chr1	956563	956812	956665	Y	UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN	HES4,ISG15,AGRN	NA	NA	NA	NA	AGRN	3060	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	1343359	1343768	1343546	Y	NA	MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20,ANKRD65,TMEM88B,VWA1	NA	NA	NA	NA	MRPL20	2666	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	TMEM52	7877	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,HES5,FAM213B	NA	NA	NA	NA	HES5	17731	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr1	2478276	2478817	2478474	Y	SKI,PANK4,TNFRSF14	PANK4,HES5,FAM213B	NA	NA	NA	NA	HES5	18592	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr1	3420761	3421065	3420920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	51771	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	4697251	4697504	4697378	Y	NA	AJAP1	NPHP4	IMR90	Hi-C	24141950	AJAP1	15288	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	6040561	6040806	6040680	Y	NA	NPHP4	NA	NA	NA	NA	NPHP4	9727	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	6321567	6321961	6321896	Y	THAP3,THAP3,GPR153	ICMT,HES3,GPR153	NA	NA	NA	NA	GPR153	2532	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	6336471	6336830	6336716	Y	ZBTB48,PHF13,GPR153,ACOT7	ICMT,HES3,GPR153	GPR153	K562	ChIA-PET	22265404	GPR153	17436	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	6370006	6370154	6370079	Y	NA	NA	HES3,ICMT,GPR153	IMR90	Hi-C	24141950	GPR153	50971	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	6661008	6661639	6661311	Y	ZBTB48,KLHL21	NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3	NA	NA	NA	NA	PHF13	10106	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	6760819	6760983	6760901	Y	NA	DNAJC11	NA	NA	NA	NA	DNAJC11	835	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	6943772	6944262	6943813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	100388	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	7764543	7764931	7764717	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	64398	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.29125731011324
chr1	7843556	7843653	7843585	Y	PER3	VAMP3,PER3	NA	NA	NA	NA	PER3	1176	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	8156648	8157003	8156918	Y	VAMP3	NA	ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	71850	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	8187563	8187834	8187771	Y	VAMP3,TNFRSF9	NA	ERRFI1,SLC45A1,RERE	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-431K24.1	102765	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	8445817	8446112	8445964	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	69931	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	8762126	8762475	8762428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	113227	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	8858188	8858497	8858477	Y	NA	RERE	NA	NA	NA	NA	RERE	17205	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	8971325	8971721	8971517	Y	NA	ENO1-IT1,ENO1	ENO1-AS1,ENO1,CA6,SLC2A7,SLC2A5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ENO1	34017	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	9111078	9111104	9111091	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	GPR157	76125	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	9760502	9760837	9760631	Y	NA	RP11-558F24.4	NA	NA	NA	NA	RP11-558F24.4	14889	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	9885367	9885695	9885655	Y	NA	CLSTN1	NA	NA	NA	NA	CLSTN1	2783	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	11968510	11969143	11969021	Y	MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP	KIAA2013,PLOD1	NA	NA	NA	NA	KIAA2013	15342	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	12112067	12112502	12112283	Y	MIIP,TNFRSF8	MIIP,TNFRSF8	NA	NA	NA	NA	TNFRSF8	8932	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	12124472	12125118	12124763	Y	MIIP,TNFRSF8	MIIP,TNFRSF8	NA	NA	NA	NA	TNFRSF8	3038	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	12193120	12193399	12193251	Y	AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF8,TNFRSF1B	TNFRSF1B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1B	31661	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	12221931	12222397	12222091	Y	FBXO6,AGTRAP,MTHFR,CLCN6,MFN2,TNFRSF8,TNFRSF1B	TNFRSF1B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1B	2663	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	12674513	12674729	12674684	Y	NA	DHRS3	NA	NA	NA	NA	DHRS3	1008	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	12717632	12717976	12717808	Y	NA	DHRS3	NA	NA	NA	NA	DHRS3	41895	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	15059594	15059681	15059648	Y	KAZN	NA	NA	NA	NA	NA	KAZN	136394	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	15697702	15697752	15697727	Y	NA	EFHD2	NA	NA	NA	NA	EFHD2	36639	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	15742467	15743324	15742634	Y	TMEM51,TMEM51,SPEN,PLEKHM2,EFHD2,CASP9	EFHD2	NA	NA	NA	NA	EFHD2	8076	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	16087189	16087372	16087266	Y	EPHA2,FBLIM1	FBLIM1	NA	NA	NA	NA	FBLIM1	6087	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr1	16125579	16125747	16125670	Y	FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2	FBLIM1,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	FBLIM1	44477	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	16212759	16213091	16212941	Y	EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	40117	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	16339773	16339933	16339866	Y	CASP9,PLEKHM2,SPEN,ZBTB17	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	39146	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	16553276	16553594	16553536	Y	NA	RSG1	NA	NA	NA	NA	RSG1	8063	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	16696032	16696399	16696223	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	19083	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	RNU1-1	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-1	12489	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	17027024	17027386	17027173	Y	NA	EIF1AXP1,CROCC	NA	NA	NA	NA	EIF1AXP1	16474	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	RP11-108M9.4	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-108M9.4	17109	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-108M9.4	26044	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr1	17353741	17353845	17353793	Y	NA	MFAP2,ATP13A2,SDHB	ATP13A2	K562	ChIA-PET	22265404	ATP13A2	17318	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	17767804	17768710	17768126	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	3584	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.05500974681765
chr1	17865185	17865523	17865202	Y	ARHGEF10L	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	855	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	17867253	17867735	17867370	Y	NA	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	2923	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	18884159	18884499	18884233	Y	NA	RP1-8B22.1	NA	NA	NA	NA	RP1-8B22.1	46547	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	19780234	19780551	19780381	Y	NA	CAPZB	NA	NA	NA	NA	CAPZB	29515	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	19796024	19796128	19796080	Y	NA	CAPZB,RNU4-28P	NA	NA	NA	NA	CAPZB	13938	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	20091332	20091506	20091448	Y	PLA2G2A,TMCO4	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	32932	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	21401731	21402159	21402110	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	3485	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	22002610	22002786	22002701	Y	NA	RAP1GAP	RAP1GAP	K562	ChIA-PET	22265404	RAP1GAP	8809	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	23589856	23590232	23590037	Y	NA	NA	KDM1A,HTR1D,LUZP1,LOC729059,HNRNPR,TCEA3,E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPR	78597	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr1	23882500	23882866	23882600	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	1419	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	24349340	24349488	24349411	Y	NA	RP11-4M23.7	LYPLA2,SRSF10,MYOM3,PNRC2,SRRM1,HMGCL,IL22RA1,LOC100506963,TCEB3,GALE,FUCA1,CNR2,IL28RA,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-4M23.7	16331	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	25051605	25051987	25051744	Y	NA	CLIC4	RUNX3,CLIC4,SRRM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLIC4	17861	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	25566618	25566670	25566639	Y	NA	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9625	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	26201699	26201757	26201716	Y	SEPN1	MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	MIR3917	29188	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	26490998	26491259	26491133	Y	NA	ZNF593,CNKSR1	NA	NA	NA	NA	ZNF593	3103	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	26642014	26642169	26642069	Y	FAM54B,SH3BGRL3,RPS6KA1,HMGN2,UBXN11,UBXN11,CD52	SH3BGRL3,CD52,UBXN11	NA	NA	NA	NA	CD52	279	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	26735858	26736255	26735942	Y	NA	LIN28A,DHDDS,RP3-476K8.4	NA	NA	NA	NA	LIN28A	589	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HMGN2	30291	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	26946837	26947249	26947076	Y	CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	73275	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr1	27321452	27321840	27321632	Y	TMEM222,TRNP1,FAM46B	C1orf172,RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	TRNP1	3254	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	27336678	27336931	27336804	Y	NA	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	FAM46B	396	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	27383957	27384315	27384137	Y	GPR3	FAM46B	C1orf172,TRNP1,FAM46B,WDTC1,SLC9A1,TMEM222,SYTL1,GPR3,GPATCH3,NR0B2,FCN3,MAP3K6,CD164L2,AHDC1,IFI6,FGR,WASF2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM46B	46630	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	27561705	27561803	27561716	Y	NA	WDTC1	NA	NA	NA	NA	WDTC1	2698	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	27625914	27626081	27626007	Y	TRNP1,MAP3K6,TMEM222	TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1	NA	NA	NA	NA	TMEM222	20570	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,GPR3	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	27831022	27831314	27831199	Y	NA	WASF2	SYTL1,GPR3,WASF2,AHDC1,FGR	IMR90	Hi-C	24141950	WASF2	16353	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	27893697	27893957	27893851	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	34985	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	27907931	27908052	27907995	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	20890	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	27916292	27916674	27916513	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1,FGR	NA	NA	NA	NA	AHDC1	12268	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	27924204	27924421	27924302	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1,FGR	NA	NA	NA	NA	AHDC1	4521	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	27926949	27927449	27927117	Y	NA	AHDC1,FGR	NA	NA	NA	NA	AHDC1	1493	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	27928507	27928973	27928740	Y	NA	FGR	NA	NA	NA	NA	AHDC1	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	27982664	27982914	27982811	Y	EYA3,STX12,C1orf38,FGR,FGR,FGR	FGR,IFI6	NA	NA	NA	NA	IFI6	13815	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	28199684	28200598	28200276	Y	SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,EYA3,WASF2,FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,XKR8	PPP1R8,RPA2	NA	NA	NA	NA	RPA2	38659	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	28204631	28205027	28204647	Y	NA	PPP1R8,RPA2	NA	NA	NA	NA	RPA2	34230	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	28318645	28318992	28318812	Y	FAM76A	XKR8	NA	NA	NA	NA	XKR8	34672	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	28355043	28355235	28355139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYA3	57972	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	28389248	28389585	28389551	Y	NA	EYA3	NA	NA	NA	NA	EYA3	23622	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	28576012	28576248	28576109	Y	STX12,C1orf38,EYA3,PTAFR,PTAFR,GMEB1,SESN2,MED18	DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	7790	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr1	29101544	29101853	29101799	Y	EPB41	YTHDF2,OPRD1	NA	NA	NA	NA	OPRD1	34801	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	29214759	29214998	29214903	Y	GMEB1,EPB41	EPB41	NA	NA	NA	NA	EPB41	3156	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	29451057	29451462	29451431	Y	TMEM200B,TMEM200B	TMEM200B	NA	NA	NA	NA	TMEM200B	2610	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	29503706	29504118	29503928	Y	NA	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2381	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	29513219	29513546	29513454	Y	NA	SRSF4,MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	SRSF4	6720	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr1	29517304	29517322	29517313	Y	NA	SRSF4,MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	SRSF4	10805	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	29563709	29564430	29563877	Y	PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	2681	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr1	29564766	29564995	29564881	Y	NA	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	3738	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr1	29565515	29565732	29565598	Y	SRSF4,PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	4487	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	4.32793047465834
chr1	29565762	29566055	29565979	Y	SRSF4,PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	4734	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.29125731011324
chr1	29598339	29598546	29598399	Y	NA	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	37311	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	29683297	29683456	29683378	Y	SRSF4,PTPRU	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRU	122269	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.81876218352206
chr1	30446180	30446480	30446328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAPTM5	782187	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	30447163	30447510	30447328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAPTM5	781157	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	31220962	31221590	31221236	Y	NA	LAPTM5	NA	NA	NA	NA	LAPTM5	7077	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr1	31360609	31360977	31360897	Y	NA	SDC3	NA	NA	NA	NA	SDC3	18631	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	31483120	31483355	31483250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PUM1	53483	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	31517703	31518005	31517854	Y	NA	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	18833	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	31602770	31603168	31602969	Y	NKAIN1	NA	PRO0611,PUM1,NKAIN1,SNRNP40	IMR90	Hi-C	24141950	PUM1	65932	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	82443	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr1	31643824	31643962	31643871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKAIN1	66439	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	31943761	31943827	31943813	Y	NA	NA	SERINC2,SNRNP40,NKAIN1,ZCCHC17,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1,PEF1,SPOCD1,HCRTR1	IMR90	Hi-C	24141950	SERINC2	63349	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	31976608	31977048	31976952	Y	PUM1	NA	LOC284551	IMR90	Hi-C	24141950	TINAGL1	63068	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	32015159	32015590	32015321	Y	NA	TINAGL1	FABP3,SERINC2,LOC284551,PEF1,HCRTR1,NKAIN1,TINAGL1	IMR90	Hi-C	24141950	TINAGL1	24526	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	32347360	32347436	32347398	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTP4A2	61021	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	32966228	32966602	32966575	Y	FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8B,ZBTB8A	NA	NA	NA	NA	ZBTB8A	36426	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr1	33089029	33089046	33089038	Y	NA	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	25458	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	33094923	33095323	33095277	Y	NA	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	19181	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	33182280	33182513	33182368	Y	KIAA1522	SYNC,KIAA1522	SYNC,S100PBP,BSDC1,ZBTB8B,RBBP4,KIAA1522,YARS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYNC	15083	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	33202470	33202806	33202641	Y	ZBTB8OS,RBBP4,RBBP4,KIAA1522	SYNC,KIAA1522	KIAA1522	K562	ChIA-PET	22265404	KIAA1522	2680	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	33203093	33203146	33203106	Y	NA	SYNC,KIAA1522	KIAA1522	K562	ChIA-PET	22265404	KIAA1522	2340	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	33221272	33221671	33221612	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	15786	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	33232248	33232565	33232367	Y	NA	KIAA1522,S100PBP,YARS	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	26762	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	33438571	33438703	33438616	Y	KIAA1522,ADC	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	10285	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr1	36103028	36103196	36103152	Y	NA	PSMB2	TFAP2E	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB2	2249	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	36173458	36173573	36173482	Y	TEKT2,EIF2C1	C1orf216	NA	NA	NA	NA	C1orf216	9500	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	36183411	36183689	36183588	Y	C1orf216	C1orf216,CLSPN	NA	NA	NA	NA	C1orf216	338	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	36351655	36352020	36351717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLSPN	118087	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	36866636	36866899	36866720	Y	LSM10	STK40,LSM10,OSCP1	NA	NA	NA	NA	LSM10	5143	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	37195884	37196007	37195923	Y	OSCP1	NA	GRIK3	IMR90	Hi-C	24141950	CSF3R	249005	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	37721552	37721986	37721683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01137	216026	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	37942874	37943354	37943027	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	4721	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	38311465	38311868	38311723	Y	ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	11424	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	38495782	38495936	38495884	Y	NA	SF3A3,FHL3,UTP11L,POU3F1	NA	NA	NA	NA	POU3F1	14514	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	39193613	39193736	39193672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRAGC	129759	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	39508832	39509204	39509012	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	18842	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	39607620	39607869	39607817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	62632	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	39624919	39625154	39625144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	79931	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	39736190	39736575	39736327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	137576	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	39791626	39791706	39791638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	82445	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	39857791	39857995	39857869	Y	NA	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	16156	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	39874208	39874673	39874342	Y	KIAA0754	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	57	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	40628781	40629153	40628997	Y	NA	RLF	NA	NA	NA	NA	RLF	3736	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	41119684	41120000	41119793	Y	NA	RIMS3,NFYC	NA	NA	NA	NA	RIMS3	9329	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	41495531	41495820	41495676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	169513	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	41501908	41501999	41501966	Y	SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	175890	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	41825927	41826139	41826062	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	333	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	41826642	41826952	41826745	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	1048	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	41915297	41915638	41915514	Y	HIVEP3	EDN2	EDN2	MCF7	ChIA-PET	22265404	EDN2	32706	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr1	41961925	41962146	41962029	Y	NA	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	13581	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	179507	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	6.36460363920344
chr1	42272535	42272820	42272654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	226776	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	42325828	42326208	42326056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	173388	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	42367142	42367456	42367439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	132140	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	42774668	42774801	42774679	Y	CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	FOXJ3	NA	NA	NA	NA	FOXJ3	24747	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr1	43406108	43407009	43406836	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	15521	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	43432863	43433109	43432938	Y	CCDC30,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	10143	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	43471435	43471828	43471543	Y	SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	48715	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	43473183	43473398	43473279	Y	C1orf210,C1orf210,SLC2A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	50463	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.29125731011324
chr1	43524188	43524462	43524346	Y	NA	NA	SLC2A1,FLJ32224,LOC100129924,C1orf50,LEPRE1,ERMAP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A1-AS1	101468	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	43666420	43666443	43666435	Y	NA	WDR65	NA	NA	NA	NA	WDR65	30600	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	43997843	43998152	43997977	Y	PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	8985	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	44011575	44011705	44011627	Y	NA	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	22717	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	44015731	44016125	44016031	Y	CCDC24,WDR65,C1orf210,C1orf210,PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	26873	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	44162019	44162313	44162287	Y	NA	KDM4A,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	7182	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	44324219	44324394	44324336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARTN	72598	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	44430681	44431060	44430788	Y	NA	ARTN,RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24	NA	NA	NA	NA	DPH2	2612	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	44452990	44453115	44453039	Y	NA	RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9	NA	NA	NA	NA	CCDC24	1916	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	44495684	44496307	44495779	Y	NA	CCDC24,SLC6A9	B4GALT2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A9	545	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	44689979	44690114	44690071	Y	NA	DMAP1	NA	NA	NA	NA	DMAP1	12852	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	45990749	45991039	45990946	Y	NA	TESK2,MMACHC,PRDX1,AKR1A1	NA	NA	NA	NA	PRDX1	4030	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	46102450	46102810	46102714	Y	NA	CCDC17,RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	12688	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	46111666	46112048	46111975	Y	NA	CCDC17,RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	3450	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	47522995	47523190	47523093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAL1	172702	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	49250651	49250822	49250750	Y	NA	BEND5	NA	NA	NA	NA	BEND5	10010	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	49430429	49430657	49430543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BEND5	189788	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	51245588	51245972	51245952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	177963	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	51312022	51312165	51312091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	111770	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	51757763	51757925	51757844	Y	TTC39A,OSBPL9	NA	NA	NA	NA	NA	TTC39A	50863	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	51823993	51824400	51824363	Y	NA	TTC39A	NA	NA	NA	NA	TTC39A	15205	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	52029722	52030067	52029870	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15,OSBPL9	OSBPL9,EPS15,NRD1	IMR90	Hi-C	24141950	OSBPL9	10784	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	52033462	52033748	52033585	Y	NA	OSBPL9	OSBPL9,EPS15,NRD1,TTC39A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL9	7103	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	52173889	52173954	52173921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	133038	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	52238666	52238881	52238774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRD1	103596	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	52507951	52508154	52508101	Y	NA	KTI12,BTF3L4,TXNDC12	NA	NA	NA	NA	KTI12	10463	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	53092647	53093031	53092839	Y	NA	GPX7,FAM159A	NA	NA	NA	NA	FAM159A	3985	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	53168640	53169047	53168726	Y	NA	ZYG11B	SELRC1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ZYG11B	21079	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr1	54261078	54261111	54261098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPF1	93296	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	54700132	54700688	54700499	Y	NA	CYB5RL	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	36423	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	54842500	54842749	54842625	Y	NA	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	34403	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	54844378	54844570	54844456	Y	NA	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	32582	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	54873075	54873515	54873406	Y	SSBP3,SSBP3	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	3637	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	54941159	54941412	54941231	Y	TCEANC2,SSBP3,SSBP3	NA	TMEM59,TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	64007	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	54941776	54941995	54941811	Y	NA	NA	TMEM59,TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2	IMR90	Hi-C	24141950	SSBP3	64624	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	54953784	54954325	54954090	Y	SSBP3,SSBP3	NA	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	76632	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	54956081	54956394	54956179	Y	NA	NA	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	78929	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	55678785	55679185	55678893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP24	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	56919158	56919299	56919214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	189675	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.29125731011324
chr1	56974162	56974535	56974381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	134439	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	57042744	57043185	57043024	Y	C8B,C8A,C1orf168,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	65789	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	57043287	57044160	57043621	Y	PRKAA2,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	64814	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	57885160	57885452	57885308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf168	601791	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	57887813	57887926	57887901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf168	604444	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	57948146	57948309	57948229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf168	664777	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	57988271	57988573	57988424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf168	704902	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	57995135	57995251	57995193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf168	711766	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	59008745	59009101	59008916	Y	NA	DAB1,OMA1,TACSTD2	NA	NA	NA	NA	DAB1	1305	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	59050239	59050578	59050488	Y	NA	DAB1,OMA1,TACSTD2	MYSM1,FGGY,OMA1	IMR90	Hi-C	24141950	TACSTD2	9073	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	59085972	59086240	59086165	Y	NA	TACSTD2	TACSTD2,OMA1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TACSTD2	44806	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	59229881	59230252	59230003	Y	NA	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	17533	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	59522982	59523218	59523118	Y	NA	NA	FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52	IMR90	Hi-C	24141950	FGGY	237092	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	60157078	60157331	60157204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HOOK1	121127	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	60196566	60196799	60196671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HOOK1	81659	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	61333622	61333797	61333765	Y	NA	NFIA	INADL	IMR90	Hi-C	24141950	NFIA	4691	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	61579491	61579639	61579512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	250560	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	62208815	62209373	62208933	Y	NA	TM2D1,INADL	NA	NA	NA	NA	INADL	2666	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	62416847	62417238	62417043	Y	INADL,USP1,KANK4	NA	NA	NA	NA	NA	INADL	210698	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	62698531	62698618	62698572	Y	USP1,USP1,KANK4,L1TD1	L1TD1	NA	NA	NA	NA	L1TD1	40028	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr1	62822173	62822473	62822319	Y	NA	KANK4	KANK4	IMR90	Hi-C	24141950	KANK4	39088	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	63785369	63785450	63785384	Y	FOXD3	LINC00466,FOXD3,RP4-792G4.2,ALG6	NA	NA	NA	NA	FOXD3	1280	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	64254998	64255371	64255034	Y	ROR1	ROR1	NA	NA	NA	NA	ROR1	17305	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	64417224	64417447	64417336	Y	ROR1	NA	NA	NA	NA	NA	CFL1P3	109868	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	65517662	65517702	65517682	Y	NA	RP4-535B20.1	NA	NA	NA	NA	RP4-535B20.1	13718	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	65639675	65639734	65639705	Y	NA	AK4	NA	NA	NA	NA	AK4	28443	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	65701792	65701883	65701838	Y	NA	DNAJC6	NA	NA	NA	NA	DNAJC6	10019	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	68215256	68215932	68215330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45A	66512	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	68314949	68315302	68315127	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	17799	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	68354536	68354908	68354722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG12	57386	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	68961350	68961555	68961472	Y	NA	DEPDC1	NA	NA	NA	NA	DEPDC1	446	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	69605544	69605634	69605589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEPDC1	644640	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	70017370	70017628	70017440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC40	651675	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	70746826	70747040	70746993	Y	ANKRD13C	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	62120	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	72749220	72749791	72749447	Y	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NA	KRT8P21	818684	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	73066346	73066731	73066539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT8P21	501744	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	74857647	74857766	74857707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNNI3K	195700	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	75182913	75182976	75182918	Y	NA	TYW3,CRYZ	NA	NA	NA	NA	TYW3	13860	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	76080205	76080672	76080321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACADM	107364	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	76541670	76541922	76541777	Y	ST6GALNAC3	ST6GALNAC3	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC3	3266	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	76645391	76645540	76645467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC3	106987	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	77385063	77385511	77385240	Y	ST6GALNAC5	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC5	53937	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	77595980	77596376	77595997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGK	86739	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	77842116	77842473	77842156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGK	159001	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	78067790	78068312	78068066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	78792	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	78132928	78133068	78133059	Y	NA	ZZZ3	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	14036	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	78404062	78404594	78404354	Y	NA	FUBP1,DNAJB4,GIPC2	NA	NA	NA	NA	FUBP1	38200	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	78423142	78423521	78423473	Y	NA	FUBP1,DNAJB4,GIPC2	NA	NA	NA	NA	FUBP1	19273	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	78441093	78441406	78441347	Y	NA	FUBP1,DNAJB4,GIPC2	NA	NA	NA	NA	FUBP1	1388	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIPC2	114120	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIPC2	772546	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	80230584	80230813	80230699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIPC2	1787358	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	82268420	82269588	82268555	Y	LPHN2	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	83042	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	84120524	84120814	84120773	Y	PRKACB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	203892	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	86072885	86073441	86073156	Y	CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90	Hi-C	24141950	CYR61	28441	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	87617475	87617831	87617556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO4	174320	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	88292387	88292883	88292561	Y	NA	NA	LMO4	IMR90	Hi-C	24141950	LMO4	500236	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	89167079	89167239	89167155	Y	GTF2B,GBP4,GBP3,GBP2,GBP1	PKN2	NA	NA	NA	NA	PKN2	19174	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	89358212	89358439	89358316	Y	PKN2,CCBL2	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	2585	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	90274070	90274340	90274210	Y	NA	LRRC8D	GEMIN8P4,ZNF326,LRRC8D	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LRRC8D	10233	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	90319744	90319959	90319950	Y	NA	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	35171	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	90372321	90372729	90372378	Y	LRRC8B,LRRC8C,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	85151	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	90376424	90376756	90376561	Y	LRRC8D,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	81124	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	91183313	91183764	91183661	Y	BARHL2	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-665J23.1	131443	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr1	91185058	91185169	91185091	Y	BARHL2	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-665J23.1	130038	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	92270160	92270686	92270504	Y	RPAP2,GLMN	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	99206	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	92907492	92907607	92907552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLMN	144948	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.54584145568138
chr1	93003662	93004045	93003868	Y	RPAP2,GLMN,RPL5,GFI1	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-59P	160446	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	93414710	93414781	93414746	Y	NA	FAM69A	NA	NA	NA	NA	FAM69A	10276	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	93914812	93914954	93914881	Y	FNBP1L	FNBP1L	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	3124	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	94007993	94008357	94008092	Y	FNBP1L,BCAR3	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	96305	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr1	94023703	94024059	94023930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	112015	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	94128177	94128297	94128262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAR3	182409	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	94535371	94535770	94535449	Y	ARHGAP29	NA	NA	NA	NA	NA	GCLM	162405	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	95007995	95008302	95008221	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	2639	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	97199537	97199912	97199566	Y	NA	PTBP2	NA	NA	NA	NA	PTBP2	14316	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	97291085	97291340	97291213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP2	105864	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	97596064	97596178	97596116	Y	PTBP2	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP2	410843	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr1	98518546	98518920	98518639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	509289	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	100555117	100555459	100555393	Y	NA	SASS6	NA	NA	NA	NA	SASS6	41052	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	100678369	100678762	100678562	Y	NA	DBT	NA	NA	NA	NA	DBT	34628	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	100858865	100858991	100858930	Y	SLC35A3,HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	50281	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	100859593	100859940	100859621	Y	HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	51009	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	100966297	100966321	100966309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	157713	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	101485385	101485713	101485528	Y	NA	RP11-421L21.3,DPH5	NA	NA	NA	NA	RP11-421L21.3	3721	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	103509479	103509769	103509633	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNPC3	556544	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	105911296	105911317	105911307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-364B6.2	1297664	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	107809244	107809255	107809250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTNG1	128615	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	108479405	108480123	108479634	Y	VAV3	VAV3	NA	NA	NA	NA	VAV3	25643	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	109467804	109468470	109468110	Y	GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	35636	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	109469350	109469540	109469522	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	34566	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	109572587	109572654	109572620	Y	NA	WDR47,TAF13	NA	NA	NA	NA	WDR47	10196	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	109797001	109797635	109797309	Y	NA	SARS,CELSR2,PSRC1	NA	NA	NA	NA	CELSR2	6360	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	109981518	109981703	109981616	Y	NA	SORT1,PSMA5,SYPL2,ATXN7L2	CELSR2,SORT1,PSMA5,SYPL2,CYB561D1,MYBPHL,ATXN7L2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PSMA5	14456	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	110334849	110335164	110334977	Y	NA	EPS8L3	CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPS8L3	30200	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr1	110360957	110361372	110361052	Y	NA	NA	CSF1,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	EPS8L3	56308	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	110548379	110548612	110548408	Y	NA	AHCYL1	NA	NA	NA	NA	AHCYL1	23071	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	111441077	111441266	111441172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRIF1	63435	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	111489179	111489247	111489213	Y	NA	LRIF1	NA	NA	NA	NA	LRIF1	15454	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	111733520	111733879	111733740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRAM2	52682	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	111981832	111982198	111982008	Y	NA	ATP5F1,WDR77	NA	NA	NA	NA	ATP5F1	7288	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	112050044	112050594	112050328	Y	C1orf183,C1orf183,CEPT1,DRAM2,RAP1A,C1orf162,ADORA3	RAP1A	NA	NA	NA	NA	RAP1A	32246	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	112163826	112164071	112163877	Y	C1orf183,C1orf183,C1orf162,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1A	80986	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	113072370	113072489	113072380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNT2B	65207	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	113369203	113369427	113369274	Y	SLC16A1,SLC16A1	RP3-522D1.1,RP11-426L16.8	RHOC,PPM1J,FAM19A3,LRIG2	IMR90	Hi-C	24141950	RP3-522D1.1	21223	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	115052481	115052766	115052572	Y	BCAS2,TRIM33	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	700	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	115445129	115445499	115445208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIKE1	123823	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	116520279	116520650	116520380	Y	ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,SLC22A15	SLC22A15	NA	NA	NA	NA	SLC22A15	3160	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	117347522	117347641	117347587	Y	CD2	NA	NA	NA	NA	NA	PTGFRN	103038	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	117421623	117422020	117421974	Y	TTF2	PTGFRN	PTGFRN,TTF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTGFRN	28659	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	117422443	117422644	117422485	Y	NA	PTGFRN	PTGFRN,TTF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTGFRN	28035	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	120180868	120181132	120181082	Y	NBPF7,ZNF697	GAPDHP33,ZNF697,PHGDH	NA	NA	NA	NA	ZNF697	7264	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	120275491	120275880	120275569	Y	ADAM30	NA	NA	NA	NA	NA	PHGDH	75070	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMBP1	225939	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr1	144533627	144534178	144533764	Y	PDE4DIP	RNU1-59P	PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNU1-59P	1589	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	144986415	144987071	144986860	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	87115	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	145023690	145024549	145024240	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	49637	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	145056399	145056625	145056543	Y	NA	PDE4DIP,SEC22B	NOTCH2NL,LOC728875,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDE4DIP	17561	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	145058996	145059322	145059204	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	PDE4DIP,SEC22B	NOTCH2NL,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDE4DIP	14864	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr1	145455122	145455741	145455465	Y	PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP	TXNIP,POLR3GL,LIX1L,RBM8A	NA	NA	NA	NA	POLR3GL	12647	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	146694437	146694614	146694526	Y	NA	CHD1L,FMO5	NA	NA	NA	NA	CHD1L	17677	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	146774989	146775112	146775013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMO5	62289	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	147012349	147012550	147012481	Y	NA	BCL9	ACP6	IMR90	Hi-C	24141950	BCL9	1167	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	4.32793047465834
chr1	147344950	147345054	147345002	Y	NA	NA	GJA5	IMR90	Hi-C	24141950	ACP6	204332	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr1	147825273	147825748	147825617	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	20387	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	148000699	148000802	148000795	Y	NA	RNVU1-13	NA	NA	NA	NA	RNVU1-13	8553	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	4.0733463290902
chr1	149215297	149215704	149215586	Y	NA	RNVU1-17,RNU1-92P	NA	NA	NA	NA	RNU1-92P	1997	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	149222771	149223127	149223106	Y	NA	RNVU1-17,RNU1-92P	NBPF10,SEC22B,NBPF15	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-92P	9471	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	149816287	149817606	149817166	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H4A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H4B	13108	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	150135231	150135764	150135536	Y	PRPF3,MCL1,PLEKHO1	NA	NA	NA	NA	NA	ANP32E	70740	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr1	150577042	150577503	150577391	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	22585	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	150585815	150586394	150586132	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,FAM63A,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	13694	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	150592182	150592667	150592572	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	7421	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	150600412	150600701	150600561	Y	CDC42SE1,BNIPL,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	324	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	150949569	150950014	150949933	Y	ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A	CERS2,ANXA9,FAM63A,PRUNE	NA	NA	NA	NA	ANXA9	2479	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	151168916	151169086	151168995	Y	NA	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	491	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	151172142	151172526	151172243	Y	FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	3717	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	151172620	151173197	151172669	Y	TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	4195	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	151284018	151284391	151284246	Y	FAM63A,CDC42SE1,TNFAIP8L2,ZNF687,RFX5,PI4KB,PI4KB	ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB,RP11-126K1.6,RFX5	NA	NA	NA	NA	PI4KB	13800	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	151579004	151579225	151579123	Y	NA	SNX27,RP11-404E16.1	RIIAD1,CELF3	IMR90	Hi-C	24141950	SNX27	3316	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	151580936	151581099	151580976	Y	NA	SNX27,RP11-404E16.1	RIIAD1,CELF3	IMR90	Hi-C	24141950	SNX27	1442	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	151696469	151696693	151696535	Y	NA	MRPL9	NA	NA	NA	NA	MRPL9	37347	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr1	151868154	151868386	151868273	Y	NA	THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	11898	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	151877533	151877895	151877666	Y	THEM4	THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	2389	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	151949461	151949565	151949513	Y	NA	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	15301	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	151960875	151961433	151961102	Y	S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	3433	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	152198460	152198859	152198660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLG-AS1	59859	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	153361312	153361704	153361428	Y	S100A9,S100A12,S100A7L2,S100A8	NA	NA	NA	NA	NA	S100A6	145016	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	153510895	153511054	153510975	Y	NA	S100A6,S100A4	NA	NA	NA	NA	S100A6	4175	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	153541018	153541368	153541269	Y	PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13	S100A6,S100A4,S100A16,S100A14	NA	NA	NA	NA	S100A4	20406	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	153549643	153549828	153549736	Y	PGLYRP3,S100A7L2	S100A6,S100A4,S100A16,S100A14,S100A1	S100A14,S100A13,S100A16,CHTOP,S100A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	S100A4	29031	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	153670755	153671012	153670885	Y	S100A9,S100A12	SNAPIN,ILF2,INTS3	NA	NA	NA	NA	INTS3	27531	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	153702935	153703414	153703046	Y	NA	INTS3,SLC27A3	NA	NA	NA	NA	INTS3	4392	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CREB3L4	1149	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	154405181	154405498	154405310	Y	CRTC2,UBAP2L,C1orf43,IL6R,ADAR,ADAR	IL6R	NA	NA	NA	NA	IL6R	29512	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	154760803	154761111	154760957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNN3	79645	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	154910155	154910399	154910216	Y	ADAR,PBXIP1,MTX1	PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1	NA	NA	NA	NA	PMVK	2688	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	154972628	154972915	154972668	Y	CLK2,DPM3,DPM3,PYGO2,FLAD1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,LENEP,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	212	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	154973036	154973200	154973120	Y	CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,LENEP,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	154973335	154973935	154973656	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,LENEP,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	208	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	154978035	154978657	154978307	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,LENEP,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	4908	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	154979104	154979305	154979208	Y	ADAR,ADAR,MTX1,PBXIP1,SHC1,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,LENEP,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	5977	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	155064132	155064186	155064153	Y	NA	ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3	NA	NA	NA	NA	EFNA3	29908	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	155064813	155064992	155064903	Y	NA	ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3	NA	NA	NA	NA	EFNA3	30589	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	TRIM46,KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr1	155703696	155704096	155703788	Y	NA	DAP3,YY1AP1	NA	NA	NA	NA	YY1AP1	46905	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	155830201	155830522	155830413	Y	ASH1L,MEX3A,ARHGEF2,ARHGEF2	GON4L,SYT11,RIT1	ARHGEF2,RXFP4,SNORA42,RIT1,KIAA0907	IMR90	Hi-C	24141950	SYT11	2901	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	155904830	155905033	155904931	Y	NA	RIT1,KIAA0907	NA	NA	NA	NA	KIAA0907	2639	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	156073854	156074351	156074085	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	RAB25,MEX3A,LMNA,SEMA4A	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	23490	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	156074715	156075305	156075042	Y	YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	RAB25,MEX3A,LMNA,SEMA4A	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	24351	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	156095033	156095181	156095051	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA	MEX3A,LMNA,SEMA4A	NA	NA	NA	NA	SEMA4A	19976	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	41117	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.05500974681765
chr1	156474686	156475018	156474923	Y	SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6066	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	156634807	156635020	156634939	Y	NES	BCAN,RP11-284F21.7,NES,CRABP2	NA	NA	NA	NA	RP11-284F21.7	5591	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr1	156677217	156677612	156677436	Y	NA	RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC	NA	NA	NA	NA	CRABP2	3609	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr1	156781780	156782101	156782026	Y	MEF2D,ETV3L,SH2D2A,SH2D2A,NTRK1	HDGF	NA	NA	NA	NA	HDGF	47063	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	157082632	157083078	157082974	Y	RRNAD1,ETV3,ETV3	ETV3	NA	NA	NA	NA	ETV3	23188	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	157244599	157245063	157244641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV3	138333	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	157989414	157989935	157989469	Y	KIRREL	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	28351	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	159054764	159054917	159054868	Y	MNDA,IFI16,AIM2	NA	CD1D,IFI16	IMR90	Hi-C	24141950	IFI16	87006	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	159158093	159158524	159158429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI16	190335	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	159880076	159880706	159880437	Y	FCRL6,DCAF8,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	CCDC19	12123	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	159910997	159911192	159911068	Y	CCDC19,ATP1A4	CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	17475	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	160056214	160056779	160056425	Y	C1orf204,PEA15,KCNJ10,KCNJ9,IGSF8,IGSF8,ATP1A2	IGSF8,ATP1A2	NA	NA	NA	NA	IGSF8	9954	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	160344568	160344717	160344643	Y	NA	NCSTN,COPA,NHLH1,VANGL2	NA	NA	NA	NA	NHLH1	9711	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	160345693	160345986	160345917	Y	NA	NCSTN,COPA,NHLH1,VANGL2	NA	NA	NA	NA	NHLH1	10836	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	160696081	160696317	160696161	Y	CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7	NA	NA	NA	NA	NA	ITLN2	226272	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	160989381	160990254	160990012	Y	NDUFS2,ADAMTS4,F11R	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	243	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	161170933	161171185	161171002	Y	ADAMTS4,NDUFS2	USP21,PPOX,B4GALT3,NDUFS2,ADAMTS4,APOA2,TOMM40L	NA	NA	NA	NA	ADAMTS4	4087	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	161348767	161349231	161349047	Y	NDUFS2	C1orf192	NA	NA	NA	NA	C1orf192	13103	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	C1orf192	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf192	24002	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	C1orf192	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf192	33409	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	161582212	161582506	161582417	Y	HSPA6,FCGR3A	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA6	90176	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	162659800	162660152	162659976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDR2	60637	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	162666168	162666338	162666209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDR2	67005	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	164174347	164174632	164174490	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB3P6	149372	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	164389251	164389388	164389267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB3P6	65247	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	165205285	165205518	165205385	Y	RXRG	NA	NA	NA	NA	NA	RXRG	206915	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	165797615	165798367	165798308	Y	UCK2	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	2623	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	167035961	167036358	167035977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEL	79615	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	168149052	168149361	168149233	Y	NA	GPR161,TIPRL,RPL34P1,SFT2D2	NA	NA	NA	NA	TIPRL	2881	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	168337258	168337475	168337348	Y	NA	NA	LOC100505918,MIR557	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	88980	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	168368318	168368620	168368438	Y	TBX19	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	120040	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	168479815	168480142	168480087	Y	NA	NA	C1orf114,BLZF1	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	231537	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	168531443	168531650	168531547	Y	NA	NA	LOC100505918,NME7	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	283165	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	171404934	171405057	171404984	Y	FMO4,PRRC2C	PRRC2C	PRRC2C	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2C	47594	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	172327558	172328156	172327708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	83074	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	172369341	172369683	172369640	Y	NA	PIGC	NA	NA	NA	NA	PIGC	41547	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	172468818	172469289	172468991	Y	NA	NA	DNM3,DARS2,CENPL,C1orf9,C1orf105,FASLG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIGC	57588	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	172507125	172507604	172507262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	95895	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	173447359	173447668	173447399	Y	PRDX6	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	2954	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	173958715	173958784	173958750	Y	NA	RC3H1,RP11-160H22.3	NA	NA	NA	NA	RC3H1	30651	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	174220636	174220943	174220783	Y	RABGAP1L	NA	NA	NA	NA	NA	RABGAP1L	94088	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	174974831	174975127	174974979	Y	NA	CACYBP,MRPS14	NA	NA	NA	NA	CACYBP	8531	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	175290630	175291019	175291015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0040	130495	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	175891419	175891824	175891531	Y	NA	RP11-318C24.1	RFWD2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-318C24.1	2308	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.54584145568138
chr1	175902819	175902853	175902836	Y	NA	RP11-318C24.1	NA	NA	NA	NA	RP11-318C24.1	13708	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	176599377	176599591	176599401	Y	PAPPA2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-195C7.1	424593	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	176750451	176750537	176750521	Y	PAPPA2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-195C7.1	575667	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	178231351	178231525	178231428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	170487	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	178305054	178305336	178305195	Y	RASAL2	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf220	204551	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	178379281	178379736	178379396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf220	130151	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	178995927	178996290	178996175	Y	AXDND1,RALGPS2,TOR3A	FAM20B	NA	NA	NA	NA	FAM20B	2988	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	179098871	179099008	179098957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	50359	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	179144823	179145001	179144950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	96311	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	179595551	179595594	179595573	Y	NA	TDRD5	NA	NA	NA	NA	TDRD5	36803	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	180249791	180250006	180249913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSOX1	127822	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	180371123	180371295	180371283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD6	98794	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	181074349	181074924	181074645	Y	XPR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	18711	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	181104265	181104352	181104277	Y	NA	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48627	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	181104473	181105818	181105427	Y	STX6,MR1,IER5	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48835	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	182113385	182113953	182113561	Y	RNASEL,GLUL,GLUL	NA	GLUL	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GLUL	245388	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	182162175	182162397	182162293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLUL	196944	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	182274457	182274562	182274517	Y	NA	NA	GLUL	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GLUL	84779	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	182643740	182644063	182644020	Y	RGS16	NA	NA	NA	NA	NA	RGS16	72197	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	182854499	182854851	182854644	Y	NA	DHX9	NA	NA	NA	NA	DHX9	47995	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	183133608	183133779	183133664	Y	LAMC2	LAMC2	NA	NA	NA	NA	LAMC2	19594	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	184357629	184357933	184357738	Y	EDEM3	C1orf21	NA	NA	NA	NA	C1orf21	3437	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	184421485	184421696	184421591	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf21	67293	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	184794829	184794875	184794854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	72782	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	184810330	184810429	184810414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	88283	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	184836042	184836526	184836376	Y	EDEM3,TRMT1L,TRMT1L,SWT1,SWT1,IVNS1ABP,FAM129A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM129A	105156	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	184885517	184885894	184885706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM129A	55788	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	185109809	185110137	185110116	Y	IVNS1ABP	TRMT1L,SWT1	NA	NA	NA	NA	TRMT1L	14067	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	185264835	185265233	185265202	Y	NA	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	19228	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	185811948	185812170	185812059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	527487	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	186590040	186590634	186590330	Y	PTGS2,PLA2G4A,C1orf27	NA	PLA2G4A	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf27	247150	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	187181531	187181740	187181636	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf27	838641	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	187677375	187677585	187677480	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf27	1334485	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	192446152	192446393	192446247	Y	RGS2,RGS1	NA	UCHL5,RGS1,RGS13,RGS2,TROVE2,GLRX2	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4426	236920	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	192953303	192953614	192953465	Y	RGS2,CDC73,TROVE2,TROVE2	NA	NA	NA	NA	NA	TROVE2	72938	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	198127475	198127965	198127580	Y	NA	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	3382	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	198128112	198128944	198128293	Y	PTPRC,DENND1B	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	4019	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	198591244	198591462	198591360	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	467151	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	200050544	200050911	200050727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF281	326273	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	200783735	200784105	200783920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf106	74071	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	200990087	200990628	200990489	Y	NA	KIF21B,RP11-168O16.1	NA	NA	NA	NA	KIF21B	200	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	201139670	201140154	201139905	Y	NA	TMEM9	KIF21B,IGFN1,LAD1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM9	968	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	201619383	201619798	201619705	Y	SHISA4,GPR37L1,NAV1	NA	NA	NA	NA	NA	CSRP1	142799	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	201864045	201864232	201864194	Y	NA	SHISA4	NA	NA	NA	NA	SHISA4	8237	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	201987611	201988279	201987793	Y	ELF3,LGR6	RNPEP,ELF3	NA	NA	NA	NA	ELF3	12538	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	202055098	202055409	202055277	Y	ELF3,GPR37L1	GPR37L1	ELF3,IPO9,RNPEP,ARL8A,GPR37L1,TIMM17A,LGR6,NAV1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GPR37L1	34577	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr1	202056138	202056515	202056288	Y	NA	GPR37L1	ELF3,IPO9,RNPEP,ARL8A,GPR37L1,TIMM17A,LGR6,NAV1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GPR37L1	33471	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	202075010	202075191	202075097	Y	PPP1R12B,ELF3,LGR6	GPR37L1,ARL8A	RNPEP,LGR6,NAV1,ELF3,ARL8A,GPR37L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPR37L1	14795	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	202161674	202161898	202161786	Y	NA	ARL8A,LGR6	NA	NA	NA	NA	LGR6	645	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	202765097	202765528	202765162	Y	NA	RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6	NA	NA	NA	NA	KDM5B	11070	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	202872285	202872308	202872297	Y	NA	RP11-480I12.5,RABIF,HNRNPA1P59,KLHL12	RABIF	MCF7	ChIA-PET	22265404	HNRNPA1P59	6632	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	203101073	203101246	203101163	Y	NA	ADORA1	NA	NA	NA	NA	ADORA1	43291	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	PRELP	NA	NA	NA	NA	PRELP	39026	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	203491011	203491485	203491466	Y	PPFIA4,SNRPE	PRELP	NA	NA	NA	NA	PRELP	48055	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	203524939	203525564	203525325	Y	NA	NA	ATP2B4,PRELP,LAX1,ZC3H11A,OPTC,FMOD	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B4	68125	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	203599092	203599518	203599142	Y	BTG2,LAX1	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	5403	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	203624863	203625211	203625050	Y	BTG2	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	31174	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	204043987	204044379	204044133	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	3744	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	204049581	204049822	204049645	Y	LAX1,PIK3C2B,SOX13	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	9338	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr1	204053773	204053963	204053834	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	13530	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	204058173	204058362	204058281	Y	SOX13	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	17930	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	204684045	204684323	204684297	Y	NA	NA	NFASC,LRRN2	IMR90	Hi-C	24141950	NFASC	111456	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	204800476	204800571	204800524	Y	PLEKHA6,PIK3C2B,LRRN2,TMCC2,NFASC,CNTN2,NFASC	NFASC	NA	NA	NA	NA	NFASC	4697	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	205090261	205090406	205090392	Y	NA	RBBP5	CNTN2	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP5	1118	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	205262860	205263030	205262955	Y	CNTN2,CDK18	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	25853	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	205263599	205264019	205263855	Y	NA	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	24864	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	205270500	205270865	205270692	Y	NA	NUAK2,SNRPGP10	NA	NA	NA	NA	NUAK2	18018	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	205283024	205283394	205283339	Y	RBBP5,NUAK2	NUAK2,SNRPGP10,KLHDC8A	NA	NA	NA	NA	NUAK2	5489	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	205420910	205421289	205421224	Y	NA	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	1793	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	205466653	205467067	205466868	Y	TMEM81	LEMD1,CDK18	TMCC2,CDK18,KLHDC8A,LOC284576,LOC284578,MFSD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDK18	4656	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	206752030	206752370	206752201	Y	RASSF5,MAPKAPK2,RASSF5	EIF2D	NA	NA	NA	NA	EIF2D	31534	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	206897147	206897463	206897235	Y	RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	40858	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	208357514	208358085	208357775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	57580	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	209601291	209601611	209601405	Y	NA	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	1126	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr1	210425971	210426288	210426079	Y	NA	SERTAD4	NA	NA	NA	NA	SERTAD4	21827	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	211662962	211663302	211663132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC30A1	86782	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	211988342	211989080	211989063	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	13034	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	212102475	212102639	212102508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	100361	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	212113260	212113497	212113379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTS7	93387	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	212182782	212182853	212182818	Y	NA	INTS7,DTL,RPL21P28	NA	NA	NA	NA	INTS7	24031	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	212513330	212513719	212513465	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206	RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	RP11-384C4.3	32470	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	212576325	212576581	212576449	Y	ATF3,ATF3,ATF3	TMEM206,NENF	NA	NA	NA	NA	TMEM206	9662	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	212671541	212672116	212671670	Y	NA	NA	ATF3,NSL1,TATDN3,BATF3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATF3	64560	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.30959389238579
chr1	212923712	212923837	212923822	Y	NA	NSL1,TATDN3	NA	NA	NA	NA	NSL1	39287	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	212926000	212926318	212926233	Y	NA	NSL1,TATDN3	NA	NA	NA	NA	NSL1	36806	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	212993371	212993544	212993485	Y	NA	NSL1,TATDN3,FLVCR1	NA	NA	NA	NA	TATDN3	30201	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	213088828	213089171	213088880	Y	VASH2,FLVCR1	VASH2	NA	NA	NA	NA	VASH2	32691	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	213090277	213090696	213090331	Y	VASH2,FLVCR1	VASH2	NA	NA	NA	NA	VASH2	31166	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr1	213160414	213160619	213160568	Y	VASH2	VASH2,ANGEL2	NA	NA	NA	NA	ANGEL2	26549	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	214162828	214163073	214162948	Y	PROX1	PROX1	NA	NA	NA	NA	PROX1	8304	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	214612784	214613126	214613017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	110666	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	218633382	218633612	218633512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRP15	176753	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	218647012	218647232	218647162	Y	NA	NA	TGFB2,LOC728463,RRP15	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RRP15	190383	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	220359525	220359939	220359742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	64973	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	220510650	220511010	220510830	Y	NA	NA	MARK1	IMR90	Hi-C	24141950	RAB3GAP2	66854	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	220512278	220512401	220512362	Y	NA	NA	MARK1	IMR90	Hi-C	24141950	RAB3GAP2	68482	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	220868801	220868862	220868831	Y	C1orf115,MOSC2,MOSC1	C1orf115	NA	NA	NA	NA	C1orf115	7614	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	221536365	221536752	221536519	Y	HLX	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP10	376766	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	222000173	222000483	222000346	Y	DUSP10,DUSP10	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	86655	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	222135050	222135329	222135215	Y	DUSP10	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	221532	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	222144602	222144957	222144787	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	231084	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	222273748	222273768	222273757	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	360230	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	222638782	222639204	222638963	Y	NA	NA	DUSP10,MIA3,AIDA,BROX	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-378J18.3	121963	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	223204032	223204174	223204104	Y	NA	NA	FAM177B	IMR90	Hi-C	24141950	DISP1	217626	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	223914239	223914747	223914523	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	26944	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	224025511	224025803	224025713	Y	NA	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	5871	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	20.6213157910191
chr1	224246484	224246581	224246513	Y	NA	NA	NVL	IMR90	Hi-C	24141950	FBXO28	53208	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	224528791	224528972	224528907	Y	NA	NVL,CNIH4	FBXO28,DEGS1,NVL,CNIH4,WDR26	IMR90	Hi-C	24141950	NVL	12702	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr1	224545542	224546006	224545661	Y	FBXO28,CNIH4	NVL,CNIH4	NA	NA	NA	NA	CNIH4	2990	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr1	224914627	224914789	224914675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAH14	167175	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	226014145	226014403	226014226	Y	EPHX1,EPHX1	EPHX1	NA	NA	NA	NA	EPHX1	18351	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	226263544	226263865	226263697	Y	C1orf55	H3F3A	NA	NA	NA	NA	H3F3A	15992	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	226297611	226298113	226297674	Y	NA	NA	ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	H3F3A	50059	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	226361229	226361382	226361305	Y	NA	ACBD3,MIXL1	NA	NA	NA	NA	ACBD3	11049	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	226435130	226435332	226435236	Y	PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A	MIXL1	NA	NA	NA	NA	MIXL1	25811	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	226592689	226592838	226592760	Y	PSEN2,PARP1	PARP1,RP11-118H4.1	NA	NA	NA	NA	PARP1	942	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	226866232	226866788	226866582	Y	ITPKB	ITPKB-IT1	NA	NA	NA	NA	ITPKB-IT1	5464	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	226890865	226891416	226891300	Y	ITPKB	ITPKB-IT1,ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB-IT1	30097	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	227730002	227730151	227730029	Y	NA	ZNF678	WNT9A,ZNF678	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF678	19093	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	227976197	227976490	227976208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD4	55085	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr1	227982614	227983033	227982728	Y	CDC42BPA,ZNF678,WNT9A,C1orf35	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD4	61502	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr1	228074836	228075224	228075030	Y	NA	NA	PRSS38	IMR90	Hi-C	24141950	WNT9A	58375	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr1	228079986	228080118	228080041	Y	ZNF678,WNT9A	NA	PRSS38	IMR90	Hi-C	24141950	WNT9A	53481	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	228098321	228098415	228098368	Y	NA	WNT9A	NA	NA	NA	NA	WNT9A	35184	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	228273480	228273740	228273633	Y	ARF1,ARF1	ARF1,C1orf35,MRPL55	NA	NA	NA	NA	ARF1	5119	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	228633222	228633907	228633608	Y	TRIM11,TRIM17,HIST3H2A	TRIM11,RP11-245P10.4,HIST3H2A,HIST3H2BB,HIST3H2BA,RNF187	NA	NA	NA	NA	HIST3H2A	9653	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	228651177	228651630	228651444	Y	HIST3H2A,HIST3H2BB	HIST3H2A,HIST3H2BB,HIST3H2BA,RNF187	RNF187	IMR90	Hi-C	24141950	HIST3H2BA	850	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	228678228	228678435	228678266	Y	NA	HIST3H2A,HIST3H2BB,HIST3H2BA,RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	5466	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr1	228782602	228782886	228782775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	85938	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84925	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	228917012	228917506	228917078	Y	RHOU	RHOU	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RHOU	48188	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	229296726	229296995	229296861	Y	RHOU	NA	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1065P14.2	68074	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	229307664	229307899	229307845	Y	NA	NA	RHOU	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1065P14.2	79012	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	229366402	229366798	229366551	Y	C1orf96	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	37977	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	229388898	229389111	229388968	Y	URB2,TAF5L,NUP133,RAB4A,C1orf96	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,NUP133,ABCB10	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	15664	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr1	229473732	229474385	229474330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB4A	68910	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	229546455	229546768	229546488	Y	NA	ACTA1	NA	NA	NA	NA	ACTA1	21077	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	229547907	229548085	229548007	Y	NA	ACTA1	NA	NA	NA	NA	ACTA1	19760	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	230561990	230562633	230562303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG2	213602	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr1	231862401	231862670	231862553	Y	TSNAX	NA	NA	NA	NA	NA	DISC1	101840	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	232362022	232362384	232362201	Y	NA	NA	SIPA1L2,TSNAX-DISC1	IMR90	Hi-C	24141950	DISC1	601461	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	232428903	232429197	232429192	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,SIPA1L2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	536736	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	232735038	232735290	232735230	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	230643	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	17.5663060442015
chr1	233241853	233241955	233241904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTPCR	157502	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	233409089	233409391	233409240	Y	NA	RPS7P3,PCNXL2	NA	NA	NA	NA	RPS7P3	13802	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	234250535	234250574	234250556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35F3	211856	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	234548581	234548830	234548706	Y	NA	RP5-827C21.4	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.4	41242	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	234659231	234659760	234659519	Y	IRF2BP2	TARBP1	NA	NA	NA	NA	TARBP1	46382	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	234767593	234767925	234767750	Y	TARBP1	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	24322	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	234812067	234812214	234812141	Y	NA	NA	LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2BP2	68796	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	234862200	234862535	234862470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	118929	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	235805098	235806119	235805875	Y	LYST,RBM34,ARID4B,ARID4B	GNG4	NA	NA	NA	NA	GNG4	5935	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr1	236022682	236022818	236022763	Y	GPR137B,LYST	NA	NA	NA	NA	NA	NID1	203644	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	236147814	236148198	236148007	Y	GPR137B	NA	NA	NA	NA	NA	NID1	78264	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	236431064	236431243	236431072	Y	LGALS8,ERO1LB	ERO1LB	NA	NA	NA	NA	ERO1LB	12076	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	236866415	236866949	236866639	Y	NA	ACTN2	NA	NA	NA	NA	ACTN2	18661	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	239524689	239525075	239524869	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMN2	650573	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	239877993	239878320	239878052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMN2	297328	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	240308546	240308862	240308776	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22593	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	241469731	241469956	241469941	Y	RGS7	RGS7	NA	NA	NA	NA	RGS7	48574	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	241771916	241772216	241772151	Y	KMO	CHML	NA	NA	NA	NA	CHML	25016	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	243476313	243476499	243476468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	58993	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	244486299	244486688	244486462	Y	AKT3,AKT3,ADSS	NA	SDCCAG8,ADSS	IMR90	Hi-C	24141950	ADSS	126748	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	244512430	244512879	244512496	Y	ADSS	NA	C1orf100,ADSS,AKT3	IMR90	Hi-C	24141950	ADSS	100557	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	244894306	244894456	244894354	Y	C1orf100,C1orf101	NA	PPPDE1,C1orf101	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPU-AS1	122343	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	244898732	244899130	244898941	Y	ADSS,PPPDE1	NA	PPPDE1,C1orf101,EFCAB2	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPU-AS1	117669	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	245544255	245544624	245544440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26B	227968	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	246061196	246061440	246061372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	607174	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr1	246086594	246086610	246086602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	582004	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	246323685	246324051	246324002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	344563	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	246469940	246470214	246470139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	198400	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	246588477	246588670	246588563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	79944	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	246958730	246958915	246958757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCCPDH	73381	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	247206107	247206337	247206222	Y	NA	ZNF695,ZNF670	NA	NA	NA	NA	ZNF670	33776	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr1	247297966	247298129	247298007	Y	NA	ZNF669	NA	NA	NA	NA	ZNF669	32292	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr1	247315116	247315371	247315289	Y	OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669	ZNF669,MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	47991	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr1	247537279	247537425	247537333	Y	NA	ZNF496	AHCTF1,ZNF496	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF496	44131	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	3088088	3088382	3088199	Y	NA	PFKP	PFKP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFKP	18143	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr10	3890952	3891240	3891130	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	65479	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	6183553	6183785	6183703	Y	NA	PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	1096	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	6245814	6246792	6246043	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	60933	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr10	6540771	6540974	6540943	Y	RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3,PRKCQ	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCQ	79289	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	6764164	6764384	6764289	Y	NA	NA	LOC100507127,SFMBT2	IMR90	Hi-C	24141950	PRKCQ	143901	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	7449887	7450154	7450051	Y	TAF3,SFMBT2,SFMBT2	SFMBT2	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	1296	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	7583205	7583490	7583242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	131755	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	7583796	7584039	7583868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	132346	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	8662161	8662543	8662250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	568594	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	12976673	12977075	12976876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPTN	162374	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	13391797	13392252	13392084	Y	SEPHS1	PHYH,SEPHS1	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	3500	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr10	13800483	13800712	13800626	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	173556	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	15165954	15166084	15166019	Y	NA	ACBD7,RPP38,NMT2	NA	NA	NA	NA	RPP38	28775	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	15278281	15278573	15278465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMT2	69589	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	20841595	20841995	20841796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	619121	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	21436057	21436346	21436225	Y	C10orf113,NEBL	NEBL	NA	NA	NA	NA	NEBL	24770	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	21581688	21582509	21582285	Y	NA	NA	C10orf114,C10orf140,MLLT10,PIP4K2A	IMR90	Hi-C	24141950	NEBL	120572	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.54584145568138
chr10	21798958	21799135	21799012	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	21959	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	21816029	21816444	21816223	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	4650	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr10	22039558	22039808	22039651	Y	MLLT10,MLLT10	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	180264	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	8.40127680374854
