chr1	840753	841210	840812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOC2L	51479	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	918449	918555	918505	Y	NA	NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN	NA	NA	NA	NA	HES4	14997	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	945769	946034	945890	Y	CCNL2,ATAD3B	PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN	NA	NA	NA	NA	ISG15	769	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	1093610	1093958	1093954	Y	ATAD3C,TMEM88B	C1orf159	NA	NA	NA	NA	C1orf159	43869	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	1456676	1456699	1456688	Y	NA	ATAD3A	NA	NA	NA	NA	ATAD3A	11145	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	1714020	1714715	1714566	Y	SKI,CDK11B,CDK11A,NADK,GNB1	NADK	NA	NA	NA	NA	NADK	4124	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	1814762	1815124	1815035	Y	SKI,C1orf86,MIB2	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	GNB1	5371	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	TMEM52	7877	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr1	2140151	2140337	2140252	Y	C1orf86	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	1822	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	2245775	2246116	2245876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	75030	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,HES5,FAM213B	NA	NA	NA	NA	HES5	17731	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr1	3229711	3230157	3229865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	138833	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	3817648	3818071	3817969	Y	LRRC47	CEP104,DFFB,C1orf174	NA	NA	NA	NA	C1orf174	2791	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	6360191	6360625	6360507	Y	PLEKHG5,PLEKHG5,HES2	GPR153	NA	NA	NA	NA	GPR153	41156	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	6894689	6894717	6894703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	51305	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr1	6943772	6944262	6943813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	100388	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	7538871	7539273	7539100	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	290056	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	7609389	7609632	7609504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	219697	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	7764543	7764931	7764717	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	64398	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	8076289	8076986	8076888	Y	NA	ERRFI1,RP11-431K24.1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	7382	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	8198088	8198334	8198235	Y	NA	NA	ERRFI1,SLC45A1,RERE,PARK7	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-431K24.1	113290	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	8254637	8254907	8254798	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,RERE,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC45A1	120979	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	8262223	8262541	8262360	Y	ERRFI1	NA	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC45A1	113345	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	8450820	8451072	8450834	Y	RERE,RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	74934	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	8810273	8810466	8810370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	65236	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	9179840	9180024	9179949	Y	NA	GPR157	NA	NA	NA	NA	GPR157	7205	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	9224991	9225286	9225137	Y	NA	GPR157,RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A	IMR90	Hi-C	24141950	RP3-510D11.2	14977	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	10269964	10270260	10269995	Y	RBP7,PGD,KIF1B	KIF1B	NA	NA	NA	NA	KIF1B	1101	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	10447707	10448369	10448247	Y	NA	PGD,APITD1,APITD1-CORT	NA	NA	NA	NA	PGD	8280	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	10556105	10556527	10556365	Y	NA	PEX14,DFFA	CASZ1	IMR90	Hi-C	24141950	DFFA	25522	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	10804844	10805001	10804872	Y	NA	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	49706	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	11410602	11410834	11410718	Y	NA	NA	FBXO2,FBXO44,UBIAD1	IMR90	Hi-C	24141950	UBIAD1	79339	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	11968510	11969143	11969021	Y	MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP	KIAA2013,PLOD1	NA	NA	NA	NA	KIAA2013	15342	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	12193120	12193399	12193251	Y	AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF8,TNFRSF1B	TNFRSF1B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1B	31661	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	12599928	12600179	12600028	Y	DHRS3	NA	DHRS3,VPS13D	K562	ChIA-PET	22265404	DHRS3	75558	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	12674513	12674729	12674684	Y	NA	DHRS3	NA	NA	NA	NA	DHRS3	1008	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	15519488	15519688	15519655	Y	NA	TMEM51	NA	NA	NA	NA	TMEM51	42460	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	15616896	15617243	15617144	Y	PLEKHM2,EFHD2,CASP9,TMEM51,TMEM51	FHAD1	NA	NA	NA	NA	FHAD1	45128	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	15649550	15649749	15649647	Y	PLEKHM2,EFHD2,CASP9	NA	EFHD2	IMR90	Hi-C	24141950	FHAD1	77782	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	15664307	15664455	15664338	Y	NA	NA	EFHD2,CTRC,CELA2A,CELA2B	IMR90	Hi-C	24141950	RP3-467K16.4	69474	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	15664580	15664866	15664723	Y	FBLIM1	NA	EFHD2,CTRC,CELA2A,CELA2B	IMR90	Hi-C	24141950	RP3-467K16.4	69063	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	15673118	15673422	15673270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-467K16.4	60507	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	15742467	15743324	15742634	Y	TMEM51,TMEM51,SPEN,PLEKHM2,EFHD2,CASP9	RP3-467K16.4,EFHD2	NA	NA	NA	NA	EFHD2	8076	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	15743639	15744318	15744205	Y	NA	RP3-467K16.4,EFHD2	NA	NA	NA	NA	EFHD2	9248	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3049	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr1	16212759	16213091	16212941	Y	EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	40117	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	16508402	16508642	16508565	Y	FBLIM1	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	EPHA2	27820	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	16669074	16669169	16669123	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	7780	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	16696032	16696399	16696223	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	19083	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	RNU1-1	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-1	12489	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.88438442310341
chr1	17020007	17020088	17020064	Y	NA	EIF1AXP1	NA	NA	NA	NA	EIF1AXP1	9457	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	NA	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP13A2	104719	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	NA	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	ATP13A2	95640	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr1	17767804	17768710	17768126	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	3584	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr1	19703880	19704261	19704067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLC2	67060	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	19803336	19803680	19803404	Y	TMCO4,UBR4	CAPZB	NA	NA	NA	NA	CAPZB	6386	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	21194399	21194490	21194445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	82583	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	21475659	21476054	21476002	Y	EIF4G3,EIF4G3	EIF4G3	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	25323	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	21588176	21588724	21588522	Y	ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	81273	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	21660622	21661187	21660789	Y	EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	8810	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	23123668	23124069	23123697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHB2	88336	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	23357547	23357765	23357628	Y	NA	KDM1A	LUZP1	IMR90	Hi-C	24141950	KDM1A	13606	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	23387479	23387794	23387637	Y	ZNF436	KDM1A	LUZP1	IMR90	Hi-C	24141950	KDM1A	43538	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	23669506	23669991	23669712	Y	NA	HNRNPR,C1orf213,ZNF436	NA	NA	NA	NA	HNRNPR	677	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	24229023	24229388	24229190	Y	NA	FUCA1,RP11-4M23.4	NA	NA	NA	NA	FUCA1	36239	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	24395125	24395214	24395170	Y	MYOM3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-4M23.7	62116	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	24518503	24518681	24518625	Y	PNRC2,GRHL3	NA	MYOM3,IL22RA1,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS,C1orf130	IMR90	Hi-C	24141950	IL22RA1	50892	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	24519628	24519970	24519647	Y	GRHL3	NA	MYOM3,IL22RA1,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS,C1orf130	IMR90	Hi-C	24141950	IL22RA1	52017	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	24691833	24692082	24691893	Y	PNRC2,GRHL3	GRHL3,NIPAL3	NA	NA	NA	NA	GRHL3	48021	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	24833128	24833464	24833216	Y	RUNX3,NIPAL3,SRRM1,RCAN3	RCAN3	NA	NA	NA	NA	RCAN3	5741	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	25344029	25344296	25344110	Y	RUNX3,SYF2,C1orf63	NA	RUNX3	IMR90	Hi-C	24141950	SYF2	212697	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr1	25347909	25348138	25347985	Y	RUNX3,SYF2,C1orf63	NA	RUNX3,CLIC4	IMR90	Hi-C	24141950	SYF2	208855	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	25348659	25349200	25348944	Y	SRRM1,RUNX3,SYF2,C1orf63	NA	RUNX3,CLIC4	IMR90	Hi-C	24141950	SYF2	207793	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	25566195	25566411	25566257	Y	TMEM57	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9202	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	26452850	26453250	26452988	Y	FAM54B,RPS6KA1,HMGN2,CEP85,CD52,PDIK1L	PDIK1L,ZNF593	NA	NA	NA	NA	PDIK1L	17186	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HMGN2	30291	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	26946837	26947249	26947076	Y	CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	73275	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr1	27160002	27160387	27160288	Y	WDTC1,SLC9A1,RPS6KA1,ARID1A,PIGV,ZDHHC18	PIGV,ZDHHC18,SFN	NA	NA	NA	NA	ZDHHC18	8801	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	27175784	27176273	27175984	Y	C1orf172,AIM1L,ZNF683,RPS6KA1,SFN	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	11360	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.54176907344824
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	27625914	27626081	27626007	Y	TRNP1,MAP3K6,TMEM222	TMEM222,RP11-4K3__A.5	NA	NA	NA	NA	TMEM222	20570	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	27626897	27627231	27626926	Y	NA	TMEM222,RP11-4K3__A.5	NA	NA	NA	NA	TMEM222	19420	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr1	29104880	29105053	29104930	Y	NA	YTHDF2	NA	NA	NA	NA	YTHDF2	43747	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	29451057	29451462	29451431	Y	TMEM200B,TMEM200B	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF4	55037	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	29503706	29504118	29503928	Y	NA	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2381	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	29504261	29504387	29504317	Y	YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2112	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	30582865	30583057	30583002	Y	NA	NA	PTPRU,MECR	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-65J11.1	712018	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	31625313	31625543	31625426	Y	NA	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	88475	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	90728	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	91382	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	32420307	32420572	32420414	Y	TMEM234,PEF1,PTP4A2,PTP4A2	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	11850	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr1	32421622	32422096	32421696	Y	MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	13165	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr1	33428474	33429020	33428770	Y	NA	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	188	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	33515825	33516245	33515960	Y	RNF19B	AK2,ADC	AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AK2	28352	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	34628613	34629024	34628705	Y	NA	CSMD2	NA	NA	NA	NA	CSMD2	419	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	36103028	36103196	36103152	Y	NA	PSMB2	TFAP2E	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB2	2249	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	36183411	36183689	36183588	Y	C1orf216	C1orf216,CLSPN	NA	NA	NA	NA	C1orf216	338	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	36555347	36555633	36555606	Y	STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2	ADPRHL2	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	2871	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	36839449	36839891	36839558	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	9606	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	36840093	36840535	36840445	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	8962	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr1	37942874	37943354	37943027	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	4721	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	37944084	37944971	37944382	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	5931	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	38317043	38317898	38317556	Y	ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	5394	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	38922036	38922121	38922079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-334L9.1	250482	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	39509536	39509726	39509631	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	19546	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	40264988	40265120	40265045	Y	NA	BMP8B	HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BMP8B	12455	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	43400932	43401203	43401085	Y	ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	21327	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	43402214	43402581	43402425	Y	ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	19949	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	43406108	43407009	43406836	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	15521	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	43427522	43427762	43427666	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	4802	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	43428386	43429108	43428580	Y	CLDN19,CCDC23,ERMAP,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	5666	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	43901568	43901739	43901659	Y	NA	MED8,SZT2,HYI	NA	NA	NA	NA	HYI	15921	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	44452990	44453115	44453039	Y	NA	RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9	NA	NA	NA	NA	CCDC24	1916	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr1	44495684	44496307	44495779	Y	NA	CCDC24,SLC6A9	B4GALT2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A9	545	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	44689979	44690114	44690071	Y	NA	DMAP1	NA	NA	NA	NA	DMAP1	12852	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	44951424	44951733	44951502	Y	TCTEX1D4,PLK3,BTBD19,SLC6A9,RNF220	NA	NA	NA	NA	NA	RNF220	82558	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	44962677	44962982	44962698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF220	93811	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	45376274	45376331	45376304	Y	NA	CCNB1IP1P1	NA	NA	NA	NA	CCNB1IP1P1	45898	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	45990749	45991039	45990946	Y	NA	TESK2,MMACHC,CCDC163P,PRDX1,AKR1A1	NA	NA	NA	NA	PRDX1	4030	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	46111666	46112048	46111975	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	3450	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr1	47102400	47102701	47102616	Y	NA	MKNK1,ATPAF1	NA	NA	NA	NA	MKNK1	21885	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	50799292	50799453	50799422	Y	NA	NA	AGBL4	IMR90	Hi-C	24141950	DMRTA2	87719	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	51703075	51703494	51703244	Y	OSBPL9	RNF11	NA	NA	NA	NA	RNF11	3132	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	52173889	52173954	52173921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	133038	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	52390204	52390438	52390419	Y	NA	NRD1	NA	NA	NA	NA	NRD1	47727	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	52628189	52628583	52628480	Y	NA	ZFYVE9,RP4-800M22.2	NA	NA	NA	NA	RP4-800M22.2	1491	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	53385696	53386052	53386029	Y	NA	ECHDC2,SCP2	NA	NA	NA	NA	ECHDC2	4832	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	53403571	53403705	53403636	Y	NA	ECHDC2,SCP2	NA	NA	NA	NA	SCP2	12670	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	54441729	54442008	54441915	Y	NA	HSPB11,LRRC42	NA	NA	NA	NA	LRRC42	31979	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	54965893	54966212	54966053	Y	NA	NA	TCEANC2,SSBP3,MRPL37,CYB5RL,CDCP2,YIPF1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4,ACOT11,FAM151A	IMR90	Hi-C	24141950	SSBP3	88741	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	55753963	55754247	55754107	Y	USP24	NA	PPAP2B,USP24	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	75177	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	59085972	59086240	59086165	Y	NA	NA	TACSTD2,OMA1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	OMA1	75498	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	59280773	59281281	59281052	Y	FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	32988	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	59281873	59282217	59282125	Y	MYSM1,FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	34088	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr1	60144543	60144796	60144669	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	384233	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	61784447	61784809	61784578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TM2D1	404286	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	61918819	61919182	61919004	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	TM2D1	269913	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	62119868	62120084	62119981	Y	NA	NA	TM2D1,INADL	IMR90	Hi-C	24141950	TM2D1	69011	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	64254998	64255371	64255034	Y	ROR1	ROR1	NA	NA	NA	NA	ROR1	17305	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	65387772	65388547	65388120	Y	JAK1	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	41640	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	65731337	65731853	65731407	Y	DNAJC6	DNAJC6	NA	NA	NA	NA	DNAJC6	19435	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	65891768	65892129	65891951	Y	NA	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	7498	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	66603112	66603115	66603114	Y	PDE4B	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4B	346915	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	66724177	66724356	66724261	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGIP1	272710	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	66800202	66800555	66800228	Y	PDE4B	NA	NA	NA	NA	NA	SGIP1	196511	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	66819100	66819322	66819204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGIP1	177744	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	66822714	66822988	66822804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGIP1	174078	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	67029939	67030347	67030122	Y	PDE4B	SGIP1	NA	NA	NA	NA	SGIP1	32873	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr1	67198280	67198800	67198648	Y	PDE4B,MIER1	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	189770	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	68077196	68077460	68077328	Y	NA	NA	GADD45A,GNG12	IMR90	Hi-C	24141950	GADD45A	71284	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	68257383	68257657	68257565	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	39493	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	6.16707629379297
chr1	68285768	68286070	68285946	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	11080	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	70745994	70746088	70746040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	61288	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	75798807	75799079	75799068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC44A5	275722	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	76645391	76645540	76645467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC3	106987	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	114487	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	102291	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr1	83506477	83506486	83506482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	818220	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	168293	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr1	84719698	84719921	84719811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	177953	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	84757421	84757614	84757534	Y	DNASE2B,DNASE2B,SAMD13,SAMD13	NA	UOX,DNASE2B	IMR90	Hi-C	24141950	RPF1	185328	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	84971050	84971209	84971115	Y	MCOLN2,GNG5	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	802	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr1	85046655	85046705	85046680	Y	NA	CTBS	CTBS	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CTBS	8492	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	85049005	85049203	85049109	Y	NA	CTBS	RPF1,GNG5	IMR90	Hi-C	24141950	CTBS	10842	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	85241214	85241288	85241250	Y	SAMD13,DNASE2B,DNASE2B,SSX2IP,SSX2IP,LPAR3	NA	SSX2IP,GNG5,TTLL7,UOX,MCOLN2,C1orf180,PRKACB,LPAR3,MCOLN3	IMR90	Hi-C	24141950	SSX2IP	86728	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr1	89358212	89358439	89358316	Y	PKN2,CCBL2	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	2585	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	90319744	90319959	90319950	Y	NA	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	35171	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	90774930	90775313	90775122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF326	316259	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	92270160	92270686	92270504	Y	RPAP2,GLMN	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	99206	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	93694062	93694249	93694102	Y	MTF2,CCDC18	TMED5	NA	NA	NA	NA	TMED5	49777	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	93773027	93773315	93773230	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	DR1	36130	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	94021310	94021626	94021469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	109622	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	94127789	94128026	94127840	Y	GCLM,TMED5,DNTTIP2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	110974	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	94145547	94146118	94145739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-488P3.1	92882	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	94169341	94169462	94169391	Y	GCLM,DNTTIP2	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	69538	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	94244939	94245309	94245199	Y	ARHGAP29,FNBP1L,BCAR3	RP11-488P3.1	BCAR3,MIR760,FNBP1L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488P3.1	5939	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	94712395	94712617	94712502	Y	ARHGAP29	ARHGAP29	ABCA4,ARHGAP29,ABCD3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP29	26007	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	94891778	94892070	94891849	Y	NA	ABCD3	NA	NA	NA	NA	ABCD3	9845	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	95107584	95108052	95107918	Y	F3,SLC44A3,SLC44A3	NA	F3,ABCD3,SLC44A3	IMR90	Hi-C	24141950	F3	102228	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	96541224	96541649	96541417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P11	368837	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	101392986	101393260	101393033	Y	S1PR1,SLC30A7,SLC30A7	EXTL2,SLC30A7	NA	NA	NA	NA	SLC30A7	33354	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	106338303	106338531	106338417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT6	1258736	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	109079557	109079899	109079743	Y	NA	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	20812	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	109133637	109134097	109133761	Y	TMEM167B,STXBP3,PRPF38B,FAM102B	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	32926	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	109262615	109262764	109262672	Y	NA	PRPF38B,STXBP3	NA	NA	NA	NA	STXBP3	24532	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr1	109784080	109784425	109784202	Y	NA	SARS,CELSR2,PSRC1	CELSR2	IMR90	Hi-C	24141950	CELSR2	6216	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	111489179	111489247	111489213	Y	NA	LRIF1	NA	NA	NA	NA	LRIF1	15454	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	112438367	112438956	112438733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM212B	141921	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	113574968	113575168	113575068	Y	NA	LRIG2	CTTNBP2NL,PPM1J,MOV10,RHOC,SLC16A1	IMR90	Hi-C	24141950	LRIG2	38663	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	114950620	114950667	114950644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM33	101114	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	116192575	116192950	116192828	Y	NA	VANGL1	NA	NA	NA	NA	VANGL1	10001	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	116520279	116520650	116520380	Y	ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,SLC22A15	NA	NA	NA	NA	NA	VANGL1	337705	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	116918925	116919548	116919274	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	5635	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	120180868	120181132	120181082	Y	NBPF7,ZNF697	GAPDHP33,ZNF697,PHGDH	NA	NA	NA	NA	ZNF697	7264	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMBP1	225939	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr1	144533627	144534178	144533764	Y	PDE4DIP	RNU1-59P	PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNU1-59P	1589	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	145455122	145455741	145455465	Y	PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP	TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L,RBM8A	NA	NA	NA	NA	POLR3GL	12647	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	146753566	146753835	146753733	Y	NA	CHD1L	NA	NA	NA	NA	CHD1L	41275	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.39830744758616
chr1	147825273	147825748	147825617	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	20387	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	149215297	149215704	149215586	Y	NA	RNVU1-17,RNU1-92P,RP11-403I13.5	NA	NA	NA	NA	RNU1-92P	1997	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	149816287	149817606	149817166	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2BC,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2BC	2733	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr1	149910900	149911536	149911461	Y	NA	SV2A,SF3B4,MTMR11	NA	NA	NA	NA	MTMR11	4109	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	150185878	150186128	150186012	Y	HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E	ANP32E,RNU2-17P	NA	NA	NA	NA	ANP32E	20376	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	150294873	150295138	150294978	Y	PLEKHO1,MCL1,CTSS,PRPF3	C1orf51,MRPS21,PRPF3,RPRD2	NA	NA	NA	NA	PRPF3	2948	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	150539630	150541082	150540777	Y	NA	ADAMTSL4,MCL1	NA	NA	NA	NA	MCL1	8984	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	150585815	150586394	150586132	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,FAM63A,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	13694	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr1	150949569	150950014	150949933	Y	ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A	CERS2,ANXA9,FAM63A,PRUNE	NA	NA	NA	NA	ANXA9	2479	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr1	151172142	151172526	151172243	Y	FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	3717	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	151255796	151256115	151256047	Y	NA	PSMD4,ZNF687,PI4KB	NA	NA	NA	NA	ZNF687	3702	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	151386066	151386146	151386106	Y	NA	SELENBP1,PSMB4,POGZ	NA	NA	NA	NA	PSMB4	16056	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	151445792	151446161	151446000	Y	C1orf56,RIIAD1,OAZ3	POGZ	RIIAD1,LOC100132111,TUFT1,CGN,SNX27,POGZ,PI4KB,PSMB4,CELF3,OAZ3,TDRKH,MRPL9,RORC,C2CD4D	IMR90,MCF7,HELA,H1ESC,K562	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	POGZ	15851	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	151580936	151581099	151580976	Y	NA	SNX27,RP11-404E16.1	RIIAD1,CELF3	IMR90	Hi-C	24141950	SNX27	1442	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	151877533	151877895	151877666	Y	THEM4	THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	2389	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr1	151913815	151914271	151914054	Y	S100A10	THEM4	S100A10,CELF3,THEM4,RORC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	33531	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr1	151918166	151918684	151918434	Y	NA	THEM4,S100A10	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	37882	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr1	151918898	151919222	151919024	Y	S100A10	THEM4,S100A10	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	38614	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	152022022	152022514	152022379	Y	SNX27,S100A10,S100A11	S100A11	THEM4	MCF7	ChIA-PET	22265404	S100A11	3639	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	152116191	152116374	152116281	Y	LCE3A	FLG-AS1	NA	NA	NA	NA	FLG-AS1	22227	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	152140379	152140745	152140485	Y	NA	FLG-AS1	NA	NA	NA	NA	FLG-AS1	1778	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr1	153510895	153511054	153510975	Y	NA	S100A6,S100A4,S100A2	NA	NA	NA	NA	S100A6	4175	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	153541018	153541368	153541269	Y	PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13	S100A6,S100A4,S100A2,S100A16	NA	NA	NA	NA	S100A2	2652	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	153929776	153930098	153929954	Y	NA	GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CRTC2	675	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	154151566	154151965	154151766	Y	NA	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	13159	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	154699087	154699216	154699140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAR	100612	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	56.5315326931022
chr1	154820307	154820671	154820489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMVK	86796	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	154910155	154910399	154910216	Y	ADAR,PBXIP1,MTX1	PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1	NA	NA	NA	NA	PMVK	2688	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	154957258	154957622	154957425	Y	NA	PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B	NA	NA	NA	NA	FLAD1	3444	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	154972628	154972915	154972668	Y	CLK2,DPM3,DPM3,PYGO2,FLAD1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	212	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	154973036	154973200	154973120	Y	CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	154973335	154973935	154973656	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	208	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	154977099	154977253	154977190	Y	ADAR,ADAR,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	3972	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	155064132	155064186	155064153	Y	NA	ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3	NA	NA	NA	NA	EFNA3	29908	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	KRTCAP2,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr1	155443130	155443303	155443253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASH1L-AS1	86518	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	155535083	155535193	155535176	Y	HCN3	ASH1L-AS1,ASH1L	NA	NA	NA	NA	ASH1L	4485	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr1	155620238	155620623	155620432	Y	NA	DAP3,YY1AP1	NA	NA	NA	NA	DAP3	35128	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.71307674827583
chr1	155951073	155951535	155951364	Y	NA	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	23326	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	156073854	156074351	156074085	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	23490	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	156095033	156095181	156095051	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA	MEX3A,LMNA	NA	NA	NA	NA	LMNA	44669	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr1	156103413	156103690	156103594	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,LMNA	NA	NA	NA	NA	NA	LMNA	53049	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	41117	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	156462474	156462813	156462575	Y	NA	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	5807	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	156468556	156468776	156468632	Y	MEF2D	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2D	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	156472693	156472952	156472780	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4073	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	156473111	156473378	156473326	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4491	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	156474686	156475018	156474923	Y	SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6066	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	156718467	156719136	156718868	Y	C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	65	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr1	156774360	156774606	156774510	Y	C1orf61	HDGF,NTRK1,SH2D2A	NA	NA	NA	NA	NTRK1	8826	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	156781780	156782101	156782026	Y	MEF2D,ETV3L,SH2D2A,SH2D2A,NTRK1	HDGF,NTRK1,SH2D2A,INSRR	NA	NA	NA	NA	NTRK1	1331	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	157076072	157076782	157076408	Y	RRNAD1,ETV3,ETV3	ETV3	NA	NA	NA	NA	ETV3	29484	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	158146699	158147069	158146946	Y	NA	ELL2P1	NA	NA	NA	NA	ELL2P1	1154	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	159515755	159515769	159515762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-419N10.5	211191	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	159859603	159860031	159859945	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	C1orf204,CCDC19,TAGLN2	C1orf204,SLAMF8	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC19	7922	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	160203977	160204039	160204035	Y	NA	PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8	NA	NA	NA	NA	RP11-574F21.2	25495	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	160546217	160546501	160546436	Y	ATP1A4,SLAMF7,CD48,CD244,CD84	NA	NA	NA	NA	NA	VANGL2	177841	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	160696081	160696317	160696161	Y	CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-312J18.5	166453	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	160701970	160702334	160702067	Y	CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-312J18.5	160436	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	160982920	160983992	160983766	Y	CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	5146	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	NA	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	77619	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr1	161360317	161360802	161360606	Y	NA	NA	NR1I3,APOA2,TOMM40L,NDUFS2,ADAMTS4,SDHC,UFC1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	78270	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	NA	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	87026	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.74092279724132
chr1	161847357	161847565	161847361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF6	113273	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	164681412	164681799	164681686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	158591	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	165204752	165205122	165204813	Y	RXRG	NA	NA	NA	NA	NA	MGST3	392976	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	165797615	165798367	165798308	Y	UCK2	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	2623	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr1	166828089	166828463	166828188	Y	POU2F1,POGK	POGK,TADA1	NA	NA	NA	NA	TADA1	15101	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	167772811	167773182	167772825	Y	CREG1	RP1-313L4.4	NA	NA	NA	NA	RP1-313L4.4	14304	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	168149052	168149361	168149233	Y	NA	GPR161,TIPRL,SFT2D2	NA	NA	NA	NA	TIPRL	2881	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	168961520	168961569	168961544	Y	NA	NA	ATP1B1	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP1B1	111366	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	170637621	170637732	170637679	Y	PRRX1	NA	NA	NA	NA	NA	GORAB	138351	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	171473011	171473311	171473138	Y	NA	PRRC2C	NA	NA	NA	NA	PRRC2C	20360	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	171652961	171653360	171653094	Y	NA	PFN1P1	NA	NA	NA	NA	PFN1P1	14882	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	172291507	172291926	172291559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	119304	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	172327070	172327187	172327139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	84043	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	172327558	172328156	172327708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	83074	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	172369341	172369683	172369640	Y	NA	PIGC	NA	NA	NA	NA	PIGC	41547	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	172804293	172804464	172804387	Y	NA	NA	CENPL,DARS2,TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	213639	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	172814602	172814764	172814686	Y	TNFSF4	NA	CENPL,DARS2,TNFSF4,LOC100506023	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	203339	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	172820425	172820587	172820541	Y	NA	NA	TNFSF4	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	197516	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	172870197	172870622	172870564	Y	NA	NA	TNFSF4,LOC100506023	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	147481	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	172878579	172879356	172878831	Y	TNFSF18	NA	TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,SNORD81,GAS5,SNORD75,SNORD47,SNORD79,LOC100506046,SNORD77,DARS2,SNORD78,SNORD80,ZBTB37,SNORD44,SNORD76	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	138747	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	172900674	172900969	172900756	Y	TNFSF18	NA	TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,DARS2,CENPL,ZBTB37,GAS5	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	117134	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	173091914	173092434	173092232	Y	NA	NA	TNFSF4,LOC100506023	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	73811	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	173328578	173328674	173328661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	115731	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr1	173447359	173447668	173447399	Y	PRDX6	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	2954	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	176079011	176079503	176079162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFWD2	95126	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	176244494	176244887	176244692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-195C7.1	69710	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	176599377	176599591	176599401	Y	PAPPA2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-195C7.1	424593	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	178378072	178378430	178378251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALGPS2	313870	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	178995927	178996290	178996175	Y	AXDND1,RALGPS2,TOR3A	FAM20B	NA	NA	NA	NA	FAM20B	2988	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	179290775	179290979	179290800	Y	NA	SOAT1	NA	NA	NA	NA	SOAT1	29850	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr1	180100723	180101052	180100780	Y	NA	QSOX1	NA	NA	NA	NA	QSOX1	20917	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	180200315	180200683	180200497	Y	LHX4	LHX4	NA	NA	NA	NA	LHX4	2894	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	180389473	180389640	180389557	Y	NA	NA	LHX4,LOC100527964	IMR90	Hi-C	24141950	ACBD6	80449	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	180921044	180921090	180921069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX6	68957	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	181074349	181074924	181074645	Y	XPR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	18711	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	181459512	181459699	181459606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IER5	403874	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	182250775	182250951	182250892	Y	GLUL,GLUL	NA	GLUL	K562	ChIA-PET	22265404	GLUL	108390	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	183239968	183240242	183240112	Y	LAMC1	NA	LAMC2	IMR90	Hi-C	24141950	SMG7	199109	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr1	183241451	183241867	183241650	Y	LAMC1	NA	LAMC2	IMR90	Hi-C	24141950	SMG7	197484	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	183248987	183249454	183249212	Y	NCF2,NCF2,ARPC5,LAMC1	NA	NA	NA	NA	NA	SMG7	189897	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr1	183594812	183595033	183594923	Y	NA	ARPC5	NA	NA	NA	NA	ARPC5	7859	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	183836661	183836955	183836765	Y	RGL1,GLT25D2	NA	NA	NA	NA	NA	TSEN15	181856	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	184033703	184034036	184033838	Y	NA	TSEN15	NA	NA	NA	NA	TSEN15	14892	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	184357629	184357933	184357738	Y	EDEM3	C1orf21	NA	NA	NA	NA	C1orf21	3437	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	184810330	184810429	184810414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	88283	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	184922808	184923031	184922923	Y	EDEM3,SWT1,SWT1,RNF2,IVNS1ABP,FAM129A	FAM129A	NA	NA	NA	NA	FAM129A	18651	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	185298342	185298619	185298496	Y	FAM129A,RNF2,TRMT1L,SWT1,TRMT1L,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	IVNS1ABP	MCF7	ChIA-PET	22265404	IVNS1ABP	13881	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	186935248	186935528	186935344	Y	PTGS2,PLA2G4A	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	139163	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	186943840	186944382	186944105	Y	PTGS2,PLA2G4A	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	147755	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	187647524	187647721	187647623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	851439	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	187996792	187997117	187996893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-316I3.2	857448	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr1	192216449	192216576	192216513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4426	466737	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	192691567	192691932	192691775	Y	NA	MIR4426	RGS13	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4426	8254	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	192873637	192874003	192873741	Y	TROVE2,CDC73,RGS1,RGS2	RN7SKP126	RGS2	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP126	30522	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	192914637	192914772	192914747	Y	TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS1,RGS2	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP126	71522	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	192915458	192915787	192915575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP126	72343	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	192924608	192924823	192924716	Y	NA	NA	RGS2	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP126	81493	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	193180704	193180924	193180776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC73	91557	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	196687240	196687293	196687267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFH	68232	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	197482296	197482309	197482303	Y	F13B,ZBTB41	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P32	173581	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	198128112	198128944	198128293	Y	PTPRC,DENND1B	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	4019	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	198893258	198893473	198893399	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-104D3.2	460796	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	198894891	198894966	198894922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-104D3.2	459303	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	198903935	198904934	198904858	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-104D3.2	449335	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	199038181	199038389	199038246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-104D3.2	315880	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	201139670	201140154	201139905	Y	NA	TMEM9,IGFN1	KIF21B,IGFN1,LAD1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM9	968	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	201295169	201295564	201295367	Y	PKP1	NA	NA	NA	NA	NA	IGFN1	137216	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	201463619	201463933	201463776	Y	LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	RP11-134G8.7	10436	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	201472589	201472996	201472808	Y	LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	RP11-134G8.7	1373	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	201494461	201494578	201494476	Y	NA	RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	CSRP1	17877	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	202003884	202004146	202004054	Y	NA	ELF3	NA	NA	NA	NA	ELF3	28811	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	202016172	202016526	202016316	Y	PPP1R12B,ELF3,LGR6	ELF3	ELF3,NAV1	MCF7	ChIA-PET	22265404	ELF3	41099	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	202872285	202872308	202872297	Y	NA	RP11-480I12.5,RABIF,HNRNPA1P59,KLHL12	RABIF	MCF7	ChIA-PET	22265404	HNRNPA1P59	6632	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	203259429	203259985	203259729	Y	RABIF,KLHL12,ADIPOR1,ADIPOR1,BTG2	BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	12634	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	111155	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	203619380	203619832	203619595	Y	BTG2,LAX1	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	25691	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	203789427	203789442	203789436	Y	NA	ZC3H11A,SNRPE	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	26645	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	204363456	204363666	204363499	Y	NA	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	15253	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	204386444	204387188	204386898	Y	PPP1R15B	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	7525	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr1	205090261	205090406	205090392	Y	NA	RBBP5	CNTN2	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP5	1118	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	205144631	205144860	205144785	Y	NA	DSTYK	NA	NA	NA	NA	DSTYK	33867	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	205253892	205254222	205253971	Y	NUAK2	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	34661	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	206763465	206763687	206763565	Y	MAPKAPK2,RASSF5	EIF2D,DYRK3	NA	NA	NA	NA	EIF2D	20217	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	206918122	206918360	206918230	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,DYRK3,IL19,MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	61833	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	207064076	207064429	207064213	Y	NA	RP11-564A8.4	NA	NA	NA	NA	RP11-564A8.4	14535	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	207997315	207997832	207997786	Y	CR1,CD46	C1orf132	NA	NA	NA	NA	C1orf132	42663	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	208021631	208021781	208021738	Y	CR1,CD46,PLXNA2,CD34	C1orf132	CD34	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf132	18714	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr1	208349565	208349646	208349606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	66019	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	208388887	208389573	208389450	Y	NA	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	26092	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	209930913	209931012	209930979	Y	G0S2,TRAF3IP3	C1orf74	NA	NA	NA	NA	C1orf74	24892	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	210812063	210812447	210812256	Y	HHAT,HHAT,KCNH1	NA	NA	NA	NA	NA	RNU5A-8P	266452	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	211035320	211035533	211035504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-543B16.1	309286	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr1	211786767	211786829	211786805	Y	NA	SLC30A1	SLC30A1,NEK2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SLC30A1	36683	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	211912030	211912428	211912229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEK2	65070	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	211976591	211977124	211977068	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	24990	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	212113260	212113497	212113379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTS7	93387	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	212182782	212182853	212182818	Y	NA	INTS7,DTL,RPL21P28	NA	NA	NA	NA	INTS7	24031	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	212458080	212458253	212458113	Y	INTS7,PPP2R5A,PPP2R5A	PPP2R5A,RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	PPP2R5A	1201	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	212659054	212659720	212659497	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	54825	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	212854473	212854873	212854553	Y	RPS6KC1,ATF3,ATF3	BATF3	NA	NA	NA	NA	BATF3	16454	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr1	214512112	214512120	214512117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD2	59667	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	214601098	214601566	214601506	Y	PTPN14	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	122226	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr1	214612784	214613126	214613017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	110666	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	215691115	215691317	215691220	Y	NA	KCTD3	KCNK2,CENPF,SMYD2,PTPN14	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD3	47418	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	216774004	216774285	216774188	Y	ESRRG,ESRRG	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	1028139	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	218523725	218524123	218523798	Y	NA	RP11-224O19.2,TGFB2	NA	NA	NA	NA	TGFB2	6148	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	218546684	218546887	218546789	Y	NA	RP11-224O19.2,TGFB2	NA	NA	NA	NA	TGFB2	29107	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	218642170	218642366	218642271	Y	NA	NA	TGFB2,LOC728463	IMR90	Hi-C	24141950	TGFB2	124593	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	218671989	218672275	218672071	Y	NA	NA	TGFB2,LOC643723,LOC728463	IMR90	Hi-C	24141950	TGFB2	154412	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	219224399	219224689	219224618	Y	NA	NA	TGFB2,LOC728463	IMR90	Hi-C	24141950	LYPLAL1	120497	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	219240049	219240272	219240170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPLAL1	104914	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	221048646	221048850	221048821	Y	NA	HLX	NA	NA	NA	NA	HLX	849	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	221612801	221613016	221612980	Y	DUSP10,DUSP10	NA	C1orf140,HLX,MIA3	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	300502	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	222638782	222639204	222638963	Y	NA	NA	DUSP10,MIA3,AIDA,BROX	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HHIPL2	80241	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	222830626	222830783	222830705	Y	TAF1A,MIA3	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	41198	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	223204032	223204174	223204104	Y	NA	NA	FAM177B	IMR90	Hi-C	24141950	DISP1	217626	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	223901276	223901546	223901311	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	13981	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	223914239	223914747	223914523	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	26944	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	223964690	223965055	223964731	Y	TP53BP2,FBXO28	NA	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	66619	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	4.45399954551715
chr1	224458940	224459060	224459002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVL	57029	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	225881856	225882162	225882024	Y	ACBD3	ENAH	ENAH,EPHX1,C1orf55,SRP9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ENAH	43012	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	226005413	226005573	226005512	Y	NA	SRP9,EPHX1	NA	NA	NA	NA	EPHX1	9619	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	226852222	226852636	226852379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPKB	72388	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	226875915	226876346	226876127	Y	ITPKB	ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB	48678	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	226890865	226891416	226891300	Y	ITPKB	ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB	33608	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr1	227405146	227405174	227405158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42BPA	99001	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	228274281	228274680	228274319	Y	NA	ARF1,C1orf35,MRPL55	NA	NA	NA	NA	ARF1	5920	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	228678228	228678435	228678266	Y	NA	HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	5466	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	228686214	228686407	228686300	Y	NA	HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	13452	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84925	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	3.08353814689649
chr1	229206013	229206222	229206093	Y	RHOU	NA	RHOU	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	198553	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	229388898	229389111	229388968	Y	URB2,TAF5L,NUP133,RAB4A,C1orf96	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,NUP133,ABCB10	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	15664	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	229690998	229691240	229691190	Y	ABCB10	NUP133,RP4-613A2.1,ABCB10	NUP133	K562	ChIA-PET	22265404	ABCB10	1202	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	230248068	230248475	230248108	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	56532	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	230258907	230259286	230258969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	67371	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	231347338	231347496	231347363	Y	C1orf124	C1orf131,GNPAT	NA	NA	NA	NA	C1orf131	27437	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	231531776	231531955	231531804	Y	NA	EGLN1	NA	NA	NA	NA	EGLN1	26835	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	232073278	232073500	232073389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DISC1	312717	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.88438442310341
chr1	234151091	234151471	234151117	Y	SLC35F3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35F3	112412	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	234163168	234163347	234163228	Y	SLC35F3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35F3	124489	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	234275805	234276023	234275906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.2	214729	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.37046139862066
chr1	234372658	234373012	234372835	Y	TARBP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.2	117740	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	234559176	234559516	234559346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.4	51837	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	234728712	234729023	234728867	Y	NA	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	14248	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr1	234757412	234757805	234757606	Y	NA	IRF2BP2	LOC100506810	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	IRF2BP2	14141	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	234792654	234793437	234793098	Y	NA	IRF2BP2	IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRF2BP2	49383	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	235122652	235122939	235122843	Y	NA	RP11-443B7.3	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	8101	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	235186710	235186949	235186846	Y	ARID4B	NA	LOC100506795,LOC100506810,LINC00184,IRF2BP2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-443B7.3	72159	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	236431064	236431243	236431072	Y	LGALS8,ERO1LB	ERO1LB	NA	NA	NA	NA	ERO1LB	12076	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	236856658	236857048	236856853	Y	ACTN2	NA	NA	NA	NA	NA	HEATR1	90854	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	237634251	237634535	237634324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYR2	430746	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	3.9400765210344
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	241775803	241776227	241776010	Y	KMO	CHML	NA	NA	NA	NA	CHML	21005	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	241781298	241781471	241781421	Y	NA	CHML	NA	NA	NA	NA	CHML	15761	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr1	242108255	242108348	242108324	Y	NA	NA	EXO1	IMR90	Hi-C	24141950	EXO1	98986	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	243923195	243923609	243923504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	88772	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	244210956	244211944	244211575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	198575	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	244212276	244213430	244213047	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	199895	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr1	244439620	244440012	244439977	Y	NA	NA	AKT3,SDCCAG8,LOC339529,ZNF238,ADSS,C1orf100	IMR90	Hi-C	24141950	ADSS	173424	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	244763140	244763529	244763408	Y	ADSS,EFCAB2	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf101	147461	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	245939665	245940062	245939864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	728552	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	245971113	245971386	245971357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	697228	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	246061196	246061440	246061372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	607174	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	246387027	246387389	246387208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	281225	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	246469940	246470214	246470139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	198400	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr1	246862505	246862699	246862612	Y	SCCPDH	SCCPDH	NA	NA	NA	NA	SCCPDH	22650	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	246948292	246948613	246948340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCCPDH	62943	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr1	247035132	247035504	247035470	Y	CNST,ZNF669,AHCTF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	57776	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr1	249157308	249157673	249157562	Y	OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692	SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2	NA	NA	NA	NA	ZNF692	5965	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	975785	976368	976035	Y	NA	LARP4B	DIP2C,LARP4B,GTPBP4,IDI1,IDI2-AS1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LARP4B	221	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	1100843	1101035	1100898	Y	NA	IDI1,WDR37	NA	NA	NA	NA	WDR37	7365	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	1390281	1390451	1390366	Y	ADARB2	NA	NA	NA	NA	NA	WDR37	296803	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	1541138	1541906	1541672	Y	WDR37,ADARB2	NA	NA	NA	NA	NA	WDR37	447660	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	2473129	2473236	2473183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFKP	633289	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	3137708	3138098	3138049	Y	NA	PFKP	NA	NA	NA	NA	PFKP	31183	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	3509617	3509911	3509759	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	296614	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	3928866	3929216	3928980	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	103393	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	4386754	4387085	4386858	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00704	331261	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	4983862	4984222	4983900	Y	NA	NA	tAKR,AKR1C2,AKR1C3,UCN3,NET1,TUBAL3	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1C1	51066	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	5314439	5314551	5314462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBAL3	130242	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	5333644	5334212	5333929	Y	NA	NA	AKR1E2,tAKR	IMR90	Hi-C	24141950	TUBAL3	110581	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.39830744758616
chr10	5587810	5588190	5587923	Y	NA	RP13-463N16.6	NA	NA	NA	NA	RP13-463N16.6	47891	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	6099241	6099508	6099389	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3,RBM17,RBM17	RBM17	NA	NA	NA	NA	RBM17	29442	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	6339022	6339139	6339081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	154141	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	6443408	6443712	6443449	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFKFB3	258527	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	7265730	7265927	7265829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-554I8.2	488386	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	14624029	14624329	14624184	Y	DCLRE1C	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	121888	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	15158719	15159034	15158939	Y	NA	ACBD7,RPP38,C10orf111,NMT2	NA	NA	NA	NA	C10orf111	21401	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	15278281	15278573	15278465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMT2	69589	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	17067559	17067950	17067759	Y	VIM	NA	NA	NA	NA	NA	CUBN	101880	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	17215777	17215793	17215785	Y	NA	CUBN,TRDMT1	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	26260	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	17553346	17553542	17553509	Y	NA	NA	ST8SIA6,CUBN,PTPLA	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ST8SIA6	59017	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	18576978	18577349	18577005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNB2	149372	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	21318909	21319293	21319209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-275N1.1	340586	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	21386477	21386751	21386615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-275N1.1	273128	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	21581688	21582509	21582285	Y	NA	NA	C10orf114,C10orf140,MLLT10,PIP4K2A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-275N1.1	77370	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	21816029	21816444	21816223	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	4650	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	22026318	22026683	22026671	Y	EBLN1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	193389	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	22535612	22535856	22535691	Y	NA	NA	ARMC3,LOC100130992	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COMMD3	67047	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	22725331	22726270	22725901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	117191	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr10	24925603	24925785	24925693	Y	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	84812	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	25211297	25211494	25211421	Y	NA	PRTFDC1	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	28039	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	25240272	25240935	25240716	Y	ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1	PRTFDC1	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	739	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	27032794	27033066	27033024	Y	NA	PDSS1	NA	NA	NA	NA	PDSS1	48206	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	27531769	27532240	27532024	Y	ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5	ACBD5	NA	NA	NA	NA	ACBD5	2710	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr10	27814920	27815352	27814981	Y	MASTL,ACBD5,RAB18	RAB18	NA	NA	NA	NA	RAB18	23723	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr10	28622853	28623578	28623396	Y	NA	MPP7	MPP7	IMR90	Hi-C	24141950	MPP7	1438	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	29755539	29755855	29755808	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	59208	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	30073207	30073608	30073571	Y	SVIL	NA	SVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA1462	328815	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr10	30346409	30346565	30346487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1462	55858	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	30347334	30347749	30347345	Y	KIAA1462	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1462	54674	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	31036627	31036865	31036760	Y	MAP3K8,ZNF438,ZNF438	NA	ZEB1,ARHGAP12,ZEB1-AS1,KIF5B,ZNF438	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	282001	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	31986198	31986456	31986355	Y	NA	NA	ARHGAP12,ZEB1,ZNF438	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP12	229286	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	31986692	31987073	31986913	Y	NA	NA	ARHGAP12,ZEB1,ZNF438	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP12	228669	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr10	32034546	32034864	32034695	Y	NA	NA	ZNF438,ARHGAP12	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP12	180878	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	32047879	32048374	32048138	Y	ZEB1	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	167368	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.37046139862066
chr10	32621222	32621521	32621374	Y	ARHGAP12,CCDC7,C10orf68,EPC1	EPC1	NA	NA	NA	NA	EPC1	44205	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	32735821	32736068	32735865	Y	NA	CCDC7	C10orf68	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCDC7	2753	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr10	33269452	33269916	33269602	Y	C10orf68	RP11-462L8.1,ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	22804	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	33272272	33272613	33272373	Y	ITGB1,ITGB1,ITGB1	RP11-462L8.1,ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	20107	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	33493386	33493597	33493492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	129593	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	33562254	33562552	33562425	Y	ITGB1,ITGB1,NRP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	60638	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	35102675	35103059	35102787	Y	NA	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	422	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	35589038	35589427	35589190	Y	CREM,CREM,CREM,CREM,CCNY	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	55085	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	35640077	35640405	35640144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	106124	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	35932153	35932694	35932189	Y	FZD8	MIR4683,FZD8	NA	NA	NA	NA	FZD8	3791	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	36783467	36783622	36783545	Y	NA	NAMPTL	FZD8	IMR90	Hi-C	24141950	NAMPTL	27540	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	36823544	36823839	36823735	Y	NA	NAMPTL	NA	NA	NA	NA	NAMPTL	12382	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	37778060	37778402	37778231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-162G10.5	366266	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	38264185	38264489	38264470	Y	ZNF37A,ZNF248,ZNF25	ZNF25,ZNF33A	NA	NA	NA	NA	ZNF25	624	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	43600895	43601120	43601049	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	30814	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr10	43905259	43905708	43905446	Y	HNRNPF,HNRNPF,HNRNPF	FXYD4,HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	HNRNPF	2645	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	43950893	43951349	43951098	Y	NA	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-517P14.2	36707	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	44046358	44046416	44046387	Y	NA	ZNF239	NA	NA	NA	NA	ZNF239	21650	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	45470476	45470795	45470517	Y	NA	RASSF4,C10orf10,ZNF22	NA	NA	NA	NA	C10orf10	1463	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	45868742	45869084	45868822	Y	ANUBL1,OR13A1,ALOX5	NA	NA	NA	NA	NA	MARCH8	219270	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	52083052	52083210	52083101	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	60314	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	52385542	52385659	52385602	Y	NA	SGMS1	NA	NA	NA	NA	SGMS1	2619	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	56854357	56854710	56854534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L5	502040	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	61645173	61645419	61645305	Y	NA	CCDC6	NA	NA	NA	NA	CCDC6	18995	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	62174641	62174784	62174750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK1	361305	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	63591158	63591311	63591235	Y	TMEM26,ARID5B	NA	RHOBTB1	IMR90	Hi-C	24141950	ARID5B	67748	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	64146249	64146339	64146308	Y	ARID5B,EGR2	ZNF365	NA	NA	NA	NA	ZNF365	14298	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	64982889	64983009	64982950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRBF2	91839	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	65078433	65078736	65078637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	106321	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	65460115	65460254	65460185	Y	NA	NA	JMJD1C	IMR90	Hi-C	24141950	REEP3	180992	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	65930110	65930546	65930307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-170M17.2	269105	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	67154801	67155033	67154934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA2P3	571472	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	68010262	68010544	68010403	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA2P3	1426933	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	69578155	69578433	69578238	Y	NA	DNAJC12	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	17491	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	69579652	69579872	69579788	Y	DNAJC12	DNAJC12	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	16052	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC12	13236	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	69913307	69913725	69913572	Y	SIRT1,PBLD,HNRNPH3	NA	NA	NA	NA	NA	HERC4	80202	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	70088080	70088572	70088236	Y	SIRT1,PBLD,HNRNPH3	HNRNPH3,PBLD	NA	NA	NA	NA	HNRNPH3	359	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	70846057	70846170	70846083	Y	NA	SRGN,VPS26A	NA	NA	NA	NA	SRGN	195	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	70849672	70851282	70850023	Y	DDX21,SUPV3L1,SRGN,VPS26A	SRGN,VPS26A	NA	NA	NA	NA	SRGN	3810	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr10	71928097	71928630	71928606	Y	NA	AIFM2,TYSND1,CALM2P2	TYSND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAR1A	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	71984000	71984297	71984282	Y	NA	PPA1	NA	NA	NA	NA	PPA1	7370	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	72363256	72363608	72363363	Y	PRF1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-399N22.3	188671	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	73026177	73026397	73026262	Y	UNC5B	NA	NA	NA	NA	NA	UNC5B-AS1	50192	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	73526437	73526878	73526654	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	4377	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	73986513	73986881	73986533	Y	C10orf105,C10orf54,CDH23,CDH23	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	NA	NA	NA	NA	ASCC1	11621	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	74014911	74015029	74015003	Y	NA	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	16649	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	74020239	74021717	74020385	Y	C10orf54,PSAP,DNAJB12,DDIT4	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	DNAJB12	K562	ChIA-PET	22265404	DDIT4	9961	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	74032298	74032943	74032475	Y	NA	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	620	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr10	74056833	74058104	74057179	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	25155	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.56961512241374
chr10	74078612	74078870	74078849	Y	PSAP,DDIT4,CBARA1,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	34118	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	74079380	74080359	74079580	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	32629	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	74080430	74080993	74080646	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	31995	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	74081865	74082262	74082021	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	30726	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	74091661	74092150	74091920	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	20838	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	75665411	75665653	75665517	Y	ANXA7,NDST2	CAMK2G,PLAU	NA	NA	NA	NA	PLAU	1282	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	76985148	76985510	76985329	Y	NA	VDAC2,COMTD1,HMGA1P5	NA	NA	NA	NA	COMTD1	8278	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	77164585	77164731	77164659	Y	ZNF503	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	4921	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	79596032	79596523	79596221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	87855	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr10	79636555	79636603	79636579	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	47775	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	80626499	80626705	80626607	Y	NA	NA	LOC283050,ZMIZ1,RPS24,LOC100132987,POLR3A	IMR90	Hi-C	24141950	ZMIZ1	200087	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	92669	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	80830818	80831199	80831077	Y	ZMIZ1	ZMIZ1	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	4026	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	80908110	80909032	80908408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	81318	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	80943996	80944377	80944135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	117204	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	80997251	80997825	80997438	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	107400	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	81071549	81071690	81071644	Y	ZMIZ1,ZCCHC24,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	33535	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr10	81080868	81081434	81081104	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	23791	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	81091409	81091966	81091732	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	13259	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	82237584	82237869	82237663	Y	TSPAN14	TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	25662	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	82258642	82258780	82258737	Y	TSPAN14	TSPAN14,RP11-137H2.4	NA	NA	NA	NA	RP11-137H2.4	34918	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	83813687	83814033	83813708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-137H2.4	1519989	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	89602886	89603081	89603056	Y	NA	CFL1P1,ATAD1,PTEN	NA	NA	NA	NA	ATAD1	3786	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr10	90527399	90527667	90527447	Y	ANKRD22,LIPN	NA	NA	NA	NA	NA	STAMBPL1	109824	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	90753757	90754132	90754032	Y	NA	FAS	NA	NA	NA	NA	FAS	5343	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	92921990	92922253	92922075	Y	HECTD2	NA	ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PCGF5	55655	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	93300438	93300742	93300617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	90069	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	94516374	94516585	94516493	Y	MARCH5,HHEX,EXOC6	NA	EXOC6,KIF11,HHEX	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HHEX	70429	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	94516915	94517155	94517045	Y	HHEX,EXOC6	NA	EXOC6,KIF11,HHEX	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HHEX	70970	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	94520397	94520594	94520523	Y	NA	NA	EXOC6,HHEX	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EXOC6	68341	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	94608884	94609046	94608952	Y	NA	EXOC6	NA	NA	NA	NA	EXOC6	19949	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	95136235	95136595	95136450	Y	MYOF	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-624L12.1	93920	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	95196959	95197603	95197264	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42471	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	95205346	95205630	95205524	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	34444	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	95224149	95224369	95224367	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	15705	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	95224699	95224811	95224754	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	15263	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	95225325	95225770	95225711	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	14304	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr10	96943397	96943661	96943560	Y	SORBS1,SORBS1	NA	C10orf129,SORBS1	IMR90	Hi-C	24141950	PDLIM1	105120	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	97020432	97020603	97020519	Y	NA	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	28178	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	97166659	97166942	97166773	Y	SORBS1,SORBS1	NA	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	117878	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	99449337	99449738	99449607	Y	C10orf28,RRP12,PI4K2A	AVPI1,MARVELD1,ZFYVE27	NA	NA	NA	NA	AVPI1	4257	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	100076500	100076699	100076593	Y	C10orf28,HPS1	NA	LOXL4,C10orf28,PYROXD2,HPS1,HPSE2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PYROXD2	96242	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	100120877	100121283	100120897	Y	PYROXD2,LOXL4	NA	PYROXD2,C10orf28,LOXL4,HPS1	IMR90	Hi-C	24141950	PYROXD2	51658	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	101475394	101475766	101475528	Y	NA	CUTC,COX15	NA	NA	NA	NA	COX15	14091	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	101537826	101537964	101537919	Y	ABCC2	COX15,ABCC2	NA	NA	NA	NA	ABCC2	2525	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	101543856	101543953	101543936	Y	COX15,ABCC2	ABCC2	NA	NA	NA	NA	ABCC2	3367	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	101736797	101737134	101736959	Y	BLOC1S2,BLOC1S2,DNMBP	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	30542	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	101765990	101766360	101766233	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	1316	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	101767938	101768201	101768028	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	262	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	101780024	101780319	101780173	Y	CUTC,WNT8B	DNMBP	DNMBP	MCF7	ChIA-PET	22265404	DNMBP	12348	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	102501164	102501306	102501235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM178A	169020	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	103124623	103124787	103124739	Y	FBXW4	BTRC	DPCD,POLL	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	12803	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	103699141	103699397	103699242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf76	114553	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.88438442310341
