chr1 855764 856157 855856 Y NA SAMD11,NOC2L,KLHL17,PLEKHN1 NA NA NA NA SAMD11 2103 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 936652 937138 936860 Y NA NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN C1orf170 K562 ChIA-PET 22265404 HES4 3100 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 945769 946034 945890 Y CCNL2,ATAD3B PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA ISG15 769 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 956563 956812 956665 Y UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA AGRN 3060 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr1 993498 993878 993664 Y NA ISG15,AGRN,RP11-465B22.3,RNF223 NA NA NA NA RP11-465B22.3 384 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 994198 994452 994303 Y NA ISG15,AGRN,RP11-465B22.3,RNF223 NA NA NA NA RP11-465B22.3 1084 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 1004646 1004986 1004766 Y NA RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159 NA NA NA NA RNF223 2701 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 1173386 1173736 1173661 Y PLEKHN1 TNFRSF18,SDF4,B3GALT6,UBE2J2 NA NA NA NA B3GALT6 7757 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 1295535 1296332 1296026 Y MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8 CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20 NA NA NA NA AURKAIP1 12543 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 1343359 1343768 1343546 Y NA AURKAIP1,CCNL2,MRPL20,RP4-758J18.7,ANKRD65,VWA1,ATAD3C NA NA NA NA MRPL20 2666 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 1708824 1709349 1708980 Y NA SLC35E2,NADK NA NA NA NA NADK 547 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 1714020 1714715 1714566 Y SKI,CDK11B,CDK11A,NADK,GNB1 SLC35E2,NADK NA NA NA NA NADK 4124 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 1814762 1815124 1815035 Y SKI,C1orf86,MIB2 GNB1,TMEM52 NA NA NA NA GNB1 5371 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 1840449 1840835 1840668 Y SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD GNB1,TMEM52 NA NA NA NA TMEM52 7877 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 2140151 2140337 2140252 Y C1orf86 C1orf86 NA NA NA NA C1orf86 1822 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 2221868 2222548 2222316 Y TNFRSF14,SKI NA NA NA NA NA C1orf86 79709 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 2245775 2246116 2245876 Y NA NA NA NA NA NA MORN1 75030 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 2478276 2478817 2478474 Y SKI,PANK4,TNFRSF14 PANK4,HES5,TNFRSF14,RP3-395M20.8,FAM213B NA NA NA NA TNFRSF14 6261 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 2505035 2505361 2505108 Y SKI,TNFRSF14 PANK4,HES5,TNFRSF14,RP3-395M20.8,FAM213B NA NA NA NA FAM213B 10569 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 3229711 3230157 3229865 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF16 138833 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 3232812 3232866 3232839 Y PRDM16 NA NA NA NA NA ARHGEF16 136124 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 3420761 3421065 3420920 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF16 51771 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 3421438 3421558 3421506 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF16 52448 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 3459907 3460197 3460078 Y NA NA NA NA NA NA MEGF6 65862 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 3463934 3464260 3464145 Y ARHGEF16 NA NA NA NA NA MEGF6 61799 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr1 4067941 4068288 4068115 Y NA NA NA NA NA NA C1orf174 253084 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 4728864 4729054 4728975 Y NA AJAP1 NA NA NA NA AJAP1 16072 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.55944026756961 chr1 4729528 4729775 4729656 Y AJAP1 AJAP1 NA NA NA NA AJAP1 16736 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr1 6319998 6320272 6320169 Y NA ICMT,GPR153 NA NA NA NA GPR153 963 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 6360191 6360625 6360507 Y PLEKHG5,PLEKHG5,HES2 GPR153 NA NA NA NA GPR153 41156 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 6661008 6661639 6661311 Y ZBTB48,KLHL21 NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3 NA NA NA NA PHF13 10106 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 6894689 6894717 6894703 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 51305 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 6943772 6944262 6943813 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 100388 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 7538871 7539273 7539100 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 290056 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 7609389 7609632 7609504 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 219697 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 7656791 7657175 7656983 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 172154 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 7729547 7729971 7729640 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 99358 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 8070132 8070398 8070299 Y PER3,SLC45A1,ERRFI1 ERRFI1,RP11-431K24.1 NA NA NA NA ERRFI1 13970 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 8076289 8076986 8076888 Y NA ERRFI1,RP11-431K24.1 NA NA NA NA ERRFI1 7382 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 8137301 8137521 8137361 Y NA NA ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 52503 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 8157417 8157780 8157543 Y NA NA ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 72619 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 8262223 8262541 8262360 Y ERRFI1 NA ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC45A1 113345 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr1 8264458 8264788 8264713 Y NA NA ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC45A1 111098 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 8272041 8272390 8272277 Y NA NA ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC45A1 103496 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 8721734 8722143 8721896 Y NA NA NA NA NA NA RERE 153559 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 8810273 8810466 8810370 Y NA NA NA NA NA NA RERE 65236 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 8933581 8933925 8933847 Y NA ENO1-IT1,ENO1 NA NA NA NA ENO1-IT1 2141 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 9222919 9223181 9223073 Y SPSB1 GPR157,RP3-510D11.2,RP3-510D11.1 SLC2A7,SLC25A33,MIR34A,GPR157 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP3-510D11.2 17082 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 9271499 9271772 9271635 Y NA RP3-510D11.2,RP3-510D11.1,H6PD SLC25A33,SLC2A7,PIK3CD,SLC2A5,GPR157,MIR34A,H6PD,SPSB1 IMR90 Hi-C 24141950 RP3-510D11.1 10821 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 9473687 9473864 9473791 Y NA NA H6PD,SPSB1,SLC25A33 IMR90 Hi-C 24141950 SPSB1 122748 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 9488839 9489227 9489154 Y NA NA SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 108314 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 10556105 10556527 10556365 Y NA PEX14,DFFA CASZ1 IMR90 Hi-C 24141950 DFFA 25522 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 10585199 10585569 10585453 Y NA NA CASZ1 IMR90 Hi-C 24141950 DFFA 54616 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 10804844 10805001 10804872 Y NA CASZ1 NA NA NA NA CASZ1 49706 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 10960432 10960567 10960498 Y NA NA PEX14,CASZ1,C1orf127,TARDBP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CASZ1 105725 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 11410602 11410834 11410718 Y NA NA FBXO2,FBXO44,UBIAD1 IMR90 Hi-C 24141950 UBIAD1 79339 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 11559549 11559947 11559917 Y NA PTCHD2 NA NA NA NA PTCHD2 22326 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 12050736 12051137 12050880 Y NPPA,NPPB,MFN2 MFN2,MIIP NA NA NA NA MFN2 12498 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 12546528 12546819 12546674 Y DHRS3 NA NA NA NA NA DHRS3 128918 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 12599928 12600179 12600028 Y DHRS3 NA DHRS3,VPS13D K562 ChIA-PET 22265404 DHRS3 75558 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 12600525 12600853 12600637 Y DHRS3 NA DHRS3,VPS13D K562 ChIA-PET 22265404 DHRS3 74884 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 12609717 12610039 12609907 Y DHRS3 NA NA NA NA NA DHRS3 65698 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 12616547 12616769 12616712 Y DHRS3 NA NA NA NA NA DHRS3 58968 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 12675687 12675874 12675779 Y VPS13D NA NA NA NA NA DHRS3 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 15119702 15119955 15119829 Y NA NA NA NA NA NA KAZN 196502 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 15240254 15240560 15240408 Y NA NA NA NA NA NA TMEM51 236468 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 15416988 15417263 15417153 Y NA NA NA NA NA NA TMEM51 59765 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 15649550 15649749 15649647 Y PLEKHM2,EFHD2,CASP9 NA EFHD2 IMR90 Hi-C 24141950 FHAD1 77782 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 15664307 15664455 15664338 Y NA NA EFHD2,CTRC,CELA2A,CELA2B IMR90 Hi-C 24141950 EFHD2 69936 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 15673118 15673422 15673270 Y NA NA NA NA NA NA EFHD2 60969 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 15743639 15744318 15744205 Y NA EFHD2 NA NA NA NA EFHD2 9248 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 16087189 16087372 16087266 Y EPHA2,FBLIM1 RP11-169K16.4,FBLIM1 NA NA NA NA FBLIM1 6087 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr1 16125579 16125747 16125670 Y FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2 FBLIM1,RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.8 26977 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 16175691 16176294 16176100 Y NA RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3049 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 16212759 16213091 16212941 Y EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 40117 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 16276028 16276482 16276329 Y CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17 ZBTB17 NA NA NA NA ZBTB17 24145 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 16489021 16489207 16489116 Y NA RP11-276H7.2,EPHA2 CLCNKA,C1orf64,HSPB7,FAM131C,CLCNKB,EPHA2,ARHGEF19,RSG1,SPATA21,C1orf144 IMR90 Hi-C 24141950 EPHA2 8439 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 16499761 16499895 16499826 Y SPEN,EPHA2 RP11-276H7.2,EPHA2 CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHA2 19179 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 16500084 16500309 16500220 Y NA RP11-276H7.2,EPHA2 CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHA2 19502 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 16670445 16670837 16670642 Y SPEN,C1orf64,FBXO42 FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 6112 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 16696032 16696399 16696223 Y NA FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 19083 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA NA SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 60166 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 17020007 17020088 17020064 Y NA EIF1AXP1 NA NA NA NA EIF1AXP1 9457 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 17231253 17231704 17231392 Y PADI4,PADI2 RP11-108M9.4 CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-108M9.4 17109 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA RP11-108M9.4 CROCC K562 ChIA-PET 22265404 RP11-108M9.4 26044 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr1 17353741 17353845 17353793 Y NA MFAP2,ATP13A2,SDHB ATP13A2 K562 ChIA-PET 22265404 ATP13A2 17318 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 17425016 17425355 17425116 Y PADI4,PADI2 SDHB,PADI2 NA NA NA NA PADI2 18593 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 17557386 17557571 17557478 Y NA PADI1 NA NA NA NA PADI1 27765 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 17578205 17578469 17578334 Y NA PADI1 NA NA NA NA PADI1 48584 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 17767804 17768710 17768126 Y NA RCC2 NA NA NA NA RCC2 3584 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr1 19248887 19249092 19248943 Y NA ALDH4A1,IFFO2 ALDH4A1 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH4A1 21612 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 19253034 19253391 19253292 Y UBR4,IFFO2 ALDH4A1,IFFO2 ALDH4A1 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH4A1 25759 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 19281204 19281307 19281256 Y NA IFFO2 NA NA NA NA IFFO2 24 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 19324821 19325090 19324988 Y TAS1R2,IFFO2 IFFO2 ALDH4A1,IFFO2,UBR4 IMR90 Hi-C 24141950 IFFO2 43641 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 19336477 19336714 19336579 Y NA NA UBR4,IFFO2,ALDH4A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFFO2 55297 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 19337577 19337942 19337698 Y NA NA UBR4,IFFO2,ALDH4A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFFO2 56397 CAGE SAS hg19 FANTOM5 4.45554362162745 chr1 19360402 19360809 19360663 Y IFFO2 NA UBR4,IFFO2,ALDH4A1 IMR90 Hi-C 24141950 IFFO2 79222 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr1 19762527 19762798 19762680 Y NBL1,NBL1,NBL1,NBL1 CAPZB NA NA NA NA CAPZB 47268 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 20091332 20091506 20091448 Y PLA2G2A,TMCO4 TMCO4 NA NA NA NA TMCO4 32932 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 20204786 20204981 20204970 Y OTUD3 OTUD3 NA NA NA NA OTUD3 2025 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.22777181081372 chr1 21284001 21284025 21284019 Y NA NA NA NA NA NA RP11-487E1.2 114221 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 21401731 21402159 21402110 Y NA RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 3485 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 21428050 21428147 21428101 Y NA RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 29804 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 21510856 21510968 21510912 Y ECE1,ECE1 EIF4G3 EIF4G3,DDOST,KIF17,HP1BP3,SH2D5 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF4G3 9479 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 21588176 21588724 21588522 Y ECE1,ECE1 NA NA NA NA NA ECE1 81273 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 22863291 22863389 22863341 Y LOC729059 NA NA NA NA NA ZBTB40 86947 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 23426690 23427100 23426944 Y NA NA NA NA NA NA LUZP1 75201 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 23429944 23430077 23430039 Y NA NA NA NA NA NA LUZP1 72224 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 23448967 23449247 23449107 Y NA NA NA NA NA NA LUZP1 53054 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 23494015 23494642 23494449 Y NA LUZP1 NA NA NA NA LUZP1 7659 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 23523350 23523682 23523502 Y LUZP1,HTR1D LUZP1 NA NA NA NA LUZP1 21049 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr1 23748973 23749126 23749052 Y NA TCEA3 NA NA NA NA TCEA3 107 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 23778586 23778784 23778678 Y NA TCEA3,ASAP3 NA NA NA NA TCEA3 29353 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 23881180 23881765 23881497 Y NA E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 2520 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 24229023 24229388 24229190 Y NA FUCA1,RP11-4M23.4 NA NA NA NA FUCA1 36239 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 24349340 24349488 24349411 Y NA RP11-4M23.7 LYPLA2,SRSF10,MYOM3,PNRC2,SRRM1,HMGCL,IL22RA1,LOC100506963,TCEB3,GALE,FUCA1,CNR2,IL28RA,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-4M23.7 16331 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 24691833 24692082 24691893 Y PNRC2,GRHL3 GRHL3,NIPAL3 NA NA NA NA GRHL3 48021 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr1 24736156 24736250 24736199 Y PNRC2,GRHL3 NIPAL3 NA NA NA NA NIPAL3 4034 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 25051605 25051987 25051744 Y NA CLIC4 RUNX3,CLIC4,SRRM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIC4 17861 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 25566618 25566670 25566639 Y NA SYF2 SYF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SYF2 9625 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 25665993 25666367 25666180 Y RUNX3,FAM54B,C1orf63 TMEM50A,C1orf63 NA NA NA NA C1orf63 3289 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 26022319 26022793 26022555 Y SEPN1 NA NA NA NA NA SEPN1 101874 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 26123435 26123824 26123740 Y NA SEPN1 NA NA NA NA SEPN1 843 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 26452850 26453250 26452988 Y FAM54B,RPS6KA1,HMGN2,CEP85,CD52,PDIK1L PDIK1L,ZNF593,CNKSR1 NA NA NA NA PDIK1L 17186 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 26683687 26684084 26683890 Y CNKSR1,AIM1L UBXN11,AIM1L NA NA NA NA AIM1L 5066 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 26946837 26947249 26947076 Y CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 73275 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 26947342 26948198 26947481 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72326 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr1 27024638 27025138 27024825 Y SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV ARID1A NA NA NA NA ARID1A 4114 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.67082885811029 chr1 27175784 27176273 27175984 Y C1orf172,AIM1L,ZNF683,RPS6KA1,SFN ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA SFN 11360 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 27185755 27186143 27185948 Y C1orf172,ZNF683,RPS6KA1,SFN ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA SFN 1490 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA SFN 3753 CAGE SAS hg19 FANTOM5 7.01748120406323 chr1 27321452 27321840 27321632 Y TMEM222,TRNP1,FAM46B C1orf172,RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B NA NA NA NA TRNP1 3254 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 27527451 27527688 27527509 Y NA SLC9A1,WDTC1 WDTC1,SLC9A1,C1orf172 IMR90 Hi-C 24141950 WDTC1 31319 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 27625914 27626081 27626007 Y TRNP1,MAP3K6,TMEM222 TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1 NA NA NA NA TMEM222 20570 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 27691785 27692261 27692091 Y TMEM222,MAP3K6 TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,GPR3 NA NA NA NA MAP3K6 402 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr1 27854575 27854919 27854692 Y SYTL1,FGR,FGR,FGR,FAM76A,C1orf38 WASF2 NA NA NA NA WASF2 39906 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 27869425 27869556 27869494 Y NA NA NA NA NA NA WASF2 54756 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 27893697 27893957 27893851 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 34985 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 27907931 27908052 27907995 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 20890 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 27922522 27922947 27922946 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 5995 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 27924204 27924421 27924302 Y XKR8,AHDC1 AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 4521 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 27986111 27986384 27986268 Y EYA3,SYTL1,WASF2,XKR8,STX12,FAM76A,C1orf38,FGR,FGR,FGR IFI6 NA NA NA NA IFI6 10345 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 28238886 28239222 28239086 Y SESN2,PTAFR,PTAFR,EYA3,FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38 RPA2,SMPDL3B,XKR8 NA NA NA NA RPA2 35 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 28431716 28431884 28431798 Y FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,SESN2,PTAFR,PTAFR,EYA3 EYA3 PTAFR,EYA3,FAM76A,LOC653566,DNAJC8,ATPIF1,SESN2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EYA3 18509 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 28573636 28574084 28573917 Y NA DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 9954 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 28640564 28640739 28640692 Y C1orf38,XKR8,PTAFR,PTAFR,TAF12,GMEB1,SESN2,MED18 MED18 MED18 MCF7 ChIA-PET 22265404 MED18 12774 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 29451057 29451462 29451431 Y TMEM200B,TMEM200B TMEM200B NA NA NA NA TMEM200B 2610 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 29503706 29504118 29503928 Y NA SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2381 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 29504261 29504387 29504317 Y YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4 SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2112 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 29563709 29564430 29563877 Y PTPRU MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 2681 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr1 29564766 29564995 29564881 Y NA MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 3738 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 29565762 29566055 29565979 Y SRSF4,PTPRU MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 4734 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr1 29598339 29598546 29598399 Y NA MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 37311 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 30503990 30504255 30504120 Y NA NA NA NA NA NA LAPTM5 724412 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 31233848 31234393 31233970 Y LAPTM5 LAPTM5 MATN1,LOC100129196,LAPTM5,SDC3,PUM1,SNORD103A IMR90 Hi-C 24141950 LAPTM5 5181 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 31360609 31360977 31360897 Y NA SDC3 NA NA NA NA SDC3 18631 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 31430605 31430735 31430670 Y NA NA NA NA NA NA SDC3 50997 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 31537719 31538012 31537814 Y LAPTM5,PUM1 PUM1 NA NA NA NA PUM1 881 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NKAIN1 82443 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr1 31628220 31628457 31628359 Y NA NA PUM1,NKAIN1,SERINC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NKAIN1 81944 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 31770743 31770927 31770835 Y NA SNRNP40,ZCCHC17 NA NA NA NA ZCCHC17 2901 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 31904621 31905133 31905124 Y NA SERINC2 NA NA NA NA SERINC2 24209 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 31943761 31943827 31943813 Y NA NA SERINC2,SNRNP40,NKAIN1,ZCCHC17,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1,PEF1,SPOCD1,HCRTR1 IMR90 Hi-C 24141950 SERINC2 63349 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 32015159 32015590 32015321 Y NA RP11-73M7.1,TINAGL1 FABP3,SERINC2,LOC284551,PEF1,HCRTR1,NKAIN1,TINAGL1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-73M7.1 23584 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 32166698 32166999 32166824 Y COL16A1 COL16A1 NA NA NA NA COL16A1 921 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 32180603 32180986 32180867 Y PEF1,SPOCD1,COL16A1 COL16A1,BAI2 PEF1,COL16A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL16A1 12683 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 32420307 32420572 32420414 Y TMEM234,PEF1,PTP4A2,PTP4A2 PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A2 11850 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 32421622 32422096 32421696 Y MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1 PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A2 13165 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 32966228 32966602 32966575 Y FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A ZBTB8B,ZBTB8A NA NA NA NA ZBTB8A 36426 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 33077721 33078012 33077949 Y FNDC5 ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 36492 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 33225777 33226084 33225890 Y TMEM54,KIAA1522 KIAA1522 NA NA NA NA KIAA1522 20291 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 33226574 33226719 33226667 Y TMEM54,KIAA1522 KIAA1522 NA NA NA NA KIAA1522 21088 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 33284832 33285123 33284978 Y NA S100PBP,YARS NA NA NA NA YARS 3078 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 33446816 33447482 33446950 Y RNF19B RNF19B RNF19B,AK2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF19B 18530 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 33457914 33458607 33458311 Y RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 29628 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 33458800 33459074 33458865 Y RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 30514 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 33511476 33511644 33511552 Y PHC2,RNF19B AK2,ADC AK2,TMEM54,FNDC5,RNF19B,HPCA,ADC,S100PBP K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AK2 32953 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 33515825 33516245 33515960 Y RNF19B AK2,ADC AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AK2 28352 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 33564918 33565286 33565197 Y NA AK2,ADC NA NA NA NA ADC 20213 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 33685276 33685676 33685470 Y NA TRIM62,ZNF362 TRIM62,ZNF362,PHC2,ZSCAN20 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF362 34470 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 35891843 35891965 35891904 Y NA NA NA NA NA NA NCDN 129109 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 35953903 35954237 35954109 Y SFPQ,EIF2C3 NA NA NA NA NA NCDN 66837 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 36555347 36555633 36555606 Y STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2 ADPRHL2 NA NA NA NA ADPRHL2 2871 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 36616485 36616868 36616577 Y STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1 TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 2312 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 36627717 36628369 36628068 Y STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3 TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 8537 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 36817040 36817280 36817137 Y NA SH3D21,STK40,LSM10 SH3D21,FAM176B K562 ChIA-PET 22265404 STK40 32217 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 36839449 36839891 36839558 Y EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 9606 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 36853020 36853462 36853143 Y NA STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 3523 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 36866636 36866899 36866720 Y LSM10 STK40,LSM10,OSCP1 NA NA NA NA LSM10 5143 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 37932554 37932910 37932770 Y NA ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA ZC3H12A 5243 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 37942874 37943354 37943027 Y YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA ZC3H12A 4721 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 38739267 38739533 38739400 Y NA NA POU3F1 IMR90 Hi-C 24141950 POU3F1 228817 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 39596184 39596482 39596236 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 51196 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 39598673 39599090 39598722 Y MACF1 NA NA NA NA NA MACF1 53685 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 39644229 39644606 39644401 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 99241 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 39657786 39658129 39657912 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 112798 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 39791626 39791706 39791638 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0754 82445 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 40264988 40265120 40265045 Y NA BMP8B HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BMP8B 12455 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.33916040135441 chr1 40283075 40283206 40283146 Y PABPC4,RLF,MFSD2A BMP8B MYCL1 K562 ChIA-PET 22265404 BMP8B 30542 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 41343431 41343839 41343651 Y NA CITED4 KCNQ4,CTPS,NFYC,CITED4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED4 17413 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 41501440 41501773 41501639 Y NA NA NA NA NA NA CITED4 175422 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 41633074 41633562 41633301 Y SCMH1,SCMH1,SCMH1 NA NA NA NA NA SCMH1 72264 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 41831444 41831806 41831485 Y SCMH1 FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 5850 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 41885108 41885337 41885223 Y EDN2 NA EDN2 IMR90 Hi-C 24141950 FOXO6 59514 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 41961925 41962146 41962029 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 136331 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 41981831 41982007 41981926 Y SLFNL1,SLFNL1 NA NA NA NA NA FOXO6 156237 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 42073844 42074019 42073961 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 248250 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 42127851 42128791 42128091 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 302257 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 42328578 42328878 42328730 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 170718 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 42366364 42366624 42366514 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 132972 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 42385609 42385954 42385889 Y FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3 NA NA NA NA NA HIVEP3 113642 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 43388597 43388971 43388887 Y NA SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 33559 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr1 43389220 43390772 43390027 Y NA SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 31758 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr1 43402214 43402581 43402425 Y ERMAP,SZT2 SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 19949 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 43402778 43403133 43403049 Y ERMAP,SZT2 SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 19397 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr1 43406108 43407009 43406836 Y YBX1,ERMAP,SZT2 SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 15521 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 43429290 43429917 43429491 Y CCDC23,ERMAP,SLC2A1 SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 6760 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 43473183 43473398 43473279 Y C1orf210,C1orf210,SLC2A1 NA NA NA NA NA SLC2A1 50653 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 43884019 43884040 43884030 Y ST3GAL3,MPL,SZT2 MED8,SZT2,HYI NA NA NA NA SZT2 30466 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 43901568 43901739 43901659 Y NA MED8,SZT2,HYI NA NA NA NA HYI 15921 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 43988888 43989038 43988936 Y PTPRF PTPRF PTPRF IMR90 Hi-C 24141950 PTPRF 30 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chr1 43997843 43998152 43997977 Y PTPRF PTPRF NA NA NA NA PTPRF 8985 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 44015731 44016125 44016031 Y CCDC24,WDR65,C1orf210,C1orf210,PTPRF PTPRF NA NA NA NA PTPRF 26873 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr1 44162019 44162313 44162287 Y NA KDM4A,ST3GAL3 NA NA NA NA ST3GAL3 7182 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 44240162 44240471 44240217 Y ATP6V0B NA NA NA NA NA ST3GAL3 70667 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 44324219 44324394 44324336 Y NA NA NA NA NA NA ARTN 72598 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 44430681 44431060 44430788 Y NA ARTN,RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24 NA NA NA NA DPH2 2612 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 44495684 44496307 44495779 Y NA CCDC24,SLC6A9 B4GALT2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC6A9 545 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 44689979 44690114 44690071 Y NA DMAP1 NA NA NA NA DMAP1 12852 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 44692988 44693156 44693052 Y ATP6V0B DMAP1 NA NA NA NA DMAP1 15861 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 44962677 44962982 44962698 Y NA NA NA NA NA NA RNF220 93811 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 45195062 45195154 45195109 Y RNF220 RNU5F-1,KIF2C,RPS8,SNORD55,RPS15AP11 NA NA NA NA KIF2C 8336 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 45323747 45323764 45323756 Y NA RNU5E-6P,PTCH2 NA NA NA NA PTCH2 17012 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 46111666 46112048 46111975 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 3450 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 46528388 46528566 46528496 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN1 110179 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 46689426 46689696 46689549 Y FAAH,C1orf190 PIK3R3,POMGNT1,RAD54L NA NA NA NA POMGNT1 5449 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 46902512 46902655 46902542 Y NA FAAH NA NA NA NA FAAH 44575 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 47718105 47718425 47718265 Y NA TAL1 TAL1 IMR90 Hi-C 24141950 TAL1 22213 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 51083951 51084011 51083988 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 339924 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 51703075 51703494 51703244 Y OSBPL9 RNF11 NA NA NA NA RNF11 3132 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 51769565 51770027 51769738 Y EPS15 TTC39A NA NA NA NA TTC39A 38761 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 51823993 51824400 51824363 Y NA TTC39A NA NA NA NA TTC39A 15205 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 51935246 51935592 51935567 Y NA RP11-191G24.1,EPS15 NA NA NA NA RP11-191G24.1 46389 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 52033462 52033748 52033585 Y NA OSBPL9 OSBPL9,EPS15,NRD1,TTC39A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OSBPL9 7103 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 52173889 52173954 52173921 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL9 133038 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 52507951 52508154 52508101 Y NA KTI12,BTF3L4,TXNDC12 NA NA NA NA KTI12 10463 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 52885344 52885737 52885540 Y ZCCHC11 ORC1,PRPF38A NA NA NA NA PRPF38A 17108 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 53168640 53169047 53168726 Y NA ZYG11B SELRC1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ZYG11B 21079 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 53566298 53566719 53566319 Y NA NA NA NA NA NA CPT2 93382 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 54695028 54695502 54695289 Y NA MRPL37,CYB5RL NA NA NA NA CYB5RL 31319 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 54873075 54873515 54873406 Y SSBP3,SSBP3 SSBP3 NA NA NA NA SSBP3 3637 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 54941159 54941412 54941231 Y TCEANC2,SSBP3,SSBP3 NA TMEM59,TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP3 64007 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 54956081 54956394 54956179 Y NA NA TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP3 78929 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 55894779 55895033 55894906 Y NA NA PPAP2B IMR90 Hi-C 24141950 USP24 215993 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 55909250 55909597 55909489 Y NA NA PPAP2B,PRKAA2 IMR90 Hi-C 24141950 USP24 230464 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 59008745 59009101 59008916 Y NA DAB1,OMA1,TACSTD2 NA NA NA NA DAB1 1305 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 59039624 59039692 59039640 Y NA DAB1,OMA1,TACSTD2 NA NA NA NA TACSTD2 1474 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr1 59049880 59049917 59049902 Y NA DAB1,OMA1,TACSTD2 MYSM1,FGGY,OMA1 IMR90 Hi-C 24141950 TACSTD2 8714 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr1 59050239 59050578 59050488 Y NA DAB1,OMA1,TACSTD2 MYSM1,FGGY,OMA1 IMR90 Hi-C 24141950 TACSTD2 9073 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr1 59083966 59084335 59084186 Y NA TACSTD2 TACSTD2,OMA1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TACSTD2 42800 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 59228706 59229186 59229035 Y NA JUN,LINC01135 NA NA NA NA JUN 18599 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 59280364 59280505 59280397 Y NA JUN,LINC01135 NA NA NA NA LINC01135 31541 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 59280773 59281281 59281052 Y FGGY,JUN JUN,LINC01135 NA NA NA NA LINC01135 31950 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 59281873 59282217 59282125 Y MYSM1,FGGY,JUN JUN,LINC01135 NA NA NA NA LINC01135 33050 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 59369049 59370138 59369602 Y FGGY NA NA NA NA NA LINC01135 120226 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 59608749 59609120 59609039 Y NA NA NA NA NA NA FGGY 151190 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 59986893 59986899 59986896 Y NA NA NA NA NA NA FGGY 226583 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 60196566 60196799 60196671 Y NA NA NA NA NA NA FGGY 436256 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 61543611 61543877 61543752 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA NFIA 214680 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 61549054 61549253 61549232 Y NA NA NA NA NA NA NFIA 220123 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 61579491 61579639 61579512 Y NA NA NA NA NA NA NFIA 250560 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 61707460 61707670 61707565 Y NA NA NA NA NA NA NFIA 378529 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 61918819 61919182 61919004 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA TM2D1 269913 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 62208815 62209373 62208933 Y NA TM2D1,INADL NA NA NA NA INADL 2666 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 62726098 62726337 62726314 Y NA NA NA NA NA NA KANK4 56748 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 62928310 62928608 62928459 Y KANK4,USP1,USP1,ATG4C USP1 NA NA NA NA USP1 28342 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 64127998 64128504 64128154 Y ROR1 NA NA NA NA NA ITGB3BP 70606 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 64197270 64197475 64197385 Y NA ROR1 ROR1,UBE2U,PGM1 IMR90 Hi-C 24141950 ROR1 40218 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 65381647 65381826 65381744 Y JAK1 JAK1 NA NA NA NA JAK1 48361 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 65639675 65639734 65639705 Y NA AK4 NA NA NA NA AK4 28443 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 65888047 65888596 65888066 Y LEPR,LEPROT,LEPR,LEPROT LEPR,LEPROT NA NA NA NA LEPROT 3777 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 65891768 65892129 65891951 Y NA LEPR,LEPROT NA NA NA NA LEPROT 7498 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 67029939 67030347 67030122 Y PDE4B NA NA NA NA NA WDR78 358223 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 67374841 67375185 67375111 Y SGIP1,WDR78 WDR78,MIER1 NA NA NA NA WDR78 13385 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 67460593 67460710 67460683 Y NA NA NA NA NA NA SLC35D1 57072 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 67847773 67848018 67847895 Y NA SERBP1 NA NA NA NA SERBP1 46080 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 68027599 68027762 68027652 Y NA NA GADD45A,GNG12,LOC100289178 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GADD45A 120982 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr1 68036173 68036524 68036291 Y NA NA GADD45A,GNG12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GADD45A 112220 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 68041528 68041694 68041684 Y GADD45A NA GADD45A,GNG12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GADD45A 107050 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 68189225 68189635 68189533 Y NA GADD45A NA NA NA NA GADD45A 40481 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 68215256 68215932 68215330 Y NA NA NA NA NA NA GADD45A 66512 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 68234822 68235039 68234951 Y NA NA NA NA NA NA GNG12 62111 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 68364057 68364377 68364218 Y NA NA NA NA NA NA GNG12 66907 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 68572958 68573227 68573176 Y NA NA NA NA NA NA WLS 123576 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 68663588 68663867 68663728 Y NA WLS NA NA NA NA WLS 32936 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 68961350 68961555 68961472 Y NA DEPDC1 NA NA NA NA DEPDC1 446 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 70691921 70692281 70691982 Y ANKRD13C,LRRC40,SRSF11 LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4 NA NA NA NA RP4-677H15.4 7215 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 70745994 70746088 70746040 Y NA NA NA NA NA NA RP4-677H15.4 61288 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 72749220 72749791 72749447 Y NEGR1 NA NA NA NA NA KRT8P21 818684 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 72750417 72750888 72750606 Y NA NA NA NA NA NA KRT8P21 817587 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 75694572 75694736 75694622 Y NA NA NA NA NA NA ACADM 493300 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 76645391 76645540 76645467 Y NA NA NA NA NA NA MSH4 384824 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 78011624 78012030 78011967 Y NA NA NA NA NA NA ZZZ3 135074 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 78386302 78386347 78386324 Y NEXN NEXN NA NA NA NA NEXN 34104 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 78404062 78404594 78404354 Y NA FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA FUBP1 38200 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 78557346 78557710 78557476 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 114487 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 78957462 78957762 78957688 Y PTGFR NA NA NA NA NA IFI44L 125845 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 79215772 79216132 79215819 Y NA NA NA NA NA NA IFI44 102291 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr1 80186272 80186571 80186386 Y NA NA NA NA NA NA IFI44 1072791 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 83528650 83529168 83528896 Y NA NA NA NA NA NA RP11-475O6.1 795538 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 83530346 83530531 83530439 Y NA NA NA NA NA NA RP11-475O6.1 794175 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 84710038 84710507 84710127 Y NA NA NA NA NA NA PRKACB 168293 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 84971050 84971209 84971115 Y MCOLN2,GNG5 RPF1,GNG5 NA NA NA NA GNG5 802 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 85007374 85007584 85007581 Y NA GNG5,CTBS NA NA NA NA CTBS 30579 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 85320078 85320332 85320201 Y GNG5,MCOLN2,C1orf52,BCL10 LPAR3 NA NA NA NA LPAR3 36564 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 85349108 85349420 85349289 Y LPAR3 LPAR3 NA NA NA NA LPAR3 7476 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 85643319 85643587 85643547 Y NA SYDE2 MIR4423 IMR90 Hi-C 24141950 SYDE2 21142 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 85667688 85667915 85667906 Y NA SYDE2 NA NA NA NA SYDE2 2959 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 85779776 85780132 85779838 Y NA BCL10 NA NA NA NA BCL10 39003 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 85794698 85795078 85794848 Y CYR61 NA NA NA NA NA BCL10 53925 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 85795855 85796291 85796120 Y DDAH1,CYR61 NA NA NA NA NA BCL10 55082 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 85796595 85797055 85796822 Y CYR61 NA NA NA NA NA BCL10 55822 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 85826803 85827129 85827050 Y NA NA NA NA NA NA BCL10 86030 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 85950230 85950550 85950520 Y NA NA NA NA NA NA DDAH1 91383 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 85968002 85968172 85968087 Y DDAH1,CYR61 NA NA NA NA NA DDAH1 73761 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 85991291 85991622 85991523 Y DDAH1,CYR61 NA NA NA NA NA DDAH1 50311 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 85992810 85993270 85993105 Y NA DDAH1 NA NA NA NA DDAH1 48663 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 86035824 86036171 86035900 Y NA DDAH1,CYR61,RP11-290M5.2 NA NA NA NA DDAH1 5762 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr1 86049987 86050100 86050044 Y NA DDAH1,CYR61,RP11-290M5.2 NA NA NA NA CYR61 5543 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 86071867 86071976 86071922 Y NA DDAH1,CYR61,RP11-290M5.2 DDAH1,CYR61,ZNHIT6 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-290M5.2 9053 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 86072885 86073441 86073156 Y CYR61 DDAH1,CYR61,RP11-290M5.2 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-290M5.2 10071 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr1 86077140 86077408 86077190 Y CYR61 DDAH1,CYR61,RP11-290M5.2 