chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RP11-465B22.3,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	11532	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	1014834	1015095	1014859	Y	NA	RP11-465B22.3,C1orf159	RNF223	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RP11-465B22.3	21720	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	1265677	1265980	1265829	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1	NA	NA	NA	NA	GLTPD1	7541	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	1295535	1296332	1296026	Y	MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8	CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	MXRA8	378	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr1	1343359	1343768	1343546	Y	NA	MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	MRPL20	2666	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	1793829	1793862	1793845	Y	CDK11B,CDK11A	GNB1	NA	NA	NA	NA	GNB1	26633	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	1803114	1803303	1803274	Y	NA	GNB1,TMEM52	NADK	IMR90	Hi-C	24141950	GNB1	17192	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	1814762	1815124	1815035	Y	SKI,C1orf86,MIB2	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	GNB1	5371	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	TMEM52	7877	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	2135885	2136186	2135927	Y	NA	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	5973	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr1	2140151	2140337	2140252	Y	C1orf86	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	1822	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	2162325	2162996	2162733	Y	TNFRSF14,SKI	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	20166	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	2177615	2177829	2177732	Y	NADK,GNB1,TNFRSF14,SKI	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	35456	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	2221868	2222548	2222316	Y	TNFRSF14,SKI	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf86	79709	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.31192201671937
chr1	2245775	2246116	2245876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	75030	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	2246556	2246763	2246722	Y	SKI	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	74383	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,TNFRSF14,FAM213B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF14	7107	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	2478276	2478817	2478474	Y	SKI,PANK4,TNFRSF14	PANK4,TNFRSF14,FAM213B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF14	6261	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	3309990	3310261	3310127	Y	PRDM16	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	215798	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	3420761	3421065	3420920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	104994	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr1	3817648	3818071	3817969	Y	LRRC47	CEP104,DFFB,C1orf174	NA	NA	NA	NA	C1orf174	2791	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	4526696	4526895	4526796	Y	NA	NA	AJAP1	IMR90	Hi-C	24141950	AJAP1	185897	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	6319998	6320272	6320169	Y	NA	ICMT,GPR153	NA	NA	NA	NA	GPR153	963	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	6341896	6342142	6342067	Y	GPR153,ACOT7	ICMT,GPR153	NA	NA	NA	NA	GPR153	22861	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	6661008	6661639	6661311	Y	ZBTB48,KLHL21	NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3	NA	NA	NA	NA	PHF13	10106	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr1	6943772	6944262	6943813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	100388	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	7289758	7290075	7289881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	446374	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	7327634	7328033	7327873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	484250	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	7359415	7359679	7359556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	469650	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	7531062	7531540	7531160	Y	PARK7	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	297789	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	7656791	7657175	7656983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	172154	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	7764543	7764931	7764717	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	64398	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	7843556	7843653	7843585	Y	PER3	VAMP3,PER3	NA	NA	NA	NA	PER3	1176	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	8070132	8070398	8070299	Y	PER3,SLC45A1,ERRFI1	ERRFI1,RP11-431K24.1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	13970	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	8107848	8108157	8108001	Y	NA	ERRFI1,RP11-431K24.1	ERRFI1,RERE,SLC45A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-431K24.1	23050	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	8154517	8154933	8154754	Y	VAMP3	NA	ERRFI1,RERE,PARK7,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	69719	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	8157417	8157780	8157543	Y	NA	NA	ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	72619	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	8229904	8230047	8229996	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,SLC45A1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-7P	34610	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	8272041	8272390	8272277	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	7384	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	8450820	8451072	8450834	Y	RERE,RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	74934	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	8487656	8487917	8487791	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	111770	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	8686491	8686867	8686745	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	188835	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	8720526	8720683	8720608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	155019	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	8721734	8722143	8721896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	153559	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	8933581	8933925	8933847	Y	NA	ENO1	NA	NA	NA	NA	ENO1	3383	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	8964053	8964236	8964145	Y	ENO1	ENO1	ENO1-AS1,ENO1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ENO1	26745	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	9256119	9256636	9256459	Y	NA	RP3-510D11.1,H6PD	SLC2A7,SLC25A33,SPSB1,H6PD,TMEM201,MIR34A,GPR157,PIK3CD	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP3-510D11.1	4042	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	9293549	9293739	9293591	Y	H6PD	RP3-510D11.1,H6PD	NA	NA	NA	NA	H6PD	715	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	9355493	9355709	9355601	Y	NA	SPSB1	NA	NA	NA	NA	SPSB1	4554	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr1	9889535	9889880	9889709	Y	KIF1B	CLSTN1	NA	NA	NA	NA	CLSTN1	6951	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	10269964	10270260	10269995	Y	RBP7,PGD,KIF1B	KIF1B	NA	NA	NA	NA	KIF1B	1101	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	10447707	10448369	10448247	Y	NA	PGD,APITD1,APITD1-CORT	NA	NA	NA	NA	PGD	8280	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	10804844	10805001	10804872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TARDBP	265413	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	11968510	11969143	11969021	Y	MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP	KIAA2013,PLOD1	NA	NA	NA	NA	KIAA2013	15342	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	12233600	12234159	12233938	Y	AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF1B,VPS13D	TNFRSF1B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1B	8540	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	12544374	12544691	12544532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	131046	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	12599928	12600179	12600028	Y	DHRS3	NA	DHRS3,VPS13D	K562	ChIA-PET	22265404	DHRS3	75558	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	12609717	12610039	12609907	Y	DHRS3	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	65698	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	15519488	15519688	15519655	Y	NA	TMEM51	NA	NA	NA	NA	TMEM51	42460	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	16007283	16007579	16007390	Y	FHAD1,EFHD2,CASP9,ZBTB17,SPEN,PLEKHM2	PLEKHM2	NA	NA	NA	NA	PLEKHM2	1248	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	16087189	16087372	16087266	Y	EPHA2,FBLIM1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	65352	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3049	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	16212759	16213091	16212941	Y	EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	40117	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr1	16276028	16276482	16276329	Y	CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	24145	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	16502532	16502678	16502612	Y	C1orf64	EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	21950	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	16508402	16508642	16508565	Y	FBLIM1	EPHA2	NA	NA	NA	NA	EPHA2	27820	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr1	16670445	16670837	16670642	Y	SPEN,C1orf64,FBXO42	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	6112	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	RNU1-1	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-1	12489	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.48976217185163
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	RP11-108M9.4	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-108M9.4	17109	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-108M9.4	26044	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	6.75792589502584
chr1	17494378	17494745	17494634	Y	NA	NA	PADI2,PADI1,PADI3,PADI6	IMR90	Hi-C	24141950	SDHB	115713	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	17518130	17518260	17518142	Y	NA	NA	NBPF1,PADI1,PADI2,PADI3	IMR90	Hi-C	24141950	SDHB	139465	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	17578205	17578469	17578334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCC2	185751	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	17865185	17865523	17865202	Y	ARHGEF10L	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	855	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	19253034	19253391	19253292	Y	UBR4,IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	ALDH4A1	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH4A1	25759	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	19762527	19762798	19762680	Y	NBL1,NBL1,NBL1,NBL1	CAPZB	NA	NA	NA	NA	CAPZB	47268	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	19780234	19780551	19780381	Y	NA	CAPZB	NA	NA	NA	NA	CAPZB	29515	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	19796024	19796128	19796080	Y	NA	CAPZB	NA	NA	NA	NA	CAPZB	13938	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	20111066	20111358	20111348	Y	NA	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	13080	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	20993397	20993558	20993485	Y	NA	PINK1,DDOST	NA	NA	NA	NA	DDOST	7397	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	3.55680310264518
chr1	21149682	21149798	21149749	Y	CAMK2N1,EIF4G3	HP1BP3	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	37866	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	21194399	21194490	21194445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	82583	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	21428050	21428147	21428101	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	29804	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	21475659	21476054	21476002	Y	EIF4G3,EIF4G3	EIF4G3	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	25323	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	21476251	21476624	21476546	Y	NA	EIF4G3	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	24753	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	21588176	21588724	21588522	Y	ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	81273	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	21588829	21589430	21588896	Y	ECE1,ALPL,EIF4G3,ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	80567	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	21664400	21664833	21664668	Y	EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	5164	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	21895072	21895699	21895173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF3	130451	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	23445594	23445963	23445683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LUZP1	56338	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	23523350	23523682	23523502	Y	LUZP1,HTR1D	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	21049	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	23888678	23889201	23888997	Y	ID3	E2F2,ID3	NA	NA	NA	NA	ID3	4393	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr1	23961555	23961694	23961621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL11	54575	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	24519628	24519970	24519647	Y	GRHL3	NA	MYOM3,IL22RA1,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS,C1orf130	IMR90	Hi-C	24141950	IL22RA1	52017	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	24581337	24581604	24581474	Y	NA	NA	MYOM3,GRHL3,C1orf201,RCAN3,NIPAL3,C1orf130	IMR90	Hi-C	24141950	IL22RA1	113726	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	24680333	24680598	24680466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPAL3	59686	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	24691833	24692082	24691893	Y	PNRC2,GRHL3	NIPAL3	NA	NA	NA	NA	NIPAL3	48202	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	24789793	24789894	24789844	Y	NA	NIPAL3,RCAN3	NA	NA	NA	NA	RCAN3	37493	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	25559638	25560067	25559796	Y	RUNX3,SYF2,C1orf63	SYF2	NA	NA	NA	NA	SYF2	2645	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	25566618	25566670	25566639	Y	NA	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9625	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	26022319	26022793	26022555	Y	SEPN1	NA	NA	NA	NA	NA	SEPN1	101874	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr1	26201699	26201757	26201716	Y	SEPN1	RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	RP1-125I3.2	17595	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	26617206	26617304	26617268	Y	SH3BGRL3,RPS6KA1,PIGV,ARID1A,UBXN11,UBXN11	SH3BGRL3,UBXN11	NA	NA	NA	NA	SH3BGRL3	13539	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2,RPS6KA1	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPS6KA1	26383	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr1	26946837	26947249	26947076	Y	CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	73275	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr1	27165490	27165816	27165600	Y	NA	ZDHHC18,GPN2	NA	NA	NA	NA	ZDHHC18	14289	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	GPN2	22861	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	4.44600387830647
chr1	27289282	27289295	27289289	Y	NA	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	RP11-344H11.4	15361	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	27321452	27321840	27321632	Y	TMEM222,TRNP1,FAM46B	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	TRNP1	3254	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	27353661	27353962	27353706	Y	TMEM222,MAP3K6,TRNP1	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	FAM46B,C1orf172,SLC9A1,WDTC1,WASF2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM46B	16334	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,RP11-4K3__A.5,MAP3K6,GPR3	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.95624170645485
chr1	27762936	27763307	27763206	Y	WASF2,STX12,FGR,FGR,FGR,C1orf38	GPR3	NA	NA	NA	NA	GPR3	45788	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	27848725	27849287	27848935	Y	WDTC1,SYTL1,FAM76A	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	34056	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	27853337	27854089	27853858	Y	NA	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	38668	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	27901397	27901604	27901422	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	27338	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	27916292	27916674	27916513	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	12268	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	27982664	27982914	27982811	Y	EYA3,STX12,C1orf38,FGR,FGR,FGR	IFI6	NA	NA	NA	NA	IFI6	13815	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	27985480	27985709	27985578	Y	EYA3,STX12,C1orf38,FGR,FGR,FGR	IFI6	NA	NA	NA	NA	IFI6	11020	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	27985869	27985982	27985925	Y	EYA3,STX12,C1orf38,FGR,FGR,FGR	IFI6	NA	NA	NA	NA	IFI6	10747	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	28189568	28190269	28189912	Y	SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,EYA3,WASF2,FGR,FGR,FGR,STX12,XKR8,C1orf38	PPP1R8,SCARNA1,RPA2	NA	NA	NA	NA	SCARNA1	30656	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	28355043	28355235	28355139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYA3	57972	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	28431716	28431884	28431798	Y	FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,SESN2,PTAFR,PTAFR,EYA3	EYA3	PTAFR,EYA3,FAM76A,LOC653566,DNAJC8,ATPIF1,SESN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EYA3	18509	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	29224369	29224479	29224424	Y	EPB41	EPB41	NA	NA	NA	NA	EPB41	12766	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	31241795	31242280	31242065	Y	LAPTM5	NA	PUM1,SNORD103A,LAPTM5,MATN1,LOC100129196,SDC3	IMR90	Hi-C	24141950	SDC3	137328	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	31625313	31625543	31625426	Y	NA	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	84858	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	82443	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	81944	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr1	31737918	31737951	31737935	Y	NA	NKAIN1,SNRNP40,ZCCHC17	NA	NA	NA	NA	NKAIN1	27517	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	31943761	31943827	31943813	Y	NA	NA	SERINC2,SNRNP40,NKAIN1,ZCCHC17,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1,PEF1,SPOCD1,HCRTR1	IMR90	Hi-C	24141950	SERINC2	63349	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	31956203	31956482	31956384	Y	PEF1	NA	SERINC2,SNRNP40,HCRTR1,NKAIN1,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1	IMR90	Hi-C	24141950	SERINC2	75791	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	32166698	32166999	32166824	Y	COL16A1	COL16A1	NA	NA	NA	NA	COL16A1	921	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	32170830	32171205	32171045	Y	NA	COL16A1	NA	NA	NA	NA	COL16A1	2910	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	32180603	32180986	32180867	Y	PEF1,SPOCD1,COL16A1	COL16A1,BAI2	PEF1,COL16A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL16A1	12683	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	32253647	32254040	32253861	Y	LCK	BAI2,SPOCD1	NA	NA	NA	NA	BAI2	25153	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	32421622	32422096	32421696	Y	MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	13165	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr1	32701561	32701886	32701724	Y	NA	CCDC28B,IQCC,EIF3I,TMEM234,MTMR9LP,FAM167B	NA	NA	NA	NA	MTMR9LP	3335	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	32966228	32966602	32966575	Y	FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8A	NA	NA	NA	NA	ZBTB8A	36426	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	33082385	33082406	33082394	Y	ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	32098	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	33131314	33131452	33131383	Y	NA	ZBTB8OS,RBBP4,SYNC	NA	NA	NA	NA	RBBP4	16571	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	33284832	33285123	33284978	Y	NA	S100PBP,YARS	NA	NA	NA	NA	YARS	3078	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	33446816	33447482	33446950	Y	RNF19B	RNF19B	RNF19B,AK2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19B	18530	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	33454783	33455472	33455325	Y	RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	26497	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	33500817	33500865	33500842	Y	NA	AK2,ADC	NA	NA	NA	NA	AK2	43732	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	33564918	33565286	33565197	Y	NA	AK2,ADC	NA	NA	NA	NA	ADC	20213	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr1	33685276	33685676	33685470	Y	NA	TRIM62,ZNF362	TRIM62,ZNF362,PHC2,ZSCAN20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF362	34470	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	33804359	33804743	33804679	Y	RNF19B,TRIM62,PHC2	AL513327.1	NA	NA	NA	NA	AL513327.1	41384	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	35891843	35891965	35891904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCDN	129109	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	35892196	35892421	35892350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCDN	128653	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	36103028	36103196	36103152	Y	NA	PSMB2	TFAP2E	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB2	2249	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	36183411	36183689	36183588	Y	C1orf216	C1orf216,CLSPN	NA	NA	NA	NA	C1orf216	338	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	36555347	36555633	36555606	Y	STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2	TEKT2,ADPRHL2,COL8A2	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	2871	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	36616485	36616868	36616577	Y	STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1	COL8A2,TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	2312	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr1	36626561	36626969	36626609	Y	STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2,MAP7D1,THRAP3	COL8A2,TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	7381	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr1	36839449	36839891	36839558	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	9606	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	36840093	36840535	36840445	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	8962	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	37721552	37721986	37721683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS29P6	72467	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	37937293	37937526	37937471	Y	YRDC,MTF1,C1orf122,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	LINC01137	486	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	37942874	37943354	37943027	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	4721	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	37944084	37944971	37944382	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	5931	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	38009784	38010404	38010149	Y	SNIP1,MTF1,ZC3H12A	MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,DNALI1,GNL2	MEAF6	IMR90	Hi-C	24141950	SNIP1	7499	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	38317043	38317898	38317556	Y	ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	5394	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	39357087	39357474	39357146	Y	MACF1,GJA9	RRAGC,RP5-864K19.4,MYCBP	NA	NA	NA	NA	MYCBP	11798	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	39508832	39509204	39509012	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	18842	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	39791626	39791706	39791638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	82445	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	39874208	39874673	39874342	Y	KIAA0754	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	57	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	40006104	40006751	40006634	Y	MFSD2A,PABPC4	PPIEL,PABPC4	NA	NA	NA	NA	PPIEL	15628	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	40848967	40849502	40849291	Y	MFSD2A,RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2	SMAP2	NA	NA	NA	NA	SMAP2	40445	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr1	41343431	41343839	41343651	Y	NA	CITED4	KCNQ4,CTPS,NFYC,CITED4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED4	17413	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	41501440	41501773	41501639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	175422	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	41501908	41501999	41501966	Y	SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	175890	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	41622480	41622650	41622563	Y	NA	NA	CTPS,LOC100507178	IMR90	Hi-C	24141950	SCMH1	83176	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	41961925	41962146	41962029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	256099	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	41994633	41994922	41994778	Y	SCMH1,HIVEP3	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	288807	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	370805	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	43428386	43429108	43428580	Y	CLDN19,CCDC23,ERMAP,SLC2A1	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	5856	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	43429290	43429917	43429491	Y	CCDC23,ERMAP,SLC2A1	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	6760	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	43471870	43472203	43472037	Y	NA	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	49340	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	44162019	44162313	44162287	Y	NA	KDM4A,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	7182	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	44176533	44177122	44176879	Y	SZT2,ATP6V0B	ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	7038	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	44299891	44300630	44300422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-7O11.3	109593	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	44324219	44324394	44324336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-7O11.3	85829	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	44380893	44381202	44381004	Y	SLC6A9,B4GALT2,ARTN	RP11-7O11.3,IPO13	NA	NA	NA	NA	RP11-7O11.3	29021	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	44430681	44431060	44430788	Y	NA	RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24	NA	NA	NA	NA	DPH2	2612	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	44452990	44453115	44453039	Y	NA	RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9	NA	NA	NA	NA	CCDC24	1916	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	44689979	44690114	44690071	Y	NA	DMAP1	NA	NA	NA	NA	DMAP1	12852	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	44703858	44704161	44704010	Y	NA	DMAP1	NA	NA	NA	NA	DMAP1	26731	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	44951424	44951733	44951502	Y	TCTEX1D4,PLK3,BTBD19,SLC6A9,RNF220	NA	NA	NA	NA	NA	RNF220	82558	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	45283789	45284126	45283958	Y	NA	RPS8,SNORD55,RPS15AP11,PLK3,TCTEX1D4,BTBD19,RNU5E-6P,PTCH2	NA	NA	NA	NA	RNU5E-6P	120	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	45376274	45376331	45376304	Y	NA	CCNB1IP1P1	NA	NA	NA	NA	CCNB1IP1P1	45898	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	45738634	45738975	45738793	Y	IPP,PLK3,TCTEX1D4,BTBD19	ZSWIM5	ZSWIM5,UROD,HECTD3,BTBD19,PLK3,TCTEX1D4	IMR90	Hi-C	24141950	ZSWIM5	30906	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	45875042	45875301	45875196	Y	IPP,TESK2	NA	NA	NA	NA	NA	MUTYH	70900	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	46111666	46112048	46111975	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	3450	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	46268583	46268737	46268651	Y	NA	MAST2	NA	NA	NA	NA	MAST2	17924	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	47102400	47102701	47102616	Y	NA	MKNK1,ATPAF1	NA	NA	NA	NA	MKNK1	21885	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	47729037	47729382	47729210	Y	NA	TAL1,STIL	TAL1	K562	ChIA-PET	22265404	TAL1	33145	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	47800262	47800514	47800436	Y	NA	STIL,CMPK1	NA	NA	NA	NA	CMPK1	2793	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	48935854	48936015	48935919	Y	NA	RNU4-61P,SPATA6	NA	NA	NA	NA	SPATA6	9	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	51083951	51084011	51083988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	339924	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	51245588	51245972	51245952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	177963	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	51298202	51298577	51298390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	125358	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	51302197	51302583	51302391	Y	FAF1	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	121352	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	52033462	52033748	52033585	Y	NA	OSBPL9	OSBPL9,EPS15,NRD1,TTC39A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL9	7103	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	52173889	52173954	52173921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	133038	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	52628189	52628583	52628480	Y	NA	ZFYVE9	NA	NA	NA	NA	ZFYVE9	22143	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	53589395	53589613	53589415	Y	PODN,PODN	NA	PODN,SCP2	IMR90	Hi-C	24141950	PODN	63541	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	53702100	53702340	53702220	Y	NA	CPT2,C1orf123	NA	NA	NA	NA	MAGOH	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	54586706	54586840	54586800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL37	60874	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	54953784	54954325	54954090	Y	SSBP3,SSBP3	NA	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	76632	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr1	55909250	55909597	55909489	Y	NA	NA	PPAP2B,PRKAA2	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	230464	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	56184456	56184884	56184686	Y	NA	NA	PRKAA2,PPAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	505670	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	56771744	56771759	56771752	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	337215	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	56991269	56991531	56991390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	117443	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	57042744	57043185	57043024	Y	C8B,C8A,C1orf168,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	65789	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	57043287	57044160	57043621	Y	PRKAA2,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	64814	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr1	57297629	57297838	57297785	Y	NA	NA	DAB1,C1orf168,C8A,C8B	IMR90	Hi-C	24141950	PRKAA2	188634	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	58969564	58969575	58969570	Y	NA	DAB1,OMA1	NA	NA	NA	NA	DAB1	40831	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	59221049	59221462	59221387	Y	NA	JUN,LINC01135	FGGY,HSD52,LOC100131060,JUN,MIR4711	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JUN	26323	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr1	59229881	59230252	59230003	Y	NA	JUN,LINC01135	NA	NA	NA	NA	JUN	17533	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	59280773	59281281	59281052	Y	FGGY,JUN	JUN,LINC01135	NA	NA	NA	NA	LINC01135	31950	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	59281873	59282217	59282125	Y	MYSM1,FGGY,JUN	JUN,LINC01135	NA	NA	NA	NA	LINC01135	33050	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr1	59369049	59370138	59369602	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-794H19.4	113921	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.13408186158711
chr1	59524373	59524568	59524471	Y	NA	RP4-794H19.4	FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-794H19.4	40314	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	59608749	59609120	59609039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-794H19.4	124690	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	59986893	59986899	59986896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	226583	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	60157078	60157331	60157204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	396768	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	60196566	60196799	60196671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	436256	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	60216360	60216669	60216553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	456050	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	60598724	60598934	60598848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	729997	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	61549054	61549253	61549232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	220123	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	61649786	61650305	61649984	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	320855	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	62928310	62928608	62928459	Y	KANK4,USP1,USP1,ATG4C	USP1	NA	NA	NA	NA	USP1	28342	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	64197270	64197475	64197385	Y	NA	ROR1	ROR1,UBE2U,PGM1	IMR90	Hi-C	24141950	ROR1	40218	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	64505281	64505575	64505361	Y	ROR1,UBE2U	NA	NA	NA	NA	NA	CFL1P3	197925	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	65292575	65293034	65292898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAVER2	83797	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	65398951	65399446	65399123	Y	LEPROT,LEPROT,LEPR,JAK1	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	30741	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr1	65421731	65422136	65422135	Y	NA	JAK1,RP11-182I10.3	NA	NA	NA	NA	JAK1	8051	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	66822714	66822988	66822804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGIP1	174078	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	66954948	66955119	66955043	Y	MIER1,PDE4B	SGIP1	PDE4B	IMR90	Hi-C	24141950	SGIP1	41947	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	67029191	67029437	67029359	Y	NA	SGIP1	NA	NA	NA	NA	SGIP1	32125	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	67029939	67030347	67030122	Y	PDE4B	SGIP1	NA	NA	NA	NA	SGIP1	32873	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr1	67802002	67802116	67802059	Y	MIER1,SLC35D1,IL23R,IL12RB2	NA	NA	NA	NA	NA	SERBP1	91982	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	68166463	68166766	68166597	Y	NA	GADD45A	NA	NA	NA	NA	GADD45A	17719	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	68189225	68189635	68189533	Y	NA	GADD45A	NA	NA	NA	NA	GADD45A	40481	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	68257383	68257657	68257565	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	39493	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	70017370	70017628	70017440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC40	651675	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr1	70746826	70747040	70746993	Y	ANKRD13C	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	62120	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	70806613	70806974	70806794	Y	NA	ANKRD13C,HHLA3	NA	NA	NA	NA	ANKRD13C	11443	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	72696545	72696864	72696705	Y	NA	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	49553	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	72715442	72715840	72715642	Y	NA	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	30577	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	72749220	72749791	72749447	Y	NEGR1	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	2803	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	3.37896294751292
chr1	72750417	72750888	72750606	Y	NA	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	4000	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	75182913	75182976	75182918	Y	NA	C1orf173,TYW3,CRYZ	NA	NA	NA	NA	TYW3	13860	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	75798807	75799079	75799068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC44A5	275722	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	77977128	77977445	77977326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	169659	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	78002564	78002920	78002661	Y	NA	NA	ZZZ3	IMR90	Hi-C	24141950	ZZZ3	144184	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	78026939	78027232	78027062	Y	FAM73A	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	119872	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	78067790	78068312	78068066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	78792	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	114487	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr1	78957462	78957762	78957688	Y	PTGFR	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44L	125845	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	83506477	83506486	83506482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL7	956347	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	84134786	84135032	84134909	Y	PRKACB	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL7	327801	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	84410654	84410770	84410712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL7	52063	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	168293	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	84971050	84971209	84971115	Y	MCOLN2,GNG5	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	802	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	85007374	85007584	85007581	Y	NA	GNG5,CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	30579	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	85349108	85349420	85349289	Y	LPAR3	NA	NA	NA	NA	NA	MCOLN2	111376	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	85744584	85744829	85744751	Y	BCL10	C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	BCL10	3811	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	85763626	85763846	85763779	Y	NA	C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	BCL10	22853	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	85791287	85791404	85791348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	50514	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	85794698	85795078	85794848	Y	CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	53925	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	85968002	85968172	85968087	Y	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	DDAH1	73761	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	85991291	85991622	85991523	Y	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	DDAH1	50311	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	85992128	85992211	85992170	Y	NA	DDAH1	NA	NA	NA	NA	DDAH1	49722	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	86035824	86036171	86035900	Y	NA	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	DDAH1	5762	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	86072885	86073441	86073156	Y	CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90	Hi-C	24141950	CYR61	28441	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	86077140	86077408	86077190	Y	CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYR61	32696	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	86077578	86077925	86077749	Y	DDAH1,CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYR61	33134	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr1	86078461	86078819	86078680	Y	DDAH1,CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYR61	34017	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	86603097	86603550	86603341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ODF2L	256473	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	87203929	87204214	87204072	Y	NA	SH3GLB1	NA	NA	NA	NA	SH3GLB1	35670	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	87306817	87307030	87306985	Y	SH3GLB1	NA	NA	NA	NA	NA	SEP15	71077	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	87691904	87692436	87692089	Y	NA	NA	LOC339524,LMO4	IMR90	Hi-C	24141950	LMO4	99715	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	87799623	87799998	87799801	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	7472	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	87800631	87801610	87800748	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	8480	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	87868475	87868540	87868484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO4	76324	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	88292387	88292883	88292561	Y	NA	NA	LMO4	IMR90	Hi-C	24141950	LMO4	500236	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	5.86872511936455
chr1	88716578	88716942	88716762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKN2	430963	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	89382528	89382593	89382561	Y	NA	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	26901	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	89739985	89740544	89740197	Y	GTF2B,GBP3,GBP1,GBP2,LRRC8C,GBP4,GBP5	NA	NA	NA	NA	NA	GBP4	77370	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	90077145	90077551	90077320	Y	ZNF326,LRRC8C	LRRC8C	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	19080	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	90101821	90102213	90101853	Y	ZNF326,LRRC8D,GBP4,GBP5,LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C	LRRC8C	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	5190	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	90135818	90136060	90135897	Y	ZNF326,GBP4,GBP5,LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C	LRRC8C	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	39187	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	90190139	90190909	90190374	Y	GBP5,LRRC8B,LRRC8C,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	93508	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	91034804	91034815	91034810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-665J23.1	280392	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	92021775	92022091	92021979	Y	NA	NA	TGFBR3,CDC7,HSP90B3P,KIAA1107,RPAP2,GLMN	IMR90	Hi-C	24141950	CDC7	57367	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	92048213	92048455	92048330	Y	NA	NA	TGFBR3,CDC7	IMR90	Hi-C	24141950	CDC7	83805	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	92048914	92049154	92049034	Y	NA	NA	TGFBR3,CDC7,HSP90B3P	IMR90	Hi-C	24141950	CDC7	84506	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	92116335	92116643	92116480	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC7	151927	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	92183243	92183457	92183382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	186435	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	92184014	92184251	92184134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	185641	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	92198149	92198440	92198227	Y	TGFBR3	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	171452	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	92218581	92218971	92218958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	150921	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	93414710	93414781	93414746	Y	NA	FAM69A	NA	NA	NA	NA	FAM69A	10276	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	93427945	93428408	93428079	Y	MTF2,DR1,FAM69A	FAM69A	NA	NA	NA	NA	FAM69A	2888	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	93634565	93634982	93634927	Y	MTF2	CCDC18,TMED5	NA	NA	NA	NA	CCDC18	8494	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	93694062	93694249	93694102	Y	MTF2,CCDC18	TMED5	NA	NA	NA	NA	TMED5	49777	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	94007993	94008357	94008092	Y	FNBP1L,BCAR3	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	96305	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	94023703	94024059	94023930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	112015	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	94084336	94084510	94084423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	172648	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	94125861	94126246	94126059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAR3	184460	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	94127789	94128026	94127840	Y	GCLM,TMED5,DNTTIP2	NA	NA	NA	NA	NA	BCAR3	182680	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	94145547	94146118	94145739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAR3	164588	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.95624170645485
chr1	94158127	94158185	94158167	Y	GCLM,DNTTIP2	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCAR3	152521	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	94158601	94159338	94158654	Y	GCLM,DNTTIP2,BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCAR3	151368	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	3.73464325777744
chr1	94167175	94167520	94167394	Y	BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCAR3	143186	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr1	94332093	94332098	94332096	Y	NA	BCAR3,DNTTIP2,GCLM	NA	NA	NA	NA	DNTTIP2	11376	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	94621912	94621923	94621919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP29	116701	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	94684511	94684818	94684682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP29	53806	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	94712051	94712193	94712123	Y	ARHGAP29	ARHGAP29	ABCA4,ARHGAP29,ABCD3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP29	26431	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	94792807	94793133	94793077	Y	ARHGAP29	RP11-148B18.3	ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-148B18.3	3690	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	95007995	95008302	95008221	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	2639	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	95113814	95114327	95114013	Y	F3	NA	F3,ABCD3,SLC44A3	IMR90	Hi-C	24141950	F3	108458	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	95249173	95249377	95249275	Y	NA	NA	ABCD3,F3,ALG14	IMR90	Hi-C	24141950	CNN3	141457	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	95645260	95645496	95645354	Y	RWDD3,TMEM56,TMEM56-RWDD3	NA	NA	NA	NA	NA	RWDD3	52215	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	97199537	97199912	97199566	Y	NA	PTBP2	NA	NA	NA	NA	PTBP2	14316	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	98177967	98178251	98178164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	168710	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	98408796	98409171	98408982	Y	NA	DPYD	DPYD,MIR137HG	IMR90	Hi-C	24141950	DPYD	24191	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	98437572	98437739	98437700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	52967	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	98606055	98606462	98606113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	221450	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	98693625	98693976	98693800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	309020	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	100505302	100505632	100505358	Y	NA	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	3649	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	100827551	100827774	100827683	Y	SLC35A3,HIAT1,CDC14A	CDC14A	NA	NA	NA	NA	CDC14A	18967	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	100966297	100966321	100966309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	157713	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	101392986	101393260	101393033	Y	S1PR1,SLC30A7,SLC30A7	EXTL2,SLC30A7	NA	NA	NA	NA	SLC30A7	33354	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	101757305	101757513	101757430	Y	NA	NA	SLC30A7,DPH5	IMR90	Hi-C	24141950	S1PR1	56861	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	101758840	101759229	101759010	Y	NA	NA	SLC30A7,DPH5	IMR90	Hi-C	24141950	S1PR1	58396	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	103572619	103572906	103572682	Y	COL11A1	COL11A1	NA	NA	NA	NA	COL11A1	567	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	107684770	107685020	107684841	Y	NA	NTNG1	NA	NA	NA	NA	NTNG1	4141	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	107809244	107809255	107809250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTNG1	128615	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	107877234	107877506	107877370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTNG1	196605	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	107935551	107935870	107935806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTNG1	254922	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	108169181	108169438	108169310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3-AS1	335627	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	108478082	108478329	108478187	Y	VAV3	VAV3-AS1,VAV3	NA	NA	NA	NA	VAV3-AS1	26736	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	108650339	108650754	108650436	Y	FAM102B,VAV3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	90717	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	109246671	109246905	109246843	Y	FAM102B,TMEM167B,PRPF38B	HENMT1,PRPF38B,STXBP3	NA	NA	NA	NA	PRPF38B	13726	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	109262615	109262764	109262672	Y	NA	PRPF38B,STXBP3	NA	NA	NA	NA	STXBP3	24532	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	109499781	109500180	109500079	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	3926	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	109784080	109784425	109784202	Y	NA	SARS,PSRC1	CELSR2	IMR90	Hi-C	24141950	SARS	29540	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	109913179	109913623	109913457	Y	SORT1	SORT1	NA	NA	NA	NA	SORT1	24950	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	109981518	109981703	109981616	Y	NA	SORT1,PSMA5,SYPL2,ATXN7L2	CELSR2,SORT1,PSMA5,SYPL2,CYB561D1,MYBPHL,ATXN7L2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PSMA5	14456	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr1	110142749	110143055	110142903	Y	PSRC1,GNAT2	AMPD2	NA	NA	NA	NA	AMPD2	13671	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	110160052	110160461	110160231	Y	GNAI3,FAM40A,AMPD2,AMPD2,AMPD2	AMPD2,GSTM4,GSTM2	NA	NA	NA	NA	AMPD2	3326	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	110364881	110365302	110365225	Y	GNAI3,AMPD2,CSF1	NA	CSF1,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	GSTM3	82497	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	110420039	110420145	110420092	Y	UBL4B	CSF1	CSF1,AHCYL1,EPS8L3,GNAI3,CYB561D1,ATXN7L2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CSF1	30719	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	110626726	110627062	110626895	Y	NA	NA	ALX3,FAM40A,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC6A17	64046	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	110778589	110778756	110778673	Y	NA	KCNC4	NA	NA	NA	NA	KCNC4	26624	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	110947330	110947681	110947535	Y	NA	LAMTOR5-AS1	NA	NA	NA	NA	LAMTOR5-AS1	23889	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	111186366	111186880	111186713	Y	NA	NA	KCNA3	IMR90	Hi-C	24141950	LAMTOR5-AS1	262925	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	111191148	111191392	111191279	Y	LRIF1,CD53,KCNA3	NA	NA	NA	NA	NA	LAMTOR5-AS1	267707	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	111251861	111252073	111251987	Y	LRIF1,CD53	NA	NA	NA	NA	NA	LRIF1	252628	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	112050044	112050594	112050328	Y	C1orf183,C1orf183,CEPT1,DRAM2,RAP1A,C1orf162,ADORA3	RAP1A	NA	NA	NA	NA	RAP1A	32246	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	112058341	112058601	112058437	Y	RAP1A,C1orf162,ADORA3	RAP1A	NA	NA	NA	NA	RAP1A	24239	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr1	112058803	112059167	112059005	Y	C1orf183,C1orf183,RAP1A,C1orf162,ADORA3	RAP1A	NA	NA	NA	NA	RAP1A	23673	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	113072370	113072489	113072380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNT2B	65207	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	113932415	113932748	113932683	Y	NA	MAGI3	NA	NA	NA	NA	MAGI3	1044	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	114236415	114236760	114236542	Y	MAGI3	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF1	63351	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	114244987	114245321	114245197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF1	54790	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	114258659	114258989	114258824	Y	NA	PHTF1	NA	NA	NA	NA	PHTF1	41122	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	115713702	115714032	115713976	Y	NGF	NA	NGF	IMR90	Hi-C	24141950	NGF	164825	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	115873164	115873576	115873409	Y	NGF	NGF	NA	NA	NA	NA	NGF	5281	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	115968975	115969167	115969071	Y	NA	NA	NGF	IMR90	Hi-C	24141950	NGF	90118	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	116088478	116088732	116088606	Y	NA	NA	NGF,VANGL1,SYCP1	IMR90	Hi-C	24141950	VANGL1	93842	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	116321345	116321551	116321511	Y	NA	NA	CASQ2	IMR90	Hi-C	24141950	VANGL1	138771	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	116370977	116371565	116371162	Y	SLC22A15	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A15	145554	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	116920378	116921129	116920740	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	7088	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	117132073	117132239	117132154	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	20412	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr1	117533270	117533527	117533328	Y	CD58,CD101	NA	NA	NA	NA	NA	TTF2	67398	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr1	119526348	119526895	119526588	Y	NA	TBX15	NA	NA	NA	NA	TBX15	3284	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	18.8510564440195
chr1	120178530	120178767	120178634	Y	NA	GAPDHP33,ZNF697,PHGDH	NA	NA	NA	NA	ZNF697	9629	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	120188395	120188927	120188667	Y	NA	PHGDH	NA	NA	NA	NA	ZNF697	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr1	120608824	120609208	120608880	Y	NOTCH2	NOTCH2	NA	NA	NA	NA	NOTCH2	1032	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	120692453	120692808	120692620	Y	NBPF7,NOTCH2	NA	NA	NA	NA	NA	NOTCH2	82213	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST2H2BA	581054	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	144533627	144534178	144533764	Y	PDE4DIP	RNU1-59P	PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNU1-59P	1589	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	144871122	144871347	144871255	Y	PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF9	61378	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	144927217	144927550	144927432	Y	PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10	RNU2-38P	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	15122	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	144987154	144987391	144987382	Y	NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	RNU2-38P	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	44482	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	144988079	144988414	144988189	Y	NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP	RNU2-38P	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	45407	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	144993199	144993244	144993232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	50527	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	145000077	145000849	145000623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	57405	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	145005016	145005394	145005195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	62344	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	145012331	145013054	145012678	Y	NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	61132	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	145023690	145024549	145024240	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	49637	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	145036432	145036531	145036463	Y	NA	PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	37655	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	145054975	145055306	145055182	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	PDE4DIP,SEC22B	NOTCH2NL,LOC728875,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDE4DIP	18880	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	145064438	145064839	145064449	Y	PDE4DIP	PDE4DIP,SEC22B	NOTCH2NL,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9,LOC728875	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDE4DIP	9347	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	145065013	145065489	145065359	Y	NA	PDE4DIP,SEC22B	NOTCH2NL,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9,LOC728875,PFN1P2,NBPF10	IMR90	Hi-C	24141950	PDE4DIP	8697	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	145090155	145090603	145090483	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	PDE4DIP,SEC22B	NBPF9,LOC653513,PDE4DIP,NOTCH2NL,SEC22B,LOC728875,NBPF10	IMR90	Hi-C	24141950	SEC22B	3617	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	145092450	145092883	145092733	Y	SEC22B,PDE4DIP	PDE4DIP,SEC22B	NBPF9,LOC653513,PDE4DIP,NOTCH2NL,SEC22B,LOC728875,NBPF10	IMR90	Hi-C	24141950	SEC22B	1337	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr1	145106553	145106772	145106662	Y	NA	PDE4DIP,SEC22B	NA	NA	NA	NA	SEC22B	12333	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	145113904	145114998	145114671	Y	PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NBPF10,NOTCH2NL	PDE4DIP,SEC22B	NA	NA	NA	NA	SEC22B	19684	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr1	145455122	145455741	145455465	Y	PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP	TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L,RBM8A	NA	NA	NA	NA	POLR3GL	12647	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	145519496	145519624	145519499	Y	NBPF10,TXNIP	LIX1L,RBM8A,RP11-315I20.1,GNRHR2,PEX11B,ITGA10,ANKRD35	NA	NA	NA	NA	ITGA10	3267	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	145701524	145701615	145701570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF115	92488	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	145702718	145703106	145702912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF115	93682	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	146764405	146764804	146764606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD1L	52114	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	146774989	146775112	146775013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD1L	62698	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	147104963	147105320	147105142	Y	NA	ACP6	NA	NA	NA	NA	ACP6	35298	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	147344950	147345054	147345002	Y	NA	NA	GJA5	IMR90	Hi-C	24141950	ACP6	204332	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.13408186158711
chr1	149222771	149223127	149223106	Y	NA	RNU1-92P	NBPF10,SEC22B,NBPF15	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-92P	9471	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	149820361	149820952	149820609	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2AA4	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	149910900	149911536	149911461	Y	NA	SV2A,SF3B4,MTMR11	NA	NA	NA	NA	MTMR11	4109	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	149981648	149981889	149981683	Y	ANP32E,OTUD7B	OTUD7B	NA	NA	NA	NA	OTUD7B	1023	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	150135231	150135764	150135536	Y	PRPF3,MCL1,PLEKHO1	PLEKHO1	NA	NA	NA	NA	PLEKHO1	15858	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	150185878	150186128	150186012	Y	HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E	ANP32E,RNU2-17P	NA	NA	NA	NA	ANP32E	20376	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr1	150577042	150577503	150577391	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	22585	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr1	150585815	150586394	150586132	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,FAM63A,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	13694	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	150592182	150592667	150592572	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	7421	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	150772798	150773105	150772952	Y	NA	CTSS,CTSK	NA	NA	NA	NA	CTSK	5694	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	151168916	151169086	151168995	Y	NA	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	491	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	151172620	151173197	151172669	Y	TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	4195	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	151184646	151184728	151184696	Y	NA	LYSMD1,VPS72,PIP5K1A,PSMD4	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	16221	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	151255796	151256115	151256047	Y	NA	PSMD4,ZNF687,PI4KB	NA	NA	NA	NA	ZNF687	3702	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	151344220	151344519	151344431	Y	NA	PI4KB,RFX5,SELENBP1,PSMB4	NA	NA	NA	NA	SELENBP1	1011	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	151580936	151581099	151580976	Y	NA	SNX27,RP11-404E16.1	RIIAD1,CELF3	IMR90	Hi-C	24141950	SNX27	1442	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	151877533	151877895	151877666	Y	THEM4	THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	2389	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	151913574	151913780	151913675	Y	S100A10	THEM4	S100A10,CELF3,THEM4,RORC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	33290	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	151913815	151914271	151914054	Y	S100A10	THEM4	S100A10,CELF3,THEM4,RORC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	33531	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	151918166	151918684	151918434	Y	NA	THEM4,S100A10	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	37882	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	151945068	151945221	151945146	Y	TUFT1,S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	19645	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	151973450	151973865	151973747	Y	S100A10	S100A10,S100A11	THEM4,S100A10,S100A11,RORC	IMR90	Hi-C	24141950	S100A10	8584	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	152116191	152116374	152116281	Y	LCE3A	FLG-AS1	NA	NA	NA	NA	FLG-AS1	22227	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	152878475	152878651	152878603	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRR2D	133756	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr1	152878925	152879083	152878954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRR2D	133324	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	153504746	153504953	153504860	Y	PGLYRP3,S100A7L2,SLC39A1	BX470102.3,S100A6,S100A5,S100A3,S100A4,S100A2	NA	NA	NA	NA	BX470102.3	667	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	153505144	153505346	153505245	Y	NA	BX470102.3,S100A6,S100A5,S100A3,S100A4,S100A2	NA	NA	NA	NA	BX470102.3	1065	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	153541018	153541368	153541269	Y	PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13	BX470102.3,S100A6,S100A5,S100A3,S100A4,S100A2,S100A16	NA	NA	NA	NA	S100A2	2652	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	153670755	153671012	153670885	Y	S100A9,S100A12	SNAPIN,ILF2,INTS3	NA	NA	NA	NA	INTS3	27531	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	153704694	153704943	153704839	Y	NA	INTS3,SLC27A3	NA	NA	NA	NA	INTS3	6151	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	153715466	153715694	153715559	Y	PGLYRP3,INTS3	INTS3,SLC27A3	NA	NA	NA	NA	INTS3	16923	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	153762591	153763309	153762932	Y	NPR1	SLC27A3	NA	NA	NA	NA	SLC27A3	17761	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	153767353	153767730	153767624	Y	NA	SLC27A3	NA	NA	NA	NA	SLC27A3	22523	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	153841080	153841191	153841137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	52260	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	153845025	153845089	153845058	Y	NA	GATAD2B	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	48362	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	153929776	153930098	153929954	Y	NA	GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CRTC2	675	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	154154606	154155027	154154830	Y	SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	10097	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	154299137	154299452	154299353	Y	UBAP2L,ATP8B2,IL6R	ATP8B2	NA	NA	NA	NA	ATP8B2	3108	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	154392646	154393050	154392862	Y	CRTC2,UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,ADAR,IL6R	IL6R	NA	NA	NA	NA	IL6R	16977	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	154832851	154833092	154832964	Y	RUSC1-AS1,RUSC1,RUSC1,CLK2,ADAR,KCNN3,PMVK,KCNN3	KCNN3	NA	NA	NA	NA	KCNN3	7664	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	154910155	154910399	154910216	Y	ADAR,PBXIP1,MTX1	PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1	NA	NA	NA	NA	PMVK	2688	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	154973335	154973935	154973656	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	208	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	155064132	155064186	155064153	Y	NA	ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3	NA	NA	NA	NA	EFNA3	29908	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	TRIM46,KRTCAP2,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr1	155283531	155283932	155283776	Y	DCST1,EFNA1	HCN3,CLK2,FDPS,RUSC1	NA	NA	NA	NA	RUSC1	4755	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	155830201	155830522	155830413	Y	ASH1L,MEX3A,ARHGEF2,ARHGEF2	GON4L,SYT11,RIT1	ARHGEF2,RXFP4,SNORA42,RIT1,KIAA0907	IMR90	Hi-C	24141950	SYT11	2901	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr1	155904830	155905033	155904931	Y	NA	RIT1,KIAA0907	NA	NA	NA	NA	KIAA0907	2639	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	155951073	155951535	155951364	Y	NA	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	23326	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr1	156073142	156073699	156073532	Y	YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	22778	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	156073854	156074351	156074085	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	23490	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	156074715	156075305	156075042	Y	YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	24351	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	156095033	156095181	156095051	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA	MEX3A,LMNA	NA	NA	NA	NA	LMNA	44669	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	156118146	156118395	156118328	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2	SLC25A44	NA	NA	NA	NA	SLC25A44	43485	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	156134935	156135401	156135063	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2	SLC25A44,PMF1-BGLAP,PMF1	NA	NA	NA	NA	SLC25A44	26479	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	41117	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	4.62384403343873
chr1	156464458	156464805	156464586	Y	NA	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	3815	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	156468556	156468776	156468632	Y	MEF2D	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2D	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	156472693	156472952	156472780	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4073	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr1	156474686	156475018	156474923	Y	SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6066	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	156541089	156541488	156541192	Y	NA	IQGAP3,APOA1BP,GPATCH4	MEF2D,C1orf61	IMR90	Hi-C	24141950	IQGAP3	693	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr1	156629760	156630406	156629967	Y	PAQR6,PAQR6,C1orf182,CCT3,ISG20L2,GPATCH4,HAPLN2	RP11-284F21.7,NES,CRABP2	NA	NA	NA	NA	RP11-284F21.7	544	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	156676478	156676824	156676750	Y	C1orf85,PEAR1,CRABP2,CRABP2	RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC	NA	NA	NA	NA	CRABP2	2870	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	3.37896294751292
chr1	156677217	156677612	156677436	Y	NA	RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC	NA	NA	NA	NA	CRABP2	3609	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr1	156679562	156679883	156679727	Y	NA	NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC	NA	NA	NA	NA	CRABP2	5954	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	156718467	156719136	156718868	Y	C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	65	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr1	156966343	156966626	156966486	Y	NA	ARHGEF11	NA	NA	NA	NA	ARHGEF11	46536	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	157076072	157076782	157076408	Y	RRNAD1,ETV3,ETV3	ETV3	NA	NA	NA	NA	ETV3	29484	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	157106691	157107326	157106962	Y	RRNAD1,ETV3,ETV3	ETV3	NA	NA	NA	NA	ETV3	425	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	157938818	157938961	157938889	Y	NA	KIRREL	AIM2,LOC646268,IFI16,KIRREL,CD1D	IMR90	Hi-C	24141950	KIRREL	22102	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	157980631	157980890	157980708	Y	KIRREL	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	19568	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr1	157989414	157989935	157989469	Y	KIRREL	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	28351	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr1	158119500	158119689	158119553	Y	NA	ELL2P1	LOC646268,KIRREL,AIM2	IMR90	Hi-C	24141950	ELL2P1	25856	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr1	158147244	158147839	158147743	Y	NA	ELL2P1	NA	NA	NA	NA	ELL2P1	1699	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	158942717	158942925	158942799	Y	OR10J1,OR10R2,OR6P1,OR10X1,OR10Z1,OR6K3,OR6N1,OR6N2,FCER1A,PYHIN1	IFI16	NA	NA	NA	NA	IFI16	24833	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	159851477	159851987	159851825	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	C1orf204,CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	CCDC19	15966	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	159859603	159860031	159859945	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	C1orf204,CCDC19,TAGLN2	C1orf204,SLAMF8	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC19	7922	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	160203977	160204039	160204035	Y	NA	PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8	NA	NA	NA	NA	RP11-574F21.2	25495	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	161170933	161171185	161171002	Y	ADAMTS4,NDUFS2	USP21,PPOX,B4GALT3,NDUFS2,ADAMTS4,TOMM40L	NA	NA	NA	NA	ADAMTS4	4087	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	161348767	161349231	161349047	Y	NDUFS2	NA	NA	NA	NA	NA	SDHC	66720	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr1	161352257	161352597	161352426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDHC	70210	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	NA	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	77619	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.95624170645485
chr1	161360317	161360802	161360606	Y	NA	NA	NR1I3,APOA2,TOMM40L,NDUFS2,ADAMTS4,SDHC,UFC1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	78270	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	NA	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	87026	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	3.9124834129097
chr1	161500608	161500899	161500816	Y	USF1,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A,ATF6,HSPA6,FCGR3B,FCGR3A,FCGR3A	NA	NA	NA	NA	NA	FCRLB	188454	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	161502624	161502920	161502837	Y	ADAMTS4,PCP4L1,C1orf192,OLFML2B	NA	NA	NA	NA	NA	FCRLB	186433	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	161582212	161582506	161582417	Y	HSPA6,FCGR3A	NA	NA	NA	NA	NA	FCRLB	106847	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	161700146	161700332	161700210	Y	NA	FCRLB,DUSP12,ATF6	NA	NA	NA	NA	FCRLB	10793	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	161706477	161706712	161706625	Y	HSPA6,FCRLB,ATF6	FCRLB,DUSP12,ATF6	DUSP12	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP12	10836	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	161973003	161973384	161973069	Y	NA	OLFML2B	NA	NA	NA	NA	OLFML2B	18260	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	162508612	162508929	162508802	Y	UAP1	UHMK1,UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	20394	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	162539981	162540420	162539994	Y	C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1	UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	10658	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	162599583	162599804	162599661	Y	NA	DDR2	NA	NA	NA	NA	DDR2	420	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr1	162709795	162709973	162709884	Y	NOS1AP,DDR2	NA	NA	NA	NA	NA	DDR2	110632	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	162846595	162846764	162846655	Y	DDR2,RGS4,RGS4,RGS4,RGS4	NA	C1orf110,RGS4,RGS5	IMR90	Hi-C	24141950	RGS4	189801	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	163844797	163845064	163844971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB3P6	478940	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	164580985	164581415	164581219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	58164	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	164686304	164686686	164686418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	163483	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	164717528	164717907	164717706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	194707	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	164750243	164750515	164750387	Y	PBX1	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	227422	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	165345662	165345996	165345868	Y	NA	NA	LRRC52,LOC400794	IMR90	Hi-C	24141950	MGST3	252102	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	165635693	165636148	165635824	Y	NA	MGST3,ALDH9A1	NA	NA	NA	NA	ALDH9A1	29952	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	165797615	165798367	165798308	Y	UCK2	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	2623	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	165823413	165823808	165823568	Y	NA	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	28421	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	166102836	166102913	166102873	Y	NA	FAM78B	NA	NA	NA	NA	FAM78B	31293	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	166828089	166828463	166828188	Y	POU2F1,POGK	POGK,TADA1	NA	NA	NA	NA	TADA1	15101	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.95624170645485
chr1	167322904	167323093	167323001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POU2F1	134838	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	167635730	167635903	167635817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPZL1	52526	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	167683554	167683813	167683605	Y	POU2F1,CREG1	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	4616	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr1	167766380	167766616	167766548	Y	SFT2D2,CREG1	RP1-313L4.4	NA	NA	NA	NA	RP1-313L4.4	20870	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	167772811	167773182	167772825	Y	CREG1	RP1-313L4.4	NA	NA	NA	NA	RP1-313L4.4	14304	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	168050664	168051125	168050872	Y	SFT2D2	NA	NA	NA	NA	NA	GPR161	53696	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	168149052	168149361	168149233	Y	NA	GPR161,TIPRL,SFT2D2	NA	NA	NA	NA	TIPRL	2881	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	168338134	168338331	168338175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	89856	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	169464285	169464545	169464529	Y	BLZF1,SLC19A2	SLC19A2,AL021068.1	NA	NA	NA	NA	AL021068.1	10905	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	169834996	169835276	169835168	Y	NA	SCYL3	NA	NA	NA	NA	SCYL3	26132	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	169886878	169886942	169886910	Y	NA	SCYL3	NA	NA	NA	NA	SCYL3	25470	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	170042588	170042670	170042627	Y	C1orf112	KIFAP3	NA	NA	NA	NA	KIFAP3	9679	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	170604086	170604323	170604205	Y	NA	PRRX1	KIFAP3,GORAB,METTL11B	IMR90	Hi-C	24141950	PRRX1	25546	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	170630769	170630992	170630884	Y	NA	PRRX1	NA	NA	NA	NA	PRRX1	900	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	170633923	170634526	170634465	Y	PRRX1	PRRX1	NA	NA	NA	NA	PRRX1	4054	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	170635008	170635144	170635076	Y	PRRX1	PRRX1	NA	NA	NA	NA	PRRX1	5139	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	170636506	170636902	170636792	Y	PRRX1	PRRX1	NA	NA	NA	NA	PRRX1	6637	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.95624170645485
chr1	170637621	170637732	170637679	Y	PRRX1	PRRX1	NA	NA	NA	NA	PRRX1	7752	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr1	170638824	170639138	170638981	Y	NA	PRRX1	NA	NA	NA	NA	PRRX1	8955	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr1	170669976	170670263	170670185	Y	PRRX1	PRRX1	NA	NA	NA	NA	PRRX1	40107	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr1	170677232	170677374	170677311	Y	PRRX1	PRRX1	NA	NA	NA	NA	PRRX1	47363	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	171407653	171408026	171407772	Y	FMO4,PRRC2C	PRRC2C	PRRC2C	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2C	44625	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	171473011	171473311	171473138	Y	NA	PRRC2C	NA	NA	NA	NA	PRRC2C	20360	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	171712214	171712716	171712399	Y	FMO4,PRRC2C	VAMP4,METTL13	NA	NA	NA	NA	VAMP4	2827	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr1	171832189	171832290	171832196	Y	DNM3	DNM3	NA	NA	NA	NA	DNM3	23568	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	172106187	172106635	172106273	Y	NA	MIR214,MIR199A2,DNM3OS	NA	NA	NA	NA	MIR214	140	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	172291507	172291926	172291559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	119304	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr1	172608229	172608375	172608255	Y	NA	NA	C1orf9,FASLG	IMR90	Hi-C	24141950	PIGC	196999	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	172631926	172632270	172632095	Y	C1orf9,C1orf9,FASLG	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	220696	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	173091914	173092434	173092232	Y	NA	NA	TNFSF4,LOC100506023	IMR90	Hi-C	24141950	PRDX6	351971	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	173958715	173958784	173958750	Y	NA	RC3H1,RP11-160H22.3	NA	NA	NA	NA	RC3H1	30651	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	179110934	179111289	179111201	Y	AXDND1,SOAT1,TOR3A,ABL2	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	62422	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	179115539	179115872	179115703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	67027	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	180249791	180250006	180249913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSOX1	127822	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	180613229	180613603	180613357	Y	NA	XPR1	NA	NA	NA	NA	XPR1	14089	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	180921044	180921090	180921069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX6	68957	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	181060502	181060611	181060567	Y	STX6,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	4864	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	181065454	181065797	181065538	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	9816	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	181068595	181069000	181068732	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	12957	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	181104473	181105818	181105427	Y	STX6,MR1,IER5	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48835	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	182118170	182119053	182118696	Y	RNASEL,GLUL,GLUL	NA	GLUL	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GLUL	240288	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	182259351	182259676	182259514	Y	NA	NA	GLUL	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GLUL	99665	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	182854499	182854851	182854644	Y	NA	DHX9	NA	NA	NA	NA	DHX9	47995	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	183132366	183132749	183132653	Y	LAMC2	NA	NA	NA	NA	NA	LAMC1	141771	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	183161027	183161375	183161120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAMC1	170432	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	183237084	183237447	183237420	Y	NA	NA	LAMC2	IMR90	Hi-C	24141950	SMG7	201904	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	183248987	183249454	183249212	Y	NCF2,NCF2,ARPC5,LAMC1	NA	NA	NA	NA	NA	SMG7	189897	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	183578502	183578873	183578650	Y	NCF2,NCF2,ARPC5	ARPC5,RGL1	NA	NA	NA	NA	ARPC5	24019	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	183579279	183579568	183579440	Y	NA	ARPC5,RGL1	NA	NA	NA	NA	ARPC5	23324	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	183912062	183912419	183912241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSEN15	106392	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	184005350	184005919	184005662	Y	RGL1,GLT25D2	TSEN15	RGL1	IMR90	Hi-C	24141950	TSEN15	12892	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	184033703	184034036	184033838	Y	NA	TSEN15	NA	NA	NA	NA	TSEN15	14892	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	184794829	184794875	184794854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	72782	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	184852237	184852590	184852311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM129A	89092	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	185127324	185127657	185127491	Y	SWT1,SWT1	TRMT1L,SWT1	NA	NA	NA	NA	SWT1	3112	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	185250433	185250655	185250484	Y	HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	33806	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	186042920	186043354	186043253	Y	HMCN1,OCLM	NA	NA	NA	NA	NA	TPR	299471	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	186567965	186567976	186567970	Y	NA	NA	PLA2G4A	IMR90	Hi-C	24141950	PTGS2	79583	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	186587444	186588060	186587743	Y	PTGS2,PLA2G4A,C1orf27	NA	PLA2G4A	IMR90	Hi-C	24141950	PTGS2	59499	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	186625019	186625399	186625247	Y	PTGS2,PLA2G4A,C1orf27	PTGS2	NA	NA	NA	NA	PTGS2	22160	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	186936898	186937303	186937025	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	140813	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	186970666	186971051	186970863	Y	PTGS2,PLA2G4A	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	174581	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	192757327	192757592	192757471	Y	TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS1	RGS2	NA	NA	NA	NA	RGS2	18577	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	192923906	192924334	192924233	Y	NA	NA	RGS2	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP126	80791	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	193073509	193073815	193073644	Y	NA	TROVE2,UCHL5,GLRX2,CDC73	NA	NA	NA	NA	GLRX2	265	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	193080839	193080969	193080896	Y	NA	GLRX2,CDC73	NA	NA	NA	NA	GLRX2	7595	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	198128112	198128944	198128293	Y	PTPRC,DENND1B	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	4019	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	198850238	198850638	198850585	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	726145	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	200321353	200321596	200321470	Y	DDX59,ZNF281	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF281	55588	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	200379777	200379959	200379899	Y	NA	ZNF281	NA	NA	NA	NA	ZNF281	2593	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr1	200857233	200857815	200857711	Y	KIF21B	NA	NA	NA	NA	NA	CAMSAP2	150547	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	201139670	201140154	201139905	Y	NA	TMEM9,IGFN1	KIF21B,IGFN1,LAD1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM9	968	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	201160901	201161255	201161022	Y	IGFN1	TMEM9,IGFN1	NA	NA	NA	NA	IGFN1	2948	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	201236006	201236165	201236054	Y	LAD1,C1orf106,PKP1	NA	NA	NA	NA	NA	IGFN1	78053	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	201508517	201509575	201509484	Y	NA	RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	CSRP1	31933	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	201520953	201521395	201521173	Y	NA	RP11-134G8.7,CSRP1	NAV1,RPS10P7,IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	CSRP1	44369	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	201605860	201605966	201605934	Y	NA	NA	IPO9,NAV1,PHLDA3,CSRP1,RPS10P7	IMR90	Hi-C	24141950	CSRP1	129276	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	201618983	201619286	201619160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSRP1	142399	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	201619383	201619798	201619705	Y	SHISA4,GPR37L1,NAV1	NA	NA	NA	NA	NA	CSRP1	142799	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	201682596	201682901	201682784	Y	ARL8A	NA	NA	NA	NA	NA	IPO9	113368	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	202075010	202075191	202075097	Y	PPP1R12B,ELF3,LGR6	ARL8A	RNPEP,LGR6,NAV1,ELF3,ARL8A,GPR37L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARL8A	36678	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	202217450	202217807	202217629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2T	91301	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	202872285	202872308	202872297	Y	NA	RP11-480I12.5,RABIF,HNRNPA1P59,KLHL12	RABIF	MCF7	ChIA-PET	22265404	HNRNPA1P59	6632	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	111155	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr1	203489584	203489741	203489635	Y	BTG2	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	103948	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	203525711	203525894	203525744	Y	NA	NA	ATP2B4,PRELP,LAX1,ZC3H11A,OPTC,FMOD	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B4	67795	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	203598711	203598999	203598777	Y	BTG2	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	5022	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	204386444	204387188	204386898	Y	PPP1R15B	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	7525	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	204976101	204976640	204976291	Y	LRRN2,LRRN2,NFASC,TMEM81,TMCC2,KLHDC8A,DSTYK,CNTN2,CDK18,NFASC	NA	NA	NA	NA	NA	RBBP5	112503	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	205253892	205254222	205253971	Y	NUAK2	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	34661	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	206725353	206725581	206725439	Y	IKBKE,MAPKAPK2,FAIM3,FAIM3,RASSF5	RASSF5,RP11-534L20.4	NA	NA	NA	NA	RP11-534L20.4	25105	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	206807155	206807335	206807245	Y	NA	EIF2D,DYRK3,MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	DYRK3	274	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	206859136	206859493	206859328	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	2847	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	206918122	206918360	206918230	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,DYRK3,IL19,MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	61833	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	206942297	206942469	206942439	Y	RASSF5,MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	86008	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	207069223	207069337	207069332	Y	NA	IL24,RP11-564A8.4	NA	NA	NA	NA	IL24	435	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	207609085	207609375	207609309	Y	CR2	NA	PFKFB2,C4BPA,C4BPB,CR1	IMR90	Hi-C	24141950	CD55	116232	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	208021631	208021781	208021738	Y	CR1,CD46,PLXNA2,CD34	C1orf132	CD34	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf132	18714	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	208136912	208137268	208137107	Y	NA	NA	CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf132	96417	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr1	208339104	208339123	208339122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	76542	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	209915892	209916078	209915980	Y	NA	RP1-28O10.1,C1orf74	NA	NA	NA	NA	RP1-28O10.1	20422	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	209942657	209943400	209942924	Y	LAMB3,G0S2,TRAF3IP3	RP1-28O10.1,C1orf74	NA	NA	NA	NA	C1orf74	12504	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	209996933	209997272	209996990	Y	NA	C1orf74,DIEXF	DIEXF,IRF6,C1orf74	K562	ChIA-PET	22265404	DIEXF	2080	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	210056461	210057439	210056772	Y	NA	NA	DIEXF,SYT14	IMR90	Hi-C	24141950	DIEXF	57109	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	210058060	210058292	210058164	Y	LAMB3	NA	DIEXF,SYT14	IMR90	Hi-C	24141950	DIEXF	58708	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	211035320	211035533	211035504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-543B16.1	309286	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	211712804	211713120	211712963	Y	NA	SLC30A1	NEK2,RD3,SLC30A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC30A1	36964	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	211950086	211950249	211950170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	51865	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	212113260	212113497	212113379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTS7	93387	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	212256975	212257253	212257095	Y	DTL,INTS7	RPL21P28	NA	NA	NA	NA	RPL21P28	33604	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	212513330	212513719	212513465	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5A	56451	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	212650622	212650921	212650683	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NENF	NSL1,ATF3,FAM71A,BATF3,FLVCR1,VASH2,ANGEL2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	46393	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	212656151	212656660	212656299	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NENF,BATF3,TATDN3,NSL1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	51922	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr1	212769584	212769966	212769788	Y	ANGEL2,PPP2R5A,ATF3,ATF3,ATF3	ATF3	NA	NA	NA	NA	ATF3	32908	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	214332608	214332757	214332710	Y	NA	NA	RPS6KC1	IMR90	Hi-C	24141950	SMYD2	119688	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	214614555	214614760	214614639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	109032	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	214620076	214620672	214620502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	103120	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	215130656	215131050	215130800	Y	KCNK2,KCNK2	NA	KCNK2	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP24	88579	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	215198285	215198630	215198297	Y	KCNK2,KCNK2	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP24	156208	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	215691115	215691317	215691220	Y	NA	KCTD3	KCNK2,CENPF,SMYD2,PTPN14	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD3	47418	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	215741534	215741966	215741880	Y	KCTD3	KCTD3	NA	NA	NA	NA	KCTD3	2799	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	216774004	216774285	216774188	Y	ESRRG,ESRRG	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	1028139	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	216938634	216938811	216938777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	863613	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	218382752	218383112	218382930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRP15	73517	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	220393257	220393560	220393376	Y	EPRS,BPNT1,RAB3GAP2	MORF4L1P1	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	31352	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	221135331	221135824	221135593	Y	HLX	NA	NA	NA	NA	NA	HLX	85632	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	221631911	221632097	221631999	Y	NA	NA	DUSP10,HHIPL2	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	281421	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	221877654	221878134	221877871	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	35384	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	221904432	221904724	221904722	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	8794	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.31192201671937
chr1	222060426	222060817	222060685	Y	NA	NA	DUSP10	MCF7	ChIA-PET	22265404	DUSP10	146908	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	222638782	222639204	222638963	Y	NA	NA	DUSP10,MIA3,AIDA,BROX	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-378J18.3	121963	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr1	222830626	222830783	222830705	Y	TAF1A,MIA3	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	41198	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	223095586	223095912	223095632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DISP1	109180	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	223964690	223965055	223964731	Y	TP53BP2,FBXO28	NA	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	66619	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	224012866	224013246	224013103	Y	NA	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	18428	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	224023477	224023773	224023693	Y	CAPN2,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	7901	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	224032316	224032686	224032418	Y	CAPN2,FBXO28,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	642	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	5.33520465396777
chr1	224356788	224356993	224356891	Y	WDR26,TP53BP2,FBXO28	RP11-365O16.1,DEGS1	NA	NA	NA	NA	RP11-365O16.1	4415	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	224393253	224393414	224393305	Y	NA	RP11-365O16.1,DEGS1	NA	NA	NA	NA	DEGS1	31795	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	224730441	224730985	224730669	Y	NA	NA	CNIH3	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	107706	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr1	224732016	224732357	224732199	Y	CNIH3	NA	CNIH3,CNIH4	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	109281	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr1	224811590	224812043	224811760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR26	188855	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	224819300	224819585	224819443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR26	196565	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	224914627	224914789	224914675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAH14	167175	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr1	225843222	225843438	225843341	Y	NA	ENAH,RP11-145A3.1	NA	NA	NA	NA	ENAH	4378	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	226297611	226298113	226297674	Y	NA	NA	ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	H3F3A	50059	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	226435130	226435332	226435236	Y	PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A	NA	NA	NA	NA	NA	LIN9	60238	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	226852222	226852636	226852379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSEN2	203249	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	226890865	226891416	226891300	Y	ITPKB	NA	NA	NA	NA	NA	PSEN2	164469	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr1	227976197	227976490	227976208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD4	55085	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	228272073	228272409	228272248	Y	NA	ARF1,C1orf35,MRPL55	NA	NA	NA	NA	ARF1	3712	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr1	228633222	228633907	228633608	Y	TRIM11,TRIM17,HIST3H2A	TRIM11,RP11-245P10.4,HIST3H2A,HIST3H2BB,HIST3H2BA,RNF187	NA	NA	NA	NA	HIST3H2A	9653	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RNF187	110504	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	230220475	230220731	230220560	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	28939	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	230241590	230241986	230241849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	50054	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	230249347	230250007	230249645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	57811	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	230282048	230282189	230282138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	90512	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	231002258	231002436	231002323	Y	C1orf198,C1orf198,C1orf198	C1orf198	NA	NA	NA	NA	C1orf198	899	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	231868761	231869568	231868969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSNAX	206362	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr1	233409089	233409391	233409240	Y	NA	RPS7P3,PCNXL2	NA	NA	NA	NA	RPS7P3	13802	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	234630748	234630905	234630828	Y	NA	TARBP1	LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,ARID4B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TARBP1	17899	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	234737347	234737653	234737498	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	5618	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	234746093	234747674	234747395	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	2822	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr1	234792654	234793437	234793098	Y	NA	IRF2BP2	IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRF2BP2	49383	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	234858843	234859287	234859154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	115572	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr1	234908151	234908764	234908277	Y	IRF2BP2	NA	IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRF2BP2	164880	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	235091427	235091813	235091690	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	198438	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	235097868	235098070	235097979	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	192181	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	235114050	235115068	235114636	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	175183	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	235133014	235133422	235133155	Y	NA	NA	LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	156829	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	235267591	235267744	235267678	Y	NA	TOMM20	NA	NA	NA	NA	TOMM20	22507	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	235668656	235669018	235668830	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	B3GALNT2	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	2875	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	236022682	236022818	236022763	Y	GPR137B,LYST	LYST	NA	NA	NA	NA	LYST	22122	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	236080566	236081247	236080933	Y	LYST,GPR137B	LYST	B3GALNT2,LYST,NID1	IMR90	Hi-C	24141950	LYST	35626	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr1	236083263	236083651	236083332	Y	GPR137B	LYST	LYST,NID1	IMR90	Hi-C	24141950	LYST	38323	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	236135691	236135959	236135881	Y	GPR137B	NA	LYST	IMR90	Hi-C	24141950	NID1	90503	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	236150188	236150690	236150367	Y	GPR137B	NA	NA	NA	NA	NA	NID1	75772	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	236179538	236179652	236179595	Y	NA	NID1	NA	NA	NA	NA	NID1	46810	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	236431064	236431243	236431072	Y	LGALS8,ERO1LB	ERO1LB	NA	NA	NA	NA	ERO1LB	12076	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	238817061	238817213	238817137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01139	169738	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	240308207	240308537	240308375	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22918	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	240397761	240398076	240397984	Y	GREM2	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	66306	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	240433849	240434175	240434014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	102394	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	240437557	240437954	240437680	Y	FMN2	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	106102	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	241441480	241441685	241441535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS7	76845	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	243428005	243428394	243428166	Y	CEP170,SDCCAG8	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	10685	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	243431437	243431793	243431509	Y	NA	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	14117	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	243644284	243644683	243644595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	226964	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	243806306	243806448	243806376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	205933	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	243923195	243923609	243923504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	88772	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	244512430	244512879	244512496	Y	ADSS	NA	C1orf100,ADSS,AKT3	IMR90	Hi-C	24141950	ADSS	100557	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	244763140	244763529	244763408	Y	ADSS,EFCAB2	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf101	147461	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	245544255	245544624	245544440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26B	227968	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	246038342	246038749	246038555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	629865	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr1	246387027	246387389	246387208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	281225	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	246760708	246760962	246760810	Y	SMYD3,CNST	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	32962	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr1	246948292	246948613	246948340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCCPDH	62943	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	247035132	247035504	247035470	Y	CNST,ZNF669,AHCTF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	57776	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	247206107	247206337	247206222	Y	NA	ZNF695,ZNF670	NA	NA	NA	NA	ZNF670	33776	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	247326566	247327229	247326989	Y	NA	MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	36133	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr1	248894360	248894532	248894495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3124	224044	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr10	361512	361916	361783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYND11	183107	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	384217	384634	384602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYND11	205812	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	500969	501047	501008	Y	ZMYND11	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2C	232636	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	516106	516519	516355	Y	ZMYND11,ZMYND11,ZMYND11,ZMYND11,DIP2C	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2C	217164	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	1100843	1101035	1100898	Y	NA	IDI1,WDR37	NA	NA	NA	NA	WDR37	7365	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	3216614	3216797	3216708	Y	NA	PITRM1	NA	NA	NA	NA	PITRM1	3611	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	3239590	3239795	3239693	Y	NA	PITRM1	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	26587	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	3510310	3510716	3510597	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	297307	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr10	3511181	3511689	3511507	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	298178	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr10	3568141	3568290	3568192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF6	257183	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	3928866	3929216	3928980	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	103393	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	3929991	3930887	3930290	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	104518	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	4283808	4284356	4284092	Y	NA	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr10	4289203	4289519	4289251	Y	NA	LINC00702	KLF6,LOC338588,LOC100216001	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	5099	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	4358748	4358982	4358870	Y	NA	NA	KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	74644	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	4414900	4415114	4415024	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	130796	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	4705159	4705783	4705486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKR1E2	121038	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	4812953	4813314	4813133	Y	NA	AKR1E2	KLF6,PITRM1	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1E2	13507	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	4855217	4855416	4855349	Y	NA	AKR1E2	KLF6,NET1	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1E2	28396	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	5770570	5770836	5770703	Y	NA	FAM208B	NA	NA	NA	NA	FAM208B	45769	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	5783071	5783414	5783247	Y	NA	NA	GDI2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM208B	58270	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	6093148	6093558	6093320	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3,RBM17,RBM17	RBM17	NA	NA	NA	NA	RBM17	35392	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	6206285	6206560	6206485	Y	NA	PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	21404	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	6234464	6234853	6234702	Y	NA	PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	49583	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	6915397	6915415	6915406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	730516	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	7362038	7362350	7362337	Y	SFMBT2,SFMBT2	NA	NA	NA	NA	NA	KIN	465640	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	8145104	8145382	8145246	Y	GATA3	NA	NA	NA	NA	NA	TAF3	286637	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	8662161	8662543	8662250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF3	803694	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	11737081	11737223	11737138	Y	NA	NA	USP6NL	IMR90	Hi-C	24141950	USP6NL	85328	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	11917828	11918087	11917940	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	UPF2	165082	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	12313010	12313140	12313022	Y	UPF2,UPF2,CAMK1D	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	76341	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	12490797	12491318	12490959	Y	SEC61A2,CAMK1D	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	101316	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	13388296	13388525	13388411	Y	NA	PHYH	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	13391797	13392252	13392084	Y	SEPHS1	PHYH,SEPHS1	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	3500	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	13754952	13755339	13755135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	128025	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	13758221	13758456	13758339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	131294	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	13908290	13908478	13908416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	281363	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	13915234	13915426	13915347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	288307	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	14003091	14003406	14003339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	376164	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	14026617	14027027	14026853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	399690	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	14051386	14052060	14051814	Y	PRPF18	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	424459	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr10	14641847	14641963	14641950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	139706	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	14647138	14647588	14647478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	144997	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	16802586	16802595	16802591	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSU1	54932	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	17067559	17067950	17067759	Y	VIM	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	174103	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr10	17068694	17069080	17068926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	172973	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	17071536	17072103	17071684	Y	VIM,TRDMT1	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	169950	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr10	17104584	17104750	17104681	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	137303	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	17105178	17105416	17105257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	136637	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	17116431	17116714	17116628	Y	VIM	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	125339	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	17280857	17281170	17281014	Y	TRDMT1,VIM	TRDMT1,VIM,RP11-124N14.3	NA	NA	NA	NA	RP11-124N14.3	6025	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	17707752	17708081	17707913	Y	VIM,ST8SIA6,STAM	STAM	NA	NA	NA	NA	STAM	23628	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	18860767	18861138	18861132	Y	NA	RP11-499P20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-499P20.2	28187	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	21386477	21386751	21386615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT10	434343	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	21436057	21436346	21436225	Y	C10orf113,NEBL	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT10	384748	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	21816029	21816444	21816223	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	4650	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr10	22540192	22540343	22540282	Y	DNAJC1,BMI1	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD3	62560	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	22725331	22726270	22725901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	117191	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.84544248211614
chr10	22922432	22922728	22922682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	78756	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	23845968	23846451	23845996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTUD1	119770	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr10	25240272	25240935	25240716	Y	ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1	PRTFDC1	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	739	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	26775274	26775560	26775412	Y	APBB1IP,PDSS1,ABI1	NA	NA	NA	NA	NA	APBB1IP	50142	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	27026601	27027004	27026841	Y	MASTL,APBB1IP,PDSS1,ABI1	PDSS1	NA	NA	NA	NA	PDSS1	42013	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	27481306	27481450	27481356	Y	PTCHD3	MASTL,YME1L1,ACBD5	NA	NA	NA	NA	YME1L1	39111	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	27531769	27532240	27532024	Y	ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5	ACBD5	NA	NA	NA	NA	ACBD5	2710	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr10	29761620	29761743	29761682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	65289	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	29879091	29879350	29879257	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	144360	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	30927139	30927274	30927203	Y	MAP3K8,ZNF438,ZNF438	NA	LOC729668,MAP3K8,LYZL2,ZEB1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K8	206273	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	31025766	31026097	31025992	Y	NA	NA	ZEB1,ARHGAP12,ZEB1-AS1,KIF5B,ZNF438	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	292769	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	31073492	31073855	31073655	Y	NA	NA	ARHGAP12,ZEB1-AS1,ZEB1,ZNF438	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	245011	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	31109229	31109540	31109356	Y	NA	NA	ZEB1,ARHGAP12,KIF5B,ZNF438,ZEB1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	209326	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	31422679	31422989	31422772	Y	ZNF438,ZNF438	NA	ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	103813	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	31770032	31770371	31770202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZEB1-AS1	162656	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	31892273	31892723	31892643	Y	NA	NA	ZEB1	IMR90	Hi-C	24141950	ZEB1-AS1	284897	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr10	31986692	31987073	31986913	Y	NA	NA	ARHGAP12,ZEB1,ZNF438	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP12	228669	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr10	32335843	32336217	32336161	Y	NA	KIF5B	NA	NA	NA	NA	KIF5B	7142	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	32626420	32626786	32626539	Y	NA	EPC1	NA	NA	NA	NA	EPC1	38940	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	33269452	33269916	33269602	Y	C10orf68	ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	22804	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr10	33272272	33272613	33272373	Y	ITGB1,ITGB1,ITGB1	ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	20107	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	33415871	33415993	33415948	Y	NA	NA	ITGB1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	123151	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	33522627	33522949	33522766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	100241	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	33537661	33538041	33537751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	85149	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	33541909	33542109	33542065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	81081	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	33562254	33562552	33562425	Y	ITGB1,ITGB1,NRP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	60638	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr10	33621123	33621423	33621243	Y	NRP1	NRP1	NA	NA	NA	NA	NRP1	1767	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	33701574	33701923	33701712	Y	NA	NA	PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	NRP1	78384	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	35431185	35431238	35431212	Y	NA	CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	17466	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	36783467	36783622	36783545	Y	NA	NAMPTL	FZD8	IMR90	Hi-C	24141950	NAMPTL	27540	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	42398389	42399045	42398432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNYL2	566643	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	42400063	42400397	42400233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNYL2	565291	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr10	42817169	42817557	42817529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNYL2	148131	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	43950893	43951349	43951098	Y	NA	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-517P14.2	36707	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	44185196	44185271	44185205	Y	NA	ZNF32	NA	NA	NA	NA	ZNF32	42892	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	44289212	44289448	44289386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF32	146908	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	44373947	44374132	44374049	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF32	231643	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	45470476	45470795	45470517	Y	NA	RASSF4,C10orf10,ZNF22	NA	NA	NA	NA	C10orf10	1463	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	49495763	49496101	49496063	Y	NA	MAPK8	FRMPD2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MAPK8	16597	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	49745028	49745223	49745126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP22	117087	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	49814847	49815442	49815148	Y	NA	ARHGAP22	NA	NA	NA	NA	ARHGAP22	46868	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	50371813	50372032	50371905	Y	FAM170B,C10orf128	NA	NA	NA	NA	NA	VSTM4	50259	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	52753196	52753414	52753311	Y	PRKG1	PRKG1	NA	NA	NA	NA	PRKG1	4251	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	53930569	53930919	53930744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKK1	141137	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	54078280	54078480	54078433	Y	NA	DKK1	NA	NA	NA	NA	DKK1	6224	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	54078781	54079176	54078966	Y	NA	DKK1	NA	NA	NA	NA	DKK1	6725	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	54203068	54203427	54203228	Y	NA	NA	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DKK1	131012	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	54203502	54203868	54203680	Y	DKK1	NA	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DKK1	131446	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr10	54246557	54246950	54246727	Y	DKK1	NA	DKK1,LOC100506939,PRKG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DKK1	174501	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr10	54774491	54774616	54774570	Y	MBL2	NA	NA	NA	NA	NA	DKK1	702435	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	60949726	60949909	60949819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13C	171030	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	61019605	61019954	61019626	Y	PHYHIPL,PHYHIPL,SLC16A9,FAM13C,FAM13C	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13C	100985	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	61645173	61645419	61645305	Y	NA	CCDC6	NA	NA	NA	NA	CCDC6	18995	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	63663540	63663817	63663641	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	4481	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	63697847	63698199	63697988	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	38788	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	63752119	63752912	63752632	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	93060	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	64504029	64504215	64504107	Y	NRBF2,EGR2,EGR2	NA	NA	NA	NA	NA	ADO	58301	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	65016713	65017097	65017085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRBF2	125663	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	65053315	65053443	65053389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	131614	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	65078433	65078736	65078637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	106321	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	65269177	65269730	65269542	Y	NA	JMJD1C,REEP3	REEP3,JMJD1C,LOC84989	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	REEP3	9393	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	65388414	65388608	65388512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	109291	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr10	65930110	65930546	65930307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-170M17.2	269105	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	68710552	68710810	68710582	Y	LRRTM3	LRRTM3	NA	NA	NA	NA	LRRTM3	26788	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC12	13236	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr10	69778500	69778679	69778642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERC4	54426	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	69796463	69796828	69796573	Y	HERC4	HERC4	NA	NA	NA	NA	HERC4	36277	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	69854882	69855277	69855187	Y	HERC4	HERC4	ATOH7,HNRNPH3,PBLD,MYPN,HERC4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HERC4	21777	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	69913307	69913725	69913572	Y	SIRT1,PBLD,HNRNPH3	NA	NA	NA	NA	NA	HERC4	80202	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	69962839	69962995	69962921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPH3	125936	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	70088080	70088572	70088236	Y	SIRT1,PBLD,HNRNPH3	HNRNPH3,PBLD	NA	NA	NA	NA	HNRNPH3	359	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	70821151	70821852	70821361	Y	DDX21,VPS26A,SRGN	SRGN	KIAA1279,DDX21,SRGN,VPS26A,SUPV3L1	IMR90	Hi-C	24141950	SRGN	24010	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	70846057	70846170	70846083	Y	NA	SRGN,VPS26A	NA	NA	NA	NA	SRGN	195	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	70884620	70884824	70884718	Y	DDX21,SUPV3L1,SRGN	SRGN,VPS26A	NA	NA	NA	NA	VPS26A	3352	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	71655656	71655993	71655813	Y	COL13A1	NA	NA	NA	NA	NA	COL13A1	96012	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	71662112	71662205	71662157	Y	H2AFY2	NA	NA	NA	NA	NA	COL13A1	102468	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	72424506	72424875	72424691	Y	ADAMTS14	ADAMTS14	KIAA1274,PRF1,ADAMTS14	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ADAMTS14	5684	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr10	72433363	72433696	72433541	Y	ADAMTS14	ADAMTS14	NA	NA	NA	NA	ADAMTS14	2804	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	72502385	72502568	72502493	Y	SGPL1	NA	NA	NA	NA	NA	SGPL1	71149	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	72973788	72974249	72973953	Y	UNC5B	UNC5B	NA	NA	NA	NA	UNC5B	3461	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	73605642	73606023	73605974	Y	DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	NA	NA	NA	NA	PSAP	3103	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	73620184	73620641	73620392	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PSAP	11058	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	73652284	73652469	73652411	Y	NA	PSAP	DNAJB12,PSAP,CHST3,CDH23,ASCC1,SPOCK2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PSAP	43158	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	74020239	74021717	74020385	Y	C10orf54,PSAP,DNAJB12,DDIT4	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	DNAJB12	K562	ChIA-PET	22265404	DDIT4	9961	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	74056833	74058104	74057179	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	25155	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.48976217185163
