chr1 856539 856757 856714 Y NA SAMD11,NOC2L,KLHL17 NA NA NA NA SAMD11 1503 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr1 858256 858648 858448 Y SAMD11 NOC2L,KLHL17 NA NA NA NA SAMD11 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 1265677 1265980 1265829 Y NA PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1 NA NA NA NA GLTPD1 7541 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 1295535 1296332 1296026 Y MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8 CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20 NA NA NA NA MXRA8 378 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 1456676 1456699 1456688 Y NA ATAD3A,TMEM240 NA NA NA NA ATAD3A 11145 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 1708824 1709349 1708980 Y NA SLC35E2,NADK NA NA NA NA NADK 547 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 1744250 1744609 1744432 Y NA NADK NA NA NA NA NADK 34354 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 1803114 1803303 1803274 Y NA GNB1,TMEM52 NADK IMR90 Hi-C 24141950 GNB1 17192 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 1814762 1815124 1815035 Y SKI,C1orf86,MIB2 GNB1,TMEM52 NA NA NA NA GNB1 5371 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 1840449 1840835 1840668 Y SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD GNB1,TMEM52 NA NA NA NA TMEM52 7877 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 2245775 2246116 2245876 Y NA NA NA NA NA NA MORN1 75030 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 2246556 2246763 2246722 Y SKI NA NA NA NA NA MORN1 74383 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 2477415 2477971 2477660 Y NA PANK4,FAM213B NA NA NA NA PANK4 21376 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr1 2574343 2574764 2574705 Y MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1 NA NA NA NA NA FAM213B 58413 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 3269112 3269418 3269330 Y NA NA NA NA NA NA TPRG1L 270148 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 3521167 3521613 3521414 Y NA TPRG1L,WRAP73 NA NA NA NA TPRG1L 17953 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 3817648 3818071 3817969 Y LRRC47 CEP104,DFFB,C1orf174 NA NA NA NA C1orf174 2791 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 4067941 4068288 4068115 Y NA NA NA NA NA NA C1orf174 253084 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 6040561 6040806 6040680 Y NA KCNAB2,NPHP4 NA NA NA NA KCNAB2 8720 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 6053603 6054107 6053839 Y CHD5,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2 KCNAB2,NPHP4 NA NA NA NA NPHP4 3070 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 6451759 6451831 6451795 Y NA ACOT7 NA NA NA NA ACOT7 620 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 6566323 6566594 6566485 Y NA PLEKHG5,NOL9 NA NA NA NA PLEKHG5 11527 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 6760819 6760983 6760901 Y NA DNAJC11 NA NA NA NA DNAJC11 835 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 6943772 6944262 6943813 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 100388 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 7137904 7138115 7138010 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 294520 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 7207208 7207593 7207350 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 363824 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 7331930 7332127 7331990 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 488546 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 7728673 7728970 7728748 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 100359 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr1 7729547 7729971 7729640 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 99358 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 7764543 7764931 7764717 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 64398 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 12.8198339285859 chr1 8076289 8076986 8076888 Y NA ERRFI1 NA NA NA NA ERRFI1 7382 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 8229904 8230047 8229996 Y NA NA ERRFI1,SLC45A1 IMR90 Hi-C 24141950 ERRFI1 145536 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 8487656 8487917 8487791 Y RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 111770 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr1 8720526 8720683 8720608 Y NA NA NA NA NA NA RERE 155019 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 8762126 8762475 8762428 Y NA NA NA NA NA NA RERE 113227 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 8849339 8849636 8849462 Y NA RERE NA NA NA NA RERE 26066 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 9223692 9223875 9223840 Y NA GPR157,RP3-510D11.2 SLC2A7,SLC25A33,MIR34A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP3-510D11.2 16388 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 9241165 9241560 9241362 Y NA RP3-510D11.2 SLC2A7,SLC25A33,GPR157,MIR34A,H6PD,SPSB1,TMEM201 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP3-510D11.2 902 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 9318130 9318195 9318182 Y NA H6PD,SPSB1 NA NA NA NA H6PD 25296 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 9355493 9355709 9355601 Y NA SPSB1 NA NA NA NA SPSB1 4554 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 9488839 9489227 9489154 Y NA NA SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 108314 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.34401484735175 chr1 10245595 10245867 10245731 Y NA KIF1B NA NA NA NA KIF1B 22996 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 10723795 10723954 10723885 Y NA NA NA NA NA NA DFFA 193212 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 11415566 11415939 11415808 Y NA NA FBXO2,FBXO44,UBIAD1 IMR90 Hi-C 24141950 UBIAD1 84303 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 11968510 11969143 11969021 Y MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP RNU5E-1,KIAA2013,PLOD1 NA NA NA NA RNU5E-1 2301 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 12193120 12193399 12193251 Y AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF8,TNFRSF1B TNFRSF1B NA NA NA NA TNFRSF1B 31661 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 15111272 15111486 15111395 Y NA NA NA NA NA NA KAZN 188072 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 15519488 15519688 15519655 Y NA TMEM51 NA NA NA NA TMEM51 42460 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 15539906 15540096 15539975 Y NA NA NA NA NA NA TMEM51 62878 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 15570270 15570435 15570342 Y PLEKHM2,EFHD2,CASP9,TMEM51,TMEM51 NA NA NA NA NA TMEM51 93242 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 16087189 16087372 16087266 Y EPHA2,FBLIM1 FBLIM1 NA NA NA NA FBLIM1 6087 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr1 16158409 16158760 16158690 Y NA RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.8 5685 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 16175691 16176294 16176100 Y NA RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3049 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr1 16209325 16209770 16209445 Y NA SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 36683 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 16212759 16213091 16212941 Y EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 40117 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 16670445 16670837 16670642 Y SPEN,C1orf64,FBXO42 FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 6112 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 16677236 16677843 16677569 Y ZBTB17,FBXO42 FBXO42 RSG1 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO42 287 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 16696032 16696399 16696223 Y NA FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 19083 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA RNU1-1 SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-1 12489 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 3.72188726958946 chr1 17020007 17020088 17020064 Y NA EIF1AXP1,CROCC NA NA NA NA EIF1AXP1 9457 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 17231253 17231704 17231392 Y PADI4,PADI2 NA CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MFAP2 73626 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA NA CROCC K562 ChIA-PET 22265404 MFAP2 64547 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.65417211981754 chr1 17557386 17557571 17557478 Y NA NA NA NA NA NA SDHB 178721 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 19703880 19704261 19704067 Y NA NA NA NA NA NA PQLC2 67060 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 19796024 19796128 19796080 Y NA CAPZB,RNU4-28P NA NA NA NA CAPZB 13938 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 20693127 20693202 20693146 Y KIF17,PINK1 NA NA NA NA NA CAMK2N1 117511 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 21149682 21149798 21149749 Y CAMK2N1,EIF4G3 HP1BP3 NA NA NA NA HP1BP3 37866 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 21428050 21428147 21428101 Y NA RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 29804 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 21611199 21611583 21611510 Y EIF4G3,ECE1,ALPL,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1 NA NA NA NA NA ECE1 58414 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 22076024 22076450 22076245 Y NA USP48 RAP1GAP IMR90 Hi-C 24141950 USP48 31649 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 22468030 22468558 22468270 Y NA NA NA NA NA NA CDC42 90910 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 22692086 22692330 22692263 Y NA NA C1QC,C1QB,EPHB2,EPHA8,WNT4,C1QA IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB40 84014 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 23076914 23077145 23077061 Y NA EPHB2 NA NA NA NA EPHB2 41582 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 23494015 23494642 23494449 Y NA LUZP1 NA NA NA NA LUZP1 7659 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 23881180 23881765 23881497 Y NA E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 2520 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr1 23888678 23889201 23888997 Y ID3 E2F2,ID3 NA NA NA NA ID3 4393 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 23925201 23925342 23925271 Y NA ID3 TCEB3,HNRNPR,ASAP3,TCEA3,E2F2,ID3,MDS2,LOC100506963,ZNF436 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID3 40916 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 24691833 24692082 24691893 Y PNRC2,GRHL3 NIPAL3 NA NA NA NA NIPAL3 48202 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.34401484735175 chr1 24970685 24970736 24970725 Y NA SRRM1 NA NA NA NA SRRM1 14478 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 25566195 25566411 25566257 Y TMEM57 SYF2 SYF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SYF2 9202 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 25566618 25566670 25566639 Y NA SYF2 SYF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SYF2 9625 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr1 25823926 25824130 25824028 Y NA NA LDLRAP1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM57 68538 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 26101389 26101767 26101516 Y PDIK1L,LDLRAP1,MAN1C1,FAM54B SEPN1 NA NA NA NA SEPN1 22900 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 26490998 26491259 26491133 Y NA ZNF593 NA NA NA NA ZNF593 3103 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 26827232 26827869 26827508 Y PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A RP3-476K8.4,HMGN2 HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HMGN2 30291 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr1 26946837 26947249 26947076 Y CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 73275 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 26947342 26948198 26947481 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72326 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 27024638 27025138 27024825 Y SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV ARID1A NA NA NA NA ARID1A 4114 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA GPN2 22861 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr1 27383957 27384315 27384137 Y GPR3 FAM46B C1orf172,TRNP1,FAM46B,WDTC1,SLC9A1,TMEM222,SYTL1,GPR3,GPATCH3,NR0B2,FCN3,MAP3K6,CD164L2,AHDC1,IFI6,FGR,WASF2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM46B 46630 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr1 27527451 27527688 27527509 Y NA SLC9A1,WDTC1 WDTC1,SLC9A1,C1orf172 IMR90 Hi-C 24141950 WDTC1 31319 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 27626897 27627231 27626926 Y NA TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1 NA NA NA NA TMEM222 19420 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 27691785 27692261 27692091 Y TMEM222,MAP3K6 TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,GPR3 NA NA NA NA MAP3K6 402 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 27924204 27924421 27924302 Y XKR8,AHDC1 AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 4521 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 27926949 27927449 27927117 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 1493 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 27928507 27928973 27928740 Y NA NA NA NA NA NA AHDC1 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 28573636 28574084 28573917 Y NA AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 9954 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 28970474 28970729 28970677 Y NA TAF12,RNU11,GMEB1 NA NA NA NA RNU11 2383 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 29503706 29504118 29503928 Y NA SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2381 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 29517304 29517322 29517313 Y NA SRSF4,MECR,PTPRU NA NA NA NA SRSF4 10805 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 29564766 29564995 29564881 Y NA MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 3738 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 30582865 30583057 30583002 Y NA NA PTPRU,MECR IMR90 Hi-C 24141950 SDC3 796551 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr1 31251287 31251533 31251452 Y NA NA LAPTM5,MECR,MATN1,LOC100129196,SNORD103A,SNORD103B,PUM1,SDC3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDC3 128075 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 31430605 31430735 31430670 Y NA NA NA NA NA NA SDC3 50997 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NKAIN1 82443 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr1 31628220 31628457 31628359 Y NA NA PUM1,NKAIN1,SERINC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NKAIN1 81944 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 31770743 31770927 31770835 Y NA SNRNP40,ZCCHC17 NA NA NA NA ZCCHC17 2901 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 33077721 33078012 33077949 Y FNDC5 ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 36492 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 33427851 33428169 33427991 Y PHC2,RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 117 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 33457406 33457727 33457615 Y RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 29120 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 33804092 33804324 33804199 Y NA AL513327.1 NA NA NA NA AL513327.1 41117 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 33829513 33829825 33829684 Y FNDC5,ZSCAN20 NA NA NA NA NA PHC2 64828 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 35389087 35389416 35389318 Y DLGAP3 DLGAP3 DLGAP3,ZMYM6NB,LOC653160 IMR90 Hi-C 24141950 DLGAP3 3770 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 35891843 35891965 35891904 Y NA NA NA NA NA NA NCDN 129109 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 36173458 36173573 36173482 Y TEKT2,EIF2C1 C1orf216 NA NA NA NA C1orf216 9500 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 36351655 36352020 36351717 Y NA NA NA NA NA NA CLSPN 118087 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 36626561 36626969 36626609 Y STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2,MAP7D1,THRAP3 TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 7381 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 36839449 36839891 36839558 Y EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 9606 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 36840093 36840535 36840445 Y EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 8962 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 37784198 37784531 37784441 Y GRIK3,EPHA10 RPS29P6 GRIK3 IMR90 Hi-C 24141950 RPS29P6 9922 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 37937293 37937526 37937471 Y YRDC,MTF1,C1orf122,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA LINC01137 486 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 38009784 38010404 38010149 Y SNIP1,MTF1,ZC3H12A MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,DNALI1,GNL2 MEAF6 IMR90 Hi-C 24141950 SNIP1 7499 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 38312444 38312820 38312535 Y ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1 C1orf122,YRDC,MTF1 NA NA NA NA MTF1 10472 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 38317043 38317898 38317556 Y ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1 C1orf122,YRDC,MTF1 NA NA NA NA MTF1 5394 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 38391752 38391859 38391812 Y NA INPP5B NA NA NA NA INPP5B 18870 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 38536566 38536896 38536731 Y NA POU3F1 RRAGC,FHL3,UTP11L IMR90 Hi-C 24141950 POU3F1 26116 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 39357087 39357474 39357146 Y MACF1,GJA9 RRAGC,RP5-864K19.4,MYCBP NA NA NA NA MYCBP 11798 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 39508832 39509204 39509012 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 18842 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr1 39516193 39516422 39516273 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 26203 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr1 39874208 39874673 39874342 Y KIAA0754 KIAA0754 NA NA NA NA KIAA0754 57 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 40005546 40005959 40005647 Y NA PABPC4 NA NA NA NA PABPC4 34503 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 40331340 40331501 40331388 Y PABPC4,PPIE,ZMPSTE24,RLF,PPT1,CAP1,BMP8B,TRIT1,MYCL1 TRIT1 NA NA NA NA TRIT1 15682 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 40561233 40561752 40561648 Y SMAP2,RLF NA NA NA NA NA PPT1 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 40851431 40851768 40851472 Y CAP1,RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2,SMAP2 SMAP2 NA NA NA NA SMAP2 42909 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 41119684 41120000 41119793 Y NA RIMS3,NFYC NA NA NA NA RIMS3 9329 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 41495531 41495820 41495676 Y NA NA NA NA NA NA CITED4 169513 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 41501908 41501999 41501966 Y SCMH1 NA NA NA NA NA CITED4 175890 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 41650800 41651168 41651109 Y KCNQ4,SCMH1,SCMH1,SCMH1 NA NA NA NA NA SCMH1 54658 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 41826642 41826952 41826745 Y NA FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 1048 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 41831444 41831806 41831485 Y SCMH1 FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 5850 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 41981831 41982007 41981926 Y SLFNL1,SLFNL1 EDN2 NA NA NA NA EDN2 33487 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr1 41994633 41994922 41994778 Y SCMH1,HIVEP3 EDN2 NA NA NA NA EDN2 46289 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 42071739 42071927 42071841 Y NA NA NA NA NA NA EDN2 123395 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 42127851 42128791 42128091 Y NA NA NA NA NA NA EDN2 179507 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.58464393721491 chr1 42230379 42230587 42230470 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 269009 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 42372562 42373017 42372843 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 126579 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 42385609 42385954 42385889 Y FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3 NA NA NA NA NA HIVEP3 113642 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 42774668 42774801 42774679 Y CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3 FOXJ3 NA NA NA NA FOXJ3 24747 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr1 42934748 42935131 42934805 Y CCDC30,RIMKLA PPCS,ZMYND12,CCDC30,TMSB4XP1 NA NA NA NA CCDC30 7747 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 43389220 43390772 43390027 Y NA SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 31758 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.86094363479473 chr1 43405621 43405821 43405630 Y CCDC30,CCDC23,ERMAP,SZT2,SLC2A1 SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 16709 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 43406108 43407009 43406836 Y YBX1,ERMAP,SZT2 SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 15521 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 43471435 43471828 43471543 Y SLC2A1 SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 48905 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 43884019 43884040 43884030 Y ST3GAL3,MPL,SZT2 MED8,SZT2,HYI NA NA NA NA SZT2 30466 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 44150815 44151139 44150977 Y ST3GAL3,SLC6A9,IPO13 KDM4A,ST3GAL3 NA NA NA NA ST3GAL3 18356 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 44232152 44232509 44232262 Y SLC6A9,IPO13,ST3GAL3 NA NA NA NA NA ST3GAL3 62657 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 44430681 44431060 44430788 Y NA RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24 NA NA NA NA DPH2 2612 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 44452990 44453115 44453039 Y NA RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9 NA NA NA NA CCDC24 1916 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 44495684 44496307 44495779 Y NA CCDC24,SLC6A9 B4GALT2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC6A9 545 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 44689979 44690114 44690071 Y NA DMAP1 NA NA NA NA DMAP1 12852 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 45787067 45787234 45787139 Y NA ZSWIM5,HPDL,TOE1,MUTYH NA NA NA NA HPDL 3311 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 46102450 46102810 46102714 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 12688 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 46111666 46112048 46111975 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 3450 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 46351629 46351956 46351793 Y C1orf190 NA NA NA NA NA MAST2 100970 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 46555686 46555960 46555823 Y NA NA NA NA NA NA PIK3R3 84200 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 46573980 46574380 46574180 Y TSPAN1,PIK3R3,PIK3R3 NA NA NA NA NA PIK3R3 65780 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 46575103 46575175 46575140 Y PIK3R3,PIK3R3 NA NA NA NA NA PIK3R3 64985 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 46639254 46639547 46639393 Y NA PIK3R3,POMGNT1 NA NA NA NA PIK3R3 613 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 46689426 46689696 46689549 Y FAAH,C1orf190 PIK3R3,POMGNT1,RAD54L NA NA NA NA POMGNT1 5449 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 46999025 46999241 46999126 Y ATPAF1-AS1 NA NA NA NA NA MKNK1 81274 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 47055088 47055141 47055115 Y NA MKNK1 NA NA NA NA MKNK1 25374 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 47800262 47800514 47800436 Y NA STIL,CMPK1 NA NA NA NA CMPK1 2793 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 48079368 48079696 48079596 Y NA NA NA NA NA NA CMPK1 281899 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 48853667 48853917 48853792 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-61P 57691 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 49518033 49518044 49518039 Y BEND5 NA NA NA NA NA BEND5 277392 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 50580035 50580167 50580147 Y NA NA NA NA NA NA ELAVL4 68349 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 50619908 50620155 50620032 Y NA NA NA NA NA NA ELAVL4 108222 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 50650068 50650310 50650189 Y NA NA NA NA NA NA ELAVL4 138382 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 50890174 50890356 50890265 Y NA DMRTA2 NA NA NA NA DMRTA2 3002 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 50902653 50903020 50902837 Y NA DMRTA2 NA NA NA NA DMRTA2 15481 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 51056997 51057361 51057215 Y NA NA NA NA NA NA DMRTA2 169825 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 51083951 51084011 51083988 Y NA NA NA NA NA NA DMRTA2 196779 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 51097851 51098184 51098018 Y NA NA NA NA NA NA DMRTA2 210679 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 51215461 51215472 51215465 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 208463 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 51261727 51261870 51261800 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 162065 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 51302197 51302583 51302391 Y FAF1 NA NA NA NA NA FAF1 121352 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 51312022 51312165 51312091 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 111770 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 51442122 51442408 51442227 Y NA FAF1,CDKN2C NA NA NA NA CDKN2C 17705 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 51475380 51475551 51475487 Y NA NA NA NA NA NA CDKN2C 50963 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 51475745 51476056 51475832 Y NA NA NA NA NA NA CDKN2C 51328 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 51703075 51703494 51703244 Y OSBPL9 RNF11 NA NA NA NA RNF11 3132 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 51886085 51886464 51886275 Y NA NA NA NA NA NA TTC39A 77297 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 51935246 51935592 51935567 Y NA EPS15 NA NA NA NA EPS15 47408 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 52132018 52132585 52132263 Y TXNDC12,EPS15,NRD1,NRD1,OSBPL9 NA NA NA NA NA OSBPL9 91167 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 52173889 52173954 52173921 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL9 133038 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 52238666 52238881 52238774 Y NA NA NA NA NA NA NRD1 103596 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 52341008 52341095 52341052 Y CC2D1B,OSBPL9 NRD1 NA NA NA NA NRD1 1382 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 52885344 52885737 52885540 Y ZCCHC11 ORC1,PRPF38A NA NA NA NA PRPF38A 17108 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 53092647 53093031 53092839 Y NA GPX7 NA NA NA NA GPX7 26603 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 53168640 53169047 53168726 Y NA ZYG11B SELRC1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ZYG11B 21079 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr1 53703343 53703361 53703351 Y NA CPT2,C1orf123,MAGOH NA NA NA NA MAGOH 1061 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 53753056 53753164 53753096 Y NA LRP8 NA NA NA NA LRP8 38578 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 53875866 53875973 53875946 Y NA NA LRP8,GLIS1 IMR90 Hi-C 24141950 LRP8 84124 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 54150852 54151742 54151620 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 202665 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 54168078 54168275 54168177 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 186132 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 54261078 54261111 54261098 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 93296 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 54286238 54286401 54286368 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 68006 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 54441729 54442008 54441915 Y NA HSPB11,LRRC42 NA NA NA NA LRRC42 31979 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 54700132 54700688 54700499 Y NA CYB5RL NA NA NA NA CYB5RL 36423 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr1 54749325 54749366 54749346 Y NA NA CYB5RL,MRPL37 IMR90 Hi-C 24141950 CYB5RL 85616 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 54808081 54808294 54808188 Y NA NA NA NA NA NA SSBP3 68858 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 54810685 54810861 54810859 Y NA NA NA NA NA NA SSBP3 66291 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 54873075 54873515 54873406 Y SSBP3,SSBP3 SSBP3 NA NA NA NA SSBP3 3637 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 54953784 54954325 54954090 Y SSBP3,SSBP3 NA TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACOT11 51605 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.24062908986315 chr1 54965120 54965643 54965198 Y NA ACOT11 TCEANC2,SSBP3,MRPL37,CYB5RL,CDCP2,YIPF1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4,ACOT11,FAM151A IMR90 Hi-C 24141950 ACOT11 40287 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 55413962 55414227 55414092 Y USP24 NA DHCR24,TMEM61,BSND,HEATR8-TTC4,USP24,C1orf177,PCSK9,TTC22 IMR90 Hi-C 24141950 DHCR24 63071 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 55594097 55594408 55594328 Y NA NA PCSK9 IMR90 Hi-C 24141950 USP24 84378 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 55677745 55677788 55677767 Y NA USP24 NA NA NA NA USP24 998 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 58002362 58002542 58002370 Y NA NA NA NA NA NA PRKAA2 893367 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 58018702 58018981 58018745 Y NA NA NA NA NA NA PRKAA2 909707 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 58020370 58020682 58020526 Y NA NA NA NA NA NA PRKAA2 911375 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 59251646 59251903 59251775 Y NA JUN NA NA NA NA JUN 3861 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 59281873 59282217 59282125 Y MYSM1,FGGY,JUN JUN NA NA NA NA JUN 34088 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 59369049 59370138 59369602 Y FGGY NA NA NA NA NA JUN 121264 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 59910700 59911009 59910820 Y NA NA NA NA NA NA FGGY 150390 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 60072128 60072386 60072257 Y FGGY NA NA NA NA NA FGGY 311818 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 60087129 60087147 60087138 Y CYP2J2 NA NA NA NA NA FGGY 326819 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 61516303 61516687 61516329 Y NA NA INADL,NFIA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFIA 187372 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 61517483 61517553 61517518 Y NA NA INADL,NFIA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFIA 188552 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 61543611 61543877 61543752 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA NFIA 214680 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 61549054 61549253 61549232 Y NA NA NA NA NA NA NFIA 220123 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 61579491 61579639 61579512 Y NA NA NA NA NA NA NFIA 250560 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr1 61583915 61584228 61583999 Y NA NA NA NA NA NA NFIA 254984 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 61649786 61650305 61649984 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA NFIA 320855 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 61918819 61919182 61919004 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA TM2D1 269913 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 62208815 62209373 62208933 Y NA TM2D1,INADL NA NA NA NA INADL 2666 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 62416847 62417238 62417043 Y INADL,USP1,KANK4 NA NA NA NA NA INADL 210698 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 62928310 62928608 62928459 Y KANK4,USP1,USP1,ATG4C USP1 NA NA NA NA USP1 28342 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 62948948 62949316 62949132 Y KANK4,USP1,ATG4C USP1 NA NA NA NA USP1 48980 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 64417224 64417447 64417336 Y ROR1 NA NA NA NA NA CFL1P3 109868 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 64558632 64559006 64558819 Y NA NA NA NA NA NA CFL1P3 251276 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 65527577 65527856 65527728 Y NA RP4-535B20.1 AK4 K562 ChIA-PET 22265404 RP4-535B20.1 3564 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr1 65731337 65731853 65731407 Y DNAJC6 DNAJC6 NA NA NA NA DNAJC6 19435 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr1 65775838 65775991 65775933 Y PDE4B,DNAJC6 NA NA NA NA NA DNAJC6 63936 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 65924548 65924883 65924716 Y NA LEPR,LEPROT NA NA NA NA LEPROT 40278 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 66520872 66520987 66520894 Y NA NA NA NA NA NA PDE4B 264675 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 66546016 66546351 66546169 Y NA NA NA NA NA NA PDE4B 289819 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 66603112 66603115 66603114 Y PDE4B NA NA NA NA NA PDE4B 346915 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 66703870 66704087 66703979 Y NA NA NA NA NA NA SGIP1 292979 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 66709580 66709765 66709653 Y PDE4B NA NA NA NA NA SGIP1 287301 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 66717339 66717678 66717593 Y PDE4B NA NA NA NA NA SGIP1 279388 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 66740731 66741065 66740898 Y NA NA NA NA NA NA SGIP1 256001 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 66747978 66748387 66748105 Y PDE4B NA NA NA NA NA SGIP1 248679 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 66760490 66760861 66760661 Y NA NA NA NA NA NA SGIP1 236205 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 66770897 66771283 66771085 Y NA NA NA NA NA NA SGIP1 225783 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 66778961 66779513 66779194 Y NA NA NA NA NA NA SGIP1 217553 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 66800202 66800555 66800228 Y PDE4B NA NA NA NA NA SGIP1 196511 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 66822714 66822988 66822804 Y NA NA NA NA NA NA SGIP1 174078 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 67374841 67375185 67375111 Y SGIP1,WDR78 WDR78,MIER1 NA NA NA NA WDR78 13385 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr1 67460593 67460710 67460683 Y NA NA NA NA NA NA SLC35D1 57072 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 67867795 67868154 67868057 Y NA SERBP1 NA NA NA NA SERBP1 25944 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 67883059 67883215 67883204 Y NA SERBP1 NA NA NA NA SERBP1 10883 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 68945486 68945782 68945636 Y NA DEPDC1 NA NA NA NA DEPDC1 15122 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 70034819 70036254 70034877 Y NA LRRC7 NA NA NA NA LRRC7 2738 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr1 70040211 70040399 70040305 Y LRRC7 LRRC7 NA NA NA NA LRRC7 8130 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 70207294 70207355 70207325 Y LRRC7 NA DEPDC1 IMR90 Hi-C 24141950 LRRC7 175213 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 70238650 70238794 70238722 Y LRRC7 NA NA NA NA NA LRRC7 206569 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 70691921 70692281 70691982 Y ANKRD13C,LRRC40,SRSF11 LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4 NA NA NA NA RP4-677H15.4 7215 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 70709017 70709466 70709138 Y NA LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4 NA NA NA NA RP4-677H15.4 24311 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 70745994 70746088 70746040 Y NA NA NA NA NA NA RP4-677H15.4 61288 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 70746826 70747040 70746993 Y ANKRD13C NA NA NA NA NA RP4-677H15.4 62120 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr1 70807938 70808237 70808103 Y NA ANKRD13C,HHLA3 NA NA NA NA ANKRD13C 10180 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 72155856 72156188 72156023 Y NA NA NA NA NA NA NEGR1 590229 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 72749220 72749791 72749447 Y NEGR1 NEGR1 NA NA NA NA NEGR1 2803 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr1 72931284 72931506 72931356 Y NA NA NA NA NA NA NEGR1 184867 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 73066346 73066731 73066539 Y NA NA NA NA NA NA NEGR1 319929 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 75182913 75182976 75182918 Y NA TYW3,CRYZ NA NA NA NA TYW3 13860 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 75694572 75694736 75694622 Y NA NA NA NA NA NA SLC44A5 380065 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 75972237 75972619 75972428 Y NA NA NA NA NA NA SLC44A5 102182 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 76080205 76080672 76080321 Y NA SLC44A5 NA NA NA NA SLC44A5 5404 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 76645391 76645540 76645467 Y NA NA NA NA NA NA ST6GALNAC3 106987 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 76751449 76751689 76751612 Y NA NA NA NA NA NA ST6GALNAC3 213045 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 77013544 77013818 77013552 Y NA NA NA NA NA NA TPI1P1 149656 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 77041434 77041827 77041631 Y NA NA NA NA NA NA TPI1P1 121647 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 77165935 77166101 77166017 Y NA TPI1P1 ST6GALNAC3 IMR90 Hi-C 24141950 TPI1P1 2461 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 77230839 77231032 77230870 Y ST6GALNAC5 NA NA NA NA NA TPI1P1 67365 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr1 77385063 77385511 77385240 Y ST6GALNAC5 NA NA NA NA NA ST6GALNAC5 53937 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 77595980 77596376 77595997 Y NA RP4-706A16.3 NA NA NA NA RP4-706A16.3 3212 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 77713696 77713788 77713742 Y NA PIGK,AK5 PIGK,AK5,ZZZ3 IMR90 Hi-C 24141950 PIGK 30581 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 77944616 77944628 77944624 Y NA NA NA NA NA NA AK5 198880 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 78021710 78022056 78021808 Y AK5,AK5,FAM73A NA NA NA NA NA ZZZ3 125048 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 78171350 78171363 78171357 Y NA ZZZ3 NA NA NA NA ZZZ3 24246 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 78348123 78348428 78348274 Y ZZZ3,FAM73A NA NA NA NA NA FUBP1 94366 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 78404062 78404594 78404354 Y NA FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA FUBP1 38200 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 78423142 78423521 78423473 Y NA FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA FUBP1 19273 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 78441093 78441406 78441347 Y NA FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA FUBP1 1388 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 78469106 78469287 78469191 Y DNAJB4 FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA DNAJB4 26247 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 78557346 78557710 78557476 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 114487 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr1 79215772 79216132 79215819 Y NA NA NA NA NA NA IFI44 102291 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr1 81240939 81241123 81241017 Y NA NA NA NA NA NA LPHN2 528722 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 81344955 81344988 81344971 Y NA NA NA NA NA NA LPHN2 424857 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 82268420 82269588 82268555 Y LPHN2 NA NA NA NA NA ST13P20 83042 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr1 84710038 84710507 84710127 Y NA NA NA NA NA NA PRKACB 168293 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 85005554 85005595 85005576 Y NA GNG5,CTBS NA NA NA NA CTBS 32568 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 85007374 85007584 85007581 Y NA GNG5,CTBS NA NA NA NA CTBS 30579 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 85047307 85047616 85047462 Y NA CTBS CTBS MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CTBS 9144 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 85049005 85049203 85049109 Y NA CTBS RPF1,GNG5 IMR90 Hi-C 24141950 CTBS 10842 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 3.20495848214648 chr1 85143846 85143980 85143979 Y SAMD13,SAMD13,DNASE2B,DNASE2B,LPAR3,SSX2IP,SSX2IP SSX2IP NA NA NA NA SSX2IP 10506 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 85241214 85241288 85241250 Y SAMD13,DNASE2B,DNASE2B,SSX2IP,SSX2IP,LPAR3 NA SSX2IP,GNG5,TTLL7,UOX,MCOLN2,C1orf180,PRKACB,LPAR3,MCOLN3 IMR90 Hi-C 24141950 SSX2IP 86728 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 85643319 85643587 85643547 Y NA NA MIR4423 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf52 79768 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 85695505 85695602 85695542 Y NA C1orf52,BCL10 NA NA NA NA C1orf52 27753 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 85843881 85844049 85844014 Y NA NA NA NA NA NA BCL10 103108 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 86010493 86010816 86010648 Y NA DDAH1,CYR61 NA NA NA NA DDAH1 31117 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 86926712 86927012 86926888 Y NA NA NA NA NA NA ODF2L 66689 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 87171187 87171726 87171422 Y SH3GLB1 SH3GLB1 NA NA NA NA SH3GLB1 2928 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 87258759 87259068 87258988 Y SH3GLB1 NA NA NA NA NA SH3GLB1 90500 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 89167079 89167239 89167155 Y GTF2B,GBP4,GBP3,GBP2,GBP1 PKN2 NA NA NA NA PKN2 19174 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 89303069 89303193 89303134 Y GBP4,GBP2,GTF2B NA NA NA NA NA GTF2B 52434 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 89459818 89459853 89459836 Y NA CCBL2,RBMXL1,GBP3 NA NA NA NA RBMXL1 3175 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 90100291 90100368 90100330 Y NA LRRC8C NA NA NA NA LRRC8C 3660 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 90101821 90102213 90101853 Y ZNF326,LRRC8D,GBP4,GBP5,LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C LRRC8C NA NA NA NA LRRC8C 5190 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 90137741 90138074 90137909 Y ZNF326,LRRC8D,GBP4,GBP5,LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C LRRC8C NA NA NA NA LRRC8C 41110 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 90185639 90185820 90185728 Y LRRC8C NA NA NA NA NA LRRC8C 89008 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 90223174 90223447 90223368 Y NA NA LRRC8C,FLJ27354,LRRC8D IMR90 Hi-C 24141950 LRRC8D 61126 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 90309838 90310280 90310072 Y LRRC8C,ZNF326 LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 25265 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 90319744 90319959 90319950 Y NA LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 35171 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 90374317 90375036 90374524 Y LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C,LRRC8D,ZNF326 NA NA NA NA NA GEMIN8P4 82844 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 90376424 90376756 90376561 Y LRRC8D,LRRC8D,ZNF326 NA NA NA NA NA GEMIN8P4 81124 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr1 91472225 91472812 91472773 Y NA ZNF644 NA NA NA NA ZNF644 13017 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 91478571 91478975 91478771 Y ZNF644,ZNF644 ZNF644 NA NA NA NA ZNF644 6854 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 91793812 91793887 91793849 Y NA NA NA NA NA NA HFM1 74539 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 91801781 91801846 91801814 Y NA NA NA NA NA NA HFM1 66580 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 92183243 92183457 92183382 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR3 186435 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 92242645 92243003 92242791 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR3 126889 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 93002551 93002867 93002761 Y RPAP2,GLMN,GFI1 NA NA NA NA NA RNU4-59P 161624 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 93427945 93428408 93428079 Y MTF2,DR1,FAM69A FAM69A NA NA NA NA FAM69A 2888 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 93634565 93634982 93634927 Y MTF2 CCDC18,TMED5 NA NA NA NA CCDC18 8494 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 93669062 93669462 93669176 Y NA CCDC18,TMED5 NA NA NA NA TMED5 24777 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 93773027 93773315 93773230 Y NA DR1,RP4-717I23.3 NA NA NA NA DR1 36130 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 93806739 93807078 93807070 Y NA DR1,RP4-717I23.3 NA NA NA NA DR1 2367 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr1 93914812 93914954 93914881 Y FNBP1L FNBP1L NA NA NA NA FNBP1L 3124 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 94007993 94008357 94008092 Y FNBP1L,BCAR3 NA NA NA NA NA FNBP1L 96305 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr1 94023703 94024059 94023930 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 112015 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 94201362 94201612 94201551 Y NA NA BCAR3,MIR760,DR1,DNTTIP2 IMR90 Hi-C 24141950 MIR760 108776 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 94621912 94621923 94621919 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP29 116701 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 94684511 94684818 94684682 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP29 53806 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 94937052 94937396 94937225 Y NA NA NA NA NA NA ABCD3 55119 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 95003688 95004160 95004042 Y NA NA NA NA NA NA ABCD3 121755 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 95331900 95332266 95332157 Y NA LINC01057,SLC44A3 CNN3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC44A3 48002 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 95464838 95464926 95464881 Y NA NA NA NA NA NA ALG14 71575 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 95484238 95484316 95484279 Y NA NA NA NA NA NA ALG14 52185 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 95551114 95551338 95551185 Y NA ALG14,TMEM56 ALG14,TMEM56-RWDD3,SLC44A3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ALG14 14613 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 95604801 95605035 95604918 Y TMEM56,TMEM56-RWDD3 TMEM56 NA NA NA NA TMEM56 23907 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 97199537 97199912 97199566 Y NA PTBP2 NA NA NA NA PTBP2 14316 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 97291085 97291340 97291213 Y NA NA NA NA NA NA PTBP2 105864 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 97535901 97536287 97536271 Y NA NA NA NA NA NA PTBP2 350680 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 97994700 97995088 97995052 Y NA SEC63P1 NA NA NA NA SEC63P1 14169 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 98011760 98012364 98012119 Y NA SEC63P1 NA NA NA NA SEC63P1 2503 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr1 98177967 98178251 98178164 Y NA NA NA NA NA NA SEC63P1 168710 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 98232940 98233333 98233137 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 151272 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 98373500 98373836 98373707 Y NA DPYD NA NA NA NA DPYD 10769 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 98408796 98409171 98408982 Y NA DPYD DPYD,MIR137HG IMR90 Hi-C 24141950 DPYD 24191 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr1 98437572 98437739 98437700 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 52967 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr1 98459458 98459857 98459685 Y NA NA NA NA NA NA MIR137HG 53562 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 98479796 98480152 98480044 Y NA MIR137HG NA NA NA NA MIR137HG 33267 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 98494244 98494658 98494592 Y NA MIR137HG NA NA NA NA MIR137HG 18761 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 98497100 98497277 98497188 Y NA MIR137HG NA NA NA NA MIR137HG 16142 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 98499783 98500490 98500262 Y NA MIR137HG NA NA NA NA MIR137HG 12929 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr1 98518546 98518920 98518639 Y NA MIR137HG NA NA NA NA MIR137HG 5127 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr1 98550811 98551163 98550987 Y NA MIR137HG NA NA NA NA MIR137HG 37392 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 98606055 98606462 98606113 Y NA NA NA NA NA NA MIR137HG 92636 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr1 98642709 98642844 98642773 Y NA NA NA NA NA NA MIR137HG 129290 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr1 98788970 98789228 98789135 Y NA NA MIR137HG,MIR2682,LOC729987,DPYD IMR90 Hi-C 24141950 MIR137HG 275551 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 98868515 98868612 98868566 Y NA NA NA NA NA NA SNX7 256624 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 100555117 100555459 100555393 Y NA SASS6 NA NA NA NA SASS6 41052 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 100678369 100678762 100678562 Y NA DBT NA NA NA NA DBT 34628 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 100828525 100828922 100828611 Y SASS6 CDC14A NA NA NA NA CDC14A 19941 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.34401484735175 chr1 100858865 100858991 100858930 Y SLC35A3,HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 50281 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 100859089 100859486 100859291 Y NA NA NA NA NA NA CDC14A 50505 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 100859593 100859940 100859621 Y HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 51009 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 101486133 101486158 101486151 Y NA RP11-421L21.3,DPH5 NA NA NA NA RP11-421L21.3 3276 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 101577594 101578108 101577808 Y SLC30A7,SLC30A7,S1PR1 NA SLC30A7,EXTL2 IMR90 Hi-C 24141950 DPH5 87950 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 102433894 102434100 102434094 Y NA OLFM3 NA NA NA NA OLFM3 26486 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 104525002 104525023 104525013 Y NA NA NA NA NA NA RNPC3 458689 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 106836458 106836476 106836467 Y NA NA NA NA NA NA PRMT6 760791 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 107684770 107685020 107684841 Y NA NTNG1 NA NA NA NA NTNG1 4141 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 109159407 109159722 109159520 Y NA HENMT1 NA NA NA NA HENMT1 42426 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 109467804 109468470 109468110 Y GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1 AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 35636 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr1 109499781 109500180 109500079 Y NA AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 3926 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr1 109572587 109572654 109572620 Y NA WDR47,TAF13 NA NA NA NA WDR47 10196 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 109754796 109754995 109754880 Y NA SARS,CELSR2 NA NA NA NA SARS 256 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 109784080 109784425 109784202 Y NA SARS,CELSR2,PSRC1 CELSR2 IMR90 Hi-C 24141950 CELSR2 6216 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr1 109802696 109802890 109802772 Y NA SARS,CELSR2,PSRC1 NA NA NA NA CELSR2 12055 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 109928106 109928152 109928114 Y NA SORT1,PSMA5 NA NA NA NA SORT1 10421 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 109933790 109934137 109934039 Y TMEM167B,GNAI3,SORT1,SORT1 SORT1,PSMA5 NA NA NA NA SORT1 4436 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 109938897 109939079 109938975 Y TMEM167B,SORT1,SORT1 SORT1,PSMA5 NA NA NA NA SORT1 324 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 110320163 110320291 110320225 Y NA GSTM3 CSF1,AHCYL1,CYB561D1,ATXN7L2,GPR61,GNAI3,AMIGO1,AMPD2,GNAT2,GSTM4,GSTM5,EPS8L3,FAM40A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GSTM3 37779 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 110502633 110502891 110502762 Y NA AHCYL1 CYB561D1,GNAI3,MIR197,AMPD2,GNAT2,GSTM4,GSTM3,EPS8L3,CSF1,AHCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 AHCYL1 22417 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 110895542 110895785 110895664 Y NA RBM15,LAMTOR5-AS1,SLC16A4 NA NA NA NA RBM15 16414 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 110927812 110928210 110927883 Y CD53,FAM40A,RBM15 RBM15,LAMTOR5-AS1,SLC16A4 NA NA NA NA SLC16A4 3494 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 111981832 111982198 111982008 Y NA ATP5F1,WDR77 NA NA NA NA ATP5F1 7288 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 112058803 112059167 112059005 Y C1orf183,C1orf183,RAP1A,C1orf162,ADORA3 RAP1A NA NA NA NA RAP1A 23673 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 112135698 112135869 112135721 Y C1orf183,DENND2D,RAP1A NA NA NA NA NA RAP1A 52858 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 112196411 112196803 112196596 Y C1orf183,RAP1A NA NA NA NA NA DDX20 99064 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 113072370 113072489 113072380 Y NA NA NA NA NA NA CAPZA1 87306 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 113468568 113468671 113468620 Y NA SLC16A1-AS1,SLC16A1 NA NA NA NA SLC16A1-AS1 28366 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 113932415 113932748 113932683 Y NA MAGI3 NA NA NA NA MAGI3 1044 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr1 113949729 113949849 113949733 Y NA MAGI3,RP11-512F24.1 NA NA NA NA MAGI3 18358 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 114236415 114236760 114236542 Y MAGI3 NA NA NA NA NA PHTF1 63351 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr1 114244987 114245321 114245197 Y NA NA NA NA NA NA PHTF1 54790 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr1 114258659 114258989 114258824 Y NA PHTF1 NA NA NA NA PHTF1 41122 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 114575620 114575801 114575630 Y NA NA SYT6 IMR90 Hi-C 24141950 OLFML3 55557 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 114950620 114950667 114950644 Y NA NA NA NA NA NA TRIM33 101114 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 115052481 115052766 115052572 Y BCAS2,TRIM33 TRIM33 NA NA NA NA TRIM33 700 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 115296637 115296935 115296808 Y NA NRAS,CSDE1,SIKE1 NA NA NA NA CSDE1 2362 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 116192575 116192950 116192828 Y NA VANGL1 NA NA NA NA VANGL1 10001 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 116694646 116694883 116694753 Y NA NA NA NA NA NA SLC22A15 177527 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 117050808 117051139 117050864 Y CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58 NA NA NA NA NA CD58 60522 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 117368438 117368774 117368618 Y NA NA PTGFRN K562 ChIA-PET 22265404 FTH1P22 52193 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 117421623 117422020 117421974 Y TTF2 PTGFRN PTGFRN,TTF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PTGFRN 28659 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 117814674 117814878 117814758 Y NA NA VTCN1,TTF2,TRIM45 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAN1A2 93193 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 119401140 119401399 119401296 Y NA NA NA NA NA NA RP11-418J17.1 279620 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 119506251 119506502 119506377 Y NA NA NA NA NA NA RP11-418J17.1 174517 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 120188395 120188927 120188667 Y NA PHGDH NA NA NA NA ZNF697 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 120275491 120275880 120275569 Y ADAM30 NA NA NA NA NA PHGDH 75070 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 121485082 121485212 121485187 Y NA NA NA NA NA NA EMBP1 225939 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr1 144533627 144534178 144533764 Y PDE4DIP RNU1-59P PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNU1-59P 1589 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr1 144986415 144987071 144986860 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 87115 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 145044480 145044713 145044599 Y NA PDE4DIP,SEC22B LOC728875,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL IMR90 Hi-C 24141950 PDE4DIP 29473 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 145067412 145067676 145067614 Y NA PDE4DIP,SEC22B NOTCH2NL,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9,LOC728875,PFN1P2,NBPF10 IMR90 Hi-C 24141950 PDE4DIP 6510 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 145092450 145092883 145092733 Y SEC22B,PDE4DIP PDE4DIP,SEC22B NBPF9,LOC653513,PDE4DIP,NOTCH2NL,SEC22B,LOC728875,NBPF10 IMR90 Hi-C 24141950 SEC22B 1337 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNVU1-6 16003 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr1 145437595 145437817 145437681 Y CD160,TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L NA NA NA NA TXNIP 1126 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 145455122 145455741 145455465 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L,RBM8A NA NA NA NA POLR3GL 12647 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 145519496 145519624 145519499 Y NBPF10,TXNIP LIX1L,RBM8A,RP11-315I20.1,GNRHR2,PEX11B NA NA NA NA PEX11B 5244 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 145702718 145703106 145702912 Y NA NA NA NA NA NA RNF115 93682 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 146774989 146775112 146775013 Y NA NA NA NA NA NA CHD1L 62698 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr1 146956714 146956895 146956804 Y GPR89B NA NA NA NA NA BCL9 54287 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 147072641 147072971 147072883 Y NA NA NA NA NA NA BCL9 61459 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 147080043 147080251 147080097 Y PRKAB2,CHD1L,BCL9 NA NA NA NA NA ACP6 60367 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr1 147775754 147775884 147775851 Y NBPF14 RNU1-120P,RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 29002 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 147806841 147807184 147807140 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 1955 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 148000699 148000802 148000795 Y NA RNVU1-13 NA NA NA NA RNVU1-13 8553 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 4.44558757200964 chr1 149138053 149138113 149138087 Y NA NA NA NA NA NA RNVU1-17 54156 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 149215297 149215704 149215586 Y NA RNVU1-17,RNU1-92P,RP11-403I13.5 NA NA NA NA RNU1-92P 1997 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 149816287 149817606 149817166 Y NA HIST2H2BF,HIST2H4A,HIST2H2AA3,HIST2H2AA4,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 3037 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 149820361 149820952 149820609 Y NA HIST2H2BF,HIST2H4A,HIST2H2AA3,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 149821015 149821647 149821349 Y NA HIST2H2BF,HIST2H4A,HIST2H2AA3,HIST2H2AA4,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 372 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 149981648 149981889 149981683 Y ANP32E,OTUD7B OTUD7B NA NA NA NA OTUD7B 1023 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 150135231 150135764 150135536 Y PRPF3,MCL1,PLEKHO1 PLEKHO1 NA NA NA NA PLEKHO1 15858 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.34401484735175 chr1 150185878 150186128 150186012 Y HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E ANP32E,RNU2-17P NA NA NA NA ANP32E 20376 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr1 150231710 150231944 150231778 Y ECM1,CA14 ANP32E,RNU2-17P,C1orf54,APH1A,C1orf51,MRPS21 NA NA NA NA C1orf54 6656 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 150294873 150295138 150294978 Y PLEKHO1,MCL1,CTSS,PRPF3 C1orf51,MRPS21,PRPF3,RPRD2 NA NA NA NA PRPF3 2948 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 150585815 150586394 150586132 Y CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,FAM63A,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 13694 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 150592182 150592667 150592572 Y CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 7421 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 150600412 150600701 150600561 Y CDC42SE1,BNIPL,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1 ENSA NA NA NA NA ENSA 324 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 151172142 151172526 151172243 Y FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4 SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 3717 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr1 151184646 151184728 151184696 Y NA LYSMD1,VPS72,PIP5K1A,PSMD4 NA NA NA NA PIP5K1A 16221 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 151284018 151284391 151284246 Y FAM63A,CDC42SE1,TNFAIP8L2,ZNF687,RFX5,PI4KB,PI4KB ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB,RP11-126K1.6,RFX5 NA NA NA NA PI4KB 13800 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 151580936 151581099 151580976 Y NA SNX27,RP11-404E16.1 RIIAD1,CELF3 IMR90 Hi-C 24141950 SNX27 1442 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 151868154 151868386 151868273 Y NA THEM4 NA NA NA NA THEM4 11898 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 151877533 151877895 151877666 Y THEM4 THEM4 NA NA NA NA THEM4 2389 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 151909443 151909536 151909490 Y S100A10 THEM4 THEM4,S100A10,CELF3,RORC IMR90 Hi-C 24141950 THEM4 29159 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 152198460 152198859 152198660 Y NA NA NA NA NA NA HMGN3P1 171194 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 153505144 153505346 153505245 Y NA S100A6,S100A3 NA NA NA NA S100A6 1374 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 153583449 153583810 153583692 Y PGLYRP3,PGLYRP4,S100A7A,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13 S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN NA NA NA NA S100A16 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 153767353 153767730 153767624 Y NA SLC27A3 NA NA NA NA SLC27A3 22523 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 153845025 153845089 153845058 Y NA GATAD2B NA NA NA NA GATAD2B 48362 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 153853385 153853782 153853590 Y NA GATAD2B NA NA NA NA GATAD2B 39669 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 154302207 154302441 154302288 Y CHRNB2,ATP8B2 AQP10,ATP8B2 NA NA NA NA ATP8B2 6178 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 154395894 154396284 154395999 Y UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,ADAR,IL6R NA NA NA NA NA ATP8B2 99865 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 154577703 154577929 154577737 Y NA UBE2Q1,CHRNB2,ADAR NA NA NA NA ADAR 20546 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 154582047 154582244 154582145 Y UBAP2L,ATP8B2,PBXIP1,ADAR,ADAR CHRNB2,ADAR NA NA NA NA ADAR 16231 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 154720589 154720696 154720649 Y NA NA NA NA NA NA KCNN3 120060 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr1 154820307 154820671 154820489 Y NA KCNN3 NA NA NA NA KCNN3 20085 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 154899922 154900189 154899933 Y NA PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1 NA NA NA NA PMVK 7278 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 154910155 154910399 154910216 Y ADAR,PBXIP1,MTX1 PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1 NA NA NA NA PMVK 2688 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 154957258 154957622 154957425 Y NA PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B NA NA NA NA FLAD1 3444 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 154972628 154972915 154972668 Y CLK2,DPM3,DPM3,PYGO2,FLAD1 PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 212 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 154973036 154973200 154973120 Y CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1 PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 154973335 154973935 154973656 Y ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 208 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 154977099 154977253 154977190 Y ADAR,ADAR,ZBTB7B,DCST1 PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 3972 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr1 155064132 155064186 155064153 Y NA ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3 NA NA NA NA EFNA3 29908 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 155164183 155164959 155164537 Y NA TRIM46,KRTCAP2,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA NA NA NA NA MTX1 11531 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr1 155496665 155497012 155496914 Y DCST1,HCN3,YY1AP1,ASH1L ASH1L-AS1,ASH1L NA NA NA NA ASH1L-AS1 32809 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 155535083 155535193 155535176 Y HCN3 ASH1L-AS1,ASH1L NA NA NA NA ASH1L 4485 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr1 155703696 155704096 155703788 Y NA DAP3,YY1AP1 NA NA NA NA YY1AP1 46905 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 155830201 155830522 155830413 Y ASH1L,MEX3A,ARHGEF2,ARHGEF2 GON4L,SYT11,RIT1 ARHGEF2,RXFP4,SNORA42,RIT1,KIAA0907 IMR90 Hi-C 24141950 SYT11 2901 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr1 155904830 155905033 155904931 Y NA RIT1,KIAA0907 NA NA NA NA KIAA0907 2639 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 156067665 156067930 156067834 Y NA UBQLN4,LAMTOR2,MEX3A,LMNA LMNA,MEX3A K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 LMNA 17301 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 156073854 156074351 156074085 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA MEX3A,LMNA LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LMNA 23490 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 156426931 156427503 156427197 Y ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 41117 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr1 156461502 156461819 156461755 Y MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6801 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 156474686 156475018 156474923 Y SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6066 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 156677217 156677612 156677436 Y NA RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC NA NA NA NA CRABP2 3609 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 156718467 156719136 156718868 Y C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1 CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF NA NA NA NA PRCC 65 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 156781780 156782101 156782026 Y MEF2D,ETV3L,SH2D2A,SH2D2A,NTRK1 HDGF,NTRK1,INSRR NA NA NA NA NTRK1 1331 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 157010714 157010878 157010796 Y NA ARHGEF11 NA NA NA NA ARHGEF11 2284 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 157082632 157083078 157082974 Y RRNAD1,ETV3,ETV3 ETV3 NA NA NA NA ETV3 23188 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 159142876 159143043 159143018 Y OR10J5,OR6K3,OR6N1,OR6N2,FCER1A,CADM3,CADM3,DARC CADM3 NA NA NA NA CADM3 3477 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 159158093 159158524 159158429 Y NA CADM3 NA NA NA NA CADM3 18694 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr1 160407857 160407975 160407870 Y SLAMF6,SLAMF1,LY9,CD48,DCAF8 VANGL2 NA NA NA NA VANGL2 39481 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 160639828 160639998 160639908 Y NA NA NA NA NA NA RP11-312J18.5 222772 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr1 161348767 161349231 161349047 Y NDUFS2 NA NA NA NA NA SDHC 66720 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr1 161359666 161360218 161359899 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 77619 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.34401484735175 chr1 161369073 161369991 161369486 Y NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 87026 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr1 161500608 161500899 161500816 Y USF1,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A,ATF6,HSPA6,FCGR3B,FCGR3A,FCGR3A HSPA6 NA NA NA NA HSPA6 8572 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr1 161582212 161582506 161582417 Y HSPA6,FCGR3A NA NA NA NA NA HSPA6 90176 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 161847357 161847565 161847361 Y NA NA NA NA NA NA ATF6 113273 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 161892699 161893027 161892754 Y NA NA NA NA NA NA OLFML2B 98617 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 162370681 162370944 162370765 Y SH2D1B NA NA NA NA NA UHMK1 94097 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 162518132 162518252 162518187 Y HSD17B7,SH2D1B,UHMK1 UAP1 NA NA NA NA UAP1 11071 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 162539981 162540420 162539994 Y C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1 UAP1 NA NA NA NA UAP1 10658 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 162685333 162685375 162685354 Y NOS1AP NA NA NA NA NA DDR2 86170 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 162709795 162709973 162709884 Y NOS1AP,DDR2 NA NA NA NA NA DDR2 110632 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 163098384 163098482 163098454 Y RGS5,RGS5 NA NA NA NA NA RGS4 61819 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 163107964 163108181 163108073 Y NA NA NA NA NA NA RGS4 71399 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 164750243 164750515 164750387 Y PBX1 NA NA NA NA NA PBX1 227422 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 164753581 164753588 164753585 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 230760 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 165797615 165798367 165798308 Y UCK2 UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 2623 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr1 165823413 165823808 165823568 Y NA UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 28421 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 166102836 166102913 166102873 Y NA FAM78B NA NA NA NA FAM78B 31293 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 166139268 166139609 166139458 Y NA FAM78B NA NA NA NA FAM78B 5062 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 166828089 166828463 166828188 Y POU2F1,POGK POGK,TADA1 NA NA NA NA TADA1 15101 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 167191021 167191933 167191618 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 2955 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr1 167398939 167399085 167399047 Y CD247 NA NA NA NA NA CREG1 121919 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 167683554 167683813 167683605 Y POU2F1,CREG1 MPZL1 NA NA NA NA MPZL1 4616 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 168050664 168051125 168050872 Y SFT2D2 NA NA NA NA NA GPR161 53696 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr1 168149052 168149361 168149233 Y NA GPR161,TIPRL,RPL34P1,SFT2D2 NA NA NA NA TIPRL 2881 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr1 168338134 168338331 168338175 Y NA NA NA NA NA NA TBX19 89856 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 168368318 168368620 168368438 Y TBX19 NA NA NA NA NA TBX19 120040 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 169886878 169886942 169886910 Y NA SCYL3 NA NA NA NA SCYL3 25470 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 170630769 170630992 170630884 Y NA NA NA NA NA NA GORAB 131499 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 171832189 171832290 171832196 Y DNM3 DNM3 NA NA NA NA DNM3 23568 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 172804293 172804464 172804387 Y NA NA CENPL,DARS2,TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 213639 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 172820425 172820587 172820541 Y NA NA TNFSF4 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 197516 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 173008475 173008781 173008627 Y TNFSF18 TNFSF18 NA NA NA NA TNFSF18 9322 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 173398914 173399297 173399234 Y NA PRDX6 NA NA NA NA PRDX6 45108 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 173447359 173447668 173447399 Y PRDX6 PRDX6 NA NA NA NA PRDX6 2954 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 173816933 173817269 173817101 Y NA DARS2,CENPL,ZBTB37,GAS5 NA NA NA NA ZBTB37 17951 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 173984193 173984403 173984298 Y GPR52,ZBTB37,RC3H1 RC3H1,RP11-160H22.3 NA NA NA NA RC3H1 5032 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 174220636 174220943 174220783 Y RABGAP1L NA NA NA NA NA RABGAP1L 94088 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 174503176 174503233 174503205 Y NA NA NA NA NA NA RABGAP1L 376628 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 174788416 174788807 174788447 Y NA NA NA NA NA NA CACYBP 177493 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 174974831 174975127 174974979 Y NA CACYBP,MRPS14 NA NA NA NA CACYBP 8531 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 175656174 175656298 175656236 Y TNR NA NA NA NA NA TNR 54608 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 176079011 176079503 176079162 Y NA NA NA NA NA NA RFWD2 95126 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 176601179 176601401 176601333 Y NA NA NA NA NA NA RP11-195C7.1 426395 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 179144823 179145001 179144950 Y NA NA NA NA NA NA TOR3A 96311 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 179726041 179726329 179726185 Y TDRD5,FAM163A FAM163A NA NA NA NA FAM163A 15743 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr1 179734817 179735116 179734826 Y FAM163A FAM163A NA NA NA NA FAM163A 24519 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.17110090726052 chr1 179997226 179997609 179997386 Y TOR1AIP1,CEP350 NA NA NA NA NA CEP350 75353 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 180237101 180237317 180237140 Y NA NA NA NA NA NA QSOX1 115132 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 180249791 180250006 180249913 Y NA NA NA NA NA NA QSOX1 127822 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 180250812 180250948 180250921 Y NA NA NA NA NA NA QSOX1 128843 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 180251899 180252130 180252121 Y NA NA NA NA NA NA QSOX1 129930 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 180371123 180371295 180371283 Y NA NA NA NA NA NA ACBD6 98794 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 180389473 180389640 180389557 Y NA NA LHX4,LOC100527964 IMR90 Hi-C 24141950 ACBD6 80449 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 180562543 180562696 180562620 Y NA XPR1 XPR1,ACBD6,KIAA1614 IMR90 Hi-C 24141950 XPR1 36444 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 180612177 180612184 180612181 Y NA XPR1 NA NA NA NA XPR1 13037 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 180613229 180613603 180613357 Y NA XPR1 NA NA NA NA XPR1 14089 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 180895607 180895967 180895721 Y NA NA NA NA NA NA STX6 94080 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 180921044 180921090 180921069 Y NA NA NA NA NA NA STX6 68957 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 181060502 181060611 181060567 Y STX6,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 4864 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 181068595 181069000 181068732 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 12957 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 181069151 181069617 181069305 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 13513 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 181074349 181074924 181074645 Y XPR1,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 18711 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 181104265 181104352 181104277 Y NA IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48627 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 181104473 181105818 181105427 Y STX6,MR1,IER5 IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48835 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 181998739 181999134 181998891 Y GLUL,GLUL NA ZNF648 MCF7 ChIA-PET 22265404 GLUL 360207 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 182162175 182162397 182162293 Y NA NA NA NA NA NA GLUL 196944 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 182274457 182274562 182274517 Y NA NA GLUL K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GLUL 84779 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 182585205 182585710 182585424 Y NA RGS16 NA NA NA NA RGS16 13662 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 182643740 182644063 182644020 Y RGS16 NA NA NA NA NA RGS16 72197 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 182854499 182854851 182854644 Y NA DHX9 NA NA NA NA DHX9 47995 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 183386078 183386213 183386099 Y NA NMNAT2 NA NA NA NA NMNAT2 341 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 183578502 183578873 183578650 Y NCF2,NCF2,ARPC5 ARPC5,RGL1 NA NA NA NA ARPC5 24019 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 183836661 183836955 183836765 Y RGL1,GLT25D2 NA NA NA NA NA TSEN15 181856 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 183846576 183846867 183846649 Y NMNAT2,RGL1,GLT25D2 NA NA NA NA NA TSEN15 171944 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 184357629 184357933 184357738 Y EDEM3 C1orf21 NA NA NA NA C1orf21 3437 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 184820980 184820991 184820986 Y NA NA NA NA NA NA EDEM3 98933 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 185109809 185110137 185110116 Y IVNS1ABP TRMT1L,SWT1 NA NA NA NA TRMT1L 14067 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 185253692 185254037 185253865 Y HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP IVNS1ABP NA NA NA NA IVNS1ABP 30424 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 185298342 185298619 185298496 Y FAM129A,RNF2,TRMT1L,SWT1,TRMT1L,SWT1,IVNS1ABP IVNS1ABP IVNS1ABP MCF7 ChIA-PET 22265404 IVNS1ABP 13881 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 186525885 186526258 186526039 Y OCLM NA PLA2G4A IMR90 Hi-C 24141950 C1orf27 182995 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 186788311 186788564 186788477 Y PTGS2,PLA2G4A NA NA NA NA NA C1orf27 445421 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 186799738 186800031 186799804 Y PTGS2,PLA2G4A NA NA NA NA NA C1orf27 456848 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 192458942 192459176 192459156 Y RGS2,RGS13,RGS1 NA RGS1,RGS2 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4426 224137 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 192953303 192953614 192953465 Y RGS2,CDC73,TROVE2,TROVE2 NA NA NA NA NA TROVE2 72938 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 193073509 193073815 193073644 Y NA TROVE2,UCHL5,GLRX2,CDC73 NA NA NA NA GLRX2 265 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 193418722 193419025 193418873 Y NA NA NA NA NA NA B3GALT2 264938 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 195602290 195602557 195602425 Y NA NA NA NA NA NA KCNT2 973798 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 196317530 196317735 196317633 Y NA NA NA NA NA NA KCNT2 258620 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 196378121 196378217 196378169 Y CFHR3,KCNT2 NA NA NA NA NA KCNT2 198138 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 196379497 196379989 196379846 Y CFHR3,KCNT2,CFH NA NA NA NA NA KCNT2 196366 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 196778400 196778793 196778592 Y NA NA NA NA NA NA KCNT2 202045 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 198127475 198127965 198127580 Y NA NEK7 NA NA NA NA NEK7 3382 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 198128112 198128944 198128293 Y PTPRC,DENND1B NEK7 NA NA NA NA NEK7 4019 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 198526099 198526320 198526230 Y PTPRC NA NA NA NA NA NEK7 402006 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 198845240 198845523 198845521 Y NA NA NA NA NA NA RP11-104D3.2 508746 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 198903935 198904934 198904858 Y PTPRC NA NA NA NA NA RP11-104D3.2 449335 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 201445401 201445412 201445405 Y NAV1 PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA PHLDA3 9036 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 201508517 201509575 201509484 Y NA RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA CSRP1 31933 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 201524172 201524339 201524258 Y LMOD1 RP11-134G8.7,CSRP1 NAV1,RPS10P7,IPO9 IMR90 Hi-C 24141950 CSRP1 47588 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 201618983 201619286 201619160 Y NA NAV1 NA NA NA NA NAV1 28572 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 201619383 201619798 201619705 Y SHISA4,GPR37L1,NAV1 NAV1 NA NA NA NA NAV1 28972 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr1 201709797 201710423 201710148 Y NA NA NA NA NA NA IPO9 85846 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 201717986 201718364 201718179 Y NA NA IPO9 IMR90 Hi-C 24141950 IPO9 77905 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 202324768 202324787 202324778 Y NA UBE2T,PPP1R12B NA NA NA NA PPP1R12B 8941 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 202737599 202737762 202737681 Y NA RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6 NA NA NA NA RP11-480I12.2 3053 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 202781525 202781905 202781812 Y NA RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6,RP11-480I12.5 NA NA NA NA PCAT6 3443 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 203101073 203101246 203101163 Y NA ADORA1 NA NA NA NA ADORA1 43291 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 203259429 203259985 203259729 Y RABIF,KLHL12,ADIPOR1,ADIPOR1,BTG2 LINC01136,BTG2 NA NA NA NA LINC01136 12452 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr1 203296328 203297068 203296686 Y LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2 LINC01136,BTG2 NA NA NA NA BTG2 23709 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 203297101 203297334 203297256 Y LAX1,TMEM183A,TMEM183B,BTG2 LINC01136,BTG2 NA NA NA NA BTG2 24482 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 203481982 203482534 203482093 Y BTG2,ATP2B4 PRELP NA NA NA NA PRELP 39026 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 203491011 203491485 203491466 Y PPFIA4,SNRPE PRELP NA NA NA NA PRELP 48055 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.27448666474912 chr1 203541292 203541507 203541407 Y NA NA ATP2B4,OPTC,PRELP,FMOD,ZC3H11A,LAX1 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B4 52182 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 204238647 204239007 204238820 Y GOLT1A,PLEKHA6 NA NA NA NA NA PLEKHA6 105786 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 204383374 204383435 204383377 Y PPP1R15B PLEKHA6,PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 4455 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 204531285 204531644 204531490 Y MDM4 MDM4 NA NA NA NA MDM4 47774 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 205090261 205090406 205090392 Y NA RBBP5 CNTN2 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP5 1118 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 205179753 205180065 205179802 Y NA DSTYK,TMCC2 NA NA NA NA DSTYK 1026 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 205512470 205512827 205512691 Y NA CDK18,RNU2-19P NA NA NA NA RNU2-19P 21017 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 205709805 205710150 205710085 Y NA NUCKS1,RAB7L1 NA NA NA NA NUCKS1 7254 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 206640538 206640724 206640631 Y NA IKBKE NA NA NA NA IKBKE 1067 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 206748926 206749451 206749084 Y IKBKE,RASSF5,MAPKAPK2,RASSF5,DYRK3 RP11-534L20.4,EIF2D NA NA NA NA EIF2D 34453 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 206751685 206751882 206751743 Y IKBKE,RASSF5,IL19,MAPKAPK2,FAIM3,FAIM3,RASSF5 EIF2D NA NA NA NA EIF2D 32022 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 206752030 206752370 206752201 Y RASSF5,MAPKAPK2,RASSF5 EIF2D NA NA NA NA EIF2D 31534 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 206754982 206755508 206755274 Y IKBKE,RASSF5,IL19,MAPKAPK2,RASSF5,DYRK3 EIF2D NA NA NA NA EIF2D 28396 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 206859748 206860259 206859963 Y IKBKE,RASSF5,FAIM3,FAIM3,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 3459 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 207509006 207509478 207509176 Y CR1,CD46,CD55 CD55 NA NA NA NA CD55 16153 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 208136912 208137268 208137107 Y NA NA CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C1orf132 96417 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr1 208387951 208388224 208388088 Y NA PLXNA2 NA NA NA NA PLXNA2 27441 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 208418631 208418859 208418806 Y PLXNA2 PLXNA2 NA NA NA NA PLXNA2 2966 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 209279666 209279995 209279816 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G2P1 159573 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 209783856 209783983 209783869 Y NA CAMK1G NA NA NA NA CAMK1G 28794 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 209830400 209831026 209830727 Y TRAF3IP3,G0S2,C1orf74,LAMB3 G0S2 NA NA NA NA G0S2 15739 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 209978699 209978810 209978755 Y LAMB3,LAMB3,IRF6 C1orf74,DIEXF NA NA NA NA DIEXF 20542 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 210058060 210058292 210058164 Y LAMB3 NA DIEXF,SYT14 IMR90 Hi-C 24141950 SYT14 51246 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 210468396 210468551 210468467 Y HHAT HHAT SYT14,DIEXF,C1orf133,SERTAD4,HHAT IMR90 Hi-C 24141950 HHAT 31045 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 210812063 210812447 210812256 Y HHAT,HHAT,KCNH1 NA NA NA NA NA HHAT 312467 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 211035320 211035533 211035504 Y NA NA NA NA NA NA KCNH1 269924 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 211084997 211085192 211085095 Y NA NA HHAT IMR90 Hi-C 24141950 KCNH1 220265 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 211146266 211146283 211146272 Y KCNH1 NA HHAT IMR90 Hi-C 24141950 KCNH1 159174 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 211258865 211259253 211259186 Y NA KCNH1 NA NA NA NA KCNH1 46204 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 211500826 211501119 211501083 Y TRAF5,TRAF5 TRAF5 NA NA NA NA TRAF5 2869 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 211837893 211837920 211837910 Y NA NEK2,RP11-122M14.1 NA NA NA NA NEK2 9040 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 211976591 211977124 211977068 Y NA LPGAT1 NA NA NA NA LPGAT1 24990 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 211988342 211989080 211989063 Y PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1 LPGAT1 NA NA NA NA LPGAT1 13034 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 212311960 212312104 212312056 Y PPP2R5A NA PPP2R5A,NENF,DTL,TMEM206 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL21P28 88589 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 212731490 212732709 212732386 Y NA ATF3 ATF3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ATF3 3967 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.24062908986315 chr1 212809966 212810356 212810074 Y RPS6KC1,ATF3,ATF3,ATF3 NA NA NA NA NA ATF3 73290 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 212841280 212841455 212841352 Y RPS6KC1,ATF3,ATF3,ATF3 NA NA NA NA NA ATF3 104604 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 212896080 212896217 212896149 Y NA NA NA NA NA NA NSL1 66907 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 213152730 213153023 213152876 Y BATF3,TATDN3,VASH2 VASH2,ANGEL2 NA NA NA NA VASH2 30868 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 213160414 213160619 213160568 Y VASH2 VASH2,ANGEL2 NA NA NA NA ANGEL2 26549 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 214162828 214163073 214162948 Y PROX1 PROX1 NA NA NA NA PROX1 8304 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 4.23881605703244 chr1 214163432 214163790 214163677 Y NA PROX1 NA NA NA NA PROX1 8908 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr1 214490616 214490868 214490808 Y SMYD2 SMYD2 NA NA NA NA SMYD2 38171 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 215655448 215655678 215655614 Y NA NA CENPF,KCNK2 IMR90 Hi-C 24141950 KCTD3 83057 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 215741534 215741966 215741880 Y KCTD3 KCTD3 NA NA NA NA KCTD3 2799 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 216774004 216774285 216774188 Y ESRRG,ESRRG NA NA NA NA NA ESRRG 534812 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 218847947 218848245 218848113 Y NA NA NA NA NA NA TGFB2 330370 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 219262446 219262621 219262479 Y NA NA NA NA NA NA LYPLAL1 82565 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 219433064 219433395 219433229 Y NA NA NA NA NA NA LYPLAL1 87878 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 219514172 219514180 219514178 Y NA NA RRP15,TGFB2,LOC728463 IMR90 Hi-C 24141950 LYPLAL1 168986 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 219632644 219633145 219633054 Y NA NA NA NA NA NA LYPLAL1 287458 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 220359525 220359939 220359742 Y NA NA NA NA NA NA MORF4L1P1 64973 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 220868801 220868862 220868831 Y C1orf115,MOSC2,MOSC1 C1orf115 NA NA NA NA C1orf115 7614 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 221048646 221048850 221048821 Y NA HLX NA NA NA NA HLX 849 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 221904432 221904724 221904722 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 8794 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 221931213 221931399 221931306 Y DUSP10 DUSP10 DUSP10 K562 ChIA-PET 22265404 DUSP10 17695 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 222638782 222639204 222638963 Y NA NA DUSP10,MIA3,AIDA,BROX IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-378J18.3 121963 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 222828361 222828786 222828451 Y TLR5 MIA3 NA NA NA NA MIA3 38933 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 222830626 222830783 222830705 Y TAF1A,MIA3 MIA3 NA NA NA NA MIA3 41198 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 223095586 223095912 223095632 Y NA NA NA NA NA NA DISP1 109180 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 223276523 223276867 223276768 Y NA TLR5 NA NA NA NA TLR5 37757 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 223349014 223349276 223349189 Y TLR5 TLR5 SUSD4,CAPN8 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TLR5 34390 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 223903033 223903347 223903117 Y TP53BP2,CAPN2 CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 15738 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 223914239 223914747 223914523 Y TP53BP2,FBXO28,CAPN2 CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 26944 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 223964690 223965055 223964731 Y TP53BP2,FBXO28 NA NA NA NA NA TP53BP2 66619 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 224025511 224025803 224025713 Y NA TP53BP2 NA NA NA NA TP53BP2 5871 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 5.99637393433858 chr1 224545542 224546006 224545661 Y FBXO28,CNIH4 NVL,CNIH4 NA NA NA NA CNIH4 2990 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 224819300 224819585 224819443 Y NA NA NA NA NA NA WDR26 196565 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 225778250 225778416 225778333 Y ENAH NA NA NA NA NA ENAH 60428 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 226014145 226014403 226014226 Y EPHX1,EPHX1 EPHX1 NA NA NA NA EPHX1 18351 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 226163769 226163979 226163848 Y NA NA NA NA NA NA PYCR2 53791 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 226263544 226263865 226263697 Y C1orf55 H3F3A NA NA NA NA H3F3A 15992 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 226297611 226298113 226297674 Y NA NA ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H3F3A 50059 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 226370122 226370365 226370224 Y C1orf55,H3F3A,ACBD3 ACBD3 NA NA NA NA ACBD3 2066 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 226435130 226435332 226435236 Y PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A NA NA NA NA NA LIN9 60238 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 226867580 226868182 226867972 Y ITPKB ITPKB-IT1 NA NA NA NA ITPKB-IT1 6812 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 226890865 226891416 226891300 Y ITPKB ITPKB-IT1,ITPKB NA NA NA NA ITPKB-IT1 30097 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr1 227751865 227752213 227752044 Y ZNF678 ZNF678 NA NA NA NA ZNF678 2621 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 227976197 227976490 227976208 Y NA NA NA NA NA NA JMJD4 55085 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr1 228273480 228273740 228273633 Y ARF1,ARF1 ARF1,C1orf35,MRPL55 NA NA NA NA ARF1 5119 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 228633222 228633907 228633608 Y TRIM11,TRIM17,HIST3H2A TRIM11,RP11-245P10.4,TRIM17,HIST3H2A,HIST3H2BB,HIST3H2BA,RNF187 NA NA NA NA HIST3H2A 9653 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr1 228634060 228634141 228634103 Y TRIM17,HIST3H2A TRIM11,RP11-245P10.4,TRIM17,HIST3H2A,HIST3H2BB,HIST3H2BA,RNF187 NA NA NA NA HIST3H2A 9419 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 228640073 228640088 228640081 Y NA TRIM11,RP11-245P10.4,TRIM17,HIST3H2A,HIST3H2BB,HIST3H2BA,RNF187 NA NA NA NA HIST3H2A 3472 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 228651177 228651630 228651444 Y HIST3H2A,HIST3H2BB TRIM17,HIST3H2A,HIST3H2BB,HIST3H2BA,RNF187 RNF187 IMR90 Hi-C 24141950 HIST3H2BA 850 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 228782602 228782886 228782775 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 85938 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 228783266 228783899 228783495 Y C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU NA NA NA NA NA RHOU 84925 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 228963953 228964182 228964095 Y RHOU NA NA NA NA NA RHOU 95129 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 229125950 229125993 229125972 Y NA NA RHOU IMR90 Hi-C 24141950 RHOU 257126 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 229473732 229474385 229474330 Y NA NA NA NA NA NA RAB4A 68910 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 229546455 229546768 229546488 Y NA NA NA NA NA NA NUP133 95335 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 229546837 229547142 229546975 Y C1orf96,ACTA1 NA NA NA NA NA NUP133 94961 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 230220164 230220401 230220223 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 28628 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 230240540 230240902 230240735 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 49004 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 230248068 230248475 230248108 Y NA NA NA NA NA NA GALNT2 56532 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 230279464 230279771 230279510 Y NA NA NA NA NA NA GALNT2 87928 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 230561990 230562633 230562303 Y NA NA NA NA NA NA COG2 213602 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.24062908986315 chr1 230772335 230772728 230772430 Y NA COG2 COG2 MCF7 ChIA-PET 22265404 COG2 3507 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 230889321 230889962 230889601 Y NA AGT NA NA NA NA AGT 41278 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 231038131 231038454 231038293 Y COG2,TTC13,GNPAT,C1orf131 C1orf198 NA NA NA NA C1orf198 34796 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 231083969 231084208 231084171 Y NA TTC13,ARV1 NA NA NA NA TTC13 28413 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 231868761 231869568 231868969 Y NA NA NA NA NA NA DISC1 108200 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 232073278 232073500 232073389 Y NA NA NA NA NA NA DISC1 312717 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 232362022 232362384 232362201 Y NA NA SIPA1L2,TSNAX-DISC1 IMR90 Hi-C 24141950 DISC1 601461 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 232735038 232735290 232735230 Y NA NA TSNAX-DISC1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 230643 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr1 232746522 232746891 232746785 Y NA NA TSNAX-DISC1,SIPA1L2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 219042 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 199806 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 4.85913060196402 chr1 233250723 233251216 233250828 Y NA NA NA NA NA NA NTPCR 166372 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 234639993 234640263 234640100 Y NA TARBP1 LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TARBP1 27144 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 234680207 234680593 234680360 Y NA NA LOC100506795,IRF2BP2 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRF2BP2 62678 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 234686100 234686288 234686192 Y NA NA LOC100506795,IRF2BP2 IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BP2 56983 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 234721506 234721689 234721614 Y NA IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 21582 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 234728712 234729023 234728867 Y NA IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 14248 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 234737347 234737653 234737498 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 5618 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 234738546 234738834 234738624 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4437 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 234746093 234747674 234747395 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 2822 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.55078636232894 chr1 234748100 234748931 234748566 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4829 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr1 234757412 234757805 234757606 Y NA IRF2BP2 LOC100506810 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 IRF2BP2 14141 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 235091073 235091332 235091158 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B NA IRF2BP2,LOC100506810 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 198919 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 235158479 235158766 235158623 Y NA NA IRF2BP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TOMM20 131485 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 235468267 235468477 235468372 Y NA GGPS1,ARID4B NA NA NA NA GGPS1 20188 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 235484403 235484795 235484782 Y NA GGPS1,ARID4B,TBCE NA NA NA NA GGPS1 3870 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 235668656 235669018 235668830 Y RBM34,ARID4B,ARID4B B3GALNT2 NA NA NA NA B3GALNT2 2875 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 236022682 236022818 236022763 Y GPR137B,LYST NA NA NA NA NA NID1 203644 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 236319808 236320415 236320177 Y LYST,LGALS8,GPR137B GPR137B NA NA NA NA GPR137B 15976 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 236323296 236323699 236323519 Y LYST,GPR137B,LGALS8 GPR137B NA NA NA NA GPR137B 19464 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 236335410 236335565 236335488 Y NA GPR137B NA NA NA NA GPR137B 31578 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 236431064 236431243 236431072 Y LGALS8,ERO1LB ERO1LB NA NA NA NA ERO1LB 12076 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 236866415 236866949 236866639 Y NA ACTN2 NA NA NA NA ACTN2 18661 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 237021571 237021855 237021713 Y NA NA NA NA NA NA MTR 64961 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 237207715 237208218 237207860 Y NA RYR2 NA NA NA NA RYR2 4210 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 237634251 237634535 237634324 Y NA NA NA NA NA NA RYR2 430746 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 239877993 239878320 239878052 Y NA NA NA NA NA NA FMN2 297328 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 239893728 239894036 239893786 Y NA NA NA NA NA NA FMN2 281612 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr1 240306890 240307603 240307416 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23852 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 240307621 240308162 240308005 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23293 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 240437557 240437954 240437680 Y FMN2 NA NA NA NA NA ADH5P3 106102 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 240783291 240783489 240783399 Y NA GREM2,RP11-467I20.3 FMN2,GREM2 IMR90 Hi-C 24141950 GREM2 9842 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 241191454 241191834 241191645 Y RGS7 RP11-435F13.2 NA NA NA NA RP11-435F13.2 31360 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 241392345 241392701 241392526 Y RGS7,KMO NA NA NA NA NA RGS7 125829 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 242686520 242686699 242686610 Y NA PLD5 NA NA NA NA PLD5 522 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 243585242 243585384 243585313 Y CEP170,AKT3,AKT3 NA NA NA NA NA SDCCAG8 167922 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 243644284 243644683 243644595 Y NA NA NA NA NA NA SDCCAG8 226964 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 243781710 243782079 243781895 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 230302 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 243788022 243788404 243788357 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 223977 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 243806306 243806448 243806376 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 205933 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 243853401 243853550 243853530 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 158831 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 243876652 243876733 243876693 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 135648 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 243923195 243923609 243923504 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 88772 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 243995795 243995860 243995825 Y NA AKT3 NA NA NA NA AKT3 16521 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 244210956 244211944 244211575 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 198575 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr1 244212276 244213430 244213047 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 199895 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 244215508 244215901 244215527 Y AKT3,ZNF238,ZNF238 NA NA NA NA NA AKT3 203127 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.55078636232894 chr1 244613820 244614139 244614120 Y NA ADSS,C1orf101 NA NA NA NA ADSS 384 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr1 244894306 244894456 244894354 Y C1orf100,C1orf101 NA PPPDE1,C1orf101 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPU-AS1 122343 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 245915127 245915205 245915167 Y NA NA NA NA NA NA KIF26B 598840 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 246042512 246042669 246042578 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 625945 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 246061196 246061440 246061372 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 607174 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr1 246129057 246129404 246129358 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 539210 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 246323685 246324051 246324002 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 344563 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 246387027 246387389 246387208 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 281225 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 246432471 246432772 246432681 Y SMYD3,CNST NA NA NA NA NA SMYD3 235842 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 246436053 246436378 246436216 Y SMYD3,SMYD3 NA NA NA NA NA SMYD3 232236 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 246749077 246749442 246749258 Y CNST TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 21331 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 246763574 246763751 246763579 Y NA TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 35828 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 246845240 246845409 246845305 Y NA SCCPDH NA NA NA NA SCCPDH 39940 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 246862505 246862699 246862612 Y SCCPDH SCCPDH NA NA NA NA SCCPDH 22650 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 246948292 246948613 246948340 Y NA NA NA NA NA NA SCCPDH 62943 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 247035132 247035504 247035470 Y CNST,ZNF669,AHCTF1 NA NA NA NA NA AHCTF1 57776 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr1 247093396 247093478 247093437 Y NA AHCTF1 NA NA NA NA AHCTF1 116 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 247206107 247206337 247206222 Y NA ZNF695,ZNF670 NA NA NA NA ZNF670 33776 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr1 247524183 247524555 247524546 Y NLRP3,NLRP3 ZNF496 ZNF496,AHCTF1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF496 31035 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 249117788 249118228 249118121 Y SH3BP5L MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692 NA NA NA NA MIR3124 348 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr1 249157308 249157673 249157562 Y OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692 MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2 NA NA NA NA ZNF692 5965 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr10 361512 361916 361783 Y NA NA NA NA NA NA ZMYND11 183107 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 384217 384634 384602 Y NA NA NA NA NA NA ZMYND11 205812 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 733208 733342 733335 Y NA DIP2C NA NA NA NA DIP2C 341 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 830510 830663 830589 Y NA NA DIP2C MCF7 ChIA-PET 22265404 DIP2C 96827 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr10 897995 898234 898074 Y NA NA NA NA NA NA LARP4B 77330 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 958233 958518 958406 Y NA LARP4B DIP2C,GTPBP4,LARP4B IMR90 Hi-C 24141950 LARP4B 17046 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 1100843 1101035 1100898 Y NA IDI1,WDR37 NA NA NA NA WDR37 7365 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 1112826 1113160 1112997 Y WDR37 IDI1,WDR37 NA NA NA NA WDR37 19348 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 1240958 1241356 1241181 Y NA NA NA NA NA NA WDR37 147480 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 1335739 1336079 1335908 Y NA NA NA NA NA NA WDR37 242261 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.86094363479473 chr10 1336083 1336245 1336171 Y ADARB2 NA NA NA NA NA WDR37 242605 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.27448666474912 chr10 1374654 1374709 1374682 Y NA NA NA NA NA NA WDR37 281176 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 1390281 1390451 1390366 Y ADARB2 NA NA NA NA NA WDR37 296803 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 1541138 1541906 1541672 Y WDR37,ADARB2 NA NA NA NA NA ADARB2 235764 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr10 1698787 1699160 1698974 Y NA NA NA NA NA NA ADARB2 78510 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr10 3145163 3145536 3145437 Y PFKP PFKP NA NA NA NA PFKP 38638 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 3438252 3438532 3438372 Y NA NA LOC338588,LOC100216001 IMR90 Hi-C 24141950 PITRM1 225249 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 3441336 3441600 3441518 Y NA NA LOC338588,LOC100216001,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 PITRM1 228333 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr10 3598970 3599136 3599051 Y KLF6 NA NA NA NA NA KLF6 226337 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr10 3937227 3937631 3937383 Y NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 111754 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 4163748 4164495 4164134 Y KLF6 NA NA NA NA NA LINC00702 119609 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 4283808 4284356 4284092 Y NA NA KLF6,LOC100216001,LOC338588 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00702 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 4991516 4991911 4991654 Y NA NA tAKR,AKR1C2,AKR1C3,UCN3,NET1,TUBAL3 IMR90 Hi-C 24141950 AKR1C1 58720 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 5783071 5783414 5783247 Y NA NA GDI2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM208B 58270 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 6206285 6206560 6206485 Y NA PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 21404 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 6234464 6234853 6234702 Y NA PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 49583 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 6243287 6243821 6243659 Y PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 58406 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 6245814 6246792 6246043 Y PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 60933 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 8077253 8077826 8077468 Y ITIH5 RP11-379F12.4,GATA3 NA NA NA NA RP11-379F12.4 13678 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 8088862 8088888 8088874 Y ITIH5,GATA3 RP11-379F12.4,GATA3 NA NA NA NA RP11-379F12.4 2616 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr10 8089680 8090146 8089800 Y ITIH5 RP11-379F12.4,GATA3 NA NA NA NA RP11-379F12.4 1358 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr10 8103293 8103465 8103334 Y TAF3,GATA3 RP11-379F12.4,GATA3 NA NA NA NA GATA3 9726 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr10 8103619 8104019 8103811 Y KIN,TAF3,GATA3 RP11-379F12.4,GATA3 NA NA NA NA GATA3 10052 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr10 8374227 8374893 8374382 Y GATA3 NA NA NA NA NA GATA3 280660 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr10 8662161 8662543 8662250 Y NA NA NA NA NA NA GATA3 568594 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 9281291 9281530 9281414 Y NA NA FLJ45983,GATA3,TAF3 IMR90 Hi-C 24141950 GATA3 1187724 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr10 12283843 12284276 12283949 Y UPF2,UPF2,SEC61A2,CAMK1D CDC123,NUDT5 NA NA NA NA NUDT5 47700 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 12306536 12306777 12306588 Y UPF2,UPF2,SEC61A2,CAMK1D NA NA NA NA NA NUDT5 70393 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr10 12455599 12455959 12455812 Y SEC61A2,CAMK1D NA NA NA NA NA CAMK1D 66118 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 12527553 12527985 12527598 Y CAMK1D NA NA NA NA NA CAMK1D 138072 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 12543456 12543849 12543654 Y SEC61A2 NA NA NA NA NA CAMK1D 153975 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 12751328 12751588 12751334 Y CAMK1D NA NA NA NA NA CAMK1D 361847 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 13390886 13391219 13391148 Y NA PHYH,SEPHS1 NA NA NA NA SEPHS1 2589 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 13391797 13392252 13392084 Y SEPHS1 PHYH,SEPHS1 NA NA NA NA SEPHS1 3500 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr10 13800483 13800712 13800626 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 173556 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 14099317 14099548 14099433 Y NA NA NA NA NA NA FRMD4A 402593 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 14624029 14624329 14624184 Y DCLRE1C NA NA NA NA NA FRMD4A 121888 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr10 14641847 14641963 14641950 Y NA NA NA NA NA NA FRMD4A 139706 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr10 14955590 14955884 14955736 Y HSPA14,SUV39H2,SUV39H2,SUV39H2 SUV39H2,DCLRE1C,MEIG1 NA NA NA NA SUV39H2 36771 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr10 15157630 15158203 15157954 Y NA ACBD7,RPP38,C10orf111 NA NA NA NA C10orf111 20312 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 15178441 15178844 15178745 Y NA ACBD7,RPP38,C10orf111,NMT2 NA NA NA NA NMT2 29848 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 15191044 15191371 15191092 Y MEIG1,NMT2,C10orf111 NMT2 NA NA NA NA NMT2 17321 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 15250805 15251188 15250997 Y CDNF,MEIG1,C10orf111 NMT2 NA NA NA NA NMT2 42113 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 15278281 15278573 15278465 Y NA NA NA NA NA NA NMT2 69589 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 15300658 15300993 15300826 Y ACBD7,FAM171A1 NA NA NA NA NA NMT2 91966 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 16802586 16802595 16802591 Y NA NA NA NA NA NA RSU1 54932 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 16946653 16946941 16946801 Y NA NA NA NA NA NA RSU1 89126 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 17215777 17215793 17215785 Y NA TRDMT1 NA NA NA NA TRDMT1 26260 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 17264441 17264580 17264545 Y VIM TRDMT1,VIM,RP11-124N14.3 VIM,CUBN,RSU1,TRDMT1 IMR90 Hi-C 24141950 VIM 3678 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 17280857 17281170 17281014 Y TRDMT1,VIM TRDMT1,VIM,RP11-124N14.3 NA NA NA NA RP11-124N14.3 6025 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 17755362 17755412 17755398 Y SLC39A12 NA NA NA NA NA STAM 71238 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 18860767 18861138 18861132 Y NA RP11-499P20.2 NA NA NA NA RP11-499P20.2 28187 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 20249117 20249390 20249254 Y NA NA NA NA NA NA PLXDC2 145949 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 21809167 21809536 21809441 Y C10orf114,C10orf140 MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 11558 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr10 21816029 21816444 21816223 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 4650 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr10 22039558 22039808 22039651 Y MLLT10,MLLT10 NA NA NA NA NA RN7SKP37 180264 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 22535612 22535856 22535691 Y NA NA ARMC3,LOC100130992 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COMMD3 67047 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 22540192 22540343 22540282 Y DNAJC1,BMI1 NA NA NA NA NA COMMD3 62560 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 22555688 22555894 22555791 Y NA COMMD3 NA NA NA NA COMMD3 47009 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 22725331 22726270 22725901 Y NA NA NA NA NA NA SPAG6 92932 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 4.23881605703244 chr10 22726811 22727194 22727116 Y NA NA NA NA NA NA SPAG6 94412 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 22907073 22907416 22907362 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 94068 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 22932994 22933290 22933224 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 68194 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 24523625 24523951 24523689 Y KIAA1217 NA NA NA NA NA ARHGAP21 486646 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 25155940 25156492 25156271 Y ARHGAP21 NA NA NA NA NA PRTFDC1 83041 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 25240272 25240935 25240716 Y ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1 PRTFDC1 NA NA NA NA PRTFDC1 739 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr10 25815030 25815346 25815189 Y NA NA NA NA NA NA GPR158 353039 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 25868086 25868454 25868092 Y NA NA NA NA NA NA GPR158 406095 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 27419520 27419901 27419745 Y NA ANKRD26,MASTL,YME1L1 NA NA NA NA MASTL 21852 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr10 27531769 27532240 27532024 Y ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5 ACBD5 NA NA NA NA ACBD5 2710 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.34401484735175 chr10 27961311 27961466 27961388 Y NA NA NA NA NA NA RAB18 170114 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 29254247 29254334 29254291 Y NA NA BAMBI,LYZL1 IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 289976 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 29879091 29879350 29879257 Y SVIL NA NA NA NA NA PTCHD3P1 182760 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 29948331 29948643 29948337 Y NA NA NA NA NA NA PTCHD3P1 252000 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 29970673 29971027 29970896 Y SVIL NA NA NA NA NA PTCHD3P1 274342 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 29980945 29980999 29980955 Y NA NA NA NA NA NA PTCHD3P1 284614 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 30420005 30420278 30420142 Y NA NA MTPAP IMR90 Hi-C 24141950 MTPAP 241099 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 30441068 30441357 30441150 Y NA NA MTPAP,KIAA1462 IMR90 Hi-C 24141950 MTPAP 220020 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 30736122 30736481 30736327 Y MAP3K8 MAP3K8 NA NA NA NA MAP3K8 15256 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 30742798 30743130 30743073 Y NA MAP3K8 NA NA NA NA MAP3K8 21932 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 31073492 31073855 31073655 Y NA NA ARHGAP12,ZEB1-AS1,ZEB1,ZNF438 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 245011 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 31093694 31093701 31093698 Y NA NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 225165 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 31204241 31204373 31204282 Y MAP3K8,ZNF438,ZNF438 NA NA NA NA NA ZNF438 114493 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 31422679 31422989 31422772 Y ZNF438,ZNF438 NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 103813 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr10 31892273 31892723 31892643 Y NA NA ZEB1 IMR90 Hi-C 24141950 ZEB1-AS1 284897 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr10 32048872 32049424 32049213 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 166318 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr10 32579146 32579267 32579207 Y NA NA NA NA NA NA EPC1 86459 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 32598255 32598442 32598434 Y NA NA NA NA NA NA EPC1 67284 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 32607439 32608014 32607606 Y EPC1 NA NA NA NA NA EPC1 57712 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 32621222 32621521 32621374 Y ARHGAP12,CCDC7,C10orf68,EPC1 EPC1 NA NA NA NA EPC1 44205 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr10 32735821 32736068 32735865 Y NA CCDC7 C10orf68 MCF7 ChIA-PET 22265404 CCDC7 2753 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 33250851 33251304 33251058 Y NA ITGB1 NA NA NA NA ITGB1 41416 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 33269452 33269916 33269602 Y C10orf68 ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 22804 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr10 33272272 33272613 33272373 Y ITGB1,ITGB1,ITGB1 ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 20107 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 34039422 34039739 34039581 Y NA NA NA NA NA NA NRP1 416232 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 34569605 34569879 34569742 Y NA NA NA NA NA NA RP11-8L18.3 381150 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 34815006 34815362 34815018 Y NA NA NA NA NA NA RP11-8L18.3 135667 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 34907489 34907514 34907502 Y NA RP11-8L18.3 NA NA NA NA RP11-8L18.3 43515 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 35070002 35070125 35070067 Y CREM PARD3 NA NA NA NA PARD3 32128 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 35080769 35081009 35080876 Y NA PARD3 NA NA NA NA PARD3 21244 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 35102675 35103059 35102787 Y NA PARD3 NA NA NA NA PARD3 422 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 35195075 35195256 35195166 Y NA SS18L2P1 PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 SS18L2P1 32937 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 35425292 35425645 35425387 Y CUL2,CUL2,CCNY,CREM,CREM CUL2,CREM NA NA NA NA CREM 11573 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 35431185 35431238 35431212 Y NA CREM NA NA NA NA CREM 17466 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 35438214 35438795 35438573 Y CREM,CREM CREM NA NA NA NA CREM 24495 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 35668149 35668482 35668241 Y CREM,CREM NA NA NA NA NA CCNY 134196 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 37778060 37778402 37778231 Y NA NA NA NA NA NA RP11-162G10.1 329508 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 38264185 38264489 38264470 Y ZNF37A,ZNF248,ZNF25 ZNF25,ZNF33A NA NA NA NA ZNF25 624 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr10 42389884 42390116 42390007 Y NA NA NA NA NA NA CCNYL2 575572 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 42737855 42738010 42737875 Y NA NA NA NA NA NA CCNYL2 227678 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 42800348 42800675 42800512 Y NA NA NA NA NA NA CCNYL2 165013 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 43633157 43633403 43633253 Y RASGEF1A CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 1223 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr10 43950893 43951349 43951098 Y NA HNRNPF,RP11-517P14.2 NA NA NA NA RP11-517P14.2 36707 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr10 44046358 44046416 44046387 Y NA ZNF239 NA NA NA NA ZNF239 21650 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 44185196 44185271 44185205 Y NA ZNF32 NA NA NA NA ZNF32 42892 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 44185624 44185942 44185694 Y NA ZNF32 NA NA NA NA ZNF32 43320 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 45374285 45374680 45374305 Y NA NA NA NA NA NA RASSF4 78175 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr10 45375087 45375420 45375335 Y NA NA NA NA NA NA RASSF4 77435 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 45441757 45442014 45441853 Y ALOX5 RASSF4,C10orf10 NA NA NA NA RASSF4 10841 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 45445885 45445945 45445917 Y RASSF4 RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25 NA NA NA NA RASSF4 6910 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 45470476 45470795 45470517 Y NA RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25 NA NA NA NA C10orf10 1463 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 45914844 45915133 45915015 Y NA NA NA NA NA NA MARCH8 173221 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr10 47149103 47149407 47149372 Y NA NA NA NA NA NA SYT15 179703 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 48323344 48323752 48323648 Y NA ZNF488 SYT15,GPRIN2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF488 29272 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 49745028 49745223 49745126 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP22 117087 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 49784925 49785316 49785121 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP22 76994 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr10 49811574 49811696 49811632 Y ARHGAP22 NA NA NA NA NA ARHGAP22 50614 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 49847565 49847971 49847911 Y NA ARHGAP22 NA NA NA NA ARHGAP22 14339 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 50536610 50536839 50536655 Y NA NA NA NA NA NA DRGX 64658 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 50604736 50605039 50604888 Y DRGX DRGX NA NA NA NA DRGX 3239 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 50606394 50606776 50606708 Y NA DRGX NA NA NA NA DRGX 4897 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 51045236 51045418 51045327 Y NA NA NA NA NA NA OGDHL 76811 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 51574472 51574922 51574693 Y FAM21A,NCOA4,NCOA4 RP11-109G10.2,NCOA4 NA NA NA NA NCOA4 11364 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 52037840 52038115 52037944 Y SGMS1 NA SGMS1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM21A 212192 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 52079574 52079882 52079666 Y NA NA NA NA NA NA FAM21A 253926 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 52217733 52218081 52217894 Y NA NA NA NA NA NA SGMS1 164842 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 52329586 52329716 52329651 Y NA NA NA NA NA NA SGMS1 53207 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 52385542 52385659 52385602 Y NA SGMS1 NA NA NA NA SGMS1 2619 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 53930569 53930919 53930744 Y NA NA NA NA NA NA DKK1 141137 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 54367095 54367120 54367106 Y NA NA NA NA NA NA DKK1 295039 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 54471417 54471775 54471523 Y NA NA NA NA NA NA DKK1 399361 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 59096410 59096633 59096523 Y NA NA NA NA NA NA IPMK 929061 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 60245742 60245756 60245749 Y NA BICC1 BICC1 IMR90 Hi-C 24141950 BICC1 25144 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 60422217 60422354 60422286 Y NA NA NA NA NA NA BICC1 151317 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 61019605 61019954 61019626 Y PHYHIPL,PHYHIPL,SLC16A9,FAM13C,FAM13C NA NA NA NA NA PHYHIPL 85255 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr10 61021646 61021734 61021690 Y PHYHIPL,PHYHIPL,SLC16A9,FAM13C,FAM13C NA NA NA NA NA PHYHIPL 87296 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 61024836 61025127 61024964 Y PHYHIPL,PHYHIPL,SLC16A9,FAM13C,FAM13C NA NA NA NA NA PHYHIPL 90486 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 61632760 61633170 61633000 Y NA CCDC6 NA NA NA NA CCDC6 31244 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr10 61645173 61645419 61645305 Y NA CCDC6 NA NA NA NA CCDC6 18995 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 61665210 61665415 61665365 Y NA CCDC6 NA NA NA NA CCDC6 796 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr10 62111952 62112088 62112018 Y ANK3,ANK3 NA NA NA NA NA ANK3 379160 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 62330469 62330833 62330827 Y ANK3 NA NA NA NA NA ANK3 160415 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 63663540 63663817 63663641 Y ARID5B ARID5B NA NA NA NA ARID5B 4481 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 63979384 63979550 63979547 Y NA RTKN2 NA NA NA NA RTKN2 46916 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 64146249 64146339 64146308 Y ARID5B,EGR2 ZNF365 NA NA NA NA ZNF365 14298 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 64532574 64532769 64532681 Y NA ADO ZNF365,ADO IMR90 Hi-C 24141950 ADO 29747 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 65016713 65017097 65017085 Y NA NA NA NA NA NA NRBF2 125663 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 65078433 65078736 65078637 Y NA NA NA NA NA NA JMJD1C 144986 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 65097775 65098183 65098051 Y NA NA NA NA NA NA JMJD1C 125539 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 65149197 65149230 65149214 Y NA NA NA NA NA NA JMJD1C 74492 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 65196810 65197156 65196994 Y NA JMJD1C NA NA NA NA JMJD1C 26566 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 65269177 65269730 65269542 Y NA JMJD1C,REEP3 REEP3,JMJD1C,LOC84989 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 REEP3 9393 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 65274637 65275000 65274913 Y NA REEP3 JMJD1C,REEP3 IMR90 Hi-C 24141950 REEP3 4123 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 65282188 65282459 65282345 Y JMJD1C,JMJD1C REEP3 NA NA NA NA REEP3 3065 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr10 65389747 65390882 65390384 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 110624 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.17110090726052 chr10 65930110 65930546 65930307 Y NA NA NA NA NA NA RP11-170M17.2 269105 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 68710552 68710810 68710582 Y LRRTM3 NA NA NA NA NA DNAJC12 885114 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 68753444 68753641 68753546 Y LRRTM3 NA NA NA NA NA DNAJC12 842283 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 69523880 69524330 69524240 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC12 71594 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 69609160 69609390 69609211 Y NA DNAJC12,SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 DNAJC12 13236 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.24062908986315 chr10 69658139 69658146 69658142 Y HNRNPH3,SIRT1,SIRT1 SIRT1 HERC4 IMR90 Hi-C 24141950 SIRT1 15712 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 69778500 69778679 69778642 Y NA NA NA NA NA NA HERC4 54426 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 69796463 69796828 69796573 Y HERC4 HERC4 NA NA NA NA HERC4 36277 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr10 69822197 69822546 69822385 Y NA HERC4 NA NA NA NA HERC4 10559 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 70088080 70088572 70088236 Y SIRT1,PBLD,HNRNPH3 HNRNPH3,PBLD NA NA NA NA HNRNPH3 359 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 71840822 71841222 71841056 Y NA H2AFY2,AIFM2 NA NA NA NA H2AFY2 30270 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 71928097 71928630 71928606 Y NA AIFM2,TYSND1 TYSND1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SAR1A 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 71984000 71984297 71984282 Y NA PPA1 NA NA NA NA PPA1 7370 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 72253805 72253950 72253868 Y NA NA NA NA NA NA EIF4EBP2 91670 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 72593001 72593337 72593129 Y SGPL1 SGPL1 NA NA NA NA SGPL1 19284 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 72973788 72974249 72973953 Y UNC5B UNC5B NA NA NA NA UNC5B 3461 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr10 72992169 72992442 72992307 Y C10orf105 UNC5B NA NA NA NA UNC5B 21842 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 73026177 73026397 73026262 Y UNC5B NA NA NA NA NA SLC29A3 50618 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 73039102 73039294 73039207 Y NA SLC29A3 NA NA NA NA SLC29A3 37721 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr10 73197630 73197701 73197666 Y NA CDH23 NA NA NA NA CDH23 42939 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 73487625 73488016 73487850 Y CDH23,C10orf54,C10orf105 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 43239 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 73568339 73568950 73568859 Y NA C10orf54,PSAP NA NA NA NA C10orf54 37084 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 73595852 73596345 73596141 Y C10orf54,PSAP PSAP CDH23 IMR90 Hi-C 24141950 PSAP 12781 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr10 73640827 73641007 73640917 Y DNAJB12,C10orf54,PSAP PSAP PSAP,SPOCK2,ASCC1,ANAPC16,CDH23,CHST3,DNAJB12 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSAP 31701 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 73744363 73744592 73744410 Y NA CHST3 NA NA NA NA CHST3 22240 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 73887320 73887439 73887380 Y NA SPOCK2 NA NA NA NA SPOCK2 40530 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 73946489 73946835 73946688 Y NA ANAPC16,ASCC1 NA NA NA NA ANAPC16 26952 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 73986513 73986881 73986533 Y C10orf105,C10orf54,CDH23,CDH23 ANAPC16,ASCC1,DDIT4 NA NA NA NA ASCC1 11621 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr10 74014911 74015029 74015003 Y NA ANAPC16,ASCC1,DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 16649 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 74019515 74019657 74019544 Y NA ANAPC16,ASCC1,DDIT4 DNAJB12 K562 ChIA-PET 22265404 DDIT4 12021 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 74032298 74032943 74032475 Y NA DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 620 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 74055686 74056073 74056016 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 24008 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 74056833 74058104 74057179 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 25155 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr10 74079380 74080359 74079580 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 32629 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr10 74080430 74080993 74080646 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 31995 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr10 74091661 74092150 74091920 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DNAJB12 NA NA NA NA DNAJB12 20838 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr10 74385233 74385288 74385261 Y NA MICU1,HMGN2P34 NA NA NA NA MICU1 1334 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 74925047 74925060 74925055 Y ANXA7,ECD FAM149B1,ECD NA NA NA NA FAM149B1 864 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr10 74990824 74990933 74990931 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA DNAJC9 15687 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr10 75004761 75005017 75004932 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA DNAJC9 1603 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 75408900 75409185 75408963 Y CAMK2G,TTC18,PPP3CB,USP54 AGAP5 NA NA NA NA AGAP5 46454 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr10 75768391 75768772 75768419 Y NA VCL NA NA NA NA VCL 12519 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 76682814 76683108 76682864 Y NA NA NA NA NA NA KAT6B 99474 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 77155063 77155414 77155221 Y NA ZNF503 NA NA NA NA ZNF503 4250 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 77164585 77164731 77164659 Y ZNF503 ZNF503 NA NA NA NA ZNF503 4921 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 78801505 78801775 78801560 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 594578 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 78886447 78886645 78886557 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 509708 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 78923836 78924098 78923933 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 472255 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 78974815 78975138 78974939 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA KCNMA1 421215 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 79561522 79561805 79561686 Y NA NA NA NA NA NA DLG5 122573 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 79636555 79636603 79636579 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 47775 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 79637463 79637788 79637654 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 46590 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 79685177 79685609 79685373 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 799 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr10 79731077 79731252 79731165 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 46699 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 80626499 80626705 80626607 Y NA NA LOC283050,ZMIZ1,RPS24,LOC100132987,POLR3A IMR90 Hi-C 24141950 ZMIZ1 200087 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 80732492 80734123 80733460 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 92669 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr10 80860192 80860276 80860234 Y NA ZMIZ1 NA NA NA NA ZMIZ1 33400 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 80917330 80917751 80917473 Y NA NA NA NA NA NA ZMIZ1 90538 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 80981088 80981226 80981157 Y NA NA NA NA NA NA PPIF 123999 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr10 80983096 80983503 80983267 Y NA NA NA NA NA NA PPIF 121722 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 80990068 80990387 80990161 Y NA NA NA NA NA NA PPIF 114838 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 80998898 81000011 80999247 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 105214 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 81001444 81002226 81001825 Y NA NA NA NA NA NA PPIF 102999 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 81028676 81029041 81028720 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 76184 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 81030651 81030992 81030820 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 74233 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr10 81034555 81034743 81034649 Y ZMIZ1 NA NA NA NA NA PPIF 70482 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 81048115 81048599 81048253 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 56626 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 81077317 81078576 81077648 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 26649 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 81080868 81081434 81081104 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 23791 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 81085771 81086240 81085963 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 18985 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 81959510 81960003 81959818 Y TSPAN14,SH2D4B,ANXA11 ANXA11,EIF5AP4 NA NA NA NA ANXA11 3325 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 81962798 81963579 81963388 Y SH2D4B,ANXA11 EIF5AP4 NA NA NA NA ANXA11 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 82176099 82176325 82176238 Y C10orf58 FAM213A,TSPAN14 NA NA NA NA FAM213A 10514 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 82214819 82214901 82214871 Y TSPAN14 FAM213A,TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 2897 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 83632793 83633001 83632946 Y NA NRG3 NA NA NA NA NRG3 69 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 83724255 83724618 83724338 Y NRG3,NRG3 NA NA NA NA NA NRG3 91185 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 83786101 83786374 83786143 Y NA NA NA NA NA NA NRG3 153031 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 84158355 84158705 84158530 Y NA NA NA NA NA NA NRG3 525285 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 84649662 84649982 84649782 Y NA NA NA NA NA NA NRG3 1016592 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 86093705 86094297 86093848 Y NA NA NA NA NA NA CDHR1 141295 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 87752944 87753321 87753210 Y NA NA NA NA NA NA GRID1 370929 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 88004394 88004782 88004588 Y NA NA NA NA NA NA GRID1 119468 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr10 88160011 88160294 88160175 Y NA GRID1 WAPAL MCF7 ChIA-PET 22265404 GRID1 35761 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 88470805 88471213 88471023 Y NA BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 43194 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr10 88517208 88517667 88517486 Y GLUD1,BMPR1A BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 2801 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 88571811 88572082 88571947 Y NA NA NA NA NA NA BMPR1A 57404 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 89508472 89508835 89508628 Y NA NA NA NA NA NA CFL1P1 66850 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 90657069 90657527 90657362 Y NA STAMBPL1 NA NA NA NA STAMBPL1 19578 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 90689067 90689322 90689158 Y NA NA NA NA NA NA STAMBPL1 51576 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 90711253 90711764 90711560 Y LIPF,CH25H,ACTA2 FAS,ACTA2 NA NA NA NA FAS 36650 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr10 91034775 91034961 91034861 Y NA RP11-149I23.3,IFIT2 IFIT1B,IFIT2,IFIT3,IFIT1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-149I23.3 6561 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 91127158 91127607 91127378 Y NA IFIT1,LIPA,IFIT5 LIPA,IFIT2,IFIT1B,SLC16A12,PANK1 IMR90 Hi-C 24141950 IFIT1 22696 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 91462035 91462111 91462091 Y NA KIF20B NA NA NA NA KIF20B 2668 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 93432082 93432315 93432239 Y NA PPP1R3C LOC100188947,HECTD2,TNKS2,RPP30,PPP1R3C IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R3C 41271 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 93647022 93647304 93647153 Y FGFBP3 FGFBP3,BTAF1 NA NA NA NA FGFBP3 19936 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr10 93991232 93991452 93991342 Y NA NA NA NA NA NA CPEB3 57392 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 94351391 94351691 94351485 Y CPEB3 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 348 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 94459466 94459797 94459609 Y HHEX HHEX NA NA NA NA HHEX 13521 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 94516915 94517155 94517045 Y HHEX,EXOC6 NA EXOC6,KIF11,HHEX IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HHEX 70970 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 94831659 94831948 94831694 Y CYP26A1,CYP26A1 NA NA NA NA NA XRCC6P1 135436 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 95766976 95767368 95767096 Y NA PLCE1 NA NA NA NA PLCE1 15230 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 96943397 96943661 96943560 Y SORBS1,SORBS1 RP11-310E22.4 C10orf129,SORBS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-310E22.4 45240 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr10 97089881 97090244 97090218 Y CYP2C9,CYP2C8,SORBS1,SORBS1 PDLIM1 PDLIM1 IMR90 Hi-C 24141950 PDLIM1 41100 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 97302511 97302656 97302624 Y NA SORBS1 NA NA NA NA SORBS1 16515 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 97313430 97313789 97313690 Y NA SORBS1 NA NA NA NA SORBS1 5382 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 97319295 97319590 97319525 Y C10orf129,SORBS1,SORBS1 SORBS1 NA NA NA NA SORBS1 124 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 97640254 97640658 97640438 Y ENTPD1,ENTPD1 NA NA NA NA NA RP11-248J23.5 117342 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 97809134 97809259 97809196 Y NA CCNJ,ENTPD1-AS1 NA NA NA NA CCNJ 7983 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr10 97809290 97809583 97809571 Y NA CCNJ,ENTPD1-AS1 NA NA NA NA CCNJ 8139 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 98308552 98308827 98308687 Y LCOR,C10orf12,ZNF518A,PIK3AP1,TM9SF3 NPM1P26,TM9SF3 NA NA NA NA NPM1P26 9115 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 98956083 98956405 98956104 Y C10orf62 SLIT1 NA NA NA NA SLIT1 12406 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 99401742 99402052 99401841 Y C10orf28,RRP12,ZFYVE27,PI4K2A MORN4,AVPI1 NA NA NA NA MORN4 10398 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 100020230 100020246 100020237 Y NA NA NA NA NA NA PYROXD2 152695 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 100153138 100153356 100153248 Y NA PYROXD2 NA NA NA NA PYROXD2 19585 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 101381465 101381554 101381515 Y NA SLC25A28,ENTPD7 NA NA NA NA SLC25A28 3099 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 101417166 101417530 101417347 Y NA SLC25A28,CUTC NA NA NA NA ENTPD7 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 101475394 101475766 101475528 Y NA CUTC,COX15 NA NA NA NA COX15 14091 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr10 101539519 101539906 101539726 Y NA COX15 NA NA NA NA COX15 49662 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 101908352 101908679 101908530 Y DNMBP,CHUK,BLOC1S2,BLOC1S2,ERLIN1,ERLIN1 ERLIN1 NA NA NA NA ERLIN1 37412 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 102130783 102131327 102130955 Y CWF19L1 SCD,LINC00263 NA NA NA NA LINC00263 45 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 102284617 102284981 102284927 Y NA HIF1AN,SEC31B,NDUFB8 NA NA NA NA HIF1AN 1848 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 102284995 102285353 102285150 Y NA HIF1AN,SEC31B,NDUFB8 NA NA NA NA HIF1AN 1476 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 102792815 102793017 102792917 Y NA C10orf2,MRPL43,LZTS2,PDZD7,SFXN3,KAZALD1 NA NA NA NA SFXN3 3824 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr10 103124623 103124787 103124739 Y FBXW4 BTRC DPCD,POLL IMR90 Hi-C 24141950 BTRC 12803 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 103453403 103453880 103453587 Y LDB1,BTRC,MGEA5 FBXW4 NA NA NA NA FBXW4 351 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 103514539 103514868 103514704 Y NA NPM3 NA NA NA NA NPM3 26302 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 103538980 103539052 103538998 Y NA NPM3,MGEA5 NA NA NA NA NPM3 2118 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 103591495 103591519 103591507 Y BTRC,KCNIP2,KCNIP2 MGEA5,KCNIP2 NA NA NA NA KCNIP2 10158 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 103600514 103600739 103600526 Y NA MGEA5,KCNIP2 NA NA NA NA KCNIP2 938 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 103876632 103876931 103876782 Y NA LDB1,PPRC1,NOLC1 NA NA NA NA LDB1 1279 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 103877464 103877788 103877718 Y MGEA5,TMEM180,SUFU,PSD,FBXL15,C10orf76,LDB1 LDB1,PPRC1,NOLC1 NA NA NA NA LDB1 422 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.96432939228333 chr10 103878662 103879287 103878814 Y NA LDB1,PPRC1,NOLC1 NA NA NA NA LDB1 452 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 103937930 103938271 103938070 Y NA PPRC1,NOLC1 NA NA NA NA NOLC1 27997 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 104388023 104388450 104388178 Y NA TRIM8 NA NA NA NA TRIM8 13803 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.34401484735175 chr10 104406463 104406725 104406695 Y NFKB2,NFKB2,TRIM8 TRIM8 NA NA NA NA TRIM8 4210 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 104473144 104473537 104473339 Y NA ARL3,SFXN2 NA NA NA NA SFXN2 849 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr10 105448441 105448500 105448481 Y NA NA NA NA NA NA OBFC1 227463 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 105452274 105452407 105452303 Y NA NA NA NA NA NA OBFC1 223556 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr10 105456300 105456542 105456434 Y NA NA NA NA NA NA OBFC1 219421 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 105519063 105519154 105519109 Y NA NA NA NA NA NA OBFC1 156809 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 105667581 105667905 105667745 Y NA OBFC1 NA NA NA NA OBFC1 8058 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 105667994 105668449 105668210 Y GSTO1,GSTO1,SLK OBFC1 NA NA NA NA OBFC1 7514 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 106065321 106065564 106065443 Y NA MIR4482-1,GSTO2,ITPRIP NA NA NA NA ITPRIP 30598 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 106065731 106065880 106065781 Y NA MIR4482-1,GSTO2,ITPRIP NA NA NA NA ITPRIP 30282 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 3.72188726958946 chr10 106082205 106082621 106082398 Y SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147 ITPRIP NA NA NA NA ITPRIP 13541 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 106087819 106088091 106087906 Y SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147 ITPRIP NA NA NA NA ITPRIP 8071 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 106096287 106096870 106096611 Y SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147 ITPRIP ITPRIP,GSTO1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ITPRIP 125 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 108152037 108152234 108152222 Y NA NA NA NA NA NA SORCS1 770058 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 108349452 108349469 108349463 Y NA NA NA NA NA NA SORCS1 572823 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 108496360 108496741 108496551 Y SORCS1 NA NA NA NA NA SORCS1 425551 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr10 108512830 108513223 108513027 Y NA NA NA NA NA NA SORCS1 409069 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 108757582 108757742 108757678 Y NA NA NA NA NA NA SORCS1 164550 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 111725333 111725444 111725334 Y NA XPNPEP1,ADD3 NA NA NA NA ADD3 28682 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 111841715 111842020 111841846 Y ADD3,SMNDC1,MXI1 NA NA NA NA NA ADD3 87589 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 111981639 111982026 111981734 Y ADD3,MXI1,MXI1 MXI1 SMNDC1 IMR90 Hi-C 24141950 MXI1 16276 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 112010766 112010816 112010791 Y NA MXI1 SMNDC1 IMR90 Hi-C 24141950 MXI1 45403 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 112051912 112052490 112052119 Y ADD3,MXI1 SMNDC1 NA NA NA NA SMNDC1 10219 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 112080196 112080214 112080204 Y NA SMNDC1 DUSP5,SMC3,RBM20 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 17487 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 112123790 112124003 112123953 Y MXI1 NA SMC3,DUSP5,RBM20 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 61081 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 112259301 112259712 112259445 Y MXI1,PDCD4,DUSP5 DUSP5 NA NA NA NA DUSP5 3705 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 112272592 112272848 112272747 Y SHOC2,BBIP1,BBIP1,DUSP5 DUSP5 NA NA NA NA DUSP5 16996 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 112401121 112401469 112401220 Y SMC3,RBM20 RBM20 NA NA NA NA RBM20 686 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 112402938 112403137 112402952 Y NA RBM20 NA NA NA NA RBM20 783 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 112432258 112432673 112432308 Y PDCD4 RBM20 PDCD4,LOC282997 IMR90 Hi-C 24141950 RBM20 30103 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 112510754 112511032 112510934 Y ADRA2A NA NA NA NA NA RBM20 108599 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 112514562 112514859 112514810 Y NA NA NA NA NA NA RBM20 112407 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 112582466 112582715 112582708 Y SMC3,ADRA2A PDCD4,PDCD4-AS1 NA NA NA NA PDCD4 46850 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 112668159 112668425 112668161 Y NA PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 8607 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 112668861 112669237 112669049 Y PDCD4,SHOC2,BBIP1,BBIP1 PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 7795 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 112670931 112671385 112671330 Y NA PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 5647 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr10 114531236 114531374 114531260 Y NA NA NA NA NA NA TCF7L2 176635 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 114709018 114709405 114709296 Y TCF7L2 TCF7L2 NA NA NA NA TCF7L2 1009 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 114853789 114854299 114853993 Y TCF7L2 NA NA NA NA NA TCF7L2 145780 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 115223609 115223817 115223724 Y NA NA VTI1A IMR90 Hi-C 24141950 CASP7 213125 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 116255200 116255589 116255576 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1L2 92685 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 117021659 117021668 117021663 Y ATRNL1 NA NA NA NA NA ATRNL1 170535 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 117425699 117425945 117425810 Y NA NA NA NA NA NA ATRNL1 574575 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 117502747 117502760 117502754 Y NA NA NA NA NA NA ATRNL1 651623 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 118894357 118894681 118894572 Y VAX1 KIAA1598 NA NA NA NA KIAA1598 10260 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 118922718 118922822 118922754 Y VAX1 KIAA1598 NA NA NA NA KIAA1598 38621 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 119019345 119019394 119019369 Y KCNK18,SLC18A2 NA NA NA NA NA PDZD8 113584 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 119046334 119046783 119046648 Y NA NA NA NA NA NA PDZD8 86195 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 119107774 119108099 119107936 Y NA PDZD8 NA NA NA NA PDZD8 24879 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 119113606 119113787 119113696 Y NA PDZD8 NA NA NA NA PDZD8 19191 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 119256221 119256343 119256282 Y KIAA1598,KCNK18,EMX2 NA NA NA NA NA PDZD8 123243 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 119686098 119686357 119686270 Y NA NA CASC2 IMR90 Hi-C 24141950 CASC2 117433 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 120072477 120072945 120072874 Y NA FAM204A NA NA NA NA FAM204A 26895 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 120591750 120591972 120591861 Y NA NA C10orf46 IMR90 Hi-C 24141950 NANOS1 195256 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 120968752 120969030 120968753 Y EIF3A,GRK5 SFXN4,PRDX3,GRK5 NA NA NA NA GRK5 3651 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 121031141 121031480 121031339 Y GRK5 NA NA NA NA NA GRK5 66040 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 121173391 121173574 121173483 Y NA NA NA NA NA NA RGS10 126646 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 121452837 121453189 121453108 Y NA BAG3,INPP5F NA NA NA NA INPP5F 30420 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 121829686 121829950 121829715 Y NA NA NA NA NA NA NACAP2 74465 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr10 123539603 123539774 123539689 Y TACC2,ATE1 NA NA NA NA NA ATE1-AS1 146053 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 123900074 123900243 123900143 Y NA NA NA NA NA NA TACC2 153385 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 123914446 123914761 123914722 Y NA NA NA NA NA NA TACC2 167757 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 123923874 123924133 123924069 Y NA NA NA NA NA NA TACC2 177185 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr10 124196519 124196712 124196524 Y TACC2,PLEKHA1,PLEKHA1,PLEKHA1 HTRA1 NA NA NA NA HTRA1 22329 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 124249700 124250033 124249857 Y NA HTRA1 NA NA NA NA HTRA1 30659 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 124613518 124613778 124613722 Y NA FAM24B,RP11-564D11.3 NA NA NA NA FAM24B 23379 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 125047496 125047735 125047709 Y NA NA NA NA NA NA BUB3 135703 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 125151294 125151544 125151434 Y NA NA NA NA NA NA BUB3 239501 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 125151623 125152081 125151906 Y HMX3,BUB3 NA NA NA NA NA BUB3 239830 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 125847012 125847291 125847256 Y NA CHST15 NA NA NA NA CHST15 3915 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr10 126373894 126374059 126373997 Y ZRANB1,FAM53B NA NA NA NA NA FAM53B 56779 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 126377488 126377718 126377625 Y FAM53B NA NA NA NA NA FAM53B 53120 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 126411752 126412342 126412027 Y FAM53B FAM53B NA NA NA NA FAM53B 18496 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 126445536 126445891 126445571 Y ZRANB1 FAM53B,METTL10,FAM175B NA NA NA NA FAM53B 14698 