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-290M5.2 14326 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 86077578 86077925 86077749 Y DDAH1,CYR61 DDAH1,CYR61,RP11-290M5.2 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-290M5.2 14764 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr1 86078461 86078819 86078680 Y DDAH1,CYR61 DDAH1,CYR61,RP11-290M5.2 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-290M5.2 15647 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr1 87240012 87240427 87240202 Y SH3GLB1 NA HS2ST1,SEP15,SH3GLB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SH3GLB1 71753 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 87636034 87636204 87636115 Y NA NA NA NA NA NA LMO4 155947 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 87800631 87801610 87800748 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 8480 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 88716578 88716942 88716762 Y NA NA NA NA NA NA PKN2 430963 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 88749888 88750086 88749988 Y NA NA LOC339524 IMR90 Hi-C 24141950 PKN2 397819 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 89149109 89149398 89149189 Y NA PKN2 NA NA NA NA PKN2 1204 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 89358212 89358439 89358316 Y PKN2,CCBL2 GTF2B NA NA NA NA GTF2B 2585 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chr1 89775606 89775953 89775816 Y NA NA NA NA NA NA GBP4 112991 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 89942348 89942369 89942360 Y NA LRRC8B NA NA NA NA LRRC8B 46026 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 90321378 90321621 90321467 Y LRRC8C,ZNF326 LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 36805 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 90372321 90372729 90372378 Y LRRC8B,LRRC8C,LRRC8D,ZNF326 NA NA NA NA NA GEMIN8P4 85151 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 90376424 90376756 90376561 Y LRRC8D,LRRC8D,ZNF326 NA NA NA NA NA GEMIN8P4 81124 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 91322848 91323191 91323185 Y NA RP4-665J23.1 NA NA NA NA RP4-665J23.1 7641 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 91472225 91472812 91472773 Y NA ZNF644 NA NA NA NA ZNF644 13017 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 91793812 91793887 91793849 Y NA NA NA NA NA NA CDC7 170521 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 93427945 93428408 93428079 Y MTF2,DR1,FAM69A FAM69A NA NA NA NA FAM69A 2888 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 93806739 93807078 93807070 Y NA DR1,RP4-717I23.3 NA NA NA NA DR1 2367 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 93812976 93813243 93813111 Y NA DR1,RP4-717I23.3 NA NA NA NA RP4-717I23.3 3394 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 93914812 93914954 93914881 Y FNBP1L FNBP1L NA NA NA NA FNBP1L 3124 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 94007993 94008357 94008092 Y FNBP1L,BCAR3 NA NA NA NA NA FNBP1L 96305 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 94021310 94021626 94021469 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 109622 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 94023703 94024059 94023930 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 112015 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 94038553 94038921 94038737 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 126865 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 94084336 94084510 94084423 Y NA NA NA NA NA NA RP11-488P3.1 154490 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 94089710 94089715 94089713 Y NA NA NA NA NA NA RP11-488P3.1 149285 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 94093325 94093611 94093590 Y NA NA NA NA NA NA RP11-488P3.1 145389 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 94125861 94126246 94126059 Y NA NA NA NA NA NA RP11-488P3.1 112754 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 94127789 94128026 94127840 Y GCLM,TMED5,DNTTIP2 NA NA NA NA NA RP11-488P3.1 110974 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 94133922 94134283 94134103 Y FNBP1L NA NA NA NA NA RP11-488P3.1 104717 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 94145547 94146118 94145739 Y NA NA NA NA NA NA RP11-488P3.1 92882 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 94158127 94158185 94158167 Y GCLM,DNTTIP2 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488P3.1 80815 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 94158601 94159338 94158654 Y GCLM,DNTTIP2,BCAR3 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488P3.1 79662 CAGE SAS hg19 FANTOM5 8.79969865271421 chr1 94167175 94167520 94167394 Y BCAR3 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488P3.1 71480 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.67082885811029 chr1 94168203 94168325 94168229 Y NA NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488P3.1 70675 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 94169341 94169462 94169391 Y GCLM,DNTTIP2 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488P3.1 69538 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 94201362 94201612 94201551 Y NA RP11-488P3.1 BCAR3,MIR760,DR1,DNTTIP2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-488P3.1 37388 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr1 94203705 94204234 94204026 Y NA RP11-488P3.1 BCAR3,MIR760,DR1,DNTTIP2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-488P3.1 34766 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr1 94244939 94245309 94245199 Y ARHGAP29,FNBP1L,BCAR3 RP11-488P3.1 BCAR3,MIR760,FNBP1L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488P3.1 5939 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr1 94309612 94309956 94309784 Y NA MIR760,BCAR3,DNTTIP2 NA NA NA NA MIR760 432 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 94527681 94527931 94527843 Y ARHGAP29 NA NA NA NA NA GCLM 154715 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 94621912 94621923 94621919 Y NA NA NA NA NA NA RP11-148B18.1 89541 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 94626535 94626661 94626598 Y NA NA NA NA NA NA RP11-148B18.1 84803 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 94684511 94684818 94684682 Y NA RP11-148B18.1 NA NA NA NA RP11-148B18.1 26646 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 94712395 94712617 94712502 Y ARHGAP29 RP11-148B18.1,ARHGAP29 ABCA4,ARHGAP29,ABCD3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-148B18.1 931 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr1 94788386 94788592 94788436 Y ARHGAP29,F3 ARHGAP29,RP11-148B18.3 ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM IMR90 Hi-C 24141950 RP11-148B18.3 8231 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr1 94792807 94793133 94793077 Y ARHGAP29 RP11-148B18.3 ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM IMR90 Hi-C 24141950 RP11-148B18.3 3690 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 94795618 94795987 94795955 Y NA RP11-148B18.3 ARHGAP29,ABCA4,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-148B18.3 836 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr1 94991460 94991992 94991709 Y NA F3 NA NA NA NA F3 13364 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 94992236 94992413 94992325 Y NA F3 NA NA NA NA F3 12943 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 94996582 94996830 94996792 Y NA F3 NA NA NA NA F3 8526 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 95003688 95004160 95004042 Y NA F3 NA NA NA NA F3 1196 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 95007995 95008302 95008221 Y NA F3 NA NA NA NA F3 2639 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 95008693 95008821 95008774 Y NA F3 NA NA NA NA F3 3337 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 95113814 95114327 95114013 Y F3 RP11-86H7.7 F3,ABCD3,SLC44A3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-86H7.7 26074 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr1 95174059 95174304 95174182 Y NA NA F3,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-86H7.7 86319 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 95179307 95179605 95179478 Y F3 NA F3,ABCD3,ALG14 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-86H7.7 91567 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 95193393 95193837 95193667 Y NA NA F3,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 90000 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 95258204 95258621 95258355 Y NA LINC01057,SLC44A3 F3,ABCD3,LOC729970 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 25216 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 95264854 95265185 95265083 Y F3 LINC01057,SLC44A3 F3,ABCD3,ABCA4,CNN3,LOC729970,ALG14,SLC44A3 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 18652 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr1 95267524 95267667 95267664 Y NA LINC01057,SLC44A3 F3,ABCD3,ABCA4,CNN3,LOC729970,ALG14,SLC44A3 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 16170 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 95276451 95276463 95276457 Y NA LINC01057,SLC44A3 F3,ABCD3,CNN3,SLC44A3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC01057 7374 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 96528556 96528891 96528724 Y NA NA NA NA NA NA EEF1A1P11 381595 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 96828119 96828533 96828302 Y NA NA PTBP2 IMR90 Hi-C 24141950 EEF1A1P11 81953 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 97549999 97550397 97550198 Y NA NA NA NA NA NA PTBP2 364778 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 98518546 98518920 98518639 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 133941 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 98606055 98606462 98606113 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 221450 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 98642709 98642844 98642773 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 258104 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 100827551 100827774 100827683 Y SLC35A3,HIAT1,CDC14A CDC14A NA NA NA NA CDC14A 18967 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 100858865 100858991 100858930 Y SLC35A3,HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 50281 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 101202267 101202571 101202418 Y NA NA NA NA NA NA EXTL2 156983 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 101392986 101393260 101393033 Y S1PR1,SLC30A7,SLC30A7 EXTL2,SLC30A7 NA NA NA NA SLC30A7 33354 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 101469727 101469819 101469773 Y NA RP11-421L21.3,DPH5 NA NA NA NA RP11-421L21.3 19615 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 107314405 107314715 107314560 Y NA NA NA NA NA NA PRMT6 282552 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 108661190 108661332 108661267 Y FAM102B NA NA NA NA NA SLC25A24 80139 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 109467804 109468470 109468110 Y GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1 AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 35636 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 109784080 109784425 109784202 Y NA SARS,CELSR2,PSRC1 CELSR2 IMR90 Hi-C 24141950 CELSR2 6216 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 110160052 110160461 110160231 Y GNAI3,FAM40A,AMPD2,AMPD2,AMPD2 AMPD2,GSTM4 NA NA NA NA AMPD2 3326 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 110320163 110320291 110320225 Y NA GSTM3,EPS8L3 CSF1,AHCYL1,CYB561D1,ATXN7L2,GPR61,GNAI3,AMIGO1,AMPD2,GNAT2,GSTM4,GSTM5,EPS8L3,FAM40A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPS8L3 15514 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 110334849 110335164 110334977 Y NA EPS8L3 CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPS8L3 30200 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 110363861 110364229 110364029 Y GNAI3,AMPD2 NA CSF1,AHCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 EPS8L3 59212 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 110435112 110435421 110435324 Y SORT1,SORT1 CSF1 CSF1,EPS8L3,SORT1,PSMA5,GSTM3,AHCYL1,GNAI3,GSTM4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CSF1 15443 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 110778589 110778756 110778673 Y NA KCNC4 NA NA NA NA KCNC4 26624 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 111177471 111177854 111177559 Y LRIF1,CD53 NA KCNA2 K562 ChIA-PET 22265404 LAMTOR5-AS1 254030 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 111489179 111489247 111489213 Y NA LRIF1 NA NA NA NA LRIF1 15454 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 111735402 111735659 111735539 Y CD53,LRIF1,RAP1A NA NA NA NA NA DRAM2 54564 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 111745467 111745610 111745539 Y CD53,CEPT1,DRAM2,CHI3L2 NA NA NA NA NA DRAM2 64629 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 111981832 111982198 111982008 Y NA OVGP1,ATP5F1,WDR77 NA NA NA NA ATP5F1 7288 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 112135698 112135869 112135721 Y C1orf183,DENND2D,RAP1A NA NA NA NA NA RAP1A 52858 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 112163826 112164071 112163877 Y C1orf183,C1orf183,C1orf162,RAP1A NA NA NA NA NA RAP1A 80986 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 112918897 112919196 112919049 Y NA CTTNBP2NL WNT2B,ST7L,DDX20 IMR90 Hi-C 24141950 CTTNBP2NL 17607 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr1 114258659 114258989 114258824 Y NA PHTF1 NA NA NA NA PHTF1 41122 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 114576701 114577036 114576869 Y NA NA SYT6 IMR90 Hi-C 24141950 HIPK1 106887 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 115605190 115605611 115605404 Y BCAS2,SIKE1 TSPAN2 NA NA NA NA TSPAN2 24510 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 115722074 115722498 115722181 Y NGF NA NGF IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN2 91953 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr1 115732772 115733197 115732900 Y NGF NA NGF IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN2 102651 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 115873164 115873576 115873409 Y NGF NGF NA NA NA NA NGF 5281 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 115968975 115969167 115969071 Y NA NA NGF IMR90 Hi-C 24141950 NGF 90118 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 116088478 116088732 116088606 Y NA NA NGF,VANGL1,SYCP1 IMR90 Hi-C 24141950 VANGL1 93842 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 116918925 116919548 116919274 Y SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1 ATP1A1,ATP1A1OS NA NA NA NA ATP1A1 5635 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 117089417 117089635 117089469 Y NA NAP1L4P1,CD58 NA NA NA NA NAP1L4P1 14703 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 119627476 119627604 119627540 Y NA NA NA NA NA NA RP11-418J17.1 53415 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 120188395 120188927 120188667 Y NA PHGDH NA NA NA NA ZNF697 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 120275491 120275880 120275569 Y ADAM30 NA NA NA NA NA PHGDH 75070 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 121485082 121485212 121485187 Y NA NA NA NA NA NA HIST2H2BA 581054 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 144533627 144534178 144533764 Y PDE4DIP RNU1-59P PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNU1-59P 1589 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr1 144988079 144988414 144988189 Y NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP RNU2-38P NA NA NA NA RNU2-38P 45407 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 145004446 145004804 145004625 Y NA NA NA NA NA NA RNU2-38P 61774 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 145005016 145005394 145005195 Y NA NA NA NA NA NA RNU2-38P 62344 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 145044480 145044713 145044599 Y NA PDE4DIP,SEC22B LOC728875,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL IMR90 Hi-C 24141950 PDE4DIP 29473 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 145058996 145059322 145059204 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP PDE4DIP,SEC22B NOTCH2NL,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDE4DIP 14864 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNVU1-6 16003 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr1 145640932 145641287 145641091 Y NBPF10 POLR3C,RNF115 NA NA NA NA RNF115 31896 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 147775754 147775884 147775851 Y NBPF14 RNU1-120P,RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 29002 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 147806841 147807184 147807140 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 1955 CAGE SAS hg19 FANTOM5 6.23776107027843 chr1 148000699 148000802 148000795 Y NA RNVU1-13 NA NA NA NA RNVU1-13 8553 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 149138053 149138113 149138087 Y NA PFN1P12 NA NA NA NA PFN1P12 25398 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 149215297 149215704 149215586 Y NA NA NA NA NA NA PFN1P12 102642 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 149222771 149223127 149223106 Y NA NA NBPF10,SEC22B,NBPF15 MCF7 ChIA-PET 22265404 PFN1P12 110116 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 149816287 149817606 149817166 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2BC 2733 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 149820361 149820952 149820609 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 149821015 149821647 149821349 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 372 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 149910900 149911536 149911461 Y NA SV2A,SF3B4,MTMR11 NA NA NA NA MTMR11 4109 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 149981648 149981889 149981683 Y ANP32E,OTUD7B OTUD7B NA NA NA NA OTUD7B 1023 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 150185878 150186128 150186012 Y HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E ANP32E,RNU2-17P NA NA NA NA ANP32E 20376 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 150577042 150577503 150577391 Y CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 22585 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 150585815 150586394 150586132 Y CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,FAM63A,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 13694 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 151168297 151168505 151168391 Y BNIPL,TUFT1,SCNM1 SCNM1,LYSMD1,VPS72 NA NA NA NA PIP5K1A 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 151172142 151172526 151172243 Y FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4 SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 3717 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 151172620 151173197 151172669 Y TMOD4 SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 4195 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 151422102 151422465 151422287 Y NA POGZ NA NA NA NA POGZ 7476 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 151485676 151485841 151485746 Y C2CD4D,CGN,TUFT1 CGN,TUFT1 NA NA NA NA CGN 4690 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr1 151580936 151581099 151580976 Y NA SNX27,RP11-404E16.1 RIIAD1,CELF3 IMR90 Hi-C 24141950 SNX27 1442 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 151913815 151914271 151914054 Y S100A10 THEM4 S100A10,CELF3,THEM4,RORC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THEM4 33531 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr1 151918166 151918684 151918434 Y NA THEM4,S100A10,NBPF18P S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THEM4 37882 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr1 151918898 151919222 151919024 Y S100A10 THEM4,S100A10,NBPF18P S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THEM4 38614 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 151945504 151945625 151945562 Y NA S100A10,NBPF18P NA NA NA NA S100A10 19241 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 151949461 151949565 151949513 Y NA S100A10,NBPF18P NA NA NA NA S100A10 15301 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 151960875 151961433 151961102 Y S100A11,S100A10 S100A10,NBPF18P NA NA NA NA S100A10 3433 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 151961675 151962369 151962069 Y S100A11,S100A10 S100A10,NBPF18P NA NA NA NA S100A10 2497 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 151973450 151973865 151973747 Y S100A10 S100A10,NBPF18P,S100A11 THEM4,S100A10,S100A11,RORC IMR90 Hi-C 24141950 NBPF18P 8443 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 152022022 152022514 152022379 Y SNX27,S100A10,S100A11 S100A11 THEM4 MCF7 ChIA-PET 22265404 S100A11 3639 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 152116191 152116374 152116281 Y LCE3A NA NA NA NA NA S100A11 97808 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 152140379 152140745 152140485 Y NA NA NA NA NA NA S100A11 121996 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr1 152878475 152878651 152878603 Y NA IVL NA NA NA NA IVL 370 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 153095466 153095607 153095484 Y NA NA NA NA NA NA SPRR2A 67453 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 153285394 153285679 153285564 Y NA S100A9 NA NA NA NA S100A9 42651 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 153525322 153525412 153525387 Y PGLYRP3,S100A9,S100A12,S100A7L2,S100A4 S100A6,S100A5,S100A2 S100A4,S100A5 K562 ChIA-PET 22265404 S100A2 12954 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 153541018 153541368 153541269 Y PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13 S100A6,S100A5,S100A2,S100A16,S100A14 NA NA NA NA S100A2 2652 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 153584539 153584862 153584750 Y NA S100A2,S100A16,S100A14,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN NA NA NA NA S100A16 918 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 153936554 153936861 153936642 Y UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4 GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9 NA NA NA NA CREB3L4 1149 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 154154606 154155027 154154830 Y SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3 TPM3,UBAP2L,C1orf43 NA NA NA NA TPM3 10097 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 154397743 154397997 154397805 Y CRTC2,UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,ADAR,ADAR,IL6R IL6R NA NA NA NA IL6R 22074 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 154405619 154406249 154405788 Y UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,IL6R,ADAR IL6R NA NA NA NA IL6R 29950 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 154973036 154973200 154973120 Y CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1 PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr1 154973335 154973935 154973656 Y ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 208 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 155098409 155098801 155098460 Y PKLR,PKLR,EFNA4,EFNA1 EFNA1,SLC50A1,DPM3,TRIM46,KRTCAP2 NA NA NA NA EFNA1 473 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 155164183 155164959 155164537 Y NA TRIM46,KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,GBAP1,GBA NA NA NA NA MIR92B 1215 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr1 155496665 155497012 155496914 Y DCST1,HCN3,YY1AP1,ASH1L ASH1L-AS1,ASH1L NA NA NA NA ASH1L-AS1 32809 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 156073142 156073699 156073532 Y YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA RAB25,MEX3A,LMNA LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LMNA 22778 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 156073854 156074351 156074085 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA RAB25,MEX3A,LMNA LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LMNA 23490 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 156089405 156089622 156089466 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,ARHGEF2,LMNA MEX3A,LMNA NA NA NA NA LMNA 39041 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 156095033 156095181 156095051 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA MEX3A,LMNA NA NA NA NA LMNA 44669 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 156103413 156103690 156103594 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,LMNA NA NA NA NA NA LMNA 53049 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 156426931 156427503 156427197 Y ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 41117 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 156461502 156461819 156461755 Y MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6801 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 156472693 156472952 156472780 Y LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 4073 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr1 156473111 156473378 156473326 Y LMNA,C1orf182,RRNAD1 MEF2D NA NA NA NA MEF2D 4491 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 156474686 156475018 156474923 Y SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6066 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 156494222 156494678 156494359 Y RRNAD1,MEF2D MEF2D,IQGAP3 NA NA NA NA MEF2D 25602 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 156677217 156677612 156677436 Y NA RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC NA NA NA NA CRABP2 3609 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 156718467 156719136 156718868 Y C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1 CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF NA NA NA NA PRCC 65 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 156781780 156782101 156782026 Y MEF2D,ETV3L,SH2D2A,SH2D2A,NTRK1 HDGF,SH2D2A NA NA NA NA SH2D2A 2553 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 157980631 157980890 157980708 Y KIRREL KIRREL NA NA NA NA KIRREL 19568 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 158146699 158147069 158146946 Y NA ELL2P1 NA NA NA NA ELL2P1 1154 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 158147244 158147839 158147743 Y NA ELL2P1 NA NA NA NA ELL2P1 1699 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 158983439 158983572 158983497 Y NA IFI16 NA NA NA NA IFI16 15681 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 159793141 159793292 159793217 Y SLAMF8 DUSP23,C1orf204 NA NA NA NA C1orf204 29845 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 159819832 159820037 159819980 Y SLAMF9,SLAMF8,TAGLN2 C1orf204,CCDC19 NA NA NA NA C1orf204 3100 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 159852272 159852569 159852526 Y SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2 C1orf204,CCDC19,TAGLN2 NA NA NA NA CCDC19 15384 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 159859603 159860031 159859945 Y SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2 C1orf204,CCDC19,TAGLN2 C1orf204,SLAMF8 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC19 7922 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 159880076 159880706 159880437 Y FCRL6,DCAF8,TAGLN2 CCDC19,TAGLN2,IGSF9 NA NA NA NA CCDC19 12123 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 159886226 159886307 159886250 Y NA CCDC19,TAGLN2,IGSF9 NA NA NA NA TAGLN2 7215 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 159887185 159887340 159887284 Y NA CCDC19,TAGLN2,IGSF9 NA NA NA NA TAGLN2 6182 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 160377718 160378261 160377994 Y IGSF9 VANGL2 NA NA NA NA VANGL2 9342 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 160639828 160639998 160639908 Y NA NA NA NA NA NA RP11-312J18.5 222772 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 160696081 160696317 160696161 Y CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7 NA NA NA NA NA RP11-312J18.5 166453 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 160982920 160983992 160983766 Y CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30 F11R,TSTD1,USF1 NA NA NA NA F11R 5146 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 160989381 160990254 160990012 Y NDUFS2,ADAMTS4,F11R F11R,TSTD1,USF1 NA NA NA NA F11R 243 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr1 161320542 161320880 161320598 Y FCRLB,ATF6,CD244,FCER1G SDHC,C1orf192 NA NA NA NA C1orf192 14784 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 161359666 161360218 161359899 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A C1orf192 NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C1orf192 24002 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr1 161369073 161369991 161369486 Y NA C1orf192 ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C1orf192 33409 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 161500608 161500899 161500816 Y USF1,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A,ATF6,HSPA6,FCGR3B,FCGR3A,FCGR3A HSPA6 NA NA NA NA HSPA6 8572 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 161582212 161582506 161582417 Y HSPA6,FCGR3A NA NA NA NA NA HSPA6 90176 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 161700146 161700332 161700210 Y NA FCRLB,DUSP12,ATF6 NA NA NA NA FCRLB 10793 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 161847357 161847565 161847361 Y NA NA NA NA NA NA ATF6 113273 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 161973003 161973384 161973069 Y NA NA NA NA NA NA NOS1AP 64180 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 162508612 162508929 162508802 Y UAP1 UHMK1,UAP1 NA NA NA NA UAP1 20394 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 162511455 162511984 162511719 Y UAP1,UHMK1 UHMK1,UAP1 NA NA NA NA UAP1 17339 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 162539981 162540420 162539994 Y C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1 UAP1 NA NA NA NA UAP1 10658 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 162827762 162827953 162827847 Y NA NA NA NA NA NA RGS4 208612 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 162937771 162938014 162937902 Y C1orf110 NA RGS4,RGS5,C1orf110 IMR90 Hi-C 24141950 RGS4 98551 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 164719768 164719930 164719859 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 196947 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 165797615 165798367 165798308 Y UCK2 UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 2623 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr1 165868061 165868423 165868295 Y NA NA NA NA NA NA TMCO1 73069 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 166828089 166828463 166828188 Y POU2F1,POGK POGK,TADA1 NA NA NA NA TADA1 15101 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 167035961 167036358 167035977 Y NA NA NA NA NA NA RP11-277B15.1 93716 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 167191021 167191933 167191618 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 2955 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr1 167313306 167313474 167313390 Y MAEL,POU2F1 NA NA NA NA NA POU2F1 125240 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 167434195 167434584 167434555 Y POU2F1,RCSD1,CD247 NA NA NA NA NA CREG1 86420 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 167520671 167521013 167520898 Y CREG1 NA NA NA NA NA CREG1 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 167683554 167683813 167683605 Y POU2F1,CREG1 MPZL1 NA NA NA NA MPZL1 4616 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 167772811 167773182 167772825 Y CREG1 NA NA NA NA NA MPZL1 84382 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 168050664 168051125 168050872 Y SFT2D2 NA NA NA NA NA GPR161 53696 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 168337258 168337475 168337348 Y NA NA LOC100505918,MIR557 IMR90 Hi-C 24141950 TBX19 88980 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 168382983 168383105 168383068 Y NA NA NA NA NA NA TBX19 134705 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 168409627 168409736 168409651 Y NA NA F5 IMR90 Hi-C 24141950 TBX19 161349 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 168531443 168531650 168531547 Y NA NA LOC100505918,NME7 IMR90 Hi-C 24141950 TBX19 283165 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 169443033 169443373 169443298 Y NA SLC19A2,AL021068.1 NA NA NA NA SLC19A2 9868 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 169452813 169453010 169452905 Y NA SLC19A2,AL021068.1 NA NA NA NA SLC19A2 231 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 169464285 169464545 169464529 Y BLZF1,SLC19A2 SLC19A2,AL021068.1 NA NA NA NA AL021068.1 10905 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 169834996 169835276 169835168 Y NA SCYL3 NA NA NA NA SCYL3 26132 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 170042588 170042670 170042627 Y C1orf112 KIFAP3 NA NA NA NA KIFAP3 9679 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 171712214 171712716 171712399 Y FMO4,PRRC2C VAMP4,METTL13 NA NA NA NA VAMP4 2827 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 172327558 172328156 172327708 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 83074 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 172466564 172466703 172466653 Y NA NA DNM3,DARS2,CENPL,C1orf9,C1orf105,FASLG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIGC 55334 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 172606833 172606931 172606882 Y FASLG,C1orf9 NA C1orf9,FASLG IMR90 Hi-C 24141950 PIGC 195603 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 172608229 172608375 172608255 Y NA NA C1orf9,FASLG IMR90 Hi-C 24141950 PIGC 196999 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 172715484 172715760 172715631 Y NA NA C1orf105,TNFSF4,LOC100506023,PRDX6,RC3H1,SLC9A11,CENPL,DARS2,SNORD81,GAS5,SNORD75,SNORD47,SNORD79,LOC100506046,SNORD77,SNORD78,SNORD80,ZBTB37,SNORD44,SNORD76 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 302343 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 172878579 172879356 172878831 Y TNFSF18 NA TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,SNORD81,GAS5,SNORD75,SNORD47,SNORD79,LOC100506046,SNORD77,DARS2,SNORD78,SNORD80,ZBTB37,SNORD44,SNORD76 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 138747 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 172882769 172883147 172883123 Y TNFSF18 NA TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,PRDX6,CENPL,DARS2,SNORD75,GAS5,SNORD81,SNORD47,SNORD78,SNORD79,SNORD77,LOC100506046,SNORD44,SNORD76,SNORD80,ZBTB37 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 134956 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 173447359 173447668 173447399 Y PRDX6 PRDX6 NA NA NA NA PRDX6 2954 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 174503176 174503233 174503205 Y NA NA NA NA NA NA RABGAP1L 376628 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 175145439 175145838 175145619 Y KIAA0040,KIAA0040 KIAA0040 NA NA NA NA KIAA0040 14297 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 175547578 175547933 175547832 Y NA NA NA NA NA NA RP11-318C24.1 341178 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 175659647 175659870 175659824 Y NA NA NA NA NA NA RP11-318C24.1 229241 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 178207948 178208160 178207999 Y NA NA NA NA NA NA RASAL2 147084 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 178231351 178231525 178231428 Y NA NA NA NA NA NA RASAL2 170487 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 178305054 178305336 178305195 Y RASAL2 NA NA NA NA NA C1orf220 204551 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 178378072 178378430 178378251 Y NA NA NA NA NA NA C1orf220 131457 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 178986906 178987226 178987066 Y NA FAM20B RALGPS2,C1orf220,FAM20B,RASAL2,C1orf49,ABL2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM20B 5713 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 179110934 179111289 179111201 Y AXDND1,SOAT1,TOR3A,ABL2 NA NA NA NA NA TOR3A 62422 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 179153644 179153909 179153868 Y NA ABL2 NA NA NA NA ABL2 42910 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 179555221 179555646 179555325 Y TDRD5,TDRD5,TDRD5 NA NA NA NA NA HNRNPA1P54 130771 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 180200315 180200683 180200497 Y LHX4 NA NA NA NA NA QSOX1 78346 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 180371123 180371295 180371283 Y NA NA NA NA NA NA ACBD6 98794 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 180403880 180403893 180403887 Y NA NA NA NA NA NA ACBD6 66196 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 180921044 180921090 180921069 Y NA NA NA NA NA NA STX6 68957 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 181060502 181060611 181060567 Y STX6,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 4864 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 181068595 181069000 181068732 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 12957 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr1 181069151 181069617 181069305 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 13513 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr1 181074349 181074924 181074645 Y XPR1,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 18711 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 181081690 181081905 181081806 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 26052 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 181096103 181096331 181096188 Y NA IER5 KIAA1614,IER5,STX6 IMR90 Hi-C 24141950 IER5 40465 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 181104265 181104352 181104277 Y NA IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48627 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 181104473 181105818 181105427 Y STX6,MR1,IER5 IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48835 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 181110732 181111003 181110864 Y STX6,MR1,IER5 NA STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 55094 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 181998739 181999134 181998891 Y GLUL,GLUL NA ZNF648 MCF7 ChIA-PET 22265404 GLUL 360207 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 182259351 182259676 182259514 Y NA NA GLUL K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GLUL 99665 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 182654224 182654561 182654393 Y NA NA RGS8 IMR90 Hi-C 24141950 RGS16 82681 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 182998797 182999044 182998924 Y NA LAMC1 NA NA NA NA LAMC1 8202 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.33916040135441 chr1 183129116 183129507 183129296 Y LAMC2 LAMC2 LAMC2 IMR90 Hi-C 24141950 LAMC2 23866 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 183133608 183133779 183133664 Y LAMC2 LAMC2 NA NA NA NA LAMC2 19594 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 183149947 183150219 183150157 Y LAMC2 LAMC2 NA NA NA NA LAMC2 3154 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 183161027 183161375 183161120 Y NA LAMC2 NA NA NA NA LAMC2 7654 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 183171353 183171815 183171539 Y LAMC2 LAMC2 NA NA NA NA LAMC2 17980 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 183241451 183241867 183241650 Y LAMC1 NA LAMC2 IMR90 Hi-C 24141950 LAMC2 88078 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 183248987 183249454 183249212 Y NCF2,NCF2,ARPC5,LAMC1 NA NA NA NA NA LAMC2 95614 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 183386078 183386213 183386099 Y NA NA NA NA NA NA SMG7 53138 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 183526698 183527308 183526965 Y SMG7,NCF2,NCF2,ARPC5 NA NA NA NA NA ARPC5 75584 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 184810330 184810429 184810414 Y NA NA NA NA NA NA EDEM3 88283 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 184922808 184923031 184922923 Y EDEM3,SWT1,SWT1,RNF2,IVNS1ABP,FAM129A FAM129A NA NA NA NA FAM129A 18651 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 185127324 185127657 185127491 Y SWT1,SWT1 TRMT1L,SWT1 NA NA NA NA SWT1 3112 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 185344563 185345243 185344914 Y FAM129A,RNF2,TRMT1L,SWT1,TRMT1L,SWT1,IVNS1ABP NA IVNS1ABP,LOC100288079 IMR90 Hi-C 24141950 IVNS1ABP 60102 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 185408687 185409225 185409010 Y NA NA IVNS1ABP,LOC100288079 IMR90 Hi-C 24141950 IVNS1ABP 124226 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 185409237 185409536 185409444 Y RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP NA IVNS1ABP,LOC100288079 IMR90 Hi-C 24141950 IVNS1ABP 124776 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 186587444 186588060 186587743 Y PTGS2,PLA2G4A,C1orf27 NA PLA2G4A IMR90 Hi-C 24141950 PTGS2 59499 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 186818504 186818763 186818666 Y PTGS2,PLA2G4A NA NA NA NA NA PTGS2 170945 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 192216449 192216576 192216513 Y NA NA NA NA NA NA MIR4426 466737 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 192469407 192469758 192469583 Y NA NA NA NA NA NA MIR4426 213555 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 192577525 192577907 192577716 Y NA NA UCHL5 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4426 105406 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 192776947 192777226 192777096 Y TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS1,RGS2 RGS2 NA NA NA NA RGS2 778 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 192783033 192783090 192783086 Y TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS2 RGS2 NA NA NA NA RGS2 6864 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 193073509 193073815 193073644 Y NA TROVE2,UCHL5,GLRX2,CDC73 NA NA NA NA GLRX2 265 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 193180704 193180924 193180776 Y NA NA NA NA NA NA CDC73 91557 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 196867253 196867632 196867443 Y ZBTB41,F13B,CFHR3 NA NA NA NA NA ASPM 246192 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 197513718 197513772 197513745 Y CRB1,DENND1B NA NA NA NA NA DENND1B 229054 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 198128112 198128944 198128293 Y PTPRC,DENND1B NEK7 NA NA NA NA NEK7 4019 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 198840125 198840497 198840438 Y NA NA NA NA NA NA RP11-104D3.2 513772 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 198903935 198904934 198904858 Y PTPRC NA NA NA NA NA RP11-104D3.2 449335 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 200379777 200379959 200379899 Y NA ZNF281 NA NA NA NA ZNF281 2593 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 200865264 200865418 200865332 Y C1orf106,C1orf106 C1orf106 NA NA NA NA C1orf106 7088 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 201032066 201032442 201032254 Y NA KIF21B KIF21B IMR90 Hi-C 24141950 KIF21B 41238 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 201236006 201236165 201236054 Y LAD1,C1orf106,PKP1 PKP1 NA NA NA NA PKP1 14415 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr1 201277329 201277484 201277406 Y PKP1 PKP1 NA NA NA NA PKP1 26749 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 201280694 201280963 201280829 Y LAD1,C1orf106,PKP1 PKP1 NA NA NA NA PKP1 30114 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 201424936 201425126 201425034 Y NA PHLDA3,RP11-134G8.7 NA NA NA NA PHLDA3 11239 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 201426190 201426373 201426369 Y NA PHLDA3,RP11-134G8.7 NA NA NA NA PHLDA3 9992 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 201431088 201431253 201431176 Y NA PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA PHLDA3 5112 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 201445401 201445412 201445405 Y NAV1 PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA PHLDA3 9036 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 201449602 201449822 201449716 Y LAD1 PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 PHLDA3 IMR90 Hi-C 24141950 PHLDA3 13237 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 201472589 201472996 201472808 Y LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1 PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA RP11-134G8.7 1373 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chr1 201508517 201509575 201509484 Y NA RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA CSRP1 31933 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 201619383 201619798 201619705 Y SHISA4,GPR37L1,NAV1 NAV1 NA NA NA NA NAV1 28972 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 201987611 201988279 201987793 Y ELF3,LGR6 RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4 NA NA NA NA RP11-465N4.4 10130 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr1 201992149 201992501 201992334 Y NA RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4 NA NA NA NA RP11-465N4.4 14668 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 202003884 202004146 202004054 Y NA ELF3,RP11-465N4.4 NA NA NA NA RP11-465N4.4 26403 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 202016172 202016526 202016316 Y PPP1R12B,ELF3,LGR6 ELF3,RP11-465N4.4 ELF3,NAV1 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-465N4.4 38691 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 202045307 202045525 202045416 Y PPP1R12B,ELF3 NA NA NA NA NA ARL8A 66344 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 202075010 202075191 202075097 Y PPP1R12B,ELF3,LGR6 ARL8A RNPEP,LGR6,NAV1,ELF3,ARL8A,GPR37L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARL8A 36678 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 202249421 202249522 202249480 Y NA NA NA NA NA NA UBE2T 59586 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 203101073 203101246 203101163 Y NA NA NA NA NA NA CHI3L1 52631 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.00499462973235 chr1 203293246 203293605 203293363 Y ZBED6,TMEM183A,TMEM183B,BTG2 BTG2 NA NA NA NA BTG2 20627 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 203481982 203482534 203482093 Y BTG2,ATP2B4 NA NA NA NA NA ATP2B4 111155 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 203489584 203489741 203489635 Y BTG2 NA NA NA NA NA ATP2B4 103948 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 