chr10	22932994	22933290	22933224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	68194	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	25240272	25240935	25240716	Y	ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1	PRTFDC1	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	739	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	26191189	26191209	26191199	Y	NA	MYO3A	NA	NA	NA	NA	MYO3A	29987	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	28432154	28432413	28432284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARMC4	146177	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	28657201	28657375	28657297	Y	WAC	MPP7	MKX,ARMC4,MPP7	IMR90	Hi-C	24141950	MPP7	35786	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	29761620	29761743	29761682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	65289	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	29887787	29888175	29887987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	135535	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	29944854	29945090	29945003	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	78620	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	29948331	29948643	29948337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	75067	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	30720407	30720642	30720475	Y	MAP3K8	MAP3K8	NA	NA	NA	NA	MAP3K8	224	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	30859701	30859874	30859760	Y	MAP3K8,ZNF438,ZNF438	NA	LOC729668	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K8	138835	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	31892273	31892723	31892643	Y	NA	NA	ZEB1	IMR90	Hi-C	24141950	ZEB1-AS1	284897	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr10	31986692	31987073	31986913	Y	NA	NA	ARHGAP12,ZEB1,ZNF438	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP12	228669	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	32047879	32048374	32048138	Y	ZEB1	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	167368	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	32215994	32216410	32215998	Y	NA	ARHGAP12	NA	NA	NA	NA	ARHGAP12	252	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	32218329	32218518	32218508	Y	NA	ARHGAP12	NA	NA	NA	NA	ARHGAP12	2587	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	32316515	32316560	32316538	Y	NA	KIF5B	NA	NA	NA	NA	KIF5B	26799	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	32579146	32579267	32579207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPC1	86459	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	32611846	32612286	32612204	Y	EPC1	NA	NA	NA	NA	NA	EPC1	53440	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	32668626	32668988	32668673	Y	EPC1,C10orf68	EPC1	EPC1	IMR90	Hi-C	24141950	EPC1	2900	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	33269452	33269916	33269602	Y	C10orf68	ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	22804	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	35080769	35081009	35080876	Y	NA	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	21244	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr10	35098240	35098611	35098558	Y	NA	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	3642	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	35258130	35258295	35258186	Y	CREM,CREM	NA	PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	SS18L2P1	95992	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	35438214	35438795	35438573	Y	CREM,CREM	NA	NA	NA	NA	NA	CUL2	60644	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	42798094	42798242	42798168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF37BP	248028	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	42817169	42817557	42817529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF37BP	228713	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	43422233	43422523	43422379	Y	NA	NA	RET	IMR90	Hi-C	24141950	BMS1	145984	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	43600895	43601120	43601049	Y	RASGEF1A	RET,CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	RET	30420	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr10	43905259	43905708	43905446	Y	HNRNPF,HNRNPF,HNRNPF	FXYD4,HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	HNRNPF	2645	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	43913618	43913796	43913710	Y	CSGALNACT2,HNRNPF	FXYD4,HNRNPF,RP11-517P14.2	ZNF487P	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-517P14.2	390	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	45470476	45470795	45470517	Y	NA	RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	C10orf10	1463	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr10	47008240	47008359	47008300	Y	GPRIN2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM21C	787592	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	49542005	49542407	49542075	Y	NA	MAPK8	ARHGAP22,MAPK8	IMR90	Hi-C	24141950	MAPK8	29307	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	49745028	49745223	49745126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPK8	232330	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	50138824	50138968	50138896	Y	WDFY4	NA	NA	NA	NA	NA	PGBD3	606118	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	52167205	52167434	52167402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	215489	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	52329586	52329716	52329651	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	53207	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	52385542	52385659	52385602	Y	NA	SGMS1	NA	NA	NA	NA	SGMS1	2619	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	65016713	65017097	65017085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRBF2	125663	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	65128612	65128923	65128710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD1C	94799	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	65930110	65930546	65930307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	650987	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	69523317	69523417	69523404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	72507	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC12	13236	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr10	69621525	69621936	69621738	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1,MYPN,HERC4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIRT1	20491	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr10	70833673	70834029	70833881	Y	SRGN	VPS26A	SRGN	K562	ChIA-PET	22265404	VPS26A	47239	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	71077076	71077284	71077148	Y	DDX21,HK1	HK1	NA	NA	NA	NA	HK1	49336	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	71172232	71172485	71172352	Y	SRGN,VPS26A	TACR2,TSPAN15	NA	NA	NA	NA	TACR2	2138	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	71928097	71928630	71928606	Y	NA	AIFM2,TYSND1	TYSND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAR1A	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	72202124	72202468	72202392	Y	EIF4EBP2,NODAL	EIF4EBP2,NODAL	NA	NA	NA	NA	NODAL	3239	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr10	72253805	72253950	72253868	Y	NA	NODAL	NA	NA	NA	NA	NODAL	48098	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	73026177	73026397	73026262	Y	UNC5B	NA	NA	NA	NA	NA	UNC5B-AS1	50192	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	73620184	73620641	73620392	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PSAP	11058	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	74032298	74032943	74032475	Y	NA	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	620	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr10	74079380	74080359	74079580	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	32629	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr10	74080430	74080993	74080646	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	31995	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr10	74082335	74082540	74082412	Y	DDIT4	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	30448	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	74925047	74925060	74925055	Y	ANXA7,ECD	FAM149B1,ECD	NA	NA	NA	NA	FAM149B1	864	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	74990824	74990933	74990931	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	DNAJC9	15687	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	75221740	75221926	75221833	Y	NA	ANXA7,RP11-345K20.2,RP11-137L10.6,PPP3CB	NA	NA	NA	NA	RP11-137L10.6	31357	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	75361338	75361489	75361457	Y	NA	USP54	USP54,PPP3CB,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L,MYOZ1,CHCHD1,TTC18,C10orf103	IMR90	Hi-C	24141950	USP54	22222	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr10	75725888	75726135	75726026	Y	NA	VCL	CAMK2G,AP3M1,VCL,NDST2,C10orf55,PLAU,ADK	IMR90	Hi-C	24141950	VCL	29737	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr10	76053029	76053199	76053114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADK	144069	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	76916394	76916800	76916595	Y	MYST4,SAMD8	DUSP13	NA	NA	NA	NA	DUSP13	49415	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	77164585	77164731	77164659	Y	ZNF503	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	4921	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	79123955	79124246	79124101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	272107	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	79265772	79266169	79265902	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	130184	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	79268227	79268357	79268284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	127996	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	79311987	79312330	79312106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	84023	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	79465060	79465341	79465251	Y	NA	NA	KCNMA1	IMR90	Hi-C	24141950	KCNMA1	68707	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	80650238	80650564	80650401	Y	NA	NA	ZMIZ1,RPS24,LOC283050	IMR90	Hi-C	24141950	ZMIZ1	176228	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	92669	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	80998898	81000011	80999247	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	105214	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	81001444	81002226	81001825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	102999	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	81045880	81046806	81046457	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	58419	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	84649662	84649982	84649782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHITM	1247214	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	85938991	85939155	85939061	Y	FAM190B	GHITM,CDHR1	NA	NA	NA	NA	CDHR1	13255	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	87592728	87593050	87592889	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRID1	531200	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	87752944	87753321	87753210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRID1	370929	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr10	88517208	88517667	88517486	Y	GLUD1,BMPR1A	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	2801	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr10	88713984	88714363	88714198	Y	SNCG	SNCG,MMRN2,AGAP11	NA	NA	NA	NA	SNCG	2012	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	89602886	89603081	89603056	Y	NA	CFL1P1,ATAD1,PTEN	NA	NA	NA	NA	ATAD1	3786	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	90488275	90488596	90488466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNLS	145988	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	90527399	90527667	90527447	Y	ANKRD22,LIPN	NA	NA	NA	NA	NA	STAMBPL1	109824	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	90862586	90862629	90862625	Y	NA	NA	CH25H,LIPA,FAS	IMR90	Hi-C	24141950	FAS	114172	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	90923331	90923726	90923650	Y	ANKRD22,FAS,IFIT5,IFIT3,IFIT3,IFIT2,IFIT1	NA	CH25H	IMR90	Hi-C	24141950	FAS	174917	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	92731604	92731862	92731771	Y	NA	NA	ANKRD1,PCGF5	IMR90	Hi-C	24141950	RPP30	102131	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	93643606	93643969	93643849	Y	NA	BTAF1	NA	NA	NA	NA	BTAF1	37557	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr10	94459466	94459797	94459609	Y	HHEX	HHEX	NA	NA	NA	NA	HHEX	13521	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	97024100	97024800	97024493	Y	NA	RP11-310E22.4,PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	23981	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	97054774	97055369	97055126	Y	ENTPD1,PDLIM1	PDLIM1	PDLIM1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PDLIM1	5993	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	98468328	98468564	98468493	Y	LCOR,C10orf12,TM9SF3,PIK3AP1	PIK3AP1,RPL13AP5	NA	NA	NA	NA	PIK3AP1	9707	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	99096745	99096901	99096835	Y	NA	ARHGAP19,FRAT1,RP11-452K12.4,FRAT2	NA	NA	NA	NA	FRAT2	4287	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr10	99302007	99302242	99302124	Y	RRP12,PI4K2A	MMS19,UBTD1,PI4K2A	HOGA1,ANKRD2	IMR90	Hi-C	24141950	PI4K2A	39889	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	99401742	99402052	99401841	Y	C10orf28,RRP12,ZFYVE27,PI4K2A	MORN4,AVPI1	NA	NA	NA	NA	MORN4	10398	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	100994096	100994429	100994263	Y	NA	HPSE2	NA	NA	NA	NA	HPSE2	477	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	101677861	101678026	101677917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNMBP	89650	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	101873975	101874319	101874110	Y	NA	NA	CPN1,ERLIN1,CHUK	IMR90	Hi-C	24141950	ERLIN1	71772	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	102284617	102284981	102284927	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	1848	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr10	102949466	102949800	102949508	Y	NA	NA	BTRC,C10orf76,TLX1NB,FBXW4,POLL,DPCD	IMR90	Hi-C	24141950	PDZD7	160576	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr10	103051353	103051800	103051498	Y	NA	NA	BTRC,FLJ41350,FBXW4,LBX1,POLL,DPCD,MIR3158-2,MGEA5,NPM3,FGF8,LOC100289509	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	60020	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	103124787	103125187	103124970	Y	NA	BTRC	DPCD,POLL	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	12967	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	103538980	103539052	103538998	Y	NA	NPM3,MGEA5	NA	NA	NA	NA	NPM3	2118	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	103877464	103877788	103877718	Y	MGEA5,TMEM180,SUFU,PSD,FBXL15,C10orf76,LDB1	LDB1,PPRC1,NOLC1	NA	NA	NA	NA	LDB1	422	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.29125731011324
chr10	104406463	104406725	104406695	Y	NFKB2,NFKB2,TRIM8	TRIM8	NA	NA	NA	NA	TRIM8	4210	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr10	104964563	104964973	104964825	Y	NA	NT5C2	NA	NA	NA	NA	NT5C2	13507	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	105000216	105000261	105000251	Y	NA	NT5C2,INA	INA,PCGF6,NT5C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INA	34659	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	105001544	105001968	105001663	Y	C10orf32,NT5C2	INA	INA,PCGF6,NT5C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INA	32952	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr10	105255021	105255220	105255121	Y	NA	CALHM2	NA	NA	NA	NA	CALHM2	44361	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	105302775	105302952	105302862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALHM2	92115	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr10	105532054	105532211	105532109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	81090	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr10	106020526	106021193	106020581	Y	SLK,MEIR5,MEIR5,ITPRIP,CCDC147,GSTO1,GSTO1	WDR96,GSTO1,MIR4482-1,GSTO2	NA	NA	NA	NA	MIR4482-1	4984	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	106065731	106065880	106065781	Y	NA	MIR4482-1,GSTO2,ITPRIP	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	30282	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	112158460	112158738	112158533	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	95751	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	112259301	112259712	112259445	Y	MXI1,PDCD4,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	3705	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	112290201	112290297	112290249	Y	NA	DUSP5,SMC3	NA	NA	NA	NA	DUSP5	34605	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr10	112401121	112401469	112401220	Y	SMC3,RBM20	RBM20	NA	NA	NA	NA	RBM20	686	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	112402938	112403137	112402952	Y	NA	RBM20	NA	NA	NA	NA	RBM20	783	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr10	112582466	112582715	112582708	Y	SMC3,ADRA2A	PDCD4	NA	NA	NA	NA	PDCD4	46850	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	114859283	114859636	114859547	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	151274	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr10	115027855	115028243	115028038	Y	TCF7L2	NA	VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	TCF7L2	319846	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	116255200	116255589	116255576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	92685	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	116275227	116275586	116275389	Y	ABLIM1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	112712	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	118656077	118656284	118656258	Y	NA	ENO4,RP11-539I5.1	NA	NA	NA	NA	RP11-539I5.1	48361	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	118714609	118714623	118714617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-539I5.1	106893	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr10	118755256	118755410	118755333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1598	128687	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	119028396	119028853	119028412	Y	SLC18A2	SLC18A2	NA	NA	NA	NA	SLC18A2	29792	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	119107774	119108099	119107936	Y	NA	PDZD8	NA	NA	NA	NA	PDZD8	24879	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	121075171	121075335	121075278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX3	138826	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr10	121446860	121447228	121446967	Y	NA	BAG3,INPP5F	NA	NA	NA	NA	INPP5F	36381	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr10	123268724	123269025	123268893	Y	FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2	NA	NA	NA	NA	NA	FGFR2	86947	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr10	123822805	123823045	123822957	Y	ATE1,DMBT1	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	76116	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr10	123923874	123924133	123924069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	177185	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	125730230	125730378	125730329	Y	NA	CPXM2	NA	NA	NA	NA	CPXM2	32447	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	126139767	126140160	126139923	Y	NKX1-2	OAT,NKX1-2,LHPP,RPS10P18	NA	NA	NA	NA	NKX1-2	3014	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	126213697	126214091	126213879	Y	NA	RPS10P18	NA	NA	NA	NA	RPS10P18	36550	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	126413244	126413567	126413371	Y	FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	METTL10	64872	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	127432481	127432807	127432790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UROS	77010	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	130440713	130441095	130440908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	518064	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	133794080	133794414	133794353	Y	NA	BNIP3	PPP2R2D	IMR90	Hi-C	24141950	BNIP3	645	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	134234707	134235257	134234764	Y	STK32C,PWWP2B	PWWP2B,C10orf91	C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	C10orf91	20574	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	134385594	134385710	134385631	Y	PWWP2B,INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	36270	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr10	135342737	135342867	135342819	Y	KNDC1,PRAP1,C10orf125,ECHS1,CYP2E1	NA	NA	NA	NA	NA	MTG1	137139	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	334344	334553	334421	Y	NA	ATHL1,IFITM2,IFITM1,IFITM3,B4GALNT4	NA	NA	NA	NA	IFITM3	8807	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr11	350841	351091	350968	Y	NA	IFITM2,IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3	SIRT3,RIC8A,SCGB1C1,ODF3,BET1L,PSMD13,NLRP6,ATHL1,IFITM1,SIGIRR,ANO9,PKP3,IFITM2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	B4GALNT4	16705	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	11072	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	364521	364678	364634	Y	NA	IFITM3,B4GALNT4,PKP3	ANO9,SIGIRR,B4GALNT4	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	3118	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	1357863	1358286	1357997	Y	TOLLIP,BRSK2	TOLLIP	TOLLIP,LOC255512	K562	ChIA-PET	22265404	TOLLIP	28979	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	1595832	1596187	1595959	Y	NA	DUSP8	NA	NA	NA	NA	DUSP8	4682	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	1793842	1794035	1793938	Y	TOLLIP,TNNI2,LSP1,CTSD,MOB2	CTSD,RPL36AP39	MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2-AS1,INS-IGF2,IGF2	IMR90,MCF7,K562,H1ESC	Hi-C,3C,ChIA-PET,5C	24141950,19890323,22265404,22955621	CTSD	10620	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	2082720	2083054	2082737	Y	NA	NA	MOB2,IGF2-AS1,IGF2,INS-IGF2,LSP1,TH,MIR4686	IMR90,K562,GM12878,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	IGF2	85779	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	2198525	2198662	2198539	Y	ASCL2,IGF2,TH	IGF2	NA	NA	NA	NA	IGF2	29692	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	2402008	2402516	2402305	Y	KCNQ1	RPL26P30,CD81,CD81-AS1,TSSC4	NA	NA	NA	NA	CD81-AS1	4786	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	2643944	2644417	2644202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	74807	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	2655024	2655339	2655183	Y	TRPM5,KCNQ1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	63885	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	2669931	2670236	2670070	Y	INS,ASCL2,TRPM5	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	48988	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	2951529	2951649	2951619	Y	KCNQ1,PHLDA2	CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	PHLDA2	2844	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	5350226	5350590	5350390	Y	OR51S1,OR51T1,OR51G2,OR51G1,MMP26,OR51L1,OR52J3,OR52A1,OR51V1,OR52N2,OR51M1,OR56B1,OR52N4,OR52D1,OR51Q1,OR52N5,OR52N1,OR51B2,OR51B6	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM34	288404	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	8730669	8730993	8730843	Y	NA	RPL27A	NA	NA	NA	NA	RPL27A	28711	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	8848675	8849002	8848759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST5	81496	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	9060824	9061053	9060961	Y	ZNF143,RPL27A,TMEM9B,NRIP3,DENND5A	NRIP3,RP11-467K18.2	NA	NA	NA	NA	RP11-467K18.2	37115	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr11	9697347	9697585	9697499	Y	NA	SWAP70	NA	NA	NA	NA	SWAP70	13723	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	10246954	10247167	10247061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SBF2	66587	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	10373282	10373523	10373408	Y	ADM,AMPD3	ADM	SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104	IMR90	Hi-C	24141950	ADM	49055	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	10373965	10374241	10374089	Y	LYVE1,EIF4G2	ADM	SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104	IMR90	Hi-C	24141950	ADM	49738	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	10388178	10388602	10388329	Y	ADM	NA	SBF2,ADM,LOC283104,AMPD3,MRVI1,MRVI1-AS1,CTR9,SWAP70,LOC440028	IMR90	Hi-C	24141950	ADM	63951	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	10634601	10634999	10634904	Y	MRVI1,MRVI1,MRVI1	NA	NA	NA	NA	NA	RNF141	73824	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	10921943	10922208	10922068	Y	AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,EIF4G2,ZBED5	ZBED5	NA	NA	NA	NA	ZBED5	43600	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	13283262	13283494	13283392	Y	NA	ARNTL	ARNTL	IMR90	Hi-C	24141950	ARNTL	12705	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	13546955	13547312	13547134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD10	64111	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	13961618	13961770	13961694	Y	RRAS2	SPON1	SPON1	IMR90	Hi-C	24141950	SPON1	20144	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	13986123	13986466	13986328	Y	SPON1	SPON1	NA	NA	NA	NA	SPON1	4209	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	14356156	14356413	14356247	Y	NA	RRAS2	NA	NA	NA	NA	RRAS2	27639	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	14362320	14362599	14362499	Y	NA	RRAS2	NA	NA	NA	NA	RRAS2	21453	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr11	14443887	14444060	14443964	Y	RRAS2	NA	RRAS2,COPB1,SPON1	IMR90	Hi-C	24141950	RRAS2	59835	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	14785995	14786323	14786008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE3B	122726	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	14874249	14874576	14874405	Y	CYP2R1	CYP2R1,CALCB	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	37222	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr11	16945489	16945781	16945647	Y	NA	RP11-466H18.1	NA	NA	NA	NA	RP11-466H18.1	48779	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	17036768	17036996	17036882	Y	PLEKHA7	RP11-466H18.1,OR7E14P,PLEKHA7	NA	NA	NA	NA	PLEKHA7	2778	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	19736892	19737150	19737126	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	366621	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	27140468	27140646	27140558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIBIN	126840	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	27419147	27419279	27419213	Y	NA	CCDC34	NA	NA	NA	NA	CCDC34	35732	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	27481800	27481840	27481820	Y	NA	LGR4,LIN7C	NA	NA	NA	NA	LGR4	10482	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	27739901	27740316	27740092	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	1289	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	27740535	27740662	27740569	Y	NA	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	943	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	28063321	28063497	28063482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL15	64298	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	31835564	31835985	31835634	Y	NA	RCN1,PAX6	NA	NA	NA	NA	PAX6	1524	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	33209856	33210115	33209986	Y	NA	CSTF3	NA	NA	NA	NA	CSTF3	27939	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	34386157	34386357	34386257	Y	ABTB2	RP1-145M24.1,ABTB2	NAT10,ABTB2,ELF5	IMR90	Hi-C	24141950	ABTB2	8602	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	35825533	35825614	35825574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDLRAD3	137917	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	36171228	36171637	36171430	Y	TRAF6,COMMD9	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD9	137362	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	36211739	36211961	36211850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD9	97038	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	39065264	39065315	39065290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf74	2451213	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	39183372	39183493	39183434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124G5.1	2374491	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	9.16502924045295
chr11	42075853	42076183	42076170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124G5.1	517869	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	43569506	43569887	43569721	Y	C11orf96	HSD17B12,MIR129-2	NA	NA	NA	NA	HSD17B12	6099	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	44032395	44032638	44032519	Y	C11orf96	NA	ALKBH3,LOC100507300	IMR90	Hi-C	24141950	ACCS	52837	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	44749241	44749630	44749607	Y	TSPAN18	TSPAN18	PRDM11,TSPAN18,CD82,TP53I11	IMR90	Hi-C	24141950	TSPAN18	3226	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	45201958	45202605	45202216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT13	103265	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr11	45519986	45520403	45520306	Y	MAPK8IP1	NA	CHST1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-430H10.1	145064	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	46004522	46004898	46004712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYLTL1B	63350	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	46143609	46143973	46143928	Y	NA	PHF21A	NA	NA	NA	NA	PHF21A	2624	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	CREB3L1	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	32014	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr11	46270167	46270467	46270346	Y	CREB3L1	CREB3L1	CREB3L1,PHF21A,DGKZ	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	26745	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	46963806	46964041	46963934	Y	NA	LRP4,C11orf49	NA	NA	NA	NA	C11orf49	7566	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	47173206	47173550	47173416	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP2	23126	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	47208524	47208884	47208580	Y	PACSIN3,PACSIN3,NR1H3	ARFGAP2,PACSIN3,DDB2	NA	NA	NA	NA	PACSIN3	2530	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr11	47226153	47226377	47226265	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3,DDB2,NR1H3,ACP2	DDB2,PACSIN3	MCF7	ChIA-PET	22265404	DDB2	8116	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	47421735	47422128	47421819	Y	MADD,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1	SLC39A13,PSMC3	SLC39A13	IMR90	Hi-C	24141950	SLC39A13	4555	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	47799022	47799247	47799135	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	12027	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	47867685	47867881	47867783	Y	OR4X1	NUP160	NA	NA	NA	NA	NUP160	226	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	47891173	47891544	47891408	Y	OR4C45,OR4B1,OR4C3,OR4X2,OR4S1	NUP160	PTPRJ,FNBP4	IMR90	Hi-C	24141950	NUP160	23066	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	47965488	47965599	47965552	Y	NA	PTPRJ	PTPRJ	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRJ	34514	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	48063635	48064268	48063917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	63522	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	48193627	48193663	48193645	Y	OR4X1,OR4C45,OR4B1,OR4C3,OR4X2,OR4S1	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	193514	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	56980843	56981208	56981026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNKS1BP1	109218	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	57083068	57083441	57083322	Y	NA	TNKS1BP1,SSRP1	NA	NA	NA	NA	TNKS1BP1	6985	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	57406709	57407290	57406997	Y	OR9I1,OR9Q1,PRG3,YPEL4,UBE2L6	SERPING1,AP000662.4,CLP1,YPEL4,ZDHHC5	NA	NA	NA	NA	AP000662.4	3212	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr11	57546018	57546724	57546105	Y	MED19,C11orf31	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	27303	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr11	59034118	59034187	59034153	Y	OR4D6,OR4D10,OR5A1,OR4D9,OR10V1	NA	NA	NA	NA	NA	DTX4	97215	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	59331910	59331948	59331929	Y	OR5AN1,OR4D6,OR4D11	OSBP	NA	NA	NA	NA	OSBP	49669	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	60877687	60877932	60877809	Y	CD6,CD5	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	49157	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	60926054	60926399	60926274	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	690	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	60931528	60932206	60931841	Y	SLC15A3,SDHAF2,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,VPS37C	VPS37C	VPS37C	K562	ChIA-PET	22265404	VPS37C	4439	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	60934770	60935212	60935096	Y	SLC15A3,TMEM138,SDHAF2,CYBASC3,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,VPS37C	VPS37C	VPS37C	K562	ChIA-PET	22265404	VPS37C	7681	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.05500974681765
chr11	61318161	61318561	61318361	Y	NA	SYT7	NA	NA	NA	NA	SYT7	28059	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	61738760	61739751	61739487	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	5628	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	62143612	62143665	62143638	Y	NA	ASRGL1,RCC2P6	NA	NA	NA	NA	RCC2P6	6994	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	62267084	62267180	62267134	Y	WDR74,STX5,SLC3A2,NXF1,AHNAK	NA	NA	NA	NA	NA	AHNAK	54527	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	62320057	62320478	62320186	Y	NA	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	AHNAK	IMR90	Hi-C	24141950	AHNAK	1229	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	63298876	63299223	63298998	Y	OTUB1,MARK2,RARRES3	HRASLS5,LGALS12	NA	NA	NA	NA	LGALS12	27320	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	63337722	63338129	63338119	Y	NA	PLA2G16	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	44226	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	63366734	63367020	63366890	Y	NA	PLA2G16	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	15335	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	63685258	63686079	63685609	Y	NA	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	2942	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr11	63686695	63687182	63686923	Y	NA	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	4379	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr11	63687620	63687907	63687858	Y	LGALS12,RCOR2	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	5304	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr11	63705603	63705837	63705685	Y	NA	RCOR2,NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	NAA40	1172	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	63795964	63796221	63796065	Y	NA	OTUB1,RP11-21A7A.2	NA	NA	NA	NA	RP11-21A7A.2	5221	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	63949132	63949273	63949224	Y	NA	MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4	NA	NA	NA	NA	STIP1	1471	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	65058176	65058598	65058417	Y	EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	21691	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	FRMD8,NEAT1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	FRMD8,NEAT1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr11	65246279	65246484	65246387	Y	SCYL1,LTBP3,EFEMP2	MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	16749	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	65252951	65253044	65253026	Y	NA	MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	10189	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	65254949	65255610	65255242	Y	NA	MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	7623	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr11	65257502	65257849	65257676	Y	NA	MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	5384	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	65259217	65259522	65259389	Y	NA	MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3711	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	65261229	65261625	65261527	Y	CDC42EP2	MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	1608	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	22.148820664428
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	66845907	66846062	66845990	Y	PITPNM1,CLCF1,CLCF1,RBM4,KDM2A,ADRBK1,RHOD	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	23618	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	67121988	67122388	67122127	Y	POLD4,CLCF1	POLD4,AP003419.11,RAD9A,TBC1D10C	NA	NA	NA	NA	POLD4	55	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	67253659	67253853	67253760	Y	PTPRCAP,NUDT8,AIP	CORO1B,TMEM134,AIP,PITPNM1,CDK2AP2	NA	NA	NA	NA	AIP	5147	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	67367234	67367512	67367373	Y	NA	GSTP1,NDUFV1,NUDT8	NA	NA	NA	NA	NDUFV1	4811	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	67895703	67896078	67896017	Y	CHKA	CHKA	CHKA,SUV420H1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHKA	8792	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	68516686	68516842	68516764	Y	NA	MTL5	NA	NA	NA	NA	MTL5	190	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	68611298	68611611	68611498	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1420	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	68623126	68623609	68623402	Y	MTL5,CPT1A	CPT1A,MRPL21,IGHMBP2	CPT1A,PPP6R3,MTL5,TPCN2,MRPL21,IGHMBP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CPT1A	13248	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	68808319	68808729	68808592	Y	IGHMBP2,TPCN2	MRGPRF,TPCN2	MTL5,CPT1A,IGHMBP2,MRPL21,MRGPRD,MRGPRF,TPCN2,CCND1,ORAOV1	IMR90	Hi-C	24141950	TPCN2	5636	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	69250208	69250340	69250290	Y	NA	NA	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFITM9P	180934	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	69251942	69252241	69252024	Y	NA	NA	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFITM9P	182668	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr11	69258094	69258432	69258217	Y	CCND1	NA	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFITM9P	188820	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	69451342	69451588	69451394	Y	NA	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	2267	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr11	69452524	69453230	69453220	Y	CCND1	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	625	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	69453520	69454472	69453912	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	69586936	69586990	69586963	Y	FGF4	FGF4	NA	NA	NA	NA	FGF4	1181	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	69794643	69794820	69794756	Y	FADD,ANO1	RP11-626H12.1	ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-626H12.1	35162	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	69808413	69808546	69808480	Y	NA	RP11-626H12.1	ANO1,ORAOV1,FGF19,FGF4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-626H12.1	21436	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	69811990	69812239	69812133	Y	FGF4	RP11-626H12.1	ANO1,ORAOV1,FGF4,FGF19	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-626H12.1	17743	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	70245269	70246141	70245676	Y	ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN	CTTN,AP000487.5	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	2675	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	71936800	71937067	71937009	Y	INPPL1	FOLR1,INPPL1,PHOX2A	NA	NA	NA	NA	INPPL1	4055	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	72462370	72462747	72462399	Y	NA	STARD10	NA	NA	NA	NA	STARD10	39979	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	72498496	72498726	72498679	Y	STARD10	STARD10,ATG16L2	NA	NA	NA	NA	STARD10	4000	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	72868553	72869130	72868609	Y	NA	FCHSD2	STARD10,FCHSD2,ATG16L2,ARAP1,MIR4692,P2RY2,P2RY6,ARHGEF17	IMR90	Hi-C	24141950	FCHSD2	17247	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	72909664	72909952	72909864	Y	RELT,RELT,P2RY2,P2RY2	NA	FCHSD2,ATG16L2,P2RY6,ARAP1,RELT	IMR90	Hi-C	24141950	FCHSD2	58358	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	72914563	72914688	72914621	Y	NA	NA	FCHSD2,ATG16L2,P2RY6,ARAP1,RELT	IMR90	Hi-C	24141950	FCHSD2	63257	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	72991769	72991956	72991802	Y	RELT,RELT,P2RY6,P2RY6	ARHGEF17	NA	NA	NA	NA	ARHGEF17	25378	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	73490242	73490316	73490279	Y	NA	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	6045	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	74465903	74466299	74466070	Y	POLD3,RNF169	RP11-864N7.2,RNF169	XRRA1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF169	7990	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	74565092	74565468	74565281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRRA1	92777	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	74609449	74609745	74609637	Y	LOC441617,XRRA1	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	48500	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	74814562	74814987	74814735	Y	ARRB1	NA	XRRA1,LOC100507050	IMR90	Hi-C	24141950	NEU3	117383	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	75041361	75041638	75041486	Y	ARRB1	ARRB1	NA	NA	NA	NA	ARRB1	19235	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	75061558	75062072	75061823	Y	NA	ARRB1,RPS3	NA	NA	NA	NA	ARRB1	685	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr11	75491254	75491442	75491286	Y	UVRAG,DGAT2	UVRAG,RP11-535A19.2	NA	NA	NA	NA	UVRAG	32770	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	76480789	76480971	76480905	Y	NA	TSKU,RP11-21L23.3	B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSKU	10324	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	76883031	76883248	76883107	Y	NA	MYO7A	NA	NA	NA	NA	MYO7A	45721	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	78029499	78029864	78029682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	97530	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	78508087	78508456	78508162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	224168	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	83396793	83397083	83396942	Y	DLG2	NA	NA	NA	NA	NA	AP003026.1	230537	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	83670710	83671103	83670907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP003026.1	504454	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	84316632	84316642	84316637	Y	DLG2	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM126B	1020987	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	85046447	85046583	85046515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM126B	291046	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	85463912	85464270	85464111	Y	CREBZF,SYTL2,SYTL2,EED,SYTL2,SYTL2	NA	CCDC89	IMR90	Hi-C	24141950	CREBZF	71961	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	87133739	87133898	87133788	Y	NA	NA	GRM5,FZD4,LOC100506368	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM135	386853	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	89937153	89937335	89937244	Y	NA	CHORDC1	NA	NA	NA	NA	CHORDC1	17197	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	91487188	91487461	91487243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A4	1441669	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	95557234	95557451	95557366	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	35661	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	95838694	95838939	95838802	Y	FAM76B,CEP57,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR2	182215	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	95893318	95893469	95893394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	180875	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	95982466	95982894	95982863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	91450	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	100547720	100547959	100547794	Y	ARHGAP42	ARHGAP42	ARHGAP42	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP42	8425	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	101881929	101882102	101882031	Y	NA	C11orf70	NA	NA	NA	NA	C11orf70	34072	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	102175501	102175731	102175600	Y	BIRC2	BIRC2	MMP7,BIRC2	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC2	40211	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	103281581	103281752	103281672	Y	NA	RP11-37O16.8	NA	NA	NA	NA	RP11-37O16.8	3196	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	104559538	104559761	104559636	Y	CARD17,CASP5,CARD16,CASP4	NA	GRIA4	IMR90	Hi-C	24141950	PDGFD	526431	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	105513261	105513284	105513272	Y	GRIA4,GRIA4,KIAA1826	GRIA4	NA	NA	NA	NA	GRIA4	34540	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	106239516	106239921	106239716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KBTBD3	293024	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	107187292	107187599	107187573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWF19L2	138973	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	107966906	107967320	107967120	Y	NA	ACAT1	ACAT1	IMR90	Hi-C	24141950	ACAT1	22923	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	111692318	111692670	111692505	Y	NA	NA	PPP2R1B	IMR90	Hi-C	24141950	C11orf1	54989	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	111824557	111824693	111824689	Y	NA	HSPB2,HSPB2-C11orf52,C11orf52,DIXDC1	NA	NA	NA	NA	DIXDC1	28689	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	113708252	113709087	113708915	Y	CLDN25	USP28	NA	NA	NA	NA	USP28	35205	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	113945404	113945849	113945581	Y	ZBTB16,ZBTB16	NA	NA	NA	NA	NA	USP28	201112	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	114312879	114313299	114312892	Y	NA	RBM7,C11orf71,REXO2	NA	NA	NA	NA	REXO2	4771	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	115017965	115018296	115018131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM1	355379	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	115371607	115371956	115371778	Y	NA	CADM1	NA	NA	NA	NA	CADM1	1719	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	115741521	115741886	115741709	Y	NA	NA	CADM1	IMR90	Hi-C	24141950	CADM1	367846	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	115867610	115867831	115867734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM1	493935	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	116061103	116061309	116061204	Y	NA	NA	CADM1,FAM55B	IMR90	Hi-C	24141950	BUD13	580395	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	117679991	117680281	117680071	Y	IL10RA	DSCAML1	NA	NA	NA	NA	DSCAML1	5959	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr11	117685393	117685836	117685712	Y	IL10RA	DSCAML1	NA	NA	NA	NA	DSCAML1	404	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	117687155	117687422	117687274	Y	NA	DSCAML1	NA	NA	NA	NA	DSCAML1	915	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.54584145568138
chr11	118791529	118792348	118792152	Y	PHLDB1,BCL9L	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	1969	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	119454963	119455433	119455083	Y	NA	KRT8P7	TRIM29,USP2,LOC100499227	IMR90	Hi-C	24141950	KRT8P7	17585	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	119461410	119461749	119461531	Y	CBL	KRT8P7	LOC100499227,USP2,PVRL1,TRIM29,GRIK4	IMR90	Hi-C	24141950	KRT8P7	11269	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	119540378	119540644	119540511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVRL1	57150	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	119598046	119598312	119598172	Y	USP2	PVRL1	NA	NA	NA	NA	PVRL1	252	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	122847536	122847832	122847753	Y	C11orf63,BSX	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD14C	80298	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	123381868	123382248	123382089	Y	SCN3B,GRAMD1B	NA	GRAMD1B	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF202	228135	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	123613222	123613605	123613414	Y	NA	ZNF202,RNU1-21P	NA	NA	NA	NA	ZNF202	2839	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	123613702	123613859	123613783	Y	OR4D5,OR10G4,OR8D4,OR10S1,OR8G2,OR6T1,OR10G7,OR6X1,OR6M1	ZNF202,RNU1-21P	NA	NA	NA	NA	ZNF202	3319	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr11	125146411	125146772	125146529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKNOX2	113828	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	126029421	126029682	126029619	Y	NA	FAM118B,RPUSD4	HYLS1,CDON	IMR90	Hi-C	24141950	FAM118B	49627	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	126084365	126084425	126084397	Y	NA	FAM118B,RPUSD4	NA	NA	NA	NA	RPUSD4	4778	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	126838913	126839134	126839118	Y	KIRREL3	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	615378	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	128344618	128344676	128344650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	110777	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	128385518	128386026	128385881	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	69427	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	128927593	128927968	128927781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ5	168342	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	129315861	129316038	129315948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM45B	367676	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	129717042	129717234	129717138	Y	ST14,TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	TMEM45B	33328	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	129871629	129871941	129871631	Y	NA	PRDM10,TCEB2P2	NA	NA	NA	NA	PRDM10	899	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	131288211	131288548	131288380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP002856.5	166894	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	132162679	132162975	132162706	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	AP002856.5	1041362	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	133429641	133429673	133429657	Y	NA	OPCML	NA	NA	NA	NA	OPCML	29227	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr11	133903772	133904156	133904071	Y	NA	RP11-713P17.3,JAM3	NA	NA	NA	NA	RP11-713P17.3	3605	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.05500974681765
chr11	133920876	133920983	133920947	Y	B3GAT1,SPATA19,JAM3	RP11-713P17.3,JAM3	NA	NA	NA	NA	JAM3	15837	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr11	133991300	133991384	133991342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JAM3	54480	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr11	134688539	134688830	134688760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B3GAT1	408727	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	680187	680377	680237	Y	NA	RP5-1154L15.2	NA	NA	NA	NA	RP5-1154L15.2	13275	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	685193	685500	685436	Y	NA	RP5-1154L15.2	NA	NA	NA	NA	RP5-1154L15.2	8152	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	860254	860664	860544	Y	RAD52,NINJ2,WNK1	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	495	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	1407863	1408257	1407945	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL14	293074	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	1511133	1511360	1511261	Y	ERC1	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL14	189971	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	1532185	1532472	1532256	Y	ERC1	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL14	168859	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	1698560	1698670	1698614	Y	FBXL14	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	2661	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	1698978	1699322	1699295	Y	NA	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	2009	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr12	1714275	1714637	1714592	Y	NA	FBXL14	FBXL14,RAD52,ERC1,WNT5B,WNK1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FBXL14	12944	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	2144277	2144357	2144308	Y	LRTM2	DCP1B,RP5-1096D14.6	CACNA1C,MIR3649,CACNA2D4,ADIPOR2,DCP1B,LOC100652846,WNT5B	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1096D14.6	32445	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	2467250	2467467	2467306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA1C-AS1	330899	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	3700577	3700596	3700587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT8	212062	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	3771576	3771874	3771725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARP11	208734	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	3913952	3914004	3913978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARP11	66604	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	4131276	4131377	4131327	Y	CCND2	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	PARP11	150668	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr12	4140182	4140815	4140542	Y	CCND2,PARP11	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	PARP11	159574	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr12	4274113	4274463	4274167	Y	CCND2	NA	NA	NA	NA	NA	CCND2	106475	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	4378284	4379414	4378568	Y	PARP11,C12orf4,CCND2,C12orf5	CCND2,C12orf5	PARP11	IMR90	Hi-C	24141950	CCND2	1524	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr12	4380607	4381576	4381205	Y	PARP11,CCND2	C12orf5	NA	NA	NA	NA	CCND2	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	4402799	4402949	4402883	Y	NA	CCND2,C12orf5	NA	NA	NA	NA	CCND2	21861	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	4403384	4403473	4403428	Y	NA	CCND2,C12orf5	NA	NA	NA	NA	CCND2	22446	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	4406037	4406342	4406147	Y	PARP11,CCND2	CCND2,C12orf5	NA	NA	NA	NA	C12orf5	22029	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	4448343	4448720	4448381	Y	PARP11,CCND2,C12orf5	C12orf5	NA	NA	NA	NA	C12orf5	19972	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	4747603	4747847	4747725	Y	NA	AKAP3,NDUFA9	NA	NA	NA	NA	AKAP3	8366	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr12	4770172	4770413	4770176	Y	NA	AKAP3,NDUFA9	NA	NA	NA	NA	NDUFA9	13911	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	4845288	4845672	4845482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNA6	70670	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	4880425	4880454	4880440	Y	NA	KCNA6	NA	NA	NA	NA	KCNA6	35888	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	4935579	4936010	4935701	Y	KCNA1,KCNA6	KCNA6	NA	NA	NA	NA	KCNA6	19237	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	5589537	5589706	5589616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANO2	463692	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	6193943	6194225	6194059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	112656	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr12	6387822	6388153	6388049	Y	NA	PLEKHG6	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLEKHG6	29449	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	6432315	6432644	6432443	Y	NA	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	PLEKHG6	14713	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	6482550	6482923	6482687	Y	SCNN1A,SCNN1A	TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A	TNFRSF1A	K562	ChIA-PET	22265404	LTBR	339	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	6616640	6616858	6616680	Y	NA	VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH,IFFO1	NA	NA	NA	NA	SCARNA10	530	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr12	6622889	6622901	6622895	Y	NA	VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH,IFFO1	NA	NA	NA	NA	SCARNA10	5501	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	6721904	6722326	6722186	Y	GPR162,ENO2,C12orf53	NOP2,CHD4,LPAR5,ACRBP,ING4	NA	NA	NA	NA	CHD4	7262	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	7000184	7000641	7000294	Y	PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6	CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57	NA	NA	NA	NA	SPSB2	3662	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.56417803795393
chr12	7034730	7034838	7034794	Y	ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1	SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,PTPN6,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	3104	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.05500974681765
chr12	7058106	7058233	7058157	Y	ACSM4,VAMP1,ZNF384,ZNF384,CD4,CD4,LRRC23,PTPN6	ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,PTPN6,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,C1S	NA	NA	NA	NA	PTPN6	4475	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	7104040	7104360	7104246	Y	NA	EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3	NA	NA	NA	NA	C1S	9689	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	7592182	7592797	7592685	Y	PEX5,NANOG	RP11-157G21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-157G21.2	1596	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr12	7790789	7791157	7790868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDF3	55215	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr12	7865522	7865674	7865603	Y	DPPA3,SLC2A3,NANOG	GDF3,DPPA3	NA	NA	NA	NA	DPPA3	3472	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr12	7978463	7978836	7978682	Y	DPPA3,SLC2A3,NANOG	NANOG	NA	NA	NA	NA	NANOG	40073	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	8013004	8013217	8013212	Y	NA	SLC2A14	NA	NA	NA	NA	SLC2A14	28527	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	8058337	8058628	8058506	Y	NA	SLC2A14,SLC2A3	NA	NA	NA	NA	SLC2A14	16593	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	8059074	8059227	8059161	Y	NA	SLC2A14,SLC2A3	NA	NA	NA	NA	SLC2A14	17330	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	8112195	8112747	8112462	Y	NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3	K562	ChIA-PET	22265404	SLC2A3	25324	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A3	36298	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	5.60085120249903
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr12	8840377	8840836	8840579	Y	RIMKLB	RIMKLB	RIMKLB	MCF7	ChIA-PET	22265404	RIMKLB	8181	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr12	8966613	8966834	8966743	Y	CLEC6A,CLEC4E,PHC1,M6PR	A2ML1-AS1	A2ML1	IMR90	Hi-C	24141950	A2ML1-AS1	14709	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr12	8971788	8972170	8971968	Y	NA	A2ML1-AS1	A2ML1	IMR90	Hi-C	24141950	A2ML1-AS1	9373	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr12	9059535	9059596	9059566	Y	PHC1	PHC1,M6PR	NA	NA	NA	NA	PHC1	4896	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	9060195	9060360	9060254	Y	PHC1	PHC1,M6PR	NA	NA	NA	NA	PHC1	4132	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	9064281	9064821	9064606	Y	NA	M6PR	M6PR	IMR90	Hi-C	24141950	PHC1	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	9065319	9065715	9065510	Y	PHC1	PHC1,M6PR	M6PR	IMR90	Hi-C	24141950	PHC1	827	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	9236028	9236753	9236097	Y	KLRG1	NA	NA	NA	NA	NA	M6PR	135477	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	9982493	9982805	9982658	Y	KLRB1,CD69,KLRD1,KLRD1,KLRF1	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC9A	198471	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	9986583	9986922	9986755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC9A	194354	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr12	10058419	10058640	10058530	Y	CLEC1B,CLEC2A	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC9A	122636	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	10130625	10130889	10130637	Y	CD69,CLEC2B,OLR1,GABARAPL1,CLEC7A,CLEC12A,CLEC12A	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC9A	50387	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	10272963	10273373	10273241	Y	NA	CLEC1A,CLEC7A	NA	NA	NA	NA	CLEC7A	7484	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	10517487	10517775	10517755	Y	NA	RP11-277P12.20	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	3119	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	10869298	10869573	10869459	Y	NA	STYK1	NA	NA	NA	NA	STYK1	44381	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	11043114	11043456	11043318	Y	TAS2R7,TAS2R8,TAS2R31,TAS2R20,TAS2R14,TAS2R13	NA	NA	NA	NA	NA	STYK1	218197	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	11221356	11221421	11221389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAS2R14	100751	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	11864651	11864937	11864724	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	63863	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	11919566	11919967	11919675	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	118778	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	12016846	12017194	12017120	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L14	183584	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	12032964	12033203	12033084	Y	BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L14	167575	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	12084529	12084746	12084638	Y	NA	NA	LOC338817	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L14	116032	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	12134000	12134396	12134085	Y	ETV6,LOH12CR1,BCL2L14	NA	LOC338817,ETV6	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L14	66382	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	12185852	12185959	12185898	Y	ETV6,BCL2L14	BCL2L14	ETV6,LOC338817,CDKN1B,BCL2L14,MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCL2L14	14819	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	12255233	12255559	12255327	Y	BCL2L14	RP11-267J23.4	NA	NA	NA	NA	RP11-267J23.4	6538	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	12298245	12298581	12298464	Y	LRP6	RP11-267J23.4	NA	NA	NA	NA	RP11-267J23.4	36148	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	12408234	12408471	12408413	Y	NA	LRP6	NA	NA	NA	NA	LRP6	9475	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	12425810	12426042	12425926	Y	NA	LRP6	BCL2L14,LRP6,MIR1244-2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LRP6	7864	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	12654210	12654272	12654270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP16	59045	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	12708006	12708373	12708190	Y	NA	DUSP16	NA	NA	NA	NA	DUSP16	4944	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	12711175	12711335	12711320	Y	NA	DUSP16	NA	NA	NA	NA	DUSP16	1982	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr12	12711400	12711706	12711553	Y	BCL2L14,DUSP16	DUSP16	LOH12CR1	MCF7	ChIA-PET	22265404	DUSP16	1611	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	12766295	12766634	12766503	Y	DUSP16,CREBL2	CREBL2	NA	NA	NA	NA	CREBL2	3534	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr12	12775556	12775830	12775680	Y	LOH12CR1,CDKN1B,APOLD1,DUSP16	CREBL2	NA	NA	NA	NA	CREBL2	12795	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	12957478	12957757	12957559	Y	GPRC5A	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	6493	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	12960939	12961466	12961074	Y	NA	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	2784	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	13025126	13025347	13025203	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	RPL13AP20	1086	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.29125731011324
chr12	13034551	13034650	13034602	Y	DDX47,GPRC5A	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	7066	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	13049170	13049423	13049295	Y	DUSP16	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	7454	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	13056884	13057235	13057060	Y	GPRC5A	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	MIR614	9528	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	13253893	13254547	13254171	Y	CDKN1B,EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	58675	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	13320198	13320450	13320349	Y	NA	EMP1	APOLD1,HTR7P1,EMP1	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	27200	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	13325962	13326157	13326075	Y	EMP1	EMP1	HTR7P1,EMP1,HEBP1,KIAA1467,GSG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EMP1	21493	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	13331850	13332340	13332007	Y	NA	EMP1	EMP1,KIAA1467	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	15310	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	13408937	13409175	13409167	Y	NA	NA	HTR7P1,HEBP1	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	61287	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	13643087	13643098	13643093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMP1	295437	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	13817220	13817383	13817356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMP1	469570	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	14413561	14413925	14413703	Y	NA	NA	ATF7IP	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATF7IP	102685	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr12	14420572	14420772	14420650	Y	PLBD1	NA	ATF7IP	IMR90	Hi-C	24141950	ATF7IP	95838	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	14926467	14926701	14926675	Y	NA	HIST4H4,H2AFJ,WBP11,C12orf60	NA	NA	NA	NA	H2AFJ	1197	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	15514461	15514838	15514654	Y	PTPRO	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-6K23.1	75623	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	18511225	18511610	18511392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	769038	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	19017500	19017849	19017674	Y	NA	NA	PIK3C2G,PLEKHA5	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHA5	262799	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	19048962	19049238	19049131	Y	NA	NA	PIK3C2G	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHA5	231410	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	19284166	19284563	19284310	Y	NA	PLEKHA5	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	3518	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	19291558	19291779	19291581	Y	AEBP2,PLEKHA5	PLEKHA5	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	10910	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr12	19496981	19496995	19496989	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEBP2	57984	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	20124309	20124606	20124452	Y	PDE3A	NA	PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-146P	248940	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	20732540	20732626	20732597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE3A	212361	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	20746479	20746810	20746645	Y	LST-3TM12	NA	NA	NA	NA	NA	PDE3A	226300	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr12	20780077	20780376	20780084	Y	LST-3TM12,PDE3A	NA	NA	NA	NA	NA	PDE3A	259898	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr12	20975224	20975562	20975349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE3A	455045	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr12	21625286	21625603	21625493	Y	NA	PYROXD1,TCEB1P31,RECQL,GOLT1B	NA	NA	NA	NA	TCEB1P31	26038	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr12	21666002	21666378	21666190	Y	NA	RECQL,GOLT1B	NA	NA	NA	NA	GOLT1B	13287	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	22607398	22607521	22607460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETNK1	168488	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	22654594	22654831	22654713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETNK1	121178	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	22779557	22779668	22779574	Y	NA	ETNK1	NA	NA	NA	NA	ETNK1	3548	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	23625293	23625709	23625512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX5	476257	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	23738517	23738975	23738828	Y	SOX5	NA	NA	NA	NA	NA	SOX5	362991	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	23804787	23805114	23804951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX5	296852	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	24376984	24377172	24377078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX5	275018	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	24861116	24861185	24861165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-444D3.1	147592	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	24903057	24903444	24903231	Y	SOX5	NA	SOX5	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-444D3.1	189533	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	24952536	24952732	24952634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	147661	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	24990714	24991079	24990897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	109314	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	24991472	24991796	24991668	Y	BCAT1	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	108597	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	24992180	24992695	24992446	Y	BCAT1	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	107698	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	24993015	24993329	24993020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	107064	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	25008843	25009219	25009048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	91174	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr12	25053045	25053436	25053335	Y	KRAS,BCAT1,BCAT1,BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	46957	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.29125731011324
chr12	25086735	25086929	25086817	Y	NA	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	13464	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	25099512	25100288	25099550	Y	BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	105	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	25178753	25179224	25179042	Y	NA	LRMP	CASC1	IMR90	Hi-C	24141950	LRMP	6817	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	25538390	25538869	25538521	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	16493	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	15955	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr12	25768042	25768407	25768182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-67P	212680	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	26130090	26130317	26130202	Y	NA	RASSF8,RASSF8-AS1	NA	NA	NA	NA	RASSF8-AS1	19392	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr12	26142824	26143171	26142998	Y	NA	RASSF8,RASSF8-AS1	NA	NA	NA	NA	RASSF8-AS1	32126	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	26267263	26267811	26267415	Y	NA	BHLHE41	NA	NA	NA	NA	BHLHE41	8249	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	26538001	26538320	26538173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE41	261941	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	26944008	26944360	26944283	Y	STK38L,C12orf71	ITPR2	NA	NA	NA	NA	ITPR2	39771	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	27174273	27174510	27174392	Y	C12orf71	TM7SF3,MED21	NA	NA	NA	NA	MED21	794	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	27430817	27431042	27430895	Y	NA	STK38L	NA	NA	NA	NA	STK38L	35916	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	27532512	27532752	27532665	Y	C12orf71	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	48725	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	27557115	27557162	27557139	Y	C12orf71,KLHDC5	NA	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	73328	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	27565982	27566076	27566029	Y	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	82195	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	27613510	27613909	27613776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	60455	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	27746027	27746077	27746069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	71663	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	27931494	27931809	27931627	Y	MANSC4	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS35	69788	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	28501330	28501622	28501413	Y	NA	RNU4-54P	NA	NA	NA	NA	RNU4-54P	30934	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	28814319	28814559	28814439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-54P	343923	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	29489399	29489493	29489486	Y	NA	ERGIC2	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	42629	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	29903685	29903894	29903854	Y	NA	TMTC1	NA	NA	NA	NA	TMTC1	31798	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	30949517	30949896	30949519	Y	CAPRIN2	CAPRIN2,RP11-77I22.2,LINC00941	NA	NA	NA	NA	LINC00941	3540	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.05500974681765
chr12	31464460	31464546	31464537	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	13446	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	31523025	31523181	31523129	Y	METTL20,FAM60A,FAM60A	FAM60A,RP11-771K4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-771K4.1	2790	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr12	31523933	31524084	31523973	Y	DDX11,METTL20,FAM60A,FAM60A	FAM60A,RP11-771K4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-771K4.1	3698	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr12	31524246	31524432	31524371	Y	NA	FAM60A,RP11-771K4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-771K4.1	4011	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	31671759	31672031	31671827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND5B-AS1	68826	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr12	31909925	31910440	31910295	Y	AMN1,H3F3C	AMN1,H3F3C	AMN1	K562	ChIA-PET	22265404	AMN1	29817	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	32204633	32204870	32204740	Y	METTL20,AMN1,H3F3C	NA	METTL20,BICD1,AMN1	IMR90	Hi-C	24141950	BICD1	52899	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr12	32263319	32263494	32263407	Y	NA	BICD1	NA	NA	NA	NA	BICD1	5550	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr12	32380941	32381343	32381040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICD1	123172	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	32405506	32405740	32405609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICD1	147737	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	32465088	32465196	32465142	Y	FGD4,BICD1	NA	NA	NA	NA	NA	BICD1	207319	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr12	32559552	32559716	32559634	Y	BICD1	NA	BICD1,FGD4	IMR90	Hi-C	24141950	DNM1L	270418	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr12	32607110	32607326	32607203	Y	NA	NA	FGD4,DNM1L,BICD1	IMR90	Hi-C	24141950	DNM1L	222808	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	32607967	32608138	32608054	Y	NA	NA	FGD4,BICD1	IMR90	Hi-C	24141950	DNM1L	221996	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr12	32635235	32635487	32635321	Y	NA	NA	FGD4	IMR90	Hi-C	24141950	DNM1L	194647	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	32738766	32738845	32738790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNM1L	91289	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr12	32742557	32742716	32742609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNM1L	87418	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	32842101	32842415	32842258	Y	NA	DNM1L,RP11-278C7.1	NA	NA	NA	NA	DNM1L	11967	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	34846341	34846449	34846401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-7D7.1	445925	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	39539251	39539539	39539453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	240019	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	39808802	39808894	39808882	Y	NA	KIF21A	NA	NA	NA	NA	KIF21A	26298	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	40467954	40468269	40468112	Y	NA	SLC2A13	NA	NA	NA	NA	SLC2A13	29622	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	42825856	42826146	42826103	Y	YAF2,YAF2,YAF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	107936	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	43699836	43700036	43699910	Y	NA	NA	PRICKLE1,PPHLN1,ZCRB1	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS20	243688	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	46380247	46380714	46380477	Y	SCAF11	SCAF11	NA	NA	NA	NA	SCAF11	3189	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	46614251	46614418	46614333	Y	NA	SLC38A1	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	47382	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	46786554	46786766	46786571	Y	NA	SLC38A2,RP11-96H19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	11092	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	47191369	47191677	47191464	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	415907	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	47616513	47616764	47616594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPAP3	481080	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	48415389	48415421	48415405	Y	OR10AD1	NA	COL2A1,TMEM106C,SENP1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM106C	60037	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	48579978	48580344	48580161	Y	OR8S1,OR10AD1	ASB8,DKFZP779L1853	NA	NA	NA	NA	ASB8	6982	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr12	49739970	49740063	49739997	Y	NA	TROAP,SPATS2	NA	NA	NA	NA	SPATS2	18304	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	50931365	50931732	50931390	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	34597	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	50932147	50932418	50932300	Y	SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,DIP2B	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	35379	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	51177941	51178161	51178051	Y	POU6F1,FAM186A,LARP4,DIP2B,HIGD1C	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	22448	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	51536826	51537135	51537116	Y	CSRNP2	TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	27791	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	51551925	51552239	51552062	Y	NA	TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	12687	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	51712804	51712960	51712882	Y	DAZAP2,BIN2	NA	NA	NA	NA	NA	SMAGP	50130	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	51720540	51720949	51720738	Y	SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,DAZAP2,GALNT6	NA	NA	NA	NA	NA	SMAGP	57866	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	51833393	51833425	51833407	Y	NA	GALNT6	NA	NA	NA	NA	GALNT6	48742	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	51885274	51885441	51885406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCN8A	96609	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	52241099	52241559	52241297	Y	NA	ANKRD33	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	38185	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	52241760	52242326	52241842	Y	SLC4A8,FIGNL2	ANKRD33	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	37418	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	52242460	52242886	52242778	Y	SLC4A8,ANKRD33	ANKRD33	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	36858	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr12	52243040	52243117	52243080	Y	SCN8A,ACVRL1,FIGNL2	ANKRD33	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	36627	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	52249721	52249808	52249784	Y	SLC4A8,FIGNL2	ANKRD33	BIN2,SCN8A,SLC4A8,ANKRD33,ACVR1B,GALNT6,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	29936	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	52257333	52257459	52257384	Y	NA	ANKRD33	SCN8A,ACVR1B,SLC4A8	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	22285	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	52257879	52258204	52258030	Y	NA	ANKRD33	SCN8A,ACVR1B,SLC4A8	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	21540	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	52262826	52263308	52263216	Y	NA	ANKRD33	SCN8A,ACVR1B,SLC4A8	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	16436	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr12	52279748	52280043	52279838	Y	NR4A1	ANKRD33	NA	NA	NA	NA	ANKRD33	4	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	52418719	52418897	52418793	Y	NR4A1,ACVRL1,GRASP,NR4A1	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	4103	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	52426547	52427164	52426822	Y	NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11931	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	42258	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	52542210	52542726	52542513	Y	KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	41058	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.81876218352206
chr12	52674043	52674518	52674247	Y	NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80	KRT7,KRT81	NA	NA	NA	NA	KRT81	8800	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr12	53318665	53319069	53319016	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	21586	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	53338460	53338676	53338568	Y	KRT18,KRT18	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	1979	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	53339346	53339557	53339459	Y	EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	1098	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr12	53398446	53398634	53398511	Y	NA	EIF4B	NA	NA	NA	NA	EIF4B	504	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	53610849	53611063	53610958	Y	NA	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	13701	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	53890170	53890360	53890251	Y	MFSD5	MAP3K12,TARBP2,NPFF	NA	NA	NA	NA	MAP3K12	1487	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	54090300	54090537	54090319	Y	NA	ATP5G2,CALCOCO1	NA	NA	NA	NA	ATP5G2	21108	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	54149784	54149995	54149877	Y	PCBP2,ATP5G2,HOXC13,HOXC11	CALCOCO1,SNORD81	ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5,HOXC8,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,HNRNPA1,HOXC10,HOXC11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CALCOCO1	30255	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	54752671	54753884	54753119	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA5	57360	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	54770417	54770796	54770608	Y	NA	ITGA5	NA	NA	NA	NA	ITGA5	40448	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	55350184	55350446	55350287	Y	NCKAP1L,KIAA0748,KIAA0748	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R1A	369741	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	55806634	55807051	55806823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BLOC1S1	300769	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	55807914	55808439	55808095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BLOC1S1	299381	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.80042560124951
chr12	55808460	55808880	55808766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BLOC1S1	298940	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr12	56132069	56132385	56132308	Y	OR6C4,OR10P1,SMARCC2,IKZF4	BLOC1S1,ITGA7,RP11-644F5.11,CD63,GDF11	NA	NA	NA	NA	GDF11	2679	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	56218960	56219310	56218990	Y	OR6C3,OR6C65,OR6C2,OR6C4,OR10P1,IKZF4	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14	NA	NA	NA	NA	TMEM198B	2219	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	56474601	56474862	56474633	Y	SLC39A5,APOF,OR10P1,METTL7B,ERBB3,ERBB3	RPS26,ERBB3,PA2G4,RPL41,ZC3H10,ESYT1	NA	NA	NA	NA	ERBB3	2960	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	56729298	56729459	56729406	Y	NA	RP11-977G19.11,CS,RP11-977G19.10,CNPY2,PAN2,IL23A,STAT2	NA	NA	NA	NA	IL23A	1204	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	56877461	56877501	56877482	Y	NA	TIMELESS,SPRYD4,GLS2,RP11-153M3.1,RBMS2	NA	NA	NA	NA	GLS2	2697	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.54584145568138
chr12	57494239	57494362	57494284	Y	MBD6,STAT6	TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	NAB2	13562	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	57751585	57751906	57751872	Y	R3HDM2	NA	INHBC	IMR90	Hi-C	24141950	R3HDM2	70882	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	57764553	57764898	57764725	Y	NA	NA	INHBC,R3HDM2,ARHGAP9	IMR90	Hi-C	24141950	R3HDM2	57890	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	57813803	57814254	57814252	Y	NA	R3HDM2,INHBE,GLI1	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	8534	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	58238225	58238735	58238639	Y	AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,XRCC6BP1,CTDSP2	NA	NA	NA	NA	NA	CTDSP2	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	58271285	58271589	58271437	Y	NA	CTDSP2	AVIL,CTDSP2	IMR90	Hi-C	24141950	CTDSP2	32763	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	59434557	59434696	59434648	Y	LRIG3,LRIG3	NA	LRIG3	IMR90	Hi-C	24141950	XRCC6BP1	1101233	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	62575569	62575732	62575651	Y	USP15,FAM19A2	NA	NA	NA	NA	NA	USP15	76387	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	62772980	62773240	62773147	Y	MON2,USP15	NA	NA	NA	NA	NA	MON2	85357	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	62796049	62796447	62796072	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MON2	62150	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	62970708	62971108	62970733	Y	NA	RP11-631N16.2	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	23424	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	63118880	63119001	63118911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	124348	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	63133542	63133622	63133582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	139010	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	63179567	63180349	63179723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1H	146468	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	65176068	65176517	65176160	Y	TBK1,RASSF3,LEMD3,GNS	GNS	NA	NA	NA	NA	GNS	24841	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	66135126	66135637	66135353	Y	HMGA2	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	80274	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	IRAK3	NA	NA	NA	NA	IRAK3	47633	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	67392180	67392257	67392219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAND1	268804	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	68705850	68706149	68706026	Y	IL22,SLC35E3,NUP107,MDM2,MDM1	MDM1	NA	NA	NA	NA	MDM1	18012	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,NUP107	NA	NA	NA	NA	RAP1B	34042	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	69122207	69122406	69122269	Y	NA	NUP107,SLC35E3	NA	NA	NA	NA	SLC35E3	15480	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	69634325	69634686	69634559	Y	SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6	CPSF6	NA	NA	NA	NA	CPSF6	3008	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	69686526	69686874	69686654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPSF6	55209	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	69724869	69725108	69724964	Y	LYZ	YEATS4	YEATS4	K562	ChIA-PET	22265404	YEATS4	26375	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	69839614	69839824	69839719	Y	CPSF6,FRS2,CCT2,CCT2,YEATS4	FRS2	FRS2	IMR90	Hi-C	24141950	FRS2	22305	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	74257635	74257658	74257647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3B	671893	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	75878955	75879237	75879096	Y	NA	KRR1	NA	NA	NA	NA	KRR1	24179	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	75900907	75901415	75901091	Y	KRR1	KRR1	NA	NA	NA	NA	KRR1	2001	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	76183993	76184325	76184134	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1,KRR1,NAP1L1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA1	241387	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	76206207	76206725	76206399	Y	GLIPR1	NA	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	218987	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	76337836	76338217	76338130	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PHLDA1	87495	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	76338350	76338647	76338468	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PHLDA1	87065	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	76371613	76372127	76371872	Y	NA	NA	OSBPL8,PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	53585	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	76919848	76920276	76920185	Y	ZDHHC17,OSBPL8	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	31313	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	77156465	77156658	77156516	Y	NA	ZDHHC17	NA	NA	NA	NA	ZDHHC17	1097	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	78233905	78233967	78233936	Y	NA	NAV3	NA	NA	NA	NA	NAV3	11220	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	79324302	79324765	79324409	Y	SYT1,SYT1,SYT1	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	68529	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	79325321	79325633	79325477	Y	SYT1	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	69548	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	79356068	79356388	79356099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	100295	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	79462781	79463098	79462967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	207008	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	79759610	79759960	79759786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	322917	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	79941021	79941361	79941199	Y	PAWR	NA	SYT1,PAWR,PPP1R12A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAWR	141516	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	79943391	79943637	79943513	Y	NA	NA	SYT1,PPP1R12A,PAWR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAWR	139240	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	83157091	83157416	83157138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC2	78432	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	85793012	85793355	85793084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALX1	121127	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	86488031	86488389	86488210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF9	259683	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	88968059	88968366	88968242	Y	NA	KITLG	NA	NA	NA	NA	KITLG	4262	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	90403694	90404042	90403890	Y	NA	NA	LOC338758	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B1	302617	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	93320988	93321201	93321103	Y	EEA1	NA	NA	NA	NA	NA	EEA1	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	93410290	93410649	93410470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC138123.2	64802	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	93474339	93474443	93474391	Y	NA	AC138123.2	NA	NA	NA	NA	AC138123.2	1008	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr12	93770329	93770575	93770474	Y	NUDT4	NUDT4	NA	NA	NA	NA	NUDT4	670	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	93805604	93805748	93805676	Y	CRADD	NUDT4,UBE2N	NA	NA	NA	NA	UBE2N	28290	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	94503133	94503402	94503197	Y	NA	PLXNC1	LOC144481,SOCS2,MRPL42,CRADD	IMR90	Hi-C	24141950	PLXNC1	37097	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	94954640	94954945	94954835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMCC3	87393	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	95034280	95034617	95034465	Y	PLXNC1,TMCC3	TMCC3	NA	NA	NA	NA	TMCC3	7721	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	95226806	95227127	95226860	Y	CCDC41	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA12	168419	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	96311989	96312050	96312020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNRPF	61283	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	97525416	97525919	97525503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD1	226415	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	98934224	98934627	98934333	Y	NA	TMPO,TMPO-AS1	NA	NA	NA	NA	TMPO-AS1	26024	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	104330398	104330552	104330475	Y	NA	HSP90B1,C12orf73,TDG	NA	NA	NA	NA	HSP90B1	8513	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	104658660	104659046	104658853	Y	NA	RPL18AP3,EID3	NA	NA	NA	NA	RPL18AP3	1604	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	104997803	104998291	104998125	Y	TXNRD1,TXNRD1,CHST11	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	150730	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	104998326	104998912	104998568	Y	TXNRD1,EID3,CHST11	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	151253	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	105043739	105043999	105043937	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	196666	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	105323709	105324023	105323856	Y	NA	SLC41A2	NA	NA	NA	NA	SLC41A2	26499	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	105486221	105486404	105486313	Y	NA	ALDH1L2,KIAA1033	ALDH1L2,TXNRD1,KIAA1033	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH1L2	9866	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	106529993	106530447	106530148	Y	NA	NUAK1	NA	NA	NA	NA	NUAK1	1364	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	106535331	106535540	106535446	Y	NA	NUAK1	NA	NA	NA	NA	NUAK1	3520	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	107363542	107363991	107363752	Y	NA	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	14953	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	108054058	108054330	108054150	Y	NA	PWP1	NA	NA	NA	NA	PWP1	23179	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr12	108054666	108054768	108054732	Y	NA	PWP1	NA	NA	NA	NA	PWP1	22741	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	108297283	108297694	108297638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM4	144234	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.54584145568138
