chr1 956563 956812 956665 Y UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA AGRN 3060 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 4.2255287393614 chr1 1004646 1004986 1004766 Y NA RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159 NA NA NA NA RNF223 2701 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 1063914 1064111 1063979 Y AGRN,VWA1 C1orf159 B3GALT6,SDF4,C1orf159,TNFRSF18,TTLL10,TNFRSF4,LOC254099,ACAP3,UBE2J2,SCNN1D,PLEKHN1,C1orf170,AGRN,ISG15,RNF223 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C1orf159 14173 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.52588537810273 chr1 1093610 1093958 1093954 Y ATAD3C,TMEM88B C1orf159 NA NA NA NA C1orf159 43869 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 1136667 1137146 1136877 Y HES4,MIB2 SDF4,B3GALT6 NA NA NA NA SDF4 28265 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 1283060 1283625 1283139 Y NA PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,AURKAIP1,CCNL2 NA NA NA NA DVL1 330 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 1343359 1343768 1343546 Y NA AURKAIP1,CCNL2,MRPL20,TMEM88B,VWA1,ATAD3C NA NA NA NA MRPL20 2666 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 1368471 1368786 1368620 Y RNF223,DVL1,NADK,LOC441869,TMEM88B,VWA1 CCNL2,MRPL20,TMEM88B,VWA1,ATAD3C,ATAD3B NA NA NA NA VWA1 230 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 1814762 1815124 1815035 Y SKI,C1orf86,MIB2 GNB1,TMEM52 NA NA NA NA GNB1 5371 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 1978731 1978937 1978887 Y NADK,PRKCZ GABRD NA NA NA NA GABRD 29951 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 2068660 2068858 2068763 Y NA NA NA NA NA NA C1orf86 73301 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 2140151 2140337 2140252 Y C1orf86 C1orf86 NA NA NA NA C1orf86 1822 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 2162325 2162996 2162733 Y TNFRSF14,SKI C1orf86 NA NA NA NA C1orf86 20166 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 2190530 2190674 2190620 Y TNFRSF14,SKI C1orf86 NA NA NA NA C1orf86 48371 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 2245775 2246116 2245876 Y NA NA NA NA NA NA MORN1 75030 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 2477415 2477971 2477660 Y NA PANK4,HES5,TNFRSF14,RP3-395M20.8,FAM213B NA NA NA NA TNFRSF14 7107 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr1 2509702 2510198 2509855 Y SKI,TNFRSF14 TNFRSF14,RP3-395M20.8,FAM213B NA NA NA NA FAM213B 5732 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.52588537810273 chr1 2574079 2574144 2574101 Y NA NA NA NA NA NA FAM213B 58149 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 2574343 2574764 2574705 Y MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1 NA NA NA NA NA FAM213B 58413 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 3374928 3375314 3374967 Y NA ARHGEF16 NA NA NA NA ARHGEF16 5938 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 3421438 3421558 3421506 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF16 52448 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 3817648 3818071 3817969 Y LRRC47 CEP104,DFFB,C1orf174 NA NA NA NA C1orf174 2791 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 6221566 6221669 6221628 Y PLEKHG5,CHD5 RNF207,RPL22 NA NA NA NA RNF207 41866 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 6319998 6320272 6320169 Y NA ICMT,GPR153 NA NA NA NA GPR153 963 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 6451759 6451831 6451795 Y NA ACOT7,ESPN NA NA NA NA ACOT7 620 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 6661008 6661639 6661311 Y ZBTB48,KLHL21 NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3 NA NA NA NA PHF13 10106 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 7764543 7764931 7764717 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 64398 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr1 8229904 8230047 8229996 Y NA NA ERRFI1,SLC45A1 IMR90 Hi-C 24141950 ERRFI1 145536 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 8487656 8487917 8487791 Y RERE NA NA NA NA NA RERE 387785 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 9222919 9223181 9223073 Y SPSB1 GPR157,RP3-510D11.2 SLC2A7,SLC25A33,MIR34A,GPR157 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP3-510D11.2 17082 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 2.1127643696807 chr1 9223692 9223875 9223840 Y NA GPR157,RP3-510D11.2 SLC2A7,SLC25A33,MIR34A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP3-510D11.2 16388 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 9223907 9224260 9224149 Y SPSB1 GPR157,RP3-510D11.2 SLC2A7,SLC25A33,MIR34A IMR90 Hi-C 24141950 RP3-510D11.2 16003 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 9318130 9318195 9318182 Y NA H6PD,SPSB1 NA NA NA NA H6PD 25296 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 9488839 9489227 9489154 Y NA NA SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 108314 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 10269964 10270260 10269995 Y RBP7,PGD,KIF1B KIF1B NA NA NA NA KIF1B 1101 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 10447707 10448369 10448247 Y NA PGD,APITD1,APITD1-CORT NA NA NA NA PGD 8280 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 11040299 11040592 11040356 Y NA TARDBP NA NA NA NA TARDBP 29822 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 11376903 11377179 11377126 Y NA UBIAD1 NA NA NA NA UBIAD1 45640 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 11559549 11559947 11559917 Y NA NA NA NA NA NA FBXO44 152485 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 12674513 12674729 12674684 Y NA DHRS3 NA NA NA NA DHRS3 1008 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 12675687 12675874 12675779 Y VPS13D NA NA NA NA NA DHRS3 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 16087189 16087372 16087266 Y EPHA2,FBLIM1 SLC25A34,TMEM82 NA NA NA NA TMEM82 20272 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 16175691 16176294 16176100 Y NA RP11-169K16.8,SPEN NA NA NA NA SPEN 3332 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 16212759 16213091 16212941 Y EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN SPEN NA NA NA NA SPEN 40400 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 16439002 16439355 16439225 Y NA FAM131C,RP11-276H7.2,EPHA2 FAM131C,CLCNKB IMR90 Hi-C 24141950 RP11-276H7.2 40351 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 16470181 16470602 16470563 Y NA RP11-276H7.2,EPHA2 NA NA NA NA RP11-276H7.2 9104 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 16478939 16479163 16479034 Y FBLIM1,EPHA2 RP11-276H7.2,EPHA2 NA NA NA NA RP11-276H7.2 543 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 16479299 16479465 16479382 Y FBLIM1,EPHA2 RP11-276H7.2,EPHA2 NA NA NA NA RP11-276H7.2 241 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 16499761 16499895 16499826 Y SPEN,EPHA2 RP11-276H7.2,EPHA2 CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHA2 19179 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 16500084 16500309 16500220 Y NA RP11-276H7.2,EPHA2 CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHA2 19502 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 16502532 16502678 16502612 Y C1orf64 RP11-276H7.2,EPHA2 CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHA2 21950 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 16508402 16508642 16508565 Y FBLIM1 RP11-276H7.2,EPHA2 NA NA NA NA EPHA2 27820 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 16511251 16511623 16511321 Y NA RP11-276H7.2,EPHA2 NA NA NA NA EPHA2 30669 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 16696032 16696399 16696223 Y NA FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 19083 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA NA SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 60166 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 17023723 17023998 17023841 Y NA EIF1AXP1 NA NA NA NA EIF1AXP1 13173 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 17027024 17027386 17027173 Y NA EIF1AXP1 NA NA NA NA EIF1AXP1 16474 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr1 17231253 17231704 17231392 Y PADI4,PADI2 RP11-108M9.4 CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-108M9.4 17109 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA RP11-108M9.4 CROCC K562 ChIA-PET 22265404 RP11-108M9.4 26044 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.87801277304951 chr1 17880613 17880854 17880734 Y NA ARHGEF10L NA NA NA NA ARHGEF10L 16283 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 19253034 19253391 19253292 Y UBR4,IFFO2 ALDH4A1,IFFO2 ALDH4A1 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH4A1 25759 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 19337577 19337942 19337698 Y NA NA UBR4,IFFO2,ALDH4A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFFO2 56397 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 19614370 19614635 19614441 Y ALDH4A1,AKR7A3 MRTO4,AKR7A2,PQLC2 NA NA NA NA AKR7A2 22005 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr1 19703880 19704261 19704067 Y NA NA NA NA NA NA PQLC2 67060 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 19794978 19795283 19795050 Y PLA2G2E,UBR4 CAPZB NA NA NA NA CAPZB 14783 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr1 19796024 19796128 19796080 Y NA CAPZB NA NA NA NA CAPZB 13938 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr1 19803913 19804113 19803998 Y PLA2G2E,TMCO4,UBR4 CAPZB NA NA NA NA CAPZB 5953 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 19804974 19805167 19805055 Y PLA2G2E CAPZB NA NA NA NA CAPZB 4899 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 20204786 20204981 20204970 Y OTUD3 OTUD3 NA NA NA NA OTUD3 2025 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 21348947 21349299 21348998 Y CDA,ECE1,ECE1 RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 48947 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 21724067 21724372 21724186 Y NA NA ECE1,NBPF3,RAP1GAP,ALPL,USP48 IMR90 Hi-C 24141950 ECE1 54070 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 21916510 21916997 21916827 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GAP 76804 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 21965161 21965473 21965377 Y RAP1GAP RAP1GAP NA NA NA NA RAP1GAP 28328 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 22002610 22002786 22002701 Y NA RAP1GAP RAP1GAP K562 ChIA-PET 22265404 RAP1GAP 8809 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 22231370 22231630 22231560 Y NA RP11-26H16.1,HSPG2 NA NA NA NA RP11-26H16.1 961 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 22468030 22468558 22468270 Y NA NA NA NA NA NA WNT4 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 23494015 23494642 23494449 Y NA LUZP1 NA NA NA NA LUZP1 7659 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 23542417 23542518 23542468 Y HTR1D LUZP1 KDM1A,LUZP1 IMR90 Hi-C 24141950 LUZP1 40116 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 23881180 23881765 23881497 Y NA E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 2520 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 23888678 23889201 23888997 Y ID3 E2F2,ID3 NA NA NA NA ID3 4393 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 24349340 24349488 24349411 Y NA RP11-4M23.7 LYPLA2,SRSF10,MYOM3,PNRC2,SRRM1,HMGCL,IL22RA1,LOC100506963,TCEB3,GALE,FUCA1,CNR2,IL28RA,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-4M23.7 16331 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 24477754 24478041 24477856 Y NA IL22RA1 IL22RA1 IMR90 Hi-C 24141950 IL22RA1 10143 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 25051079 25051208 25051162 Y NA CLIC4 RUNX3,CLIC4,SRRM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIC4 18640 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 25566195 25566411 25566257 Y TMEM57 SYF2 SYF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SYF2 9202 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 26033818 26034000 26033909 Y NA NA NA NA NA NA SEPN1 90667 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 26617206 26617304 26617268 Y SH3BGRL3,RPS6KA1,PIGV,ARID1A,UBXN11,UBXN11 SH3BGRL3,CD52,UBXN11 NA NA NA NA SH3BGRL3 13539 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 26678060 26678317 26678200 Y CNKSR1,AIM1L CD52,UBXN11,AIM1L NA NA NA NA AIM1L 304 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 26683687 26684084 26683890 Y CNKSR1,AIM1L CD52,UBXN11,AIM1L NA NA NA NA AIM1L 5066 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 26907862 26908015 26907938 Y SH3BGRL3,UBXN11 NA NA NA NA NA HMGN2 110921 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 26946837 26947249 26947076 Y CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 73275 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 26947342 26948198 26947481 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72326 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 27024638 27025138 27024825 Y SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV ARID1A NA NA NA NA ARID1A 4114 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 27175784 27176273 27175984 Y C1orf172,AIM1L,ZNF683,RPS6KA1,SFN ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA SFN 11360 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3,NR0B2 NA NA NA NA SFN 3753 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.64326117641832 chr1 27321452 27321840 27321632 Y TMEM222,TRNP1,FAM46B C1orf172,RP11-344H11.4,TRNP1 NA NA NA NA TRNP1 3254 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr1 27353661 27353962 27353706 Y TMEM222,MAP3K6,TRNP1 RP11-344H11.4,TRNP1 FAM46B,C1orf172,SLC9A1,WDTC1,WASF2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TRNP1 35463 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 27527451 27527688 27527509 Y NA SLC9A1,WDTC1 WDTC1,SLC9A1,C1orf172 IMR90 Hi-C 24141950 WDTC1 31319 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.40850957978713 chr1 27775351 27775365 27775358 Y GPR3 WASF2 NA NA NA NA WASF2 39304 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 27883449 27884140 27883881 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 44802 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr1 27890194 27890387 27890291 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 38555 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 27893464 27893671 27893490 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 35271 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 27907931 27908052 27907995 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 20890 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 27916292 27916674 27916513 Y XKR8,AHDC1 AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 12268 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 27924204 27924421 27924302 Y XKR8,AHDC1 AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 4521 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 27928507 27928973 27928740 Y NA NA NA NA NA NA AHDC1 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 28143878 28144081 28143936 Y NA STX12,PPP1R8 NA NA NA NA PPP1R8 11208 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 28573636 28574084 28573917 Y NA AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 9954 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 29214759 29214998 29214903 Y GMEB1,EPB41 EPB41 NA NA NA NA EPB41 3156 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 29451057 29451462 29451431 Y TMEM200B,TMEM200B TMEM200B NA NA NA NA TMEM200B 2610 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 31251287 31251533 31251452 Y NA NA LAPTM5,MECR,MATN1,LOC100129196,SNORD103A,SNORD103B,PUM1,SDC3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDC3 128075 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 31320336 31320627 31320524 Y NA NA SDC3 K562 ChIA-PET 22265404 SDC3 58981 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 31360609 31360977 31360897 Y NA SDC3 NA NA NA NA SDC3 18631 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 31483120 31483355 31483250 Y NA NA NA NA NA NA PUM1 53483 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 31537719 31538012 31537814 Y LAPTM5,PUM1 PUM1 NA NA NA NA PUM1 881 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 90728 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr1 31628220 31628457 31628359 Y NA NA PUM1,NKAIN1,SERINC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 91382 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 31956203 31956482 31956384 Y PEF1 NA SERINC2,SNRNP40,HCRTR1,NKAIN1,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1 IMR90 Hi-C 24141950 SERINC2 75791 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 33077721 33078012 33077949 Y FNDC5 ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 36492 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 33220297 33220575 33220521 Y NA KIAA1522 NA NA NA NA KIAA1522 14811 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 33220963 33221073 33221021 Y NA KIAA1522 NA NA NA NA KIAA1522 15477 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 33225056 33225508 33225256 Y NA KIAA1522 NA NA NA NA KIAA1522 19570 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 33225777 33226084 33225890 Y TMEM54,KIAA1522 KIAA1522 NA NA NA NA KIAA1522 20291 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr1 33226574 33226719 33226667 Y TMEM54,KIAA1522 KIAA1522 NA NA NA NA KIAA1522 21088 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr1 33438571 33438703 33438616 Y KIAA1522,ADC RNF19B NA NA NA NA RNF19B 10285 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 33446816 33447482 33446950 Y RNF19B RNF19B RNF19B,AK2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF19B 18530 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 33457914 33458607 33458311 Y RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 29628 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 33829513 33829825 33829684 Y FNDC5,ZSCAN20 NA NA NA NA NA PHC2 64828 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 36103028 36103196 36103152 Y NA PSMB2 TFAP2E IMR90 Hi-C 24141950 PSMB2 2249 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 36616485 36616868 36616577 Y STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1 TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 2312 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 36840093 36840535 36840445 Y EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 8962 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 36866636 36866899 36866720 Y LSM10 STK40,LSM10,OSCP1 NA NA NA NA LSM10 5143 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 37937293 37937526 37937471 Y YRDC,MTF1,C1orf122,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA LINC01137 486 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 37944084 37944971 37944382 Y YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA ZC3H12A 5931 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 39509536 39509726 39509631 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 19546 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 39629010 39629413 39629213 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 84022 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 39874208 39874673 39874342 Y KIAA0754 KIAA0754 NA NA NA NA KIAA0754 57 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 40264988 40265120 40265045 Y NA BMP8B HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BMP8B 12455 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 40283075 40283206 40283146 Y PABPC4,RLF,MFSD2A BMP8B MYCL1 K562 ChIA-PET 22265404 BMP8B 30542 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 40426190 40426638 40426252 Y MFSD2A MFSD2A NA NA NA NA MFSD2A 7388 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 40628781 40629153 40628997 Y NA RLF NA NA NA NA RLF 3736 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 41365158 41365531 41365407 Y NA CITED4 CITED4,CTPS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED4 39140 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 41501908 41501999 41501966 Y SCMH1 NA NA NA NA NA CITED4 175890 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 41564044 41564297 41564171 Y NA NA NA NA NA NA SCMH1 141529 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 41633074 41633562 41633301 Y SCMH1,SCMH1,SCMH1 NA NA NA NA NA SCMH1 72264 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 41966127 41966464 41966357 Y NA EDN2 NA NA NA NA EDN2 17783 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 41967378 41967702 41967588 Y NA EDN2 NA NA NA NA EDN2 19034 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 42127851 42128791 42128091 Y NA NA NA NA NA NA EDN2 179507 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr1 42774668 42774801 42774679 Y CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3 FOXJ3 NA NA NA NA FOXJ3 24747 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 43405621 43405821 43405630 Y CCDC30,CCDC23,ERMAP,SZT2,SLC2A1 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 16709 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 43428386 43429108 43428580 Y CLDN19,CCDC23,ERMAP,SLC2A1 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1-AS1 5666 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 43429290 43429917 43429491 Y CCDC23,ERMAP,SLC2A1 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1-AS1 6570 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 43432863 43433109 43432938 Y CCDC30,SLC2A1 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1-AS1 10143 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 44015731 44016125 44016031 Y CCDC24,WDR65,C1orf210,C1orf210,PTPRF PTPRF NA NA NA NA PTPRF 26873 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr1 44150815 44151139 44150977 Y ST3GAL3,SLC6A9,IPO13 KDM4A,ST3GAL3 NA NA NA NA ST3GAL3 18356 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 46008399 46008548 46008476 Y PRDX1,AKR1A1 MMACHC,PRDX1,AKR1A1,NASP PRDX1,AKR1A1,NASP,CCDC17 IMR90 Hi-C 24141950 AKR1A1 5667 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 46111666 46112048 46111975 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 3450 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 46351629 46351956 46351793 Y C1orf190 NA NA NA NA NA MAST2 100970 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 47699046 47699332 47699189 Y NA PDZK1IP1,TAL1 NA NA NA NA TAL1 3154 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 47800262 47800514 47800436 Y NA STIL,CMPK1 NA NA NA NA CMPK1 2793 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr1 48936089 48936471 48936227 Y NA SPATA6 NA NA NA NA SPATA6 244 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 51083951 51084011 51083988 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 339924 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 51302197 51302583 51302391 Y FAF1 NA NA NA NA NA FAF1 121352 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 51809780 51810107 51809799 Y NA TTC39A NA NA NA NA TTC39A 992 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 51997947 51998232 51998197 Y NA RP11-191G24.1,EPS15,OSBPL9 OSBPL9,EPS15 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPS15 14947 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 52173889 52173954 52173921 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL9 133038 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 53168640 53169047 53168726 Y NA ZYG11B SELRC1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ZYG11B 21079 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 53385696 53386052 53386029 Y NA ECHDC2,SCP2 NA NA NA NA ECHDC2 4832 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 54441729 54442008 54441915 Y NA HSPB11,LRRC42 NA NA NA NA LRRC42 31979 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 54700132 54700688 54700499 Y NA CYB5RL NA NA NA NA CYB5RL 36423 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 55594097 55594408 55594328 Y NA NA PCSK9 IMR90 Hi-C 24141950 USP24 84378 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 57043287 57044160 57043621 Y PRKAA2,PPAP2B NA NA NA NA NA PPAP2B 64814 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 59280364 59280505 59280397 Y NA JUN NA NA NA NA JUN 32579 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 59281510 59281579 59281545 Y JUN JUN NA NA NA NA JUN 33725 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 59281873 59282217 59282125 Y MYSM1,FGGY,JUN JUN NA NA NA NA JUN 34088 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 59761390 59761720 59761439 Y NA FGGY NA NA NA NA FGGY 1080 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 61649786 61650305 61649984 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA NFIA 320855 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 62208815 62209373 62208933 Y NA TM2D1,INADL NA NA NA NA INADL 2666 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 67460593 67460710 67460683 Y NA NA NA NA NA NA SLC35D1 57072 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 68166463 68166766 68166597 Y NA GADD45A NA NA NA NA GADD45A 17719 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 68215256 68215932 68215330 Y NA NA NA NA NA NA GADD45A 66512 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 68663588 68663867 68663728 Y NA WLS,RPS7P4 NA NA NA NA WLS 32936 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 68945486 68945782 68945636 Y NA DEPDC1 NA NA NA NA DEPDC1 15122 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 68961350 68961555 68961472 Y NA DEPDC1 NA NA NA NA DEPDC1 446 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 77595980 77596376 77595997 Y NA RP4-706A16.3 NA NA NA NA RP4-706A16.3 3212 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 78557346 78557710 78557476 Y NA NA NA NA NA NA GIPC2 114120 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 84120524 84120814 84120773 Y PRKACB NA NA NA NA NA RP11-475O6.1 203892 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 84710038 84710507 84710127 Y NA NA NA NA NA NA RPF1 232435 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 84971050 84971209 84971115 Y MCOLN2,GNG5 RPF1,GNG5 NA NA NA NA GNG5 802 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 85038681 85038996 85038864 Y MCOLN2,GNG5,CTBS CTBS NA NA NA NA CTBS 518 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 85248638 85248992 85248815 Y NA NA GNG5,MCOLN2,TTLL7,LPAR3,PRKACB IMR90 Hi-C 24141950 SSX2IP 94152 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 85737728 85738105 85737917 Y BCL10 C1orf52,BCL10 NA NA NA NA BCL10 2668 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 85836666 85837017 85836916 Y NA NA NA NA NA NA BCL10 95893 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 87082786 87082842 87082814 Y NA NA NA NA NA NA CLCA4 72025 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 87800631 87801610 87800748 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 8480 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 88694004 88694059 88694042 Y NA NA NA NA NA NA PKN2 453846 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 89112806 89113177 89112978 Y NA PKN2 NA NA NA NA PKN2 34728 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr1 89358212 89358439 89358316 Y PKN2,CCBL2 GTF2B NA NA NA NA GTF2B 2585 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr1 89942348 89942369 89942360 Y NA LRRC8B NA NA NA NA LRRC8B 46026 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 90100291 90100368 90100330 Y NA LRRC8C NA NA NA NA LRRC8C 3660 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 92183243 92183457 92183382 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR3 186435 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 92184014 92184251 92184134 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR3 185641 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 92295673 92296022 92295848 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR3 73870 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 93003662 93004045 93003868 Y RPAP2,GLMN,RPL5,GFI1 NA NA NA NA NA GLMN 241118 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 93133494 93133890 93133692 Y NA NA NA NA NA NA EVI5 122071 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 93634565 93634982 93634927 Y MTF2 CCDC18,TMED5 NA NA NA NA CCDC18 8494 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 93914812 93914954 93914881 Y FNBP1L FNBP1L NA NA NA NA FNBP1L 3124 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr1 94007993 94008357 94008092 Y FNBP1L,BCAR3 RP5-1033H22.2 NA NA NA NA RP5-1033H22.2 47399 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 94084336 94084510 94084423 Y NA RP5-1033H22.2 NA NA NA NA RP5-1033H22.2 28580 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 94125861 94126246 94126059 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1033H22.2 70105 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 94429275 94429464 94429371 Y GCLM NA ABCA4,ARHGAP29 IMR90 Hi-C 24141950 GCLM 56309 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 95007995 95008302 95008221 Y NA F3 NA NA NA NA F3 2639 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 95551114 95551338 95551185 Y NA ALG14,TMEM56 ALG14,TMEM56-RWDD3,SLC44A3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ALG14 14613 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 97994700 97995088 97995052 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 389517 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 98011760 98012364 98012119 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 372241 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 98606055 98606462 98606113 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 221450 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 100505302 100505632 100505358 Y NA HIAT1 NA NA NA NA HIAT1 3649 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 100828525 100828922 100828611 Y SASS6 CDC14A NA NA NA NA CDC14A 19941 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 100905821 100906168 100905941 Y SLC35A3,HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 97237 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 101202267 101202571 101202418 Y NA NA NA NA NA NA EXTL2 156983 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 103509479 103509769 103509633 Y NA NA NA NA NA NA RNPC3 556544 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 109079557 109079899 109079743 Y NA FAM102B NA NA NA NA FAM102B 20812 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 109104473 109104583 109104556 Y PRPF38B,FAM102B FAM102B NA NA NA NA FAM102B 3762 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 110320163 110320291 110320225 Y NA GSTM3,EPS8L3 CSF1,AHCYL1,CYB561D1,ATXN7L2,GPR61,GNAI3,AMIGO1,AMPD2,GNAT2,GSTM4,GSTM5,EPS8L3,FAM40A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPS8L3 15514 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 111677638 111678032 111677835 Y NA CEPT1,DRAM2 NA NA NA NA CEPT1 2217 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 111733520 111733879 111733740 Y NA DENND2D NA NA NA NA DENND2D 11278 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 111745467 111745610 111745539 Y CD53,CEPT1,DRAM2,CHI3L2 DENND2D NA NA NA NA DENND2D 310 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 113072370 113072489 113072380 Y NA NA NA NA NA NA CAPZA1 87306 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 113394964 113395159 113395070 Y NA RP3-522D1.1 FAM19A3,PPM1J IMR90 Hi-C 24141950 RP3-522D1.1 4314 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 2.46489176462748 chr1 113734243 113734639 113734494 Y NA RP11-389O22.4 NA NA NA NA RP11-389O22.4 24627 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 114950620 114950667 114950644 Y NA NA NA NA NA NA TRIM33 101114 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 116191587 116191760 116191750 Y NA VANGL1 NA NA NA NA VANGL1 9013 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 116221756 116221883 116221820 Y NA VANGL1 NA NA NA NA VANGL1 39182 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 116918925 116919548 116919274 Y SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1 ATP1A1,ATP1A1OS NA NA NA NA ATP1A1 5635 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 117017908 117018073 117017956 Y ATP1A1 NA SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1OS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAP1L4P1 56641 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 117047053 117047428 117047164 Y CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58 NAP1L4P1 NA NA NA NA NAP1L4P1 27286 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 117082797 117083071 117083005 Y CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58 NAP1L4P1,CD58 NA NA NA NA NAP1L4P1 8083 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 117100772 117101124 117100940 Y CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58 NAP1L4P1,CD58 NA NA NA NA CD58 10537 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 117112460 117112738 117112567 Y TTF2,CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58 NAP1L4P1,CD58 NA NA NA NA CD58 799 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 119503304 119503581 119503430 Y NA NA NA NA NA NA RP11-418J17.1 177438 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 121485082 121485212 121485187 Y NA NA NA NA NA NA EMBP1 225939 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 144533627 144534178 144533764 Y PDE4DIP RNU1-59P PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNU1-59P 1589 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 145009158 145009716 145009503 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 64470 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNVU1-6 16003 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 147080043 147080251 147080097 Y PRKAB2,CHD1L,BCL9 NA NA NA NA NA ACP6 60367 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 147189197 147189465 147189317 Y NA ACP6 ACP6,LOC100289211 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ACP6 48579 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 147806841 147807184 147807140 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 1955 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 2.1127643696807 chr1 149138053 149138113 149138087 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-92P 75187 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 149816287 149817606 149817166 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 3037 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 149910900 149911536 149911461 Y NA SF3B4,MTMR11 NA NA NA NA MTMR11 4109 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 149989448 149989604 149989509 Y NA OTUD7B,VPS45 NA NA NA NA OTUD7B 8823 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 150135231 150135764 150135536 Y PRPF3,MCL1,PLEKHO1 PLEKHO1 NA NA NA NA PLEKHO1 15858 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 150949569 150950014 150949933 Y ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A CERS2,ANXA9,FAM63A,PRUNE NA NA NA NA ANXA9 2479 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 151166314 151166527 151166421 Y NA SEMA6C,SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA VPS72 517 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 151168297 151168505 151168391 Y BNIPL,TUFT1,SCNM1 SCNM1,LYSMD1,VPS72 NA NA NA NA PIP5K1A 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 151344220 151344519 151344431 Y NA PI4KB,RP11-126K1.6,RFX5,SELENBP1,PSMB4 NA NA NA NA SELENBP1 1011 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 151485676 151485841 151485746 Y C2CD4D,CGN,TUFT1 CGN,SNORA44,TUFT1 NA NA NA NA CGN 4690 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.40850957978713 chr1 151486181 151486300 151486231 Y SELENBP1,RORC,CGN CGN,SNORA44,TUFT1 NA NA NA NA CGN 5195 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr1 151909443 151909536 151909490 Y S100A10 THEM4 THEM4,S100A10,CELF3,RORC IMR90 Hi-C 24141950 THEM4 29159 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 151918166 151918684 151918434 Y NA THEM4,S100A10 S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THEM4 37882 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 152006910 152007460 152006991 Y SNX27,S100A11 S100A10,S100A11 NA NA NA NA S100A11 10923 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 152007615 152008057 152007721 Y THEM4 S100A10,S100A11 NA NA NA NA S100A11 10326 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 152927734 152927742 152927738 Y C1orf68,LCE1B SPRR1A,SPRR3 LCE3E,IVL,SPRR1A,LCE3A,SPRR2F IMR90 Hi-C 24141950 SPRR1A 26815 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 153488459 153488748 153488622 Y PGLYRP4,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14 BX470102.3,S100A6,S100A5,S100A3,S100A4,S100A2 NA NA NA NA BX470102.3 15331 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 153505144 153505346 153505245 Y NA BX470102.3,S100A6,S100A5,S100A3,S100A4,S100A2 NA NA NA NA BX470102.3 1065 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 153510895 153511054 153510975 Y NA BX470102.3,S100A6,S100A5,S100A3,S100A4,S100A2 NA NA NA NA S100A5 1187 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 153541018 153541368 153541269 Y PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13 BX470102.3,S100A6,S100A5,S100A3,S100A4,S100A2,S100A16,S100A14 NA NA NA NA S100A2 2652 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr1 153583449 153583810 153583692 Y PGLYRP3,PGLYRP4,S100A7A,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13 S100A2,S100A14,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN NA NA NA NA S100A16 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr1 153584539 153584862 153584750 Y NA S100A2,S100A16,S100A14,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN NA NA NA NA S100A16 918 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 153818420 153818667 153818544 Y NA NA NA NA NA NA SLC27A3 73590 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 153936554 153936861 153936642 Y UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4 GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9 NA NA NA NA CREB3L4 1149 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr1 154154606 154155027 154154830 Y SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3 TPM3,UBAP2L,C1orf43 NA NA NA NA TPM3 10097 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 4.57765613430818 chr1 154972628 154972915 154972668 Y CLK2,DPM3,DPM3,PYGO2,FLAD1 PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 212 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 154973036 154973200 154973120 Y CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1 PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr1 154973335 154973935 154973656 Y ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 208 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 154977099 154977253 154977190 Y ADAR,ADAR,ZBTB7B,DCST1 PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 3972 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 154978035 154978657 154978307 Y ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B,DCST1 PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 4908 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 154997722 154998120 154997917 Y NA FLAD1,ZBTB7B,ADAM15,EFNA4,EFNA3 NA NA NA NA ADAM15 22922 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 155098409 155098801 155098460 Y PKLR,PKLR,EFNA4,EFNA1 EFNA1,SLC50A1,DPM3,KRTCAP2 NA NA NA NA EFNA1 473 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 155164183 155164959 155164537 Y NA KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,GBAP1,GBA NA NA NA NA MIR92B 1215 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr1 155568911 155569221 155569066 Y ASH1L ASH1L-AS1,ASH1L FDPS,RUSC1,ASH1L,RUSC1-AS1,SCAMP3,CLK2,FAM189B,HCN3,POU5F1P4,LOC645676 IMR90 Hi-C 24141950 ASH1L 38313 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 155904830 155905033 155904931 Y NA RIT1,KIAA0907 NA NA NA NA KIAA0907 2639 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 156073854 156074351 156074085 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA RAB25,MEX3A,LMNA LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LMNA 23490 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 156074715 156075305 156075042 Y YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA RAB25,MEX3A,LMNA LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LMNA 24351 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr1 156089405 156089622 156089466 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,ARHGEF2,LMNA MEX3A,LMNA NA NA NA NA LMNA 39041 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 156095033 156095181 156095051 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA MEX3A,LMNA NA NA NA NA LMNA 44669 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.29113378147154 chr1 156103413 156103690 156103594 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,LMNA NA NA NA NA NA LMNA 53049 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 156118146 156118395 156118328 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2 SLC25A44 NA NA NA NA SLC25A44 43485 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 156133837 156133883 156133860 Y C1orf182,RHBG,HAPLN2,C1orf61,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,MEX3A,PAQR6,PAQR6 SLC25A44,PMF1-BGLAP,PMF1 NA NA NA NA SLC25A44 27997 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 156134935 156135401 156135063 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2 SLC25A44,PMF1-BGLAP,PMF1 NA NA NA NA SLC25A44 26479 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 156426931 156427503 156427197 Y ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 41117 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 156541089 156541488 156541192 Y NA IQGAP3,APOA1BP,GPATCH4 MEF2D,C1orf61 IMR90 Hi-C 24141950 IQGAP3 693 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 156629760 156630406 156629967 Y PAQR6,PAQR6,C1orf182,CCT3,ISG20L2,GPATCH4,HAPLN2 RP11-284F21.7,NES,CRABP2 NA NA NA NA RP11-284F21.7 544 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 156718467 156719136 156718868 Y C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1 CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF NA NA NA NA PRCC 65 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.64326117641832 chr1 156719450 156719815 156719708 Y ETV3,ETV3,RRNAD1 CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF NA NA NA NA PRCC 1048 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.64326117641832 chr1 157124774 157125221 157124855 Y RRNAD1,ETV3,ETV3 ETV3 ETV3,ETV3L K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ETV3 18508 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 158147244 158147839 158147743 Y NA ELL2P1 NA NA NA NA ELL2P1 1699 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 159878004 159878104 159878054 Y NCSTN,TAGLN2 CCDC19,TAGLN2 NA NA NA NA CCDC19 10051 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 159880076 159880706 159880437 Y FCRL6,DCAF8,TAGLN2 CCDC19,TAGLN2,LINC01133 NA NA NA NA CCDC19 12123 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 159886226 159886307 159886250 Y NA CCDC19,TAGLN2,LINC01133 NA NA NA NA TAGLN2 7215 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 159887185 159887340 159887284 Y NA CCDC19,TAGLN2,LINC01133 NA NA NA NA TAGLN2 6182 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 159961374 159961617 159961522 Y SLAMF8,SLAMF9 LINC01133,PIGM NA NA NA NA LINC01133 32366 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 160316870 160317108 160317002 Y SLAMF7,CD48,TAGLN2,NCSTN NCSTN,COPA NA NA NA NA COPA 5680 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 160377718 160378261 160377994 Y IGSF9 NA NA NA NA NA COPA 66528 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 160696081 160696317 160696161 Y CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7 NA NA NA NA NA ITLN1 156643 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 160972513 160972848 160972620 Y SLAMF7,USF1,ARHGAP30 F11R,TSTD1,USF1 NA NA NA NA F11R 16290 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 160989381 160990254 160990012 Y NDUFS2,ADAMTS4,F11R F11R,TSTD1,USF1,ARHGAP30 NA NA NA NA F11R 243 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 161037907 161038726 161038256 Y FCGR3A,FCGR3A,CD48,CD244,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30 F11R,TSTD1,USF1,ARHGAP30,PVRL4,KLHDC9,NIT1,PFDN2 NA NA NA NA ARHGAP30 147 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 161369073 161369991 161369486 Y NA C1orf192 ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C1orf192 33409 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 161582212 161582506 161582417 Y HSPA6,FCGR3A NA NA NA NA NA DUSP12 135042 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 165797615 165798367 165798308 Y UCK2 UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 2623 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 167191021 167191933 167191618 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 2955 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 167683554 167683813 167683605 Y POU2F1,CREG1 MPZL1 NA NA NA NA MPZL1 4616 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 167772811 167773182 167772825 Y CREG1 RP1-313L4.4 NA NA NA NA RP1-313L4.4 14304 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 168409627 168409736 168409651 Y NA NA F5 IMR90 Hi-C 24141950 TBX19 161349 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 169071998 169072131 169072049 Y C1orf114,ATP1B1 ATP1B1 NA NA NA NA ATP1B1 804 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 169443033 169443373 169443298 Y NA RP1-206D15.3,SLC19A2,AL021068.1 NA NA NA NA SLC19A2 9868 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 173328578 173328674 173328661 Y NA NA NA NA NA NA PRDX6 115731 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 173447359 173447668 173447399 Y PRDX6 PRDX6 NA NA NA NA PRDX6 2954 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 174788416 174788807 174788447 Y NA NA NA NA NA NA CACYBP 177493 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 175145439 175145838 175145619 Y KIAA0040,KIAA0040 KIAA0040 NA NA NA NA KIAA0040 14297 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 175160901 175161109 175161018 Y KIAA0040,KIAA0040 KIAA0040 NA NA NA NA KIAA0040 766 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 177903071 177903284 177903119 Y NA NA NA NA NA NA RP11-568K15.1 101801 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 178995927 178996290 178996175 Y AXDND1,RALGPS2,TOR3A FAM20B NA NA NA NA FAM20B 2988 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 180200315 180200683 180200497 Y LHX4 LHX4 NA NA NA NA LHX4 2894 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 180403880 180403893 180403887 Y NA NA NA NA NA NA ACBD6 66196 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 180613229 180613603 180613357 Y NA XPR1 NA NA NA NA XPR1 14089 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 181104265 181104352 181104277 Y NA IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48627 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 181104473 181105818 181105427 Y STX6,MR1,IER5 IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48835 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 181459512 181459699 181459606 Y NA NA NA NA NA NA IER5 403874 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 182854499 182854851 182854644 Y NA DHX9 NA NA NA NA DHX9 47995 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 183936673 183936825 183936737 Y APOBEC4 NA NA NA NA NA TSEN15 81986 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 183951471 183951644 183951558 Y NCF2,NCF2 NA NA NA NA NA TSEN15 67167 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 184005350 184005919 184005662 Y RGL1,GLT25D2 TSEN15 RGL1 IMR90 Hi-C 24141950 TSEN15 12892 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr1 184123506 184123811 184123788 Y NA NA C1orf21,RGL1 IMR90 Hi-C 24141950 TSEN15 104695 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 184924828 184925180 184925091 Y IVNS1ABP,FAM129A FAM129A NA NA NA NA FAM129A 16502 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 185453251 185453699 185453469 Y RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP NA NA NA NA NA IVNS1ABP 168790 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 185540108 185540292 185540225 Y NA NA NA NA NA NA IVNS1ABP 255647 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 192458942 192459176 192459156 Y RGS2,RGS13,RGS1 NA RGS1,RGS2 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4426 224137 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 192469407 192469758 192469583 Y NA NA NA NA NA NA MIR4426 213555 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 192583467 192583478 192583473 Y RGS1 NA UCHL5 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4426 99835 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 197964894 197965254 197965077 Y NA NA NA NA NA NA C1orf53 95117 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 2.93439495788986 chr1 198128112 198128944 198128293 Y PTPRC,DENND1B NEK7 NA NA NA NA NEK7 4019 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 200050544 200050911 200050727 Y NA NA NA NA NA NA NR5A2 55814 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 200076437 200076447 200076441 Y NR5A2 NA NA NA NA NA NR5A2 81707 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 200783735 200784105 200783920 Y NA NA NA NA NA NA C1orf106 74071 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 200865264 200865418 200865332 Y C1orf106,C1orf106 C1orf106 NA NA NA NA C1orf106 7088 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr1 200865457 200866265 200866098 Y TMEM9,IGFN1,C1orf106,C1orf106 C1orf106 NA NA NA NA C1orf106 7281 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 201139670 201140154 201139905 Y NA TMEM9 KIF21B,IGFN1,LAD1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM9 968 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 201366439 201366550 201366506 Y PKP1,LAD1 TNNT2,LAD1 NA NA NA NA LAD1 186 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 201449602 201449822 201449716 Y LAD1 PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 PHLDA3 IMR90 Hi-C 24141950 PHLDA3 13237 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 201683757 201684240 201683949 Y NA NA NA NA NA NA IPO9 112029 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 201987611 201988279 201987793 Y ELF3,LGR6 RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4 NA NA NA NA RP11-465N4.4 10130 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 201992149 201992501 201992334 Y NA RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4 NA NA NA NA RP11-465N4.4 14668 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 202003479 202003610 202003599 Y NA ELF3,RP11-465N4.4 NA NA NA NA RP11-465N4.4 25998 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 202003884 202004146 202004054 Y NA ELF3,RP11-465N4.4 NA NA NA NA RP11-465N4.4 26403 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 202016172 202016526 202016316 Y PPP1R12B,ELF3,LGR6 ELF3,RP11-465N4.4 ELF3,NAV1 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-465N4.4 38691 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 202055098 202055409 202055277 Y ELF3,GPR37L1 GPR37L1 ELF3,IPO9,RNPEP,ARL8A,GPR37L1,TIMM17A,LGR6,NAV1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GPR37L1 34577 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 202075010 202075191 202075097 Y PPP1R12B,ELF3,LGR6 GPR37L1,ARL8A RNPEP,LGR6,NAV1,ELF3,ARL8A,GPR37L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPR37L1 14795 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr1 202765097 202765528 202765162 Y NA RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6 NA NA NA NA KDM5B 11070 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 203061576 203061925 203061715 Y NA NA NA NA NA NA PPFIA4 67950 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 203101073 203101246 203101163 Y NA NA NA NA NA NA PPFIA4 107447 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 203294985 203295146 203295066 Y NA RP11-134P9.3,LINC01136,BTG2,FMOD NA NA NA NA BTG2 22366 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 203296328 203297068 203296686 Y LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2 RP11-134P9.3,LINC01136,BTG2,FMOD NA NA NA NA FMOD 21549 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 203297101 203297334 203297256 Y LAX1,TMEM183A,TMEM183B,BTG2 RP11-134P9.3,LINC01136,BTG2,FMOD NA NA NA NA FMOD 21283 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 203489584 203489741 203489635 Y BTG2 PRELP NA NA NA NA PRELP 46628 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 203491011 203491485 203491466 Y PPFIA4,SNRPE PRELP NA NA NA NA PRELP 48055 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 204043987 204044379 204044133 Y NA SOX13 NA NA NA NA SOX13 3744 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 204238647 204239007 204238820 Y GOLT1A,PLEKHA6 NA NA NA NA NA GOLT1A 57427 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 204254999 204255106 204255048 Y PIK3C2B,PLEKHA6 NA NA NA NA NA GOLT1A 73779 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 204317952 204318184 204318134 Y ETNK2,PIK3C2B NA NA NA NA NA PPP1R15B 60735 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 204358316 204358342 204358328 Y NA PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 20577 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 204386444 204387188 204386898 Y PPP1R15B PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 7525 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr1 204684045 204684323 204684297 Y NA NA NFASC,LRRN2 IMR90 Hi-C 24141950 MDM4 200534 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 205288770 205288915 205288818 Y TMEM81,RBBP5,NUAK2 SNRPGP10 NA NA NA NA NUAK2 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 205410224 205410578 205410325 Y DSTYK,TMCC2 LEMD1 NA NA NA NA LEMD1 12504 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 205418015 205418182 205418073 Y NA LEMD1 NA NA NA NA LEMD1 4900 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 205638734 205639222 205638979 Y SLC45A3 ELK4,SLC45A3 NA NA NA NA SLC45A3 8365 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 206290243 206290662 206290573 Y C1orf186 C1orf186,RP11-38J22.6,CTSE NA NA NA NA C1orf186 3596 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 206642854 206643037 206642964 Y RASSF5,MAPKAPK2,RASSF5,IKBKE IKBKE,RASSF5 NA NA NA NA IKBKE 1063 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 206859748 206860259 206859963 Y IKBKE,RASSF5,FAIM3,FAIM3,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 3459 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 207265739 207265906 207265769 Y NA PFKFB2,YOD1,C4BPB,C4BPA NA NA NA NA C4BPB 5552 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 207509006 207509478 207509176 Y CR1,CD46,CD55 CD55 NA NA NA NA CD55 16153 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 209766433 209766919 209766698 Y CAMK1G NA NA NA NA NA LAMB3 56892 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 209806744 209806957 209806914 Y G0S2,LAMB3 LAMB3,G0S2 NA NA NA NA LAMB3 16854 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 209822403 209823008 209822758 Y TRAF3IP3,G0S2,LAMB3 LAMB3,G0S2 CAMK1G IMR90 Hi-C 24141950 LAMB3 803 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 209827285 209827712 209827546 Y LOC642587,IRF6,HSD11B1,LAMB3,LAMB3 LAMB3,G0S2 NA NA NA NA LAMB3 3474 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 209829183 209829498 209829302 Y IRF6,G0S2,LAMB3,LAMB3,LAMB3 LAMB3,G0S2 NA NA NA NA LAMB3 5372 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 209978699 209978810 209978755 Y LAMB3,LAMB3,IRF6 C1orf74,IRF6,DIEXF NA NA NA NA IRF6 1234 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 211035320 211035533 211035504 Y NA NA NA NA NA NA RP11-543B16.1 309286 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr1 211688648 211688771 211688711 Y NA NA NEK2,RCOR3,TRAF5,LINC00467,RD3,SLC30A1,INTS7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC30A1 61313 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 211950086 211950249 211950170 Y NA NA NA NA NA NA LPGAT1 51865 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 212113260 212113497 212113379 Y NA NA NA NA NA NA INTS7 93387 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 212658172 212658571 212658328 Y ATF3,ATF3,ATF3 NA ATF3,FAM71A,ANGEL2,NENF,BATF3,TATDN3,NSL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 53943 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 212659054 212659720 212659497 Y ATF3,ATF3,ATF3 NA ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 54825 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 212671541 212672116 212671670 Y NA NA ATF3,NSL1,TATDN3,BATF3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATF3 64560 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 212731490 212732709 212732386 Y NA ATF3 ATF3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ATF3 3967 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 213160414 213160619 213160568 Y VASH2 VASH2,ANGEL2 NA NA NA NA ANGEL2 26549 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 214612784 214613126 214613017 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 110666 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr1 221882292 221882723 221882499 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 30795 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 221916049 221916599 221916319 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 2531 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 222638782 222639204 222638963 Y NA NA DUSP10,MIA3,AIDA,BROX IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HHIPL2 80241 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 2.69964336125867 chr1 224598124 224598418 224598271 Y WDR26 WDR26 NA NA NA NA WDR26 24317 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 226014145 226014403 226014226 Y EPHX1,EPHX1 EPHX1 NA NA NA NA EPHX1 18351 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 226297611 226298113 226297674 Y NA NA ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H3F3A 50059 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 226315308 226315548 226315420 Y PARP1 NA NA NA NA NA ACBD3 56883 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr1 226315631 226315825 226315781 Y PARP1,LIN9,PYCR2 NA NA NA NA NA ACBD3 56606 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr1 226320775 226321123 226320910 Y NA NA NA NA NA NA ACBD3 51308 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr1 226890865 226891416 226891300 Y ITPKB ITPKB NA NA NA NA ITPKB 33608 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 227751865 227752213 227752044 Y ZNF678 ZNF678 NA NA NA NA ZNF678 2621 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr1 228273480 228273740 228273633 Y ARF1,ARF1 ARF1,C1orf35,MRPL55 NA NA NA NA ARF1 5119 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 228338299 228338457 228338378 Y GJC2 C1orf35,MRPL55,GUK1,IBA57 NA NA NA NA GUK1 12636 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 228782602 228782886 228782775 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 85938 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 228783266 228783899 228783495 Y C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU NA NA NA NA NA RHOU 84925 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 228783962 228784250 228784107 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 84574 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 229357329 229357959 229357668 Y RAB4A RP5-1061H20.4,RAB4A RHOU,C1orf96 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1061H20.4 46816 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 229388898 229389111 229388968 Y URB2,TAF5L,NUP133,RAB4A,C1orf96 RP5-1061H20.4,RAB4A RHOU,NUP133,ABCB10 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1061H20.4 15664 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 232725638 232725888 232725699 Y SIPA1L2 NA TSNAX-DISC1,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 240045 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 199806 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr1 233249275 233249581 233249334 Y NA NA NA NA NA NA NTPCR 164924 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 233750790 233751092 233750957 Y KCNK1 KCNK1 NA NA NA NA KCNK1 3040 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr1 233763307 233763375 233763341 Y KCNK1 KCNK1 NA NA NA NA KCNK1 15557 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 233811305 233811449 233811378 Y NA NA NA NA NA NA KCNK1 63555 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 234163168 234163347 234163228 Y SLC35F3 NA NA NA NA NA RP5-827C21.2 327405 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 234728712 234729023 234728867 Y NA IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 14248 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 234736336 234736615 234736485 Y IRF2BP2 IRF2BP2,RP4-781K5.4 NA NA NA NA IRF2BP2 6656 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 234746093 234747674 234747395 Y IRF2BP2 IRF2BP2,RP4-781K5.4 NA NA NA NA IRF2BP2 2822 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 234748100 234748931 234748566 Y IRF2BP2 IRF2BP2,RP4-781K5.4 NA NA NA NA IRF2BP2 4829 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr1 234767593 234767925 234767750 Y TARBP1 IRF2BP2,RP4-781K5.4 NA NA NA NA RP4-781K5.4 12110 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 234792654 234793437 234793098 Y NA IRF2BP2,RP4-781K5.4 IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP4-781K5.4 12619 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 234793934 234794239 234794125 Y NA RP4-781K5.4 IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP4-781K5.4 13899 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr1 234857710 234858181 234857899 Y NA NA NA NA NA NA RP4-781K5.4 77675 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 234858843 234859287 234859154 Y NA NA NA NA NA NA RP4-781K5.4 78808 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.87801277304951 chr1 234984948 234985284 234985006 Y IRF2BP2 NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 129267 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 235089980 235090270 235090133 Y NA RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 24281 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 235097868 235098070 235097979 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 16481 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 237634251 237634535 237634324 Y NA NA NA NA NA NA RPL35P1 491614 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.64326117641832 chr1 238106545 238106849 238106747 Y NA NA NA NA NA NA RPL35P1 963908 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 240306412 240306787 240306695 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 24668 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr1 240306890 240307603 240307416 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23852 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 240308207 240308537 240308375 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22918 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 243585242 243585384 243585313 Y CEP170,AKT3,AKT3 NA NA NA NA NA SDCCAG8 167922 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 243654647 243654885 243654744 Y NA NA NA NA NA NA SDCCAG8 237327 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 244210956 244211944 244211575 Y NA RP11-278H7.4 NA NA NA NA RP11-278H7.4 42384 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr1 244613820 244614139 244614120 Y NA ADSS NA NA NA NA ADSS 384 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 244894306 244894456 244894354 Y C1orf100,C1orf101 NA PPPDE1,C1orf101 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPU-AS1 122343 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 245939665 245940062 245939864 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 728552 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 247093396 247093478 247093437 Y NA AHCTF1 NA NA NA NA AHCTF1 116 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 247315116 247315371 247315289 Y OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669 ZNF669,MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 47991 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr1 247325578 247326237 247325673 Y NA MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 37125 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 516106 516519 516355 Y ZMYND11,ZMYND11,ZMYND11,ZMYND11,DIP2C NA NA NA NA NA DIP2C 217164 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 729218 729515 729367 Y NA DIP2C NA NA NA NA DIP2C 4168 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 958233 958518 958406 Y NA LARP4B DIP2C,GTPBP4,LARP4B IMR90 Hi-C 24141950 LARP4B 17046 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 975785 976368 976035 Y NA LARP4B DIP2C,LARP4B,GTPBP4,IDI1,IDI2-AS1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LARP4B 221 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 3848037 3849536 3848891 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 22564 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr10 3928866 3929216 3928980 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 103393 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 5316994 5317070 5317001 Y NA NA tAKR IMR90 Hi-C 24141950 AKR1C4 81569 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr10 5333644 5334212 5333929 Y NA NA AKR1E2,tAKR IMR90 Hi-C 24141950 AKR1C4 98219 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr10 5530637 5531333 5530982 Y NA NA NA NA NA NA NET1 78123 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr10 5587810 5588190 5587923 Y NA NA NA NA NA NA RP11-336A10.5 62566 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr10 5588881 5589169 5589084 Y NET1,CALML3 NA NA NA NA NA RP11-336A10.5 61587 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr10 5590010 5590295 5590293 Y NET1,CALML3 NA NA NA NA NA RP11-336A10.5 60461 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 5590959 5591270 5591035 Y NET1 NA NA NA NA NA RP11-336A10.5 59486 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 6165582 6165745 6165676 Y IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3 RBM17,PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 19136 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 6182474 6182743 6182618 Y NA PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 2138 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr10 6343712 6343937 6343834 Y IL15RA,PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 158831 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 6836289 6836715 6836468 Y NA NA NA NA NA NA RP11-554I8.2 58945 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 6915397 6915415 6915406 Y NA NA NA NA NA NA RP11-554I8.2 138053 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 8457951 8458678 8458502 Y GATA3 NA NA NA NA NA TAF3 599484 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 8662161 8662543 8662250 Y NA NA NA NA NA NA TAF3 803694 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 13829023 13829481 13829176 Y PRPF18 NA NA NA NA NA PRPF18 202096 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 14592372 14592822 14592665 Y NA NA NA NA NA NA FRMD4A 90231 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 14641847 14641963 14641950 Y NA NA NA NA NA NA FRMD4A 139706 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 15278281 15278573 15278465 Y NA NA NA NA NA NA NMT2 69589 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr10 15300658 15300993 15300826 Y ACBD7,FAM171A1 NA NA NA NA NA NMT2 91966 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 15306901 15307170 15307036 Y NA NA NA NA NA NA NMT2 98209 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr10 15386960 15387149 15387011 Y NMT2 FAM171A1 NA NA NA NA FAM171A1 23912 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr10 21317807 21317920 21317859 Y C10orf113 NA NA NA NA NA NEBL 143196 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr10 21386477 21386751 21386615 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 74365 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 21436057 21436346 21436225 Y C10orf113,NEBL NEBL NA NA NA NA NEBL 24770 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 22629825 22629981 22629966 Y DNAJC1 COMMD3,BMI1 NA NA NA NA BMI1 21685 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 22725331 22726270 22725901 Y NA NA NA NA NA NA BMI1 117191 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr10 24298317 24298326 24298320 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1217 316642 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 24996902 24997348 24997071 Y NA ARHGAP21 NA NA NA NA ARHGAP21 13249 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 27032794 27033066 27033024 Y NA PDSS1 NA NA NA NA PDSS1 48206 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 27531769 27532240 27532024 Y ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5 ACBD5 NA NA NA NA ACBD5 2710 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr10 28725980 28726021 28726001 Y NA NA NA NA NA NA WAC 93401 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 32047879 32048374 32048138 Y ZEB1 NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 167368 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 32048872 32049424 32049213 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 166318 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr10 32218329 32218518 32218508 Y NA ARHGAP12 NA NA NA NA ARHGAP12 2587 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 32301568 32301771 32301670 Y NA KIF5B NA NA NA NA KIF5B 41588 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 35028968 35029134 35029048 Y NA NA NA NA NA NA PARD3 73119 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr10 35424812 35424825 35424819 Y CCNY CUL2,CREM NA NA NA NA CREM 11093 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 43422233 43422523 43422379 Y NA NA RET IMR90 Hi-C 24141950 BMS1 145984 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 43633157 43633403 43633253 Y RASGEF1A CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 1223 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 43818292 43818511 43818402 Y NA NA ZNF487P IMR90 Hi-C 24141950 RASGEF1A 57925 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 51045236 51045418 51045327 Y NA NA NA NA NA NA OGDHL 76811 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 52037840 52038115 52037944 Y SGMS1 DYNC1I2P1 SGMS1 IMR90 Hi-C 24141950 DYNC1I2P1 15102 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 52385542 52385659 52385602 Y NA SGMS1 NA NA NA NA SGMS1 2619 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 59388391 59388635 59388513 Y NA NA NA NA NA NA IPMK 637059 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 62185134 62185430 62185353 Y NA NA NA NA NA NA CDK1 350659 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 63663540 63663817 63663641 Y ARID5B NA NA NA NA NA RTKN2 362649 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr10 63752119 63752912 63752632 Y ARID5B NA NA NA NA NA RTKN2 273554 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 63803306 63803648 63803427 Y NA NA NA NA NA NA RTKN2 222818 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 65078433 65078736 65078637 Y NA NA NA NA NA NA PRELID1P3 106321 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 65389747 65390882 65390384 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 110624 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr10 70782889 70783013 70782952 Y NA KIAA1279 NA NA NA NA KIAA1279 36402 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr10 70822086 70822440 70822167 Y NA NA KIAA1279,DDX21,SRGN,VPS26A,SUPV3L1 IMR90 Hi-C 24141950 VPS26A 58828 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 71228522 71228843 71228683 Y NA TSPAN15 NA NA NA NA TSPAN15 19293 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 73398011 73398245 73398040 Y NA NA NA NA NA NA C10orf54 133010 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 73612356 73612502 73612445 Y DDIT4,C10orf54,PSAP PSAP NA NA NA NA PSAP 3230 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 73620184 73620641 73620392 Y DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP PSAP PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PSAP 11058 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 74020239 74021717 74020385 Y C10orf54,PSAP,DNAJB12,DDIT4 ANAPC16,ASCC1,DDIT4 DNAJB12 K562 ChIA-PET 22265404 DDIT4 9961 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 74056833 74058104 74057179 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 25155 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 74091661 74092150 74091920 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DNAJB12 NA NA NA NA DNAJB12 20838 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 74289425 74289733 74289722 Y NA NA NA NA NA NA MICU1 94166 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 74436264 74436425 74436399 Y CCDC109A,ASCC1,ASCC1 HMGN2P34,MCU MICU1,OIT3,PLA2G12B,MCU IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MCU 13464 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 74877758 74878048 74877901 Y NA P4HA1,NUDT13,FAM149B1,ECD NA NA NA NA NUDT13 9541 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 75004761 75005017 75004932 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA DNAJC9 1603 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 75253773 75253975 75253905 Y NA RP11-137L10.6 NA NA NA NA PPP3CB 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr10 75349200 75349597 75349539 Y CAMK2G,TTC18,PPP3CB,USP54 USP54 FAM149B1,PPP3CB,USP54,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L IMR90 Hi-C 24141950 USP54 34114 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 75361338 75361489 75361457 Y NA USP54 USP54,PPP3CB,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L,MYOZ1,CHCHD1,TTC18,C10orf103 IMR90 Hi-C 24141950 USP54 22222 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr10 79346819 79347304 79347005 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA DLG5 337074 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 79389440 79389814 79389806 Y NA NA NA NA NA NA DLG5 294564 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 79592026 79592206 79592119 Y NA NA NA NA NA NA DLG5 92172 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 79685177 79685609 79685373 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 799 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr10 80830818 80831199 80831077 Y ZMIZ1 ZMIZ1 NA NA NA NA ZMIZ1 4026 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr10 80911539 80911799 80911619 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 84747 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr10 80981088 80981226 80981157 Y NA NA NA NA NA NA PPIF 123999 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 81159335 81159579 81159503 Y ZCCHC24 ZCCHC24 NA NA NA NA ZCCHC24 43804 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 81956011 81956585 81956252 Y ANXA11 ANXA11,EIF5AP4 NA NA NA NA ANXA11 6743 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 81959510 81960003 81959818 Y TSPAN14,SH2D4B,ANXA11 ANXA11,EIF5AP4 NA NA NA NA ANXA11 3325 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr10 81962798 81963579 81963388 Y SH2D4B,ANXA11 EIF5AP4 NA NA NA NA ANXA11 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr10 82214819 82214901 82214871 Y TSPAN14 FAM213A,TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 2897 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr10 82215085 82215437 82215324 Y TSPAN14,SH2D4B FAM213A,TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 3163 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 82224459 82224735 82224582 Y NA TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 12537 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 82260440 82261008 82260524 Y TSPAN14 TSPAN14,RP11-137H2.4 NA NA NA NA RP11-137H2.4 32690 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 88004394 88004782 88004588 Y NA NA NA NA NA NA WAPAL 274790 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 88470805 88471213 88471023 Y NA BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 43194 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 89500062 89500398 89500217 Y NA NA NA NA NA NA CFL1P1 75287 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 90711253 90711764 90711560 Y LIPF,CH25H,ACTA2 FAS NA NA NA NA FAS 36650 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 94351391 94351691 94351485 Y CPEB3 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 348 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr10 95225325 95225770 95225711 Y MYOF MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 14304 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr10 95226262 95226423 95226291 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 13651 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr10 96943397 96943661 96943560 Y SORBS1,SORBS1 NA C10orf129,SORBS1 IMR90 Hi-C 24141950 PDLIM1 105120 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr10 98332019 98332237 98332217 Y NA NPM1P26,TM9SF3 NA NA NA NA TM9SF3 12972 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 98396181 98396533 98396373 Y NA NA NA NA NA NA TM9SF3 50972 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 98433072 98433822 98433312 Y LCOR,PIK3AP1,TM9SF3 PIK3AP1 NA NA NA NA PIK3AP1 44449 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 100074404 100074582 100074525 Y C10orf28,HPS1 LOXL4 LOXL4,C10orf28,PYROXD2,HPS1,HPSE2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOXL4 48397 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 100153138 100153356 100153248 Y NA PYROXD2 NA NA NA NA PYROXD2 19585 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 101475394 101475766 101475528 Y NA CUTC,COX15 NA NA NA NA COX15 14091 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 101780024 101780319 101780173 Y CUTC,WNT8B DNMBP DNMBP MCF7 ChIA-PET 22265404 DNMBP 12348 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 102130336 102130669 102130535 Y NA SCD,AL139819.1,LINC00263 NA NA NA NA LINC00263 703 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr10 103539197 103539512 103539463 Y NA NPM3,MGEA5 NA NA NA NA NPM3 1658 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 103591495 103591519 103591507 Y BTRC,KCNIP2,KCNIP2 MGEA5 NA NA NA NA MGEA5 14799 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr10 105001224 105001453 105001331 Y C10orf32,NT5C2 NA INA,PCGF6,NT5C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5C2 50168 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 105650011 105650288 105650237 Y GSTO2,GSTO1,MEIR5,MEIR5,COL17A1,SLK SH3PXD2A,OBFC1 SH3PXD2A IMR90 Hi-C 24141950 OBFC1 25675 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 6.2209173107265 chr10 105667581 105667905 105667745 Y NA OBFC1 NA NA NA NA OBFC1 8058 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 105681714 105681858 105681786 Y NA OBFC1,SLK NA NA NA NA OBFC1 5751 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 106065731 106065880 106065781 Y NA MIR4482-1,GSTO2,ITPRIP NA NA NA NA ITPRIP 30282 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 111766410 111766784 111766651 Y ADD3 ADD3 NA NA NA NA ADD3 12284 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr10 111834173 111834352 111834276 Y ADD3,SMNDC1,MXI1,MXI1 NA NA NA NA NA ADD3 80047 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 111971446 111971590 111971518 Y NA MXI1 NA NA NA NA MXI1 6083 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 112155518 112156031 112155808 Y DUSP5 NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 92809 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 112158460 112158738 112158533 Y DUSP5 NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 95751 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 112159079 112159451 112159258 Y NA NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 96145 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 112170161 112170538 112170357 Y DUSP5 NA DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 85058 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 112174673 112174737 112174702 Y NA NA SMC3,DUSP5,SMNDC1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 80859 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 112220227 112220521 112220467 Y SMC3,DUSP5 DUSP5 DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 35075 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 112668159 112668425 112668161 Y NA PDCD4,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 8607 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 