIC2,MAPK1 MAPK1 NA NA NA NA MAPK1 293 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 22603390 22603658 22603457 Y TOP3B,VPREB1 VPREB1 NA NA NA NA VPREB1 6303 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.40536027741361 chr22 23273991 23274497 23274122 Y IGLL5 NA MIR650,IGLL5,GNAZ,RTDR1 IMR90 Hi-C 24141950 IGLV4-3 62305 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr22 23277682 23278181 23277858 Y NA NA MIR650,IGLL5,GNAZ,RTDR1 IMR90 Hi-C 24141950 IGLV4-3 65996 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 23285622 23285920 23285770 Y IGLL5 NA RTDR1,GNAZ,IGLL5,BCR IMR90 Hi-C 24141950 IGLV4-3 73936 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr22 23624437 23624690 23624563 Y BCR NA NA NA NA NA BCR 104546 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 23863943 23864332 23864232 Y GNAZ,RTDR1,BCR NA ZDHHC8P1 IMR90 Hi-C 24141950 IGLL1 56163 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 23907888 23908026 23907993 Y IGLL1 IGLL1 NA NA NA NA IGLL1 12469 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 23908349 23908676 23908605 Y NA IGLL1 NA NA NA NA IGLL1 11819 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr22 23923554 23923700 23923627 Y IGLL1 IGLL1 NA NA NA NA IGLL1 3059 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr22 23925970 23926369 23926153 Y VPREB3,IGLL1 IGLL1 NA NA NA NA IGLL1 5475 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 4.77822494320629 chr22 24234499 24234593 24234547 Y NA SLC2A11,MIF NA NA NA NA MIF 308 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 24255997 24256450 24256302 Y C22orf43,CABIN1,CABIN1 MIF NA NA NA NA MIF 21806 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.68643233289634 chr22 24344825 24345058 24344942 Y NA NA NA NA NA NA CABIN1 60584 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 24767148 24767407 24767278 Y GGT1 NA NA NA NA NA SPECC1L 102362 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 24903018 24903252 24903052 Y GGT1,ADORA2A SNRPD3 NA NA NA NA SNRPD3 46219 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 25883503 25883619 25883561 Y NA CRYBB2P1 MYO18B,LRP5L,CRYBB2P1,ADRBK2,SEZ6L IMR90 Hi-C 24141950 CRYBB2P1 41431 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr22 26921035 26921055 26921043 Y TPST2 HPS4,SRRD,TFIP11,HMGB1P10 NA NA NA NA TFIP11 14564 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 27028638 27029036 27028851 Y NA TPST2,CRYBB1,CTA-211A9.5 NA NA NA NA CRYBB1 16586 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 27131212 27131584 27131334 Y NA NA MN1,PITPNB,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 CTA-211A9.5 64482 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 27488405 27488660 27488521 Y NA NA PITPNB,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 RP1-40G4P.1 206894 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 28304832 28305219 28305193 Y NA TTC28-AS1,PITPNB NA NA NA NA TTC28-AS1 8145 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 29188218 29188399 29188309 Y NA CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6 NA NA NA NA XBP1 6186 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 29194018 29194404 29194339 Y NA CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6 NA NA NA NA XBP1 181 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 29206791 29206989 29206921 Y EMID1,CCDC117,XBP1 CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6 XBP1 K562 ChIA-PET 22265404 CTA-292E10.6 12120 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 29218930 29219398 29218977 Y NA XBP1,CTA-292E10.6 TTC28-AS1,TTC28,ZNRF3,EMID1,CCDC117,XBP1,KREMEN1,HSCB,CHEK2,C22orf31 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTA-292E10.6 24259 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr22 30037396 30037886 30037621 Y MTMR3 NF2 NA NA NA NA NF2 39851 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 31298089 31298190 31298144 Y NA NA MORC2,MORC2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TUG1 66473 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 31609195 31609531 31609513 Y RNF185,LIMK2 LIMK2 NA NA NA NA LIMK2 2970 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 31629034 31629491 31629163 Y SMTN,RNF185,LIMK2 LIMK2 NA NA NA NA LIMK2 22809 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 31689398 31689773 31689585 Y SMTN,DEPDC5 NA NA NA NA NA PATZ1 50445 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr22 31854917 31854933 31854925 Y NA SFI1,EIF4ENIF1 NA NA NA NA SFI1 27741 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 32027602 32027834 32027718 Y NA PISD NA NA NA NA PISD 28584 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr22 32048774 32049039 32049031 Y NA PISD SFI1,EIF4ENIF1,DEPDC5,YWHAH,C22orf24,C22orf28,LOC339666,RFPL3-AS1,PRR14L GM12878,K562,IMR90 5C,Hi-C 22955621,24141950 PISD 7379 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 34238519 34238784 34238666 Y NA NA NA NA NA NA SNORA76 139613 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 35745535 35745614 35745571 Y NA MCM5 NA NA NA NA MCM5 48442 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 36149671 36149849 36149827 Y NA NA APOL5 IMR90 Hi-C 24141950 APOL6 107229 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 36343697 36344006 36343862 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 78467 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 36727482 36728450 36727733 Y APOL3 NA NA NA NA NA MYH9 53613 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 36728624 36729163 36728912 Y IFT27 NA NA NA NA NA MYH9 52900 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 37252508 37252741 37252574 Y CYTH4,NCF4,CSF2RB NCF4 NA NA NA NA NCF4 2289 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 37258335 37258758 37258531 Y RAC2,CYTH4,NCF4,CSF2RB NCF4,CSF2RB NA NA NA NA NCF4 3305 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr22 37259042 37259418 37259076 Y NA NCF4,CSF2RB NA NA NA NA NCF4 4012 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr22 37297352 37297636 37297579 Y RAC2,CSF2RB NCF4,CSF2RB NA NA NA NA CSF2RB 10034 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr22 37310268 37310667 37310471 Y RAC2,CYTH4,NCF4,CSF2RB CSF2RB NA NA NA NA CSF2RB 2598 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 37316628 37317004 37316672 Y NA CSF2RB NA NA NA NA CSF2RB 8958 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 37323767 37324006 37323876 Y RAC2,CYTH4,NCF4,CSF2RB CSF2RB NA NA NA NA CSF2RB 16097 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 37558444 37558999 37558665 Y SH3BP1,MFNG,MFNG,RAC2,IL2RB C1QTNF6 NA NA NA NA C1QTNF6 34426 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 37638328 37638951 37638750 Y SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4 C1QTNF6,Z82188.1,CYTH4 NA NA NA NA RAC2 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr22 37681037 37681416 37681291 Y SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4 RAC2,CYTH4 NA NA NA NA CYTH4 4969 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 38139873 38139989 38139967 Y NA TRIOBP H1F0,GCAT IMR90 Hi-C 24141950 TRIOBP 48862 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 38624836 38625209 38625138 Y JOSD1,GTPBP1,CSNK1E,MAFF PLA2G6,TMEM184B NA NA NA NA PLA2G6 25139 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 38750839 38750902 38750852 Y NA CSNK1E NA NA NA NA CSNK1E 41625 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 38857668 38857748 38857703 Y NA DDX17 KCNJ4 K562 ChIA-PET 22265404 DDX17 43917 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 39253318 39253463 39253391 Y KCNJ4,LOC646851 CBX6 NA NA NA NA CBX6 12856 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 39462078 39462341 39462224 Y NA APOBEC3F,APOBEC3G,APOBEC3H NA NA NA NA APOBEC3G 27154 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr22 39541576 39542088 39541730 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7 CBX7 NA NA NA NA CBX7 4591 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 39570081 39570473 39570178 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,APOBEC3H CBX7 PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3 MCF7 ChIA-PET 22265404 CBX7 23402 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr22 39705997 39706111 39706064 Y NA RPL3,SYNGR1 NA NA NA NA RPL3 8283 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 40451411 40451463 40451437 Y NA TNRC6B,RPL7P52 NA NA NA NA TNRC6B 12590 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 40888295 40888668 40888528 Y NA NA NA NA NA NA SGSM3 123700 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr22 41417973 41418366 41418067 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39690 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr22 41418482 41418837 41418726 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39219 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr22 41840300 41840792 41840564 Y NA TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 235 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 42062739 42062953 42062873 Y NA XRCC6,C22orf46,NHP2L1,MEI1 NA NA NA NA C22orf46 19990 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr22 42257974 42258323 42258180 Y CENPM SREBF2 NA NA NA NA SREBF2 30865 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 42315897 42316153 42316014 Y CENPM,SHISA8,TNFRSF13C TNFRSF13C,CENPM NA NA NA NA TNFRSF13C 4669 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr22 42332206 42332544 42332368 Y CENPM,SHISA8,TNFRSF13C TNFRSF13C,CENPM,SEPT3 NA NA NA NA CENPM 8624 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 42840483 42840921 42840577 Y SEPT3 CTA-126B4.7 MEI1,TCF20,NDUFA6,LOC100132273,C22orf32,CYP2D6,NFAM1,WBP2NL,RNU12,POLDIP3,FAM109B,NAGA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTA-126B4.7 8454 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 42944911 42945251 42945081 Y NA RRP7A,SERHL2,RRP7B NA NA NA NA SERHL2 2372 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 43275806 43275917 43275862 Y ARFGAP3 ARFGAP3 NA NA NA NA ARFGAP3 23694 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 43400219 43400728 43400510 Y NA PACSIN2 NA NA NA NA PACSIN2 8423 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr22 45067693 45068028 45067921 Y NUP50,PARVG,PRR5 PRR5,PRR5-ARHGAP8,ARHGAP8 SAMM50,PARVB,LINC00229,KIAA1644 IMR90 Hi-C 24141950 PRR5 5100 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 45402294 45403188 45402906 Y NA PHF21B NA NA NA NA PHF21B 692 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 45664918 45665214 45665118 Y NA KIAA0930,FAM118A LOC100506714,SMC1B,PHF21B,FBLN1,KIAA0930,FAM118A,RIBC2,UPK3A,ATXN10 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0930 30268 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 45899980 45900171 45900075 Y NA NA NA NA NA NA RIBC2 92408 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 46041491 46041960 46041628 Y NA ATXN10 ATXN10,WNT7B,FAM118A,SMC1B,FBLN1,LOC730668,LOC100271722,MIRLET7BHG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATXN10 23718 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 46467914 46468476 46468052 Y NA RP6-109B7.3,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 4143 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr22 46957537 46957704 46957620 Y NA GRAMD4 TRMU,CELSR1,GRAMD4 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 12205 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr22 46983627 46984120 46983763 Y TBC1D22A,CERK,GRAMD4 GRAMD4 TRMU,GRAMD4 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 13718 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 46989093 46989561 46989508 Y TBC1D22A,CERK,GRAMD4 GRAMD4 GRAMD4,CELSR1 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 19184 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 48973025 48973426 48973083 Y FAM19A5,FAM19A5 NA NA NA NA NA C22orf34 1075764 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 2.10804041612042 chr22 49031660 49032049 49031799 Y NA NA NA NA NA NA C22orf34 1017141 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr22 49860945 49861166 49860973 Y NA NA NA NA NA NA C22orf34 188024 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr22 50248429 50248807 50248623 Y TUBGCP6,TRABD,SELO,PIM3,MOV10L1,HDAC10,BRD1,ZBED4 BRD1,ZBED4 NA NA NA NA ZBED4 2939 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 50265281 50265672 50265496 Y MOV10L1,MOV10L1 BRD1,ZBED4,CRELD2,ALG12 CRELD2,ALG12 IMR90 Hi-C 24141950 ZBED4 19791 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 50324610 50324932 50324739 Y NA CRELD2,ALG12,PIM3 NA NA NA NA ALG12 14504 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 50330725 50331030 50330945 Y MAPK12,MAPK11 CRELD2,ALG12,PIM3 NA NA NA NA ALG12 20619 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 50364350 50364715 50364589 Y NA PIM3 NA NA NA NA PIM3 12189 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 50629840 50630128 50630062 Y BRD1,ZBED4,PIM3,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,SBF1,PPP6R2,ODF3B,NCAPH2,CHKB,ARSA,PANX2,TRABD,TUBGCP6,SELO,HDAC10 TRABD,SELO NA NA NA NA SELO 7280 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 50747003 50747284 50747232 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 2947 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr22 50908246 50908896 50908576 Y IL17REL,TRABD,SELO,TUBGCP6,HDAC10,PPP6R2,CHKB,SBF1,NCAPH2 SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2 NA NA NA NA SBF1 2558 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr22 50982591 50982963 50982680 Y NA LMF2,NCAPH2,SCO2,CHKB-CPT1B NA NA NA NA SCO2 19723 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 2938260 2938635 2938449 Y NA NA NA NA NA NA TRNT1 227965 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 3532969 3532987 3532979 Y NA NA NA NA NA NA CRBN 313575 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 3854493 3854653 3854575 Y NA NA NA NA NA NA SETMAR 488335 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 4428359 4428568 4428464 Y NA NA NA NA NA NA SUMF1 78397 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 4467412 4467797 4467675 Y NA SUMF1 NA NA NA NA SUMF1 39168 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 4561829 4562207 4561897 Y BHLHE40,ITPR1 ITPR1-AS1,ITPR1 NA NA NA NA ITPR1 28797 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 5237403 5237551 5237430 Y BHLHE40,ARL8B,EDEM1 AC026202.3,EDEM1 NA NA NA NA EDEM1 10072 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 9050336 9050687 9050476 Y NA RAD18 NA NA NA NA RAD18 46879 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 9422978 9423353 9423146 Y SETD5,RAD18,THUMPD3 THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1 NA NA NA NA SETD5 13946 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 9452001 9452408 9452073 Y MTMR14,SETD5 THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1 NA NA NA NA SETD5-AS1 13738 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 11688028 11688035 11688032 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 72185 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 13062449 13062850 13062655 Y RPL32,NUP210,IQSEC1 NA NA NA NA NA RPL32 181362 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 13087949 13088097 13088023 Y RPL32,IQSEC1 NA NA NA NA NA RPL32 206862 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 13102024 13102205 13102123 Y NA NA NA NA NA NA RPL32 220937 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 13325256 13325344 13325300 Y NA NA NUP210,LOC285375 IMR90 Hi-C 24141950 NUP210 134465 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 13452835 13453081 13452953 Y IQSEC1,HDAC11,HDAC11 NUP210 NA NA NA NA NUP210 6728 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 13853533 13853845 13853702 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD4 310525 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 14167210 14167731 14167391 Y TMEM43,XPC CHCHD4,TMEM43 NA NA NA NA TMEM43 2770 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 14257734 14258042 14257871 Y NA LSM3,XPC NA NA NA NA XPC 39451 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 15105615 15105982 15105798 Y NA MRPS25,ZFYVE20 NA NA NA NA MRPS25 773 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 15340806 15341141 15340974 Y NA NA NA NA NA NA CAPN7 95147 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 15695837 15696119 15696028 Y HACL1 NA NA NA NA NA HACL1 54499 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 15813744 15814005 15813933 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,ANKRD28 NA BTD IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD28 85273 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 15845201 15845372 15845268 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,DPH3,ANKRD28 NA NA NA NA NA ANKRD28 53906 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 15901875 15902313 15902310 Y METTL6,ANKRD28 ANKRD28 NA NA NA NA ANKRD28 2597 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 16474276 16474529 16474346 Y RFTN1 NA NA NA NA NA RFTN1 79004 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 17505233 17505390 17505312 Y TBC1D5,TBC1D5 NA NA NA NA NA PLCL2 663074 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 17542863 17543019 17542979 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 700704 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 18024656 18024931 18024818 Y TBC1D5 NA NA NA NA NA TBC1D5 459378 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 18060236 18060629 18060433 Y TBC1D5,TBC1D5 NA NA NA NA NA TBC1D5 423680 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 18237686 18238028 18237782 Y TBC1D5 NA NA NA NA NA TBC1D5 246281 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA RAD23BP1 NA NA NA NA RAD23BP1 2077 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 19188369 19188866 19188531 Y NA NA NA NA NA NA RAD23BP1 610204 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 19379484 19379512 19379499 Y KCNH8 NA NA NA NA NA EFHB 607005 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 19993428 19993925 19993635 Y KAT2B,RAB5A EFHB,RAB5A NA NA NA NA RAB5A 6857 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 20201632 20201832 20201780 Y KAT2B SGOL1 NA NA NA NA SGOL1 23952 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 20205868 20206079 20206039 Y SGOL1,SGOL1 SGOL1 NA NA NA NA SGOL1 19705 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 23127365 23127541 23127536 Y NA NA NA NA NA NA UBE2E2 114970 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 23700744 23701062 23700980 Y NA NA UBE2E2,UBE2E1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 144332 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 23898490 23898770 23898565 Y NA NA NKIRAS1,RPL15 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 53096 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 25790563 25790933 25790768 Y NA OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 31475 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 26146440 26146612 26146495 Y TOP2B,NGLY1 NA NA NA NA NA NGLY1 316910 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.96750438837906 chr3 27448460 27448581 27448568 Y NA NEK10 NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 NEK10 39509 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 27524458 27524952 27524717 Y NA SLC4A7 NA NA NA NA SLC4A7 547 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA AC098614.2 SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 AC098614.2 2140 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 30646968 30647109 30647039 Y TGFBR2 TGFBR2 NA NA NA NA TGFBR2 974 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 30723230 30723490 30723363 Y TGFBR2 NA NA NA NA NA TGFBR2 77236 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 31267763 31268179 31268080 Y STT3B NA GADL1 IMR90 Hi-C 24141950 STT3B 303951 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chr3 31268600 31269021 31268879 Y NA NA GADL1 IMR90 Hi-C 24141950 STT3B 303109 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr3 31690891 31691368 31691073 Y ZNF860,OSBPL10 NA NA NA NA NA STT3B 118761 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 32426467 32426762 32426639 Y NA CMTM7 CMTM7 IMR90 Hi-C 24141950 CMTM7 4401 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 32443431 32443555 32443473 Y CMTM7 CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 12268 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 32463504 32463726 32463567 Y CMTM6 CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 32341 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 32501642 32502196 32501852 Y CNOT10,CCR4,CMTM7 CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 40704 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 32549205 32549429 32549313 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 6305 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 32857811 32858132 32857909 Y NA AC139452.2 NA NA NA NA AC139452.2 32673 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 33063733 33064078 33063817 Y NA SEC13P1 NA NA NA NA SEC13P1 9277 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 33619018 33619340 33619189 Y CLASP2 NA NA NA NA NA UBP1 138155 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 33638872 33639200 33639124 Y NA NA NA NA NA NA CLASP2 118648 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 33758685 33758853 33758767 Y UBP1,UBP1,CLASP2 CLASP2 NA NA NA NA CLASP2 837 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 35338035 35338359 35338203 Y ARPP21 NA NA NA NA NA MIR128-2 445609 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 35686061 35686293 35686199 Y NA NA NA NA NA NA MIR128-2 97675 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr3 35695966 35696237 35696190 Y ARPP21 NA NA NA NA NA MIR128-2 87731 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 35701081 35701743 35701437 Y ARPP21 NA NA NA NA NA MIR128-2 82225 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 35706105 35706656 35706353 Y ARPP21 NA NA NA NA NA MIR128-2 77312 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 35790038 35790162 35790114 Y ARPP21 MIR128-2 NA NA NA NA MIR128-2 6070 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr3 35821013 35821323 35821076 Y NA MIR128-2 NA NA NA NA MIR128-2 37045 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 36953847 36954333 36954176 Y TRANK1,MLH1,LRRFIP2,GOLGA4,EPM2AIP1 TRANK1 NA NA NA NA TRANK1 30215 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr3 37011455 37011827 37011685 Y LRRFIP2,ITGA9,GOLGA4,MLH1,MLH1,EPM2AIP1 TRANK1,EPM2AIP1,MLH1,RPL29P11 NA NA NA NA EPM2AIP1 20968 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 37495440 37496065 37495716 Y ITGA9 NA NA NA NA NA GOLGA4 212772 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 37526942 37526947 37526945 Y C3orf35 NA NA NA NA NA GOLGA4 244274 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 38189004 38189244 38189118 Y VILL,MYD88,OXSR1 ACAA1,MYD88,OXSR1 NA NA NA NA MYD88 11035 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 38207945 38208258 38208101 Y VILL,PLCD1,DLEC1,MYD88,OXSR1 ACAA1,MYD88,OXSR1 NA NA NA NA OXSR1 3365 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 39222162 39222653 39222434 Y NA CSRNP1 NA NA NA NA CSRNP1 28109 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 39399859 39400185 39399921 Y CCR8,SLC25A38 SLC25A38,RPSA NA NA NA NA SLC25A38 22654 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 39527130 39527299 39527236 Y TTC21A,CX3CR1,CX3CR1,MOBP NA NA NA NA NA RPSA 80950 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 41725291 41725392 41725346 Y NA NA NA NA NA NA ULK4 276530 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 42002407 42002746 42002471 Y ULK4 ULK4 NA NA NA NA ULK4 485 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 42067110 42067525 42067205 Y ULK4 TRAK1 TRAK1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 13816 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 42093899 42094516 42094168 Y NA TRAK1 ZNF621,ZNF620,TRAK1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 40605 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 42108049 42108561 42108178 Y ULK4 NA NA NA NA NA TRAK1 54755 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 42781527 42781699 42781652 Y HHATL NA NA NA NA NA HIGD1A 62324 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 42889474 42889730 42889711 Y CCBP2 HIGD1A NA NA NA NA HIGD1A 45451 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 43368782 43368949 43368860 Y NA SNRK NA NA NA NA SNRK 42778 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 43435481 43435714 43435568 Y SNRK,ABHD5 NA NA NA NA NA SNRK 109477 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 45103596 45103920 45103694 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC3 87919 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 45147419 45147607 45147508 Y TMEM158,CDCP1 NA NA NA NA NA RPS24P8 52060 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 45609249 45609611 45609389 Y LIMD1 LIMD1 NA NA NA NA LIMD1 14363 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr3 46134293 46134488 46134376 Y CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR3,CCR1 NA CXCR6,FYCO1,CCR5,SACM1L,SLC6A20,CCR1,CCR3,CCRL2 IMR90 Hi-C 24141950 FYCO1 98977 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 46150458 46151043 46150531 Y SACM1L,CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR3,CCR2,CCR1 NA CCR5,FYCO1,CCR1,CCR2 IMR90 Hi-C 24141950 FYCO1 115142 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 46224873 46225198 46225066 Y CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1 NA NA NA NA NA CCR5 184435 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 46332561 46332856 46332710 Y NA NA CCR3 IMR90 Hi-C 24141950 CCR5 76777 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 46425104 46425266 46425185 Y NA CCR5,RP11-24F11.2,CCRL2 NA NA NA NA CCR5 15471 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 46546407 46546628 46546504 Y CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2 NA NA NA NA NA LRRC2 72961 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 46587372 46587917 46587474 Y NA LRRC2 NA NA NA NA LRRC2 31672 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.96750438837906 chr3 46591078 46591347 46591239 Y CCR2 LRRC2 NA NA NA NA LRRC2 28242 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr3 46967558 46967892 46967707 Y KLHL18,NBEAL2 NA NA NA NA NA NBEAL2 51281 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 47002825 47003246 47003204 Y NA NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 15927 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 47466111 47466297 47466204 Y NA PTPN23 NA NA NA NA PTPN23 45610 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 47704557 47705253 47705047 Y SETD2 NA NA NA NA NA SMARCC1 116343 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr3 47845454 47845505 47845480 Y DHX30 SMARCC1,DHX30 NA NA NA NA DHX30 3055 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 47991974 47992099 47992083 Y CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A NA NA NA NA NA MAP4 136670 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr3 48332679 48332937 48332732 Y SPINK8 NME6 NA NA NA NA NME6 8238 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 49105949 49106080 49106015 Y ARIH2 DALRD3,IMPDH2,QRICH1,QARS NA NA NA NA QRICH1 23716 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 49123301 49123671 49123633 Y NA QRICH1,QARS,USP19 NA NA NA NA QRICH1 6125 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr3 49275888 49276379 49276160 Y USP4,RHOA,AMIGO3,ARIH2,DALRD3 NA NA NA NA NA CCDC71 74134 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 50264852 50265230 50265012 Y TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2 GNAI2 NA NA NA NA GNAI2 3128 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr3 51573530 51573858 51573781 Y VPRBP,RAD54L2 VPRBP NA NA NA NA VPRBP 41520 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 52057960 52058232 52058077 Y NA ABHD14B,RPL29,DUSP7 DUSP7,POC1A,ALAS1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29 30002 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 53136597 53136930 53136874 Y PBRM1,PBRM1,TMEM110,DCP1A,PRKCD RFT1 NA NA NA NA RFT1 25548 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 53360286 53360418 53360351 Y NA DCP1A NA NA NA NA DCP1A 19236 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr3 53897423 53897785 53897604 Y NA ACTR8,SELK NA NA NA NA ACTR8 16444 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 54662584 54662919 54662752 Y NA NA NA NA NA NA CACNA2D3 508010 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 54686814 54686829 54686822 Y NA NA NA NA NA NA CACNA2D3 532240 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 54851764 54851786 54851775 Y NA NA NA NA NA NA CACNA2D3 697190 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 55517501 55517653 55517577 Y NA NA NA NA NA NA CCDC66 1071536 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 57051619 57051945 57051783 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF3 59412 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 57566206 57566518 57566262 Y NA PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 15429 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 57572232 57572342 57572306 Y NA PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 9605 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 58162589 58162663 58162637 Y KCTD6 NA NA NA NA NA ABHD6 58570 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 58246699 58246763 58246737 Y ABHD6 ABHD6 NA NA NA NA ABHD6 25466 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 58335663 58335765 58335715 Y PXK RPP14,PXK NA NA NA NA PXK 19056 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 58339773 58340193 58340113 Y NA RPP14,PXK NA NA NA NA PXK 23166 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.8269683606377 chr3 58341032 58341142 58341087 Y DNASE1L3 RPP14,PXK NA NA NA NA PXK 24425 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 58412465 58412623 58412544 Y NA PDHB NA NA NA NA PDHB 4961 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 58570984 58571306 58571233 Y PXK,FAM107A NA NA NA NA NA KCTD6 95143 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 60067500 60067675 60067588 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 1167458 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 60392594 60392829 60392710 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 842304 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 60715683 60716344 60716091 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 518789 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr3 63848274 63848561 63848418 Y NA THOC7,ATXN7 NA NA NA NA ATXN7 41 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 63942094 63942115 63942105 Y NA NA NA NA NA NA PSMD6 65543 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 65013149 65013388 65013334 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS9 341473 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr3 65016570 65016819 65016695 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS9 344894 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 66394529 66394891 66394710 Y NA NA NA NA NA NA LRIG1 154796 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 66491047 66491055 66491050 Y NA NA NA NA NA NA LRIG1 58632 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 66491612 66491762 66491706 Y NA NA NA NA NA NA LRIG1 57925 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 66543351 66543557 66543448 Y NA LRIG1 NA NA NA NA LRIG1 6130 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 66546176 66546348 66546214 Y NA LRIG1 NA NA NA NA LRIG1 3339 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 66549724 66550124 66549864 Y NA LRIG1 NA NA NA NA LRIG1 37 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr3 69380103 69380434 69380250 Y MITF,FRMD4B NA NA NA NA NA ARL6IP5 248008 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 71300819 71301142 71300827 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 329998 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 71447361 71447554 71447492 Y EIF4E3 NA NA NA NA NA FOXP1 183586 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 71465988 71466289 71466193 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 164851 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 71493467 71493739 71493621 Y EIF4E3 NA NA NA NA NA FOXP1 137401 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 71551472 71551754 71551609 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 79386 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 71588104 71588187 71588146 Y NA FOXP1 NA NA NA NA FOXP1 42953 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 72545339 72545749 72545633 Y NA NA LOC201617 IMR90 Hi-C 24141950 RYBP 51270 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 72862614 72863000 72862807 Y SHQ1 SHQ1 NA NA NA NA SHQ1 46065 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 72977666 72978074 72977791 Y RYBP NA NA NA NA NA PPP4R2 65862 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 75199894 75200047 75199971 Y NA NA NA NA NA NA FAM86DP 282214 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 80819406 80819881 80819642 Y NA NA NA NA NA NA GBE1 989431 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 88208920 88209337 88209164 Y CGGBP1,C3orf38 C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA CGGBP1 11885 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 90174746 90175099 90174894 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA5P5 1526535 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 96336052 96336669 96336607 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPKP4 269654 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr3 97509307 97509490 97509360 Y NA NA NA NA NA NA CRYBG3 84329 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 98273466 98273625 98273512 Y GPR15 CLDND1,CPOX NA NA NA NA CLDND1 33556 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 98363153 98363375 98363252 Y ST3GAL6 NA NA NA NA NA CPOX 52586 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 98549481 98549862 98549828 Y NA NA NA NA NA NA DCBLD2 68671 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 98916657 98917000 98916829 Y NA NA MIR548G,COL8A1 IMR90 Hi-C 24141950 DCBLD2 298124 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 99584293 99584813 99584482 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D23 393031 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 99587238 99587483 99587373 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D23 390361 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 99646991 99647087 99647049 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D23 330757 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 99657499 99657599 99657549 Y FILIP1L NA NA NA NA NA TBC1D23 320245 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 99749892 99750279 99749982 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D23 227565 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 99751196 99751332 99751292 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D23 226512 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 99752092 99752383 99752194 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D23 225461 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 101146332 101146443 101146386 Y NA NA NA NA NA NA SENP7 83642 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 101403455 101403770 101403678 Y SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24 ZBTB11,CEP97 NA NA NA NA RPL24 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr3 101444542 101444901 101444615 Y FAM55C,FAM55C,CEP97 RPL24,CEP97 NA NA NA NA CEP97 3773 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 103522825 103523125 103522973 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-43P 646021 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 107802397 107802714 107802497 Y MYH15,HHLA2 CD47 NA NA NA NA CD47 5158 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 107803224 107803878 107803522 Y NA CD47 NA NA NA NA CD47 3994 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 107843189 107843582 107843382 Y MYH15,CD47 CD47 CD47,IFT57,MYH15 IMR90 Hi-C 24141950 CD47 35317 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.40536027741361 chr3 107844539 107845078 107844606 Y DZIP3,IFT57,CD47 CD47 CD47,IFT57,MYH15 IMR90 Hi-C 24141950 CD47 36667 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 3.37286466579267 chr3 107846269 107846510 107846297 Y CD47 CD47 CD47,IFT57,MYH15 IMR90 Hi-C 24141950 CD47 38397 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 110549558 110549723 110549642 Y NA NA NA NA NA NA CD96 459843 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 111265245 111265633 111265405 Y NA NA NA NA NA NA PLCXD2 125890 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 111326991 111326995 111326993 Y CD96 NA NA NA NA NA PLCXD2 64528 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 111484180 111484533 111484208 Y NA NA NA NA NA NA PLCXD2 92657 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 111833246 111833569 111833411 Y BTLA,GCET2 C3orf52 NA NA NA NA C3orf52 30064 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 