chr12	108776877	108777008	108776943	Y	NA	NA	WSCD2	IMR90	Hi-C	24141950	FICD	129954	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	109030971	109031245	109031128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISCU	76613	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	109036250	109036518	109036431	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISCU	81892	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	109088465	109088864	109088838	Y	SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	34508	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	109899131	109899209	109899162	Y	TRPV4,TRPV4,TRPV4	UBE3B,KCTD10	NA	NA	NA	NA	UBE3B	13998	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	110265870	110266305	110266084	Y	GIT2,ANKRD13A	TRPV4,GLTP	NA	NA	NA	NA	TRPV4	2907	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	110319208	110319481	110319350	Y	C12orf34,C12orf76	TRPV4,GLTP,TCHP	NA	NA	NA	NA	GLTP	2915	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	110867136	110867499	110867318	Y	NA	ANAPC7,HMGA1P3,ARPC3,RPL31P49,GPN3	NA	NA	NA	NA	HMGA1P3	1049	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	111475040	111475231	111475136	Y	NA	CUX2	NA	NA	NA	NA	CUX2	5212	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	111836487	111836654	111836530	Y	ALDH2,SH2B3	FAM109A,SH2B3	SH2B3	K562	ChIA-PET	22265404	SH2B3	5098	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	111842634	111842962	111842759	Y	NA	FAM109A,SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	882	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr12	111867956	111868269	111868101	Y	BRAP,SH2B3	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	26204	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	111904763	111905142	111904953	Y	ALDH2,ATXN2	NA	NA	NA	NA	NA	SH2B3	63011	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	112018937	112019235	112019073	Y	NA	ATXN2	NA	NA	NA	NA	ATXN2	16245	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	112341708	112342051	112341878	Y	ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	63926	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	112529504	112529724	112529616	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	15102	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr12	112554455	112554606	112554536	Y	ALDH2,TRAFD1	NAA25,TRAFD1	TRAFD1,NAA25	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TRAFD1	6699	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	112633664	112633952	112633817	Y	NA	NA	TRAFD1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAFD1	72359	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	112759768	112760224	112759930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	93931	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	113513069	113513377	113513212	Y	DTX1,DDX54	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL1	58667	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	113644189	113644365	113644286	Y	NA	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	TPCN1	12490	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	113660919	113661318	113661188	Y	TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	4020	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	114025549	114025908	114025724	Y	NA	NA	RBM19	IMR90	Hi-C	24141950	LHX5	117464	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr12	114029271	114029455	114029396	Y	LHX5	NA	RBM19	IMR90	Hi-C	24141950	LHX5	121186	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	7.89210851261226
chr12	116308098	116308555	116308414	Y	NA	NA	RBM19,TBX3	IMR90	Hi-C	24141950	MED13L	404588	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr12	116865168	116865340	116865257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00173	103887	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	116872040	116872309	116872217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00173	96918	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	116872632	116872752	116872692	Y	NA	NA	MED13L,LINC00173,MIR4472-2,MAP1LC3B2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00173	96475	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	116946088	116946451	116946189	Y	MED13L,MAP1LC3B2	LINC00173	LINC00173,MED13L,MAP1LC3B2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00173	22776	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr12	117988619	117988948	117988784	Y	NOS1,NOS1	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO21	362283	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	118012695	118013095	118012896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO21	386359	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	120426531	120426889	120426594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIT	113436	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.54584145568138
chr12	120666780	120666906	120666823	Y	NA	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	29686	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	120668258	120668871	120668569	Y	RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	31164	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	120851941	120852093	120852022	Y	NA	MSI1,RPS27P25,COX6A1,TRIAP1,GATC	PLA2G1B,MSI1,GATC,COX6A1,TRIAP1,SRSF9,DYNLL1	IMR90	Hi-C	24141950	COX6A1	21800	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	121367131	121367281	121367257	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	C12orf43,SPPL3,POP5	IMR90	Hi-C	24141950	RPL12P33	14583	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	121838748	121839039	121838846	Y	SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	2904	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	121951651	121951880	121951735	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM2B	65040	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	121968421	121968751	121968672	Y	SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B	KDM2B	NA	NA	NA	NA	KDM2B	48169	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	121976471	121976819	121976719	Y	NA	KDM2B	NA	NA	NA	NA	KDM2B	40101	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	121998241	121998591	121998487	Y	P2RX7,P2RX4,CAMKK2,RHOF	KDM2B	NA	NA	NA	NA	KDM2B	18329	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	122014724	122015549	122015007	Y	NA	KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	1371	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	20.1121474998829
chr12	122020670	122020879	122020764	Y	KDM2B,KDM2B	KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3750	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr12	122028609	122028883	122028798	Y	RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1	KDM2B,ORAI1	KDM2B	K562	ChIA-PET	22265404	KDM2B	11689	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr12	122067749	122067897	122067832	Y	ORAI1	ORAI1	NA	NA	NA	NA	ORAI1	5294	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	122517490	122517922	122517629	Y	RSRC2,KDM2B,SETD1B,MLXIP	AC156455.1,MLXIP	NA	NA	NA	NA	MLXIP	2862	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	6.87377193033971
chr12	123555205	123555330	123555222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	77232	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	123583230	123583584	123583407	Y	NA	PITPNM2	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	48978	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	123636095	123636496	123636485	Y	NA	PITPNM2	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	3533	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr12	123917456	123917702	123917658	Y	SBNO1,RILPL2	RILPL2,SNRNP35	NA	NA	NA	NA	RILPL2	1562	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	124198913	124199092	124199012	Y	ATP6V0A2	TCTN2,ATP6V0A2	NA	NA	NA	NA	ATP6V0A2	4048	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	124864827	124865003	124864908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM101A	409039	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	124926476	124926613	124926576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	438601	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	124985154	124985447	124985301	Y	DHX37	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	379767	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	313839	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr12	125052829	125053041	125052928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	312173	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	125117108	125117622	125117163	Y	NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	247592	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr12	125185875	125186011	125185947	Y	NA	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	179203	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	125211865	125212230	125212112	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SCARB1	152984	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	125218943	125219209	125219142	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	146005	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	125346086	125346324	125346188	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	18890	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	125353523	125353887	125353860	Y	NA	SCARB1,UBC	NA	NA	NA	NA	SCARB1	11327	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	125400956	125401141	125401046	Y	UBC	SCARB1,UBC,RPL22P19	NA	NA	NA	NA	UBC	1042	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	125405622	125405939	125405923	Y	UBC	SCARB1,UBC,RPL22P19	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	5708	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	125412421	125412524	125412468	Y	NA	SCARB1,UBC,RPL22P19	NA	NA	NA	NA	RPL22P19	5917	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	125424077	125424667	125424516	Y	NA	UBC,RPL22P19,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22P19	5636	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	125534116	125534467	125534247	Y	NA	AACS	AACS	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	AACS	13458	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	125765176	125765295	125765221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM132B	95794	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	126486528	126486706	126486599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM132B	817146	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	130923831	130924224	130924207	Y	RIMBP2	NA	NA	NA	NA	NA	RIMBP2,RP11-662M24.2	274602	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr12	131703349	131703716	131703520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR133	266897	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	132232542	132232780	132232661	Y	DDX51	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	38916	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	132368164	132368433	132368235	Y	NA	ULK1,PUS1	SFSWAP,ULK1,EP400,PUS1	IMR90	Hi-C	24141950	ULK1	8763	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr12	133701272	133701384	133701332	Y	ZNF605,ZNF605,ZNF26,ZNF84,ZNF84,ZNF268,ZNF268,ZNF10	ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268	NA	NA	NA	NA	ZNF891	3675	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr13	20555489	20555876	20555683	Y	NA	ZMYM2	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	24679	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	20644269	20644474	20644387	Y	ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2	NA	NA	NA	NA	NA	GJA3	88714	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr13	20701926	20702100	20701958	Y	PSPC1,ZMYM5	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	31088	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	21607254	21607660	21607524	Y	NA	LATS2	NA	NA	NA	NA	LATS2	26026	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	21632492	21632727	21632640	Y	NA	LATS2	NA	NA	NA	NA	LATS2	959	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	21748962	21749145	21749040	Y	NA	SAP18,SKA3,MRP63	NA	NA	NA	NA	MRP63	178	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr13	23500406	23500844	23500578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA1P6	205469	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr13	23733450	23734509	23733658	Y	NA	HMGA1P6,SGCG	NA	NA	NA	NA	SGCG	18582	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr13	23735133	23735494	23735391	Y	NA	HMGA1P6,SGCG	NA	NA	NA	NA	SGCG	17597	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	25859422	25859518	25859470	Y	NUPL1,MTMR6	MTMR6,NUPL1	NA	NA	NA	NA	MTMR6	629	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	27195593	27195693	27195643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WASF3	65753	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	28167075	28167372	28167253	Y	NA	LNX2,POLR1D	NA	NA	NA	NA	LNX2	25169	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	29594016	29594197	29594075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP69	284718	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	30982567	30982782	30982669	Y	NA	NA	KATNAL1,LINC00426,USPL1,UBL3,HMGB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KATNAL1	102946	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr13	31447062	31447451	31447297	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USPL1	257232	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	33733192	33733538	33733525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	189229	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	34116442	34117241	34116673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	193675	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr13	36412583	36412954	36412753	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLK1	290489	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	42646001	42646399	42646206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	197890	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	43171481	43171500	43171490	Y	DGKH,AKAP11,TNFSF11,TNFSF11	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	327192	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	44446151	44446617	44446342	Y	NA	CCDC122	NA	NA	NA	NA	CCDC122	5210	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	44542732	44543742	44543446	Y	SERP2	NA	SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC122	90905	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	45711306	45711547	45711428	Y	NA	GTF2F2	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	18656	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	45941510	45941762	45941695	Y	COG3,TPT1	TPT1-AS1,TPT1,SLC25A30	NA	NA	NA	NA	TPT1	28005	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr13	46095529	46095772	46095647	Y	TPT1	NA	NA	NA	NA	NA	COG3	58469	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	46761558	46761874	46761821	Y	SPERT	LCP1,LRRC63	NA	NA	NA	NA	LCP1	22132	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	48526121	48526135	48526130	Y	MED4,SUCLA2	SUCLA2-AS1	NA	NA	NA	NA	SUCLA2-AS1	47390	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr13	49563041	49563333	49563220	Y	RCBTB2,CYSLTR2,SETDB2,SETDB2,CDADC1,FNDC3A	FNDC3A	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	14993	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	51743934	51744340	51744171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM124A	50163	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	51800117	51800150	51800132	Y	DLEU7,FAM124A	FAM124A	NA	NA	NA	NA	FAM124A	5614	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	52769647	52769861	52769811	Y	NA	NEK3	NA	NA	NA	NA	NEK3	37651	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	54073704	54073716	54073710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00458	631285	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	60570337	60570455	60570340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	165666	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	60580804	60581154	60581101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	154967	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	61193005	61193146	61193084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRD3	224414	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	67457681	67458008	67457948	Y	PCDH9	NA	NA	NA	NA	NA	DACH1	4981322	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	72359501	72359862	72359720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DACH1	79468	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	72438548	72439003	72438895	Y	DACH1	DACH1	NA	NA	NA	NA	DACH1	327	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	74709487	74710034	74709735	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	3093	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr13	77519546	77519717	77519632	Y	NA	RPL7P44,DHX9P1,CLN5	NA	NA	NA	NA	RPL7P44	34334	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	78911933	78912082	78912037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF219	319232	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	80510902	80511186	80511006	Y	NA	NA	SPRY2	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY2	401900	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	80916096	80916414	80916232	Y	NA	SPRY2	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3010	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr13	81840178	81840277	81840228	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	927092	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	90167002	90167321	90167160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	1830753	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	99128143	99128552	99128498	Y	STK24	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	99642	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr13	99955691	99955924	99955808	Y	GPR18,GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	UBAC2	104663	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	100013491	100013836	100013585	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	137835	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr13	100310859	100311153	100311058	Y	ZIC5,ZIC2	NA	NA	NA	NA	NA	CLYBL	53940	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	100631413	100631577	100631494	Y	ZIC5,ZIC2	ZIC5,ZIC2	NA	NA	NA	NA	ZIC2	449	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	102437700	102438037	102437893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NALCN	370857	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	103249969	103250343	103250155	Y	ERCC5,TPP2	TPP2	NA	NA	NA	NA	TPP2	2616	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	103250853	103251030	103250900	Y	NA	TPP2	NA	NA	NA	NA	TPP2	3500	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	106751889	106752019	106751954	Y	NA	NA	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	ARGLU1	466493	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	106753025	106753272	106753030	Y	ARGLU1	NA	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	ARGLU1	465240	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	106777477	106777605	106777541	Y	NA	NA	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	ARGLU1	440907	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	107186008	107186474	107186341	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	32038	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	108503880	108504176	108504028	Y	FAM155A	FAM155A	NA	NA	NA	NA	FAM155A	12907	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	110181276	110181465	110181371	Y	IRS2	NA	MYO16,IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	224150	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	110709567	110709794	110709737	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	COL4A2	246365	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	110781860	110782469	110782431	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A2	173690	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	111212967	111213224	111213111	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	RAB20	COL4A2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RAB20	887	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	111560939	111561133	111561094	Y	NA	ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	4283	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr13	111719893	111720066	111720029	Y	NA	ARHGEF7	ANKRD10,ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF7	44840	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	112726762	112727353	112726963	Y	NA	SNORD44	NA	NA	NA	NA	SNORD44	22370	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	113434951	113435188	113435090	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11A	92308	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr13	113677034	113677374	113677296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	F10	97754	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	15.7842170252245
chr13	113806516	113806910	113806731	Y	ATP11A,CUL4A	F10	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	F10	31388	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr13	114565478	114566323	114565869	Y	GAS6,GAS6,GAS6	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	432	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr13	115078776	115079079	115078928	Y	NA	UPF3A,CHAMP1	NA	NA	NA	NA	CHAMP1	788	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	21288613	21288985	21288797	Y	NA	RNASE1	NA	NA	NA	NA	RNASE1	19176	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	21439863	21440073	21439999	Y	NA	METTL17	NA	NA	NA	NA	METTL17	15856	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	22080552	22080764	22080649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SALL2	77202	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	23307440	23308274	23307581	Y	SLC7A8,PSMB5,PSMB5,LRP10,MRPL52,MMP14	SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10	NA	NA	NA	NA	MMP14	3674	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr14	23449757	23450231	23450060	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB	MIR4707,HAUS4,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	24008139	24008541	24008214	Y	DHRS4L2,DHRS4L2,SLC22A17,SLC22A17,CMTM5,ZFHX2,JPH4	ZFHX2,AP1G2,JPH4	NA	NA	NA	NA	ZFHX2	14860	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	24163763	24164098	24163827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JPH4	117754	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr14	27997396	27997715	27997579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOVA1	932436	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr14	27998275	27998515	27998360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOVA1	933315	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	28591045	28591340	28591192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26P3	365776	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	31478440	31478826	31478753	Y	NA	AP4S1,STRN3	NA	NA	NA	NA	AP4S1	13486	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	31905446	31905450	31905448	Y	NA	HEATR5A	NA	NA	NA	NA	HEATR5A	17658	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr14	34529400	34529785	34529476	Y	EGLN3	NA	EGLN3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	399777	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	35628271	35628433	35628369	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	38516	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr14	35825324	35825456	35825405	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	PSMA6,SNX6,PPP2R3C,KIAA0391,NFKBIA	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-561B11.1	30819	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	35865196	35865330	35865211	Y	RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	6625	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	35869907	35870271	35870165	Y	FAM177A1,PPP2R3C,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	1684	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	36778207	36778309	36778259	Y	NA	MBIP	NA	NA	NA	NA	MBIP	9573	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	39958924	39958943	39958934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	59220	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	41099089	41099243	41099183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	1199385	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr14	41880555	41880659	41880564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	1980851	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	42075138	42075996	42075609	Y	LRFN5	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	2175434	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	42079862	42079990	42079926	Y	LRFN5	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	2180158	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	42158111	42158422	42158211	Y	LRFN5	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	2258407	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	43989536	43989546	43989541	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	1374952	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr14	45518258	45518310	45518284	Y	PRPF39	KLHL28,PRPF39	NA	NA	NA	NA	KLHL28	8733	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr14	50467375	50468846	50468075	Y	RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D	NA	NA	NA	NA	NA	ARF6	109565	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	50527611	50528257	50527921	Y	RPL36AL,ARF6,C14orf182	NA	NA	NA	NA	NA	SOS2	168019	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	50799629	50799645	50799635	Y	NA	ATP5S,L2HGDH	NA	NA	NA	NA	L2HGDH	22363	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr14	51834333	51834594	51834461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	119224	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	53269343	53269708	53269600	Y	PTGER2	GNPNAT1	NA	NA	NA	NA	GNPNAT1	12957	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	54900763	54901015	54900977	Y	NA	CDKN3	NA	NA	NA	NA	CDKN3	39196	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	55035984	55036343	55036300	Y	SAMD4A	SAMD4A	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	4169	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	55439267	55439511	55439438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDHD1	52312	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	55921336	55921695	55921412	Y	NA	ATG14	NA	NA	NA	NA	ATG14	44760	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	56047594	56047945	56047904	Y	NA	KTN1,KTN1-AS1	NA	NA	NA	NA	KTN1-AS1	2766	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr14	57264055	57264245	57264231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC5	469481	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	57459148	57459304	57459264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC5	274422	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	59106687	59106948	59106735	Y	NA	DACT1	NA	NA	NA	NA	DACT1	8002	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	59159760	59159979	59159850	Y	NA	NA	DACT1	IMR90	Hi-C	24141950	DACT1	61075	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	59656513	59656908	59656842	Y	DAAM1	DAAM1	NA	NA	NA	NA	DAAM1	3149	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr14	59861080	59861273	59861260	Y	DAAM1,RTN1	NA	DAAM1	IMR90	Hi-C	24141950	JKAMP	87888	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	60679186	60679974	60679676	Y	NA	DHRS7,PPM1A	NA	NA	NA	NA	PPM1A	30496	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	61188472	61188761	61188676	Y	PPM1A	SIX4,MNAT1	NA	NA	NA	NA	SIX4	305	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	61855306	61855686	61855500	Y	PRKCH	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM30B	108748	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	61937176	61937384	61937282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM30B	190618	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	61969529	61970113	61969734	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	190118	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	62130240	62130667	62130544	Y	HIF1A	HIF1A	NA	NA	NA	NA	HIF1A	29564	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	64324216	64324732	64324422	Y	PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	6533	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	64358003	64358294	64358235	Y	NA	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	40320	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	65169606	65170310	65170032	Y	NA	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	786	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr14	65172114	65172865	65172414	Y	SYNE2,ZBTB1,MAX,CHURC1,PLEKHG3	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	3294	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	65641048	65641253	65641171	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90	Hi-C	24141950	MAX	73635	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	65705173	65705467	65705275	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAX	137760	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	65722117	65722532	65722424	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FUT8	152778	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	65905118	65905243	65905181	Y	NA	FUT8	NA	NA	NA	NA	FUT8	29808	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	66104549	66104610	66104580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	229239	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	66126309	66126626	66126333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	250999	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr14	67763359	67763655	67763501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	57533	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	67809024	67809296	67809169	Y	RDH12,MPP5,PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	15418	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr14	68033590	68034347	68033627	Y	NA	PLEKHH1,PIGH	NA	NA	NA	NA	PIGH	30657	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	68320437	68320759	68320587	Y	ZFYVE26	ZFYVE26,RAD51B	NA	NA	NA	NA	RAD51B	35941	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	68604521	68604895	68604639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	282018	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	68644384	68644906	68644390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	242007	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	68658646	68658820	68658748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	228093	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	68831089	68831428	68831316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	55485	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	68864511	68864831	68864664	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	22082	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	68987766	68987894	68987825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	100853	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	69377319	69377610	69377464	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTN1	66547	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	69400981	69401191	69401073	Y	ZFP36L1,DCAF5	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	42966	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	70700911	70701061	70700986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX16	123387	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	72099518	72099532	72099525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	312987	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	73595262	73595380	73595321	Y	NA	PSEN1	NA	NA	NA	NA	PSEN1	5746	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	75125565	75125963	75125764	Y	NA	CTD-2207P18.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2207P18.2	44215	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	75920164	75920191	75920178	Y	JDP2	JDP2	NA	NA	NA	NA	JDP2	27745	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr14	76334268	76334588	76334390	Y	NA	IFT43	NA	NA	NA	NA	IFT43	31891	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	76342346	76342569	76342455	Y	BATF,TGFB3	IFT43	TGFB3	IMR90	Hi-C	24141950	IFT43	23910	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	76734272	76734379	76734290	Y	ESRRB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-187O7.1	365625	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	77381505	77381598	77381569	Y	NA	RP11-488C13.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	30412	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	77386302	77386621	77386483	Y	IRF2BPL	RP11-488C13.1,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	35209	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	77428060	77428442	77428341	Y	NA	RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.1	4584	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	77489818	77490087	77489881	Y	NA	IRF2BPL	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	2947	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	77495718	77495873	77495815	Y	NA	IRF2BPL,RP11-7F17.3	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	2684	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL,RP11-7F17.3	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr14	77503944	77504718	77504558	Y	NA	IRF2BPL,RP11-7F17.3	IRF2BPL	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BPL	10910	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr14	77586318	77586417	77586388	Y	NA	RP11-7F17.3,TMEM63C,ZDHHC22	NA	NA	NA	NA	TMEM63C	5407	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	78059840	78060228	78060134	Y	SNW1,SPTLC2	SPTLC2	NA	NA	NA	NA	SPTLC2	20888	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	78121399	78121579	78121501	Y	NA	SPTLC2	NA	NA	NA	NA	SPTLC2	40283	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	78144886	78145071	78144891	Y	NA	ALKBH1,SLIRP	NA	NA	NA	NA	ALKBH1	27292	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	SNORA79	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr14	81867255	81867616	81867435	Y	GTF2A1,GTF2A1,STON2	STON2	NA	NA	NA	NA	STON2	33193	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	85398952	85399308	85399126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT2	595180	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	86053629	86053936	86053651	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT2	59141	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	89739645	89739700	89739695	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	343793	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	89771520	89771819	89771727	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	311674	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	89772713	89772723	89772718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	310770	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	89881748	89882141	89882044	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	201352	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	89887223	89887427	89887324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	196066	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	89897229	89897488	89897403	Y	FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	186005	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	89935615	89935871	89935745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	147622	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	90000319	90000400	90000398	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	83093	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	90083286	90083622	90083526	Y	TDP1,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	90167936	90168219	90168049	Y	TDP1,FOXN3,FOXN3	NA	FOXN3,LOC400236,PRO1768,EFCAB11	IMR90	Hi-C	24141950	FOXN3	84443	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	90168731	90169025	90168878	Y	NA	NA	FOXN3,LOC400236,PRO1768,EFCAB11	IMR90	Hi-C	24141950	FOXN3	85238	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	92574762	92574984	92574843	Y	NA	ATXN3,NDUFB1,CPSF2	NA	NA	NA	NA	ATXN3	3797	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr14	92929701	92929788	92929745	Y	ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	NA	NA	NA	NA	NA	LGMN	283259	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	93121718	93122010	93121905	Y	ITPK1,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	NA	NA	NA	NA	NA	LGMN	91037	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	93511721	93512085	93511905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	68580	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	93552204	93552427	93552400	Y	NA	ITPK1,RP11-371E8.2	NA	NA	NA	NA	ITPK1	28238	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	95731733	95732288	95732036	Y	DICER1,CLMN	NA	NA	NA	NA	NA	CLMN	51955	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	96086261	96086587	96086424	Y	NA	RP11-1070N10.5	NA	NA	NA	NA	RP11-1070N10.5	1010	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr14	100659173	100659604	100659490	Y	NA	DEGS2,YY1,RP11-638I2.4	DEGS2,YY1,EVL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DEGS2	34673	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	100751761	100751840	100751790	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	19044	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	100804523	100804880	100804765	Y	NA	SLC25A29,RP11-638I2.10,WDR25,WARS	NA	NA	NA	NA	RP11-638I2.10	26085	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr14	101023349	101023562	101023455	Y	BEGAIN	NA	NA	NA	NA	NA	DLK1	166480	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	101454914	101455185	101454975	Y	DLK1,RTL1	SNORD114-1,SNORD114-13,SNORD114-19,SNORD114-20,SNORD114-21	NA	NA	NA	NA	SNORD114-21	8602	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	102227271	102227509	102227387	Y	WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C	RP11-1029J19.5,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	1136	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.05500974681765
chr14	102544859	102545271	102545048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR20	58569	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr14	102554875	102555215	102555129	Y	HSP90AA1	WDR20,HSP90AA1	NA	NA	NA	NA	WDR20	48625	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr14	102997284	102997579	102997375	Y	TRAF3,RCOR1	ANKRD9	MIR4309,RCOR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	23148	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr14	103051810	103052039	103051996	Y	NA	RCOR1	TECPR2,TRAF3,RCOR1,AMN	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RCOR1	4959	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr14	103710310	103710630	103710449	Y	NA	NA	LOC100131366,EIF5,TNFAIP2,CDC42BPB,RCOR1,EXOC3L4	IMR90	Hi-C	24141950	EIF5	87251	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	104583053	104583460	104583371	Y	NA	MIR203,KIF26A	NA	NA	NA	NA	MIR203	1311	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	104928387	104928555	104928492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM179	141429	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	105144100	105144955	105144117	Y	GPR132,AKT1	INF2	NA	NA	NA	NA	INF2	8988	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr14	105154013	105154712	105154273	Y	ADSSL1	INF2	NA	NA	NA	NA	INF2	70	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	105327046	105327788	105327205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT1	66958	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	105541748	105541955	105541831	Y	CRIP1,PLD4,GPR132	NA	AHNAK2,GPR132	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	56263	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	105557924	105558306	105558075	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,JAG2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	72439	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80	NA	NA	NA	NA	CRIP1	2511	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr15	20570096	20570220	20570180	Y	NA	NA	REREP3,POTEB,LOC348120,NF1P2,CHEK2P2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-603B24.2	1973869	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	24114794	24115156	24114976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDN	184344	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr15	25018281	25018456	25018384	Y	SNURF,SNRPN,SNRPN,SNRPN	SNRPN	NA	NA	NA	NA	SNRPN	48338	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr15	25123469	25123644	25123557	Y	SNURF,SNRPN,C15orf2,SNRPN,SNRPN	NA	NA	NA	NA	NA	SNRPN	56675	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr15	25565589	25566847	25566046	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	115281	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	26097872	26097956	26097914	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	415744	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	26327449	26327665	26327505	Y	NA	NA	ATP10A,LOC100128714	IMR90	Hi-C	24141950	UBE3A	645321	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr15	31598782	31598890	31598869	Y	NA	KLF13	OTUD7A,LOC283710,KLF13,MTMR10,TRPM1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF13	18168	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	31690304	31690476	31690390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	73246	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	34639079	34639478	34639279	Y	NA	SLC12A6,NOP10,LPCAT4	NA	NA	NA	NA	NOP10	5701	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	35354346	35354732	35354466	Y	NA	NA	ATPBD4,ZNF770	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	75858	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.80042560124951
chr15	35376835	35377041	35376987	Y	NA	NA	ATPBD4,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	98347	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr15	35384953	35385239	35385081	Y	NA	NA	ATPBD4	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	106465	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	35590731	35591134	35590845	Y	NA	NA	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	312243	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	35599049	35599138	35599102	Y	NA	NA	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	320561	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	35983013	35983197	35983137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF770	704525	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	38820654	38820765	38820702	Y	NA	RASGRP1	NA	NA	NA	NA	RASGRP1	35011	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	38943543	38943719	38943607	Y	NA	NA	FAM98B,RASGRP1	IMR90	Hi-C	24141950	RASGRP1	87767	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	39432291	39432412	39432368	Y	THBS1	NA	THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	438868	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	39561378	39561942	39561743	Y	THBS1	NA	NA	NA	NA	NA	THBS1	309338	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	39575623	39576160	39575979	Y	THBS1	NA	C15orf53,THBS1,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	295120	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	39593792	39594300	39594108	Y	THBS1	NA	FSIP1,C15orf53,THBS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THBS1	276980	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	39650604	39651044	39650772	Y	THBS1	NA	THBS1,C15orf53,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	220236	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	39673743	39674138	39673898	Y	NA	NA	THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	197142	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	39684245	39684484	39684421	Y	NA	NA	THBS1,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	186796	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	39702122	39702492	39702291	Y	NA	NA	THBS1,C15orf53	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	168788	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	40397040	40397227	40397203	Y	BUB1B,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	1866	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	40460566	40460976	40460804	Y	NA	BUB1B,PAK6	NA	NA	NA	NA	BUB1B	9342	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	40728458	40728872	40728667	Y	NA	IVD,BAHD1,CHST14	NA	NA	NA	NA	BAHD1	1048	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	40781674	40781798	40781689	Y	BAHD1	CHST14	NA	NA	NA	NA	CHST14	20514	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	40803219	40803626	40803467	Y	RHOV,BMF	CHST14	NA	NA	NA	NA	CHST14	42059	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	40803808	40804249	40803896	Y	NA	CHST14	NA	NA	NA	NA	CHST14	42648	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	41138213	41138409	41138269	Y	RHOV,SPINT1,SPINT1	ZFYVE19,DNAJC17,SPINT1,RHOV,VPS18	NA	NA	NA	NA	SPINT1	3997	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	41264604	41264924	41264664	Y	NA	DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	21444	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	41456018	41456111	41456065	Y	NA	INO80	NA	NA	NA	NA	INO80	49466	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	41920606	41920652	41920629	Y	NA	MGA	TYRO3,MAPKBP1,MGA	IMR90	Hi-C	24141950	MGA	9184	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	MGA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MGA	42496	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr15	42327713	42327843	42327787	Y	MAPKBP1,PLA2G4B	NA	EHD4	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	64937	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	43081091	43081306	43081168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDAN1	53767	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	44838663	44839045	44838853	Y	NA	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	11408	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	48104672	48105061	48104769	Y	NA	NA	SEMA6D	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2270N23.1	83540	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	48253775	48254090	48253870	Y	SEMA6D	NA	SEMA6D	IMR90	Hi-C	24141950	MYEF2	214624	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	50373381	50373578	50373480	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A2	98815	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	50995097	50995499	50995351	Y	SPPL2A	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	18085	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	51560081	51560206	51560144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP4E1	361212	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr15	52024012	52024470	52024199	Y	TMOD3,MAPK6,DMXL2,LYSMD2	TMOD2	NA	NA	NA	NA	TMOD2	17288	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	52228372	52228625	52228515	Y	NA	MAPK6,LEO1	NA	NA	NA	NA	MAPK6	13678	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.81876218352206
chr15	52580530	52580869	52580787	Y	ARPP19,MYO5C	MYO5C	NA	NA	NA	NA	MYO5C	5126	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	52684587	52684775	52684686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO5C	98592	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.54584145568138
chr15	56475345	56475479	56475412	Y	RFX7	NA	NA	NA	NA	NA	RFX7	58004	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	57529031	57529296	57529123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGNL1	136869	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	57946197	57946519	57946360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR2M	63966	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	59068062	59068279	59068172	Y	NA	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	FAM63B	6671	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	59646072	59646468	59646249	Y	NA	FAM81A,MYO1E	NA	NA	NA	NA	FAM81A	16424	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	60337265	60337365	60337315	Y	NA	FOXB1	NA	NA	NA	NA	FOXB1	42844	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	60860287	60860764	60860653	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	90910	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	60874514	60874871	60874792	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	105137	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	62207321	62207567	62207441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	143105	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	63142999	63143362	63143082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-244F12.1	100010	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	63786470	63786486	63786478	Y	RAB8B,USP3	USP3	APH1B,RAB8B,CA12,USP3,LOC100130855,FBXL22	IMR90	Hi-C	24141950	USP3	8307	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	64057692	64057995	64057851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERC1	66146	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	64920832	64921228	64921023	Y	ZNF609,OAZ2	NA	NA	NA	NA	NA	OAZ2	72252	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr15	64995974	64996331	64996160	Y	NA	OAZ2	NA	NA	NA	NA	OAZ2	2494	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	65101103	65101281	65101196	Y	NA	RBPMS2,PIF1,AC069368.3,PLEKHO2	NA	NA	NA	NA	PIF1	14586	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	65103266	65103574	65103420	Y	NA	RBPMS2,PIF1,AC069368.3,PLEKHO2	NA	NA	NA	NA	PIF1	12293	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr15	65127928	65128208	65128016	Y	NA	PIF1,AC069368.3,PLEKHO2	PIF1	K562	ChIA-PET	22265404	AC069368.3	3874	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr15	65596702	65597188	65596889	Y	DENND4A	RNU5A-1,PARP16	PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP16	5746	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr15	65823475	65823857	65823545	Y	IGDCC4	DPP8,PTPLAD1	NA	NA	NA	NA	PTPLAD1	2719	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	65831867	65832220	65831871	Y	NA	DPP8,PTPLAD1	C15orf44	IMR90	Hi-C	24141950	PTPLAD1	11111	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	66125063	66125305	66125185	Y	NA	DENND4A	SLC24A1,DENND4A,RAB11A,C15orf44,MEGF11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND4A	42432	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	66163349	66163534	66163463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80718	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	66433661	66433831	66433761	Y	DENND4A,MAP2K1	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF11	110254	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	66707547	66707736	66707571	Y	MAP2K1	TIPIN,MAP2K1	RPL4,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K1	30392	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	66764584	66765048	66764851	Y	NA	SNAPC5,ZWILCH,RPL4	NA	NA	NA	NA	SNAPC5	23103	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr15	66965990	66966192	66966090	Y	MAP2K1	SMAD6	SMAD6	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	26374	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	66972187	66972410	66972299	Y	NA	SMAD6	SMAD6	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	20156	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	67095524	67095803	67095671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD6	102958	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	67348530	67348587	67348559	Y	NA	SMAD3	SMAD3,IQCH,LOC100506686,AAGAB	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD3	5514	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	67378105	67378547	67378289	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	24004	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	67426476	67426864	67426547	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	72375	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	67467751	67468085	67467918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQCH	77053	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	67926783	67927143	67926830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2K5	93736	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	68176779	68177152	68176934	Y	NA	NA	PIAS1,CLN6,C15orf61,LOC100506686,CALML4	IMR90	Hi-C	24141950	PIAS1	167365	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	68564194	68564543	68564236	Y	NA	CLN6,FEM1B	FEM1B,CLN6,ANP32A,CORO2B,ITGA11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FEM1B	3598	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	69376017	69376173	69376096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLCE	74750	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	69385602	69385765	69385704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLCE	65158	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr15	70392960	70393272	70393150	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	4445	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	70679327	70679587	70679457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLE3	290812	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	70850665	70850865	70850772	Y	NA	NA	KIF23	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	203067	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	71008529	71008840	71008773	Y	NA	UACA	NA	NA	NA	NA	UACA	45092	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	71176892	71177111	71177002	Y	NA	LRRC49,LARP6,THAP10	NA	NA	NA	NA	THAP10	6013	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	71428826	71429023	71428945	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	245702	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	71615809	71616164	71615988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	432685	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	72003894	72004173	72003980	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	400426	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	72226785	72227154	72226872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	177445	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	72617371	72617435	72617389	Y	MYO9A,SENP8,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6	HEXA	NA	NA	NA	NA	HEXA	49382	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	74412993	74413248	74413104	Y	STRA6,CCDC33,C15orf59,TBC1D21	NA	NA	NA	NA	NA	ISLR	50764	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	74908840	74909023	74908946	Y	NA	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	19999	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	74930641	74931010	74930809	Y	ARID3B,CSK	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	41800	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	75018665	75019349	75018947	Y	SCAMP2,C15orf39,CYP1A1	EDC3,CYP1A1	NA	NA	NA	NA	CYP1A1	2714	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	75250602	75250974	75250783	Y	RPP25	COX5A,SCAMP5,RPP25	NA	NA	NA	NA	RPP25	2797	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr15	75328661	75328897	75328778	Y	MAN2C1,C15orf39	PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	14765	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr15	77579824	77580262	77579914	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEAK1	130224	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	77711297	77711794	77711478	Y	NA	PEAK1,HMG20A	NA	NA	NA	NA	HMG20A	543	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	78110975	78112297	78111796	Y	HMG20A,LINGO1,DNAJA4,ACSBG1	NA	NA	NA	NA	NA	LINGO1	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr15	78368268	78368362	78368315	Y	TBC1D2B	TBC1D2B,SNORA63	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	202	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	79635470	79635474	79635472	Y	NA	TMED3	NA	NA	NA	NA	TMED3	34066	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	79669806	79669918	79669862	Y	NA	NA	MTHFS,ST20-MTHFS,C15orf37,KIAA1024,ZFAND6	IMR90	Hi-C	24141950	TMED3	68402	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	83731534	83731663	83731576	Y	WHAMM,BTBD1	BTBD1,TM6SF1	NA	NA	NA	NA	BTBD1	2443	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	85458286	85458507	85458420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF592	168420	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr15	85874454	85874742	85874552	Y	NA	AKAP13	AKAP13	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP13	47060	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	89532902	89533939	89533555	Y	NA	NA	MFGE8,ABHD2	IMR90	Hi-C	24141950	MFGE8	78260	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	90419728	90419914	90419806	Y	ZNF710,SEMA4B,ANPEP,AP3S2	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	15660	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	90547619	90547737	90547660	Y	ANPEP,IQGAP1,ZNF710	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	4995	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	90563245	90563669	90563337	Y	ANPEP,AP3S2,IQGAP1,CIB1,ZNF710	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	20621	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	90605708	90605863	90605756	Y	NA	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	37873	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	90649995	90650276	90650136	Y	NA	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	6259	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	90701535	90701765	90701609	Y	ZNF710,SEMA4B,IQGAP1,CIB1	SEMA4B	IDH2,ZNF710,C15orf58,TTLL13,NGRN,SEMA4B,IQGAP1,CIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEMA4B	71	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	90955763	90956502	90956124	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	26313	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	91331328	91331736	91331526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BLM	72770	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	91394443	91394654	91394577	Y	CRTC3,VPS33B,UNC45A	FURIN,FES,MAN2A2	BLM,CRTC3,FURIN,FES	IMR90	Hi-C	24141950	FURIN	15168	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	91412875	91413318	91412960	Y	IQGAP1,FURIN,UNC45A,FES,FES,FES	FURIN,FES,MAN2A2	NA	NA	NA	NA	FURIN	3053	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	91417545	91417844	91417693	Y	NA	FURIN,FES,MAN2A2	NA	NA	NA	NA	FES	7081	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	91657635	91657753	91657676	Y	NA	SV2B	NA	NA	NA	NA	SV2B	16455	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	ASB9P1,FAM174B	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	FAM174B	12383	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr15	93374780	93375598	93375185	Y	NA	ASB9P1,FAM174B,CHD2	CHD2,LOC100507217,ASB9P1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM174B	23666	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	93520042	93520437	93520098	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3175	74413	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	94670993	94671018	94671006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP2	101749	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	99090927	99091248	99091140	Y	NA	NA	IGF1R,SYNM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IGF1R	98952	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr15	99091450	99092159	99091603	Y	NA	NA	IGF1R,SYNM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IGF1R	98041	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr15	99397047	99397167	99397105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	206847	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	101739961	101740273	101740216	Y	TM2D3,CHSY1	CHSY1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	49864	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr15	102202329	102202647	102202484	Y	OR4F15	TM2D3	NA	NA	NA	NA	TM2D3	11735	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	121563	121849	121614	Y	TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	RHBDF1	2505	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr16	124533	124922	124605	Y	NA	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	MPG	84	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	151121	151408	151265	Y	NA	POLR3K,RHBDF1,MPG,NPRL3	NA	NA	NA	NA	MPG	26115	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	575519	575832	575766	Y	NHLRC4	C16orf11,PIGQ	NA	NA	NA	NA	C16orf11	32590	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	651803	652154	651979	Y	NA	C16orf11,PIGQ,RAB40C,C16orf13,FAM195A	NA	NA	NA	NA	RAB40C	14446	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	729341	729555	729445	Y	NA	C16orf13,FAM195A,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,FBXL16,METRN,FAM173A,CCDC78	NA	NA	NA	NA	STUB1	1117	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr16	802051	802260	802100	Y	NA	FBXL16,METRN,FAM173A,CCDC78,NARFL,CHTF18,RPUSD1	NA	NA	NA	NA	NARFL	12722	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	1339188	1339523	1339417	Y	NA	UBE2I,BAIAP3	UBE2I	MCF7	ChIA-PET	22265404	UBE2I	14025	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	1341001	1341384	1341186	Y	CACNA1H,BAIAP3	UBE2I,BAIAP3	UBE2I,UNKL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	UBE2I	12164	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	1519780	1519909	1519802	Y	SEPX1,MAPK8IP3,CLCN7	C16orf91,CLCN7,TELO2	NA	NA	NA	NA	CLCN7	3672	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	1979729	1980160	1979842	Y	TSC2,MLST8,DNASE1L2,C16orf79,ABCA3,CCDC154,NME3,NUBP2,TBL3,RNF151	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3	NUBP2,FAHD1,IGFALS,C16orf73,HS3ST6,MAPK8IP3,SPSB3,EME2,NME3,MRPS34,HAGH,LINC00254	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB10	27349	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	2041117	2041468	2041266	Y	MAPK8IP3,EME2,SPSB3	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,NPW,SLC9A3R2	NA	NA	NA	NA	SYNGR3	3456	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	2057211	2057401	2057386	Y	NA	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,NPW,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598	423	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	2057818	2059084	2058234	Y	TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598	SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598,NPW	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	2478608	2478672	2478640	Y	RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2	CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24	NA	NA	NA	NA	CCNF	1213	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	2501459	2501492	2501476	Y	NA	CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24	NA	NA	NA	NA	C16orf59	6589	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	2582505	2583298	2582685	Y	RAB26,E4F1,SRRM2,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,CEMP1,PDPK1	ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1	NA	NA	NA	NA	PDPK1	2667	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRSS22	11760	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr16	3053798	3054225	3053960	Y	NA	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1,MMP25	NA	NA	NA	NA	CLDN9	6232	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr16	3060017	3060177	3060084	Y	NAT15,PRSS22,CCDC64B,THOC6,CLDN9	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1,MMP25	NA	NA	NA	NA	CLDN9	280	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	3114137	3114295	3114216	Y	ZNF263,ZNF205,PRSS41,ZSCAN10	TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1,MMP25,IL32,ZSCAN10,ZNF205	NA	NA	NA	NA	IL32	839	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr16	3148559	3148729	3148623	Y	ZSCAN10,ZNF597,ZNF263,OR1F1,ZNF205	IL32,ZSCAN10,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZSCAN10	1241	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	4.58251462022648
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	IL32,ZSCAN10,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	3221173	3221513	3221502	Y	NA	ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	43395	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	3285972	3286117	3286070	Y	PRSS22,ZSCAN10,ZNF200,ZNF200,ZNF200,ZNF75A,ZNF263	ZNF200,ZNF263	NA	NA	NA	NA	ZNF200	1751	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr16	3414643	3415237	3414919	Y	NA	ZNF174	NA	NA	NA	NA	ZNF174	33998	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	3730332	3730635	3730484	Y	NA	TRAP1	NA	NA	NA	NA	TRAP1	34963	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	3931357	3931444	3931401	Y	C16orf90	CREBBP	NA	NA	NA	NA	CREBBP	2630	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.05500974681765
chr16	4357393	4358110	4357824	Y	CORO7	TFAP4,PAM16	ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	36317	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	4587360	4587817	4587427	Y	HMOX2,PPL,C16orf5,C16orf5	NMRAL1	NA	NA	NA	NA	NMRAL1	43596	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	4818680	4818913	4818758	Y	C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI	ANKS3,ZNF500,ROGDI	NA	NA	NA	NA	ZNF500	3055	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	4993356	4993730	4993477	Y	PPL	SEC14L5,PPL	UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEC14L5	12588	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	5666199	5666502	5666317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX1	400593	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	6132184	6132568	6132193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX1	65089	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	6429680	6429691	6429686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX1	362585	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	6470373	6470382	6470378	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX1	403278	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	6481637	6481868	6481695	Y	RBFOX1,RBFOX1	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX1	414542	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	6705372	6705494	6705481	Y	RBFOX1	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX1	638277	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	7988073	7988426	7988349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	725114	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	8010227	8010459	8010246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	703081	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr16	8015278	8015380	8015329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	698160	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	8035197	8035214	8035207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	678326	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	8041589	8041898	8041750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	671642	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr16	8159340	8159643	8159579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	553897	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	8163053	8163492	8163342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	550048	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr16	8232837	8233487	8232942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	480053	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	8360834	8360851	8360843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	352689	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	8615559	8615931	8615745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	97609	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	9055639	9056008	9055791	Y	C16orf72,USP7	USP7	NA	NA	NA	NA	USP7	363	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	9147014	9147397	9147240	Y	ABAT	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	36108	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr16	9767919	9768425	9768098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf72	584414	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.80042560124951
chr16	9774012	9774199	9774105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf72	590507	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	9874200	9874550	9874338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF7IP2	543741	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	10221722	10221780	10221751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF7IP2	196511	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	10549193	10549271	10549232	Y	EMP2	NA	NA	NA	NA	NA	ATF7IP2	130902	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	10710964	10711341	10711185	Y	EMP2	NA	NA	NA	NA	NA	NUBP1	124302	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	10713350	10713596	10713516	Y	NUBP1	NA	NA	NA	NA	NA	NUBP1	122047	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	11086769	11086952	11086818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	50424	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	11336726	11336842	11336760	Y	LITAF,LITAF	RMI2,SOCS1	NA	NA	NA	NA	RMI2	4634	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	11407202	11407368	11407306	Y	NA	NA	CLEC16A	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	59166	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr16	11409407	11409806	11409472	Y	NA	NA	CLEC16A	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	61371	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	11422424	11422652	11422552	Y	NA	NA	CLEC16A,PRM2,PRM3,TNP2,RMI2,TXNDC11	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	74388	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr16	11422943	11423238	11423117	Y	LITAF,CIITA,SOCS1	NA	CLEC16A,PRM2,PRM3,TNP2,RMI2,TXNDC11	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	74907	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr16	11484891	11485075	11484982	Y	NA	NA	BCAR4,LITAF,TXNDC11,SNN	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	136855	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	11590987	11591512	11591296	Y	NA	NA	SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	136725	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	11591931	11591962	11591945	Y	NA	NA	SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	136275	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	11960558	11960748	11960653	Y	NA	RSL1D1,GSPT1	ZC3H7A,RSL1D1,BCAR4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RSL1D1	17116	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	12071486	12071797	12071761	Y	NA	RP11-166B2.1,SNX29	NA	NA	NA	NA	SNX29	2892	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	14377810	14378205	14378026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	214632	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	5.85543534806716
chr16	14379572	14379808	14379698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	216394	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	14397958	14398068	14398015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	234780	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	14423320	14423633	14423477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	260142	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	14529113	14529156	14529135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	195429	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	15766632	15767024	15766843	Y	KIAA0430,NDE1,NDE1	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	31508	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	17341896	17342078	17341982	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	NOMO3	1017544	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	17474933	17475301	17475104	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	NOMO3	1150581	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	17930871	17931209	17931043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15A	868496	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	18153312	18153685	18153560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15A	646020	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	19302824	19302976	19302897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT17	125531	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	19714468	19714843	19714656	Y	NA	IQCK	NA	NA	NA	NA	IQCK	10935	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	19893504	19893863	19893602	Y	NA	GPRC5B	NA	NA	NA	NA	GPRC5B	1626	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr16	19894494	19895110	19894762	Y	CCP110,GPRC5B	GPRC5B	NA	NA	NA	NA	GPRC5B	379	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	21295163	21295477	21295440	Y	NA	CRYM-AS1,CRYM	NA	NA	NA	NA	CRYM-AS1	14693	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr16	21611842	21611954	21611919	Y	CRYM,IGSF6,METTL9	METTL9	NA	NA	NA	NA	METTL9	5303	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	22202219	22202462	22202295	Y	NA	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	13141	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	22349127	22349159	22349143	Y	POLR3E	POLR3E	NA	NA	NA	NA	POLR3E	42397	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr16	22432961	22433094	22433028	Y	NA	CDR2,RRN3P3	NA	NA	NA	NA	CDR2	13392	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	23431856	23432257	23432204	Y	USP31,COG7	COG7	SCNN1B	IMR90	Hi-C	24141950	COG7	30244	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	23455511	23455803	23455657	Y	SCNN1G	COG7	NA	NA	NA	NA	COG7	6698	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	23463654	23463771	23463713	Y	NA	COG7	NA	NA	NA	NA	COG7	1153	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	23508487	23508934	23508786	Y	GGA2	COG7,GGA2	NA	NA	NA	NA	GGA2	22382	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	23531974	23532033	23532005	Y	NA	GGA2,UBFD1,EARS2	NA	NA	NA	NA	GGA2	658	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	23871062	23871733	23871381	Y	GGA2,PRKCB	PRKCB	NA	NA	NA	NA	PRKCB	25740	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	24077587	24077959	24077773	Y	PRKCB	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCB	232265	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	24679861	24680253	24680057	Y	NA	NA	TNRC6A,ARHGAP17,SLC5A11,RBBP6	IMR90	Hi-C	24141950	TNRC6A	58763	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	24696310	24696461	24696360	Y	SLC5A11	TNRC6A	RBBP6,TNRC6A	IMR90	Hi-C	24141950	TNRC6A	42555	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	25801797	25801840	25801819	Y	HS3ST4	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST4	100450	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr16	27334573	27334825	27334616	Y	NA	IL4R	NA	NA	NA	NA	IL4R	11584	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	27533512	27533805	27533694	Y	JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	25429	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	27546889	27546978	27546937	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	12256	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	28629445	28629457	28629451	Y	SBK1,IL27	SULT1A1	NA	NA	NA	NA	SULT1A1	3489	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	29126776	29127012	29126904	Y	SPNS1	NA	NA	NA	NA	NA	SPNS1	143234	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	29712327	29712432	29712378	Y	HIRIP3,QPRT	SPN,QPRT	NA	NA	NA	NA	QPRT	39727	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr16	29721114	29721129	29721122	Y	NA	SPN,QPRT	NA	NA	NA	NA	QPRT	48514	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	29836551	29836761	29836656	Y	NA	KIF22,MAZ,PRRT2,MVP,CDIPT	NA	NA	NA	NA	MVP	6836	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	30545067	30545182	30545127	Y	ZNF764	ZNF768,AC002310.12,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF785	NA	NA	NA	NA	ZNF747	894	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr16	30876491	30876606	30876548	Y	NA	BCL7C	NA	NA	NA	NA	BCL7C	27675	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	31129616	31130225	31129940	Y	ARMC5,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS	ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8,PRSS8	NA	NA	NA	NA	KAT8	4541	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	33509690	33509798	33509723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	1626611	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr16	33974683	33974853	33974768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2091604	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	34441880	34442279	34442062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2558801	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr16	46671518	46671564	46671541	Y	NA	SHCBP1,VPS35,ORC6	NA	NA	NA	NA	SHCBP1	17980	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	46823783	46824029	46823881	Y	NA	C16orf87	NA	NA	NA	NA	C16orf87	39294	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	47324349	47324747	47324746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NETO2	148441	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	48373783	48374217	48374017	Y	LONP2,N4BP1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	LONP2	97576	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	48592202	48592453	48592359	Y	SIAH1,N4BP1	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	59606	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	49888231	49888307	49888269	Y	NA	NA	ZNF423	IMR90	Hi-C	24141950	HEATR3	209545	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	49893175	49893278	49893262	Y	NA	NA	ZNF423	IMR90	Hi-C	24141950	HEATR3	204574	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	49910498	49910724	49910573	Y	NA	NA	ZNF423	IMR90	Hi-C	24141950	HEATR3	187128	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	50101332	50101352	50101341	Y	NA	HEATR3	NA	NA	NA	NA	HEATR3	3480	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	50219057	50219422	50219113	Y	NA	PAPD5	NA	NA	NA	NA	PAPD5	34228	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	50376082	50376389	50376371	Y	NA	BRD7	NA	NA	NA	NA	BRD7	24456	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	50501772	50501939	50501899	Y	NA	NA	NKD1	IMR90	Hi-C	24141950	NKD1	78302	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	51186041	51186738	51186313	Y	NA	SALL1	NA	NA	NA	NA	SALL1	2763	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr16	51572702	51572897	51572800	Y	NA	NA	SALL1	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPA1P48	104770	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	51797343	51797505	51797414	Y	NA	NA	SALL1,CYLD,LOC388276	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPA1P48	119676	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	52579555	52579603	52579574	Y	NA	TOX3	NA	NA	NA	NA	TOX3	111	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	53125869	53126178	53125948	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	38924	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr16	53134908	53135206	53135001	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	47963	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	53947888	53947948	53947918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTO	212013	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	56246770	56247072	56246869	Y	NA	GNAO1	NA	NA	NA	NA	GNAO1	23468	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	56581201	56581558	56581471	Y	MT3,GNAO1,BBS2	BBS2	MT1X,MT4,MT1B,NUP93,MT2A,MT1IP,MT1G,MT1H,OGFOD1,BBS2,MT3,AMFR,NUDT21,MT1A,MT1DP	IMR90	Hi-C	24141950	BBS2	29006	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	57164348	57164453	57164406	Y	NA	CPNE2	NA	NA	NA	NA	CPNE2	39899	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	57294233	57294672	57294611	Y	CPNE2,GPR56	ARL2BP,PLLP	NA	NA	NA	NA	ARL2BP	17223	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	57422451	57422745	57422598	Y	CCL17	CCL22,CX3CL1	NA	NA	NA	NA	CX3CL1	18081	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	57655846	57656393	57655974	Y	FAM192A,COQ9,CIAPIN1,GPR56	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	13282	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	57717053	57717380	57717096	Y	FAM192A,ZNF319,GPR97	CCDC135	NA	NA	NA	NA	CCDC135	9325	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	4.32793047465834
chr16	57841964	57842337	57842236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIFC3	52620	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	63294066	63294457	63294335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH8	1225127	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	64377838	64377886	64377853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	780129	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	66508767	66508904	66508846	Y	NA	BEAN1	NA	NA	NA	NA	BEAN1	49567	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	66659405	66659873	66659770	Y	NA	CMTM3	NA	NA	NA	NA	CMTM3	23628	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	66709355	66709374	66709366	Y	DYNC1LI2	CMTM4	NA	NA	NA	NA	CMTM4	19236	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr16	66960903	66961306	66961106	Y	PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD	RRAD,FAM96B,CES2,CES3	NA	NA	NA	NA	RRAD	3356	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	68268995	68269119	68269015	Y	NA	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	886	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	1343	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr16	68433458	68433594	68433558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-30P	72026	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	68504537	68504688	68504610	Y	DPEP2	NA	PRMT7,SMPD3	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP90	57305	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	68818214	68818347	68818232	Y	CDH1	CDH1	NA	NA	NA	NA	CDH1	49086	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr16	69106233	69106613	69106351	Y	NA	HAS3,CHTF8	NA	NA	NA	NA	HAS3	30854	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	69432325	69432475	69432421	Y	TERF2	TERF2,CYB5B	NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TERF2	7999	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	69506405	69506529	69506498	Y	NA	CYB5B	NA	NA	NA	NA	CYB5B	49977	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	69563572	69563696	69563627	Y	NA	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	33301	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	69564577	69564882	69564731	Y	WWP2	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	32115	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	69751128	69751528	69751345	Y	PDF,TERF2,NQO1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NQO1	7326	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	69790083	69790481	69790284	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NOB1	3240	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr16	70356792	70356812	70356803	Y	NA	AARS,DDX19B,DDX19A	NA	NA	NA	NA	DDX19A	21920	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	70470997	70471281	70471214	Y	NA	FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	70973998	70974194	70974080	Y	VAC14	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	140934	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	72671878	72672163	72672013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	419434	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	72965555	72965897	72965813	Y	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	125700	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	73104505	73104770	73104567	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	12908	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr16	73206454	73206866	73206668	Y	NA	NA	ZFHX3,HPR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFHX3	114857	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	75294692	75295061	75294835	Y	TERF2IP,BCAR1,BCAR1	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	4890	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	75359436	75359702	75359569	Y	NA	NA	BCAR1	IMR90	Hi-C	24141950	BCAR1	59485	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	75369399	75369431	75369415	Y	BCAR1,CFDP1	NA	BCAR1	IMR90	Hi-C	24141950	BCAR1	69448	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	75598847	75599270	75599139	Y	TMEM170A	TMEM231,GABARAPL2	NA	NA	NA	NA	GABARAPL2	598	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	75628076	75628219	75628207	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2,ADAT1	NA	NA	NA	NA	ADAT1	26979	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	76269107	76269317	76269211	Y	NA	RPL18P13	NA	NA	NA	NA	RPL18P13	1586	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	77464200	77464393	77464347	Y	VAT1L,ADAMTS18	ADAMTS18	NA	NA	NA	NA	ADAMTS18	2618	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	78908280	78908607	78908407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAF	724004	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	80710391	80710578	80710565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYL2	125648	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	81392292	81392329	81392311	Y	NA	GAN	NA	NA	NA	NA	GAN	45735	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	81557764	81558419	81558110	Y	CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	CMIP	80989	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	81693209	81693442	81693326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	77260	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	81831837	81832216	81831920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	61135	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	81843531	81843617	81843550	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	72829	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	81856913	81857368	81857087	Y	CMIP,CMIP,PLCG2	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	86211	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	81871176	81871311	81871248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	100474	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	81876199	81876416	81876256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	105497	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	82172740	82172851	82172799	Y	SDR42E1	MPHOSPH6	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH6	28980	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	82661526	82661961	82661896	Y	CDH13	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	3118	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr16	82663331	82663687	82663514	Y	NA	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	4923	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	82687139	82687406	82687299	Y	NA	CDH13	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDH13	28731	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	82693893	82694152	82693974	Y	NA	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	35485	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	83029672	83029964	83029912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH13	371264	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	83960761	83960901	83960832	Y	NA	MLYCD,OSGIN1	NA	NA	NA	NA	OSGIN1	18986	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	84329773	84330037	84329933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAD2	107029	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	84682643	84682972	84682859	Y	NA	COTL1,KLHL36,USP10	NA	NA	NA	NA	KLHL36	2512	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	84785578	84785829	84785712	Y	KIAA0513,COTL1	NA	CRISPLD2,ZDHHC7	IMR90	Hi-C	24141950	USP10	53994	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	5.09168291136275
chr16	85387544	85387685	85387655	Y	NA	NA	LOC727710,LOC400548,KIAA0182,GINS2,FAM92B,LINC00311	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA0513	328169	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	85450092	85450367	85450166	Y	NA	NA	LOC727710,GINS2,KIAA0182,FAM92B,LOC400548,C16orf74	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	271312	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	85497347	85497685	85497518	Y	KIAA0182,GINS2	NA	KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	223994	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	85603902	85604423	85603949	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	117256	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	85623714	85624085	85623926	Y	NA	NA	LOC727710,LOC400548,LINC00311,KIAA0182,C16orf74	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	97594	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	86312346	86312714	86312528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXF1	229419	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr16	86532148	86532503	86532334	Y	NA	FOXF1	NA	NA	NA	NA	FOXF1	9630	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	86775121	86775409	86775225	Y	NA	NA	FOXC2,FOXL1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXF1	232988	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	86855510	86855797	86855532	Y	NA	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679	IMR90	Hi-C	24141950	FOXF1	313377	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	86964858	86965748	86965178	Y	NA	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf95	383274	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	87378694	87379151	87378934	Y	FBXO31	C16orf95,MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	C16orf95	29672	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	87421939	87422407	87422148	Y	NA	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	FBXO31	1341	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	87780321	87780693	87780507	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	16905	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	87811524	87811882	87811665	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	13926	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	87886258	87886670	87886593	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	14424	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	88448195	88448445	88448286	Y	NA	NA	CA5A,SLC7A5,BANP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	69280	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	88701263	88701663	88701374	Y	SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZC3H18,CYBA	CYBA,MVD,SNAI3	NA	NA	NA	NA	CYBA	13897	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	88831388	88831665	88831630	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	17954	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	88835950	88836275	88836191	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	RNF166,CTU2	K562	ChIA-PET	22265404	PIEZO1	13344	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	88837093	88837695	88837443	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	11924	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	88988977	88989104	88989054	Y	NA	NA	TRAPPC2L,GALNS	MCF7	ChIA-PET	22265404	CBFA2T3	52508	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	88991704	88992157	88991819	Y	NA	CBFA2T3	TRAPPC2L,GALNS	MCF7	ChIA-PET	22265404	CBFA2T3	49455	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	89038174	89038503	89038425	Y	CYBA,PABPN1L,CBFA2T3	CBFA2T3	NA	NA	NA	NA	CBFA2T3	3109	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	89268043	89268411	89268231	Y	NA	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	13707	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	5.85543534806716