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 126749212 126749581 126749525 Y NA NA NA NA NA NA CTBP2 98158 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 127432481 127432807 127432790 Y NA NA NA NA NA NA UROS 77010 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 127535706 127535819 127535763 Y MMP21 UROS,BCCIP,RNU2-42P,DHX32,FANK1 NA NA NA NA BCCIP 25591 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 127931562 127931630 127931605 Y NA NA FANK1 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM12 143394 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 129862087 129863410 129862652 Y NA NA NA NA NA NA MKI67 59239 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 130324634 130324907 130324771 Y NA NA NA NA NA NA MKI67 401985 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr10 130339551 130339892 130339738 Y NA NA NA NA NA NA MKI67 416902 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 131436691 131436981 131436883 Y MGMT NA NA NA NA NA MGMT 173243 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 131644019 131644215 131644117 Y EBF3 NA NA NA NA NA EBF3 115890 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 131688064 131688242 131688188 Y EBF3 NA NA NA NA NA EBF3 71863 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 131750004 131750210 131750111 Y NA EBF3 NA NA NA NA EBF3 9895 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 133763722 133764008 133763747 Y NA BNIP3 NA NA NA NA BNIP3 29427 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 133776164 133776302 133776237 Y NA BNIP3 NA NA NA NA BNIP3 17133 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr10 133879247 133879524 133879406 Y NA NA BNIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BNIP3 85812 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 134053422 134053516 134053469 Y JAKMIP3 NA DPYSL4 IMR90 Hi-C 24141950 DPYSL4 55018 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr10 134221496 134221692 134221620 Y PWWP2B PWWP2B,C10orf91 NA NA NA NA PWWP2B 12824 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr10 134330832 134331178 134331005 Y NA INPP5A INPP5A,ADAM8,C10orf91 IMR90 Hi-C 24141950 INPP5A 18146 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 134373708 134374041 134373810 Y PWWP2B,INPP5A INPP5A NA NA NA NA INPP5A 24384 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 134604468 134604559 134604513 Y NA NA NA NA NA NA TTC40 149768 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 135092436 135092746 135092593 Y ADAM8,TUBGCP2 ZNF511,TUBGCP2 NA NA NA NA ZNF511 27233 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 135119353 135119734 135119518 Y ADAM8,TUBGCP2 ZNF511,TUBGCP2,PRAP1 NA NA NA NA ZNF511 245 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr10 135191872 135192182 135191943 Y NA PRAP1,ECHS1,PAOX,MTG1 NA NA NA NA PAOX 1177 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 355877 356724 356385 Y NA IFITM3,B4GALNT4 IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 B4GALNT4 11072 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 364521 364678 364634 Y NA IFITM3,B4GALNT4 ANO9,SIGIRR,B4GALNT4 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 B4GALNT4 3118 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 368352 368730 368427 Y NA IFITM3,B4GALNT4,SIGIRR NA NA NA NA B4GALNT4 556 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 589256 589485 589371 Y SIGIRR RASSF7,C11orf35,PHRF1,IRF7 NA NA NA NA PHRF1 14770 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 629192 629570 629436 Y IRF7,IRF7,SCT,DRD4 IRF7 NA NA NA NA IRF7 15193 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 926738 926879 926801 Y BRSK2,CEND1,AP2A2 CHID1,AP2A2 NA NA NA NA AP2A2 3844 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 944711 944765 944751 Y NA CHID1,AP2A2 NA NA NA NA AP2A2 21817 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr11 1015139 1015297 1015218 Y NA NA NA NA NA NA AP2A2 92245 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 1285805 1285940 1285877 Y TOLLIP TOLLIP NA NA NA NA TOLLIP 42944 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 1357863 1358286 1357997 Y TOLLIP,BRSK2 TOLLIP TOLLIP,LOC255512 K562 ChIA-PET 22265404 TOLLIP 28979 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 1404403 1404794 1404637 Y DUSP8,BRSK2 BRSK2 TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BRSK2 4335 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 1412454 1412793 1412702 Y NA BRSK2 NA NA NA NA BRSK2 3325 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr11 1847921 1848122 1848046 Y KRTAP5-3 SYT8 H19 MCF7 ChIA-PET 22265404 SYT8 1212 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 1870283 1870513 1870420 Y CTSD,MOB2 SYT8 NA NA NA NA SYT8 23574 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 1935889 1936214 1936052 Y IGF2,KRTAP5-3,TNNI2,TNNI2,TNNT3 MRPL23 NA NA NA NA MRPL23 30294 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 1988846 1989279 1989052 Y IGF2,TH,IGF2,IGF2,SYT8,TNNI2,TNNI2,TNNT3 MRPL23,H19 NA NA NA NA MRPL23 22338 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 1991146 1991394 1991373 Y TH,IGF2,IGF2 MRPL23,H19 NA NA NA NA MRPL23 24638 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr11 2176984 2177085 2177035 Y NA IGF2,TH NA NA NA NA IGF2 8151 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 2212480 2212615 2212548 Y ASCL2,TH IGF2,TH NA NA NA NA TH 21373 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 2238430 2238670 2238577 Y NA TH KCNQ1 IMR90 Hi-C 24141950 TH 47323 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 2619837 2620105 2619972 Y TRPM5 NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 99119 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 2633332 2633679 2633509 Y ASCL2 NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 85545 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 2643944 2644417 2644202 Y NA NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 74807 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 2655024 2655339 2655183 Y TRPM5,KCNQ1 NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 63885 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 2669931 2670236 2670070 Y INS,ASCL2,TRPM5 KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 48988 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 2717684 2718130 2717946 Y TSSC4,TRPM5,KCNQ1 KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 1094 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 2799950 2800256 2800114 Y KCNQ1,CDKN1C NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 80726 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 2988914 2989223 2989024 Y MRGPRG,SLC22A18 PHLDA2,NAP1L4 NA NA NA NA NAP1L4 22384 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 3443739 3443990 3443855 Y NA ZNF195,TSSC2 NA NA NA NA TSSC2 43548 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 3742975 3743362 3743342 Y NA NA NA NA NA NA PGAP2 73592 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 3831146 3831197 3831172 Y NA PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1 NA NA NA NA NUP98 14124 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 3833340 3833454 3833393 Y RRM1,NUP98,PGAP2,PGAP2,RHOG PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1 NA NA NA NA NUP98 16318 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 4129900 4130200 4130091 Y OR52M1,OR52K2,OR52K1,C11orf40,OR52I1 RRM1 NA NA NA NA RRM1 15963 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 6115595 6115703 6115649 Y TRIM34,TRIM5,TRIM22,OR52N4,OR52N1,OR52N2,OR52E6,OR52E8,OR52E4,OR56A3,OR56A5,OR56A4,OR52W1,FAM160A2,OR56A1,OR56B4 NA NA NA NA NA FAM160A2 138238 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 6489893 6490567 6490471 Y OR56A4,OR56A1,OR56B4,OR52W1,OR2AG1,OR2AG2,OR10A5,OR10A4,OR10A2,OR6A2,DCHS1 TRIM3,ARFIP2 NA NA NA NA TRIM3 3122 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr11 6523174 6523531 6523244 Y OR2D2 TRIM3,ARFIP2 NA NA NA NA ARFIP2 22508 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 6665190 6665437 6665274 Y NA RRP8,ILK,TAF10,TPP1,DCHS1,MRPL17 NA NA NA NA DCHS1 9648 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 6667820 6668268 6668018 Y OR6A2,DCHS1 RRP8,ILK,TAF10,TPP1,DCHS1,MRPL17 NA NA NA NA DCHS1 6817 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 6699628 6699937 6699850 Y OR52W1,OR10A4,OR10A2,OR6A2,OR2AG1,OR2AG2 DCHS1,MRPL17 NA NA NA NA MRPL17 2695 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr11 7426320 7426390 7426356 Y SYT9 NA NA NA NA NA OLFML1 78229 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 7636630 7636941 7636786 Y PPFIBP2,OR5P3 NA NA NA NA NA CYB5R2 59512 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 7697344 7697564 7697416 Y NA CYB5R2 NA NA NA NA CYB5R2 891 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 8104216 8104515 8104374 Y NA NA NA NA NA NA TUB 65425 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr11 8166799 8166849 8166831 Y NA RIC3 NA NA NA NA RIC3 21753 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 8251033 8251182 8251107 Y TRIM66,STK33 LMO1 NA NA NA NA LMO1 37081 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 8273804 8274153 8274013 Y NA LMO1 NA NA NA NA LMO1 14110 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.34401484735175 chr11 8723535 8723638 8723587 Y STK33 TRIM66,RPL27A NA NA NA NA RPL27A 21577 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 8730669 8730993 8730843 Y NA TRIM66,RPL27A NA NA NA NA RPL27A 28711 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr11 8848675 8849002 8848759 Y NA NA NA NA NA NA ST5 81496 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 9017468 9017784 9017768 Y NA TMEM9B-AS1,TMEM9B,NRIP3,RP11-467K18.2 NA NA NA NA NRIP3 5812 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 9023312 9023663 9023569 Y ZNF143,IPO7,DENND5A,TMEM9B,NRIP3 TMEM9B-AS1,TMEM9B,RP11-467K18.2 NA NA NA NA NRIP3 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 9250767 9251109 9250945 Y NA DENND5A NA NA NA NA DENND5A 33828 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 9385760 9386326 9386092 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 17843 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr11 9422844 9423055 9422950 Y NRIP3,IPO7 IPO7,SNORA23 NA NA NA NA IPO7 18675 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 9635436 9636077 9635827 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1,SWAP70 WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WEE1 42208 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 9686542 9686911 9686729 Y ZNF143,SWAP70 SWAP70 NA NA NA NA SWAP70 2918 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 10063724 10063946 10063792 Y SBF2,AMPD3,AMPD3,AMPD3 NA NA NA NA NA SBF2 249808 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 10135641 10135992 10135817 Y NA NA LOC283104,LOC440028 IMR90 Hi-C 24141950 SBF2 177762 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 10246954 10247167 10247061 Y NA NA NA NA NA NA SBF2 66587 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 10373282 10373523 10373408 Y ADM,AMPD3 ADM SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104 IMR90 Hi-C 24141950 ADM 49055 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 10460100 10460275 10460212 Y ZBED5,EIF4G2,SBF2,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3 NA MRVI1,AMPD3,RNF141,MTRNR2L8,CTR9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTRNR2L8 68448 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 10549004 10549441 10549205 Y AMPD3,AMPD3,MRVI1,MRVI1,RNF141 MTRNR2L8,RNF141,MRVI1-AS1 NA NA NA NA RNF141 11336 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 10619660 10619757 10619708 Y NA NA NA NA NA NA MRVI1-AS1 58841 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 10659915 10660098 10660029 Y NA NA LYVE1,MRVI1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 MRVI1-AS1 99096 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 10862862 10862982 10862965 Y NA SNORD97,EIF4G2,ZBED5 NA NA NA NA ZBED5 15361 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 10955517 10955651 10955533 Y NA NA EIF4G2,MICALCL,CTR9,GALNTL4,LOC729013,ZBED5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZBED5 77174 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 11864878 11865300 11864975 Y NA USP47 NA NA NA NA USP47 3908 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 11899555 11899888 11899585 Y NA USP47 NA NA NA NA USP47 38585 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 12218036 12218499 12218053 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 104493 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 12438419 12438761 12438595 Y NA PARVA NA NA NA NA PARVA 41687 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 12455335 12455581 12455453 Y PARVA NA NA NA NA NA PARVA 58603 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 12697923 12698543 12698251 Y PARVA,TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 3954 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 12698857 12698926 12698896 Y PARVA,TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 4888 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 12701917 12702070 12702017 Y TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 7948 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 12772830 12773175 12773002 Y NA NA NA NA NA NA TEAD1 78861 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 12821812 12822118 12821851 Y NA NA NA NA NA NA TEAD1 127843 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 12973520 12973623 12973568 Y NA NA NA NA NA NA TEAD1 279551 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 13468446 13468721 13468666 Y NA BTBD10 NA NA NA NA BTBD10 14123 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 14356156 14356413 14356247 Y NA RRAS2 NA NA NA NA RRAS2 27639 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 14563953 14564333 14564143 Y NA COPB1,PSMA1 NA NA NA NA PSMA1 24063 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 14600110 14600431 14600207 Y CYP2R1,PSMA1,PDE3B NA NA NA NA NA PSMA1 60220 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 14874249 14874576 14874405 Y CYP2R1 CYP2R1,CALCB NA NA NA NA CYP2R1 37222 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 14910529 14910668 14910599 Y NA CYP2R1,CALCB NA NA NA NA CYP2R1 1130 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 17036768 17036996 17036882 Y PLEKHA7 RP11-466H18.1,OR7E14P,PLEKHA7 NA NA NA NA PLEKHA7 2778 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 17164162 17164523 17164517 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C2A 63007 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 17374298 17375700 17374969 Y RPS13,B7H6 KCNJ11 NA NA NA NA KCNJ11 33178 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.55078636232894 chr11 17759845 17760217 17760031 Y NA MYOD1,KCNC1 NA NA NA NA KCNC1 5486 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 17929463 17929485 17929474 Y NA NA NA NA NA NA SERGEF 103224 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 18426412 18426598 18426470 Y NA LDHA,LDHAL6A NA NA NA NA LDHA 12477 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 18546072 18546398 18546234 Y SPTY2D1,TSG101 TSG101 NA NA NA NA TSG101 381 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 19205269 19205507 19205385 Y NA NA NA NA NA NA E2F8 55660 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 19649981 19650160 19650072 Y NAV2 NA NA NA NA NA NAV2 279710 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 19957110 19957424 19957380 Y NAV2 NA NA NA NA NA HTATIP2 425807 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 19962898 19963229 19963064 Y NA NA NA NA NA NA HTATIP2 420002 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 20072115 20072502 20072253 Y NA NA NA NA NA NA HTATIP2 310729 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 21637390 21637593 21637490 Y NA NA NA NA NA NA ANO5 575129 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 27350498 27350718 27350608 Y BDNF CCDC34 NA NA NA NA CCDC34 32697 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 27683148 27683223 27683174 Y NA NA NA NA NA NA BDNF 58382 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 27739901 27740316 27740092 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF BDNF NA NA NA NA BDNF 1289 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr11 27740535 27740662 27740569 Y NA BDNF NA NA NA NA BDNF 943 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 28063321 28063497 28063482 Y NA NA NA NA NA NA METTL15 64298 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr11 28128920 28129110 28128941 Y METTL15 METTL15,KIF18A NA NA NA NA KIF18A 1065 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 28588177 28588553 28588410 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 KIF18A 460322 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 28701449 28701661 28701530 Y NA NA BDNF,BDNF-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 KIF18A 573594 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 31450770 31450827 31450799 Y PAX6,PAX6,IMMP1L,ELP4,DNAJC24 NA NA NA NA NA DNAJC24 61383 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 32915475 32916456 32915913 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 2751 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.34401484735175 chr11 33096691 33097088 33096864 Y NA TCP11L1 NA NA NA NA TCP11L1 37728 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 33468371 33468737 33468467 Y NA RP1-130L23.1 C11orf41,LOC338739 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-130L23.1 45609 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 33778086 33778269 33778178 Y FBXO3 CD59,FBXO3 NA NA NA NA FBXO3 15820 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 34125347 34125667 34125520 Y NA NAT10 NA NA NA NA NAT10 198 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 34919844 34920223 34920054 Y ELF5,EHF PDHX,APIP NA NA NA NA PDHX 15153 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 34931457 34931889 34931828 Y NA PDHX,APIP NA NA NA NA PDHX 3487 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr11 35029453 35029465 35029458 Y NA NA NA NA NA NA APIP 93407 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 35401982 35402383 35402345 Y NA NA NA NA NA NA PAMR1 147465 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 36132577 36133046 36132774 Y NA NA NA NA NA NA LDLRAD3 169046 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 36211739 36211961 36211850 Y NA NA NA NA NA NA COMMD9 97038 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 36521882 36522155 36522112 Y NA TRAF6 NA NA NA NA TRAF6 7667 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 36530791 36531124 36530883 Y NA TRAF6 NA NA NA NA TRAF6 969 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 36706778 36707052 36706817 Y RAG1,RAG2 NA NA NA NA NA RAG2 88949 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 42725880 42726064 42725972 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPKP3 562879 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 43596990 43597530 43597260 Y NA HSD17B12 NA NA NA NA HSD17B12 21004 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 43757440 43757801 43757621 Y NA NA NA NA NA NA ALKBH3 142560 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 43760547 43760939 43760743 Y NA NA NA NA NA NA ALKBH3 139422 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 43927407 43927581 43927494 Y NA ALKBH3,C11orf96 NA NA NA NA C11orf96 17311 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 43952542 43952620 43952581 Y NA C11orf96 NA NA NA NA C11orf96 7650 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 44239965 44240168 44240067 Y NA NA NA NA NA NA EXT2 124866 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 44749241 44749630 44749607 Y TSPAN18 TSPAN18 PRDM11,TSPAN18,CD82,TP53I11 IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN18 3226 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr11 44758780 44759166 44758916 Y NA TSPAN18 TSPAN18,PRDM11,CD82,TP53I11,SYT13 IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN18 12765 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 44963197 44963482 44963283 Y NA TP53I11 NA NA NA NA TP53I11 7358 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr11 45167156 45167357 45167300 Y NA NA NA NA NA NA SYT13 138513 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 45201958 45202605 45202216 Y NA NA NA NA NA NA SYT13 103265 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr11 45255111 45255224 45255172 Y CHST1,SYT13 NA NA NA NA NA SYT13 50646 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 45685212 45685518 45685319 Y SYT13,MAPK8IP1,CRY2,CRY2,CHST1 CHST1 NA NA NA NA CHST1 40 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 45864713 45865116 45864826 Y NA SLC35C1,CRY2,MAPK8IP1 NA NA NA NA CRY2 1553 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 45873552 45873871 45873819 Y NA SLC35C1,CRY2,MAPK8IP1 NA NA NA NA CRY2 6883 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 46004522 46004898 46004712 Y NA NA NA NA NA NA PEX16 66159 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 46090973 46091088 46091031 Y NA PHF21A NA NA NA NA PHF21A 49897 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 46094625 46094954 46094790 Y NA PHF21A NA NA NA NA PHF21A 46031 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 46143609 46143973 46143928 Y NA PHF21A,RP11-702F3.3 NA NA NA NA PHF21A 2624 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr11 46264726 46265198 46265009 Y NA CREB3L1 DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 32014 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr11 46619183 46619437 46619308 Y NA AMBRA1,ATG13,HARBI1 AMBRA1 K562 ChIA-PET 22265404 AMBRA1 5508 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 46753121 46753488 46753304 Y F2 ARHGAP1,ZNF408 NA NA NA NA ZNF408 32753 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 47108178 47108230 47108204 Y HARBI1 NA NA NA NA NA ARFGAP2 88446 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 47109490 47109615 47109553 Y NA NA NA NA NA NA ARFGAP2 87061 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 47168963 47169205 47169084 Y NA ARFGAP2,PACSIN3 NA NA NA NA ARFGAP2 27471 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 47173206 47173550 47173416 Y NA ARFGAP2,PACSIN3 NA NA NA NA ARFGAP2 23126 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 47208524 47208884 47208580 Y PACSIN3,PACSIN3,NR1H3 ARFGAP2,PACSIN3,DDB2 NA NA NA NA PACSIN3 2530 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 47531687 47531996 47531879 Y SPI1,PTPRJ,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1 NA RAPSN IMR90 Hi-C 24141950 NDUFS3 52892 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 47573563 47574025 47573747 Y NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1 NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4,C1QTNF4 NA NA NA NA NDUFS3 10863 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 47789923 47790126 47789984 Y NA FNBP4 NA NA NA NA FNBP4 2928 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 47844695 47845036 47844861 Y NA NUP160 NA NA NA NA NUP160 23071 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 47939528 47939960 47939626 Y OR4B1,OR4S1,NUP160 RP11-793I11.1 PTPRJ,NUP160 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-793I11.1 14369 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 57083068 57083441 57083322 Y NA TNKS1BP1,SSRP1,P2RX3 NA NA NA NA TNKS1BP1 6985 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 57242995 57243389 57243187 Y OR5AK2,SSRP1,BTBD18,UBE2L6 SLC43A3,RTN4RL2,SLC43A1 NA NA NA NA RTN4RL2 16973 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 57324540 57324747 57324726 Y SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,UBE2L6,SERPING1 SLC43A1,TIMM10,UBE2L6,SERPING1 NA NA NA NA UBE2L6 9010 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 57542885 57543297 57542929 Y NA C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 24170 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 58319737 58319877 58319834 Y NA ZFP91,ZFP91-CNTF NA NA NA NA ZFP91 24707 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 58340867 58341571 58341167 Y OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN ZFP91,ZFP91-CNTF NA NA NA NA ZFP91 3013 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 60499458 60499898 60499803 Y MS4A6E,MS4A14,MS4A5,MS4A13 NA NA NA NA NA CCDC86 107646 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 60809729 60810107 60810025 Y SDHAF2,CD5,CD6 NA NA NA NA NA VPS37C 116982 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 60877687 60877932 60877809 Y CD6,CD5 VPS37C NA NA NA NA VPS37C 49157 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 60888310 60888547 60888414 Y CD6,CD5 VPS37C NA NA NA NA VPS37C 38542 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 60934770 60935212 60935096 Y SLC15A3,TMEM138,SDHAF2,CYBASC3,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,VPS37C VPS37C VPS37C K562 ChIA-PET 22265404 VPS37C 7681 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 61065380 61065516 61065448 Y NA VWCE,DAK,DDB1 NA NA NA NA VWCE 4484 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 61394263 61394463 61394368 Y NA SYT7 NA NA NA NA SYT7 47643 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 61880097 61880151 61880125 Y FADS2,FADS3,RAB3IL1 INCENP FEN1,C11orf10,FADS3,BEST1,RAB3IL1,FADS2,DKFZP434K028,C11orf9,FADS1,FTH1,INCENP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 INCENP 9294 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 62143612 62143665 62143638 Y NA ASRGL1 NA NA NA NA ASRGL1 40692 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 62211626 62212261 62212170 Y FTH1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK NA NA NA NA NA RP11-864I4.4 99210 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr11 62306762 62307027 62306934 Y WDR74,STX5,NXF1,EML3,AHNAK RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654 NA NA NA NA RP11-864I4.4 4444 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 62320057 62320478 62320186 Y NA RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 AHNAK IMR90 Hi-C 24141950 AHNAK 1229 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 62413039 62413428 62413234 Y NA MTA2,ROM1,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,SNORA57,C11orf83,C11orf48,UBXN1 NA NA NA NA GANAB 935 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 62441871 62442205 62442039 Y NXF1 GANAB,INTS5,METTL12,SNORA57,C11orf83,C11orf48,UBXN1,GNG3,BSCL2 NA NA NA NA UBXN1 2362 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 62586827 62586893 62586843 Y NA TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA STX5 10667 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 63319473 63319796 63319589 Y RARRES3,OTUB1 NA NA NA NA NA PLA2G16 62559 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 63605376 63605474 63605425 Y FERMT3,LGALS12,RTN3,MARK2 C11orf84,MARK2 NA NA NA NA MARK2 976 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 63685258 63686079 63685609 Y NA RCOR2,NAA40 NA NA NA NA RCOR2 2942 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr11 63705603 63705837 63705685 Y NA RCOR2,NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1 NA NA NA NA NAA40 1172 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 63777072 63777136 63777104 Y NA COX8A,AP000721.4,OTUB1,RP11-21A7A.2 NA NA NA NA RP11-21A7A.2 24306 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 63795964 63796221 63796065 Y NA OTUB1,RP11-21A7A.2 NA NA NA NA RP11-21A7A.2 5221 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 63822776 63822835 63822807 Y NA RP11-21A7A.2 NA NA NA NA RP11-21A7A.2 21334 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 63846659 63847077 63846694 Y NA RP11-21A7A.2 NA NA NA NA RP11-21A7A.2 45217 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 63858567 63858836 63858756 Y NA NA NA NA NA NA RP11-21A7A.2 57125 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 63949132 63949273 63949224 Y NA MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4 NA NA NA NA STIP1 1471 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 64140304 64140795 64140552 Y RCOR2,NAA40,GPR137,KCNK4,NRXN2,NRXN2,CDC42BPG RPS6KA4 NA NA NA NA RPS6KA4 15684 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 64146714 64147096 64146808 Y NA RPS6KA4 NA NA NA NA RPS6KA4 22094 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 64363562 64364093 64364079 Y NA NA NA NA NA NA NRXN2 124567 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 64916686 64916783 64916734 Y NRXN2,C11orf85 TM7SF2,ZNHIT2,MRPL49,FAU,SYVN1,RNU2-23P,CAPN1 SYVN1,CAPN1,SPDYC MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RNU2-23P 3631 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 65187297 65188198 65187553 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 47 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.24062908986315 chr11 65254949 65255610 65255242 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 7623 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr11 65259217 65259522 65259389 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 3711 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 65259930 65260851 65260542 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 2382 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 65261229 65261625 65261527 Y CDC42EP2 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 1608 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 65263684 65264604 65263856 Y SNX32 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 451 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 8.0640890841105 chr11 65328084 65328375 65328271 Y NA SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1 NA NA NA NA LTBP3 3683 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 65333490 65333816 65333671 Y SLC25A45,SIPA1,SIPA1,EIF1AD,CTSW,PCNXL3 SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3 NA NA NA NA SSSCA1 2085 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 65342581 65342818 65342732 Y TIGD3,SIPA1,SIPA1,DKFZp761E198,KCNK7,MAP3K11,EHBP1L1 LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3 NA NA NA NA EHBP1L1 1072 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 65379476 65379605 65379541 Y FAU,CAPN1,RNASEH2C,EFEMP2,CCDC85B,C11orf68,FAM89B,MAP3K11 SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA NA NA NA NA MAP3K11 1248 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 65419981 65420225 65420142 Y CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 8340 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr11 65420425 65420654 65420491 Y TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 7911 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.06771514977192 chr11 65581703 65581968 65581801 Y CDC42EP2,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,DKFZp761E198 SNX32,MUS81,CFL1 NA NA NA NA SNX32 17144 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 65849089 65849462 65849117 Y KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,SIPA1,RELA,DKFZp761E198,CTSW,PACS1 GAL3ST3,SF3B2,PACS1 NA NA NA NA PACS1 13255 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 65903912 65904457 65904250 Y NA NA NA NA NA NA PACS1 68078 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 66047866 66048291 66048031 Y NA KLC2,RAB1B,CNIH2,YIF1A,TMEM151A,RP11-867G23.13,CD248 NA NA NA NA CNIH2 4205 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 66080826 66081241 66080906 Y CD248 RAB1B,CNIH2,YIF1A,TMEM151A,RP11-867G23.13,CD248,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8 NA NA NA NA CD248 1274 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.55078636232894 chr11 66085302 66085580 66085502 Y RBM14 CNIH2,YIF1A,TMEM151A,RP11-867G23.13,CD248,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8 NA NA NA NA CD248 2787 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 66093813 66094193 66094103 Y NA YIF1A,TMEM151A,RP11-867G23.13,CD248,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2 NA NA NA NA RIN1 8118 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 66118604 66119022 66118907 Y NA RP11-867G23.13,CD248,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2 NA NA NA NA RP11-867G23.8 5183 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 66185542 66185902 66185739 Y NA SLC29A2,RP11-867G23.10,NPAS4,MRPL11,PELI3 NA NA NA NA NPAS4 573 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 66374477 66374855 66374526 Y NA CTSF,CCS,CCDC87,RNU4-39P,RBM14,RBM14-RBM4,RBM4 RBM14-RBM4 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-39P 5706 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 66494345 66494720 66494567 Y NA C11orf80 C11orf80 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 C11orf80 15202 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 66494780 66495327 66494982 Y SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2 C11orf80 C11orf80 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 C11orf80 14595 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 66882341 66882514 66882428 Y NA KDM2A SYT12,KDM2A,SSH3,PC,RHOD,C11orf80 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KDM2A 2226 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 67028976 67029390 67029158 Y NA ADRBK1,ANKRD13D,SSH3 NA NA NA NA ADRBK1 2491 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 67037275 67037527 67037373 Y TBC1D10C,RAD9A,PITPNM1,KDM2A,ADRBK1,ANKRD13D ADRBK1,ANKRD13D,SSH3 NA NA NA NA ADRBK1 5394 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 67105994 67106296 67106145 Y NA SSH3,POLD4 NA NA NA NA POLD4 16147 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 67139742 67140272 67140082 Y NA POLD4,RAD9A,PPP1CA NA NA NA NA RAD9A 16904 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 67827034 67827402 67827396 Y PPP6R3,ACY3,SUV420H1,CHKA NDUFS8 NA NA NA NA NDUFS8 30950 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 67955066 67955423 67955397 Y TCIRG1,SUV420H1 SUV420H1 NA NA NA NA SUV420H1 23872 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 68121765 68121884 68121804 Y ALDH3B1,C11orf24 LRP5 NA NA NA NA LRP5 43688 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 68141745 68141881 68141821 Y NA NA NA NA NA NA LRP5 63668 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 68238826 68238975 68238901 Y TCIRG1,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,IGHMBP2,PPP6R3 PPP6R3 NA NA NA NA PPP6R3 12640 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 68270416 68270689 68270553 Y MRGPRD PPP6R3 NA NA NA NA PPP6R3 44230 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 68273880 68274272 68274031 Y NA PPP6R3 NA NA NA NA PPP6R3 47694 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 68924761 68925032 68924956 Y TPCN2 NA ORAOV1,CCND1,MYEOV IMR90 Hi-C 24141950 TPCN2 110396 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr11 69251942 69252241 69252024 Y NA NA CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCND1 201614 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 69258094 69258432 69258217 Y CCND1 NA CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCND1 195423 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr11 69296310 69296479 69296388 Y NA NA CCND1,TPCN2,MYEOV IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCND1 157376 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 69451342 69451588 69451394 Y NA CCND1,ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 2267 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 3.61850151210087 chr11 69452524 69453230 69453220 Y CCND1 CCND1,ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 625 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.6880296947035 chr11 69453520 69454472 69453912 Y NA ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 3.30834423963508 chr11 70159213 70159451 70159301 Y PPFIA1 PPFIA1 NA NA NA NA PPFIA1 44407 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 70367951 70368077 70368014 Y SHANK2 NA NA NA NA NA AP000487.5 125357 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 70483542 70483760 70483651 Y NA NA NA NA NA NA AP000487.5 240948 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 71702677 71703050 71702869 Y FOLR3,IL18BP,IL18BP NA NA NA NA NA RNF121 64930 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 71769812 71769929 71769891 Y NA LRTOMT,NUMA1,LAMTOR1 NA NA NA NA LRTOMT 19453 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 71780398 71780482 71780403 Y IL18BP,IL18BP LRTOMT,NUMA1,LAMTOR1 NA NA NA NA LRTOMT 8900 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 71936800 71937067 71937009 Y INPPL1 INPPL1,PHOX2A NA NA NA NA INPPL1 4055 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr11 71990969 71991411 71991180 Y NA PHOX2A NA NA NA NA PHOX2A 36261 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr11 72003135 72003262 72003223 Y NA PHOX2A NA NA NA NA PHOX2A 48427 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 72351414 72351690 72351438 Y NA PDE2A NA NA NA NA PDE2A 31945 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 72381210 72381586 72381345 Y NA PDE2A NA NA NA NA PDE2A 2049 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 72431268 72431435 72431330 Y FCHSD2,ATG16L2,ARAP1,ARAP1 PDE2A NA NA NA NA PDE2A 47633 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 72487947 72488068 72488008 Y NA ARAP1,STARD10,ATG16L2 NA NA NA NA ARAP1 14576 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 72854261 72854849 72854638 Y PDE2A,ARAP1,ATG16L2,RELT,RELT,FCHSD2 FCHSD2 NA NA NA NA FCHSD2 2955 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 73088357 73088912 73088439 Y NA RELT NA NA NA NA RELT 3048 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 73126084 73126768 73126402 Y RELT,RELT RELT NA NA NA NA RELT 40775 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 73221521 73221768 73221630 Y PLEKHB1,PLEKHB1,FAM168A NA NA NA NA NA FAM168A 85466 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 73240043 73240049 73240046 Y NA NA NA NA NA NA FAM168A 67185 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 73490470 73490918 73490608 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 5443 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 73989657 73990002 73989928 Y NA NA PPME1 IMR90 Hi-C 24141950 C2CD3 109402 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 74465903 74466299 74466070 Y POLD3,RNF169 RP11-864N7.2,RNF169 XRRA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF169 7990 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 74534779 74535147 74534795 Y XRRA1,RNF169 NA NA NA NA NA RNF169 76866 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr11 74565092 74565468 74565281 Y NA NA NA NA NA NA XRRA1 92777 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 74578028 74578161 74578096 Y OR2AT4,XRRA1,RNF169 NA NA NA NA NA XRRA1 80084 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 74608675 74608873 74608772 Y NA XRRA1,SPCS2 NA NA NA NA XRRA1 49372 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 74667774 74667939 74667906 Y RNF169 XRRA1,SPCS2,NEU3 NA NA NA NA SPCS2 9482 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 74814562 74814987 74814735 Y ARRB1 NA XRRA1,LOC100507050 IMR90 Hi-C 24141950 NEU3 117383 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 74857404 74857707 74857556 Y SLCO2B1 NA NA NA NA NA NEU3 160225 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 75041361 75041638 75041486 Y ARRB1 ARRB1 NA NA NA NA ARRB1 19235 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 75061558 75062072 75061823 Y NA ARRB1,RPS3 NA NA NA NA ARRB1 685 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 75265416 75265853 75265464 Y SERPINH1 GDPD5,SERPINH1 RPS3,GDPD5,KLHL35 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINH1 5248 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.34401484735175 chr11 75312070 75312308 75312189 Y MAP6 SERPINH1 NA NA NA NA SERPINH1 40969 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 75376291 75376573 75376366 Y NA MAP6 NA NA NA NA MAP6 1592 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 75385192 75385417 75385302 Y NA MAP6 NA NA NA NA MAP6 7027 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 75537561 75537829 75537710 Y ARRB1,DGAT2,UVRAG UVRAG NA NA NA NA UVRAG 13349 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 75538796 75538953 75538875 Y NA UVRAG NA NA NA NA UVRAG 14584 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 75755875 75756235 75755993 Y UVRAG NA NA NA NA NA WNT11 163545 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 75919893 75920246 75919996 Y WNT11 WNT11 NA NA NA NA WNT11 113 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.34401484735175 chr11 75920696 75920900 75920748 Y NA WNT11 NA NA NA NA WNT11 916 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 75946013 75946323 75946187 Y NA WNT11 C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WNT11 26233 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 76340225 76340306 76340286 Y NA LRRC32 NA NA NA NA LRRC32 39485 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 76510532 76510646 76510589 Y NA TSKU,RP11-21L23.3 NA NA NA NA RP11-21L23.3 18426 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 76574228 76574537 76574458 Y OMP,ACER3 ACER3 NA NA NA NA ACER3 4317 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 76721586 76721786 76721728 Y ACER3 NA NA NA NA NA CAPN5 54193 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 76802149 76802401 76802277 Y NA CAPN5 NA NA NA NA CAPN5 26170 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 77156016 77156186 77156101 Y PAK1 PAK1 NA NA NA NA PAK1 27494 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 77751153 77751354 77751183 Y NA INTS4,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2 NA NA NA NA NDUFC2-KCTD14 37557 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 77913844 77914005 77913927 Y RSF1,INTS4 USP35,KCTD21 NA NA NA NA KCTD21 15976 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 77938673 77938848 77938785 Y NA USP35,KCTD21 NA NA NA NA KCTD21 40805 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr11 77960482 77960781 77960725 Y NA NA NA NA NA NA KCTD21 62614 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 78000759 78000964 78000861 Y GAB2,GAB2 NA NA NA NA NA KCTD21 102891 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 78001305 78001608 78001428 Y GAB2,GAB2 NA NA NA NA NA KCTD21 103437 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 78002337 78002637 78002489 Y NA NA NA NA NA NA KCTD21 104469 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 78003105 78003596 78003355 Y GAB2,GAB2 NA NA NA NA NA KCTD21 105237 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 78025089 78025245 78025191 Y GAB2,GAB2 NA NA NA NA NA GAB2 102149 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 78029499 78029864 78029682 Y NA NA NA NA NA NA GAB2 97530 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 78048124 78048554 78048530 Y GAB2,GAB2 NA NA NA NA NA GAB2 78840 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 78051625 78051814 78051807 Y NA NA NA NA NA NA GAB2 75580 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 78060066 78060579 78060413 Y NA NA NA NA NA NA GAB2 66815 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 78061236 78062132 78061949 Y NA NA NA NA NA NA GAB2 65262 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 78073883 78074276 78074154 Y NA NA NA NA NA NA GAB2 53118 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr11 78091808 78092073 78091933 Y GAB2,GAB2 GAB2 NA NA NA NA GAB2 35321 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 78113040 78113383 78113360 Y NA GAB2 NA NA NA NA GAB2 14011 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 78130392 78130692 78130610 Y GAB2 GAB2 NA NA NA NA GAB2 2998 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 78131805 78132171 78132034 Y GAB2,GAB2 GAB2 NA NA NA NA GAB2 4411 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr11 78134473 78134617 78134544 Y GAB2,GAB2 GAB2 NA NA NA NA GAB2 7079 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 78376949 78377109 78377029 Y NA NA NA NA NA NA NARS2 93030 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 78512207 78512629 78512463 Y GAB2 NA NA NA NA NA NARS2 228288 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 78544305 78544548 78544426 Y GAB2 NA NA NA NA NA NARS2 260386 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 78571472 78571494 78571483 Y NA NA NA NA NA NA NARS2 287553 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 78608425 78608570 78608498 Y NA NA NA NA NA NA NARS2 324506 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 78625090 78625245 78625168 Y NA NA NA NA NA NA NARS2 341171 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr11 78728809 78729043 78728943 Y ODZ4 NA NA NA NA NA MIR708 382110 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 78798308 78798462 78798392 Y NA NA NA NA NA NA MIR708 312691 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 78823414 78823685 78823657 Y NA NA NA NA NA NA MIR708 287468 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 78896496 78896592 78896544 Y NA NA NA NA NA NA MIR708 214561 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 78993859 78994112 78994035 Y ODZ4 NA NA NA NA NA MIR708 117041 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr11 79082463 79082536 79082500 Y NA MIR708 NA NA NA NA MIR708 28617 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 79093983 79094278 79094131 Y NA MIR708 NA NA NA NA MIR708 16875 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 79117451 79117736 79117547 Y NA MIR708 NA NA NA NA MIR708 6298 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 79148505 79148822 79148543 Y NA MIR708 NA NA NA NA MIR708 37352 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr11 79149040 79149340 79149145 Y ODZ4 MIR708 NA NA NA NA MIR708 37887 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 81696174 81696306 81696246 Y NA NA NA NA NA NA RP11-742N3.1 702265 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 81877588 81877688 81877592 Y NA NA NA NA NA NA RP11-742N3.1 520883 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 83456088 83456459 83456328 Y DLG2 NA NA NA NA NA AP003026.1 289832 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 83465602 83465658 83465617 Y NA NA NA NA NA NA AP003026.1 299346 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 83668458 83668564 83668511 Y DLG2,DLG2,DLG2 NA NA NA NA NA AP003026.1 502202 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 85310773 85310968 85310871 Y NA DLG2,TMEM126B,TMEM126A NA NA NA NA DLG2 25998 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 85768953 85769276 85769115 Y NA PICALM NA NA NA NA PICALM 9648 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 85913618 85914066 85913698 Y PICALM,PICALM EED PICALM,CCDC83,EED IMR90 Hi-C 24141950 EED 39520 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 86178922 86179317 86178974 Y NA NA NA NA NA NA C11orf73 167669 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 86184196 86184398 86184363 Y NA NA NA NA NA NA C11orf73 172943 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 86185128 86185335 86185247 Y NA NA NA NA NA NA C11orf73 173875 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 86229748 86229843 86229795 Y NA NA NA NA NA NA ME3 151835 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 86328094 86328121 86328109 Y NA NA NA NA NA NA ME3 53557 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 86355497 86355659 86355578 Y NA ME3 NA NA NA NA ME3 26019 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 86381936 86382132 86382071 Y NA ME3 NA NA NA NA ME3 258 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 86803275 86803509 86803398 Y NA NA NA NA NA NA TMEM135 56389 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 88153223 88153558 88153356 Y NA NA GRM5 IMR90 Hi-C 24141950 CTSC 84268 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 88538065 88538152 88538144 Y NA NA NA NA NA NA CTSC 469110 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 89893119 89893512 89893349 Y NAALAD2 NAALAD2 NA NA NA NA NAALAD2 30436 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 90016507 90016673 90016590 Y NA RP11-121L10.3 NA NA NA NA RP11-121L10.3 2779 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 90171328 90171529 90171499 Y NA NA NA NA NA NA RP11-121L10.3 157600 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 91958948 91959142 91959077 Y FAT3 NA FAT3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC36A4 969988 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr11 91979590 91979911 91979751 Y FAT3 NA NA NA NA NA SLC36A4 949219 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 93446176 93446355 93446266 Y NA SCARNA9,SNORD5,C11orf54 NA NA NA NA SCARNA9 6324 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr11 93863761 93864262 93864073 Y MED17,FUT4,PANX1 PANX1 NA NA NA NA PANX1 3667 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 94882788 94883137 94883023 Y NA RP11-712B9.2 NA NA NA NA RP11-712B9.2 1085 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 94987550 94987767 94987639 Y NA SESN3 NA NA NA NA SESN3 23845 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 95374786 95374968 95374868 Y NA NA NA NA NA NA CEP57 146161 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 95416773 95416906 95416840 Y NA NA SESN3,ENDOD1 IMR90 Hi-C 24141950 CEP57 104223 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 95525355 95525734 95525518 Y NA CEP57,FAM76B NA NA NA NA FAM76B 3782 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 95557234 95557451 95557366 Y NA CEP57,FAM76B NA NA NA NA FAM76B 35661 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 95610217 95610530 95610374 Y NA MTMR2 NA NA NA NA MTMR2 45949 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 95867848 95868058 95867952 Y FAM76B,MAML2,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 206286 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 95976157 95976737 95976478 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 97607 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 102216514 102216961 102216815 Y TMEM123,BIRC3,BIRC2 BIRC3,BIRC2 NA NA NA NA BIRC2 572 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 102297400 102297813 102297636 Y BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123 TMEM123 BIRC2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 41302 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 102956908 102957200 102957055 Y NA DCUN1D5,DYNC2H1 NA NA NA NA DCUN1D5 3744 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 103281581 103281752 103281672 Y NA RP11-37O16.8 NA NA NA NA RP11-37O16.8 3196 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 103316988 103317242 103317115 Y NA RP11-37O16.8 NA NA NA NA RP11-37O16.8 38603 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr11 103321873 103321933 103321886 Y NA RP11-37O16.8 NA NA NA NA RP11-37O16.8 43488 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 103342280 103342485 103342472 Y NA NA NA NA NA NA RP11-37O16.8 63895 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 103393636 103393708 103393672 Y NA NA DYNC2H1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-37O16.8 115251 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 103401149 103401246 103401211 Y NA NA DYNC2H1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-37O16.8 122764 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 103491773 103492137 103491940 Y NA NA DYNC2H1,PDGFD IMR90 Hi-C 24141950 RP11-37O16.8 213388 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 103734297 103734569 103734418 Y NA NA NA NA NA NA RP11-37O16.8 455912 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 103801275 103801290 103801283 Y NA NA NA NA NA NA RP11-37O16.8 522890 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 105516722 105517118 105516920 Y GRIA4,GRIA4,KIAA1826 GRIA4 NA NA NA NA GRIA4 38001 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 105579191 105579256 105579211 Y KBTBD3,GRIA4,GRIA4,KIAA1826 NA NA NA NA NA GRIA4 100470 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 106220892 106221244 106221068 Y NA NA NA NA NA NA KBTBD3 274400 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 107187292 107187599 107187573 Y NA NA NA NA NA NA CWF19L2 138973 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 107727726 107727971 107727842 Y NA RP11-832N8.1 NA NA NA NA RP11-832N8.1 49175 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 107818531 107818875 107818638 Y NA RP11-832N8.1,SLC35F2,RAB39A NA NA NA NA RAB39A 21302 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 107846158 107846176 107846168 Y NA SLC35F2,RAB39A,CUL5 NA NA NA NA CUL5 31283 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 108679072 108679281 108679081 Y NA NA NA NA NA NA DDX10 145320 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 111805995 111806483 111806196 Y IL18 HSPB2,HSPB2-C11orf52,C11orf52,DIXDC1 NA NA NA NA DIXDC1 10127 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 111849134 111849433 111849303 Y SIK2,CRYAB,DIXDC1,DIXDC1 DLAT NA NA NA NA DLAT 44105 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 111929773 111930099 111929899 Y DIXDC1 DLAT,C11orf57,PIH1D2,TIMM8B,SDHD NA NA NA NA C11orf57 12711 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 111990651 111990899 111990830 Y NA C11orf57,PIH1D2,TIMM8B,SDHD,IL18 NA NA NA NA SDHD 35024 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 111992719 111993046 111992953 Y NA C11orf57,PIH1D2,TIMM8B,SDHD,IL18 NA NA NA NA SDHD 37092 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 112016607 112016779 112016693 Y DIXDC1 IL18 NA NA NA NA IL18 16061 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 112706090 112706200 112706145 Y NCAM1 NA NCAM1 IMR90 Hi-C 24141950 NCAM1 123797 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 112752270 112752453 112752335 Y NCAM1 NA NA NA NA NA NCAM1 77544 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr11 112833069 112833192 112833175 Y NCAM1 NCAM1 NA NA NA NA NCAM1 3072 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr11 112842081 112842529 112842265 Y NA NCAM1 NA NA NA NA NCAM1 12084 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 112941331 112941794 112941502 Y NA NA NA NA NA NA NCAM1 111334 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr11 113020811 113021147 113020979 Y NA NA NA NA NA NA RP11-839D17.3 162012 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 113055291 113055738 113055452 Y NA NA NA NA NA NA RP11-839D17.3 127421 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr11 113071638 113071808 113071709 Y NA NA NA NA NA NA RP11-839D17.3 111351 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 113708252 113709087 113708915 Y CLDN25 USP28 NA NA NA NA USP28 35205 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 113828537 113828676 113828607 Y NA NA NA NA NA NA USP28 84245 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 114033536 114034161 114033636 Y ZBTB16,ZBTB16 NA NA NA NA NA RBM7 234591 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 114152118 114152374 114152253 Y ZBTB16,NNMT NA NNMT IMR90 Hi-C 24141950 RBM7 116378 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 114309073 114309125 114309098 Y NA RBM7,C11orf71,REXO2 NA NA NA NA REXO2 965 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 114312879 114313299 114312892 Y NA RBM7,C11orf71,REXO2 NA NA NA NA REXO2 4771 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 115017644 115017889 115017764 Y NA NA NA NA NA NA CADM1 355786 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 115017965 115018296 115018131 Y NA NA NA NA NA NA CADM1 355379 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr11 115092334 115092489 115092415 Y NA NA NA NA NA NA CADM1 281186 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 115172228 115172553 115172441 Y NA NA NA NA NA NA CADM1 201122 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 115345794 115346124 115345959 Y NA CADM1 NA NA NA NA CADM1 27551 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 115360673 115361056 115361024 Y CADM1 CADM1 NA NA NA NA CADM1 12619 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr11 115371607 115371956 115371778 Y NA CADM1 NA NA NA NA CADM1 1719 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 115372753 115373113 115372889 Y CADM1 CADM1 NA NA NA NA CADM1 562 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 115373347 115373590 115373469 Y NA CADM1 NA NA NA NA CADM1 85 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 115580048 115580396 115580258 Y NA NA NA NA NA NA RP11-136I14.5 129033 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 115741521 115741886 115741709 Y NA NA CADM1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-136I14.5 290506 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 116299046 116299325 116299186 Y APOA5 NA NA NA NA NA AP001891.1 70022 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 116302675 116302773 116302724 Y NA NA NA NA NA NA AP001891.1 66574 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 116310023 116310403 116310367 Y NA NA NA NA NA NA AP001891.1 58944 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 116722234 116722744 116722542 Y NA NA NA NA NA NA ZNF259 65468 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 116852232 116852440 116852371 Y SIK3 NA NA NA NA NA AP000936.1 52327 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 116864339 116864649 116864442 Y SIK3,PCSK7 AP000936.1 NA NA NA NA AP000936.1 40118 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 117406578 117406797 117406688 Y FXYD6,FXYD6,DSCAML1 NA NA NA NA NA BACE1 221603 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 117573445 117573815 117573739 Y NA NA NA NA NA NA DSCAML1 112425 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 117685393 117685836 117685712 Y IL10RA DSCAML1 NA NA NA NA DSCAML1 404 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 117687155 117687422 117687274 Y NA DSCAML1 NA NA NA NA DSCAML1 915 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 117721707 117722103 117721905 Y NA DSCAML1,FXYD6-FXYD2,FXYD6 NA NA NA NA FXYD6-FXYD2 23279 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 117726217 117726352 117726285 Y NA DSCAML1,FXYD6-FXYD2,FXYD6 NA NA NA NA FXYD6-FXYD2 19030 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 117745558 117745882 117745720 Y DSCAML1,SCN4B,SCN2B,FXYD6,FXYD6 FXYD6-FXYD2,FXYD6 NA NA NA NA FXYD6-FXYD2 176 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 117756668 117756781 117756736 Y FXYD6 FXYD6-FXYD2,FXYD6 FXYD6-FXYD2 IMR90 Hi-C 24141950 FXYD6 10467 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 118490168 118490609 118490335 Y PHLDB1 ARCN1,IFT46,PHLDB1 NA NA NA NA PHLDB1 15013 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 118793665 118793922 118793750 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 395 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 118800245 118800827 118800413 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5928 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 118800879 118801266 118801161 Y MLL,DDX6,VPS11,CBL,CXCR5,CXCR5,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 6562 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 119383102 119383348 119383232 Y NA NA NA NA NA NA THY1 89407 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 119540378 119540644 119540511 Y NA NA NA NA NA NA PVRL1 57150 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 119565806 119566154 119565980 Y NA PVRL1 NA NA NA NA PVRL1 31640 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 120463888 120464227 120463894 Y GRIK4 NA GRIK4 IMR90 Hi-C 24141950 GRIK4 83420 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 120895811 120895984 120895886 Y GRIK4,TBCEL,TBCEL,TECTA TBCEL NA NA NA NA TBCEL 3030 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 121526040 121526695 121526415 Y NA NA NA NA NA NA SORL1 205128 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 121542614 121542884 121542776 Y NA NA MIR100HG,MIR125B1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 221702 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 121593077 121593718 121593342 Y NA NA MIR100HG,MIR125B1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 272165 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 121594118 121594399 121594120 Y NA NA MIR100HG,MIR125B1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 273206 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 122311334 122311672 122311591 Y NA NA SC5DL,MIR100HG,MIR125B1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-166D19.1 326303 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 122586167 122586342 122586202 Y NA NA NA NA NA NA RPL34P23 318233 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 122888881 122889273 122889127 Y NA RPL34P23,SNORD14D,SNORD14C,HSPA8 NA NA NA NA RPL34P23 15302 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 123008344 123008427 123008386 Y CLMP NA NA NA NA NA CLMP 55562 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 123352361 123352657 123352509 Y OR8D4,OR6M1 GRAMD1B CLMP IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD1B 41687 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 123381868 123382248 123382089 Y SCN3B,GRAMD1B GRAMD1B GRAMD1B IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD1B 12096 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 123394284 123394590 123394437 Y NA NA NA NA NA NA GRAMD1B 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 123519920 123520232 123520133 Y OR8D4,SCN3B SCN3B NA NA NA NA SCN3B 3720 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 123605051 123605192 123605122 Y NA ZNF202,RNU1-21P NA NA NA NA ZNF202 5191 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 124668888 124669222 124669022 Y NA NA NA NA NA NA NRGN 61146 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 125145861 125146105 125145988 Y PKNOX2,FEZ1 NA NA NA NA NA PKNOX2 113278 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 125560855 125560979 125560917 Y NA NA NA NA NA NA CHEK1 67819 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 125898187 125898226 125898207 Y CDON CDON NA NA NA NA CDON 33004 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 125904022 125904031 125904027 Y NA CDON NA NA NA NA CDON 27199 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 125983623 125983738 125983673 Y CDON NA HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 CDON 52393 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 125985079 125985242 125985162 Y CDON,ST3GAL4 NA HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 CDON 53849 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 128385518 128386026 128385881 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 69427 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 129871629 129871941 129871631 Y NA PRDM10,TCEB2P2 NA NA NA NA PRDM10 899 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 131211751 131211940 131211820 Y NA NA NTM IMR90 Hi-C 24141950 SNX19 427347 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 131759058 131759559 131759199 Y NA NA NA NA NA NA SNX19 974654 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 131995649 131996509 131995944 Y NTM NA NA NA NA NA SNX19 1211245 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 132411283 132411428 132411357 Y NA NA NA NA NA NA IGSF9B 1413452 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 133804654 133804943 133804849 Y NA IGSF9B NA NA NA NA IGSF9B 19937 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr11 133812912 133813249 133813081 Y NA IGSF9B LOC283174 IMR90 Hi-C 24141950 IGSF9B 11631 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr11 133814977 133815479 133815368 Y NCAPD3,IGSF9B IGSF9B NA NA NA NA IGSF9B 9401 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 133820960 133821043 133820967 Y IGSF9B IGSF9B NA NA NA NA IGSF9B 3837 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 133823506 133823792 133823624 Y NA IGSF9B NA NA NA NA IGSF9B 1088 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr11 133825450 133825979 133825755 Y NA IGSF9B NA NA NA NA IGSF9B 570 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr11 133903772 133904156 133904071 Y NA RP11-713P17.3,JAM3 NA NA NA NA RP11-713P17.3 3605 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr11 133940508 133940868 133940637 Y NA RP11-713P17.3,JAM3 NA NA NA NA JAM3 3688 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 298364 298488 298415 Y IQSEC3 NA NA NA NA NA CCDC77 197951 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 860254 860664 860544 Y RAD52,NINJ2,WNK1 WNK1 NA NA NA NA WNK1 495 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr12 864034 864343 864158 Y CCDC77,KDM5A WNK1 NA NA NA NA WNK1 4275 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 1026879 1027238 1027070 Y NA NA NA NA NA NA RAD52 69981 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr12 1029926 1030313 1030120 Y WNK1 NA NA NA NA NA RAD52 66906 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 1407863 1408257 1407945 Y NA NA NA NA NA NA WNT5B 228800 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 1643252 1643620 1643470 Y NA WNT5B ERC1,LOC100292680,FBXL14 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5B 6195 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 1698560 1698670 1698614 Y FBXL14 FBXL14 NA NA NA NA FBXL14 2661 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 1770869 1771337 1771069 Y LRTM2,ADIPOR2 ADIPOR2 NA NA NA NA ADIPOR2 24403 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 2144277 2144357 2144308 Y LRTM2 DCP1B CACNA1C,MIR3649,CACNA2D4,ADIPOR2,DCP1B,LOC100652846,WNT5B IMR90 Hi-C 24141950 DCP1B 32576 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 2175107 2175395 2175116 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 63406 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 2195948 2196150 2196103 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 84247 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 2393331 2393479 2393338 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 281630 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 2403977 2404382 2404036 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 292276 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 2547305 2547477 2547330 Y NA NA NA NA NA NA CACNA1C-AS1 250889 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 2893281 2893436 2893294 Y NRIP2 CBX3P4,FKBP4,ITFG2,RP4-816N1.6 NRIP2,CACNA1C,FKBP4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CBX3P4 8025 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 2902210 2902546 2902293 Y NA CBX3P4,FKBP4,ITFG2,RP4-816N1.6 NA NA NA NA FKBP4 91 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 3216295 3216423 3216359 Y NA TSPAN9 NA NA NA NA TSPAN9 31774 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 3361586 3361942 3361797 Y NA RP11-543P15.1 NA NA NA NA RP11-543P15.1 42490 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 3948349 3948613 3948479 Y NA PARP11 NA NA NA NA PARP11 31995 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 4378284 4379414 4378568 Y PARP11,C12orf4,CCND2,C12orf5 C12orf5 PARP11 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf5 48957 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 4396260 4396408 4396285 Y NA C12orf5 NA NA NA NA C12orf5 31963 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 4770172 4770413 4770176 Y NA AKAP3,NDUFA9 NA NA NA NA NDUFA9 13911 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 5589537 5589706 5589616 Y NA NA NA NA NA NA VWF 642230 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 6291358 6291755 6291562 Y VWF,CD9 CD9 VWF,PLEKHG6,CD9 IMR90 Hi-C 24141950 CD9 15126 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 6383862 6383986 6383924 Y ACRBP NA VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFRSF1A 65294 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 6616640 6616858 6616680 Y NA VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH,IFFO1 NA NA NA NA SCARNA10 530 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 6663248 6663743 6663420 Y GPR162,ENO2,C12orf53,VAMP1,IFFO1 SCARNA10,GAPDH,IFFO1,NOP2 NA NA NA NA IFFO1 9 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr12 6717352 6717716 6717682 Y SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP NOP2,CHD4 NA NA NA NA CHD4 2710 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr12 6721904 6722326 6722186 Y GPR162,ENO2,C12orf53 NOP2,CHD4,ING4 NA NA NA NA CHD4 7262 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 6873427 6873901 6873603 Y C12orf53,ENO2,CLSTN3,ATN1,PTMS,GPR162 COPS7A,PTMS,MLF2 LEPREL2,CDCA3,TPI1,CD4,GPR162,SPSB2,GNB3,USP5 IMR90 Hi-C 24141950 MLF2 740 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 6962211 6962407 6962304 Y GAPDH,COPS7A,COPS7A,COPS7A,COPS7A,LEPREL2,USP5,USP5,TPI1,TPI1 GPR162,LEPREL2,CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2 NA NA NA NA USP5 2919 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 7000184 7000641 7000294 Y PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6 CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57 NA NA NA NA SPSB2 3662 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr12 7100414 7100432 7100423 Y NA RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3 NA NA NA NA C1S 6063 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 7592182 7592797 7592685 Y PEX5,NANOG RP11-157G21.2,CD163L1 NA NA NA NA RP11-157G21.2 1596 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 8111188 8111554 8111190 Y NA SLC2A3 SLC2A3 K562 ChIA-PET 22265404 SLC2A3 24317 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 8123169 8123746 8123395 Y CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3 SLC2A3 SLC2A3,FOXJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC2A3 36298 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 8179132 8179551 8179335 Y NA FOXJ2 PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 3748 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr12 8840377 8840836 8840579 Y RIMKLB MFAP5,RIMKLB RIMKLB MCF7 ChIA-PET 22265404 RIMKLB 8181 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 9982493 9982805 9982658 Y KLRB1,CD69,KLRD1,KLRD1,KLRF1 NA NA NA NA NA GABARAPL1 380252 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 10306018 10306454 10306037 Y NA NA NA NA NA NA GABARAPL1 56603 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 11648641 11648718 11648680 Y NA NA BCL2L14 IMR90 Hi-C 24141950 ETV6 152070 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 11806275 11806670 11806607 Y BCL2L14,ETV6 ETV6 NA NA NA NA ETV6 5487 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 11838255 11838510 11838381 Y NA ETV6 NA NA NA NA ETV6 37467 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 11872628 11873141 11872822 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 71840 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 11902953 11903896 11903427 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 102165 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 11966137 11966507 11966203 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 165349 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 11983185 11983541 11983219 Y NA NA NA NA NA NA ETV6 182397 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 12009987 12010279 12010170 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 209199 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 12084529 12084746 12084638 Y NA NA LOC338817 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-267J23.4 177351 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 12298245 12298581 12298464 Y LRP6 RP11-267J23.4 NA NA NA NA RP11-267J23.4 36148 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 12408234 12408471 12408413 Y NA LRP6 NA NA NA NA LRP6 9475 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr12 12504083 12504386 12504252 Y BCL2L14,MANSC1 MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1 NA NA NA NA MANSC1 2608 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 12711175 12711335 12711320 Y NA DUSP16 NA NA NA NA DUSP16 1982 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 12872470 12873013 12872652 Y MANSC1,LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B,APOLD1 GPR19,CDKN1B NA NA NA NA CDKN1B 6478 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 13253893 13254547 13254171 Y CDKN1B,EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 58675 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 13292095 13292429 13292230 Y NA NA EMP1,HTR7P1,KIAA1467,GSG1 IMR90 Hi-C 24141950 EMP1 55221 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 13643087 13643098 13643093 Y NA NA NA NA NA NA EMP1 295437 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 15514461 15514838 15514654 Y PTPRO PTPRO,RERG NA NA NA NA RERG 14852 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 16553699 16554214 16553898 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 55623 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 16554253 16554721 16554664 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 56177 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 16817876 16817986 16817888 Y LMO3 NA NA NA NA NA LMO3 56348 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 19048962 19049238 19049131 Y NA NA PIK3C2G IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHA5 231410 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 19291558 19291779 19291581 Y AEBP2,PLEKHA5 PLEKHA5 NA NA NA NA PLEKHA5 10910 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 20365637 20365979 20365748 Y NA NA NA NA NA NA PDE3A 154200 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 21039353 21039668 21039511 Y NA NA NA NA NA NA PDE3A 519174 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 22654594 22654831 22654713 Y NA NA NA NA NA NA ST8SIA1 66619 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 22779557 22779668 22779574 Y NA ETNK1 NA NA NA NA ETNK1 3548 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 23804787 23805114 23804951 Y NA NA NA NA NA NA SOX5 296852 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 24062598 24062930 24062672 Y SOX5 SOX5 NA NA NA NA SOX5 39036 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 24549320 24549550 24549435 Y NA NA NA NA NA NA RP11-444D3.1 163974 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 24952536 24952732 24952634 Y NA NA NA NA NA NA BCAT1 147661 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 24990714 24991079 24990897 Y NA NA NA NA NA NA BCAT1 109314 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 25053045 25053436 25053335 Y KRAS,BCAT1,BCAT1,BCAT1 BCAT1 NA NA NA NA BCAT1 46957 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 25075175 25075409 25075293 Y KRAS,BCAT1,BCAT1 BCAT1,RP11-662I13.1 NA NA NA NA BCAT1 24984 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 25099512 25100288 25099550 Y BCAT1 BCAT1,RP11-662I13.1 NA NA NA NA BCAT1 105 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 25537800 25538060 25537930 Y NA RNU4-67P BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-67P 17302 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 25538390 25538869 25538521 Y NA RNU4-67P BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-67P 16493 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA RNU4-67P BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-67P 15955 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.06771514977192 chr12 26267263 26267811 26267415 Y NA SSPN,BHLHE41 NA NA NA NA SSPN 5113 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 26658315 26658658 26658486 Y NA NA NA NA NA NA ITPR2 325473 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 27379304 27379685 27379495 Y NA STK38L STK38L,MED21,FGFR1OP2 IMR90 Hi-C 24141950 STK38L 15216 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 27484254 27484540 27484416 Y FGFR1OP2,STK38L ARNTL2 NA NA NA NA ARNTL2 467 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 27513734 27513812 27513790 Y NA ARNTL2 NA NA NA NA ARNTL2 29947 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 28433746 28433796 28433771 Y NA RNU4-54P NA NA NA NA RNU4-54P 36600 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 28501330 28501622 28501413 Y NA RNU4-54P NA NA NA NA RNU4-54P 30934 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 29312653 29312987 29312866 Y NA FAR2 FAR2 IMR90 Hi-C 24141950 FAR2 12617 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 29395961 29396397 29396130 Y NA NA NA NA NA NA RP11-996F15.2 72384 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 29601520 29601624 29601572 Y NA NA NA NA NA NA ERGIC2 69398 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 30949517 30949896 30949519 Y CAPRIN2 CAPRIN2,LINC00941 NA NA NA NA LINC00941 3540 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 31464460 31464546 31464537 Y NA FAM60A NA NA NA NA FAM60A 13446 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 31602301 31602617 31602553 Y NA NA NA NA NA NA FAM60A 124309 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 31804886 31805136 31805063 Y NA METTL20 NA NA NA NA METTL20 6792 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 5.4794451468956 chr12 32263319 32263494 32263407 Y NA BICD1 NA NA NA NA BICD1 5550 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 32426821 32426960 32426892 Y NA NA NA NA NA NA BICD1 169052 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 32738766 32738845 32738790 Y NA NA NA NA NA NA DNM1L 91289 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 32842101 32842415 32842258 Y NA DNM1L,RP11-278C7.1 NA NA NA NA DNM1L 11967 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 32881013 32881116 32881065 Y NA RP11-278C7.1,YARS2 NA NA NA NA RP11-278C7.1 2692 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 39104065 39104215 39104143 Y CPNE8 NA NA NA NA NA CPNE8 195017 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr12 39766876 39767120 39766998 Y NA NA NA NA NA NA KIF21A 68072 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 39800065 39800203 39800134 Y NA KIF21A NA NA NA NA KIF21A 34989 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 39808802 39808894 39808882 Y NA KIF21A NA NA NA NA KIF21A 26298 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 39816699 39816988 39816844 Y NA KIF21A NA NA NA NA KIF21A 18204 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 40250890 40251201 40251046 Y NA NA NA NA NA NA ABCD2 239337 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 41264985 41265046 41264997 Y CNTN1 NA NA NA NA NA CNTN1 180741 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 44944990 44945321 44945156 Y NELL2,NELL2,NELL2,DBX2 NA NA NA NA NA NELL2 368310 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 45626822 45627300 45627014 Y ANO6,ANO6 ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 18998 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 45627812 45628672 45628351 Y ANO6,ANO6 ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 19988 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 45628991 45629732 45629167 Y ANO6,ANO6 ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 21167 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 45644542 45644793 45644668 Y ANO6 ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 36718 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 45820263 45820702 45820515 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA8P1 212439 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 46398489 46398694 46398592 Y NA SCAF11 SCAF11 MCF7 ChIA-PET 22265404 SCAF11 14586 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 46571353 46571525 46571439 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A1 90275 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr12 46571692 46571878 46571769 Y SLC38A1 NA NA NA NA NA SLC38A1 89922 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 46603605 46603977 46603918 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A1 57823 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 46608402 46609191 46609043 Y ARID2,SCAF11,SLC38A1 NA NA NA NA NA SLC38A1 52609 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 46609835 46610258 46610179 Y ARID2,SCAF11,SLC38A1 NA NA NA NA NA SLC38A1 51542 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 46636369 46636708 46636589 Y SCAF11,SLC38A1 SLC38A1 NA NA NA NA SLC38A1 25092 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 47074564 47074850 47074707 Y NA NA SLC38A1,SLC38A2,SLC38A4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 299102 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 48053201 48053247 48053224 Y ASB8 RPAP3,RP1-197B17.3 NA NA NA NA RPAP3 44597 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 48076459 48076736 48076534 Y NA RPAP3,RP1-197B17.3 NA NA NA NA RPAP3 21108 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 48202856 48203019 48202950 Y VDR,ASB8 RAPGEF3,HDAC7 NA NA NA NA HDAC7 21896 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 48579978 48580344 48580161 Y OR8S1,OR10AD1 ASB8,C12orf68,DKFZP779L1853 NA NA NA NA C12orf68 4612 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 49584331 49584382 49584372 Y CACNB3,PRPF40B,TUBA1A TUBA1C,TUBA1A NA NA NA NA TUBA1A 3224 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 49628278 49628526 49628405 Y LMBR1L,TUBA1A TUBA1C,TUBA1A DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1A 47171 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.65417211981754 chr12 49762011 49762098 49762055 Y TUBA1A,PRPF40B TROAP,C1QL4,SPATS2 NA NA NA NA SPATS2 3644 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 49801773 49801917 49801846 Y NA SPATS2 NA NA NA NA SPATS2 43406 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 50020601 50020960 50020800 Y FMNL3,PRPF40B NA NA NA NA NA PRPF40B 60600 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 50067341 50067888 50067543 Y TUBA1A,NCKAP5L,FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 31620 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 50092156 50092464 50092310 Y FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 7044 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 50218807 50218854 50218830 Y NA NCKAP5L,BCDIN3D NA NA NA NA NCKAP5L 1679 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 50221084 50221421 50221231 Y NCKAP5L NCKAP5L,BCDIN3D NA NA NA NA NCKAP5L 551 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 50378385 50378667 50378577 Y NA RACGAP1 NA NA NA NA RACGAP1 46252 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 50460197 50460562 50460363 Y NA RACGAP1,SMARCD1,GPD1 NA NA NA NA SMARCD1 16193 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 50555629 50555991 50555816 Y ACCN2,DIP2B CERS5 NA NA NA NA CERS5 3297 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 50788333 50788545 50788438 Y DIP2B LARP4 NA NA NA NA LARP4 4167 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 50860078 50860266 50860172 Y NA DIP2B NA NA NA NA DIP2B 36502 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 50902358 50902765 50902415 Y NA DIP2B NA NA NA NA DIP2B 5590 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 50931365 50931732 50931390 Y NA DIP2B NA NA NA NA DIP2B 34597 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 50936330 50936621 50936410 Y DIP2B DIP2B NA NA NA NA DIP2B 39562 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 51177941 51178161 51178051 Y POU6F1,FAM186A,LARP4,DIP2B,HIGD1C ATF1 TMPRSS12 IMR90 Hi-C 24141950 ATF1 22448 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 51322260 51322312 51322286 Y DIP2B METTL7A NA NA NA NA METTL7A 7005 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 51536826 51537135 51537116 Y CSRNP2 RP11-416A17.1,TFCP2 NA NA NA NA TFCP2 27791 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 51786511 51786834 51786676 Y SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,CSRNP2,DAZAP2,BIN2,GALNT6 SLC4A8,GALNT6 NA NA NA NA GALNT6 1860 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 51833393 51833425 51833407 Y NA GALNT6 NA NA NA NA GALNT6 48742 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 51986166 51986575 51986504 Y NA SCN8A NA NA NA NA SCN8A 4116 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 52146424 52146626 52146525 Y NA NA NA NA NA NA ACVRL1 152066 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 52241099 52241559 52241297 Y NA NA SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACVRL1 57133 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 52241760 52242326 52241842 Y SLC4A8,FIGNL2 NA SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACVRL1 56366 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 52242460 52242886 52242778 Y SLC4A8,ANKRD33 NA SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACVRL1 55806 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 52257879 52258204 52258030 Y NA ACVRL1 SCN8A,ACVR1B,SLC4A8 IMR90 Hi-C 24141950 ACVRL1 40488 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 52262826 52263308 52263216 Y NA ACVRL1 SCN8A,ACVR1B,SLC4A8 IMR90 Hi-C 24141950 ACVRL1 35384 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 52364914 52365223 52365052 Y GRASP ACVR1B,GRASP,NR4A1 NA NA NA NA ACVR1B 21463 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 52418719 52418897 52418793 Y NR4A1,ACVRL1,GRASP,NR4A1 GRASP,NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 4103 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 52419301 52419935 52419633 Y NR4A1,GRASP,NR4A1 GRASP,NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 4685 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 52423514 52423824 52423679 Y NA GRASP,NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 8898 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 52426305 52426422 52426334 Y NR4A1,GRASP,NR4A1 GRASP,NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 11689 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 52426547 52427164 52426822 Y NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP GRASP,NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 11931 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.24062908986315 chr12 52596776 52597514 52597151 Y NR4A1 NA NA NA NA NA C12orf44 135746 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 52973884 52973999 52973956 Y NA NA NA NA NA NA RP3-416H24.4 201640 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 53253974 53254173 53254090 Y RARG,KRT6A,KRT5 NA KRT83,KRT82,KRT6A,KRT79,KRT78,KRT6B,KRT2,LOC283404,LOC283403,KRT81,KRT84,KRT85,KRT75,KRT6C,KRT71,KRT72,KRT73,KRT1,KRT77,KRT4 IMR90 Hi-C 24141950 KRT18 86482 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 53267781 53268340 53268093 Y PFDN5 NA KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT18 72315 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 53273269 53273433 53273418 Y NA NA NA NA NA NA KRT18 67222 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 53615195 53615822 53615501 Y CSAD,SP1,PRR13,PFDN5 ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1 NA NA NA NA RARG 8942 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr12 53885903 53886227 53886219 Y NA MAP3K12,TARBP2 NA NA NA NA MAP3K12 5620 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 53955466 53955638 53955506 Y NA NA NA NA NA NA ATF7 62561 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 54012118 54012371 54012242 Y PFDN5 ATF7 NA NA NA NA ATF7 5828 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 54052823 54053029 54052960 Y NA ATF7,ATP5G2 NA NA NA NA ATP5G2 16163 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 54391907 54392298 54392098 Y ATP5G2,HOXC8,HOXC6,HOXC4,HOXC12,HOXC10,HOXC9 HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5 NA NA NA NA HOXC-AS1 113 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 54400746 54401119 54400931 Y NA HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC8 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 54411861 54412590 54411908 Y COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4 HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC8 11029 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 54413422 54413659 54413446 Y ATP5G2,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5 HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC5 10978 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 54413878 54414161 54414065 Y HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5 HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC5 10476 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr12 54415475 54415883 54415632 Y NA HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC5 8754 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 54563652 54563918 54563802 Y NA RP11-834C11.4,SMUG1 NA NA NA NA SMUG1 16860 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 54745877 54746035 54745904 Y NA NA NA NA NA NA COPZ1 52891 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 54749329 54749578 54749455 Y NA NA NA NA NA NA COPZ1 56343 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 54752421 54752649 54752549 Y NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84 NA NA NA NA NA COPZ1 59435 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 54752671 54753884 54753119 Y NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84 NA NA NA NA NA COPZ1 59685 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr12 55806634 55807051 55806823 Y NA NA NA NA NA NA METTL7B 266279 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 55807914 55808439 55808095 Y NA NA NA NA NA NA METTL7B 264891 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 55808460 55808880 55808766 Y NA NA NA NA NA NA METTL7B 264450 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 56132069 56132385 56132308 Y OR6C4,OR10P1,SMARCC2,IKZF4 BLOC1S1,ITGA7,RP11-644F5.11,CD63,GDF11 NA NA NA NA GDF11 2679 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 56150085 56150369 56150213 Y OR6C6,IKZF4 BLOC1S1,ITGA7,RP11-644F5.11,CD63,GDF11 NA NA NA NA GDF11 15021 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 56219844 56220081 56219962 Y OR6C3 SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14 NA NA NA NA TMEM198B 1448 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 56831514 56831759 56831654 Y IKZF4 TIMELESS,SPRYD4,GLS2 NA NA NA NA TIMELESS 9428 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 56877461 56877501 56877482 Y NA TIMELESS,SPRYD4,GLS2,RP11-153M3.1,RBMS2 NA NA NA NA GLS2 2697 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 57026164 57026397 57026368 Y NA BAZ2A,SNORD59A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 2203 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,SNORD59A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 3.61850151210087 chr12 57162340 57162564 57162470 Y PAN2,PAN2,APOF,SPRYD4,GLS2,RDH16,GPR182,HSD17B6 NACA,PRIM1 NA NA NA NA PRIM1 18183 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 57458942 57459239 57459094 Y NA TAC3,TMEM194A,NAB2 TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM194A 20607 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 57520981 57521279 57521090 Y NA TMEM194A,NAB2,LRP1 NA NA NA NA LRP1 705 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 57557421 57557508 57557464 Y NA LRP1 NA NA NA NA LRP1 37145 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 57735992 57736374 57736348 Y NA NA R3HDM2 IMR90 Hi-C 24141950 R3HDM2 86414 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 57746067 57746152 57746110 Y NA NA R3HDM2,INHBE,ARHGAP9,GLI1 IMR90 Hi-C 24141950 R3HDM2 76636 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 57813803 57814254 57814252 Y NA R3HDM2,INHBE,GLI1 NA NA NA NA R3HDM2 8534 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 57855378 57855667 57855523 Y NA R3HDM2,INHBE,GLI1,MARS NA NA NA NA GLI1 3460 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 58094555 58094631 58094593 Y NA OS9,AGAP2-AS1,TSPAN31 NA NA NA NA OS9 8817 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 58187748 58188085 58187957 Y DDIT3,OS9 MARCH9,CDK4,METTL21B,METTL1,RP11-571M6.15,TSFM NA NA NA NA TSFM 13376 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 58281637 58282038 58281777 Y CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM CTDSP2,RP11-620J15.3 CTDSP2,TSFM,AVIL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTDSP2 43115 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 58337769 58337952 58337777 Y NA RP11-620J15.3,XRCC6BP1 NA NA NA NA XRCC6BP1 4445 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 61495854 61496021 61495938 Y NA NA NA NA NA NA USP15 1156098 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 62772980 62773240 62773147 Y MON2,USP15 NA NA NA NA NA MON2 85357 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 62796049 62796447 62796072 Y NA NA NA NA NA NA MON2 62150 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 63120395 63120633 63120547 Y NA NA NA NA NA NA MIRLET7I 124929 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 64850943 64851361 64850994 Y NA TBK1 NA NA NA NA TBK1 7283 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 64855437 64855720 64855602 Y C12orf66,TBK1 TBK1 NA NA NA NA TBK1 11777 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 65005842 65006280 65005896 Y GNS,C12orf66,TBK1,RASSF3 RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 3549 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 65015023 65015259 65015145 Y TBK1,RASSF3 RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 12730 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 65076423 65076649 65076481 Y NA NA NA NA NA NA RASSF3 74130 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 65077868 65077886 65077879 Y RASSF3,LEMD3 NA NA NA NA NA GNS 73341 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 65194398 65194833 65194618 Y TBK1,RASSF3,LEMD3,GNS GNS,TBC1D30 TBC1D30,FLJ41278 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBC1D30 21809 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 66012877 66013074 66012996 Y NA NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-118B13.1 415941 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 66089335 66089636 66089544 Y IRAK3 NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-118B13.1 339379 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 68705850 68706149 68706026 Y IL22,SLC35E3,NUP107,MDM2,MDM1 MDM1 NA NA NA NA MDM1 18012 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 69006143 69006530 69006154 Y CPM,IFNG,RAP1B RAP1B,RP11-254B13.3 NA NA NA NA RAP1B 3524 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 69019747 69019936 69019838 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3 NA NA NA NA RP11-254B13.3 14837 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr12 69150078 69150205 69150130 Y NA SLC35E3,MDM2 NA NA NA NA SLC35E3 12192 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 69179281 69179795 69179458 Y CPM,RAP1B SLC35E3,MDM2 NA NA NA NA MDM2 20161 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 69227269 69227544 69227345 Y SLC35E3 MDM2 NA NA NA NA MDM2 27313 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 69634325 69634686 69634559 Y SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6 CPSF6,RP11-1143G9.2 NA NA NA NA CPSF6 3008 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr12 69686526 69686874 69686654 Y NA RP11-1143G9.2 NA NA NA NA RP11-1143G9.2 10349 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 69724869 69725108 69724964 Y LYZ RP11-1143G9.2,YEATS4 YEATS4 K562 ChIA-PET 22265404 YEATS4 26375 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 69797421 69797731 69797518 Y NA YEATS4 NA NA NA NA YEATS4 45938 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 69839614 69839824 69839719 Y CPSF6,FRS2,CCT2,CCT2,YEATS4 FRS2 FRS2 IMR90 Hi-C 24141950 FRS2 22305 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 69868200 69868446 69868430 Y CPSF6,YEATS4,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2 FRS2 NA NA NA NA FRS2 6071 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 70388549 70388859 70388715 Y CCT2,CCT2,RAB3IP NA PTPRB IMR90 Hi-C 24141950 CNOT2 245915 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 70558769 70558849 70558809 Y NA NA NA NA NA NA CNOT2 75925 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 70630767 70631060 70630914 Y NA CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA CNOT2 3714 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 70644560 70644959 70644584 Y NA CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA RP11-611E13.2 9420 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 70648828 70649035 70648891 Y RAB3IP,CNOT2,CNOT2,CNOT2 CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA RP11-611E13.2 13688 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 70650618 70650832 70650694 Y NA CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA RP11-611E13.2 15478 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 70937766 70937789 70937778 Y NA NA NA NA NA NA PTPRB 91431 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 71037443 71037574 71037509 Y PTPRR,KCNMB4 PTPRB NA NA NA NA PTPRB 8223 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 71039604 71039990 71039715 Y NA PTPRB NA NA NA NA PTPRB 10384 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 71040722 71040853 71040780 Y CNOT2,CNOT2,CNOT2,PTPRB PTPRB NA NA NA NA PTPRB 11502 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 71042778 71042865 71042804 Y NA PTPRB NA NA NA NA PTPRB 13558 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 71085208 71085379 71085280 Y NA NA NA NA NA NA PTPRB 55988 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 71197742 71197870 71197806 Y NA NA NA NA NA NA PTPRR 114753 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 72875098 72875358 72875202 Y TRHDE NA NA NA NA NA TRHDE-AS1 208411 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 75877380 75877665 75877492 Y GLIPR1 GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA GLIPR1 4920 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 75878955 75879237 75879096 Y NA GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA GLIPR1 6495 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 75885817 75885886 75885852 Y KRR1 GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA GLIPR1 13357 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 75900907 75901415 75901091 Y KRR1 GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA KRR1 2001 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 76034915 76034997 76034960 Y NA NA PHLDA1 IMR90 Hi-C 24141950 KRR1 131499 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 76060831 76060974 76060901 Y NA NA PHLDA1,OSBPL8 IMR90 Hi-C 24141950 KRR1 157415 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 76206207 76206725 76206399 Y GLIPR1 NA NA NA NA NA PHLDA1 218987 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 76209246 76209451 76209339 Y NA NA PHLDA1,NAP1L1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PHLDA1 216261 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 76429051 76429248 76429150 Y NA PHLDA1,NAP1L1 NA NA NA NA PHLDA1 3339 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 76849053 76849336 76849202 Y OSBPL8 NA NA NA NA NA OSBPL8 102253 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 76919848 76920276 76920185 Y ZDHHC17,OSBPL8 OSBPL8 NA NA NA NA OSBPL8 31313 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 76942062 76942423 76942413 Y NA OSBPL8 NA NA NA NA OSBPL8 9166 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 76949947 76950382 76950258 Y ZDHHC17,OSBPL8 OSBPL8 NA NA NA NA OSBPL8 1207 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 76982645 76982853 76982748 Y OSBPL8 OSBPL8 OSBPL8,ZDHHC17 IMR90 Hi-C 24141950 OSBPL8 31056 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 77060081 77060100 77060091 Y NA NA E2F7,ZDHHC17 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC17 95268 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 77251083 77251471 77251277 Y NA CSRP2 NA NA NA NA CSRP2 19369 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 77426192 77426447 77426357 Y OSBPL8 E2F7 NA NA NA NA E2F7 30913 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 77456593 77456922 77456786 Y E2F7 E2F7 NA NA NA NA E2F7 438 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 78134909 78135174 78135084 Y NA NA NA NA NA NA RP1-34H18.1 418488 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 78940817 78940832 78940824 Y NA NA NA NA NA NA SYT1 314941 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 79279208 79279511 79279476 Y NA SYT1 NA NA NA NA SYT1 23435 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 79323956 79323978 79323967 Y NA NA NA NA NA NA SYT1 68183 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 79324302 79324765 79324409 Y SYT1,SYT1,SYT1 NA NA NA NA NA SYT1 68529 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 79341300 79341393 79341341 Y SYT1,SYT1 NA NA NA NA NA SYT1 85527 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 79356068 79356388 79356099 Y NA NA NA NA NA NA SYT1 100295 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 79363511 79363565 79363558 Y NA NA NA NA NA NA SYT1 107738 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 79444921 79445122 79445022 Y NA NA NA NA NA NA SYT1 189148 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 79462781 79463098 79462967 Y NA NA NA NA NA NA SYT1 207008 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 79608943 79609085 79609014 Y NA NA NA NA NA NA SYT1 353170 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 79670829 79671264 79670913 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 411613 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 79759610 79759960 79759786 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 322917 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 79817704 79817772 79817737 Y SYT1 NA NA NA NA NA PAWR 265105 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr12 79817950 79818263 79818028 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 264614 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 81271643 81271697 81271669 Y LIN7A NA NA NA NA NA LIN7A 58007 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 82155346 82155393 82155380 Y NA PPFIA2 NA NA NA NA PPFIA2 4014 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 83157091 83157416 83157138 Y NA NA NA NA NA NA TMTC2 78432 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 87130786 87131140 87131095 Y MGAT4C NA NA NA NA NA NTS 864713 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 88526600 88526872 88526736 Y NA CEP290,TMTC3 NA NA NA NA CEP290 7121 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 88828245 88828424 88828303 Y NA NA KITLG IMR90 Hi-C 24141950 KITLG 144204 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 88968059 88968366 88968242 Y NA KITLG NA NA NA NA KITLG 4262 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr12 89727563 89727887 89727725 Y ATP2B1,DUSP6 DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 17161 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 89747699 89748479 89748073 Y NA DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 2651 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr12 89845741 89845891 89845816 Y NA NA NA NA NA NA POC1B 71910 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 89910622 89910739 89910701 Y NA POC1B,GALNT4,POC1B-GALNT4 NA NA NA NA POC1B 7062 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 90234297 90234607 90234486 Y DUSP6,ATP2B1 NA NA NA NA NA ATP2B1 133220 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 90371593 90371911 90371750 Y NA NA NA NA NA NA ATP2B1 270516 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 90403694 90404042 90403890 Y NA NA LOC338758 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B1 302617 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 91900299 91900534 91900371 Y NA NA NA NA NA NA DCN 325399 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 92172749 92173207 92172879 Y BTG1 NA LOC256021 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-796E2.4 364142 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 92424488 92424877 92424862 Y BTG1 NA NA NA NA NA RP11-796E2.4 112472 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 92436632 92436991 92436801 Y BTG1 NA NA NA NA NA RP11-796E2.4 100358 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 92446330 92446640 92446498 Y BTG1 NA NA NA NA NA RP11-796E2.4 90709 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 92469930 92470196 92470132 Y BTG1 NA NA NA NA NA RP11-796E2.4 67153 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 92500767 92501208 92501155 Y NA RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA RP11-796E2.4 36141 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 92505299 92505700 92505686 Y NA RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA RP11-796E2.4 31649 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 92517978 92518398 92518142 Y BTG1 RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA RP11-796E2.4 18951 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr12 92528487 92528918 92528861 Y BTG1 RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA RP11-796E2.4 8431 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 92756580 92756813 92756713 Y BTG1,C12orf74 NA NA NA NA NA BTG1 218907 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 92914414 92914543 92914474 Y BTG1,CLLU1OS NA LOC256021 MCF7 ChIA-PET 22265404 BTG1 376741 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 93277124 93277496 93277306 Y NA EEA1 NA NA NA NA EEA1 43611 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 93709037 93709216 93709174 Y NA NA NA NA NA NA NUDT4 60443 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 93805604 93805748 93805676 Y CRADD NUDT4,UBE2N NA NA NA NA UBE2N 28290 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 93827795 93828172 93827984 Y NA UBE2N,MRPL42 NA NA NA NA UBE2N 5866 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 93890331 93890756 93890540 Y NA MRPL42 NA NA NA NA MRPL42 31067 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 94135673 94136306 94136137 Y NUDT4,SOCS2 NA NA NA NA NA CRADD 66522 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 94178297 94178734 94178344 Y CRADD NA NA NA NA NA CRADD 109146 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 94201755 94201874 94201816 Y NA NA NA NA NA NA CRADD 132604 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 94495978 94496358 94496187 Y NA PLXNC1 CRADD,LOC144481,SOCS2,MRPL42,UBE2N IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLXNC1 44141 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 94581330 94581746 94581508 Y TMCC3,PLXNC1 PLXNC1 CCDC41 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNC1 40831 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 94678246 94678308 94678278 Y PLXNC1,TMCC3 NA NA NA NA NA PLXNC1 137747 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 94681590 94681805 94681698 Y NA NA NA NA NA NA RBMS2P1 134940 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 94773845 94774167 94774046 Y PLXNC1,TMCC3 RBMS2P1 NA NA NA NA RBMS2P1 42578 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr12 94919144 94919451 94919150 Y NA NA PLXNC1 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC41 67380 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 95477787 95477978 95477880 Y NA NR2C1 NR2C1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NR2C1 12308 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 95680646 95681018 95680718 Y NA NA NA NA NA NA VEZT 71124 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 96593675 96593812 96593739 Y NA ELK3 NA NA NA NA ELK3 7515 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 96627830 96628313 96628063 Y NA ELK3 NA NA NA NA ELK3 41670 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 96649758 96650321 96650168 Y ELK3,CDK17 NA NA NA NA NA ELK3 63598 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 96752607 96752772 96752695 Y CDK17 CDK17 NA NA NA NA CDK17 39566 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 96819918 96820022 96819970 Y NA CDK17 CDK17,ELK3,LTA4H IMR90 Hi-C 24141950 CDK17 27580 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 97355714 97355975 97355919 Y NA NA NA NA NA NA NEDD1 56713 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 98934224 98934627 98934333 Y NA TMPO,TMPO-AS1 NA NA NA NA TMPO-AS1 26024 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 99043983 99044295 99044139 Y NA IKBIP,APAF1 NA NA NA NA APAF1 7064 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 99541793 99542207 99542018 Y NA NA NA NA NA NA APAF1 504874 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 100518805 100519127 100519119 Y NA UHRF1BP1L NA NA NA NA UHRF1BP1L 15499 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 100628061 100628323 100628191 Y NA ACTR6,RP11-175P13.3,SCYL2 NA NA NA NA SCYL2 30595 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 100970454 100970954 100970686 Y NA GAS2L3 NA NA NA NA RP11-575G13.2 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 102009746 102010171 102009968 Y MYBPC1 NA NA NA NA NA CHPT1 78554 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 104193580 104193857 104193839 Y NA NT5DC3 NA NA NA NA NT5DC3 39118 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 104330398 104330552 104330475 Y NA HSP90B1,C12orf73,TDG NA NA NA NA HSP90B1 8513 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 104658660 104659046 104658853 Y NA RPL18AP3,EID3 NA NA NA NA RPL18AP3 1604 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 104693849 104694220 104693862 Y NA RPL18AP3,EID3 NA NA NA NA EID3 1297 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 104846909 104846975 104846916 Y NA CHST11 NA NA NA NA CHST11 98 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 105020354 105020448 105020373 Y NA NA NA NA NA NA CHST11 173281 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 105032549 105032903 105032843 Y CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 185476 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 105062941 105063154 105062961 Y NA NA NA NA NA NA CHST11 215868 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 105477471 105477556 105477526 Y ALDH1L2 ALDH1L2,KIAA1033 NA NA NA NA ALDH1L2 1116 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 107363542 107363991 107363752 Y NA C12orf23,MTERFD3 NA NA NA NA MTERFD3 14953 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 107377522 107377900 107377585 Y RFX4,RIC8B,MTERFD3 C12orf23,MTERFD3 NA NA NA NA MTERFD3 1044 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 107473112 107473328 107473221 Y NA CRY1 NA NA NA NA CRY1 12279 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 107723329 107723653 107723513 Y NA BTBD11 NA NA NA NA BTBD11 13139 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 108056293 108056559 108056439 Y NA PWP1 NA NA NA NA PWP1 20950 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 108103294 108103307 108103300 Y PRDM4 PWP1,PRDM4 NA NA NA NA PWP1 25785 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 108297283 108297694 108297638 Y NA NA NA NA NA NA PRDM4 144234 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 108776877 108777008 108776943 Y NA NA WSCD2 IMR90 Hi-C 24141950 FICD 129954 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 108783050 108783376 108783111 Y NA NA WSCD2,CMKLR1 IMR90 Hi-C 24141950 FICD 123586 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 108990792 108990952 108990868 Y NA SART3,ISCU,TMEM119 NA NA NA NA TMEM119 696 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 109061186 109061401 109061295 Y SELPLG,SELPLG,SSH1 NA NA NA NA NA CORO1C 61971 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 109167575 109167781 109167683 Y NA CORO1C NA NA NA NA CORO1C 44203 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 109297152 109297589 109297254 Y SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 47786 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 109570576 109570747 109570637 Y ACACB ALKBH2,UNG,RP11-968O1.5 NA NA NA NA RP11-968O1.5 23553 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 110540205 110540443 110540322 Y NA C12orf76,IFT81 ANKRD13A,C12orf76,IFT81,ATP2A2,ANAPC7,ARPC3,GPN3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFT81 19697 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 110735237 110735389 110735298 Y NA ATP2A2 NA NA NA NA ATP2A2 18676 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 110931784 110931990 110931887 Y NA ARPC3,RPL31P49,GPN3,VPS29 NA NA NA NA VPS29 5932 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 111473237 111473713 111473408 Y CUX2 CUX2 NA NA NA NA CUX2 3409 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr12 111475040 111475231 111475136 Y NA CUX2 NA NA NA NA CUX2 5212 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 111494792 111495250 111495130 Y PPTC7,SH2B3,CUX2 CUX2 NA NA NA NA CUX2 24964 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 111883923 111883990 111883957 Y NA SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 42171 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 111904763 111905142 111904953 Y ALDH2,ATXN2 NA NA NA NA NA SH2B3 63011 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 111939312 111939650 111939575 Y NA NA NA NA NA NA ATXN2 95830 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 112018937 112019235 112019073 Y NA ATXN2 NA NA NA NA ATXN2 16245 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 112341708 112342051 112341878 Y ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116 NA NA NA NA NA MAPKAPK5 63926 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 112529504 112529724 112529616 Y NA NAA25,TRAFD1 NA NA NA NA NAA25 15102 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr12 112534496 112534670 112534605 Y ALDH2,TRAFD1 NAA25,TRAFD1 NA NA NA NA NAA25 10156 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 112759768 112760224 112759930 Y NA NA NA NA NA NA PTPN11 93931 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 113524315 113524473 113524399 Y DTX1 DTX1 NA NA NA NA DTX1 31801 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 113630509 113630869 113630677 Y NA DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA DDX54 9225 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 113667617 113667862 113667654 Y DTX1,IQCD,TPCN1 DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA IQCD 10718 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 114917726 114918063 114917895 Y NA NA TBX5,RBM19 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 201906 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 115103963 115104215 115104201 Y TBX3 TBX3 NA NA NA NA TBX3 15754 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 115105863 115106455 115106375 Y TBX3 TBX3 NA NA NA NA TBX3 13514 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 115123119 115123458 115123382 Y NA TBX3 NA NA NA NA TBX3 3150 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 115889491 115890073 115889778 Y NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 769522 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 116383050 116383163 116383141 Y NA NA NA NA NA NA MED13L 329980 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 116990477 116990812 116990735 Y MED13L,MAP1LC3B2 LINC00173 NA NA NA NA LINC00173 21250 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 117375665 117375672 117375669 Y NA FBXW8 NA NA NA NA FBXW8 28904 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 117871849 117872390 117872076 Y NOS1 NOS1 NA NA NA NA NOS1 15585 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 118012695 118013095 118012896 Y NA NA NA NA NA NA NOS1 124720 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 118157825 118158191 118158007 Y NA NA NA NA NA NA NOS1 269850 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 118263351 118263381 118263366 Y NA NA NA NA NA NA RFC5 186012 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 118466445 118466738 118466629 Y NA RFC5,WSB2 NA NA NA NA RFC5 17052 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 118815733 118815925 118815736 Y TAOK3 TAOK3,SUDS3 NA NA NA NA SUDS3 3548 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 120153680 120153798 120153737 Y NA NA NA NA NA NA PRKAB1 50122 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 120179533 120179605 120179597 Y NA NA NA NA NA NA PRKAB1 75975 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 120524802 120525368 120525019 Y CCDC64 RAB35 NA NA NA NA RAB35 27938 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 120956227 120956384 120956265 Y COQ5 RNF10,COQ5 NA NA NA NA RNF10 12899 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 121268399 121268878 121268839 Y NA NA NA NA NA NA SPPL3 71296 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 121310801 121311113 121311060 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 29061 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 121322345 121322363 121322358 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 17811 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 121533843 121533975 121533917 Y NA P2RX7 ACADS,UNC119B,P2RX4,POP5,CABP1,MLEC,SPPL3,C12orf43,OASL,P2RX7,CAMKK2 IMR90 Hi-C 24141950 P2RX7 34647 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 121838748 121839039 121838846 Y SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 2904 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 121839154 121839422 121839290 Y C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 3310 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr12 121864200 121864449 121864234 Y NA ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 28356 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 121888305 121888670 121888535 Y NA NA NA NA NA NA RNF34 52461 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 121904317 121904475 121904368 Y SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B NA RNF34 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF34 68473 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 122020162 122020238 122020212 Y RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3242 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 5.78960241936139 chr12 122020670 122020879 122020764 Y KDM2B,KDM2B RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3750 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 122028609 122028883 122028798 Y RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1 RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 KDM2B K562 ChIA-PET 22265404 KDM2B 11689 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr12 122227826 122228273 122227974 Y CAMKK2,KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF RHOF,AC084018.1,SETD1B NA NA NA NA RHOF 11036 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 122517490 122517922 122517629 Y RSRC2,KDM2B,SETD1B,MLXIP AC156455.1,MLXIP NA NA NA NA MLXIP 2862 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 122518432 122518585 122518507 Y MLXIP AC156455.1,MLXIP NA NA NA NA MLXIP 3804 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 122908043 122908483 122908329 Y ZCCHC8,DENR,CLIP1 CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 2864 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr12 123131126 123131793 123131490 Y CLIP1,RSRC2,VPS37B,HCAR3,HCAR2 NA NA NA NA NA DENR 103528 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 123362987 123363145 123363088 Y NA HIP1R,VPS37B NA NA NA NA VPS37B 15846 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 123377732 123378127 123378026 Y NA VPS37B NA NA NA NA VPS37B 864 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 124108091 124108301 124108196 Y NA TMED2,DDX55,EIF2B1,GTF2H3,TCTN2 NA NA NA NA EIF2B1 8012 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 124626388 124626730 124626547 Y NA NA NA NA NA NA FAM101A 170600 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 124717911 124718282 124718055 Y NA NA NA NA NA NA FAM101A 262123 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 124721310 124721532 124721425 Y NA NA NA NA NA NA FAM101A 265522 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 124866398 124866679 124866460 Y NCOR2 NA NA NA NA NA NCOR2 183456 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 124916261 124916578 124916546 Y NA NA NA NA NA NA NCOR2 133557 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 124985154 124985447 124985301 Y DHX37 NA NA NA NA NA NCOR2 64688 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 124991138 124991309 124991172 Y UBC,NCOR2 NA NA NA NA NA NCOR2 58826 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 125026162 125026505 125026332 Y NA NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 23630 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr12 125028947 125029179 125029054 Y NA NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 20956 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 125050536 125050830 125050706 Y NA NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 401 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 125050856 125051375 125051213 Y UBC,NCOR2 NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 721 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr12 125052829 125053041 125052928 Y NA NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 2694 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 125073637 125073873 125073849 Y UBC NCOR2 NCOR2 IMR90 Hi-C 24141950 NCOR2 23502 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 125117108 125117622 125117163 Y NCOR2 NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 NCOR2 66973 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 125158922 125159066 125158994 Y NA NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 NCOR2 108787 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 125197556 125198099 125197767 Y NCOR2,UBC NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 NCOR2 147421 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 125229298 125229517 125229417 Y NA NA NCOR2 IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 135697 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 125230587 125231048 125230629 Y NCOR2,UBC NA NCOR2 IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 134166 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 125259292 125259624 125259541 Y UBC NA NA NA NA NA SCARB1 105590 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 125346086 125346324 125346188 Y NA SCARB1 NA NA NA NA SCARB1 18890 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 125347630 125347766 125347649 Y NA SCARB1 NA NA NA NA SCARB1 17448 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 125403508 125403991 125403767 Y UBC SCARB1,UBC NCOR2,SCARB1,UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 3594 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 125423202 125423335 125423285 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 23288 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 125424077 125424667 125424516 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 24163 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 125425237 125425455 125425374 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 25323 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 125534116 125534467 125534247 Y NA AACS AACS K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 AACS 13458 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 125550830 125551017 125550923 Y NA AACS NA NA NA NA AACS 2905 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 125565000 125565015 125565008 Y AACS AACS NA NA NA NA AACS 17075 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 125581977 125582373 125582099 Y TMEM132B AACS NA NA NA NA AACS 34052 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 129296403 129296565 129296505 Y SLC15A4,GLT1D1 SLC15A4,GLT1D1 NA NA NA NA SLC15A4 9963 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 129301742 129302776 129302427 Y SLC15A4,GLT1D1 SLC15A4,GLT1D1 NA NA NA NA SLC15A4 3752 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 129325536 129325762 129325610 Y SLC15A4 SLC15A4,GLT1D1 SLC15A4 MCF7 ChIA-PET 22265404 GLT1D1 10210 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 129725693 129725893 129725793 Y NA NA NA NA NA NA GLT1D1 389721 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 129871586 129871714 129871650 Y NA NA NA NA NA NA TMEM132D 514497 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 130388949 130389448 130389259 Y NA TMEM132D NA NA NA NA TMEM132D 2738 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 130923831 130924224 130924207 Y RIMBP2 NA NA NA NA NA RIMBP2,RP11-662M24.2 274602 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 6.40991696429297 chr12 130947882 130948028 130947955 Y NA NA NA NA NA NA RIMBP2,RP11-662M24.2 250798 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 130976350 130976555 130976530 Y NA NA NA NA NA NA RIMBP2,RP11-662M24.2 222271 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 131058824 131059096 131058850 Y NA NA RIMBP2 IMR90 Hi-C 24141950 RIMBP2,RP11-662M24.2 139730 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 131111744 131112133 131112105 Y RIMBP2 NA RIMBP2 IMR90 Hi-C 24141950 RIMBP2,RP11-662M24.2 86693 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.17110090726052 chr12 131116739 131116826 131116804 Y NA NA NA NA NA NA RIMBP2,RP11-662M24.2 82000 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 131117194 131117823 131117569 Y RIMBP2 NA NA NA NA NA RIMBP2,RP11-662M24.2 81003 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr12 131135835 131135937 131135878 Y PIWIL1 NA NA NA NA NA RIMBP2,RP11-662M24.2 62889 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 132203397 132203510 132203472 Y ULK1 SFSWAP NA NA NA NA SFSWAP 9771 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 132232542 132232780 132232661 Y DDX51 SFSWAP NA NA NA NA SFSWAP 38916 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 132265042 132265050 132265046 Y NA MMP17 NA NA NA NA MMP17 45888 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 132293483 132293821 132293495 Y NA MMP17 NA NA NA NA MMP17 17117 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 132315038 132315239 132315115 Y MMP17 MMP17 NA NA NA NA MMP17 4100 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr12 132315862 132315946 132315904 Y MMP17 MMP17 NA NA NA NA MMP17 4924 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 132558778 132559145 132558825 Y NA SNORA49,EP400NL NA NA NA NA EP400NL 7683 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr12 132899646 132899852 132899767 Y GALNT9 NA NA NA NA NA FBRSL1 164285 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 133528012 133528357 133528019 Y NA CHFR,ZNF605 NA NA NA NA CHFR 2533 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr12 133688468 133688629 133688567 Y NA ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268 NA NA NA NA ZNF891 16430 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr12 133701272 133701384 133701332 Y ZNF605,ZNF605,ZNF26,ZNF84,ZNF84,ZNF268,ZNF268,ZNF10 ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268 NA NA NA NA ZNF891 3675 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr13 20137811 20138146 20137910 Y NA NA NA NA NA NA MPHOSPH8 67642 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 20624080 20624132 20624092 Y NA NA NA NA NA NA ZMYM2 93270 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 20644269 20644474 20644387 Y ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2 NA NA NA NA NA ZMYM2 113459 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 20693405 20693544 20693484 Y CRYL1 NA NA NA NA NA ZMYM2 162595 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 20750174 20750288 20750230 Y PSPC1,ZMYM5 NA NA NA NA NA ZMYM2 219364 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 21400254 21400509 21400379 Y NA NA NA NA NA NA N6AMT2 54157 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 21748962 21749145 21749040 Y NA SAP18,SKA3,MRP63 NA NA NA NA MRP63 178 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 22009901 22010336 22010211 Y NA ZDHHC20 NA NA NA NA ZDHHC20 21173 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 22545143 22545315 22545232 Y NA NA FGF9 IMR90 Hi-C 24141950 RPS7P10 343989 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 24528296 24528692 24528455 Y PCOTH NA SPATA13,TNFRSF19 IMR90 Hi-C 24141950 MIPEP 66738 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr13 24697003 24697328 24697264 Y NA NA SPATA13 IMR90 Hi-C 24141950 MIPEP 235445 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 25621314 25621890 25621623 Y NA PABPC3 NA NA NA NA PABPC3 46410 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 25856268 25856641 25856378 Y NA MTMR6,NUPL1 NA NA NA NA MTMR6 3506 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 25859422 25859518 25859470 Y NUPL1,MTMR6 MTMR6,NUPL1 NA NA NA NA MTMR6 629 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 25880585 25880813 25880618 Y MTMR6,NUPL1 MTMR6,NUPL1 NA NA NA NA NUPL1 6923 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 26760531 26760858 26760712 Y WASF3 RNF6 WASF3,RNF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF6 33933 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 27142181 27142413 27142195 Y NA WASF3 NA NA NA NA WASF3 12341 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 27166168 27166184 27166175 Y GPR12,WASF3 WASF3 NA NA NA NA WASF3 36328 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr13 27728821 27729155 27728988 Y USP12 USP12 NA NA NA NA USP12 14878 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 27734553 27734882 27734861 Y NA USP12 NA NA NA NA USP12 9151 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 27834117 27834352 27834235 Y USP12 RPL21,SNORD102,RASL11A NA NA NA NA SNORD102 6916 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 27843033 27843378 27843206 Y NA RPL21,SNORD102,RASL11A NA NA NA NA RASL11A 569 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 28005406 28005795 28005597 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA GTF3A 8725 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 28167075 28167372 28167253 Y NA LNX2,POLR1D NA NA NA NA LNX2 25169 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 28660576 28660679 28660628 Y FLT3 PAN3-AS1,PAN3 NA NA NA NA PAN3-AS1 49651 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 28787263 28787277 28787270 Y NA EEF1A1P3 NA NA NA NA EEF1A1P3 613 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 30060513 30060580 30060547 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A1 107245 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 30969684 30969817 30969776 Y USPL1 LINC01058 LINC00426,KATNAL1,USPL1,UBL3,HMGB1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01058 24557 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 30982567 30982782 30982669 Y NA LINC01058 KATNAL1,LINC00426,USPL1,UBL3,HMGB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC01058 11592 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 31407198 31407336 31407268 Y HSPH1 NA USPL1 IMR90 Hi-C 24141950 USPL1 217368 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 31483566 31483936 31483755 Y NA NA NA NA NA NA HSPH1 250589 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 31783320 31783649 31783428 Y C13orf26,B3GALTL HSPH1,B3GALTL NA NA NA NA B3GALTL 11247 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 32433681 32434084 32433895 Y NA EEF1DP3 NA NA NA NA EEF1DP3 14703 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 32689338 32689467 32689381 Y NA NA NA NA NA NA FRY 85901 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 33051019 33051050 33051035 Y NA NA NA NA NA NA N4BP2L1 50704 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 33412765 33412780 33412773 Y NA NA KL,PDS5B,STARD13 IMR90 Hi-C 24141950 PDS5B 254201 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 33762622 33762899 33762709 Y STARD13,STARD13 NA NA NA NA NA STARD13 159868 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 34116442 34117241 34116673 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 193675 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr13 34186963 34187337 34187175 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 202849 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 34653156 34653775 34653442 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 262970 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 35574872 35575244 35575038 Y NBEA NA NA NA NA NA NBEA 60448 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 35887010 35887329 35887304 Y NA NA NA NA NA NA MAB21L1 161503 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 36501740 36502135 36501882 Y NA NA NA NA NA NA CCDC169 367842 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 36918283 36918673 36918579 Y NA CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2,SPG20 NA NA NA NA SPG20 23644 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 37424486 37424865 37424682 Y NA RFXAP NA NA NA NA RFXAP 33125 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr13 37473939 37474133 37474036 Y C13orf36,SMAD9 SMAD9 NA NA NA NA SMAD9 18769 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr13 37493371 37493714 37493499 Y C13orf36,RFXAP,SMAD9 SMAD9 NA NA NA NA SMAD9 469 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr13 37723502 37723846 37723737 Y FAM48A,CSNK1A1L NA POSTN,LINC00547 IMR90 Hi-C 24141950 ALG5 151104 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 40467096 40467440 40467155 Y NA NA NA NA NA NA COG6 239332 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 40962857 40963140 40963012 Y FOXO1 NA NA NA NA NA FOXO1 275594 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 41651625 41651882 41651685 Y NA WBP4 NA NA NA NA WBP4 18215 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 42140186 42140232 42140209 Y NA NA NA NA NA NA NAA16 256845 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 42162855 42163294 42163201 Y C13orf15,DGKH NA NA NA NA NA NAA16 279514 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 42705100 42705257 42705170 Y NA NA NA NA NA NA DGKH 92924 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 42721459 42721826 42721635 Y NA NA NA NA NA NA DGKH 109283 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 42855017 42855240 42855076 Y AKAP11 AKAP11 NA NA NA NA AKAP11 10728 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 42969602 42969963 42969792 Y TNFSF11,TNFSF11,DGKH,AKAP11 NA NA NA NA NA AKAP11 125313 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 43629039 43630063 43629103 Y NA DNAJC15 NA NA NA NA DNAJC15 33700 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 43865785 43866112 43865949 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC15 270446 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 43866757 43867095 43866777 Y ENOX1,ENOX1 NA NA NA NA NA DNAJC15 271418 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 43912615 43912772 43912726 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC15 317276 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 43947076 43947305 43947191 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC15 351737 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 44028316 44028697 44028507 Y NA NA NA NA NA NA ENOX1 330347 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 44115188 44115336 44115262 Y ENOX1,ENOX1 NA NA NA NA NA ENOX1 243708 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr13 44201276 44201468 44201373 Y NA NA NA NA NA NA ENOX1 157576 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr13 44214613 44214990 44214818 Y ENOX1,ENOX1 NA NA NA NA NA ENOX1 144054 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 44329047 44329228 44329222 Y NA ENOX1 NA NA NA NA ENOX1 29816 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 44359761 44360131 44359976 Y ENOX1,ENOX1 ENOX1 NA NA NA NA ENOX1 717 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.34401484735175 chr13 44765408 44765809 44765737 Y NA NA SERP2,TSC22D1,LINC00284 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERP2 179992 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 45492137 45492940 45492235 Y TSC22D1 NA NA NA NA NA NUFIP1 68678 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 46339630 46339901 46339775 Y NA NA NA NA NA NA SIAH3 83970 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 46557145 46557532 46557508 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H13 67362 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 47128564 47128952 47128887 Y LCP1,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 3261 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr13 47369610 47369907 47369759 Y NA ESD NA NA NA NA ESD 243 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 48526121 48526135 48526130 Y MED4,SUCLA2 SUCLA2-AS1 NA NA NA NA SUCLA2-AS1 47390 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr13 49130835 49131251 49131085 Y FNDC3A,RB1,LPAR6,RCBTB2 RCBTB2 NA NA NA NA RCBTB2 25466 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 49563041 49563333 49563220 Y RCBTB2,CYSLTR2,SETDB2,SETDB2,CDADC1,FNDC3A FNDC3A NA NA NA NA FNDC3A 14993 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 50217217 50217337 50217325 Y SETDB2,SETDB2,PHF11,PHF11,ARL11 EBPL NA NA NA NA EBPL 46274 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 50597476 50597810 50597661 Y RCBTB1,TRIM13 TRIM13,MIR3613,MIR16-1 NA NA NA NA MIR16-1 23387 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr13 50602874 50603059 50603020 Y NA TRIM13,MIR3613,MIR16-1 NA NA NA NA MIR16-1 18138 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr13 50675373 50675756 50675618 Y NA DLEU1,DLEU2 NA NA NA NA DLEU1 21066 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 50703291 50703484 50703377 Y NA DLEU1,DLEU2 DLEU7,DLEU1,DLEU2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DLEU2 5435 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 51395866 51396155 51396034 Y NA DLEU7 NA NA NA NA DLEU7 19920 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 51508208 51508301 51508255 Y NA RNASEH2B,RNASEH2B-AS1 NA NA NA NA RNASEH2B-AS1 25360 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 51620780 51620813 51620797 Y NA NA NA NA NA NA RNASEH2B-AS1 137932 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 51800117 51800150 51800132 Y DLEU7,FAM124A FAM124A NA NA NA NA FAM124A 5614 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 51815944 51816141 51816055 Y INTS6 FAM124A NA NA NA NA FAM124A 21441 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 51902603 51902909 51902835 Y NA NA DHRS12 IMR90 Hi-C 24141950 FAM124A 108100 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 52009334 52009441 52009388 Y NA RPS4XP16,INTS6 NA NA NA NA RPS4XP16 16859 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 52218923 52219366 52219003 Y WDFY2,DHRS12,DHRS12 NA NA NA NA NA WDFY2 62279 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 52303239 52303556 52303323 Y WDFY2 NA NA NA NA NA DHRS12 72737 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 52319871 52320068 52319946 Y NA NA NA NA NA NA DHRS12 56225 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 52376068 52376210 52376139 Y INTS6,WDFY2,DHRS12,DHRS12 DHRS12,RP11-327P2.5 NA NA NA NA DHRS12 83 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 52922324 52922434 52922379 Y THSD1 NA THSD1 IMR90 Hi-C 24141950 VPS36 100329 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 53028749 53028807 53028779 Y NA VPS36,CKAP2 NA NA NA NA CKAP2 1185 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 53190916 53191040 53191000 Y NA HNRNPA1L2,MRPS31P4,SUGT1 NA NA NA NA MRPS31P4 1223 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 53302548 53302855 53302702 Y NA NA NA NA NA NA SUGT1 77704 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 65085985 65086089 65086079 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 2716379 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 67493315 67493487 67493401 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 308981 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 67674730 67675228 67675034 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 127240 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 69285358 69285440 69285385 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 1482890 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 70081949 70082002 70081975 Y NA NA NA NA NA NA H3F3BP1 2165197 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 72402256 72402488 72402430 Y NA DACH1 NA NA NA NA DACH1 36842 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 72438548 72439003 72438895 Y DACH1 DACH1 NA NA NA NA DACH1 327 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr13 72439142 72439615 72439332 Y DACH1 NA NA NA NA NA DACH1 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr13 74326809 74326882 74326846 Y KLF12 NA NA NA NA NA KLF12 379512 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 74339681 74339964 74339912 Y KLF12 NA NA NA NA NA KLF12 366430 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 74340193 74340396 74340347 Y KLF12 NA NA NA NA NA KLF12 365998 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 74508678 74508943 74508854 Y KLF12 NA NA NA NA NA KLF12 197451 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr13 74708897 74709334 74709161 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 2503 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr13 74709487 74710034 74709735 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 3093 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr13 74864558 74864878 74864747 Y KLF12 NA KLF12 IMR90 Hi-C 24141950 KLF12 158164 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 75904010 75904233 75904150 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 150017 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 75965393 75965547 75965541 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 88703 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 75966064 75966537 75966363 Y TBC1D4 NA NA NA NA NA TBC1D4 87713 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 76159377 76159493 76159435 Y NA COMMD6,UCHL3,LMO7 NA NA NA NA LMO7 33077 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 76256605 76256814 76256659 Y NA NA NA NA NA NA LMO7 64035 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 76279211 76279429 76279239 Y NA NA NA NA NA NA LMO7 86641 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 76279599 76280073 76279764 Y LMO7 NA NA NA NA NA LMO7 87029 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 76336754 76337033 76336914 Y COMMD6,LMO7 NA NA NA NA NA LMO7 144184 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 77897670 77898015 77897832 Y NA MYCBP2 NA NA NA NA MYCBP2 1170 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 78304455 78304850 78304591 Y SLAIN1,SLAIN1 SLAIN1 NA NA NA NA SLAIN1 34432 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 80916096 80916414 80916232 Y NA SPRY2 NA NA NA NA SPRY2 3010 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 84711549 84711699 84711638 Y NA NA NA NA NA NA SLITRK1 257021 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 90486324 90486483 90486404 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 1511591 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 92294972 92294984 92294978 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 296898 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 93096966 93097333 93097096 Y NA NA NA NA NA NA RNU4ATAC3P 386869 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 94472931 94472950 94472936 Y NA NA NA NA NA NA GPC6 595836 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 94785518 94785984 94785813 Y NA NA NA NA NA NA TGDS 460527 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 94913778 94913870 94913813 Y NA NA NA NA NA NA TGDS 332641 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 95003602 95003792 95003731 Y NA NA NA NA NA NA TGDS 242719 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 95128334 95128746 95128451 Y DCT NA NA NA NA NA TGDS 117765 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 95201580 95202169 95201893 Y NA TGDS,GPR180 NA NA NA NA TGDS 44342 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 95753354 95753450 95753358 Y NA NA NA NA NA NA ABCC4 198237 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 95932787 95933077 95933010 Y NA ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 18610 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 95951518 95951672 95951596 Y ABCC4 ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 15 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr13 96284564 96284961 96284763 Y NA DZIP1,DNAJC3-AS1,DNAJC3 NA NA NA NA DZIP1 9996 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 96424038 96424083 96424061 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC3 96645 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 96427402 96427645 96427445 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC3 100009 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 96517437 96517518 96517478 Y NA NA NA NA NA NA UGGT2 186218 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 97877294 97877762 97877400 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 5606 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 97879082 97879401 97879140 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 7394 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr13 97890366 97890711 97890515 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 18678 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 97913986 97914316 97914087 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 42298 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 99874246 99874352 99874282 Y NA UBAC2-AS1,UBAC2 NA NA NA NA UBAC2 23218 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 99933141 99933542 99933359 Y GPR183 NA NA NA NA NA UBAC2 82113 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 99934075 99934613 99934350 Y GPR183 NA NA NA NA NA UBAC2 83047 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 99935844 99936009 99935907 Y GPR183 NA NA NA NA NA UBAC2 84816 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 99956041 99956410 99956299 Y GPR18,GPR183 NA NA NA NA NA UBAC2 105013 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 99963491 99964160 99963691 Y NA NA NA NA NA NA UBAC2 112463 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 100013491 100013836 100013585 Y DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL NA NA NA NA NA TM9SF2 137835 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 100154383 100154610 100154487 Y GPR183 TM9SF2 NA NA NA NA TM9SF2 2712 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 100310859 100311153 100311058 Y ZIC5,ZIC2 NA NA NA NA NA CLYBL 53940 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 100314131 100314374 100314299 Y NA NA NA NA NA NA CLYBL 57212 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 100374428 100374651 100374540 Y NA NA NA NA NA NA CLYBL 117509 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 100399124 100399585 100399214 Y NA NA NA NA NA NA CLYBL 142205 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 100523777 100524089 100523900 Y NA NA NA NA NA NA ZIC5 98074 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr13 100607991 100608280 100608183 Y PCCA,ZIC5,ZIC2 ZIC5,ZIC2 NA NA NA NA ZIC5 13883 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr13 100612276 100612466 100612371 Y ZIC5,ZIC2 ZIC5,ZIC2 NA NA NA NA ZIC5 9697 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 100613023 100613308 100613091 Y NA ZIC5,ZIC2 NA NA NA NA ZIC5 8855 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 100613415 100613606 100613513 Y NA ZIC5,ZIC2 NA NA NA NA ZIC5 8557 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 100620497 100620786 100620718 Y ZIC5,ZIC2 ZIC5,ZIC2 NA NA NA NA ZIC5 1377 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 100631413 100631577 100631494 Y ZIC5,ZIC2 ZIC5,ZIC2 NA NA NA NA ZIC2 449 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr13 100641170 100641291 100641224 Y NA ZIC5,ZIC2 NA NA NA NA ZIC2 9144 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr13 100642436 100643177 100642812 Y ZIC5,ZIC2 ZIC5,ZIC2 NA NA NA NA ZIC2 10410 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.55078636232894 chr13 100643838 100643892 100643875 Y NA ZIC5,ZIC2 NA NA NA NA ZIC2 11812 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr13 100644149 100644384 100644267 Y ZIC5,ZIC2 ZIC5,ZIC2 NA NA NA NA ZIC2 12123 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 100886726 100886738 100886732 Y NA NA A2LD1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL15P18 85380 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 100928465 100928851 100928516 Y NA NA NA NA NA NA RPL15P18 127119 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 101158496 101158688 101158633 Y NA NA NA NA NA NA TMTC4 166659 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 101163000 101163083 101163042 Y NA NA NA NA NA NA TMTC4 162264 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 101212927 101213159 101213052 Y NA NA NA NA NA NA TMTC4 112188 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 102341558 102341578 102341569 Y NA NA NA NA NA NA ITGBL1 238592 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr13 102377146 102377246 102377196 Y NA NA NA NA NA NA ITGBL1 274180 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 102403781 102404089 102404035 Y NALCN NA NA NA NA NA ITGBL1 300815 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 102437700 102438037 102437893 Y NA NA NA NA NA NA ITGBL1 334734 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 102565701 102565995 102565836 Y FGF14,FGF14 NA NA NA NA NA ITGBL1 462735 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 102569627 102570054 102569972 Y NA NA NA NA NA NA ITGBL1 466661 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr13 102646785 102647092 102646972 Y NA NA NA NA NA NA FGF14-IT1 397777 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr13 102691942 102692330 102692296 Y NA NA NA NA NA NA FGF14-IT1 352539 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 102696707 102696889 102696861 Y NA NA NA NA NA NA FGF14-IT1 347980 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 102731343 102731405 102731389 Y NA NA NA NA NA NA FGF14-IT1 313464 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr13 102742627 102742968 102742903 Y FGF14 NA NA NA NA NA FGF14-IT1 301901 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 102784457 102784806 102784790 Y FGF14 NA NA NA NA NA FGF14-IT1 260063 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 102893200 102893530 102893494 Y NA NA NA NA NA NA FGF14-IT1 151339 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr13 102925517 102925660 102925589 Y NA NA NA NA NA NA FGF14-IT1 119209 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 102926292 102926685 102926630 Y NA NA NA NA NA NA FGF14-IT1 118184 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr13 102928353 102928749 102928703 Y NA NA NA NA NA NA FGF14-IT1 116120 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 102942302 102942617 102942588 Y NA NA NA NA NA NA FGF14-IT1 102252 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 102955015 102955394 102955376 Y NA NA NA NA NA NA FGF14-IT1 89475 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.86094363479473 chr13 102961357 102961731 102961699 Y NA NA NA NA NA NA FGF14-IT1 83138 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr13 102965800 102966299 102965983 Y NA NA NA NA NA NA FGF14-IT1 78570 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 103012200 103012562 103012532 Y NA FGF14-IT1,FGF14 NA NA NA NA FGF14-IT1 32307 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr13 103051676 103052522 103052411 Y BIVM,FGF14 FGF14-IT1 NA NA NA NA FGF14 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.99818696716929 chr13 103244790 103245125 103245073 Y ERCC5,TPP2 TPP2 TPP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TPP2 2228 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 103249969 103250343 103250155 Y ERCC5,TPP2 TPP2 NA NA NA NA TPP2 2616 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr13 104371816 104371919 104371873 Y NA NA NA NA NA NA ERCC5 876622 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 104663923 104664083 104664030 Y NA NA NA NA NA NA ERCC5 1168729 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 105315212 105315547 105315380 Y NA NA NA NA NA NA ERCC5 1820018 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 107127427 107127454 107127441 Y NA NA NA NA NA NA ARGLU1 91058 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 107170805 107171068 107170962 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 47444 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 107173594 107173915 107173796 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 44597 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 107186008 107186474 107186341 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 32038 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 107188808 107188962 107188940 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 29550 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 107225813 107226005 107225909 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 7301 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 108099145 108099375 108099322 Y FAM155A NA NA NA NA NA FAM155A 417708 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr13 108153519 108153767 108153691 Y NA NA NA NA NA NA FAM155A 363316 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 108181035 108181120 108181078 Y NA NA NA NA NA NA FAM155A 335963 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 108238726 108238999 108238876 Y FAM155A NA NA NA NA NA FAM155A 278084 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr13 108310994 108311341 108311278 Y NA NA NA NA NA NA FAM155A 205742 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.96432939228333 chr13 108407171 108407488 108407466 Y NA NA NA NA NA NA FAM155A 109595 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 108428526 108428615 108428535 Y NA NA NA NA NA NA FAM155A 88468 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 108503880 108504176 108504028 Y FAM155A FAM155A NA NA NA NA FAM155A 12907 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 108520131 108520835 108520801 Y LIG4,FAM155A FAM155A NA NA NA NA FAM155A 3048 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.27448666474912 chr13 108520964 108521235 108521194 Y LIG4,FAM155A FAM155A NA NA NA NA FAM155A 3881 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 109818071 109818351 109818211 Y NA NA NA NA NA NA AL162497.1 587264 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 110064831 110065141 110064985 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 340474 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr13 110147333 110147690 110147511 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 257925 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 110304107 110304656 110304398 Y IRS2 NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 100959 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 110322109 110322425 110322268 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 83190 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr13 110352571 110352699 110352636 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 52916 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 110426988 110427362 110427201 Y NA AL162497.1,IRS2 NA NA NA NA IRS2 9553 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr13 110439676 110440079 110439929 Y IRS2 AL162497.1,IRS2 NA NA NA NA IRS2 2761 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr13 110441173 110441468 110441257 Y IRS2 AL162497.1,IRS2 NA NA NA NA IRS2 4258 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 110443694 110443751 110443735 Y IRS2 AL162497.1,IRS2 MYO16,COL4A1 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 6779 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 110521819 110522258 110522077 Y NA NA MYO16,IRS2,COL4A1 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 84904 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr13 111176913 111177121 111177092 Y ING1,ING1,ANKRD10,RAB20 RAB20 NA NA NA NA RAB20 34959 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 111278486 111278706 111278495 Y NA CARKD NA NA NA NA CARKD 12605 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 111526935 111527249 111527195 Y RAB20 ANKRD10 NA NA NA NA ANKRD10 38167 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 111589420 111590157 111589779 Y NA ANKRD10 ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 24004 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr13 111843624 111843915 111843820 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF7-AS2 77599 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 112347236 112347393 112347316 Y NA NA SOX1 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD44 356999 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 113179985 113180373 113180107 Y NA NA NA NA NA NA TUBGCP3 60108 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr13 113514166 113514374 113514224 Y NA MCF2L NA NA NA NA MCF2L 32318 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr13 113585588 113585716 113585676 Y CUL4A,CUL4A MCF2L,MCF2L-AS1 C13orf35,ATP11A,MCF2L GM12878,HELA,K562,H1ESC 5C 22955621 MCF2L-AS1 35422 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 113607211 113607493 113607342 Y NA MCF2L-AS1 NA NA NA NA MCF2L-AS1 13645 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 113624891 113625152 113625027 Y MCF2L MCF2L-AS1 NA NA NA NA MCF2L-AS1 3753 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 113691953 113691973 113691963 Y NA NA NA NA NA NA MCF2L-AS1 70815 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 113806516 113806910 113806731 Y ATP11A,CUL4A NA PROZ IMR90 Hi-C 24141950 CUL4A 53642 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 114119812 114119949 114119881 Y NA RNU1-16P,DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA RNU1-16P 11444 