203491011 203491485 203491466 Y PPFIA4,SNRPE NA NA NA NA NA ATP2B4 102204 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 203599092 203599518 203599142 Y BTG2,LAX1 ATP2B4 NA NA NA NA ATP2B4 5403 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 203661733 203662076 203661795 Y NA NA NA NA NA NA ATP2B4 68044 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 204044571 204044810 204044641 Y NA SOX13 NA NA NA NA SOX13 4328 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 204073791 204074252 204073934 Y LAX1,PPP1R15B,SOX13 SOX13,ETNK2 NA NA NA NA SOX13 33548 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 204238647 204239007 204238820 Y GOLT1A,PLEKHA6 NA NA NA NA NA GOLT1A 57427 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 204363456 204363666 204363499 Y NA PLEKHA6,PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 15253 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 204386444 204387188 204386898 Y PPP1R15B PLEKHA6,PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 7525 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 204531285 204531644 204531490 Y MDM4 MDM4 NA NA NA NA MDM4 47774 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 205090261 205090406 205090392 Y NA RBBP5 CNTN2 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP5 1118 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 205253892 205254222 205253971 Y NUAK2 NUAK2 NA NA NA NA NUAK2 34661 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr1 205263599 205264019 205263855 Y NA NUAK2 NA NA NA NA NUAK2 24864 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 205265235 205265548 205265359 Y TMEM81,KLHDC8A NUAK2 NA NA NA NA NUAK2 23335 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 205267691 205267999 205267801 Y NA NUAK2 NA NA NA NA NUAK2 20884 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr1 205270500 205270865 205270692 Y NA NUAK2,SNRPGP10 NA NA NA NA NUAK2 18018 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 205288770 205288915 205288818 Y TMEM81,RBBP5,NUAK2 SNRPGP10 NA NA NA NA NUAK2 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 205442172 205442546 205442359 Y CNTN2,TMEM81 LEMD1,CDK18 KLHDC8A,NUAK2,MIR135B,LOC284576,LEMD1,CDK18 IMR90 Hi-C 24141950 LEMD1 19090 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 205512470 205512827 205512691 Y NA CDK18,RNU2-19P NA NA NA NA RNU2-19P 21017 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 206748926 206749451 206749084 Y IKBKE,RASSF5,MAPKAPK2,RASSF5,DYRK3 RP11-534L20.4,EIF2D NA NA NA NA EIF2D 34453 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 206763465 206763687 206763565 Y MAPKAPK2,RASSF5 EIF2D,DYRK3 NA NA NA NA EIF2D 20217 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 206859136 206859493 206859328 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 2847 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 206859748 206860259 206859963 Y IKBKE,RASSF5,FAIM3,FAIM3,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 3459 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 206918122 206918360 206918230 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,DYRK3,IL19,MAPKAPK2 NA NA NA NA NA MAPKAPK2 61833 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 206939730 206940044 206939954 Y NA NA NA NA NA NA MAPKAPK2 83441 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 207063537 207063710 207063660 Y RASSF5,DYRK3,MAPKAPK2,CD55,IL24 IL24,RP11-564A8.4 NA NA NA NA IL24 5078 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr1 207064076 207064429 207064213 Y NA IL24,RP11-564A8.4 NA NA NA NA IL24 4359 CAGE SAS hg19 FANTOM5 9.80219596758039 chr1 207064869 207064994 207064935 Y NA IL24,RP11-564A8.4 NA NA NA NA IL24 3794 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 207069223 207069337 207069332 Y NA IL24,RP11-564A8.4,PIGR NA NA NA NA IL24 435 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr1 207203424 207203586 207203506 Y C1orf116 C1orf116,PFKFB2,YOD1 NA NA NA NA C1orf116 515 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr1 207413364 207413503 207413411 Y IL19,CD55 NA CD55 MCF7 ChIA-PET 22265404 CD55 79350 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr1 208029774 208030104 208029939 Y NA C1orf132 NA NA NA NA C1orf132 10391 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 208136912 208137268 208137107 Y NA NA CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C1orf132 96417 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 208286487 208286766 208286698 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA2 128899 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 208314292 208314663 208314422 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA2 101002 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 208381145 208381344 208381321 Y NA PLXNA2 NA NA NA NA PLXNA2 34321 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 208387951 208388224 208388088 Y NA PLXNA2 NA NA NA NA PLXNA2 27441 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 208388887 208389573 208389450 Y NA PLXNA2 NA NA NA NA PLXNA2 26092 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 209538127 209538433 209538258 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587 NA MIR205HG MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MIR205HG 61732 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr1 209542596 209542897 209542763 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,HSD11B1,LOC642587 NA MIR205HG MCF7 ChIA-PET 22265404 MIR205HG 57268 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 209556903 209557123 209556922 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587 MIR205HG MIR205HG MCF7 ChIA-PET 22265404 MIR205HG 43042 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 209562668 209562976 209562782 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587 MIR205HG MIR205HG MCF7 ChIA-PET 22265404 MIR205HG 37189 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 209571959 209572357 209572220 Y LAMB3 MIR205HG MIR205HG MCF7 ChIA-PET 22265404 MIR205HG 27808 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 209577571 209577627 209577601 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587 MIR205HG NA NA NA NA MIR205HG 22538 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 209578512 209578819 209578654 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,HSD11B1,LOC642587 MIR205HG NA NA NA NA MIR205HG 21346 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr1 209579567 209579719 209579652 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,HSD11B1 MIR205HG NA NA NA NA MIR205HG 20446 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 209589374 209589797 209589586 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587 MIR205HG MIR205HG IMR90 Hi-C 24141950 MIR205HG 10368 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 209590107 209590333 209590233 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587 MIR205HG MIR205HG IMR90 Hi-C 24141950 MIR205HG 9832 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 209601291 209601611 209601405 Y NA MIR205HG NA NA NA NA MIR205HG 1126 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr1 209606620 209606963 209606837 Y NA MIR205HG NA NA NA NA MIR205HG 6455 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 209633173 209633397 209633285 Y NA MIR205HG NA NA NA NA MIR205HG 33008 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 209766433 209766919 209766698 Y CAMK1G NA NA NA NA NA LAMB3 56892 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr1 209783856 209783983 209783869 Y NA LAMB3 NA NA NA NA LAMB3 39828 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 209798058 209798744 209798639 Y NA LAMB3,G0S2 NA NA NA NA LAMB3 25067 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 209806744 209806957 209806914 Y G0S2,LAMB3 LAMB3,G0S2 NA NA NA NA LAMB3 16854 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 209822403 209823008 209822758 Y TRAF3IP3,G0S2,LAMB3 LAMB3,G0S2 CAMK1G IMR90 Hi-C 24141950 LAMB3 803 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 209827285 209827712 209827546 Y LOC642587,IRF6,HSD11B1,LAMB3,LAMB3 LAMB3,G0S2 NA NA NA NA LAMB3 3474 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 209828801 209829023 209828911 Y G0S2,LAMB3 LAMB3,G0S2 NA NA NA NA LAMB3 4990 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 209829183 209829498 209829302 Y IRF6,G0S2,LAMB3,LAMB3,LAMB3 LAMB3,G0S2 NA NA NA NA LAMB3 5372 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.00499462973235 chr1 209830400 209831026 209830727 Y TRAF3IP3,G0S2,C1orf74,LAMB3 LAMB3,G0S2 NA NA NA NA LAMB3 6589 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr1 209831470 209831550 209831510 Y TRAF3IP3,G0S2,LAMB3,LAMB3,LAMB3 LAMB3,G0S2 NA NA NA NA LAMB3 7659 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 209833148 209833823 209833488 Y TRAF3IP3,G0S2,C1orf74,LAMB3 LAMB3,G0S2 NA NA NA NA LAMB3 9337 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 209909843 209910309 209910139 Y LAMB3,G0S2 RP1-28O10.1,C1orf74 NA NA NA NA RP1-28O10.1 14373 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 209915892 209916078 209915980 Y NA RP1-28O10.1,C1orf74 NA NA NA NA RP1-28O10.1 20422 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 209942657 209943400 209942924 Y LAMB3,G0S2,TRAF3IP3 RP1-28O10.1,C1orf74,IRF6 NA NA NA NA C1orf74 12504 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr1 209978699 209978810 209978755 Y LAMB3,LAMB3,IRF6 C1orf74,IRF6,DIEXF NA NA NA NA IRF6 1234 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 209989263 209989693 209989489 Y LOC642587,LAMB3,LAMB3,IRF6 C1orf74,IRF6,DIEXF DIEXF,TRAF3IP3 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DIEXF 9659 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr1 209996933 209997272 209996990 Y NA C1orf74,IRF6,DIEXF DIEXF,IRF6,C1orf74 K562 ChIA-PET 22265404 DIEXF 2080 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 210058060 210058292 210058164 Y LAMB3 NA DIEXF,SYT14 IMR90 Hi-C 24141950 DIEXF 58708 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 211035320 211035533 211035504 Y NA NA NA NA NA NA RP11-543B16.1 309286 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 211988342 211989080 211989063 Y PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1 LPGAT1 NA NA NA NA LPGAT1 13034 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 212102475 212102639 212102508 Y NA NA NA NA NA NA LPGAT1 100361 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 212182782 212182853 212182818 Y NA INTS7,DTL,RPL21P28 NA NA NA NA INTS7 24031 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 212650622 212650921 212650683 Y ATF3,ATF3,ATF3 NENF NSL1,ATF3,FAM71A,BATF3,FLVCR1,VASH2,ANGEL2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 46393 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 212658172 212658571 212658328 Y ATF3,ATF3,ATF3 NA ATF3,FAM71A,ANGEL2,NENF,BATF3,TATDN3,NSL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 53943 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 212659054 212659720 212659497 Y ATF3,ATF3,ATF3 NA ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 54825 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 212661846 212662402 212662104 Y ATF3,ATF3,ATF3 NA ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 57617 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 212671541 212672116 212671670 Y NA NA ATF3,NSL1,TATDN3,BATF3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATF3 64560 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 212731490 212732709 212732386 Y NA ATF3 ATF3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ATF3 3967 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.56443489730196 chr1 212769584 212769966 212769788 Y ANGEL2,PPP2R5A,ATF3,ATF3,ATF3 ATF3,FAM71A NA NA NA NA FAM71A 25823 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 212780782 212781279 212780943 Y NA ATF3,FAM71A NA NA NA NA FAM71A 14510 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 212808992 212809268 212809126 Y VASH2,PPP2R5A FAM71A NA NA NA NA FAM71A 13203 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 212811770 212812141 212812009 Y NA FAM71A NA NA NA NA FAM71A 15981 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 212840606 212841015 212840787 Y C1orf227,BATF3,PPP2R5A,ATF3,FAM71A FAM71A,BATF3 NA NA NA NA BATF3 30312 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 212844659 212845312 212845163 Y RPS6KC1,BATF3,ATF3 FAM71A,BATF3 NA NA NA NA BATF3 26015 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 214512112 214512120 214512117 Y NA NA NA NA NA NA SMYD2 59667 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 214601098 214601566 214601506 Y PTPN14 NA NA NA NA NA PTPN14 122226 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 214612784 214613126 214613017 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 110666 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 214614555 214614760 214614639 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 109032 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 214620076 214620672 214620502 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 103120 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 214648804 214649025 214648867 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 74767 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 214712809 214712848 214712830 Y NA PTPN14 NA NA NA NA PTPN14 10944 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 215741534 215741966 215741880 Y KCTD3 KCTD3 NA NA NA NA KCTD3 2799 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 216938634 216938811 216938777 Y NA NA NA NA NA NA GPATCH2 863613 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 218382752 218383112 218382930 Y NA NA NA NA NA NA RRP15 73517 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 218553747 218554148 218553928 Y NA RP11-224O19.2,TGFB2 NA NA NA NA TGFB2 36170 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 218636802 218637167 218637004 Y NA NA NA NA NA NA TGFB2 119225 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr1 218662454 218662669 218662563 Y NA NA TGFB2,LOC728463,LOC643723 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TGFB2 144877 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 218666268 218666506 218666426 Y NA NA TGFB2,LOC728463,LOC643723 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TGFB2 148691 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 218669910 218670282 218669996 Y NA NA TGFB2,LOC643723,LOC728463 IMR90 Hi-C 24141950 TGFB2 152333 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 218758903 218759111 218758977 Y NA NA TGFB2 IMR90 Hi-C 24141950 TGFB2 241326 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 219497639 219497836 219497817 Y NA NA TGFB2,LOC728463,RRP15 IMR90 Hi-C 24141950 LYPLAL1 152453 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 219498496 219498646 219498574 Y NA NA TGFB2,LOC728463,RRP15 IMR90 Hi-C 24141950 LYPLAL1 153310 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 220359525 220359939 220359742 Y NA NA NA NA NA NA MORF4L1P1 64973 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 220427006 220427444 220427299 Y NA MORF4L1P1,RAB3GAP2 NA NA NA NA MORF4L1P1 2094 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 220510650 220511010 220510830 Y NA NA MARK1 IMR90 Hi-C 24141950 RAB3GAP2 66854 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 221201814 221202202 221201887 Y HLX NA NA NA NA NA MARC1 243713 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 221612801 221613016 221612980 Y DUSP10,DUSP10 NA C1orf140,HLX,MIA3 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 300502 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 221877654 221878134 221877871 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 35384 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 221882292 221882723 221882499 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 30795 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 221904432 221904724 221904722 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 8794 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 221913881 221914483 221914426 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 363 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 221916049 221916599 221916319 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 2531 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr1 222002644 222003471 222003177 Y DUSP10,DUSP10 NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 89126 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 222060426 222060817 222060685 Y NA NA DUSP10 MCF7 ChIA-PET 22265404 DUSP10 146908 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 222135050 222135329 222135215 Y DUSP10 NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 221532 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 223901276 223901546 223901311 Y TP53BP2,FBXO28,CAPN2 CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 13981 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 223903033 223903347 223903117 Y TP53BP2,CAPN2 CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 15738 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 223914239 223914747 223914523 Y TP53BP2,FBXO28,CAPN2 CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 26944 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr1 223925260 223925580 223925340 Y NA CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 37965 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 223964690 223965055 223964731 Y TP53BP2,FBXO28 NA NA NA NA NA TP53BP2 66619 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 224012866 224013246 224013103 Y NA TP53BP2 NA NA NA NA TP53BP2 18428 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 224022197 224022347 224022288 Y CAPN2,TP53BP2 TP53BP2 NA NA NA NA TP53BP2 9327 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 224023477 224023773 224023693 Y CAPN2,TP53BP2 TP53BP2 NA NA NA NA TP53BP2 7901 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 224024642 224024959 224024902 Y NA TP53BP2 NA NA NA NA TP53BP2 6715 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 224025511 224025803 224025713 Y NA TP53BP2 NA NA NA NA TP53BP2 5871 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 224032316 224032686 224032418 Y CAPN2,FBXO28,TP53BP2 TP53BP2 NA NA NA NA TP53BP2 642 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE SAS hg19 FANTOM5 5.680818117575 chr1 224240602 224240763 224240683 Y TP53BP2 NA NVL IMR90 Hi-C 24141950 FBXO28 59026 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 224690718 224691054 224690869 Y WDR26 NA CNIH3 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 67983 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 225613143 225613456 225613257 Y LBR,LBR LBR NA NA NA NA LBR 1171 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 225642606 225642805 225642652 Y NA LBR EPHX1,LBR,ENAH,SRP9,TMEM63A,PYCR2,LEFTY2,C1orf55,H3F3A IMR90 Hi-C 24141950 LBR 27979 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 226014145 226014403 226014226 Y EPHX1,EPHX1 EPHX1 NA NA NA NA EPHX1 18351 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 226263544 226263865 226263697 Y C1orf55 H3F3A NA NA NA NA H3F3A 15992 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 226315631 226315825 226315781 Y PARP1,LIN9,PYCR2 NA NA NA NA NA ACBD3 56606 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 226361229 226361382 226361305 Y NA ACBD3 NA NA NA NA ACBD3 11049 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 226852222 226852636 226852379 Y NA NA NA NA NA NA ITPKB 72388 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 226890865 226891416 226891300 Y ITPKB ITPKB NA NA NA NA ITPKB 33608 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 227002760 227003096 227002965 Y NA NA ITPKB,C1orf95 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSEN2 52789 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 227976197 227976490 227976208 Y NA NA NA NA NA NA JMJD4 55085 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 228350789 228351109 228350864 Y JMJD4 GUK1,IBA57,C1orf145 NA NA NA NA IBA57 407 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 228633222 228633907 228633608 Y TRIM11,TRIM17,HIST3H2A TRIM11,RP11-245P10.4,TRIM17,HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187 NA NA NA NA HIST3H2A 9653 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 228640073 228640088 228640081 Y NA TRIM11,RP11-245P10.4,TRIM17,HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187 NA NA NA NA HIST3H2A 3472 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 228651177 228651630 228651444 Y HIST3H2A,HIST3H2BB TRIM17,HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187 RNF187 IMR90 Hi-C 24141950 HIST3H2BB 7369 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 228782602 228782886 228782775 Y NA NA NA NA NA NA RNF187 109840 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 228783266 228783899 228783495 Y C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU NA NA NA NA NA RNF187 110504 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.00499462973235 chr1 228783962 228784250 228784107 Y NA NA NA NA NA NA RNF187 111200 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 229546837 229547142 229546975 Y C1orf96,ACTA1 NA NA NA NA NA NUP133 94961 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 230240540 230240902 230240735 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 49004 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 230561990 230562633 230562303 Y NA NA NA NA NA NA COG2 213602 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 231038131 231038454 231038293 Y COG2,TTC13,GNPAT,C1orf131 C1orf198 NA NA NA NA C1orf198 34796 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 231083969 231084208 231084171 Y NA TTC13,ARV1 NA NA NA NA TTC13 28413 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 231428201 231428315 231428258 Y NA EXOC8 NA NA NA NA EXOC8 43283 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 231868761 231869568 231868969 Y NA NA NA NA NA NA TSNAX 206362 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 232735038 232735290 232735230 Y NA NA TSNAX-DISC1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 230643 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 232760730 232761090 232760801 Y NA NA TSNAX-DISC1,SIPA1L2,PCNXL2,DISC2,NTPCR IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 204843 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 199806 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chr1 233249275 233249581 233249334 Y NA NA NA NA NA NA NTPCR 164924 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 233472763 233473058 233472911 Y NA RPS7P3,PCNXL2 NA NA NA NA PCNXL2 43304 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 233750790 233751092 233750957 Y KCNK1 KCNK1 NA NA NA NA KCNK1 3040 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 233763307 233763375 233763341 Y KCNK1 KCNK1 NA NA NA NA KCNK1 15557 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 234163168 234163347 234163228 Y SLC35F3 NA NA NA NA NA SLC35F3 124489 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 234250535 234250574 234250556 Y NA NA NA NA NA NA SLC35F3 211856 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 234534667 234535013 234534780 Y NA RP5-827C21.1,RP5-827C21.4 NA NA NA NA RP5-827C21.4 27328 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 234630919 234631525 234631418 Y TARBP1 TARBP1 LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,ARID4B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TARBP1 18070 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr1 234668851 234669143 234668986 Y NA NA NA NA NA NA TARBP1 56002 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 234728712 234729023 234728867 Y NA IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 14248 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.78221744865098 chr1 234736336 234736615 234736485 Y IRF2BP2 IRF2BP2,RP4-781K5.4 NA NA NA NA IRF2BP2 6656 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 234737347 234737653 234737498 Y IRF2BP2 IRF2BP2,RP4-781K5.4 NA NA NA NA IRF2BP2 5618 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 234738546 234738834 234738624 Y IRF2BP2 IRF2BP2,RP4-781K5.4 NA NA NA NA IRF2BP2 4437 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 234746093 234747674 234747395 Y IRF2BP2 IRF2BP2,RP4-781K5.4 NA NA NA NA IRF2BP2 2822 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chr1 234748100 234748931 234748566 Y IRF2BP2 IRF2BP2,RP4-781K5.4 NA NA NA NA IRF2BP2 4829 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.22777181081372 chr1 234749342 234749645 234749570 Y IRF2BP2 IRF2BP2,RP4-781K5.4 LINC00184,LOC100506810,ARID4B IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BP2 6071 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 234754264 234754665 234754337 Y NA IRF2BP2,RP4-781K5.4 ARID4B,LOC100506795,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506810 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2BP2 10993 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 234792654 234793437 234793098 Y NA IRF2BP2,RP4-781K5.4 IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP4-781K5.4 12619 CAGE SAS hg19 FANTOM5 5.12387516487157 chr1 234793934 234794239 234794125 Y NA RP4-781K5.4 IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP4-781K5.4 13899 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr1 234852227 234852379 234852265 Y NA NA LOC100506810,TARBP1,LOC100506795,IRF2BP2,LINC00184,TOMM20 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP4-781K5.4 72192 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 234858843 234859287 234859154 Y NA NA NA NA NA NA RP4-781K5.4 78808 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 234881537 234881788 234881657 Y NA NA NA NA NA NA RP4-781K5.4 101502 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 234908151 234908764 234908277 Y IRF2BP2 NA IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP4-781K5.4 128116 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 235104770 235105153 235105099 Y ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 9398 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 235106929 235107153 235107059 Y TARBP1,IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 7398 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 235110834 235111403 235111103 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 3148 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 235114050 235115068 235114636 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 235133014 235133422 235133155 Y NA RP11-443B7.3 LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 18463 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr1 235134086 235134438 235134232 Y NA RP11-443B7.3 LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 19535 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.00499462973235 chr1 235151923 235152024 235152010 Y ARID4B RP11-443B7.3 LINC00184,LOC100506795,IRF2BP2,LOC100506810 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-443B7.3 37372 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 235242252 235242564 235242410 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B TOMM20 IRF2BP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TOMM20 47687 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 235242792 235242999 235242934 Y NA TOMM20 IRF2BP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TOMM20 47252 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr1 235243001 235243596 235243521 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B TOMM20 IRF2BP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TOMM20 46655 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 235267591 235267744 235267678 Y NA TOMM20 NA NA NA NA TOMM20 22507 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr1 235390754 235391125 235391097 Y NA NA NA NA NA NA RBM34 67982 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 235486836 235487237 235487205 Y NA GGPS1,ARID4B,TBCE NA NA NA NA GGPS1 1428 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 235805098 235806119 235805875 Y LYST,RBM34,ARID4B,ARID4B GNG4 NA NA NA NA GNG4 5935 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 236022682 236022818 236022763 Y GPR137B,LYST LYST NA NA NA NA LYST 22122 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 236041479 236041632 236041556 Y NA LYST LYST,GNG4,B3GALNT2,NID1 IMR90 Hi-C 24141950 LYST 3308 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 236080566 236081247 236080933 Y LYST,GPR137B LYST B3GALNT2,LYST,NID1 IMR90 Hi-C 24141950 LYST 35626 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 236162583 236163199 236162893 Y GPR137B NA NA NA NA NA LYST 117643 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 236431064 236431243 236431072 Y LGALS8,ERO1LB ERO1LB NA NA NA NA ERO1LB 12076 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 236698906 236699167 236699014 Y EDARADD,MTR LGALS8 NA NA NA NA LGALS8 19606 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 237029172 237029469 237029246 Y NA NA NA NA NA NA MTR 72562 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 240306890 240307603 240307416 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23852 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 240308207 240308537 240308375 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22918 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 240308546 240308862 240308776 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22593 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 241392345 241392701 241392526 Y RGS7,KMO NA NA NA NA NA RP11-435F13.2 232251 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 241638824 241639283 241638985 Y KMO FH RGS7 IMR90 Hi-C 24141950 FH 41778 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 241771916 241772216 241772151 Y KMO CHML NA NA NA NA CHML 25016 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr1 241790752 241791037 241791008 Y NA CHML,OPN3 NA NA NA NA CHML 6195 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 242108255 242108348 242108324 Y NA NA EXO1 IMR90 Hi-C 24141950 EXO1 98986 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr1 242375774 242375872 242375823 Y NA NA NA NA NA NA EXO1 366505 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 243584021 243584680 243584353 Y CEP170,SDCCAG8,AKT3,AKT3 NA NA NA NA NA SDCCAG8 166701 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 243893800 243893985 243893919 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 118396 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.22777181081372 chr1 243995795 243995860 243995825 Y NA AKT3 NA NA NA NA AKT3 16521 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 243997018 243997244 243997154 Y NA AKT3 NA NA NA NA AKT3 15137 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr1 244210956 244211944 244211575 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 198575 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr1 244215508 244215901 244215527 Y AKT3,ZNF238,ZNF238 NA NA NA NA NA AKT3 203127 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 244505125 244505457 244505330 Y AKT3,AKT3,ADSS NA C1orf100,ADSS,AKT3 IMR90 Hi-C 24141950 ADSS 107979 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 244613820 244614139 244614120 Y NA ADSS NA NA NA NA ADSS 384 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 246749077 246749442 246749258 Y CNST TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 21331 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 246751015 246751281 246751184 Y NA TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 23269 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 246948292 246948613 246948340 Y NA NA NA NA NA NA SCCPDH 62943 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 247035132 247035504 247035470 Y CNST,ZNF669,AHCTF1 NA NA NA NA NA AHCTF1 57776 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 247093396 247093478 247093437 Y NA AHCTF1 NA NA NA NA AHCTF1 116 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 247295865 247296225 247296038 Y ZNF695,ZNF670,ZNF669 ZNF669 NA NA NA NA ZNF669 30191 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 247325578 247326237 247325673 Y NA MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 37125 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr1 247326566 247327229 247326989 Y NA MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 36133 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 725947 726341 726240 Y NA DIP2C NA NA NA NA DIP2C 7342 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 729218 729515 729367 Y NA DIP2C NA NA NA NA DIP2C 4168 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 958233 958518 958406 Y NA LARP4B DIP2C,GTPBP4,LARP4B IMR90 Hi-C 24141950 LARP4B 17046 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 2159978 2160127 2160053 Y NA NA NA NA NA NA ADARB2 382308 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 2256285 2256680 2256409 Y NA NA NA NA NA NA ADARB2 478615 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr10 2992232 2992361 2992295 Y NA NA WDR37,LINC00200 IMR90 Hi-C 24141950 PFKP 114164 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 3028046 3028193 3028123 Y NA NA LINC00200 IMR90 Hi-C 24141950 PFKP 78332 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 3088088 3088382 3088199 Y NA PFKP PFKP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFKP 18143 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 3137708 3138098 3138049 Y NA PFKP NA NA NA NA PFKP 31183 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 3216614 3216797 3216708 Y NA PITRM1 NA NA NA NA PITRM1 3611 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 3239590 3239795 3239693 Y NA PITRM1 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 26587 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 3509617 3509911 3509759 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 296614 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr10 3510310 3510716 3510597 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 297307 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr10 3511181 3511689 3511507 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 298178 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 3524547 3524820 3524727 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 300653 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 3710838 3711066 3710976 Y KLF6 NA KLF6 K562 ChIA-PET 22265404 KLF6 114407 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 3782727 3783283 3782915 Y KLF6 KLF6 LOC338588,LOC100216001,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 42190 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 3797195 3797502 3797389 Y KLF6 KLF6 NA NA NA NA KLF6 27971 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr10 3800307 3800531 3800378 Y KLF6 KLF6 NA NA NA NA KLF6 24942 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 3807382 3807563 3807453 Y KLF6 KLF6 NA NA NA NA KLF6 17910 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 3808656 3808872 3808754 Y KLF6 KLF6 NA NA NA NA KLF6 16601 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 3811743 3812009 3811888 Y KLF6 KLF6 NA NA NA NA KLF6 13464 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 3848037 3849536 3848891 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 22564 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr10 3852273 3852886 3852712 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 26800 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 3853393 3854169 3853583 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 27920 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr10 3867491 3867713 3867639 Y NA KLF6 LOC338588,LOC100216001,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 42018 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 4386754 4387085 4386858 Y NA NA LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00702 102650 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 4394953 4395258 4395067 Y NA NA LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00702 110849 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 4705159 4705783 4705486 Y NA LINC00704 NA NA NA NA LINC00704 12563 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 4711881 4712067 4712000 Y AKR1E2 LINC00704 NA NA NA NA LINC00704 6279 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 4712833 4713220 4712996 Y NA LINC00704 NA NA NA NA LINC00704 5126 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 4812953 4813314 4813133 Y NA NA KLF6,PITRM1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00704 94607 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 5333644 5334212 5333929 Y NA NA AKR1E2,tAKR IMR90 Hi-C 24141950 NET1 118302 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 5359534 5359986 5359835 Y GDI2 NA NA NA NA NA NET1 92528 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 5504427 5504665 5504478 Y NA NA NA NA NA NA NET1 51913 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 5530637 5531333 5530982 Y NA CALML3,RP11-116G8.5 NA NA NA NA CALML3 33591 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 5577499 5577735 5577573 Y NA CALML3,RP11-116G8.5 NA NA NA NA RP11-116G8.5 11794 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 5588881 5589169 5589084 Y NET1,CALML3 CALML3,RP11-116G8.5,RP13-463N16.6 NA NA NA NA RP11-116G8.5 23176 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr10 5590010 5590295 5590293 Y NET1,CALML3 CALML3,RP11-116G8.5,RP13-463N16.6 NA NA NA NA RP11-116G8.5 24305 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr10 5590959 5591270 5591035 Y NET1 CALML3,RP11-116G8.5,RP13-463N16.6 NA NA NA NA RP11-116G8.5 25254 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr10 5593718 5593999 5593816 Y NET1,CALML3 CALML3,RP11-116G8.5,RP13-463N16.6 NET1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-116G8.5 28013 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr10 5606066 5606314 5606283 Y NA CALML3,RP11-116G8.5,RP13-463N16.6,RP11-336A10.5 NET1,CALML5 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP13-463N16.6 29767 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 5607602 5608000 5607781 Y CALML3 CALML3,RP11-116G8.5,RP13-463N16.6,RP11-336A10.5 NET1,CALML5 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP13-463N16.6 28081 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr10 5608647 5608913 5608759 Y NA CALML3,RP11-116G8.5,RP13-463N16.6,RP11-336A10.5,RP11-336A10.4 NET1,CALML5 IMR90 Hi-C 24141950 RP13-463N16.6 27168 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr10 5638863 5639270 5639216 Y NET1,CALML3 RP13-463N16.6,RP11-336A10.5,RP11-336A10.4,RP11-336A10.7 NET1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RP13-463N16.6 2782 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr10 6013642 6013801 6013714 Y PFKFB3,PFKFB3,IL15RA RP11-536K7.3,IL15RA NA NA NA NA IL15RA 4349 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 6212827 6212938 6212883 Y FBXO18 PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 27946 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 6243287 6243821 6243659 Y PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 58406 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 6245814 6246792 6246043 Y PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 60933 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr10 6296306 6296528 6296431 Y PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 111425 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 6389510 6390540 6390147 Y IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 204629 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 6443408 6443712 6443449 Y PFKFB3,PFKFB3 NA IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKCQ 176551 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 6572253 6572436 6572313 Y PRKCQ PRKCQ NA NA NA NA PRKCQ 47827 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 6764164 6764384 6764289 Y NA RP11-554I8.2 LOC100507127,SFMBT2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-554I8.2 12960 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 6836289 6836715 6836468 Y NA NA NA NA NA NA RP11-554I8.2 58945 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr10 6919589 6919760 6919675 Y NA NA NA NA NA NA RP11-554I8.2 142245 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 7583205 7583490 7583242 Y NA NA NA NA NA NA KIN 244500 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 8662161 8662543 8662250 Y NA NA NA NA NA NA GATA3 568594 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 8931286 8931468 8931377 Y NA NA NA NA NA NA GATA3 837719 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 9042425 9042760 9042593 Y NA NA NA NA NA NA GATA3 948858 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 9052186 9052462 9052283 Y NA NA NA NA NA NA GATA3 958619 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 10831008 10831167 10831105 Y NA SFTA1P NA NA NA NA SFTA1P 3776 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr10 11061356 11061896 11061544 Y NA NA NA NA NA NA SFTA1P 226413 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 11077382 11077525 11077432 Y NA NA NA NA NA NA SFTA1P 242439 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 11555861 11556024 11555927 Y USP6NL NA NA NA NA NA USP6NL 95729 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 11651765 11651937 11651850 Y USP6NL,USP6NL USP6NL NA NA NA NA USP6NL 12 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 11652835 11653073 11652954 Y CELF2,USP6NL USP6NL NA NA NA NA USP6NL 1082 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 11835953 11836243 11836176 Y C10orf47 NA NA NA NA NA ECHDC3 53588 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 11866902 11867068 11866972 Y C10orf47 NA LOC219731 IMR90 Hi-C 24141950 PROSER2-AS1 67631 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 11917828 11918087 11917940 Y C10orf47 PROSER2-AS1 NA NA NA NA PROSER2-AS1 16612 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 11924114 11924319 11924232 Y C10orf47 PROSER2-AS1 NA NA NA NA PROSER2-AS1 10380 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr10 11940492 11940889 11940732 Y NA PROSER2-AS1 NA NA NA NA PROSER2-AS1 5793 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr10 12283843 12284276 12283949 Y UPF2,UPF2,SEC61A2,CAMK1D CDC123,NUDT5 NA NA NA NA NUDT5 47700 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 12455599 12455959 12455812 Y SEC61A2,CAMK1D NA NA NA NA NA CAMK1D 66118 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 12490797 12491318 12490959 Y SEC61A2,CAMK1D NA NA NA NA NA CAMK1D 101316 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 13391797 13392252 13392084 Y SEPHS1 PHYH,SEPHS1 NA NA NA NA SEPHS1 3500 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 13812005 13812243 13812123 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 185078 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 14032375 14032782 14032539 Y NA NA NA NA NA NA RP11-397C18.2 81501 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 14601403 14601956 14601622 Y DCLRE1C NA NA NA NA NA FRMD4A 99262 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 14641847 14641963 14641950 Y NA NA NA NA NA NA FRMD4A 139706 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 15178441 15178844 15178745 Y NA ACBD7,RPP38,C10orf111,NMT2 NA NA NA NA NMT2 29848 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 15179834 15179919 15179877 Y NA RPP38,C10orf111,NMT2 NA NA NA NA NMT2 28773 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 17063866 17063921 17063894 Y VIM NA NA NA NA NA TRDMT1 178132 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 17068694 17069080 17068926 Y NA NA NA NA NA NA TRDMT1 172973 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 17070785 17071064 17070923 Y VIM NA NA NA NA NA TRDMT1 170989 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 17074095 17074546 17074466 Y VIM NA NA NA NA NA TRDMT1 167507 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 17104584 17104750 17104681 Y NA NA NA NA NA NA TRDMT1 137303 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr10 17105178 17105416 17105257 Y NA NA NA NA NA NA TRDMT1 136637 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 20518444 20518755 20518482 Y PLXDC2 NA NA NA NA NA PLXDC2 415276 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 21386477 21386751 21386615 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 74365 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr10 21816987 21817223 21817104 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 3871 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr10 22026318 22026683 22026671 Y EBLN1 NA NA NA NA NA RN7SKP37 193389 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 22039558 22039808 22039651 Y MLLT10,MLLT10 NA NA NA NA NA RN7SKP37 180264 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 22555688 22555894 22555791 Y NA COMMD3 NA NA NA NA COMMD3 47009 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 22725331 22726270 22725901 Y NA NA NA NA NA NA BMI1 117191 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr10 25155940 25156492 25156271 Y ARHGAP21 NA NA NA NA NA PRTFDC1 83041 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 25348919 25349256 25349121 Y NA THNSL1 ARHGAP21,PRTFDC1,ENKUR,THNSL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THNSL1 45332 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 25357102 25357468 25357353 Y NA NA ARHGAP21 IMR90 Hi-C 24141950 THNSL1 53515 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 27069899 27070563 27070182 Y MASTL,ACBD5,PDSS1,ABI1 NA NA NA NA NA ABI1 77453 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 27147453 27147834 27147772 Y YME1L1,MASTL,ACBD5,APBB1IP,PDSS1,ABI1 ABI1 NA NA NA NA ABI1 182 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 27531769 27532240 27532024 Y ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5 ACBD5 NA NA NA NA ACBD5 2710 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 28700580 28701041 28700796 Y NA NA NA NA NA NA MPP7 79165 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 29254247 29254334 29254291 Y NA NA BAMBI,LYZL1 IMR90 Hi-C 24141950 WAC-AS1 434575 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 29948331 29948643 29948337 Y NA NA NA NA NA NA SVIL 75067 