chr16	89449545	89449691	89449606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	105278	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	89474257	89474602	89474526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	80367	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr16	89557852	89558189	89558050	Y	NA	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	2527	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr16	89879863	89880236	89880053	Y	NA	FANCA,SPIRE2	NA	NA	NA	NA	FANCA	829	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr16	90024486	90024764	90024610	Y	NA	MC1R,AC092143.1,TUBB3,DEF8,CENPBD1,AFG3L1P	NA	NA	NA	NA	DEF8	12153	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr16	90087429	90087721	90087595	Y	TUBB3,DBNDD1,PRDM7	GAS8,DBNDD1	NA	NA	NA	NA	DBNDD1	2893	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	817943	818099	818016	Y	FAM57A	NA	NA	NA	NA	NA	NXN	62911	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	1107024	1107388	1107281	Y	NA	AC016292.1,ABR	ABR,INPP5K,PITPNA,SLC43A2,YWHAE,LOC100306951,BHLHA9,MYO1C,CRK	IMR90	Hi-C	24141950	ABR	22927	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	1134847	1135025	1134980	Y	WDR81,WDR81,WDR81,SLC43A2,SCARF1,PITPNA,CRK	ABR	ABR,CRK,YWHAE,INPP5K,LOC100306951,PITPNA,SCARF1,RILP	IMR90	Hi-C	24141950	ABR	4532	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	1171565	1171808	1171610	Y	WDR81,PITPNA,ABR,ABR	ABR	NA	NA	NA	NA	ABR	41250	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	1466992	1467380	1467296	Y	RILP	INPP5K,PITPNA-AS1,PITPNA	NA	NA	NA	NA	PITPNA	2882	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	1533068	1533815	1533453	Y	CRK,INPP5K,WDR81,WDR81,WDR81,PITPNA,SLC43A2,SCARF1	SLC43A2	NA	NA	NA	NA	SLC43A2	2888	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	2074761	2075171	2074968	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	129506	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	2078039	2078451	2078156	Y	TSR1,HIC1,HIC1	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	126226	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	2126107	2126815	2126522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	77862	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	2241529	2241816	2241651	Y	NA	SRR,SMG6,SGSM2,TSR1	NA	NA	NA	NA	TSR1	2728	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr17	2307434	2307709	2307574	Y	NA	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	5022	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	2652547	2653322	2653300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	158043	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	2927507	2927680	2927594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	433003	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	3289388	3289823	3289641	Y	SPATA22,SPATA22,SPATA22,SPATA22,SPATA22,ASPA,ASPA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPV3	169466	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	3453416	3453706	3453615	Y	OR1G1,OR1A2,OR1A1,OR1E2,TRPV3	TRPV3	NA	NA	NA	NA	TRPV3	5583	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr17	3504662	3504760	3504711	Y	NA	TRPV3,SHPK,CTNS	TRPV3	IMR90	Hi-C	24141950	SHPK	32856	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	3791812	3792145	3792008	Y	GSG2	C17orf85,CAMKK1	NA	NA	NA	NA	CAMKK1	4040	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	4297689	4298014	4297723	Y	NA	UBE2G1	UBE2G1,SPNS3,ANKFY1,ZZEF1,CYB5D2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2G1	29766	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr17	4299458	4299796	4299670	Y	MYBBP1A,UBE2G1	UBE2G1	UBE2G1,SPNS3,ANKFY1,ZZEF1,CYB5D2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2G1	31535	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	4812526	4812616	4812571	Y	SMTNL2,ZNF232,KIF1C	C17orf107,RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1	NA	NA	NA	NA	C17orf107	11813	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	5000892	5001205	5000989	Y	NA	ZFP3,AC012146.7,ZNF232	NA	NA	NA	NA	AC012146.7	11558	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	5412379	5412497	5412422	Y	USP6	DHX33,MIS12,DERL2	NA	NA	NA	NA	DERL2	24248	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	5813088	5813344	5813243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSCD1	139534	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr17	6821400	6821836	6821600	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	66220	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	6925152	6925653	6925481	Y	PLSCR3,C17orf49,BCL6B	ALOX12,RNASEK,C17orf49,BCL6B,SLC16A13	NA	NA	NA	NA	BCL6B	813	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	7115018	7115437	7115195	Y	NA	ACADVL,DLG4,DVL2,PHF23,GABARAP,CTDNEP1,CLDN7	NA	NA	NA	NA	ACADVL	3007	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	608	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4115	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	5769	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.80042560124951
chr17	8090038	8090540	8090163	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	1024	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr17	9549792	9549873	9549833	Y	NA	USP43	NA	NA	NA	NA	USP43	3777	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	10053386	10053763	10053585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	106316	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	10075775	10076068	10075982	Y	GAS7,GAS7	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	84011	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	10658369	10658680	10658526	Y	SHISA6,TMEM220,PIRT	TMEM220,RP11-963H4.2	ZNF18,SHISA6,PIRT	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-963H4.2	10509	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	13463603	13463645	13463626	Y	HS3ST3A1	HS3ST3A1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	39599	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	14105008	14105251	14105153	Y	COX10,HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	97149	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	15895023	15895192	15895111	Y	NA	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	TTC19	5502	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	15923170	15923610	15923287	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	22139	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	15925706	15925935	15925791	Y	FAM18B2,PIGL,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	24675	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr17	15959345	15959465	15959410	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	58314	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr17	16249780	16250130	16249956	Y	CENPV	CENPV,UBB	NA	NA	NA	NA	CENPV	4840	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	16310492	16310776	16310647	Y	NA	UBB,TRPV2	TRPV2,C17orf76-AS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TRPV2	6080	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	16374519	16374788	16374546	Y	NA	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	18679	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	16375722	16375971	16375775	Y	TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	17496	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr17	16438910	16439232	16439111	Y	NA	FAM211A,ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	31288	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	16487545	16487788	16487743	Y	NA	ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	17025	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	16948336	16948515	16948428	Y	ZNF287,ZNF624,PLD6,NT5M,MED9,FLCN,COPS3,COPS3,MPRIP	MPRIP	NA	NA	NA	NA	MPRIP	4477	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	17204544	17204774	17204670	Y	NA	COPS3	NA	NA	NA	NA	NT5M	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	17493657	17493822	17493814	Y	RASD1,SREBF1,PEMT,PEMT	PEMT	NA	NA	NA	NA	PEMT	635	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr17	17596410	17596829	17596636	Y	NA	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	13623	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	17601204	17601406	17601306	Y	NA	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	18417	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	17686462	17687119	17686716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREBF1	51206	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.54584145568138
chr17	17766830	17766899	17766864	Y	LLGL1	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	28505	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	17817256	17817562	17817444	Y	SREBF1	NA	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	56174	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.80042560124951
chr17	17831776	17831833	17831804	Y	NA	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	41903	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	19398359	19398685	19398615	Y	NA	SLC47A1	SLC47A2,B9D1,EPN2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC47A1	1661	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	19411188	19411542	19411351	Y	NA	SLC47A1	EPN2,SLC47A2,B9D1,ALDH3A2,ALDH3A1,ULK2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC47A1	14490	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	19834604	19834673	19834639	Y	NA	AKAP10	NA	NA	NA	NA	AKAP10	44983	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	19883392	19883621	19883525	Y	NA	AKAP10,SPECC1	NA	NA	NA	NA	AKAP10	3736	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	21002403	21002809	21002523	Y	KCNJ18	DHRS7B	USP22,C17orf103	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DHRS7B	21868	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.29125731011324
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	21314266	21314623	21314560	Y	NA	KCNJ12	NA	NA	NA	NA	KCNJ12	36757	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	25659360	25659787	25659571	Y	LGALS9,WSB1	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40258	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	25659975	25660361	25659997	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40873	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	25672386	25672687	25672621	Y	NA	NA	KSR1,MIR4522,WSB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	53284	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr17	25680204	25680481	25680340	Y	LGALS9,WSB1	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61102	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr17	25707009	25707412	25707348	Y	NA	NA	KSR1	IMR90	Hi-C	24141950	KSR1	74258	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	25821729	25821988	25821800	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	40059	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	25833655	25833928	25833707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSR1	51985	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr17	26135195	26135302	26135249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLK	231461	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	26216019	26216352	26216295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLK	150411	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	26578258	26578420	26578387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM97	65701	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr17	26578773	26579067	26578920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM97	65054	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	26718724	26718918	26718801	Y	FOXN1,C17orf63,SEBOX,SARM1	POLDIP2,TMEM199,SARM1,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	SLC46A1	13297	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	26734916	26735044	26734980	Y	NA	SARM1,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	SLC46A1	2701	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	26870881	26871048	26870951	Y	NA	UNC119,PIGS,ALDOC	NA	NA	NA	NA	UNC119	6638	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr17	26894495	26894823	26894797	Y	NA	UNC119,PIGS,ALDOC,SPAG5,SGK494	NA	NA	NA	NA	PIGS	2067	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	26929593	26929935	26929764	Y	TIAF1,PHF12,FLOT2,UNC119	PIGS,ALDOC,SPAG5,SGK494,KIAA0100	NA	NA	NA	NA	SPAG5	5296	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	27072804	27073286	27072989	Y	TRAF4	PROCA1,RAB34,RPL23A,SNORD42A,SNORD4B,NEK8,TLCD1,TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	3802	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	27100910	27101180	27101019	Y	NA	NEK8,TLCD1,TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	31908	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	27129097	27129445	27129306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERAL1	50511	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	27264479	27264617	27264556	Y	UNC119,SDF2,FLOT2,TIAF1,TAOK1,NUFIP2,PHF12	FLOT2,DHRS13,PIPOX,PHF12	NA	NA	NA	NA	PIPOX	10914	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	27475765	27476166	27476073	Y	NEK8,PHF12	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	29264	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	27506307	27506816	27506504	Y	TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	877	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr17	27619094	27619880	27619581	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	27791459	27791862	27791696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4523	75779	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	27824938	27824945	27824941	Y	TIAF1,MYO18A,TAOK1,EFCAB5,ANKRD13B	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I13	66125	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	27966112	27966641	27966332	Y	NA	GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	CORO6	18187	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	28070496	28070746	28070685	Y	SSH2,EFCAB5	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	122571	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	29154156	29154190	29154173	Y	NA	CRLF3,CTD-2349P21.1,ATAD5	NA	NA	NA	NA	CTD-2349P21.1	1729	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	29717293	29717639	29717335	Y	OMG,RAB11FIP4	RAB11FIP4	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	651	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr17	29759240	29759393	29759318	Y	NA	RAB11FIP4	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	42598	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr17	30593810	30594211	30593930	Y	NA	RHBDL3	NA	NA	NA	NA	RHBDL3	2615	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	30603137	30603481	30603311	Y	RHBDL3	RHBDL3	NA	NA	NA	NA	RHBDL3	11942	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	30954292	30954689	30954451	Y	CDK5R1	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	142655	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	31155018	31155230	31155072	Y	MYO1D	MYO1D	NA	NA	NA	NA	MYO1D	46965	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	32426847	32427221	32427145	Y	TMEM132E,C17orf102,ACCN1	NA	NA	NA	NA	NA	CCL2	153083	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	33577736	33577912	33577824	Y	ZNF830,RFFL,SLFN5	SLFN5	NA	NA	NA	NA	SLFN5	9681	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	33673458	33673662	33673550	Y	ZNF830,RFFL,SLFN14,SLFN11,SLFN5	NA	NA	NA	NA	NA	SLFN12	84640	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	33787408	33787803	33787736	Y	ZNF830,SLFN5,CCL5,SLFN12L	SLFN12,SLFN13	NA	NA	NA	NA	SLFN13	13552	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	34160214	34160648	34160302	Y	NA	TAF15	NA	NA	NA	NA	TAF15	25755	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	34838937	34839070	34839023	Y	NA	ZNHIT3,PIGW	NA	NA	NA	NA	ZNHIT3	1403	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr17	34875469	34875747	34875679	Y	NA	ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2	NA	NA	NA	NA	PIGW	13100	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	35514299	35514470	35514425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	210124	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	35520107	35520138	35520123	Y	ACACA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215932	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	35608489	35608691	35608590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACACA	156218	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	36412216	36412471	36412263	Y	NA	RP11-1407O15.2,MRPL45	NA	NA	NA	NA	RP11-1407O15.2	7387	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.29125731011324
chr17	36757754	36758081	36757810	Y	GPR179,SOCS7,ARHGAP23,PIP4K2B,SRCIN1	SRCIN1	NA	NA	NA	NA	SRCIN1	2102	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	36765523	36765920	36765825	Y	NA	SRCIN1	SRCIN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SRCIN1	5340	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr17	36859229	36859333	36859332	Y	NA	C17orf96,MLLT6,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	MLLT6	462	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	36859613	36860666	36860145	Y	NA	C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	MLLT6	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	36907984	36908100	36908042	Y	NA	MLLT6,CISD3,PCGF2,PSMB3,PIP4K2B	NA	NA	NA	NA	PSMB3	995	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	37027781	37027987	37027914	Y	FBXO47,CWC25	CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	3669	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	37558786	37559227	37559071	Y	NA	FBXL20,MED1	NA	NA	NA	NA	FBXL20	2010	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	37845270	37845675	37845499	Y	NA	ERBB2,PGAP3,MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	ERBB2	3103	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	37896808	37897181	37897022	Y	GRB7,GRB7,GRB7,GRB7	PGAP3,MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	4628	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	18231	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	38264417	38264842	38264667	Y	WIPF2,RARA,RARA,NR1D1	MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	9439	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	38646848	38646954	38646881	Y	KRT222,THRA,RAPGEFL1	IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	TNS4	8895	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	38655848	38656036	38655907	Y	GJD3,IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	NA	TNS4	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	38674878	38675250	38674921	Y	TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4	TNS4,CCR7	IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS4	19029	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	38776396	38776659	38776550	Y	WIPF2,RARA,RARA,CCR7	SMARCE1	NA	NA	NA	NA	SMARCE1	26101	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	39010500	39010808	39010654	Y	NA	TMEM99	NA	NA	NA	NA	TMEM99	37142	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	39667444	39667684	39667594	Y	NA	KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	14876	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	39686458	39686891	39686666	Y	KRT19	KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	3898	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	40573451	40573881	40573544	Y	AOC3,GHDC,PLEKHH3,NAGLU,PTRF	STAT3,ATP6V0A1	NA	NA	NA	NA	PTRF	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	40628029	40628344	40628111	Y	NA	ATP6V0A1,AC067852.1	NA	NA	NA	NA	ATP6V0A1	19167	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	40805539	40806065	40805782	Y	NA	TUBG1,FAM134C,TUBG2,PLEKHH3	NA	NA	NA	NA	TUBG2	3258	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	41242207	41242334	41242271	Y	NA	BRCA1,NBR2	NA	NA	NA	NA	BRCA1	33166	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	41421158	41421352	41421255	Y	NA	NA	NBR1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4D	52975	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	42173050	42173151	42173101	Y	TMEM101,G6PC3	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25919	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	42173326	42173627	42173470	Y	NA	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25443	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	42198947	42199210	42199140	Y	NA	C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	42215472	42215904	42215679	Y	C17orf53	HDAC5,C17orf53,TMUB2	C17orf53	MCF7	ChIA-PET	22265404	C17orf53	1370	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.54584145568138
chr17	42589268	42589584	42589359	Y	C17orf53,GJC1,DBF4B,CCDC43,C17orf104	GPATCH8,FZD2	ATXN7L3,GPATCH8	K562	ChIA-PET	22265404	GPATCH8	10470	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr17	42706147	42706421	42706320	Y	NA	C17orf104	GPATCH8,C17orf104,RUNDC3A,CCDC43,DBF4B,ITGA2B,FZD2	IMR90	Hi-C	24141950	C17orf104	25341	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1,ADAM11	NA	NA	NA	NA	RP11-1072C15.1	2016	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	43221862	43221955	43221890	Y	ACBD4,HEXIM1	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2	NA	NA	NA	NA	HEXIM1	729	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	43249989	43250354	43250021	Y	ADAM11,HIGD1B,GFAP,DCAKD	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2,FMNL1	NA	NA	NA	NA	HEXIM2	13922	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	43449108	43449433	43449167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K14	56694	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr17	43817871	43818233	43818138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	151515	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	43951029	43951274	43951198	Y	NA	MAPT	NA	NA	NA	NA	MAPT	18474	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	44113965	44114105	44114069	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	144217	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	44240473	44240874	44240856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	270725	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	44847625	44847956	44847902	Y	WNT3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	50092	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr17	44850644	44850747	44850696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	53111	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr17	44896658	44896796	44896753	Y	WNT3,WNT9B	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	99125	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr17	45352964	45353080	45353020	Y	WNT9B	NA	NA	NA	NA	NA	CDC27	88176	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	45609469	45609601	45609554	Y	NA	NPEPPS	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	11161	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	45983662	45984115	45983847	Y	CDK5RAP3	SP2,AC003665.1,PNPO	PNPO	IMR90	Hi-C	24141950	SP2	12146	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	46089554	46089940	46089788	Y	CBX1,CBX1,CDK5RAP3	CDK5RAP3,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	NFE2L1	33751	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	46102426	46102830	46102617	Y	NA	NFE2L1	NA	NA	NA	NA	NFE2L1	20861	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	46217226	46217562	46217317	Y	CDK5RAP3,SKAP1	CBX1,SNX11	NA	NA	NA	NA	SNX11	38507	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	46605931	46606242	46606161	Y	TTLL6,HOXB1	HOXB1,HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4	NA	NA	NA	NA	HOXB1	117	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr17	47092021	47092148	47092036	Y	NA	IGF2BP1	NA	NA	NA	NA	IGF2BP1	19247	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	47098330	47098693	47098445	Y	NA	IGF2BP1	NA	NA	NA	NA	IGF2BP1	25556	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	ABI3,PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	ABI3	15080	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr17	47337469	47337918	47337568	Y	CALCOCO2,UBE2Z	PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	PHOSPHO1	31341	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	47467973	47468124	47468044	Y	ABI3,PHOSPHO1,ZNF652,ZNF652,SPOP,MYST2,FAM117A	ZNF652,PHB,AC004797.1	NA	NA	NA	NA	PHB	22122	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	47585577	47585730	47585714	Y	NA	NGFR	NA	NA	NA	NA	NGFR	14922	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr17	47586040	47586243	47586212	Y	NA	NGFR	NA	NA	NA	NA	NGFR	15385	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	47738461	47738630	47738545	Y	NA	SPOP,SLC35B1	NA	NA	NA	NA	SPOP	14966	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	48287695	48288075	48287880	Y	XYLT2,LRRC59,COL1A1	COL1A1	PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A1	10702	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	48288364	48288588	48288396	Y	XYLT2,LRRC59,COL1A1	COL1A1	PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A1	11371	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	48290532	48290619	48290576	Y	NA	COL1A1	PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A1	13539	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	48716691	48717083	48716761	Y	CHAD,SPAG9	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	6553	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	49031638	49031879	49031784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOB1	88299	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	50036821	50037210	50037183	Y	CA10,CA10,CA10	NA	NA	NA	NA	NA	UTP18	700932	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	50134051	50134402	50134227	Y	CA10,CA10,CA10	NA	NA	NA	NA	NA	UTP18	798162	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	50561518	50561825	50561670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP18	1225629	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	50795913	50796132	50795928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP18	1460024	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	50838489	50838508	50838499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP18	1502600	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	50877242	50877515	50877351	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP18	1541353	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr17	53017345	53017570	53017451	Y	TOM1L1	TOM1L1,STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	STXBP4	26518	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	53315618	53315983	53315841	Y	HLF	HLF	STXBP4,HLF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HLF	24390	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	54669912	54670125	54669969	Y	NA	NOG	NA	NA	NA	NA	NOG	852	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	55210991	55211279	55211077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP1	50538	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	55518270	55518753	55518516	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	187058	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	55734748	55734863	55734779	Y	DYNLL2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	190554	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	55749375	55749748	55749439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	175669	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	55951789	55952442	55952113	Y	SRSF1,MKS1,MKS1,BZRAP1,MRPS23	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	26372	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	56013342	56013699	56013370	Y	NA	CUEDC1,VEZF1	VEZF1,CUEDC1,SRSF1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	16985	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	56706902	56707296	56707107	Y	MKS1,MKS1,RAD51C	RNU1-60P,RNU1-85P	SEPT4,MTMR4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	27370	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	56736656	56737064	56736885	Y	MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E	RNU1-60P,RNU1-85P,RAD51C	SEPT4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	1990	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	57200500	57200626	57200599	Y	GDPD1	TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	TRIM37	18218	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	57409690	57409997	57409875	Y	YPEL2	YPEL2	NA	NA	NA	NA	YPEL2	2640	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	57511883	57511981	57511933	Y	YPEL2	NA	YPEL2,GDPD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-13P	100879	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	57515522	57515883	57515602	Y	YPEL2	NA	YPEL2,GDPD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-13P	96977	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	57863159	57864676	57863979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	51951	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	57866887	57867071	57866969	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	49556	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	57922999	57923843	57923122	Y	PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	6372	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	58468371	58468697	58468395	Y	BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,USP32	USP32	NA	NA	NA	NA	USP32	29134	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	58470515	58470600	58470558	Y	RNFT1	USP32	NA	NA	NA	NA	USP32	27231	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	58471589	58471771	58471659	Y	RNFT1	USP32	NA	NA	NA	NA	USP32	26060	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	59337920	59337981	59337951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACA2	328582	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	59398606	59399069	59398760	Y	TBX2,C17orf82	NA	NA	NA	NA	NA	NACA2	267494	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	60085676	60086036	60086030	Y	NACA2,MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	54607	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	60141349	60141594	60141514	Y	NACA2,MED13	MED13	INTS2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MED13	706	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	61043121	61043648	61043243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	340359	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	61127299	61127625	61127462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB561	394114	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	61446761	61447257	61446928	Y	NA	NA	MIR548W,MARCH10	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	74482	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	61514078	61514307	61514301	Y	SMARCD2,DDX42,CYB561,CYB561	CYB561,ACE	NA	NA	NA	NA	CYB561	7432	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	62161129	62161576	62161448	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	44603	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	62484790	62485162	62485096	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	POLG2	5992	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	63019276	63019534	63019390	Y	RGS9,GNA13	AMZ2P1,GNA13	AMZ2P1	IMR90	Hi-C	24141950	GNA13	31423	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	63053851	63054126	63053975	Y	GNA13	GNA13	AMZ2P1	IMR90	Hi-C	24141950	GNA13	2894	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	64796276	64796554	64796503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG4	162472	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	64948296	64948612	64948339	Y	CACNG4	CACNG4	CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CACNG4	10414	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	64961597	64961937	64961768	Y	CACNG4	CACNG4	NA	NA	NA	NA	CACNG4	2571	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	64963064	64963179	64963122	Y	NA	CACNG4	NA	NA	NA	NA	CACNG4	4038	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	65242250	65242562	65242536	Y	NA	HELZ,SNORA8	NA	NA	NA	NA	HELZ	2145	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	65389377	65389540	65389482	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	17802	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	65485462	65485785	65485684	Y	HELZ,BPTF	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	113887	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	65505765	65506408	65506331	Y	HELZ,PSMD12,BPTF	NA	NOL11	IMR90	Hi-C	24141950	PITPNC1	134190	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	65897183	65897370	65897273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BPTF	77543	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	65991434	65991739	65991543	Y	C17orf58	C17orf58,KPNA2	NA	NA	NA	NA	C17orf58	3669	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr17	66016382	66016768	66016696	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	12867	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	66595732	66596064	66595787	Y	NA	FAM20A	NA	NA	NA	NA	FAM20A	202	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	67756789	67757245	67756902	Y	KCNJ2	NA	KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2,MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	347950	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	68127333	68127525	68127373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2K6	718494	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	70878407	70878514	70878507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	208337	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	71152430	71152655	71152530	Y	C17orf80,SSTR2	SSTR2,COG1	NA	NA	NA	NA	SSTR2	6496	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	71200352	71200549	71200451	Y	NA	SSTR2,COG1,C17orf80,FAM104A	NA	NA	NA	NA	COG1	13223	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	71320337	71320718	71320484	Y	NA	CDC42EP4	CDC42EP4	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP4	14023	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	71338137	71338558	71338458	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	31823	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	71339324	71339501	71339471	Y	SSTR2,CDC42EP4	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	33010	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	71708165	71708381	71708273	Y	NA	NA	SDK2,LINC00469,LOC400620	IMR90	Hi-C	24141950	SDK2	69937	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	71739470	71739821	71739643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDK2	101242	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	71909993	71910008	71910001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDK2	271765	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	72276235	72276702	72276423	Y	TMEM104,CD300LF,CD300LD,CD300LB,CD300E,CD300C,CD300A,TTYH2,TTYH2	NA	NA	NA	NA	NA	TTYH2	68582	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	72728741	72729539	72729096	Y	KIF19,KCTD2,GRIN2C,FADS6,RAB37,RAB37,RAB37	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	13252	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	73007152	73007476	73007237	Y	RAB37,GRIN2C,C17orf28,CDR2L,SUMO2,NUP85,KCTD2,ARMC7	CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H	NA	NA	NA	NA	ICT1	387	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	73032786	73033119	73032977	Y	TSEN54,GGA3	ICT1,KCTD2,ATP5H,SLC16A5	NA	NA	NA	NA	KCTD2	6116	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	73073656	73074040	73073685	Y	RAB37,RAB37,ARMC7	KCTD2,ATP5H,SLC16A5,ARMC7	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	7782	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	73087456	73087829	73087515	Y	NA	ATP5H,SLC16A5,ARMC7,NT5C	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	5634	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr17	73091198	73091317	73091257	Y	TSEN54,LLGL2	SLC16A5,ARMC7,NT5C	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	9376	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	73546030	73546166	73546084	Y	NA	CASKIN2,TSEN54,LLGL2	NA	NA	NA	NA	LLGL2	26869	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	73696530	73696897	73696707	Y	SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	ITGB4	18511	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	73805010	73805399	73805102	Y	NA	GALK1,UNK,H3F3B,UNC13D,WBP2	NA	NA	NA	NA	H3F3B	25036	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	73868951	73869202	73869040	Y	TRIM47	UNC13D,WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38	NA	NA	NA	NA	TRIM47	3454	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	73891396	73891618	73891569	Y	NA	WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1	NA	NA	NA	NA	TRIM65	312	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	74116537	74116786	74116688	Y	NA	SRP68,EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	EXOC7	880	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr17	74128444	74128992	74128680	Y	LOC100130933,RECQL5,RECQL5,FOXJ1	EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	FOXJ1	6388	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr17	74341579	74341976	74341749	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	28689	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	5.60085120249903
chr17	74440987	74441354	74441087	Y	NA	UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	5934	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	74723995	74724371	74724344	Y	FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11	JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	METTL23	3083	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	74764385	74764732	74764559	Y	NA	JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	SRSF2	32929	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	74991518	74991908	74991857	Y	NA	NA	MFSD11,MGAT5B,SEC14L1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00338,SEC14L1	88890	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	75312591	75312808	75312697	Y	NA	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	37940	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	75385660	75386043	75385777	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	111009	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	75769300	75769393	75769353	Y	NA	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90	Hi-C	24141950	TMC8	355458	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr17	75798844	75799281	75799210	Y	TNRC6C,TMEM235	NA	LOC100507351,TNRC6C	IMR90	Hi-C	24141950	TMC8	325570	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMC8	170055	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	49.3893242402187
chr17	75955923	75956319	75956134	Y	TMC8,TMC6,TMC6,TNRC6C	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMC8	168532	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	76310071	76310633	76310436	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	PGS1,DNAH17,SOCS3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SOCS3	43525	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr17	76312866	76313241	76313131	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	SOCS3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SOCS3	40917	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr17	76313584	76313890	76313792	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	SOCS3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SOCS3	40268	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr17	76348964	76349371	76349046	Y	USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4787	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	76349549	76349649	76349633	Y	NA	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4509	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	76357167	76357466	76357379	Y	NA	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	3009	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.81876218352206
chr17	76377337	76378350	76377903	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	4616	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr17	76382008	76383398	76383057	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	9287	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	76480175	76480442	76480309	Y	TMEM235	NA	NA	NA	NA	NA	PGS1	107454	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	76669540	76669658	76669599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYTH1	106721	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	77702456	77702572	77702532	Y	NA	CBX2	NA	NA	NA	NA	CBX2	47359	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	77783959	77784243	77784073	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	10477	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	77814369	77814482	77814427	Y	NA	CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX4	3141	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	41238	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr17	78500391	78500494	78500444	Y	NA	RPL32P31,RPTOR	RPTOR,NPTX1,LOC100294362,ENDOV	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL32P31	13509	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr17	78512968	78513399	78513135	Y	NA	RPL32P31,RPTOR	NA	NA	NA	NA	RPL32P31	604	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	78754047	78754707	78754061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	208691	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	78763390	78763671	78763525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	199727	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	78806684	78807307	78807121	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	156091	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	79046413	79046604	79046526	Y	NA	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	39465	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	NA	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A10	51978	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	79319812	79320225	79320116	Y	FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1	NA	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A10	52465	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	79886802	79887109	79886903	Y	NA	ANAPC11,ALYREF,PCYT2,SIRT7,MAFG,MAFG-AS1,PYCR1,ASPSCR1	NA	NA	NA	NA	MAFG-AS1	3097	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	80029941	80030069	80030002	Y	HEXDC	STRA13,RAC3,DCXR,GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	DUS1L	8178	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.54584145568138
chr17	80158664	80158910	80158860	Y	DUS1L,NARF,HEXDC,CD7,CCDC57	CCDC57,SLC16A3	FASN	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC57	9796	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	80188750	80189250	80189000	Y	NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	SLC16A3	4477	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr17	80453708	80453979	80453866	Y	LRRC45,DUS1L,FASN,UTS2R,TBCD,FOXK2	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	21610	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr17	80508755	80508786	80508770	Y	CCDC57,CD7	FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	33166	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	80592968	80593241	80593234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB40B	61363	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	80712796	80713169	80712899	Y	ZNF750,TBCD	FN3KRP,FN3K,TBCD	NA	NA	NA	NA	TBCD	4856	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr17	80794045	80794420	80794166	Y	ZNF750	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	2034	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	80842917	80843211	80843101	Y	C17orf62,NARF	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	46463	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	80889616	80889925	80889758	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF750	93162	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	81012071	81012294	81012223	Y	NA	B3GNTL1,METRNL	NA	NA	NA	NA	B3GNTL1	4385	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr17	81063257	81063563	81063336	Y	NA	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	27690	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	9843	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr18	781638	782117	782009	Y	NA	RNU1-109P,YES1	NA	NA	NA	NA	RNU1-109P	14019	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	813044	813594	813404	Y	YES1	RNU1-109P,YES1	NA	NA	NA	NA	YES1	2497	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	1888648	1888915	1888782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	680593	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	2797990	2798254	2798233	Y	NA	EMILIN2	NA	NA	NA	NA	EMILIN2	46774	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	2883493	2883567	2883531	Y	NA	EMILIN2	NA	NA	NA	NA	EMILIN2	38465	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	3509218	3509430	3509419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	99612	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	3623872	3624258	3624140	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214266	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	3624338	3624601	3624482	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214732	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	3665613	3666165	3665884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	256007	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	7116326	7116685	7116423	Y	NA	LAMA1	NA	NA	NA	NA	LAMA1	513	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	8704091	8704364	8704199	Y	CCDC165	NA	CCDC165,NDUFV2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB12	96648	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	8704447	8704767	8704559	Y	NA	NA	CCDC165,NDUFV2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB12	97004	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	9017103	9017601	9017310	Y	ANKRD12	NA	CCDC165,ANKRD12,RALBP1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	83027	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr18	9219810	9220134	9219877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD12	85584	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	9824351	9824715	9824532	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	87284	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	9828298	9828524	9828428	Y	RALBP1,PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	83475	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	9856185	9856287	9856251	Y	RALBP1,PPP4R1,RAB31,VAPA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	55712	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	10544333	10544521	10544427	Y	NA	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	20431	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr18	11947272	11947721	11947412	Y	CHMP1B	MPPE1,IMPA2	IMPA2,GNAL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IMPA2	31303	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr18	12993260	12993605	12993433	Y	NA	SEH1L,CEP192	NA	NA	NA	NA	CEP192	3899	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	13418060	13418088	13418062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	306571	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	13565321	13565688	13565500	Y	C18orf1,C18orf1	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	158971	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	13890423	13890585	13890504	Y	MC5R	NA	NA	NA	NA	NA	FAM210A	165761	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	19904686	19904949	19904805	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	GATA6	157282	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	20139802	20140256	20140003	Y	GATA6	NA	CTAGE1,GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	235968	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	20855209	20855599	20855401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CABLES1	142681	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	20913960	20914007	20913982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM241	101918	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr18	21091625	21091887	21091629	Y	C18orf8	C18orf8	NA	NA	NA	NA	C18orf8	10152	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	21337339	21337459	21337412	Y	C18orf45	NA	NA	NA	NA	NA	LAMA3	69932	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.29125731011324
chr18	23609881	23610142	23609962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SS18	59039	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	25695112	25695346	25695270	Y	CDH2	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	60064	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	26982645	26982654	26982650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	1227235	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	29032478	29032594	29032536	Y	NA	DSG3,DSG2	NA	NA	NA	NA	DSG3	6720	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	29665661	29665831	29665728	Y	NA	RNF138	NA	NA	NA	NA	RNF138	3987	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	32239709	32239834	32239782	Y	MAPRE2,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	315058	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	32436094	32436130	32436112	Y	DTNA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	118762	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	32906658	32906918	32906743	Y	NA	ZSCAN30,ZNF271,ZNF24,ZNF396	NA	NA	NA	NA	ZNF24	16528	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr18	34406593	34406898	34406790	Y	NA	KIAA1328,TPGS2	NA	NA	NA	NA	KIAA1328	171	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	34765473	34765582	34765528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	358315	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	35142004	35142267	35142202	Y	CELF4	CELF4	NA	NA	NA	NA	CELF4	1733	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	37101421	37101610	37101545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	187782	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	38229341	38229542	38229442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	1303629	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	42205298	42205485	42205392	Y	NA	NA	SLC14A2	IMR90	Hi-C	24141950	SETBP1	52653	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	44392877	44393138	44393020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST8SIA5	55657	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	44762149	44762167	44762157	Y	PIAS2	NA	NA	NA	NA	NA	IER3IP1	61404	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	45472001	45472124	45472045	Y	NA	SMAD2	SMAD2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SMAD2	16486	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	45534549	45534809	45534718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	79034	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	45688048	45688324	45688110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232533	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	46072108	46072320	46072224	Y	NA	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	8691	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	46465508	46465942	46465798	Y	SMAD7,SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	402091	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	46478230	46479206	46479122	Y	SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	414813	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr18	46502180	46502412	46502333	Y	SMAD7	NA	SMAD7,CTIF	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CTIF	438763	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr18	46518186	46518409	46518369	Y	NA	NA	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTIF	454769	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	46524155	46524830	46524741	Y	NA	NA	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTIF	460738	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	46547875	46548139	46548027	Y	NA	NA	SMAD7	MCF7	ChIA-PET	22265404	DYM	437578	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr18	47325286	47325511	47325399	Y	NA	ACAA2	NA	NA	NA	NA	ACAA2	12819	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	48274760	48275068	48274915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRO	74704	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	48301659	48301815	48301762	Y	NA	MRO	NA	NA	NA	NA	MRO	47957	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	4.0733463290902
chr18	49747981	49748377	49748370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEX3C	1005307	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	51736292	51736523	51736417	Y	NA	MBD2	NA	NA	NA	NA	MBD2	12635	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	51964164	51964175	51964170	Y	NA	NA	CCDC68	IMR90	Hi-C	24141950	POLI	170390	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	54487568	54487957	54487622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL1	170737	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	55382886	55383034	55382958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP8B1	85299	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	56499009	56499169	56499089	Y	NA	ZNF532	NA	NA	NA	NA	ZNF532	28663	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	57531424	57531809	57531587	Y	NA	PMAIP1	PMAIP1,CCBE1	IMR90	Hi-C	24141950	PMAIP1	33371	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	57566379	57566616	57566437	Y	NA	PMAIP1	NA	NA	NA	NA	PMAIP1	1199	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr18	60474704	60474908	60474800	Y	ZCCHC2,PHLPP1	NA	NA	NA	NA	NA	PHLPP1	94032	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	60901936	60902433	60902315	Y	VPS4B	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	82928	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	61085026	61085396	61085214	Y	VPS4B	VPS4B	NA	NA	NA	NA	VPS4B	2320	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	61852761	61853109	61852935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERPINB8	217602	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	65751741	65751802	65751772	Y	NA	NA	LOC643542,DSEL	IMR90	Hi-C	24141950	DSEL	569524	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	67625128	67625312	67625237	Y	CD226	NA	NA	NA	NA	NA	RTTN	245869	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	70535937	70536272	70536159	Y	NA	NETO1	NA	NA	NA	NA	NETO1	2556	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	71010965	71011298	71011132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NETO1	477584	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr18	72694471	72694659	72694499	Y	ZNF407	NA	NA	NA	NA	NA	TSHZ1	226051	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	74204839	74205357	74205296	Y	NA	RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	74205649	74206020	74205889	Y	NA	ZNF516,RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	172	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	74399023	74399139	74399084	Y	NA	NA	LOC284276,ZNF516	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF236	133424	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr18	74767591	74768136	74768025	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	235028	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	75149077	75149342	75149210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	616514	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	75177214	75177519	75177367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	644651	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	76574789	76574960	76574953	Y	SALL3	NA	NA	NA	NA	NA	SALL3	163315	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	76737711	76738510	76737981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SALL3	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	77016280	77016404	77016342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	137452	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	77153646	77154504	77153944	Y	ATP9B,NFATC1,NFATC1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr18	77713083	77713430	77713261	Y	NA	PQLC1,HSBP1L1	NA	NA	NA	NA	PQLC1	3419	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	289700	289869	289784	Y	C2CD4C,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	307	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr19	290136	290651	290316	Y	RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	743	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr19	383028	383243	383101	Y	NA	MIER2,C2CD4C	NA	NA	NA	NA	C2CD4C	23896	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	384369	384669	384409	Y	SHC2,C2CD4C,MIER2	MIER2,C2CD4C	NA	NA	NA	NA	C2CD4C	22470	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.05500974681765
chr19	417829	418007	417918	Y	NA	C2CD4C,SHC2	NA	NA	NA	NA	C2CD4C	10690	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	481673	481793	481759	Y	PALM,HCN2,FGF22	SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34	NA	NA	NA	NA	MADCAM1	5383	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	485856	486161	485966	Y	PALM,HCN2,FGF22,C2CD4C,SHC2	SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34	ODF3L2,SHC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MADCAM1	1015	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr19	573434	573573	573481	Y	ODF3L2,C19orf22,CDC34,BSG	CDC34,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	4137	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	782330	783005	782707	Y	NA	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	12070	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.29125731011324
chr19	1028160	1028923	1028240	Y	SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7	WDR18,CNN2,ABCA7	NA	NA	NA	NA	CNN2	3862	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	1262305	1262850	1262469	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	4921	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr19	1408607	1408695	1408655	Y	CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15,APC2	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3039	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	2059605	2060167	2060113	Y	REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	10362	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr19	2330710	2331138	2330903	Y	NA	SPPL2B,LSM7	NA	NA	NA	NA	LSM7	4091	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	2507206	2507458	2507335	Y	DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B	GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	33086	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	2543618	2543970	2543682	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	69498	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	3035530	3035851	3035686	Y	NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2	AES	NA	NA	NA	NA	AES	25254	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr19	3222791	3223093	3222942	Y	NA	NCLN,CELF5	NA	NA	NA	NA	CELF5	90	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	3520804	3521051	3520913	Y	NA	C19orf77,DOHH,FZR1,HMG20B	NA	NA	NA	NA	FZR1	16533	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr19	3683675	3684043	3683874	Y	NA	PIP5K1C,TJP3	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	14434	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	4008398	4008778	4008498	Y	MATK,ZFR2,ATCAY	DAPK3,SNORD37,EEF2,PIAS4	NA	NA	NA	NA	PIAS4	2754	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	4393849	4394251	4394129	Y	NA	SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	4293	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	4575288	4575908	4575613	Y	CCDC94,TICAM1,SEMA6B	PLIN5,LRG1	EBI3,CCDC94,ANKRD24,TNFAIP8L1,C19orf10	IMR90	Hi-C	24141950	LRG1	36802	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	4837640	4837813	4837751	Y	SEMA6B,TICAM1	FEM1A,PLIN3	NA	NA	NA	NA	PLIN3	27967	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	4870294	4870493	4870397	Y	SEMA6B,TICAM1	PLIN3,UHRF1	NA	NA	NA	NA	PLIN3	4514	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	5339517	5339797	5339748	Y	HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,PTPRS	PTPRS	NA	NA	NA	NA	PTPRS	703	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	5435162	5435432	5435167	Y	NA	NA	KDM4B,PTPRS	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPRS	96348	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	5536566	5536826	5536635	Y	NA	NA	PTPRS,ZNRF4,PLAC2	IMR90	Hi-C	24141950	SAFB	84220	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	5829202	5829624	5829506	Y	NA	DUS3L,FUT3	NA	NA	NA	NA	FUT3	19861	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	5968077	5968307	5968208	Y	NA	RANBP3	NA	NA	NA	NA	RANBP3	7846	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	6105811	6106211	6106011	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	91372	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	6108691	6108922	6108748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88661	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	6111447	6111675	6111584	Y	SAFB2,SAFB,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	85908	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	6423549	6423953	6423663	Y	NA	GTF2F1,KHSRP,CRB3,SLC25A23	NA	NA	NA	NA	KHSRP	744	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	6556475	6556744	6556665	Y	RFX2,TNFSF9,VAV1,EMR1,TNFSF14	TNFSF9,CD70	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	27465	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	6577471	6577956	6577654	Y	DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70	TNFSF9,CD70	NA	NA	NA	NA	CD70	24158	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	6738802	6739114	6738954	Y	NA	GPR108,TRIP10,SH2D3A	NA	NA	NA	NA	TRIP10	2866	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	6766042	6766297	6766158	Y	NA	GPR108,TRIP10,SH2D3A	NA	NA	NA	NA	SH2D3A	443	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr19	7547905	7548376	7548024	Y	STXBP2,CD209,PEX11G,MCOLN1	C19orf45,ZNF358,MCOLN1,PNPLA6	NA	NA	NA	NA	C19orf45	7486	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	7665007	7665263	7665135	Y	INSR,PNPLA6,FLJ22184,KIAA1543	CAMSAP3,XAB2,STXBP2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP3	6219	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	7723326	7723586	7723448	Y	PEX11G,MCOLN1,C19orf59,LOC100131801,STXBP2	XAB2,STXBP2,TRAPPC5	NA	NA	NA	NA	TRAPPC5	20143	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	8115456	8115774	8115631	Y	PRAM1,STXBP2,C19orf59	ELAVL1	NA	NA	NA	NA	CCL25	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	8488784	8489136	8488939	Y	PRAM1,MYO1F	RAB11B,MARCH2,HNRNPM	NA	NA	NA	NA	MARCH2	12630	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	8640627	8640983	8640707	Y	MARCH2,PRAM1,MYO1F	MYO1F	NA	NA	NA	NA	MYO1F	166	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	8674150	8674979	8674636	Y	ADAMTS10	MYO1F	NA	NA	NA	NA	MYO1F	33689	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	8676425	8676449	8676437	Y	NA	MYO1F	NA	NA	NA	NA	MYO1F	35964	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	9128934	9129115	9129008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF317	119941	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	9420483	9420931	9420837	Y	NA	ZNF559	NA	NA	NA	NA	ZNF559	11517	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	9748883	9749171	9749027	Y	OR7D4,OR7E24,ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF177,ZNF177,ZNF426,ZNF846,OLFM2,ZNF562	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF561	18808	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	9783821	9783976	9783959	Y	NA	ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	45	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	9896233	9896620	9896495	Y	ZNF266,COL5A3,ZNF846	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	39872	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	10513154	10513331	10513243	Y	ICAM1,DNM2,C19orf38,TYK2,PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	940	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	10713789	10714290	10714179	Y	ICAM1,ICAM3,TYK2,PDE4A,DNM2,C19orf38,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2	KRI1,AP1M2,SLC44A2,ILF3	NA	NA	NA	NA	SLC44A2	2656	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	10983653	10983862	10983766	Y	CARM1	TMED1,C19orf38,CARM1	NA	NA	NA	NA	CARM1	3464	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	10992105	10992492	10992295	Y	NA	TMED1,C19orf38,CARM1,YIPF2,C19orf52	NA	NA	NA	NA	CARM1	11916	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	11202963	11203178	11203054	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4925	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	11205696	11206011	11205901	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	7658	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	11375157	11375492	11375297	Y	DOCK6	DOCK6	TSPAN16	MCF7	ChIA-PET	22265404	DOCK6	4000	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	11404382	11404791	11404593	Y	ACP5,ACP5,C19orf38,LPPR2,CCDC159	DOCK6,CCDC159	NA	NA	NA	NA	DOCK6	33225	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	13143095	13143350	13143204	Y	WDR83,FBXW9,TNPO2,TNPO2	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	38673	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	13166882	13167358	13167036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRMT1	59023	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr19	13231642	13232105	13231971	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	4725	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr19	13266326	13267156	13266576	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	7097	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	13273540	13274187	13273840	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	14311	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	13274586	13275096	13274696	Y	GADD45GIP1,NACC1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	15357	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr19	13278382	13278991	13278445	Y	BEST2,JUNB,LYL1,STX10	STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	19153	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr19	13444695	13444933	13444906	Y	MAST1,CACNA1A	NA	NA	NA	NA	NA	IER2	185466	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	13944359	13944683	13944571	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15	ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	40085	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	13955108	13955589	13955298	Y	CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	50834	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	13957204	13959386	13957586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	52930	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	14084978	14085262	14085120	Y	NA	DCAF15,RFX1	NA	NA	NA	NA	DCAF15	23674	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	14089228	14089566	14089336	Y	CCDC130,PKN1,CD97,RFX1	DCAF15,RFX1	NA	NA	NA	NA	RFX1	26285	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	4.0733463290902
chr19	14473667	14474081	14473883	Y	ZNF333,EMR2,DCAF15,RFX1,PKN1,CD97	CD97	CD97,DDX39A	K562	ChIA-PET	22265404	CD97	15232	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	14474119	14474280	14474154	Y	ZNF333,RFX1,PKN1,CD97	CD97	CD97,DDX39A	K562	ChIA-PET	22265404	CD97	15033	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	14794264	14794471	14794429	Y	CD97,PKN1,EMR3,ZNF333	ZNF333	ZNF333,EMR3	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF333	4142	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	14869692	14869911	14869839	Y	NA	AC005255.3	NA	NA	NA	NA	AC005255.3	31210	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	14999338	14999543	14999395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005255.3	98217	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	15161016	15161340	15161178	Y	CASP14	NA	NA	NA	NA	NA	SYDE1	54874	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	15333627	15333747	15333631	Y	SYDE1,NOTCH3	NOTCH3,EPHX3	NA	NA	NA	NA	EPHX3	8499	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	17188668	17188879	17188834	Y	HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	4077	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	17200078	17200517	17200217	Y	MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	15487	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	17236053	17237400	17237360	Y	MED26,HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9B	51462	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr19	17246297	17246722	17246423	Y	SLC27A1,PGLS,OCEL1,MYO9B	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9B	61706	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	17890338	17890582	17890537	Y	FAM129C,MAST3,JAK3,FCHO1	FCHO1,B3GNT3	NA	NA	NA	NA	B3GNT3	13055	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	18064785	18064952	18064869	Y	NA	CCDC124,KCNN1,ARRDC2	NA	NA	NA	NA	KCNN1	4683	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	18133045	18133309	18133130	Y	FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2	ARRDC2	NA	NA	NA	NA	ARRDC2	23104	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	18315989	18316123	18316056	Y	NA	IFI30,MPV17L2,RAB3A	NA	NA	NA	NA	RAB3A	3105	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	18404099	18404539	18404373	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	13212	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr19	18405326	18405850	18405541	Y	JAK3,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	14439	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	18485152	18485556	18485412	Y	ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25	PGPEP1,GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	GDF15	1611	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	18497624	18497977	18497708	Y	PDE4C,GDF15	PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	GDF15	14083	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	18526337	18526644	18526408	Y	CCDC124,IFI30,KLHL26,CRLF1,C19orf60,C19orf50,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	1030	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	18527701	18528040	18527800	Y	KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	27	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	18528263	18528792	18528577	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	589	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	18760437	18760612	18760525	Y	NA	TMEM59L,CRLF1,KLHL26,CRTC1	NA	NA	NA	NA	KLHL26	14662	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	19143307	19143510	19143378	Y	DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6	ARMC6,SUGP2,SLC25A42	NA	NA	NA	NA	SUGP2	475	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr19	19572734	19572965	19572860	Y	MAU2,GATAD2A,GMIP	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	51580	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	20162886	20163252	20163139	Y	ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682	ZNF682,ZNF90,AC006539.2	ZNF682,LOC284440	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF682	14571	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	21882044	21882358	21882227	Y	ZNF676,ZNF208	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF100	66072	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	22715195	22715609	22715437	Y	NA	ZNF98	NA	NA	NA	NA	ZNF98	1908	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.56417803795393
chr19	22724616	22724856	22724736	Y	ZNF257,ZNF98,ZNF492	ZNF98	NA	NA	NA	NA	ZNF98	11329	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	23530488	23530791	23530760	Y	NA	ZNF91	NA	NA	NA	NA	ZNF91	45571	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	23971294	23971621	23971458	Y	NA	ZNF681,RPSAP58	NA	NA	NA	NA	RPSAP58	27487	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	24216985	24217321	24217111	Y	ZNF254	ZNF254	NA	NA	NA	NA	ZNF254	2709	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	27739791	27740195	27739990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1962253	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	28208615	28209033	28208726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1493415	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	28232001	28232276	28232191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1470172	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	28232492	28232748	28232631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1469700	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	29109267	29109431	29109349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	593017	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	30336581	30336824	30336781	Y	C19orf2,C19orf2	CCNE1	NA	NA	NA	NA	CCNE1	35776	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	31631644	31631911	31631778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSHZ3	206542	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	31841682	31842327	31842237	Y	NA	TSHZ3	NA	NA	NA	NA	TSHZ3	3229	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	34625713	34625998	34625854	Y	PDCD2L	LSM14A	CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	LSM14A	35411	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	34724001	34724111	34724046	Y	NA	KIAA0355	NA	NA	NA	NA	KIAA0355	19331	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	34850085	34850642	34850351	Y	ZNF599,ZNF302,ZNF181	GPI,PDCD2L	NA	NA	NA	NA	GPI	1700	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	35491833	35492367	35492256	Y	FFAR3,FFAR2,USF2,FXYD5,FXYD5,FXYD5,GRAMD1A	ZNF792,GRAMD1A,SCN1B,HPN	NA	NA	NA	NA	GRAMD1A	8145	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	35557782	35557965	35557875	Y	MAG,SCGBL,ZNF302,ZNF181,ZNF30,HPN,LGI4	SCN1B,HPN,FXYD3	NA	NA	NA	NA	HPN	28372	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	35636009	35636339	35636175	Y	NA	FXYD3,FXYD7,FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD7	3855	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	35643836	35643967	35643905	Y	FFAR3,USF2,MAG,HPN,LGI4	FXYD3,FXYD7,FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD5	203	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	35696373	35696472	35696417	Y	FFAR1,CD22,USF2	LSR	NA	NA	NA	NA	LSR	40761	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	36013245	36013546	36013396	Y	ARHGAP33	DMKN,TMEM147,AD000090.2	NA	NA	NA	NA	DMKN	10685	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	36274503	36274656	36274589	Y	GAPDHS,ETV2,WDR62,ARHGAP33	IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37,HSPB6,C19orf55,ARHGAP33	NA	NA	NA	NA	ARHGAP33	11069	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	36618643	36619171	36618835	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1,COX7A1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	9306	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	36648389	36648571	36648491	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1,COX7A1	NA	NA	NA	NA	COX7A1	6618	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr19	36720266	36720641	36720459	Y	ARHGAP33,APLP1,CLIP3,CLIP3,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF382,ZNF260,ZFP14,ZNF565,ZNF565	ZNF146,ZNF565	NA	NA	NA	NA	ZNF565	14518	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	37246589	37246720	37246657	Y	NA	ZNF850	NA	NA	NA	NA	ZNF850	15007	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	37830170	37830469	37830239	Y	NA	HKR1,ZNF527	ZNF527	IMR90	Hi-C	24141950	HKR1	28431	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	38433320	38433698	38433507	Y	ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1	SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	37452	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	39027859	39028261	39028090	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K1	79261	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	39148533	39148920	39148613	Y	C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4	MAP4K1,EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12244	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	39149253	39149575	39149354	Y	SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4	MAP4K1,EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12964	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	39150238	39150530	39150365	Y	NA	MAP4K1,EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	13949	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	39171828	39172087	39171896	Y	FAM98C,RASGRP4,RINL,NFKBIB,HNRNPL,MAP4K1	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	35539	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	39184148	39184440	39184342	Y	C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	47859	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	39283371	39283483	39283427	Y	NA	CAPN12,LGALS4,ECH1	NA	NA	NA	NA	LGALS4	18521	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	39411140	39411539	39411467	Y	LGALS7	RINL,NFKBIB,SIRT2,MRPS12,SARS2	NA	NA	NA	NA	MRPS12	7649	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	39621407	39621638	39621523	Y	NA	PAK4	NA	NA	NA	NA	PAK4	6997	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	39801345	39801461	39801375	Y	NA	GMFG,SAMD4B	NA	NA	NA	NA	GMFG	29551	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	40315090	40315548	40315357	Y	NA	DYRK1B,FBL	NA	NA	NA	NA	DYRK1B	7293	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr19	40939716	40940068	40940022	Y	SERTAD1	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	8544	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	40951707	40952008	40951966	Y	NA	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	3095	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	41109606	41110134	41110046	Y	SERTAD1,ITPKC,EGLN2,EGLN2,C19orf54,ADCK4,SHKBP1	SHKBP1	NA	NA	NA	NA	SHKBP1	28849	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	41152132	41152466	41152220	Y	NA	NUMBL	NA	NA	NA	NA	NUMBL	42411	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	41169097	41169273	41169245	Y	NA	NUMBL	NA	NA	NA	NA	NUMBL	25604	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr19	41267029	41267391	41267210	Y	NA	ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	MIA	8162	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	41304071	41304255	41304136	Y	SERTAD1,SERTAD3,SHKBP1,ADCK4,ADCK4,RAB4B,HNRNPUL1	SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	EGLN2	1170	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	41680959	41681276	41681150	Y	NA	RPL36P16,CYP2S1,AXL	CYP2A13,CYP2B7P1,HNRNPUL1,AXL,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	RPL36P16	7193	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	41681944	41682199	41682187	Y	NA	RPL36P16,CYP2S1,AXL	CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	RPL36P16	8178	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	14.0021280062476
chr19	41695552	41695583	41695568	Y	NA	RPL36P16,CYP2S1,AXL	NA	NA	NA	NA	CYP2S1	1371	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	41701582	41701929	41701850	Y	CYP2A13,CYP2F1	RPL36P16,CYP2S1,AXL	NA	NA	NA	NA	CYP2S1	4628	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	41702138	41702290	41702230	Y	ADCK4,ITPKC,TGFB1,CCDC97	RPL36P16,CYP2S1,AXL	NA	NA	NA	NA	CYP2S1	5184	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	41795419	41795640	41795447	Y	CYP2A13,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	18454	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	41831643	41832527	41831971	Y	CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA	NA	NA	NA	NA	CCDC97	17549	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	42027706	42027846	42027786	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83084	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83703	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	42033050	42033361	42033223	Y	NA	NA	LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	88428	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	42722677	42722859	42722787	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC	NA	NA	NA	NA	ZNF526	254	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13838	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	42964614	42965000	42964807	Y	CEACAM8,DEDD2	NA	CXCL17,LIPE,CEACAM1,CEACAM8	IMR90	Hi-C	24141950	CEACAM1	98386	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	44616064	44616441	44616271	Y	KCNN4,ZNF283,ZNF404,ZNF45,ZNF221,ZNF222,ZNF233,ZNF233,ZNF229,ZNF284	ZNF284,ZNF224,ZNF225,ZNF234	NA	NA	NA	NA	ZNF225	1730	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	44824668	44825027	44825022	Y	NA	ZNF235	NA	NA	NA	NA	ZNF235	17469	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	45095975	45096232	45096112	Y	CLASRP,BCL3	PVR	CEACAM16,TOMM40,PVR,MIR4531,IGSF23	IMR90	Hi-C	24141950	PVR	48866	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	45100230	45100376	45100298	Y	NA	PVR	CEACAM16,TOMM40,PVR,MIR4531,IGSF23	IMR90	Hi-C	24141950	PVR	44722	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.29125731011324
chr19	45189303	45189576	45189367	Y	RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3	PVR	NA	NA	NA	NA	PVR	44205	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	45248499	45249479	45248793	Y	NA	CBLC	NA	NA	NA	NA	BCL3	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	45256546	45257099	45256742	Y	ZNF296,RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3	BCL3,CBLC	NA	NA	NA	NA	BCL3	7584	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	45279679	45279961	45279836	Y	CEACAM19,CBLC,BCAM	BCL3,CBLC,BCAM	NA	NA	NA	NA	CBLC	553	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40,APOE	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	45905744	45905944	45905844	Y	EML2,KLC3,PPP1R13L,ERCC1,ERCC1	ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	CD3EAP	1523	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	45999277	45999601	45999579	Y	NOVA2,DMPK,RTN2,RTN2	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	RTN2	958	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	46012498	46012899	46012640	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	4661	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	46386037	46386278	46386146	Y	OPA3,GIPR,FBXO46,SYMPK,FOXA3	SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	IRF2BP1	1098	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	46907328	46907649	46907570	Y	NA	CCDC8	NA	NA	NA	NA	CCDC8	7192	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr19	47142195	47142976	47142503	Y	NA	CALM3	NA	NA	NA	NA	CALM3	39864	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr19	47487878	47488175	47487946	Y	ZC3H4,DHX34,CCDC9,C5AR1	NPAS1	NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	NPAS1	32902	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	47552678	47552827	47552750	Y	NA	NPAS1,TMEM160	NA	NA	NA	NA	TMEM160	2790	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	47613231	47613789	47613256	Y	PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	742	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	47746329	47746738	47746506	Y	SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24	MIR3191,BBC3,CCDC9	NA	NA	NA	NA	CCDC9	10499	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	47926520	47926706	47926665	Y	NA	MEIS3,SLC8A2	NA	NA	NA	NA	MEIS3	5740	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	47950200	47950556	47950503	Y	SLC8A2	MEIS3,SLC8A2,KPTN	NA	NA	NA	NA	SLC8A2	22869	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	48293591	48293754	48293716	Y	CABP5,CRX	GLTSCR2,SEPW1,RPL23AP80	NA	NA	NA	NA	RPL23AP80	2393	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	48903450	48903602	48903513	Y	NA	TMEM143,SYNGR4,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10640	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	48996099	48996379	48996219	Y	NA	GRWD1,CYTH2	NA	NA	NA	NA	CYTH2	25810	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	49051864	49052159	49052158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPHK2	68389	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	49151515	49151640	49151575	Y	NA	SPHK2,RPL18,DBP,FUT2	NA	NA	NA	NA	DBP	12820	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	49466802	49467527	49467169	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	244	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	49495555	49495708	49495609	Y	SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2,CGB5	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	850	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	49924099	49924476	49924276	Y	TBC1D17,RRAS,RCN3,PRR12,NOSIP,AP2A1	SLC17A7,ALDH16A1,PIH1D1	NA	NA	NA	NA	SLC17A7	19141	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	50276330	50276635	50276461	Y	VRK3,BCL2L12,AP2A1,MED25	AP2A1,FUZ,MED25	NA	NA	NA	NA	AP2A1	8105	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	50414628	50414884	50414779	Y	RPS11,FCGRT,NR1H2,IL4I1,NUP62,NUP62,NUP62,NUP62,IL4I1,ATF5	PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751	NA	NA	NA	NA	ATF5	15075	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	50417620	50417965	50417778	Y	NA	PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751	NA	NA	NA	NA	ATF5	11994	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	50670716	50671002	50670859	Y	NA	IZUMO2,MYH14	NA	NA	NA	NA	IZUMO2	6264	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	50833837	50834367	50834143	Y	MYH14,GPR32,SYT3,SYT3,SHANK1,LRRC4B,ASPDH,KCNC3	NR1H2,KCNC3	NA	NA	NA	NA	KCNC3	405	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	50872495	50872846	50872654	Y	NA	NR1H2,KCNC3,POLD1,SPIB	NA	NA	NA	NA	POLD1	12615	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr19	50993680	50994951	50994565	Y	NA	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	FAM71E1	15670	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr19	51111018	51111676	51111369	Y	NA	LRRC4B,C19orf81	NA	NA	NA	NA	C19orf81	39026	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	51774338	51774710	51774481	Y	NA	IGLON5	NA	NA	NA	NA	IGLON5	38392	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	51796169	51796569	51796297	Y	NA	IGLON5	CD33,IGLON5	IMR90	Hi-C	24141950	IGLON5	16533	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr19	51797467	51797679	51797598	Y	NA	IGLON5	CD33,IGLON5	IMR90	Hi-C	24141950	IGLON5	15423	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	119534	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	52229316	52229816	52229631	Y	HAS1	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	156765	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	52586676	52587051	52586863	Y	NA	ZNF432,ZNF841	NA	NA	NA	NA	ZNF432	9940	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	52674093	52674226	52674127	Y	ZNF836	ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	ZNF836	1197	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	52996616	52996734	52996658	Y	NA	ZNF578,ZNF808	NA	NA	NA	NA	ZNF808	32171	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	53129559	53129725	53129643	Y	ZNF160,ZNF616,ZNF766,ZNF808,ZNF701,ZNF611,ZNF611,ZNF83	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF83	62024	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	53150651	53150972	53150733	Y	NA	ZNF83	ZNF137P	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF83	40777	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr19	53592651	53593387	53593361	Y	NA	ERVV-2,ZNF160,ZNF415	NA	NA	NA	NA	ZNF160	11302	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	53635063	53635358	53635174	Y	ZNF160,ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF347,ZNF347	ZNF160,ZNF415,ZNF347	NA	NA	NA	NA	ZNF415	733	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	54098247	54098689	54098487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR526B	96958	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	54286017	54286259	54286128	Y	ZNF765,ZNF761,ZNF813	AC008753.3,MIR371A,NLRP12	NA	NA	NA	NA	MIR371A	2670	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr19	54288550	54288757	54288603	Y	ZNF765,ZNF813,ZNF331,DPRX	AC008753.3,MIR371A,NLRP12	NA	NA	NA	NA	MIR371A	172	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	54291781	54292027	54291904	Y	ZNF331,DPRX,NLRP12	AC008753.3,MIR371A,NLRP12	NA	NA	NA	NA	MIR371A	2852	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	54355100	54355465	54355199	Y	VSTM1,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,ZNF331,ZNF331,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM	NLRP12,MYADM	CACNG8,CACNG6,VSTM1,NDUFA3,OSCAR,TFPT,PRPF31,TMC4,MBOAT7,LILRB5,LILRA6,LILRA4,LILRB1,PRKCG,CACNG7	HELA,K562,H1ESC,IMR90	5C,Hi-C	22955621,24141950	MYADM	12012	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	54373735	54373974	54373935	Y	VSTM1,TFPT,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,CNOT3,ZNF765,ZNF761,ZNF813,NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM	NLRP12,MYADM,CACNG7	NA	NA	NA	NA	MYADM	6258	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	54465243	54465494	54465291	Y	TFPT,PRPF31,NDUFA3,MYADM,CACNG7,CACNG8	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG7	54654	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	55540419	55540558	55540460	Y	SHISA7,KIR2DL3,NCR1	RDH13,EPS8L1	NA	NA	NA	NA	RDH13	40101	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	55626810	55627228	55626935	Y	ZNF865,PPP1R12C	RDH13,EPS8L1,TNNT1	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	55880979	55881171	55881094	Y	ZNF579,NAT14,COX6B2,IL11	SUV420H2,IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	IL11	1148	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr19	55976006	55976393	55976362	Y	NA	ISOC2,ZNF628,NAT14	NA	NA	NA	NA	ISOC2	4296	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	55983917	55984059	55984005	Y	RDH13,HSPBP1,ISOC2	ISOC2,ZNF628,NAT14	ZNF628,ISOC2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF628	1640	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr19	55985101	55985287	55985184	Y	ISOC2,SSC5D	ISOC2,ZNF628,NAT14	NA	NA	NA	NA	ZNF628	412	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	56060798	56061018	56060898	Y	NA	SBK2,ZNF579	SGK110	K562	ChIA-PET	22265404	SBK2	14342	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	56061327	56061704	56061673	Y	NA	SBK2,ZNF579,FIZ1	SGK110	K562	ChIA-PET	22265404	SBK2	14871	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr19	56117286	56117783	56117722	Y	NA	ZNF579,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	5950	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	56621885	56622165	56622061	Y	NA	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	8484	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	56674605	56674737	56674681	Y	NA	ZNF787,ZNF444	GALP	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF444	32637	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	56789143	56789486	56789342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF542	87982	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	56807694	56808027	56807709	Y	NLRP13,ZSCAN5A	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF542	69441	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	56823857	56823998	56823922	Y	ZSCAN5A	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF542	53470	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	57944833	57945004	57944919	Y	NA	ZNF548,ZNF17,ZNF749,ZNF772	NA	NA	NA	NA	ZNF749	136	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	58218479	58218613	58218485	Y	ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,VN1R1,ZNF772,ZNF419,ZNF773,ZNF549,ZNF416,ZIK1,ZNF134,ZSCAN4,ZNF551,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF814,ZNF606,ZNF418,ZNF256,ZNF135,LOC100293516,ZNF671,ZNF586,ZNF154	ZNF551,ZNF671,ZNF776	NA	NA	NA	NA	ZNF154	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	58237757	58238155	58237774	Y	NA	ZNF551,ZNF154,ZNF671,ZNF776,ZNF586	ZNF154	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF671	765	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	58315114	58315751	58315446	Y	ZNF543,ZNF549,ZNF418,ZNF135,ZNF154,ZNF552	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	8530	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	58317986	58318160	58318072	Y	NA	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	6121	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	58398826	58399093	58399050	Y	ZNF548,ZNF772,ZNF549,ZNF134,ZSCAN4,ZNF154,ZNF671,ZNF776,ZSCAN1,ZNF606,ZNF329,ZNF256,ZNF135,ZNF418	ZNF587,ZNF814,ZNF417,ZNF418	NA	NA	NA	NA	ZNF814	384	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	58501905	58502197	58501915	Y	ZNF8,ZNF132,ZNF773,ZNF549,ZNF550,ZNF416,ZIK1,ZNF134,ZSCAN4,ZNF154,ZNF671,ZNF776,ZNF814,ZNF417,ZNF418,ZSCAN18,ZNF329,ZNF256,ZSCAN1,ZNF606,ZNF135	ZNF256,CTD-2368P22.1,ZNF606,ZSCAN1	NA	NA	NA	NA	CTD-2368P22.1	9232	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	58532436	58532530	58532517	Y	NA	CTD-2368P22.1,ZNF606,ZSCAN1,ZNF135	NA	NA	NA	NA	ZSCAN1	10870	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	58715620	58715769	58715675	Y	LOC100293516,C19orf18	ZNF274,ZNF544	NA	NA	NA	NA	ZNF544	22191	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr19	59049687	59049971	59049795	Y	ZNF135,ZSCAN18,ZNF544,ZNF8,ZNF497,ZNF324B,ZNF324,UBE2M,TRIM28	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	ZBTB45	1409	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr19	59050036	59050316	59050176	Y	ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,ZNF132,ZNF324B,ZNF324,TRIM28,MZF1	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	ZBTB45	1758	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr19	59058033	59058475	59058195	Y	NA	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	TRIM28	4575	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	393939	394227	394175	Y	SH3YL1	NA	NA	NA	NA	NA	SH3YL1	129541	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	1115244	1115256	1115249	Y	SNTG2	NA	NA	NA	NA	NA	SNTG2	170690	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	2617084	2617480	2617333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	762173	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	3072634	3072961	3072804	Y	NA	NA	TSSC1	IMR90	Hi-C	24141950	TSSC1	306692	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr2	3106532	3106816	3106764	Y	NA	NA	MYT1L	IMR90	Hi-C	24141950	TSSC1	272837	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	11.4562865505662