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr13 114556439 114556767 114556713 Y NA GAS6 NA NA NA NA GAS6 8279 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 114557275 114557469 114557370 Y GAS6 GAS6 NA NA NA NA GAS6 7577 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 114864762 114865011 114864824 Y RASA3 RASA3 NA NA NA NA RASA3 31075 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr13 114875113 114875384 114875282 Y RASA3 RASA3 NA NA NA NA RASA3 20702 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr14 21150605 21151121 21150987 Y TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40 RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 269 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr14 21151333 21151694 21151411 Y NA RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 997 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr14 21288613 21288985 21288797 Y NA NA NA NA NA NA ANG 138277 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 21540493 21540634 21540528 Y RNASE6,TOX4,HNRNPC,ARHGEF40 ARHGEF40,NDRG2,ZNF219 NA NA NA NA NDRG2 3462 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 21660147 21660368 21660311 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPC 75285 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 21684818 21685080 21685024 Y OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1 NA NA NA NA NA HNRNPC 50573 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 22115392 22115940 22115648 Y RPGRIP1,SALL2 NA NA NA NA NA SALL2 112042 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 23358205 23358555 23358381 Y NA LRP10,REM2,RBM23,PRMT5-AS1,PRMT5 NA NA NA NA REM2 7831 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 23367708 23367835 23367778 Y NA LRP10,REM2,RBM23,PRMT5-AS1,PRMT5 NA NA NA NA REM2 17334 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 23466095 23466339 23466236 Y CDH24,ACIN1 HAUS4,AJUBA,C14orf93,PSMB5 NA NA NA NA C14orf93 11036 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 24015791 24015843 24015817 Y SLC22A17,ZFHX2,JPH4 RP11-66N24.4,THTPA,ZFHX2,AP1G2,JPH4 NA NA NA NA THTPA 7373 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 24018554 24018930 24018908 Y NA RP11-66N24.4,THTPA,ZFHX2,AP1G2,JPH4 NA NA NA NA THTPA 4286 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 24058094 24058646 24058322 Y NA THTPA,ZFHX2,AP1G2,JPH4,DHRS2 NA NA NA NA JPH4 12085 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr14 24861663 24861718 24861669 Y IPO4,RABGGTA,RABGGTA NFATC4,NYNRIN,KHNYN,SDR39U1 NA NA NA NA NYNRIN 4274 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 24891908 24892270 24892086 Y NA NYNRIN,KHNYN,SDR39U1 NA NA NA NA KHNYN 4222 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 24988131 24988270 24988206 Y CTSG,CMA1 NA NA NA NA NA SDR39U1 78020 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 25464405 25464804 25464526 Y CMA1,CTSG,GZMB,STXBP6 NA NA NA NA NA HMGN2P6 269738 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 27997396 27997715 27997579 Y NA NA NA NA NA NA NOVA1 932436 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 28591045 28591340 28591192 Y NA NA NA NA NA NA RPL26P3 365776 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 30739803 30740140 30739972 Y PRKD1 CTD-2251F13.1 NA NA NA NA CTD-2251F13.1 24109 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 31408112 31408404 31408271 Y NA NA NA NA NA NA COCH 66392 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 32597823 32598061 32597946 Y NUBPL NA NA NA NA NA ARHGAP5-AS1 53824 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 32800518 32800728 32800582 Y AKAP6 AKAP6 NA NA NA NA AKAP6 4039 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 32950745 32951147 32950873 Y NA RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 859 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 32953597 32954289 32954012 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 1591 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr14 32960734 32960879 32960775 Y NA RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 8728 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 33106586 33106949 33106623 Y NA NA NA NA NA NA RP11-320M16.1 154580 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 33366513 33366604 33366563 Y NA NPAS3 AKAP6 IMR90 Hi-C 24141950 NPAS3 35535 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 33402784 33403168 33402896 Y NPAS3 NPAS3 NA NA NA NA NPAS3 645 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 33696803 33697225 33696871 Y NA NA NA NA NA NA NPAS3 294664 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 34407631 34407737 34407684 Y NA NA NA NA NA NA SPTSSA 521825 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 35084533 35084797 35084665 Y EAPP RPS19P3,SNX6 NA NA NA NA SNX6 12592 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 35235794 35235835 35235815 Y FAM177A1,BAZ1A NA NA NA NA NA CFL2 53765 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 35274619 35275001 35274810 Y PPP2R3C,BAZ1A NA NA NA NA NA RP11-73E17.2 66548 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 35325148 35325514 35325424 Y PSMA6,PPP2R3C,BAZ1A RP11-73E17.2,BAZ1A NA NA NA NA RP11-73E17.2 16035 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 35399728 35399899 35399840 Y NFKBIA,EAPP,BAZ1A,PPP2R3C,KIAA0391,FAM177A1 SRP54,RP11-85K15.2 BAZ1A IMR90 Hi-C 24141950 SRP54 49264 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 35628271 35628433 35628369 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA KIAA0391 38516 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 35802936 35803364 35803178 Y BAZ1A,FAM177A1,RALGAPA1,NFKBIA NA NA NA NA NA RP11-561B11.1 52911 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 35809142 35809263 35809220 Y BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1 PPP2R3C,KIAA0391,PSMA6,NFKBIA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-561B11.1 47012 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 35837875 35838216 35837985 Y BAZ1A,FAM177A1,RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1,NFKBIA NFKBIA K562 ChIA-PET 22265404 RP11-561B11.1 18059 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 35855857 35856187 35856101 Y NA RP11-561B11.1,NFKBIA NA NA NA NA RP11-561B11.1 88 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 39559553 39559840 39559693 Y NA SEC23A,GEMIN2 NA NA NA NA SEC23A 17010 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 39664073 39664414 39664121 Y SIP1,PNN TRAPPC6B,PNN NA NA NA NA PNN 21686 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 39890491 39890736 39890687 Y NA FBXO33 NA NA NA NA FBXO33 8968 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 39900071 39900466 39900211 Y PNN,CTAGE5,FBXO33 FBXO33 NA NA NA NA FBXO33 367 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 41099089 41099243 41099183 Y NA NA NA NA NA NA FBXO33 1199385 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 41585190 41585196 41585195 Y NA NA NA NA NA NA FBXO33 1685486 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 45160440 45160781 45160566 Y NA NA NA NA NA NA C14orf28 203717 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 45721298 45721397 45721336 Y KLHL28,PRPF39,FANCM,MIS18BP1 MIS18BP1 NA NA NA NA MIS18BP1 555 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 50090977 50091033 50091007 Y METTL21D,ARF6,RPS29,NEMF,KLHDC2,RPL36AL,MGAT2,KLHDC1,DNAAF2 RPS29,LRR1,RPL36AL,MGAT2,DNAAF2 NA NA NA NA MGAT2 5488 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 50256678 50256775 50256761 Y NA KLHDC2 NA NA NA NA KLHDC2 24352 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 50328432 50328642 50328440 Y METTL21D,ARF6,RPL36AL,DNAAF2 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 10511 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr14 50334846 50335244 50334992 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 16925 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr14 50527611 50528257 50527921 Y RPL36AL,ARF6,C14orf182 NA NA NA NA NA SOS2 168019 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 50562564 50562863 50562716 Y RPL36AL,DNAAF2,NEMF,ARF6,ATP5S,C14orf182,METTL21D NA NA NA NA NA SOS2 133413 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 50648447 50648735 50648723 Y NA SOS2 NA NA NA NA SOS2 47541 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 50681069 50681448 50681362 Y NA SOS2 NA NA NA NA SOS2 14828 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr14 50799629 50799645 50799635 Y NA ATP5S,L2HGDH NA NA NA NA L2HGDH 22363 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr14 50926261 50926342 50926322 Y MAP4K5,ATL1,ATL1,CDKL1 CDKL1 NA NA NA NA CDKL1 45082 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr14 51066593 51066625 51066609 Y TRIM9,CDKL1,ATL1 MAP4K5 SAV1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP4K5 40749 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 51074312 51074388 51074350 Y TRIM9,ATL1 MAP4K5 SAV1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP4K5 48468 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 51970793 51971031 51970913 Y TRIM9 FRMD6 NA NA NA NA FRMD6 16975 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 52064245 52064576 52064411 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 110427 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 52110768 52111053 52110947 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 156950 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 52119936 52120349 52120008 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 166118 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 52163680 52163849 52163765 Y FRMD6 NA NA NA NA NA GNG2 127064 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 52328681 52329167 52329039 Y PTGER2,GNG2 GNG2 NA NA NA NA GNG2 37768 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 52336144 52336756 52336579 Y PTGER2,GNG2 GNG2 NA NA NA NA GNG2 45231 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 52350999 52351848 52351141 Y PTGER2,GNG2 NA NA NA NA NA GNG2 60086 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 52372298 52373220 52372436 Y PTGER2,GNG2 NA NA NA NA NA C14orf166 80973 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 52378269 52378599 52378273 Y NA NA NA NA NA NA C14orf166 75594 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 52389104 52389259 52389151 Y NA NA NA NA NA NA C14orf166 64934 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 52584121 52584359 52584179 Y NA NA NID2,C14orf166 IMR90 Hi-C 24141950 NID2 50409 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 52791842 52792196 52791956 Y GNG2,PTGER2 PTGER2 NA NA NA NA PTGER2 12819 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 53020677 53020806 53020735 Y PTGDR,TXNDC16,GPR137C TXNDC16,GPR137C NA NA NA NA GPR137C 2811 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr14 53302326 53302477 53302407 Y NA GNPNAT1 NA NA NA NA GNPNAT1 45940 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 53361596 53362059 53361840 Y NA NA NA NA NA NA FERMT2 55094 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 53385393 53385542 53385402 Y DDHD1 FERMT2 NA NA NA NA FERMT2 31611 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 53399403 53399746 53399574 Y NA FERMT2 NA NA NA NA FERMT2 17407 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 53416335 53416646 53416599 Y GPR137C FERMT2 NA NA NA NA FERMT2 507 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr14 54640534 54640974 54640637 Y NA NA BMP4 IMR90 Hi-C 24141950 CDKN3 220593 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 54833964 54834357 54834051 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 27210 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 54900763 54901015 54900977 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 39196 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 54954614 54954684 54954648 Y NA GMFB,CGRRF1 NA NA NA NA GMFB 700 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr14 55035984 55036343 55036300 Y SAMD4A SAMD4A NA NA NA NA SAMD4A 4169 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 55115744 55116109 55115959 Y NA NA NA NA NA NA SAMD4A 83929 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 55144129 55144414 55144262 Y NA NA NA NA NA NA SAMD4A 112314 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 55152891 55153126 55153104 Y SAMD4A NA NA NA NA NA SAMD4A 121076 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr14 55173516 55173842 55173679 Y SAMD4A NA NA NA NA NA SAMD4A 141701 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 55197259 55197652 55197332 Y NA NA NA NA NA NA SAMD4A 165444 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 55314752 55314873 55314829 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GMFB,MAPK1IP1L,GCH1 NA NA NA NA NA GCH1 52697 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 55375075 55375158 55375100 Y LGALS3,FBXO34,GMFB,MAPK1IP1L,GCH1 GCH1 NA NA NA NA GCH1 7505 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 55439267 55439511 55439438 Y NA NA NA NA NA NA WDHD1 52312 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 55569033 55569319 55569207 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 19509 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 55589429 55589640 55589507 Y NA LGALS3 LGALS3,DLGAP5,WDHD1,MAPK1IP1L IMR90 Hi-C 24141950 LGALS3 601 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 55731972 55732298 55732133 Y GCH1,MAPK1IP1L,LGALS3,FBXO34,FBXO34 FBXO34,RP11-665C16.6 TBPL2,FBXO34 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FBXO34 3723 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 55765939 55766288 55766115 Y GCH1 FBXO34,RP11-665C16.6 NA NA NA NA RP11-665C16.6 29146 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 56047594 56047945 56047904 Y NA KTN1,KTN1-AS1 NA NA NA NA KTN1-AS1 2766 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr14 56312825 56313142 56312958 Y NA NA PELI2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00520 51419 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 57459148 57459304 57459264 Y NA NA NA NA NA NA EXOC5 274422 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.48125817972631 chr14 57725682 57725794 57725735 Y NA EXOC5 NA NA NA NA EXOC5 7932 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 58449709 58450271 58450031 Y NA NA C14orf37 IMR90 Hi-C 24141950 UBA52P3 155726 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 58748134 58748542 58748422 Y ARID4A PSMA3,RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A NA NA NA NA RP11-349A22.5 14310 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 59001974 59002022 59001998 Y NA NA NA NA NA NA DACT1 96663 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 59654580 59654708 59654599 Y NA DAAM1 NA NA NA NA DAAM1 1216 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 59656513 59656908 59656842 Y DAAM1 DAAM1 NA NA NA NA DAAM1 3149 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 60168972 60169358 60169165 Y NA NA NA NA NA NA RTN1 166326 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 60679186 60679974 60679676 Y NA DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2 NA NA NA NA PPM1A 30496 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr14 61612107 61612325 61612234 Y SIX1 PRKCH SLC38A6,SIX1,SIX4,MNAT1,TRMT5 IMR90 Hi-C 24141950 PRKCH 39952 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 61937176 61937384 61937282 Y NA NA NA NA NA NA HIF1A 222847 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 62076216 62076332 62076274 Y NA NA NA NA NA NA HIF1A 83899 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 63159002 63159168 63159087 Y NA NA NA NA NA NA KCNH5 407587 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 63829601 63829975 63829789 Y WDR89,PPP2R5E,KCNH5,GPHB5 NA NA NA NA NA RHOJ 160769 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 64185455 64185764 64185678 Y PPP2R5E,SYNE2,WDR89,WDR89,SGPP1 SGPP1 NA NA NA NA SGPP1 6993 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 64320785 64320937 64320842 Y PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2 SYNE2 NA NA NA NA SYNE2 3102 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr14 64403874 64404095 64403883 Y NA NA NA NA NA NA SYNE2 86191 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr14 64968114 64968655 64968380 Y ZBTB25,ZBTB1 AKAP5,ZBTB25,HSPA2 NA NA NA NA ZBTB1 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 64975156 64975343 64975202 Y NA AKAP5,ZBTB1,ZBTB25,HSPA2 NA NA NA NA ZBTB25 5225 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 65172114 65172865 65172414 Y SYNE2,ZBTB1,MAX,CHURC1,PLEKHG3 PLEKHG3 NA NA NA NA PLEKHG3 3294 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 65229015 65229197 65229106 Y SPTB,PLEKHG3 NA NA NA NA NA PLEKHG3 60195 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 65229595 65229717 65229658 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHG3 60775 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 65231601 65231863 65231701 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHG3 62781 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 65347160 65347466 65347258 Y RAB15 SPTB,CHURC1,CHURC1-FNTB,FNTB SPTB IMR90 Hi-C 24141950 SPTB 2559 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr14 65524481 65524844 65524562 Y PLEKHG3 MAX NA NA NA NA MAX 42569 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 65525721 65526064 65525893 Y NA MAX NA NA NA NA MAX 41349 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 66126309 66126626 66126333 Y NA NA NA NA NA NA FUT8 250999 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr14 67478288 67478352 67478320 Y NA NA NA NA NA NA MPP5 227474 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 67774949 67775062 67775003 Y PLEKHH1 EIF2S1,ATP6V1D NA NA NA NA EIF2S1 49652 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 68161499 68161767 68161616 Y PLEK2 VTI1B,RDH11,RDH12 NA NA NA NA RDH11 968 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 68733798 68734208 68733983 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 152705 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 68873274 68873547 68873349 Y NA PPIAP6 NA NA NA NA PPIAP6 13366 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 69169939 69170184 69170014 Y NA NA ZFP36L1,RAD51B IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L1 91006 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 69171999 69172408 69172198 Y NA NA ZFP36L1,RAD51B IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L1 88782 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 69404659 69405002 69404945 Y NA ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 39155 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 69425235 69425583 69425528 Y NA ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 18574 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 69618210 69618757 69618360 Y NA DCAF5,EXD2 NA NA NA NA DCAF5 343 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr14 69851262 69851639 69851451 Y NA SLC39A9,ERH NA NA NA NA SLC39A9 11093 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 69913588 69913836 69913761 Y NA NA NA NA NA NA ERH 50244 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 70627626 70628027 70627962 Y NA RP11-486O13.2,SLC8A3 NA NA NA NA RP11-486O13.2 23813 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr14 70844763 70845165 70845114 Y NA COX16,SYNJ2BP NA NA NA NA COX16 20315 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 71797093 71797681 71797289 Y PCNX SIPA1L1 SIPA1L1,LOC145474 IMR90 Hi-C 24141950 SIPA1L1 11927 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 71811948 71812060 71812004 Y NA SIPA1L1 SIPA1L1 IMR90 Hi-C 24141950 SIPA1L1 26782 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 71870372 71870659 71870456 Y PCNX,SIPA1L1 NA NA NA NA NA SIPA1L1 85206 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 72099518 72099532 72099525 Y NA NA NA NA NA NA SIPA1L1 314352 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 72397692 72397730 72397711 Y SIPA1L1,RGS6,RGS6,RGS6 NA NA NA NA NA SIPA1L1 612526 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 73093466 73093649 73093558 Y NA NA RGS6,DPF3,DCAF4,ZFYVE1 IMR90 Hi-C 24141950 DPF3 265160 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 73100225 73100572 73100516 Y NA NA RGS6,DPF3 IMR90 Hi-C 24141950 DPF3 258237 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr14 73373247 73373392 73373372 Y NA DPF3,DCAF4,RP1-146I3.1 RGS6,DPF3,DCAF4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DPF3 14438 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 73595262 73595380 73595321 Y NA PSEN1 NA NA NA NA PSEN1 5746 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 73824884 73825148 73825019 Y ZFYVE1,ZFYVE1,RBM25,PSEN1,NUMB NA NA NA NA NA NUMB 103200 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 74224542 74224784 74224663 Y NA PNMA1,RP5-1021I20.1 NA NA NA NA RP5-1021I20.1 27279 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 74235090 74235238 74235164 Y C14orf43 RP5-1021I20.1 NA NA NA NA RP5-1021I20.1 16825 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 74252099 74252503 74252342 Y NA RP5-1021I20.1 NA NA NA NA RP5-1021I20.1 36 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 75521336 75521721 75521672 Y MLH3,ACYP1 ACYP1 NA NA NA NA ACYP1 12465 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr14 75592667 75593037 75593004 Y NA RP11-950C14.7,NEK9,TMED10 NA NA NA NA NEK9 620 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 75607767 75608156 75607957 Y FOS RP11-950C14.7,NEK9,TMED10 NEK9 IMR90 Hi-C 24141950 NEK9 15720 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 76395057 76395394 76395222 Y ESRRB,TGFB3 IFT43 NA NA NA NA IFT43 28578 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 76843326 76843356 76843341 Y NA NA NA NA NA NA RP11-187O7.1 256648 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 77386302 77386621 77386483 Y IRF2BPL RP11-488C13.1,RP11-7F17.1 IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488C13.1 35209 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr14 77386872 77387221 77387005 Y ZDHHC22 RP11-488C13.1,RP11-7F17.1 IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488C13.1 35779 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 77422240 77422571 77422458 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL RP11-7F17.1 IRF2BPL,KIAA1737 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.1 10455 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr14 77423763 77424258 77424192 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL RP11-7F17.1 IRF2BPL,KIAA1737 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.1 8768 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 77428060 77428442 77428341 Y NA RP11-7F17.1 IRF2BPL MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.1 4584 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 77488566 77488578 77488572 Y NA IRF2BPL NA NA NA NA IRF2BPL 4456 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 77495718 77495873 77495815 Y NA IRF2BPL NA NA NA NA IRF2BPL 2684 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 77499482 77500543 77500476 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL IRF2BPL KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 6448 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr14 77505083 77505447 77505354 Y TMEM63C,TMED8,KIAA1737 IRF2BPL IRF2BPL IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BPL 12049 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 77640033 77640278 77640160 Y NA ZDHHC22 C14orf166B,ZDHHC22,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,TMEM63C,NGB,MIR1260A,TMED8 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC22 32956 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 78031949 78032369 78032266 Y SNW1,SPTLC2 SPTLC2 NA NA NA NA SPTLC2 48747 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 78196199 78196534 78196363 Y NA ALKBH1,SLIRP,SNW1 NA NA NA NA SLIRP 23785 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 81088140 81088388 81088236 Y NA NA NA NA NA NA TSHR 330945 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 81220509 81220785 81220647 Y NA NA NA NA NA NA TSHR 198548 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 SNORA79,DYNLL1P1 NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 4.03204454205525 chr14 88715060 88715377 88715187 Y NA NA NA NA NA NA KCNK10 75874 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 89630928 89631154 89631021 Y FOXN3 NA NA NA NA NA TTC8 342431 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 89671493 89671906 89671673 Y NA NA NA NA NA NA TTC8 382996 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 89739645 89739700 89739695 Y NA NA NA NA NA NA FOXN3 343793 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 89770346 89770725 89770409 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 312768 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 89881748 89882141 89882044 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 201352 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 89887223 89887427 89887324 Y NA NA NA NA NA NA FOXN3 196066 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 89895882 89896217 89896119 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 187276 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 89959649 89959712 89959681 Y TDP1,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 123781 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 90049518 90049848 90049714 Y TDP1,FOXN3 FOXN3 NA NA NA NA FOXN3 33645 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 90083286 90083622 90083526 Y TDP1,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 90083771 90084428 90084236 Y TDP1,FOXN3 FOXN3 NA NA NA NA FOXN3 278 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 90875651 90876041 90875751 Y NA RPL21P11,CALM1 NA NA NA NA CALM1 14805 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 90919684 90920110 90919852 Y NA NA NA NA NA NA CALM1 58838 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr14 90957919 90958167 90958043 Y NA NA NA NA NA NA CALM1 97073 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 90988934 90989119 90989019 Y NA NA NA NA NA NA CALM1 128088 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr14 91022350 91022704 91022530 Y TTC7B,CALM1 NA NA NA NA NA CALM1 161504 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 91069038 91069054 91069046 Y NA NA NA NA NA NA CALM1 208192 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 91406372 91406636 91406631 Y NA NA NA NA NA NA C14orf159 118041 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 91423143 91423331 91423289 Y RPS6KA5,CCDC88C NA NA NA NA NA C14orf159 101346 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 91528012 91528136 91528074 Y SMEK1,CCDC88C,RPS6KA5 C14orf159,RPS6KA5 NA NA NA NA RPS6KA5 3032 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 91716270 91716863 91716728 Y RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C,GPR68,GPR68 GPR68 NA NA NA NA GPR68 1406 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 91727497 91727640 91727579 Y RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C,GPR68 GPR68 NA NA NA NA GPR68 9228 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 91734470 91734656 91734563 Y NA GPR68 GPR68 K562 ChIA-PET 22265404 GPR68 16201 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 91752749 91752962 91752855 Y NA GPR68 NA NA NA NA GPR68 34480 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 91833483 91833974 91833648 Y RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C CCDC88C NA NA NA NA CCDC88C 48214 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 91869322 91869469 91869402 Y TC2N,RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C CCDC88C NA NA NA NA CCDC88C 12719 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 92446493 92446853 92446680 Y SMEK1,SLC24A4,SLC24A4,ATXN3 FBLN5 NA NA NA NA FBLN5 34162 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 92572132 92572295 92572249 Y CATSPERB,SLC24A4,SLC24A4,RIN3,ATXN3 ATXN3,NDUFB1,CPSF2 NA NA NA NA ATXN3 1167 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 92938458 92938502 92938481 Y NA NA RIN3 IMR90 Hi-C 24141950 LGMN 274545 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 93035062 93035389 93035185 Y RIN3 NA NA NA NA NA LGMN 177658 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 93193771 93194035 93193928 Y MOAP1,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 LGMN NA NA NA NA LGMN 19012 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 93697718 93697880 93697787 Y ITPK1,MOAP1 MOAP1,RP11-371E8.4,UBR7,C14orf142 NA NA NA NA C14orf142 26279 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 94121988 94122062 94121998 Y FAM181A,FAM181A,FAM181A,PRIMA1 NA NA NA NA NA PRIMA1 130765 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 94360342 94360641 94360452 Y NA NA NA NA NA NA PRIMA1 107515 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr14 95014834 95014854 95014844 Y NA SERPINA5 SERPINA4 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINA5 10925 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 95239496 95239653 95239575 Y SERPINA12 NA NA NA NA NA SERPINA5 213717 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 95596986 95597082 95597060 Y NA DICER1 NA NA NA NA DICER1 25265 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 95691488 95691499 95691495 Y NA NA NA NA NA NA DICER1 69141 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 95724003 95724377 95724190 Y DICER1,DICER1,CLMN NA NA NA NA NA CLMN 59866 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 95946356 95946810 95946552 Y NA NA NA NA NA NA GLRX5 51030 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 96562177 96562641 96562498 Y NA NA NA NA NA NA C14orf132 58516 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 97043507 97043643 97043575 Y NA NA NA NA NA NA PAPOLA 77737 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 99439262 99439638 99439565 Y NA NA NA NA NA NA BCL11B 296223 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr14 99735950 99736476 99736276 Y BCL11B BCL11B NA NA NA NA BCL11B 89 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 99934490 99934508 99934499 Y EML1 SETD3,CCNK NA NA NA NA SETD3 10708 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 100029558 100029810 100029707 Y NA CCDC85C,RP11-543C4.1 NA NA NA NA CCDC85C 38553 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 100071651 100072022 100071781 Y NA CCDC85C,RP11-543C4.1,HHIPL1 NA NA NA NA RP11-543C4.1 2758 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr14 100463833 100464185 100464009 Y NA NA EVL,YY1,DEGS2 IMR90 Hi-C 24141950 YY1 238450 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 100504494 100504745 100504607 Y NA NA EVL,DEGS2,EML1 IMR90 Hi-C 24141950 YY1 197890 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 100525860 100526007 100525963 Y NA NA EVL,DEGS2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 YY1 176628 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 100566376 100566553 100566536 Y EVL NA NA NA NA NA YY1 136082 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 100633368 100633655 100633513 Y YY1 NA NA NA NA NA YY1 68980 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 100659173 100659604 100659490 Y NA YY1,RP11-638I2.4 DEGS2,YY1,EVL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 43031 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr14 100751761 100751840 100751790 Y NA YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29 NA NA NA NA SLC25A29 19044 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr14 100768169 100768349 100768287 Y NA SLC25A29 NA NA NA NA SLC25A29 2535 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 100883887 100884104 100884057 Y BEGAIN WDR25 NA NA NA NA WDR25 43132 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 100899876 100900012 100899943 Y WARS,WARS NA NA NA NA NA WDR25 59121 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 100906618 100906904 100906684 Y NA NA BEGAIN IMR90 Hi-C 24141950 WDR25 65863 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 101049817 101049857 101049837 Y DLK1,BEGAIN BEGAIN WDR25,MEG3,BEGAIN IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BEGAIN 1893 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr14 101083978 101084167 101084079 Y NA BEGAIN WDR25,BEGAIN,RTL1,MIR665,MIR136,MIR337,MIR432,MIR433,MIR127,MIR431,MIR493,WARS IMR90 Hi-C 24141950 BEGAIN 32228 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 101143693 101144188 101144055 Y NA DLK1 NA NA NA NA DLK1 45854 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 101306625 101306984 101306798 Y NA RP11-123M6.2 NA NA NA NA RP11-123M6.2 18379 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 101370822 101370975 101370899 Y BEGAIN,RTL1 RP11-123M6.2,SNORD113-3,SNORD113-4,SNORD114-1 NA NA NA NA SNORD113-3 23281 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr14 101454914 101455185 101454975 Y DLK1,RTL1 SNORD114-1,SNORD114-13,SNORD114-14,SNORD114-19,SNORD114-20,SNORD114-21,MIR543 NA NA NA NA SNORD114-21 8602 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 102050999 102051149 102051091 Y NA DIO3OS,DIO3 NA NA NA NA DIO3 25311 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 102258119 102258367 102258242 Y NA PPP2R5C NA NA NA NA PPP2R5C 31984 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 102288392 102288845 102288491 Y NA NA NA NA NA NA PPP2R5C 62257 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 102342938 102343183 102343098 Y PPP2R5C,WDR20,PPP2R5C NA NA NA NA NA DYNC1H1 85682 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.27448666474912 chr14 102415545 102415736 102415629 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13129 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 102438747 102439113 102438818 Y PPP2R5C,DYNC1H1 DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 9882 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 102544859 102545271 102545048 Y NA NA NA NA NA NA WDR20 58569 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 102554875 102555215 102555129 Y HSP90AA1 WDR20,HSP90AA1 NA NA NA NA WDR20 48625 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 102991046 102991386 102991124 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 16910 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 102991831 102991939 102991900 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 17695 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 103266656 103267057 103266785 Y NA TRAF3 CDC42BPB,AMN IMR90 Hi-C 24141950 TRAF3 24843 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 103954462 103954719 103954539 Y MARK3,KLC1 CKB,TRMT61A NA NA NA NA CKB 32729 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr14 104228992 104229118 104229080 Y NA XRCC3,ZFYVE21 NA NA NA NA ZFYVE21 48925 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr14 104601589 104601707 104601649 Y NA KIF26A NA NA NA NA KIF26A 1353 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr14 104616017 104616378 104616259 Y NA KIF26A NA NA NA NA KIF26A 12957 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr14 104690511 104690903 104690604 Y TMEM179,PPP1R13B,KIF26A RP11-260M19.2 NA NA NA NA RP11-260M19.2 2590 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.55078636232894 chr14 104763034 104763369 104763107 Y TMEM179 NA NA NA NA NA RP11-260M19.2 75113 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.75755787730614 chr14 104766695 104767088 104766699 Y TMEM179 NA NA NA NA NA RP11-260M19.2 78774 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.65417211981754 chr14 104928387 104928555 104928492 Y NA NA NA NA NA NA TMEM179 141429 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr14 105144100 105144955 105144117 Y GPR132,AKT1 INF2,ADSSL1 NA NA NA NA INF2 8988 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr14 105191285 105191466 105191451 Y NA INF2,ADSSL1,SIVA1 NA NA NA NA ADSSL1 2762 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 105265888 105266206 105266005 Y NA SIVA1,AKT1 NA NA NA NA AKT1 5800 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr14 105290315 105290696 105290451 Y GPR132 AKT1 NA NA NA NA AKT1 30227 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 105330138 105330246 105330192 Y NA NA NA NA NA NA AKT1 70050 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 105399879 105400289 105400091 Y NA AHNAK2,C14orf79 NA NA NA NA AHNAK2 42405 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 105493379 105493756 105493698 Y NA C14orf79,CDCA4 NA NA NA NA CDCA4 7894 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 105529368 105529646 105529640 Y GPR132 CDCA4 NA NA NA NA CDCA4 43883 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 105760670 105760918 105760811 Y C14orf80,C14orf80,C14orf80,GPR132,BRF1 BTBD6,PACS2,BRF1 NA NA NA NA PACS2 3982 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.24062908986315 chr14 105947921 105948133 105948082 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA CRIP1 3403 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr14 105948139 105949025 105948432 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA CRIP1 2511 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr14 105949862 105949973 105949911 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA CRIP1 1563 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr14 106857348 106857526 106857389 Y NA NA NA NA NA NA LINC00221 78919 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.58464393721491 chr14 107252931 107253417 107253022 Y NA NA NA NA NA NA LINC00221 316486 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 20570096 20570220 20570180 Y NA NA REREP3,POTEB,LOC348120,NF1P2,CHEK2P2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-603B24.2 1973869 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 20596893 20597220 20597190 Y NA NA NA NA NA NA RP11-603B24.2 1946869 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr15 20599040 20599336 20599188 Y NA NA NA NA NA NA RP11-603B24.2 1944753 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr15 20612710 20612766 20612738 Y NA NA NA NA NA NA RP11-603B24.2 1931323 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 25018281 25018456 25018384 Y SNURF,SNRPN,SNRPN,SNRPN SNRPN NA NA NA NA SNRPN 48338 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr15 25123469 25123644 25123557 Y SNURF,SNRPN,C15orf2,SNRPN,SNRPN NA NA NA NA NA SNRPN 56675 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 25563100 25563402 25563110 Y SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 118726 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr15 25564293 25564526 25564383 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 117602 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr15 25565589 25566847 25566046 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 115281 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr15 25586903 25587047 25586976 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 95081 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 25604152 25604594 25604190 Y SNURF,SNRPN,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 77534 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 25614491 25614606 25614563 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 67522 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr15 25625771 25626455 25625879 Y SNURF,SNRPN NA NA NA NA NA UBE3A 55673 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 25646289 25646668 25646556 Y SNURF,SNRPN,UBE3A UBE3A NA NA NA NA UBE3A 35460 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 26097872 26097956 26097914 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 415744 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 26327449 26327665 26327505 Y NA NA ATP10A,LOC100128714 IMR90 Hi-C 24141950 UBE3A 645321 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr15 26416756 26416952 26416854 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 734628 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 26914563 26914637 26914600 Y GABRB3,GABRB3,GABRA5,GABRA5,GABRB3 NA NA NA NA NA GABRB3 268049 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 26958560 26958904 26958869 Y NA NA NA NA NA NA GABRB3 223782 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 27300157 27300177 27300166 Y NA NA NA NA NA NA GABRG3 85728 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 28339947 28339987 28339948 Y NA OCA2 NA NA NA NA OCA2 2517 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 28494622 28494982 28494802 Y NA NA NA NA NA NA RPL41P2 63816 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 29277250 29277459 29277367 Y NDNL2,APBA2 NA NA NA NA NA APBA2 149621 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 29407243 29407640 29407337 Y FAM189A1 NA NA NA NA NA NDNL2 152393 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr15 29949236 29949642 29949365 Y NA RP11-680F8.1 NA NA NA NA RP11-680F8.1 15552 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 31215782 31215951 31215851 Y FAN1,FAN1,MTMR10 FAN1 NA NA NA NA FAN1 21727 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr15 31372759 31373034 31372889 Y MTMR10 NA NA NA NA NA MTMR10 90949 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr15 31620735 31621235 31621017 Y MTMR10,KLF13 KLF13 NA NA NA NA KLF13 3677 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 31680805 31681075 31680940 Y MTMR10 NA NA NA NA NA KLF13 63747 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 31689645 31689781 31689725 Y MTMR10,KLF13 NA NA NA NA NA KLF13 72587 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr15 31690304 31690476 31690390 Y NA NA NA NA NA NA KLF13 73246 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr15 32384266 32384605 32384436 Y CHRNA7 NA NA NA NA NA CHRNA7 63575 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 33083952 33084023 33083988 Y NA NA NA NA NA NA GREM1 75777 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 33437895 33438002 33437965 Y NA FMN1 FMN1 IMR90 Hi-C 24141950 FMN1 46895 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 33502141 33502453 33502281 Y NA FMN1 TMCO5B IMR90 Hi-C 24141950 FMN1 17244 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 33603911 33604068 33604029 Y FMN1,RYR3 RYR3 NA NA NA NA RYR3 2748 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 35384953 35385239 35385081 Y NA NA ATPBD4 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 106465 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 35590731 35591134 35590845 Y NA RP11-150L8.4 ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-150L8.4 1090 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 35650165 35650403 35650284 Y NA NA NA NA NA NA RP11-150L8.4 60524 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 35788754 35789006 35788880 Y NA NA NA NA NA NA RP11-150L8.4 199113 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 37203314 37203431 37203373 Y NA NA NA NA NA NA RP11-128A17.1 186109 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 37249666 37249815 37249741 Y NA NA NA NA NA NA RP11-128A17.1 139725 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 37253162 37253269 37253223 Y MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 NA NA NA NA NA RP11-128A17.1 136271 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 37396811 37397277 37397114 Y C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 RP11-128A17.1,MEIS2 NA NA NA NA MEIS2 5307 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr15 37398990 37399302 37399145 Y C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 RP11-128A17.1,MEIS2 NA NA NA NA MEIS2 7486 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr15 38546643 38547172 38546943 Y NA SPRED1 NA NA NA NA SPRED1 4116 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr15 38784019 38784367 38784201 Y RASGRP1 FAM98B NA NA NA NA FAM98B 39691 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 39110575 39110868 39110718 Y NA NA THBS1,FSIP1,C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 RASGRP1 254799 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 39432291 39432412 39432368 Y THBS1 NA THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 438868 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 39703846 39704297 39704020 Y NA NA THBS1,C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 166983 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 40069787 40070165 40070008 Y NA FSIP1 NA NA NA NA FSIP1 2866 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 40162582 40162954 40162766 Y NA GPR176 FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR176 48139 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 40361212 40361596 40361446 Y NA SRP14,BMF NA NA NA NA SRP14 31823 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 40391032 40391342 40391133 Y PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 7751 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr15 40397040 40397227 40397203 Y BUB1B,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 1866 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 40669843 40670190 40669979 Y GPR176,PAK6,DISP2 C15orf52,DISP2,IVD NA NA NA NA DISP2 21407 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 41220555 41220912 41220794 Y NUSAP1,DLL4 VPS18,DLL4,CHAC1 NA NA NA NA DLL4 1017 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 41920606 41920652 41920629 Y NA MGA TYRO3,MAPKBP1,MGA IMR90 Hi-C 24141950 MGA 9184 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 41953918 41954236 41954127 Y EHD4,MGA MGA MAPKBP1 IMR90 Hi-C 24141950 MGA 42496 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr15 42535686 42535733 42535710 Y NA VPS39,GANC,TMEM87A NA NA NA NA GANC 27698 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 42547123 42547182 42547153 Y NA VPS39,GANC,TMEM87A NA NA NA NA GANC 16249 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 42800654 42800904 42800762 Y NA SNAP23,LRRC57,HAUS2 LRRC57,HAUS2 IMR90 Hi-C 24141950 SNAP23 19223 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 42814906 42815063 42814960 Y NA SNAP23,LRRC57,HAUS2 NA NA NA NA LRRC57 23937 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 43135579 43135976 43135778 Y TGM7 NA NA NA NA NA TTBK2 75031 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 43152474 43152861 43152772 Y STARD9,TTBK2 NA NA NA NA NA TTBK2 58146 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 43361299 43361456 43361377 Y TP53BP1 UBR1 NA NA NA NA UBR1 34855 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 43415014 43415563 43415337 Y NA UBR1,TMEM62 NA NA NA NA TMEM62 1537 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr15 43801380 43801544 43801432 Y TP53BP1 TP53BP1,MAP1A NA NA NA NA MAP1A 224 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 43806421 43806594 43806505 Y NA TP53BP1,MAP1A NA NA NA NA MAP1A 5265 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 44161980 44162105 44162047 Y NA MFAP1,WDR76,PIN4P1 NA NA NA NA PIN4P1 4337 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 44186295 44186523 44186409 Y NA PIN4P1 NA NA NA NA PIN4P1 19853 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 44289112 44289501 44289307 Y NA ACTBP7 NA NA NA NA ACTBP7 8730 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 44592122 44592245 44592183 Y NA CASC4 NA NA NA NA CASC4 13195 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 44838663 44839045 44838853 Y NA EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 11408 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 44954800 44955080 44954968 Y CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11 SPG11,PATL2,B2M NA NA NA NA SPG11 924 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr15 45005185 45005759 45005376 Y CTDSPL2,SPG11,PATL2,B2M,TRIM69 PATL2,B2M,TRIM69 NA NA NA NA B2M 3510 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 45892726 45892758 45892742 Y NA SQRDL NA NA NA NA SQRDL 28588 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 47979261 47979603 47979432 Y MYEF2 CTD-2270N23.1 NA NA NA NA CTD-2270N23.1 41529 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 48011445 48011769 48011637 Y NA CTD-2270N23.1 NA NA NA NA CTD-2270N23.1 9363 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr15 48023492 48023830 48023661 Y NA CTD-2270N23.1 NA NA NA NA CTD-2270N23.1 2360 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 48033960 48034201 48034081 Y NA CTD-2270N23.1 NA NA NA NA CTD-2270N23.1 12828 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 48388885 48389267 48389220 Y SEMA6D,SLC24A5 NA SEMA6D,SLC12A1 IMR90 Hi-C 24141950 MYEF2 79447 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 48436189 48436527 48436248 Y SLC24A5 MYEF2,CTXN2,SLC12A1 NA NA NA NA MYEF2 32187 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 48545288 48545650 48545469 Y NA NA NA NA NA NA SLC12A1 63427 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 48647753 48647896 48647834 Y FBN1 DUT,RP11-154J22.1 NA NA NA NA RP11-154J22.1 25700 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 48821826 48821860 48821843 Y NA NA NA NA NA NA FBN1 114186 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 49217829 49218211 49218108 Y SHC4 EID1,SHC4 NA NA NA NA SHC4 35430 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 49268018 49268116 49268067 Y NA SHC4 NA NA NA NA SHC4 14377 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr15 50335306 50335619 50335473 Y NA NA NA NA NA NA SLC27A2 136774 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 50345341 50345603 50345432 Y USP8,GABPB1 NA NA NA NA NA SLC27A2 126790 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 50429549 50429984 50429688 Y USP8,GABPB1 SLC27A2 ATP8B4,GALK2,GABPB1,SHC4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC27A2 42409 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 50634288 50634665 50634477 Y NA GABPB1-AS1,GABPB1 NA NA NA NA GABPB1-AS1 10860 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 50876708 50877085 50876843 Y NA NA NA NA NA NA TRPM7 99927 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 51179096 51179478 51179366 Y USP8,TRPM7,SPPL2A AP4E1 TRPM7,SPPL2A,USP50,AP4E1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP4E1 19391 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 52148809 52148818 52148812 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 28984 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 52228372 52228625 52228515 Y NA MAPK6,LEO1 NA NA NA NA MAPK6 13678 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr15 52235970 52236006 52235989 Y DMXL2,MAPK6 MAPK6,LEO1 NA NA NA NA MAPK6 6297 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 52330351 52330361 52330356 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2184D3.1 55131 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 52851602 52851989 52851853 Y NA MYO5A,ARPP19 NA NA NA NA ARPP19 8091 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 55463152 55463211 55463182 Y NA RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 24054 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 55487267 55487658 55487506 Y NA RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 2 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 55487983 55488563 55488357 Y RAB27A,PIGB,RSL24D1 RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 718 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 55614631 55614957 55614885 Y NA PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1 NA NA NA NA RP11-139H15.1 5272 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 55928441 55928509 55928475 Y NA PYGO1 NA NA NA NA PYGO1 49296 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 56063154 56063228 56063198 Y NA PRTG NEDD4,PRTG IMR90 Hi-C 24141950 PRTG 29866 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 56127522 56127639 56127539 Y NA NA NA NA NA NA PRTG 94234 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 56332751 56332969 56332911 Y NA NEDD4 NEDD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD4 48807 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr15 56452441 56452566 56452504 Y RFX7 NA NA NA NA NA RFX7 80917 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 56475850 56476168 56476009 Y MNS1 NA NA NA NA NA RFX7 57315 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 56513902 56514185 56514176 Y NA RFX7,TEX9 NA NA NA NA RFX7 19298 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr15 56717939 56718122 56718071 Y RFX7,ZNF280D,MNS1,TEX9 MNS1 NA NA NA NA MNS1 37213 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 57261737 57262096 57261746 Y NA NA NA NA NA NA TCF12 52916 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 58521788 58521987 58521861 Y LIPC NA SLTM,ADAM10,LIPC,FAM63B IMR90 Hi-C 24141950 ADAM10 518190 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 58884938 58885321 58885256 Y NA NA NA NA NA NA ADAM10 154856 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 58898092 58898418 58898348 Y NA NA NA NA NA NA ADAM10 141759 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 58939079 58939427 58939418 Y NA NA NA NA NA NA ADAM10 100750 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 59019191 59019406 59019394 Y NA ADAM10,FAM63B NA NA NA NA ADAM10 20771 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 59138361 59138756 59138559 Y NA RNF111 NA NA NA NA RNF111 16618 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 59144484 59144794 59144639 Y LIPC RNF111 NA NA NA NA RNF111 10580 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 60701970 60702307 60702139 Y NA ANXA2,RP11-745A24.2 NA NA NA NA RP11-745A24.2 7308 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 60818402 60818756 60818740 Y RORA NARG2,RP11-219B17.1 NA NA NA NA RP11-219B17.1 49025 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 60839009 60839501 60839122 Y RORA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 69632 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 60861865 60862603 60862448 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 92488 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 61145347 61145714 61145592 Y NA NA NA NA NA NA RORA 373804 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 61264927 61265345 61265257 Y NA NA NARG2 IMR90 Hi-C 24141950 RORA 254173 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr15 61501689 61502023 61501856 Y NA RORA NA NA NA NA RORA 17495 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 61505182 61505193 61505186 Y RORA RORA NA NA NA NA RORA 14325 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 61520020 61520614 61520340 Y RORA RORA NA NA NA NA RORA 502 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr15 62130295 62130308 62130301 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 220364 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 62215780 62216024 62215899 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 134648 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 62684510 62685208 62684868 Y NA TLN2 TLN2,MGC15885 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 3785 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 62685382 62685737 62685634 Y NA TLN2 TLN2,MGC15885 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 4657 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 63432131 63432432 63432186 Y USP3,RAB8B,LACTB LACTB,RPS27L,RAB8B NA NA NA NA RPS27L 15788 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 63602976 63602991 63602984 Y NA APH1B NA NA NA NA APH1B 36759 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 63871063 63871418 63871089 Y NA USP3-AS1 NA NA NA NA USP3-AS1 20370 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 64000367 64000635 64000532 Y USP3,HERC1 NA NA NA NA NA USP3-AS1 108579 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 64538820 64539298 64539122 Y NA NA NA NA NA NA PPIB 85416 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 64654607 64654901 64654754 Y PIF1,KIAA0101 CSNK1G1,KIAA0101,TRIP4 CSNK1G1 IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1G1 8165 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 64753700 64753985 64753784 Y PLEKHO2 ZNF609 NA NA NA NA ZNF609 2759 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr15 64920832 64921228 64921023 Y ZNF609,OAZ2 RP11-330L19.1 NA NA NA NA RP11-330L19.1 37654 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 64991554 64991938 64991797 Y NA OAZ2 NA NA NA NA OAZ2 1542 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.55078636232894 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr15 65377709 65378075 65377906 Y RASL12 PDCD7 NA NA NA NA PDCD7 46099 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 65403116 65403434 65403296 Y ANKDD1A,PDCD7 PDCD7 UBAP1L,KBTBD13,OSTBETA,RASL12 IMR90 Hi-C 24141950 PDCD7 20740 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 65596266 65596532 65596409 Y NA RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5310 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 65596702 65597188 65596889 Y DENND4A RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5746 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 65831867 65832220 65831871 Y NA DPP8,PTPLAD1 C15orf44 IMR90 Hi-C 24141950 PTPLAD1 11111 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 65841762 65842141 65841952 Y PARP16 DPP8,PTPLAD1 NA NA NA NA PTPLAD1 21006 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 65951559 65951691 65951625 Y NA SLC24A1 NA NA NA NA SLC24A1 49855 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 66006814 66006895 66006855 Y NA RAB11A SLC24A1 IMR90 Hi-C 24141950 RAB11A 9497 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 66162838 66163256 66163114 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80207 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 66177095 66177419 66177152 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 94464 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 66707547 66707736 66707571 Y MAP2K1 TIPIN,MAP2K1 RPL4,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K1 30392 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 66764584 66765048 66764851 Y NA SNAPC5,SNORD18A,ZWILCH,RPL4 NA NA NA NA SNAPC5 23103 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 66993287 66993569 66993487 Y MAP2K1,SMAD6 SMAD6 NA NA NA NA SMAD6 721 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr15 67134448 67134928 67134631 Y NA NA SMAD6,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 141882 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 67366599 67366961 67366679 Y NA SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 12498 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 67409139 67409556 67409296 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 55038 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 67516633 67516865 67516859 Y NA RPS24P16,IQCH,AAGAB NA NA NA NA RPS24P16 5919 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 67926783 67927143 67926830 Y NA NA NA NA NA NA MAP2K5 93736 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 68132387 68132778 68132514 Y PIAS1 NA NA NA NA NA PIAS1 211739 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 68260561 68260756 68260687 Y C15orf61 NA PIAS1,LOC100506686,C15orf61,IQCH IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 83761 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 68441418 68441688 68441529 Y NA NA NA NA NA NA PIAS1 96901 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 68579972 68580192 68580087 Y ITGA11 CLN6,FEM1B NA NA NA NA FEM1B 11831 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 68852038 68852173 68852100 Y NOX5,CORO2B,CORO2B CORO2B NA NA NA NA CORO2B 17135 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 68852393 68852527 68852460 Y CORO2B CORO2B NA NA NA NA CORO2B 16781 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 69385602 69385765 69385704 Y NA NA NA NA NA NA GLCE 65158 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 69453904 69454158 69454121 Y GLCE GLCE NA NA NA NA GLCE 2981 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr15 69724089 69724530 69724231 Y NA KIF23,RP11-253M7.1,RPLP1 NA NA NA NA RPLP1 18593 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 70146031 70146330 70146181 Y NA NA NA NA NA NA TLE3 242185 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 70391261 70391735 70391557 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 2746 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 70391851 70392235 70392005 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3336 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr15 70392397 70392607 70392502 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3882 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 70436319 70436687 70436503 Y NA TLE3 LOC145837,TLE3,C15orf50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TLE3 47804 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 70850665 70850865 70850772 Y NA NA KIF23 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 203067 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 71615809 71616164 71615988 Y NA NA NA NA NA NA THSD4 228518 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 71657535 71657734 71657662 Y NA NA NA NA NA NA THSD4 270244 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 71733741 71734068 71733788 Y THSD4 NA NA NA NA NA THSD4 346450 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 71840441 71840454 71840446 Y NA NA NA NA NA NA THSD4 453150 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 72213908 72214290 72214099 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 190309 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 72518614 72519346 72519221 Y ARIH1,PKM2 NA NA NA NA NA CELF6 91124 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 72617371 72617435 72617389 Y MYO9A,SENP8,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6 CELF6,HEXA NA NA NA NA CELF6 6901 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 72671459 72671771 72671611 Y PARP6,ARIH1,HEXA HEXA,RP11-106M3.1 NA NA NA NA RP11-106M3.1 1408 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 72824073 72824405 72824125 Y NA NA NA NA NA NA ARIH1 59406 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 73435699 73435965 73435801 Y NEO1,HCN4 NA NA NA NA NA NEO1 93648 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 74226590 74227025 74226821 Y NA LOXL1 NA NA NA NA LOXL1 10260 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 74249257 74249448 74249278 Y NA LOXL1,STOML1,PML NA NA NA NA LOXL1 32927 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 74332904 74333192 74333031 Y NA STOML1,PML NA NA NA NA PML 47890 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 74666695 74666987 74666837 Y CLK3,ARID3B NA NA NA NA NA SEMA7A 57821 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr15 74828638 74828659 74828649 Y ISLR2,ISLR2 ARID3B ARID3B MCF7 ChIA-PET 22265404 ARID3B 2859 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 74899091 74899429 74899332 Y PPCDC,CLK3,CLK3 CLK3 NA NA NA NA CLK3 10250 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 74902698 74903096 74902987 Y NA CLK3 NA NA NA NA CLK3 13857 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 74908840 74909023 74908946 Y NA CLK3 NA NA NA NA CLK3 19999 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 74930641 74931010 74930809 Y ARID3B,CSK CLK3 NA NA NA NA CLK3 41800 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr15 74943465 74943852 74943659 Y NA EDC3 NA NA NA NA EDC3 42781 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 75077206 75078007 75077402 Y NA CSK,CPLX3 NA NA NA NA CSK 4808 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 75250602 75250974 75250783 Y RPP25 COX5A,SCAMP5,RPP25 NA NA NA NA RPP25 2797 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 75288966 75289325 75289146 Y CPLX3,ULK3,SCAMP5 SCAMP5,RPP25,PPCDC NA NA NA NA PPCDC 24571 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 75744907 75745094 75744993 Y C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1089 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr15 75745296 75745530 75745399 Y PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 653 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 75746315 75746749 75746512 Y PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 132 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.55078636232894 chr15 75747348 75747533 75747407 Y RPP25,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1165 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 75959061 75959441 75959310 Y SNX33 SNUPN,SNX33,IMP3,CSPG4 NA NA NA NA IMP3 20014 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 76050803 76051078 76050853 Y NA CSPG4,DNM1P35 NA NA NA NA DNM1P35 21839 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr15 76658083 76658321 76658202 Y NA ISL2 NA NA NA NA ISL2 31018 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 77710600 77710857 77710802 Y NA PEAK1 NA NA NA NA HMG20A 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 77711297 77711794 77711478 Y NA PEAK1,HMG20A NA NA NA NA HMG20A 543 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 77923178 77923295 77923290 Y NA NA NA NA NA NA LINGO1 187947 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 78110584 78110799 78110731 Y LINGO1 LINGO1 NA NA NA NA LINGO1 443 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 78110975 78112297 78111796 Y HMG20A,LINGO1,DNAJA4,ACSBG1 NA NA NA NA NA LINGO1 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.86094363479473 chr15 78347391 78347661 78347487 Y TBC1D2B TBC1D2B,SNORA63 NA NA NA NA TBC1D2B 20405 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 78361071 78361580 78361229 Y IREB2,TBC1D2B TBC1D2B,SNORA63 NA NA NA NA TBC1D2B 6486 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 79152508 79152900 79152703 Y IREB2 RPL21P116 MORF4L1,ADAMTS7 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RPL21P116 1171 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr15 79153464 79153800 79153632 Y RASGRF1 RPL21P116 MORF4L1,ADAMTS7 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RPL21P116 271 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 80194397 80194544 80194472 Y ZFAND6,ST20,BCL2A1,ST20-MTHFS MTHFS,C15ORF37,ST20 NA NA NA NA MTHFS 6676 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 80211506 80211893 80211588 Y NA MTHFS,C15ORF37,ST20 NA NA NA NA C15ORF37 1614 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 80211933 80212232 80212185 Y NA MTHFS,C15ORF37,ST20 NA NA NA NA C15ORF37 1275 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 80697752 80697924 80697805 Y ARNT2 ARNT2 NA NA NA NA ARNT2 3060 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 80712071 80712357 80712214 Y NA ARNT2 NA NA NA NA ARNT2 17379 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 80816171 80816419 80816261 Y ARNT2,KIAA1199 NA NA NA NA NA ARNT2 121479 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 80841630 80841706 80841692 Y NA NA NA NA NA NA ARNT2 146938 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 80932884 80933245 80933030 Y MESDC1 NA FAM108C1,ARNT2,KIAA1199 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1199 136439 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 81082693 81083043 81082764 Y KIAA1199 KIAA1199 NA NA NA NA KIAA1199 13009 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 81316981 81317108 81317017 Y STARD5,MESDC1 MESDC2,MESDC1 NA NA NA NA MESDC1 25686 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 81317366 81317544 81317456 Y STARD5,MESDC1 MESDC2,MESDC1 NA NA NA NA MESDC1 26071 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 81321783 81322073 81321879 Y STARD5,MESDC1 MESDC2,MESDC1 C15orf26,IL16 IMR90 Hi-C 24141950 MESDC1 30488 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 82339167 82339811 82339478 Y MEX3B MEX3B NA NA NA NA MEX3B 2685 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.44740060484035 chr15 83376680 83377056 83376874 Y NA RP11-752G15.4,AP3B2,RP11-752G15.6 NA NA NA NA AP3B2 14 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 83479679 83480264 83480017 Y WHAMM WHAMM HOMER2 IMR90 Hi-C 24141950 WHAMM 3299 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 83603228 83603538 83603384 Y NA HOMER2,FAM103A1 NA NA NA NA HOMER2 49123 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr15 83680959 83681167 83681099 Y NA HOMER2,FAM103A1,C15orf40 NA NA NA NA C15orf40 2566 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr15 83681404 83681605 83681512 Y NA HOMER2,FAM103A1,C15orf40 NA NA NA NA C15orf40 3011 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 83683180 83683566 83683373 Y NA HOMER2,FAM103A1,C15orf40 NA NA NA NA C15orf40 4787 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 83683877 83683893 83683890 Y NA HOMER2,FAM103A1,C15orf40 NA NA NA NA C15orf40 5484 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 83733499 83733939 83733822 Y WHAMM BTBD1,TM6SF1 NA NA NA NA BTBD1 167 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 83777211 83777631 83777545 Y NA BTBD1,TM6SF1 NA NA NA NA TM6SF1 3052 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 83778085 83778410 83778297 Y NA BTBD1,TM6SF1 NA NA NA NA TM6SF1 3926 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 83815089 83815145 83815117 Y NA TM6SF1 NA NA NA NA TM6SF1 40930 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 83857531 83857848 83857643 Y AP3B2,HDGFRP3 HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 16922 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 83857860 83858021 83857985 Y NA HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 16749 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 83869144 83869263 83869183 Y NA HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 5507 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 83879617 83879962 83879641 Y NA HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 4847 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 84118150 84118486 84118331 Y NA SH3GL3 NA NA NA NA SH3GL3 4170 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr15 85131508 85131753 85131631 Y PDE8A ZSCAN2,EGLN1P1 NA NA NA NA ZSCAN2 10464 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 85290443 85290837 85290532 Y PDE8A,ZNF592 SEC11A,ZNF592 NA NA NA NA ZNF592 577 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 85458286 85458507 85458420 Y NA NA NA NA NA NA PDE8A 63164 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr15 85645018 85645768 85645040 Y NA NA NA NA NA NA PDE8A 123347 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr15 85662697 85662918 85662803 Y PDE8A NA NA NA NA NA PDE8A 141026 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 85987048 85987479 85987219 Y AKAP13,AKAP13 NA NA NA NA NA AKAP13 65246 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 86088256 86088945 86088625 Y NA NA NA NA NA NA AKAP13 166454 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 86126699 86127744 86127307 Y AKAP13,AKAP13 NA NA NA NA NA AKAP13 204897 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 86247990 86248195 86248102 Y AKAP13 NA NA NA NA NA KLHL25 88066 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 86267591 86267810 86267701 Y NA NA NA NA NA NA KLHL25 68451 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 86285642 86285870 86285715 Y NA NA NA NA NA NA KLHL25 50391 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 87244660 87245052 87244738 Y NA NA NA NA NA NA LINC00052 873108 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 88445057 88445811 88445726 Y NA NA NA NA NA NA LINC00052 326897 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 88699675 88699741 88699708 Y NA NA NA NA NA NA NTRK3 98258 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 88801535 88801887 88801766 Y NA NTRK3 NA NA NA NA NTRK3 3536 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 89014009 89014390 89014200 Y NA MRPL46,MRPS11 NA NA NA NA MRPS11 5325 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 89027924 89028249 89027989 Y NA MRPL46,MRPS11 NA NA NA NA MRPS11 19240 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 89148971 89149164 89149068 Y NA AEN,ISG20 NA NA NA NA AEN 13363 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 89149774 89150157 89149841 Y NA AEN,ISG20 NA NA NA NA AEN 12370 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr15 89152639 89152930 89152746 Y NA AEN,ISG20 NA NA NA NA AEN 9597 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 89156201 89156887 89156382 Y NA AEN,ISG20 NA NA NA NA AEN 5640 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr15 89187882 89188205 89187952 Y NA AEN,ISG20 NA NA NA NA ISG20 10498 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 89532902 89533939 89533555 Y NA NA MFGE8,ABHD2 IMR90 Hi-C 24141950 MFGE8 78260 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 89664635 89664981 89664666 Y NA ABHD2,HMGB1P8 NA NA NA NA HMGB1P8 12745 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 89856537 89857272 89856853 Y NA POLG,LINC00925 NA NA NA NA POLG 18820 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 90017364 90017928 90017702 Y MESP1,C15orf42 RHCG NA NA NA NA RHCG 19916 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 90324413 90324614 90324489 Y POLG,ZNF710,CIB1,ANPEP MESP1 NA NA NA NA MESP1 31872 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 90402022 90402269 90402146 Y NA AP3S2 NA NA NA NA AP3S2 33305 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 90418263 90418454 90418325 Y NA AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38 NA NA NA NA AP3S2 17120 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 90441878 90442278 90442169 Y C15orf38 AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38 NA NA NA NA AP3S2 6304 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 90547918 90548344 90548145 Y NA NA NA NA NA NA C15orf38 93730 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 90571687 90571922 90571811 Y ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1 NA NA NA NA NA IDH2 71814 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 90649995 90650276 90650136 Y NA IDH2 NA NA NA NA IDH2 6259 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 90669829 90670140 90669985 Y NA IDH2,SEMA4B IQGAP1,IDH2,MESP1,SEMA4B,C15orf58,CIB1,NGRN,TTLL13,ZNF710,C15orf38-AP3S2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IDH2 26093 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 90701535 90701765 90701609 Y ZNF710,SEMA4B,IQGAP1,CIB1 SEMA4B IDH2,ZNF710,C15orf58,TTLL13,NGRN,SEMA4B,IQGAP1,CIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEMA4B 71 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 90958026 90958305 90958134 Y ZNF710,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 28576 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 91208661 91208996 91208948 Y NA RP11-387D10.2,BLM NA NA NA NA RP11-387D10.2 49376 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 91417545 91417844 91417693 Y NA FURIN,MAN2A2 NA NA NA NA FURIN 7723 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 91541068 91541209 91541180 Y NA RCCD1,PRC1,VPS33B NA NA NA NA PRC1 4209 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 92614363 92614588 92614456 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA NPM1P5 212483 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 93344993 93345488 93345070 Y CHD2 FAM174B NA NA NA NA FAM174B 5626 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 93363497 93364154 93363735 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 FAM174B ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 FAM174B 12383 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr15 93374780 93375598 93375185 Y NA FAM174B,CHD2 CHD2,LOC100507217,ASB9P1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM174B 23666 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr15 93520042 93520437 93520098 Y CHD2 NA NA NA NA NA CHD2 95516 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 93542371 93542660 93542397 Y NA NA NA NA NA NA CHD2 117845 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 93614981 93615057 93615003 Y NA NA NA NA NA NA CHD2 190455 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 94987207 94987229 94987220 Y MCTP2 NA NA NA NA NA MCTP2 214440 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 95215107 95215293 95215200 Y NA NA NA NA NA NA MCTP2 442340 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 96703320 96703585 96703453 Y NA NA LOC400456,NR2F2 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F2 163582 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 96872860 96873000 96872921 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469 NA NA NA NA MIR1469 1490 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 96884042 96884481 96884402 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469 NA NA NA NA MIR1469 9552 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr15 96884534 96884884 96884709 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469 NA NA NA NA MIR1469 10044 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 98044402 98044848 98044694 Y ARRDC4 NA NA NA NA NA ARRDC4 415936 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 99193577 99194531 99194069 Y IGF1R IGF1R NA NA NA NA IGF1R 3377 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr15 99223373 99223476 99223421 Y NA IGF1R NA NA NA NA IGF1R 33173 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 99295015 99295222 99295065 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 104815 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 99298945 99299364 99299005 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 108745 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 99318917 99319236 99319025 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 128717 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 99342514 99342944 99342658 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 152314 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 99366453 99366700 99366460 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 176253 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 99387029 99387216 99387183 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 196829 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 99387614 99387887 99387660 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 197414 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 99395486 99396002 99395689 Y IGF1R NA NA NA NA NA IGF1R 205286 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr15 99397047 99397167 99397105 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 206847 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 99401021 99401241 99401076 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 210821 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 99408611 99408985 99408683 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 218411 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 99409834 99409977 99409865 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 219634 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr15 99856918 99857221 99857070 Y NA NA NA NA NA NA HSP90B2P 61081 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 100025808 100025958 100025883 Y MEF2A,MEF2A MEF2A MEF2A,LRRC28,LYSMD4 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 10438 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 100782475 100782658 100782574 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS17 97552 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 101481750 101481996 101481861 Y LRRK1 NA NA NA NA NA ALDH1A3 65831 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 101667775 101667985 101667844 Y CHSY1 NA CHSY1,SELS,LRRK1 IMR90 Hi-C 24141950 CHSY1 122152 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 101745424 101745566 101745486 Y TM2D3,CHSY1 CHSY1 NA NA NA NA CHSY1 44571 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr15 101805289 101805580 101805451 Y NA CHSY1,SNRPA1 NA NA NA NA CHSY1 15152 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 151121 151408 151265 Y NA POLR3K,RHBDF1,MPG,NPRL3 NA NA NA NA MPG 26115 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 615969 616302 616108 Y RGS11,NHLRC4 PIGQ,NHLRC4,RAB40C NA NA NA NA NHLRC4 973 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr16 651803 652154 651979 Y NA PIGQ,NHLRC4,RAB40C,C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90 NA NA NA NA RAB40C 14446 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 729341 729555 729445 Y NA C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,FBXL16,METRN,FAM173A,HAGHL NA NA NA NA STUB1 1117 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr16 1210403 1210717 1210625 Y NA NA NA NA NA NA UBE2I 142831 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 1239202 1239436 1239320 Y BAIAP3,BAIAP3,CACNA1H NA NA NA NA NA UBE2I 114112 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 1381826 1382192 1381930 Y UNKL,SPSB3,MAPK8IP3,EME2,BAIAP3,BAIAP3 UBE2I,BAIAP3,GNPTG NA NA NA NA BAIAP3 224 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 1522812 1522824 1522818 Y MAPK8IP3,CLCN7 C16orf91,CLCN7,TELO2 NA NA NA NA CLCN7 757 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 1581133 1581345 1581183 Y C16orf42,GNPTG,TBL3,SLC9A3R2,RPS2,NUBP2,NME3,MRPS34,GFER,TMEM204 TELO2,TMEM204 NA NA NA NA TMEM204 4444 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr16 1979729 1980160 1979842 Y TSC2,MLST8,DNASE1L2,C16orf79,ABCA3,CCDC154,NME3,NUBP2,TBL3,RNF151 NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3 NUBP2,FAHD1,IGFALS,C16orf73,HS3ST6,MAPK8IP3,SPSB3,EME2,NME3,MRPS34,HAGH,LINC00254 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB10 27349 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 2041117 2041468 2041266 Y MAPK8IP3,EME2,SPSB3 NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,NPW,SLC9A3R2 NA NA NA NA SYNGR3 3456 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 2057818 2059084 2058234 Y TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598 SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 NA NA NA NA ZNF598,NPW 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 2175102 2175363 2175212 Y NME3,NUBP2,TBL3,GFER,SLC9A3R2,MLST8,MLST8,DNASE1L2,NTHL1,TSC2 RAB26,SNORD60,TRAF7 NA NA NA NA RAB26 13441 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.24062908986315 chr16 2518541 2518691 2518640 Y RAB26,E4F1,CCNF,C16orf59,TBC1D24,NTN3 CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2 NA NA NA NA NTN3 809 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr16 2518760 2519270 2519088 Y RAB26,E4F1,SRRM2,C16orf59,TBC1D24,NTN3 CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2 NA NA NA NA NTN3 230 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 2582505 2583298 2582685 Y RAB26,E4F1,SRRM2,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,CEMP1,PDPK1 ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1 NA NA NA NA PDPK1 2667 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 2917931 2918273 2918246 Y NA FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FLYWCH2 12914 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr16 2955389 2955781 2955669 Y NA FLYWCH2,FLYWCH1 NA NA NA NA FLYWCH1 4157 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 3145997 3146167 3146082 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 14394 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 3148559 3148729 3148623 Y ZSCAN10,ZNF597,ZNF263,OR1F1,ZNF205 ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 11832 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 3156056 3156304 3156227 Y PAQR4,OR2C1,CLUAP1,OR1F1 ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 4257 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 3624 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.55078636232894 chr16 3200393 3200919 3200597 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 22615 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 3202363 3202472 3202417 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 24585 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr16 3221173 3221513 3221502 Y NA ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 43395 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 3414643 3415237 3414919 Y NA MTRNR2L4,ZNF174 NA NA NA NA MTRNR2L4 5046 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 4.03204454205525 chr16 3512084 3512361 3512129 Y OR1F1,TIGD7,OR2C1,CLUAP1 ZNF597,NAA60,LA16c-306E5.1,CLUAP1 NA NA NA NA NAA60 20473 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 3730332 3730635 3730484 Y NA TRAP1 NA NA NA NA TRAP1 34963 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr16 3763227 3763392 3763351 Y NA TRAP1 NA NA NA NA TRAP1 2206 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 3796349 3796366 3796358 Y NA TRAP1 NA NA NA NA TRAP1 30751 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 3931357 3931444 3931401 Y C16orf90 CREBBP NA NA NA NA CREBBP 2630 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 4063476 4063638 4063556 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 100548 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 4233647 4234082 4234013 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 69461 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr16 4321625 4322178 4321908 Y ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4 TFAP4 NA NA NA NA TFAP4 549 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.17110090726052 chr16 4436121 4436376 4436295 Y NA PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3 NA NA NA NA VASN 16272 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 4451383 4451509 4451446 Y UBN1,UBN1,MGRN1,GLYR1,CORO7 PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3 NA NA NA NA CORO7 22197 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 4666118 4666710 4666381 Y NA MGRN1 NA NA NA NA MGRN1 1624 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.48125817972631 chr16 4818680 4818913 4818758 Y C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI NA NA NA NA ZNF500 3055 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 4944877 4945061 4944987 Y HMOX2,C16orf5,C16orf5,LOC342346,C16orf71,SEPT12,SEC14L5,ROGDI GLYR1 NA NA NA NA GLYR1 49534 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 5666199 5666502 5666317 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX1 400593 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr16 6070691 6070772 6070742 Y RBFOX1 RBFOX1 NA NA NA NA RBFOX1 3596 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 6105784 6106157 6105923 Y RBFOX1 RBFOX1 NA NA NA NA RBFOX1 38689 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 6132184 6132568 6132193 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX1 65089 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 6265510 6265835 6265674 Y RBFOX1 NA NA NA NA NA RBFOX1 198415 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 6298657 6298857 6298757 Y RBFOX1 NA NA NA NA NA RBFOX1 231562 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 6380642 6380873 6380664 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX1 313547 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr16 6420461 6420698 6420580 Y RBFOX1,RBFOX1 NA NA NA NA NA RBFOX1 353366 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 6422300 6423402 6422643 Y RBFOX1,RBFOX1 NA NA NA NA NA RBFOX1 355205 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr16 6470373 6470382 6470378 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX1 403278 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 6481637 6481868 6481695 Y RBFOX1,RBFOX1 NA NA NA NA NA RBFOX1 414542 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 6556527 6556948 6556619 Y RBFOX1,RBFOX1 NA NA NA NA NA RBFOX1 489432 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 6705372 6705494 6705481 Y RBFOX1 NA NA NA NA NA RBFOX1 638277 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr16 7170846 7171392 7171105 Y RBFOX1 NA NA NA NA NA RBFOX1 1103751 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 7700164 7700333 7700250 Y NA NA NA NA NA NA METTL22 1013207 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 8360834 8360851 8360843 Y NA NA NA NA NA NA METTL22 352689 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 8932650 8933046 8932848 Y NA TMEM186,CARHSP1 NA NA NA NA CARHSP1 27820 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr16 8939360 8939674 8939516 Y USP7 TMEM186,CARHSP1 NA NA NA NA CARHSP1 21192 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr16 8950746 8950997 8950816 Y NA CARHSP1 NA NA NA NA CARHSP1 9869 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 8978616 8978978 8978797 Y NA CARHSP1 NA NA NA NA CARHSP1 17750 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 9055639 9056008 9055791 Y C16orf72,USP7 USP7 NA NA NA NA USP7 363 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 9208363 9208890 9208559 Y NA C16orf72 NA NA NA NA C16orf72 24858 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 9221431 9221974 9221622 Y USP7,C16orf72 C16orf72 NA NA NA NA C16orf72 37926 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 9325793 9326174 9325910 Y NA NA NA NA NA NA C16orf72 142288 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 10133348 10133947 10133667 Y NA NA NA NA NA NA ATF7IP2 284344 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 10549193 10549271 10549232 Y EMP2 NA NA NA NA NA EMP2 123284 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 10563450 10564010 10563797 Y NA NA NA NA NA NA EMP2 108545 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 10710369 10710537 10710438 Y NA EMP2 NA NA NA NA EMP2 37814 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 10710964 10711341 10711185 Y EMP2 EMP2 NA NA NA NA EMP2 38409 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 10713350 10713596 10713516 Y NUBP1 EMP2 NA NA NA NA EMP2 40795 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 10953193 10953844 10953582 Y EMP2 NA CIITA IMR90 Hi-C 24141950 DEXI 80473 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 11086769 11086952 11086818 Y NA NA NA NA NA NA CLEC16A 50424 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 11126143 11126448 11126303 Y NA NA NA NA NA NA CLEC16A 89798 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 11295999 11296122 11296015 Y SNN,LITAF,LITAF,NUBP1,CIITA,SOCS1 RMI2 NA NA NA NA RMI2 45354 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 11308064 11308220 11308142 Y NA RMI2,SOCS1 SOCS1,CLEC16A,PRM3,PRM2,TNP2,RMI2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RMI2 33256 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 11336726 11336842 11336760 Y LITAF,LITAF RMI2,SOCS1 NA NA NA NA RMI2 4634 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 11591931 11591962 11591945 Y NA NA SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF IMR90 Hi-C 24141950 LITAF 136275 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 11666045 11666804 11666319 Y ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,SNN,LITAF,LITAF NA NA NA NA NA LITAF 61433 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 11709603 11709900 11709765 Y RUNDC2A LITAF TXNDC11,CLEC16A,LITAF,RSL1D1,BCAR4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LITAF 18337 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 11960558 11960748 11960653 Y NA RSL1D1,GSPT1 ZC3H7A,RSL1D1,BCAR4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RSL1D1 17116 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 11968147 11968344 11968329 Y ZC3H7A RSL1D1,GSPT1 RSL1D1 IMR90 Hi-C 24141950 RSL1D1 24705 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr16 12008398 12008797 12008598 Y NA GSPT1 NA NA NA NA GSPT1 459 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 12541943 12542343 12542144 Y RUNDC2A NA NA NA NA NA CPPED1 353531 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 12556614 12556995 12556828 Y NA NA NA NA NA NA CPPED1 338879 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 12677677 12677965 12677821 Y NA NA NA NA NA NA CPPED1 217909 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 12713340 12713716 12713664 Y NA NA SNX29 IMR90 Hi-C 24141950 CPPED1 182158 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 13873618 13873819 13873731 Y NA NA NA NA NA NA ERCC4 138195 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 14326449 14326637 14326520 Y MKL2 NA NA NA NA NA MKL2 163271 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 14379572 14379808 14379698 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 216394 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 14529113 14529156 14529135 Y NA NA NA NA NA NA PARN 195429 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 15615028 15616079 15615654 Y KIAA0430 NA NA NA NA NA C16orf45 88876 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 15769690 15769796 15769712 Y NA KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA NDE1 34566 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 16055043 16055430 16055122 Y NDE1,NDE1,ABCC1 RPL15P20,ABCC1 NA NA NA NA ABCC1 13609 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 16070854 16071189 16071093 Y NDE1 RPL15P20,ABCC1 NA NA NA NA ABCC1 29420 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 16115976 16116215 16116101 Y NA NA NA NA NA NA ABCC1 74542 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr16 16214258 16214439 16214353 Y ABCC1 NA ABCC6 IMR90 Hi-C 24141950 NOMO3 109913 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 17271616 17271785 17271673 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 290953 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 17366939 17367350 17367135 Y NA NA NA NA NA NA XYLT1 195388 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 17469718 17469971 17469868 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 92767 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 18056917 18057039 18056979 Y NA NA NA NA NA NA XYLT1 494179 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 18811720 18812078 18811899 Y SMG1,COQ7,COQ7 RPS15A,ARL6IP1 NA NA NA NA ARL6IP1 720 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 19707699 19708034 19707815 Y NA IQCK NA NA NA NA IQCK 17744 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 19769577 19769967 19769778 Y CCP110,GPRC5B,IQCK IQCK NA NA NA NA IQCK 43799 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 19893504 19893863 19893602 Y NA GPRC5B NA NA NA NA GPRC5B 1626 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 21566198 21566360 21566279 Y DNAH3 SLC7A5P2,CTD-2547E10.2,METTL9 METTL9,IGSF6 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2547E10.2 36433 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 21611842 21611954 21611919 Y CRYM,IGSF6,METTL9 METTL9 NA NA NA NA METTL9 5303 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 21637887 21638686 21638408 Y CRYM,METTL9,IGSF6 METTL9 NA NA NA NA METTL9 31348 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 22046502 22046742 22046619 Y NA C16orf52 NA NA NA NA C16orf52 29543 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr16 22202596 22202946 22202679 Y POLR3E,CDR2 EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 12657 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr16 22207042 22207397 22207176 Y NA EEF2K POLR3E,EEF2K,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 8206 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr16 22349127 22349159 22349143 Y POLR3E POLR3E NA NA NA NA POLR3E 42397 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr16 22421466 22421891 22421890 Y NA CDR2,RRN3P3 NA NA NA NA CDR2 24595 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 23431856 23432257 23432204 Y USP31,COG7 COG7 SCNN1B IMR90 Hi-C 24141950 COG7 30244 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 23463654 23463771 23463713 Y NA COG7 NA NA NA NA COG7 1153 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 23473263 23473545 23473445 Y SCNN1G,GGA2 COG7 NA NA NA NA COG7 10762 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 23518606 23518950 23518778 Y GGA2 GGA2,UBFD1,EARS2 NA NA NA NA GGA2 12366 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 23531974 23532033 23532005 Y NA GGA2,UBFD1,EARS2 NA NA NA NA GGA2 658 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 23855109 23855743 23855120 Y NA PRKCB NA NA NA NA PRKCB 9787 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 24061843 24062218 24062031 Y NA NA NA NA NA NA PRKCB 216521 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 24263992 24264018 24264005 Y NA NA NA NA NA NA SNORA1 78850 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 24865270 24865636 24865496 Y SLC5A11 NA ARHGAP17 IMR90 Hi-C 24141950 TNRC6A 126254 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 24879548 24879926 24879737 Y SLC5A11 NA ARHGAP17 IMR90 Hi-C 24141950 TNRC6A 140532 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 25005690 25005854 25005767 Y NA ARHGAP17 NA NA NA NA ARHGAP17 19133 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 25025498 25025977 25025718 Y NA ARHGAP17 NA NA NA NA ARHGAP17 511 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 26818480 26818658 26818569 Y NA NA NA NA NA NA NSMCE1 459457 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 27242037 27242327 27242262 Y NA NSMCE1 NA NA NA NA NSMCE1 35788 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 27386500 27386691 27386620 Y C16orf82,IL21R,IL4R NA NA NA NA NA IL4R 63511 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 27533512 27533805 27533694 Y JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1 GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 25429 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr16 27546889 27546978 27546937 Y NA GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 12256 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 27577101 27577365 27577280 Y NA GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA KIAA0556 17647 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 28160349 28160575 28160437 Y SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6 NA NA NA NA NA XPO6 60666 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 28871082 28871475 28871117 Y NA ATXN2L,TUFM,SH2B1 NA NA NA NA SH2B1 15161 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 29150851 29151075 29150925 Y NA NA SPNS1 IMR90 Hi-C 24141950 RRN3P2 66688 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.86094363479473 chr16 29712327 29712432 29712378 Y HIRIP3,QPRT QPRT NA NA NA NA QPRT 39727 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 30427925 30428543 30428281 Y HIRIP3,ZNF48 TBC1D10B,ZNF48,ZNF771,SNORA42,DCTPP1,SEPHS2 NA NA NA NA SNORA42 537 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 30579441 30579843 30579693 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,SEPT1,ITGAL,STX4,ZNF689 ZNF768,AC002310.12,ZNF747,ZNF764,AC002310.7,ZNF688,ZNF785 NA NA NA NA AC002310.7 1728 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 4.23881605703244 chr16 30726552 30726958 30726731 Y ZNF668,ZNF646,STX4,MYST1,FUS SRCAP,PHKG2,RNF40,C16orf93 RNF40,PHKG2,C16orf93 IMR90 Hi-C 24141950 SRCAP 19022 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr16 30825606 30826012 30825883 Y NA ZNF629 ZNF629,RNF40,MIR4519 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF629 29083 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 30885980 30886229 30886174 Y ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668 MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1 NA NA NA NA MIR4519 1336 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 31129616 31130225 31129940 Y ARMC5,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8 NA NA NA NA KAT8 4541 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 31223480 31223547 31223514 Y ZNF629 FUS NA NA NA NA FUS 34049 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 31905713 31906088 31906002 Y ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 22634 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 34441880 34442279 34442062 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 2558801 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 35029860 35030042 35030005 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 3146781 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.44740060484035 chr16 46792369 46792477 46792422 Y MYLK3 NA MYLK3,C16orf87 IMR90 Hi-C 24141950 ORC6 70814 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr16 46823783 46824029 46823881 Y NA C16orf87 NA NA NA NA C16orf87 39294 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr16 46920520 46920743 46920636 Y NA GPT2 NA NA NA NA GPT2 4230 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 47175603 47175949 47175815 Y NETO2 NA NA NA NA NA NETO2 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 47176557 47176930 47176742 Y NETO2 NETO2 NA NA NA NA NETO2 649 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr16 47454284 47454574 47454519 Y NA PHKB,ITFG1 NA NA NA NA PHKB 38460 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 47669133 47669265 47669199 Y NA NA NA NA NA NA ITFG1 173073 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 48373783 48374217 48374017 Y LONP2,N4BP1,SIAH1 NA NA NA NA NA LONP2 97576 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr16 48400459 48400723 48400564 Y LONP2,N4BP1,SIAH1 NA NA NA NA NA SIAH1 79590 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 48417730 48418013 48418003 Y N4BP1,SIAH1,SIAH1 NA NA NA NA NA SIAH1 62300 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 48593216 48593689 48593553 Y NA NA NA NA NA NA N4BP1 58370 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr16 49316261 49316466 49316357 Y CBLN1,C16orf78 CBLN1 NA NA NA NA CBLN1 2519 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 49317625 49318405 49317904 Y NA CBLN1 NA NA NA NA CBLN1 3883 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 49882114 49882389 49882252 Y NA NA NA NA NA NA HEATR3 215463 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 49893175 49893278 49893262 Y NA NA ZNF423 IMR90 Hi-C 24141950 HEATR3 204574 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 49910498 49910724 49910573 Y NA NA ZNF423 IMR90 Hi-C 24141950 HEATR3 187128 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 50101332 50101352 50101341 Y NA HEATR3 NA NA NA NA HEATR3 3480 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 50280304 50280568 50280347 Y NA NA NA NA NA NA PAPD5 95475 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 50376082 50376389 50376371 Y NA BRD7 NA NA NA NA BRD7 24456 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 50501772 50501939 50501899 Y NA NA NKD1 IMR90 Hi-C 24141950 NKD1 78302 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 51572702 51572897 51572800 Y NA NA SALL1 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPA1P48 104770 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 52854151 52854308 52854232 Y NA NA NA NA NA NA CHD9 232637 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 53095278 53095286 53095282 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 8333 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 53114402 53114975 53114686 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 27457 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 53125869 53126178 53125948 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 38924 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr16 53128013 53128430 53128279 Y RBL2 CHD9 NA NA NA NA CHD9 41068 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 53165497 53165808 53165602 Y NA NA NA NA NA NA CHD9 78552 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 53802432 53802770 53802659 Y NA NA NA NA NA NA FTO 66557 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 53865846 53866045 53865946 Y NA NA NA NA NA NA FTO 129971 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 55544017 55544378 55544293 Y MMP2,LPCAT2 NA NA NA NA NA MMP2 122405 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 55740914 55740956 55740934 Y SLC6A2,SLC6A2 NA NA NA NA NA SLC6A2 53398 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.86094363479473 chr16 56246770 56247072 56246869 Y NA GNAO1 NA NA NA NA GNAO1 23468 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 57510567 57510918 57510632 Y NA COQ9,CIAPIN1,POLR2C,DOK4 NA NA NA NA DOK4 8321 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 57518028 57518100 57518073 Y DOK4 COQ9,CIAPIN1,POLR2C,DOK4 NA NA NA NA DOK4 1139 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr16 57541705 57541726 57541715 Y NA POLR2C,DOK4,CCDC102A POLR2C,DOK4,COQ9,CIAPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 DOK4 22466 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 57841964 57842337 57842236 Y NA NA NA NA NA NA KIFC3 52620 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 58061325 58061443 58061395 Y NA MMP15 NA NA NA NA MMP15 3855 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 58555953 58556233 58556187 Y NA SETD6 NA NA NA NA SETD6 8570 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 61776736 61777059 61776898 Y CDH8 NA NA NA NA NA CDH8 291880 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 64944348 64944657 64944578 Y NA NA NA NA NA NA CDH11 213358 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 65047832 65047877 65047854 Y NA NA NA NA NA NA CDH11 110138 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 65153548 65154160 65153979 Y CDH11 CDH11 NA NA NA NA CDH11 3855 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 65154285 65154635 65154564 Y NA CDH11 NA NA NA NA CDH11 3380 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 67597304 67597932 67597899 Y THAP11,RLTPR,ACD FAM65A,CTCF NA NA NA NA CTCF 2994 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 67687517 67687714 67687560 Y HSF4,KIAA0895L,SLC9A5,TSNAXIP1,PARD6A RLTPR,ACD,PARD6A,C16orf86 NA NA NA NA ACD 4999 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr16 67689330 67689673 67689514 Y NA RLTPR,ACD,PARD6A,C16orf86 NA NA NA NA ACD 3040 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 68234152 68234458 68234209 Y NA ESRP2,PLA2G15 NA NA NA NA ESRP2 35547 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 68268995 68269119 68269015 Y NA ESRP2,PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA ESRP2 886 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 68271348 68271876 68271591 Y TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2 ESRP2,PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA ESRP2 1343 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr16 68306774 68307131 68306843 Y RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7 ESRP2,PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7 NA NA NA NA SLC7A6 10341 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr16 68320188 68320357 68320233 Y RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7 PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P NA NA NA NA SLC7A6OS 22492 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 68320405 68320913 68320608 Y ZFP90,SMPD3 PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P NA NA NA NA SLC7A6OS 21936 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr16 68465013 68465120 68465067 Y NA SMPD3 NA NA NA NA SMPD3 15471 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 69060339 69060481 69060445 Y NA NA NA NA NA NA CHTF8 91850 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 69106233 69106613 69106351 Y NA CHTF8 NA NA NA NA CHTF8 45718 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 69345968 69346332 69346034 Y NA VPS4A,PDF,NIP7,COG8 NA NA NA NA VPS4A 2709 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 69351854 69351929 69351891 Y NA VPS4A,PDF,NIP7,COG8 NA NA NA NA VPS4A 8595 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 69516681 69516730 69516706 Y NA NA NA NA NA NA CYB5B 60253 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 69601109 69601332 69601245 Y WWP2 NFAT5 NA NA NA NA NFAT5 4112 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 69790083 69790481 69790284 Y NA NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA NOB1 3240 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.99818696716929 chr16 69865358 69865753 69865556 Y NA NA NA NA NA NA WWP2 71149 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 70356792 70356812 70356803 Y NA AARS,DDX19B,DDX19A NA NA NA NA DDX19A 21920 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 70461908 70462625 70462132 Y ST3GAL2 ST3GAL2,FUK NA NA NA NA ST3GAL2 8515 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 70467076 70467247 70467197 Y NA ST3GAL2,FUK NA NA NA NA ST3GAL2 3893 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 70725776 70726100 70725941 Y MTSS1L MTSS1L MTSS1L MCF7 ChIA-PET 22265404 MTSS1L 7807 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 70749058 70749400 70749223 Y NA MTSS1L MTSS1L,IL34 IMR90 Hi-C 24141950 MTSS1L 31089 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 70783169 70783447 70783290 Y NA VAC14 NA NA NA NA VAC14 49617 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 71904264 71904408 71904360 Y PHLPP2,ZNF821 ATXN1L,IST1,ZNF821 NA NA NA NA ZNF821 22831 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 72459158 72459630 72459377 Y NA NA NA NA NA NA TXNL4B 332828 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr16 72671878 72672163 72672013 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 419434 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 72897745 72898023 72897884 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 193574 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 73076128 73076469 73076445 Y NA ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 15128 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 73088640 73089206 73088991 Y NA ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 2391 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 73090044 73090191 73090091 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 1406 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 73104505 73104770 73104567 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 12908 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr16 73206454 73206866 73206668 Y NA NA ZFHX3,HPR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFHX3 114857 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr16 73579690 73579877 73579784 Y NA NA ZFHX3 IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 488093 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 74083907 74083919 74083914 Y NA NA HPR IMR90 Hi-C 24141950 PSMD7 244754 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 74353064 74353398 74353241 Y FA2H PSMD7,RP11-252A24.2 NA NA NA NA PSMD7 24391 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr16 74356396 74356719 74356558 Y NA PSMD7,RP11-252A24.2 NA NA NA NA PSMD7 27723 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 74610751 74610842 74610827 Y NA GLG1 NA NA NA NA GLG1 28170 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 74701397 74701877 74701440 Y RFWD3 RFWD3 NA NA NA NA RFWD3 2618 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr16 74702224 74702291 74702259 Y NA RFWD3 NA NA NA NA RFWD3 3445 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 74991657 74991945 74991906 Y NA ZNRF1,WDR59 NA NA NA NA ZNRF1 38983 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 75034413 75034614 75034514 Y FA2H,ZFP1,BCAR1,BCAR1,ZNRF1 ZNRF1,WDR59 NA NA NA NA WDR59 2342 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 75108938 75109127 75108974 Y NA NA NA NA NA NA ZFP1 71263 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 75278988 75279894 75279594 Y CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1 BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 20057 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 75288221 75288577 75288338 Y NA BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 11374 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 75294692 75295061 75294835 Y TERF2IP,BCAR1,BCAR1 BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 4890 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 75359436 75359702 75359569 Y NA NA BCAR1 IMR90 Hi-C 24141950 BCAR1 59485 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 75420812 75420988 75420900 Y NA CFDP1 CTRB1,BCAR1,CTRB2 IMR90 Hi-C 24141950 CFDP1 44395 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 75483148 75483204 75483176 Y NA CFDP1,TMEM170A NA NA NA NA TMEM170A 14191 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 75604496 75604511 75604504 Y NA TMEM231,GABARAPL2 NA NA NA NA GABARAPL2 6247 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 75618166 75618518 75618190 Y NA TMEM231,GABARAPL2,ADAT1 NA NA NA NA GABARAPL2 19917 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 75636745 75636762 75636754 Y NA TMEM231,GABARAPL2,ADAT1,TERF2IP,KARS NA NA NA NA ADAT1 18436 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 75683626 75683906 75683817 Y NA ADAT1,TERF2IP,KARS NA NA NA NA KARS 3085 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 76269107 76269317 76269211 Y NA RPL18P13,CNTNAP4 NA NA NA NA RPL18P13 1586 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 77123839 77123959 77123899 Y NA NA NA NA NA NA MON1B 98773 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 78832287 78832508 78832373 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 700977 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 78928740 78929250 78929028 Y NA NA NA NA NA NA MAF 703361 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 79483871 79484059 79483959 Y NA NA NA NA NA NA MAF 148552 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 80571434 80571574 80571570 Y NA NA DYNLRB2 K562 ChIA-PET 22265404 CENPN 466529 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 81555726 81556034 81555821 Y CMIP NA NA NA NA NA CMIP 78951 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 81659842 81660553 81660320 Y NA NA NA NA NA NA CMIP 183067 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 81763852 81764387 81764185 Y NA NA NA NA NA NA CMIP 287077 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr16 81875278 81875726 81875461 Y PLCG2 NA NA NA NA NA HSD17B2 190883 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 81900511 81900900 81900809 Y CMIP,CMIP,PLCG2 NA NA NA NA NA HSD17B2 165709 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 83953538 83953937 83953606 Y NA MLYCD NA NA NA NA MLYCD 22807 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr16 84208911 84209121 84208992 Y OSGIN1,COTL1,HSDL1,TAF1C HSDL1,DNAAF1,TAF1C NA NA NA NA TAF1C 9548 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 84855927 84856178 84856013 Y CRISPLD2 CRISPLD2 NA NA NA NA CRISPLD2 4337 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 85037797 85037883 85037799 Y NA ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA ZDHHC7 5258 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 85038009 85038299 85038256 Y NA ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA ZDHHC7 4842 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 85185210 85185759 85185517 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 125835 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 85202555 85203049 85202710 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 143180 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 11.8893621111886 chr16 85264175 85264500 85264259 Y NA NA LOC400548,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0513 204800 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr16 85268297 85268637 85268360 Y NA NA LOC400548,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0513 208922 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 85405119 85405354 85405237 Y NA NA KIAA0513,FAM92B,LINC00311,LOC727710,KIAA0182 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 316325 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 85496879 85497321 85497140 Y FAM92B,KIAA0182 NA KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 224358 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 85497347 85497685 85497518 Y KIAA0182,GINS2 NA KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 223994 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 85499556 85499891 85499629 Y NA NA KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,LOC400548,FAM92B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 221788 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 85522483 85522579 85522531 Y NA NA KIAA0182,FAM92B,KIAA0513,LOC727710 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 199100 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 85557334 85557622 85557547 Y NA NA KIAA0182,LOC727710 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 164057 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 85558121 85558453 85558347 Y KIAA0182,KIAA0182 NA KIAA0182,LOC727710 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 163226 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 85586399 85586765 85586561 Y KIAA0182,KIAA0182,GINS2 NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134914 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 85586938 85587370 85587020 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134309 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr16 85604470 85605423 85604746 Y NA NA LINC00311,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 116256 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 85648720 85648939 85648787 Y NA NA NA NA NA NA GINS2 72740 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 85650361 85650613 85650432 Y NA NA NA NA NA NA GINS2 71066 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr16 85672210 85672324 85672267 Y NA GINS2 GINS2 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 49355 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 85758517 85758802 85758746 Y NA GINS2,C16orf74 GINS2,KIAA0182 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf74 23933 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 86066645 86066773 86066726 Y NA NA COX4NB,COX4I1,LOC400550,LOC732275,MTHFSD,FOXF1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-568J23.1 218503 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 86609499 86609840 86609550 Y FOXC2 MTHFSD NA NA NA NA MTHFSD 22658 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 86713823 86714104 86713964 Y FOXC2 NA FOXL1,MTHFSD,FLJ30679,FOXC2 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFSD 126982 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 86855510 86855797 86855532 Y NA NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFSD 268669 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 87158204 87158531 87158278 Y NA NA FOXC2,FLJ30679,MTHFSD,FOXL1,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 MAP1LC3B 257070 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 87359959 87360279 87360119 Y NA NA NA NA NA NA MAP1LC3B 55322 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 87428114 87428209 87428177 Y NA MAP1LC3B,FBXO31 NA NA NA NA FBXO31 4366 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 87773499 87773902 87773849 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 23696 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 87774219 87774566 87774531 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 23032 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 87780321 87780693 87780507 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 16905 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 87811234 87811383 87811309 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 13636 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 87840547 87840941 87840913 Y SLC7A5 KLHDC4 SLC7A5 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLHDC4 42949 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 87886258 87886670 87886593 Y MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 14424 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 87957908 87958324 87958193 Y NA BANP NA NA NA NA BANP 22526 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 87958916 87959287 87959164 Y NA BANP NA NA NA NA BANP 21563 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr16 88082514 88082829 88082672 Y NA NA NA NA NA NA BANP 101664 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 88575081 88575169 88575126 Y NA NA NA NA NA NA ZFPM1 57356 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 88837093 88837695 88837443 Y NA CDT1,APRT NA NA NA NA CDT1 29926 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 89070544 89070800 89070714 Y CBFA2T3 NA ACSF3,CBFA2T3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACSF3 81983 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 89086731 89086969 89086798 Y NA NA ACSF3,CBFA2T3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACSF3 65814 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 89313669 89314138 89313993 Y ZNF276,ZNF778 ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 31551 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr16 89380978 89381130 89380989 Y ZNF276,ZNF276,SPATA2L,ANKRD11,ZNF778 NA NA NA NA NA ZNF778 98860 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 89449545 89449691 89449606 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD11 105278 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 89555521 89555997 89555713 Y ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 196 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr16 89564919 89565211 89565067 Y NA ANKRD11,SPG7 ANKRD11,SPG7 IMR90 Hi-C 24141950 SPG7 9594 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr16 89568763 89569125 89568979 Y NA ANKRD11,SPG7 ANKRD11,SPG7,LOC100287036,RPL13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPG7 13438 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 89579992 89580270 89580045 Y ACSF3,ZNF778,DBNDD1,ZNF276,SPG7 ANKRD11,SPG7,RPL13,SNORD68 NA NA NA NA SPG7 24667 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 89893816 89894170 89893993 Y SPIRE2 FANCA,SPIRE2,TCF25 NA NA NA NA SPIRE2 11229 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 89904172 89904600 89904272 Y MC1R,SPIRE2 FANCA,SPIRE2,TCF25 NA NA NA NA SPIRE2 21585 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr16 90087429 90087721 90087595 Y TUBB3,DBNDD1,PRDM7 GAS8,DBNDD1 NA NA NA NA DBNDD1 2893 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 12308 12676 12492 Y NA DOC2B NA NA NA NA DOC2B 16751 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 32253 32376 32346 Y DOC2B DOC2B NA NA NA NA DOC2B 2826 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 198472 198837 198612 Y RPH3AL RPH3AL NA NA NA NA RPH3AL 35208 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 654300 654699 654470 Y NA VPS53,FAM57A,DBIL5P,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4 NA NA NA NA DBIL5P 400 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 872261 872610 872409 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 8400 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 872760 873162 873150 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 7848 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 873777 873849 873813 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 7161 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 881410 881576 881449 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 400 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 990722 991295 990801 Y NA NA NA NA NA NA TIMM22 92365 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 1094047 1094290 1094169 Y SLC43A2,PITPNA NA NA NA NA NA TIMM22 195690 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 1171565 1171808 1171610 Y WDR81,PITPNA,ABR,ABR NA NA NA NA NA YWHAE 129864 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 1267059 1267122 1267091 Y NA YWHAE NA NA NA NA YWHAE 34550 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 1390195 1390341 1390268 Y MYO1C,MYO1C,MYO1C CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 3765 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 1391218 1391783 1391434 Y NA CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 2323 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 1585953 1586309 1586247 Y NA WDR81,MIR22HG NA NA NA NA PRPF8 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 1620806 1621089 1620895 Y PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81 PRPF8,WDR81,MIR22HG,SERPINF1 NA NA NA NA MIR22HG 2338 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 1666519 1666783 1666685 Y RTN4RL1,WDR81,WDR81,SERPINF1 WDR81,MIR22HG,SERPINF1 NA NA NA NA SERPINF1 3266 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 1773985 1774184 1774050 Y SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,WDR81,WDR81,SMYD4 RPA1,SMYD4,AC016292.3 NA NA NA NA AC016292.3 14245 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 1863470 1863779 1863610 Y SGSM2,SGSM2,RTN4RL1 NA NA NA NA NA DPH1 67625 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 1953067 1954207 1953327 Y TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1 DPH1,OVCA2 NA NA NA NA OVCA2 9740 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr17 2095819 2096093 2095903 Y WDR81 NA NA NA NA NA SRR 108584 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 2126107 2126815 2126522 Y NA NA NA NA NA NA SRR 77862 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 2291927 2292298 2292113 Y NA MNT NA NA NA NA MNT 10114 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 2302778 2303366 2303033 Y SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT MNT NA NA NA NA MNT 366 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr17 2397010 2397265 2397138 Y NA METTL16 LOC284009 IMR90 Hi-C 24141950 METTL16 15920 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 2409124 2409453 2409310 Y NA METTL16 NA NA NA NA METTL16 3732 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 2652547 2653322 2653300 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 158043 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 2795960 2796135 2796054 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 301456 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 2952123 2952503 2952284 Y ASPA,ASPA,PAFAH1B1 NA NA NA NA NA PAFAH1B1 457619 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 4437372 4437692 4437444 Y NA SPNS2,MYBBP1A NA NA NA NA MYBBP1A 19234 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 4655440 4655557 4655500 Y ZNF232,ARRB2,CXCL16,ZMYND15,ZMYND15 PELP1,RP11-314A20.1,ARRB2,MED11,PSMB6 NA NA NA NA MED11 22717 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 4811647 4812042 4811731 Y NA RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1 NA NA NA NA RNF167 29261 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 4839784 4839936 4839857 Y C17orf107 RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1,SPAG7,CAMTA2 NA NA NA NA RNF167 1367 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 5000892 5001205 5000989 Y NA ZFP3,AC012146.7,ZNF232 NA NA NA NA AC012146.7 11558 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr17 7115018 7115437 7115195 Y NA ACADVL,DLG4,DVL2,PHF23,GABARAP,CTDNEP1 NA NA NA NA ACADVL 3007 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 7389589 7389989 7389739 Y C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA POLR2A 3904 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 608 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.96432939228333 chr17 7745337 7745870 7745591 Y NA KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4115 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr17 7745915 7746944 7746139 Y NA KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4693 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 5769 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.06771514977192 chr17 7790181 7790340 7790322 Y POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3 KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,KCNAB3,CNTROB,TRAPPC1 NA NA NA NA LSMD1 3625 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 8029634 8030116 8029995 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107 NA NA NA NA PER1 27708 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.44740060484035 chr17 8041932 8042438 8042328 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 15386 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 8057335 8058055 8057702 Y KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59 VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 8090038 8090540 8090163 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB NA NA NA NA C17orf59 1024 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 8095551 8095762 8095658 Y KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2 PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB NA NA NA NA C17orf59 3987 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr17 8103328 8103700 8103595 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,PFAS,CTC1 NA NA NA NA AURKB 8218 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr17 8532647 8532776 8532657 Y KRBA2 MYH10 NA NA NA NA MYH10 568 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 8855312 8855901 8855659 Y PIK3R5,PIK3R5 NA NA NA NA NA MYH10 323233 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 9155924 9156306 9156115 Y PIK3R5 NA NA NA NA NA STX8 321602 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 9267283 9267598 9267441 Y NA NA NA NA NA NA STX8 210310 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 9924626 9924875 9924814 Y NA NA NA NA NA NA RPS27AP1 235204 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 10658369 10658680 10658526 Y SHISA6,TMEM220,PIRT TMEM220,RP11-963H4.2 ZNF18,SHISA6,PIRT IMR90 Hi-C 24141950 RP11-963H4.2 10509 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 13689783 13689996 13689890 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST3A1 186539 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 14105008 14105251 14105153 Y COX10,HS3ST3B1 NA NA NA NA NA COX10 134195 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 14206970 14207459 14207274 Y HS3ST3B1 NA NA NA NA NA COX10 236157 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 15849102 15849709 15849209 Y ZSWIM7,TTC19,ADORA2B ADORA2B NA NA NA NA ADORA2B 2871 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 15862469 15862773 15862614 Y ADORA2B,ZSWIM7,TTC19 ADORA2B,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ADORA2B 16238 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 15923170 15923610 15923287 Y FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 22139 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 15925215 15925448 15925362 Y ZNF286A,NCOR1 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 24184 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 15925706 15925935 15925791 Y FAM18B2,PIGL,NCOR1,TTC19,ZSWIM7 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 24675 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 16249780 16250130 16249956 Y CENPV CENPV,UBB NA NA NA NA CENPV 4840 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr17 16281558 16281769 16281590 Y NA CENPV,UBB NA NA NA NA UBB 343 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 16374519 16374788 16374546 Y NA NA NA NA NA NA UBB 92407 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 16375722 16375971 16375775 Y TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV NA NA NA NA NA UBB 93610 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 16438910 16439232 16439111 Y NA ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 31288 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr17 16440164 16440317 16440266 Y ZNF624,CCDC144A ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 30203 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 16487545 16487788 16487743 Y NA ZNF287,AC005822.1 NA NA NA NA ZNF287 17025 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 17098696 17098916 17098799 Y MPRIP,RAI1,PEMT,NT5M,MED9,COPS3,PLD6,FLCN PLD6,FLCN NA NA NA NA PLD6 8713 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 17163211 17163219 17163215 Y NA FLCN,COPS3,NT5M NA NA NA NA COPS3 19388 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 17208754 17209324 17209000 Y PLD6,COPS3,COPS3,NT5M COPS3,NT5M NA NA NA NA NT5M 4105 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 17397062 17397447 17397255 Y NA MED9,RASD1 NA NA NA NA RASD1 262 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 17566702 17566984 17566789 Y NA RAI1 RAI1,SMCR9,PEMT,NT5M,TOM1L2,COPS3,MED9,RASD1,SMCR5,SREBF1,C17orf39,ATPAF2 IMR90 Hi-C 24141950 RAI1 15803 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 17596410 17596829 17596636 Y NA RAI1 NA NA NA NA RAI1 13623 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 17597479 17598220 17598134 Y ALKBH5,FLCN,COPS3 RAI1 NA NA NA NA RAI1 14692 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr17 17615930 17616232 17616056 Y NA RAI1 NA NA NA NA RAI1 33143 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 17686462 17687119 17686716 Y NA NA NA NA NA NA SREBF1 51206 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 17817256 17817562 17817444 Y SREBF1 NA NA NA NA NA TOM1L2 56174 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 19141562 19141875 19141665 Y RNF112,EPN2 NA NA NA NA NA SNORD3D 127613 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 19321074 19321220 19321147 Y NA MAPK7,B9D1,MFAP4,RNF112 NA NA NA NA RNF112 8636 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 20688064 20688832 20688343 Y NA OLA1P2 NA NA NA NA OLA1P2 11109 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 20755696 20755942 20755820 Y NA RP11-344E13.3,CCDC144NL NA NA NA NA RP11-344E13.3 13804 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 20814751 20814975 20814753 Y KCNJ18 RP11-344E13.3,CCDC144NL NA NA NA NA CCDC144NL 17298 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 20943914 20944165 20944106 Y NA USP22 NA NA NA NA USP22 908 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 21002403 21002809 21002523 Y KCNJ18 DHRS7B USP22,C17orf103 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHRS7B 21868 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 21003151 21003338 21003245 Y NA DHRS7B USP22,C17orf103 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHRS7B 21339 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 21416302 21416539 21416421 Y NA NA NA NA NA NA C17orf51 59183 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 25410571 25410806 25410743 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208296 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 25415234 25415538 25415430 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 203564 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.65417211981754 chr17 25415760 25416041 25415903 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 203061 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr17 25416172 25416581 25416426 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 202521 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 81.2612053860366 chr17 25479961 25480088 25479965 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 139014 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.65417211981754 chr17 25707009 25707412 25707348 Y NA NA KSR1 IMR90 Hi-C 24141950 KSR1 74258 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 25805507 25805777 25805623 Y NA KSR1 NA NA NA NA KSR1 23837 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 25891638 25891876 25891756 Y NA NA NA NA NA NA KSR1 109968 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 26718724 26718918 26718801 Y FOXN1,C17orf63,SEBOX,SARM1 POLDIP2,TMEM199,SARM1,SLC46A1 NA NA NA NA SLC46A1 13297 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 27112558 27112737 27112648 Y SGK494 TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 43556 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 27116093 27116114 27116106 Y NA TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 47091 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 27118575 27118718 27118697 Y NA TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 49573 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 27619094 27619880 27619581 Y TAOK1 NA NA NA NA NA NUFIP2 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 27791459 27791862 27791696 Y NA NA NA NA NA NA MIR4523 75779 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 27824938 27824945 27824941 Y TIAF1,MYO18A,TAOK1,EFCAB5,ANKRD13B NA NA NA NA NA TP53I13 66125 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 27918115 27918172 27918144 Y GIT1,ANKRD13B TP53I13,ANKRD13B,GIT1,CORO6 NA NA NA NA GIT1 900 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 27972817 27973010 27972914 Y NA CORO6 NA NA NA NA CORO6 24892 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 28033249 28033691 28033498 Y NUFIP2,TAOK1,SSH2 NA NA NA NA NA CORO6 85324 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 28050852 28051063 28050953 Y NA NA NA NA NA NA CORO6 102927 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 28070496 28070746 28070685 Y SSH2,EFCAB5 NA NA NA NA NA CORO6 122571 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 28166109 28166223 28166182 Y NA NA NA NA NA NA SSH2 89071 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 28431711 28432027 28431733 Y NA NSRP1 NA NA NA NA NSRP1 8512 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 28533256 28533617 28533437 Y SLC6A4 SNORD63 NA NA NA NA SNORD63 38221 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 28672650 28672985 28672901 Y NSRP1,CPD,CPD CPD NSRP1,TMIGD1,GOSR1,CPD,EFCAB5,MIR3184,SLC6A4,BLMH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CPD 30938 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 29717293 29717639 29717335 Y OMG,RAB11FIP4 RAB11FIP4 NA NA NA NA RAB11FIP4 651 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 29719593 29719962 29719805 Y OMG,RAB11FIP4 RAB11FIP4 NA NA NA NA RAB11FIP4 2951 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 29759240 29759393 29759318 Y NA RAB11FIP4 NA NA NA NA RAB11FIP4 42598 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 29787763 29788137 29787829 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 71121 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 160050 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 31155018 31155230 31155072 Y MYO1D MYO1D NA NA NA NA MYO1D 46965 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 32049616 32049940 32049779 Y NA NA NA NA NA NA TMEM98 796688 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 33787408 33787803 33787736 Y ZNF830,SLFN5,CCL5,SLFN12L NA NA NA NA NA AP2B1 115262 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 34160214 34160648 34160302 Y NA MMP28,TAF15 NA NA NA NA TAF15 25755 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 34476785 34477178 34477032 Y GGNBP2,CCL5,CCL23,CCL3,CCL4,CCL3L3,CCL3L1 NA NA NA NA NA RDM1 221008 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 34838937 34839070 34839023 Y NA ZNHIT3,PIGW NA NA NA NA ZNHIT3 1403 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr17 34875469 34875747 34875679 Y NA ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2 NA NA NA NA PIGW 13100 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 34948982 34949076 34949029 Y DHRS11 DHRS11,MRM1 NA NA NA NA DHRS11 2754 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 35492690 35492856 35492817 Y NA NA NA NA NA NA AATF 188515 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 35520107 35520138 35520123 Y ACACA NA NA NA NA NA AATF 215932 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 35682301 35682446 35682421 Y NA NA NA NA NA NA ACACA 82463 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 35741498 35741507 35741502 Y NA ACACA,TADA2A NA NA NA NA ACACA 23402 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 36122885 36123141 36123013 Y NA NA DDX52,HNF1B,SYNRG IMR90 Hi-C 24141950 DDX52 121392 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 36412216 36412471 36412263 Y NA RP11-1407O15.2,MRPL45 NA NA NA NA RP11-1407O15.2 7387 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 36571646 36572076 36571709 Y C17orf96 ARHGAP23 NA NA NA NA ARHGAP23 10586 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr17 36907984 36908100 36908042 Y NA MLLT6,CISD3,PCGF2,PSMB3,PIP4K2B NA NA NA NA PSMB3 995 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 37366071 37366159 37366135 Y STAC2 CACNB1,RPL19,STAC2 NA NA NA NA RPL19 11535 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr17 37542274 37542291 37542284 Y NA FBXL20 NA NA NA NA FBXL20 14485 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 37558786 37559227 37559071 Y NA FBXL20,MED1 NA NA NA NA FBXL20 2010 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 37661852 37662117 37661985 Y STAC2,FBXL20,MED1,CDK12 CDK12 NA NA NA NA CDK12 46088 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 37836975 37837156 37837086 Y NA STARD3,ERBB2,PGAP3,MIEN1 NA NA NA NA ERBB2 5011 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 37910411 37911394 37910787 Y FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3 MIEN1 NA NA NA NA MIEN1 25371 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 38225703 38226086 38225816 Y PPP1R1B,TCAP,THRA,THRA,NR1D1 THRA,MED24,NR1D1 NA NA NA NA MED24 10235 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 38231838 38232188 38231911 Y NA THRA,MED24,NR1D1,MSL1 NA NA NA NA MED24 16370 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 38374652 38374886 38374755 Y KRT222,THRA,THRA,NR1D1,RARA,RAPGEFL1,WIPF2 RAPGEFL1,WIPF2 NA NA NA NA WIPF2 1096 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 38464298 38464708 38464402 Y MSL1,WIPF2,RARA,RARA CDC6,RARA NA NA NA NA RARA 854 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 38470934 38471197 38471090 Y IKZF3,WIPF2,RARA,RARA CDC6,RARA NA NA NA NA RARA 7490 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 38607821 38607996 38607876 Y NA TOP2A,IGFBP4 NA NA NA NA IGFBP4 10119 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 38646848 38646954 38646881 Y KRT222,THRA,RAPGEFL1 IGFBP4 NA NA NA NA IGFBP4 49146 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 38674878 38675250 38674921 Y TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4 NA IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IGFBP4 77176 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 39110175 39110404 39110304 Y KRTAP3-2 NA NA NA NA NA TMEM99 136817 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 39686458 39686891 39686666 Y KRT19 KRT19 NA NA NA NA KRT19 3898 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 39822130 39822941 39822323 Y NA EIF1 KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 20196 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr17 39823354 39823685 39823437 Y NA EIF1 KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 19452 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 39949116 39949497 39949168 Y KRT14,JUP JUP,LEPREL4,FKBP10 NA NA NA NA JUP 7933 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 40155760 40155995 40155877 Y STAT5A CNP,NKIRAS2,DNAJC7 NA NA NA NA NKIRAS2 5405 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 40163251 40163440 40163343 Y NA CNP,NKIRAS2,DNAJC7 NA NA NA NA NKIRAS2 1851 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 40201052 40201290 40201078 Y CNP NKIRAS2,DNAJC7 HSPB9,KAT2A K562 ChIA-PET 22265404 DNAJC7 29658 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 40400517 40401003 40400833 Y EZH1,KLHL11,RAB5C,STAT3,STAT3,FAM134C,STAT5B,STAT5A STAT5B,STAT5A NA NA NA NA STAT5B 25722 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 40539110 40539537 40539349 Y NA STAT3,PTRF NA NA NA NA STAT3 524 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 40689876 40689925 40689901 Y NA AC067852.1,NAGLU,COASY,MLX,PSMC3IP NA NA NA NA NAGLU 3686 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 40805539 40806065 40805782 Y NA TUBG1,FAM134C,TUBG2,PLEKHH3,CNTNAP1 NA NA NA NA TUBG2 3258 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 41017672 41017950 41017805 Y NA PSME3,BECN1,AOC3 NA NA NA NA AOC3 16471 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 41173099 41173334 41173293 Y NAGLU,VAT1 RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1,RND2 NA NA NA NA VAT1 1806 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 41409196 41409569 41409556 Y TMEM106A TMEM106A IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM106A 47342 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 41410079 41410140 41410127 Y NA TMEM106A IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM106A 48225 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 41827198 41827473 41827372 Y NA DUSP3 NA NA NA NA DUSP3 26883 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 41974490 41974868 41974680 Y LSM12,MPP2 MPP2 CD300LG IMR90 Hi-C 24141950 MPP2 10200 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 42061095 42061375 42061233 Y NA TMEM101 NA NA NA NA TMEM101 37939 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr17 42100535 42100831 42100709 Y NA TMEM101,LSM12,G6PC3 NA NA NA NA TMEM101 1221 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 42173050 42173151 42173101 Y TMEM101,G6PC3 LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25919 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 42173326 42173627 42173470 Y NA LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25443 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 42198947 42199210 42199140 Y NA C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 42215472 42215904 42215679 Y C17orf53 HDAC5,C17orf53,TMUB2 C17orf53 MCF7 ChIA-PET 22265404 C17orf53 1370 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 42245888 42246083 42245988 Y NA HDAC5,C17orf53,TMUB2,ATXN7L3 NA NA NA NA TMUB2 16255 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.17110090726052 chr17 42347402 42347673 42347539 Y UBTF,SLC4A1,SLC25A39 RUNDC3A NA NA NA NA RUNDC3A 36108 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 42404001 42404290 42404282 Y C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39 RUNDC3A,SLC25A39,GRN,FAM171A2 NA NA NA NA SLC25A39 3763 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 42634020 42634172 42634095 Y TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2 FZD2 NA NA NA NA FZD2 1095 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 42797981 42798248 42798116 Y CCDC43 CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1,ADAM11 NA NA NA NA RP11-1072C15.1 2016 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 43018379 43018606 43018493 Y NA CCDC103,EFTUD2,FAM187A,KIF18B,C1QL1 NA NA NA NA KIF18B 4476 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 43034960 43035346 43035098 Y ADAM11,HIGD1B,DCAKD,ACBD4,GFAP KIF18B,C1QL1 KIF18B IMR90 Hi-C 24141950 C1QL1 8093 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr17 43095998 43096402 43096133 Y NA NMT1,DCAKD NA NA NA NA NMT1 30576 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 43201428 43201633 43201517 Y NA ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2 NA NA NA NA ACBD4 6334 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 43385085 43385291 43385153 Y HEXIM1,FMNL1,PLEKHM1,MAP3K14,ARHGAP27 MAP3K14 LOC100133991,FMNL1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K14 7123 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 43660811 43661173 43660906 Y ACBD4,FMNL1,PLEKHM1 NA NA NA NA NA MAP3K14 268397 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 44113965 44114105 44114069 Y KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA MAPT 144217 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr17 44131950 44132178 44132002 Y KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA MAPT 162202 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 44135698 44135955 44135827 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 165950 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 44155479 44155559 44155517 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 185731 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 44198056 44198387 44198212 Y STH,KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA MAPT 228308 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 44198532 44198560 44198547 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 228784 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 44232468 44232502 44232485 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 262720 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 44234299 44234706 44234578 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 264551 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 44240473 44240874 44240856 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 270725 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr17 44344171 44344471 44344293 Y NA NA KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAPT 374423 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.24062908986315 chr17 44847625 44847956 44847902 Y WNT3 NA NA NA NA NA RPS7P11 50092 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 44848812 44849347 44849259 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 51279 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr17 45021726 45021957 45021796 Y NA GOSR2,RPRML NA NA NA NA GOSR2 23243 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 45144155 45144236 45144196 Y NA NA NPEPPS IMR90 Hi-C 24141950 RPRML 89541 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 45352964 45353080 45353020 Y WNT9B ITGB3 NA NA NA NA ITGB3 23701 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 45609469 45609601 45609554 Y NA NPEPPS NA NA NA NA NPEPPS 11161 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 45717975 45718065 45718017 Y NA KPNB1 NA NA NA NA KPNB1 6777 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 45725037 45725352 45725118 Y SP2 KPNB1 NA NA NA NA KPNB1 195 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 45771013 45771467 45771041 Y NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1 KPNB1,TBX21 NA NA NA NA TBX21 37143 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr17 45778272 45778788 45778511 Y SNX11,SNX11,ITGB3,C17orf57,NPEPPS,SP2,OSBPL7,CDK5RAP3,TBKBP1,TBX21 TBX21 NA NA NA NA TBX21 29822 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 45867525 45867625 45867557 Y NA OSBPL7,MRPL10,LRRC46,SCRN2 NA NA NA NA OSBPL7 29575 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr17 45867879 45868153 45868016 Y NA OSBPL7,MRPL10,LRRC46,SCRN2 NA NA NA NA OSBPL7 29047 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 45983662 45984115 45983847 Y CDK5RAP3 SP2,AC003665.1,PNPO PNPO IMR90 Hi-C 24141950 SP2 12146 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 46073519 46073818 46073669 Y NA CDK5RAP3,COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA CDK5RAP3 30343 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 46080436 46080890 46080812 Y CDK5RAP3 CDK5RAP3,COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 32502 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 46089554 46089940 46089788 Y CBX1,CBX1,CDK5RAP3 CDK5RAP3,COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 23452 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr17 46091429 46091644 46091522 Y NA CDK5RAP3,COPZ2,NFE2L1 SP2,PNPO,CDK5RAP3,PRR15L IMR90 Hi-C 24141950 COPZ2 21748 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 46101351 46101579 46101379 Y NA COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 11813 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 46102426 46102830 46102617 Y NA COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 10562 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 46168455 46168716 46168586 Y NA NFE2L1,CBX1,SNX11 NA NA NA NA CBX1 8167 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 46289129 46289412 46289274 Y NA NA NA NA NA NA SNX11 110410 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 46315130 46315301 46315294 Y OSBPL7,CDK5RAP3,SKAP1 NA NA NA NA NA SNX11 136411 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 46395351 46395518 46395501 Y NA NA NA NA NA NA SNX11 216632 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 46605931 46606242 46606161 Y TTLL6,HOXB1 HOXB-AS1,HOXB2 NA NA NA NA HOXB-AS1 12671 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 47081384 47081547 47081466 Y NA IGF2BP1 NA NA NA NA IGF2BP1 8610 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 47092021 47092148 47092036 Y NA IGF2BP1 NA NA NA NA IGF2BP1 19247 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 47270202 47270509 47270359 Y CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3 NA NA NA NA NA RP11-1079K10.3 166018 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr17 47815825 47816028 47815963 Y MYST2,FAM117A,DLX4,DLX4 SLC35B1,KAT7,FAM117A NA NA NA NA SLC35B1 31449 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 47818299 47818938 47818569 Y NA SLC35B1,KAT7,FAM117A NA NA NA NA SLC35B1 33923 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 47861865 47862072 47862013 Y NA KAT7,FAM117A,RP11-613C6.4 ZNF652,NXPH3,SPOP,FAM117A,SLC35B1,KAT7,FLJ45513,TAC4,DLX3 IMR90 Hi-C 24141950 KAT7 1845 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 48206052 48206167 48206088 Y NA PDK2,SAMD14,PPP1R9B NA NA NA NA SAMD14 806 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 48228924 48229616 48229504 Y SPATA20,SAMD14 SAMD14,PPP1R9B,COL1A1 NA NA NA NA PPP1R9B 2933 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr17 48255388 48256117 48255676 Y NA PPP1R9B,COL1A1 NA NA NA NA COL1A1 20876 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 48942663 48943085 48943016 Y NA WFIKKN2,TOB1 NA NA NA NA TOB1 254 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 48996944 48997365 48997235 Y UTP18,RSAD1,TOB1 NA LOC400604,TOB1,WFIKKN2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOB1 53605 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr17 49008376 49008926 49008868 Y NA NA WFIKKN2,TOB1,LOC400604,LINC00483,ANKRD40,SPAG9 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOB1 65037 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 49031638 49031879 49031784 Y NA NA NA NA NA NA TOB1 88299 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.24062908986315 chr17 49075036 49075414 49075227 Y NA NA NA NA NA NA SPAG9 120812 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 49182545 49182921 49182907 Y NA SPAG9,NME1,NME1-NME2,NME2 NA NA NA NA SPAG9 13305 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 51165674 51166028 51165821 Y NA NA NA NA NA NA RPS2P48 667203 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 53017345 53017570 53017451 Y TOM1L1 TOM1L1,STXBP4,COX11 NA NA NA NA STXBP4 26518 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 53034991 53035170 53035032 Y NA STXBP4,COX11 NA NA NA NA STXBP4 8918 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 53171922 53172041 53171982 Y NA NA NA NA NA NA COX11 127776 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 53315618 53315983 53315841 Y HLF HLF STXBP4,HLF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HLF 24390 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr17 53394900 53394943 53394922 Y NA NA NA NA NA NA HLF 54527 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 53497202 53497618 53497598 Y NA NA NA NA NA NA MMD 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 54263832 54264049 54263912 Y NA NA NA NA NA NA NOG 405011 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 54995280 54995673 54995559 Y NA TRIM25,COIL NA NA NA NA TRIM25 5881 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 55504815 55504992 55504904 Y MSI2,MSI2 NA NA NA NA NA MSI2 173603 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 55518270 55518753 55518516 Y MSI2,MSI2 NA NA NA NA NA MSI2 187058 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 55523126 55523573 55523446 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 191914 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 55540558 55540950 55540705 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 209346 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr17 55655246 55655454 55655378 Y NA NA NA NA NA NA MRPS23 269963 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 55700521 55700792 55700709 Y NA NA NA NA NA NA MRPS23 224625 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 55706775 55707069 55706919 Y NA NA NA NA NA NA MRPS23 218348 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 55712522 55712748 55712677 Y NA NA NA NA NA NA MRPS23 212669 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 55734748 55734863 55734779 Y DYNLL2 NA NA NA NA NA MRPS23 190554 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 55740175 55740776 55740501 Y MSI2,MSI2,DYNLL2 NA NA NA NA NA MRPS23 184641 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 55749375 55749748 55749439 Y NA NA NA NA NA NA MRPS23 175669 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 55860194 55860305 55860223 Y NA NA MSI2,AKAP1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS23 65112 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 55951789 55952442 55952113 Y SRSF1,MKS1,MKS1,BZRAP1,MRPS23 MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 26372 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 3.41172999712367 chr17 55992933 55993227 55993168 Y NA CUEDC1 VEZF1,CUEDC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUEDC1 37457 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 56023350 56023692 56023525 Y NA CUEDC1,VEZF1 CUEDC1,VEZF1 IMR90 Hi-C 24141950 CUEDC1 6992 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 56025910 56026308 56026041 Y SUPT4H1 CUEDC1,VEZF1 NA NA NA NA CUEDC1 4376 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 56064193 56064677 56064258 Y NA CUEDC1,VEZF1,SRSF1 NA NA NA NA VEZF1 573 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 56161643 56161969 56161895 Y VEZF1,MTMR4 DYNLL2 NA NA NA NA DYNLL2 2867 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 56391648 56391970 56391957 Y NA BZRAP1,SUPT4H1 NA NA NA NA BZRAP1 12182 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 56412418 56413089 56412537 Y SRSF1,MPO,MTMR4,BZRAP1,SUPT4H1 BZRAP1,SUPT4H1 NA NA NA NA BZRAP1 8266 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 56419503 56419633 56419507 Y OR4D2 BZRAP1,SUPT4H1 NA NA NA NA SUPT4H1 8821 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 56428194 56428499 56428372 Y VEZF1,MTMR4,SUPT4H1 