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 30073207 30073608 30073571 Y SVIL SVIL SVIL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SVIL 49497 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 30818244 30819051 30818562 Y MAP3K8,ZNF438 NA MAP3K8,KIAA1462,MTPAP,LOC729668,LYZL2 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K8 97378 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 31422679 31422989 31422772 Y ZNF438,ZNF438 NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 103813 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 32048872 32049424 32049213 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 166318 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 32579146 32579267 32579207 Y NA NA NA NA NA NA EPC1 86459 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 32606832 32606984 32606880 Y CCDC7,C10orf68,EPC1 NA NA NA NA NA EPC1 58742 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 32607439 32608014 32607606 Y EPC1 NA NA NA NA NA EPC1 57712 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 32621222 32621521 32621374 Y ARHGAP12,CCDC7,C10orf68,EPC1 EPC1 NA NA NA NA EPC1 44205 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 33250851 33251304 33251058 Y NA ITGB1 NA NA NA NA ITGB1 41416 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 33269452 33269916 33269602 Y C10orf68 ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 22804 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 33541909 33542109 33542065 Y NA NA NA NA NA NA NRP1 81081 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 33798158 33798349 33798267 Y NA NA PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 174968 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 34569605 34569879 34569742 Y NA NA NA NA NA NA RP11-8L18.3 381150 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 34816179 34816294 34816237 Y NA NA NA NA NA NA RP11-8L18.3 134735 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 34907489 34907514 34907502 Y NA RP11-8L18.3 NA NA NA NA RP11-8L18.3 43515 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 35102675 35103059 35102787 Y NA PARD3 NA NA NA NA PARD3 422 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 35431185 35431238 35431212 Y NA CREM NA NA NA NA CREM 17466 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 35640077 35640405 35640144 Y NA NA NA NA NA NA CCNY 106124 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 38264185 38264489 38264470 Y ZNF37A,ZNF248,ZNF25 ZNF25,ZNF33A NA NA NA NA ZNF25 624 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 43248764 43248842 43248800 Y NA BMS1 NA NA NA NA BMS1 27407 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr10 43633157 43633403 43633253 Y RASGEF1A CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 1223 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr10 43950893 43951349 43951098 Y NA HNRNPF,RP11-517P14.2 NA NA NA NA RP11-517P14.2 36707 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 45461456 45461865 45461640 Y OR13A1,ALOX5 RASSF4,C10orf10,ZNF22 NA NA NA NA RASSF4 8601 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 45464299 45464380 45464314 Y ZNF22,C10orf25 RASSF4,C10orf10,ZNF22 NA NA NA NA C10orf10 7878 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 45470476 45470795 45470517 Y NA RASSF4,C10orf10,ZNF22 NA NA NA NA C10orf10 1463 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 47092142 47092537 47092340 Y NA NA NA NA NA NA SYT15 122742 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 47092943 47093271 47093193 Y NA NA NA NA NA NA SYT15 123543 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 47113842 47114070 47114068 Y NA NA NA NA NA NA SYT15 144442 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr10 47129494 47129670 47129546 Y SYT15,PPYR1 NA NA NA NA NA SYT15 160094 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 47137749 47138065 47137950 Y NA NA NA NA NA NA SYT15 168349 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 47655672 47656071 47655889 Y NA NA AGAP7 MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM25HP 82259 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 48323344 48323752 48323648 Y NA RP11-463P17.1,ZNF488 SYT15,GPRIN2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-463P17.1 6445 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 48591812 48592143 48591972 Y ZNF488 NA SYT15 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF488 238788 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 49564940 49565014 49564977 Y NA NA ARHGAP22 IMR90 Hi-C 24141950 MAPK8 52242 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 49745028 49745223 49745126 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP22 117087 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 50595145 50595278 50595227 Y C10orf128 NA NA NA NA NA PGBD3 149808 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 52037840 52038115 52037944 Y SGMS1 DYNC1I2P1 SGMS1 IMR90 Hi-C 24141950 DYNC1I2P1 15102 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 52085013 52085461 52085351 Y FAM21A NA NA NA NA NA DYNC1I2P1 62275 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 52261858 52262194 52262143 Y NA NA NA NA NA NA SGMS1 120729 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 52385542 52385659 52385602 Y NA SGMS1 NA NA NA NA SGMS1 2619 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr10 54078280 54078480 54078433 Y NA DKK1 NA NA NA NA DKK1 6224 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 54078781 54079176 54078966 Y NA DKK1 NA NA NA NA DKK1 6725 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr10 54203068 54203427 54203228 Y NA RP11-346D6.6 LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-346D6.6 24866 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 54203502 54203868 54203680 Y DKK1 RP11-346D6.6 LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-346D6.6 24425 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 54208151 54208375 54208306 Y NA RP11-346D6.6 LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-346D6.6 19918 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 54211545 54211936 54211751 Y NA RP11-346D6.6 LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-346D6.6 16357 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr10 54212715 54213183 54212814 Y NA RP11-346D6.6 LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-346D6.6 15110 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 54246557 54246950 54246727 Y DKK1 RP11-346D6.6 DKK1,LOC100506939,PRKG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-346D6.6 18264 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.78721207838333 chr10 54367095 54367120 54367106 Y NA NA NA NA NA NA RP11-346D6.6 138802 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.55944026756961 chr10 54463812 54464030 54463937 Y NA NA NA NA NA NA RP11-346D6.6 235519 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 54471417 54471775 54471523 Y NA NA NA NA NA NA RP11-346D6.6 243124 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 54484465 54484478 54484473 Y NA NA NA NA NA NA RP11-346D6.6 256172 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 55377812 55377822 55377817 Y NA NA NA NA NA NA RP11-346D6.6 1149519 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 60949726 60949909 60949819 Y NA NA NA NA NA NA SLC16A9 543851 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 62185134 62185430 62185353 Y NA NA NA NA NA NA CDK1 350659 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 63839926 63839992 63839961 Y NA NA NA NA NA NA ARID5B 180867 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 64300187 64300318 64300222 Y EGR2,EGR2 NA NA NA NA NA ZNF365 168236 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 64397818 64398131 64397964 Y NRBF2,EGR2,EGR2 NA NA NA NA NA ADO 164385 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 64875678 64875783 64875732 Y NA NRBF2 ZNF365,ADO,NRBF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NRBF2 15267 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 65033384 65033629 65033527 Y NRBF2,JMJD1C NA NA NA NA NA NRBF2 142334 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 65097775 65098183 65098051 Y NA NA NA NA NA NA PRELID1P3 86874 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 65125268 65125651 65125502 Y NA NA NA NA NA NA PRELID1P3 59406 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 65196810 65197156 65196994 Y NA PRELID1P3,JMJD1C NA NA NA NA PRELID1P3 11753 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 65269177 65269730 65269542 Y NA JMJD1C,REEP3 REEP3,JMJD1C,LOC84989 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 REEP3 9393 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 65282188 65282459 65282345 Y JMJD1C,JMJD1C REEP3 NA NA NA NA REEP3 3065 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 65389747 65390882 65390384 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 110624 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr10 65930110 65930546 65930307 Y NA NA NA NA NA NA RP11-170M17.2 269105 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr10 68010262 68010544 68010403 Y NA NA NA NA NA NA ANXA2P3 1426933 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 69523317 69523417 69523404 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC12 72507 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 69523880 69524330 69524240 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC12 71594 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 69609160 69609390 69609211 Y NA DNAJC12,SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 DNAJC12 13236 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 69778500 69778679 69778642 Y NA NA NA NA NA NA HERC4 54426 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 69796463 69796828 69796573 Y HERC4 HERC4 NA NA NA NA HERC4 36277 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 69854882 69855277 69855187 Y HERC4 HERC4 ATOH7,HNRNPH3,PBLD,MYPN,HERC4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HERC4 21777 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.11638322027304 chr10 69856894 69857171 69856968 Y NA HERC4 MYPN,HERC4,PBLD,HNRNPH3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HERC4 23789 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr10 69913307 69913725 69913572 Y SIRT1,PBLD,HNRNPH3 NA NA NA NA NA HERC4 80202 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr10 70735854 70735920 70735884 Y CCAR1,SUPV3L1,DDX50,DDX21 DDX21,KIAA1279 KIAA1279 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1279 10567 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 70736024 70736384 70736191 Y SRGN DDX21,KIAA1279 KIAA1279 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1279 10103 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 70821151 70821852 70821361 Y DDX21,VPS26A,SRGN NA KIAA1279,DDX21,SRGN,VPS26A,SUPV3L1 IMR90 Hi-C 24141950 VPS26A 59416 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 70884620 70884824 70884718 Y DDX21,SUPV3L1,SRGN VPS26A NA NA NA NA VPS26A 3352 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 71198445 71198595 71198514 Y NA TSPAN15 HKDC1,TSPAN15,C10orf35,HK1,TACR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSPAN15 10634 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 71928097 71928630 71928606 Y NA AIFM2,TYSND1,CALM2P2 TYSND1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SAR1A 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr10 71984000 71984297 71984282 Y NA PPA1 NA NA NA NA PPA1 7370 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 72433363 72433696 72433541 Y ADAMTS14 ADAMTS14 NA NA NA NA ADAMTS14 2804 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 72973788 72974249 72973953 Y UNC5B UNC5B,UNC5B-AS1 NA NA NA NA UNC5B-AS1 1736 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 73109189 73109511 73109382 Y SLC29A3 SLC29A3,CDH23 NA NA NA NA SLC29A3 32174 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 73124315 73124355 73124335 Y NA SLC29A3,CDH23 NA NA NA NA CDH23 30336 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 73486376 73486761 73486595 Y CDH23,CDH23 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 44494 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 73526437 73526878 73526654 Y CDH23,C10orf54,C10orf105 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 4377 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 73526896 73527242 73527133 Y CDH23,C10orf54,C10orf105 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 4013 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr10 73531831 73532355 73532130 Y C10orf105,CDH23,PSAP,C10orf54 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 576 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 73620184 73620641 73620392 Y DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP PSAP PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PSAP 11058 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 73627974 73628371 73628194 Y DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP PSAP C10orf54,CDH23,PSAP,SPOCK2,DNAJB12,CHST3,ASCC1,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 PSAP 18848 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 73725868 73726411 73726297 Y C10orf105,CHST3 CHST3 NA NA NA NA CHST3 3745 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 73744363 73744592 73744410 Y NA CHST3 NA NA NA NA CHST3 22240 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 73840531 73840743 73840590 Y ASCC1,ASCC1,SPOCK2 NA NA NA NA NA CHST3 118408 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr10 73954988 73955333 73955161 Y NA ANAPC16,ASCC1 NA NA NA NA ANAPC16 18454 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 74016969 74017226 74017050 Y C10orf54,PSAP,DNAJB12,DDIT4 ANAPC16,ASCC1,DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 14452 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 74020239 74021717 74020385 Y C10orf54,PSAP,DNAJB12,DDIT4 ANAPC16,ASCC1,DDIT4 DNAJB12 K562 ChIA-PET 22265404 DDIT4 9961 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 74056833 74058104 74057179 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 25155 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.56193758243578 chr10 74079380 74080359 74079580 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 32629 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 74080430 74080993 74080646 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 31995 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr10 74081865 74082262 74082021 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DNAJB12 NA NA NA NA DNAJB12 30726 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr10 74085147 74085316 74085305 Y NA DNAJB12 NA NA NA NA DNAJB12 27672 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 74091661 74092150 74091920 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DNAJB12 NA NA NA NA DNAJB12 20838 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr10 74385233 74385288 74385261 Y NA MICU1,HMGN2P34 NA NA NA NA MICU1 1334 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 75022023 75022098 75022060 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA RP11-152N13.5 11474 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 75240023 75240096 75240089 Y NA RP11-137L10.6,PPP3CB NA NA NA NA RP11-137L10.6 13187 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 75361338 75361489 75361457 Y NA USP54 USP54,PPP3CB,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L,MYOZ1,CHCHD1,TTC18,C10orf103 IMR90 Hi-C 24141950 USP54 22222 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 75648556 75649146 75648996 Y ANXA7,NDST2 CAMK2G,PLAU SEC24C,FUT11,LOC100507331,CAMK2G,NDST2,KIAA0913,VCL,PLAU,C10orf55,AP3M1,ADK IMR90 Hi-C 24141950 CAMK2G 16213 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr10 75653245 75653472 75653359 Y NA CAMK2G,PLAU NA NA NA NA PLAU 13463 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 75666465 75666800 75666554 Y ANXA7,NDST2 CAMK2G,PLAU NA NA NA NA PLAU 135 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 75716399 75716797 75716501 Y FUT11,NDST2 PLAU,VCL CAMK2G,PLAU,C10orf55,VCL,AP3M1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 VCL 39075 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 75725888 75726135 75726026 Y NA VCL CAMK2G,AP3M1,VCL,NDST2,C10orf55,PLAU,ADK IMR90 Hi-C 24141950 VCL 29737 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 75768391 75768772 75768419 Y NA VCL NA NA NA NA VCL 12519 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 75929236 75929313 75929276 Y NDST2 AP3M1,ADK NA NA NA NA ADK 20276 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 76737758 76737994 76737873 Y MYST4,SAMD8 NA NA NA NA NA SAMD8 119350 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 76866248 76866511 76866390 Y NA SAMD8 NA NA NA NA SAMD8 8904 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 76916394 76916800 76916595 Y MYST4,SAMD8 NA NA NA NA NA VDAC2 51112 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 77022416 77022492 77022443 Y NA COMTD1,HMGA1P5 COMTD1,ZNF503-AS1 MCF7 ChIA-PET 22265404 HMGA1P5 11912 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 77155629 77155954 77155896 Y ZNF503 ZNF503 NA NA NA NA ZNF503 3710 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 77165098 77165501 77165301 Y C10orf11 ZNF503 NA NA NA NA ZNF503 5434 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 78594394 78594663 78594529 Y NA NA KCNMA1 IMR90 Hi-C 24141950 DLG5 1089715 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 79152642 79152983 79152827 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA DLG5 531395 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 79291052 79291779 79291330 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA DLG5 392599 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 79633336 79633510 79633397 Y NA NA NA NA NA NA DLG5 50868 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 79685177 79685609 79685373 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 799 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr10 80732492 80734123 80733460 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 92669 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 80737664 80737999 80737882 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 88793 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr10 80830818 80831199 80831077 Y ZMIZ1 ZMIZ1 NA NA NA NA ZMIZ1 4026 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 80860192 80860276 80860234 Y NA ZMIZ1 NA NA NA NA ZMIZ1 33400 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 80911539 80911799 80911619 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 84747 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 81001444 81002226 81001825 Y NA NA NA NA NA NA PPIF 102999 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 81059255 81059879 81059575 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 45346 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 81085771 81086240 81085963 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 18985 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 81088418 81088982 81088641 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 16243 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 81090834 81091304 81091180 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 13921 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 81103020 81103289 81103138 Y NA PPIF NA NA NA NA PPIF 1936 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 81105192 81105332 81105235 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 81956011 81956585 81956252 Y ANXA11 ANXA11,EIF5AP4 NA NA NA NA ANXA11 6743 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr10 81960969 81961796 81961521 Y SH2D4B,ANXA11 ANXA11,EIF5AP4 NA NA NA NA ANXA11 1532 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 82211651 82212098 82211867 Y SH2D4B FAM213A NA NA NA NA TSPAN14 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 82258642 82258780 82258737 Y TSPAN14 TSPAN14,RP11-137H2.4 NA NA NA NA RP11-137H2.4 34918 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 85939285 85939414 85939359 Y NA GHITM NA NA NA NA GHITM 42089 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 86448211 86448543 86448377 Y NA NA NA NA NA NA RPS3AP5 130012 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 87752944 87753321 87753210 Y NA NA NA NA NA NA WAPAL 526251 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 88004394 88004782 88004588 Y NA NA NA NA NA NA WAPAL 274790 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 88160011 88160294 88160175 Y NA NA WAPAL MCF7 ChIA-PET 22265404 WAPAL 119278 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 88470805 88471213 88471023 Y NA BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 43194 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr10 88517208 88517667 88517486 Y GLUD1,BMPR1A BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 2801 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr10 88713984 88714363 88714198 Y SNCG SNCG NA NA NA NA SNCG 2012 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr10 89508472 89508835 89508628 Y NA NA NA NA NA NA CFL1P1 66850 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 91020368 91020477 91020401 Y IFIT5,IFIT1,IFIT3,IFIT3,IFIT2 RP11-149I23.3,IFIT2 NA NA NA NA RP11-149I23.3 21045 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr10 91034775 91034961 91034861 Y NA RP11-149I23.3,IFIT2 IFIT1B,IFIT2,IFIT3,IFIT1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-149I23.3 6561 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 91096650 91097012 91096836 Y IFIT2,IFIT3,IFIT3,IFIT5,IFIT1 IFIT2,IFIT3 NA NA NA NA IFIT3 10999 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 91127158 91127607 91127378 Y NA IFIT3,IFIT1,LIPA,IFIT5 LIPA,IFIT2,IFIT1B,SLC16A12,PANK1 IMR90 Hi-C 24141950 IFIT1 22696 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 91189163 91189205 91189186 Y SLC16A12 IFIT1,LIPA,IFIT5 NA NA NA NA IFIT5 16820 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 91275289 91275484 91275456 Y NA SLC16A12 NA NA NA NA SLC16A12 38914 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 92921990 92922253 92922075 Y HECTD2 NA ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PCGF5 55655 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr10 93971063 93971200 93971172 Y TNKS2,BTAF1 NA NA NA NA NA CPEB3 77644 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 94001133 94001473 94001377 Y CPEB3,CPEB3 CPEB3,MARCH5 NA NA NA NA CPEB3 47371 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 94351391 94351691 94351485 Y CPEB3 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 348 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr10 94353992 94354203 94354151 Y MARCH5 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 2949 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 95193537 95193891 95193765 Y MYOF MYOF NA NA NA NA MYOF 46183 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 95196959 95197603 95197264 Y NA MYOF NA NA NA NA MYOF 42471 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 95198614 95198817 95198708 Y NA MYOF NA NA NA NA MYOF 41257 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 95205346 95205630 95205524 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 34444 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 95218561 95218998 95218660 Y MYOF MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 21076 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 95222493 95222944 95222696 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 17130 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr10 95225325 95225770 95225711 Y MYOF MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 14304 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr10 95226262 95226423 95226291 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 13651 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 95228207 95228553 95228471 Y MYOF,CEP55,CEP55 MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 11521 CAGE SAS hg19 FANTOM5 5.34665234595294 chr10 96943397 96943661 96943560 Y SORBS1,SORBS1 NA C10orf129,SORBS1 IMR90 Hi-C 24141950 PDLIM1 105120 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 97020432 97020603 97020519 Y NA PDLIM1 NA NA NA NA PDLIM1 28178 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr10 97024100 97024800 97024493 Y NA PDLIM1 NA NA NA NA PDLIM1 23981 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr10 97026412 97026787 97026670 Y NA PDLIM1 NA NA NA NA PDLIM1 21994 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chr10 97048077 97048324 97048201 Y SORBS1 PDLIM1 NA NA NA NA PDLIM1 457 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 97687985 97688127 97688056 Y NA NA NA NA NA NA RP11-248J23.5 69873 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 98029055 98029227 98029121 Y NA BLNK NA NA NA NA BLNK 117 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 99172845 99172912 99172879 Y C10orf12,ZFYVE27,ZFYVE27,FRAT2 RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16 PGAM1,RRP12,ZDHHC16,EXOSC1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PGAM1 11005 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 99401742 99402052 99401841 Y C10orf28,RRP12,ZFYVE27,PI4K2A MORN4,AVPI1 NA NA NA NA MORN4 10398 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 99408797 99409067 99408957 Y NA MORN4,AVPI1 NA NA NA NA MORN4 17453 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr10 99449337 99449738 99449607 Y C10orf28,RRP12,PI4K2A AVPI1,MARVELD1,ZFYVE27 NA NA NA NA AVPI1 4257 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 100082942 100083374 100083163 Y C10orf28 NA LOXL4,C10orf28,PYROXD2,HPS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOXL4 56935 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 100153906 100154210 100154161 Y NA PYROXD2 NA NA NA NA PYROXD2 18731 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 100993810 100993952 100993927 Y NA NA NA NA NA NA GOT1 194429 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 101300631 101300706 101300670 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A28 77660 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 101381465 101381554 101381515 Y NA SLC25A28,ENTPD7 NA NA NA NA SLC25A28 3099 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 101666342 101666477 101666411 Y NA NA NA NA NA NA DNMBP 101199 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 101736797 101737134 101736959 Y BLOC1S2,BLOC1S2,DNMBP DNMBP NA NA NA NA DNMBP 30542 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 101765990 101766360 101766233 Y NA DNMBP NA NA NA NA DNMBP 1316 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 102067493 102067821 102067631 Y DNMBP,ERLIN1,ERLIN1,BLOC1S2,BLOC1S2 CWF19L1,BLOC1S2,SCD NA NA NA NA BLOC1S2 23024 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 102130336 102130669 102130535 Y NA SCD,LINC00263 NA NA NA NA LINC00263 703 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 102130783 102131327 102130955 Y CWF19L1 SCD,LINC00263 NA NA NA NA LINC00263 45 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 102488726 102488983 102488821 Y NA NA PAX2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM178A 181343 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 103124623 103124787 103124739 Y FBXW4 BTRC DPCD,POLL IMR90 Hi-C 24141950 BTRC 12803 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 103591495 103591519 103591507 Y BTRC,KCNIP2,KCNIP2 MGEA5 NA NA NA NA MGEA5 14799 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 103600514 103600739 103600526 Y NA MGEA5 NA NA NA NA MGEA5 23818 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 103717791 103718012 103717910 Y C10orf76 NA NA NA NA NA C10orf76 95938 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 103877464 103877788 103877718 Y MGEA5,TMEM180,SUFU,PSD,FBXL15,C10orf76,LDB1 LDB1,PPRC1,NOLC1 NA NA NA NA LDB1 422 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 104388023 104388450 104388178 Y NA TRIM8 NA NA NA NA TRIM8 13803 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr10 104473144 104473537 104473339 Y NA ARL3,SFXN2 NA NA NA NA SFXN2 849 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 104504643 104504897 104504711 Y NA ARL3,SFXN2 NA NA NA NA SFXN2 32348 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 104990991 104991184 104991120 Y NA NT5C2 SFXN2,C10orf32-AS3MT,CYP17A1,NT5C2,CNNM2,LOC729020 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5C2 39935 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 105001544 105001968 105001663 Y C10orf32,NT5C2 NA INA,PCGF6,NT5C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5C2 50488 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 105452274 105452407 105452303 Y NA NA NA NA NA NA OBFC1 223556 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 105456300 105456542 105456434 Y NA NA NA NA NA NA OBFC1 219421 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr10 105519063 105519154 105519109 Y NA NA NA NA NA NA OBFC1 156809 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 105532054 105532211 105532109 Y NA NA NA NA NA NA OBFC1 143752 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 105630366 105630555 105630455 Y GSTO2,COL17A1,SH3PXD2A OBFC1 NA NA NA NA OBFC1 45408 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 105630915 105631032 105630972 Y GSTO2,COL17A1,SH3PXD2A OBFC1 NA NA NA NA OBFC1 44931 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 105631960 105632231 105632145 Y GSTO2,COL17A1,SH3PXD2A OBFC1 NA NA NA NA OBFC1 43732 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 106065321 106065564 106065443 Y NA MIR4482-1,GSTO2,ITPRIP NA NA NA NA ITPRIP 30598 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 106087819 106088091 106087906 Y SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147 ITPRIP NA NA NA NA ITPRIP 8071 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 106096287 106096870 106096611 Y SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147 ITPRIP ITPRIP,GSTO1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ITPRIP 125 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 106399315 106399424 106399359 Y WDR96,SORCS3 NA NA NA NA NA ITPRIP 303153 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 110360095 110360471 110360395 Y NA NA NA NA NA NA XPNPEP1 1320840 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 111981639 111982026 111981734 Y ADD3,MXI1,MXI1 MXI1 SMNDC1 IMR90 Hi-C 24141950 MXI1 16276 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 112113245 112113632 112113326 Y NA NA SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMNDC1 50536 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 112116359 112116685 112116467 Y DUSP5,MXI1 NA SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMNDC1 53650 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr10 112117126 112117443 112117281 Y DUSP5,MXI1 NA SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMNDC1 54417 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr10 112123790 112124003 112123953 Y MXI1 NA SMC3,DUSP5,RBM20 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 61081 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr10 112155518 112156031 112155808 Y DUSP5 NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 92809 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr10 112158460 112158738 112158533 Y DUSP5 NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 95751 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr10 112159079 112159451 112159258 Y NA NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 96145 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr10 112168008 112168205 112168118 Y DUSP5 NA DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 87391 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr10 112170161 112170538 112170357 Y DUSP5 NA DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 85058 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr10 112174673 112174737 112174702 Y NA NA SMC3,DUSP5,SMNDC1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 80859 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 112207134 112207519 112207380 Y NA DUSP5 DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 48077 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr10 112215418 112215452 112215427 Y NA DUSP5 DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 40144 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 112220227 112220521 112220467 Y SMC3,DUSP5 DUSP5 DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 35075 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr10 112259301 112259712 112259445 Y MXI1,PDCD4,DUSP5 DUSP5 NA NA NA NA DUSP5 3705 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 112261043 112261328 112261185 Y SHOC2,DUSP5 DUSP5 NA NA NA NA DUSP5 5447 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr10 112263780 112264181 112263965 Y SHOC2,PDCD4,BBIP1,BBIP1,DUSP5 DUSP5 NA NA NA NA DUSP5 8184 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 112272592 112272848 112272747 Y SHOC2,BBIP1,BBIP1,DUSP5 DUSP5 NA NA NA NA DUSP5 16996 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 112290201 112290297 112290249 Y NA DUSP5,SMC3 NA NA NA NA DUSP5 34605 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 112295745 112296221 112296000 Y SHOC2,BBIP1,BBIP1,DUSP5 DUSP5,SMC3 SMNDC1,DUSP5,SMC3 IMR90 Hi-C 24141950 SMC3 29228 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 112306133 112306219 112306164 Y NA SMC3 SMNDC1,DUSP5,SMC3 IMR90 Hi-C 24141950 SMC3 19230 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 112401121 112401469 112401220 Y SMC3,RBM20 NA NA NA NA NA SMC3 75672 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 112533972 112534336 112534061 Y PDCD4 NA NA NA NA NA PDCD4 95229 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 114385835 114385842 114385839 Y GPAM,TECTB NA NA NA NA NA VTI1A 181079 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 114718173 114718547 114718195 Y NA TCF7L2 NA NA NA NA TCF7L2 10164 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 115122408 115122600 115122509 Y TCF7L2 NA VTI1A IMR90 Hi-C 24141950 CASP7 314342 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 115440649 115440877 115440799 Y CASP7 CASP7 NA NA NA NA CASP7 3707 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 116080506 116080782 116080645 Y AFAP1L2 NA NA NA NA NA AFAP1L2 81733 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr10 116259358 116259612 116259525 Y C10orf118,ABLIM1 NA NA NA NA NA AFAP1L2 96843 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 116282298 116282595 116282502 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1L2 119783 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 118656077 118656284 118656258 Y NA ENO4,RP11-539I5.1 NA NA NA NA RP11-539I5.1 48361 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 118894357 118894681 118894572 Y VAX1 KIAA1598 NA NA NA NA KIAA1598 10260 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 118922718 118922822 118922754 Y VAX1 KIAA1598 NA NA NA NA KIAA1598 38621 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 119107774 119108099 119107936 Y NA PDZD8 NA NA NA NA PDZD8 24879 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 119256221 119256343 119256282 Y KIAA1598,KCNK18,EMX2 NA NA NA NA NA PDZD8 123243 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 120482173 120482528 120482344 Y NA NA NA NA NA NA NANOS1 304700 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 120632969 120633291 120633120 Y NA NA NA NA NA NA NANOS1 153937 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr10 121415317 121415432 121415359 Y GRK5,BAG3 RP11-179H18.5,BAG3 NA NA NA NA BAG3 6435 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 121417930 121418047 121417978 Y BAG3 RP11-179H18.5,BAG3 NA NA NA NA BAG3 9048 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 121829686 121829950 121829715 Y NA NA NA NA NA NA NACAP2 74465 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 122828648 122828948 122828802 Y NA NA FGFR2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-159H3.1 62289 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 122836934 122837187 122837105 Y NA NA NA NA NA NA RP11-159H3.1 54050 CAGE SAS hg19 FANTOM5 10.4705275108245 chr10 122918665 122919069 122918920 Y FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2 RP11-159H3.1 NA NA NA NA RP11-159H3.1 27428 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr10 123313040 123313152 123313149 Y FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2 FGFR2 NA NA NA NA FGFR2 42820 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 123539603 123539774 123539689 Y TACC2,ATE1 NA NA NA NA NA ATE1-AS1 146053 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 123873239 123873409 123873290 Y NA NA NA NA NA NA TACC2 126550 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 124067478 124067825 124067684 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA1 64387 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 124133234 124133500 124133290 Y NA PLEKHA1 NA NA NA NA PLEKHA1 1022 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 124254349 124254758 124254614 Y NA HTRA1 NA NA NA NA HTRA1 35308 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 125754916 125755682 125755196 Y CHST15 NA NA NA NA NA CHST15 95524 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 125792973 125793185 125793048 Y CHST15 NA NA NA NA NA CHST15 58021 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 126021099 126021412 126021201 Y CHST15 NA CHST15 IMR90 Hi-C 24141950 OAT 84133 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 126329186 126329692 126329619 Y CHST15,ZRANB1,FAM53B NA NA NA NA NA FAM53B 101146 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 126337254 126337585 126337480 Y CHST15,ZRANB1,FAM53B NA NA NA NA NA FAM53B 93253 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 126490996 126491131 126491100 Y NA METTL10,FAM175B NA NA NA NA FAM175B 2642 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 126749212 126749581 126749525 Y NA NA NA NA NA NA CTBP2 98158 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 126837951 126838191 126838020 Y NA CTBP2,MRPS21P6 NA NA NA NA CTBP2 9548 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 127130064 127130207 127130136 Y MMP21 NA NA NA NA NA MRPS21P6 276818 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 127440633 127440786 127440709 Y C10orf122,FANK1 NA NA NA NA NA UROS 69031 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 127591696 127592016 127591824 Y NA RNU2-42P,DHX32,FANK1 NA NA NA NA FANK1 8588 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 127751033 127751319 127751198 Y NA NA NA NA NA NA FANK1 167925 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 127821927 127822394 127822178 Y NA NA NA NA NA NA FANK1 238819 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 127936160 127936570 127936368 Y NA NA NA NA NA NA ADAM12 138454 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 128595349 128595449 128595411 Y DOCK1 DOCK1 NA NA NA NA DOCK1 3371 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 129239664 129239829 129239755 Y NA NA NA NA NA NA PTPRE 463496 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 129706206 129706827 129706528 Y PTPRE PTPRE NA NA NA NA PTPRE 2881 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 129721316 129721687 129721518 Y NA PTPRE NA NA NA NA PTPRE 17991 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 129742865 129742981 129742943 Y NPS PTPRE NA NA NA NA PTPRE 39540 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 129775759 129776314 129776065 Y PTPRE,PTPRE NA NA NA NA NA PTPRE 72434 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 129799058 129799270 129799164 Y NA NA NA NA NA NA PTPRE 95733 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 129893841 129894010 129893942 Y NA MKI67 NA NA NA NA MKI67 28639 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 130875080 130875084 130875082 Y NA NA NA NA NA NA MGMT 388364 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 131073294 131073614 131073464 Y NA NA EBF3,MGMT IMR90 Hi-C 24141950 MGMT 189834 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 133454610 133454819 133454663 Y NA NA NA NA NA NA BNIP3 338616 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 133793049 133793425 133793362 Y NA BNIP3 PPP2R2D IMR90 Hi-C 24141950 BNIP3 10 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 133879247 133879524 133879406 Y NA NA BNIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BNIP3 85812 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr10 134221496 134221692 134221620 Y PWWP2B PWWP2B NA NA NA NA PWWP2B 12824 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 134221970 134222202 134222031 Y PWWP2B PWWP2B NA NA NA NA PWWP2B 13298 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 134260341 134260546 134260485 Y C10orf91 NA NA NA NA NA PWWP2B 51669 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.78221744865098 chr10 134330832 134331178 134331005 Y NA RP11-432J24.5,INPP5A INPP5A,ADAM8,C10orf91 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-432J24.5 1137 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 135071993 135072118 135072056 Y TUBGCP2,ADAM8 ZNF511 NA NA NA NA ZNF511 47861 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr10 135072735 135073128 135072895 Y TUBGCP2,ADAM8 ZNF511 NA NA NA NA ZNF511 46851 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 135074691 135075148 135074934 Y TUBGCP2,ADAM8 ZNF511,TUBGCP2 NA NA NA NA ZNF511 44831 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr10 135092117 135092276 135092147 Y ADAM8,TUBGCP2 ZNF511,TUBGCP2 NA NA NA NA ZNF511 27703 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr10 135092436 135092746 135092593 Y ADAM8,TUBGCP2 ZNF511,TUBGCP2 NA NA NA NA ZNF511 27233 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr11 355877 356724 356385 Y NA IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3 IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 B4GALNT4 11072 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr11 368352 368730 368427 Y NA IFITM3,B4GALNT4,PKP3,SIGIRR NA NA NA NA B4GALNT4 556 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 840856 841090 840896 Y NA SLC25A22,RPLP2,PIDD,PNPLA2,EFCAB4A,CD151,POLR2L,TSPAN4 NA NA NA NA TSPAN4 48 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 1073369 1073545 1073512 Y DRD4,EFCAB4A NA NA NA NA NA AP2A2 150475 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr11 1147842 1148157 1148045 Y NA NA MUC5B MCF7 ChIA-PET 22265404 TOLLIP 180727 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 1357863 1358286 1357997 Y TOLLIP,BRSK2 TOLLIP TOLLIP,LOC255512 K562 ChIA-PET 22265404 TOLLIP 28979 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 1409546 1409852 1409608 Y KRTAP5-1,KRTAP5-6,KRTAP5-5,KRTAP5-3 NA NA NA NA NA TOLLIP 80662 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 1412454 1412793 1412702 Y NA NA NA NA NA NA TOLLIP 83570 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 1569740 1569888 1569766 Y TNNT3,TNNI2,TNNI2,DUSP8 DUSP8 NA NA NA NA DUSP8 21262 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 1793842 1794035 1793938 Y TOLLIP,TNNI2,LSP1,CTSD,MOB2 RP11-295K3.1,CTSD,AC068580.7,RPL36AP39 MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2-AS1,INS-IGF2,IGF2 IMR90,MCF7,K562,H1ESC Hi-C,3C,ChIA-PET,5C 24141950,19890323,22265404,22955621 AC068580.7 3583 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 1804182 1804577 1804353 Y TOLLIP,TNNI2,LSP1 RP11-295K3.1,CTSD,AC068580.7,RPL36AP39,SYT8 MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2,IGF2-AS1,INS-IGF2,KRTAP5-4,SYT8 IMR90,GM12878,H1ESC,HELA,K562,MCF7 Hi-C,5C,ChIA-PET 24141950,22955621,22265404 AC068580.7 6564 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 1989837 1990190 1989954 Y IGF2,TSSC4,TH,IGF2,IGF2 MRPL23,MRPL23-AS1,H19 NA NA NA NA MRPL23-AS1 18960 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 2008416 2008795 2008568 Y NA MRPL23,MRPL23-AS1,H19 NA NA NA NA MRPL23-AS1 355 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 2009660 2010154 2009976 Y IGF2,IGF2,SYT8 MRPL23,MRPL23-AS1,H19 NA NA NA NA MRPL23-AS1 510 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr11 2176984 2177085 2177035 Y NA IGF2 NA NA NA NA IGF2 8151 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 2223798 2223980 2223871 Y ASCL2 NA NA NA NA NA IGF2 54965 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 2717684 2718130 2717946 Y TSSC4,TRPM5,KCNQ1 KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 1094 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 2919958 2920393 2920124 Y KCNQ1 CDKN1C,SLC22A18,SLC22A18AS,PHLDA2 NA NA NA NA SLC22A18 1007 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 2951529 2951649 2951619 Y KCNQ1,PHLDA2 CDKN1C,SLC22A18,SLC22A18AS,PHLDA2 NA NA NA NA PHLDA2 2844 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 3035655 3035952 3035816 Y MRGPRG NAP1L4,RNU1-91P,CARS NA NA NA NA NAP1L4 24048 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 3190882 3191107 3191009 Y NA OSBPL5 NA NA NA NA OSBPL5 4913 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 3833340 3833454 3833393 Y RRM1,NUP98,PGAP2,PGAP2,RHOG PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,MIR4687 NA NA NA NA NUP98 16318 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 6489893 6490567 6490471 Y OR56A4,OR56A1,OR56B4,OR52W1,OR2AG1,OR2AG2,OR10A5,OR10A4,OR10A2,OR6A2,DCHS1 TRIM3,ARFIP2 NA NA NA NA TRIM3 3122 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 8632537 8632549 8632543 Y ASCL3 NA NA NA NA NA RPL27A 69409 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 8723535 8723638 8723587 Y STK33 RPL27A NA NA NA NA RPL27A 21577 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr11 9250767 9251109 9250945 Y NA DENND5A NA NA NA NA DENND5A 33828 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 9385760 9386326 9386092 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 17843 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr11 9587499 9588027 9587720 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1 ZNF143,LOC644656 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 WEE1 5201 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr11 9590279 9590748 9590469 Y WEE1,WEE1 WEE1 LOC644656,ZNF143 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 