chr2	3340825	3341028	3341010	Y	NA	TSSC1,TRAPPC12	NA	NA	NA	NA	TSSC1	38625	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	3483837	3484086	3483869	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	37421	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	3487019	3487372	3487201	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	34135	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.80042560124951
chr2	8317818	8317907	8317869	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ID2	499068	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	8452467	8452563	8452533	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ID2	364412	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	8532216	8532386	8532312	Y	NA	NA	LOC100506274,LOC339788	IMR90	Hi-C	24141950	ID2	284589	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	8799689	8799929	8799811	Y	ID2	ID2,AC011747.7	LOC339788,LINC00299,ID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID2	17046	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	9142736	9142998	9142867	Y	NA	MBOAT2	NA	NA	NA	NA	MBOAT2	794	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	9678248	9678641	9678477	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	15280	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	11270081	11270242	11270156	Y	KCNF1,C2orf50	PQLC3	NA	NA	NA	NA	PQLC3	23082	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	11970305	11970612	11970555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPIN1	154584	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	15629690	15629929	15629800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	69525	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	15783989	15784378	15784047	Y	NBAS,MYCN,DDX1	NA	NA	NA	NA	NA	DDX1	54687	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	15949825	15950073	15949883	Y	NBAS	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-120J4.1	57990	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr2	16028788	16029111	16029019	Y	NBAS,DDX1	RP11-120J4.1,MYCN	NA	NA	NA	NA	RP11-120J4.1	20725	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	16243100	16243429	16243303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCNOS	162729	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr2	16549594	16549787	16549691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49A	295812	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	18362137	18362494	18362316	Y	MSGN1	NA	KCNS3,MSGN1	IMR90	Hi-C	24141950	KCNS3	305023	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	19464609	19464927	19464768	Y	NA	NA	NT5C1B-RDH14	IMR90	Hi-C	24141950	OSR1	91487	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	20176136	20176469	20176303	Y	WDR35	WDR35,MATN3	NA	NA	NA	NA	WDR35	11423	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	20249984	20250622	20250147	Y	TTC32,PUM2	MATN3,LAPTM4A	NA	NA	NA	NA	LAPTM4A	195	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	20431248	20431615	20431535	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	8054	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	20491517	20491908	20491876	Y	NA	NA	SDC1	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	58087	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	20784084	20784557	20784460	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	64292	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	23681941	23682000	23681953	Y	KLHL29	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	75853	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	24238466	24238799	24238602	Y	NA	C2orf44,FKBP1B	NA	NA	NA	NA	C2orf44	31646	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	25438901	25439135	25438983	Y	PTRHD1,ADCY3	POMC	NA	NA	NA	NA	POMC	49129	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	25482494	25482888	25482692	Y	DNMT3A	NA	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	80571	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr2	25781272	25781487	25781393	Y	RAB10	NA	NA	NA	NA	NA	DTNB	113016	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	26231667	26232185	26231781	Y	RAB10	KIF3C,UQCRHP2,RAB10	FAM59B,KIF3C,RAB10,ASXL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UQCRHP2	16004	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	26258152	26258567	26258448	Y	RAB10	UQCRHP2,RAB10	NA	NA	NA	NA	RAB10	3176	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	26352135	26352230	26352183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB10	97159	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	26980806	26981182	26980970	Y	C2orf18	CENPA	OTOF,CENPA,C2orf70,CIB4,KCNK3,DPYSL5,MAPRE3,C2orf18	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CENPA	3975	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	27304052	27304486	27304234	Y	CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1	AGBL5,OST4,EMILIN1,KHK,CGREF1,ABHD1	NA	NA	NA	NA	KHK	3129	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	27877424	27877712	27877568	Y	NA	GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L	NA	NA	NA	NA	SLC4A1AP	6626	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	27878874	27879165	27879028	Y	SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP	GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L	NA	NA	NA	NA	SLC4A1AP	5173	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	28024813	28024890	28024852	Y	IFT172,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L,MRPL33	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	32229	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	28400759	28401210	28400868	Y	RBKS,BRE,BRE,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	212105	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr2	28496743	28497020	28496828	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	116295	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	28497824	28498240	28497982	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	115075	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	29173330	29173730	29173529	Y	PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43	SNORD53	NA	NA	NA	NA	SNORD53	25397	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	30440662	30440911	30440739	Y	NA	LBH	LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	LBH	11486	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	36665586	36666219	36665918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	84517	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	36688353	36688868	36688635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	107284	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	36790527	36791707	36791646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79523	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	36795570	36795942	36795825	Y	FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	75288	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	36980864	36981389	36981193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	109634	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr2	37043619	37043714	37043667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	147901	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	37763005	37763322	37763129	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	QPCT	193288	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	37881606	37881960	37881783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	81651	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	38762228	38762367	38762309	Y	NA	NA	ATL2,HNRPLL,GALM,SRSF7,DHX57	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPLP0P6	55308	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	42329971	42330163	42329978	Y	NA	NA	EML4	IMR90	Hi-C	24141950	PKDCC	56811	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	42333001	42333603	42333353	Y	EML4	NA	EML4,LOC388942	IMR90	Hi-C	24141950	PKDCC	59841	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	42360195	42360705	42360352	Y	EML4	EML4	EML4,COX7A2L,LOC388942	IMR90	Hi-C	24141950	EML4	33785	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	42412542	42412681	42412587	Y	NA	EML4	NA	NA	NA	NA	EML4	18052	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	42696554	42696964	42696742	Y	NA	COX7A2L,KCNG3,MTA3	NA	NA	NA	NA	KCNG3	22273	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	42783314	42783348	42783329	Y	NA	AC025750.7	MTA3	IMR90	Hi-C	24141950	AC025750.7	24732	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	43037224	43037999	43037611	Y	NA	HAAO	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HAAO	19491	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	43038629	43038924	43038876	Y	NA	HAAO	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO,PLEKHH2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HAAO	20896	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	43186488	43186945	43186694	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HAAO	168755	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	43269026	43269323	43269208	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	182425	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	43405877	43406433	43406206	Y	OXER1	ZFP36L2	ZFP36L2,THADA,LOC100129726	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	45315	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	43421229	43421631	43421263	Y	HAAO,THADA,THADA	ZFP36L2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	30117	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	44849210	44849529	44849370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMKMT	262121	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	45030101	45030473	45030141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	133865	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	45160746	45160936	45160765	Y	SIX3	RP11-89K21.1	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	3402	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	45161073	45161475	45161220	Y	SIX3	RP11-89K21.1	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	2863	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	45164818	45165169	45165126	Y	NA	RP11-89K21.1	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	480	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	47296749	47297008	47296937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2	104732	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	47499706	47499760	47499719	Y	C2orf61	NA	TTC7A,CALM2,SOCS5,MCFD2,C2orf61	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC073283.4	70453	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	47796567	47796699	47796698	Y	NA	KCNK12	NA	NA	NA	NA	KCNK12	489	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	47926766	47926950	47926857	Y	NA	AC079250.1,MSH6	KCNK12	IMR90	Hi-C	24141950	MSH6	6097	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	48709527	48709805	48709665	Y	FOXN2,KLRAQ1	PPP1R21,STON1	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	43790	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	50455904	50456240	50456115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHCGR	1475024	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	51010628	51010803	51010737	Y	NRXN1,NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	LHCGR	2029748	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	53966054	53966447	53966241	Y	PSME4	CHAC2,ERLEC1	NA	NA	NA	NA	CHAC2	26482	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	54643124	54643489	54643323	Y	NA	SPTBN1	ACYP2,C2orf73,SPTBN1	IMR90	Hi-C	24141950	SPTBN1	37933	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	54786900	54787386	54787056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	105478	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr2	55193261	55193511	55193360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	144246	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr2	55450545	55450658	55450592	Y	CCDC88A,EML6,RTN4	RPS27A,MTIF2	NA	NA	NA	NA	RPS27A	6381	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	56192985	56193413	56193175	Y	NA	EFEMP1	NA	NA	NA	NA	EFEMP1	43711	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	56344982	56345239	56345001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC85A	64019	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr2	58266393	58266527	58266430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	133607	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	58336722	58337105	58336916	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	129402	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	58726353	58726421	58726382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01122	73419	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	60694839	60695290	60695042	Y	PAPOLG,BCL11A	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11A	83412	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	60696747	60696946	60696847	Y	REL	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11A	81756	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	60757464	60757761	60757646	Y	NA	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	20941	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	60760023	60760353	60760231	Y	NA	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	18349	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	61586795	61586939	61586907	Y	AHSA2,USP34	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	108965	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	61652482	61652591	61652506	Y	AHSA2,USP34	USP34	NA	NA	NA	NA	USP34	43313	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	61748471	61748954	61748828	Y	NA	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	14807	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	61757728	61758222	61758112	Y	NA	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	5539	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	61766465	61766637	61766569	Y	AHSA2,USP34	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	2704	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	61921641	61922071	61921953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM161A	157207	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	61935190	61935438	61935314	Y	NA	NA	USP34,XPO1,FAM161A	IMR90	Hi-C	24141950	FAM161A	143840	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	61990946	61991094	61991044	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	88184	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr2	62422210	62422461	62422453	Y	NA	B3GNT2	NA	NA	NA	NA	B3GNT2	962	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	63840549	63840673	63840604	Y	NA	MDH1	NA	NA	NA	NA	MDH1	26806	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	64618667	64618950	64618804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGALSL	60153	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	65065938	65066285	65066136	Y	AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	89799	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	65609993	65610402	65610168	Y	NA	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	47369	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	65656801	65657217	65657146	Y	NA	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	554	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr2	66387873	66388127	66388063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS1	270457	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	66673073	66673647	66673570	Y	NA	MEIS1,MEIS1-AS3	NA	NA	NA	NA	MEIS1-AS3	14471	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	66801899	66802241	66801940	Y	MEIS1	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS1-AS3	143297	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr2	67883850	67884178	67884174	Y	NA	NA	MEIS1	IMR90	Hi-C	24141950	ETAA1	261399	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	69533941	69534050	69534019	Y	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	NA	GFPT1	78332	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	69536922	69537085	69537004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFPT1	75297	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	69851897	69852398	69852223	Y	NA	ANXA4,AAK1	NA	NA	NA	NA	ANXA4	17159	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	69997386	69997753	69997552	Y	PCBP1,MXD1	NA	NA	NA	NA	NA	GMCL1	57021	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	70057532	70057914	70057667	Y	C2orf42,AAK1,GMCL1	GMCL1	NA	NA	NA	NA	GMCL1	2758	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	70335985	70336314	70336204	Y	AAK1,C2orf42,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	8302	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr2	70346022	70346119	70346054	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	18339	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	70363059	70363462	70363144	Y	MXD1,C2orf42,PCBP1	PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	35376	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	70847317	70847463	70847388	Y	FIGLA,ADD2,ADD2	NA	NA	NA	NA	NA	TGFA	67992	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	71078987	71079152	71079069	Y	FIGLA,CD207	VAX2	ATP6V1B1,CLEC4F,ADD2,VAX2	IMR90	Hi-C	24141950	VAX2	46568	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	71681748	71682153	71682029	Y	NA	DYSF	NA	NA	NA	NA	DYSF	2896	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	72804113	72804334	72804239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	246836	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	73613683	73613856	73613817	Y	DUSP11,ALMS1	ALMS1	NA	NA	NA	NA	ALMS1	2797	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	75894065	75894458	75894192	Y	NA	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	22156	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	77343577	77343605	77343592	Y	LRRTM4	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	669903	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	78055629	78055831	78055731	Y	NA	AC105399.2	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	42121	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	78401270	78401306	78401289	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	387762	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	78478830	78479153	78479031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	465322	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr2	78631329	78631672	78631604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	617821	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	78632836	78632912	78632895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	619328	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	79168770	79169144	79168957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNNA2	241213	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	81107061	81107275	81107187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	718800	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr2	85057054	85057454	85057405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSB10	73295	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	85066726	85066734	85066730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSB10	64015	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	85154234	85154422	85154323	Y	NA	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	23485	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	85186958	85187334	85187145	Y	NA	KCMF1	TMSB10,KCMF1	IMR90	Hi-C	24141950	KCMF1	8882	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	85267777	85267839	85267811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM3P3	59978	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	85362106	85362578	85362371	Y	NA	LSM3P3,TCF7L1	NA	NA	NA	NA	TCF7L1	3573	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr2	85664544	85665596	85664830	Y	KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6	CAPG	NA	NA	NA	NA	CAPG	20989	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	85764802	85765239	85764815	Y	SH2D6,USP39	MAT2A,GGCX,VAMP8	NA	NA	NA	NA	MAT2A	514	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	85993562	85993638	85993601	Y	NA	RNU1-38P,ATOH8	NA	NA	NA	NA	ATOH8	17095	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	86284876	86285205	86285126	Y	NA	POLR1A,PTCD3	NA	NA	NA	NA	POLR1A	46073	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	86722974	86723324	86723287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM3A	57204	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr2	88959127	88959352	88959240	Y	NA	EIF2AK3,RPIA	EIF2AK3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPIA	29810	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	97012594	97012961	97012778	Y	ASTL	SNRNP200,NCAPH	NA	NA	NA	NA	NCAPH	13069	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	97151625	97152085	97151839	Y	ASTL,DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,ARID5A	ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	48395	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	97204407	97205263	97204568	Y	NA	ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	3927	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	97291626	97292008	97291852	Y	NA	FER1L5,KANSL3	NA	NA	NA	NA	FER1L5	14466	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr2	97522669	97523105	97522935	Y	NA	CNNM3,ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	ANKRD39	837	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	98750707	98751016	98750841	Y	TMEM131	VWA3B	NA	NA	NA	NA	VWA3B	49128	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWA3B	121353	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	99125275	99125485	99125370	Y	INPP4A	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4A	65958	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	100654601	100654935	100654768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	377183	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	101566889	101567103	101566996	Y	NA	RPL31	NA	NA	NA	NA	RPL31	49074	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	101790359	101790618	101790446	Y	RNF149	NA	TBC1D8,RPL31	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D8	76710	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	101923239	101923757	101923472	Y	RPL31,MAP4K4,MAP4K4,RNF149	SNORD89,RNF149	NA	NA	NA	NA	RNF149	76	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	102649919	102650192	102650054	Y	IL1RL2,IL1R1,IL18RAP,IL18R1,MAP4K4,MAP4K4,IL1R2	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	338607	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	102867550	102867715	102867627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSD9	483632	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	104583969	104584295	104584132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC018880.2	345881	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	105275028	105275190	105275110	Y	NA	NA	LOC100506421	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS9	377251	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	105477972	105479094	105478260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS9	173347	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	105655685	105655967	105655739	Y	NA	MRPS9	NA	NA	NA	NA	MRPS9	3244	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	106008939	106009297	106009286	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	43673	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	106374121	106374298	106374210	Y	C2orf49,NCK2	NCK2	NA	NA	NA	NA	NCK2	14767	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	106551669	106551989	106551685	Y	NCK2	NA	C2orf40	IMR90	Hi-C	24141950	NCK2	192315	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	106809174	106809856	106809272	Y	UXS1	UXS1	NA	NA	NA	NA	UXS1	379	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr2	109209973	109210484	109210252	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	61116	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	111446206	111446411	111446291	Y	NA	BUB1,ACOXL	ACOXL	IMR90	Hi-C	24141950	BUB1	12515	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	111446465	111446692	111446609	Y	NPHP1	BUB1,ACOXL	ACOXL	IMR90	Hi-C	24141950	BUB1	12774	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	111829364	111829577	111829485	Y	NA	BCL2L11	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	45378	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	112417011	112417329	112417184	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90	Hi-C	24141950	ANAPC1	222938	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	112459778	112460151	112459873	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	180116	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	112768370	112768716	112768510	Y	MERTK	TMEM87B	NA	NA	NA	NA	TMEM87B	42084	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	113380153	113380493	113380323	Y	IL1A	CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	AC079922.2	2409	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	113576216	113576532	113576373	Y	IL36G,PSD4,IL1RN,IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	NA	CKAP2L	55962	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	113657771	113658101	113657937	Y	NA	NA	CKAP2L,IL1A,IL37,IL1B	IMR90	Hi-C	24141950	CKAP2L	137517	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	113871504	113872065	113871701	Y	IL1A,IL1B,IL36G,CBWD2,IL36B,IL1RN	NA	NA	NA	NA	NA	CKAP2L	351250	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	114082449	114082815	114082523	Y	NA	NA	PAX8,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	WASH2P	256849	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr2	114126317	114126521	114126419	Y	IL1F10,IL1F10	NA	PAX8,LOC654433,IL1RN,PSD4	IMR90	Hi-C	24141950	WASH2P	213143	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	114132430	114132930	114132660	Y	IL36G,IL36B,IL36RN,IL1RN,CBWD2	NA	PAX8,IL1RN,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	WASH2P	206734	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	114469366	114469830	114469722	Y	SLC35F5	SLC35F5	NA	NA	NA	NA	SLC35F5	42570	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	114615220	114615283	114615253	Y	CBWD2,ACTR3	ACTR3	ACTR3,SLC35F5	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTR3	30254	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	115177421	115177704	115177562	Y	NA	DPP10	NA	NA	NA	NA	DPP10	20172	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	115420103	115420171	115420136	Y	DPP10,DPP10,DPP10,DPP10	NA	NA	NA	NA	NA	DPP10	222227	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	115524775	115524984	115524851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPP10	326899	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	115925055	115925428	115925242	Y	NA	DPP10-AS1	NA	NA	NA	NA	DPP10-AS1	8135	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	116360896	116361163	116361028	Y	DPP10,DPP10	NA	NA	NA	NA	NA	DPP10-AS1	443976	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	116515030	116515203	116515120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPP10-AS1	598110	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	118309015	118309417	118309218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX18	260809	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr2	118722673	118722961	118722817	Y	NA	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	46748	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	119067655	119067950	119067737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSIG2	223627	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr2	119068196	119068550	119068541	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSIG2	224168	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr2	119076927	119077186	119077054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSIG2	232899	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	119266788	119266978	119266883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSIG2	422760	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	120039875	120040023	120039961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STEAP3	60491	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	120192847	120193082	120192954	Y	TMEM37	TMEM37	NA	NA	NA	NA	TMEM37	7370	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	121200367	121200763	121200697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INHBB	98648	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	121495919	121496279	121496111	Y	NA	GLI2	GLI2	IMR90	Hi-C	24141950	GLI2	4720	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	121614859	121615272	121615044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	123660	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	122132591	122132855	122132729	Y	CLASP1	NA	NA	NA	NA	NA	TFCP2L1	91808	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	122905373	122905708	122905509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSN	412694	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	122924584	122924818	122924701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSN	431905	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	128090505	128090721	128090714	Y	NA	ERCC3	NA	NA	NA	NA	ERCC3	40753	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	128173465	128174362	128173731	Y	SFT2D3,AMMECR1L,MAP3K2,PROC	MAP3K2	NA	NA	NA	NA	MAP3K2	29424	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	128258405	128258697	128258648	Y	NA	RNU4-48P,IWS1	NA	NA	NA	NA	IWS1	23765	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr2	128469057	128469300	128469179	Y	NA	SFT2D3	NA	NA	NA	NA	SFT2D3	12460	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	128562322	128562673	128562571	Y	NA	WDR33	LIMS2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR33	4088	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	128617356	128617514	128617464	Y	NA	POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	3625	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr2	129074706	129075071	129074888	Y	NA	HS6ST1	NA	NA	NA	NA	HS6ST1	555	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	131149333	131149678	131149410	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37753	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	131828545	131828813	131828794	Y	NA	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	FAM168B	20220	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr2	131863489	131864378	131863990	Y	PLEKHB2	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	PLEKHB2	3069	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	132182653	132182963	132182773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MZT2A	65353	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	132511121	132511398	132511143	Y	TUBA3D	NA	NA	NA	NA	NA	AC093838.4	262735	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	133025188	133025675	133025588	Y	NA	NA	GPR39,ANKRD30BL,CEP68,STAMBP,NRXN1,KCNIP3,ADCY3,EML4,DDX1,MIR4778,STARD7,TGOLN2,MAP3K2,RNU4ATAC,GCC2,CNNM3,LHCGR,LOC100189589,CLASP1,GMCL1,SULT6B1,ANKRD20A8P,MRPS9,NMS,RHOQ,CAPG,DGUOK,SMYD5,MPHOSPH10,ARID5A,HAAO,RMND5A,LOC440905,LIMS2,FOXN2,GPAT2,CIB4,LOC100216479,FEZ2,LOC729121,TTC7A,RTKN,CDKL4,POLR2D,LOC339803,EMILIN1,LYG1,MYCNOS,STEAP3,FAM49A,CKAP2L,EFR3B,OTOF,HK2,CNGA3,GEMIN6,ALK,SPR,LOC440895,IL18RAP,LOC375190,PTRHD1,C2orf81,MATN3,PEX13,FABP1,NPHP1,FAM161A,DDX18,ADRA2B,KRCC1,BIRC6,CCDC74B,C2orf49,THNSL2,ST3GAL5,NAT8B,ERCC3,CCDC88A,QPCT,LOC100506123,TLX2,REG1A,LOC284950,CHCHD5,SMC6,LOC254128,PNPT1,DBI,LOC100505716,LOC285103,TMSB10,RAD51AP2,MGAT4A,PLEKHH2,ELMOD3,PKDCC,GALM,GLI2,LIMS3-LOC440895,RPL31,ASXL2,LOC100132215,SMEK2,FBLN7,EPT1,SRSF7,DUSP2,CYP4F30P,LOC100131320,LOC388948,ATOH8,GCFC2,ACTR2,C2orf27B,IWS1,GPR17,MTIF2,LBX2,POU3F3,SUPT7L,SPDYA,TEKT4,ANKRD39,WDR54,RAB1A,IL36A,FAM123C,LOC285000,REV1,GPR148,MRPL33,EPB41L5,RPS27A,CEBPZ,EHBP1,RALB,APOB,DUSP11,LOC400958,CRIPT,CYP1B1-AS1,CHAC2,GFPT1,NPAS2,PTCD3,LOC389023,TRIM54,SFXN5,MALL,NT5C1B-RDH14,LOC100507334,POLE4,C2orf18,IL1A,C2orf73,CD8A,ATL2,LOC654342,UNC50,ITPRIPL1,HADHB,IL1R1,ZFP36L2,MAP4K3,FIGLA,LOC440900,ZNF512,POTEE,PDCL3,ABCG8,CCDC142,MYADML,MIR4783,PCBP1-AS1,PFN4,LOC150568,SEMA4F,TMEM177,LOC401010,MRPL19,GCKR,TTC32,GGCX,LOC151009,THUMPD2,LOC728537,IL36B,PCDP1,VAMP5,LRRTM4,SF3B14,SULT1C2,RGPD4,MCEE,AAK1,SFTPB,SLC5A7,SCTR,ACTR1B,CIAO1,DNAJC5G,SIX3,SERTAD2,PIGF,CD8B,GGT8P,SLC9A2,NFU1,SNAR-H,POTEKP,VWA3B,SH3RF3,FAHD2B,UBXN2A,LOC284998,MEIS1,FAM98A,LOC90784,LAPTM4A,CCDC104,LOC100499194,MAPRE3,PPP1R21,ANXA4,LOC440910,LOC100506421,FAM84A,GKN2,TMEM185B,RASGRP3,ABHD1,AFF3,CRIM1,MOGS,BOLA3,DNAJC27,MZT2B,MAL,NRBP1,UXS1,PRKD3,SOCS5,FLJ30838,TTC31,RNF103-CHMP3,HADHA,MIR4435-1,NOTO,RPL23AP7,C1QL2,CHMP3,RNF149,AUP1,TBC1D8,AGBL5,GYPC,MSH6,LOC728730,VPS54,EIF5B,GALNT14,PLEK,GEN1,LOC100505876,MIR4432,VAMP8,ST6GAL2,C2orf91,KIAA1841,MORN2,LOC100128590,IL1RL2,BMP10,EIF2B4,ARHGEF4,REG3A,SULT1C3,ADD2,TSN,IFT172,TSGA10,HNRPLL,DPY30,LGALSL,ZNF2,ZNF638,IMP4,CCDC138,INSIG2,ACOXL,FBXO41,DYSF,C2orf51,TMEM214,TMEM127,ALMS1P,CDC42EP3,MZT2A,TMEM150A,EGR4,FOXI3,C2orf16,FOSL2,OR7E91P,UGGT1,TMEM87B,TXNDC9,NBAS,CREG2,RGPD6,ABCG5,PUM2,RNF181,LINC00116,LOC646743,MIR4757,C2orf78,MRPL35,LOC541471,INHBB,RHOB,LOC388942,STON1-GTF2A1L,DCTN1,CCDC115,LOC100129726,KCNS3,UNQ6975,ZAP70,NAGK,C2orf53,MIR4436A,C2orf76,THADA,VRK2,SLC5A6,RABL2A,CCDC75,PLEKHB2,MXD1,ANKRD36BP2,REG1P,MIR217,C2orf63,ASTL,WDR33,NLRC4,XPO1,RETSAT,TUBA3E,TRIM43B,CAMKMT,BCL2L11,PUS10,PAIP2B,RPIA,SH2D6,PCBP1,USP39,REG3G,FSHR,MYCN,SEMA4C,ANKRD23,C1D,IL1R2,MKI67IP,MOB1A,LOC389043,ACTR3BP2,EPCAM,MAT2A,PCGF1,RGPD2,BIN1,KANSL3,LOC100287010,LOXL3,CD207,DPYSL5,VAX2,PPP1CB,POLR1A,LOC644838,BCL11A,SULT1C4,ANKRD36,DBIL5P2,B3GNT2,LINC00309,ARHGEF33,TFCP2L1,C2orf89,IL1F10,OTX1,PPM1B,GKN1,ANTXR1,FKBP1B,ATP6V1B1,CCT7,CCDC74A,TEX261,MTA3,MFSD9,COX5B,RGPD1,FOXD4L1,FLJ42351,EFEMP1,SLC30A6,FAM168B,GDF7,NEURL3,TUBA3D,POLR1B,USP34,MSH2,MFSD2B,EXOC6B,RANBP2,LRRTM1,LOC100286979,C2orf84,KCNK12,MIR4267,CAD,FAM138B,SPRED2,HTRA2,ACTG2,AHSA2,SLC30A3,RBKS,NCK2,MIR548AD,FLJ16341,TRMT61B,SLC1A4,PROKR1,ATAD2B,LOC100630918,LCLAT1,CAPN14,LMAN2L,C2orf65,CTNNA2,SRD5A2,MIR4265,CCT4,INPP4A,SLC20A1,COX7A2L,SNRNP27,TMEM178,MIR4266,SULT1C2P1,MIR4436B1,MRPS5,IMMT,ALMS1,CYP27C1,HS6ST1,LOC728819,WTH3DI,CHST10,LOC375196,SMPD4,OSR1,PAPOLG,KRTCAP3,EPAS1,MDH1,C2orf74,IL18R1,LOC1720,CCDC164,LOC285074,VIT,PLGLB2,C2orf61,LONRF2,CCDC85A,UCN,C2orf28,DQX1,FAM178B,CENPA,MRPL30,MERTK,TCF23,DNAJC27-AS1,FAM176A,IL36G,IL1B,LIPT1,ZNF513,COA5,CLEC4F,PPP3R1,BRE,C2orf15,RAB6C,DOK1,PLGLA,GPR45,MIR4780,TMEM131,CBWD2,TSPYL6,LOC388946,CLIP4,C2orf42,SNRPG,LOC654433,LOC100505624,PTPN18,C2orf71,POMC,EML6,KIF3C,WASH2P,LOC150776,GTF3C2,WDR43,MEMO1,ETAA1,TRIM43,MRPL53,CAPN13,MIR4264,TIA1,SPTBN1,CENPO,C2orf55,FLJ12334,HS1BP3,COMMD1,IL1RN,LOC285033,ANKRD36B,LOC440894,PRADC1,C2orf68,TCF7L1,TMEM37,ATP6V1E2,SIX2,REG1B,CYP26B1,PREPL,WDR35,PAX8,OST4,CGREF1,PELI1,REL,POTEF,ZC3H8,KLHL29,DHX57,C2orf40,CNTNAP5,C2orf44,TGFBRAP1,PRKCE,LRPPRC,SLC35F5,FBXO48,GPR113,SUCLG1,LOC100288911,NCAPH,WDR92,TACR1,MARCO,MIR216A,CALM2,BUB1,ANKRD53,SLC4A1AP,DDX11L2,LOC100134259,FANCL,ACYP2,ITSN2,DNMT3A,PROM2,LYG2,LOC100287216,GPR75-ASB3,PCYOX1,MAP4K4,PNO1,LOC151534,YIPF4,PREB,ANAPC1,EMX1,REEP1,GPN1,PRORSD1P,ZNF514,WDPCP,KDM3A,NAT8,KCMF1,YPEL5,C2orf27A,LIMS1,EDAR,DYNC2LI1,LOC339807,SEPT10,FUNDC2P2,EHD3,SLC9A4,RAB10,FAM179A,HEATR5B,IL37,OXER1,SOWAHC,AFTPH,LOC389033,LOC729234,DNAH6,TET3,SMYD1,RGPD8,UGP2,LOC442028,STRN,CFC1B,LTBP1,FNDC4,MIR3682,MYO7B,ZC3H6,SNX17,TGFA,C2orf56,TPRKB,TMEM17,SAP130,FBXO11,AMMECR1L,RFX8,EIF2AK3,GNLY,PLB1,MSGN1,SLC3A1,TMEM182,C2orf29,LINC00486,FAM59B,PTPN4,CNNM4,RTN4,ACTR3,MITD1,LOC645949,IL1RL1,PPM1G,ASB3,INO80B-WBP1,CNRIP1,XDH,LBH,IL36RN,SLC8A1,PROC,LINC00152,KHK,EN1,NCOA1,FAM82A1,KCNK3,FAM136A,FER1L5,PSD4,SNORD89,SLC4A5,MPV17,SDC1,SPAST,VSNL1,ERLEC1,MIR216B,SRBD1,APLF,CCDC93,LOC84931,CCDC121,C2orf43,SFT2D3,DTNB,RGPD3,TTL,FHL2,LOC100133985,SOS1,TP53I3,RAB11FIP5,ARHGAP25,MTHFD2,BOLA3-AS1,KCNG3,EIF2AK2,DPP10,CYP1B1,C2orf70,TTC27,SNRNP200,PSME4,FAHD2A,MCFD2	IMR90	Hi-C	24141950	GPR39	146472	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	133609225	133609410	133609318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD1	182073	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	137142069	137142423	137142206	Y	CXCR4,CXCR4	NA	NA	NA	NA	NA	CXCR4	268334	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	139260181	139260311	139260246	Y	SPOPL	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	SPOPL	2810	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	144020720	144020920	144020801	Y	KYNU,ARHGAP15	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	1067215	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	144941420	144941641	144941519	Y	GTDC1,ZEB2,GTDC1,GTDC1	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	146494	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	145350126	145350524	145350325	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	261991	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	145866626	145866907	145866723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P5	225891	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	145942500	145942836	145942668	Y	NA	NA	ZEB2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL6P5	149962	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	148126586	148126890	148126739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR2A	473196	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	148388064	148388488	148388310	Y	ACVR2A	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR2A	211598	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	149267026	149267240	149267133	Y	EPC2	NA	NA	NA	NA	NA	EPC2	132769	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	149634441	149634782	149634502	Y	KIF5C	KIF5C	NA	NA	NA	NA	KIF5C	3622	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	149838827	149839058	149838917	Y	KIF5C	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD6B	53563	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	150222263	150222576	150222421	Y	NA	LYPD6	NA	NA	NA	NA	LYPD6	37764	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr2	150971624	150972028	150971707	Y	NA	NA	RND3	IMR90	Hi-C	24141950	RND3	421497	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	152493697	152493937	152493847	Y	RBM43,NMI	NA	NA	NA	NA	NA	NEB	95064	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	153275296	153275683	153275311	Y	FMNL2	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	85545	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	154335936	154336181	154336134	Y	RPRM	RPRM	NA	NA	NA	NA	RPRM	2614	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr2	154442869	154442990	154442930	Y	NA	AC012501.2	NA	NA	NA	NA	AC012501.2	4811	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	154446220	154446391	154446306	Y	NA	AC012501.2	NA	NA	NA	NA	AC012501.2	1410	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr2	154495676	154495864	154495770	Y	NA	AC012501.2	NA	NA	NA	NA	AC012501.2	47875	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	154903292	154903466	154903385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT13	176866	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	156832393	156832495	156832444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR4A2	364365	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	161065805	161066369	161066265	Y	CD302	NA	ITGB6,RBMS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PLA2R1	148684	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	161086140	161086681	161086297	Y	NA	NA	ITGB6,TANK,RBMS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLA2R1	169019	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	161232354	161232597	161232498	Y	NA	MIR4785	NA	NA	NA	NA	MIR4785	29796	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	161431402	161431575	161431468	Y	NA	NA	ITGB6,RBMS1	IMR90	Hi-C	24141950	RBMS1	83097	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	162095171	162095411	162095272	Y	TBR1,SLC4A10	AC009299.3	NA	NA	NA	NA	AC009299.3	3839	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	164204698	164204962	164204800	Y	NA	NA	FIGN	IMR90	Hi-C	24141950	FIGN	385560	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	164425693	164425701	164425698	Y	FIGN	NA	NA	NA	NA	NA	FIGN	164821	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	165327196	165327565	165327381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRB14	148793	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	166671246	166671486	166671366	Y	CSRNP3	GALNT3	NA	NA	NA	NA	GALNT3	22054	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	168291941	168292335	168292012	Y	B3GALT1	NA	NA	NA	NA	NA	AC074363.1	144260	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	169816441	169816821	169816578	Y	ABCB11	SPC25	NA	NA	NA	NA	SPC25	48560	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	169967622	169967787	169967727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPC25	199741	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr2	170441657	170442069	170441908	Y	NA	FASTKD1,PPIG	NA	NA	NA	NA	PPIG	2807	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	170684911	170685465	170685124	Y	PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3	SSB,METTL5,UBR3	NA	NA	NA	NA	UBR3	2943	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	171003090	171003284	171003187	Y	NA	NA	UBR3	IMR90	Hi-C	24141950	UBR3	321122	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	171671285	171671753	171671591	Y	NA	AC007405.4,AC007405.6,GAD1	NA	NA	NA	NA	GAD1	3562	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	173306862	173307108	173306983	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	16780	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	175708423	175708587	175708507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3AP4	125918	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	176608884	176609040	176608962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1715	256527	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr2	176839402	176839757	176839580	Y	NA	KIAA1715	NA	NA	NA	NA	KIAA1715	25810	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	178116726	178117036	178116927	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	1702	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	179056084	179056225	179056143	Y	NA	OSBPL6	MIR548N	IMR90	Hi-C	24141950	OSBPL6	983	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	179471296	179471384	179471314	Y	TTN	NA	NA	NA	NA	NA	TTN-AS1	87386	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	179692765	179693175	179692935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC141	219638	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	182942372	182942392	182942382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSFA2	187812	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	183950583	183950613	183950599	Y	NA	NCKAP1,DUSP19,NUP35	NA	NA	NA	NA	DUSP19	9296	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	187318926	187319192	187319071	Y	NA	ZC3H15	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	29691	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	187440118	187440385	187440293	Y	ITGAV,ITGAV	ITGAV	ZC3H15,ITGAV	IMR90	Hi-C	24141950	ITGAV	12407	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	187814778	187815134	187814833	Y	NA	NA	CALCRL	IMR90	Hi-C	24141950	FAM171B	258080	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	188389811	188390126	188390006	Y	NA	TFPI	NA	NA	NA	NA	TFPI	38361	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	188899561	188899722	188899605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GULP1	254674	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	191104181	191104357	191104269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP1	101839	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	191880126	191880291	191880211	Y	STAT4,NAB1,GLS,STAT1	AC067945.3,STAT1	NA	NA	NA	NA	STAT1	3395	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	191984586	191984681	191984634	Y	NA	STAT4	NA	NA	NA	NA	STAT4	29641	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	192544982	192545232	192545125	Y	OBFC2A	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1B	437071	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	193026634	193026859	193026747	Y	NA	TMEFF2	NA	NA	NA	NA	TMEFF2	31576	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	194838514	194838698	194838568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	1600003	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	196523919	196524096	196523991	Y	SLC39A10	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	85218	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	197004793	197005261	197004933	Y	NA	STK17B	NA	NA	NA	NA	STK17B	33966	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	197264939	197265165	197265058	Y	STK17B	NA	NA	NA	NA	NA	STK17B	225712	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	197934286	197934620	197934500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP1	143766	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	198029302	198029554	198029323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P3	96281	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	200800298	200800427	200800328	Y	SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69	C2orf69,C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	C2orf47	17613	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	201989489	201990098	201989672	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	10662	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	201990242	201990732	201990460	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	11415	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	202079360	202079680	202079556	Y	CLK1,CLK1,CFLAR,CASP10	CASP10,CASP8	NA	NA	NA	NA	CASP8	16486	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	202102159	202102434	202102342	Y	NA	CASP8	NA	NA	NA	NA	CASP8	5993	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	202104378	202104489	202104432	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	CASP8	NA	NA	NA	NA	CASP8	8212	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	202723656	202723936	202723797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALS2	79744	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	202837575	202837889	202837743	Y	NA	NA	CDK15,NOP58,ALS2,SUMO1,FZD7	IMR90	Hi-C	24141950	ALS2	193663	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	NA	NA	NA	NA	NA	DAZAP2P1	165924	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.81876218352206
chr2	203341668	203341778	203341723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMPR2	102009	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	203652717	203652999	203652954	Y	ICA1L,ICA1L,CYP20A1	NA	NA	NA	NA	NA	KRT8P15	51505	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	205960134	205960186	205960160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARD3B	551618	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	206563648	206564168	206563856	Y	INO80D	NRP2	NA	NA	NA	NA	NRP2	18934	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	206944485	206944991	206944704	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	AC007383.3	2338	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	206948392	206948813	206948647	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	INO80D	214	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.81876218352206
chr2	207076453	207076789	207076513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFS1	54126	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr2	207669258	207669658	207669463	Y	NA	FASTKD2,MDH1B	NA	NA	NA	NA	MDH1B	40987	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	208602415	208602802	208602609	Y	NA	CCNYL1,FZD5	NA	NA	NA	NA	CCNYL1	28151	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	208942960	208943012	208942996	Y	NA	CRYGD	FZD5,CCNYL1,PLEKHM3,FASTKD2,METTL21A	IMR90	Hi-C	24141950	CRYGD	44213	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	210872654	210873081	210872784	Y	C2orf67	RPE	NA	NA	NA	NA	RPE	7365	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	212430721	212430773	212430747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL1	1090345	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	212897670	212897774	212897723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAG16	1249339	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	214053041	214053239	214053088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAG16	93874	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr2	214054270	214054576	214054510	Y	NA	NA	IKZF2	IMR90	Hi-C	24141950	SPAG16	92537	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	216473974	216474094	216474034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012668.2	78118	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	216847055	216847597	216847305	Y	NA	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	49222	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	217929014	217929457	217929116	Y	NA	NA	DIRC3,IGFBP5,TNP1	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP2	433463	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	218330199	218330382	218330291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIRC3	288934	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	219194230	219194517	219194378	Y	CXCR2,CXCR2,CXCR1,ARPC2,ARPC2,USP37,SLC11A1	TMBIM1,AC021016.7,AC021016.6	NA	NA	NA	NA	AC021016.7	22281	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	219270976	219271406	219271230	Y	CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1	AC021016.6,CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	9997	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	219271996	219272374	219272308	Y	USP37	AC021016.6,CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	11017	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	219434664	219435146	219434778	Y	USP37	USP37,RQCD1	NA	NA	NA	NA	RQCD1	3361	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	219759139	219759434	219759370	Y	WNT6,WNT10A	WNT6	NA	NA	NA	NA	WNT6	36595	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	219761045	219761550	219761369	Y	USP37,ZNF142,ZFAND2B,TUBA4A,CNPPD1,ANKZF1,ANKZF1,WNT10A	WNT6	NA	NA	NA	NA	WNT6	38501	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	219773515	219774011	219773826	Y	USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A	NA	NA	NA	NA	NA	WNT6	50971	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr2	219827943	219828258	219828078	Y	USP37,STK36,PTPRN,PTPRN,CDK5R2,FEV	NA	NA	NA	NA	NA	WNT6	105399	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	220374836	220375176	220374958	Y	NA	GMPPA,TMEM198,CHPF	NA	NA	NA	NA	GMPPA	13247	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr2	220385870	220386219	220385945	Y	ACCN4	GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1	NA	NA	NA	NA	TMEM198	20166	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	PAX3	334304	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr2	223447202	223447309	223447256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	71747	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	224591304	224591516	224591410	Y	NA	NA	AP1S3	MCF7	ChIA-PET	22265404	AP1S3	109228	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	225307433	225307612	225307516	Y	FAM124B	NA	FAM124B,CUL3,SERPINE2	IMR90	Hi-C	24141950	CUL3	140498	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	225392496	225392764	225392746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	55346	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	225782519	225782936	225782741	Y	DOCK10	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	334409	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	225792499	225793034	225792841	Y	CUL3,DOCK10	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	344389	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	227665859	227666449	227665964	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	3384	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	230198176	230198490	230198329	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	64175	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	231532055	231532298	231532144	Y	GPR55,SP100,SP100,CAB39	CAB39	CAB39	IMR90	Hi-C	24141950	CAB39	43262	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	232276597	232276762	232276665	Y	B3GNT7	B3GNT7,SNORD82	NA	NA	NA	NA	B3GNT7	18343	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	232277113	232277443	232277206	Y	C2orf72	B3GNT7,SNORD82	NA	NA	NA	NA	B3GNT7	18859	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	NMUR1	75682	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr2	232478392	232478857	232478528	Y	DIS3L2,PTMA	NA	NA	NA	NA	NA	NMUR1	85186	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr2	232478879	232479328	232479053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMUR1	85673	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.05500974681765
chr2	232485741	232486244	232485851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	83361	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr2	232507409	232507767	232507481	Y	NA	NA	PDE6D	IMR90	Hi-C	24141950	PTMA	61838	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	232526700	232527324	232527119	Y	DIS3L2	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	42281	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	232531704	232531853	232531745	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	37752	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr2	232536483	232536778	232536606	Y	DIS3L2,PTMA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	32827	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.29125731011324
chr2	232537231	232537488	232537452	Y	DIS3L2,PTMA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	32117	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	232537656	232538064	232537748	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	31541	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	232545684	232546083	232545868	Y	COPS7B	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	23522	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr2	232546670	232546982	232546826	Y	NA	PTMA	PTMA,PDE6D	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTMA	22623	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	232551717	232552221	232552147	Y	NPPC	PTMA	PTMA,PDE6D	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTMA	17384	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	232566219	232566469	232566340	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	3136	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	234068854	234069213	234068926	Y	NA	ATG16L1	NA	NA	NA	NA	ATG16L1	47484	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	234266690	234266835	234266770	Y	INPP5D,ATG16L1,DGKD	DGKD	NA	NA	NA	NA	DGKD	5537	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	235732390	235732720	235732555	Y	NA	NA	SH3BP4,TRPM8	IMR90	Hi-C	24141950	SH3BP4	125897	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	235862299	235862667	235862586	Y	SH3BP4	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	3682	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	237073092	237073409	237073337	Y	NA	AC079135.1,GBX2	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	681	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr2	237784498	237784842	237784604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS8	207113	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	237897246	237897595	237897363	Y	NA	NA	AGAP1,IQCA1,CXCR7	IMR90	Hi-C	24141950	COPS8	94360	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	238065108	238065400	238065254	Y	COL6A3	NA	COL6A3,COPS8,MLPH,LRRFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	72648	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	238398938	238399241	238399144	Y	NA	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	6867	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	238512238	238512938	238512467	Y	LRRFIP1	RAB17,LRRFIP1	LRRFIP1,MLPH,PRLH,RAB17	IMR90	Hi-C	24141950	RAB17	3981	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	238522988	238523293	238523146	Y	NA	RAB17,LRRFIP1	LRRFIP1,MLPH,RAB17,UBE2F-SCLY	IMR90	Hi-C	24141950	LRRFIP1	10926	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	238583352	238583931	238583637	Y	UBE2F,LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	49133	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	238611190	238611575	238611206	Y	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	76971	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	240145548	240145836	240145702	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	175512	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr2	240179337	240179507	240179411	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	141841	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	240195931	240196233	240196082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	125115	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	240248408	240248826	240248656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	72522	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	242030281	242030580	242030300	Y	SNED1,PASK	MTERFD2	NA	NA	NA	NA	MTERFD2	9167	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	242050705	242051124	242050885	Y	NA	MTERFD2,PPP1R7,PASK	NA	NA	NA	NA	MTERFD2	10958	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	242500447	242500594	242500505	Y	NEU4,BOK	BOK	NA	NA	NA	NA	BOK	4311	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr2	242549642	242550327	242549774	Y	ATG4B	ATG4B,THAP4	NA	NA	NA	NA	ATG4B	24301	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr20	202220	202381	202310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C20orf96	67009	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	247683	247718	247701	Y	NA	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1	NA	NA	NA	NA	C20orf96	21672	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	352488	352859	352625	Y	SRXN1,FAM110A,RBCK1	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	6402	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	353974	354548	354311	Y	SRXN1,FAM110A	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	4713	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	382514	382753	382693	Y	CSNK2A1,ZCCHC3,TRIB3,RBCK1	TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	RBCK1	3389	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	1083260	1083345	1083304	Y	SCRT2	PSMF1	RSPO4	IMR90	Hi-C	24141950	PSMF1	8561	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	1097798	1098000	1097899	Y	NA	PSMF1	NA	NA	NA	NA	PSMF1	5892	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	1259137	1259285	1259212	Y	C20orf46,C20orf202	SNPH	NA	NA	NA	NA	SNPH	14177	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	1267390	1267580	1267486	Y	SIRPG	SNPH	LOC100507495,FKBP1A-SDCBP2	IMR90	Hi-C	24141950	SNPH	22430	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	2780319	2780470	2780455	Y	NA	CPXM1,VPS16	NA	NA	NA	NA	CPXM1	1036	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	2855066	2855678	2855300	Y	NA	VPS16,PTPRA	NA	NA	NA	NA	PTPRA	12236	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	2964753	2965068	2964761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS26	59523	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	3155446	3155862	3155811	Y	EBF4,PTPRA,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	16604	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	3159596	3159937	3159912	Y	PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	20754	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr20	3200687	3201082	3200885	Y	NA	DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	ITPA	13173	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	3472887	3473113	3473000	Y	NA	ATRN	NA	NA	NA	NA	ATRN	23200	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	3932717	3933076	3932937	Y	NA	NA	MIR103B2,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF24	61153	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr20	3960925	3961306	3961172	Y	PANK2,PANK2,RNF24,RNF24	RNF24,FTLP3	NA	NA	NA	NA	RNF24	32923	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	3961377	3961729	3961667	Y	PANK2,PANK2,RNF24,RNF24	RNF24,FTLP3	NA	NA	NA	NA	RNF24	32500	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	3993168	3993585	3993445	Y	PANK2,PANK2,RNF24,RNF24	RNF24,FTLP3	NA	NA	NA	NA	RNF24	644	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	4018656	4019040	4018859	Y	PANK2,PANK2,PANK2,RNF24,RNF24	RNF24,FTLP3	RNF24,CENPB,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	FTLP3	16104	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr20	4063526	4063882	4063813	Y	NA	SMOX	RNF24,PANK2,MAVS	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	35745	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	4116351	4116485	4116423	Y	PANK2,PANK2,SMOX	SMOX	ADRA1D,SMOX	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	16724	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	4942791	4943059	4943002	Y	RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2	SLC23A2	NA	NA	NA	NA	SLC23A2	45880	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	5553446	5553705	5553635	Y	NA	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	35967	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	5900941	5901075	5900974	Y	GPCPD1,TRMT6	RNU1-55P,TRMT6,MCM8	NA	NA	NA	NA	TRMT6	28107	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	7058177	7058257	7058218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP2	311866	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	9089602	9089856	9089687	Y	NA	PLCB4	NA	NA	NA	NA	PLCB4	42192	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	9789585	9790002	9789798	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNAP25	407476	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	10447085	10447351	10447236	Y	NA	MKKS	NA	NA	NA	NA	MKKS	34215	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	10471502	10471750	10471599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	58632	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	10482481	10482747	10482670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	69611	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	10532947	10533172	10533034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JAG1	91842	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	13036502	13036844	13036725	Y	NA	SPTLC3	NA	NA	NA	NA	SPTLC3	48875	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	13678137	13678519	13678328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TASP1	60550	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	13734374	13734725	13734663	Y	NA	ESF1	NA	NA	NA	NA	ESF1	28807	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	14036151	14036406	14036253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACROD2	62136	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	15939933	15940119	15940089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF16B	611959	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	17637776	17637930	17637851	Y	BANF2	RRBP1	NA	NA	NA	NA	RRBP1	23010	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	18034343	18034358	18034351	Y	NA	PTMAP3,OVOL2	NA	NA	NA	NA	OVOL2	3474	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	18565876	18566072	18565973	Y	CSRP2BP,ZNF133,POLR3F,SEC23B,SEC23B,SEC23B,DTD1	LINC00493,DTD1	NA	NA	NA	NA	DTD1	465	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr20	19194656	19195454	19194994	Y	NA	SLC24A3	NA	NA	NA	NA	SLC24A3	3366	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	19716018	19716528	19716293	Y	NA	RP1-122P22.2	NA	NA	NA	NA	RP1-122P22.2	19824	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	19884253	19884519	19884436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA20	111241	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	20347223	20347613	20347293	Y	NA	INSM1	NA	NA	NA	NA	INSM1	458	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	21082914	21083089	21083038	Y	NA	LINC00237,PLK1S1	PLK1S1,NKX2-2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00237	1910	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr20	21147247	21147656	21147458	Y	NA	PLK1S1	NA	NA	NA	NA	PLK1S1	42623	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr20	21170951	21171134	21171012	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK1S1	66327	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr20	21172590	21172944	21172681	Y	NKX2-2	NA	NA	NA	NA	NA	PLK1S1	67966	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	22370980	22371107	22371043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00261	186173	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	22558447	22558719	22558568	Y	FOXA2,FOXA2	LINC00261	NA	NA	NA	NA	LINC00261	1167	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	25214082	25214352	25214216	Y	ENTPD6,PYGB	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	12353	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr20	25218471	25218756	25218634	Y	NA	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	7949	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr20	25227226	25227454	25227251	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	521	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	25229395	25229593	25229494	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	2690	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	25305837	25305970	25305904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD12	63649	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	29647996	29648434	29648295	Y	DEFB121,DEFB116	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	38139	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr20	29649919	29650288	29650100	Y	NA	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	40062	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	30175524	30175854	30175562	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	15232	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	30182515	30183026	30182914	Y	NA	ID1	HM13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID1	8060	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.81876218352206
chr20	30183712	30184220	30184085	Y	ID1	ID1	HM13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID1	6866	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr20	30200712	30201016	30200864	Y	TTLL9,DUSP15,DEFB116,DEFB121	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	9626	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	30249247	30249862	30249570	Y	TTLL9	NA	NA	NA	NA	NA	ID1	58161	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr20	30255856	30255976	30255884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	53816	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr20	30262675	30263005	30262853	Y	HCK,BCL2L1	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	46787	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	30307720	30308274	30308104	Y	POFUT1	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	1518	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr20	30699679	30699866	30699769	Y	BCL2L1,HCK,C20orf112,TM9SF4,PLAGL2	TM9SF4	NA	NA	NA	NA	TM9SF4	4370	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	31126528	31126767	31126720	Y	ASXL1	C20orf112	NA	NA	NA	NA	C20orf112	44109	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	31192929	31193228	31193169	Y	PLAGL2,MAPRE1,DNMT3B	C20orf112	NA	NA	NA	NA	C20orf112	22053	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	31339575	31339797	31339687	Y	NA	COMMD7,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	DNMT3B	8394	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	31350973	31351317	31351235	Y	C20orf185,DNMT3B,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B	MAPRE1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT3B	2782	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr20	31352490	31352753	31352633	Y	C20orf203,DNMT3B,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B	MAPRE1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT3B	4299	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr20	31373290	31373636	31373312	Y	C20orf185,DNMT3B,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B,MAPRE1	MAPRE1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT3B	25099	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr20	32690137	32690399	32690268	Y	NA	EIF2S2,RPS2P1	NA	NA	NA	NA	EIF2S2	7739	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr20	32753335	32753546	32753441	Y	NA	RPS2P1	ITCH,AHCY,PXMP4,ZNF341,DYNLRB1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS2P1	45059	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr20	32782933	32783102	32782955	Y	ASIP	NA	ITCH,ASIP,AHCY	IMR90	Hi-C	24141950	RPS2P1	74657	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	33024983	33025234	33025016	Y	TP53INP2	FDX1P1	NA	NA	NA	NA	FDX1P1	37045	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	33064297	33064587	33064427	Y	ACSS2	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	FDX1P1	2018	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	33150860	33150919	33150894	Y	NA	DYNLRB1,MAP1LC3A	NA	NA	NA	NA	MAP1LC3A	18202	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	33263826	33263865	33263846	Y	MYH7B	PIGU,TP53INP2	NA	NA	NA	NA	PIGU	916	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	33699049	33699250	33699220	Y	TRPC4AP,EDEM2	TRPC4AP	NA	NA	NA	NA	TRPC4AP	20375	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	33769921	33770187	33770054	Y	NA	PROCR,MT1P3,MMP24	NA	NA	NA	NA	PROCR	12045	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	33840961	33841098	33841051	Y	SPAG4,RBM39	MT1P3,MMP24,EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EDEM2	22830	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	33900177	33900484	33900409	Y	GSS,EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EIF6	29389	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	34127589	34128004	34127717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERGIC3	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr20	34217204	34217560	34217502	Y	NA	SPAG4,CPNE1,RBM12	NA	NA	NA	NA	SPAG4	15390	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr20	34330989	34331372	34331294	Y	SPAG4,SCAND1,SCAND1,PHF20,RBM39	ROMO1,NFS1,RBM39,PHF20	NA	NA	NA	NA	RBM39	2755	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	34356129	34356371	34356208	Y	SPAG4,CPNE1,RBM39,SCAND1,PHF20	RBM39,PHF20	NA	NA	NA	NA	PHF20	1525	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	NA	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SCAND1	107196	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	34658286	34658599	34658390	Y	EPB41L1	NA	LOC647979,C20orf152,EPB41L1,PHF20	IMR90	Hi-C	24141950	SCAND1	112892	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	35019888	35020140	35020089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLGAP4	127630	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	35083291	35083376	35083331	Y	EPB41L1,DLGAP4,NDRG3,KIAA0889,KIAA0889	NA	NA	NA	NA	NA	MYL9	84511	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr20	35102828	35103254	35103050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYL9	64633	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	35112957	35113192	35113075	Y	TGIF2	NA	NA	NA	NA	NA	MYL9	54695	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	35234952	35235695	35235080	Y	NA	RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	2815	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	35305263	35305453	35305359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG3	67028	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr20	35887668	35888008	35887942	Y	NA	MANBAL	NA	NA	NA	NA	MANBAL	28033	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	35947612	35947897	35947800	Y	NA	MANBAL,SRC	NA	NA	NA	NA	SRC	23191	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr20	36040566	36040861	36040811	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	31075	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	36041191	36041579	36041445	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	30357	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	36621379	36621533	36621455	Y	NNAT,VSTM2L	TTI1,RPRD1B	NA	NA	NA	NA	TTI1	38337	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	37229958	37230063	37230010	Y	ARHGAP40	ARHGAP40	NA	NA	NA	NA	ARHGAP40	1381	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr20	37302978	37303466	37303191	Y	ACTR5,SLC32A1	NA	ARHGAP40,ACTR5,SLC32A1,PPP1R16B	IMR90	Hi-C	24141950	ACTR5	71619	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr20	37499452	37499626	37499537	Y	RALGAPB,ACTR5,PPP1R16B,DHX35	NA	NA	NA	NA	NA	FAM83D	53329	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	37500884	37501078	37500926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM83D	51877	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	38739667	38739753	38739719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFB	576127	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	38844790	38845079	38844935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFB	470801	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	39190771	39191062	39190839	Y	TOP1,MAFB	NA	NA	NA	NA	NA	MAFB	124818	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	39826598	39826945	39826630	Y	CHD6	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG1	62998	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	40193452	40193754	40193691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD6	51379	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	40321359	40321668	40321514	Y	NA	NA	CHD6	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHD6	76226	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	7334	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr20	42955373	42955435	42955404	Y	NA	FITM2	NA	NA	NA	NA	FITM2	17564	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	43272652	43273023	43272879	Y	C20orf111,STK4,ADA	ADA	NA	NA	NA	NA	ADA	5851	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	43569969	43570092	43570031	Y	RBPJL,TP53TG5,STK4	PABPC1L,TOMM34,STK4	NA	NA	NA	NA	TOMM34	17035	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	43965327	43965544	43965453	Y	SDC4	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	9520	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	43972821	43973151	43973055	Y	SYS1,SDC4	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	1913	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	43974041	43974470	43974334	Y	NA	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	594	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	44062032	44062200	44062120	Y	KCNS1,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,WFDC11,WFDC6	PIGT,WFDC2	NA	NA	NA	NA	PIGT	19315	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	44622132	44622355	44622242	Y	CD40,ZNF335	ZNF335,SLC12A5	ZNF335,MMP9,SLC12A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF335	23299	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	45006307	45006609	45006393	Y	PCIF1,ZNF335	SLC35C2	NA	NA	NA	NA	SLC35C2	15264	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	45251611	45251999	45251807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC13A3	50715	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	45858819	45859007	45858915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	124560	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	45870109	45870518	45870490	Y	ZMYND8,NCOA3	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	113049	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	45946049	45946481	45946179	Y	NA	ZMYND8	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	37086	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	45987479	45988292	45987961	Y	NA	ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	3912	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	45989347	45989834	45989660	Y	SULF2	ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5780	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr20	46394797	46395044	46394952	Y	SULF2,SULF2	SULF2	NA	NA	NA	NA	SULF2	18316	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	46924305	46924474	46924390	Y	NA	NA	SULF2,NCOA3,PREX1,ARFGEF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00494	62219	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	47439402	47439940	47439658	Y	ZNFX1,STAU1,PREX1	PREX1	NA	NA	NA	NA	PREX1	2480	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	47547466	47547777	47547635	Y	ZNFX1,ARFGEF2	ARFGEF2	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	11039	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	47750965	47751079	47750977	Y	ZNFX1	NA	NA	NA	NA	NA	STAU1	51825	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr20	48293445	48293839	48293746	Y	NA	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	34576	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	48315836	48316073	48315912	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	12342	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr20	48327368	48328064	48327696	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	351	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	48381625	48382070	48381853	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,RNF114,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNRPFP1	37246	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	48384741	48385230	48384965	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,RNF114,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8,KCNB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNRPFP1	40362	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr20	48663510	48663968	48663673	Y	NA	NA	SNAI1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SNAI1	65974	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	48763277	48763795	48763638	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,CEBPB	NA	NA	NA	NA	TMEM189-UBE2V1	4379	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	49137019	49137081	49137050	Y	PTPN1	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	12128	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	49407275	49407470	49407371	Y	MOCS3	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	1961	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr20	49838536	49838841	49838768	Y	NA	NA	KCNG1	IMR90	Hi-C	24141950	KCNG1	200870	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr20	50017073	50017292	50017116	Y	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	160078	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	50272756	50273155	50272761	Y	ATP9A	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	75917	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	50416703	50416783	50416765	Y	ZFP64,SALL4	ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	SALL4	276	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr20	50416861	50417288	50417180	Y	ZFP64,SALL4	ATP9A	NA	NA	NA	NA	SALL4	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr20	51109650	51109945	51109791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP64	290803	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	52196593	52196861	52196746	Y	TSHZ2,ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	27585	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	52201463	52201802	52201714	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	22644	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr20	52239995	52240318	52240062	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	15549	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr20	52294676	52294905	52294769	Y	NA	NA	BMP7,SUMO1P1,BCAS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF217	70230	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	52355086	52355238	52355182	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	130640	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr20	52356771	52357178	52357063	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	132325	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	52380425	52380741	52380578	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	155979	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	52445816	52446339	52446069	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	221370	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	52543055	52543571	52543250	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	278815	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	52740107	52740637	52740253	Y	NA	NA	DOK5,SULF2,ZMYND8,BMP7,PTPRT	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	81749	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	55311396	55311684	55311475	Y	NA	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	TFAP2C	109038	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.05500974681765
chr20	55379556	55380011	55379738	Y	TFAP2C	NA	TFAP2C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP2C	177198	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr20	55964119	55964506	55964297	Y	ZBP1,MTRNR2L3,RBM38	RAE1,MTRNR2L3	NA	NA	NA	NA	RBM38	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	56291330	56291601	56291401	Y	NA	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	6738	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	57270107	57270808	57270490	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1	NA	NA	NA	NA	NPEPL1	7920	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	57557787	57558211	57558054	Y	ZNF831,STX16	CTSZ,ATP5E	NA	NA	NA	NA	CTSZ	22091	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	57697718	57697916	57697753	Y	STX16,ZNF831	NA	GNAS,GNAS-AS1,ZNF831	IMR90	Hi-C	24141950	SLMO2	81754	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	58459134	58459312	58459218	Y	PHACTR3,PHACTR3,PHACTR3,C20orf177	SYCP2	NA	NA	NA	NA	SYCP2	47398	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	60011356	60011607	60011563	Y	CDH4	NA	NA	NA	NA	NA	CDH4	185874	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	60803093	60803442	60803179	Y	NA	HRH3,OSBPL2	NA	NA	NA	NA	OSBPL2	8138	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr20	60875997	60876347	60876165	Y	GATA5,CABLES2	ADRM1,MIR4758	NA	NA	NA	NA	ADRM1	848	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	60940876	60941209	60940968	Y	PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	508	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr20	60941528	60941750	60941608	Y	SLCO4A1,ADRM1,LAMA5	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	1160	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr20	60943690	60943839	60943760	Y	NA	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	3322	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	61505589	61505880	61505712	Y	BHLHE23,DIDO1,C20orf11	TCFL5	TCFL5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TCFL5	14474	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr20	61506279	61506510	61506352	Y	BHLHE23,TCFL5,DIDO1,C20orf11	TCFL5	TCFL5	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TCFL5	15164	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr20	61646020	61646413	61646169	Y	C20orf11,YTHDF1	BHLHE23	NA	NA	NA	NA	BHLHE23	9633	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	61804100	61804419	61804293	Y	DIDO1	YTHDF1	NA	NA	NA	NA	YTHDF1	41167	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	62113410	62113704	62113637	Y	ZNF512B,EEF1A2	KCNQ2,EEF1A2,PPDPF	NA	NA	NA	NA	KCNQ2	11417	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	62466212	62466776	62466445	Y	OPRL1,ABHD16B	ZBTB46,TPD52L2	PTK6,SLC2A4RG,ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,ABHD16B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZBTB46	5615	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr20	62478016	62478296	62478069	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	16300	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr21	15919647	15919962	15919914	Y	HSPA13,SAMSN1	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA13	165842	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	18891260	18891546	18891459	Y	NA	CXADR	NA	NA	NA	NA	CXADR	8560	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	21202916	21203232	21203136	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM2	1165401	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	22545026	22545343	22545185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM2	176393	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr21	26745282	26745696	26745293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL39	232133	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	26762963	26763092	26762975	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL39	214737	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	26952057	26952278	26952105	Y	JAM2	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	25551	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr21	26962945	26963646	26963455	Y	NA	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	14183	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr21	27275894	27276232	27276045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5J	169910	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	27370700	27370785	27370725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	170661	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	28796596	28796902	28796773	Y	NA	NA	ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS5	459764	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	29660800	29661042	29660922	Y	NA	NA	ADAMTS1,ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	594651	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.56417803795393
chr21	30591516	30591874	30591674	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,LINC00189,BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	27124	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	30617454	30617803	30617527	Y	USP16,BACH1,BACH1	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	53062	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	30620516	30620830	30620603	Y	USP16,BACH1,BACH1	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	56124	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	30684361	30684712	30684409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	119969	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	30927917	30928144	30928028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	363525	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	32532795	32532952	32532925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIAM1	397338	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.54584145568138
chr21	32545915	32546496	32546250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIAM1	383794	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr21	32553780	32554124	32553993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIAM1	376166	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	32654582	32654950	32654771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIAM1	275340	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr21	32662959	32662987	32662974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIAM1	267303	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr21	32714682	32715016	32714813	Y	SCAF4	NA	NA	NA	NA	NA	TIAM1	215274	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	32727234	32727499	32727493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIAM1	202791	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	32781181	32781372	32781277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIAM1	148918	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	32926891	32927175	32926925	Y	NA	TIAM1	NA	NA	NA	NA	TIAM1	3115	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	32929453	32930069	32929726	Y	TIAM1	TIAM1	NA	NA	NA	NA	TIAM1	221	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr21	33247157	33247609	33247328	Y	NA	HUNK	NA	NA	NA	NA	HUNK	3529	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr21	33301390	33301573	33301482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HUNK	57762	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	33303378	33303399	33303389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HUNK	59750	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr21	33670455	33670601	33670551	Y	NA	MIS18A	NA	NA	NA	NA	MIS18A	21075	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	35057919	35058071	35057938	Y	NA	ITSN1,CRYZL1	NA	NA	NA	NA	CRYZL1	43687	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	6.61918778477158