chr10	74068319	74068595	74068530	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ASCC1,ANAPC16	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DDIT4	36641	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	74080430	74080993	74080646	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	31995	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	74174604	74174793	74174677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	61616	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	74289425	74289733	74289722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICU1	94166	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	75022023	75022098	75022060	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	RP11-152N13.5	11474	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	75666465	75666800	75666554	Y	ANXA7,NDST2	CAMK2G,PLAU	NA	NA	NA	NA	PLAU	135	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	76053029	76053199	76053114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADK	144069	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	77533067	77533251	77533127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf11	174069	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	78790288	78790415	78790352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	605938	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	79152642	79152983	79152827	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	243370	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	79261142	79261358	79261250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	134995	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	79291052	79291779	79291330	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	104574	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	79291885	79292096	79291976	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	104257	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr10	79538272	79538371	79538344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	141919	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	79592026	79592206	79592119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	92172	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	79731077	79731252	79731165	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	46699	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	80015034	80015301	80015187	Y	RPS24	LINC00856	NA	NA	NA	NA	LINC00856	8529	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	80015725	80016226	80016048	Y	RPS24	LINC00856	NA	NA	NA	NA	LINC00856	9220	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	80091311	80091643	80091437	Y	NA	NA	LOC100132987,LOC283050,ZMIZ1,RPS24	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00856	84806	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	80516479	80516892	80516667	Y	ZMIZ1	NA	LOC283050,RPS24,ZMIZ1,POLR3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZMIZ1	309900	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	92669	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr10	80734291	80734943	80734463	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	91849	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr10	80830818	80831199	80831077	Y	ZMIZ1	ZMIZ1	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	4026	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	80841621	80841843	80841705	Y	NA	ZMIZ1	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	14829	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	81009590	81010024	81009644	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	95201	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	81025991	81026714	81026492	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	78511	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	81030651	81030992	81030820	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	74233	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	81077317	81078576	81077648	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	26649	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	81085771	81086240	81085963	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	18985	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	81088418	81088982	81088641	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	16243	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	81091409	81091966	81091732	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	13259	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr10	81962798	81963579	81963388	Y	SH2D4B,ANXA11	EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr10	82237584	82237869	82237663	Y	TSPAN14	TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	25662	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	84418756	84419073	84418915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHITM	1478123	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr10	88471302	88471860	88471725	Y	LDB3,LDB3,LDB3	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	42547	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	88866849	88867228	88867039	Y	NA	FAM35A,GLUD1	NA	NA	NA	NA	GLUD1	14226	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	89912666	89913039	89912909	Y	NA	NA	KLLN,PTEN,RNLS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-380G5.3	209407	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	90689067	90689322	90689158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAMBPL1	51576	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	90711253	90711764	90711560	Y	LIPF,CH25H,ACTA2	FAS	NA	NA	NA	NA	FAS	36650	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	91647685	91647987	91647742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNRPD2P1	88487	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	92690903	92691268	92691118	Y	NA	ANKRD1	ANKRD1,PCGF5	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD1	11870	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	92921990	92922253	92922075	Y	HECTD2	NA	ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PCGF5	55655	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	92974122	92974225	92974155	Y	NA	PCGF5	NA	NA	NA	NA	PCGF5	3683	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	93373148	93373298	93373228	Y	NA	PPP1R3C	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	17513	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.84544248211614
chr10	94367821	94367909	94367865	Y	CYP26C1,KIF11	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	16778	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	95146698	95147164	95146872	Y	MYOF	NA	NA	NA	NA	NA	MYOF	92910	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	95196959	95197603	95197264	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42471	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr10	95218561	95218998	95218660	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	21076	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr10	95225325	95225770	95225711	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	14304	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr10	95226262	95226423	95226291	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	13651	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	95228207	95228553	95228471	Y	MYOF,CEP55,CEP55	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	11521	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.95624170645485
chr10	96943397	96943661	96943560	Y	SORBS1,SORBS1	NA	C10orf129,SORBS1	IMR90	Hi-C	24141950	PDLIM1	105120	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	97518502	97518757	97518660	Y	ENTPD1,ENTPD1	NA	NA	NA	NA	NA	TCTN3	66602	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	97809134	97809259	97809196	Y	NA	CCNJ,ENTPD1-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNJ	7983	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	98332019	98332237	98332217	Y	NA	NPM1P26,TM9SF3	NA	NA	NA	NA	TM9SF3	12972	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	99302907	99303185	99303057	Y	RRP12,PI4K2A	MMS19,UBTD1,HOGA1,PI4K2A	HOGA1,ANKRD2	IMR90	Hi-C	24141950	HOGA1	38895	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	99408797	99409067	99408957	Y	NA	MORN4,AVPI1	NA	NA	NA	NA	MORN4	17453	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr10	99449337	99449738	99449607	Y	C10orf28,RRP12,PI4K2A	AVPI1,MARVELD1,ZFYVE27	NA	NA	NA	NA	AVPI1	4257	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	100120877	100121283	100120897	Y	PYROXD2,LOXL4	NA	PYROXD2,C10orf28,LOXL4,HPS1	IMR90	Hi-C	24141950	PYROXD2	51658	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	101381465	101381554	101381515	Y	NA	SLC25A28,ENTPD7	NA	NA	NA	NA	SLC25A28	3099	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	101539519	101539906	101539726	Y	NA	COX15	NA	NA	NA	NA	COX15	49662	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	101736797	101737134	101736959	Y	BLOC1S2,BLOC1S2,DNMBP	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	30542	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	101765990	101766360	101766233	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	1316	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	101944283	101944461	101944347	Y	DNMBP,CWF19L1,CHUK,BLOC1S2,BLOC1S2,ERLIN1,ERLIN1	ERLIN1,CHUK,RP11-316M21.6	NA	NA	NA	NA	ERLIN1	1630	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	103124623	103124787	103124739	Y	FBXW4	BTRC	DPCD,POLL	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	12803	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	103699141	103699397	103699242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf76	114553	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	104387544	104387817	104387672	Y	GBF1,CUEDC2,ACTR1A	TRIM8	NA	NA	NA	NA	TRIM8	14436	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr10	104406801	104407099	104407026	Y	NFKB2,NFKB2,NFKB2,C10orf26,TRIM8	TRIM8	NA	NA	NA	NA	TRIM8	4548	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	104504643	104504897	104504711	Y	NA	ARL3,SFXN2	NA	NA	NA	NA	SFXN2	32348	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	104545681	104545915	104545784	Y	NT5C2,NFKB2,NFKB2,NFKB2,C10orf32	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf32	66065	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	104562998	104563277	104563137	Y	NT5C2,NFKB2,NFKB2,NFKB2,C10orf32	C10orf32	NA	NA	NA	NA	C10orf32	48703	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	104892620	104892981	104892840	Y	C10orf32,NT5C2	NA	NA	NA	NA	NA	NT5C2	58075	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	105230970	105231363	105231243	Y	NT5C2,CALHM2	CALHM2	CALHM2,PDCD11,CALHM1,USMG5	IMR90	Hi-C	24141950	CALHM2	20310	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	105530330	105530632	105530481	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	82669	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	105610087	105610227	105610144	Y	NA	SH3PXD2A	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	3074	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	105667994	105668449	105668210	Y	GSTO1,GSTO1,SLK	OBFC1	NA	NA	NA	NA	OBFC1	7514	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr10	105681714	105681858	105681786	Y	NA	OBFC1,SLK	NA	NA	NA	NA	OBFC1	5751	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	105869782	105869970	105869884	Y	GSTO1,GSTO1,CCDC147,SLK,MEIR5,MEIR5	SFR1	NA	NA	NA	NA	SFR1	9846	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	106052804	106053054	106052846	Y	MEIR5,MEIR5,GSTO1	GSTO2,ITPRIP	NA	NA	NA	NA	GSTO2	26173	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	106065321	106065564	106065443	Y	NA	GSTO2,ITPRIP	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	30598	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	106087819	106088091	106087906	Y	SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147	ITPRIP	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	8071	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr10	106109390	106109845	106109501	Y	SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147	ITPRIP	ITPRIP	K562	ChIA-PET	22265404	ITPRIP	13228	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	111649725	111649915	111649787	Y	NA	XPNPEP1	NA	NA	NA	NA	XPNPEP1	31396	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	111725333	111725444	111725334	Y	NA	XPNPEP1,ADD3	NA	NA	NA	NA	ADD3	28682	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	111834173	111834352	111834276	Y	ADD3,SMNDC1,MXI1,MXI1	NA	NA	NA	NA	NA	ADD3	80047	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	112113245	112113632	112113326	Y	NA	NA	SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMNDC1	50536	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	112158460	112158738	112158533	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	95751	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	112159079	112159451	112159258	Y	NA	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	96145	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	112170161	112170538	112170357	Y	DUSP5	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	85058	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	112207134	112207519	112207380	Y	NA	DUSP5	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	48077	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr10	112261043	112261328	112261185	Y	SHOC2,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	5447	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	112263780	112264181	112263965	Y	SHOC2,PDCD4,BBIP1,BBIP1,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	8184	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	112272592	112272848	112272747	Y	SHOC2,BBIP1,BBIP1,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	16996	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	112670931	112671385	112671330	Y	NA	PDCD4,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	5647	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	112674359	112675211	112674854	Y	NA	PDCD4,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	1821	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	114094924	114095156	114095118	Y	NA	ACSL5	TECTB	IMR90	Hi-C	24141950	ACSL5	36620	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	114531236	114531374	114531260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	176635	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	114709018	114709405	114709296	Y	TCF7L2	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	1009	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	114715800	114716132	114715855	Y	NA	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	7791	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	119046334	119046783	119046648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD8	86195	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	119069713	119069747	119069730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD8	63231	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	119157808	119158126	119157971	Y	NA	PDZD8	NA	NA	NA	NA	PDZD8	24830	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	120968752	120969030	120968753	Y	EIF3A,GRK5	SFXN4,PRDX3,GRK5	NA	NA	NA	NA	GRK5	3651	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	121161203	121161864	121161442	Y	EIF3A	NA	NA	NA	NA	NA	RGS10	138356	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	121412148	121412380	121412196	Y	BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	3266	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	123873239	123873409	123873290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	126550	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr10	123900074	123900243	123900143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	153385	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	124067478	124067825	124067684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA1	64387	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	124254349	124254758	124254614	Y	NA	HTRA1	NA	NA	NA	NA	HTRA1	35308	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr10	124613518	124613778	124613722	Y	NA	FAM24B,RP11-564D11.3	NA	NA	NA	NA	FAM24B	23379	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	125047496	125047735	125047709	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BUB3	135703	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	126213697	126214091	126213879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHPP	65294	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	126349618	126349650	126349637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	81188	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	127472572	127472831	127472732	Y	NA	UROS,BCCIP	NA	NA	NA	NA	UROS	36986	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	127535706	127535819	127535763	Y	MMP21	UROS,BCCIP,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	BCCIP	25591	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	127751033	127751319	127751198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	167925	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	127751937	127752037	127751987	Y	MMP21	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	168829	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	127813462	127813834	127813648	Y	ADAM12	NA	FANK1	IMR90	Hi-C	24141950	FANK1	230354	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	127822846	127823186	127823128	Y	MMP21	NA	NA	NA	NA	NA	FANK1	239738	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	127915196	127915439	127915419	Y	ADAM12,MMP21	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM12	159585	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr10	127932254	127933051	127932680	Y	ADAM12	NA	FANK1	IMR90	Hi-C	24141950	ADAM12	141973	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	127941447	127942303	127942296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM12	132721	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	128258462	128258762	128258558	Y	NA	NA	FANK1,DHX32,ADAM12	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00601	150014	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	128947297	128947480	128947351	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK1	355319	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr10	130875080	130875084	130875082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EBF3	885021	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	131073294	131073614	131073464	Y	NA	NA	EBF3,MGMT	IMR90	Hi-C	24141950	EBF3	686491	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	131758339	131758817	131758766	Y	EBF3	EBF3	NA	NA	NA	NA	EBF3	1288	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	131819686	131819939	131819817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EBF3	59581	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	133793049	133793425	133793362	Y	NA	BNIP3	PPP2R2D	IMR90	Hi-C	24141950	BNIP3	10	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	133794080	133794414	133794353	Y	NA	BNIP3	PPP2R2D	IMR90	Hi-C	24141950	BNIP3	645	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	134330832	134331178	134331005	Y	NA	INPP5A	INPP5A,ADAM8,C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	INPP5A	18146	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr10	134361912	134362323	134362096	Y	PWWP2B,INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	12588	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr10	135072735	135073128	135072895	Y	TUBGCP2,ADAM8	ADAM8,ZNF511	NA	NA	NA	NA	ADAM8	15244	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,IFITM3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	IFITM3	30340	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr11	1404403	1404794	1404637	Y	DUSP8,BRSK2	NA	TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOLLIP	75519	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	2484558	2484875	2484798	Y	TRPM5,KCNQ1	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC4	64840	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	2643075	2643474	2643317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	75750	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	2655024	2655339	2655183	Y	TRPM5,KCNQ1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	63885	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	2669931	2670236	2670070	Y	INS,ASCL2,TRPM5	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	48988	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	2717684	2718130	2717946	Y	TSSC4,TRPM5,KCNQ1	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	1094	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	2988914	2989223	2989024	Y	MRGPRG,SLC22A18	NAP1L4	NA	NA	NA	NA	NAP1L4	22384	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	3090855	3091125	3090991	Y	NA	RNU1-91P,CARS	NA	NA	NA	NA	CARS	14012	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	3190882	3191107	3191009	Y	NA	OSBPL5	NA	NA	NA	NA	OSBPL5	4913	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	3860220	3860837	3860518	Y	NA	PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1	NA	NA	NA	NA	RHOG	7	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	6281699	6281893	6281830	Y	TRIM3,DCHS1,APBB1,APBB1	FAM160A2	NA	NA	NA	NA	FAM160A2	27758	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	6489893	6490567	6490471	Y	OR56A4,OR56A1,OR56B4,OR52W1,OR2AG1,OR2AG2,OR10A5,OR10A4,OR10A2,OR6A2,DCHS1	TRIM3,ARFIP2	NA	NA	NA	NA	TRIM3	3122	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	6667820	6668268	6668018	Y	OR6A2,DCHS1	RRP8,ILK,TAF10,TPP1,MRPL17	NA	NA	NA	NA	TPP1	29128	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr11	6723829	6724231	6724032	Y	NA	MRPL17	NA	NA	NA	NA	MRPL17	21197	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	7719377	7719648	7719531	Y	NA	CYB5R2	NA	NA	NA	NA	CYB5R2	22924	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr11	7913705	7913868	7913824	Y	NA	RP11-35J10.5,RP11-494M8.4	NA	NA	NA	NA	RP11-35J10.5	11211	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	8973817	8973979	8973898	Y	NA	ST5,AKIP1,TMEM9B-AS1,TMEM9B,NRIP3	C11orf16	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM9B-AS1	10243	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	9310546	9310889	9310715	Y	ZNF143,NRIP3,DENND5A,TMEM41B	DENND5A,TMEM41B	NA	NA	NA	NA	TMEM41B	23438	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr11	9587499	9588027	9587720	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1	ZNF143,LOC644656	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	WEE1	5201	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	9590279	9590748	9590469	Y	WEE1,WEE1	WEE1	LOC644656,ZNF143	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	WEE1	2480	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	9635436	9636077	9635827	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1,SWAP70	WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WEE1	42208	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr11	9686542	9686911	9686729	Y	ZNF143,SWAP70	SWAP70	NA	NA	NA	NA	SWAP70	2918	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	9997247	9997641	9997474	Y	AMPD3	NA	NA	NA	NA	NA	SWAP70	313623	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	10323282	10323617	10323398	Y	NA	SBF2,RP11-351I24.1,ADM,AMPD3	NA	NA	NA	NA	RP11-351I24.1	31	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	10347188	10347587	10347388	Y	ADM	SBF2,RP11-351I24.1,ADM,AMPD3	NA	NA	NA	NA	AMPD3	19328	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	10404161	10404389	10404339	Y	ADM	NA	SWAP70,SBF2,LOC283104,MRVI1-AS1,AMPD3,MRVI1,MTRNR2L8,RNF141,LYVE1,ADM	IMR90	Hi-C	24141950	AMPD3	76301	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	10862862	10862982	10862965	Y	NA	SNORD97,EIF4G2,ZBED5	NA	NA	NA	NA	ZBED5	15361	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	11899555	11899888	11899585	Y	NA	USP47	NA	NA	NA	NA	USP47	38585	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	12097914	12098716	12098251	Y	PARVA,MICALCL,MICAL2	MICAL2	MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	14827	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	12133218	12133350	12133292	Y	MICAL2	MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	19675	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	12181262	12181458	12181363	Y	MICALCL,MICAL2	NA	MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	67719	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	12204570	12205016	12204699	Y	MICAL2	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	91027	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	12218036	12218499	12218053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	104493	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	12309352	12309734	12309588	Y	TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	PARVA	86998	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr11	12701917	12702070	12702017	Y	TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	7948	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	13238046	13238305	13238120	Y	NA	NA	ARNTL,BTBD10,LOC100506305	IMR90	Hi-C	24141950	ARNTL	57894	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr11	13283262	13283494	13283392	Y	NA	ARNTL	ARNTL	IMR90	Hi-C	24141950	ARNTL	12705	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	13359856	13360227	13360061	Y	ARNTL	NA	NA	NA	NA	NA	ARNTL	63657	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	14356156	14356413	14356247	Y	NA	RRAS2	NA	NA	NA	NA	RRAS2	27639	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	15837558	15838109	15837858	Y	NA	NA	C11orf58	IMR90	Hi-C	24141950	C11orf58	794570	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	17335831	17335998	17335921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUCB2	108131	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	17374298	17375700	17374969	Y	RPS13,B7H6	NA	NA	NA	NA	NA	NUCB2	146598	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	18405328	18405801	18405464	Y	HPS5,TSG101,SPTY2D1	LDHA	NA	NA	NA	NA	LDHA	8134	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	18426412	18426598	18426470	Y	NA	LDHA	NA	NA	NA	NA	LDHA	12477	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	18649925	18650050	18650045	Y	NA	UEVLD,SPTY2D1	NA	NA	NA	NA	SPTY2D1	4288	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	19701731	19702025	19701818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	331460	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	19736892	19737150	19737126	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	366621	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr11	19957110	19957424	19957380	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	425807	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr11	27263345	27263487	27263411	Y	NA	RP11-1L12.3	LGR4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1L12.3	23685	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	27739901	27740316	27740092	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	1289	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	28063321	28063497	28063482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL15	64298	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	28132530	28132826	28132694	Y	NA	METTL15,KIF18A	NA	NA	NA	NA	KIF18A	4675	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	28701449	28701661	28701530	Y	NA	NA	BDNF,BDNF-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	573594	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	29207165	29207501	29207312	Y	NA	NA	BDNF,BDNF-AS1,KIF18A	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	1079310	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	30127536	30127914	30127726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC24	1261473	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	32743947	32744079	32744012	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3M	140603	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	33313001	33313236	33313097	Y	NA	HIPK3	NA	NA	NA	NA	HIPK3	36783	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	33711808	33712191	33712002	Y	CD59	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	43800	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr11	33713598	33714029	33713919	Y	CD59	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	41962	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	33958868	33959233	33959043	Y	NA	NA	LMO2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CAPRIN1	111997	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	34386157	34386357	34386257	Y	ABTB2	RP1-145M24.1,ABTB2	NAT10,ABTB2,ELF5	IMR90	Hi-C	24141950	ABTB2	8602	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	34675579	34675977	34675664	Y	ABTB2,CD44	EHF	NA	NA	NA	NA	EHF	34939	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	34706877	34707176	34707110	Y	ABTB2,EHF	NA	NA	NA	NA	NA	EHF	66237	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	34919844	34920223	34920054	Y	ELF5,EHF	PDHX,APIP	NA	NA	NA	NA	PDHX	15153	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	34931457	34931889	34931828	Y	NA	PDHX,APIP	NA	NA	NA	NA	PDHX	3487	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	35029453	35029465	35029458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APIP	93407	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	35099118	35099616	35099383	Y	CD44	NA	CD44,PDHX,APIP,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	58801	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	35180596	35180888	35180668	Y	CD44	CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	22179	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	35186946	35187176	35187019	Y	CD44	CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	28529	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	35188303	35189153	35188420	Y	CD44	CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	29886	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	35297997	35298240	35298173	Y	CD44,SLC1A2,SLC1A2	NA	NA	NA	NA	NA	CD44	139580	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	35409513	35409852	35409720	Y	CD44,SLC1A2,SLC1A2	NA	NA	NA	NA	NA	PAMR1	139996	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	35508759	35508774	35508766	Y	NA	PAMR1	NA	NA	NA	NA	PAMR1	41074	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	35527662	35527995	35527828	Y	NA	PAMR1	NA	NA	NA	NA	PAMR1	21853	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr11	35571458	35571651	35571555	Y	PAMR1	PAMR1	PAMR1,PRR5L,SLC1A2,FJX1,TRIM44,LDLRAD3,COMMD9	IMR90	Hi-C	24141950	PAMR1	21610	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	35575444	35575679	35575584	Y	PAMR1,FJX1	PAMR1	PAMR1,TRIM44,LDLRAD3,FJX1	IMR90	Hi-C	24141950	PAMR1	25596	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	37525697	37526074	37525816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf74	911646	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	43360196	43360553	43360375	Y	TTC17	API5,TTC17	NA	NA	NA	NA	TTC17	17929	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	46258702	46259233	46258865	Y	DGKZ	CREB3L1	PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	37979	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	CREB3L1	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	32014	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr11	46313081	46313234	46313158	Y	NA	CREB3L1,DGKZ	NA	NA	NA	NA	CREB3L1	15869	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	46534596	46534834	46534715	Y	AMBRA1	NA	NA	NA	NA	NA	AMBRA1	78841	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	46732586	46732756	46732638	Y	NA	ARHGAP1,ZNF408	NA	NA	NA	NA	ZNF408	12218	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	47168963	47169205	47169084	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP2	27471	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	47531687	47531996	47531879	Y	SPI1,PTPRJ,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1	NA	RAPSN	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFS3	52892	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	47787265	47787534	47787400	Y	SPI1,CELF1,CELF1,CELF1,PTPRJ,FNBP4	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	270	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	47789923	47790126	47789984	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	2928	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr11	48069279	48069643	48069343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	69166	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	57045764	57045851	57045815	Y	NA	TNKS1BP1	NA	NA	NA	NA	TNKS1BP1	44575	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	57200214	57200547	57200409	Y	SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3	SLC43A3,RTN4RL2	SSRP1,TNKS1BP1,P2RX3,PRG3,PRG2,SLC43A3,TIMM10,SLC43A1,UBE2L6,SMTNL1,ZDHHC5	IMR90	Hi-C	24141950	SLC43A3	7161	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr11	57224938	57225034	57225001	Y	SLC43A1,SLC43A1,SERPING1,PRG3	SLC43A3,RTN4RL2	NA	NA	NA	NA	RTN4RL2	988	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	57242995	57243389	57243187	Y	OR5AK2,SSRP1,BTBD18,UBE2L6	SLC43A3,RTN4RL2,SLC43A1	NA	NA	NA	NA	RTN4RL2	16973	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	58263109	58263497	58263385	Y	LPXN,LPXN,OR5B21	NA	NA	NA	NA	NA	LPXN	80196	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	58319737	58319877	58319834	Y	NA	LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF	NA	NA	NA	NA	LPXN	23816	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr11	58340867	58341571	58341167	Y	OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN	LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF	NA	NA	NA	NA	LPXN	2122	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	3.37896294751292
chr11	59524471	59524655	59524596	Y	MS4A6A,MS4A6A,OSBP,PATL1,STX3	STX3	NA	NA	NA	NA	STX3	45542	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	59537612	59537828	59537719	Y	PATL1,STX3	MRPL16	NA	NA	NA	NA	MRPL16	38517	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	60789194	60789499	60789348	Y	SDHAF2,CD5,CD6	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM132A	99259	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	60906916	60907198	60907057	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	19891	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	61065380	61065516	61065448	Y	NA	DAK,DDB1	NA	NA	NA	NA	DAK	33166	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	61565191	61565522	61565357	Y	NA	FEN1,TMEM258,FADS2,FADS1	NA	NA	NA	NA	FADS2	6739	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	61690120	61690238	61690179	Y	NA	FADS3,RAB3IL1,FTH1	RAB3IL1,FTH1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RAB3IL1	4379	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	61738760	61739751	61739487	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	5628	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr11	61739990	61740514	61740301	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	6858	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr11	61872496	61872975	61872791	Y	DAGLA,FTH1	INCENP	FEN1,C11orf10,FADS3,BEST1,RAB3IL1,FADS2,C11orf9,DAGLA,DKFZP434K028,FADS1,FTH1,INCENP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INCENP	16470	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	62211626	62212261	62212170	Y	FTH1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	NA	NA	NA	NA	NA	RCC2P6	75008	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	62310227	62311393	62310863	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	AHNAK	10314	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	62320979	62321244	62321106	Y	NA	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	463	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr11	63334518	63335083	63334716	Y	RARRES3,OTUB1	PLA2G16	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	47272	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	63686695	63687182	63686923	Y	NA	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	4379	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr11	63744435	63744483	63744459	Y	KCNK4	NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	AP000721.4	4343	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	63775286	63775368	63775342	Y	KCNK4	COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	OTUB1	23961	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	63949132	63949273	63949224	Y	NA	MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4	NA	NA	NA	NA	STIP1	1471	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	64102702	64102834	64102750	Y	NA	ESRRA,TRMT112,PRDX5,RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	PRDX5	19142	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	64140304	64140795	64140552	Y	RCOR2,NAA40,GPR137,KCNK4,NRXN2,NRXN2,CDC42BPG	RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	RPS6KA4	15684	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr11	64625998	64626454	64626155	Y	CDC42EP2,RASGRP2,SF1,SF1,FAU,BATF2,EHD1	MEN1,EHD1	NA	NA	NA	NA	EHD1	27314	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	64633111	64633468	64633291	Y	CDC42EP2,SF1,SF1,FAU,EHD1	EHD1,ATG2A,PPP2R5B	NA	NA	NA	NA	EHD1	20300	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	64636604	64637051	64636910	Y	CDC42EP2,SF1,SF1,FAU,EHD1	EHD1,ATG2A,PPP2R5B	NA	NA	NA	NA	EHD1	16717	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	65058176	65058598	65058417	Y	EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	21691	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	65076655	65076852	65076688	Y	EHD1,BATF2,FAU,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	3437	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	6.22440542962907
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	5.15736449883551
chr11	65220740	65221001	65220852	Y	NA	NEAT1,AP000769.1,MALAT1	NA	NA	NA	NA	AP000769.1	12	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	65239550	65239870	65239751	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1	TIGD3,SCYL1	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18822	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	11.2039297733323
chr11	65246279	65246484	65246387	Y	SCYL1,LTBP3,EFEMP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	16749	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	3.20112279238066
chr11	65259217	65259522	65259389	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3711	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	65259637	65259913	65259840	Y	SNX32,EFEMP2,DRAP1,C11orf68	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3320	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr11	65259930	65260851	65260542	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	2382	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr11	65261229	65261625	65261527	Y	CDC42EP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	1608	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	7.64712667068714
chr11	65273934	65274467	65274182	Y	NA	MALAT1,SCYL1,LTBP3	LTBP3,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	10701	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	65323331	65323567	65323509	Y	FOSL1	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1	NA	NA	NA	NA	LTBP3	834	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr11	65537213	65537543	65537499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNASEH2C	50795	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	65656792	65657262	65656985	Y	NA	MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	CCDC85B	917	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	7.11360620529036
chr11	65670692	65670945	65670845	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1	MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	4648	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr11	65678943	65679154	65679019	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,CFL1,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,KLC2,FOSL1,SART1,DRAP1,C11orf68,BANF1	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	5434	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	6.58008573989358
chr11	65679250	65679576	65679373	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	5012	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	5.33520465396777
chr11	65683105	65683625	65683322	Y	NA	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	963	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	9.24768806687747
chr11	65852297	65852657	65852298	Y	TMEM151A,CNIH2	GAL3ST3,SF3B2,PACS1	NA	NA	NA	NA	PACS1	16463	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	66047866	66048291	66048031	Y	NA	KLC2,RAB1B,CNIH2,YIF1A,RP11-867G23.13,CD248	NA	NA	NA	NA	CNIH2	4205	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	66080826	66081241	66080906	Y	CD248	RAB1B,CNIH2,YIF1A,RP11-867G23.13,CD248,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8	NA	NA	NA	NA	CD248	1274	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	66374477	66374855	66374526	Y	NA	CTSF,CCS,CCDC87,RBM14,RBM14-RBM4,RBM4	RBM14-RBM4	IMR90	Hi-C	24141950	RBM14	7198	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	66511038	66511198	66511076	Y	KLC2,KLC2,KLC2,CNIH2,RBM4B,SPTBN2	C11orf80	NA	NA	NA	NA	C11orf80	1116	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	66738286	66738892	66738415	Y	POLD4,CLCF1,CLCF1,KDM2A,ADRBK1	PC	PC,SYT12,RHOD	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PC	14439	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	66882341	66882514	66882428	Y	NA	KDM2A	SYT12,KDM2A,SSH3,PC,RHOD,C11orf80	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KDM2A	2226	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	67037275	67037527	67037373	Y	TBC1D10C,RAD9A,PITPNM1,KDM2A,ADRBK1,ANKRD13D	ADRBK1,ANKRD13D,SSH3	NA	NA	NA	NA	ADRBK1	5394	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	67121988	67122388	67122127	Y	POLD4,CLCF1	POLD4,AP003419.11,RAD9A	NA	NA	NA	NA	POLD4	55	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr11	67138301	67138677	67138619	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	378	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	67138852	67139479	67139267	Y	NA	POLD4,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr11	67139742	67140272	67140082	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	687	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.84544248211614
chr11	67146992	67147327	67147282	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA,RPS6KB2	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	7937	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr11	67955066	67955423	67955397	Y	TCIRG1,SUV420H1	SUV420H1	NA	NA	NA	NA	SUV420H1	23872	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	68270416	68270689	68270553	Y	MRGPRD	PPP6R3	NA	NA	NA	NA	PPP6R3	44230	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	68608164	68608616	68608368	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1262	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	68611298	68611611	68611498	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1420	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	68778534	68778789	68778694	Y	MRGPRF	MRGPRF,TPCN2	NA	NA	NA	NA	MRGPRF	88	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.66760232698389
chr11	69067534	69068152	69067999	Y	TPCN2	MYEOV	NA	NA	NA	NA	MYEOV	7929	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	6.22440542962907
chr11	69069179	69069344	69069260	Y	TPCN2	MYEOV	NA	NA	NA	NA	MYEOV	9574	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr11	69069522	69069665	69069598	Y	TPCN2	MYEOV	NA	NA	NA	NA	MYEOV	9917	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr11	69089155	69089700	69089444	Y	MRGPRD	MYEOV	CCND1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYEOV	29550	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr11	69182957	69183170	69183095	Y	ORAOV1,CCND1,MYEOV	NA	CCND1,MYEOV	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MYEOV	123352	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr11	69197125	69197542	69197234	Y	ORAOV1,MYEOV	NA	MYEOV,CCND1	IMR90	Hi-C	24141950	MYEOV	137520	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	69258094	69258432	69258217	Y	CCND1	NA	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCND1	195423	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr11	69451342	69451588	69451394	Y	NA	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	2267	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	3.0232826372484
chr11	69453520	69454472	69453912	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	3.73464325777744
chr11	70150439	70150493	70150466	Y	NA	PPFIA1	NA	NA	NA	NA	PPFIA1	35633	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	70245269	70246141	70245676	Y	ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN	CTTN,AP000487.5	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	2675	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr11	71704625	71704847	71704670	Y	NA	IL18BP	NA	NA	NA	NA	IL18BP	2740	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	71829783	71830021	71829902	Y	NA	LRTOMT,NUMA1,LAMTOR1,FOLR3	NA	NA	NA	NA	FOLR3	5868	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	71990969	71991411	71991180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPPL1	58224	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	72447514	72448295	72447639	Y	P2RY2,P2RY2,FCHSD2,ATG16L2,PDE2A,ARAP1,ARAP1	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP1	54349	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	72449101	72449742	72449392	Y	P2RY2,P2RY2,FCHSD2,ATG16L2,PDE2A,ARAP1,ARAP1	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP1	52902	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	72686902	72687109	72687004	Y	RELT,RELT	NA	NA	NA	NA	NA	ATG16L2	163549	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	72968455	72968625	72968568	Y	NA	ARHGEF17	P2RY6	MCF7	ChIA-PET	22265404	ARHGEF17	48709	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	73088357	73088912	73088439	Y	NA	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	3048	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.48976217185163
chr11	73095869	73096760	73096281	Y	FCHSD2,RELT,RELT	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	10560	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	73221521	73221768	73221630	Y	PLEKHB1,PLEKHB1,FAM168A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM168A	85466	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	73490242	73490316	73490279	Y	NA	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	6045	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	73490470	73490918	73490608	Y	UCP2	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	5443	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr11	73722792	73723138	73723056	Y	LIPT2,C2CD3,UCP2	UCP2	UCP2	K562	ChIA-PET	22265404	UCP2	30440	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	74465903	74466299	74466070	Y	POLD3,RNF169	RP11-864N7.2,RNF169	XRRA1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF169	7990	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	74578028	74578161	74578096	Y	OR2AT4,XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	XRRA1	80084	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	74609449	74609745	74609637	Y	LOC441617,XRRA1	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	48500	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	74609863	74609988	74609926	Y	NA	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	48257	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	74742390	74742651	74742474	Y	ARRB1	NEU3	XRRA1,SPCS2,SLCO2B1,NEU3,OR2AT4,LOC100507050,ARRB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEU3	45211	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr11	74814562	74814987	74814735	Y	ARRB1	NA	XRRA1,LOC100507050	IMR90	Hi-C	24141950	NEU3	117383	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	75265416	75265853	75265464	Y	SERPINH1	GDPD5,SERPINH1	RPS3,GDPD5,KLHL35	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINH1	5248	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr11	75270235	75270345	75270334	Y	NA	GDPD5,SERPINH1	NA	NA	NA	NA	SERPINH1	756	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	75919893	75920246	75919996	Y	WNT11	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIR	169769	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr11	75945169	75945568	75945242	Y	NA	NA	C11orf30,MAP6,UVRAG,WNT11,PRKRIR,GUCY2E,DGAT2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKRIR	144447	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	75946917	75947052	75946991	Y	NA	NA	C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKRIR	142963	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	76463883	76464042	76463970	Y	NA	TSKU	ACER3,TSKU,B3GNT6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSKU	27253	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	76534548	76534939	76534880	Y	GDPD4	TSKU,ACER3	ACER3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACER3	34972	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	76802149	76802401	76802277	Y	NA	CAPN5	NA	NA	NA	NA	CAPN5	26170	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	77751153	77751354	77751183	Y	NA	INTS4,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2	NA	NA	NA	NA	NDUFC2-KCTD14	37557	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	77837663	77837947	77837805	Y	NA	NDUFC2-KCTD14,NDUFC2,ALG8,KCTD21-AS1	NA	NA	NA	NA	ALG8	10759	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	77898869	77899120	77899016	Y	RSF1,INTS4	USP35,KCTD21	NA	NA	NA	NA	KCTD21	1001	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	77938673	77938848	77938785	Y	NA	USP35,KCTD21	NA	NA	NA	NA	KCTD21	40805	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	78130392	78130692	78130610	Y	GAB2	GAB2	NA	NA	NA	NA	GAB2	2998	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	78426480	78426845	78426663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	142561	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr11	79130045	79130391	79130200	Y	NA	MIR708	NA	NA	NA	NA	MIR708	18892	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	79149040	79149340	79149145	Y	ODZ4	MIR708	NA	NA	NA	NA	MIR708	37887	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	83278002	83278167	83278160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC90B	282552	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr11	83350861	83351261	83351066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC90B	355411	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	83852006	83852160	83852083	Y	DLG2,DLG2	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC90B	856556	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	84316632	84316642	84316637	Y	DLG2	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM126B	1020987	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	85555514	85555895	85555623	Y	NA	SYTL2,AP000974.1	SYTL2,CCDC83,CCDC89,PICALM,EED	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000974.1	8091	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	85702937	85703343	85703240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PICALM	75581	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	85802534	85802824	85802626	Y	NA	PICALM	PICALM	IMR90	Hi-C	24141950	PICALM	23610	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	85913618	85914066	85913698	Y	PICALM,PICALM	EED	PICALM,CCDC83,EED	IMR90	Hi-C	24141950	EED	39520	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	86025840	86026030	86025935	Y	NA	C11orf73	NA	NA	NA	NA	C11orf73	14587	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	86178922	86179317	86178974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf73	167669	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	86185128	86185335	86185247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf73	173875	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	86343883	86344000	86343960	Y	NA	ME3	NA	NA	NA	NA	ME3	37678	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	86454484	86454767	86454607	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	45334	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	86454778	86455149	86454967	Y	PRSS23	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	44952	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	86620154	86620414	86620285	Y	NA	FZD4,RP11-736K20.6	ME3	IMR90	Hi-C	24141950	FZD4	44019	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	86631607	86631965	86631913	Y	ME3,ME3,ME3,TMEM135,FZD4	FZD4,RP11-736K20.6	ME3	IMR90	Hi-C	24141950	FZD4	32468	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	86642953	86643307	86643130	Y	NA	FZD4,RP11-736K20.6	NA	NA	NA	NA	FZD4	21126	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	87067687	87067836	87067698	Y	NA	NA	GRM5	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM135	320801	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	87133739	87133898	87133788	Y	NA	NA	GRM5,FZD4,LOC100506368	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM135	386853	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	87149211	87149297	87149219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM135	402325	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	88041244	88041443	88041379	Y	NA	CTSC	NA	NA	NA	NA	CTSC	27512	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	88069705	88069944	88069773	Y	CTSC	CTSC	NA	NA	NA	NA	CTSC	750	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	88071526	88071793	88071707	Y	NA	CTSC	NA	NA	NA	NA	CTSC	2571	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	88269213	88269357	88269284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTSC	200258	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	88288248	88288652	88288406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTSC	219293	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	88909137	88909241	88909198	Y	TYR	NA	NA	NA	NA	NA	GRM5	112024	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	90016507	90016673	90016590	Y	NA	RP11-121L10.3	NA	NA	NA	NA	RP11-121L10.3	2779	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	92504926	92505284	92505105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A4	423846	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	93446176	93446355	93446266	Y	NA	SCARNA9,C11orf54	NA	NA	NA	NA	SCARNA9	6324	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	93863761	93864262	93864073	Y	MED17,FUT4,PANX1	PANX1	NA	NA	NA	NA	PANX1	3667	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	93868403	93868611	93868483	Y	FUT4,PANX1	PANX1	NA	NA	NA	NA	PANX1	8309	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	95557234	95557451	95557366	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	35661	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	95610217	95610530	95610374	Y	NA	MTMR2	NA	NA	NA	NA	MTMR2	45949	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	95888692	95889856	95889448	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	184488	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	95976157	95976737	95976478	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	97607	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	96040167	96040456	96040282	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	33888	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr11	102175501	102175731	102175600	Y	BIRC2	BIRC3,BIRC2	MMP7,BIRC2	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC3	10484	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	102297400	102297813	102297636	Y	BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123	TMEM123	BIRC2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM123	41302	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	102317826	102318238	102318123	Y	BIRC3,BIRC2,TMEM123	TMEM123	NA	NA	NA	NA	TMEM123	20877	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	102867069	102867245	102867157	Y	NA	MMP13	MMP13,DCUN1D5,MMP3	IMR90	Hi-C	24141950	MMP13	42606	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	103495901	103496466	103496275	Y	NA	NA	DYNC2H1,PDGFD	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-37O16.8	217516	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	105048525	105048618	105048576	Y	CASP4,CASP5,CARD16,CARD17	NA	CASP1	IMR90	Hi-C	24141950	CARD16,CASP1	78367	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	105115100	105115515	105115329	Y	CASP4,CASP5,CARD16,CARD17	NA	GRIA4	IMR90	Hi-C	24141950	CARD16,CASP1	144942	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	105590287	105590591	105590439	Y	GRIA4,GRIA4	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-55P	102769	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	109939977	109940512	109940366	Y	FDX1,ZC3H12C	ZC3H12C	ZC3H12C	K562	ChIA-PET	22265404	ZC3H12C	21575	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	109958650	109959379	109958908	Y	NA	ZC3H12C	ZC3H12C	IMR90	Hi-C	24141950	ZC3H12C	2708	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	109966397	109966711	109966537	Y	NA	ZC3H12C	NA	NA	NA	NA	ZC3H12C	4310	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	110581726	110581943	110581819	Y	ARHGAP20	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP20	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	111195136	111195460	111195333	Y	C11orf93	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf53	70429	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	111603895	111604265	111603971	Y	NA	PPP2R1B	NA	NA	NA	NA	PPP2R1B	30886	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	112655698	112656077	112655902	Y	NA	NA	NCAM1	IMR90	Hi-C	24141950	NCAM1	173920	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	113945404	113945849	113945581	Y	ZBTB16,ZBTB16	NA	NA	NA	NA	NA	NNMT	180660	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	114192650	114192891	114192769	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NNMT	66141	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	118051304	118051408	118051361	Y	DSCAML1,FXYD6,FXYD6,TMEM25,SCN4B,SCN4B,SCN2B	NA	NA	NA	NA	NA	MPZL3	69657	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	118065939	118066307	118065952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPZL3	54758	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	118490168	118490609	118490335	Y	PHLDB1	ARCN1,IFT46,PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	15013	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	118663387	118663780	118663691	Y	NA	DDX6	NA	NA	NA	NA	DDX6	3529	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	118786339	118786473	118786384	Y	NA	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	6922	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	121526040	121526695	121526415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR125B1	441857	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	121947541	121947705	121947629	Y	NA	MIR125B1,RP11-166D19.1	NA	NA	NA	NA	MIR125B1	20847	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	122086038	122086153	122086090	Y	NA	NA	SORL1,BLID,MIR125B1,MIR100HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR100	65022	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	122311334	122311672	122311591	Y	NA	RP11-820L6.1	SC5DL,MIR100HG,MIR125B1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-820L6.1	19755	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	122552605	122552791	122552717	Y	NA	UBASH3B	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	28222	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	122596029	122596361	122596043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	71646	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	123015903	123016112	123016008	Y	NA	CLMP	NA	NA	NA	NA	CLMP	47877	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	123172454	123172607	123172529	Y	NA	NA	CLMP	IMR90	Hi-C	24141950	CLMP	108465	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	123173564	123173848	123173613	Y	NA	NA	CLMP	IMR90	Hi-C	24141950	CLMP	109575	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	123343327	123343490	123343416	Y	BSX	AP000783.1,LINC01059	HSPA8,CLMP,MIR4493	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01059	20221	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	125665065	125665247	125665168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HYLS1	86262	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	125670081	125670467	125670312	Y	CHEK1,PATE4,PATE1,PATE2	NA	NA	NA	NA	NA	HYLS1	81042	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	126322273	126322455	126322358	Y	NA	NA	ST3GAL4	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL4	98738	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	126337982	126338153	126338089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	114447	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	127391525	127391650	127391576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	1063803	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	128323342	128323695	128323510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	131758	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	128366966	128367159	128367092	Y	ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	88294	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	128373673	128373898	128373813	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	81555	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	128374504	128374665	128374585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	80788	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	128376227	128376457	128376317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	78996	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	128376891	128377234	128377096	Y	ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	78219	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	128377315	128377487	128377422	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	77966	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	129993921	129994394	129994167	Y	PRDM10,APLP2	NA	NA	NA	NA	NA	APLP2	56189	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	130392180	130392594	130392285	Y	NA	NA	SNX19,ADAMTS15	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS15	75311	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	130479003	130479154	130479069	Y	ADAMTS15	NA	ADAMTS15,SNX19	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS15	162134	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	130767627	130768066	130767878	Y	NA	SNX19	NA	NA	NA	NA	SNX19	16338	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	131619149	131619332	131619209	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	AP004372.1	145670	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	131799015	131799372	131799184	Y	NTM	AP004372.1	NA	NA	NA	NA	AP004372.1	34013	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	131934936	131935322	131935091	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	AP004372.1	169934	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr11	131942118	131942474	131942248	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	AP004372.1	177116	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	131942733	131942935	131942834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP004372.1	177731	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	131995649	131996509	131995944	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	AP004372.1	230647	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr11	131996641	131997035	131996986	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	AP004372.1	231639	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	132162679	132162975	132162706	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	AP004372.1	397677	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	132940132	132940357	132940242	Y	OPCML	NA	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	884523	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr11	134124453	134124658	134124640	Y	NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2	VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8	NA	NA	NA	NA	ACAD8	3064	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	398927	399098	399013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC77	97341	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	905489	905920	905534	Y	NA	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	45730	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	1643252	1643620	1643470	Y	NA	WNT5B	ERC1,LOC100292680,FBXL14	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5B	6195	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr12	1698560	1698670	1698614	Y	FBXL14	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	2661	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	1698978	1699322	1699295	Y	NA	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	2009	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	1717506	1717606	1717553	Y	NA	FBXL14	FBXL14,ERC1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FBXL14	16175	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	1744932	1745222	1745077	Y	NA	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	43601	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	1769144	1769497	1769318	Y	NA	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	26243	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	1769649	1770205	1769686	Y	NA	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	25535	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	2374154	2374447	2374269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP1B	262453	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	2378088	2378425	2378378	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP1B	266387	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	2444773	2444895	2444888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP1B	333072	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	2749982	2750016	2749999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP4	152103	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	3948349	3948613	3948479	Y	NA	PARP11	NA	NA	NA	NA	PARP11	31995	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	5198025	5198415	5198167	Y	NA	NA	NTF3,KCNA6,ANO2,VWF	IMR90	Hi-C	24141950	KCNA6	281683	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	5542952	5543350	5543174	Y	NTF3,NTF3	NTF3	NA	NA	NA	NA	NTF3	3674	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	5722968	5723064	5723018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTF3	183690	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr12	5918139	5918518	5918331	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTF3	378861	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	6276820	6277298	6277162	Y	VAMP1,TNFRSF1A,TAPBPL	CD9	VWF,CD9,PLEKHG6	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	29583	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	6387822	6388153	6388049	Y	NA	NA	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFRSF1A	61127	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	6444583	6445131	6444861	Y	CD4,CD4,TNFRSF1A	TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	4149	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr12	6445143	6445640	6445507	Y	VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A	TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	3640	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	6525626	6525956	6525791	Y	NA	LTBR,RP1-102E24.9,CD27-AS1,TAPBPL	TNFRSF1A,PLEKHG6,SCNN1A,TAPBPL,VAMP1,LOC678655,CD27,IFFO1,GAPDH	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-102E24.9	19708	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	6539566	6540029	6539921	Y	NA	RP1-102E24.9,CD27-AS1,TAPBPL,VAMP1	NA	NA	NA	NA	RP1-102E24.9	5635	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	6616640	6616858	6616680	Y	NA	VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH,IFFO1	NA	NA	NA	NA	SCARNA10	530	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	6622889	6622901	6622895	Y	NA	VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH,IFFO1	NA	NA	NA	NA	SCARNA10	5501	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	6663248	6663743	6663420	Y	GPR162,ENO2,C12orf53,VAMP1,IFFO1	SCARNA10,GAPDH,IFFO1,NOP2	NA	NA	NA	NA	IFFO1	9	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	6717352	6717716	6717682	Y	SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP	NOP2,CHD4,ACRBP	NA	NA	NA	NA	CHD4	2710	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	6721904	6722326	6722186	Y	GPR162,ENO2,C12orf53	NOP2,CHD4,ACRBP,ING4	NA	NA	NA	NA	CHD4	7262	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	6873427	6873901	6873603	Y	C12orf53,ENO2,CLSTN3,ATN1,PTMS,GPR162	COPS7A,PTMS,MLF2	LEPREL2,CDCA3,TPI1,CD4,GPR162,SPSB2,GNB3,USP5	IMR90	Hi-C	24141950	MLF2	740	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	7000184	7000641	7000294	Y	PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6	CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57	NA	NA	NA	NA	SPSB2	3662	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	7034730	7034838	7034794	Y	ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1	SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	3104	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	7058106	7058233	7058157	Y	ACSM4,VAMP1,ZNF384,ZNF384,CD4,CD4,LRRC23,PTPN6	ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,PHB2,C1S	NA	NA	NA	NA	RNU7-1	7127	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	7058563	7058923	7058712	Y	PEX5,VAMP1,CD4,CD4,PTPN6	ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,PHB2,C1S	NA	NA	NA	NA	RNU7-1	7584	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	7100414	7100432	7100423	Y	NA	RNU7-1,EMG1,PHB2,C1S,LPCAT3	NA	NA	NA	NA	C1S	6063	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	7736832	7737158	7736952	Y	PEX5,SLC2A3,NECAP1,C3AR1	NA	NA	NA	NA	NA	CD163L1	106339	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A3	36298	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2,C3AR1	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr12	10794413	10794704	10794528	Y	NA	MAGOHB,STYK1	NA	NA	NA	NA	MAGOHB	30191	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr12	11043114	11043456	11043318	Y	TAS2R7,TAS2R8,TAS2R31,TAS2R20,TAS2R14,TAS2R13	NA	NA	NA	NA	NA	STYK1	218197	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	11918792	11919487	11919193	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	118004	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	11987992	11988316	11988087	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	187204	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	12111679	12111898	12111693	Y	ETV6,BCL2L14	NA	ETV6,LOC338817	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-267J23.4	150199	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	12298245	12298581	12298464	Y	LRP6	RP11-267J23.4	NA	NA	NA	NA	RP11-267J23.4	36148	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	12766295	12766634	12766503	Y	DUSP16,CREBL2	CREBL2	NA	NA	NA	NA	CREBL2	3534	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	12889732	12889911	12889754	Y	LOH12CR1,DUSP16,GPR19,CDKN1B,APOLD1	CDKN1B,APOLD1	NA	NA	NA	NA	APOLD1	12881	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	12957478	12957757	12957559	Y	GPRC5A	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	6493	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	12960939	12961466	12961074	Y	NA	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	2784	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	13124934	13124993	13124963	Y	NA	HTR7P1,HEBP1	GPRC5D	IMR90	Hi-C	24141950	HTR7P1	25819	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	13253893	13254547	13254171	Y	CDKN1B,EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	58675	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr12	13292095	13292429	13292230	Y	NA	NA	EMP1,HTR7P1,KIAA1467,GSG1	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	55221	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	13325962	13326157	13326075	Y	EMP1	EMP1	HTR7P1,EMP1,HEBP1,KIAA1467,GSG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EMP1	21493	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	13326583	13326856	13326645	Y	EMP1	EMP1	HTR7P1,EMP1,HEBP1,KIAA1467,GSG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EMP1	20794	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	13359236	13359687	13359415	Y	EMP1	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	11586	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	13376138	13376415	13376269	Y	HEBP1	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	28488	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	13812261	13812521	13812427	Y	GRIN2B	NA	NA	NA	NA	NA	EMP1	464611	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	15853599	15853765	15853693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPS8	179498	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	15899366	15899730	15899546	Y	PTPRO	NA	NA	NA	NA	NA	EPS8	133533	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	15910995	15911177	15911085	Y	NA	NA	PTPRO	IMR90	Hi-C	24141950	EPS8	122086	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	19017500	19017849	19017674	Y	NA	NA	PIK3C2G,PLEKHA5	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHA5	262799	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	19284166	19284563	19284310	Y	NA	PLEKHA5	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	3518	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr12	19291558	19291779	19291581	Y	AEBP2,PLEKHA5	PLEKHA5	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	10910	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	19566135	19566181	19566158	Y	NA	AEBP2	NA	NA	NA	NA	AEBP2	11156	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	20099675	20099840	20099742	Y	PDE3A	NA	LOC100506393,PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-146P	224306	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	20780077	20780376	20780084	Y	LST-3TM12,PDE3A	NA	NA	NA	NA	NA	PDE3A	259898	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	21666002	21666378	21666190	Y	NA	RECQL,GOLT1B	NA	NA	NA	NA	GOLT1B	13287	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	24792708	24792841	24792775	Y	BCAT1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-444D3.1	79184	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	25062577	25063016	25062829	Y	BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	37377	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	25402760	25403150	25403054	Y	LRMP,CASC1,KRAS	KRAS	NA	NA	NA	NA	KRAS	890	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	25538390	25538869	25538521	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	136520	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	137212	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	4.62384403343873
chr12	25539458	25539791	25539651	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	137588	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	26130090	26130317	26130202	Y	NA	RASSF8,RASSF8-AS1	NA	NA	NA	NA	RASSF8-AS1	19392	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	26267263	26267811	26267415	Y	NA	SSPN,BHLHE41,RP11-283G6.3	NA	NA	NA	NA	SSPN	5113	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	26427494	26428032	26427844	Y	NA	NA	SSPN,BHLHE41,ITPR2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-283G6.3	149944	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr12	26613437	26613637	26613504	Y	FGFR1OP2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.3	335887	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	26658315	26658658	26658486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPR2	325473	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	27332593	27333057	27332936	Y	STK38L	NA	STK38L,MED21,TM7SF3,REP15,PPFIBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STK38L	61844	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	27513734	27513812	27513790	Y	NA	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	29947	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	27532512	27532752	27532665	Y	C12orf71	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	48725	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	27678028	27678417	27678221	Y	C12orf71	PPFIBP1	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	3664	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	27678444	27678624	27678473	Y	PPFIBP1	PPFIBP1	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	4080	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	27745630	27745707	27745691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	71266	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	27746027	27746077	27746069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	71663	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	28127967	28128359	28128243	Y	PTHLH,PTHLH	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC91	155823	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	28128658	28128812	28128736	Y	MANSC4,PTHLH,PTHLH	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC91	155370	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	28501330	28501622	28501413	Y	NA	RNU4-54P	NA	NA	NA	NA	RNU4-54P	30934	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	29194633	29194954	29194755	Y	NA	NA	CCDC91	IMR90	Hi-C	24141950	FAR2	105082	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	29473475	29473492	29473484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	58630	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	30949517	30949896	30949519	Y	CAPRIN2	CAPRIN2,RP11-77I22.2,LINC00941	NA	NA	NA	NA	LINC00941	3540	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	31804886	31805136	31805063	Y	NA	METTL20	NA	NA	NA	NA	METTL20	6792	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	3.37896294751292
chr12	32059556	32059920	32059668	Y	AMN1,H3F3C,C12orf35	NA	AMN1	IMR90	Hi-C	24141950	H3F3C	116381	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	32738766	32738845	32738790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNM1L	91289	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	34846341	34846449	34846401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-7D7.1	445925	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	39104065	39104215	39104143	Y	CPNE8	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	195017	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr12	40467954	40468269	40468112	Y	NA	SLC2A13	NA	NA	NA	NA	SLC2A13	29622	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	42470575	42470704	42470641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GXYLT1	65977	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	42958967	42958984	42958976	Y	NA	PRICKLE1	NA	NA	NA	NA	PRICKLE1	23173	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	42984702	42985091	42984897	Y	GXYLT1,PRICKLE1,PRICKLE1,PRICKLE1	PRICKLE1	NA	NA	NA	NA	PRICKLE1	2545	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	43699836	43700036	43699910	Y	NA	NA	PRICKLE1,PPHLN1,ZCRB1	IMR90	Hi-C	24141950	PUS7L	450584	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	45627812	45628672	45628351	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	19988	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	46381876	46382270	46382256	Y	SLC38A2,SCAF11	SCAF11	NA	NA	NA	NA	SCAF11	1633	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	46636369	46636708	46636589	Y	SCAF11,SLC38A1	SLC38A1	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	25092	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	46824163	46824471	46824386	Y	NA	RP11-96H19.1	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	48701	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	46917975	46918280	46918143	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	142513	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	8.35848729121617
chr12	46918651	46918824	46918737	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	143189	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	46942703	46943018	46942760	Y	NA	NA	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	167241	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	46943558	46944140	46943794	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	168096	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr12	46947043	46947401	46947166	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	171581	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	46956686	46956942	46956800	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	181224	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	47058808	47059020	47058972	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	283346	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	47474423	47475249	47474825	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	2689	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr12	48204446	48204457	48204451	Y	NA	RAPGEF3,HDAC7	NA	NA	NA	NA	HDAC7	20458	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	48297772	48297979	48297886	Y	ZNF641,ZNF641,ASB8,VDR	VDR	NA	NA	NA	NA	VDR	36852	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	48415389	48415421	48415405	Y	OR10AD1	NA	COL2A1,TMEM106C,SENP1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM106C	60037	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	49592771	49592915	49592838	Y	NA	TUBA1C,TUBA1A	TUBA1B,PRPH,TUBA1A,TUBA1C,LMBR1L,DHH	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TUBA1A	11664	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	49626851	49627096	49626872	Y	NA	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	45744	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr12	49678404	49678529	49678467	Y	NA	TROAP	NA	NA	NA	NA	TROAP	36490	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	50019010	50019299	50019155	Y	FMNL3	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF40B	59009	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	50067341	50067888	50067543	Y	TUBA1A,NCKAP5L,FMNL3	TMBIM6,FMNL3	NA	NA	NA	NA	TMBIM6	31620	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	50899744	50900179	50899947	Y	DIP2B	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	2976	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	52278286	52278855	52278613	Y	NR4A1	ACVRL1	NA	NA	NA	NA	ACVRL1	19837	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	52364914	52365223	52365052	Y	GRASP	ACVR1B,NR4A1	NA	NA	NA	NA	ACVR1B	21463	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	52419301	52419935	52419633	Y	NR4A1,GRASP,NR4A1	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	4685	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	52426305	52426422	52426334	Y	NR4A1,GRASP,NR4A1	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11689	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	52426547	52427164	52426822	Y	NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11931	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr12	52457778	52458372	52458110	Y	NA	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	C12orf44	2658	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	NA	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	C12orf44	79934	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	53267781	53268340	53268093	Y	PFDN5	NA	KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	EIF4B	129602	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	53615195	53615822	53615501	Y	CSAD,SP1,PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	8942	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	53885903	53886227	53886219	Y	NA	MAP3K12,TARBP2	NA	NA	NA	NA	MAP3K12	5620	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	53891661	53891873	53891767	Y	NA	TARBP2	NA	NA	NA	NA	MAP3K12	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	54072437	54072838	54072741	Y	CSAD,MAP3K12,ATF7,ATF7,ATP5G2,CALCOCO1	RP11-972K6.1,ATP5G2,CALCOCO1	NA	NA	NA	NA	ATP5G2	3245	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	54198975	54199124	54199050	Y	NA	NA	HOXC12,HOXC13,SMUG1,HOTAIR,HOXC11,HOXC8,HOXC9,MIR196A2,HOXC10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CALCOCO1	79446	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	54411861	54412590	54411908	Y	COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4	HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC8	11029	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr12	54413878	54414161	54414065	Y	HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5	HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	10476	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	54433983	54434162	54434078	Y	NA	HOXC9,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	9346	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	54610828	54611089	54611007	Y	NA	SMUG1	NA	NA	NA	NA	SMUG1	30050	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	54746696	54746816	54746742	Y	NA	GPR84	NA	NA	NA	NA	GPR84	9455	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	54752671	54753884	54753119	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	GPR84	NA	NA	NA	NA	GPR84	2387	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	54777021	54777369	54777117	Y	NA	GPR84,ITGA5	NA	NA	NA	NA	GPR84	20750	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	56132069	56132385	56132308	Y	OR6C4,OR10P1,SMARCC2,IKZF4	BLOC1S1,RP11-644F5.10,ITGA7,RDH5,RP11-644F5.11,CD63,GDF11	NA	NA	NA	NA	GDF11	2679	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	56147551	56147694	56147624	Y	NA	BLOC1S1,RP11-644F5.10,ITGA7,RDH5,RP11-644F5.11,CD63,GDF11	NA	NA	NA	NA	GDF11	12487	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	56240862	56241188	56240984	Y	IL23A,ZC3H10,MMP19	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14	MMP19	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAJC14	18254	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	56752579	56752932	56752841	Y	ZC3H10,RNF41,RNF41,STAT2,IL23A	RP11-977G19.10,CNPY2,PAN2,STAT2	NA	NA	NA	NA	STAT2	640	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr12	57523550	57524188	57523895	Y	MBD6,DDIT3,NAB2,STAT6,STAT6,LRP1	TMEM194A,NAB2,LRP1	NA	NA	NA	NA	STAT6	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	57546545	57546685	57546623	Y	MBD6,DDIT3,NAB2,STAT6,STAT6	LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	STAT6	22623	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	57812894	57812946	57812929	Y	NA	R3HDM2,INHBE,GLI1	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	9842	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	57813803	57814254	57814252	Y	NA	R3HDM2,INHBE,GLI1	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	8534	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	58238225	58238735	58238639	Y	AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,XRCC6BP1,CTDSP2	NA	NA	NA	NA	NA	CTDSP2	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	58259163	58259391	58259220	Y	TSPAN31,CDK4,METTL21B,CTDSP2	CTDSP2	CTDSP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	CTDSP2	20641	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr12	58281637	58282038	58281777	Y	CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM	CTDSP2,RP11-620J15.3	CTDSP2,TSFM,AVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTDSP2	43115	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	58283417	58283685	58283602	Y	AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,CTDSP2	CTDSP2,RP11-620J15.3,XRCC6BP1	CTDSP2,TSFM,AVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-620J15.3	44273	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr12	58903110	58903474	58903296	Y	NA	NA	LRIG3	IMR90	Hi-C	24141950	LRIG3	408829	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	58923778	58923975	58923913	Y	LRIG3,LRIG3	NA	LRIG3	IMR90	Hi-C	24141950	LRIG3	388328	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	59300729	59300915	59300862	Y	LRIG3,LRIG3	LRIG3	NA	NA	NA	NA	LRIG3	11388	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	62525889	62526278	62526197	Y	MON2,FAM19A2	NA	NA	NA	NA	NA	USP15	125841	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	62650628	62651393	62650813	Y	C12orf61,USP15	USP15,FAM19A2	NA	NA	NA	NA	USP15	726	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	62712963	62713140	62713056	Y	C12orf61,MON2,USP15	FAM19A2	NA	NA	NA	NA	FAM19A2	42032	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	62727827	62728150	62727887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM19A2	56896	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	62970708	62971108	62970733	Y	NA	RP11-631N16.2,C12orf61,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	23424	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	63025271	63025629	63025492	Y	NA	RP11-631N16.2,C12orf61,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	29805	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr12	63096618	63097002	63096657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	101152	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	63097406	63097648	63097535	Y	USP15,C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	101940	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	63124974	63125146	63125033	Y	C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	129508	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr12	64311746	64312216	64311964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	75673	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	64386107	64386411	64386216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	150034	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	64544712	64545066	64544890	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	69010	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr12	64546689	64546709	64546700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	67367	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	64575299	64575468	64575384	Y	NA	C12orf66,RPS11P6	NA	NA	NA	NA	C12orf66	38608	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	64850943	64851361	64850994	Y	NA	TBK1	NA	NA	NA	NA	TBK1	7283	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	65262498	65262651	65262575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNS	111271	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	65930655	65931175	65930934	Y	HMGA2	NA	MSRB3,HMGA2,RPSAP52	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	63474	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	65959414	65959817	65959668	Y	NA	RP11-221N13.3	HMGA2,MSRB3,RPSAP52	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	34832	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	65997532	65998101	65997899	Y	HMGA2	RP11-221N13.3,RP11-230G5.2	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	2883	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr12	66008791	66009141	66009009	Y	NA	RP11-221N13.3,RP11-230G5.2	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	14142	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	66028423	66029056	66028712	Y	NA	RP11-221N13.3,RP11-230G5.2	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-230G5.2	5096	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	66042799	66043321	66043056	Y	NA	RP11-221N13.3,RP11-230G5.2	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-230G5.2	8647	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	66050300	66050400	66050342	Y	NA	RP11-230G5.2	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-230G5.2	16148	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	66051570	66051762	66051716	Y	NA	RP11-230G5.2	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-230G5.2	17418	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	66059684	66059892	66059792	Y	NA	RP11-230G5.2	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-230G5.2	25532	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	66135126	66135637	66135353	Y	HMGA2	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	80274	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.31192201671937
chr12	66136008	66136292	66136116	Y	HMGA2	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	79619	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	66237933	66238219	66238043	Y	HMGA2	HMGA2,RPSAP52	NA	NA	NA	NA	RPSAP52	19179	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr12	66242690	66243107	66242729	Y	HMGA2	HMGA2,RPSAP52	NA	NA	NA	NA	RPSAP52	23936	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	66285844	66286273	66285967	Y	IRAK3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-366L20.3	53986	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	66286698	66286979	66286899	Y	IRAK3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-366L20.3	53280	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.66760232698389
chr12	66289506	66290040	66289751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-366L20.3	50219	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	66311039	66311339	66311117	Y	HMGA2	RP11-366L20.3	NA	NA	NA	NA	RP11-366L20.3	28920	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	IRAK3,RBMS1P1	NA	NA	NA	NA	RBMS1P1	1278	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	67752733	67753007	67752863	Y	NA	NA	DYRK2	IMR90	Hi-C	24141950	CAND1	91672	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr12	69312043	69312322	69312251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPM	51028	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	69401246	69401453	69401353	Y	RAP1B,SLC35E3,MDM2,CPM,LYZ,CPM	CPM	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	37896	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	69686526	69686874	69686654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYZ	53247	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	69806775	69807146	69806965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRS2	54983	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	70393617	70393726	70393672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNOT2	241048	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	70488262	70488278	70488270	Y	NA	NA	PTPRB	IMR90	Hi-C	24141950	CNOT2	146496	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	70648828	70649035	70648891	Y	RAB3IP,CNOT2,CNOT2,CNOT2	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-611E13.2	13688	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	71055637	71055848	71055742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-588H23.3	195777	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	72165791	72165958	72165868	Y	NA	RAB21	NA	NA	NA	NA	RAB21	19137	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	76052717	76052819	76052768	Y	PHLDA1	NA	PHLDA1,NAP1L1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	149301	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	76116548	76116691	76116626	Y	NA	NA	PHLDA1,OSBPL8	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRR1	213132	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	76119368	76119573	76119471	Y	NA	NA	PHLDA1,OSBPL8,NAP1L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRR1	215952	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	76206207	76206725	76206399	Y	GLIPR1	NA	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	218987	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.31192201671937
chr12	76209246	76209451	76209339	Y	NA	NA	PHLDA1,NAP1L1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PHLDA1	216261	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	76214541	76214932	76214815	Y	PHLDA1	NA	PHLDA1,NAP1L1,KRR1,GLIPR1,OSBPL8	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PHLDA1	210780	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	76219425	76219952	76219684	Y	PHLDA1	NA	PHLDA1,NAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA1	205760	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	76248800	76249037	76248808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	176675	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	76337836	76338217	76338130	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PHLDA1	87495	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	76347823	76348161	76347983	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	77551	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	76371613	76372127	76371872	Y	NA	NA	OSBPL8,PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	53585	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	76373014	76373318	76373236	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	OSBPL8,PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	52394	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	76414095	76414311	76414227	Y	NA	PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	11401	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	76414369	76415079	76414685	Y	NA	PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	10633	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr12	76497491	76497684	76497588	Y	NA	NAP1L1	OSBPL8,KRR1,NAP1L1,BBS10	IMR90	Hi-C	24141950	NAP1L1	20678	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	76552427	76552994	76552692	Y	PHLDA1,OSBPL8	NA	NAP1L1,PHLDA1,OSBPL8,BBS10	IMR90	Hi-C	24141950	NAP1L1	75614	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	76942062	76942423	76942413	Y	NA	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	9166	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	77005504	77005696	77005596	Y	OSBPL8	NA	ZDHHC17,CSRP2	IMR90	Hi-C	24141950	OSBPL8	53915	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	77251083	77251471	77251277	Y	NA	CSRP2	NA	NA	NA	NA	CSRP2	19369	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	77426192	77426447	77426357	Y	OSBPL8	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	30913	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr12	78140052	78140235	78140144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV3	82450	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	78338246	78338645	78338266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV3	115561	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	78940817	78940832	78940824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	314941	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	79323956	79323978	79323967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	68183	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	79848111	79848561	79848284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	234316	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	85344886	85345065	85345044	Y	NA	SLC6A15	NA	NA	NA	NA	SLC6A15	39492	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	85389492	85389695	85389594	Y	NA	TSPAN19,LRRIQ1	NA	NA	NA	NA	TSPAN19	38360	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	88968059	88968366	88968242	Y	NA	KITLG	NA	NA	NA	NA	KITLG	4262	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr12	89554110	89556960	89554595	Y	NA	NA	POC1B,LOC728084,DUSP6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP6	188088	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	89659937	89660045	89659992	Y	ATP2B1,DUSP6	NA	POC1B	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP6	85003	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	89747699	89748479	89748073	Y	NA	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	2651	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	89960420	89960675	89960548	Y	NA	POC1B,GALNT4,POC1B-GALNT4	LOC338758	MCF7	ChIA-PET	22265404	GALNT4,POC1B-GALNT4	42381	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	90091098	90091469	90091453	Y	NA	ATP2B1	ATP2B1,LOC338758	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2B1	9608	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	90124876	90125258	90125114	Y	DUSP6,ATP2B1	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	ATP2B1	23799	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	90125293	90125953	90125608	Y	DUSP6,ATP2B1	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	ATP2B1	24216	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	90127113	90127954	90127635	Y	DUSP6,ATP2B1	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	ATP2B1	26036	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	90484866	90485476	90485213	Y	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-753N8.1	187195	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	91492793	91493056	91492930	Y	NA	LUM	NA	NA	NA	NA	LUM	10552	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	92172749	92173207	92172879	Y	BTG1	NA	LOC256021	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C12orf79	361483	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	92469930	92470196	92470132	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	64494	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	92500767	92501208	92501155	Y	NA	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	33482	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	92517978	92518398	92518142	Y	BTG1	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	16292	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr12	92987343	92988147	92987837	Y	EEA1,BTG1	NA	DCN,LOC256021	IMR90	Hi-C	24141950	EEA1	332960	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr12	93321551	93321826	93321626	Y	EEA1	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	444	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr12	94135673	94136306	94136137	Y	NUDT4,SOCS2	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	66522	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	94172136	94172517	94172167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	102985	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	94312014	94312280	94312201	Y	SOCS2	NA	SOCS2,LOC144481,CRADD	IMR90	Hi-C	24141950	CRADD	242863	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	94565882	94566094	94566042	Y	TMCC3,PLXNC1	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	250651	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	94773845	94774167	94774046	Y	PLXNC1,TMCC3	RBMS2P1	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	42578	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	94817703	94818348	94818256	Y	NA	RBMS2P1,CCDC41	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	958	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	94919144	94919451	94919150	Y	NA	NA	PLXNC1	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC41	67380	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	95037595	95038737	95038539	Y	PLXNC1,TMCC3	TMCC3	NA	NA	NA	NA	TMCC3	3601	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr12	95680646	95681018	95680718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEZT	71124	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	96027120	96027372	96027186	Y	LTA4H	NA	NTN4	IMR90	Hi-C	24141950	USP44	83854	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	96047992	96048216	96048102	Y	METAP2,LTA4H	NA	NA	NA	NA	NA	USP44	104726	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	96589359	96589977	96589479	Y	LTA4H,ELK3	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	3199	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	96592675	96593197	96592888	Y	LTA4H,ELK3	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	6515	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	96593675	96593812	96593739	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	7515	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	96613519	96613922	96613765	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	27359	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	96627830	96628313	96628063	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	41670	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	96634891	96635110	96635001	Y	CDK17	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	48731	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	96635574	96636027	96635766	Y	CDK17	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	49414	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	96642925	96643253	96643074	Y	CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	56765	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	96649758	96650321	96650168	Y	ELK3,CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	63598	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	96752607	96752772	96752695	Y	CDK17	CDK17	NA	NA	NA	NA	CDK17	39566	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	96810217	96810461	96810410	Y	LTA4H,ELK3	CDK17,RN7SKP11	CDK17,ELK3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RN7SKP11	8803	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr12	96819131	96819446	96819342	Y	NA	CDK17	CDK17,ELK3,LTA4H	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP11	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr12	96839212	96840356	96839676	Y	NEDD1,NEDD1,CDK17	CDK17,RN7SKP11	CDK17	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP11	19948	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr12	98833710	98834204	98834052	Y	NA	RNU4-41P	NA	NA	NA	NA	RNU4-41P	23894	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	99103586	99103986	99103782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	66667	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	100518805	100519127	100519119	Y	NA	UHRF1BP1L	NA	NA	NA	NA	UHRF1BP1L	15499	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	100596885	100596960	100596910	Y	NA	ACTR6	NA	NA	NA	NA	ACTR6	5985	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	100970454	100970954	100970686	Y	NA	GAS2L3	NA	NA	NA	NA	RP11-575G13.2	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	102909608	102909974	102909790	Y	PAH	IGF1	NA	NA	NA	NA	IGF1	37185	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	104252933	104253121	104253026	Y	NA	NT5DC3	NA	NA	NA	NA	NT5DC3	19958	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	104330398	104330552	104330475	Y	NA	HSP90B1,C12orf73,TDG	NA	NA	NA	NA	HSP90B1	8513	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	104693849	104694220	104693862	Y	NA	RPL18AP3,EID3	NA	NA	NA	NA	EID3	1297	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	104998326	104998912	104998568	Y	TXNRD1,EID3,CHST11	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	151253	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	105043287	105043477	105043345	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	196214	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	105064571	105065844	105065441	Y	EID3,CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	217498	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	105477471	105477556	105477526	Y	ALDH1L2	ALDH1L2,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	ALDH1L2	1116	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	107363542	107363991	107363752	Y	NA	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	14953	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	107377522	107377900	107377585	Y	RFX4,RIC8B,MTERFD3	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	1044	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	108783050	108783376	108783111	Y	NA	NA	WSCD2,CMKLR1	IMR90	Hi-C	24141950	FICD	123586	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	108989761	108990124	108989943	Y	NA	SART3,ISCU	NA	NA	NA	NA	TMEM119	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	108990792	108990952	108990868	Y	NA	SART3,ISCU,TMEM119	NA	NA	NA	NA	TMEM119	696	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr12	109037814	109037911	109037861	Y	SSH1,SELPLG	TMEM119	NA	NA	NA	NA	TMEM119	47718	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	109061186	109061401	109061295	Y	SELPLG,SELPLG,SSH1	NA	NA	NA	NA	NA	CORO1C	61971	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	109088465	109088864	109088838	Y	SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	34508	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	109116964	109117579	109117192	Y	SELPLG,SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	5793	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	109117977	109118365	109118310	Y	SELPLG,SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	5007	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	109167575	109167781	109167683	Y	NA	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	44203	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	109209396	109209677	109209591	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	39689	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	109227089	109227462	109227320	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	21904	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	109232143	109232504	109232328	Y	FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	16862	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.84544248211614
chr12	109248007	109248657	109248411	Y	SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	709	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr12	109249958	109250678	109250397	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	592	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	3.20112279238066
chr12	109900993	109901418	109901152	Y	KCTD10	UBE3B,KCTD10	NA	NA	NA	NA	UBE3B	11789	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr12	110618684	110618848	110618757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFT81	58544	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	110750652	110751139	110750939	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	34091	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	110867136	110867499	110867318	Y	NA	ANAPC7,HMGA1P3,ARPC3,GPN3	NA	NA	NA	NA	HMGA1P3	1049	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	111015565	111016027	111015682	Y	PPTC7,ARPC3	PPTC7,TCTN1	NA	NA	NA	NA	PPTC7	3098	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	111058916	111059261	111059089	Y	NA	PPTC7,TCTN1	NA	NA	NA	NA	TCTN1	9084	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	111842634	111842962	111842759	Y	NA	FAM109A,SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	882	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	111867956	111868269	111868101	Y	BRAP,SH2B3	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	26204	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	112018937	112019235	112019073	Y	NA	ATXN2	NA	NA	NA	NA	ATXN2	16245	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	112341708	112342051	112341878	Y	ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	63926	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr12	112554455	112554606	112554536	Y	ALDH2,TRAFD1	NAA25,TRAFD1	TRAFD1,NAA25	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TRAFD1	6699	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	112759768	112760224	112759930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	93931	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	112809864	112809925	112809895	Y	C12orf51	PTPN11,RPL6	NA	NA	NA	NA	PTPN11	44230	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	113478524	113478983	113478679	Y	OAS1,OAS3,SLC24A6,SDSL,OAS2	NA	OAS2,DTX1	IMR90	Hi-C	24141950	OAS2	64324	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	113709766	113709965	113709824	Y	OAS1,OAS3,OAS2,SLC24A6,SDSL,SDS,PLBD2	NA	NA	NA	NA	NA	IQCD	52867	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	113798034	113798144	113798106	Y	SLC24A6,PLBD2,SDSL,SDS	PLBD2	SDS,SDSL	IMR90	Hi-C	24141950	PLBD2	3663	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	115103963	115104215	115104201	Y	TBX3	TBX3	NA	NA	NA	NA	TBX3	15754	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr12	115105863	115106455	115106375	Y	TBX3	TBX3	NA	NA	NA	NA	TBX3	13514	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr12	115107232	115107509	115107392	Y	TBX3	TBX3	NA	NA	NA	NA	TBX3	12460	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	3.37896294751292
chr12	115791856	115792156	115792052	Y	NA	NA	TBX3	IMR90	Hi-C	24141950	TBX3	671887	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr12	116530359	116530538	116530483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	182605	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	116661909	116662288	116662266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	50855	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	116872040	116872309	116872217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	158897	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	117255942	117256291	117256058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRK	60955	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	118497379	118497776	118497426	Y	NA	RFC5,WSB2	NA	NA	NA	NA	WSB2	459	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	118745418	118745709	118745623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAOK3	63041	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr12	119618645	119618705	119618687	Y	HSPB8	HSPB8	NA	NA	NA	NA	HSPB8	4198	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	120639993	120640274	120640078	Y	NA	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	2899	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	120668258	120668871	120668569	Y	RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	31164	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr12	120669025	120669761	120669334	Y	RAB35,RNF10,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	31813	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	120672500	120673016	120672699	Y	PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	28558	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	120675783	120676003	120675893	Y	RAB35,RNF10,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	GCN1L1,RPLP0,LOC100506649	K562	ChIA-PET	22265404	PXN	25571	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	121019899	121020145	121020000	Y	NA	COQ5,POP5,RPL11P5	NA	NA	NA	NA	POP5	2698	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	121021309	121021477	121021390	Y	NA	POP5,RPL11P5	NA	NA	NA	NA	POP5	4108	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	121268399	121268878	121268839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	71296	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	121282265	121283301	121283112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	56873	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	121310801	121311113	121311060	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	29061	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	121714857	121715111	121714996	Y	OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2	CAMKK2	NA	NA	NA	NA	CAMKK2	19000	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr12	121839154	121839422	121839290	Y	C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	3310	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr12	121888305	121888670	121888535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF34	52461	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	121976471	121976819	121976719	Y	NA	KDM2B	NA	NA	NA	NA	KDM2B	40101	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.31192201671937