WEE1 2480 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr11 10003812 10004242 10004040 Y ADM NA NA NA NA NA SBF2-AS1 225973 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr11 10323282 10323617 10323398 Y NA SBF2,RP11-351I24.1,ADM,AMPD3 NA NA NA NA RP11-351I24.1 31 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 10388178 10388602 10388329 Y ADM NA SBF2,ADM,LOC283104,AMPD3,MRVI1,MRVI1-AS1,CTR9,SWAP70,LOC440028 IMR90 Hi-C 24141950 AMPD3 60318 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 10397619 10397698 10397657 Y AMPD3 NA SBF2,SWAP70,LOC283104,ADM,LOC440028,AMPD3,RNF141,MRVI1-AS1,MRVI1,CTR9,MTRNR2L8 IMR90 Hi-C 24141950 AMPD3 69759 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 10510755 10511001 10510868 Y ZBED5 MTRNR2L8,RNF141,MRVI1-AS1 NA NA NA NA MTRNR2L8 17722 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 10549004 10549441 10549205 Y AMPD3,AMPD3,MRVI1,MRVI1,RNF141 MTRNR2L8,RNF141,MRVI1-AS1 NA NA NA NA RNF141 11336 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 10619660 10619757 10619708 Y NA NA NA NA NA NA MRVI1-AS1 58841 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 10633912 10633952 10633935 Y SBF2,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,RNF141 NA NA NA NA NA MRVI1-AS1 73093 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 10634601 10634999 10634904 Y MRVI1,MRVI1,MRVI1 NA NA NA NA NA MRVI1-AS1 73782 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 10681207 10681687 10681411 Y ADM,MRVI1,MRVI1 NA LYVE1,MRVI1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 CTR9 88847 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 10955517 10955651 10955533 Y NA CTD-2003C8.2 EIF4G2,MICALCL,CTR9,GALNTL4,LOC729013,ZBED5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2003C8.2 36648 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 12063877 12064119 12063998 Y NA DKK3,RP13-631K18.5,MICAL2 DKK3,MICAL2,USP47,CTR9,MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 DKK3 34561 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 12097914 12098716 12098251 Y PARVA,MICALCL,MICAL2 RP13-631K18.5,MICAL2 MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 RP13-631K18.5 7722 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 12101706 12102070 12101803 Y DKK3,DKK3,PARVA,MICALCL,MICAL2 RP13-631K18.5,MICAL2 MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 RP13-631K18.5 4368 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 12109558 12109847 12109697 Y PARVA,MICALCL,MICAL2 RP13-631K18.5,MICAL2 MICAL2,TEAD1,MICALCL,DKK3,USP47 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP13-631K18.5 3120 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 12111660 12111980 12111765 Y NA RP13-631K18.5,MICAL2 MICAL2,TEAD1,MICALCL,DKK3,USP47 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MICAL2 1563 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 12133218 12133350 12133292 Y MICAL2 RP13-631K18.5,MICAL2 NA NA NA NA MICAL2 19675 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 12184848 12185162 12185016 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 71305 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 12188567 12188982 12188726 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 75024 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr11 12197316 12197738 12197633 Y MICAL2,MICALCL NA NA NA NA NA MICAL2 83773 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr11 12199343 12199732 12199431 Y NA NA MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 MICAL2 85800 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 12204138 12204505 12204342 Y MICAL2,MICALCL NA NA NA NA NA MICAL2 90595 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr11 12309352 12309734 12309588 Y TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL NA NA NA NA NA PARVA 86998 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 12697923 12698543 12698251 Y PARVA,TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 3954 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 12772830 12773175 12773002 Y NA NA NA NA NA NA TEAD1 78861 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 12884715 12885004 12884787 Y NA NA NA NA NA NA RASSF10 143692 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 13189363 13189539 13189451 Y NA NA TEAD1,LOC100506305,ARNTL,RASSF10,BTBD10 IMR90 Hi-C 24141950 ARNTL 106660 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 13238046 13238305 13238120 Y NA NA ARNTL,BTBD10,LOC100506305 IMR90 Hi-C 24141950 ARNTL 57894 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr11 13283262 13283494 13283392 Y NA ARNTL ARNTL IMR90 Hi-C 24141950 ARNTL 12705 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 13299973 13300299 13300022 Y FAR1,ARNTL ARNTL NA NA NA NA ARNTL 3774 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 13373049 13373395 13373164 Y NA NA NA NA NA NA ARNTL 76850 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 14436782 14437066 14436859 Y NA NA RRAS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RRAS2 52730 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 14874249 14874576 14874405 Y CYP2R1 CYP2R1 NA NA NA NA CYP2R1 37222 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 16625688 16626709 16626131 Y SOX6,SOX6 C11orf58 SOX6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C11orf58 5970 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 16923588 16923993 16923817 Y NA NA NA NA NA NA RP11-466H18.1 70567 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 16945489 16945781 16945647 Y NA RP11-466H18.1 NA NA NA NA RP11-466H18.1 48779 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 17099866 17100401 17100030 Y NA SNORD14A,RPS13 NA NA NA NA RPS13 2532 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 18444585 18444736 18444661 Y SAAL1 LDHA,AC084117.3 NA NA NA NA AC084117.3 19429 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 19649981 19650160 19650072 Y NAV2 NA NA NA NA NA NAV2 279710 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 19701731 19702025 19701818 Y NA NA NA NA NA NA NAV2 331460 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 20072115 20072502 20072253 Y NA NA NA NA NA NA HTATIP2 310729 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 20618541 20618661 20618593 Y NA NA NA NA NA NA PRMT3 211465 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 27350498 27350718 27350608 Y BDNF CCDC34 NA NA NA NA CCDC34 32697 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr11 27657269 27657593 27657433 Y NA NA NA NA NA NA RP11-587D21.1 56042 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 27683148 27683223 27683174 Y NA NA NA NA NA NA BDNF 58382 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 27693843 27694020 27693988 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF BDNF NA NA NA NA BDNF 47585 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr11 27955713 27956134 27955920 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF RP11-1033A18.1 BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1033A18.1 45133 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 27956455 27956618 27956527 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF RP11-1033A18.1 BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1033A18.1 45875 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 28063321 28063497 28063482 Y NA NA NA NA NA NA METTL15 64298 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 28778513 28778891 28778701 Y NA NA BDNF,BDNF-AS1,KIF18A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 56351 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr11 28779294 28779601 28779473 Y NA NA BDNF,BDNF-AS1,KIF18A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 57132 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr11 28831581 28831914 28831617 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 109419 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 28855204 28855664 28855372 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 133042 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr11 28856336 28856685 28856610 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 134174 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 28857853 28858464 28857991 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 135691 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr11 28864582 28864807 28864697 Y NA NA BDNF,BDNF-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 142420 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 29332369 29332533 29332436 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 610207 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 32913428 32913828 32913453 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 704 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 32915475 32916456 32915913 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 2751 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 33146392 33146678 33146610 Y NA CSTF3 NA NA NA NA CSTF3 35239 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 33713598 33714029 33713919 Y CD59 CD59 NA NA NA NA CD59 41962 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 34272631 34272979 34272746 Y LMO2,LMO2,ABTB2 NA NA NA NA NA RP1-145M24.1 82571 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 34621875 34622041 34621973 Y ELF5,ELF5,EHF,EHF EHF APIP,EHF,CAT,PDHX,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 EHF 18599 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 34622320 34622551 34622432 Y ELF5,ELF5,EHF,EHF EHF APIP,EHF,SLC1A2,ELF5,CD44 IMR90 Hi-C 24141950 EHF 18089 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr11 34661390 34661585 34661450 Y ABTB2,ELF5,ELF5,EHF,EHF EHF NA NA NA NA EHF 20750 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 34675579 34675977 34675664 Y ABTB2,CD44 EHF NA NA NA NA EHF 34939 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr11 34701753 34702028 34701891 Y NA NA NA NA NA NA EHF 61113 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 34706877 34707176 34707110 Y ABTB2,EHF NA NA NA NA NA EHF 66237 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr11 35029453 35029465 35029458 Y NA NA NA NA NA NA APIP 93407 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 35052236 35052689 35052493 Y CD44 NA SLC1A2,CD44,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 CD44 105728 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 35061713 35062540 35061871 Y CD44 NA CD44,SLC1A2,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 CD44 95877 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 35099118 35099616 35099383 Y CD44 NA CD44,PDHX,APIP,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 CD44 58801 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr11 35103874 35105511 35104330 Y CD44 NA CD44,PDHX,APIP,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 CD44 52906 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr11 35132711 35132959 35132793 Y CD44 CD44 PDHX,CD44,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 CD44 25458 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 35188303 35189153 35188420 Y CD44 CD44 NA NA NA NA CD44 29886 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr11 35204984 35205337 35205050 Y CD44 CD44 NA NA NA NA CD44 46567 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 35297997 35298240 35298173 Y CD44,SLC1A2,SLC1A2 NA NA NA NA NA CD44 139580 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 36171228 36171637 36171430 Y TRAF6,COMMD9 NA NA NA NA NA COMMD9 137362 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 36521882 36522155 36522112 Y NA TRAF6 NA NA NA NA TRAF6 7667 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 37525697 37526074 37525816 Y NA NA NA NA NA NA C11orf74 911646 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 44239965 44240168 44240067 Y NA NA NA NA NA NA ALX4 89548 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 45067583 45067753 45067679 Y CD82 NA SYT13,LOC221122,TP53I11,PRDM11,TSPAN18,CHST1 IMR90 Hi-C 24141950 TP53I11 96743 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 45201958 45202605 45202216 Y NA NA NA NA NA NA TP53I11 231118 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr11 46258702 46259233 46258865 Y DGKZ NA PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DGKZ 93222 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 46264726 46265198 46265009 Y NA NA DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DGKZ 87257 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 46538668 46539048 46538858 Y NA NA NA NA NA NA AMBRA1 74627 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 47125777 47126225 47125967 Y NA NA NA NA NA NA ARFGAP2 70451 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 47208524 47208884 47208580 Y PACSIN3,PACSIN3,NR1H3 ARFGAP2,PACSIN3,DDB2 NA NA NA NA PACSIN3 2530 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 47412671 47413114 47412745 Y MADD,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1 SLC39A13,PSMC3 SPI1,SLC39A13 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC39A13 13569 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 47787265 47787534 47787400 Y SPI1,CELF1,CELF1,CELF1,PTPRJ,FNBP4 FNBP4 NA NA NA NA FNBP4 270 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 47789923 47790126 47789984 Y NA FNBP4 NA NA NA NA FNBP4 2928 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 48063635 48064268 48063917 Y NA NA NA NA NA NA PTPRJ 63522 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 57083068 57083441 57083322 Y NA TNKS1BP1,SSRP1 NA NA NA NA TNKS1BP1 6985 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 57242995 57243389 57243187 Y OR5AK2,SSRP1,BTBD18,UBE2L6 SLC43A3,RTN4RL2,SLC43A1 NA NA NA NA RTN4RL2 16973 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 57546018 57546724 57546105 Y MED19,C11orf31 C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 27303 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr11 57549936 57550183 57550060 Y NA C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 31221 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 57559748 57559971 57559868 Y SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,UBE2L6,CLP1,ZDHHC5 CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 41033 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 58340867 58341571 58341167 Y OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF NA NA NA NA LPXN 2122 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr11 59331910 59331948 59331929 Y OR5AN1,OR4D6,OR4D11 OSBP NA NA NA NA OSBP 49669 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 59537612 59537828 59537719 Y PATL1,STX3 MRPL16 NA NA NA NA MRPL16 38517 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 60683096 60683305 60683236 Y CYBASC3,CYBASC3,CD5,SLC15A3,CD6 PRPF19,TMEM109,TMEM132A NA NA NA NA TMEM109 3750 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 60753567 60754105 60753691 Y SDHAF2,CD5,CD6 NA NA NA NA NA TMEM132A 63632 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr11 60877687 60877932 60877809 Y CD6,CD5 VPS37C NA NA NA NA VPS37C 49157 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 60931528 60932206 60931841 Y SLC15A3,SDHAF2,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,VPS37C VPS37C VPS37C K562 ChIA-PET 22265404 VPS37C 4439 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 60934770 60935212 60935096 Y SLC15A3,TMEM138,SDHAF2,CYBASC3,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,VPS37C VPS37C VPS37C K562 ChIA-PET 22265404 VPS37C 7681 CAGE SAS hg19 FANTOM5 6.90609261352255 chr11 61065380 61065516 61065448 Y NA DAK,DDB1 NA NA NA NA DAK 33166 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 61074897 61075402 61075197 Y CD6 DAK,DDB1 NA NA NA NA DAK 23280 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 61463458 61463769 61463630 Y CYBASC3,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,SDHAF2,FTH1,DAGLA DAGLA NA NA NA NA DAGLA 17553 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 61467819 61468013 61467906 Y CYBASC3,SDHAF2,FTH1,DAGLA DAGLA NA NA NA NA DAGLA 21914 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 61523945 61524112 61524089 Y INCENP,DAK,C11orf9 FEN1,TMEM258 NA NA NA NA FEN1 33997 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 61738760 61739751 61739487 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 5628 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 61739990 61740514 61740301 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 6858 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 61780516 61780626 61780618 Y NA FTH1 FADS1,BEST1,FTH1,FADS3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FTH1 47384 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 61781118 61781313 61781282 Y DAGLA,FTH1 FTH1 FADS1,BEST1,FTH1,FADS3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FTH1 47986 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr11 62248272 62248499 62248283 Y NA NA NA NA NA NA RP11-864I4.4 62972 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 62272728 62273223 62272788 Y ROM1 RP11-864I4.4,AHNAK NA NA NA NA RP11-864I4.4 38248 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 62306762 62307027 62306934 Y WDR74,STX5,NXF1,EML3,AHNAK RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654 NA NA NA NA RP11-864I4.4 4444 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 62311446 62311797 62311501 Y WDR74,STX5,NXF1,AHNAK AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1 NA NA NA NA RP11-864I4.4 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr11 62312037 62312397 62312245 Y WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1 NA NA NA NA RP11-864I4.4 566 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 62320979 62321244 62321106 Y NA RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 NA NA NA NA AHNAK 463 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 62321348 62321821 62321541 Y NA RP11-864I4.4,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 NA NA NA NA AHNAK 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 62625165 62625549 62625272 Y TUT1,METTL12,HNRNPUL2,SLC3A2 STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA SLC3A2 3647 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 63328335 63328557 63328446 Y NA RARRES3 NA NA NA NA RARRES3 26054 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 63334518 63335083 63334716 Y RARRES3,OTUB1 RARRES3,PLA2G16 NA NA NA NA RARRES3 32237 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 63337722 63338129 63338119 Y NA RARRES3,PLA2G16 NA NA NA NA RARRES3 35441 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr11 63639638 63639903 63639715 Y NA MARK2,RCOR2 NA NA NA NA MARK2 35238 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 63686695 63687182 63686923 Y NA RCOR2,NAA40 NA NA NA NA RCOR2 4379 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 63744435 63744483 63744459 Y KCNK4 NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1 NA NA NA NA AP000721.4 4343 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 63775286 63775368 63775342 Y KCNK4 COX8A,AP000721.4,OTUB1 NA NA NA NA OTUB1 23961 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 63858567 63858836 63858756 Y NA NA NA NA NA NA MACROD1 72742 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 63949132 63949273 63949224 Y NA MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4 NA NA NA NA STIP1 1471 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 64102702 64102834 64102750 Y NA ESRRA,TRMT112,PRDX5,RPS6KA4 NA NA NA NA PRDX5 19142 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 64125464 64125650 64125510 Y MARK2,NUDT22,FKBP2,PPP1R14B,PLCB3,BAD,ESRRA,TRMT112,PRDX5,CDC42BPG,RPS6KA4 TRMT112,PRDX5,RPS6KA4 NA NA NA NA RPS6KA4 844 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr11 64205023 64205244 64205073 Y CDC42BPG,RPS6KA4 NA NRXN2,SLC22A12,RASGRP2,PYGM IMR90,K562,H1ESC,HELA,GM12878 Hi-C,5C 24141950,22955621 RPS6KA4 80403 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 64427372 64427588 64427564 Y BATF2 NA NA NA NA NA NRXN2 61072 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 64631898 64632818 64632128 Y CDC42EP2,FAU,EHD1 CDC42BPG,EHD1,ATG2A NA NA NA NA EHD1 20950 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 65076655 65076852 65076688 Y EHD1,BATF2,FAU,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2,TIGD3 NA NA NA NA CDC42EP2 3437 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 65185589 65187086 65186338 Y NA FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 1159 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr11 65187297 65188198 65187553 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 47 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.33916040135441 chr11 65239550 65239870 65239751 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1 TIGD3,SCYL1 K562 ChIA-PET 22265404 AP000769.1 18822 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.55944026756961 chr11 65254949 65255610 65255242 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 7623 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 65259217 65259522 65259389 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 3711 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 65261229 65261625 65261527 Y CDC42EP2 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 1608 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr11 65261988 65262329 65262152 Y FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 904 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.34165771622059 chr11 65323331 65323567 65323509 Y FOSL1 SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1 NA NA NA NA LTBP3 834 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr11 65333490 65333816 65333671 Y SLC25A45,SIPA1,SIPA1,EIF1AD,CTSW,PCNXL3 SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3 NA NA NA NA SSSCA1 2085 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 65419981 65420225 65420142 Y CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 8340 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr11 65420425 65420654 65420491 Y TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 7911 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr11 65492459 65492791 65492625 Y NA KAT5,RNASEH2C RNASEH2C MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RNASEH2C 6041 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 65537213 65537543 65537499 Y NA OVOL1 NA NA NA NA OVOL1 14950 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 65559034 65559399 65559282 Y NA OVOL1 NA NA NA NA OVOL1 6541 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 65656792 65657262 65656985 Y NA MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA CCDC85B 917 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 65666492 65667203 65666864 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 448 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr11 65670692 65670945 65670845 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1 MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 4648 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 65678943 65679154 65679019 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,CFL1,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,KLC2,FOSL1,SART1,DRAP1,C11orf68,BANF1 EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 5434 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr11 65679250 65679576 65679373 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1 EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 5012 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 65683105 65683625 65683322 Y NA EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 963 CAGE SAS hg19 FANTOM5 5.45804093649363 chr11 65782974 65783337 65783107 Y FOSL1 BANF1,EIF1AD,CST6,CATSPER1,SF3B2 NA NA NA NA CST6 5662 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr11 65894211 65894464 65894385 Y NA NA RAB1B,KLC2 IMR90 Hi-C 24141950 PACS1 58377 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 65910089 65910568 65910423 Y NA NA KLC2 IMR90 Hi-C 24141950 PACS1 74255 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 66118604 66119022 66118907 Y NA RP11-867G23.13,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2,RNU1-84P NA NA NA NA RP11-867G23.8 5183 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 66221780 66221966 66221875 Y RBM4 RP11-867G23.10,MRPL11,PELI3,DPP3,CTD-3074O7.5 PELI3,DPP3 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL11 10243 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 66494780 66495327 66494982 Y SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2 C11orf80 C11orf80 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 C11orf80 14595 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr11 66801218 66801427 66801323 Y SYT12,SYT12 SYT12,RHOD NA NA NA NA RHOD 20862 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 66844888 66845141 66844944 Y RHOD RHOD,KDM2A NA NA NA NA RHOD 22599 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 66845381 66845631 66845497 Y TMEM134,SSH3,RHOD RHOD,KDM2A NA NA NA NA RHOD 23092 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr11 66845907 66846062 66845990 Y PITPNM1,CLCF1,CLCF1,RBM4,KDM2A,ADRBK1,RHOD RHOD,KDM2A NA NA NA NA RHOD 23618 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr11 67103841 67103862 67103852 Y NA ANKRD13D,SSH3,POLD4,AP003419.11 NA NA NA NA POLD4 18581 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 67138301 67138677 67138619 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 378 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 67138852 67139479 67139267 Y NA POLD4,RAD9A,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr11 67139742 67140272 67140082 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 687 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.33916040135441 chr11 67142500 67143040 67142970 Y CDK2AP2,CLCF1,PPP1CA POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 3445 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chr11 67143202 67143472 67143423 Y CLCF1 POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 4147 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr11 67146992 67147327 67147282 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA,RPS6KB2 NA NA NA NA AP003419.11 7937 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr11 67827034 67827402 67827396 Y PPP6R3,ACY3,SUV420H1,CHKA NDUFS8,TCIRG1 NA NA NA NA TCIRG1 22551 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 67955066 67955423 67955397 Y TCIRG1,SUV420H1 SUV420H1 NA NA NA NA SUV420H1 23872 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 68099033 68099353 68099110 Y NA LRP5 NA NA NA NA LRP5 20956 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 68110280 68110464 68110374 Y NA LRP5 PPP6R3 IMR90 Hi-C 24141950 LRP5 32203 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 68147876 68148306 68148095 Y NA NA NA NA NA NA LRP5 69799 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 68238826 68238975 68238901 Y TCIRG1,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,IGHMBP2,PPP6R3 PPP6R3 NA NA NA NA PPP6R3 12640 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 68608164 68608616 68608368 Y NA CPT1A NA NA NA NA CPT1A 1262 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 69067534 69068152 69067999 Y TPCN2 MYEOV NA NA NA NA MYEOV 7929 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 69069179 69069344 69069260 Y TPCN2 MYEOV NA NA NA NA MYEOV 9574 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 69069522 69069665 69069598 Y TPCN2 MYEOV NA NA NA NA MYEOV 9917 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr11 69089155 69089700 69089444 Y MRGPRD MYEOV CCND1 MCF7 ChIA-PET 22265404 MYEOV 29550 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 69182957 69183170 69183095 Y ORAOV1,CCND1,MYEOV NA CCND1,MYEOV MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AP000439.2 74341 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr11 69197125 69197542 69197234 Y ORAOV1,MYEOV NA MYEOV,CCND1 IMR90 Hi-C 24141950 AP000439.2 59969 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr11 69258094 69258432 69258217 Y CCND1 AP000439.2 CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP000439.2 583 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 69451342 69451588 69451394 Y NA CCND1,ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 2267 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr11 69453520 69454472 69453912 Y NA ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr11 69639961 69640299 69640038 Y NA NA FGF3 K562 ChIA-PET 22265404 ORAOV1 151777 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 69794643 69794820 69794756 Y FADD,ANO1 NA ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD IMR90 Hi-C 24141950 ANO1 127588 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 70005779 70006157 70005922 Y ANO1,CTTN,PPFIA1,FADD FADD NA NA NA NA FADD 41112 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 70079442 70079825 70079633 Y ANO1,CTTN,FADD,PPFIA1 FADD,PPFIA1 FADD,PPFIA1,ORAOV1,ANO1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FADD 32173 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 70162610 70162835 70162663 Y PPFIA1 PPFIA1 NA NA NA NA PPFIA1 47804 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 70245269 70246141 70245676 Y ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN CTTN,AP000487.5 NA NA NA NA AP000487.5 2675 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chr11 71769812 71769929 71769891 Y NA LRTOMT,NUMA1,LAMTOR1 NA NA NA NA LRTOMT 19453 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 71892346 71892672 71892509 Y NA INPPL1 RNF121,NUMA1,LRTOMT,LAMTOR1,C11orf51,FOLR3,FOLR1 IMR90 Hi-C 24141950 INPPL1 40073 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 71936800 71937067 71937009 Y INPPL1 INPPL1 NA NA NA NA INPPL1 4055 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 72381210 72381586 72381345 Y NA PDE2A NA NA NA NA PDE2A 2049 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 72904950 72905270 72905106 Y NA P2RY2 FCHSD2,ATG16L2,P2RY6,ARAP1,P2RY2,STARD10,MIR4692,RELT IMR90,MCF7 Hi-C,3C,ChIA-PET 24141950,19890323,22265404 P2RY2 22073 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 72906397 72906513 72906453 Y NA P2RY2 FCHSD2,ATG16L2,P2RY6,ARAP1,P2RY2,STARD10,MIR4692,RELT IMR90,MCF7 Hi-C,3C,ChIA-PET 24141950,19890323,22265404 P2RY2 20830 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr11 72953792 72954055 72953924 Y NA P2RY2 NA NA NA NA P2RY2 26449 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 73036125 73036359 73036193 Y NA ARHGEF17,RELT NA NA NA NA ARHGEF17 18791 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 73088357 73088912 73088439 Y NA RELT NA NA NA NA RELT 3048 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr11 73490470 73490918 73490608 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 5443 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 74257729 74258089 74257917 Y KCNE3 NA KCNE3,P4HA3,LIPT2,PPME1,C2CD3,CHRDL2,RNF169,POLD3,PGM2L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 POLD3 54833 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 74465903 74466299 74466070 Y POLD3,RNF169 RP11-864N7.2,RNF169 XRRA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF169 7990 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.4505489918951 chr11 74608675 74608873 74608772 Y NA XRRA1,SPCS2 NA NA NA NA XRRA1 49372 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 74667774 74667939 74667906 Y RNF169 XRRA1,SPCS2,NEU3 NA NA NA NA SPCS2 9482 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 74857404 74857707 74857556 Y SLCO2B1 NA NA NA NA NA NEU3 160225 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 75061558 75062072 75061823 Y NA ARRB1,RPS3 NA NA NA NA ARRB1 685 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 75248214 75248465 75248264 Y UVRAG GDPD5,SERPINH1 GDPD5,RPS3,KLHL35,SERPINH1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GDPD5 13266 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 75482683 75483095 75482909 Y UVRAG,DGAT2 UVRAG,RP11-535A19.2 NA NA NA NA UVRAG 41117 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 75919893 75920246 75919996 Y WNT11 WNT11 NA NA NA NA WNT11 113 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr11 76510532 76510646 76510589 Y NA TSKU,RP11-21L23.3 NA NA NA NA RP11-21L23.3 18426 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 76534548 76534939 76534880 Y GDPD4 TSKU,RP11-21L23.3,ACER3 ACER3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACER3 34972 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr11 76574228 76574537 76574458 Y OMP,ACER3 ACER3 NA NA NA NA ACER3 4317 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 76721586 76721786 76721728 Y ACER3 NA NA NA NA NA CAPN5 54193 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 76802149 76802401 76802277 Y NA CAPN5 NA NA NA NA CAPN5 26170 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr11 77898869 77899120 77899016 Y RSF1,INTS4 USP35,KCTD21 NA NA NA NA KCTD21 1001 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 78426480 78426845 78426663 Y NA NA NA NA NA NA NARS2 142561 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 79130045 79130391 79130200 Y NA NA NA NA NA NA NARS2 846126 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 79794635 79795000 79794859 Y NA NA NA NA NA NA NARS2 1510716 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.78471476351716 chr11 82601745 82602138 82601973 Y NA C11orf82 NA NA NA NA C11orf82 6879 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 83278002 83278167 83278160 Y NA NA NA NA NA NA CCDC90B 282552 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr11 84093911 84093923 84093916 Y NA NA NA NA NA NA CCDC90B 1098461 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 85555514 85555895 85555623 Y NA SYTL2,AP000974.1 SYTL2,CCDC83,CCDC89,PICALM,EED IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP000974.1 8091 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 85702937 85703343 85703240 Y NA NA NA NA NA NA PICALM 75581 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 85854221 85854449 85854330 Y PICALM NA PICALM,EED IMR90 Hi-C 24141950 PICALM 75297 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 85856091 85856269 85856153 Y NA NA PICALM,EED,CCDC83 IMR90 Hi-C 24141950 PICALM 77167 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 85873395 85873578 85873505 Y PICALM,PICALM NA PICALM,EED,CCDC83 IMR90 Hi-C 24141950 EED 80008 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 86222200 86222363 86222315 Y NA NA NA NA NA NA C11orf73 210947 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 86343883 86344000 86343960 Y NA NA NA NA NA NA PRSS23 156101 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 86454484 86454767 86454607 Y NA PRSS23 PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 45334 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr11 86454778 86455149 86454967 Y PRSS23 PRSS23 PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 44952 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 87906798 87907204 87907016 Y RAB38 RAB38 NA NA NA NA RAB38 163 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 88071526 88071793 88071707 Y NA CTSC NA NA NA NA CTSC 2571 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 88154831 88155112 88154926 Y NA NA NA NA NA NA CTSC 85876 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 91980380 91980674 91980445 Y FAT3 NA NA NA NA NA SLC36A4 948456 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 92767972 92767992 92767983 Y NA NA SLC36A4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC36A4 161138 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 93253925 93254245 93254149 Y SLC36A4,C11orf75 RP11-288E14.2 NA NA NA NA RP11-288E14.2 12389 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 93446176 93446355 93446266 Y NA SCARNA9,SNORD5,C11orf54 NA NA NA NA SCARNA9 6324 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr11 93863761 93864262 93864073 Y MED17,FUT4,PANX1 PANX1 NA NA NA NA PANX1 3667 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 94480491 94481212 94480556 Y AMOTL1 AMOTL1 AMOTL1,PIWIL4 IMR90 Hi-C 24141950 AMOTL1 42894 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 94826878 94826962 94826902 Y NA SRSF8,ENDOD1 NA NA NA NA ENDOD1 5904 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 94882788 94883137 94883023 Y NA NA NA NA NA NA ENDOD1 61814 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 95557234 95557451 95557366 Y NA CEP57,FAM76B NA NA NA NA FAM76B 35661 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 95886290 95886343 95886317 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 188001 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 95888064 95888524 95888506 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 185820 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 95963875 95964372 95964111 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 109972 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 95976157 95976737 95976478 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 97607 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 95994127 95994433 95994401 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 79911 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 95996412 95996766 95996624 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 77578 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 96040167 96040456 96040282 Y MAML2 MAML2 NA NA NA NA MAML2 33888 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr11 102042993 102043398 102043047 Y C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1 NA NA NA NA NA YAP1 63801 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr11 102216514 102216961 102216815 Y TMEM123,BIRC3,BIRC2 BIRC3,BIRC2 NA NA NA NA BIRC2 572 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 102431578 102431954 102431771 Y NA MMP7 NA NA NA NA MMP7 32094 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 103316988 103317242 103317115 Y NA RP11-37O16.8 NA NA NA NA RP11-37O16.8 38603 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 104838372 104838510 104838471 Y CARD17,CASP5,CARD16,CASP4,CASP4 CASP4 NA NA NA NA CASP4 209 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 107727726 107727971 107727842 Y NA RP11-832N8.1 NA NA NA NA RP11-832N8.1 49175 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 109957593 109958086 109957862 Y FDX1,ZC3H12C ZC3H12C ZC3H12C IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZC3H12C 4001 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 109966397 109966711 109966537 Y NA ZC3H12C NA NA NA NA ZC3H12C 4310 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 111990651 111990899 111990830 Y NA C11orf57,PIH1D2,TIMM8B,SDHD,IL18 NA NA NA NA SDHD 35024 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 112028082 112028533 112028265 Y IL18 IL18,BCO2 NA NA NA NA IL18 4307 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 113828537 113828676 113828607 Y NA NA NA NA NA NA USP28 84245 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 113945404 113945849 113945581 Y ZBTB16,ZBTB16 NA NA NA NA NA NNMT 180660 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 114033536 114034161 114033636 Y ZBTB16,ZBTB16 NA NA NA NA NA NNMT 92348 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 114037766 114038216 114037805 Y NA NA NA NA NA NA NNMT 88293 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 114086670 114086890 114086745 Y ZBTB16,ZBTB16 NNMT NA NA NA NA NNMT 39619 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 114162155 114162496 114162247 Y NA NNMT NA NA NA NA NNMT 35646 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 114162667 114162750 114162694 Y NA NNMT NA NA NA NA NNMT 36158 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 114162916 114163328 114163238 Y NA NNMT NA NA NA NA NNMT 36407 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr11 114224881 114225192 114225037 Y NA RBM7,C11orf71 FAM55B,REXO2,C11orf71,RBM7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBM7 43560 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 115017644 115017889 115017764 Y NA NA NA NA NA NA REXO2 709536 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 116723326 116723638 116723620 Y SIK3 NA NA NA NA NA ZNF259 66560 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 116857252 116857500 116857432 Y SIK3 AP000936.1 NA NA NA NA AP000936.1 47267 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 117819938 117820147 117820063 Y IL10RA TMPRSS13,IL10RA FXYD6-FXYD2,DSCAML1,TMPRSS13,IL10RA IMR90 Hi-C 24141950 TMPRSS13 21764 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 118153348 118153551 118153451 Y NA MPZL3,MPZL2 AMICA1 IMR90 Hi-C 24141950 MPZL2 20097 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 118481750 118482023 118481896 Y PHLDB1 ARCN1,IFT46,PHLDB1 NA NA NA NA PHLDB1 6595 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 118490168 118490609 118490335 Y PHLDB1 ARCN1,IFT46,PHLDB1 NA NA NA NA PHLDB1 15013 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 118493108 118493651 118493460 Y NA PHLDB1 NA NA NA NA PHLDB1 17953 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 118493849 118494041 118493911 Y NA PHLDB1 NA NA NA NA PHLDB1 18694 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 118782911 118783378 118783221 Y SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84 MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 3494 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.67332617297647 chr11 118783640 118784096 118783954 Y NA MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 4223 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 118790377 118790895 118790660 Y NA MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA UPK2 2978 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 118791529 118792348 118792152 Y PHLDB1,BCL9L MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA UPK2 1525 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 118793665 118793922 118793750 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA UPK2 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 118794621 118795305 118795013 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84 MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 304 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 118800245 118800827 118800413 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84 MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5928 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 118800879 118801266 118801161 Y MLL,DDX6,VPS11,CBL,CXCR5,CXCR5,CCDC84 MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 6562 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 119241226 119241377 119241346 Y NA RNF26,USP2-AS1 NA NA NA NA USP2-AS1 9111 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 119461410 119461749 119461531 Y CBL KRT8P7 LOC100499227,USP2,PVRL1,TRIM29,GRIK4 IMR90 Hi-C 24141950 KRT8P7 11269 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 119540378 119540644 119540511 Y NA NA NA NA NA NA PVRL1 57150 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 119562613 119562997 119562902 Y TRIM29,PVRL1 PVRL1 NA NA NA NA PVRL1 34797 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr11 119590581 119590962 119590870 Y NA PVRL1 NA NA NA NA PVRL1 6832 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 119722087 119722432 119722260 Y NA NA NA NA NA NA PVRL1 124293 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 121526040 121526695 121526415 Y NA NA NA NA NA NA SORL1 205128 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 121593077 121593718 121593342 Y NA NA MIR100HG,MIR125B1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 272165 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 122608190 122608588 122608260 Y NA NA NA NA NA NA UBASH3B 83807 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 122614600 122615453 122614815 Y NA NA NA NA NA NA UBASH3B 90217 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 122940079 122940521 122940200 Y NA RPL34P23,SNORD14D,SNORD14C,HSPA8 NA NA NA NA HSPA8 8141 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 123350505 123350682 123350594 Y NA NA CLMP,MIR4493,GRAMD1B IMR90 Hi-C 24141950 ZNF202 259701 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 123394284 123394590 123394437 Y NA NA NA NA NA NA ZNF202 215793 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 124514246 124514548 124514258 Y OR8G1,OR8D1,OR8D2,OR8B4,OR8B8,OR8B12,OR8A1 TBRG1,SPA17,SIAE NA NA NA NA TBRG1 23514 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 124611800 124612504 124612072 Y NA SIAE,NRGN,RP11-677M14.3 NA NA NA NA NRGN 4058 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 124668888 124669222 124669022 Y NA RP11-677M14.3 NA NA NA NA RP11-677M14.3 41863 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 125937888 125938141 125938004 Y NA CDON,NAP1L1P1 NA NA NA NA NAP1L1P1 2454 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 126180283 126180636 126180409 Y NA FOXRED1,SRPR,TIRAP,DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4 NA NA NA NA RP11-712L6.5 8070 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 126506687 126507034 126506855 Y NA NA NA NA NA NA ST3GAL4 283152 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 128078462 128078679 128078487 Y NA NA FLI1,ETS1,KCNJ1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 376774 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 128318387 128318699 128318622 Y NA NA NA NA NA NA ETS1 136754 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 128323342 128323695 128323510 Y NA NA NA NA NA NA ETS1 131758 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr11 128339730 128340284 128340256 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 115169 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 128341794 128342415 128342241 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 113038 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 128346619 128346923 128346838 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 108530 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 128366966 128367159 128367092 Y ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 88294 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 128367325 128367539 128367441 Y NA NA NA NA NA NA ETS1 87914 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 128376891 