chr21	35308653	35309105	35308775	Y	NA	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	22369	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr21	35319562	35320491	35320153	Y	NA	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	33278	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr21	35391273	35391398	35391369	Y	NA	NA	MRPS6,ATP5O,LOC100506334	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS6	52126	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	35402450	35402634	35402553	Y	GART,GART	MRPS6,SLC5A3	MRPS6,LOC100506334	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS6	40890	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	35863434	35863747	35863591	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC6	175941	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	36214787	36216208	36215152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC6	175099	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	36227422	36227493	36227482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC6	187734	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	36475401	36475555	36475452	Y	NA	NA	RUNX1,SETD4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLIC6	435713	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	37259191	37259579	37259516	Y	NA	NA	LOC100506385,CLIC6,LINC00160	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX1	115386	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	37529889	37530052	37529971	Y	DOPEY2	CBR3,DOPEY2	NA	NA	NA	NA	DOPEY2	2809	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	37712607	37712952	37712729	Y	NA	MORC3,CHAF1B	NA	NA	NA	NA	MORC3	22120	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	37909542	37909917	37909766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHAF1B	153866	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	38072912	38073314	38073050	Y	SIM2	SIM2	HLCS	IMR90	Hi-C	24141950	SIM2	3479	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	38235070	38235202	38235136	Y	TTC3,HLCS	NA	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	101610	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	38629602	38630247	38630025	Y	NA	AP001432.14,DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	8015	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	38630405	38630786	38630710	Y	DYRK1A,DYRK1A	AP001432.14,DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	7476	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr21	39189154	39189496	39189325	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ6	97253	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	39687013	39687366	39687190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERG	344338	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	40476284	40476629	40476514	Y	ETS2	NA	ETS2,LINC00114,ERG	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	77148	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	40673787	40673929	40673891	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	17556	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	40691878	40692008	40691991	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	393	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	40716228	40716377	40716303	Y	NA	BRWD1,HMGN1,WRB	NA	NA	NA	NA	HMGN1	3196	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	42610946	42611279	42611113	Y	BACE2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM3B	62860	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	42880678	42881074	42881005	Y	TMPRSS2,TMPRSS2	TMPRSS2,SNORA32	NA	NA	NA	NA	TMPRSS2	19969	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	43832072	43832298	43832177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC37A1	81820	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	43887564	43887652	43887608	Y	NA	SLC37A1,RSPH1	NA	NA	NA	NA	SLC37A1	26466	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	44072717	44073208	44072832	Y	NA	PDE9A	NA	NA	NA	NA	PDE9A	971	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	44087083	44087334	44087223	Y	NA	PDE9A	NA	NA	NA	NA	PDE9A	15337	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr21	44278308	44278654	44278481	Y	NA	WDR4,NDUFV3	NA	NA	NA	NA	WDR4	19024	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	44395482	44395891	44395810	Y	NA	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	2862	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	44395922	44396228	44396080	Y	WDR4,U2AF1,CBS	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	3302	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr21	44796506	44796705	44796660	Y	NA	SIK1	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B	IMR90	Hi-C	24141950	SIK1	48303	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr21	44816664	44817004	44816885	Y	NA	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	28004	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr21	45235037	45235392	45235184	Y	NA	CSTB,RRP1,MYL6P1,AGPAT3	NA	NA	NA	NA	RRP1	27643	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	45441566	45441868	45441701	Y	C21orf2,TRAPPC10	TRAPPC10	PWP2,C21orf33	IMR90	Hi-C	24141950	TRAPPC10	11366	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	45566076	45566451	45566257	Y	TRAPPC10,ICOSLG,C21orf2	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	14589	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	45661962	45662435	45662161	Y	TRAPPC10,PWP2,C21orf2,ICOSLG	ICOSLG,DNMT3L,AIRE	NA	NA	NA	NA	ICOSLG	3113	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	45683777	45683905	45683814	Y	KRTAP10-6,KRTAP10-11,KRTAP12-4,KRTAP10-12,KRTAP12-2,KRTAP12-1,KRTAP10-8,DNMT3L,AIRE,AIRE	ICOSLG,DNMT3L,AIRE,PFKL	NA	NA	NA	NA	DNMT3L	3678	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr21	46097395	46097576	46097539	Y	KRTAP10-7,KRTAP10-12	TSPEAR	NA	NA	NA	NA	TSPEAR	31919	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	46122910	46123100	46123005	Y	NA	TSPEAR	NA	NA	NA	NA	TSPEAR	6395	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	46127419	46127576	46127516	Y	NA	TSPEAR	NA	NA	NA	NA	TSPEAR	1919	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	46128352	46128532	46128434	Y	NA	TSPEAR	NA	NA	NA	NA	TSPEAR	963	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	46823895	46824295	46824014	Y	COL18A1	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	843	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	46824359	46824541	46824457	Y	COL18A1	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	1307	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	46894520	46894647	46894596	Y	COL18A1	NA	SLC19A1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC19A1	67678	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	47010467	47010705	47010586	Y	NA	SLC19A1	PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC19A1	48142	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr21	47395087	47395227	47395108	Y	COL6A2,COL6A1	COL6A1	COL6A1	K562	ChIA-PET	22265404	COL6A1	4424	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr21	47554885	47555152	47555043	Y	FTCD	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	38874	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	17715051	17715201	17715110	Y	GAB4,CECR5,CECR1	AC005300.5	NA	NA	NA	NA	AC005300.5	43225	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr22	17745323	17745619	17745476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005300.5	73497	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	17849400	17850329	17849515	Y	NA	CECR2	NA	NA	NA	NA	CECR2	10563	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	17850637	17851018	17850672	Y	NA	CECR2	NA	NA	NA	NA	CECR2	11800	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	18404666	18404945	18404902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL3	100380	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr22	19331396	19331535	19331466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLTCL1	54157	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	19869401	19869687	19869604	Y	NA	C22orf29,GNB1L	NA	NA	NA	NA	GNB1L	28939	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr22	19972525	19972715	19972620	Y	NA	COMT,TXNRD2,ARVCF	NA	NA	NA	NA	ARVCF	29616	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	20850844	20851071	20850923	Y	PI4KA,AIFM3,AIFM3	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	2644	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	20923375	20923909	20923414	Y	THAP7,MED15	NA	NA	NA	NA	NA	MED15	75175	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	21273214	21273312	21273263	Y	NA	CRKL	NA	NA	NA	NA	CRKL	3500	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	21285744	21286048	21285865	Y	NA	CRKL,LZTR1	NA	NA	NA	NA	CRKL	16030	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr22	22011632	22012115	22011859	Y	NA	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	7073	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr22	22067448	22067680	22067564	Y	YPEL1	YPEL1	NA	NA	NA	NA	YPEL1	20443	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	23863943	23864332	23864232	Y	GNAZ,RTDR1,BCR	NA	ZDHHC8P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC8P1	121030	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr22	24234499	24234593	24234547	Y	NA	SLC2A11,MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	308	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	24255997	24256450	24256302	Y	C22orf43,CABIN1,CABIN1	MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	21806	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	24767148	24767407	24767278	Y	GGT1	ADORA2A	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	44440	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	24796747	24798216	24797446	Y	GGT1	ADORA2A	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	13631	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	25348731	25349104	25348989	Y	NA	NA	SGSM1,KIAA1671,TMEM211	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SGSM1	148495	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	25349333	25349980	25349695	Y	NA	NA	SGSM1,KIAA1671,TMEM211	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SGSM1	149097	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	25844657	25845002	25844694	Y	NA	CRYBB2P1	NA	NA	NA	NA	CRYBB2P1	2585	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	25883503	25883619	25883561	Y	NA	CRYBB2P1	MYO18B,LRP5L,CRYBB2P1,ADRBK2,SEZ6L	IMR90	Hi-C	24141950	CRYBB2P1	41431	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	27043800	27044733	27044318	Y	SEZ6L	MIAT,CTA-211A9.5	NA	NA	NA	NA	MIAT	3408	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	27107290	27107513	27107356	Y	NA	CTA-211A9.5	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-211A9.5	40560	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr22	27415901	27416173	27415987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTA-211A9.5	349171	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	28114157	28114741	28114406	Y	PITPNB,MN1	NA	NA	NA	NA	NA	MN1	80745	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	28115717	28115905	28115775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MN1	79581	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	28304832	28305219	28305193	Y	NA	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	TTC28-AS1	8145	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	28837872	28838192	28838073	Y	TTC28	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	297827	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	29132423	29132599	29132510	Y	NA	HSCB,CHEK2,CCDC117	NA	NA	NA	NA	HSCB	3420	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	29218930	29219398	29218977	Y	NA	XBP1,CTA-292E10.6	TTC28-AS1,TTC28,ZNRF3,EMID1,CCDC117,XBP1,KREMEN1,HSCB,CHEK2,C22orf31	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTA-292E10.6	24259	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	29365910	29365950	29365937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF3	88330	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	29467563	29467858	29467701	Y	NA	KREMEN1	NA	NA	NA	NA	KREMEN1	497	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	29705410	29705600	29705517	Y	GAS2L1	EWSR1,RHBDD3,GAS2L1,RASL10A	NA	NA	NA	NA	GAS2L1	4838	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	29877762	29878123	29877961	Y	NA	NEFH	NA	NA	NA	NA	NEFH	3543	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	30648392	30648767	30648580	Y	SF3A1	GATSL3	NA	NA	NA	NA	GATSL3	34849	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	30653574	30654311	30654075	Y	RNF215,GAL3ST1	GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	GATSL3	29305	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr22	30666798	30667328	30667040	Y	MTMR3,TBC1D10A,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM	GATSL3	NA	NA	NA	NA	GATSL3	16288	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	32027602	32027834	32027718	Y	NA	PISD	NA	NA	NA	NA	PISD	28584	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	32983251	32983414	32983333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	114588	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	33243745	33243918	33243862	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	48058	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	35773875	35773984	35773931	Y	APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1	HMOX1,MCM5	TOM1,MCM5,HMOX1,RASD2,MB,APOL6,APOL5,RBFOX2	IMR90	Hi-C	24141950	HMOX1	370	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	36385915	36386246	36386112	Y	NA	RBFOX2	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	36227	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	36448788	36448904	36448856	Y	NA	RBFOX2	RBFOX2	IMR90	Hi-C	24141950	RBFOX2	26315	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	36750973	36751374	36751265	Y	APOL3	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	30689	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	36806147	36806450	36806256	Y	NA	MYH9,RP5-1119A7.14	MYH9,FOXRED2,TXN2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYH9	24084	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	36815362	36815553	36815536	Y	NA	MYH9,RP5-1119A7.14	MYH9,FOXRED2,TXN2	IMR90	Hi-C	24141950	MYH9	33299	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	37445416	37445556	37445486	Y	NA	MPST,TST,KCTD17	NA	NA	NA	NA	KCTD17	223	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	37484097	37484413	37484195	Y	IL2RB	KCTD17	NA	NA	NA	NA	KCTD17	38318	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	37897761	37897917	37897872	Y	NA	CARD10	NA	NA	NA	NA	CARD10	15632	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	37942064	37942352	37942192	Y	KCTD17,TRIOBP,POLR2F,MICALL1,LGALS1,ANKRD54,CARD10,CDC42EP1	CARD10,CDC42EP1	ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42EP1	12102	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	37997690	37997947	37997695	Y	GGA1,GGA1	CDC42EP1,GGA1,SH3BP1	CYTH4,LGALS2,CDC42EP1,CARD10,MFNG,SH3BP1,PDXP,GGA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GGA1	4534	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	38137969	38138286	38138127	Y	TRIOBP	TRIOBP	H1F0,GCAT	IMR90	Hi-C	24141950	TRIOBP	46958	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	38199242	38199532	38199401	Y	NA	H1F0,GCAT,MIR658,EIF3L,ANKRD54	NA	NA	NA	NA	H1F0	128	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr22	38711439	38711868	38711815	Y	SUN2,SUN2,JOSD1,GTPBP1,PLA2G6,PLA2G6	TMEM184B	NA	NA	NA	NA	TMEM184B	44399	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	39462955	39463374	39463017	Y	NA	APOBEC3F,APOBEC3G,APOBEC3H	NA	NA	NA	NA	APOBEC3H	27855	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	39541576	39542088	39541730	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7	CBX7	NA	NA	NA	NA	CBX7	4591	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	39570711	39571096	39570941	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,PDGFB,APOBEC3G,APOBEC3H	CBX7	PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CBX7	24032	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr22	39695935	39696099	39695991	Y	ATF4,APOBEC3A	RPL3,SYNGR1	NA	NA	NA	NA	RPL3	18295	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	39704707	39705214	39704970	Y	ATF4,APOBEC3A	RPL3,SYNGR1	NA	NA	NA	NA	RPL3	9180	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	39784774	39784929	39784841	Y	APOBEC3D,APOBEC3G,CBX7	SYNGR1,TAB1	NA	NA	NA	NA	TAB1	8817	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	40573139	40573276	40573210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P52	72069	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr22	40575185	40575584	40575306	Y	TNRC6B,TNRC6B	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P52	74115	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	40840291	40840428	40840373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSM3	75696	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	41080878	41081122	41080979	Y	NA	GAPDHP37	NA	NA	NA	NA	GAPDHP37	12423	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr22	41417973	41418366	41418067	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39690	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	41418482	41418837	41418726	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39219	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr22	41684313	41684541	41684479	Y	PPPDE2,RANGAP1	RANGAP1,ZC3H7B	NA	NA	NA	NA	RANGAP1	4058	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr22	42062739	42062953	42062873	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19990	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	42063539	42063782	42063553	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19161	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr22	42696005	42696062	42696030	Y	SEPT3,NFAM1	NA	TCF20,NFAM1	IMR90	Hi-C	24141950	Z83851.1	67180	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr22	42835802	42836124	42835869	Y	POLDIP3,ARFGAP3,NFAM1	CTA-126B4.7	MEI1,LOC100132273,TCF20,LOC388906,NFAM1	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-126B4.7	3773	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr22	42839941	42840323	42840234	Y	POLDIP3,C22orf32,TCF20,RRP7A,NFAM1	CTA-126B4.7	MEI1,TCF20,NDUFA6,LOC100132273,C22orf32,CYP2D6,NFAM1,WBP2NL,RNU12,POLDIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTA-126B4.7	7912	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	43139012	43139195	43139112	Y	NA	A4GALT	CYB5R3,ARFGAP3,PACSIN2,RNU12,POLDIP3,A4GALT	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	A4GALT	23708	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	43333511	43333722	43333661	Y	POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2	NA	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	75429	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	43500072	43500319	43500196	Y	NA	TTLL1,BIK,MCAT,TSPO	MCAT,BIK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BIK	4435	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	43738207	43738555	43738223	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL12	157068	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	44218722	44218869	44218865	Y	NA	EFCAB6,SULT4A1	NA	NA	NA	NA	EFCAB6	12505	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	45402294	45403188	45402906	Y	NA	PHF21B	NA	NA	NA	NA	PHF21B	692	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	45403389	45403735	45403573	Y	KIAA0930,PHF21B,PHF21B,PHF21B	PHF21B	NA	NA	NA	NA	PHF21B	145	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr22	45448500	45448839	45448669	Y	NA	PHF21B	PHF21B,LOC100506714	IMR90	Hi-C	24141950	PHF21B	44620	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	45501114	45501367	45501144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	56295	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	45543738	45543876	45543815	Y	PHF21B,NUP50,NUP50	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	13786	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	45553376	45553664	45553597	Y	NA	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	3998	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	45624322	45624510	45624404	Y	KIAA0930	KIAA0930	NA	NA	NA	NA	KIAA0930	10140	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	46028588	46028889	46028879	Y	WNT7B	ATXN10	NA	NA	NA	NA	ATXN10	36789	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	46041491	46041960	46041628	Y	NA	ATXN10	ATXN10,WNT7B,FAM118A,SMC1B,FBLN1,LOC730668,LOC100271722,MIRLET7BHG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATXN10	23718	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	46423205	46423605	46423251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC38	238253	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	46745093	46745309	46745201	Y	NA	TRMU	NA	NA	NA	NA	TRMU	20321	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	46957537	46957704	46957620	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	TRMU,CELSR1,GRAMD4	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	12205	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr22	46988577	46988710	46988625	Y	NA	GRAMD4	GRAMD4,CELSR1	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	18668	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	47250044	47250415	47250236	Y	CERK,TBC1D22A	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	93526	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	48184441	48184585	48184513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM19A5	698687	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	49548057	49548240	49548148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM19A5	664785	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	49768624	49768992	49768711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	450168	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr22	50364350	50364715	50364589	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12189	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr22	50744748	50744986	50744827	Y	PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	692	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr22	50912071	50912698	50912340	Y	NA	SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2	NA	NA	NA	NA	SBF1	617	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr22	50982591	50982963	50982680	Y	NA	LMF2,NCAPH2,SCO2,SYCE3,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	SYCE3	16371	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr22	51109040	51109307	51109069	Y	SHANK3	ARSA,SHANK3	SHANK3,LMF2,NCAPH2,MAPK8IP2,CHKB-CPT1B,ARSA,SBF1,PPP6R2,ODF3B,SYCE3,KLHDC7B,TYMP,LOC100144603	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SHANK3	1536	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	3177157	3177268	3177188	Y	CRBN	TRNT1,CRBN	NA	NA	NA	NA	TRNT1	10557	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	3975411	3975745	3975578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRN1	136290	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	4392615	4392774	4392664	Y	ITPR1	SETMAR	NA	NA	NA	NA	SETMAR	49627	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	4871506	4871670	4871602	Y	ITPR1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	147131	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	4885679	4886087	4885777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	132714	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	5067974	5068590	5068209	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40	49173	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr3	5182623	5182897	5182737	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	ARL8B,EDEM1	EDEM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL8B	20718	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	9749509	9749829	9749669	Y	NA	BRPF1,OGG1	NA	NA	NA	NA	BRPF1	21584	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	10157932	10158133	10158106	Y	NA	BRK1,VHL,IRAK2	NA	NA	NA	NA	BRK1	2656	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	10276652	10276834	10276729	Y	NA	TATDN2	NA	NA	NA	NA	TATDN2	10873	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	11812040	11812191	11812115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	51820	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	13035460	13035932	13035883	Y	CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	76685	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr3	13102024	13102205	13102123	Y	NA	IQSEC1	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	10412	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	13493281	13493606	13493395	Y	NA	NUP210,HDAC11,HDAC11-AS1	IQSEC1,NUP210	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HDAC11	25618	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	13920516	13920583	13920566	Y	WNT7A	WNT7A	NA	NA	NA	NA	WNT7A	898	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	13936849	13937176	13936976	Y	NA	WNT7A	C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WNT7A	17231	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr3	15105615	15105982	15105798	Y	NA	MRPS25,ZFYVE20	NA	NA	NA	NA	MRPS25	773	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	15109564	15109704	15109605	Y	ZFYVE20	MRPS25,ZFYVE20	NA	NA	NA	NA	MRPS25	4722	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	15450643	15451124	15450971	Y	ANKRD28,NR2C2,CAPN7,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5	EAF1,METTL6	NA	NA	NA	NA	EAF1	15738	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	15704167	15704382	15704274	Y	ANKRD28,CAPN7	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	62829	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	15813744	15814005	15813933	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,ANKRD28	NA	BTD	IMR90	Hi-C	24141950	HACL1	172406	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	16324333	16324353	16324342	Y	NA	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	19627	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	16551639	16552079	16551866	Y	NA	RFTN1	NA	NA	NA	NA	RFTN1	1454	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	17543312	17543623	17543461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	940686	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	17650424	17650697	17650561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	833612	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	18237686	18238028	18237782	Y	TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	246281	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	18252681	18253057	18252788	Y	TBC1D5,SATB1	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	231252	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	18403160	18403568	18403352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	80741	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SATB1	95162	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	19188369	19188866	19188531	Y	NA	KCNH8	NA	NA	NA	NA	KCNH8	423	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	19588918	19588928	19588923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB5A	397643	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	19993428	19993925	19993635	Y	KAT2B,RAB5A	RAB5A,RNU4-85P	NA	NA	NA	NA	RAB5A	6857	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	20190984	20191185	20191115	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	34599	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	21654380	21654503	21654471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF385D-AS1	72072	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr3	22168485	22168771	22168598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF385D-AS1	586177	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	25790563	25790933	25790768	Y	NA	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	31475	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	27448460	27448581	27448568	Y	NA	NA	NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	SLC4A7	75330	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	27524458	27524952	27524717	Y	NA	SLC4A7	NA	NA	NA	NA	SLC4A7	547	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	27575366	27575733	27575573	Y	NA	NA	AZI2,SLC4A7,NEK10,EOMES	IMR90	Hi-C	24141950	SLC4A7	51455	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr3	27707886	27708022	27707939	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	35419	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	27756583	27756832	27756794	Y	EOMES	EOMES	NA	NA	NA	NA	EOMES	5374	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	27957485	27957491	27957488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EOMES	195279	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	27984483	27984771	27984759	Y	ZCWPW2,EOMES	NA	NA	NA	NA	NA	EOMES	222277	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	28078428	28078736	28078583	Y	ZCWPW2,EOMES	NA	NA	NA	NA	NA	CMC1	202339	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	31690891	31691368	31691073	Y	ZNF860,OSBPL10	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	118761	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	32534481	32534843	32534759	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	8057	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	32549205	32549429	32549313	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	6305	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	32822383	32822764	32822428	Y	TRIM71	AC139452.2,TRIM71	NA	NA	NA	NA	AC139452.2	2374	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	32823053	32823413	32823146	Y	NA	AC139452.2,TRIM71	NA	NA	NA	NA	AC139452.2	1725	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	32857811	32858132	32857909	Y	NA	AC139452.2,TRIM71	NA	NA	NA	NA	TRIM71	301	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.81876218352206
chr3	33436260	33436332	33436276	Y	CLASP2,FBXL2,FBXL2	UBP1	NA	NA	NA	NA	UBP1	44531	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	33590851	33591213	33591209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBP1	109988	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	33758685	33758853	33758767	Y	UBP1,UBP1,CLASP2	CLASP2	NA	NA	NA	NA	CLASP2	837	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	34342174	34342425	34342178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD6IP	504330	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	36805780	36806178	36806113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPM2AIP1	226617	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr3	37495440	37496065	37495716	Y	ITGA9	ITGA9	NA	NA	NA	NA	ITGA9	3834	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	37733982	37734042	37734012	Y	C3orf35,ITGA9	NA	NA	NA	NA	NA	AC093415.2	167229	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	37901883	37902306	37902042	Y	CTDSPL	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	432	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	38046580	38046956	38046768	Y	SLC22A14	VILL,PLCD1	NA	NA	NA	NA	VILL	19030	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	39193999	39194528	39194467	Y	NA	TTC21A,GORASP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr3	39399859	39400185	39399921	Y	CCR8,SLC25A38	CCR8,SLC25A38,RPSA	NA	NA	NA	NA	SLC25A38	22654	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	41404443	41404837	41404640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNNB1	170115	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	42067110	42067525	42067205	Y	ULK4	TRAK1	TRAK1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	13816	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	43458781	43458976	43458878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNRK	132777	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	43519107	43519315	43519279	Y	SNRK	NA	NA	NA	NA	NA	SNRK	193103	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	44038399	44038801	44038781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANO10	307313	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	44040259	44040834	44040651	Y	NA	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	ANO10	309173	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr3	44621262	44622718	44622436	Y	NA	ZNF660,ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF197	1662	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	44697594	44698203	44697878	Y	NA	ZNF35,RP11-944L7.4	NA	NA	NA	NA	ZNF35	9375	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	47078393	47078462	47078449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC12	56893	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	47120016	47120037	47120026	Y	SETD2,KLHL18,PRSS45,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NA	SETD2	83420	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	47201175	47201471	47201342	Y	CSPG5,SETD2	SETD2,KIF9-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD2	1986	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	47203467	47203704	47203598	Y	NA	SETD2,KIF9-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD2	10	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr3	48332679	48332937	48332732	Y	SPINK8	NME6	NA	NA	NA	NA	NME6	8238	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	48651627	48651919	48651775	Y	TREX1,DALRD3,ARIH2	COL7A1,UQCRC1,SLC26A6,CELSR3	NA	NA	NA	NA	UQCRC1	5218	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	49123301	49123671	49123633	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2	NA	NA	NA	NA	QRICH1	6125	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	49503154	49503264	49503210	Y	NA	AMT,NICN1,DAG1	NA	NA	NA	NA	DAG1	882	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	50411624	50411893	50411737	Y	NA	TUSC2,RASSF1,CYB561D2,NPRL2,TMEM115	NA	NA	NA	NA	TMEM115	16583	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	51720527	51720790	51720691	Y	VPRBP	TEX264	NA	NA	NA	NA	TEX264	25818	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	52079728	52079827	52079778	Y	DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	8739	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	52080287	52080923	52080751	Y	NT5DC2,TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	7643	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	52271619	52271840	52271686	Y	PBRM1,WDR82,GLYCTK,TWF2,PPM1M,PPM1M	ALDOAP1,ALAS1,RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82	NA	NA	NA	NA	TWF2	343	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	52926819	52927340	52927162	Y	PBRM1,SFMBT1,SFMBT1,PRKCD,DCP1A,TMEM110	TMEM110-MUSTN1,TMEM110	NA	NA	NA	NA	TMEM110-MUSTN1	2238	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	53203443	53203654	53203536	Y	PBRM1,GLT8D1,DCP1A,PRKCD	RFT1,PRKCD	NA	NA	NA	NA	PRKCD	15418	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	53876999	53877298	53877116	Y	CHDH	CHDH,IL17RB,ACTR8,SELK	NA	NA	NA	NA	CHDH	1119	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	54686814	54686829	54686822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D3	532240	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	54725134	54725214	54725174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D3	570560	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	55601569	55601909	55601898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERC2	898482	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	57096152	57096374	57096203	Y	ASB14	ARHGEF3	NA	NA	NA	NA	ARHGEF3	14983	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	57197470	57197866	57197668	Y	NA	RP11-157F20.1,IL17RD	NA	NA	NA	NA	IL17RD	4468	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	57995926	57996426	57996121	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	3799	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	58029786	58030054	58029903	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	37659	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	58035006	58035314	58035102	Y	FLNB	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	42879	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	60715683	60716344	60716091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	518789	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	62311824	62311884	62311857	Y	NA	C3orf14,PTPRG-AS1	NA	NA	NA	NA	C3orf14	9176	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	62422700	62423042	62422978	Y	C3orf14,FEZF2,CADPS	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRG-AS1	69695	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	62638435	62638623	62638529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADPS	220431	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	62780450	62780695	62780574	Y	CADPS	NA	NA	NA	NA	NA	CADPS	78359	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	62926615	62926793	62926705	Y	CADPS	NA	NA	NA	NA	NA	CADPS	67561	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	64475093	64475304	64475254	Y	NA	NA	LOC100652759,LOC100287879,PRICKLE2,LOC100507062,PSMD6,ADAMTS9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ADAMTS9-AS2	193281	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	65013149	65013388	65013334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS9	341473	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	65694421	65694810	65694689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	327699	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	66021951	66022397	66022084	Y	NA	MAGI1	NA	NA	NA	NA	MAGI1	112	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr3	66022863	66023161	66022996	Y	MAGI1	MAGI1	NA	NA	NA	NA	MAGI1	354	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	66491047	66491055	66491050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG1	58632	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	66491612	66491762	66491706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG1	57925	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	71150221	71150629	71150383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	480511	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	71151319	71151713	71151657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	479427	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	71256015	71256172	71256059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	374968	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	71543445	71543660	71543534	Y	EIF4E3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	87480	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	72386025	72386536	72386317	Y	NA	NA	SHQ1,GXYLT2,RYBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00877	96309	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	72539985	72540363	72540053	Y	RYBP	RYBP	LOC201617,RYBP,SHQ1	IMR90	Hi-C	24141950	RYBP	45916	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	72862614	72863000	72862807	Y	SHQ1	SHQ1	NA	NA	NA	NA	SHQ1	46065	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	73806539	73806557	73806550	Y	NA	NA	PDZRN3	IMR90	Hi-C	24141950	PDZRN3	134448	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	77273270	77273652	77273462	Y	ROBO2,ROBO2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	792101	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	79667523	79667843	79667648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	147122	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	80819406	80819881	80819642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBE1	989431	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	19.3483950631785
chr3	80820355	80820528	80820440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBE1	988784	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr3	88151728	88152092	88151734	Y	NA	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	C3orf38	44801	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6	1144696	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	97200440	97200579	97200496	Y	EPHA6	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6	280786	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	97387840	97388118	97387927	Y	OR5AC2,EPHA6	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6	93247	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	97509307	97509490	97509360	Y	NA	ARL6	NA	NA	NA	NA	ARL6	27942	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	98505158	98505735	98505540	Y	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	112798	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	99575221	99575605	99575379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	255752	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	99944403	99944723	99944568	Y	NA	TBC1D23	C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D23	33121	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	100028092	100028475	100028284	Y	TBC1D23	NIT2	NA	NA	NA	NA	NIT2	23070	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	100054250	100054545	100054496	Y	NA	NIT2	NA	NA	NA	NA	NIT2	2705	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr3	100088429	100088702	100088566	Y	NA	NIT2,LNP1,TOMM70A	NA	NA	NA	NA	LNP1	29335	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	101444542	101444901	101444615	Y	FAM55C,FAM55C,CEP97	RPL24,CEP97	NA	NA	NA	NA	CEP97	3773	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	101556101	101556413	101556156	Y	SENP7,ZBTB11,NFKBIZ,NFKBIZ	NFKBIZ	NA	NA	NA	NA	NFKBIZ	11266	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	101653987	101654224	101654033	Y	NFKBIZ,NFKBIZ	NA	LOC152225,NFKBIZ	IMR90	Hi-C	24141950	NFKBIZ	109152	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	105630452	105630679	105630568	Y	NA	CBLB	NA	NA	NA	NA	CBLB	44056	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	107348544	107348833	107348648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	108761	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	107807468	107807936	107807811	Y	MYH15,CD47	NA	NA	NA	NA	NA	CD47	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	110688601	110689002	110688903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCXD2	702521	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	110744004	110744030	110744017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCXD2	647493	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	111589313	111589732	111589431	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	106125	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	111816359	111816505	111816432	Y	C3orf52	C3orf52	NA	NA	NA	NA	C3orf52	13177	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	112258715	112258936	112258847	Y	SLC35A5,ATG3	SLC35A5,ATG3	NA	NA	NA	NA	SLC35A5	19620	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr3	112885717	112885943	112885795	Y	NA	NA	BOC,WDR52,KIAA2018,SIDT1	IMR90	Hi-C	24141950	C3orf17	149009	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	114577698	114578255	114577941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	804238	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	115337526	115337854	115337690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	1405691	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	115503263	115503751	115503546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	1239794	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr3	115545713	115545826	115545800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	1197719	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	115843003	115843038	115843021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	900507	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	119023177	119023412	119023295	Y	NA	ARHGAP31,ARHGAP31-AS1	NA	NA	NA	NA	ARHGAP31	11957	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	119146429	119146829	119146680	Y	ARHGAP31,CD80,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	38848	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	119157549	119157626	119157588	Y	NA	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	28051	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	119238487	119238668	119238501	Y	NA	TIMMDC1	NA	NA	NA	NA	TIMMDC1	23108	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	119514057	119514298	119514132	Y	NR1I2,NR1I2	NA	NA	NA	NA	NA	COX17	119756	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr3	119798224	119798287	119798255	Y	NA	GSK3B,RP11-18H7.1	NA	NA	NA	NA	GSK3B	12977	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	120167583	120167922	120167648	Y	NA	FSTL1	NA	NA	NA	NA	FSTL1	178	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	120277715	120278240	120277932	Y	NA	NDUFB4	FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB4	34916	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	121257379	121257441	121257436	Y	NA	RPL7AP11,POLQ,ARGFX	NA	NA	NA	NA	POLQ	5412	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	121520314	121520680	121520641	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	31246	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	121539764	121539854	121539811	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	12072	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	122397553	122397693	122397558	Y	CSTA,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,HSPBAP1,DIRC2,PARP14	EIF4BP8	NA	NA	NA	NA	EIF4BP8	20093	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	122488258	122488637	122488447	Y	CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	22034	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	123358215	123358608	123358268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	55826	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	123372011	123372488	123372368	Y	MYLK	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	69622	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	124419861	124420177	124419915	Y	KALRN	UMPS	NA	NA	NA	NA	UMPS	27036	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	124553626	124554125	124554004	Y	KALRN	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	64140	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	124604448	124604779	124604703	Y	NA	ITGB5	NA	NA	NA	NA	ITGB5	13486	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	124605050	124605342	124605178	Y	ITGB5	ITGB5	NA	NA	NA	NA	ITGB5	12923	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	SLC41A3	108923	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	125986265	125986571	125986320	Y	NA	RP11-71E19.1	KLF15,ZXDC,ALDH1L1,CCDC37	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-71E19.1	2626	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	125987620	125987662	125987641	Y	NA	RP11-71E19.1	KLF15,ZXDC,ALDH1L1,CCDC37	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-71E19.1	3981	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	126074775	126075511	126074965	Y	ALDH1L1,UROC1,CCDC37,KLF15	KLF15	NA	NA	NA	NA	KLF15	490	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	126108107	126108472	126108304	Y	NA	KLF15	KLF15,CCDC37,ALDH1L1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF15	33822	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	126391611	126391660	126391640	Y	NA	TXNRD3,CHCHD6	NA	NA	NA	NA	TXNRD3	19613	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	126680194	126680270	126680232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	259131	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	126702933	126703224	126703109	Y	NA	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	281870	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	127244302	127244595	127244437	Y	NA	NA	UROC1,CHST13,NUP210P1,CHCHD6	IMR90	Hi-C	24141950	MCM2	70471	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	127266508	127266786	127266647	Y	KBTBD12	MCM2,TPRA1	CHCHD6	IMR90	Hi-C	24141950	MCM2	48280	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	127465577	127465875	127465733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABTB1	75799	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	127554319	127554718	127554519	Y	NA	NA	MCM2,PODXL2	IMR90	Hi-C	24141950	ABTB1	164541	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	127729316	127729371	127729322	Y	DNAJB8	SEC61A1	SEC61A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SEC61A1	39113	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	128135736	128135843	128135790	Y	GATA2,GATA2,GATA2,C3orf27,DNAJB8	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475N22.4	70212	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	128475272	128475670	128475352	Y	RAB7A,ISY1,CNBP	RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	6191	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	128564550	128565114	128564776	Y	DNAJB8,KIAA1257	ACAD9	NA	NA	NA	NA	ACAD9	31325	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	128745839	128746109	128746044	Y	NA	KIAA1257	NA	NA	NA	NA	KIAA1257	26306	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr3	128837764	128838022	128837873	Y	MBD4,H1FX,C3orf37,C3orf37,KIAA1257,ISY1,CNBP,RAB43,RAB43,RAB43,RAB43	RAB43,ISY1-RAB43,ISY1	NA	NA	NA	NA	RAB43	1622	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	128945338	128945482	128945420	Y	MBD4,ISY1,CNBP	CNBP	KIAA1257,CCDC48,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1,GP9,C3orf37	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNBP	44573	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	128958880	128959235	128959095	Y	H1FOO	NA	KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNBP	58115	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	129245456	129245718	129245564	Y	RHO	NA	NA	NA	NA	NA	PLXND1	77943	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	129322103	129322311	129322182	Y	PLXND1	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	1350	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	129344975	129345039	129344984	Y	NA	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	21314	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	129346331	129346490	129346427	Y	PLXND1	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	22670	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	129690304	129690667	129690526	Y	H1FOO	TRH	NA	NA	NA	NA	TRH	481	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr3	131056791	131057139	131056963	Y	NA	NUDT16P1,RP11-933H2.4,NUDT16	NA	NA	NA	NA	NUDT16P1	21603	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	132002464	132002523	132002494	Y	NA	RPL7P16,CPNE4,ACPP	NA	NA	NA	NA	CPNE4	210	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	132787514	132787599	132787560	Y	CCRL1,UBA5,TMEM108	TMEM108	NA	NA	NA	NA	TMEM108	32279	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	133147395	133147694	133147637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDV3	142880	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	134047160	134047394	134047241	Y	ANAPC13,ANAPC13,ANAPC13,AMOTL2	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	16742	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	134182898	134183261	134183039	Y	AMOTL2	CEP63,ANAPC13	NA	NA	NA	NA	CEP63	19324	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	134874627	134874847	134874784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHB1	559984	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	136153802	136154197	136154172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCCB	186654	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	136327517	136327655	136327647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG1	141565	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	136420425	136420819	136420623	Y	NA	STAG1	NA	NA	NA	NA	STAG1	48401	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	136448168	136448437	136448423	Y	NA	STAG1	NA	NA	NA	NA	STAG1	20783	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	136631651	136631818	136631718	Y	NA	IL20RB	NA	NA	NA	NA	IL20RB	31254	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	137768870	137769254	137769106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DZIP1L	63406	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	138364761	138365360	138365102	Y	PIK3CB,ARMC8	FAIM	NA	NA	NA	NA	FAIM	39313	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	138581550	138581663	138581597	Y	NA	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	29770	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr3	138582294	138582582	138582441	Y	MRPS22	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	30514	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr3	139064285	139064552	139064299	Y	NA	COPB2,RP11-319G6.1	NA	NA	NA	NA	COPB2	42022	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	140800268	140800553	140800397	Y	NA	SPSB4	NA	NA	NA	NA	SPSB4	32024	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	141230074	141230471	141230125	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	26185	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	142580771	142580984	142580878	Y	NA	RP11-372E1.1,PCOLCE2	NA	NA	NA	NA	PCOLCE2	25061	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	142723898	142724007	142723903	Y	NA	U2SURP	NA	NA	NA	NA	U2SURP	42559	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	143750878	143751045	143750942	Y	SLC9A9	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf58	62238	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	143853302	143853504	143853403	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf58	164662	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	146257874	146258309	146258204	Y	NA	PLSCR2,PLSCR1	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	2342	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	146745799	146745822	146745813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZIC1	363387	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	147744234	147744618	147744426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P20	138467	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	149665014	149665210	149665089	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	18962	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	149665230	149665637	149665395	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	18535	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	149676286	149676648	149676501	Y	TM4SF4	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	7524	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	150714222	150714233	150714228	Y	CLRN1	CLRN1	NA	NA	NA	NA	CLRN1	25436	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	158226530	158226854	158226539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-538P18.2	60001	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	158827452	158827795	158827624	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSD1	379465	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	159493461	159493761	159493605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCHIP1	61889	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	159514645	159514911	159514780	Y	NA	SCHIP1	NA	NA	NA	NA	SCHIP1	40739	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	159538960	159539273	159539207	Y	NA	SCHIP1	NA	NA	NA	NA	SCHIP1	16377	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	160949185	160949470	160949344	Y	OTOL1	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALNT1	128013	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	161133387	161133714	161133484	Y	NA	NA	NMD3	MCF7	ChIA-PET	22265404	B3GALNT1	312215	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	161138601	161138921	161138632	Y	NMD3,C3orf57	NA	NMD3,PPM1L,B3GALNT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	B3GALNT1	317429	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	161521648	161521661	161521655	Y	OTOL1	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALNT1	700476	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	161852420	161852720	161852505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALNT1	1031248	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	165215973	165216343	165216172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBBX	1880791	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	167699117	167699438	167699278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOLIM4	112325	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	167737805	167738014	167737910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOLIM4	73749	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	169344202	169344434	169344318	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	34972	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	169376858	169377055	169376957	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	2351	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	169379831	169380308	169379976	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	425	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	169508571	169508792	169508647	Y	NA	TERC,MYNN,LRRC34	NA	NA	NA	NA	MYNN	19952	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	169751384	169751667	169751487	Y	SKIL,SKIL,SEC62,GPR160	GPR160	SEC62,LOC100128164,GPR160	IMR90	Hi-C	24141950	GPR160	2050	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	169872442	169872609	169872497	Y	NA	PHC3	NA	NA	NA	NA	PHC3	24928	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	170073991	170074311	170074218	Y	SKIL,SKIL	SKIL	NA	NA	NA	NA	SKIL	525	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	170537587	170537835	170537668	Y	NA	RPL22L1	SLC7A14,CLDN11,PRKCI,SKIL	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22L1	48437	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	170584649	170585013	170584680	Y	NA	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	RPL22L1	1259	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	170883066	170883220	170883212	Y	TNIK	NA	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	258584	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	171792323	171792831	171792493	Y	PLD1,FNDC3B	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	36905	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	171820468	171820770	171820540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	65050	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	171853185	171854055	171853751	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	97767	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	171855430	171855856	171855550	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	100012	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	171948409	171948713	171948561	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	192991	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	172416643	172417031	172416658	Y	NA	NCEH1,ECT2	NA	NA	NA	NA	NCEH1	9977	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	172510084	172510259	172510171	Y	NA	ECT2,RNU4-4P	NA	NA	NA	NA	RNU4-4P	2089	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr3	173197299	173197871	173197356	Y	NLGN1	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-4P	684951	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	173457450	173457753	173457673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	635281	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	173462363	173462632	173462507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	630402	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	173767282	173767499	173767320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	325535	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	176774167	176774584	176774367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	138677	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	176776147	176776153	176776150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	137108	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	177018025	177018414	177018104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	104764	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	177075253	177075542	177075439	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	161992	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	177076157	177076922	177076435	Y	TBL1XR1	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	162896	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr3	177077500	177078084	177077832	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	164239	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr3	179309053	179309431	179309273	Y	NA	ACTL6A,MRPL47,NDUFB5	NA	NA	NA	NA	MRPL47	11011	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	179659956	179660305	179660211	Y	PEX5L	NA	NA	NA	NA	NA	USP13	291413	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	180475891	180475917	180475905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FXR1	108012	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	181035769	181036114	181035791	Y	SOX2,DNAJC19,DNAJC19	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC19	330207	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	181418145	181418802	181418404	Y	SOX2	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	8912	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	181442269	181442851	181442522	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	14555	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.29125731011324
chr3	181444404	181445128	181444694	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	16690	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.81876218352206
chr3	181445730	181446151	181445947	Y	SOX2	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	18016	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	182903549	182903677	182903631	Y	ATP11B,KLHL6,KLHL24,B3GNT5	LAMP3	NA	NA	NA	NA	LAMP3	23922	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	183271974	183272463	183272322	Y	B3GNT5,KLHL6,KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL24	78893	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	184078263	184078665	184078465	Y	NA	EIF4G1,FAM131A,CLCN2,POLR2H,CHRD	NA	NA	NA	NA	POLR2H	757	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	184560038	184560430	184560098	Y	VPS8	VPS8	NA	NA	NA	NA	VPS8	32107	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	185339016	185339200	185339107	Y	NA	SENP2	NA	NA	NA	NA	SENP2	40732	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr3	185533882	185534105	185533994	Y	NA	IGF2BP2	SENP2	IMR90	Hi-C	24141950	IGF2BP2	6739	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	185825302	185825582	185825395	Y	NA	ETV5	NA	NA	NA	NA	ETV5	525	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	186490704	186490868	186490793	Y	ST6GAL1,TBCCD1,TBCCD1,EIF4A2	EIF4A2,RFC4	NA	NA	NA	NA	EIF4A2	8126	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr3	186606472	186606663	186606569	Y	ST6GAL1,RTP4	ST6GAL1	NA	NA	NA	NA	ST6GAL1	39611	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	186819692	186820086	186819740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL39L	76610	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	187467867	187468249	187468141	Y	BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	6352	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	187607399	187607588	187607479	Y	BCL6	NA	BCL6,LPP	IMR90	Hi-C	24141950	BCL6	145884	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	187983465	187984215	187983993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	113620	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	187984257	187984703	187984570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	114412	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	188002342	188002742	188002584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	132497	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	189240469	189240487	189240479	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1-AS1	577041	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	189524070	189524362	189524216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1-AS1	312391	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr3	192561492	192561800	192561547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MB21D2	72150	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	192634153	192634990	192634777	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	203	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	193859199	193859624	193859359	Y	TMEM44	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	7265	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	193993457	193993565	193993509	Y	NA	NA	LOC647323,LOC100131551	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC15	94907	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	194041526	194041906	194041553	Y	HES1	LRRC15	NA	NA	NA	NA	LRRC15	46566	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	194227767	194228126	194227819	Y	ATP13A3	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	10674	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	194239482	194239862	194239672	Y	NA	ATP13A3	TMEM44,ATP13A3,GP5,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	ATP13A3	22389	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	194253479	194253627	194253544	Y	ATP13A3	ATP13A3,TMEM44-AS1	TMEM44,ATP13A3,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	ATP13A3	36386	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	194461690	194461887	194461800	Y	FAM43A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM43A	57068	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	194850291	194850713	194850430	Y	PPP1R2,LSG1	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	139183	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	194875742	194876159	194875826	Y	FAM43A,C3orf21	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	113737	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	194909017	194909237	194909137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	80659	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	195153778	195154174	195153996	Y	NA	ACAP2	NA	NA	NA	NA	ACAP2	7633	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	195258657	195259038	195258847	Y	ACAP2,TNK2,PPP1R2	PPP1R2	NA	NA	NA	NA	PPP1R2	9171	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	195430866	195431240	195430948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MUC4	105908	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	195849521	195850263	195850145	Y	TFRC,TFRC	TFRC	LOC401109,PCYT1A,TFRC,MIR570,MUC20,UBXN7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFRC	42461	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	195871770	195871934	195871856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFRC	64710	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	195891844	195892227	195892035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFRC	84784	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	195946209	195946432	195946330	Y	UBXN7,RNF168,CEP19,TNK2,PCYT1A,ZDHHC19	NA	NA	NA	NA	NA	PCYT1A	66396	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	196255741	196255873	196255820	Y	NA	RNF168,FBXO45,WDR53	UBXN7,MUC20,RNF168,C3orf43,PCYT1A,TM4SF19-TCTEX1D2,WDR53,FBXO45,CEP19	IMR90	Hi-C	24141950	RNF168	27102	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr3	196290932	196291284	196291114	Y	NA	FBXO45,WDR53	NA	NA	NA	NA	FBXO45	2198	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr3	196347011	196347384	196347194	Y	PCYT1A,RNF168,SENP5,LRRC33	PIGX	WDR53,FBXO45,SENP5,UBXN7,LRRC33	IMR90	Hi-C	24141950	PIGX	17262	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	196377844	196378239	196377963	Y	NA	PIGX	NA	NA	NA	NA	PIGX	13198	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	196696811	196697020	196696957	Y	LRRC33,PIGZ	NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1	NA	NA	NA	NA	PIGZ	2880	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr3	196757369	196757726	196757658	Y	LRRC33,SENP5,MFI2,MFI2	AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2	NA	NA	NA	NA	MFI2	2682	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	197254564	197254715	197254640	Y	NA	BDH1	NA	NA	NA	NA	BDH1	43479	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr3	197478210	197478491	197478305	Y	IQCG,KIAA0226,FYTTD1,FYTTD1,LRCH3	FYTTD1,KIAA0226,LRCH3	NA	NA	NA	NA	KIAA0226	3612	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	257243	257573	257339	Y	PDE6B	ZNF732	NA	NA	NA	NA	ZNF732	39537	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	751950	752022	752014	Y	NA	RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	21615	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	873387	873975	873731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAK	50186	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	1049620	1049756	1049677	Y	NA	FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	47896	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	2538945	2539718	2539367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	76998	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	2780332	2780529	2780439	Y	NA	TNIP2,SH3BP2	NA	NA	NA	NA	SH3BP2	12221	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr4	3203733	3204143	3203890	Y	SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,HTT	NA	NA	NA	NA	NA	RGS12	88612	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	3357519	3357800	3357660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS12	64764	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	3469404	3469760	3469670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	62526	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	3492056	3492792	3492287	Y	DOK7	LRPAP1	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	39494	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr4	3931557	3931999	3931672	Y	NA	FAM86EP	NA	NA	NA	NA	FAM86EP	23147	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr4	6635412	6635534	6635472	Y	NA	MRFAP1,AC093323.3,RP11-539L10.3	NA	NA	NA	NA	MRFAP1	4284	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	6918330	6918775	6918508	Y	KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	9361	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	6928884	6929127	6929009	Y	KIAA0232,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	19915	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	7830043	7830393	7830208	Y	SH3TC1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	109260	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	7833117	7833393	7833178	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	106260	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	7877911	7878253	7878055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	61400	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	7974971	7975417	7975298	Y	AFAP1	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	35318	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	9154755	9155069	9154900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMX1	283212	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr4	10116801	10117310	10116981	Y	WDR1	WDR1	NA	NA	NA	NA	WDR1	228	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	10459917	10460083	10460004	Y	NA	ZNF518B	NA	NA	NA	NA	ZNF518B	2883	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	11603431	11603452	11603441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST1	174042	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr4	12642016	12642195	12642111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90AB2P	690843	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr4	13329661	13329866	13329822	Y	NA	HSP90AB2P	HSP90AB2P	IMR90	Hi-C	24141950	HSP90AB2P	3172	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	13908947	13909321	13909089	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,LOC152742	IMR90	Hi-C	24141950	AC006445.7	276724	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	13922430	13922925	13922628	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,C1QTNF7	IMR90	Hi-C	24141950	AC006445.7	290207	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	14223789	14223802	14223796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC006445.7	591566	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr4	14439704	14439728	14439717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB2	562570	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	15163714	15164045	15163880	Y	NA	NA	CPEB2	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB2	161416	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	15297006	15297030	15297019	Y	NA	NA	C1QTNF7	IMR90	Hi-C	24141950	CC2D2A	172459	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr4	15485746	15486124	15486037	Y	CC2D2A	CC2D2A	NA	NA	NA	NA	CC2D2A	16257	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	15553738	15553982	15553851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CC2D2A	84249	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	15590411	15590648	15590624	Y	FBXL5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	90637	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	15594702	15595080	15594956	Y	FBXL5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	86205	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	15655935	15656313	15656300	Y	FBXL5,BST1	FAM200B,FBXL5	NA	NA	NA	NA	FAM200B	24972	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	16003610	16004023	16003987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PROM1	79978	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	17642152	17642177	17642165	Y	CLRN2	MED28	NA	NA	NA	NA	MED28	27898	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	17979858	17980211	17980206	Y	CLRN2,LCORL	LCORL	NA	NA	NA	NA	LCORL	41288	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	20911113	20911126	20911120	Y	KCNIP4,KCNIP4,KCNIP4	NA	NA	NA	NA	NA	PACRGL	215208	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	22270180	22270523	22270471	Y	NA	NA	LOC100505912	IMR90	Hi-C	24141950	GPR125	245154	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	22363170	22363219	22363195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR125	152458	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	24332761	24333117	24332939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX15	251056	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	24474307	24474984	24474891	Y	NA	NA	PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	109189	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr4	26077794	26078229	26078077	Y	RBPJ,RBPJ	NA	RBPJ	IMR90	Hi-C	24141950	RBPJ	84848	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	27362567	27362929	27362697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	502346	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	28761802	28762128	28761877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	1901581	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	36131031	36131404	36131217	Y	ARAP2	NA	NA	NA	NA	NA	RELL1	1554594	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	36325568	36325959	36325621	Y	ARAP2	NA	NA	NA	NA	NA	RELL1	1360039	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	39908966	39909133	39909103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDS5A	68443	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr4	40165955	40166245	40166174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP2	109509	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	40609271	40609510	40609444	Y	NA	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	21382	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	40623743	40623952	40623867	Y	RBM47	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	6940	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	40628320	40628499	40628391	Y	NA	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	2393	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	40628627	40628976	40628881	Y	NA	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	1916	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	40674578	40674731	40674666	Y	RBM47	RBM47	RBM47	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBM47	43686	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr4	40674929	40675349	40675137	Y	RBM47	RBM47	RBM47	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBM47	44037	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	40791893	40792102	40791997	Y	NSUN7	NSUN7	NA	NA	NA	NA	NSUN7	41979	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	41469951	41470276	41469966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	110327	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	41574178	41574364	41574271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	214554	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	48840387	48840419	48840403	Y	NA	OCIAD1	NA	NA	NA	NA	OCIAD1	35158	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	55093024	55093294	55093182	Y	PDGFRA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFRA	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	57132335	57132393	57132366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AASDH	119273	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr4	57740482	57740676	57740556	Y	PPAT,REST	REST	THEGL,SPINK2	IMR90	Hi-C	24141950	REST	31399	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr4	58131678	58131691	58131684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP7	157127	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	58192382	58192585	58192405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP7	217831	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr4	66899965	66900079	66900021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	57765	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	68266370	68266649	68266476	Y	NA	RP11-584P21.4	NA	NA	NA	NA	RP11-584P21.4	43336	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	71677284	71677574	71677429	Y	NA	GRSF1	NA	NA	NA	NA	GRSF1	26088	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	72393405	72393600	72393503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCK	537150	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	75945312	75945392	75945352	Y	PARM1	NA	NA	NA	NA	NA	PARM1	89007	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	76611672	76611775	76611733	Y	RCHY1	G3BP2,USO1	NA	NA	NA	NA	G3BP2	35934	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	77041502	77041599	77041551	Y	NA	NUP54	NA	NA	NA	NA	NUP54	26069	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	78977894	78978171	78977912	Y	FRAS1	FRAS1	NA	NA	NA	NA	FRAS1	1170	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr4	79253143	79253310	79253148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA3	217363	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	79450278	79450622	79450544	Y	NA	ANXA3	ANXA3	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA3	20051	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	79521197	79521480	79521236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA3	50524	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	79859042	79859275	79859190	Y	PAQR3	PAQR3	NA	NA	NA	NA	PAQR3	450	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	81101972	81102294	81102042	Y	ANTXR2,PRDM8	NA	NA	NA	NA	NA	PAQR3	1243380	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	82342695	82343029	82342890	Y	RASGEF1B	NA	NA	NA	NA	NA	RASGEF1B,RP11-689K5.3	620368	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr4	83755588	83755973	83755970	Y	NA	SCD5	NA	NA	NA	NA	SCD5	37578	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	85420434	85420908	85420714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDS1	81224	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	87838829	87839174	87839055	Y	NA	AFF1,TECRP1	NA	NA	NA	NA	AFF1	14980	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	87882810	87883321	87882982	Y	KLHL8,AFF1,AFF1	AFF1,TECRP1	NA	NA	NA	NA	TECRP1	13534	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	87932880	87932928	87932888	Y	AFF1,AFF1	NA	NA	NA	NA	NA	TECRP1	63604	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr4	88899947	88900287	88900059	Y	NA	SPP1,RNU1-36P,PKD2	NA	NA	NA	NA	SPP1	5128	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	89747458	89747948	89747469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGY	306518	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	94201595	94201955	94201779	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCAD1	924807	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	102254740	102255090	102255043	Y	NA	AP001816.1,PPP3CA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	11847	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	103967476	103967511	103967493	Y	NA	SLC9B1	NA	NA	NA	NA	SLC9B1	28580	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	104302340	104302484	104302413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-328K4.1	127024	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	110449545	110449722	110449703	Y	SEC24B	CCDC109B	CCDC109B	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC109B	29639	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	111117471	111117868	111117585	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	487	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	113680523	113680828	113680684	Y	NA	RP11-119H12.1,RPL7AP30	NA	NA	NA	NA	RP11-119H12.1	22695	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	113852159	113852312	113852236	Y	ANK2,ANK2	NA	NA	NA	NA	NA	ANK2	114894	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr4	113956940	113957168	113957054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANK2	219675	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	113972367	113972735	113972428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANK2	235102	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr4	113985460	113985726	113985592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANK2	248195	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	114355245	114355627	114355568	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	15766	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr4	114389425	114389805	114389547	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	49946	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	114730352	114730805	114730660	Y	NA	CAMK2D	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	49269	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	117519495	117520605	117520296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNHG8	1677259	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr4	119187150	119187543	119187362	Y	NA	SNHG8	NA	NA	NA	NA	SNHG8	10321	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	122606332	122606884	122606598	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	9384	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	123074024	123074337	123074286	Y	KIAA1109,IL21,IL2	KIAA1109	KIAA1109	K562	ChIA-PET	22265404	KIAA1109	2536	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	123436599	123436634	123436617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CETN4P	214714	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	123704519	123704897	123704616	Y	FGF2	FGF2	FGF2,NUDT6,SPATA5	IMR90	Hi-C	24141950	FGF2	40966	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	123717999	123718400	123718196	Y	NA	FGF2	FGF2,NUDT6,BBS12	IMR90	Hi-C	24141950	FGF2	27463	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	123792983	123793156	123793069	Y	NA	FGF2,NUDT6,SPATA5	NA	NA	NA	NA	FGF2	47120	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr4	125634465	125634726	125634691	Y	NA	ANKRD50	NA	NA	NA	NA	ANKRD50	2578	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	128990801	128990842	128990822	Y	NA	LARP1B	NA	NA	NA	NA	LARP1B	10378	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	129389693	129389923	129389761	Y	NA	NA	PHF17,PGRMC2	IMR90	Hi-C	24141950	PGRMC2	181709	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	129605409	129605648	129605529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGRMC2	397425	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	139960222	139960706	139960403	Y	CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25279	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	140003738	140004448	140004114	Y	CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2	NA	CCRN4L	K562	ChIA-PET	22265404	CCRN4L	68795	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	140074901	140075184	140075104	Y	NA	ELF2	CCRN4L,ELF2,NAA15,NDUFC1	IMR90	Hi-C	24141950	ELF2	21188	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	140292626	140292906	140292778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	70921	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	140334690	140334958	140334824	Y	ELF2	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	37428	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	140967961	140968185	140967999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCOC	208255	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr4	140982751	140983079	140982915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCOC	193361	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	141013693	141013823	141013696	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	SCOC	162617	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	141218386	141218686	141218436	Y	MAML3,SCOC	SCOC	NA	NA	NA	NA	SCOC	41946	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	146015172	146015244	146015208	Y	NA	ABCE1,ANAPC10	NA	NA	NA	NA	ABCE1	1840	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	150756513	150756641	150756613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	1178238	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	151681778	151681989	151681952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	252890	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	152090134	152090652	152090546	Y	SH3D19	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	71409	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	152246032	152246165	152246086	Y	FAM160A1	NA	FAM160A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-610P16.1	81822	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	152650918	152651090	152650938	Y	NA	PET112	NA	NA	NA	NA	PET112	29085	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	153717992	153718074	153718038	Y	NA	TIGD4,ARFIP1	NA	NA	NA	NA	ARFIP1	18903	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr4	153884926	153884958	153884941	Y	NA	RP11-206F17.2,FHDC1	NA	NA	NA	NA	FHDC1	29422	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	154154502	154154721	154154529	Y	TRIM2,TRIM2	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM2	83008	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	154711358	154711691	154711551	Y	NA	RNF175,SFRP2	NA	NA	NA	NA	SFRP2	3086	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr4	154711839	154712367	154712106	Y	SFRP2	RNF175,SFRP2	NA	NA	NA	NA	SFRP2	3567	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	155723940	155724160	155724050	Y	NA	RBM46	NA	NA	NA	NA	RBM46	23575	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	160760364	160760617	160760491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	1072074	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	164740451	164740688	164740570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAF1	654378	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	164876357	164876532	164876526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAF1	790284	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr4	165210734	165210789	165210744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-366M4.3	585367	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr4	169802596	169802736	169802661	Y	PALLD	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	126690	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	169992046	169992220	169992129	Y	NA	NA	SH3RF1,NEK1	IMR90	Hi-C	24141950	CBR4	62620	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr4	170570348	170570457	170570384	Y	NA	NEK1,CLCN3	NA	NA	NA	NA	CLCN3	38564	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	174337339	174338040	174337759	Y	SAP30	SAP30	HMGB2,GALNT7,SAP30	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SAP30	48219	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	181271168	181271409	181271288	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-45P	2235153	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	182070656	182070725	182070691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCTD	1766364	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	185202640	185202839	185202718	Y	CASP3	NA	IRF2,CCDC111,MLF1IP,LOC728175,CASP3	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2	190895	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	185382837	185383066	185382954	Y	NA	IRF2	NA	NA	NA	NA	IRF2	10668	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	186760271	186760668	186760511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDLIM3	305505	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	187606948	187607189	187607069	Y	NA	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	38687	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	187621819	187622251	187622136	Y	NA	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	23625	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	188590659	188590926	188590793	Y	NA	NA	FAT1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP42	323999	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	188953266	188953567	188953377	Y	NA	ZFP42	ZFP42,TRIML1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP42	38341	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	189029344	189029687	189029466	Y	ZFP42,TRIML2	TRIML2	FAT1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIML2	587	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.80042560124951
chr4	190801470	190801552	190801511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	58391	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr4	190942271	190942591	190942322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	82328	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	53990	54174	54063	Y	PLEKHG4B,C5orf55	CTD-2231H16.1	LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2231H16.1	36092	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr5	373695	374160	373984	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67098	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	TPPP	93141	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	1041596	1043550	1041859	Y	NA	NKD2	NA	NA	NA	NA	NKD2	34652	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	1182870	1183091	1183042	Y	SLC6A19,SLC6A18	NA	LOC100506688,TERT,SLC6A19,TRIP13	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC12A7	72720	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	1498250	1498484	1498297	Y	LPCAT1	LPCAT1	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	23608	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	1501941	1502569	1502322	Y	LPCAT1	LPCAT1	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	19523	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	1725421	1725568	1725519	Y	NA	NA	MIR4277	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL36	73912	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	2580576	2580893	2580736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf38	169352	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	2750184	2750594	2750355	Y	C5orf38,IRX2	IRX2	NA	NA	NA	NA	C5orf38	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr5	4412030	4412043	4412037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRX1	817862	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	5209907	5210282	5210095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	208495	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	81417	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.54584145568138
chr5	7879383	7879659	7879544	Y	NA	MTRR,C5orf49,FASTKD3	NA	NA	NA	NA	FASTKD3	12233	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	10733059	10733302	10733226	Y	NA	DAP	NA	NA	NA	NA	DAP	26082	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	14142803	14143164	14142969	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	992	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	14264855	14265210	14264930	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	123044	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	14268390	14268821	14268476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	126579	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	16182017	16182269	16182250	Y	MARCH11	MARCH11	NA	NA	NA	NA	MARCH11	3146	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	16727981	16728387	16728161	Y	FAM134B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	112814	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	16736297	16736738	16736539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	121130	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	16740893	16741285	16741194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	125726	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr5	24155781	24155941	24155882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH10	487146	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	25438068	25438428	25438198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	249303	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	25443137	25443499	25443483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	254372	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	33442170	33442454	33442303	Y	NA	CTD-2203K17.1,TARS	NA	NA	NA	NA	TARS	3368	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr5	33671500	33671855	33671579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS12	218442	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	35854333	35854826	35854591	Y	SPEF2,IL7R	NA	SPEF2	IMR90	Hi-C	24141950	UGT3A2	214634	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	36022010	36022160	36022087	Y	UGT3A2	UGT3A2	NA	NA	NA	NA	UGT3A2	47300	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	36151218	36151404	36151252	Y	C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	1127	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	36229884	36229947	36229916	Y	UGT3A1,C5orf33,C5orf33	NA	NA	NA	NA	NA	SKP2	79793	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	39185861	39186166	39186014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	113351	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	39716547	39716931	39716737	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	256145	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	40840324	40840492	40840354	Y	NA	PRKAA1,RPL37	NA	NA	NA	NA	RPL37	6887	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	41845041	41845055	41845050	Y	OXCT1,FBXO4	OXCT1	NA	NA	NA	NA	OXCT1	23566	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	43498058	43498404	43498231	Y	NA	C5orf28,RP11-159F24.3,C5orf34	C5orf28	MCF7	ChIA-PET	22265404	C5orf34	14843	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	52545484	52545615	52545603	Y	ITGA2,FST	NA	ARL15,FST	IMR90	Hi-C	24141950	MOCS2	141591	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	53886377	53886761	53886569	Y	SNX18,SNX18	NA	SNX18	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	74788	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	54722913	54723133	54723024	Y	SKIV2L2	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	101396	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	54741987	54742107	54742028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	82422	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	54759780	54760082	54759933	Y	NA	NA	SKIV2L2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF138P1	64447	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	54791399	54791640	54791617	Y	NA	RNF138P1,PPAP2A	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	32889	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	54817845	54817996	54817921	Y	NA	RNF138P1,PPAP2A	SKIV2L2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF138P1	6533	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	54897039	54897427	54897238	Y	IL6ST,PPAP2A	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2A	68161	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	55288370	55289209	55288952	Y	IL6ST	NA	NA	NA	NA	NA	IL6ST,CTD-2031P19.3	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	55457979	55458137	55458083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD55	69049	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	58134614	58134758	58134713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	380527	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	58232883	58233370	58233101	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	478796	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	10.4379499682936