chr12	122028609	122028883	122028798	Y	RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1	KDM2B,ORAI1	KDM2B	K562	ChIA-PET	22265404	KDM2B	11689	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	122086492	122086728	122086610	Y	KDM2B,SETD1B,ORAI1	ORAI1	NA	NA	NA	NA	ORAI1	24037	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	122124782	122125118	122124936	Y	P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3	TMEM120B	MORN3,LOC338799,SETD1B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM120B	23540	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	122363309	122363443	122363412	Y	NA	PSMD9,WDR66	NA	NA	NA	NA	WDR66	9541	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	122462187	122462386	122462358	Y	BCL7A	BCL7A,AC156455.1	NA	NA	NA	NA	BCL7A	6859	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	122518432	122518585	122518507	Y	MLXIP	AC156455.1,MLXIP	NA	NA	NA	NA	MLXIP	3804	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr12	122771781	122771848	122771815	Y	NA	VPS33A	NA	NA	NA	NA	VPS33A	22713	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	123131126	123131793	123131490	Y	CLIP1,RSRC2,VPS37B,HCAR3,HCAR2	NA	NA	NA	NA	NA	DENR	103528	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	123555205	123555330	123555222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	77232	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	123569685	123569956	123569821	Y	C12orf65,C12orf65,C12orf65	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	62606	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	123627472	123627989	123627683	Y	C12orf65,C12orf65,C12orf65	PITPNM2	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	4573	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	124108091	124108301	124108196	Y	NA	TMED2,DDX55,EIF2B1,GTF2H3,TCTN2	NA	NA	NA	NA	EIF2B1	8012	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	124864827	124865003	124864908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	185132	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	124875337	124875736	124875419	Y	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	174399	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr12	124875953	124876085	124876023	Y	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	174050	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	124907545	124908050	124907792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	142085	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr12	124926476	124926613	124926576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	123522	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	721	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	125389117	125389584	125389422	Y	NCOR2,UBC	SCARB1,UBC	NA	NA	NA	NA	UBC	10330	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	125400956	125401141	125401046	Y	UBC	SCARB1,UBC	NA	NA	NA	NA	UBC	1042	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	125403508	125403991	125403767	Y	UBC	SCARB1,UBC	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	3594	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	125412421	125412524	125412468	Y	NA	SCARB1,UBC	NA	NA	NA	NA	UBC	12507	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	125425237	125425455	125425374	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	25323	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	125577703	125578001	125577737	Y	NA	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	29778	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	127610420	127610860	127610670	Y	NA	RP11-575F12.2,AC079949.1	NA	NA	NA	NA	RP11-575F12.2	18217	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr12	127715364	127715787	127715548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	66692	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	127910118	127910304	127910194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	261446	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	132288640	132288996	132288940	Y	SFSWAP	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	21942	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr12	132315038	132315239	132315115	Y	MMP17	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	4100	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr12	132356836	132357024	132356894	Y	SFSWAP,ULK1	MMP17,ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	20172	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	20644269	20644474	20644387	Y	ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	113459	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr13	24133122	24133556	24133337	Y	NA	TNFRSF19	MIPEP,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF19	8953	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	26760531	26760858	26760712	Y	WASF3	RNF6	WASF3,RNF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF6	33933	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	27557231	27557465	27557334	Y	USP12,RPL21,RASL11A	NA	RASL11A,USP12,RPL21,MTIF3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP12	186568	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr13	27808177	27808245	27808213	Y	NA	RPL21,RASL11A	USP12,RPL21	IMR90	Hi-C	24141950	RPL21	15201	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	29291126	29291443	29291386	Y	SLC46A3	SLC46A3	NA	NA	NA	NA	SLC46A3	19	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	30415465	30415864	30415857	Y	NA	UBL3	NA	NA	NA	NA	UBL3	6957	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	30568304	30568485	30568443	Y	KATNAL1,KATNAL1	NA	UBL3	IMR90	Hi-C	24141950	UBL3	145483	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr13	31439697	31440107	31440029	Y	C13orf33	NA	NA	NA	NA	NA	USPL1	249867	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr13	31444557	31445090	31444788	Y	C13orf26	NA	NA	NA	NA	NA	USPL1	254727	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	31483566	31483936	31483755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPH1	250589	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	32664585	32664831	32664706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRY	61148	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	33858244	33858802	33858357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	63965	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	34116442	34117241	34116673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	193675	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	34664689	34665025	34664857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	274503	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	36501740	36502135	36501882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC169	367842	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	37473939	37474133	37474036	Y	C13orf36,SMAD9	NA	NA	NA	NA	NA	RFXAP	82578	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	38740377	38740756	38740564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UFM1	181230	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	40738384	40738430	40738407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO1	500304	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	41078224	41078580	41078410	Y	NA	NA	FOXO1,TTL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FOXO1	160154	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	41202839	41203181	41203053	Y	NA	FOXO1	NA	NA	NA	NA	FOXO1	35553	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	41586512	41586699	41586606	Y	NA	WBP4,ELF1	NA	NA	NA	NA	WBP4	46711	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	42231052	42231244	42231148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	347711	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	42269057	42269475	42269218	Y	C13orf15,DGKH	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	385716	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	42422497	42422720	42422629	Y	C13orf15,DGKH	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	421569	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	42509903	42509914	42509909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	334375	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	42979877	42980186	42980020	Y	TNFSF11,TNFSF11,AKAP11	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	135588	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	43294593	43294957	43294764	Y	NA	NA	ENOX1	IMR90	Hi-C	24141950	EPSTI1	269450	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	43382131	43382356	43382244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSTI1	182051	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	43410663	43410880	43410773	Y	NA	NA	CCDC122,ENOX1,TNFSF11,EPSTI1,DNAJC15	IMR90	Hi-C	24141950	EPSTI1	153527	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	43629039	43630063	43629103	Y	NA	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	33700	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	43662550	43662935	43662749	Y	EPSTI1	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	67211	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	43938999	43939258	43939099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	343660	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	44359761	44360131	44359976	Y	ENOX1,ENOX1	ENOX1	NA	NA	NA	NA	ENOX1	717	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	44379216	44379443	44379336	Y	ENOX1	ENOX1	ENOX1,DNAJC15,EPSTI1,TNFSF11,CCDC122,LACC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ENOX1	20172	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr13	44765408	44765809	44765737	Y	NA	NA	SERP2,TSC22D1,LINC00284	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERP2	179992	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	44848357	44848873	44848719	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	SERP2,NUFIP1,TSC22D1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERP2	96928	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	44880536	44881091	44880742	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,LACC1,SERP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERP2	64710	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr13	45774024	45774110	45774098	Y	KCTD4	KCTD4	NA	NA	NA	NA	KCTD4	849	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	45779406	45779631	45779488	Y	TPT1,COG3	KCTD4	NA	NA	NA	NA	KCTD4	6231	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	45846557	45846941	45846749	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPT1-AS1	66539	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	46095529	46095772	46095647	Y	TPT1	NA	NA	NA	NA	NA	COG3	58469	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	46750972	46751177	46751169	Y	ZC3H13,C13orf18,LCP1	LCP1,LRRC63	NA	NA	NA	NA	LCP1	32829	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	46943616	46943890	46943786	Y	LCP1,C13orf18	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC63	159533	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr13	48526121	48526135	48526130	Y	MED4,SUCLA2	SUCLA2-AS1	NA	NA	NA	NA	SUCLA2-AS1	47390	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	49569007	49569270	49569139	Y	NA	FNDC3A	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	20959	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	50209681	50209984	50209832	Y	SETDB2,ARL11	NA	NA	NA	NA	NA	RCBTB1	51962	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	50597476	50597810	50597661	Y	RCBTB1,TRIM13	TRIM13,MIR3613,MIR16-1	NA	NA	NA	NA	MIR16-1	23387	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr13	50703607	50703753	50703679	Y	NA	DLEU1,DLEU2	DLEU7,DLEU1,DLEU2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DLEU2	5751	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	50704264	50704590	50704561	Y	NA	DLEU1,DLEU2	DLEU7,DLEU1,DLEU2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DLEU2	6408	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr13	50897882	50898235	50898046	Y	NA	RPL34P26	DLEU2,DLEU1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34P26	35664	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	51800117	51800150	51800132	Y	DLEU7,FAM124A	FAM124A	NA	NA	NA	NA	FAM124A	5614	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	52303239	52303556	52303323	Y	WDFY2	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	72737	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr13	52505834	52506318	52505967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALG11	78216	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	53336765	53337066	53336916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	111921	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	53814883	53815070	53814977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	590039	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	61157781	61157905	61157871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRD3	189190	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr13	64448428	64448510	64448470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	199634	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	64537945	64538229	64538154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	109915	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	64596462	64596642	64596562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	51502	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	64623751	64624068	64623941	Y	NA	LINC00355	NA	NA	NA	NA	LINC00355	24076	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	65267327	65267582	65267455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	619183	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	67240182	67240351	67240267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH9	562117	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	67722025	67722418	67722226	Y	PCDH9	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH9	80050	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	67962999	67963167	67963083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH9	160531	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	72419778	72420070	72419973	Y	DACH1	NA	NA	NA	NA	NA	MZT1	879755	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	74326809	74326882	74326846	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	379512	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	74508678	74508943	74508854	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	197451	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	74550144	74550303	74550225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	156091	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr13	74706134	74706569	74706487	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	74708897	74709334	74709161	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	2503	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr13	74709487	74710034	74709735	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	3093	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr13	75346258	75346396	75346327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	639864	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	75933518	75933672	75933595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	120578	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	76256605	76256814	76256659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	64035	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr13	80510902	80511186	80511006	Y	NA	NA	SPRY2	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY2	401900	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	80611659	80611975	80611764	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	301111	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr13	80916096	80916414	80916232	Y	NA	SPRY2	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3010	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	84071741	84071754	84071748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3158655	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	84480650	84480755	84480723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3567564	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	84839512	84839585	84839549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3926426	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	88259012	88259340	88259160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	3738734	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr13	88345046	88345403	88345227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	3652671	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	88383188	88383252	88383222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	3614822	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr13	88384592	88384886	88384741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	3613188	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	90167002	90167321	90167160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	1830753	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	93096966	93097333	93097096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	386869	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	99128638	99129073	99128919	Y	STK24	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	99121	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.95624170645485
chr13	99161455	99162128	99161863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	66066	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	99562711	99562955	99562841	Y	GPR183,STK24	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK9	173924	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr13	99933643	99933940	99933792	Y	GPR183	GPR183	NA	NA	NA	NA	GPR183	23719	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	99935844	99936009	99935907	Y	GPR183	GPR183	NA	NA	NA	NA	GPR183	21650	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	99956041	99956410	99956299	Y	GPR18,GPR183	GPR183	NA	NA	NA	NA	GPR183	1249	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	99963491	99964160	99963691	Y	NA	GPR183	NA	NA	NA	NA	GPR183	5832	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	100026921	100028247	100027781	Y	UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	GPR183	69262	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	100084902	100085483	100085174	Y	GPR183	NA	MIR548AN,UBAC2,DOCK9,UBAC2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	TM9SF2	66188	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr13	100641170	100641291	100641224	Y	NA	ZIC2	NA	NA	NA	NA	ZIC2	9144	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr13	101046682	101046918	101046816	Y	A2LD1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL15P18	245336	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	103250853	103251030	103250900	Y	NA	TPP2	NA	NA	NA	NA	TPP2	3500	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	106753025	106753272	106753030	Y	ARGLU1	NA	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00460	273639	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	107186008	107186474	107186341	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	32038	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	108103235	108103615	108103559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM155A	413468	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr13	108520131	108520835	108520801	Y	LIG4,FAM155A	FAM155A	NA	NA	NA	NA	FAM155A	3048	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	109568044	109568430	109568179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD13	699317	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr13	109576446	109576812	109576641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD13	707719	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr13	109645750	109646173	109645855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL162497.1	759442	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	3.55680310264518
chr13	109808669	109809037	109808800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL162497.1	596578	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	109818071	109818351	109818211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL162497.1	587264	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr13	109847392	109847697	109847628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL162497.1	557918	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	109852673	109853050	109852860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL162497.1	552565	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr13	109909294	109909814	109909611	Y	NA	NA	MYO16,IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	495801	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	110439676	110440079	110439929	Y	IRS2	AL162497.1,IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	2761	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	111049993	111050394	111050073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CARKD	215487	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	111312907	111313086	111312997	Y	NA	CARKD,ING1	NA	NA	NA	NA	CARKD	47026	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	111410023	111410076	111410050	Y	NA	ING1,CARS2	CARS2,LINC00346,ING1,COL4A2	IMR90	Hi-C	24141950	CARS2	46073	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	111564894	111565358	111565241	Y	RAB20,ING1,ING1,ARHGEF7,ANKRD10	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	58	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	111659256	111659421	111659366	Y	NA	NA	ANKRD10,ARHGEF7	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	93840	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr13	111695990	111696309	111696026	Y	NA	NA	ING1,ARHGEF7,ANKRD10	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF7	68597	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr13	113695694	113695999	113695800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	F10	79129	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr13	113806516	113806910	113806731	Y	ATP11A,CUL4A	F10	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	F10	31388	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr13	114147699	114148153	114147800	Y	F7,F10,PROZ,GRTP1	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	TMCO3	4389	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr13	114556439	114556767	114556713	Y	NA	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	8279	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	114600157	114600520	114600358	Y	GAS6	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	35111	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr13	114611317	114611637	114611421	Y	NA	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	46271	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	114830489	114831626	114831334	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	64460	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr13	114832815	114833231	114833102	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	62855	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	114862790	114863121	114862935	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	32965	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	114864762	114865011	114864824	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	31075	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr13	114881275	114881557	114881414	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	14529	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr13	114884280	114884926	114884814	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	11160	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr13	114894223	114894969	114894576	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	1117	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr13	114906463	114906564	114906535	Y	RASA3	RASA3	RASA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	RASA3	10377	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr14	20803011	20803143	20803077	Y	NA	TTC5,CCNB1IP1,PARP2,RPPH1	NA	NA	NA	NA	CCNB1IP1	3540	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	21150605	21151121	21150987	Y	TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	269	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr14	21151333	21151694	21151411	Y	NA	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	997	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	21288613	21288985	21288797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANG	138277	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	21439863	21440073	21439999	Y	NA	METTL17	NA	NA	NA	NA	METTL17	15856	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	21540493	21540634	21540528	Y	RNASE6,TOX4,HNRNPC,ARHGEF40	ARHGEF40,ZNF219	NA	NA	NA	NA	ARHGEF40	4064	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	21684818	21685080	21685024	Y	OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	50573	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr14	22953708	22954107	22953915	Y	NA	NA	DAD1	IMR90	Hi-C	24141950	DAD1	102068	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	23058743	23059118	23058931	Y	REM2	DAD1,ABHD4	NA	NA	NA	NA	DAD1	2568	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr14	23293879	23294567	23294288	Y	RBM23,C14orf119,SLC7A7,SLC7A7	MRPL52,MMP14,LRP10	REM2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MRPL52	2521	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr14	23307440	23308274	23307581	Y	SLC7A8,PSMB5,PSMB5,LRP10,MRPL52,MMP14	MRPL52,MMP14,LRP10	NA	NA	NA	NA	MMP14	3674	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr14	23308431	23309148	23308805	Y	NA	MRPL52,MMP14,LRP10	NA	NA	NA	NA	MMP14	4665	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.48976217185163
chr14	23320228	23321035	23320800	Y	RBM23,C14orf119,ACIN1,SLC7A7,SLC7A7	MRPL52,MMP14,LRP10	NA	NA	NA	NA	MMP14	16462	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.95624170645485
chr14	23449757	23450231	23450060	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB	MIR4707,HAUS4,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr14	23584186	23584501	23584299	Y	C14orf119	C14orf119,ACIN1	NA	NA	NA	NA	ACIN1	21363	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr14	24075347	24075692	24075500	Y	NA	AP1G2,DHRS2	C14orf167	IMR90	Hi-C	24141950	DHRS2	21632	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	24454112	24454320	24454216	Y	DHRS4L2,DHRS4L2	DHRS4,DHRS4L2	NA	NA	NA	NA	DHRS4L2	16964	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	24712544	24712898	24712739	Y	DHRS4L1,DCAF11,DCAF11,PSME1,RNF31,IRF9,RIPK3,LTB4R,KHNYN,CIDEB,TINF2	TM9SF1,CHMP4A,MDP1,NEDD8-MDP1,GMPR2,NEDD8,TINF2,RABGGTA	NA	NA	NA	NA	TINF2	2664	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	26693643	26693690	26693667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOVA1	371270	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	28061472	28061526	28061498	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26P3	895590	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	29706068	29706381	29706228	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf23	466158	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr14	30663968	30664325	30664158	Y	PRKD1	PRKD1	PRKD1,FOXG1,C14orf23	IMR90	Hi-C	24141950	PRKD1	4864	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	30739803	30740140	30739972	Y	PRKD1	NA	NA	NA	NA	NA	PRKD1	80699	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	31400109	31400220	31400192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP4S1	92092	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	31455672	31455729	31455709	Y	NA	AP4S1,STRN3	NA	NA	NA	NA	AP4S1	36583	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	32672212	32672871	32672506	Y	ARHGAP5	NA	NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP5-AS1	128213	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr14	32979007	32979394	32979291	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	27001	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	34966252	34966485	34966304	Y	NA	SPTSSA,EAPP	NA	NA	NA	NA	SPTSSA	36690	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	35325148	35325514	35325424	Y	PSMA6,PPP2R3C,BAZ1A	RP11-73E17.2,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	RP11-73E17.2	16035	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	35346506	35346753	35346630	Y	PSMA6,EAPP,PPP2R3C,FAM177A1,BAZ1A	RP11-73E17.2,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	BAZ1A	3653	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	35666202	35666508	35666414	Y	BAZ1A,FAM177A1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	76447	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	35800965	35801124	35801022	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMA6	55126	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	35810635	35811251	35810911	Y	BAZ1A,FAM177A1,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1	PPP2R3C,KIAA0391,PSMA6,NFKBIA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-561B11.1	45024	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	35835253	35835895	35835561	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	PSMA6,SNX6,PPP2R3C,KIAA0391,NFKBIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-561B11.1	20380	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr14	35865196	35865330	35865211	Y	RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	6625	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr14	37980657	37980979	37980818	Y	SLC25A21,MIPOL1	NA	NA	NA	NA	NA	MIPOL1	315539	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	39559553	39559840	39559693	Y	NA	SEC23A,GEMIN2	NA	NA	NA	NA	SEC23A	17010	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr14	42075138	42075996	42075609	Y	LRFN5	LRFN5	NA	NA	NA	NA	LRFN5	365	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr14	49519343	49519517	49519429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SL1	531780	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr14	50465888	50466432	50466066	Y	NA	C14orf182	NA	NA	NA	NA	C14orf182	5806	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr14	50511824	50512400	50511896	Y	RPL36AL,ARF6,SOS2,C14orf182	C14orf182	C14orf182,ARF6	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	C14orf182	39586	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	50527611	50528257	50527921	Y	RPL36AL,ARF6,C14orf182	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf182	55373	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	50648447	50648735	50648723	Y	NA	SOS2	NA	NA	NA	NA	SOS2	47541	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	51862095	51862490	51862300	Y	FRMD6,FRMD6	NA	LOC283553,FRMD6,FRMD6-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD6	91328	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr14	51865642	51865984	51865869	Y	FRMD6	NA	LOC283553,FRMD6,FRMD6-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD6	87834	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	51909639	51909898	51909736	Y	NA	FRMD6	FRMD6-AS1,FRMD6,LOC283553,GNG2	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD6	43920	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	51970793	51971031	51970913	Y	TRIM9	FRMD6	NA	NA	NA	NA	FRMD6	16975	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	52006399	52006758	52006578	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	52581	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr14	52064245	52064576	52064411	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	110427	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	52069018	52069473	52069211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	115200	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	52074354	52074735	52074485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	120536	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr14	52110768	52111053	52110947	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	156950	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr14	52119936	52120349	52120008	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	166118	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr14	52145900	52146294	52146052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG2	144619	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr14	52163680	52163849	52163765	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	GNG2	127064	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr14	52492753	52493004	52492825	Y	NA	C14orf166,NID2	NA	NA	NA	NA	C14orf166	38560	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	52547300	52547782	52547649	Y	NA	NID2	NID2,C14orf166,TXNDC16	IMR90	Hi-C	24141950	NID2	13588	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr14	53020677	53020806	53020735	Y	PTGDR,TXNDC16,GPR137C	TXNDC16,GPR137C	NA	NA	NA	NA	GPR137C	2811	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr14	53322931	53323139	53323035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNPNAT1	66545	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	54954614	54954684	54954648	Y	NA	GMFB,CGRRF1	NA	NA	NA	NA	GMFB	700	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr14	55173516	55173842	55173679	Y	SAMD4A	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	141701	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr14	55574465	55575376	55574639	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	MAPK1IP1L	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	13452	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr14	55584452	55585250	55584591	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	MAPK1IP1L,SOCS4,LGALS3,DLGAP5	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	3578	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	55592942	55593103	55593023	Y	GCH1,FBXO34,FBXO34	LGALS3	NA	NA	NA	NA	LGALS3	4114	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	55596570	55597156	55596587	Y	NA	LGALS3	NA	NA	NA	NA	LGALS3	7742	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr14	55716194	55716474	55716312	Y	NA	FBXO34,RP11-665C16.6	TBPL2,FBXO34,ATG14,DLGAP5	IMR90	Hi-C	24141950	FBXO34	19547	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	57047832	57047974	57047932	Y	PELI2,C14orf101	NA	NA	NA	NA	NA	PELI2	465300	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	58283600	58283763	58283750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P3	322234	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr14	59216036	59216189	59216096	Y	ARID4A	RP11-112J1.1	DACT1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-112J1.1	43183	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	59656513	59656908	59656842	Y	DAAM1	DAAM1	NA	NA	NA	NA	DAAM1	3149	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	59874044	59874284	59874170	Y	NA	NA	DAAM1	IMR90	Hi-C	24141950	JKAMP	74877	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	59949393	59949731	59949550	Y	C14orf149	JKAMP	NA	NA	NA	NA	JKAMP	232	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	60618583	60618767	60618659	Y	PPM1A,C14orf135,DHRS7	DHRS7	NA	NA	NA	NA	DHRS7	15807	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	60679186	60679974	60679676	Y	NA	DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2	NA	NA	NA	NA	PPM1A	30496	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr14	61570265	61570959	61570637	Y	SLC38A6	NA	NA	NA	NA	NA	TRMT5	124189	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	61612107	61612325	61612234	Y	SIX1	NA	SLC38A6,SIX1,SIX4,MNAT1,TRMT5	IMR90	Hi-C	24141950	TRMT5	166031	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	61938268	61939375	61939158	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	220856	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	61960014	61960497	61960231	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	199734	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	61969529	61970113	61969734	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	190118	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	62052734	62053075	62053015	Y	SYT16	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	107156	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	62053265	62053527	62053394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	106704	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	62092032	62092339	62092186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	67892	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	63159002	63159168	63159087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5E	848924	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	63829601	63829975	63829789	Y	WDR89,PPP2R5E,KCNH5,GPHB5	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5E	178117	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	64170371	64170528	64170450	Y	NA	SGPP1	NA	NA	NA	NA	SGPP1	22229	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	64320785	64320937	64320842	Y	PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	3102	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	64968114	64968655	64968380	Y	ZBTB25,ZBTB1	AKAP5,ZBTB25,HSPA2	NA	NA	NA	NA	ZBTB1	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	64975156	64975343	64975202	Y	NA	AKAP5,ZBTB1,ZBTB25,HSPA2	NA	NA	NA	NA	ZBTB25	5225	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	65546452	65546770	65546602	Y	NA	MAX	NA	NA	NA	NA	MAX	20643	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	65636145	65636439	65636337	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2509G16.2	50626	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	65637410	65637773	65637587	Y	NA	CTD-2509G16.2	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2509G16.2	49292	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	65746592	65747003	65746788	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2509G16.2	59527	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr14	65749378	65749653	65749574	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2509G16.2	62313	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	66126309	66126626	66126333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	250999	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	67478288	67478352	67478320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	227474	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	67763359	67763655	67763501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	57533	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	67809024	67809296	67809169	Y	RDH12,MPP5,PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	15418	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	68161499	68161767	68161616	Y	PLEK2	VTI1B,RDH11	NA	NA	NA	NA	RDH11	968	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr14	68420679	68421053	68420830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	136183	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	68604521	68604895	68604639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	282018	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	68607037	68607479	68607161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	279434	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	68717033	68717146	68717097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	169767	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr14	68835621	68835756	68835701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	51157	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	68884830	68884917	68884875	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	1996	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	69013502	69013901	69013730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	126589	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	69014304	69014714	69014453	Y	ACTN1	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	127391	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr14	69014972	69015327	69015083	Y	ACTN1	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	128059	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr14	69162018	69162337	69162187	Y	NA	NA	ZFP36L1,RAD51B	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L1	98853	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr14	69241519	69241814	69241672	Y	NA	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	19376	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	69252204	69252483	69252314	Y	NA	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	8707	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr14	69377319	69377610	69377464	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTN1	66547	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	69417780	69418181	69417964	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	25976	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr14	69576488	69576915	69576681	Y	NA	DCAF5	NA	NA	NA	NA	DCAF5	40952	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	69618210	69618757	69618360	Y	NA	DCAF5,EXD2	NA	NA	NA	NA	DCAF5	343	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr14	70183177	70183631	70183340	Y	KIAA0247,SRSF5,SRSF5	SRSF5	NA	NA	NA	NA	SRSF5	7986	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	71811948	71812060	71812004	Y	NA	SIPA1L1,RP1-261D10.2	SIPA1L1	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-261D10.2	25417	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	71870372	71870659	71870456	Y	PCNX,SIPA1L1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	83841	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	73110081	73110359	73110171	Y	NA	NA	RGS6,DPF3,DCAF4	IMR90	Hi-C	24141950	DPF3	248450	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr14	73131912	73132517	73132075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPF3	226292	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	73695241	73695452	73695329	Y	ZFYVE1,PSEN1,NUMB,C14orf169	PAPLN	NA	NA	NA	NA	PAPLN	6753	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	74918684	74918707	74918696	Y	NA	MIR4709,ISCA2,NPC2	VRTN	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4709	26200	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	75038441	75039020	75038725	Y	NPC2,DLST	LTBP2,CTD-2207P18.2	NA	NA	NA	NA	LTBP2	38286	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	75086409	75086922	75086553	Y	PGF	LTBP2,CTD-2207P18.2	LTBP2,KIAA0317,FCF1,YLPM1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CTD-2207P18.2	5059	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr14	75087327	75087770	75087539	Y	PGF,EIF2B2,LTBP2	LTBP2,CTD-2207P18.2	YLPM1,NPC2,ISCA2,LTBP2,KIAA0317,FCF1	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2207P18.2	5977	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr14	75492523	75492557	75492545	Y	NA	EIF2B2,MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	23678	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	75761897	75762132	75762064	Y	FOS,JDP2,JDP2,JDP2,FLVCR2,FLVCR2	RP11-293M10.2,FOS	NA	NA	NA	NA	FOS	18420	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	75963682	75963938	75963768	Y	C14orf1,BATF	BATF	TMED10,NEK9	IMR90	Hi-C	24141950	BATF	22830	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	76032638	76033032	76032887	Y	FOS,BATF,FLVCR2	BATF,FLVCR2,RP11-507E23.1	NA	NA	NA	NA	FLVCR2	9928	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	76234838	76235006	76234846	Y	NA	NA	TGFB3,IFT43	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf1	109306	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	76334268	76334588	76334390	Y	NA	IFT43	NA	NA	NA	NA	IFT43	31891	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr14	76446236	76446389	76446309	Y	NA	TGFB3	NA	NA	NA	NA	TGFB3	945	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr14	76734272	76734379	76734290	Y	ESRRB	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB3	286938	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	76843326	76843356	76843341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-187O7.1	256648	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	77384980	77385465	77385224	Y	VASH1	RP11-488C13.1,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	33887	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	77386872	77387221	77387005	Y	ZDHHC22	RP11-488C13.1,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	35779	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	77451554	77451690	77451632	Y	NA	RP11-7F17.1,IRF2BPL	IRF2BPL,KIAA1737	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-7F17.1	18528	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	77488566	77488578	77488572	Y	NA	IRF2BPL	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	4456	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr14	78144886	78145071	78144891	Y	NA	ALKBH1,SLIRP	NA	NA	NA	NA	ALKBH1	27292	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	78194844	78195080	78194962	Y	NA	ALKBH1,SLIRP,SNW1	NA	NA	NA	NA	SLIRP	22430	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	81088140	81088388	81088236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	335473	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	SNORA79	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	4.26816372317422
chr14	81867255	81867616	81867435	Y	GTF2A1,GTF2A1,STON2	NA	NA	NA	NA	NA	SEL1L	130589	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	81977973	81978150	81978054	Y	NA	SEL1L	NA	NA	NA	NA	SEL1L	20055	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	85881762	85881957	85881956	Y	FLRT2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-497E19.1	112375	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	87930298	87930498	87930398	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALC	527511	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	88495900	88496012	88495956	Y	GALC,GPR65	GALC	NA	NA	NA	NA	GALC	37891	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	89771520	89771819	89771727	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	311674	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	90875651	90876041	90875751	Y	NA	RPL21P11,CALM1	NA	NA	NA	NA	CALM1	14805	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	91406372	91406636	91406631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-3035D6.2	113900	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	91694873	91695058	91694948	Y	RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C,GPR68	GPR68	NA	NA	NA	NA	GPR68	23211	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	92970203	92970533	92970302	Y	ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	RIN3	NA	NA	NA	NA	RIN3	7585	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr14	93511721	93512085	93511905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	68580	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	93697718	93697880	93697787	Y	ITPK1,MOAP1	MOAP1,RP11-371E8.4,UBR7,C14orf142	NA	NA	NA	NA	C14orf142	26279	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr14	94431614	94431935	94431778	Y	SERPINA1,ASB2	ASB2	NA	NA	NA	NA	ASB2	9202	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	94437435	94437683	94437529	Y	SERPINA1	ASB2	NA	NA	NA	NA	ASB2	3454	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	95947097	95947214	95947185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRX5	50626	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	97647218	97647514	97647331	Y	NA	NA	C14orf177	IMR90	Hi-C	24141950	VRK1	385577	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	505578	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr14	99827366	99827674	99827539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	117542	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr14	100448901	100449138	100448963	Y	NA	NA	EML1,EVL,YY1,DEGS2	IMR90	Hi-C	24141950	EML1	246871	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	100659173	100659604	100659490	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4	DEGS2,YY1,EVL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YY1	43031	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr14	102292259	102292630	102292392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	66124	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	3.20112279238066
chr14	102415545	102415736	102415629	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13129	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr14	102991046	102991386	102991124	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	16910	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr14	103673427	103673966	103673589	Y	CDC42BPB	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	85648	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr14	104928387	104928555	104928492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-982M15.6	216928	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	105144100	105144955	105144117	Y	GPR132,AKT1	RP11-982M15.6,INF2	NA	NA	NA	NA	RP11-982M15.6	528	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	105166623	105167024	105166888	Y	C14orf180,ADSSL1	RP11-982M15.6,INF2	NA	NA	NA	NA	INF2	12680	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	105434041	105434308	105434245	Y	NA	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	8386	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	105435117	105435479	105435281	Y	KIAA0284	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	7215	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	105438668	105438757	105438725	Y	KIAA0284,JAG2,CDCA4,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	AHNAK2	3937	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	105439556	105439771	105439692	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2923	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr14	105536057	105536658	105536303	Y	CRIP1,GPR132	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA4	50572	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	105947921	105948133	105948082	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	3403	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	2511	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr15	25554216	25554517	25554319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	127611	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	25563100	25563402	25563110	Y	SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	118726	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	25564293	25564526	25564383	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	117602	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	25586903	25587047	25586976	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	95081	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	25587380	25587405	25587393	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	94723	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	25606189	25606253	25606221	Y	UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	75875	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	25614491	25614606	25614563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	67522	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr15	25634776	25635000	25634877	Y	SNURF,SNRPN	UBE3A	NA	NA	NA	NA	UBE3A	47128	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	26327449	26327665	26327505	Y	NA	NA	ATP10A,LOC100128714	IMR90	Hi-C	24141950	UBE3A	645321	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	29526240	29526874	29526776	Y	NA	NDNL2	NA	NA	NA	NA	NDNL2	33159	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	31733081	31733438	31733352	Y	MTMR10,KLF13	NA	KLF13,OTUD7A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF13	116023	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr15	31735072	31735294	31735171	Y	MTMR10,KLF13	NA	OTUD7A	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLF13	118014	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	31780397	31780546	31780469	Y	MTMR10,KLF13	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	163339	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	32974763	32975144	32974961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	69418	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr15	32975536	32975784	32975661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	70191	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	33083952	33084023	33083988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	178607	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	33111010	33111355	33111242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	205665	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr15	33120518	33121018	33120854	Y	GREM1	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	215173	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr15	33122479	33122828	33122652	Y	GREM1	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	217134	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	33125525	33125772	33125733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	220180	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr15	33132037	33132132	33132085	Y	NA	NA	GREM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP11A	226692	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	33133022	33133309	33133285	Y	GREM1	NA	GREM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP11A	227677	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr15	33134248	33134560	33134512	Y	NA	NA	GREM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP11A	228903	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr15	33135808	33135977	33135886	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	230463	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr15	33148173	33148432	33148370	Y	GREM1	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	242828	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr15	33153988	33154297	33154060	Y	GREM1	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	248643	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	33162710	33163027	33162926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	257365	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	33164908	33165041	33164975	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	259563	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	33165962	33166239	33166177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	260617	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr15	33169920	33170257	33170055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	264575	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	33172991	33173188	33173143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	267646	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr15	33188603	33188636	33188634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	283258	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr15	33212194	33212596	33212424	Y	GREM1	NA	NA	NA	NA	NA	FMN1	272301	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	33299476	33299841	33299744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMN1	185056	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr15	33408328	33408688	33408508	Y	NA	NA	FMN1,SCG5	IMR90	Hi-C	24141950	FMN1	76209	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	33418806	33419006	33418854	Y	NA	NA	FMN1,SCG5,ARHGAP11A,GREM1	IMR90	Hi-C	24141950	FMN1	65891	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	33440518	33440847	33440783	Y	NA	FMN1	FMN1	IMR90	Hi-C	24141950	FMN1	44050	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr15	34421770	34422050	34421910	Y	NA	PGBD4	NA	NA	NA	NA	PGBD4	29496	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	34531616	34532056	34531745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC12A6	96205	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	35588902	35588944	35588923	Y	NA	NA	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-323I15.2	206220	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	38345293	38345611	38345599	Y	NA	NA	SPRED1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRED1	196916	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	38422177	38422570	38422209	Y	NA	NA	SPRED1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRED1	119957	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr15	38546643	38547172	38546943	Y	NA	SPRED1	NA	NA	NA	NA	SPRED1	4116	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr15	38751078	38751316	38751209	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	6750	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	38830685	38830836	38830802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM98B	86357	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	39432291	39432412	39432368	Y	THBS1	NA	THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	438868	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	39866856	39867109	39867069	Y	FSIP1	THBS1	THBS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	THBS1	4171	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	40164744	40164978	40164948	Y	NA	GPR176	NA	NA	NA	NA	GPR176	46115	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	40200668	40200777	40200723	Y	NA	GPR176,EIF2AK4	NA	NA	NA	NA	GPR176	10316	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	40210900	40211252	40211013	Y	GPR176	EIF2AK4	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR176	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.66760232698389
chr15	40373777	40374114	40374053	Y	FSIP1,BAHD1,BMF,BMF,BMF	SRP14,BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	24979	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	40391032	40391342	40391133	Y	PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	7751	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr15	40803808	40804249	40803896	Y	NA	CHST14	NA	NA	NA	NA	CHST14	42648	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	41233721	41234461	41233781	Y	C15orf57,VPS18	VPS18,CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	8699	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr15	41254301	41254691	41254494	Y	NA	CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	11141	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	41878002	41878382	41878246	Y	NA	RPAP1,TYRO3,MGA	NA	NA	NA	NA	TYRO3	30129	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	MGA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MGA	42496	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr15	42232566	42232958	42232887	Y	EHD4	EHD4	SPTBN5	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	29818	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr15	42349424	42349982	42349743	Y	MGA,JMJD7,EHD4,VPS39,TMEM87A,SNAP23	NA	PLA2G4E	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	86648	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	42788912	42789178	42789135	Y	TTBK2	SNAP23,LRRC57,HAUS2	NA	NA	NA	NA	SNAP23	7481	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	43135579	43135976	43135778	Y	TGM7	NA	NA	NA	NA	NA	TTBK2	75031	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	43415014	43415563	43415337	Y	NA	UBR1,RPS3AP47,TMEM62	NA	NA	NA	NA	TMEM62	1537	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	43801380	43801544	43801432	Y	TP53BP1	TP53BP1,MAP1A	NA	NA	NA	NA	MAP1A	224	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	43810666	43810996	43810786	Y	MAP1A	TP53BP1,MAP1A	NA	NA	NA	NA	MAP1A	9510	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	44161980	44162105	44162047	Y	NA	MFAP1,WDR76	NA	NA	NA	NA	WDR76	44819	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	44181815	44182145	44181980	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR76	64654	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr15	44289112	44289501	44289307	Y	NA	ACTBP7	NA	NA	NA	NA	ACTBP7	8730	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	44319631	44319819	44319725	Y	NA	ACTBP7	NA	NA	NA	NA	ACTBP7	39249	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	44954800	44955080	44954968	Y	CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11	SPG11,PATL2,B2M	NA	NA	NA	NA	SPG11	924	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	45004703	45005017	45004887	Y	CASC4,CTDSPL2,SPG11,PATL2,B2M,TRIM69	PATL2,B2M,TRIM69	NA	NA	NA	NA	B2M	3028	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	45005185	45005759	45005376	Y	CTDSPL2,SPG11,PATL2,B2M,TRIM69	PATL2,B2M,TRIM69	NA	NA	NA	NA	B2M	3510	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	45784407	45784611	45784453	Y	C15orf48,SQRDL,PLDN	SLC30A4	NA	NA	NA	NA	SLC30A4	28394	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	48011445	48011769	48011637	Y	NA	CTD-2270N23.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2270N23.1	9363	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	48785600	48785984	48785868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBN1	150062	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	48963656	48963859	48963732	Y	FBN1	FBN1	SHC4,FBN1,CEP152	IMR90	Hi-C	24141950	FBN1	27610	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	48975243	48975418	48975260	Y	NA	FBN1	FBN1,SHC4,CEP152	IMR90	Hi-C	24141950	FBN1	39197	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	49217829	49218211	49218108	Y	SHC4	EID1,SHC4	NA	NA	NA	NA	SHC4	35430	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	49268018	49268116	49268067	Y	NA	SHC4	NA	NA	NA	NA	SHC4	14377	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	50347446	50348347	50347721	Y	USP8,GABPB1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A2	124046	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr15	50429549	50429984	50429688	Y	USP8,GABPB1	SLC27A2	ATP8B4,GALK2,GABPB1,SHC4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC27A2	42409	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr15	50793550	50793719	50793635	Y	USP8,TRPM7	NA	NA	NA	NA	NA	USP8	78973	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	50876708	50877085	50876843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPM7	99927	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	50995097	50995499	50995351	Y	SPPL2A	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	18085	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr15	51172834	51173079	51172965	Y	USP8,TRPM7,SPPL2A	AP4E1	TRPM7,SPPL2A,USP50,ASB18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,19890323,22265404	AP4E1	25790	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	51177416	51177715	51177636	Y	USP8,TRPM7,SPPL2A	AP4E1	TRPM7,SPPL2A,USP50,AP4E1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP4E1	21154	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	51358266	51358334	51358300	Y	GLDN	TNFAIP8L3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L3	37139	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	51369445	51369616	51369500	Y	TRPM7,SPPL2A	TNFAIP8L3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L3	25857	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	51413367	51413627	51413497	Y	NA	TNFAIP8L3	TNFAIP8L3,AP4E1,GLDN	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP8L3	17894	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	51560081	51560206	51560144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L3	164608	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	52273738	52273979	52273778	Y	NA	MAPK6,LEO1	MAPK6,GNB5,MYO5C,BCL2L10	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LEO1	11735	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	52385766	52385957	52385877	Y	DMXL2,MAPK6	NA	NA	NA	NA	NA	GNB5	95609	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr15	52545063	52545254	52545150	Y	MAPK6	NA	NA	NA	NA	NA	GNB5	63497	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	52774147	52774333	52774216	Y	MAPK6,MYO5A	MYO5A	NA	NA	NA	NA	MYO5A	44914	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	55095328	55096039	55095750	Y	RAB27A,RSL24D1	NA	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	391226	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr15	55463152	55463211	55463182	Y	NA	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	24054	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	55503902	55504218	55504040	Y	RAB27A,PIGB	RSL24D1	RSL24D1	K562	ChIA-PET	22265404	RSL24D1	16637	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	55559597	55559729	55559672	Y	NA	PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1	NA	NA	NA	NA	PIGB	49429	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr15	55574844	55574949	55574897	Y	NA	PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1	NA	NA	NA	NA	PIGB	34209	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	56063154	56063228	56063198	Y	NA	NA	NEDD4,PRTG	IMR90	Hi-C	24141950	PYGO1	184009	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	56513902	56514185	56514176	Y	NA	RFX7,TEX9	NA	NA	NA	NA	RFX7	19298	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	56965853	56966086	56966042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNS1	210518	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	57261737	57262096	57261746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF12	52916	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr15	57323913	57324233	57324065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF12	115092	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	58307957	58308317	58308137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIPC	392451	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	58898092	58898418	58898348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	141759	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	59138361	59138756	59138559	Y	NA	RNF111	NA	NA	NA	NA	RNF111	16618	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	59158498	59158653	59158597	Y	ADAM10,RNF111,SLTM	RNF111	NA	NA	NA	NA	RNF111	3124	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	59226674	59226915	59226795	Y	NA	SLTM	FAM63B	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLTM	2822	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	59461586	59461962	59461756	Y	ADAM10,SLTM,RNF111	NA	NA	NA	NA	NA	CCNB2	66309	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	59467791	59468085	59467937	Y	ADAM10,RNF111	NA	NA	NA	NA	NA	CCNB2	72514	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	59592534	59592835	59592690	Y	BNIP2,RNF111,MYO1E	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	70057	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	59848106	59848258	59848124	Y	GCNT3	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2A2	99482	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	60547541	60548010	60547775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA2	145072	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	60861865	60862603	60862448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	92488	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	60881604	60881753	60881652	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	112227	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	60883059	60884017	60883872	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	113682	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr15	60937521	60937640	60937631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	168144	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	60990052	60990360	60990127	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	220675	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	61051185	61051571	61051320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	281808	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	61459603	61459724	61459664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RORA	59794	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	61505182	61505193	61505186	Y	RORA	RORA	NA	NA	NA	NA	RORA	14325	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr15	62574155	62574333	62574245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLN2	106392	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	14.7607328759775
chr15	62683990	62684402	62684060	Y	NA	TLN2	TLN2,MGC15885	IMR90	Hi-C	24141950	TLN2	3265	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	63034731	63035286	63034964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-244F12.1	208086	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	63427902	63428515	63428147	Y	USP3,RAB8B,LACTB	LACTB,RPS27L	NA	NA	NA	NA	LACTB	15903	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr15	63663812	63664001	63663921	Y	LACTB,RAB8B	CA12	NA	NA	NA	NA	CA12	8359	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	4.09032356804196
chr15	63664402	63664810	63664706	Y	LACTB,CA12	CA12	NA	NA	NA	NA	CA12	7550	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr15	63771566	63772233	63772016	Y	HERC1,USP3	USP3	APH1B,RAB8B,CA12,USP3,HERC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP3	22560	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	63795379	63795825	63795543	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	586	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.13408186158711
chr15	63871063	63871418	63871089	Y	NA	USP3-AS1	NA	NA	NA	NA	USP3-AS1	20370	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	63960737	63961079	63961007	Y	HERC1	NA	NA	NA	NA	NA	USP3-AS1	68949	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	64722485	64722825	64722650	Y	NA	KIAA0101,TRIP4,ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	28116	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	64753700	64753985	64753784	Y	PLEKHO2	ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	2759	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	64995974	64996331	64996160	Y	NA	OAZ2	NA	NA	NA	NA	OAZ2	2494	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	65176143	65176677	65176391	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21	AC069368.3,PLEKHO2,ANKDD1A	NA	NA	NA	NA	ANKDD1A	25424	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.84544248211614
chr15	65185651	65186463	65186157	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21	ANKDD1A	NA	NA	NA	NA	ANKDD1A	15638	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.31192201671937
chr15	65277772	65277992	65277893	Y	OAZ2,PLEKHO2	SPG21,MTFMT	NA	NA	NA	NA	SPG21	2656	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	65589242	65589632	65589437	Y	NA	RNU5A-1,PARP16	MTFMT,IGDCC4,PDCD7,RASL12,IGDCC3,OSTBETA,CILP,PARP16,CLPX,UBAP1L,DPP8,PTPLAD1,SPG21,KBTBD13	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PARP16	1324	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	65596266	65596532	65596409	Y	NA	RNU5A-1,PARP16	PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP16	5310	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	65596702	65597188	65596889	Y	DENND4A	RNU5A-1,PARP16	PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP16	5746	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	65716164	65716565	65716475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPP8	91477	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	66764584	66765048	66764851	Y	NA	SNAPC5,SNORD18A,ZWILCH,RPL4	NA	NA	NA	NA	SNAPC5	23103	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	66993287	66993569	66993487	Y	MAP2K1,SMAD6	SMAD6	NA	NA	NA	NA	SMAD6	721	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr15	67095524	67095803	67095671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD6	102958	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	141882	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.13408186158711
chr15	67341124	67341334	67341261	Y	NA	SMAD3	SMAD3,IQCH,LOC100506686,AAGAB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD3	12767	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	67359902	67360303	67360058	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	5801	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	67366599	67366961	67366679	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	12498	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	67399103	67399775	67399548	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	45002	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	67413336	67413759	67413492	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	59235	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	67426476	67426864	67426547	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	72375	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	67440032	67440420	67440131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	85931	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	67442347	67443164	67443030	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	88246	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	67488498	67488886	67488594	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	IQCH	56252	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	67490281	67490446	67490307	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	IQCH	54692	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr15	67606820	67606971	67606914	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAGAB	61287	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	67926783	67927143	67926830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2K5	93736	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	68441418	68441688	68441529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	96901	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	68564990	68565500	68565181	Y	NA	CLN6,FEM1B	CLN6,ANP32A,CORO2B,FEM1B	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FEM1B	2641	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	68588456	68588855	68588647	Y	ITGA11	CLN6,FEM1B	NA	NA	NA	NA	FEM1B	20315	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	68777268	68777651	68777548	Y	NA	NA	CORO2B,ITGA11,MIR548H4,FEM1B	IMR90	Hi-C	24141950	ITGA11	54767	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	68878617	68878894	68878756	Y	CORO2B	CORO2B	NA	NA	NA	NA	CORO2B	9309	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	68894151	68894553	68894360	Y	CORO2B,CORO2B,CORO2B	CORO2B	NA	NA	NA	NA	CORO2B	24843	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	69453904	69454158	69454121	Y	GLCE	GLCE	NA	NA	NA	NA	GLCE	2981	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	69724089	69724530	69724231	Y	NA	KIF23,RP11-253M7.1,RPLP1	NA	NA	NA	NA	RPLP1	18593	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	70052375	70052953	70052736	Y	TLE3	NA	TLE3,LOC145837,C15orf50	IMR90	Hi-C	24141950	RPLP1	309252	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	70146031	70146330	70146181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLE3	242185	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.48976217185163
chr15	70436319	70436687	70436503	Y	NA	TLE3	LOC145837,TLE3,C15orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TLE3	47804	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	71084406	71084742	71084644	Y	UACA,LARP6	UACA	UACA,LARP6,LRRC49	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	30474	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	71126164	71126470	71126369	Y	NA	LRRC49,LARP6	NA	NA	NA	NA	LRRC49	17108	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	71144876	71145062	71144944	Y	NA	LRRC49,LARP6,THAP10	NA	NA	NA	NA	LARP6	378	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr15	71149072	71149436	71149201	Y	LARP6	LRRC49,LARP6,THAP10	NA	NA	NA	NA	LARP6	4574	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr15	71155799	71156069	71155993	Y	NA	LRRC49,LARP6,THAP10	NA	NA	NA	NA	LARP6	11301	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	71336506	71336742	71336642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	153382	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	71571390	71571701	71571551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	388266	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	72383313	72383702	72383619	Y	CELF6,SENP8,SENP8	SENP8,MYO9A	NA	NA	NA	NA	SENP8	20897	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	72518614	72519346	72519221	Y	ARIH1,PKM2	GRAMD2	NA	NA	NA	NA	GRAMD2	30488	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	72617371	72617435	72617389	Y	MYO9A,SENP8,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6	CELF6,HEXA	NA	NA	NA	NA	CELF6	6901	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	73077755	73078078	73077900	Y	ARIH1,ADPGK	ADPGK	NA	NA	NA	NA	ADPGK	1568	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	73926570	73926835	73926736	Y	PML	NPTN,CD276	C15orf60	IMR90	Hi-C	24141950	NPTN	2095	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	74207446	74207874	74207634	Y	NA	LOXL1	NA	NA	NA	NA	LOXL1	8456	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	74216715	74216840	74216797	Y	NA	LOXL1	NA	NA	NA	NA	LOXL1	385	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	74221354	74221537	74221415	Y	NA	LOXL1	NA	NA	NA	NA	LOXL1	5024	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	74258069	74258363	74258216	Y	C15orf59	LOXL1,STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	STOML1	26600	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	74677413	74677899	74677622	Y	SEMA7A,SEMA7A,CSK,CLK3,ARID3B	SEMA7A	SEMA7A	K562	ChIA-PET	22265404	SEMA7A	46909	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	74689389	74689592	74689450	Y	SEMA7A,SEMA7A	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	35216	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	74699762	74699966	74699869	Y	LOXL1,STOML1	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	24842	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	74834290	74834419	74834369	Y	ULK3,CSK,CLK3,ARID3B	ARID3B	NA	NA	NA	NA	ARID3B	2772	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	75018665	75019349	75018947	Y	SCAMP2,C15orf39,CYP1A1	EDC3,CYP1A1	NA	NA	NA	NA	CYP1A1	2714	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr15	75107587	75107841	75107715	Y	CPLX3	CSK,ULK3	NA	NA	NA	NA	ULK3	25846	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	75250602	75250974	75250783	Y	RPP25	COX5A,SCAMP5,RPP25	NA	NA	NA	NA	RPP25	2797	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	75328661	75328897	75328778	Y	MAN2C1,C15orf39	PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	14765	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	75397173	75397774	75397428	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,C15orf39	NA	C15orf39	MCF7	ChIA-PET	22265404	PPCDC	83277	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	75496316	75496728	75496439	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CSK,SCAMP2,C15orf39	C15orf39	NA	NA	NA	NA	C15orf39	10332	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	75742568	75742962	75742713	Y	NA	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	3221	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	75744907	75745094	75744993	Y	C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1089	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	75820261	75820616	75820439	Y	NA	PTPN9	NA	NA	NA	NA	PTPN9	49014	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	75867013	75867354	75867182	Y	C15orf39,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,UBE2Q2,ODF3L1	PTPN9,SNUPN	NA	NA	NA	NA	PTPN9	2276	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	76050803	76051078	76050853	Y	NA	CSPG4,DNM1P35	NA	NA	NA	NA	DNM1P35	21839	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	76639629	76639850	76639740	Y	NA	ETFA,ISL2	NA	NA	NA	NA	ISL2	12564	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	77543876	77544254	77544063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEAK1	166232	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	77635534	77635848	77635691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEAK1	74638	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	77675113	77675384	77675318	Y	NA	PEAK1,HMG20A	NA	NA	NA	NA	PEAK1	35102	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	77710600	77710857	77710802	Y	NA	PEAK1	NA	NA	NA	NA	HMG20A	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	77711297	77711794	77711478	Y	NA	PEAK1,HMG20A	NA	NA	NA	NA	HMG20A	543	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	79973105	79973417	79973260	Y	NA	NA	TMED3,KIAA1024	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFS	214304	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr15	80453068	80453275	80453180	Y	BCL2A1,ZFAND6	FAH	NA	NA	NA	NA	FAH	10236	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	80773280	80773702	80773515	Y	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT2	78588	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr15	81099060	81099288	81099113	Y	NA	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	29376	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	81219891	81220152	81220022	Y	STARD5	NA	NA	NA	NA	NA	MESDC2	60067	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	81291796	81292315	81292076	Y	NA	MESDC2,MESDC1	NA	NA	NA	NA	MESDC1	501	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	81315785	81316530	81316214	Y	STARD5,MESDC1	MESDC2,MESDC1	NA	NA	NA	NA	MESDC1	24490	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr15	82339167	82339811	82339478	Y	MEX3B	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	2685	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	83239509	83239741	83239625	Y	AP3B2,CPEB1	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB1	75871	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	83329401	83329783	83329629	Y	AP3B2,CPEB1,CPEB1	CPEB1,RP11-752G15.4,AP3B2	NA	NA	NA	NA	CPEB1	13789	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	83681404	83681605	83681512	Y	NA	FAM103A1,C15orf40	NA	NA	NA	NA	C15orf40	3011	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	83778085	83778410	83778297	Y	NA	BTBD1	NA	NA	NA	NA	BTBD1	43979	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	83815089	83815145	83815117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	59625	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	83817881	83818018	83817954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	56752	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	83857531	83857848	83857643	Y	AP3B2,HDGFRP3	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	16922	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	85290443	85290837	85290532	Y	PDE8A,ZNF592	SEC11A,ZNF592	NA	NA	NA	NA	ZNF592	577	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	85455479	85455863	85455740	Y	SLC28A1	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	65808	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	85458286	85458507	85458420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	63164	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	85956762	85957097	85956878	Y	AKAP13,PDE8A	AKAP13	NA	NA	NA	NA	AKAP13	34960	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	86111518	86111581	86111550	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	189716	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	86163966	86164265	86164150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	171996	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	86165783	86166027	86165915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	170234	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr15	86211201	86211615	86211423	Y	AKAP13,KLHL25	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	124646	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr15	87686750	87686803	87686776	Y	NA	NA	NTRK3,LOC283738	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-648K4.2	558280	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	89638395	89638800	89638498	Y	ISG20,HAPLN3,ABHD2	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	ABHD2	9705	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	89664635	89664981	89664666	Y	NA	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	12745	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	89675943	89676620	89676217	Y	ISG20,ABHD2	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	1106	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	89795623	89795958	89795791	Y	NA	FANCI	NA	NA	NA	NA	FANCI	10443	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	89856537	89857272	89856853	Y	NA	POLG	NA	NA	NA	NA	POLG	18820	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	90005846	90006063	90005954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLG	129754	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	90197559	90197639	90197586	Y	KIF7	KIF7,PEX11A,WDR93	NA	NA	NA	NA	KIF7	877	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	90357155	90357491	90357451	Y	POLG,ZNF710,SEMA4B,AP3S2,ANPEP	ANPEP	NA	NA	NA	NA	ANPEP	522	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	90363996	90364798	90364610	Y	POLG,ZNF710,CIB1,ANPEP,AP3S2	ANPEP	NA	NA	NA	NA	ANPEP	7363	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr15	90365179	90365539	90365285	Y	POLG,ZNF710,SEMA4B,CIB1,ANPEP,AP3S2	ANPEP	NA	NA	NA	NA	ANPEP	8546	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr15	90366635	90367145	90366908	Y	NA	ANPEP	NA	NA	NA	NA	ANPEP	10002	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	90371902	90372049	90371963	Y	ZNF710,CIB1,ANPEP,AP3S2	ANPEP	NA	NA	NA	NA	ANPEP	15269	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr15	90419728	90419914	90419806	Y	ZNF710,SEMA4B,ANPEP,AP3S2	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	15660	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	90441878	90442278	90442169	Y	C15orf38	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	6304	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	90547918	90548344	90548145	Y	NA	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	5294	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr15	90604221	90604520	90604374	Y	ANPEP,ZNF710,IQGAP1,CIB1	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	39216	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	90944087	90944636	90944284	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	14637	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	91191799	91192162	91191976	Y	UNC45A,FES,FES,FES,C15orf58,IQGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	66210	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	91208661	91208996	91208948	Y	NA	RP11-387D10.2,BLM	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	49376	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	91388571	91388689	91388618	Y	NA	FES	BLM,FURIN,CRTC3,FES	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FES	36236	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	91412875	91413318	91412960	Y	IQGAP1,FURIN,UNC45A,FES,FES,FES	FES,MAN2A2	NA	NA	NA	NA	FES	11607	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	92237367	92237612	92237489	Y	NA	NA	SV2B	IMR90	Hi-C	24141950	NPM1P5	589459	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	ASB9P1	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	ASB9P1	26620	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	93520042	93520437	93520098	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3175	74413	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr15	93542371	93542660	93542397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3175	96742	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	93571843	93572426	93572107	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3175	126214	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	94739822	94739990	94739899	Y	NA	MCTP2	NA	NA	NA	NA	MCTP2	32777	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	96867848	96868085	96868000	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	505	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	98051851	98052090	98051944	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC4	408694	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	99186701	99186900	99186850	Y	NA	IGF1R	FAM169B,IGF1R	IMR90	Hi-C	24141950	IGF1R	3300	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	99193577	99194531	99194069	Y	IGF1R	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	3377	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	99298945	99299364	99299005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	108745	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	99387029	99387216	99387183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	196829	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	99395486	99396002	99395689	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	205286	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	99396507	99396665	99396608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	206307	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr15	99397047	99397167	99397105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	206847	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	99408611	99408985	99408683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	218411	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	99409255	99409515	99409377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	219055	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr15	99409834	99409977	99409865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	219634	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	99864304	99864757	99864539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90B2P	68467	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	99995215	99995527	99995307	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	MEF2A,LRRC28	IMR90	Hi-C	24141950	MEF2A	19843	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr15	100216338	100216615	100216373	Y	MEF2A,MEF2A	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD4	55151	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	100243855	100244145	100244036	Y	NA	LYSMD4	NA	NA	NA	NA	LYSMD4	27621	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	101261855	101262549	101262221	Y	NA	NA	ALDH1A3,LRRK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINS	120420	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr15	101667290	101667533	101667378	Y	NA	NA	CHSY1,SELS,LRRK1	IMR90	Hi-C	24141950	CHSY1	122604	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr15	101741612	101741900	101741753	Y	TM2D3,CHSY1	CHSY1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	48237	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr15	101807515	101807673	101807594	Y	NA	CHSY1,VIMP,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	VIMP	8032	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr16	578748	579156	578911	Y	LUC7L	PIGQ	NA	NA	NA	NA	PIGQ	35839	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr16	729341	729555	729445	Y	NA	C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,RHBDL1,STUB1,JMJD8,WDR24,METRN,FAM173A,HAGHL,CCDC78	NA	NA	NA	NA	STUB1	1117	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	1581133	1581345	1581183	Y	C16orf42,GNPTG,TBL3,SLC9A3R2,RPS2,NUBP2,NME3,MRPS34,GFER,TMEM204	TELO2,TMEM204	NA	NA	NA	NA	TMEM204	4444	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	2057211	2057401	2057386	Y	NA	NDUFB10,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598	423	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	2065446	2065768	2065545	Y	NA	TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	RAB26	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC9A3R2	7589	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	2175102	2175363	2175212	Y	NME3,NUBP2,TBL3,GFER,SLC9A3R2,MLST8,MLST8,DNASE1L2,NTHL1,TSC2	SNORD60,TRAF7	NA	NA	NA	NA	SNORD60	27743	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	2209355	2209786	2209516	Y	NPW	SNORD60,TRAF7,MLST8	NA	NA	NA	NA	TRAF7	5656	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	2561562	2561710	2561655	Y	PKD1,RAB26,CASKIN1,PDPK1	TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1	NA	NA	NA	NA	ATP6V0C	161	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FLYWCH2	12914	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	IL32,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	3414643	3415237	3414919	Y	NA	MTRNR2L4,ZNF174	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L4	5046	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr16	3796349	3796366	3796358	Y	NA	TRAP1	NA	NA	NA	NA	TRAP1	30751	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr16	4357393	4358110	4357824	Y	CORO7	TFAP4,PAM16	ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	36317	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	4424244	4424335	4424249	Y	CREBBP,UBN1,UBN1,MGRN1,CORO7,GLIS2	PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	VASN	4395	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr16	4426208	4426420	4426289	Y	NA	PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	VASN	6359	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	4427155	4427449	4427262	Y	NA	PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	VASN	7306	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr16	4818680	4818913	4818758	Y	C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI	C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI	NA	NA	NA	NA	ZNF500	3055	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	4993356	4993730	4993477	Y	PPL	PPL	UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPL	15012	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	6822644	6823191	6822880	Y	RBFOX1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1676835	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	10563450	10564010	10563797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMP2	108545	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	10906424	10906836	10906715	Y	NUBP1	NA	NA	NA	NA	NA	NUBP1	70781	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	10922717	10923252	10923012	Y	NUBP1,SOCS1,CIITA	NA	CIITA	IMR90	Hi-C	24141950	NUBP1	87074	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	10965041	10965252	10965110	Y	NUBP1,SOCS1,CIITA	NA	NA	NA	NA	NA	DEXI	69065	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	11295999	11296122	11296015	Y	SNN,LITAF,LITAF,NUBP1,CIITA,SOCS1	RMI2	NA	NA	NA	NA	RMI2	45354	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	11422424	11422652	11422552	Y	NA	NA	CLEC16A,PRM2,PRM3,TNP2,RMI2,TXNDC11	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	74388	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	11473379	11473565	11473516	Y	ZC3H7A,TXNDC11,SNN,LITAF,LITAF,CLEC16A,SOCS1	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS1	125343	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	11734091	11734770	11734262	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	SNN	TXNDC11,SNN,CLEC16A,LITAF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNN	25500	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	11890330	11890418	11890367	Y	LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A	ZC3H7A	NA	NA	NA	NA	ZC3H7A	1207	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	12008398	12008797	12008598	Y	NA	GSPT1	NA	NA	NA	NA	GSPT1	459	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr16	14428618	14428805	14428733	Y	NA	NA	MKL2,MIR365A,PARN,MIR193B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL2	265440	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	14529113	14529156	14529135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	195429	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	14599774	14599935	14599866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	124650	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	15583408	15583655	15583541	Y	NDE1,C16orf45	NA	KIAA0430	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf45	57256	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	15617016	15617455	15617336	Y	NDE1,KIAA0430	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf45	90864	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	16070854	16071189	16071093	Y	NDE1	RPL15P20,ABCC1	NA	NA	NA	NA	ABCC1	29420	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	16092294	16092782	16092512	Y	NDE1	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	50860	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	17499199	17499488	17499485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	63250	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	19710173	19710469	19710241	Y	NA	IQCK	NA	NA	NA	NA	IQCK	15309	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	19714468	19714843	19714656	Y	NA	IQCK	NA	NA	NA	NA	IQCK	10935	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	19843151	19843406	19843180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPRC5B	52083	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	19894494	19895110	19894762	Y	CCP110,GPRC5B	GPRC5B	NA	NA	NA	NA	GPRC5B	379	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	20910424	20910792	20910538	Y	NA	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	718	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	20922860	20922979	20922921	Y	CRYM,DCUN1D3,LYRM1	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	13154	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	21313038	21313456	21313158	Y	NA	CRYM-AS1	NA	NA	NA	NA	CRYM-AS1	2868	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr16	21611842	21611954	21611919	Y	CRYM,IGSF6,METTL9	METTL9	NA	NA	NA	NA	METTL9	5303	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	22020044	22020453	22020259	Y	OTOA,VWA3A	C16orf52	VWA3A	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf52	3085	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	22201170	22202123	22201439	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	13480	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	22202219	22202462	22202295	Y	NA	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	13141	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr16	22207042	22207397	22207176	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K,C16orf52	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	8206	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr16	22349127	22349159	22349143	Y	POLR3E	POLR3E	NA	NA	NA	NA	POLR3E	42397	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	22767811	22767852	22767832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST2	55646	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	23364862	23365207	23364921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG7	97294	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	23431856	23432257	23432204	Y	USP31,COG7	COG7	SCNN1B	IMR90	Hi-C	24141950	COG7	30244	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	27228652	27228785	27228726	Y	NA	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	49330	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	27533512	27533805	27533694	Y	JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	25429	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	29168403	29168702	29168538	Y	SPNS1	NA	RRN3P2	IMR90	Hi-C	24141950	SPNS1	184861	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	29836551	29836761	29836656	Y	NA	KIF22,MAZ,PRRT2,MVP,CDIPT	NA	NA	NA	NA	MVP	6836	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	30545067	30545182	30545127	Y	ZNF764	ZNF768,AC002310.12,ZNF747,ZNF764,AC002310.7,ZNF688,ZNF785	NA	NA	NA	NA	ZNF747	894	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.66760232698389
chr16	30825606	30826012	30825883	Y	NA	ZNF629	ZNF629,RNF40,MIR4519	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF629	29083	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr16	30994228	30994553	30994360	Y	VKORC1,HSD3B7	ORAI3,SETD1A,STX4	NA	NA	NA	NA	HSD3B7	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	31083220	31083516	31083291	Y	NA	STX4,ZNF668,ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8	NA	NA	NA	NA	ZNF646	227	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	31129616	31130225	31129940	Y	ARMC5,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS	ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8	NA	NA	NA	NA	KAT8	4541	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	31888166	31888535	31888469	Y	ARMC5,ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	5087	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	31905713	31906088	31906002	Y	ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	22634	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr16	46683529	46683842	46683691	Y	NA	SHCBP1,VPS35,ORC6	NA	NA	NA	NA	SHCBP1	29991	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	46823783	46824029	46823881	Y	NA	C16orf87	NA	NA	NA	NA	C16orf87	39294	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr16	47348245	47348526	47348436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHKB	144508	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	47526942	47527306	47527022	Y	PHKB	PHKB,ITFG1	NA	NA	NA	NA	ITFG1	30882	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	50236881	50237262	50237048	Y	NA	ADCY7	NA	NA	NA	NA	ADCY7	40786	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	51572702	51572897	51572800	Y	NA	NA	SALL1	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPA1P48	104770	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	51795949	51796284	51796182	Y	NA	NA	SALL1,CYLD,LOC388276	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPA1P48	118282	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	52854151	52854308	52854232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-297L17.6	166935	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	55119645	55120042	55119844	Y	NA	NA	FTO	IMR90	Hi-C	24141950	IRX5	156871	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	55521029	55521357	55521152	Y	MMP2	LPCAT2	NA	NA	NA	NA	LPCAT2	19553	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	56352339	56352494	56352417	Y	MT3,CES5A,GNAO1,BBS2	NA	NA	NA	NA	NA	AMFR	104956	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	56640479	56640669	56640573	Y	NA	MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A	NA	NA	NA	NA	MT2A	368	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	56641054	56641530	56641359	Y	MT2A,MT1E	MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A	NA	NA	NA	NA	MT2A	943	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr16	57488914	57489209	57489062	Y	NA	COQ9,CIAPIN1,POLR2C,DOK4	NA	NA	NA	NA	POLR2C	5090	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	57717053	57717380	57717096	Y	FAM192A,ZNF319,GPR97	NA	NA	NA	NA	NA	KATNB1	50262	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	57841964	57842337	57842236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIFC3	52620	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	57927623	57928192	57928041	Y	GPR97,ZNF319	KIFC3	NA	NA	NA	NA	KIFC3	32666	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	58493284	58493520	58493447	Y	NDRG4,NDRG4,NDRG4	NDRG4	NA	NA	NA	NA	NDRG4	1230	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	65103847	65103999	65103923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	54016	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	65105283	65105525	65105355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	52490	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	65153548	65154160	65153979	Y	CDH11	CDH11	NA	NA	NA	NA	CDH11	3855	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	66398320	66398884	66398869	Y	CDH5	LINC00920	NA	NA	NA	NA	LINC00920	41543	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	66416297	66416567	66416426	Y	CDH5	LINC00920	NA	NA	NA	NA	LINC00920	23860	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	66587187	66587393	66587288	Y	NA	TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1,CMTM3	NA	NA	NA	NA	CKLF-CMTM1	2697	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr16	66960903	66961306	66961106	Y	PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD	RRAD,FAM96B,CES2,CES3	NA	NA	NA	NA	RRAD	3356	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	67047765	67048035	67047886	Y	FBXL8,CES4A	CBFB	NA	NA	NA	NA	CBFB	12984	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	67345616	67346198	67345888	Y	RRAD,CBFB,FAM65A,FHOD1,PLEKHG4	PLEKHG4	NA	NA	NA	NA	PLEKHG4	36203	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	67581625	67581971	67581838	Y	RLTPR,CTCF	FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	CTCF	12339	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	67687517	67687714	67687560	Y	HSF4,KIAA0895L,SLC9A5,TSNAXIP1,PARD6A	RLTPR,ACD,PARD6A,C16orf86	NA	NA	NA	NA	ACD	4999	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	67867011	67867153	67867060	Y	TPPP3,CENPT	RANBP10,TSNAXIP1,THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4	NA	NA	NA	NA	THAP11	7060	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	67891676	67892114	67891889	Y	RLTPR,ACD,PSMB10,NFATC3,EDC4,THAP11	THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,PSKH1	NA	NA	NA	NA	CENPT	11962	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	PLA2G15	5331	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr16	68415381	68415552	68415488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-30P	53949	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	68544131	68544336	68544235	Y	NA	ZFP90,RNU4-36P	SMPD3,CDH1,PRMT7,CDH3	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP90	17657	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	69121214	69121414	69121257	Y	NA	HAS3,CHTF8,CIRH1A	HAS3	IMR90	Hi-C	24141950	HAS3	16053	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	69351854	69351929	69351891	Y	NA	VPS4A,PDF,NIP7,COG8	NA	NA	NA	NA	VPS4A	8595	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	69564577	69564882	69564731	Y	WWP2	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	32115	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	69603393	69603628	69603450	Y	NA	NFAT5	NA	NA	NA	NA	NFAT5	6396	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	69751128	69751528	69751345	Y	PDF,TERF2,NQO1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NQO1	7326	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr16	70444676	70444732	70444694	Y	NA	ST3GAL2,FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	26408	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	70712649	70712861	70712739	Y	NA	MTSS1L	NA	NA	NA	NA	MTSS1L	5108	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	70771415	70771759	70771684	Y	EXOSC6	NA	NA	NA	NA	NA	MTSS1L	53446	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr16	70779915	70780216	70780046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	52848	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	70780634	70780961	70780786	Y	MTSS1L	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	52103	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr16	71070712	71070940	71070844	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HYDIN	191685	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	71072056	71072175	71072116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HYDIN	190450	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	71731364	71731710	71731537	Y	NA	PHLPP2	NA	NA	NA	NA	PHLPP2	24894	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	72237360	72237779	72237529	Y	AP1G1,ATXN1L,KIAA0174,DHX38	NA	HPR,PMFBP1,LOC100506172	IMR90	Hi-C	24141950	TXNL4B	111030	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	73102955	73103191	73103082	Y	ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	11358	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	74353064	74353398	74353241	Y	FA2H	PSMD7,RP11-252A24.2	NA	NA	NA	NA	PSMD7	24391	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	74672577	74672957	74672890	Y	NA	GLG1,RFWD3	NA	NA	NA	NA	RFWD3	25822	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	75411958	75412267	75412159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFDP1	53116	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	75420812	75420988	75420900	Y	NA	CFDP1	CTRB1,BCAR1,CTRB2	IMR90	Hi-C	24141950	CFDP1	44395	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	75636745	75636762	75636754	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2,ADAT1,TERF2IP,KARS	NA	NA	NA	NA	ADAT1	18436	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	77511327	77511456	77511406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT7	242955	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	77708958	77709175	77709081	Y	NA	NUDT7	CLEC3A,WWOX,VAT1L	IMR90	Hi-C	24141950	NUDT7	45236	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	77979179	77979195	77979185	Y	VAT1L,WWOX	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	152115	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	78090271	78090541	78090406	Y	NA	WWOX	NA	NA	NA	NA	WWOX	40769	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	80971971	80972227	80972105	Y	CENPN	NA	NA	NA	NA	NA	CENPN	65876	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	81434776	81434850	81434813	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	41925	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	81954337	81954551	81954444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDR42E1	88542	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	82600130	82600149	82600140	Y	NA	NA	CDH13	IMR90	Hi-C	24141950	CDH13	58259	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	82687467	82688028	82687715	Y	NA	CDH13	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDH13	29059	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	82693893	82694152	82693974	Y	NA	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	35485	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	83159856	83159879	83159868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH13	501448	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	83777004	83777385	83777194	Y	HSDL1	NA	NA	NA	NA	NA	HSBP1	62063	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	83953538	83953937	83953606	Y	NA	MLYCD,OSGIN1,NECAB2	NA	NA	NA	NA	MLYCD	22807	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	85586938	85587370	85587020	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134309	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	85783855	85783992	85783913	Y	NA	C16orf74,COX4I1	NA	NA	NA	NA	C16orf74	1120	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	86609499	86609840	86609550	Y	FOXC2	MTHFSD,FOXC2,FOXL1	NA	NA	NA	NA	FOXL1	1525	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	86619952	86620235	86620073	Y	FOXC2	MTHFSD,FOXC2,FOXL1	NA	NA	NA	NA	FOXL1	11978	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr16	86664163	86664323	86664252	Y	NA	NA	FOXL1,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	56189	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr16	86698129	86698417	86698281	Y	NA	NA	FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,FOXC2,C16orf95,FBXO31	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	90155	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr16	86775121	86775409	86775225	Y	NA	NA	FOXC2,FOXL1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	167147	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	86964858	86965748	86965178	Y	NA	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	356884	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	86985410	86985767	86985608	Y	FOXC2,FOXL1	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	377436	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr16	87811524	87811882	87811665	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	13926	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	87901718	87902209	87902044	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,KLHDC4,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	624	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	87952545	87952677	87952600	Y	BANP,BANP	BANP	NA	NA	NA	NA	BANP	28173	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	89181535	89182183	89181777	Y	CYBA,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,CBFA2T3,CBFA2T3,RPL13,RPL13,ACSF3	ACSF3	NA	NA	NA	NA	ACSF3	28752	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	89313669	89314138	89313993	Y	ZNF276,ZNF778	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	31551	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	89370103	89370259	89370211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	87985	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	89388621	89389157	89388908	Y	ZNF276,C16orf7	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	106503	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	89392350	89392997	89392648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	110232	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr16	89571786	89572109	89572034	Y	ACSF3,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	16461	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr16	89992380	89992810	89992683	Y	NA	TUBB3,DEF8,CENPBD1,AFG3L1P	NA	NA	NA	NA	TUBB3	6580	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr16	90143699	90144065	90143926	Y	C16orf55,SPATA2L,ZNF276,C16orf7,ZNF276,TCF25	NA	LOC100130015,GAS8	MCF7	ChIA-PET	22265404	DBNDD1	59163	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	574639	574965	574941	Y	NA	RPS4XP17,VPS53	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	15852	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	595370	595681	595607	Y	NA	RPS4XP17,VPS53,FAM57A	NA	NA	NA	NA	VPS53	27276	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	597415	597783	597745	Y	NA	RPS4XP17,VPS53,FAM57A	NA	NA	NA	NA	VPS53	25174	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	654300	654699	654470	Y	NA	VPS53,FAM57A,DBIL5P,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4	NA	NA	NA	NA	DBIL5P	400	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	1171565	1171808	1171610	Y	WDR81,PITPNA,ABR,ABR	ABR	NA	NA	NA	NA	ABR	41250	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	1216895	1217239	1217095	Y	TLCD2,TUSC5	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAE	84433	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	1358484	1358816	1358590	Y	NA	CRK,MYO1C	NA	NA	NA	NA	CRK	5640	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr17	1620806	1621089	1620895	Y	PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81	PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG,SERPINF1	NA	NA	NA	NA	MIR22HG	2338	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	1241	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	2078039	2078451	2078156	Y	TSR1,HIC1,HIC1	NA	NA	NA	NA	NA	HIC1	122591	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	2084810	2085252	2085043	Y	HIC1,HIC1	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	119425	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	2241529	2241816	2241651	Y	NA	SRR,SMG6,SGSM2,TSR1	NA	NA	NA	NA	TSR1	2728	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	2291927	2292298	2292113	Y	NA	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	10114	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	2300026	2300553	2300288	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	1859	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr17	2302108	2302510	2302261	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	NA	NA	NA	NA	NA	MNT	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.31192201671937
chr17	2305266	2305571	2305415	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	2854	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	2307798	2307958	2307865	Y	PAFAH1B1	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	5386	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	2952123	2952503	2952284	Y	ASPA,ASPA,PAFAH1B1	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	457619	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	3504662	3504760	3504711	Y	NA	TRPV3,SHPK,CTNS	TRPV3	IMR90	Hi-C	24141950	SHPK	32856	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	3791812	3792145	3792008	Y	GSG2	C17orf85,CAMKK1	NA	NA	NA	NA	CAMKK1	4040	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	4064613	4064785	4064717	Y	NA	ZZEF1,CYB5D2	NA	NA	NA	NA	CYB5D2	20151	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	4205148	4205753	4205440	Y	P2RX1,ATP2A3,ZZEF1,ZMYND15,ZMYND15,SMTNL2,SMTNL2,ARRB2,UBE2G1	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39874	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	4233037	4233303	4233170	Y	NA	UBE2G1	NA	NA	NA	NA	UBE2G1	34620	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	4244674	4245003	4244975	Y	NA	UBE2G1	NA	NA	NA	NA	UBE2G1	22920	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	4934963	4935218	4935186	Y	NA	CAMTA2,KIF1C,ZFP3	NA	NA	NA	NA	KIF1C	35720	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	5430157	5430402	5430333	Y	NLRP1	MIS12,DERL2	NA	NA	NA	NA	DERL2	42026	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	6897797	6898308	6898020	Y	NA	AC027763.2,RNASEK,C17orf49,BCL6B,SLC16A13	NA	NA	NA	NA	AC027763.2	15360	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	6925152	6925653	6925481	Y	PLSCR3,C17orf49,BCL6B	AC027763.2,RNASEK,C17orf49,BCL6B,SLC16A13	NA	NA	NA	NA	BCL6B	813	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr17	7115018	7115437	7115195	Y	NA	ACADVL,DLG4,DVL2,PHF23,GABARAP,CTDNEP1	NA	NA	NA	NA	ACADVL	3007	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	7389589	7389989	7389739	Y	C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A	FGF11,CHRNB1,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	POLR2A	3904	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	7737438	7738736	7737971	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	20328	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	18450	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	13194	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	12120	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	3.20112279238066
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	11508	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	3.20112279238066
chr17	8041932	8042438	8042328	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	15386	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr17	8056609	8057167	8057155	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	657	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	8057335	8058055	8057702	Y	KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59	VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	8090795	8091158	8090849	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	406	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr17	8391640	8392024	8391937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDEL1	77191	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	9155924	9156306	9156115	Y	PIK3R5	NA	NA	NA	NA	NA	STX8	321602	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	12928606	12928939	12928835	Y	MYOCD	ELAC2	ELAC2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ELAC2	9102	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	13241219	13241377	13241298	Y	NA	NA	HS3ST3B1	IMR90	Hi-C	24141950	ELAC2	321715	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	13249594	13249869	13249742	Y	HS3ST3A1	NA	HS3ST3B1,HS3ST3A1	IMR90	Hi-C	24141950	ELAC2	330090	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	13575065	13575361	13575332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX10-AS1	395451	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	14105008	14105251	14105153	Y	COX10,HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	97149	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	15787021	15787553	15787332	Y	ZSWIM7,TTC19,ADORA2B	NA	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	58678	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr17	15849102	15849709	15849209	Y	ZSWIM7,TTC19,ADORA2B	ADORA2B	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	2871	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr17	15895023	15895192	15895111	Y	NA	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	TTC19	5502	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	15959345	15959465	15959410	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	58314	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	16189250	16189597	16189494	Y	NCOR1,TRPV2	NA	NA	NA	NA	NA	CENPV	65373	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	16355497	16355695	16355534	Y	TTC19,PIGL	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	37772	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	16374519	16374788	16374546	Y	NA	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	18679	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	16438910	16439232	16439111	Y	NA	FAM211A,ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	31288	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr17	17319893	17320013	17319952	Y	FLCN	RPL13P12	NA	NA	NA	NA	RPL13P12	34567	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	17654001	17654381	17654093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	71214	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr17	17725605	17725781	17725666	Y	NA	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	12544	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr17	17752508	17752712	17752608	Y	RASD1,PEMT	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	14183	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	17861466	17861608	17861562	Y	SMCR8	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	12128	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	18032331	18032623	18032472	Y	TOM1L2,MYO15A	DRG2	NA	NA	NA	NA	DRG2	43131	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	18084670	18084979	18084825	Y	NA	ALKBH5,LLGL1	NA	NA	NA	NA	ALKBH5	278	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	18820621	18820763	18820720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPSAP2	79223	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	18825562	18825708	18825647	Y	FAM83G,TRIM16L	NA	NA	NA	NA	NA	FAM83G	80409	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	20943914	20944165	20944106	Y	NA	USP22	NA	NA	NA	NA	USP22	908	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr17	21187096	21187372	21187243	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	1112	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	21188812	21189500	21189174	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	2828	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr17	25410571	25410806	25410743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208296	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	25659360	25659787	25659571	Y	LGALS9,WSB1	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40258	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	25659975	25660361	25659997	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40873	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr17	25805507	25805777	25805623	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	23837	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	27072804	27073286	27072989	Y	TRAF4	PROCA1,RAB34,RPL23A,NEK8,TLCD1,TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	3802	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	27100910	27101180	27101019	Y	NA	NEK8,TLCD1,TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	31908	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	27104790	27105049	27104918	Y	SEBOX	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	35788	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	27189702	27189769	27189736	Y	NA	ERAL1,FLOT2,DHRS13	NA	NA	NA	NA	ERAL1	9746	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	27367295	27367696	27367449	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	PHF12	90506	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	27439260	27439514	27439393	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO18A	65916	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	27475765	27476166	27476073	Y	NEK8,PHF12	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	29264	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	27619094	27619880	27619581	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	27966112	27966641	27966332	Y	NA	GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	CORO6	18187	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	29423002	29423667	29423241	Y	NA	NF1	NA	NA	NA	NA	NF1	3057	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	29596751	29597032	29596911	Y	NA	EVI2B,EVI2A	NA	NA	NA	NA	EVI2B	42098	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVI2A	229790	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	29923737	29923924	29923895	Y	EVI2A	NA	NA	NA	NA	NA	EVI2A	276835	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	30723443	30723679	30723561	Y	NA	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	45600	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	30724674	30725107	30724769	Y	RHOT1	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	44172	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	30823818	30823986	30823902	Y	NA	CDK5R1	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	12181	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	32365538	32365912	32365713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCL2	214392	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	32425716	32426082	32425906	Y	CCL8,CCL7	NA	NA	NA	NA	NA	CCL2	154222	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	32579434	32580053	32579676	Y	CCL8,CCL7	CCL2	NA	NA	NA	NA	CCL2	251	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	32581116	32581488	32581294	Y	NA	CCL2	NA	NA	NA	NA	CCL2	812	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	33300552	33300861	33300820	Y	NA	ZNF830,LIG3,CCT6B	NA	NA	NA	NA	LIG3	4652	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	33414530	33415581	33415167	Y	SLFN5,ZNF830,RFFL	RFFL,RAD51D	NA	NA	NA	NA	RFFL	192	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	33572314	33572864	33572356	Y	NA	SLFN5	NA	NA	NA	NA	SLFN5	4259	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr17	33640144	33640597	33640233	Y	CCT6B,ZNF830,SLFN12L,SLFN5	NA	PEX12,SLFN14,SLC35G3,SLFN12L,SLFN12,SNORD7,AP2B1	IMR90	Hi-C	24141950	SLFN11	58123	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	35520107	35520138	35520123	Y	ACACA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215932	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	36102823	36103051	36102995	Y	ACACA,DDX52,HNF1B	NA	NA	NA	NA	NA	DDX52	101330	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	36412216	36412471	36412263	Y	NA	RP11-1407O15.2,MRPL45	NA	NA	NA	NA	RP11-1407O15.2	7387	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	36571646	36572076	36571709	Y	C17orf96	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	10586	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	36585417	36585600	36585486	Y	ARHGAP23	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	2755	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	36859613	36860666	36860145	Y	NA	C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	MLLT6	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	37024501	37024874	37024707	Y	NA	CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	389	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	37027781	37027987	37027914	Y	FBXO47,CWC25	CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	3669	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1	NA	NA	NA	NA	MIEN1	25371	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr17	38254249	38254664	38254597	Y	GRB7,WIPF2,RARA,RARA,NR1D1	THRA,MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	314	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr17	38264417	38264842	38264667	Y	WIPF2,RARA,RARA,NR1D1	MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	9439	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr17	38374652	38374886	38374755	Y	KRT222,THRA,THRA,NR1D1,RARA,RAPGEFL1,WIPF2	WIPF2	NA	NA	NA	NA	WIPF2	1096	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	38463315	38463694	38463488	Y	RARA	CDC6	NA	NA	NA	NA	RARA	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	38607821	38607996	38607876	Y	NA	TOP2A,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	10119	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr17	38656717	38656888	38656754	Y	KRT24,KRT10,TNS4	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	59015	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	38689625	38689996	38689764	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	91923	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	38699205	38699580	38699386	Y	RARA,CCR7	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	101503	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	38706778	38707153	38707073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCE1	95607	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	38708057	38709216	38708396	Y	KRTAP1-5,GJD3,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCE1	93544	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr17	39066622	39066986	39066860	Y	IGFBP4,KRTAP1-1,KRTAP1-5	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM99	93264	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	39536188	39536609	39536415	Y	NA	KRT34	NA	NA	NA	NA	KRT34	46	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr17	39653134	39653351	39653234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT34	116479	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr17	39686458	39686891	39686666	Y	KRT19	NA	NA	NA	NA	NA	KRT34	149803	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	40400517	40401003	40400833	Y	EZH1,KLHL11,RAB5C,STAT3,STAT3,FAM134C,STAT5B,STAT5A	STAT5B,STAT5A	NA	NA	NA	NA	STAT5B	25722	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	40573451	40573881	40573544	Y	AOC3,GHDC,PLEKHH3,NAGLU,PTRF	STAT3,ATP6V0A1	NA	NA	NA	NA	PTRF	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	40670495	40670831	40670653	Y	WNK4,RAB5C,PTRF	NAGLU,COASY,MLX	NA	NA	NA	NA	NAGLU	15359	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	41173099	41173334	41173293	Y	NAGLU,VAT1	RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1,RND2	NA	NA	NA	NA	VAT1	1806	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr17	41827198	41827473	41827372	Y	NA	DUSP3	NA	NA	NA	NA	DUSP3	26883	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	42245888	42246083	42245988	Y	NA	HDAC5,C17orf53,TMUB2,ATXN7L3	NA	NA	NA	NA	TMUB2	16255	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.95624170645485