128377234 128377096 Y ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 78219 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 128377315 128377487 128377422 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 77966 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 128385518 128386026 128385881 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 69427 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 128388897 128389626 128389454 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 65827 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 128445940 128446213 128446123 Y FLI1,FLI1 ETS1 NA NA NA NA ETS1 9240 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 128579282 128579748 128579400 Y FLI1,FLI1 FLI1 NA NA NA NA FLI1 24852 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 128584156 128584534 128584279 Y NA FLI1 NA NA NA NA FLI1 29726 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 128589113 128589189 128589151 Y NA FLI1 NA NA NA NA FLI1 34683 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 128596798 128597188 128596845 Y FLI1,FLI1 FLI1 NA NA NA NA FLI1 42368 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 129013172 129013631 129013445 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP32 133588 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 129507501 129507545 129507523 Y BARX2,NFRKB NA BARX2 IMR90 Hi-C 24141950 NFRKB 255940 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 129509159 129509661 129509390 Y BARX2 NA BARX2 IMR90 Hi-C 24141950 NFRKB 253824 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 129601384 129601709 129601599 Y NFRKB NA BARX2,ARHGAP32 IMR90 Hi-C 24141950 NFRKB 161776 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr11 129723853 129724184 129723902 Y NFRKB NFRKB NA NA NA NA NFRKB 39301 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 129781322 129781453 129781412 Y APLP2 NFRKB NA NA NA NA NFRKB 17837 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 129871629 129871941 129871631 Y NA PRDM10,TCEB2P2 NA NA NA NA PRDM10 899 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 129942098 129942391 129942179 Y PRDM10 TCEB2P2,APLP2 NA NA NA NA APLP2 4366 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 129993921 129994394 129994167 Y PRDM10,APLP2 ST14 NA NA NA NA ST14 33063 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 130016455 130016576 130016492 Y NA ST14 NA NA NA NA ST14 10881 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 130697653 130698000 130697725 Y NA NA ADAMTS15,ADAMTS8 IMR90 Hi-C 24141950 SNX19 86404 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 130767627 130768066 130767878 Y NA SNX19 NA NA NA NA SNX19 16338 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr11 131288211 131288548 131288380 Y NA NA NA NA NA NA SNX19 503807 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 131614771 131614965 131614935 Y NTM NA NA NA NA NA SNX19 830367 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 131755784 131755805 131755794 Y NA NA NA NA NA NA SNX19 971380 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 132411283 132411428 132411357 Y NA NA NA NA NA NA IGSF9B 1413452 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 133825450 133825979 133825755 Y NA IGSF9B NA NA NA NA IGSF9B 570 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr11 134124453 134124658 134124640 Y NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2 VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8 NA NA NA NA ACAD8 3064 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr12 680187 680377 680237 Y NA NA NA NA NA NA RP11-218M22.1 57680 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 864034 864343 864158 Y CCDC77,KDM5A WNK1 NA NA NA NA WNK1 4275 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 1029926 1030313 1030120 Y WNK1 NA NA NA NA NA RAD52 66906 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 1428527 1428661 1428594 Y ERC1 NA NA NA NA NA WNT5B 208396 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 1583254 1583583 1583419 Y NA NA LOC100292680 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5B 53474 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 1698978 1699322 1699295 Y NA FBXL14 NA NA NA NA FBXL14 2009 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 1714275 1714637 1714592 Y NA FBXL14 FBXL14,RAD52,ERC1,WNT5B,WNK1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FBXL14 12944 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 1770869 1771337 1771069 Y LRTM2,ADIPOR2 ADIPOR2 NA NA NA NA ADIPOR2 24403 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 2749982 2750016 2749999 Y NA NA NA NA NA NA FKBP4 152103 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 3326549 3326840 3326665 Y TSPAN9 RP11-543P15.1 NA NA NA NA RP11-543P15.1 7453 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 3420231 3420354 3420293 Y PRMT8 NA NA NA NA NA PRMT8 68161 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 3563518 3563854 3563701 Y NA NA NA NA NA NA PRMT8 75003 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr12 3948349 3948613 3948479 Y NA PARP11 NA NA NA NA PARP11 31995 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 4115951 4116335 4116221 Y NA NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 PARP11 135343 CAGE SAS hg19 FANTOM5 22.3891066986779 chr12 4120809 4121079 4120983 Y NA NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 PARP11 140201 CAGE SAS hg19 FANTOM5 11.0274704635279 chr12 4140182 4140815 4140542 Y CCND2,PARP11 NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 PARP11 159574 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.56443489730196 chr12 4216621 4216774 4216698 Y NA NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 CCND2 164164 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 4224292 4224419 4224354 Y CCND2 NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 CCND2 156519 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr12 4225746 4226120 4225854 Y NA NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 CCND2 154818 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.78221744865098 chr12 4252128 4252433 4252201 Y EFCAB4B,PARP11,CCND2,C12orf4 NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 CCND2 128505 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr12 4262574 4262924 4262750 Y EFCAB4B,PARP11,C12orf4 NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 CCND2 118014 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 4274113 4274463 4274167 Y CCND2 NA NA NA NA NA CCND2 106475 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr12 4287687 4287885 4287726 Y NA NA NA NA NA NA CCND2 93053 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.55944026756961 chr12 4313058 4313407 4313227 Y CCND2 NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 CCND2 67531 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 4378284 4379414 4378568 Y PARP11,C12orf4,CCND2,C12orf5 CCND2,CCND2-AS2,C12orf5 PARP11 IMR90 Hi-C 24141950 CCND2 1524 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 4380607 4381576 4381205 Y PARP11,CCND2 CCND2-AS2,C12orf5 NA NA NA NA CCND2 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 5198025 5198415 5198167 Y NA NA NTF3,KCNA6,ANO2,VWF IMR90 Hi-C 24141950 NTF3 340863 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 5542952 5543350 5543174 Y NTF3,NTF3 NTF3 NA NA NA NA NTF3 3674 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 5566178 5566568 5566311 Y NTF3 NTF3 NA NA NA NA NTF3 26900 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 5915509 5915755 5915702 Y NA NA NA NA NA NA ANO2 137643 CAGE SAS hg19 FANTOM5 21.7207751554338 chr12 5918139 5918518 5918331 Y NA NA NA NA NA NA ANO2 134880 CAGE SAS hg19 FANTOM5 4.0099892594647 chr12 6187612 6187773 6187703 Y NA NA NA NA NA NA CD9 119108 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 6193943 6194225 6194059 Y NA NA NA NA NA NA CD9 112656 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 6202352 6202551 6202452 Y CD9,ANO2 NA NA NA NA NA CD9 104330 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 6276820 6277298 6277162 Y VAMP1,TNFRSF1A,TAPBPL CD9 VWF,CD9,PLEKHG6 IMR90 Hi-C 24141950 CD9 29583 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 6291358 6291755 6291562 Y VWF,CD9 CD9 VWF,PLEKHG6,CD9 IMR90 Hi-C 24141950 CD9 15126 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr12 6304942 6305291 6305114 Y NA CD9 NA NA NA NA CD9 1590 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 6311406 6311775 6311432 Y NA CD9 NA NA NA NA CD9 4525 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 6325035 6325634 6325452 Y NA CD9 NA NA NA NA CD9 18154 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr12 6335136 6335793 6335267 Y SCNN1A CD9 NA NA NA NA CD9 28255 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 6387822 6388153 6388049 Y NA PLEKHG6 VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLEKHG6 29449 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 6389072 6389528 6389363 Y CD9,PLEKHG6,PLEKHG6 PLEKHG6 VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLEKHG6 28074 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr12 6403662 6404056 6403860 Y PLEKHG6,PLEKHG6,PLEKHG6 PLEKHG6,TNFRSF1A VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2 IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHG6 13546 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 6404239 6404667 6404531 Y NA PLEKHG6,TNFRSF1A VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2 IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHG6 12935 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr12 6445143 6445640 6445507 Y VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A NA NA NA NA TNFRSF1A 3640 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 6482550 6482923 6482687 Y SCNN1A,SCNN1A TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A TNFRSF1A K562 ChIA-PET 22265404 LTBR 339 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 6622889 6622901 6622895 Y NA VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH NA NA NA NA SCARNA10 5501 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 6717352 6717716 6717682 Y SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP NOP2,CHD4,LPAR5 NA NA NA NA CHD4 2710 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr12 6962211 6962407 6962304 Y GAPDH,COPS7A,COPS7A,COPS7A,COPS7A,LEPREL2,USP5,USP5,TPI1,TPI1 LEPREL2,CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2 NA NA NA NA USP5 2919 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 7034730 7034838 7034794 Y ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1 SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2 NA NA NA NA ATN1 3104 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 7058563 7058923 7058712 Y PEX5,VAMP1,CD4,CD4,PTPN6 ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,C1S NA NA NA NA RNU7-1 7584 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 7100414 7100432 7100423 Y NA RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3 NA NA NA NA C1S 6063 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 8123169 8123746 8123395 Y CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3 SLC2A3 SLC2A3,FOXJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC2A3 36298 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 8825073 8825336 8825205 Y CLEC6A,CLEC4D,CLEC4E,M6PR RP11-438L7.3,RIMKLB NA NA NA NA RIMKLB 6860 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 8840377 8840836 8840579 Y RIMKLB RIMKLB RIMKLB MCF7 ChIA-PET 22265404 RIMKLB 8181 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 9057442 9057557 9057500 Y CLEC6A,CLEC4D,CLEC4E,PHC1,M6PR M6PR NA NA NA NA M6PR 42994 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 9308932 9309318 9309073 Y KLRB1,M6PR,KLRG1,PZP A2M NA NA NA NA A2M 42107 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 9802084 9802505 9802358 Y CLECL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D NA NA NA NA NA DDX12P 203259 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 9855016 9855380 9855049 Y KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2B,CLECL1,CD69 NA NA NA NA NA CLEC2B 165355 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 10517487 10517775 10517755 Y NA RP11-277P12.9,RP11-277P12.20 NA NA NA NA RP11-277P12.20 3119 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 10833157 10833219 10833190 Y NA STYK1 NA NA NA NA STYK1 8240 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 10869298 10869573 10869459 Y NA STYK1 NA NA NA NA STYK1 44381 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr12 11221356 11221421 11221389 Y NA NA NA NA NA NA TAS2R14 100751 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 11828862 11829235 11828994 Y NA ETV6 NA NA NA NA ETV6 28074 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 11838255 11838510 11838381 Y NA ETV6 NA NA NA NA ETV6 37467 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 11867581 11867722 11867638 Y NA NA NA NA NA NA ETV6 66793 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 11919566 11919967 11919675 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 118778 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 11933482 11933754 11933622 Y NA NA NA NA NA NA ETV6 132694 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 11949422 11949819 11949574 Y NA NA NA NA NA NA ETV6 148634 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 11966137 11966507 11966203 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 165349 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 12038206 12038369 12038301 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA RP11-267J23.4 223728 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 12592534 12593034 12592768 Y BCL2L14,LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B NA NA NA NA NA LOH12CR1 84521 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 12646905 12646967 12646936 Y LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B NA LOH12CR1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP16 66350 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 12663035 12663537 12663259 Y BCL2L14,DUSP16 DUSP16 LOH12CR1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP16 49780 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 12956264 12956405 12956396 Y GPRC5A,DDX47 DDX47 NA NA NA NA DDX47 7845 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr12 12957478 12957757 12957559 Y GPRC5A DDX47 NA NA NA NA DDX47 6493 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.33916040135441 chr12 12991466 12991515 12991491 Y NA DDX47,RPL13AP20 NA NA NA NA DDX47 27216 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 13025126 13025347 13025203 Y NA RPL13AP20,GPRC5A,MIR614 NA NA NA NA RPL13AP20 1086 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.34165771622059 chr12 13034551 13034650 13034602 Y DDX47,GPRC5A RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6 NA NA NA NA GPRC5A 7066 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 13049170 13049423 13049295 Y DUSP16 RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6 NA NA NA NA GPRC5A 7454 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 13050548 13050563 13050554 Y NA RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6 NA NA NA NA GPRC5A 8832 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 13075067 13075388 13075228 Y NA RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6 NA NA NA NA RP11-392P7.6 3272 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 13145446 13145954 13145521 Y DUSP16,EMP1 HTR7P1,HEBP1,KIAA1467 NA NA NA NA HTR7P1 4858 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 13253893 13254547 13254171 Y CDKN1B,EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 58675 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr12 13255105 13255488 13255167 Y EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 59887 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 13332644 13332915 13332868 Y NA EMP1 EMP1,KIAA1467 IMR90 Hi-C 24141950 EMP1 14735 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 13357534 13357828 13357577 Y NA EMP1 NA NA NA NA EMP1 9884 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 13376628 13377027 13376828 Y NA EMP1 NA NA NA NA EMP1 28978 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 13817220 13817383 13817356 Y NA NA NA NA NA NA EMP1 469570 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 14413561 14413925 14413703 Y NA RP11-134N1.2 ATF7IP IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-134N1.2 46037 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 14426552 14426694 14426609 Y PLBD1,ATF7IP NA NA NA NA NA RP11-134N1.2 59028 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr12 14426966 14427222 14427069 Y PLBD1,ATF7IP NA NA NA NA NA RP11-134N1.2 59442 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 15700708 15700867 15700798 Y PTPRO NA NA NA NA NA RP11-6K23.1 110247 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 15899366 15899730 15899546 Y PTPRO NA NA NA NA NA EPS8 133533 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 16553699 16554214 16553898 Y NA NA NA NA NA NA DERA 491593 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 16554253 16554721 16554664 Y NA NA NA NA NA NA DERA 492147 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 19048962 19049238 19049131 Y NA NA PIK3C2G IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHA5 231410 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 19284166 19284563 19284310 Y NA PLEKHA5 NA NA NA NA PLEKHA5 3518 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 19343816 19343915 19343891 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA5 63168 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 21666002 21666378 21666190 Y NA RECQL,GOLT1B NA NA NA NA GOLT1B 13287 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 23625293 23625709 23625512 Y NA NA NA NA NA NA ETNK1 849284 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 25053045 25053436 25053335 Y KRAS,BCAT1,BCAT1,BCAT1 BCAT1 NA NA NA NA BCAT1 46957 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 25075175 25075409 25075293 Y KRAS,BCAT1,BCAT1 BCAT1 NA NA NA NA BCAT1 24984 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 25402760 25403150 25403054 Y LRMP,CASC1,KRAS KRAS NA NA NA NA KRAS 890 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 25538390 25538869 25538521 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 136520 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 137212 CAGE SAS hg19 FANTOM5 10.0249731486618 chr12 25539458 25539791 25539651 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 137588 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr12 25611028 25611430 25611226 Y NA NA RASSF8,LOC100506451,IFLTD1,MIR4302 IMR90 Hi-C 24141950 IFLTD1 188083 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 26267263 26267811 26267415 Y NA SSPN,BHLHE41,RP11-283G6.3 NA NA NA NA SSPN 5113 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr12 26427494 26428032 26427844 Y NA NA SSPN,BHLHE41,ITPR2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-283G6.3 149944 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr12 26484826 26485166 26485077 Y NA NA NA NA NA NA RP11-283G6.3 207276 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 26622713 26623111 26622903 Y NA NA NA NA NA NA RP11-283G6.3 345163 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 26945295 26945340 26945320 Y C12orf71,ITPR2 ITPR2 NA NA NA NA ITPR2 38791 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 27006268 27006662 27006518 Y NA ITPR2 ITPR2,TM7SF3 IMR90 Hi-C 24141950 ITPR2 22137 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 27332593 27333057 27332936 Y STK38L NA STK38L,MED21,TM7SF3,REP15,PPFIBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STK38L 61844 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 27484254 27484540 27484416 Y FGFR1OP2,STK38L ARNTL2 NA NA NA NA ARNTL2 467 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 27532512 27532752 27532665 Y C12orf71 ARNTL2 NA NA NA NA ARNTL2 48725 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 27565982 27566076 27566029 Y ARNTL2 NA NA NA NA NA ARNTL2 82195 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 27678028 27678417 27678221 Y C12orf71 PPFIBP1 NA NA NA NA PPFIBP1 3664 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 27702695 27702969 27702865 Y NA PPFIBP1 NA NA NA NA PPFIBP1 28331 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 27745630 27745707 27745691 Y NA NA NA NA NA NA PPFIBP1 71266 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 28127967 28128359 28128243 Y PTHLH,PTHLH NA NA NA NA NA CCDC91 155823 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 28186002 28186387 28186254 Y PTHLH,PTHLH NA NA NA NA NA CCDC91 97795 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 28501330 28501622 28501413 Y NA RNU4-54P NA NA NA NA RNU4-54P 30934 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 29487594 29487680 29487637 Y NA ERGIC2 NA NA NA NA ERGIC2 44442 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 30570849 30571198 30571024 Y NA NA NA NA NA NA IPO8 275722 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 30949517 30949896 30949519 Y CAPRIN2 CAPRIN2,LINC00941 NA NA NA NA LINC00941 3540 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 31464460 31464546 31464537 Y NA FAM60A NA NA NA NA FAM60A 13446 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr12 31469690 31470116 31469962 Y NA FAM60A NA NA NA NA FAM60A 7876 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr12 31523025 31523181 31523129 Y METTL20,FAM60A,FAM60A FAM60A NA NA NA NA FAM60A 45033 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 31671759 31672031 31671827 Y NA NA NA NA NA NA DENND5B 70000 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 31899631 31900083 31899901 Y AMN1,H3F3C AMN1,H3F3C METTL20,AMN1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMN1 19523 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 33044985 33045279 33045082 Y NA PKP2 NA NA NA NA PKP2 2495 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 33072560 33072656 33072597 Y PKP2 PKP2 NA NA NA NA PKP2 24786 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 39104065 39104215 39104143 Y CPNE8 NA NA NA NA NA CPNE8 195017 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 42470575 42470704 42470641 Y NA NA NA NA NA NA GXYLT1 65977 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 42825856 42826146 42826103 Y YAF2,YAF2,YAF2 NA NA NA NA NA ZCRB1 107936 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 42958967 42958984 42958976 Y NA PRICKLE1 NA NA NA NA PRICKLE1 23173 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 43699836 43700036 43699910 Y NA NA PRICKLE1,PPHLN1,ZCRB1 IMR90 Hi-C 24141950 PUS7L 450584 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr12 45626822 45627300 45627014 Y ANO6,ANO6 ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 18998 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 45627812 45628672 45628351 Y ANO6,ANO6 ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 19988 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 46381876 46382270 46382256 Y SLC38A2,SCAF11 SCAF11 NA NA NA NA SCAF11 1633 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 46603605 46603977 46603918 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A1 57823 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 46636369 46636708 46636589 Y SCAF11,SLC38A1 SLC38A1 NA NA NA NA SLC38A1 25092 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 46824163 46824471 46824386 Y NA RP11-96H19.1 SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 48701 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 46866769 46866797 46866784 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 91307 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 46867492 46867759 46867536 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 92030 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 46887386 46887956 46887679 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 111924 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 46888080 46888552 46888358 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 112618 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr12 46917975 46918280 46918143 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 142513 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.33916040135441 chr12 46942703 46943018 46942760 Y NA NA SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 167241 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 46943558 46944140 46943794 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 168096 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 46947043 46947401 46947166 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 171581 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr12 46949913 46950236 46950181 Y NA NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 174451 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 46956105 46956322 46956188 Y NA NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 180643 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 46956686 46956942 46956800 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 181224 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr12 47474423 47475249 47474825 Y NA AMIGO2 NA NA NA NA AMIGO2 2689 CAGE SAS hg19 FANTOM5 6.68331543244117 chr12 47476610 47477096 47476829 Y NA AMIGO2 NA NA NA NA AMIGO2 4876 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 47482441 47482676 47482559 Y NA AMIGO2 AMIGO2 K562 ChIA-PET 22265404 AMIGO2 10707 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 47612205 47612473 47612375 Y FAM113B NA NA NA NA NA AMIGO2 140471 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 47661403 47661671 47661594 Y NA NA FAM113B,AMIGO2 IMR90 Hi-C 24141950 AMIGO2 189669 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.78221744865098 chr12 47671815 47672221 47672059 Y NA NA AMIGO2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMIGO2 200081 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 47701468 47701752 47701723 Y NA NA AMIGO2,MIR4698,LOC100233209,FAM113B IMR90 Hi-C 24141950 AMIGO2 229734 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr12 48294417 48294695 48294497 Y OR10AD1,ZNF641,ZNF641,VDR VDR NA NA NA NA VDR 40136 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 48395275 48395444 48395393 Y COL2A1 TMEM106C TMEM106C MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM106C 39923 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 49277442 49277626 49277534 Y NA DDX23,RND1 RND1,DDX23,CACNB3,DDN,PRKAG1,ARF3,FKBP11 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RND1 19761 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 49595765 49596022 49595888 Y LMBR1L TUBA1C,TUBA1A TUBA1A,TUBA1B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TUBA1A 14658 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 49628278 49628526 49628405 Y LMBR1L,TUBA1A TUBA1C,TUBA1A DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1A 47171 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 49678404 49678529 49678467 Y NA TROAP NA NA NA NA TROAP 36490 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 50221084 50221421 50221231 Y NCKAP5L NCKAP5L,BCDIN3D NA NA NA NA NCKAP5L 551 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 50899744 50900179 50899947 Y DIP2B DIP2B NA NA NA NA DIP2B 2976 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 50926707 50927114 50926974 Y NA DIP2B NA NA NA NA DIP2B 29939 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 51014249 51014685 51014387 Y NA NA NA NA NA NA DIP2B 117481 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 51180627 51180997 51180727 Y SMAGP ATF1 TMPRSS12 IMR90 Hi-C 24141950 ATF1 25134 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.4505489918951 chr12 51765347 51765619 51765517 Y FIGNL2,GALNT6 GALNT6 BIN2,CELA1 IMR90 Hi-C 24141950 GALNT6 19032 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 52243040 52243117 52243080 Y SCN8A,ACVRL1,FIGNL2 NA SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACVR1B 100334 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 52364914 52365223 52365052 Y GRASP ACVR1B,NR4A1 NA NA NA NA ACVR1B 21463 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 52423514 52423824 52423679 Y NA NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 8898 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 52426305 52426422 52426334 Y NR4A1,GRASP,NR4A1 NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 11689 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 52426547 52427164 52426822 Y NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 11931 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 52438699 52439014 52438738 Y ACVR1B,NR4A1 NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA C12orf44 22016 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 52525424 52525587 52525584 Y NA NA NA NA NA NA KRT80 58197 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr12 52539319 52539712 52539621 Y KRT84,KRT80,KRT6A,KRT5 KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 44072 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.00499462973235 chr12 52540237 52540565 52540533 Y NA KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 43219 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr12 52540964 52541526 52541224 Y KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44 KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 42258 CAGE SAS hg19 FANTOM5 10.4705275108245 chr12 52542210 52542726 52542513 Y KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44 KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 41058 CAGE SAS hg19 FANTOM5 4.90109798379019 chr12 52557711 52558022 52557822 Y NA KRT80 NA NA NA NA KRT80 25762 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr12 52584709 52584955 52584807 Y C12orf44,KRT80,KRT7 KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 925 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 52588132 52588259 52588205 Y FIGNL2,GRASP,NR4A1 KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 4348 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 52588987 52589174 52589068 Y ACVR1B,NR4A1 KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 5203 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 52609215 52609817 52609526 Y NA KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT7 14487 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 52624014 52624394 52624158 Y KRT7 KRT80 NA NA NA NA KRT7 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr12 52624687 52625139 52624914 Y KRT7 KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT7 383 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 52629756 52630207 52629959 Y NA KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT7 5452 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 52674043 52674518 52674247 Y NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80 KRT7,KRT81 NA NA NA NA KRT81 8800 CAGE SAS hg19 FANTOM5 4.56693221216814 chr12 52674655 52675081 52674843 Y C12orf44,KRT80,KRT7 KRT81 NA NA NA NA KRT81 8237 CAGE SAS hg19 FANTOM5 8.01997851892941 chr12 52915277 52915747 52915499 Y C12orf44 KRT6A,KRT5 NA NA NA NA KRT5 2806 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 53261473 53261693 53261598 Y KRT2,KRT1,KRT77 NA KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85 IMR90 Hi-C 24141950 KRT4 55138 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 53265042 53265518 53265316 Y PFDN5,KRT2 NA KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85,KRT80,KRT18,KRT8,EIF4B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRT4 58707 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 53267781 53268340 53268093 Y PFDN5 NA KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT4 61446 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 53281915 53282052 53282044 Y NA NA NA NA NA NA KRT18 58603 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr12 53284889 53285178 53285173 Y ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18 NA NA NA NA NA KRT18 55477 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr12 53288883 53289427 53289224 Y NA NA NA NA NA NA KRT18 51228 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr12 53301815 53302147 53302072 Y KRT1,KRT76,KRT8 KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 38508 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 53312254 53312405 53312393 Y NA KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 28250 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 53318665 53319069 53319016 Y NA KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 21586 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr12 53336677 53336830 53336786 Y NA KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 3825 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 53339346 53339557 53339459 Y EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18 KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 1098 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr12 53615195 53615822 53615501 Y CSAD,SP1,PRR13,PFDN5 ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1 NA NA NA NA RARG 8942 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 54090300 54090537 54090319 Y NA ATP5G2,CALCOCO1 NA NA NA NA ATP5G2 21108 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr12 54391907 54392298 54392098 Y ATP5G2,HOXC8,HOXC6,HOXC4,HOXC12,HOXC10,HOXC9 HOXC11,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC8,HOXC5 NA NA NA NA HOXC8 8534 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 54446030 54446105 54446068 Y NA HOXC8,HOXC5,HOXC4 FLJ12825 IMR90 Hi-C 24141950 HOXC4 369 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 54611719 54612027 54611873 Y NA SMUG1 NA NA NA NA SMUG1 30941 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 54777021 54777369 54777117 Y NA ITGA5 NA NA NA NA ITGA5 33875 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 56147551 56147694 56147624 Y NA BLOC1S1,RP11-644F5.10,RP11-644F5.11,CD63,GDF11 NA NA NA NA GDF11 12487 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 56218960 56219310 56218990 Y OR6C3,OR6C65,OR6C2,OR6C4,OR10P1,IKZF4 SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14 NA NA NA NA TMEM198B 2219 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 56219844 56220081 56219962 Y OR6C3 SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14 NA NA NA NA TMEM198B 1448 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 56434218 56434302 56434260 Y OR6C4,OR10P1 SUOX,IKZF4,RPS26,ERBB3 NA NA NA NA RPS26 581 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 56752579 56752932 56752841 Y ZC3H10,RNF41,RNF41,STAT2,IL23A RP11-977G19.10,CNPY2,PAN2,STAT2 NA NA NA NA STAT2 640 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 56876109 56876291 56876201 Y NA TIMELESS,SPRYD4,GLS2,RP11-153M3.1,RBMS2 NA NA NA NA GLS2 3907 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 56877461 56877501 56877482 Y NA TIMELESS,SPRYD4,GLS2,RP11-153M3.1,RBMS2 NA NA NA NA GLS2 2697 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 57026164 57026397 57026368 Y NA BAZ2A,SNORD59A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 2203 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,SNORD59A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE SAS hg19 FANTOM5 10.6933046919059 chr12 57077806 57078249 57078184 Y COQ10A,PAN2,PAN2 BAZ2A,SNORD59A,ATP5B,PTGES3,NACA NA NA NA NA PTGES3 1910 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 57094657 57094840 57094721 Y STAT2,STAT6,NAB2 PTGES3,NACA,PRIM1 NA NA NA NA PTGES3 14498 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 57402902 57402987 57402944 Y NA ZBTB39 NA NA NA NA ZBTB39 4672 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 57512672 57512926 57512798 Y NAB2 TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6 TMEM194A,STAT6,LRP1,STAC3,SHMT2,NDUFA4L2 IMR90 Hi-C 24141950 LRP1 7350 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 57520981 57521279 57521090 Y NA TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6 NA NA NA NA LRP1 705 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 57813803 57814254 57814252 Y NA R3HDM2,INHBE,GLI1 NA NA NA NA R3HDM2 8534 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 58168960 58169095 58169042 Y TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM TSPAN31,MARCH9,CDK4,METTL21B,METTL1,RP11-571M6.15,TSFM NA NA NA NA RP11-571M6.15 4149 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 58187748 58188085 58187957 Y DDIT3,OS9 MARCH9,CDK4,METTL21B,METTL1,RP11-571M6.15,TSFM NA NA NA NA TSFM 13376 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 58281637 58282038 58281777 Y CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM CTDSP2,RP11-620J15.3 CTDSP2,TSFM,AVIL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTDSP2 43115 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr12 63051832 63051994 63051914 Y MON2,PPM1H NA NA NA NA NA MIRLET7I 56366 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 63118880 63119001 63118911 Y NA NA NA NA NA NA MIRLET7I 123414 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 63124974 63125146 63125033 Y C12orf61 NA NA NA NA NA MIRLET7I 129508 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 63149457 63149757 63149616 Y NA NA NA NA NA NA MIRLET7I 153991 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 64312639 64312950 64312683 Y SRGAP1 NA NA NA NA NA SRGAP1 76566 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr12 64544712 64545066 64544890 Y SRGAP1 NA NA NA NA NA C12orf66 69010 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 64546689 64546709 64546700 Y NA NA NA NA NA NA C12orf66 67367 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 64850943 64851361 64850994 Y NA TBK1 NA NA NA NA TBK1 7283 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 65005842 65006280 65005896 Y GNS,C12orf66,TBK1,RASSF3 RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 3549 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 65077868 65077886 65077879 Y RASSF3,LEMD3 NA NA NA NA NA GNS 73341 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 65930655 65931175 65930934 Y HMGA2 NA MSRB3,HMGA2,RPSAP52 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 63474 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 65997532 65998101 65997899 Y HMGA2 RP11-221N13.3 RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 2883 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 66004084 66004433 66004259 Y NA RP11-221N13.3 RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 9435 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 66027921 66028196 66028033 Y NA RP11-221N13.3 RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 33272 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 66028423 66029056 66028712 Y NA RP11-221N13.3 RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 33774 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 66042799 66043321 66043056 Y NA RP11-221N13.3 RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 48150 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 66048868 66049228 66049091 Y NA NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 54219 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 66050559 66051086 66050841 Y LEMD3 NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 55910 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 66060821 66060972 66060881 Y NA NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 66172 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 66089335 66089636 66089544 Y IRAK3 NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 94686 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 66135126 66135637 66135353 Y HMGA2 NA NA NA NA NA HMGA2 80274 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 66136008 66136292 66136116 Y HMGA2 NA NA NA NA NA HMGA2 79619 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 66159144 66159329 66159237 Y NA NA NA NA NA NA HMGA2 56582 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 66216365 66216749 66216512 Y HMGA2 HMGA2,RPSAP52 NA NA NA NA HMGA2 454 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr12 66237933 66238219 66238043 Y HMGA2 HMGA2,RPSAP52 NA NA NA NA RPSAP52 19179 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 66285844 66286273 66285967 Y IRAK3 NA NA NA NA NA RP11-366L20.3 53986 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 66286698 66286979 66286899 Y IRAK3 NA NA NA NA NA RP11-366L20.3 53280 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 67361974 67362194 67362149 Y NA NA NA NA NA NA RP11-123O10.4 98748 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 68314351 68314796 68314502 Y NA NA NA NA NA NA DYRK2 274233 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.00499462973235 chr12 68705850 68706149 68706026 Y IL22,SLC35E3,NUP107,MDM2,MDM1 MDM1 NA NA NA NA MDM1 18012 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr12 69180946 69181662 69181342 Y NA SLC35E3,MDM2 SLC35E3 IMR90 Hi-C 24141950 MDM2 18294 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 69401246 69401453 69401353 Y RAP1B,SLC35E3,MDM2,CPM,LYZ,CPM CPM CPM IMR90 Hi-C 24141950 CPM 37896 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 69418832 69418872 69418851 Y NUP107,SLC35E3,MDM2,YEATS4,FRS2,CPSF6 NA CPM IMR90 Hi-C 24141950 CPM 55482 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 69634325 69634686 69634559 Y SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6 CPSF6 NA NA NA NA CPSF6 3008 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 69686526 69686874 69686654 Y NA NA NA NA NA NA CPSF6 55209 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 69726696 69726959 69726870 Y NA YEATS4 YEATS4 K562 ChIA-PET 22265404 YEATS4 24524 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 69868200 69868446 69868430 Y CPSF6,YEATS4,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2 FRS2 NA NA NA NA FRS2 6071 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 70382625 70382986 70382644 Y CCT2,CCT2,RAB3IP NA CNOT2,KCNMB4,PTPRB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNOT2 251788 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 71055637 71055848 71055742 Y NA NA NA NA NA NA KCNMB4 297581 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 72165791 72165958 72165868 Y NA RAB21 NA NA NA NA RAB21 19137 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 72690281 72690495 72690341 Y TPH2,TRHDE TRHDE-AS1 NA NA NA NA TRHDE-AS1 23594 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 75227810 75227882 75227846 Y NA NA NA NA NA NA RP11-56G10.2 297397 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 75885817 75885886 75885852 Y KRR1 GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA GLIPR1 13357 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 75900907 75901415 75901091 Y KRR1 GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA KRR1 2001 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 75902459 75902855 75902619 Y KRR1 GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA KRR1 561 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 76045179 76045405 76045348 Y PHLDA1 NA PHLDA1,NAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 KRR1 141763 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 76052717 76052819 76052768 Y PHLDA1 NA PHLDA1,NAP1L1,OSBPL8 IMR90 Hi-C 24141950 KRR1 149301 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 76053870 76054229 76054024 Y NA NA PHLDA1,NAP1L1,OSBPL8 IMR90 Hi-C 24141950 KRR1 150454 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 76219425 76219952 76219684 Y PHLDA1 NA PHLDA1,NAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 PHLDA1 205760 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr12 76338350 76338647 76338468 Y GLIPR1,PHLDA1 NA PHLDA1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PHLDA1 87065 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 76347823 76348161 76347983 Y GLIPR1,PHLDA1 NA PHLDA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHLDA1 77551 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 76371613 76372127 76371872 Y NA NA OSBPL8,PHLDA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHLDA1 53585 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 76375899 76376264 76376114 Y NA PHLDA1 PHLDA1,KRR1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PHLDA1 49448 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 76414369 76415079 76414685 Y NA PHLDA1 NA NA NA NA PHLDA1 10633 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr12 76751627 76751939 76751780 Y NA BBS10 NA NA NA NA BBS10 11405 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 76849053 76849336 76849202 Y OSBPL8 NA NA NA NA NA OSBPL8 102253 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr12 77456593 77456922 77456786 Y E2F7 E2F7 NA NA NA NA E2F7 438 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 78398192 78398473 78398333 Y NA NA NA NA NA NA NAV3 175507 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 79325321 79325633 79325477 Y SYT1 NA NA NA NA NA RP1-78O14.1 569543 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 79608943 79609085 79609014 Y NA NA NA NA NA NA RP1-78O14.1 286091 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 79803401 79803717 79803562 Y NA NA NA NA NA NA RP1-78O14.1 91459 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 79817950 79818263 79818028 Y NA NA NA NA NA NA RP1-78O14.1 76913 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr12 79848111 79848561 79848284 Y NA RP1-78O14.1 NA NA NA NA RP1-78O14.1 46615 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr12 79941021 79941361 79941199 Y PAWR RP1-78O14.1 SYT1,PAWR,PPP1R12A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP1-78O14.1 45845 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr12 79943391 79943637 79943513 Y NA RP1-78O14.1 SYT1,PPP1R12A,PAWR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP1-78O14.1 48215 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 80032366 80032529 80032417 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 50348 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 80085577 80085980 80085873 Y NA PAWR NA NA NA NA PAWR 2700 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 80098707 80098999 80098853 Y NA PAWR SYT1,PPP1R12A,PAWR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAWR 15830 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 80327802 