114094924 114095156 114095118 Y NA ACSL5 TECTB IMR90 Hi-C 24141950 ACSL5 36620 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 114709018 114709405 114709296 Y TCF7L2 TCF7L2 NA NA NA NA TCF7L2 1009 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr10 115719262 115719399 115719345 Y NA NA ADRB1,NHLRC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NHLRC2 106842 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr10 116080506 116080782 116080645 Y AFAP1L2 NA NA NA NA NA AFAP1L2 81733 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 116161021 116161267 116161255 Y NA AFAP1L2 NA NA NA NA AFAP1L2 1248 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 116255200 116255589 116255576 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1L2 92685 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr10 116259358 116259612 116259525 Y C10orf118,ABLIM1 NA NA NA NA NA AFAP1L2 96843 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 116300910 116301495 116301299 Y FAM160B1,C10orf118,ABLIM1 NA NA NA NA NA AFAP1L2 138395 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 116392908 116393338 116393223 Y ABLIM1 ABLIM1 NA NA NA NA ABLIM1 49424 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 116678132 116678409 116678271 Y NA TRUB1 NA NA NA NA TRUB1 17543 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 118714609 118714623 118714617 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1598 169474 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr10 121030438 121030814 121030688 Y GRK5 NA NA NA NA NA GRK5 65337 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr10 121031141 121031480 121031339 Y GRK5 NA NA NA NA NA GRK5 66040 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr10 121682284 121682432 121682358 Y NA MCMBP,SEC23IP NA NA NA NA SEC23IP 32061 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 121829686 121829950 121829715 Y NA NA NA NA NA NA NACAP2 74465 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 123313040 123313152 123313149 Y FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2 FGFR2 NA NA NA NA FGFR2 42820 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr10 123494191 123494316 123494254 Y NA NA NA NA NA NA FGFR2 138219 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 123873239 123873409 123873290 Y NA NA NA NA NA NA TACC2 126550 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr10 124196519 124196712 124196524 Y TACC2,PLEKHA1,PLEKHA1,PLEKHA1 HTRA1 NA NA NA NA HTRA1 22329 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr10 124613518 124613778 124613722 Y NA FAM24B,RP11-564D11.3 NA NA NA NA FAM24B 23379 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 126703963 126704049 126704004 Y CTBP2 NA NA NA NA NA RP11-298J20.4 100251 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 126840629 126841204 126840953 Y NA CTBP2,MRPS21P6 NA NA NA NA CTBP2 6535 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.52588537810273 chr10 127432481 127432807 127432790 Y NA NA NA NA NA NA UROS 77010 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 127535706 127535819 127535763 Y MMP21 UROS,BCCIP,RNU2-42P,DHX32,FANK1 NA NA NA NA BCCIP 25591 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 129721316 129721687 129721518 Y NA CLRN3,PTPRE NA NA NA NA PTPRE 17991 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 130017279 130017540 130017352 Y PTPRE NA EBF3,MGMT,LOC387723,GLRX3,CTAGE7P IMR90 Hi-C 24141950 MKI67 94630 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 133879247 133879524 133879406 Y NA NA BNIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STK32C 263827 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr10 134122010 134122092 134122081 Y NA STK32C,LRRC27 DPYSL4 IMR90 Hi-C 24141950 STK32C 21259 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr10 134212658 134212854 134212750 Y NA PWWP2B,RP11-432J24.2 NA NA NA NA PWWP2B 3986 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 134221496 134221692 134221620 Y PWWP2B PWWP2B,RP11-432J24.2 NA NA NA NA RP11-432J24.2 8895 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr10 134221970 134222202 134222031 Y PWWP2B PWWP2B,RP11-432J24.2 NA NA NA NA RP11-432J24.2 8385 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.9953885713651 chr10 134260341 134260546 134260485 Y C10orf91 RP11-432J24.2 NA NA NA NA RP11-432J24.2 29754 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.52588537810273 chr10 134385594 134385710 134385631 Y PWWP2B,INPP5A INPP5A NA NA NA NA INPP5A 36270 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr10 135074691 135075148 135074934 Y TUBGCP2,ADAM8 ADAM8,ZNF511,TUBGCP2 NA NA NA NA ADAM8 13224 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 312288 312763 312359 Y TMEM80,TALDO1,SIGIRR,DEAF1,ATHL1,IFITM2,IFITM1 ATHL1,IFITM2,IFITM3 NA NA NA NA IFITM2 6657 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 355877 356724 356385 Y NA IFITM3,PKP3 IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 IFITM3 30340 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 629192 629570 629436 Y IRF7,IRF7,SCT,DRD4 IRF7,CDHR5 NA NA NA NA CDHR5 5114 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 655302 655449 655380 Y SIRT3,NLRP6,CDHR5,CHID1 IRF7,CDHR5,EPS8L2,TMEM80,DEAF1 NA NA NA NA CDHR5 31224 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 926738 926879 926801 Y BRSK2,CEND1,AP2A2 CHID1,AP2A2 NA NA NA NA AP2A2 3844 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 1073369 1073545 1073512 Y DRD4,EFCAB4A MUC6 NA NA NA NA MUC6 38663 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr11 1144773 1145129 1144879 Y NA MUC5AC MUC5B MCF7 ChIA-PET 22265404 MUC5AC 4451 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 1241085 1241212 1241149 Y NA MUC5B NA NA NA NA MUC5B 1084 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 1245627 1245992 1245771 Y NA MUC5B NA NA NA NA MUC5B 3331 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr11 1331682 1331784 1331733 Y NA TOLLIP NA NA NA NA TOLLIP 2798 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 1357863 1358286 1357997 Y TOLLIP,BRSK2 TOLLIP TOLLIP,LOC255512 K562 ChIA-PET 22265404 TOLLIP 28979 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 1404403 1404794 1404637 Y DUSP8,BRSK2 NA TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOLLIP 75519 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 1409546 1409852 1409608 Y KRTAP5-1,KRTAP5-6,KRTAP5-5,KRTAP5-3 NA NA NA NA NA TOLLIP 80662 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 1568333 1568421 1568379 Y BRSK2,KRTAP5-3,DUSP8 DUSP8 NA NA NA NA DUSP8 22729 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 1569740 1569888 1569766 Y TNNT3,TNNI2,TNNI2,DUSP8 DUSP8 NA NA NA NA DUSP8 21262 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 1595832 1596187 1595959 Y NA DUSP8 NA NA NA NA DUSP8 4682 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 1847921 1848122 1848046 Y KRTAP5-3 RPL36AP39,SYT8 H19 MCF7 ChIA-PET 22265404 SYT8 1212 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 1935889 1936214 1936052 Y IGF2,KRTAP5-3,TNNI2,TNNI2,TNNT3 MRPL23 NA NA NA NA MRPL23 30294 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 2226111 2226485 2226212 Y ASCL2 NA NA NA NA NA IGF2 57278 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 2465201 2465287 2465244 Y INS TSSC4,KCNQ1 NA NA NA NA KCNQ1 1287 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr11 2484558 2484875 2484798 Y TRPM5,KCNQ1 KCNQ1 NA NA NA NA KCNQ1 20644 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 2655024 2655339 2655183 Y TRPM5,KCNQ1 NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 63885 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 2746958 2747301 2747029 Y TSSC4 KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 27734 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 2933631 2934118 2933874 Y NA CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2 NA NA NA NA PHLDA2 14567 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr11 3035655 3035952 3035816 Y MRGPRG NAP1L4,CARS NA NA NA NA NAP1L4 24048 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 3742975 3743362 3743342 Y NA NA NA NA NA NA PGAP2 73592 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 5953770 5953923 5953776 Y NA TRIM5 NA NA NA NA TRIM5 3926 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 6489893 6490567 6490471 Y OR56A4,OR56A1,OR56B4,OR52W1,OR2AG1,OR2AG2,OR10A5,OR10A4,OR10A2,OR6A2,DCHS1 TRIM3,ARFIP2 NA NA NA NA TRIM3 3122 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 6884595 6884618 6884606 Y DCHS1,OR2AG2,OR2AG1,OR6A2,OR2D2,OR10A4,OR2D3,OR10A2 NA NA NA NA NA ZNF215 61017 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 8727919 8728019 8727969 Y ASCL3 RPL27A NA NA NA NA RPL27A 25961 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 9385760 9386326 9386092 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 17843 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr11 9422844 9423055 9422950 Y NRIP3,IPO7 IPO7 NA NA NA NA IPO7 18675 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 9590279 9590748 9590469 Y WEE1,WEE1 WEE1 LOC644656,ZNF143 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 WEE1 2480 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 9703256 9703389 9703323 Y WEE1 SWAP70 NA NA NA NA SWAP70 19632 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 9770028 9770265 9770206 Y WEE1,SWAP70 SBF2-AS1 NA NA NA NA SBF2-AS1 7574 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 10135641 10135992 10135817 Y NA NA LOC283104,LOC440028 IMR90 Hi-C 24141950 SBF2 177762 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 10373282 10373523 10373408 Y ADM,AMPD3 ADM SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104 IMR90 Hi-C 24141950 ADM 49055 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 10549004 10549441 10549205 Y AMPD3,AMPD3,MRVI1,MRVI1,RNF141 MTRNR2L8,RNF141 NA NA NA NA RNF141 11336 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 10955517 10955651 10955533 Y NA NA EIF4G2,MICALCL,CTR9,GALNTL4,LOC729013,ZBED5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZBED5 77174 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 12111660 12111980 12111765 Y NA MICAL2 MICAL2,TEAD1,MICALCL,DKK3,USP47 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MICAL2 1563 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 12146355 12146795 12146568 Y NA MICAL2 NA NA NA NA MICAL2 32812 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 12186762 12187077 12186920 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 73219 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.40850957978713 chr11 12188567 12188982 12188726 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 75024 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 13468446 13468721 13468666 Y NA BTBD10 NA NA NA NA BTBD10 14123 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 13986123 13986466 13986328 Y SPON1 NA NA NA NA NA FAR1 297906 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr11 14354673 14355035 14354941 Y NA RRAS2 NA NA NA NA RRAS2 29017 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 15987256 15987361 15987309 Y NA NA NA NA NA NA C11orf58 645318 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 16055828 16056182 16056005 Y NA NA NA NA NA NA C11orf58 576497 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 16625688 16626709 16626131 Y SOX6,SOX6 C11orf58 SOX6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C11orf58 5970 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 16945489 16945781 16945647 Y NA RP11-466H18.1 NA NA NA NA RP11-466H18.1 48779 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr11 17008586 17008989 17008853 Y PLEKHA7 RP11-466H18.1,OR7E14P,PLEKHA7 NA NA NA NA RP11-466H18.1 14026 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 17230717 17231092 17230803 Y NA PIK3C2A,NUCB2 NA NA NA NA NUCB2 3017 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 17307346 17307410 17307378 Y NA NA B7H6 IMR90 Hi-C 24141950 NUCB2 79646 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 17374298 17375700 17374969 Y RPS13,B7H6 KCNJ11 NA NA NA NA KCNJ11 33178 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr11 18426412 18426598 18426470 Y NA LDHA NA NA NA NA LDHA 12477 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 19681860 19681955 19681908 Y NAV2 NA NA NA NA NA E2F8 420693 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 19957110 19957424 19957380 Y NAV2 NA NA NA NA NA HTATIP2 425807 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 27380505 27380624 27380565 Y NA CCDC34 NA NA NA NA CCDC34 2791 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 28128920 28129110 28128941 Y METTL15 METTL15,KIF18A NA NA NA NA KIF18A 1065 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 32915475 32916456 32915913 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 2751 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr11 33313001 33313236 33313097 Y NA HIPK3 NA NA NA NA HIPK3 36783 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 33342450 33342853 33342574 Y NA NA NA NA NA NA HIPK3 66232 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 33668919 33669067 33668993 Y NA RP4-541C22.5 NA NA NA NA RP4-541C22.5 47180 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 33711808 33712191 33712002 Y CD59 RP4-541C22.5,CD59 NA NA NA NA RP4-541C22.5 4056 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr11 33713598 33714029 33713919 Y CD59 RP4-541C22.5,CD59 NA NA NA NA RP4-541C22.5 2218 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr11 33723473 33723762 33723676 Y NA RP4-541C22.5,CD59 NA NA NA NA RP4-541C22.5 7226 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 34125347 34125667 34125520 Y NA NAT10 NA NA NA NA NAT10 198 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 34255626 34256042 34255739 Y LMO2,LMO2,ABTB2 NA NA NA NA NA RP1-145M24.1 99508 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 34356172 34356320 34356246 Y NA RP1-145M24.1,ABTB2 NA NA NA NA RP1-145M24.1 622 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 34621875 34622041 34621973 Y ELF5,ELF5,EHF,EHF EHF APIP,EHF,CAT,PDHX,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 EHF 18599 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 34622320 34622551 34622432 Y ELF5,ELF5,EHF,EHF EHF APIP,EHF,SLC1A2,ELF5,CD44 IMR90 Hi-C 24141950 EHF 18089 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr11 34661390 34661585 34661450 Y ABTB2,ELF5,ELF5,EHF,EHF EHF NA NA NA NA EHF 20750 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr11 34676467 34676782 34676555 Y ABTB2,ELF5,ELF5,CD44,EHF EHF NA NA NA NA EHF 35827 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 34701753 34702028 34701891 Y NA NA NA NA NA NA EHF 61113 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 34706877 34707176 34707110 Y ABTB2,EHF NA NA NA NA NA EHF 66237 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 34847243 34847532 34847469 Y ELF5,ELF5,EHF,EHF NA NA NA NA NA PDHX 87844 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr11 34919844 34920223 34920054 Y ELF5,EHF PDHX,APIP NA NA NA NA PDHX 15153 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 35029453 35029465 35029458 Y NA NA NA NA NA NA APIP 93407 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 35053022 35053283 35053109 Y CD44 NA SLC1A2,CD44,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 RP4-607I7.1 104296 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 35180596 35180888 35180668 Y CD44 RP4-607I7.1,CD44 NA NA NA NA CD44 22179 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 35188303 35189153 35188420 Y CD44 RP4-607I7.1,CD44 NA NA NA NA CD44 29886 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 35258280 35258546 35258460 Y CD44 NA NA NA NA NA CD44 99863 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 36521882 36522155 36522112 Y NA TRAF6 NA NA NA NA TRAF6 7667 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 43757440 43757801 43757621 Y NA NA NA NA NA NA ALKBH3 142560 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 43779324 43779404 43779364 Y NA NA NA NA NA NA ALKBH3 120957 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 44239965 44240168 44240067 Y NA NA NA NA NA NA EXT2 124866 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 44883806 44884166 44884088 Y NA NA NA NA NA NA TP53I11 86674 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 45000515 45000921 45000720 Y SYT13,TSPAN18 TP53I11 NA NA NA NA TP53I11 29675 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 45201958 45202605 45202216 Y NA NA NA NA NA NA SYT13 103265 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 46058881 46059222 46059206 Y NA NA NA NA NA NA PHF21A 81763 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 46534596 46534834 46534715 Y AMBRA1 NA NA NA NA NA AMBRA1 78841 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 46619183 46619437 46619308 Y NA AMBRA1,ATG13,HARBI1 AMBRA1 K562 ChIA-PET 22265404 AMBRA1 5508 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 47173206 47173550 47173416 Y NA ARFGAP2,PACSIN3 NA NA NA NA ARFGAP2 23126 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 47573563 47574025 47573747 Y NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1 NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4 NA NA NA NA NDUFS3 10863 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr11 47789923 47790126 47789984 Y NA FNBP4 NA NA NA NA FNBP4 2928 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 47939528 47939960 47939626 Y OR4B1,OR4S1,NUP160 RP11-793I11.1 PTPRJ,NUP160 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-793I11.1 14369 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 48029262 48029517 48029420 Y CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ PTPRJ NA NA NA NA PTPRJ 29149 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 48040170 48040457 48040234 Y NA PTPRJ NA NA NA NA PTPRJ 40057 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 48125955 48126160 48126043 Y OR4C45,OR4B1,OR4C3,OR4X2,OR4S1 NA NA NA NA NA PTPRJ 125842 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 57242995 57243389 57243187 Y OR5AK2,SSRP1,BTBD18,UBE2L6 SLC43A3,RTN4RL2,SLC43A1 NA NA NA NA RTN4RL2 16973 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 57546018 57546724 57546105 Y MED19,C11orf31 C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 27303 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr11 58263109 58263497 58263385 Y LPXN,LPXN,OR5B21 NA NA NA NA NA ZFP91 81087 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 58319737 58319877 58319834 Y NA ZFP91,ZFP91-CNTF NA NA NA NA ZFP91 24707 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 58340867 58341571 58341167 Y OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN ZFP91,ZFP91-CNTF NA NA NA NA ZFP91 3013 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 59524471 59524655 59524596 Y MS4A6A,MS4A6A,OSBP,PATL1,STX3 STX3 NA NA NA NA STX3 45542 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 59893766 59893910 59893838 Y PATL1,STX3 NA NA NA NA NA TCN1 261718 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 59894907 59895094 59895001 Y OR10V1,STX3,MS4A13,MS4A2 NA NA NA NA NA TCN1 262859 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 60753567 60754105 60753691 Y SDHAF2,CD5,CD6 NA NA NA NA NA TMEM132A 63632 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 60877687 60877932 60877809 Y CD6,CD5 CD5,VPS37C NA NA NA NA CD5 9820 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 61523945 61524112 61524089 Y INCENP,DAK,C11orf9 FEN1 NA NA NA NA FEN1 33997 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 20.0712615119666 chr11 61738760 61739751 61739487 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 5628 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 61742606 61743000 61742909 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 9474 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 61880097 61880151 61880125 Y FADS2,FADS3,RAB3IL1 INCENP FEN1,C11orf10,FADS3,BEST1,RAB3IL1,FADS2,DKFZP434K028,C11orf9,FADS1,FTH1,INCENP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 INCENP 9294 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 62226637 62226898 62226739 Y FTH1,WDR74,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK NA NA NA NA NA AHNAK 94809 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 62264935 62265137 62265063 Y WDR74,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3 NA NA NA NA NA AHNAK 56570 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 62267714 62268111 62267986 Y NA NA NA NA NA NA AHNAK 53596 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 62306762 62307027 62306934 Y WDR74,STX5,NXF1,EML3,AHNAK AHNAK,EEF1G,MIR3654 NA NA NA NA AHNAK 14680 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 62310227 62311393 62310863 Y WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1 NA NA NA NA AHNAK 10314 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 62312037 62312397 62312245 Y WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1 NA NA NA NA AHNAK 9310 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr11 62320979 62321244 62321106 Y NA AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 NA NA NA NA AHNAK 463 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr11 62625165 62625549 62625272 Y TUT1,METTL12,HNRNPUL2,SLC3A2 STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA SLC3A2 3647 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 63350815 63351029 63350927 Y RTN3,PLA2G16,PLA2G16 PLA2G16 NA NA NA NA PLA2G16 31326 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 63639638 63639903 63639715 Y NA MARK2,RCOR2 NA NA NA NA MARK2 35238 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr11 63685258 63686079 63685609 Y NA RCOR2,NAA40 NA NA NA NA RCOR2 2942 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 63686695 63687182 63686923 Y NA RCOR2,NAA40 NA NA NA NA RCOR2 4379 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 63687620 63687907 63687858 Y LGALS12,RCOR2 RCOR2,NAA40 NA NA NA NA RCOR2 5304 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr11 63744435 63744483 63744459 Y KCNK4 NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1 NA NA NA NA AP000721.4 4343 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 63858567 63858836 63858756 Y NA NA NA NA NA NA MACROD1 72742 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 64125464 64125650 64125510 Y MARK2,NUDT22,FKBP2,PPP1R14B,PLCB3,BAD,ESRRA,TRMT112,PRDX5,CDC42BPG,RPS6KA4 TRMT112,PRDX5,CCDC88B,RPS6KA4 NA NA NA NA RPS6KA4 844 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr11 64140304 64140795 64140552 Y RCOR2,NAA40,GPR137,KCNK4,NRXN2,NRXN2,CDC42BPG CCDC88B,RPS6KA4 NA NA NA NA RPS6KA4 15684 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 65152750 65152863 65152819 Y LOC100130348,CDC42EP2,DKFZp761E198,FRMD8 TIGD3,SLC25A45,FRMD8,NEAT1 NA NA NA NA FRMD8 680 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 65184888 65185395 65184991 Y FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 2850 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 65185589 65187086 65186338 Y NA SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 1159 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.29113378147154 chr11 65187297 65188198 65187553 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 47 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 4.34290453767699 chr11 65238917 65239096 65239037 Y CDC42EP2,RELA,EHBP1L1,DKFZp761E198 AP000769.1,MALAT1 TIGD3 K562 ChIA-PET 22265404 AP000769.1 18189 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 65239550 65239870 65239751 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1 TIGD3,SCYL1 K562 ChIA-PET 22265404 AP000769.1 18822 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 4.34290453767699 chr11 65246279 65246484 65246387 Y SCYL1,LTBP3,EFEMP2 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 16749 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr11 65252951 65253044 65253026 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 10189 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 65254949 65255610 65255242 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 7623 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 65259217 65259522 65259389 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 3711 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 65259637 65259913 65259840 Y SNX32,EFEMP2,DRAP1,C11orf68 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 3320 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 65259930 65260851 65260542 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 2382 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 65261229 65261625 65261527 Y CDC42EP2 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 1608 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 25.5879240327996 chr11 65333490 65333816 65333671 Y SLC25A45,SIPA1,SIPA1,EIF1AD,CTSW,PCNXL3 SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3 NA NA NA NA SSSCA1 2085 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 65419981 65420225 65420142 Y CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 8340 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 65582060 65582341 65582183 Y NA OVOL1,MUS81,CFL1 NA NA NA NA OVOL1 29567 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 65666492 65667203 65666864 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 448 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.29113378147154 chr11 65670692 65670945 65670845 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1 MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 4648 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 65679250 65679576 65679373 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1 FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 5012 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 65683105 65683625 65683322 Y NA FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 963 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr11 66118604 66119022 66118907 Y NA RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2,RNU1-84P NA NA NA NA RP11-867G23.8 5183 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 66494345 66494720 66494567 Y NA C11orf80 C11orf80 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 C11orf80 15202 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 66494780 66495327 66494982 Y SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2 C11orf80 C11orf80 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 C11orf80 14595 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr11 66738286 66738892 66738415 Y POLD4,CLCF1,CLCF1,KDM2A,ADRBK1 PC,C11orf86 PC,SYT12,RHOD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C11orf86 1856 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 66845381 66845631 66845497 Y TMEM134,SSH3,RHOD RHOD,KDM2A NA NA NA NA RHOD 23092 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr11 67105994 67106296 67106145 Y NA SSH3,POLD4,AP003419.11 NA NA NA NA POLD4 16147 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 67121988 67122388 67122127 Y POLD4,CLCF1 POLD4,AP003419.11,RAD9A NA NA NA NA POLD4 55 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr11 67138301 67138677 67138619 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 378 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 67138852 67139479 67139267 Y NA POLD4,RAD9A,CARNS1,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr11 67139742 67140272 67140082 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 687 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 5.04715932757056 chr11 67144956 67145205 67145097 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA,RPS6KB2 NA NA NA NA AP003419.11 5901 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr11 67146992 67147327 67147282 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA,RPS6KB2 NA NA NA NA AP003419.11 7937 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr11 68065646 68065898 68065824 Y CHKA,LRP5 C11orf24,LRP5 SUV420H1,C11orf24,LRP5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRP5 12179 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 68099033 68099353 68099110 Y NA LRP5 NA NA NA NA LRP5 20956 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 68110280 68110464 68110374 Y NA LRP5 PPP6R3 IMR90 Hi-C 24141950 LRP5 32203 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr11 68238826 68238975 68238901 Y TCIRG1,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,IGHMBP2,PPP6R3 PPP6R3 NA NA NA NA PPP6R3 12640 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 68608164 68608616 68608368 Y NA CPT1A NA NA NA NA CPT1A 1262 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 68776292 68776545 68776410 Y MRGPRF TPCN2 MRGPRD IMR90 Hi-C 24141950 TPCN2 37820 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 68778534 68778789 68778694 Y MRGPRF TPCN2 NA NA NA NA TPCN2 35576 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 68819125 68819319 68819197 Y MRGPRD,TPCN2 TPCN2 NA NA NA NA TPCN2 4760 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 69182957 69183170 69183095 Y ORAOV1,CCND1,MYEOV NA CCND1,MYEOV MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MYEOV 123352 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 69197125 69197542 69197234 Y ORAOV1,MYEOV NA MYEOV,CCND1 IMR90 Hi-C 24141950 MYEOV 137520 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 69451342 69451588 69451394 Y NA CCND1,ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 2267 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 69453520 69454472 69453912 Y NA ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr11 69632815 69633180 69632998 Y NA NA NA NA NA NA FGF19 115405 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 69639961 69640299 69640038 Y NA NA FGF3 K562 ChIA-PET 22265404 FGF19 122551 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 12.441834621453 chr11 69655407 69655781 69655522 Y FGF19,FGF3 NA ANO1 IMR90 Hi-C 24141950 FGF19 137997 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 69794643 69794820 69794756 Y FADD,ANO1 RP11-626H12.1 ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD IMR90 Hi-C 24141950 RP11-626H12.1 35162 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr11 69795546 69795838 69795683 Y ANO1 RP11-626H12.1 ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD IMR90 Hi-C 24141950 RP11-626H12.1 34144 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr11 69927034 69927161 69927098 Y ANO1 ANO1 NA NA NA NA ANO1 4626 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 70005779 70006157 70005922 Y ANO1,CTTN,PPFIA1,FADD FADD NA NA NA NA FADD 41112 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 70079442 70079825 70079633 Y ANO1,CTTN,FADD,PPFIA1 FADD,PPFIA1 FADD,PPFIA1,ORAOV1,ANO1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FADD 32173 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr11 70162610 70162835 70162663 Y PPFIA1 PPFIA1 NA NA NA NA PPFIA1 47804 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 70245269 70246141 70245676 Y ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN CTTN,AP000487.5 NA NA NA NA AP000487.5 2675 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr11 72449101 72449742 72449392 Y P2RY2,P2RY2,FCHSD2,ATG16L2,PDE2A,ARAP1,ARAP1 NA NA NA NA NA ARAP1 52902 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 72906397 72906513 72906453 Y NA P2RY2 FCHSD2,ATG16L2,P2RY6,ARAP1,P2RY2,STARD10,MIR4692,RELT IMR90,MCF7 Hi-C,3C,ChIA-PET 24141950,19890323,22265404 P2RY2 20830 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 73088357 73088912 73088439 Y NA RELT NA NA NA NA RELT 3048 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr11 73134039 73134350 73134132 Y RELT,RELT RELT NA NA NA NA RELT 48730 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 73490470 73490918 73490608 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 5443 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 74176233 74176573 74176529 Y KCNE3 KCNE3,AP001372.2,LIPT2,POLD3 NA NA NA NA KCNE3 201 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr11 74871497 74871764 74871689 Y OR2AT4 NA NA NA NA NA SLCO2B1 61889 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 75248214 75248465 75248264 Y UVRAG GDPD5,SERPINH1 GDPD5,RPS3,KLHL35,SERPINH1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GDPD5 13266 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 75385192 75385417 75385302 Y NA MOGAT2 NA NA NA NA MOGAT2 41447 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 75794523 75794905 75794797 Y NA NA NA NA NA NA WNT11 124875 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 75919893 75920246 75919996 Y WNT11 WNT11 NA NA NA NA WNT11 113 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr11 75920696 75920900 75920748 Y NA WNT11 NA NA NA NA WNT11 916 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr11 76480789 76480971 76480905 Y NA TSKU,RP11-21L23.3 B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSKU 10324 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 5.16453512588615 chr11 76674520 76674873 76674698 Y B3GNT6 NA NA NA NA NA CAPN5 101106 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 76802149 76802401 76802277 Y NA CAPN5 NA NA NA NA CAPN5 26170 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 77445522 77445800 77445629 Y NA FTH1P16 NA NA NA NA FTH1P16 1451 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 77938673 77938848 77938785 Y NA USP35,KCTD21 NA NA NA NA KCTD21 40805 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr11 78051625 78051814 78051807 Y NA NA NA NA NA NA GAB2 75580 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr11 83670710 83671103 83670907 Y NA NA NA NA NA NA CCDC90B 675260 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 85757330 85757451 85757391 Y NA PICALM NA NA NA NA PICALM 21473 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 85929463 85929753 85929608 Y NA EED PICALM,CCDC83,EED,SYTL2 IMR90 Hi-C 24141950 EED 23833 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 86178922 86179317 86178974 Y NA NA NA NA NA NA C11orf73 167669 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 86222200 86222363 86222315 Y NA NA NA NA NA NA ME3 159315 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 86454484 86454767 86454607 Y NA PRSS23 PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 45334 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 86454778 86455149 86454967 Y PRSS23 PRSS23 PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 44952 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 86627337 86627645 86627491 Y FZD4 FZD4,RP11-736K20.6 ME3 IMR90 Hi-C 24141950 FZD4 36788 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 87043104 87043447 87043253 Y NA NA NA NA NA NA TMEM135 296218 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 88071526 88071793 88071707 Y NA CTSC NA NA NA NA CTSC 2571 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 88269213 88269357 88269284 Y NA NA NA NA NA NA CTSC 200258 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 90016507 90016673 90016590 Y NA RP11-121L10.3 NA NA NA NA RP11-121L10.3 2779 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 94882788 94883137 94883023 Y NA RP11-712B9.2 NA NA NA NA RP11-712B9.2 1085 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr11 102042993 102043398 102043047 Y C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1 NA NA NA NA NA YAP1 63801 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 102297400 102297813 102297636 Y BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123 TMEM123 BIRC2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 41302 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 102956908 102957200 102957055 Y NA DCUN1D5 NA NA NA NA DCUN1D5 3744 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 107966906 107967320 107967120 Y NA ACAT1 ACAT1 IMR90 Hi-C 24141950 ACAT1 22923 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 110326620 110326859 110326678 Y NA FDX1 NA NA NA NA FDX1 28013 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 111664556 111665052 111664796 Y SIK2,BCO2 PPP2R1B NA NA NA NA PPP2R1B 29405 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 113945404 113945849 113945581 Y ZBTB16,ZBTB16 NA NA NA NA NA USP28 201112 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 116679644 116679851 116679748 Y APOC3,APOA1 BUD13,ZNF259,APOA4,APOC3,APOA1 APOA5,ZNF259 IMR90 Hi-C 24141950 APOA4 12171 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr11 117015877 117016035 117015996 Y SIK3,PAFAH1B2 SIK3,PAFAH1B2,SIDT2 NA NA NA NA PAFAH1B2 2894 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 117679991 117680281 117680071 Y IL10RA FXYD2,RP11-728F11.4 NA NA NA NA FXYD2 17132 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr11 117685393 117685836 117685712 Y IL10RA FXYD2,RP11-728F11.4 NA NA NA NA FXYD2 11577 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 117693971 117694128 117694108 Y IL10RA,FXYD2,FXYD2 FXYD2,RP11-728F11.4 NA NA NA NA FXYD2 3285 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 117889009 117889463 117889284 Y IL10RA IL10RA NA NA NA NA IL10RA 33946 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 118663387 118663780 118663691 Y NA DDX6 NA NA NA NA DDX6 3529 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr11 118763139 118763505 118763387 Y NA MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 15912 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 118782911 118783378 118783221 Y SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84 MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 3494 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 11.1507008399815 chr11 118784118 118784508 118784405 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84 MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 4701 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 118788249 118788453 118788294 Y MLL,PHLDB1,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CCDC84 MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA UPK2 5420 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 118790377 118790895 118790660 Y NA MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA UPK2 2978 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.76063697473392 chr11 118791529 118792348 118792152 Y PHLDB1,BCL9L MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA UPK2 1525 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 118793665 118793922 118793750 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA UPK2 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr11 118799839 118800231 118800031 Y C2CD2L MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5522 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr11 118800245 118800827 118800413 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84 MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5928 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 118800879 118801266 118801161 Y MLL,DDX6,VPS11,CBL,CXCR5,CXCR5,CCDC84 MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 6562 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 119241226 119241377 119241346 Y NA RNF26,USP2-AS1 NA NA NA NA USP2-AS1 9111 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 119242685 119242777 119242731 Y NA RNF26,USP2-AS1 NA NA NA NA USP2-AS1 7711 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 119454963 119455433 119455083 Y NA KRT8P7 TRIM29,USP2,LOC100499227 IMR90 Hi-C 24141950 KRT8P7 17585 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr11 119540378 119540644 119540511 Y NA NA NA NA NA NA PVRL1 57150 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 119565806 119566154 119565980 Y NA PVRL1 NA NA NA NA PVRL1 31640 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 122847536 122847832 122847753 Y C11orf63,BSX NA NA NA NA NA RPL34P23 56743 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 124552795 124553089 124552942 Y OR8B4,C11orf61 SPA17,SIAE NA NA NA NA SIAE 10514 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 124611800 124612504 124612072 Y NA SIAE,NRGN,RP11-677M14.2,VSIG2,RP11-677M14.3,ESAM NA NA NA NA RP11-677M14.2 1729 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 124942192 124942648 124942569 Y TBRG1,SLC37A2 TMEM218 NA NA NA NA TMEM218 37011 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 125983623 125983738 125983673 Y CDON NA HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 CDON 52393 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 128291574 128291714 128291646 Y NA NA ETS1,FLI1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 163739 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 128294765 128294892 128294836 Y NA NA ETS1,FLI1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 160561 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 128318387 128318699 128318622 Y NA NA NA NA NA NA ETS1 136754 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 128376891 128377234 128377096 Y ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 78219 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 128377315 128377487 128377422 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 77966 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 128419505 128419554 128419521 Y NA ETS1 NA NA NA NA ETS1 35899 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 128605969 128606121 128606047 Y ETS1,FLI1,FLI1 NA NA NA NA NA ETS1 150516 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 129013172 129013631 129013445 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP32 133588 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 129102482 129102753 129102618 Y NA ARHGAP32 NA NA NA NA ARHGAP32 44466 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 129201080 129201232 129201157 Y NA BARX2 ARHGAP32,KCNJ5,C11orf45 IMR90 Hi-C 24141950 BARX2 42603 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 129246487 129246784 129246747 Y BARX2 BARX2 NA NA NA NA BARX2 2652 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 129250080 129250185 129250128 Y BARX2 BARX2 NA NA NA NA BARX2 6245 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 129282439 129282677 129282511 Y NA BARX2 NA NA NA NA BARX2 38604 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 129315060 129315380 129315220 Y BARX2 NA NA NA NA NA BARX2 71225 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr11 129317318 129317884 129317614 Y NA NA NA NA NA NA BARX2 73483 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 129730176 129730501 129730339 Y TMEM45B TMEM45B,NFRKB NA NA NA NA NFRKB 32984 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 129731747 129732130 129731880 Y ST14,NFRKB,TMEM45B TMEM45B,NFRKB NA NA NA NA NFRKB 31355 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.40850957978713 chr11 129871629 129871941 129871631 Y NA PRDM10,TCEB2P2 NA NA NA NA PRDM10 899 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 130016455 130016576 130016492 Y NA ST14 NA NA NA NA ST14 10881 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 130036262 130036668 130036368 Y PRDM10 ST14 NA NA NA NA ST14 8805 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 130062798 130062918 130062846 Y NA ST14 NA NA NA NA ST14 35341 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 131206134 131206252 131206193 Y NA NA NTM IMR90 Hi-C 24141950 SNX19 421730 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 132411283 132411428 132411357 Y NA NA NA NA NA NA IGSF9B 1413452 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 133804654 133804943 133804849 Y NA IGSF9B NA NA NA NA IGSF9B 19937 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr11 133814977 133815479 133815368 Y NCAPD3,IGSF9B IGSF9B NA NA NA NA IGSF9B 9401 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr11 134124453 134124658 134124640 Y NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2 VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8 NA NA NA NA ACAD8 3064 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr11 134509789 134510106 134509920 Y NA NA NA NA NA NA B3GAT1 229977 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 398927 399098 399013 Y NA NA NA NA NA NA CCDC77 97341 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 647081 647236 647154 Y ERC1,SLC6A12,SLC6A12,B4GALNT3 NA NA NA NA NA B4GALNT3 79551 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr12 1026879 1027238 1027070 Y NA NA NA NA NA NA RAD52 69981 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 1211682 1211803 1211740 Y NA NA NA NA NA NA ERC1 114007 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 1759390 1759637 1759510 Y NA ADIPOR2 NA NA NA NA ADIPOR2 36103 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 1769649 1770205 1769686 Y NA ADIPOR2 NA NA NA NA ADIPOR2 25535 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr12 1770869 1771337 1771069 Y LRTM2,ADIPOR2 ADIPOR2 NA NA NA NA ADIPOR2 24403 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr12 3226381 3226449 3226415 Y TSPAN9 TSPAN9 NA NA NA NA TSPAN9 41860 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 3420231 3420354 3420293 Y PRMT8 NA NA NA NA NA RP11-543P15.1 101135 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 3563518 3563854 3563701 Y NA NA NA NA NA NA RP11-543P15.1 244422 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 6202352 6202551 6202452 Y CD9,ANO2 NA NA NA NA NA CD9 104330 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr12 6311406 6311775 6311432 Y NA CD9 NA NA NA NA CD9 4525 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 6325035 6325634 6325452 Y NA CD9 NA NA NA NA CD9 18154 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 6389072 6389528 6389363 Y CD9,PLEKHG6,PLEKHG6 PLEKHG6 VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLEKHG6 28074 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 6403662 6404056 6403860 Y PLEKHG6,PLEKHG6,PLEKHG6 PLEKHG6,TNFRSF1A VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2 IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHG6 13546 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr12 6404239 6404667 6404531 Y NA PLEKHG6,TNFRSF1A VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2 IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHG6 12935 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr12 6432315 6432644 6432443 Y NA PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR NA NA NA NA PLEKHG6 14713 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 6444583 6445131 6444861 Y CD4,CD4,TNFRSF1A PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A NA NA NA NA TNFRSF1A 4149 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr12 6445143 6445640 6445507 Y VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A NA NA NA NA TNFRSF1A 3640 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 6454526 6454970 6454793 Y CD4,CD4,TNFRSF1A PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A NA NA NA NA TNFRSF1A 5246 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 6536099 6536375 6536311 Y ZNF384,VAMP1,TAPBPL,LRRC23,LPAR5,IFFO1,CD4,CD4,CD27 RP1-102E24.9,CD27-AS1,TAPBPL,VAMP1 NA NA NA NA RP1-102E24.9 9289 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 6539566 6540029 6539921 Y NA RP1-102E24.9,CD27-AS1,TAPBPL,VAMP1 NA NA NA NA RP1-102E24.9 5635 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 6622889 6622901 6622895 Y NA VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH NA NA NA NA SCARNA10 5501 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 6684613 6684668 6684641 Y NA GAPDH,NOP2,CHD4 NA NA NA NA NOP2 8756 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 6717352 6717716 6717682 Y SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP NOP2,CHD4,LPAR5 NA NA NA NA CHD4 2710 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 7034730 7034838 7034794 Y ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1 SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,PTPN6,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2 NA NA NA NA ATN1 3104 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 3.16914655452105 chr12 7104040 7104360 7104246 Y NA EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3 NA NA NA NA C1S 9689 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 7592182 7592797 7592685 Y PEX5,NANOG CD163L1 NA NA NA NA CD163L1 37696 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 8179132 8179551 8179335 Y NA FOXJ2 PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 3748 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 8840377 8840836 8840579 Y RIMKLB RIMKLB RIMKLB MCF7 ChIA-PET 22265404 RIMKLB 8181 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 9986583 9986922 9986755 Y NA CLEC2B NA NA NA NA CLEC2B 33813 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 10794413 10794704 10794528 Y NA MAGOHB,STYK1 NA NA NA NA MAGOHB 30191 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 10824879 10825003 10824941 Y NA NA MAGOHB,KLRAP1 IMR90 Hi-C 24141950 STYK1 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 10833157 10833219 10833190 Y NA STYK1 NA NA NA NA STYK1 8240 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr12 10869298 10869573 10869459 Y NA STYK1 NA NA NA NA STYK1 44381 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr12 12185852 12185959 12185898 Y ETV6,BCL2L14 BCL2L14 ETV6,LOC338817,CDKN1B,BCL2L14,MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCL2L14 14819 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 12255233 12255559 12255327 Y BCL2L14 RP11-267J23.4 NA NA NA NA RP11-267J23.4 6538 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 12504083 12504386 12504252 Y BCL2L14,MANSC1 MANSC1,LOH12CR1 NA NA NA NA MANSC1 2608 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 12956264 12956405 12956396 Y GPRC5A,DDX47 DDX47 NA NA NA NA DDX47 7845 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 13025126 13025347 13025203 Y NA RPL13AP20,GPRC5A,MIR614 NA NA NA NA RPL13AP20 1086 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr12 13050548 13050563 13050554 Y NA RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6 NA NA NA NA GPRC5A 8832 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 13124934 13124993 13124963 Y NA RP11-392P7.6,HTR7P1,HEBP1 GPRC5D IMR90 Hi-C 24141950 HTR7P1 25819 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 13251023 13251431 13251083 Y EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 55805 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 13253893 13254547 13254171 Y CDKN1B,EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 58675 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 13376628 13377027 13376828 Y NA EMP1 NA NA NA NA EMP1 28978 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 15841016 15841330 15841173 Y NA NA NA NA NA NA EPS8 191933 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 15853599 15853765 15853693 Y NA NA NA NA NA NA EPS8 179498 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 15910995 15911177 15911085 Y NA NA PTPRO IMR90 Hi-C 24141950 EPS8 122086 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr12 15916950 15917280 15917185 Y NA NA PTPRO IMR90 Hi-C 24141950 EPS8 115983 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr12 16553699 16554214 16553898 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 55623 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 19048962 19049238 19049131 Y NA NA PIK3C2G IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHA5 231410 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 19566135 19566181 19566158 Y NA AEBP2 NA NA NA NA AEBP2 11156 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 19635536 19635865 19635672 Y NA RP11-841C19.1 NA NA NA NA RP11-841C19.1 23973 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 20124309 20124606 20124452 Y PDE3A NA PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-146P 248940 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 20950319 20950359 20950339 Y NA SLCO1B3 NA NA NA NA SLCO1B3 11277 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 20959036 20959191 20959158 Y NA SLCO1B3 NA NA NA NA SLCO1B3 2445 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr12 20975224 20975562 20975349 Y NA SLCO1B3 NA NA NA NA SLCO1B3 13588 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 29.4613253772142 chr12 21039353 21039668 21039511 Y NA NA NA NA NA NA SLCO1B3 77717 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 21059259 21059529 21059394 Y SLCO1B3,LST-3TM12,SLCO1B1,SLCO1A2 NA NA NA NA NA SLCO1B3 97623 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 21162401 21162431 21162416 Y SLCO1B3,SLCO1B1,LST-3TM12 NA NA NA NA NA SLCO1B1 119705 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 22779557 22779668 22779574 Y NA ETNK1 NA NA NA NA ETNK1 3548 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 25538390 25538869 25538521 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 136520 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 137212 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.87801277304951 chr12 25539458 25539791 25539651 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 137588 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 26427494 26428032 26427844 Y NA NA SSPN,BHLHE41,ITPR2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-283G6.3 149944 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 26484826 26485166 26485077 Y NA NA NA NA NA NA RP11-283G6.3 207276 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 26495152 26495452 26495369 Y ITPR2 NA NA NA NA NA RP11-283G6.3 217602 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 26522536 26522924 26522687 Y ITPR2 NA NA NA NA NA RP11-283G6.3 244986 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 27678444 27678624 27678473 Y PPFIBP1 PPFIBP1 NA NA NA NA PPFIBP1 4080 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 28501330 28501622 28501413 Y NA RNU4-54P NA NA NA NA RNU4-54P 30934 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 28933073 28933289 28933191 Y NA NA NA NA NA NA FAR2 366747 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 29473475 29473492 29473484 Y NA NA NA NA NA NA ERGIC2 58630 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 29489399 29489493 29489486 Y NA ERGIC2 NA NA NA NA ERGIC2 42629 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 30949517 30949896 30949519 Y CAPRIN2 CAPRIN2,RP11-77I22.2,LINC00941 NA NA NA NA LINC00941 3540 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 31886733 31886952 31886810 Y NA AMN1,RP11-467L13.5 C12orf35 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMN1 6625 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 31902136 31902566 31902240 Y C12orf35,AMN1,H3F3C AMN1,RP11-467L13.5,H3F3C AMN1 K562 ChIA-PET 22265404 RP11-467L13.5 3085 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 33048688 33048837 33048763 Y PKP2 PKP2 NA NA NA NA PKP2 914 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 39104065 39104215 39104143 Y CPNE8 NA NA NA NA NA CPNE8 195017 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr12 39766876 39767120 39766998 Y NA NA NA NA NA NA KIF21A 68072 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 40467954 40468269 40468112 Y NA SLC2A13 NA NA NA NA SLC2A13 29622 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 41393179 41393524 41393257 Y NA NA NA NA NA NA SLC2A13 895288 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 42825856 42826146 42826103 Y YAF2,YAF2,YAF2 NA NA NA NA NA ZCRB1 107936 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 45820263 45820702 45820515 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA8P1 212439 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 46609835 46610258 46610179 Y ARID2,SCAF11,SLC38A1 NA NA NA NA NA SLC38A1 51542 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 46824163 46824471 46824386 Y NA RP11-96H19.1 SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 48701 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 46894676 46894859 46894768 Y SLC38A4 NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 119214 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 48195468 48195540 48195504 Y ASB8 SLC48A1,RAPGEF3,HDAC7 NA NA NA NA HDAC7 29375 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 48282882 48283045 48282955 Y ZNF641,ZNF641,ASB8,VDR NA NA NA NA NA VDR 51786 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 48294417 48294695 48294497 Y OR10AD1,ZNF641,ZNF641,VDR VDR NA NA NA NA VDR 40136 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 49203713 49203966 49203840 Y NA ADCY6,CACNB3,DDX23 NA NA NA NA CACNB3 1611 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 49277442 49277626 49277534 Y NA DDX23,RND1,FKBP11 RND1,DDX23,CACNB3,DDN,PRKAG1,ARF3,FKBP11 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RND1 19761 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 49641026 49641246 49641136 Y NA PRPH RHEBL1,TUBA1C,TUBA1A,LMBR1L,DHH,MLL2,TUBA1B,SPATS2,MCRS1,FAM186B,PRPH IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRPH 43789 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 49678404 49678529 49678467 Y NA PRPH,TROAP NA NA NA NA PRPH 6506 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 49739029 49739393 49739097 Y PRPF40B,C1QL4,DNAJC22 TROAP,DNAJC22,SPATS2 NA NA NA NA DNAJC22 329 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 50460197 50460562 50460363 Y NA RACGAP1,SMARCD1,GPD1 NA NA NA NA SMARCD1 16193 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 51327584 51327783 51327682 Y NA METTL7A NA NA NA NA METTL7A 12329 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 52418719 52418897 52418793 Y NR4A1,ACVRL1,GRASP,NR4A1 NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 4103 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 52419301 52419935 52419633 Y NR4A1,GRASP,NR4A1 NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 4685 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 52426305 52426422 52426334 Y NR4A1,GRASP,NR4A1 NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 11689 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 52426547 52427164 52426822 Y NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 11931 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 52525424 52525587 52525584 Y NA NA NA NA NA NA KRT80 58197 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr12 52539319 52539712 52539621 Y KRT84,KRT80,KRT6A,KRT5 KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 44072 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.52588537810273 chr12 52540964 52541526 52541224 Y KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44 KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 42258 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 9.03793647030077 chr12 52542210 52542726 52542513 Y KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44 KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 41058 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 2.58226756294308 chr12 52557711 52558022 52557822 Y NA KRT80 NA NA NA NA KRT80 25762 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 52584709 52584955 52584807 Y C12orf44,KRT80,KRT7 KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 925 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 52674043 52674518 52674247 Y NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80 KRT7 NA NA NA NA KRT7 49739 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 52674655 52675081 52674843 Y C12orf44,KRT80,KRT7 NA NA NA NA NA KRT7 50351 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr12 53261473 53261693 53261598 Y KRT2,KRT1,KRT77 NA KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85 IMR90 Hi-C 24141950 KRT18 78962 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 53267781 53268340 53268093 Y PFDN5 NA KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT18 72315 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 53281915 53282052 53282044 Y NA NA NA NA NA NA KRT18 58603 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.64326117641832 chr12 53284889 53285178 53285173 Y ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18 NA NA NA NA NA KRT18 55477 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr12 53288883 53289427 53289224 Y NA NA NA NA NA NA KRT18 51228 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr12 53318665 53319069 53319016 Y NA KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 21586 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 53339346 53339557 53339459 Y EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18 KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 1098 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr12 53359181 53359363 53359294 Y PCBP2,AMHR2,KRT8,KRT18,KRT18 KRT18,KRT8,EIF4B NA NA NA NA KRT8 17443 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 53445016 53445392 53445120 Y IGFBP6,C12orf10,TENC1,TENC1,TENC1,SPRYD3 EIF4B,TENC1,RP11-983P16.4,SPRYD3,IGFBP6 NA NA NA NA RP11-983P16.4 830 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 53765037 53765535 53765115 Y CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13 AAAS,SP1 SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP1 6425 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 54133160 54133497 54133297 Y ATF7,ATP5G2 CALCOCO1,SNORD81 ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5 IMR90 Hi-C 24141950 CALCOCO1 13631 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 54372759 54373189 54372957 Y HOXC13,HOXC12,HOXC11,HOXC10 HOXC11,HOXC6,HOXC9 NA NA NA NA HOXC11 7849 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr12 54752671 54753884 54753119 Y NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84 NA NA NA NA NA ITGA5 57360 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 55807914 55808439 55808095 Y NA NA NA NA NA NA METTL7B 264891 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 56219844 56220081 56219962 Y OR6C3 SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14 NA NA NA NA TMEM198B 1448 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 56474601 56474862 56474633 Y SLC39A5,APOF,OR10P1,METTL7B,ERBB3,ERBB3 RPS26,ERBB3,PA2G4,RPL41,ZC3H10,ESYT1 NA NA NA NA ERBB3 2960 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr12 57026164 57026397 57026368 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 2203 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 7.15992369725126 chr12 57077806 57078249 57078184 Y COQ10A,PAN2,PAN2 BAZ2A,ATP5B,PTGES3,NACA NA NA NA NA PTGES3 1910 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 57079143 57079532 57079338 Y NA ATP5B,PTGES3,NACA NA NA NA NA PTGES3 627 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 57494239 57494362 57494284 Y MBD6,STAT6 TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6 NA NA NA NA NAB2 13562 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 57520981 57521279 57521090 Y NA TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6 NA NA NA NA LRP1 705 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr12 57746067 57746152 57746110 Y NA NA R3HDM2,INHBE,ARHGAP9,GLI1 IMR90 Hi-C 24141950 R3HDM2 76636 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 57812894 57812946 57812929 Y NA R3HDM2,GLI1 NA NA NA NA R3HDM2 9842 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 57855378 57855667 57855523 Y NA R3HDM2,GLI1,MARS NA NA NA NA GLI1 3460 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 62796049 62796447 62796072 Y NA NA NA NA NA NA MON2 62150 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 62970708 62971108 62970733 Y NA RP11-631N16.2,MIRLET7I NA NA NA NA RP11-631N16.2 23424 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 64346406 64346706 64346556 Y NA NA NA NA NA NA SRGAP1 110333 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 64414724 64414736 64414730 Y NA NA NA NA NA NA SRGAP1 178651 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 64482177 64482504 64482346 Y SRGAP1,TBK1,C12orf66 NA NA NA NA NA C12orf66 131572 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 64546689 64546709 64546700 Y NA NA NA NA NA NA C12orf66 67367 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr12 65019058 65019979 65019210 Y TBK1,RASSF3,GNS RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 16765 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr12 66289506 66290040 66289751 Y NA NA NA NA NA NA HMGA2 73595 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 66628292 66629290 66628922 Y TMBIM4,IRAK3,HELB NA NA NA NA NA HELB 65035 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 67275619 67275719 67275669 Y NA NA NA NA NA NA RP11-123O10.4 185223 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 2.23014016799629 chr12 69070582 69070990 69070845 Y MDM1,SLC35E3,NUP107,MDM2 RP11-254B13.3,NUP107 NA NA NA NA NUP107 7524 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 69180946 69181662 69181342 Y NA SLC35E3,MDM2 SLC35E3 IMR90 Hi-C 24141950 MDM2 18294 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 69220588 69221011 69220784 Y NA MDM2 NA NA NA NA MDM2 20632 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 69634325 69634686 69634559 Y SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6 CPSF6 NA NA NA NA CPSF6 3008 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 69686526 69686874 69686654 Y NA NA NA NA NA NA LYZ 53247 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 69722229 69722626 69722379 Y LYZ LYZ,RP11-1143G9.4,YEATS4 CPSF6,YEATS4 K562 ChIA-PET 22265404 LYZ 17495 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 69724869 69725108 69724964 Y LYZ LYZ,RP11-1143G9.4,YEATS4 YEATS4 K562 ChIA-PET 22265404 LYZ 15013 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr12 69725132 69725785 69725647 Y CPM,LYZ LYZ,RP11-1143G9.4,YEATS4 YEATS4 K562 ChIA-PET 22265404 LYZ 14336 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 70634012 70634396 70634290 Y RAB3IP,KCNMB4,CNOT2,CNOT2,CNOT2 CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA CNOT2 378 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 71555404 71555561 71555484 Y TSPAN8 NA NA NA NA NA LGR5 275989 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr12 72125251 72125450 72125351 Y NA TMEM19,RP11-498M15.1,RAB21 NA NA NA NA RAB21 21204 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 76429051 76429248 76429150 Y NA PHLDA1,NAP1L1 NA NA NA NA PHLDA1 3339 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 76751627 76751939 76751780 Y NA BBS10 NA NA NA NA BBS10 11405 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 79526323 79526826 79526502 Y SYT1 NA NA NA NA NA PAWR 556051 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 80305277 80305475 80305376 Y NA RP11-84G21.1,PPP1R12A NA NA NA NA RP11-84G21.1 21206 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 88703962 88704349 88704186 Y NA NA KITLG IMR90 Hi-C 24141950 TMTC3 169889 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 88968059 88968366 88968242 Y NA KITLG NA NA NA NA KITLG 4262 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr12 89747699 89748479 89748073 Y NA DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 2651 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr12 90091098 90091469 90091453 Y NA ATP2B1 ATP2B1,LOC338758 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP2B1 9608 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 92428496 92429133 92428829 Y NA NA NA NA NA NA C12orf79 105557 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 92517978 92518398 92518142 Y BTG1 C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA C12orf79 16292 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr12 92836682 92836892 92836798 Y EEA1,BTG1 NA NA NA NA NA C12orf74 257727 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 93277124 93277496 93277306 Y NA EEA1 NA NA NA NA EEA1 43611 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 93321551 93321826 93321626 Y EEA1 EEA1 NA NA NA NA EEA1 444 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 93709037 93709216 93709174 Y NA NA NA NA NA NA NUDT4 60443 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 93770329 93770575 93770474 Y NUDT4 NUDT4 NA NA NA NA NUDT4 670 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 95034280 95034617 95034465 Y PLXNC1,TMCC3 TMCC3 NA NA NA NA TMCC3 7721 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 95043067 95043319 95043087 Y TMCC3 TMCC3 NA NA NA NA TMCC3 729 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 102009746 102010171 102009968 Y MYBPC1 MYBPC1 NA NA NA NA MYBPC1 49615 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr12 104252933 104253121 104253026 Y NA NT5DC3 NA NA NA NA NT5DC3 19958 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 104658660 104659046 104658853 Y NA RPL18AP3,RP11-818F20.5 NA NA NA NA RPL18AP3 1604 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 104671230 104671489 104671317 Y TXNRD1 RPL18AP3,RP11-818F20.5 NA NA NA NA RP11-818F20.5 1011 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 106640032 106640193 106640140 Y NA NA NA NA NA NA TCP11L2 53514 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 108054058 108054330 108054150 Y NA PWP1 NA NA NA NA PWP1 23179 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 108920909 108921183 108921031 Y NA FICD,SART3,ISCU NA NA NA NA FICD 13947 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 109036250 109036518 109036431 Y NA NA NA NA NA NA ISCU 81892 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 109061186 109061401 109061295 Y SELPLG,SELPLG,SSH1 NA NA NA NA NA CORO1C 61971 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 109249958 109250678 109250397 Y NA SSH1 NA NA NA NA SSH1 592 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 110260802 110261197 110261051 Y TRPV4,TRPV4,TRPV4 TRPV4 NA NA NA NA TRPV4 8015 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr12 110687741 110688014 110687886 Y TRPV4,ATP2A2 ATP2A2 ATP2A2,C12orf76,IFT81,ANAPC7,ANKRD13A,GIT2,ARPC3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ATP2A2 28547 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 110867136 110867499 110867318 Y NA ANAPC7,HMGA1P3,ARPC3,RPL31P49,GPN3 NA NA NA NA HMGA1P3 1049 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 111016111 111016444 111016311 Y PPTC7,ARPC3 PPTC7,TCTN1 NA NA NA NA PPTC7 2681 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 111019873 111020249 111019900 Y MYL2,ATP2A2,PPTC7 PPTC7,TCTN1 RAD9B IMR90 Hi-C 24141950 PPTC7 748 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 111881338 111881509 111881420 Y ALDH2,SH2B3 SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 39586 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 112341708 112342051 112341878 Y ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116 NA NA NA NA NA MAPKAPK5 63926 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr12 112529504 112529724 112529616 Y NA NAA25,TRAFD1 NA NA NA NA NAA25 15102 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 113574868 113575216 113574905 Y NA RASAL1,CCDC42B,DDX54 NA NA NA NA RASAL1 2824 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 113579863 113580302 113580091 Y OAS1,OAS3,OAS2,SLC24A6,SDSL,SDS,RASAL1,RASAL1 RASAL1,CCDC42B,DDX54 NA NA NA NA CCDC42B 5361 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 113580533 113580764 113580647 Y OAS1,OAS3,OAS2,SLC24A6,SDSL,SDS,RASAL1,RASAL1 RASAL1,CCDC42B,DDX54 NA NA NA NA CCDC42B 4899 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr12 113644189 113644365 113644286 Y NA DDX54,TPCN1 NA NA NA NA TPCN1 12490 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr12 113660919 113661318 113661188 Y TPCN1 DDX54,TPCN1 NA NA NA NA TPCN1 4064 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 116570796 116571229 116571121 Y MED13L,MAP1LC3B2 NA NA NA NA NA MED13L 141914 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 116958826 116959052 116958939 Y MED13L,MAP1LC3B2 NA LINC00173,MED13L,MIR4472-2 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf49 214823 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 116990477 116990812 116990735 Y MED13L,MAP1LC3B2 NA NA NA NA NA C12orf49 183063 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 117375665 117375672 117375669 Y NA FBXW8 NA NA NA NA FBXW8 28904 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 117480044 117480441 117480323 Y TESC NA NA NA NA NA TESC 54843 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 117488733 117488972 117488786 Y NA TESC NA NA NA NA TESC 46312 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 118466445 118466738 118466629 Y NA RFC5,WSB2 NA NA NA NA RFC5 17052 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 118815733 118815925 118815736 Y TAOK3 TAOK3,SUDS3 NA NA NA NA SUDS3 3548 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 120179533 120179605 120179597 Y NA NA NA NA NA NA PRKAB1 75975 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 120433844 120433899 120433873 Y CCDC64 NA NA NA NA NA RAB35 119407 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 120524802 120525368 120525019 Y CCDC64 RAB35 NA NA NA NA RAB35 27938 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 120906143 120906276 120906236 Y RAB35 COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1 NA NA NA NA DYNLL1 490 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 120956227 120956384 120956265 Y COQ5 RNF10,COQ5 NA NA NA NA RNF10 12899 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 121268399 121268878 121268839 Y NA NA NA NA NA NA SPPL3 71296 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 121402785 121402795 121402791 Y HNF1A HNF1A,HNF1A-AS1,C12orf43 NA NA NA NA HNF1A 11551 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr12 121714857 121715111 121714996 Y OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2 CAMKK2 NA NA NA NA CAMKK2 19000 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 121715307 121715461 121715407 Y OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2 CAMKK2 NA NA NA NA CAMKK2 18650 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 121838748 121839039 121838846 Y SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 2904 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr12 121951651 121951880 121951735 Y NA NA NA NA NA NA KDM2B 65040 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 122224293 122224471 122224351 Y CAMKK2,KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF RHOF,AC084018.1,SETD1B NA NA NA NA RHOF 14838 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 122229588 122230472 122229850 Y KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF RHOF,AC084018.1,SETD1B NA NA NA NA RHOF 8837 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 122462187 122462386 122462358 Y BCL7A BCL7A,AC156455.1 NA NA NA NA BCL7A 6859 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 122897459 122897572 122897541 Y NA CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 7607 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 123320749 123321200 123320858 Y NA HIP1R NA NA NA NA HIP1R 3749 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 123362987 123363145 123363088 Y NA HIP1R,VPS37B NA NA NA NA VPS37B 15846 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr12 123377732 123378127 123378026 Y NA VPS37B NA NA NA NA VPS37B 864 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 123930588 123930862 123930771 Y RILPL2 RILPL2,SNRNP35 SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SNRNP35 9326 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 124907545 124908050 124907792 Y NA NA NA NA NA NA NCOR2 142085 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 124991138 124991309 124991172 Y UBC,NCOR2 NA NA NA NA NA NCOR2 58826 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 125026162 125026505 125026332 Y NA NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 23630 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 125050856 125051375 125051213 Y UBC,NCOR2 NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 721 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.64326117641832 chr12 125110878 125111184 125111029 Y UBC,NCOR2 NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 NCOR2 60743 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr12 125117895 125118180 125118038 Y NA NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 NCOR2 67760 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 125185875 125186011 125185947 Y NA NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 NCOR2 135740 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 125225235 125225448 125225342 Y NCOR2,UBC NA NCOR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SCARB1 139766 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 125229298 125229517 125229417 Y NA NA NCOR2 IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 135697 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 125231951 125232267 125232149 Y UBC NA NCOR2 IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 132947 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 125347630 125347766 125347649 Y NA SCARB1 NA NA NA NA SCARB1 17448 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 125353523 125353887 125353860 Y NA SCARB1,UBC NA NA NA NA SCARB1 11327 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 125400956 125401141 125401046 Y UBC SCARB1,UBC NA NA NA NA UBC 1042 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 125412421 125412524 125412468 Y NA SCARB1,UBC NA NA NA NA UBC 12507 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 125423202 125423335 125423285 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 23288 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 125424077 125424667 125424516 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 24163 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.29113378147154 chr12 125550830 125551017 125550923 Y NA AACS NA NA NA NA AACS 2905 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 125577703 125578001 125577737 Y NA AACS NA NA NA NA AACS 29778 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr12 129336764 129337118 129336941 Y NA SLC15A4 NA NA NA NA SLC15A4 30236 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 132221686 132221872 132221813 Y NOC4L SFSWAP NA NA NA NA SFSWAP 28060 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 132232542 132232780 132232661 Y DDX51 SFSWAP NA NA NA NA SFSWAP 38916 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 132265042 132265050 132265046 Y NA MMP17 NA NA NA NA MMP17 45888 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr12 132293483 132293821 132293495 Y NA MMP17 NA NA NA NA MMP17 17117 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr12 133021534 133022956 133022670 Y POLE,DDX51,FBRSL1 FBRSL1 LOC100507055,FBRSL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FBRSL1 41181 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr13 20137811 20138146 20137910 Y NA NA NA NA NA NA MPHOSPH8 67642 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 20419964 20420131 20420036 Y PSPC1,ZMYM5 ZMYM5 NA NA NA NA ZMYM5 15645 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 20692936 20693199 20693068 Y CRYL1 NA NA NA NA NA GJB2 71838 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 20693405 20693544 20693484 Y CRYL1 NA NA NA NA NA GJB2 71493 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 20694627 20695029 20694906 Y PSPC1,ZMYM5 NA NA NA NA NA GJB2 70008 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 21748962 21749145 21749040 Y NA SAP18,SKA3,MRP63 NA NA NA NA MRP63 178 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 22135396 22135683 22135678 Y EFHA1 NA NA NA NA NA RPS7P10 65471 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 24133122 24133556 24133337 Y NA TNFRSF19 MIPEP,TNFRSF19 IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF19 8953 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 24289001 24289462 24289192 Y PCOTH NA NA NA NA NA TNFRSF19 146492 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 22.0666500833317 chr13 24290088 24290194 24290124 Y NA NA NA NA NA NA TNFRSF19 147579 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr13 24528296 24528692 24528455 Y PCOTH NA SPATA13,TNFRSF19 IMR90 Hi-C 24141950 MIPEP 66738 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr13 24697003 24697328 24697264 Y NA NA SPATA13 IMR90 Hi-C 24141950 MIPEP 235445 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 27843033 27843378 27843206 Y NA RPL21,SNORD102,RASL11A NA NA NA NA RASL11A 569 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 28006253 28006341 28006297 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA GTF3A 9572 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 28025291 28025563 28025486 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA MTIF3 2552 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr13 30969684 30969817 30969776 Y USPL1 LINC01058 LINC00426,KATNAL1,USPL1,UBL3,HMGB1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01058 24557 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 34731212 34731445 34731362 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 341026 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr13 35322323 35322497 35322408 Y NBEA NA NA NA NA NA NBEA 191927 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr13 