BZRAP1 NA NA NA NA SUPT4H1 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 56587640 56587744 56587729 Y PPM1E,DYNLL2,MKS1,SEPT4,MTMR4 MTMR4,SEPT4 NA NA NA NA MTMR4 5522 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr17 56706902 56707296 56707107 Y MKS1,MKS1,RAD51C RNU1-60P,RNU1-85P SEPT4,MTMR4,C17orf47 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 27370 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 56736656 56737064 56736885 Y MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E RNU1-60P,RNU1-85P,RAD51C SEPT4,C17orf47 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 1990 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.86094363479473 chr17 57200500 57200626 57200599 Y GDPD1 AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA TRIM37 18218 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 57203741 57203833 57203787 Y NA AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA TRIM37 21459 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 57231102 57231481 57231293 Y C17orf71 AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA PRR11 242 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 57231530 57231848 57231723 Y NA AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA PRR11 670 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr17 57276702 57276986 57276911 Y NA SKA2,PRR11,SMG8,GDPD1 NA NA NA NA SMG8 7775 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 57298532 57298798 57298672 Y NA SMG8,GDPD1 NA NA NA NA GDPD1 2704 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 57502587 57502904 57502671 Y NA NA YPEL2 IMR90 Hi-C 24141950 YPEL2 95537 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 57515522 57515883 57515602 Y YPEL2 NA YPEL2,GDPD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-13P 96977 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 57698412 57698732 57698592 Y YPEL2,RNFT1,VMP1 CLTC NA NA NA NA CLTC 3193 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 57830594 57831044 57830806 Y VMP1,RNFT1 VMP1,PTRH2 NA NA NA NA PTRH2 47607 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 57847286 57847866 57847541 Y YPEL2,RNFT1 NA NA NA NA NA PTRH2 64299 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 57861698 57862055 57862024 Y RNFT1 NA NA NA NA NA PTRH2 78711 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 57882537 57882682 57882623 Y YPEL2,VMP1,RNFT1 NA NA NA NA NA TUBD1 85622 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 57904186 57904344 57904253 Y VMP1,CA4 NA NA NA NA NA TUBD1 63960 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 57905350 57905555 57905420 Y NA NA NA NA NA NA TUBD1 62749 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 57906379 57907270 57906882 Y RNFT1 NA NA NA NA NA TUBD1 61034 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 57930626 57931026 57930760 Y NA TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA TUBD1 37278 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 57962596 57962816 57962625 Y NA TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA TUBD1 5488 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 57966021 57966396 57966241 Y NA TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA TUBD1 1908 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 57975372 57975465 57975395 Y NA TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA RPS6KB1 6925 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 58212242 58212405 58212344 Y NA NA C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEATR6 57950 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 58468371 58468697 58468395 Y BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,USP32 USP32 NA NA NA NA USP32 29134 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 58678620 58678973 58678714 Y PPM1D PPM1D NA NA NA NA PPM1D 3076 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 58804933 58805128 58805031 Y NA NA NA NA NA NA BCAS3 52119 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 59150035 59150103 59150069 Y BCAS3 NA NA NA NA NA TBX2 325154 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 59213347 59213460 59213422 Y TBX4,TBX2 NA NA NA NA NA TBX2 261797 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 59337920 59337981 59337951 Y NA NA NA NA NA NA TBX2 137276 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 59391895 59392060 59391978 Y NA NA NA NA NA NA TBX2 83197 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 59398606 59399069 59398760 Y TBX2,C17orf82 NA NA NA NA NA TBX2 76188 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 59449966 59450070 59450027 Y NA TBX2 NA NA NA NA TBX2 25187 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 59473431 59474098 59473741 Y TBX2,C17orf82 TBX2 NA NA NA NA TBX2 1159 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 59474585 59474918 59474715 Y NA TBX2 NA NA NA NA TBX2 339 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.34401484735175 chr17 59488217 59488528 59488332 Y NA TBX2 NA NA NA NA TBX2 12960 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr17 59784149 59784411 59784258 Y BRIP1 NA NA NA NA NA NACA2 117586 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 59939507 59939855 59939761 Y BRIP1 BRIP1 NA NA NA NA BRIP1 625 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 59956289 59956463 59956377 Y NA BRIP1,INTS2 BRIP1 IMR90 Hi-C 24141950 BRIP1 17407 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 60085676 60086036 60086030 Y NACA2,MED13 NA NA NA NA NA MED13 54607 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 60141349 60141594 60141514 Y NACA2,MED13 MED13 INTS2 MCF7 ChIA-PET 22265404 MED13 706 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 60555037 60555507 60555099 Y NA RP11-464D20.2 MRC2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-464D20.2 36621 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 60649611 60649792 60649701 Y NA NA MRC2 IMR90 Hi-C 24141950 MRC2 52970 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 60707692 60707749 60707711 Y NA MRC2 NA NA NA NA MRC2 4930 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 60721967 60722242 60722046 Y NA MRC2 NA NA NA NA MRC2 19205 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.06771514977192 chr17 60728042 60728375 60728101 Y NA MRC2 NA NA NA NA MRC2 25280 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 60729712 60730300 60729931 Y NA MRC2 NA NA NA NA MRC2 26950 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 60947655 60947933 60947794 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 244893 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 61042784 61043115 61042811 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 340022 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 61043121 61043648 61043243 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 340359 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.75755787730614 chr17 61127299 61127625 61127462 Y NA NA NA NA NA NA CYB561 394114 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 61279197 61279372 61279284 Y NA NA NA NA NA NA CYB561 242367 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 61299362 61299669 61299468 Y MAP3K3 NA MIR548W,DCAF7,MARCH10 IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 222070 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 61357224 61357494 61357377 Y MAP3K3,LIMD2 NA MIR548W,MARCH10 IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 164245 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 61451328 61451417 61451341 Y NA NA MIR548W,MARCH10 IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 70322 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 61639369 61639739 61639552 Y NA KCNH6,DCAF7,TACO1 NA NA NA NA DCAF7 13547 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 61779039 61779508 61779383 Y NA LIMD2,STRADA NA NA NA NA LIMD2 2507 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 61779769 61779866 61779823 Y NA LIMD2,STRADA NA NA NA NA LIMD2 3237 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 61787185 61787371 61787278 Y NA LIMD2,STRADA NA NA NA NA LIMD2 10653 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 61920991 61921115 61921104 Y NA PSMC5,FTSJ3,SMARCD2 NA NA NA NA SMARCD2 2566 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 62159440 62159790 62159613 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 46389 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 62339620 62339793 62339707 Y CEP95 TEX2 NA NA NA NA TEX2 959 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 62484790 62485162 62485096 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA POLG2 5992 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr17 62491373 62491767 62491605 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA POLG2 219 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 62534383 62534677 62534525 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA DDX5 32066 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 62537971 62538164 62538007 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA DDX5 35654 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 63053851 63054126 63053975 Y GNA13 GNA13 AMZ2P1 IMR90 Hi-C 24141950 GNA13 2894 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 63119249 63119621 63119552 Y GNA13 RGS9 RGS9,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RGS9 11928 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 63552177 63552345 63552261 Y NA AXIN2 NA NA NA NA AXIN2 3420 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 63639930 63640399 63640359 Y NA NA NA NA NA NA AXIN2 84165 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 63759124 63759374 63759249 Y NA NA NA NA NA NA AXIN2 203359 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 63996608 63996849 63996729 Y NA NA NA NA NA NA CEP112 189353 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 64194072 64194322 64194164 Y NA CEP112 NA NA NA NA CEP112 7870 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 64301184 64301397 64301241 Y NA PRKCA NA NA NA NA PRKCA 4430 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 64499082 64499411 64499095 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 202328 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 64544411 64544774 64544437 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 247657 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 64695504 64695853 64695677 Y NA NA NA NA NA NA CACNG5 133382 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 64796276 64796554 64796503 Y NA CACNG5 NA NA NA NA CACNG5 32681 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 64947420 64948018 64947947 Y NA CACNG4 CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CACNG4 11008 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 64959449 64959766 64959607 Y NA CACNG4 NA NA NA NA CACNG4 423 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 64961597 64961937 64961768 Y CACNG4 CACNG4 NA NA NA NA CACNG4 2571 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr17 64962057 64962755 64962345 Y NA CACNG4 NA NA NA NA CACNG4 3031 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 65001910 65002048 65001970 Y CACNG4 CACNG4 NA NA NA NA CACNG4 42884 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 65220181 65220399 65220279 Y NA HELZ,SNORA8 NA NA NA NA HELZ 19706 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 65258633 65258801 65258718 Y NA HELZ,SNORA8 NA NA NA NA SNORA8 6784 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 65339190 65339485 65339338 Y BPTF PSMD12,PITPNC1 NA NA NA NA PSMD12 21258 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 65471645 65472025 65471701 Y NA NA NA NA NA NA PITPNC1 100070 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 65487114 65487504 65487449 Y HELZ,PSMD12,PITPNC1 NA NA NA NA NA PITPNC1 115539 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 65847253 65847408 65847335 Y NA BPTF NA NA NA NA BPTF 27613 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.55078636232894 chr17 66041204 66041633 66041268 Y NA KPNA2 NA NA NA NA KPNA2 11569 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 66348483 66348670 66348577 Y PRKAR1A NA NA NA NA NA ARSG 95160 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 66509186 66509763 66509535 Y SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A PRKAR1A NA NA NA NA PRKAR1A 3265 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 67315191 67315526 67315500 Y NA NA NA NA NA NA MAP2K6 93313 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 68286289 68286704 68286515 Y KCNJ2 NA MAP2K6 IMR90 Hi-C 24141950 KCNJ2 123475 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 69590205 69590225 69590215 Y NA LOC124685 NA NA NA NA LOC124685 24894 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 69824557 69824843 69824637 Y NA NA NA NA NA NA LINC01152 199589 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 70113355 70113523 70113439 Y NA SOX9 NA NA NA NA SOX9 1638 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 70412502 70412837 70412669 Y SOX9 NA NA NA NA NA SOX9-AS1 196525 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 70585924 70586379 70586141 Y NA RPL32P33,LINC00511 NA NA NA NA RPL32P33 34991 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 70779461 70779663 70779556 Y CPSF4L NA NA NA NA NA LINC00511 144850 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 70924179 70924389 70924230 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A11 162462 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 71087635 71087942 71087798 Y SLC39A11 SLC39A11 NA NA NA NA SLC39A11 784 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 71152430 71152655 71152530 Y C17orf80,SSTR2 SSTR2,COG1 NA NA NA NA SSTR2 6496 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 71160364 71160483 71160395 Y SSTR2 SSTR2,COG1 NA NA NA NA SSTR2 1213 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 71200352 71200549 71200451 Y NA SSTR2,COG1,C17orf80,FAM104A NA NA NA NA COG1 13223 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 71227425 71227646 71227536 Y NA COG1,C17orf80,FAM104A NA NA NA NA C17orf80 1053 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 71286924 71287020 71286972 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 19294 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 71305759 71306422 71306099 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP4 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 71320337 71320718 71320484 Y NA CDC42EP4 CDC42EP4 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP4 14023 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 71339324 71339501 71339471 Y SSTR2,CDC42EP4 CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 33010 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr17 71470506 71470810 71470640 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP4 164192 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.44740060484035 chr17 71499846 71500069 71499928 Y NA NA NA NA NA NA SDK2 138159 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 71529957 71530242 71530108 Y SSTR2 NA NA NA NA NA SDK2 107986 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 72532761 72533135 72532770 Y TTYH2,TTYH2,CD300A,TMEM104,CD300LF,CD300E,CD300LB,CD300LD,CD300C NA NA NA NA NA SLC9A3R1 209656 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 72627955 72628575 72628190 Y TTYH2,TTYH2,CD300A,CD300LB,CD300C,CD300LD,TMEM104,SLC16A5,CD300E,CD300LF NA GPRC5C,C17orf77,CD300LD,RAB37,CD300E IMR90 Hi-C 24141950 SLC9A3R1 114216 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 72673744 72674303 72674161 Y KCTD2,GRIN2C,RAB37,RAB37,RAB37 NA NA NA NA NA SLC9A3R1 68488 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 72745955 72746124 72746086 Y NA SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA SLC9A3R1 3164 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 72746451 72746964 72746655 Y NA SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA SLC9A3R1 3660 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 72776079 72776526 72776246 Y CD300A,CD300LB,CD300C,CD300E,CD300LF,RAB37,SLC9A3R1,SLC16A5,GGA3,TMEM104 SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA TMEM104 5457 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 72809186 72809552 72809426 Y KIF19,RAB37,KCTD2,FADS6,GRIN2C NAT9,TMEM104 NA NA NA NA TMEM104 38564 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 72978355 72978661 72978434 Y KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CDR2L 3066 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.75755787730614 chr17 72984795 72985307 72985001 Y RAB37,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 NA NA NA NA CDR2L 3068 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.24062908986315 chr17 73007152 73007476 73007237 Y RAB37,GRIN2C,C17orf28,CDR2L,SUMO2,NUP85,KCTD2,ARMC7 CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H NA NA NA NA ICT1 387 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr17 73007918 73008254 73008160 Y RAB37,GRIN2C,FADS6,C17orf28,CDR2L,SUMO2,KCTD2,ARMC7 CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H NA NA NA NA ICT1 1153 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 73009835 73009966 73009891 Y NA CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H NA NA NA NA ICT1 3070 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr17 73073656 73074040 73073685 Y RAB37,RAB37,ARMC7 KCTD2,ATP5H,ARMC7 NA NA NA NA ARMC7 30007 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 73304838 73305233 73305159 Y UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19 MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19 NA NA NA NA SLC25A19 21247 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 73689850 73690283 73690148 Y KIAA0195,CASKIN2,WBP2 SAP30BP,RECQL5 NA NA NA NA RECQL5 28581 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 73850621 73850811 73850693 Y GRB2,GRB2,SAP30BP,H3F3B,FAM100B,EVPL,ACOX1,UNC13D,WBP2,TRIM47 WBP2,TRIM47,TRIM65 NA NA NA NA WBP2 33 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 73891396 73891618 73891569 Y NA WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1 NA NA NA NA TRIM65 312 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr17 73992927 73993207 73992957 Y NA TEN1,ACOX1,CDK3 NA NA NA NA CDK3 1780 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 74067493 74067877 74067630 Y RNF157,FAM100B SRP68,EXOC7 NA NA NA NA SRP68 759 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 74188633 74188942 74188716 Y NA ATF4P3,RNF157 NA NA NA NA ATF4P3 31945 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 74189615 74189996 74189806 Y RNF157 ATF4P3,RNF157 NA NA NA NA ATF4P3 30891 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 74213607 74213973 74213891 Y NA ATF4P3,RNF157 NA NA NA NA ATF4P3 6914 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 74233896 74234348 74234226 Y NA ATF4P3,RNF157 NA NA NA NA RNF157 106 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 74341579 74341976 74341749 Y NA SPHK1,PRPSAP1 NA NA NA NA SPHK1 28689 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 74413626 74413718 74413672 Y NA SPHK1,PRPSAP1,UBE2O,AANAT NA NA NA NA UBE2O 33570 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 74415585 74415933 74415760 Y MFSD11,RNF157 SPHK1,PRPSAP1,UBE2O,AANAT NA NA NA NA UBE2O 31355 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 74440987 74441354 74441087 Y NA UBE2O,AANAT NA NA NA NA UBE2O 5934 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 74496062 74496568 74496378 Y FAM100B,SPHK1,SPHK1,ST6GALNAC2,JMJD6,RHBDF2,RHBDF2 UBE2O,AANAT,RHBDF2,PRCD,CYGB NA NA NA NA RHBDF2 190 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 74525744 74526079 74526045 Y ST6GALNAC2,MGAT5B,CYGB RHBDF2,PRCD,CYGB NA NA NA NA PRCD 4076 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 74583031 74583415 74583256 Y NA CYGB,ST6GALNAC2 NA NA NA NA ST6GALNAC2 1993 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 74692944 74693312 74693210 Y NA MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA MXRA7 11786 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 74696685 74696955 74696820 Y NA MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA MXRA7 8143 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 74705254 74705618 74705431 Y MXRA7 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA MXRA7 156 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.58464393721491 chr17 74713062 74713219 74713141 Y NA MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA JMJD6 7647 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 74723995 74724371 74724344 Y FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA METTL23 3083 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.27448666474912 chr17 74836829 74837207 74837140 Y UBE2O,MGAT5B MGAT5B MFSD11,MGAT5B,SEC14L1,SRSF2,SEPT9 IMR90 Hi-C 24141950 MGAT5B 25331 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 75116381 75116522 75116452 Y NA LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 35583 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 75199050 75199385 75199187 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 75266 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 75370768 75371003 75370901 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 96117 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr17 75384636 75384998 75384811 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 109985 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 75388510 75388802 75388677 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 113859 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 75402047 75402301 75402134 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 127396 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 75405377 75405733 75405639 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 130726 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 75421302 75421687 75421325 Y SEPT9,SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA SEPT9 146651 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 75422359 75422648 75422577 Y SEPT9,SEPT9,SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA SEPT9 147708 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 75429541 75429800 75429625 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 154890 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 75430734 75431332 75430992 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 156083 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 75431413 75431687 75431621 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 156762 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 75461802 75462176 75461947 Y SEC14L1,SEC14L1 NA NA NA NA NA SEPT9 187151 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 75504499 75504824 75504660 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 229848 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 75667082 75667363 75667223 Y NA NA TNRC6C,FLJ45079,LOC100507351 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-80P 246817 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 75769300 75769393 75769353 Y NA NA TNRC6C,LOC100507351 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-80P 144787 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 75798844 75799281 75799210 Y TNRC6C,TMEM235 NA LOC100507351,TNRC6C IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-80P 114899 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 75953939 75954304 75954190 Y TMEM235,TMC8,TMC6,TMC6,SOCS3,PGS1,TNRC6C RNU1-80P,TNRC6C TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-80P 39759 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA RNU1-80P,TNRC6C TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-80P 40213 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 55.2079944989104 chr17 75955923 75956319 75956134 Y TMC8,TMC6,TMC6,TNRC6C RNU1-80P,TNRC6C TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-80P 41743 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr17 76023092 76023250 76023241 Y NA TNRC6C NA NA NA NA TNRC6C 24843 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 76165603 76166001 76165654 Y SYNGR2 TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5 NA NA NA NA SYNGR2 2964 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 76247000 76247249 76247129 Y TMEM235 BIRC5 NA NA NA NA BIRC5 38733 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 76247657 76247919 76247750 Y TNRC6C,TMC6,TMC8,TMC6 BIRC5 NA NA NA NA BIRC5 39390 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 76348964 76349371 76349046 Y USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 4787 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 76588219 76588768 76588537 Y NA NA DNAH17,CYTH1,USP36 IMR90 Hi-C 24141950 CYTH1 187611 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 76635137 76635288 76635196 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 NA CYTH1,DNAH17 IMR90 Hi-C 24141950 CYTH1 141091 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 76718520 76718722 76718578 Y TMEM235 NA NA NA NA NA CYTH1 57657 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 76801462 76801678 76801575 Y DNAH17,USP36,CYTH1 CYTH1,USP36 NA NA NA NA CYTH1 25083 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 76871917 76872130 76872058 Y PGS1,CYTH1,CANT1 USP36,TIMP2 NA NA NA NA USP36 36394 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 76879007 76879631 76879400 Y CYTH1,ENGASE,CANT1,USP36 USP36,TIMP2 NA NA NA NA TIMP2 39838 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 76879876 76880180 76879977 Y NA USP36,TIMP2 NA NA NA NA TIMP2 39289 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr17 76919844 76920193 76919970 Y CYTH1,CANT1 TIMP2 NA NA NA NA TIMP2 375 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 76930060 76930674 76930419 Y NA TIMP2,LGALS3BP TIMP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TIMP2 10591 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.96432939228333 chr17 77330475 77330799 77330637 Y NA NA NA NA NA NA ENGASE 261454 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 77702456 77702572 77702532 Y NA CBX2 NA NA NA NA CBX2 47359 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 77778056 77778248 77778123 Y CBX2,CBX8 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 4574 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 77778301 77778701 77778443 Y CBX2,CBX8,CBX4 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 4819 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr17 77783959 77784243 77784073 Y CBX2,CBX8 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 10477 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 3.82527302707806 chr17 77784894 77785612 77785337 Y NA CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 11412 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr17 77787297 77787609 77787349 Y NA CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 13815 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr17 77815304 77815490 77815418 Y NA CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX4 4076 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 77817686 77818105 77817998 Y NA CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX4 6458 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 77967532 77967765 77967641 Y CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 39882 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr17 78008584 78008924 78008651 Y TBC1D16,GAA TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA CCDC40 149 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 78023284 78023378 78023331 Y NA TBC1D16,CCDC40,GAA NA NA NA NA CCDC40 14849 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 78134342 78134588 78134495 Y NA EIF4A3 EIF4A3,CARD14,SGSH,SLC26A11 IMR90 Hi-C 24141950 EIF4A3 15360 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 78134790 78135293 78135090 Y NA EIF4A3 EIF4A3,CARD14,SGSH,SLC26A11 IMR90 Hi-C 24141950 EIF4A3 15808 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 78198081 78198434 78198366 Y NA SLC26A11,SGSH,RNF213 NA NA NA NA SGSH 5359 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 78289864 78290143 78290056 Y NPTX1 NA LOC100294362,ENDOV IMR90 Hi-C 24141950 RNF213 57199 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV,NPTX1 NA NA NA NA NPTX1 20369 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 3.51511575461227 chr17 78459744 78459968 78459843 Y RPTOR NPTX1 NA NA NA NA NPTX1 10101 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 78471918 78472124 78472096 Y NA NPTX1,RPL32P31,RPTOR RPTOR,ENDOV,LOC100294362,CHMP6 IMR90 Hi-C 24141950 NPTX1 22275 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 78524165 78524352 78524226 Y NA RPL32P31,RPTOR NA NA NA NA RPTOR 7546 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 78626044 78626134 78626054 Y NA NA NA NA NA NA RPTOR 109425 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 78724836 78725014 78724914 Y NA NA NA NA NA NA RPTOR 208217 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 78734428 78734929 78734574 Y C17orf56 NA NA NA NA NA RPTOR 217809 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 78747875 78748340 78748187 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 215058 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 78754047 78754707 78754061 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 208691 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr17 78756741 78756888 78756815 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 206510 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 78763390 78763671 78763525 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 199727 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 78806684 78807307 78807121 Y C17orf56 NA NA NA NA NA CHMP6 156091 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr17 78830209 78830686 78830492 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 132712 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 78900870 78900990 78900942 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 62408 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 78962835 78962976 78962910 Y NA CHMP6,BAIAP2 NA NA NA NA CHMP6 422 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 79056542 79056873 79056681 Y NA BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 49594 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 79068878 79069252 79068906 Y C17orf56 NA NA NA NA NA BAIAP2 61930 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 79128807 79129119 79128972 Y C17orf56 NA NA NA NA NA AZI1 65680 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 79319812 79320225 79320116 Y FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 52465 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr17 79399158 79399431 79399295 Y NA NA NA NA NA NA RP13-766D20.1 78658 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 79399639 79399699 79399664 Y GCGR,BAHCC1 NA NA NA NA NA RP13-766D20.1 78390 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 79439092 79439387 79439261 Y PCYT2,FAM195B,C17orf90,C17orf70,ACTG1 RP13-766D20.1,ACTG1 NA NA NA NA RP13-766D20.1 38702 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 79451287 79451558 79451462 Y AATK,AZI1,BAHCC1 RP13-766D20.1,ACTG1 NA NA NA NA RP13-766D20.1 26531 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 79779684 79779899 79779792 Y NA FAM195B,P4HB,ARHGDIA NA NA NA NA FAM195B 9279 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 79886802 79887109 79886903 Y NA ANAPC11,ALYREF,NPB,PCYT2,SIRT7,MAFG,MAFG-AS1,PYCR1,ASPSCR1 NA NA NA NA MAFG-AS1 3097 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 79925685 79926075 79926048 Y TSPAN10 SIRT7,MAFG,MAFG-AS1,PYCR1,ASPSCR1 ASPSCR1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ASPSCR1 6608 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 79942701 79942868 79942785 Y SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62 PYCR1,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3 NA NA NA NA ASPSCR1 10018 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 79949658 79950000 79949804 Y SLC25A10,STRA13,LRRC45,FASN,DCXR,PCYT2,NOTUM,ASPSCR1 ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR NA NA NA NA ASPSCR1 16975 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 79979263 79979824 79979465 Y NA ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR,GPS1,RFNG,DUS1L NA NA NA NA LRRC45 85 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 80052713 80052821 80052782 Y MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN GPS1,RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 1387 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr17 80056613 80056910 80056718 Y C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 2405 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 4.03204454205525 chr17 80060759 80061000 80060880 Y NA DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 6551 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 80068190 80068440 80068326 Y NA DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 13982 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 80079695 80079832 80079748 Y NA FASN NA NA NA NA FASN 25487 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 80158664 80158910 80158860 Y DUS1L,NARF,HEXDC,CD7,CCDC57 CCDC57,SLC16A3 FASN K562 ChIA-PET 22265404 CCDC57 9796 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 80215337 80215590 80215470 Y SIRT7,WDR45L,NARF,CSNK1D,CD7,C17orf62,C17orf62,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3 CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 14017 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 80216124 80216440 80216314 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 13167 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 80255299 80255755 80255478 Y SIRT7,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7 CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 25692 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr17 80255798 80256475 80256187 Y SIRT7,MAFG,MAFG,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,HEXDC,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7 CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 26191 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr17 80454894 80455238 80455175 Y LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 20351 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.44740060484035 chr17 80494129 80494268 80494139 Y NA FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 18540 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 80712796 80713169 80712899 Y ZNF750,TBCD FN3KRP,FN3K,TBCD NA NA NA NA TBCD 4856 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 80747083 80747366 80747210 Y ZNF750 TBCD NA NA NA NA TBCD 39143 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 80889616 80889925 80889758 Y NA NA NA NA NA NA B3GNTL1 117761 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr17 81066773 81067186 81066924 Y NA METRNL NA NA NA NA METRNL 31206 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 221277 221425 221379 Y THOC1,ENOSF1,ENOSF1 THOC1 NA NA NA NA THOC1 44625 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 222573 222827 222703 Y NA THOC1 NA NA NA NA THOC1 43223 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 228420 228816 228694 Y THOC1 THOC1 NA NA NA NA THOC1 37234 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 235900 236290 236249 Y NA THOC1 NA NA NA NA THOC1 29760 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr18 494806 494991 494899 Y NA COLEC12 NA NA NA NA COLEC12 3731 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 666183 666708 666437 Y THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56 NA NA NA NA C18orf56 9843 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr18 2549022 2549121 2549072 Y NA METTL4,NDC80 NA NA NA NA METTL4 20387 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 2966730 2966994 2966962 Y NA LPIN2 NA NA NA NA LPIN2 44319 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 3250721 3251122 3250738 Y NA MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12A 5242 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 3623872 3624258 3624140 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA MYL12B 363965 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 3923131 3923150 3923141 Y NA NA NA NA NA NA MYL12B 663224 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 5318474 5318779 5318487 Y ZFP161 NA NA NA NA NA L3MBTL4 1094457 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 5583376 5583748 5583658 Y EPB41L3 NA NA NA NA NA L3MBTL4 829488 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 5895274 5895803 5895585 Y TMEM200C NA L3MBTL4 IMR90 Hi-C 24141950 L3MBTL4 517433 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 7512213 7512497 7512355 Y NA NA PTPRM IMR90 Hi-C 24141950 PTPRM 52283 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 8661812 8662039 8661951 Y NA NA ANKRD12,CCDC165,TWSG1,NDUFV2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB12 54369 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 8750933 8751304 8751068 Y NA NA NA NA NA NA RAB12 143490 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 8801229 8801479 8801315 Y CCDC165 NA NA NA NA NA RAB12 193786 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 9128926 9129321 9129124 Y NDUFV2,ANKRD12,ANKRD12 NDUFV2,ANKRD12 ANKRD12 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD12 4905 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr18 9138526 9138911 9138547 Y ANKRD12,ANKRD12 NDUFV2,ANKRD12 NA NA NA NA ANKRD12 4300 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 9613164 9613539 9613352 Y NA NA NA NA NA NA PPP4R1 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 9914998 9915501 9915128 Y PPP4R1,RAB31,VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 2999 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 10401653 10401807 10401722 Y NAPG,VAPA NA APCDD1 IMR90 Hi-C 24141950 NAPG 122095 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 10528233 10528593 10528264 Y NA NAPG NA NA NA NA NAPG 4331 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 10543130 10543398 10543236 Y NAPG NAPG NA NA NA NA NAPG 19228 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 10708268 10708433 10708298 Y NA NA NA NA NA NA NAPG 184366 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 11995516 11995787 11995574 Y NA IMPA2 NA NA NA NA IMPA2 16492 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 12059774 12060081 12059918 Y NA NA GNAL,IMPA2 IMR90 Hi-C 24141950 IMPA2 80750 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 3.51511575461227 chr18 12076743 12076871 12076848 Y NA NA GNAL IMR90 Hi-C 24141950 IMPA2 97719 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.55078636232894 chr18 12330841 12331244 12331045 Y NA TUBB6,AFG3L2 NA NA NA NA TUBB6 25173 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 12336380 12336603 12336512 Y NA TUBB6,AFG3L2 NA NA NA NA TUBB6 30712 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 12347442 12347507 12347473 Y CEP76,AFG3L2 TUBB6,AFG3L2 NA NA NA NA AFG3L2 27806 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 12408700 12408821 12408736 Y NA AFG3L2,SLMO1 SPIRE1 IMR90 Hi-C 24141950 SLMO1 2805 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 12641281 12641332 12641311 Y SPIRE1,SPIRE1,PSMG2 AP005482.1,SPIRE1,PSMG2 NA NA NA NA AP005482.1 14710 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 12839100 12839985 12839163 Y NA NA NA NA NA NA PTPN2 87657 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 12864190 12864369 12864245 Y NA NA NA NA NA NA PTPN2 63273 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr18 12880036 12880906 12880743 Y NA PTPN2 NA NA NA NA PTPN2 46736 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 13217020 13217525 13217240 Y NA NA NA NA NA NA CEP192 227659 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr18 13369777 13369964 13369871 Y MC5R NA NA NA NA NA RNMT 354695 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 13501125 13501479 13501273 Y NA NA NA NA NA NA RNMT 223180 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 13824016 13824345 13824089 Y MC5R NA NA NA NA NA FAM210A 99354 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 18596588 18597119 18596879 Y NA NA NA NA NA NA ROCK1 92693 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 19373794 19374099 19373861 Y NA NA NA NA NA NA MIB1 90876 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 19453532 19453543 19453538 Y NA NA NA NA NA NA MIB1 170614 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 20035500 20035848 20035676 Y NA NA GATA6,CTAGE1 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 340376 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 20104385 20104397 20104392 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 271827 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 21336252 21336608 21336275 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD29 95403 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 21463540 21463749 21463607 Y NA NA NA NA NA NA TTC39C 106988 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 21945811 21945986 21945899 Y NA OSBPL1A NA NA NA NA OSBPL1A 29858 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 23609881 23610142 23609962 Y NA NA NA NA NA NA SS18 59039 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 23657156 23657540 23657507 Y NA SS18 NA NA NA NA SS18 11641 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 23836366 23836416 23836389 Y TAF4B TAF4B NA NA NA NA TAF4B 32466 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr18 24107807 24108046 24107927 Y NA NA NA NA NA NA KCTD1 127319 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 24235836 24236242 24235958 Y NA KCTD1 TAF4B,KCTD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KCTD1 471 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 24237719 24238162 24238112 Y NA KCTD1 TAF4B,KCTD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KCTD1 2354 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 25536974 25537193 25537082 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 218217 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 25645418 25645770 25645581 Y CDH2 NA NA NA NA NA CDH2 109640 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 25695112 25695346 25695270 Y CDH2 NA NA NA NA NA CDH2 60064 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 25754926 25755429 25755157 Y CDH2 NA NA NA NA NA CDH2 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 26347956 26348190 26348041 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 592546 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 26915236 26915445 26915422 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 1159826 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 27516319 27516434 27516379 Y NA NA NA NA NA NA B4GALT6 1747365 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 29232383 29232901 29232639 Y NA B4GALT6 NA NA NA NA B4GALT6 30898 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr18 31460453 31460828 31460641 Y NOL4,NOL4,NOL4 NA NA NA NA NA ASXL3 303874 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 32413678 32413828 32413755 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE2 141064 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 32436094 32436130 32436112 Y DTNA NA NA NA NA NA MAPRE2 118762 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 32527945 32528002 32527974 Y DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,ZNF397,MAPRE2 MAPRE2 NA NA NA NA MAPRE2 26890 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 32622568 32623026 32622758 Y ZNF24,MAPRE2 NA NA NA NA NA MAPRE2 67676 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 32674767 32675124 32674837 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE2 119875 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr18 32684186 32684352 32684206 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE2 129294 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr18 32829674 32829781 32829775 Y ZNF397,ZSCAN30 ZNF397,ZSCAN30,ZNF271 NA NA NA NA ZNF397 10680 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 32906658 32906918 32906743 Y NA ZSCAN30,ZNF271,ZNF24,ZNF396 NA NA NA NA ZNF24 16528 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 33073738 33073904 33073824 Y NA INO80C NA NA NA NA INO80C 2051 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 33311016 33311295 33311162 Y NA NA NA NA NA NA GALNT1 151935 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 33577061 33577192 33577127 Y NA C18orf21 NA NA NA NA C18orf21 27015 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 33737531 33737917 33737788 Y NA SLC39A6,ELP2,MOCOS NA NA NA NA MOCOS 27565 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 33876540 33877026 33876703 Y NA FHOD3 NA NA NA NA FHOD3 863 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.24062908986315 chr18 33878609 33878753 33878681 Y FHOD3 FHOD3 NA NA NA NA FHOD3 2932 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 34107164 34107375 34107280 Y RPRD1A,FHOD3 NA NA NA NA NA FHOD3 231487 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 34160410 34160525 34160482 Y FHOD3 NA NA NA NA NA KIAA1328 246544 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 34406593 34406898 34406790 Y NA KIAA1328,TPGS2 NA NA NA NA KIAA1328 171 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 34547272 34547713 34547483 Y NA NA NA NA NA NA TPGS2 140114 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 34813677 34814006 34813844 Y NA NA NA NA NA NA CELF4 329994 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 34915511 34915689 34915620 Y NA NA NA NA NA NA CELF4 228311 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 34993424 34993521 34993473 Y NA NA NA NA NA NA CELF4 150479 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 35009721 35010039 35009931 Y CELF4 NA NA NA NA NA CELF4 133961 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 35063649 35063942 35063793 Y NA NA NA NA NA NA CELF4 80058 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 35096057 35096363 35096210 Y NA CELF4 NA NA NA NA CELF4 47637 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 35138994 35139043 35139019 Y CELF4 CELF4 NA NA NA NA CELF4 4957 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 36903724 36904130 36903931 Y NA RPL7AP66 NA NA NA NA RPL7AP66 9509 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 37101421 37101610 37101545 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 187782 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr18 37151664 37151869 37151793 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 238025 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr18 38400153 38400634 38400214 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C3 1132537 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 38446239 38446490 38446414 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C3 1086681 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 39520548 39520801 39520707 Y NA PIK3C3 PIK3C3 IMR90 Hi-C 24141950 PIK3C3 12370 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 39773021 39773454 39773163 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C3 239850 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 40081740 40082126 40081758 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C3 548569 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 42261426 42261651 42261539 Y NA SETBP1 NA NA NA NA SETBP1 3288 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 42301858 42302085 42301972 Y NA SETBP1 NA NA NA NA SETBP1 43720 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 43593456 43593723 43593664 Y PSTPIP2,EPG5 EPG5 NA NA NA NA EPG5 48216 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 43608916 43609273 43609243 Y PSTPIP2,EPG5 PSTPIP2 NA NA NA NA PSTPIP2 40965 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 43992467 43992610 43992545 Y RNF165 NA NA NA NA NA RNF165 87695 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 44370223 44370563 44370393 Y RNF165,PIAS2 NA NA NA NA NA KATNAL2 124892 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 44392877 44393138 44393020 Y NA NA NA NA NA NA KATNAL2 102317 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 44675442 44676177 44675810 Y NA HDHD2,IER3IP1 NA NA NA NA HDHD2 551 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 45417757 45417861 45417809 Y NA SMAD2 NA NA NA NA SMAD2 37654 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 45534549 45534809 45534718 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 79034 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 45688048 45688324 45688110 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232533 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr18 46066779 46067121 46067052 Y CTIF CTIF NA NA NA NA CTIF 3362 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 46311579 46311776 46311715 Y SMAD7 NA NA NA NA NA CTIF 248162 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 46317070 46317289 46317180 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 253653 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 46324397 46324797 46324645 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 260980 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 46349762 46350033 46349891 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 286345 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 46382446 46382625 46382534 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 319029 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 46449093 46449527 46449211 Y SMAD7 NA NA NA NA NA CTIF 385676 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 46459367 46459671 46459607 Y SMAD7,SMAD7 NA NA NA NA NA CTIF 395950 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 46465508 46465942 46465798 Y SMAD7,SMAD7,SMAD7 NA NA NA NA NA CTIF 402091 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 46478230 46479206 46479122 Y SMAD7,SMAD7 NA NA NA NA NA CTIF 414813 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr18 46502180 46502412 46502333 Y SMAD7 NA SMAD7,CTIF MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CTIF 438763 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr18 46733107 46733359 46733209 Y DYM NA NA NA NA NA DYM 252358 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 46754603 46754925 46754865 Y DYM NA NA NA NA NA DYM 230792 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 47357197 47357543 47357370 Y NA ACAA2 NA NA NA NA ACAA2 18867 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 48462357 48462700 48462360 Y ME2 ELAC1,SMAD4 NA NA NA NA ELAC1 29661 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr18 48616016 48616044 48616031 Y NA NA NA NA NA NA SMAD4 123606 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 48720847 48721238 48721193 Y NA MEX3C NA NA NA NA MEX3C 21436 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 48721492 48722312 48721913 Y SMAD4,MEX3C MEX3C NA NA NA NA MEX3C 20362 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr18 51013905 51013920 51013913 Y NA NA NA NA NA NA MBD2 735238 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 51741820 51741880 51741850 Y STARD6 MBD2 NA NA NA NA MBD2 7278 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 51883843 51884006 51883925 Y NA NA NA NA NA NA POLI 90069 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr18 53041931 53042230 53042160 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 287788 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.55078636232894 chr18 53072982 53073437 53073370 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 256581 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr18 53087236 53087444 53087369 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 242574 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 53107364 53107398 53107375 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 222620 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 53180110 53180413 53180343 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 149605 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr18 55104670 55104954 55104730 Y NA ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 3753 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 55105190 55105288 55105239 Y ST8SIA3,ONECUT2 ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 4273 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 55108837 55109086 55108936 Y ONECUT2 ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 7920 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 55109141 55109496 55109318 Y ONECUT2 ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 8224 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 55250571 55250884 55250819 Y FECH FECH,NARS NA NA NA NA FECH 1120 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 55255652 55255824 55255739 Y FECH FECH,NARS NA NA NA NA FECH 3648 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 55267032 55267261 55267214 Y NEDD4L FECH,NARS NA NA NA NA FECH 15028 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 56339458 56339877 56339543 Y MALT1 ALPK2,MALT1 NA NA NA NA MALT1 2840 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 56494810 56495111 56494923 Y ALPK2 ZNF532 NA NA NA NA ZNF532 32721 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 56537923 56538093 56537956 Y ZNF532 ZNF532 NA NA NA NA ZNF532 10091 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 56579254 56579314 56579284 Y NA NA NA NA NA NA ZNF532 51422 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 56631378 56631745 56631564 Y NA NA NA NA NA NA ZNF532 103546 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 56633214 56633485 56633410 Y ZNF532 NA NA NA NA NA ZNF532 105382 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 56663357 56663639 56663444 Y NA NA NA NA NA NA ZNF532 135525 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 57482239 57482409 57482315 Y NA NA CCBE1 IMR90 Hi-C 24141950 RPS26P54 55449 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 59057308 59057461 59057385 Y CDH20 RPL30P14 NA NA NA NA RPL30P14 12977 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 59371386 59371621 59371504 Y NA NA RNF152 IMR90 Hi-C 24141950 RNF152 187859 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 59403476 59403640 59403574 Y NA NA RNF152 IMR90 Hi-C 24141950 RNF152 155840 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 59968434 59968761 59968590 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1468 115943 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 60193382 60194139 60194065 Y KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 5142 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr18 60774219 60774617 60774418 Y SERPINB12 NA NA NA NA NA BCL2 210744 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 60821911 60821964 60821938 Y NA NA NA NA NA NA BCL2 163397 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 60822300 60822488 60822325 Y VPS4B,BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 162873 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 60827006 60827299 60827155 Y BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 158062 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 60828947 60829338 60829223 Y VPS4B,BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 156023 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 60854025 60854354 60854177 Y NA NA NA NA NA NA BCL2 131007 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 60874386 60874946 60874584 Y VPS4B,BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 110415 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 60875086 60875640 60875342 Y BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 109721 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 60886280 60886709 60886627 Y BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 98652 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr18 60901936 60902433 60902315 Y VPS4B NA NA NA NA NA BCL2 82928 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 60929877 60930247 60930066 Y SERPINB12 NA NA NA NA NA BCL2 55114 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 60941193 60941490 60941349 Y BCL2 BCL2 NA NA NA NA BCL2 43871 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 60944557 60944827 60944760 Y NA BCL2 NA NA NA NA BCL2 40534 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 60966877 60967061 60966974 Y NA BCL2 NA NA NA NA BCL2 18300 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 60973604 60973976 60973940 Y NA BCL2 NA NA NA NA BCL2 11385 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 60984165 60984609 60984519 Y BCL2 BCL2,KDSR NA NA NA NA BCL2 752 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 61033511 61033750 61033687 Y NA BCL2,KDSR NA NA NA NA KDSR 768 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 61046049 61046189 61046119 Y NA KDSR,VPS4B NA NA NA NA KDSR 13306 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 61085026 61085396 61085214 Y VPS4B VPS4B NA NA NA NA VPS4B 2320 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr18 61220427 61220683 61220555 Y NA NA NA NA NA NA VPS4B 132711 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 61537611 61537785 61537630 Y NA NA SERPINB5 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINB8 97374 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 67442113 67442512 67442133 Y NA NA NA NA NA NA DOK6 375822 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 67602629 67602968 67602766 Y RTTN,CD226 NA NA NA NA NA RTTN 268213 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 67682034 67682164 67682099 Y NA NA NA NA NA NA RTTN 189017 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 67957012 67957306 67957264 Y NA SOCS6 NA NA NA NA SOCS6 2875 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 68004496 68004658 68004562 Y NA NA NA NA NA NA SOCS6 50359 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 68196083 68196104 68196093 Y NA NA NA NA NA NA SOCS6 241946 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 68326255 68326550 68326425 Y RTTN NA NA NA NA NA SOCS6 372118 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 70814652 70814839 70814746 Y NA NA NA NA NA NA CBLN2 510896 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 72676291 72676559 72676424 Y ZNF407,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 242744 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 72694471 72694659 72694499 Y ZNF407 NA NA NA NA NA ZADH2 224644 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 72706946 72707254 72707048 Y ZNF407,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 212049 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 72916177 72916455 72916218 Y NA ZADH2,TSHZ1 NA NA NA NA ZADH2 2848 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 72919537 72919929 72919697 Y ZADH2 ZADH2,TSHZ1 NA NA NA NA ZADH2 234 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 72919988 72920296 72920123 Y ZADH2,TSHZ1 ZADH2,TSHZ1 NA NA NA NA TSHZ1 414 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 74199867 74199923 74199879 Y NA ZNF516,RP11-17M16.1 NA NA NA NA ZNF516 5223 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr18 74204839 74205357 74205296 Y NA RP11-17M16.1 NA NA NA NA ZNF516 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 74205649 74206020 74205889 Y NA ZNF516,RP11-17M16.1 NA NA NA NA RP11-17M16.1 172 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr18 74237245 74237630 74237448 Y NA ZNF516,RP11-17M16.1 NA NA NA NA RP11-17M16.1 31768 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 74768655 74769369 74768895 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 236092 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 74808374 74808713 74808562 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 275811 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 74963593 74963883 74963770 Y GALR1 NA NA NA NA NA ZNF236 431030 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr18 75149077 75149342 75149210 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 616514 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 75318958 75319303 75319131 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 786395 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 76734377 76734736 76734420 Y NA NA NA NA NA NA ATP9B 92549 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 76884362 76884757 76884560 Y NA NA NA NA NA NA ATP9B 57077 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr18 77006633 77006788 77006711 Y ATP9B NA NA NA NA NA NFATC1 147068 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 77165685 77166189 77165921 Y ATP9B,CTDP1,CTDP1,NFATC1,NFATC1 NFATC1 NA NA NA NA NFATC1 11829 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 77394218 77394591 77394404 Y NA CTDP1 ATP9B,NFATC1 IMR90 Hi-C 24141950 CTDP1 43210 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 77682652 77682872 77682762 Y NA PQLC1,HSBP1L1 NA NA NA NA PQLC1 26792 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr18 78004258 78004625 78004566 Y PARD6G PARD6G NA NA NA NA PARD6G 829 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 445179 445348 445264 Y NA C2CD4C,SHC2,MADCAM1 NA NA NA NA SHC2 13648 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 778993 779222 779048 Y GPX4,BSG,CNN2 PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 15853 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 789308 789721 789469 Y NA PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 5354 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 800594 800755 800691 Y NA PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA MIR4745 2185 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 925071 925217 925123 Y NA MED16,R3HDM4,ARID3A NA NA NA NA ARID3A 1290 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 934999 935434 935086 Y MIDN,CIRBP MED16,R3HDM4,ARID3A,WDR18 NA NA NA NA ARID3A 11218 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 996390 996745 996544 Y HMHA1,CIRBP,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7 WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7 NA NA NA NA WDR18 15216 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 1085284 1085426 1085350 Y C19orf22,ARID3A,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2 ABCA7,POLR2E,GPX4 NA NA NA NA POLR2E 8172 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 1161691 1161983 1161922 Y NA SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 10299 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 1169743 1170349 1170015 Y NA SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 1933 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.99818696716929 chr19 1214932 1215433 1215243 Y NA SBNO2,STK11,C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP NA NA NA NA C19orf26 20593 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 1240232 1240534 1240365 Y MUM1,APC2,C19orf26 C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA ATP5D 483 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr19 1252961 1253429 1253036 Y C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA CIRBP 3955 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 1260732 1261171 1260912 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA CIRBP 3348 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr19 1266359 1266798 1266589 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA C19orf24 6228 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 1725719 1725877 1725796 Y C19orf26,MUM1,APC2 NA TCF3,C19orf25,ONECUT3,PLK5,UQCR11,ATP8B3,LOC100288123,REXO1 IMR90 Hi-C 24141950 TCF3 75115 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 1855247 1855761 1855485 Y SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3 ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3 NA NA NA NA KLF16 5806 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 2032329 2032652 2032524 Y LINGO3,C19orf35 BTBD2,MKNK2 NA NA NA NA BTBD2 228 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 2049976 2050209 2050080 Y OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2 BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 733 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 2059605 2060167 2060113 Y REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2 BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 10362 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 2061356 2061737 2061654 Y SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 12113 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr19 2095281 2095723 2095416 Y NA MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MOB3A 609 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 2165096 2165788 2165320 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 2632 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr19 2167436 2167667 2167594 Y CSNK1G2,GADD45B,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 4972 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 2332363 2332647 2332580 Y REXO1,CSNK1G2,MKNK2,GNG7,SPPL2B SPPL2B,LSM7 NA NA NA NA LSM7 5744 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 2494705 2495117 2494880 Y DOT1L,GADD45B LMNB2,GADD45B NA NA NA NA GADD45B 20585 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 2543618 2543970 2543682 Y DOT1L,GADD45B NA NA NA NA NA GADD45B 69498 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 2679436 2679769 2679633 Y NA DIRAS1 NA NA NA NA DIRAS1 39647 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 2719845 2720284 2720049 Y JSRP1,TLE6,AES,GNG7,DIRAS1 DIRAS1,SLC39A3 NA NA NA NA DIRAS1 429 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 2950130 2950295 2950189 Y NA ZNF77,TLE6 THOP1,ZNF555,ZNF554,ZNF57,ZNF77,TLE6,AES,TLE2,GNA11,S1PR4,NCLN,GNA15,CELF5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF77 7161 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 3035530 3035851 3035686 Y NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2 TLE2,AES NA NA NA NA TLE2 9782 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr19 3133345 3133760 3133513 Y FZR1,GNA15 GNA11,NCLN NA NA NA NA GNA11 40937 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 3231384 3231772 3231576 Y ZNF555,ZNF77,TLE2,C19orf29,CELF5,CELF5 NCLN,CELF5 NA NA NA NA CELF5 8683 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 3271003 3271310 3271072 Y ZNF555,C19orf71,CELF5,CELF5 CELF5 NA NA NA NA CELF5 48302 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 3314117 3314647 3314306 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 42914 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 3358221 3358724 3358471 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 660 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 3360183 3360356 3360294 Y TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 2622 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 3360896 3361804 3361247 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 3335 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr19 3367171 3367852 3367502 Y NFIC,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 9610 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 3387730 3388119 3388011 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 30169 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 3671007 3671294 3671202 Y NFIC,MAP2K2,EEF2,PIP5K1C,APBA3 PIP5K1C NA NA NA NA PIP5K1C 27183 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 3683675 3684043 3683874 Y NA PIP5K1C NA NA NA NA PIP5K1C 14434 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 3684195 3684491 3684434 Y NA PIP5K1C NA NA NA NA PIP5K1C 13986 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 4008398 4008778 4008498 Y MATK,ZFR2,ATCAY DAPK3,SNORD37,EEF2,PIAS4 NA NA NA NA PIAS4 2754 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 4059413 4059635 4059428 Y CCDC94 ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 5308 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 4064154 4064453 4064218 Y SEMA6B,MATK ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 490 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 4067781 4068111 4067963 Y SEMA6B,ATCAY,ZBTB7A ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 2838 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 4089074 4089290 4089084 Y NA ZBTB7A,MAP2K2 NA NA NA NA ZBTB7A 24131 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 4123124 4123351 4123249 Y MATK,ZFR2,ATCAY MAP2K2 NA NA NA NA MAP2K2 998 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 4379386 4379764 4379673 Y NA MPND,SH3GL1,CHAF1A NA NA NA NA SH3GL1 18780 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 4393849 4394251 4394129 Y NA SH3GL1,CHAF1A NA NA NA NA SH3GL1 4293 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 4456035 4456301 4456168 Y NA UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 216 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 4456385 4456784 4456737 Y UBXN6,UBXN6 UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 566 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 4837640 4837813 4837751 Y SEMA6B,TICAM1 FEM1A,TICAM1,PLIN3 NA NA NA NA TICAM1 7924 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 4912030 4912419 4912247 Y NA PLIN3,UHRF1 NA NA NA NA UHRF1 10938 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 4936813 4936840 4936828 Y NA UHRF1,KDM4B NA NA NA NA KDM4B 30285 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 4970760 4971027 4970931 Y NA KDM4B NA NA NA NA KDM4B 3635 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 5250100 5250567 5250354 Y NA RPL32P34 NA NA NA NA RPL32P34 25178 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 5338459 5338816 5338637 Y PTPRS NA NA NA NA NA PTPRS 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 5339517 5339797 5339748 Y HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,PTPRS PTPRS NA NA NA NA PTPRS 703 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 5585977 5586132 5586057 Y NA SAFB,SAFB2 NA NA NA NA SAFB 34914 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 5624052 5624252 5624226 Y VMAC,RFX2,DUS3L,SAFB2,SAFB SAFB,SAFB2,RPL36 NA NA NA NA SAFB2 1995 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 5968077 5968307 5968208 Y NA RANBP3 NA NA NA NA RANBP3 7846 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 5989815 5989915 5989890 Y SLC25A23,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L RANBP3 NA NA NA NA RANBP3 13662 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 6063576 6063994 6063809 Y RFX2 NA NA NA NA NA RANBP3 87423 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 6105811 6106211 6106011 Y NA NA NA NA NA NA RFX2 91372 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 6108978 6109271 6109224 Y NA NA NA NA NA NA RFX2 88312 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 6132012 6132373 6132181 Y NA NA NA NA NA NA RFX2 65210 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 6189136 6189412 6189274 Y NA RFX2 NA NA NA NA RFX2 8171 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 6238228 6238618 6238539 Y RFX2 RFX2,MLLT1 NA NA NA NA MLLT1 39341 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 6577471 6577956 6577654 Y DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70 TNFSF9,CD70 NA NA NA NA CD70 24158 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 6592539 6592761 6592714 Y DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70 CD70 NA NA NA NA CD70 9353 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 6802447 6802718 6802569 Y DENND1C,TNFSF9,TNFSF14,EMR1,GPR108,VAV1 NA NA NA NA NA TRIP10 66511 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 7197339 7197547 7197388 Y NA NA NA NA NA NA INSR 94498 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 7427436 7427895 7427614 Y ZNF557,XAB2,STXBP2,PNPLA6,LOC100131801,ARHGEF18 ARHGEF18 INSR,ARHGEF18,PNPLA6,MCOLN1,ZNF358,C19orf45,CD209,CLEC4G IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 30104 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 7437354 7437833 7437574 Y ZNF557,STXBP2,PNPLA6,PEX11G,LOC100131801,EVI5L,ARHGEF18 ARHGEF18 INSR,ARHGEF18,C19orf45,PEX11G,CLEC4G,CLEC4M,CD209,CLEC4GP1 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 20166 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 7483723 7483869 7483787 Y NA ARHGEF18 NA NA NA NA ARHGEF18 25724 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 7547905 7548376 7548024 Y STXBP2,CD209,PEX11G,MCOLN1 C19orf45,PEX11G,ZNF358,MCOLN1,PNPLA6 NA NA NA NA C19orf45 7486 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 7665007 7665263 7665135 Y INSR,PNPLA6,FLJ22184,KIAA1543 CAMSAP3,XAB2 NA NA NA NA CAMSAP3 6219 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 7756040 7757119 7756175 Y ARHGEF18,FBN3,MAP2K7,FLJ22184,EVI5L,FCER2,FCER2 TRAPPC5 NA NA NA NA TRAPPC5 12311 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 8060665 8061040 8060896 Y FLJ22184,FBN3 ELAVL1 NA NA NA NA ELAVL1 7503 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 8226134 8226320 8226231 Y NA CERS4 FBN3,TIMM44 IMR90 Hi-C 24141950 CERS4 43300 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 8488784 8489136 8488939 Y PRAM1,MYO1F RAB11B,MARCH2,HNRNPM NA NA NA NA MARCH2 12630 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 8674150 8674979 8674636 Y ADAMTS10 ADAMTS10 NA NA NA NA ADAMTS10 530 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 8676425 8676449 8676437 Y NA ADAMTS10 NA NA NA NA ADAMTS10 2805 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 9420483 9420931 9420837 Y NA ZNF559 NA NA NA NA ZNF559 11517 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 9517572 9518021 9517955 Y NA ZNF266 NA NA NA NA ZNF266 26233 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr19 9684452 9684634 9684543 Y NA ZNF426,ZNF121,ZNF561 NA NA NA NA ZNF121 8575 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 9748883 9749171 9749027 Y OR7D4,OR7E24,ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF177,ZNF177,ZNF426,ZNF846,OLFM2,ZNF562 ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF561 18808 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 9757386 9757713 9757550 Y NA ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 26063 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 9758216 9758505 9758322 Y ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF846 ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 25271 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 9776683 9777096 9776903 Y OR7D4,ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF177,ZNF426,ZNF121,ZNF846,OLFM2 ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 6680 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr19 9777343 9777681 9777659 Y ZNF559,ZNF559,ZNF177,ZNF846 ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 6095 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 9783821 9783976 9783959 Y NA ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 45 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr19 9896233 9896620 9896495 Y ZNF266,COL5A3,ZNF846 FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA FBXL12 39872 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 9903168 9903577 9903239 Y NA FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA FBXL12 32915 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 9919463 9919725 9919715 Y ZNF846,FBXL12 FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA FBXL12 16767 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 9937602 9937876 9937738 Y NA FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA UBL5 1034 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 10138488 10138727 10138608 Y EIF3G,COL5A3 NA NA NA NA NA C19orf66 56071 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 10148101 10148280 10148177 Y NA C19orf66 NA NA NA NA C19orf66 46518 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 10304383 10304612 10304534 Y TYK2,KRI1,ILF3 S1PR2,DNMT1 PPAN-P2RY11,EIF3G MCF7 ChIA-PET 22265404 S1PR2 35336 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 10337076 10337216 10337146 Y NA S1PR2,DNMT1,MRPL4 NA NA NA NA S1PR2 2732 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 10515339 10515636 10515481 Y PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181,PDE4A NA NA NA NA MIR1181 3125 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 10517647 10518072 10517920 Y NA TYK2,MIR1181,PDE4A CDC37 MCF7 ChIA-PET 22265404 MIR1181 5433 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 10519571 10519867 10519659 Y P2RY11,ICAM3,S1PR5,C19orf38,ATG4D,TYK2,PDE4A,PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181,PDE4A CDC37 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PDE4A 5582 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 10529596 10529758 10529677 Y NA TYK2,MIR1181,PDE4A NA NA NA NA PDE4A 4147 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 10678483 10678588 10678537 Y TYK2,KRI1 ATG4D,KRI1,CDKN2D,SLC44A2 NA NA NA NA CDKN2D 748 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 10766466 10766790 10766534 Y NA ILF3,QTRT1 NA NA NA NA ILF3 3529 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 10928296 10928707 10928651 Y NA MIR199A1,TMED1 NA NA NA NA MIR199A1 2124 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 10983653 10983862 10983766 Y CARM1 TMED1,CARM1 NA NA NA NA CARM1 3464 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 10992105 10992492 10992295 Y NA TMED1,CARM1,YIPF2,C19orf52 NA NA NA NA CARM1 11916 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 11044199 11044446 11044323 Y NA YIPF2,C19orf52,SMARCA4 NA NA NA NA C19orf52 6790 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 11484314 11484469 11484411 Y ZNF439,ZNF653,ZNF627,ZNF491,ZNF441,ELAVL3,CCDC151,SMARCA4,SMARCA4 CCDC159,RAB3D,TMEM205,SWSAP1,EPOR NA NA NA NA SWSAP1 953 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 11592904 11593323 11593025 Y ZNF491,ZNF441,CCDC151,ELAVL3,ZNF653 PRKCSH,CCDC151,ELAVL3,ZNF653,CTC-398G3.2,ECSIT NA NA NA NA ELAVL3 3043 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr19 11641329 11641510 11641441 Y ZNF491,ZNF441,CCDC151,ELAVL3,ZNF653 ZNF653,CTC-398G3.2,ECSIT,CNN1,ELOF1,ZNF627 NA NA NA NA ECSIT 3340 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 11681098 11681238 11681168 Y CCDC159,ACP5,ACP5 CTC-398G3.2,ECSIT,CNN1,ELOF1,ZNF627 NA NA NA NA ZNF627 12909 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 11804467 11804940 11804795 Y ZNF878,ZNF823,ZNF491 HNRNPA1P10,ZNF823 NA NA NA NA HNRNPA1P10 28622 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr19 11878639 11879058 11878901 Y NA ZNF823,ZNF441,ZNF491,ZNF440 NA NA NA NA ZNF441 2824 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 11925678 11926080 11925867 Y NA ZNF441,ZNF491,ZNF440,ZNF439 NA NA NA NA ZNF440 2579 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 12131760 12131812 12131786 Y NA CTD-2006C1.2,ZNF433,ZNF878,ZNF844 NA NA NA NA ZNF433 12744 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 12245844 12245929 12245887 Y NA ZNF788,ZNF20,CTC-359D24.3,ZNF625,ZNF136 NA NA NA NA ZNF20 3293 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr19 12892961 12894040 12893343 Y ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 6270 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 12899457 12901460 12900777 Y NA PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr19 12901644 12901726 12901699 Y NA JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 1334 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 13023589 13024232 13023881 Y ZNF709,TNPO2,TNPO2,MAST1,DAND5 HOOK2,DNASE2,GCDH,FARSA,CALR,RAD23A,GADD45GIP1,DAND5 NA NA NA NA FARSA 18619 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 13048278 13048689 13048364 Y MAN2B1 GCDH,FARSA,CALR,RAD23A,GADD45GIP1,DAND5 NA NA NA NA CALR 886 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 13094405 13094796 13094616 Y ZNF709,TNPO2,TNPO2,MAST1,DAND5 CALR,RAD23A,GADD45GIP1,DAND5,NFIX NA NA NA NA NFIX 9626 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 13133010 13133371 13133241 Y FBXW9,NFIX NFIX NA NA NA NA NFIX 28588 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 13138013 13138252 13138133 Y TNPO2,TNPO2,MAST1,CACNA1A NFIX NA NA NA NA NFIX 33591 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 13232387 13232613 13232547 Y NA LYL1,TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA NACC1 5470 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 13238145 13238217 13238180 Y NA LYL1,TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA NACC1 11228 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 4.34220181452104 chr19 13266326 13267156 13266576 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 7097 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 13267779 13268208 13267877 Y MAN2B1,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 8550 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 13274586 13275096 13274696 Y GADD45GIP1,NACC1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 15357 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 13278382 13278991 13278445 Y BEST2,JUNB,LYL1,STX10 STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 19153 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 13917794 13918010 13917903 Y RFX1,ZSWIM4,NANOS3 MRI1,C19orf53,ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 13520 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 13944151 13944331 13944193 Y CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4 ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 39877 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 13957204 13959386 13957586 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM4 52930 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 13975574 13976059 13975671 Y CACNA1A,LPHN1,CC2D1A,C19orf57 CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 38955 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 13976745 13977653 13977105 Y CACNA1A,RFX1,LPHN1,ZSWIM4,C19orf57 CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 37361 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr19 13995889 13996057 13995977 Y NA CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 18957 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 14084978 14085262 14085120 Y NA DCAF15,RFX1 NA NA NA NA DCAF15 23674 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 14115648 14116111 14115801 Y CCDC130,ZSWIM4,PKN1,DDX39A,CD97,DCAF15,RFX1,IL27RA IL27RA NA NA NA NA RFX1 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 14229419 14229865 14229637 Y CCDC130,ZSWIM4,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,DDX39A,CD97 SAMD1,PRKACA,ASF1B NA NA NA NA PRKACA 2523 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 14274504 14274771 14274661 Y C19orf57,RFX1,LPHN1 PRKACA,ASF1B,LPHN1 NA NA NA NA ASF1B 28736 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 14276845 14277176 14277145 Y NA PRKACA,ASF1B,LPHN1 NA NA NA NA ASF1B 31077 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 14474119 14474280 14474154 Y ZNF333,RFX1,PKN1,CD97 CD97 CD97,DDX39A K562 ChIA-PET 22265404 CD97 15033 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 14499980 14500202 14500091 Y OR7A17,ZNF333,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,CD97 CD97,DDX39A,PKN1 NA NA NA NA CD97 10667 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 14665322 14665552 14665478 Y SLC1A6 TECR,DNAJB1,NDUFB7 NA NA NA NA NDUFB7 15322 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 14869692 14869911 14869839 Y NA AC005255.3 NA NA NA NA AC005255.3 31210 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 14880267 14880429 14880348 Y NA AC005255.3 NA NA NA NA AC005255.3 20692 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 15310768 15311119 15311001 Y NA NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 976 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 15334094 15334476 15334286 Y SLC1A6,WIZ NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 24302 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr19 15505627 15505808 15505718 Y NA AKAP8,AKAP8L NA NA NA NA AKAP8 17018 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 15947617 15948119 15947980 Y AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1 NA NA NA NA NA TPM4 227712 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 16188924 16190024 16189835 Y TPM4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 13093 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.55078636232894 chr19 16205409 16205807 16205414 Y EPS15L1,RAB8A,HSH2D TPM4,RAB8A NA NA NA NA RAB8A 14632 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 16462018 16462188 16462137 Y CIB3 NA NA NA NA NA EPS15L1 118708 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 16482225 16482879 16482589 Y MED26,KLF2 NA NA NA NA NA EPS15L1 98017 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 16779311 16779659 16779460 Y NA MED26,TMEM38A NA NA NA NA TMEM38A 9373 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 17124642 17124654 17124646 Y NA NA NA NA NA NA HAUS8 59781 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 17200566 17201240 17200825 Y MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 15975 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 17224246 17224646 17224434 Y MED26,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 39655 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 17236053 17237400 17237360 Y MED26,HAUS8,MYO9B NA NA NA NA NA MYO9B 51462 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr19 17246297 17246722 17246423 Y SLC27A1,PGLS,OCEL1,MYO9B NA NA NA NA NA MYO9B 61706 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr19 17345747 17345835 17345791 Y NA USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1,ANKLE1 NA NA NA NA NR2F6 8914 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 17961350 17961505 17961471 Y FAM129C,FCHO1,FCHO1,IL12RB1,IFI30,ARRDC2,JAK3 RPL18A PLVAP,FAM125A,TMEM221,BST2,NXNL1,UNC13A,GLT25D1,FAM129C,MAP1S,FCHO1,INSL3,B3GNT3,JAK3,SLC5A5,KCNN1,RPL18A,CCDC124,ARRDC2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL18A 7180 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 18133045 18133309 18133130 Y FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2 ARRDC2 NA NA NA NA ARRDC2 23104 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 18402387 18403564 18402535 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1 KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA MIR3188 11500 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 18404099 18404539 18404373 Y NA KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA MIR3188 13212 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 18405326 18405850 18405541 Y JAK3,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,C19orf60,JUND KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA MIR3188 14439 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr19 18415031 18416060 18415513 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 16024 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 18527231 18527472 18527362 Y LSM4,SSBP4,ISYNA1,ISYNA1 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 202 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr19 18527701 18528040 18527800 Y KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 27 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 18528263 18528792 18528577 Y UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 589 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr19 18740732 18741107 18740923 Y NA C19orf60,TMEM59L,CRLF1,KLHL26 NA NA NA NA KLHL26 4668 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 18811913 18812040 18811994 Y UPF1,SLC25A42,JUND,FKBP8,UBA52,CRTC1 CRTC1 NA NA NA NA CRTC1 19426 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 19143307 19143510 19143378 Y DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6 ARMC6,SUGP2,SLC25A42 NA NA NA NA SUGP2 475 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.24062908986315 chr19 19248225 19248392 19248286 Y NA TMEM161A NA NA NA NA TMEM161A 903 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 19248583 19248716 19248628 Y NA TMEM161A NA NA NA NA TMEM161A 1261 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 19432213 19432594 19432445 Y SUGP2,NCAN,ZNF14,PBX4,SUGP1,MAU2 MAU2,SUGP1 NA NA NA NA SUGP1 2560 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 19432680 19432782 19432710 Y NA MAU2,SUGP1 NA NA NA NA SUGP1 3027 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 19571175 19572073 19571752 Y ZNF506,RFXANK,MAU2,GATAD2A,ZNF14,PBX4,GMIP NA NA NA NA NA NDUFA13 52472 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 19623798 19624201 19624001 Y NA NDUFA13,TSSK6,YJEFN3,CILP2 NA NA NA NA NDUFA13 344 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 19705357 19705479 19705434 Y NA PBX4,LPAR2,GMIP NA NA NA NA PBX4 22246 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 19977247 19977754 19977315 Y PBX4,LPAR2,ZNF101,ZNF14,ZNF682,ZNF682,ZNF506,ZNF253 ZNF506,ZNF253,ZNF93 NA NA NA NA ZNF253 2552 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 20128543 20128860 20128736 Y NA ZNF682 NA NA NA NA ZNF682 19455 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 20337633 20337845 20337749 Y ZNF93,ZNF682,ZNF682,ZNF90,ZNF486 NA NA NA NA NA ZNF486 61596 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr19 20747496 20747853 20747738 Y NA ZNF737 NA NA NA NA ZNF737 881 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 21511296 21511520 21511376 Y NA ZNF708,ZNF738 NA NA NA NA ZNF708 1069 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 23309445 23309479 23309469 Y NA NA NA NA NA NA ZNF730 53433 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 23425915 23426300 23426108 Y NA ZNF724P NA NA NA NA ZNF724P 4892 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 23530488 23530791 23530760 Y NA ZNF91 NA NA NA NA ZNF91 45571 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr19 28217479 28217822 28217621 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1484626 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 28219787 28220540 28220091 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1481908 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 28232492 28232748 28232631 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1469700 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 28234930 28234990 28234960 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1467458 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 28242746 28243185 28242855 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1459263 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 28252106 28252716 28252616 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1449732 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 28265126 28266155 28265940 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1436293 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 30187610 30187930 30187770 Y NA PLEKHF1,C19orf12 NA NA NA NA C19orf12 16434 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 30207596 30207744 30207670 Y NA C19orf12 NA NA NA NA C19orf12 3232 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 30215159 30215467 30215313 Y NA C19orf12 NA NA NA NA C19orf12 10795 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 30336581 30336824 30336781 Y C19orf2,C19orf2 CCNE1 NA NA NA NA CCNE1 35776 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr19 30718140 30718340 30718240 Y NA NA NA NA NA NA URI1 305589 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr19 30752250 30752526 30752388 Y NA NA NA NA NA NA URI1 339699 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 30852657 30852738 30852698 Y NA NA ZNF536 IMR90 Hi-C 24141950 URI1 440106 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 31041576 31041942 31041745 Y NA NA NA NA NA NA URI1 629025 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr19 31837695 31837707 31837704 Y NA TSHZ3 NA NA NA NA TSHZ3 746 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 31841682 31842327 31842237 Y NA TSHZ3 NA NA NA NA TSHZ3 3229 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 31843033 31843344 31843257 Y NA TSHZ3 NA NA NA NA TSHZ3 4580 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 32021641 32022032 32021837 Y NA NA NA NA NA NA TSHZ3 183188 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 32863977 32864267 32864121 Y NA ZNF507,DPY19L3 NA NA NA NA ZNF507 29477 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 32989653 32989935 32989794 Y NA NA NA NA NA NA PDCD5 80039 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 33165229 33165376 33165346 Y NA RGS9BP,ANKRD27,NUDT19 NA NA NA NA ANKRD27 127 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 33541924 33542310 33542117 Y NA RHPN2,GPATCH1 NA NA NA NA RHPN2 11484 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 33789888 33790286 33790087 Y NA CEBPA NA NA NA NA CEBPA 1184 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 33875552 33875576 33875564 Y NA CEBPG NA NA NA NA CEBPG 13316 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 33996867 33997517 33996997 Y LRP3 PEPD NA NA NA NA PEPD 13183 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr19 34310855 34311133 34311012 Y NA KCTD15 NA NA NA NA KCTD15 26017 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 34746041 34746169 34746166 Y KIAA0355 KIAA0355,RPL29P33 NA NA NA NA KIAA0355 2599 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 34850085 34850642 34850351 Y ZNF599,ZNF302,ZNF181 GPI,PDCD2L NA NA NA NA GPI 1700 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr19 35100505 35100815 35100739 Y ZNF302 NA NA NA NA NA AC020910.2 65671 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 35127557 35127738 35127685 Y NA AC020910.2,ZNF302 SCGB2B2,ZNF302,LOC400685 IMR90 Hi-C 24141950 AC020910.2 38748 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 35453242 35453666 35453504 Y ZNF792 ZNF30,ZNF792,GRAMD1A NA NA NA NA ZNF792 289 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr19 35494139 35494542 35494364 Y NA ZNF792,GRAMD1A NA NA NA NA GRAMD1A 10451 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 36013245 36013546 36013396 Y ARHGAP33 TMEM147,AD000090.2 NA NA NA NA TMEM147 20951 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 36373129 36373360 36373222 Y NA KIRREL2,APLP1,NFKBID,HCST NA NA NA NA APLP1 16328 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 36437886 36438022 36437944 Y GAPDHS,ETV2,WDR62 NFKBID,HCST,LRFN3,SDHAF1 NA NA NA NA LRFN3 13626 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 36519340 36519516 36519376 Y ZNF565 SDHAF1,ALKBH6,CLIP3,THAP8,WDR62 NA NA NA NA CLIP3 2729 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 36618643 36619171 36618835 Y NA TBCB,POLR2I,CAPNS1 NA NA NA NA CAPNS1 9306 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 36879565 36879874 36879872 Y NA ZFP14,ZFP82 NA NA NA NA ZFP14 11464 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 36882143 36882391 36882267 Y NA ZFP14,ZFP82 NA NA NA NA ZFP14 14042 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 36891925 36892272 36892205 Y NA ZFP14,ZFP82 NA NA NA NA ZFP82 15286 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 37156610 37156902 37156838 Y ZNF565,ZNF565,ZFP14,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF790,ZNF420,ZNF345,ZNF345,ZNF529,ZNF382,ZNF567,ZNF461 ZNF461,AC074138.3,ZNF567 NA NA NA NA ZNF461 855 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 37246589 37246720 37246657 Y NA ZNF850 NA NA NA NA ZNF850 15007 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 37322216 37322466 37322299 Y ZFP14,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF829,ZNF829,ZNF585B,ZNF568,ZNF420,ZNF383,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345 ZNF345,ZNF790 NA NA NA NA ZNF345 16797 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 37408041 37408149 37408081 Y ZNF527,HKR1,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF585B,ZNF420,ZNF383,ZNF829,ZNF568 ZNF829,ZNF568 NA NA NA NA ZNF568 2810 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 37424676 37424848 37424761 Y ZNF527,HKR1,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF461,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF585B,ZNF420,ZNF383,ZNF829,ZNF829,ZNF568 ZNF829,ZNF568 NA NA NA NA ZNF568 19445 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 37795242 37795359 37795301 Y ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF829,ZNF568,ZNF420,ZNF585B,ZNF793,ZNF781,ZNF607,ZNF607,ZNF573,ZNF570,ZNF569,ZNF540,ZNF527,HKR1 HKR1 NA NA NA NA HKR1 6380 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 37822125 37822150 37822138 Y NA HKR1,ZNF527 NA NA NA NA HKR1 20386 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 37942009 37942313 37942161 Y ZNF420,ZNF585B,ZNF527,ZNF781,ZNF607,ZNF607,ZNF573,ZNF571,ZNF540,ZNF540,ZFP30,ZNF793,ZNF570,ZNF569 ZNF570,ZNF569 NA NA NA NA ZNF570 14174 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 37953316 37953327 37953324 Y NA ZNF570,ZNF569,ZNF793 NA NA NA NA ZNF570 3160 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr19 38186506 38186731 38186619 Y ZNF527,ZNF793,ZNF540,ZFP30,ZNF781,ZNF607,ZNF573 ZNF781,ZFP30,ZNF607 NA NA NA NA ZFP30 5268 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 38493976 38494435 38494152 Y YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3 NA NA NA NA NA SIPA1L3 98108 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 38495647 38495987 38495738 Y SPRED3 NA NA NA NA NA SIPA1L3 99779 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr19 38719187 38719304 38719247 Y ZNF573,DPF1,PPP1R14A,DPF1 DPF1,SPINT2,PPP1R14A NA NA NA NA DPF1 833 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr19 38807798 38808031 38807971 Y MAP4K1,EIF3K,RASGRP4,FAM98C YIF1B,KCNK6,CATSPERG NA NA NA NA KCNK6 453 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 39167742 39168127 39167771 Y NA ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 31453 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 39411140 39411539 39411467 Y LGALS7 RINL,NFKBIB,SIRT2,MRPS12,SARS2 NA NA NA NA MRPS12 7649 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 39849240 39849632 39849436 Y NA SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36 MED29,PAF1 IMR90 Hi-C 24141950 SAMD4B 18204 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 39891902 39892845 39892340 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,RPS16,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H NA NA NA NA ZFP36 2608 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 39921308 39921946 39921495 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H,TIMM50 NA NA NA NA RPS16 2642 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 40315090 40315548 40315357 Y NA DYRK1B,FBL NA NA NA NA DYRK1B 7293 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr19 40543471 40543758 40543711 Y SPTBN4,ZNF546,ZNF780B ZNF780B NA NA NA NA ZNF780B 16358 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 40823184 40823546 40823487 Y NA AKT2,PLD3,C19orf47 NA NA NA NA PLD3 28817 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 40930264 40930817 40930514 Y SERTAD1 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4 NA NA NA NA SERTAD1 332 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 40939716 40940068 40940022 Y SERTAD1 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4 NA NA NA NA SERTAD3 8544 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr19 41037324 41037469 41037389 Y ZNF780B,MAP3K10,TTC9B,SPTBN4,SPTBN4 SHKBP1 NA NA NA NA SHKBP1 43288 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 41109606 41110134 41110046 Y SERTAD1,ITPKC,EGLN2,EGLN2,C19orf54,ADCK4,SHKBP1 SHKBP1,LTBP4 NA NA NA NA LTBP4 12817 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 41771602 41771660 41771636 Y CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1 AXL,HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA HNRNPUL1 5201 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 41831643 41832527 41831971 Y CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA CCDC97 17549 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 41834727 41835191 41834967 Y CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA TMEM91 19625 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 41915515 41915996 41915671 Y ARHGEF1,HNRNPUL1,TGFB1 B9D2,BCKDHA,EXOSC5,B3GNT8,ATP5SL NA NA NA NA EXOSC5 14131 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 42028325 42028365 42028354 Y NA NA CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 83703 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 42379575 42379860 42379642 Y ZNF574,DEDD2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1 RPS19,ARHGEF1 NA NA NA NA ARHGEF1 5368 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr19 42419916 42420316 42420067 Y ZNF574,GRIK5,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1 ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA ARHGEF1 34688 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 42429105 42429824 42429205 Y DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1 ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 31718 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 42444277 42444712 42444407 Y POU2F2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1 RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 16830 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 42493914 42494230 42494205 Y TMEM145,MEGF8,GRIK5,ATP1A3 RABAC1,ATP1A3 NA NA NA NA ATP1A3 5419 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.34401484735175 chr19 42571588 42571990 42571604 Y NA ZNF574 NA NA NA NA ZNF574 959 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 42654657 42654924 42654791 Y TMEM145 NA NA NA NA NA DEDD2 67368 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 42750338 42750718 42750490 Y NA DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC NA NA NA NA GSK3A 5561 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 42756581 42756634 42756608 Y ATP1A3,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3 NA NA NA NA ERF 675 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 42772295 42772768 42772477 Y NA ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 1606 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr19 42772804 42773312 42773020 Y CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 2115 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr19 42784087 42784212 42784170 Y CEACAM8,CEACAM3,DEDD2 GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13398 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr19 42784527 42784991 42784716 Y ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13838 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.44740060484035 chr19 42902919 42903213 42903066 Y TMEM145 NA CNFN MCF7 ChIA-PET 22265404 MEGF8 75158 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 42924318 42924497 42924408 Y NA NA NA NA NA NA MEGF8 96557 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 43835548 43835842 43835742 Y NA CD177 TEX101 IMR90 Hi-C 24141950 CD177 19969 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 44124638 44124922 44124781 Y CADM4 XRCC1,IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4,PLAUR NA NA NA NA ZNF428 2612 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 44137942 44138031 44138016 Y ZNF575,ZNF221,LYPD5,ZNF428,CADM4 IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4,PLAUR NA NA NA NA CADM4 3960 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 44287065 44287299 44287223 Y NA SMG9,KCNN4,LYPD5,ZNF283 NA NA NA NA KCNN4 3656 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 44308607 44308871 44308732 Y CADM4 KCNN4,LYPD5,ZNF283 NA NA NA NA LYPD5 20487 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 44616064 44616441 44616271 Y KCNN4,ZNF283,ZNF404,ZNF45,ZNF221,ZNF222,ZNF233,ZNF233,ZNF229,ZNF284 ZNF284,ZNF224,ZNF225,ZNF234 NA NA NA NA ZNF225 1730 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 44711538 44711905 44711597 Y NA ZNF226,ZNF227,ZNF233 NA NA NA NA ZNF227 1838 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr19 44749585 44749846 44749685 Y LYPD5,ZNF221,ZNF223,ZNF284,ZNF224,ZNF234,ZNF226,ZNF226,ZNF226,ZNF285,ZNF229,ZFP112,ZNF227,ZNF235,ZNF233,ZNF233 ZNF227,ZNF233 NA NA NA NA ZNF233 2472 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 44773096 44773391 44773244 Y LYPD5,ZNF221,ZNF284,ZNF224,ZNF234,ZNF226,ZNF226,ZNF226,ZNF285,ZFP112,ZNF227,ZNF233,ZNF233,ZNF235 ZNF233,ZNF235 NA NA NA NA ZNF233 20778 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 44780646 44780756 44780701 Y NA ZNF233,ZNF235 NA NA NA NA ZNF235 26443 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 44821121 44821451 44821434 Y ZNF221,ZNF223,ZNF284,ZNF285,ZNF180,ZFP112,ZNF227 ZNF235 NA NA NA NA ZNF235 13922 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 44824668 44825027 44825022 Y NA ZNF235 NA NA NA NA ZNF235 17469 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 44825986 44826083 44826035 Y ZNF221,ZNF284,ZNF285,ZNF233,ZNF233 ZNF235 NA NA NA NA ZNF235 18787 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 45195366 45195649 45195556 Y RELB,CLASRP,BCL3 NA NA NA NA NA PVR 50268 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 45393623 45393866 45393750 Y ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40 PVRL2,TOMM40,APOE NA NA NA NA TOMM40 1797 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr19 45601584 45601804 45601678 Y FOSB ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37 NA NA NA NA PPP1R37 8930 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 45663964 45664347 45664315 Y NA TRAPPC6A,BLOC1S3 NA NA NA NA TRAPPC6A 15148 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 45755637 45756189 45755812 Y RELB,CLASRP,VASP NA NA NA NA NA BLOC1S3 75634 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 45826869 45827146 45827057 Y DMPK,RTN2,CKM ERCC2 NA NA NA NA ERCC2 45030 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 45844650 45844836 45844820 Y FBXO46,PPP1R13L ERCC2 NA NA NA NA ERCC2 27340 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 45905744 45905944 45905844 Y EML2,KLC3,PPP1R13L,ERCC1,ERCC1 ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L NA NA NA NA CD3EAP 1523 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 45946690 45947113 45946759 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22140 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr19 45953764 45954783 45954182 Y NA CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 14470 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 45980345 45980732 45980359 Y GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP NA NA NA NA ERCC1 259 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 45999277 45999601 45999579 Y NOVA2,DMPK,RTN2,RTN2 FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP NA NA NA NA VASP 8236 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 46385401 46385465 46385433 Y NA SYMPK,IRF2BP1,MYPOP NA NA NA NA IRF2BP1 1911 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 46437050 46437156 46437068 Y NA IRF2BP1,MYPOP,NOVA2 NANOS2 IMR90 Hi-C 24141950 MYPOP 33188 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 46478594 46479000 46478748 Y NA NOVA2,CCDC61 NA NA NA NA NOVA2 3790 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 46803943 46804533 46804229 Y IRF2BP1,MYPOP,HIF3A,HIF3A,HIF3A,CCDC8 PPP5C NA NA NA NA PPP5C 43718 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 46876247 46876539 46876393 Y NA PPP5C NA NA NA NA PPP5C 27996 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 46907328 46907649 46907570 Y NA NA NA NA NA NA PPP5C 59077 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 46930027 46930174 46930086 Y NA PNMAL1 CCDC8,LOC100506012 IMR90 Hi-C 24141950 PNMAL1 42646 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 47142195 47142976 47142503 Y NA CALM3,PTGIR,GNG8,DACT3 NA NA NA NA GNG8 6253 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 3.41172999712367 chr19 47253619 47253881 47253750 Y NA PRKD2,FKRP,STRN4,SLC1A5 NA NA NA NA STRN4 5368 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 47269374 47269772 47269575 Y LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5 FKRP,STRN4,SLC1A5 NA NA NA NA SLC1A5 20079 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 47324064 47324441 47324224 Y NA SLC1A5,AP2S1 NA NA NA NA AP2S1 27808 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 47363167 47364689 47363471 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 AP2S1 SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 10918 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr19 47458912 47459233 47458939 Y ZC3H4,CCDC9 NA NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 NPAS1 61844 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 47487878 47488175 47487946 Y ZC3H4,DHX34,CCDC9,C5AR1 NPAS1 NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 NPAS1 32902 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 47611153 47611400 47611382 Y NA SAE1,ZC3H4 TMEM160,NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 SAE1 3131 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 47613231 47613789 47613256 Y PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4 SAE1,ZC3H4 TMEM160,NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 SAE1 742 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr19 47742856 47743228 47743000 Y NA BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA BBC3 8833 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 47746329 47746738 47746506 Y SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24 BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA CCDC9 10499 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 47765844 47766042 47765943 Y NA BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA CCDC9 8607 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 47776748 47776969 47776841 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1 BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA PRR24 606 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 47805638 47805769 47805718 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,GPR77,C5AR1 CCDC9,PRR24,DHX34 PRR24,DHX34,SLC8A2,MEIS3,GLTSCR2,GLTSCR1,EHD2 IMR90 Hi-C 24141950 PRR24 29496 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 47886542 47886975 47886851 Y GLTSCR2,ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34 DHX34,MEIS3 NA NA NA NA MEIS3 33805 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 47892089 47892242 47892175 Y ZC3H4,BBC3,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34 DHX34,MEIS3 NA NA NA NA MEIS3 28538 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 48016024 48016351 48016088 Y SULT2A1,CCDC9,GPR77,DHX34,NAPA SLC8A2,KPTN,NAPA NA NA NA NA NAPA 146 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 48076356 48076760 48076653 Y SLC8A2,ZNF541 NA GLTSCR1,KPTN,MEIS3,SLC8A2,NAPA,LOC100505681,ZNF541 IMR90 Hi-C 24141950 NAPA 59859 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 48103581 48103982 48103689 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA GLTSCR1,NAPA MCF7 ChIA-PET 22265404 NAPA 87084 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr19 48222362 48222481 48222377 Y SEPW1,PLA2G4C,MEIS3,SLC8A2 EHD2,GLTSCR2 NA NA NA NA EHD2 7762 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr19 48642255 48642637 48642446 Y NA PLA2G4C,LIG1,ZNF114 NA NA NA NA LIG1 29223 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 48657871 48658185 48658028 Y NA PLA2G4C,LIG1,ZNF114 NA NA NA NA LIG1 13675 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 48996099 48996379 48996219 Y NA GRWD1,CYTH2 NA NA NA NA CYTH2 25810 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 49315464 49315783 49315738 Y NA BCAT2,HSD17B14 NA NA NA NA BCAT2 3178 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 49493898 49494273 49494153 Y NA BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA GYS1 294 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 49495555 49495708 49495609 Y SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4 BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 850 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 49698080 49698342 49698211 Y NA TRPM4 NA NA NA NA TRPM4 39082 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 49924099 49924476 49924276 Y TBC1D17,RRAS,RCN3,PRR12,NOSIP,AP2A1 SLC17A7,ALDH16A1,PIH1D1 NA NA NA NA SLC17A7 19141 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 50004159 50004640 50004502 Y PNKP,SNRNP70,C19orf73,CD37,PRR12,IRF3,BCL2L12,ALDH16A1,FLT3LG,FLT3LG,RPL13A,RPS11 ALDH16A1,PIH1D1,FLT3LG,RPL13A,SNORD32A,SNORD33,SNORD34,SNORD35A,RPS11,SNORD35B,FCGRT,RCN3 NA NA NA NA FCGRT 3433 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 50413852 50414197 50414025 Y LOC645971,NR1H2 PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751 NA NA NA NA ATF5 15762 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 50414628 50414884 50414779 Y RPS11,FCGRT,NR1H2,IL4I1,NUP62,NUP62,NUP62,NUP62,IL4I1,ATF5 PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751 NA NA NA NA ATF5 15075 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 50417620 50417965 50417778 Y NA PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751 NA NA NA NA ATF5 11994 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 50425284 50425454 50425359 Y RPS11,FCGRT,NR1H2,IL4I1,NUP62,NUP62,NUP62,NUP62,IL4I1,ATF5 TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751 NA NA NA NA ATF5 4505 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 50833837 50834367 50834143 Y MYH14,GPR32,SYT3,SYT3,SHANK1,LRRC4B,ASPDH,KCNC3 NR1H2,KCNC3 NA NA NA NA KCNC3 405 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 50872495 50872846 50872654 Y NA NR1H2,KCNC3,POLD1 NA NA NA NA POLD1 12615 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 50888786 50889179 50888984 Y ACPT,LOC342918 POLD1 NA NA NA NA POLD1 3325 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 50990086 50990332 50990328 Y NA FAM71E1,JOSD2,ASPDH NA NA NA NA FAM71E1 12076 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 50993680 50994951 50994565 Y NA FAM71E1,JOSD2,ASPDH NA NA NA NA FAM71E1 15670 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr19 51003635 51004295 51004006 Y MYH14,MYBPC2 FAM71E1,JOSD2,ASPDH NA NA NA NA JOSD2 8315 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 51059944 51060288 51060130 Y NA JOSD2,ASPDH,LRRC4B NA NA NA NA LRRC4B 9014 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 51111018 51111676 51111369 Y NA LRRC4B,C19orf81 NA NA NA NA C19orf81 39026 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 51166998 51167396 51167198 Y KLK4,KLK6,KLK14,SYT3,LOC342918 C19orf81,SYT3 NA NA NA NA SYT3 2255 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 51182448 51182932 51182864 Y NA C19orf81,SYT3,SHANK1 NA NA NA NA SYT3 12797 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 51197974 51198378 51198356 Y NA C19orf81,SYT3,SHANK1 NA NA NA NA SHANK1 22329 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr19 51198423 51198838 51198828 Y KLK6,KCNC3,ASPDH,LRRC4B,SYT3,SYT3,SHANK1 C19orf81,SYT3,SHANK1 NA NA NA NA SHANK1 21869 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 12.4062908986315 chr19 51224129 51224276 51224235 Y C19orf48,C19orf48,SHANK1,CLEC11A SHANK1 NA NA NA NA SHANK1 3422 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 51287900 51288107 51288100 Y NA C19orf48 NA NA NA NA C19orf48 18079 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr19 51465501 51465788 51465642 Y SYT3,SYT3,LOC342918,ACPT,KLK14,IGLON5,ETFB,C19orf75,KLK4 NA NA NA NA NA CTU1 143839 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 51934392 51934883 51934537 Y SIGLEC9,SIGLEC14,FPR3,FPR2,FPR1 NA NA NA NA NA ETFB 66720 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 51944053 51944530 51944252 Y SIGLEC9,SIGLEC7,ZNF649,ZNF175,SIGLEC6,SIGLEC10 NA NA NA NA NA ETFB 76381 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 52075080 52075242 52075159 Y ZNF615,ZNF614,ZNF613,SIGLEC7,SIGLEC6,ZNF649,ZNF175 ZNF175 NA NA NA NA ZNF175 2529 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 52192085 52192767 52192400 Y ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577 MIRLET7E NA NA NA NA MIRLET7E 1272 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr19 52194056 52194504 52194155 Y ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1 MIRLET7E NA NA NA NA MIRLET7E 17 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 52194594 52195259 52195000 Y ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1 MIRLET7E NA NA NA NA MIRLET7E 555 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 52641935 52642117 52642107 Y ZNF649,ZNF610,ZNF528,ZNF836,ZNF616 ZNF432,ZNF841,ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A NA NA NA NA ZNF616 760 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr19 52674093 52674226 52674127 Y ZNF836 ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A NA NA NA NA ZNF836 1197 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 52734516 52734674 52734594 Y ZNF610 PPP2R1A,ZNF766 NA NA NA NA ZNF766 36150 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 53129559 53129725 53129643 Y ZNF160,ZNF616,ZNF766,ZNF808,ZNF701,ZNF611,ZNF611,ZNF83 NA NA NA NA NA ZNF83 62024 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 53145294 53145545 53145446 Y NA ZNF83 NA NA NA NA ZNF83 46204 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 53150651 53150972 53150733 Y NA ZNF83 ZNF137P IMR90 Hi-C 24141950 ZNF83 40777 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 53237186 53237523 53237297 Y ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611 ZNF83,ZNF611 NA NA NA NA ZNF611 860 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 53239075 53239317 53239102 Y NA ZNF83,ZNF611,ZNF600 NA NA NA NA ZNF611 2749 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 53425304 53425713 53425359 Y ERVV-1,ZNF320 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 18141 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 53426305 53426488 53426354 Y ZNF765,ZNF468,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 17366 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 53444729 53445104 53444918 Y ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 875 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 53592651 53593387 53593361 Y NA ERVV-2,ZNF160,ZNF415 NA NA NA NA ZNF160 11302 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 53635063 53635358 53635174 Y ZNF160,ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF347,ZNF347 ZNF160,ZNF415,ZNF347 NA NA NA NA ZNF415 733 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 53727403 53727861 53727738 Y NA ZNF665,ZNF677 NA NA NA NA ZNF677 28290 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr19 53917190 53917573 53917346 Y NA ZNF765,ZNF761 NA NA NA NA ZNF761 15654 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 54411435 54411746 54411498 Y MYADM,PRKCG,CACNG8,CACNG7 MYADM,AC008753.6,CACNG7 NA NA NA NA CACNG7 846 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 54433325 54433420 54433359 Y TARM1,ZNF813,DPRX,CACNG7 CACNG7 NA NA NA NA CACNG7 22736 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 54463562 54463897 54463703 Y NA NA NA NA NA NA CACNG7 52973 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 54465243 54465494 54465291 Y TFPT,PRPF31,NDUFA3,MYADM,CACNG7,CACNG8 NA NA NA NA NA CACNG7 54654 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 54548907 54549052 54548979 Y NLRP12,NLRP12,VSTM1 NA NA NA NA NA OSCAR 54948 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 54707641 54707712 54707644 Y NA LENG1,MBOAT7,TSEN34,RPS9 NA NA NA NA RPS9 5031 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 54714720 54715094 54714879 Y NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6 MBOAT7,TSEN34,RPS9 NA NA NA NA RPS9 12110 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr19 55546101 55546409 55546255 Y NA RDH13 NA NA NA NA RDH13 34250 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 55620515 55620603 55620559 Y NA RDH13,PPP1R12C NA NA NA NA PPP1R12C 6324 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 55626810 55627228 55626935 Y ZNF865,PPP1R12C RDH13 NA NA NA NA PPP1R12C 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 55627475 55627790 55627718 Y LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C RDH13,PPP1R12C NA NA NA NA PPP1R12C 548 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr19 55794552 55795020 55794712 Y NA PPP6R1,HSPBP1,BRSK1 NA NA NA NA BRSK1 3112 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 55850120 55850505 55850225 Y KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564 SUV420H2,IL11,TMEM238,RPL28 NA NA NA NA SUV420H2 899 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 55909655 55909755 55909754 Y PPP1R12C,TMEM150B IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA UBE2S 7390 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 55917170 55917359 55917333 Y U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA UBE2S 25 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr19 56097081 56097467 56097273 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581 SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF579 6870 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr19 56098668 56099098 56098905 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581 SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF579 8457 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 4872 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr19 56117286 56117783 56117722 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 5950 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 56148080 56148375 56148228 Y ZNF580 ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2,EPN1 NA NA NA NA CCDC106 2053 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 56169893 56170373 56169939 Y NA ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2,EPN1 NA NA NA NA U2AF2 6381 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 56218548 56218666 56218607 Y SUV420H2,NLRP9,U2AF2 EPN1 NA NA NA NA EPN1 33956 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 56621885 56622165 56622061 Y NA ZNF787,ZNF444 NA NA NA NA ZNF787 8484 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 56796830 56796936 56796883 Y NA NA NA NA NA NA ZNF542 80532 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 56798845 56799016 56798855 Y NLRP11,NLRP8,NLRP5,ZSCAN5A,ZNF583,ZNF583,ZNF583 NA NA NA NA NA ZNF542 78452 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 56807694 56808027 56807709 Y NLRP13,ZSCAN5A NA NA NA NA NA ZNF542 69441 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 56810811 56811236 56810900 Y NA NA NA NA NA NA ZNF542 66232 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 56811653 56811926 56811777 Y NA NA NA NA NA NA ZNF542 65542 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 56823857 56823998 56823922 Y ZSCAN5A NA NA NA NA NA ZNF542 53470 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 57020241 57020583 57020445 Y ZNF582,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF835,ZIM2,PEG3,PEG3,LOC147670,ZNF471,ZNF71,ZNF470,ZFP28 ZNF667-AS1,ZNF667,ZNF471 NA NA NA NA ZNF471 3029 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr19 57349423 57349757 57349684 Y ZNF543,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF471,ZNF470,ZNF71,LOC147670,ZNF835,ZIM2,PEG3 PEG3,ZIM2 NA NA NA NA PEG3 339 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 57351144 57351414 57351350 Y ZNF543,AURKC,AURKC,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF471,ZFP28,ZNF470,LOC147670,ZNF835,PEG3,ZIM2,PEG3 PEG3,ZIM2 NA NA NA NA ZIM2 1047 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 57944833 57945004 57944919 Y NA ZNF548,ZNF17,ZNF749,ZNF772 NA NA NA NA ZNF749 136 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 57965552 57965851 57965609 Y NA ZNF17,ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773 NA NA NA NA ZNF749 20855 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 57976528 57976751 57976646 Y NA ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773 NA NA NA NA ZNF772 10187 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 57980425 57980680 57980553 Y NA ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773 NA NA NA NA ZNF772 6258 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 58175767 58176046 58175802 Y ZNF460,ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,ZNF772,ZNF549,ZSCAN18,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF776,ZNF671,ZNF586,ZNF418,ZNF417,ZNF256,ZNF135,ZNF550,ZNF211,ZNF551 ZNF211,ZNF551,ZNF154 NA NA NA NA ZNF551 15291 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 58217187 58217439 58217313 Y NA ZNF551,ZNF154,ZNF671,ZNF776 NA NA NA NA ZNF154 1140 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 58218479 58218613 58218485 Y ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,VN1R1,ZNF772,ZNF419,ZNF773,ZNF549,ZNF416,ZIK1,ZNF134,ZSCAN4,ZNF551,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF814,ZNF606,ZNF418,ZNF256,ZNF135,LOC100293516,ZNF671,ZNF586,ZNF154 ZNF551,ZNF671,ZNF776 NA NA NA NA ZNF154 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr19 58237757 58238155 58237774 Y NA ZNF551,ZNF154,ZNF671,ZNF776,ZNF586 ZNF154 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF671 765 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 58321012 58321020 58321017 Y VN1R1,ZNF211,ZNF587,ZNF417,ZNF776,ZNF586,ZNF552 ZNF586,ZNF552,ZNF587 NA NA NA NA ZNF552 3261 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr19 58413801 58413982 58413868 Y ZNF154,ZNF418 ZNF814,ZNF417,ZNF418,ZNF256 NA NA NA NA ZNF417 11996 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 58415823 58415990 58415970 Y NA ZNF814,ZNF417,ZNF418,ZNF256 NA NA NA NA ZNF417 9988 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 58501905 58502197 58501915 Y ZNF8,ZNF132,ZNF773,ZNF549,ZNF550,ZNF416,ZIK1,ZNF134,ZSCAN4,ZNF154,ZNF671,ZNF776,ZNF814,ZNF417,ZNF418,ZSCAN18,ZNF329,ZNF256,ZSCAN1,ZNF606,ZNF135 ZNF256,CTD-2368P22.1,ZNF606,ZSCAN1 NA NA NA NA CTD-2368P22.1 9232 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 58557282 58557656 58557471 Y NA CTD-2368P22.1,ZNF606,ZSCAN1,ZNF135 NA NA NA NA ZNF135 10951 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 58781089 58781297 58781193 Y NA ZNF544,ZNF8,ERVK3-1 ZNF8 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF8 7021 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 58886804 58887095 58886950 Y ZNF606,ZSCAN22,ZNF324B A1BG-AS1,A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584 NA NA NA NA ZNF837 3332 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.55078636232894 chr19 59049687 59049971 59049795 Y ZNF135,ZSCAN18,ZNF544,ZNF8,ZNF497,ZNF324B,ZNF324,UBE2M,TRIM28 SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1 NA NA NA NA ZBTB45 1409 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr19 59078228 59078288 59078258 Y CHMP2A,CHMP2A ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1 NA NA NA NA CENPBD1P1 4582 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 605283 605589 605326 Y NA NA TPO,MYT1L IMR90 Hi-C 24141950 TMEM18 69850 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 739928 740199 740059 Y NA NA TMEM18 MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM18 64489 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr2 857378 857399 857389 Y NA NA NA NA NA NA SNTG2 87155 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 915949 916124 916037 Y NA SNTG2 TPO,SNTG2,MYT1L IMR90 Hi-C 24141950 SNTG2 28430 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 1608037 1608218 1608215 Y NA NA NA NA NA NA PXDN 138406 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 1608919 1609202 1609060 Y PXDN NA NA NA NA NA PXDN 137422 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 1659182 1659769 1659438 Y NA NA NA NA NA NA PXDN 86855 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr2 1661359 1661779 1661556 Y NA NA NA NA NA NA PXDN 84845 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 1676691 1676995 1676843 Y NA NA NA NA NA NA PXDN 69629 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 1715466 1715652 1715559 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 30972 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 1719023 1719384 1719170 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 27240 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 1722150 1722351 1722236 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 24273 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr2 1813532 1813689 1813613 Y NA NA NA NA NA NA PXDN 66908 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 1858495 1858644 1858520 Y MYT1L NA NA NA NA NA PXDN 111871 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 2105199 2105393 2105246 Y MYT1L NA NA NA NA NA MYT1L 227639 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr2 2263242 2263642 2263442 Y NA NA NA NA NA NA MYT1L 69390 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr2 2311871 2312010 2311889 Y NA MYT1L NA NA NA NA MYT1L 21022 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.37787242223771 chr2 2468009 2468259 2468065 Y NA NA NA NA NA NA MYT1L 134977 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr2 2617084 2617480 2617333 Y NA NA NA NA NA NA MYT1L 284052 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.44740060484035 chr2 2746502 2746702 2746633 Y NA NA NA NA NA NA MYT1L 413470 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 2850815 2851100 2850821 Y NA NA NA NA NA NA MYT1L 517783 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 4.03204454205525 chr2 3072634 3072961 3072804 Y NA NA TSSC1 IMR90 Hi-C 24141950 TSSC1 306692 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 3151866 3152164 3152133 Y NA NA TSSC1 IMR90 Hi-C 24141950 TSSC1 227489 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 3352595 3352738 3352719 Y NA TSSC1,TRAPPC12 NA NA NA NA TSSC1 26915 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr2 3483837 3484086 3483869 Y NA ADI1 NA NA NA NA ADI1 37421 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr2 3487019 3487372 3487201 Y NA ADI1 NA NA NA NA ADI1 34135 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr2 3698707 3698801 3698754 Y NA NA NA NA NA NA COLEC11 58281 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 3699787 3700199 3700016 Y NA NA NA NA NA NA COLEC11 59361 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 5680125 5680324 5680162 Y NA NA NA NA NA NA AC108025.2 148926 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr2 6912526 6912690 6912595 Y NA NA NA NA NA NA CMPK2 92076 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 6998422 6998819 6998665 Y RSAD2,CMPK2 CMPK2 NA NA NA NA CMPK2 5947 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 7068069 7068244 7068157 Y NA RNF144A NA NA NA NA RNF144A 12546 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 7081985 7082191 7081999 Y NA RNF144A NA NA NA NA RNF144A 26462 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 7082324 7082720 7082522 Y RNF144A RNF144A NA NA NA NA RNF144A 26801 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 7152754 7152946 7152770 Y NA NA NA NA NA NA RNF144A 97231 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 7191649 7191931 7191786 Y RNF144A NA NA NA NA NA RNF144A 136126 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 8372169 8372224 8372194 Y ID2 NA NA NA NA NA ID2 444751 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 8816590 8817048 8816915 Y NA AC011747.7 NA NA NA NA ID2 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 8927568 8927875 8927735 Y NA KIDINS220 NA NA NA NA KIDINS220 47885 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 9142736 9142998 9142867 Y NA MBOAT2 NA NA NA NA MBOAT2 794 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 9347909 9348072 9347942 Y NA ASAP2 NA NA NA NA ASAP2 3015 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 9411571 9411694 9411610 Y ADAM17 NA NA NA NA NA ASAP2 66677 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 9641378 9641587 9641543 Y NA IAH1 NA NA NA NA IAH1 29591 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 9678248 9678641 9678477 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 15280 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr2 9688603 9688902 9688848 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 5019 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 9816070 9816294 9816134 Y NA YWHAQ YWHAQ,ADAM17 IMR90 Hi-C 24141950 YWHAQ 46927 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 9919638 9919938 9919833 Y NA NA YWHAQ,KLF11,CYS1,ADAM17,GRHL1,RRM2,TAF1B IMR90 Hi-C 24141950 TAF1B 61545 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 10075100 10075410 10075131 Y TAF1B GRHL1 GRHL1 IMR90 Hi-C 24141950 GRHL1 7931 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr2 10258344 10258406 10258377 Y NA RRM2 NA NA NA NA RRM2 2049 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 10260365 10260994 10260486 Y ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2 NA NA NA NA NA RRM2 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 4.34220181452104 chr2 10274411 10274722 10274506 Y TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48 RRM2 NA NA NA NA RRM2 13956 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 10330449 10330626 10330557 Y NA NA NA NA NA NA RRM2 69994 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr2 10341486 10341905 10341708 Y KLF11 NA NA NA NA NA RRM2 81031 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 10471190 10471549 10471320 Y HPCAL1,HPCAL1 HPCAL1 ODC1 IMR90 Hi-C 24141950 HPCAL1 30175 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 10550434 10550795 10550555 Y HPCAL1,HPCAL1 ODC1,RP11-320M2.1 ODC1 IMR90 Hi-C 24141950 ODC1 35835 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr2 10950898 10951279 10951023 Y NA PDIA6 ATP6V1C2 IMR90 Hi-C 24141950 PDIA6 24824 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 11270081 11270242 11270156 Y KCNF1,C2orf50 PQLC3 NA NA NA NA PQLC3 23082 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 11623044 11623914 11623865 Y NA E2F6,GREB1 GREB1,NTSR2,FLJ33534,C2orf50,MIR4429,ROCK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 E2F6 18747 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 11970305 11970612 11970555 Y NA NA NA NA NA NA LPIN1 154584 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 12323357 12323603 12323480 Y NA NA TRIB2 IMR90 Hi-C 24141950 LPIN1 507636 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 14851119 14851133 14851127 Y NA NA NA NA NA NA FAM84A 80309 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 15397207 15397542 15397373 Y DDX1,NBAS NA NA NA NA NA NBAS 301912 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 15446828 15446905 15446867 Y NBAS NA NA NA NA NA NBAS 252549 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 15464031 15464396 15464252 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 235058 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 15561739 15562014 15561765 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 137440 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 15629690 15629929 15629800 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 69525 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 15700375 15700622 15700454 Y DDX1,NBAS NBAS,DDX1 NA NA NA NA NBAS 921 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 15734291 15734400 15734305 Y NBAS,MYCN,DDX1 NBAS,DDX1 NA NA NA NA DDX1 4989 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 15851620 15851962 15851790 Y NBAS NA NA NA NA NA DDX1 122318 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 15966617 15966728 15966673 Y NA RP11-120J4.1 NA NA NA NA RP11-120J4.1 41335 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr2 16014885 16015169 16015155 Y NBAS,DDX1,MYCN RP11-120J4.1 NA NA NA NA RP11-120J4.1 6822 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr2 16028788 16029111 16029019 Y NBAS,DDX1 RP11-120J4.1,MYCN NA NA NA NA RP11-120J4.1 20725 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 16030051 16030242 16030135 Y NBAS,DDX1,MYCN RP11-120J4.1,MYCN NA NA NA NA RP11-120J4.1 21988 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr2 16048221 16048594 16048431 Y NBAS,DDX1 RP11-120J4.1,MYCN,MYCNOS NA NA NA NA MYCN 30092 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 16052794 16053077 16052931 Y NBAS RP11-120J4.1,MYCN,MYCNOS NA NA NA NA MYCN 25609 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 16054729 16054969 16054864 Y NA RP11-120J4.1,MYCN,MYCNOS NA NA NA NA MYCN 23717 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 16067860 16068250 16068057 Y NA MYCN,MYCNOS NA NA NA NA MYCN 10436 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 16084165 16084643 16084249 Y NBAS,DDX1,MYCN MYCN,MYCNOS NA NA NA NA MYCNOS 3794 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr2 16122453 16123200 16122898 Y NBAS,MYCN MYCN,MYCNOS NA NA NA NA MYCNOS 42082 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 11.3724333237456 chr2 16123687 16124268 16124038 Y NBAS,DDX1,MYCN MYCN,MYCNOS NA NA NA NA MYCNOS 43316 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 16124503 16124641 16124550 Y NBAS,DDX1,MYCN MYCN,MYCNOS NA NA NA NA MYCNOS 44132 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr2 16149011 16149377 16149168 Y NBAS NA NA NA NA NA MYCNOS 68640 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 16152892 16153059 16152979 Y NBAS NA NA NA NA NA MYCNOS 72521 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 16219682 16220075 16219855 Y NA NA NA NA NA NA MYCNOS 139311 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 16337116 16337220 16337168 Y MYCN NA NA NA NA NA AC010745.2 66095 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr2 16365312 16365661 16365578 Y NA AC010745.2 NA NA NA NA AC010745.2 37654 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 16404568 16404813 16404655 Y MYCN AC010745.2 NA NA NA NA AC010745.2 1253 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 4.65235908698683 chr2 16420067 16420139 16420088 Y NA AC010745.2 NA NA NA NA AC010745.2 16752 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 16421806 16421992 16421870 Y NA AC010745.2 NA NA NA NA AC010745.2 18491 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 16489272 16489649 16489463 Y NA NA NA NA NA NA AC010745.2 85957 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 16493094 16493437 16493362 Y MYCN NA NA NA NA NA AC010745.2 89779 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr2 16575995 16576348 16576051 Y NA NA NA NA NA NA AC010745.2 172680 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 16576517 16576693 16576605 Y NA NA NA NA NA NA AC010745.2 173202 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 16827046 16827326 16827275 Y FAM49A FAM49A NA NA NA NA FAM49A 18273 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 16835049 16835704 16835307 Y FAM49A FAM49A NA NA NA NA FAM49A 9895 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 16837187 16837623 16837438 Y FAM49A FAM49A NA NA NA NA FAM49A 7976 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 16845411 16845884 16845697 Y FAM49A NA NA NA NA NA FAM49A 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 17005594 17005646 17005620 Y NA NA NA NA NA NA FAM49A 159995 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 17719194 17719451 17719323 Y MSGN1 VSNL1 NA NA NA NA VSNL1 801 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 18811449 18811776 18811476 Y NA NA OSR1,NT5C1B-RDH14 IMR90 Hi-C 24141950 RDH14 71503 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 19547126 19547267 19547173 Y NA OSR1 NA NA NA NA OSR1 9147 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 20176136 20176469 20176303 Y WDR35 WDR35,MATN3 NA NA NA NA WDR35 11423 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 20252703 20252899 20252848 Y NA MATN3,LAPTM4A,RP11-644K8.1 NA NA NA NA RP11-644K8.1 2808 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 20534195 20534238 20534216 Y NA PUM2 NA NA NA NA PUM2 15757 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 20544740 20544866 20544805 Y NA PUM2 PUM2,HS1BP3 IMR90 Hi-C 24141950 PUM2 5129 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr2 20548410 20548604 20548507 Y NA PUM2 HS1BP3,PUM2 IMR90 Hi-C 24141950 PUM2 1391 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 21474623 21474859 21474741 Y NA NA NA NA NA NA C2orf43 453741 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 22707603 22708000 22707760 Y NA NA NA NA NA NA KLHL29 898088 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 23609943 23610311 23610250 Y KLHL29 KLHL29 NA NA NA NA KLHL29 3855 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 23681941 23682000 23681953 Y KLHL29 NA NA NA NA NA KLHL29 75853 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 24234264 24234694 24234378 Y MFSD2B C2orf44,FKBP1B NA NA NA NA C2orf44 35751 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 24324329 24324521 24324426 Y NA SF3B14,TP53I3,PFN4 NA NA NA NA TP53I3 17598 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 24491623 24491942 24491630 Y ATAD2B,NCOA1,ITSN2 NA NA NA NA NA RPL36AP13 63439 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 24580732 24581123 24580905 Y NA RPL36AP13,ITSN2 NA NA NA NA ITSN2 460 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 24713346 24713697 24713476 Y DNAJC27,ITSN2 NCOA1 CENPO,NCOA1 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA1 563 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 24852047 24852369 24852206 Y NA NA NA NA NA NA NCOA1 139264 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 25021346 25021618 25021482 Y NA CENPO,PTRHD1 NA NA NA NA PTRHD1 7095 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 25473699 25473887 25473786 Y EFR3B NA NA NA NA NA DNMT3A 89572 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 25482494 25482888 25482692 Y DNMT3A NA NA NA NA NA DNMT3A 80571 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 25508945 25509154 25508991 Y DNAJC27,DNMT3A NA NA NA NA NA DNMT3A 54305 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 25514055 25514238 25514170 Y NA DNMT3A NA NA NA NA DNMT3A 49221 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 25518028 25518279 25518198 Y DNAJC27,DNMT3A DNMT3A NA NA NA NA DNMT3A 45180 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 25545894 25546051 25546003 Y NA DNMT3A NA NA NA NA DNMT3A 17408 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr2 25554693 25554929 25554813 Y NA DNMT3A NA NA NA NA DNMT3A 8530 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 25781272 25781487 25781393 Y RAB10 NA NA NA NA NA DTNB 113016 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 26184450 26184595 26184522 Y NA KIF3C NA NA NA NA KIF3C 19023 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 26258152 26258567 26258448 Y RAB10 RAB10 NA NA NA NA RAB10 3176 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 26259161 26259559 26259360 Y RAB10 RAB10 NA NA NA NA RAB10 4185 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 26328559 26328812 26328686 Y FAM59B,RAB10 NA NA NA NA NA RAB10 73583 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 26605539 26605826 26605756 Y RAB10 GPR113 NA NA NA NA GPR113 37854 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 27069178 27069486 27069284 Y NA DPYSL5 NA NA NA NA DPYSL5 563 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 27072078 27072262 27072179 Y UCN,CCDC164,OTOF,MAPRE3,DPYSL5 DPYSL5 NA NA NA NA DPYSL5 3463 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.55078636232894 chr2 27194386 27194503 27194476 Y NA MAPRE3 NA NA NA NA MAPRE3 2906 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 27574731 27574755 27574743 Y NA MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3 NA NA NA NA AC074117.10 2358 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 27614467 27614499 27614483 Y EIF2B4,EIF2B4 AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1 NA NA NA NA FTH1P3 233 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 27629706 27629770 27629738 Y NA EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1 NA NA NA NA PPM1G 784 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 27674321 27674677 27674499 Y NA PPM1G,NRBP1,IFT172,FNDC4 NA NA NA NA NRBP1 25664 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 27878874 27879165 27879028 Y SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L NA NA NA NA SLC4A1AP 5173 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 28115961 28116240 28116051 Y NA BRE,RBKS NA NA NA NA RBKS 3996 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 28134368 28134411 28134390 Y NA BRE,RBKS NA NA NA NA RBKS 22403 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 28143450 28143703 28143578 Y FOSL2,RBKS,BRE,BRE BRE,RBKS NA NA NA NA RBKS 31485 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 28179877 28180142 28179961 Y FOSL2,RBKS,BRE,BRE NA NA NA NA NA RBKS 67912 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 28183212 28183402 28183309 Y FOSL2 NA NA NA NA NA RBKS 71247 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 28400759 28401210 28400868 Y RBKS,BRE,BRE,FOSL2 NA NA NA NA NA FOSL2 212105 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 28492228 28492339 28492284 Y NA NA NA NA NA NA FOSL2 120976 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 28492364 28492732 28492561 Y NA NA NA NA NA NA FOSL2 120583 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 28579030 28579220 28579083 Y RBKS,FOSL2 FOSL2 NA NA NA NA FOSL2 34095 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 28589661 28589896 28589794 Y FOSL2 FOSL2 BRE,RBKS,FOSL2,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSL2 23419 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 28953773 28954089 28953931 Y NA PPP1CB PLB1,PPP1CB IMR90 Hi-C 24141950 PPP1CB 18417 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 29050679 29050871 29050775 Y NA TRMT61B NA NA NA NA TRMT61B 40296 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 29075660 29075992 29075826 Y TRMT61B TRMT61B,WDR43 NA NA NA NA TRMT61B 15175 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr2 29173330 29173730 29173529 Y PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43 SNORD53 NA NA NA NA SNORD53 25397 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 29435309 29435425 29435367 Y SPDYA NA NA NA NA NA CLIP4 116738 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 29439591 29440302 29440265 Y NA NA NA NA NA NA CLIP4 121020 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 7.13361726671314 chr2 29485561 29485725 29485698 Y NA NA NA NA NA NA CLIP4 166990 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 29490719 29491008 29490844 Y NA NA NA NA NA NA CLIP4 172148 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 29644170 29644398 29644293 Y NA NA NA NA NA NA CLIP4 325599 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 29674441 29674554 29674498 Y ALK NA NA NA NA NA CLIP4 355870 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 29746427 29746759 29746593 Y ALK NA NA NA NA NA ALK 395673 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 29783332 29783373 29783353 Y NA NA NA NA NA NA ALK 359059 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 29836771 29837012 29836869 Y ALK NA NA NA NA NA ALK 305420 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr2 29870290 29870662 29870408 Y ALK NA NA NA NA NA ALK 271770 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 29888370 29888705 29888625 Y ALK NA NA NA NA NA ALK 253727 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 30063514 30063882 30063849 Y NA NA NA NA NA NA ALK 78550 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 30107746 30108130 30108067 Y ALK ALK NA NA NA NA ALK 34302 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 30489009 30489377 30489252 Y YPEL5 LBH NA NA NA NA LBH 36612 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 30631915 30632243 30632028 Y LBH LCLAT1 LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LCLAT1 35849 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 30704285 30704557 30704478 Y NA LCLAT1 NA NA NA NA LCLAT1 36193 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 30788063 30788262 30788163 Y NA NA NA NA NA NA LCLAT1 119971 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 30791728 30792075 30791902 Y NA NA NA NA NA NA LCLAT1 123636 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 32166229 32166498 32166237 Y NA NA NA NA NA NA MEMO1 67801 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 33383509 33383834 33383717 Y FAM98A NA NA NA NA NA LTBP1 213470 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 33441691 33441836 33441744 Y LTBP1 NA NA NA NA NA LTBP1 271652 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 33863068 33863290 33863179 Y NA FAM98A NA NA NA NA FAM98A 40619 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 36599325 36599532 36599405 Y NA CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 18256 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 36712578 36712925 36712822 Y CRIM1,FEZ2 NA NA NA NA NA CRIM1 131509 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 36761840 36762400 36762263 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 108830 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 36790527 36791707 36791646 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 79523 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr2 36795570 36795942 36795825 Y FEZ2 NA NA NA NA NA FEZ2 75288 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 37103475 37103824 37103655 Y NA NA NA NA NA NA STRN 87791 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 37116938 37117262 37117216 Y NA NA NA NA NA NA STRN 74353 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 37308622 37308977 37308800 Y NA HEATR5B NA NA NA NA HEATR5B 508 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 37383262 37383336 37383288 Y NA EIF2AK2,AC007390.4 NA NA NA NA EIF2AK2 1054 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 37497492 37497655 37497574 Y HEATR5B CEBPZ NA NA NA NA CEBPZ 40636 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 37592833 37593153 37593092 Y NA PRKD3,QPCT NA NA NA NA QPCT 23116 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 37763462 37763512 37763507 Y FAM82A1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA QPCT 193745 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 37852383 37852553 37852466 Y EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 111058 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 37868257 37868517 37868387 Y EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 95094 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 37880894 37881162 37881056 Y EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 82449 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr2 37883470 37883595 37883540 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP3 80016 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 37897080 37897760 37897461 Y QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 65851 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 38315585 38315885 38315608 Y CDC42EP3,CYP1B1 NA CYP1B1 MCF7 ChIA-PET 22265404 RPL7P12 140825 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 38417790 38418062 38417924 Y CYP1B1 RPL7P12 NA NA NA NA RPL7P12 38648 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 39078847 39079086 39078967 Y NA DHX57,MORN2 NA NA NA NA DHX57 21989 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 39079289 39079498 39079407 Y SRSF7,ARHGEF33 DHX57,MORN2 NA NA NA NA DHX57 21577 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr2 39334876 39335293 39335230 Y NA SOS1 NA NA NA NA SOS1 14193 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr2 39665108 39665339 39665266 Y NA AC007246.3,MAP4K3 NA NA NA NA MAP4K3 2655 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 39722003 39722381 39722147 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K3 59550 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 40608600 40608944 40608858 Y NA NA NA NA NA NA SLC8A1 227249 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 40662022 40662435 40662315 Y NA NA LOC100128590 IMR90 Hi-C 24141950 SLC8A1 173758 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 40943671 40944072 40943872 Y NA NA NA NA NA NA SLC8A1 107478 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 42053679 42053991 42053965 Y PKDCC NA NA NA NA NA PKDCC 219169 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 42161610 42162017 42161892 Y NA NA NA NA NA NA PKDCC 111143 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 42182061 42182670 42182320 Y PKDCC NA NA NA NA NA PKDCC 90490 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr2 42194638 42194757 42194709 Y NA NA C2orf91 IMR90 Hi-C 24141950 PKDCC 78403 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 42360195 42360705 42360352 Y EML4 EML4 EML4,COX7A2L,LOC388942 IMR90 Hi-C 24141950 EML4 33785 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr2 42368874 42369229 42369001 Y EML4 EML4 EML4,LOC388942,C2orf91,COX7A2L IMR90 Hi-C 24141950 EML4 25261 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 42412542 42412681 42412587 Y NA EML4 NA NA NA NA EML4 18052 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 42481657 42481775 42481735 Y EML4 NA NA NA NA NA EML4 87167 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 42535809 42536204 42535901 Y NA NA COX7A2L IMR90 Hi-C 24141950 COX7A2L 114024 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 42567305 42567366 42567336 Y EML4 NA NA NA NA NA COX7A2L 82862 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 42696554 42696964 42696742 Y NA COX7A2L,KCNG3,MTA3 NA NA NA NA KCNG3 22273 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 43023531 43023735 43023679 Y NA NA NA NA NA NA AC025750.7 264949 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 43037224 43037999 43037611 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC025750.7 278642 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr2 43038629 43038924 43038876 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO,PLEKHH2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC025750.7 280047 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr2 43269026 43269323 43269208 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 182425 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 43310956 43311104 43311039 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 140644 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 43327979 43328013 43327996 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L2 123735 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 43396497 43396745 43396689 Y OXER1,ZFP36L2 NA LOC100129726,ZFP36L2,THADA IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 55003 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 43494611 43494821 43494751 Y NA ZFP36L2 NA NA NA NA ZFP36L2 42863 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 43532128 43532543 43532333 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZFP36L2 80380 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 43647114 43647287 43647224 Y NA NA LOC100129726,ZFP36L2 MCF7 ChIA-PET 22265404 THADA 173898 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 43692800 43693176 43692988 Y NA NA NA NA NA NA THADA 128009 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 43908548 43908922 43908739 Y PLEKHH2 PLEKHH2 NA NA NA NA PLEKHH2 46136 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 44007303 44007575 44007439 Y NA DYNC2LI1 NA NA NA NA DYNC2LI1 8125 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 44212195 44212421 44212308 Y NA LRPPRC NA NA NA NA LRPPRC 8723 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 44849210 44849529 44849370 Y NA NA NA NA NA NA CAMKMT 262121 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 44944979 44944991 44944986 Y NA NA NA NA NA NA RP11-89K21.1 219347 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 45161073 45161475 45161220 Y SIX3 RP11-89K21.1,SIX3,SIX3-AS1 NA NA NA NA RP11-89K21.1 2863 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 45177079 45177275 45177123 Y NA RP11-89K21.1,SIX3,SIX3-AS1,AC012354.8 NA NA NA NA SIX3-AS1 10067 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 45955611 45956065 45955689 Y NA NA NA NA NA NA PRKCE 79127 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 46100592 46100616 46100604 Y NA NA NA NA NA NA PRKCE 224108 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 46212455 46212485 46212471 Y PRKCE NA NA NA NA NA EPAS1 306321 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 46265425 46265774 46265513 Y NA NA NA NA NA NA EPAS1 253032 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 46303554 46303874 46303714 Y NA NA NA NA NA NA EPAS1 214932 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr2 46525633 46526278 46526263 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 6827 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr2 46536857 46537129 46536993 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 18051 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 46542843 46542999 46542890 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 24037 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 46561811 46562247 46561970 Y SOCS5,SOCS5 EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 43005 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 46825586 46825695 46825639 Y NA CRIPT,PIGF NA NA NA NA CRIPT 15860 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 46928465 46928698 46928588 Y MCFD2,MCFD2,SOCS5,SOCS5 SOCS5 NA NA NA NA SOCS5 4374 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 46997897 46997963 46997932 Y MCFD2,MCFD2,SOCS5,SOCS5 NA NA NA NA NA SOCS5 73806 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 47214273 47214540 47214407 Y NA MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 47279 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 47229826 47230084 47229931 Y TTC7A NA NA NA NA NA MCFD2 62832 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr2 47284732 47284905 47284823 Y TTC7A,MCFD2 NA NA NA NA NA CALM2 116835 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 47296749 47297008 47296937 Y NA NA NA NA NA NA CALM2 104732 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 47306951 47307378 47307182 Y NA NA NA NA NA NA CALM2 94362 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 47526778 