80327850 80327826 Y NA RP11-84G21.1,PPP1R12A NA NA NA NA PPP1R12A 562 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 81171843 81172335 81171905 Y NA NA NA NA NA NA RP11-244J10.1 676730 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 83461267 83461506 83461387 Y NA NA NA NA NA NA RPL6P25 81604 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 88526600 88526872 88526736 Y NA CEP290,TMTC3 NA NA NA NA CEP290 7121 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 88703962 88704349 88704186 Y NA NA KITLG IMR90 Hi-C 24141950 TMTC3 169889 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 88968059 88968366 88968242 Y NA KITLG NA NA NA NA KITLG 4262 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr12 89432794 89433184 89433022 Y NA NA POC1B,DUSP6 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP6 311864 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 89554110 89556960 89554595 Y NA NA POC1B,LOC728084,DUSP6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP6 188088 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 89619217 89620117 89619718 Y DUSP6,ATP2B1 NA DUSP6,LOC728084,POC1B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DUSP6 124931 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 89740427 89740813 89740638 Y POC1B,ATP2B1,DUSP6 DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 4235 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 89747699 89748479 89748073 Y NA DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 2651 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 90065963 90066366 90066126 Y NA ATP2B1 ATP2B1,LOC338758 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP2B1 34711 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 90091098 90091469 90091453 Y NA ATP2B1 ATP2B1,LOC338758 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP2B1 9608 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 90124876 90125258 90125114 Y DUSP6,ATP2B1 ATP2B1 NA NA NA NA ATP2B1 23799 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 90150470 90150910 90150738 Y NA ATP2B1 LOC338758 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP2B1 49393 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 90175016 90175190 90175077 Y DUSP6,POC1B,ATP2B1 NA C12orf37,LOC338758 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP2B1 73939 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 90233937 90234119 90234010 Y DUSP6,POC1B,ATP2B1 NA NA NA NA NA ATP2B1 132860 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 90403694 90404042 90403890 Y NA NA LOC338758 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B1 302617 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 90484866 90485476 90485213 Y ATP2B1 NA NA NA NA NA ATP2B1 383789 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 92172749 92173207 92172879 Y BTG1 NA LOC256021 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C12orf79 361483 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 92427755 92427874 92427825 Y CLLU1,BTG1 NA NA NA NA NA C12orf79 106816 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 92474192 92474586 92474423 Y BTG1 NA NA NA NA NA C12orf79 60104 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 92509431 92509711 92509674 Y NA C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA C12orf79 24979 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 92517978 92518398 92518142 Y BTG1 C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA C12orf79 16292 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr12 92947125 92947543 92947361 Y EEA1,BTG1 NA LOC256021 IMR90 Hi-C 24141950 EEA1 373564 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 93321551 93321826 93321626 Y EEA1 EEA1 NA NA NA NA EEA1 444 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 93762169 93762549 93762358 Y NA NUDT4 NA NA NA NA NUDT4 7110 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 93805604 93805748 93805676 Y CRADD NUDT4,UBE2N NA NA NA NA UBE2N 28290 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 93949724 93949882 93949803 Y NA SOCS2,SOCS2-AS1 NA NA NA NA SOCS2 11708 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 94179016 94179409 94179114 Y NA NA NA NA NA NA CRADD 109865 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 94495978 94496358 94496187 Y NA NA CRADD,LOC144481,SOCS2,MRPL42,UBE2N IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBMS2P1 320387 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 94817703 94818348 94818256 Y NA RBMS2P1,CCDC41 NA NA NA NA RBMS2P1 958 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr12 94919144 94919451 94919150 Y NA NA PLXNC1 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC41 67380 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 94954640 94954945 94954835 Y NA NA NA NA NA NA TMCC3 87393 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 95012768 95013068 95012914 Y PLXNC1,TMCC3 TMCC3 NA NA NA NA TMCC3 29270 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.67332617297647 chr12 95034280 95034617 95034465 Y PLXNC1,TMCC3 TMCC3 NA NA NA NA TMCC3 7721 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 95037595 95038737 95038539 Y PLXNC1,TMCC3 TMCC3 NA NA NA NA TMCC3 3601 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.67082885811029 chr12 95043067 95043319 95043087 Y TMCC3 TMCC3 NA NA NA NA TMCC3 729 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr12 95155432 95155603 95155503 Y NA NA TMCC3 IMR90 Hi-C 24141950 TMCC3 113094 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 95594660 95595399 95595279 Y FGD6 FGD6,VEZT NA NA NA NA FGD6 13859 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr12 95597894 95598075 95597980 Y NA FGD6,VEZT NA NA NA NA FGD6 11183 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 95609786 95609977 95609896 Y FGD6 FGD6,VEZT NA NA NA NA VEZT 264 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 95680646 95681018 95680718 Y NA NA NA NA NA NA VEZT 71124 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 96047992 96048216 96048102 Y METAP2,LTA4H NA NA NA NA NA NTN4 134714 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 96589359 96589977 96589479 Y LTA4H,ELK3 ELK3 NA NA NA NA ELK3 3199 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr12 96592675 96593197 96592888 Y LTA4H,ELK3 ELK3 NA NA NA NA ELK3 6515 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 96593675 96593812 96593739 Y NA ELK3 NA NA NA NA ELK3 7515 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 96613519 96613922 96613765 Y NA ELK3 NA NA NA NA ELK3 27359 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr12 96631530 96631765 96631742 Y CDK17 ELK3 NA NA NA NA ELK3 45370 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 96634891 96635110 96635001 Y CDK17 ELK3 NA NA NA NA ELK3 48731 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 96636403 96636783 96636456 Y CDK17 NA NA NA NA NA ELK3 50243 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 96649758 96650321 96650168 Y ELK3,CDK17 NA NA NA NA NA ELK3 63598 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 96752607 96752772 96752695 Y CDK17 CDK17 NA NA NA NA CDK17 39566 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 96794959 96795305 96795211 Y CDK17 CDK17,RN7SKP11 NA NA NA NA CDK17 2621 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 96819131 96819446 96819342 Y NA CDK17 CDK17,ELK3,LTA4H IMR90 Hi-C 24141950 RN7SKP11 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 96839212 96840356 96839676 Y NEDD1,NEDD1,CDK17 CDK17,RN7SKP11 CDK17 IMR90 Hi-C 24141950 RN7SKP11 19948 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 97355714 97355975 97355919 Y NA NA NA NA NA NA NEDD1 56713 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 98818500 98818672 98818666 Y NA RNU4-41P,SLC9A7P1 LOC100128191,TMPO MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU4-41P 8684 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 99103586 99103986 99103782 Y NA NA NA NA NA NA APAF1 66667 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 101692271 101692665 101692300 Y NA UTP20 NA NA NA NA UTP20 20384 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 104252933 104253121 104253026 Y NA NT5DC3 NA NA NA NA NT5DC3 19958 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 104301376 104301628 104301530 Y NA HSP90B1 NA NA NA NA HSP90B1 20257 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 104452729 104452893 104452811 Y TXNRD1 GLT8D2,HCFC2 GNN,GLT8D2,TDG,C12orf73,HSP90B1,HCFC2,NFYB,TXNRD1,ALDH1L2,KIAA1033 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLT8D2 3068 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 104613868 104614024 104613970 Y CHST11,TXNRD1,TXNRD1 TXNRD1,RPL18AP3 NA NA NA NA TXNRD1 6311 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 104791559 104791875 104791716 Y TXNRD1 NA CHST11,SLC41A2,C12orf45 IMR90 Hi-C 24141950 CHST11 55198 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 104912129 104912512 104912321 Y NA NA NA NA NA NA CHST11 65056 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 105030278 105030644 105030428 Y NA NA NA NA NA NA CHST11 183205 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 105064571 105065844 105065441 Y EID3,CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 217498 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 105486221 105486404 105486313 Y NA ALDH1L2,KIAA1033 ALDH1L2,TXNRD1,KIAA1033 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1L2 9866 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 106328094 106328476 106328238 Y CKAP4 NA NUAK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NUAK1 203335 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 107377522 107377900 107377585 Y RFX4,RIC8B,MTERFD3 C12orf23,MTERFD3 NA NA NA NA MTERFD3 1044 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 107856980 107857227 107857220 Y NA NA NA NA NA NA BTBD11 146790 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 108297283 108297694 108297638 Y NA NA NA NA NA NA PRDM4 144234 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr12 108699402 108699607 108699511 Y CORO1C,SELPLG NA NA NA NA NA FICD 207355 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 109023569 109024011 109023688 Y SSH1,SELPLG,SELPLG NA NA NA NA NA ISCU 69211 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 109030971 109031245 109031128 Y NA NA NA NA NA NA ISCU 76613 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 109088465 109088864 109088838 Y SSH1,CORO1C CORO1C NA NA NA NA CORO1C 34508 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 109116964 109117579 109117192 Y SELPLG,SSH1,CORO1C CORO1C NA NA NA NA CORO1C 5793 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 109117977 109118365 109118310 Y SELPLG,SSH1,CORO1C CORO1C NA NA NA NA CORO1C 5007 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 109209396 109209677 109209591 Y NA SSH1 NA NA NA NA SSH1 39689 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 109227089 109227462 109227320 Y NA SSH1 NA NA NA NA SSH1 21904 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr12 109232143 109232504 109232328 Y FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 16862 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr12 109248007 109248657 109248411 Y SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 709 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr12 109249958 109250678 109250397 Y NA SSH1 NA NA NA NA SSH1 592 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr12 109570576 109570747 109570637 Y ACACB ALKBH2,UNG NA NA NA NA UNG 37197 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 109899131 109899209 109899162 Y TRPV4,TRPV4,TRPV4 UBE3B,KCTD10 NA NA NA NA UBE3B 13998 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 109900993 109901418 109901152 Y KCTD10 UBE3B,KCTD10 NA NA NA NA UBE3B 11789 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 110707461 110707714 110707625 Y NA ATP2A2 ANKRD13A,ATP2A2,C12orf76,GIT2,IFT81 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP2A2 8847 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 110750652 110751139 110750939 Y NA ATP2A2 NA NA NA NA ATP2A2 34091 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 110867136 110867499 110867318 Y NA ANAPC7,HMGA1P3,ARPC3,RPL31P49,GPN3 NA NA NA NA HMGA1P3 1049 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 111019873 111020249 111019900 Y MYL2,ATP2A2,PPTC7 PPTC7,TCTN1 RAD9B IMR90 Hi-C 24141950 PPTC7 748 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 111252728 111252961 111252814 Y NA NA CUX2 IMR90 Hi-C 24141950 PPP1CC 73984 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 111842634 111842962 111842759 Y NA FAM109A,SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 882 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 111847615 111848064 111847953 Y ALDH2,FAM109A,SH2B3 FAM109A,SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 5863 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 112018937 112019235 112019073 Y NA ATXN2 NA NA NA NA ATXN2 16245 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 112341708 112342051 112341878 Y ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116 NA NA NA NA NA MAPKAPK5 63926 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 112464061 112464211 112464136 Y NA TMEM116,ERP29 NA NA NA NA ERP29 14941 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 112529504 112529724 112529616 Y NA NAA25,TRAFD1 NA NA NA NA NAA25 15102 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 112569313 112569455 112569350 Y NA NAA25,TRAFD1 NA NA NA NA TRAFD1 8008 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 112633664 112633952 112633817 Y NA NA TRAFD1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAFD1 72359 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 112759768 112760224 112759930 Y NA NA NA NA NA NA PTPN11 93931 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 112996187 112996311 112996218 Y NA NA NA NA NA NA RPL6 141545 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 113478524 113478983 113478679 Y OAS1,OAS3,SLC24A6,SDSL,OAS2 NA OAS2,DTX1 IMR90 Hi-C 24141950 OAS2 64324 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 113660919 113661318 113661188 Y TPCN1 DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA IQCD 4020 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 113684297 113684702 113684391 Y NA TPCN1,IQCD NA NA NA NA IQCD 27398 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr12 113741046 113741165 113741159 Y NA NA NA NA NA NA PLBD2 53206 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 113903072 113903274 113903194 Y NA SDSL NA NA NA NA SDSL 45030 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 114917726 114918063 114917895 Y NA NA TBX5,RBM19 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 201906 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 115105863 115106455 115106375 Y TBX3 TBX3 NA NA NA NA TBX3 13514 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 115791856 115792156 115792052 Y NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 671887 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr12 116362516 116362609 116362584 Y MED13L NA NA NA NA NA MED13L 350534 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 116498439 116498839 116498749 Y MED13L,MAP1LC3B2 NA NA NA NA NA MED13L 214304 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 116530359 116530538 116530483 Y NA NA NA NA NA NA MED13L 182605 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 116661909 116662288 116662266 Y NA NA NA NA NA NA MED13L 50855 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 116666460 116666763 116666749 Y NA MED13L NA NA NA NA MED13L 46380 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 116796896 116797249 116796984 Y NA NA MED13L,MIR4472-2,LINC00173,MAP1LC3B2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MED13L 83753 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 116946674 116946880 116946778 Y NA RP11-148B3.1,LINC00173 LINC00173,MED13L,MAP1LC3B2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-148B3.1 6783 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 117173952 117174265 117174216 Y MED13L,MAP1LC3B2 C12orf49 NA NA NA NA RNFT2 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 118123457 118123641 118123524 Y NA NA NA NA NA NA RFC5 325752 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 120153680 120153798 120153737 Y NA NA NA NA NA NA PRKAB1 50122 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 120524802 120525368 120525019 Y CCDC64 RAB35 NA NA NA NA RAB35 27938 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 120666780 120666906 120666823 Y NA GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN NA NA NA NA PXN-AS1 29686 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 120668258 120668871 120668569 Y RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1 NA NA NA NA PXN-AS1 31164 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr12 120669025 120669761 120669334 Y RAB35,RNF10,PXN GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1 NA NA NA NA PXN 31813 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr12 120672500 120673016 120672699 Y PXN GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1 NA NA NA NA PXN 28558 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 120851941 120852093 120852022 Y NA MSI1,RPS27P25,COX6A1,TRIAP1,GATC PLA2G1B,MSI1,GATC,COX6A1,TRIAP1,SRSF9,DYNLL1 IMR90 Hi-C 24141950 COX6A1 21800 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 120912483 120912692 120912652 Y NA COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1 NA NA NA NA DYNLL1 6830 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 121282265 121283301 121283112 Y NA NA NA NA NA NA SPPL3 56873 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 121310801 121311113 121311060 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 29061 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 121322345 121322363 121322358 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 17811 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 121366513 121366710 121366614 Y NA SPPL3,RPL12P33 C12orf43,SPPL3,POP5 IMR90 Hi-C 24141950 RPL12P33 13965 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 121367131 121367281 121367257 Y NA SPPL3,RPL12P33 C12orf43,SPPL3,POP5 IMR90 Hi-C 24141950 RPL12P33 14583 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 121533843 121533975 121533917 Y NA NA ACADS,UNC119B,P2RX4,POP5,CABP1,MLEC,SPPL3,C12orf43,OASL,P2RX7,CAMKK2 IMR90 Hi-C 24141950 OASL 58798 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 121714857 121715111 121714996 Y OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2 CAMKK2 NA NA NA NA CAMKK2 19000 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr12 121838748 121839039 121838846 Y SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 2904 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 121841505 121841570 121841538 Y NA ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 5661 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 122067749 122067897 122067832 Y ORAI1 ORAI1,MORN3 NA NA NA NA ORAI1 5294 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 122517490 122517922 122517629 Y RSRC2,KDM2B,SETD1B,MLXIP AC156455.1,MLXIP NA NA NA NA MLXIP 2862 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 122519763 122520228 122519936 Y ZCCHC8,RSRC2,ORAI1,SETD1B,MLXIP AC156455.1,MLXIP NA NA NA NA MLXIP 5135 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 122771781 122771848 122771815 Y NA VPS33A NA NA NA NA VPS33A 22713 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 122908043 122908483 122908329 Y ZCCHC8,DENR,CLIP1 CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 2864 CAGE SAS hg19 FANTOM5 4.90109798379019 chr12 123320749 123321200 123320858 Y NA HIP1R NA NA NA NA HIP1R 3749 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr12 123352500 123352698 123352696 Y VPS37B HIP1R,VPS37B NA NA NA NA VPS37B 26293 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 123362987 123363145 123363088 Y NA HIP1R,VPS37B NA NA NA NA VPS37B 15846 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 123377732 123378127 123378026 Y NA VPS37B NA NA NA NA VPS37B 864 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 124108091 124108301 124108196 Y NA TMED2,DDX55,EIF2B1,GTF2H3,TCTN2 NA NA NA NA EIF2B1 8012 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 124866398 124866679 124866460 Y NCOR2 NA NA NA NA NA CCDC92 411020 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 124875337 124875736 124875419 Y NCOR2 NA NA NA NA NA CCDC92 419959 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 124907545 124908050 124907792 Y NA NA NA NA NA NA CCDC92 452167 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr12 124985154 124985447 124985301 Y DHX37 NA NA NA NA NA SCARB1 379767 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 125008756 125009019 125008888 Y NA NA NA NA NA NA SCARB1 356195 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 125050856 125051375 125051213 Y UBC,NCOR2 NA NA NA NA NA SCARB1 313839 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 125110878 125111184 125111029 Y UBC,NCOR2 NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 254030 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 125204801 125205082 125204928 Y UBC NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 160132 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 125256511 125256612 125256543 Y NA NA NA NA NA NA SCARB1 108602 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 125259292 125259624 125259541 Y UBC NA NA NA NA NA SCARB1 105590 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 125400956 125401141 125401046 Y UBC SCARB1,UBC NA NA NA NA UBC 1042 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 125403508 125403991 125403767 Y UBC SCARB1,UBC NCOR2,SCARB1,UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 3594 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 125404545 125404922 125404790 Y UBC SCARB1,UBC NCOR2,SCARB1,UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 4631 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 125425237 125425455 125425374 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 25323 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 125550830 125551017 125550923 Y NA AACS NA NA NA NA AACS 2905 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 125581977 125582373 125582099 Y TMEM132B AACS NA NA NA NA AACS 34052 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 127769611 127770006 127769815 Y NA NA NA NA NA NA AC079949.1 120939 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 130610556 130610854 130610701 Y RIMBP2 FZD10-AS1,FZD10 NA NA NA NA FZD10-AS1 33947 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 132221686 132221872 132221813 Y NOC4L SFSWAP NA NA NA NA SFSWAP 28060 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 132232542 132232780 132232661 Y DDX51 SFSWAP NA NA NA NA SFSWAP 38916 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 132315038 132315239 132315115 Y MMP17 MMP17 NA NA NA NA MMP17 4100 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr12 132356836 132357024 132356894 Y SFSWAP,ULK1 MMP17,ULK1 NA NA NA NA ULK1 20172 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 132903795 132904258 132904060 Y GALNT9 NA NA NA NA NA FBRSL1 159879 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 132904307 132904701 132904477 Y NA NA NA NA NA NA FBRSL1 159436 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 133021534 133022956 133022670 Y POLE,DDX51,FBRSL1 FBRSL1 LOC100507055,FBRSL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FBRSL1 41181 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr12 133528012 133528357 133528019 Y NA CHFR,ZNF605 NA NA NA NA CHFR 2533 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr12 133688468 133688629 133688567 Y NA ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268 NA NA NA NA ZNF891 16430 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 20419964 20420131 20420036 Y PSPC1,ZMYM5 ZMYM5 NA NA NA NA ZMYM5 15645 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 20546038 20546426 20546233 Y NA ZMYM2 NA NA NA NA ZMYM2 15228 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 20555489 20555876 20555683 Y NA ZMYM2 NA NA NA NA ZMYM2 24679 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 20644269 20644474 20644387 Y ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2 NA NA NA NA NA GJA3 88714 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr13 20693405 20693544 20693484 Y CRYL1 GJA3 NA NA NA NA GJA3 39644 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 20735697 20735843 20735813 Y PSPC1,ZMYM5 GJA3,GJB2 NA NA NA NA GJA3 2509 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 20748931 20749662 20749408 Y PSPC1,ZMYM5 GJA3,GJB2 NA NA NA NA GJB2 15375 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 21015788 21016178 21015983 Y NA NA NA NA NA NA CRYL1 81818 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 21517643 21517924 21517794 Y LATS2 XPO4 CRYL1,SKA3,MRP63,LATS2,SAP18 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 XPO4 42456 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 21607254 21607660 21607524 Y NA RNU4-9P,LATS2 NA NA NA NA RNU4-9P 3146 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 23973487 23973793 23973652 Y NA SACS NA NA NA NA SACS 32048 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 24131522 24131823 24131734 Y SACS TNFRSF19 MIPEP,TNFRSF19 IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF19 10686 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 24567849 24568139 24567952 Y NA NA SPATA13 IMR90 Hi-C 24141950 MIPEP 106291 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 24850457 24850700 24850616 Y PARP4 NA NA NA NA NA PARP4 234248 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 25880585 25880813 25880618 Y MTMR6,NUPL1 MTMR6,NUPL1 NA NA NA NA NUPL1 6923 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 26118734 26119070 26118902 Y FAM123A,ATP8A2 NA NA NA NA NA NUPL1 245072 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 27166168 27166184 27166175 Y GPR12,WASF3 WASF3 NA NA NA NA WASF3 36328 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 27198783 27198789 27198786 Y NA NA NA NA NA NA WASF3 68943 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 27734553 27734882 27734861 Y NA USP12 NA NA NA NA USP12 9151 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 28006253 28006341 28006297 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA GTF3A 9572 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 28025291 28025563 28025486 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA MTIF3 2552 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr13 28167075 28167372 28167253 Y NA LNX2,POLR1D NA NA NA NA LNX2 25169 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 28534904 28535178 28535096 Y LNX2,FLT3,PRHOXNB NA NA NA NA NA PAN3 175465 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 28540285 28540611 28540449 Y LNX2,CDX2 NA NA NA NA NA PAN3 170032 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 30060513 30060580 30060547 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A1 107245 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 30415465 30415864 30415857 Y NA UBL3 NA NA NA NA UBL3 6957 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 30969684 30969817 30969776 Y USPL1 LINC01058,UBE2L5P LINC00426,KATNAL1,USPL1,UBL3,HMGB1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01058 24557 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 31619955 31620221 31620066 Y ALOX5AP NA TEX26-AS1,USPL1,ALOX5AP,HSPH1,HMGB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HSPH1 114304 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 31746734 31747017 31746876 Y NA HSPH1,B3GALTL NA NA NA NA HSPH1 12209 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 32687742 32687974 32687911 Y N4BP2L2,N4BP2L2 NA NA NA NA NA FRY 84305 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 33003304 33003483 33003393 Y NA N4BP2L1 NA NA NA NA N4BP2L1 2989 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 33744347 33744745 33744546 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 178022 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 33762622 33762899 33762709 Y STARD13,STARD13 NA NA NA NA NA STARD13 159868 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 33788488 33788595 33788542 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 134172 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 34116442 34117241 34116673 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 193675 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 34216569 34217156 34216982 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 173030 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 34253090 34253722 34253494 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 136464 CAGE SAS hg19 FANTOM5 7.35164697568529 chr13 34664689 34665025 34664857 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 274503 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 34731212 34731445 34731362 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 341026 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 40064271 40064571 40064449 Y NA NA NA NA NA NA LHFP 111094 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 40677084 40677323 40677230 Y NA NA NA NA NA NA COG6 449320 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 41226066 41226446 41226348 Y NA FOXO1 NA NA NA NA FOXO1 12288 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 41234261 41234650 41234508 Y NA FOXO1 NA NA NA NA FOXO1 4084 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 41519573 41519973 41519773 Y NA SUGT1P3 NA NA NA NA SUGT1P3 25663 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 41554566 41554842 41554704 Y NA NA NA NA NA NA SUGT1P3 60656 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 41560539 41560879 41560717 Y NA NA NA NA NA NA SUGT1P3 66629 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 42228867 42229175 42229114 Y NAA16,C13orf15 NA NA NA NA NA NAA16 345526 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 42269057 42269475 42269218 Y C13orf15,DGKH NA NA NA NA NA NAA16 385716 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr13 42855017 42855240 42855076 Y AKAP11 AKAP11 NA NA NA NA AKAP11 10728 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 43099384 43099709 43099478 Y DGKH,AKAP11,TNFSF11,TNFSF11 NA ENOX1 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP11 255095 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 43451053 43451467 43451346 Y EPSTI1 NA NA NA NA NA EPSTI1 112940 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 43451555 43451845 43451701 Y NA NA NA NA NA NA EPSTI1 112562 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.89360603919167 chr13 43570775 43570983 43570833 Y EPSTI1 EPSTI1,DNAJC15 EPSTI1,ENOX1 IMR90 Hi-C 24141950 EPSTI1 6368 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr13 43632661 43632965 43632672 Y NA DNAJC15 NA NA NA NA DNAJC15 37322 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr13 43656094 43656342 43656191 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC15 60755 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 43727960 43728297 43728107 Y NA NA ENOX1,DNAJC15,CCDC122,LACC1 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJC15 132621 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 44542732 44543742 44543446 Y SERP2 DGKZP1 SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 DGKZP1 2172 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 44834615 44834626 44834621 Y NA NA SERP2,LINC00284,TSC22D1,NUFIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DGKZP1 294055 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 44869116 44869398 44869230 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA TSC22D1,SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 279885 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 44875300 44875802 44875641 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA TSC22D1,SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 273481 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 44880536 44881091 44880742 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA TSC22D1,LACC1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 268192 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 44884974 44885381 44885134 Y CCDC122,TSC22D1 NA TSC22D1,LACC1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 263902 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 44887042 44887399 44887172 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA TSC22D1,SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 261884 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 45288309 45288506 45288432 Y KCTD4 NA NUFIP1,TSC22D1,TSC22D1-AS1,SERP2,LINC00330 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 139026 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 45333095 45333256 45333140 Y NA NA TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 183812 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 45813210 45813281 45813243 Y NA NA NA NA NA NA TPT1-AS1 100199 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr13 47128078 47128394 47128310 Y LCP1,C13orf18,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 2775 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 47128564 47128952 47128887 Y LCP1,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 3261 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 47129209 47129516 47129266 Y NA LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 3906 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 48526121 48526135 48526130 Y MED4,SUCLA2 NA NA NA NA NA NUDT15 83568 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 49130835 49131251 49131085 Y FNDC3A,RB1,LPAR6,RCBTB2 RCBTB2 NA NA NA NA RCBTB2 25466 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 49563041 49563333 49563220 Y RCBTB2,CYSLTR2,SETDB2,SETDB2,CDADC1,FNDC3A FNDC3A NA NA NA NA FNDC3A 14993 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 49601050 49601794 49601184 Y NA NA NA NA NA NA FNDC3A 53002 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 50094191 50094472 50094332 Y CAB39L,SETDB2,PHF11,PHF11 PHF11 NA NA NA NA PHF11 26445 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 50217217 50217337 50217325 Y SETDB2,SETDB2,PHF11,PHF11,ARL11 EBPL NA NA NA NA EBPL 46274 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 50597476 50597810 50597661 Y RCBTB1,TRIM13 TRIM13,MIR3613,MIR16-1 NA NA NA NA MIR16-1 23387 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 50630657 50630910 50630784 Y NA MIR16-1,DLEU1 NA NA NA NA MIR16-1 9460 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 50796509 50797212 50796853 Y NA NA DLEU7 IMR90 Hi-C 24141950 DLEU2 98653 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 50897882 50898235 50898046 Y NA RPL34P26 DLEU2,DLEU1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 35664 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 51210187 51210463 51210320 Y NA NA DLEU2 IMR90 Hi-C 24141950 RNASEH2B 271351 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 51641920 51642198 51642053 Y INTS6 NA NA NA NA NA RNASEH2B-AS1 159072 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 52009334 52009441 52009388 Y NA RPS4XP16,INTS6 NA NA NA NA RPS4XP16 16859 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 52303239 52303556 52303323 Y WDFY2 NA NA NA NA NA DHRS12 72737 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 52406665 52407091 52406817 Y NA DHRS12,RP11-327P2.5 NA NA NA NA RP11-327P2.5 30232 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 52922324 52922434 52922379 Y THSD1 NA THSD1 IMR90 Hi-C 24141950 THSD1 56195 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr13 52956042 52956135 52956089 Y NA THSD1 NA NA NA NA THSD1 22494 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 53190916 53191040 53191000 Y NA HNRNPA1L2,MRPS31P4,SUGT1 NA NA NA NA MRPS31P4 1223 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 53336765 53337066 53336916 Y NA NA NA NA NA NA SUGT1 111921 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 53765519 53765549 53765534 Y NA NA NA NA NA NA SUGT1 540675 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr13 61157781 61157905 61157871 Y NA NA NA NA NA NA TDRD3 189190 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 73223300 73223692 73223493 Y PIBF1 NA NA NA NA NA RPL21P110 52139 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 73909414 73909609 73909563 Y NA NA PIBF1 IMR90 Hi-C 24141950 KLF5 282300 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 73942793 73943059 73942972 Y KLF5 NA NA NA NA NA KLF5 315679 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr13 74002389 74002533 74002463 Y KLF5 NA KLF5,PIBF1,KLF12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF5 375275 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 74508678 74508943 74508854 Y KLF12 NA NA NA NA NA KLF12 197451 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 74709487 74710034 74709735 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 3093 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr13 74864558 74864878 74864747 Y KLF12 NA KLF12 IMR90 Hi-C 24141950 KLF12 158164 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 75346258 75346396 75346327 Y NA NA NA NA NA NA KLF12 639864 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 75939887 75940324 75940051 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 113926 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 76138851 76139260 76139031 Y NA COMMD6,UCHL3 NA NA NA NA UCHL3 17232 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 76279211 76279429 76279239 Y NA NA NA NA NA NA LMO7 86641 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr13 76279599 76280073 76279764 Y LMO7 NA NA NA NA NA LMO7 87029 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr13 76289938 76289995 76289967 Y NA NA NA NA NA NA LMO7 97368 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 76290964 76291186 76291007 Y NA NA NA NA NA NA LMO7 98394 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr13 76336754 76337033 76336914 Y COMMD6,LMO7 NA NA NA NA NA LMO7 144184 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr13 76390114 76390391 76390144 Y NA NA NA NA NA NA LMO7 197544 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 77453598 77454010 77453765 Y FBXL3,KCTD12 KCTD12 NA NA NA NA KCTD12 4530 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 77899332 77899971 77899636 Y KCTD12,FBXL3,MYCBP2 MYCBP2 NA NA NA NA MYCBP2 147 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 78090399 78090658 78090529 Y NA SCEL NA NA NA NA SCEL 17151 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 78158324 78158538 78158433 Y MYCBP2,SLAIN1,SLAIN1,EDNRB,EDNRB NA NA NA NA NA SCEL 50515 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 80078013 80078214 80078058 Y NA NDFIP2 NA NA NA NA NDFIP2 24726 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 80122895 80122985 80122937 Y NA NA NA NA NA NA NDFIP2 69608 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 80916096 80916414 80916232 Y NA SPRY2 NA NA NA NA SPRY2 3010 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr13 80916799 80917232 80917156 Y NA SPRY2 NA NA NA NA SPRY2 3713 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 91807857 91808125 91807991 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 189949 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 92874267 92874578 92874398 Y NA NA NA NA NA NA RNU4ATAC3P 164170 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 94297506 94297518 94297511 Y GPC6 NA NA NA NA NA TGDS 948993 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 95931058 95931197 95931128 Y ABCC4 ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 20490 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 96350660 96350996 96350828 Y NA DNAJC3-AS1,DNAJC3 NA NA NA NA DNAJC3 23267 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 96427402 96427645 96427445 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC3 100009 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 97879082 97879401 97879140 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 7394 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 97890366 97890711 97890515 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 18678 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 97908706 97909024 97908751 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 37018 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr13 97912286 97912462 97912389 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 40598 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr13 97913986 97914316 97914087 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 42298 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 97991476 97991911 97991864 Y MBNL2 NA NA NA NA NA RAP2A 92565 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 99121203 99121258 99121231 Y NA NA NA NA NA NA STK24 106936 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 99128638 99129073 99128919 Y STK24 NA NA NA NA NA STK24 99121 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 99161455 99162128 99161863 Y NA NA NA NA NA NA STK24 66066 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 99223213 99223429 99223417 Y STK24 STK24 NA NA NA NA STK24 4765 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr13 99562711 99562955 99562841 Y GPR183,STK24 NA NA NA NA NA CALM2P4 271218 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 99922932 99923366 99923036 Y GPR183 NA NA NA NA NA UBAC2 71904 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 99950103 99950501 99950500 Y GPR18,GPR183 NA NA NA NA NA UBAC2 99075 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 99955691 99955924 99955808 Y GPR18,GPR183 NA NA NA NA NA UBAC2 104663 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 99974545 99974749 99974637 Y GPR183 NA NA NA NA NA UBAC2 123517 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 99991522 99991909 99991574 Y NA NA NA NA NA NA UBAC2 140494 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 100013491 100013836 100013585 Y DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL NA NA NA NA NA TM9SF2 137835 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 100312355 100312691 100312364 Y NA NA NA NA NA NA CLYBL 55436 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 100399124 100399585 100399214 Y NA NA NA NA NA NA CLYBL 142205 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 102105666 102105949 102105700 Y ITGBL1 NALCN,ITGBL1 NA NA NA NA ITGBL1 2700 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr13 102403781 102404089 102404035 Y NALCN NA NA NA NA NA ITGBL1 300815 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 102696707 102696889 102696861 Y NA NA NA NA NA NA TPP2 550464 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 102827333 102827727 102827645 Y FGF14 NA NA NA NA NA TPP2 419626 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 103249969 103250343 103250155 Y ERCC5,TPP2 TPP2 NA NA NA NA TPP2 2616 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 106803810 106804031 106803901 Y NA NA EFNB2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00460 222880 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 106808885 106809142 106808998 Y NA NA EFNB2,LINC00460 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00460 217769 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr13 107124360 107124455 107124408 Y NA NA NA NA NA NA ARGLU1 94057 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 107127427 107127454 107127441 Y NA NA NA NA NA NA ARGLU1 91058 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr13 107160222 107160504 107160362 Y NA NA NA NA NA NA ARGLU1 58008 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 107182699 107183083 107182911 Y EFNB2 ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 35429 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 107186008 107186474 107186341 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 32038 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 107188808 107188962 107188940 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 29550 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 108503880 108504176 108504028 Y FAM155A NA NA NA NA NA LIG4 364540 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 108919755 108919960 108919910 Y TNFSF13B,LIG4,ABHD13 NA NA NA NA NA ABHD13 51028 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 109568044 109568430 109568179 Y NA NA NA NA NA NA ABHD13 699317 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 109572126 109572187 109572157 Y MYO16,MYO16 NA NA NA NA NA ABHD13 703399 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 109807507 109807975 109807755 Y NA NA NA NA NA NA AL162497.1 597640 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr13 109808669 109809037 109808800 Y NA NA NA NA NA NA AL162497.1 596578 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.00499462973235 chr13 109852673 109853050 109852860 Y NA NA NA NA NA NA AL162497.1 552565 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 109895773 109895899 109895836 Y NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 509716 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr13 109909294 109909814 109909611 Y NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 495801 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr13 109921804 109922211 109922051 Y NA NA IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 483404 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.55944026756961 chr13 110322109 110322425 110322268 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 83190 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 110390802 110390941 110390862 Y NA AL162497.1,IRS2 NA NA NA NA AL162497.1 14674 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 110439676 110440079 110439929 Y IRS2 AL162497.1,IRS2 NA NA NA NA IRS2 2761 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr13 110521819 110522258 110522077 Y NA NA MYO16,IRS2,COL4A1 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 84904 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 110631754 110631774 110631764 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 194839 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr13 110664530 110664847 110664695 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 