35887010 35887329 35887304 Y NA NA NA NA NA NA MAB21L1 161503 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 36630888 36631287 36631099 Y DCLK1 NA NA NA NA NA MAB21L1 582056 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 40677084 40677323 40677230 Y NA NA NA NA NA NA COG6 449320 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr13 40690248 40690533 40690364 Y NA NA FOXO1 IMR90 Hi-C 24141950 COG6 462484 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 41589057 41589218 41589148 Y NA WBP4,ELF1 NA NA NA NA WBP4 44192 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 42855017 42855240 42855076 Y AKAP11 AKAP11 NA NA NA NA AKAP11 10728 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 43099384 43099709 43099478 Y DGKH,AKAP11,TNFSF11,TNFSF11 NA ENOX1 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP11 255095 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 43451555 43451845 43451701 Y NA NA NA NA NA NA EPSTI1 112562 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr13 43632661 43632965 43632672 Y NA DNAJC15 NA NA NA NA DNAJC15 37322 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr13 44542732 44543742 44543446 Y SERP2 NA SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC122 90905 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr13 44620658 44620684 44620670 Y ENOX1 NA NA NA NA NA CCDC122 168831 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 44848357 44848873 44848719 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA SERP2,NUFIP1,TSC22D1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 300410 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 44880536 44881091 44880742 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA TSC22D1,LACC1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 268192 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr13 44882133 44882330 44882202 Y NA NA TSC22D1,LACC1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 266953 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr13 45338378 45338728 45338554 Y NA NA TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1,LINC00330 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 189095 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 45752820 45753055 45752934 Y NA NA NA NA NA NA GTF2F2 60170 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 46095529 46095772 46095647 Y TPT1 NA NA NA NA NA COG3 58469 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 46102041 46102392 46102214 Y NA NA NA NA NA NA COG3 64981 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 47128564 47128952 47128887 Y LCP1,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 3261 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr13 48526121 48526135 48526130 Y MED4,SUCLA2 NA NA NA NA NA NUDT15 83568 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 48730170 48730306 48730224 Y RCBTB2,RB1,LPAR6,ITM2B,MED4 POLR2KP2 NA NA NA NA POLR2KP2 23500 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 50602874 50603059 50603020 Y NA TRIM13,MIR3613 NA NA NA NA MIR3613 34237 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 50630657 50630910 50630784 Y NA DLEU1 NA NA NA NA DLEU1 23397 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 50661413 50661685 50661628 Y NA DLEU1,DLEU2 NA NA NA NA DLEU1 7106 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 50675373 50675756 50675618 Y NA DLEU1,DLEU2 NA NA NA NA DLEU1 21066 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 51168515 51168827 51168588 Y RNASEH2B NA DLEU2,DLEU1,DLEU7 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 234616 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 51200392 51200766 51200454 Y NA NA NA NA NA NA RPL34P26 266493 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 51288107 51288409 51288197 Y NA NA NA NA NA NA RNASEH2B 193405 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 51641920 51642198 51642053 Y INTS6 NA NA NA NA NA FAM124A 152305 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 52319871 52320068 52319946 Y NA NA NA NA NA NA DHRS12 56225 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 52769647 52769861 52769811 Y NA NEK3 NA NA NA NA NEK3 37651 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 59854407 59854488 59854447 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 881633 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 60679231 60679569 60679243 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 56552 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 64491531 64491783 64491579 Y NA NA NA NA NA NA TDRD3 3522940 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 72419778 72420070 72419973 Y DACH1 DACH1 NA NA NA NA DACH1 19260 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 73768530 73768732 73768575 Y NA NA NA NA NA NA FABP5P1 95407 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.40850957978713 chr13 73942793 73943059 73942972 Y KLF5 NA NA NA NA NA FABP5P1 269670 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 73985614 73985783 73985667 Y NA NA NA NA NA NA FABP5P1 312491 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 9.85956705850993 chr13 74002389 74002533 74002463 Y KLF5 NA KLF5,PIBF1,KLF12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FABP5P1 329266 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr13 74184794 74185193 74184838 Y NA NA PIBF1 IMR90 Hi-C 24141950 FABP5P1 511671 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr13 74708897 74709334 74709161 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 2503 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 74709487 74710034 74709735 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 3093 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr13 74864558 74864878 74864747 Y KLF12 NA KLF12 IMR90 Hi-C 24141950 KLF12 158164 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr13 75966064 75966537 75966363 Y TBC1D4 NA NA NA NA NA TBC1D4 87713 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 76279211 76279429 76279239 Y NA NA NA NA NA NA LMO7 86641 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr13 77453598 77454010 77453765 Y FBXL3,KCTD12 KCTD12 NA NA NA NA KCTD12 4530 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 79232403 79232753 79232546 Y NA RNF219 NA NA NA NA RNF219 1089 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 80916096 80916414 80916232 Y NA SPRY2 NA NA NA NA SPRY2 3010 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr13 91807857 91808125 91807991 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 189949 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 95620867 95621252 95621220 Y NA NA CLDN10 IMR90 Hi-C 24141950 ABCC4 330435 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 95938060 95938332 95938319 Y NA ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 13355 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 99223213 99223429 99223417 Y STK24 STK24 NA NA NA NA STK24 4765 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 99302784 99302934 99302858 Y SLC15A1 CALM2P4 FARP1,STK24,SLC15A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALM2P4 11291 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr13 99957911 99958107 99958020 Y DOCK9,CLYBL,GPR18,GPR183 NA NA NA NA NA UBAC2 106883 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 99991522 99991909 99991574 Y NA NA NA NA NA NA UBAC2 140494 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr13 100928465 100928851 100928516 Y NA NA NA NA NA NA RPL15P18 127119 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 105315212 105315547 105315380 Y NA NA NA NA NA NA ERCC5 1820018 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 108153519 108153767 108153691 Y NA NA NA NA NA NA FAM155A 363316 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr13 108520131 108520835 108520801 Y LIG4,FAM155A FAM155A NA NA NA NA FAM155A 3048 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 3.16914655452105 chr13 108520964 108521235 108521194 Y LIG4,FAM155A FAM155A NA NA NA NA FAM155A 3881 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr13 109568044 109568430 109568179 Y NA NA NA NA NA NA ABHD13 699317 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 111544033 111544176 111544105 Y ING1,ING1 LINC00346,ANKRD10 NA NA NA NA ANKRD10 21240 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr13 111560939 111561133 111561094 Y NA LINC00346,ANKRD10 NA NA NA NA ANKRD10 4283 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr13 111589420 111590157 111589779 Y NA ANKRD10 ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 24004 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr13 111623981 111624100 111624039 Y ING1,C13orf16 NA ARHGEF7 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 58565 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 111719893 111720066 111720029 Y NA ARHGEF7 ANKRD10,ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF7 44840 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr13 113650051 113650400 113650313 Y MCF2L MCF2L-AS1 NA NA NA NA MCF2L-AS1 28913 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr13 113677034 113677374 113677296 Y NA NA NA NA NA NA MCF2L-AS1 55896 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr13 113806516 113806910 113806731 Y ATP11A,CUL4A F7,F10 PROZ IMR90 Hi-C 24141950 F10 31388 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr13 113828673 113828834 113828768 Y ATP11A,DCUN1D2,CUL4A CUL4A,PCID2 NA NA NA NA CUL4A 31718 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 113870568 113870732 113870682 Y MCF2L,DCUN1D2,ADPRHL1,F10 CUL4A,PCID2 NA NA NA NA PCID2 9539 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 113982391 113982456 113982424 Y NA LAMP1,GRTP1 NA NA NA NA LAMP1 32835 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 114147699 114148153 114147800 Y F7,F10,PROZ,GRTP1 DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA TMCO3 4389 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr13 114556439 114556767 114556713 Y NA GAS6 NA NA NA NA GAS6 8279 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr13 114740287 114740680 114740494 Y NA NA NA NA NA NA RASA3 155406 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 3.05177075620545 chr13 114770181 114770639 114770503 Y NA NA NA NA NA NA RASA3 125447 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 3.87340134441461 chr13 114830489 114831626 114831334 Y RASA3 NA NA NA NA NA RASA3 64460 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr14 21135159 21135539 21135349 Y RNASE4,ANG RNASE4,ANG NA NA NA NA RNASE4 14720 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 21150605 21151121 21150987 Y TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40 RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 269 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 21151333 21151694 21151411 Y NA RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 997 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 21288613 21288985 21288797 Y NA RNASE1 NA NA NA NA RNASE1 19176 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 21684818 21685080 21685024 Y OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1 NA NA NA NA NA HNRNPC 50573 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 22025629 22026018 22025838 Y NA METTL3 NA NA NA NA METTL3 48112 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 23358205 23358555 23358381 Y NA LRP10,RBM23,PRMT5,RP11-298I3.1 NA NA NA NA LRP10 19383 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 24861663 24861718 24861669 Y IPO4,RABGGTA,RABGGTA NYNRIN,KHNYN,SDR39U1 NA NA NA NA NYNRIN 4274 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr14 24891908 24892270 24892086 Y NA NYNRIN,KHNYN,SDR39U1 NA NA NA NA KHNYN 4222 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr14 25476676 25476861 25476696 Y NA STXBP6 NA NA NA NA STXBP6 40642 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 31360303 31360625 31360494 Y NA COCH NA NA NA NA COCH 18583 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 31698850 31699225 31699035 Y STRN3 HECTD1 AP4S1,HECTD1,STRN3,HEATR5A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HECTD1 23840 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr14 32261719 32262250 32261957 Y NA NA NA NA NA NA RP11-187E13.1 149809 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 32672212 32672871 32672506 Y ARHGAP5 NA NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP5-AS1 128213 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr14 32953597 32954289 32954012 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 1591 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr14 34162040 34162301 34162172 Y NA NA NA NA NA NA SPTSSA 767261 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 34479811 34480147 34480032 Y NA NA NA NA NA NA SPTSSA 449415 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 34529400 34529785 34529476 Y EGLN3 NA EGLN3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 399777 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 35628271 35628433 35628369 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA KIAA0391 38516 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr14 35810635 35811251 35810911 Y BAZ1A,FAM177A1,RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1 PPP2R3C,KIAA0391,PSMA6,NFKBIA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-561B11.1 45024 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 38052956 38053419 38053189 Y FOXA1 RP11-356O9.2,TTC6,FOXA1 NA NA NA NA TTC6 9633 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr14 38067310 38067714 38067659 Y NA RP11-356O9.2,TTC6,FOXA1 NA NA NA NA FOXA1 65 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.52588537810273 chr14 38188537 38188545 38188541 Y NA NA NA NA NA NA FOXA1 121292 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 39559553 39559840 39559693 Y NA SEC23A,GEMIN2 NA NA NA NA SEC23A 17010 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 40668245 40668567 40668390 Y NA NA NA NA NA NA FBXO33 768541 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 43816626 43817007 43816818 Y NA NA NA NA NA NA C14orf28 1547491 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr14 49375724 49376075 49375898 Y NA NA NA NA NA NA RPS29 687333 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 50016855 50017158 50017090 Y NA RPS29,LRR1 NA NA NA NA RPS29 46250 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 50328432 50328642 50328440 Y METTL21D,ARF6,RPL36AL,DNAAF2 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 10511 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr14 50334846 50335244 50334992 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 16925 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr14 50378479 50378620 50378548 Y RPL36AL,MGAT2,C14orf182,SOS2,ARF6 ARF6 NA NA NA NA ARF6 20669 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 50465888 50466432 50466066 Y NA NA NA NA NA NA ARF6 108078 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 50467375 50468846 50468075 Y RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D NA NA NA NA NA ARF6 109565 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 2.93439495788986 chr14 50648447 50648735 50648723 Y NA SOS2 NA NA NA NA SOS2 47541 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 50681069 50681448 50681362 Y NA SOS2 NA NA NA NA SOS2 14828 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 50799629 50799645 50799635 Y NA ATP5S,L2HGDH NA NA NA NA L2HGDH 22363 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 52584121 52584359 52584179 Y NA NA NID2,C14orf166 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf166 129928 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr14 52791842 52792196 52791956 Y GNG2,PTGER2 PTGER2 NA NA NA NA PTGER2 12819 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 54075172 54075431 54075302 Y NA NA NA NA NA NA BMP4 348048 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 54443717 54444101 54443910 Y NA BMP4 NA NA NA NA BMP4 20238 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 54581430 54581538 54581471 Y NA NA NA NA NA NA BMP4 157951 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr14 54833964 54834357 54834051 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 27210 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr14 55544097 55544118 55544108 Y NA MAPK1IP1L,LGALS3 NA NA NA NA MAPK1IP1L 27748 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 55544307 55544654 55544518 Y NA MAPK1IP1L,LGALS3 NA NA NA NA MAPK1IP1L 27958 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr14 55565052 55565329 55565247 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L MAPK1IP1L,LGALS3 LGALS3,DLGAP5 IMR90 Hi-C 24141950 LGALS3 23499 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 55569733 55570176 55570087 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 18652 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 2.23014016799629 chr14 56845316 56845513 56845413 Y PELI2 NA PELI2,RPL13AP3 IMR90 Hi-C 24141950 PELI2 262784 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 57725803 57726155 57725979 Y NA EXOC5 NA NA NA NA EXOC5 7571 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 58766869 58767218 58767044 Y ARID4A RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A NA NA NA NA ARID4A 3766 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 60074995 60075284 60075140 Y NA NA NA NA NA NA JKAMP 125834 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 60679186 60679974 60679676 Y NA DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2 NA NA NA NA PPM1A 30496 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr14 61822624 61823005 61822699 Y PRKCH NA NA NA NA NA TMEM30B 76066 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 62026213 62026731 62026533 Y NA NA NA NA NA NA HIF1A 133500 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 63829601 63829975 63829789 Y WDR89,PPP2R5E,KCNH5,GPHB5 GPHB5 NA NA NA NA GPHB5 46008 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 64109095 64109326 64109156 Y SYNE2,WDR89,WDR89 HSPE1P2,WDR89 NA NA NA NA WDR89 2516 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 64320785 64320937 64320842 Y PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2 SYNE2 NA NA NA NA SYNE2 3102 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr14 64324216 64324732 64324422 Y PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2 SYNE2 NA NA NA NA SYNE2 6533 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 64670198 64670275 64670237 Y NA NA NA NA NA NA RP11-544I20.2 133042 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 64705009 64705329 64705170 Y PLEKHG3,SYNE2 NA NA NA NA NA RP11-544I20.2 97988 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr14 64968114 64968655 64968380 Y ZBTB25,ZBTB1 AKAP5,ZBTB25,HSPA2,PPP1R36 NA NA NA NA ZBTB1 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr14 64975156 64975343 64975202 Y NA AKAP5,ZBTB1,ZBTB25,HSPA2,PPP1R36 NA NA NA NA ZBTB25 5225 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 65169606 65170310 65170032 Y NA PLEKHG3 NA NA NA NA PLEKHG3 786 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 65231601 65231863 65231701 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHG3 62781 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 66516389 66516661 66516525 Y NA NA NA NA NA NA GPHN 455464 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 67478288 67478352 67478320 Y NA NA NA NA NA NA MPP5 227474 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 67751261 67751573 67751281 Y RDH12,PLEKHH1,PIGH MPP5 NA NA NA NA MPP5 45435 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 67809024 67809296 67809169 Y RDH12,MPP5,PLEKHH1 EIF2S1,ATP6V1D NA NA NA NA EIF2S1 15418 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 68161499 68161767 68161616 Y PLEK2 VTI1B,RDH11,RDH12 NA NA NA NA RDH11 968 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr14 68456427 68456429 68456428 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 171931 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 68555905 68556402 68556038 Y PIGH NA NA NA NA NA RAD51B 271409 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 69169939 69170184 69170014 Y NA NA ZFP36L1,RAD51B IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L1 91006 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 69404659 69405002 69404945 Y NA ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 39155 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr14 69512620 69512951 69512699 Y NA NA NA NA NA NA ACTN1 68463 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 69618210 69618757 69618360 Y NA DCAF5,EXD2 NA NA NA NA DCAF5 343 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 70251267 70251371 70251319 Y SLC10A1 NA NA NA NA NA SRSF5 59650 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 71164534 71164679 71164625 Y MED6 RP6-65G23.1 NA NA NA NA RP6-65G23.1 1119 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 71996595 71997083 71996703 Y NA NA NA NA NA NA RP1-261D10.2 210064 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 74207610 74207866 74207660 Y C14orf43 PNMA1 NA NA NA NA PNMA1 28482 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr14 74220862 74221204 74221002 Y NUMB,ZNF410,C14orf43,C14orf43 PNMA1 NA NA NA NA PNMA1 41734 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 74224982 74225468 74225101 Y NA PNMA1 NA NA NA NA PNMA1 45854 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 75491919 75492089 75492033 Y NA EIF2B2,MLH3,ACYP1 NA NA NA NA MLH3 24146 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr14 75761897 75762132 75762064 Y FOS,JDP2,JDP2,JDP2,FLVCR2,FLVCR2 RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5 NA NA NA NA RP11-293M10.5 2790 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr14 75768536 75769006 75768683 Y NA RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5 NA NA NA NA RP11-293M10.5 9429 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 76395057 76395394 76395222 Y ESRRB,TGFB3 IFT43 NA NA NA NA IFT43 28578 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 77499482 77500543 77500476 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL IRF2BPL KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 6448 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr14 77517690 77517970 77517808 Y NA IRF2BPL C14orf166B,IRF2BPL,KIAA1737 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2BPL 24656 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 77591216 77591790 77591612 Y TMED8,NGB NA NA NA NA NA IRF2BPL 98182 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 77639599 77639692 77639653 Y NA NA C14orf166B,ZDHHC22,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,TMEM63C,NGB,MIR1260A,TMED8 IMR90 Hi-C 24141950 GSTZ1,POMT2 145535 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 DYNLL1P1 NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.40850957978713 chr14 89671493 89671906 89671673 Y NA NA NA NA NA NA TTC8 382996 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 89680457 89680908 89680785 Y FOXN3 NA NA NA NA NA TTC8 391960 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 90975200 90975474 90975336 Y NA NA LOC400238,CALM1,C14orf102,TTC7B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CALM1 114354 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 91734470 91734656 91734563 Y NA NA GPR68 K562 ChIA-PET 22265404 CCDC88C 147532 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 91863961 91864070 91864025 Y C14orf159,CCDC88C CCDC88C NA NA NA NA CCDC88C 18118 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 91926776 91927002 91926960 Y NA CCDC88C,SMEK1 NA NA NA NA CCDC88C 44588 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 92997430 92998230 92997929 Y ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 NA NA NA NA NA LGMN 214817 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 93509801 93510236 93510094 Y NA NA NA NA NA NA ITPK1 70429 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr14 93510584 93510744 93510686 Y NA NA NA NA NA NA ITPK1 69921 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr14 93511721 93512085 93511905 Y NA NA NA NA NA NA ITPK1 68580 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr14 94808145 94809286 94808819 Y SERPINA1 SERPINA6,SERPINA1 NA NA NA NA SERPINA6 20414 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 94840163 94840451 94840311 Y SERPINA1 SERPINA1 NA NA NA NA SERPINA1 14579 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 95731733 95732288 95732036 Y DICER1,CLMN NA NA NA NA NA CLMN 51955 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr14 95734707 95735043 95734878 Y NA CLMN NA NA NA NA CLMN 49200 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 95947097 95947214 95947185 Y NA NA NA NA NA NA GLRX5 50626 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 99439262 99439638 99439565 Y NA NA NA NA NA NA BCL11B 296223 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 99735950 99736476 99736276 Y BCL11B BCL11B NA NA NA NA BCL11B 89 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr14 100068632 100068970 100068687 Y NA CCDC85C,HHIPL1 NA NA NA NA RP11-543C4.1 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 100071651 100072022 100071781 Y NA CCDC85C,RP11-543C4.1,HHIPL1 NA NA NA NA RP11-543C4.1 2758 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 100659173 100659604 100659490 Y NA DEGS2,YY1,RP11-638I2.4 DEGS2,YY1,EVL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DEGS2 34673 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 101159258 101159870 101159708 Y NA NA NA NA NA NA WARS 318116 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 101370822 101370975 101370899 Y BEGAIN,RTL1 NA NA NA NA NA WARS 529680 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr14 101539526 101539734 101539702 Y NA NA NA NA NA NA RP11-1029J19.5 655711 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr14 102554875 102555215 102555129 Y HSP90AA1 WDR20,HSP90AA1 NA NA NA NA WDR20 48625 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 102991046 102991386 102991124 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 16910 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr14 103537585 103537989 103537775 Y NA CDC42BPB,RP11-736N17.8,TNFAIP2 CDC42BPB,EIF5 MCF7 ChIA-PET 22265404 CDC42BPB 15786 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr14 103539359 103539722 103539623 Y NA CDC42BPB,RP11-736N17.8,TNFAIP2 CDC42BPB,EIF5 MCF7 ChIA-PET 22265404 CDC42BPB 17560 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr14 103541337 103541574 103541446 Y NA CDC42BPB,RP11-736N17.8,TNFAIP2 CDC42BPB,EIF5 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-736N17.8 17486 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr14 103673427 103673966 103673589 Y CDC42BPB NA LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP2 85648 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 104583053 104583460 104583371 Y NA MIR203 NA NA NA NA MIR203 1311 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 5.86878991577972 chr14 105132512 105132664 105132612 Y TMEM179,INF2 RP11-982M15.6,INF2 NA NA NA NA RP11-982M15.6 12819 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 105143455 105143754 105143546 Y GPR132 RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1 NA NA NA NA RP11-982M15.6 1729 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 105144100 105144955 105144117 Y GPR132,AKT1 RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1 NA NA NA NA RP11-982M15.6 528 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr14 105148231 105148612 105148591 Y INF2 RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1 NA NA NA NA RP11-982M15.6 2748 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 105154013 105154712 105154273 Y ADSSL1 RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1 NA NA NA NA INF2 70 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr14 105327046 105327788 105327205 Y NA NA NA NA NA NA AKT1 66958 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 105368048 105368162 105368106 Y NA NA NA NA NA NA C14orf79 81950 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 105438668 105438757 105438725 Y KIAA0284,JAG2,CDCA4,C14orf79,AHNAK2 C14orf79,CDCA4 NA NA NA NA C14orf79 11355 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr14 105439556 105439771 105439692 Y INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2 C14orf79,CDCA4 PLD4 MCF7 ChIA-PET 22265404 C14orf79 10341 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr14 105500263 105500628 105500453 Y NA CDCA4 NA NA NA NA CDCA4 14778 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr14 105557924 105558306 105558075 Y NA NA BTBD6,BRF1,JAG2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDCA4 72439 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr14 105631701 105632085 105631796 Y NA JAG2,NUDT14 NA NA NA NA JAG2 1076 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr14 105947921 105948133 105948082 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80 NA NA NA NA CRIP1 3403 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr14 105948139 105949025 105948432 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80 NA NA NA NA CRIP1 2511 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 2.23014016799629 chr14 107252931 107253417 107253022 Y NA NA NA NA NA NA C14orf80 1298739 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 22938552 22938923 22938737 Y CYFIP1 CYFIP1 NIPA2 IMR90 Hi-C 24141950 CYFIP1 48547 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 25565589 25566847 25566046 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 115281 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 25586903 25587047 25586976 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 95081 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 25614491 25614606 25614563 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 67522 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 26864879 26864942 26864916 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 1182751 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 31372759 31373034 31372889 Y MTMR10 NA NA NA NA NA MTMR10 90949 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr15 31627410 31627711 31627458 Y NA KLF13 NA NA NA NA KLF13 10352 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 31689645 31689781 31689725 Y MTMR10,KLF13 NA NA NA NA NA KLF13 72587 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 32384266 32384605 32384436 Y CHRNA7 NA NA NA NA NA CHRNA7 63575 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 35599049 35599138 35599102 Y NA NA ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 320561 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 38546643 38547172 38546943 Y NA SPRED1 NA NA NA NA SPRED1 4116 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr15 38751078 38751316 38751209 Y NA FAM98B NA NA NA NA FAM98B 6750 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 38820654 38820765 38820702 Y NA RASGRP1 NA NA NA NA RASGRP1 35011 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 41138213 41138409 41138269 Y RHOV,SPINT1,SPINT1 ZFYVE19,DNAJC17,PPP1R14D,SPINT1,RHOV,VPS18 NA NA NA NA SPINT1 3997 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr15 41158071 41158384 41158228 Y RHOV PPP1R14D,SPINT1,RHOV,VPS18 NA NA NA NA RHOV 6103 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 41199675 41199878 41199759 Y DLL4 RHOV,VPS18,CHAC1 DLL4 IMR90 Hi-C 24141950 VPS18 15047 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 41220555 41220912 41220794 Y NUSAP1,DLL4 VPS18,CHAC1 NA NA NA NA CHAC1 22248 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr15 41953918 41954236 41954127 Y EHD4,MGA MGA MAPKBP1 IMR90 Hi-C 24141950 MGA 42496 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr15 42228791 42229215 42228969 Y MGA,JMJD7,TMEM87A,EHD4 SPTBN5,EHD4 NA NA NA NA EHD4 33561 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 43415014 43415563 43415337 Y NA UBR1,RPS3AP47,TMEM62 NA NA NA NA TMEM62 1537 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr15 44838663 44839045 44838853 Y NA EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 11408 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 49939997 49940334 49940166 Y NA DTWD1 NA NA NA NA DTWD1 28820 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 51369445 51369616 51369500 Y TRPM7,SPPL2A TNFAIP8L3 NA NA NA NA TNFAIP8L3 25857 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 51369900 51370046 51369953 Y NA TNFAIP8L3 NA NA NA NA TNFAIP8L3 25427 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 51413367 51413627 51413497 Y NA TNFAIP8L3 TNFAIP8L3,AP4E1,GLDN IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP8L3 17894 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 52135746 52136104 52135949 Y DMXL2,MAPK6,TMOD3 TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 15921 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 52153526 52153874 52153708 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 33701 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr15 52235970 52236006 52235989 Y DMXL2,MAPK6 MAPK6,LEO1 NA NA NA NA MAPK6 6297 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 52526918 52527038 52526972 Y KIAA1370,GNB5 GNB5 NA NA NA NA GNB5 45352 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 52545063 52545254 52545150 Y MAPK6 MYO5C NA NA NA NA MYO5C 40741 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 52580530 52580869 52580787 Y ARPP19,MYO5C MYO5C NA NA NA NA MYO5C 5126 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 52581885 52582216 52582049 Y NA MYO5C NA NA NA NA MYO5C 3779 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr15 52851602 52851989 52851853 Y NA ARPP19 NA NA NA NA ARPP19 8091 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 56162319 56162688 56162565 Y NA NA NA NA NA NA NEDD4 121256 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 56332751 56332969 56332911 Y NA NEDD4 NEDD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD4 48807 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 57465140 57465369 57465208 Y ZNF280D,TCF12 NA LOC283663 IMR90 Hi-C 24141950 CGNL1 200796 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 57798359 57798473 57798399 Y NA NA NA NA NA NA GCOM1 83633 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 58732356 58732646 58732550 Y NA NA NA NA NA NA ADAM10 307531 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 58733027 58733372 58733200 Y NA NA NA NA NA NA ADAM10 306805 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 58884938 58885321 58885256 Y NA NA NA NA NA NA ADAM10 154856 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 59158498 59158653 59158597 Y ADAM10,RNF111,SLTM ZNF444P1,RNF111 NA NA NA NA RNF111 3124 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr15 59576201 59576407 59576333 Y GCNT3,MYO1E NA NA NA NA NA FAM81A 86485 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr15 59649595 59649770 59649683 Y NA FAM81A,MYO1E,RP11-356M20.1 NA NA NA NA FAM81A 13122 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 59978652 59978797 59978720 Y BNIP2 GTF2A2,BNIP2 NA NA NA NA RP11-361D15.2 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 60700608 60701055 60700809 Y NA ANXA2,RP11-745A24.2 NA NA NA NA RP11-745A24.2 5946 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr15 61113423 61113507 61113465 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 344046 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 62215780 62216024 62215899 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 134648 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 63786470 63786486 63786478 Y RAB8B,USP3 USP3 APH1B,RAB8B,CA12,USP3,LOC100130855,FBXL22 IMR90 Hi-C 24141950 USP3 8307 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 63795379 63795825 63795543 Y NA USP3 NA NA NA NA USP3 586 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.64326117641832 chr15 64385169 64385477 64385384 Y NA DAPK2,FAM96A,SNX1 NA NA NA NA SNX1 847 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr15 64601637 64601745 64601727 Y NA CSNK1G1 NA NA NA NA CSNK1G1 44697 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr15 64919514 64919887 64919625 Y NA RP11-330L19.1 NA NA NA NA RP11-330L19.1 36336 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr15 65596702 65597188 65596889 Y DENND4A RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5746 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 66112118 66112295 66112211 Y DENND4A DENND4A SLC24A1,DENND4A,PTPLAD1,C15orf44,RAB11A,MEGF11 IMR90 Hi-C 24141950 DENND4A 29487 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 66162838 66163256 66163114 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80207 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr15 66163349 66163534 66163463 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80718 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 66177095 66177419 66177152 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 94464 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 66993287 66993569 66993487 Y MAP2K1,SMAD6 SMAD6 NA NA NA NA SMAD6 721 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 67134448 67134928 67134631 Y NA NA SMAD6,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 141882 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 67359902 67360303 67360058 Y NA RP11-798K3.2,SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 5801 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr15 67399103 67399775 67399548 Y SMAD3 RP11-798K3.2,SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 45002 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 67467751 67468085 67467918 Y NA NA NA NA NA NA IQCH 77053 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 67490281 67490446 67490307 Y SMAD3 NA NA NA NA NA IQCH 54692 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 68132387 68132778 68132514 Y PIAS1 NA NA NA NA NA PIAS1 211739 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 68176779 68177152 68176934 Y NA NA PIAS1,CLN6,C15orf61,LOC100506686,CALML4 IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 167365 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 70391851 70392235 70392005 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3336 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr15 70679327 70679587 70679457 Y NA NA NA NA NA NA TLE3 290812 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 71371688 71372044 71371801 Y THSD4 NA LRRC49,THSD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THAP10 188564 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 71385768 71386181 71385996 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 202644 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 72671459 72671771 72671611 Y PARP6,ARIH1,HEXA HEXA,RP11-106M3.1 NA NA NA NA RP11-106M3.1 1408 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 73448773 73449049 73448902 Y NA NA NA NA NA NA NEO1 106722 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 74289381 74289564 74289454 Y PML STOML1,PML NA NA NA NA PML 4367 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr15 74343707 74344076 74343754 Y NA NA NA NA NA NA PML 58693 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 74412993 74413248 74413104 Y STRA6,CCDC33,C15orf59,TBC1D21 NA NA NA NA NA PML 127979 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 74908840 74909023 74908946 Y NA CLK3 NA NA NA NA CLK3 19999 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr15 75250602 75250974 75250783 Y RPP25 COX5A,SCAMP5,RPP25 NA NA NA NA RPP25 2797 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr15 75742568 75742962 75742713 Y NA SIN3A NA NA NA NA SIN3A 3221 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 75746315 75746749 75746512 Y PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 132 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 75747348 75747533 75747407 Y RPP25,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1165 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 75820261 75820616 75820439 Y NA PTPN9 NA NA NA NA PTPN9 49014 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 75959061 75959441 75959310 Y SNX33 SNUPN,SNX33,IMP3,CSPG4 NA NA NA NA IMP3 20014 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr15 76050803 76051078 76050853 Y NA CSPG4,ODF3L1,DNM1P35 NA NA NA NA DNM1P35 21839 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 76639120 76639380 76639270 Y NA ETFA,ISL2 NA NA NA NA ISL2 12055 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr15 78667581 78667654 78667595 Y NA NA CRABP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IREB2 60119 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr15 79216586 79216987 79216944 Y RASGRF1 CTSH NA NA NA NA CTSH 22929 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 79234527 79234916 79234688 Y CTSH CTSH NA NA NA NA CTSH 5000 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 81277111 81277444 81277389 Y STARD5,MESDC1 MESDC2,MESDC1 NA NA NA NA MESDC2 2775 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 81291796 81292315 81292076 Y NA MESDC2,MESDC1 NA NA NA NA MESDC1 501 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 82339167 82339811 82339478 Y MEX3B MEX3B NA NA NA NA MEX3B 2685 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 83680959 83681167 83681099 Y NA HOMER2,FAM103A1,C15orf40 NA NA NA NA C15orf40 2566 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 83778085 83778410 83778297 Y NA BTBD1 NA NA NA NA BTBD1 43979 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 85290443 85290837 85290532 Y PDE8A,ZNF592 SEC11A,ZNF592 NA NA NA NA ZNF592 577 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 85455479 85455863 85455740 Y SLC28A1 NA NA NA NA NA PDE8A 65808 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 85956762 85957097 85956878 Y AKAP13,PDE8A AKAP13 NA NA NA NA AKAP13 34960 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr15 86165783 86166027 86165915 Y NA RP11-815J21.2 NA NA NA NA RP11-815J21.2 44374 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 86192682 86192944 86192801 Y NA NA NA NA NA NA RP11-815J21.2 71273 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 86211201 86211615 86211423 Y AKAP13,KLHL25 NA NA NA NA NA RP11-815J21.2 89792 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr15 89187882 89188205 89187952 Y NA AEN,ISG20 NA NA NA NA ISG20 10498 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 89664635 89664981 89664666 Y NA ABHD2,HMGB1P8 NA NA NA NA HMGB1P8 12745 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr15 89672226 89672631 89672291 Y ABHD2 ABHD2,HMGB1P8 NA NA NA NA HMGB1P8 5095 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr15 90005846 90006063 90005954 Y NA NA NA NA NA NA POLG 129754 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 90017364 90017928 90017702 Y MESP1,C15orf42 NA NA NA NA NA POLG 141272 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 90365179 90365539 90365285 Y POLG,ZNF710,SEMA4B,CIB1,ANPEP,AP3S2 NA NA NA NA NA AP3S2 70035 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 90456787 90457058 90456927 Y NA AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38 NA NA NA NA C15orf38 2599 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr15 90578762 90579351 90578884 Y ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1 NA NA NA NA NA IDH2 64385 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 90606841 90607396 90607176 Y ANPEP,AP3S2,ZNF710,IQGAP1,CIB1 IDH2 NA NA NA NA IDH2 36340 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 90754464 90755447 90755260 Y SEMA4B,SEMA4B,CIB1 CIB1 NA NA NA NA CIB1 19832 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr15 91190174 91190180 91190177 Y NA NA NA NA NA NA RP11-387D10.2 68192 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 91191799 91192162 91191976 Y UNC45A,FES,FES,FES,C15orf58,IQGAP1 NA NA NA NA NA RP11-387D10.2 66210 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 92612839 92613223 92613006 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA NPM1P5 213848 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 93344993 93345488 93345070 Y CHD2 ASB9P1,FAM174B NA NA NA NA FAM174B 5626 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 93363497 93364154 93363735 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 ASB9P1,FAM174B ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 FAM174B 12383 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 93374780 93375598 93375185 Y NA ASB9P1,FAM174B,CHD2 CHD2,LOC100507217,ASB9P1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM174B 23666 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 96900508 96900866 96900583 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1 NA NA NA NA NR2F2-AS1 31918 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 99193577 99194531 99194069 Y IGF1R IGF1R NA NA NA NA IGF1R 3377 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr15 99342514 99342944 99342658 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 152314 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr15 99358585 99358846 99358731 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 168385 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr15 99387029 99387216 99387183 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 196829 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 99416036 99416369 99416103 Y IGF1R NA NA NA NA NA IGF1R 225836 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 99444571 99445210 99444854 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 254371 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 99499686 99499980 99499831 Y NA NA NA NA NA NA TTC23 289448 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 100014381 100014718 100014638 Y MEF2A,MEF2A MEF2A MEF2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MEF2A 652 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr15 101253659 101254026 101253922 Y ALDH1A3 NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90 Hi-C 24141950 LINS 112224 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 121563 121849 121614 Y TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA RHBDF1 2505 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr16 124533 124922 124605 Y NA SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA MPG 84 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 151121 151408 151265 Y NA POLR3K,RHBDF1,MPG,NPRL3 NA NA NA NA MPG 26115 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 163381 163878 163678 Y NA RHBDF1,MPG,NPRL3 NA NA NA NA NPRL3 22981 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 578748 579156 578911 Y LUC7L PIGQ NA NA NA NA PIGQ 35839 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr16 643606 643989 643708 Y SSTR5,RAB40C,RAB40C PIGQ,RAB40C,C16orf13,FAM195A NA NA NA NA RAB40C 6249 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr16 729341 729555 729445 Y NA C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,RHBDL1,STUB1,JMJD8,WDR24,METRN,FAM173A,HAGHL,CCDC78 NA NA NA NA STUB1 1117 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr16 809662 809847 809755 Y MSLN,MSLN,MSLN METRN,FAM173A,HAGHL,CCDC78,NARFL,MSLN,CHTF18,RPUSD1 NA NA NA NA MSLN 900 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 1046787 1046930 1046814 Y NA LMF1,SOX8 NA NA NA NA SOX8 16979 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 1132307 1132794 1132674 Y RAB40C,RAB40C,WDR90,CACNA1H,SSTR5 SSTR5 NA NA NA NA SSTR5 11551 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 9.03793647030077 chr16 1133120 1133226 1133175 Y RAB40C,RAB40C,FAM195A,WDR90,CACNA1H,SSTR5 SSTR5 NA NA NA NA SSTR5 12364 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 1150049 1150415 1150232 Y NA SSTR5 NA NA NA NA SSTR5 29293 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr16 2057818 2059084 2058234 Y TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598 RPS2,SNHG9,TBL3,NOXO1,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 NA NA NA NA ZNF598,NPW 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 2209355 2209786 2209516 Y NPW RAB26,SNORD60,TRAF7,MLST8 NA NA NA NA TRAF7 5656 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 2478608 2478672 2478640 Y RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2 CCNF,C16orf59,TBC1D24 NA NA NA NA CCNF 1213 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 2518541 2518691 2518640 Y RAB26,E4F1,CCNF,C16orf59,TBC1D24,NTN3 CCNF,C16orf59,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2 NA NA NA NA TBC1D24 4456 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 2557760 2557909 2557835 Y SRRM2,PDPK1,CEMP1 C16orf59,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1 NA NA NA NA ATP6V0C 3962 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 2582505 2583298 2582685 Y RAB26,E4F1,SRRM2,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,CEMP1,PDPK1 ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1 NA NA NA NA PDPK1 2667 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 2885761 2886144 2885824 Y NA PRSS21,PRSS30P,PRSS22,FLYWCH2 NA NA NA NA PRSS30P 4601 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 8.56843327703839 chr16 2904626 2904661 2904644 Y NA PRSS21,PRSS30P,PRSS22,FLYWCH2 NA NA NA NA PRSS22 1510 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 2917931 2918273 2918246 Y NA PRSS30P,PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRSS22 11760 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 3053798 3054225 3053960 Y NA KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1 NA NA NA NA TNFRSF12A 12221 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 IL32,ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 3624 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 3200393 3200919 3200597 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 22615 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 3285972 3286117 3286070 Y PRSS22,ZSCAN10,ZNF200,ZNF200,ZNF200,ZNF75A,ZNF263 ZNF200,ZNF263 NA NA NA NA ZNF200 1751 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 3763227 3763392 3763351 Y NA TRAP1 NA NA NA NA TRAP1 2206 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.9953885713651 chr16 4233647 4234082 4234013 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 69461 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.29113378147154 chr16 4321625 4322178 4321908 Y ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4 TFAP4 NA NA NA NA TFAP4 549 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 4357393 4358110 4357824 Y CORO7 TFAP4,PAM16 ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 36317 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr16 4464344 4465352 4464553 Y NUDT16L1,CORO7 VASN,CORO7,DNAJA3 NA NA NA NA CORO7 8354 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 4678373 4678564 4678416 Y CORO7,UBN1,UBN1,GLYR1,MGRN1 MGRN1 NA NA NA NA MGRN1 13879 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 4818680 4818913 4818758 Y C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI NA NA NA NA ZNF500 3055 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 7146096 7146326 7146211 Y RBFOX1 NA NA NA NA NA METTL22 1567214 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 8939360 8939674 8939516 Y USP7 TMEM186,CARHSP1 NA NA NA NA CARHSP1 21192 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 9055639 9056008 9055791 Y C16orf72,USP7 USP7 NA NA NA NA USP7 363 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 10746944 10747196 10747087 Y NA NA NA NA NA NA EMP2 74389 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr16 10922717 10923252 10923012 Y NUBP1,SOCS1,CIITA NA CIITA IMR90 Hi-C 24141950 NUBP1 87074 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 10956294 10956664 10956435 Y NUBP1,CIITA NA CIITA IMR90 Hi-C 24141950 DEXI 77653 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 11618570 11618665 11618618 Y NA NA NA NA NA NA LITAF 109572 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 11734091 11734770 11734262 Y SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF,SNN TXNDC11,SNN,CLEC16A,LITAF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LITAF 5854 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 11968147 11968344 11968329 Y ZC3H7A RSL1D1,GSPT1 RSL1D1 IMR90 Hi-C 24141950 RSL1D1 24705 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr16 12008398 12008797 12008598 Y NA GSPT1 NA NA NA NA GSPT1 459 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 14395683 14396371 14395873 Y MKL2 NA NA NA NA NA MKL2 232505 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 14423689 14423899 14423743 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 260511 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 14752031 14752218 14752119 Y NA PARN,BFAR NA NA NA NA BFAR 27359 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 15670640 15671032 15670885 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0430 63991 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.64326117641832 chr16 15684514 15685137 15684868 Y NDE1,NDE1,KIAA0430 KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA KIAA0430 49886 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 16115976 16116215 16116101 Y NA NA NA NA NA NA ABCC1 74542 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 17256252 17256784 17256587 Y XYLT1 NA NA NA NA NA NOMO3 931900 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 19106464 19106699 19106563 Y NA COQ7,ITPRIPL2 NA NA NA NA ITPRIPL2 16555 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 19489216 19489473 19489247 Y NA GDE1,CCP110 NA NA NA NA GDE1 41994 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 19532119 19532450 19532314 Y CCP110 GDE1,CCP110,C16orf62 NA NA NA NA GDE1 652 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 20908672 20908960 20908809 Y CRYM,LYRM1,DCUN1D3 LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA LYRM1 230 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 22046502 22046742 22046619 Y NA C16orf52 NA NA NA NA C16orf52 29543 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 22202596 22202946 22202679 Y POLR3E,CDR2 EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 12657 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr16 22207042 22207397 22207176 Y NA EEF2K POLR3E,EEF2K,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 8206 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 23455511 23455803 23455657 Y SCNN1G COG7 NA NA NA NA COG7 6698 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 23508487 23508934 23508786 Y GGA2 COG7,GGA2 NA NA NA NA GGA2 22382 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 23518606 23518950 23518778 Y GGA2 GGA2,UBFD1,EARS2 NA NA NA NA GGA2 12366 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 24855986 24856230 24856033 Y NA NA NA NA NA NA TNRC6A 116970 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 25005690 25005854 25005767 Y NA ARHGAP17 NA NA NA NA ARHGAP17 19133 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 25025498 25025977 25025718 Y NA ARHGAP17 NA NA NA NA ARHGAP17 511 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 27334573 27334825 27334616 Y NA IL4R NA NA NA NA IL4R 11584 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 27620703 27620731 27620720 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0556 61249 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 29836551 29836761 29836656 Y NA KIF22,MAZ,PRRT2,MVP,CDIPT NA NA NA NA MVP 6836 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 30427925 30428543 30428281 Y HIRIP3,ZNF48 TBC1D10B,ZNF48,ZNF771,SNORA42,DCTPP1,SEPHS2 NA NA NA NA SNORA42 537 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.9953885713651 chr16 30876491 30876606 30876548 Y NA MIR4519,BCL7C NA NA NA NA MIR4519 8038 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 30885980 30886229 30886174 Y ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668 MIR4519,BCL7C,FBXL19,FBXL19-AS1 NA NA NA NA MIR4519 1336 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 31129616 31130225 31129940 Y ARMC5,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8,PRSS8 NA NA NA NA KAT8 4541 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 31223480 31223547 31223514 Y ZNF629 FUS,PYCARD,TRIM72,ITGAM NA NA NA NA TRIM72 138 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 31264985 31265278 31265093 Y STX4,ZNF668,ZNF646,MYST1,ITGAX,PYCARD,ITGAM TRIM72,ITGAM NA NA NA NA ITGAM 4033 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 31887367 31887596 31887374 Y NA ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 4288 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 31888166 31888535 31888469 Y ARMC5,ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 5087 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 31891820 31892363 31891972 Y ARMC5,ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 8741 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr16 34377841 34378195 34377988 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 2494762 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 46823783 46824029 46823881 Y NA C16orf87 NA NA NA NA C16orf87 39294 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 47324349 47324747 47324746 Y NA NA NA NA NA NA NETO2 148441 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 48592202 48592453 48592359 Y SIAH1,N4BP1 NA NA NA NA NA N4BP1 59606 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 57103047 57103214 57103125 Y NLRC5 CPNE2 NA NA NA NA CPNE2 21235 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 57125471 57125887 57125617 Y NA CPNE2 NA NA NA NA CPNE2 1022 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 57302834 57302977 57302910 Y NA ARL2BP,PLLP NA NA NA NA PLLP 13622 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 57350531 57350815 57350676 Y NA PLLP CIAPIN1,CCL22,CX3CL1,POLR2C,COQ9,CCL17 IMR90 Hi-C 24141950 PLLP 33932 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 57564039 57564411 57564096 Y ZNF319,GPR114 DOK4,CCDC102A NA NA NA NA CCDC102A 4100 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 57573031 57573089 57573067 Y GPR114 CCDC102A NA NA NA NA CCDC102A 4520 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 57622732 57623027 57622920 Y GPR114 GPR56 NA NA NA NA GPR56 19537 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 57657206 57657412 57657318 Y NA GPR56 NA NA NA NA GPR56 14642 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 57717053 57717380 57717096 Y FAM192A,ZNF319,GPR97 CCDC135 NA NA NA NA CCDC135 9325 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 58555953 58556233 58556187 Y NA SETD6 NA NA NA NA SETD6 8570 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 66587187 66587393 66587288 Y NA TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1,CMTM3 NA NA NA NA CKLF-CMTM1 2697 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 66709355 66709374 66709366 Y DYNC1LI2 CMTM4 NA NA NA NA CMTM4 19236 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 66906996 66907469 66907329 Y SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2 NAE1,PDP2,CDH16 NA NA NA NA NAE1 1837 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 67047765 67048035 67047886 Y FBXL8,CES4A CES4A,CBFB NA NA NA NA CBFB 12984 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 68268995 68269119 68269015 Y NA ESRP2,PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA ESRP2 886 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 68271348 68271876 68271591 Y TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2 ESRP2,PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA ESRP2 1343 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 68526458 68526774 68526616 Y NA SMPD3,ZFP90,RNU4-36P SMPD3,CDH1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP90 35219 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr16 68778758 68779020 68778839 Y NA CDH1 NA NA NA NA CDH1 9630 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 69345968 69346332 69346034 Y NA VPS4A,PDF,NIP7,COG8 NA NA NA NA VPS4A 2709 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 69442470 69442627 69442557 Y NA TERF2,CYB5B NFAT5,CYB5B IMR90 Hi-C 24141950 TERF2 1996 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.9953885713651 chr16 70564094 70564236 70564165 Y NA COG4,SF3B3,SNORD111B NA NA NA NA SNORD111B 2682 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 70779915 70780216 70780046 Y NA NA NA NA NA NA VAC14 52848 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 72459158 72459630 72459377 Y NA NA NA NA NA NA TXNL4B 332828 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr16 73104505 73104770 73104567 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 12908 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 74702224 74702291 74702259 Y NA RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 3445 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 74774732 74775110 74775064 Y FA2H MLKL,FA2H NA NA NA NA FA2H 31619 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.29113378147154 chr16 74777612 74777799 74777727 Y NA MLKL,FA2H NA NA NA NA FA2H 28930 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr16 74791303 74791619 74791461 Y NA FA2H NA NA NA NA FA2H 15110 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 75278988 75279894 75279594 Y CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1 BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 20057 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 75283958 75284369 75284078 Y NA BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 15582 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.29113378147154 chr16 75636745 75636762 75636754 Y NA TMEM231,GABARAPL2,ADAT1,TERF2IP,KARS NA NA NA NA ADAT1 18436 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 76269107 76269317 76269211 Y NA RPL18P13 NA NA NA NA RPL18P13 1586 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 78090271 78090541 78090406 Y NA WWOX NA NA NA NA WWOX 40769 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 79261371 79261598 79261485 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 1130061 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 81309341 81309748 81309489 Y NA BCMO1,GAN GAN IMR90 Hi-C 24141950 GAN 36809 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 81439497 81439896 81439576 Y NA CMIP NA NA NA NA CMIP 36879 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 81491583 81491773 81491678 Y NA CMIP NA NA NA NA CMIP 14808 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 81555726 81556034 81555821 Y CMIP NA NA NA NA NA CMIP 78951 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 81560583 81561027 81560837 Y PLCG2,CMIP,CMIP NA NA NA NA NA CMIP 83808 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 81592572 81592719 81592646 Y GAN,CMIP NA NA NA NA NA CMIP 115797 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 81659418 81659741 81659491 Y PLCG2,CMIP NA NA NA NA NA PLCG2 110961 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 81659842 81660553 81660320 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 110149 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 81785976 81786155 81786044 Y PLCG2,CMIP,CMIP PLCG2 ATMIN,PKD1L2,GAN,BCMO1,MIR4720 IMR90 Hi-C 24141950 PLCG2 15274 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 82172740 82172851 82172799 Y SDR42E1 MPHOSPH6 NA NA NA NA MPHOSPH6 28980 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 84544701 84544717 84544711 Y NA NA COTL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 COTL1 104966 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 84785578 84785829 84785712 Y KIAA0513,COTL1 NA CRISPLD2,ZDHHC7 IMR90 Hi-C 24141950 USP10 53994 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 85028506 85028759 85028547 Y COTL1,CRISPLD2,ZDHHC7,KIAA0513 ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA ZDHHC7 14382 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 85038009 85038299 85038256 Y NA ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA ZDHHC7 4842 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr16 85080631 85081139 85080973 Y KIAA0513 ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA KIAA0513 21256 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 85202555 85203049 85202710 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 143180 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.87801277304951 chr16 85355565 85356105 85355766 Y NA NA FAM92B,LOC727710,GINS2,KIAA0182,KIAA0513,LINC00311 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0513 296190 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 85456219 85456617 85456516 Y FAM92B NA KIAA0182,LOC400548,LOC727710,C16orf74 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 265062 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 85471045 85471389 85471119 Y NA NA KIAA0182,LOC400548,FAM92B,LINC00311,LOC727710,GINS2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 250290 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 85548685 85548970 85548791 Y NA NA KIAA0182 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 172709 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 85586399 85586765 85586561 Y KIAA0182,KIAA0182,GINS2 NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134914 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 85648720 85648939 85648787 Y NA NA NA NA NA NA GINS2 72740 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr16 85678973 85679150 85679027 Y NA GINS2 GINS2 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 42529 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 85726494 85726553 85726524 Y NA GINS2 NA NA NA NA GINS2 4815 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 85758517 85758802 85758746 Y NA GINS2,C16orf74 GINS2,KIAA0182 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf74 23933 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 85780154 85780247 85780189 Y NA C16orf74,COX4I1 GINS2 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf74 2488 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr16 85783425 85783755 85783547 Y NA C16orf74,COX4I1 NA NA NA NA C16orf74 690 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 85783855 85783992 85783913 Y NA C16orf74,COX4I1 NA NA NA NA C16orf74 1120 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 85950196 85950424 85950316 Y COX4I1,IRF8 NA NA NA NA NA RP11-568J23.1 102054 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 86312346 86312714 86312528 Y NA NA NA NA NA NA MTHFSD 274127 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 86609499 86609840 86609550 Y FOXC2 MTHFSD NA NA NA NA MTHFSD 22658 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 87083742 87083830 87083787 Y NA NA FOXC2,FLJ30679,MTHFSD,FOXL1,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf95 265192 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 87378694 87379151 87378934 Y FBXO31 C16orf95,MAP1LC3B,FBXO31 NA NA NA NA C16orf95 29672 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 87421939 87422407 87422148 Y NA MAP1LC3B,FBXO31 NA NA NA NA FBXO31 1341 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 87607297 87607309 87607303 Y NA NA MAP1LC3B,FBXO31,ZCCHC14,KLHDC4,JPH3,CA5A IMR90 Hi-C 24141950 FBXO31 183549 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 87774219 87774566 87774531 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 23032 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 87810498 87810587 87810524 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 12900 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 87980577 87980839 87980700 Y NA BANP CA5A MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BANP 11 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 88365536 88366092 88365805 Y ZNF469 NA BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 151633 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 88520905 88521327 88521137 Y ZC3H18,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZFPM1 ZFPM1 NA NA NA NA ZFPM1 3180 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 88575081 88575169 88575126 Y NA NA NA NA NA NA ZFPM1 57356 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 88829964 88830251 88830166 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 19368 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 88835950 88836275 88836191 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT RNF166,CTU2 K562 ChIA-PET 22265404 PIEZO1 13344 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr16 88837093 88837695 88837443 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 11924 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr16 89323118 89323579 89323381 Y NA ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 41000 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.40850957978713 chr16 89564919 89565211 89565067 Y NA ANKRD11,SPG7 ANKRD11,SPG7 IMR90 Hi-C 24141950 SPG7 9594 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr16 89919863 89919956 89919927 Y DPEP1,DBNDD1,PRDM7,C16orf3 FANCA,SPIRE2,TCF25 NA NA NA NA TCF25 18044 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr16 90024486 90024764 90024610 Y NA MC1R,TUBB3,DEF8,CENPBD1,AFG3L1P NA NA NA NA DEF8 12153 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 693293 693510 693390 Y RNMTL1 DBIL5P,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4 NA NA NA NA GLOD4 9712 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 873777 873849 873813 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 7161 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 932596 932954 932809 Y NA TIMM22 NXN IMR90 Hi-C 24141950 TIMM22 34239 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 1011015 1011228 1011147 Y NA NA NA NA NA NA TIMM22 112658 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 1014015 1014933 1014151 Y PITPNA,CRK,ABR NA NA NA NA NA ABR 115382 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 1157102 1157245 1157179 Y NA ABR ABR,YWHAE,PITPNA,INPP5K,LOC100306951,SCARF1,RILP,TUSC5,BHLHA9,CRK,SLC43A2 IMR90 Hi-C 24141950 ABR 26787 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 1358484 1358816 1358590 Y NA CRK,MYO1C NA NA NA NA CRK 5640 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 1390195 1390341 1390268 Y MYO1C,MYO1C,MYO1C CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 3765 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 1391218 1391783 1391434 Y NA CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 2323 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr17 1521068 1521369 1521308 Y CRK,WDR81,HIC1,PITPNA,SLC43A2,SCARF1 SLC43A2,RILP NA NA NA NA SLC43A2 8811 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 1533068 1533815 1533453 Y CRK,INPP5K,WDR81,WDR81,WDR81,PITPNA,SLC43A2,SCARF1 SLC43A2,RILP NA NA NA NA SLC43A2 2888 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 1953067 1954207 1953327 Y TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1 RTN4RL1,DPH1,OVCA2 NA NA NA NA OVCA2 9740 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr17 1979194 1979509 1979218 Y NA DPH1,OVCA2 NA NA NA NA OVCA2 35867 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 2162010 2162402 2162193 Y SMYD4,METTL16,SMG6,SMG6 SRR,SMG6 NA NA NA NA SRR 42275 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 2299235 2299531 2299372 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 2881 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 2300026 2300553 2300288 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 1859 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 2302108 2302510 2302261 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT NA NA NA NA NA MNT 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 2302778 2303366 2303033 Y SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT MNT NA NA NA NA MNT 366 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.40850957978713 chr17 2305266 2305571 2305415 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 2854 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr17 2612424 2612524 2612493 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 117920 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr17 2614073 2614260 2614119 Y KIAA0664 NA NA NA NA NA PAFAH1B1 119569 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.87801277304951 chr17 2627139 2627523 2627311 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 132635 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 2627618 2628097 2628087 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 133114 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 2757819 2758227 2758154 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 263315 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 2863545 2863659 2863602 Y OR3A2,OR1G1 NA NA NA NA NA PAFAH1B1 369041 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 3791812 3792145 3792008 Y GSG2 C17orf85 NA NA NA NA C17orf85 44267 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 4386875 4387235 4387089 Y NA SPNS2 NA NA NA NA SPNS2 12898 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 4404427 4404640 4404582 Y SPNS3,SPNS2 SPNS2 NA NA NA NA SPNS2 4294 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 4437372 4437692 4437444 Y NA SPNS2,MYBBP1A,GGT6 NA NA NA NA MYBBP1A 19234 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 4737531 4737755 4737558 Y PLD2,MINK1 PSMB6,PLD2,MINK1 NA NA NA NA MINK1 2848 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr17 5430157 5430402 5430333 Y NLRP1 MIS12,DERL2 NA NA NA NA DERL2 42026 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 6375097 6375395 6375262 Y WSCD1,AIPL1 FAM64A NA NA NA NA FAM64A 29362 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 6829755 6829811 6829784 Y NA NA ALOX12P2,ASGR1 IMR90 Hi-C 24141950 ALOX12P2 74575 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 6842907 6843154 6843090 Y NA NA ALOX12,LOC100506713 K562 ChIA-PET 22265404 AC027763.2 70514 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 7389589 7389989 7389739 Y C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA POLR2A 3904 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 7737438 7738736 7737971 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 20328 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 18450 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr17 7745337 7745870 7745591 Y NA CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 13194 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr17 7745915 7746944 7746139 Y NA CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 12120 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.9953885713651 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 11508 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 3.75602554609902 chr17 7790181 7790340 7790322 Y POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3 CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,CNTROB,TRAPPC1 NA NA NA NA LSMD1 3625 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 8041932 8042438 8042328 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 15386 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 8056609 8057167 8057155 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 657 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 8090038 8090540 8090163 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 1024 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 8090795 8091158 8090849 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 406 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 10581804 10582199 10582113 Y MYH4 SCO1,TMEM220 NA NA NA NA SCO1 17493 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 14044844 14045160 14045003 Y NA NA NA NA NA NA COX10 74031 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 15393997 15394379 15394217 Y PMP22,FAM18B2 NA NA NA NA NA SNORA74 80954 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 15895023 15895192 15895111 Y NA ADORA2B,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA TTC19 5502 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 16189250 16189597 16189494 Y NCOR1,TRPV2 NA NA NA NA NA CENPV 65373 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 16249780 16250130 16249956 Y CENPV CENPV,UBB NA NA NA NA CENPV 4840 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 16440164 16440317 16440266 Y ZNF624,CCDC144A FAM211A NA NA NA NA FAM211A 46697 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 16924574 16924970 16924629 Y NA MPRIP FLCN,MPRIP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MPRIP 18889 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 17397062 17397447 17397255 Y NA MED9,RASD1 NA NA NA NA RASD1 262 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 17595288 17595502 17595395 Y NA RAI1 NA NA NA NA RAI1 12501 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 17597479 17598220 17598134 Y ALKBH5,FLCN,COPS3 RAI1 NA NA NA NA RAI1 14692 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr17 17641556 17641857 17641643 Y MYO15A NA NA NA NA NA RAI1 58769 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr17 17644687 17645051 17644950 Y TOM1L2,LRRC48,LLGL1 NA NA NA NA NA RAI1 61900 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 17655489 17655938 17655636 Y DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9 NA NA NA NA NA RAI1 72702 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 17743258 17743857 17743527 Y SMCR8 SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 4933 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr17 18032331 18032623 18032472 Y TOM1L2,MYO15A DRG2 NA NA NA NA DRG2 43131 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 18825562 18825708 18825647 Y FAM83G,TRIM16L NA NA NA NA NA FAM83G 80409 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 19207556 19207821 19207642 Y MAPK7 NA NA NA NA NA MAPK7 71213 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 19411188 19411542 19411351 Y NA NA EPN2,SLC47A2,B9D1,ALDH3A2,ALDH3A1,ULK2 IMR90 Hi-C 24141950 B9D1 131693 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 19656390 19656618 19656531 Y MAPK7,MAPK7 ALDH3A1 NA NA NA NA ALDH3A1 6134 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 19834604 19834673 19834639 Y NA AKAP10 NA NA NA NA AKAP10 44983 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 20688064 20688832 20688343 Y NA OLA1P2,SCDP1 NA NA NA NA SCDP1 2106 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr17 21179100 21179414 21179208 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 6570 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 21188812 21189500 21189174 Y MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 NA NA NA NA MAP2K3 2828 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 21189600 21190105 21189864 Y MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 NA NA NA NA MAP2K3 3616 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.76063697473392 chr17 25409900 25410125 25410078 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208977 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 25821729 25821988 25821800 Y NA NA NA NA NA NA LGALS9 132836 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 25981784 25982180 25981982 Y NA LGALS9 NA NA NA NA LGALS9 26960 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 27100910 27101180 27101019 Y NA NEK8,TLCD1,TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 31908 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 27138672 27138846 27138777 Y NA ERAL1 NA NA NA NA ERAL1 41110 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr17 27220048 27220212 27220121 Y NA ERAL1,FLOT2,DHRS13 NA NA NA NA FLOT2 2485 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr17 27506307 27506816 27506504 Y TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A MYO18A NA NA NA NA MYO18A 877 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr17 27530741 27530989 27530946 Y NA MYO18A MYO18A,TAOK1,NUFIP2 IMR90 Hi-C 24141950 MYO18A 25311 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 27824938 27824945 27824941 Y TIAF1,MYO18A,TAOK1,EFCAB5,ANKRD13B NA NA NA NA NA TP53I13 66125 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 27919265 27919579 27919303 Y NA TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6 NA NA NA NA GIT1 193 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 160050 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 30588630 30588823 30588726 Y NA NA NA NA NA NA C17orf75 86219 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 30724674 30725107 30724769 Y RHOT1 C17orf75,ZNF207,PSMD11 NA NA NA NA PSMD11 44172 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 31155018 31155230 31155072 Y MYO1D MYO1D NA NA NA NA MYO1D 46965 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 32365538 32365912 32365713 Y NA NA NA NA NA NA ZNF830 920637 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 33383216 33383365 33383329 Y SLFN5,RFFL RFFL NA NA NA NA RFFL 30973 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 33414530 33415581 33415167 Y SLFN5,ZNF830,RFFL RFFL,RAD51D NA NA NA NA RFFL 192 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 33787408 33787803 33787736 Y ZNF830,SLFN5,CCL5,SLFN12L SLFN13 NA NA NA NA SLFN13 13552 