chr10	104838794	104839158	104838851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT5C2	111898	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	105001224	105001453	105001331	Y	C10orf32,NT5C2	NA	INA,PCGF6,NT5C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NT5C2	50168	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr10	105456300	105456542	105456434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	156759	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	105650011	105650288	105650237	Y	GSTO2,GSTO1,MEIR5,MEIR5,COL17A1,SLK	SH3PXD2A,OBFC1	SH3PXD2A	IMR90	Hi-C	24141950	OBFC1	25675	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	105667994	105668449	105668210	Y	GSTO1,GSTO1,SLK	OBFC1	NA	NA	NA	NA	OBFC1	7514	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	105725440	105725838	105725745	Y	NA	OBFC1,SLK	NA	NA	NA	NA	SLK	481	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	105805832	105806162	105806026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFR1	73654	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	106052804	106053054	106052846	Y	MEIR5,MEIR5,GSTO1	MIR4482-1,GSTO2,ITPRIP	NA	NA	NA	NA	GSTO2	26173	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr10	106065321	106065564	106065443	Y	NA	MIR4482-1,GSTO2,ITPRIP,CCDC147-AS1	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	30598	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	106065731	106065880	106065781	Y	NA	MIR4482-1,GSTO2,ITPRIP,CCDC147-AS1	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	30282	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	106094943	106095283	106095247	Y	NA	ITPRIP,CCDC147-AS1	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	879	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	108702155	108702347	108702207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SORCS1	219945	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	112123790	112124003	112123953	Y	MXI1	NA	SMC3,DUSP5,RBM20	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	61081	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	112155518	112156031	112155808	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	92809	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	112158460	112158738	112158533	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	95751	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	112168008	112168205	112168118	Y	DUSP5	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	87391	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	112170161	112170538	112170357	Y	DUSP5	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	85058	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	112207134	112207519	112207380	Y	NA	DUSP5	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	48077	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	112220227	112220521	112220467	Y	SMC3,DUSP5	DUSP5	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	35075	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	112272592	112272848	112272747	Y	SHOC2,BBIP1,BBIP1,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	16996	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	112432258	112432673	112432308	Y	PDCD4	RBM20	PDCD4,LOC282997	IMR90	Hi-C	24141950	RBM20	30103	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	112668159	112668425	112668161	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	8607	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	113855611	113855893	113855723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAM	117242	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	114531236	114531374	114531260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	176635	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	115440649	115440877	115440799	Y	CASP7	CASP7	NA	NA	NA	NA	CASP7	3707	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr10	115441699	115442134	115441810	Y	CASP7	CASP7	NA	NA	NA	NA	CASP7	4757	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	115719262	115719399	115719345	Y	NA	NA	ADRB1,NHLRC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NHLRC2	106842	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	116255200	116255589	116255576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABLIM1	187173	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	116300910	116301495	116301299	Y	FAM160B1,C10orf118,ABLIM1	NA	NA	NA	NA	NA	ABLIM1	141267	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	116392908	116393338	116393223	Y	ABLIM1	ABLIM1	NA	NA	NA	NA	ABLIM1	49424	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	121829686	121829950	121829715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACAP2	74465	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	123873239	123873409	123873290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	126550	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr10	123914164	123914234	123914222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	167475	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	124227704	124228047	124227968	Y	NA	HTRA1	NA	NA	NA	NA	HTRA1	8663	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	124524018	124524025	124524022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM24B	113132	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	125847012	125847291	125847256	Y	NA	CHST15	NA	NA	NA	NA	CHST15	3915	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	126029584	126030073	126029818	Y	CHST15	NA	HMX3	IMR90	Hi-C	24141950	OAT	75472	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr10	126339460	126339914	126339618	Y	ZRANB1,FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	90924	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	126346022	126346943	126346570	Y	FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	83895	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	126410085	126410502	126410408	Y	FAM53B	FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	20336	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	126421726	126422139	126421939	Y	FAM53B	FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	8699	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	126429723	126430192	126430042	Y	FAM53B	FAM53B,METTL10	NA	NA	NA	NA	FAM53B	646	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	126749212	126749581	126749525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP2	98158	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	126773443	126773862	126773517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP2	73877	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	126811654	126811843	126811733	Y	NA	CTBP2,MRPS21P6	ZRANB1	IMR90	Hi-C	24141950	CTBP2	35896	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	127574091	127574564	127574346	Y	NA	DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	DHX32	8441	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	127576052	127576450	127576389	Y	NA	DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	DHX32	6555	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	128995351	128995518	128995467	Y	NA	FAM196A	NA	NA	NA	NA	FAM196A	2929	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	133763722	133764008	133763747	Y	NA	BNIP3	NA	NA	NA	NA	BNIP3	29427	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	133879247	133879524	133879406	Y	NA	NA	BNIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BNIP3	85812	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	4.62530722034473
chr10	134122010	134122092	134122081	Y	NA	STK32C,LRRC27	DPYSL4	IMR90	Hi-C	24141950	STK32C	21259	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	134260341	134260546	134260485	Y	C10orf91	RP11-432J24.2,C10orf91	NA	NA	NA	NA	C10orf91	4510	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr10	134401859	134402261	134402219	Y	PWWP2B,INPP5A	NA	NA	NA	NA	NA	INPP5A	52535	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	135074691	135075148	135074934	Y	TUBGCP2,ADAM8	ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ZNF511	44831	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr10	135092436	135092746	135092593	Y	ADAM8,TUBGCP2	ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ZNF511	27233	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr10	135191872	135192182	135191943	Y	NA	CALY,ECHS1,PAOX,MTG1	NA	NA	NA	NA	PAOX	1177	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	269337	269903	269511	Y	TMEM80,TALDO1,SIGIRR,DEAF1,IFITM2,IFITM1,ATHL1	PSMD13,SIRT3,ATHL1,IFITM2,IFITM1	NA	NA	NA	NA	ATHL1	17232	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	11072	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr11	368352	368730	368427	Y	NA	IFITM3,B4GALNT4,PKP3,SIGIRR	NA	NA	NA	NA	B4GALNT4	556	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr11	840856	841090	840896	Y	NA	SLC25A22,RPLP2,PIDD,PNPLA2,CD151,AP006621.8,POLR2L,TSPAN4	NA	NA	NA	NA	TSPAN4	48	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	944711	944765	944751	Y	NA	CHID1,AP2A2	NA	NA	NA	NA	AP2A2	21817	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	1053255	1053594	1053287	Y	NA	NA	MUC5B,MOB2,AP2A2	IMR90	Hi-C	24141950	MUC5AC	95986	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	1285805	1285940	1285877	Y	TOLLIP	TOLLIP	NA	NA	NA	NA	TOLLIP	42944	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	1357863	1358286	1357997	Y	TOLLIP,BRSK2	TOLLIP	TOLLIP,LOC255512	K562	ChIA-PET	22265404	TOLLIP	28979	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr11	1404403	1404794	1404637	Y	DUSP8,BRSK2	BRSK2	TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BRSK2	4335	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr11	1794819	1794975	1794880	Y	NA	RP11-295K3.1,CTSD,RPL36AP39	MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2-AS1,INS-IGF2,IGF2,KRTAP5-5,KRTAP5-6,FAM99B	IMR90,MCF7,K562,H1ESC	Hi-C,3C,ChIA-PET,5C	24141950,19890323,22265404,22955621	CTSD	11597	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr11	2465201	2465287	2465244	Y	INS	TSSC4	NA	NA	NA	NA	TSSC4	45483	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	2988914	2989223	2989024	Y	MRGPRG,SLC22A18	PHLDA2,NAP1L4	NA	NA	NA	NA	NAP1L4	22384	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	3443739	3443990	3443855	Y	NA	ZNF195	NA	NA	NA	NA	ZNF195	45291	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	4232015	4232345	4232181	Y	OR52M1,OR52K2,OR52K1,OR51D1,C11orf40,OR52I1	NA	OR52M1,TRIM68,OR52I1	IMR90	Hi-C	24141950	RRM1	118078	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	5504793	5505065	5505006	Y	NA	HBE1	NA	NA	NA	NA	HBE1	19782	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	6564206	6564247	6564227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRP8	58603	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	8166799	8166849	8166831	Y	NA	RIC3	NA	NA	NA	NA	RIC3	21753	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	9587499	9588027	9587720	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1	ZNF143,LOC644656	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	WEE1	5201	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr11	10003812	10004242	10004040	Y	ADM	NA	NA	NA	NA	NA	SBF2	309512	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	11864878	11865300	11864975	Y	NA	USP47	NA	NA	NA	NA	USP47	3908	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	11899555	11899888	11899585	Y	NA	USP47	NA	NA	NA	NA	USP47	38585	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	12697923	12698543	12698251	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	3954	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr11	12701917	12702070	12702017	Y	TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	7948	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr11	12772830	12773175	12773002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	78861	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	13986123	13986466	13986328	Y	SPON1	NA	NA	NA	NA	NA	FAR1	297906	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	14635727	14635946	14635944	Y	NA	PDE3B	NA	NA	NA	NA	PDE3B	27323	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	14874249	14874576	14874405	Y	CYP2R1	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	37222	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr11	14910529	14910668	14910599	Y	NA	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	1130	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	16073747	16074032	16073896	Y	SOX6,SOX6	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	558647	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	16625688	16626709	16626131	Y	SOX6,SOX6	C11orf58	SOX6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C11orf58	5970	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr11	18426412	18426598	18426470	Y	NA	LDHA,AC084117.3,LDHC	NA	NA	NA	NA	AC084117.3	1256	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	18546072	18546398	18546234	Y	SPTY2D1,TSG101	RP11-613F22.5,TSG101	NA	NA	NA	NA	TSG101	381	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	19440729	19441084	19440796	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC13	304083	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr11	20016658	20016921	20016770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	366310	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	20046945	20047208	20047086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	336023	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	20072115	20072502	20072253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	310729	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	27350498	27350718	27350608	Y	BDNF	CCDC34	NA	NA	NA	NA	CCDC34	32697	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	27682701	27682852	27682777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BDNF	58753	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	27683148	27683223	27683174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BDNF	58382	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	27693843	27694020	27693988	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	47585	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	27715832	27716154	27716086	Y	NA	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	25451	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	27739901	27740316	27740092	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	1289	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	28701449	28701661	28701530	Y	NA	RP11-115J23.1	BDNF,BDNF-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	20501	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.54176907344824
chr11	28776161	28776492	28776325	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF,KIF18A,METTL15	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	53999	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.22699977275857
chr11	28779294	28779601	28779473	Y	NA	NA	BDNF,BDNF-AS1,KIF18A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	57132	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	28792909	28793103	28792913	Y	NA	NA	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	70747	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr11	28795482	28795636	28795549	Y	NA	NA	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	73320	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	28831581	28831914	28831617	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	109419	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr11	28853592	28853798	28853653	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	131430	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.54176907344824
chr11	28855204	28855664	28855372	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	133042	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr11	28857853	28858464	28857991	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	135691	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr11	28864582	28864807	28864697	Y	NA	NA	BDNF,BDNF-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	142420	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr11	29141601	29141895	29141706	Y	NA	NA	BDNF,BDNF-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	419439	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	29302148	29302272	29302237	Y	NA	NA	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	579986	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	29323978	29324331	29324155	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	601816	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	29330322	29330692	29330507	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	608160	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr11	31317361	31317619	31317485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC24	71768	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	33723473	33723762	33723676	Y	NA	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	32229	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	33742880	33743486	33743237	Y	NA	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	12505	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	34931457	34931889	34931828	Y	NA	PDHX,APIP	NA	NA	NA	NA	PDHX	3487	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	35029453	35029465	35029458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APIP	93407	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	35052236	35052689	35052493	Y	CD44	NA	SLC1A2,CD44,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	105728	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr11	35571458	35571651	35571555	Y	PAMR1	NA	PAMR1,PRR5L,SLC1A2,FJX1,TRIM44,LDLRAD3,COMMD9	IMR90	Hi-C	24141950	FJX1	66084	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	45864713	45865116	45864826	Y	NA	SLC35C1,CRY2,MAPK8IP1	NA	NA	NA	NA	CRY2	1553	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	46258702	46259233	46258865	Y	DGKZ	CREB3L1	PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	37979	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	47789923	47790126	47789984	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	2928	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	47844695	47845036	47844861	Y	NA	NUP160	NA	NA	NA	NA	NUP160	23071	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	58340867	58341571	58341167	Y	OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN	ZFP91,ZFP91-CNTF,CNTF	NA	NA	NA	NA	ZFP91	3013	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	60929738	60929978	60929839	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	2649	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	61074897	61075402	61075197	Y	CD6	DAK,DDB1	NA	NA	NA	NA	DAK	23280	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	61319246	61319400	61319342	Y	NA	SYT7	NA	NA	NA	NA	SYT7	27220	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	61738760	61739751	61739487	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	5628	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	61739990	61740514	61740301	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	6858	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr11	61792928	61793609	61793204	Y	DAGLA,FTH1	NA	FADS3,FADS2,FTH1,BEST1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	59796	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	62211244	62211404	62211317	Y	FTH1,WDR74,STX5,SLC3A2,NXF1,AHNAK	NA	NA	NA	NA	NA	RCC2P6	74626	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	63334518	63335083	63334716	Y	RARRES3,OTUB1	PLA2G16	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	47272	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	63744435	63744483	63744459	Y	KCNK4	NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	AP000721.4	4343	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	63858567	63858836	63858756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACROD1	72742	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr11	63954598	63954956	63954814	Y	FERMT3,CCDC88B,OTUB1	MACROD1,STIP1,FERMT3,NUDT22,TRPT1,DNAJC4,RP11-783K16.14,VEGFB	NA	NA	NA	NA	STIP1	3854	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	65058176	65058598	65058417	Y	EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	21691	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	65059737	65059988	65059827	Y	EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	20301	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr11	65083603	65083722	65083697	Y	NA	CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	3314	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	65151984	65152145	65152131	Y	NA	SLC25A45,NEAT1	NA	NA	NA	NA	FRMD8	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.22699977275857
chr11	65239550	65239870	65239751	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1	TIGD3,SCYL1	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18822	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr11	65246279	65246484	65246387	Y	SCYL1,LTBP3,EFEMP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	16749	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr11	65248969	65249218	65249208	Y	SNX32	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	FRMD8,SLC25A45,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	14015	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	65254949	65255610	65255242	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	7623	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr11	65259217	65259522	65259389	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3711	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	3.9400765210344
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.71307674827583
chr11	65852297	65852657	65852298	Y	TMEM151A,CNIH2	SF3B2,PACS1	NA	NA	NA	NA	PACS1	16463	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	66659730	66659912	66659812	Y	CLCF1,RBM4	LRFN4	NA	NA	NA	NA	LRFN4	37612	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	67037275	67037527	67037373	Y	TBC1D10C,RAD9A,PITPNM1,KDM2A,ADRBK1,ANKRD13D	ADRBK1,ANKRD13D,SSH3	NA	NA	NA	NA	ADRBK1	5394	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	67121988	67122388	67122127	Y	POLD4,CLCF1	POLD4,AP003419.11,RAD9A	NA	NA	NA	NA	POLD4	55	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	67139742	67140272	67140082	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	687	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr11	67144956	67145205	67145097	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA,RPS6KB2	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	5901	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	67146992	67147327	67147282	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA,RPS6KB2	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	7937	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	68238826	68238975	68238901	Y	TCIRG1,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,IGHMBP2,PPP6R3	PPP6R3	NA	NA	NA	NA	PPP6R3	12640	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	68608164	68608616	68608368	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1262	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	68778534	68778789	68778694	Y	MRGPRF	TPCN2	NA	NA	NA	NA	TPCN2	35576	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	69258094	69258432	69258217	Y	CCND1	NA	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFITM9P	188820	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr11	69453520	69454472	69453912	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr11	70470330	70470512	70470409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	227736	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	72343411	72343720	72343689	Y	PDE2A	PDE2A	NA	NA	NA	NA	PDE2A	39915	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	72429149	72429366	72429274	Y	ATG16L2,ARAP1,ARAP1	PDE2A	NA	NA	NA	NA	PDE2A	45514	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	72662392	72662530	72662447	Y	ARAP1,ARAP1,ATG16L2,RELT,RELT	NA	ATG16L2	IMR90	Hi-C	24141950	ATG16L2	139039	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	73088357	73088912	73088439	Y	NA	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	3048	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	73221521	73221768	73221630	Y	PLEKHB1,PLEKHB1,FAM168A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM168A	85466	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	73490470	73490918	73490608	Y	UCP2	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	5443	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	74465903	74466299	74466070	Y	POLD3,RNF169	RP11-864N7.2,RNF169	XRRA1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF169	7990	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.39830744758616
chr11	74609863	74609988	74609926	Y	NA	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	48257	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	75376291	75376573	75376366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERPINH1	105190	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	75385192	75385417	75385302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERPINH1	114091	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	75538796	75538953	75538875	Y	NA	UVRAG	NA	NA	NA	NA	UVRAG	14584	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	75755875	75756235	75755993	Y	UVRAG	NA	NA	NA	NA	NA	UVRAG	231663	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	76463883	76464042	76463970	Y	NA	RP11-21L23.4,TSKU,RP11-21L23.3	ACER3,TSKU,B3GNT6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-21L23.4	13225	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr11	76480789	76480971	76480905	Y	NA	RP11-21L23.4,TSKU,RP11-21L23.3	B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-21L23.4	3522	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.05569209793099
chr11	76534548	76534939	76534880	Y	GDPD4	TSKU,RP11-21L23.3,ACER3	ACER3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACER3	34972	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	76883031	76883248	76883107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPN5	107052	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	83203378	83203797	83203488	Y	DLG2	AP003026.1	NA	NA	NA	NA	AP003026.1	37122	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr11	83278002	83278167	83278160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP003026.1	111746	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	83350861	83351261	83351066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP003026.1	184605	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	83396793	83397083	83396942	Y	DLG2	NA	NA	NA	NA	NA	AP003026.1	230537	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr11	86452946	86453377	86453076	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	46724	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	86454484	86454767	86454607	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	45334	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	86627337	86627645	86627491	Y	FZD4	FZD4,RP11-736K20.6	ME3	IMR90	Hi-C	24141950	FZD4	36788	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	86631607	86631965	86631913	Y	ME3,ME3,ME3,TMEM135,FZD4	FZD4,RP11-736K20.6	ME3	IMR90	Hi-C	24141950	FZD4	32468	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	86664236	86664677	86664307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FZD4,RP11-736K20.6	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	88269213	88269357	88269284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTSC	200258	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	89937153	89937335	89937244	Y	NA	CHORDC1	NA	NA	NA	NA	CHORDC1	17197	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	91487188	91487461	91487243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A4	1441669	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	95098655	95098797	95098720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESN3	134950	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	95557234	95557451	95557366	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	35661	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	95778897	95779169	95779022	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR2	122418	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	95888064	95888524	95888506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	185820	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	95888692	95889856	95889448	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	184488	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	95990308	95990455	95990418	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	83889	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	96040167	96040456	96040282	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	33888	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr11	97836778	97837204	97837004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JRKL	1715625	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	102231981	102232209	102232014	Y	TMEM123,BIRC3,BIRC2	BIRC3,BIRC2	NA	NA	NA	NA	BIRC2	16039	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	102631066	102631384	102631342	Y	BIRC2	MMP10,MMP1	NA	NA	NA	NA	MMP10	17975	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	102956908	102957200	102957055	Y	NA	DCUN1D5,DYNC2H1	NA	NA	NA	NA	DCUN1D5	3744	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	107859673	107859731	107859704	Y	RAB39	CUL5	NA	NA	NA	NA	CUL5	17728	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	111664556	111665052	111664796	Y	SIK2,BCO2	PPP2R1B	NA	NA	NA	NA	PPP2R1B	29405	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	111692318	111692670	111692505	Y	NA	NA	PPP2R1B	IMR90	Hi-C	24141950	C11orf1	54989	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr11	111929773	111930099	111929899	Y	DIXDC1	DLAT,C11orf57,PIH1D2,TIMM8B,SDHD	NA	NA	NA	NA	C11orf57	12711	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	112833069	112833192	112833175	Y	NCAM1	NCAM1	NA	NA	NA	NA	NCAM1	3072	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr11	112842081	112842529	112842265	Y	NA	NCAM1	NA	NA	NA	NA	NCAM1	12084	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr11	113020811	113021147	113020979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-839D17.3	162012	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	113055291	113055738	113055452	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-839D17.3	127421	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	113059055	113059658	113059425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-839D17.3	123501	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	113945404	113945849	113945581	Y	ZBTB16,ZBTB16	NA	NA	NA	NA	NA	NNMT	180660	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr11	118788249	118788453	118788294	Y	MLL,PHLDB1,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5864	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	118790377	118790895	118790660	Y	NA	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	3422	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr11	118791529	118792348	118792152	Y	PHLDB1,BCL9L	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	1969	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr11	118793665	118793922	118793750	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	395	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr11	118806138	118806167	118806153	Y	NA	MIR4492,BCL9L	PHLDB1,TREH,DDX6,MIR4492,BCL9L,FOXR1,UPK2	IMR90	Hi-C	24141950	BCL9L	11821	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	121338733	121339149	121338843	Y	SORL1	SORL1	NA	NA	NA	NA	SORL1	17821	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	122586167	122586342	122586202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	61784	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr11	123077641	123077822	123077735	Y	NA	CLMP	CLMP	IMR90	Hi-C	24141950	CLMP	13652	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	123343327	123343490	123343416	Y	BSX	AP000783.1,LINC01059	HSPA8,CLMP,MIR4493	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01059	20221	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr11	123353850	123354009	123353930	Y	NA	LINC01059	CLMP	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01059	30744	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr11	123414630	123415056	123414666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01059	91524	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	123468998	123469339	123469251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF202	141044	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	123513712	123514126	123514044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF202	96257	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	123879192	123879570	123879381	Y	OR6X1,OR6M1,OR8D4,OR4D5,OR6T1,OR8D2,OR8B4,OR8G2,OR8D1,OR8B8,OR8G1,OR10G9,OR10G4,OR10G7	NA	NA	NA	NA	NA	VWA5A	104499	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	124552795	124553089	124552942	Y	OR8B4,C11orf61	SPA17,SIAE	NA	NA	NA	NA	SIAE	10514	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	124668888	124669222	124669022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRGN	61146	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	125937888	125938141	125938004	Y	NA	CDON	NA	NA	NA	NA	CDON	6658	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	125983623	125983738	125983673	Y	CDON	NA	HYLS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	52393	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	126290424	126290762	126290592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	66889	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	126337982	126338153	126338089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	114447	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	128376227	128376457	128376317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	78996	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	128927593	128927968	128927781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	472140	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	129250080	129250185	129250128	Y	BARX2	NA	NA	NA	NA	NA	NFRKB	513300	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	129993921	129994394	129994167	Y	PRDM10,APLP2	NA	NA	NA	NA	NA	APLP2	56189	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr11	131417840	131417998	131417919	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	NTM	179467	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr11	132502586	132503019	132502881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP004372.1	737584	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	398927	399098	399013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC77	97341	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	685193	685500	685436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-218M22.1	52557	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	726826	727017	726943	Y	CCDC77,KDM5A,WNK1	RP11-218M22.1	NA	NA	NA	NA	RP11-218M22.1	11040	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	1643252	1643620	1643470	Y	NA	WNT5B	ERC1,LOC100292680,FBXL14	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5B	6195	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	1698978	1699322	1699295	Y	NA	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	2009	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	1876861	1877254	1877034	Y	NA	RPS4XP14	NA	NA	NA	NA	RPS4XP14	11684	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	3948349	3948613	3948479	Y	NA	PARP11	NA	NA	NA	NA	PARP11	31995	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr12	4380607	4381576	4381205	Y	PARP11,CCND2	C12orf5	NA	NA	NA	NA	C12orf5	46795	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr12	5589537	5589706	5589616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	717175	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	6717352	6717716	6717682	Y	SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP	NOP2,CHD4,ACRBP	NA	NA	NA	NA	CHD4	2710	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	7000184	7000641	7000294	Y	PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6	CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57	NA	NA	NA	NA	SPSB2	3662	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	7100414	7100432	7100423	Y	NA	EMG1,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3	NA	NA	NA	NA	C1S	6063	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	7592182	7592797	7592685	Y	PEX5,NANOG	RP11-157G21.2,CD163L1	NA	NA	NA	NA	RP11-157G21.2	1596	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.22699977275857
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A3	36298	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	3.25484582172407
chr12	8123968	8124323	8124120	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A3	37097	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr12	9308932	9309318	9309073	Y	KLRB1,M6PR,KLRG1,PZP	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP4	81609	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	10833157	10833219	10833190	Y	NA	STYK1	NA	NA	NA	NA	STYK1	8240	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	10869298	10869573	10869459	Y	NA	STYK1	NA	NA	NA	NA	STYK1	44381	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr12	12646905	12646967	12646936	Y	LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B	NA	LOH12CR1	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP16	66350	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	12960939	12961466	12961074	Y	NA	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	2784	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	13025126	13025347	13025203	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	RPL13AP20	1086	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	7.36623001758605
chr12	13049170	13049423	13049295	Y	DUSP16	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	7454	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	13253893	13254547	13254171	Y	CDKN1B,EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	58675	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr12	13255105	13255488	13255167	Y	EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	59887	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	16553699	16554214	16553898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	55623	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr12	18511225	18511610	18511392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	769038	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	19048962	19049238	19049131	Y	NA	NA	PIK3C2G	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHA5	231410	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr12	19260911	19261231	19261176	Y	NA	PLEKHA5	PIK3C2G	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHA5	19417	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	19557871	19558201	19558036	Y	NA	AEBP2	AEBP2	IMR90	Hi-C	24141950	AEBP2	2892	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	19566135	19566181	19566158	Y	NA	AEBP2,EEF1A1P4	NA	NA	NA	NA	AEBP2	11156	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	20069508	20069793	20069676	Y	PDE3A	NA	LOC100506393,PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-146P	194139	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	3.59746117137923
chr12	20099675	20099840	20099742	Y	PDE3A	NA	LOC100506393,PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-146P	224306	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	5.48184559448264
chr12	20124309	20124606	20124452	Y	PDE3A	NA	PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-146P	248940	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr12	20365637	20365979	20365748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE3A	154200	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	20543386	20543422	20543406	Y	NA	PDE3A	NA	NA	NA	NA	PDE3A	23207	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr12	20732540	20732626	20732597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE3A	212361	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	25075175	25075409	25075293	Y	KRAS,BCAT1,BCAT1	BCAT1,RP11-662I13.1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	24984	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	25538390	25538869	25538521	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	16493	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	15955	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.56961512241374
chr12	26130090	26130317	26130202	Y	NA	RASSF8,RASSF8-AS1	NA	NA	NA	NA	RASSF8-AS1	19392	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	26512613	26512980	26512754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.3	235063	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	26921613	26921734	26921675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPR2	62397	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	27746027	27746077	27746069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	71663	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	28176067	28176342	28176190	Y	PTHLH,PTHLH	NA	PTHLH	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC91	107840	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	28501330	28501622	28501413	Y	NA	RNU4-54P	NA	NA	NA	NA	RNU4-54P	30934	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	29487594	29487680	29487637	Y	NA	ERGIC2	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	44442	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	30945631	30945953	30945771	Y	NA	CAPRIN2,LINC00941	NA	NA	NA	NA	LINC00941	24	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr12	30949517	30949896	30949519	Y	CAPRIN2	CAPRIN2,LINC00941	NA	NA	NA	NA	LINC00941	3540	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	31902136	31902566	31902240	Y	C12orf35,AMN1,H3F3C	AMN1,H3F3C	AMN1	K562	ChIA-PET	22265404	AMN1	22028	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr12	32380941	32381343	32381040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICD1	123172	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	34500403	34500725	34500579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-7D7.1	99987	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	38493611	38493806	38493706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALG10B	214574	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr12	39297687	39297825	39297799	Y	NA	CPNE8	NA	NA	NA	NA	CPNE8	1407	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	39539251	39539539	39539453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	240019	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	39808802	39808894	39808882	Y	NA	KIF21A	NA	NA	NA	NA	KIF21A	26298	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	39816699	39816988	39816844	Y	NA	KIF21A	NA	NA	NA	NA	KIF21A	18204	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	40250890	40251201	40251046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A13	246690	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	40467954	40468269	40468112	Y	NA	SLC2A13	NA	NA	NA	NA	SLC2A13	29622	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr12	40531165	40531312	40531256	Y	NA	SLC2A13	LRRK2	GM12878	5C	22955621	SLC2A13	33274	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	41137156	41137542	41137225	Y	CNTN1	NA	NA	NA	NA	NA	CNTN1	52912	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	42825856	42826146	42826103	Y	YAF2,YAF2,YAF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	107936	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr12	44522730	44522871	44522801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM117	294960	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	45627812	45628672	45628351	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	19988	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	45820263	45820702	45820515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	212439	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	46398489	46398694	46398592	Y	NA	SCAF11	SCAF11	MCF7	ChIA-PET	22265404	SCAF11	14586	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	46603605	46603977	46603918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	57823	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	46786554	46786766	46786571	Y	NA	SLC38A2,RP11-96H19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	11092	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	46824163	46824471	46824386	Y	NA	RP11-96H19.1	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	48701	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr12	46917975	46918280	46918143	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	142513	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr12	46956686	46956942	46956800	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	181224	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr12	47185736	47186095	47186020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	285639	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	47191369	47191677	47191464	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	280057	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	47474423	47475249	47474825	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	2689	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr12	47482441	47482676	47482559	Y	NA	AMIGO2	AMIGO2	K562	ChIA-PET	22265404	AMIGO2	10707	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	47583701	47583845	47583774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	111967	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	48395275	48395444	48395393	Y	COL2A1	TMEM106C,COL2A1	TMEM106C	MCF7	ChIA-PET	22265404	COL2A1	825	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr12	49452736	49452852	49452791	Y	NA	PRKAG1,LMBR1L	NA	NA	NA	NA	PRKAG1	41756	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	49594805	49595186	49594996	Y	NA	TUBA1C,TUBA1A	TUBA1A,TUBA1C,LMBR1L,DHH,TUBA1B	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TUBA1A	13698	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	49595765	49596022	49595888	Y	LMBR1L	TUBA1C,TUBA1A	TUBA1A,TUBA1B	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TUBA1A	14658	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.71307674827583
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	51536826	51537135	51537116	Y	CSRNP2	RP11-416A17.1,TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	27791	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr12	52426305	52426422	52426334	Y	NR4A1,GRASP,NR4A1	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11689	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	52426547	52427164	52426822	Y	NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11931	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	52457778	52458372	52458110	Y	NA	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	C12orf44	2658	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	42258	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr12	52545730	52546132	52545994	Y	KRT6A,C12orf44	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	37652	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	52557711	52558022	52557822	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	25762	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	52596776	52597514	52597151	Y	NR4A1	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	12992	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr12	52674043	52674518	52674247	Y	NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80	KRT7,KRT81	NA	NA	NA	NA	KRT81	8800	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr12	52973884	52973999	52973956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-416H24.4	201640	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	53265042	53265518	53265316	Y	PFDN5,KRT2	NA	KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85,KRT80,KRT18,KRT8,EIF4B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRT18	75137	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	53267781	53268340	53268093	Y	PFDN5	NA	KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT18	72315	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	53338460	53338676	53338568	Y	KRT18,KRT18	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	1979	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	53615195	53615822	53615501	Y	CSAD,SP1,PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	8942	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	53955466	53955638	53955506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF7	62561	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	53969356	53969561	53969448	Y	NA	ATF7	NA	NA	NA	NA	ATF7	48638	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	54052823	54053029	54052960	Y	NA	ATF7,ATP5G2	NA	NA	NA	NA	ATP5G2	16163	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	54752421	54752649	54752549	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA5	58595	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	54754477	54754933	54754658	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA5	56311	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	54999697	54999798	54999745	Y	NCKAP1L,PPP1R1A	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA5	188453	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	56294124	56294208	56294164	Y	NA	RNU1-69P,DGKA,WIBG	NA	NA	NA	NA	DGKA	24895	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.56961512241374
chr12	57635972	57636429	57636328	Y	SLC26A10,R3HDM2,DTX3,B4GALNT1,ARHGEF25,NDUFA4L2	NXPH4,SHMT2,NDUFA4L2	NA	NA	NA	NA	NDUFA4L2	3474	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	58903110	58903474	58903296	Y	NA	NA	LRIG3	IMR90	Hi-C	24141950	LRIG3	408829	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr12	59488814	59489192	59489003	Y	NA	NA	LRIG3	IMR90	Hi-C	24141950	LRIG3	176511	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	62983522	62983540	62983531	Y	NA	RP11-631N16.2,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	10992	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	62998747	62999127	62998791	Y	NA	RP11-631N16.2,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	3281	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr12	63051832	63051994	63051914	Y	MON2,PPM1H	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	56366	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr12	63096618	63097002	63096657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	101152	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	63097406	63097648	63097535	Y	USP15,C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	101940	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	63118880	63119001	63118911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	123414	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr12	63124974	63125146	63125033	Y	C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	129508	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr12	63179567	63180349	63179723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1H	146468	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	64311746	64312216	64311964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	75673	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr12	64312639	64312950	64312683	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	76566	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	64544712	64545066	64544890	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	69010	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	65076423	65076649	65076481	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF3	74130	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.9122304720689
chr12	66050300	66050400	66050342	Y	NA	NA	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-118B13.1	378615	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	68758917	68759565	68759229	Y	IFNG,RAP1B	MDM1	RAP1B,NUP107,LOC100507250	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MDM1	34756	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	69006143	69006530	69006154	Y	CPM,IFNG,RAP1B	RAP1B,RP11-254B13.3	NA	NA	NA	NA	RAP1B	3524	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.05569209793099
chr12	69150078	69150205	69150130	Y	NA	SLC35E3,MDM2	NA	NA	NA	NA	SLC35E3	12192	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	69179281	69179795	69179458	Y	CPM,RAP1B	SLC35E3,MDM2	NA	NA	NA	NA	MDM2	20161	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	70634012	70634396	70634290	Y	RAB3IP,KCNMB4,CNOT2,CNOT2,CNOT2	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	CNOT2	378	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	70951536	70951916	70951606	Y	KCNMB4	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMB4	193480	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr12	71085208	71085379	71085280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMB4	327152	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	76338350	76338647	76338468	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PHLDA1	87065	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	76373014	76373318	76373236	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	OSBPL8,PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	52394	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr12	76375899	76376264	76376114	Y	NA	PHLDA1	PHLDA1,KRR1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PHLDA1	49448	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr12	76414095	76414311	76414227	Y	NA	PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	11401	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	76552427	76552994	76552692	Y	PHLDA1,OSBPL8	NA	NAP1L1,PHLDA1,OSBPL8,BBS10	IMR90	Hi-C	24141950	NAP1L1	75614	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	77005504	77005696	77005596	Y	OSBPL8	NA	ZDHHC17,CSRP2	IMR90	Hi-C	24141950	OSBPL8	53915	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	80327802	80327850	80327826	Y	NA	PPP1R12A	NA	NA	NA	NA	PPP1R12A	562	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	85344886	85345065	85345044	Y	NA	SLC6A15	NA	NA	NA	NA	SLC6A15	39492	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	88527986	88528043	88528042	Y	NA	CEP290,TMTC3	NA	NA	NA	NA	CEP290	5950	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	88968059	88968366	88968242	Y	NA	KITLG	NA	NA	NA	NA	KITLG	4262	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	89747699	89748479	89748073	Y	NA	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	2651	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr12	89960420	89960675	89960548	Y	NA	POC1B,GALNT4,POC1B-GALNT4	LOC338758	MCF7	ChIA-PET	22265404	GALNT4,POC1B-GALNT4	42381	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	89978345	89978700	89978451	Y	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT4,POC1B-GALNT4	60306	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	90091098	90091469	90091453	Y	NA	ATP2B1	ATP2B1,LOC338758	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2B1	9608	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr12	90345013	90345239	90345184	Y	POC1B,ATP2B1	NA	LOC338758	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2B1	243936	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr12	90484866	90485476	90485213	Y	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B1	383789	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr12	92528487	92528918	92528861	Y	BTG1	RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	8431	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	93277124	93277496	93277306	Y	NA	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	43611	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr12	93321551	93321826	93321626	Y	EEA1	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	444	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	94817703	94818348	94818256	Y	NA	RBMS2P1,CCDC41	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	958	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	95680646	95681018	95680718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEZT	71124	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	96636403	96636783	96636456	Y	CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	50243	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	96650909	96650966	96650937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	64749	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr12	96664847	96665248	96665048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	78687	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	101692271	101692665	101692300	Y	NA	UTP20	NA	NA	NA	NA	UTP20	20384	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr12	102187051	102187461	102187342	Y	DRAM1,GNPTAB	GNPTAB	NA	NA	NA	NA	GNPTAB	35255	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	104613052	104613575	104613267	Y	CHST11,TXNRD1,TXNRD1	TXNRD1,RPL18AP3	NA	NA	NA	NA	TXNRD1	5495	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr12	104658660	104659046	104658853	Y	NA	RPL18AP3,EID3	NA	NA	NA	NA	RPL18AP3	1604	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	104693849	104694220	104693862	Y	NA	RPL18AP3,EID3	NA	NA	NA	NA	EID3	1297	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr12	105061987	105062372	105062098	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	214914	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	105064571	105065844	105065441	Y	EID3,CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	217498	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	105715924	105716167	105716100	Y	APPL2,C12orf75	NA	C12orf75,APPL2	IMR90	Hi-C	24141950	APPL2	87908	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	105837759	105838125	105838029	Y	NA	NA	NUAK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	APPL2	209743	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr12	106328094	106328476	106328238	Y	CKAP4	NA	NUAK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NUAK1	203335	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	106593469	106593866	106593668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUAK1	61658	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	107363542	107363991	107363752	Y	NA	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	14953	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	107377522	107377900	107377585	Y	RFX4,RIC8B,MTERFD3	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	1044	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	108054058	108054330	108054150	Y	NA	PWP1	NA	NA	NA	NA	PWP1	23179	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	108054666	108054768	108054732	Y	NA	PWP1	NA	NA	NA	NA	PWP1	22741	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	108877904	108878160	108878033	Y	SSH1,SELPLG,SELPLG	FICD	NA	NA	NA	NA	FICD	28802	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	109248007	109248657	109248411	Y	SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	709	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr12	109249389	109249909	109249762	Y	CORO1C,SSH1,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	23	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	109249958	109250678	109250397	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	592	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.37046139862066
chr12	109570576	109570747	109570637	Y	ACACB	ALKBH2,UNG,RP11-968O1.5	NA	NA	NA	NA	RP11-968O1.5	23553	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	111095518	111095878	111095698	Y	PPTC7,HVCN1,HVCN1	TCTN1,HVCN1	NA	NA	NA	NA	HVCN1	44877	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	111881338	111881509	111881420	Y	ALDH2,SH2B3	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	39586	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	112018937	112019235	112019073	Y	NA	ATXN2	NA	NA	NA	NA	ATXN2	16245	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	112341708	112342051	112341878	Y	ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	63926	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	112633664	112633952	112633817	Y	NA	NA	TRAFD1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAFD1	72359	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	112741741	112742068	112741904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	112087	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	113630509	113630869	113630677	Y	NA	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	DDX54	9225	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	113660919	113661318	113661188	Y	TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	4020	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	114029271	114029455	114029396	Y	LHX5	NA	RBM19	IMR90	Hi-C	24141950	SDSL	171229	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	115105863	115106455	115106375	Y	TBX3	TBX3	NA	NA	NA	NA	TBX3	13514	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	115791856	115792156	115792052	Y	NA	NA	TBX3	IMR90	Hi-C	24141950	TBX3	671887	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	117100450	117100717	117100699	Y	NA	NA	MED13L,LINC00173,C12orf49	IMR90	Hi-C	24141950	C12orf49	73158	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	117277511	117277610	117277564	Y	NOS1,RNFT2,HRK	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW8	69151	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	117498032	117498586	117498265	Y	NA	TESC	NA	NA	NA	NA	TESC	36698	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	120153680	120153798	120153737	Y	NA	RP11-768F21.1	NA	NA	NA	NA	RP11-768F21.1	49796	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr12	120426531	120426889	120426594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIT	113436	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	120524802	120525368	120525019	Y	CCDC64	RAB35	NA	NA	NA	NA	RAB35	27938	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr12	120700935	120701192	120701121	Y	NA	PXN,NME2P1,RNU4-2,RNU4-1	NA	NA	NA	NA	PXN	382	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	121282265	121283301	121283112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	56873	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr12	121310801	121311113	121311060	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	29061	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	122028609	122028883	122028798	Y	RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	KDM2B	K562	ChIA-PET	22265404	KDM2B	11689	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.37046139862066
chr12	123320749	123321200	123320858	Y	NA	HIP1R	NA	NA	NA	NA	HIP1R	3749	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.37046139862066
chr12	123362987	123363145	123363088	Y	NA	HIP1R,VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	15846	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	123569685	123569956	123569821	Y	C12orf65,C12orf65,C12orf65	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	62606	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	123930588	123930862	123930771	Y	RILPL2	RILPL2,SNRNP35	SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SNRNP35	9326	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	124907545	124908050	124907792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	142085	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.54176907344824
chr12	124937911	124938596	124938282	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	111539	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	125026162	125026505	125026332	Y	NA	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	23630	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	721	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	3.76876884620682
chr12	125110878	125111184	125111029	Y	UBC,NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	60743	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	125145708	125145948	125145828	Y	FAM101A	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A,SCARB1	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	95573	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	125179424	125179850	125179505	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A,SCARB1	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	129289	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	125188436	125188747	125188585	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	138301	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	125197556	125198099	125197767	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	147421	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	125204801	125205082	125204928	Y	UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	154666	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	125230587	125231048	125230629	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	134166	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	128823822	128824230	128823901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC15A4	482298	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	131405313	131405624	131405469	Y	RIMBP2,GPR133	GPR133	NA	NA	NA	NA	GPR133	30828	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr12	131439876	131440100	131439986	Y	NA	GPR133,RP11-76C10.5	NA	NA	NA	NA	GPR133	3424	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr12	131510828	131511048	131510920	Y	NA	RP11-76C10.5	NA	NA	NA	NA	RP11-76C10.5	34307	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.05569209793099
chr12	131513179	131513358	131513281	Y	GPR133	RP11-76C10.5	NA	NA	NA	NA	RP11-76C10.5	36658	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	3.59746117137923
chr12	131702988	131703123	131703024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-76C10.5	226467	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr12	131855919	131857124	131856355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	336502	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	42.8269187068956
chr12	132232542	132232780	132232661	Y	DDX51	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	38916	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	132315038	132315239	132315115	Y	MMP17	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	4100	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	132345340	132345736	132345589	Y	SFSWAP,ULK1	MMP17,ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	31460	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	132349078	132349283	132349182	Y	NA	MMP17,ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	27913	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	132970087	132970237	132970177	Y	CHFR,ANKLE2,FBRSL1	NA	GALNT9,LOC100130238,P2RX2,POLE,DDX51,NOC4L,LOC100507055,FBRSL1,EP400NL	IMR90	Hi-C	24141950	FBRSL1	93900	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr12	133021534	133022956	133022670	Y	POLE,DDX51,FBRSL1	FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FBRSL1	41181	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.54176907344824
chr13	20692936	20693199	20693068	Y	CRYL1	NA	NA	NA	NA	NA	GJB2	71838	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	20701926	20702100	20701958	Y	PSPC1,ZMYM5	NA	NA	NA	NA	NA	GJB2	62937	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	20771601	20771692	20771689	Y	NA	GJB2	NA	NA	NA	NA	GJB2	6564	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	22107257	22107449	22107379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC20	75748	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	24062649	24062979	24062814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SACS	56808	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	24133122	24133556	24133337	Y	NA	TNFRSF19	MIPEP,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF19	8953	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr13	24191778	24192157	24192102	Y	NA	TNFRSF19	NA	NA	NA	NA	TNFRSF19	49269	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	27557231	27557465	27557334	Y	USP12,RPL21,RASL11A	NA	RASL11A,USP12,RPL21,MTIF3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP12	186568	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	27728821	27729155	27728988	Y	USP12	USP12	NA	NA	NA	NA	USP12	14878	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	28387236	28387515	28387376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDX1	104642	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	28725313	28725682	28725498	Y	PAN3	PAN3-AS1,PAN3	NA	NA	NA	NA	PAN3	14670	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	29148829	29149214	29148994	Y	POMP	EIF4A1P7	FLT1	IMR90	Hi-C	24141950	EIF4A1P7	21756	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	30407984	30408178	30408116	Y	UBL3	UBL3	NA	NA	NA	NA	UBL3	14643	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr13	31472880	31473382	31473215	Y	C13orf33	NA	NA	NA	NA	NA	HSPH1	261143	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	31483566	31483936	31483755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPH1	250589	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	32556798	32557016	32556860	Y	N4BP2L1	FRY	EEF1DP3,FRY,BRCA2,ZAR1L	IMR90	Hi-C	24141950	FRY	46421	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	32625512	32625609	32625561	Y	NA	FRY	NA	NA	NA	NA	FRY	22075	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	32691995	32692202	32692106	Y	N4BP2L2,N4BP2L2,N4BP2L1,BRCA2	NA	NA	NA	NA	NA	FRY	88558	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	34116442	34117241	34116673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	193675	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr13	34253090	34253722	34253494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	136464	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.88438442310341
chr13	34730516	34730744	34730573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	340330	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	34731212	34731445	34731362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	341026	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr13	36918283	36918673	36918579	Y	NA	CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2,SPG20	NA	NA	NA	NA	SPG20	23644	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	37493371	37493714	37493499	Y	C13orf36,RFXAP,SMAD9	SMAD9,LAMTOR3P1	NA	NA	NA	NA	SMAD9	469	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	43451555	43451845	43451701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSTI1	112562	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.74092279724132
chr13	43796435	43796650	43796543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	201096	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	44446151	44446617	44446342	Y	NA	LACC1,CCDC122	NA	NA	NA	NA	LACC1	4803	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	44811516	44811943	44811701	Y	NA	NA	TSC22D1,SERP2,NUFIP1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SERP2	133858	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	44818555	44818615	44818583	Y	C13orf31,C13orf31	NA	TSC22D1,SERP2,LINC00284	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SERP2	127186	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	44848357	44848873	44848719	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	SERP2,NUFIP1,TSC22D1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERP2	96928	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	44880536	44881091	44880742	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,LACC1,SERP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERP2	64710	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr13	44887042	44887399	44887172	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	SERP2	58402	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	45338378	45338728	45338554	Y	NA	NA	TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1,LINC00330	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	189095	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	45928010	45928281	45928087	Y	NA	TPT1-AS1,TPT1	NA	NA	NA	NA	TPT1	14505	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	46244354	46244716	46244645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG3	207294	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	46752144	46752602	46752461	Y	C13orf18,LCP1	LCP1,LRRC63	NA	NA	NA	NA	LCP1	31404	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	47128564	47128952	47128887	Y	LCP1,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	3261	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	50597476	50597810	50597661	Y	RCBTB1,TRIM13	TRIM13	NA	NA	NA	NA	TRIM13	29452	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	50602874	50603059	50603020	Y	NA	TRIM13	NA	NA	NA	NA	TRIM13	34850	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	50897882	50898235	50898046	Y	NA	RPL34P26	DLEU2,DLEU1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34P26	35664	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr13	51200392	51200766	51200454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P26	266493	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr13	52218212	52218391	52218309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDFY2	61568	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr13	64537945	64538229	64538154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	109915	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	64563606	64563820	64563696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	84324	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	64623751	64624068	64623941	Y	NA	LINC00355	NA	NA	NA	NA	LINC00355	24076	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	64652316	64652644	64652373	Y	NA	LINC00355	NA	NA	NA	NA	LINC00355	4172	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	67568177	67568566	67568563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH9	233902	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	72206339	72206570	72206525	Y	DACH1	H3F3BP1	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	40629	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	76138851	76139260	76139031	Y	NA	COMMD6,UCHL3	NA	NA	NA	NA	UCHL3	17232	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	76279599	76280073	76279764	Y	LMO7	NA	NA	NA	NA	NA	UCHL3	157980	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	76834064	76834452	76834258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD12	624088	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	76967658	76967689	76967675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD12	490851	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	78158324	78158538	78158433	Y	MYCBP2,SLAIN1,SLAIN1,EDNRB,EDNRB	NA	NA	NA	NA	NA	SCEL	50515	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	80916096	80916414	80916232	Y	NA	SPRY2	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3010	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr13	88211990	88212263	88212129	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4500HG	109251	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	92294972	92294984	92294978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPC5	246043	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	93899040	93899272	93899121	Y	NA	GPC6	NA	NA	NA	NA	GPC6	21945	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	95931058	95931197	95931128	Y	ABCC4	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	20490	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	99161455	99162128	99161863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	66066	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	99562711	99562955	99562841	Y	GPR183,STK24	NA	NA	NA	NA	NA	SLC15A1	159803	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	99867739	99867834	99867779	Y	DOCK9,GPR18,CLYBL,UBAC2,UBAC2	UBAC2-AS1,UBAC2,H2AFZP3	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	1727	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	99935844	99936009	99935907	Y	GPR183	GPR183	NA	NA	NA	NA	GPR183	21650	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	100399124	100399585	100399214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLYBL	142205	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	102569627	102570054	102569972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGBL1	466661	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	11.3063065386204
chr13	103249969	103250343	103250155	Y	ERCC5,TPP2	TPP2	NA	NA	NA	NA	TPP2	2616	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	106753025	106753272	106753030	Y	ARGLU1	NA	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00460	273639	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr13	106810133	106810294	106810212	Y	NA	NA	EFNB2,LINC00460	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00460	216617	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	108099145	108099375	108099322	Y	FAM155A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM155A	417708	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	108153519	108153767	108153691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM155A	363316	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	108181035	108181120	108181078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM155A	335963	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr13	108520131	108520835	108520801	Y	LIG4,FAM155A	FAM155A	NA	NA	NA	NA	FAM155A	3048	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	4.62530722034473
chr13	109568044	109568430	109568179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD13	699317	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr13	109852673	109853050	109852860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL162497.1	552565	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	109921804	109922211	109922051	Y	NA	NA	IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	483404	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr13	110132729	110132862	110132798	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	272753	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	110147333	110147690	110147511	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	257925	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	110337257	110337548	110337429	Y	NA	NA	MYO16,IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	68067	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	110439676	110440079	110439929	Y	IRS2	AL162497.1,IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	2761	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr13	110991031	110991380	110991291	Y	COL4A1,COL4A2	COL4A2,COL4A1	NA	NA	NA	NA	COL4A1	33535	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	111013776	111014136	111013979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	56280	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	111172874	111173635	111173314	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	RAB20	NA	NA	NA	NA	RAB20	38445	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	111174336	111174835	111174468	Y	ANKRD10,RAB20	RAB20	NA	NA	NA	NA	RAB20	37245	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	111176913	111177121	111177092	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	RAB20	NA	NA	NA	NA	RAB20	34959	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	3.76876884620682
chr13	111180820	111181023	111180903	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	RAB20	NA	NA	NA	NA	RAB20	31057	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	111184119	111184417	111184276	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	RAB20	NA	NA	NA	NA	RAB20	27663	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	111212967	111213224	111213111	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	RAB20	COL4A2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RAB20	887	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr13	111278486	111278706	111278495	Y	NA	CARKD	NA	NA	NA	NA	CARKD	12605	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	111564894	111565358	111565241	Y	RAB20,ING1,ING1,ARHGEF7,ANKRD10	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	58	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr13	111699295	111699448	111699370	Y	NA	NA	ING1,ARHGEF7,ANKRD10	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGEF7	65458	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	114147699	114148153	114147800	Y	F7,F10,PROZ,GRTP1	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	TMCO3	4389	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr13	114770181	114770639	114770503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	125447	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr13	114830489	114831626	114831334	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	64460	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr13	114834440	114834743	114834634	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	61343	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	3.59746117137923