47526800 47526792 Y KCNK12 AC073283.4 TTC7A,CALM2,MCFD2,C2orf61,EPCAM IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC073283.4 43413 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 48559553 48559778 48559608 Y FOXN2 FOXN2,RNU4-49P NA NA NA NA RNU4-49P 6187 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 50267276 50267578 50267576 Y NA NA NA NA NA NA AC007560.1 787238 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 50631357 50631742 50631589 Y NRXN1 NA NA NA NA NA AC007560.1 423074 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 50951878 50951957 50951935 Y NA NA NA NA NA NA AC007560.1 102859 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 51010628 51010803 51010737 Y NRXN1,NRXN1 AC007560.1 NA NA NA NA AC007560.1 44013 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 51065604 51065768 51065686 Y NA AC007560.1 NA NA NA NA AC007560.1 10788 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 52975138 52975144 52975141 Y NA NA NA NA NA NA CHAC2 1017785 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 54196339 54196842 54196524 Y ASB3,ASB3,PSME4 ACYP2,PSME4 NA NA NA NA PSME4 362 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 54751942 54752182 54752042 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 70520 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 54786900 54787386 54787056 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 105478 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 54787503 54787764 54787623 Y RTN4,SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 106081 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr2 54845847 54845943 54845895 Y NA NA NA NA NA NA EML6 102693 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 54967479 54967831 54967651 Y NA EML6 NA NA NA NA EML6 18843 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 54971761 54972012 54971777 Y NA EML6 NA NA NA NA EML6 23125 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr2 55212013 55212317 55212165 Y CCDC88A NA NA NA NA NA RTN4 125440 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 55248216 55248544 55248355 Y NA NA NA NA NA NA RTN4 89213 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 55346891 55347057 55346962 Y NA RTN4 RTN4,EML6,C2orf63 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RTN4 9134 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 55349627 55349798 55349713 Y CCDC88A RTN4 RTN4,C2orf63,EML6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RTN4 11870 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 55450545 55450658 55450592 Y CCDC88A,EML6,RTN4 RPS27A,MTIF2 NA NA NA NA RPS27A 6381 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 55767070 55767336 55767332 Y NA CCDC104 NA NA NA NA CCDC104 22330 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 57861899 57862248 57862095 Y NA NA NA NA NA NA VRK2 270538 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 58384642 58384701 58384672 Y NA NA NA NA NA NA FANCL 81806 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 59983827 59983888 59983858 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-32P 625852 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 60228228 60228402 60228315 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-32P 381338 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 60694019 60694324 60694172 Y BCL11A NA NA NA NA NA RNU1-32P 84279 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 60694839 60695290 60695042 Y PAPOLG,BCL11A NA NA NA NA NA BCL11A 83412 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr2 60696747 60696946 60696847 Y REL NA NA NA NA NA BCL11A 81756 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 60711222 60711498 60711369 Y REL NA NA NA NA NA BCL11A 67204 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 60747849 60747913 60747881 Y PEX13,BCL11A BCL11A NA NA NA NA BCL11A 30789 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 60757464 60757761 60757646 Y NA BCL11A NA NA NA NA BCL11A 20941 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr2 60776650 60777166 60776879 Y REL,BCL11A BCL11A NA NA NA NA BCL11A 1536 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 60778604 60778787 60778696 Y REL,BCL11A NA NA NA NA NA BCL11A 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 60779041 60779656 60779263 Y REL,BCL11A BCL11A NA NA NA NA BCL11A 339 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 60962204 60962802 60962781 Y NA PAPOLG NA NA NA NA PAPOLG 18563 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 61464355 61464721 61464539 Y NA NA NA NA NA NA AHSA2 61802 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 61466894 61467158 61467026 Y NA NA NA NA NA NA AHSA2 64341 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 61580039 61580318 61580309 Y NA NA NA NA NA NA USP34 115586 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 61748471 61748954 61748828 Y NA XPO1 NA NA NA NA XPO1 14807 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 61766465 61766637 61766569 Y AHSA2,USP34 XPO1 NA NA NA NA XPO1 2704 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 61916176 61916324 61916236 Y NA NA FAM161A,XPO1 IMR90 Hi-C 24141950 XPO1 152415 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 61921641 61922071 61921953 Y NA NA NA NA NA NA FAM161A 157207 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 61990946 61991094 61991044 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 88184 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 87618 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.48125817972631 chr2 62386116 62386510 62386313 Y NA B3GNT2 NA NA NA NA B3GNT2 34738 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 62536871 62537441 62537187 Y NA NA COMMD1 IMR90 Hi-C 24141950 B3GNT2 115623 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 63023345 63023597 63023471 Y NA NA NA NA NA NA EHBP1 124359 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 63129477 63129780 63129501 Y NA NA NA NA NA NA EHBP1 230491 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 63452850 63453196 63453026 Y NA NA NA NA NA NA MDH1 360547 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 63633298 63633304 63633301 Y OTX1 NA NA NA NA NA MDH1 180439 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 64239166 64239247 64239208 Y PELI1 VPS54 NA NA NA NA VPS54 4959 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 64245195 64245602 64245370 Y NA VPS54 NA NA NA NA VPS54 989 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 64364775 64365257 64365170 Y NA AC074289.1,PELI1 NA NA NA NA AC074289.1 3116 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 64367846 64368162 64368149 Y NA AC074289.1,PELI1 NA NA NA NA AC074289.1 211 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 64756167 64756526 64756224 Y NA AFTPH NA NA NA NA AFTPH 6702 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 64821728 64822106 64821796 Y SLC1A4,PELI1 NA NA NA NA NA AFTPH 72263 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 64836549 64836646 64836605 Y SLC1A4,PELI1,SERTAD2,AFTPH NA NA NA NA NA AFTPH 87084 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 64879120 64879608 64879340 Y NA NA LOC339807 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 96531 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 64957479 64957902 64957679 Y NA SERTAD2 SERTAD2,AFTPH,LOC339807 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 18237 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 64978173 64978610 64978385 Y CEP68 SERTAD2 SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 2034 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr2 64994926 64995226 64995021 Y SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 18787 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr2 64995321 64996019 64995711 Y SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 19182 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 64998040 64998317 64998210 Y NA SERTAD2 SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 21901 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 65089781 65090129 65089916 Y AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 113642 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 65173308 65173867 65173558 Y AFTPH,SERTAD2 SLC1A4 SERTAD2,AFTPH,LOC339807,LOC400958,SLC1A4,CEP68,ACTR2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC1A4 39744 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 65303160 65303240 65303200 Y SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A CEP68 NA NA NA NA CEP68 21660 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 65326595 65326952 65326834 Y NA CEP68,RAB1A NA NA NA NA RAB1A 28288 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 65328578 65328848 65328754 Y NA CEP68,RAB1A NA NA NA NA RAB1A 26392 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 65656801 65657217 65657146 Y NA SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 554 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 65657861 65658229 65658008 Y SLC1A4,SPRED2,SPRED2 SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 90 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.65417211981754 chr2 65849750 65849939 65849914 Y NA NA MEIS1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED2 191979 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 66673073 66673647 66673570 Y NA MEIS1,MEIS1-AS3 NA NA NA NA MEIS1-AS3 14471 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 66804515 66804719 66804617 Y MEIS1 NA NA NA NA NA MEIS1-AS3 145913 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.44740060484035 chr2 67883850 67884178 67884174 Y NA NA MEIS1 IMR90 Hi-C 24141950 ETAA1 261399 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 68278313 68278683 68278526 Y NA NA NA NA NA NA C1D 57397 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 68472906 68473226 68473141 Y PPP3R1 PPP3R1 NA NA NA NA PPP3R1 8143 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr2 68544914 68545935 68545552 Y CNRIP1 NA NA NA NA NA CNRIP1 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 68651029 68651566 68651417 Y PROKR1,FBXO48,APLF,PLEK FBXO48,APLF NA NA NA NA FBXO48 40824 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 69250610 69250802 69250769 Y NA ANTXR1 NA NA NA NA ANTXR1 12300 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 69857892 69858266 69858093 Y NA ANXA4,AAK1 NA NA NA NA ANXA4 11291 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 70141198 70141461 70141241 Y NA SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA MXD1 18378 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 70145725 70146134 70145771 Y NA SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA MXD1 22905 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 70154281 70154743 70154417 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA MXD1 31461 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 70212443 70213458 70213040 Y PCBP1,MXD1,ASPRV1 ASPRV1 NA NA NA NA ASPRV1 25046 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 70226911 70227071 70226991 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 ASPRV1 NA NA NA NA ASPRV1 39514 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 70273102 70273420 70273221 Y GMCL1,MXD1,ASPRV1,PCBP1 PCBP1,PCBP1-AS1 NA NA NA NA PCBP1 39165 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 70296121 70296604 70296392 Y GMCL1,MXD1,ASPRV1,C2orf42,PCBP1 PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA PCBP1 15981 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 70350372 70350687 70350608 Y NA PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 22689 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 70608938 70609447 70609175 Y TGFA NA NA NA NA NA FAM136A 81716 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 70823866 70823963 70823915 Y TGFA TGFA NA NA NA NA TGFA 44541 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 71129017 71129173 71129049 Y NA VAX2 NA NA NA NA VAX2 3297 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 71704588 71704899 71704719 Y NAGK,DYSF NA NA NA NA NA ZNF638 202897 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 72732418 72732763 72732614 Y NA NA NA NA NA NA EXOC6B 318407 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 73613683 73613856 73613817 Y DUSP11,ALMS1 ALMS1 NA NA NA NA ALMS1 2797 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr2 73774930 73775287 73775109 Y NA NA NA NA NA NA ALMS1 164044 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 74237302 74237493 74237398 Y NA DGUOK-AS1,AC073046.25,TET3 DGUOK IMR90 Hi-C 24141950 TET3 9462 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 74446656 74447054 74446868 Y NA MOB1A,MTHFD2 NA NA NA NA MTHFD2 22967 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 74722835 74723021 74722928 Y NA INO80B,WBP1,MOGS,MRPL53,TTC31,CCDC142,PCGF1,TLX2,HTRA2,AUP1 NA NA NA NA PCGF1 10686 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 74765672 74765911 74765792 Y WBP1,LBX2,LOXL3,DOK1 PCGF1,TLX2,HTRA2,AUP1,DOK1,LOXL3 NA NA NA NA DOK1 8242 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 74766124 74766334 74766228 Y NA PCGF1,TLX2,HTRA2,AUP1,DOK1,LOXL3 NA NA NA NA DOK1 7819 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 74778065 74778079 74778072 Y NA PCGF1,TLX2,HTRA2,AUP1,DOK1,LOXL3 NA NA NA NA LOXL3 2738 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 74815492 74815667 74815580 Y NA DOK1,LOXL3 AUP1,TTC31,LBX2,CCDC142,TLX2,LOC151534,DQX1,MRPL53,LOXL3,PCGF1,HTRA2,DOK1 IMR90 Hi-C 24141950 LOXL3 34675 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 74982664 74982814 74982739 Y NA AC007387.2 HK2,SEMA4F,LOXL3 IMR90 Hi-C 24141950 AC007387.2 2718 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 75043732 75043824 75043778 Y NA HK2 HK2,SEMA4F IMR90 Hi-C 24141950 HK2 15284 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 75063027 75063135 75063034 Y HK2 HK2 NA NA NA NA HK2 3919 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 75072652 75072899 75072736 Y HK2 HK2 NA NA NA NA HK2 13544 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 75114636 75114786 75114714 Y NA NA NA NA NA NA HK2 55528 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 75141745 75142080 75142074 Y NA POLE4 NA NA NA NA POLE4 41539 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 75172635 75172664 75172650 Y NA POLE4 POLE4,TACR1,HK2 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 POLE4 10955 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 75894065 75894458 75894192 Y NA MRPL19,GCFC2 NA NA NA NA MRPL19 22156 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 75912574 75912759 75912685 Y NA MRPL19,GCFC2 NA NA NA NA GCFC2 23356 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 79787220 79787231 79787226 Y NA NA NA NA NA NA CTNNA2 376863 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 80016891 80017267 80017079 Y NA NA NA NA NA NA AC016716.1 370994 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 80419252 80419386 80419319 Y NA AC016716.1 NA NA NA NA AC016716.1 30991 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 80511562 80511761 80511662 Y NA LRRTM1 NA NA NA NA LRRTM1 18113 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 84683355 84683532 84683444 Y NA SUCLG1 NA NA NA NA SUCLG1 1637 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 85567649 85568034 85567918 Y NA TGOLN2,ELMOD3,RETSAT TGOLN2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ELMOD3 11483 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 85664544 85665596 85664830 Y KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6 NA NA NA NA NA RETSAT 84801 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr2 85673142 85673285 85673214 Y NA NA NA NA NA NA MAT2A 91003 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr2 85764802 85765239 85764815 Y SH2D6,USP39 MAT2A,GGCX,VAMP5 NA NA NA NA MAT2A 514 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr2 85887180 85887589 85887391 Y SH2D6,SFTPB C2orf68 NA NA NA NA C2orf68 49991 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 85969500 85969917 85969748 Y VAMP5,TMEM150A,ATOH8 RNU1-38P,ATOH8 ATOH8,POLR1A,USP39,C2orf68,SFTPB,LOC284950,ST3GAL5,LOC90784,PTCD3 IMR90 Hi-C 24141950 ATOH8 6550 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 86102907 86103036 86102912 Y NA ST3GAL5,AC105053.4 NA NA NA NA ST3GAL5 11101 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 86113603 86114063 86113862 Y CAPG,GNLY,ST3GAL5 ST3GAL5,AC105053.4 LOC284950 IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL5 74 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 86120990 86121249 86121122 Y NA ST3GAL5,AC105053.4 ST3GAL5,POLR1A IMR90 Hi-C 24141950 AC105053.4 6587 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 86224309 86224458 86224357 Y NA NA NA NA NA NA POLR1A 106820 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 86284876 86285205 86285126 Y NA POLR1A,PTCD3 NA NA NA NA POLR1A 46073 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 86388217 86388607 86388413 Y NA SNORD94,IMMT,MRPL35 NA NA NA NA SNORD94 27224 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 86722014 86722392 86722297 Y RMND5A NA NA NA NA NA KDM3A 56244 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 86722974 86723324 86723287 Y NA NA NA NA NA NA KDM3A 57204 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr2 86761300 86761347 86761323 Y REEP1,REEP1 NA NA NA NA NA RNF103 87642 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 87019569 87019949 87019758 Y CD8B,CD8A,CD8A NA NA NA NA NA CHMP3,RNF103-CHMP3 73324 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 87036674 87037618 87036781 Y CD8A,CD8A,CD8B NA NA NA NA NA CHMP3,RNF103-CHMP3 90429 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 88353539 88354148 88353800 Y KRCC1 RNU2-63P,KRCC1 NA NA NA NA KRCC1 291 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 88923115 88923478 88923431 Y NA EIF2AK3 NA NA NA NA EIF2AK3 1616 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 90485310 90485405 90485339 Y NA NA NA NA NA NA IGKV1D-27 479633 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 91759872 91760090 91759934 Y NA NA NA NA NA NA IGKV1D-27 1754195 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr2 91815672 91815808 91815787 Y NA NA NA NA NA NA IGKV1D-27 1809995 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 91821438 91821799 91821741 Y NA NA NA NA NA NA IGKV1D-27 1815761 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr2 91936197 91936406 91936290 Y NA NA NA NA NA NA IGKV1D-27 1930520 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 96077364 96077399 96077382 Y NA FAHD2A NA NA NA NA FAHD2A 10895 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 96995983 96996007 96995995 Y ITPRIPL1,ITPRIPL1 SNRNP200,AC021188.4,ITPRIPL1,NCAPH NA NA NA NA NCAPH 3518 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 97557375 97557484 97557475 Y NA ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C NA NA NA NA SEMA4C 22881 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 98598628 98598759 98598694 Y NA TMEM131 NA NA NA NA TMEM131 11629 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 98822932 98823207 98823080 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 212544 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 99085276 99085461 99085369 Y NA INPP4A COA5,UNC50 IMR90 Hi-C 24141950 INPP4A 25959 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 99551773 99552038 99551906 Y NA NA NA NA NA NA C2orf15 203910 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 100082054 100082282 100082201 Y NA REV1 NA NA NA NA REV1 22215 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 100104968 100105518 100105262 Y REV1 REV1 NA NA NA NA REV1 471 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 100814245 100814421 100814304 Y NA NA AFF3 IMR90 Hi-C 24141950 CHST10 217697 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 101010496 101010959 101010820 Y AFF3 CHST10 NA NA NA NA CHST10 21159 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 101922226 101922443 101922331 Y NA SNORD89,RNF149 NA NA NA NA RNF149 720 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 101922561 101923216 101923063 Y NA SNORD89 NA NA NA NA RNF149 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 101923239 101923757 101923472 Y RPL31,MAP4K4,MAP4K4,RNF149 SNORD89,RNF149 NA NA NA NA RNF149 76 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 102333492 102333834 102333706 Y IL1R1,RNF149,IL1R2,MAP4K4,MAP4K4 MAP4K4 NA NA NA NA MAP4K4 22180 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 102353138 102353817 102353456 Y IL1R1,RNF149,MAP4K4,MAP4K4 MAP4K4 NA NA NA NA MAP4K4 41826 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 102380179 102380656 102380455 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K4 68867 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 102382879 102383094 102382925 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K4 71567 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 102399741 102400097 102399970 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K4 88429 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 102478902 102479140 102479043 Y MAP4K4,MAP4K4 NA NA NA NA NA MAP4K4 167590 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 104425071 104425142 104425107 Y NA NA NA NA NA NA AC018880.2 186983 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 104503960 104504175 104504043 Y NA NA NA NA NA NA AC018880.2 265872 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 105489803 105490153 105490078 Y GPR45,POU3F3 NA NA NA NA NA MRPS9 162288 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 105655685 105655967 105655739 Y NA MRPS9 NA NA NA NA MRPS9 3244 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 105764311 105764500 105764406 Y NA AC104655.3 GPR45,MRPS9 IMR90 Hi-C 24141950 AC104655.3 5740 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 106370571 106370808 106370750 Y TGFBRAP1,C2orf49,NCK2 NCK2 NA NA NA NA NCK2 11217 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 106551669 106551989 106551685 Y NCK2 NA C2orf40 IMR90 Hi-C 24141950 C2orf40 125713 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 109506497 109506716 109506551 Y LIMS1,CCDC138,EDAR NA NA NA NA NA CCDC138 105284 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 109514642 109514975 109514799 Y NA NA NA NA NA NA CCDC138 113429 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 110319562 110319852 110319693 Y NA SEPT10 NA NA NA NA SEPT10 49931 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 110859077 110859497 110859213 Y NA MALL NA NA NA NA MALL 12646 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 111874507 111874890 111874668 Y NA BCL2L11 NA NA NA NA BCL2L11 65 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 111879046 111879315 111879118 Y NA BCL2L11 NA NA NA NA BCL2L11 4091 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 113008998 113009283 113009141 Y ZC3H6 ZC3H8,ZC3H6 NA NA NA NA ZC3H8 1430 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 113058633 113059002 113058901 Y NA ZC3H8,ZC3H6 NA NA NA NA ZC3H6 27462 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 113341105 113341247 113341152 Y POLR1B POLR1B,CHCHD5,AC079922.2 NA NA NA NA CHCHD5 1288 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 114469366 114469830 114469722 Y SLC35F5 MIR4782,SLC35F5 NA NA NA NA MIR4782 7115 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 114616401 114616618 114616536 Y CBWD2,ACTR3 ACTR3 ACTR3,SLC35F5 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTR3 28919 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 118578074 118578451 118578195 Y CCDC93,DDX18 DDX18 NA NA NA NA DDX18 7848 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 118740185 118740994 118740898 Y DDX18,CCDC93 CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 28715 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 119697641 119697888 119697716 Y DBI NA NA NA NA NA STEAP3 281496 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 120891923 120892273 120892121 Y NA NA NA NA NA NA TMEM185B 86711 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 120905923 120906046 120905986 Y EPB41L5,EPB41L5 NA NA NA NA NA TMEM185B 72938 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 121495235 121495636 121495561 Y NA GLI2 GLI2 IMR90 Hi-C 24141950 GLI2 4036 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 121585967 121586372 121586071 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 94768 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 121614859 121615272 121615044 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 123660 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr2 121650745 121651146 121650942 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 159546 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 122298770 122299123 122298947 Y NA RNU4ATAC NA NA NA NA RNU4ATAC 12313 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 127824493 127824859 127824771 Y MAP3K2,IWS1,BIN1 BIN1 NA NA NA NA BIN1 38072 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 127838302 127838430 127838354 Y MAP3K2 BIN1 NA NA NA NA BIN1 24501 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 127862933 127863341 127863123 Y NA BIN1 NA NA NA NA BIN1 2 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr2 127863441 127863795 127863513 Y NA BIN1 NA NA NA NA BIN1 510 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr2 128090505 128090721 128090714 Y NA ERCC3 NA NA NA NA ERCC3 40753 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 128258405 128258697 128258648 Y NA RNU4-48P,IWS1 NA NA NA NA IWS1 23765 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 128469057 128469300 128469179 Y NA LIMS2,SFT2D3 NA NA NA NA SFT2D3 12460 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 128562322 128562673 128562571 Y NA WDR33 LIMS2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR33 4088 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr2 128598749 128599093 128599053 Y IWS1,SFT2D3,AMMECR1L WDR33,POLR2D NA NA NA NA POLR2D 14638 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 129073927 129074235 129074112 Y NA NA NA NA NA NA HS6ST1 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 131148815 131149203 131148908 Y FAM123C,FAM123C,FAM123C,CCDC115,PTPN18 PTPN18 NA NA NA NA PTPN18 37235 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 131149333 131149678 131149410 Y FAM123C,FAM123C,FAM123C PTPN18 NA NA NA NA PTPN18 37753 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr2 131485043 131485533 131485339 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF4 106956 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr2 131555592 131555820 131555689 Y CCDC115 ARHGEF4 PLEKHB2,FAM168B K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ARHGEF4 36669 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 131828545 131828813 131828794 Y NA FAM168B,PLEKHB2 NA NA NA NA FAM168B 20220 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 131863489 131864378 131863990 Y PLEKHB2 FAM168B,PLEKHB2 NA NA NA NA PLEKHB2 3069 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 132182653 132182963 132182773 Y NA NA NA NA NA NA MZT2A 65353 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 132995001 132995176 132995089 Y NA NA NA NA NA NA LYPD1 431976 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 133304410 133304432 133304421 Y NA NA LYPD1 IMR90 Hi-C 24141950 LYPD1 122720 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 134878523 134878632 134878609 Y MGAT5 MGAT5 NA NA NA NA MGAT5 2969 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 134878887 134879265 134878997 Y NA MGAT5 NA NA NA NA MGAT5 3333 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 135054765 135054954 135054860 Y MGAT5 NA NA NA NA NA MGAT5 179211 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 135701216 135701448 135701313 Y NA CCNT2,CCNT2-AS1 NA NA NA NA CCNT2-AS1 26936 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 136242341 136242686 136242514 Y NA ZRANB3,R3HDM1 NA NA NA NA ZRANB3 44120 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 136268329 136268541 136268430 Y NA ZRANB3,R3HDM1 NA NA NA NA ZRANB3 18265 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 136632932 136633416 136633308 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 MCM6 NA NA NA NA MCM6 936 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 137511013 137511026 137511020 Y NA THSD7B NA NA NA NA THSD7B 10089 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 137755829 137756118 137755974 Y NA NA NA NA NA NA THSD7B 234714 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 138052194 138052549 138052372 Y THSD7B NA NA NA NA NA THSD7B 531079 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 138059421 138059750 138059540 Y NA NA NA NA NA NA THSD7B 538306 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr2 138825307 138825392 138825350 Y NA NA NA NA NA NA HNMT 105717 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 139260506 139260990 139260920 Y SPOPL AC097721.2,SPOPL NA NA NA NA SPOPL 3135 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 139289140 139289372 139289256 Y NA AC097721.2,SPOPL NA NA NA NA SPOPL 31769 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 140977991 140978216 140978106 Y NA NA NA NA NA NA SPOPL 1720620 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 142874625 142874987 142874896 Y LRP1B NA NA NA NA NA GTDC1 2213148 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 144470370 144470652 144470511 Y NA NA NA NA NA NA GTDC1 617483 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 144499811 144499873 144499842 Y NA NA NA NA NA NA GTDC1 588262 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 144769205 144769351 144769311 Y GTDC1,GTDC1 NA NA NA NA NA GTDC1 318784 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 145212298 145212826 145212615 Y GTDC1,GTDC1,GTDC1,ZEB2 NA NA NA NA NA ZEB2 67321 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 145338212 145338608 145338410 Y NA NA ZEB2 K562 ChIA-PET 22265404 ZEB2 58065 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 148671388 148671433 148671412 Y ORC4,ORC4,ORC4,ORC4,ORC4 NA NA NA NA NA ACVR2A 71302 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 149403654 149404182 149403820 Y NA EPC2 NA NA NA NA EPC2 3645 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr2 149633974 149634183 149633979 Y NA KIF5C NA NA NA NA KIF5C 3155 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 149634441 149634782 149634502 Y KIF5C KIF5C NA NA NA NA KIF5C 3622 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr2 149645940 149646152 149646140 Y KIF5C KIF5C NA NA NA NA KIF5C 15121 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 149819679 149819759 149819686 Y KIF5C NA NA NA NA NA LYPD6B 72862 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 150314581 150314916 150314749 Y NA NA NA NA NA NA AC144449.1 126794 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 151323622 151323873 151323744 Y NA NA NA NA NA NA RND3 69652 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 151536085 151536156 151536124 Y RND3 NA RBM43,RND3 IMR90 Hi-C 24141950 RND3 142560 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 151768299 151768310 151768305 Y NA NA RND3 IMR90 Hi-C 24141950 RBM43 348083 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 152159553 152159620 152159604 Y TNFAIP6 RBM43,NMI RBM43,NMI,TNFAIP6,RIF1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NMI 14982 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 152899445 152899713 152899562 Y NA NA NA NA NA NA STAM2 130793 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 153450651 153451105 153450977 Y PRPF40A NA NA NA NA NA ARL6IP6 121302 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 153599082 153599296 153599189 Y NA ARL6IP6,PRPF40A NA NA NA NA PRPF40A 26571 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 154729073 154729474 154729153 Y NA GALNT13 NA NA NA NA GALNT13 2647 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 156548736 156548859 156548817 Y NA NA NA NA NA NA NR4A2 648001 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 157257270 157257340 157257305 Y NA GPD2 NR4A2,GALNT5,GPD2 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GPD2 32462 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 157659765 157659881 157659802 Y NA NA NA NA NA NA GPD2 369963 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr2 158673009 158673352 158673181 Y NA NA NA NA NA NA ACVR1 57022 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 159853491 159853713 159853657 Y NA TANC1 NA NA NA NA TANC1 30345 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 159908773 159909006 159908845 Y NA NA NA NA NA NA TANC1 85627 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 159994086 159994676 159994284 Y NA NA NA NA NA NA WDSUB1 146634 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 160106082 160106269 160106215 Y MARCH7 WDSUB1 NA NA NA NA WDSUB1 35041 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 160219490 160219798 160219643 Y MARCH7,CD302 NA NA NA NA NA WDSUB1 78180 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 160470388 160470776 160470715 Y NA AC009506.1,BAZ2B NA NA NA NA BAZ2B 427 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 161098241 161098623 161098428 Y ITGB6 NA TANK,ITGB6,RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4785 163770 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 161141907 161142179 161141926 Y NA NA NA NA NA NA MIR4785 120214 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 161155946 161156394 161156280 Y NA NA NA NA NA NA MIR4785 105999 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 161201536 161201707 161201641 Y NA NA NA NA NA NA MIR4785 60686 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 161208357 161208687 161208675 Y NA NA NA NA NA NA MIR4785 53706 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 161244338 161244737 161244615 Y NA MIR4785 NA NA NA NA MIR4785 17656 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 161607616 161608069 161607675 Y TANK,TANK NA RBMS1,ITGB6 IMR90 Hi-C 24141950 RBMS1 259311 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 162094289 162094955 162094372 Y NA NA NA NA NA NA PSMD14 67594 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 162197345 162197490 162197464 Y NA PSMD14,AC009299.5 NA NA NA NA AC009299.5 1508 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr2 165430240 165430431 165430256 Y NA GRB14 NA NA NA NA GRB14 45927 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 165766653 165766876 165766835 Y SLC38A11,COBLL1 NA NA NA NA NA GRB14 290295 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 166161416 166161745 166161474 Y SCN2A,SCN2A NA NA NA NA NA SCN2A 67504 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 166462925 166463090 166463060 Y TTC21B,SCN3A,SCN2A,CSRNP3,CSRNP3 NA NA NA NA NA CSRNP3 138768 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 166491383 166491530 166491513 Y NA NA NA NA NA NA CSRNP3 167226 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 166705742 166705996 166705870 Y NA NA NA NA NA NA TTC21B 102357 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 166779898 166780276 166780103 Y NA TTC21B NA NA NA NA TTC21B 28077 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 166842018 166842187 166842119 Y NA TTC21B NA NA NA NA TTC21B 33665 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 168291941 168292335 168292012 Y B3GALT1 NA NA NA NA NA AC074363.1 144260 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 168858571 168859104 168858832 Y NA NA NA NA NA NA STK39 243547 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 168911148 168911462 168911308 Y NA NA NA NA NA NA STK39 191189 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 169058014 169058040 169058027 Y B3GALT1 STK39 NA NA NA NA STK39 44611 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 169409032 169409398 169409117 Y NA NA NA NA NA NA CERS6 98660 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 169434382 169434732 169434541 Y NA NA NA NA NA NA CERS6 124010 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 170573146 170573520 170573335 Y NA PHOSPHO2,KLHL23 NA NA NA NA KLHL23 24148 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 170684911 170685465 170685124 Y PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3 SSB,METTL5,UBR3 NA NA NA NA UBR3 2943 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr2 171786835 171787228 171786978 Y TLK1 GORASP2 NA NA NA NA GORASP2 3861 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 171830049 171830396 171830113 Y NA GORASP2 NA NA NA NA GORASP2 47075 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 171977769 171978174 171977980 Y NA NA NA NA NA NA TLK1 107650 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 172628972 172629294 172629196 Y NA NA NA NA NA NA DYNC1I2 87053 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 172649817 172649933 172649875 Y NA NA NA NA NA NA DYNC1I2 107898 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 172693152 172693396 172693274 Y NA NA NA NA NA NA HAT1 83562 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 173063327 173063488 173063398 Y NA NA ITGA6 IMR90 Hi-C 24141950 DLX2 97699 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 173796243 173796588 173796342 Y NA NA NA NA NA NA RAPGEF4 198241 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 173827595 173827793 173827718 Y ZAK NA NA NA NA NA RAPGEF4 229593 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 173876038 173876102 173876070 Y NA NA NA NA NA NA RAPGEF4 278036 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 174007383 174007707 174007544 Y ZAK NA NA NA NA NA CDCA7 209841 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 174776201 174776462 174776332 Y NA NA NA NA NA NA SP3 51968 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 174800246 174800560 174800554 Y NA SP3 NA NA NA NA SP3 27870 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 174889919 174890381 174890067 Y NA NA SP3,OLA1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP3 61489 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 175085975 175086128 175086062 Y NA OLA1 NA NA NA NA OLA1 25298 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 175248509 175248787 175248661 Y SP3,SP3 CIR1,SCRN3 NA NA NA NA CIR1 9656 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 175459812 175460479 175460357 Y CIR1,GPR155,WIPF1 NA NA NA NA NA WIPF1 85165 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 175465107 175465494 175465405 Y CIR1,WIPF1 NA NA NA NA NA WIPF1 80150 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 175529164 175529469 175529254 Y NA WIPF1 NA NA NA NA WIPF1 16175 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 175540530 175540594 175540562 Y CIR1,GPR155,WIPF1,WIPF1 WIPF1,H3F3AP4 NA NA NA NA WIPF1 5050 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 175708423 175708587 175708507 Y NA NA NA NA NA NA H3F3AP4 125918 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr2 175762241 175762347 175762322 Y NA NA NA NA NA NA CHN1 105750 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 176866139 176866392 176866261 Y KIAA1715 KIAA1715 NA NA NA NA KIAA1715 572 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr2 177047108 177047317 177047213 Y NA HOXD3,HOXD-AS2,HOXD4,AC009336.24,HOXD-AS1,AC016739.2 NA NA NA NA HOXD-AS1 4369 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 177419249 177419407 177419328 Y NA NA HOXD-AS1,HOXD1,HOXD4,MIR10B,HOXD-AS2,HOXD8 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01117 81031 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 177518737 177518933 177518835 Y NA LINC01117,LINC01116 HOXD10,HOXD11,HOXD8,HOXD-AS2,HOXD9,HOXD4,MIR10B IMR90 Hi-C 24141950 LINC01116 18078 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 177530948 177531117 177531033 Y NA LINC01117,LINC01116 HOXD-AS1,HOXD1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01116 30289 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 178030162 178030520 178030353 Y NFE2L2 HNRNPA3,AC079305.8 HOXD-AS2,LOC100130691,AGPS,PDE11A,NFE2L2,HNRNPA3,TTC30A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HNRNPA3 44771 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 178104644 178105169 178104872 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10 NA NA NA NA MIR3128 13569 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 178261376 178261686 178261570 Y NA AGPS,AC074286.1,NFE2L2 NA NA NA NA NFE2L2 5951 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 179471296 179471384 179471314 Y TTN NA NA NA NA NA TTN-AS1 87386 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 179692765 179693175 179692935 Y NA NA NA NA NA NA TTN-AS1 308855 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 180585338 180585678 180585637 Y ZNF385B,ZNF385B NA NA NA NA NA ZNF385B 138554 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 182284297 182284552 182284389 Y NA ITGA4 NA NA NA NA ITGA4 35377 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 183877830 183878146 183878099 Y NA NCKAP1 NA NA NA NA NCKAP1 23440 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 183950583 183950613 183950599 Y NA NCKAP1,DUSP19,NUP35 NA NA NA NA DUSP19 9296 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 185499442 185500071 185499458 Y NA ZNF804A NA NA NA NA ZNF804A 38349 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 186638782 186639016 186638929 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 709867 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 186785756 186786079 186786020 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 562804 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 187015061 187015446 187015349 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 333437 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 187194208 187194220 187194214 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 154663 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 187263813 187264095 187263899 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 84788 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 187455745 187456210 187455889 Y NA ITGAV NA NA NA NA ITGAV 2953 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 187601377 187601405 187601389 Y ZSWIM2,FAM171B FAM171B NA NA NA NA FAM171B 44679 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 188414787 188415077 188415012 Y NA TFPI NA NA NA NA TFPI 13410 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 189168145 189168606 189168510 Y NA GULP1 NA NA NA NA GULP1 13749 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 189391407 189391613 189391501 Y GULP1 NA NA NA NA NA GULP1 237011 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 190235497 190235832 190235693 Y NA NA COL5A2,GULP1 IMR90 Hi-C 24141950 WDR75 68327 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 190244640 190245037 190244845 Y NA NA COL5A2,GULP1 IMR90 Hi-C 24141950 WDR75 59122 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 190324760 190324912 190324838 Y NA WDR75 NA NA NA NA WDR75 20601 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 190729809 190730106 190729887 Y OSGEPL1,PMS1 C2orf88 NA NA NA NA C2orf88 12229 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 190739432 190739578 190739518 Y NA C2orf88 NA NA NA NA C2orf88 2757 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 191075616 191075973 191075872 Y NA NA NA NA NA NA INPP1 130223 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr2 191104181 191104357 191104269 Y NA NA NA NA NA NA INPP1 101839 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 191416774 191417126 191416837 Y MFSD6,TMEM194B TMEM194B NA NA NA NA TMEM194B 19326 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 191709790 191710154 191709972 Y STAT4,NAB1,STAT1,GLS GLS,AC005540.3 GLS,STAT1,NAB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLS 33399 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 191814146 191814507 191814301 Y STAT1 AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 41786 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 191815156 191815612 191815322 Y GLS AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 40681 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr2 191825811 191826187 191826065 Y NAB1,GLS,STAT1 AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 30106 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 192071077 192071476 192071425 Y STAT4 MYO1B MYO1B,STAT4 IMR90 Hi-C 24141950 MYO1B 36435 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 192123995 192124097 192124046 Y NA MYO1B NA NA NA NA MYO1B 16084 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 192489815 192490209 192490062 Y STAT4,OBFC2A NA OBFC2A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDPR 219772 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 193054279 193054640 193054459 Y NA TMEFF2 NA NA NA NA TMEFF2 3795 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 194142383 194142416 194142400 Y NA NA NA NA NA NA TMEFF2 1083948 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 196531201 196531576 196531334 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A10 92500 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 196617949 196618273 196617953 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A10 179248 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 197023417 197023933 197023871 Y NA STK17B NA NA NA NA STK17B 15294 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 197097649 197097961 197097892 Y NA AC020571.3 NA NA NA NA AC020571.3 24787 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 197104380 197104716 197104446 Y STK17B AC020571.3 NA NA NA NA AC020571.3 18032 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 197466180 197466534 197466307 Y NA HECW2,CCDC150 CCDC150,HECW2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HECW2 9764 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 197779870 197780287 197779995 Y NA PGAP1 NA NA NA NA PGAP1 10233 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 197787148 197787421 197787192 Y NA PGAP1 NA NA NA NA PGAP1 3099 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 197818777 197818924 197818851 Y NA PGAP1 PGAP1,ANKRD44 IMR90 Hi-C 24141950 PGAP1 28257 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 197895243 197895319 197895281 Y NA NA NA NA NA NA PGAP1 104723 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 197936511 197936873 197936784 Y NA NA NA NA NA NA PGAP1 145991 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 197962665 197962866 197962743 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G2P3 162969 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 198024213 198024664 198024538 Y SF3B1,COQ10B NA NA NA NA NA ATP5G2P3 101171 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 198112714 198113044 198112879 Y NA ATP5G2P3 NA NA NA NA ATP5G2P3 12791 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr2 198144443 198144693 198144592 Y NA ATP5G2P3,ANKRD44 NA NA NA NA ATP5G2P3 18608 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 198158784 198159350 198159060 Y SF3B1,MOBKL3,MOBKL3,MOBKL3,COQ10B,ANKRD44 ATP5G2P3,ANKRD44 NA NA NA NA ANKRD44 14547 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 198350765 198350931 198350852 Y NA COQ10B,HSPE1,MOB4,HSPD1 NA NA NA NA HSPE1 11787 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 198774163 198774487 198774325 Y NA NA NA NA NA NA PLCL1 106737 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 199565057 199565374 199565265 Y NA NA NA NA NA NA SATB2 768615 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 200470477 200470965 200470826 Y NA NA NA NA NA NA SATB2 136488 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 200800298 200800427 200800328 Y SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69 C2orf69,C2orf47,TYW5 NA NA NA NA C2orf47 17613 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 200912605 200912617 200912611 Y NA NA SPATS2L,KCTD18 IMR90 Hi-C 24141950 TYW5 94146 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 201238754 201239056 201238905 Y NA NA NA NA NA NA SPATS2L 70150 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 201411222 201411458 201411252 Y PPIL3,NIF3L1,NIF3L1,SGOL2 SGOL2,KCTD18,AOX1 NA NA NA NA KCTD18 28715 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 201777095 201777270 201777183 Y FAM126B,CFLAR,CFLAR CLK1,PPIL3,NIF3L1,ORC2 NA NA NA NA NIF3L1 25045 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 201829288 201829721 201829590 Y KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2 ORC2 NA NA NA NA ORC2 2885 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 201989489 201990098 201989672 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 10662 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 202079360 202079680 202079556 Y CLK1,CLK1,CFLAR,CASP10 NA NA NA NA NA CFLAR 100533 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 202109391 202109622 202109507 Y NA NA NA NA NA NA CFLAR 130564 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 202302698 202302857 202302778 Y FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR TRAK2 NA NA NA NA TRAK2 11445 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 202560879 202561324 202561082 Y NA NA NA NA NA NA TMEM237 54586 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 202831820 202832017 202831920 Y ALS2 NA CDK15,NOP58,FZD7,ALS2,SUMO1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V1P11 144549 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 202898182 202898685 202898353 Y TMEM237,FZD7 NA NA NA NA NA PSMA2P3 143335 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr2 203090268 203090335 203090273 Y NA PSMA2P3,DAZAP2P1,SUMO1,NOP58 NA NA NA NA SUMO1 10996 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 203292079 203292309 203292231 Y NA NA NA NA NA NA BMPR2 52420 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 203341668 203341778 203341723 Y NA NA NA NA NA NA BMPR2 102009 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 203935433 203935668 203935572 Y NBEAL1 NA NA NA NA NA NBEAL1 57831 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 204311629 204311925 204311741 Y NBEAL1,CYP20A1,ABI2 NA NA NA NA NA RAPH1 86208 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 204315265 204315638 204315451 Y NA NA NA NA NA NA RAPH1 82495 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 204861490 204861668 204861580 Y CD28,CTLA4,ICOS NA NA NA NA NA RAPH1 463357 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 204887951 204888087 204888015 Y CD28,CTLA4,ICOS NA NRP2 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 489818 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 205836059 205836159 205836109 Y NA NA NA NA NA NA PARD3B 427543 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 206005178 206005232 206005204 Y NA NA NA NA NA NA NRP2 539482 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 206563648 206564168 206563856 Y INO80D NRP2 NA NA NA NA NRP2 18934 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 206935678 206936046 206935862 Y NA AC007383.3,INO80D NA NA NA NA AC007383.3 11283 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 206944485 206944991 206944704 Y NA AC007383.3,INO80D NA NA NA NA AC007383.3 2338 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 206948392 206948813 206948647 Y NA AC007383.3,INO80D NA NA NA NA INO80D 214 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr2 207348794 207348941 207348896 Y NA ADAM23 NA NA NA NA ADAM23 42531 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 207981292 207981447 207981370 Y NA KLF7 NA NA NA NA KLF7 48544 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 208007936 208008436 208008192 Y METTL21A,METTL21A,KLF7,CREB1 KLF7 NA NA NA NA KLF7 21555 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 208016492 208017045 208016857 Y CREB1 KLF7 NA NA NA NA KLF7 12946 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 208027980 208028625 208028335 Y CREB1,KLF7 KLF7 NA NA NA NA KLF7 1366 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 208028732 208029438 208029179 Y METTL21A,CREB1,KLF7 KLF7 NA NA NA NA KLF7 553 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 208395422 208395980 208395659 Y PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1 CREB1,AC007879.5 NA NA NA NA AC007879.5 2903 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr2 210429278 210429418 210429290 Y MAP2,MAP2 NA NA NA NA NA MAP2 142496 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 210547424 210547820 210547680 Y MAP2,MAP2,UNC80 NA NA NA NA NA UNC80 86897 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 210580281 210580584 210580403 Y NA NA NA NA NA NA UNC80 54133 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 210872654 210873081 210872784 Y C2orf67 RPE NA NA NA NA RPE 7365 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr2 210937153 210937376 210937265 Y NA NA NA NA NA NA RPE 71864 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 213400949 213401339 213401014 Y ERBB4 ERBB4 NA NA NA NA ERBB4 226 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 216216233 216216482 216216439 Y NA ATIC NA NA NA NA ATIC 41693 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 216222058 216222324 216222191 Y FN1 ATIC NA NA NA NA ATIC 47518 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 216224117 216224404 216224261 Y NA ATIC NA NA NA NA ATIC 49577 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 216325420 216325734 216325606 Y NA FN1 LOC646324,FN1 IMR90 Hi-C 24141950 FN1 26525 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 216483720 216484034 216483877 Y NA NA NA NA NA NA FN1 184825 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 216698635 216698894 216698754 Y NA NA NA NA NA NA MREG 197925 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 216847055 216847597 216847305 Y NA MREG NA NA NA NA MREG 49222 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 216865894 216866240 216866102 Y TMEM169,PECR,MREG MREG NA NA NA NA MREG 30579 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 216870818 216871425 216871006 Y NA MREG NA NA NA NA MREG 25394 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 216948718 216948931 216948849 Y NA TMEM169,PECR,XRCC5 NA NA NA NA PECR 3040 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 217312390 217312696 217312543 Y NA SMARCAL1,RPL37A,AC098820.3 NA NA NA NA SMARCAL1 37253 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 217501395 217501614 217501574 Y NA PSMB3P2,IGFBP2 NA NA NA NA IGFBP2 5844 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 217556283 217557311 217557110 Y NA IGFBP5 NA NA NA NA AC007563.5 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 217557565 217558269 217557956 Y NA AC007563.5 NA NA NA NA IGFBP5 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 217715639 217715697 217715668 Y NA NA NA NA NA NA IGFBP5 157391 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 217725896 217726248 217726076 Y NA NA NA NA NA NA IGFBP5 167648 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 218113105 218113304 218113205 Y NA NA DIRC3,IGFBP5,IGFBP2,TNP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DIRC3 506012 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 218258363 218258761 218258688 Y NA NA NA NA NA NA DIRC3 360555 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 218571910 218572214 218572013 Y NA DIRC3 NA NA NA NA DIRC3 47102 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 218701196 218701490 218701305 Y NA NA NA NA NA NA DIRC3 81880 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 218782937 218783199 218783125 Y NA NA NA NA NA NA TNS1 82519 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 218793134 218793717 218793417 Y TMBIM1,SLC11A1,PNKD,ARPC2,ARPC2 NA NA NA NA NA TNS1 72001 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 218857857 218858115 218857951 Y NA TNS1 TNS1,RUFY4 IMR90 Hi-C 24141950 TNS1 7603 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 218880725 218880838 218880786 Y NA TNS1 TNS1 IMR90 Hi-C 24141950 TNS1 15007 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 219270976 219271406 219271230 Y CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1 CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 9997 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr2 219271996 219272374 219272308 Y USP37 CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 11017 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 219336861 219337006 219336933 Y NA NA NA NA NA NA CTDSP1 75882 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 219434664 219435146 219434778 Y USP37 USP37,RQCD1,PLCD4 NA NA NA NA RQCD1 3361 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 219773515 219774011 219773826 Y USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A CDK5R2 NA NA NA NA CDK5R2 48366 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.86094363479473 chr2 219774108 219774202 219774159 Y USP37,TTLL4,NHEJ1,ANKZF1,ANKZF1 CDK5R2 NA NA NA NA CDK5R2 48175 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 219827943 219828258 219828078 Y USP37,STK36,PTPRN,PTPRN,CDK5R2,FEV CDK5R2,FEV,AC097468.4 NA NA NA NA CDK5R2 5566 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.65417211981754 chr2 219861860 219861953 219861873 Y USP37,ZNF142,FEV,CRYBA2,CRYBA2 CDK5R2,FEV,AC097468.4,CCDC108 NA NA NA NA AC097468.4 2984 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 219862366 219862575 219862480 Y FEV CDK5R2,FEV,AC097468.4,CCDC108 NA NA NA NA AC097468.4 2362 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 220376290 220376386 220376338 Y ATG9A,DNPEP,STK11IP GMPPA,TMEM198,CHPF NA NA NA NA GMPPA 14701 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 220385870 220386219 220385945 Y ACCN4 GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1 NA NA NA NA TMEM198 20166 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 220400310 220400471 220400469 Y NA GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1 NA NA NA NA TMEM198 5914 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 220460061 220460205 220460133 Y NA OBSL1,STK11IP,SLC4A3 NA NA NA NA STK11IP 377 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 221802042 221802413 221802264 Y NA NA NA NA NA NA EPHA4 634509 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 222826690 222827411 222827014 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 AC010980.2 353583 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 223170887 223171031 223170916 Y NA AC010980.2 NA NA NA NA AC010980.2 9963 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 223429708 223429962 223429836 Y FARSB NA NA NA NA NA FARSB 89094 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 223447202 223447309 223447256 Y NA NA NA NA NA NA FARSB 71747 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 223462160 223462364 223462326 Y NA NA NA NA NA NA FARSB 56692 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 223776983 223777159 223777060 Y SGPP2 NA NA NA NA NA ACSL3 53331 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 223829237 223829437 223829324 Y NA NA NA NA NA NA KCNE4 85095 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 224761528 224761781 224761678 Y WDFY1 WDFY1 NA NA NA NA WDFY1 46323 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 224774056 224774145 224774098 Y WDFY1 WDFY1,MRPL44 NA NA NA NA WDFY1 33959 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 225392496 225392764 225392746 Y NA NA NA NA NA NA CUL3 55346 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 225782519 225782936 225782741 Y DOCK10 NA NA NA NA NA DOCK10 122226 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 225905656 225906528 225906251 Y CUL3,DOCK10 DOCK10 NA NA NA NA DOCK10 494 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 227656309 227656561 227656437 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 5914 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr2 227665859 227666449 227665964 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 3384 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 228437239 228437625 228437329 Y NA NA NA NA NA NA AGFG1 102371 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 231276384 231276790 231276706 Y NA SP100 NA NA NA NA SP100 1867 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 232277113 232277443 232277206 Y C2orf72 B3GNT7,SNORD82 NA NA NA NA B3GNT7 18859 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 232330093 232330255 232330170 Y NA SNORD82,NCL,LINC00471 NA NA NA NA SNORD82 6942 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 232468888 232470128 232469532 Y DIS3L2,PTMA,NMUR1 NA NA NA NA NA LINC00471 91838 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.48125817972631 chr2 232470282 232470477 232470427 Y NA NA NA NA NA NA LINC00471 93232 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 232478392 232478857 232478528 Y DIS3L2,PTMA NA NA NA NA NA PTMA 90748 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 232478879 232479328 232479053 Y NA NA NA NA NA NA PTMA 90277 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr2 232507409 232507767 232507481 Y NA NA PDE6D IMR90 Hi-C 24141950 PTMA 61838 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 232530920 232531416 232531295 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 38189 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 232531704 232531853 232531745 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 37752 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 232542757 232542767 232542764 Y NA PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 26838 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 232545684 232546083 232545868 Y COPS7B PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 23522 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr2 232551717 232552221 232552147 Y NPPC PTMA PTMA,PDE6D K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTMA 17384 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 232582048 232582308 232582138 Y NCL,PTMA PTMA NA NA NA NA PTMA 12443 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 232840477 232840577 232840527 Y DIS3L2 DIS3L2 NA NA NA NA DIS3L2 16522 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 233654871 233654934 233654903 Y NA NA NA NA NA NA C2orf82 65046 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 234411221 234411336 234411279 Y NA NA NA NA NA NA USP40 62092 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 234630754 234630813 234630784 Y NA NA NA NA NA NA HJURP 130399 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 235244091 235244800 235244645 Y ARL4C NA SPP2,ARL4C IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 158897 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 235388083 235388436 235388365 Y NA ARL4C NA NA NA NA ARL4C 15261 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 235399360 235399773 235399533 Y ARL4C ARL4C NA NA NA NA ARL4C 3924 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 235732390 235732720 235732555 Y NA NA SH3BP4,TRPM8 IMR90 Hi-C 24141950 SH3BP4 125897 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 235872484 235872869 235872649 Y NA SH3BP4 NA NA NA NA SH3BP4 13867 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 235959667 235960159 235959834 Y NA NA NA NA NA NA SH3BP4 101050 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr2 236299191 236299376 236299366 Y NA NA AGAP1 IMR90 Hi-C 24141950 AGAP1 101357 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 236453392 236453640 236453439 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 52659 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 236489079 236489125 236489102 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 88346 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 236547901 236548387 236548201 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 147168 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 236552972 236553189 236553098 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 152239 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 236586407 236586717 236586603 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 185674 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 237247429 237247691 237247614 Y IQCA1 NA NA NA NA NA GBX2 172417 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 237482983 237483115 237483021 Y NA NA NA NA NA NA GBX2 407971 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 237765492 237765769 237765631 Y NA NA NA NA NA NA COPS8 226186 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 237933842 237934085 237933935 Y NA NA CXCR7,IQCA1,ASB18 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 COPS8 57870 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 237992319 237992330 237992325 Y NA COPS8,AC105760.2 NA NA NA NA AC105760.2 130 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 238016795 238017153 238016975 Y NA COPS8,AC105760.2 NA NA NA NA AC105760.2 24335 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 238018538 238018666 238018550 Y NA COPS8,AC105760.2 NA NA NA NA AC105760.2 26078 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr2 238036930 238037258 238037105 Y NA COPS8,AC105760.2 COPS8,COL6A3,MLPH,PRLH,RAB17,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 44470 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 238038460 238038824 238038818 Y NA COPS8,AC105760.2 COPS8,COL6A3,MLPH,PRLH,RAB17,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 46000 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr2 238066036 238066584 238066320 Y MLPH,COL6A3 NA COL6A3,COPS8,MLPH,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 73576 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 238223884 238224369 238224058 Y COL6A3 NA NA NA NA NA COL6A3 96649 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 238582267 238582825 238582560 Y LRRFIP1 LRRFIP1 NA NA NA NA LRRFIP1 48048 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 238585463 238585872 238585569 Y LRRFIP1 NA NA NA NA NA LRRFIP1 51244 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 238611190 238611575 238611206 Y LRRFIP1 NA NA NA NA NA LRRFIP1 76971 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 238694351 238694559 238694455 Y NA NA NA NA NA NA RAMP1 70977 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 238779455 238779579 238779499 Y RAMP1 RAMP1 NA NA NA NA RAMP1 13919 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 238795312 238795637 238795485 Y LRRFIP1,UBE2F,RAMP1 RAMP1 NA NA NA NA RAMP1 29776 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr2 238807318 238807662 238807419 Y PER2,ILKAP,ESPNL,UBE2F,RAMP1 RAMP1 NA NA NA NA RAMP1 41782 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 238810877 238811153 238811015 Y NA RAMP1 NA NA NA NA RAMP1 45341 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 238832423 238832667 238832502 Y NA UBE2F NA NA NA NA UBE2F 40802 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 238854258 238854421 238854312 Y NA UBE2F ILKAP,RBM44,UBE2F-SCLY,RAMP1,RAB17,LRRFIP1,KLHL30,ESPNL,HES6,LOC643387,LOC151174,PER2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2F 19048 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 238968617 238969014 238968782 Y NA SCLY NA NA NA NA SCLY 1087 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 239085902 239086198 239086162 Y NA FAM132B,ILKAP NA NA NA NA FAM132B 20279 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 239108088 239108227 239108158 Y ILKAP FAM132B,ILKAP,HES6 NA NA NA NA ILKAP 2143 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 239767893 239768141 239768017 Y NA NA NA NA NA NA ASB1 434510 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 239779123 239779526 239779330 Y TWIST2 NA NA NA NA NA ASB1 445740 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 239968226 239968465 239968347 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 352665 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 240080723 240081253 240081085 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 239877 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr2 240144176 240144295 240144274 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 176835 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 240196933 240197336 240197049 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 123794 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 240238754 240239047 240238989 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 82083 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 240267449 240267666 240267577 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 53464 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 240291335 240291754 240291620 Y HDAC4 AC062017.1,HDAC4 NA NA NA NA AC062017.1 29376 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 240854377 240854983 240854483 Y NA NA LOC150935,MIR4786 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFA10 107836 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 240920223 240920529 240920311 Y NA NDUFA10 NA NA NA NA NDUFA10 42290 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 241431316 241431521 241431419 Y NA NA NA NA NA NA GPC1 58228 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 241719064 241719393 241719333 Y KIF1A KIF1A NA NA NA NA KIF1A 38332 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr2 241719463 241720148 241720097 Y ANKMY1,AQP12B,AQP12A,KIF1A KIF1A NA NA NA NA KIF1A 37577 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 241771658 241772038 241771862 Y KIF1A KIF1A ANKMY1,RNPEPL1,CAPN10,KIF1A,C2orf54,SNED1,PASK,HDLBP,ANO7,PPP1R7 IMR90 Hi-C 24141950 KIF1A 13933 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 241856097 241856248 241856111 Y GPC1,RNPEPL1,SNED1 NA LOC200772,SNED1,MTERFD2 IMR90 Hi-C 24141950 SNED1 80007 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 242030281 242030580 242030300 Y SNED1,PASK MTERFD2 NA NA NA NA MTERFD2 9167 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 242262018 242262304 242262161 Y NA SEPT2,HDLBP,FARP2 NA NA NA NA HDLBP 7542 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 242267084 242267405 242267274 Y MTERFD2 SEPT2,HDLBP,FARP2 NA NA NA NA HDLBP 12608 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 242304310 242304654 242304483 Y FARP2 HDLBP,FARP2 NA NA NA NA FARP2 10652 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr2 242365047 242365293 242365170 Y NA NA NA NA NA NA FARP2 71389 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 242425566 242425726 242425646 Y NA STK25 NA NA NA NA STK25 21419 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 242484648 242485001 242484705 Y NA STK25,BOK NA NA NA NA BOK 11135 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 242698564 242698745 242698671 Y THAP4,ATG4B,PDCD1,D2HGDH D2HGDH NA NA NA NA D2HGDH 26570 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 242702443 242702859 242702736 Y ATG4B,PDCD1,D2HGDH D2HGDH NA NA NA NA D2HGDH 30449 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 242703403 242703714 242703570 Y ATG4B,D2HGDH D2HGDH NA NA NA NA D2HGDH 31409 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 242714145 242714474 242714395 Y NEU4,D2HGDH,GAL3ST2 D2HGDH NA NA NA NA D2HGDH 42151 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 242791150 242791474 242791404 Y NA AC131097.3 NA NA NA NA AC131097.3 30040 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr2 242805912 242805984 242805949 Y ATG4B,ING5,GAL3ST2,PDCD1 AC131097.3 PDCD1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 AC131097.3 15530 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr2 242911452 242911734 242911512 Y NA NA LOC728323 IMR90 Hi-C 24141950 AC131097.3 89938 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 290672 290826 290757 Y SOX12,NRSN2 C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4 NA NA NA NA SOX12 13381 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr20 290991 291448 291293 Y C20orf54 C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4 NA NA NA NA SOX12 12759 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 321375 321752 321587 Y NA ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3 NA NA NA NA NRSN2 3674 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 453687 453779 453733 Y NA TBC1D20 NA NA NA NA TBC1D20 12490 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 478652 479003 478850 Y NA TBC1D20,CSNK2A1 NA NA NA NA TBC1D20 37455 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 483361 483443 483402 Y NA TBC1D20,CSNK2A1 NA NA NA NA CSNK2A1 39022 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 652993 653392 653352 Y NA SRXN1,SCRT2 NA NA NA NA SCRT2 1431 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 1168274 1168908 1168417 Y NA TMEM74B NA NA NA NA TMEM74B 4215 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr20 1258531 1258969 1258603 Y NA SNPH FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495 IMR90 Hi-C 24141950 SNPH 13571 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 1332285 1332772 1332374 Y C20orf46,SDCBP2 FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 39034 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 1333597 1333845 1333762 Y NA FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 37961 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 1338546 1338920 1338732 Y NA FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 32886 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 1372569 1372994 1372930 Y PSMF1,SDCBP2,SIRPB2,SIRPB1 FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 763 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 1757792 1758093 1758078 Y NA NA NA NA NA NA NSFL1C 305305 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 1838179 1838365 1838258 Y SIRPB2,SIRPA NA NA NA NA NA STK35 241892 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 1842464 1842590 1842566 Y NA NA NA NA NA NA STK35 237667 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 1943238 1943441 1943340 Y NA NA NA NA NA NA STK35 136816 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 2329862 2330147 2330005 Y SIRPA,SIRPA,SIRPA NA NA NA NA NA SNORD119 111536 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 2450025 2450398 2450237 Y NA SNORD119,SNRPB NA NA NA NA SNRPB 526 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 2771027 2771047 2771039 Y NA CPXM1,VPS16 NA NA NA NA CPXM1 8236 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 2780319 2780470 2780455 Y NA CPXM1,VPS16 NA NA NA NA CPXM1 1036 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 2802059 2802221 2802148 Y CPXM1 CPXM1,VPS16,PTPRA NA NA NA NA VPS16 17128 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 2812856 2812910 2812883 Y NA CPXM1,VPS16,PTPRA NA NA NA NA VPS16 6439 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 2964753 2965068 2964761 Y NA NA NA NA NA NA MRPS26 59523 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 3159596 3159937 3159912 Y PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194 FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA NA NA NA NA UBOX5 20754 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 3394210 3394590 3394400 Y OXT,AVP C20orf194 C20orf194,ATRN IMR90 Hi-C 24141950 C20orf194 7938 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 3472887 3473113 3473000 Y NA ATRN NA NA NA NA ATRN 23200 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr20 3932717 3933076 3932937 Y NA NA MIR103B2,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF24 61153 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr20 4431092 4431240 4431215 Y NA NA ADRA1D IMR90 Hi-C 24141950 RPS4XP2 177625 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 4906233 4906312 4906273 Y RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2 NA NA NA NA NA SNORA31 58603 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 4942791 4943059 4943002 Y RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2 SLC23A2 NA NA NA NA SLC23A2 45880 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 4970261 4970448 4970382 Y NA SLC23A2 RASSF2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC23A2 18491 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 5079708 5080023 5079866 Y NA PCNA,CDS2 NA NA NA NA PCNA 25249 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 5512444 5512652 5512587 Y CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1 NA NA NA NA NA GPCPD1 77020 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 5553446 5553705 5553635 Y NA GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 35967 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 5589880 5590681 5590650 Y CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 208 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr20 5639559 5639832 5639740 Y PROKR2,GPCPD1,TRMT6 GPCPD1 C20orf196,GPCPD1,TRMT6 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 49887 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 5739573 5739619 5739595 Y PROKR2 C20orf196 NA NA NA NA C20orf196 10534 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 5741425 5741673 5741600 Y NA C20orf196 NA NA NA NA C20orf196 12386 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 7967671 7967684 7967678 Y NA TMX4 NA NA NA NA TMX4 30792 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 7978054 7978163 7978110 Y NA TMX4 NA NA NA NA TMX4 20313 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 7998924 7999176 7999047 Y NA TMX4 NA NA NA NA TMX4 448 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 8173456 8173854 8173482 Y NA NA NA NA NA NA PLCB1 62632 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 8210701 8210953 8210827 Y NA NA NA NA NA NA PLCB1 99877 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr20 8380615 8380981 8380808 Y PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 269791 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 8412863 8413194 8412910 Y TMX4,PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 302039 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr20 8435134 8435511 8435284 Y PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 324310 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 8437471 8437869 8437556 Y PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 326647 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 8464613 8464952 8464618 Y PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 353789 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr20 8737014 8737369 8737294 Y NA NA NA NA NA NA PLCB4 310041 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 9065873 9065924 9065899 Y NA PLCB4 NA NA NA NA PLCB4 18463 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 9254416 9254452 9254434 Y PLCB4,PLCB4,PLCB4 NA NA NA NA NA PLCB4 207006 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 9291356 9291748 9291412 Y NA NA NA NA NA NA LAMP5 201257 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 9384292 9384675 9384295 Y PLCB4,PLCB4,PLCB4 NA NA NA NA NA LAMP5 108330 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 9476940 9477296 9477117 Y PLCB4,PLCB4,PLCB4 LAMP5 NA NA NA NA LAMP5 15709 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr20 9479194 9479413 9479304 Y NA LAMP5 NA NA NA NA LAMP5 13592 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 9733190 9733588 9733389 Y NA NA NA NA NA NA PAK7 84101 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 9789585 9790002 9789798 Y NA PAK7 NA NA NA NA PAK7 27687 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 9859892 9860224 9860058 Y NA PAK7 PAK7 IMR90 Hi-C 24141950 PAK7 42203 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 10224599 10224683 10224625 Y NA SNAP25 NA NA NA NA SNAP25 27121 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr20 10299398 10299502 10299451 Y MKKS NA NA NA NA NA SNAP25 101920 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr20 10466571 10466854 10466711 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 53701 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 10471502 10471750 10471599 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 58632 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 10482481 10482747 10482670 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 69611 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 10573634 10573815 10573748 Y NA NA JAG1 IMR90 Hi-C 24141950 JAG1 51199 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 10585324 10585599 10585462 Y NA JAG1 NA NA NA NA JAG1 39415 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 13311967 13312338 13312291 Y NA NA NA NA NA NA TASP1 305249 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 13434936 13435260 13435184 Y NA NA NA NA NA NA TASP1 182327 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 13473886 13474103 13473974 Y NA NA NA NA NA NA TASP1 143484 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 13705752 13706023 13705888 Y NA NA NA NA NA NA ESF1 57509 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 17554539 17554936 17554702 Y NA DSTN NA NA NA NA DSTN 6031 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 17557154 17557457 17557241 Y NA DSTN NA NA NA NA DSTN 8646 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 17593106 17593506 17593263 Y NA DSTN NA NA NA NA DSTN 44598 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 17637776 17637930 17637851 Y BANF2 RRBP1 NA NA NA NA RRBP1 23010 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 17644857 17645185 17645058 Y NA RRBP1 NA NA NA NA RRBP1 15755 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 17946136 17946538 17946496 Y SNX5,SNX5 SNORD17,SNX5,PTMAP3 NA NA NA NA SNX5 1085 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr20 19293639 19293701 19293669 Y NA NA NA NA NA NA RP1-122P22.2 442651 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 19724032 19724214 19724159 Y NA RP1-122P22.2 NA NA NA NA RP1-122P22.2 12138 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 20009163 20009558 20009361 Y NA NAA20,CRNKL1 NA NA NA NA NAA20 13403 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 20343522 20343915 20343617 Y NA INSM1 INSM1 IMR90 Hi-C 24141950 INSM1 2850 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 20432950 20433312 20432989 Y C20orf26,INSM1 NA NA NA NA NA INSM1 86185 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 20590950 20591282 20591151 Y RALGAPA2 NA NA NA NA NA RALGAPA2 99849 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 21147247 21147656 21147458 Y NA PLK1S1 NA NA NA NA PLK1S1 42623 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 24484148 24484457 24484314 Y TMEM90B SYNDIG1 NA NA NA NA SYNDIG1 36313 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 24709936 24710315 24710275 Y NA NA NA NA NA NA SYNDIG1 262101 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 24947572 24947946 24947787 Y NA NA NA NA NA NA ACSS1 89670 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 25047846 25048544 25048538 Y NA ACSS1 ACSS1 IMR90 Hi-C 24141950 ACSS1 10230 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 25227906 25228088 25227908 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 1201 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 25229395 25229593 25229494 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 2690 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr20 25671297 25671837 25671511 Y NA ZNF337 NA NA NA NA ZNF337 3640 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr20 25838960 25839094 25839045 Y ZNF337 NA NA NA NA NA ZNF337 163483 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 25846181 25846562 25846485 Y ZNF337 NA NA NA NA NA ZNF337 170704 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 29518777 29518943 29518821 Y NA NA NA NA NA NA FRG1B 90914 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr20 29647996 29648434 29648295 Y DEFB121,DEFB116 FRG1B NA NA NA NA FRG1B 38139 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr20 30104625 30104737 30104681 Y HM13 HM13 NA NA NA NA HM13 4394 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 30161920 30162316 30162154 Y NA ID1 NA NA NA NA ID1 28770 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 30183712 30184220 30184085 Y ID1 ID1 HM13 MCF7 ChIA-PET 22265404 ID1 6866 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr20 30190743 30190994 30190797 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 92 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 30191850 30192346 30192159 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 764 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.44740060484035 chr20 30194967 30195344 30195216 Y NA ID1 NA NA NA NA ID1 3881 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr20 30196293 30196740 30196417 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 5207 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 30200712 30201016 30200864 Y TTLL9,DUSP15,DEFB116,DEFB121 ID1 NA NA NA NA ID1 9626 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 30266315 30266710 30266574 Y NA BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 43082 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 30301047 30301377 30301326 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 8415 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 30700574 30701059 30700820 Y HCK,C20orf112,TM9SF4,PLAGL2 TM9SF4 NA NA NA NA TM9SF4 5265 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 31044923 31045080 31044970 Y NA NA NA NA NA NA ASXL1 100768 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.65417211981754 chr20 31045263 31045487 31045417 Y KIF3B NA NA NA NA NA ASXL1 101108 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 31099798 31099830 31099816 Y NA NA NA NA NA NA C20orf112 71046 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 31373290 31373636 31373312 Y C20orf185,DNMT3B,DNMT3B COMMD7,DNMT3B,MAPRE1 MAPRE1 IMR90 Hi-C 24141950 DNMT3B 25099 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 31410946 31411262 31411169 Y NA MAPRE1 NA NA NA NA MAPRE1 5247 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 32093960 32094027 32093984 Y NA CBFA2T2 NA NA NA NA CBFA2T2 18079 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr20 32284379 32284570 32284475 Y C20orf71,C20orf144,C20orf134 ACTL10,NECAB3,E2F1,PXMP4,ZNF341 NA NA NA NA E2F1 12169 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 32623943 32624156 32623948 Y NA RALY,RP5-1125A11.1 NA NA NA NA RP5-1125A11.1 43780 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 32694090 32694253 32694172 Y NA EIF2S2,RPS2P1 NA NA NA NA EIF2S2 3885 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 32803033 32803441 32803244 Y NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 94167 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 32803456 32803920 32803688 Y NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 93688 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr20 32826582 32826856 32826719 Y TP53INP2 NA EIF2S2,AHCY,ASIP,ITCH,DYNLRB1,PIGU IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 70752 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr20 32966378 32966977 32966403 Y GGT7 ITCH NA NA NA NA ITCH 17337 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 33024983 33025234 33025016 Y TP53INP2 FDX1P1 NA NA NA NA FDX1P1 37045 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 33064297 33064587 33064427 Y ACSS2 FDX1P1,DYNLRB1 NA NA NA NA FDX1P1 2018 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr20 33100877 33101215 33100990 Y NA FDX1P1,DYNLRB1,MAP1LC3A NA NA NA NA DYNLRB1 999 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 33150860 33150919 33150894 Y NA DYNLRB1,MAP1LC3A NA NA NA NA MAP1LC3A 18202 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr20 33263826 33263865 33263846 Y MYH7B PIGU,TP53INP2 NA NA NA NA PIGU 916 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 33896147 33896435 33896303 Y EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 NA NA NA NA EIF6 25359 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 34471781 34472424 34472101 Y NA RNU4-40P NA NA NA NA RNU4-40P 1157 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 34652590 34653055 34652672 Y NA EPB41L1 LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EPB41L1 24371 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr20 34689096 34689267 34689261 Y C20orf152 EPB41L1 SCAND1,C20orf152,EPB41L1 IMR90 Hi-C 24141950 EPB41L1 11670 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 34803190 34803436 34803313 Y NA NA NA NA NA NA DLGAP4 88822 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 34804384 34804527 34804456 Y NA NA NA NA NA NA DLGAP4 87731 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 35464098 35464342 35464182 Y RBL1,DSN1,DSN1 NA NA NA NA NA DSN1 63877 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr20 35490387 35490628 35490526 Y MANBAL,KIAA0889 NA KIAA0889 MCF7 ChIA-PET 22265404 SAMHD1 87618 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr20 35723463 35723698 35723601 Y NA RBL1 NA NA NA NA RBL1 1275 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 35874402 35874620 35874497 Y NA MANBAL NA NA NA NA MANBAL 41421 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 35905068 35905696 35905172 Y SAMHD1,SRC,MANBAL MANBAL RPN2,NNAT,BLCAP,MANBAL,GHRH,SRC,LOC100287792,VSTM2L,TTI1,RPRD1B IMR90 Hi-C 24141950 MANBAL 10345 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 35922737 35923093 35922847 Y SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC MANBAL,SRC NA NA NA NA MANBAL 6696 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 35947612 35947897 35947800 Y NA MANBAL,SRC NA NA NA NA SRC 23191 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 35964748 35965459 35965134 Y NA MANBAL,SRC NA NA NA NA SRC 5629 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 36034782 36035452 36035129 Y C20orf132,VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 36484 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr20 36040005 36040428 36040132 Y VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 31508 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 36040566 36040861 36040811 Y NA RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 31075 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 36041191 36041579 36041445 Y NA RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 30357 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 36042310 36042952 36042529 Y NA RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 28984 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr20 36132626 36132893 36132840 Y NA NNAT,BLCAP NA NA NA NA NNAT 14724 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr20 36135409 36135682 36135567 Y NA NNAT,BLCAP NA NA NA NA NNAT 11935 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr20 36154671 36154957 36154793 Y BLCAP,BLCAP,BLCAP NNAT,BLCAP NA NA NA NA BLCAP 338 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr20 36563221 36563354 36563288 Y NA VSTM2L NA NA NA NA VSTM2L 33722 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr20 36616982 36617239 36617111 Y NA TTI1,RPRD1B NA NA NA NA TTI1 42631 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 36621379 36621533 36621455 Y NNAT,VSTM2L TTI1,RPRD1B NA NA NA NA TTI1 38337 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 36763112 36763416 36763201 Y NA TGM2 NA NA NA NA TGM2 29564 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 37435049 37435642 37435193 Y RALGAPB,DHX35,ACTR5,PPP1R16B PPP1R16B NA NA NA NA PPP1R16B 2701 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 37437739 37437969 37437791 Y RALGAPB,DHX35,ACTR5,PPP1R16B PPP1R16B NA NA NA NA PPP1R16B 5391 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 37499452 37499626 37499537 Y RALGAPB,ACTR5,PPP1R16B,DHX35 NA NA NA NA NA FAM83D 53329 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 37504064 37504454 37504244 Y RALGAPB,ACTR5,PPP1R16B,DHX35 FAM83D NA NA NA NA FAM83D 48501 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 37512879 37513131 37513021 Y ACTR5,PPP1R16B FAM83D NA NA NA NA FAM83D 39824 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 37626282 37626666 37626585 Y NA DHX35 NA NA NA NA DHX35 37340 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 37678805 37678873 37678867 Y SLC32A1,PPP1R16B NA NA NA NA NA DHX35 89863 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 38952136 38952602 38952393 Y NA NA NA NA NA NA MAFB 363278 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 39093469 39093767 39093632 Y MAFB NA MAFB MCF7 ChIA-PET 22265404 MAFB 222113 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 39785946 39786458 39785968 Y CHD6,PLCG1 PLCG1 NA NA NA NA PLCG1 22346 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 39826598 39826945 39826630 Y CHD6 NA NA NA NA NA PLCG1 62998 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 40188226 40188487 40188477 Y NA NA NA NA NA NA CHD6 56646 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 40321359 40321668 40321514 Y NA NA CHD6 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD6 76226 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr20 41577893 41577991 41577942 Y NA NA NA NA NA NA SRSF6 506577 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 42286061 42286420 42286177 Y SRSF6,L3MBTL1,MYBL2 MYBL2 MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 7334 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.65417211981754 chr20 42833040 42833424 42833233 Y C20orf111 OSER1-AS1,GDAP1L1 NA NA NA NA OSER1-AS1 4176 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 43238683 43239068 43238831 Y NA ADA NA NA NA NA ADA 39806 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 43517782 43518230 43517943 Y NA YWHAB,PABPC1L PABPC1L IMR90 Hi-C 24141950 YWHAB 5465 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 44001576 44001658 44001579 Y WFDC11,KCNS1,TP53TG5,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2 SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2,PIGT NA NA NA NA SYS1-DBNDD2 11736 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 44056635 44056652 44056644 Y NA PIGT NA NA NA NA PIGT 13918 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 45006307 45006609 45006393 Y PCIF1,ZNF335 SLC35C2 NA NA NA NA SLC35C2 15264 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 45946049 45946481 45946179 Y NA RP4-569M23.2,ZMYND8 NA NA NA NA RP4-569M23.2 32824 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 45987479 45988292 45987961 Y NA RP4-569M23.2,ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 3912 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 46299616 46300006 46299878 Y NCOA3,SULF2,SULF2 NA NA NA NA NA SULF2 113354 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr20 46316176 46316372 46316269 Y NA NA NA NA NA NA SULF2 96988 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 46320177 46320280 46320230 Y SULF2 NA NA NA NA NA SULF2 93080 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 46351193 46351379 46351286 Y NA NA NA NA NA NA SULF2 61981 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 46356086 46356757 46356412 Y SULF2,SULF2 NA NA NA NA NA SULF2 56603 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 46653872 46653986 46653882 Y NA NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SULF2 240512 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr20 47337131 47337315 47337224 Y NA NA NA NA NA NA PREX1 105105 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 47547466 47547777 47547635 Y ZNFX1,ARFGEF2 ARFGEF2 NA NA NA NA ARFGEF2 11039 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr20 47750965 47751079 47750977 Y ZNFX1 NA NA NA NA NA STAU1 51825 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 47803381 47804147 47803544 Y PREX1,STAU1 STAU1,DDX27 NA NA NA NA STAU1 477 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 47893075 47893400 47893157 Y B4GALT5,ZNFX1 ZNFX1,SNORD12B,SNORD12 NA NA NA NA ZNFX1 112 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 48285223 48285402 48285313 Y SPATA2,SLC9A8 B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 43013 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 48293445 48293839 48293746 Y NA B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 34576 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr20 48315836 48316073 48315912 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 12342 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr20 48317822 48318037 48318021 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 10378 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 48327368 48328064 48327696 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 351 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 48663510 48663968 48663673 Y NA NA SNAI1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SNAI1 65974 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 48717588 48717974 48717858 Y NA UBE2V1 NA NA NA NA UBE2V1 12522 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 48876301 48877479 48876571 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB NA PTPN1,LOC284751,FAM65C,PARD6B,CEBPB IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CEBPB 70925 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 48921857 48922230 48922089 Y NA NA NA NA NA NA CEBPB 116481 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 48924890 48925591 48925260 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA NA NA NA NA CEBPB 119514 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr20 49286898 49287066 49286958 Y NA FAM65C PTPN1,PARD6B,FAM65C,BCAS4,EYA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM65C 18999 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 49407275 49407470 49407371 Y MOCS3 BCAS4 ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCAS4 1961 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr20 49516325 49516426 49516399 Y ADNP RP5-914P20.5,ADNP NA NA NA NA RP5-914P20.5 29095 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 49524499 49524706 49524614 Y ADNP RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA RP5-914P20.5 20815 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 49539044 49539098 49539071 Y NA RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA RP5-914P20.5 6423 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 49574418 49574471 49574465 Y PTPN1,ADNP RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA MOCS3 1055 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 49641280 49641578 49641516 Y NA KCNG1 NA NA NA NA KCNG1 3614 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 50017073 50017292 50017116 Y NFATC2 NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 331780 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 50023236 50023561 50023399 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 325511 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 50072988 50073809 50073517 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 275263 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 50272756 50273155 50272761 Y ATP9A NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 75917 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 50383575 50384083 50383723 Y ATP9A RP5-827A12.2,ATP9A NA NA NA NA ATP9A 402 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr20 51591897 51592288 51592140 Y TSHZ2,TSHZ2 TSHZ2 NA NA NA NA TSHZ2 4951 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 51694232 51694450 51694303 Y TSHZ2 NA NA NA NA NA TSHZ2 107286 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 51695658 51695926 51695787 Y NA NA NA NA NA NA TSHZ2 108712 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 51842749 51842980 51842865 Y TSHZ2 NA NA NA NA NA TSHZ2 255803 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 51947269 51947531 51947400 Y NA NA NA NA NA NA ZNF217 276915 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 52201463 52201802 52201714 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 22644 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 52239995 52240318 52240062 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BMP7,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 15549 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 52374184 52374569 52374228 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 149738 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 52543055 52543571 52543250 Y ZNF217 NA NA NA NA NA PFDN4 278815 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 53116440 53116542 53116504 Y DOK5 NA NA NA NA NA PFDN4 294054 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 55750465 55750757 55750669 Y RAE1,RAE1,BMP7 NA NA NA NA NA BMP7 88928 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 55780606 55780977 55780774 Y NA NA NA NA NA NA BMP7 58708 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 55825592 55825967 55825782 Y NA BMP7 NA NA NA NA BMP7 13718 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 55838908 55839396 55838948 Y NA BMP7 NA NA NA NA BMP7 289 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 56016094 56016430 56016231 Y NA HMGB1P1 NA NA NA NA HMGB1P1 45653 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 56027077 56027304 56027131 Y NA HMGB1P1 MIR5095 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HMGB1P1 34779 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 56251701 56252046 56251896 Y NA PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 32546 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 56293544 56293843 56293665 Y NA PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 8952 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.55078636232894 chr20 56550215 56550469 56550425 Y NA NA ZBP1,CTCFL,PCK1,PMEPA1 IMR90 Hi-C 24141950 PMEPA1 265623 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 57018014 57018479 57018179 Y STX16 NA NA NA NA NA VAPB 55836 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 57032377 57032636 57032571 Y NA NA NA NA NA NA APCDD1L 55551 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 57198784 57199334 57199089 Y NA STX16,STX16-NPEPL1 NA NA NA NA STX16 24994 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 57236406 57236742 57236622 Y RAB22A,STX16 STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1 NA NA NA NA STX16-NPEPL1 11916 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 57270107 57270808 57270490 Y NA STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1 NA NA NA NA NPEPL1 7920 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 57557787 57558211 57558054 Y ZNF831,STX16 ATP5E NA NA NA NA ATP5E 47226 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 57596187 57596442 57596344 Y NA ATP5E,SLMO2 NA NA NA NA ATP5E 8995 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 58436515 58436843 58436553 Y PHACTR3,PHACTR3,PHACTR3,SYCP2,C20orf177,C20orf177 NA NA NA NA NA PPP1R3D 76509 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 59828827 59829192 59829064 Y CDH4 CDH4 NA NA NA NA CDH4 3345 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 59989556 59989819 59989629 Y NA NA NA NA NA NA CDH4 164074 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 60256764 60257074 60256889 Y CDH4 NA NA NA NA NA TAF4 381792 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 60529765 60530009 60529928 Y NA NA NA NA NA NA TAF4 108857 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr20 60719468 60719634 60719593 Y SS18L1,GTPBP5 LSM14B,PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 2646 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr20 60803093 60803442 60803179 Y NA HRH3,OSBPL2 NA NA NA NA OSBPL2 8138 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 60941528 60941750 60941608 Y SLCO4A1,ADRM1,LAMA5 LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 1160 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 60956313 60956720 60956445 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA RPS21 3452 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 60956743 60957219 60956871 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA RPS21 2953 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr20 60972798 60973035 60972874 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA CABLES2 7306 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 61282674 61283033 61282738 Y OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1 SLCO4A1 NA NA NA NA SLCO4A1 10877 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 61283206 61283870 61283565 Y OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1 SLCO4A1 NA NA NA NA SLCO4A1 11409 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 61425509 61425950 61425706 Y DPH3P1,DIDO1,OGFR OGFR,COL9A3 NA NA NA NA OGFR 8237 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 61553883 61554120 61553955 Y DIDO1 DIDO1 NA NA NA NA DIDO1 13184 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 61585554 61585775 61585703 Y SLC17A9 DIDO1 NA NA NA NA DIDO1 18250 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 61724045 61724282 61724168 Y NA NA NA NA NA NA YTHDF1 121304 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 61974179 61974444 61974306 Y NA NA NA NA NA NA ARFGAP1 72042 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 62026934 62027328 62027132 Y NA NA NA NA NA NA KCNQ2 74665 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 62081744 62082029 62081931 Y NA KCNQ2,EEF1A2 NA NA NA NA KCNQ2 19964 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr20 62085174 62085706 62085468 Y BHLHE23,NKAIN4,CHRNA4,SRMS,UCKL1,STMN3,RTEL1,EEF1A2,KCNQ2 KCNQ2,EEF1A2 NA NA NA NA KCNQ2 16287 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.55078636232894 chr20 62088084 62088568 62088367 Y NA KCNQ2,EEF1A2 NA NA NA NA KCNQ2 13425 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr20 62105526 62105723 62105589 Y NA KCNQ2,EEF1A2,PPDPF NA NA NA NA KCNQ2 3533 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr20 62887659 62888425 62887862 Y SAMD10,PCMTD2 PCMTD2 NA NA NA NA PCMTD2 2565 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr21 10852099 10852403 10852350 Y NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 885514 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 11118249 11118623 11118434 Y NA NA BAGE5 IMR90 Hi-C 24141950 TEKT4P2 1151664 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr21 15450488 15450803 15450511 Y NA NA NA NA NA NA AP001347.6 52746 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr21 15546243 15546620 15546432 Y NA RBM11 NA NA NA NA RBM11 39831 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 16222795 16222981 16222977 Y NA NA NRIP1 IMR90 Hi-C 24141950 NRIP1 212340 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 16288986 16289227 16289075 Y NA NA NA NA NA NA NRIP1 146094 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 16435480 16435873 16435862 Y NRIP1 NRIP1 NA NA NA NA NRIP1 159 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 16662871 16663259 16663022 Y NA NA SAMSN1,NRIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NRIP1 227550 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 17103695 17103792 17103750 Y USP25 USP25 NA NA NA NA USP25 3351 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 17125389 17125620 17125425 Y USP25 USP25 NA NA NA NA USP25 25045 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 17153700 17154031 17153865 Y NA NA NA NA NA NA USP25 53356 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 17264124 17264427 17264344 Y NA NA NA NA NA NA USP25 163780 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 17276028 17276063 17276046 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 164779 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 17681993 17682347 17682285 Y NA SNORD74 NA NA NA NA SNORD74 26904 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr21 17906222 17906467 17906345 Y NA MIRLET7C NA NA NA NA MIRLET7C 3676 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 17906909 17907886 17907248 Y NA MIRLET7C NA NA NA NA MIRLET7C 2257 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr21 17924273 17924626 17924451 Y NA MIRLET7C NA NA NA NA MIRLET7C 14130 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 17959400 17959753 17959559 Y NA MIRLET7C NA NA NA NA MIRLET7C 49257 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 17960667 17961305 17960883 Y NA NA NA NA NA NA MIRLET7C 50524 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr21 18115504 18115510 18115507 Y NA NA NA NA NA NA MIRLET7C 205361 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 18891260 18891546 18891459 Y NA CXADR NA NA NA NA CXADR 8560 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 18984370 18984546 18984496 Y NA BTG3 NA NA NA NA BTG3 1105 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 19171826 19171995 19171943 Y C21orf91 C21orf91 NA NA NA NA C21orf91 17708 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 20332271 20332391 20332319 Y NA NA NA NA NA NA CHODL 1060691 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 22469408 22469563 22469502 Y NA NA NA NA NA NA NCAM2 100775 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 26840397 26840546 26840424 Y NA NA MIR155HG IMR90 Hi-C 24141950 MRPL39 137283 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 26952057 26952278 26952105 Y JAM2 MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 25551 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr21 26956680 26957339 26957242 Y NA MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 20490 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr21 26962945 26963646 26963455 Y NA MRPL39,JAM2 NA NA NA NA MRPL39 14183 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr21 27082933 27083032 27082983 Y NA GABPA,ATP5J NA NA NA NA GABPA 21849 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr21 27285950 27286116 27286033 Y APP NA NA NA NA NA ATP5J 179966 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 27335144 27335525 27335335 Y APP NA NA NA NA NA APP 205921 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 27370700 27370785 27370725 Y NA NA NA NA NA NA APP 170661 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 27544040 27544194 27544117 Y APP APP NA NA NA NA APP 2594 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 27855729 27855767 27855735 Y CYYR1 NA NA NA NA NA CYYR1 87836 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr21 28207147 28207505 28207325 Y NA ADAMTS1 NA NA NA NA ADAMTS1 8223 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr21 28218728 28219247 28219071 Y ADAMTS5,ADAMTS1 ADAMTS1 NA NA NA NA ADAMTS1 3000 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr21 28797067 28797570 28797293 Y NA NA ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS5 460235 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 28962741 28962988 28962847 Y NA NA ADAMTS1 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS5 625909 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr21 29186148 29186441 29186404 Y NA NA LINC00161 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS5 849316 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr21 29461833 29462120 29461977 Y NA NA NA NA NA NA N6AMT1 793573 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 29476694 29476903 29476871 Y NA NA NA NA NA NA N6AMT1 778790 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 6.82345999424735 chr21 30684361 30684712 30684409 Y NA NA NA NA NA NA BACH1 119969 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 30754427 30754628 30754578 Y NA NA NA NA NA NA BACH1 190035 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 32531402 32531778 32531665 Y NA NA NA NA NA NA AP000251.3 397780 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr21 32532795 32532952 32532925 Y NA NA NA NA NA NA AP000251.3 396606 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr21 32545915 32546496 32546250 Y NA NA NA NA NA NA AP000251.3 383062 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr21 32546701 32546751 32546739 Y NA NA NA NA NA NA AP000251.3 382807 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr21 32553780 32554124 32553993 Y NA NA NA NA NA NA AP000251.3 375434 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 32560711 32560765 32560739 Y NA NA NA NA NA NA AP000251.3 368793 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 32662959 32662987 32662974 Y NA NA NA NA NA NA AP000251.3 266571 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr21 32714682 32715016 32714813 Y SCAF4 NA NA NA NA NA AP000251.3 214542 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 32727234 32727499 32727493 Y NA NA NA NA NA NA AP000251.3 202059 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 32781181 32781372 32781277 Y NA NA NA NA NA NA AP000251.3 148186 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 32862869 32863036 32862944 Y NA NA NA NA NA NA AP000251.3 66522 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 32868770 32868927 32868849 Y NA NA NA NA NA NA AP000251.3 60631 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 33042550 33042842 33042696 Y NA SOD1 NA NA NA NA SOD1 12615 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr21 33105563 33105881 33105775 Y SCAF4 SCAF4 NA NA NA NA SCAF4 3175 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr21 33265141 33265272 33265205 Y NA HUNK NA NA NA NA HUNK 21513 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 33301390 33301573 33301482 Y NA NA NA NA NA NA HUNK 57762 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 33702310 33702533 33702421 Y NA NA NA NA NA NA MIS18A 52930 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 34181776 34182141 34181959 Y OLIG1,C21orf62 C21orf49 NA NA NA NA C21orf49 39365 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 34836293 34836479 34836379 Y OLIG2,OLIG1,CRYZL1,TMEM50B TMEM50B,DNAJC28 NA NA NA NA TMEM50B 13839 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 35574029 35574459 35574413 Y NA NA NA NA NA NA SLC5A3 130159 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 36203156 36203348 36203246 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 217715 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 36419290 36419780 36419662 Y RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 433849 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 36689355 36689577 36689433 Y NA NA RUNX1,LOC100506385 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1 685388 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 36801404 36801749 36801488 Y RUNX1 NA CLIC6,RUNX1,LOC100506385 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1 573216 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr21 37304517 37304946 37304672 Y NA NA CLIC6,LOC100506385,LINC00160,RUNX1,RCAN1 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1 70019 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 37694250 37694633 37694410 Y NA MORC3 NA NA NA NA MORC3 3763 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 37695369 37695803 37695437 Y MORC3 MORC3 NA NA NA NA MORC3 4882 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 37712607 37712952 37712729 Y NA MORC3,CHAF1B NA NA NA NA MORC3 22120 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr21 38151764 38151954 38151859 Y NA NA NA NA NA NA AP000704.5 184858 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 38629602 38630247 38630025 Y NA AP001432.14,DSCR3 NA NA NA NA DSCR3 8015 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr21 38630405 38630786 38630710 Y DYRK1A,DYRK1A AP001432.14,DSCR3 NA NA NA NA DSCR3 7476 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr21 38801876 38802213 38802018 Y DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A NA NA NA NA NA DYRK1A 65784 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr21 38825760 38825986 38825873 Y NA NA NA NA NA NA DYRK1A 89668 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 38935728 38936411 38936235 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 199636 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.17110090726052 chr21 38936686 38937128 38936852 Y DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 200594 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr21 38988988 38989241 38989189 Y NA NA NA NA NA NA DYRK1A 252896 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 40361689 40362112 40361935 Y NA NA ETS2,WRB,LINC00114 IMR90,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 ETS2 186458 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr21 40527943 40528201 40528072 Y NA PSMG1 NA NA NA NA PSMG1 25576 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 40673787 40673929 40673891 Y NA BRWD1,HMGN1 NA NA NA NA BRWD1 17556 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr21 40753076 40753485 40753292 Y WRB HMGN1,WRB NA NA NA NA WRB 2906 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 41048329 41048488 41048408 Y SH3BGR NA NA NA NA NA B3GALT5 121960 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr21 41964918 41965179 41965085 Y DSCAM NA NA NA NA NA DSCAM 251886 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 42213096 42213280 42213166 Y DSCAM DSCAM NA NA NA NA DSCAM 3785 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 43188787 43189188 43188843 Y RIPK4 NA NA NA NA NA PRDM15 108403 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 43214290 43214658 43214474 Y NA NA NA NA NA NA PRDM15 82933 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 43653155 43654253 43653819 Y NA ABCG1 TFF3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCG1 35356 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr21 43654635 43655282 43654967 Y NA ABCG1 TFF3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCG1 36836 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr21 43952961 43953452 43953160 Y PKNOX1,ABCG1,ABCG1,ABCG1 NA NA NA NA NA PDE9A 118294 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 44072717 44073208 44072832 Y NA PDE9A NA NA NA NA PDE9A 971 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 44278308 44278654 44278481 Y NA WDR4,NDUFV3 NA NA NA NA WDR4 19024 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 44395482 44395891 44395810 Y NA PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 2862 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr21 44395922 44396228 44396080 Y WDR4,U2AF1,CBS PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 3302 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 44425410 44425661 44425536 Y NA PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 32790 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 44597156 44597534 44597315 Y SIK1 NA NA NA NA NA U2AF1 71459 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr21 44697672 44698016 44697845 Y NA NA LINC00313,SIK1,HSF2BP IMR90 Hi-C 24141950 SIK1 146992 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 44874156 44874417 44874299 Y NA SIK1 NA NA NA NA SIK1 29148 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr21 45080522 45080871 45080626 Y TRAPPC10,PWP2,SIK1,RRP1B HSF2BP,RRP1B NA NA NA NA RRP1B 3093 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr21 45146832 45147391 45147298 Y NA PDXK,CSTB NA NA NA NA PDXK 9857 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 45358133 45358224 45358178 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC10 71976 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 45573584 45574271 45573954 Y PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG PWP2,C21orf33 NA NA NA NA C21orf33 22097 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 45614142 45614593 45614385 Y NA NA AIRE,PFKL,ICOSLG,C21orf33,PWP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C21orf33 62655 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 45943778 45945170 45944363 Y NA C21orf90 NA NA NA NA C21orf90 8679 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr21 46124045 46124372 46124063 Y DNMT3L,AIRE,AIRE,TSPEAR NA NA NA NA NA UBE2G2 95562 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 46295070 46295864 46295519 Y ITGB2 PTTG1IP NA NA NA NA PTTG1IP 3318 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr21 46769779 46770045 46769871 Y NA NA ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL18A1 53007 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 46783934 46784395 46784118 Y NA COL18A1 ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COL18A1 38657 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 46894520 46894647 46894596 Y COL18A1 NA SLC19A1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC19A1 67678 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr21 46971386 46971506 46971439 Y POFUT2,SLC19A1 SLC19A1 SLC19A1,LOC100129027,PCBP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC19A1 9061 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 47010467 47010705 47010586 Y NA SLC19A1 PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC19A1 48142 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr21 47010868 47011351 47011033 Y NA SLC19A1 PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC19A1 48543 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr21 47027110 47027382 47027175 Y NA PCBP3 PCBP3,SLC19A1,POFUT2 IMR90 Hi-C 24141950 PCBP3 34226 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 47167832 47168236 47167895 Y NA NA PCBP3,LOC100129027 IMR90 Hi-C 24141950 PCBP3 106224 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr21 47191109 47191365 47191237 Y NA NA LOC100129027,SLC19A1 IMR90 Hi-C 24141950 PCBP3 129501 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr21 47212658 47212880 47212769 Y NA NA ADARB1,SLC19A1,PCBP3 IMR90 Hi-C 24141950 PCBP3 151050 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 47240506 47240853 47240623 Y NA NA NA NA NA NA COL6A1 158798 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr21 47266684 47266899 47266840 Y NA NA NA NA NA NA COL6A1 132752 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 47291758 47292008 47291998 Y NA NA NA NA NA NA COL6A1 107643 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 47499343 47499535 47499461 Y COL6A1,COL6A2 COL6A2 NA NA NA NA COL6A2 16476 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr21 47993556 47993894 47993723 Y DIP2A,S100B,PRMT2 S100B NA NA NA NA S100B 29227 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr21 48042238 48042469 48042310 Y DIP2A,PRMT2 S100B,PRMT2 DIP2A,PCNT,S100B,PRMT2 IMR90 Hi-C 24141950 PRMT2 10610 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 17528836 17529213 17528959 Y NA IL17RA NA NA NA NA IL17RA 34631 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr22 17652206 17652871 17652785 Y NA CECR5-AS1,CECR5,AC005300.5 NA NA NA NA CECR5 8029 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr22 17745323 17745619 17745476 Y NA NA NA NA NA NA AC005300.5 73497 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr22 17849400 17850329 17849515 Y NA NA NA NA NA NA AC005300.5 177574 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr22 17850637 17851018 17850672 Y NA NA NA NA NA NA AC005300.5 178811 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 18506386 18506784 18506419 Y MICAL3 MICAL3 NA NA NA NA MICAL3 1061 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 18538907 18539143 18539025 Y NA MICAL3,PEX26 NA NA NA NA PEX26 19546 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 19043288 19043502 19043327 Y NA NA NA NA NA NA DGCR2 64465 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 19073720 19074078 19073888 Y NA DGCR2 NA NA NA NA DGCR2 33889 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 7.34038878169033 chr22 19337870 19338225 19337898 Y NA NA NA NA NA NA CLTCL1 60631 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 19410653 19410889 19410838 Y HIRA MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39 NA NA NA NA MRPL40 6536 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 19564748 19565059 19564792 Y CLDN5 NA HIRA,CLDN5,LOC150185,CLTCL1,UFD1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC45 99766 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 19703205 19703405 19703340 Y NA SEPT5,TBX1 NA NA NA NA SEPT5 3218 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 19869401 19869687 19869604 Y NA C22orf29,GNB1L NA NA NA NA GNB1L 28939 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 19941739 19941814 19941777 Y NA COMT,TXNRD2 NA NA NA NA TXNRD2 14398 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 19946850 19947150 19946987 Y NA COMT,TXNRD2 NA NA NA NA TXNRD2 19509 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 19972525 19972715 19972620 Y NA COMT,TXNRD2,ARVCF NA NA NA NA ARVCF 29616 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 20142939 20143182 20143142 Y NA RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8 NA NA NA NA ZDHHC8 27960 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 20232624 20232972 20232704 Y TRMT2A NA NA NA NA NA XXbac-B444P24.10 52311 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 20258205 20258516 20258358 Y NA XXbac-B444P24.10,DGCR6L NA NA NA NA XXbac-B444P24.10 26767 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 20287043 20287283 20287165 Y NA XXbac-B444P24.10,DGCR6L NA NA NA NA XXbac-B444P24.10 1760 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 20772547 20772776 20772578 Y PI4KA ZNF74,SCARF2 NA NA NA NA SCARF2 17370 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr22 20850844 20851071 20850923 Y PI4KA,AIFM3,AIFM3 KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 2644 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 20863506 20864089 20863850 Y MED15 KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 15306 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 21285744 21286048 21285865 Y NA CRKL,LZTR1 NA NA NA NA CRKL 16030 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 22010846 22011267 22010978 Y YPEL1 YDJC,CCDC116,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 6287 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr22 22011632 22012115 22011859 Y NA YDJC,CCDC116,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 7073 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr22 22067448 22067680 22067564 Y YPEL1 YPEL1 NA NA NA NA YPEL1 20443 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 22098382 22098623 22098439 Y NA YPEL1 NA NA NA NA YPEL1 10259 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 22334723 22335115 22334952 Y NA PPM1F,TOP3B NA NA NA NA TOP3B 98 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr22 23415058 23415342 23415197 Y NA GNAZ NA NA NA NA GNAZ 4518 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 23725705 23725832 23725738 Y NA ZDHHC8P1 NA NA NA NA ZDHHC8P1 17081 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 23863943 23864332 23864232 Y GNAZ,RTDR1,BCR NA ZDHHC8P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC8P1 121030 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.24062908986315 chr22 24080371 24080411 24080401 Y NA GUSBP11,ZNF70,MMP11,CHCHD10,SMARCB1 NA NA NA NA ZNF70 10868 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 24153288 24153648 24153392 Y RGL4,LOC391322 MMP11,CHCHD10,SMARCB1,SLC2A11 DERL3 IMR90 Hi-C 24141950 SMARCB1 26138 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr22 24188777 24188988 24188883 Y DERL3 SLC2A11,MIF DERL3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC2A11 7902 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 24234499 24234593 24234547 Y NA SLC2A11,MIF NA NA NA NA MIF 308 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 24255997 24256450 24256302 Y C22orf43,CABIN1,CABIN1 MIF NA NA NA NA MIF 21806 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.34401484735175 chr22 24752898 24753006 24752951 Y UPB1 NA NA NA NA NA SPECC1L-ADORA2A 88032 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 24756229 24756614 24756466 Y NA NA NA NA NA NA SPECC1L-ADORA2A 91363 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 24767148 24767407 24767278 Y GGT1 NA NA NA NA NA SPECC1L-ADORA2A 102282 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 24796747 24798216 24797446 Y GGT1 NA NA NA NA NA SPECC1L-ADORA2A 131881 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr22 24833641 24833901 24833753 Y NA NA NA NA NA NA SNRPD3 115570 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 25463741 25463900 25463813 Y NA NA NA NA NA NA SNORD56 168560 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 25815594 25815803 25815685 Y ADRBK2,LRP5L LRP5L,CRYBB2P1 MYO18B,CRYBB2P1,LRP5L,SEZ6L,KIAA1671 IMR90 Hi-C 24141950 LRP5L 16250 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 5.5828309043842 chr22 25844657 25845002 25844694 Y NA LRP5L,CRYBB2P1 NA NA NA NA CRYBB2P1 2585 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr22 25883503 25883619 25883561 Y NA CRYBB2P1 MYO18B,LRP5L,CRYBB2P1,ADRBK2,SEZ6L IMR90 Hi-C 24141950 CRYBB2P1 41431 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 27490650 27490855 27490753 Y NA NA PITPNB,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 RP1-40G4P.1 209139 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 27725325 27725665 27725495 Y MN1 NA MIAT,MN1 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-40G4P.1 443814 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 28304832 28305219 28305193 Y NA TTC28-AS1,PITPNB NA NA NA NA TTC28-AS1 8145 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr22 28314180 28314595 28314448 Y PITPNB TTC28-AS1,PITPNB NA NA NA NA PITPNB 58 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr22 28372624 28372939 28372782 Y NA NA NA NA NA NA PITPNB 58502 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr22 28475489 28475734 28475658 Y NA NA NA NA NA NA PITPNB 161367 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 28549378 28549438 28549411 Y NA NA NA NA NA NA PITPNB 235256 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 28797071 28797274 28797258 Y PITPNB,XBP1,CCDC117 NA NA NA NA NA HSCB 338745 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 28837872 28838192 28838073 Y TTC28 NA NA NA NA NA HSCB 297827 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr22 28956104 28956479 28956470 Y NA NA NA NA NA NA HSCB 179540 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 29206791 29206989 29206921 Y EMID1,CCDC117,XBP1 CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6 XBP1 K562 ChIA-PET 22265404 CTA-292E10.6 12120 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 29209751 29210048 29209892 Y CCDC117,XBP1 CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6 CHEK2,HSCB,C22orf31,ZNRF3,KREMEN1,TTC28,TTC28-AS1,EMID1,CCDC117,XBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTA-292E10.6 15080 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 29280564 29280869 29280661 Y NA ZNRF3 NA NA NA NA ZNRF3 2984 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 29365910 29365950 29365937 Y NA NA NA NA NA NA ZNRF3 88330 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 29428666 29428910 29428854 Y C22orf31 KREMEN1 NA NA NA NA KREMEN1 38156 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 30647782 30648063 30647863 Y SEC14L2,RNF215,GAL3ST1,LIF GATSL3 NA NA NA NA GATSL3 35553 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 30801557 30801812 30801706 Y OSM,CCDC157,SF3A1 SEC14L2,RNF215,MTFP1 NA NA NA NA SEC14L2 10711 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 30938421 30938985 30938910 Y LIF,OSM,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1,DUSP18 NA NA NA NA NA TCN2 61840 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 31298089 31298190 31298144 Y NA NA MORC2,MORC2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TUG1 66473 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 31467272 31467654 31467462 Y NA SMTN,SELM,INPP5J OSBP2,MORC2,MORC2-AS1,TUG1,SELM,SMTN IMR90 Hi-C 24141950 SMTN 9181 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 31629034 31629491 31629163 Y SMTN,RNF185,LIMK2 LIMK2 NA NA NA NA LIMK2 22809 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 31631095 31631484 31631184 Y SMTN,RNF185,LIMK2 LIMK2 NA NA NA NA LIMK2 24870 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 31665995 31666466 31666007 Y NA PIK3IP1 NA NA NA NA PIK3IP1 20054 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 31689398 31689773 31689585 Y SMTN,DEPDC5 PIK3IP1 NA NA NA NA PIK3IP1 2878 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr22 31934846 31935146 31934960 Y NA EIF4ENIF1 NA NA NA NA EIF4ENIF1 44752 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 32027602 32027834 32027718 Y NA PISD NA NA NA NA PISD 28584 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 32322992 32323244 32323115 Y RFPL2,EIF4ENIF1,EIF4ENIF1,YWHAH YWHAH NA NA NA NA YWHAH 15203 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 33199078 33199894 33199157 Y NA TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 3391 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 33202971 33203258 33203149 Y NA TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 7284 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 33238776 33239102 33239072 Y SYN3,SYN3 TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 43089 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 33265683 33265702 33265692 Y TIMP3 NA NA NA NA NA TIMP3 69996 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr22 33277060 33277478 33277268 Y NA NA NA NA NA NA TIMP3 81373 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 35529944 35530291 35530139 Y ISX NA LARGE IMR90 Hi-C 24141950 CTA-714B7.5 94758 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 35767811 35768194 35767985 Y APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1 HMOX1,MCM5 NA NA NA NA HMOX1 6160 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 35842495 35842590 35842543 Y NA MCM5 NA NA NA NA MCM5 48439 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 36149671 36149849 36149827 Y NA NA APOL5 IMR90 Hi-C 24141950 RASD2 214756 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr22 36172767 36172943 36172931 Y MB,MB,RBFOX2,RBFOX2 NA APOL5 IMR90 Hi-C 24141950 RASD2 237852 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr22 36245846 36246212 36246206 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 176261 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 36299462 36299943 36299718 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 122530 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 36310688 36310985 36310744 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 111488 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr22 36325608 36325959 36325784 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 96514 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr22 36343697 36344006 36343862 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 78467 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 36385915 36386246 36386112 Y NA RBFOX2 NA NA NA NA RBFOX2 36227 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 36621171 36621450 36621368 Y NA APOL2 NA NA NA NA APOL2 12550 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 36727482 36728450 36727733 Y APOL3 NA NA NA NA NA MYH9 53613 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr22 36728624 36729163 36728912 Y IFT27 NA NA NA NA NA MYH9 52900 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 36750973 36751374 36751265 Y APOL3 MYH9 NA NA NA NA MYH9 30689 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 36767098 36767482 36767405 Y NA MYH9 NA NA NA NA MYH9 14581 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 36847830 36847945 36847861 Y APOL3,APOL3,APOL2,APOL2,NCF4,CSF2RB RP5-1119A7.14,TXN2 NA NA NA NA RP5-1119A7.14 1046 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 36866824 36867261 36867092 Y NA RP5-1119A7.14,TXN2,FOXRED2 NA NA NA NA TXN2 8816 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 37490501 37490532 37490517 Y NA KCTD17 NA NA NA NA KCTD17 44722 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 38057516 38057596 38057556 Y NA SH3BP1,PDXP,LGALS1,NOL12,TRIOBP NA NA NA NA PDXP 4782 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr22 38137969 38138286 38138127 Y TRIOBP TRIOBP H1F0,GCAT IMR90 Hi-C 24141950 TRIOBP 46958 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr22 38139873 38139989 38139967 Y NA TRIOBP H1F0,GCAT IMR90 Hi-C 24141950 TRIOBP 48862 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 38148564 38148886 38148725 Y CDC42EP1 NA NA NA NA NA H1F0 50228 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr22 38351215 38351232 38351224 Y NA POLR2F,C22orf23 NA NA NA NA C22orf23 3539 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 38848472 38848673 38848585 Y NA KDELR3 NA NA NA NA KDELR3 13394 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 39253318 39253463 39253391 Y KCNJ4,LOC646851 NPTXR,CBX6 NA NA NA NA CBX6 12856 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 39541576 39542088 39541730 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7 CBX7 NA NA NA NA CBX7 4591 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr22 39570081 39570473 39570178 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,APOBEC3H CBX7 PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3 MCF7 ChIA-PET 22265404 CBX7 23402 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 39698105 39698354 39698234 Y NA RPL3,SYNGR1 NA NA NA NA RPL3 16040 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 39784258 39784471 39784339 Y MGAT3,MGAT3,CBX7,SYNGR1 SYNGR1,TAB1 NA NA NA NA TAB1 9275 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 39923809 39924011 39923907 Y NA ATF4,RPS19BP1 NA NA NA NA RPS19BP1 2849 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 40451411 40451463 40451437 Y NA TNRC6B,RPL7P52 NA NA NA NA TNRC6B 12590 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 40575185 40575584 40575306 Y TNRC6B,TNRC6B NA NA NA NA NA RPL7P52 74115 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr22 40589903 40590338 40589971 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P52 88833 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 40781478 40781596 40781515 Y NA ADSL,SGSM3 NA NA NA NA SGSM3 16883 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 40832612 40832827 40832769 Y NA NA NA NA NA NA SGSM3 68017 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 40958851 40958976 40958969 Y NA NA NA NA NA NA MKL1 71730 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr22 40982487 40982801 40982645 Y NA MKL1 NA NA NA NA MKL1 47905 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 41047729 41047883 41047796 Y NA MKL1,GAPDHP37,MCHR1 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17023 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr22 41048065 41048352 41048232 Y EP300,MKL1 MKL1,GAPDHP37,MCHR1 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17359 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr22 41417973 41418366 41418067 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39690 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr22 41418482 41418837 41418726 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39219 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr22 41460471 41460696 41460583 Y NA RP11-12M9.3,EP300 RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-12M9.3 2415 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 41776948 41777130 41776981 Y NA TEF NA NA NA NA TEF 15611 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.06771514977192 chr22 41840300 41840792 41840564 Y NA TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 235 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 41844337 41844774 41844650 Y SHISA8,TEF,TEF,TOB2 TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 3310 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 42008568 42008780 42008674 Y NA PMM1,XRCC6 NA NA NA NA XRCC6 6343 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 42062739 42062953 42062873 Y NA XRCC6,C22orf46,NHP2L1 NA NA NA NA C22orf46 19990 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 42073632 42073949 42073667 Y TOB2 C22orf46,NHP2L1 NA NA NA NA C22orf46 8994 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 42339043 42339310 42339264 Y NA SHISA8,TNFRSF13C,CENPM,SEPT3 NA NA NA NA CENPM 1858 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 42345357 42345934 42345409 Y NA SHISA8,TNFRSF13C,CENPM,SEPT3,WBP2NL TNFRSF13C K562 ChIA-PET 22265404 CENPM 4189 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 42485778 42486189 42485966 Y CCDC134,CENPM,NFAM1,C22orf32 NAGA,NDUFA6,OLA1P1 NA NA NA NA NDUFA6 819 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 42679264 42679621 42679518 Y NA NA NA NA NA NA Z83851.1 83621 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 42696005 42696062 42696030 Y SEPT3,NFAM1 NA TCF20,NFAM1 IMR90 Hi-C 24141950 Z83851.1 67180 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 42835802 42836124 42835869 Y POLDIP3,ARFGAP3,NFAM1 CTA-126B4.7 MEI1,LOC100132273,TCF20,LOC388906,NFAM1 IMR90 Hi-C 24141950 CTA-126B4.7 3773 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 42839941 42840323 42840234 Y POLDIP3,C22orf32,TCF20,RRP7A,NFAM1 CTA-126B4.7 MEI1,TCF20,NDUFA6,LOC100132273,C22orf32,CYP2D6,NFAM1,WBP2NL,RNU12,POLDIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTA-126B4.7 7912 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 43100819 43101017 43100994 Y NA NA NA NA NA NA CYB5R3 57245 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 43653252 43653585 43653298 Y NA NA NA NA NA NA TTLL12 72113 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 43659776 43660445 43660004 Y NA NA NA NA NA NA SCUBE1 76949 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 43811216 43811611 43811451 Y SULT4A1,TTLL1,SCUBE1,MPPED1 NA NA NA NA NA SCUBE1 73822 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 44218722 44218869 44218865 Y NA EFCAB6,SULT4A1 NA NA NA NA EFCAB6 12505 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 44541394 44541995 44541679 Y NA NA NA NA NA NA PARVB 148303 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 44759236 44759683 44759589 Y NA NA KIAA1644,PARVB,LINC00207,SAMM50,LINC00229 IMR90 Hi-C 24141950 LDOC1L 132495 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 44993593 44993881 44993680 Y NA NA NA NA NA NA PRR5 68712 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 45012617 45012993 45012776 Y NA PRR5 NA NA NA NA PRR5 49600 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 45016324 45016531 45016433 Y PARVG,PARVG,PRR5 PRR5 NA NA NA NA PRR5 46062 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 45402294 45403188 45402906 Y NA PHF21B NA NA NA NA PHF21B 692 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 45403389 45403735 45403573 Y KIAA0930,PHF21B,PHF21B,PHF21B PHF21B NA NA NA NA PHF21B 145 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr22 45543738 45543876 45543815 Y PHF21B,NUP50,NUP50 CTA-217C2.1,NUP50 NA NA NA NA CTA-217C2.1 13786 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 45551419 45551722 45551561 Y NA CTA-217C2.1,NUP50 NA NA NA NA CTA-217C2.1 5940 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 45553376 45553664 45553597 Y NA CTA-217C2.1,NUP50 NA NA NA NA CTA-217C2.1 3998 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 45554826 45555155 45554995 Y KIAA0930 CTA-217C2.1,NUP50 NA NA NA NA CTA-217C2.1 2507 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 45664918 45665214 45665118 Y NA KIAA0930,FAM118A LOC100506714,SMC1B,PHF21B,FBLN1,KIAA0930,FAM118A,RIBC2,UPK3A,ATXN10 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0930 30268 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 45820096 45820426 45820265 Y NA RIBC2 NA NA NA NA RIBC2 12524 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 46374858 46375446 46375153 Y NA NA NA NA NA NA RP6-109B7.3 72139 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 46442068 46442299 46442118 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4 NA NA NA NA RP6-109B7.3 5286 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 46455003 46455485 46455192 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4 NA NA NA NA C22orf26 6979 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 46462776 46462894 46462836 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 877 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 46464940 46465203 46464976 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 1169 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 46467914 46468476 46468052 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 4143 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr22 46472616 46472825 46472697 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 8845 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 46474643 46475112 46474791 Y C22orf26 RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 10872 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr22 46480881 46481264 46481017 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 17110 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr22 46483894 46484294 46483949 Y C22orf26 RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 20123 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr22 46495432 46495673 46495573 Y C22orf26 RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B,PPARA NA NA NA NA MIR4763 11773 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 46641618 46641856 46641678 Y PPARA TTC38,GTSE1 NA NA NA NA TTC38 20002 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr22 46745093 46745309 46745201 Y NA TRMU NA NA NA NA TRMU 20321 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 46975782 46975960 46975875 Y NA CELSR1,GRAMD4 TRMU,GRAMD4,CELSR1 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 5873 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 46988577 46988710 46988625 Y NA GRAMD4 GRAMD4,CELSR1 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 18668 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 46992036 46992348 46992220 Y NA GRAMD4 CELSR1,GRAMD4 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 22127 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 47126357 47126654 47126612 Y NA CERK,TBC1D22A NA NA NA NA CERK 5504 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 47498045 47498267 47498202 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 341527 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 47579960 47580142 47580051 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 423442 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 47848340 47848433 47848387 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 691822 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 48819492 48819902 48819578 Y FAM19A5 NA NA NA NA NA FAM19A5 63370 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 48963094 48963472 48963279 Y NA NA NA NA NA NA FAM19A5 79822 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.65417211981754 chr22 48973025 48973426 48973083 Y FAM19A5,FAM19A5 NA NA NA NA NA FAM19A5 89753 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.65417211981754 chr22 49123378 49123388 49123383 Y NA NA NA NA NA NA FAM19A5 240106 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 49546517 49546852 49546699 Y NA NA NA NA NA NA FAM19A5 663245 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr22 49548057 49548240 49548148 Y NA NA NA NA NA NA FAM19A5 664785 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 50242140 50242406 50242374 Y MLC1,HDAC10 BRD1,ZBED4 ZBED4,BRD1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZBED4 3084 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 50262824 50262951 50262946 Y TUBGCP6,MLC1 BRD1,ZBED4,CRELD2,ALG12 NA NA NA NA ZBED4 17334 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 50265281 50265672 50265496 Y MOV10L1,MOV10L1 BRD1,ZBED4,CRELD2,ALG12 CRELD2,ALG12 IMR90 Hi-C 24141950 ZBED4 19791 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 50272789 50273094 50272966 Y NA ZBED4,CRELD2,ALG12 NA NA NA NA ZBED4 27299 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr22 50273824 50274276 50274235 Y TUBGCP6,HDAC10,ZBED4 ZBED4,CRELD2,ALG12 NA NA NA NA ZBED4 28334 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr22 50329443 50330313 50330025 Y TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1 CRELD2,ALG12,PIM3 NA NA NA NA ALG12 19337 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 50364171 50364294 50364188 Y NA PIM3 NA NA NA NA PIM3 12010 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 50364350 50364715 50364589 Y NA PIM3 NA NA NA NA PIM3 12189 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr22 50743986 50744741 50744427 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 50744748 50744986 50744827 Y PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 692 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 50747003 50747284 50747232 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 2947 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr22 50784754 50785397 50785059 Y PPP6R2 PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PPP6R2 5021 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 50891150 50891343 50891221 Y MOV10L1,TUBGCP6,HDAC10,PPP6R2,CHKB,SBF1,NCAPH2 SBF1,ADM2 NA NA NA NA SBF1 20111 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr22 50912071 50912698 50912340 Y NA SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2 NA NA NA NA SBF1 617 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.06771514977192 chr22 51051274 51051666 51051314 Y NA CHKB-CPT1B,MAPK8IP2,CHKB,ARSA NA NA NA NA ARSA 12941 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 3177157 3177268 3177188 Y CRBN TRNT1,CRBN NA NA NA NA TRNT1 10557 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr3 3219649 3219829 3219819 Y NA CRBN NA NA NA NA CRBN 255 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 3532969 3532987 3532979 Y NA NA NA NA NA NA LRRN1 306134 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 3639816 3640081 3639965 Y NA NA NA NA NA NA LRRN1 199040 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr3 3854493 3854653 3854575 Y NA LRRN1 NA NA NA NA LRRN1 15372 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr3 3975411 3975745 3975578 Y NA NA NA NA NA NA LRRN1 136290 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 4392615 4392774 4392664 Y ITPR1 SETMAR NA NA NA NA SETMAR 49627 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 4428359 4428568 4428464 Y NA NA NA NA NA NA SUMF1 78397 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 4561829 4562207 4561897 Y BHLHE40,ITPR1 ITPR1-AS1,ITPR1 NA NA NA NA ITPR1 28797 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 4575529 4575739 4575617 Y NA ITPR1-AS1,ITPR1 NA NA NA NA ITPR1 42497 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 4763636 4764014 4763825 Y NA NA NA NA NA NA AC018816.3 162963 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 4780474 4780964 4780800 Y EDEM1,BHLHE40,ARL8B NA NA NA NA NA AC018816.3 146013 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 4781579 4781854 4781808 Y EDEM1,BHLHE40,ARL8B NA NA NA NA NA AC018816.3 145123 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 4801058 4801218 4801184 Y NA NA NA NA NA NA AC018816.3 125759 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 4851245 4851552 4851399 Y NA NA NA NA NA NA AC018816.3 75425 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 4870922 4871280 4871101 Y NA NA NA NA NA NA AC018816.3 55697 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 4881719 4881745 4881731 Y ITPR1 AC018816.3 NA NA NA NA AC018816.3 45232 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 4885679 4886087 4885777 Y NA AC018816.3 NA NA NA NA AC018816.3 40890 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 5157481 5157555 5157517 Y NA ARL8B NA NA NA NA ARL8B 4350 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 5181258 5181597 5181446 Y BHLHE40,ARL8B,EDEM1 ARL8B,EDEM1 EDEM1 IMR90 Hi-C 24141950 ARL8B 19353 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 5182623 5182897 5182737 Y BHLHE40,ARL8B,EDEM1 ARL8B,EDEM1 EDEM1 IMR90 Hi-C 24141950 ARL8B 20718 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 7015968 7016152 7016014 Y NA NA NA NA NA NA GRM7 206280 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 7637576 7637959 7637768 Y NA NA NA NA NA NA GRM7 827888 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr3 9006142 9006408 9006272 Y NA RAD18 NA NA NA NA RAD18 2685 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 9050336 9050687 9050476 Y NA RAD18 NA NA NA NA RAD18 46879 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 9178010 9178181 9178119 Y NA NA NA NA NA NA RAD18 174553 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 9422978 9423353 9423146 Y SETD5,RAD18,THUMPD3 THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1 NA NA NA NA SETD5 13946 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr3 9995528 9995903 9995716 Y NA IL17RC,CRELD1,PRRT3-AS1,PRRT3,EMC3-AS1 NA NA NA NA PRRT3 3450 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 10157932 10158133 10158106 Y NA BRK1,VHL,IRAK2 NA NA NA NA BRK1 2656 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 10395342 10395455 10395399 Y NA SEC13 NA NA NA NA SEC13 34480 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 10402355 10402452 10402401 Y FANCD2 SEC13 NA NA NA NA SEC13 41493 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 10530301 10530340 10530330 Y NA NA NA NA NA NA SEC13 169439 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 11138272 11138477 11138338 Y NA HRH1 HRH1,ATG7 IMR90 Hi-C 24141950 HRH1 38302 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 11237617 11237805 11237677 Y NA NA NA NA NA NA HRH1 60838 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 11591830 11592141 11591986 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 168079 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 11812040 11812191 11812115 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 51820 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 12137205 12137457 12137242 Y NA NA NA NA NA NA TIMP4 61394 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 12163583 12163954 12163774 Y SYN2 TIMP4 NA NA NA NA TIMP4 34897 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 12211698 12212069 12211921 Y PPARG,PPARG TIMP4 NA NA NA NA TIMP4 12847 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 12567743 12567843 12567793 Y NA TSEN2,MKRN2 NA NA NA NA MKRN2 28670 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 12621651 12621927 12621686 Y RPL32 MKRN2 NA NA NA NA MKRN2 25138 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 12688995 12689498 12689361 Y RAF1 RAF1 NA NA NA NA RAF1 14227 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 13040844 13041238 13041111 Y RAF1 NA NA NA NA NA IQSEC1 71379 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 13045680 13046084 13045881 Y NA NA NA NA NA NA IQSEC1 66533 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 13062449 13062850 13062655 Y RPL32,NUP210,IQSEC1 IQSEC1 NA NA NA NA IQSEC1 49767 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 13083903 13084071 13084052 Y NA IQSEC1 NA NA NA NA IQSEC1 28546 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr3 13111176 13111312 13111239 Y NUP210,IQSEC1 IQSEC1 NA NA NA NA IQSEC1 1305 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 13325256 13325344 13325300 Y NA NA NUP210,LOC285375 IMR90 Hi-C 24141950 NUP210 134465 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 13452835 13453081 13452953 Y IQSEC1,HDAC11,HDAC11 NUP210 NA NA NA NA NUP210 6728 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 13457131 13457321 13457226 Y NUP210 NUP210 NA NA NA NA NUP210 2488 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 13493281 13493606 13493395 Y NA NUP210,HDAC11 IQSEC1,NUP210 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HDAC11 25618 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 13884272 13884624 13884569 Y WNT7A NA NA NA NA NA CHCHD4 279746 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 13936849 13937176 13936976 Y NA NA C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CHCHD4 227194 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 14167210 14167731 14167391 Y TMEM43,XPC CHCHD4,TMEM43 NA NA NA NA TMEM43 2770 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 14257734 14258042 14257871 Y NA LSM3,XPC NA NA NA NA XPC 39451 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.34401484735175 chr3 14419300 14419574 14419395 Y C3orf19,SLC6A6 SLC6A6 SLC6A6,LSM3,XPC,GRIP2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC6A6 22502 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 14465560 14465693 14465626 Y C3orf19,SLC6A6 SLC6A6 NA NA NA NA SLC6A6 23484 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 14466133 14466429 14466346 Y C3orf19,XPC,SLC6A6 SLC6A6 NA NA NA NA SLC6A6 24057 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 14715115 14715196 14715168 Y NR2C2,C3orf20 C3orf20 NA NA NA NA C3orf20 509 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 15060728 15061023 15060876 Y NR2C2 MRPS25 NA NA NA NA MRPS25 43819 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 15105615 15105982 15105798 Y NA MRPS25,ZFYVE20 NA NA NA NA MRPS25 773 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 15285479 15285699 15285585 Y NR2C2,ZFYVE20,SH3BP5,CAPN7 CAPN7 NA NA NA NA CAPN7 39820 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 15286616 15286745 15286681 Y NR2C2,ZFYVE20,SH3BP5,EAF1,COLQ,CAPN7 CAPN7 NA NA NA NA CAPN7 40957 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 15443040 15443420 15443273 Y ANKRD28,METTL6,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5 EAF1,METTL6 NA NA NA NA EAF1 23442 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 15704167 15704382 15704274 Y ANKRD28,CAPN7 NA NA NA NA NA HACL1 62829 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 15780032 15780074 15780052 Y SH3BP5,EAF1 NA BTD IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD28 119204 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 15783171 15783247 15783208 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD28 116031 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 15835826 15836097 15835987 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28 NA NA NA NA NA ANKRD28 63181 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 15901875 15902313 15902310 Y METTL6,ANKRD28 ANKRD28 NA NA NA NA ANKRD28 2597 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr3 16324333 16324353 16324342 Y NA DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 19627 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr3 16351640 16351656 16351648 Y RFTN1,OXNAD1 DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 46934 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 16352603 16353027 16352777 Y RFTN1,OXNAD1 DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 47897 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr3 16373323 16373612 16373405 Y ANKRD28,OXNAD1 NA NA NA NA NA OXNAD1 68617 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr3 16440818 16441233 16441127 Y DPH3,RFTN1 NA NA NA NA NA RFTN1 112300 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 16508881 16509222 16509075 Y PLCL2,DPH3,RFTN1 RFTN1 NA NA NA NA RFTN1 44311 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 16552919 16553213 16553144 Y NA RFTN1 NA NA NA NA RFTN1 320 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 16557386 16557712 16557598 Y PLCL2,OXNAD1,RFTN1 RFTN1 NA NA NA NA RFTN1 3853 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 16561749 16562172 16561969 Y NA RFTN1 RFTN1,OXNAD1,ANKRD28 IMR90 Hi-C 24141950 RFTN1 8216 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 17063194 17063491 17063326 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 221035 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 17345014 17345355 17345310 Y TBC1D5,TBC1D5 NA NA NA NA NA PLCL2 502855 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 17378312 17378639 17378476 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 536153 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 17404652 17404912 17404782 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 562493 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 17441926 17442172 17442040 Y PLCL2 NA NA NA NA NA PLCL2 599767 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 17542863 17543019 17542979 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 700704 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 17543312 17543623 17543461 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 701153 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 17913596 17913897 17913750 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 570412 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA RAD23BP1 NA NA NA NA RAD23BP1 2077 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 18701655 18701870 18701736 Y NA NA NA NA NA NA RAD23BP1 123490 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 19188369 19188866 19188531 Y NA KCNH8 NA NA NA NA KCNH8 423 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 19276013 19276112 19276058 Y NA NA NA NA NA NA KCNH8 88067 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 7.96070332662191 chr3 19379484 19379512 19379499 Y KCNH8 NA NA NA NA NA KCNH8 191538 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 19399413 19399531 19399472 Y NA NA NA NA NA NA KCNH8 211467 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 19470380 19470682 19470561 Y NA NA NA NA NA NA KCNH8 282434 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr3 19993428 19993925 19993635 Y KAT2B,RAB5A EFHB,RAB5A NA NA NA NA RAB5A 6857 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 20082717 20083237 20083200 Y RAB5A,KAT2B KAT2B NA NA NA NA KAT2B 3202 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 20096123 20096547 20096288 Y RAB5A KAT2B NA NA NA NA KAT2B 16608 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 20190984 20191185 20191115 Y SGOL1,SGOL1 SGOL1 NA NA NA NA SGOL1 34599 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 20200050 20200329 20200065 Y NA SGOL1 NA NA NA NA SGOL1 25455 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 22057761 22057940 22057851 Y NA NA NA NA NA NA ZNF385D 354872 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 23389835 23390198 23389844 Y NA NA NA NA NA NA UBE2E2 147324 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 23432118 23432366 23432242 Y NA NA NA NA NA NA UBE2E2 189607 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 23609558 23609766 23609671 Y NA NA NA NA NA NA UBE2E1 235628 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 23804408 23804637 23804450 Y NA UBE2E1 UBE2E1,UBE2E2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 40757 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 23898490 23898770 23898565 Y NA NA NKIRAS1,RPL15 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 53096 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 25790563 25790933 25790768 Y NA OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 31475 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 25796078 25796406 25796226 Y NGLY1 OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 26002 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 25909131 25909147 25909139 Y NA NA NA NA NA NA NGLY1 79601 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 27524458 27524952 27524717 Y NA SLC4A7,RNU1-96P NA NA NA NA SLC4A7 547 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA AC098614.2 SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 AC098614.2 2140 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.34401484735175 chr3 28367464 28367703 28367584 Y NA AZI2,ZCWPW2 NA NA NA NA AZI2 20915 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 28684984 28685217 28685101 Y NA NA NA NA NA NA LINC00693 70702 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 28713649 28713858 28713754 Y ZCWPW2 NA NA NA NA NA LINC00693 99367 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 29288264 29288669 29288439 Y NA RBMS3 RBMS3 IMR90 Hi-C 24141950 RBMS3 31804 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 29321469 29321877 29321696 Y NA RBMS3 NA NA NA NA RBMS3 996 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr3 29365730 29366225 29365913 Y NA RBMS3 NA NA NA NA RBMS3 45257 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr3 29412640 29413015 29412700 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 92167 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 29496223 29496522 29496266 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 175750 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 29568670 29568984 29568828 Y RBMS3 NA NA NA NA NA RBMS3-AS2 113316 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 29660032 29660218 29660060 Y NA RBMS3-AS2 NA NA NA NA RBMS3-AS2 22082 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr3 29660758 29661082 29660950 Y NA RBMS3-AS2 NA NA NA NA RBMS3-AS2 21218 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr3 29725037 29725420 29725261 Y NA RBMS3-AS2 NA NA NA NA RBMS3-AS2 42737 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 29735360 29735534 29735491 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3-AS2 53060 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 29736457 29736614 29736535 Y RBMS3 NA NA NA NA NA RBMS3-AS2 54157 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 29983920 29984245 29984164 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3-AS2 301620 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 30221819 30222038 30221911 Y NA NA TGFBR2,GADL1 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBR2 423956 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 30377149 30377465 30377308 Y NA NA TGFBR2 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBR2 268529 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 31207703 31207815 31207739 Y STT3B NA GADL1 IMR90 Hi-C 24141950 STT3B 364315 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 31584966 31585359 31585050 Y NA STT3B NA NA NA NA STT3B 12836 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 31690891 31691368 31691073 Y ZNF860,OSBPL10 NA NA NA NA NA STT3B 118761 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 31924742 31925048 31924896 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL10 192024 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 32434248 32434406 32434345 Y NA CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 3085 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 32443431 32443555 32443473 Y CMTM7 CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 12268 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 32535422 32535827 32535806 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 7073 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 32857811 32858132 32857909 Y NA AC139452.2 NA NA NA NA AC139452.2 32673 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr3 33002804 33002999 33002866 Y NA NA NA NA NA NA SEC13P1 70356 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 33063733 33064078 33063817 Y NA SEC13P1 NA NA NA NA SEC13P1 9277 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 33086079 33086426 33086309 Y CCR4 SEC13P1,TMPPE NA NA NA NA SEC13P1 12724 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 33190938 33191178 33190994 Y NA CRTAP NA NA NA NA CRTAP 37467 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 33382066 33382350 33382208 Y CLASP2 NA NA NA NA NA FBXL2 65549 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 33436260 33436332 33436276 Y CLASP2,FBXL2,FBXL2 UBP1 NA NA NA NA UBP1 44531 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 33554713 33555077 33554895 Y NA NA NA NA NA NA UBP1 73850 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 33590851 33591213 33591209 Y NA NA NA NA NA NA UBP1 109988 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr3 33619018 33619340 33619189 Y CLASP2 NA NA NA NA NA UBP1 138155 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr3 34466240 34466377 34466243 Y NA NA NA NA NA NA PDCD6IP 628396 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 35554607 35554628 35554618 Y NA NA NA NA NA NA STAC 865208 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 36536348 36536512 36536414 Y MLH1,MLH1,EPM2AIP1 NA NA NA NA NA STAC 116512 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 37011455 37011827 37011685 Y LRRFIP2,ITGA9,GOLGA4,MLH1,MLH1,EPM2AIP1 EPM2AIP1,MLH1,RPL29P11 NA NA NA NA EPM2AIP1 20968 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 37164159 37164535 37164493 Y NA NA MLH1 IMR90 Hi-C 24141950 LRRFIP2 58645 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 37218637 37218971 37218954 Y DCLK3,TRANK1,C3orf35 LRRFIP2 MLH1 IMR90 Hi-C 24141950 LRRFIP2 4209 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 37344922 37345358 37345096 Y NA NA NA NA NA NA AC097359.1 61236 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 37901883 37902306 37902042 Y CTDSPL AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 432 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.65417211981754 chr3 38209266 38209592 38209336 Y VILL,PLCD1,SLC22A14,ACAA1,MYD88,OXSR1 ACAA1,MYD88,OXSR1 NA NA NA NA OXSR1 4686 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 38227489 38227608 38227524 Y NA MYD88,OXSR1 NA NA NA NA OXSR1 22909 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 38497232 38497482 38497354 Y NA ACVR2B,EXOG NA NA NA NA ACVR2B 3890 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr3 38568637 38569221 38568871 Y SCN10A,SCN11A,SLC22A14,EXOG EXOG NA NA NA NA EXOG 33019 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 38586516 38586674 38586595 Y NA NA NA NA NA NA EXOG 50898 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 39193999 39194528 39194467 Y NA TTC21A,GORASP1 NA NA NA NA CSRNP1 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 39222162 39222653 39222434 Y NA CSRNP1 NA NA NA NA CSRNP1 28109 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 39416078 39416196 39416159 Y TTC21A,MOBP SLC25A38,RPSA SLC25A38 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC25A38 6643 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 41043965 41044133 41044050 Y NA NA ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 CTNNB1 190195 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 42220925 42221235 42221114 Y TRAK1 NA NA NA NA NA TRAK1 167631 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 42514954 42515471 42515310 Y NA RP11-219I21.1,VIPR1 TRAK1,VIPR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-219I21.1 5822 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 42531634 42531985 42531932 Y NA RP11-219I21.1,VIPR1 NA NA NA NA VIPR1 2843 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 42922564 42922793 42922612 Y C3orf39 ZNF662 NA NA NA NA ZNF662 22430 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 43812189 43812581 43812343 Y NA NA ANO10,MIR138-1 IMR90 Hi-C 24141950 ANO10 81103 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 44036592 44036799 44036686 Y NA NA NA NA NA NA ANO10 305506 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 44040259 44040834 44040651 Y NA NA ANO10 IMR90 Hi-C 24141950 ANO10 309173 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr3 44599751 44600128 44599940 Y ZNF167 ZNF852,ZNF660,ZNF197 NA NA NA NA ZNF660 17587 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 44621262 44622718 44622436 Y NA ZNF660,ZNF197 NA NA NA NA ZNF197 1662 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 44652575 44652865 44652702 Y ZNF445,ZNF502,ZNF501,ZNF167,ZNF660,ZNF197 ZNF660,ZNF197,ZNF35 NA NA NA NA ZNF197 28195 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 44654573 44654874 44654724 Y ZNF445,ZNF501,ZNF167,ZNF660,ZNF197 ZNF660,ZNF197,ZNF35 NA NA NA NA ZNF197 30193 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 44697594 44698203 44697878 Y NA ZNF35,RP11-944L7.4 NA NA NA NA ZNF35 9375 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 45035735 45035877 45035806 Y ZNF660,ZNF35 EXOSC7,ZDHHC3 NA NA NA NA ZDHHC3 20058 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 45175300 45175656 45175542 Y NA CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 10258 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 45387426 45387653 45387535 Y NA LARS2 LIMD1,LARS2,CLEC3B,LOC644714,SACM1L,EXOSC7,CDCP1,TMEM158,FYCO1 IMR90 Hi-C 24141950 LARS2 40345 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 45609249 45609611 45609389 Y LIMD1 LIMD1 NA NA NA NA LIMD1 14363 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 46125575 46126002 46125636 Y NA NA FYCO1,XCR1,SLC6A20,CCR9,CXCR6,CCR5,SACM1L,LZTFL1,CCR1,LRRC2 IMR90 Hi-C 24141950 FYCO1 90259 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 46600040 46600219 46600077 Y NA LRRC2 NA NA NA NA LRRC2 19370 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 46971519 46971826 46971651 Y SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12 NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 47347 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 46990572 46990937 46990863 Y NA NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 28236 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 46995135 46995433 46995392 Y NA NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 23740 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 47002825 47003246 47003204 Y NA NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 15927 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 47072517 47072982 47072882 Y NBEAL2 NA NA NA NA NA CCDC12 51017 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 47120016 47120037 47120026 Y SETD2,KLHL18,PRSS45,CCDC12 NA NA NA NA NA SETD2 83420 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 47134411 47134793 47134602 Y SETD2 NA NA NA NA NA SETD2 68664 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 47176804 47177094 47176949 Y PRSS45,PRSS42 SETD2,KIF9-AS1 NA NA NA NA SETD2 26363 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 47201175 47201471 47201342 Y CSPG5,SETD2 SETD2,KIF9-AS1 NA NA NA NA SETD2 1986 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 47203467 47203704 47203598 Y NA SETD2,KIF9-AS1 NA NA NA NA SETD2 10 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 47204029 47204492 47204291 Y NA SETD2,KIF9-AS1 NA NA NA NA KIF9-AS1 42 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 47421570 47421869 47421711 Y NA PTPN23 NA NA NA NA PTPN23 1069 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 47704557 47705253 47705047 Y SETD2 NA NA NA NA NA CSPG5 84275 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr3 47875023 47875428 47875228 Y NA DHX30 NA NA NA NA DHX30 32624 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 47898226 47898293 47898260 Y NA NA NA NA NA NA DHX30 55827 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 47991974 47992099 47992083 Y CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A NA NA NA NA NA MAP4 136670 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 48128782 48129302 48129029 Y NA MAP4,RP11-1029M24.1 NA NA NA NA MAP4 13 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr3 48332679 48332937 48332732 Y SPINK8 NME6 NA NA NA NA NME6 8238 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 48734201 48734270 48734236 Y NA CELSR3,NCKIPSD,IP6K2 NA NA NA NA NCKIPSD 12404 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 48967045 48967316 48967140 Y NA SLC25A20,ARIH2 NA NA NA NA ARIH2 12791 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 49105949 49106080 49106015 Y ARIH2 DALRD3,IMPDH2,QRICH1,QARS NA NA NA NA QRICH1 23716 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 49123301 49123671 49123633 Y NA QRICH1,QARS,USP19,LAMB2 NA NA NA NA QRICH1 6125 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr3 49358291 49358883 49358713 Y ARIH2,C3orf71,NDUFAF3,DALRD3,QRICH1,USP19,UBA7,IP6K1,USP4 USP4,GPX1 NA NA NA NA USP4 17262 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 49696171 49696492 49696217 Y NA APEH,RNF123,MST1 APEH,MST1,RNF123 IMR90 Hi-C 24141950 APEH 12943 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 50264852 50265230 50265012 Y TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2 SLC38A3,GNAI2 NA NA NA NA GNAI2 3128 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 50411624 50411893 50411737 Y NA TUSC2,RASSF1,CYB561D2,NPRL2,TMEM115 NA NA NA NA TMEM115 16583 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 50472730 50473023 50472977 Y NA NA NA NA NA NA CACNA2D2 66652 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 50484818 50485110 50484987 Y GNAI2,RASSF1,RASSF1,CYB561D2,MAPKAPK3 NA CYB561D2,TMEM115,NPRL2 IMR90 Hi-C 24141950 CACNA2D2 54565 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 50510468 50510743 50510606 Y RASSF1,RASSF1 CACNA2D2 NA NA NA NA CACNA2D2 28932 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 50638353 50638905 50638586 Y MAPKAPK3,CISH HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH NA NA NA NA MAPKAPK3 8046 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 51062777 51063032 51062936 Y VPRBP,RBM15B NA NA NA NA NA MIR4787 352266 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 51506153 51506528 51506417 Y VPRBP,RAD54L2,GPR62 VPRBP NA NA NA NA VPRBP 25482 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 51573530 51573858 51573781 Y VPRBP,RAD54L2 VPRBP NA NA NA NA VPRBP 41520 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 51628881 51628909 51628894 Y GPR62 NA NA NA NA NA TEX264 65800 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 52009750 52010220 52010093 Y NA RRP9,PARP3,GPR62,PCBP4,ABHD14A,ABHD14A-ACY1,ACY1,ABHD14B,RPL29 NA NA NA NA ABHD14A-ACY1,ACY1 2684 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 52081342 52081690 52081545 Y GPR62,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 6876 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 52091161 52091675 52091445 Y TWF2,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 2595 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 52121101 52121264 52121190 Y NA DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 32535 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 52168814 52168827 52168821 Y NA POC1A NA NA NA NA POC1A 17879 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 52278175 52278351 52278252 Y PBRM1,PBRM1,WDR82,GLYCTK,TWF2,PPM1M,PPM1M ALAS1,RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82 NA NA NA NA PPM1M 334 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 52287340 52287625 52287477 Y PBRM1,NISCH,WDR82,GLYCTK,PPM1M,PPM1M RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82,GLYCTK-AS1 NA NA NA NA PPM1M 9499 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 52334165 52334539 52334405 Y NA GLYCTK,WDR82,GLYCTK-AS1 NA NA NA NA GLYCTK-AS1 3082 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 52502448 52502781 52502494 Y ABHD14B,NISCH SEMA3G,NISCH NA NA NA NA NISCH 15314 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 52590623 52590962 52590793 Y NA NT5DC2 NA NA NA NA NT5DC2 23553 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 53136597 53136930 53136874 Y PBRM1,PBRM1,TMEM110,DCP1A,PRKCD RFT1 NA NA NA NA RFT1 25548 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 53362706 53362961 53362819 Y NA DCP1A NA NA NA NA DCP1A 16693 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 53380883 53380907 53380896 Y TMEM110,PRKCD,DCP1A DCP1A NA NA NA NA DCP1A 1229 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 53568043 53568300 53568167 Y SFMBT1 CACNA1D NA NA NA NA CACNA1D 41360 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 54477784 54478003 54477891 Y NA NA NA NA NA NA RPS15P5 180239 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 54856337 54856720 54856396 Y NA NA NA NA NA NA RPS15P5 198095 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 55232673 55232906 55232681 Y WNT5A NA WNT5A,CACNA2D3,ERC2,C3orf51 IMR90 Hi-C 24141950 RPS15P5 574431 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 55517501 55517653 55517577 Y NA NA NA NA NA NA RPS15P5 859259 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 56416908 56417062 56416985 Y ERC2 NA NA NA NA NA ERC2 83329 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 56443112 56443203 56443174 Y NA NA NA NA NA NA ERC2 57188 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 56665346 56665542 56665444 Y C3orf63 FAM208A NA NA NA NA FAM208A 49723 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 56814931 56815295 56815113 Y NA NA NA NA NA NA FAM208A 99666 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 56864313 56864691 56864516 Y NA NA NA NA NA NA FAM208A 149048 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 57197470 57197866 57197668 Y NA RP11-157F20.1,IL17RD NA NA NA NA IL17RD 4468 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 57555554 57555589 57555572 Y FAM116A,PDE12 PDE12,ARF4 NA NA NA NA PDE12 15551 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 57562103 57562255 57562188 Y SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12 PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 19692 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr3 57566206 57566518 57566262 Y NA PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 15429 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 57572232 57572342 57572306 Y NA PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 9605 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 58218436 58218533 58218485 Y ABHD6 ABHD6 FLNB,DNASE1L3,ABHD6 IMR90 Hi-C 24141950 ABHD6 2700 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 59488457 59488969 59488744 Y NA NA NA NA NA NA C3orf67 454647 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 60360991 60361355 60361182 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 873778 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 60695765 60695821 60695814 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 539312 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 60715683 60716344 60716091 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 518789 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 62364078 62364515 62364449 Y NA PTPRG-AS1 NA NA NA NA PTPRG-AS1 11073 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 62422700 62423042 62422978 Y C3orf14,FEZF2,CADPS NA NA NA NA NA PTPRG-AS1 69695 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 62590443 62590784 62590607 Y NA NA NA NA NA NA PTPRG-AS1 237438 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 63848274 63848561 63848418 Y NA THOC7 NA NA NA NA THOC7 695 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 64563963 64564300 64564067 Y ADAMTS9 NA NA NA NA NA ADAMTS9-AS2 104285 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 64867225 64867230 64867228 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS9 195549 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 64958590 64958764 64958643 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS9 286914 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 65006245 65006269 65006257 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS9 334569 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 65016570 65016819 65016695 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS9 344894 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 65045774 65045784 65045779 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS9 374098 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 65260004 65260375 65260190 Y NA NA ADAMTS9-AS2 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS9 588328 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 65375565 65375903 65375734 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 646606 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 65744738 65744801 65744770 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 277708 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 66546176 66546348 66546214 Y NA LRIG1 NA NA NA NA LRIG1 3339 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 67050514 67050733 67050633 Y KBTBD8 KBTBD8 NA NA NA NA KBTBD8 3787 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 67455058 67455415 67455236 Y NA NA NA NA NA NA SUCLG2 247623 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 68924385 68924396 68924391 Y NA NA NA NA NA NA FAM19A4 55365 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 69218338 69218527 69218433 Y FRMD4B NA NA NA NA NA ARL6IP5 86243 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 69228052 69228449 69228187 Y NA NA NA NA NA NA ARL6IP5 95957 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 69237386 69237579 69237483 Y NA NA NA NA NA NA ARL6IP5 105291 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 69255559 69255753 69255624 Y TMF1 NA NA NA NA NA ARL6IP5 123464 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 69262443 69262764 69262745 Y NA NA NA NA NA NA ARL6IP5 130348 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 69380103 69380434 69380250 Y MITF,FRMD4B NA NA NA NA NA FRMD4B 209300 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 69555585 69555706 69555646 Y NA FRMD4B NA NA NA NA FRMD4B 34028 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 69582774 69582816 69582795 Y NA FRMD4B NA NA NA NA FRMD4B 6918 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 71031841 71032211 71032107 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 598929 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 71116020 71116294 71116249 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 514846 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 71151319 71151713 71151657 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 479427 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 71158778 71158960 71158907 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 472180 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 71267437 71267786 71267612 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 363354 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 71439009 71439199 71439166 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 191941 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 71490469 71490633 71490551 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 140507 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 71538205 71538976 71538530 Y EIF4E3 NA NA NA NA NA FOXP1 92164 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 71588104 71588187 71588146 Y NA FOXP1 NA NA NA NA FOXP1 42953 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 71628462 71628802 71628743 Y NA FOXP1 NA NA NA NA FOXP1 2338 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 71628829 71629563 71629383 Y EIF4E3 FOXP1 NA NA NA NA FOXP1 1577 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 71775445 71775695 71775661 Y PROK2,EIF4E3,GPR27,EIF4E3,EIF4E3 GPR27,EIF4E3 NA NA NA NA GPR27 25506 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 72059238 72059542 72059440 Y RYBP,EIF4E3 NA SHQ1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00870 138866 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 72338130 72338451 72338187 Y NA LINC00877 SHQ1,RYBP IMR90 Hi-C 24141950 LINC00877 48414 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 72862614 72863000 72862807 Y SHQ1 SHQ1 NA NA NA NA SHQ1 46065 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 73159773 73160145 73159855 Y EBLN2 NA PDZRN3,CACNA1D IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC75P1 70297 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr3 73492361 73492586 73492474 Y NA NA NA NA NA NA PDZRN3 179505 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 73697614 73697785 73697708 Y NA PDZRN3 NA NA NA NA PDZRN3 25523 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 73835686 73835988 73835837 Y NA NA PDZRN3 IMR90 Hi-C 24141950 PDZRN3 163595 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 74641204 74641330 74641267 Y NA NA NA NA NA NA FAM86DP 840931 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 77632301 77632638 77632470 Y NA NA NA NA NA NA RP11-550F7.1 1151132 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 79455772 79456088 79455911 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 358877 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 79674571 79674688 79674630 Y ROBO1 NA NA NA NA NA ROBO1 140277 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 79786804 79786811 79786808 Y NA ROBO1 NA NA NA NA ROBO1 28154 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 80630991 80631014 80631005 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 816026 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr3 80819406 80819881 80819642 Y NA NA NA NA NA NA GBE1 989431 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 30.4987984591359 chr3 80820355 80820528 80820440 Y NA NA NA NA NA NA GBE1 988784 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr3 85011127 85011790 85011174 Y NA CADM2 NA NA NA NA CADM2 4995 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 85071263 85071596 85071400 Y NA NA NA NA NA NA CADM2 65131 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 85120525 85120655 85120534 Y CADM2 NA NA NA NA NA CADM2 114393 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 85158641 85158936 85158716 Y CADM2 NA NA NA NA NA CADM2 152509 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 85318532 85318917 85318639 Y NA NA NA NA NA NA CADM2 312400 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 85479934 85479951 85479943 Y NA NA NA NA NA NA CADM2 473802 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 88151728 88152092 88151734 Y NA C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA C3orf38 44801 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 88208920 88209337 88209164 Y CGGBP1,C3orf38 C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA CGGBP1 11885 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 88211290 88211624 88211397 Y NA C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA CGGBP1 14255 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 88255753 88255858 88255769 Y HTR1F NA NA NA NA NA CGGBP1 58718 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 88367245 88367614 88367269 Y NA ABCF2P1 NA NA NA NA ABCF2P1 2939 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 89352653 89353050 89352849 Y EPHA3 NA NA NA NA NA NDUFA5P5 704442 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 95513567 95513728 95513648 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPKP4 552670 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 96336052 96336669 96336607 Y NA NA NA NA NA NA EPHA6 194756 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 97508761 97509065 97508913 Y NA ARL6 NA NA NA NA ARL6 27396 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 98060136 98060151 98060144 Y OR5AC2,OR5H6,OR5H2,OR5K4 NA GABRR3 IMR90 Hi-C 24141950 CLDND1 179759 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 98483541 98483706 98483644 Y ST3GAL6 ST3GAL6 NA NA NA NA ST3GAL6 34461 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 98504725 98505044 98504856 Y OR5K4,ST3GAL6 NA NA NA NA NA ST3GAL6 55645 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr3 98505158 98505735 98505540 Y ST3GAL6 NA NA NA NA NA ST3GAL6 56078 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr3 98509261 98509585 98509483 Y NA NA NA NA NA NA ST3GAL6 60181 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 98544884 98545154 98545150 Y NA NA NA NA NA NA DCBLD2 73379 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 98549481 98549862 98549828 Y NA NA NA NA NA NA DCBLD2 68671 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 99248067 99248436 99248240 Y NA NA NA NA NA NA LINC00973 550165 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 99575221 99575605 99575379 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 255752 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 99582587 99582828 99582708 Y FILIP1L NA NA NA NA NA FILIP1L 248529 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 99584293 99584813 99584482 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 246544 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 99596957 99597300 99597045 Y TBC1D23 NA NA NA NA NA FILIP1L 234057 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 99749892 99750279 99749982 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 81078 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 99751196 99751332 99751292 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 80025 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 99764609 99765000 99764644 Y FILIP1L,C3orf26 NA TMEM30C IMR90 Hi-C 24141950 FILIP1L 66357 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 99944403 99944723 99944568 Y NA TBC1D23 C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D23 33121 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 100028092 100028475 100028284 Y TBC1D23 NIT2 NA NA NA NA NIT2 23070 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 100077983 100078198 100078091 Y FILIP1L NIT2,LNP1,TOMM70A NA NA NA NA NIT2 26438 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 101046086 101046265 101046174 Y ZBTB11,SENP7,CEP97 NA NA NA NA NA SENP7 183820 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 101403455 101403770 101403678 Y SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24 ZBTB11,CEP97 NA NA NA NA RPL24 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr3 101444542 101444901 101444615 Y FAM55C,FAM55C,CEP97 RPL24,CEP97 NA NA NA NA CEP97 3773 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr3 101598094 101598345 101598104 Y ZBTB11,NFKBIZ,NFKBIZ NA NA NA NA NA NFKBIZ 53259 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 101617563 101618145 101617662 Y ZBTB11,NFKBIZ,NFKBIZ NA LOC152225 IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIZ 72728 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 101669653 101669734 101669694 Y NA NA NA NA NA NA NFKBIZ 124818 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 103188921 103189148 103189133 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-43P 312117 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 105087916 105088171 105088021 Y ALCAM ALCAM NA NA NA NA ALCAM 4163 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 105088270 105088514 105088471 Y ALCAM ALCAM NA NA NA NA ALCAM 4517 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 105395533 105395739 105395657 Y NA NA NA NA NA NA CBLB 190657 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 105716646 105717231 105716913 Y NA NA NA NA NA NA CBLB 130250 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 106445547 106445782 106445665 Y NA NA CBLB IMR90 Hi-C 24141950 LINC00883 511757 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 107111079 107111236 107111158 Y NA NA NA NA NA NA BBX 128547 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 107148336 107148412 107148401 Y NA NA LOC344595,BBX,LOC100302640 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BBX 91371 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 107148837 107149015 107148915 Y NA NA LOC344595,BBX,LOC100302640 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BBX 90768 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr3 107503481 107503523 107503501 Y NA NA NA NA NA NA BBX 263698 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 107564404 107564418 107564411 Y CCDC54 NA NA NA NA NA CD47 243454 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 107705661 107706042 107705959 Y CD47 NA MYH15,IFT57,CD47,LOC285205 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD47 101830 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 107802397 107802714 107802497 Y MYH15,HHLA2 CD47 NA NA NA NA CD47 5158 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 107803224 107803878 107803522 Y NA CD47 NA NA NA NA CD47 3994 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 111287302 111287434 111287368 Y CD96,PLCXD2 NA NA NA NA NA PLCXD2 104089 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 111456632 111456831 111456661 Y NA PHLDB2 NA NA NA NA PHLDB2 7288 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 111721363 111721636 111721520 Y NA ABHD10,TAGLN3 NA NA NA NA TAGLN3 5852 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 111723588 111723714 111723651 Y SLC9A10,TAGLN3,TAGLN3 ABHD10,TAGLN3 NA NA NA NA TAGLN3 8077 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 112069423 112069692 112069474 Y SLC9A10 CD200 NA NA NA NA CD200 20229 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 112100966 112101341 112101156 Y ATG3 NA NA NA NA NA CD200 51772 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 112258715 112258936 112258847 Y SLC35A5,ATG3 SLC35A5,ATG3 NA NA NA NA SLC35A5 19620 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 112739908 112740217 112740094 Y CD200R1 GTPBP8,RP11-572M11.4,C3orf17 NA NA NA NA C3orf17 3200 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 112866931 112867023 112866972 Y BOC NA BOC,WDR52 IMR90 Hi-C 24141950 BOC 60827 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr3 112885717 112885943 112885795 Y NA BOC BOC,WDR52,KIAA2018,SIDT1 IMR90 Hi-C 24141950 BOC 41907 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 113078924 113079182 113079053 Y NA NA NA NA NA NA BOC 151074 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 113293012 113293390 113293190 Y SPICE1,SIDT1 NA NA NA NA NA SPICE1 60978 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 113701770 113701838 113701802 Y KIAA1407,DRD3,ZDHHC23 QTRTD1 NA NA NA NA QTRTD1 20842 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 114078948 114079017 114078985 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1407 305488 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 114119592 114119835 114119768 Y ZBTB20,KIAA1407,ZBTB20 NA NA NA NA NA KIAA1407 346132 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 114165361 114165710 114165642 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1407 391901 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 114349924 114350199 114350024 Y ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20 NA NA NA NA NA ZBTB20 513919 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 114373701 114374062 114373901 Y ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20 NA NA NA NA NA ZBTB20 490056 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 114681173 114681431 114681302 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 182687 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 114798123 114798367 114798245 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 65751 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 114858726 114858764 114858745 Y NA ZBTB20 NA NA NA NA ZBTB20 5354 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 115231466 115231705 115231586 Y NA NA NA NA NA NA GAP43 108466 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 115502758 115503253 115502970 Y NA NA NA NA NA NA GAP43 162587 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr3 115503263 115503751 115503546 Y NA NA NA NA NA NA GAP43 163092 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr3 115503837 115504240 115504182 Y NA NA NA NA NA NA GAP43 163666 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 116118770 116119229 116119052 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 624316 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 117134107 117134368 117134238 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 390562 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 117632292 117632433 117632362 Y NA NA NA NA NA NA LSAMP 81662 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 119142297 119142580 119142348 Y ARHGAP31,NR1I2,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 43097 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 119144576 119144994 119144966 Y ARHGAP31,COX17,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 40683 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 119146429 119146829 119146680 Y ARHGAP31,CD80,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 38848 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr3 119147570 119147724 119147648 Y NA TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 37953 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 119238487 119238668 119238501 Y NA TIMMDC1 NA NA NA NA TIMMDC1 23108 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr3 119357693 119358081 119357897 Y GSK3B,ARHGAP31,ADPRH RP11-190C22.1,POPDC2,COX17 NA NA NA NA RP11-190C22.1 4696 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 119358479 119358737 119358596 Y NA RP11-190C22.1,POPDC2,COX17 NA NA NA NA RP11-190C22.1 5482 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 119369915 119370223 119370069 Y NR1I2 RP11-190C22.1,POPDC2,COX17 NA NA NA NA POPDC2 11948 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 119514057 119514298 119514132 Y NR1I2,NR1I2 NA NA NA NA NA COX17 119756 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 119613107 119613331 119613219 Y NA NA NA NA NA NA GSK3B 197933 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 119644387 119644860 119644721 Y NA NA NA NA NA NA GSK3B 166404 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 119809073 119809433 119809278 Y NA GSK3B,RP11-18H7.1 NA NA NA NA GSK3B 1831 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 120277715 120278240 120277932 Y NA NDUFB4 FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB4 34916 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 120492875 120493095 120492951 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33035 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 121257379 121257441 121257436 Y NA RPL7AP11,POLQ NA NA NA NA POLQ 5412 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 121520314 121520680 121520641 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 31246 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr3 122013970 122014538 122014305 Y CD86,PARP9,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DTX3L,DIRC2,CSTA NA NA NA NA NA CCDC58 85540 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 122151096 122151154 122151125 Y KPNA1 WDR5B NA NA NA NA WDR5B 18214 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 122151664 122151964 122151814 Y NA WDR5B NA NA NA NA WDR5B 18782 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 122201925 122202222 122202174 Y NA KPNA1 NA NA NA NA KPNA1 29570 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 122208819 122209075 122208974 Y NA KPNA1 NA NA NA NA KPNA1 22717 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 122400701 122401439 122401076 Y CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,HSPBAP1,DIRC2,PARP14 EIF4BP8,PARP14 NA NA NA NA PARP14 3236 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 122464996 122465160 122465078 Y PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2 HSPBAP1,DIRC2 NA NA NA NA HSPBAP1 45511 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 122476470 122476801 122476636 Y NA HSPBAP1,DIRC2 NA NA NA NA HSPBAP1 33870 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 122516218 122516436 122516387 Y CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2 HSPBAP1,DIRC2 NA NA NA NA DIRC2 4576 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 122700872 122701093 122700983 Y SEMA5B SEMA5B NA NA NA NA SEMA5B 44359 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 122800797 122800907 122800804 Y NA PDIA5 NA NA NA NA PDIA5 16888 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 123241172 123241525 123241376 Y NA NA NA NA NA NA PTPLB 60507 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 123304962 123305362 123305193 Y PTPLB PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA MYLK-AS1 2573 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 123351425 123351671 123351446 Y ADCY5 PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA MYLK-AS1 49036 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 123379811 123380137 123379976 Y NA NA NA NA NA NA MYLK-AS1 77422 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 123391718 123392030 123392015 Y ADCY5,MYLK NA NA NA NA NA MYLK-AS1 89329 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 123508502 123508917 123508819 Y NA NA NA NA NA NA MYLK 92261 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 123587912 123588093 123588031 Y ADCY5 MYLK NA NA NA NA MYLK 13085 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 123762181 123762190 123762188 Y NA NA KALRN,ROPN1 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC14 83617 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 123771847 123772007 123771927 Y NA NA KALRN IMR90 Hi-C 24141950 CCDC14 93283 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 123824591 123825032 123824690 Y NA NA NA NA NA NA CCDC14 146027 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 123976892 123977339 123977059 Y NA NA NA NA NA NA CCDC14 298328 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 124152441 124152638 124152541 Y NA NA NA NA NA NA UMPS 294575 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 124188163 124188429 124188181 Y NA NA NA NA NA NA UMPS 258784 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 124781797 124782117 124781832 Y NA HEG1 NA NA NA NA HEG1 8995 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 125053590 125053890 125053754 Y NA NA NA NA NA NA SNX4 183151 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 125709142 125709481 125709414 Y ZXDC,CCDC37 NA NA NA NA NA FAM86JP 75679 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 3.10157272465789 chr3 125993096 125993292 125993181 Y NA NA KLF15,ZXDC,ALDH1L1,CCDC37 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1L1 78259 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 126126680 126126867 126126779 Y NA NA NA NA NA NA KLF15 52395 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 126359707 126359720 126359714 Y NA TXNRD3NB,TXNRD3 NA NA NA NA TXNRD3 12278 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 126391611 126391660 126391640 Y NA TXNRD3,CHCHD6 NA NA NA NA TXNRD3 19613 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 126721076 126721245 126721142 Y PLXNA1 NA NA NA NA NA CHCHD6 300013 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 126854229 126854593 126854376 Y TXNRD3 NA NUP210P1,CHCHD6 IMR90 Hi-C 24141950 CHCHD6 433166 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 127605255 127605518 127605387 Y NA NA PODXL2,KBTBD12 IMR90 Hi-C 24141950 MGLL 65204 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 127831332 127831517 127831439 Y GATA2,GATA2 EEFSEC,RUVBL1 NA NA NA NA EEFSEC 38780 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 128129010 128129170 128129084 Y NA NA NA NA NA NA RP11-475N22.4 76885 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 128134219 128134423 128134321 Y GATA2,GATA2,GATA2,DNAJB8 NA NA NA NA NA RP11-475N22.4 71632 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 128134820 128135360 128135009 Y EEFSEC,GATA2,GATA2,GATA2,DNAJB8 NA NA NA NA NA RP11-475N22.4 70695 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 128214371 128214730 128214426 Y EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2 RP11-475N22.4,GATA2 DNAJB8,DNAJB8-AS1,GATA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GATA2 4343 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr3 128216520 128216923 128216625 Y EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2 RP11-475N22.4,GATA2 GATA2,C3orf27,RUVBL1,EEFSEC,DNAJB8,DNAJB8-AS1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GATA2 6492 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr3 128312973 128313336 128313155 Y NA NA EEFSEC,GATA2,LOC90246 IMR90 Hi-C 24141950 RPN1 84582 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 128327283 128327483 128327387 Y GATA2,GATA2,GATA2 NA NA NA NA NA RPN1 70435 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 128336521 128336831 128336572 Y DNAJB8 NA NA NA NA NA RPN1 61087 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr3 128338287 128338590 128338558 Y RAB7A NA NA NA NA NA RPN1 59328 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 128446542 128446927 128446583 Y NA RPN1,RAB7A,FTH1P4 NA NA NA NA RAB7A 3577 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 128538992 128539042 128539017 Y DNAJB8,C3orf27 NA NA NA NA NA FTH1P4 57131 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 128564550 128565114 128564776 Y DNAJB8,KIAA1257 ACAD9 NA NA NA NA ACAD9 31325 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 128745839 128746109 128746044 Y NA KIAA1257 NA NA NA NA KIAA1257 26306 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr3 128958880 128959235 128959095 Y H1FOO NA KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNBP 58115 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 129295610 129296083 129295875 Y RAB43,C3orf37,C3orf37,H1FX,MBD4 PLXND1 NA NA NA NA PLXND1 27578 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 129315678 129315871 129315798 Y PLXND1 PLXND1 NA NA NA NA PLXND1 7790 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 129519745 129520139 129519943 Y H1FOO NA NA NA NA NA TMCC1 90280 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 129572979 129573244 129573238 Y NA TMCC1 NA NA NA NA TMCC1 37175 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 130558055 130558328 130558247 Y NA ATP2C1 NA NA NA NA ATP2C1 9111 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 131197540 131197572 131197556 Y NA MRPL3 NA NA NA NA MRPL3 22255 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 132787514 132787599 132787560 Y CCRL1,UBA5,TMEM108 TMEM108 NA NA NA NA TMEM108 32279 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 132979220 132979385 132979303 Y NA RP11-402L6.1 NA NA NA NA RP11-402L6.1 5188 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr3 133147395 133147694 133147637 Y NA NA NA NA NA NA CDV3 142880 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 133295128 133295300 133295215 Y NA CDV3 NA NA NA NA CDV3 4554 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 133968581 133968789 133968685 Y NA RYK NA NA NA NA RYK 892 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 134082893 134083489 134083439 Y AMOTL2 AMOTL2 NA NA NA NA AMOTL2 8832 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 134181248 134181600 134181434 Y NA CEP63,ANAPC13 NA NA NA NA CEP63 20985 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 135827453 135827844 135827484 Y PPP2R3A NA NA NA NA NA MSL2 86239 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 135861520 135861675 135861598 Y MSL2,MSL2 NA NA NA NA NA MSL2 52408 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 135890782 135891068 135890882 Y NA MSL2 NA NA NA NA MSL2 23015 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 136067042 136067151 136067097 Y NA NA NA NA NA NA PCCB 99894 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 136153802 136154197 136154172 Y NA NA NA NA NA NA PCCB 186654 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 136420425 136420819 136420623 Y NA STAG1 NA NA NA NA STAG1 48401 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 136563637 136563997 136563817 Y NA RP11-85F14.5,NCK1 NA NA NA NA RP11-85F14.5 14899 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 136571906 136572239 136572061 Y TMEM22 RP11-85F14.5,NCK1 NA NA NA NA RP11-85F14.5 6657 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 137768870 137769254 137769106 Y NA NA NA NA NA NA DZIP1L 63406 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 137990064 137990319 137990141 Y NA NA NA NA NA NA ARMC8 85955 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 138442687 138442826 138442751 Y NA NA NA NA NA NA PIK3CB 108954 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 139064285 139064552 139064299 Y NA COPB2,RP11-319G6.1 NA NA NA NA COPB2 42022 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 139253953 139254145 139254018 Y NA RBP1 NA NA NA NA RBP1 2526 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 139715933 139715982 139715958 Y NA NA NA NA NA NA CLSTN2 63906 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 139922309 139922336 139922321 Y CLSTN2 NA NA NA NA NA CLSTN2 270282 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr3 141065863 141066028 141065983 Y NA ZBTB38 NA NA NA NA ZBTB38 24808 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 141230074 141230471 141230125 Y NA RASA2 NA NA NA NA RASA2 26185 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 141458120 141458481 141458300 Y RASA2 RNF7 NA NA NA NA RNF7 3074 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 141482175 141482451 141482314 Y NA RNF7 NA NA NA NA RNF7 27129 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 141610914 141611173 141610928 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 17948 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr3 141611491 141611772 141611584 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 18525 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 141758636 141758867 141758743 Y NA RP11-343B5.1 NA NA NA NA RP11-343B5.1 2173 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 141845785 141846169 141845896 Y NA TFDP2 NA NA NA NA TFDP2 20217 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 142580771 142580984 142580878 Y NA RP11-372E1.1,PCOLCE2 NA NA NA NA PCOLCE2 25061 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 142723898 142724007 142723903 Y NA PAQR9,U2SURP NA NA NA NA U2SURP 42559 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 142844875 142844897 142844886 Y PAQR9,CHST2 CHST2,PBX2P1 NA NA NA NA CHST2 8702 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 143406447 143406725 143406586 Y NA NA NA NA NA NA SLC9A9 158648 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 143693787 143694146 143693885 Y C3orf58,C3orf58 C3orf58 NA NA NA NA C3orf58 5147 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 143705621 143705974 143705695 Y C3orf58,C3orf58 C3orf58 NA NA NA NA C3orf58 16981 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 146114612 146114675 146114644 Y NA NA NA NA NA NA PLSCR1 145976 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 148781933 148782210 148782183 Y NA HLTF NA NA NA NA HLTF 20131 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr3 148899476 148899525 148899501 Y AGTR1,AGTR1,TM4SF4,CP NA NA NA NA NA HPS3 54105 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 149151278 149151442 149151363 Y NA NA GYG1,TM4SF18,TM4SF1,WWTR1,WWTR1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TM4SF1 57626 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 149657313 149657850 149657694 Y TSC22D2,RNF13 ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 26322 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 149665014 149665210 149665089 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 18962 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 149665230 149665637 149665395 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 18535 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 149668313 149668642 149668480 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 15530 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 149960024 149960302 149960150 Y NA NA TSC22D2,RNF13,PFN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 163820 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 150086629 150086866 150086749 Y NA TSC22D2 RNF13,PFN2,TSC22D2,SERP1,EIF2A,LOC646903 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 37256 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 150329194 150329427 150329421 Y NA SELT,SERP1 NA NA NA NA SERP1 10179 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 150348986 150349006 150348996 Y CLRN1 SELT,SERP1 NA NA NA NA SERP1 29971 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 150453151 150453509 150453478 Y CLRN1 RP11-103G8.2,FAM194A,SIAH2-AS1,SIAH2 NA NA NA NA SIAH2-AS1 24215 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 150456267 150456381 150456351 Y NA RP11-103G8.2,FAM194A,SIAH2-AS1,SIAH2 NA NA NA NA SIAH2-AS1 21343 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 150987276 150987626 150987385 Y P2RY12,MED12L NA NA NA NA NA MED12L 185792 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 151016558 151016712 151016648 Y MED12L,P2RY12,GPR87 NA NA NA NA NA MED12L 215074 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 152026905 152027295 152026911 Y NA MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 41561 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 152030036 152030551 152030147 Y MBNL1,MBNL1 MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 44692 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 152878171 152878732 152878352 Y P2RY1,RAP2B RAP2B NA NA NA NA RAP2B 142 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 153003780 153003941 153003880 Y NA NA RAP2B IMR90 Hi-C 24141950 RAP2B 125751 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 155464601 155464622 155464613 Y NA NA NA NA NA NA C3orf33 57518 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 155705974 155706059 155706016 Y NA NA NA NA NA NA GMPS 119649 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 156206621 156206945 156206715 Y NA NA NA NA NA NA SSR3 64028 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 156207242 156207761 156207575 Y NA NA NA NA NA NA SSR3 63212 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 156822906 156823344 156823241 Y NA NA NA NA NA NA CCNL1 53205 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 158070419 158070585 158070503 Y MFSD1 NA NA NA NA NA MLF1 216367 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 158226530 158226854 158226539 Y NA NA NA NA NA NA MLF1 60098 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 158491929 158492257 158492161 Y NA MFSD1,RARRES1 RARRES1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RARRES1 43444 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 159183407 159183504 159183456 Y SCHIP1,IQCJ,SCHIP1 NA NA NA NA NA SCHIP1 372146 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 159356402 159356534 159356468 Y SCHIP1,SCHIP1 NA NA NA NA NA SCHIP1 199116 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 159493461 159493761 159493605 Y NA NA NA NA NA NA SCHIP1 61889 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 159540179 159540477 159540438 Y NA SCHIP1 NA NA NA NA SCHIP1 15173 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 160014353 160014630 160014494 Y NA NA NA NA NA NA C3orf80 72930 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 160949185 160949470 160949344 Y OTOL1 NA NA NA NA NA B3GALNT1 128013 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 163200280 163200389 163200295 Y NA NA NA NA NA NA BCHE 2352871 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 164789607 164789821 164789770 Y NA NA NA NA NA NA BCHE 763439 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 165217698 165218028 165217864 Y NA NA NA NA NA NA BCHE 335232 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 167369160 167369394 167369277 Y NA NA NA NA NA NA PDCD10 81333 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 167737805 167738014 167737910 Y NA NA NA NA NA NA GOLIM4 73749 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 167751925 167752226 167752094 Y NA NA NA NA NA NA GOLIM4 59537 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 169482089 169482431 169482154 Y NA TERC,MYNN,LRRC34 NA NA NA NA TERC 1241 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 169502698 169502873 169502785 Y GPR160,MYNN,LRRC34 TERC,MYNN,LRRC34 NA NA NA NA MYNN 14079 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 169508571 169508792 169508647 Y NA TERC,MYNN,LRRC34 NA NA NA NA MYNN 19952 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 170446657 170446914 170446737 Y NA NA CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 139358 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 170584649 170585013 170584680 Y NA RPL22L1,EIF5A2 NA NA NA NA RPL22L1 1259 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr3 172510084 172510259 172510171 Y NA ECT2,RNU4-4P NA NA NA NA RNU4-4P 2089 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 176133548 176133972 176133699 Y NA NA NA NA NA NA UBE2V1P2 699090 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 176862590 176862993 176862904 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 50268 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 176912879 176913389 176913098 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 177076157 177076922 177076435 Y TBL1XR1 NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 162896 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 177077500 177078084 177077832 Y NA NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 164239 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 178786594 178786786 178786690 Y NA ZMAT3 NA NA NA NA ZMAT3 1281 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 178787910 178788066 178787991 Y ZMAT3 ZMAT3 NA NA NA NA ZMAT3 1 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 178978348 178978737 178978528 Y PIK3CA,MFN1,GNB4 LRRFIP1P1 NA NA NA NA LRRFIP1P1 1287 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr3 179471930 179472312 179472121 Y NA NA NA NA NA NA USP13 103387 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 179671739 179671761 179671750 Y NA NA NA NA NA NA USP13 303196 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 179684304 179684515 179684308 Y NA NA NA NA NA NA USP13 315761 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 179685404 179685725 179685692 Y NA NA NA NA NA NA USP13 316861 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 179687230 179687579 179687379 Y PEX5L NA NA NA NA NA USP13 318687 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 180059459 180059617 180059527 Y PEX5L NA NA NA NA NA TTC14 258301 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 181414061 181414442 181414162 Y SOX2 SOX2 NA NA NA NA SOX2 13272 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 182645862 182646115 182645990 Y MCF2L2,MCCC1 NA NA NA NA NA DCUN1D1 55626 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 182973593 182973879 182973736 Y ATP11B,KLHL6,KLHL24,B3GNT5 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 4561 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 182978108 182978472 182978157 Y ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 9076 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 183003579 183004143 183003750 Y ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 34547 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr3 183067117 183067522 183067194 Y KLHL24 NA NA NA NA NA MCF2L2 77044 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 183079075 183079309 183079198 Y NA NA NA NA NA NA MCF2L2 65257 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 184560038 184560430 184560098 Y VPS8 VPS8 NA NA NA NA VPS8 32107 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 184727770 184727947 184727859 Y NA NA NA NA NA NA C3orf70 140855 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 184775166 184775451 184775309 Y VPS8 NA NA NA NA NA C3orf70 93351 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 185825302 185825582 185825395 Y NA ETV5 NA NA NA NA ETV5 525 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 186490704 186490868 186490793 Y ST6GAL1,TBCCD1,TBCCD1,EIF4A2 EIF4A2,RFC4 NA NA NA NA EIF4A2 8126 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr3 186784569 186784773 186784671 Y NA NA NA NA NA NA RPL39L 111923 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 187520692 187521092 187520953 Y NA NA LPP,BCL6 IMR90 Hi-C 24141950 BCL6 59177 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 188632491 188632766 188632583 Y NA NA NA NA NA NA LPP 763419 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 191160044 191160233 191160139 Y PYDC2 NA FGF12 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC50 115178 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 191781460 191781643 191781536 Y NA NA NA NA NA NA CCDC50 736594 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 192608372 192608637 192608617 Y NA MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 25313 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 192873675 192873788 192873739 Y NA NA NA NA NA NA MB21D2 239725 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 193851636 193853009 193852912 Y ATP13A3,HES1 NA NA NA NA NA HES1 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr3 193876735 193877026 193876899 Y NA HES1 NA NA NA NA HES1 24801 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 193993457 193993565 193993509 Y NA NA LOC647323,LOC100131551 IMR90 Hi-C 24141950 HES1 141523 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 194153543 194153935 194153911 Y ATP13A3 NA NA NA NA NA ATP13A3 63158 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 194210438 194211060 194210799 Y HES1,ATP13A3 ATP13A3 NA NA NA NA ATP13A3 6033 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 194561866 194562021 194561957 Y FAM43A NA LOC100507391,XXYLT1,ACAP2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM43A 157244 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 194839135 194839291 194839213 Y FAM43A,C3orf21 NA NA NA NA NA XXYLT1 150605 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 194843909 194844196 194844053 Y APOD NA NA NA NA NA XXYLT1 145700 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 194871039 194871493 194871089 Y FAM43A,C3orf21 NA NA NA NA NA XXYLT1 118403 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 194875742 194876159 194875826 Y FAM43A,C3orf21 NA NA NA NA NA XXYLT1 113737 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 194898663 194899282 194898930 Y NA NA NA NA NA NA XXYLT1 90614 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 194973636 194973680 194973658 Y NA XXYLT1 NA NA NA NA XXYLT1 16216 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 195153778 195154174 195153996 Y NA ACAP2 NA NA NA NA ACAP2 7633 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 195258657 195259038 195258847 Y ACAP2,TNK2,PPP1R2 PPP1R2 NA NA NA NA PPP1R2 9171 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 195264699 195265107 195264994 Y ACAP2,TNK2,PPP1R2 PPP1R2 NA NA NA NA PPP1R2 3102 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 195430866 195431240 195430948 Y NA NA NA NA NA NA MUC4 105908 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 195632869 195633225 195632990 Y ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2 NA NA NA NA NA MUC4 95721 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 195946209 195946432 195946330 Y UBXN7,RNF168,CEP19,TNK2,PCYT1A,ZDHHC19 NA NA NA NA NA PCYT1A 66396 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 195946520 195946837 195946671 Y LRRC33,PCYT1A NA NA NA NA NA PCYT1A 65991 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 196208308 196208582 196208445 Y NA RNF168 NA NA NA NA RNF168 20057 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 196255741 196255873 196255820 Y NA RNF168,FBXO45,WDR53 UBXN7,MUC20,RNF168,C3orf43,PCYT1A,TM4SF19-TCTEX1D2,WDR53,FBXO45,CEP19 IMR90 Hi-C 24141950 RNF168 27102 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr3 196290932 196291284 196291114 Y NA FBXO45,WDR53 NA NA NA NA FBXO45 2198 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 196377844 196378239 196377963 Y NA LINC01063,PIGX NA NA NA NA PIGX 13198 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 196635737 196635948 196635847 Y UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5 SENP5,NCBP2 NA NA NA NA NCBP2 31520 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 196696811 196697020 196696957 Y LRRC33,PIGZ NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1 NA NA NA NA PIGZ 2880 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr3 197153931 197154131 197153988 Y MFI2,MFI2 NA BDH1,DLG1,LOC100507086 IMR90 Hi-C 24141950 DLG1 129760 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 197247664 197248059 197247722 Y NA NA NA NA NA NA BDH1 50135 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 197264445 197264691 197264611 Y NA BDH1 NA NA NA NA BDH1 33503 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr3 197461391 197461841 197461700 Y IQCG,LRCH3,KIAA0226 FYTTD1,KIAA0226 NA NA NA NA FYTTD1 209 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr3 197478210 197478491 197478305 Y IQCG,KIAA0226,FYTTD1,FYTTD1,LRCH3 FYTTD1,KIAA0226,LRCH3 NA NA NA NA KIAA0226 3612 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 43553 43799 43797 Y ZNF141 ZNF595 ZNF718 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF595 7380 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 257243 257573 257339 Y PDE6B ZNF732 NA NA NA NA ZNF732 39537 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 330052 330352 330160 Y NA ZNF732,ZNF141 NA NA NA NA ZNF141 449 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 742666 742733 742699 Y NA PCGF3,RP11-440L14.1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 30904 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 751950 752022 752014 Y NA RP11-440L14.1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 21615 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 765995 766248 766202 Y NA RP11-440L14.1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 7389 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 770204 770556 770391 Y ZNF141 RP11-440L14.1,CPLX1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 3081 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 867282 867339 867287 Y NA CPLX1 NA NA NA NA CPLX1 49296 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 873387 873975 873731 Y NA NA NA NA NA NA GAK 50186 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 1237849 1238004 1237927 Y NA CTBP1,MAEA NA NA NA NA CTBP1 3737 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 1562061 1562319 1562152 Y NA NA NA NA NA NA SLBP 149963 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 1712467 1712893 1712787 Y WHSC1 SLBP,TMEM129,TACC3 NA NA NA NA SLBP 185 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 1843900 1844033 1843967 Y NA LETM1,WHSC1 NA NA NA NA LETM1 11941 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 1875191 1875366 1875328 Y NA LETM1,WHSC1 NA NA NA NA WHSC1 4040 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 1966776 1967112 1967086 Y WHSC1,WHSC1 SCARNA22 NA NA NA NA SCARNA22 7251 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 1968542 1968629 1968571 Y WHSC1,WHSC1 SCARNA22 NA NA NA NA SCARNA22 5734 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 1970462 1970680 1970571 Y NA SCARNA22 NA NA NA NA SCARNA22 3683 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr4 2538945 2539718 2539367 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 76998 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 2574508 2574529 2574516 Y NA NA POLN,MXD4,LOC402160,RNF4,FAM193A,TNIP2,ADD1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF4 112561 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 3357519 3357800 3357660 Y NA NA NA NA NA NA RGS12 64764 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 3372879 3372940 3372901 Y RGS12 NA NA NA NA NA RGS12 80124 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 3493312 3493795 3493528 Y NA LRPAP1 NA NA NA NA LRPAP1 38491 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr4 3784192 3784335 3784264 Y OTOP1,RGS12 ADRA2C NA NA NA NA ADRA2C 18117 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 4542716 4543043 4542880 Y ZBTB49,STX18 STX18-AS1,STX18 NA NA NA NA STX18 643 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 4854782 4854915 4854832 Y NA MSX1 MSX1 K562 ChIA-PET 22265404 MSX1 4478 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 5884684 5884906 5884686 Y NA CRMP1 EVC IMR90 Hi-C 24141950 CRMP1 7879 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 6172675 6172972 6172793 Y NA JAKMIP1 NA NA NA NA JAKMIP1 27346 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 6200459 6200744 6200584 Y JAKMIP1 JAKMIP1 NA NA NA NA JAKMIP1 141 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 6223621 6224023 6223692 Y PPP2R2C,PPP2R2C,MRFAP1L1,CRMP1,CRMP1,JAKMIP1 JAKMIP1,WFS1 NA NA NA NA JAKMIP1 23303 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.55078636232894 chr4 6437206 6437596 6437541 Y JAKMIP1,PPP2R2C,PPP2R2C NA NA NA NA NA PPP2R2C 125731 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 6635412 6635534 6635472 Y NA MRFAP1,AC093323.3,RP11-539L10.3 NA NA NA NA MRFAP1 4284 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 6785099 6785509 6785391 Y TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232 KIAA0232 NA NA NA NA KIAA0232 3997 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr4 6912537 6913143 6912820 Y KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14 TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 3568 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 6934348 6934486 6934417 Y NA TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 25379 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 7228179 7228250 7228215 Y NA SORCS2 NA NA NA NA SORCS2 35914 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 7833117 7833393 7833178 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 106260 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 7834057 7834311 7834184 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 105342 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 7846072 7846237 7846145 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 93416 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 7973730 7974208 7973960 Y NA AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 34077 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 8223394 8223615 8223527 Y METTL19,SH3TC1 SH3TC1,HTRA3 NA NA NA NA SH3TC1 41595 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 8912643 8912767 8912705 Y LOC650293 HMX1 NA NA NA NA HMX1 41100 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 9154755 9155069 9154900 Y NA FAM86KP NA NA NA NA FAM86KP 1733 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr4 10116801 10117310 10116981 Y WDR1 WDR1 NA NA NA NA WDR1 228 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 11426480 11426816 11426649 Y NA HS3ST1 NA NA NA NA HS3ST1 2573 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 12642016 12642195 12642111 Y NA RP11-352E6.2 NA NA NA NA RP11-352E6.2 1755 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 13257922 13258131 13258027 Y NA NA NA NA NA NA HSP90AB2P 74907 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 13282552 13282692 13282688 Y NA NA NA NA NA NA HSP90AB2P 50346 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 13439753 13439937 13439845 Y NA RAB28 NA NA NA NA RAB28 44052 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 13613048 13613249 13613164 Y NA AC006445.7 NA NA NA NA AC006445.7 18974 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 13908947 13909321 13909089 Y NA NA LOC441009,CPEB2,LOC152742 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01085 202271 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 14439704 14439728 14439717 Y NA NA NA NA NA NA LINC01085 328112 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 15485746 15486124 15486037 Y CC2D2A CC2D2A NA NA NA NA CC2D2A 16257 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 15553738 15553982 15553851 Y NA NA NA NA NA NA CC2D2A 84249 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 15590411 15590648 15590624 Y FBXL5 NA NA NA NA NA FAM200B 90637 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 15594702 15595080 15594956 Y FBXL5 NA NA NA NA NA FAM200B 86205 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 15651682 15652058 15651870 Y NA FAM200B,FBXL5 NA NA NA NA FAM200B 29227 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 15655935 15656313 15656300 Y FBXL5,BST1 FAM200B,FBXL5,BST1 NA NA NA NA FAM200B 24972 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 15820988 15821366 15820993 Y NA NA NA NA NA NA RP11-115L11.1 89738 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 17483580 17483992 17483821 Y QDPR,CLRN2 QDPR NA NA NA NA QDPR 27865 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr4 17581888 17582305 17582055 Y LAP3,MED28 LAP3,MED28 NA NA NA NA LAP3 5073 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 17829390 17829398 17829394 Y CLRN2,NCAPG FAM184B,DCAF16,NCAPG NA NA NA NA NCAPG 18865 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 18320696 18320883 18320800 Y NA NA NA NA NA NA LCORL 299197 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 20197125 20197285 20197196 Y NA NA NA NA NA NA SLIT2 55598 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 21452260 21452636 21452587 Y NA NA NA NA NA NA PACRGL 756355 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 21554604 21554992 21554968 Y NA NA NA NA NA NA PACRGL 858699 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 21602576 21603408 21603328 Y KCNIP4,KCNIP4,KCNIP4 NA NA NA NA NA PACRGL 906671 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr4 21619972 21620195 21620166 Y KCNIP4,KCNIP4,KCNIP4 NA NA NA NA NA GPR125 895482 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 21670292 21670426 21670359 Y NA NA NA NA NA NA GPR125 845251 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 21678631 21679026 21678848 Y NA NA NA NA NA NA GPR125 836651 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr4 22676419 22676434 22676427 Y NA NA NA NA NA NA CDC42P6 51139 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 22743232 22743512 22743354 Y NA CDC42P6 NA NA NA NA CDC42P6 15659 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 23299933 23300259 23300096 Y NA NA NA NA NA NA RP11-412P11.1 302759 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 23890124 23890507 23890316 Y PPARGC1A PPARGC1A NA NA NA NA PPARGC1A 13205 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 24471215 24471562 24471389 Y NA NA PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 112611 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 24471602 24472014 24471897 Y NA NA PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 112159 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 24579124 24579339 24579231 Y NA DHX15 NA NA NA NA DHX15 4834 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 24660007 24660225 24660117 Y NA ATP5LP3 CCDC149,MIR573 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5LP3 2009 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 25402341 25402497 25402460 Y NA ANAPC4 NA NA NA NA ANAPC4 25506 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 26449466 26449471 26449469 Y NA CCKAR NA NA NA NA CCKAR 40613 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 26886069 26886538 26886211 Y TBC1D19,STIM2 STIM2,RP11-293A21.1 NA NA NA NA RP11-293A21.1 25848 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 26887004 26887397 26887051 Y STIM2 STIM2,RP11-293A21.1 NA NA NA NA RP11-293A21.1 26783 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 30718904 30719447 30718947 Y PCDH7,PCDH7 PCDH7 NA NA NA NA PCDH7 590 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 30719661 30720023 30719741 Y PCDH7,PCDH7 PCDH7 NA NA NA NA PCDH7 14 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 33302868 33303228 33302942 Y NA NA NA NA NA NA PCDH7 2582831 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 36327190 36327471 36327331 Y ARAP2 NA NA NA NA NA RELL1 1358527 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 37891515 37891921 37891558 Y NA TBC1D1 NA NA NA NA TBC1D1 807 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 38102941 38103486 38103298 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 142885 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 38665008 38665204 38665059 Y TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3 KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA RP11-617D20.1 504 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 38673994 38674276 38674074 Y NA KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA RP11-617D20.1 9490 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 38735219 38735515 38735398 Y NA NA KLF3,TBC1D1,FLJ13197 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-617D20.1 70715 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 38793422 38793699 38793608 Y NA NA NA NA NA NA TLR1 62739 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 38859134 38859762 38859410 Y KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6 TLR1,FAM114A1 NA NA NA NA TLR1 2696 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 38871281 38871430 38871296 Y NA TLR1,FAM114A1 NA NA NA NA FAM114A1 3983 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 39045195 39045532 39045360 Y NA KLHL5 NA NA NA NA KLHL5 536 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 39285630 39285978 39285919 Y RFC1 NA NA NA NA NA RFC1 80017 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 39316114 39316675 39316347 Y NA RFC1 NA NA NA NA RFC1 49320 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 39548258 39548506 39548382 Y KLHL5 UGDH-AS1,UGDH NA NA NA NA UGDH 20327 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 39908966 39909133 39909103 Y NA NA NA NA NA NA PDS5A 68443 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 40057110 40057493 40057154 Y RHOH,N4BP2 N4BP2 NA NA NA NA N4BP2 664 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 41148833 41148910 41148907 Y LIMCH1,LIMCH1 NA NA NA NA NA APBB2 67821 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 41365078 41365459 41365240 Y NA LIMCH1 NA NA NA NA LIMCH1 5454 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 41384257 41384615 41384267 Y NA LIMCH1 NA NA NA NA LIMCH1 24633 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 41469951 41470276 41469966 Y NA NA NA NA NA NA LIMCH1 110327 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 41859260 41859639 41859308 Y PHOX2B LINC00682 PHOX2B IMR90 Hi-C 24141950 LINC00682 22989 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr4 41875913 41876282 41876100 Y PHOX2B LINC00682 PHOX2B,LIMCH1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00682 6346 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.6880296947035 chr4 41880927 41881193 41881022 Y PHOX2B LINC00682 PHOX2B,LIMCH1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00682 1435 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.17110090726052 chr4 41886373 41886653 41886561 Y PHOX2B LINC00682,TMEM33 PHOX2B,LIMCH1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00682 3745 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.17110090726052 chr4 46278614 46278629 46278622 Y NA NA NA NA NA NA RAC1P2 445996 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 47121817 47122010 47121920 Y NA NA NA NA NA NA COMMD8 341726 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 48532180 48532355 48532269 Y NA SLC10A4 NA NA NA NA SLC10A4 48820 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 48851417 48851730 48851443 Y ZAR1,FRYL OCIAD1 NA NA NA NA OCIAD1 46188 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 52725801 52726193 52725998 Y NA DCUN1D4 NA NA NA NA DCUN1D4 18635 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 53725752 53726074 53725904 Y NA RASL11B NA NA NA NA RASL11B 383 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr4 53879042 53879203 53879109 Y NA NA NA NA NA NA RASL11B 152585 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 53890542 53890886 53890882 Y NA NA NA NA NA NA RASL11B 164085 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 54032997 54033196 54033097 Y NA NA NA NA NA NA SCFD2 197046 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 54137122 54137385 54137364 Y SCFD2 NA NA NA NA NA SCFD2 92857 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 54172916 54173263 54173102 Y SCFD2 NA NA NA NA NA SCFD2 56979 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 54338842 54339193 54339023 Y NA NA NA NA NA NA FIP1L1 97032 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 54467426 54467549 54467488 Y NA NA LNX1 IMR90 Hi-C 24141950 FIP1L1 225616 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 54771921 54772318 54772120 Y NA NA FIP1L1,LNX1,SCFD2,RPL21P44,CHIC2,GSX2,PDGFRA IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 156539 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 54784132 54784299 54784203 Y CHIC2 NA SCFD2,PDGFRA,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 144558 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 54871626 54871896 54871863 Y NA NA NA NA NA NA CHIC2 56961 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 54886131 54886730 54886449 Y GSX2 CHIC2 NA NA NA NA CHIC2 42127 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 54928262 54928437 54928381 Y NA CHIC2,GSX2 NA NA NA NA CHIC2 420 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 54951124 54951140 54951133 Y NA CHIC2,GSX2 SCFD2,CHIC2,FIP1L1,PDGFRA IMR90 Hi-C 24141950 GSX2 12550 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 54958023 54958135 54958077 Y NA CHIC2,GSX2 SCFD2,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 GSX2 5555 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.44740060484035 chr4 55093767 55093987 55093860 Y NA PDGFRA NA NA NA NA PDGFRA 503 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 55100480 55100923 55100634 Y PDGFRA PDGFRA NA NA NA NA PDGFRA 7216 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 56453376 56453745 56453528 Y NA CLOCK,NMU NA NA NA NA CLOCK 42071 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr4 57001106 57001114 57001110 Y NA NA NA NA NA NA CEP135 188069 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 57048653 57048701 57048677 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP31 171600 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 57254661 57255026 57254688 Y CEP135 RPL7AP31,AASDH,PPAT,PAICS NA NA NA NA AASDH 2995 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 57313900 57314193 57314047 Y NA PPAT,PAICS,SRP72 NA NA NA NA PAICS 13993 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 62391434 62391750 62391592 Y NA NA NA NA NA NA RP11-621K7.1 247818 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 65475793 65476032 65475913 Y NA NA NA NA NA NA RP11-204H9.2 181166 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 66516104 66516284 66516196 Y NA NA NA NA NA NA RP11-204H9.2 1221477 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 68394565 68394648 68394607 Y NA NA NA NA NA NA RP11-584P21.4 84580 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 68487662 68488005 68487834 Y NA NA NA NA NA NA UBA6 76892 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 68538149 68538306 68538215 Y NA UBA6,UBA6-AS1 NA NA NA NA UBA6 26591 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 71695000 71695080 71695041 Y NA GRSF1 NA NA NA NA GRSF1 8582 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 73887463 73887489 73887476 Y NA COX18 ADAMTS3 IMR90 Hi-C 24141950 COX18 45983 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 74527283 74527866 74527619 Y MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2 NA CXCL5,RASSF6,CXCL2,ANKRD17,IL8,PF4V1,CXCL3,CXCL6,PPBPL2,CXCL1,PF4,PPBP,MTHFD2L IMR90 Hi-C 24141950 RP11-692D12.1 404357 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 74575200 74575450 74575368 Y ANKRD17,IL8,CXCL3,CXCL2 NA MTHFD2L IMR90 Hi-C 24141950 CXCL2 387560 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 74588737 74589023 74588915 Y ANKRD17,CXCL3,CXCL2,IL8 NA IL8,CXCL1,CXCL3,CXCL2 IMR90 Hi-C 24141950 CXCL2 373987 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 74884607 74884942 74884772 Y IL8,MTHFD2L,EREG,CXCL3,CXCL2 NA NA NA NA NA CXCL2 78068 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 75187079 75187238 75187159 Y EPGN NA NA NA NA NA MTHFD2L 209188 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 75539265 75539284 75539274 Y NA NA NA NA NA NA PARM1 317021 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 76611672 76611775 76611733 Y RCHY1 G3BP2,USO1 NA NA NA NA G3BP2 35934 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 77173424 77173631 77173514 Y ART3,CCDC158 SCARB2,FAM47E NA NA NA NA FAM47E 40231 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 77366246 77366349 77366298 Y NA SHROOM3 NA NA NA NA SHROOM3 11993 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 77611633 77612016 77611712 Y NA NA NA NA NA NA SEPT11 256840 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 77868010 77868840 77868612 Y NA SEPT11 NA NA NA NA SEPT11 16 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 77869398 77869850 77869619 Y SEPT11 SEPT11 NA NA NA NA SEPT11 542 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 77931984 77932418 77932077 Y NA NA NA NA NA NA CCNI 62740 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 78711096 78711128 78711114 Y NA CNOT6L NA NA NA NA CNOT6L 27641 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 78823537 78823752 78823560 Y NA MRPL1 NA NA NA NA MRPL1 41863 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 78842671 78842943 78842808 Y NA NA NA NA NA NA MRPL1 60997 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 78977894 78978171 78977912 Y FRAS1 FRAS1 NA NA NA NA FRAS1 1170 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 79264997 79265051 79265025 Y NA NA NA NA NA NA ANXA3 205622 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 79550555 79550802 79550658 Y NA NA NA NA NA NA ANXA3 79882 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 79613098 79613437 79613268 Y BMP2K NA NA NA NA NA BMP2K 82059 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 79859042 79859275 79859190 Y PAQR3 PAQR3 NA NA NA NA PAQR3 450 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 81056560 81056903 81056754 Y ANTXR2 ANTXR2,PRDM8 PRDM8 IMR90 Hi-C 24141950 ANTXR2 11952 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 81119203 81119473 81119338 Y PRDM8,PRDM8 PRDM8 NA NA NA NA PRDM8 16170 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 82430038 82430905 82430549 Y RASGEF1B NA NA NA NA NA RASGEF1B,RP11-689K5.3 532492 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 83205945 83206187 83206036 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPD 87469 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 83681282 83681423 83681411 Y NA SCD5 NA NA NA NA SCD5 36587 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 83755588 83755973 83755970 Y NA SCD5 NA NA NA NA SCD5 37578 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr4 83912303 83912539 83912423 Y NA LIN54,COPS4 NA NA NA NA LIN54 19540 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 84196492 84196601 84196547 Y NA COQ2 NA NA NA NA COQ2 7466 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 84359899 84360122 84360011 Y NA HELQ,MRPS18C NA NA NA NA HELQ 14887 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 84478147 84478291 84478208 Y PLAC8,COQ2,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,AGPAT9 FAM175A,AGPAT9 NA NA NA NA AGPAT9 23080 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 85047369 85047537 85047456 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT9 592302 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr4 85420434 85420908 85420714 Y NA NA NA NA NA NA WDFY3-AS2 464630 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.75755787730614 chr4 85868944 85869302 85869263 Y NA WDFY3-AS2,WDFY3 NA NA NA NA WDFY3-AS2 16236 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 85873236 85873576 85873407 Y NA WDFY3-AS2,WDFY3 NA NA NA NA WDFY3-AS2 11962 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 87048261 87048368 87048363 Y NA NA NA NA NA NA MAPK10 464916 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 87835479 87835856 87835675 Y NA AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA AFF1 18298 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 87960081 87960248 87960138 Y NA NA NA NA NA NA TECRP1 90805 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 88074850 88075090 88074969 Y DSPP NA NA NA NA NA KLHL8 84376 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 88408034 88408084 88408060 Y SPARCL1 NA NA NA NA NA NUDT9 66300 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 88443267 88443740 88443428 Y DSPP,SPARCL1 NA NA NA NA NA NUDT9 101533 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 89185531 89185830 89185781 Y NA PPM1K,RP11-10L7.1 NA NA NA NA PPM1K 18091 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 89202679 89202817 89202765 Y NA PPM1K,RP11-10L7.1 NA NA NA NA PPM1K 1104 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 89302401 89302730 89302543 Y HERC6,HERC5 NA NA NA NA NA HERC5 73538 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 89466327 89466604 89466570 Y NA HERC3,PIGY HERC3 IMR90 Hi-C 24141950 PIGY 25387 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 89726737 89726837 89726787 Y NA NA NA NA NA NA NAP1L5 109351 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr4 89747458 89747948 89747469 Y NA NA NA NA NA NA NAP1L5 130072 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr4 89922113 89922454 89922284 Y NA NA NA NA NA NA FAM13A 108095 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 90224802 90225147 90225000 Y FAM13A,GPRIN3 GPRIN3 NA NA NA NA GPRIN3 2014 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 91049597 91049943 91049669 Y FAM190A NA NA NA NA NA SNCA 292131 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.24062908986315 chr4 91453996 91454262 91454133 Y NA NA NA NA NA NA SNCA 696530 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 92218724 92218762 92218742 Y NA NA NA NA NA NA SNCA 1461258 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr4 93226746 93226922 93226838 Y GRID2 NA NA NA NA NA SMARCAD1 1899840 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr4 95373822 95374139 95373960 Y PDLIM5 PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 2785 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 95374521 95374795 95374668 Y NA PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 3484 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 95469761 95469962 95469859 Y HPGDS,PDLIM5 NA NA NA NA NA PDLIM5 98724 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 96071597 96071692 96071645 Y NA NA NA NA NA NA BMPR1B 394478 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 96100940 96101127 96101035 Y BMPR1B NA NA NA NA NA UNC5C 367230 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 96133625 96133991 96133679 Y NA NA NA NA NA NA UNC5C 334366 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 96332977 96333151 96333005 Y UNC5C NA NA NA NA NA UNC5C 135206 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr4 96345355 96345692 96345542 Y UNC5C NA NA NA NA NA UNC5C 122665 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr4 96351676 96352072 96351938 Y UNC5C NA NA NA NA NA UNC5C 116285 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 96388797 96389173 96389000 Y NA NA NA NA NA NA UNC5C 79184 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr4 96466701 96466894 96466857 Y NA UNC5C NA NA NA NA UNC5C 1463 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.55078636232894 chr4 99580316 99580421 99580372 Y NA TSPAN5 NA NA NA NA TSPAN5 2536 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 99845137 99845196 99845164 Y NA EIF4E NA NA NA NA EIF4E 4592 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 99937707 99938078 99937893 Y NA METAP1 NA NA NA NA METAP1 22936 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 99984592 99984944 99984751 Y NA ADH5 NA NA NA NA ADH5 23008 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 101704781 101705096 101704865 Y NA NA NA NA NA NA AP001816.1 561841 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 101989384 101989498 101989458 Y NA NA NA NA NA NA AP001816.1 277439 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 102113415 102113532 102113437 Y NA NA NA NA NA NA AP001816.1 153405 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 102254048 102254281 102254164 Y NA AP001816.1,PPP3CA NA NA NA NA AP001816.1 12656 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 102254740 102255090 102255043 Y NA AP001816.1,PPP3CA NA NA NA NA AP001816.1 11847 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 102266716 102267419 102267189 Y NA PPP3CA NA NA NA NA AP001816.1 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 103536028 103536474 103536149 Y NHEDC1,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA,NFKB1 NA NA NA NA NA NFKB1 115542 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 103596395 103596588 103596491 Y NA NA NA NA NA NA MANBA 83563 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 103673229 103673433 103673315 Y NHEDC1,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA MANBA NA NA NA NA MANBA 6718 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 103750426 103750532 103750434 Y NHEDC1,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3 RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2 NA NA NA NA RP11-10L12.4 3214 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 103781884 103782294 103782163 Y MANBA RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2 NA NA NA NA UBE2D3 5759 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 106324406 106324791 106324687 Y NA NA NA NA NA NA PPA2 68447 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 106362976 106363368 106363172 Y NA PPA2,EEF1A1P9 NA NA NA NA PPA2 29870 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 106390941 106391445 106391094 Y TET2,TET2 PPA2,EEF1A1P9 NA NA NA NA PPA2 1793 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 106391866 106392288 106392204 Y TET2,TET2 PPA2,EEF1A1P9 NA NA NA NA PPA2 950 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 106628155 106628490 106628322 Y NA GSTCD NA NA NA NA GSTCD 220 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 107780277 107780572 107780473 Y NA NA NA NA NA NA DKK2 422391 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 107955286 107955747 107955665 Y DKK2 NA NA NA NA NA DKK2 247216 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 109513186 109513523 109513472 Y NA RPL34-AS1,RPL34 NA NA NA NA RPL34-AS1 26093 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 110125324 110125640 110125483 Y NA NA NA NA NA NA COL25A1 96173 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 110361567 110361723 110361645 Y NA SEC24B,SEC24B-AS1 NA NA NA NA SEC24B-AS1 8594 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 110464231 110464470 110464351 Y NA CCDC109B NA NA NA NA CCDC109B 14891 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 110887461 110887463 110887462 Y NA NA NA NA NA NA GAR1 152795 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 111114926 111115298 111115104 Y GAR1,ELOVL6,ELOVL6 RP11-115A14.1,ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 3057 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr4 111117471 111117868 111117585 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 487 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.44740060484035 chr4 111535166 111535692 111535412 Y NA NA NA NA NA NA RP11-433B3.1 350993 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 113797634 113797869 113797752 Y NEUROG2,ANK2,ANK2 NA NA NA NA NA ANK2 60369 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 113852159 113852312 113852236 Y ANK2,ANK2 NA NA NA NA NA ANK2 114894 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 113894342 113894685 113894441 Y NEUROG2,ANK2,ANK2 NA NA NA NA NA ANK2 157077 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 113956940 113957168 113957054 Y NA NA NA NA NA NA ANK2 219675 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 113972367 113972735 113972428 Y NA NA NA NA NA NA ANK2 235102 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 113985460 113985726 113985592 Y NA NA NA NA NA NA ANK2 248195 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr4 114104327 114104616 114104364 Y ANK2,ANK2 NA NA NA NA NA RNU1-138P 234863 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr4 114382932 114383313 114383209 Y NA RNU1-138P NA NA NA NA RNU1-138P 43453 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 117519495 117520605 117520296 Y NA NA NA NA NA NA TRAM1L1 484131 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 119756174 119756657 119756269 Y NA SEC24D NA NA NA NA SEC24D 1181 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 119815891 119816222 119816082 Y NA SYNPO2 NA NA NA NA SYNPO2 7895 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 119857071 119857382 119857110 Y SYNPO2 SYNPO2 NA NA NA NA SYNPO2 49075 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 119890642 119890944 119890758 Y NA NA NA NA NA NA SYNPO2 82646 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr4 119905071 119905247 119905165 Y NA NA NA NA NA NA SYNPO2 97075 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 119910469 119910954 119910765 Y NA NA NA NA NA NA SYNPO2 102473 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 119931328 119931723 119931654 Y NA NA NA NA NA NA SYNPO2 123332 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 119946666 119946843 119946767 Y NA NA NA NA NA NA SYNPO2 138670 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 120437308 120437708 120437606 Y NA NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 63362 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 120458820 120459280 120459019 Y PDE5A,PDE5A,PDE5A NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 84874 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 120476359 120476426 120476393 Y PDE5A NA NA NA NA NA PDE5A 71720 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 121812608 121812671 121812657 Y NA PRDM5 NA NA NA NA PRDM5 29354 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 122611926 122612330 122612120 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 3938 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 122632771 122633033 122632919 Y NA ANXA5 ANXA5,BBS7,CCNA2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ANXA5 16503 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 123074024 123074337 123074286 Y KIAA1109,IL21,IL2 KIAA1109 KIAA1109 K562 ChIA-PET 22265404 KIAA1109 2536 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 123096398 123096477 123096437 Y IL2 KIAA1109 NA NA NA NA KIAA1109 24910 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 123792983 123793156 123793069 Y NA FGF2,NUDT6,SPATA5 NA NA NA NA FGF2 47120 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 124364843 124364989 124364898 Y SPRY1 SPRY1 SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY1 48893 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 124676622 124676861 124676742 Y NA NA NA NA NA NA SPRY1 360672 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 125634465 125634726 125634691 Y NA ANKRD50 NA NA NA NA ANKRD50 2578 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 127544750 127544766 127544759 Y NA NA FAT4 IMR90 Hi-C 24141950 INTU 997660 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 127966730 127967007 127966867 Y NA NA NA NA NA NA INTU 575419 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 128990801 128990842 128990822 Y NA LARP1B NA NA NA NA LARP1B 10378 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 129308281 129308471 129308363 Y NA NA PGRMC2,PHF17,LARP1B,SCLT1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PGRMC2 100297 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 129389693 129389923 129389761 Y NA NA PHF17,PGRMC2 IMR90 Hi-C 24141950 PGRMC2 181709 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 129965980 129966229 129966106 Y NA C4orf33,SCLT1 NA NA NA NA C4orf33 46243 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 130012970 130013118 130013063 Y PHF17,SCLT1,C4orf33 C4orf33,SCLT1 NA NA NA NA SCLT1 206 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 138989223 138989276 138989250 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A11 172227 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 139251287 139251510 139251393 Y SLC7A11 NA NA NA NA NA SLC7A11 89784 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 139326439 139326794 139326543 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A11 164936 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 139814320 139814623 139814472 Y NA NA SLC7A11,LOC641365 IMR90 Hi-C 24141950 CCRN4L 120320 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 139831999 139832463 139832295 Y NA NA LOC641365,SLC7A11,LOC641364 IMR90 Hi-C 24141950 CCRN4L 102480 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 139865200 139865393 139865387 Y NA NA SLC7A11 IMR90 Hi-C 24141950 CCRN4L 69550 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 139960222 139960706 139960403 Y CCRN4L CCRN4L NA NA NA NA CCRN4L 25279 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 139960939 139961173 139961057 Y NAA15,CCRN4L CCRN4L NA NA NA NA CCRN4L 25996 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 140003738 140004448 140004114 Y CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2 NA CCRN4L K562 ChIA-PET 22265404 CCRN4L 68795 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 140017684 140017800 140017744 Y RAB33B,ELF2 NA NA NA NA NA ELF2 78572 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 140035787 140036142 140035958 Y NA NA NA NA NA NA ELF2 60230 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 140096766 140097018 140096889 Y CCRN4L,RAB33B,ELF2 ELF2 ELF2,NAA15 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ELF2 394 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 140292626 140292906 140292778 Y NA NA NA NA NA NA NDUFC1 70921 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 140321405 140321719 140321434 Y ELF2,NAA15,RAB33B NA NA NA NA NA RAB33B 50667 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 140331152 140331480 140331316 Y NA RAB33B NA NA NA NA RAB33B 40906 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 140578910 140579141 140579109 Y NA NA SCOC,LOC100129858,MGST2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SETD7 53057 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 140656102 140656508 140656327 Y MAML3 NA NA NA NA NA SETD7 130249 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 140656765 140657105 140656839 Y MAML3 NA NA NA NA NA SETD7 130912 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 140667675 140667827 140667711 Y MAML3 NA NA NA NA NA SETD7 141822 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 140727942 140728268 140728103 Y MAML3 NA NA NA NA NA SETD7 202089 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 140737173 140737338 140737263 Y NA NA NA NA NA NA SETD7 211320 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 140787614 140787718 140787639 Y NA NA NA NA NA NA SETD7 261761 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 140793640 140793753 140793693 Y MAML3 NA NA NA NA NA SETD7 267787 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 140850270 140850709 140850607 Y MAML3,CLGN NA NA NA NA NA MAML3 222629 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 140886001 140886373 140886187 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 186965 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 140891718 140892054 140891918 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 181284 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 140970177 140970718 140970535 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 102620 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 141012548 141012827 141012747 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 60511 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr4 141013693 141013823 141013696 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 59515 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr4 141014112 141014221 141014167 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 59117 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 141015177 141015539 141015358 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 57799 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr4 141015706 141016341 141016156 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 56997 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 141016837 141017139 141016990 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 56199 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr4 141017143 141017617 141017414 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 55721 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 141019887 141020108 141020058 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 53230 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 141021103 141021485 141021348 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 51853 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 141071159 141071540 141071326 Y NA MAML3 NA NA NA NA MAML3 1798 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 141071687 141072625 141072041 Y MAML3 MAML3 NA NA NA NA MAML3 713 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 141077775 141077952 141077864 Y MAML3 MAML3 NA NA NA NA MAML3 4437 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 141174275 141174653 141174618 Y NA SCOC MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SCOC 1787 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 141287573 141287758 141287638 Y NA RP11-425I13.1 NA NA NA NA RP11-425I13.1 1558 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 141801657 141801765 141801711 Y RNF150 NA NA NA NA NA TBC1D9 126383 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 141859083 141859381 141859282 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D9 183809 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr4 141897706 141897818 141897714 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D9 222432 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr4 141931548 141931580 141931564 Y NA NA NA NA NA NA RNF150 200451 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 142026323 142026393 142026368 Y RNF150 NA NA NA NA NA RNF150 105638 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 142347756 142348088 142347922 Y NA NA NA NA NA NA ZNF330 207715 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 144332697 144332829 144332792 Y GAB1 NA NA NA NA NA GAB1 76782 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 146015172 146015244 146015208 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ABCE1 1840 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 146024258 146024314 146024286 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ANAPC10 6565 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 146229939 146230027 146229996 Y NA NA NA NA NA NA RTN3P1 64668 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 146674591 146674889 146674740 Y NA NA NA NA NA NA MMAA 137176 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 146703198 146703494 146703347 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 154293 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 146725275 146725660 146725360 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 132127 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 146764373 146764705 146764540 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 93082 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 146782687 146782726 146782712 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 75061 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 147192653 147192904 147192792 Y ZNF827,SLC10A7 NA NA NA NA NA LSM6 97816 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 148654111 148654384 148654270 Y PRMT10 ARHGAP10 NA NA NA NA ARHGAP10 2897 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 148729482 148729491 148729487 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP10 78268 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 148747260 148747735 148747373 Y PRMT10,ARHGAP10 NA NA NA NA NA ARHGAP10 96046 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 148768906 148769305 148769088 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP10 117692 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 148981855 148982042 148981912 Y PRMT10,NR3C2 NA NA NA NA NA ARHGAP10 330641 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 151241204 151241585 151241396 Y NA NA NA NA NA NA DCLK2 243778 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 151264145 151264674 151264371 Y NA NA NA NA NA NA MAB21L2 236403 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr4 151314417 151314500 151314459 Y NA NA NA NA NA NA MAB21L2 186577 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 151316952 151317347 151317150 Y NA NA NA NA NA NA MAB21L2 183730 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 151405544 151405555 151405550 Y NA NA NA NA NA NA MAB21L2 95522 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 151873741 151873900 151873783 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 60979 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 152047125 152047385 152047255 Y NA RPS3A NA NA NA NA RPS3A 28400 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 152048107 152048440 152048274 Y LRBA,LRBA RPS3A NA NA NA NA RPS3A 29382 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 152090134 152090652 152090546 Y SH3D19 NA NA NA NA NA RPS3A 71409 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr4 152105959 152106222 152106091 Y NA NA NA NA NA NA RPS3A 87234 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 153445736 153446128 153446118 Y NA FBXW7,MIR4453 NA NA NA NA FBXW7 9125 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 153461614 153461859 153461737 Y NA FBXW7,MIR4453 NA NA NA NA MIR4453 6198 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 153599392 153599746 153599719 Y FBXW7,ARFIP1,TMEM154 TMEM154 NA NA NA NA TMEM154 75 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 153717992 153718074 153718038 Y NA TIGD4,ARFIP1 NA NA NA NA ARFIP1 18903 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 154170296 154170804 154170469 Y TIGD4,KIAA0922 NA NA NA NA NA MND1 92997 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 154235645 154236052 154235798 Y TRIM2,TRIM2,RNF175 MND1 NA NA NA NA MND1 27749 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 154269495 154269528 154269512 Y TRIM2,MND1 MND1 NA NA NA NA MND1 5694 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 154408922 154409996 154409474 Y NA KIAA0922 NA NA NA NA KIAA0922 23424 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 154548347 154548481 154548383 Y KIAA0922,TLR2 NA NA NA NA NA RNF175 130906 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 155378623 155378919 155378786 Y NA NA NA NA NA NA PLRG1 90668 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 158904600 158904766 158904702 Y NA NA NA NA NA NA FAM198B 187704 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 159103850 159104073 159103996 Y NA FAM198B NA NA NA NA FAM198B 11380 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 159592059 159592445 159592194 Y NA ETFDH,C4orf46 NA NA NA NA C4orf46 652 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr4 159641149 159641258 159641192 Y NA ETFDH,C4orf46,PPID,FNIP2 NA NA NA NA PPID 1290 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 159643443 159643599 159643521 Y FNIP2,PPID PPID,FNIP2 NA NA NA NA PPID 895 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 159732931 159733171 159733059 Y PPID,RAPGEF2,FNIP2 FNIP2 NA NA NA NA FNIP2 44641 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 159925060 159925429 159925240 Y FNIP2 NA NA NA NA NA FNIP2 236770 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 160191202 160191310 160191258 Y RAPGEF2 NA NA NA NA NA FNIP2 502912 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 160195976 160196239 160196029 Y RAPGEF2 NA NA NA NA NA FNIP2 507686 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 164464203 164464350 164464219 Y NPY1R,NPY5R,MARCH1 NA NA NA NA NA NAF1 378130 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 164471489 164471679 164471583 Y NA NA NA NA NA NA NAF1 385416 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 165882303 165882624 165882495 Y CPE,C4orf39 RP11-366M4.2,NACA3P NA NA NA NA NACA3P 19861 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 168818156 168818524 168818473 Y NA NA NA NA NA NA DDX60 419434 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 169420329 169420517 169420424 Y NA PALLD,DDX60L NA NA NA NA PALLD 4112 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 169839395 169839702 169839549 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 89724 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 170547481 170547627 170547562 Y CLCN3 NEK1,CLCN3 C4orf27 IMR90 Hi-C 24141950 CLCN3 15697 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 170570348 170570457 170570384 Y NA NEK1,CLCN3 NA NA NA NA CLCN3 38564 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 172774003 172774328 172774166 Y GALNTL6 GALNTL6 NA NA NA NA GALNTL6 42598 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 173077271 173077317 173077294 Y NA NA NA NA NA NA GALNTL6 345866 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 174210504 174211007 174210885 Y GALNT7 HMGB2 NA NA NA NA HMGB2 43269 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 174285204 174285286 174285258 Y NA HMGB2,SAP30,SCRG1 SAP30 K562 ChIA-PET 22265404 SAP30 3834 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 174337339 174338040 174337759 Y SAP30 SAP30,SCRG1 HMGB2,GALNT7,SAP30 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SCRG1 11808 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.65417211981754 chr4 174399518 174399676 174399543 Y NA HAND2-AS1,HAND2 NA NA NA NA HAND2-AS1 46745 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 174399736 174400115 174399926 Y NA HAND2-AS1,HAND2 NA NA NA NA HAND2-AS1 46306 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 174435467 174435730 174435599 Y HAND2 HAND2-AS1,HAND2 NA NA NA NA HAND2-AS1 10691 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr4 174439063 174439445 174439212 Y NA HAND2-AS1,HAND2 NA NA NA NA HAND2-AS1 6976 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.55078636232894 chr4 174440246 174440721 174440674 Y NA HAND2-AS1,HAND2 NA NA NA NA HAND2-AS1 5700 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 7.34038878169033 chr4 174443232 174443552 174443433 Y HAND2 HAND2-AS1,HAND2 NA NA NA NA HAND2-AS1 2869 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.44740060484035 chr4 174443845 174444302 174443959 Y HAND2 HAND2-AS1,HAND2 NA NA NA NA HAND2-AS1 2119 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 6.92684575173595 chr4 174470601 174470612 174470607 Y NA HAND2-AS1,HAND2 NA NA NA NA HAND2 21221 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 174667670 174667818 174667761 Y HAND2 NA NA NA NA NA RANP6 114148 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr4 174799900 174800331 174800064 Y NA NA NA NA NA NA RANP6 246378 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 174856893 174857258 174857076 Y HAND2 NA NA NA NA NA RP11-148L24.1 282291 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.44740060484035 chr4 174945090 174945120 174945105 Y HAND2 NA NA NA NA NA RP11-148L24.1 194429 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.44740060484035 chr4 174958102 174958199 174958151 Y NA NA NA NA NA NA RP11-148L24.1 181350 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 175138375 175138746 175138561 Y CEP44,CEP44 RP11-148L24.1 NA NA NA NA RP11-148L24.1 803 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 175148409 175148685 175148547 Y NA RP11-148L24.1 NA NA NA NA RP11-148L24.1 8860 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 175261747 175261928 175261838 Y NA NA NA NA NA NA FBXO8 58332 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 175263937 175264166 175264013 Y CEP44,CEP44,FBXO8 NA NA NA NA NA FBXO8 60522 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 175281816 175282139 175281824 Y CEP44,CEP44,FBXO8 NA NA NA NA NA FBXO8 78401 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr4 176340355 176340496 176340426 Y NA NA NA NA NA NA WDR17 644489 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 176814255 176814522 176814389 Y GPM6A,GPM6A NA NA NA NA NA WDR17 170463 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 177011365 177011620 177011493 Y NA WDR17 NA NA NA NA WDR17 26380 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 178469887 178470022 178469954 Y NA NA NA NA NA NA AGA 108230 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 182573293 182573310 182573302 Y NA NA ODZ3 IMR90 Hi-C 24141950 AC108142.1 491092 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 183110695 183110955 183110887 Y NA AC108142.1 NA NA NA NA AC108142.1 46293 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 183161464 183161792 183161628 Y ODZ3 NA ODZ3 IMR90 Hi-C 24141950 AC108142.1 97062 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 183439666 183439879 183439717 Y NA NA NA NA NA NA AC108142.1 375264 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 183536176 183536411 183536208 Y NA NA NA NA NA NA DCTD 300678 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 183568083 183568352 183568218 Y NA NA NA NA NA NA DCTD 268737 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 183826285 183826336 183826311 Y NA DCTD NA NA NA NA DCTD 10753 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 184319940 184320161 184319981 Y NA CDKN2AIP WWC2,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 43583 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 184328356 184328744 184328447 Y CDKN2AIP CDKN2AIP WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 35000 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr4 184387095 184387281 184387201 Y C4orf41,CDKN2AIP CDKN2AIP,ING2 NA NA NA NA CDKN2AIP 23351 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 184423820 184424211 184423984 Y STOX2 NA NA NA NA NA ING2 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 184643961 184644129 184644061 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC11 65541 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 184888585 184888733 184888700 Y STOX2 RP11-739P1.2 NA NA NA NA RP11-739P1.2 18098 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 185115354 185115759 185115584 Y NA ENPP6 NA NA NA NA ENPP6 24624 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 185283565 185283989 185283873 Y ACSL1 NA LOC728175,IRF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2 109745 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 185296800 185297408 185297103 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 96326 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 185298493 185298859 185298858 Y NA NA NA NA NA NA IRF2 94875 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 185306912 185307204 185307108 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 86530 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 185321628 185321981 185321757 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 71753 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 185331149 185331516 185331503 Y NA NA NA NA NA NA IRF2 62218 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 185338413 185338600 185338537 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 55134 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 185393561 185393895 185393573 Y ACSL1,CASP3,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 185609676 185609967 185609740 Y NA CASP3 NA NA NA NA CASP3 41013 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 185613623 185613900 185613762 Y CCDC111 CASP3 NA NA NA NA CASP3 44960 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr4 185781182 185781867 185781492 Y IRF2,ACSL1 ACSL1 NA NA NA NA ACSL1 35210 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 186037213 186037356 186037285 Y NA SLC25A4 LOC100506229,ACSL1,KIAA1430,SLC25A4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A4 25039 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr4 186306025 186306048 186306047 Y NA LRP2BP,UFSP2,C4orf47 NA NA NA NA LRP2BP 9005 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 186738363 186738465 186738414 Y NA NA NA NA NA NA PDLIM3 283597 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 186831211 186831564 186831371 Y SORBS2 NA NA NA NA NA FAM149A 192009 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 186842172 186842274 186842223 Y NA NA NA NA NA NA FAM149A 181299 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 190197516 190197817 190197669 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-51P 431051 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr4 190592622 190592758 190592693 Y FRG1 RNU1-51P NA NA NA NA RNU1-51P 36110 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 190708637 190708848 190708802 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-51P 79769 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr4 190942271 190942591 190942322 Y NA NA NA NA NA NA FRG1 82328 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 53990 54174 54063 Y PLEKHG4B,C5orf55 CTD-2231H16.1 LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2231H16.1 36092 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr5 190691 190901 190821 Y SDHA,LRRC14B CCDC127,SDHA NA NA NA NA CCDC127 25429 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 373695 374160 373984 Y EXOC3 NA NA NA NA NA C5orf55 67098 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 413817 414070 413960 Y NA C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 27188 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 448928 449328 449227 Y NA C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5 NA NA NA NA EXOC3 7655 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 557070 557448 557336 Y NA NA SLC9A3,TPPP,CEP72 IMR90 Hi-C 24141950 CEP72 52939 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 656184 656577 656381 Y SLC9A3,ZDHHC11,TPPP CEP72,TPPP NA NA NA NA TPPP 34933 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 671573 671920 671762 Y TPPP TPPP NA NA NA NA TPPP 19590 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 672861 673336 673024 Y NA TPPP NA NA NA NA TPPP 18174 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.34401484735175 chr5 758121 758535 758359 Y TPPP NA SLC9A3,ZDHHC11,BRD9,CEP72,TRIP13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TPPP 66611 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 777448 777883 777776 Y NA NA NA NA NA NA TPPP 85938 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 784651 785023 784908 Y ZDHHC11,TPPP NA NA NA NA NA TPPP 93141 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 4.34220181452104 chr5 1041596 1043550 1041859 Y NA NKD2 NA NA NA NA NKD2 34652 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 1182870 1183091 1183042 Y SLC6A19,SLC6A18 NA LOC100506688,TERT,SLC6A19,TRIP13 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC12A7 72720 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 1478329 1478968 1478499 Y LPCAT1 LPCAT1 SLC6A3 IMR90 Hi-C 24141950 LPCAT1 43124 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 1485196 1485502 1485375 Y SLC12A7,LPCAT1 LPCAT1 SLC6A3 IMR90 Hi-C 24141950 LPCAT1 36590 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 1501941 1502569 1502322 Y LPCAT1 LPCAT1 NA NA NA NA LPCAT1 19523 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 1536479 1536809 1536604 Y SLC12A7,LPCAT1 LPCAT1 SLC6A3 IMR90 Hi-C 24141950 LPCAT1 14387 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 2669640 2670190 2669944 Y NA NA NA NA NA NA NDUFS6 870126 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 5423578 5423857 5423693 Y KIAA0947 KIAA0947 NA NA NA NA KIAA0947 4801 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr5 6485735 6486094 6485897 Y NA UBE2QL1 NA NA NA NA UBE2QL1 38999 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA RP11-332J15.3 50027 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 10.6487330213254 chr5 6766717 6766947 6766763 Y SRD5A1,PAPD7 RP11-332J15.3 NA NA NA NA RP11-332J15.3 2713 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 6927514 6927543 6927527 Y NA NA NA NA NA NA RP11-332J15.3 163510 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 7742239 7742282 7742261 Y NA NA NA NA NA NA MTRR 107017 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 7882044 7882425 7882249 Y NA MTRR,C5orf49,FASTKD3 NA NA NA NA FASTKD3 14894 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 9544480 9544834 9544772 Y SEMA5A SEMA5A NA NA NA NA SEMA5A 293 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr5 9547741 9548115 9547963 Y NA SEMA5A NA NA NA NA SEMA5A 3554 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 10229611 10229778 10229690 Y NA FAM173B,CCT5 NA NA NA NA FAM173B 18231 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 10352620 10352938 10352732 Y NA CMBL,MARCH6 NA NA NA NA MARCH6 805 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 10422961 10423316 10423021 Y NA NA NA NA NA NA RPL30P7 63616 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 10485180 10485474 10485337 Y NA RPL30P7 NA NA NA NA RPL30P7 1458 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr5 10601684 10601853 10601839 Y ANKRD33B ANKRD33B NA NA NA NA ANKRD33B 39242 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 10634343 10634413 10634378 Y MARCH6,ANKRD33B NA NA NA NA NA ANKRD33B 71901 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 14011107 14011342 14011264 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 68455 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 14154284 14154671 14154327 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 12473 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 14174472 14174896 14174531 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 32661 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 14199302 14199513 14199379 Y NA NA NA NA NA NA TRIO 57491 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 14208272 14208510 14208423 Y FAM105B NA NA NA NA NA TRIO 66461 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 14250238 14250405 14250312 Y NA NA NA NA NA NA TRIO 108427 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr5 14251046 14251256 14251151 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 109235 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 14264855 14265210 14264930 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 123044 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr5 14408020 14408375 14408038 Y TRIO NA NA NA NA NA FAM105A 171509 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 14600164 14600334 14600249 Y FAM105B FAM105A NA NA NA NA FAM105A 20280 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 14673178 14673249 14673214 Y NA EEF1A1P13,FAM105B NA NA NA NA FAM105B 10405 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 16089697 16089720 16089715 Y MARCH11 NA NA NA NA NA MARCH11 89151 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 17282496 17282827 17282587 Y BASP1 NA NA NA NA NA RN7SKP133 60898 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 18403562 18403676 18403619 Y NA NA NA NA NA NA RPL36AP21 355903 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 19735118 19735431 19735276 Y NA NA NA NA NA NA CDH18 838551 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 21392233 21392585 21392409 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP1 52291 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 26017692 26017938 26017815 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 828927 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 26513622 26513644 26513633 Y NA NA NA NA NA NA LINC01021 956755 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 31459519 31459540 31459530 Y NA NA NA NA NA NA DROSHA 70763 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 32366924 32367006 32366965 Y NA NA NA NA NA NA MTMR12 55809 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 33442170 33442454 33442303 Y NA CTD-2203K17.1,TARS NA NA NA NA TARS 3368 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr5 34048471 34048803 34048799 Y NA AMACR NA NA NA NA AMACR 42251 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 34949030 34949157 34949062 Y NA BRIX1,RAD1,DNAJC21 NA NA NA NA DNAJC21 21332 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 36119586 36119746 36119728 Y SLC1A3,SLC1A3,C5orf33,C5orf33,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA LMBRD2 30317 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 36151218 36151404 36151252 Y C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA SKP2 1127 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr5 36174356 36174616 36174412 Y SLC1A3,SLC1A3,RANBP3L,C5orf33,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA SKP2 24265 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 36229884 36229947 36229916 Y UGT3A1,C5orf33,C5orf33 NA NA NA NA NA SKP2 79793 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 36657665 36658163 36657813 Y NIPBL NA NA NA NA NA SLC1A3 53208 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 36690488 36690876 36690655 Y NIPBL NA NA NA NA NA SLC1A3 86031 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 37029618 37029862 37029736 Y NA NA NA NA NA NA NIPBL 154757 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 37209037 37209204 37209072 Y C5orf42 C5orf42 NA NA NA NA C5orf42 38326 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 37776965 37777327 37776998 Y NA NA NA NA NA NA WDR70 399651 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 38660472 38660667 38660594 Y LIFR NA EGFLAM,LIFR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIFR 54016 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 39072904 39073873 39073587 Y FYB,RICTOR RICTOR NA NA NA NA RICTOR 394 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr5 39292432 39292553 39292530 Y NA NA NA NA NA NA RICTOR 219922 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 40356568 40356664 40356595 Y PTGER4,CARD6 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 320936 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 40430020 40430156 40430070 Y PTGER4 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 247444 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 40735267 40735522 40735406 Y NA TTC33 NA NA NA NA TTC33 18555 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 40754670 40754884 40754791 Y PTGER4 TTC33,PRKAA1 NA NA NA NA TTC33 593 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 41288648 41289018 41288835 Y NA NA NA NA NA NA PLCXD3 219712 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 41446274 41446654 41446465 Y NA NA NA NA NA NA PLCXD3 62076 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 41465247 41465490 41465440 Y PLCXD3 PLCXD3 NA NA NA NA PLCXD3 43240 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr5 41845041 41845055 41845050 Y OXCT1,FBXO4 OXCT1 NA NA NA NA OXCT1 23566 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr5 42465969 42466319 42466144 Y GHR,GHR,GHR,GHR,GHR,GHR,GHR NA NA NA NA NA CCDC152 288584 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 43007637 43008177 43007831 Y NA NA NA NA NA NA ZNF131 55101 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 43099724 43100011 43099805 Y NA ZNF131,CTD-2201E18.3 ZNF131,LOC648987 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2201E18.3 34203 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 50263404 50263601 50263575 Y ISL1 NA NA NA NA NA PARP8 303671 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.44740060484035 chr5 50677492 50677845 50677668 Y NA ISL1 NA NA NA NA ISL1 571 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr5 50780147 50780591 50780387 Y NA NA NA NA NA NA ISL1 103226 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 51211467 51211491 51211480 Y NA NA NA NA NA NA ISL1 534546 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 51270919 51270989 51270955 Y NA NA NA NA NA NA ISL1 593998 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.48125817972631 chr5 53309437 53310024 53309694 Y ARL15 NA NA NA NA NA ARL15 294388 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 53358665 53359272 53358974 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 245140 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 53460447 53460703 53460575 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 143709 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 54120977 54121197 54121092 Y NA NA SNX18 IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 309388 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 54622279 54622499 54622328 Y NA DHX29,SKIV2L2 NA NA NA NA SKIV2L2 20691 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 54722913 54723133 54723024 Y SKIV2L2 NA NA NA NA NA RNF138P1 101396 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 54729958 54730125 54730050 Y SKIV2L2,DDX4 NA NA NA NA NA RNF138P1 94404 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 54731133 54731267 54731160 Y NA NA NA NA NA NA RNF138P1 93262 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 54741987 54742107 54742028 Y NA NA NA NA NA NA RNF138P1 82422 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 54777886 54777973 54777929 Y SKIV2L2 RNF138P1 NA NA NA NA RNF138P1 46556 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 55655118 55655221 55655151 Y NA NA MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC022431.1 143678 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 56060040 56060308 56060136 Y NA MAP3K1 MAP3K1 MCF7,IMR90,HELA ChIA-PET,Hi-C,5C 22265404,24141950,22955621 MAP3K1 49093 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 56131312 56131556 56131415 Y GPBP1,GPBP1,GPBP1,MAP3K1 MAP3K1 NA NA NA NA MAP3K1 21911 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 58156479 58156810 58156634 Y GAPT,PDE4D NA NA NA NA NA RAB3C 280431 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 58359884 58360252 58360059 Y RAB3C,PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA RAB3C 483836 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 58422372 58422713 58422580 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA RAB3C 546324 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 58423022 58423147 58423096 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA RAB3C 546974 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 58866470 58866828 58866806 Y NA NA NA NA NA NA PART1 914712 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 59173236 59173442 59173374 Y NA NA NA NA NA NA PART1 608098 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 60239574 60239836 60239702 Y ELOVL7,ZSWIM6,ERCC8 ERCC8,NDUFAF2 NA NA NA NA NDUFAF2 618 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 60258688 60258981 60258835 Y NA ERCC8,NDUFAF2 NA NA NA NA NDUFAF2 19732 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 60315642 60315784 60315678 Y NA NA NA NA NA NA NDUFAF2 76686 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr5 60626321 60626538 60626370 Y ZSWIM6 ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 221 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 60629089 60629454 60629159 Y NA ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 2989 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr5 60629701 60630027 60629731 Y ZSWIM6 ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 3601 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 60704594 60705129 60704691 Y NA RPL3P6 NA NA NA NA RPL3P6 18896 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 60710257 60710608 60710433 Y NA RPL3P6 NA NA NA NA RPL3P6 24559 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 60751661 60751965 60751750 Y ZSWIM6 NA NA NA NA NA RPL3P6 65963 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 64224703 64224806 64224755 Y NA NA NA NA NA NA CWC27 161946 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 64309059 64309061 64309060 Y NA NA NA NA NA NA CWC27 246302 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 64331292 64332267 64331637 Y NA NA NA NA NA NA CWC27 268535 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 64398874 64399506 64398924 Y NA NA ADAMTS6,CWC27,PPWD1,CENPK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CWC27 336117 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 64572544 64572695 64572620 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS6 203052 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 64710773 64711167 64710966 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS6 64580 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 64821420 64821488 64821458 Y NA ADAMTS6,CENPK,PPWD1 NA NA NA NA CENPK 35510 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 65030733 65031192 65030953 Y SREK1,ERBB2IP,SGTB NLN,SGTB NA NA NA NA SGTB 13871 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 65097290 65097569 65097365 Y ERBB2IP,SGTB NA NA NA NA NA SGTB 80428 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 65228217 65228394 65228309 Y NA ERBB2IP NA NA NA NA ERBB2IP 7914 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 66145750 66145926 66145797 Y NA NA CD180 IMR90 Hi-C 24141950 MAST4 255574 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 68026547 68026771 68026659 Y PIK3R1 NA NA NA NA NA SLC30A5 360702 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 68179946 68179956 68179951 Y NA NA NA NA NA NA SLC30A5 207517 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 68338463 68338878 68338699 Y NA SLC30A5 NA NA NA NA SLC30A5 48595 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr5 68608364 68608565 68608447 Y CCDC125 CCDC125 NA NA NA NA CCDC125 18071 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 71404360 71404518 71404455 Y MAP1B MAP1B NA NA NA NA MAP1B 3299 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 71424352 71424432 71424374 Y NA MAP1B NA NA NA NA MAP1B 23291 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 71462643 71462861 71462688 Y NA NA NA NA NA NA MAP1B 61582 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr5 71481497 71481884 71481610 Y MAP1B NA NA NA NA NA MAP1B 80436 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 71659094 71659472 71659166 Y NA PTCD2,MRPS27 NA NA NA NA MRPS27 44621 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 72118223 72118546 72118402 Y TNPO1 TNPO1 NA NA NA NA TNPO1 8084 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 72218346 72218584 72218427 Y NA FCHO2 NA NA NA NA FCHO2 31224 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 72233721 72233796 72233759 Y NA FCHO2 NA NA NA NA FCHO2 16012 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 72934554 72934908 72934667 Y RGNEF NA NA NA NA NA ANKRA2 75043 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 73002983 73003378 73003181 Y NA NA NA NA NA NA ANKRA2 143472 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 73114160 73114455 73114328 Y NA NA NA NA NA NA ANKRA2 254649 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 73209063 73209467 73209267 Y NA NA NA NA NA NA ANKRA2 349552 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 73330710 73331077 73330894 Y NA NA FAM169A,ENC1 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRA2 471199 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 73611863 73612159 73611974 Y NA NA RGNEF,ENC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEXB 321689 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 74020638 74021005 74020822 Y NA NSA2,GFM2 NA NA NA NA NSA2 39812 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 74883919 74884208 74884013 Y NA NA NA NA NA NA COL4A3BP 77956 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr5 76422152 76422524 76422338 Y NA ZBED3-AS1,ZBED3 NA NA NA NA ZBED3 41004 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 77147501 77147797 77147637 Y NA TBCA NA NA NA NA TBCA 14807 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 77765293 77765351 77765322 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 110954 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 77792703 77793028 77792954 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 138364 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 77800435 77801147 77800993 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA SCAMP1 146096 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 77810178 77810481 77810268 Y AP3B1 NA NA NA NA NA SCAMP1 155839 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 77843085 77843301 77843193 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 188746 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 77843471 77844086 77843723 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA SCAMP1 189132 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 78270986 78271091 78271032 Y NA ARSB NA NA NA NA ARSB 8819 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 78411121 78411135 78411130 Y NA BHMT NA NA NA NA BHMT 5519 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 78585055 78585206 78585119 Y NA CTC-451P13.1 NA NA NA NA CTC-451P13.1 6314 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 78686873 78686981 78686927 Y NA NA NA NA NA NA CTC-451P13.1 108132 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 78744780 78744887 78744834 Y NA NA NA NA NA NA RP11-342F17.1 59370 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 78993167 78993488 78993350 Y THBS4,CMYA5 NA NA NA NA NA PAPD4 87224 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 79458255 79458620 79458438 Y MSH3,SERINC5 NA NA NA NA NA SERINC5 91278 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 79553045 79553765 79553579 Y NA SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 3147 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 80055694 80056072 80055883 Y NA NA NA NA NA NA DHFR 106892 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 80490965 80491330 80491148 Y NA NA NA NA NA NA CKMT2-AS1 104049 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 80564528 80564843 80564784 Y NA CKMT2-AS1,ZCCHC9 NA NA NA NA CKMT2-AS1 30536 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 80707651 80707683 80707665 Y SSBP2 NA NA NA NA NA ZCCHC9 112242 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 80895638 80895717 80895678 Y NA NA NA NA NA NA SSBP2 149899 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 80898051 80898414 80898329 Y NA NA NA NA NA NA SSBP2 147202 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 80927026 80927304 80927299 Y NA NA NA NA NA NA SSBP2 118312 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 81045433 81045821 81045530 Y NA NA NA NA NA NA SSBP2 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 81147637 81148063 81147790 Y NA CTD-2249K22.1 ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2249K22.1 2217 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.75755787730614 chr5 81148608 81149026 81148707 Y SSBP2 CTD-2249K22.1 ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2249K22.1 3188 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 81149415 81149815 81149554 Y NA CTD-2249K22.1 ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2249K22.1 3995 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 82339174 82339396 82339285 Y NA XRCC4,TMEM167A NA NA NA NA XRCC4 31921 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 82670509 82670662 82670577 Y TMEM167A,VCAN NA NA NA NA NA VCAN 94622 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 82696125 82696357 82696275 Y VCAN NA TMEM167A,XRCC4 IMR90 Hi-C 24141950 VCAN 68927 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 82768408 82768816 82768560 Y NA VCAN NA NA NA NA VCAN 3124 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 82769254 82769739 82769524 Y VCAN VCAN NA NA NA NA VCAN 3970 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 82770174 82770695 82770300 Y NA VCAN NA NA NA NA VCAN 4890 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 83140507 83140806 83140549 Y NA RNU4-11P NA NA NA NA RNU4-11P 43134 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 83305524 83305826 83305754 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-11P 208151 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 86610420 86610785 86610768 Y NA RASA1 NA NA NA NA RASA1 48715 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 86619927 86620237 86620117 Y NA NA NA NA NA NA RASA1 58222 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 86649300 86650123 86649885 Y NA NA NA NA NA NA CCNH 56713 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 86667091 86667409 86667357 Y NA CCNH NA NA NA NA CCNH 39427 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 86673186 86673474 86673330 Y CCNH,CCNH CCNH NA NA NA NA CCNH 33362 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 87553177 87553334 87553293 Y NA TMEM161B-AS1,TMEM161B NA NA NA NA TMEM161B-AS1 9378 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 87692594 87693229 87692926 Y MEF2C RPS3AP22 NA NA NA NA RPS3AP22 16820 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 88159446 88159658 88159552 Y NA MEF2C NA NA NA NA MEF2C 38264 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 89940937 89941287 89941029 Y NA NA NA NA NA NA LYSMD3 117536 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 92593669 92593984 92593827 Y NA NA FLJ42709 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F1 323059 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 92937296 92937457 92937384 Y NA NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 20253 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 92940140 92940350 92940245 Y NR2F1 NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 23097 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 92958001 92958327 92958133 Y NA NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 40958 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 93013083 93013343 93013254 Y NA NPM1P27 NA NA NA NA NPM1P27 4030 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 93256507 93256894 93256879 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 188510 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr5 93316390 93316647 93316523 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 128757 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 94049532 94049756 94049644 Y KIAA0825 NA NA NA NA NA KIAA0825 97223 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 94967007 94967227 94967103 Y NA RFESD NA NA NA NA RFESD 13231 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 95094861 95094991 95094889 Y NA RHOBTB3,CTD-2154I11.2 GLRX IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2154I11.2 28862 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 95113820 95114121 95113969 Y NA CTD-2154I11.2,GLRX NA NA NA NA GLRX 42588 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 96475990 96476170 96476132 Y NA LIX1,RIOK2 NA NA NA NA LIX1 406 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 98175322 98175662 98175493 Y NA NA NA NA NA NA RGMB-AS1 68149 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 98253335 98253735 98253703 Y CHD1 CTD-2007H13.3 NA NA NA NA CTD-2007H13.3 9140 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 98262747 98263243 98263080 Y CHD1 NA NA NA NA NA CTD-2007H13.3 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 99382569 99383254 99382906 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 485712 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr5 99387251 99388845 99388529 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 480121 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr5 100113377 100113868 100113542 Y ST8SIA4,ST8SIA4 NA NA NA NA NA ST8SIA4 123102 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 100163819 100164102 100163976 Y ST8SIA4,ST8SIA4 NA NA NA NA NA ST8SIA4 72868 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 102091646 102092087 102091846 Y NA PAM NA NA NA NA PAM 3961 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr5 102194504 102194814 102194701 Y NA NA NA NA NA NA PAM 106819 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 102304978 102305194 102305031 Y NA NA NA NA NA NA PPIP5K2 148659 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 103048573 103048840 103048666 Y NA NA NA NA NA NA NUDT12 152079 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 105752390 105752961 105752697 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 1251635 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr5 106803068 106803432 106803267 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 201164 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 106806041 106806198 106806107 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 198398 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 106822252 106822471 106822392 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 182125 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 106837531 106838094 106837969 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 166502 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr5 106862612 106863005 106862809 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 141591 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 106900103 106900354 106900202 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 104242 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 106901710 106902084 106901897 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 102512 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 106906858 106907181 106907119 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 97415 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 106931094 106931453 106931417 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 73143 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 106967635 106967784 106967710 Y NA EFNA5 NA NA NA NA EFNA5 36812 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 107004755 107005118 107004922 Y NA EFNA5 NA NA NA NA EFNA5 159 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 107555103 107555441 107555272 Y NA NA NA NA NA NA FBXL17 160358 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 108071450 108071807 108071776 Y FER FER FER IMR90 Hi-C 24141950 FER 9716 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 108137615 108137706 108137661 Y NA NA NA NA NA NA FER 56092 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 108391550 108391948 108391605 Y NA NA NA NA NA NA FER 310027 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 108460806 108460908 108460857 Y NA NA NA NA NA NA PJA2 282787 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 109079577 109079706 109079642 Y NA NA NA NA NA NA MAN2A1 56510 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 110057836 110058086 110057958 Y NA SLC25A46,TMEM232 NA NA NA NA SLC25A46 13751 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 110561753 110562145 110561768 Y CAMK4 AC010468.1,CAMK4 NA NA NA NA CAMK4 4402 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 110563061 110563453 110563180 Y CAMK4 AC010468.1,CAMK4 NA NA NA NA CAMK4 5710 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 110590382 110590645 110590535 Y WDR36,CAMK4 CAMK4 NA NA NA NA CAMK4 33031 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 110592143 110592348 110592174 Y NA CAMK4 NA NA NA NA CAMK4 34792 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 110608063 110608453 110608093 Y NA NA NA NA NA NA CAMK4 50712 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 110790342 110790723 110790533 Y NA NA NA NA NA NA STARD4 55565 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 110797509 110797845 110797534 Y NA STARD4 NA NA NA NA STARD4 48443 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 110830968 110831101 110831035 Y WDR36,CAMK4,STARD4 STARD4 NA NA NA NA STARD4 15187 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 110838164 110838531 110838380 Y WDR36,CAMK4,STARD4 STARD4 NA NA NA NA STARD4 7757 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 110846985 110847356 110847238 Y WDR36,STARD4 STARD4 NA NA NA NA STARD4 697 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr5 111054290 111054596 111054444 Y C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13 NA NA NA NA NA STARD4 208002 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 111502817 111502914 111502867 Y C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,EPB41L4A EPB41L4A-AS1 NA NA NA NA EPB41L4A-AS1 8594 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 112218687 112219263 112218745 Y APC SRP19,REEP5 NA NA NA NA SRP19 23768 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 112219334 112219897 112219506 Y NA SRP19,REEP5 NA NA NA NA SRP19 24415 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 112383528 112383665 112383560 Y DCP2,YTHDC2 NA NA NA NA NA DCP2 73129 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 112395053 112395446 112395196 Y NA NA NA NA NA NA DCP2 84654 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 112425460 112425614 112425558 Y NA NA NA NA NA NA DCP2 115061 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr5 112509140 112509432 112509369 Y NA NA NA NA NA NA DCP2 198741 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr5 112628840 112629057 112628905 Y MCC,MCC NA NA NA NA NA MCC 193470 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 112629156 112629538 112629463 Y NA NA NA NA NA NA MCC 192989 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 112857514 112857856 112857617 Y NA MCC,YTHDC2 NA NA