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 34445033 34445052 34445044 Y LYZL6 NA NA NA NA NA CCL23 102028 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 34476785 34477178 34477032 Y GGNBP2,CCL5,CCL23,CCL3,CCL4,CCL3L3,CCL3L1 NA NA NA NA NA CCL23 133780 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 34875469 34875747 34875679 Y NA ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2 NA NA NA NA PIGW 13100 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 34948982 34949076 34949029 Y DHRS11 DHRS11,MRM1 NA NA NA NA DHRS11 2754 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 35278050 35278157 35278104 Y MRM1 RP11-445F12.1,AATF LHX1,AATF MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-445F12.1 13803 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 35281857 35282039 35281949 Y LHX1 RP11-445F12.1,AATF NA NA NA NA RP11-445F12.1 9921 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr17 35288156 35288415 35288296 Y LHX1 RP11-445F12.1,AATF AATF K562 ChIA-PET 22265404 RP11-445F12.1 3545 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 35292129 35292558 35292512 Y ACACA,LHX1,AATF RP11-445F12.1,AATF NA NA NA NA RP11-445F12.1 169 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 11.3854524366127 chr17 35296825 35297078 35296886 Y LHX1 RP11-445F12.1,AATF NA NA NA NA RP11-445F12.1 4865 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 35492690 35492856 35492817 Y NA NA NA NA NA NA AATF 188515 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 36058346 36058663 36058473 Y NA RP11-115K3.1,HNF1B NA NA NA NA RP11-115K3.1 44543 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 36062721 36062883 36062777 Y DDX52,HNF1B RP11-115K3.1,HNF1B NA NA NA NA RP11-115K3.1 40323 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 5.98616571409531 chr17 36068867 36069181 36068997 Y ACACA,HNF1B RP11-115K3.1,HNF1B NA NA NA NA RP11-115K3.1 34025 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 2.46489176462748 chr17 36073088 36073441 36073335 Y ACACA,HNF1B RP11-115K3.1,HNF1B NA NA NA NA RP11-115K3.1 29765 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 3.87340134441461 chr17 36101828 36102076 36101951 Y DDX52,HNF1B RP11-115K3.1,HNF1B NA NA NA NA RP11-115K3.1 1130 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 36102823 36103051 36102995 Y ACACA,DDX52,HNF1B RP11-115K3.1,HNF1B NA NA NA NA RP11-115K3.1 155 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 8.09893008377601 chr17 36103612 36103841 36103732 Y HNF1B RP11-115K3.1,HNF1B NA NA NA NA HNF1B 375 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 2.23014016799629 chr17 36412216 36412471 36412263 Y NA RP11-1407O15.2,MRPL45 NA NA NA NA RP11-1407O15.2 7387 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr17 36480536 36480738 36480637 Y NA MRPL45,SOCS7 NA NA NA NA SOCS7 25373 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 36859613 36860666 36860145 Y NA C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3 NA NA NA NA MLLT6 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr17 37027781 37027987 37027914 Y FBXO47,CWC25 CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1 NA NA NA NA LASP1 3669 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr17 37831191 37831499 37831297 Y GSDMB,GRB7,GRB7,GRB7,PGAP3,ERBB2 STARD3,ERBB2,PGAP3 NA NA NA NA ERBB2 10668 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr17 37862068 37862252 37862166 Y GSDMB,GRB7,GRB7,GRB7,GRB7,PGAP3,ERBB2,ERBB2 ERBB2,PGAP3,MIEN1,GRB7 NA NA NA NA PGAP3 11018 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr17 37896808 37897181 37897022 Y GRB7,GRB7,GRB7,GRB7 PGAP3,MIEN1,GRB7 NA NA NA NA GRB7 4628 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 37910411 37911394 37910787 Y FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3 MIEN1,GRB7 NA NA NA NA GRB7 18231 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr17 38227405 38227627 38227516 Y GSDMB THRA,MED24,NR1D1,MSL1 NA NA NA NA MED24 11937 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 38227745 38227903 38227871 Y NEUROD2,THRA THRA,MED24,NR1D1,MSL1 NA NA NA NA MED24 12277 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr17 38229285 38229466 38229392 Y GSDMB THRA,MED24,NR1D1,MSL1 NA NA NA NA MED24 13817 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 38231838 38232188 38231911 Y NA THRA,MED24,NR1D1,MSL1 NA NA NA NA MED24 16370 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 38689625 38689996 38689764 Y NA TNS4,CCR7 NA NA NA NA CCR7 29728 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 39653134 39653351 39653234 Y NA KRT13,KRT19 NA NA NA NA KRT13 6606 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 39682585 39682843 39682821 Y JUP,KRTAP4-11,KRT19 KRT13,KRT19 NA NA NA NA KRT19 25 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 39683248 39683750 39683386 Y NA KRT13,KRT19 NA NA NA NA KRT19 688 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 39685394 39685532 39685463 Y KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9 KRT13,KRT19 NA NA NA NA KRT19 2834 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr17 39686458 39686891 39686666 Y KRT19 KRT13,KRT19 NA NA NA NA KRT19 3898 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.29113378147154 chr17 39703664 39703881 39703736 Y NA KRT13,KRT19 NA NA NA NA KRT19 21104 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 39703962 39704520 39704217 Y NA KRT13,KRT19 NA NA NA NA KRT19 21402 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.76063697473392 chr17 39705098 39705383 39705310 Y NA KRT13,KRT19 NA NA NA NA KRT19 22538 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 39735892 39736012 39735959 Y JUP,KRT36,KRT13,KRT15,KRT19,KRT9,KRT17,KRT16,KRT14 KRT16,KRT17 NA NA NA NA KRT16 34139 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr17 39782029 39782271 39782148 Y JUP,KRT36,KRT13,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17 KRT16,KRT17 NA NA NA NA KRT17 2935 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 39802138 39802335 39802276 Y NKIRAS2,NKIRAS2,DHX58,EIF1 KRT16,KRT17,EIF1 KRT19,KRT15 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT17 23044 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 39807728 39808143 39807934 Y JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17 KRT16,KRT17,EIF1 KRT19,KRT15,LOC147093 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT17 28634 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.40850957978713 chr17 39810156 39810822 39810530 Y JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17 KRT16,KRT17,EIF1 KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KRT17 31062 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr17 39811785 39812247 39811996 Y JUP,KRT37,KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17 KRT16,KRT17,EIF1 KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 30890 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr17 39822130 39822941 39822323 Y NA KRT17,EIF1 KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 20196 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 39949116 39949497 39949168 Y KRT14,JUP JUP,LEPREL4 NA NA NA NA JUP 7933 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 39949517 39949745 39949566 Y KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP JUP,LEPREL4 NA NA NA NA JUP 8334 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr17 39956975 39957353 39957171 Y KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17,JUP JUP,LEPREL4 NA NA NA NA LEPREL4 9503 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr17 40240476 40240486 40240480 Y KLHL10,TTC25,CNP,HSPB9 ZNF385C,DHX58,KAT2A NA NA NA NA DHX58 22265 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 40539110 40539537 40539349 Y NA STAT3,PTRF NA NA NA NA STAT3 524 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 40816292 40816343 40816318 Y NA TUBG2,PLEKHH3,CNTNAP1 NA NA NA NA TUBG2 6969 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 41162878 41163074 41162972 Y TUBG1,CNTD1,NBR1,NBR1,ETV4 AARSD1,RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1,RND2 NA NA NA NA IFI35 6136 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 41410079 41410140 41410127 Y NA TMEM106A IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM106A 48225 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 41500242 41500532 41500387 Y NA ARL4D NA NA NA NA ARL4D 25915 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 41657407 41657423 41657415 Y MPP2 ETV4 DHX8,MIR2117,MPP2 IMR90 Hi-C 24141950 ETV4 2419 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 42198947 42199210 42199140 Y NA C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 5.16453512588615 chr17 42416163 42416367 42416282 Y TMUB2,TMUB2,GRN SLC25A39,GRN,FAM171A2,ITGA2B NA NA NA NA GRN 4247 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 42797981 42798248 42798116 Y CCDC43 CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1 NA NA NA NA RP11-1072C15.1 2016 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr17 43201428 43201633 43201517 Y NA ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2 NA NA NA NA ACBD4 6334 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 43249989 43250354 43250021 Y ADAM11,HIGD1B,GFAP,DCAKD ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2 NA NA NA NA HEXIM2 13922 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 43389475 43389771 43389724 Y FMNL1,PLEKHM1,MAP3K14 MAP3K14 TEX34,LOC100133991 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K14 2643 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 44131950 44132178 44132002 Y KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA MAPT 162202 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 44155479 44155559 44155517 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 185731 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 44344171 44344471 44344293 Y NA NA KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAPT 374423 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 44848812 44849347 44849259 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 51279 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr17 45609469 45609601 45609554 Y NA NPEPPS NA NA NA NA NPEPPS 11161 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 46043736 46043949 46043771 Y PRR15L AC003665.1,PNPO,PRR15L,CDK5RAP3 NA NA NA NA CDK5RAP3 560 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 46101351 46101579 46101379 Y NA COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 11813 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 46102426 46102830 46102617 Y NA COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 10562 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 46289129 46289412 46289274 Y NA NA NA NA NA NA SNX11 110410 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 46643791 46644035 46643913 Y NA HOXB-AS3,HOXB6,HOXB8 NA NA NA NA HOXB-AS3 18799 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 46644443 46644754 46644601 Y HOXB9,HOXB8,HOXB6 HOXB-AS3,HOXB6,HOXB8 NA NA NA NA HOXB-AS3 19451 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr17 46662684 46663231 46662943 Y HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5 HOXB-AS3,HOXB6,HOXB8,HOXB7 NA NA NA NA HOXB6 17123 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.52588537810273 chr17 47467973 47468124 47468044 Y ABI3,PHOSPHO1,ZNF652,ZNF652,SPOP,MYST2,FAM117A ZNF652,PHB,AC004797.1 NA NA NA NA PHB 22122 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 47913501 47913854 47913589 Y TMEM92 KAT7,FAM117A,RP11-613C6.4 NA NA NA NA RP11-613C6.4 42796 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr17 48139711 48140314 48140012 Y XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3 ITGA3,PDK2 NA NA NA NA ITGA3 8379 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 48228924 48229616 48229504 Y SPATA20,SAMD14 SAMD14,PPP1R9B NA NA NA NA PPP1R9B 2933 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 48348027 48348139 48348077 Y COL1A1,TMEM92 TMEM92 NA NA NA NA TMEM92 1260 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 48367346 48367814 48367643 Y PPP1R9B TMEM92 NA NA NA NA TMEM92 20579 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 48726648 48726741 48726695 Y NA ABCC3 NA NA NA NA ABCC3 16510 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 48942663 48943085 48943016 Y NA TOB1 NA NA NA NA TOB1 254 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr17 48996377 48996488 48996474 Y RSAD1 RP11-700H6.1 LOC400604,TOB1,WFIKKN2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-700H6.1 23586 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 48996944 48997365 48997235 Y UTP18,RSAD1,TOB1 RP11-700H6.1 LOC400604,TOB1,WFIKKN2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-700H6.1 22709 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr17 49027288 49027482 49027366 Y NA RP11-700H6.1 NA NA NA NA RP11-700H6.1 7214 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 49028088 49028439 49028211 Y NA RP11-700H6.1 NA NA NA NA RP11-700H6.1 8014 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 49196679 49197214 49196965 Y NA SPAG9,NME1,NME1-NME2,NME2 NA NA NA NA SPAG9 453 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 53315618 53315983 53315841 Y HLF HLF STXBP4,HLF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HLF 24390 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 54993018 54993544 54993286 Y SCPEP1,TRIM25 TRIM25,COIL DGKE MCF7 ChIA-PET 22265404 TRIM25 3619 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 55210991 55211279 55211077 Y NA NA NA NA NA NA AKAP1 50538 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 55434822 55435211 55435067 Y MSI2,MSI2 NA NA NA NA NA MSI2 103610 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 55447287 55447561 55447443 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 116075 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr17 55504815 55504992 55504904 Y MSI2,MSI2 NA NA NA NA NA MSI2 173603 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 55517850 55518075 55517943 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 186638 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr17 55518270 55518753 55518516 Y MSI2,MSI2 NA NA NA NA NA MSI2 187058 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 55540558 55540950 55540705 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 209346 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 55734748 55734863 55734779 Y DYNLL2 NA NA NA NA NA MRPS23 190554 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 55977135 55977456 55977362 Y NA NA NA NA NA NA MRPS23 51718 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 56013342 56013699 56013370 Y NA CUEDC1,VEZF1 VEZF1,CUEDC1,SRSF1 IMR90 Hi-C 24141950 CUEDC1 16985 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 56020686 56021039 56020762 Y NA CUEDC1,VEZF1 VEZF1,CUEDC1,SRSF1 IMR90 Hi-C 24141950 CUEDC1 9645 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 56025910 56026308 56026041 Y SUPT4H1 CUEDC1,VEZF1 NA NA NA NA CUEDC1 4376 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 56064193 56064677 56064258 Y NA CUEDC1,VEZF1,SRSF1 NA NA NA NA VEZF1 573 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 56419503 56419633 56419507 Y OR4D2 MIR142,SUPT4H1 NA NA NA NA SUPT4H1 8821 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 56426877 56426962 56426920 Y MTMR4,SUPT4H1 MIR142,SUPT4H1 NA NA NA NA SUPT4H1 1492 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 56428194 56428499 56428372 Y VEZF1,MTMR4,SUPT4H1 MIR142 NA NA NA NA SUPT4H1 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr17 56441767 56441894 56441848 Y NA MIR142,SUPT4H1 NA NA NA NA SUPT4H1 13313 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 56468859 56469318 56469005 Y RNF43 SUPT4H1,RNF43 NA NA NA NA RNF43 23638 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.9953885713651 chr17 56736656 56737064 56736885 Y MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E RNU1-60P,RNU1-108P,RNU1-85P,RAD51C SEPT4,C17orf47 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 1990 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr17 56744054 56744558 56744332 Y SUPT4H1 RNU1-60P,RNU1-108P,RNU1-85P,RAD51C NA NA NA NA RNU1-108P 1996 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 57194064 57194075 57194070 Y NA TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA TRIM37 11782 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 57231530 57231848 57231723 Y NA TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA PRR11 670 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 57853705 57854627 57854148 Y NA NA NA NA NA NA MIR21 62000 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 57860256 57860659 57860446 Y DHX40,VMP1,CA4 NA NA NA NA NA MIR21 55968 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 57866887 57867071 57866969 Y NA MIR21 NA NA NA NA MIR21 49556 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 57905350 57905555 57905420 Y NA MIR21 NA NA NA NA MIR21 11072 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.76063697473392 chr17 57906379 57907270 57906882 Y RNFT1 MIR21 NA NA NA NA MIR21 9357 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr17 57922999 57923843 57923122 Y PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6 MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 6372 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 57925185 57925429 57925290 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 8558 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr17 57930626 57931026 57930760 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 13999 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 58228293 58228479 58228403 Y CA4 NA NA NA NA NA HEATR6 74001 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 59150035 59150103 59150069 Y BCAS3 NA NA NA NA NA BCAS3 397221 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 59956289 59956463 59956377 Y NA BRIP1,INTS2 BRIP1 IMR90 Hi-C 24141950 BRIP1 17407 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 60141349 60141594 60141514 Y NACA2,MED13 MED13 INTS2 MCF7 ChIA-PET 22265404 MED13 706 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 60256998 60257133 60257064 Y NA NA NA NA NA NA MED13 116355 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 60557252 60557333 60557299 Y NA RP11-464D20.2 MRC2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-464D20.2 34795 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 60729712 60730300 60729931 Y NA MRC2 NA NA NA NA MRC2 26950 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 60780424 60780717 60780568 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 77662 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 60868052 60868313 60868162 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 165290 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 61639369 61639739 61639552 Y NA DCAF7,TACO1 NA NA NA NA DCAF7 13547 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 61796482 61796787 61796636 Y NA LIMD2,STRADA NA NA NA NA LIMD2 19950 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 62072274 62072575 62072534 Y NA C17orf72,ICAM2 NA NA NA NA C17orf72 1136 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 62159440 62159790 62159613 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 46389 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 62161129 62161576 62161448 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 44603 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 62339620 62339793 62339707 Y CEP95 TEX2 NA NA NA NA TEX2 959 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 62484790 62485162 62485096 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA POLG2 5992 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 62491373 62491767 62491605 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA POLG2 219 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 63639930 63640399 63640359 Y NA NA NA NA NA NA AXIN2 84165 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr17 64301184 64301397 64301241 Y NA PRKCA NA NA NA NA PRKCA 4430 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 64499082 64499411 64499095 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 202328 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 64503657 64504241 64503882 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 206903 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 65220181 65220399 65220279 Y NA HELZ,SNORA8 NA NA NA NA HELZ 19706 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 65339190 65339485 65339338 Y BPTF PSMD12,PITPNC1 NA NA NA NA PSMD12 21258 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr17 66421215 66421317 66421250 Y NA WIPI1 NA NA NA NA WIPI1 30337 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 66434083 66434422 66434387 Y NA WIPI1 NA NA NA NA WIPI1 17232 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 66509186 66509763 66509535 Y SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A PRKAR1A NA NA NA NA PRKAR1A 3265 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 67089514 67089753 67089674 Y ABCA6 ABCA6 NA NA NA NA ABCA6 46276 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 68127333 68127525 68127373 Y NA KCNJ2 NA NA NA NA KCNJ2 35289 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 68133591 68133755 68133649 Y KCNJ2 KCNJ2 NA NA NA NA KCNJ2 29059 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 68135658 68135754 68135749 Y NA KCNJ2 NA NA NA NA KCNJ2 27060 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 68141797 68141870 68141834 Y NA KCNJ2 NA NA NA NA KCNJ2 20944 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 69437254 69437446 69437407 Y NA NA SOX9,LOC100499467,SLC39A11 IMR90 Hi-C 24141950 LOC124685 177673 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 70403681 70403886 70403813 Y SOX9 NA NA NA NA NA RPL32P33 217484 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 70423161 70423493 70423326 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 197877 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 70442621 70442708 70442666 Y SOX9 NA NA NA NA NA RPL32P33 178662 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr17 70462396 70462597 70462589 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 158773 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 70512872 70513243 70513164 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 108127 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 70577972 70578326 70578149 Y NA RPL32P33 NA NA NA NA RPL32P33 43044 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 70585200 70585480 70585419 Y NA RPL32P33,LINC00511 NA NA NA NA RPL32P33 35890 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr17 70585924 70586379 70586141 Y NA RPL32P33,LINC00511 NA NA NA NA RPL32P33 34991 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 70587266 70587776 70587444 Y NA RPL32P33,LINC00511 NA NA NA NA RPL32P33 33594 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.40850957978713 chr17 70610080 70610203 70610142 Y NA RPL32P33,LINC00511 LOC100499467 MCF7 ChIA-PET 22265404 RPL32P33 11167 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 70706379 70706638 70706553 Y NA NA NA NA NA NA LINC00511 71768 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr17 70712408 70712674 70712489 Y NA NA NA NA NA NA LINC00511 77797 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 70924179 70924389 70924230 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A11 162462 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 70939903 70940361 70940187 Y SSTR2,C17orf80 NA NA NA NA NA SLC39A11 146490 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 71287548 71287861 71287762 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 18453 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 71304431 71304616 71304518 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 1698 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 71305759 71306422 71306099 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP4 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 4.1081529410458 chr17 71439964 71440055 71440021 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP4 133650 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 72564769 72564992 72564860 Y NA CD300C NA NA NA NA CD300C 24487 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 72746451 72746964 72746655 Y NA SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA SLC9A3R1 3660 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 72978355 72978661 72978434 Y KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CDR2L 3066 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 72984795 72985307 72985001 Y RAB37,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 NA NA NA NA CDR2L 3068 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 73073656 73074040 73073685 Y RAB37,RAB37,ARMC7 KCTD2,ATP5H,SLC16A5,ARMC7 NA NA NA NA SLC16A5 7782 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 73074678 73074996 73074848 Y LLGL2,C17orf28,ARMC7 KCTD2,ATP5H,SLC16A5,ARMC7 NA NA NA NA SLC16A5 6826 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 73087456 73087829 73087515 Y NA ATP5H,SLC16A5,ARMC7,NT5C NA NA NA NA SLC16A5 5634 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 5.16453512588615 chr17 73091198 73091317 73091257 Y TSEN54,LLGL2 SLC16A5,ARMC7,NT5C NA NA NA NA SLC16A5 9376 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 16.197860167552 chr17 73120387 73120767 73120528 Y GRB2,GRB2,CD300LF,HN1,HN1,SLC16A5,NT5C SLC16A5,ARMC7,NT5C,HN1 NA NA NA NA NT5C 5123 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 73304838 73305233 73305159 Y UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19 MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19 NA NA NA NA SLC25A19 21247 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 73333353 73333637 73333600 Y H3F3B,GRB2,GRB2,GGA3 SLC25A19 NA NA NA NA SLC25A19 49762 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 73514344 73514665 73514525 Y GGA3,MIF4GD,TEN1,SAP30BP,H3F3B,TSEN54 CASKIN2,TSEN54,LLGL2 NA NA NA NA TSEN54 4203 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 73545364 73545732 73545559 Y NA CASKIN2,TSEN54,LLGL2 NA NA NA NA LLGL2 26203 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.87801277304951 chr17 73631575 73631992 73631838 Y C17orf109 SAP30BP,RECQL5 NA NA NA NA SAP30BP 29204 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr17 73641652 73641951 73641723 Y CASKIN2,LLGL2,FOXJ1,EVPL,LOC100130933 SAP30BP,RECQL5 NA NA NA NA SAP30BP 19245 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 73691946 73692277 73692043 Y NA SAP30BP,RECQL5,ITGB4 NA NA NA NA ITGB4 23131 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 73696530 73696897 73696707 Y SAP30BP,ITGB4,ITGB4 SAP30BP,RECQL5,ITGB4 NA NA NA NA ITGB4 18511 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 2.58226756294308 chr17 73718198 73718514 73718306 Y NA ITGB4,GALK1 NA NA NA NA ITGB4 2790 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 9.62481546187874 chr17 73719261 73719909 73719549 Y MRPS7,LLGL2,LOC100130933,EVPL,ITGB4,ITGB4 ITGB4,GALK1 NA NA NA NA ITGB4 3853 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 15.6109811759741 chr17 73992927 73993207 73992957 Y NA TEN1,ACOX1,CDK3,EVPL NA NA NA NA CDK3 1780 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 74128444 74128992 74128680 Y LOC100130933,RECQL5,RECQL5,FOXJ1 EXOC7,FOXJ1 NA NA NA NA FOXJ1 6388 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr17 74264426 74264836 74264522 Y NA ATF4P3 NA NA NA NA ATF4P3 43539 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 74413626 74413718 74413672 Y NA SPHK1,PRPSAP1,UBE2O NA NA NA NA UBE2O 33570 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 74494294 74494838 74494393 Y NA UBE2O,RHBDF2 NA NA NA NA RHBDF2 1034 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 74496600 74496786 74496748 Y NA UBE2O,RHBDF2,CYGB NA NA NA NA RHBDF2 728 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 74583031 74583415 74583256 Y NA CYGB,ST6GALNAC2 NA NA NA NA ST6GALNAC2 1993 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 74664017 74664029 74664023 Y NA ST6GALNAC1,MXRA7 NA NA NA NA ST6GALNAC1 26097 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 74704169 74704303 74704279 Y CYGB,PRCD MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA MXRA7 795 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 74705254 74705618 74705431 Y MXRA7 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA MXRA7 156 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 75120383 75120864 75120582 Y JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 39585 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 75251434 75251777 75251766 Y NA SEPT9 SEPT9,SRSF2,METTL23,MFSD11,SEC14L1,MGAT5B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEPT9 22874 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 75262778 75262892 75262812 Y NA SEPT9 SEPT9,MGAT5B,SEC14L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEPT9 11759 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 75278845 75279720 75279369 Y NA SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 4194 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 75281264 75281453 75281354 Y SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 6613 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 75281811 75282557 75281917 Y SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 7160 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr17 75282703 75283463 75282995 Y SEPT9,SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 8052 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.76063697473392 chr17 75284936 75285118 75285041 Y NA SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 10285 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 75312591 75312808 75312697 Y NA SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 37940 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 75318595 75318736 75318679 Y SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 43944 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 75319670 75320031 75319742 Y MGAT5B,SEPT9,SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 45019 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 75361925 75362048 75361987 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 87274 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 75402047 75402301 75402134 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 127396 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 75450694 75450827 75450755 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 176043 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA TNRC6C TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNRC6C 43453 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 5.86878991577972 chr17 76165603 76166001 76165654 Y SYNGR2 TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5 NA NA NA NA SYNGR2 2964 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 76310071 76310633 76310436 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3 PGS1,DNAH17,SOCS3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SOCS3 43525 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 76312866 76313241 76313131 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3 SOCS3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SOCS3 40917 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 76335027 76335218 76335120 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 18940 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 76337607 76338208 76338068 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 15950 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr17 76338337 76338836 76338651 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 15322 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr17 76339301 76339497 76339364 Y NA SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 14661 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 76348964 76349371 76349046 Y USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 4787 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr17 76377337 76378350 76377903 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA PGS1 4616 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 76731686 76732147 76732043 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 CYTH1 NA NA NA NA CYTH1 44232 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 76858403 76858717 76858585 Y PGS1,CYTH1,ENGASE,USP36 USP36 NA NA NA NA USP36 22880 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 76879007 76879631 76879400 Y CYTH1,ENGASE,CANT1,USP36 USP36,TIMP2 NA NA NA NA TIMP2 39838 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 76879876 76880180 76879977 Y NA USP36,TIMP2 NA NA NA NA TIMP2 39289 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 76912078 76912524 76912123 Y CYTH1,CANT1 TIMP2 NA NA NA NA TIMP2 6945 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 76930060 76930674 76930419 Y NA TIMP2,LGALS3BP TIMP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TIMP2 10591 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 76992140 76992468 76992317 Y NA LGALS3BP,CANT1,C1QTNF1 NA NA NA NA CANT1 11481 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr17 77784894 77785612 77785337 Y NA CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 11412 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 77787297 77787609 77787349 Y NA CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 13815 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr17 77788517 77788922 77788877 Y NA CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 15035 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 77916401 77916581 77916489 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D16 91066 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 77961931 77962339 77962251 Y NA TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 45308 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 77965696 77966573 77966281 Y CBX2,CBX8,CBX4,CCDC40 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 41074 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 77967532 77967765 77967641 Y CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 39882 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr17 78238527 78238862 78238699 Y GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213 SLC26A11,SGSH,RNF213 NA NA NA NA RNF213 5862 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV,NPTX1 NA NA NA NA NPTX1 20369 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.52588537810273 chr17 78652497 78652856 78652573 Y SGSH,RNF213 NA NA NA NA NA RPTOR 135878 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 78669175 78669353 78669258 Y NA NA NA NA NA NA RPTOR 152556 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr17 78800697 78801105 78800867 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 162293 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 78806684 78807307 78807121 Y C17orf56 NA NA NA NA NA CHMP6 156091 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 78824691 78824852 78824790 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 138546 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 78830209 78830686 78830492 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 132712 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr17 79011145 79011369 79011293 Y BAIAP2 CHMP6,BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 4197 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 79017666 79018027 79017910 Y AZI1,BAIAP2 BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 10718 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 79107096 79107396 79107264 Y AATK NA NA NA NA NA AZI1 87403 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.87801277304951 chr17 79317785 79317948 79317891 Y FAM195B,C17orf70,ACTG1,BAHCC1 LINC00482,TMEM105 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM105 15311 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 79319325 79319648 79319507 Y FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1 LINC00482,TMEM105 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM105 16851 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 79339701 79340108 79339894 Y NA TMEM105 SLC38A10,NPLOC4 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM105 37227 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 79360408 79361324 79361141 Y ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10 NA NA NA NA NA TMEM105 57934 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 79362745 79363068 79363048 Y NA NA NA NA NA NA TMEM105 60271 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 79370754 79371569 79371407 Y NA NA NA NA NA NA TMEM105 68280 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 79421564 79421842 79421610 Y NA NA NA NA NA NA RP13-766D20.1 56247 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr17 79925685 79926075 79926048 Y TSPAN10 SIRT7,MAFG,MAFG-AS1,PYCR1,NOTUM,ASPSCR1 ASPSCR1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ASPSCR1 6608 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 79942701 79942868 79942785 Y SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62 PYCR1,NOTUM,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3 NA NA NA NA ASPSCR1 10018 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 79949658 79950000 79949804 Y SLC25A10,STRA13,LRRC45,FASN,DCXR,PCYT2,NOTUM,ASPSCR1 NOTUM,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR NA NA NA NA ASPSCR1 16975 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 80052713 80052821 80052782 Y MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN GPS1,RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 1387 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.40850957978713 chr17 80056613 80056910 80056718 Y C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 2405 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr17 80068913 80069274 80069094 Y NARF,HEXDC,CCDC57 DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 14705 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 80164087 80164383 80164236 Y SIRT7,MAFG,MAFG,SECTM1,NARF,CSNK1D,C17orf62,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CCDC57 CCDC57,SLC16A3 NA NA NA NA CCDC57 4323 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 80215337 80215590 80215470 Y SIRT7,WDR45L,NARF,CSNK1D,CD7,C17orf62,C17orf62,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3 CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 14017 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 80216124 80216440 80216314 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 13167 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 80239829 80239997 80239937 Y NA CSNK1D,SECTM1 CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1D 10222 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 80342594 80342740 80342634 Y NA TEX19,HEXDC NA NA NA NA TEX19 27471 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 80453708 80453979 80453866 Y LRRC45,DUS1L,FASN,UTS2R,TBCD,FOXK2 C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 21610 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 80454894 80455238 80455175 Y LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 20351 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 80594524 80594906 80594740 Y UTS2R,WDR45L NA NA NA NA NA RAB40B 59698 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 80655375 80655626 80655561 Y RAB40B,FN3K RAB40B,FN3KRP,FN3K NA NA NA NA RAB40B 771 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 80712796 80713169 80712899 Y ZNF750,TBCD FN3KRP,FN3K,TBCD NA NA NA NA TBCD 4856 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr17 80817904 80818262 80818042 Y C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL NA NA NA NA NA TBCD 109964 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 80833209 80833609 80833394 Y ZNF750 NA NA NA NA NA TBCD 125269 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr17 80840475 80841074 80840735 Y HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL NA NA NA NA NA TBCD 132535 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr17 81031472 81031760 81031658 Y METRNL B3GNTL1,METRNL B3GNTL1 K562 ChIA-PET 22265404 METRNL 3807 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr17 81049749 81049909 81049815 Y NA B3GNTL1,METRNL NA NA NA NA METRNL 14182 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr18 159482 159743 159659 Y CETN1 USP14 NA NA NA NA USP14 3099 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 666183 666708 666437 Y THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 9843 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.40850957978713 chr18 813044 813594 813404 Y YES1 YES1 NA NA NA NA YES1 2497 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 2056727 2056859 2056778 Y NA NA NA NA NA NA METTL4 512649 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 2605641 2605936 2605854 Y NA METTL4,NDC80,CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA NDC80 36131 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 3276279 3276423 3276302 Y NA MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12B 16372 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr18 3623872 3624258 3624140 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214266 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr18 3624338 3624601 3624482 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214732 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 3624841 3625119 3625035 Y MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 215235 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr18 3625326 3625427 3625380 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 215720 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 3665613 3666165 3665884 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 256007 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr18 3816827 3817202 3817015 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 407221 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 7512213 7512497 7512355 Y NA NA PTPRM IMR90 Hi-C 24141950 PTPRM 52283 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 8801229 8801479 8801315 Y CCDC165 NA NA NA NA NA RAB12 193786 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 9101793 9102110 9101852 Y RAB12,ANKRD12,ANKRD12 NDUFV2,ANKRD12 NA NA NA NA NDUFV2 1165 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 9914998 9915501 9915128 Y PPP4R1,RAB31,VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 2999 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr18 10708268 10708433 10708298 Y NA NA NA NA NA NA NAPG 184366 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 11005597 11005922 11005792 Y NA NA NA NA NA NA NAPG 481695 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 4.34290453767699 chr18 11947272 11947721 11947412 Y CHMP1B MPPE1,IMPA2 IMPA2,GNAL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IMPA2 31303 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr18 12059774 12060081 12059918 Y NA NA GNAL,IMPA2 IMR90 Hi-C 24141950 IMPA2 80750 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr18 12864190 12864369 12864245 Y NA NA NA NA NA NA PTPN2 63273 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 12880036 12880906 12880743 Y NA PTPN2 NA NA NA NA PTPN2 46736 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 13890423 13890585 13890504 Y MC5R NA NA NA NA NA FAM210A 165761 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 18517849 18518397 18517887 Y NA NA NA NA NA NA ROCK1 171415 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 19090172 19090203 19090178 Y NA NA NA NA NA NA ESCO1 88642 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr18 19457629 19457900 19457765 Y NA NA NA NA NA NA MIB1 174711 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 19774212 19774351 19774284 Y GATA6 GATA6 NA NA NA NA GATA6 26808 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr18 20138967 20139156 20139093 Y GATA6 NA CTAGE1,GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 237068 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 20263132 20263811 20263406 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 112413 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr18 20274994 20275099 20275066 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 101125 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 21002815 21003000 21002900 Y RBBP8,RBBP8,NPC1,C18orf8 TMEM241,RIOK3 NA NA NA NA TMEM241 12925 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 21165246 21165762 21165429 Y C18orf8,NPC1 NPC1 NA NA NA NA NPC1 384 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr18 21463540 21463749 21463607 Y NA NA NA NA NA NA TTC39C 106988 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 22928411 22928577 22928434 Y NA NA NA NA NA NA SS18 740604 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 26735180 26735449 26735256 Y NA NA NA NA NA NA DSC2 1944929 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 26744101 26744374 26744185 Y NA NA NA NA NA NA DSC2 1936004 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr18 28786845 28787168 28787084 Y DSC3,DSC2,DSG3,DSG2,DSG1,DSC1 NA DSC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 DSC2 106467 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 29542474 29542964 29542885 Y RNF138 TRAPPC8 NA NA NA NA TRAPPC8 11375 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 29665661 29665831 29665728 Y NA RNF138 NA NA NA NA RNF138 3987 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 29952485 29952862 29952679 Y NA NA NA NA NA NA RNF138 282667 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 32829674 32829781 32829775 Y ZNF397,ZSCAN30 ZNF397,ZSCAN30,ZNF271 NA NA NA NA ZNF397 10680 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr18 33071303 33071471 33071398 Y NA INO80C NA NA NA NA INO80C 4484 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 33093148 33093751 33093628 Y GALNT1 INO80C NA NA NA NA INO80C 17193 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 33577061 33577192 33577127 Y NA C18orf21 NA NA NA NA C18orf21 27015 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr18 34908671 34908689 34908687 Y NA NA NA NA NA NA TPGS2 501513 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 37033966 37034182 37034037 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 120327 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr18 45529364 45529594 45529519 Y NA NA SMAD2,ZBTB7C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD2 73849 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 45534549 45534809 45534718 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 79034 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 45687716 45687836 45687757 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232201 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr18 45688048 45688324 45688110 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232533 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr18 46357104 46357294 46357200 Y NA NA NA NA NA NA SMAD7 117787 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 46478230 46479206 46479122 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 3149 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr18 46502180 46502412 46502333 Y SMAD7 SMAD7 SMAD7,CTIF MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SMAD7 27099 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr18 46523478 46523814 46523611 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 CTIF,SMAD7,DYM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD7 48397 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr18 46524155 46524830 46524741 Y NA SMAD7 CTIF,SMAD7,DYM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD7 49074 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr18 46543550 46543788 46543750 Y NA NA SMAD7 MCF7 ChIA-PET 22265404 SMAD7 68469 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr18 46547875 46548139 46548027 Y NA NA SMAD7 MCF7 ChIA-PET 22265404 SMAD7 72794 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.76063697473392 chr18 47250062 47250416 47250239 Y NA NA ACAA2,SCARNA17,MYO5B,LIPG IMR90 Hi-C 24141950 ACAA2 87914 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 47620136 47620367 47620252 Y NA NA NA NA NA NA MYO5B 99096 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 47688363 47688450 47688407 Y NA MYO5B NA NA NA NA MYO5B 31013 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr18 48380307 48380600 48380464 Y ME2 ME2 SMAD4 IMR90 Hi-C 24141950 ME2 22819 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 48462357 48462700 48462360 Y ME2 ELAC1,SMAD4 NA NA NA NA ELAC1 29661 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 48680201 48680643 48680497 Y MEX3C NA NA NA NA NA MEX3C 62031 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 52613483 52613779 52613741 Y NA CCDC68 NA NA NA NA CCDC68 10960 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 53060777 53060994 53060923 Y NA NA NA NA NA NA CCDC68 436038 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 55104670 55104954 55104730 Y NA ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 3753 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 55105190 55105288 55105239 Y ST8SIA3,ONECUT2 ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 4273 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 55108837 55109086 55108936 Y ONECUT2 ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 7920 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 55109141 55109496 55109318 Y ONECUT2 ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 8224 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 55710685 55710979 55710720 Y NEDD4L NEDD4L NA NA NA NA NEDD4L 1086 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 56012421 56012506 56012466 Y NA NA NA NA NA NA SNORD28 253357 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 56208933 56209328 56209119 Y MALT1 NA NA NA NA NA SNORD28 56535 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 56514801 56515232 56515114 Y NA ZNF532 NA NA NA NA ZNF532 12600 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 56672148 56672229 56672220 Y NA NA NA NA NA NA SEC11C 132480 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 57566379 57566616 57566437 Y NA PMAIP1 NA NA NA NA PMAIP1 1199 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 60189219 60189514 60189362 Y TNFRSF11A,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 979 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr18 60273018 60273214 60273116 Y NA NA NA NA NA NA ZCCHC2 84778 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 60864948 60865713 60864996 Y PHLPP1,VPS4B NA NA NA NA NA BCL2 119648 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 60873001 60873358 60873117 Y BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 112003 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 61350519 61350880 61350698 Y SERPINB5,SERPINB12,SERPINB3,SERPINB11 NA SERPINB10,SERPINB7 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINB5 208525 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr18 61504955 61505077 61505043 Y VPS4B,SERPINB8,SERPINB2 NA SERPINB7,SERPINB11,SERPINB5,SERPINB8 IMR90 Hi-C 24141950 HMSD 109458 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 61642248 61642613 61642430 Y NA HMSD,SERPINB8 NA NA NA NA SERPINB8 7089 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 68004496 68004658 68004562 Y NA NA NA NA NA NA SOCS6 50359 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr18 72501282 72501640 72501447 Y NA NA NA NA NA NA ZNF407 238176 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 72676291 72676559 72676424 Y ZNF407,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 242744 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 73966259 73966767 73966600 Y NA NA NA NA NA NA ZNF516 238379 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 74204839 74205357 74205296 Y NA RP11-17M16.1 NA NA NA NA ZNF516 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 74205649 74206020 74205889 Y NA ZNF516,RP11-17M16.1 NA NA NA NA RP11-17M16.1 172 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 74755425 74755811 74755618 Y MBP,MBP NA NA NA NA NA ZNF236 222862 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 74764902 74765159 74765004 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 232339 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 74766602 74767022 74766743 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 234039 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr18 74780243 74780707 74780579 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 247680 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 74803559 74803662 74803615 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 270996 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 74823541 74824614 74824455 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 290978 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 76734377 76734736 76734420 Y NA NA NA NA NA NA ATP9B 92549 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 76831132 76831674 76831321 Y NFATC1,NFATC1,ATP9B ATP9B NA NA NA NA ATP9B 3847 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 77442917 77443176 77442992 Y PQLC1,ADNP2,NFATC1,CTDP1,CTDP1 CTDP1 NA NA NA NA CTDP1 5116 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr18 77682652 77682872 77682762 Y NA PQLC1,HSBP1L1 NA NA NA NA PQLC1 26792 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 289700 289869 289784 Y C2CD4C,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C PPAP2C NA NA NA NA PPAP2C 307 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr19 290136 290651 290316 Y RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C PPAP2C NA NA NA NA PPAP2C 743 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.40850957978713 chr19 485856 486161 485966 Y PALM,HCN2,FGF22,C2CD4C,SHC2 SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34 ODF3L2,SHC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 MADCAM1 1015 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 573434 573573 573481 Y ODF3L2,C19orf22,CDC34,BSG CDC34,BSG NA NA NA NA BSG 4137 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 661410 661735 661571 Y HMHA1,GZMM,C19orf6,ABCA7,RNF126 POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM NA NA NA NA RNF126 133 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 662216 662510 662281 Y HMHA1,GZMM,C19orf6,C19orf22,ABCA7,RNF126 POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM NA NA NA NA RNF126 939 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 751766 752111 751822 Y PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21 PALM,PTBP1 NA NA NA NA PTBP1 42964 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr19 752652 753043 752777 Y PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21 PALM,PTBP1,MIR4745 NA NA NA NA PTBP1 42032 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr19 782330 783005 782707 Y NA PTBP1,MIR4745 NA NA NA NA PTBP1 12070 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr19 888565 888780 888647 Y SBNO2,HMHA1,CIRBP,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7 CFD,MED16,RNU6-9,R3HDM4,KISS1R NA NA NA NA MED16 2438 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 908605 908810 908775 Y NA MED16,RNU6-9,R3HDM4,KISS1R NA NA NA NA R3HDM4 2430 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 1028160 1028923 1028240 Y SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7 WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7 NA NA NA NA CNN2 3862 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 1161691 1161983 1161922 Y NA SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 10299 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 1172839 1173266 1172915 Y CFD,ATP5D,GPX4,GPX4 SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 557 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 1183874 1184237 1184064 Y SBNO2 SBNO2,STK11 ATP5D,MIDN,SBNO2,STK11,GPX4 MCF7 ChIA-PET 22265404 STK11 3169 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 1252961 1253429 1253036 Y C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA CIRBP 3955 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr19 1260732 1261171 1260912 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA CIRBP 3348 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 1262305 1262850 1262469 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA CIRBP 4921 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 1266359 1266798 1266589 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA C19orf24 6228 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr19 1284432 1284856 1284552 Y REEP6,ONECUT3,GAMT,EFNA2 C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA EFNA2 279 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.64326117641832 chr19 1410481 1410741 1410600 Y NA NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 4913 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 1453873 1454140 1454045 Y C19orf26,MUM1,APC2 DAZAP1,RPS15,C19orf25,PCSK4,REEP6 NA NA NA NA RPS15 17515 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 1632932 1633212 1633140 Y STK11 MBD3,UQCR11,TCF3 NA NA NA NA TCF3 17392 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 1651371 1651730 1651556 Y NA UQCR11,TCF3 NA NA NA NA TCF3 767 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 1654223 1654456 1654354 Y NA TCF3 NA NA NA NA TCF3 3619 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 28.5223189906894 chr19 1658049 1658081 1658059 Y EFNA2,ONECUT3 TCF3 TCF3 MCF7 ChIA-PET 22265404 TCF3 7445 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.87801277304951 chr19 1747200 1747550 1747426 Y PLEKHJ1,DAZAP1,RPS15,ONECUT3 ONECUT3 TCF3,ONECUT3,ADAMTSL5,PLK5,UQCR11,ATP8B3,REXO1,LOC100288123 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ONECUT3 2822 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr19 1755338 1755626 1755509 Y NA ONECUT3 NA NA NA NA ONECUT3 4966 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr19 1763363 1763749 1763439 Y NA ONECUT3,ATP8B3 NA NA NA NA ONECUT3 12991 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 1855247 1855761 1855485 Y SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3 ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3 NA NA NA NA KLF16 5806 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr19 1856794 1856864 1856840 Y NA ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3 NA NA NA NA KLF16 4703 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr19 1857160 1857480 1857446 Y NA ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3 NA NA NA NA KLF16 4087 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr19 1909763 1910077 1909925 Y KLF16 KLF16,SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2 NA NA NA NA ADAT3 6386 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 1942586 1943099 1942836 Y OAZ1,DOT1L,C19orf35,MOBKL2A,MKNK2,REXO1,KLF16,CSNK1G2 SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2 NA NA NA NA CSNK1G2 3398 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 2032329 2032652 2032524 Y LINGO3,C19orf35 BTBD2,MKNK2 NA NA NA NA BTBD2 228 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 2049976 2050209 2050080 Y OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2 BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 733 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr19 2061356 2061737 2061654 Y SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 12113 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr19 2162744 2162943 2162860 Y CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 280 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 2165096 2165788 2165320 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 2632 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr19 2167436 2167667 2167594 Y CSNK1G2,GADD45B,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 4972 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr19 2168890 2169464 2169082 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 6426 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 2171377 2171588 2171512 Y REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 8913 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 2330710 2331138 2330903 Y NA SPPL2B,LSM7 NA NA NA NA LSM7 4091 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 3.28652235283664 chr19 2770206 2770498 2770360 Y DIRAS1,AES SLC39A3,SGTA,THOP1,ZNF554 NA NA NA NA SGTA 10871 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 3035530 3035851 3035686 Y NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2 AES NA NA NA NA AES 25254 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 3360183 3360356 3360294 Y TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 2622 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 3405079 3405252 3405203 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 47518 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 3655813 3656105 3655965 Y NA PIP5K1C NA NA NA NA PIP5K1C 42372 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 4051584 4052099 4051914 Y CCDC94 PIAS4,ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 12844 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 4052414 4052757 4052628 Y CCDC94,ZBTB7A PIAS4,ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 12186 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr19 4053092 4053572 4053301 Y CCDC94,ZBTB7A PIAS4,ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 11371 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 4057405 4058198 4058044 Y CCDC94,ZBTB7A ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 6745 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 4059877 4060289 4060128 Y SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6 ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 4654 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr19 4061318 4061457 4061400 Y SEMA6B,PLIN5,ZBTB7A ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 3486 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr19 4063699 4063930 4063813 Y NA ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 1013 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 4064475 4064868 4064603 Y SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6 ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 75 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr19 4089074 4089290 4089084 Y NA ZBTB7A,MAP2K2 NA NA NA NA ZBTB7A 24131 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 4375735 4376107 4375790 Y ZBTB7A,EBI3 STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A NA NA NA NA SH3GL1 22437 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 4456035 4456301 4456168 Y NA UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 216 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 4456385 4456784 4456737 Y UBXN6,UBXN6 UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 566 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 4636294 4636441 4636384 Y ANKRD24,SH3GL1,SH3GL1,SEMA6B,TICAM1,TNFAIP8L1,TNFAIP8L1 TNFAIP8L1,C19orf10 NA NA NA NA TNFAIP8L1 1089 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 4677231 4677531 4677381 Y NA TNFAIP8L1,C19orf10,DPP9 NA NA NA NA C19orf10 8849 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 4936813 4936840 4936828 Y NA UHRF1,KDM4B NA NA NA NA KDM4B 30285 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 5046594 5046918 5046679 Y NA NA NA NA NA NA KDM4B 79469 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 5804044 5804378 5804211 Y NA DUS3L,FUT6,FUT3 NDUFA11,DUS3L,NRTN,LONP1,CATSPERD,RANBP3,LOC100128568,FUT6,VMAC,PRR22,FUT3,RFX2,FUT5,CAPS K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DUS3L 14795 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 6056849 6057757 6057360 Y DENND1C,SAFB2,SAFB,VMAC,RFX2 NA NA NA NA NA RANBP3 80696 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 6066698 6067208 6066827 Y SLC25A41,TMEM146,PRR22,DUS3L,RFX2,ACSBG2 NA NA NA NA NA RANBP3 90545 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 6067299 6067617 6067410 Y DENND1C,SAFB2,SAFB,RFX2 NA NA NA NA NA RANBP3 91146 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 6092440 6092966 6092758 Y RFX2 NA NA NA NA NA RFX2 104617 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 6539979 6540238 6540076 Y NA TNFSF9 NA NA NA NA TNFSF9 10969 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 6738802 6739114 6738954 Y NA C3,GPR108,TRIP10,SH2D3A NA NA NA NA TRIP10 2866 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 6766042 6766297 6766158 Y NA C3,GPR108,TRIP10,SH2D3A NA NA NA NA SH2D3A 443 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.64326117641832 chr19 8518703 8518940 8518821 Y NA MARCH2,HNRNPM NA NA NA NA HNRNPM 11052 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 9783821 9783976 9783959 Y NA ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 45 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr19 10138488 10138727 10138608 Y EIF3G,COL5A3 COL5A3,C3P1 NA NA NA NA C3P1 7752 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr19 10148101 10148280 10148177 Y NA COL5A3,C3P1,C19orf66 NA NA NA NA C3P1 1622 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 86.8580907535398 chr19 10148640 10148857 10148749 Y NA COL5A3,C3P1,C19orf66 NA NA NA NA C3P1 2161 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr19 10515339 10515636 10515481 Y PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 3125 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 10723101 10723460 10723261 Y NA KRI1,CDKN2D,AP1M2,SLC44A2,ILF3 NA NA NA NA SLC44A2 11968 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 10862011 10862152 10862080 Y ICAM1,ICAM3,TYK2,PDE4A,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2,C19orf38,DNM2 DNM2 NA NA NA NA DNM2 35256 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr19 10949257 10949551 10949405 Y CDC37,KEAP1,KRI1,ILF3,QTRT1,DNM2,SPC24,SMARCA4,SMARCA4 TMED1,CARM1 NA NA NA NA TMED1 4263 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 11202212 11202837 11202668 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 4174 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 11202963 11203178 11203054 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 4925 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 11205696 11206011 11205901 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 7658 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr19 11253991 11254271 11254206 Y PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6 SPC24 NA NA NA NA SPC24 10213 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr19 11269215 11269426 11269321 Y SMARCA4,SMARCA4,C19orf39 SPC24,KANK2 NA NA NA NA SPC24 4731 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 11404382 11404791 11404593 Y ACP5,ACP5,C19orf38,LPPR2,CCDC159 DOCK6,CCDC159 NA NA NA NA DOCK6 33225 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 11925678 11926080 11925867 Y NA ZNF441,ZNF440 NA NA NA NA ZNF440 2579 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 12404552 12404928 12404719 Y ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44 CTD-2666L21.3,ZNF44 NA NA NA NA ZNF44 850 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.87801277304951 chr19 12892961 12894040 12893343 Y ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 6270 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 12894545 12895330 12894818 Y ZNF44,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 4980 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 12899457 12901460 12900777 Y NA PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 13095998 13096573 13096246 Y ZNF490,ZNF791,TNPO2,TNPO2,MAST1 CALR,RAD23A,GADD45GIP1,NFIX NA NA NA NA NFIX 7849 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr19 13166882 13167358 13167036 Y NA NA NA NA NA NA TRMT1 59023 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr19 13238145 13238217 13238180 Y NA TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA NACC1 11228 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.40850957978713 chr19 13275397 13275802 13275486 Y NA TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 16168 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 13917794 13918010 13917903 Y RFX1,ZSWIM4,NANOS3 MRI1,C19orf53,ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 13520 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 13954357 13954714 13954441 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM4 50083 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 13955108 13955589 13955298 Y CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4 NA NA NA NA NA ZSWIM4 50834 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr19 13957204 13959386 13957586 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM4 52930 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 13972364 13973309 13972780 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4 CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 41705 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 14084978 14085262 14085120 Y NA DCAF15,RFX1 NA NA NA NA DCAF15 23674 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 14172809 14173223 14173004 Y NA IL27RA,EEF1DP1,SAMD1 NA NA NA NA EEF1DP1 5931 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr19 14545997 14546246 14546106 Y NA DDX39A,PKN1,PTGER1 NA NA NA NA PKN1 4132 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 14732511 14733275 14733016 Y SYDE1 NA NA NA NA NA NDUFB7 51637 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 15333627 15333747 15333631 Y SYDE1,NOTCH3 NOTCH3,EPHX3 NA NA NA NA EPHX3 8499 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 15947617 15948119 15947980 Y AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1 UCA1 NA NA NA NA UCA1 9846 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 16181046 16181841 16181607 Y OR10H2,OR10H3,OR10H4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 5215 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr19 16188924 16190024 16189835 Y TPM4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 13093 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr19 16205409 16205807 16205414 Y EPS15L1,RAB8A,HSH2D TPM4,RAB8A,HSH2D NA NA NA NA RAB8A 14632 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 16482225 16482879 16482589 Y MED26,KLF2 KLF2 NA NA NA NA KLF2 48597 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 18133045 18133309 18133130 Y FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2 NA NA NA NA NA MAST3 73294 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.40850957978713 chr19 18155923 18156099 18156029 Y NA NA NA NA NA NA MAST3 50504 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 18365499 18365609 18365555 Y B3GNT3 PDE4C,KIAA1683,JUND,MIR3188 NA NA NA NA PDE4C 1270 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.29113378147154 chr19 18402387 18403564 18402535 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1 PDE4C,KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA MIR3188 11500 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 18415031 18416060 18415513 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 16024 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 18439179 18439536 18439334 Y NA JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1,GDF15 PGPEP1 K562 ChIA-PET 22265404 LSM4 7095 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 18485152 18485556 18485412 Y ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25 PGPEP1,GDF15,SSBP4 NA NA NA NA GDF15 1611 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr19 18497624 18497977 18497708 Y PDE4C,GDF15 PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA GDF15 14083 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 18527701 18528040 18527800 Y KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 27 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 18631384 18632027 18631497 Y ELL ELL,FKBP8,KXD1,UBA52 NA NA NA NA ELL 447 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 19432213 19432594 19432445 Y SUGP2,NCAN,ZNF14,PBX4,SUGP1,MAU2 MAU2,SUGP1 NA NA NA NA SUGP1 2560 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 19488658 19488936 19488750 Y NA GATAD2A NA NA NA NA GATAD2A 5699 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 19589693 19590012 19589853 Y NA NDUFA13,TSSK6,YJEFN3 NA NA NA NA NDUFA13 34533 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 19600012 19600395 19600260 Y RFXANK,MAU2,GATAD2A,PBX4,GMIP NDUFA13,TSSK6,YJEFN3 NA NA NA NA NDUFA13 24150 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 19977247 19977754 19977315 Y PBX4,LPAR2,ZNF101,ZNF14,ZNF682,ZNF682,ZNF506,ZNF253 ZNF506 NA NA NA NA ZNF506 46687 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 23530488 23530791 23530760 Y NA ZNF91 NA NA NA NA ZNF91 45571 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 28232492 28232748 28232631 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1469700 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 30447917 30448294 30448014 Y NA URI1 NA NA NA NA URI1 35366 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr19 31371885 31372199 31372043 Y NA NA NA NA NA NA URI1 959334 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 33049643 33049878 33049760 Y NA PDCD5 NA NA NA NA PDCD5 20096 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 33532238 33532582 33532339 Y RHPN2,GPATCH1,PDCD5,ANKRD27,NUDT19,CEP89,C19orf40 RHPN2,GPATCH1 NA NA NA NA RHPN2 21212 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr19 33538325 33538659 33538479 Y RHPN2,GPATCH1,NUDT19,CEP89,C19orf40 RHPN2,GPATCH1 NA NA NA NA RHPN2 15135 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr19 34625713 34625998 34625854 Y PDCD2L LSM14A CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD IMR90 Hi-C 24141950 LSM14A 35411 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr19 34850085 34850642 34850351 Y ZNF599,ZNF302,ZNF181 GPI,PDCD2L NA NA NA NA GPI 1700 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 37830170 37830469 37830239 Y NA HKR1,ZNF527 ZNF527 IMR90 Hi-C 24141950 HKR1 28431 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 39148533 39148920 39148613 Y C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4 EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 12244 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr19 39149253 39149575 39149354 Y SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4 EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 12964 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 39150238 39150530 39150365 Y NA EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 13949 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 39175000 39175365 39175141 Y NFKBIB,HNRNPL,EIF3K ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 38711 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr19 39182594 39182977 39182723 Y PAK4,ACTN4 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 46305 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr19 39184148 39184440 39184342 Y C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 47859 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr19 39283371 39283483 39283427 Y NA CAPN12,LGALS4,ECH1 NA NA NA NA LGALS4 18521 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 39645312 39645609 39645461 Y LGALS7B PAK4 NA NA NA NA PAK4 30902 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 39894353 39894945 39894613 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H NA NA NA NA ZFP36 508 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 39921308 39921946 39921495 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H,TIMM50 NA NA NA NA RPS16 2642 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 40413949 40414284 40414119 Y SUPT5H,SUPT5H CTC-471F3.4 NA NA NA NA CTC-471F3.4 33350 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 41108162 41108528 41108432 Y NA SHKBP1,LTBP4 NA NA NA NA LTBP4 11373 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 41152132 41152466 41152220 Y NA NUMBL NA NA NA NA NUMBL 42411 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 41267029 41267391 41267210 Y NA ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,MIA-RAB4B,RAB4B,EGLN2 NA NA NA NA MIA,MIA-RAB4B 8162 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 42419916 42420316 42420067 Y ZNF574,GRIK5,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1 ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA ARHGEF1 34688 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 42429105 42429824 42429205 Y DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1 ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 31718 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 42430880 42431141 42430883 Y NA ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 30401 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 42432096 42432209 42432128 Y NA ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 29333 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 42772295 42772768 42772477 Y NA ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 1606 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr19 42772804 42773312 42773020 Y CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 2115 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 42774379 42774759 42774668 Y CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 3690 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr19 42775992 42776735 42776352 Y NA GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3 NA NA NA NA CIC 5303 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 42784527 42784991 42784716 Y ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13838 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 42964614 42965000 42964807 Y CEACAM8,DEDD2 NA CXCL17,LIPE,CEACAM1,CEACAM8 IMR90 Hi-C 24141950 CEACAM1 98386 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 44165978 44166186 44166121 Y NA ZNF428,CADM4,PLAUR NA NA NA NA PLAUR 6513 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 44177519 44178042 44177954 Y CD177,IRGQ,ZNF230,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61 CADM4,PLAUR PLAUR MCF7 ChIA-PET 22265404 PLAUR 4820 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 44179506 44179853 44179716 Y TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61 CADM4,PLAUR PLAUR MCF7 ChIA-PET 22265404 PLAUR 6807 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr19 44711538 44711905 44711597 Y NA ZNF226,ZNF227,ZNF233 NA NA NA NA ZNF227 1838 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 45228436 45228775 45228695 Y IGSF23,RELB,APOE,APOC4,APOC2,BCL3 BCL3 NA NA NA NA BCL3 20187 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr19 45242034 45242469 45242251 Y RELB,CLASRP,BCL3 BCL3,CBLC BCL3 K562 ChIA-PET 22265404 BCL3 6493 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 45279679 45279961 45279836 Y CEACAM19,CBLC,BCAM BCL3,CBLC,BCAM NA NA NA NA CBLC 553 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr19 45344497 45344782 45344640 Y CEACAM16,NKPD1,CLASRP BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 2650 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 45350775 45351289 45350997 Y BCL3,PVRL2,RELB BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 3343 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 4.81240773093937 chr19 45373382 45373614 45373476 Y NA PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA TOMM40 18212 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 45393623 45393866 45393750 Y ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40 PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA TOMM40 1797 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr19 45663964 45664347 45664315 Y NA TRAPPC6A,BLOC1S3 NA NA NA NA TRAPPC6A 15148 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 45946690 45947113 45946759 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22140 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr19 45953764 45954783 45954182 Y NA CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 14470 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 45959420 45959846 45959631 Y GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP FOSB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 9407 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 45980345 45980732 45980359 Y GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP NA NA NA NA ERCC1 259 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 46011701 46012269 46011904 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP NA NA NA NA VASP 3864 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 46012498 46012899 46012640 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP NA NA NA NA VASP 4661 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 46386037 46386278 46386146 Y OPA3,GIPR,FBXO46,SYMPK,FOXA3 SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP NA NA NA NA IRF2BP1 1098 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr19 