chr17	42357085	42357361	42357237	Y	TMUB2,TMUB2,GPATCH8,GRN	SLC25A39	SLC4A1,RUNDC3A,UBTF,SLC25A39	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A39	42877	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	42404001	42404290	42404282	Y	C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39	SLC25A39,GRN,FAM171A2	NA	NA	NA	NA	SLC25A39	3763	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr17	42416163	42416367	42416282	Y	TMUB2,TMUB2,GRN	SLC25A39,GRN,FAM171A2	NA	NA	NA	NA	GRN	4247	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	42589268	42589584	42589359	Y	C17orf53,GJC1,DBF4B,CCDC43,C17orf104	GPATCH8,FZD2	ATXN7L3,GPATCH8	K562	ChIA-PET	22265404	GPATCH8	10470	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	42624253	42624886	42624582	Y	TMUB2,TMUB2,GRN	GPATCH8,FZD2	GPATCH8,FZD2,ITGA2B,DBF4B,C17orf104,CCDC43	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FZD2	8039	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	42872286	42872458	42872432	Y	FMNL1,GRN	ADAM11,GJC1	NA	NA	NA	NA	GJC1	33726	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	43095998	43096402	43096133	Y	NA	NMT1,DCAKD	NA	NA	NA	NA	NMT1	30576	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	43170304	43170536	43170449	Y	ADAM11,HIGD1B,GFAP	NMT1,DCAKD,ACBD4,PLCD3	NA	NA	NA	NA	DCAKD	33831	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr17	43221862	43221955	43221890	Y	ACBD4,HEXIM1	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2	NA	NA	NA	NA	HEXIM1	729	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr17	43304336	43305039	43304628	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	NA	NA	NA	NA	NA	HEXIM2	68269	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	43309202	43309383	43309263	Y	MAP3K14,FMNL1	NA	NA	NA	NA	NA	HEXIM2	73135	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	43951029	43951274	43951198	Y	NA	MAPT	NA	NA	NA	NA	MAPT	18474	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MAPT	374423	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	45317390	45317724	45317566	Y	TBKBP1	ITGB3	NA	NA	NA	NA	ITGB3	11539	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	45333109	45333278	45333129	Y	NA	ITGB3	NA	NA	NA	NA	ITGB3	3846	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	45343380	45343597	45343479	Y	TBKBP1	ITGB3	NA	NA	NA	NA	ITGB3	14117	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	45356357	45357027	45356891	Y	NA	ITGB3	NA	NA	NA	NA	ITGB3	27094	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	45609469	45609601	45609554	Y	NA	NPEPPS	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	11161	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	45771013	45771467	45771041	Y	NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1	KPNB1,TBX21	NA	NA	NA	NA	TBX21	37143	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	45867525	45867625	45867557	Y	NA	OSBPL7,MRPL10,LRRC46,SCRN2	NA	NA	NA	NA	OSBPL7	29575	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	45980057	45980402	45980230	Y	NA	SP2,AC003665.1,PNPO	NA	NA	NA	NA	SP2	8541	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	46102426	46102830	46102617	Y	NA	COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	10562	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	46217226	46217562	46217317	Y	CDK5RAP3,SKAP1	CBX1,SNX11	NA	NA	NA	NA	SNX11	38507	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	46314423	46314444	46314434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX11	135704	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	47099859	47100181	47099940	Y	PRAC,IGF2BP1	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-42P	74977	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	GNGT2,PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	GNGT2	15427	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr17	47857403	47857727	47857543	Y	NA	KAT7,FAM117A,RP11-613C6.4	FAM117A,ZNF652,KAT7	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KAT7	6190	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr17	48105546	48105721	48105634	Y	ITGA3	ITGA3	LOC284080,ITGA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	ITGA3	25611	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	48208282	48208563	48208423	Y	NA	PDK2,SAMD14,PPP1R9B	NA	NA	NA	NA	SAMD14	3036	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	SAMD14,PPP1R9B,COL1A1	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr17	48251038	48251269	48251124	Y	XYLT2,LRRC59,COL1A1	SAMD14,PPP1R9B,COL1A1	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	25047	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	48255388	48256117	48255676	Y	NA	PPP1R9B,COL1A1	NA	NA	NA	NA	COL1A1	20876	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	48287695	48288075	48287880	Y	XYLT2,LRRC59,COL1A1	COL1A1	PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A1	10702	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr17	48288364	48288588	48288396	Y	XYLT2,LRRC59,COL1A1	COL1A1	PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A1	11371	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.95624170645485
chr17	48367346	48367814	48367643	Y	PPP1R9B	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT2	53639	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr17	48642446	48642840	48642521	Y	PDK2,SAMD14,CACNA1G	SPATA20,CACNA1G	NA	NA	NA	NA	CACNA1G	6017	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr17	48870441	48870661	48870502	Y	NA	NA	TOB1,LINC00483,LOC400604,CACNA1G,SPAG9,WFIKKN2,ANKRD40	IMR90	Hi-C	24141950	TOB1	72678	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	49027288	49027482	49027366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOB1	83949	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	51165674	51166028	51165821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOM1L1	1808720	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	53315618	53315983	53315841	Y	HLF	HLF	STXBP4,HLF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HLF	24390	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	53497202	53497618	53497598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMD	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	54263832	54264049	54263912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCTP	437492	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	54993018	54993544	54993286	Y	SCPEP1,TRIM25	TRIM25,COIL	DGKE	MCF7	ChIA-PET	22265404	TRIM25	3619	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr17	54995280	54995673	54995559	Y	NA	TRIM25,COIL	NA	NA	NA	NA	TRIM25	5881	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	55712522	55712748	55712677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	212669	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	55912487	55912699	55912681	Y	NA	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	12718	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	55947370	55947506	55947438	Y	NA	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	21953	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	55951789	55952442	55952113	Y	SRSF1,MKS1,MKS1,BZRAP1,MRPS23	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	26372	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	55970352	55970806	55970481	Y	SUPT4H1,VEZF1	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	44935	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	56012688	56013140	56012704	Y	NA	CUEDC1	VEZF1,SRSF1,CUEDC1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	17544	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	56014018	56014160	56014055	Y	NA	CUEDC1,VEZF1	VEZF1,CUEDC1,SRSF1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	16524	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	56020686	56021039	56020762	Y	NA	CUEDC1,VEZF1	VEZF1,CUEDC1,SRSF1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	9645	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	56064193	56064677	56064258	Y	NA	CUEDC1,VEZF1,SRSF1	NA	NA	NA	NA	VEZF1	573	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	56161643	56161969	56161895	Y	VEZF1,MTMR4	DYNLL2	NA	NA	NA	NA	DYNLL2	2867	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	56587640	56587744	56587729	Y	PPM1E,DYNLL2,MKS1,SEPT4,MTMR4	MTMR4	NA	NA	NA	NA	MTMR4	5522	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	56706902	56707296	56707107	Y	MKS1,MKS1,RAD51C	RNU1-60P,RNU1-85P	SEPT4,MTMR4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	27370	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	57515173	57515465	57515270	Y	YPEL2	NA	YPEL2,GDPD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YPEL2	108123	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	57831888	57832338	57832062	Y	VMP1,RNFT1	VMP1,PTRH2	NA	NA	NA	NA	PTRH2	48901	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr17	57839956	57840355	57840071	Y	RNFT1	NA	NA	NA	NA	NA	PTRH2	56969	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	57860256	57860659	57860446	Y	DHX40,VMP1,CA4	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	55968	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	57861698	57862055	57862024	Y	RNFT1	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	54572	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	57863159	57864676	57863979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	51951	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr17	57902814	57903248	57902913	Y	YPEL2,VMP1,RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	13379	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	57905350	57905555	57905420	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	11072	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	57906379	57907270	57906882	Y	RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	9357	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr17	57907420	57907736	57907558	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	8891	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	57922999	57923843	57923122	Y	PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	6372	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	57929068	57929265	57929192	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	12441	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr17	58212242	58212405	58212344	Y	NA	NA	C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEATR6	57950	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	58468371	58468697	58468395	Y	BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,USP32	USP32	NA	NA	NA	NA	USP32	29134	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	58470515	58470600	58470558	Y	RNFT1	USP32	NA	NA	NA	NA	USP32	27231	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	58678620	58678973	58678714	Y	PPM1D	PPM1D	NA	NA	NA	NA	PPM1D	3076	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	59449966	59450070	59450027	Y	NA	TBX2	NA	NA	NA	NA	TBX2	25187	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	59474585	59474918	59474715	Y	NA	TBX2	NA	NA	NA	NA	TBX2	339	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	59488217	59488528	59488332	Y	NA	TBX2,TBX4	NA	NA	NA	NA	TBX2	12960	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	59784149	59784411	59784258	Y	BRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	NACA2	117586	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	60555037	60555507	60555099	Y	NA	RP11-464D20.2	MRC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-464D20.2	36621	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	60729712	60730300	60729931	Y	NA	MRC2	NA	NA	NA	NA	MRC2	26950	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	60745829	60746119	60745974	Y	TLK2	MRC2	NA	NA	NA	NA	MRC2	43067	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	60868640	60868941	60868827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	165878	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	60973132	60973339	60973182	Y	TLK2	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	270370	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr17	61043121	61043648	61043243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	340359	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr17	61243701	61244044	61243838	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB561	277695	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	61279197	61279372	61279284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB561	242367	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	61299362	61299669	61299468	Y	MAP3K3	NA	MIR548W,DCAF7,MARCH10	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	222070	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	61357224	61357494	61357377	Y	MAP3K3,LIMD2	NA	MIR548W,MARCH10	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	164245	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	61370802	61371122	61370929	Y	MAP3K3,LIMD2	NA	MIR548W	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	150617	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	61514078	61514307	61514301	Y	SMARCD2,DDX42,CYB561,CYB561	CYB561,ACE	NA	NA	NA	NA	CYB561	7432	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	61538235	61538385	61538330	Y	NA	CYB561,ACE	CYB561,ACE,MIR548W,KCNH6,DCAF7,TACO1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CYB561	16496	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	61787185	61787371	61787278	Y	NA	LIMD2,STRADA	NA	NA	NA	NA	LIMD2	10653	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	61920991	61921115	61921104	Y	NA	PSMC5,FTSJ3,SMARCD2,TCAM1P	NA	NA	NA	NA	SMARCD2	2566	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr17	62011006	62011202	62011104	Y	GH1	NA	NA	NA	NA	NA	TCAM1P	86354	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	62159440	62159790	62159613	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	46389	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	62201742	62201923	62201916	Y	DDX5,ERN1	ERN1,SNORD104	NA	NA	NA	NA	ERN1	4256	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	62339620	62339793	62339707	Y	CEP95	TEX2	NA	NA	NA	NA	TEX2	959	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	62409252	62409599	62409468	Y	ICAM2,ERN1,PECAM1,DDX5	NA	NA	NA	NA	NA	TEX2	70591	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	62675748	62676312	62676051	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2,LOC146880	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMURF2	19562	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr17	62773066	62773435	62773116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHM1P	57837	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	62958497	62958860	62958615	Y	NA	LRRC37A3,AMZ2P1	NA	NA	NA	NA	AMZ2P1	10834	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	63119249	63119621	63119552	Y	GNA13	RGS9	RGS9,GNA13,AMZ2P1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RGS9	11928	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	63654769	63655153	63655091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	99004	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	64380133	64380302	64380218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	83379	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	64455929	64456369	64456061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	159175	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr17	64463185	64463416	64463350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	166431	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	64524337	64524637	64524487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	227583	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	64566647	64567007	64566809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	269893	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	65220181	65220399	65220279	Y	NA	HELZ,SNORA8	NA	NA	NA	NA	HELZ	19706	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	65339190	65339485	65339338	Y	BPTF	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PSMD12	21258	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	65386872	65387224	65386898	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	15297	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr17	65389377	65389540	65389482	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	17802	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr17	65394789	65395150	65395019	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NOL11	IMR90	Hi-C	24141950	PITPNC1	23214	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	65418011	65418377	65418257	Y	HELZ,PSMD12,PITPNC1,BPTF	PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	46436	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	65430262	65430593	65430339	Y	HELZ,PITPNC1,BPTF	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	58687	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	65470400	65470556	65470469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	98825	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	65477756	65478333	65478203	Y	HELZ,PSMD12	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	106181	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	65487114	65487504	65487449	Y	HELZ,PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	115539	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr17	65516763	65517072	65516877	Y	PITPNC1	NA	NOL11	IMR90	Hi-C	24141950	PITPNC1	145188	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	65525014	65525424	65525241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	153439	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr17	65567749	65567899	65567852	Y	NOL11	NA	NA	NA	NA	NA	NOL11	144050	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	65583636	65583728	65583682	Y	BPTF	NA	NA	NA	NA	NA	NOL11	128221	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr17	66041204	66041633	66041268	Y	NA	KPNA2	NA	NA	NA	NA	KPNA2	11569	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	66308597	66309089	66308898	Y	BPTF,PRKAR1A,PRKAR1A,SLC16A6	NA	NA	NA	NA	NA	AMZ2	66882	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	66314385	66314893	66314731	Y	BPTF,SLC16A6	NA	NA	NA	NA	NA	AMZ2	72670	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	66374219	66374806	66374507	Y	SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	76848	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr17	66374808	66375131	66375016	Y	SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	76523	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	66376984	66377775	66377396	Y	NA	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	73879	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	66419326	66419636	66419592	Y	NA	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	32018	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr17	66421215	66421317	66421250	Y	NA	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	30337	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	66452097	66452412	66452224	Y	SLC16A6	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	443	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	66452519	66452682	66452605	Y	SLC16A6,WIPI1	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	865	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	67270709	67270940	67270826	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCA5	50445	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	67757945	67758523	67758299	Y	KCNJ2	NA	KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2,MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	349106	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	68985545	68985917	68985627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LOC124685	629202	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	69068010	69068257	69068112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LOC124685	546862	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr17	69229008	69229023	69229016	Y	NA	NA	LOC100499467	IMR90	Hi-C	24141950	LOC124685	386096	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	69437254	69437446	69437407	Y	NA	NA	SOX9,LOC100499467,SLC39A11	IMR90	Hi-C	24141950	LOC124685	177673	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	70122851	70122907	70122879	Y	NA	SOX9	NA	NA	NA	NA	SOX9	7690	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	70147771	70147892	70147832	Y	NA	SOX9	SOX9,LOC100499467	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SOX9	32610	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	70461830	70461987	70461862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	159383	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	70587266	70587776	70587444	Y	NA	RPL32P33	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	33594	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	70664433	70664574	70664507	Y	NA	RPL32P33	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	43063	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	71287548	71287861	71287762	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	18453	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr17	71301216	71301553	71301269	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	4761	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	71305759	71306422	71306099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	71320337	71320718	71320484	Y	NA	CDC42EP4	CDC42EP4	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP4	14023	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	71603632	71603970	71603800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	297318	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	71909993	71910008	71910001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL38	287713	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	72453815	72453911	72453863	Y	TTYH2,TTYH2,RAB37,GRIN2C,GPRC5C	NA	NA	NA	NA	NA	CD300C	86371	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	72508636	72509320	72508920	Y	TTYH2,CD300A,TMEM104,CD300LF,CD300E,CD300LD,CD300LB,CD300C	CD300C	NA	NA	NA	NA	CD300C	30962	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	72745955	72746124	72746086	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3164	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	72830385	72830471	72830428	Y	NA	FDXR	NA	NA	NA	NA	FDXR	36685	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	72984795	72985307	72985001	Y	RAB37,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	NA	NA	NA	NA	CDR2L	3068	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr17	73007918	73008254	73008160	Y	RAB37,GRIN2C,FADS6,C17orf28,CDR2L,SUMO2,KCTD2,ARMC7	CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H	NA	NA	NA	NA	ICT1	1153	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	73009835	73009966	73009891	Y	NA	CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H	NA	NA	NA	NA	ICT1	3070	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	73032786	73033119	73032977	Y	TSEN54,GGA3	ICT1,KCTD2,ATP5H,SLC16A5	NA	NA	NA	NA	KCTD2	6116	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	73304838	73305233	73305159	Y	UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19	MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	8177	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	73333353	73333637	73333600	Y	H3F3B,GRB2,GRB2,GGA3	SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	19943	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr17	73696530	73696897	73696707	Y	SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5	NA	NA	NA	NA	RECQL5	35261	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	73891396	73891618	73891569	Y	NA	WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1	NA	NA	NA	NA	TRIM65	312	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	74067493	74067877	74067630	Y	RNF157,FAM100B	SRP68,GALR2,EXOC7	NA	NA	NA	NA	SRP68	759	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	74117633	74117738	74117682	Y	NA	GALR2,EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	EXOC7	1976	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr17	74189615	74189996	74189806	Y	RNF157	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	ATF4P3	30891	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	74248222	74248574	74248373	Y	ST6GALNAC2,RHBDF2,RHBDF2,JMJD6,H3F3B,UNC13D,WBP2,ACOX1,SPHK1,FAM100B	ATF4P3,RNF157	RNF157	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNF157	13768	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	74264426	74264836	74264522	Y	NA	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	RNF157	29972	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	74304435	74304789	74304685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPHK1	65876	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	74415585	74415933	74415760	Y	MFSD11,RNF157	SPHK1,PRPSAP1,UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	31355	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	74511289	74512094	74511811	Y	QRICH2,SPHK1,SPHK1,SRSF2,JMJD6,RHBDF2,RHBDF2	RHBDF2,CYGB	NA	NA	NA	NA	RHBDF2	15417	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	74525516	74525637	74525615	Y	NA	RHBDF2,CYGB	NA	NA	NA	NA	CYGB	19620	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr17	74525744	74526079	74526045	Y	ST6GALNAC2,MGAT5B,CYGB	RHBDF2,CYGB	NA	NA	NA	NA	CYGB	19178	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	74526422	74526750	74526585	Y	CYGB	RHBDF2,CYGB	NA	NA	NA	NA	CYGB	18507	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr17	74664017	74664029	74664023	Y	NA	MXRA7	NA	NA	NA	NA	MXRA7	41069	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	74692944	74693312	74693210	Y	NA	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	MXRA7	11786	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	74705254	74705618	74705431	Y	MXRA7	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	MXRA7	156	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr17	74713062	74713219	74713141	Y	NA	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	JMJD6	7647	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	74723995	74724371	74724344	Y	FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	METTL23	3083	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr17	74785319	74785747	74785427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF2	53863	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	75120383	75120864	75120582	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	39585	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	75319028	75319523	75319372	Y	SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	44377	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr17	75319670	75320031	75319742	Y	MGAT5B,SEPT9,SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	45019	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	75384636	75384998	75384811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	109985	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr17	75387909	75388384	75388205	Y	SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	113258	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	75461802	75462176	75461947	Y	SEC14L1,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	187151	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	75504499	75504824	75504660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	229848	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	RNU1-80P,TNRC6C	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-80P	40213	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	19.206736754284
chr17	75955923	75956319	75956134	Y	TMC8,TMC6,TMC6,TNRC6C	RNU1-80P,TNRC6C	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-80P	41743	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	76310071	76310633	76310436	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	PGS1,DNAH17,SOCS3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SOCS3	43525	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr17	76318991	76319257	76319075	Y	NA	SOCS3	NA	NA	NA	NA	SOCS3	34901	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	76320464	76321292	76320695	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	NA	NA	NA	NA	SOCS3	32866	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	76325206	76325964	76325662	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	28194	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr17	76330688	76331173	76330803	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	22985	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	76337607	76338208	76338068	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	15950	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.95624170645485
chr17	76338337	76338836	76338651	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	15322	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr17	76349549	76349649	76349633	Y	NA	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4509	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	76409170	76409735	76409347	Y	CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1	PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	36449	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	76635563	76635793	76635778	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	NA	DNAH17,CYTH1	IMR90	Hi-C	24141950	CYTH1	140586	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	76801462	76801678	76801575	Y	DNAH17,USP36,CYTH1	CYTH1,USP36	NA	NA	NA	NA	CYTH1	25083	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	76875667	76876103	76875916	Y	CYTH1,ENGASE,CANT1	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	USP36	40144	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr17	76879007	76879631	76879400	Y	CYTH1,ENGASE,CANT1,USP36	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39838	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr17	76879876	76880180	76879977	Y	NA	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39289	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr17	76929562	76929807	76929665	Y	CANT1	TIMP2,LGALS3BP	TIMP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TIMP2	10093	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	76930060	76930674	76930419	Y	NA	TIMP2,LGALS3BP	TIMP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TIMP2	10591	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	77034665	77035262	77034914	Y	CYTH1,USP36,ENGASE	CANT1,C1QTNF1,ENGASE	NA	NA	NA	NA	C1QTNF1	17769	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr17	77404221	77404595	77404558	Y	RBFOX3	NA	NA	NA	NA	NA	ENGASE	335200	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	77967532	77967765	77967641	Y	CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	39882	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.84544248211614
chr17	78228476	78228940	78228764	Y	GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213	SLC26A11,SGSH,RNF213	NA	NA	NA	NA	RNF213	3725	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	78238527	78238862	78238699	Y	GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213	SLC26A11,SGSH,RNF213	NA	NA	NA	NA	RNF213	5862	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	78352228	78352499	78352367	Y	GAA,RNF213	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	34466	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	41238	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	5.51304480910003
chr17	78431372	78431666	78431608	Y	GAA,EIF4A3,SGSH,SLC26A11	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	44407	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	78560725	78560872	78560817	Y	NA	RPL32P31,RPTOR	NA	NA	NA	NA	RPTOR	44106	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	78754047	78754707	78754061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	208691	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	78756741	78756888	78756815	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	206510	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	78763390	78763671	78763525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	199727	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr17	78800697	78801105	78800867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	162293	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	78803936	78804105	78804080	Y	AATK	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	159293	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr17	78806684	78807307	78807121	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	156091	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	6.40224558476132
chr17	78824691	78824852	78824790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	138546	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	78830209	78830686	78830492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	132712	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr17	79068878	79069252	79068906	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	61930	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	79316253	79317268	79317090	Y	NA	SLC38A10	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,C17orf56,C17orf89,LINC00482,MIR3186,C17orf70,FSCN2,NPLOC4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A10	48906	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	NA	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A10	51978	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr17	79360408	79361324	79361141	Y	ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	93061	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	79369574	79370687	79370597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	102227	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	79397073	79397461	79397298	Y	MAFG,MAFG,NPLOC4,HGS	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	80628	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	79439092	79439387	79439261	Y	PCYT2,FAM195B,C17orf90,C17orf70,ACTG1	RP13-766D20.1,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	38702	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr17	79482562	79482804	79482728	Y	NA	RP13-766D20.1,ACTG1,C17orf70	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	4473	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	79546845	79547000	79546944	Y	PCYT2	C17orf70	NA	NA	NA	NA	C17orf70	27858	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	79942701	79942868	79942785	Y	SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62	PYCR1,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	10018	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	3.20112279238066
chr17	80188750	80189250	80189000	Y	NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	SLC16A3	4477	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	80239829	80239997	80239937	Y	NA	CSNK1D,SECTM1	CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1D	10222	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	80245965	80246238	80246057	Y	MAFG,MAFG,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1	CSNK1D,SECTM1	CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1D	16358	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	80255299	80255755	80255478	Y	SIRT7,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7	CSNK1D,SECTM1	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	25692	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr17	80255798	80256475	80256187	Y	SIRT7,MAFG,MAFG,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,HEXDC,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7	CSNK1D,SECTM1	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	26191	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr17	80296831	80297318	80297085	Y	NA	SECTM1,TEX19	SECTM1,CCDC57,SLC16A3,CSNK1D,CD7,TEX19,C17orf62,C17orf101,NARF,HEXDC,FOXK2,WDR45L	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SECTM1	6881	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr17	80592968	80593241	80593234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB40B	61363	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	80805995	80806457	80806155	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	98055	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	80845276	80845458	80845382	Y	C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	137336	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	81038687	81040054	81039707	Y	B3GNTL1,METRNL	B3GNTL1,METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	3120	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr17	81066773	81067186	81066924	Y	NA	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	31206	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr17	81067352	81067511	81067418	Y	NA	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	31785	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr17	81103238	81103635	81103449	Y	METRNL	NA	METRNL	MCF7	ChIA-PET	22265404	METRNL	67671	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr17	81147237	81149188	81147763	Y	METRNL	NA	METRNL,B3GNTL1,TBCD	MCF7	ChIA-PET	22265404	METRNL	111670	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr17	81150899	81151424	81151082	Y	METRNL	NA	METRNL	MCF7	ChIA-PET	22265404	METRNL	115332	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr18	221277	221425	221379	Y	THOC1,ENOSF1,ENOSF1	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	44625	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	222573	222827	222703	Y	NA	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	43223	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	228420	228816	228694	Y	THOC1	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	37234	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	235900	236290	236249	Y	NA	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	29760	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	323417	323617	323527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THOC1	57367	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	394915	395311	395219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COLEC12	103411	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	395862	395959	395924	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COLEC12	102763	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr18	410446	410458	410452	Y	ADCYAP1,ADCYAP1	NA	NA	NA	NA	NA	COLEC12	88264	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	494806	494991	494899	Y	NA	COLEC12	NA	NA	NA	NA	COLEC12	3731	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	9843	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	3.73464325777744
chr18	668283	668526	668405	Y	THOC1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11943	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	711356	711474	711397	Y	ENOSF1,ENOSF1	ENOSF1	NA	NA	NA	NA	ENOSF1	680	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	781638	782117	782009	Y	NA	RNU1-109P,YES1	NA	NA	NA	NA	RNU1-109P	14019	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	830446	830703	830580	Y	NA	RNU1-109P,YES1	CLUL1,ENOSF1,YES1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YES1	19899	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	2302701	2302761	2302738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	266747	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	2515543	2515690	2515617	Y	EMILIN2	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	53818	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	2516331	2516615	2516492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	52893	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.31192201671937
chr18	2797990	2798254	2798233	Y	NA	EMILIN2	NA	NA	NA	NA	EMILIN2	46774	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	2875334	2875786	2875693	Y	NA	EMILIN2	NA	NA	NA	NA	EMILIN2	30306	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr18	2978254	2978441	2978377	Y	NA	LPIN2	NA	NA	NA	NA	LPIN2	32872	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	2980400	2980653	2980492	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,SMCHD1,EMILIN2	LPIN2	NA	NA	NA	NA	LPIN2	30660	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	3250721	3251122	3250738	Y	NA	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12A	5242	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	3446696	3446930	3446873	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	TGIF1	NA	NA	NA	NA	TGIF1	37090	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	3594733	3596177	3595596	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	185127	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr18	3623872	3624258	3624140	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214266	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	3.55680310264518
chr18	3624338	3624601	3624482	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214732	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr18	3624841	3625119	3625035	Y	MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215235	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.13408186158711
chr18	3650005	3650381	3650193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	240399	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	3794813	3795294	3795021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	385207	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	4356734	4357177	4357014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	947128	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	4404011	4404377	4404194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	994405	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	5509992	5510526	5510282	Y	EPB41L3	NA	NA	NA	NA	NA	EPB41L3	118173	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	5542461	5543034	5542604	Y	EPB41L3	NA	NA	NA	NA	NA	EPB41L3	85665	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr18	5582937	5583209	5583037	Y	NA	EPB41L3	NA	NA	NA	NA	EPB41L3	45490	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	5629750	5630120	5629929	Y	NA	EPB41L3	NA	NA	NA	NA	EPB41L3	1051	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	7273554	7273981	7273852	Y	NA	NA	PTPRM	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRM	290799	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	7958203	7958469	7958242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRM	393423	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	8948545	8948913	8948824	Y	TWSG1	NA	CCDC165	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	151715	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	9017103	9017601	9017310	Y	ANKRD12	NA	CCDC165,ANKRD12,RALBP1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	83027	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr18	9017601	9018155	9017805	Y	NA	NA	CCDC165,ANKRD12,RALBP1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	82473	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr18	9129786	9129925	9129855	Y	PPP4R1,ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	ANKRD12	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD12	4301	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	9219810	9220134	9219877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD12	85584	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	9643596	9643835	9643765	Y	NA	PPP4R1	PPP4R1,VAPA,ANKRD12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP4R1	30358	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	9743544	9744009	9743684	Y	VAPA,RAB31	RAB31	NA	NA	NA	NA	RAB31	37382	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	9812085	9812326	9812208	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	99673	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	9828298	9828524	9828428	Y	RALBP1,PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	83475	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	9877272	9877635	9877453	Y	VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	34364	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	10708268	10708433	10708298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	184366	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	11005597	11005922	11005792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	481695	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	11849903	11850727	11850169	Y	MPPE1,CHMP1B	CHMP1B	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	508	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	11947272	11947721	11947412	Y	CHMP1B	MPPE1,IMPA2	IMPA2,GNAL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IMPA2	31303	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	11995516	11995787	11995574	Y	NA	IMPA2	NA	NA	NA	NA	IMPA2	16492	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	12048672	12049055	12049000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMPA2	69648	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	12330841	12331244	12331045	Y	NA	TUBB6,AFG3L2	NA	NA	NA	NA	TUBB6	25173	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	12347442	12347507	12347473	Y	CEP76,AFG3L2	TUBB6,AFG3L2	NA	NA	NA	NA	AFG3L2	27806	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	12471098	12471401	12471374	Y	PSMG2	NA	NA	NA	NA	NA	SLMO1	65203	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	12641281	12641332	12641311	Y	SPIRE1,SPIRE1,PSMG2	SPIRE1,PSMG2	NA	NA	NA	NA	SPIRE1	14801	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	12864190	12864369	12864245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN2	63273	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	13217020	13217525	13217240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	227659	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	13824016	13824345	13824089	Y	MC5R	NA	NA	NA	NA	NA	FAM210A	99354	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	18517030	18517512	18517393	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROCK1	172300	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	18596588	18597119	18596879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROCK1	92693	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	18942831	18943125	18942978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREB1L	122628	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	19373794	19374099	19373861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIB1	90876	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	20003008	20003135	20003072	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	GATA6	255604	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	20131932	20132167	20132050	Y	NA	NA	CTAGE1,GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	244057	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	20139802	20140256	20140003	Y	GATA6	NA	CTAGE1,GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	235968	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	20811230	20811702	20811444	Y	NPC1,C18orf8,RBBP8,RBBP8	NA	NA	NA	NA	NA	CABLES1	98702	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr18	21153994	21154335	21154180	Y	NA	NPC1	NA	NA	NA	NA	NPC1	10527	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr18	21173695	21174031	21173886	Y	C18orf8,NPC1	NPC1	NA	NA	NA	NA	NPC1	8833	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	21228672	21228807	21228737	Y	LAMA3,ANKRD29	ANKRD29	NA	NA	NA	NA	ANKRD29	12042	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	21336252	21336608	21336275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD29	95403	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	21562247	21562750	21562607	Y	NA	TTC39C	TTC39C	IMR90	Hi-C	24141950	TTC39C	7987	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	21808250	21808465	21808434	Y	OSBPL1A	NA	NA	NA	NA	NA	CABYR	91308	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	22730586	22730811	22730699	Y	ZNF521	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF521	199343	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	22876042	22876109	22876076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF521	54045	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	22929287	22929693	22929350	Y	NA	ZNF521	NA	NA	NA	NA	ZNF521	461	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr18	23609881	23610142	23609962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SS18	59039	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	23657156	23657540	23657507	Y	NA	SS18	NA	NA	NA	NA	SS18	11641	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	25695112	25695346	25695270	Y	CDH2	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	60064	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	26347956	26348190	26348041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	592546	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	26744101	26744374	26744185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	988691	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	26745136	26745536	26745463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	989726	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	29542474	29542964	29542885	Y	RNF138	TRAPPC8	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	11375	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	31336306	31336396	31336375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASXL3	179727	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	32289089	32289403	32289194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNA	217835	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	32291109	32291369	32291156	Y	MAPRE2,NOL4,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNA	219855	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	32399644	32399985	32399810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	154907	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	32439346	32439714	32439476	Y	ZNF397,ZNF24,MAPRE2	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	115178	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	33185452	33185527	33185471	Y	ZNF397,GALNT1	GALNT1	NA	NA	NA	NA	GALNT1	26371	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	33275532	33275916	33275719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT1	116451	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	33311016	33311295	33311162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT1	151935	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	33876540	33877026	33876703	Y	NA	FHOD3	NA	NA	NA	NA	FHOD3	863	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr18	34152288	34152711	34152516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1328	254358	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	34532943	34533308	34533124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	125785	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	34547272	34547713	34547483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	140114	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	34765473	34765582	34765528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	358315	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	37629293	37629563	37629339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	715654	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	38256782	38257032	38256860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	1276139	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	38447528	38447658	38447616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	1085513	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	38655284	38655543	38655423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	877628	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	43307603	43307620	43307613	Y	NA	SLC14A1	NA	NA	NA	NA	SLC14A1	5511	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	43382830	43382969	43382904	Y	NA	NA	EPG5,SLC14A2,SLC14A1,SIGLEC15	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC14A1	80738	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr18	43407687	43408063	43407797	Y	PSTPIP2,EPG5	NA	NA	NA	NA	NA	SLC14A1	105595	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr18	43533217	43533245	43533231	Y	NA	EPG5	NA	NA	NA	NA	EPG5	11995	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	44451829	44452200	44451995	Y	NA	KATNAL2,PIAS2	NA	NA	NA	NA	KATNAL2	43255	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	45353824	45354074	45353943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	101441	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	45420480	45420806	45420653	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	34709	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	45444466	45444807	45444662	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	10708	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	45479794	45480168	45480059	Y	SMAD2,SMAD2	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	24279	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	46066779	46067121	46067052	Y	CTIF	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	3362	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	46253142	46253362	46253168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	189725	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	46345038	46345364	46345209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	129717	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	46349762	46350033	46349891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	125048	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	46451209	46451517	46451363	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	23564	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	46465508	46465942	46465798	Y	SMAD7,SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	9139	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	46478230	46479206	46479122	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	3149	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr18	46482158	46482454	46482304	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	SMAD7	K562	ChIA-PET	22265404	SMAD7	7077	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr18	46502180	46502412	46502333	Y	SMAD7	SMAD7	SMAD7,CTIF	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SMAD7	27099	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr18	46520518	46520924	46520659	Y	NA	SMAD7	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD7	45437	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	46524155	46524830	46524741	Y	NA	SMAD7	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD7	49074	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	46579464	46579684	46579624	Y	DYM	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	104383	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	46582084	46582553	46582428	Y	SMAD7,DYM	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	107003	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr18	47252630	47252839	47252704	Y	LIPG	NA	ACAA2,SCARNA17,MYO5B,LIPG	IMR90	Hi-C	24141950	ACAA2	85491	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr18	47834061	47834491	47834223	Y	CCDC11,MBD1,MBD1	CCDC11,MBD1,CXXC1	CCDC11,CXXC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CXXC1	21387	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	47834587	47834811	47834691	Y	NA	CCDC11,MBD1,CXXC1	CCDC11,CXXC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CXXC1	21913	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	48720847	48721238	48721193	Y	NA	MEX3C	NA	NA	NA	NA	MEX3C	21436	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	52490491	52490717	52490508	Y	RAB27B	NA	RAB27B	MCF7	ChIA-PET	22265404	RAB27B	107400	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	52613483	52613779	52613741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB27B	230392	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	53041931	53042230	53042160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	287788	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	53074073	53074201	53074145	Y	TCF4	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	255817	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	54327448	54327828	54327638	Y	NA	WDR7,TXNL1	NA	NA	NA	NA	TXNL1	10617	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	55108837	55109086	55108936	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	7920	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr18	55382886	55383034	55382958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP8B1	85299	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	55448232	55448442	55448350	Y	NA	ATP8B1	NA	NA	NA	NA	ATP8B1	19891	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	55474402	55474444	55474420	Y	NA	ATP8B1	ATP8B1	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP8B1	6069	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	56208513	56208704	56208597	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	57159	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	56339458	56339877	56339543	Y	MALT1	ALPK2,MALT1	NA	NA	NA	NA	MALT1	2840	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	56526446	56526759	56526519	Y	NA	ZNF532	NA	NA	NA	NA	ZNF532	1073	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	56631378	56631745	56631564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF532	103546	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr18	57274287	57274609	57274551	Y	CCBE1	NA	NA	NA	NA	NA	CCBE1	88003	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	57482239	57482409	57482315	Y	NA	NA	CCBE1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS26P54	55449	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	57541463	57541721	57541613	Y	NA	PMAIP1	PMAIP1,CCBE1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PMAIP1	23459	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	57552932	57553277	57553219	Y	PMAIP1	PMAIP1	PMAIP1	K562	ChIA-PET	22265404	PMAIP1	11903	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	57572110	57572452	57572282	Y	PMAIP1	PMAIP1	NA	NA	NA	NA	PMAIP1	6930	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	58951957	58952157	58952057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL30P14	118281	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	60087446	60087621	60087533	Y	ZCCHC2	NA	PHLPP1,ZCCHC2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFRSF11A	96926	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	60189219	60189514	60189362	Y	TNFRSF11A,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	979	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr18	60609893	60610245	60610069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLPP1	229221	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	60828947	60829338	60829223	Y	VPS4B,BCL2	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	156023	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	60860186	60860413	60860298	Y	VPS4B	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	124948	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	60904218	60904684	60904493	Y	VPS4B	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	80677	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	61033511	61033750	61033687	Y	NA	BCL2,KDSR	NA	NA	NA	NA	KDSR	768	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr18	61220427	61220683	61220555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS4B	132711	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	61350519	61350880	61350698	Y	SERPINB5,SERPINB12,SERPINB3,SERPINB11	NA	SERPINB10,SERPINB7	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINB7	67289	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	61426678	61427045	61426861	Y	SERPINB8,SERPINB2	SERPINB7	NA	NA	NA	NA	SERPINB7	8509	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.31192201671937
chr18	61539875	61540105	61540059	Y	VPS4B,SERPINB12,SERPINB8,SERPINB10,SERPINB2	SERPINB2	NA	NA	NA	NA	SERPINB2	2949	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	61549883	61550442	61550030	Y	VPS4B,SERPINB8,SERPINB2	SERPINB2	SERPINB7	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINB2	12957	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr18	61565801	61566233	61565950	Y	NA	SERPINB2,HMSD	NA	NA	NA	NA	SERPINB2	28875	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	61642248	61642613	61642430	Y	NA	HMSD,SERPINB8	NA	NA	NA	NA	SERPINB8	7089	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	63434118	63434346	63434234	Y	CDH7	NA	NA	NA	NA	NA	CDH19	835029	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	64968652	64968919	64968666	Y	NA	NA	CCDC102B,TMX3	IMR90	Hi-C	24141950	DSEL	213298	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	65027496	65027665	65027594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSEL	154552	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr18	67158128	67158224	67158176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTTN	712957	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	67285857	67286143	67286048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTTN	585038	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	67711885	67712217	67712098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTTN	158964	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	67901995	67902279	67902045	Y	NA	RTTN	NA	NA	NA	NA	RTTN	30814	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	67957012	67957306	67957264	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	2875	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	68001159	68001386	68001197	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	47022	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	68772419	68772586	68772499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS6	818282	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	71563069	71563215	71563130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO15	249885	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	71871963	71872167	71872065	Y	NA	NA	C18orf63,CYB5A,CNDP2	IMR90	Hi-C	24141950	TIMM21	58217	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	72676291	72676559	72676424	Y	ZNF407,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	242744	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr18	72694471	72694659	72694499	Y	ZNF407	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	224644	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	74205649	74206020	74205889	Y	NA	RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	172	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	74766602	74767022	74766743	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	234039	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr18	74767033	74767545	74767189	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	234470	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	74780891	74781094	74780990	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	248328	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	74813361	74814191	74813850	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	280798	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr18	77060474	77060624	77060564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	233189	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	342831	343179	342882	Y	MIER2	MIER2	NA	NA	NA	NA	MIER2	33	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	481673	481793	481759	Y	PALM,HCN2,FGF22	MADCAM1,TPGS1,CDC34	NA	NA	NA	NA	MADCAM1	5383	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	510583	510951	510744	Y	NA	MADCAM1,TPGS1,CDC34	NA	NA	NA	NA	TPGS1	5284	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	751766	752111	751822	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PTBP1	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42964	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	753188	753320	753238	Y	C19orf20	PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	41755	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	925071	925217	925123	Y	NA	MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	ARID3A	1290	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	933164	933556	933549	Y	NA	MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	ARID3A	9383	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr19	934999	935434	935086	Y	MIDN,CIRBP	MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	ARID3A	11218	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	1028160	1028923	1028240	Y	SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7	WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7	NA	NA	NA	NA	CNN2	3862	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	1085284	1085426	1085350	Y	C19orf22,ARID3A,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2	ABCA7,POLR2E,GPX4	NA	NA	NA	NA	POLR2E	8172	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	1101850	1102062	1101942	Y	C19orf6,MIDN,HMHA1,SBNO2,SBNO2	POLR2E	NA	NA	NA	NA	GPX4	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	1240232	1240534	1240365	Y	MUM1,APC2,C19orf26	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	ATP5D	483	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	1252961	1253429	1253036	Y	C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3955	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	1260732	1261171	1260912	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3348	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr19	1265810	1266064	1265967	Y	C19orf6,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6962	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.31192201671937
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	3.37896294751292
chr19	1408835	1409120	1409078	Y	NA	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15,APC2	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3267	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	1445282	1445452	1445336	Y	C19orf26,EFNA2,MUM1,APC2	GAMT,DAZAP1,RPS15,APC2,C19orf25,PCSK4,REEP6	NA	NA	NA	NA	APC2	982	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	1725719	1725877	1725796	Y	C19orf26,MUM1,APC2	NA	TCF3,C19orf25,ONECUT3,PLK5,UQCR11,ATP8B3,LOC100288123,REXO1	IMR90	Hi-C	24141950	TCF3	75115	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	1855247	1855761	1855485	Y	SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	5806	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr19	1857160	1857480	1857446	Y	NA	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	4087	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	2032329	2032652	2032524	Y	LINGO3,C19orf35	BTBD2,MKNK2	NA	NA	NA	NA	BTBD2	228	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	2049976	2050209	2050080	Y	OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	733	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	2056461	2056895	2056707	Y	OAZ1,C19orf35,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	7218	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	2059605	2060167	2060113	Y	REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	10362	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	2165096	2165788	2165320	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	2632	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.95624170645485
chr19	2167436	2167667	2167594	Y	CSNK1G2,GADD45B,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	4972	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	2168890	2169464	2169082	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	6426	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	2171641	2172019	2171832	Y	NA	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	9177	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	2266489	2266732	2266611	Y	NA	SF3A2,PLEKHJ1,OAZ1	NA	NA	NA	NA	OAZ1	753	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	2494705	2495117	2494880	Y	DOT1L,GADD45B	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	20585	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr19	2524971	2525260	2525066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	50851	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	2540691	2541097	2540881	Y	TIMM13	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	66571	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	2543618	2543970	2543682	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	69498	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr19	3035530	3035851	3035686	Y	NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2	AES	NA	NA	NA	NA	AES	25254	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr19	3133345	3133760	3133513	Y	FZR1,GNA15	GNA11,NCLN	NA	NA	NA	NA	GNA11	40937	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	3153392	3153939	3153476	Y	GNA15,FZR1	NCLN	NA	NA	NA	NA	NCLN	29622	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	3154006	3154458	3154241	Y	GNA15,FZR1,S1PR4	NCLN	NA	NA	NA	NA	NCLN	29103	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	3222791	3223093	3222942	Y	NA	NCLN	NA	NA	NA	NA	NCLN	39230	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	3314117	3314647	3314306	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	42914	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	3360183	3360356	3360294	Y	TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	2622	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	3360896	3361804	3361247	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	3335	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	3367171	3367852	3367502	Y	NFIC,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	9610	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	3369394	3369884	3369615	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	11833	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	3404098	3404373	3404237	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	46537	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr19	3404656	3404792	3404728	Y	TLE2,TLE2,PIP5K1C,ATCAY,NFIC,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	47095	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr19	3450938	3451227	3451079	Y	GNA15	DOHH	NA	NA	NA	NA	DOHH	47711	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	3655813	3656105	3655965	Y	NA	PIP5K1C	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	42372	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr19	3670243	3670423	3670333	Y	NFIC	PIP5K1C	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	28054	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	3671007	3671294	3671202	Y	NFIC,MAP2K2,EEF2,PIP5K1C,APBA3	PIP5K1C	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	27183	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr19	3923611	3923782	3923733	Y	ITGB1BP3	DAPK3	NA	NA	NA	NA	DAPK3	45339	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	4057405	4058198	4058044	Y	CCDC94,ZBTB7A	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	6745	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	4059877	4060289	4060128	Y	SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	4654	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr19	4064475	4064868	4064603	Y	SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	75	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	4375126	4375688	4375404	Y	NA	STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	22856	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	4375735	4376107	4375790	Y	ZBTB7A,EBI3	STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	22437	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	4456035	4456301	4456168	Y	NA	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	216	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	4456385	4456784	4456737	Y	UBXN6,UBXN6	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	566	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr19	4812881	4813376	4813265	Y	SEMA6B,TICAM1	FEM1A,TICAM1	NA	NA	NA	NA	TICAM1	16340	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	4912030	4912419	4912247	Y	NA	PLIN3,UHRF1	NA	NA	NA	NA	UHRF1	10938	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr19	4970760	4971027	4970931	Y	NA	KDM4B	NA	NA	NA	NA	KDM4B	3635	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	4976440	4976890	4976638	Y	TICAM1,KDM4B	KDM4B	NA	NA	NA	NA	KDM4B	9315	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	5141795	5142033	5141919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P34	133712	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	6056849	6057757	6057360	Y	DENND1C,SAFB2,SAFB,VMAC,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	80696	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr19	6092440	6092966	6092758	Y	RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	104617	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	6108978	6109271	6109224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88312	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	6189136	6189412	6189274	Y	NA	RFX2	NA	NA	NA	NA	RFX2	8171	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	6423549	6423953	6423663	Y	NA	GTF2F1,KHSRP,SLC25A23	NA	NA	NA	NA	KHSRP	744	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	6539979	6540238	6540076	Y	NA	TNFSF9	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	10969	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	6738802	6739114	6738954	Y	NA	C3,GPR108,TRIP10	NA	NA	NA	NA	TRIP10	2866	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	6773738	6774101	6773933	Y	DENND1C,ZNF557,EMR1,GPR108,VAV1	C3,GPR108,TRIP10	NA	NA	NA	NA	TRIP10	37802	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	7197339	7197547	7197388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSR	94498	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	7427436	7427895	7427614	Y	ZNF557,XAB2,STXBP2,PNPLA6,LOC100131801,ARHGEF18	ARHGEF18	INSR,ARHGEF18,PNPLA6,MCOLN1,ZNF358,C19orf45,CD209,CLEC4G	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF18	30104	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	7756040	7757119	7756175	Y	ARHGEF18,FBN3,MAP2K7,FLJ22184,EVI5L,FCER2,FCER2	TRAPPC5	NA	NA	NA	NA	TRAPPC5	12311	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	8051436	8051456	8051449	Y	NA	TIMM44,ELAVL1	NA	NA	NA	NA	ELAVL1	17087	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	8488784	8489136	8488939	Y	PRAM1,MYO1F	RAB11B,MARCH2,HNRNPM	NA	NA	NA	NA	MARCH2	12630	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr19	9420483	9420931	9420837	Y	NA	ZNF559	NA	NA	NA	NA	ZNF559	11517	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	9748883	9749171	9749027	Y	OR7D4,OR7E24,ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF177,ZNF177,ZNF426,ZNF846,OLFM2,ZNF562	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF561	18808	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	9974094	9974487	9974263	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	PIN1	30161	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	10056236	10056512	10056406	Y	ZNF846,COL5A3,OLFM2	NA	NA	NA	NA	NA	COL5A3	62635	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	10215832	10216068	10215900	Y	S1PR5,S1PR5,ANGPTL6	C19orf66,PPAN-P2RY11,PPAN,EIF3G	NA	NA	NA	NA	PPAN	867	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	10337076	10337216	10337146	Y	NA	S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM1	NA	NA	NA	NA	S1PR2	2732	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	10515339	10515636	10515481	Y	PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	3125	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	10766466	10766790	10766534	Y	NA	ILF3,QTRT1	NA	NA	NA	NA	ILF3	3529	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	10928296	10928707	10928651	Y	NA	MIR199A1,TMED1	NA	NA	NA	NA	MIR199A1	2124	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr19	10983266	10983642	10983440	Y	PDE4A,CARM1	TMED1,CARM1	NA	NA	NA	NA	CARM1	3077	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4174	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	11205696	11206011	11205901	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	7658	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	11248443	11248964	11248826	Y	NA	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	15520	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	11253262	11253482	11253341	Y	TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	11002	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	11641329	11641510	11641441	Y	ZNF491,ZNF441,CCDC151,ELAVL3,ZNF653	ZNF653,ECSIT,ELOF1,ZNF627,ACP5	NA	NA	NA	NA	ECSIT	3340	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	11804467	11804940	11804795	Y	ZNF878,ZNF823,ZNF491	HNRNPA1P10,ZNF823	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P10	28622	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	4.80168418857099
chr19	12892961	12894040	12893343	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	6270	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	12899457	12901460	12900777	Y	NA	PRDX2,RNASEH2A,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.13408186158711
chr19	12957682	12957886	12957783	Y	NA	PRDX2,RNASEH2A,RTBDN,HOOK2,DNASE2,GCDH	NA	NA	NA	NA	RTBDN	13440	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	13094405	13094796	13094616	Y	ZNF709,TNPO2,TNPO2,MAST1,DAND5	CALR,RAD23A,GADD45GIP1,NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	9626	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	13095998	13096573	13096246	Y	ZNF490,ZNF791,TNPO2,TNPO2,MAST1	CALR,RAD23A,GADD45GIP1,NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	7849	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	13123653	13124120	13123822	Y	WDR83,TNPO2,TNPO2,NFIX,CACNA1A	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	19231	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr19	13164647	13164970	13164763	Y	NA	LYL1	NA	NA	NA	NA	LYL1	47005	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr19	13166882	13167358	13167036	Y	NA	LYL1	NA	NA	NA	NA	LYL1	44617	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.95624170645485
chr19	13238145	13238217	13238180	Y	NA	LYL1,TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	11228	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	13.3380116349194
chr19	13266326	13267156	13266576	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	7097	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr19	13267779	13268208	13267877	Y	MAN2B1,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	8550	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	13273540	13274187	13273840	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	14311	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr19	13274586	13275096	13274696	Y	GADD45GIP1,NACC1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	15357	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	13278382	13278991	13278445	Y	BEST2,JUNB,LYL1,STX10	STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	19153	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	13732373	13732509	13732441	Y	NA	NA	CACNA1A	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC130	108065	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	13907523	13907866	13907763	Y	NA	MRI1,C19orf53,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	3249	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	13944359	13944683	13944571	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15	ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	40085	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	13954357	13954714	13954441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	50083	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	13955108	13955589	13955298	Y	CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	50834	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	13957204	13959386	13957586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	52930	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr19	13972364	13973309	13972780	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	41705	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	14545712	14545849	14545765	Y	NDUFB7,PKN1	DDX39A,PKN1,PTGER1	NA	NA	NA	NA	PKN1	3847	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	14545997	14546246	14546106	Y	NA	DDX39A,PKN1,PTGER1	NA	NA	NA	NA	PKN1	4132	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	14597679	14597949	14597721	Y	NA	PTGER1,GIPC1,TECR,DNAJB1	NA	NA	NA	NA	GIPC1	6995	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	14616908	14617174	14617017	Y	GIPC1	PTGER1,GIPC1,TECR,DNAJB1	GIPC1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TECR	8723	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr19	15947617	15948119	15947980	Y	AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1	NA	NA	NA	NA	NA	CYP4F11	95558	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr19	16181046	16181841	16181607	Y	OR10H2,OR10H3,OR10H4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	5215	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.95624170645485
chr19	16193841	16194249	16194048	Y	NA	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	18010	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	16205409	16205807	16205414	Y	EPS15L1,RAB8A,HSH2D	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	RAB8A	14632	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr19	16403791	16404489	16404426	Y	NA	KLF2	AP1M1,KLF2,EPS15L1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF2	29139	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	16442138	16442160	16442149	Y	NA	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	8510	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	16453203	16453340	16453316	Y	NWD1,MED26,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	19575	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	16557779	16558043	16557912	Y	RAB8A,HSH2D,KLF2,MED26,EPS15L1	EPS15L1,CALR3,C19orf44	NA	NA	NA	NA	EPS15L1	22853	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	16573693	16573897	16573763	Y	HSH2D	EPS15L1,CALR3,C19orf44	NA	NA	NA	NA	EPS15L1	6999	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	17190539	17191239	17190954	Y	HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	5948	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr19	17200566	17201240	17200825	Y	MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	15975	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	17218539	17219391	17218963	Y	MED26,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	33948	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	17220741	17221250	17221017	Y	MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	36150	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	17890338	17890582	17890537	Y	FAM129C,MAST3,JAK3,FCHO1	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1S	62287	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	18059806	18059879	18059816	Y	UNC13A,KCNN1	CCDC124	NA	NA	NA	NA	CCDC124	17981	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	18133045	18133309	18133130	Y	FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAST3	73294	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	18315989	18316123	18316056	Y	NA	IFI30,MPV17L2,RAB3A	NA	NA	NA	NA	RAB3A	3105	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr19	18404099	18404539	18404373	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	13212	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	3.0232826372484
chr19	18415031	18416060	18415513	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	16024	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr19	18485152	18485556	18485412	Y	ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25	PGPEP1,GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	GDF15	1611	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	18497624	18497977	18497708	Y	PDE4C,GDF15	PGPEP1,GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	GDF15	14083	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	18526337	18526644	18526408	Y	CCDC124,IFI30,KLHL26,CRLF1,C19orf60,C19orf50,SSBP4	GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	SSBP4	1030	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr19	18527701	18528040	18527800	Y	KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	SSBP4	27	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	18528263	18528792	18528577	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	SSBP4	589	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr19	18533547	18533601	18533574	Y	ARRDC2,IL12RB1	SSBP4	NA	NA	NA	NA	SSBP4	5873	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	18588665	18588964	18588926	Y	NA	ELL	NA	NA	NA	NA	ELL	41973	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	18630929	18631259	18631008	Y	UPF1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,ELL	FKBP8,KXD1,UBA52	NA	NA	NA	NA	ELL	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	18631384	18632027	18631497	Y	ELL	ELL,FKBP8,KXD1,UBA52	NA	NA	NA	NA	ELL	447	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr19	18760437	18760612	18760525	Y	NA	TMEM59L,CRLF1,KLHL26,CRTC1	NA	NA	NA	NA	KLHL26	14662	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	18760748	18761152	18761048	Y	COMP,CRLF1	TMEM59L,CRLF1,KLHL26,CRTC1	NA	NA	NA	NA	KLHL26	14973	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	18761338	18761719	18761657	Y	TMEM161A,COPE,COMP,CRLF1,KLHL26	TMEM59L,CRLF1,KLHL26,CRTC1	NA	NA	NA	NA	KLHL26	15563	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr19	18768622	18768973	18768794	Y	KIAA1683	KLHL26,CRTC1	NA	NA	NA	NA	KLHL26	22847	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	18960289	18960480	18960366	Y	NA	UPF1,GDF1,CERS1	NA	NA	NA	NA	UPF1	19542	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	19143307	19143510	19143378	Y	DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6	ARMC6,SUGP2,SLC25A42	NA	NA	NA	NA	SUGP2	475	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	19600012	19600395	19600260	Y	RFXANK,MAU2,GATAD2A,PBX4,GMIP	NDUFA13,TSSK6,YJEFN3	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	24150	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr19	20747496	20747853	20747738	Y	NA	ZNF737	NA	NA	NA	NA	ZNF737	881	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	23732304	23732710	23732386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF675	135312	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	27739791	27740195	27739990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1962253	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	30157267	30157499	30157417	Y	PLEKHF1,C19orf12,C19orf12	PLEKHF1,C19orf12	NA	NA	NA	NA	PLEKHF1	3304	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr19	30336581	30336824	30336781	Y	C19orf2,C19orf2	CCNE1	NA	NA	NA	NA	CCNE1	35776	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	31618618	31618806	31618712	Y	NA	NA	TSHZ3	IMR90	Hi-C	24141950	TSHZ3	219647	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr19	31705006	31705320	31705186	Y	NA	NA	TSHZ3	IMR90	Hi-C	24141950	TSHZ3	133133	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr19	31837695	31837707	31837704	Y	NA	TSHZ3	NA	NA	NA	NA	TSHZ3	746	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	31841682	31842327	31842237	Y	NA	TSHZ3	NA	NA	NA	NA	TSHZ3	3229	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	32447611	32447906	32447759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF507	386594	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	32842918	32843112	32843016	Y	ZNF507	ZNF507	NA	NA	NA	NA	ZNF507	8418	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	32863977	32864267	32864121	Y	NA	ZNF507,DPY19L3	NA	NA	NA	NA	ZNF507	29477	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	33382845	33383180	33383014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP89	77717	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	33668108	33668528	33668227	Y	SLC7A10,LRP3	LRP3	NA	NA	NA	NA	LRP3	1599	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	33750621	33750673	33750623	Y	CEBPA	CEBPA	CHST8,PEPD,LOC80054,CEBPA	IMR90	Hi-C	24141950	CEBPA	40797	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	33789888	33790286	33790087	Y	NA	CEBPA	NA	NA	NA	NA	CEBPA	1184	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	33875552	33875576	33875564	Y	NA	CEBPG	NA	NA	NA	NA	CEBPG	13316	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	33996867	33997517	33996997	Y	LRP3	PEPD	NA	NA	NA	NA	PEPD	13183	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr19	34625713	34625998	34625854	Y	PDCD2L	LSM14A	CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	LSM14A	35411	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr19	34724001	34724111	34724046	Y	NA	KIAA0355	NA	NA	NA	NA	KIAA0355	19331	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	34850085	34850642	34850351	Y	ZNF599,ZNF302,ZNF181	GPI,PDCD2L	NA	NA	NA	NA	GPI	1700	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr19	34874880	34875495	34875019	Y	NA	GPI,PDCD2L,UBA2	NA	NA	NA	NA	PDCD2L	17794	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	35100505	35100815	35100739	Y	ZNF302	NA	NA	NA	NA	NA	AC020910.2	65671	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	35453242	35453666	35453504	Y	ZNF792	ZNF30,ZNF792,GRAMD1A	NA	NA	NA	NA	ZNF792	289	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	35809679	35810380	35810036	Y	GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,IGFLR1,FFAR3	NA	NA	NA	NA	NA	USF2	51798	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	36030863	36031038	36030900	Y	NA	SBSN,TMEM147,AD000090.2	NA	NA	NA	NA	TMEM147	3459	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	36448313	36448413	36448320	Y	ZNF565,ZNF565,ZFP14,APLP1	LRFN3,SDHAF1	NA	NA	NA	NA	LRFN3	24053	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	36891925	36892272	36892205	Y	NA	ZFP14,ZFP82	NA	NA	NA	NA	ZFP82	15286	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	37424676	37424848	37424761	Y	ZNF527,HKR1,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF461,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF585B,ZNF420,ZNF383,ZNF829,ZNF829,ZNF568	ZNF829,ZNF568	NA	NA	NA	NA	ZNF568	19445	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	38433320	38433698	38433507	Y	ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1	SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	37452	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	38490005	38490506	38490269	Y	YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	94137	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr19	38491114	38491333	38491222	Y	PPP1R14A	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	95246	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	38493976	38494435	38494152	Y	YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	98108	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr19	38719187	38719304	38719247	Y	ZNF573,DPF1,PPP1R14A,DPF1	DPF1	NA	NA	NA	NA	DPF1	833	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	39148533	39148920	39148613	Y	C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12244	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	39149253	39149575	39149354	Y	SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12964	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr19	39167742	39168127	39167771	Y	NA	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	31453	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	39411140	39411539	39411467	Y	LGALS7	NFKBIB,SIRT2,MRPS12,SARS2	NA	NA	NA	NA	MRPS12	7649	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	39550329	39550402	39550365	Y	EID2B,LGALS7,PAPL	PAPL	SAMD4B,FBXO27,GMFG	IMR90	Hi-C	24141950	PAPL	22151	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	39627416	39627544	39627474	Y	NA	PAK4	NA	NA	NA	NA	PAK4	13006	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	39894353	39894945	39894613	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	508	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	40466097	40466407	40466254	Y	ZNF546,FCGBP	CTC-471F3.4,PSMC4,ZNF546	NA	NA	NA	NA	PSMC4	8505	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	40725827	40726069	40725973	Y	NA	MAP3K10	NA	NA	NA	NA	MAP3K10	30176	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	40939716	40940068	40940022	Y	SERTAD1	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	8544	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	41109606	41110134	41110046	Y	SERTAD1,ITPKC,EGLN2,EGLN2,C19orf54,ADCK4,SHKBP1	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	12817	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	41169097	41169273	41169245	Y	NA	NUMBL	NA	NA	NA	NA	NUMBL	25604	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	41267029	41267391	41267210	Y	NA	ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	MIA	8162	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	41729438	41729579	41729517	Y	ATP5SL,ATP5SL,AXL	AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	6330	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	41814398	41814719	41814610	Y	HNRNPUL1,TMEM91,TGFB1,CCDC97,B9D2	HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1	NA	NA	NA	NA	CCDC97	304	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83703	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	42037922	42038313	42037990	Y	CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1	NA	LOC100505495	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	93300	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	42379575	42379860	42379642	Y	ZNF574,DEDD2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1	RPS19,ARHGEF1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	5368	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	42404902	42404963	42404932	Y	NA	RPS19,ARHGEF1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	19674	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	42419916	42420316	42420067	Y	ZNF574,GRIK5,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	34688	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	42440101	42440390	42440246	Y	ARHGEF1,ARHGEF1	RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	21152	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	2115	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	CIC	5303	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13838	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr19	43835548	43835842	43835742	Y	NA	NA	TEX101	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF575	191807	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	44032541	44032939	44032740	Y	NA	ZNF575,ETHE1,XRCC1	NA	NA	NA	NA	ETHE1	3145	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	44269192	44269953	44269534	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9	NA	NA	NA	NA	SMG9	12050	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	44288540	44288860	44288798	Y	NA	SMG9,ZNF283	NA	NA	NA	NA	SMG9	31398	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	44616064	44616441	44616271	Y	KCNN4,ZNF283,ZNF404,ZNF45,ZNF221,ZNF222,ZNF233,ZNF233,ZNF229,ZNF284	ZNF284,ZNF224,ZNF225,ZNF234	NA	NA	NA	NA	ZNF225	1730	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	44711538	44711905	44711597	Y	NA	ZNF226,ZNF227	NA	NA	NA	NA	ZNF227	1838	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr19	45248499	45249479	45248793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL3	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	45256546	45257099	45256742	Y	ZNF296,RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	7584	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40,APOE	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr19	45601584	45601804	45601678	Y	FOSB	ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	PPP1R37	8930	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr19	45931993	45932316	45932152	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1	NA	NA	NA	NA	PPP1R13L	24386	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr19	45943163	45943490	45943268	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP,FOSB,CD3EAP,PPP1R13L	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	25763	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr19	45945937	45946679	45946251	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22574	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr19	45959420	45959846	45959631	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	FOSB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	9407	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	45980345	45980732	45980359	Y	GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	ERCC1	259	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr19	45987073	45987327	45987197	Y	NOVA2,RELB,CLASRP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	PPM1N	2708	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	47142195	47142976	47142503	Y	NA	CALM3,PTGIR	NA	NA	NA	NA	PTGIR	15820	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	47269374	47269772	47269575	Y	LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5	FKRP,STRN4,SLC1A5	NA	NA	NA	NA	SLC1A5	20079	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	47448240	47448462	47448420	Y	PNMAL1,PNMAL2,DACT3,ARHGAP35,MEIS3,NPAS1	NA	NA	NA	NA	NA	AP2S1	95991	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	47611153	47611400	47611382	Y	NA	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	3131	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	606	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr19	47818553	47819137	47818792	Y	ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,C5AR1,GPR77	PRR24,DHX34	NA	NA	NA	NA	DHX34	31401	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	48101913	48102072	48101991	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85416	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr19	48903450	48903602	48903513	Y	NA	TMEM143,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10640	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr19	49092091	49092636	49092297	Y	BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11	SPHK2,RPL18,DBP	NA	NA	NA	NA	SPHK2	27912	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	49151515	49151640	49151575	Y	NA	SPHK2,RPL18,DBP,CA11	NA	NA	NA	NA	CA11	3946	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	49315464	49315783	49315738	Y	NA	BCAT2,HSD17B14	NA	NA	NA	NA	BCAT2	3178	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	49386525	49386775	49386581	Y	CD37,PPP1R15A	HSD17B14,PLEKHA4,PPP1R15A,NUCB1	NA	NA	NA	NA	PPP1R15A	12876	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	49466802	49467527	49467169	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	244	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr19	49495555	49495708	49495609	Y	SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	850	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr19	50004159	50004640	50004502	Y	PNKP,SNRNP70,C19orf73,CD37,PRR12,IRF3,BCL2L12,ALDH16A1,FLT3LG,FLT3LG,RPL13A,RPS11	ALDH16A1,PIH1D1,RPL13A,SNORD34,SNORD35A,RPS11,SNORD35B,FCGRT,RCN3	NA	NA	NA	NA	FCGRT	3433	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	50116585	50116794	50116665	Y	NA	NOSIP,PRR12,RRAS,SCAF1	NA	NA	NA	NA	PRR12	23685	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr19	50205874	50206272	50205974	Y	NA	BCL2L12,IRF3,PRMT1,CPT1C	NA	NA	NA	NA	CPT1C	13719	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	50400896	50401285	50401161	Y	ALDH16A1,RPS11,FCGRT,NR1H2,IL4I1,NUP62,NUP62,NUP62,IL4I1,ATF5	PTOV1,PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62	NA	NA	NA	NA	AKT1S1	21180	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	50414628	50414884	50414779	Y	RPS11,FCGRT,NR1H2,IL4I1,NUP62,NUP62,NUP62,NUP62,IL4I1,ATF5	PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62	NA	NA	NA	NA	ATF5	15075	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	50872495	50872846	50872654	Y	NA	NR1H2,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	12615	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	51166998	51167396	51167198	Y	KLK4,KLK6,KLK14,SYT3,LOC342918	C19orf81	NA	NA	NA	NA	C19orf81	16296	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	51287900	51288107	51288100	Y	NA	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	18079	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	51622537	51622653	51622545	Y	SIGLEC7,SIGLEC9	CTU1,SIGLEC17P	CTU1	K562	ChIA-PET	22265404	CTU1	12910	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	52049983	52050318	52050095	Y	ZNF615,SIGLEC7,CD33,SIGLEC8,SIGLEC6,ZNF175	ZNF175	ZNF175,CEACAM18	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF175	22233	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	HAS1	NA	NA	NA	NA	HAS1	32480	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr19	52193633	52193945	52193814	Y	ZNF836,ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC8,SIGLEC6,FPR2,FPR2,FPR1	HAS1	NA	NA	NA	NA	HAS1	31302	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	52229316	52229816	52229631	Y	HAS1	HAS1	NA	NA	NA	NA	HAS1	4069	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr19	53129559	53129725	53129643	Y	ZNF160,ZNF616,ZNF766,ZNF808,ZNF701,ZNF611,ZNF611,ZNF83	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF83	62024	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	53145294	53145545	53145446	Y	NA	ZNF83	NA	NA	NA	NA	ZNF83	46204	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	53237186	53237523	53237297	Y	ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611	ZNF83,ZNF611	NA	NA	NA	NA	ZNF611	860	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	53426305	53426488	53426354	Y	ZNF765,ZNF468,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	17366	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	53444729	53445104	53444918	Y	ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	875	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	ZNF677	NA	NA	NA	NA	ZNF677	28290	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr19	54707641	54707712	54707644	Y	NA	LENG1,MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	5031	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	54714720	54715094	54714879	Y	NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6	MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	12110	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	55917170	55917359	55917333	Y	U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S	TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	UBE2S	25	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	55988531	55988605	55988568	Y	NAT14	ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D	NA	NA	NA	NA	ZNF628	2832	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	56031210	56031577	56031512	Y	TMEM150B,SGK110	ZNF628,NAT14,SSC5D	NA	NA	NA	NA	SSC5D	33439	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr19	56673673	56673939	56673846	Y	NA	ZNF787,ZNF444	GALP	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF444	31705	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	56811653	56811926	56811777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN5A	65826	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	56823857	56823998	56823922	Y	ZSCAN5A	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN5A	53754	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	58237757	58238155	58237774	Y	NA	ZNF551,ZNF776,ZNF586	ZNF154	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF776	18009	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	58413801	58413982	58413868	Y	ZNF154,ZNF418	ZNF417	NA	NA	NA	NA	ZNF417	11996	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr19	58532436	58532530	58532517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF417	106458	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr19	59058033	59058475	59058195	Y	NA	ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	TRIM28	4575	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	935776	935934	935857	Y	NA	NA	TPO,MYT1L	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM18	260337	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	1722150	1722351	1722236	Y	NA	PXDN	NA	NA	NA	NA	PXDN	24273	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	1725053	1725311	1725239	Y	NA	PXDN	NA	NA	NA	NA	PXDN	21313	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	2617084	2617480	2617333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	762173	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	3340825	3341028	3341010	Y	NA	TSSC1,TRAPPC12	NA	NA	NA	NA	TSSC1	38625	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	3583560	3583858	3583796	Y	NA	AC108488.4,RNASEH1-AS1,RNASEH1,RPS7	NA	NA	NA	NA	AC108488.4	1097	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr2	7152754	7152946	7152770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144A	97231	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	7171830	7172101	7171947	Y	RNF144A	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144A	116307	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	7191649	7191931	7191786	Y	RNF144A	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144A	136126	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	8144336	8144872	8144521	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ID2	672103	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	8816590	8817048	8816915	Y	NA	AC011747.7	NA	NA	NA	NA	ID2	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	9427801	9428115	9428020	Y	YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	82907	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr2	9428594	9428712	9428653	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	83700	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	9688603	9688902	9688848	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	5019	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	9705660	9705808	9705714	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	11739	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr2	10075100	10075410	10075131	Y	TAF1B	GRHL1	GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL1	7931	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	10261505	10261712	10261609	Y	NA	RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	1050	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	10341486	10341905	10341708	Y	KLF11	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	81031	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	10423423	10423670	10423576	Y	NA	HPCAL1	RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPCAL1	17345	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	10430004	10430228	10430116	Y	NA	HPCAL1	HPCAL1,C2orf48,CYS1,RRM2,MIR4261,ODC1,NOL10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPCAL1	10787	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	11483029	11483376	11483266	Y	NA	ROCK2	NA	NA	NA	NA	ROCK2	3080	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	11514785	11514933	11514926	Y	NA	ROCK2	ROCK2,E2F6,PQLC3,PDIA6,C2orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ROCK2	28329	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	11720189	11720409	11720300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPIN1	95312	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	11970305	11970612	11970555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPIN1	154584	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	12928047	12928351	12928221	Y	NA	NA	LPIN1,MIR4262,TRIB2,LOC100506474	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	73032	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	15309828	15310293	15310034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	389161	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	15445260	15445596	15445428	Y	DDX1,NBAS	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	253858	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	15629690	15629929	15629800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	69525	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	18811449	18811776	18811476	Y	NA	NA	OSR1,NT5C1B-RDH14	IMR90	Hi-C	24141950	RDH14	71503	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr2	19150904	19151018	19150988	Y	NA	NA	MIR4757,OSR1	IMR90	Hi-C	24141950	OSR1	405396	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	19340591	19340734	19340664	Y	OSR1	NA	OSR1,MIR4757	IMR90	Hi-C	24141950	OSR1	215680	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	19548078	19548301	19548191	Y	NA	OSR1	NA	NA	NA	NA	OSR1	8113	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	20176136	20176469	20176303	Y	WDR35	WDR35	NA	NA	NA	NA	WDR35	11423	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	20356621	20356779	20356666	Y	NA	NA	SDC1,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	SDC1	66415	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	20386283	20386578	20386422	Y	TTC32,HS1BP3	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	36616	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	20544740	20544866	20544805	Y	NA	PUM2	PUM2,HS1BP3	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	5129	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	20548410	20548604	20548507	Y	NA	PUM2	HS1BP3,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	1391	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	20638245	20638508	20638456	Y	HS1BP3	RHOB	HS1BP3,GDF7	IMR90	Hi-C	24141950	RHOB	6327	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	20779015	20779511	20779185	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	69338	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	20848318	20848468	20848370	Y	NA	HS1BP3	NA	NA	NA	NA	HS1BP3	381	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	23525558	23525779	23525689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	80309	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	24852047	24852369	24852206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPO	161636	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	25108646	25108862	25108815	Y	DNAJC27	ADCY3	NA	NA	NA	NA	ADCY3	31846	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	26220678	26220902	26220866	Y	RAB10	KIF3C,RAB10	ASXL2,RAB10,FAM59B,KIF3C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIF3C	17060	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	26225947	26226220	26226028	Y	RAB10	KIF3C,RAB10	RAB10,KIF3C,FAM59B,ASXL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIF3C	22329	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	26919291	26919602	26919376	Y	NA	AC015977.5	NA	NA	NA	NA	AC015977.5	19913	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	26980806	26981182	26980970	Y	C2orf18	CENPA	OTOF,CENPA,C2orf70,CIB4,KCNK3,DPYSL5,MAPRE3,C2orf18	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CENPA	3975	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	27304052	27304486	27304234	Y	CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1	AGBL5,OST4,EMILIN1,KHK	NA	NA	NA	NA	KHK	3129	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr2	27543962	27544264	27544065	Y	NA	SLC30A3,MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17	NA	NA	NA	NA	MPV17	2283	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	27614467	27614499	27614483	Y	EIF2B4,EIF2B4	AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1	NA	NA	NA	NA	FTH1P3	233	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	27878874	27879165	27879028	Y	SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP	GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L	NA	NA	NA	NA	SLC4A1AP	5173	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	27958320	27958698	27958604	Y	NA	MRPL33	BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL33	33886	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr2	28021914	28022357	28022176	Y	RBKS	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	29330	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	28183212	28183402	28183309	Y	FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	RBKS	71247	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	28319174	28319559	28319300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBKS	207209	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	28497824	28498240	28497982	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	115075	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	28498872	28499304	28499073	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	114011	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	28519223	28519459	28519305	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	93856	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr2	28806831	28807046	28806964	Y	FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1CB	165460	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	29060448	29060640	29060540	Y	PPP1CB,PPP1CB	TRMT61B	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	30527	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	29075660	29075992	29075826	Y	TRMT61B	TRMT61B,WDR43	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	15175	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	29173330	29173730	29173529	Y	PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43	NA	NA	NA	NA	NA	WDR43	57821	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	29331222	29331429	29331307	Y	NA	CLIP4	CLIP4	MCF7	ChIA-PET	22265404	CLIP4	12651	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	29339148	29339698	29339489	Y	NA	CLIP4	NA	NA	NA	NA	CLIP4	20577	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	29439591	29440302	29440265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIP4	121020	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	29870290	29870662	29870408	Y	ALK	NA	NA	NA	NA	NA	ALK	271770	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	30791728	30792075	30791902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	123636	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	30887906	30888094	30887998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	219814	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr2	30889265	30889652	30889547	Y	NA	NA	YPEL5,LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	LCLAT1	221173	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr2	33437244	33437520	33437371	Y	FAM98A,LTBP1	NA	NA	NA	NA	NA	RASGRP3	221871	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	34215610	34215617	34215614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM98A	393161	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	36584242	36585529	36584872	Y	FEZ2,CRIM1	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	3173	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr2	36599325	36599532	36599405	Y	NA	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	18256	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	36700444	36700711	36700553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	119375	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	36791809	36792197	36792002	Y	CRIM1	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79033	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	36795570	36795942	36795825	Y	FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	75288	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	37491311	37491687	37491498	Y	NA	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	34455	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	37603882	37604154	37604086	Y	QPCT	QPCT	NA	NA	NA	NA	QPCT	34165	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	37813379	37813644	37813592	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	149967	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	37851057	37851610	37851419	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	112001	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	37851755	37851898	37851787	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	111713	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	37858321	37858709	37858681	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	104902	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	37860871	37861279	37860884	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	102332	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	37875700	37876061	37875917	Y	EIF2AK2,QPCT,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	87550	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	37879485	37879782	37879514	Y	EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	83829	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	37884022	37884434	37884213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	79177	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	37938546	37938819	37938725	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	24792	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr2	38003710	38004005	38003838	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3,PRKD3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	40099	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	38120007	38120217	38120112	Y	FAM82A1	NA	CDC42EP3,QPCT,PRKD3,FAM82A1	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	156396	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	38264530	38264933	38264752	Y	CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	70111	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	38265442	38265742	38265584	Y	CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	69302	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	38372999	38373624	38373225	Y	NA	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	37955	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	38373682	38374230	38374188	Y	CDC42EP3,CYP1B1	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	38638	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	38401547	38402107	38401851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P12	54603	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	38405386	38405542	38405477	Y	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P12	51168	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	38418747	38419129	38419037	Y	NA	RPL7P12,AC009229.5	NA	NA	NA	NA	RPL7P12	37581	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	40630548	40630840	40630736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC8A1	205353	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	40662022	40662435	40662315	Y	NA	NA	LOC100128590	IMR90	Hi-C	24141950	SLC8A1	173758	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	40740451	40740721	40740596	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC8A1	95472	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	40899157	40899397	40899276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC8A1	62964	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	41963199	41963639	41963355	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	EML4	430851	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	42359577	42359846	42359732	Y	EML4	EML4	EML4,COX7A2L,LOC388942	IMR90	Hi-C	24141950	EML4	34644	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	42368526	42368635	42368598	Y	NA	EML4	EML4,LOC388942,C2orf91,COX7A2L	IMR90	Hi-C	24141950	EML4	25855	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	42368874	42369229	42369001	Y	EML4	EML4	EML4,LOC388942,C2orf91,COX7A2L	IMR90	Hi-C	24141950	EML4	25261	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	42567305	42567366	42567336	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	COX7A2L	82862	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	43037224	43037999	43037611	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MTA3	317515	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr2	43038629	43038924	43038876	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO,PLEKHH2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MTA3	318920	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr2	43145341	43145449	43145376	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L2	306299	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	43302253	43302513	43302383	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	149235	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	43313736	43313941	43313748	Y	NA	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	137807	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	43496273	43496611	43496398	Y	NA	ZFP36L2	NA	NA	NA	NA	ZFP36L2	44525	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr2	44212195	44212421	44212308	Y	NA	LRPPRC	NA	NA	NA	NA	LRPPRC	8723	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	45237112	45237533	45237325	Y	SIX2	AC012354.8,SIX2	NA	NA	NA	NA	SIX2	2543	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	45881346	45881543	45881445	Y	NA	SRBD1,PRKCE	NA	NA	NA	NA	PRKCE	4862	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	46303554	46303874	46303714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	214932	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	46542401	46542637	46542520	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	23595	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	46561811	46562247	46561970	Y	SOCS5,SOCS5	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	43005	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr2	46784048	46784469	46784214	Y	NA	RHOQ,ATP6V1E2	NA	NA	NA	NA	ATP6V1E2	16352	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	46825586	46825695	46825639	Y	NA	CRIPT,PIGF	NA	NA	NA	NA	CRIPT	15860	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	46928465	46928698	46928588	Y	MCFD2,MCFD2,SOCS5,SOCS5	SOCS5	NA	NA	NA	NA	SOCS5	4374	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	46993562	46993962	46993767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS5	69471	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	46997897	46997963	46997932	Y	MCFD2,MCFD2,SOCS5,SOCS5	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS5	73806	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	47031260	47031826	47031474	Y	NA	NA	LOC388948,SOCS5,CRIPT,LOC100134259,MCFD2,TTC7A	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS5	107169	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	47039745	47040099	47039914	Y	MCFD2,MCFD2,SOCS5,SOCS5	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	101197	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	47077976	47078245	47078111	Y	SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	63051	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr2	47206692	47207332	47207009	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	39698	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	47213827	47213985	47213928	Y	NA	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	46833	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr2	47270774	47271231	47270943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	103780	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr2	48475818	48475987	48475845	Y	NA	NA	FOXN2	IMR90	Hi-C	24141950	FOXN2	63789	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	48709527	48709805	48709665	Y	FOXN2,KLRAQ1	PPP1R21,STON1	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	43790	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	48737563	48737807	48737675	Y	STON1-GTF2A1L,STON1	STON1	NA	NA	NA	NA	STON1	16715	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	50640036	50640337	50640124	Y	NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	STON1	1885514	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	53331505	53331666	53331586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHAC2	661263	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	53357480	53357870	53357760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHAC2	635059	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	54022416	54022710	54022562	Y	NA	CHAC2,ERLEC1	NA	NA	NA	NA	ERLEC1	10235	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	54111882	54111915	54111897	Y	NA	GPR75-ASB3,ASB3	NA	NA	NA	NA	ASB3	26585	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	54165408	54165630	54165519	Y	NA	ACYP2,PSME4	NA	NA	NA	NA	ACYP2	30345	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	54196339	54196842	54196524	Y	ASB3,ASB3,PSME4	ACYP2,PSME4	NA	NA	NA	NA	PSME4	362	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	54786900	54787386	54787056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	105478	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	54861793	54862155	54861956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EML6	86481	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	55212013	55212317	55212165	Y	CCDC88A	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	125440	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	55249584	55250267	55249993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	87490	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	55327778	55327923	55327859	Y	NA	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	9834	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	55329161	55329446	55329300	Y	NA	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	8311	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	55450545	55450658	55450592	Y	CCDC88A,EML6,RTN4	RPS27A,MTIF2	NA	NA	NA	NA	RPS27A	6381	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr2	56089907	56090266	56090122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFEMP1	59008	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	58384642	58384701	58384672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	81806	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	60694839	60695290	60695042	Y	PAPOLG,BCL11A	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	85099	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	61165363	61165465	61165452	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REL	58707	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	61586795	61586939	61586907	Y	AHSA2,USP34	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	108965	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	61698926	61699282	61699220	Y	PUS10,AHSA2,USP34	USP34	NA	NA	NA	NA	USP34	3022	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	61766465	61766637	61766569	Y	AHSA2,USP34	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	2704	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	61921641	61922071	61921953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM161A	157207	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr2	61990946	61991094	61991044	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	88184	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.84544248211614