111866338 111866609 111866454 Y NA NA NA NA NA NA C3orf52 63156 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 112960908 112961353 112961141 Y NA NA NA NA NA NA C3orf17 224200 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 113209161 113209501 113209331 Y NA SPICE1,SIDT1 NA NA NA NA SPICE1 22533 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 113638745 113638778 113638762 Y NA NA NA NA NA NA RP11-435F17.1 71167 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 113704407 113704728 113704558 Y SIDT1,KIAA2018,KIAA1407,ZDHHC23 QTRTD1 NA NA NA NA QTRTD1 17952 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr3 115696572 115696769 115696673 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 1046776 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 119146429 119146829 119146680 Y ARHGAP31,CD80,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 38848 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 120277715 120278240 120277932 Y NA NDUFB4 FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB4 34916 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.40536027741361 chr3 120493479 120494008 120493729 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33639 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 120857899 120858271 120857953 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP11 352686 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 121083011 121083367 121083189 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP11 127590 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 121257379 121257441 121257436 Y NA RPL7AP11,POLQ NA NA NA NA POLQ 5412 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 121374377 121374548 121374517 Y EAF2,HCLS1,GOLGB1 HCLS1 NA NA NA NA HCLS1 3226 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 121539764 121539854 121539811 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 12072 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 121550824 121551193 121550988 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 733 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 121713958 121714176 121714068 Y HCLS1,EAF2,CD86 NA NA NA NA NA CD86 58037 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 121987630 121987719 121987689 Y CD86,CD86 NA NA NA NA NA CCDC58 112359 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 122988091 122988383 122988237 Y NA NA NA NA NA NA SEC22A 69317 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 123391718 123392030 123392015 Y ADCY5,MYLK NA NA NA NA NA MYLK-AS1 89329 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 123476863 123477567 123477241 Y MYLK NA NA NA NA NA MYLK-AS1 174474 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 123508502 123508917 123508819 Y NA NA NA NA NA NA CCDC14 169647 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 124865861 124866318 124866168 Y OSBPL11 NA NA NA NA NA HEG1 93059 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 125709142 125709481 125709414 Y ZXDC,CCDC37 NA NA NA NA NA FAM86JP 75679 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr3 126939932 126940049 126939992 Y NA NA NUP210P1,CHCHD6 IMR90 Hi-C 24141950 MCM2 375017 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chr3 126940272 126940448 126940345 Y NA NA NUP210P1,CHCHD6 IMR90 Hi-C 24141950 MCM2 374618 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr3 126945882 126946306 126946211 Y MCM2 NA NUP210P1 IMR90 Hi-C 24141950 MCM2 368760 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 127266508 127266786 127266647 Y KBTBD12 MCM2,TPRA1 CHCHD6 IMR90 Hi-C 24141950 MCM2 48280 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 127416375 127416550 127416435 Y NA ABTB1 NA NA NA NA ABTB1 26597 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 127469268 127470071 127469577 Y TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL NA NA NA NA NA ABTB1 79490 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 128336521 128336831 128336572 Y DNAJB8 NA NA NA NA NA RPN1 61087 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 128564550 128565114 128564776 Y DNAJB8,KIAA1257 ACAD9 NA NA NA NA ACAD9 31325 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 128745839 128746109 128746044 Y NA NA NA NA NA NA RAB43 93535 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr3 129245456 129245718 129245564 Y RHO NA NA NA NA NA PLXND1 77943 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 129311648 129311919 129311783 Y PLXND1 PLXND1 NA NA NA NA PLXND1 11742 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 129337923 129338085 129337977 Y NA PLXND1 RPL32P3,C3orf25,IFT122,MBD4,H1FOO,PLXND1,TMCC1 IMR90 Hi-C 24141950 PLXND1 14262 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 129630197 129630419 129630269 Y MBD4,TMCC1,TMCC1 TMCC1 NA NA NA NA TMCC1 19778 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 132261870 132262263 132261985 Y DNAJC13 NA NA NA NA NA UBA5 109027 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 133295128 133295300 133295215 Y NA CDV3 NA NA NA NA CDV3 4554 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 133956955 133957302 133957129 Y NA RYK NA NA NA NA RYK 10387 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 133968581 133968789 133968685 Y NA RYK NA NA NA NA RYK 892 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 134068231 134068586 134068519 Y NA NA NA NA NA NA RYK 100542 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 136448168 136448437 136448423 Y NA STAG1 NA NA NA NA STAG1 20783 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 138582294 138582582 138582441 Y MRPS22 PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 30514 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.8269683606377 chr3 138634319 138634690 138634472 Y NA NA ESYT3,PIK3CB,MRPS22,MRAS,CEP70,FAIM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIK3CB 82539 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 139064285 139064552 139064299 Y NA COPB2,RP11-319G6.1 NA NA NA NA COPB2 42022 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 139253953 139254145 139254018 Y NA RBP1 NA NA NA NA RBP1 2526 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 139271371 139271598 139271484 Y NA RBP1 NA NA NA NA RBP1 14700 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 141118771 141119120 141118811 Y NA NA NA NA NA NA RASA2 84769 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 141217752 141218175 141217834 Y ATP1B3,RASA2 RASA2 NA NA NA NA RASA2 13863 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 141230074 141230471 141230125 Y NA RASA2 NA NA NA NA RASA2 26185 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 141515444 141515577 141515511 Y TFDP2,GK5,RASA2 NA NA NA NA NA RNF7 60398 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 141833838 141834123 141833981 Y NA TFDP2 NA NA NA NA TFDP2 32263 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 142580771 142580984 142580878 Y NA RP11-372E1.1,PCOLCE2 NA NA NA NA PCOLCE2 25061 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 142804014 142804376 142804307 Y NA CHST2,RP11-80H8.4 CHST2 K562 ChIA-PET 22265404 CHST2 31797 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 142844875 142844897 142844886 Y PAQR9,CHST2 CHST2,RP11-80H8.4 NA NA NA NA RP11-80H8.4 4671 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr3 143108310 143108441 143108388 Y NA NA NA NA NA NA RP11-80H8.4 268106 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 143705621 143705974 143705695 Y C3orf58,C3orf58 C3orf58 NA NA NA NA C3orf58 16981 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 143717163 143717502 143717283 Y NA C3orf58 NA NA NA NA C3orf58 28523 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 147331675 147331840 147331755 Y ZIC4,ZIC4,ZIC1 NA NA NA NA NA HNRNPA1P20 551245 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 148595334 148595685 148595388 Y NA NA NA NA NA NA GYG1 111443 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 149499134 149499345 149499187 Y NA COMMD2,RNF13 COMMD2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF13 29150 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 149657313 149657850 149657694 Y TSC22D2,RNF13 NA NA NA NA NA RNF13 128818 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 150102610 150102865 150102834 Y SIAH2,SERP1,TSC22D2 TSC22D2 PFN2,RNF13,TSC22D2,SERP1,EIF2A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 21257 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 150348986 150349006 150348996 Y CLRN1 SELT,SERP1 NA NA NA NA SERP1 29971 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 150478267 150478712 150478564 Y TSC22D2,SERP1,SELT,GPR171,SIAH2 SIAH2-AS1,SIAH2 NA NA NA NA SIAH2-AS1 543 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 150983738 150984063 150983889 Y P2RY14 P2RY14 NA NA NA NA P2RY14 10192 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 151923088 151923367 151923343 Y MBNL1 MBNL1 MBNL1,LOC401093 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MBNL1 36250 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.54589630515498 chr3 152030036 152030551 152030147 Y MBNL1,MBNL1 NA NA NA NA NA MBNL1 70419 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 152121454 152121974 152121660 Y MBNL1 NA NA NA NA NA MBNL1 161837 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 152309571 152309599 152309585 Y NA NA NA NA NA NA MBNL1 349954 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 153017510 153017568 153017539 Y NA NA NA NA NA NA RAP2B 139481 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 155316441 155316741 155316588 Y NA NA NA NA NA NA PLCH1 144115 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 156822906 156823344 156823241 Y NA NA NA NA NA NA CCNL1 53205 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 160267928 160268193 160268163 Y NA SCARNA7,KPNA4 NA NA NA NA KPNA4 13183 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 168449002 168449381 168449192 Y NA NA NA NA NA NA GOLIM4 637239 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 169376858 169377055 169376957 Y NA NA NA NA NA NA TERC 103793 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 169482089 169482431 169482154 Y NA TERC,MYNN,LRRC34 NA NA NA NA TERC 1241 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 169494029 169494036 169494033 Y NA TERC,MYNN,LRRC34 NA NA NA NA MYNN 5410 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 169508571 169508792 169508647 Y NA TERC,MYNN,LRRC34 NA NA NA NA MYNN 19952 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 170073991 170074311 170074218 Y SKIL,SKIL SKIL NA NA NA NA SKIL 525 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 170841724 170842009 170841889 Y NA NA NA NA NA NA RPL22L1 255452 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 170957638 170957941 170957717 Y NA NA NA NA NA NA RPL22L1 371366 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 171849993 171850504 171850202 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 94575 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 171935922 171936083 171936003 Y FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 180504 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 173650294 173650720 173650491 Y NA NA NA NA NA NA RP11-393N4.2 442314 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 177077500 177078084 177077832 Y NA NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 164239 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 177315732 177315915 177315819 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 402471 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 177494497 177494836 177494667 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 581236 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 178754661 178754788 178754723 Y KCNMB3 ZMAT3 NA NA NA NA ZMAT3 33279 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 178755149 178755598 178755383 Y NA ZMAT3 NA NA NA NA ZMAT3 32469 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr3 178978348 178978737 178978528 Y PIK3CA,MFN1,GNB4 NA NA NA NA NA ZNF639 60042 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 178983793 178983839 178983817 Y KCNMB3 NA NA NA NA NA ZNF639 54940 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 179161841 179162229 179161903 Y NA GNB4 NA NA NA NA GNB4 5149 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 180475891 180475917 180475905 Y NA NA NA NA NA NA FXR1 108012 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 182550667 182550775 182550721 Y ATP11B ATP11B NA NA NA NA ATP11B 41379 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 182645862 182646115 182645990 Y MCF2L2,MCCC1 NA NA NA NA NA DCUN1D1 55626 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 182980917 182981737 182981029 Y NA NA NA NA NA NA MCCC1 149054 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 183229776 183229950 183229863 Y KLHL6 KLHL6 NA NA NA NA KLHL6 41527 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 183231092 183231442 183231267 Y B3GNT5,KLHL6,KLHL24 KLHL6 NA NA NA NA KLHL6 40035 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr3 184503800 184503841 184503824 Y NA VPS8 VPS8,EPHB3,EIF4G1,POLR2H,THPO,CHRD IMR90 Hi-C 24141950 VPS8 24090 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 184560038 184560430 184560098 Y VPS8 VPS8 NA NA NA NA VPS8 32107 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 184727770 184727947 184727859 Y NA NA NA NA NA NA VPS8 199839 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 184775166 184775451 184775309 Y VPS8 NA NA NA NA NA EIF2S2P2 186778 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 185463229 185463551 185463382 Y NA NA NA NA NA NA SENP2 164945 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr3 185825302 185825582 185825395 Y NA ETV5 NA NA NA NA ETV5 525 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 186490704 186490868 186490793 Y ST6GAL1,TBCCD1,TBCCD1,EIF4A2 EIF4A2,RFC4 NA NA NA NA EIF4A2 8126 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr3 186715660 186715959 186715816 Y RTP1,ST6GAL1,ST6GAL1 NA NA NA NA NA ST6GAL1 69386 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 186733684 186733815 186733810 Y NA NA NA NA NA NA ST6GAL1 87410 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 186745346 186745889 186745388 Y TBCCD1,EIF4A2,RTP4,ST6GAL1 NA NA NA NA NA ST6GAL1 99072 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 186784569 186784773 186784671 Y NA NA NA NA NA NA RPL39L 111923 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 187304327 187304487 187304407 Y NA NA ST6GAL1,MASP1 IMR90 Hi-C 24141950 BCL6 157028 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 187457681 187458370 187457991 Y RTP4,BCL6,BCL6,BCL6 BCL6 NA NA NA NA BCL6 3145 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 187687318 187687647 187687573 Y NA NA BCL6,LPP,LPP-AS2 IMR90 Hi-C 24141950 LPP 181425 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 187697421 187697657 187697609 Y NA NA BCL6,LPP,LPP-AS2,LOC100131635 IMR90 Hi-C 24141950 LPP 171415 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 187717670 187717903 187717797 Y BCL6,BCL6 NA BCL6,LPP IMR90 Hi-C 24141950 LPP 151169 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 188017658 188018009 188017791 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 147813 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 188276216 188276468 188276344 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 406371 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 188475500 188475699 188475599 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 605655 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 190335085 190335347 190335197 Y IL1RAP NA NA NA NA NA IL1RAP 105245 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 193597420 193597611 193597456 Y NA NA HES1,OPA1,LOC647323 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 OPA1 288487 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 193851636 193853009 193852912 Y ATP13A3,HES1 NA NA NA NA NA LRRC15 235463 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 194820742 194820949 194820800 Y PPP1R2,ACAP2 XXYLT1-AS2 NA NA NA NA XXYLT1-AS2 45651 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 194871039 194871493 194871089 Y FAM43A,C3orf21 XXYLT1-AS2 NA NA NA NA XXYLT1-AS2 4439 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 194875742 194876159 194875826 Y FAM43A,C3orf21 XXYLT1-AS2 NA NA NA NA XXYLT1-AS2 9142 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 194898663 194899282 194898930 Y NA XXYLT1-AS2 NA NA NA NA XXYLT1-AS2 32063 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 195264699 195265107 195264994 Y ACAP2,TNK2,PPP1R2 PPP1R2 NA NA NA NA PPP1R2 3102 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 195891844 195892227 195892035 Y NA NA NA NA NA NA TFRC 84784 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 196370086 196370426 196370273 Y PCYT1A,UBXN7,RNF168,SENP5,LRRC33 LINC01063,PIGX NA NA NA NA PIGX 5440 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 196635737 196635948 196635847 Y UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5 SENP5,NCBP2 NA NA NA NA NCBP2 31520 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 196696811 196697020 196696957 Y LRRC33,PIGZ NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1 NA NA NA NA PIGZ 2880 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 197264445 197264691 197264611 Y NA BDH1 NA NA NA NA BDH1 33503 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr3 197439165 197439566 197439302 Y IQCG,LRCH3,KIAA0226 MIR922,FYTTD1,KIAA0226 NA NA NA NA FYTTD1 22484 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr3 197838995 197839386 197839068 Y NA ANKRD18DP LMLN,ANKRD18DP IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD18DP 33404 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 51618 52013 51955 Y NA NA NA NA NA NA ABCA11P 413905 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 751950 752022 752014 Y NA RP11-440L14.1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 21615 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 765995 766248 766202 Y NA RP11-440L14.1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 7389 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 918576 918805 918690 Y KIAA1530,PIGG,ZNF721,TMEM175,GAK,DGKQ GAK,TMEM175 NA NA NA NA GAK 5356 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 1305077 1305367 1305246 Y DGKQ,KIAA1530 MAEA KIAA1530 IMR90 Hi-C 24141950 MAEA 23438 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr4 1875191 1875366 1875328 Y NA LETM1,WHSC1 NA NA NA NA WHSC1 4040 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 1966776 1967112 1967086 Y WHSC1,WHSC1 NA NA NA NA NA WHSC1 95625 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr4 2292648 2292996 2292766 Y ZFYVE28,ZFYVE28,TNIP2,RNF4,RNF4,LOC402160,HAUS3 MXD4 NA NA NA NA MXD4 30627 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 2414575 2415364 2414914 Y HAUS3,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,RNF4,RNF4,LOC402160 RNF4 NA NA NA NA RNF4 46583 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr4 2574508 2574529 2574516 Y NA NA POLN,MXD4,LOC402160,RNF4,FAM193A,TNIP2,ADD1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF4 112561 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 2691649 2691991 2691819 Y NA NA NA NA NA NA TNIP2 64112 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 2764467 2764789 2764630 Y LOC402160 TNIP2 TNIP2,NOP14-AS1,NOP14,MFSD10 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TNIP2 8364 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr4 3085381 3085754 3085447 Y NA HTT NA NA NA NA HTT 10973 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 3493312 3493795 3493528 Y NA LRPAP1 NA NA NA NA LRPAP1 38491 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 6179706 6179940 6179759 Y JAKMIP1 NA NA NA NA NA WFS1 89636 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 6592942 6593078 6593012 Y NA MAN2B2,MRFAP1 NA NA NA NA MAN2B2 18040 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 6785099 6785509 6785391 Y TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232 KIAA0232 NA NA NA NA KIAA0232 3997 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 6891169 6891522 6891340 Y TBC1D14,TBC1D14 TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 17447 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 6940825 6940952 6940860 Y NA TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 31856 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 6989470 6989868 6989678 Y TBC1D14 NA NA NA NA NA TADA2B 51758 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 7142827 7143002 7142919 Y NA NA SORCS2,AFAP1-AS1,AFAP1 IMR90 Hi-C 24141950 GRPEL1 74903 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 7191564 7191944 7191754 Y NA NA NA NA NA NA GRPEL1 123640 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 7648496 7648718 7648592 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1 290935 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 7974971 7975417 7975298 Y AFAP1 AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 35318 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 9154755 9155069 9154900 Y NA FAM86KP NA NA NA NA FAM86KP 1733 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr4 11473418 11473587 11473515 Y NA NA CLNK IMR90 Hi-C 24141950 MIR572 104967 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 12642016 12642195 12642111 Y NA RP11-352E6.2 NA NA NA NA RP11-352E6.2 1755 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr4 15036867 15037072 15036952 Y NA CPEB2 NA NA NA NA CPEB2 34569 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 15356839 15357216 15357028 Y NA NA NA NA NA NA FAM200B 324069 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 15655935 15656313 15656300 Y FBXL5,BST1 FAM200B,FBXL5 NA NA NA NA FAM200B 24972 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 15757957 15758240 15758119 Y FBXL5,TAPT1,CD38 RP11-115L11.1,CD38 C1QTNF7,CD38,FGFBP2,PROM1,CC2D2A IMR90 Hi-C 24141950 CD38 19658 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 15781600 15782008 15781690 Y FBXL5,BST1,CD38 CD38 NA NA NA NA CD38 3702 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 15820988 15821366 15820993 Y NA CD38 NA NA NA NA CD38 43090 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 16125304 16125914 16125552 Y NA NA PROM1 IMR90 Hi-C 24141950 TAPT1 101119 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 16226860 16227020 16226938 Y FGFBP2,TAPT1 TAPT1,RPS21P4 NA NA NA NA TAPT1 13 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 17827662 17827866 17827764 Y NA DCAF16,NCAPG NA NA NA NA NCAPG 17137 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 17829390 17829398 17829394 Y CLRN2,NCAPG DCAF16,NCAPG NA NA NA NA NCAPG 18865 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 17938692 17938903 17938798 Y NA NA NA NA NA NA LCORL 82596 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 20780664 20780780 20780767 Y KCNIP4,KCNIP4 NA NA NA NA NA PACRGL 84759 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 21066453 21066508 21066495 Y NA NA NA NA NA NA PACRGL 370548 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 21532869 21532884 21532877 Y KCNIP4 NA NA NA NA NA PACRGL 836964 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 23299933 23300259 23300096 Y NA NA NA NA NA NA CDC42P6 572360 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 23335645 23335866 23335720 Y NA NA NA NA NA NA CDC42P6 608072 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 24660007 24660225 24660117 Y NA ATP5LP3 CCDC149,MIR573 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5LP3 2009 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 25175369 25175577 25175408 Y NA SEPSECS,PI4K2B NA NA NA NA PI4K2B 15106 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr4 25536997 25537326 25537166 Y NA NA NA NA NA NA RP11-302F12.1 141146 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 26449466 26449471 26449469 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D19 126588 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 26887004 26887397 26887051 Y STIM2 STIM2,RP11-293A21.1 NA NA NA NA RP11-293A21.1 26783 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 26888311 26888739 26888468 Y NA STIM2,RP11-293A21.1 NA NA NA NA RP11-293A21.1 28090 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 26994323 26994529 26994430 Y STIM2 NA NA NA NA NA RP11-293A21.1 134102 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 36183139 36183486 36183313 Y NA NA NA NA NA NA RP11-431M7.3 60252 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 36243506 36243686 36243606 Y NA RP11-431M7.3,ARAP2 NA NA NA NA RP11-431M7.3 52 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 36270620 36271063 36270847 Y ARAP2,DTHD1,DTHD1 RP11-431M7.3,ARAP2 NA NA NA NA ARAP2 26489 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr4 38084338 38084956 38084492 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 124282 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 38320550 38320897 38320770 Y NA NA FLJ13197,KLF3,TBC1D1,TLR10 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF3 342920 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 39935708 39936100 39935904 Y NA PDS5A NA NA NA NA PDS5A 41476 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 40056293 40056591 40056356 Y NA NA NA NA NA NA N4BP2 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 40057110 40057493 40057154 Y RHOH,N4BP2 N4BP2 NA NA NA NA N4BP2 664 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 40208219 40208356 40208278 Y RBM47 RHOH NA NA NA NA RHOH 17546 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 40220241 40220518 40220360 Y NA RHOH NA NA NA NA RHOH 29568 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 40240312 40240963 40240621 Y RHOH,RBM47 RHOH NA NA NA NA RHOH 49639 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 40249216 40249266 40249241 Y PDS5A,RHOH NA NA NA NA NA RHOH 58543 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 40324884 40325018 40324960 Y NA NA LOC344967,N4BP2,CHRNA9 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RHOH 134211 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 40724553 40725127 40724836 Y RBM47 NSUN7 CHRNA9,RBM47,NSUN7,N4BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NSUN7 24787 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 41162074 41162440 41162321 Y APBB2 NA NA NA NA NA APBB2 54291 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 41886373 41886653 41886561 Y PHOX2B TMEM33 PHOX2B,LIMCH1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM33 48484 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 42440171 42440281 42440226 Y NA NA NA NA NA NA ATP8A1 216841 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 42548278 42548665 42548446 Y GRXCR1 NA NA NA NA NA ATP8A1 108457 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 42640821 42641323 42641074 Y GRXCR1,ATP8A1 ATP8A1 NA NA NA NA ATP8A1 15799 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 48532180 48532355 48532269 Y NA NA NA NA NA NA SLAIN2 190841 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 48851417 48851730 48851443 Y ZAR1,FRYL OCIAD1 NA NA NA NA OCIAD1 46188 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 54338842 54339193 54339023 Y NA NA NA NA NA NA FIP1L1 97032 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr4 54467426 54467549 54467488 Y NA NA LNX1 IMR90 Hi-C 24141950 FIP1L1 225616 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 54568898 54569145 54569018 Y CHIC2 NA SCFD2,LNX1,PDGFRA,FIP1L1,RPL21P44,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 FIP1L1 327088 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 54771921 54772318 54772120 Y NA NA FIP1L1,LNX1,SCFD2,RPL21P44,CHIC2,GSX2,PDGFRA IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 156539 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 54968962 54969096 54969029 Y NA CHIC2 NA NA NA NA CHIC2 40105 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 55093024 55093294 55093182 Y PDGFRA NA NA NA NA NA PDGFRA 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 55093767 55093987 55093860 Y NA PDGFRA NA NA NA NA PDGFRA 503 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr4 55100480 55100923 55100634 Y PDGFRA PDGFRA NA NA NA NA PDGFRA 7216 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 57152895 57152955 57152925 Y KIAA1211,ARL9 NA NA NA NA NA RPL7AP31 67346 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 57254661 57255026 57254688 Y CEP135 RPL7AP31,AASDH,PPAT,PAICS NA NA NA NA AASDH 2995 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 57278248 57278433 57278373 Y NA AASDH,PPAT,PAICS NA NA NA NA PPAT 21348 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 57313900 57314193 57314047 Y NA PPAT,PAICS,SRP72 NA NA NA NA PAICS 13993 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 68264537 68264852 68264695 Y NA RP11-584P21.4 NA NA NA NA RP11-584P21.4 45133 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 70579444 70579641 70579538 Y SULT1B1 NA NA NA NA NA IGJ 965893 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 71695000 71695080 71695041 Y NA GRSF1 NA NA NA NA GRSF1 8582 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 74055104 74055142 74055123 Y ANKRD17,ALB,AFM NA NA NA NA NA ANKRD17 67373 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 75806298 75806441 75806350 Y NA NA NA NA NA NA THAP6 630715 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 77041502 77041599 77041551 Y NA NUP54 NA NA NA NA NUP54 26069 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 78708574 78708903 78708795 Y CNOT6L CNOT6L NA NA NA NA CNOT6L 29866 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 78711096 78711128 78711114 Y NA CNOT6L NA NA NA NA CNOT6L 27641 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 79550555 79550802 79550658 Y NA NA NA NA NA NA BMP2K 144694 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 81775377 81775583 81775480 Y NA NA NA NA NA NA RASGEF1B 1187814 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 83383009 83383387 83383198 Y NA ENOPH1 NA NA NA NA ENOPH1 33294 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 83681282 83681423 83681411 Y NA SCD5 NA NA NA NA SCD5 36587 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 84138724 84139183 84138985 Y THAP9,LIN54,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,COQ2,AGPAT9,PLAC8,PLAC8 NA PLAC8,COPS4,COQ2 IMR90 Hi-C 24141950 COQ2 64884 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 86647112 86647286 86647162 Y NA NA NA NA NA NA AFF1 1206868 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 87882810 87883321 87882982 Y KLHL8,AFF1,AFF1 AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA TECRP1 13534 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr4 88128179 88128500 88128218 Y NA KLHL8 NA NA NA NA KLHL8 30966 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 88310144 88310324 88310202 Y AFF1,HSD17B11 HSD17B11,NUDT9 NA NA NA NA HSD17B11 214 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 88446974 88447282 88447233 Y MEPE,SPARCL1 NA NA NA NA NA NUDT9 105240 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 88943044 88943294 88943160 Y NA SPP1,RNU1-36P,PKD2 NA NA NA NA PKD2 16224 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 89185531 89185830 89185781 Y NA ABCG2,PPM1K NA NA NA NA PPM1K 18091 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 91453996 91454262 91454133 Y NA NA NA NA NA NA NAP1L5 1836610 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 92381693 92381784 92381739 Y NA NA NA NA NA NA SMARCAD1 2744978 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 92985275 92985297 92985287 Y NA NA NA NA NA NA SMARCAD1 2141465 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 99319477 99319794 99319573 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GDS1 138942 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 99848541 99848872 99848707 Y NA EIF4E NA NA NA NA EIF4E 916 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 101816852 101816959 101816896 Y NA EMCN NA NA NA NA EMCN 17569 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 101989384 101989498 101989458 Y NA NA NA NA NA NA EMCN 190101 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 102153053 102153484 102153407 Y NA NA NA NA NA NA AP001816.1 113453 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 102200557 102200885 102200839 Y PPP3CA NA NA NA NA NA AP001816.1 66052 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 102243269 102243535 102243491 Y NA AP001816.1,PPP3CA NA NA NA NA AP001816.1 23402 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 103673229 103673433 103673315 Y NHEDC1,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA MANBA NA NA NA NA MANBA 6718 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 103678847 103679008 103678977 Y NA MANBA NA NA NA NA MANBA 1143 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 103701783 103702159 103702029 Y NA MANBA,RP11-10L12.4 NA NA NA NA MANBA 21632 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 106362976 106363368 106363172 Y NA PPA2,EEF1A1P9 NA NA NA NA PPA2 29870 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 107780277 107780572 107780473 Y NA NA NA NA NA NA TBCK 539625 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 109047956 109048357 109048341 Y NA LEF1-AS1,LEF1 NA NA NA NA LEF1-AS1 38324 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr4 109078014 109078240 109078233 Y NA LEF1-AS1,LEF1 NA NA NA NA LEF1-AS1 8441 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 109081038 109081258 109081096 Y NA LEF1-AS1,LEF1 NA NA NA NA LEF1-AS1 5423 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 111086740 111086853 111086804 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 31502 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 111114926 111115298 111115104 Y GAR1,ELOVL6,ELOVL6 ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 3057 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 111116750 111117174 111116883 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 1181 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 111117471 111117868 111117585 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 487 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.40536027741361 chr4 113067380 113067784 113067656 Y LARP7,LARP7,TIFA,AP1AR,C4orf32 C4orf32 NA NA NA NA C4orf32 2827 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 113205194 113205406 113205300 Y NA ALPK1,TIFA NA NA NA NA TIFA 135 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 114753908 114754213 114754112 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP30 1045874 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 116213565 116213665 116213636 Y NA NA NA NA NA NA ACTN4P1 1303652 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 117474098 117474276 117474187 Y NA ACTN4P1 NA NA NA NA ACTN4P1 43041 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 117519495 117520605 117520296 Y NA ACTN4P1 NA NA NA NA ACTN4P1 2178 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 119756174 119756657 119756269 Y NA SEC24D NA NA NA NA SEC24D 1181 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 120458820 120459280 120459019 Y PDE5A,PDE5A,PDE5A NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 84874 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 120962747 120963053 120963021 Y NA RP11-679C8.2,MAD2L1 NA NA NA NA RP11-679C8.2 23060 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 121010657 121011025 121010845 Y NA RP11-679C8.2,MAD2L1 NDNF IMR90 Hi-C 24141950 MAD2L1 24428 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 122487638 122487728 122487683 Y NA NA NA NA NA NA ANXA5 128540 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 124364843 124364989 124364898 Y SPRY1 SPRY1 SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY1 48893 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 124373851 124374047 124373905 Y NA NA NA NA NA NA SPRY1 57901 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 124521229 124521410 124521292 Y NA NA NA NA NA NA SPRY1 205279 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr4 124538169 124538584 124538401 Y NA NA NA NA NA NA SPRY1 222219 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr4 128990801 128990842 128990822 Y NA LARP1B NA NA NA NA LARP1B 10378 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 129733811 129733921 129733891 Y NA NA NA NA NA NA C4orf33 278551 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 129965980 129966229 129966106 Y NA C4orf33,SCLT1 NA NA NA NA C4orf33 46243 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 131810894 131810973 131810934 Y NA NA NA NA NA NA SCLT1 1798130 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 134077378 134077602 134077486 Y NA NA NA NA NA NA SCLT1 4064614 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr4 139875082 139875464 139875289 Y NA NA CCRN4L IMR90 Hi-C 24141950 CCRN4L 59479 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 139960222 139960706 139960403 Y CCRN4L CCRN4L NA NA NA NA CCRN4L 25279 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 140003738 140004448 140004114 Y CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2 NA CCRN4L K562 ChIA-PET 22265404 CCRN4L 68795 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr4 140074901 140075184 140075104 Y NA ELF2 CCRN4L,ELF2,NAA15,NDUFC1 IMR90 Hi-C 