46853988 46854113 46854077 Y PRKD2 PPP5C NA NA NA NA PPP5C 5737 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 46877153 46877367 46877269 Y NA PPP5C NA NA NA NA PPP5C 28902 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr19 46907328 46907649 46907570 Y NA NA NA NA NA NA PPP5C 59077 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr19 47033456 47033629 47033471 Y NA PNMAL2,GAPDHP38 NA NA NA NA GAPDHP38 26269 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 47221635 47221817 47221775 Y ZC3H4,PRKD2 PRKD2,FKRP,STRN4 NA NA NA NA PRKD2 3251 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 47363167 47364689 47363471 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 AP2S1 SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 10918 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 47599577 47599849 47599731 Y NA TMEM160,SAE1,ZC3H4 NA NA NA NA SAE1 14682 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr19 47613231 47613789 47613256 Y PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4 SAE1,ZC3H4 TMEM160,NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 SAE1 742 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 47776748 47776969 47776841 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1 MIR3191,BBC3,CCDC9 NA NA NA NA CCDC9 19511 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr19 47792934 47793257 47793053 Y NA CCDC9 NA NA NA NA CCDC9 35697 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr19 47805638 47805769 47805718 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,GPR77,C5AR1 CCDC9,DHX34 PRR24,DHX34,SLC8A2,MEIS3,GLTSCR2,GLTSCR1,EHD2 IMR90 Hi-C 24141950 DHX34 44769 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 48016024 48016351 48016088 Y SULT2A1,CCDC9,GPR77,DHX34,NAPA KPTN,NAPA NA NA NA NA NAPA 146 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 2.23014016799629 chr19 48103581 48103982 48103689 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA GLTSCR1,NAPA MCF7 ChIA-PET 22265404 NAPA 87084 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 48657871 48658185 48658028 Y NA PLA2G4C,LIG1 NA NA NA NA LIG1 13675 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 48903013 48903207 48903134 Y PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1 TMEM143,SYNGR4,KDELR1,GRWD1 NA NA NA NA KDELR1 10203 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr19 49046614 49046906 49046677 Y NA SULT2B1 SULT2B1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SULT2B1 6426 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr19 49465555 49466264 49465736 Y IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA FTL 294 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr19 49466802 49467527 49467169 Y IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA FTL 244 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 49493898 49494273 49494153 Y NA BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA GYS1 294 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 49495555 49495708 49495609 Y SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4 BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 850 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr19 49832847 49832906 49832877 Y PTH2 TEAD2 NA NA NA NA TEAD2 30808 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 50718358 50718781 50718691 Y NA MYH14 NA NA NA NA MYH14 28915 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 50872495 50872846 50872654 Y NA NR1H2,KCNC3,NAPSB,POLD1,SPIB NA NA NA NA POLD1 12615 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 51339255 51339614 51339393 Y KLK14,IGLON5,LRRC4B,SYT3,SYT3 C19orf48 NA NA NA NA C19orf48 33069 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 53129559 53129725 53129643 Y ZNF160,ZNF616,ZNF766,ZNF808,ZNF701,ZNF611,ZNF611,ZNF83 NA NA NA NA NA ZNF701 72484 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 53426305 53426488 53426354 Y ZNF765,ZNF468,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 17366 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 53727403 53727861 53727738 Y NA NA NA NA NA NA ZNF845 107141 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr19 55582606 55582776 55582718 Y NA RDH13,EPS8L1,PPP1R12C NA NA NA NA EPS8L1 1218 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 55626810 55627228 55626935 Y ZNF865,PPP1R12C RDH13,EPS8L1 NA NA NA NA PPP1R12C 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 55850120 55850505 55850225 Y KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564 SUV420H2,COX6B2,TMEM238,RPL28 NA NA NA NA SUV420H2 899 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr19 55917170 55917359 55917333 Y U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA UBE2S 25 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 55983917 55984059 55984005 Y RDH13,HSPBP1,ISOC2 ISOC2,ZNF628,NAT14 ZNF628,ISOC2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF628 1640 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.64326117641832 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 4872 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr19 56117286 56117783 56117722 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 5950 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 56218548 56218666 56218607 Y SUV420H2,NLRP9,U2AF2 EPN1 NA NA NA NA EPN1 33956 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 58162762 58163096 58162801 Y NA ZNF134,ZNF211,ZNF551 NA NA NA NA ZNF211 23001 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr19 58398826 58399093 58399050 Y ZNF548,ZNF772,ZNF549,ZNF134,ZSCAN4,ZNF154,ZNF671,ZNF776,ZSCAN1,ZNF606,ZNF329,ZNF256,ZNF135,ZNF418 ZNF587,ZNF814,ZNF417 NA NA NA NA ZNF814 384 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr19 58557282 58557656 58557471 Y NA ZNF606 NA NA NA NA ZNF606 44565 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.29113378147154 chr19 59029635 59029989 59029796 Y NA SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M SLC27A5 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC27A5 7855 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr2 1590812 1591204 1590899 Y NA NA PXDN,MYT1L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM18 915373 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 1719023 1719384 1719170 Y NA NA NA NA NA NA TMEM18 1043584 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 1859174 1859261 1859218 Y NA NA NA NA NA NA TMEM18 1183735 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 2850815 2851100 2850821 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 528553 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 3340825 3341028 3341010 Y NA TSSC1,TRAPPC12 NA NA NA NA TSSC1 38625 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 3359907 3360169 3360140 Y NA TSSC1,TRAPPC12 NA NA NA NA TSSC1 19484 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.76063697473392 chr2 8231020 8231604 8231329 Y NA NA NA NA NA NA AC011747.4 490318 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 8597253 8597584 8597383 Y KIDINS220 NA LOC100506274,LINC00299,LOC339788 IMR90 Hi-C 24141950 AC011747.4 124338 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 8816590 8817048 8816915 Y NA AC011747.7 NA NA NA NA ID2 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr2 9347909 9348072 9347942 Y NA ASAP2 NA NA NA NA ASAP2 3015 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 9678248 9678641 9678477 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 15280 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 9894353 9894610 9894569 Y ADAM17,KLF11,KLF11,GRHL1 NA YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1,KLF11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF1B 86873 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 10260365 10260994 10260486 Y ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2 CYS1 NA NA NA NA RRM2 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr2 10423423 10423670 10423576 Y NA HPCAL1 RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HPCAL1 17345 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 10550434 10550795 10550555 Y HPCAL1,HPCAL1 ODC1,RP11-320M2.1 ODC1 IMR90 Hi-C 24141950 ODC1 35835 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 10633765 10634017 10633925 Y NOL10 ODC1,RP11-320M2.1 ODC1,HPCAL1,NOL10,CYS1,RRM2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-320M2.1 46945 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 11352501 11352895 11352887 Y NA NA NA NA NA NA PQLC3 59177 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 11884050 11884543 11884432 Y NA NA NA NA NA NA LPIN1 68329 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 12596433 12596805 12596535 Y NA NA LPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 258210 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 12633247 12633315 12633291 Y NA NA TRIB2,LPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 221700 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 12703502 12703613 12703558 Y NA NA TRIB2 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 151402 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 12703835 12703993 12703936 Y NA NA TRIB2 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 151022 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 12856062 12856442 12856137 Y NA TRIB2 NA NA NA NA TRIB2 1047 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr2 15815563 15815811 15815751 Y NBAS NA NA NA NA NA DDX1 86261 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 20341243 20341467 20341355 Y NA NA PUM2,WDR35,MATN3,SDC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDC1 81727 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 20385260 20385778 20385600 Y TTC32,HS1BP3 SDC1 NA NA NA NA SDC1 37416 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 20386283 20386578 20386422 Y TTC32,HS1BP3 SDC1 NA NA NA NA SDC1 36616 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr2 20817015 20817334 20817182 Y RHOB,GDF7 HS1BP3 NA NA NA NA HS1BP3 31515 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 20849276 20849608 20849479 Y NA HS1BP3 NA NA NA NA HS1BP3 427 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 23743180 23743526 23743353 Y NA NA NA NA NA NA KLHL29 137092 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr2 23923305 23923445 23923375 Y NA NA NA NA NA NA ATAD2B 224539 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 24491623 24491942 24491630 Y ATAD2B,NCOA1,ITSN2 NA NA NA NA NA RPL36AP13 63439 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 24852047 24852369 24852206 Y NA NA NA NA NA NA CENPO 161636 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 25508945 25509154 25508991 Y DNAJC27,DNMT3A NA NA NA NA NA DNMT3A 54305 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 25545894 25546051 25546003 Y NA DNMT3A NA NA NA NA DNMT3A 17408 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 26220678 26220902 26220866 Y RAB10 KIF3C,RAB10 ASXL2,RAB10,FAM59B,KIF3C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIF3C 17060 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.29113378147154 chr2 26231667 26232185 26231781 Y RAB10 KIF3C,RAB10 FAM59B,KIF3C,RAB10,ASXL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB10 22791 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 27194386 27194503 27194476 Y NA MAPRE3 NA NA NA NA MAPRE3 2906 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 27958320 27958698 27958604 Y NA MRPL33 BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL33 33886 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 27988549 27989353 27988873 Y NA MRPL33 NA NA NA NA MRPL33 3231 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 28003613 28003725 28003670 Y NA MRPL33 NA NA NA NA MRPL33 11029 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 28120564 28120959 28120784 Y FOSL2,RBKS BRE,RBKS NA NA NA NA RBKS 8599 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 28492364 28492732 28492561 Y NA NA NA NA NA NA FOSL2 120583 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 28668874 28669088 28668964 Y PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 NA BRE,RBKS,PLB1 IMR90 Hi-C 24141950 AC104695.3 53335 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 28767576 28768254 28768064 Y WDR43,TRMT61B,SPDYA NA NA NA NA NA AC104695.3 152037 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 29050679 29050871 29050775 Y NA TRMT61B NA NA NA NA TRMT61B 40296 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 29173330 29173730 29173529 Y PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43 NA NA NA NA NA WDR43 57821 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 29352302 29352469 29352324 Y NA CLIP4 NA NA NA NA CLIP4 33731 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 30489009 30489377 30489252 Y YPEL5 LBH NA NA NA NA LBH 36612 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 33295461 33295712 33295665 Y NA NA NA NA NA NA RASGRP3 363679 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 36603527 36603925 36603600 Y NA CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 22458 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 36688353 36688868 36688635 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 107284 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 36790527 36791707 36791646 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 79523 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 37103475 37103824 37103655 Y NA NA NA NA NA NA STRN 87791 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 37491311 37491687 37491498 Y NA CEBPZ NA NA NA NA CEBPZ 34455 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 37880894 37881162 37881056 Y EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 82449 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 38219907 38219960 38219946 Y NA NA NA NA NA NA CYP1B1 115084 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 39334876 39335293 39335230 Y NA SOS1 NA NA NA NA SOS1 14193 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 39665108 39665339 39665266 Y NA AC007246.3,MAP4K3 NA NA NA NA MAP4K3 2655 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr2 39683895 39683929 39683912 Y NA AC007246.3,MAP4K3 NA NA NA NA MAP4K3 21442 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 39695061 39695250 39695144 Y NA AC007246.3,MAP4K3 NA NA NA NA MAP4K3 32608 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 39722003 39722381 39722147 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K3 59550 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 39800503 39800829 39800666 Y CDKL4 NA NA NA NA NA MAP4K3 138050 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 42481657 42481775 42481735 Y EML4 NA NA NA NA NA EML4 87167 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 43037224 43037999 43037611 Y NA HAAO THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HAAO 19491 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 43152648 43152978 43152751 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC016735.1 78222 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr2 43155191 43155549 43155370 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC016735.1 75651 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 43197884 43198002 43197975 Y NA AC016735.1 ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC016735.1 33198 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 43206770 43207218 43206984 Y HAAO AC016735.1 ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC016735.1 23982 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr2 43385938 43386506 43386186 Y OXER1,ZFP36L2 NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 65242 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr2 43390138 43390489 43390286 Y NA NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 61259 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr2 43421229 43421631 43421263 Y HAAO,THADA,THADA ZFP36L2 ZFP36L2,LOC100129726,THADA K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFP36L2 30117 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 43422005 43422472 43422185 Y THADA,THADA,ZFP36L2 ZFP36L2 ZFP36L2,LOC100129726,THADA K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFP36L2 29276 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.52588537810273 chr2 43434759 43434952 43434875 Y OXER1 ZFP36L2 NA NA NA NA ZFP36L2 16796 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr2 44518633 44519032 44518761 Y NA SLC3A1 NA NA NA NA SLC3A1 18034 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr2 44542790 44543096 44543052 Y SLC3A1 SLC3A1,PREPL,CAMKMT NA NA NA NA SLC3A1 42191 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr2 44718441 44718530 44718486 Y NA NA NA NA NA NA CAMKMT 131352 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 44849210 44849529 44849370 Y NA NA NA NA NA NA CAMKMT 262121 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 45164818 45165169 45165126 Y NA RP11-89K21.1 NA NA NA NA RP11-89K21.1 480 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 46542401 46542637 46542520 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 23595 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 46614603 46614745 46614671 Y RHOQ NA NA NA NA NA EPAS1 95797 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 47031260 47031826 47031474 Y NA NA LOC388948,SOCS5,CRIPT,LOC100134259,MCFD2,TTC7A IMR90 Hi-C 24141950 SOCS5 107169 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 47077976 47078245 47078111 Y SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2 NA NA NA NA NA TTC7A 63051 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 47194379 47194775 47194547 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 27385 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 47195176 47195614 47195246 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 28182 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.9953885713651 chr2 47213827 47213985 47213928 Y NA MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 46833 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 47297632 47297822 47297725 Y NA NA NA NA NA NA CALM2 103918 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 47306951 47307378 47307182 Y NA NA NA NA NA NA CALM2 94362 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 50701819 50701837 50701828 Y NRXN1 NA NA NA NA NA PPP1R21 2036082 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 53331505 53331666 53331586 Y NA NA NA NA NA NA CHAC2 661263 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 54165408 54165630 54165519 Y NA ACYP2,PSME4 NA NA NA NA ACYP2 30345 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 54270419 54270555 54270547 Y GPR75,ACYP2 NA SPTBN1,EML6,PSME4,ACYP2 IMR90 Hi-C 24141950 PSME4 74442 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 54786900 54787386 54787056 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 105478 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 54787503 54787764 54787623 Y RTN4,SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 106081 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 54796924 54797237 54797074 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 115502 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 54799241 54799892 54799606 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 117819 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 54806978 54807402 54807168 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 125556 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr2 55450545 55450658 55450592 Y CCDC88A,EML6,RTN4 RPS27A,MTIF2 NA NA NA NA RPS27A 6381 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 58334895 58335527 58335141 Y VRK2,VRK2,VRK2 NA NA NA NA NA FANCL 130980 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 59463950 59464234 59464027 Y NA NA POU2F1 MCF7 ChIA-PET 19890323 FANCL 997443 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 61580039 61580318 61580309 Y NA NA NA NA NA NA USP34 115586 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 61921641 61922071 61921953 Y NA NA NA NA NA NA FAM161A 157207 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 61990946 61991094 61991044 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 88184 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 87618 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr2 62519354 62519381 62519368 Y NA NA COMMD1,B3GNT2 IMR90 Hi-C 24141950 B3GNT2 98106 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 62805190 62805410 62805295 Y NA NA EHBP1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM17 68161 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 63023345 63023597 63023471 Y NA NA NA NA NA NA EHBP1 124359 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 64587056 64587400 64587325 Y NA NA AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 LGALSL 91703 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 64772977 64773339 64773158 Y SLC1A4,AFTPH AFTPH NA NA NA NA AFTPH 23512 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 64879615 64879792 64879667 Y SERTAD2 NA LOC339807 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 96347 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 64994926 64995226 64995021 Y SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 18787 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 65058327 65058875 65058618 Y AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 82188 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 65065938 65066285 65066136 Y AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 89799 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 65086460 65086681 65086529 Y AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 110321 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 65212867 65212968 65212911 Y NA SLC1A4 NA NA NA NA SLC1A4 643 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 65214378 65214996 65214823 Y NA SLC1A4 NA NA NA NA SLC1A4 767 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 65609993 65610402 65610168 Y NA SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 47369 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 65657861 65658229 65658008 Y SLC1A4,SPRED2,SPRED2 SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 90 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr2 69135600 69135857 69135778 Y NA NA ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10 IMR90 Hi-C 24141950 APLF 442907 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 69309666 69309994 69309927 Y NA NA NA NA NA NA GFPT1 302388 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 69989990 69990667 69990520 Y NA NA GMCL1 IMR90 Hi-C 24141950 GMCL1 64107 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr2 70000495 70000634 70000556 Y MXD1 NA NA NA NA NA GMCL1 54140 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 70004336 70004726 70004528 Y NA NA NA NA NA NA GMCL1 50048 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 70141198 70141461 70141241 Y NA SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA MXD1 18378 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 70335985 70336314 70336204 Y AAK1,C2orf42,PCBP1 PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 8302 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr2 70342945 70343256 70343171 Y NA PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 15262 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 70823463 70823663 70823562 Y TGFA TGFA NA NA NA NA TGFA 44138 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 74152201 74152400 74152268 Y NA DGUOK NA NA NA NA DGUOK 248 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr2 74153090 74153262 74153147 Y NA DGUOK NA NA NA NA DGUOK 1137 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr2 78328146 78328439 78328293 Y NA NA NA NA NA NA AC105399.2 314638 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 78386991 78387304 78387148 Y NA NA NA NA NA NA AC105399.2 373483 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 78478830 78479153 78479031 Y NA NA NA NA NA NA AC105399.2 465322 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 78632836 78632912 78632895 Y NA NA NA NA NA NA AC105399.2 619328 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 78683398 78683574 78683486 Y NA NA NA NA NA NA AC105399.2 669890 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 84878729 84879090 84878910 Y NA NA NA NA NA NA DNAH6 137150 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 85147093 85147556 85147171 Y TMSB10 TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 16344 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 85173188 85173797 85173736 Y TMSB10 TMSB10,KCMF1 KCMF1,TMSB10 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KCMF1 22419 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr2 85567649 85568034 85567918 Y NA TGOLN2,ELMOD3,RETSAT TGOLN2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ELMOD3 11483 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 85664544 85665596 85664830 Y KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6 CAPG NA NA NA NA CAPG 20989 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 85887180 85887589 85887391 Y SH2D6,SFTPB C2orf68 NA NA NA NA C2orf68 49991 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 85993562 85993638 85993601 Y NA RNU1-38P NA NA NA NA RNU1-38P 40102 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 86722974 86723324 86723287 Y NA NA NA NA NA NA KDM3A 57204 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 86922220 86922584 86922381 Y NA RMND5A,CHMP3,RNF103-CHMP3 NA NA NA NA RMND5A 22712 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr2 91936197 91936406 91936290 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2947035 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 91954549 91954973 91954634 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2965387 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 91960340 91960566 91960493 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2971178 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr2 96782666 96782871 96782861 Y NA ADRA2B,DUSP2 NA NA NA NA ADRA2B 2682 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr2 96871048 96871111 96871053 Y ASTL,DUSP2,KIAA1310,ARID5A,TMEM127 STARD7 NA NA NA NA STARD7 1452 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 96923964 96924135 96924075 Y DUSP2,KIAA1310,ARID5A,TMEM127 TMEM127,CIAO1,SNRNP200 NA NA NA NA TMEM127 5597 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 97151625 97152085 97151839 Y ASTL,DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,ARID5A NEURL3,ARID5A NA NA NA NA NEURL3 19761 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 98485830 98486136 98485916 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 124252 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 99452356 99452772 99452668 Y TSGA10,LIPT1,LIPT1,INPP4A,MGAT4A,MGAT4A NA NA NA NA NA MGAT4A 106767 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 100124156 100124186 100124170 Y NA REV1 NA NA NA NA REV1 19659 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr2 100907600 100907945 100907823 Y NA NA NA NA NA NA PDCL3 269207 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 101397207 101397582 101397418 Y C2orf29 NPAS2 NPAS2,RPL31,TBC1D8 IMR90 Hi-C 24141950 NPAS2 37032 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 101435496 101435968 101435616 Y NPAS2 NPAS2 NA NA NA NA NPAS2 882 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 101669826 101670190 101670079 Y TBC1D8 NA NA NA NA NA RPL31 53649 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 101680419 101680493 101680454 Y NA NA NA NA NA NA RPL31 64242 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr2 101712877 101712902 101712892 Y NA NA NA NA NA NA RPL31 96700 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 102595591 102595758 102595675 Y NA IL1R2 IL1R2,RFX8,MAP4K4,IL1RL2 IMR90 Hi-C 24141950 IL1R2 10548 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 106364522 106364900 106364611 Y TGFBRAP1,C2orf49,NCK2 NCK2 NA NA NA NA NCK2 5168 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 106474357 106474542 106474414 Y NA NA NA NA NA NA NCK2 115003 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 110016494 110016637 110016500 Y NA NA NA NA NA NA SEPT10 353146 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 110318153 110318301 110318244 Y NA NA NA NA NA NA SEPT10 51482 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 110859077 110859497 110859213 Y NA MALL NA NA NA NA MALL 12646 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 111879046 111879315 111879118 Y NA BCL2L11 NA NA NA NA BCL2L11 4091 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 112463608 112463919 112463793 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANAPC1 176348 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 113448603 113448987 113448785 Y IL36B,IL36G,IL1RN,IL1B,IL1A SLC20A1,NT5DC4 POLR1B,CHCHD5,SLC20A1,CKAP2L,FLJ42351 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5DC4 28076 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 113450750 113451037 113450852 Y NA SLC20A1,NT5DC4 SLC20A1,FLJ42351 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5DC4 26026 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 113583112 113583470 113583291 Y IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B NA NA NA NA NA CKAP2L 62858 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 113635122 113635394 113635287 Y NA NA IL1B,CKAP2L,IL37,IL1A IMR90 Hi-C 24141950 CKAP2L 114868 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 113881199 113882653 113881886 Y IL1A,IL1B,IL36G,IL36B,IL1RN PSD4 NA NA NA NA PSD4 30249 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 113924878 113925123 113925003 Y IL1A,IL1B,IL36G,IL36B,IL1RN,CBWD2 PSD4,PAX8-AS1 PSD4 K562 ChIA-PET 22265404 PSD4 11976 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 114014908 114015299 114015271 Y NA PAX8-AS1 NA NA NA NA PAX8-AS1 47809 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 114046330 114046643 114046448 Y NA NA PAX8,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 PAX8-AS1 79231 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr2 114082449 114082815 114082523 Y NA NA PAX8,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 PAX8-AS1 115350 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr2 114126317 114126521 114126419 Y IL1F10,IL1F10 NA PAX8,LOC654433,IL1RN,PSD4 IMR90 Hi-C 24141950 PAX8-AS1 159218 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 114132430 114132930 114132660 Y IL36G,IL36B,IL36RN,IL1RN,CBWD2 NA PAX8,IL1RN,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 PAX8-AS1 165331 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 114469366 114469830 114469722 Y SLC35F5 MIR4782,SLC35F5 NA NA NA NA MIR4782 7115 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 114672841 114673224 114672915 Y NA ACTR3 NA NA NA NA ACTR3 27304 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 118739522 118739775 118739730 Y DDX18,CCDC93 CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 29934 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 120996274 120996566 120996498 Y NA AC012363.4,TMEM185B,RALB EPB41L5,RALB,TMEM185B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RALB 634 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr2 121200367 121200763 121200697 Y NA NA NA NA NA NA RALB 204727 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 121495235 121495636 121495561 Y NA GLI2 GLI2 IMR90 Hi-C 24141950 GLI2 4036 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr2 122226715 122226882 122226860 Y NA NA NA NA NA NA RNU4ATAC 59575 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 127862609 127862665 127862637 Y NA BIN1 NA NA NA NA BIN1 266 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 128090505 128090721 128090714 Y NA ERCC3 NA NA NA NA ERCC3 40753 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 128119420 128119722 128119576 Y NA MAP3K2 IWS1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K2 24319 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 128165400 128165641 128165534 Y NA MAP3K2,PROC NA NA NA NA PROC 8362 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 128258405 128258697 128258648 Y NA IWS1,MYO7B NA NA NA NA IWS1 23765 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 128283052 128283292 128283172 Y MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L IWS1,MYO7B NA NA NA NA IWS1 590 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 128469057 128469300 128469179 Y NA SFT2D3 NA NA NA NA SFT2D3 12460 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 128617356 128617514 128617464 Y NA POLR2D NA NA NA NA POLR2D 3625 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 128651321 128651407 128651347 Y PROC,LIMS2,AMMECR1L POLR2D SAP130 IMR90 Hi-C 24141950 POLR2D 37590 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 129074706 129075071 129074888 Y NA HS6ST1 NA NA NA NA HS6ST1 555 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 129248071 129248194 129248123 Y NA NA NA NA NA NA HS6ST1 173920 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 131828545 131828813 131828794 Y NA FAM168B,PLEKHB2 NA NA NA NA FAM168B 20220 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 131863489 131864378 131863990 Y PLEKHB2 FAM168B,PLEKHB2 NA NA NA NA PLEKHB2 3069 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 134878523 134878632 134878609 Y MGAT5 MGAT5 NA NA NA NA MGAT5 2969 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 134878887 134879265 134878997 Y NA MGAT5 NA NA NA NA MGAT5 3333 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 136268329 136268541 136268430 Y NA ZRANB3,R3HDM1 NA NA NA NA ZRANB3 18265 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr2 136880226 136880532 136880413 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 CXCR4 NA NA NA NA CXCR4 6491 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 139260181 139260311 139260246 Y SPOPL AC097721.2,SPOPL NA NA NA NA SPOPL 2810 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 148671388 148671433 148671412 Y ORC4,ORC4,ORC4,ORC4,ORC4 NA NA NA NA NA ACVR2A 71302 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr2 149017229 149017560 149017414 Y NA NA NA NA NA NA ORC4 240082 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 149403654 149404182 149403820 Y NA EPC2 NA NA NA NA EPC2 3645 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 149527542 149527937 149527740 Y EPC2 NA NA NA NA NA EPC2 127533 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 149925246 149925613 149925433 Y NA LYPD6B NA NA NA NA LYPD6B 32625 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 150222263 150222576 150222421 Y NA LYPD6 NA NA NA NA LYPD6 37764 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 150470264 150470563 150470414 Y NA AC144449.1,MMADHC RND3,RBM43 IMR90 Hi-C 24141950 MMADHC 27934 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 152144821 152144962 152144854 Y RIF1,RIF1,RIF1,NMI RBM43,NMI NA NA NA NA NMI 250 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr2 152789657 152790028 152790018 Y FMNL2 NA NA NA NA NA ARL5A 106651 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 152971717 152971973 152971845 Y NA NA NA NA NA NA STAM2 58533 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 153057173 153057360 153057266 Y FMNL2 STAM2 FMNL2 IMR90 Hi-C 24141950 STAM2 26667 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 153263916 153264284 153263950 Y NA NA NA NA NA NA FMNL2 74165 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 157190328 157191531 157191235 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 5329 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr2 157191997 157192231 157192220 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 4629 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 157659765 157659881 157659802 Y NA NA NA NA NA NA GPD2 369963 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 159354074 159354382 159354127 Y NA PKP4 NA NA NA NA PKP4 42598 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr2 160059380 160059738 160059444 Y NA NA NA NA NA NA WDSUB1 81572 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 160097747 160098072 160097910 Y TANC1 WDSUB1 NA NA NA NA WDSUB1 43238 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 160646880 160647090 160646985 Y NA CD302 NA NA NA NA CD302 5663 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 160752173 160752279 160752226 Y LY75 LY75-CD302,LY75 NA NA NA NA LY75-CD302 6942 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 161078300 161078513 161078433 Y ITGB6 ITGB6 RBMS1,ITGB6,TANK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB6 47886 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 161098241 161098623 161098428 Y ITGB6 ITGB6 TANK,ITGB6,RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB6 27776 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr2 161995122 161995254 161995230 Y TANK,TANK TANK NA NA NA NA TANK 3703 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 162095171 162095411 162095272 Y TBR1,SLC4A10 AC009299.3 NA NA NA NA AC009299.3 3839 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 162197345 162197490 162197464 Y NA PSMD14,AC009299.5 NA NA NA NA AC009299.5 1508 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 165430240 165430431 165430256 Y NA GRB14 NA NA NA NA GRB14 45927 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 166649551 166649790 166649651 Y GALNT3 GALNT3 NA NA NA NA GALNT3 359 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 168994093 168994243 168994234 Y NA NA NA NA NA NA STK39 108408 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 169409032 169409398 169409117 Y NA NA NA NA NA NA CERS6 98660 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 169677226 169677236 169677231 Y NA NOSTRIN NA NA NA NA NOSTRIN 36177 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 169893346 169893881 169893427 Y DHRS9,DHRS9 DHRS9 ABCB11 K562 ChIA-PET 22265404 DHRS9 25418 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 172628972 172629294 172629196 Y NA NA NA NA NA NA DYNC1I2 87053 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 173302497 173302807 173302540 Y NA ITGA6 NA NA NA NA ITGA6 12415 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 173306862 173307108 173306983 Y NA ITGA6 NA NA NA NA ITGA6 16780 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr2 173316258 173316587 173316571 Y NA ITGA6 NA NA NA NA ITGA6 26176 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 173826948 173827225 173827025 Y ZAK NA NA NA NA NA CDCA7 390323 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 175069870 175070170 175070019 Y WIPF1,SP3,SP3 OLA1 NA NA NA NA OLA1 41256 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 178100990 178101571 178101482 Y NA HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128 NA NA NA NA MIR3128 17167 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 178104644 178105169 178104872 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128 NA NA NA NA MIR3128 13569 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr2 178116726 178117036 178116927 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128 NA NA NA NA MIR3128 1702 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr2 180098781 180098979 180098880 Y NA SESTD1 NA NA NA NA SESTD1 28538 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 180579667 180579746 180579673 Y ZNF385B,ZNF385B NA NA NA NA NA CWC22 290094 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 181776008 181776093 181776087 Y NA FTH1P20 NA NA NA NA FTH1P20 39867 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 182956199 182956480 182956369 Y NA NA NA NA NA NA PPP1R1C 139231 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 187420042 187420288 187420183 Y ITGAV,ITGAV,ZC3H15 ITGAV ZC3H15,ITGAV IMR90 Hi-C 24141950 ITGAV 32504 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 187922387 187922712 187922454 Y NA NA NA NA NA NA FAM171B 365689 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 189391407 189391613 189391501 Y GULP1 NA NA NA NA NA GULP1 237011 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 190324760 190324912 190324838 Y NA WDR75 NA NA NA NA WDR75 20601 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 191075616 191075973 191075872 Y NA NA NA NA NA NA INPP1 130223 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 191377806 191377826 191377816 Y NA TMEM194B NA NA NA NA TMEM194B 19622 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 191815156 191815612 191815322 Y GLS AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 40681 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 192562556 192562918 192562693 Y NA NA NA NA NA NA SDPR 147063 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 193356347 193356635 193356490 Y NA NA NA NA NA NA SDPR 646366 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 197895243 197895319 197895281 Y NA NA NA NA NA NA PGAP1 104723 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 200800298 200800427 200800328 Y SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69 C2orf69,C2orf47,TYW5 NA NA NA NA C2orf47 17613 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 201167757 201168004 201167857 Y SPATS2L,SPATS2L SPATS2L NA NA NA NA SPATS2L 600 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr2 201238754 201239056 201238905 Y NA NA NA NA NA NA SPATS2L 70150 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 201289842 201289940 201289893 Y NA NA NA NA NA NA SGOL2 82791 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 201829288 201829721 201829590 Y KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2 AC005037.3,ORC2 NA NA NA NA ORC2 2885 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 201990242 201990732 201990460 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 11415 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 202078581 202078959 202078777 Y CASP10 CASP10,CASP8 NA NA NA NA CASP8 17207 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 202100663 202100910 202100770 Y NA CASP8 NA NA NA NA CASP8 4497 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 202109391 202109622 202109507 Y NA CASP8 NA NA NA NA CASP8 13225 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 202898182 202898685 202898353 Y TMEM237,FZD7 NA NA NA NA NA PSMA2P3 143335 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 203239784 203239912 203239798 Y NA BMPR2 NA NA NA NA BMPR2 125 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 204311629 204311925 204311741 Y NBEAL1,CYP20A1,ABI2 NA NA NA NA NA RAPH1 86208 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr2 204315265 204315638 204315451 Y NA NA NA NA NA NA RAPH1 82495 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 204362935 204363240 204363075 Y NA RAPH1 NA NA NA NA RAPH1 34893 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 206948392 206948813 206948647 Y NA AC007383.3,INO80D NA NA NA NA INO80D 214 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 208395422 208395980 208395659 Y PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1 CREB1,AC007879.5 NA NA NA NA AC007879.5 2903 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 210872654 210873081 210872784 Y C2orf67 RPE NA NA NA NA RPE 7365 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 211032670 211033036 211032982 Y NA AC006994.2 NA NA NA NA AC006994.2 1206 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 211404935 211405006 211404955 Y CPS1 NA NA NA NA NA LANCL1 64559 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 215735917 215736192 215736055 Y NA NA NA NA NA NA BARD1 63489 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 216222058 216222324 216222191 Y FN1 ATIC NA NA NA NA ATIC 47518 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 217180784 217180970 217180877 Y NA NA NA NA NA NA SMARCAL1 94167 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 217501395 217501614 217501574 Y NA PSMB3P2,IGFBP2 NA NA NA NA IGFBP2 5844 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 218764264 218764471 218764407 Y TMBIM1,SLC11A1,PNKD,ARPC2,ARPC2 NA NA NA NA NA TNS1 101247 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 218857857 218858115 218857951 Y NA TNS1 TNS1,RUFY4 IMR90 Hi-C 24141950 TNS1 7603 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 219152622 219152760 219152751 Y USP37,SLC11A1,PNKD GPBAR1,AAMP,PNKD,TMBIM1 NA NA NA NA TMBIM1 2549 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 219270976 219271406 219271230 Y CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1 CTDSP1,VIL1 NA NA NA NA CTDSP1 9997 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr2 219271996 219272374 219272308 Y USP37 CTDSP1,VIL1 NA NA NA NA VIL1 9441 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 219434664 219435146 219434778 Y USP37 USP37,RQCD1,PLCD4 NA NA NA NA RQCD1 3361 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr2 219596297 219596622 219596516 Y TMBIM1,PNKD,SLC11A1,USP37,TTLL4,CYP27A1 TTLL4,CYP27A1 NA NA NA NA TTLL4 22729 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 219759139 219759434 219759370 Y WNT6,WNT10A WNT10A NA NA NA NA WNT10A 16054 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr2 219761045 219761550 219761369 Y USP37,ZNF142,ZFAND2B,TUBA4A,CNPPD1,ANKZF1,ANKZF1,WNT10A WNT10A NA NA NA NA WNT10A 17960 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 219773515 219774011 219773826 Y USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A WNT10A NA NA NA NA WNT10A 30430 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr2 220400310 220400471 220400469 Y NA GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1 NA NA NA NA TMEM198 5914 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr2 221000091 221000153 221000122 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A3 510042 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 222826690 222827411 222827014 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 SGPP2 459825 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr2 223595926 223596259 223596093 Y NA NA NA NA NA NA MOGAT1 61421 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 224569350 224569680 224569515 Y NA NA AP1S3 IMR90 Hi-C 24141950 AP1S3 131064 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 225249837 225250244 225250048 Y NA NA NA NA NA NA CUL3 197866 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 225307433 225307612 225307516 Y FAM124B NA FAM124B,CUL3,SERPINE2 IMR90 Hi-C 24141950 CUL3 140498 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 2.1127643696807 chr2 225747342 225747583 225747427 Y NA NA NA NA NA NA DOCK10 157579 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 226985613 226985988 226985800 Y NA NA IRS1,LOC646736 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRS1 676487 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 227586845 227587105 227586929 Y NA NA NA NA NA NA IRS1 75370 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 227656309 227656561 227656437 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 5914 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 227665859 227666449 227665964 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 3384 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 228437239 228437625 228437329 Y NA NA NA NA NA NA AGFG1 102371 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 228578021 228578290 228578242 Y NA SLC19A3 NA NA NA NA SLC19A3 2438 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 228717939 228718338 228718141 Y NA CCL20 WDR69 IMR90 Hi-C 24141950 CCL20 41381 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 231922388 231922877 231922602 Y NA C2orf72,PSMD1 NA NA NA NA PSMD1 2810 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 231965808 231966135 231965987 Y NA PSMD1 NA NA NA NA PSMD1 46230 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.52588537810273 chr2 232229850 232230117 232229960 Y NA B3GNT7 NA NA NA NA B3GNT7 28137 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 232276597 232276762 232276665 Y B3GNT7 B3GNT7,SNORD82 NA NA NA NA B3GNT7 18343 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 232277113 232277443 232277206 Y C2orf72 B3GNT7,SNORD82 NA NA NA NA B3GNT7 18859 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr2 232468888 232470128 232469532 Y DIS3L2,PTMA,NMUR1 NA NA NA NA NA LINC00471 91838 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr2 232478392 232478857 232478528 Y DIS3L2,PTMA NA NA NA NA NA PTMA 90748 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr2 232478879 232479328 232479053 Y NA NA NA NA NA NA PTMA 90277 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr2 232507409 232507767 232507481 Y NA NA PDE6D IMR90 Hi-C 24141950 PTMA 61838 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 232526700 232527324 232527119 Y DIS3L2 PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 42281 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 232530920 232531416 232531295 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 38189 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr2 232531704 232531853 232531745 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 37752 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 232537656 232538064 232537748 Y NA PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 31541 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr2 232545684 232546083 232545868 Y COPS7B PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 23522 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr2 232546670 232546982 232546826 Y NA PTMA PTMA,PDE6D K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTMA 22623 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 232566219 232566469 232566340 Y NA PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 3136 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 233763823 233764207 233764133 Y EFHD1,NGEF C2orf82 NA NA NA NA C2orf82 43843 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 233766797 233767190 233766879 Y NA C2orf82 NA NA NA NA C2orf82 46817 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr2 233876295 233876308 233876302 Y NEU2,NGEF NGEF NA NA NA NA NGEF 313 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 234357256 234357513 234357369 Y NA NA NA NA NA NA DGKD 96103 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr2 234465976 234466363 234466311 Y HJURP USP40 NA NA NA NA USP40 7065 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 234608579 234609196 234608912 Y NA UGT1A6,UGT1A5 NA NA NA NA UGT1A6 10326 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 234630754 234630813 234630784 Y NA UGT1A6,UGT1A5,UGT1A1 NA NA NA NA UGT1A5 11116 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 236547901 236548387 236548201 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 147168 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 236610513 236610911 236610705 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 209780 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 236910231 236910384 236910319 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 509498 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 237482983 237483115 237483021 Y NA NA NA NA NA NA COPS8 508840 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 238036930 238037258 238037105 Y NA COPS8,AC105760.2 COPS8,COL6A3,MLPH,PRLH,RAB17,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 44470 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr2 238190645 238190921 238190759 Y NA NA MLPH,COL6A3,COPS8,RAB17,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 198185 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 238199102 238199242 238199209 Y COL6A3 NA COL6A3,COPS8,MLPH,LRRFIP1,PRLH,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 MLPH 192829 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 238391204 238391436 238391383 Y LRRFIP1,MLPH MLPH NA NA NA NA MLPH 635 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 238876433 238876638 238876539 Y LRRFIP1,UBE2F UBE2F NA NA NA NA UBE2F 2964 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 239050654 239050828 239050729 Y KLHL30 NA NA NA NA NA ILKAP 59542 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 239080379 239080669 239080523 Y NA ILKAP NA NA NA NA ILKAP 29701 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 239194414 239194788 239194667 Y NA HES6,PER2,TRAF3IP1 LOC643387,LOC151174,HES6 IMR90 Hi-C 24141950 PER2 1955 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 239347857 239348510 239348285 Y ASB1 ASB1 NA NA NA NA ASB1 14474 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr2 240190277 240190476 240190405 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 130654 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 240196255 240196671 240196554 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 124459 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr2 240196933 240197336 240197049 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 123794 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr2 240213505 240213689 240213606 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 107441 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 240386953 240387173 240387118 Y NA NA NDUFA10,HDAC4,LOC150935 IMR90 Hi-C 24141950 HDAC4 65605 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 241309624 241309945 241309791 Y GPC1 NA PP14571,GPC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPC1 63143 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 241366341 241366661 241366471 Y GPR35,GPC1 GPC1 NA NA NA NA GPC1 6427 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr2 241373489 241373922 241373594 Y GPC1 GPC1 NA NA NA NA GPC1 401 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 241561048 241561275 241561167 Y DUSP28,RNPEPL1,CAPN10,GPR35 CAPN10 NA NA NA NA CAPN10 36915 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr2 241960934 241960944 241960939 Y AQP12A,PASK SNED1,AC005237.4 NA NA NA NA SNED1 24679 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr2 242549642 242550327 242549774 Y ATG4B ATG4B,THAP4 NA NA NA NA ATG4B 24301 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr2 242714145 242714474 242714395 Y NEU4,D2HGDH,GAL3ST2 D2HGDH NA NA NA NA D2HGDH 42151 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr20 321375 321752 321587 Y NA ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3 NA NA NA NA NRSN2 3674 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 1258531 1258969 1258603 Y NA SNPH,SDCBP2 FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495 IMR90 Hi-C 24141950 SNPH 13571 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 1259137 1259285 1259212 Y C20orf46,C20orf202 SNPH,SDCBP2 NA NA NA NA SNPH 14177 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 1307828 1308261 1308086 Y SDCBP2 NA NA NA NA NA SDCBP2 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 1310858 1311228 1310987 Y SDCBP2,SDCBP2,SIRPG SDCBP2 NA NA NA NA SDCBP2 2975 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr20 4072203 4072410 4072307 Y NA SMOX RNF24,PANK2,MAVS,LOC728228,CDC25B,C20orf29,MIR103B2,SMOX,ADRA1D IMR90 Hi-C 24141950 SMOX 27217 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 4116351 4116485 4116423 Y PANK2,PANK2,SMOX SMOX ADRA1D,SMOX IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMOX 16724 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr20 5512444 5512652 5512587 Y CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1 NA NA NA NA NA GPCPD1 77020 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 5589880 5590681 5590650 Y CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 208 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 10471502 10471750 10471599 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 58632 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 14248741 14249040 14248807 Y NA NA NA NA NA NA FLRT3 67222 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 15936534 15936777 15936657 Y NA NA NA NA NA NA KIF16B 615301 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 17554539 17554936 17554702 Y NA BFSP1,DSTN NA NA NA NA DSTN 6031 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr20 17637776 17637930 17637851 Y BANF2 RRBP1 NA NA NA NA RRBP1 23010 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 17946136 17946538 17946496 Y SNX5,SNX5 SNORD17,SNX5,PTMAP3 NA NA NA NA SNX5 1085 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 18276093 18276447 18276109 Y CSRP2BP ZNF133 NA NA NA NA ZNF133 8972 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 19716018 19716528 19716293 Y NA RP1-122P22.2 NA NA NA NA RP1-122P22.2 19824 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr20 19717747 19718119 19717916 Y NA RP1-122P22.2 NA NA NA NA RP1-122P22.2 18233 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 19737104 19737460 19737269 Y NA RP1-122P22.2 SLC24A3,RIN2,C20orf26,CRNKL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP1-122P22.2 752 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr20 19783112 19783320 19783290 Y NA RP1-122P22.2 RIN2,SLC24A3 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-122P22.2 46760 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr20 22567524 22567732 22567628 Y NA FOXA2 NA NA NA NA FOXA2 3431 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 24722182 24722302 24722287 Y NA NA SYNDIG1 IMR90 Hi-C 24141950 ACSS1 315314 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 24947572 24947946 24947787 Y NA NA NA NA NA NA ACSS1 89670 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 25214082 25214352 25214216 Y ENTPD6,PYGB ENTPD6,PYGB NA NA NA NA PYGB 12353 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.52588537810273 chr20 25218471 25218756 25218634 Y NA ENTPD6,PYGB NA NA NA NA PYGB 7949 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr20 25226687 25226893 25226791 Y NA NA NA NA NA NA PYGB 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 25227226 25227454 25227251 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 521 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr20 25227906 25228088 25227908 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 1201 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr20 25229395 25229593 25229494 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 2690 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 25267859 25268242 25268026 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 41154 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 25671297 25671837 25671511 Y NA ZNF337 NA NA NA NA ZNF337 3640 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr20 25846181 25846562 25846485 Y ZNF337 NA NA NA NA NA RP13-401N8.1 116327 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 29647996 29648434 29648295 Y DEFB121,DEFB116 FRG1B NA NA NA NA FRG1B 38139 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 30148718 30149081 30148825 Y HCK,HM13 HM13,ID1 NA NA NA NA ID1 42005 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 30161920 30162316 30162154 Y NA ID1 NA NA NA NA ID1 28770 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 30182515 30183026 30182914 Y NA ID1 HM13 MCF7 ChIA-PET 22265404 ID1 8060 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 30191850 30192346 30192159 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 764 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr20 30249247 30249862 30249570 Y TTLL9 NA NA NA NA NA ID1 58161 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 30255856 30255976 30255884 Y NA NA NA NA NA NA BCL2L1 53816 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 30260311 30260679 30260495 Y NA BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 49113 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 30263216 30263335 30263276 Y NA BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 46457 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 30263480 30263875 30263840 Y NA BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 45917 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 30292336 30292785 30292516 Y NA BCL2L1,TPX2 COX4I2 IMR90 Hi-C 24141950 BCL2L1 17007 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr20 30300504 30300973 30300648 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 8819 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr20 30301047 30301377 30301326 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 8415 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr20 30305141 30305549 30305422 Y PLAGL2,HCK BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 4243 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 30307720 30308274 30308104 Y POFUT1 BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 1518 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr20 31045263 31045487 31045417 Y KIF3B NA NA NA NA NA ASXL1 101108 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 31063072 31063625 31063366 Y NA NA ASXL1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf112 107251 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.9953885713651 chr20 32400902 32401106 32400958 Y CHMP4B CHMP4B NA NA NA NA CHMP4B 3792 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 32690137 32690399 32690268 Y NA EIF2S2,RPS2P1 NA NA NA NA EIF2S2 7739 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 33055325 33055363 33055345 Y NA DYNLRB1 NA NA NA NA DYNLRB1 46851 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 33861234 33861630 33861491 Y NA EDEM2,EIF6 NA NA NA NA EDEM2 2298 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 33906285 33906606 33906471 Y GSS,EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 35497 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr20 34197138 34197351 34197252 Y NA FER1L4,SPAG4 NA NA NA NA FER1L4 3654 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr20 34303643 34304038 34303890 Y NA ROMO1,NFS1,RBM39 NA NA NA NA NFS1 18362 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 34652590 34653055 34652672 Y NA EPB41L1 LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EPB41L1 24371 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr20 34681523 34681969 34681863 Y EPB41L1,DLGAP4,EPB41L1 EPB41L1 LOC647979,PHF20,EPB41L1,C20orf4,C20orf152 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPB41L1 4097 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 35102828 35103254 35103050 Y NA NA NA NA NA NA MYL9 64633 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 35234952 35235695 35235080 Y NA TGIF2,C20orf24 NA NA NA NA C20orf24 2815 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr20 35305263 35305453 35305359 Y NA NA NA NA NA NA NDRG3 67028 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr20 35305679 35305903 35305811 Y NA NA NA NA NA NA NDRG3 66578 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr20 35464098 35464342 35464182 Y RBL1,DSN1,DSN1 NA NA NA NA NA DSN1 63877 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.29113378147154 chr20 35972053 35972195 35972121 Y SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC SRC NA NA NA NA SRC 965 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr20 36034782 36035452 36035129 Y C20orf132,VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 36484 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 36040005 36040428 36040132 Y VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 31508 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 36772576 36772945 36772677 Y RPRD1B,BPI TGM2 NA NA NA NA TGM2 20035 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 37302978 37303466 37303191 Y ACTR5,SLC32A1 NA ARHGAP40,ACTR5,SLC32A1,PPP1R16B IMR90 Hi-C 24141950 ACTR5 71619 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 40321359 40321668 40321514 Y NA NA CHD6 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD6 76226 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 42189975 42190335 42190153 Y SGK2,SGK2 SGK2,IFT52 NA NA NA NA SGK2 4367 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 42286061 42286420 42286177 Y SRSF6,L3MBTL1,MYBL2 RPL27AP,MYBL2 MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL27AP 6898 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr20 43965327 43965544 43965453 Y SDC4 SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 9520 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 43974041 43974470 43974334 Y NA SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 594 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr20 45870109 45870518 45870490 Y ZMYND8,NCOA3 NA NA NA NA NA RP4-569M23.2 108787 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr20 45946049 45946481 45946179 Y NA RP4-569M23.2,ZMYND8 NA NA NA NA RP4-569M23.2 32824 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 45960088 45960376 45960270 Y ZMYND8 RP4-569M23.2,ZMYND8 NA NA NA NA RP4-569M23.2 18929 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 45987479 45988292 45987961 Y NA RP4-569M23.2,ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 3912 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 45989347 45989834 45989660 Y SULF2 RP4-569M23.2,ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 5780 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr20 46021549 46021674 46021604 Y NA RP4-569M23.2,ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,SLC2A10,EYA2,NCOA3,PARD6B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZMYND8 37982 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 46067688 46067974 46067774 Y NCOA3 NA NCOA3,ZMYND8 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA3 60627 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 46438543 46438763 46438619 Y SULF2,SULF2 SULF2 NA NA NA NA SULF2 25183 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr20 46601191 46601469 46601377 Y SULF2,SULF2 NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SULF2 187831 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr20 47750965 47751079 47750977 Y ZNFX1 NA NA NA NA NA STAU1 51825 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 47803381 47804147 47803544 Y PREX1,STAU1 STAU1,DDX27 NA NA NA NA STAU1 477 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 5.28191092420175 chr20 48285223 48285402 48285313 Y SPATA2,SLC9A8 B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 43013 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr20 48291121 48291501 48291391 Y ZNFX1,SNAI1,SLC9A8,B4GALT5 B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 36914 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 48311078 48311758 48311363 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 16657 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 48391675 48392320 48391995 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC9A8 34930 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr20 48726581 48727101 48726820 Y SPATA2,SPATA2 UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189 NA NA NA NA UBE2V1 3395 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 48900220 48901229 48900600 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 RP11-290F20.3 PTPN1,LOC284751,PARD6B,FAM65C,MIR645,CEBPB,TMEM189-UBE2V1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-290F20.3 18197 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr20 48924890 48925591 48925260 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 RP11-290F20.3 NA NA NA NA RP11-290F20.3 42867 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr20 49032230 49032497 49032297 Y NA NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 92394 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr20 49341306 49341865 49341532 Y NA PARD6B NCOA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 PARD6B 4216 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 49345638 49345902 49345710 Y MOCS3,PARD6B PARD6B NA NA NA NA PARD6B 179 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr20 49346260 49347200 49346344 Y NA PARD6B NA NA NA NA PARD6B 179 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr20 49378305 49378754 49378413 Y DPM1,PARD6B,BCAS4 PARD6B,BCAS4 NA NA NA NA BCAS4 30677 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr20 50072988 50073809 50073517 Y NA NA NA NA NA NA NFATC2 103561 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 50366772 50367203 50366881 Y ZFP64,ATP9A ATP9A NA NA NA NA ATP9A 15970 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr20 50383575 50384083 50383723 Y ATP9A ATP9A NA NA NA NA ATP9A 402 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr20 52355086 52355238 52355182 Y NA NA ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 130640 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 53250335 53250676 53250406 Y DOK5 NA NA NA NA NA PFDN4 427949 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 55968808 55969481 55968821 Y ZBP1,PMEPA1 RAE1,MTRNR2L3,RBM38 NA NA NA NA RBM38 4345 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 56010646 56011025 56010972 Y NA RBM38 NA NA NA NA RBM38 46183 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr20 56592800 56593208 56592856 Y NA NA ZBP1,PMEPA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP4R1L 289287 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 57018014 57018479 57018179 Y STX16 NA NA NA NA NA VAPB 55836 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 60934143 60934390 60934309 Y TAF4,PSMA7,SS18L1,RPS21,NTSR1,CABLES2,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5 LAMA5,RPS21,CABLES2 ADRM1 K562 ChIA-PET 22265404 LAMA5 5978 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 60939635 60939778 60939673 Y SLCO4A1,NTSR1,LAMA5 LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 590 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 61001783 61002051 61001918 Y NA RPS21,CABLES2 NA NA NA NA CABLES2 21442 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr20 61057611 61057886 61057678 Y NA NA NA NA NA NA CABLES2 77270 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 61192605 61193059 61192901 Y NA NA NA NA NA NA SLCO4A1 78738 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 61283206 61283870 61283565 Y OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1 SLCO4A1,RP11-93B14.5 NA NA NA NA SLCO4A1 11409 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr20 61317452 61317806 61317666 Y DPH3P1,OGFR,SLCO4A1 SLCO4A1,RP11-93B14.5 NA NA NA NA RP11-93B14.5 21376 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr20 61342361 61342694 61342588 Y NA RP11-93B14.5 NA NA NA NA RP11-93B14.5 46285 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 61400175 61400479 61400325 Y NA OGFR,COL9A3 NA NA NA NA OGFR 33708 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 61425509 61425950 61425706 Y DPH3P1,DIDO1,OGFR OGFR,COL9A3 NA NA NA NA OGFR 8237 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 61806793 61806933 61806887 Y STMN3,KCNQ2,EEF1A2,COL20A1,CHRNA4 YTHDF1 NA NA NA NA YTHDF1 38653 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 62170184 62170345 62170251 Y YTHDF1,UCKL1,SAMD10,PRPF6,PTK6,SRMS,C20orf195 EEF1A2,PPDPF,PTK6 NA NA NA NA PTK6 3461 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 62176586 62176848 62176717 Y NA EEF1A2,PPDPF,PTK6 NA NA NA NA PTK6 9863 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.29113378147154 chr20 62887659 62888425 62887862 Y SAMD10,PCMTD2 PCMTD2 NA NA NA NA PCMTD2 2565 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 10852099 10852403 10852350 Y NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 885514 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 11130122 11130404 11130162 Y NA NA BAGE5 IMR90 Hi-C 24141950 TEKT4P2 1163537 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 16345757 16346184 16346094 Y NA NA NA NA NA NA NRIP1 89137 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 17276028 17276063 17276046 Y NA NA NA NA NA NA USP25 175684 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 17924273 17924626 17924451 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 269184 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 18886111 18886899 18886569 Y NA CXADR NA NA NA NA CXADR 3411 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 18984370 18984546 18984496 Y NA BTG3 NA NA NA NA BTG3 1105 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 26952057 26952278 26952105 Y JAM2 MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 25551 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 27370700 27370785 27370725 Y NA NA NA NA NA NA APP 170661 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr21 29765694 29766009 29765812 Y NA NA NA NA NA NA AL035610.1 346961 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr21 30009367 30009732 30009551 Y NA NA ADAMTS1,LINC00161 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 245961 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr21 33853478 33853730 33853567 Y NA NA NA NA NA NA C21orf119 90039 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 36208387 36209191 36208566 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 222946 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr21 36216696 36217156 36217046 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 231255 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr21 36217934 36218360 36217961 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 232493 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 36223731 36223900 36223856 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 238290 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 38282263 38282520 38282368 Y CLDN14 NA NA NA NA NA AP000704.5 54292 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 38500086 38500176 38500125 Y NA NA NA NA NA NA TTC3 56560 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 38630405 38630786 38630710 Y DYRK1A,DYRK1A AP001432.14,DSCR3 NA NA NA NA DSCR3 7476 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr21 38825760 38825986 38825873 Y NA NA NA NA NA NA DYRK1A 89668 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 38935728 38936411 38936235 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 199636 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr21 38936686 38937128 38936852 Y DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 200594 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr21 39723755 39724311 39724014 Y ETS2 NA NA NA NA NA ETS2 450920 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 40159439 40159794 40159507 Y NA ETS2 ETS2,LINC00114 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ETS2 15437 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 40202751 40202888 40202797 Y ETS2 ETS2 NA NA NA NA ETS2 27520 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 40211972 40212276 40212079 Y ETS2 ETS2 NA NA NA NA ETS2 36741 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 40338093 40338255 40338153 Y NA NA ETS2,LINC00114,PSMG1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS2 162862 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr21 40673787 40673929 40673891 Y NA BRWD1,HMGN1 NA NA NA NA BRWD1 17556 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr21 42543184 42543509 42543444 Y BACE2 BACE2,PLAC4 NA NA NA NA BACE2 5456 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr21 43654635 43655282 43654967 Y NA ABCG1 TFF3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCG1 36836 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr21 43885293 43886049 43885531 Y ZNF295,UMODL1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,UBASH3A SLC37A1,RSPH1 NA NA NA NA SLC37A1 28069 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr21 43892136 43892349 43892248 Y NA SLC37A1,RSPH1 NA NA NA NA SLC37A1 21769 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 44597156 44597534 44597315 Y SIK1 NA NA NA NA NA U2AF1 71459 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr21 44631329 44631684 44631488 Y NA NA LINC00313,SIK1,HSF2BP,LINC00319 IMR90 Hi-C 24141950 U2AF1 105632 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr21 44631926 44632172 44632049 Y NA NA LINC00313,SIK1,HSF2BP,LINC00319 IMR90 Hi-C 24141950 U2AF1 106229 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr21 44753292 44753457 44753456 Y NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 91551 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr21 44760713 44760913 44760830 Y NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 84095 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr21 44816664 44817004 44816885 Y NA SIK1 NA NA NA NA SIK1 28004 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr21 44850435 44851222 44850996 Y CBS SIK1 CRYAA,SIK1,HSF2BP,LINC00313,LINC00319,RRP1B IMR90 Hi-C 24141950 SIK1 5427 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr21 44856189 44856512 44856455 Y NA SIK1 CRYAA,SIK1,HSF2BP,LINC00313,LINC00319,RRP1B IMR90 Hi-C 24141950 SIK1 11181 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr21 44860778 44861412 44860950 Y SIK1 SIK1 NA NA NA NA SIK1 15770 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr21 44908266 44908370 44908324 Y NA NA LINC00319,SIK1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SIK1 63258 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 44914466 44914931 44914660 Y PDXK,U2AF1,SIK1 NA CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 69458 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 45117744 45118082 45118052 Y NA HSF2BP,RRP1B,PDXK PDXK IMR90 Hi-C 24141950 PDXK 18893 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 45132062 45132504 45132250 Y HSF2BP,PDXK PDXK NA NA NA NA PDXK 4471 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 45187861 45188442 45188176 Y ICOSLG,PDXK,CSTB CSTB,RRP1 NA NA NA NA CSTB 5884 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 45358133 45358224 45358178 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC10 71976 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 45604332 45605113 45604833 Y PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG NA ICOSLG,PWP2,DNMT3L,PFKL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C21orf33 52845 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 46097395 46097576 46097539 Y KRTAP10-7,KRTAP10-12 NA NA NA NA NA UBE2G2 122358 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 46185657 46185775 46185721 Y NA UBE2G2 NA NA NA NA UBE2G2 34159 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr21 46749567 46749782 46749739 Y NA POFUT2 COL18A1,LINC00315,LOC642852,POFUT2,COL18A1-AS1,LOC100129027,PCBP3,ADARB1,SLC19A1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 POFUT2 43754 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.40850957978713 chr21 46749941 46750271 46750188 Y NA POFUT2 COL18A1,LINC00315,LOC642852,POFUT2,COL18A1-AS1,LOC100129027,PCBP3,ADARB1,SLC19A1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 POFUT2 44128 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr21 46823895 46824295 46824014 Y COL18A1 COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 843 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr21 46824359 46824541 46824457 Y COL18A1 COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 1307 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr21 46836537 46836812 46836569 Y NA COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 13485 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 46894520 46894647 46894596 Y COL18A1 NA SLC19A1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC19A1 67678 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 47238270 47238607 47238438 Y NA NA NA NA NA NA COL6A1 161044 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr21 47563985 47564239 47564071 Y NA COL6A2,FTCD NA NA NA NA FTCD 9242 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr21 47637534 47637799 47637667 Y NA LSS,MCM3AP-AS1 NA NA NA NA LSS 8939 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 18919384 18919770 18919551 Y PRODH,PRODH DGCR6,PRODH,DGCR5 NA NA NA NA PRODH 2296 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr22 19378121 19378382 19378253 Y NA MRPL40 NA NA NA NA MRPL40 39043 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 19410653 19410889 19410838 Y HIRA MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39 NA NA NA NA MRPL40 6536 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 20850844 20851071 20850923 Y PI4KA,AIFM3,AIFM3 KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 2644 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 20863506 20864089 20863850 Y MED15 KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 15306 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr22 22011632 22012115 22011859 Y NA YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 7073 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr22 22170870 22171333 22171102 Y HIC2,PPM1F,MAPK1 MAPK1 NA NA NA NA MAPK1 48637 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 22334723 22335115 22334952 Y NA PPM1F,TOP3B NA NA NA NA TOP3B 98 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 23413714 23413937 23413833 Y NA GNAZ NA NA NA NA GNAZ 3174 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 23528251 23528416 23528284 Y BCR RAB36,BCR NA NA NA NA BCR 8360 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 23624437 23624690 23624563 Y BCR NA NA NA NA NA BCR 