NA NA YTHDC2 10134 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 114847596 114847935 114847760 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 30656 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 114848957 114849251 114849109 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 29340 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 114881094 114881387 114881239 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 2503 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 114970299 114970641 114970577 Y NA TMED7-TICAM2,TMED7 NA NA NA NA TMED7 3610 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 115794810 115794877 115794844 Y COMMD10,SEMA6A NA NA NA NA NA CTB-118N6.1 101381 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 115908516 115909016 115908646 Y SEMA6A CTB-118N6.1 NA NA NA NA SEMA6A 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr5 118165526 118165828 118165677 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP2 141663 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 118257403 118257748 118257576 Y NA PTMAP2 NA NA NA NA PTMAP2 49743 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 118453384 118453586 118453485 Y NA CTB-161M19.4,RP11-950K24.2 NA NA NA NA RP11-950K24.2 8553 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 118592872 118593203 118593036 Y NA TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 9184 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 118610393 118610883 118610628 Y DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8 TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 8006 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 118627745 118627943 118627845 Y NA TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 25358 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 118679433 118679692 118679586 Y DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8 NA NA NA NA NA TNFAIP8 77046 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 119574806 119575142 119575014 Y NA NA NA NA NA NA PRR16 222831 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 119643931 119643945 119643937 Y NA NA NA NA NA NA PRR16 154028 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 119994126 119994308 119994217 Y NA NA NA NA NA NA PRR16 196153 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 120004624 120004640 120004633 Y NA NA NA NA NA NA PRR16 206651 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 122177778 122177931 122177816 Y NA SNX24 NA NA NA NA SNX24 644 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 122885327 122885717 122885442 Y CEP120,CSNK1G3 CSNK1G3 NA NA NA NA CSNK1G3 39534 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 123909192 123909435 123909314 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 173065 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 123987356 123987539 123987440 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 94961 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr5 123997171 123997561 123997207 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 84939 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 124042490 124042759 124042619 Y NA ZNF608 NA NA NA NA ZNF608 39741 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 124077955 124078154 124078062 Y ZNF608 ZNF608 NA NA NA NA ZNF608 4346 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 124085012 124085124 124085092 Y NA ZNF608 ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 2512 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 124748569 124748778 124748675 Y NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-436H11.1 605643 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 126181513 126181654 126181594 Y MARCH3 NA NA NA NA NA LMNB1 71198 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 126199771 126199925 126199848 Y NA NA NA NA NA NA LMNB1 89456 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 126478879 126479210 126479043 Y NA NA NA NA NA NA C5orf63 71695 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 126847905 126848122 126848004 Y NA PRRC1 PRRC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 PRRC1 3179 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 127211761 127211779 127211769 Y NA NA SLC12A2,FLJ33630,PRRC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC12A2 205679 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 128924961 128925290 128925126 Y ADAMTS19 NA NA NA NA NA ADAMTS19-AS1 130579 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 128959817 128960143 128960025 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS19-AS1 165435 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 129020678 129020929 129020798 Y ADAMTS19 NA NA NA NA NA CHSY3 217236 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.86094363479473 chr5 130711215 130711396 130711236 Y NA NA NA NA NA NA CDC42SE2 132029 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 130714603 130715158 130715088 Y NA NA NA NA NA NA CDC42SE2 135417 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 130750368 130750574 130750471 Y CDC42SE2,RAPGEF6 NA NA NA NA NA CDC42SE2 171182 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 131074214 131074509 131074363 Y NA NA NA NA NA NA FNIP1 56201 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 131108111 131108375 131108174 Y NA FNIP1 NA NA NA NA FNIP1 22335 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 131594769 131595694 131595371 Y PDLIM4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA PDLIM4 3405 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr5 131629178 131629624 131629352 Y FNIP1,IRF1,SLC22A4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 170 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.65417211981754 chr5 131764930 131765294 131765112 Y NA C5orf56,AC116366.6 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 C5orf56 20602 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 131830040 131830170 131830098 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 AC116366.6,IRF1 NA NA NA NA IRF1 5550 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 131981394 131981469 131981432 Y NA NA NA NA NA NA KIF3A 89861 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 132323487 132323535 132323508 Y NA AFF4,AC010240.3,ZCCHC10 NA NA NA NA AC010240.3 1685 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 133259809 133260031 133259966 Y NA C5orf15 FSTL4,HSPA4 IMR90 Hi-C 24141950 C5orf15 42447 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 133331351 133332089 133331904 Y NA C5orf15,VDAC1 C5orf15 IMR90 Hi-C 24141950 VDAC1 6735 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 133435759 133436442 133436277 Y PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7 TCF7 TCF7,SKP1 IMR90 Hi-C 24141950 TCF7 11960 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 133458261 133458756 133458481 Y UBE2B,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7 TCF7 NA NA NA NA TCF7 9859 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 133460352 133460406 133460379 Y UBE2B,PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7 TCF7 NA NA NA NA TCF7 11950 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 133543428 133543671 133543548 Y NA SKP1,PPP2CA NA NA NA NA PPP2CA 16162 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 133562679 133563046 133562870 Y NA PPP2CA NA NA NA NA PPP2CA 2846 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 133801466 133801754 133801589 Y NA NA PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 55877 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 133863130 133863560 133863438 Y NA NA NA NA NA NA CDKN2AIPNL 117541 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 133890161 133890536 133890268 Y TCF7,PPP2CA,CDKL3,UBE2B,SEC24A,CAMLG,PHF15 NA NA NA NA NA SEC24A 91943 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 133891612 133892163 133891823 Y PPP2CA,UBE2B,SEC24A NA NA NA NA NA SEC24A 90316 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461 NA NA NA NA MTND5P11 246 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11 NA NA NA NA MTND4P12,MIR4461 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr5 134729736 134729896 134729816 Y NA H2AFY NA NA NA NA H2AFY 3708 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 135416297 135416409 135416350 Y NA NA NA NA NA NA SMAD5 50125 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 135547897 135548364 135548088 Y NA NA NA NA NA NA SMAD5 81363 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 136374592 136374995 136374792 Y NA NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 183275 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 136450174 136450503 136450334 Y NA NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 258857 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 136727566 136727823 136727577 Y NA NA NA NA NA NA SPOCK1 204245 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr5 136770007 136770201 136770104 Y NA NA NA NA NA NA SPOCK1 161867 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 136795919 136796307 136796181 Y NA NA NA NA NA NA SPOCK1 135761 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 136797859 136797994 136797927 Y KLHL3 NA NA NA NA NA SPOCK1 134074 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 137237773 137238021 137237897 Y WNT8A PKD2L2,RP11-381K20.2 NA NA NA NA RP11-381K20.2 14748 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 137785775 137785891 137785836 Y WNT8A,NME5,LRRTM2,REEP2 REEP2,EGR1 NA NA NA NA REEP2 13069 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 137799770 137800154 137799916 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 591 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.44740060484035 chr5 137800317 137800564 137800421 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 1138 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.7914154521921 chr5 137815410 137815785 137815600 Y BRD8,HSPA9 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 16231 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr5 137826508 137826985 137826545 Y NA EGR1 NA NA NA NA EGR1 27329 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 137827710 137828119 137827817 Y EGR1 EGR1,ETF1 NA NA NA NA EGR1 28531 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.17110090726052 chr5 137833063 137833252 137833158 Y FAM53C,EGR1 EGR1,ETF1 NA NA NA NA EGR1 33884 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 137870529 137870619 137870574 Y FAM53C,KDM3B,ETF1 ETF1,HSPA9 NA NA NA NA ETF1 6370 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 138277949 138278244 138278038 Y NA NA NA NA NA NA LRRTM2 68892 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 138686401 138686737 138686569 Y NA PAIP2 NA NA NA NA PAIP2 11125 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 138786651 138786712 138786682 Y NA SPATA24,DNAJC18 NA NA NA NA DNAJC18 8471 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 138851930 138852095 138852011 Y NA NA NA NA NA NA UBE2D2 51921 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 138897527 138897822 138897662 Y MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2 UBE2D2 DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2D2 6194 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr5 138965572 138965797 138965632 Y NA NA NA NA NA NA CXXC5 59087 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr5 139015811 139016118 139015905 Y MATR3,MATR3,MZB1,CXXC5 CXXC5 CXXC5 IMR90 Hi-C 24141950 CXXC5 8766 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 139017086 139017541 139017145 Y CXXC5 CXXC5 CXXC5 IMR90 Hi-C 24141950 CXXC5 7343 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 139040519 139041115 139040855 Y PAIP2 CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 15635 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 139043719 139044204 139043873 Y PAIP2 CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 18835 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 139076374 139076603 139076510 Y CXXC5 NA NA NA NA NA CXXC5 51490 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 139077054 139077268 139077188 Y CXXC5 NA NA NA NA NA CXXC5 52170 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 139078128 139078514 139078502 Y C5orf53,DNAJC18,CXXC5,NRG2,PSD2 NA NA NA NA NA CXXC5 53244 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 139090416 139090834 139090571 Y MATR3,MATR3,CXXC5 NA CXXC5 K562 ChIA-PET 22265404 CXXC5 65532 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr5 139090940 139091124 139091019 Y NA NA CXXC5 K562 ChIA-PET 22265404 CXXC5 66056 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 139104562 139104943 139104720 Y NA NA DNAJC18,UBE2D2,CXXC5 IMR90 Hi-C 24141950 PSD2 68463 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 139132414 139132610 139132513 Y NA PSD2 UBE2D2,CXXC5,DNAJC18,NRG2,CYSTM1 IMR90 Hi-C 24141950 PSD2 40796 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 139420805 139420894 139420865 Y NRG2 NA NA NA NA NA NRG2 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 139464204 139464218 139464211 Y NA NRG2,PURA,IGIP CYSTM1,NRG2 IMR90 Hi-C 24141950 PURA 21144 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 139488718 139489038 139488945 Y NA PURA,IGIP NRG2,CYSTM1,IGIP IMR90 Hi-C 24141950 PURA 3356 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 139636160 139636260 139636251 Y SRA1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 44446 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr5 139638984 139639383 139639269 Y C5orf32,ZMAT2,SRA1,IK,HARS2,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 41323 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 139724210 139724515 139724457 Y SRA1,CD14,CD14,APBB3,HBEGF,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA HBEGF 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 139782360 139782578 139782471 Y NA RNU4-14P,ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3 NA NA NA NA ANKHD1-EIF4EBP3 2867 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 139933633 139933898 139933723 Y ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3 EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3 NA NA NA NA SRA1 1997 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 140090601 140091006 140090806 Y NA WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3 NA NA NA NA VTRNA1-1 1741 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 140098281 140098628 140098472 Y NA HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3 NA NA NA NA VTRNA1-3 5115 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 140322933 140323011 140322970 Y PCDHGA8,PCDHGB6,PCDHGA9,PCDHGA6,PCDHB16,PCDHB15,PCDHB12,PCDHA1,PCDHA2,PCDHA3,PCDHA4,PCDHA5,PCDHA7,PCDHB4,PCDHA13,PCDHAC2 PCDHAC2 NA NA NA NA PCDHAC2 20809 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 140376000 140376321 140376119 Y PCDHGA8,PCDHGC4,PCDHGB6,PCDHGA9,PCDHGA6,PCDHB16,PCDHB15,PCDHB12,PCDHA1,PCDHA2,PCDHA3,PCDHA4,PCDHA5,PCDHA6,PCDHA7,PCDHA10,PCDHA13 PCDHAC2 NA NA NA NA PCDHAC2 32180 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 140381128 140381335 140381222 Y NA PCDHAC2 NA NA NA NA PCDHAC2 37308 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 140381838 140382244 140382041 Y DND1,PCDHAC1,PCDHAC2,PCDHAC2 PCDHAC2 NA NA NA NA PCDHAC2 38018 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 140714021 140714065 140714043 Y PCDHB12,PCDHB15,PCDHGC4 TAF7,PCDHGA1,PCDHGA2,PCDHGA3,PCDHGB1,PCDHGA4,PCDHGB2,PCDHGB3,PCDHGA6,PCDHGA7 NA NA NA NA PCDHGA2 2474 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 140875639 140876085 140875835 Y PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1 PCDHGC3 NA NA NA NA PCDHGC3 22059 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr5 140888509 140888855 140888756 Y PCDH12,PCDHGA11,PCDHGA12 PCDHGC3 NA NA NA NA PCDHGC3 34929 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 140893513 140893891 140893828 Y PCDH12,KIAA0141,DIAPH1 PCDHGC3 NA NA NA NA PCDHGC3 39933 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 140910138 140910894 140910494 Y NA NA NA NA NA NA PCDHGC3 56558 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 140985133 140985553 140985464 Y TAF7,PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1 DIAPH1,HDAC3,RELL2,FCHSD1 NA NA NA NA DIAPH1 11069 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 141054975 141055298 141055138 Y PCDHB12,PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGB7,PCDHGB7,PCDHGC3,PCDHGC4 HDAC3,RELL2,FCHSD1,ARAP3 NA NA NA NA ARAP3 4490 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 141056831 141057056 141056944 Y NA HDAC3,RELL2,FCHSD1,ARAP3 NA NA NA NA ARAP3 2732 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 141191253 141191653 141191448 Y PCDHGA3,PCDHGB1,PCDHGB2,PCDHGA6,PCDHGA8,PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1 NA PCDH1,LOC729080,PCDH12 IMR90 Hi-C 24141950 PCDH1 65158 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 141375136 141375383 141375261 Y NA RNF14,GNPDA1 NA NA NA NA GNPDA1 15223 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 141404371 141404781 141404694 Y DIAPH1,FCHSD1 GNPDA1 GNPDA1,NDFIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNPDA1 13765 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 141444983 141445199 141445045 Y NA NDFIP1 FGF1,NDFIP1,GNPDA1,ARAP3,FCHSD1 IMR90 Hi-C 24141950 NDFIP1 40871 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 141736379 141736797 141736670 Y ARHGAP26 AC005592.2,SPRY4 NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPRY4 32359 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr5 142315332 142315934 142315386 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 167383 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 142341115 142341252 142341163 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP26 193166 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 142357164 142357537 142357332 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 209215 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 142541504 142541934 142541585 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA RPL7P21 168236 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 142600445 142600900 142600783 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA RPL7P21 109270 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 142609232 142609364 142609290 Y NR3C1,NR3C1 NA NA NA NA NA RPL7P21 100806 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 142819954 142820205 142820015 Y NA NR3C1 NA NA NA NA NR3C1 6877 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 143258212 143258461 143258260 Y NA NA ARHGAP26,NR3C1 IMR90 Hi-C 24141950 YIPF5 289817 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 145498086 145498488 145498483 Y NA NA NA NA NA NA LARS 61735 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 146751772 146751865 146751838 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL3 135754 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 146831561 146831956 146831686 Y PPP2R2B,JAKMIP2,DPYSL3 NA NA NA NA NA DPYSL3 55663 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 146890135 146890280 146890247 Y NA DPYSL3 NA NA NA NA DPYSL3 2516 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 147073908 147073968 147073938 Y SPINK14,JAKMIP2 NA NA NA NA NA JAKMIP2 86370 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 147083144 147083174 147083159 Y SPINK14,JAKMIP2 NA NA NA NA NA JAKMIP2 77164 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 147584875 147585351 147585146 Y FBXO38 NA NA NA NA NA RP11-373N22.3 175995 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 147782971 147782994 147782983 Y ADRB2,SPINK14,FBXO38 RP11-373N22.3,FBXO38 NA NA NA NA FBXO38 21473 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 148738164 148738422 148738235 Y PCYOX1L GRPEL2,PCYOX1L,MIR143HG NA NA NA NA PCYOX1L 2594 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 149110531 149110757 149110649 Y PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2670 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 149261958 149262272 149262115 Y NA NA NA NA NA NA SLC26A2 76028 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 149518246 149518623 149518550 Y NA PDGFRB NA NA NA NA PDGFRB 14812 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 149533722 149534084 149534015 Y SYNPO,SYNPO,PDGFRB PDGFRB NA NA NA NA PDGFRB 287 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 149945724 149945760 149945742 Y SYNPO,ZNF300 SYNPO NA NA NA NA SYNPO 32882 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 149979570 149980059 149979818 Y NA SYNPO NA NA NA NA SYNPO 928 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr5 149985154 149985492 149985203 Y NA SYNPO NA NA NA NA SYNPO 6512 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr5 150086779 150087134 150086956 Y RBM22,DCTN4,DCTN4 RBM22,DCTN4 MYOZ3,RBM22 IMR90 Hi-C 24141950 RBM22 8110 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 150108879 150109189 150109172 Y SYNPO RBM22,DCTN4 NA NA NA NA DCTN4 27482 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 150142965 150143377 150143063 Y CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62 DCTN4 DCTN4,C5orf62 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 DCTN4 6294 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 150454717 150454894 150454780 Y NA TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 16244 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 150461516 150462400 150461744 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 8738 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 150462985 150463261 150463131 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 7877 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 150873344 150873758 150873456 Y NA NA NA NA NA NA SLC36A1 58737 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 151200780 151201112 151200835 Y GLRA1 NA NA NA NA NA ATOX1 50687 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 151213355 151213633 151213423 Y NA NA NA NA NA NA ATOX1 63262 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 151307213 151307514 151307357 Y NA GLRA1 NA NA NA NA GLRA1 4810 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 153743049 153743076 153743063 Y NA NA NA NA NA NA SAP30L-AS1 80334 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 153855980 153856061 153856023 Y HAND1 SAP30L-AS1,SAP30L,HAND1,CTB-158E9.1 NA NA NA NA HAND1 156 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 153862086 153862603 153862319 Y NA SAP30L-AS1,SAP30L,HAND1,CTB-158E9.1 HAND1,FAM114A2,MFAP3,LARP1,C5orf4 IMR90 Hi-C 24141950 CTB-158E9.1 1107 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 3.41172999712367 chr5 153896784 153897165 153896975 Y NA HAND1,CTB-158E9.1 SAP30L,HAND1 IMR90 Hi-C 24141950 CTB-158E9.1 33074 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 153903267 153903411 153903357 Y HAND1 HAND1,CTB-158E9.1 NA NA NA NA CTB-158E9.1 39557 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr5 153988097 153988522 153988309 Y NA NA GRIA1,FAM114A2,MFAP3,GALNT10,FLJ38109,SAP30L,HAND1,C5orf4 IMR90 Hi-C 24141950 LARP1 101940 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 153990009 153990256 153990067 Y NA NA GRIA1,FAM114A2,MFAP3,GALNT10,FLJ38109,SAP30L,HAND1,C5orf4 IMR90 Hi-C 24141950 LARP1 100206 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 154071115 154071211 154071188 Y NA LARP1 LARP1,C5orf4 IMR90 Hi-C 24141950 LARP1 19251 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 154205315 154205569 154205444 Y KIF4B,GEMIN5 CNOT8 NA NA NA NA CNOT8 29544 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 154274946 154275114 154275030 Y NA CNOT8,GEMIN5,MRPL22 NA NA NA NA CNOT8 39833 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 154313326 154313392 154313358 Y NA GEMIN5,MRPL22 NA NA NA NA GEMIN5 2377 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 154871450 154872048 154871744 Y KIF4B NA NA NA NA NA MRPL22 552820 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr5 155211653 155211669 155211662 Y NA NA NA NA NA NA MRPL22 893023 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 156718541 156718931 156718583 Y HAVCR2,ADAM19,CYFIP2,CYFIP2,CYFIP2 CYFIP2 NA NA NA NA CYFIP2 27452 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 156814689 156815040 156814693 Y NA NA NA NA NA NA NIPAL4 69987 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 156914271 156914616 156914546 Y CYFIP2,CYFIP2,ADAM19 NIPAL4 NA NA NA NA NIPAL4 29244 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 157030326 157030804 157030600 Y HAVCR2,NIPAL4,ADAM19 ADAM19 CYFIP2,FNDC9,NIPAL4,ADAM19,SOX30,C5orf52,THG1L,LSM11 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM19 29543 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 157257409 157257732 157257678 Y NA CLINT1 NA NA NA NA CLINT1 26451 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 157284724 157285025 157284835 Y NIPAL4,ADAM19 CLINT1 LSM11 IMR90 Hi-C 24141950 CLINT1 541 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 158136422 158136652 158136537 Y NA NA NA NA NA NA EBF1 388117 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 158201990 158201999 158201995 Y NA NA NA NA NA NA EBF1 322770 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 158478339 158478495 158478452 Y EBF1 EBF1,RP11-175K6.1 NA NA NA NA EBF1 46274 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 158481442 158481711 158481685 Y NA EBF1,RP11-175K6.1 NA NA NA NA EBF1 43058 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 158491555 158491917 158491726 Y EBF1 EBF1,RP11-175K6.1 NA NA NA NA EBF1 32852 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 158507046 158507207 158507202 Y NA EBF1,RP11-175K6.1 NA NA NA NA EBF1 17562 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 158521683 158522288 158522053 Y EBF1 EBF1,RP11-175K6.1 NA NA NA NA EBF1 2481 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 158611896 158612266 158612182 Y IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145 RNF145 NA NA NA NA RNF145 22795 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 158854760 158855055 158854852 Y EBF1 NA NA NA NA NA UBLCP1 166671 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 159414162 159414427 159414404 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 19693 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 159480874 159481257 159481243 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 46754 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 159533500 159533764 159533742 Y NA PWWP2A NA NA NA NA PWWP2A 10666 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 159592107 159592427 159592336 Y NA PWWP2A,FABP6 TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FABP6 19947 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 159592617 159593055 159592885 Y NA PWWP2A,FABP6 TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FABP6 19319 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr5 159861130 159861264 159861184 Y PWWP2A,FABP6 C5orf54,SLU7,PTTG1 NA NA NA NA PTTG1 14301 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 159933720 159933957 159933888 Y PWWP2A,SLU7 NA NA NA NA NA PTTG1 86891 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 160156032 160156411 160156222 Y NA NA NA NA NA NA PTTG1 309203 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 160754027 160754417 160754191 Y NA NA NA NA NA NA PTTG1 907198 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 167011273 167011672 167011457 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 704984 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 168055373 168055394 168055384 Y NA CTC-575D19.1 NA NA NA NA CTC-575D19.1 14056 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 168156426 168156708 168156567 Y NA NA NA NA NA NA CTC-575D19.1 115109 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 168229147 168229460 168229328 Y NA NA NA NA NA NA CTC-575D19.1 187830 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr5 168232470 168232861 168232812 Y NA NA NA NA NA NA CTC-575D19.1 191153 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr5 168279021 168279443 168279141 Y NA NA NA NA NA NA CTC-575D19.1 237704 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 168287563 168287715 168287633 Y NA NA NA NA NA NA CTC-575D19.1 246246 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 168302839 168303219 168303163 Y NA NA NA NA NA NA CTC-575D19.1 261522 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 168460125 168460505 168460446 Y NA NA NA NA NA NA SLIT3 265628 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr5 168472035 168472299 168472205 Y NA NA NA NA NA NA SLIT3 253834 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 168503083 168503413 168503326 Y NA NA NA NA NA NA SLIT3 222720 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 168527289 168527410 168527350 Y NA NA NA NA NA NA SLIT3 198723 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 168588352 168588495 168588423 Y NA NA NA NA NA NA SLIT3 137638 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 169398141 169398453 169398335 Y NA FAM196B NA NA NA NA FAM196B 7291 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 170024399 170024639 170024519 Y NA NA NA NA NA NA KCNIP1 245908 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 170289548 170289859 170289780 Y NA RANBP17 NA NA NA NA RANBP17 2674 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 170378492 170378604 170378547 Y RANBP17 NA NA NA NA NA RANBP17 91618 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 170552523 170552751 170552637 Y NA NA NA NA NA NA TLX3 181537 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 170662332 170662346 170662338 Y NA NA NA NA NA NA TLX3 71942 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr5 171039588 171039891 171039740 Y NA NA FBXW11 IMR90 Hi-C 24141950 FGF18 194928 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 171135787 171136029 171135908 Y NA NA FGF18 IMR90 Hi-C 24141950 FGF18 291127 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 171326428 171326478 171326475 Y NA NA NA NA NA NA FBXW11 105399 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 171432610 171432692 171432660 Y NA FBXW11 NA NA NA NA FBXW11 733 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 171709316 171709633 171709569 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 241 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 171834226 171834319 171834273 Y NA SH3PXD2B NA NA NA NA SH3PXD2B 45208 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 171839597 171840252 171839919 Y DUSP1,STK10,UBTD2 SH3PXD2B NA NA NA NA SH3PXD2B 39275 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 172192263 172193766 172192583 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2432 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr5 172198749 172199959 172199636 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2551 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr5 172225425 172225974 172225664 Y ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1,ERGIC1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 29227 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 172264744 172264958 172264926 Y DUSP1,C5orf41,ERGIC1 ERGIC1 NA NA NA NA ERGIC1 5466 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 172283530 172283741 172283563 Y NA ERGIC1 NA NA NA NA ERGIC1 24252 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 172350033 172350394 172350214 Y NA RPL26L1 NA NA NA NA RPL26L1 33338 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 172370220 172370579 172370385 Y ERGIC1,ATP6V0E1 RPL26L1,ATP6V0E1 NA NA NA NA RPL26L1 13153 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 173031200 173031306 173031275 Y NA BOD1 NA NA NA NA BOD1 10357 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 173391031 173391183 173391109 Y HMP19 NA NA NA NA NA CPEB4 77748 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 173391394 173391777 173391587 Y CPEB4 NA NA NA NA NA CPEB4 78111 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 173492049 173492420 173492400 Y HMP19 NA NA NA NA NA CPEB4 178766 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 173572937 173573111 173573024 Y HMP19 NA HMP19 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 259654 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 173738914 173739193 173739170 Y HMP19 NA BOD1 IMR90 Hi-C 24141950 MSX2 410343 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr5 173765324 173765497 173765445 Y MSX2 NA HMP19,MIR4634,MSX2,FLJ16171 IMR90 Hi-C 24141950 MSX2 384039 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 173811612 173811806 173811713 Y NA NA NA NA NA NA MSX2 337730 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 173846140 173846257 173846227 Y NA NA MSX2,MIR4634 IMR90 Hi-C 24141950 MSX2 303279 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 174670280 174670302 174670292 Y NA NA DRD1 IMR90 Hi-C 24141950 SFXN1 231763 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 175302369 175302773 175302579 Y DRD1,CPLX2,C5orf25,CPLX2 NA NA NA NA NA CPLX2 81056 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 176250127 176250448 176250189 Y GPRIN1,SNCB,EIF4E1B,NSD1,UNC5A UNC5A NA NA NA NA UNC5A 14649 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 176337374 176337559 176337468 Y NA NA NA NA NA NA UNC5A 101896 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 176359562 176359884 176359876 Y RNF44,UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,GRK6 NA NA NA NA NA UIMC1 87750 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 176421508 176421945 176421807 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,RAB24,GRK6,HK3 UIMC1,ZNF346 NA NA NA NA UIMC1 25689 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 176422952 176423155 176423071 Y HK3,UIMC1,UIMC1,UIMC1,RAB24,GRK6 UIMC1,ZNF346 NA NA NA NA UIMC1 24479 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 176424414 176424699 176424557 Y NA UIMC1,ZNF346 NA NA NA NA UIMC1 22935 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 176699119 176699281 176699198 Y NSD1 RAB24,PRELID1,MXD3 NA NA NA NA RAB24 29464 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr5 177041998 177042331 177042024 Y NSD1 TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 16897 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 177645267 177645446 177645363 Y N4BP3,CLK4,AGXT2L2 HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 15759 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 177645477 177646261 177645593 Y NA HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 15969 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr5 177647239 177647603 177647383 Y CLK4,AGXT2L2 HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 17731 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 177757894 177758005 177757937 Y CLK4 NA NA NA NA NA HNRNPAB 128386 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 177933093 177933334 177933266 Y NHP2,HNRNPAB,COL23A1 NA NA NA NA NA COL23A1 82222 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 178165468 178165782 178165663 Y NA ZNF354A JPH2 MCF7 ChIA-PET 19890323 ZNF354A 9765 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 178255974 178256130 178256077 Y NA ZNF354B ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF354B 28824 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr5 178257722 178258121 178258094 Y NA ZNF354B ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF354B 26833 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 178259703 178260206 178260005 Y ZNF879 ZNF354B,RNU1-39P ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF354B 24748 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 22.021166345071 chr5 178323440 178323622 178323554 Y NA ZNF354B,RNU1-39P,ZFP2,ZNF454 NA NA NA NA ZFP2 2545 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 178326649 178327118 178326669 Y NA ZNF354B,RNU1-39P,ZFP2,ZNF454 NA NA NA NA ZFP2 5754 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 178985972 178986151 178986083 Y NA RUFY1 NA NA NA NA RUFY1 10413 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 179038504 179038699 179038602 Y NA HNRNPH1 NA NA NA NA HNRNPH1 21086 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 179453285 179453637 179453562 Y RUFY1,HNRNPH1,MAML1,SQSTM1,RNF130 RNF130 NA NA NA NA RNF130 43481 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 179512852 179513059 179513042 Y MAML1,LTC4S RNF130 NA NA NA NA RNF130 15734 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 179967202 179967410 179967248 Y NA CNOT6 NA NA NA NA CNOT6 47790 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 180473265 180473624 180473271 Y BTNL9 NA NA NA NA NA CTC-338M12.5 143300 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 180611137 180611357 180611292 Y MGAT1 CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 5567 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr5 180615428 180615595 180615512 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 1329 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr5 180615864 180616079 180615972 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 845 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 180633694 180634117 180633980 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM7 3401 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr5 180634441 180634803 180634658 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM7 4148 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr6 542839 543066 543064 Y NA NA NA NA NA NA EXOC2 148051 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 1609094 1609758 1609395 Y FOXC1 FOXC1 NA NA NA NA FOXC1 413 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 2038182 2038509 2038345 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 205417 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 2299603 2299973 2299788 Y NA NA NA NA NA NA GMDS-AS1 55621 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 2738073 2738511 2738408 Y NA WRNIP1 NA NA NA NA WRNIP1 25137 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 2849123 2849376 2849246 Y SERPINB9,RIPK1,NQO2,SERPINB1 SERPINB1 NA NA NA NA SERPINB1 8883 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 3069574 3070273 3069674 Y NA HTATSF1P2,RIPK1,BPHL LOC100507194,WRNIP1 K562 ChIA-PET 22265404 RIPK1 7349 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 3072108 3072295 3072201 Y NA RIPK1,BPHL NA NA NA NA RIPK1 9883 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 3163246 3163428 3163368 Y NA BPHL,TUBB2A NA NA NA NA TUBB2A 7486 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 3230738 3231042 3230747 Y NA PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 774 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 3238745 3238826 3238788 Y NA PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 8781 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 3248062 3248427 3248198 Y SLC22A23,TUBB2A,TUBB2B PSMG4,TUBB2B TUBB2A,BPHL,RIPK1,LOC100507194,TUBB2B IMR90 Hi-C 24141950 TUBB2B 18098 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.06771514977192 chr6 3254273 3254642 3254472 Y SLC22A23 PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 24309 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr6 5157743 5158129 5157936 Y NA NA NA NA NA NA LYRM4 101043 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 5206171 5206360 5206265 Y NA NA NA NA NA NA LYRM4 52812 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 5246431 5246752 5246693 Y NA LYRM4,FARS2 NA NA NA NA LYRM4 12420 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 5280343 5280601 5280557 Y NA LYRM4,FARS2 NA NA NA NA FARS2 21066 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 5660943 5661332 5661178 Y NA NA NA NA NA NA NRN1 343868 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr6 5994378 5994644 5994564 Y NRN1 NRN1 NA NA NA NA NRN1 10556 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 5996432 5996750 5996575 Y NA NRN1 NA NA NA NA NRN1 8450 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 6000594 6000986 6000896 Y NRN1 NRN1 NA NA NA NA NRN1 4214 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 7074033 7074425 7074227 Y LY86,RREB1,RREB1 RREB1 NA NA NA NA RREB1 31405 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 7731119 7731407 7731310 Y TXNDC5,TXNDC5,BMP6 BMP6 NA NA NA NA BMP6 6089 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 8083649 8083837 8083720 Y NA EEF1E1 NA NA NA NA EEF1E1 16974 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 10719904 10720278 10720060 Y NA PAK1IP1,C6orf52,TMEM14C,TMEM14B,SYCP2L NA NA NA NA TMEM14C 870 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 10771427 10771996 10771700 Y ELOVL2,MAK TMEM14B,SYCP2L NA NA NA NA SYCP2L 25400 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 11170049 11170298 11170253 Y NA NA NA NA NA NA ELOVL2 127502 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 11217429 11217753 11217578 Y MAK,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 162828 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 11229489 11229708 11229675 Y TMEM170B,MAK,ELOVL2,NEDD9,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 150873 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 11331718 11332104 11332092 Y NA NEDD9 NA NA NA NA NEDD9 48477 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 12265023 12265287 12265176 Y HIVEP1,EDN1 NA TMEM170B,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL15P3 247055 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 12472967 12473281 12473124 Y NA RPL15P3 NA NA NA NA RPL15P3 39061 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 12729754 12730156 12729835 Y NA NA NA NA NA NA RPL15P3 217412 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 12757628 12757881 12757647 Y PHACTR1 NA NA NA NA NA RPL15P3 245286 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 12771306 12771602 12771454 Y NA NA NA NA NA NA RPL15P3 258964 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 12909376 12909688 12909473 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-11P 302600 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 12965020 12965354 12965088 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-11P 246934 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 13059086 13059210 13059117 Y PHACTR1 NA NA NA NA NA RNU1-11P 153078 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 13302642 13303798 13303216 Y GFOD1,GFOD1,TBC1D7 TBC1D7 NA NA NA NA TBC1D7 23017 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 13307248 13307611 13307538 Y GFOD1,GFOD1,TBC1D7 TBC1D7 LOC100130357 K562 ChIA-PET 22265404 TBC1D7 19204 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 13636617 13636971 13636795 Y TBC1D7,GFOD1,CD83 NOL7 NA NA NA NA NOL7 23058 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 13649579 13649948 13649702 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 36020 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr6 13662469 13662838 13662724 Y NA NOL7,RANBP9 NA NA NA NA RANBP9 46958 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 13709903 13710182 13710119 Y TBC1D7,CD83,RANBP9 RANBP9 SIRT5,NOL7 K562 ChIA-PET 22265404 RANBP9 107 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 14211061 14211714 14211398 Y CD83 NA JARID2,DTNBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD83 95189 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 14837546 14837947 14837747 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 406580 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 15365610 15365867 15365688 Y JARID2,DTNBP1 NA NA NA NA NA JARID2-AS1 118745 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 15436683 15436898 15436793 Y JARID2 NA NA NA NA NA JARID2-AS1 189818 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 15554239 15554360 15554316 Y JARID2,DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 106929 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 16151584 16151748 16151704 Y NA MYLIP NA NA NA NA MYLIP 24228 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 16205650 16206035 16205852 Y NA NA DTNBP1,MYLIP,GMPR IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYLIP 78294 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 16607418 16607798 16607611 Y NA NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 151571 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 16652450 16652671 16652543 Y NA NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 106698 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 16690265 16690543 16690477 Y ATXN1 NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 68826 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 16713666 16713734 16713668 Y ATXN1 RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 45635 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 16803732 16803856 16803794 Y NA RP1-151F17.1,ATXN1 FLJ23152,GMPR,ATXN1 IMR90 Hi-C 24141950 ATXN1 44010 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 17473157 17473283 17473220 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P26 56600 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 17703484 17703614 17703560 Y KDM1B,FAM8A1,NUP153 NUP153 NA NA NA NA NUP153 1042 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 17864491 17864751 17864619 Y NA NA NA NA NA NA KIF13A 121103 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 18153083 18153444 18153238 Y RNF144B,NHLRC1,KDM1B NHLRC1,KDM1B NA NA NA NA TPMT 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 18308493 18308879 18308567 Y NA DEK RNF144B IMR90 Hi-C 24141950 DEK 45439 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 18419977 18420304 18420012 Y NA NA NA NA NA NA DEK 156923 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 20404913 20405227 20404970 Y MBOAT1 E2F3 NA NA NA NA E2F3 4515 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 20418274 20418752 20418425 Y NA E2F3 NA NA NA NA E2F3 17876 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 20604004 20604027 20604016 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 71316 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 20994795 20995087 20994932 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 462107 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 21098770 21098791 21098780 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 493181 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr6 21383430 21383704 21383606 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 208268 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 21587723 21589288 21589205 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2684 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr6 21589338 21589711 21589681 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2261 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 21667588 21667834 21667745 Y SOX4 NA NA NA NA NA SOX4 75616 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 21925228 21925506 21925404 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 333256 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 21997954 21998076 21998022 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 405982 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 22148644 22148866 22148767 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 556672 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr6 22149387 22149566 22149505 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 557415 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 24927472 24927654 24927651 Y ALDH5A1,TDP2,C6orf62 PPIAP29 FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 PPIAP29 46993 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 25034556 25034972 25034914 Y C6orf62 NA FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 PPIAP29 59909 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 25050592 25050945 25050684 Y C6orf62 NA FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 PPIAP29 75945 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 25094713 25094741 25094729 Y NA NA NA NA NA NA CMAHP 70052 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2 NA NA NA NA HIST1H3A 25645 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 5.4794451468956 chr6 26026306 26026795 26026679 Y HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H4B 826 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr6 26126352 26126787 26126533 Y HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD NA NA NA NA HIST1H2AC 3979 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.86094363479473 chr6 26232920 26233434 26233137 Y NA HIST1H4D,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI NA NA NA NA HIST1H1D 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 26233560 26233958 26233761 Y NA HIST1H4D,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI,HIST1H4H NA NA NA NA HIST1H1D 344 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 26266741 26266990 26266911 Y NA HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI,HIST1H4H NA NA NA NA HIST1H3G 2622 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 26304989 26305345 26305268 Y NA HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI,HIST1H4H HCG11,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H2AE,HIST1H2BF,HIST1H2BG,HIST1H3D,HIST1H4E,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H4G,HIST1H2BI,HIST1H3G,HIST1H4H,BTN3A2,BTN2A2,BTN1A1,HMGN4,BTN3A3,HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,ABT1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H4H 21227 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 26474010 26474599 26474187 Y NA BTN3A3,BTN2A1,HCG11 NA NA NA NA BTN2A1 17860 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 26521003 26521206 26521108 Y HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1 HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HCG11 927 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr6 26522673 26522990 26522813 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HCG11 2597 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr6 26537641 26538043 26537718 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 1008 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr6 26550694 26551000 26550826 Y NA HCG11,HMGN4,ABT1 NA NA NA NA HMGN4 14061 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 27300679 27301026 27300902 Y NA ZNF204P,ZNF391 NA NA NA NA ZNF204P 36278 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr6 27640311 27640352 27640335 Y NA NA ZNF391,PRSS16 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BL 133357 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 27655152 27655475 27655306 Y FKSG83,ZNF391,ZNF184,ZNF192,HIST1H3H,HIST1H2BO,HIST1H2BN,HIST1H2AM NA LOC100507173,ZNF184 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HIST1H2BL 118234 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 27655687 27656083 27655918 Y NA NA LOC100507173 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HIST1H2BL 117626 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr6 27706104 27706357 27706299 Y NA NA NA NA NA NA HIST1H2BL 67352 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr6 27740489 27740807 27740621 Y NA HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J NA NA NA NA HIST1H2BL 32902 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 27759985 27760333 27760032 Y ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN NA NA NA NA HIST1H2BL 13376 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr6 27807310 27807672 27807617 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L NA NA NA NA HIST1H2BN 2987 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 27862895 27863061 27863012 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 3692 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr6 27863298 27863662 27863535 Y ZKSCAN3,ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZNF323,ZNF193,ZNF192,ZKSCAN4,PGBD1,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 4095 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr6 28072476 28072872 28072543 Y HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192 ZSCAN12P1,ZSCAN16 NA NA NA NA ZSCAN12P1 15544 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr6 28080593 28080792 28080693 Y NA ZSCAN12P1,ZSCAN16,ZNF192P1 NA NA NA NA ZSCAN16 9546 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 28101066 28101269 28101177 Y OR2B2,ZNF187,ZKSCAN4,ZSCAN16 ZSCAN12P1,ZSCAN16,ZNF192P1 NA NA NA NA ZSCAN16 10728 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr6 28280351 28280639 28280495 Y NA PGBD1,ZKSCAN3 NA NA NA NA PGBD1 33037 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 28414953 28415259 28415025 Y NA ZSCAN12,ZSCAN23,COX11P1 NA NA NA NA COX11P1 2203 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 28457225 28458028 28457315 Y NA ZSCAN23,COX11P1 NA NA NA NA COX11P1 44475 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 28601930 28602271 28602104 Y NA SCAND3 NA NA NA NA SCAND3 19941 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 28603148 28603326 28603259 Y NKAPL,ZNF187,ZSCAN23,SCAND3 SCAND3 NA NA NA NA SCAND3 21159 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 28710805 28711035 28710922 Y NA NA NA NA NA NA XXbac-BPG308K3.5 93748 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 28834475 28834586 28834545 Y NA XXbac-BPG308K3.5,HCG14 NA NA NA NA HCG14 27721 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 29568471 29568641 29568556 Y MOG,GABBR1 GABBR1 NA NA NA NA GABBR1 31112 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 29932777 29932958 29932802 Y HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A HLA-A NA NA NA NA HLA-A 25740 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 30069810 30070038 30069951 Y HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39 ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11 NA NA NA NA PPP1R11 37324 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 30177609 30178061 30177863 Y NA TRIM26,HLA-L NA NA NA NA TRIM26 1143 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 30247447 30247451 30247450 Y NA HLA-L,TRIM39,HCG18 NA NA NA NA HLA-L 22086 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 30254050 30254472 30254356 Y NA HLA-L,TRIM39,HCG18 NA NA NA NA HLA-L 28689 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr6 30453844 30454132 30453996 Y ZNRD1,TUBB RANP1,HLA-E HLA-E MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HLA-E 1112 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 30519269 30519607 30519590 Y NA PRR3,GNL1,ABCF1 NA NA NA NA PRR3 3056 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 30736850 30737361 30737156 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3 FLOT1,IER3 DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 26519 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr6 31702368 31703528 31702658 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5 NA NA NA NA CLIC1 2012 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 3244 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr6 31942054 31942322 31942254 Y NA SKIV2L,STK19 NA NA NA NA STK19 5186 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 32038612 32038798 32038673 Y LY6G5C,C6orf27,PRRT1,EGFL8 NA NA NA NA NA ATF6B 55232 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 32081652 32082042 32081917 Y NA ATF6B,FKBPL,PPT2,PRRT1,EGFL8 NA NA NA NA ATF6B 11988 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr6 32653438 32653801 32653767 Y HLA-DRA,HLA-DRB5,HLA-DRB1,HLA-DQA1,HLA-DQB1,TAP2,PSMB9,PSMB8,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DOB,HLA-DOA,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,HLA-DQB2,HLA-DQA2 NA NA NA NA NA TAP2 150756 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 32819276 32819643 32819486 Y HLA-DRA,HLA-DRB5,TAPBP,RGL2,HLA-DPA1,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,B3GALT4,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9 TAP2,PSMB8 NA NA NA NA PSMB8 8796 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 32952668 32952702 32952685 Y NA BRD2,BRD2-IT1,HLA-DOA NA NA NA NA BRD2-IT1 16659 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 32956037 32956271 32956088 Y NA BRD2,BRD2-IT1,HLA-DOA NA NA NA NA HLA-DOA 19118 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr6 33129390 33129479 33129402 Y NA SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1 NA NA NA NA SLC39A7 36743 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr6 33159164 33159383 33159309 Y NA SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1 NA NA NA NA SLC39A7 6839 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 33216178 33216307 33216243 Y NA SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1,HCG25,RPS18,VPS52,B3GALT4,PFDN6,WDR46,RGL2 NA NA NA NA HCG25 867 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 33392796 33393285 33393082 Y SYNGAP1 KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9 NA NA NA NA SYNGAP1 6949 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 33396313 33396709 33396628 Y SYNGAP1 KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9 NA NA NA NA SYNGAP1 10466 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 33401049 33401362 33401206 Y SYNGAP1 KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9 NA NA NA NA SYNGAP1 15202 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 33538378 33538887 33538702 Y LEMD2,LEMD2,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1 BAK1 NA NA NA NA BAK1 7132 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 33538911 33539356 33539169 Y LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1 BAK1 NA NA NA NA BAK1 6663 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr6 33712309 33712484 33712432 Y IP6K3 IP6K3,LEMD2 NA NA NA NA IP6K3 278 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 33818239 33818267 33818253 Y NA NA GRM4,MLN,IP6K3,LINC00336,BAK1,GGNBP1,LEMD2,LOC100507584,MIR1275 IMR90 Hi-C 24141950 LEMD2 63326 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 34191726 34192136 34191830 Y C6orf1,HMGA1 CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2 RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1 MCF7 ChIA-PET 22265404 CYCSP55 6510 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr6 34358644 34359014 34358829 Y NA NUDT3,RPS10 NA NA NA NA NUDT3 193 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 34624445 34624747 34624649 Y TAF11 C6orf106 NA NA NA NA C6orf106 37889 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 35035271 35035638 35035433 Y NA NA NA NA NA NA TCP11 78749 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 35170056 35170397 35170225 Y NA NA TCP11,ANKS1A,ZNF76,SCUBE3 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF76 54289 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 35185451 35185811 35185631 Y NA ZNF76 NA NA NA NA ZNF76 38875 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 35331114 35331538 35331252 Y PPARD PPARD NA NA NA NA PPARD 22779 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 35445364 35445634 35445501 Y RPL10A FANCE,RPL10A,TEAD3 NA NA NA NA RPL10A 11179 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 35457906 35458213 35458053 Y TEAD3 FANCE,RPL10A,TEAD3 NA NA NA NA TEAD3 4640 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr6 35532430 35532714 35532506 Y NA RP3-340B19.2 NA NA NA NA RP3-340B19.2 10780 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 35632268 35633036 35633003 Y NA NA NA NA NA NA FKBP5 61324 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr6 35875551 35875739 35875654 Y SLC26A8,SLC26A8,SLC26A8,MAPK14,MAPK13,BRPF3,SRPK1 SRPK1 NA NA NA NA SRPK1 11380 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 36005886 36006030 36005958 Y NA MAPK14 NA NA NA NA MAPK14 12398 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 36010041 36010276 36010159 Y NA MAPK14 NA NA NA NA MAPK14 16553 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 36321421 36321620 36321472 Y CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7 NA NA NA NA NA KCTD20 86924 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 36391024 36391283 36391227 Y SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,PXT1 KCTD20,PXT1 NA NA NA NA KCTD20 17261 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 36634782 36635224 36635042 Y MTCH1,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A RNU1-88P,LAP3P2,CDKN1A CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LAP3P2 4370 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr6 36656050 36656213 36656132 Y ETV7,ETV7,KCTD20,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A LAP3P2,CDKN1A NA NA NA NA CDKN1A 13745 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 37070053 37070857 37070460 Y CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2 NA PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 65122 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr6 37190361 37190574 37190538 Y NA TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TBC1D22B 32974 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 37269905 37270172 37270040 Y C6orf89,TBC1D22B TBC1D22B,TMEM217,RNF8 NA NA NA NA TMEM217 45974 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 37271813 37272101 37271931 Y PIM1,TBC1D22B TBC1D22B,TMEM217,RNF8 NA NA NA NA RNF8 47647 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 37424991 37425195 37425093 Y NA CCDC167 CCDC167 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC167 40503 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr6 37484293 37484960 37484497 Y NA CCDC167 CCDC167,MDGA1,RNF8,FTSJD2,TBC1D22B,MIR4462,ZFAND3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC167 18595 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 37879889 37880256 37879963 Y NA NA NA NA NA NA ZFAND3 94614 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 37892657 37892863 37892737 Y NA NA NA NA NA NA ZFAND3 107382 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 38033139 38033395 38033278 Y ZFAND3 NA NA NA NA NA ZFAND3 247864 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 38325891 38326009 38325959 Y NA NA NA NA NA NA BTBD9 279915 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 38605801 38606040 38606032 Y NA NA NA NA NA NA BTBD9 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 39122561 39122673 39122617 Y NA SAYSD1 GLP1R,DNAH8 IMR90 Hi-C 24141950 SAYSD1 41596 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 39279620 39279758 39279742 Y NA NA NA NA NA NA KCNK5 84394 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 39850347 39850811 39850571 Y NA MOCS1 NA NA NA NA MOCS1 49479 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 40215028 40215342 40215185 Y NA NA KIF6 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-278E11.3 290456 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 40404515 40404662 40404592 Y NA NA NA NA NA NA LRFN2 148542 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 41341728 41341773 41341752 Y FRS3 NA NA NA NA NA FOXP4 170391 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 41674655 41674829 41674723 Y TREM1,TFEB TFEB NA NA NA NA TFEB 27168 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 41686086 41686432 41686391 Y NA TFEB NA NA NA NA TFEB 15565 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 41698347 41698506 41698456 Y TFEB TFEB,PRICKLE4 NA NA NA NA TFEB 3491 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 41889955 41890338 41890119 Y FRS3 USP49,MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 3029 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 41906927 41907077 41907010 Y CCND3 USP49,MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 20001 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 41907242 41907431 41907365 Y TAF8,TFEB,CCND3 USP49,MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 20316 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 42255073 42255501 42255249 Y NA NA NA NA NA NA MRPS10 71470 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 42409399 42409623 42409499 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 8166 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 42420719 42421067 42420926 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 2930 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr6 42515407 42515543 42515467 Y NA UBR2 TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBR2 14257 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 42515662 42516014 42516002 Y GUCA1A,MEA1,KIAA0240 UBR2 TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBR2 13786 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 42722931 42723177 42723029 Y NA ATP6V0CP3,TBCC UBR2,KIAA0240,TBCC,PRPH2,RPL7L1,KLHDC3,RRP36,GUCA1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBCC 10373 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 42898508 42898648 42898552 Y NA C6orf226,CNPY3,RPL24P4,PEX6 NA NA NA NA CNPY3 3570 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 43085846 43085863 43085854 Y NA PTK7 NA NA NA NA PTK7 43840 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 43228716 43229109 43228913 Y GNMT,KLC4,KLC4,KLC4,TJAP1,SLC22A7,TTBK1 TTBK1 CRIP3,ZNF318,SLC22A7 IMR90 Hi-C 24141950 TTBK1 19298 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 43229544 43229904 43229724 Y TTBK1 TTBK1 CRIP3,ZNF318,SLC22A7 IMR90 Hi-C 24141950 TTBK1 20126 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 43295599 43295850 43295834 Y TJAP1 ZNF318 NA NA NA NA ZNF318 39366 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 43635973 43636240 43636108 Y NA GTPBP2,MAD2L1BP,MRPS18A NA NA NA NA MRPS18A 17288 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 43894411 43894725 43894584 Y NFKBIE,TJAP1,GTPBP2,MAD2L1BP NA NA NA NA NA C6orf223 71592 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 44011946 44012485 44012109 Y NA C6orf223,RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1120P11.3 27165 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr6 44024667 44024914 44024806 Y SLC35B2 RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP5-1120P11.3 14736 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 44029482 44029781 44029724 Y NFKBIE,MAD2L1BP RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MAD2L1BP,VEGFA,XPO5,MRPS18A,C6orf223,MRPL14 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP5-1120P11.3 9869 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 44070488 44070804 44070651 Y NA RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1,TMEM63B,MRPL14 NA NA NA NA TMEM63B 21847 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr6 44184938 44185313 44184944 Y MRPL14 HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE NA NA NA NA SLC29A1 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 44205272 44205504 44205346 Y NFKBIE SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE,TMEM151B NA NA NA NA HSP90AB1 7320 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr6 44205807 44206020 44205896 Y NA SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE,TMEM151B NA NA NA NA HSP90AB1 6804 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 44230828 44231731 44231363 Y NFKBIE SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,TMEM151B,AARS2 NA NA NA NA NFKBIE 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 44396303 44396427 44396307 Y NA CDC5L NA NA NA NA CDC5L 43041 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 44630454 44631299 44630653 Y NA NA CLIC5,RUNX2,SUPT3H,CDC5L IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 277192 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 44799052 44799432 44799175 Y NA NA NA NA NA NA CDC5L 445790 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 44887030 44887214 44887174 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 456476 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 45083481 45083547 45083514 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 260143 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 45163722 45164151 45163901 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 179539 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 45294493 45294953 45294580 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 48737 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 45302184 45302302 45302245 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 41388 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 45306825 45307168 45307007 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 36522 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 45313959 45314320 45314140 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 29370 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 45317803 45318343 45317888 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 25347 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 45319946 45320392 45320176 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 23298 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 47263537 47263554 47263549 Y NA TNFRSF21 NA NA NA NA TNFRSF21 12087 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 50785208 50785298 50785212 Y NA TFAP2B,RPS17P5 NA NA NA NA TFAP2B 772 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.34401484735175 chr6 50787533 50788503 50788259 Y NA TFAP2B,RPS17P5 NA NA NA NA TFAP2B 3097 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.55078636232894 chr6 50818020 50818494 50818241 Y NA TFAP2B,RPS17P5 NA NA NA NA RPS17P5 4881 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 52382425 52382779 52382512 Y NA NA NA NA NA NA TRAM2 56934 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 52460126 52460529 52460233 Y TRAM2 TRAM2 EFHC1,TRAM2,MCM3,ICK,LOC730101 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRAM2 20413 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 52461371 52461586 52461469 Y NA TRAM2 EFHC1,TRAM2,MCM3,ICK,LOC730101 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRAM2 21658 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 52952230 52952503 52952367 Y NA FBXO9,ICK NA NA NA NA ICK 27630 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 53191249 53191636 53191614 Y NA ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 20311 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 53199994 53200715 53200310 Y FBXO9,FBXO9,FBXO9,ELOVL5 ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 11232 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 53224045 53224723 53224315 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 12098 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 53376137 53376766 53376496 Y NA NA NA NA NA NA GCLC 103002 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 53412768 53413364 53413026 Y GCLC NA NA NA NA NA GCLC 66404 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 54027576 54027936 54027713 Y KLHL31,MLIP NA NA NA NA NA MLIP 234796 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 56315031 56315399 56315215 Y NA NA NA NA NA NA COL21A1 58139 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 57288314 57288720 57288442 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 110711 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 57313567 57313842 57313733 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 135964 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 57327654 57327860 57327770 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 150051 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 57389697 57390070 57389732 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 212094 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 57478986 57479248 57479117 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 301383 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 58776280 58777091 58777029 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 521711 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 58777244 58778438 58777771 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 522675 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr6 64308595 64308777 64308676 Y NA PHF3 NA NA NA NA PHF3 34948 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 64386722 64387357 64386973 Y PHF3 PHF3 NA NA NA NA PHF3 42997 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 69353902 69354407 69354113 Y NA BAI3 NA NA NA NA BAI3 10643 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 69390302 69390390 69390344 Y NA BAI3 NA NA NA NA BAI3 47043 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr6 69431654 69431887 69431658 Y NA NA NA NA NA NA BAI3 88395 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 69471294 69471734 69471424 Y BAI3 NA NA NA NA NA BAI3 128035 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr6 69487592 69487966 69487779 Y BAI3 NA NA NA NA NA BAI3 144333 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 69557739 69558046 69557893 Y BAI3 NA NA NA NA NA BAI3 214480 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 69594665 69594883 69594694 Y NA NA NA NA NA NA BAI3 251406 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 69598127 69598365 69598163 Y NA NA NA NA NA NA BAI3 254868 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr6 69630519 69630829 69630559 Y BAI3 NA NA NA NA NA BAI3 287260 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 69802983 69803339 69803007 Y NA NA NA NA NA NA BAI3 459724 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr6 69803382 69803773 69803578 Y BAI3 NA NA NA NA NA BAI3 460123 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 69809524 69809816 69809670 Y NA NA NA NA NA NA BAI3 466265 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 69896068 69896326 69896076 Y NA NA NA NA NA NA BAI3 552809 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr6 70371691 70371695 70371693 Y NA NA NA NA NA NA LMBRD1 133308 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 70479579 70479974 70479889 Y NA LMBRD1 NA NA NA NA LMBRD1 25029 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 70489653 70490034 70489967 Y NA LMBRD1 NA NA NA NA LMBRD1 14969 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 71184425 71184878 71184622 Y NA NA NA NA NA NA FAM135A 63781 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 71856502 71856731 71856607 Y B3GAT2 NA NA NA NA NA OGFRL1 139775 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 72010402 72010735 72010435 Y NA OGFRL1 NA NA NA NA OGFRL1 13896 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 72092992 72093394 72093291 Y NA LINC00472 NA NA NA NA LINC00472 35078 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 72103736 72104124 72104114 Y NA LINC00472 NA NA NA NA LINC00472 24348 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 72683550 72683736 72683643 Y RIMS1 NA NA NA NA NA RIMS1 89144 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 73329727 73330142 73329822 Y NA KCNQ5 NA NA NA NA KCNQ5 207 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 73330314 73330844 73330342 Y NA KCNQ5 NA NA NA NA KCNQ5 794 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr6 73333516 73333763 73333694 Y KCNQ5 KCNQ5 NA NA NA NA KCNQ5 3996 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr6 73335940 73336259 73335964 Y NA KCNQ5 NA NA NA NA KCNQ5 6420 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr6 73354930 73355043 73354987 Y NA KCNQ5 NA NA NA NA KCNQ5 25410 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr6 73355182 73355469 73355282 Y NA KCNQ5 NA NA NA NA KCNQ5 25662 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr6 73378236 73378609 73378395 Y NA KCNQ5 NA NA NA NA KCNQ5 48716 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr6 73504067 73504420 73504243 Y NA NA NA NA NA NA KCNQ5 174547 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 73524800 73525128 73524864 Y NA NA NA NA NA NA KCNQ5 195280 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 73851485 73852230 73851840 Y OOEP NA NA NA NA NA RP11-398K22.12 118708 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 73867627 73867898 73867877 Y NA NA NA NA NA NA RP11-398K22.12 103040 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 73889907 73890177 73890065 Y NA NA NA NA NA NA RP11-398K22.12 80761 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 76367901 76367953 76367944 Y NA NA NA NA NA NA SENP6 58676 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 76494746 76495208 76494920 Y NA MYO6 NA NA NA NA MYO6 37837 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 79773928 79774085 79774072 Y NA PHIP NA NA NA NA PHIP 11868 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr6 80220281 80220611 80220519 Y NA LCA5 NA NA NA NA LCA5 24564 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 81348599 81348680 81348638 Y NA NA BCKDHB IMR90 Hi-C 24141950 BCKDHB 534235 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 82228967 82229122 82229026 Y NA NA NA NA NA NA IBTK 726349 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 83935269 83935637 83935453 Y NA RWDD2A,PGM3 NA NA NA NA PGM3 33614 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 84139998 84140114 84140099 Y ME1 ME1 NA NA NA NA ME1 1201 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 84761974 84762047 84762024 Y NA MRAP2 NA NA NA NA MRAP2 20499 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 84762376 84762517 84762446 Y NA MRAP2 NA NA NA NA MRAP2 20901 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 84917634 84917758 84917696 Y NA KIAA1009 NA NA NA NA KIAA1009 17595 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 85705228 85705597 85705413 Y NA NA NA NA NA NA NT5E 452212 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 86377022 86377042 86377037 Y NA SYNCRIP,SNHG5 NA NA NA NA SNHG5 9409 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 87727434 87727816 87727518 Y HTR1E,GJB7 NA NA NA NA NA HTR1E 82410 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 87881047 87881581 87881092 Y NA ZNF292 NA NA NA NA ZNF292 20496 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 88213981 88214157 88214070 Y GJB7 SLC35A1 NA NA NA NA SLC35A1 35640 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 89315918 89316052 89315985 Y NA NA NA NA NA NA ACTBP8 331210 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 89591363 89591365 89591364 Y NA NA NA NA NA NA RNGTT 79983 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 89796215 89796534 89796231 Y NA PNRC1,SRSF12 NA NA NA NA PNRC1 7745 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 90550185 90550523 90550354 Y NA MDN1,CASP8AP2 NA NA NA NA CASP8AP2 12572 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 90596283 90596734 90596349 Y NA NA NA NA NA NA CASP8AP2 58670 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 90774597 90775020 90774993 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 229607 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 90778063 90778292 90778178 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 226335 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 90793727 90794010 90793801 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 210617 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 90856849 90857084 90856969 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 147543 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 90878882 90879095 90878991 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 125532 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 90983807 90984597 90984358 Y MDN1,BACH2,BACH2 BACH2 NA NA NA NA BACH2 20030 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 91134952 91135221 91135020 Y NA NA BACH2 IMR90 Hi-C 24141950 BACH2 130325 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 93036003 93036032 93036018 Y NA NA NA NA NA NA EPHA7 1091233 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 93802046 93802077 93802062 Y NA NA NA NA NA NA EPHA7 325188 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 94127729 94128504 94127840 Y NA EPHA7 NA NA NA NA EPHA7 464 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 95244699 95244909 95244803 Y NA NA NA NA NA NA MANEA 778510 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 95324557 95324827 95324692 Y NA NA NA NA NA NA MANEA 698592 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 95887569 95887862 95887716 Y NA NA NA NA NA NA MANEA 135557 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 97632369 97632997 97632691 Y NA NA NA NA NA NA MMS22L 96096 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr6 97681036 97681361 97681334 Y NA MMS22L NA NA NA NA MMS22L 47732 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 97908458 97908789 97908626 Y NA NA NA NA NA NA MMS22L 179365 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 99272215 99272664 99272374 Y POU3F2 POU3F2 NA NA NA NA POU3F2 7916 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 99280317 99280875 99280652 Y POU3F2 NA NA NA NA NA POU3F2 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 99293549 99293815 99293794 Y POU3F2 POU3F2 NA NA NA NA POU3F2 12969 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 99382979 99383150 99383065 Y NA FBXL4 NA NA NA NA FBXL4 10699 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 99777728 99778013 99777871 Y POU3F2,C6orf168 NA NA NA NA NA COQ3 62067 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 99886915 99887218 99887074 Y NA COQ3,RP11-98I9.4,PNISR NA NA NA NA PNISR 15708 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 99975087 99975427 99975257 Y NA USP45,CCNC NA NA NA NA USP45 7483 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 99995359 99995841 99995579 Y PNISR USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 19008 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 100002359 100002730 100002672 Y PNISR,USP45,LOC100130890 USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 12119 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 100007525 100007878 100007702 Y LOC100130890 USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 6971 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr6 100008682 100008928 100008805 Y NA USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 5921 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 100012296 100012415 100012356 Y NA USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 2434 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 100236025 100236072 100236049 Y NA NA NA NA NA NA CCNC 221176 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 101149750 101149957 101149936 Y NA NA NA NA NA NA RP1-121G13.3 173598 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 101204667 101204976 101204826 Y NA NA NA NA NA NA ASCC3 122272 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 101311437 101311450 101311446 Y NA ASCC3 NA NA NA NA ASCC3 15798 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 101593141 101593339 101593267 Y NA NA NA NA NA NA GRIK2 251325 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 101902058 101902283 101902278 Y NA NA NA NA NA NA GRIK2 57394 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 101965513 101965732 101965659 Y NA NA NA NA NA NA GRIK2 120849 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 102355867 102356256 102356058 Y NA NA NA NA NA NA GRIK2 511203 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 102471700 102472091 102472046 Y NA NA NA NA NA NA GRIK2 627036 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 105388915 105389637 105389155 Y HACE1 LIN28B NA NA NA NA LIN28B 13286 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 4.65235908698683 chr6 105401566 105401766 105401705 Y LIN28B LIN28B NA NA NA NA LIN28B 1157 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 105403500 105403904 105403556 Y NA LIN28B NA NA NA NA LIN28B 577 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 105477997 105478373 105478087 Y NA NA NA NA NA NA LIN28B 75074 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 105743987 105744339 105744163 Y NA NA NA NA NA NA PREP 104620 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 106440406 106440671 106440473 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 ATG5 330995 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 106589360 106589531 106589446 Y NA NA ATG5,PRDM1,LIN28B IMR90 Hi-C 24141950 ATG5 182135 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 106616078 106616322 106616199 Y NA NA NA NA NA NA ATG5 155344 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 107014040 107014053 107014047 Y BEND3,RTN4IP1 NA NA NA NA NA RTN4IP1 61320 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 107047078 107047343 107047210 Y BEND3 RTN4IP1,QRSL1 NA NA NA NA RTN4IP1 28030 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 107773333 107773402 107773368 Y SOBP PDSS2,SOBP NA NA NA NA PDSS2 5366 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 107774853 107775271 107775085 Y BEND3 PDSS2,SOBP NA NA NA NA PDSS2 3497 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 107976275 107976365 107976320 Y NA NA NA NA NA NA SOBP 167113 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 108141852 108141997 108141916 Y SCML4 SCML4 NA NA NA NA SCML4 1524 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 108239964 108240066 108240015 Y NA SEC63 NA NA NA NA SEC63 37327 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 108324190 108324471 108324239 Y NA SEC63,RPL3P7 NA NA NA NA RPL3P7 301 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 108574394 108574619 108574507 Y NA SNX3,LACE1 NA NA NA NA SNX3 5845 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 108879164 108879427 108879300 Y SESN1,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 126 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr6 108879521 108879931 108879808 Y SESN1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 483 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.44740060484035 chr6 108883670 108884545 108884024 Y OSTM1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 4632 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.55078636232894 chr6 108951509 108952142 108951722 Y NA NA NA NA NA NA FOXO3 72471 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 108972074 108972278 108972175 Y FOXO3 NA NA NA NA NA FOXO3 93036 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 109011028 109011405 109011217 Y NA NA NA NA NA NA FOXO3 131990 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 109269728 109269873 109269801 Y NA RP11-249L21.4 SESN1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-249L21.4 42652 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 109680867 109680881 109680874 Y SMPD2 CD164 NA NA NA NA CD164 20881 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 110094103 110094197 110094150 Y CD164,MICAL1 NA NA NA NA NA FIG4 83604 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 110379820 110380137 110379979 Y WASF1 NA FIG4,METTL24,AKD1,DDO IMR90 Hi-C 24141950 GPR6 82306 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 110415658 110415810 110415734 Y NA NA NA NA NA NA WASF1 83397 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 110418117 110418342 110418281 Y NA NA NA NA NA NA WASF1 80865 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 110456590 110456951 110456841 Y WASF1,CDC40,C6orf186 WASF1,CDC40 NA NA NA NA WASF1 42256 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 110502951 110503352 110503102 Y FIG4,CDC40 WASF1,CDC40 NA NA NA NA CDC40 3607 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 110864475 110864588 110864515 Y CDK19 NA RPF2,CDK19 IMR90 Hi-C 24141950 CDK19 270573 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 111049772 111049981 111049963 Y NA NA NA NA NA NA CDK19 85180 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr6 111666861 111666999 111666959 Y REV3L,FYN NA NA NA NA NA KIAA1919 88310 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 111720734 111721265 111721077 Y NA NA NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 81449 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 111727743 111727975 111727836 Y SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L NA NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 74739 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 111730761 111730999 111730880 Y NA NA NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 71715 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 111733320 111733976 111733973 Y NA NA NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 68738 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr6 111758931 111759246 111759206 Y NA TRAF3IP2-AS1,REV3L NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 43468 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 111795712 111796054 111795883 Y NA TRAF3IP2-AS1,REV3L NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 6660 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 111873587 111873978 111873729 Y NA NA NA NA NA NA REV3L 70669 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 111902540 111902626 111902591 Y REV3L NA NA NA NA NA REV3L 99622 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 111946442 111946461 111946452 Y NA NA TRAF3IP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 REV3L 143524 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 112072134 112072549 112072500 Y REV3L,FYN,FYN,FYN NA NA NA NA NA FYN 120106 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 112078631 112078983 112078811 Y REV3L,FYN,FYN,FYN NA NA NA NA NA FYN 113672 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 112116190 112116657 112116390 Y NA NA NA NA NA NA FYN 75998 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 112145008 112145393 112145362 Y REV3L,TRAF3IP2,FYN,FYN,FYN FYN NA NA NA NA FYN 47262 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 112192236 112192610 112192499 Y REV3L,FYN,FYN,FYN FYN NA NA NA NA FYN 45 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 112364338 112364486 112364397 Y TRAF3IP2,FYN,FYN,FYN TUBE1 FYN,TRAF3IP2-AS1,TRAF3IP2,REV3L IMR90 Hi-C 24141950 TUBE1 42246 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 112552727 112553228 112552920 Y LAMA4 LAMA4 NA NA NA NA LAMA4 20913 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 113673815 113673995 113673934 Y NA NA LAMA4,FLJ34503,MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 MARCKS 502546 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 114662111 114662444 114662262 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST5 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr6 114662587 114662962 114662866 Y NA HS3ST5 NA NA NA NA HS3ST5 378 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr6 114664746 114665107 114665068 Y NA HS3ST5 NA NA NA NA HS3ST5 2537 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 116550472 116550927 116550585 Y KPNA5,TSPYL4,TSPYL1 TSPYL4,DSE,RP3-486I3.4,TSPYL1 NA NA NA NA TSPYL4 22334 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr6 117069916 117070184 117070134 Y NA FAM162B NA NA NA NA FAM162B 14702 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr6 118008335 118008695 118008355 Y NA NUS1 NA NA NA NA NUS1 13670 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 118759105 118759218 118759162 Y NA NA NA NA NA NA PLN 108243 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 119129812 119130192 119130083 Y C6orf204,MCM9,C6orf204 NA NA NA NA NA ASF1A 83192 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 119131601 119131904 119131835 Y C6orf204,MCM9,C6orf204 NA NA NA NA NA ASF1A 81480 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 119214275 119214495 119214295 Y C6orf204,C6orf204,FAM184A,MCM9,ASF1A ASF1A,MCM9 NA NA NA NA ASF1A 891 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 119218988 119219366 119219177 Y MCM9 ASF1A,MCM9 NA NA NA NA ASF1A 5604 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 119606195 119606320 119606258 Y NA NA NA NA NA NA MAN1A1 62606 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 119661427 119661533 119661480 Y MAN1A1 MAN1A1 NA NA NA NA MAN1A1 7393 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 120445667 120446036 120445852 Y NA NA NA NA NA NA MAN1A1 776741 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 121396728 121397112 121396920 Y C6orf170 NA NA NA NA NA RP1-276J11.2 303506 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 121758280 121758805 121758450 Y GJA1 GJA1,RNU4-35P NA NA NA NA GJA1 3442 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 122769670 122769957 122769896 Y HSF2,PKIB SERINC1,PKIB NA NA NA NA SERINC1 21010 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr6 123350349 123350632 123350491 Y CLVS2 CLVS2 NA NA NA NA CLVS2 35233 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 125622252 125622475 125622321 Y NA HDDC2 NA NA NA NA HDDC2 970 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 126112858 126113033 126112985 Y TRMT11,HINT3,NCOA7 NCOA7 NA NA NA NA NCOA7 12551 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 126167488 126167529 126167508 Y NCOA7 NA NA NA NA NA NCOA7 67181 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 126241150 126241321 126241235 Y NCOA7 HINT3 NA NA NA NA HINT3 34606 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr6 126579500 126579620 126579560 Y NA NA NA NA NA NA CENPW 79700 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 127638757 127639069 127638966 Y NA ECHDC1 NA NA NA NA ECHDC1 23685 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 127741693 127741944 127741787 Y RNF146 RP3-403A15.1 NA NA NA NA RP3-403A15.1 12837 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 127778453 127778833 127778741 Y NA RP3-403A15.1 NA NA NA NA RP3-403A15.1 23672 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr6 127980874 127981174 127981075 Y NA NA NA NA NA NA SOGA3 142728 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 128080284 128080680 128080614 Y THEMIS NA NA NA NA NA SOGA3 242138 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 128607751 128608140 128608092 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 231730 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 128747260 128747445 128747404 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 92425 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 128840669 128840970 128840936 Y PTPRK,PTPRK PTPRK NA NA NA NA PTPRK 799 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 130342212 130342458 130342393 Y SAMD3,SAMD3,L3MBTL3 L3MBTL3 NA NA NA NA L3MBTL3 9368 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 131929733 131930009 131929873 Y NA MED23,RNU4-18P NA NA NA NA MED23 17360 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr6 133134288 133134908 133134317 Y NA RPS12 NA NA NA NA SNORD101 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 133839183 133839299 133839241 Y EYA4 NA NA NA NA NA EYA4 279447 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 133843297 133843543 133843427 Y NA NA NA NA NA NA EYA4 283561 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 133932660 133932952 133932806 Y NA NA MGC34034,TCF21 IMR90 Hi-C 24141950 TBPL1 338356 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 134635412 134635949 134635717 Y NA SGK1 NA NA NA NA SGK1 1301 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 135344059 135344242 135344151 Y NA NA NA NA NA NA HBS1L 77952 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 135636764 135637196 135637190 Y NA NA NA NA NA NA MYB 136311 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 135707385 135707414 135707388 Y NA NA NA NA NA NA LINC00271 109075 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 136312028 136312251 136312140 Y NA NA NA NA NA NA PDE7B 141194 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 136813959 136814231 136814138 Y MAP7,MAP7,MAP7,MAP7 NA NA NA NA NA MAP7 55726 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 137181238 137181571 137181404 Y PEX7 PEX7 NA NA NA NA PEX7 39521 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 137310723 137310892 137310775 Y IL20RA,SLC35D3 NA NA NA NA NA IL20RA 53406 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr6 137538142 137538256 137538167 Y NA IFNGR1 NA NA NA NA IFNGR1 330 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 138027517 138027801 138027604 Y NA NA TNFAIP3,PERP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 158550 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 138133089 138133355 138133227 Y TNFAIP3 NA TNFAIP3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 52996 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 138495604 138495926 138495622 Y NA NA NA NA NA NA PERP 68956 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 139304978 139305148 139305081 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 2250 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr6 139348964 139349250 139349073 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 41566 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 139350632 139351255 139350885 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 43234 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr6 140203387 140203540 140203467 Y NA NA NA NA NA NA CITED2 509630 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 141804737 141805118 141804969 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 661249 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 143123144 143123510 143123441 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 140828 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 143247398 143248213 143248022 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 16125 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 143770817 143770943 143770879 Y ADAT2 ADAT2,PEX3 NA NA NA NA PEX3 873 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.65417211981754 chr6 143918177 143918387 143918274 Y NA NA PHACTR2,ZC2HC1B,PLAGL1 IMR90 Hi-C 24141950 PHACTR2 62195 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 144066654 144067070 144066822 Y NA NA NA NA NA NA LTV1 95411 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 144279957 144280354 144280096 Y NA NA NA NA NA NA PLAGL1 103381 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 144479104 144479443 144479274 Y NA STX11,TPT1P4 NA NA NA NA STX11 9441 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 146953097 146953482 146953290 Y NA NA NA NA NA NA RAB32 90268 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 147124877 147125201 147125102 Y NA NA NA NA NA NA RAB32 262048 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 147235645 147236230 147236149 Y RAB32,STXBP5 NA NA NA NA NA STXBP5 287331 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 147643373 147644201 147643793 Y NA NA NA NA NA NA YAP1P1 81824 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 147985018 147985058 147985038 Y NA NA NA NA NA NA SAMD5 156955 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 149290876 149291114 149290995 Y NA NA NA NA NA NA TAB2 246663 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 149416134 149416493 149416352 Y TAB2 NA NA NA NA NA TAB2 121284 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 149534143 149534249 149534188 Y ZC3H12D,TAB2 TAB2 NA NA NA NA TAB2 3528 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 149798853 149798873 149798863 Y ZC3H12D NA NA NA NA NA PPIL4 66301 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 150010989 150011176 150011138 Y NA KATNA1,LATS1 NA NA NA NA LATS1 26216 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 150076607 150076998 150076645 Y KATNA1,LATS1 LATS1,PCMT1,NUP43 NA NA NA NA NUP43 7806 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 151090718 151090960 151090871 Y PLEKHG1 NA NA NA NA NA MTHFD1L 93725 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 151302311 151302568 151302430 Y PLEKHG1 NA NA NA NA NA RP1-292B18.1 116097 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 151365804 151366060 151365928 Y NA NA NA NA NA NA RP1-292B18.1 52605 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 151381285 151381592 151381452 Y NA RP1-292B18.1 NA NA NA NA RP1-292B18.1 37073 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 151634197 151634634 151634284 Y NA NA NA NA NA NA AKAP12 75063 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 151647622 151647708 151647665 Y NA NA ZBTB2 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB2 62975 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 151730569 151730753 151730690 Y NA ZBTB2,RMND1,C6orf211 NA NA NA NA ZBTB2 19886 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 152497154 152497169 152497162 Y NA NA NA NA NA NA SYNE1 459767 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 152889271 152889451 152889361 Y NA NA NA NA NA NA SYNE1 67485 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 153411582 153411939 153411751 Y MTRF1L RGS17 NA NA NA NA RGS17 38445 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 153448617 153448871 153448744 Y NA RGS17 NA NA NA NA RGS17 1513 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 154402078 154402202 154402141 Y NA NA NA NA NA NA OPRM1 72447 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr6 154441744 154441825 154441785 Y OPRM1,OPRM1 NA NA NA NA NA OPRM1 112113 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr6 154566463 154566856 154566632 Y SCAF8 NA NA NA NA NA OPRM1 236832 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 154830409 154830718 154830573 Y CNKSR3 CNKSR3 NA NA NA NA CNKSR3 616 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 155181312 155181660 155181451 Y TIAM2,TIAM2 TIAM2 TIAM2 IMR90 Hi-C 24141950 TIAM2 29481 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 155193821 155194059 155193913 Y NA TIAM2 TIAM2,TFB1M,CLDN20 IMR90 Hi-C 24141950 TIAM2 41990 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 155306251 155306499 155306375 Y TIAM2 NA TIAM2,TFB1M,CLDN20 IMR90 Hi-C 24141950 TIAM2 154420 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 155590165 155590417 155590245 Y NA RP11-477D19.2,TFB1M NA NA NA NA RP11-477D19.2 14307 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr6 155593046 155593119 155593050 Y NA RP11-477D19.2,TFB1M NA NA NA NA RP11-477D19.2 17188 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 155636183 155636317 155636271 Y NA TFB1M NA NA NA NA TFB1M 2556 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 157007979 157008724 157008580 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88339 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.06771514977192 chr6 157096939 157097165 157097038 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 157101566 157102083 157101700 Y ARID1B ARID1B NA NA NA NA ARID1B 4503 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr6 157110744 157110907 157110826 Y NA ARID1B NA NA NA NA ARID1B 13681 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 157158909 157159282 157158999 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 61846 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 157160663 157161314 157160954 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 63600 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 157162870 157163071 157163026 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 65807 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 157285008 157285408 157285041 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 187945 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 157342507 157343524 157343342 Y ARID1B,ZDHHC14 NA NA NA NA NA ARID1B 245444 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr6 157542479 157542718 157542566 Y NA NA NA NA NA NA TMEM242 199915 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr6 157695432 157695688 157695582 Y NA TMEM242 NA NA NA NA TMEM242 46945 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 157726321 157726550 157726459 Y NA TMEM242 NA NA NA NA TMEM242 16083 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 157738321 157738749 157738506 Y NA TMEM242 NA NA NA NA TMEM242 3884 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr6 158254729 158255396 158255020 Y NA SNX9 NA NA NA NA SNX9 12433 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr6 158314373 158314686 158314419 Y SNX9 NA NA NA NA NA SNX9 72077 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 158981403 158981866 158981661 Y NA TMEM181 NA NA NA NA TMEM181 25935 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr6 158987674 158988091 158987879 Y NA TMEM181 NA NA NA NA TMEM181 32206 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 159229924 159230242 159230166 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 8202 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 159234698 159235091 159235070 Y NA EZR NA NA NA NA EZR 3353 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 159383408 159383511 159383422 Y NA RSPH3 NA NA NA NA RSPH3 35708 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 159434370 159434675 159434475 Y TAGAP RSPH3 NA NA NA NA RSPH3 15151 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 159454571 159454940 159454757 Y TAGAP RSPH3 NA NA NA NA RSPH3 35352 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 160141572 160141909 160141740 Y MAS1,IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP WTAP,ACAT2,SOD2 LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WTAP 2708 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 160144181 160144267 160144224 Y NA WTAP,ACAT2,SOD2 NA NA NA NA WTAP 350 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 160404300 160404614 160404397 Y SOD2,WTAP,WTAP,IGF2R IGF2R NA NA NA NA IGF2R 16169 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 160404785 160405521 160405109 Y SOD2,WTAP,WTAP,MAS1,IGF2R IGF2R NA NA NA NA IGF2R 16654 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 160425266 160425362 160425272 Y NA IGF2R NA NA NA NA IGF2R 37135 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 160427336 160427466 160427400 Y NA IGF2R NA NA NA NA IGF2R 39205 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 9.92503271890524 chr6 161183008 161183335 161183172 Y LPA NA NA NA NA NA MAP3K4 227424 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 161536644 161536718 161536688 Y AGPAT4 NA NA NA NA NA MAP3K4 125885 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 161545851 161546111 161545978 Y AGPAT4 NA NA NA NA NA MAP3K4 135092 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 161549553 161550030 161549828 Y AGPAT4 NA NA NA NA NA MAP3K4 138794 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 161591208 161591315 161591299 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT4 101778 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 161607618 161607817 161607715 Y AGPAT4 NA NA NA NA NA AGPAT4 85276 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 161794970 161795177 161795007 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT4 101877 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 163773301 163773556 163773408 Y QKI NA NA NA NA NA QKI 59476 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 163833938 163834442 163834340 Y NA QKI NA NA NA NA QKI 906 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 163840967 163841346 163841003 Y NA QKI NA NA NA NA QKI 7935 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr6 164396601 164397000 164396801 Y NA NA QKI,CAHM IMR90 Hi-C 24141950 QKI 563569 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 166055438 166055636 166055513 Y NA NA NA NA NA NA PDE10A 342455 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 166067950 166069085 166068916 Y NA NA NA NA NA NA PDE10A 329006 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 166422302 166422862 166422743 Y NA PDE10A NA NA NA NA PDE10A 24211 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 166795008 166795404 166795174 Y NA SFT2D1 NA NA NA NA SFT2D1 40929 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 166964478 166964522 166964502 Y NA NA NA NA NA NA SFT2D1 210399 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 166967000 166967189 166967118 Y NA NA NA NA NA NA SFT2D1 212921 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 167028527 167028763 167028637 Y NA NA NA NA NA NA SFT2D1 274448 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 167038809 167038976 167038893 Y RPS6KA2 NA NA NA NA NA RPS6KA2 278963 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 167411045 167411413 167411177 Y NA RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP NA NA NA NA FGFR1OP 375 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 167834861 167835135 167834902 Y NA NA SMOC2 IMR90 Hi-C 24141950 CCR6 311566 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 168408262 168408655 168408498 Y NA KIF25-AS1 SMOC2,KIF25 IMR90 Hi-C 24141950 KIF25-AS1 12505 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 169278156 169278506 169278379 Y NA NA WDR27,LINC00574 IMR90 Hi-C 24141950 THBS2 373633 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 169308928 169309266 169309084 Y THBS2 NA WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242 IMR90 Hi-C 24141950 THBS2 342873 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 170054470 170055295 170054892 Y TCTE3 WDR27,C6orf120 NA NA NA NA WDR27 44864 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 170203615 170204008 170203729 Y NA NA NA NA NA NA TCTE3 53960 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 170208297 170208700 170208496 Y NA NA NA NA NA NA TCTE3 58642 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 170589556 170589600 170589578 Y WDR27,TCTE3,TBP DLL1,FAM120B NA NA NA NA DLL1 7961 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr6 170692180 170692479 170692329 Y NA NA NA NA NA NA FAM120B 94389 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr6 170838453 170838652 170838543 Y NA PSMB1,TBP NA NA NA NA PSMB1 21777 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 191531 191871 191582 Y FAM20C FAM20C,AC093627.12 NA NA NA NA AC093627.12 309 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 213646 214008 213845 Y NA FAM20C,AC093627.12 NA NA NA NA AC093627.12 21466 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 543299 543586 543435 Y GET4,CYP2W1,PDGFA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 14347 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 579426 579712 579625 Y PRKAR1B,PRKAR1B,GET4,PDGFA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 21493 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 652642 652893 652768 Y PRKAR1B,ADAP1 NA NA NA NA NA PDGFA 94709 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 655576 655910 655797 Y NA NA NA NA NA NA PDGFA 97643 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 657520 657797 657766 Y CYP2W1 NA NA NA NA NA PDGFA 99587 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 658155 658418 658267 Y COX19 NA NA NA NA NA PDGFA 100222 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 875702 875833 875757 Y SUN1,SUN1 SUN1,GET4 NA NA NA NA SUN1 22174 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 949099 949177 949151 Y ZFAND2A,ADAP1 GET4,ADAP1 NA NA NA NA GET4 34910 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 1066965 1067028 1066969 Y NA GPR146 NA NA NA NA GPR146 15184 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 1139272 1139516 1139401 Y SUN1,TMEM184A C7orf50 NA NA NA NA C7orf50 36380 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 1198505 1198792 1198744 Y NA C7orf50,AC091729.9,ZFAND2A NA NA NA NA ZFAND2A 110 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 1329910 1330257 1330187 Y NA NA UNCX IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND2A 131515 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 1553000 1553189 1553120 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK MICALL2,INTS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 INTS1 9511 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 1658452 1658596 1658524 Y ELFN1 PSMG3 NA NA NA NA PSMG3 49811 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 1707278 1707453 1707366 Y NA NA MAD1L1,KIAA1908 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG3 98637 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 2106199 2106418 2106303 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 164460 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 2143904 2144149 2144041 Y LFNG NA NA NA NA NA MAD1L1 126729 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr7 2150639 2150902 2150796 Y SNX8,LFNG NA NA NA NA NA MAD1L1 119976 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 2178123 2178459 2178160 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 92419 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 2276986 2277172 2277058 Y LFNG,SNX8 MAD1L1,FTSJ2,NUDT1 NA NA NA NA FTSJ2 2668 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 2356665 2356933 2356799 Y NA EIF3B,SNX8 NA NA NA NA EIF3B 34788 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 2362962 2363263 2363259 Y AMZ1 EIF3B,SNX8 KIAA1908,PSMG3,TFAMP1,ELFN1,MAD1L1,SNX8,FTSJ2,NUDT1,EIF3B IMR90 Hi-C 24141950 EIF3B 28458 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 2364831 2365125 2365016 Y SNX8,LFNG EIF3B,SNX8 KIAA1908,PSMG3,TFAMP1,ELFN1,MAD1L1,SNX8,FTSJ2,NUDT1,EIF3B,MAFK,TMEM184A IMR90 Hi-C 24141950 EIF3B 26596 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 2657383 2657705 2657445 Y IQCE,TTYH3 TTYH3 NA NA NA NA TTYH3 11880 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 2661791 2662128 2661981 Y NA TTYH3 AMZ1,TTYH3 IMR90 Hi-C 24141950 TTYH3 7457 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 2673416 2673872 2673677 Y NA TTYH3 NA NA NA NA TTYH3 3831 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 2860040 2860490 2860319 Y LFNG,LFNG,GNA12 AC006028.11,GNA12 NA NA NA NA AC006028.11 12765 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 2903227 2903785 2903462 Y LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12 AC006028.11,GNA12 GNA12 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNA12 21269 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 2960647 2961036 2960906 Y NA NA NA NA NA NA GNA12 78689 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 3568098 3568478 3568121 Y SDK1 NA NA NA NA NA SDK1 229018 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 4133088 4133284 4133186 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 548104 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 4184588 4184872 4184657 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 496516 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.55078636232894 chr7 4287329 4287662 4287450 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 393726 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 4681329 4681565 4681443 Y MMD2 NA SDK1,FOXK1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXK1 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.24062908986315 chr7 4764796 4765177 4765030 Y KIAA0415 NA NA NA NA NA FOXK1 83408 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr7 4765280 4765661 4765569 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 83892 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 5379232 5379531 5379399 Y NA NA NA NA NA NA SLC29A4 67232 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 5469639 5470034 5469987 Y NA TNRC18 TNRC18,FBXL18,ACTB MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TNRC18 6594 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 5492663 5492953 5492758 Y MMD2,SLC29A4 TNRC18 TNRC18 MCF7 ChIA-PET 22265404 TNRC18 29618 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 5594554 5594977 5594837 Y WIPI2 FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 6438 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr7 5609221 5609424 5609333 Y FBXL18 ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 7806 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 5609541 5610012 5609880 Y SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 8126 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.96432939228333 chr7 5634980 5635411 5634989 Y AIMP2,FBXL18,ACTB,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216 IMR90 Hi-C 24141950 FSCN1 4541 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 5635420 5636238 5635862 Y NA ACTB,FSCN1 NA NA NA NA FSCN1 4981 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 5650367 5650762 5650403 Y NA ACTB,FSCN1 NA NA NA NA FSCN1 19928 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 5724329 5724708 5724518 Y NA NA NA NA NA NA FSCN1 93890 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 5761606 5761918 5761762 Y USP42,RNF216 NA NA NA NA NA RNF216 57452 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 6145406 6145878 6145682 Y USP42 EIF2AK1,AC004895.4,USP42 NA NA NA NA USP42 2891 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 6422514 6422839 6422633 Y CCZ1 RAC1 NA NA NA NA RAC1 10360 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 6467944 6468137 6468104 Y NA NA NA NA NA NA DAGLB 53684 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 6473446 6473633 6473567 Y DAGLB DAGLB,KDELR2 NA NA NA NA DAGLB 48188 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 6677371 6677641 6677424 Y DAGLB,ZNF12,C7orf26 C7orf26,ZNF316,AC073343.13 NA NA NA NA ZNF316 2418 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr7 6741580 6741996 6741754 Y C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12 AC073343.13,ZNF12,PMS2CL NA NA NA NA ZNF12 2558 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 7268746 7268912 7268835 Y NA NA NA NA NA NA C1GALT1 74181 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 7605671 7605858 7605804 Y NA MIOS NA NA NA NA MIOS 1168 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 7608686 7608956 7608841 Y MIOS MIOS NA NA NA NA MIOS 4183 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 7911710 7911812 7911761 Y NA NA NA NA NA NA GLCCI1 94613 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 8016516 8016759 8016566 Y GLCCI1 GLCCI1 NA NA NA NA GLCCI1 10091 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 8165403 8166093 8165752 Y GLCCI1 NA NA NA NA NA AC007009.1 133770 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 8168743 8169144 8168949 Y GLCCI1 NA NA NA NA NA AC007009.1 130719 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 8218168 8218233 8218201 Y NA NA NA NA NA NA AC007009.1 81630 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 8254354 8254751 8254559 Y NA AC007009.1,ICA1 NA NA NA NA AC007009.1 45112 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 8295276 8295343 8295310 Y NA AC007009.1,ICA1 NA NA NA NA AC007009.1 4520 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr7 8300349 8300667 8300508 Y ICA1,ICA1,ICA1 AC007009.1,ICA1 NA NA NA NA ICA1 32 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr7 8300852 8301132 8300960 Y ICA1,ICA1,ICA1 AC007009.1,ICA1 NA NA NA NA ICA1 535 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.37787242223771 chr7 8550473 8550803 8550530 Y NA NA NA NA NA NA NXPH1 78888 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 9561904 9562245 9562075 Y NA NA NA NA NA NA HSPA8P8 926693 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 11089099 11089199 11089149 Y NA NA NA NA NA NA PHF14 77600 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 11211603 11211773 11211701 Y NA NA NA NA NA NA PHF14 200104 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 11499121 11499331 11499225 Y NA NA NA NA NA NA THSD7A 370493 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 11859641 11859960 11859801 Y THSD7A THSD7A NA NA NA NA THSD7A 9864 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr7 11860647 11861050 11860853 Y THSD7A THSD7A NA NA NA NA THSD7A 8774 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 11867283 11867421 11867420 Y NA THSD7A NA NA NA NA THSD7A 2403 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr7 11869426 11869707 11869551 Y NA THSD7A NA NA NA NA THSD7A 117 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 13368007 13368354 13368181 Y NA NA NA NA NA NA ARL4A 643526 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr7 18255196 18255381 18255289 Y NA NA NA NA NA NA HDAC9 130624 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 18540943 18541343 18541016 Y NA NA NA NA NA NA HDAC9 416371 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 18551067 18551390 18551179 Y NA NA NA NA NA NA HDAC9 426495 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 18560411 18560650 18560558 Y NA NA NA NA NA NA HDAC9 435839 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 18563504 18563902 18563528 Y HDAC9,HDAC9,HDAC9 NA NA NA NA NA HDAC9 438932 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 18611788 18612131 18611882 Y HDAC9 NA NA NA NA NA HDAC9 487216 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 18678257 18678434 18678328 Y NA NA NA NA NA NA TWIST1 476861 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 18688713 18688867 18688789 Y HDAC9,HDAC9 NA NA NA NA NA TWIST1 466428 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 18828374 18828759 18828502 Y NA NA NA NA NA NA TWIST1 326536 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr7 18847495 18847887 18847515 Y FERD3L NA NA NA NA NA TWIST1 307408 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr7 18865089 18865093 18865091 Y HDAC9,HDAC9 NA NA NA NA NA TWIST1 290202 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 19024350 19024628 19024489 Y NA NA NA NA NA NA TWIST1 130667 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 19146147 19146774 19146493 Y FERD3L,TWIST1 TWIST1,FERD3L NA NA NA NA TWIST1 8521 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr7 19147118 19147950 19147488 Y FERD3L,TWIST1 TWIST1,FERD3L NA NA NA NA TWIST1 7345 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.24062908986315 chr7 19157963 19158297 19158271 Y NA TWIST1,FERD3L NA NA NA NA TWIST1 2668 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr7 19186475 19186536 19186492 Y TWIST1,FERD3L TWIST1,FERD3L NA NA NA NA FERD3L 3431 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.06771514977192 chr7 19640371 19640397 19640383 Y TMEM196 NA NA NA NA NA TWISTNB 106313 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 20154173 20154365 20154304 Y TWISTNB NA NA NA NA NA RPL21P75 113827 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 20463565 20463840 20463661 Y ITGB8 NA NA NA NA NA ITGB8 95240 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 21502446 21502711 21502550 Y SP4 SP4 NA NA NA NA SP4 36794 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 21928607 21928632 21928620 Y NA NA NA NA NA NA CDCA7L 55070 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr7 22122614 22122929 22122771 Y NA NA RAPGEF5 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA7L 138912 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 23229571 23229876 23229614 Y NA NUPL2,GPNMB NA NA NA NA NUPL2 10125 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 23346374 23346675 23346525 Y NA NA NA NA NA NA GPNMB 72788 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 23348040 23348443 23348292 Y KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3 NA NA NA NA NA GPNMB 74454 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr7 23410116 23410259 23410188 Y NA NA NA NA NA NA IGF2BP3 97827 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 23411315 23411579 23411447 Y NA NA NA NA NA NA IGF2BP3 96507 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 23488792 23489118 23488955 Y KLHL7,NUPL2,IGF2BP3 IGF2BP3,AC079780.3 NA NA NA NA IGF2BP3 18968 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 23501559 23501943 23501874 Y NUPL2,IGF2BP3 IGF2BP3,AC079780.3 NA NA NA NA IGF2BP3 6143 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 23504984 23505316 23505313 Y NA IGF2BP3,AC079780.3 NA NA NA NA IGF2BP3 2770 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 23510676 23511223 23510889 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3,AC079780.3 NA NA NA NA IGF2BP3 2590 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.65417211981754 chr7 23513815 23514383 23514045 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3,AC079780.3 MALSU1 K562 ChIA-PET 22265404 AC079780.3 3989 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.7914154521921 chr7 24626460 24626850 24626473 Y NA MPP6 NA NA NA NA MPP6 15573 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 24739704 24740021 24739930 Y DFNA5,DFNA5 NA NA NA NA NA DFNA5 67223 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 24795767 24795828 24795792 Y C7orf31,DFNA5,DFNA5 DFNA5 NA NA NA NA DFNA5 11416 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 25009429 25009748 25009721 Y NA OSBPL3 NA NA NA NA OSBPL3 9505 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 25659927 25660160 25660060 Y NA NA LOC441204 IMR90 Hi-C 24141950 C7orf31 441952 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 25894654 25894946 25894846 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CBX3 343836 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr7 25896245 25896461 25896419 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CBX3 342321 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr7 25896515 25897081 25896801 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CBX3 341701 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 25901745 25902114 25902023 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CBX3 336668 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 26220261 26220628 26220627 Y CBX3 CBX3,HNRNPA2B1 NA NA NA NA CBX3 18154 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 26317891 26318244 26318068 Y NA AC010677.5 HNRNPA2B1,CBX3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 AC010677.5 4076 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 27573880 27573985 27573933 Y NA NA NA NA NA NA EIF4HP1 77412 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 27876967 27877264 27877116 Y CREB5 NA NA NA NA NA TAX1BP1 100017 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 27923177 27923290 27923234 Y NA NA NA NA NA NA TAX1BP1 146227 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 28172246 28172388 28172317 Y NA JAZF1-AS1,JAZF1 NA NA NA NA JAZF1-AS1 45553 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 28190212 28190323 28190268 Y NA JAZF1-AS1,JAZF1 NA NA NA NA JAZF1-AS1 27618 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 28195097 28195228 28195166 Y NA JAZF1-AS1,JAZF1 NA NA NA NA JAZF1-AS1 22713 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 28450839 28451193 28451101 Y CREB5 NA NA NA NA NA CREB5 113899 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 28471608 28471631 28471619 Y CREB5,CREB5 NA NA NA NA NA CREB5 134668 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 28514871 28515202 28515167 Y NA NA NA NA NA NA CREB5 177931 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 28548594 28548738 28548668 Y NA NA NA NA NA NA CREB5 211654 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 28825008 28825257 28825133 Y NA NA NA NA NA NA TRIL 170677 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 29042480 29042583 29042532 Y NA TRIL NA NA NA NA TRIL 46546 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr7 30212903 30212961 30212932 Y NA AC007036.5 NA NA NA NA AC007036.5 17756 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 30658764 30658962 30658863 Y NA GARS,AC005154.6 NA NA NA NA AC005154.6 26339 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 32546004 32546038 32546035 Y NA LSM5,AVL9 NA NA NA NA AVL9 12966 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 32551548 32551619 32551584 Y NA LSM5,AVL9 NA NA NA NA AVL9 18510 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 32929600 32929824 32929751 Y NA KBTBD2 NA NA NA NA KBTBD2 1919 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 35075861 35076697 35076367 Y NA NA NA NA NA NA TBX20 215061 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 36301055 36301385 36301112 Y AOAH,SEPT7,EEPD1 NA NA NA NA NA EEPD1 110297 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 36532434 36532616 36532525 Y ELMO1,AOAH,EEPD1 NA NA NA NA NA KIAA0895 104700 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 36785983 36786266 36786088 Y AOAH NA AOAH IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0895 358249 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 36849242 36849408 36849406 Y ELMO1 NA NA NA NA NA KIAA0895 421508 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 36903591 36903813 36903689 Y AOAH,ELMO1 NA NA NA NA NA KIAA0895 475857 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 37105106 37105894 37105654 Y AOAH,ELMO1,ELMO1,ELMO1 NA NA NA NA NA ELMO1 380958 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 37394321 37394728 37394476 Y GPR141,ELMO1,ELMO1,ELMO1 NA NA NA NA NA ELMO1 92124 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 37487081 37487482 37487160 Y GPR141,ELMO1,ELMO1,ELMO1 ELMO1 NA NA NA NA ELMO1 229 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 38426501 38426719 38426610 Y NA NA NA NA NA NA AC006033.22 77517 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 38695355 38695603 38695479 Y NA AMPH AMPH IMR90 Hi-C 24141950 AMPH 26188 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 38750267 38750277 38750273 Y NA NA NA NA NA NA AMPH 81100 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 39632170 39632581 39632314 Y RALA YAE1D1,RALA NA NA NA NA YAE1D1 28195 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 40088776 40089159 40088837 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 101140 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr7 40585377 40585721 40585560 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 597741 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 40756959 40757193 40757114 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 769323 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 41924805 41925034 41925028 Y NA NA LOC285954,C7orf10,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 184099 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 42026442 42026777 42026611 Y NA NA NA NA NA NA INHBA 285736 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 42047614 42048012 42047844 Y NA NA NA NA NA NA INHBA 306908 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 42927750 42928726 42928340 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 NA NA NA NA C7orf25 21178 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr7 43117230 43117632 43117554 Y NA NA HECW1,MRPL32,PSMA2 IMR90 Hi-C 24141950 PSMA2 147408 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 43626451 43626626 43626528 Y URGCP,STK17A STK17A C7orf44 IMR90 Hi-C 24141950 STK17A 6094 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 43644873 43645023 43645002 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 24516 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr7 43652779 43653072 43652905 Y POLM,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 32422 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr7 43654812 43655175 43654945 Y POLM,DBNL,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 34455 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 43657815 43658085 43657951 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 37458 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr7 43658377 43658532 43658408 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 38020 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr7 43659947 43660692 43660336 Y DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 39590 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 43670120 43670185 43670135 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 49763 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 43676905 43677264 43677045 Y POLM,DBNL,STK17A,URGCP NA NA NA NA NA STK17A 56548 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 43714128 43714419 43714274 Y NA NA NA NA NA NA BLVRA 81860 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 43740255 43740653 43740556 Y GCK NA NA NA NA NA BLVRA 55626 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr7 43801940 43802267 43802061 Y NA BLVRA NA NA NA NA BLVRA 5661 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 43835897 43835899 43835898 Y NA BLVRA NA NA NA NA BLVRA 39618 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 43959007 43959429 43959215 Y NA URGCP,UBE2D4 NA NA NA NA URGCP 4581 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 43996825 43996925 43996859 Y NA URGCP,UBE2D4 NA NA NA NA UBE2D4 32788 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 44436686 44437032 44436900 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2B 64510 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 44674941 44675231 44675112 Y PURB,MYO1G,CCM2,DDX56,OGDH OGDH ZMIZ2 IMR90 Hi-C 24141950 OGDH 30770 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 44679392 44679514 44679453 Y ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH OGDH NA NA NA NA OGDH 35221 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 44764845 44765151 44764999 Y RAMP3 ZMIZ2 NA NA NA NA ZMIZ2 21029 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 44855333 44855416 44855373 Y TBRG4,H2AFV PPIA,H2AFV NA NA NA NA PPIA 21054 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 47514732 47515208 47514929 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 104948 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 47620098 47620164 47620135 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 48031393 48031616 48031481 Y HUS1 HUS1 HUS1 K562 ChIA-PET 22265404 HUS1 14215 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 49177785 49177982 49177884 Y NA NA NA NA NA NA HUS1 1160607 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 50306514 50306844 50306594 Y IKZF1,FIGNL1 IKZF1 NA NA NA NA IKZF1 34876 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 50603281 50603405 50603343 Y NA NA NA NA NA NA FIGNL1 87193 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 55131480 55131905 55131522 Y EGFR EGFR NA NA NA NA EGFR 46766 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr7 55141624 55142112 55141893 Y SEC61G,EGFR NA NA NA NA NA EGFR 56910 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 55155188 55155533 55155358 Y EGFR NA NA NA NA NA EGFR 70474 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr7 55322570 55322956 55322611 Y EGFR NA EGFR,SEC61G IMR90 Hi-C 24141950 LANCL2 108185 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.24062908986315 chr7 55529793 55530311 55530129 Y ZNF713,VOPP1 NA NA NA NA NA LANCL2 98652 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr7 55542922 55542955 55542935 Y VOPP1 NA NA NA NA NA VOPP1 95726 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 55543241 55543436 55543358 Y VOPP1 NA NA NA NA NA VOPP1 95245 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 56013517 56013601 56013542 Y ZNF713 GBAS,MRPS17 NA NA NA NA GBAS 3885 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 56034549 56034772 56034661 Y NA GBAS,MRPS17 NA NA NA NA MRPS17 17037 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 56606357 56606502 56606382 Y LOC389493 NA NA NA NA NA CHCHD2 434088 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr7 57639323 57639702 57639567 Y ZNF479,ZNF716 NA NA NA NA NA CHCHD2 1467054 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 61968807 61969730 61969008 Y NA NA NA NA NA NA RP11-340I6.8 1389471 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 63924105 63924304 63924148 Y NA HNRNPCP7 NA NA NA NA HNRNPCP7 34899 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 4.44558757200964 chr7 64196878 64197130 64197096 Y NA NA NA NA NA NA ZNF138 55636 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 64733908 64734317 64734037 Y NA NA NA NA NA NA ZNF92 102395 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 65878387 65878723 65878560 Y RABGEF1,KCTD7 NA ASL,CRCP,TPST1,LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 GS1-124K5.3 77830 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.55078636232894 chr7 66056218 66056609 66056384 Y NA KCTD7 KCTD7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KCTD7 35259 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 66095598 66095867 66095736 Y RABGEF1,KCTD7 KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1 NA NA NA NA KCTD7 3730 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 66120269 66120628 66120390 Y RABGEF1,KCTD7 KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1 NA NA NA NA RP4-756H11.3 2744 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 66152523 66152575 66152558 Y RABGEF1,KCTD7 RP4-756H11.3,RABGEF1 KCTD7,LOC493754,RABGEF1 IMR90 Hi-C 24141950 RABGEF1 7372 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 66783772 66783944 66783858 Y NA STAG3L4,PMS2P4 NA NA NA NA PMS2P4 17878 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 66897123 66897210 66897167 Y NA NA NA NA NA NA PMS2P4 131229 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 69069799 69069881 69069840 Y NA AUTS2 NA NA NA NA AUTS2 7894 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 69091011 69091330 69091153 Y NA AUTS2 NA NA NA NA AUTS2 29106 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 69308115 69308415 69308239 Y AUTS2,AUTS2 NA NA NA NA NA AUTS2 246210 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr7 69393144 69393376 69393212 Y NA NA NA NA NA NA AUTS2 331239 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 70125511 70125845 70125628 Y NA NA NA NA NA NA WBSCR17 469310 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 70160459 70160922 70160898 Y NA NA NA NA NA NA WBSCR17 434233 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 70204788 70204872 70204831 Y NA NA NA NA NA NA WBSCR17 390283 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr7 70206735 70207047 70206891 Y NA NA NA NA NA NA WBSCR17 388108 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 70953472 70953588 70953527 Y NA NA NA NA NA NA WBSCR17 358317 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 71336027 71336353 71336220 Y CALN1 NA NA NA NA NA CALN1 573783 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 72929530 72929887 72929777 Y NA BAZ1B,BCL7B NA NA NA NA BAZ1B 4721 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 72934537 72934921 72934642 Y NA BCL7B NA NA NA NA BAZ1B 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 73078661 73079023 73078813 Y NA MLXIPL,WBSCR22,DNAJC30 NA NA NA NA WBSCR22 16332 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 73153813 73154099 73154081 Y FZD9,STX1A,ABHD11,CLDN4,CLDN3 STX1A,ABHD11 NA NA NA NA ABHD11 2616 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 73443567 73443942 73443908 Y CLIP2,ELN ELN NA NA NA NA ELN 3448 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 73641053 73641366 73641100 Y LIMK1,LAT2 RFC2 NA NA NA NA RFC2 25408 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 73915723 73915843 73915806 Y NA GTF2IRD1 NA NA NA NA GTF2IRD1 49603 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 73994648 73994954 73994780 Y NA NA NA NA NA NA GTF2I 75040 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 74020929 74021149 74021053 Y NA GTF2I NA NA NA NA GTF2I 48845 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 75267820 75268040 75267850 Y POR NA NA NA NA NA HIP1 98240 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 75268782 75269322 75269061 Y NA NA NA NA NA NA HIP1 96958 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 75546128 75546229 75546156 Y NA POR STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 POR 19610 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 75567331 75567651 75567437 Y POR POR NA NA NA NA POR 40813 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 75795833 75796053 75795969 Y RHBDD2,POR SRRM3 SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 SRRM3 33163 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr7 75923846 75924306 75924205 Y HSPB1 HSPB1 NA NA NA NA HSPB1 5555 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.44740060484035 chr7 75940045 75940212 75940167 Y NA HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 10184 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 75947305 75947626 75947472 Y RHBDD2,SRRM3 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 17444 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.06771514977192 chr7 75948116 75948327 75948250 Y RHBDD2 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 18255 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 75993825 75994303 75994024 Y NA YWHAG,ZP3 YWHAG MCF7 ChIA-PET 22265404 YWHAG 7477 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 76009173 76009680 76009431 Y POR YWHAG,ZP3 NA NA NA NA ZP3 15155 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 76627484 76628238 76628092 Y NA NA NA NA NA NA FAM185BP 121195 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 77316787 77316835 77316811 Y NA RSBN1L-AS1,RSBN1L NA NA NA NA RSBN1L-AS1 6747 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 77428722 77429286 77429067 Y PION,PTPN12,RSBN1L,PHTF2,PHTF2 TMEM60,PHTF2 NA NA NA NA PHTF2 2600 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 77561991 77562080 77562036 Y NA NA NA NA NA NA PHTF2 135869 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 77953225 77953430 77953328 Y NA NA NA NA NA NA PHTF2 527103 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 78947044 78947146 78947095 Y MAGI2 NA NA NA NA NA MAGI2-AS3 133052 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 80441834 80442054 80441993 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3C 107621 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 80571600 80571811 80571745 Y NA SEMA3C NA NA NA NA SEMA3C 21925 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 81582871 81583219 81583134 Y NA NA NA NA NA NA HGF 185117 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr7 81584968 81585322 81585145 Y CACNA2D1 NA NA NA NA NA HGF 187214 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr7 81655164 81655347 81655329 Y NA NA NA NA NA NA HGF 257410 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr7 81739157 81739440 81739299 Y NA NA NA NA NA NA CACNA2D1 331674 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 81858656 81858971 81858814 Y CACNA2D1 NA NA NA NA NA CACNA2D1 212143 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 81927516 81927685 81927601 Y NA NA NA NA NA NA CACNA2D1 143429 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr7 82004642 82004673 82004658 Y NA NA NA NA NA NA CACNA2D1 66441 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 82013345 82013689 82013507 Y NA NA NA NA NA NA CACNA2D1 57425 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 82014296 82014582 82014440 Y NA NA NA NA NA NA CACNA2D1 56532 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 82063702 82063952 82063837 Y CACNA2D1 CACNA2D1 NA NA NA NA CACNA2D1 7162 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 82071570 82071737 82071656 Y NA CACNA2D1 NA NA NA NA CACNA2D1 456 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 82596075 82596467 82596271 Y NA NA NA NA NA NA PCLO 193779 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 83662977 83663317 83663147 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3E 386651 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 83688045 83688341 83688303 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3E 411719 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 86287114 86287421 86287268 Y KIAA1324L NA NA NA NA NA KIAA1324L 399594 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 86563227 86563622 86563425 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1324L 123393 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 87266303 87266323 87266313 Y NA RUNDC3B NA NA NA NA RUNDC3B 11439 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 87306649 87306854 87306752 Y NA ABCB1 NA NA NA NA ABCB1 33757 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 87448204 87448549 87448377 Y RUNDC3B,ADAM22 NA NA NA NA NA DBF4 54982 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 87453552 87453801 87453676 Y NA DBF4,SLC25A40 NA NA NA NA DBF4 49730 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 87886356 87886519 87886436 Y STEAP4 SRI NA NA NA NA SRI 32048 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 92156983 92157235 92157087 Y CDK6,CDK6,PEX1,FAM133B,C7orf64 PEX1,RBM48 NA NA NA NA RBM48 896 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr7 92227351 92227620 92227450 Y CDK6,CDK6 FAM133B FAM133B K562 ChIA-PET 22265404 FAM133B 9643 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr7 92233387 92233691 92233548 Y NA FAM133B FAM133B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 FAM133B 15679 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 92260832 92261202 92261012 Y NA FAM133B FAM133B K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 43124 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 92261439 92261837 92261823 Y NA FAM133B FAM133B K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 43731 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 92262528 92262734 92262631 Y NA FAM133B FAM133B K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 44820 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 92274593 92274946 92274914 Y CDK6 NA NA NA NA NA FAM133B 56885 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 92277080 92277232 92277129 Y ANKIB1,GATAD1,CDK6 NA NA NA NA NA FAM133B 59372 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr7 92282305 92282698 92282463 Y LRRD1,KRIT1,KRIT1,KRIT1,SAMD9L,SAMD9 NA NA NA NA NA FAM133B 64597 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 92361219 92361296 92361260 Y NA NA NA NA NA NA AC002454.1 102501 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr7 92373404 92373742 92373580 Y NA NA NA NA NA NA AC002454.1 90055 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 92382003 92382200 92382102 Y CDK6 NA NA NA NA NA AC002454.1 81597 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 92459714 92460134 92460069 Y SAMD9 AC002454.1,CDK6 NA NA NA NA AC002454.1 3663 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr7 92463754 92464079 92463922 Y CDK6,CDK6 NA NA NA NA NA AC002454.1,CDK6 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 93585573 93585617 93585595 Y NA GNG11,BET1 NA NA NA NA GNG11 36562 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 93811483 93811628 93811573 Y TFPI2,GNG11 NA TFPI2,BET1,GNGT1 IMR90 Hi-C 24141950 BET1 179789 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 94286949 94287416 94287082 Y PPP1R9A,PPP1R9A,CASD1,PEG10,PEG10 SGCE,PEG10,RPS3AP25 NA NA NA NA PEG10 3312 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 94687971 94688075 94688023 Y NA RNU4-16P NA NA NA NA RNU4-16P 37464 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 94751086 94751478 94751282 Y NA RNU4-16P NA NA NA NA RNU4-16P 25547 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 94769120 94769288 94769204 Y NA RNU4-16P NA NA NA NA RNU4-16P 43581 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 95861904 95862185 95862172 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 87274 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 96482190 96482573 96482196 Y NA NA NA NA NA NA SHFM1 144987 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 96694369 96694759 96694746 Y NA ACN9 DYNC1I1 IMR90 Hi-C 24141950 ACN9 49143 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 96905282 96905489 96905385 Y NA NA NA NA NA NA ACN9 161380 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 97763424 97763629 97763532 Y BRI3,LMTK2 LMTK2 NA NA NA NA LMTK2 29227 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 98189463 98189580 98189522 Y NA NA NA NA NA NA NPTX2 55029 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 98724585 98724789 98724635 Y ZNF394,SMURF1 SMURF1 NA NA NA NA SMURF1 14934 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 98871923 98872129 98871984 Y NA ARPC1A NA NA NA NA ARPC1A 49392 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 98973055 98973209 98973129 Y ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B ARPC1B,BUD31,PDAP1 NA NA NA NA ARPC1B 3183 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 98990795 98991133 98991082 Y NA ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4 NA NA NA NA BUD31 13131 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 99000499 99000617 99000560 Y NA ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4 NA NA NA NA BUD31 3647 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 99020392 99020577 99020441 Y OR2AE1,FAM200A,BUD31,ZNF789 BUD31,PDAP1,CPSF4,PTCD1,ATP5J2-PTCD1,ATP5J2,ZNF789 NA NA NA NA CPSF4 13968 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 99094567 99094648 99094634 Y NA PTCD1,ATP5J2-PTCD1,ATP5J2,ZNF789,ZNF394,ZKSCAN5 NA NA NA NA ZNF394 1299 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 99178135 99178365 99178354 Y ZNF789 ZNF655,FAM200A NA NA NA NA FAM200A 23976 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr7 99291105 99291222 99291169 Y PTCD1,CYP3A43,CYP3A4,AZGP1,CYP3A5 NA NA NA NA NA FAM200A 136946 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 99684818 99685168 99684993 Y TSC22D4,PILRB,PILRA ZSCAN21,ZNF3,COPS6,AP4M1,MCM7,CNPY4,TAF6,MBLAC1,RP11-506M12.1 NA NA NA NA COPS6 241 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 99957855 99958254 99957887 Y NA PILRB,PMS2P1 NA NA NA NA PMS2P1 20324 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 99961767 99962035 99961969 Y NA PILRB,PMS2P1 PILRA IMR90 Hi-C 24141950 PMS2P1 24236 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 99962576 99962959 99962740 Y MCM7,C7orf43,ZCWPW1,TSC22D4,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,GIGYF1,PILRB,PILRA PILRB,PMS2P1 PILRA IMR90 Hi-C 24141950 PMS2P1 25045 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 100143295 100143664 100143516 Y NA AGFG2,LRCH4 NA NA NA NA AGFG2 8461 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 100433472 100433773 100433685 Y NA SLC12A9,EPHB4,RP11-126L15.4,TRIP6,SRRT AGFG2,MOSPD3,PCOLCE,FBXO24,LOC100129845,POP7,EPO,GIGYF1,EPHB4,ZAN,SRRT,SLC12A9,TRIP6,SERPINE1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHB4 10351 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 100809834 100810470 100810178 Y NA SERPINE1,AP1S1,VGF,ZNHIT1,PLOD3 NA NA NA NA VGF 2960 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr7 101245696 101245932 101245814 Y MOGAT3 NA NA NA NA NA CUX1 211027 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 101579917 101580029 101579973 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 122958 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 101672273 101672589 101672281 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 215314 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 101678350 101678537 101678444 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 221391 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 101707897 101708291 101708217 Y SH2B2,CUX1,CUX1 NA NA NA NA NA CUX1 250938 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 101775527 101775981 101775908 Y CUX1,CUX1,SH2B2,ORAI2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 226338 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 101929501 101929660 101929574 Y CUX1,CUX1,CUX1,POLR2J3,ORAI2,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72659 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72006 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 9.71826120392804 chr7 101931211 101931437 101931291 Y CUX1,CUX1,CUX1,ORAI2,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 70882 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 102773056 102773346 102773244 Y NA RPL19P12,NAPEPLD ARMC10 IMR90 Hi-C 24141950 RPL19P12 7040 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 102958965 102959200 102958983 Y NA DPY19L2P2,PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4 NA NA NA NA PMPCB 23096 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr7 104206127 104206133 104206130 Y NA NA NA NA NA NA ORC5 359632 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 104618643 104618978 104618693 Y NA LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 32513 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 104626890 104627731 104627241 Y MLL5 LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 23760 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 104992589 104992852 104992773 Y NA SRPK2 NA NA NA NA SRPK2 44903 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 105123568 105123582 105123575 Y NA PUS7,RINT1 NA NA NA NA PUS7 37132 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 105416484 105416867 105416678 Y NA CTA-351J1.1 NA NA NA NA CTA-351J1.1 41071 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 105459888 105460220 105459903 Y NA CTA-351J1.1 NA NA NA NA CTA-351J1.1 1950 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 105602769 105602970 105602871 Y NA NA NA NA NA NA CDHR3 87527 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 105988057 105988433 105988164 Y FLJ36031,NAMPT NA NAMPT,CCDC71L,PIK3CG K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NAMPT 63285 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 106061034 106061788 106061567 Y NA NA NAMPT,CCDC71L,CDHR3 IMR90 Hi-C 24141950 NAMPT 136262 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 106808132 106808705 106808532 Y NA HBP1 NA NA NA NA HBP1 726 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 106838325 106838672 106838499 Y NA HBP1 NA NA NA NA HBP1 30919 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 106901302 106901364 106901333 Y NA NA NA NA NA NA HBP1 93896 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr7 106943118 106943475 106943297 Y NA NA NA NA NA NA HBP1 135712 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 107026511 107026865 107026723 Y NA NA NA NA NA NA GPR22 81598 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 107079032 107079264 107079148 Y NA GPR22 NA NA NA NA GPR22 29199 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 107109276 107109645 107109473 Y NA GPR22 NA NA NA NA GPR22 813 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 107116622 107117169 107116900 Y NA GPR22 NA NA NA NA GPR22 8159 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 107142222 107142266 107142244 Y NA GPR22 NA NA NA NA GPR22 33759 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 107554407 107554624 107554481 Y DLD DLD NA NA NA NA DLD 24992 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 107555392 107555607 107555420 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 25977 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 107567788 107568066 107567911 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 38373 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 107573965 107574445 107574339 Y LAMB1 DLD NA NA NA NA DLD 44550 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 107606262 107606577 107606420 Y NRCAM LAMB1 NA NA NA NA LAMB1 35123 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 107840467 107840775 107840621 Y NA NA NA NA NA NA LAMB1 198767 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 107935130 107935280 107935250 Y NA NA NA NA NA NA NRCAM 159881 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 107939769 107940082 107939931 Y NA NA NA NA NA NA NRCAM 155079 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 107949313 107949798 107949569 Y NA NA NA NA NA NA NRCAM 145363 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 108059525 108059612 108059569 Y PNPLA8 NRCAM NA NA NA NA NRCAM 35549 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 108095684 108095814 108095727 Y NRCAM,NRCAM NRCAM NA NA NA NA NRCAM 523 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr7 109647470 109647641 109647556 Y NA NA NA NA NA NA AC003088.1 525170 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 109682039 109682053 109682046 Y NA NA NA NA NA NA AC003088.1 490758 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 110326819 110326998 110326909 Y NA NA NA NA NA NA AC003088.1 154008 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 110732834 110733321 110733005 Y NA LRRN3 NA NA NA NA LRRN3 3772 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 110753766 110754103 110753883 Y LRRN3 LRRN3 NA NA NA NA LRRN3 24704 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 110808410 110808626 110808556 Y NA NA NA NA NA NA LRRN3 79348 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 110849154 110849473 110849333 Y NA NA NA NA NA NA LRRN3 120092 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 110856868 110857086 110856977 Y NA NA NA NA NA NA LRRN3 127806 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 111200844 111201149 111201059 Y NA IMMP2L NA NA NA NA IMMP2L 271 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 111721905 111722337 111722086 Y ZNF277,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 122129 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 111764528 111764737 111764684 Y ZNF277,IFRD1,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 79729 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 111832262 111832632 111832471 Y NA DOCK4,ZNF277 NA NA NA NA DOCK4 11834 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 111971895 111972278 111972086 Y NA RN7SKP187 NA NA NA NA RN7SKP187 45217 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 112517846 112518028 112517949 Y IFRD1,C7orf60 NA NA NA NA NA C7orf60 59943 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 112599414 112599621 112599541 Y C7orf60 C7orf60 NA NA NA NA C7orf60 21443 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 114571864 114572137 114571962 Y MDFIC NA NA NA NA NA TFEC 1225813 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 115957025 115957120 115957073 Y NA NA CAV1,CAV2,TES,CAPZA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TES 108478 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 116504290 116504456 116504319 Y NA NA NA NA NA NA CAPZA2 55166 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 116651956 116652355 116652105 Y NA NA NA NA NA NA ST7-AS1 59568 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 116793573 116793925 116793605 Y NA NA NA NA NA NA ST7-AS1 201185 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr7 116804623 116804954 116804811 Y NA NA NA NA NA NA ST7-AS1 212235 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 116930307 116930575 116930441 Y NA NA NA NA NA NA ST7-AS1 337919 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 117253655 117254026 117253841 Y NA NA NA NA NA NA NAA38 568060 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 120938122 120938485 120938307 Y FAM3C NA NA NA NA NA FAM3C 95933 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 121025846 121026096 121025939 Y ING3 FAM3C NA NA NA NA FAM3C 8322 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 