chr5	60315642	60315784	60315678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFAF2	76686	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	60704594	60705129	60704691	Y	NA	RPL3P6	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	18896	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	64331292	64332267	64331637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWC27	268535	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	64398874	64399506	64398924	Y	NA	NA	ADAMTS6,CWC27,PPWD1,CENPK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CWC27	336117	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	65030733	65031192	65030953	Y	SREK1,ERBB2IP,SGTB	NLN,SGTB	NA	NA	NA	NA	SGTB	13871	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	66188697	66188845	66188789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAST4-AS1	108936	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	SLC30A5	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	48595	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr5	70772003	70772134	70772073	Y	NA	BDP1	NA	NA	NA	NA	BDP1	22561	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	71218510	71218673	71218589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	182388	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	71404360	71404518	71404455	Y	MAP1B	MAP1B	NA	NA	NA	NA	MAP1B	3299	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	71424352	71424432	71424374	Y	NA	MAP1B	NA	NA	NA	NA	MAP1B	23291	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	71462643	71462861	71462688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	61582	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	71804159	71804292	71804254	Y	ZNF366	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS27	189686	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	72599094	72599410	72599166	Y	NA	NA	FCHO2,BTF3,FOXD1,TMEM171	IMR90	Hi-C	24141950	FOXD1	142942	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	74163639	74163858	74163748	Y	NA	FAM169A	GFM2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM169A	2863	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	74800476	74800595	74800536	Y	NA	POLK,COL4A3BP	NA	NA	NA	NA	POLK	4986	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	75756691	75756710	75756701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQGAP2	59617	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	76103019	76103387	76103332	Y	F2RL1	F2RL1	F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R	IMR90	Hi-C	24141950	F2RL1	9371	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	4.58251462022648
chr5	76103961	76104259	76104075	Y	NA	F2RL1	F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R	IMR90	Hi-C	24141950	F2RL1	8499	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	76110007	76110333	76110205	Y	NA	F2RL1	NA	NA	NA	NA	F2RL1	2425	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	76928376	76928558	76928504	Y	NA	WDR41	NA	NA	NA	NA	WDR41	13940	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	79458255	79458620	79458438	Y	MSH3,SERINC5	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	91278	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	79480253	79480678	79480326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	69220	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	79487807	79488093	79488033	Y	SERINC5	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	61805	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	79553045	79553765	79553579	Y	NA	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	3147	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr5	80579237	80579431	80579394	Y	NA	CKMT2-AS1,ZCCHC9	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	15948	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	NA	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATG10	117781	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	81934356	81934439	81934367	Y	NA	NA	VCAN	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	361960	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	82005927	82005935	82005931	Y	ATP6AP1L	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC4	365382	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	82769254	82769739	82769524	Y	VCAN	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	3970	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	82770174	82770695	82770300	Y	NA	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	4890	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	82847701	82847887	82847796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCAN	82417	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	83018086	83018575	83018426	Y	NA	HAPLN1	NA	NA	NA	NA	HAPLN1	2654	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	86662563	86662890	86662661	Y	RASA1,RASA1	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	43946	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	86663167	86663443	86663248	Y	NA	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	43393	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	87530742	87531117	87530930	Y	NA	TMEM161B-AS1,TMEM161B	NA	NA	NA	NA	TMEM161B-AS1	31595	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	87956632	87957169	87956907	Y	MEF2C,MEF2C	LINC00461	NA	NA	NA	NA	LINC00461	27689	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	92593669	92593984	92593827	Y	NA	NA	FLJ42709	IMR90	Hi-C	24141950	NPM1P27	423389	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	93697867	93698390	93698151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	252463	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.81876218352206
chr5	94033836	94034405	94034124	Y	KIAA0825,ANKRD32	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0825	81527	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	95298372	95298734	95298686	Y	ELL2	CTD-2337A12.1,ELL2	NA	NA	NA	NA	ELL2	2597	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	95507678	95508048	95507916	Y	NA	NA	ELL2,MIR583	IMR90	Hi-C	24141950	ELL2	211903	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	97643613	97643769	97643691	Y	NA	CH17-12M21.1	RGMB,FLJ35946	IMR90	Hi-C	24141950	CH17-12M21.1	28679	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	97790785	97791036	97790856	Y	RGMB	NA	FLJ35946,RGMB	IMR90	Hi-C	24141950	CH17-12M21.1	118337	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	98175322	98175662	98175493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGMB-AS1	68149	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr5	98197255	98197391	98197342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGMB-AS1	90082	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	98262747	98263243	98263080	Y	CHD1	NA	NA	NA	NA	NA	RGMB-AS1	155574	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	99382569	99383254	99382906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	485712	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr5	101134919	101134927	101134923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO4C1	495326	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	101404486	101404751	101404619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO4C1	225502	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	106724874	106725113	106725059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	279483	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	108735031	108735161	108735096	Y	NA	PJA2	NA	NA	NA	NA	PJA2	8534	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	109870902	109871116	109871008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A46	200721	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	112219334	112219897	112219506	Y	NA	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	24415	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	112265559	112265904	112265733	Y	NA	REEP5,DCP2	REEP5	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	REEP5	9323	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	112661132	112661145	112661139	Y	MCC	NA	NA	NA	NA	NA	MCC	161382	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	114623111	114623418	114623265	Y	NA	PGGT1B,CCDC112	NA	NA	NA	NA	CCDC112	7110	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	114847596	114847935	114847760	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	30656	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	115412236	115412448	115412328	Y	NA	CTD-2287O16.1,COMMD10	NA	NA	NA	NA	COMMD10	6240	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	115908516	115909016	115908646	Y	SEMA6A	CTB-118N6.1	NA	NA	NA	NA	SEMA6A	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	115911792	115912152	115911976	Y	SEMA6A	CTB-118N6.1,SEMA6A	NA	NA	NA	NA	SEMA6A	3162	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	116384111	116384324	116384221	Y	SEMA6A	NA	NA	NA	NA	NA	RPS17P2	334182	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	118320389	118320797	118320598	Y	NA	PTMAP2,DTWD2	NA	NA	NA	NA	DTWD2	1443	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	118453384	118453586	118453485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMXL1	81917	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	118698549	118698602	118698556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSD17B4	87536	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	121402997	121403353	121403172	Y	LOX,LOX	NA	NA	NA	NA	NA	SRFBP1	107341	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	122177778	122177931	122177816	Y	NA	SNX24	NA	NA	NA	NA	SNX24	644	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	122690309	122690381	122690346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP120	66905	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	124006979	124007355	124007057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	75145	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	124085012	124085124	124085092	Y	NA	ZNF608	ZNF608	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF608	2512	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	126015927	126016326	126016055	Y	LMNB1,LMNB1	NA	LMNB1,MEGF10	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHAX	81967	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	126181513	126181654	126181594	Y	MARCH3	NA	NA	NA	NA	NA	LMNB1	71198	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr5	126478879	126479210	126479043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf63	71695	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	126847905	126848122	126848004	Y	NA	PRRC1	PRRC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	PRRC1	3179	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	127849179	127849476	127849294	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBN2	143402	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	129020678	129020929	129020798	Y	ADAMTS19	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS19	226720	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	PDLIM4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	131981394	131981469	131981432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF3A	89861	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	133681629	133682059	133681927	Y	NA	CDKL3,UBE2B	NA	NA	NA	NA	CDKL3	22679	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	133763329	133763680	133763576	Y	NA	CDKN2AIPNL	CDKN2AIPNL	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDKN2AIPNL	17740	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	5.85543534806716
chr5	133801466	133801754	133801589	Y	NA	NA	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIPNL	55877	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	133847692	133847829	133847767	Y	NA	NA	PHF15,CDKN2AIPNL,CDKL3,UBE2B,SKP1,PPP2CA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIPNL	102103	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	133863130	133863560	133863438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2AIPNL	117541	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	133891612	133892163	133891823	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	SEC24A	90316	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12,MIR4461	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr5	134824618	134825007	134824746	Y	NA	NEUROG1	NA	NA	NA	NA	NEUROG1	44632	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	137001251	137001596	137001494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL3	68183	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	137908044	137908328	137908223	Y	NA	ETF1,HSPA9,CTNNA1	NA	NA	NA	NA	HSPA9	805	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	139076374	139076603	139076510	Y	CXXC5	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	51490	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	139077393	139077627	139077507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	52509	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	139078128	139078514	139078502	Y	C5orf53,DNAJC18,CXXC5,NRG2,PSD2	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	53244	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	139167686	139167904	139167758	Y	NA	NA	CXXC5,UBE2D2,DNAJC18,NRG2,PSD2,CYSTM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CXXC5	142802	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	140381838	140382244	140382041	Y	DND1,PCDHAC1,PCDHAC2,PCDHAC2	PCDHAC2	NA	NA	NA	NA	PCDHAC2	38018	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr5	140893513	140893891	140893828	Y	PCDH12,KIAA0141,DIAPH1	PCDHGC3,PCDHGC4	NA	NA	NA	NA	PCDHGC4	30772	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	140983787	140984197	140984031	Y	PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1	DIAPH1,HDAC3,RELL2,FCHSD1	NA	NA	NA	NA	DIAPH1	12425	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	141056831	141057056	141056944	Y	NA	HDAC3,RELL2,FCHSD1,ARAP3	NA	NA	NA	NA	ARAP3	2732	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	141256552	141256862	141256814	Y	PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1,PCDH1	KIAA0141	NA	NA	NA	NA	PCDH1	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	141262176	141262446	141262287	Y	PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1,PCDH1	PCDH1,KIAA0141	NA	NA	NA	NA	PCDH1	5365	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr5	141659754	141659954	141659854	Y	NA	AC005592.2,SPRY4	SPRY4,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	AC005592.2	42904	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	142157420	142157683	142157517	Y	NA	ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	9471	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	142362111	142362403	142362189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	214162	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	142383259	142383413	142383268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	235310	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	142534225	142534485	142534355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	175685	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	142541504	142541934	142541585	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	168236	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	145498086	145498488	145498483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	61735	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	145572478	145572767	145572623	Y	GPR151,GRXCR2	LARS,RBM27	LARS,RBM27	IMR90	Hi-C	24141950	RBM27	8346	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	146831561	146831956	146831686	Y	PPP2R2B,JAKMIP2,DPYSL3	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	55663	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	146832241	146832308	146832261	Y	JAKMIP2,DPYSL3	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	55311	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	146834939	146835189	146835093	Y	DPYSL3,DPYSL3	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	52430	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	146947412	146947925	146947557	Y	DPYSL3	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	59793	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr5	147184471	147185173	147184731	Y	NA	JAKMIP2	NA	NA	NA	NA	JAKMIP2	24133	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	147248632	147248939	147248760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JAKMIP2	88294	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr5	147253882	147254078	147253986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JAKMIP2	93544	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	148760371	148760619	148760464	Y	NA	GRPEL2,PCYOX1L	NA	NA	NA	NA	PCYOX1L	24801	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	149110531	149110757	149110649	Y	PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2670	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	149110836	149111455	149111198	Y	ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2975	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr5	149658643	149658710	149658677	Y	SYNPO,SLC6A7,CAMK2A	NA	NA	NA	NA	NA	ARSI	58160	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	149853688	149853975	149853788	Y	NA	RPS14,NDST1	SYNPO,MYOZ3,C5orf62,RPS14,NDST1,DCTN4,RBM22	IMR90	Hi-C	24141950	NDST1	9406	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	150086779	150087134	150086956	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4	RBM22,DCTN4	MYOZ3,RBM22	IMR90	Hi-C	24141950	RBM22	8110	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	150167184	150167440	150167321	Y	CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,C5orf62	DCTN4	NA	NA	NA	NA	DCTN4	30513	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	151017311	151017607	151017366	Y	FAT2	SPARC	SLC36A1,FAT2,ATOX1	IMR90	Hi-C	24141950	SPARC	47119	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	152822087	152822411	152822258	Y	NA	GRIA1	GRIA1	IMR90	Hi-C	24141950	GRIA1	44764	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr5	153963327	153963532	153963423	Y	MRPL22,SAP30L,HAND1	NA	NA	NA	NA	NA	HAND1	107503	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	154062607	154063000	154062805	Y	GEMIN5	LARP1	LARP1,C5orf4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LARP1	27462	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr5	154071115	154071211	154071188	Y	NA	LARP1	LARP1,C5orf4	IMR90	Hi-C	24141950	LARP1	19251	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr5	156718541	156718931	156718583	Y	HAVCR2,ADAM19,CYFIP2,CYFIP2,CYFIP2	CYFIP2	NA	NA	NA	NA	CYFIP2	27452	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	158201990	158201999	158201995	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EBF1	322770	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	158438022	158438330	158438136	Y	RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,EBF1	NA	NA	NA	NA	NA	EBF1	86439	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	158611896	158612266	158612182	Y	IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145	RNF145	NA	NA	NA	NA	RNF145	22795	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	159414162	159414427	159414404	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	19693	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	159533500	159533764	159533742	Y	NA	PWWP2A	NA	NA	NA	NA	PWWP2A	10666	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	159592617	159593055	159592885	Y	NA	PWWP2A,FABP6	TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FABP6	19319	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	159904569	159904939	159904751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG1	57740	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	169665764	169666018	169665944	Y	NA	C5orf58	NA	NA	NA	NA	C5orf58	8313	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	170060615	170060931	170060764	Y	RANBP17	NA	NA	NA	NA	NA	GABRP	127423	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr5	171431879	171432256	171432181	Y	UBTD2,STK10	FBXW11	NA	NA	NA	NA	FBXW11	2	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	171432610	171432692	171432660	Y	NA	FBXW11	NA	NA	NA	NA	FBXW11	733	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	171601698	171602038	171601921	Y	NA	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	11352	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	171605314	171605550	171605494	Y	STK10	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	7840	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	171660495	171660734	171660615	Y	NA	STK10,UBTD2	NA	NA	NA	NA	STK10	47105	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	172198749	172199959	172199636	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2551	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	173586705	173586920	173586830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf47	187923	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	176526460	176526848	176526554	Y	FGFR4,FGFR4	FGFR4,NSD1	NA	NA	NA	NA	FGFR4	14573	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	176543923	176544044	176544003	Y	TSPAN17,PRR7,DBN1	FGFR4,NSD1	NA	NA	NA	NA	NSD1	13982	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	176972522	176972758	176972729	Y	NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3	PDLIM7,DDX41,FAM193B,TMED9	NA	NA	NA	NA	FAM193B	6784	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	176973275	176973657	176973542	Y	NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3	DDX41,FAM193B,TMED9	NA	NA	NA	NA	FAM193B	5885	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	177541057	177541427	177541157	Y	N4BP3	N4BP3,RMND5B,NHP2	NA	NA	NA	NA	N4BP3	2613	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr5	177542150	177542670	177542238	Y	N4BP3	N4BP3,RMND5B,NHP2	NA	NA	NA	NA	N4BP3	3706	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr5	179434619	179435010	179434852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF130	62108	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	179496400	179496705	179496553	Y	NA	RNF130	NA	NA	NA	NA	RNF130	413	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	179512347	179512479	179512439	Y	MAML1,LTC4S	RNF130	NA	NA	NA	NA	RNF130	15229	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	179517331	179517686	179517646	Y	HNRNPH1,MAML1,RNF130	RNF130	NA	NA	NA	NA	RNF130	20213	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	180611137	180611357	180611292	Y	MGAT1	TRIM41	NA	NA	NA	NA	TRIM41	36142	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	180615864	180616079	180615972	Y	NA	TRIM41	NA	NA	NA	NA	TRIM41	31420	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr5	180672693	180672910	180672808	Y	NA	TRIM41,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1,TRIM52,TRIM52-AS1	NA	NA	NA	NA	GNB2L1	186	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	2128026	2128199	2128099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	115727	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	2849123	2849376	2849246	Y	SERPINB9,RIPK1,NQO2,SERPINB1	SERPINB1	NA	NA	NA	NA	SERPINB1	8883	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	2902288	2902696	2902436	Y	SERPINB1,RIPK1,SERPINB9	SERPINB9	MGC39372,MIR4645,SERPINB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERPINB9	774	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	2921060	2921305	2921156	Y	NA	SERPINB9,SERPINB6	SERPINB9,SERPINB6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERPINB9	19546	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	3160462	3160701	3160583	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	4702	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	3209395	3209963	3209634	Y	SERPINB9	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	PSMG4	19674	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	3356099	3356749	3356628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	98507	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	5179288	5179492	5179391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYRM4	79680	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	7143191	7143555	7143322	Y	NA	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	37361	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	7174134	7174405	7174138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	68304	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	7532623	7532708	7532667	Y	NA	DSP	CAGE1	IMR90	Hi-C	24141950	DSP	7100	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	7692548	7692711	7692643	Y	NA	NA	PIP5K1P1,MUTED-TXNDC5,BMP6,TXNDC5,EEF1E1-MUTED,SSR1	IMR90	Hi-C	24141950	SNRNP48	104116	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	10589491	10589864	10589781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAK1IP1	103064	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	10970926	10971179	10971053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYCP2L	224899	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	11144047	11144288	11144135	Y	TMEM170B,C6orf52,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	236293	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	11331718	11332104	11332092	Y	NA	NEDD9	NA	NA	NA	NA	NEDD9	48477	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	12472967	12473281	12473124	Y	NA	RPL15P3	NA	NA	NA	NA	RPL15P3	39061	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	12729754	12730156	12729835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL15P3	217412	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	12965020	12965354	12965088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-11P	246934	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	13649579	13649948	13649702	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	36020	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	14573197	14573256	14573227	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	457325	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	14587491	14587822	14587657	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	471619	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	14596764	14596944	14596823	Y	CD83	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	480892	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	14640701	14640843	14640773	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	524829	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	14732820	14733791	14733202	Y	NA	NA	DTNBP1,JARID2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	510736	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	14766593	14766865	14766789	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	477662	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	14837546	14837947	14837747	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	406580	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	14875420	14876058	14875492	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	368469	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	14921244	14921932	14921499	Y	JARID2	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	322595	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	14922104	14922958	14922362	Y	JARID2	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	321569	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	14945973	14946248	14946214	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	298279	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr6	14966546	14966931	14966759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2	277596	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	15017481	15017823	15017765	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	226704	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	15021707	15021883	15021795	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	222644	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr6	15022090	15022421	15022413	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	222106	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	4.0733463290902
chr6	15078356	15078482	15078419	Y	NA	NA	JARID2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	JARID2	166045	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	15199575	15199598	15199586	Y	NA	JARID2	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	44929	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	15206545	15206759	15206651	Y	JARID2	JARID2	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	37768	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	15474239	15474654	15474451	Y	JARID2,DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	186635	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	15541251	15541598	15541282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	119691	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	15542142	15542162	15542152	Y	JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	119127	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	16256823	16257099	16256961	Y	NA	GMPR	NA	NA	NA	NA	GMPR	20012	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	17715315	17715544	17715493	Y	NUP153	NUP153	NUP153,KIF13A	IMR90	Hi-C	24141950	NUP153	10659	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	18016545	18016825	18016604	Y	NA	KIF13A	TPMT,NHLRC1	IMR90	Hi-C	24141950	KIF13A	30691	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	4.58251462022648
chr6	18020711	18021071	18020890	Y	NA	KIF13A	KIF13A,NHLRC1,TPMT	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KIF13A	34857	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	18022998	18023444	18023299	Y	NA	KIF13A	KIF13A,NHLRC1,TPMT	IMR90	Hi-C	24141950	KIF13A	37144	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	18153083	18153444	18153238	Y	RNF144B,NHLRC1,KDM1B	NHLRC1,KDM1B	NA	NA	NA	NA	TPMT	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	19691933	19692175	19692049	Y	ID4	NA	NA	NA	NA	NA	ID4	143442	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	20404913	20405227	20404970	Y	MBOAT1	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	4515	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	20978432	20978689	20978561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	445744	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	20994795	20995087	20994932	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	462107	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	21098770	21098791	21098780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	493181	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	21383430	21383704	21383606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	208268	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr6	21603523	21603934	21603831	Y	SOX4	SOX4	NA	NA	NA	NA	SOX4	11551	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	21740205	21740397	21740265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	148233	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	21765300	21765398	21765349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	173328	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	22148644	22148866	22148767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDGFL1	418812	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	24302656	24303033	24302868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCDC2	53247	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	24834309	24834321	24834317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMNN	61150	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2	NA	NA	NA	NA	HIST1H1A	22967	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.54584145568138
chr6	26016753	26016987	26016816	Y	HIST1H1A	HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H1A	713	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	26029019	26029363	26029242	Y	NA	HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H3B	925	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	26232920	26233434	26233137	Y	NA	HIST1H4D,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2BI	NA	NA	NA	NA	HIST1H1D	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	26233560	26233958	26233761	Y	NA	HIST1H4D,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2BI,HIST1H4H	NA	NA	NA	NA	HIST1H1D	344	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	26521444	26521777	26521577	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	1368	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	26550694	26551000	26550826	Y	NA	HCG11,HMGN4,ABT1	NA	NA	NA	NA	HMGN4	14061	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	27513313	27513537	27513433	Y	NA	NA	HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AM,HIST1H3J,HIST1H2BO	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF184	74416	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	27655687	27656083	27655918	Y	NA	NA	LOC100507173	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HIST1H2BL	117626	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	28457225	28458028	28457315	Y	NA	ZSCAN23	NA	NA	NA	NA	ZSCAN23	47946	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr6	30247447	30247451	30247450	Y	NA	HLA-L,TRIM39,HCG18	NA	NA	NA	NA	HLA-L	22086	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	30254050	30254472	30254356	Y	NA	HLA-L,TRIM39,HCG18	NA	NA	NA	NA	HLA-L	28689	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	30453844	30454132	30453996	Y	ZNRD1,TUBB	RANP1,HLA-E	HLA-E	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HLA-E	1112	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	30719576	30719814	30719695	Y	IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	DPCR1,NRM,PPP1R18,MDC1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,VARS2,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	9245	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	31140737	31140986	31140881	Y	NA	CCHCR1,TCF19,POU5F1	NA	NA	NA	NA	POU5F1	5522	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr6	32081652	32082042	32081917	Y	NA	TNXB,ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8	NA	NA	NA	NA	TNXB	541	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	32114130	32114430	32114186	Y	GPANK1,GPANK1,LY6G5C,DOM3Z,FKBPL	TNXB,ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8,AGPAT1,RNF5,AGER,XXbac-BPG300A18.13,PBX2,GPSM3	NA	NA	NA	NA	PPT2	4788	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	32834766	32835076	32834920	Y	BRD2,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9	TAP2	NA	NA	NA	NA	TAP2	30209	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	32956037	32956271	32956088	Y	NA	BRD2,HLA-DMA,BRD2-IT1,HLA-DOA	NA	NA	NA	NA	HLA-DOA	19118	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	33386765	33387072	33386901	Y	HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,HLA-DPA1,HLA-DPB1	KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	SYNGAP1	918	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr6	33392796	33393285	33393082	Y	SYNGAP1	KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	SYNGAP1	6949	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	33558672	33558897	33558785	Y	NA	BAK1,LINC00336,ITPR3	NA	NA	NA	NA	LINC00336	218	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	33684801	33685193	33684861	Y	NA	IP6K3	MNF1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IP6K3	27569	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	33781645	33781809	33781745	Y	LEMD2,LEMD2	LEMD2,MLN	IP6K3,LEMD2,LOC100507584,MIR1275,GRM4,RPS10-NUDT3,C6orf106,MLN	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MLN	11857	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr6	33818239	33818267	33818253	Y	NA	MLN	GRM4,MLN,IP6K3,LINC00336,BAK1,GGNBP1,LEMD2,LOC100507584,MIR1275	IMR90	Hi-C	24141950	MLN	48451	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	33872168	33872571	33872419	Y	PHF1,ZBTB9,LEMD2	NA	NA	NA	NA	NA	MLN	102380	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	34048216	34048600	34048360	Y	NA	NA	MIR1275	IMR90	Hi-C	24141950	CYCSP55	136616	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	34060373	34060777	34060697	Y	LEMD2,LEMD2	NA	MIR1275	IMR90	Hi-C	24141950	CYCSP55	124439	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr6	34102440	34102470	34102458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYCSP55	82746	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr6	34112239	34112588	34112446	Y	PACSIN1,GRM4	NA	MIR1275	IMR90	Hi-C	24141950	CYCSP55	72628	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	34191726	34192136	34191830	Y	C6orf1,HMGA1	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CYCSP55	6510	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr6	34202925	34203288	34202990	Y	NA	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	NA	NA	NA	NA	HMGA1	275	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr6	34615040	34615205	34615123	Y	NA	C6orf106	NA	NA	NA	NA	C6orf106	47431	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	35035271	35035638	35035433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKS1A	180229	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	35331114	35331538	35331252	Y	PPARD	PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	22779	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	35453228	35453566	35453395	Y	NA	FANCE,RPL10A,TEAD3	NA	NA	NA	NA	TEAD3	9287	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr6	35457906	35458213	35458053	Y	TEAD3	FANCE,RPL10A,TEAD3	NA	NA	NA	NA	TEAD3	4640	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	36391024	36391283	36391227	Y	SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,PXT1	KCTD20	NA	NA	NA	NA	KCTD20	17261	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	36634782	36635224	36635042	Y	MTCH1,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A	RNU1-88P,LAP3P2,CDKN1A	CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LAP3P2	4370	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	37024161	37024556	37024514	Y	NA	NA	CPNE5,C6orf89,FGD2,PIM1,TMEM217,TBC1D22B	IMR90	Hi-C	24141950	FGD2	52739	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	37070053	37070857	37070460	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	65122	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr6	37093441	37093739	37093580	Y	NA	PIM1	PIM1,PPIL1,FGD2,C6orf89,TMEM217,CPNE5,MTCH1,TBC1D22B,CDKN1A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	42240	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr6	37094186	37094408	37094276	Y	PPIL1	PIM1	PIM1,PPIL1,FGD2,C6orf89,TMEM217,CPNE5,MTCH1,TBC1D22B,CDKN1A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	41571	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	37095912	37096089	37096014	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	39890	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	37098455	37099411	37099295	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2	IMR90	Hi-C	24141950	PIM1	36568	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	37104071	37104158	37104105	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	31821	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr6	37104908	37105418	37105405	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	30561	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr6	37150975	37151397	37151210	Y	TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1	PIM1	NA	NA	NA	NA	PIM1	14996	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	37271813	37272101	37271931	Y	PIM1,TBC1D22B	TBC1D22B,RNF8	NA	NA	NA	NA	RNF8	47647	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	37484293	37484960	37484497	Y	NA	CCDC167	CCDC167,MDGA1,RNF8,FTSJD2,TBC1D22B,MIR4462,ZFAND3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC167	18595	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	37751286	37751497	37751341	Y	NA	ZFAND3	BTBD9,ZFAND3,FTSJD2,CCDC167,MDGA1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND3	33778	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr6	37752102	37752667	37752552	Y	MDGA1	ZFAND3	BTBD9,ZFAND3,FTSJD2,CCDC167,MDGA1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND3	32608	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr6	37879889	37880256	37879963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	94614	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	39171657	39171958	39171719	Y	NA	KCNK5	NA	NA	NA	NA	KCNK5	23268	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	39279620	39279758	39279742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNK5	84394	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	40965087	40965613	40965406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFYA	73071	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	41400166	41400378	41400291	Y	FOXP4	NA	FOXP4	IMR90,H1ESC	Hi-C,5C	24141950,22955621	FOXP4	111786	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr6	41471691	41471833	41471786	Y	NA	FOXP4,RP11-328M4.2	FOXP4	IMR90	Hi-C	24141950	FOXP4	40331	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	41472054	41472459	41472263	Y	NA	FOXP4,RP11-328M4.2	FOXP4	IMR90	Hi-C	24141950	FOXP4	39705	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	41528607	41528881	41528714	Y	TAF8,CCND3,NFYA,TFEB	FOXP4,RP11-328M4.2	NA	NA	NA	NA	RP11-328M4.2	14248	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr6	41546441	41546593	41546496	Y	FRS3	FOXP4,RP11-328M4.2	NA	NA	NA	NA	RP11-328M4.2	32082	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	41612844	41613289	41612975	Y	NA	MDFI	NA	NA	NA	NA	MDFI	10224	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	41649853	41650127	41649990	Y	NA	MDFI	NA	NA	NA	NA	MDFI	47233	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	42013318	42013860	42013560	Y	TFEB,TRERF1,CCND3	CCND3,TAF8	NA	NA	NA	NA	CCND3	2235	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	42228452	42228568	42228527	Y	NA	MRPS10	NA	NA	NA	NA	MRPS10	44849	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	42284486	42284710	42284609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS10	100883	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	42335050	42335266	42335166	Y	UBR2,TRERF1	NA	NA	NA	NA	NA	TRERF1	82523	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	42420719	42421067	42420926	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	2930	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	42515407	42515543	42515467	Y	NA	UBR2	TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBR2	14257	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	43058034	43058580	43058415	Y	NA	CUL7,MRPL2,PTK7	NA	NA	NA	NA	PTK7	16028	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	43878497	43878687	43878563	Y	GTPBP2,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	142576	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	43978439	43978901	43978686	Y	NFKBIE	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM63B	113750	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	44010067	44010199	44010133	Y	C6orf223	NA	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM63B	82452	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	44070488	44070804	44070651	Y	NA	TMEM63B,MRPL14	NA	NA	NA	NA	TMEM63B	21847	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	44096308	44096658	44096594	Y	NA	TMEM63B,MRPL14	NA	NA	NA	NA	MRPL14	3114	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	44184938	44185313	44184944	Y	MRPL14	HSP90AB1,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	SLC29A1	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	44190356	44190650	44190419	Y	NA	SLC29A1,HSP90AB1,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	SLC29A1	5114	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr6	44594803	44595107	44595003	Y	AARS2	NA	CLIC5,SUPT3H,RUNX2	IMR90	Hi-C	24141950	CDC5L	241541	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr6	44598266	44598445	44598361	Y	NA	NA	CLIC5,SUPT3H,RUNX2	IMR90	Hi-C	24141950	CDC5L	245004	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	44634916	44635472	44635214	Y	NA	NA	CLIC5,SUPT3H,RUNX2	IMR90	Hi-C	24141950	CDC5L	281654	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	44669523	44669744	44669613	Y	NA	NA	CLIC5,SUPT3H,RUNX2	IMR90	Hi-C	24141950	CDC5L	316261	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	46738555	46739161	46738809	Y	PLA2G7,PLA2G7	NA	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	536480	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	49524322	49524464	49524384	Y	NA	C6orf141	NA	NA	NA	NA	C6orf141	8209	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	52261634	52261809	52261784	Y	EFHC1	PAQR8,EFHC1	NA	NA	NA	NA	EFHC1	21297	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	52383934	52384018	52383972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	55695	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	52416960	52417092	52417044	Y	GSTA5,PAQR8	TRAM2	NA	NA	NA	NA	TRAM2	22621	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	52439625	52439825	52439764	Y	TRAM2	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	52841440	52841610	52841523	Y	NA	GSTA4	NA	NA	NA	NA	GSTA4	16566	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	53191249	53191636	53191614	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	20311	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	53297739	53297913	53297859	Y	NA	NA	GCM1,FBXO9,ELOVL5	IMR90	Hi-C	24141950	ELOVL5	85792	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	53381866	53382077	53382067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	97691	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	56296413	56296568	56296543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BEND6	521205	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr6	57288314	57288720	57288442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	110711	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	57292576	57292862	57292719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	114973	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	57478986	57479248	57479117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	301383	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	58776280	58777091	58777029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	521711	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr6	58777244	58778438	58777771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	522675	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	58778631	58779245	58778717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	524062	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr6	62308410	62308765	62308588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTP4A1	1920901	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	64398084	64398491	64398303	Y	PHF3	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	54359	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	69905412	69905430	69905421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BAI3	562153	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	70505414	70505608	70505498	Y	NA	LMBRD1	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	411	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	73728224	73728284	73728227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHDC1L	205209	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	74186150	74186447	74186193	Y	MTO1	MB21D1,MTO1,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	MTO1	16849	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	81197510	81197656	81197595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	383146	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	81516803	81516898	81516851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	702439	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	84917634	84917758	84917696	Y	NA	KIAA1009	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	17595	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	85218127	85218200	85218164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	282774	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	88213981	88214157	88214070	Y	GJB7	SLC35A1	NA	NA	NA	NA	SLC35A1	35640	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	88408243	88408692	88408556	Y	AKIRIN2	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	1235	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	89090505	89090612	89090559	Y	CNR1	NA	NA	NA	NA	NA	ACTBP8	105797	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	90596283	90596734	90596349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASP8AP2	58670	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	90691660	90691667	90691664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASP8AP2	154047	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	90856849	90857084	90856969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH2	147543	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	91078844	91079184	91078980	Y	NA	NA	BACH2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BACH2	74217	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	93697293	93697548	93697421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA7	429717	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	95244699	95244909	95244803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEA	778510	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	99084955	99085121	99085082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL4	308728	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	99995359	99995841	99995579	Y	PNISR	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	19008	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	101149750	101149957	101149936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-121G13.3	173598	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	102251136	102251209	102251173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCC3	923888	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	105388915	105389637	105389155	Y	HACE1	LIN28B	NA	NA	NA	NA	LIN28B	13286	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.80042560124951
chr6	105401566	105401766	105401705	Y	LIN28B	LIN28B	NA	NA	NA	NA	LIN28B	1157	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	106440406	106440671	106440473	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	91524	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr6	106442094	106442641	106442261	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	89554	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	106442778	106443178	106442990	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	89017	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	107047078	107047343	107047210	Y	BEND3	RTN4IP1,QRSL1	NA	NA	NA	NA	RTN4IP1	28030	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	108141852	108141997	108141916	Y	SCML4	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63	135396	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	108169525	108169909	108169631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63	107484	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	108879164	108879427	108879300	Y	SESN1,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	126	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	108879521	108879931	108879808	Y	SESN1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	483	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr6	108883670	108884545	108884024	Y	OSTM1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	4632	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	109056613	109056789	109056693	Y	FOXO3	NA	FOXO3,LINC00222	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARMC2	110830	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	109102631	109102946	109102736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARMC2	64673	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	110677101	110677173	110677119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC40	177757	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	111614404	111614762	111614615	Y	NA	KIAA1919	NA	NA	NA	NA	KIAA1919	35853	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr6	111873587	111873978	111873729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	51503	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	111889822	111890007	111889856	Y	REV3L	TRAF3IP2	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	35474	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	111925507	111925888	111925538	Y	REV3L,TRAF3IP2	TRAF3IP2	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	26	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	112314244	112314384	112314319	Y	TRAF3IP2,FYN	NA	FYN,TRAF3IP2-AS1,TRAF3IP2,REV3L	IMR90	Hi-C	24141950	TUBE1	92348	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	113673815	113673995	113673934	Y	NA	NA	LAMA4,FLJ34503,MARCKS	IMR90	Hi-C	24141950	MARCKS	502546	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	114147001	114147334	114147168	Y	HS3ST5	MARCKS	NA	NA	NA	NA	MARCKS	29207	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	114662111	114662444	114662262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST5	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	116550472	116550927	116550585	Y	KPNA5,TSPYL4,TSPYL1	TSPYL4,DSE,RP3-486I3.4,TSPYL1	NA	NA	NA	NA	TSPYL4	22334	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	116708579	116708861	116708730	Y	ZUFSP,DSE,FAM26F	NA	NA	NA	NA	NA	FAM26F	71672	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	116731085	116731228	116731157	Y	NA	FAM26F	NA	NA	NA	NA	FAM26F	49305	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	118246881	118246985	118246933	Y	SLC35F1	SLC35F1	NA	NA	NA	NA	SLC35F1	20192	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	119896932	119897123	119897095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAN1A1	228006	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	120445667	120446036	120445852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAN1A1	776741	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	121398601	121398951	121398918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GJA1	355887	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	121530032	121530291	121530288	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GJA1	224547	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	121758280	121758805	121758450	Y	GJA1	GJA1,RNU4-35P	NA	NA	NA	NA	GJA1	3442	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr6	121894723	121894832	121894778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-35P	121456	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	122990249	122990620	122990435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FABP7	108000	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	125420389	125420754	125420652	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	17441	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	125426714	125426967	125426959	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	11228	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	125952344	125952361	125952353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEY2	114449	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	126068034	126068254	126068125	Y	HEY2	HEY2,NCOA7	NA	NA	NA	NA	HEY2	1224	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr6	126071522	126071828	126071676	Y	NA	HEY2,NCOA7	NA	NA	NA	NA	HEY2	4712	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	126241150	126241321	126241235	Y	NCOA7	HINT3	NA	NA	NA	NA	HINT3	34606	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr6	127980874	127981174	127981075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226093	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	128043180	128043438	128043309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	288399	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	128607751	128608140	128608092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	231730	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	130513480	130513753	130513616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM200A	171126	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr6	131644422	131644782	131644602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP7	189616	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	131929733	131930009	131929873	Y	NA	MED23,RNU4-18P	NA	NA	NA	NA	MED23	17360	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr6	132787299	132787948	132787832	Y	NA	STX7	NA	NA	NA	NA	STX7	44389	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	132812514	132812803	132812689	Y	TAAR5,C6orf192,TAAR6	STX7	NA	NA	NA	NA	STX7	19534	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	132832416	132832580	132832524	Y	VNN1,STX7	STX7	NA	NA	NA	NA	STX7	79	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	133059787	133059954	133059917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS12	73626	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	133134288	133134908	133134317	Y	NA	RPS12	NA	NA	NA	NA	SNORD101	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	134395597	134395721	134395640	Y	NA	SLC2A12	TBPL1,SLC2A12,HBS1L,EYA4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC2A12	23823	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	134620653	134620958	134620903	Y	SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	16292	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	135346100	135346282	135346249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBS1L	75912	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	135352829	135352991	135352910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBS1L	69203	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	136788990	136789214	136789102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP7	80743	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	137227679	137227915	137227797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEX7	85962	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	137244333	137244577	137244412	Y	SLC35D3	NA	NA	NA	NA	NA	PEX7	102616	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	138495604	138495926	138495622	Y	NA	KIAA1244	NA	NA	NA	NA	KIAA1244	14546	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	138821349	138821443	138821380	Y	REPS1,NHSL1	NA	NA	NA	NA	NA	HEBP2	98681	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr6	138876782	138877039	138876959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NHSL1	134669	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	138914049	138914108	138914056	Y	NA	NA	HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906	IMR90	Hi-C	24141950	NHSL1	97600	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	139300314	139300341	139300327	Y	NHSL1	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	7057	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	139304978	139305148	139305081	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	2250	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	139348964	139349250	139349073	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	41566	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	140210036	140210207	140210122	Y	NA	NA	CITED2,LOC100132735	IMR90	Hi-C	24141950	CITED2	516279	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	140926275	140926589	140926526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED2	1232518	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	140929042	140929323	140929183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED2	1235285	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	143130260	143130659	143130530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	133679	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	144066654	144067070	144066822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTV1	95411	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	144129010	144129242	144129156	Y	STX11,PLAGL1	LTV1	NA	NA	NA	NA	LTV1	33239	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	144585551	144585700	144585606	Y	NA	UTRN	UTRN	IMR90	Hi-C	24141950	UTRN	19137	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	144657152	144657284	144657222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTRN	52315	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	145449220	145449615	145449418	Y	NA	NA	UTRN	IMR90	Hi-C	24141950	EPM2A	605545	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	149929442	149929538	149929496	Y	NA	RPS18P9,KATNA1	NA	NA	NA	NA	RPS18P9	16222	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	151178145	151178545	151178467	Y	MTHFD1L	MTHFD1L	NA	NA	NA	NA	MTHFD1L	6140	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	151730569	151730753	151730690	Y	NA	ZBTB2,RMND1,C6orf211	NA	NA	NA	NA	ZBTB2	19886	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	151770191	151770744	151770510	Y	NA	RMND1,C6orf211	NA	NA	NA	NA	RMND1	515	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	152085145	152085342	152085266	Y	ESR1,ESR1,ESR1,ESR1	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf211	313723	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	152634983	152635621	152635105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE1	321315	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	153002467	153002857	153002662	Y	NA	SYNE1	SYNE1,MYCT1	IMR90	Hi-C	24141950	SYNE1	45531	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	154665591	154665920	154665816	Y	IPCEF1	NA	NA	NA	NA	NA	CNKSR3	163873	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	155590165	155590417	155590245	Y	NA	RP11-477D19.2,TFB1M	NA	NA	NA	NA	RP11-477D19.2	14307	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr6	156600917	156600980	156600950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	496083	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	157007979	157008724	157008580	Y	ARID1B	NA	MIR4466,ARID1B,NOX3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	88339	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	157041058	157041538	157041248	Y	ARID1B	NA	ARID1B,MIR4466	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	55525	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr6	157110744	157110907	157110826	Y	NA	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	13681	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	157137665	157137911	157137871	Y	ARID1B	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	40602	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	157168828	157169241	157169084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	71765	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	157267788	157267851	157267817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	170725	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	158184460	158184689	158184561	Y	SNX9	NA	SNX9,TMEM242,ZDHHC14,SYNJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNX9	57607	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	158784092	158784407	158784250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM181	171061	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	TMEM181	NA	NA	NA	NA	TMEM181	25935	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr6	158982051	158982465	158982168	Y	NA	TMEM181	NA	NA	NA	NA	TMEM181	26583	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	158987674	158988091	158987879	Y	NA	TMEM181	NA	NA	NA	NA	TMEM181	32206	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	159226894	159227283	159227272	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	11161	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	159229924	159230242	159230166	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	8202	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	159271429	159272000	159271674	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	16971	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	159273925	159274893	159274526	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	14078	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	4.58251462022648
chr6	159359890	159360005	159359951	Y	EZR	NA	EZR	IMR90	Hi-C	24141950	RSPH3	59214	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr6	159360638	159360649	159360643	Y	TAGAP	NA	EZR	IMR90	Hi-C	24141950	RSPH3	58570	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	159525207	159525384	159525309	Y	EZR,EZR,TAGAP	NA	TAGAP,RSPH3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RSPH3	105988	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	160371712	160371722	160371717	Y	SOD2,WTAP,WTAP,MAS1	IGF2R	FNDC1,PNLDC1,IGF2R	IMR90	Hi-C	24141950	IGF2R	16409	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	163606625	163606682	163606645	Y	QKI	NA	NA	NA	NA	NA	QKI	226350	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	163774373	163774768	163774571	Y	QKI	NA	NA	NA	NA	NA	QKI	58264	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	166964478	166964522	166964502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	210399	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	167854632	167854836	167854718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCR6	331337	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	169308928	169309266	169309084	Y	THBS2	NA	WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	342873	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr6	170600439	170600921	170600644	Y	NA	DLL1,FAM120B	NA	NA	NA	NA	FAM120B	2648	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	555332	555565	555456	Y	GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	2368	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr7	556288	556672	556400	Y	LOC100288524,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	1261	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	652642	652893	652768	Y	PRKAR1B,ADAP1	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	94709	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	850307	850449	850380	Y	SUN1,SUN1	SUN1	NA	NA	NA	NA	SUN1	3079	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	1407991	1408135	1408052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICALL2	89003	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	2006506	2006818	2006734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	264060	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	2111827	2112126	2111988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	158752	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	2143904	2144149	2144041	Y	LFNG	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	126729	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	2178123	2178459	2178160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	92419	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	2306623	2306831	2306646	Y	MAD1L1	MAD1L1,FTSJ2,NUDT1	NA	NA	NA	NA	NUDT1	26766	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr7	2672306	2673216	2673099	Y	LFNG,TTYH3	TTYH3,AMZ1	NA	NA	NA	NA	TTYH3	2721	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	3668930	3669293	3669112	Y	SDK1	NA	NA	NA	NA	NA	SDK1	329850	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	4723112	4724257	4723950	Y	NA	FOXK1	NA	NA	NA	NA	FOXK1	41724	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	4746884	4747018	4746986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	65496	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	4784652	4785031	4784763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	103264	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	5419074	5419498	5419154	Y	NA	TNRC18	NA	NA	NA	NA	TNRC18	43547	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	5452779	5453024	5452968	Y	NA	TNRC18	NA	NA	NA	NA	TNRC18	10021	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	5458136	5458686	5458477	Y	FBXL18,TNRC18	TNRC18	NA	NA	NA	NA	TNRC18	4359	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	5571351	5571818	5571666	Y	WIPI2,ACTB	FBXL18,ACTB	NA	NA	NA	NA	FBXL18	19922	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr7	5594554	5594977	5594837	Y	WIPI2	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	6438	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.30959389238579
chr7	5596196	5596581	5596543	Y	CCZ1,ACTB	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	4834	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	5604591	5604992	5604792	Y	NA	ACTB,FSCN1	RNF216	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ACTB	3176	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	5609221	5609424	5609333	Y	FBXL18	ACTB,FSCN1	RNF216,FSCN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	7806	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	5609541	5610012	5609880	Y	SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216,FSCN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	8126	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr7	5631413	5631525	5631469	Y	NA	ACTB,FSCN1	RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	FSCN1	974	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	5634980	5635411	5634989	Y	AIMP2,FBXL18,ACTB,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	FSCN1	4541	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	5635420	5636238	5635862	Y	NA	ACTB,FSCN1	NA	NA	NA	NA	FSCN1	4981	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	6467944	6468137	6468104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAGLB	53684	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	6677371	6677641	6677424	Y	DAGLB,ZNF12,C7orf26	C7orf26,ZNF316,AC073343.13	NA	NA	NA	NA	ZNF316	2418	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr7	6741580	6741996	6741754	Y	C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12	AC073343.13,ZNF12,PMS2CL	NA	NA	NA	NA	ZNF12	2558	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr7	7249464	7249811	7249639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1	54899	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr7	7604061	7604281	7604173	Y	MIOS	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	222	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	13694099	13694114	13694107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV1	334936	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr7	13700759	13700990	13700876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV1	328060	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	13758700	13759051	13758876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV1	269999	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr7	13818689	13818849	13818801	Y	ETV1	NA	NA	NA	NA	NA	ETV1	210201	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	14042792	14042945	14042854	Y	NA	ETV1	NA	NA	NA	NA	ETV1	13742	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	16095120	16095542	16095311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISPD	363405	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	17084621	17084791	17084701	Y	AHR	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC003075.4	252190	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	17315787	17316189	17315986	Y	NA	AC003075.4	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC003075.4	20792	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	19119779	19120171	19119934	Y	NA	TWIST1	HDAC9	IMR90	Hi-C	24141950	TWIST1	35124	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	20006905	20007156	20007031	Y	TMEM196	RPL21P75	NA	NA	NA	NA	RPL21P75	33190	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr7	20059372	20059444	20059408	Y	NA	RPL21P75	NA	NA	NA	NA	RPL21P75	19026	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr7	20123446	20123761	20123595	Y	TWISTNB,ITGB8	NA	NA	NA	NA	NA	AC005062.2	54315	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	20163699	20164108	20163996	Y	NA	AC005062.2	NA	NA	NA	NA	AC005062.2	13968	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr7	20202226	20202605	20202544	Y	NA	AC005062.2	NA	NA	NA	NA	AC005062.2	24150	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	20242848	20242947	20242898	Y	NA	MACC1,AC005083.1	NA	NA	NA	NA	MACC1	12080	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	20488084	20488380	20488322	Y	NA	NA	TMEM196	IMR90	Hi-C	24141950	AC005083.1	232884	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	20488630	20489286	20488971	Y	ITGB8	NA	TMEM196	IMR90	Hi-C	24141950	AC005083.1	233430	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	20837430	20837819	20837731	Y	SP8	SP8,RPL23P8,LINC01162	SP8	K562	ChIA-PET	22265404	SP8	12925	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr7	20993749	20993911	20993806	Y	SP8	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01162	120699	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	6.61918778477158
chr7	21120779	21120894	21120878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01162	247729	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr7	22162881	22162961	22162899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7L	179179	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	22589401	22589537	22589455	Y	NA	EEF1A1P6	KLHL7,KLHL7-AS1,TOMM7,FAM126A,LOC100506178,IL6,SNORD93,IGF2BP3	IMR90	Hi-C	24141950	EEF1A1P6	39783	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	22589858	22590064	22589967	Y	NA	EEF1A1P6	KLHL7,KLHL7-AS1,TOMM7,FAM126A,LOC100506178,IL6,SNORD93,IGF2BP3	IMR90	Hi-C	24141950	EEF1A1P6	40240	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	22622740	22623204	22623070	Y	NA	STEAP1B	NA	NA	NA	NA	STEAP1B	47340	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	22742975	22743282	22743130	Y	NA	NA	FAM126A,LOC100506178	IMR90	Hi-C	24141950	STEAP1B	72431	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	22851635	22851773	22851763	Y	NA	TOMM7	NA	NA	NA	NA	TOMM7	8697	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	22894313	22894860	22894668	Y	STEAP1B,TOMM7	TOMM7	NA	NA	NA	NA	TOMM7	33843	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	23348040	23348443	23348292	Y	KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	NA	GPNMB	74454	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	23501559	23501943	23501874	Y	NUPL2,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	6143	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	23504984	23505316	23505313	Y	NA	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2770	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	23510676	23511223	23510889	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2590	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr7	23513815	23514383	23514045	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	MALSU1	K562	ChIA-PET	22265404	IGF2BP3	5729	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr7	24960670	24960974	24960767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	58279	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	25894654	25894946	25894846	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	294914	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	25896245	25896461	25896419	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	293399	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr7	25896515	25897081	25896801	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	292779	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	25897167	25897316	25897282	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	292544	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr7	25990725	25991211	25991018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	198649	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr7	26140883	26141586	26141235	Y	SNX10,SNX10,SNX10,HNRNPA2B1	NFE2L3	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	48274	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	26193570	26193972	26193862	Y	SNX10,SNX10,HNRNPA2B1	NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	3710	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	29163209	29163338	29163275	Y	NA	CHN2	NA	NA	NA	NA	CHN2	3319	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	30272091	30272372	30272222	Y	ZNRF2	ZNRF2	WIPF3	IMR90	Hi-C	24141950	ZNRF2	49551	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	30956234	30956541	30956398	Y	NA	GHRHR	NA	NA	NA	NA	GHRHR	19743	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr7	31028177	31028553	31028368	Y	ADCYAP1R1	NA	NA	NA	NA	NA	GHRHR	51893	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	32551548	32551619	32551584	Y	NA	LSM5,AVL9	NA	NA	NA	NA	AVL9	18510	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	32944853	32945232	32945065	Y	KBTBD2	KBTBD2,RP9P,FKBP9	NA	NA	NA	NA	KBTBD2	13110	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	34481286	34481294	34481290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMPER	538763	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	36480174	36480717	36480189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	52440	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	36698240	36698520	36698401	Y	AOAH	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	270506	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	37706109	37706403	37706265	Y	GPR141	EPDR1	NA	NA	NA	NA	EPDR1	15043	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	39454182	39454306	39454268	Y	POU6F2	NA	NA	NA	NA	NA	YAE1D1	149669	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	40007110	40007159	40007135	Y	NA	CDK13	NA	NA	NA	NA	CDK13	19474	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr7	40756959	40757193	40757114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	769323	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr7	41826532	41826836	41826663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI3	448633	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	42147213	42147355	42147278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI3	128114	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr7	42258020	42258279	42258155	Y	GLI3	GLI3	NA	NA	NA	NA	GLI3	17190	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	42533163	42533415	42533331	Y	NA	NA	GLI3	IMR90	Hi-C	24141950	GLI3	257694	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	42927750	42928726	42928340	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	NA	NA	NA	NA	C7orf25	21178	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr7	42954351	42954549	42954430	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	C7orf25	K562	ChIA-PET	22265404	C7orf25	4447	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	43115932	43116315	43116148	Y	NA	HECW1	HECW1,MRPL32,PSMA2	IMR90	Hi-C	24141950	HECW1	33883	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	43117230	43117632	43117554	Y	NA	HECW1	HECW1,MRPL32,PSMA2	IMR90	Hi-C	24141950	HECW1	32566	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	10.4379499682936
chr7	43625905	43626316	43625996	Y	URGCP,STK17A	STK17A	C7orf44	IMR90	Hi-C	24141950	STK17A	5548	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	43657815	43658085	43657951	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	37458	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	43658377	43658532	43658408	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	38020	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	43670120	43670185	43670135	Y	POLM,DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	49763	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	43676905	43677264	43677045	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	NA	NA	NA	NA	NA	STK17A	56548	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	43996825	43996925	43996859	Y	NA	URGCP,UBE2D4	NA	NA	NA	NA	UBE2D4	32788	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	44436686	44437032	44436900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC004453.8	68409	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	44674941	44675231	44675112	Y	PURB,MYO1G,CCM2,DDX56,OGDH	OGDH	ZMIZ2	IMR90	Hi-C	24141950	OGDH	30770	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	45019224	45019585	45019470	Y	OGDH,ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G	MYO1G,CCM2	NA	NA	NA	NA	MYO1G	2527	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	45633722	45633912	45633893	Y	ADCY1	ADCY1	NA	NA	NA	NA	ADCY1	21983	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	46186512	46186858	46186578	Y	IGFBP3	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	SEPT7P2	379895	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	46708141	46708157	46708149	Y	NA	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	SEPT7P2	901524	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	47366502	47366627	47366552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	253529	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	47391456	47391672	47391564	Y	C7orf65	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	228484	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	47514732	47515208	47514929	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104948	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr7	47536985	47537239	47537063	Y	HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	82917	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	47612587	47612873	47612749	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	7283	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	47620098	47620164	47620135	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	47631233	47631542	47631345	Y	C7orf69,TNS3	TNS3	TNS3,LINC00525,C7orf69,PKD1L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	11077	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	47826128	47826596	47826342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HUS1	190582	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	48031393	48031616	48031481	Y	HUS1	HUS1,C7orf57	HUS1	K562	ChIA-PET	22265404	HUS1	14215	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.30959389238579
chr7	48126389	48126700	48126545	Y	NA	UPP1	NA	NA	NA	NA	UPP1	164	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	49814202	49814497	49814292	Y	VWC2	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	701591	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	50682806	50683075	50682899	Y	DDC	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	166718	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	51395107	51395355	51395171	Y	NA	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	12592	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr7	55063666	55063958	55063856	Y	EGFR	EGFR	EGFR	IMR90	Hi-C	24141950	EGFR	20756	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	55146809	55147410	55146997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	62095	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	55245390	55245594	55245555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	160676	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	55529793	55530311	55530129	Y	ZNF713,VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL2	98652	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr7	55637986	55638270	55638071	Y	VOPP1	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	411	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	56029737	56030120	56029923	Y	CCT6A,MRPS17,GBAS	GBAS,MRPS17	NA	NA	NA	NA	MRPS17	12225	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	56243524	56243790	56243559	Y	LOC389493	NA	NA	NA	NA	NA	NUPR1L	61431	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	57471842	57471971	57471867	Y	NA	ZNF716	NA	NA	NA	NA	ZNF716	35912	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	57706434	57706786	57706770	Y	ZNF716	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF716	198551	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	61968807	61969730	61969008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-73B2.6	1414954	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	63767130	63767234	63767166	Y	NA	ZNF736	NA	NA	NA	NA	ZNF736	1293	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	63924105	63924304	63924148	Y	NA	HNRNPCP7	NA	NA	NA	NA	HNRNPCP7	34899	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	5.09168291136275
chr7	64072607	64072919	64072776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF680	51123	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	64295695	64295915	64295830	Y	ZNF680	ZNF138,ZNF273	NA	NA	NA	NA	ZNF273	32635	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	64733908	64734317	64734037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF92	102395	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr7	65761130	65761447	65761274	Y	RABGEF1,KCTD7	NA	NA	NA	NA	NA	TPST1	92944	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	65878387	65878723	65878560	Y	RABGEF1,KCTD7	NA	ASL,CRCP,TPST1,LINC00174	IMR90	Hi-C	24141950	GS1-124K5.3	77830	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.54584145568138
chr7	66056218	66056609	66056384	Y	NA	KCTD7	KCTD7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KCTD7	35259	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	66343310	66343680	66343495	Y	NA	NA	C7orf42	IMR90	Hi-C	24141950	TYW1	114480	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr7	66897123	66897210	66897167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMS2P4	131229	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	69215481	69215818	69215531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	153576	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	70146101	70146417	70146317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WBSCR17	448738	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	70204788	70204872	70204831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WBSCR17	390283	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	70953472	70953588	70953527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WBSCR17	358317	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	71336027	71336353	71336220	Y	CALN1	NA	NA	NA	NA	NA	WBSCR17	740872	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	72934537	72934921	72934642	Y	NA	BCL7B	NA	NA	NA	NA	BAZ1B	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	73037168	73037552	73037436	Y	MLXIPL	TBL2,MLXIPL	NA	NA	NA	NA	MLXIPL	295	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	73062013	73062614	73062579	Y	BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A	MLXIPL,WBSCR22,DNAJC30	MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A	IMR90	Hi-C	24141950	MLXIPL	25140	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr7	73157180	73157738	73157420	Y	FZD9,BAZ1B,TBL2,MLXIPL,ABHD11,CLDN4,CLDN3	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	5983	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	73785571	73785673	73785623	Y	CLIP2	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	80447	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	73866647	73867033	73866768	Y	LAT2	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	527	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	73869724	73869891	73869863	Y	GTF2IRD1	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	3604	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	74020929	74021149	74021053	Y	NA	GTF2I	NA	NA	NA	NA	GTF2I	48845	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	74074203	74074528	74074318	Y	LAT2,GTF2I	GTF2I	NA	NA	NA	NA	GTF2I	4209	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr7	74138320	74138615	74138328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2I	68326	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	75253450	75253956	75253637	Y	POR	NA	NA	NA	NA	NA	PMS2P3	97972	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	75268782	75269322	75269061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIP1	96958	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	75795833	75796053	75795969	Y	RHBDD2,POR	NA	SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	MDH2	120464	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.54584145568138