104546 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr22 23863943 23864332 23864232 Y GNAZ,RTDR1,BCR NA ZDHHC8P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC8P1 121030 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 24255997 24256450 24256302 Y C22orf43,CABIN1,CABIN1 MIF NA NA NA NA MIF 21806 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr22 25082452 25082825 25082629 Y ADORA2A,GGT1 CRIP1P4 PIWIL3 IMR90 Hi-C 24141950 CRIP1P4 23434 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr22 28261904 28262359 28262203 Y PITPNB,MN1 NA NA NA NA NA TTC28-AS1 51005 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 28314180 28314595 28314448 Y PITPNB TTC28-AS1,PITPNB NA NA NA NA PITPNB 58 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 29280564 29280869 29280661 Y NA ZNRF3 NA NA NA NA ZNRF3 2984 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr22 29505815 29505935 29505933 Y NA KREMEN1 NA NA NA NA KREMEN1 38749 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 30591785 30593544 30592394 Y NA LIF NA NA NA NA LIF 47296 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr22 30598549 30598642 30598596 Y LIF LIF HORMAD2,LIF,GATSL3 IMR90 Hi-C 24141950 LIF 42198 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 30604572 30605275 30604996 Y NA LIF HORMAD2,LIF,GATSL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIF 35565 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr22 30643780 30644513 30644215 Y GAL3ST1,LIF LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 2940 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr22 30644816 30645407 30645321 Y NA LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 3976 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 11.854955629875 chr22 30646485 30646883 30646861 Y SEC14L2,RNF215,LIF LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 5645 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr22 30648392 30648767 30648580 Y SF3A1 LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 7552 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr22 30649196 30649657 30649496 Y MTMR3,TBC1D10A,SF3A1,DUSP18,LIF,OSM LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 8356 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.9953885713651 chr22 30650339 30650644 30650477 Y LIF LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 9499 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr22 30651841 30652045 30651989 Y RNF215 LIF,GATSL3 LIF IMR90 Hi-C 24141950 LIF 11001 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr22 30653574 30654311 30654075 Y RNF215,GAL3ST1 LIF,GATSL3 LIF IMR90 Hi-C 24141950 LIF 12734 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 11.3854524366127 chr22 31298089 31298190 31298144 Y NA NA MORC2,MORC2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 MORC2 64094 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr22 31629034 31629491 31629163 Y SMTN,RNF185,LIMK2 LIMK2 NA NA NA NA LIMK2 22809 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 31639861 31640267 31640177 Y NA LIMK2,PIK3IP1 NA NA NA NA LIMK2 33636 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 32291389 32291694 32291650 Y RFPL2,SFI1,PRR14L,DEPDC5 YWHAH NA NA NA NA YWHAH 46753 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 32448968 32449243 32449043 Y SLC5A4,RFPL3,SLC5A1 SC22CB-1E7.1,SLC5A1 NA NA NA NA SLC5A1 11949 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 32465502 32465679 32465590 Y SLC5A4,SLC5A1 SC22CB-1E7.1,SLC5A1 NA NA NA NA SLC5A1 28483 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 32928366 32928835 32928615 Y NA NA NA NA NA NA FBXO7 59703 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 33176423 33176673 33176603 Y NA TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 19014 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 34055725 34056096 34055879 Y NA SNORA76 NA NA NA NA SNORA76 42810 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 34073272 34073505 34073390 Y NA SNORA76 NA NA NA NA SNORA76 25401 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 35528321 35528338 35528332 Y NA NA LARGE IMR90 Hi-C 24141950 CTA-714B7.5 96711 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 35529944 35530291 35530139 Y ISX NA LARGE IMR90 Hi-C 24141950 CTA-714B7.5 94758 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr22 35709404 35709640 35709485 Y APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1 TOM1 NA NA NA NA TOM1 16136 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 35710736 35710808 35710790 Y APOL6,TOM1,TOM1 TOM1 NA NA NA NA TOM1 17468 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 36149671 36149849 36149827 Y NA NA APOL5 IMR90 Hi-C 24141950 APOL6 107229 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 36172767 36172943 36172931 Y MB,MB,RBFOX2,RBFOX2 NA APOL5 IMR90 Hi-C 24141950 APOL6 130325 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 36245846 36246212 36246206 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 176261 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 36727482 36728450 36727733 Y APOL3 NA NA NA NA NA MYH9 53613 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr22 36728624 36729163 36728912 Y IFT27 NA NA NA NA NA MYH9 52900 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 36748222 36748386 36748297 Y NA MYH9 NA NA NA NA MYH9 33677 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 36750973 36751374 36751265 Y APOL3 MYH9 NA NA NA NA MYH9 30689 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 36765300 36765605 36765487 Y APOL3,NCF4,MYH9 MYH9 NA NA NA NA MYH9 16458 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 36766615 36766810 36766723 Y NCF4,MYH9 MYH9 NA NA NA NA MYH9 15253 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr22 36806147 36806450 36806256 Y NA MYH9 MYH9,FOXRED2,TXN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYH9 24084 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 36815362 36815553 36815536 Y NA MYH9 MYH9,FOXRED2,TXN2 IMR90 Hi-C 24141950 MYH9 33299 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 36866824 36867261 36867092 Y NA TXN2,FOXRED2 NA NA NA NA TXN2 8816 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 37428831 37429188 37428927 Y CARD10,TMPRSS6,TST,MPST MPST,TST,KCTD17 KCTD17,TMPRSS6 IMR90 Hi-C 24141950 TST 15150 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr22 37663226 37663580 37663275 Y MFNG,MFNG,NCF4,RAC2 RAC2 CARD10,C1QTNF6,SSTR3,RAC2,CYTH4,ELFN2,MFNG,CDC42EP1,LGALS2 IMR90 Hi-C 24141950 RAC2 24738 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 37897761 37897917 37897872 Y NA CARD10 NA NA NA NA CARD10 15632 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr22 37937864 37938255 37937972 Y SH3BP1,LGALS2,GGA1,GGA1 CARD10,CDC42EP1 CARD10,MFNG,LGALS2,PDXP,TRIOBP,ELFN2,CDC42EP1,GGA1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC42EP1 16199 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr22 37942064 37942352 37942192 Y KCTD17,TRIOBP,POLR2F,MICALL1,LGALS1,ANKRD54,CARD10,CDC42EP1 CARD10,CDC42EP1 ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC42EP1 12102 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr22 37957606 37958042 37957847 Y NA CARD10,CDC42EP1,GGA1 NA NA NA NA CDC42EP1 3152 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 38142899 38142964 38142949 Y CDC42EP1,LGALS1,TRIOBP,POLR2F,GCAT,ANKRD54 NA NA NA NA NA TRIOBP 51888 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 38568765 38569142 38568994 Y PLA2G6,PLA2G6,MAFF,MAFF MAFF,PLA2G6 NA NA NA NA MAFF 26747 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 38614588 38614867 38614785 Y MICALL1,TMEM184B,TMEM184B,CSNK1E,MAFF,MAFF MAFF,PLA2G6 NA NA NA NA PLA2G6 14891 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr22 38624836 38625209 38625138 Y JOSD1,GTPBP1,CSNK1E,MAFF MAFF,PLA2G6,TMEM184B NA NA NA NA PLA2G6 25139 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 39869379 39869438 39869422 Y NA ATF4 ATF4,SMCR7L IMR90 Hi-C 24141950 ATF4 44262 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr22 40781478 40781596 40781515 Y NA ADSL,SGSM3 NA NA NA NA SGSM3 16883 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr22 40958851 40958976 40958969 Y NA NA NA NA NA NA MKL1 71730 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 41047729 41047883 41047796 Y NA MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17023 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 41048065 41048352 41048232 Y EP300,MKL1 MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17359 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 41417973 41418366 41418067 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39690 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 41776948 41777130 41776981 Y NA TEF NA NA NA NA TEF 15611 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr22 41840300 41840792 41840564 Y NA TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 235 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 42062739 42062953 42062873 Y NA XRCC6,C22orf46,NHP2L1,MEI1 NA NA NA NA C22orf46 19990 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 42315897 42316153 42316014 Y CENPM,SHISA8,TNFRSF13C TNFRSF13C,CENPM NA NA NA NA TNFRSF13C 4669 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 43283489 43283802 43283626 Y NFAM1,POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2 ARFGAP3 NA NA NA NA ARFGAP3 31377 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr22 43333511 43333722 43333661 Y POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2 NA NA NA NA NA PACSIN2 75429 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr22 43369643 43369761 43369702 Y NA PACSIN2 NA NA NA NA PACSIN2 39390 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 43551882 43552085 43551987 Y ARFGAP3,PACSIN2 BIK,MCAT,TSPO,TTLL12 NA NA NA NA TSPO 6362 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 44321391 44321759 44321599 Y PNPLA3 PNPLA3,SAMM50,RP4-796I17.5 NA NA NA NA PNPLA3 3772 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 45554826 45555155 45554995 Y KIAA0930 CTA-217C2.1,NUP50 NA NA NA NA CTA-217C2.1 2507 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 45642150 45642482 45642292 Y NA KIAA0930 LOC100506714,NUP50,KIAA0930,UPK3A,FBLN1,SMC1B IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0930 7500 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 45820096 45820426 45820265 Y NA RIBC2 NA NA NA NA RIBC2 12524 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr22 45944996 45945587 45945178 Y NA FBLN1 NA NA NA NA FBLN1 48878 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr22 46035019 46035329 46035174 Y NA ATXN10 NA NA NA NA ATXN10 30349 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 46041491 46041960 46041628 Y NA ATXN10 ATXN10,WNT7B,FAM118A,SMC1B,FBLN1,LOC730668,LOC100271722,MIRLET7BHG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATXN10 23718 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 46370456 46370600 46370533 Y NA WNT7B NA NA NA NA WNT7B 409 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 46464940 46465203 46464976 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 1169 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 46467914 46468476 46468052 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 4143 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr22 46472616 46472825 46472697 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 8845 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr22 46480881 46481264 46481017 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 17110 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr22 46483894 46484294 46483949 Y C22orf26 RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 20123 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr22 46771050 46771392 46771204 Y NA TRMU NA NA NA NA TRMU 46278 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr22 46935060 46935431 46935290 Y CELSR1 CELSR1,GRAMD4 NA NA NA NA CELSR1 3993 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 47330872 47331057 47330965 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 174354 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 47525665 47525872 47525801 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 369147 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr22 48886346 48887067 48886885 Y FAM19A5 NA NA NA NA NA BRD1 1332093 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 50272789 50273094 50272966 Y NA ZBED4,CRELD2,ALG12 NA NA NA NA ZBED4 27299 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 50342658 50342932 50342773 Y NA CRELD2,ALG12,PIM3 PLXNB2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PIM3 9229 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.76063697473392 chr22 50364350 50364715 50364589 Y NA PIM3 NA NA NA NA PIM3 12189 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr22 50625511 50626004 50625814 Y BRD1,ZBED4,PIM3,SCO2,SBF1,PPP6R2,ODF3B,NCAPH2,CHKB,ARSA,PANX2,TUBGCP6,SELO,HDAC10 PANX2,TRABD,SELO NA NA NA NA TRABD 3167 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr22 50738042 50738272 50738161 Y NA MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 5784 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr22 50741799 50742849 50742615 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 1207 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr22 50742925 50743370 50743124 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 686 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr22 50743986 50744741 50744427 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr22 50744748 50744986 50744827 Y PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 692 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr22 50912071 50912698 50912340 Y NA SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2 NA NA NA NA SBF1 617 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr22 50977955 50978429 50978214 Y PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,SYCE3,CHKB-CPT1B NA NA NA NA ODF3B 8946 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 5028534 5029013 5028702 Y ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 8888 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 5059566 5059965 5059743 Y ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40-AS1 39920 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 5725857 5726011 5725946 Y NA NA NA NA NA NA EDEM1 498526 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 6398384 6398410 6398397 Y NA NA NA NA NA NA EDEM1 1171053 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 8540908 8541201 8541046 Y NA LMCD1 NA NA NA NA LMCD1 192 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 9422978 9423353 9423146 Y SETD5,RAD18,THUMPD3 THUMPD3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1 NA NA NA NA SETD5 13946 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 10240691 10241307 10240999 Y ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2,TATDN2 NA NA NA NA IRAK2 36142 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 10273840 10274164 10273944 Y VHL,IRAK2,TATDN2 TATDN2 NA NA NA NA TATDN2 13543 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 10402355 10402452 10402401 Y FANCD2 SEC13 NA NA NA NA SEC13 41493 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 11632872 11633201 11633091 Y SYN2,VGLL4 NA NA NA NA NA VGLL4 127019 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 11812040 11812191 11812115 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 51820 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 13035460 13035932 13035883 Y CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1 NA NA NA NA NA IQSEC1 76685 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr3 13325256 13325344 13325300 Y NA NA NUP210,LOC285375 IMR90 Hi-C 24141950 NUP210 134465 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 13460446 13460799 13460651 Y NA NUP210 NA NA NA NA NUP210 637 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 13526767 13526807 13526787 Y NA HDAC11 NA NA NA NA HDAC11 7543 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 13936849 13937176 13936976 Y NA TPRXL C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TPRXL 39580 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr3 14167210 14167731 14167391 Y TMEM43,XPC CHCHD4,TMEM43 NA NA NA NA TMEM43 2770 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr3 14444961 14445761 14445267 Y C3orf19,SLC6A6 SLC6A6 NA NA NA NA SLC6A6 2885 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 14481056 14481424 14481147 Y C3orf19,SLC6A6 SLC6A6 NA NA NA NA SLC6A6 38980 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 14495430 14495824 14495495 Y NR2C2,C3orf19,XPC,SLC6A6 NA NA NA NA NA SLC6A6 53354 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 14845285 14845503 14845389 Y NA NA NA NA NA NA C3orf20 130679 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr3 15712856 15713111 15712984 Y NA NA NA NA NA NA HACL1 71518 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 15835826 15836097 15835987 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28 NA NA NA NA NA ANKRD28 63181 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 16324333 16324353 16324342 Y NA DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 19627 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 17404652 17404912 17404782 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 562493 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 17913596 17913897 17913750 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 570412 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 18399008 18399057 18399033 Y SATB1 NA NA NA NA NA TBC1D5 85252 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA NA NA NA NA NA SATB1 95162 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 19188369 19188866 19188531 Y NA KCNH8 NA NA NA NA KCNH8 423 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 19470380 19470682 19470561 Y NA NA NA NA NA NA KCNH8 282434 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 19687209 19687217 19687213 Y NA NA NA NA NA NA RAB5A 299354 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 19993428 19993925 19993635 Y KAT2B,RAB5A RAB5A NA NA NA NA RAB5A 6857 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 20190984 20191185 20191115 Y SGOL1,SGOL1 SGOL1 NA NA NA NA SGOL1 34599 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr3 20205868 20206079 20206039 Y SGOL1,SGOL1 SGOL1 NA NA NA NA SGOL1 19705 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 23898490 23898770 23898565 Y NA NA NKIRAS1,RPL15 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 53096 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 23991964 23992189 23991965 Y NA RPL15,NR1D2,NKIRAS1 NA NA NA NA NKIRAS1 5882 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 25790563 25790933 25790768 Y NA OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 31475 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 27448460 27448581 27448568 Y NA NA NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 75330 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA AC098614.2 SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 AC098614.2 2140 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr3 30646968 30647109 30647039 Y TGFBR2 TGFBR2 NA NA NA NA TGFBR2 974 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr3 31690891 31691368 31691073 Y ZNF860,OSBPL10 NA NA NA NA NA STT3B 118761 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 31737462 31737733 31737598 Y NA NA NA NA NA NA STT3B 165332 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 32339022 32339260 32339142 Y NA NA NA NA NA NA CMTM8 60851 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 32434248 32434406 32434345 Y NA CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 3085 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 32453477 32453643 32453560 Y NA CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 22314 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 32461951 32462075 32462013 Y CMTM7 CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 30788 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr3 32526070 32526309 32526138 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 16591 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 32549205 32549429 32549313 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 6305 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr3 33436260 33436332 33436276 Y CLASP2,FBXL2,FBXL2 UBP1 NA NA NA NA UBP1 44531 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 33478074 33478410 33478365 Y NA UBP1 NA NA NA NA UBP1 2453 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 33638872 33639200 33639124 Y NA NA NA NA NA NA CLASP2 118648 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 36536348 36536512 36536414 Y MLH1,MLH1,EPM2AIP1 NA NA NA NA NA STAC 116512 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 37164159 37164535 37164493 Y NA NA MLH1 IMR90 Hi-C 24141950 LRRFIP2 58645 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 37495440 37496065 37495716 Y ITGA9 NA NA NA NA NA AC097359.1 211754 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 37901883 37902306 37902042 Y CTDSPL AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 432 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr3 37939195 37939560 37939378 Y NA AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 37744 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 38144034 38144304 38144167 Y VILL,SLC22A14,OXSR1,MYD88 ACAA1,MYD88 NA NA NA NA ACAA1 32429 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 39192381 39192719 39192586 Y WDR48,CSRNP1 TTC21A,GORASP1,CSRNP1 NA NA NA NA CSRNP1 1334 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 39193999 39194528 39194467 Y NA TTC21A,GORASP1 NA NA NA NA CSRNP1 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 5.51666252083294 chr3 39222162 39222653 39222434 Y NA CSRNP1 NA NA NA NA CSRNP1 28109 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 42062353 42062651 42062504 Y NA TRAK1 TRAK1,ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 9059 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 42067110 42067525 42067205 Y ULK4 TRAK1 TRAK1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 13816 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 42220925 42221235 42221114 Y TRAK1 NA NA NA NA NA TRAK1 167631 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.87801277304951 chr3 42237448 42237989 42237678 Y NA NA NA NA NA NA TRAK1 184154 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 45109274 45109492 45109385 Y NA NA NA NA NA NA CDCP1 76422 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 45140818 45140977 45140897 Y NA CDCP1 NA NA NA NA CDCP1 44937 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 45157727 45158120 45157925 Y CDCP1 CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 27794 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 45209101 45209416 45209191 Y LIMD1 CDCP1,RPS24P8 LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS24P8 9434 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr3 46036343 46036779 46036493 Y CCR5,CCR2,SACM1L,CXCR6,FYCO1 FYCO1 NA NA NA NA FYCO1 1027 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 46434949 46435277 46435219 Y CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2 RP11-24F11.2,CCRL2 NA NA NA NA RP11-24F11.2 11273 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 46440905 46441384 46441314 Y CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2 RP11-24F11.2,CCRL2 CCR1,CCR2,CCRL2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-24F11.2 5166 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 46600040 46600219 46600077 Y NA NA NA NA NA NA RTP3 63059 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 46988775 46989017 46988932 Y SETD2,KLHL18,KIF9,NBEAL2,CCDC12 NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 30156 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr3 46989736 46990203 46989983 Y SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12 NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 28970 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr3 47004561 47004925 47004746 Y NA NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 14248 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 47420724 47420876 47420775 Y NA PTPN23 NA NA NA NA PTPN23 223 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 47421570 47421869 47421711 Y NA PTPN23 NA NA NA NA PTPN23 1069 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr3 47704557 47705253 47705047 Y SETD2 NA NA NA NA NA CSPG5 84275 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 47991974 47992099 47992083 Y CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A NA NA NA NA NA MAP4 136670 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr3 48332679 48332937 48332732 Y SPINK8 NME6 NA NA NA NA NME6 8238 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 49358291 49358883 49358713 Y ARIH2,C3orf71,NDUFAF3,DALRD3,QRICH1,USP19,UBA7,IP6K1,USP4 USP4,GPX1 NA NA NA NA USP4 17262 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 49938038 49938186 49938111 Y TUSC2,APEH,GMPPB,SEMA3F,MST1R,MON1A,IFRD2,C3orf54 TRAIP,MST1R,MON1A,RBM6 NA NA NA NA MST1R 1113 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 50194710 50194859 50194796 Y TUSC2,HYAL2,GMPPB,C3orf54,MST1R,MON1A,IFRD2,SEMA3F SEMA3F,SLC38A3 NA NA NA NA SEMA3F 4232 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 50264852 50265230 50265012 Y TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2 SLC38A3,GNAI2,SEMA3B NA NA NA NA GNAI2 3128 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 50302065 50302532 50302296 Y SEMA3B GNAI2,SEMA3B,IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL1 NA NA NA NA SEMA3B 458 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 52073968 52074235 52074157 Y GPR62 RPL29,DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 14331 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 52081342 52081690 52081545 Y GPR62,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 6876 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 52091161 52091675 52091445 Y TWF2,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 2595 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 52287340 52287625 52287477 Y PBRM1,NISCH,WDR82,GLYCTK,PPM1M,PPM1M RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82 NA NA NA NA PPM1M 9499 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 53107324 53107487 53107433 Y TMEM110,SFMBT1,SFMBT1,DCP1A SFMBT1 NA NA NA NA SFMBT1 28558 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 53304049 53304491 53304265 Y PRKCD,DCP1A,TKT TKT NA NA NA NA TKT 15981 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 53859957 53860202 53860080 Y CACNA1D,CHDH CHDH,IL17RB NA NA NA NA CHDH 18215 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 57562103 57562255 57562188 Y SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12 DNAH12,PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 19692 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 57964155 57964263 57964209 Y FLNB FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 27864 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 58162589 58162663 58162637 Y KCTD6 NA NA NA NA NA ABHD6 58570 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 58163548 58163776 58163593 Y NA NA NA NA NA NA ABHD6 57457 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr3 58859909 58860302 58860288 Y NA NA NA NA NA NA C3orf67 173508 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 60018233 60018421 60018327 Y NA NA NA NA NA NA C3orf67 984423 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 60654100 60654144 60654124 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 580989 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 60695765 60695821 60695814 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 539312 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 60715683 60716344 60716091 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 518789 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 60804439 60804744 60804592 Y FHIT NA NA NA NA NA FHIT 430389 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 63946118 63946531 63946303 Y NA NA LOC100507062 IMR90 Hi-C 24141950 PSMD6 61127 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 65694421 65694810 65694689 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 327699 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 65744738 65744801 65744770 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 277708 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr3 65831008 65831290 65831149 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 191219 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 65939140 65939412 65939262 Y MAGI1 NA NA NA NA NA MAGI1 83097 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.87801277304951 chr3 65950044 65950258 65950163 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 72251 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 66022863 66023161 66022996 Y MAGI1 MAGI1 NA NA NA NA MAGI1 354 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 66533474 66533812 66533569 Y NA LRIG1 NA NA NA NA LRIG1 15875 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 69134869 69134938 69134904 Y TMF1 TMF1,UBA3,ARL6IP5 NA NA NA NA ARL6IP5 2774 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 69135158 69135511 69135504 Y NA TMF1,UBA3,ARL6IP5 NA NA NA NA ARL6IP5 3063 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr3 69261592 69261838 69261780 Y NA NA NA NA NA NA ARL6IP5 129497 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 71136796 71137147 71137136 Y FOXP1 NA NA NA NA NA FOXP1 493993 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 71151319 71151713 71151657 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 479427 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 71158778 71158960 71158907 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 472180 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 71176805 71177031 71176814 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 454109 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 71465988 71466289 71466193 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 164851 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr3 72862614 72863000 72862807 Y SHQ1 SHQ1 NA NA NA NA SHQ1 46065 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 73159773 73160145 73159855 Y EBLN2 NA PDZRN3,CACNA1D IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC75P1 70297 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr3 75472638 75472968 75472803 Y NA FAM86DP NA NA NA NA FAM86DP 9293 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 86999128 86999300 86999212 Y CHMP2B NA NA NA NA NA CHMP2B 275121 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr3 88151728 88152092 88151734 Y NA C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA C3orf38 44801 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 88208920 88209337 88209164 Y CGGBP1,C3orf38 C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA CGGBP1 11885 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 96336052 96336669 96336607 Y NA NA NA NA NA NA ARL6 1144696 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr3 97200440 97200579 97200496 Y EPHA6 NA NA NA NA NA ARL6 280786 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 97437630 97437758 97437694 Y NA ARL6 NA NA NA NA ARL6 43607 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 99238230 99238268 99238249 Y NA NA MIR548G,COL8A1 IMR90 Hi-C 24141950 FILIP1L 593089 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 100630207 100630226 100630217 Y NA NA NA NA NA NA TFG 204002 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 101403455 101403770 101403678 Y SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24 ZBTB11,CEP97 NA NA NA NA RPL24 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 101645465 101645839 101645546 Y NA NA FAM55C,NFKBIZ,LOC152225 IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIZ 100630 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 101901132 101901377 101901290 Y NA NA FAM55C,LOC152225,NFKBIZ IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFKBIZ 356297 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 101914180 101914598 101914381 Y NFKBIZ,NFKBIZ,ZPLD1 NA FAM55C,LOC152225,NFKBIZ IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIZ 369345 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 103522825 103523125 103522973 Y NA NA NA NA NA NA ALCAM 1560628 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 104014158 104014524 104014365 Y NA NA NA NA NA NA ALCAM 1069229 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 104155776 104156155 104156140 Y NA NA NA NA NA NA ALCAM 927598 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.29113378147154 chr3 105087492 105087848 105087688 Y NA ALCAM NA NA NA NA ALCAM 3739 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 3.05177075620545 chr3 105087916 105088171 105088021 Y ALCAM ALCAM NA NA NA NA ALCAM 4163 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr3 105088270 105088514 105088471 Y ALCAM ALCAM NA NA NA NA ALCAM 4517 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 105395533 105395739 105395657 Y NA NA NA NA NA NA CBLB 190657 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 113078924 113079182 113079053 Y NA NA NA NA NA NA SPICE1 152852 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 113416036 113416177 113416128 Y SIDT1 KIAA2018,NAA50,ATP6V1A NA NA NA NA KIAA2018 2543 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 115337526 115337854 115337690 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 473408 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 115545713 115545826 115545800 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 681595 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 115595102 115595314 115595123 Y GAP43 NA NA NA NA NA ZBTB20 730984 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 115790074 115790198 115790193 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 925956 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 117050913 117051371 117051328 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 307368 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 119068324 119068683 119068464 Y NA NA NA NA NA NA B4GALT4 110374 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 119157549 119157626 119157588 Y NA TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 28051 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 119356620 119357543 119356968 Y GSK3B,ARHGAP31,ADPRH,COX17 PLA1A,RP11-190C22.1,COX17 NA NA NA NA RP11-190C22.1 3623 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 120065370 120065692 120065535 Y NA LRRC58 NA NA NA NA LRRC58 494 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 120355972 120356358 120356256 Y NA NDUFB4,HGD NA NA NA NA NDUFB4 42816 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 120361404 120361730 120361550 Y NA NDUFB4,HGD NA NA NA NA HGD 37688 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 120397505 120397688 120397597 Y NA HGD NA NA NA NA HGD 1730 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 120463141 120463503 120463258 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 3301 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 120493479 120494008 120493729 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33639 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 121539764 121539854 121539811 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 12072 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 121550824 121551193 121550988 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 733 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 122208819 122209075 122208974 Y NA KPNA1 NA NA NA NA KPNA1 22717 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 123263878 123263964 123263921 Y ADCY5,ADCY5 PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA PTPLB 38068 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 123976892 123977339 123977059 Y NA NA NA NA NA NA CCDC14 298328 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 124605050 124605342 124605178 Y ITGB5 ITGB5 NA NA NA NA ITGB5 12923 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 125709142 125709481 125709414 Y ZXDC,CCDC37 NA NA NA NA NA FAM86JP 75679 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 125986265 125986571 125986320 Y NA NA KLF15,ZXDC,ALDH1L1,CCDC37 IMR90 Hi-C 24141950 SLC41A3 167861 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 126391611 126391660 126391640 Y NA TXNRD3,CHCHD6 NA NA NA NA TXNRD3 19613 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 126701397 126702091 126701497 Y PLXNA1 NA CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CHCHD6 280334 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr3 127448420 127448704 127448528 Y TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL NA NA NA NA NA ABTB1 58642 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 127465577 127465875 127465733 Y NA NA NA NA NA NA MGLL 74176 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr3 127536409 127536633 127536521 Y TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL,KBTBD12 MGLL NA NA NA NA MGLL 3418 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 127539467 127539812 127539513 Y MGLL,MGLL MGLL NA NA NA NA MGLL 239 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr3 127795566 127796407 127795838 Y GATA2,GATA2,GATA2,DNAJB8 SEC61A1 NA NA NA NA SEC61A1 27082 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 128366732 128367045 128366901 Y NA RPN1 NA NA NA NA RPN1 30873 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 128475272 128475670 128475352 Y RAB7A,ISY1,CNBP RAB7A,FTH1P4 NA NA NA NA FTH1P4 6191 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 128670578 128670889 128670734 Y DNAJB8,C3orf27 NA NA NA NA NA ACAD9 74139 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 128967680 128967946 128967799 Y NA NA NA NA NA NA H1FX-AS1 64289 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 129346331 129346490 129346427 Y PLXND1 PLXND1 NA NA NA NA PLXND1 22670 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 132979220 132979385 132979303 Y NA NA NA NA NA NA CDV3 311189 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 133295128 133295300 133295215 Y NA CDV3 NA NA NA NA CDV3 4554 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 134082893 134083489 134083439 Y AMOTL2 RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA AMOTL2 8832 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 136563637 136563997 136563817 Y NA RP11-85F14.5,NCK1 NA NA NA NA RP11-85F14.5 14899 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 137707770 137708146 137707919 Y NA NA NA NA NA NA DZIP1L 124514 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 138364761 138365360 138365102 Y PIK3CB,ARMC8 FAIM NA NA NA NA FAIM 39313 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 138438822 138439037 138438988 Y PRR23C NA NA NA NA NA PIK3CB 112743 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 138581757 138582253 138582041 Y NA PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 29977 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 138582294 138582582 138582441 Y MRPS22 PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 30514 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 2.1127643696807 chr3 138594717 138594956 138594896 Y NA PIK3CB NA NA NA NA PIK3CB 42937 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 139064285 139064552 139064299 Y NA COPB2,RP11-319G6.1 NA NA NA NA COPB2 42022 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 139344390 139344678 139344552 Y NA NA NA NA NA NA NMNAT3 50181 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 141065039 141065478 141065219 Y NA ZBTB38 NA NA NA NA ZBTB38 23984 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 141482175 141482451 141482314 Y NA RNF7 NA NA NA NA RNF7 27129 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 141610914 141611173 141610928 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 17948 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 141611491 141611772 141611584 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 18525 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 142585828 142586021 142585923 Y NA RP11-372E1.1,PCOLCE2 NA NA NA NA PCOLCE2 20024 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 145164438 145164687 145164563 Y NA NA NA NA NA NA RPL21P39 375839 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 148318861 148319089 148318964 Y NA NA NA NA NA NA GYG1 388039 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 149104739 149105065 149104981 Y COMMD2,TM4SF1 TM4SF1 GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM4SF1 11087 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 149108520 149108892 149108690 Y COMMD2,TM4SF1 TM4SF1 WWTR1,HLTF,HPS3,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1-AS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM4SF1 14868 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 149113631 149114007 149113702 Y NA TM4SF1 WWTR1,HLTF,HPS3,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1-AS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM4SF1 19979 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 149194266 149194620 149194394 Y CP,TM4SF4 TM4SF4,RP11-278L15.6 NA NA NA NA TM4SF4 4505 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.52588537810273 chr3 149265788 149265935 149265852 Y WWTR1 NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 55341 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 149271786 149271997 149271800 Y NA NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 61339 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 149284462 149284628 149284613 Y NA NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 74015 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 149356424 149356747 149356622 Y NA NA NA NA NA NA WWTR1 95754 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 149566176 149566232 149566181 Y RNF13 RNF13 NA NA NA NA RNF13 37681 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 150089534 150090066 150089791 Y NA TSC22D2 TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 34056 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 151507223 151507685 151507381 Y NA RP11-64D22.2,AADAC NA NA NA NA RP11-64D22.2 21007 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 152026905 152027295 152026911 Y NA MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 41561 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 152121454 152121974 152121660 Y MBNL1 NA NA NA NA NA MBNL1-AS1 136110 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 152313972 152314194 152314081 Y NA NA NA NA NA NA P2RY1 236542 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr3 152878171 152878732 152878352 Y P2RY1,RAP2B RAP2B NA NA NA NA RAP2B 142 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr3 156530301 156530778 156530576 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1 PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA LINC00886 2073 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 156837520 156837824 156837670 Y NA RP11-6F2.5,CCNL1 NA NA NA NA CCNL1 38725 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 156847368 156847750 156847738 Y NA RP11-6F2.5,CCNL1,RP11-550I24.2 NA NA NA NA CCNL1 28799 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 158440805 158440990 158440882 Y MFSD1 MFSD1,RARRES1 NA NA NA NA MFSD1 6997 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 160267928 160268193 160268163 Y NA SCARNA7,KPNA4 NA NA NA NA KPNA4 13183 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 160735129 160735256 160735193 Y NA NA NA NA NA NA NMD3 85228 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 167468188 167468573 167468282 Y NA PDCD10,SERPINI1 NA NA NA NA SERPINI1 17157 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 167737805 167738014 167737910 Y NA NA NA NA NA NA GOLIM4 73749 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 168930237 168930275 168930257 Y NA NA NA NA NA NA MECOM 449131 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.29113378147154 chr3 168939202 168939471 168939359 Y NA NA NA NA NA NA MECOM 439935 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 3.28652235283664 chr3 169051059 169051429 169051244 Y NA NA NA NA NA NA MECOM 327977 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 169075984 169076327 169076322 Y NA NA NA NA NA NA MECOM 303079 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr3 169300300 169300658 169300540 Y NA NA NA NA NA NA MECOM 78748 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr3 169344202 169344434 169344318 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 34972 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 169376089 169376313 169376201 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 3093 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 169376858 169377055 169376957 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 2351 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr3 169377431 169377952 169377740 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 1454 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr3 169378305 169378656 169378554 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 750 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 169379063 169379412 169379208 Y MECOM NA NA NA NA NA MECOM 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr3 169379831 169380308 169379976 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 425 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr3 169384405 169384800 169384618 Y MECOM MECOM MECOM MCF7 ChIA-PET 22265404 MECOM 4999 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 169482089 169482431 169482154 Y NA TERC,MYNN NA NA NA NA TERC 1241 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 170883066 170883220 170883212 Y TNIK NA NA NA NA NA SLC2A2 140527 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 171175851 171176236 171176082 Y TNIK NA NA NA NA NA TNIK 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 171870963 171871593 171871291 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 115545 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 171954526 171954782 171954635 Y FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA BZW1P1 188097 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 172467147 172467552 172467259 Y NA NCEH1,ECT2 NCEH1,ECT2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ECT2 675 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 172510084 172510259 172510171 Y NA ECT2 NA NA NA NA ECT2 43612 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 173650294 173650720 173650491 Y NA NA NA NA NA NA RP11-393N4.2 442314 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 177075253 177075542 177075439 Y NA NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 161992 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 177076157 177076922 177076435 Y TBL1XR1 NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 162896 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr3 182642205 182642465 182642335 Y NA NA NA NA NA NA DCUN1D1 59276 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 182825824 182825958 182825903 Y NA MCCC1 NA NA NA NA MCCC1 5905 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr3 183003579 183004143 183003750 Y ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 34547 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr3 183010054 183010455 183010255 Y NA B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 41022 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 184078263 184078665 184078465 Y NA EIF4G1,FAM131A,CLCN2,POLR2H,CHRD NA NA NA NA POLR2H 757 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 185215412 185215562 185215482 Y NA TMEM41A NA NA NA NA TMEM41A 567 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr3 187457681 187458370 187457991 Y RTP4,BCL6,BCL6,BCL6 BCL6 NA NA NA NA BCL6 3145 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 187607399 187607588 187607479 Y BCL6 NA BCL6,LPP IMR90 Hi-C 24141950 BCL6 145884 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 187984257 187984703 187984570 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 114412 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 188156976 188157533 188157052 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 287131 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 188324508 188324886 188324659 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 454663 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 190104242 190104447 190104367 Y NA NA NA NA NA NA CLDN1 65978 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 192873675 192873788 192873739 Y NA NA NA NA NA NA MB21D2 239725 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 193587539 193587846 193587782 Y NA RP11-528A4.2 LOC100131551,LOC647323,HES1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-528A4.2 27726 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 193590130 193590422 193590276 Y NA RP11-528A4.2 LOC100131551,LOC647323,HES1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-528A4.2 30317 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr3 193859199 193859624 193859359 Y TMEM44 HES1 NA NA NA NA HES1 7265 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr3 193876735 193877026 193876899 Y NA HES1 NA NA NA NA HES1 24801 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 2.1127643696807 chr3 194040514 194040910 194040840 Y HES1 NA NA NA NA NA ATP13A3 176183 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr3 194153543 194153935 194153911 Y ATP13A3 NA NA NA NA NA ATP13A3 63158 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 194247870 194248550 194248205 Y HES1,ATP13A3 ATP13A3 ATP13A3,GP5,TMEM44,FLJ34208 IMR90 Hi-C 24141950 ATP13A3 30777 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 194253479 194253627 194253544 Y ATP13A3 ATP13A3,TMEM44-AS1 TMEM44,ATP13A3,FLJ34208 IMR90 Hi-C 24141950 ATP13A3 36386 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 194299958 194300402 194300090 Y NA TMEM44-AS1 ATP13A3,FLJ34208 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM44-AS1 2338 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 194319358 194319899 194319518 Y LRRC15 TMEM44-AS1,AC046143.3,TMEM44 NA NA NA NA TMEM44-AS1 16618 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 195627582 195627903 195627662 Y ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2,TNK2 TNK2 NA NA NA NA TNK2 8913 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr3 196071529 196071904 196071800 Y UBXN7,RNF168,LRRC33,PCYT1A,TM4SF19 TCTEX1D2 TM4SF19-TCTEX1D2 IMR90 Hi-C 24141950 TCTEX1D2 28359 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr3 196696811 196697020 196696957 Y LRRC33,PIGZ NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1 NA NA NA NA PIGZ 2880 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr3 197247664 197248059 197247722 Y NA NA NA NA NA NA BDH1 50135 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr3 197264445 197264691 197264611 Y NA BDH1 NA NA NA NA BDH1 33503 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr4 991255 991645 991565 Y ZNF721,PDE6B,CPLX1,TMEM175 DGKQ,IDUA,SLC26A1,FGFRL1 NA NA NA NA SLC26A1 6027 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 1035263 1035607 1035280 Y FGFRL1,FGFRL1 FGFRL1 NA NA NA NA FGFRL1 33539 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 1237849 1238004 1237927 Y NA CTBP1,MAEA NA NA NA NA CTBP1 3737 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 1339592 1340250 1339850 Y NA NA NA NA NA NA MAEA 57953 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 1966776 1967112 1967086 Y WHSC1,WHSC1 NA NA NA NA NA C4orf48 74577 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 1972677 1973039 1972858 Y WHSC1 NA NA NA NA NA C4orf48 68650 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 2173906 2174201 2174078 Y NA NA NAT8L,C4orf48 IMR90 Hi-C 24141950 POLN 67647 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr4 2764467 2764789 2764630 Y LOC402160 TNIP2,SH3BP2 TNIP2,NOP14-AS1,NOP14,MFSD10 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TNIP2 8364 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 3438789 3438989 3438900 Y NA DOK7 NA NA NA NA DOK7 24044 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr4 3463022 3463837 3463465 Y NA NA NA NA NA NA DOK7 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 6592942 6593078 6593012 Y NA PPP2R2C,MAN2B2,MRFAP1 NA NA NA NA MAN2B2 18040 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 6734442 6734743 6734533 Y KIAA0232 S100P,MRFAP1L1,KIAA0232 NA NA NA NA MRFAP1L1 24835 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 6785099 6785509 6785391 Y TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232 KIAA0232 NA NA NA NA KIAA0232 3997 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr4 6841864 6842265 6841993 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0232 60762 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 6887984 6888235 6888115 Y NA TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 20734 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.29113378147154 chr4 6895356 6895637 6895499 Y KIAA0232 TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 13332 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 6918330 6918775 6918508 Y KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14 TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 9361 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 6919401 6919899 6919549 Y MAN2B2,KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14 TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 10432 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 6959680 6959690 6959685 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D14 50711 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr4 7972368 7972631 7972565 Y NA AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 32715 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr4 8356357 8356569 8356465 Y ACOX3 NA NA NA NA NA ACOX3 83881 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 10116801 10117310 10116981 Y WDR1 WDR1 NA NA NA NA WDR1 228 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 11426480 11426816 11426649 Y NA HS3ST1 NA NA NA NA HS3ST1 2573 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr4 11473418 11473587 11473515 Y NA HS3ST1 CLNK IMR90 Hi-C 24141950 HS3ST1 44029 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 12642016 12642195 12642111 Y NA RP11-352E6.2 NA NA NA NA RP11-352E6.2 1755 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr4 13282552 13282692 13282688 Y NA NA NA NA NA NA RAB28 201297 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 15036867 15037072 15036952 Y NA CPEB2 NA NA NA NA CPEB2 34569 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr4 15553738 15553982 15553851 Y NA NA NA NA NA NA CC2D2A 84249 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr4 15775826 15776085 15775905 Y FGFBP2 RP11-115L11.1 CC2D2A,CD38 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115L11.1 44576 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 15907638 15908044 15907859 Y FBXL5,BST1,FGFBP1 FGFBP1 BST1 IMR90 Hi-C 24141950 FGFBP1 30319 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr4 16003610 16004023 16003987 Y NA FGFBP2 NA NA NA NA FGFBP2 34678 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr4 20340711 20340985 20340805 Y NA NA NA NA NA NA PACRGL 354920 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 22270180 22270523 22270471 Y NA NA LOC100505912 IMR90 Hi-C 24141950 GPR125 245154 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 6.10354151241091 chr4 24660007 24660225 24660117 Y NA ATP5LP3 CCDC149,MIR573 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5LP3 2009 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr4 24840398 24840758 24840578 Y NA NA SOD3 IMR90 Hi-C 24141950 SOD3 50864 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 25536997 25537326 25537166 Y NA NA NA NA NA NA RP11-302F12.1 141146 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr4 25861466 25861639 25861549 Y RBPJ,ANAPC4,SEL1L3 SEL1L3 NA NA NA NA SEL1L3 1743 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 26343884 26344230 26344058 Y NA NA NA NA NA NA RBPJ 180807 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 26888311 26888739 26888468 Y NA STIM2,RP11-293A21.1 NA NA NA NA RP11-293A21.1 28090 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 30718904 30719447 30718947 Y PCDH7,PCDH7 PCDH7 NA NA NA NA PCDH7 590 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr4 30964566 30964778 30964672 Y NA NA NA NA NA NA PCDH7 244529 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 37581972 37582372 37582240 Y NA NA NA NA NA NA RELL1 103626 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 38080175 38080435 38080304 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 120119 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr4 38162520 38162833 38162765 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 202464 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 38281500 38281609 38281534 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 321444 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr4 38281692 38282075 38281884 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 321636 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 38665008 38665204 38665059 Y TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3 KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA RP11-617D20.1 504 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 38671040 38671097 38671090 Y NA KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA RP11-617D20.1 6536 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 38674773 38675062 38674906 Y KLF3 KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA RP11-617D20.1 10269 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr4 39354929 39355678 39355646 Y NA RFC1 WDR19 IMR90 Hi-C 24141950 RFC1 10317 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr4 39659267 39659273 39659270 Y NA UBE2K LIAS,LOC401127,PDS5A,UBE2K IMR90 Hi-C 24141950 UBE2K 38391 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 40628627 40628976 40628881 Y NA RBM47 NA NA NA NA RBM47 1916 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr4 40910052 40910602 40910542 Y NA NA NA NA NA NA NSUN7 160138 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 41936193 41936441 41936268 Y TMEM33 TMEM33 NA NA NA NA TMEM33 1056 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr4 44727575 44727855 44727678 Y KCTD8,GNPDA2 GUF1,GNPDA2 NA NA NA NA GNPDA2 963 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 48700290 48700744 48700528 Y NA NA NA NA NA NA FRYL 79595 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 52725801 52726193 52725998 Y NA DCUN1D4 NA NA NA NA DCUN1D4 18635 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 54794044 54794386 54794192 Y NA NA SCFD2,PDGFRA,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 134471 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 54825725 54826062 54825894 Y GSX2 NA RPL21P44,SCFD2,LNX1,FIP1L1,CHIC2,GSX2,PDGFRA IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 102795 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr4 54958023 54958135 54958077 Y NA CHIC2 SCFD2,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 29166 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr4 57278248 57278433 57278373 Y NA AASDH,PPAT,PAICS NA NA NA NA PPAT 21348 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 69813796 69814179 69814033 Y UGT2B15,UGT2B10,UGT2B7,UGT2A3 UGT2A3 NA NA NA NA UGT2A3 1330 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr4 72125321 72125676 72125518 Y NA NA NA NA NA NA SLC4A4 74318 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 74680452 74680792 74680616 Y NA NA MTHFD2L,CXCL1 IMR90 Hi-C 24141950 CXCL1 52318 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 77129675 77129810 77129753 Y NAAA SCARB2,FAM47E NA NA NA NA SCARB2 3236 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 77133814 77134170 77133987 Y NAAA,CXCL10,CXCL11 SCARB2,FAM47E NA NA NA NA FAM47E 621 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 77505994 77506531 77506183 Y NA NA NA NA NA NA SHROOM3 151741 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 77511406 77511861 77511558 Y ANKRD56,SHROOM3 NA NA NA NA NA SHROOM3 157153 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr4 77543952 77543974 77543961 Y NA NA NA NA NA NA SHROOM3 189699 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr4 77546849 77546886 77546883 Y NA NA NA NA NA NA SHROOM3 192596 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 77611633 77612016 77611712 Y NA NA NA NA NA NA SOWAHB 204986 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr4 77752154 77752315 77752229 Y NA NA SHROOM3,SEPT11,SOWAHB IMR90 Hi-C 24141950 SOWAHB 64687 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr4 78977894 78978171 78977912 Y FRAS1 FRAS1 NA NA NA NA FRAS1 1170 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 79550555 79550802 79550658 Y NA NA NA NA NA NA ANXA3 79882 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 82510510 82510750 82510651 Y RASGEF1B NA NA NA NA NA RASGEF1B,RP11-689K5.3 452647 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 83912303 83912539 83912423 Y NA LIN54,COPS4 NA NA NA NA LIN54 19540 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr4 84469544 84469879 84469660 Y PLAC8,COQ2,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,AGPAT9 FAM175A,AGPAT9 NA NA NA NA AGPAT9 14477 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 85812250 85812275 85812263 Y NA NA NA NA NA NA WDFY3-AS2 73263 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 85820969 85821357 85821323 Y NA NA NA NA NA NA WDFY3-AS2 64181 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 85873236 85873576 85873407 Y NA WDFY3-AS2,WDFY3 NA NA NA NA WDFY3-AS2 11962 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 87835479 87835856 87835675 Y NA AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA AFF1 18298 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 87838829 87839174 87839055 Y NA AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA AFF1 14980 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 88074850 88075090 88074969 Y DSPP NA NA NA NA NA KLHL8 84376 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 88130914 88131113 88130991 Y AFF1,HSD17B11 KLHL8 NA NA NA NA KLHL8 28353 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 91049597 91049943 91049669 Y FAM190A NA NA NA NA NA RP11-115D19.1 579090 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.40850957978713 chr4 91453996 91454262 91454133 Y NA NA NA NA NA NA RP11-115D19.1 983489 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 93104192 93104578 93104286 Y NA NA NA NA NA NA SMARCAD1 2022184 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr4 95373822 95374139 95373960 Y PDLIM5 PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 2785 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr4 95374521 95374795 95374668 Y NA PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 3484 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr4 95542272 95542471 95542377 Y NA NA NA NA NA NA BMPR1B 134648 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 102200557 102200885 102200839 Y PPP3CA NA NA NA NA NA AP001816.1 66052 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 3.99077714273021 chr4 103605742 103606270 103606017 Y NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA NA NA NA NA NA MANBA 73881 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 103678847 103679008 103678977 Y NA MANBA NA NA NA NA MANBA 1143 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 103750426 103750532 103750434 Y NHEDC1,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3 RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2 NA NA NA NA RP11-10L12.4 3214 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr4 106628155 106628490 106628322 Y NA GSTCD NA NA NA NA GSTCD 220 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 106841550 106841937 106841687 Y TBCK,LOC100507096 NPNT,INTS12 NA NA NA NA INTS12 26407 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 107164804 107165067 107164936 Y NA NA NA NA NA NA AIMP1 69634 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 107955286 107955747 107955665 Y DKK2 NA NA NA NA NA PAPSS1 683861 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 108783895 108784172 108784033 Y SGMS2 SGMS2 NA NA NA NA SGMS2 40176 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 111114926 111115298 111115104 Y GAR1,ELOVL6,ELOVL6 ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 3057 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 111117471 111117868 111117585 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 487 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 113095488 113095850 113095539 Y NA C4orf32 NA NA NA NA C4orf32 30935 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 114355245 114355627 114355568 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2D 325456 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr4 117519495 117520605 117520296 Y NA ACTN4P1 NA NA NA NA ACTN4P1 2178 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr4 119115424 119115493 119115457 Y NA NA NA NA NA NA SNHG8 82371 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr4 120437308 120437708 120437606 Y NA NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 63362 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 128752654 128753022 128752839 Y HSPA4L PLK4 NA NA NA NA PLK4 46994 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 134046475 134046584 134046530 Y NA NA NA NA NA NA SCLT1 4033711 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 139067903 139068306 139067999 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A11 93197 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr4 140278994 140279360 140279178 Y NA NA NA NA NA NA NDUFC1 57289 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr4 140656765 140657105 140656839 Y MAML3 NA NA NA NA NA MGST2 71843 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 140727942 140728268 140728103 Y MAML3 NA NA NA NA NA MGST2 143020 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 143488504 143488630 143488569 Y NA NA NA NA NA NA INPP4B 277955 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 144271294 144271615 144271412 Y NA GAB1 NA NA NA NA GAB1 15379 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr4 145498597 145498714 145498656 Y NA NA NA NA NA NA ABCE1 518370 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 145956046 145956369 145956259 Y NA NA NA NA NA NA ABCE1 60715 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 145975837 145976119 145976108 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ABCE1 40965 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 146015172 146015244 146015208 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ABCE1 1840 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 146024258 146024314 146024286 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ANAPC10 6565 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 146101946 146102251 146102199 Y NA OTUD4 ABCE1 K562 ChIA-PET 22265404 OTUD4 2633 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 146856855 146857112 146856936 Y NA ZNF827 NA NA NA NA ZNF827 675 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 149756405 149756578 149756515 Y NA NA NA NA NA NA NR3C2 392555 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr4 151681778 151681989 151681952 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 252890 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 152105959 152106222 152106091 Y NA NA NA NA NA NA RPS3A 87234 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 152246032 152246165 152246086 Y FAM160A1 NA FAM160A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-610P16.1 81822 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr4 153180891 153181284 153181088 Y NA NA PET112,FBXW7 IMR90 Hi-C 24141950 FBXW7 273969 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 153190429 153190517 153190474 Y NA NA FAM160A1,PET112,FBXW7 IMR90 Hi-C 24141950 FBXW7 264736 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 153445736 153446128 153446118 Y NA FBXW7,MIR4453 NA NA NA NA FBXW7 9125 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 153630965 153631147 153631056 Y NA TMEM154 TMEM154 MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM154 31648 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 153884926 153884958 153884941 Y NA RP11-206F17.2,FHDC1 NA NA NA NA FHDC1 29422 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr4 153894415 153894544 153894479 Y NA RP11-206F17.2,FHDC1 NA NA NA NA FHDC1 38911 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 154127038 154127322 154127172 Y NA NA NA NA NA NA TRIM2 55544 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr4 154170296 154170804 154170469 Y TIGD4,KIAA0922 NA NA NA NA NA MND1 92997 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 154429389 154429734 154429551 Y NA KIAA0922 NA NA NA NA KIAA0922 43891 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 157869778 157870097 157870082 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 20449 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr4 157870715 157871133 157870964 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 19413 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr4 157889828 157890031 157889884 Y PDGFC PDGFC NA NA NA NA PDGFC 515 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 158125886 158126027 158125941 Y NA NA NA NA NA NA GLRB 130677 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 159748095 159748254 159748211 Y FNIP2 NA NA NA NA NA FNIP2 59805 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 160519936 160519948 160519942 Y NA NA NA NA NA NA FNIP2 831646 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 164464203 164464350 164464219 Y NPY1R,NPY5R,MARCH1 NA NA NA NA NA NPY1R 200219 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 164471489 164471679 164471583 Y NA NA NA NA NA NA NPY1R 207505 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 165728924 165729125 165729024 Y NA NA NA NA NA NA NACA3P 133317 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr4 168818156 168818524 168818473 Y NA NA NA NA NA NA ANXA10 193142 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 169992046 169992220 169992129 Y NA NA SH3RF1,NEK1 IMR90 Hi-C 24141950 CBR4 62620 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 170023521 170023783 170023621 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 94095 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 170172551 170172946 170172870 Y NA SH3RF1 NA NA NA NA SH3RF1 17310 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 183418367 183418505 183418425 Y NA NA NA NA NA NA AC108142.1 353965 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 183826285 183826336 183826311 Y NA DCTD NA NA NA NA DCTD 10753 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 184643961 184644129 184644061 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC11 65541 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr4 184718887 184719489 184719407 Y NA NA ENPP6,CASP3 IMR90 Hi-C 24141950 TRAPPC11 140467 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr4 185269961 185270243 185270083 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 123491 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 185609676 185609967 185609740 Y NA CASP3 NA NA NA NA CASP3 41013 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr4 187614690 187615080 187614853 Y NA FAT1 NA NA NA NA FAT1 30796 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr4 189361062 189361328 189361166 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219G10.1 91884 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 373695 374160 373984 Y EXOC3 NA NA NA NA NA C5orf55 67098 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 399875 400445 400189 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 40813 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 656184 656577 656381 Y SLC9A3,ZDHHC11,TPPP CEP72,TPPP NA NA NA NA TPPP 34933 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 669501 669935 669710 Y TPPP TPPP NA NA NA NA TPPP 21575 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 671573 671920 671762 Y TPPP TPPP NA NA NA NA TPPP 19590 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 672237 672545 672500 Y EXOC3,CEP72 TPPP NA NA NA NA TPPP 18965 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 672861 673336 673024 Y NA TPPP NA NA NA NA TPPP 18174 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr5 784651 785023 784908 Y ZDHHC11,TPPP NA NA NA NA NA ZDHHC11 64078 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 3.28652235283664 chr5 1110480 1111164 1110500 Y LPCAT1,SLC12A7 SLC12A7 NA NA NA NA SLC12A7 330 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 1111223 1111556 1111501 Y LPCAT1,SLC12A7 SLC12A7 NA NA NA NA SLC12A7 1073 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr5 1129967 1130071 1130019 Y SLC12A7 SLC12A7 BRD9,LOC100506688,TRIP13,SLC12A7,NKD2,SLC6A18,CLPTM1L,MIR4457,ZDHHC11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC12A7 19817 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 1130725 1130985 1130924 Y NA SLC12A7 BRD9,LOC100506688,TRIP13,SLC12A7,NKD2,SLC6A18,CLPTM1L,MIR4457,ZDHHC11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC12A7 20575 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 4.46028033599259 chr5 1152155 1152545 1152489 Y NA SLC12A7,SLC6A19 SLC12A7,TRIP13,SLC6A18,BRD9 IMR90 Hi-C 24141950 SLC12A7 42005 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 1316464 1316882 1316563 Y TERT,SLC6A3 TERT,CLPTM1L TERT IMR90 Hi-C 24141950 TERT 23280 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 1478329 1478968 1478499 Y LPCAT1 LPCAT1 SLC6A3 IMR90 Hi-C 24141950 LPCAT1 43124 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 1725421 1725568 1725519 Y NA NA MIR4277 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL36 73912 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr5 5423578 5423857 5423693 Y KIAA0947 KIAA0947 NA NA NA NA KIAA0947 4801 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA RP11-332J15.3 50027 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 3.05177075620545 chr5 10996392 10996605 10996573 Y NA NA NA NA NA NA DAP 237008 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 12060867 12061015 12060936 Y NA NA NA NA NA NA DAP 1301483 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 13580191 13580395 13580319 Y NA NA DNAH5 IMR90 Hi-C 24141950 DNAH5 362257 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 14639692 14640047 14639871 Y NA EEF1A1P13,FAM105B TRIO,FAM105A IMR90 Hi-C 24141950 EEF1A1P13 11391 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 14742718 14742956 14742837 Y NA NA NA NA NA NA RBBP4P1 53553 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 15002381 15002579 15002465 Y NA NA FAM105B,ANKH,LOC100130744 IMR90 Hi-C 24141950 ANKH 132494 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 16715199 16715528 16715435 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 100032 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 16735791 16735955 16735874 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 120624 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr5 16736297 16736738 16736539 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 121130 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr5 16740893 16741285 16741194 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 125726 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 16894604 16895174 16894829 Y NA CTB-55B8.1,MYO10 NA NA NA NA CTB-55B8.1 5576 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr5 17282496 17282827 17282587 Y BASP1 NA NA NA NA NA RN7SKP133 60898 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 22947765 22947938 22947850 Y NA NA NA NA NA NA HSPD1P1 1067071 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 25910581 25911176 25910785 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 721816 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 33442170 33442454 33442303 Y NA CTD-2203K17.1,TARS NA NA NA NA TARS 3368 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr5 34585438 34585952 34585758 Y RAI14,RAI14 NA RAI14 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAI14 68390 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 35405015 35405048 35405025 Y NA NA SPEF2 IMR90 Hi-C 24141950 PRLR 176221 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 36898243 36898633 36898363 Y NIPBL NIPBL NA NA NA NA NIPBL 23382 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 37718043 37718447 37718273 Y NA NA NA NA NA NA WDR70 340729 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 39256594 39256894 39256792 Y RICTOR,FYB NA NA NA NA NA RICTOR 184084 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 40967939 40968194 40968008 Y C6,C7 NA NA NA NA NA CARD6 128653 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 41845041 41845055 41845050 Y OXCT1,FBXO4 NA NA NA NA NA C5orf51 57235 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 43008201 43008438 43008332 Y NA AC025171.1 NA NA NA NA AC025171.1 31239 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 43061828 43062062 43061945 Y NA AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA ZNF131 1216 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 43099724 43100011 43099805 Y NA ZNF131,CTD-2201E18.3 ZNF131,LOC648987 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2201E18.3 34203 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 43303282 43303485 43303367 Y NA HMGCS1 NA NA NA NA HMGCS1 8129 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 53358665 53359272 53358974 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 245140 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 54039991 54040439 54040234 Y SNX18,SNX18 NA SNX18,GPX8,CDC20B IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 228402 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 55289605 55289989 55289924 Y IL6ST IL6ST,CTD-2031P19.3 NA NA NA NA CTD-2031P19.3 610 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 55654713 55655022 55654890 Y NA NA MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC022431.1 143877 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 55655118 55655221 55655151 Y NA NA MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC022431.1 143678 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 56468272 56468727 56468348 Y MAP3K1,C5orf35,GPBP1,GPBP1,GPBP1 GPBP1 NA NA NA NA GPBP1 497 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 56731620 56731973 56731778 Y NA ACTBL2 PLK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTBL2 44663 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 57758033 57758252 57758173 Y NA PLK2 NA NA NA NA PLK2 3946 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr5 58400134 58400374 58400226 Y PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 646047 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 58874550 58874813 58874554 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 941134 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 59492329 59492580 59492443 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 323367 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 60597691 60598057 60597813 Y NA ZSWIM6 ZSWIM6,C5orf43 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZSWIM6 28043 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 60704594 60705129 60704691 Y NA RPL3P6 NA NA NA NA RPL3P6 18896 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 61661747 61661797 61661772 Y NA DIMT1,IPO11 NA NA NA NA DIMT1 35969 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 64710773 64711167 64710966 Y NA NA NA NA NA NA CENPK 145831 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 65329982 65330329 65330156 Y NA NA NA NA NA NA SREK1 103470 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 66187482 66187743 66187625 Y NA NA NA NA NA NA MAST4-AS1 110038 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 66306628 66307107 66306725 Y NA MAST4-AS1 NA NA NA NA MAST4-AS1 8847 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 67069285 67069755 67069460 Y PIK3R1 NA NA NA NA NA PIK3R1 439793 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 68338463 68338878 68338699 Y NA CTC-498J12.1,SLC30A5 NA NA NA NA CTC-498J12.1 815 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr5 70772003 70772134 70772073 Y NA BDP1 NA NA NA NA BDP1 22561 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 71045616 71045849 71045733 Y NA NA MCCC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 MCCC2 164501 