chr13	114881275	114881557	114881414	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	14529	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	20539809	20540045	20539927	Y	OR4Q3,OR4M1,OR4N2,OR4K2,OR4K5,OR4K1,OR4N5,OR11H4,OR11H6,OR4K17,OR4K14,OR4K13,OR4L1	NA	NA	NA	NA	NA	TTC5	232108	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	20803011	20803143	20803077	Y	NA	TTC5,CCNB1IP1,PARP2,RPPH1	NA	NA	NA	NA	CCNB1IP1	3540	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	21150605	21151121	21150987	Y	TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	269	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	21577986	21578258	21578000	Y	NA	ARHGEF40,ZNF219	NA	NA	NA	NA	ZNF219	7105	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	23058743	23059118	23058931	Y	REM2	DAD1,ABHD4	NA	NA	NA	NA	DAD1	2568	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	23449757	23450231	23450060	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB	MIR4707,HAUS4,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr14	23466494	23466910	23466688	Y	CDH24,C14orf93	MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93,PSMB5	NA	NA	NA	NA	C14orf93	10465	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	24454112	24454320	24454216	Y	DHRS4L2,DHRS4L2	DHRS4,DHRS4L2	NA	NA	NA	NA	DHRS4L2	16964	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	24755187	24755313	24755250	Y	DHRS4L1	TINF2,RABGGTA,DHRS1	NA	NA	NA	NA	DHRS1	11726	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	24861663	24861718	24861669	Y	IPO4,RABGGTA,RABGGTA	NFATC4,KHNYN,SDR39U1	NA	NA	NA	NA	NFATC4	28784	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr14	25148998	25149284	25149081	Y	CIDEB,KHNYN,GZMH,GZMB	NA	NA	NA	NA	NA	SDR39U1	238887	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	25385464	25385666	25385565	Y	CMA1,CTSG,STXBP6	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP6	131837	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	27263370	27263754	27263562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOVA1	198410	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	27311220	27311475	27311345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOVA1	246260	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	31400109	31400220	31400192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COCH	58389	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	31478440	31478826	31478753	Y	NA	AP4S1,STRN3	NA	NA	NA	NA	AP4S1	13486	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	32472672	32472966	32472819	Y	NA	RP11-187E13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-187E13.2	1142	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr14	32597823	32598061	32597946	Y	NUBPL	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP5-AS1	53824	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.22699977275857
chr14	33126424	33126565	33126444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	174418	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	34801443	34801630	34801553	Y	NA	NA	SPTSSA	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	127932	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	34966252	34966485	34966304	Y	NA	SPTSSA,EGLN3,EAPP	NA	NA	NA	NA	EGLN3	36272	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr14	35805683	35806194	35806003	Y	BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	50081	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	35816738	35817044	35816815	Y	NA	RP11-561B11.1	KIAA0391,PPP2R3C,PSMA6	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-561B11.1	39231	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	35836736	35837242	35837045	Y	NA	RP11-561B11.1,NFKBIA	PSMA6,SNX6,PPP2R3C,KIAA0391,NFKBIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-561B11.1	19033	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	35855857	35856187	35856101	Y	NA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	88	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	37317346	37317701	37317507	Y	NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1	NA	NA	NA	NA	NA	PAX9	192573	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	38052956	38053419	38053189	Y	FOXA1	TTC6,FOXA1	NA	NA	NA	NA	TTC6	9633	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	38067310	38067714	38067659	Y	NA	TTC6,FOXA1	NA	NA	NA	NA	FOXA1	65	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	8.05146071689638
chr14	42075138	42075996	42075609	Y	LRFN5	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	2175434	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	45160440	45160781	45160566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	203717	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr14	50439731	50439867	50439806	Y	NA	C14orf182	NA	NA	NA	NA	C14orf182	32371	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	50799629	50799645	50799635	Y	NA	ATP5S,L2HGDH	NA	NA	NA	NA	L2HGDH	22363	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr14	51897315	51897533	51897426	Y	TRIM9	NA	FRMD6-AS1,FRMD6,LOC283553,TMX1	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD6	56285	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	52110768	52111053	52110947	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	156950	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	52547300	52547782	52547649	Y	NA	NID2	NID2,C14orf166,TXNDC16	IMR90	Hi-C	24141950	NID2	13588	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	52584121	52584359	52584179	Y	NA	NA	NID2,C14orf166	IMR90	Hi-C	24141950	NID2	50409	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	52774627	52775077	52774946	Y	GNG2,PTGER2	NA	NA	NA	NA	NA	NID2	240915	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	54640534	54640974	54640637	Y	NA	NA	BMP4	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN3	220593	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	54833964	54834357	54834051	Y	NA	CDKN3	NA	NA	NA	NA	CDKN3	27210	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr14	55249380	55249603	55249505	Y	LGALS3,FBXO34,GMFB,MAPK1IP1L,GCH1	NA	NA	NA	NA	NA	GCH1	117967	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	55544307	55544654	55544518	Y	NA	MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	27958	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr14	56677019	56677095	56677057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PELI2	94487	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	56733293	56733420	56733313	Y	PELI2	NA	NA	NA	NA	NA	PELI2	150761	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	56806823	56806983	56806903	Y	PELI2	NA	PELI2,KTN1,LINC00520	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PELI2	224291	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	58637905	58638297	58638125	Y	NA	UBA52P3,ACTR10	NA	NA	NA	NA	ACTR10	26501	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	60061321	60061594	60061405	Y	DAAM1,RTN1,C14orf38,RTN1	NA	NA	NA	NA	NA	JKAMP	112160	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	60189263	60189533	60189522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN1	146151	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr14	60214885	60214948	60214918	Y	RTN1	NA	NA	NA	NA	NA	RTN1	120736	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	60618583	60618767	60618659	Y	PPM1A,C14orf135,DHRS7	DHRS7	NA	NA	NA	NA	DHRS7	15807	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	60679186	60679974	60679676	Y	NA	DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2	NA	NA	NA	NA	PPM1A	30496	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr14	61938268	61939375	61939158	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	220856	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	61956573	61957255	61956876	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	202976	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	61978878	61979019	61978952	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	181212	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	62025043	62025333	62025150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	134898	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	62026213	62026731	62026533	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	133500	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	62066520	62066831	62066675	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	93400	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	64976158	64976191	64976175	Y	ZBTB25,ZBTB1	ZBTB1,ZBTB25,HSPA2	NA	NA	NA	NA	ZBTB25	6227	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	65172114	65172865	65172414	Y	SYNE2,ZBTB1,MAX,CHURC1,PLEKHG3	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	3294	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	66126309	66126626	66126333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	250999	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	68161499	68161767	68161616	Y	PLEK2	VTI1B,RDH11	NA	NA	NA	NA	RDH11	968	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr14	68884830	68884917	68884875	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	1996	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	69014304	69014714	69014453	Y	ACTN1	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	127391	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	69014972	69015327	69015083	Y	ACTN1	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	128059	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr14	69251306	69251504	69251405	Y	NA	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	9686	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	69417007	69417266	69417043	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	26891	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	69417780	69418181	69417964	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	25976	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr14	69867695	69867997	69867846	Y	NA	SLC39A9,ERH	NA	NA	NA	NA	ERH	4351	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	69913588	69913836	69913761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERH	50244	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	70020113	70020453	70020282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	55860	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	70447892	70448065	70447949	Y	SMOC1	NA	NA	NA	NA	NA	SMOC1	129044	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr14	70464665	70464959	70464731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMOC1	145817	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr14	70737226	70737562	70737394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX16	86886	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	70803999	70804244	70804143	Y	NA	COX16	NA	NA	NA	NA	COX16	20204	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	71164534	71164679	71164625	Y	MED6	NA	NA	NA	NA	NA	MED6	99150	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr14	71797093	71797681	71797289	Y	PCNX	SIPA1L1	SIPA1L1,LOC145474	IMR90	Hi-C	24141950	SIPA1L1	11927	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr14	71870372	71870659	71870456	Y	PCNX,SIPA1L1	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L1	85206	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	73026467	73026767	73026635	Y	DPF3	NA	NA	NA	NA	NA	DCAF4	364273	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	74954618	74954759	74954689	Y	PROX2,NPC2	MIR4709,ISCA2,NPC2	NA	NA	NA	NA	ISCA2	3664	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	75592667	75593037	75593004	Y	NA	RP11-950C14.7,NEK9,TMED10	NA	NA	NA	NA	NEK9	620	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr14	76243945	76244101	76244023	Y	TGFB3	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf1	118413	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	76843326	76843356	76843341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-187O7.1	256648	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr14	77422240	77422571	77422458	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.1	IRF2BPL,KIAA1737	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.1	10455	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	77423763	77424258	77424192	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.1	IRF2BPL,KIAA1737	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.1	8768	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	77431067	77431579	77431238	Y	NA	RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.1	1447	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL,RP11-7F17.3	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr14	77500544	77500911	77500765	Y	NA	IRF2BPL,RP11-7F17.3	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	7510	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	77505083	77505447	77505354	Y	TMEM63C,TMED8,KIAA1737	IRF2BPL,RP11-7F17.3	IRF2BPL	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BPL	12049	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	77577466	77577695	77577651	Y	NA	RP11-7F17.3	NA	NA	NA	NA	RP11-7F17.3	36779	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	77591216	77591790	77591612	Y	TMED8,NGB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-7F17.3	50529	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	79406333	79406507	79406344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCK1	1141907	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	80050129	80050354	80050306	Y	NRXN3	NA	NA	NA	NA	NA	DIO2	801746	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr14	84176891	84176909	84176900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-406A9.2	1069927	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	85881762	85881957	85881956	Y	FLRT2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-497E19.1	112375	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	88445167	88445328	88445280	Y	GPR65,GALC,GALC	GALC,GPR65	NA	NA	NA	NA	GALC	12681	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr14	88461350	88461753	88461554	Y	GALC,GALC,GPR65	GALC,GPR65	NA	NA	NA	NA	GALC	3341	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr14	89739645	89739700	89739695	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	343793	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	90875651	90876041	90875751	Y	NA	RPL21P11,CALM1	NA	NA	NA	NA	CALM1	14805	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	91090658	91091172	91090732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7B	189651	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	91224328	91224362	91224343	Y	C14orf159,CALM1	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7B	56461	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	91528012	91528136	91528074	Y	SMEK1,CCDC88C,RPS6KA5	C14orf159,RPS6KA5	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	3032	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	91683304	91683542	91683359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	158324	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	91727497	91727640	91727579	Y	RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C,GPR68	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	154548	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	92070183	92070310	92070247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMEK1	95285	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	93030823	93030949	93030917	Y	ATXN3,LGMN	NA	NA	NA	NA	NA	RIN3	52705	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	93192576	93192808	93192662	Y	MOAP1,C14orf142,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	LGMN	NA	NA	NA	NA	LGMN	20239	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	93552204	93552427	93552400	Y	NA	ITPK1	NA	NA	NA	NA	ITPK1	28238	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr14	93698124	93698181	93698153	Y	NA	MOAP1,RP11-371E8.4,UBR7,C14orf142	NA	NA	NA	NA	C14orf142	26685	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	93776910	93777138	93777024	Y	PRIMA1	BTBD7	NA	NA	NA	NA	BTBD7	20300	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	95354502	95354744	95354634	Y	CLMN	NA	CLMN,GSC	IMR90	Hi-C	24141950	GSC	119940	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	4.28269187068956
chr14	95680303	95680655	95680479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DICER1	57956	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	95691488	95691499	95691495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DICER1	69141	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr14	95734707	95735043	95734878	Y	NA	CLMN	NA	NA	NA	NA	CLMN	49200	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	95779970	95780439	95780333	Y	DICER1,CLMN	CLMN	NA	NA	NA	NA	CLMN	3804	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr14	96086261	96086587	96086424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNHG10	87052	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	98011080	98011227	98011154	Y	NA	NA	BCL11B	IMR90	Hi-C	24141950	VRK1	749439	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	505578	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.56961512241374
chr14	100071651	100072022	100071781	Y	NA	CCDC85C,RP11-543C4.1,HHIPL1	NA	NA	NA	NA	RP11-543C4.1	2758	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr14	100874667	100875097	100874987	Y	WARS,WARS,WDR25,WDR25	RP11-638I2.10,WDR25,WARS,RP11-362L22.1	NA	NA	NA	NA	RP11-362L22.1	3731	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	100883887	100884104	100884057	Y	BEGAIN	WDR25,WARS,RP11-362L22.1	NA	NA	NA	NA	RP11-362L22.1	12951	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.71307674827583
chr14	100905618	100905757	100905695	Y	BEGAIN	RP11-362L22.1	BEGAIN	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-362L22.1	34682	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr14	101020509	101020866	101020628	Y	WARS,WARS,WDR25,WDR25,BEGAIN	BEGAIN	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	30884	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr14	101023349	101023562	101023455	Y	BEGAIN	BEGAIN	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	28188	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr14	101024059	101024421	101024266	Y	WARS,WARS,WDR25,WDR25	BEGAIN	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	27329	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr14	101029795	101030067	101029931	Y	NA	BEGAIN	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	21683	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr14	101049817	101049857	101049837	Y	DLK1,BEGAIN	BEGAIN	WDR25,MEG3,BEGAIN	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BEGAIN	1893	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	101155057	101155401	101155388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	103307	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	101370822	101370975	101370899	Y	BEGAIN,RTL1	NA	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	319072	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	102227271	102227509	102227387	Y	WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C	RP11-1029J19.5,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	1136	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr14	102394756	102394884	102394784	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	33981	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	3.59746117137923
chr14	102438747	102439113	102438818	Y	PPP2R5C,DYNC1H1	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	9882	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	102977207	102977381	102977329	Y	AMN	ANKRD9	NA	NA	NA	NA	ANKRD9	3071	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	102991046	102991386	102991124	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	16910	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	102991831	102991939	102991900	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	17695	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	103577206	103577606	103577492	Y	C14orf153	TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	10173	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	103673427	103673966	103673589	Y	CDC42BPB	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	85648	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	103929089	103929460	103929098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKB	57988	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	103954462	103954719	103954539	Y	MARK3,KLC1	CKB,TRMT61A	NA	NA	NA	NA	CKB	32729	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	104766695	104767088	104766699	Y	TMEM179	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26A	163635	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.05569209793099
chr14	104928387	104928555	104928492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM179	141429	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	105143455	105143754	105143546	Y	GPR132	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	RP11-982M15.6	1729	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	105144100	105144955	105144117	Y	GPR132,AKT1	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	RP11-982M15.6	528	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr14	105154013	105154712	105154273	Y	ADSSL1	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	70	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	105191285	105191466	105191451	Y	NA	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1,SIVA1	NA	NA	NA	NA	ADSSL1	2762	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	105290315	105290696	105290451	Y	GPR132	AKT1	NA	NA	NA	NA	AKT1	30227	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	105439556	105439771	105439692	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2923	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr14	105491233	105491512	105491453	Y	NA	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	5748	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.88438442310341
chr14	105790841	105790905	105790875	Y	NA	PACS2,BRF1	NA	NA	NA	NA	BRF1	10915	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	2511	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr14	107252931	107253417	107253022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGHV1-3	783208	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr15	20570096	20570220	20570180	Y	NA	NA	REREP3,POTEB,LOC348120,NF1P2,CHEK2P2	IMR90	Hi-C	24141950	TUBGCP5	2261175	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr15	20590692	20590758	20590725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP5	2240637	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	20596893	20597220	20597190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP5	2234175	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr15	20612710	20612766	20612738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP5	2218629	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr15	21905791	21906130	21906013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP5	925265	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	30.8353814689649
chr15	21914435	21914569	21914482	Y	OR4N4	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP5	916826	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr15	21925957	21925972	21925965	Y	OR4N4,OR4M2	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP5	905423	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	22927527	22927784	22927666	Y	CYFIP1	CYFIP1	NA	NA	NA	NA	CYFIP1	37522	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	25565589	25566847	25566046	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	115281	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr15	25597069	25597306	25597188	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	84822	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	25608093	25608225	25608159	Y	SNURF,SNRPN	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	73903	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	25646289	25646668	25646556	Y	SNURF,SNRPN,UBE3A	UBE3A	NA	NA	NA	NA	UBE3A	35460	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	33111010	33111355	33111242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	205665	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	34807090	34807442	34807248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOLGA8B	71262	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	35590731	35591134	35590845	Y	NA	NA	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	312243	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	37207397	37207450	37207424	Y	C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS2	184054	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	37249666	37249815	37249741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS2	141689	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	38546643	38547172	38546943	Y	NA	SPRED1	NA	NA	NA	NA	SPRED1	4116	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr15	38750000	38750177	38750089	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	5672	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	39276567	39276774	39276671	Y	C15orf53	NA	FSIP1,C15orf53	IMR90	Hi-C	24141950	RASGRP1	420791	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	39361992	39362177	39362006	Y	NA	NA	FSIP1,C15orf53	IMR90	Hi-C	24141950	RASGRP1	506216	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	39432291	39432412	39432368	Y	THBS1	NA	THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	438868	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr15	39685855	39686105	39686012	Y	NA	NA	THBS1,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	185175	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	40391032	40391342	40391133	Y	PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF	NA	NA	NA	NA	NA	BUB1B	59882	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr15	40728458	40728872	40728667	Y	NA	IVD,BAHD1,CHST14	NA	NA	NA	NA	BAHD1	1048	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	MGA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MGA	42496	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	42349424	42349982	42349743	Y	MGA,JMJD7,EHD4,VPS39,TMEM87A,SNAP23	NA	PLA2G4E	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	86648	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	42535686	42535733	42535710	Y	NA	VPS39,GANC,TMEM87A	NA	NA	NA	NA	GANC	27698	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	43810666	43810996	43810786	Y	MAP1A	TP53BP1,MAP1A	NA	NA	NA	NA	MAP1A	9510	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	44954800	44955080	44954968	Y	CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11	SPG11,PATL2,B2M	NA	NA	NA	NA	SPG11	924	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr15	45748469	45749175	45748989	Y	SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN	C15orf48,RP11-519G16.3	NA	NA	NA	NA	RP11-519G16.3	9844	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr15	46256210	46256268	46256256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQRDL	334864	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	48311619	48311717	48311668	Y	NA	NA	SEMA6D,SLC12A1	IMR90	Hi-C	24141950	MYEF2	156997	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	50140337	50140734	50140509	Y	FGF7,DTWD1	NA	NA	NA	NA	NA	DTWD1	229160	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	50429549	50429984	50429688	Y	USP8,GABPB1	SLC27A2	ATP8B4,GALK2,GABPB1,SHC4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC27A2	42409	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr15	50620432	50620711	50620437	Y	NA	GABPB1-AS1,GABPB1	NA	NA	NA	NA	GABPB1-AS1	24814	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	50995097	50995499	50995351	Y	SPPL2A	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	18085	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr15	51177416	51177715	51177636	Y	USP8,TRPM7,SPPL2A	AP4E1	TRPM7,SPPL2A,USP50,AP4E1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP4E1	21154	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	52235970	52236006	52235989	Y	DMXL2,MAPK6	MAPK6,LEO1	NA	NA	NA	NA	MAPK6	6297	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	52385766	52385957	52385877	Y	DMXL2,MAPK6	CTD-2184D3.1,CTD-2184D3.5	NA	NA	NA	NA	CTD-2184D3.1	274	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr15	53942854	53943115	53943028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ONECUT1	861581	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	4.96792256999989
chr15	55463152	55463211	55463182	Y	NA	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	24054	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	55487983	55488563	55488357	Y	RAB27A,PIGB,RSL24D1	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	718	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	56965853	56966086	56966042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNS1	210518	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	58568513	58568584	58568545	Y	NA	NA	LIPC,ADAM10,FAM63B,SLTM	IMR90	Hi-C	24141950	ADAM10	471593	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	60818402	60818756	60818740	Y	RORA	NARG2,RP11-219B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	49025	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	60839009	60839501	60839122	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	69632	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	60860287	60860764	60860653	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	90910	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	60861865	60862603	60862448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	92488	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr15	60865969	60866384	60866286	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	96592	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	60881604	60881753	60881652	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	112227	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr15	60883059	60884017	60883872	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	113682	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	62215780	62216024	62215899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	134648	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	62405210	62405473	62405223	Y	NA	C2CD4A	NA	NA	NA	NA	C2CD4A	48034	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	63766170	63766327	63766326	Y	HERC1,USP3	USP3	APH1B,RAB8B,FBXL22,LOC100130855,USP3,CA12,HERC1,FAM96A,SNX1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP3	28466	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	64277389	64277453	64277421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAPK2	84779	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	64540216	64540468	64540344	Y	HERC1,ZNF609	NA	NA	NA	NA	NA	PPIB	86812	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	64920832	64921228	64921023	Y	ZNF609,OAZ2	RP11-330L19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-330L19.1	37654	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	65823475	65823857	65823545	Y	IGDCC4	DPP8,PTPLAD1	NA	NA	NA	NA	PTPLAD1	2719	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	66125063	66125305	66125185	Y	NA	DENND4A	SLC24A1,DENND4A,RAB11A,C15orf44,MEGF11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND4A	42432	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	66993287	66993569	66993487	Y	MAP2K1,SMAD6	SMAD6	NA	NA	NA	NA	SMAD6	721	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	67095524	67095803	67095671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD6	102958	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	141882	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr15	67341124	67341334	67341261	Y	NA	SMAD3	SMAD3,IQCH,LOC100506686,AAGAB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD3	12767	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	67348530	67348587	67348559	Y	NA	SMAD3	SMAD3,IQCH,LOC100506686,AAGAB	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD3	5514	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	68132387	68132778	68132514	Y	PIAS1	RP11-34F13.3	NA	NA	NA	NA	RP11-34F13.3	9324	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	68564194	68564543	68564236	Y	NA	CLN6,FEM1B	FEM1B,CLN6,ANP32A,CORO2B,ITGA11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FEM1B	3598	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	68644845	68645256	68644912	Y	PIAS1	NA	NA	NA	NA	NA	FEM1B	76704	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	69385602	69385765	69385704	Y	NA	LINC00277	NA	NA	NA	NA	LINC00277	22336	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.22699977275857
chr15	69453904	69454158	69454121	Y	GLCE	GLCE	NA	NA	NA	NA	GLCE	2981	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	69490173	69490404	69490203	Y	NA	GLCE	NA	NA	NA	NA	GLCE	39250	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr15	70392960	70393272	70393150	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	4445	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	70679327	70679587	70679457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLE3	290812	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	72518614	72519346	72519221	Y	ARIH1,PKM2	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9A	109696	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	72897243	72897463	72897311	Y	SENP8,SENP8,MYO9A,TMEM202	NA	NA	NA	NA	NA	BBS4	79064	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	74223574	74223817	74223712	Y	LOXL1	LOXL1	NA	NA	NA	NA	LOXL1	7244	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	74249257	74249448	74249278	Y	NA	LOXL1,STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	LOXL1	32927	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	75460054	75460405	75460311	Y	NA	C15orf39	SCAMP5,PPCDC,C15orf39	IMR90	Hi-C	24141950	C15orf39	25579	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr15	75959061	75959441	75959310	Y	SNX33	SNUPN,SNX33,IMP3,CSPG4	NA	NA	NA	NA	IMP3	20014	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	78619959	78620089	78620013	Y	DNAJA4	WDR61,CRABP1	WDR61,DNAJA4	IMR90	Hi-C	24141950	CRABP1	10577	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	79315517	79315838	79315652	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTSH	75601	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	80270919	80271718	80271313	Y	ZFAND6,BCL2A1	NA	BCL2A1	K562	ChIA-PET	22265404	ST20	56875	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	80873166	80873354	80873251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT2	178474	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	81125183	81125474	81125331	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	55499	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	81393942	81394130	81394078	Y	NA	NA	IL16,C15orf26	IMR90	Hi-C	24141950	MESDC1	102647	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	83817881	83818018	83817954	Y	NA	TM6SF1	NA	NA	NA	NA	TM6SF1	43722	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	84256275	84256758	84256443	Y	SH3GL3	NA	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	381505	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	85225191	85225385	85225287	Y	PDE8A,ZNF592	WDR73,NMB,SEC11A	NA	NA	NA	NA	NMB	25397	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	85956762	85957097	85956878	Y	AKAP13,PDE8A	AKAP13	NA	NA	NA	NA	AKAP13	34960	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	86315137	86315409	86315289	Y	KLHL25	KLHL25	NA	NA	NA	NA	KLHL25	20852	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	88801535	88801887	88801766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL46	206763	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	89027924	89028249	89027989	Y	NA	MRPL46,MRPS11	NA	NA	NA	NA	MRPS11	19240	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	89183173	89183667	89183329	Y	ABHD2,ISG20	AEN,ISG20	NA	NA	NA	NA	ISG20	5789	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr15	89532902	89533939	89533555	Y	NA	NA	MFGE8,ABHD2	IMR90	Hi-C	24141950	MFGE8	78260	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr15	89856537	89857272	89856853	Y	NA	POLG	NA	NA	NA	NA	POLG	18820	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	90441878	90442278	90442169	Y	C15orf38	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	6304	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr15	90708840	90709227	90709106	Y	NA	SEMA4B	CIB1,C15orf58,SEMA4B,ZNF710,IDH2,TTLL13,NGRN	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEMA4B	7004	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr15	90944087	90944636	90944284	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	14637	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr15	90957340	90957730	90957416	Y	FES,ZNF710,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	27890	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	91208661	91208996	91208948	Y	NA	BLM	NA	NA	NA	NA	BLM	49562	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	92400491	92400865	92400640	Y	SLCO3A1	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	5566	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	ASB9P1,FAM174B	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	FAM174B	12383	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr15	93458042	93458417	93458141	Y	NA	CHD2	NA	NA	NA	NA	CHD2	33516	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	95388455	95388700	95388578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR2F2	1478467	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	96739448	96739540	96739494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR2F2	127627	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	99193577	99194531	99194069	Y	IGF1R	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	3377	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr15	99318481	99318879	99318554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	128281	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	99403545	99404056	99403701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	213345	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	99416036	99416369	99416103	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	SYNM	220051	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	99444571	99445210	99444854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNM	191210	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	101261855	101262549	101262221	Y	NA	NA	ALDH1A3,LRRK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINS	120420	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	101690439	101690702	101690610	Y	CHSY1	NA	NA	NA	NA	NA	CHSY1	99435	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	101723592	101723961	101723926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHSY1	66176	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr15	101807515	101807673	101807594	Y	NA	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	17378	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	578748	579156	578911	Y	LUC7L	PIGQ,NHLRC4	NA	NA	NA	NA	PIGQ	35839	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr16	1132307	1132794	1132674	Y	RAB40C,RAB40C,WDR90,CACNA1H,SSTR5	SSTR5	NA	NA	NA	NA	SSTR5	11551	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr16	1166792	1167154	1166886	Y	NA	SSTR5,CACNA1H	CACNA1H,RPUSD1,CHTF18,GNG13,PRR25,LMF1,SOX8	IMR90	Hi-C	24141950	CACNA1H	34087	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	2057818	2059084	2058234	Y	TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598	SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598,NPW	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FLYWCH2	12914	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.37046139862066
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr16	3414643	3415237	3414919	Y	NA	MTRNR2L4,ZNF174	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L4	5046	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	5.13923024482748
chr16	3730332	3730635	3730484	Y	NA	TRAP1	NA	NA	NA	NA	TRAP1	34963	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	4021311	4021627	4021472	Y	CORO7	NA	NA	NA	NA	NA	CREBBP	92584	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr16	4357393	4358110	4357824	Y	CORO7	TFAP4,PAM16	ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	36317	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr16	4678373	4678564	4678416	Y	CORO7,UBN1,UBN1,GLYR1,MGRN1	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	13879	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	9147014	9147397	9147240	Y	ABAT	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	36108	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	9208363	9208890	9208559	Y	NA	C16orf72	NA	NA	NA	NA	C16orf72	24858	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	9583805	9584097	9583876	Y	NA	NA	GRIN2A	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf72	400300	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	10713350	10713596	10713516	Y	NUBP1	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	40795	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr16	11188261	11188580	11188312	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	151916	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	11319095	11319543	11319384	Y	LITAF,CLEC16A,SOCS1	SOCS1	CLEC16A,SOCS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SOCS1	28493	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	11336726	11336842	11336760	Y	LITAF,LITAF	SOCS1	NA	NA	NA	NA	SOCS1	11194	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	11591931	11591962	11591945	Y	NA	NA	SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	136275	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr16	11633611	11633797	11633714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	94440	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	11734091	11734770	11734262	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF,SNN	TXNDC11,SNN,CLEC16A,LITAF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	5854	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.88438442310341
chr16	11890330	11890418	11890367	Y	LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A	ZC3H7A	NA	NA	NA	NA	ZC3H7A	1207	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	14397958	14398068	14398015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	234780	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	14423320	14423633	14423477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	260142	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	14529113	14529156	14529135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	195429	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	14752031	14752218	14752119	Y	NA	PARN,BFAR	NA	NA	NA	NA	BFAR	27359	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	15583408	15583655	15583541	Y	NDE1,C16orf45	NA	KIAA0430	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf45	57256	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr16	15670640	15671032	15670885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0430	63991	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.37046139862066
chr16	15684514	15685137	15684868	Y	NDE1,NDE1,KIAA0430	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	KIAA0430	49886	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr16	15766632	15767024	15766843	Y	KIAA0430,NDE1,NDE1	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	31508	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr16	16055043	16055430	16055122	Y	NDE1,NDE1,ABCC1	RPL15P20,ABCC1	NA	NA	NA	NA	ABCC1	13609	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	16070854	16071189	16071093	Y	NDE1	RPL15P20,ABCC1	NA	NA	NA	NA	ABCC1	29420	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr16	16115976	16116215	16116101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	74542	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr16	17231064	17231355	17231210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	331383	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	17257893	17258025	17257960	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	304713	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	17411483	17411608	17411498	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	151130	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	17485561	17485736	17485646	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	77002	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	17499199	17499488	17499485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	63250	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.54176907344824
chr16	17542654	17543047	17542953	Y	XYLT1	XYLT1	NA	NA	NA	NA	XYLT1	19691	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr16	19106464	19106699	19106563	Y	NA	COQ7,ITPRIPL2	NA	NA	NA	NA	ITPRIPL2	16555	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr16	19222406	19222654	19222461	Y	NA	SYT17	NA	NA	NA	NA	SYT17	45113	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	20922860	20922979	20922921	Y	CRYM,DCUN1D3,LYRM1	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	13154	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	21295163	21295477	21295440	Y	NA	CRYM-AS1	NA	NA	NA	NA	CRYM-AS1	14693	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	21611842	21611954	21611919	Y	CRYM,IGSF6,METTL9	METTL9	NA	NA	NA	NA	METTL9	5303	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	4.28269187068956
chr16	21622558	21622759	21622643	Y	CRYM,IGSF6,METTL9	METTL9	NA	NA	NA	NA	METTL9	16019	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.54176907344824
chr16	21637887	21638686	21638408	Y	CRYM,METTL9,IGSF6	METTL9	NA	NA	NA	NA	METTL9	31348	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	22207042	22207397	22207176	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K,C16orf52	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	8206	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr16	22421466	22421891	22421890	Y	NA	CDR2,RRN3P3	NA	NA	NA	NA	CDR2	24595	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	22658333	22658705	22658519	Y	NA	NA	SLC7A5P2,THUMPD1,CRYM,ANKS4B,ZP2,COG7,DNAH3,CRYM-AS1,METTL9,TMEM159,OTOA,HS3ST2,LOC81691,DCUN1D3,MIR548AA2,MIR548D2	IMR90	Hi-C	24141950	RRN3P3	211297	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	23463654	23463771	23463713	Y	NA	COG7	NA	NA	NA	NA	COG7	1153	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr16	23531974	23532033	23532005	Y	NA	GGA2,UBFD1,EARS2	NA	NA	NA	NA	GGA2	658	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	23855109	23855743	23855120	Y	NA	PRKCB	NA	NA	NA	NA	PRKCB	9787	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	27254406	27254878	27254778	Y	IL4R	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	23237	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	28839972	28840187	28840086	Y	CCDC101,LAT,LAT,SH2B1,SH2B1,SH2B1,NFATC2IP	ATXN2L,TUFM,SH2B1	NA	NA	NA	NA	ATXN2L	7616	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	29954900	29955228	29955066	Y	NA	SEZ6L2,ASPHD1,KCTD13,TMEM219,TAOK2,INO80E	MVP,KCTD13,ZG16,PRRT2,MAZ,KIF22,C16orf54,LOC440356,ASPHD1,SEZ6L2,CDIPT,TMEM219,TAOK2,HIRIP3,INO80E,ALDOA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM219	4694	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	5.48184559448264
chr16	30885980	30886229	30886174	Y	ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668	MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1	NA	NA	NA	NA	MIR4519	1336	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	31083220	31083516	31083291	Y	NA	STX4,ZNF668,ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8	NA	NA	NA	NA	ZNF646	227	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr16	31905713	31906088	31906002	Y	ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	22634	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	33509690	33509798	33509723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	1626611	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	46823783	46824029	46823881	Y	NA	C16orf87	NA	NA	NA	NA	C16orf87	39294	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr16	47176557	47176930	47176742	Y	NETO2	NETO2	NA	NA	NA	NA	NETO2	649	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	51186041	51186738	51186313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYLD	412080	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	52854151	52854308	52854232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-297L17.6	166935	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	53086726	53087108	53087065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	53114402	53114975	53114686	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	27457	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	57657206	57657412	57657318	Y	NA	GPR56,GPR97	NA	NA	NA	NA	GPR56	14642	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	57670999	57671200	57671100	Y	GPR56,PLLP,CX3CL1,CCL17,GPR56	GPR56,GPR97	NA	NA	NA	NA	GPR56	28435	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	57701111	57701632	57701437	Y	FAM192A,ZNF319,C16orf57,GPR97	GPR97	NA	NA	NA	NA	GPR97	1012	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	57717053	57717380	57717096	Y	FAM192A,ZNF319,GPR97	GPR97	NA	NA	NA	NA	GPR97	16954	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr16	57841964	57842337	57842236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIFC3	52620	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr16	58555953	58556233	58556187	Y	NA	SETD6	NA	NA	NA	NA	SETD6	8570	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	60711786	60711795	60711791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOT2	1945525	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	62042930	62043142	62043028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	3114873	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	65020062	65020376	65020219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	137639	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr16	65036446	65036851	65036669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	121164	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	65047832	65047877	65047854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	110138	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	65103847	65103999	65103923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	54016	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	65105283	65105525	65105355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	52490	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr16	65153548	65154160	65153979	Y	CDH11	CDH11	NA	NA	NA	NA	CDH11	3855	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.71307674827583
chr16	65154285	65154635	65154564	Y	NA	CDH11	NA	NA	NA	NA	CDH11	3380	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr16	65337559	65337576	65337568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	179544	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr16	65378012	65378388	65378200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	219997	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	66508767	66508904	66508846	Y	NA	BEAN1	NA	NA	NA	NA	BEAN1	49567	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	66719308	66719396	66719350	Y	NA	CMTM4	NA	NA	NA	NA	CMTM4	9214	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	66784501	66784840	66784671	Y	NA	DYNC1LI2	NA	NA	NA	NA	DYNC1LI2	800	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.54176907344824
chr16	67597304	67597932	67597899	Y	THAP11,RLTPR,ACD	FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	CTCF	2994	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	67891676	67892114	67891889	Y	RLTPR,ACD,PSMB10,NFATC3,EDC4,THAP11	THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,NRN1L,PSKH1	NA	NA	NA	NA	CENPT	11962	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	67892470	67892795	67892734	Y	RLTPR,ACD,NFATC3,EDC4,THAP11	THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,NRN1L,PSKH1	NA	NA	NA	NA	EDC4	12131	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	PLA2G15	5331	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr16	68320405	68320913	68320608	Y	ZFP90,SMPD3	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	21936	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	69432325	69432475	69432421	Y	TERF2	TERF2,CYB5B	NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TERF2	7999	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	69790083	69790481	69790284	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NOB1	3240	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.71307674827583
chr16	71904264	71904408	71904360	Y	PHLPP2,ZNF821	ATXN1L,IST1,ZNF821	NA	NA	NA	NA	ZNF821	22831	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	71931018	71931097	71931057	Y	DHX38,ATXN1L,KIAA0174	ZNF821	NA	NA	NA	NA	ZNF821	3779	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	73012151	73012443	73012287	Y	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	79154	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	73088640	73089206	73088991	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	2391	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	73102955	73103191	73103082	Y	ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	11358	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	73558765	73558950	73558947	Y	NA	NA	HP,HPR	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	467168	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr16	74702224	74702291	74702259	Y	NA	RFWD3,MLKL	NA	NA	NA	NA	RFWD3	3445	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr16	74774732	74775110	74775064	Y	FA2H	MLKL	NA	NA	NA	NA	MLKL	41874	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.37046139862066
chr16	74777612	74777799	74777727	Y	NA	MLKL	NA	NA	NA	NA	MLKL	44754	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr16	75598847	75599270	75599139	Y	TMEM170A	TMEM231,GABARAPL2	NA	NA	NA	NA	GABARAPL2	598	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	75604496	75604511	75604504	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2	NA	NA	NA	NA	GABARAPL2	6247	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	75636745	75636762	75636754	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2,ADAT1,TERF2IP,KARS	NA	NA	NA	NA	ADAT1	18436	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	77721999	77722135	77722067	Y	WWOX	NUDT7	VAT1L	IMR90	Hi-C	24141950	NUDT7	32276	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	79310537	79310702	79310620	Y	MAF	NA	NA	NA	NA	NA	MAF	321909	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	81560583	81561027	81560837	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	CMIP	83808	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	81659842	81660553	81660320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	110149	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	81875278	81875726	81875461	Y	PLCG2	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	104576	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	82661526	82661961	82661896	Y	CDH13	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	3118	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.88438442310341
chr16	82662605	82662975	82662756	Y	CDH13	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	4197	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	22.4413054024133
chr16	82663331	82663687	82663514	Y	NA	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	4923	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr16	82667775	82667948	82667787	Y	NA	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	9367	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	82686651	82686853	82686732	Y	NA	CDH13	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDH13	28243	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr16	82687139	82687406	82687299	Y	NA	CDH13	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDH13	28731	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.74092279724132
chr16	82687467	82688028	82687715	Y	NA	CDH13	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDH13	29059	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr16	82689057	82689347	82689181	Y	NA	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	30649	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr16	82733427	82733620	82733554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH13	75019	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	83069400	83069774	83069647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH13	410992	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	83111437	83111826	83111632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH13	453029	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	83399347	83399604	83399475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSBP1	439844	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	83777004	83777385	83777194	Y	HSDL1	NA	NA	NA	NA	NA	HSBP1	62063	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr16	83795986	83796265	83796126	Y	NA	HSBP1	NA	NA	NA	NA	HSBP1	43183	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	83964806	83964956	83964869	Y	NA	MLYCD,OSGIN1	NA	NA	NA	NA	OSGIN1	14931	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr16	85672210	85672324	85672267	Y	NA	GINS2	GINS2	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	49355	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	86421149	86421325	86421222	Y	FOXF1,FOXC2	NA	LOC400550,LOC732275,LOC146513,FOXF1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXF1	120808	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr16	86587305	86587716	86587504	Y	NA	FOXF1,MTHFSD	NA	NA	NA	NA	MTHFSD	464	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	86609499	86609840	86609550	Y	FOXC2	MTHFSD	NA	NA	NA	NA	MTHFSD	22658	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr16	86698129	86698417	86698281	Y	NA	NA	FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,FOXC2,C16orf95,FBXO31	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	111288	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr16	86775121	86775409	86775225	Y	NA	NA	FOXC2,FOXL1	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	188280	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	86795224	86795595	86795410	Y	NA	NA	FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,C16orf95,FOXC2,FBXO31	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	208383	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr16	86890972	86891338	86891155	Y	NA	NA	FOXL1,C16orf95,FLJ30679,MTHFSD,FOXC2	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	304131	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	87812654	87813065	87812978	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	15056	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	87889826	87890140	87890011	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	10954	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr16	87899593	87899990	87899750	Y	BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	1104	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	87978906	87979489	87979213	Y	ZCCHC14,BANP,BANP	BANP	CA5A,KLHDC4	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BANP	1361	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr16	87997747	87997931	87997804	Y	BANP	BANP	NA	NA	NA	NA	BANP	16897	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	88365536	88366092	88365805	Y	ZNF469	NA	BANP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	151633	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	88700249	88701257	88700631	Y	ACSF3,ZFPM1,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,CBFA2T3,ZC3H18,CYBA	CYBA,MVD	NA	NA	NA	NA	CYBA	14303	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	89313669	89314138	89313993	Y	ZNF276,ZNF778	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	31551	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr16	89382399	89382987	89382651	Y	ZNF276,ZNF276,SPATA2L,C16orf7,ANKRD11	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	100281	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr16	89571786	89572109	89572034	Y	ACSF3,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	16461	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr16	89688213	89688598	89688406	Y	NA	CPNE7,CHMP1A	NA	NA	NA	NA	CHMP1A	33655	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	89893816	89894170	89893993	Y	SPIRE2	FANCA,SPIRE2,TCF25	NA	NA	NA	NA	SPIRE2	11229	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	89904172	89904600	89904272	Y	MC1R,SPIRE2	FANCA,SPIRE2,TCF25	NA	NA	NA	NA	SPIRE2	21585	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr16	89919863	89919956	89919927	Y	DPEP1,DBNDD1,PRDM7,C16orf3	FANCA,SPIRE2,TCF25	NA	NA	NA	NA	TCF25	18044	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	12308	12676	12492	Y	NA	DOC2B	NA	NA	NA	NA	DOC2B	16751	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	32253	32376	32346	Y	DOC2B	DOC2B	NA	NA	NA	NA	DOC2B	2826	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	154480	154575	154515	Y	DOC2B	NA	NA	NA	NA	NA	RPH3AL	79470	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	200517	200885	200707	Y	RPH3AL	RPH3AL	NA	NA	NA	NA	RPH3AL	33160	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	232485	232614	232550	Y	NA	RPH3AL,C17orf97	RPH3AL,VPS53	IMR90	Hi-C	24141950	RPH3AL	1431	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	234794	234851	234823	Y	DOC2B	RPH3AL,C17orf97	RPH3AL,DOC2B	IMR90	Hi-C	24141950	RPH3AL	749	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	438529	438886	438717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	119901	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	505873	506062	505986	Y	VPS53	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	52725	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.88438442310341
chr17	851603	851932	851829	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	29078	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	872261	872610	872409	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	8400	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	990722	991295	990801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM22	92365	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr17	1171565	1171808	1171610	Y	WDR81,PITPNA,ABR,ABR	ABR	NA	NA	NA	NA	ABR	41250	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	1620806	1621089	1620895	Y	PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81	PRPF8,WDR81,MIR22HG	NA	NA	NA	NA	MIR22HG	2338	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	DPH1,OVCA2	NA	NA	NA	NA	OVCA2	9740	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.37046139862066
chr17	2300026	2300553	2300288	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	1859	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	2302108	2302510	2302261	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	NA	NA	NA	NA	NA	MNT	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	2385753	2385870	2385809	Y	SMG6,SMG6,MNT,RAP1GAP2,METTL16	METTL16	SGSM2,MNT	IMR90	Hi-C	24141950	METTL16	27315	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	3600340	3600752	3600646	Y	NA	TAX1BP3,P2RX5-TAX1BP3,P2RX5,GSG2	NA	NA	NA	NA	P2RX5	2642	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	3791812	3792145	3792008	Y	GSG2	C17orf85,CAMKK1	NA	NA	NA	NA	CAMKK1	4040	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	4205148	4205753	4205440	Y	P2RX1,ATP2A3,ZZEF1,ZMYND15,ZMYND15,SMTNL2,SMTNL2,ARRB2,UBE2G1	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39874	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	6814987	6815378	6815170	Y	DLG4	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	59807	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	7737438	7738736	7737971	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	20328	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	18450	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.88438442310341
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	13194	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.54176907344824
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	12120	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	3.9400765210344
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	11508	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	14.5611523603445
chr17	8029074	8029494	8029268	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	HES7	3664	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	HES7	4224	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	6.50969164344814
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr17	8830714	8831256	8830917	Y	NDEL1,PIK3R5,PIK3R5	PIK3R5	NA	NA	NA	NA	PIK3R5	35773	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	8850448	8850862	8850791	Y	PIK3R5,PIK3R5	PIK3R5	NA	NA	NA	NA	PIK3R5	16167	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	8869986	8870720	8870441	Y	PIK3R5,PIK3R5	PIK3R5	NA	NA	NA	NA	PIK3R5	2957	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	9720284	9720569	9720567	Y	GAS7	GLP2R	USP43,GLP2R	IMR90	Hi-C	24141950	GLP2R	2954	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	9731829	9732213	9732092	Y	NA	GLP2R	NA	NA	NA	NA	GLP2R	8306	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	9741106	9741641	9741382	Y	NA	GLP2R	RCVRN,GAS7	IMR90	Hi-C	24141950	GLP2R	17583	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	9772002	9772101	9772006	Y	NA	GLP2R	NA	NA	NA	NA	GLP2R	48479	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr17	13575065	13575361	13575332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	71821	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	3.9400765210344
chr17	14105008	14105251	14105153	Y	COX10,HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	97149	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	15393997	15394379	15394217	Y	PMP22,FAM18B2	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA74	80954	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	15849102	15849709	15849209	Y	ZSWIM7,TTC19,ADORA2B	ADORA2B	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	2871	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	15925215	15925448	15925362	Y	ZNF286A,NCOR1	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	24184	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	16189250	16189597	16189494	Y	NCOR1,TRPV2	NA	NA	NA	NA	NA	CENPV	65373	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr17	16249780	16250130	16249956	Y	CENPV	CENPV,UBB	NA	NA	NA	NA	CENPV	4840	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	16319642	16320463	16320033	Y	NA	UBB,TRPV2	NA	NA	NA	NA	TRPV2	2786	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr17	16375722	16375971	16375775	Y	TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	17496	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr17	17439265	17439511	17439439	Y	NA	RASD1	NA	NA	NA	NA	RASD1	41556	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	17677876	17678068	17678030	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREBF1	60257	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	19656390	19656618	19656531	Y	MAPK7,MAPK7	ALDH3A1	NA	NA	NA	NA	ALDH3A1	6134	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr17	19913206	19913926	19913276	Y	ULK2,AKAP10	AKAP10,SPECC1	NA	NA	NA	NA	SPECC1	2549	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	20688064	20688832	20688343	Y	NA	OLA1P2,SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	2106	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr17	21002403	21002809	21002523	Y	KCNJ18	DHRS7B	USP22,C17orf103	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DHRS7B	21868	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr17	21314266	21314623	21314560	Y	NA	KCNJ12	NA	NA	NA	NA	KCNJ12	36757	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	21795425	21795556	21795487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C17orf51	319703	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	25571981	25572190	25572120	Y	LGALS9,WSB1	WSB1	WSB1,KSR1,MIR4522	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	46912	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	25572576	25572861	25572643	Y	WSB1	WSB1	WSB1,KSR1,MIR4522	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	46241	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	25659975	25660361	25659997	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40873	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	25680204	25680481	25680340	Y	LGALS9,WSB1	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61102	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.37046139862066
chr17	25794670	25794745	25794710	Y	NA	KSR1	TBC1D3P5,KSR1	IMR90	Hi-C	24141950	KSR1	13000	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	25816130	25816488	25816250	Y	WSB1,LGALS9	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	34460	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	26718724	26718918	26718801	Y	FOXN1,C17orf63,SEBOX,SARM1	POLDIP2,TMEM199,SARM1,VTN,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	SLC46A1	13297	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	26929593	26929935	26929764	Y	TIAF1,PHF12,FLOT2,UNC119	PIGS,ALDOC,SPAG5-AS1,SPAG5,SGK494,KIAA0100	NA	NA	NA	NA	SPAG5	5296	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	27072804	27073286	27072989	Y	TRAF4	PROCA1,RAB34,RPL23A,SNORD42B,SNORD42A,SNORD4B,NEK8,TLCD1,TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	3802	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	27129097	27129445	27129306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERAL1	50511	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	27473466	27473709	27473569	Y	NA	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	31721	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	27791459	27791862	27791696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4523	75779	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVI2B	237562	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr17	30723443	30723679	30723561	Y	NA	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	45600	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	30778136	30778420	30778202	Y	ZNF207	PSMD11,CDK5R1	NA	NA	NA	NA	PSMD11	8857	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	31159026	31159151	31159124	Y	NA	MYO1D	NA	NA	NA	NA	MYO1D	43044	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	32546346	32546705	32546474	Y	NA	NA	CCL2,CCL8,CCL13	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF830	739844	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	32936342	32936566	32936435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF830	349983	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	32940308	32940705	32940417	Y	TMEM132E	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF830	345844	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	33414530	33415581	33415167	Y	SLFN5,ZNF830,RFFL	RFFL,RAD51D	NA	NA	NA	NA	RFFL	192	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	33572314	33572864	33572356	Y	NA	SLFN5	NA	NA	NA	NA	SLFN5	4259	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr17	34045470	34045815	34045642	Y	NA	RASL10B	RASL10B	IMR90	Hi-C	24141950	RASL10B	10853	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	36571646	36572076	36571709	Y	C17orf96	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	10586	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	36859229	36859333	36859332	Y	NA	C17orf96,MLLT6,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	MLLT6	462	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	36907984	36908100	36908042	Y	NA	MLLT6,CISD3,PCGF2,PSMB3,PIP4K2B	NA	NA	NA	NA	PSMB3	995	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	37558786	37559227	37559071	Y	NA	FBXL20,MED1	NA	NA	NA	NA	FBXL20	2010	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	38264417	38264842	38264667	Y	WIPF2,RARA,RARA,NR1D1	MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	9439	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	39683248	39683750	39683386	Y	NA	KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	688	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	39802138	39802335	39802276	Y	NKIRAS2,NKIRAS2,DHX58,EIF1	EIF1	KRT19,KRT15	MCF7	ChIA-PET	22265404	EIF1	40802	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	39949517	39949745	39949566	Y	KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	8334	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr17	40464466	40464885	40464704	Y	STAT5A	STAT5B,STAT5A	NA	NA	NA	NA	STAT5A	26901	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	41162878	41163074	41162972	Y	TUBG1,CNTD1,NBR1,NBR1,ETV4	AARSD1,RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1	NA	NA	NA	NA	IFI35	6136	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.54176907344824
chr17	41796772	41797488	41797204	Y	TMUB2,TMEM106A,DHX8,DUSP3	NA	LOC100130581,MPP3,DUSP3,DHX8,ETV4,MEOX1,C17orf105,SOST,CD300LG,HDAC5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP3	56868	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	42173050	42173151	42173101	Y	TMEM101,G6PC3	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25919	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	42173326	42173627	42173470	Y	NA	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25443	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.22699977275857
chr17	42404001	42404290	42404282	Y	C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39	SLC25A39,GRN,FAM171A2	NA	NA	NA	NA	SLC25A39	3763	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	42634020	42634172	42634095	Y	TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2	FZD2	NA	NA	NA	NA	FZD2	1095	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1072C15.1	2016	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr17	43084352	43084694	43084637	Y	NA	C1QL1,NMT1	NA	NA	NA	NA	C1QL1	40913	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	43302645	43302970	43302880	Y	NA	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	5834	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	43303050	43303852	43303644	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	6239	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	43305165	43306978	43306453	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	8354	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.54176907344824
chr17	43385085	43385291	43385153	Y	HEXIM1,FMNL1,PLEKHM1,MAP3K14,ARHGAP27	MAP3K14	LOC100133991,FMNL1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K14	7123	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	44198056	44198387	44198212	Y	STH,KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	228308	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	44198532	44198560	44198547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	228784	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	44240473	44240874	44240856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	270725	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MAPT	374423	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.37046139862066
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr17	45983662	45984115	45983847	Y	CDK5RAP3	SP2,AC003665.1,PNPO	PNPO	IMR90	Hi-C	24141950	SP2	12146	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	46101351	46101579	46101379	Y	NA	COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	11813	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	46289129	46289412	46289274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX11	110410	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	46605931	46606242	46606161	Y	TTLL6,HOXB1	NA	NA	NA	NA	NA	HOXB6	74112	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	46644443	46644754	46644601	Y	HOXB9,HOXB8,HOXB6	HOXB6,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB6	35600	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	46696942	46697254	46696999	Y	NA	HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17	NA	NA	NA	NA	HOXB9	4585	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF652	167326	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	PPP1R9B,COL1A1	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr17	48367346	48367814	48367643	Y	PPP1R9B	TMEM92	NA	NA	NA	NA	TMEM92	20579	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	48716257	48716537	48716480	Y	NA	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	6119	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr17	48726648	48726741	48726695	Y	NA	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	16510	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr17	48942663	48943085	48943016	Y	NA	TOB1	NA	NA	NA	NA	TOB1	254	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	3.08353814689649
chr17	49027288	49027482	49027366	Y	NA	RP11-700H6.1	NA	NA	NA	NA	RP11-700H6.1	7214	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr17	53006732	53007120	53006925	Y	NA	TOM1L1,STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	TOM1L1	31984	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	53810067	53810185	53810125	Y	NA	TMEM100,PCTP	NA	NA	NA	NA	TMEM100	2585	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	55740175	55740776	55740501	Y	MSI2,MSI2,DYNLL2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	184641	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	55912487	55912699	55912681	Y	NA	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	12718	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	56587640	56587744	56587729	Y	PPM1E,DYNLL2,MKS1,SEPT4,MTMR4	MTMR4	NA	NA	NA	NA	MTMR4	5522	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr17	57046055	57046358	57046140	Y	SEPT4	NA	NA	NA	NA	NA	AC099850.1	135601	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	57048474	57048847	57048688	Y	YPEL2	NA	NA	NA	NA	NA	AC099850.1	133112	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	57511883	57511981	57511933	Y	YPEL2	NA	YPEL2,GDPD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-13P	100879	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	57863159	57864676	57863979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	51951	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr17	57904186	57904344	57904253	Y	VMP1,CA4	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	12283	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	57962596	57962816	57962625	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	TUBD1	5488	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr17	58468371	58468697	58468395	Y	BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,USP32	USP32	NA	NA	NA	NA	USP32	29134	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	58804933	58805128	58805031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAS3	52119	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	59329573	59329874	59329791	Y	NACA2	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	145383	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	59337920	59337981	59337951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	137276	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	59434096	59434461	59434196	Y	NA	TBX2	NA	NA	NA	NA	TBX2	40796	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	59473194	59473360	59473229	Y	NA	TBX2	NA	NA	NA	NA	TBX2	1897	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	59956289	59956463	59956377	Y	NA	BRIP1,INTS2	BRIP1	IMR90	Hi-C	24141950	BRIP1	17407	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	60085676	60086036	60086030	Y	NACA2,MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	54607	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	60247601	60248070	60247921	Y	MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	106958	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.37046139862066
chr17	60780424	60780717	60780568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	77662	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	61356227	61356695	61356586	Y	MAP3K3,LIMD2	NA	MIR548W,MARCH10	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	165044	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	62159440	62159790	62159613	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	46389	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr17	62586168	62586194	62586181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMURF2	69992	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	63119249	63119621	63119552	Y	GNA13	RGS9	RGS9,GNA13,AMZ2P1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RGS9	11928	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	84165	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr17	64194072	64194322	64194164	Y	NA	CEP112	NA	NA	NA	NA	CEP112	7870	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr17	64646348	64646488	64646431	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG4	312538	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	64708077	64708220	64708107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG4	250806	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr17	64948296	64948612	64948339	Y	CACNG4	CACNG4	CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CACNG4	10414	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	65258633	65258801	65258718	Y	NA	HELZ,SNORA8	NA	NA	NA	NA	SNORA8	6784	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	65386872	65387224	65386898	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	15297	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	65389377	65389540	65389482	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	17802	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr17	65418011	65418377	65418257	Y	HELZ,PSMD12,PITPNC1,BPTF	PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	46436	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr17	65437128	65437554	65437154	Y	HELZ,PITPNC1,BPTF	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	65553	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	65471347	65471548	65471437	Y	HELZ,PITPNC1,BPTF	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	99772	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr17	65471645	65472025	65471701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	100070	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	65477756	65478333	65478203	Y	HELZ,PSMD12	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	106181	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	65485462	65485785	65485684	Y	HELZ,BPTF	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	113887	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	65487114	65487504	65487449	Y	HELZ,PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	115539	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	66282999	66283385	66283192	Y	NA	AMZ2,ARSG,SLC16A6	NA	NA	NA	NA	SLC16A6	2023	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	66301406	66301537	66301464	Y	BPTF,SLC16A6	ARSG,SLC16A6	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC16A6	15998	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	66308597	66309089	66308898	Y	BPTF,PRKAR1A,PRKAR1A,SLC16A6	SLC16A6	NA	NA	NA	NA	SLC16A6	23189	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	66311166	66311345	66311242	Y	BPTF,PRKAR1A,PRKAR1A,SLC16A6	SLC16A6	NA	NA	NA	NA	SLC16A6	25758	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	66315636	66315845	66315767	Y	BPTF,SLC16A6	SLC16A6	NA	NA	NA	NA	SLC16A6	30228	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	66374219	66374806	66374507	Y	SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	76848	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.37046139862066