24141950 ELF2 21188 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 140235316 140235657 140235500 Y ELF2,RAB33B NAA15,NDUFC1 NA NA NA NA NDUFC1 13611 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 140278994 140279360 140279178 Y NA NA NA NA NA NA NDUFC1 57289 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 140292626 140292906 140292778 Y NA NA NA NA NA NA NDUFC1 70921 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 140321405 140321719 140321434 Y ELF2,NAA15,RAB33B NA NA NA NA NA RAB33B 50667 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr4 140656102 140656508 140656327 Y MAML3 NA NA NA NA NA MGST2 71180 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 140690476 140690707 140690592 Y NA NA NA NA NA NA MGST2 105554 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 140727942 140728268 140728103 Y MAML3 NA NA NA NA NA MGST2 143020 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr4 141016837 141017139 141016990 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 56199 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr4 141017143 141017617 141017414 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 55721 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 141071687 141072625 141072041 Y MAML3 MAML3 NA NA NA NA MAML3 713 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr4 141118561 141118903 141118732 Y NA MAML3 MGST2,MAML3,LOC100129858,SCOC IMR90 Hi-C 24141950 MAML3 45223 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 144151997 144152130 144152064 Y SMARCA5,FREM3,USP38 USP38 NA NA NA NA USP38 47927 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 144271294 144271615 144271412 Y NA GAB1 NA NA NA NA GAB1 15379 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 144280232 144280410 144280287 Y USP38,SMARCA5,GAB1 GAB1 NA NA NA NA GAB1 24317 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 144332697 144332829 144332792 Y GAB1 NA NA NA NA NA GAB1 76782 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 146024258 146024314 146024286 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ANAPC10 6565 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 146408898 146409228 146409003 Y OTUD4 SMAD1,SMAD1-AS2 NA NA NA NA SMAD1 8552 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr4 146726845 146727018 146726937 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 130769 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 146856855 146857112 146856936 Y NA ZNF827 NA NA NA NA ZNF827 675 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 148639177 148639323 148639282 Y ARHGAP10 PRMT10,ARHGAP10 ARHGAP10 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP10 11891 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 149366972 149367375 149367074 Y NA NR3C2 NA NA NA NA NR3C2 3122 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 151204830 151205055 151204941 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 729824 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 151557010 151557332 151557171 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 377547 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 151641898 151642513 151641954 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 292366 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 151873741 151873900 151873783 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 60979 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 152117073 152117218 152117121 Y FAM160A1,SH3D19 NA NA NA NA NA RPS3A 98348 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 153165200 153165300 153165250 Y NA NA FAM160A1,FBXW7 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-18H21.1 145294 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 153424227 153424394 153424311 Y NA MIR4453 NA NA NA NA MIR4453 31022 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 153717992 153718074 153718038 Y NA TIGD4,ARFIP1 NA NA NA NA ARFIP1 18903 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 154253952 154254140 154254046 Y NA MND1 NA NA NA NA MND1 9661 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 154269495 154269528 154269512 Y TRIM2,MND1 MND1 NA NA NA NA MND1 5694 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr4 154354806 154355109 154354963 Y TLR2 KIAA0922 NA NA NA NA KIAA0922 30389 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 154360422 154360809 154360778 Y MND1,KIAA0922 KIAA0922 MND1,TRIM2,KIAA0922 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA0922 24689 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr4 154361957 154362025 154361991 Y NA KIAA0922 MND1,TRIM2 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0922 23473 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 154408922 154409996 154409474 Y NA KIAA0922 NA NA NA NA KIAA0922 23424 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 154429389 154429734 154429551 Y NA KIAA0922 NA NA NA NA KIAA0922 43891 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 154548347 154548481 154548383 Y KIAA0922,TLR2 NA NA NA NA NA KIAA0922 162849 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr4 154577062 154577591 154577315 Y TLR2 NA NA NA NA NA KIAA0922 191564 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 159592059 159592445 159592194 Y NA ETFDH,C4orf46 NA NA NA NA C4orf46 652 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 159732931 159733171 159733059 Y PPID,RAPGEF2,FNIP2 FNIP2 NA NA NA NA FNIP2 44641 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 160160934 160161439 160160999 Y FNIP2,RAPGEF2 NA FNIP2,RAPGEF2 IMR90 Hi-C 24141950 FNIP2 472644 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 164414222 164414415 164414319 Y TKTL2,C4orf43 NA NA NA NA NA NAF1 328149 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr4 164464203 164464350 164464219 Y NPY1R,NPY5R,MARCH1 NA NA NA NA NA NAF1 378130 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr4 165210734 165210789 165210744 Y NA NA NA NA NA NA RP11-366M4.3 585367 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 166331391 166331603 166331463 Y C4orf39,CPE NA NA NA NA NA MSMO1 84616 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 169791118 169791499 169791286 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 137927 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 174185845 174186217 174186078 Y NA NA NA NA NA NA HMGB2 68059 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 174285204 174285286 174285258 Y NA HMGB2,SAP30 SAP30 K562 ChIA-PET 22265404 SAP30 3834 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 174337339 174338040 174337759 Y SAP30 SAP30 HMGB2,GALNT7,SAP30 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SAP30 48219 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr4 177715411 177715680 177715585 Y VEGFC NA NA NA NA NA RP11-87F15.2 475802 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 184328356 184328744 184328447 Y CDKN2AIP CDKN2AIP WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 35000 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 185189191 185189340 185189323 Y IRF2,CASP3 NA IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111,MLF1IP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2 204394 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 185296048 185296446 185296396 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 97288 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 185298493 185298859 185298858 Y NA NA NA NA NA NA IRF2 94875 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 185303433 185303616 185303580 Y NA NA NA NA NA NA IRF2 90118 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr4 185306912 185307204 185307108 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 86530 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr4 185393561 185393895 185393573 Y ACSL1,CASP3,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr4 185613623 185613900 185613762 Y CCDC111 CASP3 NA NA NA NA CASP3 44960 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr4 187766570 187766763 187766651 Y NA NA FAT1,LOC339975 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYP4V2 655896 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 402925 403258 403130 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 38000 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 656184 656577 656381 Y SLC9A3,ZDHHC11,TPPP CEP72 NA NA NA NA CEP72 45797 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 672861 673336 673024 Y NA NA NA NA NA NA CEP72 62474 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr5 963791 964176 964051 Y NA RP11-43F13.3,NKD2 SLC12A7,TRIP13,BRD9,LOC100506688 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-43F13.3 31247 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 964244 964536 964396 Y NKD2 RP11-43F13.3,NKD2 SLC12A7,TRIP13,BRD9,LOC100506688 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-43F13.3 30887 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr5 1130725 1130985 1130924 Y NA NA BRD9,LOC100506688,TRIP13,SLC12A7,NKD2,SLC6A18,CLPTM1L,MIR4457,ZDHHC11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NKD2 123781 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 1313264 1313453 1313378 Y NA TERT,CLPTM1L NA NA NA NA TERT 20080 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 1315765 1316275 1315843 Y TERT TERT,CLPTM1L TERT IMR90 Hi-C 24141950 TERT 22581 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr5 1316464 1316882 1316563 Y TERT,SLC6A3 TERT,CLPTM1L TERT IMR90 Hi-C 24141950 TERT 23280 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr5 1782613 1782742 1782678 Y TERT MRPL36,NDUFS6 NA NA NA NA MRPL36 16738 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr5 2594554 2594649 2594602 Y NA NA NA NA NA NA NDUFS6 795040 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA SRD5A1 81417 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 5.76197713739582 chr5 10229611 10229778 10229690 Y NA FAM173B,CCT5 NA NA NA NA FAM173B 18231 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 10422961 10423316 10423021 Y NA NA NA NA NA NA RPL30P7 63616 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 10565896 10566253 10566086 Y NA ANKRD33B NA NA NA NA ANKRD33B 3454 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 11524882 11524979 11524955 Y CTNND2 NA NA NA NA NA DAP 765498 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 12314219 12314247 12314235 Y NA NA NA NA NA NA DAP 1554835 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 14142332 14142650 14142445 Y NA TRIO NA NA NA NA TRIO 521 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 14142803 14143164 14142969 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 992 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 14174472 14174896 14174531 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 32661 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 14673178 14673249 14673214 Y NA EEF1A1P13,FAM105B NA NA NA NA FAM105B 10405 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 14937373 14937729 14937572 Y FAM105A NA ANKH,FAM105B IMR90 Hi-C 24141950 ANKH 67486 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 16539355 16539674 16539525 Y FAM134B NA NA NA NA NA ZNF622 75454 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 16727981 16728387 16728161 Y FAM134B NA NA NA NA NA FAM134B 112814 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr5 25910581 25911176 25910785 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 721816 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr5 31459519 31459540 31459530 Y NA NA NA NA NA NA DROSHA 70763 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 32349231 32349269 32349250 Y NA MTMR12 NA NA NA NA MTMR12 38116 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 33442170 33442454 33442303 Y NA CTD-2203K17.1,TARS NA NA NA NA TARS 3368 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 34048471 34048803 34048799 Y NA AMACR NA NA NA NA AMACR 42251 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 35855453 35855636 35855568 Y IL7R IL7R NA NA NA NA IL7R 4656 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 35859478 35859884 35859711 Y NA IL7R NA NA NA NA IL7R 8681 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 35884312 35884698 35884400 Y NA IL7R NA NA NA NA IL7R 33515 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 36229884 36229947 36229916 Y UGT3A1,C5orf33,C5orf33 NA NA NA NA NA RANBP3L 70269 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 36277859 36278299 36278119 Y NA RANBP3L NA NA NA NA RANBP3L 21917 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 36425659 36425959 36425758 Y NA NA NA NA NA NA RANBP3L 125443 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 36689194 36689678 36689532 Y NIPBL CTD-2353F22.1 NA NA NA NA CTD-2353F22.1 33619 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 36690488 36690876 36690655 Y NIPBL CTD-2353F22.1 NA NA NA NA CTD-2353F22.1 32421 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 37029618 37029862 37029736 Y NA NA NA NA NA NA NIPBL 154757 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 38968924 38969094 38969009 Y NA NA NA NA NA NA RICTOR 103416 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 39072904 39073873 39073587 Y FYB,RICTOR RICTOR NA NA NA NA RICTOR 394 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 39215442 39215743 39215646 Y RICTOR,FYB NA NA NA NA NA RICTOR 142932 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 39721328 39721512 39721418 Y NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 RICTOR 648818 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 40384315 40384536 40384395 Y PTGER4,PRKAA1 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 293064 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 40386604 40386824 40386669 Y PTGER4 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 290776 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 41084074 41084331 41084322 Y NA NA NA NA NA NA CARD6 244788 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 41845041 41845055 41845050 Y OXCT1,FBXO4 OXCT1 NA NA NA NA OXCT1 23566 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 42994649 42995346 42995172 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 21185 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.54589630515498 chr5 43007637 43008177 43007831 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 8354 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 43008201 43008438 43008332 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 8093 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 43010298 43010802 43010620 Y GHR,ZNF131,C5orf39 CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 5729 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 43020158 43020617 43020275 Y C5orf28,ZNF131,C5orf39 CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 3627 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr5 43038627 43038828 43038720 Y ZNF131,C5orf39 CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA AC025171.1 849 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 45599934 45599939 45599937 Y HCN1 NA NA NA NA NA MRPS30 792907 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 49653216 49653308 49653301 Y PARP8 NA NA NA NA NA EMB 83774 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 49660016 49660402 49660209 Y NA NA NA NA NA NA EMB 76680 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 49719324 49719499 49719409 Y PARP8 EMB NA NA NA NA EMB 17583 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 53293727 53293898 53293842 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 310514 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 53309437 53310024 53309694 Y ARL15 NA NA NA NA NA ARL15 294388 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 53317506 53317866 53317808 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 286546 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 54622279 54622499 54622328 Y NA DHX29,SKIV2L2 NA NA NA NA SKIV2L2 20691 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr5 54729958 54730125 54730050 Y SKIV2L2,DDX4 NA NA NA NA NA RNF138P1 94404 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 54741987 54742107 54742028 Y NA NA NA NA NA NA RNF138P1 82422 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 55969082 55969325 55969253 Y MAP3K1 NA MAP3K1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAP3K1 140076 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 56025254 56025318 56025310 Y MAP3K1,GPBP1,GPBP1 NA NA NA NA NA MAP3K1 84083 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr5 56131312 56131556 56131415 Y GPBP1,GPBP1,GPBP1,MAP3K1 MAP3K1 NA NA NA NA MAP3K1 21911 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 56468272 56468727 56468348 Y MAP3K1,C5orf35,GPBP1,GPBP1,GPBP1 GPBP1 NA NA NA NA GPBP1 497 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 58359884 58360252 58360059 Y RAB3C,PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA DEPDC1B 1633765 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 58866470 58866828 58866806 Y NA NA NA NA NA NA DEPDC1B 1127189 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 59183388 59183889 59183871 Y NA NA NA NA NA NA DEPDC1B 810128 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 59492329 59492580 59492443 Y NA NA NA NA NA NA DEPDC1B 501437 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 59917855 59917860 59917858 Y NA NA NA NA NA NA DEPDC1B 76157 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 60571773 60571988 60571884 Y ZSWIM6 NA NDUFAF2 IMR90 Hi-C 24141950 ZSWIM6 54112 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 60626678 60627139 60626902 Y ZSWIM6 ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 578 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 60629701 60630027 60629731 Y ZSWIM6 ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 3601 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 60704594 60705129 60704691 Y NA RPL3P6 NA NA NA NA RPL3P6 18896 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 60930420 60930711 60930566 Y NA NA NA NA NA NA RPL3P6 244722 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 64778400 64778738 64778694 Y NA ADAMTS6 NA NA NA NA ADAMTS6 2653 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 64821420 64821488 64821458 Y NA ADAMTS6,CENPK,PPWD1 NA NA NA NA CENPK 35510 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 65329982 65330329 65330156 Y NA NA NA NA NA NA SREK1 103470 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 65447669 65447962 65447814 Y SREK1,SREK1 SREK1 NA NA NA NA SREK1 13870 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 66498749 66498986 66498818 Y CD180 CD180 MAST4 IMR90 Hi-C 24141950 CD180 8122 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 66511530 66511924 66511850 Y NA CD180 MAST4,PIK3R1 MCF7 ChIA-PET 22265404 CD180 20903 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 66518350 66518491 66518422 Y CD180 CD180 NA NA NA NA CD180 27723 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 67806918 67806931 67806925 Y NA NA NA NA NA NA PIK3R1 297370 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 68338463 68338878 68338699 Y NA SLC30A5 NA NA NA NA SLC30A5 48595 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 3.93500877675812 chr5 71424352 71424432 71424374 Y NA MAP1B NA NA NA NA MAP1B 23291 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 71505945 71506221 71506083 Y NA NA NA NA NA NA MAP1B 104884 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 71998945 71999238 71999064 Y NA NA ZNF366,TNPO1 IMR90 Hi-C 24141950 TNPO1 110901 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 73926262 73926632 73926507 Y FAM169A HEXB,ENC1 NA NA NA NA HEXB 7216 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 74020638 74021005 74020822 Y NA NSA2,GFM2 NA NA NA NA NSA2 39812 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 74353522 74353651 74353610 Y ANKRD31,FAM169A NA NA NA NA NA HMGCR 276503 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 75599689 75600175 75599911 Y IQGAP2 NA NA NA NA NA RP11-156N15.1 70325 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 75769607 75769838 75769712 Y IQGAP2,S100Z NA NA NA NA NA IQGAP2 72533 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 75796812 75797204 75796850 Y IQGAP2,S100Z NA NA NA NA NA IQGAP2 99738 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 76590045 76590451 76590191 Y NA NA NA NA NA NA ZBED3 208897 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 77374282 77374304 77374295 Y NA NA NA NA NA NA TBCA 211678 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 78095218 78095295 78095257 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2073O6.1 85313 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 78270986 78271091 78271032 Y NA ARSB NA NA NA NA ARSB 8819 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 78279443 78279488 78279465 Y NA ARSB NA NA NA NA ARSB 422 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 79428091 79428419 79428255 Y SERINC5 NA NA NA NA NA SERINC5 121479 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 79458255 79458620 79458438 Y MSH3,SERINC5 NA NA NA NA NA SERINC5 91278 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 79487807 79488093 79488033 Y SERINC5 NA NA NA NA NA SERINC5 61805 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 80705760 80705793 80705777 Y ACOT12 NA NA NA NA NA ZCCHC9 110351 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 80898051 80898414 80898329 Y NA NA NA NA NA NA SSBP2 147202 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr5 80927026 80927304 80927299 Y NA NA NA NA NA NA SSBP2 118312 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 80989989 80990372 80990282 Y NA NA NA NA NA NA SSBP2 55244 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 81045433 81045821 81045530 Y NA NA NA NA NA NA SSBP2 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr5 81074673 81075064 81074862 Y NA SSBP2 SSBP2,ZCCHC9,ATG10 IMR90 Hi-C 24141950 SSBP2 29057 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 81147637 81148063 81147790 Y NA CTD-2249K22.1 ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2249K22.1 2217 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.54589630515498 chr5 81148608 81149026 81148707 Y SSBP2 CTD-2249K22.1 ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2249K22.1 3188 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 81465137 81465359 81465307 Y ATP6AP1L NA NA NA NA NA RPS23 107037 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 82453115 82453241 82453191 Y TMEM167A,XRCC4,VCAN NA NA NA NA NA TMEM167A 81433 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 82807080 82807411 82807109 Y XRCC4,VCAN NA NA NA NA NA TMEM167A 435398 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 86662563 86662890 86662661 Y RASA1,RASA1 CCNH NA NA NA NA CCNH 43946 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 86667091 86667409 86667357 Y NA CCNH NA NA NA NA CCNH 39427 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 88049137 88049533 88049445 Y MEF2C NA NA NA NA NA MEF2C-AS1 127612 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 88125046 88125161 88125149 Y MEF2C NA NA NA NA NA MEF2C-AS1 51984 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr5 88159446 88159658 88159552 Y NA MEF2C-AS1,MEF2C NA NA NA NA MEF2C-AS1 17487 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 88171082 88171456 88171409 Y MEF2C MEF2C-AS1,MEF2C NA NA NA NA MEF2C-AS1 5689 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 88177466 88177636 88177509 Y NA MEF2C-AS1,MEF2C NA NA NA NA MEF2C-AS1 321 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr5 90673049 90673245 90673226 Y ARRDC3 ARRDC3 NA NA NA NA ARRDC3 3931 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr5 90679835 90680013 90679955 Y ARRDC3 ARRDC3 NA NA NA NA ARRDC3 2659 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 91949366 91949620 91949441 Y NA NA NA NA NA NA NPM1P27 1067753 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 92593669 92593984 92593827 Y NA NA FLJ42709 IMR90 Hi-C 24141950 NPM1P27 423389 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr5 93304446 93304744 93304683 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 140660 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 94052096 94052474 94052285 Y KIAA0825 NA NA NA NA NA KIAA0825 99787 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 95170754 95171173 95170855 Y GLRX,ELL2 GLRX RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 14045 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 95178953 95179190 95179087 Y GLRX,ELL2 GLRX GLRX,SPATA9,RFESD,RHOBTB3,C5orf27 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 22244 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 96142552 96142955 96142798 Y CAST,CAST,LNPEP ERAP1 NA NA NA NA ERAP1 749 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 98262747 98263243 98263080 Y CHD1 NA NA NA NA NA CTD-2007H13.3 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 99382569 99383254 99382906 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 485712 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 99387251 99388845 99388529 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 480121 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr5 100175986 100176458 100176300 Y ST8SIA4,ST8SIA4 NA NA NA NA NA ST8SIA4 60512 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 100213080 100213240 100213164 Y ST8SIA4,ST8SIA4 ST8SIA4 NA NA NA NA ST8SIA4 23730 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 101134919 101134927 101134923 Y NA NA NA NA NA NA ST8SIA4 897949 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 102091646 102092087 102091846 Y NA PAM NA NA NA NA PAM 3961 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr5 102304978 102305194 102305031 Y NA NA NA NA NA NA PPIP5K2 148659 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 102878534 102878661 102878604 Y C5orf30 NA NA NA NA NA C5orf30 286131 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 108460806 108460908 108460857 Y NA NA NA NA NA NA PJA2 282787 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 108735031 108735161 108735096 Y NA PJA2 NA NA NA NA PJA2 8534 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 108791627 108791782 108791705 Y NA PJA2 PJA2 IMR90 Hi-C 24141950 PJA2 47932 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 109807174 109807435 109807305 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A46 264402 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 111018976 111019194 111019085 Y C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13 NA NA NA NA NA STARD4 172688 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 111054290 111054596 111054444 Y C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13 NA NA NA NA NA STARD4 208002 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr5 111110231 111110436 111110341 Y NA NA NA NA NA NA STARD4 263943 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 114881094 114881387 114881239 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 2503 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 114959651 114959879 114959766 Y COMMD10 AC010226.4,TMED7 NA NA NA NA TMED7-TICAM2,TICAM2 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 115412236 115412448 115412328 Y NA CTD-2287O16.1,COMMD10 NA NA NA NA COMMD10 6240 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 115794810 115794877 115794844 Y COMMD10,SEMA6A NA NA NA NA NA CTB-118N6.1 101381 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 118592872 118593203 118593036 Y NA TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 9184 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 118610393 118610883 118610628 Y DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8 TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 8006 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr5 118626064 118626362 118626186 Y DMXL1,TNFAIP8 TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 23677 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 11.2428822193089 chr5 118627745 118627943 118627845 Y NA TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 25358 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 118677194 118677610 118677495 Y DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8 NA NA NA NA NA TNFAIP8 74807 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 119079822 119079988 119079905 Y NA NA NA NA NA NA HSD17B4 293684 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 122885327 122885717 122885442 Y CEP120,CSNK1G3 CSNK1G3 NA NA NA NA CSNK1G3 39534 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 123774307 123774708 123774529 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 307792 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 123966351 123966687 123966497 Y NA NA NA NA NA NA ZNF608 115813 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 123997171 123997561 123997207 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 84939 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 124006979 124007355 124007057 Y NA NA NA NA NA NA ZNF608 75145 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 124042490 124042759 124042619 Y NA ZNF608 NA NA NA NA ZNF608 39741 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 126307935 126308247 126308163 Y NA NA NA NA NA NA MARCH3 56253 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 126847905 126848122 126848004 Y NA PRRC1 PRRC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 PRRC1 3179 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 130711215 130711396 130711236 Y NA NA NA NA NA NA CDC42SE2 132029 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 131629178 131629624 131629352 Y FNIP1,IRF1,SLC22A4 P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 170 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 131763102 131763516 131763179 Y SLC22A4,IRF1 C5orf56,AC116366.6 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 C5orf56 18774 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 132323487 132323535 132323508 Y NA AFF4,AC010240.3,ZCCHC10 NA NA NA NA AC010240.3 1685 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 132368718 132369095 132368932 Y AFF4,ZCCHC10 AC010240.3,ZCCHC10,HSPA4 ZCCHC10,HSPA4,AFF4 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZCCHC10 8422 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 132581339 132581487 132581431 Y ANKRD43 NA NA NA NA NA HSPA4 195685 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 133266048 133266394 133266263 Y NA C5orf15 NA NA NA NA C5orf15 36084 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 133270974 133271015 133270995 Y NA C5orf15 NA NA NA NA C5orf15 31463 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 133313011 133313350 133313119 Y UBE2B,PPP2CA C5orf15,VDAC1 NA NA NA NA C5orf15 10533 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 133330374 133330645 133330542 Y NA C5orf15,VDAC1 C5orf15 IMR90 Hi-C 24141950 VDAC1 8179 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr5 133331351 133332089 133331904 Y NA C5orf15,VDAC1 C5orf15 IMR90 Hi-C 24141950 VDAC1 6735 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.68643233289634 chr5 133863130 133863560 133863438 Y NA NA NA NA NA NA CDKN2AIPNL 117541 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND4P12,MIR4461 NA NA NA NA MTND6P4 1315 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4 NA NA NA NA MTND4P12,MIR4461 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 134712896 134713181 134712989 Y SLC25A48,H2AFY H2AFY NA NA NA NA H2AFY 20423 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 134729023 134729250 134729122 Y H2AFY H2AFY NA NA NA NA H2AFY 4354 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 137001251 137001596 137001494 Y NA NA NA NA NA NA KLHL3 68183 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 137370531 137370718 137370637 Y PKD2L2,KDM3B,FAM53C,FAM53C,FAM13B,NME5 FAM13B PKD2L2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM13B 14932 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 137799770 137800154 137799916 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 591 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr5 137800317 137800564 137800421 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 1138 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr5 138277949 138278244 138278038 Y NA NA NA NA NA NA MATR3 329197 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 138620359 138620541 138620439 Y UBE2D2,MATR3 MATR3,SIL1 NA NA NA NA SIL1 6705 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr5 138786651 138786712 138786682 Y NA SPATA24,DNAJC18 NA NA NA NA DNAJC18 8471 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 138965572 138965797 138965632 Y NA NA NA NA NA NA CXXC5 59087 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr5 139017934 139018665 139018227 Y MZB1,CXXC5 CXXC5 CXXC5 IMR90 Hi-C 24141950 CXXC5 6219 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 139022530 139022885 139022670 Y NA CXXC5 CXXC5 IMR90 Hi-C 24141950 CXXC5 1999 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 139049454 139050310 139049802 Y MATR3,MZB1,CXXC5 CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 24570 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr5 139488718 139489038 139488945 Y NA PURA NRG2,CYSTM1,IGIP IMR90 Hi-C 24141950 PURA 3356 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 139636160 139636260 139636251 Y SRA1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 44446 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr5 139782360 139782578 139782471 Y NA ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3 NA NA NA NA ANKHD1-EIF4EBP3 2867 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 139933633 139933898 139933723 Y ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3 EIF4EBP3,SRA1 NA NA NA NA SRA1 1997 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 140875639 140876085 140875835 Y PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1 PCDHGC3 NA NA NA NA PCDHGC3 22059 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr5 140893513 140893891 140893828 Y PCDH12,KIAA0141,DIAPH1 PCDHGC3 NA NA NA NA PCDHGC3 39933 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 140985133 140985553 140985464 Y TAF7,PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1 DIAPH1,HDAC3,RELL2 NA NA NA NA DIAPH1 11069 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 141256552 141256862 141256814 Y PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1,PCDH1 KIAA0141 NA NA NA NA KIAA0141 44511 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 142315332 142315934 142315386 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 167383 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 142383259 142383413 142383268 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP26 235310 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 142535933 142536319 142536126 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P21 173851 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 142785420 142785784 142785543 Y NR3C1 NR3C1 ARHGAP26 IMR90 Hi-C 24141950 NR3C1 27293 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 146268013 146268084 146268061 Y STK32A,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B NA NA NA NA NA TCERG1 443139 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 148668144 148668260 148668168 Y AFAP1L1 NA NA NA NA NA PCYOX1L 67310 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 149110531 149110757 149110649 Y PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2670 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 149422019 149422297 149422100 Y NA HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA TIGD6 43289 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 149789263 149789759 149789627 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,CD74,CD74 CD74,RPS14 NA NA NA NA CD74 733 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 150267218 150267533 150267276 Y IRGM NA NA NA NA NA DCTN4 130547 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 150505089 150505277 150505181 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,TNIP1,CCDC69,ANXA6 TNIP1,ANXA6 TNIP1 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA6 30166 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 150593680 150594043 150593885 Y DCTN4,DCTN4,TNIP1,SLC36A1,CCDC69 GM2A,CCDC69 NA NA NA NA GM2A 3969 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 151119916 151120243 151119990 Y NA RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1 SPARC IMR90 Hi-C 24141950 RP11-54C4.1 23696 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 151200780 151201112 151200835 Y GLRA1 NA NA NA NA NA ATOX1 50687 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 154205315 154205569 154205444 Y KIF4B,GEMIN5 CNOT8 NA NA NA NA CNOT8 29544 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr5 154871450 154872048 154871744 Y KIF4B NA NA NA NA NA MRPL22 552820 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr5 156599431 156599694 156599562 Y FNDC9,CYFIP2,CYFIP2,ITK HAVCR2,MED7 NA NA NA NA MED7 15401 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 156698884 156699173 156698941 Y HAVCR2,NIPAL4,ADAM19,CYFIP2,CYFIP2,CYFIP2 CYFIP2 NA NA NA NA CYFIP2 7795 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 156718541 156718931 156718583 Y HAVCR2,ADAM19,CYFIP2,CYFIP2,CYFIP2 CYFIP2 NA NA NA NA