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 71218510 71218673 71218589 Y NA NA NA NA NA NA MCCC2 337395 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 71648982 71649164 71649085 Y NA PTCD2,MRPS27 NA NA NA NA MRPS27 34509 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 74861939 74862072 74862007 Y NA NA NA NA NA NA COL4A3BP 55976 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 75034241 75034569 75034405 Y NA POC5 NA NA NA NA POC5 22928 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 77140620 77140840 77140736 Y NA TBCA NA NA NA NA TBCA 21764 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 77810178 77810481 77810268 Y AP3B1 NA NA NA NA NA SCAMP1 155839 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 78612719 78612843 78612781 Y JMY CTC-451P13.1 NA NA NA NA CTC-451P13.1 33978 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 79480253 79480678 79480326 Y NA NA NA NA NA NA SERINC5 69220 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 79543086 79543324 79543242 Y ZFYVE16,SERINC5 SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 6574 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 79553045 79553765 79553579 Y NA SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 3147 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.52588537810273 chr5 79584551 79584948 79584750 Y NA SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 34653 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 81661583 81662026 81661933 Y NA NA VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 89187 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 82339174 82339396 82339285 Y NA XRCC4,TMEM167A NA NA NA NA XRCC4 31921 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 82768927 82769141 82769084 Y VCAN VCAN NA NA NA NA VCAN 3643 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 82769254 82769739 82769524 Y VCAN VCAN NA NA NA NA VCAN 3970 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 82769870 82770125 82769934 Y TMEM167A,VCAN VCAN NA NA NA NA VCAN 4586 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 82770174 82770695 82770300 Y NA VCAN NA NA NA NA VCAN 4890 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr5 83790350 83790680 83790547 Y NA NA NA NA NA NA VCAN 1025066 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 85654132 85654483 85654435 Y NA NA NA NA NA NA COX7C 257238 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 86417249 86417398 86417310 Y CCNH,CCNH NA MIR4280 K562 ChIA-PET 22265404 RASA1 144307 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 86629389 86629577 86629451 Y NA NA NA NA NA NA RASA1 67684 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 87956632 87957169 87956907 Y MEF2C,MEF2C NA NA NA NA NA RPS3AP22 280858 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 90772639 90772960 90772848 Y NA NA NA NA NA NA ARRDC3 95463 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 92593669 92593984 92593827 Y NA NA FLJ42709 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F1 323059 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 95157129 95157323 95157255 Y NA GLRX NA NA NA NA GLRX 420 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 95295681 95296335 95296056 Y ELL2 NA NA NA NA NA CTD-2337A12.1,ELL2 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 98197255 98197391 98197342 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2007H13.3 65484 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 99382569 99383254 99382906 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 485712 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 99387251 99388845 99388529 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 480121 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr5 102091646 102092087 102091846 Y NA PAM NA NA NA NA PAM 3961 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr5 106805205 106805528 106805416 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 199068 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 108735031 108735161 108735096 Y NA PJA2 NA NA NA NA PJA2 8534 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 110830968 110831101 110831035 Y WDR36,CAMK4,STARD4 STARD4 NA NA NA NA STARD4 15187 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 110865894 110866475 110866210 Y STARD4 STARD4 NA NA NA NA STARD4 19606 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 114623111 114623418 114623265 Y NA PGGT1B,CCDC112 NA NA NA NA CCDC112 7110 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 114726097 114726311 114726134 Y NA NA NA NA NA NA CCDC112 95569 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 114749513 114749705 114749609 Y FEM1C NA FEM1C IMR90 Hi-C 24141950 CCDC112 118985 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 114750887 114751289 114751050 Y NA NA FEM1C IMR90 Hi-C 24141950 CCDC112 120359 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 28.4049431923738 chr5 114847596 114847935 114847760 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 30656 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 115794810 115794877 115794844 Y COMMD10,SEMA6A NA NA NA NA NA CTB-118N6.1 101381 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 115908516 115909016 115908646 Y SEMA6A CTB-118N6.1,CTB-118N6.2 NA NA NA NA SEMA6A 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 2.23014016799629 chr5 118592872 118593203 118593036 Y NA TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 9184 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 118610393 118610883 118610628 Y DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8 TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 8006 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr5 118664608 118664762 118664738 Y DMXL1,TNFAIP8 NA NA NA NA NA TNFAIP8 62221 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 122087226 122087448 122087366 Y NA SNX2 PRDM6 IMR90 Hi-C 24141950 SNX2 21243 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 124085012 124085124 124085092 Y NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-436H11.1 57802 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr5 126217588 126217612 126217598 Y NA NA NA NA NA NA LMNB1 107273 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 127295109 127295375 127295239 Y NA NA SLC12A2,FLJ33630,PRRC1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC12A2 122083 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 128462285 128462535 128462410 Y NA ISOC1 NA NA NA NA ISOC1 33841 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 130693580 130694145 130693755 Y FNIP1,CDC42SE2 NA NA NA NA NA CDC42SE2 114394 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 130718102 130718482 130718270 Y FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6 NA NA NA NA NA CDC42SE2 138916 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 131594769 131595694 131595371 Y PDLIM4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA PDLIM4 3405 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 2.34751596631189 chr5 131595834 131595951 131595900 Y KIF3A,PDLIM4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA PDLIM4 4470 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 2.1127643696807 chr5 131601385 131601782 131601639 Y P4HA2 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA PDLIM4 10021 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr5 131629178 131629624 131629352 Y FNIP1,IRF1,SLC22A4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 170 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 131764930 131765294 131765112 Y NA C5orf56 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 C5orf56 20602 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 131832561 131832909 131832704 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 IRF1 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 IRF1 8071 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr5 131833002 131833333 131833168 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 IRF1 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 IRF1 8512 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 132323487 132323535 132323508 Y NA AFF4,AC010240.3,ZCCHC10 NA NA NA NA AC010240.3 1685 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr5 132368718 132369095 132368932 Y AFF4,ZCCHC10 AC010240.3,ZCCHC10,HSPA4 ZCCHC10,HSPA4,AFF4 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZCCHC10 8422 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 132404436 132404641 132404539 Y LEAP2 ZCCHC10,HSPA4 NA NA NA NA HSPA4 18782 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 133435759 133436442 133436277 Y PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7 TCF7 TCF7,SKP1 IMR90 Hi-C 24141950 TCF7 11960 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 133801466 133801754 133801589 Y NA AC005355.2 PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC005355.2 38489 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461 NA NA NA NA MTND5P11 246 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11 NA NA NA NA MTND4P12,MIR4461 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr5 134471631 134472059 134471710 Y C5orf20,PITX1 NA PCBD2,LOC340073,CATSPER3,H2AFY,PITX1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTC-276P9.1 97894 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 134729736 134729896 134729816 Y NA H2AFY NA NA NA NA H2AFY 3708 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 134733668 134734080 134733976 Y H2AFY H2AFY NA NA NA NA H2AFY 64 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 134824618 134825007 134824746 Y NA NA NA NA NA NA CXCL14 87962 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 135361559 135361923 135361880 Y NA NA NA NA NA NA SMAD5 104611 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 135885544 135885599 135885577 Y NA NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 305718 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.40850957978713 chr5 137075973 137076263 137076118 Y NA HNRNPA0 NA NA NA NA HNRNPA0 11776 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 137333439 137333810 137333723 Y NA NA NA NA NA NA FAM13B 51840 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 137800317 137800564 137800421 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 1138 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr5 137810438 137810840 137810496 Y NA REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 11259 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 137826508 137826985 137826545 Y NA EGR1 NA NA NA NA EGR1 27329 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 137827710 137828119 137827817 Y EGR1 EGR1,ETF1 NA NA NA NA EGR1 28531 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 137881069 137881276 137881109 Y WNT8A,FAM53C,ETF1 ETF1,HSPA9 NA NA NA NA ETF1 4080 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 138127302 138127500 138127374 Y NA AC034243.1 NA NA NA NA AC034243.1 40304 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 138262166 138262549 138262196 Y NA NA NA NA NA NA AC034243.1 175168 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 138620359 138620541 138620439 Y UBE2D2,MATR3 MATR3,SIL1 NA NA NA NA SIL1 6705 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr5 138965572 138965797 138965632 Y NA NA NA NA NA NA CXXC5 59087 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 139090940 139091124 139091019 Y NA NA CXXC5 K562 ChIA-PET 22265404 CXXC5 66056 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 139568486 139568801 139568644 Y NA NA NA NA NA NA IGIP 64965 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 139631101 139631601 139631302 Y SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 49105 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 139633683 139634086 139633757 Y SRA1,IK,HBEGF,EIF4EBP3,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 46620 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 139636160 139636260 139636251 Y SRA1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 44446 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 139638984 139639383 139639269 Y C5orf32,ZMAT2,SRA1,IK,HARS2,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 41323 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 139641396 139641769 139641570 Y SRA1,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 38937 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 140090601 140091006 140090806 Y NA WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-3 NA NA NA NA VTRNA1-3 12737 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 140875639 140876085 140875835 Y PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1 PCDHGC3 NA NA NA NA PCDHGC3 22059 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 140900821 140901187 140900923 Y PCDH12,KIAA0141,DIAPH1 PCDHGC3 NA NA NA NA PCDHGC3 47241 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 141256552 141256862 141256814 Y PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1,PCDH1 KIAA0141 NA NA NA NA PCDH1 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 141375136 141375383 141375261 Y NA RNF14,GNPDA1 NA NA NA NA GNPDA1 15223 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 141404371 141404781 141404694 Y DIAPH1,FCHSD1 GNPDA1 GNPDA1,NDFIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNPDA1 13765 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 141736379 141736797 141736670 Y ARHGAP26 AC005592.2,SPRY4 NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPRY4 32359 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 141844342 141844631 141844489 Y NA NA SPRY4,GNPDA1,NDFIP1,FGF1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY4 140322 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 142179291 142179440 142179363 Y ARHGAP26 ARHGAP26 NA NA NA NA ARHGAP26 31342 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 142357164 142357537 142357332 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 209215 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 145326011 145326414 145326305 Y NA SH3RF2 NA NA NA NA SH3RF2 11869 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 145455339 145455700 145455520 Y NA NA NA NA NA NA LARS 104523 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 147782971 147782994 147782983 Y ADRB2,SPINK14,FBXO38 FBXO38 NA NA NA NA FBXO38 21473 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 149110836 149111455 149111198 Y ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2975 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr5 149111581 149111664 149111645 Y NA PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 3720 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 149979570 149980059 149979818 Y NA SYNPO NA NA NA NA SYNPO 928 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 150403259 150403641 150403341 Y NA GPX3 NA NA NA NA GPX3 5135 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 150455023 150455538 150455407 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 15600 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr5 150461516 150462400 150461744 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 8738 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 150462985 150463261 150463131 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 7877 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr5 150464543 150466084 150465220 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 5054 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr5 150474739 150475397 150475230 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62,TNIP1,SLC36A1,CCDC69 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 3601 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 151200780 151201112 151200835 Y GLRA1 NA NA NA NA NA ATOX1 50687 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 152494885 152495216 152495051 Y NA NA NA NA NA NA NMUR2 683956 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 153809274 153809597 153809436 Y NA SAP30L-AS1,SAP30L NA NA NA NA SAP30L-AS1 13813 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 154062607 154063000 154062805 Y GEMIN5 LARP1 LARP1,C5orf4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LARP1 27462 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr5 154205315 154205569 154205444 Y KIF4B,GEMIN5 CNOT8 NA NA NA NA CNOT8 29544 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 154871450 154872048 154871744 Y KIF4B NA NA NA NA NA MRPL22 552820 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr5 156814689 156815040 156814693 Y NA NA NA NA NA NA CTB-109A12.1 70046 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 158611896 158612266 158612182 Y IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145 RNF145 NA NA NA NA RNF145 22795 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 159414162 159414427 159414404 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 19693 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 159533500 159533764 159533742 Y NA PWWP2A NA NA NA NA PWWP2A 10666 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 159951614 159951766 159951649 Y FABP6 NA NA NA NA NA PTTG1 104785 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 164001485 164001746 164001616 Y NA NA NA NA NA NA MAT2B 1073365 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 167157088 167157552 167157214 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 559104 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 167224919 167225220 167225022 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 491436 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 167343894 167343960 167343927 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 372696 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 167741798 167742197 167741960 Y WWC1 WWC1 NA NA NA NA WWC1 25142 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 167744761 167745078 167744891 Y WWC1 WWC1 NA NA NA NA WWC1 28105 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 168232470 168232861 168232812 Y NA NA NA NA NA NA CTC-575D19.1 191153 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 171431879 171432256 171432181 Y UBTD2,STK10 FBXW11 NA NA NA NA FBXW11 2 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 171529769 171530204 171529991 Y NA NA NA NA NA NA STK10 83186 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr5 171681735 171682053 171681977 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 27022 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 172192263 172193766 172192583 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2432 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 172193800 172194232 172193914 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 1966 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 172198749 172199959 172199636 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2551 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 172205264 172205447 172205353 Y UBTD2,C5orf41,DUSP1 DUSP1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,ATP6V0E1,RPL26L1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP1 9066 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr5 172234136 172234644 172234380 Y NA DUSP1,ERGIC1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERGIC1 24634 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr5 173193377 173193650 173193560 Y NA CTB-43E15.3 CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CTB-43E15.3 22163 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 173312606 173312854 173312733 Y CPEB4 CPEB4 NA NA NA NA CPEB4 429 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 175962179 175962700 175962413 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,HK3,HIGD2A,RNF44,CDHR2 RNF44,CDHR2 FAF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 RNF44 326 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 175974830 175975038 175974917 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,HK3,C5orf25,RNF44,CDHR2 RNF44,CDHR2 NA NA NA NA CDHR2 7318 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 176526460 176526848 176526554 Y FGFR4,FGFR4 FGFR4,NSD1 NA NA NA NA FGFR4 14573 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr5 176782864 176783054 176782988 Y NA MXD3,LMAN2,RGS14,GRK6 NA NA NA NA RGS14 26 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 177041998 177042331 177042024 Y NSD1 TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 16897 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr5 180616521 180617006 180616799 Y ZFP62,TRIM52,TRIM41 TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A NA NA NA NA TRIM7 13287 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr5 180634441 180634803 180634658 Y NA TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM7 4148 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 1055850 1056126 1055989 Y FOXQ1 NA NA NA NA NA FOXQ1 254549 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 1311143 1311466 1311342 Y NA FOXQ1 NA NA NA NA FOXQ1 468 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr6 1609094 1609758 1609395 Y FOXC1 FOXC1 NA NA NA NA FOXC1 413 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr6 1641578 1641903 1641733 Y NA FOXC1 NA NA NA NA FOXC1 32897 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr6 2330490 2330806 2330587 Y NA NA NA NA NA NA GMDS-AS1 86508 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 3160462 3160701 3160583 Y NA BPHL,TUBB2A NA NA NA NA TUBB2A 4702 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 3238745 3238826 3238788 Y NA PSMG4 NA NA NA NA PSMG4 9108 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr6 3259939 3260435 3260206 Y NA PSMG4 NA NA NA NA PSMG4 30302 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 3356099 3356749 3356628 Y NA NA NA NA NA NA SLC22A23 98507 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 6687140 6687567 6687361 Y NA NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 418263 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 6811454 6812228 6812086 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 293602 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr6 6851413 6851674 6851488 Y NA NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 254156 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 6972865 6973138 6973002 Y NA NA LY86 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 132692 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 7174134 7174405 7174138 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 68304 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 10355646 10355875 10355765 Y NA NA NA NA NA NA GCNT2 134581 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 11243333 11243432 11243383 Y MAK,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 137149 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 11344526 11344935 11344784 Y TMEM170B,NEDD9 NEDD9 NA NA NA NA NEDD9 35646 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 12242168 12242480 12242308 Y HIVEP1,EDN1 EDN1 TMEM170B,ADTRP,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 46116 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 12288471 12288892 12288524 Y NA NA NA NA NA NA EDN1 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 12324386 12324755 12324542 Y NA EDN1 EDN1 MCF7 ChIA-PET 22265404 EDN1 35790 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr6 12729754 12730156 12729835 Y NA NA NA NA NA NA RPL15P3 217412 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr6 13303878 13304185 13304075 Y GFOD1,GFOD1,TBC1D7 TBC1D7 NA NA NA NA TBC1D7 22630 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 13391107 13391478 13391293 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D7 64292 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr6 13602068 13602103 13602086 Y NA SIRT5,NOL7 NA NA NA NA NOL7 11456 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 13636617 13636971 13636795 Y TBC1D7,GFOD1,CD83 NOL7 NA NA NA NA NOL7 23058 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 13649579 13649948 13649702 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 36020 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 13709903 13710182 13710119 Y TBC1D7,CD83,RANBP9 RANBP9 SIRT5,NOL7 K562 ChIA-PET 22265404 RANBP9 107 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 14271187 14271701 14271310 Y CD83 NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 155315 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 15526544 15526623 15526553 Y NA NA NA NA NA NA DTNBP1 134666 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 15569583 15569742 15569685 Y DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 91547 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 16422379 16422759 16422608 Y NA NA NA NA NA NA GMPR 185568 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 16771345 16771373 16771363 Y NA RP1-151F17.1,ATXN1 ATXN1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ATXN1 11623 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr6 17715315 17715544 17715493 Y NUP153 NUP153 NUP153,KIF13A IMR90 Hi-C 24141950 NUP153 10659 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 17925685 17925969 17925835 Y NA NA NA NA NA NA KIF13A 59885 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 18150871 18151234 18151053 Y NUP153,KDM1B NHLRC1,TPMT,KDM1B NA NA NA NA TPMT 2071 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 18153083 18153444 18153238 Y RNF144B,NHLRC1,KDM1B NHLRC1,KDM1B NA NA NA NA TPMT 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 20404913 20405227 20404970 Y MBOAT1 E2F3 NA NA NA NA E2F3 4515 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 21022706 21023638 21022736 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 490018 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr6 21098770 21098791 21098780 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 493181 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 21587723 21589288 21589205 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2684 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr6 24363883 24363911 24363897 Y GPLD1,GPLD1 DCDC2,MRS2 NA NA NA NA DCDC2 7603 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 24584505 24584676 24584669 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0319 59707 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 25352378 25352572 25352400 Y NA NA NA NA NA NA LRRC16A 75072 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2 NA NA NA NA HIST1H1A 22967 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr6 26026306 26026795 26026679 Y HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H4B 826 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr6 26126352 26126787 26126533 Y HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD NA NA NA NA HIST1H2AC 3979 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr6 26266741 26266990 26266911 Y NA HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI,HIST1H4H NA NA NA NA HIST1H3G 2622 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 26521003 26521206 26521108 Y HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1 HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HCG11 927 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 27640311 27640352 27640335 Y NA NA ZNF391,PRSS16 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BL 133357 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 27655152 27655475 27655306 Y FKSG83,ZNF391,ZNF184,ZNF192,HIST1H3H,HIST1H2BO,HIST1H2BN,HIST1H2AM NA LOC100507173,ZNF184 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HIST1H2BL 118234 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 27745023 27745278 27745151 Y OR2B6,OR2B2 HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J NA NA NA NA HIST1H2BL 28431 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 27780866 27781094 27780996 Y ZNF184,HIST1H4L,HIST1H4K,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H2AK,HIST1H1B,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AJ HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL NA NA NA NA HIST1H2BM 44 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 27807310 27807672 27807617 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L NA NA NA NA HIST1H2BN 2987 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr6 27838810 27838848 27838829 Y NA HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H4L 441 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 28072476 28072872 28072543 Y HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192 ZNF165,ZSCAN16 NA NA NA NA ZSCAN16 17466 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 28299231 28299616 28299424 Y GPX6,ZSCAN23,SCAND3,OR2B2,ZNF193,ZNF187,PGBD1 ZKSCAN3 NA NA NA NA ZKSCAN3 16075 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 28414953 28415259 28415025 Y NA NA NA NA NA NA ZKSCAN3 99262 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 29932777 29932958 29932802 Y HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A HLA-K,HLA-A,HLA-J NA NA NA NA HLA-A 25740 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr6 29933738 29934144 29933980 Y NA HLA-K,HLA-A,HLA-J NA NA NA NA HLA-A 26701 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 30068638 30068845 30068662 Y NA ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39,TRIM31 NA NA NA NA TRIM31 10038 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.29113378147154 chr6 30069810 30070038 30069951 Y HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39 ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39,TRIM31 NA NA NA NA TRIM31 8845 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr6 30247447 30247451 30247450 Y NA TRIM39,HCG18 NA NA NA NA TRIM39 44805 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 30453844 30454132 30453996 Y ZNRD1,TUBB RANP1,HLA-E HLA-E MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HLA-E 1112 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr6 30717441 30717627 30717503 Y RPP21,SFTA2,PSORS1C1 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3 PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1 IMR90 Hi-C 24141950 IER3 7110 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr6 30755729 30756010 30755821 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,FLOT1,IER3 FLOT1,IER3 FLOT1,C6orf15,PSORS1C1,DHX16,PPP1R18,TUBB,NRM,IER3,MDC1,DDR1,DPCR1,SFTA2,VARS2,C6orf136,GTF2H4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 45398 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 31702368 31703528 31702658 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5,VWA7 NA NA NA NA CLIC1 2012 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr6 31705604 31706142 31705906 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1,VWA7 NA NA NA NA MSH5 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.29113378147154 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,SNORD52 NA NA NA NA HSPA1B 3244 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 32657421 32657546 32657499 Y HLA-DRA,HLA-DRB5,HLA-DRB1,HLA-DQB1,TAP2,PSMB8,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DOB,HLA-DOA,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,HLA-DQA2 NA NA NA NA NA TAP2 147011 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 33546480 33546561 33546538 Y LEMD2,B3GALT4,RGL2,TAPBP,PHF1 BAK1,LINC00336,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 461 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 33558672 33558897 33558785 Y NA BAK1,LINC00336,ITPR3 NA NA NA NA LINC00336 218 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr6 33590898 33591125 33590902 Y ITPR3 BAK1,LINC00336,ITPR3 NA NA NA NA ITPR3 4756 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr6 33602402 33602476 33602439 Y NA LINC00336,ITPR3 IP6K3 IMR90 Hi-C 24141950 ITPR3 16260 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 34992488 34992843 34992549 Y NA NA NA NA NA NA ANKS1A 137446 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 35445364 35445634 35445501 Y RPL10A FANCE,RPL10A,TEAD3 NA NA NA NA RPL10A 11179 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 35693475 35694027 35693643 Y PPARD,FKBP5,FKBP5 FKBP5 NA NA NA NA FKBP5 333 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 36010041 36010276 36010159 Y NA MAPK14 NA NA NA NA MAPK14 16553 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 36409257 36409482 36409373 Y MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20 KCTD20 NA NA NA NA KCTD20 713 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 37227057 37227393 37227190 Y FTSJD2,TMEM217,TBC1D22B,TMEM217 TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TMEM217 3126 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 37529793 37530180 37530041 Y NA NA CCDC167,TBC1D22B,RNF8,FTSJD2,MIR4462,MDGA1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CCDC167 64095 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 39171657 39171958 39171719 Y NA KCNK5 NA NA NA NA KCNK5 23268 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr6 39195802 39196179 39195967 Y KCNK5 KCNK5 NA NA NA NA KCNK5 576 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 41400166 41400378 41400291 Y FOXP4 NA FOXP4 IMR90,H1ESC Hi-C,5C 24141950,22955621 FOXP4 111786 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 41512989 41513289 41513139 Y NA FOXP4,RP11-328M4.2 NA NA NA NA FOXP4 825 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 41964920 41965094 41964987 Y GUCA1A NA NA NA NA NA CCND3 51001 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr6 42081758 42081907 42081849 Y NA C6orf132 NA NA NA NA C6orf132 26450 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr6 42086253 42086632 42086383 Y NA C6orf132 NA NA NA NA C6orf132 21725 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr6 42090479 42090803 42090657 Y NA C6orf132 NA NA NA NA C6orf132 17554 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr6 42228452 42228568 42228527 Y NA MRPS10 NA NA NA NA MRPS10 44849 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 42743007 42743021 42743017 Y CUL9,TRERF1,UBR2,TBCC,C6orf226 TBCC KIAA0240,UBR2,RPL7L1,C6orf226,PTCRA,TBCC,PRPH2,KLHDC3,MEA1,PPP2R5D IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBCC 30449 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 43001164 43001472 43001318 Y NA MEA1,KLHDC3,RRP36,KLC4,CUL7,MRPL2,PTK7 NA NA NA NA KLC4 5043 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 43242978 43243220 43243076 Y GNMT,KLC4,SLC22A7,CRIP3 CRIP3 SLC22A7,CRIP3,ZNF318 IMR90 Hi-C 24141950 CRIP3 31315 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr6 43636886 43637091 43636988 Y NA GTPBP2,MAD2L1BP,MRPS18A NA NA NA NA MRPS18A 16437 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 43692783 43693195 43692965 Y TJAP1,MAD2L1BP MRPS18A,VEGFA MRPS18A,LOC100132354,RSPH9,MRPL14,CAPN11,TMEM63B,POLH,VEGFA,XPO5,MAD2L1BP,GTPBP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPS18A 39255 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 43766474 43766976 43766784 Y NFKBIE,MAD2L1BP VEGFA NA NA NA NA VEGFA 30553 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr6 43771690 43772179 43771963 Y NFKBIE,MAD2L1BP VEGFA NA NA NA NA VEGFA 35769 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 43894411 43894725 43894584 Y NFKBIE,TJAP1,GTPBP2,MAD2L1BP NA NA NA NA NA C6orf223 71592 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 43979820 43980209 43980006 Y NFKBIE,MAD2L1BP C6orf223 NA NA NA NA C6orf223 13503 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 44230828 44231731 44231363 Y NFKBIE SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,AARS2 NA NA NA NA NFKBIE 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr6 45299468 45299716 45299591 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 43974 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 45503698 45503963 45503769 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 160008 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr6 47102503 47102708 47102571 Y NA NA TNFRSF21 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPR110 94404 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr6 49521190 49521511 49521254 Y NA C6orf141 NA NA NA NA C6orf141 5077 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr6 52505026 52505217 52505106 Y NA TMEM14A EFHC1,TRAM2,PAQR8,LOC730101 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM14A 28690 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 53224045 53224723 53224315 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 12098 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr6 53660581 53660848 53660781 Y LRRC1 LRRC1 NA NA NA NA LRRC1 3286 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 57046105 57046302 57046204 Y NA BAG2,RAB23 NA NA NA NA BAG2 10981 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 64150073 64150241 64150156 Y NA NA NA NA NA NA PTP4A1 79425 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 64771855 64771881 64771868 Y NA NA NA NA NA NA PHF3 428130 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 64810831 64811146 64811044 Y NA NA NA NA NA NA PHF3 467106 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 66497701 66498057 66497748 Y NA NA NA NA NA NA PHF3 2153976 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 72294841 72295504 72295148 Y NA KRT19P1 RIMS1 IMR90 Hi-C 24141950 KRT19P1 2417 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr6 74186150 74186447 74186193 Y MTO1 MB21D1,MTO1,EEF1A1 NA NA NA NA MTO1 16849 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 74194767 74195136 74194952 Y NA MB21D1,MTO1,EEF1A1 NA NA NA NA MTO1 25466 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr6 74289769 74290568 74290415 Y MB21D1,SLC17A5,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA EEF1A1 58249 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 81348599 81348680 81348638 Y NA NA BCKDHB IMR90 Hi-C 24141950 BCKDHB 534235 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 82648128 82648420 82648330 Y NA NA NA NA NA NA FAM46A 187637 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr6 83931407 83931579 83931543 Y UBE2CBP,PRSS35,RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 IMR90 Hi-C 24141950 PGM3 29752 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 86114496 86114829 86114663 Y NT5E RP11-30P6.6,NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-30P6.6 16592 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr6 87433521 87433927 87433716 Y NA NA NA NA NA NA RCN1P1 396479 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 88183289 88183642 88183572 Y NA SLC35A1 NA NA NA NA SLC35A1 4948 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr6 88889388 88889661 88889633 Y NA NA NA NA NA NA ACTBP8 95047 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 92185644 92186055 92185825 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K7 890880 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 100051584 100051769 100051603 Y NA CCNC NA NA NA NA CCNC 36735 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 101149750 101149957 101149936 Y NA NA NA NA NA NA RP1-121G13.3 173598 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 106545257 106545540 106545397 Y PRDM1 PRDM1 NA NA NA NA PRDM1 13062 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 107209131 107209144 107209138 Y BEND3 RP1-60O19.1 NA NA NA NA RP1-60O19.1 24272 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr6 107216864 107217098 107216981 Y NA RP1-60O19.1 NA NA NA NA RP1-60O19.1 16318 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr6 108324190 108324471 108324239 Y NA SEC63,RPL3P7 NA NA NA NA RPL3P7 301 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr6 108879521 108879931 108879808 Y SESN1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 483 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 108883670 108884545 108884024 Y OSTM1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 4632 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 109558807 109559007 109558956 Y SMPD2,MICAL1,CD164 NA CD164,CCDC162P K562 ChIA-PET 22265404 CD164 142755 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 110870639 110870789 110870697 Y NA NA RPF2,CDK19 IMR90 Hi-C 24141950 DDO 135874 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 111049772 111049981 111049963 Y NA NA NA NA NA NA CDK19 85180 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr6 111265873 111266130 111266017 Y SLC16A10,AMD1,AMD1 GTF3C6,RPF2 CDK19,AMD1,SLC22A16 IMR90 Hi-C 24141950 GTF3C6 11633 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 111733320 111733976 111733973 Y NA NA NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 68738 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 111873587 111873978 111873729 Y NA NA NA NA NA NA TRAF3IP2 51503 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 115163170 115163515 115163320 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST5 500961 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 115392062 115392420 115392336 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST5 729853 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 116713690 116714094 116713959 Y ZUFSP,DSE,FAM26F NA NA NA NA NA TSPYL1 114624 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 117804575 117804878 117804739 Y NA DCBLD1 NA NA NA NA DCBLD1 31595 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 119151345 119151482 119151449 Y MCM9 NA NA NA NA NA ASF1A 61902 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 119166106 119166505 119166300 Y NA ASF1A NA NA NA NA ASF1A 46879 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 119218988 119219366 119219177 Y MCM9 ASF1A,MCM9 NA NA NA NA ASF1A 5604 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 119634187 119634405 119634308 Y MCM9,MAN1A1 MAN1A1 NA NA NA NA MAN1A1 34521 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 121758280 121758805 121758450 Y GJA1 GJA1 NA NA NA NA GJA1 3442 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr6 127980874 127981174 127981075 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 226093 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 128607751 128608140 128608092 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 231730 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr6 128675135 128675339 128675237 Y PTPRK,PTPRK NA NA NA NA NA PTPRK 164531 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 128793943 128794334 128794205 Y NA PTPRK NA NA NA NA PTPRK 45536 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 128816273 128816626 128816620 Y NA PTPRK NA NA NA NA PTPRK 23244 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 128830157 128830356 128830243 Y NA PTPRK NA NA NA NA PTPRK 9514 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr6 128840669 128840970 128840936 Y PTPRK,PTPRK PTPRK NA NA NA NA PTPRK 799 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 130005105 130005433 130005370 Y L3MBTL3,ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 23937 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 130513480 130513753 130513616 Y NA NA NA NA NA NA L3MBTL3 180636 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 131350914 131351060 131350987 Y AKAP7 EPB41L2 NA NA NA NA EPB41L2 31402 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 132474362 132474724 132474477 Y NA NA NA NA NA NA CTGF 203849 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 134741718 134742020 134741875 Y SGK1,SGK1,SGK1 NA SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 104468 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 135503898 135504621 135504156 Y HBS1L,AHI1,MYB MYB NA NA NA NA MYB 3445 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr6 136528020 136528260 136528195 Y NA NA NA NA NA NA BCLAF1 80729 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 136688131 136688248 136688227 Y NA NA NA NA NA NA BCLAF1 79142 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 136788990 136789214 136789102 Y NA NA NA NA NA NA MAP7 80743 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 137181238 137181571 137181404 Y PEX7 PEX7 NA NA NA NA PEX7 39521 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 137242009 137242335 137242164 Y IL20RA,SLC35D3 NA NA NA NA NA PEX7 100292 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 138131793 138132158 138131947 Y TNFAIP3 NA TNFAIP3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 54193 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 138231733 138231922 138231805 Y TNFAIP3 TNFAIP3 NA NA NA NA TNFAIP3 45382 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 138821349 138821443 138821380 Y REPS1,NHSL1 NA NA NA NA NA HEBP2 98681 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr6 139860975 139861228 139861133 Y CITED2,CITED2,CITED2 NA CITED2,LOC100132735 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CITED2 167218 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 140085604 140086085 140085978 Y CITED2,CITED2,CITED2 NA TXLNB,CITED2,LOC645434,LOC100132735 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 391847 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 143247398 143248213 143248022 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 16125 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr6 144284201 144284585 144284512 Y NA NA NA NA NA NA PLAGL1 99150 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 144982592 144982877 144982735 Y NA NA NA NA NA NA UTRN 377755 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 145977217 145977350 145977284 Y NA NA NA NA NA NA EPM2A 77810 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 146866760 146867250 146866919 Y RAB32 RAB32 NA NA NA NA RAB32 3931 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 151701197 151701769 151701451 Y C6orf97,ZBTB2 ZBTB2 NA NA NA NA ZBTB2 8914 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 151770191 151770744 151770510 Y NA RMND1,C6orf211 NA NA NA NA RMND1 515 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 151990047 151990437 151990162 Y NA NA ESR1,RMND1,C6orf211,SYNE1,C6orf97 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C6orf211 218625 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 154505237 154505477 154505359 Y NA NA NA NA NA NA CNKSR3 324316 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 154830409 154830718 154830573 Y CNKSR3 CNKSR3 NA NA NA NA CNKSR3 616 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 155593046 155593119 155593050 Y NA TFB1M NA NA NA NA TFB1M 40508 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr6 155649228 155649931 155649893 Y NA TFB1M ARID1B,MIR4466 IMR90 Hi-C 24141950 TFB1M 15601 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr6 157007979 157008724 157008580 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88339 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr6 157299126 157299275 157299174 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 202063 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 157342507 157343524 157343342 Y ARID1B,ZDHHC14 NA NA NA NA NA ARID1B 245444 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr6 158034114 158034488 158034146 Y NA NA NA NA NA NA SNX9 207808 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 158184460 158184689 158184561 Y SNX9 NA SNX9,TMEM242,ZDHHC14,SYNJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNX9 57607 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 158254729 158255396 158255020 Y NA SNX9 NA NA NA NA SNX9 12433 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 158375265 158375579 158375328 Y NA SYNJ2 NA NA NA NA SYNJ2 25309 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr6 158424430 158424803 158424679 Y SYNJ2 SYNJ2 NA NA NA NA SYNJ2 23542 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 158481547 158481708 158481650 Y SNX9 NA NA NA NA NA SYNJ2 80659 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 158895983 158896180 158896053 Y NA NA NA NA NA NA DYNLT1 167591 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 158981403 158981866 158981661 Y NA NA NA NA NA NA DYNLT1 81905 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 159195572 159195684 159195582 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 42760 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 159226894 159227283 159227272 Y NA EZR NA NA NA NA EZR 11161 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 159270971 159271326 159271104 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR,C6orf99 NA NA NA NA C6orf99 17645 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr6 159273925 159274893 159274526 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR,C6orf99 NA NA NA NA C6orf99 14078 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.64326117641832 chr6 166795008 166795404 166795174 Y NA SFT2D1 NA NA NA NA SFT2D1 40929 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 167115544 167115618 167115576 Y NA NA NA NA NA NA RP11-514O12.4 251994 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 167834861 167835135 167834902 Y NA NA SMOC2 IMR90 Hi-C 24141950 CCR6 311566 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 168250541 168251043 168250675 Y NA MLLT4 NA NA NA NA MLLT4 24939 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr6 169308928 169309266 169309084 Y THBS2 NA WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242 IMR90 Hi-C 24141950 WDR27 790893 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr6 170054470 170055295 170054892 Y TCTE3 WDR27,C6orf120 NA NA NA NA WDR27 44864 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr6 170838453 170838652 170838543 Y NA PSMB1,TBP NA NA NA NA PSMB1 21777 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 373094 373351 373247 Y PRKAR1B NA FLJ44511,PDGFA MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM20C 182125 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr7 475920 475996 475984 Y NA NA HEATR2,PRKAR1B MCF7 ChIA-PET 22265404 PDGFA 81937 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 525455 525590 525542 Y GET4,PDGFA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 32343 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr7 543299 543586 543435 Y GET4,CYP2W1,PDGFA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 14347 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 577876 578141 578015 Y PRKAR1B,PRKAR1B,HEATR2,GET4,PDGFA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 19943 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.40850957978713 chr7 579426 579712 579625 Y PRKAR1B,PRKAR1B,GET4,PDGFA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 21493 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr7 657520 657797 657766 Y CYP2W1 NA NA NA NA NA PDGFA 99587 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr7 875702 875833 875757 Y SUN1,SUN1 SUN1,GET4 NA NA NA NA SUN1 22174 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr7 964406 964697 964471 Y ZFAND2A,COX19,ADAP1 ADAP1,COX19 NA NA NA NA ADAP1 28346 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.40850957978713 chr7 965289 965600 965408 Y ZFAND2A,ADAP1 ADAP1,COX19 NA NA NA NA ADAP1 27443 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.87801277304951 chr7 988760 989207 989097 Y ADAP1 ADAP1,COX19,CYP2W1 NA NA NA NA ADAP1 3836 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 3.16914655452105 chr7 1017371 1017727 1017512 Y PRKAR1B,PRKAR1B,GET4,CYP2W1 ADAP1,COX19,CYP2W1 NA NA NA NA CYP2W1 3108 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 1039490 1039728 1039629 Y NA ADAP1,COX19,CYP2W1,GPR146 NA NA NA NA CYP2W1 18655 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 1416814 1417157 1416984 Y NA NA NA NA NA NA MICALL2 79981 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 1456103 1456158 1456132 Y NA MICALL2 NA NA NA NA MICALL2 40980 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr7 1495047 1495214 1495102 Y NA MICALL2,INTS1 NA NA NA NA MICALL2 1924 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.76063697473392 chr7 1571273 1571500 1571366 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 2923 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr7 1572262 1572844 1572636 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 3912 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr7 1968189 1968469 1968397 Y NA NA NA NA NA NA AC074389.9 188262 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 3.75602554609902 chr7 2058997 2060327 2059312 Y SNX8,MAFK NA NA NA NA NA MAD1L1 210551 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 2150639 2150902 2150796 Y SNX8,LFNG NA NA NA NA NA MAD1L1 119976 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr7 2306623 2306831 2306646 Y MAD1L1 MAD1L1,FTSJ2,NUDT1 NA NA NA NA NUDT1 26766 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 2561604 2562123 2561810 Y LFNG,LFNG LFNG,BRAT1,IQCE NA NA NA NA LFNG 11441 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 2569438 2569603 2569498 Y LFNG,LFNG,IQCE,BRAT1 LFNG,BRAT1,IQCE NA NA NA NA LFNG 19275 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 2570337 2570495 2570402 Y LFNG,BRAT1 LFNG,BRAT1,IQCE NA NA NA NA LFNG 20174 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 2575019 2575461 2575251 Y NA LFNG,BRAT1,IQCE NA NA NA NA BRAT1 17900 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 2662902 2663119 2663008 Y NA TTYH3 AMZ1,TTYH3 IMR90 Hi-C 24141950 TTYH3 6466 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 2667919 2668210 2667992 Y NA TTYH3 NA NA NA NA TTYH3 1375 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr7 2672306 2673216 2673099 Y LFNG,TTYH3 TTYH3 NA NA NA NA TTYH3 2721 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr7 2676969 2677494 2677317 Y LFNG TTYH3 NA NA NA NA TTYH3 7384 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 2860040 2860490 2860319 Y LFNG,LFNG,GNA12 AC006028.11,GNA12 NA NA NA NA AC006028.11 12765 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 2861620 2861774 2861696 Y LFNG,GNA12 AC006028.11,GNA12 NA NA NA NA AC006028.11 11481 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 2903227 2903785 2903462 Y LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12 AC006028.11,GNA12 GNA12 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNA12 21269 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr7 3018099 3018595 3018309 Y NA NA NA NA NA NA CARD11 62984 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 4681329 4681565 4681443 Y MMD2 NA SDK1,FOXK1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXK1 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 4764796 4765177 4765030 Y KIAA0415 NA NA NA NA NA FOXK1 83408 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr7 4765280 4765661 4765569 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 83892 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 5039702 5040026 5039789 Y NA RNF216P1,RBAK NA NA NA NA RNF216P1 28083 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 5458136 5458686 5458477 Y FBXL18,TNRC18 TNRC18 NA NA NA NA TNRC18 4359 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 5469639 5470034 5469987 Y NA TNRC18 TNRC18,FBXL18,ACTB MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TNRC18 6594 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr7 5492663 5492953 5492758 Y MMD2,SLC29A4 TNRC18 TNRC18 MCF7 ChIA-PET 22265404 TNRC18 29618 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 5571967 5572766 5572739 Y RBAK,RBAK FBXL18,ACTB NA NA NA NA FBXL18 20538 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr7 5594554 5594977 5594837 Y WIPI2 FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 6438 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 5595490 5596184 5595557 Y CCZ1,ACTB FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 5231 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 5596196 5596581 5596543 Y CCZ1,ACTB FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 4834 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 5634980 5635411 5634989 Y AIMP2,FBXL18,ACTB,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216 IMR90 Hi-C 24141950 FSCN1 4541 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 6467944 6468137 6468104 Y NA NA NA NA NA NA DAGLB 53684 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 6677371 6677641 6677424 Y DAGLB,ZNF12,C7orf26 C7orf26,ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 2418 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr7 6741580 6741996 6741754 Y C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12 ZNF12,PMS2CL NA NA NA NA ZNF12 2558 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 7249464 7249811 7249639 Y NA AC005532.5 NA NA NA NA AC005532.5 42974 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 7298478 7298713 7298536 Y MIOS AC005532.5 NA NA NA NA AC005532.5 5693 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 7605671 7605858 7605804 Y NA MIOS NA NA NA NA MIOS 1168 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 7804088 7804477 7804243 Y NA RPA3,RPL23AP51 NA NA NA NA RPL23AP51 23922 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 7911710 7911812 7911761 Y NA NA NA NA NA NA GLCCI1 94613 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 8295276 8295343 8295310 Y NA AC007009.1,ICA1 NA NA NA NA AC007009.1 4520 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 9135754 9136028 9135891 Y NA NA NA NA NA NA ICA1 835437 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 13372875 13373192 13373034 Y NA NA NA NA NA NA ARL4A 648394 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 13512547 13512927 13512737 Y NA NA DGKB IMR90 Hi-C 24141950 ETV1 516123 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 13592138 13592417 13592278 Y NA NA DGKB IMR90 Hi-C 24141950 ETV1 436633 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 13700759 13700990 13700876 Y NA NA NA NA NA NA ETV1 328060 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 13797003 13797366 13797185 Y NA NA NA NA NA NA ETV1 231684 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 13818689 13818849 13818801 Y ETV1 NA NA NA NA NA ETV1 210201 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 16707771 16707941 16707875 Y NA ANKMY2,BZW2 NA NA NA NA BZW2 24015 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 16886935 16887473 16887050 Y NA AGR2,AGR3 NA NA NA NA AGR2 15878 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 17139132 17139382 17139242 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AHR 196864 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr7 17360383 17360757 17360401 Y NA AHR,AC003075.4 NA NA NA NA AC003075.4 23402 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 17402534 17402650 17402592 Y NA NA NA NA NA NA AC003075.4 65553 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 17412000 17412058 17412028 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC003075.4 75019 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 17564000 17564574 17564249 Y NA AC017060.1 AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC017060.1 31959 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr7 19017733 19017917 19017790 Y TWIST1 NA NA NA NA NA TWIST1 137378 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 20006905 20007156 20007031 Y TMEM196 RPL21P75 NA NA NA NA RPL21P75 33190 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 20123446 20123761 20123595 Y TWISTNB,ITGB8 NA NA NA NA NA RPL21P75 83100 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 20197239 20197492 20197368 Y NA NA NA NA NA NA MACC1 57535 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr7 20217388 20217681 20217578 Y TWISTNB,MACC1 MACC1,AC005083.1 NA NA NA NA MACC1 37346 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 20240719 20241217 20240796 Y TWISTNB MACC1,AC005083.1 NA NA NA NA MACC1 13810 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 20386006 20386499 20386153 Y ITGB8 ITGB8 NA NA NA NA ITGB8 17681 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 20439186 20439753 20439406 Y NA NA NA NA NA NA ITGB8 70861 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 20447290 20447655 20447472 Y ITGB8 NA NA NA NA NA ITGB8 78965 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 20463565 20463840 20463661 Y ITGB8 NA NA NA NA NA ITGB8 95240 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 20837430 20837819 20837731 Y SP8 SP8,RPL23P8 SP8 K562 ChIA-PET 22265404 SP8 12925 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 20993749 20993911 20993806 Y SP8 NA NA NA NA NA RPL23P8 128804 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 22484182 22484549 22484368 Y NA NA NA NA NA NA EEF1A1P6 65069 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 22485088 22485297 22485116 Y RAPGEF5 NA NA NA NA NA EEF1A1P6 64321 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr7 22894313 22894860 22894668 Y STEAP1B,TOMM7 TOMM7 NA NA NA NA TOMM7 33843 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 23229571 23229876 23229614 Y NA NUPL2 NA NA NA NA NUPL2 10125 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 23411315 23411579 23411447 Y NA NA NA NA NA NA IGF2BP3 96507 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 23504984 23505316 23505313 Y NA IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2770 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr7 23510676 23511223 23510889 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2590 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr7 23513815 23514383 23514045 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 MALSU1 K562 ChIA-PET 22265404 IGF2BP3 5729 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 23853769 23853785 23853777 Y NPY NA NA NA NA NA AC006026.13 135364 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 24861129 24861331 24861204 Y C7orf31,DFNA5 NA NA NA NA NA DFNA5 53885 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr7 24947142 24947425 24947387 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL3 71828 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 25896515 25897081 25896801 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 292779 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 26193570 26193972 26193862 Y SNX10,SNX10,HNRNPA2B1 NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1 NA NA NA NA NFE2L3 3710 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 26361230 26361345 26361289 Y SNX10,SNX10,SNX10 AC010677.5,SNX10 NA NA NA NA SNX10 31689 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 27231816 27231998 27231907 Y HOXA10,HOXA11,HOXA13 HOXA6,HOXA7,RP1-170O19.20,HOXA11,HOTTIP,HOXA13 NA NA NA NA HOTTIP 4196 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 27717680 27717897 27717733 Y NA HIBADH HOTTIP,HOXA13,HIBADH,TAX1BP1,JAZF1 IMR90 Hi-C 24141950 HIBADH 17066 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr7 27876967 27877264 27877116 Y CREB5 NA NA NA NA NA AC004549.6 98953 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 28893180 28893544 28893363 Y CREB5 NA CREB5 IMR90 Hi-C 24141950 CHN2 266346 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 29163209 29163338 29163275 Y NA CHN2 NA NA NA NA CHN2 3319 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 29534563 29534631 29534599 Y WIPF3 NA NA NA NA NA AC007255.8 66655 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr7 30188805 30188913 30188846 Y NA AC007036.5 NA NA NA NA AC007036.5 6234 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 30636092 30636194 30636111 Y NA GGCT,GARS,AC005154.6 NA NA NA NA AC005154.6 3667 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 30658764 30658962 30658863 Y NA GARS,AC005154.6 NA NA NA NA AC005154.6 26339 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 32026855 32027150 32027002 Y NA NA NA NA NA NA LSM5 505745 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 32531348 32531711 32531530 Y PDE1C,PDE1C,PDE1C LSM5,AVL9 NA NA NA NA LSM5 1184 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 32551548 32551619 32551584 Y NA LSM5,AVL9 NA NA NA NA AVL9 18510 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 33316298 33316594 33316442 Y NA NA NA NA NA NA BBS9 149442 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 35075861 35076697 35076367 Y NA NA NA NA NA NA NPSR1 380010 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.64326117641832 chr7 35285792 35286017 35285905 Y TBX20 NA NA NA NA NA HERPUD2 447164 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 36480174 36480717 36480189 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0895 52440 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 36776109 36776821 36776493 Y ELMO1,AOAH NA ELMO1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0895 348375 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 38750267 38750277 38750273 Y NA NA NA NA NA NA VPS41 219717 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 39126664 39126675 39126670 Y NA NA NA NA NA NA VPS41 156670 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 40088776 40089159 40088837 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 101140 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 42927750 42928726 42928340 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 NA NA NA NA C7orf25 21178 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 43626451 43626626 43626528 Y URGCP,STK17A STK17A C7orf44 IMR90 Hi-C 24141950 STK17A 6094 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 43654812 43655175 43654945 Y POLM,DBNL,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 34455 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 43657815 43658085 43657951 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 37458 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 43670120 43670185 43670135 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 49763 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 43959007 43959429 43959215 Y NA URGCP,UBE2D4 NA NA NA NA URGCP 4581 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 44436686 44437032 44436900 Y NA NA NA NA NA NA AC004453.8 68409 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 44674941 44675231 44675112 Y PURB,MYO1G,CCM2,DDX56,OGDH OGDH ZMIZ2 IMR90 Hi-C 24141950 OGDH 30770 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 44677628 44678244 44677873 Y ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH OGDH ZMIZ2 IMR90 Hi-C 24141950 OGDH 33457 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr7 44679392 44679514 44679453 Y ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH OGDH NA NA NA NA OGDH 35221 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr7 44764845 44765151 44764999 Y RAMP3 ZMIZ2 NA NA NA NA ZMIZ2 21029 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 44845785 44846169 44845977 Y DDX56 PPIA,H2AFV NA NA NA NA PPIA 11506 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 44855333 44855416 44855373 Y TBRG4,H2AFV PPIA,H2AFV NA NA NA NA PPIA 21054 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr7 45129269 45129527 45129398 Y ADCY1,NACAD NACAD,TBRG4 NA NA NA NA NACAD 2756 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 45928899 45929352 45929108 Y IGFBP1 IGFBP1,IGFBP3 NA NA NA NA IGFBP1 2943 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 45947887 45948101 45948023 Y NA IGFBP1,IGFBP3 NA NA NA NA IGFBP3 11372 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 47367058 47367181 47367120 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 252975 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 47391456 47391672 47391564 Y C7orf65 NA NA NA NA NA TNS3 228484 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 47510195 47510559 47510444 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 109597 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 76.1768931068208 chr7 47514732 47515208 47514929 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 104948 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr7 48240591 48240965 48240675 Y NA NA NA NA NA NA UPP1 114366 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr7 50306514 50306844 50306594 Y IKZF1,FIGNL1 NA NA NA NA NA FIGNL1 209244 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 50602565 50602886 50602809 Y NA DDC NA NA NA NA DDC 28268 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 50682806 50683075 50682899 Y DDC NA NA NA NA NA DDC 51652 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 7.62942689051363 chr7 50695565 50695835 50695829 Y NA NA NA NA NA NA DDC 64411 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 51189835 51190140 51189988 Y NA NA NA NA NA NA COBL 192375 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 51370562 51370701 51370648 Y COBL COBL NA NA NA NA COBL 11814 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 51382954 51383359 51383079 Y COBL COBL NA NA NA NA COBL 439 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr7 55132578 55133258 55132929 Y SEC61G,EGFR EGFR NA NA NA NA EGFR 47864 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 55141624 55142112 55141893 Y SEC61G,EGFR NA NA NA NA NA EGFR 56910 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 55146809 55147410 55146997 Y NA NA NA NA NA NA EGFR 62095 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 2.46489176462748 chr7 55542922 55542955 55542935 Y VOPP1 NA NA NA NA NA VOPP1 95726 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 55614421 55614857 55614666 Y VOPP1 VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 23824 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 55635235 55635573 55635336 Y NA VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 3108 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 56168682 56168929 56168809 Y ZNF713 SUMF2,CHCHD2 NA NA NA NA CHCHD2 3340 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 56173322 56173423 56173410 Y NA SUMF2,CHCHD2 NA NA NA NA CHCHD2 1053 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr7 64196878 64197130 64197096 Y NA NA NA NA NA NA ZNF138 55636 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 65878387 65878723 65878560 Y RABGEF1,KCTD7 NA ASL,CRCP,TPST1,LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 GS1-124K5.3 77830 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 66223934 66224293 66224105 Y KCTD7,RABGEF1 NA NA NA NA NA RABGEF1 78783 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 66783772 66783944 66783858 Y NA STAG3L4,PMS2P4 NA NA NA NA PMS2P4 17878 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 70983544 70983939 70983644 Y NA NA NA NA NA NA TYW1B 1312838 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 72939749 72940060 72940006 Y BAZ1B BAZ1B,BCL7B NA NA NA NA BAZ1B 5141 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 72990459 72990574 72990513 Y NA BCL7B,TBL2,MLXIPL NA NA NA NA TBL2 547 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 73015142 73015298 73015257 Y NA BCL7B,TBL2,MLXIPL NA NA NA NA MLXIPL 21575 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 73037168 73037552 73037436 Y MLXIPL TBL2,MLXIPL NA NA NA NA MLXIPL 295 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 73062013 73062614 73062579 Y BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A MLXIPL,WBSCR22,DNAJC30 MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A IMR90 Hi-C 24141950 MLXIPL 25140 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.29113378147154 chr7 73132412 73132545 73132481 Y LAT2,BCL7B WBSCR22,DNAJC30,STX1A,ABHD11 NA NA NA NA STX1A 410 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 73133049 73133354 73133303 Y NA WBSCR22,DNAJC30,STX1A,ABHD11,CLDN3 NA NA NA NA STX1A 1047 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 73153813 73154099 73154081 Y FZD9,STX1A,ABHD11,CLDN4,CLDN3 STX1A,ABHD11,CLDN3 NA NA NA NA ABHD11 2616 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr7 73157180 73157738 73157420 Y FZD9,BAZ1B,TBL2,MLXIPL,ABHD11,CLDN4,CLDN3 STX1A,ABHD11,CLDN3 NA NA NA NA ABHD11 5983 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr7 73694024 73694283 73694118 Y LAT2 RFC2,CLIP2 CLIP2 IMR90 Hi-C 24141950 CLIP2 7522 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 74050043 74050194 74050049 Y GTF2IRD2B GTF2I GTF2IRD1,GTF2I IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTF2I 19800 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 75354773 75355120 75354947 Y NA HIP1 NA NA NA NA HIP1 11160 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 75449549 75449901 75449725 Y NA RHBDD2 HIP1,CCL26,CCL24,POR,TMEM120A,STYXL1,MDH2 IMR90 Hi-C 24141950 RHBDD2 20019 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 75795833 75796053 75795969 Y RHBDD2,POR NA SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 MDH2 120464 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 75948116 75948327 75948250 Y RHBDD2 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 18255 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr7 76002661 76002791 76002762 Y POR YWHAG,ZP3 NA NA NA NA YWHAG 16313 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 77042340 77042746 77042618 Y PTPN12,PTPN12,PION NA NA NA NA NA PTPN12 121846 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr7 77428722 77429286 77429067 Y PION,PTPN12,RSBN1L,PHTF2,PHTF2 TMEM60,PHTF2 NA NA NA NA PHTF2 2600 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 78922771 78923130 78923056 Y MAGI2 NA NA NA NA NA GNAI1 838141 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 79844591 79844960 79844776 Y NA NA NA NA NA NA GNAI1 83320 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 81582871 81583219 81583134 Y NA NA NA NA NA NA CACNA2D1 487895 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 81851268 81851277 81851273 Y NA NA NA NA NA NA CACNA2D1 219837 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 81927516 81927685 81927601 Y NA NA NA NA NA NA CACNA2D1 143429 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 90637974 90638276 90638003 Y NA NA NA NA NA NA FZD1 253507 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 91142488 91142502 91142497 Y MTERF NA NA NA NA NA FZD1 250705 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 92227351 92227620 92227450 Y CDK6,CDK6 FAM133B FAM133B K562 ChIA-PET 22265404 FAM133B 9643 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 92233387 92233691 92233548 Y NA FAM133B FAM133B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 FAM133B 15679 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 92263416 92263696 92263624 Y SAMD9,CDK6 FAM133B FAM133B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 45708 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 92324544 92325563 92325510 Y NA NA FAM133B IMR90 Hi-C 24141950 FAM133B 106836 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr7 92361219 92361296 92361260 Y NA NA NA NA NA NA CDK6 102612 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 92373404 92373742 92373580 Y NA NA NA NA NA NA CDK6 90166 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 92392967 92393205 92393086 Y PEX1,C7orf64,FAM133B,SAMD9,CDK6,CDK6 NA FAM133B IMR90 Hi-C 24141950 CDK6 70703 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 93231275 93231507 93231391 Y CCDC132 NA NA NA NA NA CCDC132 371622 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 93930998 93931300 93931121 Y NA NA COL1A2,GNG11 IMR90 Hi-C 24141950 CASD1 205231 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 97761073 97761517 97761248 Y BRI3,LMTK2 LMTK2 NA NA NA NA LMTK2 26876 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 97913424 97913987 97913861 Y LMTK2,BRI3 TECPR1,BRI3 NA NA NA NA BRI3 33733 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr7 97915595 97916070 97915699 Y LMTK2,BRI3 TECPR1,BRI3 NA NA NA NA BRI3 35904 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 97994295 97994325 97994312 Y BAIAP2L1 RPS3AP26,BAIAP2L1 BRI3 IMR90 Hi-C 24141950 RPS3AP26 19571 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr7 98048213 98048460 98048408 Y BRI3 RPS3AP26,BAIAP2L1 BAIAP2L1,TRRAP,TMEM130 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BAIAP2L1 19833 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 98286893 98287005 98286947 Y NA NA NA NA NA NA TRRAP 186551 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 98739351 98739615 98739543 Y NA SMURF1 NA NA NA NA SMURF1 108 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 98809347 98809684 98809536 Y ZNF655,ZNF655,ZKSCAN5,PTCD1,PDAP1,FAM200A,CPSF4,BUD31,ATP5J2,ARPC1A,SMURF1,KPNA7 NA SMURF1 IMR90 Hi-C 24141950 SMURF1 69624 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr7 98871923 98872129 98871984 Y NA ARPC1A NA NA NA NA ARPC1A 49392 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 98973055 98973209 98973129 Y ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B ARPC1B,BUD31,PDAP1 NA NA NA NA ARPC1B 3183 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 99000499 99000617 99000560 Y NA ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4 NA NA NA NA BUD31 3647 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 99957855 99958254 99957887 Y NA PILRB,PMS2P1 NA NA NA NA PMS2P1 20324 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 100042030 100042585 100042239 Y COPS6,EPHB4 MEPCE,ZCWPW1,PPP1R35,TSC22D4 NA NA NA NA PPP1R35 9842 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 100433472 100433773 100433685 Y NA SLC12A9,EPHB4,RP11-126L15.4,TRIP6,SRRT AGFG2,MOSPD3,PCOLCE,FBXO24,LOC100129845,POP7,EPO,GIGYF1,EPHB4,ZAN,SRRT,SLC12A9,TRIP6,SERPINE1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHB4 10351 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 100522006 100522082 100522044 Y NA UFSP1,ACHE,RP13-650G11.1,MUC3A MUC12,MUC17,TRIM56,EMID2 IMR90 Hi-C 24141950 RP13-650G11.1 1908 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 101596326 101596693 101596419 Y SH2B2,CUX1,CUX1 NA NA NA NA NA CUX1 139367 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr7 101672273 101672589 101672281 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 215314 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72006 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr7 104585458 104586124 104585640 Y MLL5 RP11-325F22.5 LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-325F22.5 20381 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 104608110 104608364 104608281 Y NA RP11-325F22.5,LINC01004 NA NA NA NA RP11-325F22.5 43033 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 104614051 104614727 104614598 Y NA RP11-325F22.5,LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 36764 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 104857177 104857523 104857432 Y NA NA NA NA NA NA SRPK2 180232 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 104980501 104980737 104980707 Y NA NA NA NA NA NA SRPK2 57018 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 105447208 105447599 105447347 Y NA NA NA NA NA NA ATXN7L1 67451 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 105459888 105460220 105459903 Y NA NA NA NA NA NA ATXN7L1 54830 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 105602769 105602970 105602871 Y NA NA NA NA NA NA CDHR3 87527 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 105711914 105712310 105712244 Y NA SYPL1 NA NA NA NA SYPL1 38712 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 106089773 106090176 106089868 Y NAMPT,PIK3CG NA NAMPT IMR90 Hi-C 24141950 NAMPT 165001 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 106808132 106808705 106808532 Y NA HBP1 NA NA NA NA HBP1 726 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 106901302 106901364 106901333 Y NA NA NA NA NA NA HBP1 93896 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 107026511 107026865 107026723 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 175064 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 107567788 107568066 107567911 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 38373 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 107644827 107645024 107644950 Y LAMB1 LAMB1 NA NA NA NA LAMB1 3127 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 110326552 110326706 110326634 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 873867 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 110808410 110808626 110808556 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 391947 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 113100139 113100486 113100313 Y GPR85,GPR85,GPR85 NA NA NA NA NA LINC00998 343471 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr7 115957232 115957778 115957588 Y NA CAV2 CAV1,CAV2,TES,CAPZA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CAV2 31798 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 116328034 116328226 116328184 Y ST7,CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,MET MET NA NA NA NA MET 17590 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 116356493 116356879 116356812 Y NA MET NA NA NA NA MET 46049 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 116452966 116453226 116453141 Y CAPZA2 CAPZA2 NA NA NA NA CAPZA2 3842 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr7 116523983 116524309 116524052 Y NA NA NA NA NA NA ST7 66983 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 116651956 116652355 116652105 Y NA NA NA NA NA NA ST7-AS1 59568 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 116793573 116793925 116793605 Y NA NA NA NA NA NA ST7-AS1 201185 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 116990120 116990313 116990215 Y NA NA