chr17	66374808	66375131	66375016	Y	SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	76523	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	3.76876884620682
chr17	66376984	66377775	66377396	Y	NA	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	73879	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr17	66379549	66379922	66379702	Y	SLC16A6,WIPI1	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	71732	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr17	66382740	66382853	66382787	Y	NA	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	68801	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	66456929	66457226	66456998	Y	NA	WIPI1,PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	WIPI1	5275	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	66509186	66509763	66509535	Y	SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A	PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	PRKAR1A	3265	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr17	66694330	66694724	66694542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAR1A	188409	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	67172740	67173121	67172931	Y	NA	ABCA6	NA	NA	NA	NA	ABCA6	36711	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	68869215	68869451	68869336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ2	706401	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	70403681	70403886	70403813	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	217484	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	70417215	70417683	70417549	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	203687	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr17	70423161	70423493	70423326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	197877	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	70442621	70442708	70442666	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	178662	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	70461830	70461987	70461862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	159383	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	70706379	70706638	70706553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	85009	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	71139042	71139706	71139380	Y	NA	COG1	SLC39A11,COG1	IMR90	Hi-C	24141950	COG1	47423	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	71227425	71227646	71227536	Y	NA	COG1,C17orf80,FAM104A	NA	NA	NA	NA	C17orf80	1053	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	71439964	71440055	71440021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	133650	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	72247418	72247796	72247504	Y	NA	RPL38,TTYH2	NA	NA	NA	NA	TTYH2	39765	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	72532761	72533135	72532770	Y	TTYH2,TTYH2,CD300A,TMEM104,CD300LF,CD300E,CD300LB,CD300LD,CD300C	NA	NA	NA	NA	NA	GPRC5C	113771	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	72565404	72566131	72565833	Y	TTYH2,TTYH2,CD300A,TMEM104,CD300LF,CD300E,CD300LB,CD300C,CD300LD	NA	NA	NA	NA	NA	GPRC5C	146414	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	72596633	72597034	72596924	Y	TTYH2,CD300A,TMEM104,CD300LF,CD300E,CD300LB,CD300C,CD300LD	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	145757	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	72686594	72686880	72686692	Y	TTYH2,CD300A,CD300LB,CD300C,CD300LD,TMEM104,SLC16A5,CD300E,CD300LF	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	55911	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr17	72984795	72985307	72985001	Y	RAB37,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	NA	NA	NA	NA	CDR2L	3068	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr17	73087456	73087829	73087515	Y	NA	ATP5H,SLC16A5,ARMC7,NT5C	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	5634	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr17	73091198	73091317	73091257	Y	TSEN54,LLGL2	SLC16A5,ARMC7,NT5C	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	9376	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	73120387	73120767	73120528	Y	GRB2,GRB2,CD300LF,HN1,HN1,SLC16A5,NT5C	SLC16A5,ARMC7,NT5C,HN1	NA	NA	NA	NA	NT5C	5123	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	73133469	73133809	73133510	Y	NA	ARMC7,NT5C,HN1,SUMO2	NA	NA	NA	NA	NT5C	7579	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	73167917	73168048	73167983	Y	NA	NT5C,HN1,SUMO2,NUP85	HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HN1	5541	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	73891396	73891618	73891569	Y	NA	WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1	NA	NA	NA	NA	TRIM65	312	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	74248222	74248574	74248373	Y	ST6GALNAC2,RHBDF2,RHBDF2,JMJD6,H3F3B,UNC13D,WBP2,ACOX1,SPHK1,FAM100B	ATF4P3,RNF157	RNF157	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNF157	13768	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr17	74264426	74264836	74264522	Y	NA	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	RNF157	29972	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	74440987	74441354	74441087	Y	NA	UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	5934	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	75120383	75120864	75120582	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	39585	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr17	75281811	75282557	75281917	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201013	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr17	75282703	75283463	75282995	Y	SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201905	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	75284936	75285118	75285041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	204138	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	75318206	75318391	75318316	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	237408	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	75318595	75318736	75318679	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	237797	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	75319028	75319523	75319372	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	238230	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	75319670	75320031	75319742	Y	MGAT5B,SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	238872	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr17	75872051	75872295	75872261	Y	TMC6,SOCS3	RNU1-80P	NA	NA	NA	NA	RNU1-80P	41885	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	75882477	75882802	75882634	Y	TMC6,SOCS3,PGS1	RNU1-80P	NA	NA	NA	NA	RNU1-80P	31378	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	75883563	75884329	75884163	Y	TNRC6C,TMC8,TMC6,TMC6,SOCS3,PGS1	RNU1-80P	NA	NA	NA	NA	RNU1-80P	29851	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	RNU1-80P	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-80P	40213	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	7.02361466793088
chr17	76165603	76166001	76165654	Y	SYNGR2	TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	NA	NA	NA	NA	SYNGR2	2964	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	76255359	76255484	76255439	Y	NA	BIRC5	NA	NA	NA	NA	BIRC5	47092	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	76268764	76268973	76268872	Y	TNRC6C,TMC6,TMC8,TMC6,SOCS3,PGS1	NA	TK1,AFMID,CYTH1,TMC6,LOC100131096,TNRC6C,SOCS3,DNAH17,PGS1	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC5	60497	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	76318991	76319257	76319075	Y	NA	SOCS3	NA	NA	NA	NA	SOCS3	34901	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	76330688	76331173	76330803	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	22985	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	76335027	76335218	76335120	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	18940	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr17	76337607	76338208	76338068	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	15950	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr17	76338337	76338836	76338651	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	15322	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr17	76347582	76348110	76347694	Y	SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	6048	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr17	76348964	76349371	76349046	Y	USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4787	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	76349549	76349649	76349633	Y	NA	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4509	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	76356993	76357093	76357047	Y	SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	2835	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr17	76357167	76357466	76357379	Y	NA	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	3009	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.05569209793099
chr17	76360667	76361291	76360957	Y	NA	SOCS3,PGS1	PGS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOCS3	6509	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	76384421	76384943	76384751	Y	USP36,CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	11700	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	76438570	76439399	76439026	Y	USP36,CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	NA	PGS1	65849	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	76614590	76614700	76614637	Y	NA	NA	CYTH1,DNAH17	IMR90	Hi-C	24141950	CYTH1	161679	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	76731686	76732147	76732043	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	CYTH1	NA	NA	NA	NA	CYTH1	44232	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	76744782	76745072	76745044	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	CYTH1	NA	NA	NA	NA	CYTH1	31307	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	76801462	76801678	76801575	Y	DNAH17,USP36,CYTH1	CYTH1,USP36	NA	NA	NA	NA	CYTH1	25083	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	76879007	76879631	76879400	Y	CYTH1,ENGASE,CANT1,USP36	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39838	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	77730841	77731207	77731024	Y	CBX8,CBX2	CBX2,CBX8	NA	NA	NA	NA	CBX2	18724	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr17	77778056	77778248	77778123	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	4574	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr17	77967532	77967765	77967641	Y	CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	39882	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.37046139862066
chr17	78087852	78088239	78088062	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	GAA	14497	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	41238	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.71307674827583
chr17	78763390	78763671	78763525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	199727	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	78800697	78801105	78800867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	162293	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	78803936	78804105	78804080	Y	AATK	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	159293	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	78830209	78830686	78830492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	132712	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	LINC00482	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00482	38277	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.54176907344824
chr17	79360408	79361324	79361141	Y	ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00482	79360	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	79368790	79369424	79369000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00482	87742	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	79375864	79375954	79375909	Y	DYSFIP1,BAHCC1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00482	94816	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	79886802	79887109	79886903	Y	NA	ANAPC11,ALYREF,NPB,PCYT2,SIRT7,MAFG,MAFG-AS1,PYCR1,ASPSCR1	NA	NA	NA	NA	MAFG-AS1	3097	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.71307674827583
chr17	80188750	80189250	80189000	Y	NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	SLC16A3	4477	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	80255299	80255755	80255478	Y	SIRT7,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7	CSNK1D,SECTM1	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	25692	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr17	80255798	80256475	80256187	Y	SIRT7,MAFG,MAFG,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,HEXDC,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7	CSNK1D,SECTM1	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	26191	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	80817363	80817528	80817446	Y	HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF,NARF	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	109423	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr17	81063257	81063563	81063336	Y	NA	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	27690	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	10894	11221	11019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROCK1P1	95844	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	228420	228816	228694	Y	THOC1	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	37234	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	9843	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr18	668283	668526	668405	Y	THOC1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11943	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr18	711356	711474	711397	Y	ENOSF1,ENOSF1	ENOSF1	NA	NA	NA	NA	ENOSF1	680	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	1192820	1193070	1192907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP72	129016	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr18	2031840	2031857	2031849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	537651	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	2223503	2223515	2223509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	345993	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	2515543	2515690	2515617	Y	EMILIN2	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	53818	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	2516331	2516615	2516492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	52893	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr18	3250721	3251122	3250738	Y	NA	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12A	5242	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	3594733	3596177	3595596	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	185127	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	3623872	3624258	3624140	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214266	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr18	3624338	3624601	3624482	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214732	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	3624841	3625119	3625035	Y	MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215235	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr18	3661317	3661540	3661407	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	251711	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	5463205	5463732	5463541	Y	EPB41L3	NA	NA	NA	NA	NA	EPB41L3	164967	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr18	5542461	5543034	5542604	Y	EPB41L3	NA	NA	NA	NA	NA	EPB41L3	85665	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.88438442310341
chr18	5582937	5583209	5583037	Y	NA	EPB41L3	NA	NA	NA	NA	EPB41L3	45490	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	5629750	5630120	5629929	Y	NA	EPB41L3	NA	NA	NA	NA	EPB41L3	1051	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr18	5895274	5895803	5895585	Y	TMEM200C	NA	L3MBTL4	IMR90	Hi-C	24141950	EPB41L3	266575	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.9122304720689
chr18	6056483	6056866	6056675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	L3MBTL4	356370	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	6193210	6193559	6193391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	L3MBTL4	219677	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	7048074	7048376	7048212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAMA1	67437	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr18	7273554	7273981	7273852	Y	NA	SNORA48	PTPRM	IMR90	Hi-C	24141950	SNORA48	25170	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr18	9548277	9548390	9548335	Y	ANKRD12,VAPA,RAB31,PPP4R1	NA	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	64848	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	9711641	9712077	9711750	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	RAB31	NA	NA	NA	NA	RAB31	5479	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	9742137	9742641	9742378	Y	NA	RAB31	TXNDC2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB31	35975	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr18	9743544	9744009	9743684	Y	VAPA,RAB31	RAB31	NA	NA	NA	NA	RAB31	37382	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr18	9753891	9754160	9754063	Y	VAPA,RAB31	RAB31	NA	NA	NA	NA	RAB31	47729	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	9829152	9829470	9829321	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	82529	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	9849459	9849859	9849589	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	62140	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.74092279724132
chr18	10528233	10528593	10528264	Y	NA	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	4331	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	10708268	10708433	10708298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	184366	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr18	11849903	11850727	11850169	Y	MPPE1,CHMP1B	CHMP1B	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	508	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr18	11859926	11860218	11860181	Y	CHMP1B	CHMP1B,MPPE1	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	10531	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.39830744758616
chr18	11947272	11947721	11947412	Y	CHMP1B	MPPE1,IMPA2	IMPA2,GNAL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IMPA2	31303	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr18	12059774	12060081	12059918	Y	NA	NA	GNAL,IMPA2	IMR90	Hi-C	24141950	IMPA2	80750	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	12092408	12092760	12092594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMPA2	113384	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	12330841	12331244	12331045	Y	NA	TUBB6,AFG3L2	NA	NA	NA	NA	TUBB6	25173	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	12606965	12607268	12607096	Y	PTPN2,SPIRE1	AP005482.1,SPIRE1,PSMG2	NA	NA	NA	NA	AP005482.1	48774	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	13377550	13377830	13377662	Y	RNMT,PTPN2,C18orf1	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	346829	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	13824016	13824345	13824089	Y	MC5R	NA	NA	NA	NA	NA	FAM210A	99354	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	19397108	19397142	19397125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIB1	114190	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	19453532	19453543	19453538	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIB1	170614	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	21562247	21562750	21562607	Y	NA	TTC39C	TTC39C	IMR90	Hi-C	24141950	TTC39C	7987	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr18	28786845	28787168	28787084	Y	DSC3,DSC2,DSG3,DSG2,DSG1,DSC1	NA	DSC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	DSC2	106467	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	29542474	29542964	29542885	Y	RNF138	TRAPPC8	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	11375	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr18	29897352	29897676	29897515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138	227534	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	32289089	32289403	32289194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNA	217835	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	32436094	32436130	32436112	Y	DTNA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	118762	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	33844964	33845139	33845043	Y	NA	FHOD3	NA	NA	NA	NA	FHOD3	30538	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	34215471	34215669	34215572	Y	FHOD3	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1328	191400	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr18	42305633	42305950	42305768	Y	SETBP1	SETBP1	NA	NA	NA	NA	SETBP1	47495	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	43578353	43578485	43578413	Y	SLC14A2,RNF165	EPG5	NA	NA	NA	NA	EPG5	33113	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	44394118	44394485	44394384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KATNAL2	100970	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	44675442	44676177	44675810	Y	NA	HDHD2,IER3IP1	NA	NA	NA	NA	HDHD2	551	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr18	45444466	45444807	45444662	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	10708	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	45454827	45455289	45455128	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	226	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr18	45529364	45529594	45529519	Y	NA	NA	SMAD2,ZBTB7C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD2	73849	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	45534549	45534809	45534718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	79034	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	45541725	45542128	45542097	Y	SMAD2,SMAD2	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	86210	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	46066779	46067121	46067052	Y	CTIF	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	3362	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr18	46130104	46130567	46130233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	66687	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	46242460	46242735	46242629	Y	SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	179043	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	46253142	46253362	46253168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	189725	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	46254756	46255278	46254982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	191339	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	46297484	46297823	46297654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	234067	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	46308878	46309205	46308934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	245461	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	46354445	46354549	46354497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	291028	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	46382446	46382625	46382534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	319029	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	46502180	46502412	46502333	Y	SMAD7	NA	SMAD7,CTIF	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CTIF	438763	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	46740928	46741364	46741195	Y	DYM	NA	NA	NA	NA	NA	DYM	244353	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	47252630	47252839	47252704	Y	LIPG	NA	ACAA2,SCARNA17,MYO5B,LIPG	IMR90	Hi-C	24141950	ACAA2	85491	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr18	47620136	47620367	47620252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO5B	99096	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	47834587	47834811	47834691	Y	NA	CCDC11,MBD1,CXXC1	CCDC11,CXXC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CXXC1	21913	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	48737977	48738244	48738154	Y	ME2	MEX3C	MEX3C	K562	ChIA-PET	22265404	MEX3C	4430	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	51883843	51884006	51883925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLI	90069	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	52613483	52613779	52613741	Y	NA	CCDC68	NA	NA	NA	NA	CCDC68	10960	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	53180110	53180413	53180343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	149605	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	54384245	54384484	54384365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL1	67414	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	54672062	54672240	54672149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL1	355231	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	55102016	55102207	55102112	Y	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	NA	FECH	149797	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	56032271	56032718	56032513	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	233145	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	56161690	56161866	56161857	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	103997	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr18	56192839	56193142	56192990	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	72721	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	56193191	56193601	56193321	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	72262	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	56208933	56209328	56209119	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	56535	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr18	56293090	56293297	56293189	Y	ALPK2	SNORD28,ALPK2,MALT1	NA	NA	NA	NA	ALPK2	892	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr18	56325382	56325774	56325680	Y	MALT1	ALPK2,MALT1	ALPK2,MALT1	IMR90	Hi-C	24141950	MALT1	10844	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	56499009	56499169	56499089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALT1	162391	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	56672148	56672229	56672220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC11C	132480	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	60118389	60118639	60118544	Y	KIAA1468,ZCCHC2	NA	PHLPP1,ZCCHC2	IMR90	Hi-C	24141950	ZCCHC2	69601	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	60172936	60173272	60173091	Y	NA	ZCCHC2	ZCCHC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZCCHC2	14968	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	60189219	60189514	60189362	Y	TNFRSF11A,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	979	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr18	60609893	60610245	60610069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLPP1	229221	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	60904218	60904684	60904493	Y	VPS4B	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	80677	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	61350519	61350880	61350698	Y	SERPINB5,SERPINB12,SERPINB3,SERPINB11	SERPINB11	SERPINB10,SERPINB7	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINB11	37706	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.54176907344824
chr18	61642248	61642613	61642430	Y	NA	HMSD,SERPINB8	NA	NA	NA	NA	SERPINB8	7089	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr18	67602629	67602968	67602766	Y	RTTN,CD226	CD226	NA	NA	NA	NA	CD226	24071	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	67616100	67616494	67616353	Y	CD226	CD226	NA	NA	NA	NA	CD226	10545	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	67957012	67957306	67957264	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	2875	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	68004496	68004658	68004562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS6	50359	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	72683878	72684340	72684028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	234963	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	72779013	72779193	72779110	Y	ZNF407,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	140110	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	73233894	73234003	73233962	Y	C18orf62	NA	ZNF407	IMR90	Hi-C	24141950	TSHZ1	313184	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	74194351	74194716	74194640	Y	NA	ZNF516,RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	10430	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	74204839	74205357	74205296	Y	NA	RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	74277239	74277430	74277301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	71762	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr18	74399023	74399139	74399084	Y	NA	NA	LOC284276,ZNF516	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF236	133424	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	74755425	74755811	74755618	Y	MBP,MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	222862	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	74767033	74767545	74767189	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	234470	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	74773141	74773504	74773389	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	240578	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	74775208	74775557	74775363	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	242645	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	74779066	74780013	74779875	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	246503	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	74793525	74793679	74793600	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	260962	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	74803559	74803662	74803615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	270996	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr18	74829789	74830209	74830033	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	297226	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	74830215	74830809	74830560	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	297652	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	77153646	77154504	77153944	Y	ATP9B,NFATC1,NFATC1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr18	77551694	77552094	77551810	Y	PQLC1,CTDP1	NA	KCNG2,PQLC1,CTDP1,RBFA,TXNL4A	IMR90	Hi-C	24141950	CTDP1	113893	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr19	289700	289869	289784	Y	C2CD4C,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	307	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	290136	290651	290316	Y	RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	743	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr19	488227	488667	488380	Y	NA	SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34	ODF3L2,SHC2,TPGS1,MADCAM1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	MADCAM1	1051	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	751766	752111	751822	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PALM,PTBP1	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42964	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr19	753188	753320	753238	Y	C19orf20	PALM,PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	41755	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr19	778993	779222	779048	Y	GPX4,BSG,CNN2	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	15853	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	782330	783005	782707	Y	NA	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	12070	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	9.59322979034462
chr19	958944	959162	959060	Y	NA	R3HDM4,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	WDR18	22012	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr19	1169743	1170349	1170015	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1933	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.54176907344824
chr19	1240232	1240534	1240365	Y	MUM1,APC2,C19orf26	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	ATP5D	483	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	1260732	1261171	1260912	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3348	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr19	1262305	1262850	1262469	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	4921	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.05569209793099
chr19	1408607	1408695	1408655	Y	CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3039	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	1855247	1855761	1855485	Y	SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	5806	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr19	1942393	1942508	1942451	Y	OAZ1,DOT1L,C19orf35,MOBKL2A,MKNK2,REXO1,KLF16,CSNK1G2	SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2	NA	NA	NA	NA	CSNK1G2	3205	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	2056461	2056895	2056707	Y	OAZ1,C19orf35,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	7218	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	2059605	2060167	2060113	Y	REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	10362	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.37046139862066
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	2165096	2165788	2165320	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	2632	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	2168320	2168637	2168529	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	5856	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	2507206	2507458	2507335	Y	DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B	GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	33086	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr19	2540691	2541097	2540881	Y	TIMM13	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	66571	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	2543618	2543970	2543682	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	69498	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	3360896	3361804	3361247	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	3335	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	3367171	3367852	3367502	Y	NFIC,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	9610	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	3369394	3369884	3369615	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	11833	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	3671007	3671294	3671202	Y	NFIC,MAP2K2,EEF2,PIP5K1C,APBA3	PIP5K1C	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	27183	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	4052414	4052757	4052628	Y	CCDC94,ZBTB7A	PIAS4,ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	12186	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	4057405	4058198	4058044	Y	CCDC94,ZBTB7A	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	6745	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	4064154	4064453	4064218	Y	SEMA6B,MATK	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	490	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	4089074	4089290	4089084	Y	NA	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	24131	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	4393849	4394251	4394129	Y	NA	SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	4293	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	4456385	4456784	4456737	Y	UBXN6,UBXN6	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	566	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	4620862	4621172	4621017	Y	NA	C19orf10	NA	NA	NA	NA	C19orf10	47210	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	5339517	5339797	5339748	Y	HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,PTPRS	PTPRS	NA	NA	NA	NA	PTPRS	703	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	5968077	5968307	5968208	Y	NA	RANBP3	NA	NA	NA	NA	RANBP3	7846	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	6063576	6063994	6063809	Y	RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	87423	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	6228782	6229121	6229035	Y	NA	RFX2,MLLT1	NA	NA	NA	NA	RFX2	31199	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	6271729	6272422	6272353	Y	NDUFA11,MLLT1	MLLT1	NA	NA	NA	NA	MLLT1	5537	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	6273754	6274259	6273940	Y	VAV1,GPR108,DENND1C,RFX2,MLLT1	MLLT1	NA	NA	NA	NA	MLLT1	3700	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr19	6516969	6517178	6517079	Y	NA	TUBB4A,TNFSF9	TNFSF9	K562	ChIA-PET	22265404	TNFSF9	11832	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	6539979	6540238	6540076	Y	NA	TUBB4A,TNFSF9	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	10969	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	6587274	6587651	6587637	Y	DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70	CD70	NA	NA	NA	NA	CD70	14463	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	6588388	6589226	6588715	Y	NA	CD70	NA	NA	NA	NA	CD70	12888	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	6594143	6594234	6594202	Y	NA	CD70	NA	NA	NA	NA	CD70	7880	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	6668609	6668941	6668849	Y	DENND1C,ZNF557,VAV1,GPR108,EMR1,TNFSF14	NA	NA	NA	NA	NA	C3	59632	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	6801116	6801467	6801221	Y	SH2D3A,VAV1	SH2D3A	NA	NA	NA	NA	SH2D3A	35517	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	8051436	8051456	8051449	Y	NA	TIMM44,ELAVL1	NA	NA	NA	NA	ELAVL1	17087	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	8115456	8115774	8115631	Y	PRAM1,STXBP2,C19orf59	ELAVL1	NA	NA	NA	NA	ELAVL1	46913	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	9783821	9783976	9783959	Y	NA	ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	45	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr19	9937602	9937876	9937738	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	UBL5	1034	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	9974094	9974487	9974263	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	PIN1	30161	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	10516279	10516445	10516385	Y	P2RY11,ICAM1,ICAM3,C19orf38,TYK2,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	4065	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	10523082	10523284	10523181	Y	C19orf66,ICAM3,S1PR5,S1PR5,ATG4D,TYK2	TYK2,MIR1181	CDC37	K562	ChIA-PET	22265404	MIR1181	10868	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	10988040	10988081	10988060	Y	NA	TMED1,CARM1,YIPF2,C19orf52	NA	NA	NA	NA	CARM1	7851	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.22699977275857
chr19	12896870	12897372	12897198	Y	ZNF44,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,STX10,LYL1,DNASE2,JUNB	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	2938	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	12899457	12901460	12900777	Y	NA	PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr19	13238145	13238217	13238180	Y	NA	LYL1,TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	11228	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr19	13273540	13274187	13273840	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	14311	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr19	13275397	13275802	13275486	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	16168	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	13278382	13278991	13278445	Y	BEST2,JUNB,LYL1,STX10	STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	19153	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	13944151	13944331	13944193	Y	CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4	ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	39877	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	13957204	13959386	13957586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	52930	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr19	14229419	14229865	14229637	Y	CCDC130,ZSWIM4,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,DDX39A,CD97	SAMD1,PRKACA,ASF1B	NA	NA	NA	NA	PRKACA	2523	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	14249278	14249642	14249460	Y	NA	SAMD1,PRKACA,ASF1B	NA	NA	NA	NA	ASF1B	3510	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	14616908	14617174	14617017	Y	GIPC1	PTGER1,GIPC1,TECR,DNAJB1	GIPC1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TECR	8723	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	15333627	15333747	15333631	Y	SYDE1,NOTCH3	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	23835	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	16181046	16181841	16181607	Y	OR10H2,OR10H3,OR10H4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	5215	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr19	16442138	16442160	16442149	Y	NA	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	8510	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	16477143	16477842	16477298	Y	MED26,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	43515	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr19	16482225	16482879	16482589	Y	MED26,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	48597	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	17791017	17791370	17791235	Y	MAP1S,IFI30,ARRDC2,ARRDC2	UNC13A,MAP1S	NA	NA	NA	NA	UNC13A	6031	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	18133045	18133309	18133130	Y	FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2	NA	NA	NA	NA	NA	KCNN1	72943	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr19	18155923	18156099	18156029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAST3	50504	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	18162301	18162691	18162523	Y	NA	MAST3	NA	NA	NA	NA	MAST3	43912	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	18214987	18215493	18215283	Y	NA	MAST3,PIK3R2	NA	NA	NA	NA	MAST3	8384	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	18402387	18403564	18402535	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	11500	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	18415031	18416060	18415513	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	16024	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	18526337	18526644	18526408	Y	CCDC124,IFI30,KLHL26,CRLF1,C19orf60,C19orf50,SSBP4	GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	SSBP4	1030	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	18527231	18527472	18527362	Y	LSM4,SSBP4,ISYNA1,ISYNA1	GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	SSBP4	202	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr19	18527701	18528040	18527800	Y	KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	SSBP4	27	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	18760748	18761152	18761048	Y	COMP,CRLF1	TMEM59L,CRLF1,KLHL26,CRTC1	NA	NA	NA	NA	KLHL26	14973	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	18761338	18761719	18761657	Y	TMEM161A,COPE,COMP,CRLF1,KLHL26	TMEM59L,CRLF1,KLHL26,CRTC1	NA	NA	NA	NA	KLHL26	15563	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr19	18768622	18768973	18768794	Y	KIAA1683	KLHL26,CRTC1	NA	NA	NA	NA	KLHL26	22847	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr19	19192588	19193136	19192878	Y	NA	SUGP2,SLC25A42	NA	NA	NA	NA	SLC25A42	19780	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	19248225	19248392	19248286	Y	NA	TMEM161A	NA	NA	NA	NA	TMEM161A	903	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	19488658	19488936	19488750	Y	NA	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	5699	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr19	28217479	28217822	28217621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1484626	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	28219787	28220540	28220091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1481908	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	30447917	30448294	30448014	Y	NA	URI1	NA	NA	NA	NA	URI1	35366	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr19	31841682	31842327	31842237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF507	992173	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	33668108	33668528	33668227	Y	SLC7A10,LRP3	LRP3	NA	NA	NA	NA	LRP3	1599	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	34625713	34625998	34625854	Y	PDCD2L	LSM14A	CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	LSM14A	35411	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	34850085	34850642	34850351	Y	ZNF599,ZNF302,ZNF181	GPI,PDCD2L	NA	NA	NA	NA	GPI	1700	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	34874880	34875495	34875019	Y	NA	GPI,PDCD2L,UBA2	NA	NA	NA	NA	PDCD2L	17794	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr19	36618643	36619171	36618835	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	9306	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	36863070	36863255	36863179	Y	NA	ZFP14,ZFP82	NA	NA	NA	NA	ZFP14	4846	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	37322216	37322466	37322299	Y	ZFP14,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF829,ZNF829,ZNF585B,ZNF568,ZNF420,ZNF383,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345	ZNF345,ZNF790	NA	NA	NA	NA	ZNF345	16797	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	39148533	39148920	39148613	Y	C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12244	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	39167742	39168127	39167771	Y	NA	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	31453	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	39175000	39175365	39175141	Y	NFKBIB,HNRNPL,EIF3K	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	38711	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr19	39184148	39184440	39184342	Y	C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	47859	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr19	39411140	39411539	39411467	Y	LGALS7	RINL,NFKBIB,SIRT2,MRPS12,SARS2	NA	NA	NA	NA	MRPS12	7649	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr19	39627416	39627544	39627474	Y	NA	PAK4	NA	NA	NA	NA	PAK4	13006	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.71307674827583
chr19	39919610	39919819	39919723	Y	NA	PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H,TIMM50	NA	NA	NA	NA	RPS16	4769	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	39921308	39921946	39921495	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H,TIMM50	NA	NA	NA	NA	RPS16	2642	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr19	41108162	41108528	41108432	Y	NA	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	11373	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	41152132	41152466	41152220	Y	NA	NUMBL	NA	NA	NA	NA	NUMBL	42411	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	41731541	41731893	41731762	Y	NA	AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	8433	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	41831643	41832527	41831971	Y	CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA	NA	NA	NA	NA	CCDC97	17549	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83703	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr19	42037922	42038313	42037990	Y	CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1	NA	LOC100505495	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	93300	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr19	42444277	42444712	42444407	Y	POU2F2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1	RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	16830	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	42514619	42514744	42514681	Y	ATP1A3	ATP1A3	NA	NA	NA	NA	ATP1A3	14970	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	ERF	14986	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	ERF	15495	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr19	42774379	42774759	42774668	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC	GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	ERF	17070	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	ERF	18683	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,MEGF8	NA	NA	NA	NA	PRR19	19259	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr19	44287065	44287299	44287223	Y	NA	SMG9,KCNN4,LYPD5,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	3656	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	44288540	44288860	44288798	Y	NA	SMG9,KCNN4,LYPD5,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	5131	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr19	44711538	44711905	44711597	Y	NA	ZNF226,ZNF227	NA	NA	NA	NA	ZNF227	1838	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr19	45228436	45228775	45228695	Y	IGSF23,RELB,APOE,APOC4,APOC2,BCL3	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	20187	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	45248499	45249479	45248793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL3	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	45755637	45756189	45755812	Y	RELB,CLASRP,VASP	NA	NA	NA	NA	NA	BLOC1S3	75634	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	45945937	45946679	45946251	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	CD3EAP,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22574	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,FOSB,ERCC1,PPM1N	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr19	46665382	46665717	46665592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC61	169043	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr19	46683956	46684315	46684191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP5C	163936	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	134.476524739652
chr19	46877153	46877367	46877269	Y	NA	PPP5C	NA	NA	NA	NA	PPP5C	28902	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr19	47613231	47613789	47613256	Y	PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	742	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr19	47746329	47746738	47746506	Y	SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24	MIR3191,BBC3,CCDC9,C5AR1	NA	NA	NA	NA	CCDC9	10499	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	MIR3191,BBC3,CCDC9,C5AR1	NA	NA	NA	NA	C5AR1	14311	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	47792934	47793257	47793053	Y	NA	CCDC9,C5AR1	NA	NA	NA	NA	C5AR1	1654	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	48101913	48102072	48101991	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85416	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	48903013	48903207	48903134	Y	PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1	TMEM143,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10203	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	49092091	49092636	49092297	Y	BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11	SPHK2,RPL18,DBP	NA	NA	NA	NA	SPHK2	27912	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr19	49465555	49466264	49465736	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	294	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	49466802	49467527	49467169	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	244	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	49495555	49495708	49495609	Y	SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	850	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr19	49521043	49521282	49521101	Y	NA	GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	26338	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	49836983	49837445	49837293	Y	SNRNP70,IRF3,FLT3LG,FLT3LG,BCL2L12,ALDH16A1,CD37	CTC-301O7.4,TEAD2	NA	NA	NA	NA	CTC-301O7.4	4420	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	50872495	50872846	50872654	Y	NA	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	12615	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	50993276	50993671	50993522	Y	MYH14,MYBPC2	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	FAM71E1	15266	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	50993680	50994951	50994565	Y	NA	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	FAM71E1	15670	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	119534	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	52192842	52193550	52192951	Y	ZNF615,IGLON5,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	120291	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	52292213	52292705	52292413	Y	ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC12,SIGLEC14,FPR3,FPR1,FPR2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF613	135695	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	52586676	52587051	52586863	Y	NA	ZNF432,ZNF841	NA	NA	NA	NA	ZNF432	9940	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	53128477	53128840	53128754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF83	62909	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF347	67075	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr19	54465243	54465494	54465291	Y	TFPT,PRPF31,NDUFA3,MYADM,CACNG7,CACNG8	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG7	54654	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr19	55794552	55795020	55794712	Y	NA	PPP6R1,HSPBP1,BRSK1	NA	NA	NA	NA	BRSK1	3112	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr19	56117286	56117783	56117722	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	5950	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	56148080	56148375	56148228	Y	ZNF580	ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2,EPN1	NA	NA	NA	NA	CCDC106	2053	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	56621885	56622165	56622061	Y	NA	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	8484	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	56674605	56674737	56674681	Y	NA	ZNF787,ZNF444	GALP	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF444	32637	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	56796830	56796936	56796883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN5A	80816	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	57020241	57020583	57020445	Y	ZNF582,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF835,ZIM2,PEG3,PEG3,LOC147670,ZNF471,ZNF71,ZNF470,ZFP28	ZNF471	NA	NA	NA	NA	ZNF471	3029	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr19	58557282	58557656	58557471	Y	NA	ZNF606	NA	NA	NA	NA	ZNF606	44565	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr19	59087419	59087864	59087514	Y	NA	ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	MZF1	4477	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	3226904	3227345	3227045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	152308	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	3340825	3341028	3341010	Y	NA	TSSC1,TRAPPC12	NA	NA	NA	NA	TSSC1	38625	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	3483837	3484086	3483869	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	37421	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	3583560	3583858	3583796	Y	NA	AC108488.4,RNASEH1-AS1,RNASEH1,RPS7	NA	NA	NA	NA	AC108488.4	1097	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	7081985	7082191	7081999	Y	NA	RNF144A	NA	NA	NA	NA	RNF144A	26462	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	8872785	8872976	8872902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC011747.7	52792	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	9347909	9348072	9347942	Y	NA	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	3015	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	9374844	9375591	9375054	Y	YWHAQ,ASAP2	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	29950	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	9411571	9411694	9411610	Y	ADAM17	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	66677	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	9641378	9641587	9641543	Y	NA	IAH1	NA	NA	NA	NA	IAH1	29591	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	9705660	9705808	9705714	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	11739	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	10075100	10075410	10075131	Y	TAF1B	GRHL1	GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL1	7931	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	10258344	10258406	10258377	Y	NA	CYS1,RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	2049	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	CYS1	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr2	10423423	10423670	10423576	Y	NA	HPCAL1	RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPCAL1	17345	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	10425680	10425925	10425803	Y	HPCAL1	HPCAL1	HPCAL1,RRM2,C2orf48,MIR4261	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPCAL1	15090	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	10950898	10951279	10951023	Y	NA	PDIA6	ATP6V1C2	IMR90	Hi-C	24141950	PDIA6	24824	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	11531800	11532088	11531893	Y	NTSR2,KCNF1,C2orf50	ROCK2	ROCK2,PDIA6,PQLC3,KCNF1,FLJ33534,C2orf50,GREB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ROCK2	45344	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	11672394	11672952	11672719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	E2F6	68097	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	11970305	11970612	11970555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPIN1	154584	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	12633247	12633315	12633291	Y	NA	NA	TRIB2,LPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	221700	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	13793212	13793312	13793262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB2	938197	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	19547126	19547267	19547173	Y	NA	OSR1	NA	NA	NA	NA	OSR1	9147	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	19548078	19548301	19548191	Y	NA	OSR1	NA	NA	NA	NA	OSR1	8113	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	19986322	19986559	19986384	Y	TTC32	NA	NA	NA	NA	NA	TTC32	113188	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	20534195	20534238	20534216	Y	NA	PUM2	NA	NA	NA	NA	PUM2	15757	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	20795868	20796230	20795893	Y	RHOB,HS1BP3	NA	HS1BP3,RHOB,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	HS1BP3	52619	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	20811186	20811439	20811262	Y	NA	HS1BP3	NA	NA	NA	NA	HS1BP3	37410	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	21149421	21149424	21149423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf43	128539	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	21575338	21575411	21575375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf43	554456	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	23643689	23643801	23643697	Y	NA	KLHL29	NA	NA	NA	NA	KLHL29	37601	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	24324329	24324521	24324426	Y	NA	SF3B14,TP53I3,PFN4	NA	NA	NA	NA	TP53I3	17598	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	24552849	24553177	24552876	Y	NA	RPL36AP13,ITSN2	NA	NA	NA	NA	RPL36AP13	2204	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	24859370	24859696	24859496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPO	154309	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	25438901	25439135	25438983	Y	PTRHD1,ADCY3	POMC	NA	NA	NA	NA	POMC	49129	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	26220678	26220902	26220866	Y	RAB10	KIF3C,RAB10	ASXL2,RAB10,FAM59B,KIF3C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIF3C	17060	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr2	26235500	26235661	26235564	Y	RAB10	KIF3C,RAB10	FAM59B,KIF3C,RAB10,ASXL2,HADHA,HADHB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAB10	19315	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	26946934	26947339	26946998	Y	C2orf28,C2orf28,HADHA,HADHB,C2orf18	AC015977.5,KCNK3,CENPA	NA	NA	NA	NA	KCNK3	33315	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr2	27574731	27574755	27574743	Y	NA	MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3	NA	NA	NA	NA	AC074117.10	2358	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	27878874	27879165	27879028	Y	SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP	GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L	NA	NA	NA	NA	SLC4A1AP	5173	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	28492364	28492732	28492561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	120583	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	28496743	28497020	28496828	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	116295	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	28498872	28499304	28499073	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	114011	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	28632075	28632521	28632225	Y	PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	AC104695.3	16536	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	29026080	29026331	29026243	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1CB	53574	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	29331222	29331429	29331307	Y	NA	CLIP4	CLIP4	MCF7	ChIA-PET	22265404	CLIP4	12651	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	30489009	30489377	30489252	Y	YPEL5	LBH	NA	NA	NA	NA	LBH	36612	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	33111186	33111571	33111379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTBP1	58468	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	33435749	33436022	33435923	Y	FAM98A,LTBP1	NA	NA	NA	NA	NA	LTBP1	265710	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	33441691	33441836	33441744	Y	LTBP1	NA	NA	NA	NA	NA	LTBP1	271652	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	36761840	36762400	36762263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	108830	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	36790527	36791707	36791646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79523	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	37116938	37117262	37117216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	74353	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	37432341	37432705	37432523	Y	NA	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	24151	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	37489254	37489354	37489306	Y	NA	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	32398	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	37491311	37491687	37491498	Y	NA	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	34455	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	37603882	37604154	37604086	Y	QPCT	QPCT	NA	NA	NA	NA	QPCT	34165	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	37605671	37605839	37605750	Y	CCDC75,QPCT	QPCT	NA	NA	NA	NA	QPCT	35954	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.37046139862066
chr2	37622307	37622582	37622438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QPCT	52590	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	37789550	37789826	37789587	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	173785	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	37868257	37868517	37868387	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	95094	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	38323202	38323810	38323564	Y	CDC42EP3,CYP1B1	CYP1B1	CYP1B1,FAM82A1,CYP1B1-AS1,HNRPLL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CYP1B1	11234	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	38369402	38369882	38369670	Y	NA	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	34358	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	38384417	38384601	38384509	Y	NA	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	49373	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	39683895	39683929	39683912	Y	NA	MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	21442	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	40676285	40676532	40676459	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC8A1	159661	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	41997270	41997551	41997541	Y	PKDCC	NA	NA	NA	NA	NA	PKDCC	275609	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	42030306	42030675	42030574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKDCC	242485	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	42368526	42368635	42368598	Y	NA	EML4	EML4,LOC388942,C2orf91,COX7A2L	IMR90	Hi-C	24141950	EML4	25855	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	43037224	43037999	43037611	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MTA3	317515	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr2	43361604	43361811	43361729	Y	OXER1,ZFP36L2,THADA,THADA	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	89937	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	43705862	43706134	43705998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THADA	115051	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	44007303	44007575	44007439	Y	NA	DYNC2LI1	NA	NA	NA	NA	DYNC2LI1	8125	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	45160125	45160245	45160184	Y	SIX3	RP11-89K21.1,SIX3-AS1	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	4093	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	45164818	45165169	45165126	Y	NA	RP11-89K21.1,SIX3-AS1	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	480	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	45176497	45176546	45176522	Y	NA	RP11-89K21.1,SIX3-AS1,AC012354.8	NA	NA	NA	NA	SIX3-AS1	9485	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	45968952	45969144	45969027	Y	PRKCE	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCE	92468	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	46452124	46452363	46452229	Y	RHOQ	NA	PRKCE,EPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	EPAS1	66443	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	46636668	46636826	46636747	Y	NA	NA	EPAS1,PRKCE,RHOQ,PIGF,CRIPT	IMR90	Hi-C	24141950	EPAS1	117862	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	47195176	47195614	47195246	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	28182	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	47270774	47271231	47270943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	103780	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	47499706	47499760	47499719	Y	C2orf61	NA	TTC7A,CALM2,SOCS5,MCFD2,C2orf61	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC073283.4	70453	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	48737563	48737807	48737675	Y	STON1-GTF2A1L,STON1	STON1	NA	NA	NA	NA	STON1	16715	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	52975138	52975144	52975141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHAC2	1017785	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	54643124	54643489	54643323	Y	NA	SPTBN1	ACYP2,C2orf73,SPTBN1	IMR90	Hi-C	24141950	SPTBN1	37933	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	54786900	54787386	54787056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	105478	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr2	54799241	54799892	54799606	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	117819	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	54800045	54800558	54800206	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	118623	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	54816609	54817000	54816923	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	135187	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	55338983	55339153	55339057	Y	CCDC88A,RTN4,RTN4	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	1226	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	55360588	55360689	55360671	Y	NA	RTN4	RTN4,C2orf63,EML6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RTN4	22831	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	56099404	56099776	56099646	Y	NA	EFEMP1	NA	NA	NA	NA	EFEMP1	49498	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	56131792	56132138	56131916	Y	NA	EFEMP1	NA	NA	NA	NA	EFEMP1	17136	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	57400650	57400670	57400660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	732116	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	58271974	58272513	58272036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	139188	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	58336722	58337105	58336916	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	129402	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	58384642	58384701	58384672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	81806	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	60962204	60962802	60962781	Y	NA	PAPOLG	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	18563	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr2	61046625	61046961	61046874	Y	REL,AHSA2,PAPOLG	NA	NA	NA	NA	NA	REL	59695	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	61204524	61204872	61204698	Y	NA	PEX13,PUS10	REL	IMR90	Hi-C	24141950	PEX13	37488	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	61580039	61580318	61580309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	115586	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	61586795	61586939	61586907	Y	AHSA2,USP34	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	108965	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	61766465	61766637	61766569	Y	AHSA2,USP34	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	2704	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	61898281	61898531	61898442	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90	Hi-C	24141950	XPO1	134520	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	61921641	61922071	61921953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM161A	157207	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	61990946	61991094	61991044	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	88184	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.9122304720689
chr2	62883210	62883234	62883222	Y	OTX1	EHBP1	EHBP1,TMEM17	IMR90	Hi-C	24141950	EHBP1	15752	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	64175541	64175571	64175556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS54	68635	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	64978173	64978610	64978385	Y	CEP68	SERTAD2	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	2034	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	65093958	65094266	65094153	Y	NA	NA	SERTAD2,AFTPH,LOC339807	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SERTAD2	117819	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	65303160	65303240	65303200	Y	SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A	CEP68	NA	NA	NA	NA	CEP68	21660	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	67680448	67680810	67680629	Y	NA	NA	MEIS1	IMR90	Hi-C	24141950	ETAA1	57997	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	69135600	69135857	69135778	Y	NA	GKN2	ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10	IMR90	Hi-C	24141950	GKN2	42245	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	69241314	69241782	69241454	Y	ANTXR1	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	3004	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr2	69424670	69425029	69424849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	186360	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	69663778	69663884	69663817	Y	AAK1	NFU1	NA	NA	NA	NA	NFU1	1018	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	70048617	70048893	70048741	Y	ANXA4	GMCL1	NA	NA	NA	NA	GMCL1	5881	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	70144957	70145388	70145176	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	22137	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	70363059	70363462	70363144	Y	MXD1,C2orf42,PCBP1	PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	35376	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	71129017	71129173	71129049	Y	NA	VAX2	NA	NA	NA	NA	VAX2	3297	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	74446656	74447054	74446868	Y	NA	MOB1A,MTHFD2	NA	NA	NA	NA	MTHFD2	22967	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	74722835	74723021	74722928	Y	NA	INO80B,WBP1,MOGS,MRPL53,TTC31,CCDC142,LBX2,PCGF1,HTRA2,AUP1	NA	NA	NA	NA	LBX2	5422	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	75141745	75142080	75142074	Y	NA	POLE4	NA	NA	NA	NA	POLE4	41539	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	75172635	75172664	75172650	Y	NA	POLE4	POLE4,TACR1,HK2	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	POLE4	10955	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr2	75498571	75498680	75498627	Y	NA	NA	TACR1	IMR90	Hi-C	24141950	POLE4	314952	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	75894065	75894458	75894192	Y	NA	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	22156	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	75903279	75903482	75903481	Y	C2orf3,C2orf3	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	31370	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	75912574	75912759	75912685	Y	NA	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	GCFC2	23356	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	77536393	77536550	77536540	Y	LRRTM4	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	476958	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	82896168	82896224	82896196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC098817.3	147031	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	85147093	85147556	85147171	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	16344	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	85151844	85152193	85152004	Y	NA	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	21095	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	85664544	85665596	85664830	Y	KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6	CAPG	NA	NA	NA	NA	CAPG	20989	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	85673142	85673285	85673214	Y	NA	CAPG	NA	NA	NA	NA	CAPG	29587	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	86722974	86723324	86723287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM3A	57204	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	91759872	91760090	91759934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2770710	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	91960340	91960566	91960493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2971178	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	96348390	96348623	96348461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAHD2A	281921	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	96822944	96823234	96823089	Y	ARID5A,DUSP2	DUSP2,STARD7	DUSP2,STARD7,LOC285033,ADRA2B,SNRNP200,TMEM127,CIAO1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DUSP2	13765	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	97291626	97292008	97291852	Y	NA	KANSL3	NA	NA	NA	NA	KANSL3	14516	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	97330891	97331185	97331060	Y	TMEM127,ARID5A,KIAA1310	KANSL3	NA	NA	NA	NA	KANSL3	24367	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	98389575	98389609	98389594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-8P	110381	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWA3B	121353	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr2	99077455	99077668	99077504	Y	TMEM131,MGAT4A,MGAT4A,INPP4A	INPP4A	NA	NA	NA	NA	INPP4A	18138	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	99104168	99104367	99104271	Y	TMEM131,INPP4A	INPP4A	NA	NA	NA	NA	INPP4A	44851	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	100104968	100105518	100105262	Y	REV1	REV1	NA	NA	NA	NA	REV1	471	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	100630312	100630613	100630507	Y	AFF3	NA	NA	NA	NA	NA	LONRF2	306582	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	100654601	100654935	100654768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LONRF2	282260	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	101010496	101010959	101010820	Y	AFF3	CHST10	NA	NA	NA	NA	CHST10	21159	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	101435496	101435968	101435616	Y	NPAS2	NPAS2	NA	NA	NA	NA	NPAS2	882	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr2	101680419	101680493	101680454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL31	64242	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr2	101712877	101712902	101712892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL31	96700	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	101972073	101972519	101972434	Y	NA	RNF149,CREG2	NA	NA	NA	NA	CREG2	29538	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	102383406	102383725	102383568	Y	MAP4K4,MAP4K4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	72094	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	102844003	102844653	102844435	Y	IL1R2,IL18RAP,IL1R1	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RL1	81309	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	102854655	102855173	102854991	Y	IL1R1	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RL1	70789	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr2	102867550	102867715	102867627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RL1	58247	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	106329728	106329936	106329837	Y	NA	NCK2	NA	NA	NA	NA	NCK2	29418	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	107652241	107652475	107652358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC114755.2	748732	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	108100579	108100790	108100686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCC2	962227	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	111829364	111829577	111829485	Y	NA	BCL2L11	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	45378	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	111879046	111879315	111879118	Y	NA	BCL2L11	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	4091	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	112428952	112429342	112429151	Y	MERTK	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90	Hi-C	24141950	ANAPC1	210925	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.9122304720689
chr2	112459778	112460151	112459873	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	180116	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	113380153	113380493	113380323	Y	IL1A	CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	AC079922.2	2409	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	113388786	113388926	113388836	Y	NA	CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	AC079922.2	11042	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	113398370	113398650	113398523	Y	NA	AC079922.2,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	SLC20A1	2784	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	113551784	113552157	113551927	Y	IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL37,IL1A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IL1A	11617	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	113570329	113570602	113570498	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	IL1B	21878	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	114132430	114132930	114132660	Y	IL36G,IL36B,IL36RN,IL1RN,CBWD2	NA	PAX8,IL1RN,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4782	344015	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	114469366	114469830	114469722	Y	SLC35F5	MIR4782,SLC35F5	NA	NA	NA	NA	MIR4782	7115	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr2	114616401	114616618	114616536	Y	CBWD2,ACTR3	ACTR3	ACTR3,SLC35F5	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTR3	28919	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	115355996	115356162	115356079	Y	DPP10,DPP10	NA	NA	NA	NA	NA	DPP10	158120	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	115897297	115897567	115897434	Y	DPP10,DPP10,DPP10	DPP10-AS1	NA	NA	NA	NA	DPP10-AS1	19353	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.56961512241374
chr2	115929290	115929677	115929479	Y	DPP10,DPP10	DPP10-AS1	NA	NA	NA	NA	DPP10-AS1	12370	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	15.2463830596548