chr2	62375163	62375426	62375211	Y	B3GNT2	B3GNT2	NA	NA	NA	NA	B3GNT2	45822	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	62805190	62805410	62805295	Y	NA	NA	EHBP1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM17	68161	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	63285480	63285937	63285754	Y	OTX1	OTX1	NA	NA	NA	NA	OTX1	10288	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	63287182	63287416	63287280	Y	OTX1	OTX1	NA	NA	NA	NA	OTX1	11990	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	63633298	63633304	63633301	Y	OTX1	NA	NA	NA	NA	NA	MDH1	180439	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	64239166	64239247	64239208	Y	PELI1	VPS54	NA	NA	NA	NA	VPS54	4959	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	64490373	64490733	64490649	Y	NA	NA	LINC00309,PELI1	IMR90	Hi-C	24141950	PELI1	120785	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	64587056	64587400	64587325	Y	NA	NA	AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	AFTPH	162065	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	64821728	64822106	64821796	Y	SLC1A4,PELI1	NA	NA	NA	NA	NA	AFTPH	72263	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	64836549	64836646	64836605	Y	SLC1A4,PELI1,SERTAD2,AFTPH	NA	NA	NA	NA	NA	AFTPH	87084	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	64879615	64879792	64879667	Y	SERTAD2	NA	LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	96347	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	64978173	64978610	64978385	Y	CEP68	SERTAD2	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	2034	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	64994926	64995226	64995021	Y	SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2	SERTAD2	SERTAD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	18787	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr2	65065938	65066285	65066136	Y	AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	89799	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	65081925	65082185	65082093	Y	AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	105786	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	65086968	65087262	65087080	Y	AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	110829	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	65093958	65094266	65094153	Y	NA	NA	SERTAD2,AFTPH,LOC339807	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SERTAD2	117819	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr2	65212867	65212968	65212911	Y	NA	SLC1A4	NA	NA	NA	NA	SLC1A4	643	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	65326595	65326952	65326834	Y	NA	CEP68,RAB1A	NA	NA	NA	NA	RAB1A	28288	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	65583296	65583698	65583484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRED2	74073	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr2	65849750	65849939	65849914	Y	NA	NA	MEIS1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRED2	191979	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr2	68278313	68278683	68278526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1D	57397	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	68428934	68429266	68429100	Y	NA	WDR92,PNO1	NA	NA	NA	NA	PNO1	45958	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	68654356	68654764	68654592	Y	FBXO48,APLF,PLEK	FBXO48,APLF	NA	NA	NA	NA	FBXO48	37626	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	68994705	68995199	68995002	Y	FBXO48,ARHGAP25,ARHGAP25	NA	BMP10	IMR90	Hi-C	24141950	ANTXR1	243111	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	69135600	69135857	69135778	Y	NA	NA	ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10	IMR90	Hi-C	24141950	ANTXR1	102453	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	69250610	69250802	69250769	Y	NA	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	12300	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	69533320	69533461	69533391	Y	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	NA	GFPT1	78921	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	69536922	69537085	69537004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFPT1	75297	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	69989990	69990667	69990520	Y	NA	NA	GMCL1	IMR90	Hi-C	24141950	GMCL1	64107	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	70141198	70141461	70141241	Y	NA	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	18378	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	70144957	70145388	70145176	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	22137	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	70161598	70161791	70161659	Y	PCBP1,C2orf42,MXD1,ASPRV1	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	25606	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	70226418	70226806	70226612	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	39021	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	70285414	70285703	70285559	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	PCBP1	26882	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	70363059	70363462	70363144	Y	MXD1,C2orf42,PCBP1	PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	35376	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	71129017	71129173	71129049	Y	NA	VAX2	NA	NA	NA	NA	VAX2	3297	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	72732418	72732763	72732614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	318407	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	72774678	72774916	72774797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	276254	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	73233755	73233809	73233782	Y	NA	NA	EMX1	IMR90	Hi-C	24141950	SFXN5	66938	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	73318348	73318566	73318457	Y	NA	SFXN5	NA	NA	NA	NA	SFXN5	17601	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	73338552	73338952	73338867	Y	RAB11FIP5	SFXN5,RAB11FIP5	NA	NA	NA	NA	SFXN5	37805	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	73404053	73404270	73404162	Y	EGR4	RAB11FIP5,SMYD5	EMX1,RAB11FIP5,SFXN5,NOTO,PRADC1,CCT7,SMYD5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAB11FIP5	22204	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	74765672	74765911	74765792	Y	WBP1,LBX2,LOXL3,DOK1	LBX2,PCGF1,TLX2,HTRA2,AUP1,DOK1,LOXL3	NA	NA	NA	NA	DOK1	8242	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	74766124	74766334	74766228	Y	NA	LBX2,PCGF1,TLX2,HTRA2,AUP1,DOK1,LOXL3	NA	NA	NA	NA	DOK1	7819	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	74778065	74778079	74778072	Y	NA	LBX2,PCGF1,TLX2,HTRA2,AUP1,DOK1,LOXL3	NA	NA	NA	NA	LOXL3	2738	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	74793766	74794164	74794010	Y	WBP1,LBX2,LOXL3,DOK1	HTRA2,AUP1,DOK1,LOXL3	NA	NA	NA	NA	LOXL3	12949	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	74801154	74801351	74801200	Y	DOK1	HTRA2,AUP1,DOK1,LOXL3	NA	NA	NA	NA	LOXL3	20337	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	74804828	74804964	74804881	Y	MOBKL1B,DOK1	AUP1,DOK1,LOXL3	NA	NA	NA	NA	LOXL3	24011	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	75071156	75071353	75071277	Y	LBX2,HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	12048	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr2	75072652	75072899	75072736	Y	HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	13544	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	75102185	75102665	75102322	Y	HK2	HK2,AC104135.3	NA	NA	NA	NA	AC104135.3	40610	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	75219008	75219394	75219161	Y	NA	POLE4	NA	NA	NA	NA	POLE4	35389	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	75770641	75770653	75770647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL19	101256	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	75834246	75834589	75834429	Y	NA	MRPL19	FAM176A,TACR1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL19	37320	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr2	75894065	75894458	75894192	Y	NA	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	22156	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	78478830	78479153	78479031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	465322	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	78486500	78486864	78486682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	472992	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	78632836	78632912	78632895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	619328	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	78683398	78683574	78683486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	669890	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	79168770	79169144	79168957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	1155262	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	81709176	81709459	81709306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG1	2975710	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr2	85057054	85057454	85057405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSB10	73295	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	85147093	85147556	85147171	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	16344	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr2	85154234	85154422	85154323	Y	NA	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	23485	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	85242321	85242336	85242334	Y	NA	KCMF1	NA	NA	NA	NA	KCMF1	46105	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	85505021	85505175	85505098	Y	TMSB10,TMEM150A,ATOH8	TGOLN2	NA	NA	NA	NA	TGOLN2	48373	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	85505624	85505644	85505635	Y	SH2D6	TGOLN2	NA	NA	NA	NA	TGOLN2	47904	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	85969500	85969917	85969748	Y	VAMP5,TMEM150A,ATOH8	RNU1-38P,ATOH8	ATOH8,POLR1A,USP39,C2orf68,SFTPB,LOC284950,ST3GAL5,LOC90784,PTCD3	IMR90	Hi-C	24141950	ATOH8	6550	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	86284876	86285205	86285126	Y	NA	POLR1A,PTCD3	NA	NA	NA	NA	POLR1A	46073	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	86722014	86722392	86722297	Y	RMND5A	NA	NA	NA	NA	NA	KDM3A	56244	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	86922220	86922584	86922381	Y	NA	RMND5A,CHMP3,RNF103-CHMP3	NA	NA	NA	NA	RMND5A	22712	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	88353539	88354148	88353800	Y	KRCC1	RNU2-63P,KRCC1	NA	NA	NA	NA	KRCC1	291	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	91815672	91815808	91815787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2826510	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	91815826	91816191	91816014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2826664	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	91821438	91821799	91821741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2832276	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	91954549	91954973	91954634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2965387	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr2	91960340	91960566	91960493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2971178	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	8.00280698095166
chr2	95982487	95982780	95982632	Y	TRIM43B,KCNIP3	NA	NA	NA	NA	NA	FAHD2A	83689	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	96923964	96924135	96924075	Y	DUSP2,KIAA1310,ARID5A,TMEM127	TMEM127,CIAO1,SNRNP200	NA	NA	NA	NA	TMEM127	5597	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	96995983	96996007	96995995	Y	ITPRIPL1,ITPRIPL1	SNRNP200,NCAPH	NA	NA	NA	NA	NCAPH	3518	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	97151625	97152085	97151839	Y	ASTL,DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,ARID5A	ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	48395	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	97330891	97331185	97331060	Y	TMEM127,ARID5A,KIAA1310	FER1L5,KANSL3	NA	NA	NA	NA	KANSL3	24367	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	98364129	98364314	98364298	Y	TMEM131,ZAP70,ZAP70	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	85559	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	98367978	98368166	98368128	Y	TMEM131,ANKRD36B,ZAP70,ZAP70	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	89408	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	98465985	98466159	98466067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	144229	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	98485830	98486136	98485916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	124252	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC092675.3	147261	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	99118904	99119212	99119061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4A	59587	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	100026434	100026453	100026444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNDC9	71269	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	100496681	100496959	100496872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	392184	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	100630312	100630613	100630507	Y	AFF3	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	401505	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr2	100654601	100654935	100654768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	377183	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	100885369	100885541	100885455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	146577	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	100937334	100937484	100937407	Y	LONRF2	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	94634	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	101435496	101435968	101435616	Y	NPAS2	NPAS2	NA	NA	NA	NA	NPAS2	882	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr2	101680419	101680493	101680454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL31	64242	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	101712877	101712902	101712892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL31	96700	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	101872333	101872649	101872491	Y	RNF149	TBC1D8	NA	NA	NA	NA	TBC1D8	5005	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	101923239	101923757	101923472	Y	RPL31,MAP4K4,MAP4K4,RNF149	RNF149	NA	NA	NA	NA	RNF149	76	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	102081384	102081611	102081486	Y	RNF149,MAP4K4,MAP4K4,RFX8	RFX8	NA	NA	NA	NA	RFX8	7554	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr2	102133779	102134093	102133972	Y	MAP4K4,MAP4K4	RFX8	MAP4K4,RFX8,CREG2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RFX8	44614	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr2	102383406	102383725	102383568	Y	MAP4K4,MAP4K4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	72094	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr2	102643904	102644218	102643997	Y	NA	IL1R1	NA	NA	NA	NA	IL1R1	34786	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	102711352	102711649	102711577	Y	IL1R1,MAP4K4,MAP4K4	IL1R1	IL1R2,MAP4K4,IL1RL2	IMR90	Hi-C	24141950	IL1R1	32348	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	102775841	102776136	102775926	Y	MAP4K4,MAP4K4,IL1R1	NA	NA	NA	NA	NA	IL1R1	96837	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	102844003	102844653	102844435	Y	IL1R2,IL18RAP,IL1R1	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RL1	81309	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	102867550	102867715	102867627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RL1	58247	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	102874948	102875482	102875196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RL1	50480	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	104018145	104018369	104018235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC018880.2	219719	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	106008939	106009297	106009286	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	43673	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	106022630	106022770	106022732	Y	GPR45	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	30200	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	110016494	110016637	110016500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3RF3	272690	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	110271705	110271931	110271836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT10	97852	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	110859077	110859497	110859213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPHP1	101146	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	112417011	112417329	112417184	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90	Hi-C	24141950	ANAPC1	222938	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	112456456	112456792	112456629	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	183475	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	112463608	112463919	112463793	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	176348	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	112811776	112811937	112811878	Y	ZC3H6	TMEM87B	NA	NA	NA	NA	TMEM87B	976	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	113398370	113398650	113398523	Y	NA	SLC20A1	NA	NA	NA	NA	SLC20A1	2784	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	113569466	113569945	113569683	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	IL1B	22535	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr2	113570329	113570602	113570498	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	IL1B	21878	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	113637417	113638142	113637790	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	IL1B	CKAP2L,IL1A,IL1B,IL37	IMR90	Hi-C	24141950	IL1B	44937	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	113638257	113639193	113638961	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	IL1B	CKAP2L,IL1A	IMR90	Hi-C	24141950	IL1B	45777	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	113693868	113694223	113694055	Y	IL1A,IL1B,IL36B,IL36RN,IL1RN,IL36G	NA	NA	NA	NA	NA	IL1B	101388	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	113811675	113812041	113811939	Y	IL1A,IL1B,IL36G,IL36B,IL36RN,IL1RN	IL36RN	NA	NA	NA	NA	IL36RN	2174	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr2	113835949	113836406	113836219	Y	IL1A,IL1B,IL36G,CBWD2,IL36B,IL36RN,IL1RN	IL36RN	NA	NA	NA	NA	IL36RN	21734	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	113862706	113863200	113862936	Y	IL1A,IL1B,IL36G,IL36B,IL1RN	IL36RN	IL1F10	IMR90	Hi-C	24141950	IL36RN	48491	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	113924878	113925123	113925003	Y	IL1A,IL1B,IL36G,IL36B,IL1RN,CBWD2	PAX8-AS1	PSD4	K562	ChIA-PET	22265404	PAX8-AS1	41976	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	113969874	113970195	113970111	Y	NA	PAX8-AS1	NA	NA	NA	NA	PAX8-AS1	2775	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	114014908	114015299	114015271	Y	NA	PAX8-AS1	NA	NA	NA	NA	PAX8-AS1	47809	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	114082449	114082815	114082523	Y	NA	NA	PAX8,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	PAX8-AS1	115350	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr2	114469366	114469830	114469722	Y	SLC35F5	MIR4782,SLC35F5	NA	NA	NA	NA	MIR4782	7115	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	118847045	118847263	118847087	Y	INSIG2	INSIG2	NA	NA	NA	NA	INSIG2	3017	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	119067655	119067950	119067737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC093901.1	125693	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr2	119669178	119669437	119669357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EN1	65924	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	120996274	120996566	120996498	Y	NA	TMEM185B,RALB	EPB41L5,RALB,TMEM185B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RALB	634	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	121614859	121615272	121615044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	123660	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	121624920	121625080	121625001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	133721	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	122313325	122313599	122313462	Y	NA	RNU4ATAC	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC	26868	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	122456992	122457582	122457167	Y	CLASP1	TSN	NA	NA	NA	NA	TSN	35097	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	123566430	123566580	123566535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSN	1073751	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	124260647	124260891	124260797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSN	1767968	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	127416778	127417376	127416886	Y	NA	GYPC	NA	NA	NA	NA	GYPC	5269	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	127772292	127772580	127772500	Y	MAP3K2	NA	NA	NA	NA	NA	BIN1	90351	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	127863441	127863795	127863513	Y	NA	BIN1	NA	NA	NA	NA	BIN1	510	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	127934423	127934665	127934539	Y	MAP3K2	NA	NA	NA	NA	NA	BIN1	71492	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	128453755	128454028	128453898	Y	MAP3K2,IWS1,AMMECR1L,SFT2D3	SFT2D3	LIMS2	IMR90	Hi-C	24141950	SFT2D3	2569	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	128562322	128562673	128562571	Y	NA	WDR33	LIMS2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR33	4088	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	128598749	128599093	128599053	Y	IWS1,SFT2D3,AMMECR1L	WDR33,POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	14638	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	128761594	128761964	128761779	Y	NA	SAP130	NA	NA	NA	NA	SAP130	21730	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	131828545	131828813	131828794	Y	NA	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	FAM168B	20220	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	131863489	131864378	131863990	Y	PLEKHB2	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	PLEKHB2	3069	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	133011418	133011623	133011538	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR39	160524	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	133407314	133407482	133407398	Y	LYPD1,LYPD1	LYPD1	NA	NA	NA	NA	LYPD1	19670	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	134570885	134571181	134570989	Y	NA	NA	NCKAP5	IMR90	Hi-C	24141950	NCKAP5	246851	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr2	136268329	136268541	136268430	Y	NA	ZRANB3,R3HDM1	NA	NA	NA	NA	ZRANB3	18265	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	136404449	136404849	136404497	Y	R3HDM1	NA	NA	NA	NA	NA	UBXN4	92340	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	136632932	136633416	136633308	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	MCM6	NA	NA	NA	NA	MCM6	936	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr2	136783030	136783335	136783274	Y	NA	AC093391.2,DARS	NA	NA	NA	NA	DARS	41360	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	143400236	143400580	143400366	Y	KYNU	NA	KYNU	IMR90	Hi-C	24141950	KYNU	232487	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	143615896	143616223	143616082	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7	ChIA-PET	22265404	KYNU	16844	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr2	143630782	143631707	143631171	Y	KYNU	KYNU	NA	NA	NA	NA	KYNU	1360	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr2	143688672	143689047	143688712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	55605	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	143964493	143964873	143964522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP15	117562	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	145115622	145115908	145115729	Y	ZEB2	GTDC1	ZEB2,ARHGAP15,GTDC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GTDC1	27487	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	149017229	149017560	149017414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ORC4	240082	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	149267026	149267240	149267133	Y	EPC2	NA	NA	NA	NA	NA	EPC2	132769	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	150222263	150222576	150222421	Y	NA	LYPD6	NA	NA	NA	NA	LYPD6	37764	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	150505364	150505670	150505432	Y	NA	NA	RBM43,RND3	IMR90	Hi-C	24141950	MMADHC	63034	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	150999106	150999378	150999253	Y	RND3	NA	RND3,MMADHC,RBM43	IMR90	Hi-C	24141950	RND3	394147	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr2	150999673	151000010	150999769	Y	NA	NA	RND3,MMADHC,RBM43	IMR90	Hi-C	24141950	RND3	393515	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	151330104	151330756	151330441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RND3	62769	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	151377866	151378135	151377929	Y	RND3	RND3	RND3,RBM43	IMR90	Hi-C	24141950	RND3	15390	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	151383394	151383753	151383509	Y	RND3	RND3	RND3,RBM43	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RND3	9772	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr2	151477368	151477581	151477492	Y	RND3	NA	RBM43	IMR90	Hi-C	24141950	RND3	83843	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	151536085	151536156	151536124	Y	RND3	NA	RBM43,RND3	IMR90	Hi-C	24141950	RND3	142560	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	151537937	151538357	151538169	Y	NA	NA	RBM43,RND3,MMADHC	IMR90	Hi-C	24141950	RND3	144412	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	151768299	151768310	151768305	Y	NA	NA	RND3	IMR90	Hi-C	24141950	RBM43	348083	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	153057173	153057360	153057266	Y	FMNL2	STAM2	FMNL2	IMR90	Hi-C	24141950	STAM2	26667	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	153302279	153302595	153302384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	112528	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	153429708	153430091	153429909	Y	PRPF40A	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6IP6	142316	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	154903292	154903466	154903385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF40A	1330781	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	4.44600387830647
chr2	157191997	157192231	157192220	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	4629	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	157257270	157257340	157257305	Y	NA	GPD2	NR4A2,GALNT5,GPD2	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GPD2	32462	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	157262022	157262267	157262175	Y	GPD2,NR4A2	GPD2	NR4A2,GALNT5,GPD2	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GPD2	27535	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	157659765	157659881	157659802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPD2	369963	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	158030373	158030519	158030484	Y	NA	NA	NR4A2,GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	GALNT5	81591	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	158067838	158068005	158067865	Y	NA	GALNT5	NA	NA	NA	NA	GALNT5	44105	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	158117931	158118105	158118018	Y	GALNT5	GALNT5	NA	NA	NA	NA	GALNT5	5821	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	158673009	158673352	158673181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR1	57022	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	158687871	158687996	158687910	Y	ACVR1,ACVR1	ACVR1	NA	NA	NA	NA	ACVR1	42378	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr2	158712267	158712700	158712451	Y	ACVR1,ACVR1	ACVR1	NA	NA	NA	NA	ACVR1	17674	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	160095412	160095531	160095474	Y	NA	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	45779	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	160100045	160100277	160100255	Y	NA	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	41033	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	160491864	160492115	160492090	Y	NA	BAZ2B	BAZ2B	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BAZ2B	20661	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	161080666	161080905	161080769	Y	NA	NA	ITGB6,RBMS1,TANK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLA2R1	163545	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	161141907	161142179	161141926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4785	120214	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	161155946	161156394	161156280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4785	105999	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	161232354	161232597	161232498	Y	NA	MIR4785	NA	NA	NA	NA	MIR4785	29796	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	161244338	161244737	161244615	Y	NA	MIR4785	NA	NA	NA	NA	MIR4785	17656	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr2	161277229	161277590	161277411	Y	NA	MIR4785	NA	NA	NA	NA	MIR4785	14836	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	161348201	161348679	161348535	Y	RBMS1	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS1	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	161431402	161431575	161431468	Y	NA	NA	ITGB6,RBMS1	IMR90	Hi-C	24141950	RBMS1	83097	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	161607616	161608069	161607675	Y	TANK,TANK	NA	RBMS1,ITGB6	IMR90	Hi-C	24141950	RBMS1	259311	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	162197345	162197490	162197464	Y	NA	PSMD14,AC009299.5	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	1508	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr2	162565636	162565807	162565722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC4A10	286793	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	164204698	164204962	164204800	Y	NA	NA	FIGN	IMR90	Hi-C	24141950	FIGN	385560	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr2	164534395	164534690	164534543	Y	FIGN	NA	NA	NA	NA	NA	FIGN	55832	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	165430240	165430431	165430256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COBLL1	267758	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	165777057	165777208	165777083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COBLL1	78868	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	166523404	166523752	166523720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSRNP3	199247	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	166983519	166983786	166983732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC21B	175166	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	168150182	168150557	168150197	Y	NA	AC074363.1	NA	NA	NA	NA	AC074363.1	2501	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	168822360	168822564	168822456	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK39	280087	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	169409032	169409398	169409117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CERS6	98660	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	171865748	171866100	171865790	Y	TLK1	NA	NA	NA	NA	NA	GORASP2	82774	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	172959536	172959659	172959591	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5969	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	172960097	172960530	172960322	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5098	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr2	172961367	172961608	172961457	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	4020	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.95624170645485
chr2	172961678	172962145	172962061	Y	NA	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	3483	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	173117910	173118399	173118084	Y	NA	NA	ITGA6	IMR90	Hi-C	24141950	DLX2	152282	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	174007383	174007707	174007544	Y	ZAK	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7	209841	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	174016358	174016802	174016556	Y	ZAK	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7	200746	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	174889919	174890381	174890067	Y	NA	NA	SP3,OLA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP3	61489	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	175085975	175086128	175086062	Y	NA	OLA1	NA	NA	NA	NA	OLA1	25298	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	175700542	175700958	175700833	Y	CHRNA1	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3AP4	118037	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	178100990	178101571	178101482	Y	NA	AC079305.8,MIR3128,AC079305.10	NA	NA	NA	NA	MIR3128	17167	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	AC079305.8,MIR3128,AC079305.10	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	178116726	178117036	178116927	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	AC079305.8,MIR3128,AC079305.10	NA	NA	NA	NA	MIR3128	1702	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	180098781	180098979	180098880	Y	NA	SESTD1	NA	NA	NA	NA	SESTD1	28538	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	180116495	180116858	180116779	Y	SESTD1	SESTD1	NA	NA	NA	NA	SESTD1	10659	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	180325251	180325377	180325327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESTD1	197734	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	181776008	181776093	181776087	Y	NA	FTH1P20	NA	NA	NA	NA	FTH1P20	39867	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	182258262	182258376	182258308	Y	ITGA4	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA4	61553	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	182367881	182368047	182367964	Y	ITGA4	ITGA4	NA	NA	NA	NA	ITGA4	47952	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	182418889	182419281	182419085	Y	NEUROD1,CERKL	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA4	98960	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	183839050	183839414	183839395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	62172	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	183877830	183878146	183878099	Y	NA	NCKAP1	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	23440	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	183927847	183928122	183927946	Y	DUSP19	NCKAP1,DUSP19	NA	NA	NA	NA	DUSP19	13165	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	187601377	187601405	187601389	Y	ZSWIM2,FAM171B	FAM171B	NA	NA	NA	NA	FAM171B	44679	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	188112953	188113150	188112989	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALCRL	198037	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	188389811	188390126	188390006	Y	NA	TFPI	NA	NA	NA	NA	TFPI	38361	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	189391407	189391613	189391501	Y	GULP1	NA	NA	NA	NA	NA	GULP1	237011	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	189978697	189979080	189978901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL5A2	63525	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	190032574	190032988	190032786	Y	NA	COL5A2	NA	NA	NA	NA	COL5A2	9617	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	190043432	190043827	190043588	Y	DIRC1,COL3A1,COL5A2	COL5A2	NA	NA	NA	NA	COL5A2	827	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	190324760	190324912	190324838	Y	NA	WDR75	NA	NA	NA	NA	WDR75	20601	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	191075616	191075973	191075872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP1	130223	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	191447882	191447975	191447929	Y	NA	NA	TMEM194B,NAB1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM194B	50434	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	191492626	191492865	191492683	Y	INPP1,STAT1,NAB1	NAB1	MFSD6	IMR90	Hi-C	24141950	NAB1	16607	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	191724246	191724433	191724303	Y	NA	GLS,AC005540.3	GLS,STAT1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLS	19120	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	191810388	191810629	191810413	Y	GLS	AC067945.3	STAT1	IMR90	Hi-C	24141950	AC067945.3	45664	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	191826753	191827142	191827070	Y	NA	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	29151	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	192034233	192034465	192034355	Y	MYO1B,MYO1B	NA	MYO1B,STAT4,OBFC2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYO1B	73446	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	192112527	192112680	192112632	Y	NA	MYO1B	NA	NA	NA	NA	MYO1B	4616	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	192544982	192545232	192545125	Y	OBFC2A	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	164749	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	194142383	194142416	194142400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEFF2	1083948	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	194212584	194212652	194212618	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEFF2	1154149	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	194838514	194838698	194838568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	1600003	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	15.2942533413743
chr2	196523919	196524096	196523991	Y	SLC39A10	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	85218	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	196547563	196547821	196547646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	108862	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	197195800	197196140	197196081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK17B	156573	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	197271750	197271952	197271866	Y	HECW2	NA	NA	NA	NA	NA	HECW2	184464	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	197934286	197934620	197934500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP1	143766	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	197962665	197962866	197962743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P3	162969	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	198017079	198017377	198017323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P3	108458	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	198024213	198024664	198024538	Y	SF3B1,COQ10B	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P3	101171	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	198158784	198159350	198159060	Y	SF3B1,MOBKL3,MOBKL3,MOBKL3,COQ10B,ANKRD44	ATP5G2P3,ANKRD44	NA	NA	NA	NA	ANKRD44	14547	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	200328214	200328741	200328463	Y	SATB2,SATB2,SATB2	SATB2	NA	NA	NA	NA	SATB2	5248	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	200839985	200840279	200840201	Y	NA	C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	TYW5	21526	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	200850363	200850607	200850485	Y	NA	C2orf47,TYW5	SPATS2L,KCTD18	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TYW5	31904	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	201829288	201829721	201829590	Y	KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2	ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	2885	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	201992378	201992654	201992500	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	13551	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	202560879	202561324	202561082	Y	NA	MPP4	NA	NA	NA	NA	MPP4	93	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	202723656	202723936	202723797	Y	NA	UBE2V1P11	NA	NA	NA	NA	UBE2V1P11	36385	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	FZD7	NA	NA	NA	NA	FZD7	872	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr2	206005178	206005232	206005204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	539482	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	206439575	206439768	206439663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	104946	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	206944485	206944991	206944704	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	AC007383.3	2338	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	207981292	207981447	207981370	Y	NA	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	48544	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	208007936	208008436	208008192	Y	METTL21A,METTL21A,KLF7,CREB1	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	21555	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	208016492	208017045	208016857	Y	CREB1	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	12946	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	208027980	208028625	208028335	Y	CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	1366	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr2	208028732	208029438	208029179	Y	METTL21A,CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	553	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr2	208154070	208154333	208154202	Y	NA	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF7	124079	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	208176046	208176541	208176319	Y	CREB1,CCNYL1	NA	KLF7,CREB1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF7	146055	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr2	208198821	208199856	208199157	Y	KLF7	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF7	168830	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	208378687	208378932	208378791	Y	CREB1	CREB1,AC007879.5	KLF7,CREB1,METTL21A,CCNYL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB1	13529	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	208395422	208395980	208395659	Y	PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1	CREB1,AC007879.5	NA	NA	NA	NA	AC007879.5	2903	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	210233724	210233884	210233805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2	52898	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	213275825	213276172	213276170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERBB4	125393	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	213708586	213709017	213708777	Y	NA	NA	IKZF2	IMR90	Hi-C	24141950	IKZF2	306134	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	216489283	216489494	216489351	Y	FN1	NA	NA	NA	NA	NA	AC012462.1	190307	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	216558345	216558652	216558547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012462.1	259369	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	216695142	216695306	216695226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREG	201513	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	217970488	217971016	217970653	Y	NA	NA	IGFBP5,DIRC3,IGFBP2,TNP1	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP5	412240	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	218027339	218027548	218027469	Y	NA	NA	DIRC3,IGFBP5,IGFBP2,TNP1	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP5	469091	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	218088198	218088590	218088283	Y	NA	NA	DIRC3,IGFBP5,IGFBP2	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP5	529950	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr2	218258363	218258761	218258688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP5	700115	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	218278062	218278387	218278165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP5	719814	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	218736007	218736119	218736065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARPC2	343698	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	219270976	219271406	219271230	Y	CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1	CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	9997	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	EPHA4	389768	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	223709158	223709348	223709234	Y	SGPP2	ACSL3	ACSL3,MOGAT1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACSL3	14304	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	224751909	224752110	224752042	Y	WDFY1	NA	NA	NA	NA	NA	AP1S3	51165	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	224761528	224761781	224761678	Y	WDFY1	WDFY1	NA	NA	NA	NA	WDFY1	46323	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	224951199	224951592	224951399	Y	NA	SERPINE2	NA	NA	NA	NA	SERPINE2	49163	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	225325353	225325370	225325362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	122740	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	225392496	225392764	225392746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	55346	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	225720701	225721025	225720950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4439	152232	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	225841174	225841410	225841405	Y	NA	MIR4439	NA	NA	NA	NA	MIR4439	31847	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	226979861	226980232	226980018	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC068138.1	67855	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	227517160	227517436	227517301	Y	IRS1	NA	IRS1,LOC646736	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	145039	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	227656309	227656561	227656437	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	5914	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	227665142	227665696	227665306	Y	IRS1	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	2667	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	227849549	227849707	227849645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHBDD1	151252	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	230215591	230215819	230215699	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	81590	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	230274489	230274615	230274507	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	140488	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	230309727	230309993	230309861	Y	TRIP12,PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	175726	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	230319642	230320072	230319824	Y	TRIP12,PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	185641	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	231276384	231276790	231276706	Y	NA	SP100	NA	NA	NA	NA	SP100	1867	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr2	231532055	231532298	231532144	Y	GPR55,SP100,SP100,CAB39	CAB39	CAB39	IMR90	Hi-C	24141950	CAB39	43262	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	231636017	231636396	231636213	Y	NA	BANF1P3	NA	NA	NA	NA	BANF1P3	47899	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	231901045	231901225	231901135	Y	NA	PSMD1	NA	NA	NA	NA	PSMD1	18353	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	232095962	232096104	232096033	Y	NA	ARMC9,AC018738.2	NA	NA	NA	NA	AC018738.2	22706	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	232229850	232230117	232229960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD82	93034	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr2	232277113	232277443	232277206	Y	C2orf72	SNORD82	NA	NA	NA	NA	SNORD82	45708	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00471	91838	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr2	232478392	232478857	232478528	Y	DIS3L2,PTMA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90748	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	232526700	232527324	232527119	Y	DIS3L2	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	42281	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr2	232531704	232531853	232531745	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	37752	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	232545684	232546083	232545868	Y	COPS7B	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	23522	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr2	232580827	232581056	232580891	Y	NA	PTMA	NA	NA	NA	NA	PTMA	11222	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	233766797	233767190	233766879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIGYF2	206788	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	234630754	234630813	234630784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HJURP	130399	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	234673088	234673246	234673167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HJURP	87966	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	235160532	235160873	235160730	Y	NA	NA	TRPM8,AGAP1,SH3BP4,ARL4C,SPP2	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	242824	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	235198516	235198843	235198584	Y	ARL4C	NA	TRPM8,ARL4C	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	204854	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr2	235244091	235244800	235244645	Y	ARL4C	NA	SPP2,ARL4C	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	158897	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	235863329	235863490	235863430	Y	SH3BP4	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	4712	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	236547901	236548387	236548201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	147168	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	237481215	237481391	237481283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQCA1	67030	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	237640726	237641053	237640951	Y	NA	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IQCA1	226541	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	237652147	237652530	237652442	Y	NA	NA	CXCR7	IMR90	Hi-C	24141950	IQCA1	237962	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	237779975	237780996	237780247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS8	210959	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	237881431	237881780	237881646	Y	NA	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90	Hi-C	24141950	COPS8	110175	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	238038460	238038824	238038818	Y	NA	COPS8,AC105760.2	COPS8,COL6A3,MLPH,PRLH,RAB17,LRRFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	46000	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	238065108	238065400	238065254	Y	COL6A3	NA	COL6A3,COPS8,MLPH,LRRFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	72648	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr2	238066036	238066584	238066320	Y	MLPH,COL6A3	NA	COL6A3,COPS8,MLPH,LRRFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	73576	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	238080117	238080402	238080307	Y	COL6A3	NA	COL6A3,MLPH	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	87657	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	238092955	238093156	238093082	Y	NA	NA	COL6A3,MLPH,LRRFIP1,RAB17,PRLH	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	100495	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr2	238136450	238136659	238136506	Y	COL6A3	NA	COL6A3,PRLH,RAB17	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	143990	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	238187174	238187402	238187364	Y	NA	NA	COL6A3,MLPH,COPS8	IMR90	Hi-C	24141950	COL6A3	133616	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr2	238188791	238189175	238189021	Y	COL6A3	NA	MLPH,COL6A3,COPS8	IMR90	Hi-C	24141950	COL6A3	131843	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	238292882	238293292	238292932	Y	COPS8,LRRFIP1,COL6A3	COL6A3	NA	NA	NA	NA	COL6A3	27726	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	238299841	238300132	238300017	Y	COPS8,LRRFIP1,COL6A3	COL6A3	NA	NA	NA	NA	COL6A3	20886	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	238320410	238321055	238320789	Y	COL6A3	NA	NA	NA	NA	NA	COL6A3	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	238321382	238321708	238321611	Y	COL6A3	COL6A3	NA	NA	NA	NA	COL6A3	364	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	238382776	238383011	238382901	Y	LRRFIP1	NA	LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COL6A3	61758	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	238383141	238383356	238383272	Y	NA	NA	LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COL6A3	62123	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	238578518	238578831	238578655	Y	COL6A3	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	44299	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	239017680	239017839	239017760	Y	ESPNL	FAM132B	NA	NA	NA	NA	FAM132B	47784	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	239080379	239080669	239080523	Y	NA	FAM132B,ILKAP	NA	NA	NA	NA	FAM132B	14756	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	239347857	239348510	239348285	Y	ASB1	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	14474	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr2	239545160	239545510	239545294	Y	NA	NA	LOC151171,TRAF3IP1,HDAC4,MIR4440	IMR90	Hi-C	24141950	TWIST2	209163	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	239552819	239552999	239552910	Y	PER2	NA	LOC151171	IMR90	Hi-C	24141950	TWIST2	201674	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	239636221	239636523	239636333	Y	TWIST2	NA	LOC151171,TRAF3IP1,LOC150935	IMR90	Hi-C	24141950	TWIST2	118150	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	239636771	239636988	239636877	Y	TWIST2	NA	LOC151171,TRAF3IP1,LOC150935	IMR90	Hi-C	24141950	TWIST2	117685	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	239755854	239755907	239755878	Y	TWIST2	TWIST2	NA	NA	NA	NA	TWIST2	1181	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	239758150	239758505	239758333	Y	NA	TWIST2	NA	NA	NA	NA	TWIST2	3477	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr2	239779123	239779526	239779330	Y	TWIST2	TWIST2	NA	NA	NA	NA	TWIST2	24450	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	239870450	239870747	239870599	Y	NA	NA	LOC151171,TRAF3IP1,FLJ43879,MIR4786,TWIST2,HDAC4	IMR90	Hi-C	24141950	TWIST2	115777	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	240195931	240196233	240196082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	124897	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	240196933	240197336	240197049	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	123794	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr2	240355727	240356102	240355822	Y	NA	AC062017.1,HDAC4	HDAC4	IMR90	Hi-C	24141950	HDAC4	34379	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	241585712	241586190	241585819	Y	DUSP28,CAPN10,GPR35,MTERFD2	NA	NA	NA	NA	NA	CAPN10	61579	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	241860652	241861096	241860920	Y	GPC1,SNED1	NA	LOC200772,SNED1,MTERFD2	IMR90	Hi-C	24141950	SNED1	75159	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr2	242030281	242030580	242030300	Y	SNED1,PASK	MTERFD2	NA	NA	NA	NA	MTERFD2	9167	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	242050705	242051124	242050885	Y	NA	MTERFD2,PPP1R7,PASK	NA	NA	NA	NA	MTERFD2	10958	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr2	242425566	242425726	242425646	Y	NA	STK25	NA	NA	NA	NA	STK25	21419	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	247683	247718	247701	Y	NA	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1	NA	NA	NA	NA	C20orf96	21672	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	290672	290826	290757	Y	SOX12,NRSN2	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,RP5-1103G7.4	NA	NA	NA	NA	SOX12	13381	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr20	290991	291448	291293	Y	C20orf54	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,RP5-1103G7.4	NA	NA	NA	NA	SOX12	12759	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	623492	623974	623709	Y	NA	SRXN1	NA	NA	NA	NA	SRXN1	8040	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	1167289	1167675	1167648	Y	NA	RAD21L1	NA	NA	NA	NA	RAD21L1	37025	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	1168274	1168908	1168417	Y	NA	RAD21L1	NA	NA	NA	NA	RAD21L1	35792	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	1267390	1267580	1267486	Y	SIRPG	SNPH	LOC100507495,FKBP1A-SDCBP2	IMR90	Hi-C	24141950	SNPH	22430	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	1332285	1332772	1332374	Y	C20orf46,SDCBP2	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	39034	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	1338546	1338920	1338732	Y	NA	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	32886	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	1396685	1396983	1396828	Y	SDCBP2,SIRPA	FKBP1A	SNPH,RAD21L1,FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495	IMR90	Hi-C	24141950	FKBP1A	24879	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	1398801	1399138	1399021	Y	FKBP1A	FKBP1A	SNPH,RAD21L1,FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495	IMR90	Hi-C	24141950	FKBP1A	26995	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	1415597	1415981	1415837	Y	NA	FKBP1A,NSFL1C	FKBP1A-SDCBP2	IMR90	Hi-C	24141950	NSFL1C	36506	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	1757792	1758093	1758078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	115061	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	1790289	1790734	1790591	Y	NA	NA	SIRPA,STK35	IMR90	Hi-C	24141950	SIRPA	82420	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	1925678	1926256	1925964	Y	SIRPB2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	52524	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	2450025	2450398	2450237	Y	NA	SNORD119,SNRPB	NA	NA	NA	NA	SNRPB	526	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	2851057	2851398	2851292	Y	NA	VPS16,PTPRA	NA	NA	NA	NA	PTPRA	8227	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	3170247	3170648	3170474	Y	NA	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	DDRGK1	12683	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	3377596	3377907	3377772	Y	C20orf194	C20orf194	NA	NA	NA	NA	C20orf194	8365	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	3472887	3473113	3473000	Y	NA	ATRN	NA	NA	NA	NA	ATRN	23200	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	3520013	3520365	3520159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATRN	70326	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	3660633	3661051	3660900	Y	CENPB,ADAM33	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM33	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr20	3788108	3788452	3788409	Y	NA	C20orf27,CENPB,CDC25B,MAVS	NA	NA	NA	NA	CDC25B	22530	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	3909447	3909819	3909642	Y	RNF24,RNF24,PANK2	PANK2	NA	NA	NA	NA	PANK2	41961	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	3932717	3933076	3932937	Y	NA	NA	MIR103B2,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF24	61153	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	4016729	4016906	4016897	Y	NA	RNF24,FTLP3	RNF24,CENPB,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	FTLP3	14177	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	4045309	4045541	4045432	Y	C20orf27,CENPB,C20orf29	FTLP3	RNF24,PANK2,MAVS	IMR90	Hi-C	24141950	FTLP3	42757	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	4065883	4066158	4066005	Y	PANK2,RNF24,RNF24	SMOX	RNF24,PANK2,MAVS,MIR103B2,LOC728228	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	33469	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	4493607	4493844	4493709	Y	NA	NA	ADRA1D	IMR90	Hi-C	24141950	PRNP	171038	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	5046140	5046913	5046758	Y	PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2	NA	SLC23A2,C20orf30,RASSF2,PCNA,PCNA-AS1,PRND,PRNT,CDS2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC23A2	57201	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr20	5054597	5054958	5054657	Y	PRNP,PRNP,RASSF2,SLC23A2	NA	NA	NA	NA	NA	PCNA	50314	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	5059148	5059500	5059412	Y	PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2	PCNA,CDS2	NA	NA	NA	NA	PCNA	45772	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	5060940	5061369	5061194	Y	PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2	PCNA,CDS2	NA	NA	NA	NA	PCNA	43903	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	5553446	5553705	5553635	Y	NA	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	35967	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	5635212	5635550	5635485	Y	TRMT6,GPCPD1	GPCPD1	C20orf196,GPCPD1,TRMT6	IMR90	Hi-C	24141950	GPCPD1	45540	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	5655070	5655307	5655188	Y	GPCPD1,TRMT6	NA	C20orf196,GPCPD1	IMR90	Hi-C	24141950	GPCPD1	65398	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	7058177	7058257	7058218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMX4	940219	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	7676323	7676671	7676477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMX4	321805	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	7722665	7722821	7722752	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMX4	275655	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	7724927	7725300	7725200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMX4	273176	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	8464613	8464952	8464618	Y	PLCB1	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	353789	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	10492212	10492484	10492413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	79342	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	10652083	10652420	10652292	Y	JAG1	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	27069	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	10655214	10655688	10655561	Y	NA	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	30200	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	12055042	12055294	12055170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD3	185671	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	14248741	14249040	14248807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT3	67222	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	15012319	15012450	15012385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT3	696057	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr20	15876480	15876870	15876712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF16B	675208	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	16331149	16331548	16331320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF16B	220530	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	16555525	16555956	16555640	Y	NA	KIF16B	NA	NA	NA	NA	KIF16B	3447	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	17554539	17554936	17554702	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	6031	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	17557154	17557457	17557241	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	8646	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	17816995	17817233	17817164	Y	DSTN	NA	BANF2,RRBP1,BFSP1	IMR90	Hi-C	24141950	SNORD17	124356	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	17830512	17830807	17830760	Y	NA	NA	BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5	IMR90	Hi-C	24141950	SNORD17	110782	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	17830949	17831353	17831268	Y	NA	NA	BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5	IMR90	Hi-C	24141950	SNORD17	110236	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	17919475	17919751	17919605	Y	NA	SNORD17,SNX5	NA	NA	NA	NA	SNORD17	21838	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	17946136	17946538	17946496	Y	SNX5,SNX5	SNORD17,SNX5,PTMAP3	NA	NA	NA	NA	SNX5	1085	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	18565876	18566072	18565973	Y	CSRP2BP,ZNF133,POLR3F,SEC23B,SEC23B,SEC23B,DTD1	LINC00493,DTD1	NA	NA	NA	NA	DTD1	465	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	18686203	18686430	18686281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTD1	119666	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	19917960	19918777	19918135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA20	76983	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	20605285	20605597	20605591	Y	RALGAPA2	NA	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	85534	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	22392618	22392869	22392732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00261	164411	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	22842612	22842915	22842803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THBD	185463	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr20	23031353	23032100	23031620	Y	GZF1,THBD,CD93	THBD	NA	NA	NA	NA	THBD	2975	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	23123782	23124035	23123853	Y	NA	NA	LOC200261	IMR90	Hi-C	24141950	THBD	95404	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr20	23125768	23126430	23126237	Y	THBD,CD93,GZF1,CST3	NA	LOC200261	IMR90	Hi-C	24141950	THBD	97390	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	23136585	23137102	23136883	Y	THBD,CD93,GZF1	NA	NA	NA	NA	NA	THBD	108207	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr20	23206035	23206305	23206209	Y	THBD,CD93,GZF1,CST3	NA	THBD,CD93	IMR90	Hi-C	24141950	NXT1	123068	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	25291624	25291957	25291812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYGB	64919	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	26116339	26116766	26116505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR663A	113396	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr20	29647996	29648434	29648295	Y	DEFB121,DEFB116	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	38139	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	29649919	29650288	29650100	Y	NA	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	40062	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	30104625	30104737	30104681	Y	HM13	HM13	NA	NA	NA	NA	HM13	4394	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	30105267	30105465	30105369	Y	HM13	HM13	NA	NA	NA	NA	HM13	5036	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	30183712	30184220	30184085	Y	ID1	ID1	HM13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID1	6866	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr20	30191850	30192346	30192159	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	764	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr20	30200712	30201016	30200864	Y	TTLL9,DUSP15,DEFB116,DEFB121	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	9626	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	30249247	30249862	30249570	Y	TTLL9	NA	NA	NA	NA	NA	ID1	58161	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	30255856	30255976	30255884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	53816	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	30262675	30263005	30262853	Y	HCK,BCL2L1	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	46787	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr20	30263480	30263875	30263840	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	45917	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	30266315	30266710	30266574	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	43082	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	30300504	30300973	30300648	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8819	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	30301047	30301377	30301326	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8415	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr20	30705137	30705472	30705281	Y	HCK,PLAGL2	TM9SF4	NA	NA	NA	NA	TM9SF4	9828	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	31044923	31045080	31044970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASXL1	100768	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	31045263	31045487	31045417	Y	KIF3B	NA	NA	NA	NA	NA	ASXL1	101108	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr20	31063072	31063625	31063366	Y	NA	NA	ASXL1	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf112	107251	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	3.20112279238066
chr20	31998840	31999088	31998873	Y	C20orf185	CDK5RAP1,SNTA1	CDK5RAP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDK5RAP1	11473	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	32093960	32094027	32093984	Y	NA	CBFA2T2	NA	NA	NA	NA	CBFA2T2	18079	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	32142835	32143155	32142948	Y	C20orf186,CDK5RAP1,CHMP4B	NA	NA	NA	NA	NA	CBFA2T2	66954	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	32694090	32694253	32694172	Y	NA	EIF2S2	NA	NA	NA	NA	EIF2S2	3885	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	32803456	32803920	32803688	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	93688	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	32989671	32989803	32989744	Y	NA	ITCH	NA	NA	NA	NA	ITCH	40630	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	33064297	33064587	33064427	Y	ACSS2	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	FDX1P1	2018	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	33263826	33263865	33263846	Y	MYH7B	PIGU,TP53INP2	NA	NA	NA	NA	PIGU	916	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	33294754	33295084	33294783	Y	NA	PIGU,TP53INP2	NA	NA	NA	NA	TP53INP2	4660	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	33803083	33803443	33803260	Y	NA	PROCR,MT1P3	TRPC4AP,PROCR,GGT7,CEP250,ACSS2,EDEM2,MMP24,UQCC,FAM83C,EIF6	IMR90	Hi-C	24141950	MT1P3	369	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	33861234	33861630	33861491	Y	NA	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EDEM2	2298	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	33900177	33900484	33900409	Y	GSS,EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EIF6	29389	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	33906285	33906606	33906471	Y	GSS,EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	35497	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	33907005	33907177	33907091	Y	EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	36217	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	33907745	33907913	33907842	Y	MMP24,GDF5	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	36957	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	33908268	33908438	33908376	Y	NA	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	37480	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr20	34093619	34093844	34093641	Y	NA	ERGIC3	NA	NA	NA	NA	ERGIC3	33926	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	34217204	34217560	34217502	Y	NA	SPAG4,CPNE1,RBM12	NA	NA	NA	NA	SPAG4	15390	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	34303643	34304038	34303890	Y	NA	ROMO1,NFS1,RBM39,RPF2P1	NA	NA	NA	NA	NFS1	18362	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	34357066	34357356	34357208	Y	NA	RBM39,RPF2P1,PHF20	NA	NA	NA	NA	PHF20	540	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	34463368	34463773	34463624	Y	NFS1	RNU4-40P	NA	NA	NA	NA	RNU4-40P	9808	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	34471781	34472424	34472101	Y	NA	RNU4-40P	NA	NA	NA	NA	RNU4-40P	1157	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	EPB41L1	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EPB41L1	24371	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr20	35172533	35172668	35172598	Y	MYL9	MYL9,RP5-977B1.7,TGIF2	NA	NA	NA	NA	MYL9	4646	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	35239893	35239986	35239939	Y	NA	RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	7756	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	35273218	35273375	35273256	Y	RBL1,TGIF2,SAMHD1,SLA2	C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	41081	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	35305679	35305903	35305811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG3	66578	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	35490387	35490628	35490526	Y	MANBAL,KIAA0889	NA	KIAA0889	MCF7	ChIA-PET	22265404	SAMHD1	87618	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr20	35612420	35612442	35612434	Y	RBL1	SAMHD1	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	34174	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr20	35821029	35821195	35821110	Y	NA	RPN2	GHRH	IMR90	Hi-C	24141950	RPN2	16216	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	35874402	35874620	35874497	Y	NA	MANBAL	NA	NA	NA	NA	MANBAL	41421	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	35985970	35986139	35986055	Y	NA	SRC	NA	NA	NA	NA	SRC	14882	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	36008343	36008504	36008424	Y	SAMHD1,MANBAL,SRC	SRC	NA	NA	NA	NA	SRC	37255	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	36034782	36035452	36035129	Y	C20orf132,VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	36484	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	36040005	36040428	36040132	Y	VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	31508	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	36045421	36045655	36045607	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	26281	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	36722822	36723019	36722924	Y	CTNNBL1,RPRD1B,RALGAPB,BPI	NA	NA	NA	NA	NA	RPRD1B	62874	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	36986320	36986515	36986447	Y	BPI	LBP	NA	NA	NA	NA	LBP	13561	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	39051364	39051718	39051672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFB	264162	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	39632234	39632572	39632465	Y	MAFB,TOP1	RNU2-52P,TOP1	PLCG1,TOP1,ZHX3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU2-52P	18273	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr20	39958158	39958419	39958360	Y	NA	ZHX3,LPIN3	PLCG1,ZHX3,LPIN3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LPIN3	9141	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr20	40321359	40321668	40321514	Y	NA	NA	CHD6	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHD6	76226	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	RPL27AP,MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL27AP	6898	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr20	42379932	42380273	42380130	Y	NA	NA	TOX2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	86178	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	42718699	42718853	42718776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSER1-AS1	118747	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	42938917	42939166	42938990	Y	NA	FITM2	GDAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	FITM2	1108	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	43123975	43124199	43124088	Y	C20orf111,STK4,ADA,SERINC3	RPL37AP1,TTPAL,SERINC3,PKIG	NA	NA	NA	NA	TTPAL	21449	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	43181587	43181787	43181669	Y	NA	SERINC3,PKIG	NA	NA	NA	NA	PKIG	23161	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	43181922	43182397	43182243	Y	SERINC3	SERINC3,PKIG	NA	NA	NA	NA	PKIG	23496	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	43238683	43239068	43238831	Y	NA	ADA	NA	NA	NA	NA	ADA	39806	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr20	43321614	43322020	43321838	Y	WISP2,KCNK15	ADA,WISP2	LOC79015,YWHAB,WISP2,SERINC3,TTPAL,PKIG,ADA,KCNK15,RIMS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WISP2	19465	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	43517782	43518230	43517943	Y	NA	YWHAB,PABPC1L	PABPC1L	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAB	5465	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr20	43582253	43582415	43582335	Y	NA	PABPC1L,TOMM34,STK4	NA	NA	NA	NA	TOMM34	4712	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	43767332	43767709	43767669	Y	NA	PI3	STK4,MATN4,RBPJL	IMR90	Hi-C	24141950	PI3	33808	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	43972821	43973151	43973055	Y	SYS1,SDC4	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	1913	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	44001576	44001658	44001579	Y	WFDC11,KCNS1,TP53TG5,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2,PIGT	NA	NA	NA	NA	SYS1-DBNDD2	11736	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	44056635	44056652	44056644	Y	NA	PIGT	NA	NA	NA	NA	PIGT	13918	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	45006307	45006609	45006393	Y	PCIF1,ZNF335	SLC35C2	NA	NA	NA	NA	SLC35C2	15264	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	45870109	45870518	45870490	Y	ZMYND8,NCOA3	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	113049	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	45946049	45946481	45946179	Y	NA	ZMYND8	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	37086	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	45962816	45963214	45963054	Y	NA	ZMYND8	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	20353	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	47339273	47339687	47339536	Y	PREX1	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	102733	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	47547466	47547777	47547635	Y	ZNFX1,ARFGEF2	ARFGEF2	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	11039	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	47750965	47751079	47750977	Y	ZNFX1	NA	NA	NA	NA	NA	STAU1	51825	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	47796581	47796870	47796726	Y	NA	STAU1,DDX27	NA	NA	NA	NA	STAU1	6034	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	48293445	48293839	48293746	Y	NA	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	34576	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	48327368	48328064	48327696	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	351	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	48598723	48598794	48598730	Y	B4GALT5,SLC9A8,TMEM189,CEBPB,RNF114,SNAI1	RNF114	NA	NA	NA	NA	RNF114	47775	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	48753681	48754062	48753956	Y	B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,PTPN1,CEBPB	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4	NA	NA	NA	NA	TMEM189-UBE2V1	14112	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	48841053	48841720	48841386	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	CEBPB,RP11-290F20.3	PTPN1,CEBPB,LOC284751,FAM65C,MIR645	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPB	35677	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr20	48868757	48869061	48868987	Y	NA	RP11-290F20.3	PTPN1,FAM65C,MIR645,CEBPB,LOC284751,PARD6B	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-290F20.3	12962	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	48902426	48902799	48902722	Y	CEBPB	RP11-290F20.3	LOC284751,PARD6B,PTPN1,FAM65C,MIR645,CEBPB	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-290F20.3	20403	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	48903106	48903611	48903352	Y	NA	RP11-290F20.3	LOC284751,PARD6B,PTPN1,FAM65C,MIR645,CEBPB	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-290F20.3	21083	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr20	48921857	48922230	48922089	Y	NA	RP11-290F20.3	NA	NA	NA	NA	RP11-290F20.3	39834	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr20	48924890	48925591	48925260	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	RP11-290F20.3	NA	NA	NA	NA	RP11-290F20.3	42867	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr20	48951795	48951969	48951898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-290F20.3	69772	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	48995783	48996016	48995938	Y	NA	NA	LOC284751,PTPN1,MIR645,CEBPB	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-290F20.3	113760	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr20	49032230	49032497	49032297	Y	NA	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	92394	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	49055532	49055924	49055757	Y	SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	68967	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr20	49057048	49057261	49057196	Y	SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	67630	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	49100027	49100544	49100221	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	24347	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr20	49134968	49135201	49135019	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	10077	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	49407275	49407470	49407371	Y	MOCS3	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	1961	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr20	49454379	49454475	49454388	Y	NA	BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	44948	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	49516325	49516426	49516399	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	29095	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	49524499	49524706	49524614	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	20815	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	49574418	49574471	49574465	Y	PTPN1,ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	MOCS3	1055	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	49838536	49838841	49838768	Y	NA	NA	KCNG1	IMR90	Hi-C	24141950	KCNG1	200870	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	49963208	49963745	49963374	Y	NFATC2	NA	KCNG1,ATP9A,NFATC2	IMR90	Hi-C	24141950	KCNG1	325542	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr20	49967560	49968079	49967777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNG1	329894	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	49982226	49982434	49982404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNG1	344560	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	50059094	50059263	50059179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	289809	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	50366772	50367203	50366881	Y	ZFP64,ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	15970	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr20	50383575	50384083	50383723	Y	ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	402	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	52201463	52201802	52201714	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	22644	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	52239995	52240318	52240062	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	15549	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr20	52380425	52380741	52380578	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	155979	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	52391089	52391563	52391364	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	166643	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr20	52444580	52444892	52444748	Y	NA	NA	ZNF217,SUMO1P1,BCAS1,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	220134	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr20	52445043	52445455	52445100	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	220597	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	52445816	52446339	52446069	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	221370	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	4.26816372317422
chr20	52516053	52516507	52516332	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	272005	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr20	52519942	52520105	52520009	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,ZNF217,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	268407	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	52532315	52532889	52532591	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	255623	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr20	52533564	52534521	52533763	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	253991	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	52543055	52543571	52543250	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	CYP24A1	244941	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr20	52934604	52934614	52934609	Y	DOK5	NA	PFDN4,DOK5	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PFDN4	112218	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	54729980	54730207	54730095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM210B	201764	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	56881907	56882420	56882011	Y	STX16,RAB22A	PPP4R1L,RAB22A	NA	NA	NA	NA	PPP4R1L	75	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	57032377	57032636	57032571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APCDD1L	55551	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	57198784	57199334	57199089	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16	24994	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr20	57270107	57270808	57270490	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1	NA	NA	NA	NA	NPEPL1	7920	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	58451421	58451787	58451564	Y	SYCP2,PPP1R3D,C20orf177,C20orf177	NA	NA	NA	NA	NA	SYCP2	54923	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	59325352	59325574	59325428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1043L13.1	664457	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	4.80168418857099
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	60875997	60876347	60876165	Y	GATA5,CABLES2	ADRM1	NA	NA	NA	NA	ADRM1	848	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	60924549	60924827	60924688	Y	TAF4,SS18L1,SLCO4A1,C20orf151,LAMA5	ADRM1,LAMA5,RPS21	NA	NA	NA	NA	LAMA5	15541	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	60956743	60957219	60956871	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	RPS21	2953	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	61192605	61193059	61192901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO4A1	78738	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	61200879	61201219	61201079	Y	NA	NA	RPS21,C20orf151,CABLES2,C20orf166,C20orf166-AS1,NTSR1,COL9A3,OGFR,C20orf20	IMR90	Hi-C	24141950	SLCO4A1	70578	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr20	61267975	61268016	61267996	Y	NA	SLCO4A1	NA	NA	NA	NA	SLCO4A1	3781	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	61283206	61283870	61283565	Y	OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1	SLCO4A1	NA	NA	NA	NA	SLCO4A1	11409	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	61425509	61425950	61425706	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	OGFR	NA	NA	NA	NA	OGFR	8237	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	61506279	61506510	61506352	Y	BHLHE23,TCFL5,DIDO1,C20orf11	TCFL5	TCFL5	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TCFL5	15164	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	61553883	61554120	61553955	Y	DIDO1	DIDO1,SLC17A9	NA	NA	NA	NA	DIDO1	13184	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	61585554	61585775	61585703	Y	SLC17A9	DIDO1,SLC17A9	NA	NA	NA	NA	SLC17A9	3502	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr20	61764397	61764626	61764512	Y	NA	NA	LOC63930,NKAIN4,BIRC7,HAR1B,HAR1A	IMR90	Hi-C	24141950	YTHDF1	80960	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	62313782	62314225	62314041	Y	NA	STMN3,RTEL1,ZGPAT,ARFRP1	NA	NA	NA	NA	ZGPAT	22592	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.66760232698389
chr20	62709200	62709458	62709264	Y	GMEB2,ZGPAT,LIME1,PCMTD2,RGS19,RGS19,OPRL1	ZNF512B,TCEA2	NA	NA	NA	NA	TCEA2	30011	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	62820558	62820833	62820696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	64261	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr21	11063933	11064260	11064086	Y	NA	BAGE2	NA	NA	NA	NA	BAGE2	32720	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	11122554	11122900	11122727	Y	NA	BAGE2	BAGE5	IMR90	Hi-C	24141950	BAGE2	25574	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	15449757	15449894	15449826	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM11	136557	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	16129964	16130277	16130229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AF127936.7	122019	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	16354668	16355055	16354876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRIP1	80266	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	17276028	17276063	17276046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00478	164779	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	17656088	17656430	17656111	Y	NA	SNORD74	NA	NA	NA	NA	SNORD74	999	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	17660204	17660286	17660245	Y	NA	SNORD74	NA	NA	NA	NA	SNORD74	5115	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	17745935	17746301	17746052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	90846	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	17906909	17907886	17907248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	251820	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	17924273	17924626	17924451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	269184	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	23538013	23538045	23538029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBAP	1241403	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	23855769	23855794	23855782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBAP	923654	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	26771629	26771778	26771704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR155HG	160443	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	26800874	26801226	26801090	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR155HG	130995	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	28218728	28219247	28219071	Y	ADAMTS5,ADAMTS1	ADAMTS1	NA	NA	NA	NA	ADAMTS1	3000	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr21	28336800	28337144	28336952	Y	ADAMTS1,ADAMTS5	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS5	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr21	28343155	28343488	28343281	Y	NA	ADAMTS5	NA	NA	NA	NA	ADAMTS5	6323	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	28942556	28942990	28942803	Y	NA	NA	ADAMTS1,ADAMTS5,MIR4759	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS5	605724	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	28943005	28943182	28943085	Y	NA	NA	ADAMTS1,ADAMTS5,MIR4759	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS5	606173	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	29814932	29815277	29815168	Y	NA	NA	ADAMTS1	IMR90	Hi-C	24141950	AF131217.1	229893	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	30006167	30006692	30006407	Y	NA	AF131217.1	ADAMTS1,LINC00161	IMR90	Hi-C	24141950	AF131217.1	38478	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr21	30009367	30009732	30009551	Y	NA	AF131217.1	ADAMTS1,LINC00161	IMR90	Hi-C	24141950	AF131217.1	35438	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.66760232698389
chr21	30567933	30569654	30568878	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	3541	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	30758449	30758782	30758692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	194057	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	30967382	30967686	30967533	Y	GRIK1	NA	NA	NA	NA	NA	GRIK1	342665	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	31248571	31248641	31248639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRIK1	61710	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr21	33853478	33853730	33853567	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf119	90039	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	36074753	36075133	36074820	Y	KCNE2	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	89312	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	36207924	36208159	36208081	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	222483	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	36208387	36209191	36208566	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	222946	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr21	36214787	36216208	36215152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	229346	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	36220332	36220721	36220527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	234891	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr21	36254204	36254725	36254297	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	268763	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr21	36263020	36263336	36263172	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	277579	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr21	36423642	36423856	36423739	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	438201	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	36577614	36577815	36577724	Y	NA	NA	RUNX1,SETD4,CLIC6,LOC100506385	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RCAN1	592173	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr21	36936186	36936505	36936342	Y	NA	NA	RUNX1,LOC100506385	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX1	438460	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr21	36937518	36937720	36937706	Y	NA	NA	RUNX1,LOC100506385	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX1	437245	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr21	37009808	37010026	37009922	Y	NA	NA	RUNX1,CLIC6,LINC00160,LOC100506385	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX1	364939	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr21	37485408	37485566	37485491	Y	NA	CBR1,SETD4,AP000688.29,CBR3,DOPEY2	NA	NA	NA	NA	AP000688.29	10229	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	37712607	37712952	37712729	Y	NA	MORC3,CHAF1B	NA	NA	NA	NA	MORC3	22120	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr21	38232574	38232719	38232637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	104093	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	38623241	38623485	38623453	Y	NA	AP001432.14,DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	14777	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.31192201671937
chr21	38936686	38937128	38936852	Y	DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	200594	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr21	39543838	39544086	39544003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ6	257089	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr21	39568176	39568479	39568328	Y	NA	NA	KCNJ6	IMR90	Hi-C	24141950	KCNJ6	281427	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	39593313	39593902	39593631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ6	306564	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr21	39616792	39617335	39616969	Y	KCNJ15	NA	KCNJ6,KCNJ15,DSCR10	IMR90	Hi-C	24141950	KCNJ6	330043	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr21	39635387	39635785	39635510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ6	348638	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr21	39638764	39638897	39638765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ6	352015	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr21	39675119	39675662	39675396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ6	388370	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	39678263	39678712	39678528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ6	391514	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	39678794	39679150	39678924	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ6	392045	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	39696232	39696607	39696353	Y	NA	NA	KCNJ6,DSCR10,KCNJ15,DSCR8	IMR90	Hi-C	24141950	KCNJ6	409483	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr21	39700000	39700188	39700119	Y	NA	NA	KCNJ15,DSCR8	IMR90	Hi-C	24141950	KCNJ6	413251	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	39715625	39715930	39715831	Y	ERG	NA	KCNJ15,KCNJ6,DSCR8	IMR90	Hi-C	24141950	KCNJ6	428876	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	39723755	39724311	39724014	Y	ETS2	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ6	437006	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr21	40182920	40183779	40183392	Y	ETS2	ETS2	NA	NA	NA	NA	ETS2	7689	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr21	40216170	40216521	40216290	Y	NA	ETS2	NA	NA	NA	NA	ETS2	40939	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	40331056	40331378	40331206	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114,PSMG1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS2	155825	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	40357559	40358114	40357780	Y	ETS2	NA	ETS2,WRB,LINC00114	IMR90,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	ETS2	182328	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	40361689	40362112	40361935	Y	NA	NA	ETS2,WRB,LINC00114	IMR90,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	ETS2	186458	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	40376938	40377126	40376993	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	176651	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	41146916	41147071	41146994	Y	LCA5L	NA	NA	NA	NA	NA	PCP4	90172	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	43460613	43461088	43460825	Y	C2CD2,SLC37A1	NA	NA	NA	NA	NA	C2CD2	88614	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr21	43518001	43518239	43518148	Y	ZNF295,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1	NA	NA	NA	NA	NA	C2CD2	146002	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	43653155	43654253	43653819	Y	NA	NA	TFF3	IMR90	Hi-C	24141950	SLC37A1	259865	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	43860192	43860442	43860317	Y	UMODL1,UBASH3A	NA	NA	NA	NA	NA	SLC37A1	53676	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	44614192	44614410	44614235	Y	NA	NA	HSF2BP,LINC00313,SIK1	IMR90	Hi-C	24141950	U2AF1	88495	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	44918002	44918401	44918083	Y	NA	NA	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	72994	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	45080522	45080871	45080626	Y	TRAPPC10,PWP2,SIK1,RRP1B	HSF2BP,RRP1B	NA	NA	NA	NA	RRP1B	3093	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	45187861	45188442	45188176	Y	ICOSLG,PDXK,CSTB	CSTB,RRP1	NA	NA	NA	NA	CSTB	5884	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr21	45557942	45558217	45558021	Y	AGPAT3,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG,C21orf2	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	6455	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	46097395	46097576	46097539	Y	KRTAP10-7,KRTAP10-12	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2G2	122358	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	46298625	46298957	46298811	Y	ITGB2	PTTG1IP	PTTG1IP	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTTG1IP	6873	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	46654979	46655032	46655006	Y	NA	NA	POFUT2	IMR90	Hi-C	24141950	POFUT2	50781	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	46783934	46784395	46784118	Y	NA	COL18A1	ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COL18A1	38657	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr21	46859041	46859207	46859093	Y	NA	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	35989	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr21	47266684	47266899	47266840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL6A1	132752	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	47369296	47369698	47369623	Y	NA	COL6A1	NA	NA	NA	NA	COL6A1	29953	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	47394030	47394545	47394409	Y	LSS,COL6A2,C21orf56,COL6A1	COL6A1	COL6A1	K562	ChIA-PET	22265404	COL6A1	5106	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr21	47395087	47395227	47395108	Y	COL6A2,COL6A1	COL6A1	COL6A1	K562	ChIA-PET	22265404	COL6A1	4424	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr21	47411286	47411466	47411356	Y	NA	COL6A1	NA	NA	NA	NA	COL6A1	11635	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	47442529	47442669	47442610	Y	NA	COL6A1	NA	NA	NA	NA	COL6A1	42878	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr21	47469357	47469652	47469491	Y	COL6A1,COL6A2	COL6A2	COL6A2,FTCD,PCBP3,COL6A1,LSS,MCM3AP-AS1,C21orf56	IMR90	Hi-C	24141950	COL6A2	46359	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr21	47480637	47481027	47480832	Y	COL6A1,COL6A2	COL6A2	COL6A2,FTCD,C21orf56,MCM3AP-AS1,MCM3AP,COL6A1,LSS	IMR90	Hi-C	24141950	COL6A2	34984	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr21	47498553	47498697	47498654	Y	COL6A1,COL6A2	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	17314	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr21	47499343	47499535	47499461	Y	COL6A1,COL6A2	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	16476	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr21	47512247	47512670	47512489	Y	COL6A1,COL6A2	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	3341	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr21	47524636	47524785	47524711	Y	NA	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	8625	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr21	47543656	47544056	47543951	Y	NA	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	27645	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr21	47554885	47555152	47555043	Y	FTCD	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	38874	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr21	47563985	47564239	47564071	Y	NA	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	47974	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr21	47993556	47993894	47993723	Y	DIP2A,S100B,PRMT2	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT2	59185	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	17306294	17306463	17306397	Y	IL17RA,CECR1	NA	NA	NA	NA	NA	IL17RA	257381	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr22	17652206	17652871	17652785	Y	NA	CECR5-AS1,CECR5,AC005300.5	NA	NA	NA	NA	CECR5	8029	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr22	18506386	18506784	18506419	Y	MICAL3	MICAL3	NA	NA	NA	NA	MICAL3	1061	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	3.0232826372484
chr22	19564748	19565059	19564792	Y	CLDN5	NA	HIRA,CLDN5,LOC150185,CLTCL1,UFD1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC45	99766	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	20068627	20068902	20068750	Y	COMT,DGCR8	DGCR8,RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8	NA	NA	NA	NA	DGCR8	2872	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr22	20199029	20199266	20199148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC8	84050	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	20772547	20772776	20772578	Y	PI4KA	ZNF74,SCARF2	NA	NA	NA	NA	SCARF2	17370	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	20863506	20864089	20863850	Y	MED15	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	15306	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	22010846	22011267	22010978	Y	YPEL1	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	6287	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	23413714	23413937	23413833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB36	71576	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	24153288	24153648	24153392	Y	RGL4,LOC391322	MMP11,CHCHD10,SMARCB1,DERL3,SLC2A11	DERL3	IMR90	Hi-C	24141950	DERL3	25667	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	24255997	24256450	24256302	Y	C22orf43,CABIN1,CABIN1	MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	21806	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr22	27041081	27041748	27041447	Y	SEZ6L,ASPHD2	MIAT,CTA-211A9.5	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	MIAT	689	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	28314180	28314595	28314448	Y	PITPNB	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	PITPNB	58	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	28475489	28475734	28475658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNB	161367	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	28956104	28956479	28956470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	179540	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	29467563	29467858	29467701	Y	NA	KREMEN1	NA	NA	NA	NA	KREMEN1	497	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	29469912	29470391	29470070	Y	XBP1,KREMEN1	KREMEN1	NA	NA	NA	NA	KREMEN1	2846	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr22	29471077	29471334	29471238	Y	KREMEN1	KREMEN1	NA	NA	NA	NA	KREMEN1	4011	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr22	30440424	30440670	30440589	Y	MTMR3,OSM,CCDC157	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR3	163280	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	30591785	30593544	30592394	Y	NA	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	47296	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr22	30601535	30602099	30601994	Y	MTMR3,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF	LIF	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	38741	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr22	30604572	30605275	30604996	Y	NA	LIF	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIF	35565	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr22	30613698	30614158	30613948	Y	NA	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	26682	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	30644816	30645407	30645321	Y	NA	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	3976	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr22	30651841	30652045	30651989	Y	RNF215	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	11001	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr22	30708168	30708313	30708241	Y	MTMR3,TBC1D10A,CCDC157	GATSL3,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1	NA	NA	NA	NA	TBC1D10A	12722	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	31030399	31030736	31030505	Y	SMTN,OSM,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1,DUSP18,SLC35E4	TCN2,PES1,SLC35E4,DUSP18	NA	NA	NA	NA	SLC35E4	760	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	31226011	31226350	31226247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUG1	138313	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr22	31298089	31298190	31298144	Y	NA	NA	MORC2,MORC2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	TUG1	66473	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	32313330	32313725	32313463	Y	NA	YWHAH	NA	NA	NA	NA	YWHAH	24722	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr22	32614060	32614086	32614078	Y	DEPDC5,SLC5A1,SLC5A4	NA	NA	NA	NA	NA	SC22CB-1E7.1	180583	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	32819656	32819735	32819695	Y	RFPL3,TIMP3	FBXO7	NA	NA	NA	NA	FBXO7	48928	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	33240240	33240586	33240349	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	44553	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	34249918	34249944	34249938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMP3	1054231	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	34317541	34317731	34317667	Y	LARGE	NA	NA	NA	NA	NA	TIMP3	1121854	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	35708559	35708961	35708654	Y	APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1	TOM1	NA	NA	NA	NA	TOM1	15291	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	35767811	35768194	35767985	Y	APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1	HMOX1,MCM5	NA	NA	NA	NA	HMOX1	6160	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr22	35842495	35842590	35842543	Y	NA	MCM5	NA	NA	NA	NA	MCM5	48439	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr22	36172767	36172943	36172931	Y	MB,MB,RBFOX2,RBFOX2	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	APOL6	130325	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	36299462	36299943	36299718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	122530	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr22	36325608	36325959	36325784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	96514	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	36750973	36751374	36751265	Y	APOL3	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	30689	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr22	37445416	37445556	37445486	Y	NA	MPST,TST,KCTD17	NA	NA	NA	NA	KCTD17	223	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	37490501	37490532	37490517	Y	NA	KCTD17	NA	NA	NA	NA	KCTD17	44722	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr22	37667327	37667623	37667420	Y	SH3BP1,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4	RAC2	CARD10,C1QTNF6,SSTR3,RAC2,CYTH4,ELFN2,MFNG,CDC42EP1,LGALS2	IMR90	Hi-C	24141950	RAC2	28839	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr22	37714418	37714696	37714539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAC2	75930	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	38142899	38142964	38142949	Y	CDC42EP1,LGALS1,TRIOBP,POLR2F,GCAT,ANKRD54	NA	NA	NA	NA	NA	TRIOBP	51888	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	38143248	38143734	38143618	Y	LGALS1,TRIOBP,POLR2F	NA	NA	NA	NA	NA	TRIOBP	52237	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr22	38599886	38600218	38600032	Y	NA	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	189	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr22	38653163	38653507	38653358	Y	NA	TMEM184B	MAFF	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM184B	13533	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	39541576	39542088	39541730	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7	CBX7	NA	NA	NA	NA	CBX7	4591	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	39890901	39891082	39890968	Y	ATF4	ATF4,RPS19BP1	SMCR7L	IMR90	Hi-C	24141950	ATF4	22618	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr22	40589903	40590338	40589971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P52	88833	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	40781478	40781596	40781515	Y	NA	ADSL,SGSM3	NA	NA	NA	NA	SGSM3	16883	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	40958851	40958976	40958969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL1	71730	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	40982487	40982801	40982645	Y	NA	MKL1	NA	NA	NA	NA	MKL1	47905	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	41047729	41047883	41047796	Y	NA	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17023	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr22	41048065	41048352	41048232	Y	EP300,MKL1	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17359	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr22	41079087	41079368	41079234	Y	MCHR1	MKL1,GAPDHP37	NA	NA	NA	NA	GAPDHP37	10632	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	41417973	41418366	41418067	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39690	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	41460471	41460696	41460583	Y	NA	RP11-12M9.3,RP11-12M9.4,EP300	RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-12M9.3	2415	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	41776948	41777130	41776981	Y	NA	TEF	NA	NA	NA	NA	TEF	15611	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.95624170645485