CYFIP2 27452 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr5 156814689 156815040 156814693 Y NA NA NA NA NA NA CYFIP2 123600 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr5 156939273 156939536 156939403 Y NA NA NA NA NA NA ADAM19 61247 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 157022180 157022337 157022277 Y HAVCR2,NIPAL4,ADAM19 ADAM19 CYFIP2,FNDC9,NIPAL4,ADAM19,SOX30,C5orf52,THG1L,LSM11 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM19 21397 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 157621558 157621972 157621746 Y NA CTC-436K13.5 EBF1 IMR90 Hi-C 24141950 CTC-436K13.5 20128 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr5 157669030 157669040 157669036 Y NA NA NA NA NA NA CTC-436K13.5 67600 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr5 157816902 157817244 157817074 Y NA NA EBF1,LOC285626,IL12B IMR90 Hi-C 24141950 CTC-436K13.5 215472 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 17.7075394954115 chr5 157817633 157817942 157817746 Y NA NA EBF1,LOC285626,IL12B IMR90 Hi-C 24141950 CTC-436K13.5 216203 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 157938513 157938762 157938602 Y NA NA NA NA NA NA CTC-436K13.5 337083 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.96750438837906 chr5 158136422 158136652 158136537 Y NA NA NA NA NA NA EBF1 388117 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 158166813 158166864 158166841 Y NA NA NA NA NA NA EBF1 357905 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 158201990 158201999 158201995 Y NA NA NA NA NA NA EBF1 322770 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr5 158245937 158246321 158246106 Y NA NA NA NA NA NA EBF1 278448 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr5 158248563 158248909 158248669 Y EBF1 NA NA NA NA NA EBF1 275860 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 158260214 158260321 158260268 Y NA NA NA NA NA NA EBF1 264448 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 158326675 158326933 158326881 Y NA NA NA NA NA NA EBF1 197836 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 158364876 158365080 158364964 Y NA NA NA NA NA NA EBF1 159689 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 158448175 158448456 158448348 Y RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,IL12B NA NA NA NA NA EBF1 76313 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 158471730 158472045 158472013 Y NA NA NA NA NA NA EBF1 52724 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr5 158478339 158478495 158478452 Y EBF1 EBF1,RP11-175K6.1 NA NA NA NA EBF1 46274 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr5 158481442 158481711 158481685 Y NA EBF1,RP11-175K6.1 NA NA NA NA EBF1 43058 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 158489129 158489509 158489418 Y NA EBF1,RP11-175K6.1 NA NA NA NA EBF1 35260 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 158507046 158507207 158507202 Y NA EBF1,RP11-175K6.1 NA NA NA NA EBF1 17562 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 158521683 158522288 158522053 Y EBF1 EBF1,RP11-175K6.1 NA NA NA NA EBF1 2481 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr5 158611896 158612266 158612182 Y IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145 RNF145 NA NA NA NA RNF145 22795 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 158764609 158764870 158764738 Y RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,IL12B NA NA NA NA NA UBLCP1 76520 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 159414162 159414427 159414404 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 19693 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 159451021 159451194 159451125 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 16901 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 159533500 159533764 159533742 Y NA PWWP2A NA NA NA NA PWWP2A 10666 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 159688113 159688294 159688164 Y CCNJL RP11-34P1.2 NA NA NA NA RP11-34P1.2 4853 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 159837617 159837836 159837727 Y NA C5orf54,SLU7,PTTG1 NA NA NA NA SLU7 8882 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 159951614 159951766 159951649 Y FABP6 NA NA NA NA NA MIR146A 58339 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 162202155 162202531 162202344 Y NA NA NA NA NA NA RP11-541P9.3 659801 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 163187606 163187815 163187725 Y NA NA NA NA NA NA MAT2B 259486 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 163767017 163767182 163767164 Y NA CTC-340A15.2 NA NA NA NA CTC-340A15.2 45315 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr5 163787570 163787906 163787815 Y NA NA NA NA NA NA CTC-340A15.2 65868 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 164057443 164057448 164057446 Y NA NA NA NA NA NA CTC-340A15.2 335741 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 164189701 164189961 164189831 Y NA NA NA NA NA NA CTC-340A15.2 467999 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 164442746 164442751 164442749 Y NA NA NA NA NA NA CTC-340A15.2 721044 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr5 164615750 164616137 164615944 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P20 838179 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 166427113 166427459 166427286 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P20 972797 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 166810731 166810955 166810843 Y NA NA NA NA NA NA RARS 1100495 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 168503083 168503413 168503326 Y NA NA NA NA NA NA CTC-575D19.1 461766 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 169215174 169215454 169215255 Y DOCK2 NA NA NA NA NA DOCK2 152923 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 171498342 171498743 171498483 Y NA NA NA NA NA NA FBXW11 66465 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 171602273 171602685 171602548 Y STK10 STK10 NA NA NA NA STK10 10705 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr5 171605811 171606325 171606156 Y STK10 STK10 NA NA NA NA STK10 7065 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr5 171606484 171606964 171606720 Y UBTD2,STK10 STK10 NA NA NA NA STK10 6426 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 172192263 172193766 172192583 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2432 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 172193800 172194232 172193914 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 1966 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr5 172198749 172199959 172199636 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2551 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 172264744 172264958 172264926 Y DUSP1,C5orf41,ERGIC1 ERGIC1 NA NA NA NA ERGIC1 5466 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr5 172327024 172327318 172327167 Y NA NA NA NA NA NA RPL26L1 56414 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 172451248 172451363 172451250 Y NA ATP6V0E1 NA NA NA NA ATP6V0E1 42488 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 172663658 172663862 172663754 Y NA NA NA NA NA NA STC2 90644 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 172710965 172711353 172711102 Y NA STC2 ATP6V0E1,BNIP1,LOC285593,NKX2-5,NEURL1B,RPL26L1,STC2,C5orf41 IMR90 Hi-C 24141950 STC2 43153 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 173293652 173293800 173293732 Y CPEB4 CPEB4 CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 19483 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 174670280 174670302 174670292 Y NA NA DRD1 IMR90 Hi-C 24141950 SFXN1 231763 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 174906234 174906555 174906308 Y NA SFXN1 NA NA NA NA SFXN1 4169 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 175302369 175302773 175302579 Y DRD1,CPLX2,C5orf25,CPLX2 NA NA NA NA NA HRH2 219336 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 175347355 175347516 175347492 Y NA NA CPLX2 IMR90 Hi-C 24141950 HRH2 264322 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 175960481 175960718 175960661 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,RNF44,CDHR2 RNF44 NA NA NA NA RNF44 2308 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 175962179 175962700 175962413 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,HK3,HIGD2A,RNF44,CDHR2 RNF44 FAF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 RNF44 326 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr5 176421508 176421945 176421807 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,RAB24,GRK6,HK3 UIMC1,ZNF346 NA NA NA NA UIMC1 25689 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 176699119 176699281 176699198 Y NSD1 RAB24,PRELID1,MXD3 NA NA NA NA RAB24 29464 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 176782864 176783054 176782988 Y NA MXD3,LMAN2,RGS14,GRK6 NA NA NA NA RGS14 26 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 176856256 176856655 176856453 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,NSD1,RAB24,RGS14,FAM193B,GRK6,PRR7,DOK3,DOK3 GRK6,PRR7,DBN1 NA NA NA NA PRR7 14791 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 176973275 176973657 176973542 Y NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3 DOK3,DDX41,FAM193B,TMED9 NA NA NA NA FAM193B 5885 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 177041998 177042331 177042024 Y NSD1 TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 16897 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr5 177541057 177541427 177541157 Y N4BP3 N4BP3,RMND5B,NHP2 NA NA NA NA N4BP3 2613 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr5 177543541 177543921 177543784 Y AGXT2L2,N4BP3 N4BP3,RMND5B,NHP2 NA NA NA NA N4BP3 5097 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 177645267 177645446 177645363 Y N4BP3,CLK4,AGXT2L2 HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 15759 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 177645477 177646261 177645593 Y NA HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 15969 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 179350502 179350731 179350619 Y RUFY1,HNRNPH1,MAML1,SQSTM1,RNF130 TBC1D9B RNF130 IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D9B 17643 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr5 179399876 179400065 179399971 Y RNF130,RASGEF1C NA NA NA NA NA TBC1D9B 67017 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 179434619 179435010 179434852 Y NA NA NA NA NA NA RNF130 62108 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 179496400 179496705 179496553 Y NA RNF130 NA NA NA NA RNF130 413 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 179604412 179604725 179604569 Y RASGEF1C RASGEF1C NA NA NA NA RASGEF1C 29428 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 180611137 180611357 180611292 Y MGAT1 CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 5567 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 180615864 180616079 180615972 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 845 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr5 180616521 180617006 180616799 Y ZFP62,TRIM52,TRIM41 TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A NA NA NA NA CTC-338M12.5 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 3.37286466579267 chr5 180634441 180634803 180634658 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM7 4148 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 235986 236322 236025 Y NA NA DUSP22,IRF4,EXOC2 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP22 53308 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 257100 257415 257248 Y DUSP22 DUSP22 IRF4 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP22 32215 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr6 286457 287090 286788 Y NA DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 2540 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 317745 318083 317920 Y DUSP22,IRF4 DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 28115 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 393896 394326 394097 Y DUSP22,IRF4,EXOC2 IRF4 NA NA NA NA IRF4 4157 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 3.09179261030995 chr6 422827 423098 422962 Y DUSP22,IRF4 IRF4 NA NA NA NA IRF4 33088 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 541825 541828 541827 Y NA NA NA NA NA NA EXOC2 149289 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 710742 711015 710979 Y HUS1B EXOC2 NA NA NA NA EXOC2 19625 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 711154 711526 711478 Y DUSP22,EXOC2 EXOC2 NA NA NA NA EXOC2 20037 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr6 2733560 2734016 2733750 Y SERPINB9,SERPINB1,RIPK1,NQO2 WRNIP1 NA NA NA NA WRNIP1 29632 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 2767771 2767941 2767856 Y NA WRNIP1 NA NA NA NA WRNIP1 4123 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 3163246 3163428 3163368 Y NA BPHL,TUBB2A NA NA NA NA TUBB2A 7486 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 3238745 3238826 3238788 Y NA PSMG4 NA NA NA NA PSMG4 9108 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 3243120 3243374 3243247 Y TUBB2A,TUBB2B PSMG4 RIPK1,BPHL,TUBB2B,TUBB2A,LOC100507194 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG4 13483 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 3259939 3260435 3260206 Y NA PSMG4 NA NA NA NA PSMG4 30302 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 4447290 4447339 4447314 Y NA NA CDYL IMR90 Hi-C 24141950 CDYL 257054 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 4688350 4688741 4688427 Y NA CDYL CDYL,FAM217A,C6orf201,ECI2 IMR90 Hi-C 24141950 CDYL 15652 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 5031190 5031205 5031197 Y NA RPP40 RPP40 MCF7 ChIA-PET 22265404 RPP40 28893 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 5204719 5205035 5204877 Y NA NA NA NA NA NA LYRM4 54137 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 5206171 5206360 5206265 Y NA NA NA NA NA NA LYRM4 52812 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 5724236 5724398 5724319 Y NA NA NA NA NA NA NRN1 280802 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 5724558 5724824 5724692 Y NA NA NA NA NA NA NRN1 280376 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 5996432 5996750 5996575 Y NA NRN1 NA NA NA NA NRN1 8450 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 5997075 5997523 5997169 Y NRN1 NRN1 NA NA NA NA NRN1 7677 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 6008887 6009261 6009138 Y NRN1 NRN1 NA NA NA NA NRN1 3687 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr6 6331637 6331947 6331782 Y NA NA NA NA NA NA LY86 254394 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr6 6407628 6407920 6407729 Y LY86 NA NA NA NA NA LY86 178421 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr6 6657678 6658009 6657847 Y NA NA NA NA NA NA LY86 71337 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 6662049 6662264 6662157 Y NA NA NA NA NA NA LY86 75708 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 6702168 6702420 6702249 Y NA NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 LY86 115827 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr6 6879215 6879409 6879309 Y RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 226421 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 7052517 7053280 7052961 Y LY86 NA RREB1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RREB1 52550 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 7074033 7074425 7074227 Y LY86,RREB1,RREB1 RREB1 NA NA NA NA RREB1 31405 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 7174134 7174405 7174138 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 68304 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 7915829 7915944 7915887 Y SNRNP48 NA NA NA NA NA TXNDC5 108702 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 10407698 10407754 10407725 Y PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A NA NA NA NA NA PAK1IP1 285174 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 10520494 10520618 10520557 Y NA NA NA NA NA NA PAK1IP1 172310 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 11321238 11321480 11321378 Y NA NA NA NA NA NA NEDD9 59101 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 11393241 11393536 11393390 Y NEDD9 NEDD9 NEDD9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD9 12660 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 11730766 11731308 11730965 Y TMEM170B,HIVEP1 NA NA NA NA NA TMEM170B 194828 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 12577591 12578036 12577836 Y NA NA EDN1,TMEM170B IMR90 Hi-C 24141950 RPL15P3 65249 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 13147785 13147909 13147848 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-11P 64379 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 13261181 13261379 13261243 Y NA RNU1-11P NA NA NA NA RNU1-11P 48893 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 3.09179261030995 chr6 13373745 13373768 13373757 Y NA TBC1D7 NA NA NA NA TBC1D7 46930 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 13527016 13527208 13527126 Y TBC1D7,GFOD1,GFOD1 GFOD1,RPS4XP7,SIRT5 GFOD1,SIRT5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS4XP7 7518 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 13602068 13602103 13602086 Y NA SIRT5,NOL7 NA NA NA NA NOL7 11456 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 13636617 13636971 13636795 Y TBC1D7,GFOD1,CD83 NOL7 NA NA NA NA NOL7 23058 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 13649579 13649948 13649702 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 36020 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 13762938 13763200 13763069 Y RNF182 NA NA NA NA NA RANBP9 53142 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 14075513 14075713 14075634 Y RANBP9,CD83 CD83 DTNBP1,RNF182 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 40159 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 14211061 14211714 14211398 Y CD83 NA JARID2,DTNBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD83 95189 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 14452907 14453346 14453088 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 337035 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 14640701 14640843 14640773 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 524829 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr6 15299924 15300312 15299931 Y NA NA NA NA NA NA JARID2-AS1 53059 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 15313668 15313748 15313709 Y DTNBP1,JARID2 NA NA NA NA NA JARID2-AS1 66803 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.96750438837906 chr6 15365610 15365867 15365688 Y JARID2,DTNBP1 NA NA NA NA NA JARID2-AS1 118745 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 15542142 15542162 15542152 Y JARID2 NA NA NA NA NA DTNBP1 119127 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 16151584 16151748 16151704 Y NA MYLIP NA NA NA NA MYLIP 24228 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 16322882 16323237 16323091 Y MYLIP,ATXN1 NA NA NA NA NA GMPR 86071 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 16413735 16414124 16414005 Y MYLIP,ATXN1 NA NA NA NA NA GMPR 176924 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 17703484 17703614 17703560 Y KDM1B,FAM8A1,NUP153 NUP153 NA NA NA NA NUP153 1042 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 18365705 18366033 18365869 Y RNF144B RNF144B NA NA NA NA RNF144B 746 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 18419977 18420304 18420012 Y NA NA NA NA NA NA RNF144B 53198 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 18700371 18700729 18700516 Y NA NA NA NA NA NA RNF144B 333592 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 20239005 20239080 20239045 Y NA MBOAT1 MBOAT1 IMR90 Hi-C 24141950 MBOAT1 28335 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 20404913 20405227 20404970 Y MBOAT1 E2F3 NA NA NA NA E2F3 4515 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr6 20575670 20575691 20575681 Y NA CDKAL1 NA NA NA NA CDKAL1 42982 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 20642705 20642902 20642804 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 110017 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 20811412 20811642 20811580 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 278724 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 20868773 20869042 20868908 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 336085 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 20910575 20910817 20910696 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 377887 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 21022706 21023638 21022736 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 490018 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 21028713 21029000 21028890 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 496025 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 21098770 21098791 21098780 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 493181 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 21438877 21439001 21438926 Y NA NA CDKAL1 IMR90 Hi-C 24141950 SOX4 152971 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 21587723 21589288 21589205 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2684 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr6 21603523 21603934 21603831 Y SOX4 SOX4 NA NA NA NA SOX4 11551 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr6 21947021 21947287 21947156 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 355049 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 21997954 21998076 21998022 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 405982 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 22024666 22024942 22024815 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 432694 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 22073995 22074367 22074183 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 482023 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 24834309 24834321 24834317 Y NA NA NA NA NA NA GMNN 61150 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 24929581 24929797 24929724 Y NA PPIAP29 FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 PPIAP29 44850 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 2.24857644386178 chr6 25094713 25094741 25094729 Y NA NA NA NA NA NA FAM65B 54475 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2 NA NA NA NA HIST1H3A 25645 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 3.51340069353403 chr6 26026306 26026795 26026679 Y HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H4B 826 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr6 26029019 26029363 26029242 Y NA HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H3B 925 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 26034352 26034599 26034546 Y NA HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H2AB 2556 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 26126352 26126787 26126533 Y HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD NA NA NA NA HIST1H2AC 3979 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 26219063 26219301 26219164 Y NA HIST1H2BE,HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F NA NA NA NA HIST1H2AE 3898 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 26223563 26223671 26223616 Y NA HIST1H2BE,HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI NA NA NA NA HIST1H3E 180 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 26304989 26305345 26305268 Y NA HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI,HIST1H4H HCG11,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H2AE,HIST1H2BF,HIST1H2BG,HIST1H3D,HIST1H4E,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H4G,HIST1H2BI,HIST1H3G,HIST1H4H,BTN3A2,BTN2A2,BTN1A1,HMGN4,BTN3A3,HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,ABT1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H4H 21227 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr6 26322637 26323123 26322876 Y NA HIST1H4H,BTN3A2 HIST1H1D,HIST1H4F,ABT1,HIST1H4G,HMGN4,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2BI,HIST1H3G,HCG11,HIST1H4I,HIST1H2BK IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H4H 38875 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 26474010 26474599 26474187 Y NA BTN3A3,BTN2A1 NA NA NA NA BTN2A1 17860 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 26521003 26521206 26521108 Y HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1 HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 15427 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr6 26533222 26533398 26533310 Y NA HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 3235 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 26536966 26537248 26536997 Y NA HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 333 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 26537641 26538043 26537718 Y NA HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 1008 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 27145585 27145720 27145705 Y FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 31303 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr6 27145729 27146130 27146023 Y ZNF184 HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 30893 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr6 27156271 27156423 27156401 Y NA HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 20600 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 27416333 27416557 27416445 Y NA ZNF184 NA NA NA NA ZNF184 22340 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 27446506 27447382 27447356 Y NA ZNF184 ZNF184,HIST1H2AG,MIR3143,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,PRSS16,LOC100131289,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,OR2B2,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2AM K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF184 7609 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr6 27759985 27760333 27760032 Y ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN NA NA NA NA HIST1H2BL 13376 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr6 27862895 27863061 27863012 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 3692 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr6 27863298 27863662 27863535 Y ZKSCAN3,ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZNF323,ZNF193,ZNF192,ZKSCAN4,PGBD1,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 4095 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr6 28080593 28080792 28080693 Y NA ZNF165,ZSCAN16 NA NA NA NA ZSCAN16 9546 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 28101066 28101269 28101177 Y OR2B2,ZNF187,ZKSCAN4,ZSCAN16 ZSCAN16 NA NA NA NA ZSCAN16 10728 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr6 28188130 28188520 28188276 Y ZNF193 ZKSCAN4 NA NA NA NA ZKSCAN4 36491 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 28601930 28602271 28602104 Y NA SCAND3 NA NA NA NA SCAND3 19941 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 28805076 28805418 28805247 Y NA XXbac-BPG308K3.5 NA NA NA NA XXbac-BPG308K3.5 293 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 28834475 28834586 28834545 Y NA XXbac-BPG308K3.5,HCG14 NA NA NA NA HCG14 27721 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr6 28860175 28860528 28860363 Y NA HCG14,TRIM27 NA NA NA NA HCG14 1779 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 28885422 28885544 28885424 Y NA HCG14,TRIM27 NA NA NA NA TRIM27 4222 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 29932777 29932958 29932802 Y HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A HLA-K,HLA-A,HLA-J NA NA NA NA HLA-A 25740 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 29933738 29934144 29933980 Y NA HLA-K,HLA-A,HLA-J NA NA NA NA HLA-A 26701 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 29935319 29935652 29935489 Y NA HLA-K,HLA-A,HLA-J NA NA NA NA HLA-A 28282 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 29949488 29949840 29949664 Y NA HLA-A,HLA-J NA NA NA NA HLA-J 22520 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 30177609 30178061 30177863 Y NA TRIM26,HLA-L NA NA NA NA TRIM26 1143 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 30254050 30254472 30254356 Y NA HLA-L,TRIM39,HCG18 NA NA NA NA HLA-L 28689 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 30276337 30276699 30276532 Y ATAT1,ATAT1 TRIM39,HCG18,RPP21 NA NA NA NA TRIM39 15557 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 30453844 30454132 30453996 Y ZNRD1,TUBB RANP1,HLA-E HLA-E MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HLA-E 1112 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 30477053 30477329 30477202 Y PPP1R11,TRIM40,TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,HLA-E,PRR3 RANP1,HLA-E,PRR3,GNL1 NA NA NA NA HLA-E 21809 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 30519269 30519607 30519590 Y NA PRR3,GNL1,ABCF1 NA NA NA NA PRR3 3056 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 30796195 30796565 30796398 Y HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3 DDR1 IER3,FLOT1,DDR1,VARS2,GTF2H4,C6orf136,DHX16,C6orf15,PSORS1C1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LINC00243 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 30804295 30804603 30804450 Y DDR1,DDR1 LINC00243,DDR1 FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,C6orf15,PSORS1C1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00243 7859 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr6 30845366 30845734 30845666 Y PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3 LINC00243,DDR1,GTF2H4,VARS2 NA NA NA NA DDR1 3168 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 31240851 31241006 31240942 Y NCR3,LY6G5B,LTB,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,ABHD16A,ABHD16A,HLA-C,HLA-B HLA-C,RPL3P2 NA NA NA NA HLA-C 2944 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 31702368 31703528 31702658 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5 NA NA NA NA CLIC1 2012 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 31705604 31706142 31705906 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1 NA NA NA NA MSH5 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,SNORD52,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 3244 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 32081652 32082042 32081917 Y NA ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8 NA NA NA NA ATF6B 11988 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 32405012 32405514 32405402 Y TAP2,TAP1,PSMB9,PSMB8,PSMB8,HLA-DRB1,HLA-DQB2,HLA-DQB1,HLA-DQA2,STK19,GPSM3,HLA-DRB5,HLA-DRA HLA-DRA,HLA-DRB9 HLA-DRA,HLA-DQB2,HLA-DQA2 IMR90 Hi-C 24141950 HLA-DRA 105 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 32571766 32572024 32571886 Y NA HLA-DRB1,HLA-DQA1 NA NA NA NA HLA-DRB1 16141 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 32789030 32789171 32789101 Y HSD17B8,PSMB8 TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1 NA NA NA NA TAP2 15386 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 32802290 32802518 32802510 Y NA TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1 NA NA NA NA TAP2 2039 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 32819276 32819643 32819486 Y HLA-DRA,HLA-DRB5,TAPBP,RGL2,HLA-DPA1,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,B3GALT4,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9 TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1 NA NA NA NA TAP1 112 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 32834766 32835076 32834920 Y BRD2,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9 TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1 NA NA NA NA TAP1 15011 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 32912229 32912629 32912303 Y HLA-DRB5,HLA-DRB1,HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DOB,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9,TAPBP,RGL2,HLA-DPB1,HLA-DPA1,B3GALT4,HLA-DMB,HLA-DOA,HLA-DMA,BRD2,BRD2 HLA-DMB,BRD2,HLA-DMA,BRD2-IT1 NA NA NA NA HLA-DMB 5382 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 32997077 32997532 32997301 Y HLA-DRB5,HLA-DRB1,HLA-DQA1,HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DQB2,HLA-DOB,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9,TAPBP,PHF1,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,HLA-DOA HLA-DOA,HLA-DPB1,HLA-DPA1 HLA-DPB2,VPS52,HLA-DPB1 IMR90 Hi-C 24141950 HLA-DOA 21688 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 33038663 33038946 33038898 Y HLA-DRB1,HLA-DQA1,HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DQB2,HLA-DOB,TAP2,PSMB8,TAP1,PSMB9,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,HLA-DOA,TAPBP,PHF1,HLA-DPB1,HLA-DPA1 HLA-DPB1,HLA-DPA1 NA NA NA NA HLA-DPB1 2757 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 33392796 33393285 33393082 Y SYNGAP1 KIFC1,PHF1,CUTA,ZBTB9 NA NA NA NA CUTA 8702 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 33396313 33396709 33396628 Y SYNGAP1 KIFC1,PHF1,CUTA,ZBTB9 NA NA NA NA CUTA 12219 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 33538911 33539356 33539169 Y LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1 BAK1,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 6663 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr6 33581625 33581918 33581825 Y NA BAK1,ITPR3 NA NA NA NA ITPR3 4224 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 33872168 33872571 33872419 Y PHF1,ZBTB9,LEMD2 NA NA NA NA NA LEMD2 117255 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr6 33872922 33873175 33873050 Y PHF1 NA NA NA NA NA LEMD2 118009 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 2.38911247160314 chr6 34048216 34048600 34048360 Y NA NA MIR1275 IMR90 Hi-C 24141950 CYCSP55 136616 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 34191726 34192136 34191830 Y C6orf1,HMGA1 CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2 RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1 MCF7 ChIA-PET 22265404 CYCSP55 6510 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 34358644 34359014 34358829 Y NA NUDT3,RPS10 NA NA NA NA NUDT3 193 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 34625381 34625487 34625387 Y HMGA1 C6orf106 NA NA NA NA C6orf106 37149 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 34992488 34992843 34992549 Y NA NA NA NA NA NA ANKS1A 137446 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 35016451 35016706 35016532 Y NA NA NA NA NA NA ANKS1A 161409 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr6 35017720 35018080 35017831 Y NA NA NA NA NA NA ANKS1A 162678 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 35279423 35279720 35279457 Y FKBP5,TAF11,ZNF76,RPL10A,DEF6 DEF6,PPARD NA NA NA NA DEF6 15828 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr6 35331114 35331538 35331252 Y PPARD PPARD NA NA NA NA PPARD 22779 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 35445364 35445634 35445501 Y RPL10A FANCE,RPL10A,TEAD3 NA NA NA NA RPL10A 11179 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 35569141 35569999 35569809 Y FKBP5,SLC26A8,SLC26A8,SLC26A8,MAPK14,FKBP5,FKBP5,ZNF76,DEF6 RP3-340B19.2 NA NA NA NA RP3-340B19.2 47491 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 35685740 35686068 35685867 Y NA FKBP5 NA NA NA NA FKBP5 8292 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 36560154 36560313 36560234 Y STK38,SRSF3 STK38,SRSF3,RNU1-88P NA NA NA NA SRSF3 9 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 37018897 37019476 37019424 Y SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2 FGD2 CPNE5,C6orf89,FGD2,PIM1,TMEM217,TBC1D22B IMR90 Hi-C 24141950 FGD2 47475 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 37070053 37070857 37070460 Y CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2 NA PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 65122 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr6 37366071 37366087 37366081 Y NA RNF8 NA NA NA NA RNF8 46323 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 37424991 37425195 37425093 Y NA CCDC167 CCDC167 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC167 40503 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 37464858 37465170 37465019 Y NA CCDC167 NA NA NA NA CCDC167 528 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 37470188 37470996 37470682 Y NA CCDC167 CCDC167,FTSJD2,MDGA1,RNF8,MIR4462,BTBD9 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CCDC167 4490 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 37484293 37484960 37484497 Y NA CCDC167 CCDC167,MDGA1,RNF8,FTSJD2,TBC1D22B,MIR4462,ZFAND3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC167 18595 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 37892657 37892863 37892737 Y NA NA NA NA NA NA ZFAND3 107382 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 40678267 40678503 40678338 Y NA NA APOBEC2 IMR90 Hi-C 24141950 LRFN2 125063 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 41512989 41513289 41513139 Y NA FOXP4,RP11-328M4.2 NA NA NA NA FOXP4 825 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 41906927 41907077 41907010 Y CCND3 USP49,MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 20001 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr6 41907242 41907431 41907365 Y TAF8,TFEB,CCND3 USP49,MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 