chr2	115944602	115944633	115944617	Y	DPP10,DPP10,DPP10	DPP10-AS1	NA	NA	NA	NA	DPP10-AS1	27682	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr2	115945684	115945957	115945851	Y	DPP10,DPP10,DPP10	DPP10-AS1	NA	NA	NA	NA	DPP10-AS1	28764	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	115983015	115983392	115983035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPP10-AS1	66095	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	116027244	116027630	116027326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPP10-AS1	110324	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	116027974	116028021	116027995	Y	DPP10,DPP10,DPP10	NA	NA	NA	NA	NA	DPP10-AS1	111054	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	116360896	116361163	116361028	Y	DPP10,DPP10	NA	NA	NA	NA	NA	DPP10-AS1	443976	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	116469497	116469517	116469506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPP10-AS1	552577	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	119671340	119671863	119671557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STEAP3	307521	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	120402567	120402612	120402590	Y	PTPN4	TMEM177	NA	NA	NA	NA	TMEM177	32131	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	120971736	120972136	120971936	Y	NA	TMEM185B,RALB	NA	NA	NA	NA	TMEM185B	6848	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	121624920	121625080	121625001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	133721	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	124260647	124260891	124260797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSN	1767968	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr2	127824493	127824859	127824771	Y	MAP3K2,IWS1,BIN1	BIN1	NA	NA	NA	NA	BIN1	38072	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	128090505	128090721	128090714	Y	NA	ERCC3	NA	NA	NA	NA	ERCC3	40753	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	128258405	128258697	128258648	Y	NA	RNU4-48P,IWS1	NA	NA	NA	NA	IWS1	23765	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	128562322	128562673	128562571	Y	NA	WDR33	LIMS2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR33	4088	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	131148815	131149203	131148908	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C,CCDC115,PTPN18	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37235	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	131485043	131485533	131485339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF4	106956	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	131586593	131586950	131586772	Y	NA	ARHGEF4	ARHGEF4	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF4	5539	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	131828545	131828813	131828794	Y	NA	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	FAM168B	20220	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	131863489	131864378	131863990	Y	PLEKHB2	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	PLEKHB2	3069	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	133111183	133111270	133111216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD1	315882	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	134084028	134084575	134084301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP5	239459	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	134570885	134571181	134570989	Y	NA	NA	NCKAP5	IMR90	Hi-C	24141950	NCKAP5	246851	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	134878523	134878632	134878609	Y	MGAT5	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	2969	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	137134367	137134774	137134473	Y	CXCR4,CXCR4	NA	NA	NA	NA	NA	DARS	392697	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	138579362	138579670	138579516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNMT	139920	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	141613060	141613069	141613065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	1274201	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	142471212	142471452	142471332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	415818	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	142874625	142874987	142874896	Y	LRP1B	LRP1B	NA	NA	NA	NA	LRP1B	12283	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	143615203	143615596	143615531	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7	ChIA-PET	22265404	KYNU	17471	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	143615896	143616223	143616082	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7	ChIA-PET	22265404	KYNU	16844	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr2	143621410	143621600	143621515	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KYNU	11467	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	143624367	143624985	143624879	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7	ChIA-PET	22265404	KYNU	8082	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	143625721	143626570	143625926	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7	ChIA-PET	22265404	KYNU	6497	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	143628214	143628759	143628425	Y	NA	KYNU	NA	NA	NA	NA	KYNU	4308	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.37046139862066
chr2	143630782	143631707	143631171	Y	KYNU	KYNU	NA	NA	NA	NA	KYNU	1360	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr2	143688672	143689047	143688712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	55605	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	143697269	143697638	143697450	Y	KYNU	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	64202	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	144019688	144020135	144019849	Y	KYNU,ARHGAP15	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	386621	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	144333976	144334184	144334004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	700909	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	152144821	152144962	152144854	Y	RIF1,RIF1,RIF1,NMI	RBM43,NMI	NA	NA	NA	NA	NMI	250	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr2	152159553	152159620	152159604	Y	TNFAIP6	RBM43,NMI	RBM43,NMI,TNFAIP6,RIF1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NMI	14982	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	153057173	153057360	153057266	Y	FMNL2	STAM2	FMNL2	IMR90	Hi-C	24141950	STAM2	26667	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	153275296	153275683	153275311	Y	FMNL2	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	85545	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	153309679	153309745	153309721	Y	CACNB4,CACNB4,CACNB4,FMNL2,ARL6IP6	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	119928	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	153362104	153362315	153362141	Y	FMNL2	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	172353	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	153568262	153568351	153568307	Y	NA	ARL6IP6,PRPF40A	NA	NA	NA	NA	ARL6IP6	4056	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	153599082	153599296	153599189	Y	NA	ARL6IP6,PRPF40A	NA	NA	NA	NA	PRPF40A	26571	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	154448468	154448804	154448636	Y	NA	AC012501.2	NA	NA	NA	NA	AC012501.2	667	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	154729073	154729474	154729153	Y	NA	GALNT13	NA	NA	NA	NA	GALNT13	2647	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	154903292	154903466	154903385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT13	176866	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr2	157191997	157192231	157192220	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	4629	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr2	157293916	157294289	157294044	Y	NA	GPD2	NA	NA	NA	NA	GPD2	4114	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	158084243	158084386	158084315	Y	NA	GALNT5	GALNT5	IMR90	Hi-C	24141950	GALNT5	27724	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	158325907	158326296	158326106	Y	CYTIP	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR1C	157221	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	158673009	158673352	158673181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR1	57022	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	160057929	160058272	160058017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	83038	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	160097747	160098072	160097910	Y	TANC1	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	43238	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	160208394	160208612	160208503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	67084	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	160411225	160411529	160411489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009506.1	58278	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	160804631	160804934	160804783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2R1	112187	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	160858239	160858486	160858430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2R1	58635	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	161232354	161232597	161232498	Y	NA	MIR4785	NA	NA	NA	NA	MIR4785	29796	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	165430240	165430431	165430256	Y	NA	GRB14	NA	NA	NA	NA	GRB14	45927	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	167269953	167270071	167269980	Y	NA	SCN9A	NA	NA	NA	NA	SCN9A	39450	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	170856738	170857087	170856755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBR3	174770	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	171830049	171830396	171830113	Y	NA	GORASP2	NA	NA	NA	NA	GORASP2	47075	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	172101085	172101413	172101325	Y	NA	TLK1	METTL8,TLK1	IMR90	Hi-C	24141950	TLK1	15261	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	172649817	172649933	172649875	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2	107898	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	172747551	172747817	172747684	Y	NA	HAT1	NA	NA	NA	NA	HAT1	29141	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	172792873	172793084	172792979	Y	NA	HAT1	NA	NA	NA	NA	HAT1	15915	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	173647954	173648254	173648105	Y	NA	RAPGEF4	NA	NA	NA	NA	RAPGEF4	49952	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	173796243	173796588	173796342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF4	198241	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	173908830	173909139	173908955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7	308409	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	174963658	174963852	174963755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP3	135228	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	175036157	175036485	175036321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OLA1	74941	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	175465107	175465494	175465405	Y	CIR1,WIPF1	NA	NA	NA	NA	NA	WIPF1	80150	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	175525795	175526184	175525990	Y	NA	WIPF1	NA	NA	NA	NA	WIPF1	19460	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	178100990	178101571	178101482	Y	NA	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	17167	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	178116726	178117036	178116927	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	1702	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr2	178176683	178176989	178176836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3128	57945	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	179471296	179471384	179471314	Y	TTN	NA	NA	NA	NA	NA	TTN-AS1	87386	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	180579667	180579746	180579673	Y	ZNF385B,ZNF385B	NA	NA	NA	NA	NA	CWC22	290094	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	185499442	185500071	185499458	Y	NA	ZNF804A	NA	NA	NA	NA	ZNF804A	38349	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	186645587	186645801	186645694	Y	NA	FSIP2	NA	NA	NA	NA	FSIP2	44232	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	186832070	186832214	186832142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSIP2	230715	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	187420042	187420288	187420183	Y	ITGAV,ITGAV,ZC3H15	ITGAV	ZC3H15,ITGAV	IMR90	Hi-C	24141950	ITGAV	32504	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	188404228	188404596	188404560	Y	TFPI	TFPI	NA	NA	NA	NA	TFPI	23891	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr2	189957665	189957918	189957859	Y	COL3A1,COL5A2	NA	NA	NA	NA	NA	COL5A2	84687	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	189973214	189973535	189973374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL5A2	69070	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	189996829	189996972	189996897	Y	NA	COL5A2	NA	NA	NA	NA	COL5A2	45633	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	190014709	190015152	190014914	Y	NA	COL5A2	NA	NA	NA	NA	COL5A2	27453	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	190043432	190043827	190043588	Y	DIRC1,COL3A1,COL5A2	COL5A2	NA	NA	NA	NA	COL5A2	827	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.71307674827583
chr2	190056615	190056806	190056658	Y	NA	COL5A2	GULP1,COL5A2	IMR90	Hi-C	24141950	COL5A2	14010	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	6.50969164344814
chr2	191709136	191709198	191709167	Y	STAT4,NAB1,STAT1,GLS	GLS,AC005540.3	GLS,STAT1,NAB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLS	34355	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	191709790	191710154	191709972	Y	STAT4,NAB1,STAT1,GLS	GLS,AC005540.3	GLS,STAT1,NAB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLS	33399	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	192717272	192717408	192717316	Y	NA	AC098617.1,SDPR	NA	NA	NA	NA	SDPR	7291	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr2	192870555	192870805	192870799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	160574	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	192889960	192890123	192890039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEFF2	168312	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	192915570	192915970	192915770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEFF2	142465	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	194142383	194142416	194142400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEFF2	1083948	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	196523919	196524096	196523991	Y	SLC39A10	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	85218	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	197047464	197047675	197047511	Y	STK17B	STK17B	NA	NA	NA	NA	STK17B	8237	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	197104380	197104716	197104446	Y	STK17B	NA	NA	NA	NA	NA	STK17B	65153	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	197188373	197188663	197188518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK17B	149146	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	197466180	197466534	197466307	Y	NA	HECW2,CCDC150	CCDC150,HECW2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HECW2	9764	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	197895243	197895319	197895281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP1	104723	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	197934286	197934620	197934500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP1	143766	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	197934773	197935033	197934860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP1	144253	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	197936511	197936873	197936784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP1	145991	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	198224203	198224295	198224249	Y	NA	NA	PGAP1,ANKRD44	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD44	50306	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	198537682	198538053	198537906	Y	NA	RFTN2,MARS2	NA	NA	NA	NA	RFTN2	716	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	200675242	200675584	200675389	Y	NA	FTCDNL1	NA	NA	NA	NA	FTCDNL1	38312	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	201652202	201652395	201652320	Y	NA	BZW1	BZW1	IMR90	Hi-C	24141950	BZW1	20922	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	201978583	201978718	201978642	Y	CLK1,CLK1,TRAK2,STRADB,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,FAM126B,CFLAR	NDUFB3,FAM126B,AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	109	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	201989489	201990098	201989672	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	10662	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	201991403	201992374	201991715	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	12576	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	201992378	201992654	201992500	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	13551	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	202109391	202109622	202109507	Y	NA	CASP8	NA	NA	NA	NA	CASP8	13225	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	202897639	202898135	202897874	Y	FZD7	FZD7	NA	NA	NA	NA	FZD7	329	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	FZD7	NA	NA	NA	NA	FZD7	872	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr2	203131534	203131826	203131673	Y	FAM117B,NOP58	SUMO1,NOP58	NA	NA	NA	NA	NOP58	3095	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	203176830	203176888	203176863	Y	NA	NOP58	NA	NA	NA	NA	NOP58	48391	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	203830574	203830808	203830669	Y	NA	WDR12,NBEAL1	NA	NA	NA	NA	WDR12	46713	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr2	204311629	204311925	204311741	Y	NBEAL1,CYP20A1,ABI2	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	86208	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	204547424	204547617	204547518	Y	NA	NA	RAPH1,CD28	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	149291	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	204548440	204549024	204548878	Y	NA	NA	RAPH1,CD28	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	150307	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	204570146	204570432	204570186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	172013	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	204676480	204676691	204676598	Y	NA	NA	RAPH1,CD28,NBEAL1,CYP20A1	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	278347	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	204865221	204865530	204865345	Y	CD28,CTLA4,ICOS	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	467088	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	206005178	206005232	206005204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	539482	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	206439575	206439768	206439663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	104946	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	207348794	207348941	207348896	Y	NA	ADAM23	NA	NA	NA	NA	ADAM23	42531	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	208348288	208348659	208348648	Y	NA	CREB1,AC007879.5	KLF7,CCNYL1,FASTKD2,METTL21A,CREB1,FZD5	IMR90	Hi-C	24141950	CREB1	43802	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	208395422	208395980	208395659	Y	PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1	CREB1,AC007879.5	NA	NA	NA	NA	AC007879.5	2903	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	208472249	208472458	208472354	Y	NA	METTL21A	NA	NA	NA	NA	METTL21A	16194	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	208656928	208657357	208657034	Y	FZD5	FZD5	PLEKHM3,CCNYL1,FZD5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FZD5	24641	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	210046809	210047163	210046986	Y	MAP2	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2	239619	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	210259105	210259242	210259184	Y	NA	MAP2	NA	NA	NA	NA	MAP2	27540	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	211404935	211405006	211404955	Y	CPS1	NA	NA	NA	NA	NA	CPS1	64529	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	211413660	211414008	211413843	Y	ACADL,CPS1,CPS1	NA	NA	NA	NA	NA	CPS1	73254	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr2	211423571	211423754	211423675	Y	ACADL,CPS1,CPS1	NA	NA	NA	NA	NA	CPS1	83165	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr2	211423993	211424366	211424119	Y	CPS1,CPS1,CPS1	NA	NA	NA	NA	NA	CPS1	83587	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr2	211426065	211426416	211426368	Y	ACADL,CPS1,CPS1	NA	NA	NA	NA	NA	CPS1	85659	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	211470804	211470937	211470808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPS1	130398	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	216216233	216216482	216216439	Y	NA	ATIC	NA	NA	NA	NA	ATIC	41693	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	216402536	216402702	216402564	Y	FN1	NA	LOC646324,FN1	IMR90	Hi-C	24141950	AC012462.1	103560	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	216636605	216637052	216636855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREG	259767	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	216695142	216695306	216695226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREG	201513	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	217180784	217180970	217180877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARCH4	53780	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	217414791	217414849	217414821	Y	IGFBP2	NA	DIRC3,IGFBP2,RPL37A,IGFBP5	IMR90	Hi-C	24141950	AC098820.3	53307	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	218518007	218518420	218518200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARPC2	561397	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	218549825	218550302	218550107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARPC2	529515	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	219270976	219271406	219271230	Y	CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1	SLC11A1,CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	9997	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	219434664	219435146	219434778	Y	USP37	USP37,RQCD1,PLCD4	NA	NA	NA	NA	RQCD1	3361	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	219773515	219774011	219773826	Y	USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A	CDK5R2	NA	NA	NA	NA	CDK5R2	48366	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	219827943	219828258	219828078	Y	USP37,STK36,PTPRN,PTPRN,CDK5R2,FEV	CDK5R2	NA	NA	NA	NA	CDK5R2	5566	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	222383007	222383509	222383204	Y	EPHA4	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	53413	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	PAX3	334304	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr2	223922386	223922775	223922580	Y	KCNE4	KCNE4	NA	NA	NA	NA	KCNE4	7854	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	224467803	224467963	224467901	Y	SCG2	SCG2	NA	NA	NA	NA	SCG2	2582	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr2	224477772	224478078	224477872	Y	NA	SCG2	AP1S3,KCNE4,SCG2	IMR90	Hi-C	24141950	SCG2	12551	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	224564336	224564481	224564409	Y	NA	NA	SCG2	IMR90	Hi-C	24141950	SCG2	99115	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	224569350	224569680	224569515	Y	NA	NA	AP1S3	IMR90	Hi-C	24141950	SCG2	104129	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	224852422	224852838	224852675	Y	NA	WDFY1,MRPL44,SERPINE2	NA	NA	NA	NA	MRPL44	32301	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	225392496	225392764	225392746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	55346	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	225774741	225775150	225774924	Y	CUL3,DOCK10	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK10	130012	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	225878647	225879031	225878803	Y	DOCK10	DOCK10	NA	NA	NA	NA	DOCK10	26131	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	225880660	225880871	225880768	Y	DOCK10	DOCK10	NA	NA	NA	NA	DOCK10	24291	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	227517160	227517436	227517301	Y	IRS1	NA	IRS1,LOC646736	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	145039	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	227665859	227666449	227665964	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	3384	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	228234939	228235085	228235004	Y	CCL20,AGFG1	MFF	NA	NA	NA	NA	MFF	47072	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	228236714	228236871	228236778	Y	CCL20,AGFG1	MFF	NA	NA	NA	NA	MFF	48847	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	228253438	228253721	228253534	Y	CCL20,AGFG1	NA	TM4SF20,AGFG1	IMR90	Hi-C	24141950	MFF	65571	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr2	228437239	228437625	228437329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGFG1	102371	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	228536293	228536759	228536585	Y	SLC19A3	SLC19A3	NA	NA	NA	NA	SLC19A3	43969	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	228578021	228578290	228578242	Y	NA	SLC19A3	NA	NA	NA	NA	SLC19A3	2438	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	228742760	228743014	228742884	Y	WDR69	NA	NA	NA	NA	NA	CCL20	66202	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	228873880	228874070	228873976	Y	C2orf83,SPHKAP	NA	NA	NA	NA	NA	SPHKAP	170291	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	230138474	230138658	230138545	Y	PID1	PID1	PID1	IMR90	Hi-C	24141950	PID1	4473	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	230273013	230273684	230273347	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	139012	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	230274489	230274615	230274507	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	140488	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.71307674827583
chr2	230309727	230309993	230309861	Y	TRIP12,PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	175726	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr2	231922388	231922877	231922602	Y	NA	PSMD1	NA	NA	NA	NA	PSMD1	2810	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	232026724	232026986	232026907	Y	NA	ARMC9	NA	NA	NA	NA	ARMC9	34274	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	232229850	232230117	232229960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD82	93034	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	232330093	232330255	232330170	Y	NA	SNORD82,NCL,LINC00471	NA	NA	NA	NA	SNORD82	6942	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00471	91838	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.54176907344824
chr2	232507409	232507767	232507481	Y	NA	NA	PDE6D	IMR90	Hi-C	24141950	PTMA	61838	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	232545684	232546083	232545868	Y	COPS7B	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	23522	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	233367792	233368150	233367876	Y	ALPP,GIGYF2,ALPI,ECEL1,PRSS56,TIGD1	ECEL1,EIF4E2,TIGD1	MIR1471,ECEL1P2	IMR90	Hi-C	24141950	ECEL1	17254	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	233766797	233767190	233766879	Y	NA	C2orf82	NA	NA	NA	NA	C2orf82	46817	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	234322287	234322459	234322373	Y	SAG	NA	NA	NA	NA	NA	DGKD	61134	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	234357256	234357513	234357369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKD	96103	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr2	234465976	234466363	234466311	Y	HJURP	USP40	NA	NA	NA	NA	USP40	7065	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	234608579	234609196	234608912	Y	NA	UGT1A6	NA	NA	NA	NA	UGT1A6	10326	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	234630754	234630813	234630784	Y	NA	UGT1A6	NA	NA	NA	NA	UGT1A6	32501	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	236172421	236172477	236172436	Y	NA	NA	AGAP1	IMR90	Hi-C	24141950	AGAP1	228256	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	236886303	236886528	236886416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	187562	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	236910231	236910384	236910319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	163706	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	237016237	237016450	237016344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	57640	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	237073092	237073409	237073337	Y	NA	AC079135.1	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	681	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	237685373	237686074	237685499	Y	CXCR7	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COPS8	305881	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	237933842	237934085	237933935	Y	NA	NA	CXCR7,IQCA1,ASB18	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	COPS8	57870	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	238391204	238391436	238391383	Y	LRRFIP1,MLPH	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	635	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	238392046	238392381	238392184	Y	LRRFIP1,MLPH	NA	NA	NA	NA	NA	MLPH	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr2	238396973	238397455	238397139	Y	NA	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	4902	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	238421741	238422134	238421894	Y	MLPH	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	29670	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	238583352	238583931	238583637	Y	UBE2F,LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	49133	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	238616188	238616491	238616226	Y	ILKAP,LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	81969	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	238779455	238779579	238779499	Y	RAMP1	RAMP1	NA	NA	NA	NA	RAMP1	13919	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	239085902	239086198	239086162	Y	NA	FAM132B,ILKAP	NA	NA	NA	NA	FAM132B	20279	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	239347857	239348510	239348285	Y	ASB1	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	14474	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	239552819	239552999	239552910	Y	PER2	NA	LOC151171	IMR90	Hi-C	24141950	TWIST2	201674	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	239758150	239758505	239758333	Y	NA	TWIST2	NA	NA	NA	NA	TWIST2	3477	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr2	239779123	239779526	239779330	Y	TWIST2	TWIST2	NA	NA	NA	NA	TWIST2	24450	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	239997480	239997793	239997637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWIST2	242807	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	240144176	240144295	240144274	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	176835	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	240190277	240190476	240190405	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	130654	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	240195931	240196233	240196082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	124897	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	240196255	240196671	240196554	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	124459	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	3.25484582172407
chr2	240196933	240197336	240197049	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	123794	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr2	240200846	240201180	240201020	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	119950	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	240267449	240267666	240267577	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	53464	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	241190569	241190767	241190645	Y	NA	NA	GPC1,ANKMY1,PP14571	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYEOV2	116345	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	242365047	242365293	242365170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARP2	71389	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	242480531	242480899	242480752	Y	NA	STK25,BOK	NA	NA	NA	NA	BOK	15237	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr2	242549642	242550327	242549774	Y	ATG4B	ATG4B,THAP4	NA	NA	NA	NA	ATG4B	24301	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	290672	290826	290757	Y	SOX12,NRSN2	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4	NA	NA	NA	NA	SOX12	13381	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	352488	352859	352625	Y	SRXN1,FAM110A,RBCK1	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	6402	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr20	353974	354548	354311	Y	SRXN1,FAM110A	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	4713	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr20	625872	626198	626085	Y	NA	SRXN1	NA	NA	NA	NA	SRXN1	5816	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	641092	641461	641194	Y	NA	SRXN1	SRXN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SRXN1	9078	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr20	1310858	1311228	1310987	Y	SDCBP2,SDCBP2,SIRPG	SDCBP2	NA	NA	NA	NA	SDCBP2	2975	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr20	1372355	1372517	1372472	Y	NA	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	549	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr20	1372569	1372994	1372930	Y	PSMF1,SDCBP2,SIRPB2,SIRPB1	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	763	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr20	1878572	1879041	1878847	Y	SIRPB2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA	SIRPA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	5418	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	1883804	1884142	1883973	Y	NA	SIRPA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	10650	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	2191833	2192468	2191958	Y	SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	PDYN,TGM3,TGM6	IMR90	Hi-C	24141950	STK35	111576	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr20	2295693	2295966	2295830	Y	SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD119	145717	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr20	2855066	2855678	2855300	Y	NA	VPS16,PTPRA	NA	NA	NA	NA	PTPRA	12236	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	3155446	3155862	3155811	Y	EBF4,PTPRA,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	16604	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	3159596	3159937	3159912	Y	PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	20754	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	3779808	3780100	3779895	Y	PANK2,PANK2,CDC25B	C20orf27,CENPB,CDC25B,MAVS	NA	NA	NA	NA	CDC25B	14230	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	3788108	3788452	3788409	Y	NA	C20orf27,CENPB,CDC25B,MAVS	NA	NA	NA	NA	CDC25B	22530	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr20	3932717	3933076	3932937	Y	NA	NA	MIR103B2,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF24	61153	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	4198420	4198722	4198592	Y	SMOX,ADRA1D	ADRA1D	NA	NA	NA	NA	ADRA1D	28999	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr20	4210249	4210540	4210481	Y	ADRA1D	ADRA1D	NA	NA	NA	NA	ADRA1D	17181	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	4906233	4906312	4906273	Y	RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA31	58603	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	5072801	5072926	5072885	Y	NA	PCNA,CDS2	NA	NA	NA	NA	PCNA	32346	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	5553446	5553705	5553635	Y	NA	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	35967	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	5717960	5718260	5718168	Y	C20orf196	C20orf196	NA	NA	NA	NA	C20orf196	10779	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	6975107	6975482	6975156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP2	228796	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	8173456	8173854	8173482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	62632	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	8210701	8210953	8210827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	99877	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr20	10492212	10492484	10492413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	79342	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	12181765	12181772	12181769	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD3	312394	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	15805660	15806043	15805852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF16B	746035	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	17485095	17485774	17485421	Y	PCSK2	NA	NA	NA	NA	NA	BFSP1	62091	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	17557154	17557457	17557241	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	8646	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	17946136	17946538	17946496	Y	SNX5,SNX5	SNORD17,SNX5,PTMAP3	NA	NA	NA	NA	SNX5	1085	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	18276093	18276447	18276109	Y	CSRP2BP	ZNF133	NA	NA	NA	NA	ZNF133	8972	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	19706762	19707007	19706910	Y	NA	RP1-122P22.2	NA	NA	NA	NA	RP1-122P22.2	29345	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	19860938	19861220	19861002	Y	NA	NA	SLC24A3,RIN2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP1-122P22.2	124586	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	19881587	19881718	19881652	Y	RIN2,RIN2	NA	NA	NA	NA	NA	NAA20	114042	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	23132994	23133379	23133148	Y	THBD,CD93,GZF1,CST3	NA	THBD	K562	ChIA-PET	22265404	THBD	104616	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	24608551	24608896	24608878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSS1	428720	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	24947572	24947946	24947787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSS1	89670	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	25214082	25214352	25214216	Y	ENTPD6,PYGB	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	12353	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.54176907344824
chr20	25218471	25218756	25218634	Y	NA	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	7949	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr20	25227226	25227454	25227251	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	521	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	25227906	25228088	25227908	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	1201	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr20	25229395	25229593	25229494	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	2690	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr20	25267859	25268242	25268026	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	41154	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	25671297	25671837	25671511	Y	NA	ZNF337	NA	NA	NA	NA	ZNF337	3640	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	30148718	30149081	30148825	Y	HCK,HM13	HM13,ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	42005	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr20	30303594	30303801	30303667	Y	TTLL9,DUSP15	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	5991	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	30307720	30308274	30308104	Y	POFUT1	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	1518	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	30699679	30699866	30699769	Y	BCL2L1,HCK,C20orf112,TM9SF4,PLAGL2	TM9SF4	NA	NA	NA	NA	TM9SF4	4370	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	31063072	31063625	31063366	Y	NA	NA	ASXL1	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf112	107251	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr20	31170393	31170766	31170763	Y	NA	C20orf112	NA	NA	NA	NA	C20orf112	110	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	32803456	32803920	32803688	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	93688	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr20	33064297	33064587	33064427	Y	ACSS2	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	FDX1P1	2018	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr20	33491673	33492056	33491689	Y	TP53INP2,ACSS2	ACSS2,GGT7,GSS	NA	NA	NA	NA	GGT7	33010	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	34463368	34463773	34463624	Y	NFS1	RNU4-40P	NA	NA	NA	NA	RNU4-40P	9808	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	34471781	34472424	34472101	Y	NA	RNU4-40P	NA	NA	NA	NA	RNU4-40P	1157	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr20	34479476	34479734	34479606	Y	NA	RNU4-40P	NA	NA	NA	NA	RNU4-40P	5895	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.39830744758616
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	EPB41L1	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EPB41L1	24371	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	35234952	35235695	35235080	Y	NA	TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	2815	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	3.9400765210344
chr20	35251667	35252083	35251778	Y	NA	C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	19530	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	35490387	35490628	35490526	Y	MANBAL,KIAA0889	NA	KIAA0889	MCF7	ChIA-PET	22265404	SAMHD1	87618	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	35821029	35821195	35821110	Y	NA	RPN2	GHRH	IMR90	Hi-C	24141950	RPN2	16216	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	35905068	35905696	35905172	Y	SAMHD1,SRC,MANBAL	MANBAL	RPN2,NNAT,BLCAP,MANBAL,GHRH,SRC,LOC100287792,VSTM2L,TTI1,RPRD1B	IMR90	Hi-C	24141950	MANBAL	10345	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	35964748	35965459	35965134	Y	NA	MANBAL,SRC	NA	NA	NA	NA	SRC	5629	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	36007590	36007925	36007762	Y	SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC	SRC	NA	NA	NA	NA	SRC	36502	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr20	36034782	36035452	36035129	Y	C20orf132,VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	36484	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	36042310	36042952	36042529	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	28984	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	36154671	36154957	36154793	Y	BLCAP,BLCAP,BLCAP	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	338	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	36298725	36299073	36298903	Y	C20orf132	CTNNBL1	VSTM2L,LOC100287792,RPN2,CTNNBL1,TTI1,LBP	IMR90	Hi-C	24141950	CTNNBL1	21335	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	36693519	36693713	36693616	Y	RPRD1B	TTI1,RPRD1B	NA	NA	NA	NA	RPRD1B	33571	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	37229958	37230063	37230010	Y	ARHGAP40	NA	NA	NA	NA	NA	RALGAPB	130499	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	37302978	37303466	37303191	Y	ACTR5,SLC32A1	NA	ARHGAP40,ACTR5,SLC32A1,PPP1R16B	IMR90	Hi-C	24141950	ACTR5	71619	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	37678805	37678873	37678867	Y	SLC32A1,PPP1R16B	NA	NA	NA	NA	NA	DHX35	89863	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	43540233	43540373	43540312	Y	DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,PABPC1L	YWHAB,PABPC1L,TOMM34	NA	NA	NA	NA	PABPC1L	3530	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr20	43970100	43970351	43970215	Y	NA	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	4713	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	43972821	43973151	43973055	Y	SYS1,SDC4	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	1913	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	45870109	45870518	45870490	Y	ZMYND8,NCOA3	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	108787	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	45987479	45988292	45987961	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	3912	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	46021549	46021674	46021604	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,SLC2A10,EYA2,NCOA3,PARD6B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZMYND8	37982	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr20	46620819	46621265	46621146	Y	NA	NA	SULF2,CMTM7,BCAS1	MCF7	ChIA-PET	22265404,19890323	SULF2	207459	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	46653872	46653986	46653882	Y	NA	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SULF2	240512	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	47343676	47344035	47343854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	192392	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr20	47750965	47751079	47750977	Y	ZNFX1	NA	NA	NA	NA	NA	STAU1	51825	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	48317219	48317517	48317348	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	10898	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	48753681	48754062	48753956	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,PTPN1,CEBPB	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4	NA	NA	NA	NA	TMEM189-UBE2V1	14112	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	48804007	48804349	48804187	Y	B4GALT5,SLC9A8,SPATA2,PTPN1,CEBPB	TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	CEBPB	1027	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	48924890	48925591	48925260	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPB	119514	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	3.25484582172407
chr20	49032230	49032497	49032297	Y	NA	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	92394	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	49055532	49055924	49055757	Y	SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	68967	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	49067387	49067853	49067497	Y	SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C,MIR645,PARD6B	IMR90	Hi-C	24141950	PTPN1	57038	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr20	49100027	49100544	49100221	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	24347	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr20	49157621	49157908	49157761	Y	NA	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	32730	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	49524499	49524706	49524614	Y	ADNP	ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	ADNP	21252	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	49650336	49650514	49650422	Y	NA	KCNG1	KCNG1,NFATC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KCNG1	12670	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	49963208	49963745	49963374	Y	NFATC2	NA	KCNG1,ATP9A,NFATC2	IMR90	Hi-C	24141950	NFATC2	213625	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	50021136	50021625	50021333	Y	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	155745	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	50030493	50030755	50030670	Y	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	146615	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	50247670	50248383	50248096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	70300	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr20	50252715	50253081	50252915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	75345	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr20	50366772	50367203	50366881	Y	ZFP64,ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	15970	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr20	50383575	50384083	50383723	Y	ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	402	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.54176907344824
chr20	50416703	50416783	50416765	Y	ZFP64,SALL4	ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	33530	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	52201463	52201802	52201714	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	22644	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	52239995	52240318	52240062	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	15549	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr20	52355086	52355238	52355182	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	130640	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr20	52445816	52446339	52446069	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	221370	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr20	54729980	54730207	54730095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM210B	201764	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	55362710	55362938	55362792	Y	AURKA,TFAP2C	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTMAP6	88140	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	55363467	55363682	55363577	Y	NA	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTMAP6	88897	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr20	57198784	57199334	57199089	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16	24994	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr20	57420469	57420802	57420636	Y	NA	GNAS,GNAS-AS1,RP1-309F20.3	NA	NA	NA	NA	GNAS-AS1	3156	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	57734969	57735118	57735019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLMO2	119005	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr20	57735475	57736078	57735576	Y	TUBB1,ZNF831	NA	NA	NA	NA	NA	SLMO2	119511	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	57738628	57739096	57738774	Y	ZNF831	NA	NA	NA	NA	NA	SLMO2	122664	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr20	60247024	60247153	60247088	Y	CDH4,SS18L1	NA	NA	NA	NA	NA	TAF4	391713	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr20	60934143	60934390	60934309	Y	TAF4,PSMA7,SS18L1,RPS21,NTSR1,CABLES2,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	MIR4758,RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2	ADRM1	K562	ChIA-PET	22265404	LAMA5	5978	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.22699977275857
chr20	60939635	60939778	60939673	Y	SLCO4A1,NTSR1,LAMA5	MIR4758,RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	590	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr20	60940876	60941209	60940968	Y	PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	MIR4758,RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	508	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr20	60941528	60941750	60941608	Y	SLCO4A1,ADRM1,LAMA5	MIR4758,RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	1160	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	60956313	60956720	60956445	Y	NA	RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	RPS21	3452	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	61282674	61283033	61282738	Y	OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1	SLCO4A1,RP11-93B14.5	NA	NA	NA	NA	SLCO4A1	10877	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	61342361	61342694	61342588	Y	NA	RP11-93B14.5,NTSR1	NA	NA	NA	NA	NTSR1	4172	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	61371540	61371927	61371747	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	NTSR1	NA	NA	NA	NA	NTSR1	33351	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr20	61425509	61425950	61425706	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	OGFR,COL9A3	NA	NA	NA	NA	OGFR	8237	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr20	61555881	61556606	61556058	Y	DIDO1	DIDO1,SLC17A9	NA	NA	NA	NA	DIDO1	10698	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	61585167	61585546	61585389	Y	NA	DIDO1,SLC17A9	NA	NA	NA	NA	SLC17A9	3115	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.39830744758616
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	9881917	9882087	9882000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3648	58085	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr21	16064365	16064765	16064448	Y	HSPA13,SAMSN1,NRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA13	310560	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	17906909	17907886	17907248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	251820	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	17959400	17959753	17959559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	304311	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr21	17960667	17961305	17960883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	305578	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	18984370	18984546	18984496	Y	NA	BTG3	NA	NA	NA	NA	BTG3	1105	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	22555444	22555624	22555534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM2	186811	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	26962945	26963646	26963455	Y	NA	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	14183	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	3.42615349655165
chr21	30451583	30451905	30451778	Y	USP16,BACH1,BACH1,C21orf7	CCT8	NA	NA	NA	NA	CCT8	7465	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	30563273	30563702	30563587	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,LINC00189,BACH1	NA	NA	NA	NA	LINC00189	99	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	30617454	30617803	30617527	Y	USP16,BACH1,BACH1	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	53062	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	30924978	30925301	30925140	Y	GRIK1	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	360586	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	31029045	31029571	31029224	Y	BACH1,BACH1	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	464653	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr21	33822696	33822707	33822702	Y	C21orf63,C21orf62	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf119	59257	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	33853478	33853730	33853567	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf119	90039	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	34752926	34753284	34753094	Y	IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2	IFNGR2	NA	NA	NA	NA	IFNGR2	19918	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr21	34801962	34801998	34801980	Y	NA	IFNGR2,TMEM50B	NA	NA	NA	NA	IFNGR2	28760	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	36355491	36355634	36355586	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	370050	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	36798542	36798764	36798653	Y	NA	NA	CLIC6,RUNX1,LOC100506385	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX1	576201	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	38282263	38282520	38282368	Y	CLDN14	NA	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	54292	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	38630405	38630786	38630710	Y	DYRK1A,DYRK1A	AP001432.14,DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	7476	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr21	38801876	38802213	38802018	Y	DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	65784	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr21	39238494	39238669	39238574	Y	DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,KCNJ15	KCNJ6	NA	NA	NA	NA	KCNJ6	48080	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	39723755	39724311	39724014	Y	ETS2	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ6	437006	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr21	40317605	40318001	40317816	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114,ERG	IMR90	Hi-C	24141950	ETS2	142374	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	40395176	40395277	40395227	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	158500	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	40860443	40860729	40860586	Y	NA	LCA5L,SH3BGR	NA	NA	NA	NA	SH3BGR	44662	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	41712304	41712672	41712472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACE2	825056	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	42543184	42543509	42543444	Y	BACE2	BACE2,PLAC4	NA	NA	NA	NA	BACE2	5456	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	43654635	43655282	43654967	Y	NA	ABCG1	TFF3	IMR90	Hi-C	24141950	ABCG1	36836	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	44395482	44395891	44395810	Y	NA	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	2862	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	44395922	44396228	44396080	Y	WDR4,U2AF1,CBS	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	3302	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr21	44597156	44597534	44597315	Y	SIK1	NA	NA	NA	NA	NA	U2AF1	71459	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr21	44599156	44599262	44599209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	U2AF1	73459	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr21	44631329	44631684	44631488	Y	NA	NA	LINC00313,SIK1,HSF2BP,LINC00319	IMR90	Hi-C	24141950	U2AF1	105632	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	44752617	44753007	44752874	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	2698	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr21	44753292	44753457	44753456	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	3373	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.37046139862066
chr21	44753663	44753942	44753875	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	3744	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	44760713	44760913	44760830	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	10794	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr21	44764269	44764611	44764455	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319,CRYAA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	14350	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr21	44803157	44803673	44803421	Y	PKNOX1,SIK1	SIK1	HSF2BP,RRP1B,SIK1	IMR90	Hi-C	24141950	SIK1	41335	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr21	44816664	44817004	44816885	Y	NA	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	28004	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr21	44831891	44832268	44832005	Y	SIK1	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	12740	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	44850435	44851222	44850996	Y	CBS	SIK1,LINC00313	CRYAA,SIK1,HSF2BP,LINC00313,LINC00319,RRP1B	IMR90	Hi-C	24141950	SIK1	5427	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	44859375	44859527	44859442	Y	NA	SIK1,LINC00313	NA	NA	NA	NA	SIK1	14367	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	44860778	44861412	44860950	Y	SIK1	SIK1,LINC00313	NA	NA	NA	NA	SIK1	15770	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr21	44862613	44862764	44862681	Y	NA	SIK1,LINC00313	NA	NA	NA	NA	SIK1	17605	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	44867284	44867543	44867469	Y	NA	SIK1,LINC00313	NA	NA	NA	NA	SIK1	22276	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	44908266	44908370	44908324	Y	NA	LINC00313	LINC00319,SIK1	MCF7	ChIA-PET	22265404	LINC00313	10852	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	44914466	44914931	44914660	Y	PDXK,U2AF1,SIK1	LINC00313	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00313	17052	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr21	45187861	45188442	45188176	Y	ICOSLG,PDXK,CSTB	CSTB,RRP1	NA	NA	NA	NA	CSTB	5884	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr21	45235037	45235392	45235184	Y	NA	CSTB,RRP1,MYL6P1,AGPAT3	NA	NA	NA	NA	RRP1	27643	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	45587301	45587635	45587415	Y	PDXK,AGPAT3,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG	C21orf33	C21orf33	K562	ChIA-PET	22265404	C21orf33	35814	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr21	45661962	45662435	45662161	Y	TRAPPC10,PWP2,C21orf2,ICOSLG	ICOSLG	NA	NA	NA	NA	ICOSLG	3113	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	45943778	45945170	45944363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC3	70409	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.22699977275857
chr21	46097395	46097576	46097539	Y	KRTAP10-7,KRTAP10-12	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2G2	122358	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	46461202	46461645	46461341	Y	ITGB2,ADARB1	ADARB1	ADARB1,SSR4P1	K562	ChIA-PET	22265404	ADARB1	30123	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr21	46495480	46495526	46495490	Y	KRTAP10-12,ADARB1	ADARB1	NA	NA	NA	NA	ADARB1	3712	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	46549530	46549961	46549631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADARB1	57762	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	46971386	46971506	46971439	Y	POFUT2,SLC19A1	SLC19A1	SLC19A1,LOC100129027,PCBP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC19A1	9061	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	47010467	47010705	47010586	Y	NA	SLC19A1	PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC19A1	48142	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.54176907344824
chr21	47010868	47011351	47011033	Y	NA	SLC19A1	PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC19A1	48543	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	47035179	47035682	47035497	Y	NA	PCBP3	PCBP3,POFUT2,SLC19A1,COL18A1,LOC100129027,ADARB1	IMR90	Hi-C	24141950	PCBP3	25926	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	47038276	47038513	47038446	Y	NA	PCBP3	PCBP3,ADARB1,LOC100129027,LOC642852,LINC00315,POFUT2,SLC19A1	IMR90	Hi-C	24141950	PCBP3	23095	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	47266684	47266899	47266840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL6A1	132752	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr21	47370674	47370877	47370809	Y	NA	COL6A1	COL6A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL6A1	28774	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	17567178	17567397	17567371	Y	CECR2,IL17RA,CECR1	IL17RA	NA	NA	NA	NA	IL17RA	3334	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	17652206	17652871	17652785	Y	NA	CECR5-AS1,CECR5,AC005300.5	NA	NA	NA	NA	CECR5	8029	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	19043288	19043502	19043327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGCR2	64465	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	4.45399954551715
chr22	19410653	19410889	19410838	Y	HIRA	MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39	NA	NA	NA	NA	MRPL40	6536	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	19983834	19983932	19983883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNRD2	56493	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	20287043	20287283	20287165	Y	NA	RTN4R,DGCR6L	NA	NA	NA	NA	RTN4R	18274	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	20863506	20864089	20863850	Y	MED15	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	15306	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	21132162	21132336	21132252	Y	NA	SERPIND1	NA	NA	NA	NA	SERPIND1	5995	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	22170870	22171333	22171102	Y	HIC2,PPM1F,MAPK1	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	48637	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	24255997	24256450	24256302	Y	C22orf43,CABIN1,CABIN1	MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	21806	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	24948988	24949121	24949055	Y	ADORA2A	SNRPD3,GGT1,FAM211B	NA	NA	NA	NA	SNRPD3	350	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	25551532	25551738	25551635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP5L	247606	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	27041081	27041748	27041447	Y	SEZ6L,ASPHD2	MIAT,CTA-211A9.5	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	MIAT	689	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	27506238	27506397	27506317	Y	NA	NA	PITPNB,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-40G4P.1	224727	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	27508990	27509624	27509325	Y	NA	NA	PITPNB,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-40G4P.1	227479	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	28065247	28065726	28065530	Y	PITPNB,MN1	NA	MIAT,MN1	IMR90	Hi-C	24141950	MN1	129760	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr22	28113176	28113408	28113323	Y	PITPNB,MN1	NA	NA	NA	NA	NA	MN1	82078	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr22	28114157	28114741	28114406	Y	PITPNB,MN1	NA	NA	NA	NA	NA	MN1	80745	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr22	28115717	28115905	28115775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MN1	79581	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr22	28797071	28797274	28797258	Y	PITPNB,XBP1,CCDC117	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	338745	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr22	28837872	28838192	28838073	Y	TTC28	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	297827	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	30096148	30096264	30096206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMAT5	64736	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	30591785	30593544	30592394	Y	NA	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	47296	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr22	30598549	30598642	30598596	Y	LIF	LIF	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	42198	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr22	30601535	30602099	30601994	Y	MTMR3,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF	LIF	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	38741	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr22	30643780	30644513	30644215	Y	GAL3ST1,LIF	LIF,OSM,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	2940	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	30646485	30646883	30646861	Y	SEC14L2,RNF215,LIF	LIF,OSM,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	5645	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr22	30647782	30648063	30647863	Y	SEC14L2,RNF215,GAL3ST1,LIF	LIF,OSM,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	6942	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr22	30649196	30649657	30649496	Y	MTMR3,TBC1D10A,SF3A1,DUSP18,LIF,OSM	LIF,OSM,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	8356	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr22	30650339	30650644	30650477	Y	LIF	LIF,OSM,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	9499	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr22	30651841	30652045	30651989	Y	RNF215	LIF,OSM,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	OSM	8784	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr22	30653574	30654311	30654075	Y	RNF215,GAL3ST1	LIF,OSM,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	OSM	6518	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	10.278460489655
chr22	30657088	30657478	30657295	Y	MTMR3,TBC1D10A,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM	LIF,OSM,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	OSM	3351	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr22	30788647	30788880	30788764	Y	NA	CCDC157,SF3A1,SEC14L2,RNF215,MTFP1	NA	NA	NA	NA	SEC14L2	1966	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	31030399	31030736	31030505	Y	SMTN,OSM,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1,DUSP18,SLC35E4	TCN2,PES1,SLC35E4,DUSP18	NA	NA	NA	NA	SLC35E4	760	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	31606567	31606987	31606713	Y	SMTN,RNF185,LIMK2	LIMK2	NA	NA	NA	NA	LIMK2	342	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr22	31665995	31666466	31666007	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMK2	59770	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	32027602	32027834	32027718	Y	NA	PISD	NA	NA	NA	NA	PISD	28584	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	32485326	32485424	32485375	Y	RFPL2,RFPL3	NA	NA	NA	NA	NA	SC22CB-1E7.1	51849	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	35529944	35530291	35530139	Y	ISX	NA	LARGE	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-714B7.5	94758	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	35767811	35768194	35767985	Y	APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1	HMOX1,MCM5	NA	NA	NA	NA	HMOX1	6160	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr22	36753062	36753318	36753212	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	28745	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	36846070	36846169	36846119	Y	APOL3,APOL2,APOL2,APOL1,NCF4,CSF2RB	TXN2	NA	NA	NA	NA	TXN2	29908	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	37281603	37281788	37281721	Y	CYTH4,NCF4,CSF2RB	NA	NA	NA	NA	NA	IFT27	111303	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	37681037	37681416	37681291	Y	SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4	RAC2	NA	NA	NA	NA	RAC2	42549	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	38139873	38139989	38139967	Y	NA	TRIOBP	H1F0,GCAT	IMR90	Hi-C	24141950	TRIOBP	48862	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	38143248	38143734	38143618	Y	LGALS1,TRIOBP,POLR2F	NA	NA	NA	NA	NA	TRIOBP	52237	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr22	38148564	38148886	38148725	Y	CDC42EP1	NA	NA	NA	NA	NA	H1F0	50228	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	39377467	39377527	39377498	Y	DNAL4,CBX6,APOBEC3B	APOBEC3B,APOBEC3C,APOBEC3D	NA	NA	NA	NA	APOBEC3B	1115	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	39890901	39891082	39890968	Y	ATF4	ATF4,RPS19BP1	SMCR7L	IMR90	Hi-C	24141950	ATF4	22618	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	41047729	41047883	41047796	Y	NA	MKL1	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17023	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr22	41048065	41048352	41048232	Y	EP300,MKL1	MKL1	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17359	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	41294862	41295130	41294948	Y	NA	ST13,XPNPEP3	NA	NA	NA	NA	XPNPEP3	43781	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	41417973	41418366	41418067	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39690	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	41460471	41460696	41460583	Y	NA	RP11-12M9.3,EP300	RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-12M9.3	2415	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr22	42063539	42063782	42063553	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1,MEI1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19161	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	43076677	43076928	43076817	Y	NFAM1,ARFGAP3	CYB5R3,A4GALT	NA	NA	NA	NA	CYB5R3	33103	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	43100819	43101017	43100994	Y	NA	A4GALT	NA	NA	NA	NA	A4GALT	14287	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	43400219	43400728	43400510	Y	NA	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	8423	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	44759236	44759683	44759589	Y	NA	NA	KIAA1644,PARVB,LINC00207,SAMM50,LINC00229	IMR90	Hi-C	24141950	LDOC1L	132495	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr22	44947082	44947372	44947286	Y	PARVG,PARVG	NA	PARVB,KIAA1644,SAMM50,LINC00229	IMR90	Hi-C	24141950	LDOC1L	54904	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr22	45553376	45553664	45553597	Y	NA	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	3998	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	45664918	45665214	45665118	Y	NA	KIAA0930,FAM118A	LOC100506714,SMC1B,PHF21B,FBLN1,KIAA0930,FAM118A,RIBC2,UPK3A,ATXN10	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0930	30268	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	45944996	45945587	45945178	Y	NA	FBLN1	NA	NA	NA	NA	FBLN1	48878	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.71307674827583
chr22	46374166	46374684	46374539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	72901	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	46474643	46475112	46474791	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	10872	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	46480881	46481264	46481017	Y	NA	RP6-109B7.3,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	17110	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr22	47134957	47135355	47135288	Y	NA	CERK,TBC1D22A	NA	NA	NA	NA	CERK	2799	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr22	47364562	47364667	47364649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	208044	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	48973025	48973426	48973083	Y	FAM19A5,FAM19A5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM19A5	89753	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr22	49031660	49032049	49031799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM19A5	148388	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	50272789	50273094	50272966	Y	NA	ZBED4,CRELD2,ALG12	NA	NA	NA	NA	ZBED4	27299	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	50329443	50330313	50330025	Y	TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	19337	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	50364350	50364715	50364589	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12189	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	50764173	50764461	50764208	Y	NA	PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PPP6R2	15272	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	50784754	50785397	50785059	Y	PPP6R2	PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PPP6R2	5021	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	50912071	50912698	50912340	Y	NA	SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2	NA	NA	NA	NA	SBF1	617	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr22	50977955	50978429	50978214	Y	PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B	LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,SYCE3,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	ODF3B	8946	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	253885	254142	254014	Y	NA	CHL1	NA	NA	NA	NA	CHL1	17606	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	350243	350428	350336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHL1	113964	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	3202241	3202572	3202332	Y	NA	IL5RA,TRNT1,CRBN	NA	NA	NA	NA	CRBN	16822	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	3854493	3854653	3854575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETMAR	488335	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	4783422	4783695	4783523	Y	EDEM1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	143282	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	4885679	4886087	4885777	Y	NA	AC018816.3	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	40890	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	4909917	4910799	4910503	Y	ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B	AC018816.3	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	16178	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	5028534	5029013	5028702	Y	ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	8888	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	5059566	5059965	5059743	Y	ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	39920	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	5067974	5068590	5068209	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	48328	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	5145575	5145674	5145603	Y	NA	ARL8B	ITPR1,EGOT	IMR90	Hi-C	24141950	ARL8B	16231	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	5182623	5182897	5182737	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	ARL8B,EDEM1	EDEM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL8B	20718	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	9995528	9995903	9995716	Y	NA	IL17RC,CRELD1,PRRT3-AS1,EMC3-AS1	NA	NA	NA	NA	PRRT3-AS1	8440	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	10233695	10234220	10233931	Y	VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	29146	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	10240437	10240684	10240523	Y	ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2,TATDN2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	35888	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	10593561	10593984	10593868	Y	NA	NA	ATP2B2	IMR90	Hi-C	24141950	SEC13	232699	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	11581408	11581480	11581447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	178740	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	11591830	11592141	11591986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	168079	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	11612359	11612503	11612424	Y	HRH1,ATG7	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	147717	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	13042124	13042470	13042313	Y	RAF1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	70147	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	13493281	13493606	13493395	Y	NA	NUP210,HDAC11,HDAC11-AS1	IQSEC1,NUP210	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HDAC11	25618	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	14457192	14457307	14457247	Y	NA	SLC6A6	NA	NA	NA	NA	SLC6A6	15116	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	15678965	15679290	15679049	Y	NA	BTD,HACL1	NA	NA	NA	NA	HACL1	37627	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	16352603	16353027	16352777	Y	RFTN1,OXNAD1	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	47897	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	16556249	16556592	16556372	Y	DPH3,RFTN1	NA	NA	NA	NA	NA	AC091493.2	180394	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	17345014	17345355	17345310	Y	TBC1D5,TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	502855	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	17506581	17506846	17506713	Y	TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	664422	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr3	19993428	19993925	19993635	Y	KAT2B,RAB5A	EFHB,RAB5A,RNU4-85P	NA	NA	NA	NA	RAB5A	6857	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	21762451	21762481	21762466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB1P5	658829	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	22039046	22039346	22039196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB1P5	381964	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	22060274	22060563	22060426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB1P5	360747	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	23991964	23992189	23991965	Y	NA	RPL15,NR1D2,NKIRAS1	NA	NA	NA	NA	NKIRAS1	5882	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	25462479	25462863	25462673	Y	NA	NA	RARB	IMR90	Hi-C	24141950	TOP2B	241535	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	25494741	25494759	25494749	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOP2B	209639	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	25623618	25623990	25623898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOP2B	80408	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	25790563	25790933	25790768	Y	NA	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	31475	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr3	28029513	28029820	28029667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMC1	251255	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	28534381	28534544	28534465	Y	ZCWPW2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCWPW2	145744	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	29568670	29568984	29568828	Y	RBMS3	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	248197	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	29660032	29660218	29660060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	339559	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	32535422	32535827	32535806	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	7073	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	32549205	32549429	32549313	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	6305	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr3	32929924	32929958	32929941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC139452.2	104786	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	33758685	33758853	33758767	Y	UBP1,UBP1,CLASP2	CLASP2	NA	NA	NA	NA	CLASP2	837	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	36999426	36999810	36999630	Y	LRRFIP2,MLH1,MLH1,EPM2AIP1	TRANK1,EPM2AIP1,MLH1	EPM2AIP1,MLH1	K562	ChIA-PET	22265404	TRANK1	14878	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	37332823	37333208	37333001	Y	NA	AC097359.1	NA	NA	NA	NA	AC097359.1	49137	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	38568637	38569221	38568871	Y	SCN10A,SCN11A,SLC22A14,EXOG	EXOG	NA	NA	NA	NA	EXOG	33019	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	39192828	39193549	39193225	Y	NA	TTC21A,GORASP1,CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	504	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	39222162	39222653	39222434	Y	NA	CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	28109	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	39369442	39369804	39369631	Y	WDR48,CSRNP1,SLC25A38,RPSA,CCR8	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A38	53035	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	42108875	42109165	42109003	Y	ULK4	NA	NA	NA	NA	NA	TRAK1	55581	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	42736762	42737356	42737132	Y	FAM198A,KBTBD5,ZNF662,ZNF662,HHATL	NA	NA	NA	NA	NA	SEC22C	96190	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	43368782	43368949	43368860	Y	NA	SNRK	NA	NA	NA	NA	SNRK	42778	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	43437259	43437582	43437422	Y	ZNF662,ZNF662,FAM198A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-353H3.1	87790	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	44040259	44040834	44040651	Y	NA	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	ANO10	309173	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.05569209793099