chr7	75833146	75833486	75833315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPB1	96375	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	75923846	75924306	75924205	Y	HSPB1	HSPB1	NA	NA	NA	NA	HSPB1	5555	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	17444	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	75948116	75948327	75948250	Y	RHBDD2	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	18255	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	75993825	75994303	75994024	Y	NA	YWHAG,ZP3,SRCRB4D	YWHAG	MCF7	ChIA-PET	22265404	YWHAG	7477	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	76009173	76009680	76009431	Y	POR	YWHAG,ZP3,SRCRB4D	NA	NA	NA	NA	ZP3	15155	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	77199277	77199536	77199359	Y	FGL2,PION,PTPN12,PTPN12	PTPN12	NA	NA	NA	NA	PTPN12	34685	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	78922771	78923130	78923056	Y	MAGI2	NA	NA	NA	NA	NA	GNAI1	838141	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	81431614	81431790	81431695	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	639324	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	82596075	82596467	82596271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCLO	193779	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	83089748	83090034	83089772	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCLO	299502	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	83092459	83092603	83092529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCLO	302213	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	84165433	84165798	84165584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCLO	1375187	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	84248657	84248668	84248663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCLO	1458411	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	92290698	92291011	92290856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	72990	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	92340516	92340848	92340839	Y	CDK6	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	122808	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	92463754	92464079	92463922	Y	CDK6,CDK6	NA	NA	NA	NA	NA	CDK6	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	92745192	92745375	92745297	Y	SAMD9	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD9	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	93231275	93231507	93231391	Y	CCDC132	CALCR	NA	NA	NA	NA	CALCR	29233	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	94022848	94022915	94022881	Y	NA	COL1A2	NA	NA	NA	NA	COL1A2	975	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	94284072	94284624	94284343	Y	NA	SGCE,PEG10,RPS3AP25	NA	NA	NA	NA	PEG10	435	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	94799053	94799326	94799190	Y	PPP1R9A,PPP1R9A	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-16P	73514	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	95030354	95030375	95030365	Y	NA	PON2	NA	NA	NA	NA	PON2	32135	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	95206497	95206802	95206650	Y	PDK4	PDK4	NA	NA	NA	NA	PDK4	17001	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	95861904	95862185	95862172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	87274	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	95877265	95877280	95877275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	72179	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	96176969	96177132	96177051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHFM1	160071	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	96482190	96482573	96482196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHFM1	144987	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	97915595	97916070	97915699	Y	LMTK2,BRI3	TECPR1,BRI3	NA	NA	NA	NA	BRI3	35904	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	97994295	97994325	97994312	Y	BAIAP2L1	RPS3AP26,BAIAP2L1	BRI3	IMR90	Hi-C	24141950	RPS3AP26	19571	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	98099989	98100186	98100071	Y	TMEM130	NA	TMEM130	IMR90	Hi-C	24141950	BAIAP2L1	71609	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr7	99094567	99094648	99094634	Y	NA	PTCD1,ATP5J2-PTCD1,ATP5J2,ZNF789,ZNF394,ZKSCAN5	NA	NA	NA	NA	ZNF394	1299	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	99684818	99685168	99684993	Y	TSC22D4,PILRB,PILRA	ZSCAN21,ZNF3,COPS6,AP4M1,MCM7,CNPY4,TAF6,MBLAC1	NA	NA	NA	NA	COPS6	241	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	99785086	99785350	99785241	Y	ZKSCAN1,MCM7,GATS	C7orf43,GAL3ST4,GPC2,STAG3	NA	NA	NA	NA	STAG3	11900	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	99994747	99995042	99994880	Y	ACTL6B,PILRB	MEPCE,ZCWPW1,PPP1R35	NA	NA	NA	NA	MEPCE	29371	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr7	100434359	100434559	100434459	Y	SAP25,EPHB4	SLC12A9,EPHB4,RP11-126L15.4,TRIP6,SRRT	EPHB4,ZAN,POP7,TRIP6,SLC12A9,LOC100129845,FBXO24,PCOLCE,MOSPD3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHB4	11238	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr7	100743461	100743946	100743576	Y	GNB2,TRIM56	TRIM56,SERPINE1	SERPINE1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM56	16741	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	100749807	100749916	100749853	Y	TRIM56	TRIM56,SERPINE1,AP1S1	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	18454	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	100809834	100810470	100810178	Y	NA	SERPINE1,AP1S1,VGF,MOGAT3,ZNHIT1,PLOD3	NA	NA	NA	NA	VGF	2960	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	101045498	101045795	101045583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RABL5	82394	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	101062164	101062286	101062177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RABL5	99060	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr7	101377148	101377442	101377338	Y	NA	NA	CUX1,EMID2,SH2B2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CUX1	79517	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	101428138	101428355	101428247	Y	NA	CUX1	CUX1	IMR90	Hi-C	24141950	CUX1	28604	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	101929501	101929660	101929574	Y	CUX1,CUX1,CUX1,POLR2J3,ORAI2,SH2B2	SH2B2	NA	NA	NA	NA	SH2B2	3096	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	SH2B2	NA	NA	NA	NA	SH2B2	3573	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	8.40127680374854
chr7	104008526	104008908	104008623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ORC5	162031	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr7	104960256	104960357	104960307	Y	MLL5,SRPK2	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	77398	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	104980501	104980737	104980707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	57018	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	105329677	105330033	105329813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFCAB10	90355	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr7	105416484	105416867	105416678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L1	98183	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	105447208	105447599	105447347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L1	67451	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	105455089	105455224	105455200	Y	NAMPT,ATXN7L1	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L1	59826	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	106808132	106808705	106808532	Y	NA	HBP1	NA	NA	NA	NA	HBP1	726	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	107026511	107026865	107026723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	175064	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	107109276	107109645	107109473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	92284	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	107136125	107136576	107136361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	65353	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	107554407	107554624	107554481	Y	DLD	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	24992	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	107562078	107562130	107562088	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	32663	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	107644827	107645024	107644950	Y	LAMB1	LAMB1	NA	NA	NA	NA	LAMB1	3127	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	110808410	110808626	110808556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	391947	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	111421395	111421784	111421410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	220822	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	111721905	111722337	111722086	Y	ZNF277,IFRD1,DOCK4	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK4	122129	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	114571241	114571658	114571396	Y	MDFIC	NA	NA	NA	NA	NA	TES	1276889	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	115665353	115665797	115665679	Y	TES,TFEC	NA	NA	NA	NA	NA	TES	182750	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	116699859	116700243	116700052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	107471	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	119269873	119270211	119270042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-328J2.1	275218	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr7	119283625	119284006	119283817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-328J2.1	261423	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	120420082	120420394	120420238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN12	76062	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	120422644	120422993	120422820	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN12	73463	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr7	121150464	121150828	121150695	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM3C	116046	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	121951914	121952318	121952125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AASS	169580	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	123903491	123903761	123903674	Y	NA	NA	GPR37,LOC154872	IMR90	Hi-C	24141950	WASL	516370	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	126658207	126658487	126658347	Y	GRM8	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF800	411491	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	127455662	127455822	127455742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SND1	165428	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr7	128383172	128383597	128383318	Y	NA	FAM71F1,CALU,CCDC136	NA	NA	NA	NA	CALU	5826	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	128500948	128501348	128501123	Y	NA	FLNC,ATP6V1F,KCP	NA	NA	NA	NA	ATP6V1F	68	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	128549999	128550078	128550039	Y	NA	ATP6V1F,KCP	NA	NA	NA	NA	KCP	1226	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	128696279	128696583	128696469	Y	NA	TNPO3	NA	NA	NA	NA	TNPO3	3081	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	129057225	129057410	129057318	Y	NA	RP11-305M3.2	NA	NA	NA	NA	RP11-305M3.2	9014	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	129419118	129419176	129419138	Y	NA	NA	UBE2H,NRF1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	169563	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	129419876	129420343	129420085	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	170321	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	4.0733463290902
chr7	129420694	129421120	129420768	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	UBE2H	169669	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	129421490	129421976	129421792	Y	FAM40B	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	UBE2H	168813	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	129464915	129465297	129464948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	125492	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	129590044	129590333	129590306	Y	NA	UBE2H	NA	NA	NA	NA	UBE2H	456	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	130641725	130642119	130642041	Y	MKLN1	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	150736	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	130665753	130666114	130665990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	126741	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	130692586	130692952	130692786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	99903	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	130920397	130920794	130920689	Y	MKLN1,MKLN1	AC009362.2	NA	NA	NA	NA	AC009362.2	4555	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	131271012	131271384	131271093	Y	NA	PODXL	NA	NA	NA	NA	PODXL	30036	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	131289586	131289917	131289766	Y	PODXL	PODXL	PODXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PODXL	48610	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr7	131290113	131290454	131290336	Y	NA	PODXL	PODXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PODXL	49137	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr7	131872857	131873222	131873095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009518.4	292457	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	132656149	132656423	132656408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	108425	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	135443440	135443607	135443468	Y	FAM180A	NA	C7orf73,SLC13A4	IMR90	Hi-C	24141950	C7orf73	98196	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	136582219	136582518	136582369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTN	444093	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	137387266	137387617	137387499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKI	142221	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	137928273	137928746	137928445	Y	AKR1D1,TRIM24	NA	NA	NA	NA	NA	AC008155.2	52483	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	139929659	139930294	139929953	Y	TBXAS1,RAB19,JHDM1D	NA	JHDM1D,LOC100134229	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP12	168138	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	140262789	140263047	140262916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRN1	85420	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	140776370	140776415	140776407	Y	LOC100131199	RNU4-74P	NA	NA	NA	NA	RNU4-74P	26321	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	144462107	144462147	144462127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPK1	69341	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	145847092	145847701	145847439	Y	CNTNAP2	CNTNAP2	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	35639	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	145925339	145925571	145925397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	113886	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	145932628	145933064	145932806	Y	CNTNAP2	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	121175	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	145933200	145933594	145933373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	121747	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	145934224	145934573	145934546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	122771	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	145943025	145943194	145943108	Y	CNTNAP2	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	131572	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	RNY5	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNY5	1693	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	RNY5,PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr7	150705271	150705459	150705364	Y	GIMAP7,GIMAP4,GIMAP6,GIMAP2,GIMAP1,GIMAP5,LOC100128542,KCNH2	KCNH2,NOS3,ATG9B,ABCB8,SLC4A2,CDK5	NA	NA	NA	NA	ATG9B	14127	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	151284346	151284467	151284405	Y	SMARCD3,SMARCD3,WDR86	NA	NA	NA	NA	NA	RHEB	69140	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	152105895	152106094	152106005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	265156	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	152160343	152160554	152160402	Y	ACTR3B	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	210696	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	152160715	152161193	152160959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	210057	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	152219127	152219295	152219254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	151955	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	153585684	153585818	153585716	Y	DPP6,DPP6,DPP6	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR3B	1130850	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	155580383	155580450	155580415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009403.2	144484	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	155752755	155752934	155752845	Y	SHH	NA	LOC285889	IMR90	Hi-C	24141950	AC009403.2	316856	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	156724801	156725029	156724915	Y	NA	LMBR1,NOM1	NOM1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NOM1	15388	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	156932490	156932855	156932681	Y	NA	UBE3C	NA	NA	NA	NA	UBE3C	2883	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	157071910	157072285	157071928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	53790	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	157103071	157103446	157103266	Y	NA	DNAJB6	UBE3C,DNAJB6	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB6	22629	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr7	157131379	157131690	157131421	Y	NA	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	5304	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	157338058	157338440	157338352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	211983	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	157549772	157549906	157549839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	423697	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	158225517	158225999	158225657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	269521	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	158493510	158493807	158493659	Y	NCAPG2	NCAPG2	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	1713	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr7	158595763	158596162	158596010	Y	ESYT2	ESYT2	NA	NA	NA	NA	ESYT2	24782	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr7	158613624	158614053	158613981	Y	ESYT2	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	6891	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	841612	841879	841708	Y	C8orf42	NA	NA	NA	NA	NA	ERICH1	155506	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr8	1011862	1012449	1011913	Y	NA	NA	DLGAP2	IMR90	Hi-C	24141950	ERICH1	325756	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	1220424	1220599	1220512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLN8	481345	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	1452379	1452383	1452381	Y	KBTBD11	NA	NA	NA	NA	NA	CLN8	249561	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	1750336	1750494	1750412	Y	NA	CLN8,CTD-2336O2.1,ARHGEF10	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	19648	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr8	1765271	1765682	1765322	Y	NA	ARHGEF10	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	4460	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr8	1780723	1781665	1781560	Y	NA	ARHGEF10	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	10581	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr8	2591169	2591450	2591225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KBTBD11	671125	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	6323096	6323426	6323195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPH1	60983	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	8706541	8706605	8706573	Y	NA	MFHAS1	NA	NA	NA	NA	MFHAS1	42550	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	8915585	8915895	8915753	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERI1	57928	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	9040807	9041224	9041065	Y	NA	PPP1R3B,RP11-10A14.4	NA	NA	NA	NA	RP11-10A14.4	33555	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	4.58251462022648
chr8	9219931	9220273	9220102	Y	PPP1R3B	NA	NA	NA	NA	NA	TNKS	191151	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	9764051	9764441	9764391	Y	MSRA	LINC00599	NA	NA	NA	NA	LINC00599	3175	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.29125731011324
chr8	9791185	9791439	9791249	Y	MSRA	LINC00599	LOC157627,MSRA	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00599	30309	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	9912937	9913246	9913138	Y	NA	MSRA	NA	NA	NA	NA	MSRA	3159	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr8	10191869	10192038	10191953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	282091	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	10192260	10192787	10192448	Y	MSRA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	282482	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr8	10193189	10193473	10193425	Y	MSRA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	283411	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	16613104	16613477	16613307	Y	NA	NA	TUSC3,MSR1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC2	398061	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	20125746	20125979	20125927	Y	NA	LZTS1	DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1	IMR90	Hi-C	24141950	LZTS1	33495	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr8	20126353	20126692	20126612	Y	NA	LZTS1	DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1	IMR90	Hi-C	24141950	LZTS1	32782	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	20345349	20345374	20345363	Y	NA	NA	LOC286114,GFRA2	IMR90	Hi-C	24141950	LZTS1	185875	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr8	20365880	20366059	20365989	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LZTS1	206406	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	21624397	21624558	21624547	Y	NPM2,GFRA2	NA	NA	NA	NA	NA	XPO7	150622	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	21775759	21776194	21775973	Y	PHYHIP,DOK2,NPM2	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	579	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr8	22710401	22710511	22710455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	132419	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	22808149	22808394	22808223	Y	NA	RHOBTB2	PEBP4,TNFRSF10B,BIN3,EGR3,RHOBTB2	IMR90	Hi-C	24141950	RHOBTB2	34536	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr8	22854119	22854395	22854224	Y	EGR3,EGR3,RHOBTB2,RHOBTB2	RHOBTB2,RP11-875O11.1	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	11189	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	22858849	22858903	22858877	Y	NA	RHOBTB2,RP11-875O11.1	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	15919	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	24799462	24799718	24799592	Y	NEFL	NEFM,NEFL	NA	NA	NA	NA	NEFL	12906	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr8	25356816	25356840	25356828	Y	NA	KCTD9,CDCA2	NA	NA	NA	NA	CDCA2	42303	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	26429509	26429959	26429867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	59718	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr8	27464961	27465271	27465267	Y	NA	CLU	NA	NA	NA	NA	CLU	5277	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	27517363	27517693	27517481	Y	NA	CLU	NA	NA	NA	NA	CLU	46815	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	27730121	27730534	27730322	Y	ELP3,PBK	PBK	NA	NA	NA	NA	PBK	36509	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr8	28258528	28258941	28258737	Y	HMBOX1,HMBOX1	ZNF395	ZNF395,FBXO16	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF395	310	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr8	28263906	28264152	28263987	Y	HMBOX1,HMBOX1,ZNF395	ZNF395	ZNF395	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF395	5688	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.0366731645451
chr8	28355222	28355409	28355286	Y	NA	FBXO16,FZD3	NA	NA	NA	NA	FZD3	5493	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr8	28569820	28569970	28569874	Y	ZNF395,FZD3,EXTL3	NA	NA	NA	NA	NA	EXTL3	113834	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr8	28859805	28860025	28859905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2647L4.4	51427	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	30363851	30364149	30364000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBPMS-AS1	122934	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	30435369	30435466	30435408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2E2	78302	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	30769723	30770025	30769859	Y	NA	NA	TEX15,WRN,PPP2CB,PURG	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2CB	99893	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr8	33718252	33718557	33718395	Y	NA	RP1-273G13.1	NA	NA	NA	NA	RP1-273G13.1	2511	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	35238175	35238554	35238365	Y	UNC5D	NA	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	142727	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	4.58251462022648
chr8	37961561	37961954	37961758	Y	NA	ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	801	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	38009325	38009705	38009661	Y	NA	ASH2L,BAG4,LSM1	NA	NA	NA	NA	BAG4	22346	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr8	38035023	38035257	38035173	Y	WHSC1L1,LETM2,LETM2,BAG4	BAG4,LSM1,DDHD2	NA	NA	NA	NA	LSM1	2775	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	38312135	38312514	38312441	Y	NA	FGFR1	NA	NA	NA	NA	FGFR1	11838	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	38313401	38313535	38313485	Y	NA	FGFR1	NA	NA	NA	NA	FGFR1	10817	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	38794582	38795442	38794757	Y	TACC1,PLEKHA2	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	37829	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	40256946	40256967	40256958	Y	NA	NA	ZMAT4	IMR90	Hi-C	24141950	ZMAT4	496385	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	41908079	41908836	41908505	Y	POLB,IKBKB,IKBKB,AP3M2,AGPAT6,MYST3	KAT6A	NA	NA	NA	NA	KAT6A	571	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	41997279	41998522	41997937	Y	NA	AP3M2	KAT6A,ANK1,POLB,AP3M2,VDAC3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP3M2	9942	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	43092918	43093442	43093017	Y	HOOK3	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	99362	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr8	47903412	47903538	47903475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP2	163203	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	49229155	49229573	49229245	Y	NA	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	65577	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	54658367	54658716	54658684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP6V1H	95402	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	54884595	54884649	54884642	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	48440	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	54884977	54885679	54885327	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	47410	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr8	54932125	54932445	54932251	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	644	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	56202539	56202563	56202551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGS1	481138	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	56744320	56744391	56744354	Y	TGS1	LYN	NA	NA	NA	NA	LYN	45981	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr8	56891091	56891632	56891326	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD54	92828	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	59499727	59499886	59499762	Y	UBXN2B,NSMAF,NSMAF,SDCBP	SDCBP	NA	NA	NA	NA	SDCBP	36244	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	59768911	59769118	59769011	Y	NA	RNU4-50P	NA	NA	NA	NA	RNU4-50P	43800	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	59959496	59959676	59959637	Y	TOX	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-50P	234385	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	61850776	61851191	61851141	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261439	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	63776641	63776831	63776733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGH	172899	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	65282966	65283235	65283141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTHDF3	1203854	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr8	66615323	66615688	66615531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	60354	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	66749896	66750187	66749927	Y	PDE7A	PDE7A	NA	NA	NA	NA	PDE7A	2370	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	66935018	66935363	66935175	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM55	101768	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	67699786	67700084	67699891	Y	VCPIP1,SGK3,SGK3	NA	NA	NA	NA	NA	SGK3	77133	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	70982774	70982831	70982803	Y	PRDM14	PRDM14,RNU1-101P,RP11-152C15.1	NA	NA	NA	NA	PRDM14	846	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	70985003	70985175	70985161	Y	NA	PRDM14,RNU1-101P,RP11-152C15.1	NA	NA	NA	NA	PRDM14	3075	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr8	71084923	71085298	71085131	Y	NCOA2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	70509	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	71149519	71149670	71149631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	135105	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr8	73690966	73691186	73691160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-1145L24.1	100789	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	75515244	75515546	75515314	Y	NA	RP11-730G20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-730G20.2	765	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	75578837	75579082	75578960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-730G20.2	64358	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	76035291	76035498	76035400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRISPLD1	140541	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr8	76131324	76131607	76131526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRISPLD1	236574	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr8	79674578	79674862	79674701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STMN2	846187	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr8	80275634	80276026	80275830	Y	STMN2	NA	NA	NA	NA	NA	STMN2	245023	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr8	80680806	80681178	80681064	Y	HEY1	NA	NA	NA	NA	NA	STMN2	159757	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	81050951	81051119	81051010	Y	TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	TPD52	90348	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	82167350	82167604	82167486	Y	NA	FABP5	ZNF704,PAG1,FABP12	IMR90	Hi-C	24141950	FABP5	22994	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	86090980	86091058	86091024	Y	E2F5,E2F5	E2F5,C8orf59	NA	NA	NA	NA	E2F5	3520	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	87444767	87445117	87444942	Y	WWP1	CPNE3	NA	NA	NA	NA	CPNE3	49942	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	87673960	87674305	87674138	Y	CNGB3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A3P4	160140	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	91479808	91480381	91480048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM64	321479	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	94728357	94728657	94728477	Y	NA	FAM92A1,RBM12B,TMEM67	NA	NA	NA	NA	FAM92A1	19568	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	95429933	95430227	95430143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD54B	55110	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	97669610	97669970	97669871	Y	PGCP	NA	NA	NA	NA	NA	SDC2	166031	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	98038035	98038331	98038307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPYL5	249845	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	99526737	99526942	99526761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POP1	399212	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr8	101427912	101428321	101428112	Y	SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19A	81466	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr8	101920209	101920392	101920320	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	RPS26P6,YWHAZ	NA	NA	NA	NA	RPS26P6	14235	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	101920723	101921107	101920870	Y	NA	RPS26P6,YWHAZ	NA	NA	NA	NA	RPS26P6	14749	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	102505982	102506363	102506168	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	3322	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	103249003	103249378	103249091	Y	UBR5,KLF10,RRM2B,RRM2B	KB-431C1.4	NA	NA	NA	NA	RRM2B	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	103411260	103411483	103411351	Y	UBR5	UBR5	NA	NA	NA	NA	UBR5	11586	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	103669922	103670289	103670129	Y	ATP6V1C1,KLF10,KLF10	KLF10	NA	NA	NA	NA	KLF10	3792	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	103939794	103939949	103939858	Y	NA	AZIN1	AZIN1,ATP6V1C1	IMR90	Hi-C	24141950	AZIN1	35702	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr8	105409050	105409327	105409190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP12	189925	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	113119329	113119491	113119407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	1267407	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	115227918	115228008	115227963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-267L5.1	64288	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	115233906	115233914	115233910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-267L5.1	58382	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	116660380	116660747	116660648	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	159152	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	116678291	116678885	116678654	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	141014	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	118885059	118885357	118885328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	236735	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	119808728	119809168	119808881	Y	TNFRSF11B	NA	TNFRSF11B	IMR90	Hi-C	24141950	SAMD12	176494	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	120779948	120780281	120780115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF2	62822	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	120995010	120995163	120995088	Y	DEPTOR	NA	NA	NA	NA	NA	COL14A1	74856	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr8	121060310	121060648	121060608	Y	NA	COL14A1	NA	NA	NA	NA	COL14A1	9371	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr8	121442839	121443137	121442988	Y	NA	MTBP,MRPL13	NA	NA	NA	NA	MTBP	12503	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	121815954	121816374	121816244	Y	SNTB1	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL13	360312	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	124248679	124249062	124248866	Y	NA	C8orf76,ZHX1	NA	NA	NA	NA	C8orf76	2576	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	124529265	124529734	124529486	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	21712	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	125656235	125656588	125656492	Y	ZNF572,RNF139,MTSS1	NA	NA	NA	NA	NA	MTSS1	82142	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	126037665	126038021	126037843	Y	NA	SQLE	NA	NA	NA	NA	SQLE	28926	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	126193275	126193543	126193371	Y	NA	NA	TRIB1	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0196	91193	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	126286229	126286368	126286299	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	154195	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	126290719	126290948	126290836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	149615	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	126354343	126354802	126354718	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	85761	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	126400704	126400965	126400873	Y	NA	TRIB1	TRIB1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TRIB1	39598	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.80042560124951
chr8	126556751	126557301	126556981	Y	NA	NA	NSMCE2,KIAA0196,TRIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	116188	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	127574722	127575027	127574875	Y	NA	RP11-89K10.1,FAM84B	NA	NA	NA	NA	FAM84B	6084	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	127837362	127837443	127837401	Y	FAM84B	NA	PVT1,MYC,LOC727677	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM84B	268724	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	128099457	128099542	128099514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POU5F1B	324993	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	128744100	128744550	128744397	Y	NA	MYC	NA	NA	NA	NA	MYC	1130	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	128825013	128825274	128825028	Y	MYC	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	20234	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	128871975	128872421	128872033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	67196	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	129061512	129061955	129061598	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	40655	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	129593885	129594223	129593976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	573028	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	129659601	129660006	129659683	Y	NA	NA	MYC	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU4-25P	638744	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr8	130594185	130594451	130594334	Y	FAM49B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	432924	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	130996669	130996803	130996748	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	30572	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr8	131264949	131265429	131265208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	188477	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr8	133220166	133220184	133220177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFR3A	305831	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	133318227	133318435	133318380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC6	367403	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	133562041	133562364	133562205	Y	HHLA1,KCNQ3,KCNQ3	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC6	123474	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	134094333	134095052	134094858	Y	ST3GAL1,TMEM71,PHF20L1	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	217213	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	134699077	134699376	134699146	Y	NA	NA	ST3GAL1	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL1	116894	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	134908857	134909245	134909052	Y	ST3GAL1	NA	ST3GAL1,ZFAT	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL1	326674	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	135635794	135636288	135636020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAT	87004	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	137937938	137938287	137938113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-35P	1185200	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	140716297	140716707	140716660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	749971	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	141110302	141110773	141110688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	355905	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	142215999	142216277	142216212	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	90622	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	12.2200389872706
chr8	142216641	142216829	142216751	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	91264	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr8	142247795	142248221	142248078	Y	DENND3,PTP4A3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A4	68183	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	143533998	143534621	143534303	Y	LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1	NA	BAI1,TSNARE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TSNARE1	51397	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	144032047	144032423	144032233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LY6E	64976	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	144189739	144190110	144189925	Y	GML	NA	ZFP41	IMR90	Hi-C	24141950	LY6E	92340	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	144301806	144302247	144302025	Y	MAFA	ZFP41,GLI4	NA	NA	NA	NA	ZFP41	25033	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr8	144328155	144328364	144328211	Y	NA	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	ZFP41	875	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	144629463	144629732	144629564	Y	SPATC1,GRINA	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,TIGD5,EEF1D	NA	NA	NA	NA	GSDMD	3645	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	145015768	145015971	145015849	Y	FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	32931	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	145022492	145023108	145022824	Y	PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	25794	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr8	145911932	145912089	145912059	Y	SCRT1,KIFC2,LRRC24,ZNF34	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF34	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	2738	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	972038	972418	972053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMRT2	75936	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr9	2241944	2242239	2242031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA2	228602	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	2279055	2279418	2279226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA2	265713	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	2281532	2281772	2281628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA2	268190	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr9	2875811	2876206	2875956	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	33570	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	3508264	3508975	3508586	Y	RFX3	RFX3,RP11-509J21.1	NA	NA	NA	NA	RFX3	15029	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	4137159	4137519	4137339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAPDC2	522779	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	4738592	4738723	4738708	Y	NA	AK3	NA	NA	NA	NA	AK3	1320	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	4864348	4864647	4864448	Y	NA	MIR101-2	NA	NA	NA	NA	MIR101-2	16057	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	5558340	5558581	5558428	Y	CD274,KIAA2026,KIAA1432	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1432	68444	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	5879621	5879741	5879699	Y	NA	ERMP1	ERMP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	ERMP1	48504	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	6564380	6564534	6564488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-106A1.2	72605	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,GLDC,RP11-390F4.6,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr9	14229495	14229796	14229646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	167186	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	15300887	15301166	15301002	Y	TTC39B	TTC39B	NA	NA	NA	NA	TTC39B	4192	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	15306066	15306408	15306119	Y	NA	TTC39B	NA	NA	NA	NA	TTC39B	708	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	15477137	15477463	15477300	Y	NA	PSIP1,FTH1P12	NA	NA	NA	NA	PSIP1	31554	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	16521914	16522385	16522163	Y	BNC2	NA	NA	NA	NA	NA	BNC2	346456	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	18547624	18547850	18547739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-296P7.4	477040	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	18718417	18718817	18718751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-296P7.4	306073	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	19124098	19124309	19124196	Y	ACER2,PLIN2	HAUS6,PLIN2	NA	NA	NA	NA	PLIN2	22979	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr9	20224812	20225090	20224997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC24A2	439886	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	21016783	21016802	21016795	Y	IFNA1,IFNA6,IFNA5,IFNW1	PTPLAD2	NA	NA	NA	NA	PTPLAD2	12833	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr9	21081727	21081778	21081753	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPLAD2	52092	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	22408637	22408662	22408639	Y	NA	DMRTA1	NA	NA	NA	NA	DMRTA1	36178	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	27416206	27416570	27416389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	111209	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	27564116	27564302	27564198	Y	C9orf72,C9orf72	MOB3B,C9orf72	NA	NA	NA	NA	C9orf72	7562	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr9	27564817	27564968	27564873	Y	C9orf72,C9orf72	MOB3B,C9orf72	NA	NA	NA	NA	C9orf72	6896	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	27658983	27659268	27659122	Y	C9orf72,C9orf72	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf72	87119	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	29213900	29214394	29214154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMXP2	1472709	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.29125731011324
chr9	32556634	32556872	32556767	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	TOPORS	6083	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	33436336	33436688	33436507	Y	NA	AQP3,NOL6	NA	NA	NA	NA	AQP3	8921	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	33942829	33943199	33943013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBAP2	103748	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	33953868	33954185	33954034	Y	UBE2R2,UBAP1	NA	NA	NA	NA	NA	UBAP2	92762	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	34016159	34016420	34016379	Y	NA	UBAP2	NA	NA	NA	NA	UBAP2	30527	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	34577617	34577859	34577738	Y	ARID3C,DNAJB5,DNAJB5,CNTFR,CNTFR	DCTN3	NA	NA	NA	NA	DCTN3	40656	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	35518041	35518590	35518314	Y	CREB3,VCP,STOML2,RUSC2	RUSC2	NA	NA	NA	NA	RUSC2	29917	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1,SIT1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	35726275	35726587	35726326	Y	NA	TPM2,CREB3,TLN1,RGP1,GBA2	NA	NA	NA	NA	CREB3	3745	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	36764220	36764685	36764538	Y	NA	NA	MELK	IMR90	Hi-C	24141950	MELK	193361	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	36924974	36925090	36925030	Y	MELK	NA	NA	NA	NA	NA	PAX5	107013	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	37032033	37032396	37032120	Y	ZCCHC7,PAX5	NA	NA	NA	NA	NA	PAX5	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	37859471	37859543	37859507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	60037	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	38689769	38689953	38689855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD18A	114565	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	68417391	68418146	68417579	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	35229	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.05500974681765
chr9	71175047	71175635	71175329	Y	NA	NA	PGM5	IMR90	Hi-C	24141950	PIP5K1B	142940	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	71728196	71728449	71728285	Y	NA	TJP2	NA	NA	NA	NA	TJP2	5760	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	72360056	72360394	72360281	Y	NA	PTAR1	NA	NA	NA	NA	PTAR1	12481	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr9	72837972	72838313	72838181	Y	NA	SMC5	NA	NA	NA	NA	SMC5	33624	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr9	72923580	72923722	72923651	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	51643	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chr9	73035561	73035945	73035863	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8021	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr9	75088538	75088711	75088620	Y	ZFAND5	NA	TMC1,ZFAND5	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND5	110375	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	75129013	75129167	75129063	Y	NA	NA	TMC1,ZFAND5	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND5	150850	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr9	76703113	76703431	76703273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-197P3.1	844661	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	79303501	79303668	79303622	Y	GCNT1	NA	NA	NA	NA	NA	AL161626.1	118770	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	80911003	80911373	80911119	Y	PSAT1	PSAT1	NA	NA	NA	NA	PSAT1	944	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr9	81003152	81003350	81003249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAT1	93093	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	81341677	81341857	81341765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAT1	431618	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	81586798	81586848	81586823	Y	NA	NA	TLE4	IMR90	Hi-C	24141950	CHCHD2P9	417371	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	81627556	81627780	81627606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2P9	376439	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	81704987	81705355	81705134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2P9	298864	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	82226280	82226508	82226439	Y	TLE4	TLE4	NA	NA	NA	NA	TLE4	41592	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	84046577	84046973	84046817	Y	NA	NA	TLE1	IMR90	Hi-C	24141950	TLE1	255247	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	84270722	84271111	84271084	Y	NA	TLE1	NA	NA	NA	NA	TLE1	31109	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	85498647	85499068	85498841	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-522I20.3	821441	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	87459243	87459541	87459302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC28A3	505571	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	89699545	89699882	89699714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	74978	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	89952631	89952908	89952845	Y	NA	NA	DAPK1,LOC440173	IMR90	Hi-C	24141950	DAPK1	157235	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	89953262	89953308	89953285	Y	NA	NA	DAPK1,LOC440173	IMR90	Hi-C	24141950	DAPK1	156835	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr9	90195086	90195422	90195273	Y	DAPK1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	56869	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	90216174	90216503	90216403	Y	DAPK1,CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	77957	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	91096507	91096802	91096655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPIN1	95173	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	91795136	91795669	91795494	Y	C9orf47,SHC3	SHC3	NA	NA	NA	NA	SHC3	3454	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr9	92050487	92050811	92050719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA4D	60234	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr9	92218967	92219282	92219262	Y	NA	GADD45G	NA	NA	NA	NA	GADD45G	1039	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	93880356	93880696	93880620	Y	NA	NA	LOC100129316,AUH,ROR2	IMR90	Hi-C	24141950	AUH	241499	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	94296561	94296715	94296638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIL3	112417	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	94614253	94614381	94614318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROR2	96063	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	95911723	95912154	95911876	Y	IPPK,C9orf89,NINJ1	NINJ1	WNK2,NINJ1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NINJ1	17153	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF169	90183	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	97710922	97711259	97710966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	223939	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	97852724	97853044	97852860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	224947	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	97966578	97966817	97966786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	111174	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	98273012	98273438	98273114	Y	C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-435O5.2	85934	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	98273818	98274186	98273872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-435O5.2	86740	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	98789709	98789934	98789859	Y	C9orf102	NA	LOC158435	IMR90	Hi-C	24141950	EIF4BP3	116355	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	98899705	98899808	98899766	Y	CDC14B	EIF4BP3	FBP1,C9orf102,PTCH1,LOC158435,LOC158434,LINC00092,FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	EIF4BP3	6481	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	99106686	99107122	99106995	Y	NA	SLC35D2	NA	NA	NA	NA	SLC35D2	36870	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr9	99171138	99171308	99171256	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	RP11-172F4.2	3572	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	2936	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr9	99976780	99977107	99976893	Y	NA	ZNF322P1,RP11-498P14.5	NA	NA	NA	NA	ZNF322P1	16870	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	99977715	99977938	99977827	Y	NA	ZNF322P1,RP11-498P14.5	NA	NA	NA	NA	ZNF322P1	17805	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	100548546	100549029	100548790	Y	FOXE1	NA	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	FOXE1	64507	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	100565577	100566264	100565821	Y	CORO2A,FOXE1	FOXE1	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	FOXE1	47272	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr9	100696898	100697242	100697085	Y	NA	C9orf156,ANP32B	NA	NA	NA	NA	C9orf156	14046	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	100747732	100748046	100747912	Y	NA	ANP32B	NA	NA	NA	NA	ANP32B	4089	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	100772550	100772875	100772560	Y	NA	ANP32B,NANS	NANS,TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	ANP32B	28907	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr9	100880203	100880431	100880317	Y	C9orf156,HEMGN,TRIM14,TRIM14	TRIM14	NA	NA	NA	NA	TRIM14	709	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	100981172	100981639	100981390	Y	NA	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	CORO2A	28250	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr9	100985595	100985973	100985751	Y	TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	29942	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	100994380	100994637	100994474	Y	TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	21278	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	101030800	101031187	101030994	Y	NA	TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	14885	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr9	101081243	101081884	101081560	Y	GABBR2	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	65328	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	102007294	102007527	102007424	Y	NA	ALG2,SEC61B	NA	NA	NA	NA	SEC61B	24948	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	102908427	102908826	102908633	Y	NA	ERP44,INVS	NA	NA	NA	NA	INVS	48889	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr9	103029299	103029483	103029391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEX10	83738	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	105957487	105957816	105957647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC2	896725	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	107730510	107730878	107730708	Y	SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1	RP11-217B7.2,ABCA1	ABCA1	IMR90	Hi-C	24141950	ABCA1	41992	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	107755412	107756258	107755691	Y	ABCA1	NA	ABCA1,SLC44A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ABCA1	66894	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr9	108042949	108043294	108043141	Y	ABCA1,TMEM38B,FSD1L,FSD1L	SLC44A1	NA	NA	NA	NA	SLC44A1	38046	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	108052780	108053053	108052862	Y	ABCA1,TMEM38B,FSD1L,FSD1L	SLC44A1	NA	NA	NA	NA	SLC44A1	47877	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	108621964	108622364	108622354	Y	NA	NA	MIR548Q,ZNF462	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM38B	167139	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	108673876	108674293	108674054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM38B	219051	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	109626456	109627144	109627032	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	3078	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	109655422	109655715	109655552	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	32044	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	109933165	109933377	109933258	Y	KLF4	NA	ZNF462,MIR548Q,RAD23B	IMR90	Hi-C	24141950	RAD23B	110041	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	110227888	110228126	110228018	Y	KLF4	KLF4	NA	NA	NA	NA	KLF4	22637	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	110512153	110512586	110512216	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-438P9.1	217482	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr9	111003656	111003963	111003923	Y	NA	NA	KLF4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-220D10.1	383150	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	111545721	111546132	111545939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IKBKAP	148264	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	112091755	112092133	112091802	Y	PTPN3	EPB41L4B	EPB41L4B	MCF7	ChIA-PET	22265404	EPB41L4B	10511	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	112811971	112812606	112812251	Y	AKAP2	RP11-151F5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-151F5.2	26333	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	112827825	112828236	112827913	Y	AKAP2	RP11-151F5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-151F5.2	42187	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	112864001	112864218	112864083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-151F5.2	78363	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	113014576	113014999	113014920	Y	AKAP2,TXN	TXN	NA	NA	NA	NA	TXN	1921	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	113020932	113021563	113021207	Y	AKAP2	TXN	TXNDC8,SVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	TXN	4012	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	114292075	114292469	114292256	Y	NA	KIAA0368,ZNF483	NA	NA	NA	NA	ZNF483	6636	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr9	114707434	114708001	114707643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	50388	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	114783014	114783329	114783192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	125968	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	114790542	114790702	114790622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	133496	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	114836654	114837091	114837061	Y	PTGR1,PTGR1,UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	98597	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	115031676	115032066	115031959	Y	KIAA1958	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP3	61881	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	115067475	115067560	115067518	Y	SNX30,ROD1,KIAA1958,HSDL2	PTBP3	NA	NA	NA	NA	PTBP3	26387	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	115110736	115110930	115110781	Y	NA	PTBP3,HSDL2	NA	NA	NA	NA	PTBP3	16789	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	115470219	115470249	115470232	Y	ROD1,HSDL2,C9orf80	SNX30	NA	NA	NA	NA	SNX30	40869	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	115625683	115626114	115625766	Y	SNX30,SLC31A2,FKBP15,SLC46A2	NA	NA	NA	NA	NA	SNX30	114565	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	116011576	116011925	116011593	Y	NA	FKBP15,SLC31A1,PRPF4,CDC26	NA	NA	NA	NA	PRPF4	23698	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	116385277	116385518	116385372	Y	RGS3	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	180266	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr9	117159955	117160026	117159991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFNB31	105704	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	117314293	117314590	117314355	Y	TNFSF8,TNFSF15,DFNB31,ATP6V1G1	DFNB31,ATP6V1G1	DFNB31,ATP6V1G1,C9orf91	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP6V1G1	33436	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr9	117942308	117942603	117942434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	63772	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.80042560124951
chr9	118028504	118028557	118028531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	149968	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	118350454	118350525	118350489	Y	DEC1	NA	ASTN2,PAPPA,TNC,DEC1,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	471918	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	118473939	118474297	118474118	Y	NA	NA	PAPPA,ASTN2,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	595403	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	119055041	119055304	119055148	Y	PAPPA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	392277	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	119404408	119404429	119404420	Y	NA	TRIM32	NA	NA	NA	NA	TRIM32	43152	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	120500225	120500303	120500231	Y	ASTN2	NA	NA	NA	NA	NA	ASTN2	324877	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	120523356	120523735	120523438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTN2	348008	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	120613271	120613631	120613451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTN2	437923	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	120680016	120680381	120680199	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTN2	504668	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	124260871	124261375	124261091	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	65961	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr9	124361597	124361984	124361689	Y	NA	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	34261	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr9	124498744	124498978	124498839	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	171408	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	124499221	124499709	124499392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	171885	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.54584145568138
chr9	124664946	124665174	124665060	Y	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL11	188711	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	126028834	126029635	126029406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	126237774	126237937	126237796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	208919	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	126597388	126597650	126597587	Y	DENND1A	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	92781	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr9	127165878	127166187	127166033	Y	NA	PSMB7	NA	NA	NA	NA	PSMB7	9536	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	127519137	127519296	127519279	Y	NA	NR6A1,OLFML2A	NA	NA	NA	NA	NR6A1	12293	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	127519728	127520109	127519909	Y	NA	NR6A1,OLFML2A	NA	NA	NA	NA	NR6A1	11480	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	128172483	128172773	128172647	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	150410	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr9	128211957	128212104	128212028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPVD1	189884	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	128230899	128231249	128231074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPVD1	208826	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	128433867	128434078	128433973	Y	NA	MAPKAP1	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	33435	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	128530354	128530667	128530385	Y	NA	PBX3	NA	NA	NA	NA	PBX3	22730	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	129483874	129484165	129483990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	81120	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	129484571	129485188	129484881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	80097	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	130328926	130329278	130329070	Y	FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	9990	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	130461605	130461892	130461787	Y	GARNL3,STXBP1,ST6GALNAC6,SLC25A25,PIP5KL1,TTC16	PTRH1,TOR2A	NA	NA	NA	NA	PTRH1	23260	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	130730158	130730541	130730220	Y	NA	PIP5KL1,DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	FAM102A	10251	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	130764123	130764312	130764223	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS	FAM102A	FAM102A,DPM2,PIP5KL1,SLC25A25,NAIF1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM102A	23331	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	131929415	131929566	131929473	Y	METTL11A,C9orf106	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8974	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr9	131937094	131937487	131937262	Y	PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1053	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr9	132040752	132040968	132040856	Y	NA	RP11-344B5.2	C9orf106,IER5L,LOC100506190,PPP2R4,CRAT,C9orf50,METTL11A	IMR90,MCF7,HELA,K562	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	RP11-344B5.2	1769	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	132114489	132114812	132114671	Y	NA	RP11-65J3.1	PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A,C9orf50	MCF7,HELA,K562,IMR90	ChIA-PET,5C,Hi-C	22265404,22955621,24141950	RP11-65J3.1	21910	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr9	132168772	132168919	132168823	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	74811	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr9	132241150	132241608	132241414	Y	NA	LINC00963	PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,LOC100506190,C9orf50,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	2122	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	132244062	132244824	132244277	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	332	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	132257886	132258547	132258348	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	14156	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr9	132319720	132320056	132319894	Y	DOLPP1	NA	FAM73B,DOLPP1,IER5L,LOC100506190,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	75990	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr9	132321078	132321454	132321255	Y	NA	NA	FAM73B,DOLPP1,IER5L,LOC100506190,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	77348	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr9	132330057	132330508	132330201	Y	NA	NA	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ASB6	71936	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr9	132330921	132331424	132331168	Y	IER5L,C9orf50	NA	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ASB6	71020	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr9	132331590	132331738	132331651	Y	CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	NA	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ASB6	70706	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	132359283	132359664	132359324	Y	CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L,PTGES,METTL11A,ASB6	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	42780	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	132359774	132359922	132359814	Y	PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,METTL11A	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	42522	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chr9	132372165	132372686	132372524	Y	NA	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	29758	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	132373475	132373922	132373518	Y	NA	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	28522	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	132646480	132646964	132646831	Y	ASB6,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf78	50338	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	133565926	133566149	133566038	Y	NA	RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1	NA	NA	NA	NA	EXOSC2	959	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	3.30959389238579
chr9	134609553	134609906	134609765	Y	FAM78A,PRRC2B,RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	3555	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	135197315	135197652	135197484	Y	NA	SETX	NA	NA	NA	NA	SETX	30720	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	135226317	135226646	135226576	Y	NA	SETX	NA	NA	NA	NA	SETX	1726	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	135231921	135232175	135232157	Y	NA	SETX,TTF1	NA	NA	NA	NA	SETX	3549	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chr9	136009131	136009458	136009277	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	27843	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	136779643	136779949	136779796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	75777	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	136800116	136800268	136800192	Y	C9orf7	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	55458	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	136823955	136824162	136824035	Y	ADAMTSL2,SARDH,VAV2	VAV2	NA	NA	NA	NA	VAV2	31564	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	136856624	136856782	136856656	Y	VAV2	VAV2,LINC00094	NA	NA	NA	NA	VAV2	898	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chr9	138348639	138348707	138348673	Y	NA	PPP1R26,MRPS2,C9orf116	NA	NA	NA	NA	PPP1R26	20218	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr9	138986008	138986159	138986118	Y	NACC2	NACC2,C9orf69	NA	NA	NA	NA	NACC2	877	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	139136338	139136616	139136467	Y	QSOX2	QSOX2	NA	NA	NA	NA	QSOX2	651	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	139826661	139826850	139826762	Y	NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2	FBXW5,C8G	NA	NA	NA	NA	FBXW5	10298	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7,MIR3621	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	15308	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chr9	140205114	140205300	140205216	Y	PNPLA7,NOXA1,NRARP	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	10411	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chr9	140689053	140689448	140689207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA1B	80793	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	2719389	2719617	2719532	Y	NA	GYG2	NA	NA	NA	NA	GYG2	25212	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chrX	9786668	9786951	9786810	Y	NA	GPR143,SHROOM2,RP11-98L4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-98L4.1	1159	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	10712546	10712862	10712704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-120D5.1	414399	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	13958141	13958523	13958388	Y	NA	GPM6B	NA	NA	NA	NA	GPM6B	3384	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	17415371	17415448	17415410	Y	NA	NHS	NA	NA	NA	NA	NHS	23828	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	18904688	18905149	18904995	Y	PHKA2	NA	NA	NA	NA	NA	PHKA2	95567	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	19859063	19859320	19859184	Y	SH3KBP1	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	44399	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	22909771	22909782	22909777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX4	770597	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	22914204	22914355	22914279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX4	766024	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	23320949	23320962	23320957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX4	359417	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	23368174	23368523	23368350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX4	311856	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	4.83709876579461
chrX	23387295	23387690	23387493	Y	PTCHD1	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX4	292689	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	23390523	23390925	23390723	Y	PTCHD1	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX4	289454	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chrX	23392393	23392738	23392570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX4	287641	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chrX	23448720	23448865	23448793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX4	231514	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chrX	23470262	23470555	23470409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX4	209824	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	23919211	23919551	23919376	Y	ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,ACOT9,SAT1	APOO	NA	NA	NA	NA	APOO	4506	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	23922308	23922544	23922448	Y	NA	APOO	NA	NA	NA	NA	APOO	1513	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	24534920	24535303	24535112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDK3	53582	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	31848875	31849137	31848986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBCAP1	1208375	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	37604688	37604864	37604776	Y	CYBB	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT3	100026	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	38079037	38079366	38079180	Y	SRPX	SRPX	NA	NA	NA	NA	SRPX	341	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	39646201	39646652	39646229	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	811	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chrX	39674855	39675112	39674981	Y	NA	GAPDHP1	BCOR	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP1	29465	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	39676098	39676409	39676231	Y	NA	GAPDHP1	BCOR	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP1	30708	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chrX	39680161	39680842	39680511	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	34771	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chrX	39865489	39865898	39865566	Y	BCOR,BCOR	AC092198.1	NA	NA	NA	NA	AC092198.1	631	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chrX	39871700	39871985	39871950	Y	BCOR,BCOR	AC092198.1	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AC092198.1	5171	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	39872499	39873023	39872596	Y	NA	AC092198.1	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AC092198.1	5970	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	39873339	39874259	39873676	Y	NA	AC092198.1	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AC092198.1	6810	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chrX	39949495	39949781	39949700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC092198.1	82966	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chrX	39958407	39958722	39958627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	75860	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	39961698	39961932	39961714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	72650	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	39964528	39964690	39964611	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	69892	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	39965558	39965902	39965820	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	68680	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	7.63752436704413
chrX	39966584	39967157	39966963	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	67425	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	39968308	39968728	39968376	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65854	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chrX	40011614	40011816	40011787	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	22766	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chrX	40012729	40012965	40012840	Y	BCOR,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	21617	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	40013089	40013254	40013186	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	21328	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chrX	40014046	40014813	40014331	Y	BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	19769	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chrX	40015911	40016135	40015987	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	18447	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chrX	40016662	40016910	40016734	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	17672	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chrX	40017598	40017727	40017669	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	16855	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	40026864	40027458	40027209	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	7124	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chrX	40028554	40028949	40028781	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	5633	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chrX	40030956	40031200	40030978	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	3382	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	40031344	40032243	40032130	Y	BCOR,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	2339	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chrX	40032962	40033837	40033453	Y	BCOR,CXorf38,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	745	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chrX	40034694	40035505	40035056	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	112	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chrX	40792948	40793319	40793225	Y	ATP6AP2	RP11-77G22.2	USP9X,MED14	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-77G22.2	27711	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	40943673	40944218	40943773	Y	CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X	USP9X	NA	NA	NA	NA	USP9X	785	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chrX	41182589	41182765	41182693	Y	NA	DDX3X	DDX3X	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DDX3X	7886	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	41242516	41242827	41242698	Y	DDX3X	NA	DDX3X,USP9X	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DDX3X	51865	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	41335242	41335481	41335291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3X	144591	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	NDP	57840	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chrX	44733657	44734406	44734027	Y	KDM6A	KDM6A	NA	NA	NA	NA	KDM6A	2900	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	45366261	45366615	45366438	Y	NA	NA	MIR221,MIR222	IMR90	Hi-C	24141950	MIR221	237079	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	45493055	45493058	45493057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR221	110636	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	45618389	45618809	45618683	Y	NA	MIR221,MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR222	13859	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	45626471	45627108	45626806	Y	NA	MIR221,MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR222	21941	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	45647781	45648040	45647909	Y	NA	MIR221,MIR222	NA	NA	NA	NA	MIR222	43251	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	45666059	45666529	45666404	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	42391	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	46487332	46487848	46487692	Y	RP2,ZNF674,CHST7	NA	NA	NA	NA	NA	CHST7	56113	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	46989082	46989431	46989227	Y	NA	RBM10,NDUFB11	NA	NA	NA	NA	RBM10	12837	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chrX	47180934	47181052	47180967	Y	ELK1,CDK16	NA	UBA1,USP11	IMR90	Hi-C	24141950	USP11	90845	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chrX	47492098	47492440	47492261	Y	ARAF,CFP,CFP	SYN1,CFP,ELK1,UXT	NA	NA	NA	NA	CFP	4394	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	48571837	48572283	48571996	Y	TBC1D25,PQBP1,PIM2,OTUD5,GRIPAP1	SUV39H1	NA	NA	NA	NA	SUV39H1	19892	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chrX	52004971	52005124	52005057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGED1	460868	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chrX	52949996	52950343	52950129	Y	TSPYL2,KDM5C,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	31660	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	45908	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chrX	53428419	53428681	53428625	Y	NA	SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	SMC1A	18996	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chrX	53468564	53468782	53468716	Y	IQSEC2	SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	HSD17B10	9244	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	53744165	53744436	53744325	Y	NA	HUWE1	HUWE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	HUWE1	32492	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	56791132	56791384	56791234	Y	NA	RP11-622K12.1,UQCRBP1	NA	NA	NA	NA	UQCRBP1	29122	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	57420009	57420263	57420031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAAH2	108870	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	57421884	57422193	57422039	Y	FAAH2	NA	NA	NA	NA	NA	FAAH2	110745	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	57490949	57491197	57490977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZXDB	125072	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chrX	63554308	63554471	63554461	Y	MTMR8	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR8	58862	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chrX	64520324	64520642	64520384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAS1L	232013	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	67905691	67905742	67905716	Y	STARD8	STARD8	NA	NA	NA	NA	STARD8	40183	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	EFNB1	NA	NA	NA	NA	EFNB1	42163	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chrX	68776201	68776510	68776416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDA	57401	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	69653784	69653948	69653832	Y	NA	GDPD2,DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8763	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	69654278	69654566	69654417	Y	DLG3	GDPD2,DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8145	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chrX	70275409	70275661	70275633	Y	NA	RNU1-56P,SNX12,FOXO4	NA	NA	NA	NA	SNX12	10612	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	70401853	70402134	70401993	Y	IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO	NA	NA	NA	NA	NA	MED12	65447	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chrX	73237406	73237798	73237506	Y	CHIC1	NA	NA	NA	NA	NA	JPX	75247	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	73250242	73250558	73250399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JPX	88083	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	73272054	73272428	73272273	Y	CHIC1	NA	NA	NA	NA	NA	JPX	109895	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	73338544	73338621	73338582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USMG5P1	53104	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chrX	73507125	73507445	73507287	Y	NA	FTX	NA	NA	NA	NA	FTX	3964	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chrX	73510244	73510542	73510484	Y	RLIM	FTX	NA	NA	NA	NA	FTX	867	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	73756210	73756567	73756298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLIM	75885	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chrX	73791399	73791714	73791557	Y	RLIM	RLIM	NA	NA	NA	NA	RLIM	40738	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chrX	84443490	84443657	84443574	Y	SATL1,ZNF711	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF711	53340	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	85294512	85294785	85294645	Y	CHM	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	5781	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chrX	87351546	87351899	87351791	Y	NA	RP3-452M16.1	NA	NA	NA	NA	RP3-452M16.1	1320	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	92479084	92479478	92479382	Y	NA	RP13-88F20.1	NA	NA	NA	NA	RP13-88F20.1	1070	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	95228939	95229189	95229110	Y	NA	RP5-961K14.1	NA	NA	NA	NA	RP5-961K14.1	1625	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	96641794	96641810	96641802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	704132	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	96737764	96737861	96737813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	800102	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	102820880	102821034	102820957	Y	NA	TCEAL4,TCEAL3	NA	NA	NA	NA	TCEAL4	8125	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	103019589	103020004	103019883	Y	NA	PLP1	LOC340544,MORF4L2,GLRA4,TMEM31,PLP1	IMR90	Hi-C	24141950	PLP1	6643	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	4.58251462022648
chrX	103953879	103954145	103953966	Y	IL1RAPL2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM199X	544578	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	108883543	108883897	108883721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL4	90735	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	109083180	109083422	109083333	Y	ACSL4	NA	ACSL4	IMR90	Hi-C	24141950	ACSL4	108548	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	109429267	109429621	109429491	Y	AMMECR1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM164	185408	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	109563862	109564162	109564033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMMECR1	117299	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	109645744	109645944	109645869	Y	NA	AMMECR1	TMEM164	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AMMECR1	35517	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	111949700	111949719	111949710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMOT	132324	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chrX	112465306	112465313	112465310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMOT	383263	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	113170298	113170599	113170449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMOT	1088255	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	113761667	113761873	113761772	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRCH2	704762	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chrX	114819160	114819326	114819285	Y	NA	PLS3	NA	NA	NA	NA	PLS3	25659	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	114925070	114925398	114925234	Y	NA	EEF1GP5,RP1-241P17.1	NA	NA	NA	NA	EEF1GP5	9733	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	115083189	115083554	115083375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chrX	116006387	116006717	116006592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	922965	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	117843836	117843978	117843907	Y	LONRF3	IL13RA1	NA	NA	NA	NA	IL13RA1	15557	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	119619289	119619732	119619620	Y	ZBTB33,ZBTB33	LAMP2	LAMP2	K562	ChIA-PET	22265404	LAMP2	18069	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chrX	120337126	120337342	120337247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	575121	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	123606177	123606254	123606218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG2	514115	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	123735078	123735231	123735154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-161N10.1	600956	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	124340013	124340052	124340037	Y	NA	RP1-161N10.1	NA	NA	NA	NA	RP1-161N10.1	3826	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chrX	125406399	125406559	125406479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	198309	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.763752436704413
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	10.9471182594299
chrX	128225148	128225423	128225251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA1	430054	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	2.80042560124951
chrX	129118011	129118370	129118054	Y	NA	BCORL1	BCORL1,UTP14A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCORL1	4928	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chrX	129245756	129246153	129246006	Y	NA	ELF4	NA	NA	NA	NA	ELF4	3065	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	130201514	130201626	130201527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX2	166306	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	130706744	130706880	130706830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGSF1	175067	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	130942336	130942500	130942419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MST4	212793	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	131220821	131221272	131220959	Y	MST4,MST4,RAP2C	RP1-305B16.3	NA	NA	NA	NA	RP1-305B16.3	42108	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	132588536	132588894	132588715	Y	NA	GPC4	NA	NA	NA	NA	GPC4	41018	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	133305762	133306165	133305903	Y	PHF6,CCDC160	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC160	62912	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chrX	133309031	133309218	133309079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC160	59859	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	134485580	134485626	134485601	Y	ZNF449,CT45A6	ZNF75D,ZNF449	NA	NA	NA	NA	ZNF449	8859	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.01833658227255
chrX	136632347	136632538	136632444	Y	ZIC3	RP1-137H15.2,ZIC3	NA	NA	NA	NA	RP1-137H15.2	12008	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chrX	136647486	136647742	136647575	Y	NA	RP1-137H15.2,ZIC3	NA	NA	NA	NA	ZIC3	1185	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275
chrX	138215503	138215737	138215513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF13	87202	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.52750487340883
chrX	139809387	139809785	139809560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX3	224162	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	147500402	147500425	147500414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFF2	79714	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	150071015	150071211	150071113	Y	NA	CD99L2	NA	NA	NA	NA	CD99L2	5726	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	150071678	150071798	150071740	Y	NA	CD99L2	NA	NA	NA	NA	CD99L2	6389	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	150347417	150347568	150347539	Y	GPR50	GPR50	NA	NA	NA	NA	GPR50	4292	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	152951257	152951653	152951455	Y	NA	DUSP9,RPL18AP16,PNCK,BCAP31,ABCD1	NA	NA	NA	NA	SLC6A8	0	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	153084450	153084610	153084498	Y	NA	SSR4,IDH3G,PDZD4,CYCSP45	NA	NA	NA	NA	PDZD4	9410	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	153093734	153093743	153093739	Y	NA	SSR4,IDH3G,PDZD4,CYCSP45	NA	NA	NA	NA	PDZD4	277	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	153152883	153153053	153153003	Y	RENBP	CYCSP45,L1CAM,ARHGAP4,NAA10	NA	NA	NA	NA	L1CAM	19624	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	153166203	153166850	153166548	Y	ABCD1,PLXNB3,MECP2,ATP6AP1,RENBP	L1CAM,ARHGAP4,NAA10,RENBP	NA	NA	NA	NA	L1CAM	5827	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.78208901897696
chrX	153359354	153359823	153359622	Y	NA	MECP2	NA	NA	NA	NA	MECP2	1389	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrX	153596671	153598676	153598064	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	2330	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	1.27292072784069
chrX	153755432	153755621	153755566	Y	NA	LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD	FAM3A	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	IKBKG	11793	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrY	7147506	7147599	7147553	Y	NA	PRKY	NA	NA	NA	NA	PRKY	7493	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrY	21046816	21047207	21047093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTTY14	190095	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.254584145568138
chrY	28555183	28555400	28555298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF1AY	5819572	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	6.61918778477158
chrY	28555690	28555797	28555743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF1AY	5820079	CAGE	NEC14	hg19	FANTOM5	0.509168291136275