20316 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr6 42255073 42255501 42255249 Y NA NA NA NA NA NA MRPS10 71470 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 42283764 42284050 42283900 Y NA NA NA NA NA NA MRPS10 100161 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 42348376 42348588 42348501 Y TRERF1 NA NA NA NA NA TRERF1 69201 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 42361651 42361664 42361659 Y TRERF1 NA NA NA NA NA TRERF1 56125 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 42409399 42409623 42409499 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 8166 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 42420719 42421067 42420926 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 2930 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr6 42722931 42723177 42723029 Y NA TBCC UBR2,KIAA0240,TBCC,PRPH2,RPL7L1,KLHDC3,RRP36,GUCA1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBCC 10373 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 42743007 42743021 42743017 Y CUL9,TRERF1,UBR2,TBCC,C6orf226 TBCC KIAA0240,UBR2,RPL7L1,C6orf226,PTCRA,TBCC,PRPH2,KLHDC3,MEA1,PPP2R5D IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBCC 30449 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 43351423 43351855 43351784 Y NA ZNF318,ABCC10 TJAP1,TTBK1,DLK2,POLH,SLC22A7,ABCC10,C6orf108,CUL9,YIPF3,LRRC73,POLR1C,CRIP3,ZNF318,XPO5 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF318 16207 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 44050434 44050837 44050619 Y NA RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1,TMEM63B,MRPL14 MAD2L1BP,GTPBP2,RSPH9,POLH,VEGFA,MRPS18A,XPO5,LOC100132354,TMEM63B,CAPN11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP5-1120P11.1 10045 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr6 44070488 44070804 44070651 Y NA RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1,TMEM63B,MRPL14 NA NA NA NA TMEM63B 21847 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr6 44205807 44206020 44205896 Y NA SLC29A1,HSP90AB1,SLC35B2,NFKBIE NA NA NA NA HSP90AB1 6804 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 44783475 44783845 44783660 Y NA NA NA NA NA NA CDC5L 430213 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 44887030 44887214 44887174 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 456476 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 45294493 45294953 45294580 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 48737 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 45299904 45300369 45300004 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 43321 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 45301191 45301441 45301316 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 42249 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 45392235 45392572 45392528 Y RUNX2 SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 48545 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 46685904 46686172 46686038 Y PLA2G7,PLA2G7 NA NA NA NA NA TNFRSF21 589469 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 47214948 47215452 47215060 Y NA NA NA NA NA NA TNFRSF21 60189 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 47263537 47263554 47263549 Y NA TNFRSF21 NA NA NA NA TNFRSF21 12087 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 52242466 52242866 52242548 Y NA PAQR8,EFHC1 NA NA NA NA PAQR8 18247 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 52247517 52247853 52247539 Y NA PAQR8,EFHC1 NA NA NA NA PAQR8 23298 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 52389241 52389494 52389368 Y NA NA NA NA NA NA TRAM2 50219 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 53191249 53191636 53191614 Y NA ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 20311 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 53195071 53195341 53195324 Y NA ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 16606 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 53224045 53224723 53224315 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 12098 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 2.38911247160314 chr6 53225010 53225140 53225110 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 13063 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 53297739 53297913 53297859 Y NA NA GCM1,FBXO9,ELOVL5 IMR90 Hi-C 24141950 ELOVL5 85792 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 53660581 53660848 53660781 Y LRRC1 LRRC1 NA NA NA NA LRRC1 3286 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 56296413 56296568 56296543 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1586 612779 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr6 56297273 56297383 56297328 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1586 611964 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 57354557 57355032 57354719 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 176954 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 57389697 57390070 57389732 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 212094 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 57396616 57396964 57396757 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 219013 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 58776280 58777091 58777029 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 521711 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 58777244 58778438 58777771 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 522675 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 58778631 58779245 58778717 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 524062 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr6 67062209 67062219 67062214 Y NA NA NA NA NA NA PHF3 2718484 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 73329727 73330142 73329822 Y NA KCNQ5 NA NA NA NA KCNQ5 207 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr6 73330314 73330844 73330342 Y NA KCNQ5 NA NA NA NA KCNQ5 794 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr6 73354930 73355043 73354987 Y NA KCNQ5 NA NA NA NA KCNQ5 25410 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 73355182 73355469 73355282 Y NA KCNQ5 NA NA NA NA KCNQ5 25662 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 73378236 73378609 73378395 Y NA KCNQ5 NA NA NA NA KCNQ5 48716 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 73728224 73728284 73728227 Y NA NA NA NA NA NA RP11-398K22.12 242654 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 73813476 73813625 73813551 Y KCNQ5 NA NA NA NA NA RP11-398K22.12 157313 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 73833038 73833304 73833144 Y NA NA NA NA NA NA RP11-398K22.12 137634 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 75853490 75853812 75853630 Y COL12A1 NA NA NA NA NA COX7A2 104227 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 79758680 79758772 79758726 Y NA PHIP NA NA NA NA PHIP 27181 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 81044945 81045591 81045323 Y NA NA NA NA NA NA BCKDHB 230581 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 83546132 83546541 83546207 Y NA NA UBE3D,IBTK IMR90 Hi-C 24141950 DOPEY1 228844 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 83756669 83757034 83756938 Y PGM3,DOPEY1 DOPEY1 NA NA NA NA DOPEY1 18351 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 83931407 83931579 83931543 Y UBE2CBP,PRSS35,RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 IMR90 Hi-C 24141950 PGM3 29752 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 84761974 84762047 84762024 Y NA MRAP2 NA NA NA NA MRAP2 20499 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 84877511 84877669 84877594 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1009 57684 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 87881047 87881581 87881092 Y NA ZNF292 NA NA NA NA ZNF292 20496 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 88213981 88214157 88214070 Y GJB7 SLC35A1 NA NA NA NA SLC35A1 35640 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 88408243 88408692 88408556 Y AKIRIN2 AKIRIN2 NA NA NA NA AKIRIN2 1235 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 88451884 88452128 88452035 Y AKIRIN2 AKIRIN2 ORC3,RARS2 IMR90 Hi-C 24141950 AKIRIN2 41957 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.40536027741361 chr6 88628138 88628524 88628262 Y NA NA RNGTT IMR90 Hi-C 24141950 AKIRIN2 218211 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 88632431 88632870 88632722 Y CNR1 NA RNGTT IMR90 Hi-C 24141950 AKIRIN2 222504 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr6 88635405 88635681 88635510 Y NA NA RNGTT IMR90 Hi-C 24141950 AKIRIN2 225478 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr6 89796215 89796534 89796231 Y NA PNRC1 NA NA NA NA PNRC1 7745 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 90031448 90031662 90031542 Y PNRC1,UBE2J1 UBE2J1 NA NA NA NA UBE2J1 28905 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 90619987 90620233 90620110 Y NA NA NA NA NA NA CASP8AP2 82374 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr6 90691660 90691667 90691664 Y NA NA NA NA NA NA CASP8AP2 154047 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 90695509 90695956 90695679 Y BACH2,BACH2 NA NA NA NA NA CASP8AP2 157896 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr6 90747205 90747269 90747237 Y NA NA NA NA NA NA CASP8AP2 209592 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 90754756 90755156 90755038 Y NA NA NA NA NA NA CASP8AP2 217143 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 90774597 90775020 90774993 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 229607 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr6 90782420 90782788 90782672 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 221839 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 90788132 90788473 90788314 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 216154 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 90788791 90788954 90788872 Y MDN1,BACH2,BACH2 NA NA NA NA NA BACH2 215673 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 90793727 90794010 90793801 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 210617 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 90797796 90798074 90797935 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 206553 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 90817628 90817941 90817897 Y BACH2,BACH2 NA NA NA NA NA BACH2 186686 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 90818937 90819075 90819003 Y BACH2,BACH2 NA NA NA NA NA BACH2 185552 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 90856849 90857084 90856969 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 147543 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 90878882 90879095 90878991 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 125532 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 90914790 90915015 90914903 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 89612 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 90937522 90937637 90937581 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 66990 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 90951466 90952108 90951796 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 52519 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 90970974 90971061 90971018 Y NA BACH2 NA NA NA NA BACH2 33566 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 90983807 90984597 90984358 Y MDN1,BACH2,BACH2 BACH2 NA NA NA NA BACH2 20030 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 90994076 90994276 90994132 Y MDN1,BACH2,BACH2 BACH2 NA NA NA NA BACH2 10351 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 90994449 90994671 90994572 Y MDN1,BACH2,BACH2 BACH2 NA NA NA NA BACH2 9956 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.68643233289634 chr6 91004075 91004656 91004496 Y MDN1,BACH2,BACH2 NA NA NA NA NA BACH2 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr6 91004830 91005121 91005041 Y MDN1,BACH2,BACH2 BACH2 NA NA NA NA BACH2 203 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 91060377 91060660 91060482 Y NA NA BACH2 IMR90 Hi-C 24141950 BACH2 55750 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr6 91121051 91121489 91121257 Y BACH2,BACH2 NA BACH2,MIR4464 IMR90 Hi-C 24141950 BACH2 116424 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 92484123 92484133 92484128 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K7 1189359 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 95149839 95150112 95150046 Y NA NA NA NA NA NA MANEA 873307 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 95445556 95445774 95445747 Y NA NA NA NA NA NA MANEA 577645 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 97632369 97632997 97632691 Y NA NA NA NA NA NA MMS22L 96096 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 98336263 98336652 98336458 Y NA NA NA NA NA NA MMS22L 607170 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 99293549 99293815 99293794 Y POU3F2 NA NA NA NA NA FBXL4 100034 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 100008682 100008928 100008805 Y NA USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 5921 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 101149750 101149957 101149936 Y NA NA NA NA NA NA RP1-121G13.3 173598 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 101204667 101204976 101204826 Y NA NA NA NA NA NA ASCC3 122272 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 101211686 101211775 101211752 Y NA NA NA NA NA NA ASCC3 115473 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 105061628 105062008 105061974 Y LIN28B,HACE1 NA NA NA NA NA HACE1 243786 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 106369673 106369731 106369703 Y PRDM1 NA ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 162464 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 106442778 106443178 106442990 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 89017 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 106532439 106532606 106532449 Y PRDM1 PRDM1 NA NA NA NA PRDM1 244 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 106540002 106540199 106540101 Y PRDM1 PRDM1 NA NA NA NA PRDM1 7807 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 106768988 106769157 106769073 Y NA ATG5 NA NA NA NA ATG5 2509 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 107150270 107150783 107150511 Y NA NA NA NA NA NA QRSL1 74817 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 107773333 107773402 107773368 Y SOBP PDSS2,SOBP NA NA NA NA PDSS2 5366 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 108034539 108034693 108034601 Y SCML4 NA NA NA NA NA SCML4 108828 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 108144215 108144549 108144466 Y SCML4 SCML4 NA NA NA NA SCML4 694 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 108440032 108440340 108440122 Y NA OSTM1 LACE1,NR2E1,ARMC2,SESN1 IMR90 Hi-C 24141950 OSTM1 44718 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 108879164 108879427 108879300 Y SESN1,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 126 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 108879521 108879931 108879808 Y SESN1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 483 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr6 110418117 110418342 110418281 Y NA NA NA NA NA NA WASF1 80865 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 110502951 110503352 110503102 Y FIG4,CDC40 WASF1,CDC40 NA NA NA NA CDC40 3607 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 111025527 111025575 111025551 Y NA NA NA NA NA NA CDK19 109586 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 111049772 111049981 111049963 Y NA NA NA NA NA NA CDK19 85180 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 111612312 111612528 111612438 Y AMD1,AMD1,SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L,KIAA1919 KIAA1919 NA NA NA NA KIAA1919 33761 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 111727743 111727975 111727836 Y SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L NA NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 74739 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 111748625 111749047 111748803 Y SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L NA NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 53667 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 111889822 111890007 111889856 Y REV3L TRAF3IP2 NA NA NA NA TRAF3IP2 35474 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 115163170 115163515 115163320 Y NA NA NA NA NA NA HDAC2 832698 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 116988703 116988966 116988944 Y DSE,ZUFSP,KPNA5 ZUFSP,KPNA5 NA NA NA NA ZUFSP 746 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr6 119151345 119151482 119151449 Y MCM9 NA NA NA NA NA ASF1A 61902 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 119218988 119219366 119219177 Y MCM9 ASF1A,MCM9 NA NA NA NA ASF1A 5604 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 119764172 119764289 119764182 Y MAN1A1 NA NA NA NA NA MAN1A1 95246 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr6 121398601 121398951 121398918 Y NA NA NA NA NA NA HSF2 1319740 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 122769670 122769957 122769896 Y HSF2,PKIB SERINC1 NA NA NA NA SERINC1 21010 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 127980874 127981174 127981075 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 226093 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 127981338 127981402 127981371 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 226557 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 129855341 129855708 129855581 Y ARHGAP18 NA NA NA NA NA ARHGAP18 173662 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 129994496 129994751 129994657 Y ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 34619 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 130069572 130069764 130069691 Y NA ARHGAP18 ARHGAP18,L3MBTL3 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP18 40202 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr6 130212906 130213257 130213070 Y NA NA TMEM244,LAMA2,ARHGAP18,L3MBTL3 IMR90 Hi-C 24141950 L3MBTL3 119587 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 130342212 130342458 130342393 Y SAMD3,SAMD3,L3MBTL3 L3MBTL3 NA NA NA NA L3MBTL3 9368 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 131327805 131328036 131327854 Y NA NA NA NA NA NA EPB41L2 54426 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 132811280 132811490 132811390 Y VNN2,VNN2,VNN2,VNN1,STX7 STX7 NA NA NA NA STX7 20847 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 133059787 133059954 133059917 Y NA VNN1 NA NA NA NA VNN1 26599 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 133134288 133134908 133134317 Y NA RPS12 NA NA NA NA SNORD101 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 134085872 134085913 134085879 Y NA NA TCF21,MGC34034 IMR90 Hi-C 24141950 TBPL1 185395 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 134741718 134742020 134741875 Y SGK1,SGK1,SGK1 NA SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 104468 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 135435494 135435847 135435630 Y NA HBS1L AHI1 IMR90 Hi-C 24141950 HBS1L 13300 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr6 135503898 135504621 135504156 Y HBS1L,AHI1,MYB MYB NA NA NA NA MYB 3445 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr6 135611032 135611105 135611069 Y ALDH8A1 NA NA NA NA NA MYB 110579 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 135636764 135637196 135637190 Y NA NA NA NA NA NA MYB 136311 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 136702762 136702864 136702842 Y MAP7,MAP7,MAP7,MAP7 NA NA NA NA NA BCLAF1 93773 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 136927621 136927854 136927738 Y NA NA MAP7 MCF7 ChIA-PET 22265404 MAP3K5 183802 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 137109342 137109643 137109396 Y IFNGR1,BCLAF1,MAP3K5 MAP3K5,PEX7 NA NA NA NA MAP3K5 2013 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 138057580 138057838 138057749 Y PBOV1,TNFAIP3 NA TNFAIP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 128513 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 138151589 138151844 138151703 Y TNFAIP3 TNFAIP3 TNFAIP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 34507 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 138184436 138184726 138184672 Y TNFAIP3 TNFAIP3 NA NA NA NA TNFAIP3 1625 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 138509527 138509629 138509578 Y NHSL1 NA NA NA NA NA HEBP2 213039 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 138821349 138821443 138821380 Y REPS1,NHSL1 NA NA NA NA NA HEBP2 98681 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.8269683606377 chr6 138862383 138862798 138862711 Y PBOV1 NA NA NA NA NA HEBP2 139715 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 138914049 138914108 138914056 Y NA NA HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906 IMR90 Hi-C 24141950 NHSL1 97600 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 138914342 138914559 138914540 Y NA NA HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906 IMR90 Hi-C 24141950 NHSL1 97149 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 139348964 139349250 139349073 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 41566 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 139350632 139351255 139350885 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 43234 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 139351818 139352158 139351992 Y CCDC28A,C6orf115,HECA REPS1 NA NA NA NA REPS1 44420 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr6 139611795 139612307 139611990 Y REPS1,C6orf115,HECA TXLNB NA NA NA NA TXLNB 519 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr6 140383051 140383491 140383322 Y NA NA CITED2,LOC100132735 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 689294 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 141804737 141805118 141804969 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 661249 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 141805925 141806152 141806020 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 660215 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 143134397 143134731 143134564 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 129607 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 143206296 143206927 143206703 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 57411 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 143234736 143235083 143235000 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 29255 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 143247398 143248213 143248022 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 16125 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr6 143503002 143503176 143503018 Y NA NA NA NA NA NA AIG1 123369 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 144537313 144537754 144537668 Y NA NA STX11,SF3B5 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 UTRN 67083 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 148830845 148831563 148831298 Y UST NA NA NA NA NA TAB2 706214 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 148879188 148879351 148879251 Y NA NA NA NA NA NA TAB2 658426 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr6 149081701 149082266 149082198 Y UST NA NA NA NA NA TAB2 455511 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 149802219 149802342 149802288 Y LATS1,KATNA1,TAB2,PPIL4,SUMO4,ZC3H12D ZC3H12D NA NA NA NA ZC3H12D 1855 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 149803455 149803649 149803509 Y LATS1,KATNA1,TAB2,PPIL4,ZC3H12D ZC3H12D NA NA NA NA ZC3H12D 548 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 150739160 150739823 150739483 Y NA NA NA NA NA NA ULBP3 350929 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 151302311 151302568 151302430 Y PLEKHG1 NA NA NA NA NA RP1-292B18.1 116097 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 151730569 151730753 151730690 Y NA ZBTB2,RMND1,C6orf211 NA NA NA NA ZBTB2 19886 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 152012429 152012574 152012475 Y ZBTB2,C6orf97,ESR1 ESR1 NA NA NA NA ESR1 36603 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr6 152583976 152584217 152584151 Y NA NA NA NA NA NA ESR1 608150 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 154486740 154486949 154486839 Y NA NA NA NA NA NA IPCEF1 188977 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 154578208 154578409 154578338 Y SCAF8 NA NA NA NA NA IPCEF1 97517 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 155181312 155181660 155181451 Y TIAM2,TIAM2 NA TIAM2 IMR90 Hi-C 24141950 SCAF8 128853 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 155593046 155593119 155593050 Y NA RP11-477D19.2,TFB1M NA NA NA NA RP11-477D19.2 17188 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 155636183 155636317 155636271 Y NA TFB1M NA NA NA NA TFB1M 2556 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr6 157007979 157008724 157008580 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88339 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 157101566 157102083 157101700 Y ARID1B ARID1B NA NA NA NA ARID1B 4503 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr6 157160663 157161314 157160954 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 63600 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 157297453 157297730 157297519 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 200390 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 157342507 157343524 157343342 Y ARID1B,ZDHHC14 NA NA NA NA NA ARID1B 245444 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 157542479 157542718 157542566 Y NA NA NA NA NA NA TMEM242 199915 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr6 157881944 157882245 157882133 Y ZDHHC14,SNX9 NA NA NA NA NA ZDHHC14 81779 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 157978590 157978748 157978669 Y SYNJ2,ZDHHC14 NA NA NA NA NA ZDHHC14 178425 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 158481547 158481708 158481650 Y SNX9 NA NA NA NA NA SERAC1 105604 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 158981403 158981866 158981661 Y NA TMEM181 NA NA NA NA TMEM181 25935 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.40536027741361 chr6 158982051 158982465 158982168 Y NA TMEM181 NA NA NA NA TMEM181 26583 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 158987674 158988091 158987879 Y NA TMEM181 NA NA NA NA TMEM181 32206 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 159234698 159235091 159235070 Y NA EZR NA NA NA NA EZR 3353 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 159483193 159483967 159483477 Y DYNLT1,SYTL3,TAGAP NA NA NA NA NA RSPH3 63974 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 160400282 160400543 160400410 Y SOD2,WTAP,WTAP,IGF2R IGF2R NA NA NA NA IGF2R 12151 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 160402732 160403272 160403091 Y SOD2,WTAP,WTAP,MAS1,IGF2R IGF2R NA NA NA NA IGF2R 14601 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 161545851 161546111 161545978 Y AGPAT4 NA NA NA NA NA MAP3K4 135092 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 161791976 161792215 161792098 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT4 98883 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 162808264 162808283 162808273 Y NA NA NA NA NA NA QKI 1024749 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 163833938 163834442 163834340 Y NA QKI NA NA NA NA QKI 906 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 163972161 163972427 163972234 Y NA NA NA NA NA NA QKI 139129 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 164137885 164138154 164138024 Y NA NA NA NA NA NA QKI 304853 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 166385606 166385834 166385795 Y NA NA NA NA NA NA SFT2D1 368245 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 166422302 166422862 166422743 Y NA NA NA NA NA NA SFT2D1 331217 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 166959684 166959988 166959836 Y NA NA NA NA NA NA SFT2D1 205605 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 167372859 167373027 167372950 Y GPR31,RNASET2 RP11-514O12.4,RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP NA NA NA NA RNASET2 4180 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 167395299 167395692 167395496 Y NA RP11-514O12.4,RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP NA NA NA NA RP1-167A14.2 14861 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr6 167411692 167411848 167411735 Y RNASET2,GPR31 RP11-514O12.4,RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP NA NA NA NA FGFR1OP 1022 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 167461087 167461406 167461193 Y RNASET2,GPR31,CCR6 NA NA NA NA NA FGFR1OP 50417 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 167507570 167507764 167507695 Y RNASET2,GPR31,CCR6,CCR6 CCR6 NA NA NA NA CCR6 15531 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 167527463 167527857 167527693 Y CCR6,CCR6 CCR6 NA NA NA NA CCR6 4168 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 168100191 168100503 168100332 Y NA NA NA NA NA NA C6orf123 95036 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 169308928 169309266 169309084 Y THBS2 NA WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242 IMR90 Hi-C 24141950 SMOC2 469097 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 170054470 170055295 170054892 Y TCTE3 WDR27,C6orf120 NA NA NA NA WDR27 44864 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr6 170208297 170208700 170208496 Y NA NA NA NA NA NA TCTE3 58642 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr6 170654095 170654292 170654195 Y FAM120B NA NA NA NA NA FAM120B 56304 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 416236 416525 416371 Y NA NA NA NA NA NA PDGFA 141408 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 652642 652893 652768 Y PRKAR1B,ADAP1 NA NA NA NA NA PDGFA 94709 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 655576 655910 655797 Y NA NA NA NA NA NA PDGFA 97643 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 949613 949923 949864 Y NA GET4 NA NA NA NA GET4 35424 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 1039490 1039728 1039629 Y NA COX19,GPR146 NA NA NA NA COX19 26255 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 1062588 1063089 1062812 Y COX19 COX19,GPR146 COX19,CYP2W1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR146 19123 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 1099866 1100419 1100164 Y ADAP1,COX19,ZFAND2A,MAFK GPR146 NA NA NA NA GPR146 17654 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 1125303 1125884 1125584 Y GPER,GPER GPR146 NA NA NA NA GPR146 43091 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.40536027741361 chr7 1139272 1139516 1139401 Y SUN1,TMEM184A C7orf50 NA NA NA NA C7orf50 36380 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 1140726 1141099 1140817 Y SUN1,TMEM184A C7orf50 NA NA NA NA C7orf50 34797 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 1329910 1330257 1330187 Y NA NA UNCX IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND2A 131515 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 1407991 1408135 1408052 Y NA NA NA NA NA NA INTS1 135354 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 1546424 1546775 1546565 Y NA INTS1,MAFK NA NA NA NA INTS1 2935 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr7 1550412 1550644 1550473 Y NA INTS1,MAFK,TMEM184A MICALL2 MCF7 ChIA-PET 22265404 INTS1 6923 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr7 1571273 1571500 1571366 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 2923 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 1709256 1709641 1709356 Y NA NA MAD1L1,KIAA1908 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG3 100615 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 1883097 1883273 1883258 Y NA NA NA NA NA NA PSMG3 274456 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 1965570 1966023 1965918 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 304855 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 2048581 2048903 2048796 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 221975 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 2079127 2079493 2079280 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 191385 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 2106199 2106418 2106303 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 164460 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 4.63768891546493 chr7 2143904 2144149 2144041 Y LFNG NA NA NA NA NA MAD1L1 126729 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr7 2145561 2145831 2145692 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 125047 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr7 2150639 2150902 2150796 Y SNX8,LFNG NA NA NA NA NA MAD1L1 119976 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 2178123 2178459 2178160 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 92419 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 4.07554480449948 chr7 2353156 2353455 2353307 Y NA EIF3B,SNX8 NA NA NA NA EIF3B 38266 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 2548551 2548955 2548724 Y LFNG,LFNG LFNG,BRAT1,IQCE LFNG K562 ChIA-PET 22265404 LFNG 1208 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr7 2550421 2551074 2550672 Y LFNG,LFNG,BRAT1 LFNG,BRAT1,IQCE NA NA NA NA LFNG 258 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 2570337 2570495 2570402 Y LFNG,BRAT1 LFNG,BRAT1,IQCE NA NA NA NA LFNG 20174 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 2681143 2681305 2681209 Y SNX8,LFNG,LFNG,TTYH3 TTYH3 NA NA NA NA TTYH3 11558 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 2697261 2697345 2697303 Y IQCE TTYH3 NA NA NA NA TTYH3 27676 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 2860040 2860490 2860319 Y LFNG,LFNG,GNA12 AC006028.11,GNA12 NA NA NA NA AC006028.11 12765 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 2934107 2934513 2934382 Y CARD11 NA NA NA NA NA GNA12 52149 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 3018099 3018595 3018309 Y NA NA NA NA NA NA GNA12 136141 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr7 4681329 4681565 4681443 Y MMD2 NA SDK1,FOXK1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXK1 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr7 4784652 4785031 4784763 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 103264 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 5419074 5419498 5419154 Y NA NA NA NA NA NA FBXL18 131931 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 5609541 5610012 5609880 Y SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1 ACTB RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 8126 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 5761606 5761918 5761762 Y USP42,RNF216 NA NA NA NA NA RNF216 57452 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 6467944 6468137 6468104 Y NA NA NA NA NA NA DAGLB 53684 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 6677371 6677641 6677424 Y DAGLB,ZNF12,C7orf26 C7orf26,ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 2418 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 6741580 6741996 6741754 Y C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12 ZNF12,PMS2CL NA NA NA NA ZNF12 2558 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 7759003 7759285 7759121 Y NA RPA3,RPL23AP51 NA NA NA NA RPA3 2765 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 7996944 7997264 7997104 Y NA GLCCI1 LOC729852,GLCCI1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLCCI1 9161 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 8482629 8482725 8482675 Y NXPH1 NA NA NA NA NA GLCCI1 476204 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 8547057 8547266 8547162 Y NA NA NA NA NA NA GLCCI1 540632 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 12297328 12297575 12297487 Y ARL4A TMEM106B NA NA NA NA TMEM106B 48461 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 13368007 13368354 13368181 Y NA NA NA NA NA NA RPL6P21 740651 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr7 14702275 14702543 14702458 Y NA NA NA NA NA NA RPL6P21 593270 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 18255196 18255381 18255289 Y NA NA NA NA NA NA HDAC9 130624 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 18483962 18483986 18483974 Y NA NA NA NA NA NA HDAC9 359390 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 18560411 18560650 18560558 Y NA NA NA NA NA NA HDAC9 435839 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 18563504 18563902 18563528 Y HDAC9,HDAC9,HDAC9 NA NA NA NA NA HDAC9 438932 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 18847495 18847887 18847515 Y FERD3L NA NA NA NA NA HDAC9 722923 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 18865089 18865093 18865091 Y HDAC9,HDAC9 NA NA NA NA NA HDAC9 740517 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 18901208 18901607 18901411 Y NA NA NA NA NA NA HDAC9 776636 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 20006905 20007156 20007031 Y TMEM196 RPL21P75 NA NA NA NA RPL21P75 33190 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 20191913 20192270 