chr3	44042164	44042329	44042275	Y	NA	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	ANO10	311078	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	44621262	44622718	44622436	Y	NA	ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF197	1662	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	45035735	45035877	45035806	Y	ZNF660,ZNF35	EXOSC7,ZDHHC3	NA	NA	NA	NA	ZDHHC3	20058	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	45208648	45208845	45208728	Y	LIMD1	CDCP1,RPS24P8	LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS24P8	8981	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	45209101	45209416	45209191	Y	LIMD1	CDCP1,RPS24P8	LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS24P8	9434	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	45686431	45686643	45686512	Y	NA	SACM1L	SACM1L,LOC644714	IMR90	Hi-C	24141950	SACM1L	41905	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	45688648	45689066	45688756	Y	LIMD1	SACM1L	SACM1L,LOC644714	IMR90	Hi-C	24141950	SACM1L	39482	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	46600040	46600219	46600077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALS2CL	132975	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	46990572	46990937	46990863	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	28236	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	46995135	46995433	46995392	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	23740	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	47002825	47003246	47003204	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	15927	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	47420724	47420876	47420775	Y	NA	PTPN23	NA	NA	NA	NA	PTPN23	223	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	47466111	47466297	47466204	Y	NA	PTPN23	NA	NA	NA	NA	PTPN23	45610	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	47704557	47705253	47705047	Y	SETD2	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCC1	116343	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	47898226	47898293	47898260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX30	55827	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	48330483	48330839	48330661	Y	PLXNB1	ZNF589,NME6	NA	NA	NA	NA	NME6	10336	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	48967045	48967316	48967140	Y	NA	SLC25A20,ARIH2	NA	NA	NA	NA	ARIH2	12791	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	48990226	48990305	48990298	Y	USP4	ARIH2,P4HTM	NA	NA	NA	NA	P4HTM	35014	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	49123301	49123671	49123633	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2	NA	NA	NA	NA	QRICH1	6125	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	50264852	50265230	50265012	Y	TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2	GNAI2,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	3128	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr3	50274525	50274666	50274593	Y	RASSF1,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2	GNAI2,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	12801	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	50292420	50292632	50292507	Y	RASSF1,MAPKAPK3,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2	GNAI2,SEMA3B,IFRD2,NAT6,HYAL3	C3orf45,SEMA3B	IMR90	Hi-C	24141950	SEMA3B	10358	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	51573530	51573858	51573781	Y	VPRBP,RAD54L2	VPRBP	NA	NA	NA	NA	VPRBP	41520	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	52073968	52074235	52074157	Y	GPR62	RPL29,DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	14331	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	52080287	52080923	52080751	Y	NT5DC2,TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	7643	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	52091161	52091675	52091445	Y	TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	2595	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	53270281	53270430	53270371	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	17638	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	53272912	53273168	53273085	Y	TMEM110,PRKCD,DCP1A	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	14900	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	53286308	53286764	53286678	Y	NA	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	1304	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	53288705	53289353	53289077	Y	NA	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	637	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	53304049	53304491	53304265	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	15981	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	54389983	54390168	54390067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D3	235409	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	54686814	54686829	54686822	Y	NA	RPS15P5	NA	NA	NA	NA	RPS15P5	28572	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	54725134	54725214	54725174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15P5	66892	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	54851764	54851786	54851775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15P5	193522	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	56769464	56769764	56769614	Y	CCDC66	NA	NA	NA	NA	NA	FAM208A	54199	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	57562103	57562255	57562188	Y	SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12	DNAH12,PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	19692	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	57566206	57566518	57566262	Y	NA	DNAH12,PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	15429	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	57572232	57572342	57572306	Y	NA	DNAH12,PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	9605	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	57639210	57639572	57639391	Y	SLMAP,FAM116A	RP11-755B10.3	NA	NA	NA	NA	RP11-755B10.3	37360	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	57960548	57960842	57960815	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	31285	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	58029786	58030054	58029903	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	37659	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	58163548	58163776	58163593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD6	57457	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	58336517	58336871	58336595	Y	PXK	RPP14,PXK	NA	NA	NA	NA	PXK	19910	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	58411955	58412199	58412053	Y	NA	PDHB	NA	NA	NA	NA	PDHB	5385	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	58457172	58457525	58457255	Y	RPP14,RPP14,KCTD6	PDHB,KCTD6	PXK,RPP14,KCTD6,ACOX2,PDHB	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD6	18316	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	58984210	58984527	58984399	Y	NA	C3orf67	NA	NA	NA	NA	C3orf67	49283	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	60064522	60064780	60064643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	1030712	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	60715683	60716344	60716091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	518789	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	60745368	60745684	60745652	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	489449	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	61579072	61579152	61579112	Y	PTPRG	PTPRG	NA	NA	NA	NA	PTPRG	33829	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	61828479	61828865	61828501	Y	PTPRG	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	101699	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	63484465	63484750	63484608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf49	318288	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	66348485	66348581	66348534	Y	SLC25A26	NA	LRIG1	IMR90	Hi-C	24141950	LRIG1	201106	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	66547159	66547390	66547275	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	2297	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	67217816	67217984	67217900	Y	NA	NA	FAM19A1,FAM19A4	IMR90	Hi-C	24141950	SUCLG2	485054	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	69134869	69134938	69134904	Y	TMF1	TMF1,UBA3,ARL6IP5	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	2774	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	69135158	69135511	69135504	Y	NA	TMF1,UBA3,ARL6IP5	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	3063	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr3	70175230	70175612	70175604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITF	388644	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	71267437	71267786	71267612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	363354	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	72977666	72978074	72977791	Y	RYBP	GXYLT2,FTH1P23	NA	NA	NA	NA	FTH1P23	1471	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	73697614	73697785	73697708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC75P1	467172	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	78934560	78934824	78934693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	880141	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	85011127	85011790	85011174	Y	NA	CADM2	NA	NA	NA	NA	CADM2	4995	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	85930839	85930993	85930916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM2	924707	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	87382490	87382853	87382616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP2B	108069	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	88367245	88367614	88367269	Y	NA	ABCF2P1	NA	NA	NA	NA	ABCF2P1	2939	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPKP4	269654	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	3.9400765210344
chr3	99248067	99248436	99248240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	106883	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	99254161	99254407	99254283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	100912	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	99377938	99378211	99378054	Y	COL8A1	COL8A1	NA	NA	NA	NA	COL8A1	22619	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	99381280	99381540	99381410	Y	NA	COL8A1	NA	NA	NA	NA	COL8A1	25961	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	99579229	99579736	99579484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	223910	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	99582587	99582828	99582708	Y	FILIP1L	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	227268	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	100077983	100078198	100078091	Y	FILIP1L	NIT2,LNP1,TOMM70A	NA	NA	NA	NA	NIT2	26438	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	100079179	100079422	100079420	Y	NA	NIT2,LNP1,TOMM70A	NA	NA	NA	NA	NIT2	27634	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	100784871	100785104	100785043	Y	ABI3BP	NA	ABI3BP	IMR90	Hi-C	24141950	ABI3BP	74512	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	101403455	101403770	101403678	Y	SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24	ZBTB11,CEP97	NA	NA	NA	NA	RPL24	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	105087492	105087848	105087688	Y	NA	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	3739	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	105087916	105088171	105088021	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	4163	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	105088270	105088514	105088471	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	4517	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	106839867	106840135	106840037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00883	117404	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	107148336	107148412	107148401	Y	NA	NA	LOC344595,BBX,LOC100302640	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BBX	91371	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	111623667	111623869	111623803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	71988	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	112577470	112577712	112577653	Y	NA	NA	CD200R1L,CD200R1	IMR90	Hi-C	24141950	GTPBP8	130053	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	114724447	114724794	114724621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	139324	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	114813239	114813371	114813303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	50747	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	115556507	115556695	115556650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	692389	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	115771171	115771507	115771363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	907053	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	115831620	115831831	115831726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	911714	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	116061509	116061660	116061570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	681885	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	117050913	117051371	117051328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	307368	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	117299509	117299697	117299683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-384F7.2	414742	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	117441757	117441996	117441951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-384F7.2	272443	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	117715221	117715404	117715326	Y	NA	RP11-384F7.2	NA	NA	NA	NA	RP11-384F7.2	782	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	119613107	119613331	119613219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	197933	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	120167583	120167922	120167648	Y	NA	FSTL1	NA	NA	NA	NA	FSTL1	178	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.71307674827583
chr3	120277715	120278240	120277932	Y	NA	NDUFB4	FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB4	34916	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	120355972	120356358	120356256	Y	NA	NDUFB4,HGD	NA	NA	NA	NA	NDUFB4	42816	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	120397505	120397688	120397597	Y	NA	HGD	NA	NA	NA	NA	HGD	1730	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	121058660	121058701	121058680	Y	STXBP5L	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP11	152256	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	121374377	121374548	121374517	Y	EAF2,HCLS1,GOLGB1	HCLS1	NA	NA	NA	NA	HCLS1	3226	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	121520314	121520680	121520641	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	31246	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	121798974	121799563	121799190	Y	EAF2,PARP9,PARP9,PARP9,CD86	NA	NA	NA	NA	NA	CSTA	242528	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	122151664	122151964	122151814	Y	NA	WDR5B	NA	NA	NA	NA	WDR5B	18782	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	123478378	123478570	123478420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	175989	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	125986265	125986571	125986320	Y	NA	RP11-71E19.1	KLF15,ZXDC,ALDH1L1,CCDC37	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-71E19.1	2626	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	126187165	126187389	126187309	Y	ZXDC	ZXDC	NA	NA	NA	NA	ZXDC	5373	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	126701397	126702091	126701497	Y	PLXNA1	PLXNA1	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PLXNA1	3346	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	126945882	126946306	126946211	Y	MCM2	NA	NUP210P1	IMR90	Hi-C	24141950	PLXNA1	240445	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr3	127449073	127449115	127449094	Y	TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	NA	NA	NA	NA	NA	ABTB1	59295	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	127465577	127465875	127465733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLL	74176	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	127496785	127497122	127497034	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	42929	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	128745839	128746109	128746044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB43	93535	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	128957834	128958071	128957930	Y	NA	NA	KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNBP	57069	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	131090710	131090810	131090760	Y	NA	NUDT16P1,RP11-933H2.4,NUDT16	NA	NA	NA	NA	RP11-933H2.4	7509	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	131096350	131096447	131096399	Y	NA	NUDT16P1,RP11-933H2.4,NUDT16	NA	NA	NA	NA	RP11-933H2.4	1872	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	132138974	132139193	132139084	Y	NA	DNAJC13	NA	NA	NA	NA	DNAJC13	4604	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	134047160	134047394	134047241	Y	ANAPC13,ANAPC13,ANAPC13,AMOTL2	AMOTL2	NA	NA	NA	NA	AMOTL2	44927	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	136327517	136327655	136327647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG1	141565	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	136427457	136427837	136427826	Y	STAG1	STAG1	NA	NA	NA	NA	STAG1	41383	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	136571906	136572239	136572061	Y	TMEM22	RP11-85F14.5,NCK1	NA	NA	NA	NA	RP11-85F14.5	6657	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	138364761	138365360	138365102	Y	PIK3CB,ARMC8	FAIM	NA	NA	NA	NA	FAIM	39313	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	138581757	138582253	138582041	Y	NA	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	29977	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	138582294	138582582	138582441	Y	MRPS22	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	30514	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	138634319	138634690	138634472	Y	NA	FOXL2,C3orf72	ESYT3,PIK3CB,MRPS22,MRAS,CEP70,FAIM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXL2	29292	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	141050524	141051086	141050761	Y	NA	ZBTB38	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	9469	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	141118771	141119120	141118811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	77716	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	141126018	141126305	141126087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	77584	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	141129371	141129776	141129494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	74113	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	141131755	141132151	141131882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	71738	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	141230074	141230471	141230125	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	26185	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	141610914	141611173	141610928	Y	NA	ATP1B3	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	17948	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	141659994	141660128	141660061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	67028	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	143164009	143164340	143164242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST2	327836	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	146745799	146745822	146745813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	485148	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	148704982	148705163	148705084	Y	NA	GYG1	HLTF,GYG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GYG1	1965	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	148942843	148943311	148943144	Y	NA	CP	NA	NA	NA	NA	CP	5001	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	149099928	149100323	149100052	Y	TM4SF1	TM4SF18,TM4SF1	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90	Hi-C	24141950	TM4SF1	6276	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	149104739	149105065	149104981	Y	COMMD2,TM4SF1	TM4SF1	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM4SF1	11087	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	149151278	149151442	149151363	Y	NA	NA	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,WWTR1,WWTR1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	TM4SF1	57626	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	149265788	149265935	149265852	Y	WWTR1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	55341	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	149284462	149284628	149284613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	74015	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	149356424	149356747	149356622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	95754	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	149566176	149566232	149566181	Y	RNF13	RNF13	NA	NA	NA	NA	RNF13	37681	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	149657313	149657850	149657694	Y	TSC22D2,RNF13	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	26322	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	149819776	149820103	149819802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFN2	53201	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	150417166	150417289	150417212	Y	NA	RP11-103G8.2,FAM194A	NA	NA	NA	NA	RP11-103G8.2	2062	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	151507223	151507685	151507381	Y	NA	RP11-64D22.2,AADAC	NA	NA	NA	NA	RP11-64D22.2	21007	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	151514227	151514622	151514246	Y	NA	RP11-64D22.2,AADAC	NA	NA	NA	NA	AADAC	15203	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	156229646	156229758	156229715	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	41215	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	156443600	156443618	156443611	Y	LEKR1,LEKR1,CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	53433	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	156506058	156506346	156506123	Y	SSR3	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	20175	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	156538683	156538849	156538764	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	LEKR1	2421	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	158440805	158440990	158440882	Y	MFSD1	MFSD1	NA	NA	NA	NA	MFSD1	6997	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr3	160735129	160735256	160735193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMD3	85228	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	160949185	160949470	160949344	Y	OTOL1	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALNT1	128013	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	161731102	161731436	161731432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALNT1	909930	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	169075984	169076327	169076322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TERC	404521	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	169482089	169482431	169482154	Y	NA	TERC,MYNN,LRRC34	NA	NA	NA	NA	TERC	1241	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	169669954	169670204	169670056	Y	SKIL,SKIL,SEC62	SEC62	NA	NA	NA	NA	SEC62	12219	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	170584649	170585013	170584680	Y	NA	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	RPL22L1	1259	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	171495458	171495728	171495684	Y	FNDC3B,PLD1	PP13439,PLD1	NA	NA	NA	NA	PP13439	29986	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	171519572	171519961	171519854	Y	NA	PP13439,PLD1	NA	NA	NA	NA	PP13439	5753	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	171543191	171543627	171543455	Y	FNDC3B,PLD1	PP13439,PLD1	FNDC3B,PLD1,TMEM212	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLD1	16451	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	171853185	171854055	171853751	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	97767	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	171935922	171936083	171936003	Y	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	180504	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	172038895	172038985	172038971	Y	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	BZW1P1	103894	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	172086059	172086253	172086084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BZW1P1	56626	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	174157357	174157932	174157609	Y	NA	NAALADL2	NAALADL2	IMR90	Hi-C	24141950	NAALADL2	2994	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	177979552	177979945	177979765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	808122	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	179182237	179182507	179182372	Y	NA	GNB4	GNB4	IMR90	Hi-C	24141950	GNB4	14859	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	181418145	181418802	181418404	Y	SOX2	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC19	712583	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	181438058	181438556	181438099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC19	732496	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	183003579	183004143	183003750	Y	ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	34547	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.37046139862066
chr3	183024720	183025033	183024891	Y	B3GNT5,KLHL6,KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	55688	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	183254296	183254410	183254310	Y	B3GNT5,KLHL6,KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL24	96946	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	185034789	185035224	185034953	Y	NA	EHHADH,MAP3K13	NA	NA	NA	NA	MAP3K13	36060	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	185450719	185450896	185450815	Y	NA	C3orf65	NA	NA	NA	NA	C3orf65	22403	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	185956078	185956394	185956322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV5	129971	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	186819692	186820086	186819740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL39L	76610	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	187458720	187459019	187458856	Y	LPP,BCL6,BCL6,BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	2496	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	187574248	187574709	187574377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL6	112733	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	187673173	187673416	187673302	Y	RTP2,BCL6,BCL6	NA	BCL6,LPP,LPP-AS2	IMR90	Hi-C	24141950	LPP	195656	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	188953015	188953026	188953020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1-AS1	883727	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	189006455	189006689	189006536	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1-AS1	830064	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	189632708	189632930	189632825	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1-AS1	203823	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	189793562	189793947	189793945	Y	LEPREL1	LEPREL1-AS1,LEPREL1	NA	NA	NA	NA	LEPREL1-AS1	42806	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	189842010	189842154	189842110	Y	TMEM207	LEPREL1-AS1,LEPREL1	NA	NA	NA	NA	LEPREL1	3784	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	190041292	190041577	190041442	Y	NA	CLDN1	NA	NA	NA	NA	CLDN1	3028	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	190062904	190063381	190063085	Y	LEPREL1,CLDN1,CLDN16	CLDN1	LEPREL1,CLDN1,CLDN16	IMR90	Hi-C	24141950	CLDN1	24640	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	192634153	192634990	192634777	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	203	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	192873675	192873788	192873739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRASLS	83126	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	193207892	193208001	193207949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPA1	100932	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	193851636	193853009	193852912	Y	ATP13A3,HES1	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr3	193859199	193859624	193859359	Y	TMEM44	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	7265	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	194040514	194040910	194040840	Y	HES1	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	176183	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	194561866	194562021	194561957	Y	FAM43A	NA	LOC100507391,XXYLT1,ACAP2	IMR90	Hi-C	24141950	LSG1	170660	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	196064212	196064579	196064504	Y	WDR53,ZDHHC19	TCTEX1D2,TM4SF19	NA	NA	NA	NA	TM4SF19	838	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr3	196377844	196378239	196377963	Y	NA	LINC01063,PIGX	NA	NA	NA	NA	PIGX	13198	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr3	196855650	196855726	196855688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFI2	100963	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	49782	50031	49981	Y	NA	ZNF595	NA	NA	NA	NA	ZNF595	1148	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	683740	684022	683889	Y	GAK,MYL5,MFSD7,PCGF3	MYL5,ATP5I,PCGF3	NA	NA	NA	NA	PCGF3	13515	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	899253	899541	899397	Y	NA	GAK,TMEM175	NA	NA	NA	NA	GAK	24620	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	924714	925388	925028	Y	MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,IDUA,GAK	GAK,TMEM175	NA	NA	NA	NA	TMEM175	539	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	1035263	1035607	1035280	Y	FGFRL1,FGFRL1	FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	33539	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	1184509	1184886	1184846	Y	RNF212,CRIPAK	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP1	56855	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	1562061	1562319	1562152	Y	NA	RP11-1398P2.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1398P2.1	17661	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr4	1712467	1712893	1712787	Y	WHSC1	SLBP,TMEM129,TACC3	NA	NA	NA	NA	SLBP	185	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	1875191	1875366	1875328	Y	NA	LETM1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	WHSC1	4040	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	2414575	2415364	2414914	Y	HAUS3,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,RNF4,RNF4,LOC402160	ZFYVE28,RNF4	NA	NA	NA	NA	ZFYVE28	3026	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	3438789	3438989	3438900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	93297	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	4577048	4577566	4577357	Y	NA	STX18-AS1,STX18	NA	NA	NA	NA	STX18	34975	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	6928884	6929127	6929009	Y	KIAA0232,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	19915	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	6959680	6959690	6959685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	50711	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	7012933	7013112	7013014	Y	NA	TADA2B,CCDC96	NA	NA	NA	NA	TADA2B	28514	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	7510082	7510101	7510091	Y	SORCS2	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	429552	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	7649791	7650390	7650086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	289263	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	7807485	7807548	7807490	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	132105	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	7846072	7846237	7846145	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	93416	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	7905982	7906260	7906100	Y	AFAP1	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	33393	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	10830954	10831154	10831060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF518B	373920	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	12642016	12642195	12642111	Y	NA	RP11-352E6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-352E6.2	1755	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr4	13922430	13922925	13922628	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,C1QTNF7	IMR90	Hi-C	24141950	AC006445.7	290207	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	15596739	15596980	15596942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	84305	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	15684115	15684561	15684231	Y	FBXL5,FAM200B,BST1	FAM200B,FBXL5,BST1,RP11-115L11.1	NA	NA	NA	NA	FBXL5	2813	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	16735880	16736127	16736004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS21P4	479702	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	17483580	17483992	17483821	Y	QDPR,CLRN2	QDPR	NA	NA	NA	NA	QDPR	27865	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	17853657	17853735	17853696	Y	NA	DCAF16,NCAPG	NA	NA	NA	NA	NCAPG	43132	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	21895049	21895394	21895392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR125	620283	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	23335645	23335866	23335720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPARGC1A	567846	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	23879721	23879980	23879976	Y	NA	PPARGC1A	NA	NA	NA	NA	PPARGC1A	23732	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	23947088	23947695	23947571	Y	NA	PPARGC1A	NA	NA	NA	NA	PPARGC1A	43376	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	24263388	24263431	24263410	Y	NA	NA	PPARGC1A	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	320742	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	24322640	24323331	24322979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX15	260842	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	24471602	24472014	24471897	Y	NA	NA	PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	112159	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	24472474	24473298	24472910	Y	NA	NA	PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	110875	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr4	24474307	24474984	24474891	Y	NA	NA	PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	109189	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr4	24660007	24660225	24660117	Y	NA	NA	CCDC149,MIR573	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	75834	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	25672730	25672924	25672817	Y	NA	RP11-302F12.1	NA	NA	NA	NA	RP11-302F12.1	5548	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	25828026	25828318	25828201	Y	NA	SEL1L3	NA	NA	NA	NA	SEL1L3	35064	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	26123354	26123506	26123386	Y	NA	RBPJ	RBPJ,STIM2	IMR90	Hi-C	24141950	RBPJ	39571	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	28621646	28621809	28621725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	1761425	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	30718904	30719447	30718947	Y	PCDH7,PCDH7	PCDH7	NA	NA	NA	NA	PCDH7	590	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	36131031	36131404	36131217	Y	ARAP2	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	112727	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	37956443	37956472	37956456	Y	NA	PTTG2	NA	NA	NA	NA	PTTG2	3584	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	38665008	38665204	38665059	Y	TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	504	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	38836297	38836387	38836342	Y	NA	TLR1,TLR6,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	TLR1,TLR6	20051	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	38857753	38857899	38857797	Y	KLF3,TLR1,TLR6	TLR1,TLR6,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	TLR1,TLR6	1315	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	38859134	38859762	38859410	Y	KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6	TLR1,TLR6,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	TLR1,TLR6	2696	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	5.65315326931022
chr4	39048044	39048301	39048173	Y	KLF3,TLR1,TLR6	TMEM156,KLHL5	NA	NA	NA	NA	KLHL5	3385	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	39285630	39285978	39285919	Y	RFC1	NA	NA	NA	NA	NA	RFC1	80017	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	40240312	40240963	40240621	Y	RHOH,RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP2	183866	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	40674578	40674731	40674666	Y	RBM47	RBM47	RBM47	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBM47	43686	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	40722899	40723292	40723210	Y	RBM47	NA	CHRNA9,RBM47,NSUN7,N4BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBM47	92007	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	40943410	40943552	40943502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	273179	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	41000829	41000972	41000906	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	215759	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	41469951	41470276	41469966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	110327	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	41509451	41509766	41509557	Y	LIMCH1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	149827	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	41936193	41936441	41936268	Y	TMEM33	TMEM33	NA	NA	NA	NA	TMEM33	1056	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr4	47308450	47308659	47308604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD8	155077	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	47473680	47473878	47473784	Y	NA	COMMD8,ATP10D	NA	NA	NA	NA	COMMD8	9944	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	47931737	47931989	47931863	Y	NA	NIPAL1,NFXL1	NA	NA	NA	NA	NFXL1	17084	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	48851417	48851730	48851443	Y	ZAR1,FRYL	OCIAD1	NA	NA	NA	NA	OCIAD1	46188	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	53725752	53726074	53725904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERVMER34-1	109945	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	54338842	54339193	54339023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIP1L1	97032	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	54794044	54794386	54794192	Y	NA	NA	SCFD2,PDGFRA,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	134471	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	54866446	54866641	54866544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHIC2	62216	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	55408742	55408991	55408942	Y	KIT	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFRA	315478	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	66392114	66392503	66392309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-807H7.1	141176	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	66404380	66404519	66404495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-807H7.1	129160	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	66516104	66516284	66516196	Y	NA	RP11-807H7.1,EPHA5	NA	NA	NA	NA	RP11-807H7.1	17395	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	67972662	67972987	67972824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA6	591910	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	74464812	74465326	74464976	Y	RASSF6,RASSF6	NA	NA	NA	NA	NA	IL8	138897	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	74569694	74570920	74570464	Y	ANKRD17,MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2	IL8	MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	IL8	33303	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	74570970	74571346	74571160	Y	MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2,CXCL1	IL8	MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	IL8	32877	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr4	74571543	74571767	74571655	Y	MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2	IL8	MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	IL8	32456	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	74583240	74583435	74583319	Y	ANKRD17,CXCL3,CXCL2,IL8	IL8	MTHFD2L,CXCL3	IMR90	Hi-C	24141950	IL8	20788	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	74588737	74589023	74588915	Y	ANKRD17,CXCL3,CXCL2,IL8	IL8	IL8,CXCL1,CXCL3,CXCL2	IMR90	Hi-C	24141950	IL8	15200	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.37046139862066
chr4	74589677	74589871	74589799	Y	MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8	IL8	IL8,CXCL1,CXCL3,CXCL2	IMR90	Hi-C	24141950	IL8	14352	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	74593361	74593798	74593698	Y	NA	IL8	IL8,RASSF6,PF4V1,CXCL3,CXCL2,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IL8	10425	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr4	74596111	74596370	74596188	Y	MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8	IL8	IL8,RASSF6,PF4V1,CXCL3,CXCL2,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IL8	7853	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	74596602	74597090	74596757	Y	ANKRD17,MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8	IL8	IL8,PF4V1,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,PPBPL2	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IL8	7133	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	74922344	74922785	74922568	Y	IL8,MTHFD2L,EREG,CXCL3,CXCL2	CXCL3,CXCL2	CXCL3	K562	ChIA-PET	22265404	CXCL3	19820	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	74977575	74978125	74977847	Y	NA	CXCL2	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	75070819	75070991	75070879	Y	IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L	NA	NA	NA	NA	NA	MTHFD2L	92928	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	77626325	77626422	77626374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT11	242434	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	77752154	77752315	77752229	Y	NA	NA	SHROOM3,SEPT11,SOWAHB	IMR90	Hi-C	24141950	SEPT11	116541	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	77928518	77929121	77928831	Y	CCNI,CCNG2	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT11	59662	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	77974492	77974926	77974738	Y	CCNI	CCNI	NA	NA	NA	NA	CCNI	20232	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	79083838	79083918	79083865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRAS1	107114	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr4	80900549	80900754	80900650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR2	143854	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	4.11138419586198
chr4	83755588	83755973	83755970	Y	NA	SCD5	NA	NA	NA	NA	SCD5	37578	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	84398625	84398990	84398638	Y	NA	HELQ,MRPS18C,FAM175A	NA	NA	NA	NA	MRPS18C	23540	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	84469544	84469879	84469660	Y	PLAC8,COQ2,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,AGPAT9	FAM175A,AGPAT9	NA	NA	NA	NA	AGPAT9	14477	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	84887961	84887976	84887969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT9	432894	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	85420434	85420908	85420714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDFY3-AS2	464630	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.37046139862066
chr4	87835479	87835856	87835675	Y	NA	AFF1	NA	NA	NA	NA	AFF1	18298	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	87920181	87920277	87920229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFF1	66027	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	88408034	88408084	88408060	Y	SPARCL1	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT9	66300	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	88817372	88817671	88817543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPP1	77148	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	88899947	88900287	88900059	Y	NA	SPP1,RNU1-36P,PKD2	NA	NA	NA	NA	SPP1	5128	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	89377235	89377564	89377513	Y	HERC6,HERC5	HERC5	NA	NA	NA	NA	HERC5	967	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	90212945	90213002	90212979	Y	GPRIN3	GPRIN3	NA	NA	NA	NA	GPRIN3	14159	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	90215736	90216024	90215874	Y	GPRIN3	GPRIN3	NA	NA	NA	NA	GPRIN3	11137	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	90224802	90225147	90225000	Y	FAM13A,GPRIN3	GPRIN3	NA	NA	NA	NA	GPRIN3	2014	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	90226723	90227111	90227016	Y	GPRIN3	GPRIN3	NA	NA	NA	NA	GPRIN3	50	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	92519231	92519397	92519314	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNCA	1761765	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	95273130	95273620	95273286	Y	HPGDS	HPGDS	NA	NA	NA	NA	HPGDS	11103	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	95406092	95406259	95406175	Y	NA	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	35055	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	96133625	96133991	96133679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL30P6	430453	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	103320279	103320457	103320336	Y	SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,NFKB1,MANBA	SLC39A8	NA	NA	NA	NA	SLC39A8	29958	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	106226051	106226420	106226239	Y	TET2,TET2	NA	NA	NA	NA	NA	TET2	161019	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	111117471	111117868	111117585	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	487	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	117519495	117520605	117520296	Y	NA	ACTN4P1	NA	NA	NA	NA	ACTN4P1	2178	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	119629667	119629850	119629760	Y	NA	METTL14	NA	NA	NA	NA	METTL14	25144	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	119756174	119756657	119756269	Y	NA	SEC24D	NA	NA	NA	NA	SEC24D	1181	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr4	120458820	120459280	120459019	Y	PDE5A,PDE5A,PDE5A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	84874	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	122077221	122077584	122077249	Y	TNIP3	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM5	235196	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	122606332	122606884	122606598	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	9384	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	124709037	124709145	124709084	Y	SPRY1	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY1	393087	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	125634465	125634726	125634691	Y	NA	ANKRD50	NA	NA	NA	NA	ANKRD50	2578	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	128990801	128990842	128990822	Y	NA	LARP1B	NA	NA	NA	NA	LARP1B	10378	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	129275726	129275798	129275762	Y	NA	NA	PHF17,LARP1B,SCLT1,C4orf33,PGRMC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-420A23.1	63820	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	129308281	129308471	129308363	Y	NA	NA	PGRMC2,PHF17,LARP1B,SCLT1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-420A23.1	96375	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	139156559	139157143	139156950	Y	SLC7A11	SLC7A11	NA	NA	NA	NA	SLC7A11	4360	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	139173167	139173319	139173175	Y	NA	SLC7A11	SLC7A11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC7A11	11664	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	139177153	139177364	139177274	Y	SLC7A11	SLC7A11	SLC7A11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC7A11	15650	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr4	139182736	139183009	139182873	Y	SLC7A11	SLC7A11	SLC7A11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC7A11	21233	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	140321405	140321719	140321434	Y	ELF2,NAA15,RAB33B	NA	NA	NA	NA	NA	RAB33B	50667	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	140650307	140650710	140650510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	65385	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	140696118	140696274	140696196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	111196	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	140924986	140925148	140925064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	148190	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	141012548	141012827	141012747	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	60511	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr4	141015706	141016341	141016156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	56997	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr4	141016837	141017139	141016990	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	56199	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	141017143	141017617	141017414	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	55721	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	141071687	141072625	141072041	Y	MAML3	MAML3	NA	NA	NA	NA	MAML3	713	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	141118561	141118903	141118732	Y	NA	MAML3	MGST2,MAML3,LOC100129858,SCOC	IMR90	Hi-C	24141950	MAML3	45223	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	141174275	141174653	141174618	Y	NA	SCOC	MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SCOC	1787	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	143185718	143186074	143185891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	580511	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	143488504	143488630	143488569	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	277955	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	144271294	144271615	144271412	Y	NA	GAB1	NA	NA	NA	NA	GAB1	15379	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr4	145956046	145956369	145956259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCE1	60715	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	146656396	146656737	146656614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAA	118981	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	146703198	146703494	146703347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF827	154293	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	146764373	146764705	146764540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF827	93082	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	150806012	150806019	150806016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLK2	191407	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	150977820	150977939	150977880	Y	NA	DCLK2	DCLK2	IMR90	Hi-C	24141950	DCLK2	19487	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	152033251	152033470	152033361	Y	NA	RPS3A	NA	NA	NA	NA	RPS3A	14526	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	153461614	153461859	153461737	Y	NA	FBXW7,MIR4453	NA	NA	NA	NA	MIR4453	6198	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	153717992	153718074	153718038	Y	NA	TIGD4,ARFIP1	NA	NA	NA	NA	ARFIP1	18903	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	153858553	153859077	153858605	Y	TRIM2,FHDC1	RP11-206F17.2,FHDC1	ARFIP1,FHDC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FHDC1	3049	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr4	153884926	153884958	153884941	Y	NA	RP11-206F17.2,FHDC1	NA	NA	NA	NA	FHDC1	29422	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr4	157867687	157867968	157867878	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	22578	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	159130594	159130739	159130610	Y	TMEM144	RP11-597D13.9,FAM198B,TMEM144	NA	NA	NA	NA	TMEM144	9838	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	164512914	164513104	164513008	Y	MARCH1	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	248930	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	164876357	164876532	164876526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-39C10.1	230931	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr4	165210734	165210789	165210744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-39C10.1	103271	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	165882303	165882624	165882495	Y	CPE,C4orf39	RP11-366M4.2,NACA3P	NA	NA	NA	NA	NACA3P	19861	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	166315734	166315907	166315821	Y	NA	CPE	NA	NA	NA	NA	CPE	35388	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	167737971	167738147	167738059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA10	1273519	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	169490335	169490520	169490463	Y	PALLD	DDX60L	NA	NA	NA	NA	DDX60L	33398	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr4	169559850	169560019	169559874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	102913	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	169595912	169596309	169596196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	138975	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	169705913	169706245	169706080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	223181	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	169849945	169850177	169850075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	79249	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	170172551	170172946	170172870	Y	NA	SH3RF1	NA	NA	NA	NA	SH3RF1	17310	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	170543360	170543629	170543529	Y	NEK1,CLCN3	NEK1,CLCN3	C4orf27	IMR90	Hi-C	24141950	CLCN3	11576	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	170548136	170548389	170548218	Y	NEK1,CLCN3	NEK1,CLCN3	C4orf27	IMR90	Hi-C	24141950	CLCN3	16352	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	170570348	170570457	170570384	Y	NA	NEK1,CLCN3	NA	NA	NA	NA	CLCN3	38564	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	176452577	176452812	176452695	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR17	532173	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	176922084	176922777	176922424	Y	GPM6A,WDR17,GPM6A	NA	NA	NA	NA	NA	WDR17	62208	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	178229393	178229664	178229462	Y	NA	NEIL3	NA	NA	NA	NA	NEIL3	403	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	180979072	180979692	180979379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-45P	1943057	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	182826694	182826707	182826700	Y	NA	NA	ODZ3	IMR90	Hi-C	24141950	AC108142.1	237695	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	184319940	184320161	184319981	Y	NA	CDKN2AIP	WWC2,CLDN22,CDKN2AIP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIP	43583	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	184330014	184330225	184330125	Y	CDKN2AIP	CDKN2AIP	WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIP	33519	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	185115354	185115759	185115584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-739P1.2	208523	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	185186820	185187542	185187472	Y	IRF2,CASP3	NA	IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2	206192	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr4	185189434	185189785	185189717	Y	IRF2,CASP3	NA	IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111,MLF1IP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2	203949	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	185298493	185298859	185298858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	94875	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	185609676	185609967	185609740	Y	NA	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	41013	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr4	186306025	186306048	186306047	Y	NA	ANKRD37,UFSP2,C4orf47	NA	NA	NA	NA	ANKRD37	9127	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	186481104	186481365	186481225	Y	NA	PDLIM3	PDLIM3,SORBS2	IMR90	Hi-C	24141950	PDLIM3	26338	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	186818044	186818172	186818109	Y	SORBS2	NA	NA	NA	NA	NA	TLR3	170134	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	186823839	186824139	186824048	Y	CCDC110,SORBS2	NA	NA	NA	NA	NA	TLR3	164167	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	187762182	187762435	187762391	Y	NA	NA	FAT1,LOC339975	IMR90	Hi-C	24141950	FAT1	116306	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	189048639	189048958	189048819	Y	NA	TRIML2	NA	NA	NA	NA	TRIML2	19882	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr4	190504163	190504534	190504471	Y	FRG1	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	124334	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	190708637	190708848	190708802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	79769	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr4	190937232	190937266	190937251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	77289	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr4	190942271	190942591	190942322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	82328	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr5	53990	54174	54063	Y	PLEKHG4B,C5orf55	NA	LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC127	162156	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	373392	373627	373429	Y	EXOC3,C5orf55,PDCD6	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67631	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	400756	401055	400906	Y	NA	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	40203	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	523225	523441	523256	Y	SLC9A3	SLC9A3	NA	NA	NA	NA	SLC9A3	778	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	523686	523917	523764	Y	SLC9A3	SLC9A3	NA	NA	NA	NA	SLC9A3	1239	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr5	656184	656577	656381	Y	SLC9A3,ZDHHC11,TPPP	CEP72,TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	34933	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr5	671573	671920	671762	Y	TPPP	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	19590	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	672861	673336	673024	Y	NA	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18174	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.71307674827583
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	TPPP	93141	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr5	1022145	1022187	1022166	Y	SLC6A18,NKD2	NKD2	NA	NA	NA	NA	NKD2	15201	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	5376440	5376820	5376639	Y	NA	KIAA0947	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	41957	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	5423578	5423857	5423693	Y	KIAA0947	KIAA0947	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	4801	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-332J15.3	50027	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	5.13923024482748
chr5	6766717	6766947	6766763	Y	SRD5A1,PAPD7	RP11-332J15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-332J15.3	2713	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	6961316	6961478	6961397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-332J15.3	197312	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	7784884	7784893	7784889	Y	ADCY2	NA	NA	NA	NA	NA	MTRR	64406	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	10422961	10423316	10423021	Y	NA	ROPN1L	NA	NA	NA	NA	ROPN1L	16320	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	10485180	10485474	10485337	Y	NA	ROPN1L,RPL30P7	NA	NA	NA	NA	RPL30P7	1458	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	10631579	10631933	10631756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD33B	69137	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	10743646	10743952	10743932	Y	NA	DAP	NA	NA	NA	NA	DAP	15432	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	10996392	10996605	10996573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	237008	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	11035965	11036506	11036174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	276581	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	12658501	12658830	12658774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNND2	756346	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	14109130	14109647	14109337	Y	NA	TRIO	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIO	32164	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	14268390	14268821	14268476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	126579	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	14404233	14404452	14404428	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	FAM105A	175432	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	14489488	14489835	14489662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM105A	90049	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	16894604	16895174	16894829	Y	NA	CTB-55B8.1,MYO10	NA	NA	NA	NA	CTB-55B8.1	5576	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	17118695	17119132	17119047	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	BASP1	54988	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	17154796	17154999	17154850	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	AC091878.1	60157	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	17177639	17177702	17177672	Y	NA	AC091878.1	NA	NA	NA	NA	AC091878.1	37454	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	17192994	17193219	17193125	Y	NA	AC091878.1	NA	NA	NA	NA	AC091878.1	21937	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	17224986	17225514	17225115	Y	BASP1	AC091878.1	NA	NA	NA	NA	AC091878.1	9830	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	17249327	17249860	17249454	Y	NA	AC091878.1	NA	NA	NA	NA	AC091878.1	34171	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	17255490	17256325	17255691	Y	BASP1	AC091878.1	NA	NA	NA	NA	AC091878.1	40334	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	17282496	17282827	17282587	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	60898	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	17302170	17302536	17302353	Y	BASP1	RN7SKP133	BASP1,LOC285696	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RN7SKP133	41189	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	17302742	17303327	17302998	Y	BASP1	RN7SKP133,FTH1P10	BASP1,LOC285696	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RN7SKP133	40398	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.88438442310341
chr5	23303766	23303789	23303778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH10	1339298	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	24549413	24549679	24549546	Y	CDH10	NA	NA	NA	NA	NA	CDH10	93408	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	24614672	24615059	24614866	Y	NA	CDH10	NA	NA	NA	NA	CDH10	28028	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD29	1100991	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.71307674827583
chr5	26847119	26847280	26847167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD29	2037529	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	29796154	29796219	29796166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL19P11	1255453	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.88438442310341
chr5	32366924	32367006	32366965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR12	55809	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	32391012	32391652	32391274	Y	SUB1	NA	NA	NA	NA	NA	ZFR	51215	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	32768263	32768639	32768422	Y	SUB1	NA	NA	NA	NA	NA	NPR3	81087	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	33442170	33442454	33442303	Y	NA	CTD-2203K17.1,TARS	NA	NA	NA	NA	TARS	3368	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	33807297	33807469	33807384	Y	ADAMTS12	NA	NA	NA	NA	NA	AMACR	198751	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	34525926	34526105	34525960	Y	NA	NA	RAI14,RAD1,BRIX1,TTC23L,DNAJC21	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAI14	128237	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	34585438	34585952	34585758	Y	RAI14,RAI14	NA	RAI14	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAI14	68390	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	36151218	36151404	36151252	Y	C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	1127	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	36174356	36174616	36174412	Y	SLC1A3,SLC1A3,RANBP3L,C5orf33,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	24265	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	38446340	38446486	38446390	Y	EGFLAM	CTD-2263F21.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2263F21.1	19955	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	38660472	38660667	38660594	Y	LIFR	NA	EGFLAM,LIFR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIFR	54016	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	38854077	38854436	38854323	Y	OSMR,OSMR	CTD-2127H9.1,OSMR	NA	NA	NA	NA	OSMR	10117	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	38866844	38867106	38866976	Y	NA	CTD-2127H9.1,OSMR	NA	NA	NA	NA	OSMR	22884	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	39178902	39179192	39179129	Y	RICTOR	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	106392	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	39249966	39250313	39250140	Y	RICTOR,FYB	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	177456	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	41446274	41446654	41446465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OXCT1	421967	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	42949793	42950117	42950048	Y	ZNF131,C5orf39	NA	LOC648987,LOC153684	IMR90	Hi-C	24141950	SEPP1	64299	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	42994649	42995346	42995172	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	21185	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.56961512241374
chr5	43007637	43008177	43007831	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	8354	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	43020158	43020617	43020275	Y	C5orf28,ZNF131,C5orf39	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	3627	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	43303282	43303485	43303367	Y	NA	HMGCS1	NA	NA	NA	NA	HMGCS1	8129	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	51270919	51270989	51270955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA1	810741	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	52630176	52630365	52630298	Y	NA	NA	ARL15	IMR90	Hi-C	24141950	FST	143874	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	52714720	52715039	52714904	Y	NA	NA	ARL15	IMR90	Hi-C	24141950	FST	59200	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	53298305	53298413	53298402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	305999	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	54722913	54723133	54723024	Y	SKIV2L2	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	101396	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	55289605	55289989	55289924	Y	IL6ST	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2031P19.3	610	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	57953324	57953469	57953397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	77276	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	58156479	58156810	58156634	Y	GAPT,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	280431	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	58255899	58256231	58256006	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	379851	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	58316206	58316509	58316424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	440158	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	58358500	58358548	58358538	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	482452	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	58359884	58360252	58360059	Y	RAB3C,PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	483836	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	58365928	58366326	58366127	Y	PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	489880	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	58374119	58374354	58374236	Y	PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	498071	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	58391200	58391585	58391393	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	515152	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	58395760	58396044	58395902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	519712	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	58400134	58400374	58400226	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	524086	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	58418380	58418697	58418552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	542332	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	58420146	58420252	58420199	Y	PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	544098	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	58421119	58421626	58421279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	545071	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr5	58422372	58422713	58422580	Y	PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	546324	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	58423311	58423752	58423511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	547263	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	58445128	58445519	58445324	Y	PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	569080	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	58497739	58497828	58497784	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	621691	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	58508843	58508938	58508881	Y	PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	632795	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	58816932	58817290	58817225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	940884	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	58866470	58866828	58866806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	914712	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	58926109	58926323	58926216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	855217	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	58951498	58952014	58951831	Y	PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	829526	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	59042319	59042506	59042428	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	739034	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	59045613	59045932	59045792	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	735608	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	59056590	59056824	59056644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	724716	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	59070253	59070532	59070393	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	711008	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	59084884	59085044	59084964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	696496	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	59086263	59086677	59086406	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	694863	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	59171284	59171310	59171298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	610230	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	59173236	59173442	59173374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	608098	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr5	59183388	59183889	59183871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	597651	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	59482252	59482435	59482368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	299105	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr5	59492329	59492580	59492443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	288960	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.71307674827583
chr5	59618984	59619244	59619114	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	162296	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr5	59630308	59630442	59630415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	151098	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	59702985	59703129	59703057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	78411	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	59735221	59735571	59735396	Y	PDE4D	PART1	NA	NA	NA	NA	PART1	45969	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	59743173	59743572	59743444	Y	NA	PART1	NA	NA	NA	NA	PART1	37968	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr5	59834380	59834549	59834441	Y	NA	PDE4D	NA	NA	NA	NA	PDE4D	18433	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	59836852	59837180	59836950	Y	ELOVL7	PDE4D	NA	NA	NA	NA	PDE4D	20905	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	60315642	60315784	60315678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFAF2	76686	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	60597691	60598057	60597813	Y	NA	ZSWIM6	ZSWIM6,C5orf43	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZSWIM6	28043	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr5	60626321	60626538	60626370	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	221	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	60629089	60629454	60629159	Y	NA	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	2989	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	60629701	60630027	60629731	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	3601	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	64328123	64328532	64328278	Y	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	NA	CWC27	265366	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	64331292	64332267	64331637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWC27	268535	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	64368719	64369105	64368844	Y	FAM159B	NA	ADAMTS6,CWC27	IMR90	Hi-C	24141950	CWC27	305962	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	64504102	64504227	64504158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	271520	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	64505244	64505511	64505327	Y	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	270236	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	64710773	64711167	64710966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	64580	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	64796548	64796879	64796719	Y	PPWD1,CENPK	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	20801	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	SLC30A5	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	48595	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr5	70772003	70772134	70772073	Y	NA	BDP1	NA	NA	NA	NA	BDP1	22561	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	71045616	71045849	71045733	Y	NA	NA	MCCC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MCCC2	164501	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	71659094	71659472	71659166	Y	NA	PTCD2,MRPS27	NA	NA	NA	NA	MRPS27	44621	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	72138720	72138932	72138785	Y	TNPO1	TNPO1	NA	NA	NA	NA	TNPO1	28581	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr5	72659896	72660226	72660062	Y	NA	NA	FOXD1,BTF3,FCHO2,TMEM171,TMEM174	IMR90	Hi-C	24141950	FOXD1	82126	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	72792808	72793048	72792966	Y	NA	BTF3	NA	NA	NA	NA	BTF3	575	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	73926262	73926632	73926507	Y	FAM169A	HEXB,ENC1	NA	NA	NA	NA	HEXB	7216	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr5	74997783	74997822	74997793	Y	COL4A3BP,COL4A3BP	POC5	NA	NA	NA	NA	POC5	13491	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	75817951	75818026	75817987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	F2RL2	99233	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	76034658	76035100	76034908	Y	IQGAP2	F2R	NA	NA	NA	NA	F2R	24790	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	76086859	76087104	76086921	Y	F2R,F2RL1	F2RL1	NCRUPAR,F2R,IQGAP2	IMR90	Hi-C	24141950	F2RL1	25654	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	77800435	77801147	77800993	Y	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	146096	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	77830052	77831195	77830385	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	175713	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	78686873	78686981	78686927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-451P13.1	108132	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	80551638	80551938	80551834	Y	NA	CKMT2-AS1,ZCCHC9	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	43441	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	82768408	82768816	82768560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM167A	396726	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	82807080	82807411	82807109	Y	XRCC4,VCAN	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM167A	435398	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	83588624	83588917	83588807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	89328	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	86619148	86619498	86619336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA1	57443	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	86662563	86662890	86662661	Y	RASA1,RASA1	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	43946	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	87956632	87957169	87956907	Y	MEF2C,MEF2C	CTC-467M3.1	NA	NA	NA	NA	CTC-467M3.1	12867	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	88124507	88124863	88124685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2C-AS1	52282	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	88171082	88171456	88171409	Y	MEF2C	MEF2C-AS1,MEF2C	NA	NA	NA	NA	MEF2C-AS1	5689	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	93768342	93768439	93768383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD32	183613	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	93853995	93854051	93854006	Y	ANKRD32	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD32	98001	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	94033836	94034405	94034124	Y	KIAA0825,ANKRD32	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0825	81527	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	3.9400765210344
chr5	94038768	94039036	94038830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0825	86459	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	94380006	94380293	94380145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP1	237986	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	94395359	94395872	94395571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP1	222407	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	95094861	95094991	95094889	Y	NA	RHOBTB3,CTD-2154I11.2	GLRX	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2154I11.2	28862	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr5	95170754	95171173	95170855	Y	GLRX,ELL2	GLRX,AC008592.5	RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	14045	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr5	95177682	95177989	95177809	Y	GLRX,ELL2	GLRX,AC008592.5	GLRX,SPATA9,RFESD,RHOBTB3,C5orf27	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC008592.5	17501	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	95179469	95179934	95179619	Y	NA	GLRX,AC008592.5	GLRX,SPATA9,RFESD,RHOBTB3,C5orf27	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC008592.5	15556	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	95199166	95199388	95199264	Y	GLRX,ELL2	GLRX,AC008592.5	NA	NA	NA	NA	AC008592.5	3676	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	95482384	95482735	95482679	Y	NA	NA	ELL2	IMR90	Hi-C	24141950	ELL2	186609	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	95562741	95563074	95562934	Y	NA	NA	ELL2,RHOBTB3,GLRX,C5orf27,MIR583,PCSK1,SPATA9	IMR90	Hi-C	24141950	ELL2	266966	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	95845653	95846023	95845804	Y	NA	CAST	NA	NA	NA	NA	CAST	12948	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	95853104	95853290	95853183	Y	ERAP1	CAST	PCSK1,CAST	IMR90	Hi-C	24141950	CAST	5681	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	95901647	95901819	95901752	Y	NA	CAST	PCSK1,CAST,ELL2,C5orf27,SPATA9	IMR90	Hi-C	24141950	CAST	42676	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.37046139862066
chr5	96022483	96022592	96022538	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERAP1	119211	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	98175322	98175662	98175493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGMB-AS1	68149	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	98197255	98197391	98197342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	65484	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	98262747	98263243	98263080	Y	CHD1	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	99382569	99383254	99382906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	485712	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	99386410	99387139	99386777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	481827	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	99389717	99390411	99390143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	478555	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	103273913	103274153	103274008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-140P	158422	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	103465253	103465580	103465434	Y	NA	RNU1-140P	NA	NA	NA	NA	RNU1-140P	32678	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	106803068	106803432	106803267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	201164	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	106805205	106805528	106805416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	199068	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr5	106806041	106806198	106806107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	198398	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	106837531	106838094	106837969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	166502	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	106900103	106900354	106900202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	104242	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	106906858	106907181	106907119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	97415	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	106967635	106967784	106967710	Y	NA	EFNA5	NA	NA	NA	NA	EFNA5	36812	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	107004755	107005118	107004922	Y	NA	EFNA5	NA	NA	NA	NA	EFNA5	159	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	107179705	107179785	107179745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	175109	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	108137615	108137706	108137661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FER	56092	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	108170397	108170414	108170406	Y	FER	NA	NA	NA	NA	NA	FER	88874	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	108391550	108391948	108391605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FER	310027	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	108735031	108735161	108735096	Y	NA	PJA2	NA	NA	NA	NA	PJA2	8534	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	108747394	108747617	108747516	Y	MAN2A1	PJA2	NA	NA	NA	NA	PJA2	3699	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	110057836	110058086	110057958	Y	NA	SLC25A46,TMEM232	NA	NA	NA	NA	SLC25A46	13751	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr5	110865894	110866475	110866210	Y	STARD4	STARD4	NA	NA	NA	NA	STARD4	19606	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr5	112219334	112219897	112219506	Y	NA	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	24415	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	112383528	112383665	112383560	Y	DCP2,YTHDC2	NA	NA	NA	NA	NA	DCP2	73129	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	112395053	112395446	112395196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP2	84654	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	112585066	112585229	112585152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCC	237298	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	112628840	112629057	112628905	Y	MCC,MCC	NA	NA	NA	NA	NA	MCC	193470	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	114726097	114726311	114726134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC112	95569	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	114847596	114847935	114847760	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	30656	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr5	114959651	114959879	114959766	Y	COMMD10	TMED7	NA	NA	NA	NA	TMED7-TICAM2	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	115420076	115420175	115420113	Y	LOC644100	CTD-2287O16.1,COMMD10	NA	NA	NA	NA	COMMD10	1388	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	118597128	118597415	118597272	Y	NA	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	4972	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	118670685	118671156	118670901	Y	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	68298	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr5	120609806	120610048	120609927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRFBP1	685608	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	122885327	122885717	122885442	Y	CEP120,CSNK1G3	CSNK1G3	NA	NA	NA	NA	CSNK1G3	39534	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	124473209	124473536	124473320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-436H11.1	330283	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	126847905	126848122	126848004	Y	NA	PRRC1	PRRC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	PRRC1	3179	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr5	127211761	127211779	127211769	Y	NA	NA	SLC12A2,FLJ33630,PRRC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC12A2	205679	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	131074214	131074509	131074363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP1	56201	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	131108111	131108375	131108174	Y	NA	FNIP1	NA	NA	NA	NA	FNIP1	22335	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	131764930	131765294	131765112	Y	NA	C5orf56	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	C5orf56	20602	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	131800033	131800450	131800090	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	IRF1	NA	NA	NA	NA	IRF1	24040	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	131832561	131832909	131832704	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8071	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,AC010240.3,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AC010240.3	1685	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr5	132851323	132851715	132851519	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSTL4	94540	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	133259809	133260031	133259966	Y	NA	C5orf15	FSTL4,HSPA4	IMR90	Hi-C	24141950	C5orf15	42447	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	133466882	133467138	133467027	Y	PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7,SKP1	NA	NA	NA	NA	TCF7	18480	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	133801466	133801754	133801589	Y	NA	AC005355.1	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.1	31064	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr5	133863130	133863560	133863438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005355.1	92728	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr5	133880902	133881116	133881009	Y	PCBD2,CDKL3,PHF15	NA	NA	NA	NA	NA	SEC24A	101363	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	246	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.05569209793099