NA NA NA NA CFTR 113525 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 117253655 117254026 117253841 Y NA NA NA NA NA NA CFTR 149817 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr7 117290130 117290152 117290141 Y NA NA NA NA NA NA CFTR 186292 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 121025846 121026096 121025939 Y ING3 FAM3C NA NA NA NA FAM3C 8322 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 121956215 121956565 121956447 Y NA FEZF1-AS1 NA NA NA NA FEZF1-AS1 14503 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 127665265 127665386 127665326 Y NA NA NA NA NA NA RBM28 316576 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 127807416 127807928 127807646 Y LRRC4 NA SND1 IMR90 Hi-C 24141950 RBM28 174034 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.87801277304951 chr7 128249599 128249637 128249625 Y NA RP11-212P7.1 FLJ45340,CALU,FAM71F1,IRF5 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-212P7.1 40857 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 128383172 128383597 128383318 Y NA CALU,CCDC136 NA NA NA NA CALU 5826 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 129010616 129010786 129010717 Y NA RP11-305M3.2 FAM40B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-305M3.2 37425 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 129014301 129014725 129014533 Y AHCYL2,FAM40B,AHCYL2 RP11-305M3.2 FAM40B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-305M3.2 33486 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 129419118 129419176 129419138 Y NA NA UBE2H,NRF1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 169563 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 129419876 129420343 129420085 Y NA NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 170321 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr7 129464915 129465297 129464948 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 125492 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 129465628 129465864 129465722 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 124925 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 129469996 129470292 129470140 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 120497 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 129960010 129960125 129960069 Y NA CPA4 NA NA NA NA CPA4 29036 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 130571851 130572495 130572306 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 23574 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 130575591 130576512 130576394 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 19557 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr7 130581597 130582393 130581985 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 13676 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr7 130586004 130586434 130586371 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 9635 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr7 130589567 130590049 130589961 Y NA MIR29A MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 6020 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 130602337 130602820 130602733 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A FLJ43663 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 6268 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 130606000 130606565 130606293 Y NA MIR29A LOC646329 MCF7 ChIA-PET 22265404 MIR29A 9931 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 130636331 130636776 130636707 Y MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 40262 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 130645057 130645459 130645325 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 48988 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 132484487 132484560 132484524 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD3 280288 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 134117156 134117311 134117298 Y NA AKR1B1 NA NA NA NA AKR1B1 24725 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 134287776 134287871 134287820 Y NA BPGM AKR1B1,AKR1B10,AKR1B15,BPGM IMR90 Hi-C 24141950 BPGM 41689 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 135708293 135708582 135708438 Y NA MTPN C7orf73 IMR90 Hi-C 24141950 MTPN 48192 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 137311444 137311452 137311448 Y NA NA NA NA NA NA CREB3L2 373361 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 137387266 137387617 137387499 Y NA NA NA NA NA NA CREB3L2 297196 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 138081171 138081424 138081337 Y TRIM24 AC008155.1 NA NA NA NA AC008155.1 5844 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 138643234 138643648 138643551 Y TRIM24,SVOPL,UBN2,LUC7L2,KIAA1549 KIAA1549 NA NA NA NA KIAA1549 20416 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 140372003 140372139 140372071 Y NA ADCK2,NDUFB2 NA NA NA NA ADCK2 1050 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 141492164 141492415 141492290 Y TAS2R38,OR9A4,TAS2R3,TAS2R4,TAS2R5 NA NA NA NA NA SSBP1 56043 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 141501394 141501805 141501703 Y NA NA NA NA NA NA SSBP1 65273 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 142246179 142246560 142246372 Y EPHB6 NA EPHB6 IMR90 Hi-C 24141950 EPHB6 304232 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 143083267 143084129 143083354 Y TAS2R40,FAM131B,FAM131B AC093673.5,ZYX,EPHA1 NA NA NA NA ZYX 7094 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 144223556 144223561 144223559 Y NA NA NA NA NA NA OR2A20P 275506 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 148334506 148334940 148334775 Y NA NA NA NA NA NA CUL1 58066 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 148637842 148638122 148637883 Y NA NA EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZH2 58429 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA NA EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZH2 58860 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.29113378147154 chr7 148680544 148680840 148680694 Y NA PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 42893 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr7 148684338 148684706 148684475 Y NA PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 39027 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr7 148685182 148685277 148685231 Y NA PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 38456 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr7 148788628 148788884 148788863 Y ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398 ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2754 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 148824928 148825234 148824952 Y NA ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF398 3420 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 149468740 149469267 149468803 Y NA ZNF467 NA NA NA NA ZNF467 172 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr7 149745351 149745623 149745500 Y NA NA NA NA NA NA ATP6V0E2-AS1 169652 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 150075425 150075527 150075503 Y NA REPIN1,ZNF775 NA NA NA NA ZNF775 11546 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 150691752 150691942 150691795 Y GIMAP7,GIMAP4,GIMAP6,GIMAP2,GIMAP1,GIMAP5,LOC100128542 KCNH2,ATG9B,ABCB8 NA NA NA NA KCNH2 18349 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 151182414 151182755 151182660 Y AGAP3,PRKAG2 RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 32451 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 151184518 151184840 151184768 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 30366 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr7 151199311 151199621 151199557 Y NA RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 15585 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 152105895 152106094 152106005 Y NA FABP5P3 NA NA NA NA FABP5P3 25886 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA FABP5P3 NA NA NA NA FABP5P3 28735 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr7 152161348 152162014 152161594 Y NA FABP5P3 NA NA NA NA FABP5P3 29368 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr7 153892426 153892621 153892506 Y DPP6 NA NA NA NA NA PAXIP1 900173 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 155006028 155006426 155006187 Y NA NA NA NA NA NA INSIG1 81060 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 155752755 155752934 155752845 Y SHH AC021218.2 LOC285889 IMR90 Hi-C 24141950 AC021218.2 392 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr7 155754558 155754796 155754722 Y NA AC021218.2 LOC285889 IMR90 Hi-C 24141950 AC021218.2 1232 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 5.86878991577972 chr7 157054104 157054271 157054188 Y NA NA NA NA NA NA RP4-814D15.2 71042 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 157082402 157082699 157082633 Y NA DNAJB6 NA NA NA NA DNAJB6 43376 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 157085416 157085724 157085621 Y DNAJB6,DNAJB6 DNAJB6 NA NA NA NA DNAJB6 40351 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr7 157092515 157093215 157092989 Y DNAJB6,DNAJB6 DNAJB6 UBE3C,DNAJB6 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB6 32860 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr7 157405982 157406183 157406105 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 279907 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 3.52127394946783 chr7 158224670 158224991 158224878 Y NA NA NA NA NA NA PTPRN2 153489 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr7 158301130 158301237 158301184 Y NA NA NA NA NA NA PTPRN2 77243 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 158410794 158411171 158410984 Y NA PTPRN2 NA NA NA NA PTPRN2 32314 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr7 158613624 158614053 158613981 Y ESYT2 ESYT2,WDR60 NA NA NA NA ESYT2 6891 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 1765271 1765682 1765322 Y NA ARHGEF10 NA NA NA NA ARHGEF10 4460 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 1898205 1898424 1898394 Y NA KBTBD11 NA NA NA NA KBTBD11 21620 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 2418829 2418999 2418939 Y NA NA NA NA NA NA KBTBD11 498785 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 3001693 3001780 3001737 Y NA NA NA NA NA NA KBTBD11 1081649 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 6721983 6722491 6722202 Y NA DEFB1 NA NA NA NA DEFB1 11053 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr8 8153597 8154098 8153801 Y NA NA MFHAS1,SGK223,CLDN23,FLJ10661 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SGK223 87910 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr8 8247461 8247709 8247494 Y NA SGK223 NA NA NA NA SGK223 5453 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 8742026 8742246 8742225 Y NA MFHAS1 NA NA NA NA MFHAS1 6909 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 8746516 8746997 8746809 Y CLDN23 MFHAS1 NA NA NA NA MFHAS1 2158 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 9912937 9913246 9913138 Y NA MSRA NA NA NA NA MSRA 3159 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 10240341 10240349 10240345 Y NA NA NA NA NA NA MSRA 330563 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 11312887 11313950 11313920 Y NA FAM167A NA NA NA NA FAM167A 16274 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr8 11314255 11315026 11314813 Y XKR6,MTMR9,FAM167A FAM167A NA NA NA NA FAM167A 15198 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr8 11315246 11315781 11315560 Y XKR6,MTMR9 FAM167A NA NA NA NA FAM167A 14443 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr8 11560575 11560973 11560829 Y GATA4 NA NA NA NA NA NEIL2 64175 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 13988363 13988798 13988479 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1456 1187212 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr8 17665479 17665814 17665519 Y NA RP11-156K13.1 NA NA NA NA RP11-156K13.1 8625 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr8 17708923 17709156 17709065 Y MTMR7,MTUS1 NA NA NA NA NA RP11-156K13.1 52069 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr8 18768857 18769292 18769046 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 170948 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 18991999 18992391 18992140 Y NA NA PSD3,LOC100128993 IMR90 Hi-C 24141950 PSD3 51759 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.52588537810273 chr8 18998257 18998415 18998308 Y NA NA PSD3,LOC100128993 IMR90 Hi-C 24141950 PSD3 58017 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr8 21775759 21776194 21775973 Y PHYHIP,DOK2,NPM2 XPO7 NA NA NA NA XPO7 579 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr8 21867707 21867918 21867811 Y PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2 NPM2 NA NA NA NA NPM2 11718 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 22439546 22439823 22439672 Y NA SORBS3,PDLIM2,C8orf58 NA NA NA NA PDLIM2 5754 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 22441359 22441704 22441532 Y NA SORBS3,PDLIM2,C8orf58 NA NA NA NA PDLIM2 7567 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 22469003 22469432 22469219 Y NA PDLIM2,C8orf58 NA NA NA NA C8orf58 13889 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 22561043 22561327 22561142 Y PPP3CC,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10B,EGR3 BIN3,EGR3 NA NA NA NA EGR3 12228 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr8 22596434 22597212 22596743 Y NA EGR3 NA NA NA NA EGR3 47619 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 22854119 22854395 22854224 Y EGR3,EGR3,RHOBTB2,RHOBTB2 RHOBTB2 NA NA NA NA RHOBTB2 11189 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 22855581 22855914 22855756 Y EGR3,EGR3,EGR3 RHOBTB2 NA NA NA NA RHOBTB2 12651 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 22872750 22872814 22872762 Y NA RHOBTB2 NA NA NA NA RHOBTB2 29820 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 23618921 23619563 23619216 Y ENTPD4,ENTPD4 NA STC1,ENTPD4 IMR90 Hi-C 24141950 NKX3-1 80481 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr8 25096912 25097126 25097024 Y DOCK5 NA NA NA NA NA DOCK5 56674 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 26306627 26307336 26307213 Y NA NA BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DPYSL2 62455 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 27474556 27474730 27474657 Y NA CLU,SCARA3 SCARA3,TRIM35,CLU,CCDC25,ESCO2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CLU 4008 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 27730121 27730534 27730322 Y ELP3,PBK PBK NA NA NA NA PBK 36509 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 28054419 28054435 28054427 Y FZD3 NA NA NA NA NA RPL5P22 100765 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 28269273 28269920 28269515 Y ZNF395 ZNF395 NA NA NA NA ZNF395 11055 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr8 29097584 29097960 29097935 Y HMBOX1,HMBOX1,KIF13B KIF13B NA NA NA NA KIF13B 20681 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 29144637 29144837 29144777 Y NA KIF13B KIF13B IMR90 Hi-C 24141950 KIF13B 25996 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 29202154 29202365 29202273 Y DUSP4,DUSP4 DUSP4 NA NA NA NA DUSP4 3820 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 29204481 29204724 29204678 Y NA DUSP4 NA NA NA NA DUSP4 1461 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 29522725 29523096 29522814 Y KIF13B NA LOC286135,DUSP4,C8orf75 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 316540 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 29595040 29595214 29595121 Y KIF13B,DUSP4,DUSP4,TMEM66,LEPROTL1 NA NA NA NA NA TMEM66 343509 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr8 30358644 30358942 30358767 Y NA NA NA NA NA NA RBPMS-AS1 117727 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.40850957978713 chr8 30769723 30770025 30769859 Y NA NA TEX15,WRN,PPP2CB,PURG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2CB 99893 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 33245630 33245874 33245728 Y NA NA NA NA NA NA FUT10 83066 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA LSM12P1 NA NA NA NA LSM12P1 1527 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 3.28652235283664 chr8 36136186 36136422 36136302 Y NA NA NA NA NA NA LSM12P1 754905 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 37376212 37376482 37376355 Y NA NA KCNU1,ERLIN2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-150O12.3 78894 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 37740422 37740703 37740667 Y WHSC1L1,RAB11FIP1,BAG4 BRF2,RAB11FIP1 GPR124,BRF2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB11FIP1 14282 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 37757888 37758317 37758017 Y WHSC1L1,RAB11FIP1 RAB11FIP1 NA NA NA NA RAB11FIP1 2903 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 37760968 37761285 37761070 Y RAB11FIP1 RAB11FIP1 RAB11FIP1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RAB11FIP1 5983 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 37928414 37928535 37928451 Y ADRB3,WHSC1L1 EIF4EBP1,ASH2L NA NA NA NA ASH2L 32225 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 38223626 38223954 38223916 Y DDHD2,DDHD2 WHSC1L1,LETM2 DDHD2,PPAPDC1B IMR90 Hi-C 24141950 WHSC1L1 13836 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 38226082 38226528 38226264 Y TACC1,WHSC1L1,LETM2,LETM2 WHSC1L1,LETM2 NA NA NA NA WHSC1L1 11262 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 38781974 38782296 38782041 Y NA NA NA NA NA NA TM2D2 70047 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 39918999 39919284 39919148 Y C8orf4 NA C8orf4,ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM9 1066611 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 39956643 39956887 39956760 Y C8orf4 NA C8orf4 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM9 1104255 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 41628099 41628173 41628135 Y ANK1 NA NA NA NA NA NKX6-3 121244 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 41733569 41733873 41733722 Y NA ANK1 NA NA NA NA ANK1 18407 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 41997279 41998522 41997937 Y NA AP3M2 KAT6A,ANK1,POLB,AP3M2,VDAC3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP3M2 9942 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr8 42356471 42356680 42356560 Y NA SLC20A2 NA NA NA NA SLC20A2 38389 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 42398083 42398473 42398470 Y NA SLC20A2 NA NA NA NA SLC20A2 3014 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr8 43092918 43093442 43093017 Y HOOK3 NA NA NA NA NA HGSNAT 99362 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 48265617 48265884 48265750 Y CEBPD NA NA NA NA NA NDUFA5P12 191124 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 48293270 48293403 48293337 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA5P12 218777 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr8 48910578 48910837 48910684 Y NA PRKDC,MCM4,UBE2V2 NA NA NA NA UBE2V2 8123 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 2.23014016799629 chr8 52747281 52747589 52747434 Y NA NA NA NA NA NA PCMTD1 62146 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 52797055 52797111 52797083 Y NA PCMTD1,RP11-110G21.1 NA NA NA NA PCMTD1 12624 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 53242912 53243261 53243214 Y ST18 NA NA NA NA NA RB1CC1 413142 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 54884977 54885679 54885327 Y NA TCEA1 NA NA NA NA TCEA1 47410 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 56756553 56757241 56756740 Y LYN LYN NA NA NA NA LYN 33131 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 56798106 56798776 56798363 Y LYN LYN NA NA NA NA LYN 7734 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 56891091 56891632 56891326 Y LYN NA NA NA NA NA SNORD54 92828 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 58908204 58908269 58908237 Y NA RP11-1112C15.1,FAM110B NA NA NA NA FAM110B 3136 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 59067695 59067925 59067785 Y SDCBP NA NA NA NA NA FAM110B 162627 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 59983682 59983838 59983818 Y NA NA NA NA NA NA NSMAF 413279 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 61564243 61564650 61564285 Y CA8,CHD7 RP11-91I20.2,CHD7 CHD7,RAB2A MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-91I20.2 123 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 61592861 61593584 61592948 Y NA RP11-91I20.2,CHD7 NA NA NA NA CHD7 3524 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 61626654 61626933 61626781 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 37317 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 61627150 61627529 61627187 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 37813 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 2.93439495788986 chr8 61708880 61709194 61708899 Y NA NA NA NA NA NA CHD7 119543 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr8 61825257 61825601 61825298 Y NA NA NA NA NA NA CHD7 235920 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 61850490 61850754 61850677 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261153 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 62427686 62427987 62427837 Y NA NA NA NA NA NA ASPH 197168 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr8 62620817 62621622 62621526 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA ASPH 3533 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 63051600 63051694 63051612 Y NA NA NA NA NA NA MIR4470 426253 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 66641187 66641625 66641410 Y PDE7A NA NA NA NA NA MTFR1 86218 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 66652181 66652518 66652302 Y NA NA NA NA NA NA MTFR1 97212 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 68090392 68090564 68090531 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 96374 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 68098646 68098899 68098873 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 104628 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 71124105 71124438 71124275 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 109691 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 72843451 72843829 72843757 Y NA NA NA NA NA NA KCNB2 603797 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 73559096 73559368 73559359 Y KCNB2 NA NA NA NA NA KCNB2 111470 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 74926613 74926741 74926708 Y UBE2W,TMEM70,LY96 TCEB1,TMEM70,RP11-367E12.4 NA NA NA NA RP11-367E12.4 31885 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 75135577 75135926 75135753 Y NA NA NA NA NA NA GDAP1 95439 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 79674578 79674862 79674701 Y NA NA NA NA NA NA HEY1 1003236 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 80696342 80696550 80696513 Y HEY1 HEY1 MRPS28,HEY1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEY1 18244 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 81893837 81894122 81894063 Y PAG1 NA NA NA NA NA PAG1 128181 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 82167350 82167604 82167486 Y NA FABP5,RP11-363E6.3 ZNF704,PAG1,FABP12 IMR90 Hi-C 24141950 FABP5 22994 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 86378354 86378674 86378384 Y LRRCC1,CA2 CA2 NA NA NA NA CA2 4273 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 87444767 87445117 87444942 Y WWP1 CPNE3 NA NA NA NA CPNE3 49942 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 87673960 87674305 87674138 Y CNGB3 NA NA NA NA NA CPNE3 178901 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr8 90556024 90556173 90556098 Y NA NA NA NA NA NA RP11-37B2.1 211782 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 95003706 95004122 95004001 Y NA NA LINC00535,RBM12B,RAD54B,CDH17,GEM IMR90 Hi-C 24141950 PDP1 135671 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 95132318 95132456 95132369 Y NA NA NA NA NA NA KB-1247B1.1 80824 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr8 95433210 95433488 95433370 Y NA NA NA NA NA NA RAD54B 51849 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 101385316 101385524 101385421 Y NA RNF19A MIR4471 IMR90 Hi-C 24141950 RNF19A 38870 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 101427912 101428321 101428112 Y SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A NA SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KB-1615E4.2 57582 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 101455424 101455703 101455525 Y PABPC1,SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A KB-1615E4.2 SPAG1 IMR90 Hi-C 24141950 KB-1615E4.2 30200 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr8 101486265 101486558 101486389 Y SPAG1,SPAG1,RNF19A KB-1615E4.2 SPAG1,RNF19A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KB-1615E4.2 362 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 101914244 101914460 101914402 Y ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ RPS26P6,YWHAZ NA NA NA NA RPS26P6 8270 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 101920723 101921107 101920870 Y NA RPS26P6,YWHAZ NA NA NA NA RPS26P6 14749 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 102092753 102093116 102092848 Y GRHL2 NA NA NA NA NA ZNF706 123305 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr8 102168240 102168326 102168276 Y NA ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 48095 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 102171133 102171473 102171263 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 44948 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 102467254 102467614 102467418 Y GRHL2 GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 35046 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr8 102505547 102505759 102505677 Y GRHL2 GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 2887 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr8 102505982 102506363 102506168 Y GRHL2 GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 3322 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr8 102513804 102514123 102513992 Y NA GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 11144 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 103141791 103142123 103141938 Y NA NA NA NA NA NA RRM2B 107223 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 103669513 103669869 103669680 Y AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10 KLF10 NA NA NA NA KLF10 3383 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr8 103669922 103670289 103670129 Y ATP6V1C1,KLF10,KLF10 KLF10 NA NA NA NA KLF10 3792 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 103743323 103743460 103743418 Y NA NA KLF10 IMR90 Hi-C 24141950 KLF10 77193 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr8 103801151 103801773 103801337 Y NA NA KLF10,UBR5,ODF1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KB-1507C5.2 72755 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr8 103803215 103803631 103803453 Y AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10 NA KLF10,UBR5,ODF1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KB-1507C5.2 70897 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr8 103822630 103823284 103823186 Y NA NA NA NA NA NA KB-1507C5.2 51244 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 103858397 103858789 103858587 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 NA NA NA NA KB-1507C5.2 15739 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 104059632 104059708 104059689 Y NA ATP6V1C1 NA NA NA NA ATP6V1C1 28341 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 115322659 115322858 115322759 Y NA NA NA NA NA NA RP11-709P2.1 935761 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 116068457 116069128 116068655 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 750771 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 116439816 116440252 116439936 Y TRPS1 NA NA NA NA NA TRPS1 379647 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 117711370 117711748 117711590 Y NA NA NA NA NA NA UTP23 64994 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 118958698 118959000 118958912 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 163092 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 119317381 119317491 119317437 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 195289 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr8 119395540 119395777 119395661 Y EXT1 NA NA NA NA NA SAMD12 236457 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 119536968 119537364 119537323 Y NA NA NA NA NA NA SAMD12 94870 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr8 119788546 119788868 119788707 Y NA RPS26P35 TNFRSF11B IMR90 Hi-C 24141950 RPS26P35 16106 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 120217398 120217670 120217528 Y MAL2 MAL2 NA NA NA NA MAL2 42125 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 121442839 121443137 121442988 Y NA MTBP,MRPL13 NA NA NA NA MTBP 12503 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 121839869 121840146 121840008 Y NA SNTB1 SNTB1 IMR90 Hi-C 24141950 SNTB1 16356 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 124169504 124169661 124169520 Y NA FAM83A NA NA NA NA FAM83A 19539 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 124248679 124249062 124248866 Y NA C8orf76,ZHX1 NA NA NA NA C8orf76 2576 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 124529265 124529734 124529486 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 21712 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 125367728 125368050 125367886 Y TRMT12,TATDN1,NDUFB9 TMEM65 NA NA NA NA TMEM65 14883 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 126231490 126231859 126231657 Y MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 129408 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr8 126286229 126286368 126286299 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 154195 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 126441416 126441734 126441625 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 853 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 126556751 126557301 126556981 Y NA NA NSMCE2,KIAA0196,TRIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 116188 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 127927068 127927434 127927240 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 301899 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 127928770 127929133 127928805 Y FAM84B NA NA NA NA NA CCAT1 300200 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 128070328 128070629 128070508 Y FAM84B NA NA NA NA NA CCAT1 158704 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 128099457 128099542 128099514 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 129791 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 128112845 128113195 128113019 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 116138 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 128193341 128193750 128193748 Y NA CCAT1 MYC MCF7 ChIA-PET 22265404 CCAT1 35583 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 128218099 128218752 128218687 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 10581 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr8 128231853 128232218 128232163 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 2520 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr8 128237300 128237732 128237515 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 7967 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr8 128305149 128305567 128305521 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 75816 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr8 128306934 128307283 128307196 Y MYC NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 77601 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.76063697473392 chr8 128309901 128310145 128310009 Y MYC NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 80568 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 128311072 128311242 128311156 Y MYC NA NA NA NA NA CCAT1 81739 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 2.93439495788986 chr8 128843918 128844302 128844002 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 39139 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 128888391 128888698 128888485 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 83612 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 128926432 128926732 128926619 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 94125 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr8 128989961 128990273 128990255 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 30584 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 129061512 129061955 129061598 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 40655 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 129691731 129691904 129691818 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 670874 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 130876466 130876830 130876577 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 150545 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr8 131058084 131058195 131058140 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 30709 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 131276645 131276741 131276715 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 177165 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr8 131454495 131454885 131454765 Y NA ASAP1 NA NA NA NA ASAP1 589 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 134580779 134581429 134580915 Y ST3GAL1 ST3GAL1 NA NA NA NA ST3GAL1 754 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr8 140830815 140831120 140830968 Y NA NA NA NA NA NA KCNK9 117516 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 141102173 141102317 141102281 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 364361 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 141474376 141475403 141474918 Y NA TRAPPC9,CHRAC1 TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TRAPPC9 7698 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 141598802 141599709 141599120 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 79405 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 141606825 141607480 141607253 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 87428 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 141849368 141849592 141849371 Y TRAPPC9 NA NA NA NA NA PTK2 160723 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 142047873 142048201 142048171 Y PTK2 PTK2 PTK2,DENND3,SLC45A4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTK2 37558 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 142082969 142083325 142083150 Y NA NA PTK2,DENND3,EIF2C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTK2 72654 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 142215999 142216277 142216212 Y DENND3,SLC45A4 NA NA NA NA NA SLC45A4 100127 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr8 143757526 143757895 143757616 Y NA PSCA,JRK NA NA NA NA JRK 3491 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 143809767 143809928 143809818 Y C8orf55 JRK NA NA NA NA JRK 48381 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.52588537810273 chr8 143897219 143897551 143897306 Y LY6E,GLI4 LY6D LY6D,LYNX1,PSCA,JRK,C8orf55,LOC100288181,SLURP1,LY6E,LOC100133669 MCF7 ChIA-PET 22265404 LY6D 31211 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 144360422 144361034 144360946 Y ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696 NA NA NA NA RP13-582O9.5 826 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr8 144785317 144785390 144785376 Y NA ZNF707,MAPK15,FAM83H,FAM83H-AS1 NA NA NA NA MAPK15 11039 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 144843026 144843252 144843141 Y NA MAPK15,FAM83H,FAM83H-AS1 SCRIB,PUF60 IMR90 Hi-C 24141950 FAM83H-AS1 28716 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 144948428 144948782 144948624 Y EPPK1 PUF60,NRBP2,EPPK1 NRBP2 IMR90 Hi-C 24141950 EPPK1 1850 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 145015768 145015971 145015849 Y FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 32931 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr8 145022492 145023108 145022824 Y PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 25794 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr8 145025737 145026802 145026365 Y ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10 PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 22100 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr8 145909522 145909717 145909620 Y NA ARHGAP39 ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP39 328 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr8 146010487 146010786 146010731 Y NA ZNF251,RPL8,ZNF7 NA NA NA NA ZNF34 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr9 545729 545758 545741 Y NA NA NA NA NA NA KANK1 77438 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 2623377 2623723 2623671 Y NA VLDLR NA NA NA NA VLDLR 3543 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 2875811 2876206 2875956 Y NA KIAA0020 NA NA NA NA KIAA0020 33570 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 3848588 3848740 3848655 Y NA GLIS3-AS1 NA NA NA NA GLIS3-AS1 47902 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr9 3863148 3863487 3863216 Y NA GLIS3-AS1 NA NA NA NA GLIS3-AS1 33155 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 3877182 3877575 3877493 Y GLIS3 GLIS3-AS1 NA NA NA NA GLIS3-AS1 19067 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr9 3971837 3971870 3971849 Y NA NA NA NA NA NA GLIS3-AS1 75195 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 4042913 4043209 4043135 Y NA NA NA NA NA NA GLIS3-AS1 146271 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr9 4283058 4283285 4283172 Y GLIS3,GLIS3 NA NA NA NA NA GLIS3 63107 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 4293316 4293716 4293485 Y GLIS3 NA NA NA NA NA GLIS3 52676 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 4296901 4297617 4297146 Y GLIS3 GLIS3 NA NA NA NA GLIS3 48775 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 4334414 4334840 4334611 Y NA GLIS3 GLIS3 IMR90 Hi-C 24141950 GLIS3 11552 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 4340074 4340431 4340362 Y NA GLIS3 GLIS3,RFX3,GLIS3-AS1,KIAA0020 IMR90 Hi-C 24141950 GLIS3 5961 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 4366732 4366922 4366806 Y GLIS3 GLIS3 GLIS3,RFX3 IMR90 Hi-C 24141950 GLIS3 20340 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 4510954 4511309 4511045 Y SLC1A1 SLC1A1 NA NA NA NA SLC1A1 22510 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr9 4656742 4656927 4656747 Y PPAPDC2,CDC37L1,C9orf68 PPAPDC2,CDC37L1 NA NA NA NA PPAPDC2 3371 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 4738592 4738723 4738708 Y NA AK3 NA NA NA NA AK3 1320 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr9 5901129 5901190 5901160 Y NA NA NA NA NA NA ERMP1 70012 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 6488249 6488567 6488283 Y NA NA NA NA NA NA UHRF2 77098 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 6680895 6681975 6681336 Y UHRF2,KDM4C RP11-106A1.2,KDM4C KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 36888 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr9 6788210 6788382 6788241 Y NA NA NA NA NA NA KDM4C 69347 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr9 6958089 6958102 6958095 Y NA NA NA NA NA NA KDM4C 239226 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 8576629 8576984 8576673 Y NA NA NA NA NA NA RP11-134K1.2 134327 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 10027810 10028140 10027960 Y NA NA NA NA NA NA PTPRD 582583 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 11065025 11065362 11065124 Y NA NA NA NA NA NA PTPRD 454302 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 13.8503442012401 chr9 12421960 12422048 12422006 Y NA NA NA NA NA NA PTPRD 1811237 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 12818643 12818927 12818803 Y NA NA NA NA NA NA NFIB 1578055 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 14147587 14147657 14147622 Y NFIB NA NA NA NA NA NFIB 249325 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 14233168 14233395 14233282 Y NFIB NA NA NA NA NA NFIB 163587 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 14251419 14251628 14251514 Y NA NA NA NA NA NA NFIB 145354 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 14320331 14320603 14320385 Y NA NA NA NA NA NA NFIB 76379 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 14322295 14322910 14322674 Y ZDHHC21,NFIB NA NA NA NA NA NFIB 74072 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr9 14349817 14350014 14349895 Y NA NFIB NA NA NA NA NFIB 46968 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 15306066 15306408 15306119 Y NA TTC39B NA NA NA NA TTC39B 708 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 15477137 15477463 15477300 Y NA PSIP1,FTH1P12 NA NA NA NA PSIP1 31554 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 18490587 18490949 18490797 Y ADAMTSL1 NA NA NA NA NA RP11-296P7.4 533941 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 19694522 19694909 19694905 Y NA NA NA NA NA NA RP11-363E7.3 232000 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 20356496 20357005 20356641 Y NA NA NA NA NA NA MLLT3 263537 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 20532398 20532530 20532463 Y MLLT3 NA NA NA NA NA MLLT3 88012 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr9 21695810 21696232 21696052 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 104310 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 22103396 22103678 22103511 Y MTAP,CDKN2A,CDKN2B NA NA NA NA NA UBA52P6 93242 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 26946072 26946289 26946254 Y PLAA,IFT74,IFT74 IFT74,PLAA NA NA NA NA PLAA 611 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 27352450 27352737 27352522 Y IFT74,IFT74,PLAA,C9orf72,C9orf72 NA NA NA NA NA MOB3B 175042 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 27365157 27365383 27365271 Y MOBKL2B NA NA NA NA NA MOB3B 162396 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 29826048 29826378 29826215 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 860725 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 32535412 32535514 32535462 Y NA DDX58,TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 11090 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 32535541 32535857 32535751 Y NA DDX58,TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 11219 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 33159013 33159478 33159222 Y DNAJA1,NFX1,CHMP5,B4GALT1,SMU1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 5876 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 33165457 33166051 33165900 Y DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 103 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr9 33231410 33231538 33231469 Y NA SPINK4,BAG1,CHMP5 NA NA NA NA SPINK4 15047 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 33233885 33234477 33234128 Y NA SPINK4,BAG1,CHMP5 NA NA NA NA SPINK4 17522 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 33329062 33329543 33329355 Y NA NFX1 NA NA NA NA NFX1 40553 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 33942829 33943199 33943013 Y NA NA NA NA NA NA UBAP2 103748 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 34179799 34180083 34180009 Y UBE2R2,UBAP1 UBAP1,AL353662.2,RP11-571F15.3 NA NA NA NA UBAP1 2796 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 34375136 34375287 34375212 Y NA KIF24,NUDT2,KIAA1161,C9orf24 NA NA NA NA KIAA1161 285 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr9 34681857 34682174 34682025 Y ARID3C,IL11RA,IL11RA SIGMAR1,GALT,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5 NA NA NA NA RP11-195F19.5 17748 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr9 35114116 35114547 35114222 Y DNAJB5,KIAA1539 VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B NA NA NA NA FAM214B 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 35116905 35117142 35117025 Y NA VCP,FANCG,PIGO,STOML2,FAM214B,UNC13B NA NA NA NA FAM214B 2567 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 35603992 35604628 35604112 Y TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2 TESK1 NA NA NA NA TESK1 625 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 35726275 35726587 35726326 Y NA TPM2,CREB3,TLN1,RGP1,GBA2 NA NA NA NA CREB3 3745 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 36232002 36232125 36232063 Y GNE CLTA,GNE NA NA NA NA GNE 42928 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 36471008 36471193 36471156 Y NA RNF38 RNF38,MELK IMR90 Hi-C 24141950 RNF38 14352 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 36621370 36621719 36621545 Y NA NA NA NA NA NA MELK 50511 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 36924974 36925090 36925030 Y MELK NA NA NA NA NA ZCCHC7 193446 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 37197241 37197478 37197431 Y NA NA NA NA NA NA ZCCHC7 78705 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 37771609 37771892 37771762 Y NA DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA DCAF10 26607 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 37835930 37836292 37836154 Y NA DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA EXOSC3 36496 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 37963992 37964293 37964120 Y NA NA NA NA NA NA RP11-613M10.9 102391 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.76063697473392 chr9 38066980 38067628 38067261 Y SHB RP11-613M10.9 NA NA NA NA SHB 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 66455332 66455763 66455668 Y NA NA NA NA NA NA RP11-764K9.4 1997612 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 68299584 68299663 68299624 Y NA NA NA NA NA NA RP11-764K9.4 153712 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 1886 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.05638218484035 chr9 71449303 71449452 71449360 Y PRKACG NA NA NA NA NA FAM122A 56339 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 71728196 71728449 71728285 Y NA NA NA NA NA NA FXN 80021 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr9 71825244 71825637 71825441 Y NA NA NA NA NA NA FXN 177069 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 72923580 72923722 72923651 Y SMC5 NA NA NA NA NA SMC5 51643 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr9 73035561 73035945 73035863 Y KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8021 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr9 73085472 73085592 73085532 Y NA NA TRPM3,SMC5,KLF9 IMR90 Hi-C 24141950 KLF9 57932 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 74371995 74372048 74372016 Y NA NA NA NA NA NA TMEM2 57558 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 75747117 75747734 75747349 Y ANXA1 ANXA1 ANXA1 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA1 16939 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 76299237 76299618 76299309 Y NA NA NA NA NA NA ANXA1 534564 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr9 78507446 78507579 78507560 Y PCSK5 PCSK5 NA NA NA NA PCSK5 3886 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr9 81328733 81329212 81328971 Y NA NA NA NA NA NA PSAT1 418674 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 85888522 85888919 85888721 Y NA NA NA NA NA NA RP11-439K3.1 56276 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 86123071 86123201 86123136 Y UBQLN1,KIF27,HNRNPK,HNRNPK FRMD3 NA NA NA NA FRMD3 28260 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 86239584 86239974 86239757 Y NA NA NA NA NA NA RP11-522I20.3 80535 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 87370377 87370471 87370425 Y NA NA NA NA NA NA NTRK2 88911 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 88264467 88264715 88264594 Y NA NA NA NA NA NA AGTPBP1 90229 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 88357534 88357780 88357692 Y AGTPBP1 AGTPBP1 NA NA NA NA AGTPBP1 2590 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 89626902 89626982 89626949 Y NA CDC20P1 NA NA NA NA CDC20P1 2335 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 89627893 89628105 89627999 Y NA CDC20P1 NA NA NA NA CDC20P1 3326 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 89699545 89699882 89699714 Y NA NA NA NA NA NA CDC20P1 74978 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 90216174 90216503 90216403 Y DAPK1,CTSL1 NA NA NA NA NA RP11-40C6.2 77957 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 91795136 91795669 91795494 Y C9orf47,SHC3 NA NA NA NA NA CKS2 128444 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr9 93955991 93956732 93956142 Y NA NA NA NA NA NA AUH 165463 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 94872861 94873095 94872978 Y NA SPTLC1 NA NA NA NA SPTLC1 2571 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 95845794 95846166 95845981 Y NINJ1,C9orf89 SUSD3,C9orf89,NINJ1 NA NA NA NA C9orf89 10334 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 96044305 96044695 96044445 Y NA NA NA NA NA NA NINJ1 149735 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 96928143 96928630 96928259 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 10486 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 9706 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 2.46489176462748 chr9 97574717 97574955 97574837 Y NA NA FANCC IMR90 Hi-C 24141950 C9orf3 87734 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 98173547 98173783 98173614 Y NA RP11-435O5.2 NA NA NA NA RP11-435O5.2 13295 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 98846089 98846388 98846374 Y NA NA LOC158434 IMR90 Hi-C 24141950 EIF4BP3 59901 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 98899705 98899808 98899766 Y CDC14B EIF4BP3 FBP1,C9orf102,PTCH1,LOC158435,LOC158434,LINC00092,FANCC IMR90 Hi-C 24141950 EIF4BP3 6481 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 99106686 99107122 99106995 Y NA SLC35D2 NA NA NA NA SLC35D2 36870 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 99181547 99181719 99181643 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA ZNF367 2936 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 100565577 100566264 100565821 Y CORO2A,FOXE1 NA FOXE1,C9orf156 IMR90 Hi-C 24141950 XPA 107938 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr9 100931425 100931550 100931485 Y C9orf156 CORO2A NA NA NA NA CORO2A 21372 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 101973951 101974336 101974174 Y NA ALG2,SEC61B NA NA NA NA ALG2 7902 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 102585833 102586368 102586147 Y ERP44,NR4A3 RP11-554F20.1,NR4A3 NA NA NA NA NR4A3 3696 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 103173830 103174136 103174107 Y NA NA C9orf30-TMEFF1,TEX10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TEX10 60609 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 108058871 108059613 108059363 Y ABCA1,TMEM38B,FSD1L,FSD1L NA NA NA NA NA SLC44A1 53968 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 108166209 108166576 108166239 Y NA FSD1L NA NA NA NA FSD1L 41501 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 108284643 108284789 108284719 Y NA FKTN NA NA NA NA FKTN 33622 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 111773643 111773659 111773652 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 150 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 111774521 111775173 111774726 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 712 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 112262069 112262452 112262225 Y PTPN3 PTPN3 NA NA NA NA PTPN3 3479 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 113681942 113682364 113682085 Y NA NA NA NA NA NA LPAR1 116617 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 114821548 114821936 114821739 Y GNG10,SUSD1 NA NA NA NA NA SUSD1 113752 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 114828005 114828556 114828288 Y UGCG NA NA NA NA NA SUSD1 107132 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 114831912 114832228 114831995 Y GNG10,SUSD1 NA NA NA NA NA SUSD1 103460 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 114960117 114960327 114960222 Y NA SUSD1 NA NA NA NA SUSD1 24429 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 115606684 115606763 115606738 Y ZFP37 NA NA NA NA NA SNX30 95566 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 116918999 116919461 116919193 Y NA COL27A1 NA NA NA NA COL27A1 3159 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 117249092 117249487 117249472 Y NA DFNB31 NA NA NA NA DFNB31 16243 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 117566825 117567042 117566994 Y TNFSF15 TNFSF15 NA NA NA NA TNFSF15 419 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 117942308 117942603 117942434 Y NA NA NA NA NA NA TNFSF15 375902 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 123455501 123455738 123455670 Y NA MEGF9 NA NA NA NA MEGF9 19010 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 124361597 124361984 124361689 Y NA DAB2IP NA NA NA NA DAB2IP 34261 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chr9 124498744 124498978 124498839 Y GSN NA NA NA NA NA DAB2IP 171408 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr9 124499221 124499709 124499392 Y NA NA NA NA NA NA DAB2IP 171885 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 7.98155428546042 chr9 125109314 125109437 125109338 Y NA PTGS1 TTLL11,MIR4478,MORN5,NDUFA8,LHX6,RBM18,MRRF,PTGS1,OR1K1,PDCL IMR90 Hi-C 24141950 PTGS1 21387 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 126297071 126297260 126297221 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 268216 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 126983428 126983685 126983554 Y DENND1A NEK6 DENND1A,NEK6,PSMB7,LHX2,LOC100129034 IMR90 Hi-C 24141950 NEK6 34200 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr9 127943373 127943395 127943384 Y NA SCAI,PPP6C,RABEPK NA NA NA NA PPP6C 6823 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 127980597 127980978 127980790 Y NA PPP6C,RABEPK,HSPA5,RP11-65N13.8,GAPVD1 NA NA NA NA RABEPK 19776 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 128299092 128299304 128299184 Y NA NA NA NA NA NA MAPKAP1 168209 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 128908654 128909040 128908854 Y NA NA PBX3 IMR90 Hi-C 24141950 PBX3 401030 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 130281582 130281994 130281773 Y TOR2A,SH2D3C,FAM129B,CDK9 NA NA NA NA NA FAM129B 57274 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 130307843 130308200 130307973 Y SLC2A8,FAM129B FAM129B NA NA NA NA FAM129B 31068 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr9 130308766 130308904 130308855 Y NA FAM129B NA NA NA NA FAM129B 30364 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 130328926 130329278 130329070 Y FAM129B FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 9990 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr9 130329548 130329691 130329605 Y PTRH1,FPGS,FPGS,ENG,CDK9,FAM129B,FAM129B FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 9577 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.29113378147154 chr9 130336494 130336746 130336628 Y TOR2A,FPGS,FPGS,CDK9,FAM129B FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 2522 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr9 130341922 130342377 130342071 Y NA FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 2654 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 130461605 130461892 130461787 Y GARNL3,STXBP1,ST6GALNAC6,SLC25A25,PIP5KL1,TTC16 MIR3911,PTRH1,TOR2A NA NA NA NA MIR3911 10531 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 130718218 130718307 130718248 Y NA ST6GALNAC4,DPM2,FAM102A NA NA NA NA DPM2 19455 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 130764123 130764312 130764223 Y FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS FAM102A FAM102A,DPM2,PIP5KL1,SLC25A25,NAIF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM102A 23331 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 130907941 130908020 130907981 Y SLC27A4,PIP5KL1,PTGES2 PTGES2,LCN2,C9orf16 NA NA NA NA LCN2 1330 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 130992546 130992666 130992589 Y SPTAN1,SH2D3C,SH2D3C,ST6GALNAC6,SLC25A25,DNM1,CIZ1 DNM1,CIZ1,SWI5,GOLGA2 NA NA NA NA CIZ1 27884 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 131127114 131127521 131127297 Y SLC25A25 COQ4,TRUB2,SLC27A4,URM1 NA NA NA NA URM1 4077 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 131929415 131929566 131929473 Y METTL11A,C9orf106 IER5L NA NA NA NA IER5L 8974 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr9 131937094 131937487 131937262 Y PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L IER5L NA NA NA NA IER5L 1053 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr9 132145857 132146151 132146146 Y FAM73B,C9orf106,USP20,USP20,TOR1B,C9orf78,ASB6 NA C9orf106,LOC100506190,IER5L,C9orf50,PPP2R4,CRAT IMR90,MCF7,K562,HELA Hi-C,ChIA-PET,5C 24141950,22265404,22955621 RP11-65J3.1 53278 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr9 132168772 132168919 132168823 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 74811 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 67404 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.40850957978713 chr9 132176730 132177172 132176936 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 66558 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 132223086 132223659 132223410 Y C9orf106,TOR1B LINC00963 PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106,C9orf50,METTL11A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 20071 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 132244062 132244824 132244277 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 332 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 132247452 132247693 132247545 Y C9orf106 LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 3722 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr9 132249112 132249430 132249268 Y CRAT,IER5L,PRRX2 LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 5382 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr9 132249735 132250094 132249903 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 6005 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr9 132257886 132258547 132258348 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 14156 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.704254789893566 chr9 132330057 132330508 132330201 Y NA NA FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-483H20.4 70247 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr9 132331590 132331738 132331651 Y CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L NA FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-483H20.4 69017 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 132359283 132359664 132359324 Y CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L,PTGES,METTL11A,ASB6 RP11-483H20.4,ASB6 NA NA NA NA RP11-483H20.4 41091 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr9 132359774 132359922 132359814 Y PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,METTL11A RP11-483H20.4,ASB6 NA NA NA NA RP11-483H20.4 40833 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr9 132369856 132370376 132370136 Y CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107 RP11-483H20.4,ASB6 NA NA NA NA RP11-483H20.4 30379 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 5.86878991577972 chr9 132372165 132372686 132372524 Y NA RP11-483H20.4,ASB6 NA NA NA NA RP11-483H20.4 28069 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.9953885713651 chr9 132385793 132386123 132385875 Y C9orf106,TOR1B,PRRX2 RP11-483H20.4,ASB6,PRRX2 NA NA NA NA RP11-483H20.4 14632 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 132648080 132648314 132648193 Y ASB6,TOR1B,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1 NA NA NA NA NA C9orf78 51938 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr9 132949592 132949704 132949653 Y C9orf78 NCS1 NA NA NA NA NCS1 16735 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 133029216 133029604 133029410 Y NA NA NCS1,GPR107,FNBP1,USP20,FUBP3,TOR1A,C9orf78,ASS1 IMR90 Hi-C 24141950 NCS1 96359 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 133565449 133565699 133565571 Y NA RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1 NA NA NA NA EXOSC2 1409 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr9 133721311 133721454 133721341 Y NA NA NA NA NA NA FIBCD1 91219 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.87801277304951 chr9 134278219 134278688 134278276 Y NA PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A,PPAPDC3 IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 10739 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 134582403 134582762 134582583 Y NA RAPGEF1 PRRC2B,UCK1,POMT1 IMR90 Hi-C 24141950 RAPGEF1 30699 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 134608936 134609538 134609242 Y RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 3923 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 134610888 134611363 134611119 Y RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 2098 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr9 134613837 134614689 134614350 Y RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 376 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 135016724 135016887 135016786 Y NA NTNG2 MED27,RAPGEF1,NTNG2,SETX IMR90 Hi-C 24141950 NTNG2 18447 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 136001357 136002105 136001796 Y SLC2A6,RALGDS,RALGDS RALGDS NA NA NA NA RALGDS 35196 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 136009131 136009458 136009277 Y GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS RALGDS NA NA NA NA RALGDS 27843 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 136015387 136015607 136015473 Y RALGDS RALGDS NA NA NA NA RALGDS 21694 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 136292897 136293168 136293034 Y SLC2A6,RALGDS REXO4,SLC2A6 NA NA NA NA REXO4 11733 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 136856624 136856782 136856656 Y VAV2 VAV2,LINC00094 NA NA NA NA VAV2 898 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 136996268 136996567 136996488 Y NA WDR5,RNU6ATAC WDR5 K562 ChIA-PET 22265404 WDR5 1920 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 137220336 137220598 137220352 Y NA RXRA NA NA NA NA RXRA 13392 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chr9 137221806 137221969 137221887 Y NA RXRA NA NA NA NA RXRA 14862 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 137233458 137233505 137233466 Y RXRA RXRA NA NA NA NA RXRA 26514 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.939006386524755 chr9 137247900 137248164 137247916 Y NA RXRA NA NA NA NA RXRA 40956 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.821630588209161 chr9 137250651 137250992 137250728 Y NA RXRA NA NA NA NA RXRA 43707 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 137302036 137302210 137302202 Y RXRA NA NA NA NA NA RXRA 95092 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 137394714 137394986 137394879 Y NA NA COL5A1 IMR90 Hi-C 24141950 RXRA 187770 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 138233554 138233668 138233594 Y NA NA OLFM1 IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R26 135257 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 138348639 138348707 138348673 Y NA PPP1R26,MRPS2,C9orf116 NA NA NA NA PPP1R26 20218 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 138624743 138624998 138624873 Y KCNT1 NA NA NA NA NA CAMSAP1 172076 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 138666183 138666357 138666270 Y NA NA NA NA NA NA CAMSAP1 130717 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 138796932 138797111 138797062 Y CAMSAP1 RP11-432J22.2 NA NA NA NA CAMSAP1 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 138986008 138986159 138986118 Y NACC2 NACC2,C9orf69 NA NA NA NA NACC2 877 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 139415789 139416380 139416258 Y NA SEC16A,NOTCH1,RP11-611D20.2 NA NA NA NA NOTCH1 21934 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 139420614 139420765 139420738 Y PTGDS,LCNL1,C9orf172 NOTCH1,RP11-611D20.2 NA NA NA NA NOTCH1 17549 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.64326117641832 chr9 139444945 139445101 139445057 Y TMEM141,SDCCAG3 NOTCH1,RP11-611D20.2 MIR4674,NOTCH1 K562 ChIA-PET 22265404 RP11-611D20.2 6281 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 139538309 139538610 139538485 Y SEC16A,NOTCH1,UAP1L1 AGPAT2 SEC16A,C9orf163 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AGPAT2 41265 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 139591698 139592004 139591952 Y C8G AGPAT2,SNHG7 NA NA NA NA AGPAT2 11823 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 139826661 139826850 139826762 Y NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2 FBXW5,C8G NA NA NA NA FBXW5 10298 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7,MIR3621,LRRC26 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 5.28191092420175 chr9 140101916 140102100 140102008 Y C9orf172,FUT7 MIR3621,LRRC26,ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA NDOR1 3769 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA C9orf169 501 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 140134697 140134985 140134927 Y C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3 TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 1032 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.52588537810273 chr9 140189199 140189592 140189229 Y NA NRARP NA NA NA NA NRARP 5111 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 6.80779630230447 chr9 140190695 140190800 140190760 Y NA NRARP NA NA NA NA NRARP 3903 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 140205114 140205300 140205216 Y PNPLA7,NOXA1,NRARP NRARP NA NA NA NA NRARP 10411 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 140205908 140206072 140205991 Y NRARP NRARP NA NA NA NA NRARP 11205 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chr9 140301516 140301688 140301630 Y CACNA1B,NRARP EXD3,NOXA1,ENTPD8 NA NA NA NA EXD3 14026 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr9 140306093 140306345 140306289 Y NRARP EXD3,NOXA1,ENTPD8 NA NA NA NA EXD3 9369 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chr9 140388730 140388770 140388753 Y FUT7,C9orf140,UAP1L1,DPP7,NDOR1,NOXA1 NA NA NA NA NA PNPLA7 54216 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chr9 140565381 140565755 140565635 Y NRARP NA NA NA NA NA EHMT1 53937 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chrX 3732525 3732707 3732561 Y NA NA NA NA NA NA PRKX 102876 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 3732842 3733263 3733002 Y PRKX NA NA NA NA NA PRKX 103193 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 3870962 3871082 3871022 Y NA NA NA NA NA NA PRKX 241313 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 9786668 9786951 9786810 Y NA RP11-98L4.1 NA NA NA NA RP11-98L4.1 1159 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 13002969 13003378 13003273 Y TLR7,TMSB4X TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 11742 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 13687345 13687715 13687534 Y TCEANC,RAB9A TCEANC,RAB9A NA NA NA NA RAB9A 17529 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 22078705 22079027 22078867 Y PHEX NA NA NA NA NA SMS 122014 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 23922308 23922544 23922448 Y NA APOO NA NA NA NA APOO 1513 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 2.1127643696807 chrX 24187705 24188069 24187889 Y NA ZFX NA NA NA NA ZFX 22415 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 28999435 28999810 28999466 Y NA NA NA NA NA NA RP11-268G12.1 1584321 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 37341448 37341496 37341472 Y NA NA NA NA NA NA PRRG1 134920 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 39646201 39646652 39646229 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 811 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chrX 39872499 39873023 39872596 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 161559 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.586878991577972 chrX 39873339 39874259 39873676 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 160323 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chrX 39963931 39964200 39963990 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 70382 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chrX 39965558 39965902 39965820 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 68680 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chrX 39966584 39967157 39966963 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 67425 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chrX 39968308 39968728 39968376 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65854 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 40028554 40028949 40028781 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 5633 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 40030956 40031200 40030978 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2 BCOR NA NA NA NA BCOR 3382 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 40691770 40692090 40691930 Y NA NA NA NA NA NA RP11-77G22.2 73147 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 40692126 40692324 40692241 Y NA NA NA NA NA NA RP11-77G22.2 72913 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 40943673 40944218 40943773 Y CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X USP9X NA NA NA NA USP9X 785 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 41125005 41125150 41125071 Y NA NA DDX3X,USP9X IMR90 Hi-C 24141950 DDX3X 65501 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 41182589 41182765 41182693 Y NA DDX3X DDX3X IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDX3X 7886 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 41759638 41759871 41759773 Y NA CASK NA NA NA NA CASK 20845 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 43888590 43889088 43888779 Y EFHC2 NA NA NA NA NA MAOB 148897 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chrX 45338516 45338773 45338583 Y NA NA MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 MIR221 264921 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 45493055 45493058 45493057 Y NA NA NA NA NA NA MIR221 110636 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 45648299 45648762 45648585 Y NA MIR221,MIR222 NA NA NA NA MIR222 43769 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chrX 45665386 45665505 45665456 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 43415 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 45666059 45666529 45666404 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 42391 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 45702877 45703292 45703236 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 5628 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 46182516 46182747 46182636 Y NA RP1-30G7.2 NA NA NA NA RP1-30G7.2 2333 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 7.98155428546042 chrX 46278987 46279293 46279130 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 18856 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 46316161 46316444 46316394 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 18012 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 47415526 47415793 47415667 Y NA ARAF,TIMP1 NA NA NA NA ARAF 2723 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 48648070 48648274 48648122 Y SSX3,SLC38A5,MAGIX,GATA1,HDAC6 GLOD5,HDAC6,PCSK1N NA NA NA NA HDAC6 9510 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 52949996 52950343 52950129 Y TSPYL2,KDM5C,FAM156A NA NA NA NA NA EIF4A2P4 89047 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 52964244 52964539 52964367 Y TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A NA NA NA NA NA EIF4A2P4 103295 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 53428419 53428681 53428625 Y NA RIBC1,SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA RIBC1 18958 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 53468564 53468782 53468716 Y IQSEC2 RIBC1,SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA HSD17B10 9244 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 54665732 54666388 54666226 Y NA NA ITIH6,MAGED2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNL3L 111088 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 57421884 57422193 57422039 Y FAAH2 NA NA NA NA NA FAAH2 110745 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 65114053 65114269 65114162 Y NA NA NA NA NA NA HEPH 266122 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 67291116 67291490 67291298 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 360265 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 67352579 67352916 67352601 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 298839 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 68004355 68004677 68004478 Y NA EFNB1 NA NA NA NA EFNB1 42163 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 68058070 68058239 68058155 Y NA EFNB1 NA NA NA NA EFNB1 11230 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.17375798315594 chrX 68215899 68216039 68215946 Y NA NA NA NA NA NA PJA1 167597 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.64326117641832 chrX 68851851 68852116 68851941 Y PJA1,EDA EDA NA NA NA NA EDA 17940 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 69654278 69654566 69654417 Y DLG3 GDPD2,DLG3 NA NA NA NA DLG3 8145 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 70401853 70402134 70401993 Y IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO GJB1 NA NA NA NA GJB1 30910 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chrX 70640504 70640913 70640718 Y NA NA NA NA NA NA TAF1 56390 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 73507125 73507445 73507287 Y NA FTX NA NA NA NA FTX 3964 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 73755621 73755953 73755678 Y RLIM NA NA NA NA NA RLIM 76499 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chrX 73756210 73756567 73756298 Y NA NA NA NA NA NA RLIM 75885 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 73791399 73791714 73791557 Y RLIM RLIM NA NA NA NA RLIM 40738 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 74266683 74266817 74266750 Y NA NA NA NA NA NA ABCB7 107750 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 79828855 79829064 79828956 Y NA NA NA NA NA NA BRWD3 234123 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chrX 85294512 85294785 85294645 Y CHM CHM NA NA NA NA CHM 5781 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 85339971 85340972 85340615 Y NA CHM NA NA NA NA CHM 39405 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chrX 92479084 92479478 92479382 Y NA RP13-88F20.1 NA NA NA NA RP13-88F20.1 1070 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 100111421 100111452 100111441 Y NA CSTF2 NA NA NA NA CSTF2 38037 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 100792680 100793554 100793013 Y NA NA NA NA NA NA ARMCX6 77437 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 101914784 101914936 101914847 Y BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1 NA NA NA NA NA GPRASP2 50168 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chrX 106595212 106595632 106595477 Y NA NA NA NA NA NA NUP62CL 147542 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.352127394946783 chrX 106920003 106920801 106920325 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 50266 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chrX 106922076 106922520 106922399 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3 IMR90 Hi-C 24141950 PRPS1 52339 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 106979997 106980351 106980180 Y NA TSC22D3 NA NA NA NA TSC22D3 38221 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 106985108 106985412 106985307 Y TSC22D3,TSC22D3,TSC22D3 TSC22D3 NA NA NA NA TSC22D3 33160 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 109264938 109265350 109265175 Y RGAG1 TMEM164 NA NA NA NA TMEM164 21079 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 115083189 115083554 115083375 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 0 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 117858426 117858628 117858540 Y DOCK11,LONRF3,IL13RA1 IL13RA1 IL13RA1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IL13RA1 907 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 117885861 117886125 117885896 Y LONRF3 IL13RA1 NA NA NA NA IL13RA1 26326 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 117896439 117896822 117896632 Y NA IL13RA1 NA NA NA NA IL13RA1 36904 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 119385485 119385791 119385733 Y NA NKAPP1,ZBTB33 NA NA NA NA ZBTB33 2878 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chrX 120331489 120331718 120331553 Y NA NA NA NA NA NA C1GALT1C1 569484 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 3.87340134441461 chrX 120799323 120799330 120799327 Y NA NA NA NA NA NA C1GALT1C1 1037318 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 122343995 122344043 122344020 Y GRIA3 NA NA NA NA NA MRRFP1 94361 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 2.23014016799629 chrX 128225148 128225423 128225251 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA1 430054 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 128364824 128364943 128364883 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA1 290534 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 128656237 128656454 128656444 Y NA SMARCA1,OCRL NA NA NA NA SMARCA1 760 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 129121612 129121744 129121653 Y NA BCORL1 BCORL1,UTP14A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCORL1 8529 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 129218658 129218852 129218759 Y SASH3,ELF4,ELF4 ELF4 NA NA NA NA ELF4 23839 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 129255072 129255259 129255158 Y SASH3,ELF4,ELF4 ELF4,AIFM1 ELF4 K562 ChIA-PET 22265404 ELF4 12381 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 129400519 129400680 129400638 Y NA ZNF280C NA NA NA NA ZNF280C 193 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 130722857 130723460 130723167 Y NA NA NA NA NA NA IGSF1 191180 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chrX 130942336 130942500 130942419 Y NA NA NA NA NA NA MST4 212793 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 132769856 132769864 132769860 Y NA RP3-417G15.1 NA NA NA NA RP3-417G15.1 33135 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 133305762 133306165 133305903 Y PHF6,CCDC160 NA NA NA NA NA CCDC160 62912 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 134718222 134718415 134718313 Y NA NA NA NA NA NA DDX26B 65638 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 138002307 138002505 138002406 Y NA NA NA NA NA NA FGF13 300434 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 147498488 147498733 147498611 Y NA NA NA NA NA NA FTH1P8 366735 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 150152595 150153067 150152778 Y NA HMGB3,RPL19P21 NA NA NA NA HMGB3 5613 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 1.52588537810273 chrX 152064300 152064566 152064432 Y NA NA CETN2,NSDHL MCF7 ChIA-PET 22265404 NSDHL 66789 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.469503193262378 chrX 152065195 152065303 152065205 Y NA NA CETN2,NSDHL MCF7 ChIA-PET 22265404 NSDHL 67684 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.234751596631189 chrX 152127371 152127756 152127434 Y NA NA NA NA NA NA NSDHL 129860 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 152648727 152649001 152648990 Y SLC6A8,ZNF275 NA NA NA NA NA ZNF275 51114 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 153755432 153755621 153755566 Y NA LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD FAM3A MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 IKBKG 11793 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 153771070 153771275 153771201 Y IRAK1,MECP2,TEX28,TEX28,EMD,DNASE1L1,TAZ,ATP6AP1,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1,GAB3,IKBKG,IKBKG,IKBKG FAM3A,IKBKG,G6PD NA NA NA NA G6PD 2512 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 153771434 153771677 153771549 Y IRAK1,MECP2,TEX28,TEX28,EMD,DNASE1L1,TAZ,ATP6AP1,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1,GAB3,IKBKG,IKBKG,IKBKG FAM3A,IKBKG,G6PD NA NA NA NA G6PD 2110 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594 chrX 153962169 153963128 153962765 Y EMD,DNASE1L1,TAZ,IKBKG,IKBKG,IKBKG,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1,GAB3 GAB3,DKC1 CTAG2 IMR90 Hi-C 24141950 GAB3 14730 CAGE NUGC-4 hg19 FANTOM5 0.117375798315594