20192088 Y TWISTNB NA NA NA NA NA MACC1 62757 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 20197239 20197492 20197368 Y NA NA NA NA NA NA MACC1 57535 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 20414219 20414454 20414223 Y NA NA NA NA NA NA MACC1 159192 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 20439186 20439753 20439406 Y NA NA NA NA NA NA MACC1 184159 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 20636990 20637450 20637203 Y ITGB8 NA TMEM196 IMR90 Hi-C 24141950 RPL23P8 227495 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 21928607 21928632 21928620 Y NA NA NA NA NA NA CDCA7L 55070 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 22253669 22254026 22253848 Y NA NA NA NA NA NA CDCA7L 269967 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 22484182 22484549 22484368 Y NA NA NA NA NA NA EEF1A1P6 65069 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr7 22485088 22485297 22485116 Y RAPGEF5 NA NA NA NA NA EEF1A1P6 64321 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 23488792 23489118 23488955 Y KLHL7,NUPL2,IGF2BP3 IGF2BP3,AC079780.3 NA NA NA NA IGF2BP3 18968 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 23510676 23511223 23510889 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3,AC079780.3 NA NA NA NA IGF2BP3 2590 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr7 23513815 23514383 23514045 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3,AC079780.3 MALSU1 K562 ChIA-PET 22265404 AC079780.3 3989 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr7 24006556 24006902 24006729 Y NPY NA NA NA NA NA AC006026.13 288151 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 25659927 25660160 25660060 Y NA NA LOC441204 IMR90 Hi-C 24141950 C7orf31 441952 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr7 26317891 26318244 26318068 Y NA AC010677.5 HNRNPA2B1,CBX3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 AC010677.5 4076 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 28194446 28194874 28194789 Y NA NA NA NA NA NA AC004549.6 416432 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 28471608 28471631 28471619 Y CREB5,CREB5 NA NA NA NA NA AC004549.6 693594 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 29041948 29042327 29041980 Y NA NA NA NA NA NA FKBP14 1021973 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 29645878 29645994 29645936 Y NA NA PRR15 MCF7 ChIA-PET 22265404 FKBP14 418306 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 30514545 30514933 30514653 Y NA NOD1 NA NA NA NA NOD1 1467 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 30658764 30658962 30658863 Y NA GARS NA NA NA NA GARS 26467 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 31757734 31758047 31757891 Y NA NA NA NA NA NA LSM5 774848 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 32929600 32929824 32929751 Y NA KBTBD2 NA NA NA NA KBTBD2 1919 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 33316298 33316594 33316442 Y NA NA NA NA NA NA BBS9 149442 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 35075861 35076697 35076367 Y NA NA NA NA NA NA HERPUD2 656484 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 35285792 35286017 35285905 Y TBX20 NA NA NA NA NA HERPUD2 447164 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 36555269 36555573 36555424 Y ELMO1,AOAH,EEPD1 NA NA NA NA NA KIAA0895 127535 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 36574030 36574714 36574417 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0895 146296 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 36698240 36698520 36698401 Y AOAH NA NA NA NA NA AOAH 63634 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 36771570 36771751 36771708 Y AOAH AOAH NA NA NA NA AOAH 9416 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 36903591 36903813 36903689 Y AOAH,ELMO1 NPM1P18 NA NA NA NA NPM1P18 47027 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 37071492 37071821 37071657 Y AOAH,ELMO1,ELMO1 ELMO1-AS1 NA NA NA NA ELMO1-AS1 36091 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 37105106 37105894 37105654 Y AOAH,ELMO1,ELMO1,ELMO1 NA NA NA NA NA ELMO1-AS1 69705 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 39661947 39662014 39661981 Y NA RALA NA NA NA NA RALA 865 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 40007110 40007159 40007135 Y NA CDK13 NA NA NA NA CDK13 19474 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 40088776 40089159 40088837 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 101140 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 41048804 41049055 41048930 Y NA NA LOC285954,INHBA,C7orf10 IMR90 Hi-C 24141950 CDK13 1061168 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 42145452 42145673 42145563 Y NA NA NA NA NA NA GLI3 129796 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 42927750 42928726 42928340 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 NA NA NA NA C7orf25 21178 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 43652779 43653072 43652905 Y POLM,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 32422 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 43654812 43655175 43654945 Y POLM,DBNL,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 34455 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 43740255 43740653 43740556 Y GCK NA NA NA NA NA BLVRA 55626 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 43996825 43996925 43996859 Y NA URGCP,UBE2D4 NA NA NA NA UBE2D4 32788 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr7 44085815 44086626 44086335 Y STK17A,DBNL,POLM POLR2J4,DBNL,POLM NA NA NA NA DBNL 3576 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 44136998 44137292 44137136 Y POLM POLM,AEBP1,POLD2 AEBP1 IMR90 Hi-C 24141950 AEBP1 4668 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.68643233289634 chr7 44140138 44140294 44140236 Y NA POLM,AEBP1,POLD2 NA NA NA NA AEBP1 1666 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 44141919 44142207 44141937 Y AEBP1 POLM,POLD2 NA NA NA NA AEBP1 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 44435204 44435581 44435393 Y NA NA NA NA NA NA AC004453.8 69860 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 44436686 44437032 44436900 Y NA NA NA NA NA NA AC004453.8 68409 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 44855333 44855416 44855373 Y TBRG4,H2AFV PPIA,H2AFV NA NA NA NA PPIA 21054 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr7 45040907 45041213 45041027 Y DDX56,OGDH,MYO1G,CCM2 MYO1G,SNHG15,CCM2 NA NA NA NA CCM2 3833 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 47092629 47092731 47092679 Y NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 527425 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 47185619 47185934 47185820 Y NA NA IGFBP3,IGFBP1 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 434222 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 48031393 48031616 48031481 Y HUS1 HUS1,C7orf57 HUS1 K562 ChIA-PET 22265404 HUS1 14215 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 50321209 50321522 50321293 Y NA IKZF1 NA NA NA NA IKZF1 20198 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 50346944 50347066 50347038 Y IKZF1 IKZF1 NA NA NA NA IKZF1 5224 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr7 50350065 50350197 50350095 Y IKZF1 IKZF1 NA NA NA NA IKZF1 8345 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 50361175 50361592 50361449 Y IKZF1 IKZF1 NA NA NA NA IKZF1 19455 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 50432478 50432805 50432538 Y IKZF1 NA NA NA NA NA FIGNL1 83283 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 50615386 50615579 50615483 Y GRB10 NA NA NA NA NA FIGNL1 99298 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 50695953 50696288 50696121 Y NA NA NA NA NA NA GRB10 162871 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 55529793 55530311 55530129 Y ZNF713,VOPP1 NA NA NA NA NA LANCL2 98652 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 55576461 55576688 55576528 Y VOPP1 NA NA NA NA NA VOPP1 61993 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 55600779 55601841 55601199 Y VOPP1 VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 36840 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 56013517 56013601 56013542 Y ZNF713 GBAS,MRPS17 NA NA NA NA GBAS 3885 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr7 56168682 56168929 56168809 Y ZNF713 SUMF2,CHCHD2 NA NA NA NA CHCHD2 3340 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 56173322 56173423 56173410 Y NA SUMF2,CHCHD2 NA NA NA NA CHCHD2 1053 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 57706434 57706786 57706770 Y ZNF716 NA NA NA NA NA CHCHD2 1534165 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 61968807 61969730 61969008 Y NA NA NA NA NA NA RP11-340I6.8 1389471 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 63924105 63924304 63924148 Y NA HNRNPCP7 NA NA NA NA HNRNPCP7 34899 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 64295695 64295915 64295830 Y ZNF680 ZNF138,ZNF273 NA NA NA NA ZNF273 32635 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 69069799 69069881 69069840 Y NA AUTS2 NA NA NA NA AUTS2 7894 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 69215481 69215818 69215531 Y NA NA NA NA NA NA AUTS2 153576 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 69308115 69308415 69308239 Y AUTS2,AUTS2 NA NA NA NA NA AUTS2 246210 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 69643869 69644054 69643961 Y NA NA NA NA NA NA AUTS2 581964 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 70113143 70113470 70113265 Y NA NA NA NA NA NA AUTS2 1051238 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 72990459 72990574 72990513 Y NA BCL7B,TBL2 NA NA NA NA TBL2 547 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 73323660 73323965 73323813 Y NA NA NA NA NA NA WBSCR27 68795 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 73625323 73625613 73625399 Y LIMK1,LAT2 EIF4H,LAT2,RFC2 NA NA NA NA LAT2 13341 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 73631936 73632436 73632119 Y LAT2 EIF4H,LAT2,RFC2 NA NA NA NA LAT2 19954 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr7 74064444 74064957 74064539 Y GTF2IRD2B,LAT2 GTF2I NA NA NA NA GTF2I 5037 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 3.79447274901676 chr7 74074203 74074528 74074318 Y LAT2,GTF2I GTF2I NA NA NA NA GTF2I 4209 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 75465283 75465439 75465360 Y MDH2 RHBDD2 STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR IMR90 Hi-C 24141950 RHBDD2 4481 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 75546128 75546229 75546156 Y NA POR STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 POR 19610 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 75599122 75599360 75599199 Y NA TMEM120A NA NA NA NA TMEM120A 22617 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 75675722 75675985 75675853 Y NA STYXL1,MDH2 NA NA NA NA MDH2 353 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 75947305 75947626 75947472 Y RHBDD2,SRRM3 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 17444 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 75948116 75948327 75948250 Y RHBDD2 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 18255 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 75993825 75994303 75994024 Y NA YWHAG YWHAG MCF7 ChIA-PET 22265404 YWHAG 7477 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 76820393 76820583 76820488 Y NA NA NA NA NA NA CCDC146 70642 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 77344619 77344946 77344783 Y RSBN1L RSBN1L-AS1,RSBN1L NA NA NA NA RSBN1L 20859 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 79803492 79803786 79803598 Y NA GNAI1 NA NA NA NA GNAI1 42221 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 80559039 80559447 80559284 Y NA NA SEMA3C IMR90 Hi-C 24141950 GNAI1 797768 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 81070726 81071084 81070905 Y NA NA SEMA3C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNAI1 1309455 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 86121271 86121385 86121277 Y NA NA NA NA NA NA DMTF1 658292 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 87453552 87453801 87453676 Y NA DBF4,SLC25A40 NA NA NA NA DBF4 49730 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 87571513 87571795 87571654 Y NA ADAM22 NA NA NA NA ADAM22 10055 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 90090705 90090957 90090817 Y NA CDK14 CDK14,FZD1 IMR90,H1ESC,HELA,K562,GM12878 Hi-C,5C 24141950,22955621 CDK14 2781 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 90637974 90638276 90638003 Y NA NA NA NA NA NA AC002456.2 413307 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 92156983 92157235 92157087 Y CDK6,CDK6,PEX1,FAM133B,C7orf64 PEX1,RBM48 NA NA NA NA RBM48 896 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.54589630515498 chr7 92227351 92227620 92227450 Y CDK6,CDK6 FAM133B FAM133B K562 ChIA-PET 22265404 FAM133B 9643 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 92233387 92233691 92233548 Y NA FAM133B FAM133B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 FAM133B 15679 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 92262528 92262734 92262631 Y NA FAM133B FAM133B K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 44820 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 92271612 92271814 92271678 Y SAMD9 NA NA NA NA NA FAM133B 53904 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 92274593 92274946 92274914 Y CDK6 NA NA NA NA NA FAM133B 56885 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 92277080 92277232 92277129 Y ANKIB1,GATAD1,CDK6 NA NA NA NA NA FAM133B 59372 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 92384322 92384817 92384698 Y CDK6 NA NA NA NA NA AC002454.1 78980 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 92437286 92437617 92437517 Y SAMD9 AC002454.1,CDK6 NA NA NA NA AC002454.1 26180 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 92459714 92460134 92460069 Y SAMD9 AC002454.1,CDK6 NA NA NA NA AC002454.1 3663 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 92463754 92464079 92463922 Y CDK6,CDK6 NA NA NA NA NA AC002454.1,CDK6 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr7 92488583 92488710 92488601 Y CDK6,CDK6 AC002454.1,CDK6 NA NA NA NA CDK6 24675 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 92512382 92512474 92512428 Y NA AC002454.1,CDK6 NA NA NA NA CDK6 48474 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 92574319 92574346 92574333 Y NA NA NA NA NA NA CDK6 110411 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 94280099 94280356 94280228 Y NA RPS3AP25 NA NA NA NA RPS3AP25 42775 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 95674465 95674690 95674578 Y DYNC1I1,FLJ42280 NA NA NA NA NA SLC25A13 274769 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 95861904 95862185 95862172 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 87274 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 96356973 96357275 96357162 Y NA SHFM1 NA NA NA NA SHFM1 19770 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 97994295 97994325 97994312 Y BAIAP2L1 RPS3AP26 BRI3 IMR90 Hi-C 24141950 RPS3AP26 19571 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 98650927 98651298 98651264 Y NA NA NA NA NA NA SMURF1 88425 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 98978423 98978863 98978747 Y SMURF1,ZNF655,ZNF655,ZNF498,ZNF394,ZKSCAN5 ARPC1B,BUD31,PDAP1 NA NA NA NA ARPC1B 8551 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 99000499 99000617 99000560 Y NA ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4 NA NA NA NA BUD31 3647 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 99684818 99685168 99684993 Y TSC22D4,PILRB,PILRA ZSCAN21,ZNF3,COPS6,AP4M1,MCM7,CNPY4,TAF6,MBLAC1,RP11-506M12.1 NA NA NA NA COPS6 241 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 99961767 99962035 99961969 Y NA PILRB,PMS2P1 PILRA IMR90 Hi-C 24141950 PMS2P1 24236 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 99963158 99963846 99963542 Y ZCWPW1,MEPCE,PILRA PILRB,PMS2P1 PILRA IMR90 Hi-C 24141950 PMS2P1 25627 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 100434359 100434559 100434459 Y SAP25,EPHB4 SLC12A9,EPHB4,RP11-126L15.4,TRIP6,SRRT EPHB4,ZAN,POP7,TRIP6,SLC12A9,LOC100129845,FBXO24,PCOLCE,MOSPD3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHB4 11238 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 100776070 100776161 100776131 Y SERPINE1 TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF NA NA NA NA SERPINE1 7700 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 101062164 101062286 101062177 Y NA NA NA NA NA NA RABL5 99060 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 101384323 101384583 101384424 Y NA NA CUX1,EMID2,SH2B2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUX1 72376 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 101567515 101567769 101567671 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 110556 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 101613260 101613283 101613272 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 156301 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 101672273 101672589 101672281 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 215314 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72006 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 5.90251316513718 chr7 102081983 102082063 102082048 Y NA ORAI2,ALKBH4,LRWD1,POLR2J NA NA NA NA ORAI2 10430 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 104583415 104583719 104583567 Y SRPK2,MLL5 RP11-325F22.2 LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-325F22.2 3905 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 104585458 104586124 104585640 Y MLL5 RP11-325F22.2 LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-325F22.2 5948 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 104614051 104614727 104614598 Y NA RP11-325F22.2,LINC01004 NA NA NA NA RP11-325F22.2 34541 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 104626890 104627731 104627241 Y MLL5 RP11-325F22.2,LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 23760 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 104684659 104684988 104684665 Y NA LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 33168 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 105449570 105449934 105449707 Y ATXN7L1,ATXN7L1 NA NA NA NA NA ATXN7L1 65116 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 105602769 105602970 105602871 Y NA NA NA NA NA NA CDHR3 87527 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 106358724 106358979 106358846 Y NAMPT,PIK3CG,HBP1,FLJ36031 NA CCDC71L,NAMPT IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC71L 59282 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 106838325 106838672 106838499 Y NA HBP1 NA NA NA NA HBP1 30919 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 106901302 106901364 106901333 Y NA NA NA NA NA NA HBP1 93896 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 107573965 107574445 107574339 Y LAMB1 DLD NA NA NA NA DLD 44550 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 110326552 110326706 110326634 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 873867 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 110808410 110808626 110808556 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 391947 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 110956734 110956926 110956906 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 243647 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 111024464 111024780 111024739 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 175793 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 116504290 116504456 116504319 Y NA NA NA NA NA NA CAPZA2 55166 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 120884704 120884786 120884745 Y NA NA NA NA NA NA FAM3C 149632 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 121025846 121026096 121025939 Y ING3 FAM3C NA NA NA NA FAM3C 8322 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 121783025 121783385 121783205 Y PTPRZ1,AASS AASS NA NA NA NA AASS 691 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 123843194 123843309 123843252 Y TMEM229A NA GPR37,LOC154872 IMR90 Hi-C 24141950 WASL 456073 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 3.93500877675812 chr7 128249599 128249637 128249625 Y NA RP11-212P7.1 FLJ45340,CALU,FAM71F1,IRF5 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-212P7.1 40857 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 128573328 128573749 128573398 Y NA NA IRF5 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP6V1F 72448 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 128958632 128958719 128958676 Y NA NA FAM40B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-305M3.2 89492 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 129246747 129246901 129246817 Y NA NRF1 NRF1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 2654 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 130151792 130152099 130151899 Y NA NA NA NA NA NA CEP41 71518 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 130586004 130586434 130586371 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 206421 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 130606000 130606565 130606293 Y NA NA LOC646329 MCF7 ChIA-PET 22265404 MKLN1 186290 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 130641725 130642119 130642041 Y MKLN1 NA NA NA NA NA MKLN1 150736 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 130645057 130645459 130645325 Y MKLN1,MKLN1 NA NA NA NA NA MKLN1 147396 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 130665753 130666114 130665990 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 126741 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 130669444 130669692 130669631 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 123163 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 130696655 130697004 130696978 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 95851 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 130720133 130720826 130720768 Y MKLN1,MKLN1 NA NA NA NA NA MKLN1 72029 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 130916172 130916668 130916569 Y NA AC009362.2 NA NA NA NA AC009362.2 8681 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 131152589 131152603 131152595 Y NA NA NA NA NA NA PODXL 88373 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 131166569 131166943 131166757 Y PODXL NA NA NA NA NA PODXL 74033 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 132340200 132340344 132340290 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD3 424504 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 132488555 132488726 132488642 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD3 276122 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 132660683 132660693 132660688 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD3 104155 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 133390444 133390812 133390625 Y NA NA NA NA NA NA LRGUK 419240 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 133706471 133706698 133706584 Y NA NA NA NA NA NA LRGUK 103354 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 134845913 134846266 134846037 Y WDR91,CNOT4,TMEM140 TMEM140,C7orf49,WDR91 NA NA NA NA C7orf49 7281 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 135665513 135665767 135665568 Y NA MTPN NA NA NA NA MTPN 5412 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 135771654 135771794 135771701 Y NA AC009784.3 NA NA NA NA AC009784.3 3879 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 137138499 137138631 137138565 Y NA NA NA NA NA NA CREB3L2 546182 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 137573369 137573542 137573460 Y NA NA NA NA NA NA CREB3L2 111271 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 138249829 138249954 138249896 Y NA NA NA NA NA NA TRIM24 106750 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 138250447 138250496 138250473 Y AKR1D1,TRIM24 NA NA NA NA NA TRIM24 107368 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 138643234 138643648 138643551 Y TRIM24,SVOPL,UBN2,LUC7L2,KIAA1549 KIAA1549 NA NA NA NA KIAA1549 20416 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 138755461 138755819 138755643 Y SVOPL,ZC3HAV1 ZC3HAV1L,ZC3HAV1 NA NA NA NA ZC3HAV1 36646 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 138791748 138791993 138791908 Y UBN2,LUC7L2,ZC3HAV1 ZC3HAV1,TTC26 NA NA NA NA ZC3HAV1 472 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 142505354 142505882 142505518 Y GSTK1,CASP2 NA NA NA NA NA GSTK1 433304 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 143072489 143072836 143072701 Y GSTK1,FAM115C AC093673.5,ZYX NA NA NA NA AC093673.5 2752 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 145860816 145861156 145860986 Y CNTNAP2 NA NA NA NA NA TPK1 1329328 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 146086153 146086538 146086171 Y NA NA NA NA NA NA TPK1 1554665 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 148424586 148424815 148424779 Y NA CUL1 NA NA NA NA CUL1 31580 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 148553939 148554320 148554152 Y CUL1,EZH2,EZH2 EZH2 NA NA NA NA EZH2 25093 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA NA EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZH2 58860 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 3.6539367212754 chr7 148680544 148680840 148680694 Y NA PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 42893 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 148684338 148684706 148684475 Y NA PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 39027 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chr7 148788628 148788884 148788863 Y ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398 ZNF786,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2754 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 148824928 148825234 148824952 Y NA ZNF786,ZNF398 NA NA NA NA ZNF398 3420 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 149468740 149469267 149468803 Y NA ZNF467 NA NA NA NA ZNF467 172 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 149745351 149745623 149745500 Y NA NA NA NA NA NA ATP6V0E2 177294 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 150414963 150415154 150414991 Y GIMAP8,GIMAP7,GIMAP4,GIMAP6,GIMAP2,GIMAP1,LOC100128542,GIMAP5 GIMAP2,GIMAP1 NA NA NA NA GIMAP1 3318 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 150594675 150594819 150594747 Y NA NA ATG9B,NOS3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCB8 128691 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 150691752 150691942 150691795 Y GIMAP7,GIMAP4,GIMAP6,GIMAP2,GIMAP1,GIMAP5,LOC100128542 ABCB8 NA NA NA NA ABCB8 31568 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 150782057 150782091 150782074 Y GIMAP2,GIMAP1,GIMAP5,LOC100128542,SMARCD3,SMARCD3,SLC4A2 SLC4A2,CDK5,FASTK,TMUB1,AGAP3 NA NA NA NA AGAP3 1139 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 151198552 151198933 151198803 Y AGAP3,PRKAG2,PRKAG2 RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 16273 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 151480048 151480422 151480235 Y PRKAG2,GALNTL5 NA NA NA NA NA PRKAG2-AS1 91705 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 210057 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr7 152161348 152162014 152161594 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 209236 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 152338571 152338711 152338613 Y NA XRCC2 NA NA NA NA XRCC2 32539 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 154742897 154743129 154742996 Y NA PAXIP1 NA NA NA NA PAXIP1 49665 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 154743291 154743691 154743552 Y NA PAXIP1 NA NA NA NA PAXIP1 49103 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 155276719 155276807 155276762 Y PAXIP1,CNPY1 CNPY1 NA NA NA NA CNPY1 47750 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 155580383 155580450 155580415 Y NA NA NA NA NA NA AC009403.2 144484 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 157054104 157054271 157054188 Y NA NA NA NA NA NA RP4-814D15.2 71042 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 157067817 157068138 157067978 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 57937 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 157070019 157070314 157070105 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 55761 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 157255834 157256209 157256022 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 129759 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr7 157405982 157406183 157406105 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 279907 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr7 158410794 158411171 158410984 Y NA PTPRN2 NA NA NA NA PTPRN2 32314 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 158808159 158808606 158808258 Y VIPR2 NA NA NA NA NA VIPR2 127043 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr7 158988480 158988780 158988594 Y ESYT2 NA VIPR2 IMR90 Hi-C 24141950 VIPR2 52831 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.40536027741361 chr8 1897074 1897760 1897667 Y NA KBTBD11 NA NA NA NA KBTBD11 22284 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 3.79447274901676 chr8 1898205 1898424 1898394 Y NA KBTBD11 NA NA NA NA KBTBD11 21620 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.40536027741361 chr8 2588091 2588111 2588101 Y NA GS1-57L11.1,RP11-134O21.1 NA NA NA NA RP11-134O21.1 4100 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr8 2591169 2591450 2591225 Y NA GS1-57L11.1,RP11-134O21.1 NA NA NA NA RP11-134O21.1 7178 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.54589630515498 chr8 2740285 2740400 2740343 Y NA NA NA NA NA NA RP11-134O21.1 156294 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 3252665 3252838 3252782 Y NA NA NA NA NA NA RP11-134O21.1 668674 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 6415254 6415472 6415345 Y NA ANGPT2 NA NA NA NA ANGPT2 3458 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 8203793 8204189 8204138 Y NA SGK223 NA NA NA NA SGK223 37819 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 8267771 8268089 8267930 Y NA SGK223 SGK223 IMR90 Hi-C 24141950 SGK223 25763 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 8610591 8610846 8610739 Y NA NA ERI1,SGK223,MFHAS1 IMR90 Hi-C 24141950 MFHAS1 138309 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 8742026 8742246 8742225 Y NA MFHAS1 NA NA NA NA MFHAS1 6909 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 8897951 8898142 8898036 Y NA ERI1 MIR4660 IMR90 Hi-C 24141950 ERI1 40294 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 10079596 10079605 10079601 Y MSRA NA NA NA NA NA MSRA 169818 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 10192260 10192787 10192448 Y MSRA NA NA NA NA NA MSRA 282482 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 10823160 10823372 10823178 Y PRSS55,C8orf74 NA NA NA NA NA PINX1 127766 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr8 10872577 10873059 10872733 Y XKR6,MTMR9 NA NA NA NA NA PINX1 177183 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 11013396 11013600 11013498 Y NA XKR6 NA NA NA NA XKR6 43275 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 11032163 11032532 11032339 Y NA XKR6 NA NA NA NA XKR6 24343 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 11312887 11313950 11313920 Y NA BLK NA NA NA NA BLK 35560 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr8 11319529 11319661 11319595 Y NA BLK NA NA NA NA BLK 29849 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 11690057 11690160 11690110 Y NA SUB1P1,FDFT1,RP11-297N6.4,CTSB NA NA NA NA RP11-297N6.4 31980 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 11735335 11735756 11735393 Y CTSB CTSB CTSB,BLK,FDFT1,FAM167A IMR90 Hi-C 24141950 CTSB 10378 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 11755941 11756161 11756072 Y CTSB CTSB CTSB,FAM167A,BLK,NEIL2,GATA4,FDFT1 IMR90 Hi-C 24141950 CTSB 30984 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 12615395 12615750 12615522 Y NA LONRF1 NA NA NA NA LONRF1 3813 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 16219402 16219917 16219607 Y MSR1 NA MSR1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC2 791621 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 16304872 16305090 16304981 Y NA NA TUSC3 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC2 706448 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 17553591 17554013 17553880 Y NA NA NA NA NA NA PCM1 224336 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 17893767 17894158 17893964 Y NAT1,ASAH1,ASAH1 ASAH1 NA NA NA NA ASAH1 46336 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 18953463 18953695 18953605 Y NA PSD3 LOC100128993,CSGALNACT1,PSD3,SH2D4A IMR90 Hi-C 24141950 PSD3 13223 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 19058200 19058838 19058472 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 117960 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 19553967 19554124 19554035 Y NA NA CSGALNACT1 IMR90 Hi-C 24141950 CSGALNACT1 59416 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 19956829 19957079 19956916 Y ATP6V1B2 NA LPL IMR90 Hi-C 24141950 ATP6V1B2 95799 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 20059971 20060332 20060110 Y ATP6V1B2 ATP6V1B2 NA NA NA NA ATP6V1B2 7093 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 20125746 20125979 20125927 Y NA NA DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1 IMR90 Hi-C 24141950 ATP6V1B2 72868 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 20126353 20126692 20126612 Y NA NA DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1 IMR90 Hi-C 24141950 ATP6V1B2 73475 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 21624397 21624558 21624547 Y NPM2,GFRA2 NA NA NA NA NA XPO7 150622 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 21775759 21776194 21775973 Y PHYHIP,DOK2,NPM2 XPO7 NA NA NA NA XPO7 579 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr8 21804083 21804253 21804128 Y NA XPO7 NA NA NA NA XPO7 28903 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 21999982 22000221 22000101 Y POLR3D NUDT18,HR,REEP4,BMP1 NA NA NA NA REEP4 2518 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr8 22103553 22103662 22103605 Y NA MIR320A,POLR3D NA NA NA NA POLR3D 2936 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 22469003 22469432 22469219 Y NA C8orf58 NA NA NA NA C8orf58 13889 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 22513437 22513754 22513670 Y NA BIN3 NA NA NA NA BIN3 10907 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 22551843 22553123 22552848 Y PPP3CC,PDLIM2,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10C,EGR3 BIN3 NA NA NA NA BIN3 27182 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 22562170 22562986 22562572 Y PPP3CC,PDLIM2,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10C,TNFRSF10B,EGR3 BIN3 NA NA NA NA BIN3 37509 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 23016406 23016568 23016458 Y ENTPD4,ENTPD4,BIN3,TNFRSF10C TNFRSF10D NA NA NA NA TNFRSF10D 2975 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 24647521 24647845 24647683 Y NA NA NA NA NA NA KCTD9 666147 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 26232086 26232281 26232177 Y NA BNIP3L,SDAD1P1 NA NA NA NA BNIP3L 6133 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 26306627 26307336 26307213 Y NA NA BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DPYSL2 62455 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 26466894 26467238 26467101 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL2 97103 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 26661148 26661460 26661304 Y NA RP11-384C12.1 NA NA NA NA RP11-384C12.1 33841 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 27114452 27114997 27114718 Y NA NA NA NA NA NA TRIM35 51839 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 27208490 27208766 27208628 Y PTK2B,PTK2B TRIM35,PTK2B NA NA NA NA PTK2B 41491 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 27221120 27221544 27221428 Y PTK2B,PTK2B NA NA NA NA NA PTK2B 54121 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr8 27236352 27236561 27236406 Y PTK2B,PTK2B NA NA NA NA NA PTK2B 69353 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr8 27547704 27547787 27547746 Y NA NA NA NA NA NA ESCO2 79679 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 27630770 27631068 27630863 Y NA ESCO2,CCDC25 NA NA NA NA CCDC25 2600 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 28004860 28005043 28004968 Y NA NA NA NA NA NA ELP3 59670 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 28258528 28258941 28258737 Y HMBOX1,HMBOX1 ZNF395 ZNF395,FBXO16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF395 310 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr8 28269273 28269920 28269515 Y ZNF395 ZNF395 NA NA NA NA ZNF395 11055 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr8 28884105 28884486 28884217 Y HMBOX1,HMBOX1 CTD-2647L4.4 NA NA NA NA CTD-2647L4.4 26966 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 29558749 29558970 29558858 Y KIF13B AC145110.1 NA NA NA NA AC145110.1 44855 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 