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12,MIR4461	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr5	134471631	134472059	134471710	Y	C5orf20,PITX1	NA	PCBD2,LOC340073,CATSPER3,H2AFY,PITX1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTC-276P9.1	97894	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.37046139862066
chr5	134475601	134475808	134475692	Y	PITX1	NA	LOC340073,PCBD2,CATSPER3,H2AFY	IMR90	Hi-C	24141950	CTC-276P9.1	101864	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	135361559	135361923	135361880	Y	NA	TGFBI	NA	NA	NA	NA	TGFBI	661	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	136727566	136727823	136727577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOCK1	204245	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	136770007	136770201	136770104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOCK1	161867	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	136795919	136796307	136796181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOCK1	135761	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	136900041	136900222	136900186	Y	NA	SPOCK1	TRPC7	IMR90	Hi-C	24141950	SPOCK1	31846	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr5	137370531	137370718	137370637	Y	PKD2L2,KDM3B,FAM53C,FAM53C,FAM13B,NME5	FAM13B	PKD2L2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM13B	14932	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.22699977275857
chr5	137868208	137868538	137868536	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	8451	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	137870529	137870619	137870574	Y	FAM53C,KDM3B,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	6370	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	138277949	138278244	138278038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATR3	329197	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	138325344	138325620	138325482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATR3	281821	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	138620359	138620541	138620439	Y	UBE2D2,MATR3	MATR3,SIL1	NA	NA	NA	NA	SIL1	6705	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr5	138686401	138686737	138686569	Y	NA	PAIP2	NA	NA	NA	NA	PAIP2	11125	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	138897527	138897822	138897662	Y	MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2	TMEM173,UBE2D2	DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2D2	6194	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	138965572	138965797	138965632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	59087	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr5	139090940	139091124	139091019	Y	NA	NA	CXXC5	K562	ChIA-PET	22265404	CXXC5	66056	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	139091629	139092020	139091912	Y	NA	NA	CXXC5,UBE2D2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CXXC5	66745	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	139167686	139167904	139167758	Y	NA	NA	CXXC5,UBE2D2,DNAJC18,NRG2,PSD2,CYSTM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CXXC5	142802	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	139638984	139639383	139639269	Y	C5orf32,ZMAT2,SRA1,IK,HARS2,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	41323	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	140090601	140091006	140090806	Y	NA	WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-3	12737	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr5	140098281	140098628	140098472	Y	NA	HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-3	5115	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	140420005	140420137	140420073	Y	NA	NA	PCDHA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PCDHB2	52090	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr5	140983787	140984197	140984031	Y	PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1	DIAPH1,HDAC3,RELL2,FCHSD1	NA	NA	NA	NA	DIAPH1	12425	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	141589976	141590075	141590026	Y	NA	NA	FGF1,GNPDA1,SPRY4,NDFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	NDFIP1	103906	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	141736379	141736797	141736670	Y	ARHGAP26	SPRY4	NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPRY4	32359	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr5	141844342	141844631	141844489	Y	NA	NA	SPRY4,GNPDA1,NDFIP1,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	140322	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	142182965	142183820	142183151	Y	ARHGAP26	ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	35016	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	142357164	142357537	142357332	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	209215	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	143267812	143268155	143268024	Y	NA	NA	ARHGAP26,NR3C1,YIPF5	IMR90	Hi-C	24141950	YIPF5	280123	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	143578105	143578377	143578180	Y	YIPF5	YIPF5,KCTD16	NA	NA	NA	NA	KCTD16	29709	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr5	145498086	145498488	145498483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	61735	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	146783633	146784144	146783972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK32A	171107	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	148172345	148172765	148172447	Y	FBXO38,ADRB2	NA	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3	IMR90	Hi-C	24141950	SH3TC2	267961	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	148533618	148533717	148533668	Y	NA	ABLIM3	NA	NA	NA	NA	ABLIM3	14572	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	148600871	148601299	148600941	Y	ARHGEF37,SH3TC2	AFAP1L1	AFAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	AFAP1L1	48135	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	149339062	149339484	149339111	Y	CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3	SLC26A2,HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	SLC26A2	762	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr5	149379132	149379170	149379142	Y	NA	SLC26A2,HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	TIGD6	402	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	149422019	149422297	149422100	Y	NA	HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	TIGD6	43289	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	149518246	149518623	149518550	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIGD6	139516	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	149522462	149523132	149522666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIGD6	143732	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr5	150144156	150144495	150144295	Y	NA	DCTN4	C5orf62,DCTN4,RBM22	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	DCTN4	7485	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	150630662	150630980	150630918	Y	NA	GM2A,CCDC69	NA	NA	NA	NA	CCDC69	28956	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	151088912	151089056	151088970	Y	SLC36A3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-54C4.1	54883	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	151200780	151201112	151200835	Y	GLRA1	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	50687	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	153743049	153743076	153743063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAP30L	80441	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	155211653	155211669	155211662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	893023	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	156718541	156718931	156718583	Y	HAVCR2,ADAM19,CYFIP2,CYFIP2,CYFIP2	CYFIP2	NA	NA	NA	NA	CYFIP2	27452	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	157097652	157097963	157097872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THG1L	58242	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	158489129	158489509	158489418	Y	NA	EBF1,RP11-175K6.1	NA	NA	NA	NA	EBF1	35260	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	158854760	158855055	158854852	Y	EBF1	NA	NA	NA	NA	NA	UBLCP1	166671	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	159414162	159414427	159414404	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	19693	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	163631602	163631918	163631788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-340A15.2	89784	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	163767017	163767182	163767164	Y	NA	CTC-340A15.2	NA	NA	NA	NA	CTC-340A15.2	45315	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	164595581	164595748	164595665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P20	858568	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	169215174	169215454	169215255	Y	DOCK2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM196B	190290	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	169398141	169398453	169398335	Y	NA	FAM196B	NA	NA	NA	NA	FAM196B	7291	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	169754818	169755156	169755019	Y	LCP2,KCNMB1	NA	KCNIP1,LCP2,LOC257358	IMR90	Hi-C	24141950	FAM196B	349074	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	171298269	171298393	171298371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW11	133484	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	171660495	171660734	171660615	Y	NA	STK10,UBTD2	NA	NA	NA	NA	STK10	47105	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	171681735	171682053	171681977	Y	NA	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	27022	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr5	172192263	172193766	172192583	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2432	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	172198749	172199959	172199636	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2551	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr5	172202171	172203025	172202666	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	5973	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	172228151	172228566	172228394	Y	DUSP1	DUSP1,ERGIC1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERGIC1	30712	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	172257827	172258390	172258174	Y	DUSP1,C5orf41,ERGIC1	ERGIC1	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	888	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	172350033	172350394	172350214	Y	NA	RPL26L1	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	33338	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	172881373	172881649	172881564	Y	CPEB4	NA	LOC285593,STC2,BOD1,CPEB4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STC2	126867	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr5	172882283	172882785	172882503	Y	NA	NA	LOC285593,STC2,BOD1,NKX2-5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STC2	127777	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	172899322	172899544	172899428	Y	NA	NA	LOC285593,STC2,BOD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BOD1	142119	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	173031200	173031306	173031275	Y	NA	BOD1	NA	NA	NA	NA	BOD1	10357	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	173586705	173586920	173586830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB4	273422	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	173811612	173811806	173811713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSX2	337730	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	173846140	173846257	173846227	Y	NA	NA	MSX2,MIR4634	IMR90	Hi-C	24141950	MSX2	303279	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	175960481	175960718	175960661	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,RNF44,CDHR2	RNF44	NA	NA	NA	NA	RNF44	2308	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	175962179	175962700	175962413	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,HK3,HIGD2A,RNF44,CDHR2	RNF44	FAF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNF44	326	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	177041998	177042331	177042024	Y	NSD1	TMED9,B4GALT7	NA	NA	NA	NA	B4GALT7	16897	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	177645267	177645446	177645363	Y	N4BP3,CLK4,AGXT2L2	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15759	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	177647239	177647603	177647383	Y	CLK4,AGXT2L2	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	17731	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	178034122	178034420	178034258	Y	ZNF354B,AGXT2L2,CLK4	CLK4	NA	NA	NA	NA	CLK4	21196	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	179894931	179895217	179894999	Y	NA	CTC-573N18.1,CNOT6	GFPT2,MAPK9,CNOT6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNOT6	24195	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	180611137	180611357	180611292	Y	MGAT1	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	5567	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	180615428	180615595	180615512	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	1329	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	180615864	180616079	180615972	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	845	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	180616521	180617006	180616799	Y	ZFP62,TRIM52,TRIM41	TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr5	180633694	180634117	180633980	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM7	3401	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr5	180634441	180634803	180634658	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM7	4148	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr6	330181	330320	330251	Y	DUSP22	DUSP22	NA	NA	NA	NA	DUSP22	40551	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr6	422827	423098	422962	Y	DUSP22,IRF4	IRF4	NA	NA	NA	NA	IRF4	33088	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	710742	711015	710979	Y	HUS1B	EXOC2	NA	NA	NA	NA	EXOC2	19625	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	1311143	1311466	1311342	Y	NA	FOXQ1	NA	NA	NA	NA	FOXQ1	468	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr6	1311552	1311897	1311757	Y	NA	FOXQ1	NA	NA	NA	NA	FOXQ1	877	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr6	1394442	1394694	1394568	Y	NA	FOXF2	NA	NA	NA	NA	FOXF2	6373	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	1609094	1609758	1609395	Y	FOXC1	FOXC1	NA	NA	NA	NA	FOXC1	413	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr6	1953013	1953362	1953197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	290564	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	2128026	2128199	2128099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	115727	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	2377151	2377429	2377354	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS-AS1	133169	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	2818912	2819151	2819031	Y	SERPINB1	SERPINB1	NA	NA	NA	NA	SERPINB1	21089	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	3238745	3238826	3238788	Y	NA	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	8781	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	3259939	3260435	3260206	Y	NA	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	29975	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	3356099	3356749	3356628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	98507	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	3403581	3403822	3403689	Y	BPHL,SLC22A23	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	51434	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	3427913	3428207	3428060	Y	SLC22A23	SLC22A23	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	27049	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	4613428	4613746	4613742	Y	NA	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	CDYL	90647	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr6	5179288	5179492	5179391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYRM4	79680	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	5287917	5288162	5288028	Y	NA	LYRM4,FARS2	NA	NA	NA	NA	FARS2	28640	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	6687140	6687567	6687361	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	F13A1	367894	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr6	6742676	6742724	6742701	Y	NA	NA	RREB1,SSR1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	363106	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	6885637	6886125	6885854	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	219705	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr6	7137966	7138068	7138020	Y	RIOK1,RIOK1,CAGE1,RREB1,RREB1	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	32136	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	7701709	7702095	7701966	Y	NA	BMP6	MUTED-TXNDC5,PIP5K1P1,EEF1E1-MUTED	IMR90	Hi-C	24141950	BMP6	22935	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	10407698	10407754	10407725	Y	PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	10138	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	10441526	10441791	10441655	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,GCNT2,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A,GCNT2	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	23634	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	11210069	11210603	11210460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELOVL2	167522	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	11212824	11213214	11213068	Y	TMEM170B,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	167367	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	11217429	11217753	11217578	Y	MAK,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	162828	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	11229489	11229708	11229675	Y	TMEM170B,MAK,ELOVL2,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	150873	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	11318376	11319012	11318732	Y	TMEM170B,MAK,LOC221710,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	61569	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	11428073	11428442	11428380	Y	NA	NEDD9	NEDD9,C6orf228,SYCP2L,ELOVL2,ERVFRD-1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD9	47492	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	11439294	11439659	11439465	Y	TMEM170B,ERVFRD-1,NEDD9	NA	NEDD9,C6orf228,ERVFRD-1,ELOVL2,SYCP2L	IMR90	Hi-C	24141950	NEDD9	58713	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	11606636	11606709	11606673	Y	NA	NA	TMEM170B,HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM170B	70698	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	12472967	12473281	12473124	Y	NA	RPL15P3	NA	NA	NA	NA	RPL15P3	39061	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	12729754	12730156	12729835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL15P3	217412	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	14211061	14211714	14211398	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD83	95189	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	14658378	14658636	14658484	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	542506	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	14725890	14726226	14726089	Y	NA	NA	DTNBP1,JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	518301	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr6	14744083	14744613	14744392	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	499914	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	14766593	14766865	14766789	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	477662	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	14777704	14777964	14777898	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	466563	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	11.1349988637929
chr6	16420932	16421664	16421198	Y	MYLIP,ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	184121	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	16673403	16673483	16673443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	85886	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	17016303	17016440	17016335	Y	NA	NA	ATXN1,GMPR	IMR90	Hi-C	24141950	ATXN1	256581	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	18153083	18153444	18153238	Y	RNF144B,NHLRC1,KDM1B	NHLRC1,KDM1B	NA	NA	NA	NA	TPMT	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	20404913	20405227	20404970	Y	MBOAT1	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	4515	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	21141154	21141340	21141254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	450632	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	21587723	21589288	21589205	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2684	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	21947021	21947287	21947156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	355049	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	22145253	22145497	22145375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	553281	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	22148644	22148866	22148767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	556672	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	24584505	24584676	24584669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0319	59707	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr6	24698648	24698887	24698768	Y	NA	TDP2,ACOT13,C6orf62	NA	NA	NA	NA	C6orf62	20177	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	25043414	25043566	25043497	Y	TDP2,C6orf62	NA	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC16A	233740	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST1H3A	25645	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.56961512241374
chr6	26006419	26006453	26006436	Y	NA	TRIM38,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H3A	12265	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	26025834	26026125	26026038	Y	BTN2A1,BTN2A1,TRIM38	HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H4B	354	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HFE,HIST1H4C,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr6	26304989	26305345	26305268	Y	NA	HIST1H3G,HIST1H2BI,HIST1H4H	HCG11,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H2AE,HIST1H2BF,HIST1H2BG,HIST1H3D,HIST1H4E,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H4G,HIST1H2BI,HIST1H3G,HIST1H4H,BTN3A2,BTN2A2,BTN1A1,HMGN4,BTN3A3,HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,ABT1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HIST1H4H	21227	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	26521003	26521206	26521108	Y	HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	927	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	27145729	27146130	27146023	Y	ZNF184	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	30893	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	27513313	27513537	27513433	Y	NA	NA	HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AM,HIST1H3J,HIST1H2BO	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF184	74416	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr6	27640311	27640352	27640335	Y	NA	NA	ZNF391,PRSS16	IMR90	Hi-C	24141950	HIST1H2BL	133357	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	27655687	27656083	27655918	Y	NA	NA	LOC100507173	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HIST1H2BL	117626	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	27798416	27798741	27798578	Y	NA	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H4K	1111	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	27807310	27807672	27807617	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BN	2987	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	28072476	28072872	28072543	Y	HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192	ZSCAN16	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	17466	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	28101066	28101269	28101177	Y	OR2B2,ZNF187,ZKSCAN4,ZSCAN16	ZSCAN16,ZNF192P1	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	10728	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	28180543	28180884	28180590	Y	NA	ZKSCAN4	NA	NA	NA	NA	ZKSCAN4	44127	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	28299231	28299616	28299424	Y	GPX6,ZSCAN23,SCAND3,OR2B2,ZNF193,ZNF187,PGBD1	ZKSCAN3	NA	NA	NA	NA	ZKSCAN3	16075	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	28302002	28302386	28302196	Y	NA	ZKSCAN3	NA	NA	NA	NA	ZKSCAN3	13305	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	28414953	28415259	28415025	Y	NA	ZSCAN12	NA	NA	NA	NA	ZSCAN12	49442	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	28457225	28458028	28457315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN12	91714	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	8.05146071689638
chr6	28601930	28602271	28602104	Y	NA	SCAND3	NA	NA	NA	NA	SCAND3	19941	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	28715387	28715696	28715451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXbac-BPG308K3.5	89087	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	29932777	29932958	29932802	Y	HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A	HLA-K,HLA-A,HLA-J	NA	NA	NA	NA	HLA-A	25740	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.54176907344824
chr6	29933738	29934144	29933980	Y	NA	HLA-K,HLA-A,HLA-J	NA	NA	NA	NA	HLA-A	26701	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr6	30453844	30454132	30453996	Y	ZNRD1,TUBB	RANP1,HLA-E	HLA-E	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HLA-E	1112	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr6	30840574	30840974	30840689	Y	ABCF1,C6orf136	DDR1,GTF2H4,VARS2	DHX16,VARS2,DPCR1,DDR1,MUC22,CCHCR1,MDC1,PPP1R18,NRM,TUBB,IER3,FLOT1,SFTA2,PSORS1C1,C6orf15,PSORS1C2	IMR90	Hi-C	24141950	DDR1	1224	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr6	32050642	32051035	32051003	Y	LY6G6C,TNXB,PPT2,PPT2,TNXB	ATF6B,FKBPL	NA	NA	NA	NA	ATF6B	42995	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr6	32051111	32051460	32051307	Y	NA	ATF6B,FKBPL	NA	NA	NA	NA	ATF6B	42570	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	32075999	32076179	32076125	Y	LY6G6C,TNXB,RNF5,EGFL8,TNXB	ATF6B,FKBPL,PPT2	NA	NA	NA	NA	ATF6B	17851	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	32114130	32114430	32114186	Y	GPANK1,GPANK1,LY6G5C,DOM3Z,FKBPL	ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8,AGPAT1,RNF5,XXbac-BPG300A18.13,PBX2,GPSM3	NA	NA	NA	NA	PPT2	4788	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	33129390	33129479	33129402	Y	NA	SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1	NA	NA	NA	NA	SLC39A7	36743	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	33792376	33792455	33792405	Y	CUTA,C6orf1	LEMD2	IP6K3,GRM4,RPS10-NUDT3,C6orf106,LEMD2,LOC100507584,MIR1275	IMR90	Hi-C	24141950	LEMD2	37463	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	34191726	34192136	34191830	Y	C6orf1,HMGA1	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CYCSP55	6510	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	34514432	34514838	34514655	Y	NA	RP3-391O22.3	NA	NA	NA	NA	RP3-391O22.3	27595	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	35035271	35035638	35035433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKS1A	180229	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	35228332	35228733	35228603	Y	PPARD,ZNF76	ZNF76,DEF6	NA	NA	NA	NA	ZNF76	3646	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	37070053	37070857	37070460	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	65122	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	37098455	37099411	37099295	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2	IMR90	Hi-C	24141950	PIM1	36568	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	37104908	37105418	37105405	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	30561	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	40904550	40904902	40904649	Y	UNC5CL	NA	APOBEC2,C6orf130,TSPO2,UNC5CL	IMR90	Hi-C	24141950	NFYA	133782	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	41412168	41412234	41412201	Y	FRS3	NA	FOXP4,TFEB,NCR2,PGC,TOMM6,PRICKLE4,USP49,MDFI	IMR90,HELA,GM12878,H1ESC,K562	Hi-C,5C	24141950,22955621	FOXP4	99930	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	41889955	41890338	41890119	Y	FRS3	USP49,MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	3029	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	41929474	41929675	41929644	Y	NA	MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	42548	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr6	42944777	42944970	42944923	Y	NA	CNPY3,RPL24P4,PPP2R5D,MEA1,KLHDC3,RRP36	NA	NA	NA	NA	PEX6	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	43244173	43244568	43244268	Y	NA	NA	SLC22A7,CRIP3,ZNF318	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF318	90648	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	43636886	43637091	43636988	Y	NA	GTPBP2,MAD2L1BP,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	MRPS18A	16437	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	43878497	43878687	43878563	Y	GTPBP2,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	142576	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr6	43945734	43945924	43945799	Y	NFKBIE	NA	LOC100132354,POLH,MAD2L1BP,RSPH9,GTPBP2,VEGFA,C6orf223,MRPS18A	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM63B	146727	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	44205272	44205504	44205346	Y	NFKBIE	SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	HSP90AB1	7320	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	44205807	44206020	44205896	Y	NA	SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	HSP90AB1	6804	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	45301191	45301441	45301316	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	42249	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	47275760	47275938	47275849	Y	NA	TNFRSF21	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	119	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	51275260	51275721	51275608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS17P5	451885	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	52217307	52217701	52217502	Y	NA	PAQR8	PAQR8,MCM3,EFHC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAQR8	6518	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	52345672	52345732	52345729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFHC1	62566	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	52741236	52741253	52741245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSTA4	116923	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	52952230	52952503	52952367	Y	NA	FBXO9,ICK	NA	NA	NA	NA	ICK	27630	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	53174339	53174666	53174484	Y	FBXO9,ELOVL5	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	37281	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	53412768	53413364	53413026	Y	GCLC	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	66404	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	62308410	62308765	62308588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP1C	1610586	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	63124224	63124506	63124365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP1C	794845	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	64088639	64088972	64088831	Y	NA	NA	EYS	IMR90	Hi-C	24141950	PTP4A1	140694	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	64150073	64150241	64150156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTP4A1	79425	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr6	64151294	64151779	64151706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTP4A1	77887	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.39830744758616
chr6	64629183	64629230	64629207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	285458	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	69487592	69487966	69487779	Y	BAI3	NA	NA	NA	NA	NA	BAI3	144333	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	71337325	71337571	71337450	Y	NA	SMAP1	NA	NA	NA	NA	SMAP1	37908	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	72051718	72051897	72051837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OGFRL1	55212	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	72103736	72104124	72104114	Y	NA	MIR30A,LINC00472	NA	NA	NA	NA	MIR30A	7200	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	72114373	72114910	72114587	Y	NA	MIR30A,LINC00472	NA	NA	NA	NA	MIR30A	3049	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	72294841	72295504	72295148	Y	NA	KRT19P1	RIMS1	IMR90	Hi-C	24141950	KRT19P1	2417	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr6	73867627	73867898	73867877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	103040	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	73987583	73987923	73987651	Y	NA	RP11-398K22.12,KHDC1	KHDC1L	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-398K22.12	16645	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	80838245	80838506	80838365	Y	NA	BCKDHB	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	23881	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	81348599	81348680	81348638	Y	NA	NA	BCKDHB	IMR90	Hi-C	24141950	BCKDHB	534235	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr6	82785578	82785603	82785590	Y	NA	NA	C9orf46	MCF7	ChIA-PET	19890323	IBTK	169868	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	83935269	83935637	83935453	Y	NA	RWDD2A,PGM3	NA	NA	NA	NA	PGM3	33614	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr6	86114496	86114829	86114663	Y	NT5E	NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	NT5E	42980	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	87832223	87832245	87832242	Y	NA	CGA,RCN1P1,ZNF292	ZNF292	IMR90	Hi-C	24141950	RCN1P1	1817	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	88401154	88401337	88401278	Y	NA	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	8590	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	89744998	89746016	89745827	Y	UBE2J1,PNRC1	PNRC1	PNRC1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PNRC1	42454	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	90860237	90860588	90860527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH2	144039	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr6	90885505	90885892	90885812	Y	BACH2,BACH2	NA	NA	NA	NA	NA	BACH2	118735	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	93802046	93802077	93802062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEA	2221342	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	99279823	99280075	99279977	Y	POU3F2	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL4	113774	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	99280317	99280875	99280652	Y	POU3F2	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL4	112974	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	99975087	99975427	99975257	Y	NA	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	USP45	7483	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	100584000	100584312	100584155	Y	NA	NA	SIM1,ASCC3	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-121G13.3	391840	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	105388915	105389637	105389155	Y	HACE1	NA	NA	NA	NA	NA	HACE1	83121	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	106049296	106049799	106049571	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PREP	200337	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	106284892	106285069	106284969	Y	PRDM1	NA	ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PREP	435933	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	108574394	108574619	108574507	Y	NA	SNX3,LACE1	NA	NA	NA	NA	SNX3	5845	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	108879521	108879931	108879808	Y	SESN1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	483	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	109602805	109602853	109602823	Y	NA	NA	CCDC162P	IMR90	Hi-C	24141950	CD164	98909	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	111889822	111890007	111889856	Y	REV3L	TRAF3IP2	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	35474	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	111924339	111924647	111924531	Y	TRAF3IP2	TRAF3IP2	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	834	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	114815822	114815857	114815840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC2	485350	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	116988703	116988966	116988944	Y	DSE,ZUFSP,KPNA5	ZUFSP,KPNA5	NA	NA	NA	NA	ZUFSP	746	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	119210409	119210579	119210468	Y	NA	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	2805	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	119217591	119217640	119217616	Y	NA	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	4207	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	126108316	126108682	126108499	Y	NA	HEY2,NCOA7	NA	NA	NA	NA	NCOA7	8009	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	126112858	126113033	126112985	Y	TRMT11,HINT3,NCOA7	HEY2,NCOA7	NA	NA	NA	NA	NCOA7	12551	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr6	126167488	126167529	126167508	Y	NCOA7	NA	NA	NA	NA	NA	NCOA7	67181	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	126241150	126241321	126241235	Y	NCOA7	HINT3	NA	NA	NA	NA	HINT3	34606	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.37046139862066
chr6	126271537	126271736	126271680	Y	NA	HINT3,TRMT11	NA	NA	NA	NA	HINT3	4191	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.88438442310341
chr6	126279126	126279509	126279187	Y	NCOA7	HINT3,TRMT11	NA	NA	NA	NA	HINT3	3199	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	127481688	127482073	127481881	Y	RNF146,C6orf174,RSPO3	RSPO3	NA	NA	NA	NA	RSPO3	43939	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	128080284	128080680	128080614	Y	THEMIS	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	325503	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	129855341	129855708	129855581	Y	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	173662	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	130029105	130029310	130029206	Y	NA	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	60	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	136133495	136133602	136133548	Y	NA	PDE7B	PDE7B,LINC00271	IMR90	Hi-C	24141950	PDE7B	37232	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	136312028	136312251	136312140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE7B	141194	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr6	136691586	136691742	136691665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	82597	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	136702762	136702864	136702842	Y	MAP7,MAP7,MAP7,MAP7	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	93773	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	136724164	136724966	136724405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	115175	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	137242009	137242335	137242164	Y	IL20RA,SLC35D3	NA	NA	NA	NA	NA	PEX7	100292	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	137546255	137546371	137546263	Y	NA	IFNGR1	NA	NA	NA	NA	IFNGR1	7669	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	138001907	138002451	138002124	Y	NA	NA	IL20RA	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-356I2.1	55669	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	138027517	138027801	138027604	Y	NA	RP11-356I2.1	TNFAIP3,PERP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-356I2.1	30319	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	138053118	138053503	138053361	Y	TNFAIP3	RP11-356I2.1	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-356I2.1	4617	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr6	138053751	138053959	138053916	Y	PBOV1,TNFAIP3	RP11-356I2.1	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-356I2.1	4161	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr6	138055973	138056386	138056068	Y	TNFAIP3	RP11-356I2.1	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-356I2.1	1734	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	138113661	138114081	138114010	Y	OLIG3,TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-356I2.1	55541	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.71307674827583
chr6	138132277	138133056	138132650	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFAIP3	53295	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr6	138148087	138148219	138148190	Y	TNFAIP3	TNFAIP3	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	38132	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr6	138164498	138164657	138164583	Y	TNFAIP3	TNFAIP3	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	21694	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	138184436	138184726	138184672	Y	TNFAIP3	TNFAIP3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP3	1625	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	138194322	138194912	138194642	Y	TNFAIP3	TNFAIP3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP3	7971	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr6	138427134	138427492	138427302	Y	PERP	PERP	NA	NA	NA	NA	PERP	486	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	138552516	138552583	138552548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1244	71458	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	141765105	141765268	141765171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	701099	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr6	141804737	141805118	141804969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	661249	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	141873662	141873944	141873832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	592423	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr6	143123144	143123510	143123441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	140828	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	143163714	143164598	143164218	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	99740	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	144283965	144283971	144283968	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAGL1	99764	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	145550206	145550533	145550340	Y	NA	NA	EPM2A,UTRN	IMR90	Hi-C	24141950	EPM2A	504627	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	147235645	147236230	147236149	Y	RAB32,STXBP5	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	287331	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	148358652	148358995	148358836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASH1	232445	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	148822303	148822649	148822378	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASH1	230863	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr6	149080716	149081059	149080880	Y	NA	UST	NA	NA	NA	NA	UST	14252	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	150183311	150183513	150183478	Y	NA	LRP11,RAET1E	NA	NA	NA	NA	LRP11	686	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	150955970	150956257	150955981	Y	PLEKHG1	NA	NA	NA	NA	NA	MTHFD1L	228428	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	151381285	151381592	151381452	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	37073	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	157299126	157299275	157299174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	202063	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	157738321	157738749	157738506	Y	NA	TMEM242	NA	NA	NA	NA	TMEM242	3884	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr6	158185393	158186221	158185862	Y	SNX9	NA	SNX9,TMEM242,SYNJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNX9	56075	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	158254729	158255396	158255020	Y	NA	SNX9	NA	NA	NA	NA	SNX9	12433	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	81905	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	159226894	159227283	159227272	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	11161	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr6	159237852	159238517	159238245	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	NA	NA	NA	NA	NA	EZR	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	159270971	159271326	159271104	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	17645	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	159271429	159272000	159271674	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	16971	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr6	159273925	159274893	159274526	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	14078	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	160137124	160138386	160137829	Y	NA	WTAP,ACAT2,SOD2	LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WTAP	6231	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	160409606	160409719	160409663	Y	IGF2R	IGF2R	NA	NA	NA	NA	IGF2R	21475	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	160699946	160700334	160700305	Y	LPA	RP1-276N6.2	NA	NA	NA	NA	RP1-276N6.2	8297	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	161829346	161829532	161829475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	136253	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	162477618	162478021	162477976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARK2	668782	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	21.5847670282754
chr6	162478278	162478398	162478338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARK2	668405	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr6	163784160	163784198	163784179	Y	NA	QKI	PACRG	IMR90	Hi-C	24141950	QKI	48834	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	163833938	163834442	163834340	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	906	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	165988383	165988522	165988473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE10A	409569	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	166078176	166078539	166078376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE10A	319552	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	166115463	166115816	166115719	Y	NA	NA	PDE10A	IMR90	Hi-C	24141950	PDE10A	282275	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	166121234	166121494	166121453	Y	NA	NA	PDE10A	IMR90	Hi-C	24141950	PDE10A	276597	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	166364914	166365167	166365041	Y	T	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	PDE10A	32924	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr6	166378442	166378825	166378818	Y	NA	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	PDE10A	19266	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr6	166385606	166385834	166385795	Y	NA	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	PDE10A	12257	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr6	166386011	166386354	166386183	Y	NA	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	PDE10A	11737	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr6	166398427	166398527	166398479	Y	NA	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	PDE10A	336	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr6	166419567	166419719	166419697	Y	PRR18	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	LINC00473	20031	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr6	166420168	166420416	166420184	Y	T	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	LINC00473	20632	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.37046139862066
chr6	166422302	166422862	166422743	Y	NA	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	LINC00473	22766	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.56961512241374
chr6	168558082	168558596	168558447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT4	332480	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	387969	388196	388081	Y	PDGFA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	169737	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	650155	650947	650502	Y	COX19	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	92222	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	1066965	1067028	1066969	Y	NA	GPR146	NA	NA	NA	NA	GPR146	15184	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	1101900	1102191	1102037	Y	ADAP1,COX19,ZFAND2A,MAFK	GPR146	NA	NA	NA	NA	GPR146	19688	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	1500451	1500958	1500750	Y	NA	MICALL2,INTS1	NA	NA	NA	NA	MICALL2	3313	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	1546091	1546367	1546260	Y	NA	MICALL2,INTS1,MAFK	NA	NA	NA	NA	INTS1	2602	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr7	1546424	1546775	1546565	Y	NA	MICALL2,INTS1,MAFK	NA	NA	NA	NA	INTS1	2935	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr7	1553000	1553189	1553120	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A	MICALL2,INTS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	INTS1	9511	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.37046139862066
chr7	1571273	1571500	1571366	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	2923	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr7	1571848	1572026	1571934	Y	ZFAND2A,TMEM184A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3498	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr7	1572262	1572844	1572636	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3912	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	9.59322979034462
chr7	1573524	1573718	1573598	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	5174	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.39830744758616
chr7	1574153	1574602	1574313	Y	NA	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	5803	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	2111827	2112126	2111988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	158752	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	2153688	2153995	2153858	Y	SNX8,LFNG	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	116883	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	2339596	2339897	2339719	Y	LFNG,SNX8	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3B	51824	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	2778515	2778860	2778688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	94395	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	2797465	2798227	2798113	Y	SNX8,LFNG,GNA12	NA	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	75028	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	2903227	2903785	2903462	Y	LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12	AC006028.11,GNA12	GNA12	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNA12	21269	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	2996430	2996653	2996492	Y	LFNG	NA	NA	NA	NA	NA	GNA12	114472	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	4723112	4724257	4723950	Y	NA	FOXK1	NA	NA	NA	NA	FOXK1	41724	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	4755132	4755354	4755253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	73744	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	4765280	4765661	4765569	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	83892	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	4778448	4778853	4778548	Y	KIAA0415	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	97060	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr7	4779326	4779630	4779587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	97938	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	4913549	4913687	4913618	Y	NA	AC092610.12,RADIL	NA	NA	NA	NA	RADIL	7663	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr7	5458136	5458686	5458477	Y	FBXL18,TNRC18	TNRC18	NA	NA	NA	NA	TNRC18	4359	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr7	5571351	5571818	5571666	Y	WIPI2,ACTB	FBXL18,ACTB	NA	NA	NA	NA	FBXL18	19922	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	5594554	5594977	5594837	Y	WIPI2	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	6438	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	5631413	5631525	5631469	Y	NA	ACTB,FSCN1	RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	FSCN1	974	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	5634980	5635411	5634989	Y	AIMP2,FBXL18,ACTB,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	FSCN1	4541	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	5787686	5787972	5787829	Y	NA	RNF216	NA	NA	NA	NA	RNF216	31398	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	6049655	6049813	6049700	Y	NA	PMS2,AIMP2,EIF2AK1	NA	NA	NA	NA	AIMP2	2779	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	6677371	6677641	6677424	Y	DAGLB,ZNF12,C7orf26	C7orf26,ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	2418	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	6741580	6741996	6741754	Y	C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12	ZNF12,PMS2CL	NA	NA	NA	NA	ZNF12	2558	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	7608686	7608956	7608841	Y	MIOS	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	4183	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	8175214	8175426	8175339	Y	GLCCI1	NA	NA	NA	NA	NA	AC007009.1	124437	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	8300349	8300667	8300508	Y	ICA1,ICA1,ICA1	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	ICA1	32	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	8300852	8301132	8300960	Y	ICA1,ICA1,ICA1	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	ICA1	535	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	8547057	8547266	8547162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NXPH1	75472	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	8550473	8550803	8550530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NXPH1	78888	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	11499121	11499331	11499225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THSD7A	370493	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr7	11867283	11867421	11867420	Y	NA	THSD7A	NA	NA	NA	NA	THSD7A	2403	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	12755276	12755712	12755432	Y	VWDE,ARL4A	ARL4A	NA	NA	NA	NA	ARL4A	30795	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	12758831	12759023	12758905	Y	ARL4A	ARL4A	ARL4A	K562	ChIA-PET	22265404	ARL4A	34350	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	13889552	13889950	13889896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV1	139100	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	17029591	17029925	17029620	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AGR2	158534	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr7	17082630	17082968	17082726	Y	AHR	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AGR2	211573	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	17402534	17402650	17402592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC003075.4	65553	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	20228342	20228547	20228441	Y	TWISTNB,ITGB8	MACC1,AC005083.1	NA	NA	NA	NA	MACC1	26480	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	20239036	20239390	20239182	Y	TWISTNB	MACC1,AC005083.1	NA	NA	NA	NA	MACC1	15637	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	20346814	20347223	20346902	Y	NA	ITGB8	TMEM196,MACC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB8	21102	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.54176907344824
chr7	20547767	20548194	20547808	Y	ITGB8	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB8	179442	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	20837430	20837819	20837731	Y	SP8	RPL23P8	SP8	K562	ChIA-PET	22265404	RPL23P8	27126	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	21260621	21260992	21260836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP4	204660	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	21928607	21928632	21928620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7L	55070	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	22130088	22130317	22130208	Y	NA	NA	RAPGEF5	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA7L	146386	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	22614875	22615270	22614981	Y	IL6	AC002480.4	NA	NA	NA	NA	AC002480.4	12054	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr7	22631710	22632105	22631870	Y	IL6	AC002480.4	NA	NA	NA	NA	AC002480.4	4386	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	22742818	22742960	22742910	Y	NA	IL6,AC073072.5	FAM126A,LOC100506178	IMR90	Hi-C	24141950	IL6	20543	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	22742975	22743282	22743130	Y	NA	IL6,AC073072.5	FAM126A,LOC100506178	IMR90	Hi-C	24141950	IL6	20221	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	22757674	22758207	22757934	Y	NA	IL6,AC073072.5	NA	NA	NA	NA	IL6	5296	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr7	22894313	22894860	22894668	Y	STEAP1B,TOMM7	TOMM7	NA	NA	NA	NA	TOMM7	33843	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr7	23348040	23348443	23348292	Y	KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	NA	NUPL2	128594	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	23411315	23411579	23411447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	96507	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	23510676	23511223	23510889	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2590	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr7	24626460	24626850	24626473	Y	NA	MPP6	NA	NA	NA	NA	MPP6	15573	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	24772828	24773057	24772934	Y	DFNA5,DFNA5	DFNA5	NA	NA	NA	NA	DFNA5	34187	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	25064852	25065012	25064919	Y	NA	OSBPL3	OSBPL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL3	45599	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	25896245	25896461	25896419	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	293399	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr7	25990725	25991211	25991018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	198649	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	26477083	26477150	26477118	Y	CBX3	AC004540.5	NA	NA	NA	NA	AC004540.5	40870	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	26815721	26816027	26815980	Y	SNX10,SNX10,SKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	SKAP2	216831	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	27143635	27143783	27143725	Y	NA	HOXA-AS2,HOXA6	NA	NA	NA	NA	HOXA-AS2	1613	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	27774829	27775014	27774922	Y	NA	TAX1BP1	NA	NA	NA	NA	TAX1BP1	1936	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	28076890	28077172	28076964	Y	CREB5	NA	NA	NA	NA	NA	JAZF1	141190	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	30387689	30388072	30387783	Y	NOD1,ZNRF2	AC006978.6	NA	NA	NA	NA	AC006978.6	20915	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	30658764	30658962	30658863	Y	NA	GARS	NA	NA	NA	NA	GARS	26467	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	31923409	31923701	31923603	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE1C	413240	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr7	35075861	35076697	35076367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERPUD2	656484	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr7	37992305	37992525	37992415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD3NL	223299	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	40938770	40939089	40938937	Y	NA	NA	C7orf10,LOC285954,INHBA	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	801617	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	41025919	41026252	41026112	Y	NA	NA	C7orf10,LOC285954,INHBA	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	714454	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	42026442	42026777	42026611	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI3	248692	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	42147213	42147355	42147278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI3	128114	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	42927750	42928726	42928340	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	NA	NA	NA	NA	C7orf25	21178	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.71307674827583
chr7	43654812	43655175	43654945	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	34455	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	43732901	43733056	43732913	Y	DBNL,STK17A	NA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	63223	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	44677628	44678244	44677873	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	ZMIZ2	IMR90	Hi-C	24141950	OGDH	33457	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	44884505	44884603	44884554	Y	NA	H2AFV,PURB	NA	NA	NA	NA	H2AFV	1079	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	45518614	45518951	45518783	Y	CCM2	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY1	92788	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	45947887	45948101	45948023	Y	NA	IGFBP1,IGFBP3	NA	NA	NA	NA	IGFBP3	11372	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	46597190	46597387	46597291	Y	NA	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	637717	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.39830744758616
chr7	47514732	47515208	47514929	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104948	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	47675013	47675155	47675094	Y	TNS3	NA	TNS3,C7orf69,PKD1L1,C7orf65,LINC00525	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	54857	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	48127053	48127182	48127123	Y	HUS1,UPP1,UPP1	UPP1	NA	NA	NA	NA	UPP1	828	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	50615386	50615579	50615483	Y	GRB10	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	99298	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	51370562	51370701	51370648	Y	COBL	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	11814	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	55131480	55131905	55131522	Y	EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	46766	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	55155188	55155533	55155358	Y	EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	70474	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	55167745	55167964	55167855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	83031	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	56034549	56034772	56034661	Y	NA	GBAS,MRPS17	NA	NA	NA	NA	MRPS17	17037	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	56168682	56168929	56168809	Y	ZNF713	SUMF2,CHCHD2	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	3340	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	56243524	56243790	56243559	Y	LOC389493	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	71255	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	61971522	61971701	61971612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPCP7	1987502	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	65360437	65360759	65360712	Y	NA	VKORC1L1	NA	NA	NA	NA	VKORC1L1	24183	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	65762762	65763060	65762890	Y	RABGEF1,KCTD7	NA	NA	NA	NA	NA	TPST1	94576	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	65878387	65878723	65878560	Y	RABGEF1,KCTD7	NA	ASL,CRCP,TPST1,LINC00174	IMR90	Hi-C	24141950	GS1-124K5.3	77830	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	66056218	66056609	66056384	Y	NA	KCTD7	KCTD7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KCTD7	35259	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	66159622	66159870	66159746	Y	NA	RP4-756H11.3,RABGEF1	KCTD7,LOC493754,RABGEF1	IMR90	Hi-C	24141950	RABGEF1	14471	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	66783772	66783944	66783858	Y	NA	STAG3L4,PMS2P4	NA	NA	NA	NA	PMS2P4	17878	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	68721718	68722081	68721900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	339824	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr7	73132412	73132545	73132481	Y	LAT2,BCL7B	WBSCR22,DNAJC30,STX1A,ABHD11	NA	NA	NA	NA	STX1A	410	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	73631936	73632436	73632119	Y	LAT2	EIF4H,LAT2,RFC2	NA	NA	NA	NA	LAT2	19954	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	73694024	73694283	73694118	Y	LAT2	RFC2,CLIP2	CLIP2	IMR90	Hi-C	24141950	CLIP2	7522	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	73866647	73867033	73866768	Y	LAT2	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	527	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	73987997	73988205	73988054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2I	81789	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	74057565	74058043	74057767	Y	LAT2	GTF2I	GTF2I	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	GTF2I	11951	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	74138320	74138615	74138328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2I	68326	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	75465283	75465439	75465360	Y	MDH2	RHBDD2	STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR	IMR90	Hi-C	24141950	RHBDD2	4481	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	75567331	75567651	75567437	Y	POR	POR	NA	NA	NA	NA	POR	40813	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	75795833	75796053	75795969	Y	RHBDD2,POR	NA	SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	AC005077.12	59736	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	17444	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	75993529	75993613	75993570	Y	POR	YWHAG,ZP3	YWHAG	MCF7	ChIA-PET	22265404	YWHAG	7181	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	76002661	76002791	76002762	Y	POR	YWHAG,ZP3	NA	NA	NA	NA	YWHAG	16313	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	76009173	76009680	76009431	Y	POR	YWHAG,ZP3	NA	NA	NA	NA	ZP3	15155	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	77038853	77039042	77038951	Y	PTPN12,PTPN12,PION	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN12	125550	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	77039475	77039927	77039691	Y	PTPN12,PTPN12,PION	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN12	124665	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	81655164	81655347	81655329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	415767	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	84248657	84248668	84248663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3A	128617	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	84267436	84267624	84267532	Y	NA	NA	SEMA3A	IMR90	Hi-C	24141950	SEMA3A	147396	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	86287114	86287421	86287268	Y	KIAA1324L	NA	NA	NA	NA	NA	DMTF1	492256	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	92156983	92157235	92157087	Y	CDK6,CDK6,PEX1,FAM133B,C7orf64	PEX1,RBM48	NA	NA	NA	NA	RBM48	896	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	92290698	92291011	92290856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	72990	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	92412911	92413100	92413006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK6	50808	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	92439060	92439368	92439205	Y	PEX1,C7orf64,FAM133B,SAMD9	CDK6	NA	NA	NA	NA	CDK6	24540	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	92512382	92512474	92512428	Y	NA	CDK6	NA	NA	NA	NA	CDK6	48474	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	93426376	93426400	93426388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFPI2	91903	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	93511378	93511666	93511551	Y	BET1,TFPI2	TFPI2,GNG11	NA	NA	NA	NA	TFPI2	6637	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	93686304	93686593	93686441	Y	NA	AC003092.1	TFPI2,GNG11,BET1	IMR90	Hi-C	24141950	AC003092.1	36159	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	93688988	93689431	93689251	Y	NA	AC003092.1	TFPI2,GNG11,BET1	IMR90	Hi-C	24141950	AC003092.1	38843	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr7	95070230	95070589	95070236	Y	PON1,PON3,PDK4	PON1,PON3,PON2	PON2	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PON2	7720	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	95238124	95238400	95238252	Y	PON1,PON3	PDK4	NA	NA	NA	NA	PDK4	14321	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	96227712	96227722	96227717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHFM1	109481	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	96622528	96622811	96622637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACN9	121091	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	96748066	96748124	96748095	Y	NA	ACN9	NA	NA	NA	NA	ACN9	4164	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	97913424	97913987	97913861	Y	LMTK2,BRI3	TECPR1,BRI3	NA	NA	NA	NA	BRI3	33733	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	98199346	98199589	98199468	Y	NA	NPTX2	NPTX2	IMR90	Hi-C	24141950	NPTX2	45020	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	98557558	98557720	98557639	Y	KPNA7	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3609	80285	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	98650927	98651298	98651264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMURF1	88425	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	98724585	98724789	98724635	Y	ZNF394,SMURF1	SMURF1	NA	NA	NA	NA	SMURF1	14934	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	98739351	98739615	98739543	Y	NA	SMURF1	NA	NA	NA	NA	SMURF1	108	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	98809347	98809684	98809536	Y	ZNF655,ZNF655,ZKSCAN5,PTCD1,PDAP1,FAM200A,CPSF4,BUD31,ATP5J2,ARPC1A,SMURF1,KPNA7	NA	SMURF1	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF1	69624	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	98973055	98973209	98973129	Y	ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B	ARPC1B,BUD31,PDAP1	NA	NA	NA	NA	ARPC1B	3183	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	101499743	101500539	101499888	Y	SH2B2,CUX1,CUX1,CUX1	CUX1	NA	NA	NA	NA	CUX1	42784	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	101525517	101525682	101525579	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	68558	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	101526005	101526525	101526438	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	69046	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr7	101590034	101590314	101590170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	133075	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	101672273	101672589	101672281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	215314	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	101690848	101690892	101690861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	233889	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	3.76876884620682
chr7	102452256	102452586	102452421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM185A	64838	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	103509686	103510063	103509875	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELN	117900	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	104585458	104586124	104585640	Y	MLL5	NA	LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01004	65367	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	104597631	104597869	104597756	Y	MLL5	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	53622	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	105223133	105223294	105223281	Y	NA	EFCAB10	NA	NA	NA	NA	EFCAB10	16028	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr7	105459888	105460220	105459903	Y	NA	CTA-351J1.1	NA	NA	NA	NA	CTA-351J1.1	1950	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr7	106018568	106018864	106018729	Y	NAMPT	NA	CCDC71L,NAMPT	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAMPT	93796	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr7	106058630	106058799	106058684	Y	NAMPT,PIK3CG,FLJ36031	NA	NAMPT,CCDC71L,CDHR3	IMR90	Hi-C	24141950	NAMPT	133858	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	106065261	106066901	106065591	Y	NA	NA	NAMPT,CCDC71L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAMPT	140489	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr7	106089773	106090176	106089868	Y	NAMPT,PIK3CG	NA	NAMPT	IMR90	Hi-C	24141950	NAMPT	165001	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.05569209793099
chr7	107109276	107109645	107109473	Y	NA	GPR22	NA	NA	NA	NA	GPR22	813	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	107573965	107574445	107574339	Y	LAMB1	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	44550	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	107875663	107876003	107875815	Y	NRCAM	NA	NA	NA	NA	NA	NRCAM	219158	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	108046989	108047316	108047161	Y	NA	NRCAM	NA	NA	NA	NA	NRCAM	47845	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	108056534	108056914	108056866	Y	PNPLA8,DNAJB9	NRCAM	NA	NA	NA	NA	NRCAM	38247	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	108095684	108095814	108095727	Y	NRCAM,NRCAM	NRCAM	NA	NA	NA	NA	NRCAM	523	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	110326552	110326706	110326634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	873867	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	111720320	111721594	111721184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK4	122872	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	111721905	111722337	111722086	Y	ZNF277,IFRD1,DOCK4	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK4	122129	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr7	111724432	111725068	111724745	Y	ZNF277,IFRD1,DOCK4	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK4	119398	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	114408811	114408841	114408826	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFIC	151368	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	114459820	114459999	114459910	Y	NA	NA	FOXP2	IMR90	Hi-C	24141950	MDFIC	100210	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	115995232	115995555	115995330	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	NA	CAV2,CAV1,TES,MET	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CAV2	69798	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	116271021	116271344	116271193	Y	NA	MET	TES,CAV1,MET,CAPZA2	IMR90,H1ESC,GM12878	Hi-C,5C	24141950,22955621	MET	39100	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	116504290	116504456	116504319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPZA2	55166	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	116523983	116524309	116524052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7	66983	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	117472298	117472618	117472458	Y	CTTNBP2	NA	NA	NA	NA	NA	NAA38	349468	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	117953120	117953279	117953191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA38	131034	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	119283625	119284006	119283817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN12	1212450	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	119435371	119435694	119435534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN12	1060762	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	120035648	120036038	120035761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN12	460418	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	120666718	120667076	120666787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ING3	77915	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	120938122	120938485	120938307	Y	FAM3C	NA	NA	NA	NA	NA	FAM3C	95933	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	120942380	120942663	120942460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM3C	91755	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	121025846	121026096	121025939	Y	ING3	FAM3C	NA	NA	NA	NA	FAM3C	8322	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	121048712	121048836	121048774	Y	NA	FAM3C	NA	NA	NA	NA	FAM3C	14294	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	121951485	121951902	121951877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AASS	169151	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	122442410	122442454	122442432	Y	TAS2R16,CADPS2	NA	NA	NA	NA	NA	CADPS2	82359	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	126341155	126341491	126341268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF800	728487	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	127663304	127663714	127663503	Y	IMPDH1,GCC1,LRRC4	NA	NA	NA	NA	NA	RBM28	318248	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	127807416	127807928	127807646	Y	LRRC4	NA	SND1	IMR90	Hi-C	24141950	RBM28	174034	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.56961512241374
chr7	129246747	129246901	129246817	Y	NA	NRF1	NRF1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	2654	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	129419118	129419176	129419138	Y	NA	NA	UBE2H,NRF1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	169563	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	129465628	129465864	129465722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	124925	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	129469996	129470292	129470140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	120497	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	129508753	129509075	129508928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	81714	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	129590044	129590333	129590306	Y	NA	UBE2H	NA	NA	NA	NA	UBE2H	456	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	129650131	129650429	129650342	Y	NRF1	ZC3HC1	NA	NA	NA	NA	ZC3HC1	38862	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	130586004	130586434	130586371	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	9635	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	130589567	130590049	130589961	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6020	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	130602337	130602820	130602733	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6268	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	130606000	130606565	130606293	Y	NA	MIR29A	LOC646329	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR29A	9931	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	130641725	130642119	130642041	Y	MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	45656	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	130645057	130645459	130645325	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	48988	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	130665753	130666114	130665990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR29A	69684	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	130669444	130669692	130669631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR29A	73375	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	130670866	130671152	130671128	Y	MKLN1	NA	NA	NA	NA	NA	MIR29A	74797	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	130795999	130796263	130796171	Y	MKLN1,MKLN1	MKLN1,LINC-PINT	NA	NA	NA	NA	LINC-PINT	3064	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	130799789	130800044	130799917	Y	NA	MKLN1,LINC-PINT	NA	NA	NA	NA	LINC-PINT	6854	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	130920397	130920794	130920689	Y	MKLN1,MKLN1	AC009362.2	NA	NA	NA	NA	AC009362.2	4555	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr7	131919616	131920007	131919874	Y	PLXNA4	NA	NA	NA	NA	NA	PODXL	678640	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	133223721	133224093	133223724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC083875.2	225554	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	134117156	134117311	134117298	Y	NA	AKR1B1	NA	NA	NA	NA	AKR1B1	24725	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr7	134287776	134287871	134287820	Y	NA	BPGM	AKR1B1,AKR1B10,AKR1B15,BPGM	IMR90	Hi-C	24141950	BPGM	41689	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	134430855	134431029	134430942	Y	CALD1	NA	CALD1,BPGM	IMR90	Hi-C	24141950	BPGM	101295	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	134475089	134475514	134475151	Y	CALD1	NA	NA	NA	NA	NA	BPGM	145529	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	134845913	134846266	134846037	Y	WDR91,CNOT4,TMEM140	TMEM140,C7orf49,WDR91	NA	NA	NA	NA	C7orf49	7281	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	135665513	135665767	135665568	Y	NA	MTPN	NA	NA	NA	NA	MTPN	5412	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	6.8523069931033