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr22	41844337	41844774	41844650	Y	SHISA8,TEF,TEF,TOB2	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	3310	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	42062739	42062953	42062873	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19990	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr22	42063539	42063782	42063553	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19161	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr22	42331053	42331125	42331089	Y	SHISA8	CENPM	NA	NA	NA	NA	CENPM	10043	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr22	42339043	42339310	42339264	Y	NA	CENPM	NA	NA	NA	NA	CENPM	1858	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	43076677	43076928	43076817	Y	NFAM1,ARFGAP3	CYB5R3,A4GALT	NA	NA	NA	NA	CYB5R3	33103	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	43100819	43101017	43100994	Y	NA	A4GALT	NA	NA	NA	NA	A4GALT	14287	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	43178512	43178746	43178699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	A4GALT	63208	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	43233624	43233705	43233665	Y	NA	ARFGAP3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP3	18407	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	44759236	44759683	44759589	Y	NA	NA	KIAA1644,PARVB,LINC00207,SAMM50,LINC00229	IMR90	Hi-C	24141950	LDOC1L	132495	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr22	44947082	44947372	44947286	Y	PARVG,PARVG	NA	PARVB,KIAA1644,SAMM50,LINC00229	IMR90	Hi-C	24141950	LDOC1L	54904	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	45543738	45543876	45543815	Y	PHF21B,NUP50,NUP50	NUP50	NA	NA	NA	NA	NUP50	13846	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	45850302	45850453	45850378	Y	FBLN1	RIBC2,FBLN1	NA	NA	NA	NA	RIBC2	42730	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	45899980	45900171	45900075	Y	NA	FBLN1	NA	NA	NA	NA	FBLN1	3862	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	45944996	45945587	45945178	Y	NA	FBLN1	NA	NA	NA	NA	FBLN1	48878	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr22	46008367	46008678	46008581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN10	57000	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr22	46041491	46041960	46041628	Y	NA	ATXN10	ATXN10,WNT7B,FAM118A,SMC1B,FBLN1,LOC730668,LOC100271722,MIRLET7BHG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATXN10	23718	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	46392166	46392677	46392532	Y	C22orf26	NA	C22orf40,PKDREJ,ATXN10,GTSE1,CN5H6.4,TRMU	IMR90	Hi-C	24141950	RP6-109B7.3	54908	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr22	46423205	46423605	46423251	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	23980	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr22	46464940	46465203	46464976	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	1169	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr22	46467914	46468476	46468052	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	4143	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr22	46472616	46472825	46472697	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	8845	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr22	46474643	46475112	46474791	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	10872	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr22	46480881	46481264	46481017	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	17110	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr22	46495432	46495673	46495573	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B,PPARA	NA	NA	NA	NA	MIR4763	11773	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	46516040	46516252	46516108	Y	NA	MIR4763,MIRLET7B,PPARA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7B	8474	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr22	46944783	46944886	46944827	Y	NA	GRAMD4	NA	NA	NA	NA	GRAMD4	25023	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	46957537	46957704	46957620	Y	NA	GRAMD4	TRMU,CELSR1,GRAMD4	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	12205	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr22	47150443	47150659	47150583	Y	CERK,TBC1D22A	CERK,TBC1D22A	CERK	MCF7	ChIA-PET	22265404	TBC1D22A	5859	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr22	49009124	49009326	49009225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C22orf34	1039864	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	49768624	49768992	49768711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C22orf34	280198	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	50262824	50262951	50262946	Y	TUBGCP6,MLC1	BRD1,ZBED4,CRELD2,ALG12	NA	NA	NA	NA	ZBED4	17334	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	50329443	50330313	50330025	Y	TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	19337	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	50364350	50364715	50364589	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12189	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr22	50449135	50449422	50449263	Y	TUBGCP6,HDAC10,PIM3	NA	NA	NA	NA	NA	MOV10L1	76886	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK11,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	50784754	50785397	50785059	Y	PPP6R2	PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PPP6R2	5021	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr22	50977955	50978429	50978214	Y	PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B	LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,CTA-384D8.31,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	CTA-384D8.31	4415	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr22	51026472	51026838	51026655	Y	MOV10L1,FAM116B,RABL2B,MAPK8IP2,MAPK8IP2	CTA-384D8.31,CHKB-CPT1B,CHKB,ARSA	NA	NA	NA	NA	CHKB-CPT1B	7078	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	3177157	3177268	3177188	Y	CRBN	TRNT1,CRBN	NA	NA	NA	NA	TRNT1	10557	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	3202241	3202572	3202332	Y	NA	TRNT1,CRBN	NA	NA	NA	NA	CRBN	16822	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	4462883	4463183	4463026	Y	NA	SUMF1	NA	NA	NA	NA	SUMF1	43782	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	4571700	4571916	4571754	Y	BHLHE40,ITPR1	ITPR1-AS1,ITPR1	NA	NA	NA	NA	ITPR1	38668	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	4871506	4871670	4871602	Y	ITPR1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	147131	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	5036570	5037120	5036867	Y	NA	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	16924	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	5063521	5063694	5063575	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	43875	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	5067974	5068590	5068209	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	48328	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	8500443	8500771	8500604	Y	NA	LMCD1	NA	NA	NA	NA	LMCD1	40622	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	9050336	9050687	9050476	Y	NA	RAD18	NA	NA	NA	NA	RAD18	46879	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr3	9452001	9452408	9452073	Y	MTMR14,SETD5	THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5-AS1	13738	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	10233695	10234220	10233931	Y	VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	29146	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	10238203	10238635	10238546	Y	ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2,TATDN2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	33654	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	10240691	10241307	10240999	Y	ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2,TATDN2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	36142	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	10402355	10402452	10402401	Y	FANCD2	SEC13	NA	NA	NA	NA	SEC13	41493	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	11197111	11197379	11197271	Y	VGLL4,SLC6A11,SLC6A1,HRH1	HRH1	NA	NA	NA	NA	HRH1	20332	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	11237617	11237805	11237677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRH1	60838	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	11279893	11280094	11280011	Y	NA	ATG7	NA	NA	NA	NA	ATG7	31901	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	11591830	11592141	11591986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	168079	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	11609664	11609798	11609746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	150422	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr3	11612359	11612503	11612424	Y	HRH1,ATG7	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	147717	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	12131259	12131529	12131269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPARG	195338	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	13035460	13035932	13035883	Y	CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	76685	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr3	14257734	14258042	14257871	Y	NA	LSM3,XPC	NA	NA	NA	NA	XPC	39451	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	15677848	15678314	15678139	Y	ANKRD28,SH3BP5,SH3BP5,EAF1	BTD,HACL1	NA	NA	NA	NA	HACL1	36510	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr3	15704167	15704382	15704274	Y	ANKRD28,CAPN7	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	62829	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	15813744	15814005	15813933	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,ANKRD28	NA	BTD	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD28	85273	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	15847096	15847637	15847448	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD28	51641	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	16024262	16024670	16024542	Y	NA	NA	ANKRD28,GALNTL2,MIR563	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD28	124984	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	16101834	16102183	16102049	Y	NA	NA	GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28	IMR90	Hi-C	24141950	DPH3	202296	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	16218160	16218375	16218215	Y	GALNTL2	NA	NA	NA	NA	NA	DPH3	86104	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	16238433	16238798	16238616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPH3	65681	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	16280641	16280873	16280792	Y	NA	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	DPH3	23606	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr3	16281854	16282110	16281982	Y	NA	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	DPH3	22369	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	16324333	16324353	16324342	Y	NA	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	19627	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	16373323	16373612	16373405	Y	ANKRD28,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	68617	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	16552919	16553213	16553144	Y	NA	RFTN1	NA	NA	NA	NA	RFTN1	320	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	17229616	17229788	17229702	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	387457	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	17404652	17404912	17404782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	562493	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	17506581	17506846	17506713	Y	TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	664422	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	17543312	17543623	17543461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	701153	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	17622451	17622654	17622556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	780292	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	17913596	17913897	17913750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	570412	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	18140643	18140862	18140682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	343447	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SATB1	95162	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	20096123	20096547	20096288	Y	RAB5A	KAT2B	NA	NA	NA	NA	KAT2B	16608	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	20190984	20191185	20191115	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	34599	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	20205868	20206079	20206039	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	19705	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	21722785	21723001	21722895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF385D	689811	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr3	21755607	21755966	21755787	Y	ZNF385D	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF385D	656846	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	23935594	23935945	23935770	Y	NA	RPL15,NR1D2	NA	NA	NA	NA	RPL15	20091	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	25790563	25790933	25790768	Y	NA	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	31475	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	25796078	25796406	25796226	Y	NGLY1	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	26002	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	27524458	27524952	27524717	Y	NA	SLC4A7,RNU1-96P	NA	NA	NA	NA	SLC4A7	547	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	4.80168418857099
chr3	27984483	27984771	27984759	Y	ZCWPW2,EOMES	NA	NA	NA	NA	NA	CMC1	296304	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	28534381	28534544	28534465	Y	ZCWPW2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCWPW2	145744	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	29365730	29366225	29365913	Y	NA	RBMS3	NA	NA	NA	NA	RBMS3	45257	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr3	29496223	29496522	29496266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	175750	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	29568670	29568984	29568828	Y	RBMS3	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	248197	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	29983920	29984245	29984164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR2	661749	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	30204273	30204295	30204284	Y	NA	NA	TGFBR2,GADL1	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBR2	441699	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	30383908	30384096	30384004	Y	TGFBR2	NA	TGFBR2,GADL1	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBR2	261898	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	30586274	30586622	30586478	Y	TGFBR2	NA	TGFBR2,RBMS3	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBR2	59372	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	30794572	30794739	30794667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADL1	139518	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	31967720	31967825	31967773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF860	53438	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	32506024	32506133	32506068	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	36767	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	32549205	32549429	32549313	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	6305	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	32823053	32823413	32823146	Y	NA	AC139452.2	NA	NA	NA	NA	AC139452.2	1725	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	33060795	33061128	33060939	Y	CCR4	SEC13P1	NA	NA	NA	NA	SEC13P1	12227	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	34546800	34546816	34546806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD6IP	708956	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	36999426	36999810	36999630	Y	LRRFIP2,MLH1,MLH1,EPM2AIP1	EPM2AIP1,MLH1	EPM2AIP1,MLH1	K562	ChIA-PET	22265404	EPM2AIP1	32985	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	37221290	37221535	37221382	Y	NA	LRRFIP2	LRRFIP2	IMR90	Hi-C	24141950	LRRFIP2	1645	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	37901883	37902306	37902042	Y	CTDSPL	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	432	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	38209266	38209592	38209336	Y	VILL,PLCD1,SLC22A14,ACAA1,MYD88,OXSR1	ACAA1,MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	4686	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	38227489	38227608	38227524	Y	NA	MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	22909	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	38568637	38569221	38568871	Y	SCN10A,SCN11A,SLC22A14,EXOG	EXOG	NA	NA	NA	NA	EXOG	33019	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	39193999	39194528	39194467	Y	NA	TTC21A,GORASP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	39399859	39400185	39399921	Y	CCR8,SLC25A38	SLC25A38,RPSA	NA	NA	NA	NA	SLC25A38	22654	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	42062353	42062651	42062504	Y	NA	TRAK1	TRAK1,ULK4	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	9059	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	42237448	42237989	42237678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAK1	184154	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	42922564	42922793	42922612	Y	C3orf39	NA	NA	NA	NA	NA	HIGD1A	78541	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	43437259	43437582	43437422	Y	ZNF662,ZNF662,FAM198A	NA	NA	NA	NA	NA	SNRK	111255	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	43913925	43914045	43914001	Y	ANO10	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	ANO10	182839	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	44036592	44036799	44036686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANO10	305506	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	44038399	44038801	44038781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANO10	307313	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	44040259	44040834	44040651	Y	NA	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	ANO10	309173	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	8.71416760148069
chr3	44925504	44925895	44925674	Y	NA	TMEM42,MIR564	NA	NA	NA	NA	MIR564	24124	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	45085220	45085486	45085391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC3	69543	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	45106273	45106458	45106405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC3	90596	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	45142532	45142787	45142664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS24P8	56880	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	45146738	45147081	45147019	Y	TMEM158,CDCP1	NA	NA	NA	NA	NA	RPS24P8	52586	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	45147419	45147607	45147508	Y	TMEM158,CDCP1	NA	NA	NA	NA	NA	RPS24P8	52060	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	45164613	45164770	45164669	Y	NA	RPS24P8	NA	NA	NA	NA	RPS24P8	34897	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	45165344	45165812	45165623	Y	NA	RPS24P8	NA	NA	NA	NA	RPS24P8	33855	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr3	45165992	45166137	45166089	Y	NA	RPS24P8	NA	NA	NA	NA	RPS24P8	33530	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr3	45208648	45208845	45208728	Y	LIMD1	RPS24P8	LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS24P8	8981	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	46139244	46140413	46139465	Y	CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1	NA	CXCR6,FYCO1,CCR5,SACM1L,SLC6A20,CCR1,CCR3,CCRL2	IMR90	Hi-C	24141950	FYCO1	103928	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	46600040	46600219	46600077	Y	NA	LRRC2	NA	NA	NA	NA	LRRC2	19370	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	46989533	46989702	46989634	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	29471	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	46990572	46990937	46990863	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	28236	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	47421570	47421869	47421711	Y	NA	PTPN23	NA	NA	NA	NA	PTPN23	1069	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	47704557	47705253	47705047	Y	SETD2	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCC1	116343	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	47898226	47898293	47898260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX30	55827	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr3	48407940	48408314	48408284	Y	TREX1	NA	CCDC51,PLXNB1,ATRIP,CCDC72	IMR90	Hi-C	24141950	NME6	66765	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	48967045	48967316	48967140	Y	NA	SLC25A20,ARIH2	NA	NA	NA	NA	ARIH2	12791	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	49123301	49123671	49123633	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2	NA	NA	NA	NA	QRICH1	6125	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	50264852	50265230	50265012	Y	TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2	GNAI2,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	3128	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	50664800	50665228	50664999	Y	GNAI2,MAPKAPK3	MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	CISH	17538	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	51377903	51378233	51378113	Y	NA	MANF,RBM15B	NA	NA	NA	NA	MANF	42245	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr3	51506153	51506528	51506417	Y	VPRBP,RAD54L2,GPR62	VPRBP	NA	NA	NA	NA	VPRBP	25482	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	51728520	51728585	51728552	Y	NA	TEX264	NA	NA	NA	NA	TEX264	33811	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	52080287	52080923	52080751	Y	NT5DC2,TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	7643	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	52091161	52091675	52091445	Y	TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	2595	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	52287340	52287625	52287477	Y	PBRM1,NISCH,WDR82,GLYCTK,PPM1M,PPM1M	RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82	NA	NA	NA	NA	PPM1M	9499	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	52334165	52334539	52334405	Y	NA	GLYCTK,WDR82	NA	NA	NA	NA	WDR82	14129	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	52625235	52625395	52625315	Y	DNAH1,PBRM1	NA	NA	NA	NA	NA	NT5DC2	58165	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	52704686	52705129	52704984	Y	WDR82,GLYCTK,TMEM110,PRKCD,PBRM1	GNL3,PBRM1,SPCS1,GLT8D1	NA	NA	NA	NA	GNL3	8043	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	53024364	53024471	53024418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT1	54295	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	53136597	53136930	53136874	Y	PBRM1,PBRM1,TMEM110,DCP1A,PRKCD	RFT1	NA	NA	NA	NA	RFT1	25548	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	54916561	54916754	54916658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15P5	258319	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	55178043	55178603	55178498	Y	NA	NA	WNT5A,CACNA2D3	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	343370	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr3	55194265	55194440	55194343	Y	WNT5A	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	327533	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	55194450	55194988	55194909	Y	WNT5A	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	326985	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	55201679	55201928	55201859	Y	WNT5A	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2,LRTM1,C3orf51	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	320045	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	55364571	55364745	55364625	Y	NA	NA	CACNA2D3,WNT5A,ERC2,C3orf51	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	157228	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	55401949	55401987	55401976	Y	NA	NA	CACNA2D3	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	119986	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	55511418	55511654	55511489	Y	WNT5A	WNT5A	NA	NA	NA	NA	WNT5A	10319	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	56154046	56154390	56154129	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC66	434799	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	56159334	56159686	56159623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC66	429503	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	56443112	56443203	56443174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC66	145986	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	57562103	57562255	57562188	Y	SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	19692	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr3	57566206	57566518	57566262	Y	NA	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	15429	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	57572232	57572342	57572306	Y	NA	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	9605	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	57945627	57945950	57945779	Y	PDE12	FLNB	FLNB,ARF4	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	46177	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	58163548	58163776	58163593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD6	57457	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	58411955	58412199	58412053	Y	NA	PDHB	NA	NA	NA	NA	PDHB	5385	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	58469083	58469272	58469182	Y	NA	KCTD6	NA	NA	NA	NA	KCTD6	6569	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	58570984	58571306	58571233	Y	PXK,FAM107A	ACOX2,FAM107A	NA	NA	NA	NA	FAM107A	40031	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	58984210	58984527	58984399	Y	NA	C3orf67	NA	NA	NA	NA	C3orf67	49283	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	59794681	59795022	59794839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	760871	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	60067500	60067675	60067588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	1033690	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	60654100	60654144	60654124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	580989	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	60715683	60716344	60716091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	518789	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	61548977	61549431	61549203	Y	NA	PTPRG	NA	NA	NA	NA	PTPRG	3734	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	61579072	61579152	61579112	Y	PTPRG	PTPRG	NA	NA	NA	NA	PTPRG	33829	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	62572991	62573174	62573036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRG-AS1	219986	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr3	62573493	62573782	62573553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRG-AS1	220488	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	62590103	62590230	62590174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRG-AS1	237098	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	63848274	63848561	63848418	Y	NA	THOC7	NA	NA	NA	NA	THOC7	695	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	64251870	64252260	64252194	Y	NA	NA	PRICKLE2,LOC100652759	IMR90	Hi-C	24141950	PRICKLE2	176892	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	65260004	65260375	65260190	Y	NA	NA	ADAMTS9-AS2	IMR90	Hi-C	24141950	MAGI1	762134	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	65694421	65694810	65694689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	327699	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	65744738	65744801	65744770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	277708	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr3	66279224	66279373	66279285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A26	161939	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	66491612	66491762	66491706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG1	57925	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	66543351	66543557	66543448	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	6130	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	67050514	67050733	67050633	Y	KBTBD8	KBTBD8	NA	NA	NA	NA	KBTBD8	3787	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	67711705	67712002	67711881	Y	NA	SUCLG2,RP11-81N13.1	NA	NA	NA	NA	RP11-81N13.1	8584	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	69790676	69790712	69790690	Y	MITF	MITF	NA	NA	NA	NA	MITF	4090	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	69853911	69854091	69854013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITF	67325	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	70820701	70820757	70820729	Y	NA	NA	FOXP1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXP1	810383	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	70881667	70881911	70881828	Y	NA	NA	FOXP1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXP1	749229	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	71136796	71137147	71137136	Y	FOXP1	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	493993	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	71150221	71150629	71150383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	480511	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	71153323	71153512	71153422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	477628	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	71158778	71158960	71158907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	472180	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr3	71222111	71222440	71222307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	408700	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	71298409	71298581	71298470	Y	EIF4E3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	332559	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	71439009	71439199	71439166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	191941	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	71464859	71465257	71465038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	165883	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	71493467	71493739	71493621	Y	EIF4E3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	137401	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	71553174	71553740	71553492	Y	EIF4E3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	77400	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	71564915	71565059	71565002	Y	PROK2,GPR27,FOXP1,EIF4E3,EIF4E3,EIF4E3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	66081	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	71628829	71629563	71629383	Y	EIF4E3	FOXP1	NA	NA	NA	NA	FOXP1	1577	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	72038378	72038636	72038504	Y	RYBP,EIF4E3	NA	SHQ1,LOC201617,RYBP	IMR90	Hi-C	24141950	EIF4E3	236454	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	72048209	72048563	72048384	Y	RYBP	NA	SHQ1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00877	241153	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	72532064	72532489	72532159	Y	RYBP	RYBP	PPP4R2,SHQ1,LOC201617	IMR90	Hi-C	24141950	RYBP	37995	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	72940180	72940555	72940311	Y	GXYLT2	SHQ1,GXYLT2,FTH1P23	NA	NA	NA	NA	GXYLT2	4956	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	72977666	72978074	72977791	Y	RYBP	GXYLT2,FTH1P23	NA	NA	NA	NA	FTH1P23	1471	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	73022372	73022552	73022446	Y	PPP4R2,EBLN2	FTH1P23,PPP4R2	NA	NA	NA	NA	PPP4R2	21384	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	73159773	73160145	73159855	Y	EBLN2	NA	PDZRN3,CACNA1D	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC75P1	70297	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	73611832	73612189	73612011	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZRN3	59902	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	78934560	78934824	78934693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	880141	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	80100853	80101105	80100983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	285888	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	86842931	86843272	86843115	Y	VGLL3	NA	VGLL3	IMR90	Hi-C	24141950	VGLL3	194997	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	87038753	87038992	87038799	Y	VGLL3	VGLL3	NA	NA	NA	NA	VGLL3	484	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	87336210	87336427	87336319	Y	NA	NA	CGGBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CHMP2B	61789	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	87382490	87382853	87382616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP2B	108069	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	87871242	87871381	87871312	Y	HTR1F	RP11-451B8.1	NA	NA	NA	NA	RP11-451B8.1	30463	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	87914039	87914361	87914172	Y	ZNF654,HTR1F	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-451B8.1	73260	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	88046474	88046673	88046586	Y	ZNF654,CGGBP1,C3orf38	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf38	150220	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	88079560	88079697	88079616	Y	C3orf38	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf38	117196	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	88151728	88152092	88151734	Y	NA	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	C3orf38	44801	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	88208920	88209337	88209164	Y	CGGBP1,C3orf38	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	CGGBP1	11885	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr3	88211290	88211624	88211397	Y	NA	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	CGGBP1	14255	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPKP4	269654	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	98504725	98505044	98504856	Y	OR5K4,ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	113489	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	98505158	98505735	98505540	Y	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	112798	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	98544884	98545154	98545150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	73379	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	98681428	98681771	98681644	Y	DCBLD2	LINC00973	MIR548G,COL8A1,DCBLD2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00973	16131	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	98685741	98686133	98685825	Y	NA	LINC00973	DCBLD2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00973	11769	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	98689970	98690253	98690112	Y	DCBLD2	LINC00973	DCBLD2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00973	7649	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	98691142	98691300	98691170	Y	DCBLD2	LINC00973	DCBLD2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00973	6602	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	98848000	98848317	98848116	Y	DCBLD2	NA	COL8A1,MIR548G	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00973	150098	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	99356024	99356457	99356227	Y	NA	COL8A1	NA	NA	NA	NA	COL8A1	705	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	99377938	99378211	99378054	Y	COL8A1	COL8A1	NA	NA	NA	NA	COL8A1	22619	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	99575221	99575605	99575379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	219902	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	99584293	99584813	99584482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	228974	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	99596957	99597300	99597045	Y	TBC1D23	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	234057	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	99657499	99657599	99657549	Y	FILIP1L	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	173758	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	99749892	99750279	99749982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	81078	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	99761045	99761306	99761215	Y	TMEM45A	NA	TMEM30C	IMR90	Hi-C	24141950	FILIP1L	70051	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	99944403	99944723	99944568	Y	NA	TBC1D23	C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D23	33121	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	100077983	100078198	100078091	Y	FILIP1L	NIT2,LNP1,TOMM70A	NA	NA	NA	NA	NIT2	26438	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	100244695	100244934	100244873	Y	NA	TMEM45A	NA	NA	NA	NA	TMEM45A	35232	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr3	101403455	101403770	101403678	Y	SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24	ZBTB11,CEP97	NA	NA	NA	NA	RPL24	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	101444542	101444901	101444615	Y	FAM55C,FAM55C,CEP97	RPL24,CEP97	NA	NA	NA	NA	CEP97	3773	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	103522825	103523125	103522973	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-43P	646021	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	105087492	105087848	105087688	Y	NA	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	3739	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	105625722	105626117	105625911	Y	NA	CBLB	NA	NA	NA	NA	CBLB	39326	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	105716646	105717231	105716913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	130250	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	105838688	105838919	105838809	Y	NA	NA	CBLB	MCF7	ChIA-PET	22265404	CBLB	252292	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	106926972	106927298	106927135	Y	NA	LINC00882,LINC00883	NA	NA	NA	NA	LINC00882	30190	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	107663005	107663249	107663088	Y	CD47	NA	NA	NA	NA	NA	CD47	144623	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	107807468	107807936	107807811	Y	MYH15,CD47	NA	NA	NA	NA	NA	CD47	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	111521164	111521550	111521388	Y	PHLDB2,PHLDB2	NA	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	71820	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	112395778	112395997	112395824	Y	CCDC80	CCDC80	CCDC80	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCDC80	29401	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	113209161	113209501	113209331	Y	NA	SPICE1	NA	NA	NA	NA	SPICE1	22533	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	113638745	113638778	113638762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QTRTD1	83902	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	113935167	113935298	113935229	Y	NA	RP11-553L6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-553L6.2	4007	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	113940418	113940798	113940600	Y	TIGIT	RP11-553L6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-553L6.2	9258	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	114100743	114101091	114100917	Y	ZBTB20,ZBTB20	ZBTB20-AS1	NA	NA	NA	NA	ZBTB20-AS1	32085	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	114103176	114103363	114103329	Y	NA	ZBTB20-AS1	NA	NA	NA	NA	ZBTB20-AS1	34518	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	114144881	114145214	114145066	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20-AS1	76223	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	115231466	115231705	115231586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	108466	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	115502758	115503253	115502970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	162587	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	115503263	115503751	115503546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	163092	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	115503837	115504240	115504182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	163666	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	115696572	115696769	115696673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	356401	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	115724212	115724599	115724432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	384041	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	116118770	116119229	116119052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	624316	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	116145742	116145918	116145863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	597627	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	116949788	116950143	116949966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	206243	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	117175008	117175053	117175027	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	431463	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	117299509	117299697	117299683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSAMP	414398	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	117632292	117632433	117632362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSAMP	81662	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	119147570	119147724	119147648	Y	NA	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	37953	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	119238487	119238668	119238501	Y	NA	TIMMDC1	NA	NA	NA	NA	TIMMDC1	23108	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	119613107	119613331	119613219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	197933	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	119644387	119644860	119644721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	166404	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	120065370	120065692	120065535	Y	NA	LRRC58	NA	NA	NA	NA	LRRC58	494	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	120167583	120167922	120167648	Y	NA	FSTL1	NA	NA	NA	NA	FSTL1	178	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	120277715	120278240	120277932	Y	NA	NDUFB4	FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB4	34916	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	120397142	120397339	120397236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2E1	62145	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	121149194	121149225	121149210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP11	61732	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	122400701	122401439	122401076	Y	CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,HSPBAP1,DIRC2,PARP14	EIF4BP8,PARP14	NA	NA	NA	NA	PARP14	3236	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	122464996	122465160	122465078	Y	PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	45511	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	123263878	123263964	123263921	Y	ADCY5,ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	PTPLB	38068	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	123351425	123351671	123351446	Y	ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	49036	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	123396914	123397344	123397115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	94525	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	124419861	124420177	124419915	Y	KALRN	UMPS	NA	NA	NA	NA	UMPS	27036	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	124531464	124532111	124531823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UMPS	84251	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	124564415	124564677	124564502	Y	HEG1,ITGB5	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	53588	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	124605050	124605342	124605178	Y	ITGB5	ITGB5	NA	NA	NA	NA	ITGB5	12923	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	124964412	124964802	124964608	Y	NA	SLC12A8	SLC12A8	IMR90	Hi-C	24141950	SLC12A8	31219	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	125053590	125053890	125053754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC12A8	57569	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	125113338	125113617	125113432	Y	NA	NA	HEG1,SLC12A8,ZNF148,SNX4,MUC13	IMR90	Hi-C	24141950	SLC12A8	117317	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86JP	75679	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	126630341	126630598	126630469	Y	ZXDC	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA1	74839	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr3	126701397	126702091	126701497	Y	PLXNA1	PLXNA1	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PLXNA1	3346	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	126721076	126721245	126721142	Y	PLXNA1	PLXNA1	NA	NA	NA	NA	PLXNA1	15639	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr3	127404993	127405883	127405741	Y	MGLL	ABTB1	NA	NA	NA	NA	ABTB1	15215	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	127453672	127453937	127453742	Y	TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	NA	NA	NA	NA	NA	ABTB1	63894	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	127469268	127470071	127469577	Y	TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	NA	NA	NA	NA	NA	MGLL	69980	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr3	127473675	127474224	127473998	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	NA	NA	NA	NA	NA	MGLL	65827	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	127487223	127487760	127487461	Y	TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	NA	NA	NA	NA	NA	MGLL	52291	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	127522578	127522702	127522699	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	17349	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	127795566	127796407	127795838	Y	GATA2,GATA2,GATA2,DNAJB8	SEC61A1,RUVBL1-AS1	NA	NA	NA	NA	RUVBL1-AS1	2913	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	128366732	128367045	128366901	Y	NA	RPN1	NA	NA	NA	NA	RPN1	30873	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	128446542	128446927	128446583	Y	NA	RPN1,RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	RAB7A	3577	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	128564550	128565114	128564776	Y	DNAJB8,KIAA1257	ACAD9	NA	NA	NA	NA	ACAD9	31325	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	128745839	128746109	128746044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB43	93535	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	128822143	128822374	128822225	Y	H1FOO	RAB43	NA	NA	NA	NA	RAB43	17270	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	129346331	129346490	129346427	Y	PLXND1	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	22670	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	131056791	131057139	131056963	Y	NA	NUDT16P1,RP11-933H2.4,NUDT16	NA	NA	NA	NA	NUDT16P1	21603	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	131096350	131096447	131096399	Y	NA	NUDT16P1,RP11-933H2.4,NUDT16	NA	NA	NA	NA	RP11-933H2.4	1872	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	132261870	132262263	132261985	Y	DNAJC13	NA	NA	NA	NA	NA	UBA5	109027	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	132288543	132288708	132288626	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA5	82582	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	133289121	133289251	133289178	Y	SRPRB	CDV3	CDV3	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDV3	1323	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	134082893	134083489	134083439	Y	AMOTL2	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	AMOTL2	8832	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	134145641	134145965	134145857	Y	NA	NA	ANAPC13,AMOTL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AMOTL2	53320	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	134182898	134183261	134183039	Y	AMOTL2	CEP63,ANAPC13	NA	NA	NA	NA	CEP63	19324	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	135827453	135827844	135827484	Y	PPP2R3A	NA	NA	NA	NA	NA	MSL2	86239	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	137768870	137769254	137769106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DZIP1L	63406	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	137938227	137938395	137938336	Y	ARMC8	DBR1,ARMC8	NA	NA	NA	NA	ARMC8	34118	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	139064285	139064552	139064299	Y	NA	COPB2,RP11-319G6.1	NA	NA	NA	NA	COPB2	42022	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	139491345	139491740	139491614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLSTN2	160287	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	140186013	140186197	140186105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A36	472475	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	141050524	141051086	141050761	Y	NA	ZBTB38	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	9469	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	141129371	141129776	141129494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	74113	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	141131172	141131505	141131226	Y	SLC25A36,RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	72384	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	141131755	141132151	141131882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	71738	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	141173878	141174028	141173977	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	29861	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	141319185	141319480	141319327	Y	RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	115296	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	141482175	141482451	141482314	Y	NA	RNF7	NA	NA	NA	NA	RNF7	27129	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	141994757	141995052	141994916	Y	NA	NA	GK5,TFDP2,ATP1B3,XRN1,GRK7	IMR90	Hi-C	24141950	GK5	52308	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	142164400	142165110	142164972	Y	XRN1	NA	NA	NA	NA	NA	XRN1	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	142723898	142724007	142723903	Y	NA	U2SURP	NA	NA	NA	NA	U2SURP	42559	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	142844875	142844897	142844886	Y	PAQR9,CHST2	CHST2,PBX2P1	NA	NA	NA	NA	CHST2	8702	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	143108310	143108441	143108388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX2P1	215183	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	143162621	143163181	143162827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX2P1	269494	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	143164009	143164340	143164242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX2P1	270882	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	143828914	143829061	143828972	Y	C3orf58,C3orf58	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf58	140274	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	145546772	145546788	145546780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLOD2	332652	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	146269018	146269189	146269121	Y	PLSCR1	PLSCR1	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	8367	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	146686002	146686397	146686202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZIC1	422812	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	146955604	146955955	146955778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZIC1	153254	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	147016506	147016766	147016597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZIC1	92443	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	147137005	147137222	147137047	Y	ZIC4,ZIC4,ZIC4,ZIC1	ZIC1,ZIC4	NA	NA	NA	NA	ZIC4	14358	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	147290616	147291014	147290824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZIC4	167969	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	148942843	148943311	148943144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HPS3	97472	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	149104739	149105065	149104981	Y	COMMD2,TM4SF1	TM4SF1	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM4SF1	11087	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	149284462	149284628	149284613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	74015	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	149330317	149330600	149330464	Y	WWTR1,WWTR1,WWTR1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	119870	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	149356424	149356747	149356622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	95754	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	149566176	149566232	149566181	Y	RNF13	RNF13	NA	NA	NA	NA	RNF13	37681	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	149665014	149665210	149665089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFN2	101365	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	149668313	149668642	149668480	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFN2	97933	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	149865143	149865465	149865344	Y	NA	NA	RNF13,LOC646903,PFN2,TSC22D2	IMR90	Hi-C	24141950	PFN2	98568	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	149953459	149953819	149953634	Y	NA	NA	TSC22D2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D2	170303	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	150089534	150090066	150089791	Y	NA	TSC22D2	TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D2	34056	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	152121454	152121974	152121660	Y	MBNL1	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	136110	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	152878171	152878732	152878352	Y	P2RY1,RAP2B	RAP2B	NA	NA	NA	NA	RAP2B	142	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	153007263	153007499	153007331	Y	P2RY1,RAP2B	NA	RAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	RAP2B	129234	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	154788699	154789128	154788815	Y	NA	MME	MME	IMR90	Hi-C	24141950	MME	48786	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	155382767	155382896	155382833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf33	139244	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	156149618	156149810	156149747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSR3	121163	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	156202207	156202259	156202239	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1	NA	NA	NA	NA	NA	SSR3	68714	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	156206621	156206945	156206715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSR3	64028	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	156207242	156207761	156207575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSR3	63212	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	156229646	156229758	156229715	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	41215	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	156252887	156253352	156253202	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	17621	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	156268270	156268550	156268410	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	2423	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	156403084	156403595	156403347	Y	LEKR1,LEKR1,CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	TIPARP,TIPARP-AS1	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	12917	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	156432757	156433079	156432845	Y	CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	TIPARP,TIPARP-AS1	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	42590	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	156443600	156443618	156443611	Y	LEKR1,LEKR1,CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	53433	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	156453441	156453522	156453482	Y	CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	63274	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	156480605	156480801	156480703	Y	NA	PA2G4P4	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	45720	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	156506058	156506346	156506123	Y	SSR3	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	20175	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	156529352	156529637	156529452	Y	NA	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	2831	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	156530301	156530778	156530576	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	LINC00886	2073	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	156784451	156784922	156784633	Y	PTX3,C3orf55	RP11-6F2.5	NA	NA	NA	NA	RP11-6F2.5	12708	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	156846039	156846735	156846192	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1,CCNL1	RP11-6F2.5,CCNL1,RP11-550I24.2	NA	NA	NA	NA	CCNL1	29814	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	156849691	156850000	156849844	Y	NA	CCNL1,RP11-550I24.2	NA	NA	NA	NA	CCNL1	26549	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	157053563	157053826	157053695	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTX3	98752	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	157147600	157147913	157147782	Y	CCNL1,PTX3	PTX3	NA	NA	NA	NA	PTX3	4665	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	157249695	157249901	157249798	Y	VEPH1	VEPH1,C3orf55	C3orf55,RSRC1,SHOX2,MFSD1,VEPH1,RARRES1	IMR90	Hi-C	24141950	VEPH1	287	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	157935893	157935900	157935896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHOX2	113601	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	158048767	158049059	158048913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHOX2	226475	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	158887731	158887850	158887799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RARRES1	439246	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	159540179	159540477	159540438	Y	NA	SCHIP1	NA	NA	NA	NA	SCHIP1	15173	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	160714920	160715128	160715024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMD3	105356	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	165215973	165216343	165216172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCHE	336917	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	167769401	167769602	167769443	Y	NA	GOLIM4	NA	NA	NA	NA	GOLIM4	42161	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	168616433	168616445	168616439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFEM1P	651123	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	169172792	169172932	169172865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	206474	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	169482089	169482431	169482154	Y	NA	TERC,MYNN,LRRC34	NA	NA	NA	NA	TERC	1241	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	170420897	170421107	170421029	Y	CLDN11	RP11-373E16.4	SLC7A14,CLDN11,PRKCI,SKIL	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	36047	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	170444418	170445820	170444586	Y	CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2	RP11-373E16.4	CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	11334	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.84544248211614
chr3	170463049	170463502	170463289	Y	CLDN11	RP11-373E16.4	SLC7A14,CLDN11,PRKCI,SKIL	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	5895	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	170469010	170469069	170469037	Y	CLDN11,CLDN11,EIF5A2	RP11-373E16.4	SLC7A14,CLDN11,SKIL	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	11856	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	170527099	170527304	170527203	Y	EIF5A2	NA	SLC7A14,CLDN11,SKIL,PRKCI	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22L1	58968	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	170527835	170528013	170527928	Y	NA	NA	SLC7A14,CLDN11,SKIL,PRKCI	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22L1	58259	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	170975109	170975430	170975328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	200767	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	171002565	171002750	171002646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	173447	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	171847438	171848726	171847798	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	92020	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	171870963	171871593	171871291	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	115545	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	171948409	171948713	171948561	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	192991	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	172344996	172345137	172345044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCEH1	81871	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	172376302	172376661	172376383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCEH1	50347	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	172423916	172424228	172424139	Y	NA	NCEH1,ECT2	NA	NA	NA	NA	NCEH1	2780	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	172467147	172467552	172467259	Y	NA	NCEH1,ECT2,RNU4-4P	NCEH1,ECT2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ECT2	675	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	172510084	172510259	172510171	Y	NA	ECT2,RNU4-4P	NA	NA	NA	NA	RNU4-4P	2089	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	173873395	173873401	173873398	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	219633	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	174157357	174157932	174157609	Y	NA	NAALADL2	NAALADL2	IMR90	Hi-C	24141950	NAALADL2	2994	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	176774167	176774584	176774367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	138677	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	177075253	177075542	177075439	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	161992	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	177076157	177076922	177076435	Y	TBL1XR1	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	162896	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr3	177077500	177078084	177077832	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	164239	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	178236576	178236655	178236649	Y	KCNMB2	NA	KCNMB2	IMR90	Hi-C	24141950	ZMAT3	551412	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	179122098	179122379	179122239	Y	NA	GNB4	NA	NA	NA	NA	GNB4	44999	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	179372057	179372188	179372123	Y	NA	USP13	NA	NA	NA	NA	USP13	3514	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	181419160	181419816	181419173	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	7898	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	181422063	181422170	181422118	Y	SOX2	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	5544	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	182550667	182550775	182550721	Y	ATP11B	ATP11B	NA	NA	NA	NA	ATP11B	41379	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	182645862	182646115	182645990	Y	MCF2L2,MCCC1	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	55626	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	183003579	183004143	183003750	Y	ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	MCCC1	171716	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	184560038	184560430	184560098	Y	VPS8	VPS8	NA	NA	NA	NA	VPS8	32107	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	185339016	185339200	185339107	Y	NA	SENP2	NA	NA	NA	NA	SENP2	40732	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	185463229	185463551	185463382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2BP2	77293	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	185905496	185905742	185905693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV5	79389	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	185948324	185948597	185948503	Y	DGKG	NA	NA	NA	NA	NA	ETV5	122217	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	187304327	187304487	187304407	Y	NA	NA	ST6GAL1,MASP1	IMR90	Hi-C	24141950	BCL6	157028	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	187459288	187459644	187459469	Y	RTP4,BCL6,BCL6,BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	1871	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	187574248	187574709	187574377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL6	112733	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	187891343	187891657	187891500	Y	NA	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	21498	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	187948643	187949049	187948891	Y	LPP,LPP,LPP	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	78798	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	187983465	187984215	187983993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	113620	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	188002342	188002742	188002584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	132497	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	188296495	188296603	188296541	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1-AS1	366825	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	188374364	188374933	188374638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1-AS1	288495	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	188475500	188475699	188475599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1-AS1	187729	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	189766714	189767004	189766859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1-AS1	69749	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	190104242	190104447	190104367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLDN1	65978	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	190284228	190284576	190284349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	54388	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	190581013	190581092	190581053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSTN	333938	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	190956161	190956506	190956333	Y	NA	OSTN	NA	NA	NA	NA	OSTN	41131	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	192604773	192605048	192605023	Y	NA	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	28902	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	192634153	192634990	192634777	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	203	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr3	192873675	192873788	192873739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MB21D2	239725	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr3	193851636	193853009	193852912	Y	ATP13A3,HES1	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	193859199	193859624	193859359	Y	TMEM44	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	7265	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	193983162	193983541	193983368	Y	TMEM44	NA	LOC647323,OPA1	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC15	104931	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	194247870	194248550	194248205	Y	HES1,ATP13A3	ATP13A3	ATP13A3,GP5,TMEM44,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	ATP13A3	30777	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	194461690	194461887	194461800	Y	FAM43A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM43A	57068	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	194820742	194820949	194820800	Y	PPP1R2,ACAP2	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	168947	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	195430866	195431240	195430948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R2	162657	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	196047617	196047878	196047747	Y	NA	PCYT1A,TCTEX1D2,TM4SF19	NA	NA	NA	NA	TCTEX1D2	4447	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	196255741	196255873	196255820	Y	NA	RNF168,FBXO45,WDR53	UBXN7,MUC20,RNF168,C3orf43,PCYT1A,TM4SF19-TCTEX1D2,WDR53,FBXO45,CEP19	IMR90	Hi-C	24141950	RNF168	27102	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	196635737	196635948	196635847	Y	UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5	SENP5,NCBP2	NA	NA	NA	NA	NCBP2	31520	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr3	196855650	196855726	196855688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFI2	100963	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	196948967	196949228	196949097	Y	NA	NA	MFI2	IMR90	Hi-C	24141950	DLG1	74943	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	197461391	197461841	197461700	Y	IQCG,LRCH3,KIAA0226	FYTTD1,KIAA0226	NA	NA	NA	NA	FYTTD1	209	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr3	197478210	197478491	197478305	Y	IQCG,KIAA0226,FYTTD1,FYTTD1,LRCH3	FYTTD1,KIAA0226,LRCH3	NA	NA	NA	NA	KIAA0226	3612	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	751950	752022	752014	Y	NA	RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	21615	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr4	899253	899541	899397	Y	NA	GAK,TMEM175	NA	NA	NA	NA	GAK	24620	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	924714	925388	925028	Y	MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,IDUA,GAK	GAK,TMEM175	NA	NA	NA	NA	TMEM175	539	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	4.26816372317422
chr4	1170900	1171323	1171147	Y	GAK,DGKQ,KIAA1530	SPON2	NA	NA	NA	NA	SPON2	29427	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	1184509	1184886	1184846	Y	RNF212,CRIPAK	SPON2	NA	NA	NA	NA	SPON2	15864	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	1237849	1238004	1237927	Y	NA	SPON2,CTBP1,MAEA	NA	NA	NA	NA	CTBP1	3737	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr4	1874737	1875082	1874826	Y	WHSC1	LETM1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	WHSC1	3586	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.13408186158711
chr4	1875191	1875366	1875328	Y	NA	LETM1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	WHSC1	4040	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	1966776	1967112	1967086	Y	WHSC1,WHSC1	SCARNA22	NA	NA	NA	NA	SCARNA22	7251	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr4	2384521	2384810	2384722	Y	TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,LOC402160	ZFYVE28	NA	NA	NA	NA	ZFYVE28	33580	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	2385582	2385754	2385689	Y	TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,LOC402160	ZFYVE28	NA	NA	NA	NA	ZFYVE28	32636	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	2414575	2415364	2414914	Y	HAUS3,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,RNF4,RNF4,LOC402160	ZFYVE28,RNF4	NA	NA	NA	NA	ZFYVE28	3026	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr4	2537711	2538436	2538089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	75764	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr4	2765898	2766146	2766030	Y	NA	TNIP2,SH3BP2	TNIP2,NOP14-AS1,NOP14,MFSD10	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TNIP2	9795	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr4	3047149	3047582	3047407	Y	RGS12,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2	HTT	NA	NA	NA	NA	HTT	26826	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	3293872	3294174	3294028	Y	NA	RGS12	RGS12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RGS12	1117	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr4	3390647	3391111	3390815	Y	RGS12	NA	NA	NA	NA	NA	RGS12	97892	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	3488499	3488826	3488767	Y	NA	LRPAP1	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	43460	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	4577048	4577566	4577357	Y	NA	STX18-AS1,STX18	NA	NA	NA	NA	STX18	34975	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	4855584	4855774	4855697	Y	NA	MSX1	MSX1	K562	ChIA-PET	22265404	MSX1	3619	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	5545973	5546345	5546227	Y	CRMP1	NA	NA	NA	NA	NA	EVC2	162930	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	5587454	5587568	5587511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVC2	121707	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	6785099	6785509	6785391	Y	TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232	KIAA0232	NA	NA	NA	NA	KIAA0232	3997	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	9154755	9155069	9154900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPZ	562368	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	10116801	10117310	10116981	Y	WDR1	WDR1	NA	NA	NA	NA	WDR1	228	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	12189077	12189099	12189089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-352E6.2	451162	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	13439753	13439937	13439845	Y	NA	RAB28	NA	NA	NA	NA	RAB28	44052	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	13486596	13486918	13486821	Y	BOD1L,RAB28	RAB28	NA	NA	NA	NA	RAB28	2607	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	13908947	13909321	13909089	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,LOC152742	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01085	202271	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	13920582	13920969	13920807	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,C1QTNF7	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01085	190623	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	15235793	15235968	15235850	Y	CPEB2,FBXL5,BST1	NA	PROM1,C1QTNF7,FBXL5,CC2D2A	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB2	233495	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	15488697	15488958	15488934	Y	NA	CC2D2A	NA	NA	NA	NA	CC2D2A	19208	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	15590411	15590648	15590624	Y	FBXL5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	90637	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	15596739	15596980	15596942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	84305	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	15655935	15656313	15656300	Y	FBXL5,BST1	FAM200B,FBXL5,BST1	NA	NA	NA	NA	FAM200B	24972	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	16226860	16227020	16226938	Y	FGFBP2,TAPT1	TAPT1,RPS21P4	NA	NA	NA	NA	TAPT1	13	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	16357169	16357203	16357186	Y	NA	NA	QDPR	IMR90	Hi-C	24141950	RPS21P4	100991	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	16440383	16440394	16440389	Y	NA	NA	QDPR,PROM1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS21P4	184205	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	16629750	16630155	16629855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDB2	268277	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	17642152	17642177	17642165	Y	CLRN2	MED28	NA	NA	NA	NA	MED28	27898	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	17829390	17829398	17829394	Y	CLRN2,NCAPG	DCAF16,NCAPG	NA	NA	NA	NA	NCAPG	18865	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	20197125	20197285	20197196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLIT2	55598	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	24579124	24579339	24579231	Y	NA	DHX15	NA	NA	NA	NA	DHX15	4834	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	24660007	24660225	24660117	Y	NA	ATP5LP3	CCDC149,MIR573	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5LP3	2009	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	26090058	26090547	26090383	Y	RBPJ,RBPJ	NA	RBPJ,TBC1D19	IMR90	Hi-C	24141950	RBPJ	72530	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr4	26888311	26888739	26888468	Y	NA	STIM2,RP11-293A21.1	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	28090	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	35107542	35107966	35107823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-79E3.3	1068027	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	37581972	37582372	37582240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELL1	103626	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	38312171	38312322	38312247	Y	KLF3	NA	FLJ13197,KLF3,TBC1D1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF3	351495	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	38735219	38735515	38735398	Y	NA	NA	KLF3,TBC1D1,FLJ13197	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-617D20.1	70715	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	38859134	38859762	38859410	Y	KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6	TLR1,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	TLR1	2696	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	38871281	38871430	38871296	Y	NA	TLR1,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	FAM114A1	3983	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr4	39038547	39038755	39038651	Y	NA	TMEM156,KLHL5	NA	NA	NA	NA	KLHL5	5904	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	39316114	39316675	39316347	Y	NA	RFC1	NA	NA	NA	NA	RFC1	49320	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	39908966	39909133	39909103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDS5A	68443	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	39935708	39936100	39935904	Y	NA	PDS5A	NA	NA	NA	NA	PDS5A	41476	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	40056293	40056591	40056356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP2	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	40994779	40995404	40995184	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	221327	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	44727575	44727855	44727678	Y	KCTD8,GNPDA2	GUF1,GNPDA2	NA	NA	NA	NA	GNPDA2	963	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	53725752	53726074	53725904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP46-AS1	202179	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	54172916	54173263	54173102	Y	SCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	SCFD2	56979	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	54338842	54339193	54339023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIP1L1	97032	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	54600901	54601043	54600966	Y	CHIC2	NA	NA	NA	NA	NA	CHIC2	327814	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	54780399	54780822	54780654	Y	CHIC2	NA	LNX1,SCFD2,PDGFRA,CHIC2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	148035	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	54886131	54886730	54886449	Y	GSX2	CHIC2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	42127	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	54929171	54929915	54929573	Y	CHIC2	CHIC2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	314	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr4	54958023	54958135	54958077	Y	NA	CHIC2	SCFD2,CHIC2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	29166	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr4	55093024	55093294	55093182	Y	PDGFRA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFRA	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.95624170645485
chr4	55093767	55093987	55093860	Y	NA	PDGFRA	NA	NA	NA	NA	PDGFRA	503	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr4	55097338	55097659	55097499	Y	PDGFRA	PDGFRA	NA	NA	NA	NA	PDGFRA	4074	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	55100480	55100923	55100634	Y	PDGFRA	PDGFRA	NA	NA	NA	NA	PDGFRA	7216	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	56178022	56178286	56178222	Y	TMEM165,SRD5A3	SRD5A3	KDR	IMR90	Hi-C	24141950	SRD5A3	31990	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	56419632	56419978	56419838	Y	NA	CLOCK	NA	NA	NA	NA	CLOCK	8327	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr4	57048653	57048701	57048677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AASDH	202965	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	61549274	61549357	61549330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-621K7.1	1090211	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	66107153	66107671	66107555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-807H7.1	426008	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.84544248211614
chr4	66533536	66533932	66533732	Y	EPHA5	EPHA5	NA	NA	NA	NA	RP11-807H7.1	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	66899965	66900079	66900021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	57765	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	66960590	66960760	66960693	Y	NA	RP11-396M11.1	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	2746	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr4	67430351	67431255	67431078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	472507	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr4	67431681	67431779	67431730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	473837	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	67438719	67438955	67438878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	480875	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	68538149	68538306	68538215	Y	NA	UBA6,UBA6-AS1	NA	NA	NA	NA	UBA6	26591	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	71638038	71638166	71638102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRSF1	65496	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	71695000	71695080	71695041	Y	NA	GRSF1	NA	NA	NA	NA	GRSF1	8582	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr4	71996619	71996848	71996732	Y	NA	NA	DCK,SLC4A4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC4A4	54155	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr4	74355902	74356106	74356004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF6	128242	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	74783021	74783195	74783091	Y	IL8,MTHFD2L,EREG,CXCL3,CXCL2,CXCL1	CXCL1	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	CXCL1	49911	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	74961952	74962121	74962037	Y	IL8,MTHFD2L,EREG,CXCL3,CXCL2	CXCL2,MTHFD2L	NA	NA	NA	NA	CXCL2	889	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	74975298	74975961	74975834	Y	CXCL1,AREG	CXCL2,MTHFD2L	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	1930	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	75096380	75097063	75096677	Y	IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L	NA	NA	NA	NA	NA	MTHFD2L	118489	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	75228037	75228384	75228211	Y	NA	EREG	NA	NA	NA	NA	EREG	476	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	75859868	75860329	75860092	Y	BTC,PARM1	PARM1	NA	NA	NA	NA	PARM1	3563	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	77011342	77011736	77011528	Y	NAAA,CXCL9,CXCL10,CXCL11	NA	NA	NA	NA	NA	NUP54	55932	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	77041502	77041599	77041551	Y	NA	NUP54	NA	NA	NA	NA	NUP54	26069	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	77129675	77129810	77129753	Y	NAAA	SCARB2	NA	NA	NA	NA	SCARB2	3236	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	77674311	77674688	77674546	Y	SEPT11	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT11	194168	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	77931984	77932418	77932077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNI	62740	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	77974492	77974926	77974738	Y	CCNI	CCNI	NA	NA	NA	NA	CCNI	20232	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	78571860	78572194	78572027	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNOT6L	166575	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	78711096	78711128	78711114	Y	NA	CNOT6L	NA	NA	NA	NA	CNOT6L	27641	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	80979830	80980309	80980136	Y	ANTXR2	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR2	64299	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	80991308	80991698	80991476	Y	PRDM8,ANTXR2	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR2	52910	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	80998878	80999095	80998994	Y	PRDM8,ANTXR2	ANTXR2	NA	NA	NA	NA	ANTXR2	45513	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	81229160	81229644	81229481	Y	NA	FGF5,C4orf22	NA	NA	NA	NA	C4orf22	25230	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	81960750	81960835	81960793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKG2	173383	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	82527950	82528304	82528033	Y	RASGEF1B	NA	NA	NA	NA	NA	PRKG2	393732	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	83205945	83206187	83206036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPD	87469	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	83681282	83681423	83681411	Y	NA	SCD5	NA	NA	NA	NA	SCD5	36587	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	84140527	84140710	84140595	Y	THAP9,HPSE,HPSE,HPSE,COQ2,AGPAT9,PLAC8	NA	PLAC8,COPS4,COQ2	IMR90	Hi-C	24141950	COQ2	63357	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	84773321	84773491	84773400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT9	318254	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	84776291	84776536	84776414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT9	321224	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	85420434	85420908	85420714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDS1	81224	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr4	85668684	85668904	85668818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDS1	166552	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	86664396	86664842	86664610	Y	ARHGAP24	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	270129	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	86927841	86928538	86928361	Y	MAPK10,MAPK10,MAPK10	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	533574	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	87615730	87616123	87615813	Y	PTPN13,SLC10A6	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN13	102262	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	87835479	87835856	87835675	Y	NA	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	AFF1	18298	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	87894121	87894618	87894307	Y	NA	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	TECRP1	24845	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	88128695	88128755	88128733	Y	NA	KLHL8	NA	NA	NA	NA	KLHL8	30711	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	88408034	88408084	88408060	Y	SPARCL1	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT9	66300	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	88446974	88447282	88447233	Y	MEPE,SPARCL1	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT9	105240	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	88765103	88765413	88765203	Y	HSD17B11	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-36P	153976	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	88939808	88939842	88939826	Y	NA	RNU1-36P,PKD2	NA	NA	NA	NA	PKD2	12988	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	88943044	88943294	88943160	Y	NA	RNU1-36P,PKD2	NA	NA	NA	NA	PKD2	16224	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	92985275	92985297	92985287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRID2	238253	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	93226746	93226922	93226838	Y	GRID2	GRID2	NA	NA	NA	NA	GRID2	3196	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr4	93695522	93695754	93695563	Y	GRID2	NA	NA	NA	NA	NA	GRID2	471972	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	95373822	95374139	95373960	Y	PDLIM5	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	2785	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	99575135	99575326	99575229	Y	NA	TSPAN5	NA	NA	NA	NA	TSPAN5	2454	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	102200557	102200885	102200839	Y	PPP3CA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	66052	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	103360468	103360812	103360586	Y	SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,NFKB1,MANBA	SLC39A8	BDH2,NFKB1,SLC9B1,UBE2D3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC39A8	10053	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	103360821	103361254	103361183	Y	SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,NFKB1,MANBA	SLC39A8	NFKB1,SLC9B1,UBE2D3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC39A8	10406	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	103750426	103750532	103750434	Y	NHEDC1,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3	RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2	NA	NA	NA	NA	RP11-10L12.4	3214	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	103781884	103782294	103782163	Y	MANBA	RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2	NA	NA	NA	NA	UBE2D3	5759	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	103788773	103788886	103788830	Y	NA	RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2	NA	NA	NA	NA	CISD2	638	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	106226051	106226420	106226239	Y	TET2,TET2	NA	NA	NA	NA	NA	TET2	161019	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	108760061	108760236	108760128	Y	NA	SGMS2	NA	NA	NA	NA	SGMS2	16342	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	109037834	109038179	109038007	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HADH	128964	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	111085558	111085919	111085739	Y	NA	RP11-115A14.1,ELOVL6	NA	NA	NA	NA	RP11-115A14.1	20028	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	111117471	111117868	111117585	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	487	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	111553099	111553258	111553149	Y	PITX2,PITX2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-433B3.1	368926	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	112913088	112913237	112913174	Y	TIFA,AP1AR	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf32	151316	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	114355245	114355627	114355568	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	15766	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	114366444	114366711	114366574	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	26965	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	114367129	114367387	114367298	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	27650	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	114382932	114383313	114383209	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	43453	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	114389425	114389805	114389547	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	49946	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr4	117519495	117520605	117520296	Y	NA	ACTN4P1	NA	NA	NA	NA	ACTN4P1	2178	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr4	119629667	119629850	119629760	Y	NA	METTL14	NA	NA	NA	NA	METTL14	25144	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	119756174	119756657	119756269	Y	NA	SEC24D	NA	NA	NA	NA	SEC24D	1181	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr4	120130181	120130604	120130427	Y	NA	USP53	NA	NA	NA	NA	USP53	1138	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	120458820	120459280	120459019	Y	PDE5A,PDE5A,PDE5A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	84874	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	120476359	120476426	120476393	Y	PDE5A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	102413	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	122609803	122610189	122610094	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	6079	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	122611926	122612330	122612120	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	3938	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr4	122632771	122633033	122632919	Y	NA	ANXA5	ANXA5,BBS7,CCNA2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ANXA5	16503	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	123072095	123072295	123072185	Y	NA	KIAA1109	NA	NA	NA	NA	KIAA1109	607	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	123792983	123793156	123793069	Y	NA	FGF2,NUDT6,SPATA5	NA	NA	NA	NA	FGF2	47120	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	124621616	124621886	124621708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY1	305666	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	127966730	127967007	127966867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTU	575419	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	128083998	128084288	128084127	Y	NA	NA	FAT4	IMR90	Hi-C	24141950	INTU	458138	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	129308281	129308471	129308363	Y	NA	NA	PGRMC2,PHF17,LARP1B,SCLT1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PGRMC2	100297	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	129474102	129474409	129474120	Y	NA	NA	PGRMC2,PHF17,LARP1B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PGRMC2	266118	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	135287127	135287346	135287189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PABPC4L	166224	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	139960939	139961173	139961057	Y	NAA15,CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25996	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	140003738	140004448	140004114	Y	CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2	NA	CCRN4L	K562	ChIA-PET	22265404	CCRN4L	68795	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr4	140321405	140321719	140321434	Y	ELF2,NAA15,RAB33B	NA	NA	NA	NA	NA	RAB33B	50667	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	140667675	140667827	140667711	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	82753	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	140793640	140793753	140793693	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	208718	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	140970177	140970718	140970535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	102620	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	141014112	141014221	141014167	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	59117	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	141071687	141072625	141072041	Y	MAML3	MAML3	NA	NA	NA	NA	MAML3	713	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	141174275	141174653	141174618	Y	NA	SCOC	MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SCOC	1787	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	141217539	141217769	141217667	Y	NA	SCOC	NA	NA	NA	NA	SCOC	41099	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	143012897	143013276	143013057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL15	457145	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	143325385	143325488	143325414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	441097	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	143536371	143536723	143536559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	229862	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	143608710	143609035	143608873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	157550	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	146725275	146725660	146725360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF827	132127	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	146729401	146729770	146729628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF827	128017	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	147192653	147192904	147192792	Y	ZNF827,SLC10A7	NA	NA	NA	NA	NA	LSM6	97816	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	148746659	148746986	148746792	Y	PRMT10,ARHGAP10	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	95445	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	149709037	149709300	149709169	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR3C2	345187	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	149756405	149756578	149756515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR3C2	392555	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	151204830	151205055	151204941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLK2	207404	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	151641898	151642513	151641954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	292366	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	152048107	152048440	152048274	Y	LRBA,LRBA	RPS3A	NA	NA	NA	NA	RPS3A	29382	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	152090134	152090652	152090546	Y	SH3D19	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	71409	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	152117073	152117218	152117121	Y	FAM160A1,SH3D19	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	98348	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	152127737	152127987	152127916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	109012	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	152246032	152246165	152246086	Y	FAM160A1	SH3D19	FAM160A1	IMR90	Hi-C	24141950	SH3D19	1248	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr4	153445736	153446128	153446118	Y	NA	FBXW7,MIR4453	NA	NA	NA	NA	FBXW7	9125	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	154548347	154548481	154548383	Y	KIAA0922,TLR2	NA	NA	NA	NA	NA	SFRP2	159791	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	157868046	157868334	157868214	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	22212	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	157870715	157871133	157870964	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	19413	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	158941982	158942153	158942075	Y	TMEM144	NA	FAM198B,GRIA2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-597D13.9	147751	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	159731152	159732543	159732097	Y	PPID,RAPGEF2,FNIP2	FNIP2	NA	NA	NA	NA	FNIP2	42862	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr4	159732931	159733171	159733059	Y	PPID,RAPGEF2,FNIP2	FNIP2	NA	NA	NA	NA	FNIP2	44641	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	167776737	167777031	167776885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOCK3	376916	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	167910118	167910292	167910246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOCK3	243655	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	169371058	169372404	169371437	Y	DDX60,DDX60L	PALLD	NA	NA	NA	NA	PALLD	43813	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	169853850	169854103	169853858	Y	PALLD	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	75323	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	170023521	170023783	170023621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	94095	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	170193381	170193745	170193612	Y	SH3RF1	SH3RF1	NA	NA	NA	NA	SH3RF1	3125	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	170570348	170570457	170570384	Y	NA	NEK1,CLCN3	NA	NA	NA	NA	CLCN3	38564	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	174337339	174338040	174337759	Y	SAP30	SAP30	HMGB2,GALNT7,SAP30	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SAP30	48219	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	177459522	177459662	177459586	Y	VEGFC	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-87F15.2	219913	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	177705907	177706270	177706189	Y	NA	VEGFC	NA	NA	NA	NA	VEGFC	5611	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	177710943	177711419	177711262	Y	VEGFC	VEGFC	NA	NA	NA	NA	VEGFC	462	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	177715411	177715680	177715585	Y	VEGFC	VEGFC	NA	NA	NA	NA	VEGFC	3530	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr4	177824075	177824477	177824359	Y	NA	NA	VEGFC	IMR90	Hi-C	24141950	VEGFC	112194	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	179336968	179337246	179337206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-45P	300953	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	181844755	181844937	181844843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCTD	1992152	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	184328356	184328744	184328447	Y	CDKN2AIP	CDKN2AIP	WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIP	35000	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	185189434	185189785	185189717	Y	IRF2,CASP3	NA	IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111,MLF1IP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2	203949	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	185304654	185305034	185304819	Y	ACSL1,IRF2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	88700	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr4	185306912	185307204	185307108	Y	ACSL1,IRF2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	86530	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	185589829	185589977	185589872	Y	ACSL1,IRF2	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	21166	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	189329642	189330099	189329860	Y	NA	LINC01060	TRIML1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01060	9752	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr4	190936592	190936699	190936668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	76649	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	190937232	190937266	190937251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	77289	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr4	190942271	190942591	190942322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	82328	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	373695	374160	373984	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67098	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr5	378611	379250	378849	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	62008	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr5	379590	379862	379712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	61396	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr5	389983	390379	390026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	50879	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr5	392668	393182	392808	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	48076	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	394851	394874	394864	Y	NA	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	46384	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	395451	395827	395512	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	45431	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr5	399875	400445	400189	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	40813	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	4.09032356804196
chr5	400756	401055	400906	Y	NA	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	40203	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr5	426647	427011	426980	Y	NA	C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5	NA	NA	NA	NA	C5orf55	14247	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr5	523686	523917	523764	Y	SLC9A3	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2228K2.5	52473	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	672237	672545	672500	Y	EXOC3,CEP72	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18965	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	672861	673336	673024	Y	NA	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18174	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	TPPP	93141	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	1562820	1563021	1562959	Y	SLC12A7,LPCAT1	LPCAT1	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	40728	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	5376440	5376820	5376639	Y	NA	KIAA0947	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	41957	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	81417	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	4.80168418857099
chr5	9888689	9888977	9888832	Y	TAS2R1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM173B	359032	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	10229611	10229778	10229690	Y	NA	FAM173B,CCT5	NA	NA	NA	NA	FAM173B	18231	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	10352620	10352938	10352732	Y	NA	CMBL,MARCH6	NA	NA	NA	NA	MARCH6	805	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	10422961	10423316	10423021	Y	NA	ROPN1L	NA	NA	NA	NA	ROPN1L	16320	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	10692588	10692818	10692805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	66566	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	10759548	10759882	10759715	Y	NA	DAP	NA	NA	NA	NA	DAP	164	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	14186205	14186627	14186374	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	44394	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	14208730	14209007	14208812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	66919	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr5	14250238	14250405	14250312	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	108427	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	14264855	14265210	14264930	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	123044	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr5	14268390	14268821	14268476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	126579	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	14489488	14489835	14489662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM105A	90049	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	14673178	14673249	14673214	Y	NA	EEF1A1P13,FAM105B	NA	NA	NA	NA	FAM105B	10405	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	14742718	14742956	14742837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBBP4P1	53553	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	14809867	14810211	14810035	Y	FAM105A,FAM105B	RBBP4P1	NA	NA	NA	NA	RBBP4P1	13358	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.95624170645485
chr5	14817188	14817452	14817373	Y	NA	RBBP4P1	NA	NA	NA	NA	RBBP4P1	20679	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	16715199	16715528	16715435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	100032	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	16727981	16728387	16728161	Y	FAM134B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	112814	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	16735791	16735955	16735874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	120624	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	16894604	16895174	16894829	Y	NA	MYO10	NA	NA	NA	NA	MYO10	39198	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	17154796	17154999	17154850	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	BASP1	91089	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	17184758	17185051	17184904	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	BASP1	121051	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	19929233	19929395	19929314	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH18	644587	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	24549413	24549679	24549546	Y	CDH10	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD29	259911	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	721816	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr5	31459519	31459540	31459530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DROSHA	70763	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	31894536	31894834	31894609	Y	NA	CTD-2206G10.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2206G10.2	26639	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	32164142	32164348	32164245	Y	ZFR	GOLPH3	NA	NA	NA	NA	GOLPH3	8108	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	32175167	32175567	32175368	Y	NA	GOLPH3,CTD-2186M15.1	NA	NA	NA	NA	GOLPH3	2711	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	32391012	32391652	32391274	Y	SUB1	NA	NA	NA	NA	NA	ZFR	51215	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	33312073	33312323	33312255	Y	NA	CTD-2066L21.3	NPR3,LOC340113	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2066L21.3	16057	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr5	33313222	33313474	33313360	Y	NA	CTD-2066L21.3	NPR3,TARS	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2066L21.3	17206	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr5	33789074	33789288	33789217	Y	ADAMTS12	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS12	101009	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	33807297	33807469	33807384	Y	ADAMTS12	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS12	82828	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	33834348	33834761	33834680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS12	55536	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	33892874	33893172	33893071	Y	NA	ADAMTS12	NA	NA	NA	NA	ADAMTS12	2577	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	34048471	34048803	34048799	Y	NA	AMACR	NA	NA	NA	NA	AMACR	42251	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	34586139	34586737	34586416	Y	NA	NA	RAI14	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAI14	67605	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	34835599	34835693	34835610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRIX1	77788	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	36151218	36151404	36151252	Y	C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	1127	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	36174356	36174616	36174412	Y	SLC1A3,SLC1A3,RANBP3L,C5orf33,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	24265	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	36229884	36229947	36229916	Y	UGT3A1,C5orf33,C5orf33	NA	NA	NA	NA	NA	SKP2	79793	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	36690488	36690876	36690655	Y	NIPBL	CTD-2353F22.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2353F22.1	32421	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr5	36693190	36693464	36693394	Y	NIPBL	CTD-2353F22.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2353F22.1	29833	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	36722958	36723309	36723211	Y	NIPBL	NA	NIPBL,LOC646719	MCF7	ChIA-PET	22265404	CTD-2353F22.1	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	37615302	37615631	37615482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDNF	222157	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	37718043	37718447	37718273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDNF	119341	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	37740558	37740859	37740716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDNF	96929	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	37771819	37772240	37771999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDNF	65548	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr5	37838047	37838605	37838394	Y	GDNF,GDNF,GDNF	GDNF	NA	NA	NA	NA	GDNF	259	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr5	37838959	37839206	37839080	Y	GDNF,GDNF,GDNF	GDNF	NA	NA	NA	NA	GDNF	1171	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	38514652	38514707	38514680	Y	NA	CTD-2263F21.1,MIR3650	NA	NA	NA	NA	MIR3650	40956	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	38538245	38538619	38538432	Y	LIFR	MIR3650	NA	NA	NA	NA	MIR3650	17044	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	38846956	38846992	38846979	Y	OSMR,OSMR	CTD-2127H9.1,OSMR	NA	NA	NA	NA	OSMR	2996	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	38968924	38969094	38969009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	103416	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	39014770	39014929	39014863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	57581	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	39403483	39403837	39403660	Y	NA	C9	NA	NA	NA	NA	C9	19133	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	39411101	39411451	39411362	Y	NA	C9,DAB2	NA	NA	NA	NA	C9	11519	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	39760848	39761179	39761033	Y	NA	NA	PTGER4,PRKAA1,TTC33	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	300446	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	40224075	40224396	40224233	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	PTGER4	453204	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr5	40428361	40428496	40428418	Y	PTGER4	NA	PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	PTGER4	249104	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	40490442	40491221	40490632	Y	PTGER4,CARD6	NA	NA	NA	NA	NA	PTGER4	186379	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	40682862	40683125	40682898	Y	CARD6,PTGER4	PTGER4	NA	NA	NA	NA	PTGER4	5262	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	42505068	42505257	42505244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHR	83189	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr5	42994649	42995346	42995172	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	21185	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.95624170645485
chr5	42999523	42999876	42999700	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	16655	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	43007637	43008177	43007831	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	8354	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	43051482	43051716	43051600	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	ZNF131	11562	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	52319874	52320078	52320019	Y	NA	ITGA2	LOC257396	IMR90	Hi-C	24141950	ITGA2	36718	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	52327592	52327905	52327807	Y	ITGA2	ITGA2	NA	NA	NA	NA	ITGA2	44436	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	52332019	52332357	52332083	Y	FST,ITGA2	ITGA2	NA	NA	NA	NA	ITGA2	48863	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr5	52545484	52545615	52545603	Y	ITGA2,FST	NA	ARL15,FST	IMR90	Hi-C	24141950	MOCS2	141591	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	52714720	52715039	52714904	Y	NA	NA	ARL15	IMR90	Hi-C	24141950	FST	59200	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr5	53309437	53310024	53309694	Y	ARL15	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2081C10.1	195921	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	53466021	53466779	53466401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	137633	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	54197279	54197516	54197431	Y	NA	NA	SNX18,HSPB3,ARL15,CDC20B,GPX8,GZMK,CCNO,ESM1	IMR90	Hi-C	24141950	ESM1	118983	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	54622279	54622499	54622328	Y	NA	DHX29,SKIV2L2	NA	NA	NA	NA	SKIV2L2	20691	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	54722913	54723133	54723024	Y	SKIV2L2	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	101396	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	54729958	54730125	54730050	Y	SKIV2L2,DDX4	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	94404	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	54759780	54760082	54759933	Y	NA	NA	SKIV2L2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF138P1	64447	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	54777886	54777973	54777929	Y	SKIV2L2	RNF138P1	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	46556	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	54897039	54897427	54897238	Y	IL6ST,PPAP2A	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2A	68161	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	55287334	55287994	55287973	Y	NA	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	IL6ST	827	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	55289605	55289989	55289924	Y	IL6ST	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2031P19.3	610	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	55463907	55464287	55464105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2031P19.3	174912	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	56738135	56738571	56738168	Y	ACTBL2	NA	PLK2,ACTBL2	IMR90	Hi-C	24141950	GPBP1	270360	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr5	57706389	57706561	57706467	Y	NA	PLK2	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	PLK2	47526	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	58165920	58166304	58166218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	411833	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	58255899	58256231	58256006	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	501812	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	58332286	58332474	58332297	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	578199	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	58423022	58423147	58423096	Y	PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	668935	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	58866470	58866828	58866806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	949119	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	59042319	59042506	59042428	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	773441	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	60315642	60315784	60315678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFAF2	76686	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	60526663	60526879	60526778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	99221	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	60597691	60598057	60597813	Y	NA	ZSWIM6	ZSWIM6,C5orf43	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZSWIM6	28043	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr5	60624078	60624207	60624180	Y	ELOVL7,ZSWIM6	ZSWIM6	ZSWIM6	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZSWIM6	1893	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	60625710	60626179	60625844	Y	ELOVL7,ZSWIM6	NA	ZSWIM6	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZSWIM6	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	60626321	60626538	60626370	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	221	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	60626678	60627139	60626902	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	578	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr5	60629701	60630027	60629731	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	3601	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr5	64328123	64328532	64328278	Y	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	NA	CWC27	265366	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	64331292	64332267	64331637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWC27	268535	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr5	64398874	64399506	64398924	Y	NA	NA	ADAMTS6,CWC27,PPWD1,CENPK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CWC27	336117	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr5	64459611	64459838	64459685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	315909	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	64498189	64498386	64498364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	277361	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	64505244	64505511	64505327	Y	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	270236	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	64727937	64728302	64728145	Y	NA	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	47445	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	64778400	64778738	64778694	Y	NA	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	2653	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	64809602	64809952	64809754	Y	NA	ADAMTS6,CENPK,PPWD1	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	33855	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	67242397	67242498	67242448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	267050	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	67410541	67410768	67410614	Y	PIK3R1,PIK3R1	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	98780	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	SLC30A5	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	48595	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	71404360	71404518	71404455	Y	MAP1B	MAP1B	NA	NA	NA	NA	MAP1B	3299	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	71852712	71853181	71852905	Y	TNPO1	NA	TNPO1,ZNF366,PTCD2	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS27	238239	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr5	71896178	71896784	71896469	Y	NA	NA	TNPO1,ZNF366,PTCD2	IMR90	Hi-C	24141950	TNPO1	213355	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	72934554	72934908	72934667	Y	RGNEF	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRA2	75043	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	75034241	75034569	75034405	Y	NA	POC5	NA	NA	NA	NA	POC5	22928	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	77374282	77374304	77374295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBCA	211678	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	77792703	77793028	77792954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	138364	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	77797282	77797316	77797309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	142943	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	77803150	77803526	77803443	Y	AP3B1,LHFPL2,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	148811	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr5	77822722	77823939	77823093	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	168383	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr5	77830052	77831195	77830385	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	175713	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	77843471	77844086	77843723	Y	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	189132	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	77892981	77893377	77893333	Y	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	NA	LHFPL2	170467	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	79421543	79422183	79421865	Y	ZFYVE16,FAM151B	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	127715	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	79422868	79423198	79423038	Y	ZFYVE16,FAM151B	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	126700	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	79428091	79428419	79428255	Y	SERINC5	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	121479	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	79458255	79458620	79458438	Y	MSH3,SERINC5	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	91278	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	80372631	80372748	80372736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASGRF2	118140	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	80564528	80564843	80564784	Y	NA	CKMT2-AS1,ZCCHC9	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	30536	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	NA	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP2	102021	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	81661583	81662026	81661933	Y	NA	NA	VCAN	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	89187	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	82576471	82576688	82576580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCAN	188596	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	82673073	82673304	82673128	Y	TMEM167A,XRCC4,VCAN	NA	NA	NA	NA	NA	VCAN	91980	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	82768927	82769141	82769084	Y	VCAN	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	3643	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	82769254	82769739	82769524	Y	VCAN	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	3970	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	82770174	82770695	82770300	Y	NA	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	4890	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	82771448	82771603	82771549	Y	NA	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	6164	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	83545538	83546053	83545791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	132192	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	83585889	83586179	83586107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	92066	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	85654132	85654483	85654435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX7C	257238	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	86417249	86417398	86417310	Y	CCNH,CCNH	NA	MIR4280	K562	ChIA-PET	22265404	RASA1	144307	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	86604017	86604207	86604034	Y	RASA1,RASA1	RASA1	NA	NA	NA	NA	RASA1	42312	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	86620547	86620785	86620574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA1	58842	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	86663167	86663443	86663248	Y	NA	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	43393	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	87530742	87531117	87530930	Y	NA	TMEM161B	NA	NA	NA	NA	TMEM161B	32176	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	88042920	88043139	88043027	Y	MEF2C,MEF2C	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2C-AS1	134006	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	90772639	90772960	90772848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	95463	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	92593669	92593984	92593827	Y	NA	NA	FLJ42709	IMR90	Hi-C	24141950	NR2F1	323059	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	92760867	92761238	92761060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR2F1	155805	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	92914746	92915169	92914912	Y	NR2F1	NR2F1	NA	NA	NA	NA	NR2F1	1874	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	94038768	94039036	94038830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0825	86459	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	94052096	94052474	94052285	Y	KIAA0825	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0825	99787	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	94395359	94395872	94395571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP1	222407	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	95170754	95171173	95170855	Y	GLRX,ELL2	GLRX	RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	14045	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	95178953	95179190	95179087	Y	GLRX,ELL2	GLRX	GLRX,SPATA9,RFESD,RHOBTB3,C5orf27	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	22244	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	95240158	95240487	95240414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELL2	55288	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	95295681	95296335	95296056	Y	ELL2	NA	NA	NA	NA	NA	ELL2	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	95482384	95482735	95482679	Y	NA	NA	ELL2	IMR90	Hi-C	24141950	ELL2	186609	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	95633075	95633361	95633245	Y	GLRX	NA	ELL2,RHOBTB3,MIR583,GLRX,C5orf27,CAST	IMR90	Hi-C	24141950	CAST	225610	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	95845653	95846023	95845804	Y	NA	CAST	NA	NA	NA	NA	CAST	12948	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	95853104	95853290	95853183	Y	ERAP1	CAST	PCSK1,CAST	IMR90	Hi-C	24141950	CAST	5681	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	95986710	95987017	95986807	Y	CAST,CAST	NA	CAST	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CAST	127739	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	97444170	97444562	97444463	Y	NA	NA	RGMB,FLJ35946	IMR90	Hi-C	24141950	CH17-12M21.1	227886	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	97445347	97445652	97445445	Y	NA	NA	FLJ35946,RGMB	IMR90	Hi-C	24141950	CH17-12M21.1	226796	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr5	97645408	97646168	97645558	Y	RGMB	CH17-12M21.1	RGMB,FLJ35946	IMR90	Hi-C	24141950	CH17-12M21.1	26280	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr5	97650049	97650331	97650134	Y	RGMB	CH17-12M21.1	RGMB,FLJ35946	IMR90	Hi-C	24141950	CH17-12M21.1	22117	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	97790785	97791036	97790856	Y	RGMB	NA	FLJ35946,RGMB	IMR90	Hi-C	24141950	CH17-12M21.1	118337	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	98262747	98263243	98263080	Y	CHD1	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	99382569	99383254	99382906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	485712	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr5	102091646	102092087	102091846	Y	NA	PAM	NA	NA	NA	NA	PAM	3961	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr5	102194504	102194814	102194701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAM	106819	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	102304978	102305194	102305031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIP5K2	148659	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	103559627	103559775	103559695	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT12	663133	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.66760232698389