29631647 29631969 29631808 Y NA AC145110.1 C8orf75,LOC286135 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC145110.1 27822 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr8 29946002 29946367 29946215 Y TMEM66,LEPROTL1 TMEM66,LEPROTL1,RPS15AP24 NA NA NA NA LEPROTL1 4547 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 32508172 32508500 32508337 Y NRG1,NRG1 NA NA NA NA NA FUT10 820440 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 33287156 33287526 33287341 Y NA FUT10 NA NA NA NA FUT10 41414 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA LSM12P1 NA NA NA NA LSM12P1 1527 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 2.38911247160314 chr8 36441429 36441454 36441442 Y NA NA NA NA NA NA LSM12P1 1060148 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 37643587 37643772 37643645 Y NA PROSC,GPR124 NA NA NA NA GPR124 3878 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 37928414 37928535 37928451 Y ADRB3,WHSC1L1 EIF4EBP1,ASH2L NA NA NA NA ASH2L 32225 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 37961561 37961954 37961758 Y NA ASH2L NA NA NA NA ASH2L 801 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 37992032 37992208 37992120 Y NA ASH2L,BAG4,LSM1 NA NA NA NA ASH2L 31272 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 38794203 38794537 38794324 Y TACC1,PLEKHA2 PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 37450 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 40256946 40256967 40256958 Y NA NA ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD65 1025207 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 41882456 41882591 41882524 Y NA KAT6A NA NA NA NA KAT6A 24917 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 41908079 41908836 41908505 Y POLB,IKBKB,IKBKB,AP3M2,AGPAT6,MYST3 KAT6A NA NA NA NA KAT6A 571 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 43092918 43093442 43093017 Y HOOK3 NA NA NA NA NA HGSNAT 99362 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 43093596 43094096 43093640 Y NA NA NA NA NA NA HGSNAT 100040 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 47962058 47962075 47962067 Y NA NA NA NA NA NA RPL10AP2 104666 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 48504387 48504764 48504567 Y CEBPD NA NA NA NA NA PRKDC 365979 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 49427546 49427722 49427633 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 132396 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 49606082 49606224 49606171 Y NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 310932 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 50466157 50466168 50466163 Y NA NA NA NA NA NA RPL29P19 1171007 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 52747281 52747589 52747434 Y NA NA NA NA NA NA PCMTD1 62146 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 55125016 55125190 55125101 Y ATP6V1H,ATP6V1H NA NA NA NA NA MRPL15 79246 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 56352496 56352535 56352512 Y XKR4 NA NA NA NA NA TGS1 331166 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 56744320 56744391 56744354 Y TGS1 LYN NA NA NA NA LYN 45981 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 56756553 56757241 56756740 Y LYN LYN NA NA NA NA LYN 33131 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 56903187 56904166 56903812 Y LYN NA NA NA NA NA SNORD54 80294 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 59476129 59476409 59476167 Y NA SDCBP NA NA NA NA SDCBP 12646 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 61592861 61593584 61592948 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 3524 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 61657043 61657068 61657053 Y CHD7 NA NA NA NA NA CHD7 67706 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 61660299 61660611 61660357 Y CHD7 NA NA NA NA NA CHD7 70962 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 61664874 61665035 61664955 Y NA NA NA NA NA NA CHD7 75537 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr8 61705362 61705819 61705615 Y NA NA NA NA NA NA CHD7 116025 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.40536027741361 chr8 61821464 61821801 61821596 Y CHD7 NA NA NA NA NA CHD7 232127 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 61850490 61850754 61850677 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261153 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 61850776 61851191 61851141 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261439 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr8 62923736 62924137 62923937 Y NKAIN3 NA NA NA NA NA NKAIN3 235013 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 63162204 63162589 63162538 Y NA NKAIN3 NA NA NA NA NKAIN3 3054 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 63776641 63776831 63776733 Y NA NA NA NA NA NA GGH 172899 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 66862327 66863132 66862741 Y PDE7A NA PDE7A MCF7 ChIA-PET 22265404 PDE7A 109770 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 66863902 66864441 66863992 Y RRS1,PDE7A NA PDE7A MCF7 ChIA-PET 22265404 PDE7A 111345 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.68643233289634 chr8 66893726 66894034 66893791 Y PDE7A NA DNAJC5B IMR90 Hi-C 24141950 PDE7A 141169 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 67433991 67434613 67434592 Y NA NA NA NA NA NA MYBL1 89869 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 67445791 67446197 67446047 Y ADHFE1,VCPIP1,MYBL1 NA NA NA NA NA MYBL1 78285 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 67522221 67522599 67522407 Y ADHFE1,VCPIP1,MYBL1 MYBL1 NA NA NA NA MYBL1 1883 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 68105132 68105308 68105276 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 111114 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 70787574 70787763 70787675 Y SLCO5A1,SLCO5A1,SLCO5A1 RP11-159H10.3,SLCO5A1 NA NA NA NA SLCO5A1 42275 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 71968659 71968838 71968749 Y NA NA NA NA NA NA LACTB2 389250 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 74453012 74453349 74453181 Y NA NA NA NA NA NA STAU2 204594 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 74805063 74805433 74805333 Y NA UBE2W UBE2W IMR90 Hi-C 24141950 UBE2W 15918 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 75515244 75515546 75515314 Y NA RP11-730G20.2 NA NA NA NA RP11-730G20.2 765 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 77585675 77585844 77585753 Y ZFHX4 NA NA NA NA NA PEX2 325436 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 79674578 79674862 79674701 Y NA NA NA NA NA NA MRPS28 1265662 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 80275634 80276026 80275830 Y STMN2 NA NA NA NA NA MRPS28 664498 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 80859511 80859794 80859653 Y NA NA NA NA NA NA MRPS28 80730 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 81289521 81289894 81289680 Y ZBTB10 NA ZNF704 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB10 105960 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 81782792 81783006 81782996 Y ZBTB10,ZNF704 NA NA NA NA NA PAG1 239297 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr8 81923399 81923674 81923541 Y PAG1 NA NA NA NA NA PAG1 98629 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 81926658 81927068 81927016 Y NA NA NA NA NA NA PAG1 95235 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 81933989 81934508 81934361 Y NA NA NA NA NA NA PAG1 87795 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 81993720 81993926 81993821 Y PAG1 PAG1 NA NA NA NA PAG1 28377 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 82042673 82043029 82042906 Y PAG1 PAG1,RP11-1149M10.2 PAG1 IMR90 Hi-C 24141950 PAG1 20370 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 82043336 82043603 82043470 Y NA PAG1,RP11-1149M10.2 PAG1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1149M10.2 20911 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 82061220 82061392 82061249 Y ZNF704,PMP2 PAG1,RP11-1149M10.2 PAG1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1149M10.2 3122 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr8 87404027 87404214 87404101 Y NA NA NA NA NA NA WWP1 51060 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 87484005 87484360 87484214 Y NA CPNE3,SLC2A3P4 NA NA NA NA CPNE3 10699 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 90740659 90741027 90740842 Y NA RP11-37B2.1,RIPK2 DECR1,NBN,RIPK2,OSGIN2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-37B2.1 26928 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 90794286 90794738 90794600 Y OSGIN2,RIPK2 RP11-37B2.1,RIPK2 NA NA NA NA RIPK2 26311 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 90912887 90913271 90913166 Y NA OSGIN2 NA NA NA NA OSGIN2 800 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 90987349 90987665 90987516 Y RIPK2,OSGIN2 DECR1,NBN NA NA NA NA DECR1 23968 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 91020764 91021152 91020912 Y NA DECR1,NBN NA NA NA NA NBN 7308 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 95003706 95004122 95004001 Y NA NA LINC00535,RBM12B,RAD54B,CDH17,GEM IMR90 Hi-C 24141950 PDP1 135671 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 96146998 96147210 96147103 Y TP53INP1,PLEKHF2 PLEKHF2 NA NA NA NA PLEKHF2 2966 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 97319675 97319761 97319753 Y NA MTERFD1,PTDSS1 NA NA NA NA PTDSS1 47732 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 99411965 99412163 99412094 Y NIPAL2,KCNS2 NA NIPAL2,STK3,POP1,KCNS2 IMR90 Hi-C 24141950 NIPAL2 107344 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 99953302 99954000 99953407 Y STK3,OSR2 STK3,OSR2 NA NA NA NA STK3 247 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 100808377 100808591 100808586 Y NA NA NA NA NA NA COX6C 95699 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 101512336 101512720 101512423 Y SPAG1,SPAG1 NA NA NA NA NA ANKRD46 57292 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr8 101527632 101527771 101527702 Y RNF19A,RNF19A ANKRD46 NA NA NA NA ANKRD46 42241 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 101731045 101731633 101731441 Y NA PABPC1 NA NA NA NA PABPC1 1404 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr8 101821654 101822280 101821977 Y RNF19A,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ NA SNX31,PABPC1,ANKRD46 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS26P6 83694 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 101920723 101921107 101920870 Y NA RPS26P6,YWHAZ NA NA NA NA RPS26P6 14749 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr8 102149452 102149813 102149564 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA YWHAZ,FLJ42969,ZNF706 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 66608 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr8 103411260 103411483 103411351 Y UBR5 UBR5 NA NA NA NA UBR5 11586 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 103795045 103795342 103795198 Y NA NA UBR5,KLF10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KB-1507C5.2 79186 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 104059632 104059708 104059689 Y NA ATP6V1C1 NA NA NA NA ATP6V1C1 28341 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 108452941 108453080 108453009 Y NA NA NA NA NA NA TAGLN2P1 744700 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 109230729 109230920 109230833 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 214642 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 110288477 110288741 110288621 Y NA NA NA NA NA NA ENY2 55812 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 110324960 110325029 110324995 Y NA ENY2,NUDCD1 NA NA NA NA ENY2 19524 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 116660380 116660747 116660648 Y TRPS1 NA NA NA NA NA UTP23 1115995 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 117529764 117530094 117529930 Y C8orf85 NA NA NA NA NA UTP23 246648 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 117883999 117884137 117884073 Y UTP23,RAD21 MIR3610,RAD21 NA NA NA NA MIR3610 902 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 118128259 118128494 118128265 Y NA NA NA NA NA NA RAD21 243154 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 121456351 121456697 121456524 Y SNTB1,MTBP,MRPL13 MTBP,MRPL13 NA NA NA NA MRPL13 709 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 121628287 121628559 121628462 Y NA NA NA NA NA NA MRPL13 172645 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 121649803 121649981 121649892 Y NA NA NA NA NA NA SNTB1 173532 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 121702901 121703232 121703165 Y NA NA NA NA NA NA SNTB1 120281 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 121737162 121737328 121737239 Y NA NA NA NA NA NA SNTB1 86185 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 121815954 121816374 121816244 Y SNTB1 SNTB1 NA NA NA NA SNTB1 7139 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 121822442 121823157 121823030 Y NA SNTB1 NA NA NA NA SNTB1 356 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 121873597 121873929 121873801 Y NA RP11-369K17.1 SNTB1,MRPL13,MTBP IMR90 Hi-C 24141950 RP11-369K17.1 49376 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 122351960 122352334 122352147 Y NA NA HAS2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-369K17.1 428655 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 123795111 123795992 123795667 Y C8orf76,ZHX2 ZHX2 NA NA NA NA ZHX2 3478 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.68643233289634 chr8 123811167 123811696 123811506 Y C8orf76,ZHX2 ZHX2 NA NA NA NA ZHX2 19534 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 123883965 123883977 123883971 Y NA NA NA NA NA NA ZHX2 92332 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 123908169 123908483 123908299 Y NA NA NA NA NA NA ZHX2 116536 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 124248679 124249062 124248866 Y NA C8orf76,ZHX1 NA NA NA NA C8orf76 2576 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 124407455 124407786 124407574 Y FAM91A1,C8orf76,ZHX1,ATAD2 ATAD2,WDYHV1 NA NA NA NA ATAD2 18804 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 124462485 124463022 124462596 Y NA ATAD2,WDYHV1 NA NA NA NA WDYHV1 35520 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 124695521 124695846 124695602 Y NA NA NA NA NA NA FAM91A1 82850 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 125210059 125210285 125210207 Y FAM91A1,TMEM65,RNF139 ARF1P3 TMEM65,FAM91A1,FER1L6,FER1L6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ARF1P3 47895 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr8 125267263 125267302 125267281 Y FAM91A1,RNF139 NA TMEM65,FER1L6,FER1L6-AS1,FAM91A1 IMR90 Hi-C 24141950 ARF1P3 105099 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 125302460 125302812 125302637 Y TMEM65,RNF139 NA NA NA NA NA TMEM65 80121 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 125649664 125650232 125649981 Y ZNF572,RNF139 NA NA NA NA NA TATDN1 99965 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 125656235 125656588 125656492 Y ZNF572,RNF139,MTSS1 NA NA NA NA NA TATDN1 106536 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 125683084 125683301 125683193 Y MTSS1 NA NA NA NA NA TATDN1 133385 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 126193275 126193543 126193371 Y NA NA TRIB1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0196 91193 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 126290719 126290948 126290836 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 149615 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 3.79447274901676 chr8 126335524 126335526 126335525 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 105037 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 126441416 126441734 126441625 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 853 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 126446642 126447323 126446973 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 6079 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 126541064 126541373 126541286 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NSMCE2,TRIB1,KIAA0196 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 100501 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 127104655 127104821 127104738 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 664092 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 128099457 128099542 128099514 Y NA NA NA NA NA NA MYC 646138 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 128167127 128167527 128167484 Y NA NA NA NA NA NA MYC 578153 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 128203137 128203490 128203390 Y NA NA NA NA NA NA MYC 542190 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 128403573 128403875 128403698 Y MYC NA NA NA NA NA MYC 341805 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 128734724 128735010 128734826 Y NA MYC NA NA NA NA MYC 10670 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 128878082 128878481 128878225 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 73303 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 128888391 128888698 128888485 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 83612 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 128919831 128920544 128920233 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 100313 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 128926432 128926732 128926619 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 94125 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 129036981 129037022 129036995 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 16124 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 129053712 129054462 129054053 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 32855 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 129076309 129076777 129076518 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 55452 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 129115789 129116244 129116059 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 94932 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 129872221 129872562 129872390 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00977 378934 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 129888455 129888974 129888966 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00977 362522 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 129942288 129942645 129942469 Y NA NA MYC IMR90 Hi-C 24141950 LINC00977 308851 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr8 130184913 130184979 130184946 Y NA NA NA NA NA NA LINC00977 66517 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 130284402 130285105 130284786 Y NA LINC00977 NA NA NA NA LINC00977 32906 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 130315048 130315337 130315217 Y NA NA NA NA NA NA LINC00977 63552 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 130373600 130373989 130373795 Y NA NA NA NA NA NA LINC00977 122104 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 130430686 130431090 130430988 Y NA NA NA NA NA NA LINC00977 179190 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 130548053 130548359 130548185 Y NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 LINC00977 296557 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 130550763 130551187 130550985 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00977 299267 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 130553474 130554279 130554012 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00977 301978 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 130558328 130558659 130558367 Y FAM49B NA NA NA NA NA LINC00977 306832 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 130559153 130559435 130559226 Y NA NA NA NA NA NA LINC00977 307657 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr8 130560066 130560288 130560191 Y NA NA NA NA NA NA LINC00977 308570 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 130566236 130566665 130566321 Y NA NA NA NA NA NA LINC00977 314740 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr8 130566808 130567296 130566886 Y FAM49B NA NA NA NA NA LINC00977 315312 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 130604361 130604767 130604632 Y FAM49B NA NA NA NA NA LINC00977 352865 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 130605679 130605945 130605781 Y FAM49B NA NA NA NA NA LINC00977 354183 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 130876466 130876830 130876577 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 150545 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 130983929 130984348 130984047 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 43027 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 131134027 131134054 131134041 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 106652 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 131269679 131269819 131269766 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 184087 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 131495645 131495684 131495664 Y NA ASAP1 ASAP1 IMR90 Hi-C 24141950 ASAP1 41739 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 133490570 133490736 133490650 Y NA NA NA NA NA NA LRRC6 195102 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 134510785 134510981 134510865 Y SLA NA NA NA NA NA ST3GAL1 71202 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 134963247 134963579 134963383 Y ST3GAL1 NA ST3GAL1 IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL1 381064 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 135635794 135636288 135636020 Y NA NA NA NA NA NA ZFAT 87004 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 135842490 135842788 135842753 Y NA NA ZFAT IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFAT 119198 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 135843585 135843751 135843688 Y ZFAT NA ZFAT,MIR30D,MIR30B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFAT 120293 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr8 141474376 141475403 141474918 Y NA TRAPPC9,CHRAC1 TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TRAPPC9 7698 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 141555144 141555348 141555233 Y EIF2C2,CHRAC1 CHRAC1 NA NA NA NA CHRAC1 35747 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 141604721 141605198 141605144 Y EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 85324 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 141972530 141972881 141972765 Y NA PTK2 NA NA NA NA PTK2 37434 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 142105625 142105840 142105724 Y EIF2C2,SLC45A4,PTP4A3,DENND3 DENND3,RP11-809O17.1 PTK2,DENND3 IMR90 Hi-C 24141950 DENND3 19537 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 142128241 142128488 142128412 Y NA DENND3,RP11-809O17.1 PTK2,DENND3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DENND3 2864 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 142215999 142216277 142216212 Y DENND3,SLC45A4 NA NA NA NA NA RP11-809O17.1 77939 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 142216641 142216829 142216751 Y DENND3,SLC45A4 NA NA NA NA NA RP11-809O17.1 78581 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 142275441 142276204 142275736 Y NA SLC45A4 PTK2,DENND3,SLC45A4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC45A4 40200 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 142550661 142551112 142550824 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPA1P38 83486 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 143813380 143813410 143813405 Y GPIHBP1 NA NA NA NA NA JRK 51994 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 144107532 144108153 144107940 Y MAFA LY6E NA NA NA NA LY6E 10133 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 144360422 144361034 144360946 Y ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696 NA NA NA NA RP13-582O9.5 826 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 144598131 144598463 144598197 Y PARP10 ZC3H3,GSDMD NA NA NA NA ZC3H3 23160 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 145025737 145026802 145026365 Y ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10 PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 22100 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr8 145118322 145118976 145118932 Y LOC100130274,SPATC1 PARP10,OPLAH,EXOSC4,CTD-3065J16.9,GPAA1,CYC1,MAF1,SHARPIN NA NA NA NA OPLAH 1587 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 145549095 145549459 145549304 Y NA BOP1,HSF1,DGAT1,FBXL6,ADCK5 NA NA NA NA DGAT1 522 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 145995593 145996127 145996081 Y COMMD5,COMMD5,COMMD5,ZNF34 ZNF251,ZNF34,RPL8 NA NA NA NA ZNF34 14603 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr8 146010487 146010786 146010731 Y NA ZNF251,RPL8,ZNF7 NA NA NA NA ZNF34 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr9 2018040 2018611 2018274 Y SMARCA2 SMARCA2 NA NA NA NA SMARCA2 4698 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 2018914 2019279 2019030 Y NA SMARCA2 NA NA NA NA SMARCA2 5572 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 2109301 2109656 2109323 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA2 95959 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 2241944 2242239 2242031 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA2 228602 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr9 2623377 2623723 2623671 Y NA VLDLR NA NA NA NA VLDLR 3543 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr9 2632517 2632641 2632572 Y KCNV2 VLDLR NA NA NA NA VLDLR 12683 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 2655543 2655805 2655674 Y NA VLDLR NA NA NA NA VLDLR 35709 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 2657497 2657645 2657571 Y NA VLDLR NA NA NA NA VLDLR 37663 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 2875811 2876206 2875956 Y NA KIAA0020 NA NA NA NA KIAA0020 33570 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 3508264 3508975 3508586 Y RFX3 RFX3,RP11-509J21.1 NA NA NA NA RFX3 15029 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 4656742 4656927 4656747 Y PPAPDC2,CDC37L1,C9orf68 PPAPDC2,CDC37L1 NA NA NA NA PPAPDC2 3371 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr9 4738592 4738723 4738708 Y NA AK3 NA NA NA NA AK3 1320 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 4933308 4933545 4933427 Y NA JAK2 RCL1,JAK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JAK2 49488 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 5499914 5500215 5500099 Y NA NA NA NA NA NA CD274 51411 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 5583347 5583481 5583453 Y NA KIAA1432 NA NA NA NA KIAA1432 43544 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 5627107 5627559 5627241 Y CD274,RANBP6,KIAA2026,KIAA1432 KIAA1432 NA NA NA NA KIAA1432 82 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr9 5777401 5777564 5777483 Y NA NA NA NA NA NA ERMP1 53553 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 6384866 6385180 6385056 Y NA UHRF2 NA NA NA NA UHRF2 25971 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 6680895 6681975 6681336 Y UHRF2,KDM4C RP11-106A1.2,KDM4C KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 36888 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chr9 6958089 6958102 6958095 Y NA NA NA NA NA NA KDM4C 239226 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 9469595 9469625 9469608 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P3 380719 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 10027810 10028140 10027960 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P3 938934 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 14233168 14233395 14233282 Y NFIB NA NA NA NA NA LDHAP4 686937 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 14322295 14322910 14322674 Y ZDHHC21,NFIB NA NA NA NA NA LDHAP4 597422 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chr9 14958123 14958476 14958300 Y NA LDHAP4 NA NA NA NA LDHAP4 37791 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 19918390 19918457 19918424 Y NA NA KIAA1797,MLLT3 IMR90 Hi-C 24141950 ACER2 511465 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 21695810 21696232 21696052 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 UBA52P6 313922 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr9 21696521 21696698 21696606 Y IFNA6,IFNA1 NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 UBA52P6 313456 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 21696721 21697113 21696912 Y IFNA8 NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 UBA52P6 313041 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 25344326 25344345 25344335 Y NA NA NA NA NA NA IFT74 1600692 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 27111788 27111916 27111879 Y TEK NA NA NA NA NA PLAA 166327 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 28492930 28493080 28493005 Y NA NA NA NA NA NA C9orf72 921066 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 29826048 29826378 29826215 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 860725 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 31347195 31347362 31347281 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P2 516972 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 32535412 32535514 32535462 Y NA DDX58,TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 11090 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 33028063 33028460 33028077 Y NA APTX,DNAJA1,SMU1 NA NA NA NA DNAJA1 4854 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 33033161 33033386 33033274 Y TOPORS,DNAJA1,NFX1,SMU1 APTX,DNAJA1,SMU1 NA NA NA NA DNAJA1 9952 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 33164497 33164994 33164772 Y APTX,APTX,APTX,SMU1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 360 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 33202575 33202797 33202660 Y NA B4GALT1,SPINK4 SMU1,B4GALT1,SPINK4 IMR90 Hi-C 24141950 SPINK4 13566 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr9 33942829 33943199 33943013 Y NA NA NA NA NA NA UBAP2 103748 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 33953868 33954185 33954034 Y UBE2R2,UBAP1 NA NA NA NA NA UBAP2 92762 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 34016159 34016420 34016379 Y NA UBAP2 NA NA NA NA UBAP2 30527 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 34454815 34455060 34454916 Y NA DNAI1 NA NA NA NA DNAI1 352 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 34986458 34986973 34986609 Y KIAA1539,DNAJB5 DNAJB5 NA NA NA NA DNAJB5 665 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 35116905 35117142 35117025 Y NA VCP,FANCG,PIGO,STOML2,FAM214B,UNC13B NA NA NA NA FAM214B 2567 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 35516545 35516820 35516591 Y NA RUSC2 NA NA NA NA RUSC2 28421 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 35603992 35604628 35604112 Y TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2 TESK1,CD72,SIT1 NA NA NA NA TESK1 625 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 36471008 36471193 36471156 Y NA RNF38 RNF38,MELK IMR90 Hi-C 24141950 RNF38 14352 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 36621370 36621719 36621545 Y NA NA NA NA NA NA MELK 50511 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 36764861 36764955 36764921 Y RNF38 NA MELK IMR90 Hi-C 24141950 MELK 194002 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 36765862 36766252 36766147 Y RNF38,RNF38 NA MELK IMR90 Hi-C 24141950 MELK 195003 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 36869466 36869710 36869657 Y ZCCHC7,PAX5 NA NA NA NA NA RP11-297B17.3 130984 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr9 36909866 36910144 36910005 Y ZCCHC7,PAX5 NA NA NA NA NA RP11-297B17.3 90550 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 36924974 36925090 36925030 Y MELK NA NA NA NA NA RP11-297B17.3 75604 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr9 36951908 36952256 36952225 Y ZCCHC7,PAX5 RP11-297B17.3 NA NA NA NA RP11-297B17.3 48438 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 37004568 37004781 37004672 Y ZCCHC7,PAX5 RP11-297B17.3,PAX5 NA NA NA NA RP11-297B17.3 3874 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 37030516 37030798 37030764 Y NA RP11-297B17.3,PAX5 NA NA NA NA PAX5 1305 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr9 37032033 37032396 37032120 Y ZCCHC7,PAX5 RP11-297B17.3 NA NA NA NA PAX5 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.68643233289634 chr9 37035251 37035762 37035526 Y ZCCHC7,PAX5 RP11-297B17.3,PAX5 NA NA NA NA PAX5 3148 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr9 37035783 37036025 37035954 Y ZCCHC7,PAX5 RP11-297B17.3,PAX5 NA NA NA NA PAX5 3680 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 3.37286466579267 chr9 37036641 37037011 37036829 Y ZCCHC7,ZBTB5,PAX5 RP11-297B17.3,PAX5 NA NA NA NA PAX5 4538 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 3.6539367212754 chr9 37037734 37038057 37038046 Y NA RP11-297B17.3,PAX5 NA NA NA NA PAX5 5631 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 37197241 37197478 37197431 Y NA NA NA NA NA NA ZCCHC7 78705 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr9 37197498 37198123 37197885 Y NA NA NA NA NA NA ZCCHC7 78962 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 37295997 37296383 37296038 Y PAX5,ZCCHC7,FRMPD1 NA NA NA NA NA GRHPR 124280 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr9 37301679 37301776 37301705 Y NA NA NA NA NA NA GRHPR 118887 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 37324373 37324708 37324405 Y PAX5,ZCCHC7,ZBTB5,FBXO10 NA NA NA NA NA GRHPR 95955 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr9 37773119 37773290 37773253 Y FRMPD1 DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA DCAF10 25209 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 37835930 37836292 37836154 Y NA DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA EXOSC3 36496 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 37924173 37924321 37924247 Y NA NA NA NA NA NA EXOSC3 124739 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 38066980 38067628 38067261 Y SHB NA NA NA NA NA SHB 0 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 68417391 68418146 68417579 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 35229 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 68423908 68424365 68424207 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 29010 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 1886 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chr9 71728196 71728449 71728285 Y NA NA NA NA NA NA FXN 80021 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 71795556 71796114 71795819 Y TJP2 NA NA NA NA NA FXN 147381 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 72344996 72345326 72345161 Y NA PTAR1 NA NA NA NA PTAR1 27549 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 72923580 72923722 72923651 Y SMC5 NA NA NA NA NA SMC5 51643 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 2.24857644386178 chr9 73035561 73035945 73035863 Y KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8021 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 74511654 74511799 74511765 Y NA C9orf85 NA NA NA NA C9orf85 12627 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 75124677 75124777 75124727 Y NA NA TMC1,ZFAND5 IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND5 146514 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 75125387 75125400 75125394 Y TMC1 NA TMC1,ZFAND5 IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND5 147224 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 75518800 75519107 75519099 Y NA NA NA NA NA NA ZFAND5 540637 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 75658145 75658406 75658361 Y ANXA1 NA NA NA NA NA ZFAND5 679982 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 76944728 76944906 76944817 Y NA NA NA NA NA NA RP11-197P3.1 603186 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 79018113 79018533 79018297 Y NA RFK,GCNT1 NA NA NA NA RFK 10680 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr9 79191243 79191544 79191412 Y NA AL161626.1 NA NA NA NA AL161626.1 6512 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr9 81235127 81235583 81235285 Y NA NA NA NA NA NA PSAT1 325068 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 81581465 81581839 81581652 Y NA NA TLE4 IMR90 Hi-C 24141950 CHCHD2P9 422380 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 82213229 82213622 82213243 Y NA TLE4 NA NA NA NA TLE4 28541 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 85378567 85378941 85378719 Y NA NA NA NA NA NA RASEF 297151 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr9 86239584 86239974 86239757 Y NA NA NA NA NA NA RP11-522I20.3 80535 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 86886391 86886731 86886547 Y NTRK2,NTRK2,NTRK2 NA NA NA NA NA RMI1 292765 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 88264467 88264715 88264594 Y NA NA NA NA NA NA AGTPBP1 90229 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 88346951 88347024 88346988 Y NA AGTPBP1 NA NA NA NA AGTPBP1 7920 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 88598937 88598983 88598960 Y NA NAA35 NA NA NA NA NAA35 44876 