chr7	135708293	135708582	135708438	Y	NA	MTPN	C7orf73	IMR90	Hi-C	24141950	MTPN	48192	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	135708856	135709118	135708987	Y	NA	MTPN	C7orf73	IMR90	Hi-C	24141950	MTPN	48755	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	135771654	135771794	135771701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPN	111553	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	137387266	137387617	137387499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	297196	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	137402741	137402885	137402822	Y	DGKI	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	281928	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	137505466	137505823	137505684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	178990	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	137573369	137573542	137573460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	111271	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	137659854	137660135	137660099	Y	NA	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	24678	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr7	138035380	138035759	138035568	Y	CREB3L2,SVOPL,TRIM24	NA	NA	NA	NA	NA	AC008155.1	51509	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	138791748	138791993	138791908	Y	UBN2,LUC7L2,ZC3HAV1	ZC3HAV1,TTC26	NA	NA	NA	NA	ZC3HAV1	472	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	139365521	139365926	139365718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBXAS1	108924	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	139930863	139931473	139931211	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	LOC100134229,JHDM1D	MCF7	ChIA-PET	22265404	PARP12	169342	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	141287085	141287318	141287296	Y	TAS2R5	AGK	NA	NA	NA	NA	AGK	38096	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	143589612	143589642	143589628	Y	OR2F1,OR2A2,OR2A25,OR2A12,TAS2R60,FAM115A,FAM115A,FAM115A	FAM115A	NA	NA	NA	NA	FAM115A	7649	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	144223556	144223561	144223559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OR2A20P	275506	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	148334506	148334940	148334775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL1	58066	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	NA	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EZH2	58860	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.05569209793099
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	148788414	148788490	148788418	Y	CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2540	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	148824928	148825234	148824952	Y	NA	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF398	3420	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	149191913	149192296	149192075	Y	SSPO,ZNF746	ZNF746	NA	NA	NA	NA	ZNF746	612	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr7	149468740	149469267	149468803	Y	NA	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	172	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	151184518	151184840	151184768	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	30366	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	151193551	151193826	151193799	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	21380	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	151823102	151823484	151823293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT11	102343	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	29368	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr7	155137156	155137555	155137357	Y	INSIG1	INSIG1	INSIG1,PAXIP1,LOC100132707	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INSIG1	49670	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	155744375	155744769	155744531	Y	NA	AC021218.2	LOC285889,SHH,LMBR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC021218.2	8557	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	155754558	155754796	155754722	Y	NA	AC021218.2	LOC285889	IMR90	Hi-C	24141950	AC021218.2	1232	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr7	156444597	156444947	156444772	Y	NA	C7orf13	NA	NA	NA	NA	C7orf13	13249	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	157082177	157082296	157082243	Y	NA	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	43779	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	157092515	157093215	157092989	Y	DNAJB6,DNAJB6	DNAJB6	UBE3C,DNAJB6	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB6	32860	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	157629246	157629505	157629365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	503171	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	157673991	157674159	157674024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	547916	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	157840945	157841296	157841083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRN2	537184	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	158044474	158044782	158044628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRN2	333698	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	158224670	158224991	158224878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRN2	153489	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	16.7881521331031
chr7	158225517	158225999	158225657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRN2	152481	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	3.42615349655165
chr7	158238760	158239031	158238837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRN2	139449	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	3.59746117137923
chr7	158242532	158242975	158242888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRN2	135505	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	9.42192211551704
chr7	158243394	158243763	158243659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRN2	134717	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.05569209793099
chr7	158527660	158527846	158527783	Y	NA	NCAPG2	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	32140	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr7	158613624	158614053	158613981	Y	ESYT2	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	6891	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr7	158808159	158808606	158808258	Y	VIPR2	NA	NA	NA	NA	NA	WDR60	160890	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	582547	582966	582856	Y	ERICH1	NA	NA	NA	NA	NA	ERICH1	103140	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	638062	638589	638348	Y	ZNF596,ZNF596,ERICH1	ERICH1	NA	NA	NA	NA	ERICH1	47517	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr8	1693574	1694042	1693752	Y	CLN8	CLN8,CTD-2336O2.1	ARHGEF10,CLN8,MIR596,KBTBD11,ZNF596	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLN8	7902	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr8	1694228	1694696	1694461	Y	CLN8	CLN8,CTD-2336O2.1	ARHGEF10,CLN8,ZNF596	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLN8	7248	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	1736486	1736690	1736554	Y	NA	CLN8,CTD-2336O2.1,ARHGEF10	NA	NA	NA	NA	CTD-2336O2.1	25818	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	1780723	1781665	1781560	Y	NA	ARHGEF10	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	10581	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	8878847	8879137	8878870	Y	NA	ERI1	NA	NA	NA	NA	ERI1	21190	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	13230060	13230464	13230283	Y	DLC1	NA	NA	NA	NA	NA	DLC1	140703	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	13393176	13393534	13393351	Y	DLC1	DLC1	DLC1	IMR90	Hi-C	24141950	DLC1	22009	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	15375029	15375057	15375043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC3	102305	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	15546823	15547116	15546970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC3	274099	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	17194213	17194219	17194216	Y	SLC7A2,SLC7A2	NA	NA	NA	NA	NA	CNOT7	91826	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	17355613	17356072	17355737	Y	NA	SLC7A2	NA	NA	NA	NA	SLC7A2	3016	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr8	18424432	18424631	18424532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAT1	398446	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	18585215	18585382	18585299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	354858	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	18768857	18769292	18769046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	170948	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	18854306	18854486	18854451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	85754	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr8	18884209	18884230	18884220	Y	NA	NA	PSD3,LOC100128993	IMR90	Hi-C	24141950	PSD3	56010	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	18991999	18992391	18992140	Y	NA	NA	PSD3,LOC100128993	IMR90	Hi-C	24141950	PSD3	51759	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	18993184	18993532	18993372	Y	NA	NA	LOC100128993,PSD3	IMR90	Hi-C	24141950	PSD3	52944	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	18998257	18998415	18998308	Y	NA	NA	PSD3,LOC100128993	IMR90	Hi-C	24141950	PSD3	58017	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	19266409	19266742	19266623	Y	CSGALNACT1	NA	NA	NA	NA	NA	SH2D4A	97281	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr8	19414490	19414802	19414647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-1105O14.1	119281	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	19436473	19436611	19436572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-1105O14.1	97472	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	19522969	19523285	19523139	Y	NA	RP11-1105O14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1105O14.1	10798	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	19533548	19533780	19533688	Y	CSGALNACT1	RP11-1105O14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1105O14.1	303	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	19808496	19808756	19808622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPL	51268	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	21167334	21167434	21167384	Y	GFRA2	NA	NA	NA	NA	NA	XPO7	607746	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	21867707	21867918	21867811	Y	PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM160B2	76752	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	22048643	22048944	22048828	Y	DOK2	BMP1	NA	NA	NA	NA	BMP1	28394	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	22469003	22469432	22469219	Y	NA	PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	C8orf58	13889	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	22561043	22561327	22561142	Y	PPP3CC,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10B,EGR3	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	EGR3	12228	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr8	22642199	22642631	22642285	Y	RHOBTB2,RHOBTB2,EGR3,EGR3	NA	NA	NA	NA	NA	EGR3	93384	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	22710401	22710511	22710455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	132419	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr8	22808149	22808394	22808223	Y	NA	RHOBTB2	PEBP4,TNFRSF10B,BIN3,EGR3,RHOBTB2	IMR90	Hi-C	24141950	RHOBTB2	34536	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	22858322	22858618	22858470	Y	EGR3,EGR3,RHOBTB2,RHOBTB2	RHOBTB2	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	15392	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	23038375	23038737	23038576	Y	ENTPD4,ENTPD4,TNFRSF10D	TNFRSF10D,TNFRSF10A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF10D	18832	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	23308133	23308499	23308237	Y	TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4	LOXL2,ENTPD4	NA	NA	NA	NA	ENTPD4	4709	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	23396383	23397127	23396699	Y	TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4,SLC25A37	SLC25A37	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	12065	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	23405243	23405645	23405476	Y	TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4	SLC25A37	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	20925	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	24799462	24799718	24799592	Y	NEFL	NEFL	NA	NA	NA	NA	NEFL	12906	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr8	24858208	24858485	24858356	Y	NA	NEFL	NA	NA	NA	NA	NEFL	45584	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	25242857	25243137	25242939	Y	NA	NA	KCTD9	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD9	70855	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	26466894	26467238	26467101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	97103	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr8	26468935	26469319	26469207	Y	DPYSL2	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	99144	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	27209291	27209793	27209526	Y	PTK2B,PTK2B	TRIM35,PTK2B	NA	NA	NA	NA	PTK2B	42292	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	27794107	27794493	27794301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARA5	53751	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	29198749	29199265	29198931	Y	KIF13B,DUSP4,DUSP4	DUSP4	NA	NA	NA	NA	DUSP4	6920	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr8	29202154	29202365	29202273	Y	DUSP4,DUSP4	DUSP4	NA	NA	NA	NA	DUSP4	3820	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	29230784	29230978	29230896	Y	KIF13B,DUSP4	DUSP4	C8orf75,LOC286135,MIR3148,MIR548O2,TMEM66,LEPROTL1,DUSP4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	24599	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	29248095	29248236	29248197	Y	NA	DUSP4	MIR3148	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	41910	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	29267244	29267441	29267354	Y	KIF13B	NA	C8orf75,DUSP4,LOC286135,MIR3148,TMEM66,MIR548O2,LEPROTL1	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	61059	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	29316675	29316889	29316765	Y	KIF13B,DUSP4	NA	C8orf75	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	110490	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr8	29419877	29419995	29419892	Y	KIF13B	NA	DUSP4,LOC286135,C8orf75	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DUSP4	213692	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr8	29492579	29492739	29492696	Y	KIF13B	NA	DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR548O2	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	286394	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	29495067	29495424	29495202	Y	KIF13B	NA	DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR3148	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	288882	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	29499383	29499527	29499389	Y	KIF13B	NA	DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR3148	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	293198	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	29511970	29512365	29512072	Y	KIF13B	NA	DUSP4,MIR3148,C8orf75,LOC286135	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	305785	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	29513029	29513506	29513190	Y	KIF13B	NA	DUSP4,MIR3148,C8orf75,LOC286135	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	306844	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	29522725	29523096	29522814	Y	KIF13B	NA	LOC286135,DUSP4,C8orf75	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	316540	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr8	29526859	29527039	29527017	Y	NA	NA	LOC286135,DUSP4,C8orf75	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	320674	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	15.2463830596548
chr8	29576846	29577118	29576977	Y	KIF13B	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM66	361605	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	29623150	29623293	29623215	Y	NA	NA	C8orf75,DUSP4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM66	315430	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	29630716	29630847	29630782	Y	NA	NA	C8orf75,LOC286135	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM66	307876	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	30892930	30893420	30892948	Y	NA	WRN	NA	NA	NA	NA	WRN	3613	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	31861794	31862187	31861910	Y	NRG1	NA	NA	NA	NA	NA	NRG1	366892	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	33747203	33747216	33747209	Y	NA	RP1-273G13.1	NA	NA	NA	NA	RP1-273G13.1	31462	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr8	37159589	37159912	37159750	Y	NA	NA	ZNF703,KCNU1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF703	391357	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	37961561	37961954	37961758	Y	NA	ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	801	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	38262735	38263237	38262894	Y	TACC1,PLEKHA2,C8orf86	WHSC1L1,LETM2	NA	NA	NA	NA	LETM2	21010	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	38895649	38895937	38895811	Y	TACC1,PLEKHA2,HTRA4	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	43261	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	41146046	41146081	41146065	Y	SFRP1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD65	136093	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	41733569	41733873	41733722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAT6A	173635	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	41908079	41908836	41908505	Y	POLB,IKBKB,IKBKB,AP3M2,AGPAT6,MYST3	KAT6A	NA	NA	NA	NA	KAT6A	571	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	42149533	42149606	42149596	Y	NA	RP11-231D20.2,IKBKB,POLB	NA	NA	NA	NA	IKBKB	22713	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	42184337	42184357	42184347	Y	NA	POLB	NA	NA	NA	NA	POLB	9615	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	42383718	42383741	42383730	Y	NA	SLC20A2	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	11328	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	48242793	48242802	48242797	Y	NA	NA	PRKDC	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFA5P12	168300	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	49086776	49087078	49086884	Y	NA	NA	SNAI2,EFCAB1	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2V2	167816	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	49320367	49320668	49320511	Y	NA	RPL29P19	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	25217	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	49426952	49427328	49427172	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131802	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	49427546	49427722	49427633	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	132396	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	49835974	49836286	49836197	Y	SNAI2	SNAI2	NA	NA	NA	NA	SNAI2	3675	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr8	50653553	50653944	50653741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNAI2	821254	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	53625473	53626379	53625848	Y	RB1CC1	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	30024	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	54256811	54256964	54256882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP6V1H	497154	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	57389900	57390701	57390447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17A4.1	108243	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	59470194	59470547	59470220	Y	NA	SDCBP	NA	NA	NA	NA	SDCBP	6711	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	61850490	61850754	61850677	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261153	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	61850776	61851191	61851141	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261439	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	62445230	62445580	62445420	Y	CLVS1,ASPH	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	179575	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	62566892	62567143	62567071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	58012	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	62606389	62606706	62606619	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	18449	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	62620817	62621622	62621526	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	3533	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr8	62624516	62625412	62625017	Y	ASPH	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH,MIR4470	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	62634023	62634407	62634126	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	MIR4470	8676	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr8	62634431	62634735	62634612	Y	ASPH	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	MIR4470	9084	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	62679636	62680132	62679874	Y	NA	NA	ASPH,MIR4470	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MIR4470	54289	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr8	63776641	63776831	63776733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGH	172899	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	66641187	66641625	66641410	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	86218	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	66935018	66935363	66935175	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	PDE7A	182461	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	67433991	67434613	67434592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADHFE1	93571	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr8	67668655	67668834	67668702	Y	ADHFE1,SGK3,SGK3	SGK3	NA	NA	NA	NA	SGK3	46002	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	68090392	68090564	68090531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	96374	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	71303418	71303670	71303544	Y	NA	NCOA2,RP11-333A23.1	NA	NA	NA	NA	NCOA2	10370	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	72743502	72744020	72743667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPA1	241832	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	75515244	75515546	75515314	Y	NA	RP11-730G20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-730G20.2	765	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	77515612	77515766	77515691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX4	75688	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	79674578	79674862	79674701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKIA	248204	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	80705910	80706255	80706054	Y	HEY1	HEY1	HEY1,MRPS28	IMR90	Hi-C	24141950	HEY1	27812	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr8	81933989	81934508	81934361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAG1	87795	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	81938706	81938999	81938911	Y	PAG1	NA	NA	NA	NA	NA	PAG1	83304	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	82019096	82019493	82019305	Y	PAG1	PAG1	NA	NA	NA	NA	PAG1	2810	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	87484005	87484360	87484214	Y	NA	CPNE3,SLC2A3P4	NA	NA	NA	NA	CPNE3	10699	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	87673960	87674305	87674138	Y	CNGB3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A3P4	160140	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	90899646	90899998	90899819	Y	RIPK2,OSGIN2	OSGIN2	OSGIN2,RIPK2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	OSGIN2	12089	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	90901747	90901955	90901807	Y	RIPK2,OSGIN2	OSGIN2	OSGIN2,RIPK2	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	OSGIN2	10132	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	93086953	93087351	93087249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTUD6B	1006529	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	97319675	97319761	97319753	Y	NA	MTERFD1,PTDSS1	NA	NA	NA	NA	PTDSS1	47732	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	97571754	97571902	97571855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDC2	68175	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	97866979	97867264	97866987	Y	PGCP	NA	NA	NA	NA	NA	SDC2	363400	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	98454033	98454434	98454234	Y	NA	NA	PTDSS1,SDC2,CPQ,TSPYL5	IMR90	Hi-C	24141950	MTDH	199973	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	98841899	98841938	98841919	Y	POP1	RPS23P1,MATN2	NA	NA	NA	NA	RPS23P1	33344	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	101427912	101428321	101428112	Y	SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19A	81466	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	5.13923024482748
chr8	101428409	101428827	101428524	Y	RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19A	81963	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	101484105	101484411	101484224	Y	NA	NA	SPAG1,RNF19A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD46	85601	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	101731045	101731633	101731441	Y	NA	PABPC1	NA	NA	NA	NA	PABPC1	1404	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	101920209	101920392	101920320	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	RPS26P6,YWHAZ	NA	NA	NA	NA	RPS26P6	14235	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr8	101920723	101921107	101920870	Y	NA	RPS26P6,YWHAZ	NA	NA	NA	NA	RPS26P6	14749	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr8	102015928	102016078	102016021	Y	NA	NA	FLJ42969,YWHAZ,ZNF706	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	52312	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	102038562	102039020	102038731	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	74946	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	103486772	103487100	103486937	Y	NA	NA	ODF1	IMR90	Hi-C	24141950	UBR5	63703	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	103549220	103549421	103549330	Y	NA	NA	UBR5,ODF1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF10	116709	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr8	103549503	103549899	103549700	Y	NA	NA	UBR5,ODF1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF10	116231	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	103669513	103669869	103669680	Y	AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10	KLF10	NA	NA	NA	NA	KLF10	3383	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	103750893	103751082	103750980	Y	AZIN1,KLF10,KLF10	NA	UBR5,KLF10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF10	84763	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	103801151	103801773	103801337	Y	NA	NA	KLF10,UBR5,ODF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1507C5.2	72755	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	103803215	103803631	103803453	Y	AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10	NA	KLF10,UBR5,ODF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1507C5.2	70897	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	103806867	103807011	103806958	Y	NA	NA	KLF10,UBR5,ODF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1507C5.2	67517	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	104043647	104043928	104043793	Y	KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1	ATP6V1C1	NA	NA	NA	NA	ATP6V1C1	12356	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	104059632	104059708	104059689	Y	NA	ATP6V1C1	NA	NA	NA	NA	ATP6V1C1	28341	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	105034041	105034154	105034124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-5A11.1	464424	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	105677496	105678173	105677683	Y	TM7SF4,LRP12	NA	LRP12	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LRP12	78244	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	107054607	107054687	107054647	Y	OXR1	RP11-152P17.2	OXR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-152P17.2	16065	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	107059911	107060047	107059923	Y	NA	RP11-152P17.2	OXR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-152P17.2	10705	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	107740443	107740789	107740616	Y	NA	TAGLN2P1	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	32202	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	114266349	114266595	114266472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	120303	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	115707569	115707650	115707588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	1112249	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	119047899	119048328	119048216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	73764	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	123795111	123795992	123795667	Y	C8orf76,ZHX2	NA	NA	NA	NA	NA	DERL1	256671	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	124248679	124249062	124248866	Y	NA	C8orf76,ZHX1	NA	NA	NA	NA	C8orf76	2576	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	124301303	124301534	124301414	Y	NA	C8orf76,ZHX1	ATAD2,ZHX1-C8ORF76	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZHX1	15522	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	124649068	124649399	124649254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO32	97622	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	125210059	125210285	125210207	Y	FAM91A1,TMEM65,RNF139	ARF1P3	TMEM65,FAM91A1,FER1L6,FER1L6-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ARF1P3	47895	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	125721699	125722377	125721996	Y	ZNF572,NSMCE2,KIAA0196,RNF139,MTSS1	MTSS1	NA	NA	NA	NA	MTSS1	16353	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	126508271	126508573	126508428	Y	NA	NA	NSMCE2,KIAA0196,TRIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	67708	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	127422712	127423196	127422971	Y	NA	NA	FAM84B	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-89K10.1	144924	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	128099457	128099542	128099514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	530819	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	128744100	128744550	128744397	Y	NA	MYC	NA	NA	NA	NA	MYC	1130	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	128772812	128773062	128772941	Y	NA	MYC,PVT1	NA	NA	NA	NA	MYC	27132	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.37046139862066
chr8	128811691	128811973	128811933	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	6912	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr8	128822019	128822203	128822035	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	17240	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	128822251	128823013	128822500	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	17472	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	128825013	128825274	128825028	Y	MYC	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	20234	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr8	128865187	128865467	128865327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	60408	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr8	128871975	128872421	128872033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	67196	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	128888391	128888698	128888485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	83612	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	128910613	128910985	128910818	Y	MYC	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	105834	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	128919831	128920544	128920233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	100313	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	128944008	128944415	128944139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	76442	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	128961875	128962320	128962073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	58537	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.71307674827583
chr8	128989961	128990273	128990255	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	30584	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	129047466	129047656	129047576	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	26609	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.05569209793099
chr8	129053712	129054462	129054053	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	32855	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	129061512	129061955	129061598	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	40655	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr8	129188825	129189407	129189075	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-25P	167968	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	129397787	129398025	129397906	Y	NA	NA	MYC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	376930	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	129436806	129436985	129436896	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	415949	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	129517304	129517688	129517627	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	496447	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.54176907344824
chr8	129527030	129527320	129527153	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	506173	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr8	129535046	129535177	129535106	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	514189	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	129539101	129539374	129539248	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	518244	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.56961512241374
chr8	129552751	129552881	129552850	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	531894	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	129553292	129553480	129553386	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	532435	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr8	129563997	129564224	129564200	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	543140	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	4.96792256999989
chr8	129569050	129569202	129569118	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	548193	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	5.31053791965506
chr8	129593885	129594223	129593976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	573028	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr8	129706266	129706412	129706340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	685409	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	130433555	130433672	130433615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	593703	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	130461810	130462206	130462131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	565169	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	130490796	130491097	130490948	Y	FAM49B	NA	MYC	IMR90	Hi-C	24141950	FAM49B	536278	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	130566236	130566665	130566321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	460710	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	131080516	131080850	131080671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	53141	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	133562041	133562364	133562205	Y	HHLA1,KCNQ3,KCNQ3	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC6	123474	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	134513057	134513519	134513217	Y	SLA,ST3GAL1	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL1	68664	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	134532639	134533046	134532970	Y	ST3GAL1	ST3GAL1	NA	NA	NA	NA	ST3GAL1	49137	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	134919002	134919092	134919047	Y	NA	NA	ST3GAL1,ZFAT	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL1	336819	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	135843585	135843751	135843688	Y	ZFAT	NA	ZFAT,MIR30D,MIR30B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFAT	120293	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	136373366	136373545	136373456	Y	NA	NA	LOC286094	IMR90	Hi-C	24141950	KHDRBS3	94155	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	138948473	138948574	138948485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL22A1	975675	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	141474376	141475403	141474918	Y	NA	TRAPPC9,CHRAC1	TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TRAPPC9	7698	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	141598802	141599709	141599120	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	79405	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	142128241	142128488	142128412	Y	NA	DENND3	PTK2,DENND3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND3	2864	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	142163740	142163864	142163753	Y	NA	DENND3	NA	NA	NA	NA	DENND3	38363	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	142215999	142216277	142216212	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	90622	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	142411426	142411896	142411690	Y	DENND3,SLC45A4,PTP4A3	PTP4A3	PTP4A3,FLJ43860	IMR90	Hi-C	24141950	PTP4A3	11333	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	142424106	142424307	142424175	Y	NA	PTP4A3,HNRNPA1P38	NA	NA	NA	NA	PTP4A3	24013	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	143353648	143353818	143353814	Y	TSNARE1,BAI1	NA	NA	NA	NA	NA	TSNARE1	128783	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	143532398	143532722	143532656	Y	LYNX1,LYNX1,LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1	TSNARE1,BAI1	NA	NA	NA	NA	BAI1	3607	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	143533998	143534621	143534303	Y	LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1	BAI1	BAI1,TSNARE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	BAI1	5207	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	145022492	145023108	145022824	Y	PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	25794	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	22100	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr8	145869377	145869481	145869429	Y	NA	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP39	39713	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	749759	749963	749884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	281468	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	2141799	2141979	2141843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA2	128457	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	2875811	2876206	2875956	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	33570	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	3971837	3971870	3971849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	374522	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr9	4099830	4100173	4099979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	246219	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	4137159	4137519	4137339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	208873	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	4241498	4241696	4241599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	104696	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	4293316	4293716	4293485	Y	GLIS3	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	52676	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	4738592	4738723	4738708	Y	NA	AK3	NA	NA	NA	NA	AK3	1320	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	4864348	4864647	4864448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCL1	73479	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr9	5536750	5536929	5536840	Y	CD274,PDCD1LG2,KIAA1432	PDCD1LG2	NA	NA	NA	NA	PDCD1LG2	28205	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	5553244	5553515	5553396	Y	NA	PDCD1LG2	NA	NA	NA	NA	PDCD1LG2	44699	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,RP11-390F4.6,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.54176907344824
chr9	6958089	6958102	6958095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4C	239226	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr9	8950472	8950666	8950590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-75C9.1	94342	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	11065025	11065362	11065124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRD	454302	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr9	12779203	12779569	12779249	Y	NA	RP11-3L8.3	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	32775	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	14322295	14322910	14322674	Y	ZDHHC21,NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	74072	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr9	14438651	14438904	14438893	Y	NA	NFIB	FLJ41200,MPDZ	IMR90	Hi-C	24141950	NFIB	41669	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	18490587	18490949	18490797	Y	ADAMTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-296P7.4	533941	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	20532398	20532530	20532463	Y	MLLT3	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	88012	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	21699320	21699393	21699347	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	101149	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	26243860	26243998	26243927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC1	567004	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	27416206	27416570	27416389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf72	155294	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	28649799	28650020	28649948	Y	LINGO2	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf72	1077935	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	29213900	29214394	29214154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P2	1615829	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr9	29826048	29826378	29826215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P2	1003845	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr9	32461734	32461764	32461747	Y	DDX58	NA	NA	NA	NA	NA	DDX58	62558	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	33017262	33017602	33017524	Y	NA	APTX,DNAJA1	DNAJA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	APTX	5564	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	33151008	33151398	33151341	Y	NA	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	13956	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	33160944	33161390	33161236	Y	DNAJA1,SMU1,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	3964	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr9	33162668	33163130	33162954	Y	DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	2224	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr9	33165457	33166051	33165900	Y	DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	103	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr9	33233885	33234477	33234128	Y	NA	BAG1,CHMP5	NA	NA	NA	NA	BAG1	28284	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	34193349	34193568	34193460	Y	NA	UBAP1,RP11-571F15.3	NA	NA	NA	NA	UBAP1	16346	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	34452221	34452408	34452315	Y	ARID3C,ENHO,CNTFR,CNTFR,C9orf25	NA	C9orf24,KIAA1161	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1161	77370	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	35726275	35726587	35726326	Y	NA	TPM2,CREB3,TLN1,RGP1,GBA2,MSMP	NA	NA	NA	NA	CREB3	3745	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	36294075	36294254	36294162	Y	OR13J1,OR2S2	RNU4-53P,GNE	RNF38,CLTA,GNE	IMR90	Hi-C	24141950	GNE	19022	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	37773119	37773290	37773253	Y	FRMPD1	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	25209	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	37835930	37836292	37836154	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	36496	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr9	38017265	38017614	38017440	Y	SHB	RP11-613M10.9,SHB	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	49070	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	38066980	38067628	38067261	Y	SHB	RP11-613M10.9	NA	NA	NA	NA	SHB	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	68423908	68424365	68424207	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	29010	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.19915372379308
chr9	71336446	71336479	71336451	Y	NA	PIP5K1B	NA	NA	NA	NA	PIP5K1B	17871	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	71728196	71728449	71728285	Y	NA	TJP2	NA	NA	NA	NA	TJP2	5760	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr9	71734977	71735184	71735061	Y	NA	TJP2	NA	NA	NA	NA	TJP2	768	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	72561735	72561997	72561908	Y	NA	NA	APBA1,MAMDC2,LOC100507299,LOC100507244,C9orf135,TRPM3,KLF9	IMR90	Hi-C	24141950	PTAR1	188860	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	72717148	72717358	72717253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	154579	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.88438442310341
chr9	73035561	73035945	73035863	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8021	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	73184848	73185244	73185056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	157308	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	73278368	73278569	73278469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR204	144431	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	74318584	74318670	74318629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM2	110936	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	74657404	74657841	74657552	Y	TMEM2,ZFAND5	NA	NA	NA	NA	NA	GDA	69670	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr9	74823247	74823495	74823337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDA	95736	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr9	75088538	75088711	75088620	Y	ZFAND5	NA	TMC1,ZFAND5	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND5	110375	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	75747117	75747734	75747349	Y	ANXA1	ANXA1	ANXA1	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA1	16939	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr9	81341677	81341857	81341765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAT1	431618	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	82213229	82213622	82213243	Y	NA	TLE4	NA	NA	NA	NA	TLE4	28541	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	82495908	82496274	82496091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLE4	311220	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	84989090	84989102	84989097	Y	FAM75D1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD95	487257	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	88264467	88264715	88264594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	90229	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	88358353	88358730	88358394	Y	AGTPBP1	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	3409	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	89699545	89699882	89699714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	74978	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	90115567	90115708	90115625	Y	DAPK1	RP11-40C6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	22509	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	90326659	90327327	90326985	Y	DAPK1,CTSL1	NA	CTSL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-40C6.2	188442	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr9	90328172	90328868	90328486	Y	DAPK1,CTSL1	NA	CTSL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-40C6.2	189955	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	90329827	90330158	90329945	Y	DAPK1,CTSL1	NA	CTSL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-40C6.2	191610	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	90408310	90408593	90408480	Y	DAPK1,CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	CDK20	179075	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	91795136	91795669	91795494	Y	C9orf47,SHC3	SHC3	NA	NA	NA	NA	SHC3	3454	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr9	92218967	92219282	92219262	Y	NA	GADD45G	NA	NA	NA	NA	GADD45G	1039	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	92515795	92516064	92515808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45G	297867	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	93029524	93029856	93029690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-389K14.3	163931	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	93955991	93956732	93956142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	165463	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr9	94178668	94178865	94178761	Y	NFIL3	NFIL3	NA	NA	NA	NA	NFIL3	5279	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	94993084	94993195	94993158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IARS	60843	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr9	95882095	95882646	95882428	Y	IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1	C9orf89,NINJ1	NA	NA	NA	NA	NINJ1	11924	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	95894467	95895029	95894875	Y	IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1	C9orf89	NA	NA	NA	NA	NINJ1	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	10486	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	9706	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr9	97906311	97906710	97906505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	171281	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	98273012	98273438	98273114	Y	C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	3901	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	98744078	98744248	98744144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00476	107819	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	99106686	99107122	99106995	Y	NA	SLC35D2	NA	NA	NA	NA	SLC35D2	36870	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	99171138	99171308	99171256	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	RP11-172F4.2	3572	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	100432763	100433089	100432926	Y	TSTD2,XPA	NCBP1,TSTD2,XPA	NA	NA	NA	NA	XPA	24550	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	100880203	100880431	100880317	Y	C9orf156,HEMGN,TRIM14,TRIM14	TRIM14	NA	NA	NA	NA	TRIM14	709	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr9	101002580	101002910	101002849	Y	C9orf156,NANS,TBC1D2	TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	13005	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr9	101557390	101557800	101557457	Y	NA	ANKS6,GALNT12	NA	NA	NA	NA	ANKS6	143	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	101819311	101819726	101819606	Y	TGFBR1	TGFBR1	NA	NA	NA	NA	TGFBR1	44594	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	101868249	101868435	101868378	Y	NA	TGFBR1	NA	NA	NA	NA	TGFBR1	3929	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr9	101871896	101872113	101872024	Y	TGFBR1	TGFBR1	NA	NA	NA	NA	TGFBR1	7576	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	102192463	102192924	102192635	Y	NR4A3	NA	NA	NA	NA	NA	SEC61B	210117	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	102767343	102767551	102767505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERP44	91771	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	104185147	104185490	104185310	Y	NA	MRPL50,ZNF189	NA	NA	NA	NA	ZNF189	25992	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	104248590	104248780	104248669	Y	C9orf125	RNF20	NA	NA	NA	NA	RNF20	45353	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr9	108058871	108059613	108059363	Y	ABCA1,TMEM38B,FSD1L,FSD1L	NA	NA	NA	NA	NA	SLC44A1	53968	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr9	108166209	108166576	108166239	Y	NA	FSD1L	NA	NA	NA	NA	FSD1L	41501	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	109626456	109627144	109627032	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	3078	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	109627297	109627657	109627483	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	3919	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	109932773	109933133	109932953	Y	NA	NA	ZNF462,MIR548Q,RAD23B	IMR90	Hi-C	24141950	RAD23B	110285	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	110266981	110267369	110267173	Y	NA	KLF4,RP11-438P9.1	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLF4	16218	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr9	110310627	110311050	110310826	Y	KLF4	RP11-438P9.1	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-438P9.1	15956	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	110401220	110401740	110401394	Y	NA	NA	KLF4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-438P9.1	106549	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr9	110512153	110512586	110512216	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-438P9.1	217482	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr9	110517575	110517896	110517754	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-438P9.1	222904	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	111063260	111063480	111063351	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-220D10.1	323633	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr9	111774521	111775173	111774726	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	712	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	112238648	112239006	112238827	Y	PTPN3	PTPN3	NA	NA	NA	NA	PTPN3	19584	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	112543534	112543655	112543595	Y	NA	PALM2-AKAP2,AKAP2	NA	NA	NA	NA	AKAP2	2765	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	114364049	114364191	114364143	Y	KIAA0368,GNG10	PTGR1,DNAJC25,DNAJC25-GNG10	NA	NA	NA	NA	PTGR1	3914	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr9	114389379	114389396	114389388	Y	NA	PTGR1,DNAJC25,DNAJC25-GNG10,GNG10	DNAJC25-GNG10	MCF7	ChIA-PET	22265404	DNAJC25	2236	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	114707434	114708001	114707643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	50388	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	115031676	115032066	115031959	Y	KIAA1958	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP3	61881	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	115606684	115606763	115606738	Y	ZFP37	NA	NA	NA	NA	NA	SNX30	95566	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	115981344	115981857	115981657	Y	SNX30,SLC46A2,RGS3,SLC31A2,FKBP15	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP15,SLC31A1	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	116454569	116454896	116454742	Y	BSPRY,ZNF618	NA	WDR31,BSPRY,ZNF618	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF618	181666	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	117152820	117152929	117152875	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFNB31	112801	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	117249092	117249487	117249472	Y	NA	DFNB31	NA	NA	NA	NA	DFNB31	16243	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	118706424	118707025	118706637	Y	NA	NA	ASTN2,LINC00474,PAPPA	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	207058	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	118919313	118920155	118919798	Y	PAPPA	PAPPA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	5230	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	119704265	119704279	119704273	Y	ASTN2	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	256684	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	120507373	120507587	120507563	Y	NA	TLR4	NA	NA	NA	NA	TLR4	42763	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	122670497	122670869	122670683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	669579	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	123237192	123237494	123237347	Y	MEGF9,FBXW2	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	102954	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	123283577	123283819	123283724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	56629	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	124383753	124383935	124383823	Y	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	NA	STOM	253222	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	124498744	124498978	124498839	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL11	354907	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	126002195	126002288	126002252	Y	OR1L6,RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,GPR21,STRBP,STRBP	STRBP	NA	NA	NA	NA	STRBP	26567	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	126154038	126154354	126154284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	125183	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	126160444	126160608	126160526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	131589	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	126297071	126297260	126297221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	268216	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	126630393	126630526	126630439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	59905	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	126695812	126695993	126695905	Y	PSMB7	DENND1A	NA	NA	NA	NA	DENND1A	5381	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	126895140	126895472	126895256	Y	NA	NA	DENND1A,NEK6,PSMB7,LOC100129034	IMR90	Hi-C	24141950	NEK6	122413	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	127161847	127162149	127162003	Y	NA	PSMB7	NA	NA	NA	NA	PSMB7	13574	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	127266277	127266534	127266531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMB7	90554	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	127509473	127509808	127509481	Y	NA	NR6A1,OLFML2A	NA	NA	NA	NA	NR6A1	21781	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	127519728	127520109	127519909	Y	NA	NR6A1,OLFML2A	NA	NA	NA	NA	NR6A1	11480	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	127541719	127542010	127541865	Y	NA	NR6A1,OLFML2A	NA	NA	NA	NA	OLFML2A	4282	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	127621077	127621225	127621167	Y	NA	RPL35,ARPC5L,RNU4-82P	NA	NA	NA	NA	RPL35	1035	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	127944437	127944756	127944696	Y	NR6A1,GOLGA1,PPP6C,GAPVD1	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	5462	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	127980597	127980978	127980790	Y	NA	PPP6C,RABEPK,HSPA5,GAPVD1	NA	NA	NA	NA	RABEPK	19776	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	128170862	128170906	128170878	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	148789	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr9	128172483	128172773	128172647	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	150410	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	11.477614213448
chr9	128298527	128298744	128298662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	168769	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	128299092	128299304	128299184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	168209	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr9	129290502	129290605	129290554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMX1B	84117	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	129481833	129482256	129482109	Y	ZBTB43,ZBTB34	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	83029	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	130319753	130319894	130319823	Y	ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,FPGS,FPGS,FAM129B	FAM129B	NA	NA	NA	NA	FAM129B	19374	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	130336494	130336746	130336628	Y	TOR2A,FPGS,FPGS,CDK9,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	2522	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr9	130461605	130461892	130461787	Y	GARNL3,STXBP1,ST6GALNAC6,SLC25A25,PIP5KL1,TTC16	MIR3911,PTRH1,TOR2A	NA	NA	NA	NA	MIR3911	10531	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	130764123	130764312	130764223	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS	FAM102A	FAM102A,DPM2,PIP5KL1,SLC25A25,NAIF1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM102A	23331	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr9	131316865	131317367	131316977	Y	NA	RP11-216B9.6,SPTAN1	NA	NA	NA	NA	SPTAN1	3999	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	131929415	131929566	131929473	Y	METTL11A,C9orf106	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8974	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr9	131937094	131937487	131937262	Y	PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1053	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	132040752	132040968	132040856	Y	NA	NA	C9orf106,IER5L,LOC100506190,PPP2R4,CRAT,C9orf50,METTL11A	IMR90,MCF7,HELA,K562	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	RP11-65J3.1	51611	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	132168772	132168919	132168823	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	74811	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr9	132223086	132223659	132223410	Y	C9orf106,TOR1B	LINC00963	PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106,C9orf50,METTL11A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	20071	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	132249112	132249430	132249268	Y	CRAT,IER5L,PRRX2	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	5382	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.0278460489655
chr9	132249735	132250094	132249903	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	6005	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	132257886	132258547	132258348	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	14156	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr9	132312044	132312247	132312152	Y	NA	NA	DOLPP1,LOC100506190,FAM73B,IER5L,CRAT,PPP2R4,C9orf106,C9orf50,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	68314	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	132330057	132330508	132330201	Y	NA	NA	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ASB6	71936	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	132349858	132350089	132350073	Y	NA	NA	LOC100506190,IER5L,C9orf50	MCF7	ChIA-PET	22265404	ASB6	52355	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	132359774	132359922	132359814	Y	PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,METTL11A	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	42522	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	132369856	132370376	132370136	Y	CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	32068	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chr9	132372165	132372686	132372524	Y	NA	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	29758	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	132385793	132386123	132385875	Y	C9orf106,TOR1B,PRRX2	ASB6,PRRX2	NA	NA	NA	NA	ASB6	16321	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	132539303	132540203	132539702	Y	C9orf106,FNBP1,TOR1B	PTGES,TOR1B,TOR1A	PPP2R4,PRRX2,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20,TOR1B,TOR1A,FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,GPR107	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOR1B	23229	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr9	132646480	132646964	132646831	Y	ASB6,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf78	50338	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	132757819	132758165	132758070	Y	TOR1B,FNBP1	FNBP1	NA	NA	NA	NA	FNBP1	45308	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr9	133321021	133321306	133321114	Y	ASS1	ASS1	NA	NA	NA	NA	ASS1	2705	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr9	133565449	133565699	133565571	Y	NA	RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1	NA	NA	NA	NA	EXOSC2	1409	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chr9	135197315	135197652	135197484	Y	NA	SETX	NA	NA	NA	NA	SETX	30720	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	135481058	135481229	135481144	Y	CEL	NA	NA	NA	NA	NA	GTF3C4	62193	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	136009131	136009458	136009277	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	27843	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	137221069	137221192	137221119	Y	RXRA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	14125	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	137264490	137265116	137264820	Y	RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	57546	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr9	137980289	137980456	137980357	Y	NA	OLFM1	NA	NA	NA	NA	OLFM1	15021	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	138348639	138348707	138348673	Y	NA	PPP1R26,MRPS2,C9orf116	NA	NA	NA	NA	PPP1R26	20218	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chr9	138764440	138764927	138764627	Y	NA	CAMSAP1,RP11-432J22.2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP1	32147	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	139826661	139826850	139826762	Y	NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2	MIR4479,FBXW5	NA	NA	NA	NA	FBXW5	10298	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	140022067	140022152	140022137	Y	EHMT1,WDR85,NDOR1,ANAPC2	MAN1B1,DPP7,MIR3621	NA	NA	NA	NA	DPP7	14438	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	140023271	140023604	140023504	Y	EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2	MAN1B1,DPP7,MIR3621	NA	NA	NA	NA	DPP7	15642	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7,MIR3621	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	12.3341525875859
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	15308	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.54176907344824
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chr9	140301516	140301688	140301630	Y	CACNA1B,NRARP	EXD3,NOXA1	NA	NA	NA	NA	EXD3	14026	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	140341522	140341675	140341601	Y	EHMT1,ANAPC2,NELF	EXD3,NOXA1	NA	NA	NA	NA	NOXA1	25720	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chr9	140463644	140464019	140463889	Y	FAM166A,C9orf173	PNPLA7,MRPL41,ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	ZMYND19	18923	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	2845714	2845991	2845779	Y	NA	ARSD	NA	NA	NA	NA	ARSD	322	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chrX	3629342	3629771	3629444	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chrX	9536624	9537203	9536862	Y	TBL1X,TBL1X	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1X	107289	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chrX	9786668	9786951	9786810	Y	NA	RP11-98L4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-98L4.1	1159	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	10135057	10135251	10135239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC3	153455	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	10547215	10547494	10547354	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1	302279	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	11455735	11455931	11455831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSL3	318347	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chrX	12228582	12228906	12228588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSL3	454304	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	12968289	12968795	12968434	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	22432	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	13002969	13003378	13003273	Y	TLR7,TMSB4X	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	11742	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	13119924	13120175	13120039	Y	NA	NA	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB4X	128697	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	14262210	14262757	14262259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8	216198	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	15787454	15787695	15787561	Y	NA	ZRSR2	NA	NA	NA	NA	ZRSR2	18900	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	16501635	16501820	16501725	Y	SYAP1	NA	GRPR,CTPS2	IMR90	Hi-C	24141950	CTPS2	227239	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	17395556	17395647	17395622	Y	NHS	NHS	NA	NA	NA	NA	NHS	4013	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	18693104	18693424	18693141	Y	PHKA2,CDKL5	NA	NA	NA	NA	NA	CDKL5	251401	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.54176907344824
chrX	18904688	18905149	18904995	Y	PHKA2	NA	NA	NA	NA	NA	PHKA2	95567	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chrX	22914204	22914355	22914279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD1	435778	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	23392393	23392738	23392570	Y	NA	PTCHD1	NA	NA	NA	NA	PTCHD1	42260	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chrX	30319869	30320142	30320108	Y	NA	NR0B1	NA	NA	NA	NA	NR0B1	5573	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	30631397	30631710	30631444	Y	GK,CXorf21	FTLP2,GK	NA	NA	NA	NA	FTLP2	14705	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	39680161	39680842	39680511	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	34771	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	39871700	39871985	39871950	Y	BCOR,BCOR	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	162597	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	39872499	39873023	39872596	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	161559	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	39873339	39874259	39873676	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	160323	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chrX	39963356	39963613	39963579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	70969	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	39965558	39965902	39965820	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	68680	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chrX	40013089	40013254	40013186	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	21328	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chrX	40691770	40692090	40691930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-77G22.2	73147	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	40943673	40944218	40943773	Y	CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X	USP9X	NA	NA	NA	NA	USP9X	785	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	41182589	41182765	41182693	Y	NA	DDX3X	DDX3X	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DDX3X	7886	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	41480372	41480697	41480463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3X	289721	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.05569209793099
chrX	41594711	41594837	41594774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASK	185879	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	42390700	42390987	42390889	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P4	434274	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	43503580	43504080	43503735	Y	NA	MAOA	NA	NA	NA	NA	MAOA	9387	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAOB	148897	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	44733657	44734406	44734027	Y	KDM6A	KDM6A	NA	NA	NA	NA	KDM6A	2900	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chrX	45626471	45627108	45626806	Y	NA	MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR222	21941	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	46278987	46279293	46279130	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18856	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	47016809	47017199	47017004	Y	NA	RBM10,NDUFB11,UBA1	NA	NA	NA	NA	NDUFB11	13906	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chrX	47415526	47415793	47415667	Y	NA	NUS1P1,ARAF,TIMP1	NA	NA	NA	NA	ARAF	2723	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	47438054	47438403	47438273	Y	CFP,CFP,ARAF	ARAF,TIMP1,SYN1,CFP	NA	NA	NA	NA	TIMP1	1309	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chrX	48777238	48777933	48777700	Y	TBC1D25,WAS,PQBP1,PPP1R3F,PIM2,OTUD5,OTUD5,GRIPAP1	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2,OTUD5	NA	NA	NA	NA	PIM2	2937	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	52949996	52950343	52950129	Y	TSPYL2,KDM5C,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	31660	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	45908	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chrX	53110126	53110560	53110260	Y	NA	GPR173,TSPYL2,LINC01155	NA	NA	NA	NA	TSPYL2	577	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	53172968	53173150	53172985	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01155	51641	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	53467183	53467489	53467297	Y	FAM156A,TSPYL2,IQSEC2	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	HSD17B10	7863	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	53468564	53468782	53468716	Y	IQSEC2	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	HSD17B10	9244	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	54665732	54666388	54666226	Y	NA	NA	ITIH6,MAGED2	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNL3L	111088	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chrX	56269843	56269989	56269918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBQLN2	318037	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chrX	57490949	57491197	57490977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZXDB	125072	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	57929641	57930031	57929858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZXDB	313372	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	58292059	58292236	58292148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZXDB	675790	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	63554308	63554471	63554461	Y	MTMR8	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR8	58862	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	64888338	64888720	64888577	Y	MSN	NA	NA	NA	NA	NA	MSN	82081	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chrX	67291116	67291490	67291298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPHN1	360265	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	67724193	67724408	67724299	Y	NA	YIPF6	NA	NA	NA	NA	YIPF6	8028	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	EFNB1	NA	NA	NA	NA	EFNB1	42163	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chrX	69653784	69653948	69653832	Y	NA	DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8763	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	70401853	70402134	70401993	Y	IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO	NA	NA	NA	NA	NA	MED12	65447	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	70640504	70640913	70640718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF1	56390	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chrX	71761722	71762003	71761864	Y	NA	HDAC8	NA	NA	NA	NA	HDAC8	28950	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	73246732	73246982	73246857	Y	CHIC1	NA	NA	NA	NA	NA	JPX	84573	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	73340869	73341139	73340910	Y	RLIM	NA	NA	NA	NA	NA	USMG5P1	50586	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chrX	73507125	73507445	73507287	Y	NA	FTX	NA	NA	NA	NA	FTX	3964	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	73510244	73510542	73510484	Y	RLIM	FTX	NA	NA	NA	NA	FTX	867	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	74960822	74961039	74960972	Y	NA	TTC3P1	NA	NA	NA	NA	TTC3P1	3710	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	77226253	77226302	77226278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP7A	62059	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chrX	77306835	77307068	77306952	Y	NA	PGK1	NA	NA	NA	NA	PGK1	11617	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chrX	92479084	92479478	92479382	Y	NA	RP13-88F20.1	NA	NA	NA	NA	RP13-88F20.1	1070	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chrX	100664036	100664412	100664274	Y	NA	RPL36A,GLA,HNRNPH2,ARMCX4	NA	NA	NA	NA	HNRNPH2	2753	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	101914784	101914936	101914847	Y	BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1	NA	NA	NA	NA	NA	GPRASP2	50168	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chrX	106920003	106920801	106920325	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	50266	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chrX	109017105	109017471	109017326	Y	NA	ACSL4	NA	NA	NA	NA	ACSL4	42473	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	110863259	110863845	110863518	Y	NA	EIF4BP7,ALG13	NA	NA	NA	NA	EIF4BP7	542	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	114956184	114956305	114956232	Y	NA	EEF1GP5	NA	NA	NA	NA	EEF1GP5	21053	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	115083189	115083554	115083375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	0	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chrX	115239457	115239782	115239623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	156035	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	117487110	117487426	117487273	Y	DOCK11,WDR44	WDR44	NA	NA	NA	NA	WDR44	9074	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	119076607	119076872	119076702	Y	NKRF	NKAP	NA	NA	NA	NA	NKAP	872	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	119619980	119620335	119620161	Y	NA	LAMP2	LAMP2	K562	ChIA-PET	22265404	LAMP2	18760	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	119883101	119883187	119883145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	121096	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	120331489	120331718	120331553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	569484	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.513923024482748
chrX	120885494	120885577	120885536	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	1123489	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	1.88438442310341
chrX	128656237	128656454	128656444	Y	NA	SMARCA1,OCRL	NA	NA	NA	NA	SMARCA1	760	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chrX	129065451	129065820	129065554	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	27354	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	129255072	129255259	129255158	Y	SASH3,ELF4,ELF4	ELF4,AIFM1	ELF4	K562	ChIA-PET	22265404	ELF4	12381	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	129400519	129400680	129400638	Y	NA	ZNF280C	NA	NA	NA	NA	ZNF280C	193	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.856538374137913
chrX	134048475	134048529	134048502	Y	MOSPD1	MOSPD1	NA	NA	NA	NA	MOSPD1	1178	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	134485580	134485626	134485601	Y	ZNF449,CT45A6	ZNF75D,ZNF449	NA	NA	NA	NA	ZNF449	8859	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.68523069931033
chrX	136647486	136647742	136647575	Y	NA	ZIC3	NA	NA	NA	NA	ZIC3	1185	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	144930014	144930037	144930026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPCP10	1009716	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	149533685	149533896	149533780	Y	MAMLD1	MAMLD1	NA	NA	NA	NA	MAMLD1	5996	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	149863588	149863865	149863755	Y	MTM1,MTMR1	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	4153	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	2.56961512241374
chrX	152127371	152127756	152127434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSDHL	129860	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	153233137	153233308	153233234	Y	ABCD1,ARHGAP4,RENBP,TAZ,MECP2,DNASE1L1,TMEM187	ARHGAP4,NAA10,RENBP,HCFC1,TMEM187	NA	NA	NA	NA	HCFC1	1950	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	153596671	153598676	153598064	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	2330	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165
chrX	153755432	153755621	153755566	Y	NA	LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD	FAM3A	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	IKBKG	11793	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	153771070	153771275	153771201	Y	IRAK1,MECP2,TEX28,TEX28,EMD,DNASE1L1,TAZ,ATP6AP1,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1,GAB3,IKBKG,IKBKG,IKBKG	FAM3A,IKBKG,G6PD	NA	NA	NA	NA	G6PD	2512	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrX	154256125	154256514	154256179	Y	IKBKG,IKBKG,IKBKG,GAB3,MPP1,LOC100132963,F8A1,F8A2	FUNDC2,BRCC3	NA	NA	NA	NA	FUNDC2	3870	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrY	13479190	13479567	13479379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTTY15	1292698	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrY	13484567	13484797	13484656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTTY15	1287468	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.171307674827583
chrY	15207344	15207441	15207401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3Y	193325	CAGE	NCI-H460	hg19	FANTOM5	0.342615349655165