chr5	105752390	105752961	105752697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-6N13.1	1025719	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	106700369	106701196	106700617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	303400	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	106806041	106806198	106806107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	198398	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	106862612	106863005	106862809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	141591	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	106878561	106878904	106878854	Y	EFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	125692	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	106931094	106931453	106931417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	73143	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	107004755	107005118	107004922	Y	NA	EFNA5	NA	NA	NA	NA	EFNA5	159	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	107896272	107896622	107896503	Y	NA	NA	PJA2	IMR90	Hi-C	24141950	FBXL17	180473	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	108747394	108747617	108747516	Y	MAN2A1	PJA2	NA	NA	NA	NA	PJA2	3699	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	110838164	110838531	110838380	Y	WDR36,CAMK4,STARD4	STARD4	NA	NA	NA	NA	STARD4	7757	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	112218687	112219263	112218745	Y	APC	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	23768	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	112219334	112219897	112219506	Y	NA	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	24415	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	112314594	112314663	112314629	Y	NA	DCP2	NA	NA	NA	NA	DCP2	4195	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	112383528	112383665	112383560	Y	DCP2,YTHDC2	NA	NA	NA	NA	NA	DCP2	73129	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	114750887	114751289	114751050	Y	NA	NA	FEM1C	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC112	120359	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	114786469	114786715	114786546	Y	NA	NA	FEM1C,TMED7-TICAM2	IMR90	Hi-C	24141950	FEM1C	91876	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	114847596	114847935	114847760	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	30656	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	114913600	114913827	114913746	Y	NA	FEM1C,TMED7-TICAM2,TICAM2	NA	NA	NA	NA	FEM1C	35009	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	114959651	114959879	114959766	Y	COMMD10	TMED7	NA	NA	NA	NA	TMED7-TICAM2,TICAM2	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	115236990	115237113	115237051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG12	61435	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	115794810	115794877	115794844	Y	COMMD10,SEMA6A	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-118N6.1	101381	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	115855956	115855969	115855965	Y	NA	CTB-118N6.1	NA	NA	NA	NA	CTB-118N6.1	40289	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	118165526	118165828	118165677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP2	141663	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	118733226	118733719	118733474	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	NA	HSD17B4	52419	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	118747047	118747470	118747128	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	HSD17B4	NA	NA	NA	NA	HSD17B4	38668	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	119778960	119779078	119779019	Y	NA	PRR16	NA	NA	NA	NA	PRR16	18895	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	120004624	120004640	120004633	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRR16	206651	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	120563462	120563486	120563474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRFBP1	732170	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	121516793	121517196	121516968	Y	LOX,LOX	NA	NA	NA	NA	NA	LOX	104813	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	125690030	125690185	125690123	Y	GRAMD3,GRAMD3	GRAMD3	GRAMD3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GRAMD3	3639	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr5	125773418	125773804	125773609	Y	GRAMD3	NA	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	79594	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	126738712	126738949	126738790	Y	MEGF10	NA	NA	NA	NA	NA	PRRC1	112352	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	126782344	126782609	126782476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRRC1	68692	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	126847905	126848122	126848004	Y	NA	PRRC1	PRRC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	PRRC1	3179	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	130970028	130970178	130970095	Y	FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6	RAPGEF6	NA	NA	NA	NA	RAPGEF6	1099	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	131074214	131074509	131074363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP1	56201	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	131108111	131108375	131108174	Y	NA	FNIP1	NA	NA	NA	NA	FNIP1	22335	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	131422074	131422446	131422224	Y	NA	CSF2	NA	NA	NA	NA	CSF2	14591	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	131430055	131430830	131430575	Y	RAPGEF6,FNIP1,SLC22A4,IRF1	CSF2	NA	NA	NA	NA	CSF2	22572	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr5	131431180	131431494	131431281	Y	RAPGEF6,FNIP1,SLC22A4,IRF1	CSF2	NA	NA	NA	NA	CSF2	23697	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	131439036	131439325	131439215	Y	NA	CSF2	PDLIM4,IL3	IMR90	Hi-C	24141950	CSF2	31553	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	131560740	131561286	131561173	Y	IL3,CSF2,PDLIM4,P4HA2,P4HA2	PDLIM4	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	30078	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	131601385	131601782	131601639	Y	P4HA2	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	10021	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr5	131832561	131832909	131832704	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8071	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	131833441	131833717	131833513	Y	IRF1	AC116366.6,IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8951	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	131833993	131834254	131834119	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	9503	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,AC010240.3,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AC010240.3	1685	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	132581339	132581487	132581431	Y	ANKRD43	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA4	195685	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	133460352	133460406	133460379	Y	UBE2B,PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7	NA	NA	NA	NA	TCF7	11950	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	133460893	133461176	133461013	Y	PHF15,TCF7,TCF7	TCF7,SKP1	NA	NA	NA	NA	TCF7	12491	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr5	133801466	133801754	133801589	Y	NA	NA	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIPNL	55877	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	133802349	133802592	133802584	Y	PPP2CA,SEC24A,UBE2B	NA	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIPNL	56760	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	133839310	133839404	133839346	Y	NA	NA	PHF15,PPP2CA,CDKL3,CDKN2AIPNL,SAR1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIPNL	93721	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	134469772	134469821	134469797	Y	C5orf20	NA	PCBD2,LOC340073,PITX1,CATSPER3,H2AFY	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITX1	101269	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	134527149	134527274	134527245	Y	NA	NA	CATSPER3,PCBD2,H2AFY,PITX1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITX1	158646	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	135341804	135342193	135341990	Y	FBXL21,TGFBI	TGFBI	TGFBI,VTRNA2-1,FBXL21	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBI	20391	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	135342387	135342803	135342527	Y	TGFBI	TGFBI	TGFBI,VTRNA2-1,FBXL21	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBI	19781	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	135356057	135356513	135356322	Y	NA	TGFBI	VTRNA2-1,TGFBI,FBXL21,LECT2,SMAD5	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBI	6071	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	135416297	135416409	135416350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD5	50125	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr5	136795919	136796307	136796181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOCK1	135761	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	137797072	137797362	137797204	Y	FAM53C,ETF1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1817	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.95624170645485
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	3.73464325777744
chr5	137815410	137815785	137815600	Y	BRD8,HSPA9	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	16231	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	137822279	137822351	137822306	Y	NA	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	23100	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	137827710	137828119	137827817	Y	EGR1	EGR1,ETF1	NA	NA	NA	NA	EGR1	28531	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr5	137868208	137868538	137868536	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	8451	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	138620359	138620541	138620439	Y	UBE2D2,MATR3	MATR3,SIL1	NA	NA	NA	NA	SIL1	6705	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	138838499	138838633	138838566	Y	TMEM173	ECSCR,TMEM173	NA	NA	NA	NA	ECSCR	1695	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	138897527	138897822	138897662	Y	MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2	TMEM173,UBE2D2	DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2D2	6194	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr5	138965572	138965797	138965632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	59087	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	139017086	139017541	139017145	Y	CXXC5	CXXC5	CXXC5	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC5	7343	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	139076374	139076603	139076510	Y	CXXC5	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	51490	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	139167686	139167904	139167758	Y	NA	NA	CXXC5,UBE2D2,DNAJC18,NRG2,PSD2,CYSTM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CXXC5	142802	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	139631101	139631601	139631302	Y	SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	49105	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	139633683	139634086	139633757	Y	SRA1,IK,HBEGF,EIF4EBP3,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	46620	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	139636160	139636260	139636251	Y	SRA1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	44446	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	139638984	139639383	139639269	Y	C5orf32,ZMAT2,SRA1,IK,HARS2,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	41323	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	139677985	139678148	139678067	Y	NA	PFDN1,HBEGF	NA	NA	NA	NA	PFDN1	2558	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	139782360	139782578	139782471	Y	NA	CTC-329D1.3,ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3	NA	NA	NA	NA	ANKHD1-EIF4EBP3	2867	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	140090601	140091006	140090806	Y	NA	WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-1	1741	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	140098281	140098628	140098472	Y	NA	HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-3	5115	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	140888509	140888855	140888756	Y	PCDH12,PCDHGA11,PCDHGA12	PCDHGC3	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	34929	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	140893513	140893891	140893828	Y	PCDH12,KIAA0141,DIAPH1	PCDHGC3	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	39933	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	141056831	141057056	141056944	Y	NA	HDAC3,RELL2,FCHSD1,ARAP3	NA	NA	NA	NA	ARAP3	2732	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	141201064	141201327	141201197	Y	PCDH1	NA	PCDH1,LOC729080,FCHSD1,ARAP3,KIAA0141,PCDH12,RNF14	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0141	100046	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr5	141404371	141404781	141404694	Y	DIAPH1,FCHSD1	GNPDA1	GNPDA1,NDFIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNPDA1	13765	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	141443513	141443887	141443583	Y	NA	NDFIP1	FGF1,NDFIP1,GNPDA1,ARAP3,FCHSD1	IMR90	Hi-C	24141950	NDFIP1	42183	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	141736379	141736797	141736670	Y	ARHGAP26	AC005592.2,SPRY4	NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPRY4	32359	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr5	141805995	141806051	141806008	Y	NA	NA	SPRY4,FGF1,NDFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	101975	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	141825669	141826086	141825870	Y	SPRY4	NA	NDFIP1,SPRY4,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	121649	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	141851932	141852283	141852109	Y	NA	NA	SPRY4,GNPDA1,NDFIP1,FGF1,RNF14	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	147912	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	141917041	141917377	141917209	Y	NA	NA	NDFIP1,SPRY4,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	213021	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	142388287	142389194	142388887	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	240338	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	142584878	142585235	142585051	Y	ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	124935	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	142623562	142623962	142623719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	86208	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	142697698	142698151	142698028	Y	NR3C1,NR3C1	RPL7P21	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	12019	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	142933744	142934083	142933945	Y	NR3C1,NR3C1	NA	NR3C1,ARHGAP26,HMHB1,KCTD16,YIPF5	IMR90	Hi-C	24141950	NR3C1	120667	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	142962532	142962958	142962674	Y	NR3C1,NR3C1	NA	HMHB1,NR3C1,ARHGAP26	IMR90	Hi-C	24141950	NR3C1	149455	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	143300463	143300651	143300509	Y	NA	NA	ARHGAP26,NR3C1	IMR90	Hi-C	24141950	YIPF5	247627	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	143858927	143858997	143858987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD16	310531	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	145326011	145326414	145326305	Y	NA	SH3RF2	NA	NA	NA	NA	SH3RF2	11869	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	145827727	145827826	145827802	Y	NA	TCERG1	GPR151	IMR90	Hi-C	24141950	TCERG1	2853	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	146783633	146784144	146783972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	103475	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	147024840	147025034	147024978	Y	DPYSL3,JAKMIP2	NA	NA	NA	NA	NA	JAKMIP2	135304	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	147218600	147219023	147218871	Y	SPINK1	NA	JAKMIP2	IMR90	Hi-C	24141950	JAKMIP2	58262	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	148352583	148352893	148352766	Y	ADRB2	NA	NA	NA	NA	NA	ADRB2	148427	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr5	148514080	148514173	148514127	Y	NA	ABLIM3	ABLIM3,AFAP1L1,ADRB2,SH3TC2	IMR90	Hi-C	24141950	ABLIM3	4873	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	148552711	148552897	148552801	Y	NA	ABLIM3	AFAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	ABLIM3	33665	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	148591795	148592037	148591918	Y	ABLIM3	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L1	57397	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	148664180	148664379	148664280	Y	NA	AFAP1L1	NA	NA	NA	NA	AFAP1L1	14746	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	148832906	148833066	148832986	Y	NA	MIR143HG,MIR143	NA	NA	NA	NA	MIR143	26425	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	148835583	148835880	148835720	Y	NA	MIR143	NA	NA	NA	NA	MIR143	29102	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	148869266	148869383	148869317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1	59624	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	149110836	149111455	149111198	Y	ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2975	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr5	149445526	149445798	149445671	Y	SLC26A2,HMGXB3,CD74,CD74	NA	NA	NA	NA	NA	TIGD6	66796	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	149789263	149789759	149789627	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,CD74,CD74	CD74,RPS14	NA	NA	NA	NA	CD74	733	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	149852669	149852742	149852704	Y	NA	RPS14,NDST1,CTC-367J11.1	SYNPO,MYOZ3,C5orf62,RPS14,NDST1,DCTN4,RBM22	IMR90	Hi-C	24141950	NDST1	10639	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	150086779	150087134	150086956	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4	RBM22,DCTN4	MYOZ3,RBM22	IMR90	Hi-C	24141950	RBM22	8110	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	150142965	150143377	150143063	Y	CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62	DCTN4	DCTN4,C5orf62	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	DCTN4	6294	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	150159490	150160262	150159991	Y	CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62	DCTN4	NA	NA	NA	NA	DCTN4	22819	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	8.71416760148069
chr5	150161319	150161633	150161505	Y	ANXA6,C5orf62	DCTN4	NA	NA	NA	NA	DCTN4	24648	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr5	150163031	150163501	150163387	Y	TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,C5orf62	DCTN4	NA	NA	NA	NA	DCTN4	26360	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	150169826	150170319	150169982	Y	CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62	DCTN4	NA	NA	NA	NA	DCTN4	33155	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	150476545	150477196	150477013	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,TNIP1,CCDC69	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	5407	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	151078700	151079028	151078874	Y	ATOX1,SPARC	SPARC	SPARC,ATOX1	IMR90	Hi-C	24141950	SPARC	13974	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	151119916	151120243	151119990	Y	NA	RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1	SPARC	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-54C4.1	23696	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr5	151213355	151213633	151213423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	63262	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	151307213	151307514	151307357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	157120	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	152494885	152495216	152495051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAP3	921250	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	153008472	153008835	153008712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAP3	407631	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	154219246	154219480	154219363	Y	NA	CNOT8	NA	NA	NA	NA	CNOT8	15633	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	154274946	154275114	154275030	Y	NA	CNOT8,GEMIN5,MRPL22	NA	NA	NA	NA	CNOT8	39833	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	SGCD	423306	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr5	155107244	155107656	155107286	Y	NA	NA	PPP1R2P3,TIMD4,SGCD	IMR90	Hi-C	24141950	SGCD	187698	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	156708045	156708232	156708114	Y	HAVCR2,NIPAL4,ADAM19,CYFIP2,CYFIP2,CYFIP2	CYFIP2	NA	NA	NA	NA	CYFIP2	16956	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	156814689	156815040	156814693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPAL4	69987	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	156943029	156943356	156943193	Y	HAVCR2,NIPAL4,ADAM19	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM19	57427	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	157029541	157029807	157029692	Y	HAVCR2,NIPAL4,ADAM19	ADAM19	CYFIP2,FNDC9,NIPAL4,ADAM19,SOX30,C5orf52,THG1L,LSM11	IMR90	Hi-C	24141950	ADAM19	28758	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	157097652	157097963	157097872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THG1L	58242	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	157817633	157817942	157817746	Y	NA	NA	EBF1,LOC285626,IL12B	IMR90	Hi-C	24141950	CLINT1	533450	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	158364876	158365080	158364964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EBF1	159689	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	158366953	158367057	158367005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EBF1	157712	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	158478339	158478495	158478452	Y	EBF1	EBF1,RP11-175K6.1	NA	NA	NA	NA	EBF1	46274	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	159414162	159414427	159414404	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	19693	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr5	159451021	159451194	159451125	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	16901	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	159533500	159533764	159533742	Y	NA	PWWP2A	NA	NA	NA	NA	PWWP2A	10666	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr5	159592107	159592427	159592336	Y	NA	PWWP2A,FABP6	TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FABP6	19947	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr5	159592617	159593055	159592885	Y	NA	PWWP2A,FABP6	TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FABP6	19319	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr5	159896720	159897088	159896809	Y	NA	PTTG1	NA	NA	NA	NA	PTTG1	49891	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	171540284	171540310	171540295	Y	STK10	NA	NA	NA	NA	NA	STK10	73080	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	171560333	171560981	171560496	Y	UBTD2,STK10	NA	NA	NA	NA	NA	STK10	52409	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	171788471	171789086	171788773	Y	DUSP1,STK10,UBTD2	NA	NA	NA	NA	NA	UBTD2	79396	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	171839597	171840252	171839919	Y	DUSP1,STK10,UBTD2	SH3PXD2B	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2B	39275	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	172160207	172160396	172160286	Y	NA	DUSP1	ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	35802	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	172160417	172160946	172160788	Y	ATP6V0E1	DUSP1	ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	35252	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	172192263	172193766	172192583	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2432	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	172198749	172199959	172199636	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2551	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr5	172225425	172225974	172225664	Y	ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1,ERGIC1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	29227	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	172257827	172258390	172258174	Y	DUSP1,C5orf41,ERGIC1	ERGIC1	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	888	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	172288216	172288483	172288386	Y	DUSP1,C5orf41,ERGIC1	ERGIC1	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	28938	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	172881373	172881649	172881564	Y	CPEB4	NA	LOC285593,STC2,BOD1,CPEB4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STC2	126867	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	172882283	172882785	172882503	Y	NA	NA	LOC285593,STC2,BOD1,NKX2-5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STC2	127777	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr5	172899322	172899544	172899428	Y	NA	NA	LOC285593,STC2,BOD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BOD1	142119	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	173191567	173191754	173191643	Y	CPEB4	NA	CPEB4,C5orf47	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	121529	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	176543923	176544044	176544003	Y	TSPAN17,PRR7,DBN1	NSD1	NA	NA	NA	NA	NSD1	13982	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	176973275	176973657	176973542	Y	NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3	DDX41,FAM193B,TMED9	NA	NA	NA	NA	FAM193B	5885	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	177645267	177645446	177645363	Y	N4BP3,CLK4,AGXT2L2	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15759	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr5	178692524	178692976	178692825	Y	ADAMTS2	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS2	77455	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	178820200	178820548	178820392	Y	SQSTM1,RUFY1,MAML1,HNRNPH1	ADAMTS2	ADAMTS2,CLK4,ZNF454	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS2	49769	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	179206190	179206408	179206299	Y	NA	MAML1,LTC4S,SQSTM1,MGAT4B	NA	NA	NA	NA	LTC4S	12573	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	179465387	179465429	179465409	Y	MAML1,MGAT4B,RNF130	RNF130	NA	NA	NA	NA	RNF130	31689	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	179517331	179517686	179517646	Y	HNRNPH1,MAML1,RNF130	RNF130	NA	NA	NA	NA	RNF130	20213	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr5	180611137	180611357	180611292	Y	MGAT1	CTC-338M12.5,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	5567	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	472688	472701	472695	Y	HUS1B,EXOC2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF4	82949	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	1131986	1132306	1132130	Y	NA	NA	LOC285768	IMR90	Hi-C	24141950	FOXQ1	178369	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.31192201671937
chr6	1298118	1298254	1298186	Y	NA	FOXQ1	EXOC2,LOC285768,FOXF2	IMR90	Hi-C	24141950	FOXQ1	12421	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	1394442	1394694	1394568	Y	NA	FOXF2	NA	NA	NA	NA	FOXF2	6373	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	2952080	2952258	2952142	Y	SERPINB1,RIPK1,SERPINB9,NQO2	SERPINB6,NQO2	NA	NA	NA	NA	SERPINB6	17832	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	3248062	3248427	3248198	Y	SLC22A23,TUBB2A,TUBB2B	PSMG4	TUBB2A,BPHL,RIPK1,LOC100507194,TUBB2B	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG4	18425	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	3356099	3356749	3356628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	98507	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr6	3389811	3390490	3390264	Y	SERPINB6,SLC22A23,C6orf145	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	64766	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	3426515	3426916	3426721	Y	NA	SLC22A23	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	28340	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	5660943	5661332	5661178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARS2	401666	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	6008887	6009261	6009138	Y	NRN1	NA	NA	NA	NA	NA	FARS2	749610	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	7261407	7261720	7261663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-69L16.5	76081	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	7392474	7392879	7392481	Y	NA	SSR1,RIOK1,CAGE1	NA	NA	NA	NA	CAGE1	4498	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	11270585	11270869	11270602	Y	TMEM170B,MAK,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	109712	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	11316345	11316699	11316437	Y	TMEM170B,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	63882	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	11331718	11332104	11332092	Y	NA	NEDD9	NA	NA	NA	NA	NEDD9	48477	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	12052115	12052407	12052202	Y	HIVEP1	HIVEP1	NA	NA	NA	NA	HIVEP1	45120	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	13302642	13303798	13303216	Y	GFOD1,GFOD1,TBC1D7	TBC1D7	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	23017	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	13391107	13391478	13391293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	64292	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	13649579	13649948	13649702	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	36020	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	13651430	13651585	13651505	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	37871	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	13766479	13766874	13766549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP9	56683	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	14671680	14671958	14671829	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	555808	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	14706582	14707144	14706813	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	537383	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	14711169	14711813	14711625	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	532714	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	14713126	14713654	14713380	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	530873	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	14732820	14733791	14733202	Y	NA	NA	DTNBP1,JARID2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	510736	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	14733801	14734229	14733883	Y	NA	NA	DTNBP1,JARID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	510298	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	14744083	14744613	14744392	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	499914	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	15313668	15313748	15313709	Y	DTNBP1,JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2-AS1	66803	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	16652450	16652671	16652543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN1	107051	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	16668776	16668955	16668866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN1	90767	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	16766520	16766751	16766672	Y	NA	ATXN1	ATXN1	K562	ChIA-PET	22265404	ATXN1	6798	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	16771345	16771373	16771363	Y	NA	ATXN1	ATXN1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ATXN1	11623	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	17703484	17703614	17703560	Y	KDM1B,FAM8A1,NUP153	NUP153	NA	NA	NA	NA	NUP153	1042	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	17712711	17712926	17712817	Y	NA	NUP153	FAM8A1,NUP153,KIF13A	IMR90	Hi-C	24141950	NUP153	8055	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	17864491	17864751	17864619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF13A	121103	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	17932767	17932988	17932837	Y	RNF144B,KDM1B	NA	NA	NA	NA	NA	KIF13A	52866	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	18150871	18151234	18151053	Y	NUP153,KDM1B	NHLRC1,TPMT,KDM1B	NA	NA	NA	NA	TPMT	2071	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	18503772	18504216	18504116	Y	NA	NA	RNF144B,DEK	IMR90	Hi-C	24141950	DEK	240718	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	21022706	21023638	21022736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	490018	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	21098770	21098791	21098780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	493181	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	21129910	21130117	21129994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	461855	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	21258987	21259049	21259040	Y	NA	NA	CDKAL1	IMR90	Hi-C	24141950	SOX4	332923	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	21587723	21589288	21589205	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2684	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	24951869	24952437	24952321	Y	ALDH5A1,KIAA0319,KIAA0319,TDP2,C6orf62	PPIAP29	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	PPIAP29	22210	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	25094713	25094741	25094729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP29	120066	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	25303199	25303368	25303284	Y	NA	LRRC16A	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	25893	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	25525007	25525226	25525060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AA	199564	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	25535758	25535798	25535770	Y	HIST1H4B,HIST1H4A,HIST1H3B,HIST1H3A,HIST1H2AB	NA	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AA	188992	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2	NA	NA	NA	NA	HIST1H1A	22967	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	3.55680310264518
chr6	26026306	26026795	26026679	Y	HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A	HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H4B	826	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HFE,HIST1H4C,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr6	26437952	26438171	26438062	Y	HIST1H4G,BTN1A1	BTN3A1,BTN2A3P,BTN3A3,BTN2A1	NA	NA	NA	NA	BTN3A3	529	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	26462244	26462270	26462257	Y	BTN2A1,BTN2A1	BTN2A3P,BTN3A3,BTN2A1	NA	NA	NA	NA	BTN2A1	6094	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	26521003	26521206	26521108	Y	HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	927	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	26522673	26522990	26522813	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	2597	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	26536966	26537248	26536997	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	333	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	26537641	26538043	26537718	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	1008	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	27136362	27136689	27136526	Y	NA	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AH	23501	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	27145585	27145720	27145705	Y	FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	31303	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	27203038	27203420	27203229	Y	NA	RP11-209A2.1	OR2B2,LOC100131289,ZNF184	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-209A2.1	26015	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	27416333	27416557	27416445	Y	NA	ZNF184	NA	NA	NA	NA	ZNF184	22340	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	27446506	27447382	27447356	Y	NA	ZNF184	ZNF184,HIST1H2AG,MIR3143,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,PRSS16,LOC100131289,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,OR2B2,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2AM	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF184	7609	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr6	27807310	27807672	27807617	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BN	2987	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	28072476	28072872	28072543	Y	HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192	ZNF165,ZSCAN16	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	17466	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	28414953	28415259	28415025	Y	NA	ZSCAN12,ZSCAN23	NA	NA	NA	NA	ZSCAN23	5674	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	28457225	28458028	28457315	Y	NA	ZSCAN23	NA	NA	NA	NA	ZSCAN23	47946	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr6	28885422	28885544	28885424	Y	NA	HCG14,TRIM27	NA	NA	NA	NA	TRIM27	4222	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	28956602	28956848	28956725	Y	NA	HCG15,ZNF311	NA	NA	NA	NA	HCG15	4622	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	29932777	29932958	29932802	Y	HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A	HLA-K,HLA-A	NA	NA	NA	NA	HLA-A	25740	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	30069810	30070038	30069951	Y	HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11	NA	NA	NA	NA	PPP1R11	37324	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	30254050	30254472	30254356	Y	NA	HLA-L,TRIM39,HCG18	NA	NA	NA	NA	HLA-L	28689	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	30453844	30454132	30453996	Y	ZNRD1,TUBB	RANP1,HLA-E	HLA-E	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HLA-E	1112	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	30649746	30650798	30650074	Y	TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949	C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB	NA	NA	NA	NA	PPP1R18	2874	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr6	30731781	30732171	30732168	Y	NA	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	21450	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	30737456	30737900	30737560	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3	FLOT1,IER3	DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A,MRPS18B,PPP1R10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	27125	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	30787859	30788252	30788206	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,IER3	NA	FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DDR1	53946	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	30840574	30840974	30840689	Y	ABCF1,C6orf136	DDR1,GTF2H4,VARS2	DHX16,VARS2,DPCR1,DDR1,MUC22,CCHCR1,MDC1,PPP1R18,NRM,TUBB,IER3,FLOT1,SFTA2,PSORS1C1,C6orf15,PSORS1C2	IMR90	Hi-C	24141950	DDR1	1224	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	30926851	30926868	30926858	Y	ATAT1,ATAT1,PBMUCL1,DDR1,DDR1,DDR1,DDR1	NA	NA	NA	NA	NA	VARS2	52832	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	31702368	31703528	31702658	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5	NA	NA	NA	NA	CLIC1	2012	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr6	31705604	31706142	31705906	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1	NA	NA	NA	NA	MSH5	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	32050642	32051035	32051003	Y	LY6G6C,TNXB,PPT2,PPT2,TNXB	TNXB,ATF6B,FKBPL	NA	NA	NA	NA	TNXB	30076	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	32081652	32082042	32081917	Y	NA	TNXB,ATF6B,FKBPL,PPT2,PRRT1,EGFL8	NA	NA	NA	NA	TNXB	541	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	32783377	32783532	32783485	Y	HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DQB2,TAPBP,RGL2,BRD2,BRD2,B3GALT4,TAP2,HLA-DOB	TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1	NA	NA	NA	NA	TAP2	21025	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	32956037	32956271	32956088	Y	NA	HLA-DMB,BRD2,HLA-DMA,BRD2-IT1	NA	NA	NA	NA	BRD2-IT1	20028	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	33216178	33216307	33216243	Y	NA	SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1,HCG25,RPS18,VPS52,B3GALT4,PFDN6,WDR46,RGL2	NA	NA	NA	NA	HCG25	867	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	33386765	33387072	33386901	Y	HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,HLA-DPA1,HLA-DPB1	KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	SYNGAP1	918	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	33392796	33393285	33393082	Y	SYNGAP1	KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	SYNGAP1	6949	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	33538911	33539356	33539169	Y	LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	6663	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	33558672	33558897	33558785	Y	NA	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	12653	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	33581625	33581918	33581825	Y	NA	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	ITPR3	4224	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	34191726	34192136	34191830	Y	C6orf1,HMGA1	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CYCSP55	6510	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	34358644	34359014	34358829	Y	NA	NUDT3,RPS10	NA	NA	NA	NA	NUDT3	193	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	34625381	34625487	34625387	Y	HMGA1	C6orf106	NA	NA	NA	NA	C6orf106	37149	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	35149645	35149913	35149805	Y	NA	NA	UHRF1BP1,ANKS1A,SCUBE3,ZNF76,TCP11	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF76	74773	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	35336371	35336758	35336422	Y	NA	PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	28036	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	35337950	35338511	35338285	Y	ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD	PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	29615	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	36010041	36010276	36010159	Y	NA	MAPK14	NA	NA	NA	NA	MAPK14	16553	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	36321421	36321620	36321472	Y	CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7	RP1-50J22.4	NA	NA	NA	NA	RP1-50J22.4	30988	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr6	36391024	36391283	36391227	Y	SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,PXT1	RP1-50J22.4,KCTD20	NA	NA	NA	NA	KCTD20	17261	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	36404249	36404468	36404378	Y	MAPK14,PNPLA1,STK38	KCTD20	ETV7	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD20	4076	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	36409257	36409482	36409373	Y	MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20	KCTD20	NA	NA	NA	NA	KCTD20	713	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	36821118	36821514	36821315	Y	NA	C6orf89,PPIL1	CPNE5	IMR90	Hi-C	24141950	C6orf89	16132	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	37063832	37064083	37063943	Y	NA	NA	PIM1,PPIL1,FGD2,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89	IMR90	Hi-C	24141950	PIM1	71896	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	37070053	37070857	37070460	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	65122	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	37093441	37093739	37093580	Y	NA	PIM1	PIM1,PPIL1,FGD2,C6orf89,TMEM217,CPNE5,MTCH1,TBC1D22B,CDKN1A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	42240	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	37102324	37102775	37102642	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	33204	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	37104908	37105418	37105405	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	30561	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	37178650	37178811	37178707	Y	NA	PIM1,TBC1D22B	NA	NA	NA	NA	PIM1	42671	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	37271813	37272101	37271931	Y	PIM1,TBC1D22B	TBC1D22B,RNF8	NA	NA	NA	NA	RNF8	47647	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	37673124	37673343	37673226	Y	NA	NA	MDGA1	K562	ChIA-PET	22265404	ZFAND3	111932	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	37673638	37673745	37673684	Y	NA	NA	MDGA1	K562	ChIA-PET	22265404	ZFAND3	111530	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	37752102	37752667	37752552	Y	MDGA1	ZFAND3	BTBD9,ZFAND3,FTSJD2,CCDC167,MDGA1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND3	32608	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	37879889	37880256	37879963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	94614	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	39334666	39335042	39334859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAYSD1	253701	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	41528607	41528881	41528714	Y	TAF8,CCND3,NFYA,TFEB	FOXP4	NA	NA	NA	NA	FOXP4	16443	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	41906927	41907077	41907010	Y	CCND3	USP49,MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	20001	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	42259187	42259201	42259195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS10	75584	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	42279921	42280349	42280253	Y	TRERF1	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS10	96318	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	42420719	42421067	42420926	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	2930	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	42515407	42515543	42515467	Y	NA	UBR2	TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBR2	14257	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	42694331	42694739	42694439	Y	KLC4,KLC4,CUL9,TRERF1,C6orf226,PRPH2,TBCC	TBCC	NA	NA	NA	NA	TBCC	17819	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	44011946	44012485	44012109	Y	NA	NA	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM63B	80166	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	44019349	44019523	44019394	Y	NA	NA	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,VEGFA,MRPS18A,MAD2L1BP,C6orf223	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM63B	73128	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	44022822	44022968	44022901	Y	NA	NA	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM63B	69683	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	44026121	44027353	44026480	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	NA	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM63B	65298	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr6	44031882	44032664	44032378	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	NA	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MAD2L1BP,C6orf223,MRPS18A,VEGFA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM63B	59987	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	44205272	44205504	44205346	Y	NFKBIE	SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	HSP90AB1	7320	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	44458019	44458222	44458132	Y	NA	NA	SUPT3H,RUNX2,CLIC5	IMR90	Hi-C	24141950	CDC5L	104757	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	44835345	44835718	44835412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RUNX2	458176	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	45299468	45299716	45299591	Y	NA	RUNX2,SUPT3H	NA	NA	NA	NA	RUNX2	5574	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	45319946	45320392	45320176	Y	NA	RUNX2,SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	23298	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	45338943	45339150	45338952	Y	RUNX2	RUNX2,SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	4540	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	45390987	45391259	45391097	Y	RUNX2	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	47297	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	45391820	45391891	45391857	Y	RUNX2	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	48130	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	45413515	45413853	45413708	Y	RUNX2	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	69825	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	45428920	45429031	45428964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	85230	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	45503403	45503548	45503462	Y	RUNX2	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	159713	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	45623562	45623937	45623654	Y	NA	NA	RUNX2,SUPT3H,CLIC5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUPT3H	279872	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	45665421	45665594	45665503	Y	NA	NA	RUNX2,CDC5L,CLIC5	IMR90	Hi-C	24141950	SUPT3H	321731	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	50683623	50683755	50683704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFAP2B	100681	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	50785208	50785298	50785212	Y	NA	TFAP2B,RPS17P5	NA	NA	NA	NA	TFAP2B	772	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	52022474	52022690	52022600	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCM3	124989	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	52217307	52217701	52217502	Y	NA	PAQR8	PAQR8,MCM3,EFHC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAQR8	6518	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	52242466	52242866	52242548	Y	NA	PAQR8,EFHC1	NA	NA	NA	NA	PAQR8	18247	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	52376478	52376751	52376615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	62962	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	52377018	52377269	52377212	Y	GSTA5,TRAM2	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	62444	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	52382425	52382779	52382512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	56934	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	52404444	52404567	52404560	Y	NA	TRAM2	EFHC1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAM2	35146	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	52522235	52522527	52522515	Y	NA	TMEM14A	NA	NA	NA	NA	TMEM14A	11380	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	53167531	53167800	53167691	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	44147	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	53224045	53224723	53224315	Y	NA	ELOVL5	ELOVL5	K562	ChIA-PET	22265404	ELOVL5	12098	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr6	53412768	53413364	53413026	Y	GCLC	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	66404	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	56315031	56315399	56315215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL21A1	58139	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	57123026	57123284	57123221	Y	BAG2,RAB23,RAB23	RAB23	RAB23,ZNF451,BAG2,PRIM2,KIAA1586,BEND6	IMR90	Hi-C	24141950	RAB23	37948	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	57178706	57179008	57178897	Y	RAB23	PRIM2	BAG2,ZNF451,PRIM2	IMR90	Hi-C	24141950	PRIM2	1103	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	57395913	57396073	57396021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	218310	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	57396616	57396964	57396757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	219013	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	57561032	57561048	57561040	Y	NA	NA	PRIM2	IMR90	Hi-C	24141950	PRIM2	383429	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	58777244	58778438	58777771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	522675	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	64398084	64398491	64398303	Y	PHF3	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	54359	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	64629183	64629230	64629207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-59D5__B.2	114454	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	71064198	71064205	71064202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM135A	56439	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	74289769	74290568	74290415	Y	MB21D1,SLC17A5,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	58249	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr6	74861347	74861685	74861516	Y	NA	NA	COL12A1	IMR90	Hi-C	24141950	CD109	457839	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	75853490	75853812	75853630	Y	COL12A1	NA	NA	NA	NA	NA	COL12A1	59955	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	75917428	75917795	75917727	Y	NA	COL12A1,COX7A2	NA	NA	NA	NA	COL12A1	3661	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	79835760	79835776	79835768	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	49807	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	80246020	80246303	80246162	Y	NA	LCA5	NA	NA	NA	NA	LCA5	845	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	81167165	81167315	81167240	Y	NA	NA	FAM46A	IMR90	Hi-C	24141950	BCKDHB	352801	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	86113432	86113601	86113525	Y	NT5E	NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	NT5E	44208	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	86114496	86114829	86114663	Y	NT5E	NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	NT5E	42980	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	86370103	86370257	86370180	Y	NA	SYNCRIP,SNHG5	NA	NA	NA	NA	SNHG5	16194	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	88213981	88214157	88214070	Y	GJB7	SLC35A1	NA	NA	NA	NA	SLC35A1	35640	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	89744998	89746016	89745827	Y	UBE2J1,PNRC1	PNRC1	PNRC1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PNRC1	42454	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	89796215	89796534	89796231	Y	NA	PNRC1	NA	NA	NA	NA	PNRC1	7745	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	90061423	90061611	90061503	Y	RNGTT,SRSF12,GABRR1,UBE2J1	UBE2J1	NA	NA	NA	NA	UBE2J1	856	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	91004075	91004656	91004496	Y	MDN1,BACH2,BACH2	NA	NA	NA	NA	NA	BACH2	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	93802046	93802077	93802062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA7	325188	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	96292932	96293309	96293121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEA	269513	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	97632369	97632997	97632691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMS22L	96096	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	99280317	99280875	99280652	Y	POU3F2	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL4	112974	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	99901572	99901766	99901669	Y	NA	RP11-98I9.4,PNISR	NA	NA	NA	NA	PNISR	30365	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	100002359	100002730	100002672	Y	PNISR,USP45,LOC100130890	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	12119	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	100051584	100051769	100051603	Y	NA	CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	36735	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	101149750	101149957	101149936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-121G13.3	173598	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	105043045	105043499	105043369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HACE1	262295	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	105707945	105708326	105708046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POPDC3	82075	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	106252415	106252491	106252453	Y	PRDM1	NA	ATG5,PRDM1	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	279704	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	106440406	106440671	106440473	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	91524	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	106442094	106442641	106442261	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	89554	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr6	106442778	106443178	106442990	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	89017	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr6	106511410	106511721	106511566	Y	NA	PRDM1	ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	20474	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	106532439	106532606	106532449	Y	PRDM1	PRDM1	NA	NA	NA	NA	PRDM1	244	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	106611101	106611647	106611464	Y	PRDM1	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM1	78906	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	108169525	108169909	108169631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63	107484	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	108324190	108324471	108324239	Y	NA	SEC63,RPL3P7	NA	NA	NA	NA	RPL3P7	301	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	108879164	108879427	108879300	Y	SESN1,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	126	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	108879521	108879931	108879808	Y	SESN1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	483	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr6	108883670	108884545	108884024	Y	OSTM1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	4632	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr6	109558807	109559007	109558956	Y	SMPD2,MICAL1,CD164	NA	CD164,CCDC162P	K562	ChIA-PET	22265404	CD164	142755	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	109672770	109673128	109672949	Y	NA	CD164	NA	NA	NA	NA	CD164	28634	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	111049772	111049981	111049963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK19	85180	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	111382725	111382978	111382849	Y	AMD1,AMD1,REV3L,SLC16A10	SLC16A10	NA	NA	NA	NA	SLC16A10	23803	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	3.9124834129097
chr6	111720734	111721265	111721077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	81449	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	111784023	111784230	111784203	Y	NA	TRAF3IP2-AS1,REV3L	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	18484	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	111841823	111842197	111842010	Y	NA	TRAF3IP2-AS1,REV3L	NA	NA	NA	NA	REV3L	38905	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	111873587	111873978	111873729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	51503	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	111924339	111924647	111924531	Y	TRAF3IP2	TRAF3IP2	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	834	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	111925507	111925888	111925538	Y	REV3L,TRAF3IP2	TRAF3IP2	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	26	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr6	112078631	112078983	112078811	Y	REV3L,FYN,FYN,FYN	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	113672	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	112292948	112293337	112293186	Y	REV3L,TRAF3IP2,FYN	NA	FYN,TRAF3IP2,TRAF3IP2-AS1,REV3L	IMR90	Hi-C	24141950	FYN	100293	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	112358882	112359559	112359206	Y	TRAF3IP2	TUBE1	FYN,TRAF3IP2-AS1,TRAF3IP2,REV3L	IMR90	Hi-C	24141950	TUBE1	47173	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	112364338	112364486	112364397	Y	TRAF3IP2,FYN,FYN,FYN	TUBE1	FYN,TRAF3IP2-AS1,TRAF3IP2,REV3L	IMR90	Hi-C	24141950	TUBE1	42246	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	112428707	112428734	112428721	Y	LAMA4	TUBE1	NA	NA	NA	NA	TUBE1	21975	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	112470522	112470637	112470580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBE1	63790	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	112552727	112553228	112552920	Y	LAMA4	LAMA4	NA	NA	NA	NA	LAMA4	20913	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	112573913	112574044	112574030	Y	LAMA4	LAMA4	NA	NA	NA	NA	LAMA4	97	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	113885832	113886201	113886017	Y	MARCKS	NA	FLJ34503,MARCKS	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-367G18.1	83075	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	113951649	113952852	113952545	Y	MARCKS	RP11-367G18.1	MARCKS,FLJ34503,LOC285758,HDAC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-367G18.1	16424	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	114176108	114176553	114176196	Y	MARCKS	NA	NA	NA	NA	NA	MARCKS	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	116707738	116708095	116707832	Y	ZUFSP,DSE,FAM26F	NA	NA	NA	NA	NA	FAM26F	72438	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	116731952	116732286	116732048	Y	DSE,FAM26F	FAM26F	NA	NA	NA	NA	FAM26F	48247	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	116772615	116772756	116772721	Y	ZUFSP,DSE,FAM26F	FAM26F	NA	NA	NA	NA	FAM26F	7777	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	117819510	117819668	117819589	Y	NA	DCBLD1	NA	NA	NA	NA	DCBLD1	46530	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	118648714	118648964	118648839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-632C17__A.1	330576	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	119210409	119210579	119210468	Y	NA	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	2805	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	119214275	119214495	119214295	Y	C6orf204,C6orf204,FAM184A,MCM9,ASF1A	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	891	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	119468463	119468799	119468540	Y	FAM184A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM184A	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	121530032	121530291	121530288	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GJA1	224547	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	121758280	121758805	121758450	Y	GJA1	GJA1,RNU4-35P	NA	NA	NA	NA	GJA1	3442	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr6	121759226	121759877	121759689	Y	GJA1	GJA1,RNU4-35P	NA	NA	NA	NA	GJA1	4388	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	122253904	122254092	122253993	Y	NA	NA	GJA1	IMR90	Hi-C	24141950	HSF2	464599	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	125622252	125622475	125622321	Y	NA	HDDC2	NA	NA	NA	NA	HDDC2	970	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	126112858	126113033	126112985	Y	TRMT11,HINT3,NCOA7	NCOA7	NA	NA	NA	NA	NCOA7	12551	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	126241150	126241321	126241235	Y	NCOA7	HINT3	NA	NA	NA	NA	HINT3	34606	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	126279126	126279509	126279187	Y	NCOA7	HINT3,TRMT11	NA	NA	NA	NA	HINT3	3199	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	127638757	127639069	127638966	Y	NA	ECHDC1	NA	NA	NA	NA	ECHDC1	23685	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	127981338	127981402	127981371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226557	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	128607751	128608140	128608092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	231730	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	128617083	128617221	128617152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	222649	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	128637396	128637725	128637581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	202145	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	128675135	128675339	128675237	Y	PTPRK,PTPRK	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	164531	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	128921613	128921847	128921739	Y	NA	NA	PTPRK	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTPRK	81743	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	130005105	130005433	130005370	Y	L3MBTL3,ARHGAP18	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	23937	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	130342212	130342458	130342393	Y	SAMD3,SAMD3,L3MBTL3	L3MBTL3	NA	NA	NA	NA	L3MBTL3	9368	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	130922387	130922557	130922422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM200A	237508	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	130923561	130923822	130923693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM200A	238682	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	131961253	131961437	131961342	Y	NA	MED23,RNU4-18P	NA	NA	NA	NA	RNU4-18P	669	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	132381910	132382292	132382102	Y	NA	NA	LOC100507254,CTGF,ENPP1	IMR90,K562,HELA,GM12878	Hi-C,5C	24141950,22955621	CTGF	111397	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	133383318	133383532	133383367	Y	EYA4	NA	NA	NA	NA	NA	EYA4	176204	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	133890779	133890909	133890844	Y	NA	NA	MGC34034,TBPL1,SLC2A12,TCF21	IMR90	Hi-C	24141950	EYA4	331043	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr6	133930803	133931089	133930946	Y	NA	NA	MGC34034,TCF21	IMR90	Hi-C	24141950	TBPL1	340219	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	134026254	134026532	134026380	Y	NA	NA	MGC34034	IMR90	Hi-C	24141950	TBPL1	244776	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	134072842	134073074	134072958	Y	NA	NA	TCF21,MGC34034	IMR90	Hi-C	24141950	TBPL1	198234	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	134088671	134088966	134088914	Y	NA	NA	MGC34034,TCF21	IMR90	Hi-C	24141950	TBPL1	182342	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr6	134264415	134264799	134264607	Y	NA	TBPL1	TBPL1,SLC2A12	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TBPL1	6509	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	134609640	134610343	134609803	Y	SGK1,SGK1,SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	26907	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	134668918	134669336	134669288	Y	NA	SGK1	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	31668	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	134669516	134669878	134669820	Y	NA	SGK1	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	32266	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	134838672	134838766	134838701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGK1	201422	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	134863333	134863348	134863341	Y	NA	NA	LOC154092,SGK1,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	226083	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	134961963	134962506	134962356	Y	SGK1,SGK1,SGK1	NA	LOC154092,SGK1,ALDH8A1,HMGA1P7	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SGK1	324713	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	135707385	135707414	135707388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00271	109075	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	136278220	136278515	136278405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE7B	107386	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	136312028	136312251	136312140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE7B	141194	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	136316549	136316741	136316613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE7B	145715	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	136336050	136336507	136336258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE7B	165216	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	136455870	136456219	136456181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	152770	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	136492327	136492682	136492505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	116307	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	136907576	136907759	136907659	Y	NA	MAP7	NA	NA	NA	NA	MAP7	37619	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	136908722	136909081	136908931	Y	NA	MAP7	NA	NA	NA	NA	MAP7	38765	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	136912004	136912367	136912204	Y	NA	MAP7	NA	NA	NA	NA	MAP7	42047	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	137418316	137418442	137418404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFNGR1	120144	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	138053118	138053503	138053361	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	132848	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	138113661	138114081	138114010	Y	OLIG3,TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	72270	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	138914342	138914559	138914540	Y	NA	NA	HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC28A	178098	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr6	139100392	139100553	139100462	Y	NHSL1	CCDC28A	NA	NA	NA	NA	CCDC28A	7735	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	139304978	139305148	139305081	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	2250	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	139348964	139349250	139349073	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	41566	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr6	139350632	139351255	139350885	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	43234	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	139852407	139852567	139852460	Y	HECA	NA	LOC100132735,CITED2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	158650	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	139861409	139861802	139861629	Y	HECA,CITED2,CITED2,CITED2	NA	CITED2,LOC100132735	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CITED2	167652	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	139899473	139899647	139899531	Y	CITED2,CITED2,CITED2	NA	CITED2,LOC645434	IMR90	Hi-C	24141950	CITED2	205716	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	139918701	139919066	139919016	Y	CITED2,CITED2,CITED2	NA	CITED2	IMR90	Hi-C	24141950	CITED2	224944	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	140893217	140893627	140893519	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED2	1199460	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	140930496	140930538	140930517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED2	1236739	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	141204403	141204777	141204486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	1261590	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	143123144	143123510	143123441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	140828	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	143163714	143164598	143164218	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	99740	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	143200640	143200895	143200768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	63443	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	143206296	143206927	143206703	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	57411	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr6	143223836	143224147	143224035	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	40191	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	143247398	143248213	143248022	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	16125	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	144053697	144053884	144053799	Y	STX11,PLAGL1	NA	NA	NA	NA	NA	LTV1	108597	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	144129010	144129242	144129156	Y	STX11,PLAGL1	LTV1	NA	NA	NA	NA	LTV1	33239	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	144975415	144975576	144975532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPT1P4	455313	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	146611524	146611827	146611649	Y	RAB32,FBXO30	NA	NA	NA	NA	NA	RAB32	251002	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	147124877	147125201	147125102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB32	262048	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	147235088	147235549	147235197	Y	RAB32,STXBP5	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	288012	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr6	147235645	147236230	147236149	Y	RAB32,STXBP5	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	287331	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr6	147480962	147481272	147481115	Y	NA	STXBP5	NA	NA	NA	NA	STXBP5	42289	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	147516145	147516533	147516350	Y	NA	STXBP5	NA	NA	NA	NA	STXBP5	7028	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	148588961	148589218	148589102	Y	UST	SASH1	SASH1	IMR90	Hi-C	24141950	SASH1	2222	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	148628020	148628101	148628061	Y	NA	SASH1	SASH1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SASH1	36580	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	148685178	148685519	148685372	Y	SASH1	NA	NA	NA	NA	NA	SASH1	93738	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	148822303	148822649	148822378	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASH1	230863	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	148834877	148835159	148834957	Y	UST	NA	NA	NA	NA	NA	UST	231305	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	149069640	149070024	149069807	Y	UST	UST	NA	NA	NA	NA	UST	3176	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	149082428	149082821	149082685	Y	NA	UST	NA	NA	NA	NA	UST	15964	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	149382626	149382831	149382713	Y	NA	RP11-162J8.3	NA	NA	NA	NA	RP11-162J8.3	30917	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	149461644	149462305	149462169	Y	ZC3H12D,TAB2,PPIL4	NA	NA	NA	NA	NA	TAB2	75472	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	149657882	149658028	149657899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAB2	120105	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	149744636	149745011	149744913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIL4	120163	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	149829691	149830032	149829852	Y	LATS1,KATNA1,TAB2,SUMO4,ZC3H12D,PPIL4	PPIL4	NA	NA	NA	NA	PPIL4	35142	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	150176203	150176399	150176290	Y	NA	LRP11	NA	NA	NA	NA	LRP11	7800	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	151365804	151366060	151365928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	52605	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	151366985	151367228	151367157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	51437	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	151701197	151701769	151701451	Y	C6orf97,ZBTB2	ZBTB2	NA	NA	NA	NA	ZBTB2	8914	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	151730569	151730753	151730690	Y	NA	ZBTB2,RMND1,C6orf211	NA	NA	NA	NA	ZBTB2	19886	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	151770191	151770744	151770510	Y	NA	RMND1,C6orf211	NA	NA	NA	NA	RMND1	515	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	152012429	152012574	152012475	Y	ZBTB2,C6orf97,ESR1	ESR1	NA	NA	NA	NA	ESR1	36603	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	152085145	152085342	152085266	Y	ESR1,ESR1,ESR1,ESR1	NA	NA	NA	NA	NA	ESR1	109319	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr6	152583976	152584217	152584151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE1	372719	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	153002467	153002857	153002662	Y	NA	SYNE1	SYNE1,MYCT1	IMR90	Hi-C	24141950	SYNE1	45531	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	153358098	153358156	153358117	Y	SYNE1,RGS17	MTRF1L	NA	NA	NA	NA	MTRF1L	36278	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	153411582	153411939	153411751	Y	MTRF1L	RGS17	NA	NA	NA	NA	RGS17	38445	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	154830409	154830718	154830573	Y	CNKSR3	CNKSR3	NA	NA	NA	NA	CNKSR3	616	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	155590165	155590417	155590245	Y	NA	RP11-477D19.2,TFB1M	NA	NA	NA	NA	RP11-477D19.2	14307	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	155636183	155636317	155636271	Y	NA	TFB1M	NA	NA	NA	NA	TFB1M	2556	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	155850166	155850642	155850364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFB1M	216539	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	157007979	157008724	157008580	Y	ARID1B	NA	MIR4466,ARID1B,NOX3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	88339	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr6	157041058	157041538	157041248	Y	ARID1B	NA	ARID1B,MIR4466	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	55525	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	157101566	157102083	157101700	Y	ARID1B	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	4503	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	157174408	157174845	157174627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	77345	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	157274060	157274135	157274104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	176997	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	157297453	157297730	157297519	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	200390	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	157342507	157343524	157343342	Y	ARID1B,ZDHHC14	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	245444	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	157542479	157542718	157542566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	199915	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	157694703	157694954	157694858	Y	NA	TMEM242	NA	NA	NA	NA	TMEM242	47679	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	157738321	157738749	157738506	Y	NA	TMEM242	NA	NA	NA	NA	TMEM242	3884	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	158034114	158034488	158034146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX9	207808	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	158185393	158186221	158185862	Y	SNX9	NA	SNX9,TMEM242,SYNJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNX9	56075	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	158191942	158192437	158192205	Y	SNX9	SNX9	SNX9,SYNJ2	IMR90	Hi-C	24141950	SNX9	49859	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	158254729	158255396	158255020	Y	NA	SNX9	NA	NA	NA	NA	SNX9	12433	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr6	158424430	158424803	158424679	Y	SYNJ2	SYNJ2	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	23542	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	158452388	158452885	158452569	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	51500	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr6	158472000	158472226	158472116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	71112	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	158478416	158478907	158478642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	77528	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.13408186158711
chr6	158481547	158481708	158481650	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	80659	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	81905	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	158987674	158988091	158987879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	75680	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	159076335	159076366	159076351	Y	TAGAP,SYTL3	DYNLT1	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	12564	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	160141572	160141909	160141740	Y	MAS1,IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP	WTAP,ACAT2,SOD2	LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WTAP	2708	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	160425266	160425362	160425272	Y	NA	IGF2R	NA	NA	NA	NA	IGF2R	37135	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	161571430	161571737	161571637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	121356	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	161591208	161591315	161591299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	101778	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	161620136	161620467	161620302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	72626	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	161650248	161650386	161650340	Y	AGPAT4	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	42707	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	161678868	161678882	161678875	Y	NA	AGPAT4	MAP3K4	IMR90	Hi-C	24141950	AGPAT4	14211	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	161693137	161693518	161693484	Y	NA	AGPAT4	MAP3K4	IMR90	Hi-C	24141950	AGPAT4	44	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	161794970	161795177	161795007	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	101877	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	161855973	161856365	161856002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	162880	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	163833938	163834442	163834340	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	906	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr6	164215366	164215430	164215398	Y	NA	NA	QKI	IMR90	Hi-C	24141950	QKI	382334	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	166067950	166069085	166068916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE10A	329006	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	166077084	166077462	166077274	Y	PDE10A,PDE10A	NA	NA	NA	NA	NA	PDE10A	320629	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	166422302	166422862	166422743	Y	NA	PDE10A	NA	NA	NA	NA	PDE10A	24211	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	167038809	167038976	167038893	Y	RPS6KA2	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA2	278963	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	167411692	167411848	167411735	Y	RNASET2,GPR31	RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP	NA	NA	NA	NA	FGFR1OP	1022	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	168375482	168375653	168375488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT4	149880	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	169308928	169309266	169309084	Y	THBS2	NA	WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	342873	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr6	169497404	169497715	169497550	Y	THBS2	NA	PHF10,THBS2,WDR27,C6orf70	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	154424	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	170054470	170055295	170054892	Y	TCTE3	WDR27,C6orf120	NA	NA	NA	NA	WDR27	44864	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr6	170208297	170208700	170208496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCTE3	58642	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr6	170692180	170692479	170692329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM120B	94389	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	89354	89662	89513	Y	NA	NA	FAM20C,HEATR2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM20C	101307	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	191531	191871	191582	Y	FAM20C	FAM20C	NA	NA	NA	NA	FAM20C	562	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr7	416236	416525	416371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	141408	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	577876	578141	578015	Y	PRKAR1B,PRKAR1B,HEATR2,GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	19943	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	1092665	1092797	1092731	Y	NA	GPR146	NA	NA	NA	NA	GPR146	10453	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	1553000	1553189	1553120	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK	MICALL2,INTS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	INTS1	9511	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	1571273	1571500	1571366	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	2923	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	1572262	1572844	1572636	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3912	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr7	1573524	1573718	1573598	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	5174	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr7	1975652	1975765	1975709	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELFN1	249897	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	2058424	2058871	2058630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	212007	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr7	2058997	2060327	2059312	Y	SNX8,MAFK	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	210551	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	2185604	2185706	2185655	Y	SNX8,LFNG	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	85172	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	2356665	2356933	2356799	Y	NA	EIF3B,SNX8	NA	NA	NA	NA	EIF3B	34788	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	2657383	2657705	2657445	Y	IQCE,TTYH3	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	11880	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	2773642	2774144	2773933	Y	SNX8,LFNG	NA	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	99111	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	2903227	2903785	2903462	Y	LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12	AC006028.11,GNA12	GNA12	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNA12	21269	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	4764796	4765177	4765030	Y	KIAA0415	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	83408	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	4778448	4778853	4778548	Y	KIAA0415	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	97060	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	4784652	4785031	4784763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	103264	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	5452779	5453024	5452968	Y	NA	TNRC18	NA	NA	NA	NA	TNRC18	10021	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	5471668	5472052	5471860	Y	NA	TNRC18	WIPI2,SLC29A4,TNRC18,RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	TNRC18	8623	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	5594554	5594977	5594837	Y	WIPI2	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	6438	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr7	5596196	5596581	5596543	Y	CCZ1,ACTB	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	4834	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	5609541	5610012	5609880	Y	SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216,FSCN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	8126	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	5634980	5635411	5634989	Y	AIMP2,FBXL18,ACTB,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	FSCN1	4541	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	5635420	5636238	5635862	Y	NA	ACTB,FSCN1	NA	NA	NA	NA	FSCN1	4981	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	6467944	6468137	6468104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAGLB	53684	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	6682292	6682670	6682512	Y	C7orf26	ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	7339	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr7	6741580	6741996	6741754	Y	C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12	ZNF12,PMS2CL	NA	NA	NA	NA	ZNF12	2558	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr7	7216835	7216977	7216903	Y	NA	C1GALT1	C1GALT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	C1GALT1	22270	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	7604061	7604281	7604173	Y	MIOS	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	222	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	7759003	7759285	7759121	Y	NA	RPA3,RPL23AP51	NA	NA	NA	NA	RPA3	2765	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	7835201	7835604	7835382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL23AP51	55035	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	8550473	8550803	8550530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLCCI1	544048	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	11745887	11746284	11746085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THSD7A	123540	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	11859641	11859960	11859801	Y	THSD7A	THSD7A	NA	NA	NA	NA	THSD7A	9864	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	11867283	11867421	11867420	Y	NA	THSD7A	NA	NA	NA	NA	THSD7A	2403	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	11881231	11881244	11881238	Y	NA	THSD7A	THSD7A	IMR90	Hi-C	24141950	THSD7A	11407	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	12105634	12105996	12105845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM106B	142871	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	12622868	12623180	12622963	Y	NA	SCIN	NA	NA	NA	NA	SCIN	14665	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	12624573	12625024	12624751	Y	NA	SCIN	NA	NA	NA	NA	SCIN	16370	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	12755276	12755712	12755432	Y	VWDE,ARL4A	ARL4A	NA	NA	NA	NA	ARL4A	30795	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	13818689	13818849	13818801	Y	ETV1	NA	NA	NA	NA	NA	ETV1	210201	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr7	13889552	13889950	13889896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV1	139100	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr7	16707771	16707941	16707875	Y	NA	ANKMY2,BZW2	NA	NA	NA	NA	BZW2	24015	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr7	16751358	16751548	16751453	Y	NA	TSPAN13	NA	NA	NA	NA	TSPAN13	39612	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	17029591	17029925	17029620	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	TSPAN13	238431	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	17225443	17225596	17225470	Y	AHR	NA	NA	NA	NA	NA	AHR	110650	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	17276329	17276492	17276431	Y	AHR	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AHR	59754	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	17402534	17402650	17402592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC003075.4	65553	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	17412000	17412058	17412028	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC003075.4	75019	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr7	17664691	17664931	17664811	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	SNX13	313193	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	17721637	17721811	17721724	Y	NA	NA	HDAC9,AGR2,AHR	IMR90	Hi-C	24141950	SNX13	256313	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	17722333	17722641	17722455	Y	AHR	NA	HDAC9	IMR90	Hi-C	24141950	SNX13	255483	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	18548166	18548343	18548284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC9	423594	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	18551067	18551390	18551179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC9	426495	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	18575593	18575869	18575740	Y	HDAC9,HDAC9,HDAC9	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC9	451021	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	19146147	19146774	19146493	Y	FERD3L,TWIST1	TWIST1	NA	NA	NA	NA	TWIST1	8521	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr7	20070639	20070953	20070726	Y	NA	RPL21P75	NA	NA	NA	NA	RPL21P75	30293	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	20547767	20548194	20547808	Y	ITGB8	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB8	179442	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	20837430	20837819	20837731	Y	SP8	NA	SP8	K562	ChIA-PET	22265404	ITGB8	469105	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	20993749	20993911	20993806	Y	SP8	NA	NA	NA	NA	NA	SP4	471741	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	22122992	22123068	22123014	Y	NA	NA	RAPGEF5	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA7L	139290	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr7	22622740	22623204	22623070	Y	NA	STEAP1B	NA	NA	NA	NA	STEAP1B	47340	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	22667218	22667359	22667242	Y	IL6	STEAP1B	LOC100506178,SNORD93,IL6,TOMM7	IMR90	Hi-C	24141950	STEAP1B	3185	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	22687053	22687419	22687223	Y	IL6	STEAP1B	LOC100506178,SNORD93,TOMM7,IL6,FAM126A	IMR90	Hi-C	24141950	STEAP1B	16509	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	22757674	22758207	22757934	Y	NA	IL6,AC073072.5	NA	NA	NA	NA	IL6	5296	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr7	22861021	22861212	22861181	Y	NA	TOMM7,AC005682.5	NA	NA	NA	NA	TOMM7	551	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	22894313	22894860	22894668	Y	STEAP1B,TOMM7	TOMM7,AC005682.5	NA	NA	NA	NA	AC005682.5	2516	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr7	23229571	23229876	23229614	Y	NA	NUPL2,GPNMB	NA	NA	NA	NA	NUPL2	10125	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	23348040	23348443	23348292	Y	KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	NA	GPNMB	74454	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	23375804	23376081	23376055	Y	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	NA	GPNMB	102218	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	23410116	23410259	23410188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	97827	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	23411315	23411579	23411447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	96507	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	23501559	23501943	23501874	Y	NUPL2,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	6143	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	23510676	23511223	23510889	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2590	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr7	23513815	23514383	23514045	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	MALSU1	K562	ChIA-PET	22265404	IGF2BP3	5729	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr7	23904639	23904947	23904793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC006026.13	186234	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	24818395	24818855	24818677	Y	C7orf31,DFNA5,DFNA5	DFNA5	NA	NA	NA	NA	DFNA5	11151	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	24820839	24820982	24820878	Y	NA	DFNA5	NA	NA	NA	NA	DFNA5	13595	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	24824166	24824267	24824230	Y	DFNA5	DFNA5	NA	NA	NA	NA	DFNA5	16922	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	24826484	24826966	24826807	Y	C7orf31,DFNA5,DFNA5	DFNA5	NA	NA	NA	NA	DFNA5	19240	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	24861129	24861331	24861204	Y	C7orf31,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	53885	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	24875802	24875986	24875894	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	68558	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	24924727	24925102	24925076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	94151	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	25424979	25425345	25425162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYCS	261999	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	25894654	25894946	25894846	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	294914	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.48976217185163
chr7	25896245	25896461	25896419	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	293399	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	25896515	25897081	25896801	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	292779	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	25897167	25897316	25897282	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	292544	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	25901745	25902114	25902023	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	287746	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	25990725	25991211	25991018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	198649	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	26460550	26460642	26460600	Y	NA	AC004540.5	NA	NA	NA	NA	AC004540.5	24337	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	26589150	26589521	26589235	Y	SNX10	NA	LOC441204,KIAA0087	IMR90	Hi-C	24141950	AC004540.5	152937	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	27206716	27206932	27206874	Y	HOXA7,HOXA9,HOXA13,HOXA11,HOXA10	HOXA4,HOXA6,HOXA3,HOXA7,HOXA10-AS,HOXA9,RP1-170O19.20,HOXA10,HOXA11	NA	NA	NA	NA	HOXA10-AS	478	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	27386345	27386573	27386562	Y	NA	AC004009.3	NA	NA	NA	NA	AC004009.3	12889	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	27717680	27717897	27717733	Y	NA	HIBADH	HOTTIP,HOXA13,HIBADH,TAX1BP1,JAZF1	IMR90	Hi-C	24141950	HIBADH	17066	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	27876967	27877264	27877116	Y	CREB5	NA	NA	NA	NA	NA	AC004549.6	98953	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	28076890	28077172	28076964	Y	CREB5	NA	NA	NA	NA	NA	JAZF1	141190	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	28398288	28398440	28398364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB5	61348	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	30203047	30203422	30203138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF2	118501	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	30208837	30209260	30209012	Y	ZNRF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF2	112663	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	30220432	30220648	30220509	Y	ZNRF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF2	101275	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	30505141	30505406	30505161	Y	NA	NOD1	NA	NA	NA	NA	NOD1	10994	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	30636092	30636194	30636111	Y	NA	GGCT,GARS	NA	NA	NA	NA	GARS	3795	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	30658764	30658962	30658863	Y	NA	GARS	NA	NA	NA	NA	GARS	26467	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	32546004	32546038	32546035	Y	NA	LSM5,AVL9	NA	NA	NA	NA	AVL9	12966	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	32929600	32929824	32929751	Y	NA	KBTBD2	NA	NA	NA	NA	KBTBD2	1919	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	34026970	34027411	34027080	Y	BMPER	NA	NA	NA	NA	NA	BMPER	84447	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	34173056	34173436	34173156	Y	BMPER	NA	NA	NA	NA	NA	BMPER	230533	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	35075861	35076697	35076367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERPUD2	656484	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr7	36480174	36480717	36480189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	52440	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr7	36843340	36843728	36843600	Y	ELMO1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	415606	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	38664238	38664553	38664451	Y	POU6F2	AMPH	NA	NA	NA	NA	AMPH	4614	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	39629281	39629774	39629554	Y	RALA	YAE1D1,RALA	NA	NA	NA	NA	YAE1D1	25306	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	39653266	39653514	39653363	Y	RALA	YAE1D1,RALA	NA	NA	NA	NA	RALA	7568	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	39661364	39661771	39661496	Y	NA	RALA	NA	NA	NA	NA	RALA	282	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	40591236	40591497	40591392	Y	NA	AC004988.1	NA	NA	NA	NA	AC004988.1	6709	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	41738328	41738691	41738507	Y	INHBA	INHBA	NA	NA	NA	NA	INHBA	2015	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr7	41749009	41749672	41749462	Y	INHBA	INHBA	NA	NA	NA	NA	INHBA	8303	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	41926602	41926763	41926636	Y	NA	NA	LOC285954,C7orf10,INHBA	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	185896	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	41951393	41951863	41951630	Y	INHBA	NA	LOC285954,C7orf10,INHBA	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	210687	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	41952797	41953130	41952994	Y	NA	NA	LOC285954,C7orf10,INHBA	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	212091	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	42174635	42174902	42174765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI3	100567	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	42927750	42928726	42928340	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	NA	NA	NA	NA	C7orf25	21178	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr7	43625293	43625372	43625313	Y	URGCP,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	4936	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	43652779	43653072	43652905	Y	POLM,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	32422	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	43654812	43655175	43654945	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	34455	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	43657815	43658085	43657951	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	37458	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	43658377	43658532	43658408	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	38020	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	43683947	43684262	43684105	Y	POLM,DBNL,STK17A	NA	NA	NA	NA	NA	STK17A	63590	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	43912365	43912715	43912516	Y	NA	MRPS24	NA	NA	NA	NA	MRPS24	4873	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	44085815	44086626	44086335	Y	STK17A,DBNL,POLM	POLR2J4,DBNL,POLM	NA	NA	NA	NA	DBNL	3576	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	44127636	44127736	44127679	Y	YKT6,AEBP1	DBNL,POLM,AEBP1,POLD2	PGAM2,POLM,AEBP1,POLD2,GCK,YKT6,CAMK2B	IMR90	Hi-C	24141950	POLM	7497	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr7	44141919	44142207	44141937	Y	AEBP1	POLM,POLD2	NA	NA	NA	NA	AEBP1	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	44674941	44675231	44675112	Y	PURB,MYO1G,CCM2,DDX56,OGDH	OGDH	ZMIZ2	IMR90	Hi-C	24141950	OGDH	30770	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	44677628	44678244	44677873	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	ZMIZ2	IMR90	Hi-C	24141950	OGDH	33457	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	44678622	44679047	44678972	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	34451	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	44775082	44775384	44775244	Y	OGDH,PURB,MYO1G,ZMIZ2,ZMIZ2	ZMIZ2	DDX56,TMED4,OGDH,PPIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZMIZ2	10796	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	44936968	44937252	44937141	Y	OGDH,MYO1G,PURB	PURB	TBRG4,OGDH	IMR90	Hi-C	24141950	PURB	14008	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	46972513	46972753	46972628	Y	NA	NA	IGFBP3,IGFBP1	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	1013040	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	47390589	47390737	47390670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HUS1	626441	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	47521562	47522093	47521877	Y	HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	HUS1	495085	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	47826128	47826596	47826342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HUS1	190582	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	50615386	50615579	50615483	Y	GRB10	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	99298	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	50666851	50666964	50666921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	150763	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	55131480	55131905	55131522	Y	EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	46766	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	55141624	55142112	55141893	Y	SEC61G,EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	56910	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	55201472	55201858	55201601	Y	SEC61G	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	116758	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr7	55322570	55322956	55322611	Y	EGFR	NA	EGFR,SEC61G	IMR90	Hi-C	24141950	LANCL2	108185	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr7	55529793	55530311	55530129	Y	ZNF713,VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL2	98652	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.13408186158711
chr7	55638699	55638887	55638779	Y	VOPP1	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	18	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	63924105	63924304	63924148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF680	97180	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	65613460	65613645	65613556	Y	ASL,ASL	CRCP	NA	NA	NA	NA	CRCP	35869	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	65878387	65878723	65878560	Y	RABGEF1,KCTD7	NA	ASL,CRCP,TPST1,LINC00174	IMR90	Hi-C	24141950	GS1-124K5.3	77830	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	66040596	66040908	66040816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD7	50960	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	66056218	66056609	66056384	Y	NA	KCTD7	KCTD7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KCTD7	35259	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	66152523	66152575	66152558	Y	RABGEF1,KCTD7	RP4-756H11.3,RABGEF1	KCTD7,LOC493754,RABGEF1	IMR90	Hi-C	24141950	RABGEF1	7372	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	66184244	66184571	66184390	Y	NA	RABGEF1	LOC493754,RABGEF1,LOC729156	IMR90	Hi-C	24141950	RABGEF1	39093	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	66206459	66206659	66206557	Y	KCTD7,C7orf42,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RABGEF1	61308	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr7	72756043	72756175	72756109	Y	TYW1B,BCL7B	NSUN5	NA	NA	NA	NA	NSUN5	35179	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	72929530	72929887	72929777	Y	NA	BAZ1B,BCL7B	NA	NA	NA	NA	BAZ1B	4721	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	72990459	72990574	72990513	Y	NA	BCL7B,TBL2	NA	NA	NA	NA	TBL2	547	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	73132412	73132545	73132481	Y	LAT2,BCL7B	WBSCR22,DNAJC30,STX1A,ABHD11	NA	NA	NA	NA	STX1A	410	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	73236868	73237278	73236968	Y	CLDN3,CLDN4	WBSCR27	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	17587	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	73265870	73266203	73266092	Y	BCL7B	WBSCR27	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	11005	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	73314080	73314324	73314199	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	59215	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	73512377	73512557	73512465	Y	NA	LIMK1	NA	NA	NA	NA	LIMK1	17114	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	73694024	73694283	73694118	Y	LAT2	RFC2,CLIP2	CLIP2	IMR90	Hi-C	24141950	CLIP2	7522	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	73866647	73867033	73866768	Y	LAT2	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	527	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr7	73983073	73983199	73983128	Y	NA	NA	GTF2I	IMR90	Hi-C	24141950	GTF2I	86795	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	74001829	74001994	74001904	Y	NA	NA	GTF2I	IMR90	Hi-C	24141950	GTF2I	68000	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	74074203	74074528	74074318	Y	LAT2,GTF2I	GTF2I	NA	NA	NA	NA	GTF2I	4209	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	75354773	75355120	75354947	Y	NA	HIP1	NA	NA	NA	NA	HIP1	11160	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	75465283	75465439	75465360	Y	MDH2	RHBDD2	STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR	IMR90	Hi-C	24141950	RHBDD2	4481	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	75567331	75567651	75567437	Y	POR	POR	NA	NA	NA	NA	POR	40813	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	75795833	75796053	75795969	Y	RHBDD2,POR	NA	SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	MDH2	120464	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr7	75923846	75924306	75924205	Y	HSPB1	HSPB1	NA	NA	NA	NA	HSPB1	5555	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	17444	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr7	75948116	75948327	75948250	Y	RHBDD2	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	18255	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	75993529	75993613	75993570	Y	POR	YWHAG	YWHAG	MCF7	ChIA-PET	22265404	YWHAG	7181	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr7	76009173	76009680	76009431	Y	POR	YWHAG	NA	NA	NA	NA	YWHAG	22825	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr7	76627484	76628238	76628092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM185BP	121195	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	77057322	77057668	77057603	Y	PTPN12,PTPN12,PION	NA	PION,PTPN12	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTPN12	106924	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	77199277	77199536	77199359	Y	FGL2,PION,PTPN12,PTPN12	PTPN12	NA	NA	NA	NA	PTPN12	34685	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	77201219	77201434	77201295	Y	FGL2,PION,PTPN12,PTPN12	PTPN12	NA	NA	NA	NA	PTPN12	36627	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	77316787	77316835	77316811	Y	NA	RSBN1L-AS1,RSBN1L	NA	NA	NA	NA	RSBN1L-AS1	6747	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	77344619	77344946	77344783	Y	RSBN1L	RSBN1L-AS1,RSBN1L	NA	NA	NA	NA	RSBN1L	20859	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	78613277	78613663	78613470	Y	MAGI2	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI2-AS3	466535	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	78786871	78787189	78787030	Y	MAGI2	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI2-AS3	293009	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	80128570	80128822	80128710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAI1	367299	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	80171671	80172049	80171853	Y	NA	NA	GNAT3,CD36	IMR90	Hi-C	24141950	SEMA3C	377626	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	80352083	80352704	80352185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	196971	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	80512986	80513276	80513113	Y	NA	SEMA3C	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	36399	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	80550378	80550824	80550614	Y	NA	SEMA3C	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	703	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	80571600	80571811	80571745	Y	NA	SEMA3C	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	21925	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	84248657	84248668	84248663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3A	128617	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	90600966	90601241	90601095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FZD1	290542	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	90637974	90638276	90638003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FZD1	253507	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	90711391	90711663	90711528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FZD1	180120	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	92227351	92227620	92227450	Y	CDK6,CDK6	FAM133B	FAM133B	K562	ChIA-PET	22265404	FAM133B	9643	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	92233387	92233691	92233548	Y	NA	FAM133B	FAM133B	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	FAM133B	15679	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	92277080	92277232	92277129	Y	ANKIB1,GATAD1,CDK6	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	59372	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	92437286	92437617	92437517	Y	SAMD9	CDK6	NA	NA	NA	NA	CDK6	26291	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	92488583	92488710	92488601	Y	CDK6,CDK6	CDK6	NA	NA	NA	NA	CDK6	24675	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	92745192	92745375	92745297	Y	SAMD9	SAMD9L	NA	NA	NA	NA	SAMD9	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	93511378	93511666	93511551	Y	BET1,TFPI2	TFPI2,GNG11	NA	NA	NA	NA	TFPI2	6637	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	93672671	93673149	93672763	Y	NA	BET1,AC003092.1	GNG11,TFPI2,BET1	IMR90	Hi-C	24141950	AC003092.1	22526	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	93688988	93689431	93689251	Y	NA	AC003092.1	TFPI2,GNG11,BET1	IMR90	Hi-C	24141950	AC003092.1	38843	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	93800221	93800521	93800341	Y	NA	NA	TFPI2,GNGT1,BET1	IMR90	Hi-C	24141950	AC003092.1	150076	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	93812688	93813130	93812921	Y	NA	NA	TFPI2,BET1,GNGT1	IMR90	Hi-C	24141950	AC003092.1	162543	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr7	93926616	93927074	93926886	Y	SGCE,COL1A2	NA	COL1A2,GNG11	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A2	94799	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr7	93997588	93997985	93997804	Y	GNG11,SGCE,COL1A2	COL1A2	COL1A2	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A2	23888	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr7	94003622	94003870	94003684	Y	NA	COL1A2	NA	NA	NA	NA	COL1A2	18003	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	94021237	94021945	94021560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL1A2	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	94280099	94280356	94280228	Y	NA	SGCE,PEG10	NA	NA	NA	NA	SGCE	3165	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	94286949	94287416	94287082	Y	PPP1R9A,PPP1R9A,CASD1,PEG10,PEG10	SGCE,PEG10	NA	NA	NA	NA	PEG10	3312	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr7	94769120	94769288	94769204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC002429.5	72356	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	94799053	94799326	94799190	Y	PPP1R9A,PPP1R9A	AC002429.5	NA	NA	NA	NA	AC002429.5	42318	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	95320009	95320109	95320059	Y	PON1	NA	ASB4	IMR90	Hi-C	24141950	DYNC1I1	79757	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	95835254	95835261	95835258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	114198	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	97913424	97913987	97913861	Y	LMTK2,BRI3	TECPR1,BRI3	NA	NA	NA	NA	BRI3	33733	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr7	97915595	97916070	97915699	Y	LMTK2,BRI3	TECPR1,BRI3	NA	NA	NA	NA	BRI3	35904	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	98286893	98287005	98286947	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRRAP	186551	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	98871923	98872129	98871984	Y	NA	ARPC1A	NA	NA	NA	NA	ARPC1A	49392	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	98973055	98973209	98973129	Y	ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B	ARPC1B,BUD31,PDAP1	NA	NA	NA	NA	ARPC1B	3183	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr7	98990795	98991133	98991082	Y	NA	ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4	NA	NA	NA	NA	BUD31	13131	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	99000499	99000617	99000560	Y	NA	ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4	NA	NA	NA	NA	BUD31	3647	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr7	99178135	99178365	99178354	Y	ZNF789	ZNF655,FAM200A	NA	NA	NA	NA	FAM200A	23976	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr7	99957855	99958254	99957887	Y	NA	PILRB,PMS2P1,PILRA	NA	NA	NA	NA	PILRA	4899	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	100042030	100042585	100042239	Y	COPS6,EPHB4	MEPCE,ZCWPW1,PPP1R35,TSC22D4,NYAP1	NA	NA	NA	NA	PPP1R35	9842	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr7	100757831	100758077	100757885	Y	NA	TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	10293	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	100760673	100761017	100760905	Y	GNB2,EPHB4,ZNHIT1,PLOD3,AP1S1,SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF	AP1S1,VGF	MCF7	ChIA-PET	22265404	SERPINE1	7353	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	100765253	100766084	100765924	Y	TRIM56,SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	2286	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr7	100772917	100773243	100773005	Y	SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	4547	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	100776070	100776161	100776131	Y	SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	7700	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	101525517	101525682	101525579	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	68558	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	101526005	101526525	101526438	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	69046	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr7	101569375	101569771	101569405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	112416	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	101596326	101596693	101596419	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	139367	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	101672273	101672589	101672281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	215314	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	101678350	101678537	101678444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	221391	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr7	102773056	102773346	102773244	Y	NA	RPL19P12,NAPEPLD	ARMC10	IMR90	Hi-C	24141950	RPL19P12	7040	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	102958965	102959200	102958983	Y	NA	DPY19L2P2,PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4	NA	NA	NA	NA	PMPCB	23096	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	103277543	103277794	103277680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTA-276O3.4	290495	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr7	104585458	104586124	104585640	Y	MLL5	NA	LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01004	65367	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	104597631	104597869	104597756	Y	MLL5	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	53622	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr7	104608110	104608364	104608281	Y	NA	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	43127	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	104614051	104614727	104614598	Y	NA	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	36764	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr7	104771248	104771300	104771252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	119757	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	104771634	104771765	104771700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	120143	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	104842983	104843396	104843385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	191492	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	104884738	104885065	104884890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	152690	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	104980501	104980737	104980707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	57018	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	105416484	105416867	105416678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L1	98183	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	105459888	105460220	105459903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L1	54830	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	105508245	105508445	105508345	Y	NA	ATXN7L1,CDHR3	NA	NA	NA	NA	ATXN7L1	6605	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	105705488	105705603	105705542	Y	NA	SYPL1	ATXN7L1,SYPL1,CDHR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYPL1	45419	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	105857491	105857771	105857742	Y	NA	NA	NAMPT,CCDC71L	IMR90	Hi-C	24141950	NAMPT	67001	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	106009960	106010160	106010041	Y	PIK3CG,NAMPT	NA	CCDC71L,SYPL1,NAMPT	IMR90	Hi-C	24141950	NAMPT	85188	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	106065261	106066901	106065591	Y	NA	NA	NAMPT,CCDC71L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAMPT	140489	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr7	106089773	106090176	106089868	Y	NAMPT,PIK3CG	NA	NAMPT	IMR90	Hi-C	24141950	NAMPT	165001	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	106358724	106358979	106358846	Y	NAMPT,PIK3CG,HBP1,FLJ36031	NA	CCDC71L,NAMPT	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC71L	59282	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	106808132	106808705	106808532	Y	NA	HBP1	NA	NA	NA	NA	HBP1	726	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	106901302	106901364	106901333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBP1	93896	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	106943118	106943475	106943297	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBP1	135712	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	107205466	107205592	107205534	Y	COG5	DUS4L,COG5,BCAP29	NA	NA	NA	NA	COG5	2507	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	107567511	107567568	107567540	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	38096	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	107567788	107568066	107567911	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	38373	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	107573965	107574445	107574339	Y	LAMB1	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	44550	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	107594636	107594797	107594717	Y	NA	LAMB1	NA	NA	NA	NA	LAMB1	46903	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	107949313	107949798	107949569	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB9	258214	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	108139925	108140311	108140116	Y	PNPLA8,DNAJB9	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB9	67701	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	110326552	110326706	110326634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRN3	402356	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	110778024	110778148	110778086	Y	NA	LRRN3	NA	NA	NA	NA	LRRN3	48962	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	110849154	110849473	110849333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRN3	120092	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	110874557	110874601	110874588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRN3	145495	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	111024464	111024780	111024739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	175793	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	111396932	111397360	111397129	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	196359	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	111594540	111594797	111594666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK4	249669	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	111633053	111633148	111633101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK4	211318	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	111720320	111721594	111721184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK4	122872	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	111754573	111754855	111754765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK4	89611	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	111760791	111761135	111760993	Y	ZNF277,IFRD1,IFRD1,IFRD1,DOCK4	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK4	83331	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	111814530	111814935	111814850	Y	NA	DOCK4,ZNF277	NA	NA	NA	NA	DOCK4	29531	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	111819433	111819596	111819575	Y	NA	DOCK4,ZNF277	NA	NA	NA	NA	DOCK4	24870	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	114459820	114459999	114459910	Y	NA	NA	FOXP2	IMR90	Hi-C	24141950	MDFIC	100210	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	114571864	114572137	114571962	Y	MDFIC	MDFIC	NA	NA	NA	NA	MDFIC	11655	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	114677768	114677789	114677777	Y	MDFIC	NA	NA	NA	NA	NA	MDFIC	117559	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	116058055	116058274	116058222	Y	NA	NA	CAV2,TES,MET,CAV1	IMR90,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	AC002066.1	79245	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	116168216	116168790	116168273	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	AC002066.1,CAV1	NA	NA	NA	NA	CAV1	5377	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	116202174	116202561	116202326	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	CAV1	NA	NA	NA	NA	CAV1	39335	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	116217100	116217359	116217210	Y	CAV1,CAV1	NA	NA	NA	NA	NA	CAV1	54261	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	116223147	116223399	116223366	Y	CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	NA	TES,MET,CAV2,CAV1	GM12878,H1ESC,IMR90	5C,Hi-C	22955621,24141950	CAV1	60308	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	116232713	116233127	116232950	Y	NA	NA	MET,TES,CAV2,CAV1,CAPZA2	IMR90,H1ESC,GM12878,K562	Hi-C,5C	24141950,22955621	CAV1	69874	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	116292970	116293085	116293033	Y	NA	MET	MET	IMR90	Hi-C	24141950	MET	17359	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	116328034	116328226	116328184	Y	ST7,CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,MET	MET	NA	NA	NA	NA	MET	17590	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	116523983	116524309	116524052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7	66983	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	117472298	117472618	117472458	Y	CTTNBP2	CTTNBP2	NA	NA	NA	NA	CTTNBP2	39575	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	120589568	120589730	120589649	Y	ING3	ING3	NA	NA	NA	NA	ING3	765	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	120666718	120667076	120666787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ING3	77915	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	120938122	120938485	120938307	Y	FAM3C	WNT16	NA	NA	NA	NA	WNT16	24936	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	121783025	121783385	121783205	Y	PTPRZ1,AASS	AASS	NA	NA	NA	NA	AASS	691	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr7	123387168	123387479	123387315	Y	NA	WASL	NA	NA	NA	NA	WASL	47	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	127663304	127663714	127663503	Y	IMPDH1,GCC1,LRRC4	NA	NA	NA	NA	NA	RBM28	318248	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	127857172	127857463	127857244	Y	IMPDH1	NA	NA	NA	NA	NA	RBM28	124499	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	4.80168418857099