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 88935508 88935794 88935577 Y NA ISCA1,ZCCHC6 NA NA NA NA ZCCHC6 31575 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 88974167 88974346 88974269 Y ZCCHC6 ZCCHC6 ZCCHC6,DAPK1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZCCHC6 6798 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 89190934 89191346 89191092 Y NA NA NA NA NA NA ZCCHC6 223565 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr9 89626902 89626982 89626949 Y NA CDC20P1 NA NA NA NA CDC20P1 2335 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 89627893 89628105 89627999 Y NA CDC20P1 NA NA NA NA CDC20P1 3326 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 90279667 90279982 90279701 Y NA NA NA NA NA NA RP11-40C6.2 141450 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 90328172 90328868 90328486 Y DAPK1,CTSL1 NA CTSL1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-40C6.2 189955 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 91022048 91022386 91022218 Y NA SPIN1 NA NA NA NA SPIN1 20714 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 92762010 92762340 92762146 Y NA NA NA NA NA NA GADD45G 544082 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 93577739 93577890 93577821 Y SYK,SYK SYK NA NA NA NA SYK 15670 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 93955991 93956732 93956142 Y NA NA NA NA NA NA AUH 165463 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr9 94182259 94182597 94182338 Y NFIL3 NFIL3 NA NA NA NA NFIL3 1547 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 94968812 94969005 94968908 Y NA NA NA NA NA NA IARS 85033 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 94993084 94993195 94993158 Y NA NA NA NA NA NA IARS 60843 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 95168954 95169114 95169066 Y OGN OGN,OMD NA NA NA NA OGN 3976 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 95383874 95384172 95384023 Y NA IPPK NA NA NA NA IPPK 46375 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 95388417 95388814 95388616 Y FGD3,CENPP IPPK NA NA NA NA IPPK 41733 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 95452860 95453088 95452974 Y NA IPPK NA NA NA NA IPPK 22313 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 95536839 95537017 95536928 Y NA BICD2 BICD2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BICD2 11745 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 95731311 95731640 95731457 Y SUSD3,FAM120AOS,FGD3 FGD3 NA NA NA NA FGD3 23578 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 95845794 95846166 95845981 Y NINJ1,C9orf89 SUSD3,C9orf89,NINJ1 NA NA NA NA C9orf89 10334 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 96434811 96435085 96434948 Y PHF2 NA NA NA NA NA PHF2 98122 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 96901972 96902054 96902023 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 37062 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 96928143 96928630 96928259 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 10486 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 9706 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr9 97273853 97274253 97274073 Y NA NA NA NA NA NA HIATL1 139020 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr9 97288097 97288106 97288102 Y FBP1,FBP1 NA NA NA NA NA HIATL1 153264 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 97505796 97506082 97505939 Y NA C9orf3 NA NA NA NA C9orf3 18813 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 97623374 97623749 97623496 Y C9orf3,C9orf3 NA NA NA NA NA C9orf3 136391 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 97624826 97625112 97624969 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 137843 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 98273012 98273438 98273114 Y C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1 PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 3901 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr9 98768233 98768612 98768423 Y NA NA NA NA NA NA LINC00476 131974 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 99181547 99181719 99181643 Y NA RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA ZNF367 2936 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 100747732 100748046 100747912 Y NA ANP32B NA NA NA NA ANP32B 4089 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 101554135 101554384 101554323 Y NA ANKS6,GALNT12 NA NA NA NA ANKS6 2863 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 101557390 101557800 101557457 Y NA ANKS6,GALNT12 NA NA NA NA ANKS6 143 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 101630117 101630425 101630271 Y NA NA NA NA NA NA GALNT12 62136 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 102353104 102353513 102353353 Y TGFBR1,NR4A3 NA NR4A3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-554F20.1 226658 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 102445308 102445530 102445368 Y ERP44,NR4A3 NA NA NA NA NA RP11-554F20.1 134641 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 107613144 107613436 107613262 Y NA NA NA NA NA NA ABCA1 75082 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 108474101 108474491 108474408 Y TMEM38B TMEM38B NA NA NA NA TMEM38B 19276 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 109627297 109627657 109627483 Y NA NA NA NA NA NA RAD23B 415761 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 110437099 110437420 110437250 Y KLF4 NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-438P9.1 142428 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 110694459 110694617 110694520 Y KLF4 NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-438P9.1 399788 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 111386829 111386933 111386883 Y NA RP11-220D10.1 KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-220D10.1 180 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 111773643 111773659 111773652 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 150 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 112669829 112670129 112670003 Y NA NA NA NA NA NA RP11-151F5.2 115509 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 113014576 113014999 113014920 Y AKAP2,TXN TXN NA NA NA NA TXN 1921 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 114723325 114723781 114723480 Y NA NA C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGCG 66279 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 114774761 114774976 114774762 Y UGCG NA NA NA NA NA UGCG 117715 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 114809786 114810087 114810015 Y GNG10 NA NA NA NA NA SUSD1 125601 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 115031676 115032066 115031959 Y KIAA1958 NA NA NA NA NA PTBP3 61881 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 115071018 115071139 115071076 Y NA PTBP3 NA NA NA NA PTBP3 22808 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 115258728 115258879 115258816 Y SNX30,SUSD1,ROD1 KIAA1958,C9orf147 NA NA NA NA C9orf147 11244 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 115470219 115470249 115470232 Y ROD1,HSDL2,C9orf80 RP11-276E15.4,SNX30 NA NA NA NA RP11-276E15.4 40487 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 115523438 115523763 115523601 Y ZFP37 RP11-276E15.4,SNX30 NA NA NA NA SNX30 12320 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 117135053 117135760 117135486 Y DFNB31,DFNB31,AKNA AKNA NA NA NA NA AKNA 18925 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 117147567 117148178 117147802 Y DFNB31,DFNB31,ATP6V1G1,ORM2,AKNA AKNA NA NA NA NA AKNA 6507 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 120523356 120523735 120523438 Y NA NA NA NA NA NA TLR4 58746 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 123243513 123243809 123243661 Y NA NA NA NA NA NA CDK5RAP2 96639 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 123251976 123252022 123252001 Y CDK5RAP2 NA NA NA NA NA CDK5RAP2 88426 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 123346430 123346633 123346540 Y TRAF1 CDK5RAP2 CDK5RAP2 K562 ChIA-PET 22265404 CDK5RAP2 5982 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr9 123478444 123478636 123478538 Y NA MEGF9 NA NA NA NA MEGF9 3696 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 123640419 123640826 123640772 Y NA PSMD5,PHF19 NA NA NA NA PHF19 2813 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 123653794 123654121 123654065 Y NA PHF19 NA NA NA NA PHF19 16188 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 123662780 123662807 123662790 Y NA PHF19 NA NA NA NA PHF19 25174 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 124664946 124665174 124665060 Y DAB2IP NA NA NA NA NA TTLL11 188711 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 124726521 124726899 124726710 Y NA NA NA NA NA NA TTLL11 126986 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 125109314 125109437 125109338 Y NA NA TTLL11,MIR4478,MORN5,NDUFA8,LHX6,RBM18,MRRF,PTGS1,OR1K1,PDCL IMR90 Hi-C 24141950 RBM18 84196 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 126102323 126102736 126102675 Y NA NA RC3H2,RABGAP1,MIR600HG,STRBP,CRB2,DENND1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STRBP 73468 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chr9 126297071 126297260 126297221 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 268216 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 126978996 126979273 126979176 Y DENND1A,NEK6,NEK6 NEK6 DENND1A,NEK6,PSMB7 IMR90 Hi-C 24141950 NEK6 38612 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 126979649 126979873 126979792 Y DENND1A NEK6 DENND1A,NEK6,PSMB7 IMR90 Hi-C 24141950 NEK6 38012 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 127018843 127019044 127018944 Y NA NEK6 NA NA NA NA NEK6 958 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 127509473 127509808 127509481 Y NA NR6A1 NA NA NA NA NR6A1 21781 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 127980597 127980978 127980790 Y NA PPP6C,RABEPK,HSPA5,RP11-65N13.8,GAPVD1 NA NA NA NA RABEPK 19776 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 128530354 128530667 128530385 Y NA PBX3 NA NA NA NA PBX3 22730 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 128592115 128592428 128592308 Y PBX3 NA NA NA NA NA PBX3 84491 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 128908654 128909040 128908854 Y NA NA PBX3 IMR90 Hi-C 24141950 PBX3 401030 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 4.77822494320629 chr9 129481833 129482256 129482109 Y ZBTB43,ZBTB34 NA NA NA NA NA ZBTB43 83029 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 129484571 129485188 129484881 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB43 80097 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr9 129485609 129485808 129485757 Y FAM125B,ZBTB34 NA NA NA NA NA ZBTB43 79477 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr9 130373507 130373780 130373645 Y GARNL3,SLC25A25,FAM102A,STXBP1 FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA STXBP1 963 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 130898933 130899188 130899061 Y FAM102A PTGES2,C9orf16 NA NA NA NA PTGES2 10192 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 131127114 131127521 131127297 Y SLC25A25 COQ4,TRUB2,SLC27A4,URM1,CERCAM NA NA NA NA URM1 4077 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr9 131316865 131317367 131316977 Y NA RP11-216B9.6,SPTAN1 NA NA NA NA SPTAN1 3999 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr9 131929415 131929566 131929473 Y METTL11A,C9orf106 IER5L NA NA NA NA IER5L 8974 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 132145857 132146151 132146146 Y FAM73B,C9orf106,USP20,USP20,TOR1B,C9orf78,ASB6 NA C9orf106,LOC100506190,IER5L,C9orf50,PPP2R4,CRAT IMR90,MCF7,K562,HELA Hi-C,ChIA-PET,5C 24141950,22265404,22955621 IER5L 207317 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB6 226118 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr9 132176730 132177172 132176936 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB6 225272 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 132369856 132370376 132370136 Y CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107 ASB6 NA NA NA NA ASB6 32068 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 132505331 132505539 132505390 Y PTGES NA NA NA NA NA TOR1B 57893 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 132646480 132646964 132646831 Y ASB6,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1 NA NA NA NA NA C9orf78 50338 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 132648080 132648314 132648193 Y ASB6,TOR1B,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1 NA NA NA NA NA C9orf78 51938 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chr9 132707337 132707718 132707526 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1 95755 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 132785309 132785843 132785545 Y USP20,USP20,FNBP1 FNBP1,GPR107 NA NA NA NA FNBP1 17630 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 132802902 132803300 132803100 Y ASB6,USP20,USP20,FNBP1 FNBP1,GPR107 NA NA NA NA FNBP1 173 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 132814142 132814504 132814316 Y TOR1B FNBP1,GPR107 NCS1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR107 437 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 133565926 133566149 133566038 Y NA RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1 NA NA NA NA EXOSC2 959 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 134113096 134113636 134113575 Y PRRC2B,NUP214,FAM78A PPAPDC3 NA NA NA NA PPAPDC3 49445 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 134114047 134114338 134114158 Y NA PPAPDC3 NA NA NA NA PPAPDC3 48743 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 134131602 134132161 134131829 Y RAPGEF1,PRRC2B,QRFP,NUP214,FAM78A PPAPDC3 NA NA NA NA PPAPDC3 30920 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.12428822193089 chr9 134552911 134553181 134553024 Y FAM78A,RAPGEF1,RAPGEF1 NA NA NA NA NA RAPGEF1 60280 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 134553923 134554245 134554041 Y FAM78A,PRRC2B,RAPGEF1,MED27,RAPGEF1 NA NA NA NA NA RAPGEF1 59216 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 134600757 134600889 134600837 Y RAPGEF1,NTNG2 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 12572 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 134608249 134608835 134608704 Y FAM78A,RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 4626 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 135197315 135197652 135197484 Y NA SETX NA NA NA NA SETX 30720 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 135279793 135280144 135280078 Y TTF1 TTF1 NA NA NA NA TTF1 65 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 135287067 135287190 135287129 Y NA TTF1 NA NA NA NA TTF1 6858 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 135818615 135818626 135818622 Y RALGDS,C9orf96 TSC1 NA NA NA NA TSC1 595 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 136009131 136009458 136009277 Y GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 27843 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 136576519 136576779 136576603 Y SURF4 NA NA NA NA NA SLC2A6 234260 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 136720858 136721171 136721081 Y SLC2A6,RXRA NA NA NA NA NA LINC00094 167390 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 137367331 137367474 137367390 Y COL5A1 NA COL5A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A1 164146 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 138348639 138348707 138348673 Y NA MRPS2,C9orf116 NA NA NA NA MRPS2 41123 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chr9 138666183 138666357 138666270 Y NA NA NA NA NA NA CAMSAP1 130717 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 139123667 139124081 139124003 Y SEC16A,NOTCH1,CARD9 QSOX2 NA NA NA NA QSOX2 11606 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 7.72948152577488 chr9 139136338 139136616 139136467 Y QSOX2 QSOX2 NA NA NA NA QSOX2 651 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 2.10804041612042 chr9 139223291 139223329 139223306 Y NA GPSM1,DNLZ,CARD9 NA NA NA NA GPSM1 3359 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 139444945 139445101 139445057 Y TMEM141,SDCCAG3 NOTCH1 MIR4674,NOTCH1 K562 ChIA-PET 22265404 NOTCH1 6631 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 139540778 139541198 139541031 Y NOTCH1,NPDC1,FAM69B,EGFL7,EGFL7 RP11-251M1.1,AGPAT2 SEC16A,C9orf163 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RP11-251M1.1 11675 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 139595249 139595639 139595357 Y SEC16A,FUT7,C9orf142,ANAPC2,ABCA2 RP11-251M1.1,AGPAT2,FAM69B,SNHG7,LCN10,LCN6 SNORA43,SNHG7 MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM69B 9383 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 139595835 139596071 139595988 Y SEC16A,LCNL1,FUT7,C9orf142,ANAPC2,ABCA2 RP11-251M1.1,AGPAT2,FAM69B,SNHG7,LCN10,LCN6 SNORA43,SNHG7 MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM69B 8951 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 139606234 139606418 139606254 Y LCNL1,FUT7,CLIC3,C9orf142,ABCA2,KIAA1984 AGPAT2,FAM69B,SNHG7,LCN10,LCN6,LCN8 NA NA NA NA FAM69B 1212 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 139608163 139608561 139608378 Y EGFL7,EGFL7,NPDC1,FAM69B AGPAT2,FAM69B,SNHG7,LCN10,LCN6,LCN8 NA NA NA NA FAM69B 3141 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 139608810 139609132 139608936 Y SNAPC4,INPP5E,EGFL7,EGFL7,FAM69B AGPAT2,FAM69B,SNHG7,LCN10,LCN6,LCN8 NA NA NA NA FAM69B 3788 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 139826661 139826850 139826762 Y NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2 FBXW5 NA NA NA NA FBXW5 10298 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 139919787 139920355 139920165 Y NA C9orf142,ABCA2,UAP1L1 NA NA NA NA ABCA2 1012 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 140022067 140022152 140022137 Y EHMT1,WDR85,NDOR1,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,MIR3621,LRRC26 NA NA NA NA DPP7 14438 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 140023271 140023604 140023504 Y EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,MIR3621,LRRC26 NA NA NA NA DPP7 15642 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7,MIR3621,LRRC26 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 8.0105535812576 chr9 140067700 140068118 140068026 Y LCNL1,C9orf142,CLIC3,ABCA2,FUT7 MIR3621,LRRC26,ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169 NA NA NA NA LRRC26 5197 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 140101916 140102100 140102008 Y C9orf172,FUT7 MIR3621,LRRC26,ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA NDOR1 3769 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA C9orf169 501 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chr9 140143070 140143291 140143174 Y LCNL1,ABCA2,SLC34A3 TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 9405 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 140169154 140169348 140169240 Y NA TUBB4B,NRARP NA NA NA NA NRARP 25355 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chr9 140200054 140200221 140200146 Y EXD3,NRARP NRARP NA NA NA NA NRARP 5351 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 140312019 140312179 140312116 Y LCNL1,ABCA2,FAM166A,C9orf173 EXD3 NA NA NA NA EXD3 3535 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chr9 140523205 140523460 140523276 Y ANAPC2,NDOR1,EHMT1 ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1 NA NA NA NA EHMT1 11761 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chr9 140565381 140565755 140565635 Y NRARP NA NA NA NA NA EHMT1 53937 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chrX 3732842 3733263 3733002 Y PRKX NA NA NA NA NA PRKX 103193 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chrX 9309120 9309320 9309226 Y TBL1X,TBL1X NA TBL1X IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1X 120015 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chrX 9477403 9477544 9477474 Y FAM9B,TBL1X,LOC100288814 TBL1X NA NA NA NA TBL1X 48068 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 9979116 9979440 9979257 Y NA WWC3 SHROOM2,WWC3 IMR90 Hi-C 24141950 WWC3 2162 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 10079384 10079999 10079621 Y NA NA NA NA NA NA WWC3 97782 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chrX 10167232 10167620 10167424 Y WWC3,CLCN4 NA NA NA NA NA WWC3 185630 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chrX 11811393 11811529 11811432 Y NA MSL3 NA NA NA NA MSL3 37115 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 12968289 12968795 12968434 Y TMSB4X,TLR7,TLR8 TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 22432 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 12972600 12972806 12972677 Y NA TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 18421 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chrX 12974184 12974672 12974538 Y TMSB4X,TLR7,TLR8 TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 16555 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chrX 12980169 12980547 12980403 Y NA TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 10680 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 12989837 12990050 12989934 Y TLR7,TLR8,TMSB4X TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 1177 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 12996273 12996492 12996427 Y NA TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 5046 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 13017682 13017863 13017801 Y TLR7,TMSB4X TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 26455 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chrX 13018378 13018636 13018544 Y TLR7,TMSB4X TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 27151 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chrX 13103747 13104137 13103763 Y NA NA TMSB4X MCF7 ChIA-PET 22265404 TMSB4X 112520 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chrX 18637228 18637392 18637280 Y NA NA NA NA NA NA PPEF1 54637 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 19643767 19644028 19643952 Y SH3KBP1 NA NA NA NA NA SH3KBP1 259691 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 20998267 20998386 20998380 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KA3 714744 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 23806806 23807042 23806932 Y ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,ACOT9,SAT1 ACOT9,SAT1,RPL9P7 NA NA NA NA SAT1 7516 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 24497982 24498378 24498262 Y NA PDK3 NA NA NA NA PDK3 16644 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 25664451 25664736 25664645 Y MAGEB18 NA NA NA NA NA POLA1 954415 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 26656235 26656312 26656257 Y NA NA NA NA NA NA POLA1 1946199 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 29496854 29497166 29496936 Y NA NA NA NA NA NA CXorf21 1096795 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 29699916 29700254 29699978 Y NA NA NA NA NA NA CXorf21 893707 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 30631397 30631710 30631444 Y GK,CXorf21 CXorf21,FTLP2,GK NA NA NA NA FTLP2 14705 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 30667899 30668468 30668243 Y NA FTLP2,GK NA NA NA NA GK 1008 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 30744406 30744763 30744585 Y CXorf21,GK NA NA NA NA NA GK 74930 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 37614393 37614669 37614509 Y CYBB NA NA NA NA NA RPGR 570148 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 38738910 38739411 38739092 Y NA NA NA NA NA NA MID1IP1 80225 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 39018621 39018929 39018842 Y MID1IP1 NA NA NA NA NA MID1IP1 359936 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 39646201 39646652 39646229 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 811 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chrX 39873339 39874259 39873676 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 160323 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chrX 39964938 39965503 39965246 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 69079 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 39965558 39965902 39965820 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 68680 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chrX 40005202 40005365 40005305 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 29217 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chrX 40012729 40012965 40012840 Y BCOR,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 21617 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chrX 40013089 40013254 40013186 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 21328 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 40028554 40028949 40028781 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 5633 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 40030956 40031200 40030978 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2 BCOR NA NA NA NA BCOR 3382 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 2.52964849934451 chrX 40031344 40032243 40032130 Y BCOR,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 2339 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chrX 40034694 40035505 40035056 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 112 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chrX 40132742 40132979 40132844 Y ATP6AP2 NA BCOR K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 98160 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chrX 40693990 40694519 40694253 Y NA MKRN4P NA NA NA NA MKRN4P 2252 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 40726668 40726852 40726751 Y ATP6AP2,MED14 MKRN4P,RP11-77G22.2 USP9X,CXorf38,MED14,LOC100132831 IMR90 Hi-C 24141950 MKRN4P 34930 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 40841745 40842012 40841881 Y NA NA MED14 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-77G22.2 76508 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 40943673 40944218 40943773 Y CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X USP9X NA NA NA NA USP9X 785 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.562144110965446 chrX 41182589 41182765 41182693 Y NA DDX3X DDX3X IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDX3X 7886 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 41190836 41191010 41190932 Y NA DDX3X NA NA NA NA DDX3X 185 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 41192009 41192079 41192030 Y NA DDX3X NA NA NA NA DDX3X 1358 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 42588439 42588616 42588528 Y NA NA NA NA NA NA RP3-326I13.1 445627 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 42802909 42803102 42803007 Y NA NA NA NA NA NA RP3-326I13.1 231141 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chrX 43888590 43889088 43888779 Y EFHC2 NA NA NA NA NA FUNDC1 511159 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chrX 44168721 44168911 44168853 Y NA NA NA NA NA NA FUNDC1 231336 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 46278987 46279293 46279130 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 18856 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 46487332 46487848 46487692 Y RP2,ZNF674,CHST7 NA NA NA NA NA CHST7 56113 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chrX 46509009 46509283 46509068 Y NA NA NA NA NA NA CHST7 77790 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chrX 46773328 46773680 46773526 Y NA NA NA NA NA NA RP2 78953 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chrX 46989082 46989431 46989227 Y NA RBM10,NDUFB11 NA NA NA NA RBM10 12837 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 47438054 47438403 47438273 Y CFP,CFP,ARAF ARAF,TIMP1 NA NA NA NA TIMP1 1309 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 47701110 47701161 47701136 Y NA ZNF81 NA NA NA NA ZNF81 6809 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 48748801 48749222 48749175 Y NA PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2 NA NA NA NA PQBP1 3973 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 49012442 49012818 49012676 Y NA GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP MAGIX,PLP2 IMR90 Hi-C 24141950 PLP2 13455 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 49139256 49139619 49139438 Y FOXP3,PPP1R3F CCDC22,PPP1R3F NA NA NA NA PPP1R3F 14950 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chrX 52004971 52005124 52005057 Y NA NA NA NA NA NA MAGED1 460868 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 52964244 52964539 52964367 Y TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 45908 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chrX 53155305 53155690 53155322 Y XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2 TSPYL2,LINC01155 KDM5C IMR90 Hi-C 24141950 LINC01155 33978 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 53428419 53428681 53428625 Y NA RIBC1,SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA RIBC1 18958 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 54665732 54666388 54666226 Y NA NA ITIH6,MAGED2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNL3L 111088 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chrX 56269843 56269989 56269918 Y NA NA NA NA NA NA UBQLN2 318037 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 64070524 64070939 64070785 Y MTMR8 NA NA NA NA NA ZC4H2 181654 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 1.26482424967225 chrX 64148338 64148413 64148376 Y NA NA NA NA NA NA ZC4H2 104180 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 64520324 64520642 64520384 Y NA NA NA NA NA NA LAS1L 232013 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 64815346 64815780 64815481 Y MSN MSN MSN IMR90 Hi-C 24141950 MSN 9089 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 65225187 65225542 65225503 Y NA NA NA NA NA NA MSN 418930 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 65233150 65233304 65233208 Y MSN NA NA NA NA NA MSN 426893 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 68004355 68004677 68004478 Y NA SERBP1P1,EFNB1 NA NA NA NA SERBP1P1 3040 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.843216166448168 chrX 70275409 70275661 70275633 Y NA SNX12,FOXO4 NA NA NA NA SNX12 10612 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 70401853 70402134 70401993 Y IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO RP5-1091N2.9 NA NA NA NA RP5-1091N2.9 13891 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 70415917 70416007 70415951 Y IL2RG,MED12,TAF1,CXCR3 RP5-1091N2.9 NA NA NA NA RP5-1091N2.9 18 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 71402877 71403170 71402921 Y NA PIN4 NA NA NA NA PIN4 3674 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 73250242 73250558 73250399 Y NA NA NA NA NA NA JPX 88083 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 73755621 73755953 73755678 Y RLIM NA NA NA NA NA RLIM 76499 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 77226253 77226302 77226278 Y NA NA NA NA NA NA ATP7A 62059 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 77306835 77307068 77306952 Y NA PGK1 NA NA NA NA PGK1 11617 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 77908831 77908963 77908901 Y CYSLTR1 NA NA NA NA NA P2RY10 289866 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 78400687 78400811 78400726 Y NA NA NA NA NA NA P2RY10 201858 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 78402052 78402538 78402412 Y P2RY10,GPR174 NA NA NA NA NA P2RY10 203223 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 78438106 78438299 78438217 Y P2RY10,GPR174 NA NA NA NA NA ITM2A 182865 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 78514564 78514938 78514760 Y P2RY10,GPR174 NA NA NA NA NA ITM2A 106226 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 85278748 85279124 85278988 Y CHM CHM NA NA NA NA CHM 21442 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chrX 85280770 85281145 85280958 Y CHM CHM NA NA NA NA CHM 19421 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 85339971 85340972 85340615 Y NA CHM NA NA NA NA CHM 39405 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807 chrX 85442428 85442440 85442435 Y NA NA NA NA NA NA CHM 141862 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 100111421 100111452 100111441 Y NA CSTF2 NA NA NA NA CSTF2 38037 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 100792680 100793554 100793013 Y NA NA NA NA NA NA ARMCX6 77437 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 101914784 101914936 101914847 Y BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1 NA NA NA NA NA ARMCX5 62688 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chrX 105809036 105809195 105809116 Y NA NA NA NA NA NA RBM41 550862 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 106595667 106595822 106595802 Y NA NA NA NA NA NA RBM41 235610 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 106693156 106693529 106693316 Y NA NA NA NA NA NA PRPS1 176208 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 106917022 106917635 106917444 Y NA PRPS1 TSC22D3,PRPS1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 47285 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 106920003 106920801 106920325 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 50266 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chrX 106954265 106954667 106954451 Y TSC22D3,TSC22D3,ATG4A NA NA NA NA NA TSC22D3 63905 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 108883543 108883897 108883721 Y NA NA NA NA NA NA ACSL4 90735 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chrX 109085106 109085401 109085292 Y NXT2,NXT2,ACSL4 NA ACSL4 IMR90 Hi-C 24141950 ACSL4 110474 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 109487499 109487581 109487556 Y AMMECR1 NA NA NA NA NA AMMECR1 193880 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chrX 113028207 113028379 113028299 Y NA NA NA NA NA NA AMOT 946164 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 118788207 118788334 118788273 Y NA SEPT6 NA NA NA NA SEPT6 36999 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 118816365 118816526 118816445 Y NKRF,RPL39,RNF113A,SEPT6 SEPT6 NA NA NA NA SEPT6 8807 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 119076607 119076872 119076702 Y NKRF NKAP NA NA NA NA NKAP 872 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 119385485 119385791 119385733 Y NA NKAPP1,ZBTB33 NA NA NA NA ZBTB33 2878 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 119619289 119619732 119619620 Y ZBTB33,ZBTB33 LAMP2 LAMP2 K562 ChIA-PET 22265404 LAMP2 18069 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 122217721 122218007 122217924 Y NA MRRFP1 NA NA NA NA MRRFP1 31627 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 122898767 122899176 122898998 Y NA THOC2 NA NA NA NA THOC2 33861 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chrX 123351438 123351580 123351505 Y SH2D1A NA NA NA NA NA STAG2 259376 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chrX 128225148 128225423 128225251 Y NA NA NA NA NA NA OCRL 446403 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.421608083224084 chrX 128915135 128915622 128915382 Y ELF4,ELF4,BCORL1,SASH3 SASH3 NA NA NA NA SASH3 3180 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.98375219418953 chrX 129118011 129118370 129118054 Y NA BCORL1 BCORL1,UTP14A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCORL1 4928 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chrX 134718222 134718415 134718313 Y NA NA NA NA NA NA DDX26B 65638 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 135628652 135628822 135628737 Y CD40LG,ARHGEF6 NA NA NA NA NA HTATSF1 51414 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 135940631 135940874 135940833 Y HTATSF1 RBMX,RP11-308D16.4 NA NA NA NA RBMX 20049 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 149084401 149084780 149084588 Y NA LINC00894,CXorf40B NA NA NA NA LINC00894 20066 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 149534295 149534593 149534360 Y MAMLD1 NA NA NA NA NA MTM1 200476 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 149863588 149863865 149863755 Y MTM1,MTMR1 MTMR1 NA NA NA NA MTMR1 4153 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chrX 150152595 150153067 150152778 Y NA HMGB3,RPL19P21 NA NA NA NA HMGB3 5613 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chrX 153755432 153755621 153755566 Y NA LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD FAM3A MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 IKBKG 11793 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 153946199 153946375 153946299 Y TEX28,TEX28,EMD,DNASE1L1,TAZ,IKBKG,IKBKG,IKBKG,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1,GAB3 GAB3,DKC1 NA NA NA NA GAB3 31483 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrX 153965423 153965624 153965606 Y NA GAB3,DKC1 CTAG2 IMR90 Hi-C 24141950 GAB3 12234 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.281072055482723 chrY 2872046 2872325 2872195 Y RPS4Y1,ZFY,ZFY NA NA NA NA NA ZFY 70934 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrY 7147506 7147599 7147553 Y NA PRKY NA NA NA NA PRKY 7493 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.140536027741361 chrY 15207344 15207441 15207401 Y NA NA NA NA NA NA DDX3Y 193325 CAGE NALM-6 hg19 FANTOM5 0.702680138706807