123387767 123387941 123387854 Y NA WASL NA NA NA NA WASL 646 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr7 123677483 123677526 123677503 Y TMEM229A TMEM229A NA NA NA NA TMEM229A 5960 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 126199207 126199226 126199216 Y NA NA NA NA NA NA GRM8 692122 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 126341155 126341491 126341268 Y NA NA NA NA NA NA GRM8 549857 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr7 126658207 126658487 126658347 Y GRM8 NA NA NA NA NA GRM8 232861 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 127455662 127455822 127455742 Y NA NA NA NA NA NA SND1 165428 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 127807416 127807928 127807646 Y LRRC4 NA SND1 IMR90 Hi-C 24141950 LRRC4 137256 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 128094514 128094949 128094639 Y LEP,C7orf68 IMPDH1,HILPDA,RP11-155G14.6,METTL2B NA NA NA NA RP11-155G14.6 523 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 5.4794451468956 chr7 128249599 128249637 128249625 Y NA RP11-212P7.1 FLJ45340,CALU,FAM71F1,IRF5 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-212P7.1 40857 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 128471531 128472043 128471766 Y FLNC CCDC136,FLNC,ATP6V1F NA NA NA NA FLNC 3100 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr7 128472556 128472915 128472760 Y NA CCDC136,FLNC,ATP6V1F NA NA NA NA FLNC 4125 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 128500948 128501348 128501123 Y NA FLNC,ATP6V1F,KCP NA NA NA NA ATP6V1F 68 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 128549999 128550078 128550039 Y NA ATP6V1F,KCP NA NA NA NA KCP 1226 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 128995385 128995592 128995489 Y NA NA FAM40B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-305M3.2 52619 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 129010616 129010786 129010717 Y NA RP11-305M3.2 FAM40B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-305M3.2 37425 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 129014301 129014725 129014533 Y AHCYL2,FAM40B,AHCYL2 RP11-305M3.2 FAM40B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-305M3.2 33486 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 129246747 129246901 129246817 Y NA NRF1 NRF1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 2654 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 129464915 129465297 129464948 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 125492 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 129465628 129465864 129465722 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 124925 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 129590044 129590333 129590306 Y NA UBE2H NA NA NA NA UBE2H 456 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 130005430 130005716 130005580 Y TMEM209 NA NA NA NA NA CPA4 74456 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 130581597 130582393 130581985 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 210462 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 130633473 130633870 130633858 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 158985 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 130636331 130636776 130636707 Y MKLN1 NA NA NA NA NA MKLN1 156079 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 130756735 130757090 130757043 Y NA MKLN1,LINC-PINT NA NA NA NA MKLN1 35765 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 131152589 131152603 131152595 Y NA NA NA NA NA NA PODXL 88373 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 132441115 132441141 132441128 Y NA NA FLJ40288 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNA4 109668 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 132484487 132484560 132484524 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA4 153040 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 132488555 132488726 132488642 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA4 157108 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 132607236 132607300 132607268 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD3 157548 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 133092941 133093104 133093022 Y NA NA NA NA NA NA AC083875.2 94774 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 133148039 133148314 133148177 Y NA NA NA NA NA NA AC083875.2 149872 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 133431716 133432104 133431827 Y NA NA NA NA NA NA LRGUK 377948 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 133706471 133706698 133706584 Y NA NA NA NA NA NA LRGUK 103354 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 134117156 134117311 134117298 Y NA AKR1B1 NA NA NA NA AKR1B1 24725 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr7 134142605 134142975 134142790 Y AKR1B1 AKR1B1 NA NA NA NA AKR1B1 569 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 134287776 134287871 134287820 Y NA BPGM AKR1B1,AKR1B10,AKR1B15,BPGM IMR90 Hi-C 24141950 BPGM 41689 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 134475089 134475514 134475151 Y CALD1 CALD1 NA NA NA NA CALD1 48086 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 134677531 134677740 134677636 Y AGBL3 AGBL3 NA NA NA NA AGBL3 8272 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 134836328 134836759 134836549 Y WDR91,CNOT4,TMEM140 C7orf49 NA NA NA NA C7orf49 16788 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 134845913 134846266 134846037 Y WDR91,CNOT4,TMEM140 C7orf49,WDR91 NA NA NA NA C7orf49 7281 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 135120473 135120740 135120725 Y NA NA NA NA NA NA CNOT4 72135 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 135771654 135771794 135771701 Y NA NA NA NA NA NA MTPN 111553 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 137036619 137036971 137036795 Y NA PTN NA NA NA NA PTN 10008 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 137355325 137355590 137355458 Y NA NA NA NA NA NA DGKI 174248 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 137387266 137387617 137387499 Y NA NA NA NA NA NA DGKI 142221 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 137418965 137419308 137419135 Y NA NA NA NA NA NA DGKI 110530 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 137441898 137442245 137442146 Y NA NA NA NA NA NA DGKI 87593 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 137573369 137573542 137573460 Y NA DGKI NA NA NA NA DGKI 43531 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 138250447 138250496 138250473 Y AKR1D1,TRIM24 NA NA NA NA NA TRIM24 107368 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 138317555 138317877 138317771 Y KIAA1549,TRIM24,SVOPL,SVOPL NA NA NA NA NA AC020983.5 53848 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 138645726 138646137 138646013 Y SVOPL,UBN2,LUC7L2,KIAA1549 KIAA1549 NA NA NA NA KIAA1549 17927 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 138650306 138650635 138650366 Y SVOPL,UBN2,LUC7L2,KIAA1549 KIAA1549 NA NA NA NA KIAA1549 13429 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 138662189 138662362 138662288 Y NA KIAA1549 NA NA NA NA KIAA1549 1702 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 138779904 138780459 138780182 Y NA ZC3HAV1,TTC26 NA NA NA NA ZC3HAV1 12006 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 139333682 139334086 139333875 Y TBXAS1,HIPK2 NA NA NA NA NA ERHP1 116696 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 139930863 139931473 139931211 Y TBXAS1,JHDM1D NA LOC100134229,JHDM1D MCF7 ChIA-PET 22265404 PARP12 169342 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 140338889 140339239 140339064 Y NA ADCK2,DENND2A,NDUFB2 DENND2A,MKRN1 IMR90 Hi-C 24141950 ADCK2 31714 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 140572858 140572991 140572984 Y BRAF BRAF NA NA NA NA BRAF 49573 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 140613036 140613224 140613135 Y NA BRAF NA NA NA NA BRAF 9340 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 140774728 140775101 140774915 Y NA RNU4-74P NA NA NA NA RNU4-74P 24679 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr7 140807032 140807954 140807105 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-74P 56983 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr7 141031546 141031842 141031694 Y LOC100131199,WEE2,TAS2R5,TAS2R4 NA NA NA NA NA AGK 217147 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 141052183 141052582 141052369 Y NA NA NA NA NA NA AGK 196407 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 141334636 141334647 141334642 Y TAS2R3 NA NA NA NA NA KIAA1147 65306 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 141371952 141372250 141372100 Y CLEC5A KIAA1147 NA NA NA NA KIAA1147 27703 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 141380130 141380660 141380538 Y NA KIAA1147,RNU1-82P NA NA NA NA KIAA1147 19293 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 141492164 141492415 141492290 Y TAS2R38,OR9A4,TAS2R3,TAS2R4,TAS2R5 NA NA NA NA NA SSBP1 56043 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 141660382 141660901 141660703 Y CLEC5A,TAS2R38 NA NA NA NA NA SSBP1 224261 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 142512822 142513372 142512967 Y GSTK1,CASP2,EPHB6 NA EPHB6 IMR90 Hi-C 24141950 GSTK1 425814 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 142519257 142519562 142519385 Y TAS2R39,OR9A2 NA EPHB6,TRPV5 IMR90 Hi-C 24141950 GSTK1 419624 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 142936809 142937123 142937021 Y NA GSTK1,CASP2 NA NA NA NA GSTK1 2063 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 143083267 143084129 143083354 Y TAS2R40,FAM131B,FAM131B FAM131B,AC093673.5,ZYX NA NA NA NA ZYX 7094 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr7 145847092 145847701 145847439 Y CNTNAP2 NA NA NA NA NA TPK1 1315604 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 148424586 148424815 148424779 Y NA CUL1 NA NA NA NA CUL1 31580 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA RNY5 EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNY5 1693 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.24062908986315 chr7 148680544 148680840 148680694 Y NA RNY5,PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 42893 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr7 148684338 148684706 148684475 Y NA RNY5,PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 39027 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr7 148788414 148788490 148788418 Y CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398 ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2540 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 149112304 149112563 149112312 Y ZNF862 NA NA NA NA NA ZNF746 80345 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 149744537 149744792 149744633 Y NA NA NA NA NA NA ATP6V0E2-AS1 168838 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 149745351 149745623 149745500 Y NA NA NA NA NA NA ATP6V0E2-AS1 169652 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 150676721 150676998 150676859 Y NA KCNH2,NOS3,ABCB8 NA NA NA NA KCNH2 3318 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 150691752 150691942 150691795 Y GIMAP7,GIMAP4,GIMAP6,GIMAP2,GIMAP1,GIMAP5,LOC100128542 KCNH2,NOS3,ABCB8 NA NA NA NA NOS3 5669 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 151039447 151039627 151039551 Y SLC4A2,AGAP3,SMARCD3,SMARCD3,NUB1 NUB1 NA NA NA NA NUB1 2662 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 151068443 151068736 151068590 Y SMARCD3,CRYGN,WDR86 NUB1,WDR86 NA NA NA NA NUB1 31658 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 151184518 151184840 151184768 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 30366 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 151193551 151193826 151193799 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 21380 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 151198552 151198933 151198803 Y AGAP3,PRKAG2,PRKAG2 RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 16273 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr7 151199311 151199621 151199557 Y NA RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 15585 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 151236196 151236396 151236297 Y SMARCD3,PRKAG2 RHEB NA NA NA NA RHEB 20990 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 151620751 151620976 151620906 Y RHEB,PRKAG2,PRKAG2 PRKAG2-AS1,PRKAG2 LOC100505483,PRKAG2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PRKAG2 48541 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 152160343 152160554 152160402 Y ACTR3B FABP5P3 NA NA NA NA FABP5P3 28363 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA FABP5P3 NA NA NA NA FABP5P3 28735 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr7 152161348 152162014 152161594 Y NA FABP5P3 NA NA NA NA FABP5P3 29368 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.58464393721491 chr7 152338571 152338711 152338613 Y NA XRCC2 NA NA NA NA XRCC2 32539 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 153585684 153585818 153585716 Y DPP6,DPP6,DPP6 DPP6 NA NA NA NA DPP6 3502 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr7 153645622 153645864 153645639 Y NA NA NA NA NA NA DPP6 63440 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 153866590 153866687 153866639 Y NA NA NA NA NA NA DPP6 284408 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 153876218 153876403 153876311 Y NA NA NA NA NA NA DPP6 294036 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 154036651 154036737 154036694 Y NA NA NA NA NA NA DPP6 454469 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 154730644 154730988 154730877 Y NA NA NA NA NA NA PAXIP1 61806 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 155105447 155105513 155105480 Y NA INSIG1 NA NA NA NA INSIG1 17961 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 155276719 155276807 155276762 Y PAXIP1,CNPY1 NA NA NA NA NA RBM33 158338 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 155383034 155383540 155383287 Y RBM33 NA LMBR1,CNPY1,RBM33,LOC100132707 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBM33 51605 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 156444597 156444947 156444772 Y NA C7orf13 NA NA NA NA C7orf13 13249 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 157034052 157034373 157034213 Y NA NA NA NA NA NA RP4-814D15.2 50990 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr7 157054104 157054271 157054188 Y NA NA NA NA NA NA RP4-814D15.2 71042 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 157067817 157068138 157067978 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 57937 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 157072331 157072686 157072549 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 53389 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 157225296 157225625 157225465 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 99221 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 157338058 157338440 157338352 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 211983 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 157405982 157406183 157406105 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 279907 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 157793988 157794028 157794008 Y NA NA NA NA NA NA PTPRN2 584452 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 157853709 157853980 157853845 Y NA NA NA NA NA NA PTPRN2 524500 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 157924006 157924393 157924072 Y PTPRN2 NA NA NA NA NA PTPRN2 454087 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 158044474 158044782 158044628 Y NA NA NA NA NA NA PTPRN2 333698 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 158118853 158119159 158118930 Y NA NA NA NA NA NA PTPRN2 259321 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 158167398 158167566 158167494 Y NA NA NA NA NA NA PTPRN2 210914 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 158225517 158225999 158225657 Y NA NA NA NA NA NA PTPRN2 152481 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 158301829 158302021 158301840 Y NA NA NA NA NA NA PTPRN2 76459 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 158378369 158378681 158378482 Y PTPRN2 NA NA NA NA NA PTPRN2 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 158493510 158493807 158493659 Y NCAPG2 NCAPG2 NA NA NA NA NCAPG2 1713 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 158527660 158527846 158527783 Y NA NCAPG2 NA NA NA NA NCAPG2 32140 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 158603982 158604371 158604316 Y NA ESYT2,WDR60 NA NA NA NA ESYT2 16573 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr7 158613624 158614053 158613981 Y ESYT2 ESYT2,WDR60 NA NA NA NA ESYT2 6891 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr7 158765978 158766170 158766074 Y NA NA NCAPG2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR60 118709 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 479972 480137 480087 Y NA NA NA NA NA NA FBXO25 125544 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 638062 638589 638348 Y ZNF596,ZNF596,ERICH1 ERICH1 NA NA NA NA ERICH1 47517 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 1011862 1012449 1011913 Y NA NA DLGAP2 IMR90 Hi-C 24141950 ERICH1 325756 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 3.30834423963508 chr8 1060714 1060735 1060723 Y NA NA NA NA NA NA ERICH1 374608 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 1414853 1414992 1414933 Y NA NA NA NA NA NA CLN8 286952 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 1424538 1424595 1424570 Y CLN8 NA NA NA NA NA CLN8 277349 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 1780723 1781665 1781560 Y NA ARHGEF10 NA NA NA NA ARHGEF10 10581 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 1837817 1838203 1838066 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF10 67675 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr8 1960083 1960443 1960148 Y KBTBD11 KBTBD11-OT1,KBTBD11,RP11-439C15.4 NA NA NA NA RP11-439C15.4 39280 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 2263330 2263439 2263406 Y NA NA NA NA NA NA GS1-57L11.1 319419 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 2591169 2591450 2591225 Y NA GS1-57L11.1,RP11-134O21.1 NA NA NA NA RP11-134O21.1 7178 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.24062908986315 chr8 3252665 3252838 3252782 Y NA NA NA NA NA NA RP11-134O21.1 668674 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 6275449 6275723 6275483 Y NA MCPH1,RP11-115C21.2 NA NA NA NA RP11-115C21.2 12786 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 6407469 6407794 6407634 Y NA ANGPT2 NA NA NA NA ANGPT2 11136 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 6431105 6431496 6431367 Y NA ANGPT2 NA NA NA NA ANGPT2 12175 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 6575644 6576065 6575803 Y MCPH1,AGPAT5 CTD-2541M15.1,AGPAT5 NA NA NA NA AGPAT5 11766 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 6605896 6606328 6606048 Y NA CTD-2541M15.1,AGPAT5 NA NA NA NA AGPAT5 42018 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 6663567 6663735 6663651 Y NA XKR5 NA NA NA NA XKR5 27431 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 6721983 6722491 6722202 Y NA XKR5,DEFB1 NA NA NA NA DEFB1 11053 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 8498145 8498322 8498234 Y NA NA SGK223,FLJ10661 IMR90 Hi-C 24141950 MFHAS1 250833 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 8706541 8706605 8706573 Y NA MFHAS1 NA NA NA NA MFHAS1 42550 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 8878847 8879137 8878870 Y NA ERI1 NA NA NA NA ERI1 21190 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 9408701 9409304 9408905 Y NA TNKS NA NA NA NA TNKS 2120 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 9764051 9764441 9764391 Y MSRA LINC00599 NA NA NA NA LINC00599 3175 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr8 9791185 9791439 9791249 Y MSRA LINC00599 LOC157627,MSRA IMR90 Hi-C 24141950 LINC00599 30309 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 10192260 10192787 10192448 Y MSRA NA NA NA NA NA MSRA 282482 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 10386068 10386214 10386141 Y NA NA NA NA NA NA PINX1 309180 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 10676875 10677241 10677058 Y NA PINX1 NA NA NA NA PINX1 18153 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr8 11282611 11282836 11282801 Y FAM167A FAM167A NA NA NA NA FAM167A 47388 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 11286873 11287154 11286982 Y FAM167A FAM167A NA NA NA NA FAM167A 43070 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 11311289 11311840 11311810 Y NA FAM167A NA NA NA NA FAM167A 18384 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 11312263 11312525 11312305 Y FAM167A FAM167A NA NA NA NA FAM167A 17699 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 11312887 11313950 11313920 Y NA FAM167A NA NA NA NA FAM167A 16274 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 6.51330272178156 chr8 11314255 11315026 11314813 Y XKR6,MTMR9,FAM167A FAM167A NA NA NA NA FAM167A 15198 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 3.10157272465789 chr8 11322358 11322501 11322433 Y NEIL2,XKR6,MTMR9,FAM167A FAM167A NA NA NA NA FAM167A 7723 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr8 13004776 13005088 13004835 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1456 203625 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 13101435 13101826 13101810 Y NA NA NA NA NA NA DLC1 269341 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr8 13122971 13123135 13123062 Y DLC1 NA NA NA NA NA DLC1 248032 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 13210778 13210972 13210875 Y NA NA NA NA NA NA DLC1 160195 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 13302544 13302935 13302756 Y NA NA NA NA NA NA DLC1 68232 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 13329086 13329400 13329354 Y DLC1 DLC1 NA NA NA NA DLC1 41767 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr8 13349643 13349945 13349794 Y DLC1,DLC1 DLC1 NA NA NA NA DLC1 21222 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr8 13393176 13393534 13393351 Y DLC1 DLC1,C8orf48 DLC1 IMR90 Hi-C 24141950 DLC1 22009 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.75755787730614 chr8 14502458 14502468 14502463 Y NA NA NA NA NA NA SGCZ 591380 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 15443006 15443379 15443076 Y NA NA NA NA NA NA TUSC3 170282 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 16965727 16966045 16965748 Y NA ZDHHC2 NA NA NA NA ZDHHC2 45493 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 17194213 17194219 17194216 Y SLC7A2,SLC7A2 NA NA NA NA NA MTMR7 74818 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 17385893 17386107 17386000 Y SLC7A2,SLC7A2 SLC7A2,PDGFRL NA NA NA NA SLC7A2 33296 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 18768857 18769292 18769046 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 170948 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 18836263 18836433 18836318 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 103807 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 18854306 18854486 18854451 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 85754 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 18991999 18992391 18992140 Y NA NA PSD3,LOC100128993 IMR90 Hi-C 24141950 PSD3 51759 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 20058362 20058772 20058410 Y ATP6V1B2 SLC18A1,ATP6V1B2 NA NA NA NA ATP6V1B2 5484 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 20064190 20064507 20064297 Y ATP6V1B2 SLC18A1,ATP6V1B2 NA NA NA NA ATP6V1B2 11312 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 20125746 20125979 20125927 Y NA LZTS1 DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1 IMR90 Hi-C 24141950 LZTS1 33495 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr8 20126353 20126692 20126612 Y NA LZTS1 DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1 IMR90 Hi-C 24141950 LZTS1 32782 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr8 21167334 21167434 21167384 Y GFRA2 NA NA NA NA NA GFRA2 500435 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 21624397 21624558 21624547 Y NPM2,GFRA2 GFRA2 NA NA NA NA GFRA2 43311 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 21695950 21696343 21696116 Y POLR3D,XPO7 GFRA2 NA NA NA NA GFRA2 28081 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 21775759 21776194 21775973 Y PHYHIP,DOK2,NPM2 XPO7 NA NA NA NA XPO7 579 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr8 21804083 21804253 21804128 Y NA XPO7 NA NA NA NA XPO7 28903 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr8 21817623 21817860 21817686 Y NA XPO7 NA NA NA NA XPO7 42443 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 21867707 21867918 21867811 Y PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2 NPM2 NA NA NA NA NPM2 11718 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 21999982 22000221 22000101 Y POLR3D NUDT18,HR,REEP4,LGI3,BMP1 NA NA NA NA REEP4 2518 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 22068132 22068339 22068246 Y NA BMP1,PHYHIP,MIR320A,POLR3D NA NA NA NA PHYHIP 19515 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr8 22301187 22301546 22301465 Y BIN3,PPP3CC PPP3CC,RP11-382J24.2 NA NA NA NA PPP3CC 4855 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 22469003 22469432 22469219 Y NA PDLIM2,C8orf58 NA NA NA NA C8orf58 13889 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 22513437 22513754 22513670 Y NA BIN3,EGR3 NA NA NA NA BIN3 10907 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 22535910 22536200 22536167 Y NA BIN3,EGR3 NA NA NA NA BIN3 11249 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 22551843 22553123 22552848 Y PPP3CC,PDLIM2,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10C,EGR3 BIN3,EGR3 NA NA NA NA EGR3 3028 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr8 22710401 22710511 22710455 Y NA NA NA NA NA NA RHOBTB2 132419 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 22808149 22808394 22808223 Y NA RHOBTB2 PEBP4,TNFRSF10B,BIN3,EGR3,RHOBTB2 IMR90 Hi-C 24141950 RHOBTB2 34536 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr8 23308133 23308499 23308237 Y TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4 LOXL2,ENTPD4 NA NA NA NA ENTPD4 4709 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 23353842 23353942 23353892 Y TNFRSF10C,SLC25A37 ENTPD4,SLC25A37 NKX3-1,SLC25A37,NKX2-6 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A37 30376 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 24134954 24135036 24134995 Y NA NA ADAM28 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-148P 202283 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 24624446 24624496 24624472 Y NEFM,NEFM,NEFL NA NA NA NA NA NEFM 144029 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 24799462 24799718 24799592 Y NEFL NEFM,NEFL NA NA NA NA NEFL 12906 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.65417211981754 chr8 24858208 24858485 24858356 Y NA NEFL NA NA NA NA NEFL 45584 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 25242857 25243137 25242939 Y NA NA KCTD9 IMR90 Hi-C 24141950 KCTD9 70855 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 26232086 26232281 26232177 Y NA BNIP3L,SDAD1P1 NA NA NA NA BNIP3L 6133 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 26305968 26306033 26305997 Y NA NA BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PNMA2 63575 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 26306627 26307336 26307213 Y NA NA BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PNMA2 62272 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 26429509 26429959 26429867 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL2 59718 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 26453595 26453975 26453687 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL2 83804 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 26466209 26466513 26466418 Y PPP2R2A,BNIP3L NA NA NA NA NA DPYSL2 96418 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 26466894 26467238 26467101 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL2 97103 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 27114452 27114997 27114718 Y NA STMN4 NA NA NA NA STMN4 515 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 27119314 27119699 27119379 Y NA STMN4,TRIM35 NA NA NA NA STMN4 5377 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 27138634 27138989 27138722 Y PTK2B STMN4,TRIM35 NA NA NA NA STMN4 24697 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 27198229 27198437 27198331 Y PTK2B,PTK2B TRIM35 NA NA NA NA TRIM35 31393 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 27200806 27201031 27200919 Y PTK2B,PTK2B TRIM35 NA NA NA NA TRIM35 33970 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 27252539 27252934 27252816 Y PTK2B,PTK2B NA NA NA NA NA TRIM35 85703 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 27547704 27547787 27547746 Y NA NA NA NA NA NA SCARA3 58319 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 27630770 27631068 27630863 Y NA ESCO2,CCDC25 NA NA NA NA CCDC25 2600 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 27972693 27972953 27972823 Y NA ELP3 NA NA NA NA ELP3 27503 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 28004860 28005043 28004968 Y NA NA NA NA NA NA ELP3 59670 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 28258528 28258941 28258737 Y HMBOX1,HMBOX1 ZNF395 ZNF395,FBXO16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF395 310 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 28269273 28269920 28269515 Y ZNF395 ZNF395 NA NA NA NA ZNF395 11055 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr8 28320295 28320574 28320435 Y NA FBXO16,FZD3 NA NA NA NA FBXO16 25261 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 28352811 28353080 28352947 Y HMBOX1,HMBOX1,FZD3 FBXO16,FZD3 NA NA NA NA FZD3 3082 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 28355222 28355409 28355286 Y NA FBXO16,FZD3 NA NA NA NA FZD3 5493 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 28569820 28569970 28569874 Y ZNF395,FZD3,EXTL3 EXTL3-AS1 NA NA NA NA EXTL3-AS1 12839 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 28637206 28637596 28637433 Y EXTL3,KIF13B NA NA NA NA NA EXTL3-AS1 80225 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 28785346 28785716 28785529 Y NA INTS9,HMBOX1 NA NA NA NA HMBOX1 39435 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 28859805 28860025 28859905 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2647L4.4 51427 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 28874740 28875053 28874870 Y KIF13B CTD-2647L4.4 NA NA NA NA CTD-2647L4.4 36399 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 28886327 28886717 28886347 Y HMBOX1,HMBOX1,DUSP4 CTD-2647L4.4 NA NA NA NA CTD-2647L4.4 24735 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 28890628 28890717 28890674 Y KIF13B CTD-2647L4.4 NA NA NA NA CTD-2647L4.4 20735 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 29097584 29097960 29097935 Y HMBOX1,HMBOX1,KIF13B KIF13B NA NA NA NA KIF13B 20681 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 29202154 29202365 29202273 Y DUSP4,DUSP4 DUSP4 NA NA NA NA DUSP4 3820 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr8 29204481 29204724 29204678 Y NA DUSP4 NA NA NA NA DUSP4 1461 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 29498600 29498751 29498676 Y KIF13B NA DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR3148 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 292415 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 29595040 29595214 29595121 Y KIF13B,DUSP4,DUSP4,TMEM66,LEPROTL1 NA NA NA NA NA TMEM66 343509 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 30015593 30015700 30015665 Y NA RPS15AP24,DCTN6 NA NA NA NA DCTN6 3780 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 30273402 30273800 30273435 Y NA RBPMS NA NA NA NA RBPMS 33458 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 30462940 30463157 30463081 Y NA NA NA NA NA NA GTF2E2 50611 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 30506010 30506203 30506101 Y NA GTF2E2 NA NA NA NA GTF2E2 7565 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 30769723 30770025 30769859 Y NA NA TEX15,WRN,PPP2CB,PURG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2CB 99893 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.06771514977192 chr8 30892240 30892587 30892393 Y UBXN8 PURG,WRN NA NA NA NA WRN 2923 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 30892930 30893420 30892948 Y NA PURG,WRN NA NA NA NA WRN 3613 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 33265826 33266145 33265940 Y NA NA NA NA NA NA FUT10 62795 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 33456177 33456579 33456440 Y DUSP26 RNF122,DUSP26 NA NA NA NA DUSP26 553 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr8 34078648 34078885 34078767 Y NA NA NA NA NA NA RP1-84O15.1 100275 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 34447539 34447655 34447597 Y NA NA NA NA NA NA RP1-84O15.1 268379 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 34908939 34908961 34908949 Y NA NA NA NA NA NA UNC5D 182014 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 35119361 35119644 35119503 Y UNC5D UNC5D NA NA NA NA UNC5D 28386 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 35270986 35270995 35270991 Y UNC5D NA NA NA NA NA LSM12P1 110286 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA LSM12P1 NA NA NA NA LSM12P1 1527 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.17110090726052 chr8 36136186 36136422 36136302 Y NA NA NA NA NA NA LSM12P1 754905 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr8 37643587 37643772 37643645 Y NA PROSC,GPR124 NA NA NA NA GPR124 3878 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 37656576 37656905 37656741 Y GOT1L1 PROSC,GPR124,BRF2 NA NA NA NA GPR124 16867 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 37678678 37679141 37678937 Y RAB11FIP1 GPR124,BRF2 NA NA NA NA BRF2 26281 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 37748183 37748461 37748291 Y WHSC1L1,RAB11FIP1,LETM2,LETM2 BRF2,RAB11FIP1 NA NA NA NA RAB11FIP1 6524 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 37749222 37749683 37749580 Y WHSC1L1,LETM2,LETM2,RAB11FIP1 BRF2,RAB11FIP1 NA NA NA NA RAB11FIP1 5302 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 37754518 37754975 37754800 Y NA BRF2,RAB11FIP1 NA NA NA NA RAB11FIP1 10 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 37928414 37928535 37928451 Y ADRB3,WHSC1L1 EIF4EBP1,ASH2L NA NA NA NA ASH2L 32225 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 37929132 37929304 37929218 Y NA EIF4EBP1,ASH2L NA NA NA NA ASH2L 31456 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 37961561 37961954 37961758 Y NA ASH2L NA NA NA NA ASH2L 801 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 37992032 37992208 37992120 Y NA ASH2L,BAG4,LSM1 NA NA NA NA ASH2L 31272 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 38035023 38035257 38035173 Y WHSC1L1,LETM2,LETM2,BAG4 BAG4,LSM1,DDHD2 NA NA NA NA LSM1 2775 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 38160807 38161004 38160956 Y NA PPAPDC1B NA NA NA NA PPAPDC1B 36046 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 38217250 38217535 38217393 Y NA WHSC1L1,LETM2 NA NA NA NA WHSC1L1 20255 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 38312135 38312514 38312441 Y NA FGFR1 NA NA NA NA FGFR1 11838 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr8 38313401 38313535 38313485 Y NA FGFR1 NA NA NA NA FGFR1 10817 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr8 38816649 38817007 38816807 Y NA TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA TM2D2 35336 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 41146046 41146081 41146065 Y SFRP1 SFRP1 NA NA NA NA SFRP1 18935 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr8 41153046 41153278 41153162 Y NA SFRP1 NA NA NA NA SFRP1 11738 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 41160567 41160649 41160637 Y NA SFRP1 NA NA NA NA SFRP1 4367 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr8 41445863 41446158 41445968 Y NA AGPAT6,RP11-360L9.4 NA NA NA NA RP11-360L9.4 11976 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 41462271 41462436 41462354 Y NA AGPAT6,RP11-360L9.4 NA NA NA NA RP11-360L9.4 28384 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 41775383 41775559 41775471 Y NA NA ANK1 IMR90 Hi-C 24141950 KAT6A 131949 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 41882456 41882591 41882524 Y NA KAT6A NA NA NA NA KAT6A 24917 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 41886687 41887061 41886965 Y NA KAT6A NA NA NA NA KAT6A 20447 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr8 41908079 41908836 41908505 Y POLB,IKBKB,IKBKB,AP3M2,AGPAT6,MYST3 KAT6A NA NA NA NA KAT6A 571 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 42067442 42067508 42067475 Y NA PLAT NA NA NA NA PLAT 4200 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 42370484 42370865 42370805 Y NA SLC20A2 NA NA NA NA SLC20A2 24204 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 42383718 42383741 42383730 Y NA SLC20A2 NA NA NA NA SLC20A2 11328 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 42398083 42398473 42398470 Y NA SLC20A2 NA NA NA NA SLC20A2 3014 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 42749479 42749732 42749583 Y NA MIR4469,HOOK3,RNF170 NA NA NA NA MIR4469 61 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 42951870 42952118 42951994 Y FNTA HGSNAT NA NA NA NA HGSNAT 41438 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 43092918 43093442 43093017 Y HOOK3 NA NA NA NA NA HGSNAT 99362 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 48282787 48283030 48282901 Y KIAA0146,CEBPD NA NA NA NA NA NDUFA5P12 208294 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 48311654 48311845 48311740 Y CEBPD NA NA NA NA NA RP11-697N18.2 191326 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 48350721 48350922 48350822 Y NA NA NA NA NA NA RP11-697N18.2 152249 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 48540167 48540694 48540467 Y CEBPD RP11-697N18.2 NA NA NA NA RP11-697N18.2 36996 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 48580617 48580970 48580793 Y NA NA NA NA NA NA CEBPD 68678 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 48814148 48814416 48814291 Y NA NA NA NA NA NA PRKDC 56327 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 49344700 49344905 49344800 Y NA RPL29P19 SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 49550 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 49426952 49427328 49427172 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 131802 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.24062908986315 chr8 49427546 49427722 49427633 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 132396 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr8 49494192 49494425 49494282 Y NA NA SNAI2,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 EFCAB1 151445 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr8 49606082 49606224 49606171 Y NA EFCAB1 SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 EFCAB1 39646 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 50466157 50466168 50466163 Y NA NA NA NA NA NA SNAI2 633858 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 52809491 52809887 52809877 Y PCMTD1 NA NA NA NA NA PCMTD1,RP11-110G21.1 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 53625473 53626379 53625848 Y RB1CC1 RB1CC1 NA NA NA NA RB1CC1 30024 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr8 54636276 54636450 54636366 Y NA NA NA NA NA NA ATP6V1H 117668 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 54659884 54660111 54659998 Y NA NA NA NA NA NA ATP6V1H 94007 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 54884595 54884649 54884642 Y NA TCEA1 NA NA NA NA TCEA1 48440 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 54884977 54885679 54885327 Y NA TCEA1 NA NA NA NA TCEA1 47410 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr8 54931181 54931405 54931291 Y NA TCEA1 NA NA NA NA TCEA1 1684 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 55088607 55088824 55088716 Y NA MRPL15 NA NA NA NA MRPL15 42837 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 56342291 56342398 56342345 Y NA NA NA NA NA NA TGS1 341303 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 56744320 56744391 56744354 Y TGS1 LYN NA NA NA NA LYN 45981 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 56791431 56791783 56791438 Y LYN LYN NA NA NA NA LYN 1059 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 56796346 56796794 56796413 Y LYN LYN NA NA NA NA LYN 5974 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 56842990 56843446 56843124 Y LYN NA NA NA NA NA LYN 52618 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 56903187 56904166 56903812 Y LYN NA NA NA NA NA SNORD54 80294 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 57122742 57122884 57122813 Y NA PLAG1,CHCHD7 NA NA NA NA CHCHD7 497 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 57215871 57215911 57215891 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD7 93626 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 57360424 57360919 57360645 Y SDR16C5,PENK,PENK RP11-17A4.2,PENK NA NA NA NA PENK 3131 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 58122348 58122589 58122430 Y NA NA LOC100507632,LOC100507651,LOC286177 IMR90 Hi-C 24141950 IMPAD1 217945 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 58908204 58908269 58908237 Y NA FAM110B NA NA NA NA FAM110B 3136 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 59763369 59763610 59763548 Y NA RNU4-50P NA NA NA NA RNU4-50P 38258 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 59768911 59769118 59769011 Y NA RNU4-50P NA NA NA NA RNU4-50P 43800 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 59786438 59786547 59786493 Y UBXN2B NA NA NA NA NA RNU4-50P 61327 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 59871523 59871872 59871698 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-50P 146412 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 59921030 59921384 59921260 Y NA NA NA NA NA NA RP11-25K19.1 108215 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 59949464 59949741 59949603 Y TOX NA NA NA NA NA RP11-25K19.1 79858 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 59980234 59980420 59980383 Y NA RP11-25K19.1,TOX NA NA NA NA RP11-25K19.1 49179 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 59995784 59996163 59995974 Y NA RP11-25K19.1,TOX NA NA NA NA RP11-25K19.1 33436 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 60158285 60158455 60158370 Y TOX NA NA NA NA NA TOX 128518 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 61564243 61564650 61564285 Y CA8,CHD7 CHD7 CHD7,RAB2A MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD7 24687 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 61592861 61593584 61592948 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 3524 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 61657043 61657068 61657053 Y CHD7 NA NA NA NA NA CHD7 67706 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 61660299 61660611 61660357 Y CHD7 NA NA NA NA NA CHD7 70962 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 61664874 61665035 61664955 Y NA NA NA NA NA NA CHD7 75537 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 61705362 61705819 61705615 Y NA NA NA NA NA NA CHD7 116025 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 61824831 61825142 61824996 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CLVS1 142575 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 61850490 61850754 61850677 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CLVS1 116963 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr8 61850776 61851191 61851141 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CLVS1 116526 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr8 62606389 62606706 62606619 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA ASPH 18449 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 63536458 63536860 63536645 Y NA NA NA NA NA NA GGH 412870 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 63776641 63776831 63776733 Y NA NA NA NA NA NA GGH 172899 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr8 65589993 65590291 65590142 Y NA NA NA NA NA NA CYP7B1 119027 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 65684237 65684466 65684340 Y BHLHE22,CYP7B1 CYP7B1 NA NA NA NA CYP7B1 24852 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 66641187 66641625 66641410 Y PDE7A NA NA NA NA NA MTFR1 86218 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 66652181 66652518 66652302 Y NA NA NA NA NA NA MTFR1 97212 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 67522221 67522599 67522407 Y ADHFE1,VCPIP1,MYBL1 MYBL1 NA NA NA NA MYBL1 1883 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 67566708 67566914 67566811 Y NA MYBL1,VCPIP1,C8orf44 NA NA NA NA VCPIP1 10538 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 68105132 68105308 68105276 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 111114 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 69749844 69750162 69750003 Y NA NA NA NA NA NA SULF1 626697 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 70787574 70787763 70787675 Y SLCO5A1,SLCO5A1,SLCO5A1 RP11-159H10.3,SLCO5A1 NA NA NA NA SLCO5A1 42275 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 71106642 71106934 71106707 Y NCOA2 NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 92228 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 71357346 71357735 71357541 Y NA NCOA2,RP11-333A23.1 NCOA2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-333A23.1 22535 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 71522610 71523035 71522826 Y NA TRAM1 NA NA NA NA TRAM1 3988 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 72143679 72143939 72143809 Y NA NA NA NA NA NA EYA1 128528 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 72147139 72147519 72147466 Y NA NA NA NA NA NA EYA1 124948 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr8 72187885 72188197 72188041 Y EYA1 NA NA NA NA NA EYA1 84270 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr8 72194927 72195300 72195185 Y NA NA NA NA NA NA EYA1 77167 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr8 72770493 72770720 72770591 Y MSC NA NA NA NA NA RP11-1102P16.1 268233 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 72772671 72773228 72772951 Y NA NA NA NA NA NA RP11-1102P16.1 270411 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 73139685 73140008 73139881 Y NA NA NA NA NA NA KCNB2 307618 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr8 73227505 73227652 73227579 Y NA NA NA NA NA NA KCNB2 219974 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 73481000 73481171 73481085 Y KCNB2 KCNB2 NA NA NA NA KCNB2 33374 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 73559096 73559368 73559359 Y KCNB2 NA NA NA NA NA KCNB2 111470 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 74581626 74581813 74581790 Y NA NA NA NA NA NA STAU2 76130 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 75135577 75135926 75135753 Y NA NA NA NA NA NA GDAP1 95439 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 75515244 75515546 75515314 Y NA RP11-730G20.2 NA NA NA NA RP11-730G20.2 765 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 75908161 75908345 75908173 Y NA CRISPLD1 NA NA NA NA CRISPLD1 13411 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 76131324 76131607 76131526 Y NA NA NA NA NA NA CRISPLD1 236574 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 77729936 77730258 77730097 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX4 138482 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 79674578 79674862 79674701 Y NA IL7 NA NA NA NA IL7 40896 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 79675234 79675631 79675433 Y NA IL7 NA NA NA NA IL7 40127 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 80680806 80681178 80681064 Y HEY1 HEY1 NA NA NA NA HEY1 2708 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 80696342 80696550 80696513 Y HEY1 HEY1 MRPS28,HEY1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEY1 18244 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 80696935 80697150 80697007 Y HEY1 HEY1 MRPS28,HEY1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEY1 18837 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 81034251 81034528 81034390 Y ZBTB10,TPD52 NA NA NA NA NA MRPS28 93727 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 81400222 81400395 81400296 Y ZBTB10 ZBTB10 NA NA NA NA ZBTB10 4368 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 81587419 81587669 81587654 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB10 191565 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 81615108 81615487 81615408 Y ZNF704 NA NA NA NA NA ZBTB10 219254 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr8 81639602 81640013 81639931 Y ZNF704 NA NA NA NA NA ZBTB10 243748 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr8 81671131 81671440 81671286 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB10 275277 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 81695028 81695405 81695288 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB10 299174 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr8 81699574 81699876 81699725 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB10 303720 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr8 81742521 81742946 81742703 Y NA NA NA NA NA NA PAG1 279357 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr8 81774871 81775022 81774952 Y ZNF704 NA NA NA NA NA PAG1 247281 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 81782792 81783006 81782996 Y ZBTB10,ZNF704 NA NA NA NA NA PAG1 239297 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.65417211981754 chr8 81831009 81831253 81831114 Y ZBTB10,PAG1 NA ZNF704 IMR90 Hi-C 24141950 PAG1 191050 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 86090980 86091058 86091024 Y E2F5,E2F5 E2F5,C8orf59 NA NA NA NA E2F5 3520 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 87358801 87359051 87358932 Y NA WWP1 NA NA NA NA WWP1 5834 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 87650704 87651077 87650891 Y NA NA NA NA NA NA CPNE3 155645 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 89100699 89100971 89100829 Y NA NA NA NA NA NA RP11-586K2.1 236094 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 90213226 90213534 90213296 Y NA NA NA NA NA NA RP11-37B2.1 554421 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 90741352 90741628 90741481 Y OSGIN2,RIPK2 RP11-37B2.1,RIPK2 DECR1,RIPK2,NBN IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-37B2.1 26327 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 90899646 90899998 90899819 Y RIPK2,OSGIN2 OSGIN2 OSGIN2,RIPK2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 OSGIN2 12089 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 90912887 90913271 90913166 Y NA OSGIN2 NA NA NA NA OSGIN2 800 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 90986800 90987074 90986966 Y RIPK2,OSGIN2,OSGIN2,NBN DECR1,NBN NA NA NA NA DECR1 24559 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 91064955 91065319 91065136 Y NA CALB1 NA NA NA NA CALB1 40384 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr8 92045909 92045927 92045918 Y TMEM55A TMEM55A,GS1-251I9.4,OTUD6B NA NA NA NA TMEM55A 5365 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 92112003 92112264 92112167 Y NA GS1-251I9.4,OTUD6B NA NA NA NA OTUD6B 31579 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 93037158 93037539 93037349 Y NA NA NA NA NA NA RUNX1T1 75975 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 94835578 94835753 94835625 Y NA PDP1 NA NA NA NA PDP1 32282 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 95786265 95786660 95786406 Y RAD54B,KIAA1429 INTS8 NA NA NA NA INTS8 36879 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 95896385 95896691 95896542 Y NA CCNE2 NA NA NA NA CCNE2 10215 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 95943173 95943450 95943312 Y NA CCNE2,TP53INP1,RP11-347C18.3 NA NA NA NA TP53INP1 16189 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 97173806 97174188 97174149 Y NA GDF6 NA NA NA NA GDF6 2786 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr8 97571754 97571902 97571855 Y NA NA NA NA NA NA SDC2 68175 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 98795675 98796209 98795739 Y NA LAPTM4B NA NA NA NA LAPTM4B 10390 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 98843865 98843962 98843914 Y NA RPS23P1,MATN2 NA NA NA NA RPS23P1 31320 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 98865970 98866240 98866105 Y NA RPS23P1,MATN2 NA NA NA NA RPS23P1 9042 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 99637150 99637421 99637401 Y NA NA NA NA NA NA STK3 315634 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 100808377 100808591 100808586 Y NA NA NA NA NA NA COX6C 95699 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 101731045 101731633 101731441 Y NA PABPC1 NA NA NA NA PABPC1 1404 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr8 101880714 101880933 101880768 Y ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ NA YWHAZ,ZNF706 IMR90 Hi-C 24141950 YWHAZ 82683 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 102167683 102167913 102167765 Y NA ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 48508 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 102191448 102191797 102191796 Y NA ZNF706 NA NA NA NA ZNF706 24624 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 102842210 102842224 102842217 Y NA NA NA NA NA NA NCALD 292911 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 103740665 103741062 103740742 Y NA NA KLF10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF10 74535 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 103741796 103742226 103742065 Y NA NA KLF10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF10 75666 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 103757592 103757997 103757773 Y NA NA KLF10,UBR5 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF10 91462 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 103803215 103803631 103803453 Y AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10 NA KLF10,UBR5,ODF1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KB-1507C5.2 70897 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 103858397 103858789 103858587 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 NA NA NA NA KB-1507C5.2 15739 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 103906775 103907150 103906829 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 ATP6V1C1 IMR90 Hi-C 24141950 AZIN1 2683 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 104043647 104043928 104043793 Y KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1 ATP6V1C1 NA NA NA NA ATP6V1C1 12356 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 104059632 104059708 104059689 Y NA ATP6V1C1 NA NA NA NA ATP6V1C1 28341 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 104305857 104306236 104306047 Y NA FZD6 NA NA NA NA FZD6 2425 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 104406173 104406574 104406390 Y NA CTHRC1,DCAF13,SLC25A32 NA NA NA NA DCAF13 18368 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 104553511 104553813 104553575 Y NA RIMS2,RP11-1C8.4,RP11-5A11.1 NA NA NA NA RP11-5A11.1 15804 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 104792192 104792465 104792329 Y RIMS2 NA NA NA NA NA RP11-5A11.1 222575 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 105212578 105212580 105212579 Y NA NA NA NA NA NA LRP12 386672 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 105598029 105598284 105598149 Y TM7SF4,LRP12 LRP12 NA NA NA NA LRP12 968 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr8 105716523 105716766 105716665 Y NA NA LRP12,DPYS IMR90 Hi-C 24141950 LRP12 117271 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 105983543 105983550 105983547 Y NA NA ZFPM2 IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM2 345370 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 107603836 107604153 107603995 Y NA NA NA NA NA NA TAGLN2P1 104088 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 108848123 108848219 108848185 Y NA NA NA NA NA NA RSPO2 245694 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 110288477 110288741 110288621 Y NA NA NA NA NA NA ENY2 55812 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 116660380 116660747 116660648 Y TRPS1 NA NA NA NA NA UTP23 1115995 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 117630556 117630790 117630561 Y NA NA NA NA NA NA UTP23 145952 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 117711370 117711748 117711590 Y NA NA NA NA NA NA UTP23 64994 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 118969079 118969407 118969255 Y MED30 NA NA NA NA NA EXT1 152685 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 119023512 119024035 119023740 Y EXT1 NA NA NA NA NA EXT1 98057 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 120591382 120591641 120591509 Y NA NA NA NA NA NA ENPP2 92052 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 120656261 120656532 120656398 Y NA ENPP2 ENPP2 IMR90 Hi-C 24141950 ENPP2 27161 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 121396509 121396604 121396557 Y NA NA NA NA NA NA MTBP 59036 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 121649803 121649981 121649892 Y NA NA NA NA NA NA SNTB1 173532 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 121809679 121809816 121809747 Y NA SNTB1 NA NA NA NA SNTB1 13697 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 122347775 122347860 122347818 Y NA NA NA NA NA NA HAS2 303770 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 122361097 122361402 122361250 Y NA NA HAS2 IMR90 Hi-C 24141950 HAS2 290228 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 122755244 122755615 122755430 Y NA NA NA NA NA NA HAS2 103614 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 123795111 123795992 123795667 Y C8orf76,ZHX2 ZHX2 NA NA NA NA ZHX2 3478 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 123882951 123883328 123883140 Y NA NA NA NA NA NA ZHX2 91318 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 124169504 124169661 124169520 Y NA NA NA NA NA NA C8orf76 81977 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr8 124248679 124249062 124248866 Y NA C8orf76,ZHX1 NA NA NA NA C8orf76 2576 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr8 124407044 124407322 124407183 Y NA ATAD2,WDYHV1 NA NA NA NA ATAD2 19268 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 124407455 124407786 124407574 Y FAM91A1,C8orf76,ZHX1,ATAD2 ATAD2,WDYHV1 NA NA NA NA ATAD2 18804 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 124524433 124524792 124524749 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 26654 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 125382714 125382961 125382953 Y NA NA NA NA NA NA TMEM65 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 125466570 125466668 125466619 Y NA TRMT12,RNF139-AS1,RNF139 NA NA NA NA TRMT12 5522 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 125640439 125640642 125640477 Y NA NA NA NA NA NA TATDN1 90740 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 125672540 125672913 125672841 Y NA NA NA NA NA NA MTSS1 65817 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 125683084 125683301 125683193 Y MTSS1 NA NA NA NA NA MTSS1 55429 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 125683699 125684014 125683857 Y NA NA NA NA NA NA MTSS1 54716 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 126037665 126038021 126037843 Y NA SQLE NA NA NA NA SQLE 28926 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 126112372 126112753 126112532 Y TRIB1,NSMCE2 NSMCE2,KIAA0196 NA NA NA NA KIAA0196 10290 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 126187320 126187484 126187432 Y TRIB1,KIAA0196,NSMCE2 NA NA NA NA NA KIAA0196 85238 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 126285545 126285900 126285649 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 154663 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 126372255 126372562 126372409 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 68001 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 126400704 126400965 126400873 Y NA TRIB1 TRIB1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TRIB1 39598 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 126441416 126441734 126441625 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 853 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr8 126446642 126447323 126446973 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 6079 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 126451967 126452238 126452064 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 11404 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 126452500 126452812 126452633 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 11937 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 126984156 126984525 126984411 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 543593 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 127104655 127104821 127104738 Y NA NA NA NA NA NA FAM84B 463817 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 127447013 127447387 127447083 Y FAM84B NA NA NA NA NA FAM84B 121251 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 127837362 127837443 127837401 Y FAM84B NA PVT1,MYC,LOC727677 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM84B 268724 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 127908732 127908971 127908856 Y NA NA MYC,LOC727677,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM84B 340094 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 127938432 127938773 127938643 Y NA NA NA NA NA NA FAM84B 369794 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 128099457 128099542 128099514 Y NA NA NA NA NA NA FAM84B 530819 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 128811691 128811973 128811933 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 6912 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 128821272 128821652 128821500 Y MYC PVT1 NA NA NA NA PVT1 16493 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 128822251 128823013 128822500 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 17472 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 128888391 128888698 128888485 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 83612 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 128919831 128920544 128920233 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 100313 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 128926432 128926732 128926619 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 94125 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 129002909 129003328 129003001 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 17529 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 129036981 129037022 129036995 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 16124 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 129053712 129054462 129054053 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 32855 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr8 129076309 129076777 129076518 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 55452 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 129204780 129204979 129204839 Y NA NA PVT1,MYC IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-25P 183923 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 129205979 129206284 129206246 Y NA NA PVT1,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-25P 185122 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 129659601 129660006 129659683 Y NA NA MYC MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU4-25P 638744 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 130430686 130431090 130430988 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 596285 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 130433555 130433672 130433615 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 593703 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 130640898 130641202 130641020 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 386173 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 130876466 130876830 130876577 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 150545 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 130996669 130996803 130996748 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 30572 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr8 131024148 131024528 131024501 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 2847 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 131080516 131080850 131080671 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 53141 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 131089372 131089764 131089568 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 61997 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 131134027 131134054 131134041 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 106652 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 131148484 131148822 131148654 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 121109 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 131204007 131204378 131204106 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 176632 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 131245360 131245556 131245456 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 208350 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 131271304 131271556 131271460 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 182350 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 131291188 131291588 131291505 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 162318 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 131364558 131364729 131364627 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 89177 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 131454495 131454885 131454765 Y NA ASAP1 NA NA NA NA ASAP1 589 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 131864452 131864841 131864646 Y ADCY8 NA NA NA NA NA ASAP1 410546 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 133508104 133508400 133508366 Y NA NA KCNQ3,LRRC6 IMR90 Hi-C 24141950 PHF20L1 277218 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 134103972 134104984 134104568 Y ST3GAL1,TG,SLA NA NA NA NA NA NDRG1 207281 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 135352426 135352442 135352435 Y NA NA NA NA NA NA ZFAT 370850 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 135469388 135469911 135469674 Y NA NA NA NA NA NA ZFAT 253381 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr8 135515802 135516060 135515897 Y NA NA NA NA NA NA ZFAT 207232 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 135635794 135636288 135636020 Y NA NA NA NA NA NA ZFAT 87004 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 135763975 135764179 135764077 Y NA ZFAT ZFAT MCF7 ChIA-PET 22265404 ZFAT 40683 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 135843585 135843751 135843688 Y ZFAT MIR30D ZFAT,MIR30D,MIR30B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR30D 28397 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 136476552 136476867 136476709 Y NA KHDRBS3 NA NA NA NA KHDRBS3 8852 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 136587606 136587905 136587756 Y NA NA NA NA NA NA KHDRBS3 119906 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 136623331 136623657 136623494 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-35P 129081 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 139799567 139799714 139799659 Y NA NA NA NA NA NA COL22A1 124535 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 140710203 140710577 140710390 Y KCNK9 NA NA NA NA NA TRAPPC9 756101 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 140716297 140716707 140716660 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 749971 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.96432939228333 chr8 141108929 141109987 141109387 Y KCNK9,TRAPPC9 NA NA NA NA NA TRAPPC9 356691 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr8 141110302 141110773 141110688 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 355905 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.65417211981754 chr8 141474376 141475403 141474918 Y NA TRAPPC9,CHRAC1 TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TRAPPC9 7698 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr8 141555144 141555348 141555233 Y EIF2C2,CHRAC1 CHRAC1 NA NA NA NA CHRAC1 35747 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 141607900 141608150 141608005 Y NA NA NA NA NA NA CHRAC1 88503 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr8 141608422 141608817 141608788 Y NA NA NA NA NA NA CHRAC1 89025 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 141707505 141707982 141707957 Y NA NA NA NA NA NA CHRAC1 188108 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 141804565 141804680 141804623 Y NA NA NA NA NA NA PTK2 205635 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 141886994 141887102 141887066 Y PTK2 NA NA NA NA NA PTK2 123213 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 142215999 142216277 142216212 Y DENND3,SLC45A4 NA NA NA NA NA DENND3 90622 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr8 142411426 142411896 142411690 Y DENND3,SLC45A4,PTP4A3 PTP4A3 PTP4A3,FLJ43860 IMR90 Hi-C 24141950 PTP4A3 11333 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 143353648 143353818 143353814 Y TSNARE1,BAI1 NA NA NA NA NA LINC00051 75931 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr8 143403466 143403590 143403541 Y TSNARE1 NA NA NA NA NA TSNARE1 79011 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 143421581 143421778 143421663 Y TSNARE1 NA NA NA NA NA TSNARE1 60823 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 143696778 143697162 143696893 Y NA ARC NA NA NA NA ARC 1945 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.24062908986315 chr8 143897219 143897551 143897306 Y LY6E,GLI4 LYNX1,LY6D LY6D,LYNX1,PSCA,JRK,C8orf55,LOC100288181,SLURP1,LY6E,LOC100133669 MCF7 ChIA-PET 22265404 LY6D 31211 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 144032047 144032423 144032233 Y NA NA NA NA NA NA LY6E 64976 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 144360422 144361034 144360946 Y ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696 NA NA NA NA RP13-582O9.5 826 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr8 144684263 144684410 144684337 Y NA NAPRT1,TIGD5,EEF1D,PYCRL,TSTA3,ZNF623 NA NA NA NA EEF1D 4552 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 144820199 144820570 144820386 Y RHPN1,C8orf73,FAM83H NA NA NA NA NA ZNF707 55577 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 144948428 144948782 144948624 Y EPPK1 PUF60,NRBP2 NRBP2 IMR90 Hi-C 24141950 NRBP2 26228 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 145002494 145002937 145002709 Y SPATC1,PLEC PLEC NA NA NA NA PLEC 45965 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 145025737 145026802 145026365 Y ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10 PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 22100 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr8 145549095 145549459 145549304 Y NA BOP1,HSF1,DGAT1,SCRT1,FBXL6,ADCK5 NA NA NA NA DGAT1 522 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 145558616 145559185 145558966 Y ZNF517,ZNF34,LRRC24,KIFC2,CYHR1,SCRT1 BOP1,HSF1,DGAT1,SCRT1,FBXL6,ADCK5 NA NA NA NA SCRT1 673 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 5.27267363191841 chr8 145909879 145909957 145909931 Y SCRT1,KIFC2,LRRC24,ARHGAP39,ZNF517,ZNF34 ARHGAP39 ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP39 685 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr8 145995593 145996127 145996081 Y COMMD5,COMMD5,COMMD5,ZNF34 ZNF251,ZNF34,RPL8 NA NA NA NA ZNF34 14603 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr8 146010487 146010786 146010731 Y NA ZNF251,RPL8,ZNF7 NA NA NA NA ZNF34 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr8 146058579 146058595 146058588 Y ARHGAP39 ZNF34,RPL8,ZNF7,COMMD5 NA NA NA NA ZNF7 7730 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr8 146125688 146125902 146125777 Y ZNF250 COMMD5,ZNF250,ZNF16 NA NA NA NA ZNF250 135 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 224646 225023 224847 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA2 1788319 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 278768 279182 278781 Y DOCK8,DOCK8 NA NA NA NA NA SMARCA2 1734160 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 694779 695236 694990 Y DOCK8,C9orf66,KANK1 NA NA NA NA NA SMARCA2 1318106 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 2018040 2018611 2018274 Y SMARCA2 SMARCA2 NA NA NA NA SMARCA2 4698 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 2018914 2019279 2019030 Y NA SMARCA2 NA NA NA NA SMARCA2 5572 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 2241944 2242239 2242031 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA2 228602 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr9 2279055 2279418 2279226 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA2 265713 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 2465114 2465154 2465134 Y NA NA VLDLR,FLJ35024 IMR90 Hi-C 24141950 VLDLR 154680 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 2490043 2490145 2490094 Y NA NA KIAA0020 IMR90 Hi-C 24141950 VLDLR 129689 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 2623377 2623723 2623671 Y NA VLDLR NA NA NA NA VLDLR 3543 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 2657497 2657645 2657571 Y NA VLDLR NA NA NA NA VLDLR 37663 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 2875811 2876206 2875956 Y NA KIAA0020 NA NA NA NA KIAA0020 33570 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 3507863 3508210 3507917 Y RFX3 RFX3,RP11-509J21.1 NA NA NA NA RFX3 15794 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 4083576 4083986 4083877 Y GLIS3,GLIS3 NA NA NA NA NA RP11-509J21.1 558853 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 4738592 4738723 4738708 Y NA AK3 NA NA NA NA AK3 1320 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr9 4829866 4830028 4829909 Y NA RCL1,MIR101-2 NA NA NA NA MIR101-2 18263 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 4835219 4835506 4835309 Y CDC37L1,RCL1 RCL1,MIR101-2 NA NA NA NA MIR101-2 12785 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 4855592 4855625 4855609 Y NA MIR101-2 NA NA NA NA MIR101-2 7301 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 4862153 4862558 4862241 Y NA MIR101-2 NA NA NA NA MIR101-2 13862 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 5478337 5478574 5478428 Y JAK2,KIAA1432,C9orf46,CD274 CD274 NA NA NA NA CD274 29834 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 5509549 5510003 5509837 Y C9orf46,CD274,PDCD1LG2 NA NA NA NA NA CD274 61046 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 5893266 5893397 5893330 Y MLANA NA NA NA NA NA ERMP1 62149 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 5965964 5966267 5966115 Y NA KIAA2026,RANBP6 NA NA NA NA KIAA2026 39634 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 6004392 6004777 6004642 Y NA KIAA2026,RANBP6 NA NA NA NA KIAA2026 1124 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 6485944 6485989 6485946 Y NA NA NA NA NA NA UHRF2 74793 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 6488249 6488567 6488283 Y NA NA NA NA NA NA UHRF2 77098 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 6564380 6564534 6564488 Y NA NA NA NA NA NA RP11-106A1.2 72605 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 6680895 6681975 6681336 Y UHRF2,KDM4C RP11-106A1.2,GLDC,RP11-390F4.6,KDM4C KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 36888 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.86094363479473 chr9 10446077 10446442 10446410 Y PTPRD NA NA NA NA NA PTPRD 164281 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 12779203 12779569 12779249 Y NA RP11-3L8.3 NA NA NA NA RP11-3L8.3 32775 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 12784417 12784967 12784682 Y C9orf150 RP11-3L8.3 NA NA NA NA RP11-3L8.3 27377 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 13034069 13034552 13034397 Y NA NA NFIB IMR90 Hi-C 24141950 RP11-3L8.3 221725 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr9 13237438 13237544 13237492 Y NA MPDZ NA NA NA NA MPDZ 40045 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 13248843 13249002 13248988 Y NA MPDZ NA NA NA NA MPDZ 28587 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 13278024 13278458 13278161 Y NA MPDZ NFIB IMR90 Hi-C 24141950 MPDZ 435 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr9 14096603 14096776 14096679 Y NA NA NA NA NA NA RP11-120J1.1 218308 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 14147587 14147657 14147622 Y NFIB NA NA NA NA NA RP11-120J1.1 167427 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 14213496 14213805 14213615 Y NFIB NA NA NA NA NA RP11-120J1.1 101279 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 14271164 14271559 14271500 Y NA RP11-120J1.1 NA NA NA NA RP11-120J1.1 43525 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 14301558 14301649 14301604 Y NA RP11-120J1.1 NA NA NA NA RP11-120J1.1 13435 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 14316018 14316353 14316263 Y NFIB RP11-120J1.1 NA NA NA NA RP11-120J1.1 934 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 14322295 14322910 14322674 Y ZDHHC21,NFIB RP11-120J1.1 NA NA NA NA RP11-120J1.1 7211 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 3.82527302707806 chr9 14343303 14343452 14343378 Y NFIB RP11-120J1.1 NA NA NA NA RP11-120J1.1 28219 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 14343788 14343918 14343814 Y ZDHHC21,NFIB RP11-120J1.1 NA NA NA NA RP11-120J1.1 28704 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 14344703 14345053 14344877 Y ZDHHC21,NFIB RP11-120J1.1 NA NA NA NA RP11-120J1.1 29619 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 14437606 14437932 14437918 Y NA NFIB FLJ41200,NFIB IMR90 Hi-C 24141950 NFIB 40624 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr9 15926060 15926268 15926072 Y NA NA NA NA NA NA PSIP1 417043 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 15936680 15936904 15936792 Y NA NA NA NA NA NA PSIP1 427663 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 16236430 16236757 16236598 Y NA NA BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-62F24.2 488055 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 16515842 16516452 16516406 Y NA NA NA NA NA NA RP11-62F24.2 208360 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 16709928 16710291 16710201 Y NA RP11-62F24.2 NA NA NA NA RP11-62F24.2 14521 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 16869534 16869976 16869661 Y BNC2 BNC2 NA NA NA NA BNC2 693 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 18718417 18718817 18718751 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTSL1 246525 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 19694522 19694909 19694905 Y NA NA NA NA NA NA SLC24A2 90017 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 19743951 19744256 19744139 Y SLC24A2 SLC24A2 NA NA NA NA SLC24A2 40670 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 20484725 20484943 20484834 Y NA NA NA NA NA NA MLLT3 135599 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 20532398 20532530 20532463 Y MLLT3 NA NA NA NA NA MLLT3 88012 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 21388342 21388353 21388348 Y NA NA NA NA NA NA KLHL9 54963 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 21696521 21696698 21696606 Y IFNA6,IFNA1 NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 103844 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 21699320 21699393 21699347 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 101149 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 21836477 21836868 21836612 Y NA MTAP NA NA NA NA MTAP 35935 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 21901395 21901428 21901412 Y IFNA8,IFNA1 NA NA NA NA NA CDKN2A 91872 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 21996542 21996712 21996656 Y MTAP,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2B CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 3242 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 23452489 23452846 23452665 Y NA NA NA NA NA NA ELAVL2 371489 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 26243860 26243998 26243927 Y NA NA NA NA NA NA TUSC1 567004 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 26921358 26921728 26921543 Y NA IFT74,PLAA NA NA NA NA IFT74 23309 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 26922057 26922297 26922177 Y NA IFT74,PLAA NA NA NA NA IFT74 22740 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 26946072 26946289 26946254 Y PLAA,IFT74,IFT74 IFT74,PLAA NA NA NA NA PLAA 611 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 27564116 27564302 27564198 Y C9orf72,C9orf72 MOB3B,C9orf72 NA NA NA NA C9orf72 7562 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 28539492 28539760 28539590 Y LINGO2 NA NA NA NA NA C9orf72 967628 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 28753682 28753926 28753804 Y NA NA NA NA NA NA C9orf72 1181818 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 28813062 28813251 28813159 Y NA NA NA NA NA NA C9orf72 1241198 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr9 28932604 28932646 28932625 Y NA NA NA NA NA NA C9orf72 1360740 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 29211344 29211542 29211410 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 1475561 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 29213900 29214394 29214154 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 1472709 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 5.06590211694121 chr9 29826048 29826378 29826215 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 860725 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 32535412 32535514 32535462 Y NA DDX58,TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 11090 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 32556634 32556872 32556767 Y NA DDX58,TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA TOPORS 6083 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 33023891 33023961 33023926 Y NA APTX,DNAJA1 NA NA NA NA DNAJA1 682 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 33028063 33028460 33028077 Y NA APTX,DNAJA1,SMU1 NA NA NA NA DNAJA1 4854 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 33268680 33268843 33268732 Y NA BAG1,CHMP5,NFX1 NA NA NA NA CHMP5 5740 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 33953868 33954185 33954034 Y UBE2R2,UBAP1 NA NA NA NA NA UBAP2 92762 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 34016159 34016420 34016379 Y NA UBAP2 NA NA NA NA UBAP2 30527 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 34233080 34233513 34233116 Y NA AL353662.2,RP11-571F15.3 NA NA NA NA RP11-571F15.3 10454 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 34394792 34394981 34394887 Y NA KIAA1161 NA NA NA NA KIAA1161 19941 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 34452221 34452408 34452315 Y ARID3C,ENHO,CNTFR,CNTFR,C9orf25 DNAI1 C9orf24,KIAA1161 IMR90 Hi-C 24141950 DNAI1 3004 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 34575663 34576052 34575846 Y ARID3C,KIAA1045,DNAJB5,DNAJB5,C9orf25,ENHO,CNTFR,CNTFR CNTFR,DCTN3 NA NA NA NA CNTFR 12069 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr9 34577617 34577859 34577738 Y ARID3C,DNAJB5,DNAJB5,CNTFR,CNTFR CNTFR,DCTN3 NA NA NA NA CNTFR 10262 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 34681857 34682174 34682025 Y ARID3C,IL11RA,IL11RA SIGMAR1,GALT,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5 NA NA NA NA RP11-195F19.5 17748 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 34986458 34986973 34986609 Y KIAA1539,DNAJB5 DNAJB5 NA NA NA NA DNAJB5 665 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr9 35114116 35114547 35114222 Y DNAJB5,KIAA1539 VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B NA NA NA NA FAM214B 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 35116905 35117142 35117025 Y NA VCP,FANCG,PIGO,STOML2,FAM214B,UNC13B NA NA NA NA FAM214B 2567 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 35232989 35233276 35233133 Y DNAJB5 NA NA NA NA NA UNC13B 72990 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 35603992 35604628 35604112 Y TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2 TESK1 NA NA NA NA TESK1 625 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.27448666474912 chr9 35769980 35770349 35770169 Y NA CREB3,TLN1,RGP1,GBA2,SPAG8,TMEM8B,HINT2 NA NA NA NA GBA2 21997 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 35914292 35914707 35914657 Y NA NDUFA5P4 NA NA NA NA NDUFA5P4 41101 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 36039800 36039974 36039887 Y OR2S2,RECK RECK NA NA NA NA RECK 5370 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 36040345 36040403 36040371 Y NA RECK NA NA NA NA RECK 5915 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 36140543 36140881 36140681 Y GLIPR2 GLIPR2,CLTA NA NA NA NA GLIPR2 5811 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 36166552 36166755 36166690 Y CREB3,TLN1 GLIPR2,CLTA NA NA NA NA CLTA 22098 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 36231547 36231666 36231607 Y NA CLTA,RNU4-53P,GNE NA NA NA NA RNU4-53P 34114 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 36232002 36232125 36232063 Y GNE CLTA,RNU4-53P,GNE NA NA NA NA RNU4-53P 33655 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 36471008 36471193 36471156 Y NA RNF38 RNF38,MELK IMR90 Hi-C 24141950 RNF38 14352 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 36764220 36764685 36764538 Y NA NA MELK IMR90 Hi-C 24141950 MELK 193361 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr9 36764861 36764955 36764921 Y RNF38 NA MELK IMR90 Hi-C 24141950 MELK 194002 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 36765862 36766252 36766147 Y RNF38,RNF38 NA MELK IMR90 Hi-C 24141950 MELK 195003 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.55078636232894 chr9 36951908 36952256 36952225 Y ZCCHC7,PAX5 NA NA NA NA NA ZCCHC7 166280 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 37036641 37037011 37036829 Y ZCCHC7,ZBTB5,PAX5 NA NA NA NA NA ZCCHC7 81525 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 37197498 37198123 37197885 Y NA NA NA NA NA NA ZCCHC7 78962 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 37198449 37198887 37198604 Y ZBTB5,ZCCHC7 NA NA NA NA NA ZCCHC7 79913 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 37270797 37270994 37270913 Y PAX5 NA NA NA NA NA GRHPR 149669 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 37771609 37771892 37771762 Y NA DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA DCAF10 26607 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 37773119 37773290 37773253 Y FRMPD1 DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA DCAF10 25209 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr9 37859471 37859543 37859507 Y NA NA NA NA NA NA EXOSC3 60037 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 37902777 37903120 37902949 Y NA NA NA NA NA NA EXOSC3 103343 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 37914600 37914735 37914730 Y NA NA NA NA NA NA EXOSC3 115166 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 38689769 38689953 38689855 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD18A 114565 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 66455332 66455763 66455668 Y NA NA NA NA NA NA RP11-764K9.4 1997612 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.65417211981754 chr9 66843628 66843847 66843730 Y NA NA LOC642236 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-764K9.4 1609528 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 68377347 68377469 68377407 Y NA NA NA NA NA NA RP11-764K9.4 75906 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr9 68417391 68418146 68417579 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 35229 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr9 68419808 68420298 68419990 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 33077 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr9 68423908 68424365 68424207 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 29010 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 68436364 68436652 68436508 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 16723 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 1886 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 8.68440362904208 chr9 71728196 71728449 71728285 Y NA TJP2 NA NA NA NA TJP2 5760 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr9 71789916 71790363 71790201 Y TJP2 NA NA NA NA NA TJP2 55707 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 71825244 71825637 71825441 Y NA NA NA NA NA NA TJP2 91035 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 72360056 72360394 72360281 Y NA PTAR1 NA NA NA NA PTAR1 12481 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 72837972 72838313 72838181 Y NA SMC5 NA NA NA NA SMC5 33624 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 72923580 72923722 72923651 Y SMC5 NA NA NA NA NA SMC5 51643 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 73021810 73022419 73022127 Y NA KLF9 NA NA NA NA KLF9 5121 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.7914154521921 chr9 73035561 73035945 73035863 Y KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8021 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr9 73036465 73036957 73036835 Y KLF9 KLF9 TRPM3,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8925 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 74581601 74581796 74581711 Y NA NA NA NA NA NA C9orf85 57175 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 75518800 75519107 75519099 Y NA NA NA NA NA NA ANXA1 245566 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 80091262 80091345 80091331 Y NA NA NA NA NA NA GNA14 169878 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 80325325 80325445 80325383 Y NA NA NA NA NA NA GNA14 64102 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 80911003 80911373 80911119 Y PSAT1 PSAT1 NA NA NA NA PSAT1 944 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 81341677 81341857 81341765 Y NA NA NA NA NA NA PSAT1 431618 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 81627556 81627780 81627606 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD2P9 376439 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 81641483 81641834 81641545 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD2P9 362385 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 81704987 81705355 81705134 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD2P9 298864 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 82213229 82213622 82213243 Y NA TLE4 NA NA NA NA TLE4 28541 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 84025176 84025464 84025320 Y NA NA TLE1 IMR90 Hi-C 24141950 TLE1 276756 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 85888522 85888919 85888721 Y NA NA NA NA NA NA RP11-439K3.1 56276 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 86123071 86123201 86123136 Y UBQLN1,KIF27,HNRNPK,HNRNPK FRMD3 NA NA NA NA FRMD3 28260 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 87370377 87370471 87370425 Y NA NA NA NA NA NA NTRK2 88911 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 87655610 87656099 87655899 Y NA NA NA NA NA NA NTRK2 374144 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 88264467 88264715 88264594 Y NA NA NA NA NA NA AGTPBP1 90229 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr9 88286391 88286647 88286519 Y NA NA NA NA NA NA AGTPBP1 68297 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 88588670 88588806 88588674 Y NA NAA35 NA NA NA NA NAA35 34609 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 89699545 89699882 89699714 Y NA NA NA NA NA NA CDC20P1 74978 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 90216174 90216503 90216403 Y DAPK1,CTSL1 NA NA NA NA NA RP11-40C6.2 77957 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 90279667 90279982 90279701 Y NA NA NA NA NA NA RP11-40C6.2 141450 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 91125141 91125399 91125267 Y NA NA SPIN1,SHC3,SECISBP2,CKS2 IMR90 Hi-C 24141950 SPIN1 123807 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 91152717 91153030 91152890 Y NA NA NA NA NA NA SPIN1 151383 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 91762072 91762095 91762084 Y NA SHC3 NA NA NA NA SHC3 29587 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 91795136 91795669 91795494 Y C9orf47,SHC3 SHC3 NA NA NA NA SHC3 3454 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 22.7448666474912 chr9 92036953 92037404 92037167 Y SECISBP2 NA NA NA NA NA SEMA4D 73641 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 92116297 92116830 92116600 Y NA SEMA4D SEMA4D,SECISBP2 IMR90 Hi-C 24141950 SEMA4D 5252 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 92218643 92218902 92218819 Y GADD45G GADD45G NA NA NA NA GADD45G 715 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 92276961 92277319 92277054 Y NA NA NA NA NA NA GADD45G 59033 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr9 93277850 93278071 93278025 Y NA NA NA NA NA NA DIRAS2 125315 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 93683361 93683758 93683679 Y NA NA NA NA NA NA DIRAS2 279975 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 93975322 93975401 93975365 Y NA NA NA NA NA NA AUH 146794 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 94565955 94566119 94566028 Y NA NA NA NA NA NA ROR2 144325 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 94660957 94661066 94661012 Y NA ROR2 NA NA NA NA ROR2 49378 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 94662459 94662552 94662493 Y ROR2 ROR2 NA NA NA NA ROR2 47892 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 94668024 94668724 94668369 Y ROR2 ROR2 NA NA NA NA ROR2 41720 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 94860272 94860642 94860609 Y NA SPTLC1 NA NA NA NA SPTLC1 15024 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 94872861 94873095 94872978 Y NA SPTLC1 NA NA NA NA SPTLC1 2571 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 94993084 94993195 94993158 Y NA NA NA NA NA NA IARS 60843 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 95029374 95029660 95029516 Y NA IARS NA NA NA NA IARS 24378 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 95383874 95384172 95384023 Y NA IPPK NA NA NA NA IPPK 46375 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 95388417 95388814 95388616 Y FGD3,CENPP IPPK NA NA NA NA IPPK 41733 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 95452860 95453088 95452974 Y NA IPPK NA NA NA NA IPPK 22313 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 95860928 95861146 95861059 Y IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1 C9orf89,NINJ1 NA NA NA NA C9orf89 4428 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 95880555 95880921 95880640 Y NA C9orf89,NINJ1 NA NA NA NA NINJ1 13649 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 96044305 96044695 96044445 Y NA NA NA NA NA NA C9orf129 62001 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 96049065 96049236 96049156 Y NA NA NA NA NA NA C9orf129 57460 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 96072126 96072271 96072199 Y NA C9orf129 NA NA NA NA C9orf129 34425 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 96377714 96377795 96377762 Y PHF2 PHF2 NA NA NA NA PHF2 41025 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 96434811 96435085 96434948 Y PHF2 NA NA NA NA NA PHF2 98122 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 96701891 96702241 96702065 Y NA NA NA NA NA NA PTPDC1 88835 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 96928143 96928630 96928259 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 10486 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 9706 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr9 97624826 97625112 97624969 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 137843 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 97629577 97629759 97629671 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 142594 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 97630074 97630491 97630387 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 143091 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 97631649 97631973 97631839 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 144666 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 97633078 97633398 97633277 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 146095 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 97679079 97679413 97679326 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 192096 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 97699905 97700054 97699963 Y NA NA FANCC IMR90 Hi-C 24141950 C9orf3 212922 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 97758166 97758608 97758351 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 271183 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 97770536 97771110 97770577 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 283553 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr9 97881296 97881429 97881363 Y FBP1 NA NA NA NA NA FANCC 196562 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 97966859 97967268 97967183 Y NA NA NA NA NA NA FANCC 110723 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 98218146 98218184 98218162 Y NA NA NA NA NA NA PTCH1 59155 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 98262009 98262267 98262138 Y PTCH1,PTCH1,PTCH1 PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 15072 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 98273012 98273438 98273114 Y C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1 PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 3901 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr9 98273818 98274186 98273872 Y NA PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 3153 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 98642406 98642593 98642483 Y PTCH1,PTCH1,C9orf102 LINC00476 NA NA NA NA LINC00476 6147 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 98744078 98744248 98744144 Y NA NA NA NA NA NA LINC00476 107819 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 98768233 98768612 98768423 Y NA NA NA NA NA NA LINC00476 131974 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 98888830 98888946 98888888 Y NA EIF4BP3 FANCC,FBP1,LOC158435,C9orf102 IMR90 Hi-C 24141950 EIF4BP3 17343 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 99106686 99107122 99106995 Y NA SLC35D2 NA NA NA NA SLC35D2 36870 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 99171138 99171308 99171256 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA RP11-172F4.2 3572 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 99181547 99181719 99181643 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA ZNF367 2936 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 99322452 99322838 99322645 Y ZNF782 NA HABP4 IMR90 Hi-C 24141950 CDC14B 57274 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 100199913 100200188 100200069 Y NA TDRD7 NA NA NA NA TDRD7 27681 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 100264469 100265020 100264497 Y NA TMOD1 NA NA NA NA TMOD1 3007 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 100319967 100320340 100320265 Y TMOD1,TMOD1 NA NA NA NA NA TMOD1 58505 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 100432763 100433089 100432926 Y TSTD2,XPA NCBP1,TSTD2,XPA NA NA NA NA XPA 24550 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 100454693 100454853 100454773 Y TSTD2,XPA XPA NA NA NA NA XPA 2786 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 100455337 100455352 100455343 Y NA XPA NA NA NA NA XPA 2287 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 100565577 100566264 100565821 Y CORO2A,FOXE1 NA FOXE1,C9orf156 IMR90 Hi-C 24141950 XPA 107938 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 100772550 100772875 100772560 Y NA ANP32B,NANS NANS,TRIM14 IMR90 Hi-C 24141950 ANP32B 28907 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 100788386 100788828 100788550 Y NA ANP32B,NANS NA NA NA NA NANS 28193 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 100860253 100860371 100860321 Y C9orf156 NANS,TRIM14 NA NA NA NA TRIM14 19123 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 100880203 100880431 100880317 Y C9orf156,HEMGN,TRIM14,TRIM14 TRIM14 NA NA NA NA TRIM14 709 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 100931425 100931550 100931485 Y C9orf156 CORO2A NA NA NA NA CORO2A 21372 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 101868249 101868435 101868378 Y NA TGFBR1 NA NA NA NA TGFBR1 3929 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 101973951 101974336 101974174 Y NA ALG2,SEC61B NA NA NA NA ALG2 7902 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 102006739 102006945 102006777 Y NA ALG2,SEC61B NA NA NA NA SEC61B 24393 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 102580616 102580992 102580865 Y NA RP11-554F20.1,NR4A3 NA NA NA NA RP11-554F20.1 445 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 102646895 102646933 102646914 Y NA STX17 NA NA NA NA STX17 19982 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 103173830 103174136 103174107 Y NA TMEFF1 C9orf30-TMEFF1,TEX10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEFF1 28424 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 103253539 103253903 103253550 Y NA NA MURC IMR90 Hi-C 24141950 TMEFF1 50979 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 105248809 105248820 105248818 Y NA NA NA NA NA NA GRIN3A 749947 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 109623887 109624414 109624068 Y ZNF462 ZNF462 NA NA NA NA ZNF462 509 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 109626456 109627144 109627032 Y NA ZNF462 NA NA NA NA ZNF462 3078 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 110109718 110109795 110109757 Y NA NA NA NA NA NA RAD23B 66300 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 110275711 110275985 110275817 Y KLF4 KLF4,RP11-438P9.1 NA NA NA NA RP11-438P9.1 18686 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 110512153 110512586 110512216 Y KLF4 NA KLF4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-438P9.1 217482 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 111313727 111314112 111313882 Y NA NA KLF4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-220D10.1 73001 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 111759404 111759745 111759575 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 14064 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 111773643 111773659 111773652 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 150 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 112578065 112578653 112578312 Y PALM2 PALM2-AKAP2,AKAP2 NA NA NA NA AKAP2 37296 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 113014576 113014999 113014920 Y AKAP2,TXN TXN NA NA NA NA TXN 1921 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 113646742 113646840 113646791 Y NA NA NA NA NA NA LPAR1 152141 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 113681942 113682364 113682085 Y NA NA NA NA NA NA LPAR1 116617 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 113753501 113753784 113753656 Y NA LPAR1 NA NA NA NA LPAR1 45197 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 113783956 113784262 113784109 Y NA LPAR1 NA NA NA NA LPAR1 14719 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 114111620 114111657 114111640 Y OR2K2 NA NA NA NA NA KIAA0368 133368 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 114700203 114700566 114700273 Y DNAJC25,GNG10,SUSD1,ROD1,HSDL2 UGCG NA NA NA NA UGCG 43157 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 114783014 114783329 114783192 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 125968 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 114790542 114790702 114790622 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 133496 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 114790932 114791388 114791198 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 133886 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 115110736 115110930 115110781 Y NA PTBP3,HSDL2 NA NA NA NA PTBP3 16789 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 115294232 115294441 115294354 Y NA KIAA1958,C9orf147 NA NA NA NA C9orf147 46748 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 115470219 115470249 115470232 Y ROD1,HSDL2,C9orf80 RP11-276E15.4,SNX30 NA NA NA NA RP11-276E15.4 40487 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 115757286 115757809 115757590 Y NA ZNF883 NA NA NA NA ZNF883 14698 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr9 116281787 116282895 116282664 Y NA NA NA NA NA NA RGS3 76776 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 116728685 116728905 116728795 Y AMBP NA NA NA NA NA ZNF618 92123 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 117125723 117126093 117125808 Y DFNB31,DFNB31,AKNA NA NA NA NA NA DFNB31 139637 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 117134599 117134885 117134873 Y NA NA NA NA NA NA DFNB31 130845 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 117147567 117148178 117147802 Y DFNB31,DFNB31,ATP6V1G1,ORM2,AKNA NA NA NA NA NA DFNB31 117552 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 117159955 117160026 117159991 Y NA NA NA NA NA NA DFNB31 105704 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 117716098 117716662 117716365 Y DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8 NA LOC100505478,AKNA,DFNB31,ATP6V1G1,C9orf91,TNC,TNFSF15,TNFSF8 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 161874 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 118917854 118918405 118917899 Y PAPPA NA NA NA NA NA TRIM32 529176 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 119018286 119018486 119018325 Y PAPPA NA NA NA NA NA TRIM32 429095 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 119055041 119055304 119055148 Y PAPPA NA NA NA NA NA TRIM32 392277 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 119084686 119084813 119084781 Y NA NA NA NA NA NA TRIM32 362768 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 119311432 119311888 119311785 Y NA NA NA NA NA NA TRIM32 135693 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 119404408 119404429 119404420 Y NA TRIM32 NA NA NA NA TRIM32 43152 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr9 119466124 119466469 119466162 Y NA TRIM32 NA NA NA NA TRIM32 18543 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 119722130 119722198 119722164 Y NA NA NA NA NA NA TRIM32 274549 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 119722499 119722767 119722633 Y NA NA NA NA NA NA TRIM32 274918 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 119856579 119856832 119856800 Y NA NA NA NA NA NA ASTN2 318516 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 120162627 120162904 120162792 Y NA ASTN2 NA NA NA NA ASTN2 12444 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 120175638 120175763 120175745 Y ASTN2 ASTN2 NA NA NA NA ASTN2 290 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.75755787730614 chr9 120176306 120176455 120176377 Y NA ASTN2 NA NA NA NA ASTN2 958 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 120680016 120680381 120680199 Y NA NA NA NA NA NA ASTN2 504668 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 120884663 120884980 120884821 Y NA NA NA NA NA NA ASTN2 709315 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 122914670 122914945 122914761 Y NA NA NA NA NA NA CDK5RAP2 425503 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 122984020 122984078 122984028 Y NA NA NA NA NA NA CDK5RAP2 356370 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 123251976 123252022 123252001 Y CDK5RAP2 NA NA NA NA NA CDK5RAP2 88426 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 123346430 123346633 123346540 Y TRAF1 CDK5RAP2 CDK5RAP2 K562 ChIA-PET 22265404 CDK5RAP2 5982 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 123640419 123640826 123640772 Y NA PSMD5,PHF19 NA NA NA NA PHF19 2813 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 123878647 123878673 123878659 Y NA CNTRL NA NA NA NA CNTRL 43506 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 124361597 124361984 124361689 Y NA DAB2IP NA NA NA NA DAB2IP 34261 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.96432939228333 chr9 124664946 124665174 124665060 Y DAB2IP NA NA NA NA NA TTLL11 188711 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 124704763 124705076 124704868 Y TTLL11,MRRF,DAB2IP NA NA NA NA NA TTLL11 148809 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 125654025 125654372 125654281 Y NA RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,RABGAP1 NA NA NA NA RC3H2 11248 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 125663245 125663345 125663303 Y NA RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,RABGAP1 NA NA NA NA RC3H2 2275 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 125811144 125811514 125811213 Y NA NA MIR600HG IMR90 Hi-C 24141950 RABGAP1 110032 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 125869246 125869355 125869301 Y OR1L3,OR1K1,GPR21 NA NA NA NA NA STRBP 159500 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 126029655 126030141 126030108 Y NA STRBP NA NA NA NA STRBP 800 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 126119304 126119701 126119598 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 90449 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 126160444 126160608 126160526 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 131589 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 126169211 126169592 126169399 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 140356 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 126237774 126237937 126237796 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 208919 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 126297071 126297260 126297221 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 268216 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 126446407 126446440 126446424 Y NA NA NA NA NA NA DENND1A 243991 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 126597388 126597650 126597587 Y DENND1A NA NA NA NA NA DENND1A 92781 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 126624648 126624917 126624783 Y NA NA NA NA NA NA DENND1A 65514 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 126632279 126632299 126632291 Y NA NA NA NA NA NA DENND1A 58132 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 126959399 126959957 126959825 Y DENND1A NA DENND1A,NEK6 IMR90 Hi-C 24141950 NEK6 57928 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 127165878 127166187 127166033 Y NA PSMB7 NA NA NA NA PSMB7 9536 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 127466904 127467345 127467172 Y NA MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 48158 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 127468042 127468336 127468195 Y NA MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 49296 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 127475055 127475439 127475319 Y NA NA NA NA NA NA NR6A1 56150 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 127509473 127509808 127509481 Y NA NR6A1 NA NA NA NA NR6A1 21781 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 127519728 127520109 127519909 Y NA NR6A1 NA NA NA NA NR6A1 11480 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 127947242 127947259 127947251 Y NA SCAI,PPP6C,RABEPK NA NA NA NA PPP6C 2959 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 127980597 127980978 127980790 Y NA PPP6C,RABEPK,HSPA5,RP11-65N13.8,GAPVD1 NA NA NA NA RABEPK 19776 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 128172483 128172773 128172647 Y NA NA PBX3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GAPVD1 150410 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 128211957 128212104 128212028 Y NA NA NA NA NA NA GAPVD1 189884 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 128433867 128434078 128433973 Y NA MAPKAP1 NA NA NA NA MAPKAP1 33435 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 128592115 128592428 128592308 Y PBX3 NA NA NA NA NA PBX3 84491 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 128651913 128652195 128652163 Y FAM125B NA NA NA NA NA PBX3 144289 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 129263295 129263658 129263477 Y FAM125B,RALGPS1,RALGPS1,LMX1B NA NA NA NA NA ZBTB43 301627 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 129285503 129285639 129285571 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB43 279646 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr9 129481833 129482256 129482109 Y ZBTB43,ZBTB34 NA NA NA NA NA ZBTB43 83029 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chr9 129483874 129484165 129483990 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB43 81120 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 129484571 129485188 129484881 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB43 80097 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.55078636232894 chr9 129485609 129485808 129485757 Y FAM125B,ZBTB34 NA NA NA NA NA ZBTB43 79477 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chr9 129495309 129495335 129495322 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB43 69950 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 129889359 129889542 129889416 Y NA ANGPTL2 NA NA NA NA ANGPTL2 6197 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 130329548 130329691 130329605 Y PTRH1,FPGS,FPGS,ENG,CDK9,FAM129B,FAM129B FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 9577 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 130341922 130342377 130342071 Y NA FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 2654 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 130461605 130461892 130461787 Y GARNL3,STXBP1,ST6GALNAC6,SLC25A25,PIP5KL1,TTC16 MIR3911,PTRH1,TOR2A NA NA NA NA MIR3911 10531 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 130590782 130591142 130590862 Y FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS CDK9,FPGS,ENG,AK1 NA NA NA NA ENG 23893 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr9 130595798 130596243 130596054 Y FAM129B,TOR2A,SH2D3C,CDK9,FPGS,FPGS CDK9,FPGS,ENG,AK1 NA NA NA NA ENG 18792 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 130627836 130628198 130628079 Y NA ENG,AK1,ST6GALNAC6,ST6GALNAC4 NA NA NA NA AK1 9824 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 130730158 130730541 130730220 Y NA DPM2,FAM102A NA NA NA NA FAM102A 10251 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 130731999 130732057 130732026 Y SLC25A25,DPM2,FAM102A DPM2,FAM102A NA NA NA NA FAM102A 8735 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 130733227 130733464 130733411 Y SLC25A25,NAIF1,DPM2,FAM102A DPM2,FAM102A NA NA NA NA FAM102A 7328 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 130733540 130734011 130733863 Y SLC25A25,NAIF1,DPM2,FAM102A,FAM102A DPM2,FAM102A NA NA NA NA FAM102A 6781 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 130736209 130736450 130736330 Y NA DPM2,FAM102A NA NA NA NA FAM102A 4342 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 130834459 130834744 130834726 Y NA SLC25A25,NAIF1 NA NA NA NA NAIF1 5974 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 130834970 130835273 130835056 Y FAM129B,TOR2A,SH2D3C,CDK9,SLC25A25 SLC25A25,NAIF1 NA NA NA NA NAIF1 6485 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 130992546 130992666 130992589 Y SPTAN1,SH2D3C,SH2D3C,ST6GALNAC6,SLC25A25,DNM1,CIZ1 DNM1,CIZ1,SWI5,GOLGA2 NA NA NA NA CIZ1 27884 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 131007254 131007504 131007363 Y URM1,CERCAM,FPGS,FPGS,ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,PIP5KL1,CIZ1 DNM1,CIZ1,SWI5,GOLGA2 NA NA NA NA SWI5 28154 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 131127114 131127521 131127297 Y SLC25A25 COQ4,TRUB2,SLC27A4,URM1,CERCAM NA NA NA NA URM1 4077 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 131316865 131317367 131316977 Y NA RP11-216B9.6,SPTAN1 NA NA NA NA SPTAN1 3999 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 131645612 131645749 131645679 Y NA LRRC8A,CCBL1,PHYHD1 NA NA NA NA CCBL1 2839 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 131788763 131789149 131789046 Y SH3GLB2 SH3GLB2,FAM73B NA NA NA NA SH3GLB2 181 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 131909035 131909223 131909126 Y PHYHD1 PPP2R4,CRAT,IER5L NA NA NA NA IER5L 29317 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 131936354 131936600 131936398 Y METTL11A,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4 IER5L NA NA NA NA IER5L 1940 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 131937094 131937487 131937262 Y PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L IER5L NA NA NA NA IER5L 1053 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr9 131988173 131988389 131988342 Y NA IER5L LOC100506190,IER5L,METTL11A,PPP2R4,ASB6,SH3GLB2,CRAT,C9orf106,C9orf50 IMR90,K562,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 IER5L 49633 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 132114489 132114812 132114671 Y NA C9orf106,RP11-65J3.1 PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A,C9orf50 MCF7,HELA,K562,IMR90 ChIA-PET,5C,Hi-C 22265404,22955621,24141950 RP11-65J3.1 21910 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 132171147 132171349 132171255 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 72381 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 67404 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 3.10157272465789 chr9 132189846 132190422 132190182 Y NA NA C9orf106,C9orf50,PPP2R4,LOC100506190 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00963 53308 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 132221518 132221749 132221614 Y USP20,USP20,C9orf78 LINC00963 PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 21981 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 132223086 132223659 132223410 Y C9orf106,TOR1B LINC00963 PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106,C9orf50,METTL11A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 20071 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 132244062 132244824 132244277 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 332 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 132257886 132258547 132258348 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 14156 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr9 132312044 132312247 132312152 Y NA NA DOLPP1,LOC100506190,FAM73B,IER5L,CRAT,PPP2R4,C9orf106,C9orf50,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 68314 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 132349858 132350089 132350073 Y NA NA LOC100506190,IER5L,C9orf50 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-483H20.4 50666 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 132372165 132372686 132372524 Y NA RP11-483H20.4,ASB6 NA NA NA NA RP11-483H20.4 28069 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 132429420 132429769 132429595 Y C9orf50,PRRX2 RP11-483H20.4,ASB6,PRRX2 NA NA NA NA PRRX2 3500 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 132459422 132459648 132459595 Y NA PRRX2 NA NA NA NA PRRX2 33502 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 132460473 132461091 132460806 Y ASB6,PRRX2 PRRX2 NA NA NA NA PRRX2 34553 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 132537165 132537327 132537245 Y FNBP1,TOR1B PTGES,TOR1B,TOR1A PPP2R4,PRRX2,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20,TOR1B,TOR1A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTGES 23839 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 132568357 132568650 132568524 Y TOR1B TOR1B,TOR1A,USP20,C9orf78 NA NA NA NA TOR1B 4925 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 132707337 132707718 132707526 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1 95755 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 132754435 132754683 132754561 Y USP20,USP20,FNBP1 FNBP1 NA NA NA NA FNBP1 48790 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 132757819 132758165 132758070 Y TOR1B,FNBP1 FNBP1 NA NA NA NA FNBP1 45308 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 132802902 132803300 132803100 Y ASB6,USP20,USP20,FNBP1 FNBP1,GPR107 NA NA NA NA FNBP1 173 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 132807262 132807460 132807345 Y USP20,USP20 FNBP1,GPR107 NA NA NA NA FNBP1 3789 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 132847110 132847326 132847217 Y USP20,USP20 FNBP1,GPR107 NA NA NA NA GPR107 33405 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 132963704 132964128 132963904 Y NCS1 NCS1 NA NA NA NA NCS1 30847 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 132976727 132976899 132976847 Y NA NCS1 NA NA NA NA NCS1 43870 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 133321021 133321306 133321114 Y ASS1 ASS1 NA NA NA NA ASS1 2705 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr9 133342925 133343088 133343007 Y PRDM12 ASS1 NA NA NA NA ASS1 24609 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 133565449 133565699 133565571 Y NA RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1 NA NA NA NA EXOSC2 1409 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr9 133721311 133721454 133721341 Y NA NA NA NA NA NA ABL1 133978 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 133736245 133736518 133736410 Y ABL1 NA NA NA NA NA ABL1 148912 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 134114047 134114338 134114158 Y NA PPAPDC3 NA NA NA NA PPAPDC3 48743 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.75755787730614 chr9 134510539 134511032 134510903 Y RAPGEF1,RAPGEF1 NA NA NA NA NA RAPGEF1 102429 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 134600757 134600889 134600837 Y RAPGEF1,NTNG2 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 12572 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 134609553 134609906 134609765 Y FAM78A,PRRC2B,RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 3555 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 134714946 134715332 134715277 Y NA NA NA NA NA NA RAPGEF1 101485 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 134770006 134770262 134770128 Y NA NA NA NA NA NA RAPGEF1 156545 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 134773213 134773507 134773412 Y NA NA NA NA NA NA RAPGEF1 159752 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 134908976 134909021 134908999 Y NA MED27 NA NA NA NA MED27 44274 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 135016724 135016887 135016786 Y NA NTNG2 MED27,RAPGEF1,NTNG2,SETX IMR90 Hi-C 24141950 NTNG2 18447 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 135197315 135197652 135197484 Y NA SETX NA NA NA NA SETX 30720 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 135279793 135280144 135280078 Y TTF1 TTF1 NA NA NA NA TTF1 65 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 135335367 135335561 135335464 Y NA NA NA NA NA NA TTF1 55158 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 135442917 135443010 135442964 Y NA NA NA NA NA NA GTF3C4 100412 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 135460369 135460861 135460532 Y NA NA NA NA NA NA GTF3C4 82561 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 135818615 135818626 135818622 Y RALGDS,C9orf96 TSC1 NA NA NA NA TSC1 595 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr9 135994562 135994927 135994701 Y ADAMTSL2,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 42374 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 135995063 135995322 135995085 Y RALGDS,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 41979 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 2.58464393721491 chr9 135999727 136000118 136000091 Y SLC2A6,RPL7A,RALGDS,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 37183 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 136008698 136009031 136008833 Y ADAMTSL2,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 28270 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chr9 136009131 136009458 136009277 Y GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 27843 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 136019465 136020353 136020023 Y NA RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 16948 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 136075454 136075720 136075558 Y NA RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA GBGT1 38122 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 136226163 136226469 136226316 Y NA SURF6,MED22,RPL7A,SNORD36A,SNORD36C,SURF2,SURF1,SURF4,C9orf96 NA NA NA NA SURF1 4611 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 136284309 136284583 136284382 Y C9orf96 SURF4,C9orf96,ADAMTS13,REXO4 NA NA NA NA REXO4 3145 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 136292897 136293168 136293034 Y SLC2A6,RALGDS ADAMTS13,REXO4,SLC2A6 NA NA NA NA REXO4 11733 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 136475001 136475406 136475372 Y ADAMTSL2,FAM163B DBH C9orf96,SURF4,VAV2,TMEM8C,ADAMTSL2,DBH,SARDH IMR90 Hi-C 24141950 DBH 24076 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 136738611 136738757 136738701 Y NA NA NA NA NA NA VAV2 116969 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 136739075 136739598 136739373 Y VAV2 NA NA NA NA NA VAV2 116128 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 136746393 136746610 136746453 Y VAV2 NA NA NA NA NA VAV2 109116 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 136800116 136800268 136800192 Y C9orf7 NA NA NA NA NA VAV2 55458 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 136820460 136820750 136820516 Y SARDH VAV2 NA NA NA NA VAV2 34976 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 136856624 136856782 136856656 Y VAV2 VAV2,LINC00094 NA NA NA NA VAV2 898 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 136999790 136999893 136999856 Y NA WDR5 NA NA NA NA WDR5 1303 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 137030495 137030803 137030732 Y NA WDR5 NA NA NA NA WDR5 32008 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 137250651 137250992 137250728 Y NA RXRA NA NA NA NA RXRA 43707 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 137257724 137257990 137257923 Y RXRA NA NA NA NA NA RXRA 50780 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 137267558 137268069 137267755 Y NA NA NA NA NA NA RXRA 60614 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 137367331 137367474 137367390 Y COL5A1 NA COL5A1 IMR90 Hi-C 24141950 RXRA 160387 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 137598866 137599219 137599002 Y NA NA NA NA NA NA COL5A1 67246 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 137980289 137980456 137980357 Y NA OLFM1 NA NA NA NA OLFM1 15021 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 138016639 138016801 138016720 Y NA NA NA NA NA NA OLFM1 51371 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 138233554 138233668 138233594 Y NA NA OLFM1 IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R26 135257 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 138348639 138348707 138348673 Y NA PPP1R26,MRPS2,C9orf116 NA NA NA NA PPP1R26 20218 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 138540539 138540770 138540645 Y NA NA GLT6D1,KCNT1 IMR90 Hi-C 24141950 C9orf116 148959 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 138624743 138624998 138624873 Y KCNT1 NA NA NA NA NA CAMSAP1 172076 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 138643149 138643429 138643239 Y KCNT1 NA NA NA NA NA CAMSAP1 153645 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 138666183 138666357 138666270 Y NA NA NA NA NA NA CAMSAP1 130717 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 138764440 138764927 138764627 Y NA CAMSAP1,RP11-432J22.2 NA NA NA NA CAMSAP1 32147 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 138778583 138778765 138778659 Y KCNT1 CAMSAP1,RP11-432J22.2 NA NA NA NA CAMSAP1 18309 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 138780125 138780291 138780208 Y CAMSAP1 CAMSAP1,RP11-432J22.2 NA NA NA NA CAMSAP1 16783 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 138884665 138885093 138884961 Y NA UBAC1 NA NA NA NA UBAC1 33439 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 138915703 138915918 138915811 Y NA NA NA NA NA NA UBAC1 64477 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 139024359 139024752 139024554 Y NA NACC2,C9orf69 C9orf69 MCF7 ChIA-PET 22265404 C9orf69 15628 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 139608163 139608561 139608378 Y EGFL7,EGFL7,NPDC1,FAM69B FAM69B,SNHG7 NA NA NA NA FAM69B 3141 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 139608810 139609132 139608936 Y SNAPC4,INPP5E,EGFL7,EGFL7,FAM69B FAM69B,SNHG7 NA NA NA NA FAM69B 3788 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 139826661 139826850 139826762 Y NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2 FBXW5,PTGDS NA NA NA NA FBXW5 10298 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.13724333237456 chr9 140022067 140022152 140022137 Y EHMT1,WDR85,NDOR1,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,GRIN1,MIR3621 NA NA NA NA GRIN1 8690 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 140023271 140023604 140023504 Y EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,GRIN1,MIR3621 NA NA NA NA GRIN1 7238 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7,GRIN1,MIR3621 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 GRIN1 6451 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 18.5060505904587 chr9 140047623 140048201 140047695 Y NA DPP7,GRIN1,MIR3621,ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1 NA NA NA NA MIR3621 13521 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chr9 140101916 140102100 140102008 Y C9orf172,FUT7 MIR3621,ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA NDOR1 3769 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA C9orf169 501 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.86094363479473 chr9 140134697 140134985 140134927 Y C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3 TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 1032 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chr9 140143070 140143291 140143174 Y LCNL1,ABCA2,SLC34A3 TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 9405 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 140189199 140189592 140189229 Y NA NRARP NA NA NA NA NRARP 5111 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chr9 140274735 140275080 140274933 Y CACNA1B,PTGDS,ABCA2,GRIN1,RNF208,PNPLA7 EXD3,NOXA1 NA NA NA NA EXD3 40634 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 140312019 140312179 140312116 Y LCNL1,ABCA2,FAM166A,C9orf173 EXD3,NOXA1 NA NA NA NA EXD3 3535 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chr9 140412995 140413413 140413155 Y CACNA1B,ABCA2,ENTPD2,GRIN1,RNF208,PNPLA7 PNPLA7,MRPL41 NA NA NA NA PNPLA7 29573 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 140463644 140464019 140463889 Y FAM166A,C9orf173 PNPLA7,MRPL41,ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1 NA NA NA NA ZMYND19 18923 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 140565381 140565755 140565635 Y NRARP NA NA NA NA NA EHMT1 53937 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chr9 140618604 140618831 140618749 Y NA NA NA NA NA NA EHMT1 107160 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chr9 140689053 140689448 140689207 Y NA NA NA NA NA NA CACNA1B 80793 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 3732842 3733263 3733002 Y PRKX NA NA NA NA NA PRKX 103193 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chrX 3870962 3871082 3871022 Y NA NA NA NA NA NA PRKX 241313 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 9433838 9434425 9434365 Y TBL1X TBL1X NA NA NA NA TBL1X 4503 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chrX 9536624 9537203 9536862 Y TBL1X,TBL1X NA NA NA NA NA TBL1X 107289 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 9701264 9701389 9701313 Y NA NA NA NA NA NA RP11-98L4.1 84120 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 10135694 10135962 10135820 Y NA CLCN4 NA NA NA NA CLCN4 12670 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 10161663 10162021 10162010 Y NA CLCN4 NA NA NA NA CLCN4 38639 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 12996273 12996492 12996427 Y NA TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 5046 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 12996518 12996966 12996772 Y NA TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 5291 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 14262210 14262757 14262259 Y NA NA NA NA NA NA GEMIN8 216198 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 16203717 16204054 16203956 Y NA RPL6P30 CTPS2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL6P30 11358 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 16805192 16805460 16805250 Y TXLNG TXLNG NA NA NA NA TXLNG 2642 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 16900871 16900973 16900947 Y TXLNG RBBP7,RNU4-6P RBBP7,TXLNG MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNU4-6P 9481 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 17395556 17395647 17395622 Y NHS NHS NA NA NA NA NHS 4013 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 18530059 18530229 18530144 Y NA NA NA NA NA NA CDKL5 88356 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 18693104 18693424 18693141 Y PHKA2,CDKL5 PPEF1 NA NA NA NA PPEF1 1075 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chrX 19580626 19581004 19580815 Y NA MAP3K15 NA NA NA NA MAP3K15 49247 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 19701008 19701387 19701257 Y SH3KBP1 NA NA NA NA NA MAP3K15 169629 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 19893071 19893438 19893374 Y NA SH3KBP1 NA NA NA NA SH3KBP1 10281 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chrX 20154251 20154286 20154269 Y NA MAP7D2,EIF1AX NA NA NA NA EIF1AX 3676 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 20281516 20281702 20281609 Y SH3KBP1,SH3KBP1,RPS6KA3 RPS6KA3 NA NA NA NA RPS6KA3 1821 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 20283183 20283718 20283506 Y SH3KBP1,RPS6KA3 NA NA NA NA NA RPS6KA3 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 20472378 20472495 20472437 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KA3 188855 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 22708356 22708573 22708502 Y NA NA NA NA NA NA PTCHD1 641560 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 22914204 22914355 22914279 Y NA NA NA NA NA NA PTCHD1 435778 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 23800091 23800377 23800148 Y NA ACOT9,SAT1 NA NA NA NA SAT1 801 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 24044003 24044417 24044292 Y ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,PDK3,ACOT9,SAT1 EIF2S3 NA NA NA NA EIF2S3 26416 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 24751355 24751521 24751438 Y NA POLA1 NA NA NA NA POLA1 41319 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 26656235 26656312 26656257 Y NA NA NA NA NA NA HMGA1P1 107834 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 31848875 31849137 31848986 Y NA NA NA NA NA NA TAB3 857674 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 38206429 38206721 38206558 Y MID1IP1,RPGR RPGR NA NA NA NA RPGR 21612 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 39018443 39018533 39018484 Y NA NA NA NA NA NA MID1IP1 359758 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 39614973 39615267 39615108 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 30123 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 39646201 39646652 39646229 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 811 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 39680161 39680842 39680511 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 34771 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 39873339 39874259 39873676 Y NA AC092198.1 BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AC092198.1 6810 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.65417211981754 chrX 39953769 39954197 39953849 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 80385 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chrX 39964528 39964690 39964611 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 69892 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 39965558 39965902 39965820 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 68680 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chrX 39966584 39967157 39966963 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 67425 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 39968308 39968728 39968376 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65854 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chrX 39968932 39969265 39969200 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65317 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 40005202 40005365 40005305 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 29217 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 40011614 40011816 40011787 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 22766 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 40013089 40013254 40013186 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 21328 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.75755787730614 chrX 40014046 40014813 40014331 Y BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 19769 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chrX 40015911 40016135 40015987 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 18447 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 40032962 40033837 40033453 Y BCOR,CXorf38,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 745 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chrX 40034377 40034649 40034428 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 40034694 40035505 40035056 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 112 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chrX 40132742 40132979 40132844 Y ATP6AP2 NA BCOR K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 98160 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chrX 40943673 40944218 40943773 Y CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X USP9X NA NA NA NA USP9X 785 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chrX 41182589 41182765 41182693 Y NA DDX3X DDX3X IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDX3X 7886 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 41759638 41759871 41759773 Y NA CASK NA NA NA NA CASK 20845 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 43576697 43576992 43576709 Y NA NA NA NA NA NA MAOA 63230 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 43577926 43578322 43578048 Y NA NA NA NA NA NA MAOA 64459 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 43579100 43579475 43579156 Y NA NA NA NA NA NA MAOA 65633 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 43888590 43889088 43888779 Y EFHC2 NA NA NA NA NA EFHC2 311830 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chrX 44733657 44734406 44734027 Y KDM6A KDM6A NA NA NA NA KDM6A 2900 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 46278987 46279293 46279130 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 18856 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 46316672 46316948 46316811 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 18523 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 46338861 46339028 46338937 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 40712 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 46436763 46437171 46436936 Y RP2,ZNF674,CHST7 ZNF674,CHST7 NA NA NA NA CHST7 5544 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 46773328 46773680 46773526 Y NA NA NA NA NA NA RP2 78953 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 46989082 46989431 46989227 Y NA RBM10,NDUFB11 NA NA NA NA RBM10 12837 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chrX 47221453 47221809 47221639 Y USP11,ZNF81,SYN1 NA UBA1,USP11 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF41 118536 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 47382833 47383145 47382966 Y SYN1,SPACA5,CFP,CFP ZNF41,NUS1P1,ARAF UBA1,ZNF41,USP11,CDK16 IMR90 Hi-C 24141950 NUS1P1 11951 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chrX 47423323 47423681 47423373 Y CDK16,CFP,CFP,ARAF ARAF,TIMP1 NA NA NA NA ARAF 4807 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 47438054 47438403 47438273 Y CFP,CFP,ARAF ARAF,TIMP1,SYN1 NA NA NA NA TIMP1 1309 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 48571837 48572283 48571996 Y TBC1D25,PQBP1,PIM2,OTUD5,GRIPAP1 SUV39H1 NA NA NA NA SUV39H1 19892 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chrX 48748801 48749222 48749175 Y NA PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2 NA NA NA NA PQBP1 3973 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 48794332 48794681 48794452 Y PORCN,TBC1D25,WAS,PQBP1,TFE3,PPP1R3F,FOXP3,PIM2,OTUD5,OTUD5,GRIPAP1 PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2,OTUD5,KCND1 NA NA NA NA OTUD5 18967 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 49012442 49012818 49012676 Y NA GPKOW,PLP2,SYP MAGIX,PLP2 IMR90 Hi-C 24141950 PLP2 13455 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chrX 49108550 49108714 49108667 Y PIM2,PPP1R3F,FOXP3 CCDC22,PPP1R3F NA NA NA NA PPP1R3F 15592 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chrX 49139256 49139619 49139438 Y FOXP3,PPP1R3F CCDC22,PPP1R3F NA NA NA NA PPP1R3F 14950 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 51633926 51634124 51634025 Y NA NA NA NA NA NA MAGED1 89823 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 52004971 52005124 52005057 Y NA NA NA NA NA NA MAGED1 460868 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chrX 52949996 52950343 52950129 Y TSPYL2,KDM5C,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 31660 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chrX 52964244 52964539 52964367 Y TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 45908 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chrX 53083409 53083784 53083564 Y NA GPR173,TSPYL2,LINC01155 NA NA NA NA GPR173 7136 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chrX 53155305 53155690 53155322 Y XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2 TSPYL2,LINC01155 KDM5C IMR90 Hi-C 24141950 LINC01155 33978 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 53172968 53173150 53172985 Y NA NA NA NA NA NA LINC01155 51641 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chrX 53398923 53399250 53399087 Y NA RIBC1,SMC1A NA NA NA NA RIBC1 48389 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 53428419 53428681 53428625 Y NA RIBC1,SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA RIBC1 18958 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 53468564 53468782 53468716 Y IQSEC2 RIBC1,SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA HSD17B10 9244 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 54665732 54666388 54666226 Y NA NA ITIH6,MAGED2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNL3L 111088 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chrX 57420009 57420263 57420031 Y NA NA NA NA NA NA ZXDB 196006 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 57421884 57422193 57422039 Y FAAH2 NA NA NA NA NA ZXDB 194076 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 57929641 57930031 57929858 Y NA ZXDA NA NA NA NA ZXDA 5036 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 62965283 62965341 62965311 Y NA ARHGEF9 NA NA NA NA ARHGEF9 38085 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 64255385 64255512 64255449 Y ZC4H2 ZC4H2 NA NA NA NA ZC4H2 2792 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 64520324 64520642 64520384 Y NA NA NA NA NA NA LAS1L 232013 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 67291116 67291490 67291298 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 360265 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 67724193 67724408 67724299 Y NA YIPF6 NA NA NA NA YIPF6 8028 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 68004355 68004677 68004478 Y NA SERBP1P1,EFNB1 NA NA NA NA SERBP1P1 3040 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chrX 69386644 69386665 69386655 Y NA IGBP1 NA NA NA NA IGBP1 35345 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 69653784 69653948 69653832 Y NA NA NA NA NA NA PDZD11 145420 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 69654278 69654566 69654417 Y DLG3 NA NA NA NA NA PDZD11 145914 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 69666219 69666233 69666226 Y DLG3 NA NA NA NA NA PDZD11 157855 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 70640504 70640913 70640718 Y NA NA NA NA NA NA TAF1 56390 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chrX 71314849 71315044 71314940 Y CXCR3 NA NA NA NA NA PIN4 84159 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 71327344 71327556 71327407 Y NA NA NA NA NA NA PIN4 71647 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 71343802 71343935 71343869 Y NA NA NA NA NA NA PIN4 55268 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 71402877 71403170 71402921 Y NA PIN4 NA NA NA NA PIN4 3674 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 71635914 71636037 71635976 Y HDAC8 NA NA NA NA NA CITED1 110877 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 71761722 71762003 71761864 Y NA HDAC8 NA NA NA NA HDAC8 28950 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 72786594 72786762 72786676 Y NAP1L2,CDX4,CHIC1 CHIC1 NA NA NA NA CHIC1 5558 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chrX 73250242 73250558 73250399 Y NA NA NA NA NA NA JPX 88083 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 73340869 73341139 73340910 Y RLIM NA NA NA NA NA USMG5P1 50586 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chrX 73350281 73350820 73350789 Y RLIM USMG5P1 JPX IMR90 Hi-C 24141950 USMG5P1 40905 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 73507125 73507445 73507287 Y NA FTX NA NA NA NA FTX 3964 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 73510244 73510542 73510484 Y RLIM FTX NA NA NA NA FTX 867 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 73755621 73755953 73755678 Y RLIM NA NA NA NA NA RLIM 76499 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 73756210 73756567 73756298 Y NA NA NA NA NA NA RLIM 75885 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.516928787442981 chrX 73833460 73833840 73833652 Y NA RLIM NA NA NA NA RLIM 1008 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 74033137 74033450 74033294 Y NA NA NA NA NA NA KIAA2022 109832 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 74259170 74259182 74259176 Y NA NA NA NA NA NA ABCB7 115385 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chrX 74266683 74266817 74266750 Y NA NA NA NA NA NA ABCB7 107750 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 74960822 74961039 74960972 Y NA TTC3P1,MAGEE2 NA NA NA NA TTC3P1 3710 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 77226253 77226302 77226278 Y NA NA NA NA NA NA ATP7A 62059 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 78394362 78394643 78394474 Y P2RY10,GPR174 NA NA NA NA NA TAF9B 1001159 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 79827525 79827860 79827693 Y NA NA NA NA NA NA BRWD3 235327 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 79828855 79829064 79828956 Y NA NA NA NA NA NA BRWD3 234123 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 85278748 85279124 85278988 Y CHM CHM NA NA NA NA CHM 21442 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 85294512 85294785 85294645 Y CHM CHM NA NA NA NA CHM 5781 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 85339971 85340972 85340615 Y NA CHM NA NA NA NA CHM 39405 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chrX 95940743 95941133 95941025 Y DIAPH2 DIAPH2 NA NA NA NA DIAPH2 3081 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 99913933 99914424 99914133 Y SYTL4,SYTL4 TSPAN6 NA NA NA NA TSPAN6 20945 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chrX 100111421 100111452 100111441 Y NA CSTF2 NA NA NA NA CSTF2 38037 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 100670556 100670756 100670646 Y NA RPL36A,GLA,HNRNPH2,ARMCX4 NA NA NA NA ARMCX4 519 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chrX 100792680 100793554 100793013 Y NA ARMCX1 NA NA NA NA ARMCX1 9960 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 101914784 101914936 101914847 Y BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1 GPRASP1 NA NA NA NA GPRASP1 10490 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chrX 102880714 102880758 102880737 Y PLP1,PLP1 TCEAL3,TCEAL1 NA NA NA NA TCEAL1 874 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 105809036 105809195 105809116 Y NA NA NA NA NA NA MORC4 432279 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 106595212 106595632 106595477 Y NA NA NA NA NA NA RBM41 235155 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 106595667 106595822 106595802 Y NA NA NA NA NA NA RBM41 235610 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 106920003 106920801 106920325 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 50266 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chrX 109091814 109092062 109091940 Y NA NA ACSL4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACSL4 117182 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 109382352 109382583 109382468 Y NA NA NA NA NA NA TMEM164 138493 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 109487499 109487581 109487556 Y AMMECR1 NA NA NA NA NA AMMECR1 193880 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 109563862 109564162 109564033 Y NA NA NA NA NA NA AMMECR1 117299 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 115083189 115083554 115083375 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 0 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.723700302420173 chrX 117499894 117500112 117500003 Y NA WDR44 NA NA NA NA WDR44 21858 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 117631588 117631815 117631704 Y NA DOCK11 NA NA NA NA DOCK11 3727 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 117635665 117635786 117635726 Y DOCK11 DOCK11 NA NA NA NA DOCK11 7804 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 118788207 118788334 118788273 Y NA SEPT6 NA NA NA NA SEPT6 36999 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 118824830 118825236 118824917 Y UBE2A,UBE2A,SEPT6 SEPT6 NA NA NA NA SEPT6 97 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 118890270 118890420 118890345 Y SEPT6,ZBTB33,ZBTB33,RNF113A RPL39 SEPT6 IMR90 Hi-C 24141950 RPL39 33186 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 119619980 119620335 119620161 Y NA LAMP2 LAMP2 K562 ChIA-PET 22265404 LAMP2 18760 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 120337126 120337342 120337247 Y NA NA NA NA NA NA C1GALT1C1 575121 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 120799323 120799330 120799327 Y NA NA NA NA NA NA C1GALT1C1 1037318 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 122898767 122899176 122898998 Y NA THOC2 NA NA NA NA THOC2 33861 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 123796301 123796431 123796368 Y NA NA NA NA NA NA RP1-161N10.1 539756 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.930471817397366 chrX 127434305 127434453 127434370 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA1 1221024 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 128656237 128656454 128656444 Y NA SMARCA1,OCRL NA NA NA NA SMARCA1 760 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 129118011 129118370 129118054 Y NA BCORL1 BCORL1,UTP14A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCORL1 4928 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.82708605990877 chrX 129121612 129121744 129121653 Y NA BCORL1 BCORL1,UTP14A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCORL1 8529 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 129255072 129255259 129255158 Y SASH3,ELF4,ELF4 AIFM1,RAB33A ELF4 K562 ChIA-PET 22265404 AIFM1 42602 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 129400519 129400680 129400638 Y NA ZNF280C NA NA NA NA ZNF280C 193 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chrX 129982936 129983220 129983074 Y NA NA NA NA NA NA ENOX2 51988 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 130201514 130201626 130201527 Y NA NA NA NA NA NA ENOX2 166306 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 130722581 130722843 130722721 Y NA NA NA NA NA NA IGSF1 190904 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 130880517 130880959 130880705 Y NA NA NA NA NA NA MST4 274334 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 130942336 130942500 130942419 Y NA NA NA NA NA NA MST4 212793 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chrX 131159301 131159695 131159439 Y RAP2C,MBNL3,MST4,MST4 MST4 NA NA NA NA MST4 4008 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 132089755 132090160 132089782 Y NA HS6ST2 NA NA NA NA HS6ST2 3263 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 133305762 133306165 133305903 Y PHF6,CCDC160 NA NA NA NA NA GPC3 187840 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chrX 133509019 133509280 133509152 Y PHF6 PHF6 NA NA NA NA PHF6 3736 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 134138094 134138444 134138243 Y NA FAM127C,FAM127A,FAM127B NA NA NA NA FAM127C 16115 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 134567184 134567298 134567231 Y NA LINC00086 NA NA NA NA LINC00086 13316 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 135940631 135940874 135940833 Y HTATSF1 RBMX,RP11-308D16.4 NA NA NA NA RBMX 20049 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.620314544931577 chrX 136647486 136647742 136647575 Y NA ZIC3 NA NA NA NA ZIC3 1185 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 138929859 138929869 138929864 Y CXorf66 NA NA NA NA NA ATP11C 95566 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 139793034 139793280 139793108 Y CDR1 NA NA NA NA NA LDOC1 476030 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.310157272465789 chrX 139809387 139809785 139809560 Y NA NA NA NA NA NA LDOC1 459525 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.413543029954385 chrX 139814619 139814812 139814632 Y NA NA NA NA NA NA LDOC1 454498 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 139858514 139858763 139858620 Y NA NA NA NA NA NA LDOC1 410547 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 149533685 149533896 149533780 Y MAMLD1 MAMLD1 NA NA NA NA MAMLD1 5996 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 149863384 149863571 149863479 Y NA MTMR1 NA NA NA NA MTMR1 3949 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 150152595 150153067 150152778 Y NA HMGB3,RPL19P21 NA NA NA NA HMGB3 5613 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 150347417 150347568 150347539 Y GPR50 GPR50 NA NA NA NA GPR50 4292 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 152127371 152127756 152127434 Y NA NA NA NA NA NA PNMA3 95010 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 152742295 152742894 152742640 Y NA TREX2,BGN,HAUS7,ATP2B3 HAUS7,ATP2B3 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TREX2 8250 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 152812807 152812922 152812865 Y SLC6A8 ATP2B3 NA NA NA NA ATP2B3 31673 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 153084450 153084610 153084498 Y NA SSR4,IDH3G,PDZD4,CYCSP45 NA NA NA NA PDZD4 9410 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 153144826 153145116 153145102 Y NA CYCSP45,L1CAM NA NA NA NA L1CAM 27561 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 153304167 153304640 153304272 Y ABCD1,ARHGAP4,RENBP,TEX28,TEX28,TAZ,MECP2,IKBKG,IKBKG,IKBKG,EMD,DNASE1L1,TMEM187,IRAK1 IRAK1 NA NA NA NA IRAK1 20736 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 153308986 153309188 153309114 Y NA IRAK1 IRAK1,MIR718 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRAK1 25555 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrX 153359354 153359823 153359622 Y NA MECP2 NA NA NA NA MECP2 1389 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrX 153596671 153598676 153598064 Y NA FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1 NA NA NA NA FLNA 2330 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 1.03385757488596 chrX 153755432 153755621 153755566 Y NA LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD FAM3A MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 IKBKG 11793 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.206771514977192 chrY 7143028 7143486 7143308 Y AMELY PRKY NA NA NA NA PRKY 3015 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrY 13254353 13254589 13254477 Y NA NA NA NA NA NA GYG2P1 1275666 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrY 13470203 13470486 13470410 Y NA NA NA NA NA NA GYG2P1 1059769 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrY 14775457 14775545 14775476 Y NA TTTY15 NA NA NA NA TTTY15 3192 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrY 15207344 15207441 15207401 Y NA NA NA NA NA NA DDX3Y 193325 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrY 16866179 16866578 16866379 Y NA NA NA NA NA NA AGKP1 117203 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596 chrY 21046816 21047207 21047093 Y NA NA NA NA NA NA TTTY14 190095 CAGE NH-12 hg19 FANTOM5 0.103385757488596