chr7	128468302	128468509	128468385	Y	FLNC	CCDC136,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.48976217185163
chr7	128471531	128472043	128471766	Y	FLNC	CCDC136,FLNC,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	3100	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	128696279	128696583	128696469	Y	NA	TNPO3	NA	NA	NA	NA	TNPO3	3081	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr7	129078824	129079119	129078920	Y	NA	RP11-305M3.2,RNU1-72P	NA	NA	NA	NA	RP11-305M3.2	30613	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	129465628	129465864	129465722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	124925	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr7	129469996	129470292	129470140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	120497	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	129589680	129589810	129589737	Y	NA	UBE2H	NA	NA	NA	NA	UBE2H	979	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	129590044	129590333	129590306	Y	NA	UBE2H	NA	NA	NA	NA	UBE2H	456	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	130530611	130530821	130530670	Y	NA	NA	MEST,KLHDC10,MIR29A,MIR29B1,ZC3HC1,C7orf45,CPA5,LOC646329	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	65248	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr7	130571851	130572495	130572306	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	23574	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	130575591	130576512	130576394	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	19557	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr7	130581597	130582393	130581985	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	13676	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr7	130583676	130584341	130584164	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	11728	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	130586004	130586434	130586371	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	9635	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.95624170645485
chr7	130588239	130588699	130588531	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	7370	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr7	130589567	130590049	130589961	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6020	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr7	130593505	130595916	130594870	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	153	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr7	130601178	130601963	130601463	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	5109	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.66760232698389
chr7	130602337	130602820	130602733	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6268	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	130614674	130615489	130615212	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	18605	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	130633473	130633870	130633858	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	37404	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	130641725	130642119	130642041	Y	MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	45656	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	130645057	130645459	130645325	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	48988	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr7	130658258	130658537	130658456	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR29A	62189	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	130696655	130697004	130696978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	95851	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	130735932	130736596	130736429	Y	MKLN1	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	56259	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	130756735	130757090	130757043	Y	NA	MKLN1,LINC-PINT	NA	NA	NA	NA	MKLN1	35765	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	130795999	130796263	130796171	Y	MKLN1,MKLN1	MKLN1,LINC-PINT	NA	NA	NA	NA	LINC-PINT	3064	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	130873403	130873921	130873619	Y	MKLN1,MKLN1	NA	NA	NA	NA	NA	AC009362.2	51428	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	130923142	130923337	130923228	Y	MKLN1,MKLN1	AC009362.2	NA	NA	NA	NA	AC009362.2	2012	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	131166569	131166943	131166757	Y	PODXL	NA	NA	NA	NA	NA	PODXL	74033	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	131314351	131314532	131314442	Y	NA	NA	PODXL,MKLN1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PODXL	73375	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	132260559	132260718	132260593	Y	PLXNA4	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA4	70729	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	133223721	133224093	133223724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC4	287892	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	134032840	134033111	134032976	Y	NA	SLC35B4	EXOC4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC35B4	33037	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	134117156	134117311	134117298	Y	NA	AKR1B1	NA	NA	NA	NA	AKR1B1	24725	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	134144888	134145050	134144951	Y	AKR1B1	AKR1B1	NA	NA	NA	NA	AKR1B1	2852	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	134540961	134541304	134541061	Y	CALD1	NA	NA	NA	NA	NA	CALD1	113958	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	134845913	134846266	134846037	Y	WDR91,CNOT4,TMEM140	TMEM140,C7orf49,WDR91	NA	NA	NA	NA	C7orf49	7281	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	135430585	135430983	135430863	Y	FAM180A	FAM180A	NA	NA	NA	NA	FAM180A	611	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.48976217185163
chr7	135665513	135665767	135665568	Y	NA	MTPN	NA	NA	NA	NA	MTPN	5412	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	135719733	135719962	135719751	Y	NA	NA	C7orf73	IMR90	Hi-C	24141950	AC009784.3	55711	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	135771654	135771794	135771701	Y	NA	AC009784.3	NA	NA	NA	NA	AC009784.3	3879	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	137036619	137036971	137036795	Y	NA	PTN	NA	NA	NA	NA	PTN	10008	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	137264728	137264844	137264813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTN	238117	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	137311444	137311452	137311448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKI	218386	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	137457622	137457847	137457706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKI	71991	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	137659854	137660135	137660099	Y	NA	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	24678	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	137661285	137661695	137661644	Y	NA	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	23118	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	137663180	137663556	137663478	Y	CREB3L2	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	21257	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	137685065	137685809	137685664	Y	TRIM24,CREB3L2	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	252	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	138917056	138917428	138917261	Y	ZC3HAV1,UBN2	UBN2	NA	NA	NA	NA	UBN2	3954	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	139320693	139321014	139320839	Y	PARP12,LUC7L2	NA	NA	NA	NA	NA	ERHP1	103707	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	139365521	139365926	139365718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	109651	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	4.80168418857099
chr7	139366770	139367125	139366961	Y	TBXAS1	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	108452	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr7	139367160	139367381	139367316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	108196	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	139367600	139367827	139367677	Y	TBXAS1	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	107750	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr7	139577679	139577876	139577701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	102102	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	139911821	139912154	139911956	Y	NA	NA	JHDM1D,SLC37A3	IMR90	Hi-C	24141950	PARP12	150300	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	140015850	140016530	140016109	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	NA	NA	NA	NA	SLC37A3	85703	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	140808107	140808453	140808225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS33	95079	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	141334636	141334647	141334642	Y	TAS2R3	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1147	65306	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	142191082	142191483	142191195	Y	NA	TRBV9	NA	NA	NA	NA	TRBV9	46575	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	142554592	142555033	142554706	Y	EPHB6	EPHB6	NA	NA	NA	NA	EPHB6	3800	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	143083267	143084129	143083354	Y	TAS2R40,FAM131B,FAM131B	AC093673.5,ZYX	NA	NA	NA	NA	ZYX	7094	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr7	148334506	148334940	148334775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL1	58066	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	NA	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EZH2	58860	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	148788414	148788490	148788418	Y	CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2540	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	149193399	149193541	149193458	Y	ZNF467,ZNF746	ZNF746	NA	NA	NA	NA	ZNF746	491	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	149468740	149469267	149468803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRBA1	58868	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	150137170	150137441	150137307	Y	TMEM176B,GIMAP5,GIMAP8	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF775	73291	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	151157060	151157432	151157203	Y	NA	NA	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	57774	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	151182414	151182755	151182660	Y	AGAP3,PRKAG2	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	32451	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	151184518	151184840	151184768	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	30366	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr7	151199311	151199621	151199557	Y	NA	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	15585	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	151806252	151806472	151806362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT11	85493	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	152065077	152065428	152065152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	305822	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	152105895	152106094	152106005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	265156	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	152160715	152161193	152160959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	210057	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	209236	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	152670161	152670279	152670220	Y	ACTR3B	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR3B	215327	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	154999343	155001070	155000829	Y	NA	AC099552.4	INSIG1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	AC099552.4	11178	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	155006028	155006426	155006187	Y	NA	AC099552.4	NA	NA	NA	NA	AC099552.4	17863	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	155049368	155049519	155049432	Y	NA	INSIG1	NA	NA	NA	NA	INSIG1	37967	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr7	155105447	155105513	155105480	Y	NA	INSIG1	NA	NA	NA	NA	INSIG1	17961	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	155678402	155678700	155678446	Y	NA	NA	LMBR1	IMR90	Hi-C	24141950	AC021218.2	74626	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	155714561	155715080	155714837	Y	NA	AC021218.2	LMBR1	IMR90	Hi-C	24141950	AC021218.2	38246	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	155744375	155744769	155744531	Y	NA	AC021218.2	LOC285889,SHH,LMBR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC021218.2	8557	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr7	156111013	156111412	156111192	Y	RNF32,RNF32,RNF32	NA	NA	NA	NA	NA	AC021218.2	357687	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	157112606	157112849	157112710	Y	NA	DNAJB6	UBE3C,DNAJB6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAJB6	13226	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	157467461	157467872	157467756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	341386	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	158493510	158493807	158493659	Y	NCAPG2	NCAPG2	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	1713	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr7	158613624	158614053	158613981	Y	ESYT2	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	6891	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	638062	638589	638348	Y	ZNF596,ZNF596,ERICH1	ERICH1	NA	NA	NA	NA	ERICH1	47517	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	1684662	1684866	1684764	Y	CLN8	CLN8,CTD-2336O2.1	CLN8,ARHGEF10	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CLN8	17078	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	1693574	1694042	1693752	Y	CLN8	CLN8,CTD-2336O2.1	ARHGEF10,CLN8,MIR596,KBTBD11,ZNF596	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLN8	7902	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr8	1694228	1694696	1694461	Y	CLN8	CLN8,CTD-2336O2.1	ARHGEF10,CLN8,ZNF596	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLN8	7248	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr8	1780723	1781665	1781560	Y	NA	ARHGEF10	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	10581	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	1837817	1838203	1838066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	67675	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	2263330	2263439	2263406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	493188	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	4848301	4848393	4848346	Y	CSMD1	NA	NA	NA	NA	NA	PAICSP4	205447	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	6536860	6537447	6537204	Y	NA	CTD-2541M15.1,AGPAT5	LOC100287015,MCPH1,ANGPT2	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2541M15.1	26283	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	8932382	8932915	8932599	Y	CLDN23,PPP1R3B	NA	PPP1R3B,ERI1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PPP1R3B	74169	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr8	11032163	11032532	11032339	Y	NA	XKR6	NA	NA	NA	NA	XKR6	24343	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	11312887	11313950	11313920	Y	NA	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	16274	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	11315246	11315781	11315560	Y	XKR6,MTMR9	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	14443	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	11322764	11323135	11322939	Y	FAM167A	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	7089	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	11560575	11560973	11560829	Y	GATA4	NA	NA	NA	NA	NA	NEIL2	64175	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	11734631	11734824	11734746	Y	CTSB	CTSB	CTSB,BLK,FDFT1,FAM167A	IMR90	Hi-C	24141950	CTSB	9674	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	11749167	11749418	11749260	Y	CTSB	CTSB	CTSB,FAM167A,BLK,NEIL2,GATA4,FDFT1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTSB	24210	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	12988209	12988727	12988474	Y	DLC1	NA	NA	NA	NA	NA	LONRF1	376627	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	13174158	13174460	13174309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLC1	196707	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	13210778	13210972	13210875	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLC1	160195	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	13224231	13224684	13224410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLC1	146483	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	13329086	13329400	13329354	Y	DLC1	DLC1	NA	NA	NA	NA	DLC1	41767	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	15503132	15503306	15503219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC2	1508232	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	16489924	16490119	16489983	Y	MSR1	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC2	521419	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	17165650	17166030	17165840	Y	PDGFRL	NA	NA	NA	NA	NA	CNOT7	63263	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	17465660	17466084	17465890	Y	MTUS1	PDGFRL	NA	NA	NA	NA	PDGFRL	33718	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	17466233	17466439	17466333	Y	NA	PDGFRL	NA	NA	NA	NA	PDGFRL	34291	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	18991999	18992391	18992140	Y	NA	NA	PSD3,LOC100128993	IMR90	Hi-C	24141950	PSD3	51759	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr8	19028579	19029034	19028823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	88339	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr8	19066932	19067320	19067099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH2D4A	101808	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr8	19266409	19266742	19266623	Y	CSGALNACT1	NA	NA	NA	NA	NA	SH2D4A	97281	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr8	20182767	20183137	20182952	Y	NA	NA	ATP6V1B2,LZTS1	IMR90	Hi-C	24141950	ATP6V1B2	129889	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	21541404	21541810	21541602	Y	DOK2	NA	NA	NA	NA	NA	XPO7	233370	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	21775759	21776194	21775973	Y	PHYHIP,DOK2,NPM2	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	579	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	21804083	21804253	21804128	Y	NA	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	28903	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	21867707	21867918	21867811	Y	PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM160B2	76752	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	22240884	22241560	22241218	Y	C8orf58	SLC39A14	NA	NA	NA	NA	SLC39A14	18122	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	22469003	22469432	22469219	Y	NA	PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	C8orf58	13889	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	22513437	22513754	22513670	Y	NA	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	BIN3	10907	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	22551843	22553123	22552848	Y	PPP3CC,PDLIM2,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10C,EGR3	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	EGR3	3028	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	22561043	22561327	22561142	Y	PPP3CC,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10B,EGR3	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	EGR3	12228	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	22710401	22710511	22710455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	132419	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	22808149	22808394	22808223	Y	NA	RHOBTB2	PEBP4,TNFRSF10B,BIN3,EGR3,RHOBTB2	IMR90	Hi-C	24141950	RHOBTB2	34536	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	23138717	23138953	23138815	Y	LOXL2	CHMP7,R3HCC1	NA	NA	NA	NA	R3HCC1	13084	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	23211536	23211676	23211614	Y	TNFRSF10D,LOXL2	NA	NA	NA	NA	NA	LOXL2	69165	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	23408969	23409174	23408998	Y	TNFRSF10B,ENTPD4,ENTPD4	SLC25A37,RNU4-71P	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	24651	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	23436711	23436787	23436740	Y	NA	RNU4-71P	NA	NA	NA	NA	RNU4-71P	18864	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	23618921	23619563	23619216	Y	ENTPD4,ENTPD4	NA	STC1,ENTPD4	IMR90	Hi-C	24141950	NKX3-1	80481	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr8	23655999	23656321	23656218	Y	STC1	NA	STC1,SLC25A37	IMR90	Hi-C	24141950	STC1	53999	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	23710742	23711028	23710888	Y	STC1	STC1	NA	NA	NA	NA	STC1	422	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	24013716	24014104	24013764	Y	STC1	NA	STC1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-148P	81045	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	24799462	24799718	24799592	Y	NEFL	NEFL	NA	NA	NA	NA	NEFL	12906	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr8	24858208	24858485	24858356	Y	NA	NEFL	NA	NA	NA	NA	NEFL	45584	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	25904215	25904335	25904275	Y	NA	EBF2	NA	NA	NA	NA	EBF2	3302	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	26305968	26306033	26305997	Y	NA	NA	BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PNMA2	63575	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	26306627	26307336	26307213	Y	NA	NA	BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PNMA2	62272	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr8	26324913	26325141	26325047	Y	NA	PNMA2,DPYSL2	NA	NA	NA	NA	PNMA2	44467	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	26466209	26466513	26466418	Y	PPP2R2A,BNIP3L	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	96418	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr8	26498541	26498935	26498595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-384C12.1	128372	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	27464961	27465271	27465267	Y	NA	CLU,SCARA3	NA	NA	NA	NA	CLU	5277	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	27474556	27474730	27474657	Y	NA	CLU,SCARA3	SCARA3,TRIM35,CLU,CCDC25,ESCO2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CLU	4008	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr8	28258528	28258941	28258737	Y	HMBOX1,HMBOX1	ZNF395	ZNF395,FBXO16	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF395	310	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.13408186158711
chr8	28637206	28637596	28637433	Y	EXTL3,KIF13B	NA	NA	NA	NA	NA	EXTL3-AS1	80225	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	29097584	29097960	29097935	Y	HMBOX1,HMBOX1,KIF13B	KIF13B	NA	NA	NA	NA	KIF13B	20681	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	29230784	29230978	29230896	Y	KIF13B,DUSP4	DUSP4	C8orf75,LOC286135,MIR3148,MIR548O2,TMEM66,LEPROTL1,DUSP4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	24599	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	29522725	29523096	29522814	Y	KIF13B	NA	LOC286135,DUSP4,C8orf75	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	316540	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	29526859	29527039	29527017	Y	NA	NA	LOC286135,DUSP4,C8orf75	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	320674	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	29595040	29595214	29595121	Y	KIF13B,DUSP4,DUSP4,TMEM66,LEPROTL1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM66	343509	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	30363851	30364149	30364000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBPMS-AS1	122934	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	30666266	30666462	30666364	Y	NA	PPP2CB	NA	NA	NA	NA	PPP2CB	3368	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	31040746	31040774	31040760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRN	151429	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	32558705	32558963	32558834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT10	769977	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	32642880	32643214	32643047	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT10	685726	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr8	37678678	37679141	37678937	Y	RAB11FIP1	GPR124,BRF2	NA	NA	NA	NA	BRF2	26281	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr8	37679848	37680132	37679943	Y	RAB11FIP1	GPR124,BRF2	NA	NA	NA	NA	BRF2	25290	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	37949268	37949491	37949380	Y	ASH2L,ASH2L	ASH2L	LETM2,WHSC1L1,ASH2L	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ASH2L	11269	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	37961561	37961954	37961758	Y	NA	ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	801	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	38219963	38220671	38220346	Y	WHSC1L1,LETM2,LETM2	WHSC1L1,LETM2	DDHD2,PPAPDC1B	IMR90	Hi-C	24141950	WHSC1L1	17119	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	38262735	38263237	38262894	Y	TACC1,PLEKHA2,C8orf86	WHSC1L1,LETM2	NA	NA	NA	NA	LETM2	21010	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr8	38312135	38312514	38312441	Y	NA	FGFR1	NA	NA	NA	NA	FGFR1	11838	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	38384926	38385302	38385064	Y	HTRA4,TACC1,PLEKHA2,C8orf86	NA	NA	NA	NA	NA	FGFR1	60574	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	38627692	38628125	38628027	Y	LETM2,LETM2,C8orf86,PLEKHA2,TACC1	TACC1	NA	NA	NA	NA	TACC1	43988	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr8	38790614	38790631	38790622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TM2D2	61712	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	38794203	38794537	38794324	Y	TACC1,PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	NA	TM2D2	57806	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	38794582	38795442	38794757	Y	TACC1,PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	NA	TM2D2	56901	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	38856419	38857534	38856583	Y	NA	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	4031	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr8	38895649	38895937	38895811	Y	TACC1,PLEKHA2,HTRA4	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	43261	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	39957250	39957527	39957387	Y	NA	NA	C8orf4	IMR90	Hi-C	24141950	IDO1	199456	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	42053833	42054135	42053951	Y	NA	AP3M2,PLAT	NA	NA	NA	NA	PLAT	9107	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	42270426	42270603	42270558	Y	NA	VDAC3	NA	NA	NA	NA	VDAC3	23284	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr8	42749479	42749732	42749583	Y	NA	MIR4469,HOOK3,RNF170	NA	NA	NA	NA	MIR4469	61	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	43092918	43093442	43093017	Y	HOOK3	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	99362	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr8	43093596	43094096	43093640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	100040	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr8	43097072	43097415	43097345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	103516	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	46856094	46856491	46856295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP2	1210250	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	48424795	48425379	48425168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	224269	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	48540167	48540694	48540467	Y	CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	108954	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	48580617	48580970	48580793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	68678	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	49229155	49229573	49229245	Y	NA	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	65577	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	49426952	49427328	49427172	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131802	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	49467466	49467648	49467542	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	172316	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	49494192	49494425	49494282	Y	NA	NA	SNAI2,EFCAB1	IMR90	Hi-C	24141950	EFCAB1	151445	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	52797055	52797111	52797083	Y	NA	PCMTD1,RP11-110G21.1	NA	NA	NA	NA	PCMTD1	12624	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	53188453	53188874	53188470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-110G21.1	378568	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr8	53625473	53626379	53625848	Y	RB1CC1	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	30024	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	54659884	54660111	54659998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP6V1H	94007	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	54798731	54798762	54798749	Y	NA	ATP6V1H,RGS20	NA	NA	NA	NA	RGS20	36363	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	56282047	56282150	56282095	Y	XKR4	NA	NA	NA	NA	NA	TGS1	401551	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	56744320	56744391	56744354	Y	TGS1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM68	60354	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	57594764	57594896	57594825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17A4.1	95820	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	59491466	59491801	59491581	Y	UBXN2B,SDCBP	SDCBP	NA	NA	NA	NA	SDCBP	27983	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	59980234	59980420	59980383	Y	NA	RP11-25K19.1,TOX	NA	NA	NA	NA	RP11-25K19.1	49179	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	61850776	61851191	61851141	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	RAB2A	423360	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	62385898	62385985	62385942	Y	CLVS1	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	239170	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	62566892	62567143	62567071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	58012	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr8	62600598	62600698	62600684	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	24457	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	62606389	62606706	62606619	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	18449	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr8	62620817	62621622	62621526	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	3533	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr8	62624516	62625412	62625017	Y	ASPH	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH,MIR4470	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr8	62634023	62634407	62634126	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	MIR4470	8676	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	64082499	64082747	64082682	Y	YTHDF3	YTHDF3	NA	NA	NA	NA	YTHDF3	3387	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	66615323	66615688	66615531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	60354	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	67035997	67036639	67036283	Y	NA	AC084082.3	NA	NA	NA	NA	AC084082.3	13095	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	67433991	67434613	67434592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	89869	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	67434763	67435122	67434951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	89360	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	67445791	67446197	67446047	Y	ADHFE1,VCPIP1,MYBL1	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	78285	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	67447907	67448273	67448065	Y	MYBL1,C8orf45	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	76209	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	68075038	68075412	68075329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	81020	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	68097028	68097398	68097213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	103010	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	68098646	68098899	68098873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	104628	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	68105132	68105308	68105276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	111114	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	68418389	68418528	68418467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGEF1	164477	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	72194927	72195300	72195185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-383H13.1	543102	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	72743005	72743258	72743225	Y	NA	RP11-383H13.1,MSC	NA	NA	NA	NA	RP11-383H13.1	4603	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	72743502	72744020	72743667	Y	NA	RP11-383H13.1,MSC	NA	NA	NA	NA	RP11-383H13.1	5100	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr8	72757668	72757969	72757918	Y	MSC	RP11-383H13.1,MSC	NA	NA	NA	NA	MSC	2965	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	72770493	72770720	72770591	Y	MSC	RP11-383H13.1,MSC	NA	NA	NA	NA	MSC	15790	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	72836370	72836680	72836477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSC	81667	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	72880263	72880309	72880290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPA1	105543	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	72917567	72918022	72917791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPA1	67830	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	74805063	74805433	74805333	Y	NA	UBE2W	UBE2W	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2W	15918	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	75494116	75494334	75494225	Y	NA	RP11-730G20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-730G20.2	20145	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	76035291	76035498	76035400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRISPLD1	140541	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	77529546	77529917	77529736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX4	61537	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	77585675	77585844	77585753	Y	ZFHX4	ZFHX4,ZFHX4-AS1	NA	NA	NA	NA	ZFHX4	5610	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	77590079	77590470	77590424	Y	ZFHX4	ZFHX4,ZFHX4-AS1	NA	NA	NA	NA	ZFHX4	984	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr8	77731385	77731402	77731393	Y	ZFHX4	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX4-AS1	137872	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	79578942	79579038	79579012	Y	IL7,FAM164A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-594N15.2	110204	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	79661368	79661417	79661393	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL7	54341	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	80705910	80706255	80706054	Y	HEY1	NA	HEY1,MRPS28	IMR90	Hi-C	24141950	STMN2	184861	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	80859511	80859794	80859653	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	80730	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	82167350	82167604	82167486	Y	NA	FABP5,RP11-363E6.3	ZNF704,PAG1,FABP12	IMR90	Hi-C	24141950	FABP5	22994	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	87358801	87359051	87358932	Y	NA	WWP1	NA	NA	NA	NA	WWP1	5834	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	88655608	88655638	88655622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AF121898.3	110308	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	89132899	89133146	89133023	Y	MMP16	NA	NA	NA	NA	NA	MMP16	205108	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	90270902	90271148	90271067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-37B2.1	496807	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	90740659	90741027	90740842	Y	NA	RP11-37B2.1,RIPK2	DECR1,NBN,RIPK2,OSGIN2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-37B2.1	26928	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	90776453	90776674	90776498	Y	OSGIN2,RIPK2	RP11-37B2.1,RIPK2	NA	NA	NA	NA	RIPK2	8478	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr8	90942619	90942853	90942786	Y	RIPK2,NBN,OSGIN2	OSGIN2	NA	NA	NA	NA	OSGIN2	30532	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr8	91479808	91480381	91480048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM64	321479	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	94850124	94850307	94850200	Y	PDP1,PDP1,PDP1,PDP1,GEM	PDP1	NA	NA	NA	NA	PDP1	17728	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	94892570	94892797	94892694	Y	NA	PDP1	TMEM67,PDP1,MIR378D2	IMR90	Hi-C	24141950	PDP1	24535	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	94950843	94950973	94950908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDP1	82808	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	95254172	95254606	95254439	Y	GEM	KB-1247B1.1,GEM	CDH17	IMR90	Hi-C	24141950	GEM	17972	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	95271404	95271652	95271620	Y	GEM	GEM	NA	NA	NA	NA	GEM	926	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	96180882	96181195	96181039	Y	PLEKHF2	PLEKHF2	NA	NA	NA	NA	PLEKHF2	36850	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	96197025	96197314	96197170	Y	NA	NA	PLEKHF2,C8orf69	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHF2	52993	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	97919369	97919918	97919418	Y	PGCP	NA	NA	NA	NA	NA	SDC2	415790	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	97923635	97924111	97923770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDC2	420056	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	98865970	98866240	98866105	Y	NA	RPS23P1,MATN2	NA	NA	NA	NA	RPS23P1	9042	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	99411965	99412163	99412094	Y	NIPAL2,KCNS2	NA	NIPAL2,STK3,POP1,KCNS2	IMR90	Hi-C	24141950	NIPAL2	107344	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	99478821	99479039	99478921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPAL2	174200	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	99637150	99637421	99637401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK3	315634	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	99952283	99952358	99952318	Y	OSR2	STK3,OSR2	NA	NA	NA	NA	STK3	697	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr8	99952429	99952792	99952702	Y	NA	STK3,OSR2	NA	NA	NA	NA	STK3	263	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr8	99953302	99954000	99953407	Y	STK3,OSR2	STK3,OSR2	NA	NA	NA	NA	STK3	247	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr8	100461450	100461455	100461453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13B	437956	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	100803946	100804239	100804046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX6C	100051	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	101731045	101731633	101731441	Y	NA	PABPC1	NA	NA	NA	NA	PABPC1	1404	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr8	101774635	101775034	101774843	Y	RNF19A,YWHAZ	PABPC1	PABPC1,SNX31	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PABPC1	41598	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	101913945	101914105	101914022	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	49511	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	101920723	101921107	101920870	Y	NA	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	42509	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr8	102038562	102039020	102038731	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	74946	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	102171133	102171473	102171263	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	ZNF706	ZNF706,YWHAZ,FLJ42969	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	44948	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	102171817	102172037	102171960	Y	YWHAZ,ZNF706,ZNF706	ZNF706	ZNF706,YWHAZ,FLJ42969	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	44384	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	102185716	102186115	102186035	Y	NA	ZNF706	YWHAZ,FLJ42969,ZNF706	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	30306	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	103401606	103401938	103401841	Y	NA	UBR5	NA	NA	NA	NA	UBR5	21131	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	103613012	103613469	103613324	Y	KLF10,KLF10	NA	UBR5,KLF10,ODF1,AZIN1,RRM2B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF10	52661	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	103669513	103669869	103669680	Y	AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10	KLF10	NA	NA	NA	NA	KLF10	3383	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr8	103750893	103751082	103750980	Y	AZIN1,KLF10,KLF10	NA	UBR5,KLF10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KB-1732A1.1	64663	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	103801151	103801773	103801337	Y	NA	KB-1732A1.1	KLF10,UBR5,ODF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1732A1.1	13972	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	104038342	104038540	104038441	Y	NA	ATP6V1C1	NA	NA	NA	NA	ATP6V1C1	7051	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	104059632	104059708	104059689	Y	NA	ATP6V1C1	NA	NA	NA	NA	ATP6V1C1	28341	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	104117409	104117806	104117725	Y	KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1,SLC25A32	BAALC	FZD6,BAALC,SLC25A32,LOC100499183,ATP6V1C1,C8orf56,DCAF13,RIMS2,CTHRC1	IMR90	Hi-C	24141950	BAALC	33132	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr8	104121309	104121576	104121444	Y	KLF10,KLF10,ATP6V1C1,BAALC	BAALC	BAALC,FZD6,CTHRC1,RIMS2	IMR90	Hi-C	24141950	BAALC	29362	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	107665296	107665542	107665419	Y	NA	TAGLN2P1	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	42699	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	108168455	108168523	108168489	Y	NA	NA	ANGPT1	IMR90	Hi-C	24141950	ANGPT1	339760	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	112163030	112163347	112163189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EBAG9	1613090	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	114266349	114266595	114266472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	120303	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	114877856	114878270	114878128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSMD3	430528	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	116068457	116069128	116068655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	750771	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	116439816	116440252	116439936	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	379647	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	116463689	116463880	116463766	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	356019	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	116474696	116474834	116474765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	345065	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	116660380	116660747	116660648	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	159152	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	117069192	117069529	117069276	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	249293	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	117456775	117457003	117456919	Y	NA	NA	TRPS1,LINC00536	IMR90	Hi-C	24141950	UTP23	319739	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr8	117529764	117530094	117529930	Y	C8orf85	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	246648	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	117664503	117664654	117664532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	112088	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	118778404	118778792	118778598	Y	NA	NA	EXT1	IMR90	Hi-C	24141950	MED30	247452	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	118801002	118801354	118801210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED30	270050	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	118885059	118885357	118885328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	236735	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	118969079	118969407	118969255	Y	MED30	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	152685	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr8	119023512	119024035	119023740	Y	EXT1	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	98057	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr8	119068312	119068746	119068717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	53346	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	119117518	119117887	119117807	Y	NA	EXT1	NA	NA	NA	NA	EXT1	4205	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	119317381	119317491	119317437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	195289	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	119469054	119469434	119469101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	162800	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	119536200	119536581	119536442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	95653	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	119917519	119917835	119917587	Y	NA	TNFRSF11B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF11B	44604	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	120331278	120331302	120331291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOV	95244	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	120591382	120591641	120591509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENPP2	92052	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	120593887	120594019	120593985	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENPP2	89674	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	121456351	121456697	121456524	Y	SNTB1,MTBP,MRPL13	MTBP,MRPL13	NA	NA	NA	NA	MRPL13	709	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	121649803	121649981	121649892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTB1	173532	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	121702901	121703232	121703165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTB1	120281	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	121809679	121809816	121809747	Y	NA	SNTB1	NA	NA	NA	NA	SNTB1	13697	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	121822442	121823157	121823030	Y	NA	SNTB1	NA	NA	NA	NA	SNTB1	356	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr8	122274970	122275319	122275245	Y	NA	NA	HAS2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-369K17.1	351665	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	122335950	122336427	122336136	Y	NA	NA	HAS2,HAS2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	HAS2	315203	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	122755244	122755615	122755430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAS2	103614	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	123122948	123123294	123123119	Y	NA	NA	HAS2	IMR90	Hi-C	24141950	HAS2	471318	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	123193210	123193342	123193276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAS2	541580	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	124169504	124169661	124169520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C8orf76	81977	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	124248679	124249062	124248866	Y	NA	C8orf76,ZHX1	NA	NA	NA	NA	C8orf76	2576	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr8	124407044	124407322	124407183	Y	NA	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	ATAD2	19268	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	124407455	124407786	124407574	Y	FAM91A1,C8orf76,ZHX1,ATAD2	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	ATAD2	18804	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	124529265	124529734	124529486	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	21712	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	124552481	124552488	124552485	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	1035	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	124642629	124642836	124642770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO32	91183	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	124816728	124816894	124816751	Y	NA	FAM91A1	NA	NA	NA	NA	FAM91A1	38032	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	125193673	125194016	125193878	Y	NA	ARF1P3	TMEM65,FER1L6,FER1L6-AS1,FAM91A1,TRMT12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARF1P3	31509	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	125273978	125274355	125274169	Y	FAM91A1,RNF139	RP11-383J24.1	FER1L6,FER1L6-AS1,TMEM65,FAM91A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-383J24.1	7569	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	125302460	125302812	125302637	Y	TMEM65,RNF139	RP11-383J24.1	NA	NA	NA	NA	RP11-383J24.1	20536	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	125367728	125368050	125367886	Y	TRMT12,TATDN1,NDUFB9	TMEM65	NA	NA	NA	NA	TMEM65	14883	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	125382714	125382961	125382953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM65	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	125513273	125513673	125513472	Y	NA	RNF139-AS1,RNF139,NDUFB9,TATDN1	NA	NA	NA	NA	RNF139	28294	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	126112372	126112753	126112532	Y	TRIB1,NSMCE2	NSMCE2,KIAA0196	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	10290	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	126195292	126195668	126195512	Y	TRIB1,KIAA0196,NSMCE2	NA	TRIB1	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0196	93210	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	126232175	126232753	126232302	Y	MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	130093	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	126268557	126268681	126268622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	166475	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	126285545	126285900	126285649	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	154663	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	126335524	126335526	126335525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	105037	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	126400704	126400965	126400873	Y	NA	TRIB1	TRIB1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TRIB1	39598	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	126441416	126441734	126441625	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	853	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	126446642	126447323	126446973	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	6079	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	128099457	128099542	128099514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYC	646138	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	128311782	128311908	128311845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYC	433772	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	128333152	128333458	128333317	Y	MYC	NA	NA	NA	NA	NA	MYC	412222	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	128403573	128403875	128403698	Y	MYC	NA	NA	NA	NA	NA	MYC	341805	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	128811691	128811973	128811933	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	6912	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	128822251	128823013	128822500	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	17472	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	128919831	128920544	128920233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	100313	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	128926432	128926732	128926619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	94125	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	128944008	128944415	128944139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	76442	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	128948050	128948240	128948055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	72617	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	129185963	129186138	129186049	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-25P	165106	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	129188825	129189407	129189075	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-25P	167968	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	129195465	129196052	129195562	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	174608	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	129527030	129527320	129527153	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	506173	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	129874065	129874230	129874161	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	853208	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr8	130595828	130596191	130596024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	431184	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	130697904	130698138	130698105	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM49B	329237	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	131454495	131454885	131454765	Y	NA	ASAP1	NA	NA	NA	NA	ASAP1	589	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	132037966	132038112	132038039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	584060	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	132616158	132616501	132616166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFR3A	297834	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	132828459	132829599	132829218	Y	EFR3A	NA	ADCY8	IMR90	Hi-C	24141950	EFR3A	84736	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	132868655	132869774	132869195	Y	EFR3A	EFR3A	ADCY8	IMR90	Hi-C	24141950	EFR3A	44561	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	132928633	132929053	132928845	Y	NA	EFR3A	NA	NA	NA	NA	EFR3A	14298	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	134258134	134258466	134258300	Y	PHF20L1,NDRG1	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	53799	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	135843585	135843751	135843688	Y	ZFAT	NA	ZFAT,MIR30D,MIR30B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFAT	120293	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	135869837	135869951	135869873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAT	146545	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	140716297	140716707	140716660	Y	NA	KCNK9	NA	NA	NA	NA	KCNK9	2998	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	141474376	141475403	141474918	Y	NA	TRAPPC9,CHRAC1	TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TRAPPC9	7698	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	141598802	141599709	141599120	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	79405	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr8	142215999	142216277	142216212	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	90622	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	143449565	143449834	143449726	Y	TSNARE1	TSNARE1	NA	NA	NA	NA	TSNARE1	32767	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	143533998	143534621	143534303	Y	LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1	NA	BAI1,TSNARE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TSNARE1	51397	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	143926112	143926283	143926201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JRK	164726	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	144302525	144302816	144302585	Y	LY6H,LY6H,LY6H	ZFP41,GLI4	NA	NA	NA	NA	ZFP41	24464	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	144684263	144684410	144684337	Y	NA	NAPRT1,TIGD5,EEF1D,PYCRL,TSTA3,ZNF623	NA	NA	NA	NA	EEF1D	4552	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	145022492	145023108	145022824	Y	PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	25794	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	22100	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr8	145549095	145549459	145549304	Y	NA	BOP1,HSF1,DGAT1,FBXL6,ADCK5	NA	NA	NA	NA	DGAT1	522	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr8	146010487	146010786	146010731	Y	NA	ZNF251,RPL8,ZNF7	NA	NA	NA	NA	ZNF34	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr8	146085419	146085616	146085518	Y	NA	ZNF7,COMMD5,ZNF250	NA	NA	NA	NA	COMMD5	8298	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	631583	631920	631840	Y	KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	163292	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	2241944	2242239	2242031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA2	228602	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	2655543	2655805	2655674	Y	NA	VLDLR	NA	NA	NA	NA	VLDLR	35709	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	2657497	2657645	2657571	Y	NA	VLDLR	NA	NA	NA	NA	VLDLR	37663	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	2875811	2876206	2875956	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	33570	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr9	3578891	3579091	3578989	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-509J21.1	54168	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	3742705	3743097	3742775	Y	NA	NA	GLIS3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-509J21.1	217982	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	3865342	3865632	3865553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-509J21.1	340619	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	3877182	3877575	3877493	Y	GLIS3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-509J21.1	352459	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	4086123	4086410	4086330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	259982	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	4137159	4137519	4137339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	208873	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	4241498	4241696	4241599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	104696	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	4283058	4283285	4283172	Y	GLIS3,GLIS3	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	63107	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	5509549	5510003	5509837	Y	C9orf46,CD274,PDCD1LG2	PDCD1LG2	NA	NA	NA	NA	PDCD1LG2	1004	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	5582977	5583121	5583054	Y	NA	KIAA1432	NA	NA	NA	NA	KIAA1432	43904	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	5586544	5586797	5586563	Y	C9orf46,CD274	KIAA1432	NA	NA	NA	NA	KIAA1432	40228	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr9	11065025	11065362	11065124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-87N24.2	453823	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr9	12421960	12422048	12422006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	390296	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	12818643	12818927	12818803	Y	NA	RP11-3L8.3	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	6299	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	14213496	14213805	14213615	Y	NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	183177	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	14322295	14322910	14322674	Y	ZDHHC21,NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	74072	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr9	16159777	16160100	16159939	Y	NA	NA	C9orf93,BNC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-62F24.2	564712	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	16236430	16236757	16236598	Y	NA	NA	BNC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-62F24.2	488055	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	16344409	16344763	16344480	Y	NA	NA	BNC2,C9orf93	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-62F24.2	380049	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	16521914	16522385	16522163	Y	BNC2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	202427	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	16681430	16681562	16681496	Y	NA	RP11-62F24.2	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	43250	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	16794774	16794903	16794900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	69962	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	16869534	16869976	16869661	Y	BNC2	BNC2	NA	NA	NA	NA	BNC2	693	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr9	16985936	16986021	16986007	Y	NA	NA	BNC2	IMR90	Hi-C	24141950	BNC2	117095	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	18478894	18479067	18478986	Y	ADAMTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-296P7.4	545823	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	18490587	18490949	18490797	Y	ADAMTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-296P7.4	533941	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr9	19184256	19184894	19184463	Y	PLIN2	PLIN2	HAUS6,ACER2,DENND4C,PLIN2	IMR90	Hi-C	24141950	PLIN2	36968	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	20552301	20552464	20552406	Y	MLLT3	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	68078	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	21491701	21492113	21492049	Y	NA	MIR31	NA	NA	NA	NA	MIR31	18071	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	21496569	21496909	21496764	Y	NA	MIR31	NA	NA	NA	NA	MIR31	13275	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	21685022	21685416	21685227	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	115126	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	21695810	21696232	21696052	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	104310	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	21832056	21832478	21832164	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	31514	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	21996542	21996712	21996656	Y	MTAP,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2B	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	CDKN2A	3242	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	22117547	22117648	22117588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	107393	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	26243860	26243998	26243927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFT74	701039	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	27564116	27564302	27564198	Y	C9orf72,C9orf72	MOB3B,C9orf72	NA	NA	NA	NA	C9orf72	7562	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	29826048	29826378	29826215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf72	2254184	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	31966420	31966696	31966558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACO1	415922	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	32395934	32396350	32396089	Y	NA	ACO1	NA	NA	NA	NA	ACO1	13316	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	32701589	32701944	32701680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB6	130429	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr9	33160944	33161390	33161236	Y	DNAJA1,SMU1,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	3964	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr9	34016159	34016420	34016379	Y	NA	UBAP2	NA	NA	NA	NA	UBAP2	30527	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	35491656	35492052	35492019	Y	OR13J1,TPM2,CREB3,CCDC107,RUSC2	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	111315	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	35492185	35492605	35492350	Y	RUSC2	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	110762	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	35518041	35518590	35518314	Y	CREB3,VCP,STOML2,RUSC2	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	84777	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	35603577	35603740	35603659	Y	RECK	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	210	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	36132257	36132411	36132324	Y	GLIPR2	GLIPR2	NA	NA	NA	NA	GLIPR2	2321	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	36232965	36233105	36233040	Y	NA	CLTA,RNU4-53P,GNE	NA	NA	NA	NA	RNU4-53P	32675	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	37270797	37270994	37270913	Y	PAX5	NA	NA	NA	NA	NA	GRHPR	149669	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	37771609	37771892	37771762	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	26607	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	37773119	37773290	37773253	Y	FRMPD1	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	25209	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	37954084	37954355	37954258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	112329	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	66455332	66455763	66455668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGM5	4485461	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	68423908	68424365	68424207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGM5	2516859	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGM5	2485668	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	72561735	72561997	72561908	Y	NA	NA	APBA1,MAMDC2,LOC100507299,LOC100507244,C9orf135,TRPM3,KLF9	IMR90	Hi-C	24141950	MAMDC2	94500	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	72731610	72732001	72731807	Y	MAMDC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAMDC2	75113	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	72801648	72801771	72801710	Y	MAMDC2	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	70166	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	72805213	72805492	72805447	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	66445	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr9	72871058	72871439	72871223	Y	NA	SMC5	NA	NA	NA	NA	SMC5	498	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	72923580	72923722	72923651	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	51643	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	73021440	73021667	73021582	Y	NA	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	5873	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	73021810	73022419	73022127	Y	NA	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	5121	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	73025885	73026723	73026293	Y	KLF9	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	817	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	7.46928651555488
chr9	73035561	73035945	73035863	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8021	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	3.73464325777744
chr9	73196795	73197009	73196903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	169255	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	73215942	73217043	73216172	Y	KLF9	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	188402	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr9	73219456	73219798	73219627	Y	TRPM3,KLF9	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	191916	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	74318584	74318670	74318629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM2	110936	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	75155526	75155660	75155598	Y	ZFAND5	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND5	177363	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	75172533	75172850	75172692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND5	194370	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	75200734	75200878	75200827	Y	ZFAND5	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND5	222571	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	75747117	75747734	75747349	Y	ANXA1	ANXA1	ANXA1	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA1	16939	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	77588894	77589149	77589022	Y	NA	RP11-197P3.1,C9orf40	NA	NA	NA	NA	C9orf40	23092	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	80911003	80911373	80911119	Y	PSAT1	PSAT1	NA	NA	NA	NA	PSAT1	944	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	82226280	82226508	82226439	Y	TLE4	TLE4	NA	NA	NA	NA	TLE4	41592	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	86051693	86051979	86051837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-439K3.1	219447	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	86785805	86786025	86785915	Y	NA	NA	HNRNPK,RMI1,C9orf64,SLC28A3	IMR90	Hi-C	24141950	RMI1	192179	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	88358353	88358730	88358394	Y	AGTPBP1	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	3409	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr9	88544402	88544561	88544480	Y	NA	NAA35	NA	NA	NA	NA	NAA35	9500	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	89626902	89626982	89626949	Y	NA	CDC20P1	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	2335	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr9	90182587	90182864	90182726	Y	NA	RP11-40C6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	44370	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	90326659	90327327	90326985	Y	DAPK1,CTSL1	NA	CTSL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-40C6.2	188442	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.66760232698389
chr9	90328172	90328868	90328486	Y	DAPK1,CTSL1	NA	CTSL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-40C6.2	189955	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr9	90329827	90330158	90329945	Y	DAPK1,CTSL1	NA	CTSL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-40C6.2	191610	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr9	90407699	90408115	90407854	Y	DAPK1,CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	CDK20	179553	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr9	91653504	91653820	91653662	Y	C9orf47,SHC3	S1PR3	NA	NA	NA	NA	S1PR3	49142	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	91762072	91762095	91762084	Y	NA	SHC3	NA	NA	NA	NA	SHC3	29587	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	91795136	91795669	91795494	Y	C9orf47,SHC3	SHC3	NA	NA	NA	NA	SHC3	3454	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	9.78120853227425
chr9	92004867	92005103	92005008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SECISBP2	73446	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	93823339	93823577	93823437	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	298618	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	93862627	93863018	93862659	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	AUH,ROR2,LOC100129316,NFIL3,MIR3910-1,MIR3910-2	IMR90	Hi-C	24141950	AUH	259177	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	93893646	93894080	93893930	Y	NA	NA	LOC100129316,AUH	IMR90	Hi-C	24141950	AUH	228115	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr9	93955243	93955725	93955362	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	166470	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr9	93955991	93956732	93956142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	165463	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.95624170645485
chr9	94181531	94181930	94181720	Y	NFIL3	NFIL3	NA	NA	NA	NA	NFIL3	2214	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	94249438	94249755	94249665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIL3	65294	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	94587450	94587551	94587492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROR2	122893	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	94614253	94614381	94614318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROR2	96063	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	94671066	94671340	94671201	Y	NA	ROR2	NA	NA	NA	NA	ROR2	39104	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	95383874	95384172	95384023	Y	NA	IPPK	NA	NA	NA	NA	IPPK	46375	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	95880555	95880921	95880640	Y	NA	C9orf89,NINJ1	NA	NA	NA	NA	NINJ1	13649	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	95980208	95980347	95980278	Y	ZNF484,ZNF484	NA	NA	NA	NA	NA	NINJ1	85638	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	96901972	96902054	96902023	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	37062	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	10486	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	9706	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.13408186158711
chr9	97630074	97630491	97630387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	143091	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	97881296	97881429	97881363	Y	FBP1	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	196562	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	97966578	97966817	97966786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	111174	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	97968410	97968794	97968763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	109197	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	98173547	98173783	98173614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	95556	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	98273012	98273438	98273114	Y	C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	3901	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr9	98629500	98629569	98629535	Y	NA	LINC00476	NA	NA	NA	NA	LINC00476	6690	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	2936	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.42272124105807
chr9	99213129	99213681	99213680	Y	ZNF510,CDC14B,HABP4	RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	HABP4	2646	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	99322452	99322838	99322645	Y	ZNF782	NA	HABP4	IMR90	Hi-C	24141950	CDC14B	57274	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	100454693	100454853	100454773	Y	TSTD2,XPA	XPA	NA	NA	NA	NA	XPA	2786	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	100455337	100455352	100455343	Y	NA	XPA	NA	NA	NA	NA	XPA	2287	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	100772550	100772875	100772560	Y	NA	ANP32B,NANS	NANS,TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	ANP32B	28907	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	100788386	100788828	100788550	Y	NA	ANP32B,NANS	NA	NA	NA	NA	NANS	28193	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	100985595	100985973	100985751	Y	TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	29942	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	101002580	101002910	101002849	Y	C9orf156,NANS,TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	13005	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr9	101011075	101011589	101011252	Y	C9orf156,NANS,TBC1D2	TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	4326	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	101557390	101557800	101557457	Y	NA	ANKS6,GALNT12	NA	NA	NA	NA	ANKS6	143	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	101868249	101868435	101868378	Y	NA	TGFBR1	NA	NA	NA	NA	TGFBR1	3929	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	101871896	101872113	101872024	Y	TGFBR1	TGFBR1	NA	NA	NA	NA	TGFBR1	7576	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	102006739	102006945	102006777	Y	NA	ALG2,SEC61B	NA	NA	NA	NA	SEC61B	24393	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	102021755	102022139	102021870	Y	NA	ALG2,SEC61B	ALG2,SEC61B,ERP44	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEC61B	39409	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	102421675	102421965	102421849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-554F20.1	158206	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	103173830	103174136	103174107	Y	NA	TMEFF1	C9orf30-TMEFF1,TEX10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEFF1	28424	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr9	103795840	103796119	103795981	Y	LPPR1	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL50	362777	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr9	104248590	104248780	104248669	Y	C9orf125	RNF20	NA	NA	NA	NA	RNF20	45353	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	107510718	107511248	107511059	Y	ABCA1,NIPSNAP3A	NIPSNAP3A,NIPSNAP3B	NA	NA	NA	NA	NIPSNAP3A	2749	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	107628415	107628839	107628708	Y	ABCA1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-217B7.2	58995	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	107635337	107635884	107635542	Y	ABCA1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-217B7.2	51950	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	107668768	107669725	107669153	Y	SLC44A1,OR13C3	RP11-217B7.2,ABCA1	NA	NA	NA	NA	RP11-217B7.2	18109	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr9	107730510	107730878	107730708	Y	SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1	RP11-217B7.2,ABCA1,RP11-217B7.3	ABCA1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-217B7.3	21184	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	107755412	107756258	107755691	Y	ABCA1	RP11-217B7.3	ABCA1,SLC44A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-217B7.3	3350	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	108266303	108266427	108266370	Y	FSD1L,FSD1L,TMEM38B	NA	NA	NA	NA	NA	FKTN	51984	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	109626456	109627144	109627032	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	3078	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	109647843	109648061	109647872	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	24465	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	110227888	110228126	110228018	Y	KLF4	KLF4	NA	NA	NA	NA	KLF4	22637	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	110254619	110254916	110254689	Y	NA	KLF4,RP11-438P9.1	NA	NA	NA	NA	KLF4	3856	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	110310627	110311050	110310826	Y	KLF4	RP11-438P9.1	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-438P9.1	15956	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	110401220	110401740	110401394	Y	NA	NA	KLF4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-438P9.1	106549	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	110512153	110512586	110512216	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-438P9.1	217482	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr9	110514044	110514454	110514287	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-438P9.1	219373	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	111206149	111206336	111206243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-220D10.1	180777	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	111774521	111775173	111774726	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	712	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr9	112543534	112543655	112543595	Y	NA	PALM2-AKAP2,AKAP2	NA	NA	NA	NA	AKAP2	2765	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	112569081	112569243	112569086	Y	PALM2	PALM2-AKAP2,AKAP2	NA	NA	NA	NA	AKAP2	28312	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	112578065	112578653	112578312	Y	PALM2	PALM2-AKAP2,AKAP2	NA	NA	NA	NA	AKAP2	37296	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	112578765	112579213	112578950	Y	PALM2	PALM2-AKAP2,AKAP2	NA	NA	NA	NA	AKAP2	37996	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr9	112579595	112579724	112579673	Y	NA	PALM2-AKAP2,AKAP2	C9orf152	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP2	38826	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	112730714	112730897	112730789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP2	189945	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	112791583	112792117	112791820	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	224803	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	112793164	112793205	112793171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	223715	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	112811971	112812606	112812251	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	204314	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr9	112813346	112813601	112813470	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	203319	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr9	112831833	112832445	112832154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	184475	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	112861625	112861803	112861710	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	155117	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	112878723	112879133	112878887	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	137787	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	112903621	112903940	112903708	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	112980	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	113119206	113119305	113119256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	102286	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	113195641	113195768	113195705	Y	SVEP1	NA	NA	NA	NA	NA	SVEP1	144392	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	113412585	113412772	113412669	Y	NA	NA	LPAR1,KIAA0368,SVEP1,MUSK,OR2K2,DNAJC25-GNG10	IMR90	Hi-C	24141950	SVEP1	72425	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr9	113413222	113413721	113413633	Y	LPAR1	NA	LPAR1,KIAA0368,SVEP1,MUSK,OR2K2,DNAJC25-GNG10	IMR90	Hi-C	24141950	SVEP1	73062	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr9	113507067	113507395	113507232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVEP1	166907	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	113515103	113515367	113515167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVEP1	174943	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	113646742	113646840	113646791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAR1	152141	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	113680597	113681099	113680790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAR1	117882	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	113699125	113699364	113699246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAR1	99617	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	113753501	113753784	113753656	Y	NA	LPAR1	NA	NA	NA	NA	LPAR1	45197	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	113783956	113784262	113784109	Y	NA	LPAR1	NA	NA	NA	NA	LPAR1	14719	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	114111620	114111657	114111640	Y	OR2K2	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0368	133368	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	114585349	114585680	114585428	Y	NA	NA	MIR3134,C9orf84,SUSD1,UGCG	IMR90	Hi-C	24141950	UGCG	71366	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	114720285	114720825	114720474	Y	UGCG	NA	C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UGCG	63239	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	114808602	114808743	114808666	Y	PTGR1,PTGR1,UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	126945	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	115110736	115110930	115110781	Y	NA	PTBP3,HSDL2	NA	NA	NA	NA	PTBP3	16789	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	115995182	115995346	115995289	Y	SNX30,SLC46A2,RGS3,SLC31A2,FKBP15	FKBP15,SLC31A1,PRPF4,CDC26	NA	NA	NA	NA	SLC31A1	13374	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	116385277	116385518	116385372	Y	RGS3	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	180266	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr9	116728685	116728905	116728795	Y	AMBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF618	92123	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	117159955	117160026	117159991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFNB31	105704	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	117249092	117249487	117249472	Y	NA	DFNB31	NA	NA	NA	NA	DFNB31	16243	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	117314293	117314590	117314355	Y	TNFSF8,TNFSF15,DFNB31,ATP6V1G1	DFNB31,ATP6V1G1	DFNB31,ATP6V1G1,C9orf91	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP6V1G1	33436	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	117785314	117785612	117785505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	92924	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	117878279	117878434	117878355	Y	NA	TNC	NA	NA	NA	NA	TNC	102	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	117967486	117967725	117967595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	88950	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	118028504	118028557	118028531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	149968	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	118353952	118354125	118354022	Y	TNC	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	475416	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	118358577	118359027	118358666	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	480041	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr9	118378080	118378500	118378342	Y	NA	NA	PAPPA,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	499544	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	118412488	118412760	118412588	Y	NA	NA	PAPPA,ASTN2,LOC100128505,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	501323	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	118430899	118431573	118430988	Y	NA	NA	PAPPA,ASTN2,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	482510	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	118434933	118435213	118435118	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	478870	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chr9	118435271	118435690	118435488	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	478393	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	118453042	118453852	118453530	Y	NA	NA	PAPPA,ASTN2,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	460231	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr9	118914445	118914679	118914506	Y	PAPPA	PAPPA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	362	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	118919313	118920155	118919798	Y	PAPPA	PAPPA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	5230	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	118953256	118953446	118953306	Y	PAPPA	PAPPA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	39173	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	119055041	119055304	119055148	Y	PAPPA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	140958	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	119066427	119066819	119066625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	152344	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	119311432	119311888	119311785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	135693	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	119404408	119404429	119404420	Y	NA	TRIM32	NA	NA	NA	NA	TRIM32	43152	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	120523356	120523735	120523438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLR4	58746	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	123208545	123208837	123208691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	131611	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	123251976	123252022	123252001	Y	CDK5RAP2	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	88426	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	123393159	123393348	123393336	Y	TRAF1,MEGF9	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	52711	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	123455501	123455738	123455670	Y	NA	MEGF9	NA	NA	NA	NA	MEGF9	19010	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	123477335	123478104	123478033	Y	NA	MEGF9	NA	NA	NA	NA	MEGF9	2587	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chr9	123640419	123640826	123640772	Y	NA	PSMD5,PHF19,TRAF1	NA	NA	NA	NA	PHF19	2813	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	123834049	123834395	123834258	Y	TRAF1,TRAF1,CNTRL	CNTRL	CNTRL,TRAF1	IMR90	Hi-C	24141950	CNTRL	746	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	124040831	124041134	124040970	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	RAB14	57539	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	124499221	124499709	124499392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL11	354176	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	125811144	125811514	125811213	Y	NA	NA	MIR600HG	IMR90	Hi-C	24141950	RABGAP1	110032	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	126187790	126188025	126187905	Y	RABGAP1,GPR21,CRB2	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	158935	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	126302696	126302988	126302896	Y	LHX2	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	273841	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	126597388	126597650	126597587	Y	DENND1A	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	92781	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	127059883	127060148	127059983	Y	NA	NEK6	NA	NA	NA	NA	NEK6	41998	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	127110676	127110867	127110772	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMB7	64856	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	127468042	127468336	127468195	Y	NA	MIR181A2HG	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	49296	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	127509473	127509808	127509481	Y	NA	NR6A1,OLFML2A	NA	NA	NA	NA	NR6A1	21781	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	127519728	127520109	127519909	Y	NA	NR6A1,OLFML2A	NA	NA	NA	NA	NR6A1	11480	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	127621077	127621225	127621167	Y	NA	WDR38,RPL35,ARPC5L,RNU4-82P	NA	NA	NA	NA	RPL35	1035	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	127943373	127943395	127943384	Y	NA	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	6823	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	127944437	127944756	127944696	Y	NR6A1,GOLGA1,PPP6C,GAPVD1	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	5462	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr9	128172483	128172773	128172647	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	150410	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	128211957	128212104	128212028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPVD1	189884	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	128274126	128274455	128274251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	193058	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	128299092	128299304	128299184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	168209	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	128422195	128422516	128422378	Y	HSPA5	MAPKAP1	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	44997	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	128592115	128592428	128592308	Y	PBX3	NA	NA	NA	NA	NA	PBX3	84491	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	129466839	129467134	129467067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	98151	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	129862611	129862888	129862750	Y	NA	ANGPTL2	NA	NA	NA	NA	ANGPTL2	20274	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	130281582	130281994	130281773	Y	TOR2A,SH2D3C,FAM129B,CDK9	NA	NA	NA	NA	NA	FAM129B	57274	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	130319753	130319894	130319823	Y	ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,FPGS,FPGS,FAM129B	FAM129B	NA	NA	NA	NA	FAM129B	19374	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	130461605	130461892	130461787	Y	GARNL3,STXBP1,ST6GALNAC6,SLC25A25,PIP5KL1,TTC16	PTRH1,TOR2A	NA	NA	NA	NA	PTRH1	23260	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr9	130600573	130601245	130600861	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS	FPGS,ENG,AK1	NA	NA	NA	NA	ENG	13790	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chr9	130733540	130734011	130733863	Y	SLC25A25,NAIF1,DPM2,FAM102A,FAM102A	DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	FAM102A	6781	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	130743802	130743907	130743855	Y	FAM102A	DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	FAM102A	3010	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr9	130992546	130992666	130992589	Y	SPTAN1,SH2D3C,SH2D3C,ST6GALNAC6,SLC25A25,DNM1,CIZ1	DNM1,CIZ1,SWI5,GOLGA2	NA	NA	NA	NA	CIZ1	27884	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	131007254	131007504	131007363	Y	URM1,CERCAM,FPGS,FPGS,ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,PIP5KL1,CIZ1	DNM1,CIZ1,SWI5,GOLGA2	NA	NA	NA	NA	SWI5	28154	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr9	131560607	131560712	131560660	Y	NA	ZER1,TBC1D13,ENDOG,C9orf114	NA	NA	NA	NA	TBC1D13	13124	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	131900982	131901116	131901071	Y	ENDOG,PHYHD1,CRAT,IER5L	PPP2R4,CRAT,IER5L	NA	NA	NA	NA	CRAT	29514	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	131929415	131929566	131929473	Y	METTL11A,C9orf106	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8974	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	131930457	131930532	131930510	Y	PRRX2	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8008	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	131937094	131937487	131937262	Y	PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1053	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.31192201671937
chr9	132244062	132244824	132244277	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	332	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	132257886	132258547	132258348	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	14156	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	132359774	132359922	132359814	Y	PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,METTL11A	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	42522	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	132372165	132372686	132372524	Y	NA	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	29758	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr9	132459422	132459648	132459595	Y	NA	PRRX2	NA	NA	NA	NA	PRRX2	33502	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr9	132460473	132461091	132460806	Y	ASB6,PRRX2	PRRX2	NA	NA	NA	NA	PRRX2	34553	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	132539303	132540203	132539702	Y	C9orf106,FNBP1,TOR1B	PTGES,TOR1B,TOR1A	PPP2R4,PRRX2,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20,TOR1B,TOR1A,FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,GPR107	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOR1B	23229	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	132646480	132646964	132646831	Y	ASB6,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf78	50338	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	132648080	132648314	132648193	Y	ASB6,TOR1B,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf78	51938	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chr9	132807262	132807460	132807345	Y	USP20,USP20	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	FNBP1	3789	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	132847110	132847326	132847217	Y	USP20,USP20	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	GPR107	33405	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	133565449	133565699	133565571	Y	NA	RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1	NA	NA	NA	NA	EXOSC2	1409	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	133721311	133721454	133721341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIBCD1	91219	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	133722867	133723250	133723071	Y	NA	NA	QRFP,FIBCD1	IMR90	Hi-C	24141950	FIBCD1	89423	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr9	134510539	134511032	134510903	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	102429	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	134515858	134516155	134515990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	97306	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	134608936	134609538	134609242	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	3923	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	134613837	134614689	134614350	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	376	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	134913456	134913470	134913463	Y	NA	MED27	NA	NA	NA	NA	MED27	39825	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	134953880	134954115	134953996	Y	MED27	MED27	NA	NA	NA	NA	MED27	585	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	135991045	135991361	135991245	Y	SLC2A6,RPL7A,RALGDS,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	45940	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chr9	136009131	136009458	136009277	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	27843	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	136075454	136075720	136075558	Y	NA	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	GBGT1	38122	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	136999790	136999893	136999856	Y	NA	WDR5	NA	NA	NA	NA	WDR5	1303	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	137233458	137233505	137233466	Y	RXRA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	26514	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	137348030	137348540	137348200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	141086	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr9	137367331	137367474	137367390	Y	COL5A1	NA	COL5A1	IMR90	Hi-C	24141950	RXRA	160387	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr9	137483960	137484781	137484422	Y	NA	COL5A1	RXRA,COL5A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL5A1	46839	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	137536549	137536868	137536739	Y	COL5A1	COL5A1	NA	NA	NA	NA	COL5A1	4929	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chr9	137718262	137718824	137718799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL5A1	186642	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	139120043	139120348	139120196	Y	NOTCH1	QSOX2	NA	NA	NA	NA	QSOX2	15339	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.84544248211614
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	C9orf169	501	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chr9	140200054	140200221	140200146	Y	EXD3,NRARP	NA	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	66389	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chr9	140312019	140312179	140312116	Y	LCNL1,ABCA2,FAM166A,C9orf173	EXD3,NOXA1	NA	NA	NA	NA	EXD3	3535	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	3263317	3263504	3263415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4767	3800397	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4767	3330638	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chrX	11158305	11158560	11158458	Y	ARHGAP6	RP11-120D5.1,HCCS	NA	NA	NA	NA	HCCS	30884	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	11722971	11723163	11723070	Y	NA	ARHGAP6	ARHGAP6	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP6	41150	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	12228582	12228906	12228588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMPD4	73997	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.60056139619033
chrX	12390298	12390694	12390463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMPD4	235713	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	12968289	12968795	12968434	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	22432	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chrX	12996518	12996966	12996772	Y	NA	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	5291	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	12996986	12997135	12997061	Y	TLR8,TMSB4X	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	5759	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chrX	13119924	13120175	13120039	Y	NA	NA	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB4X	128697	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	13128879	13129151	13129129	Y	NA	NA	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB4X	137652	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	13416625	13416882	13416754	Y	NA	GPX1P1	FAM9C,TMSB4X,LOC100133123	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPX1P1	21166	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	14262210	14262757	14262259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8	216198	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chrX	15354246	15354416	15354344	Y	ZRSR2,CA5B,MOSPD2,PIGA	PIGA,FIGF	NA	NA	NA	NA	PIGA	2570	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	16176605	16176961	16176614	Y	GRPR	GRPR,RPL6P30	NA	NA	NA	NA	GRPR	36926	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	16671538	16671979	16671762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTPS2	57080	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	16805192	16805460	16805250	Y	TXLNG	TXLNG	NA	NA	NA	NA	TXLNG	2642	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	16900871	16900973	16900947	Y	TXLNG	RBBP7,RNU4-6P	RBBP7,TXLNG	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNU4-6P	9481	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	18693104	18693424	18693141	Y	PHKA2,CDKL5	NA	NA	NA	NA	NA	CDKL5	251401	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	19893071	19893438	19893374	Y	NA	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	10281	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	20154251	20154286	20154269	Y	NA	EIF1AX	NA	NA	NA	NA	EIF1AX	3676	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	20283183	20283718	20283506	Y	SH3KBP1,RPS6KA3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA3	0	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chrX	22666072	22666114	22666093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMS	709381	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	23922308	23922544	23922448	Y	NA	APOO	NA	NA	NA	NA	APOO	1513	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	24187705	24188069	24187889	Y	NA	ZFX	NA	NA	NA	NA	ZFX	22415	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	29678122	29678339	29678241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEB2	553338	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	38079037	38079366	38079180	Y	SRPX	SRPX	NA	NA	NA	NA	SRPX	341	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	38165166	38165490	38165328	Y	RPGR	RPGR	NA	NA	NA	NA	RPGR	19327	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	39953769	39954197	39953849	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	80385	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	39963931	39964200	39963990	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	70382	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	39965558	39965902	39965820	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	68680	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	39966584	39967157	39966963	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	67425	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	39968308	39968728	39968376	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65854	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	40014046	40014813	40014331	Y	BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	19769	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	40633117	40633446	40633258	Y	ATP6AP2,MED14	MED14	USP9X,MED14	IMR90	Hi-C	24141950	MED14	40007	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	40869896	40870061	40869955	Y	ATP6AP2	NA	MED14,USP9X	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP9X	72827	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chrX	40943673	40944218	40943773	Y	CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X	USP9X	NA	NA	NA	NA	USP9X	785	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	NDP	57840	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chrX	44733657	44734406	44734027	Y	KDM6A	KDM6A	NA	NA	NA	NA	KDM6A	2900	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chrX	45338516	45338773	45338583	Y	NA	RP11-245M24.1	MIR221,MIR222	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-245M24.1	23860	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	45374628	45375077	45374937	Y	NA	RP11-245M24.1	MIR221,MIR222	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-245M24.1	11995	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chrX	45376807	45376988	45376867	Y	NA	RP11-245M24.1	MIR221,MIR222	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-245M24.1	14174	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chrX	45480900	45481410	45481103	Y	NA	NA	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-245M24.1	118267	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chrX	45488077	45488123	45488115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR221	115571	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	45568719	45568861	45568812	Y	NA	MIR221,MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR221	34833	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chrX	45569317	45570037	45569421	Y	NA	MIR221,MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR221	33657	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chrX	45570603	45570921	45570704	Y	NA	MIR221,MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR221	32773	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chrX	45665386	45665505	45665456	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	43415	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	45666628	45666834	45666726	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	42086	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	45668056	45668432	45668257	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	40488	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	45702877	45703292	45703236	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	5628	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	46436763	46437171	46436936	Y	RP2,ZNF674,CHST7	ZNF674,CHST7	NA	NA	NA	NA	CHST7	5544	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chrX	46495805	46496079	46496076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST7	64586	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	46651969	46652131	46652053	Y	ZNF674,CHST7,RP2	SLC9A7,RP2	CHST7,ZNF674,LOC401588,SLC9A7,RP2,PHF16	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A7	35479	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	46989082	46989431	46989227	Y	NA	RBM10,NDUFB11	NA	NA	NA	NA	RBM10	12837	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	47016809	47017199	47017004	Y	NA	RBM10,NDUFB11,UBA1	NA	NA	NA	NA	NDUFB11	13906	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chrX	47175541	47175936	47175853	Y	NA	NA	USP11,CDK16,UBA1	IMR90	Hi-C	24141950	USP11	85452	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	47415526	47415793	47415667	Y	NA	ARAF,TIMP1	NA	NA	NA	NA	ARAF	2723	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chrX	47701110	47701161	47701136	Y	NA	ZNF81	NA	NA	NA	NA	ZNF81	6809	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	48345811	48346195	48345963	Y	WAS,RBM3,PQBP1,PQBP1,PQBP1,OTUD5	FTSJ1,PORCN,EBP,TBC1D25	NA	NA	NA	NA	FTSJ1	13270	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	48390158	48390246	48390210	Y	NA	PORCN,EBP,TBC1D25,RBM3	NA	NA	NA	NA	TBC1D25	5599	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	48571549	48571765	48571661	Y	NA	SUV39H1	NA	NA	NA	NA	SUV39H1	19604	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	48571837	48572283	48571996	Y	TBC1D25,PQBP1,PIM2,OTUD5,GRIPAP1	SUV39H1	NA	NA	NA	NA	SUV39H1	19892	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	48748167	48748450	48748403	Y	NA	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2	NA	NA	NA	NA	PQBP1	4745	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	48938465	48938570	48938518	Y	NA	TFE3,PRAF2,WDR45,GPKOW	NA	NA	NA	NA	PRAF2	8735	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	49012442	49012818	49012676	Y	NA	GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	13455	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	49108550	49108714	49108667	Y	PIM2,PPP1R3F,FOXP3	HSPB1P2,CCDC22,PPP1R3F	NA	NA	NA	NA	PPP1R3F	15592	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	52949996	52950343	52950129	Y	TSPYL2,KDM5C,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	31660	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	45908	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.06704093079355
chrX	53083409	53083784	53083564	Y	NA	GPR173,TSPYL2,LINC01155	NA	NA	NA	NA	GPR173	7136	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	53110126	53110560	53110260	Y	NA	GPR173,TSPYL2,LINC01155	NA	NA	NA	NA	TSPYL2	577	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chrX	53155305	53155690	53155322	Y	XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2	TSPYL2,LINC01155	KDM5C	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01155	33978	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	53172968	53173150	53172985	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01155	51641	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	53428419	53428681	53428625	Y	NA	SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	SMC1A	18996	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	53467837	53468052	53468003	Y	KDM5C	SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	HSD17B10	8517	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	53468564	53468782	53468716	Y	IQSEC2	SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	HSD17B10	9244	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chrX	53505172	53505424	53505298	Y	NA	HSD17B10	IQSEC2,HSD17B10,RIBC1,SMC1A	IMR90	Hi-C	24141950	HSD17B10	45852	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	54665732	54666388	54666226	Y	NA	NA	ITIH6,MAGED2	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNL3L	111088	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	56269843	56269989	56269918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBQLN2	318037	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	56791132	56791384	56791234	Y	NA	RP11-622K12.1,UQCRBP1	NA	NA	NA	NA	UQCRBP1	29122	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	64888338	64888720	64888577	Y	MSN	NA	NA	NA	NA	NA	MSN	82081	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	64898955	64899156	64899089	Y	MSN	NA	NA	NA	NA	NA	MSN	92698	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	EFNB1	NA	NA	NA	NA	EFNB1	42163	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chrX	69653784	69653948	69653832	Y	NA	DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8763	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	70401853	70402134	70401993	Y	IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO	NA	NA	NA	NA	NA	MED12	65447	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chrX	73237406	73237798	73237506	Y	CHIC1	RP13-36G14.3	NA	NA	NA	NA	RP13-36G14.3	46120	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chrX	73250242	73250558	73250399	Y	NA	RP13-36G14.3	NA	NA	NA	NA	RP13-36G14.3	33360	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	73756210	73756567	73756298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLIM	75885	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	73791399	73791714	73791557	Y	RLIM	RLIM	NA	NA	NA	NA	RLIM	40738	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	77908831	77908963	77908901	Y	CYSLTR1	NA	NA	NA	NA	NA	TAF9B	515628	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	79828855	79829064	79828956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRWD3	234123	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.889200775661295
chrX	94679861	94680217	94680039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALM1P1	72386	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	99913933	99914424	99914133	Y	SYTL4,SYTL4	TSPAN6,SRPX2	NA	NA	NA	NA	SRPX2	16718	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	100792680	100793554	100793013	Y	NA	ARMCX1	NA	NA	NA	NA	ARMCX1	9960	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chrX	101914784	101914936	101914847	Y	BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1	NA	NA	NA	NA	NA	GPRASP2	50168	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.95624170645485
chrX	102820880	102821034	102820957	Y	NA	TCEAL4,TCEAL3	NA	NA	NA	NA	TCEAL4	8125	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	102880714	102880758	102880737	Y	PLP1,PLP1	TCEAL3,TCEAL1	NA	NA	NA	NA	TCEAL1	874	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	106595212	106595632	106595477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM41	235155	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	106595667	106595822	106595802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM41	235610	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chrX	106693156	106693529	106693316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPS1	176208	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	108883543	108883897	108883721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL4	90735	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	109017803	109018393	109018148	Y	NA	ACSL4	NA	NA	NA	NA	ACSL4	43171	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	109330355	109330526	109330451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM164	86496	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	109429267	109429621	109429491	Y	AMMECR1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM164	185408	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chrX	114819160	114819326	114819285	Y	NA	PLS3	NA	NA	NA	NA	PLS3	25659	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	117499894	117500112	117500003	Y	NA	WDR44	NA	NA	NA	NA	WDR44	21858	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	117654579	117654738	117654653	Y	LONRF3	DOCK11	NA	NA	NA	NA	DOCK11	26718	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	120337126	120337342	120337247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	575121	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	122898767	122899176	122898998	Y	NA	THOC2	NA	NA	NA	NA	THOC2	33861	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	2.31192201671937
chrX	129065451	129065820	129065554	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	27354	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	129118011	129118370	129118054	Y	NA	BCORL1	BCORL1,UTP14A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCORL1	4928	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.24488108592581
chrX	129121612	129121744	129121653	Y	NA	BCORL1	BCORL1,UTP14A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCORL1	8529	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	129255072	129255259	129255158	Y	SASH3,ELF4,ELF4	ELF4,AIFM1,RAB33A	ELF4	K562	ChIA-PET	22265404	ELF4	12381	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chrX	129307329	129307713	129307433	Y	NA	AIFM1,RAB33A	NA	NA	NA	NA	RAB33A	3706	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chrX	129400519	129400680	129400638	Y	NA	ZNF280C	NA	NA	NA	NA	ZNF280C	193	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chrX	134096434	134096824	134096629	Y	NA	MOSPD1	FAM127C	IMR90	Hi-C	24141950	MOSPD1	49137	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.533520465396777
chrX	152064300	152064566	152064432	Y	NA	NA	CETN2,NSDHL	MCF7	ChIA-PET	22265404	NSDHL	66789	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.711360620529036
chrX	152065195	152065303	152065205	Y	NA	NA	CETN2,NSDHL	MCF7	ChIA-PET	22265404	NSDHL	67684	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chrX	153311757	153312308	153312067	Y	NA	IRAK1,MECP2	NA	NA	NA	NA	IRAK1	28326	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrX	153596671	153598676	153598064	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	2330	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	1.77840155132259
chrX	153755432	153755621	153755566	Y	NA	LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD	FAM3A	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	IKBKG	11793	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.355680310264518
chrY	2817706	2817951	2817827	Y	NA	ZFY	NA	NA	NA	NA	ZFY	16594	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrY	13476723	13477122	13476988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYG2P1	1053133	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrY	21664138	21664302	21664220	Y	KDM5D	NA	NA	NA	NA	NA	TXLNG2P	62897	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259
chrY	28555183	28555400	28555298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF1AY	5819572	CAGE	NMFH-1	hg19	FANTOM5	0.177840155132259