227615 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr13 110669788 110670084 110669997 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 232873 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr13 110746992 110747342 110747118 Y NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 COL4A2 208817 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 110790027 110791241 110790617 Y RAB20,IRS2 NA NA NA NA NA COL4A2 164918 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 111068169 111068419 111068294 Y RAB20,ANKRD10 NA NA NA NA NA COL4A1 110673 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 111096220 111096502 111096363 Y NA NA NA NA NA NA RAB20 115578 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 111124207 111124408 111124318 Y RAB20,ING1,ING1,ANKRD10 NA NA NA NA NA RAB20 87672 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 111172874 111173635 111173314 Y ING1,ING1,ANKRD10,RAB20 RAB20 NA NA NA NA RAB20 38445 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 111176913 111177121 111177092 Y ING1,ING1,ANKRD10,RAB20 RAB20 NA NA NA NA RAB20 34959 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 111278486 111278706 111278495 Y NA CARKD NA NA NA NA CARKD 12605 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr13 111312907 111313086 111312997 Y NA CARKD,ING1 NA NA NA NA CARKD 47026 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 111410023 111410076 111410050 Y NA ING1,CARS2 CARS2,LINC00346,ING1,COL4A2 IMR90 Hi-C 24141950 CARS2 46073 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 111526935 111527249 111527195 Y RAB20 LINC00346,ANKRD10 NA NA NA NA LINC00346 6773 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 111544033 111544176 111544105 Y ING1,ING1 LINC00346,ANKRD10 NA NA NA NA ANKRD10 21240 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 111589420 111590157 111589779 Y NA ANKRD10 ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 24004 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr13 111594578 111594832 111594693 Y RAB20,ANKRD10 ANKRD10 ANKRD10,ARHGEF7 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 29162 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr13 111595123 111595236 111595180 Y NA ANKRD10 ANKRD10,ARHGEF7 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 29707 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr13 111597919 111598063 111597990 Y NA ANKRD10 ARHGEF7 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 32503 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 111607450 111607830 111607755 Y RAB20,ING1,ING1,ANKRD10 ANKRD10 ARHGEF7,ANKRD10 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 42034 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 111609846 111610157 111610005 Y RAB20,ANKRD10 ANKRD10 ARHGEF7,ANKRD10 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 44430 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 111616634 111616920 111616701 Y NA NA LINC00346,ING1,ANKRD10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD10 51218 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr13 111719893 111720066 111720029 Y NA ARHGEF7 ANKRD10,ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF7 44840 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 112726762 112727353 112726963 Y NA SNORD44 NA NA NA NA SNORD44 22370 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr13 112727649 112728064 112727870 Y NA SNORD44 NA NA NA NA SNORD44 23257 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr13 113373357 113373630 113373494 Y ATP11A ATP11A NA NA NA NA ATP11A 30714 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 113585588 113585716 113585676 Y CUL4A,CUL4A MCF2L-AS1 C13orf35,ATP11A,MCF2L GM12878,HELA,K562,H1ESC 5C 22955621 MCF2L-AS1 35422 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr13 113588902 113588931 113588917 Y NA MCF2L-AS1 MCF2L,MCF2L-AS1,F10,F7,CUL4A H1ESC,HELA,K562,IMR90 5C,Hi-C 22955621,24141950 MCF2L-AS1 32207 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 113624891 113625152 113625027 Y MCF2L MCF2L-AS1 NA NA NA NA MCF2L-AS1 3753 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 113806516 113806910 113806731 Y ATP11A,CUL4A NA PROZ IMR90 Hi-C 24141950 CUL4A 53642 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 113982391 113982456 113982424 Y NA LAMP1,GRTP1 NA NA NA NA LAMP1 32835 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 114119812 114119949 114119881 Y NA DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA DCUN1D2 23318 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 114147699 114148153 114147800 Y F7,F10,PROZ,GRTP1 DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA TMCO3 4389 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 114301802 114302224 114301872 Y GAS6 NA NA NA NA NA TFDP1 64789 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 114459608 114459701 114459670 Y NA NA NA NA NA NA GAS6 105345 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 114565478 114566323 114565869 Y GAS6,GAS6,GAS6 GAS6 NA NA NA NA GAS6 432 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 114600157 114600520 114600358 Y GAS6 GAS6 NA NA NA NA GAS6 35111 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr13 114830489 114831626 114831334 Y RASA3 NA NA NA NA NA RASA3 64460 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr13 114864762 114865011 114864824 Y RASA3 RASA3 NA NA NA NA RASA3 31075 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 114913990 114914490 114914288 Y RASA3 RASA3 LOC100506394,GAS6,RASA3,CDC16,CHAMP1,FLJ44054,ATP4B IMR90 Hi-C 24141950 RASA3 17904 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr13 114995132 114995533 114995333 Y NA CDC16,UPF3A NA NA NA NA CDC16 2829 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 21150605 21151121 21150987 Y TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40 RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 269 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 21151333 21151694 21151411 Y NA RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 997 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 21684818 21685080 21685024 Y OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1 NA NA NA NA NA HNRNPC 50573 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 22736761 22737207 22736959 Y NA NA OXA1L,SLC7A7 IMR90 Hi-C 24141950 DAD1 318968 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 23083172 23083436 23083304 Y NA DAD1,ABHD4 NA NA NA NA ABHD4 18026 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr14 23293879 23294567 23294288 Y RBM23,C14orf119,SLC7A7,SLC7A7 MRPL52,MMP14,LRP10 REM2 MCF7 ChIA-PET 22265404 MRPL52 2521 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 23307440 23308274 23307581 Y SLC7A8,PSMB5,PSMB5,LRP10,MRPL52,MMP14 MRPL52,MMP14,LRP10 NA NA NA NA MMP14 3674 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 23308431 23309148 23308805 Y NA MRPL52,MMP14,LRP10 NA NA NA NA MMP14 4665 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 23320228 23321035 23320800 Y RBM23,C14orf119,ACIN1,SLC7A7,SLC7A7 MRPL52,MMP14,LRP10 NA NA NA NA MMP14 16462 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 23322319 23322495 23322408 Y NA MRPL52,MMP14,LRP10 NA NA NA NA LRP10 16327 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 23358205 23358555 23358381 Y NA LRP10,RBM23,PRMT5-AS1,PRMT5,RP11-298I3.1 NA NA NA NA LRP10 19383 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 23449151 23449315 23449234 Y MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93 NA NA NA NA AJUBA 536 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr14 23449757 23450231 23450060 Y MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB MIR4707,HAUS4,C14orf93 NA NA NA NA AJUBA 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.78221744865098 chr14 23466095 23466339 23466236 Y CDH24,ACIN1 MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93,PSMB5 NA NA NA NA C14orf93 11036 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 23584186 23584501 23584299 Y C14orf119 C14orf119,ACIN1 NA NA NA NA ACIN1 21363 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 24861663 24861718 24861669 Y IPO4,RABGGTA,RABGGTA NFATC4,NYNRIN,KHNYN,SDR39U1 NA NA NA NA NYNRIN 4274 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr14 25143666 25144075 25143734 Y TINF2,CIDEB,LTB4R,RIPK3,KHNYN,SDR39U1,GZMH,GZMB NA NA NA NA NA SDR39U1 233555 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 25148189 25148528 25148392 Y CIDEB,RIPK3,CMA1,CTSG,GZMH,GZMB NA NA NA NA NA SDR39U1 238078 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 27631441 27631502 27631472 Y NA NA NA NA NA NA RPL26P3 1325614 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 28846944 28847285 28847115 Y FOXG1 NA NA NA NA NA RPL26P3 109831 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 32420109 32420203 32420156 Y NA NA AKAP6 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-187E13.2 53905 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 32672212 32672871 32672506 Y ARHGAP5 NA NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP5-AS1 128213 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 32976944 32977104 32977024 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP5-AS1 432945 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 34504920 34505230 34505078 Y NA NA EGLN3 MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 424332 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr14 34529400 34529785 34529476 Y EGLN3 NA EGLN3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 399777 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 34966252 34966485 34966304 Y NA SPTSSA,EGLN3,EAPP NA NA NA NA EGLN3 36272 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 35250371 35250766 35250653 Y SRP54,BAZ1A NA NA NA NA NA CFL2 68342 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 35325148 35325514 35325424 Y PSMA6,PPP2R3C,BAZ1A RP11-73E17.2,BAZ1A NA NA NA NA RP11-73E17.2 16035 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 35628271 35628433 35628369 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA KIAA0391 38516 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 35800965 35801124 35801022 Y BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA NA NA NA NA NA PSMA6 55126 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 35802936 35803364 35803178 Y BAZ1A,FAM177A1,RALGAPA1,NFKBIA NA NA NA NA NA RP11-561B11.1 52911 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 35816738 35817044 35816815 Y NA RP11-561B11.1 KIAA0391,PPP2R3C,PSMA6 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-561B11.1 39231 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 35853509 35853868 35853721 Y FAM177A1,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1,NFKBIA NA NA NA NA RP11-561B11.1 2407 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 35876265 35876636 35876451 Y FAM177A1,FAM177A1,PPP2R3C,RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1,NFKBIA NA NA NA NA NFKBIA 4310 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 36277376 36277519 36277444 Y NFKBIA,RALGAPA1 RALGAPA1,NUTF2P2,BRMS1L NA NA NA NA RALGAPA1 866 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 37469718 37470010 37469970 Y NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1 NA NA NA NA NA SLC25A21 170061 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 37586141 37586465 37586450 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A21 53606 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 37587049 37587449 37587434 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A21 52622 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 37785804 37785829 37785809 Y NA NA NA NA NA NA MIPOL1 120686 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 38052089 38052429 38052199 Y NA TTC6,FOXA1 NA NA NA NA TTC6 10623 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 39559553 39559840 39559693 Y NA SEC23A,GEMIN2 NA NA NA NA SEC23A 17010 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 39637578 39637824 39637713 Y NA PNN NA NA NA NA TRAPPC6B 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 39664073 39664414 39664121 Y SIP1,PNN TRAPPC6B,PNN NA NA NA NA PNN 21686 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 43420114 43420297 43420206 Y NA NA NA NA NA NA C14orf28 1944201 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 43989536 43989546 43989541 Y NA NA NA NA NA NA C14orf28 1374952 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 44249775 44250158 44250052 Y NA NA NA NA NA NA C14orf28 1114340 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 45505148 45505421 45505276 Y NA KLHL28,PRPF39 NA NA NA NA KLHL28 4104 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 45721298 45721397 45721336 Y KLHL28,PRPF39,FANCM,MIS18BP1 MIS18BP1 NA NA NA NA MIS18BP1 555 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 49979013 49979291 49979168 Y C14orf182 NA NA NA NA NA RN7SL1 72006 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 50328432 50328642 50328440 Y METTL21D,ARF6,RPL36AL,DNAAF2 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 10511 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr14 50334846 50335244 50334992 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 16925 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr14 50429310 50429592 50429451 Y NA NA NA NA NA NA ARF6 71500 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 50467375 50468846 50468075 Y RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D NA NA NA NA NA ARF6 109565 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr14 50475850 50475934 50475889 Y ARF6,C14orf182 NA NA NA NA NA ARF6 118040 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 50528497 50528810 50528555 Y NA NA NA NA NA NA SOS2 167466 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 50799629 50799645 50799635 Y NA ATP5S,L2HGDH NA NA NA NA L2HGDH 22363 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 51136928 51137372 51137340 Y NA SAV1 NA NA NA NA SAV1 3879 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 51367871 51368235 51368053 Y NA PYGL NA NA NA NA PYGL 41219 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 51410207 51410388 51410282 Y NIN,PYGL PYGL NA NA NA NA PYGL 753 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 51862095 51862490 51862300 Y FRMD6,FRMD6 RP11-255G12.3 LOC283553,FRMD6,FRMD6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-255G12.3 242 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr14 51980347 51980357 51980352 Y TRIM9 FRMD6 NA NA NA NA FRMD6 26529 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 51985478 51985553 51985508 Y NA FRMD6 NA NA NA NA FRMD6 31660 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 51992800 51993196 51992853 Y NA FRMD6 NA NA NA NA FRMD6 38982 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 52006399 52006758 52006578 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 52581 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr14 52063277 52063629 52063461 Y NA NA NA NA NA NA FRMD6 109459 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 52064245 52064576 52064411 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 110427 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 52104818 52105424 52105148 Y NA NA NA NA NA NA FRMD6 151000 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 52110768 52111053 52110947 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 156950 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 52145900 52146294 52146052 Y NA NA NA NA NA NA FRMD6 192082 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 52584121 52584359 52584179 Y NA NA NID2,C14orf166 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf166 129928 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr14 52622606 52622722 52622664 Y NA NA C14orf166,NID2,PTGDR IMR90 Hi-C 24141950 PTGER2 156301 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 53020677 53020806 53020735 Y PTGDR,TXNDC16,GPR137C TXNDC16,GPR137C NA NA NA NA GPR137C 2811 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 53257268 53257587 53257438 Y NA GNPNAT1 NA NA NA NA GNPNAT1 882 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 53385393 53385542 53385402 Y DDHD1 FERMT2 NA NA NA NA FERMT2 31611 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 53416335 53416646 53416599 Y GPR137C FERMT2 NA NA NA NA FERMT2 507 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 54649490 54649642 54649566 Y NA NA BMP4 IMR90 Hi-C 24141950 CDKN3 211925 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 54902274 54902529 54902415 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 40707 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 54954614 54954684 54954648 Y NA GMFB,CGRRF1 NA NA NA NA GMFB 700 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 55035984 55036343 55036300 Y SAMD4A SAMD4A NA NA NA NA SAMD4A 4169 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 55115744 55116109 55115959 Y NA NA NA NA NA NA SAMD4A 83929 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 55120784 55121076 55120951 Y NA NA NA NA NA NA SAMD4A 88969 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 55152891 55153126 55153104 Y SAMD4A NA NA NA NA NA SAMD4A 121076 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 55541499 55541595 55541574 Y NA WDHD1,SOCS4,MAPK1IP1L,LGALS3 NA NA NA NA MAPK1IP1L 25150 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 55569733 55570176 55570087 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 18652 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.67582348784265 chr14 55574465 55575376 55574639 Y GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3 LGALS3 MAPK1IP1L IMR90 Hi-C 24141950 LGALS3 13452 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr14 55589429 55589640 55589507 Y NA LGALS3 LGALS3,DLGAP5,WDHD1,MAPK1IP1L IMR90 Hi-C 24141950 LGALS3 601 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 55589903 55590059 55589993 Y GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3 LGALS3 LGALS3,DLGAP5,WDHD1,MAPK1IP1L IMR90 Hi-C 24141950 LGALS3 1075 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 55596570 55597156 55596587 Y NA LGALS3 NA NA NA NA LGALS3 7742 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 56047594 56047945 56047904 Y NA KTN1,KTN1-AS1 NA NA NA NA KTN1-AS1 2766 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 56274024 56274269 56274148 Y NA NA NA NA NA NA KTN1-AS1 229196 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 56472041 56472329 56472134 Y NA NA PELI2 IMR90 Hi-C 24141950 PELI2 110203 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 58637905 58638297 58638125 Y NA UBA52P3,ACTR10 NA NA NA NA ACTR10 26501 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr14 58748134 58748542 58748422 Y ARID4A PSMA3,RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A NA NA NA NA RP11-349A22.5 14310 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 59216036 59216189 59216096 Y ARID4A RP11-112J1.1 DACT1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-112J1.1 43183 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 59656513 59656908 59656842 Y DAAM1 DAAM1 NA NA NA NA DAAM1 3149 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr14 60629133 60629293 60629144 Y NA DHRS7 NA NA NA NA DHRS7 5281 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 60679186 60679974 60679676 Y NA DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2 NA NA NA NA PPM1A 30496 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr14 60778203 60778479 60778369 Y PPM1A NA NA NA NA NA CTD-2184C24.2 64720 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 61933004 61933260 61933132 Y HIF1A NA NA NA NA NA RP11-902B17.1 145468 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 61938268 61939375 61939158 Y HIF1A NA NA NA NA NA RP11-902B17.1 150732 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 61985151 61985397 61985317 Y HIF1A NA NA NA NA NA HIF1A 174834 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 62070604 62070799 62070701 Y HIF1A NA NA NA NA NA HIF1A 89432 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 64109095 64109326 64109156 Y SYNE2,WDR89,WDR89 HSPE1P2,WDR89 NA NA NA NA WDR89 2516 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 64320785 64320937 64320842 Y PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2 SYNE2 NA NA NA NA SYNE2 3102 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 64584533 64584935 64584736 Y NA NA NA NA NA NA SYNE2 266850 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 64975156 64975343 64975202 Y NA ZBTB1,ZBTB25,HSPA2 NA NA NA NA ZBTB25 5225 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 65147051 65147198 65147125 Y NA PLEKHG3 SPTB,PPP1R36,PLEKHG3,CHURC1-FNTB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLEKHG3 21622 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr14 65169606 65170310 65170032 Y NA PLEKHG3 NA NA NA NA PLEKHG3 786 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 65193422 65193546 65193484 Y ZBTB1,PLEKHG3 PLEKHG3 NA NA NA NA PLEKHG3 24602 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 65273271 65273625 65273457 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHG3 104451 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 65637410 65637773 65637587 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAX 69997 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.89360603919167 chr14 65746592 65747003 65746788 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90 Hi-C 24141950 FUT8 128307 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 67562927 67563276 67562937 Y TMEM229B,PLEKHH1 NA NA NA NA NA MPP5 142550 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 67735210 67735475 67735304 Y NA MPP5 NA NA NA NA MPP5 29384 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 67751261 67751573 67751281 Y RDH12,PLEKHH1,PIGH MPP5 NA NA NA NA MPP5 45435 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 67763359 67763655 67763501 Y NA NA NA NA NA NA MPP5 57533 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 67774949 67775062 67775003 Y PLEKHH1 EIF2S1,ATP6V1D NA NA NA NA EIF2S1 49652 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 67809024 67809296 67809169 Y RDH12,MPP5,PLEKHH1 EIF2S1,ATP6V1D NA NA NA NA EIF2S1 15418 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 68161499 68161767 68161616 Y PLEK2 VTI1B,RDH11 NA NA NA NA RDH11 968 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr14 68407691 68408026 68407854 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 123195 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 68456427 68456429 68456428 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 171931 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 68555311 68555805 68555391 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 270815 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 68571232 68571846 68571404 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 286736 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 68604521 68604895 68604639 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 282018 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr14 68607037 68607479 68607161 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 279434 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr14 68613334 68613955 68613742 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 272958 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 68699331 68699744 68699520 Y ZFYVE26 NA NA NA NA NA PPIAP6 187169 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 68925660 68925982 68925837 Y NA PPIAP6 NA NA NA NA PPIAP6 38747 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 69013502 69013901 69013730 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 126589 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 69014304 69014714 69014453 Y ACTN1 NA NA NA NA NA PPIAP6 127391 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr14 69014972 69015327 69015083 Y ACTN1 NA NA NA NA NA PPIAP6 128059 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr14 69022058 69022216 69022137 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2325P2.3 128066 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 69143232 69143639 69143443 Y NA CTD-2325P2.3 RAD51B,ZFP36L1 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2325P2.3 6643 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 69162018 69162337 69162187 Y NA CTD-2325P2.3 ZFP36L1,RAD51B IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2325P2.3 11736 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr14 69246726 69246992 69246942 Y DCAF5 ZFP36L1 NA NA NA NA ZFP36L1 14198 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 69377319 69377610 69377464 Y NA NA NA NA NA NA ACTN1 66547 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 69400981 69401191 69401073 Y ZFP36L1,DCAF5 ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 42966 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 69417780 69418181 69417964 Y NA ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 25976 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr14 69425235 69425583 69425528 Y NA ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 18574 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 69472543 69472713 69472613 Y NA ACTN1 DCAF5,ACTN1 IMR90 Hi-C 24141950 ACTN1 28386 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 69618210 69618757 69618360 Y NA DCAF5,EXD2 NA NA NA NA DCAF5 343 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 70020113 70020453 70020282 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0247 55860 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 70079600 70080000 70079702 Y NA KIAA0247 NA NA NA NA KIAA0247 3287 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 70152055 70152259 70152141 Y KIAA0247,SRSF5,SRSF5 SRSF5 NA NA NA NA SRSF5 39358 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 70251545 70251918 70251732 Y NA NA NA NA NA NA SRSF5 59928 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 70464665 70464959 70464731 Y NA NA NA NA NA NA SRSF5 273048 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr14 70465984 70466470 70466191 Y NA NA NA NA NA NA SRSF5 274367 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr14 70844763 70845165 70845114 Y NA COX16,SYNJ2BP-COX16,SYNJ2BP NA NA NA NA COX16 20315 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 71132254 71132379 71132336 Y TTC9 TTC9 NA NA NA NA TTC9 25750 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 71249264 71249522 71249393 Y NA MAP3K9,RP6-65G23.3 NA NA NA NA MAP3K9 24729 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr14 71349559 71349894 71349705 Y MED6,PCNX PCNX NA NA NA NA PCNX 22228 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 71425019 71425182 71425094 Y NA NA NA NA NA NA PCNX 52897 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 71838643 71839069 71838909 Y PCNX,SIPA1L1 NA SIPA1L1 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-261D10.2 52112 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 71870372 71870659 71870456 Y PCNX,SIPA1L1 NA NA NA NA NA RP1-261D10.2 83841 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 71955425 71955735 71955597 Y NA NA NA NA NA NA RP1-261D10.2 168894 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 72602663 72602717 72602690 Y RGS6,RGS6 NA NA NA NA NA DPF3 756092 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 73595262 73595380 73595321 Y NA PSEN1 NA NA NA NA PSEN1 5746 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 74207610 74207866 74207660 Y C14orf43 PNMA1,MIR4505,RP5-1021I20.1 NA NA NA NA MIR4505 15584 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 74208106 74208498 74208298 Y C14orf43 PNMA1,MIR4505,RP5-1021I20.1 NA NA NA NA MIR4505 14952 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 74238517 74238805 74238733 Y C14orf169,ZNF410,COQ6,COQ6,C14orf43,C14orf43 MIR4505,RP5-1021I20.1 NA NA NA NA RP5-1021I20.1 13258 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 74741846 74742137 74741995 Y FCF1 ABCD4 NA NA NA NA ABCD4 25622 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr14 74949377 74949710 74949544 Y NA MIR4709,ISCA2,NPC2 NA NA NA NA MIR4709 4470 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 74981330 74981609 74981543 Y NPC2 MIR4709,ISCA2,NPC2 NA NA NA NA NPC2 22450 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 75033495 75033781 75033700 Y NA LTBP2,CTD-2207P18.2 NA NA NA NA LTBP2 43525 CAGE SAS hg19 FANTOM5 5.79220670811568 chr14 75037027 75037351 75037159 Y NA LTBP2,CTD-2207P18.2 NA NA NA NA LTBP2 39955 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 75038441 75039020 75038725 Y NPC2,DLST LTBP2,CTD-2207P18.2 NA NA NA NA LTBP2 38286 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr14 75040596 75041021 75040862 Y LTBP2 LTBP2,CTD-2207P18.2 ISCA2,NPC2 IMR90 Hi-C 24141950 LTBP2 36285 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 75086409 75086922 75086553 Y PGF LTBP2,CTD-2207P18.2 LTBP2,KIAA0317,FCF1,YLPM1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CTD-2207P18.2 5059 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr14 75087327 75087770 75087539 Y PGF,EIF2B2,LTBP2 LTBP2,CTD-2207P18.2 YLPM1,NPC2,ISCA2,LTBP2,KIAA0317,FCF1 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2207P18.2 5977 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 75688633 75689211 75688968 Y DLST,FOS TMED10,RP11-293M10.2 PGF,NEK9,TMED10,FOS,LOC731223,BATF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-293M10.2 34903 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 75750758 75751180 75750884 Y PROX2,JDP2,JDP2,JDP2,JDP2,FOS RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5 NA NA NA NA FOS 7281 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr14 75761897 75762132 75762064 Y FOS,JDP2,JDP2,JDP2,FLVCR2,FLVCR2 RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5 NA NA NA NA RP11-293M10.5 2790 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 76027371 76027398 76027385 Y NA FLVCR2,RP11-507E23.1 NA NA NA NA FLVCR2 15562 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 76243945 76244101 76244023 Y TGFB3 NA NA NA NA NA C14orf1 118413 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 76843326 76843356 76843341 Y NA NA NA NA NA NA RP11-187O7.1 256648 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr14 77265287 77265548 77265418 Y NA VASH1,ANGEL1 NA NA NA NA ANGEL1 25041 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 77384574 77384777 77384608 Y IRF2BPL RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1 IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488C13.1 33481 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 77384980 77385465 77385224 Y VASH1 RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1 IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488C13.1 33887 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 77386872 77387221 77387005 Y ZDHHC22 RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1 IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488C13.1 35779 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 77425025 77425260 77425132 Y C14orf166B,IRF2BPL RP11-7F17.7,RP11-7F17.1 IRF2BPL MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.7 1044 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 77428060 77428442 77428341 Y NA RP11-7F17.7,RP11-7F17.1 IRF2BPL MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.7 4079 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 77431067 77431579 77431238 Y NA RP11-7F17.7,RP11-7F17.1 IRF2BPL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.1 1447 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr14 77444143 77444725 77444469 Y NA RP11-7F17.7,RP11-7F17.1,IRF2BPL IRF2BPL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-7F17.1 11117 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 77488566 77488578 77488572 Y NA IRF2BPL NA NA NA NA IRF2BPL 4456 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 77499482 77500543 77500476 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL IRF2BPL KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 6448 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr14 77500544 77500911 77500765 Y NA IRF2BPL KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 7510 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 77554689 77554897 77554781 Y NA NA KIAA1737,ANGEL1,C14orf166B,IRF2BPL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZDHHC22 52180 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 78194844 78195080 78194962 Y NA ALKBH1,SLIRP,SNW1 NA NA NA NA SLIRP 22430 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr14 78196199 78196534 78196363 Y NA ALKBH1,SLIRP,SNW1 NA NA NA NA SLIRP 23785 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 81019191 81019257 81019224 Y DIO2,CEP128 NA NA NA NA NA DIO2 167091 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 81036045 81036252 81036151 Y NA NA NA NA NA NA DIO2 183945 CAGE SAS hg19 FANTOM5 14.8146825419113 chr14 81088140 81088388 81088236 Y NA NA NA NA NA NA DIO2 236040 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr14 81375179 81375565 81375372 Y STON2,CEP128 CEP128 NA NA NA NA CEP128 48296 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 SNORA79,DYNLL1P1 NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 4.34415503108676 chr14 81867255 81867616 81867435 Y GTF2A1,GTF2A1,STON2 STON2 NA NA NA NA STON2 33193 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 81867886 81868104 81867969 Y GTF2A1,GTF2A1 STON2 NA NA NA NA STON2 32705 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 89935615 89935871 89935745 Y NA NA NA NA NA NA EFCAB11 483250 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 90875651 90876041 90875751 Y NA RPL21P11,CALM1 NA NA NA NA CALM1 14805 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 90988934 90989119 90989019 Y NA NA NA NA NA NA CALM1 128088 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 91224328 91224362 91224343 Y C14orf159,CALM1 NA NA NA NA NA TTC7B 56461 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 91393752 91394149 91393951 Y NA NA NA NA NA NA CTD-3035D6.2 101280 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 91696123 91696361 91696283 Y RPS6KA5,C14orf159,SMEK1,CCDC88C,GPR68,GPR68 NA NA NA NA NA RPS6KA5 171143 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 91752749 91752962 91752855 Y NA NA NA NA NA NA CCDC88C 129226 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 91926776 91927002 91926960 Y NA CCDC88C,SMEK1 NA NA NA NA CCDC88C 44588 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 92970203 92970533 92970302 Y ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 RIN3 NA NA NA NA RIN3 7585 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr14 93509801 93510236 93510094 Y NA NA NA NA NA NA ITPK1 70429 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr14 93510584 93510744 93510686 Y NA NA NA NA NA NA ITPK1 69921 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr14 93511721 93512085 93511905 Y NA NA NA NA NA NA ITPK1 68580 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr14 93569992 93570233 93570210 Y KIAA1409,C14orf109,C14orf109 ITPK1 NA NA NA NA ITPK1 10432 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 93698124 93698181 93698153 Y NA MOAP1,RP11-371E8.4,UBR7,C14orf142 NA NA NA NA C14orf142 26685 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 93776910 93777138 93777024 Y PRIMA1 BTBD7 NA NA NA NA BTBD7 20300 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 94429465 94429837 94429620 Y SERPINA1,DDX24 NA NA NA NA NA OTUB2 60838 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 94808145 94809286 94808819 Y SERPINA1 SERPINA1 NA NA NA NA SERPINA1 45744 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 94840163 94840451 94840311 Y SERPINA1 SERPINA1 NA NA NA NA SERPINA1 14579 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr14 95014834 95014854 95014844 Y NA SERPINA5 SERPINA4 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINA5 10925 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 95610253 95610413 95610333 Y CLMN,DICER1,DICER1 DICER1 NA NA NA NA DICER1 11934 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 95731733 95732288 95732036 Y DICER1,CLMN NA NA NA NA NA CLMN 51955 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chr14 95734707 95735043 95734878 Y NA CLMN NA NA NA NA CLMN 49200 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 95779970 95780439 95780333 Y DICER1,CLMN CLMN NA NA NA NA CLMN 3804 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 96012218 96012367 96012292 Y GLRX5 RP11-1070N10.3,GLRX5,SCARNA13,SNHG10 NA NA NA NA SNHG10 13009 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr14 96570939 96571330 96571109 Y BDKRB2,BDKRB1 NA NA NA NA NA C14orf132 67278 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr14 96718007 96718377 96718192 Y BDKRB1 BDKRB2,RP11-404P21.8,BDKRB1 NA NA NA NA BDKRB1 1784 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 97685606 97685621 97685614 Y NA NA NA NA NA NA VRK1 423965 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 99247816 99248022 99247919 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 697194 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 99439262 99439638 99439565 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 505578 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr14 99735950 99736476 99736276 Y BCL11B NA NA NA NA NA SETD3 208740 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 100040610 100041006 100040947 Y SETD3,CCDC85C CCDC85C NA NA NA NA CCDC85C 27357 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 100045606 100045757 100045663 Y CCDC85C CCDC85C NA NA NA NA CCDC85C 22606 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 100071651 100072022 100071781 Y NA CCDC85C,HHIPL1 NA NA NA NA CCDC85C 3288 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr14 100495518 100495795 100495680 Y NA NA EVL,YY1,DEGS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 206840 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr14 100659173 100659604 100659490 Y NA YY1,RP11-638I2.4 DEGS2,YY1,EVL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 43031 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr14 100751761 100751840 100751790 Y NA YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29 NA NA NA NA SLC25A29 19044 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr14 100883887 100884104 100884057 Y BEGAIN WDR25,WARS NA NA NA NA WARS 42745 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 101029795 101030067 101029931 Y NA BEGAIN NA NA NA NA BEGAIN 21683 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 101151381 101151698 101151540 Y RTL1,DLK1 DLK1 NA NA NA NA DLK1 38344 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 101159258 101159870 101159708 Y NA DLK1 NA NA NA NA DLK1 30172 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr14 102227271 102227509 102227387 Y WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C PPP2R5C NA NA NA NA PPP2R5C 1136 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.22777181081372 chr14 102438747 102439113 102438818 Y PPP2R5C,DYNC1H1 DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 9882 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 102544859 102545271 102545048 Y NA NA NA NA NA NA WDR20 58569 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 102554875 102555215 102555129 Y HSP90AA1 WDR20,HSP90AA1 NA NA NA NA WDR20 48625 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 102746257 102746658 102746398 Y NA MOK,ZNF839 NA NA NA NA MOK 22879 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 102780583 102780765 102780709 Y NA MOK,ZNF839,CINP,TECPR2 MOK,DYNC1H1,HSP90AA1,WDR20,ZNF839 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF839 949 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr14 102991046 102991386 102991124 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 16910 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr14 102991831 102991939 102991900 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 17695 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 103299136 103299384 103299260 Y NA NA NA NA NA NA TRAF3 57323 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 103541337 103541574 103541446 Y NA CDC42BPB,RP11-736N17.8,TNFAIP2 CDC42BPB,EIF5 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-736N17.8 17486 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 103557952 103558007 103557980 Y NA CDC42BPB,RP11-736N17.8,TNFAIP2 CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,EIF5,LOC100131366,MARK3 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-736N17.8 1053 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 103577206 103577606 103577492 Y C14orf153 RP11-736N17.8,TNFAIP2 NA NA NA NA TNFAIP2 10173 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.78221744865098 chr14 103585248 103585668 103585540 Y NA RP11-736N17.8,TNFAIP2 NA NA NA NA TNFAIP2 2111 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 103673427 103673966 103673589 Y CDC42BPB NA LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP2 85648 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 103710310 103710630 103710449 Y NA NA LOC100131366,EIF5,TNFAIP2,CDC42BPB,RCOR1,EXOC3L4 IMR90 Hi-C 24141950 EIF5 87251 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 104018443 104019067 104018893 Y PPP1R13B CKB,TRMT61A,KLC1,BAG5,APOPT1,RNU4-68P NA NA NA NA KLC1 7166 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 104356058 104356494 104356205 Y TRMT61A,PPP1R13B PPP1R13B,C14orf2 PPP1R13B,LOC145216 MCF7 ChIA-PET 22265404 C14orf2 36112 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 104583053 104583460 104583371 Y NA MIR203 NA NA NA NA MIR203 1311 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.00499462973235 chr14 104993565 104993828 104993574 Y NA NA KIF26A IMR90 Hi-C 24141950 INF2 160115 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 105144100 105144955 105144117 Y GPR132,AKT1 INF2,ADSSL1 NA NA NA NA INF2 8988 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.67082885811029 chr14 105163052 105163361 105163217 Y NA INF2,ADSSL1 NA NA NA NA INF2 9109 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 105327046 105327788 105327205 Y NA NA NA NA NA NA AKT1 66958 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 105330138 105330246 105330192 Y NA NA NA NA NA NA AKT1 70050 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 105433766 105434012 105433864 Y KIAA0284,JAG2,AHNAK2 AHNAK2,C14orf79 PLD4 MCF7 ChIA-PET 22265404 AHNAK2 8682 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 105434041 105434308 105434245 Y NA AHNAK2,C14orf79 PLD4 MCF7 ChIA-PET 22265404 AHNAK2 8386 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 105438668 105438757 105438725 Y KIAA0284,JAG2,CDCA4,C14orf79,AHNAK2 AHNAK2,C14orf79,CDCA4 NA NA NA NA AHNAK2 3937 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr14 105439556 105439771 105439692 Y INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2 AHNAK2,C14orf79,CDCA4 PLD4 MCF7 ChIA-PET 22265404 AHNAK2 2923 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr14 105491233 105491512 105491453 Y NA AHNAK2,C14orf79,CDCA4 NA NA NA NA CDCA4 5748 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 105500263 105500628 105500453 Y NA CDCA4 NA NA NA NA CDCA4 14778 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 105546439 105546836 105546640 Y NA NA BTBD6,BRF1 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA4 60954 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr14 105549558 105549976 105549724 Y NA NA BTBD6,BRF1 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA4 64073 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr14 105554572 105554923 105554752 Y NA NA BTBD6,BRF1,AHNAK2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDCA4 69087 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr14 105557924 105558306 105558075 Y NA NA BTBD6,BRF1,JAG2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDCA4 72439 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr14 105660827 105661024 105660911 Y NA JAG2,NUDT14 NA NA NA NA NUDT14 15167 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr14 105947921 105948133 105948082 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA CRIP1 3403 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr14 105948139 105949025 105948432 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA CRIP1 2511 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.55944026756961 chr15 20599040 20599336 20599188 Y NA NA NA NA NA NA RP11-603B24.2 1944753 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 25555752 25555966 25555813 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 126162 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 25563100 25563402 25563110 Y SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 118726 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 25564293 25564526 25564383 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 117602 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 25565589 25566847 25566046 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 115281 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 25586903 25587047 25586976 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 95081 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 25608093 25608225 25608159 Y SNURF,SNRPN NA NA NA NA NA UBE3A 73903 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 25614491 25614606 25614563 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 67522 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 25678066 25678357 25678212 Y NA UBE3A NA NA NA NA UBE3A 3771 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 26176179 26176311 26176243 Y ATP10A NA NA NA NA NA UBE3A 494051 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 26327449 26327665 26327505 Y NA NA ATP10A,LOC100128714 IMR90 Hi-C 24141950 UBE3A 645321 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 30213334 30213722 30213356 Y NA TJP1 TJP1,FAM189A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TJP1 45346 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 30216999 30217403 30217070 Y TJP1 TJP1 TJP1,FAM189A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TJP1 41665 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 31689645 31689781 31689725 Y MTMR10,KLF13 NA NA NA NA NA KLF13 72587 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 31733081 31733438 31733352 Y MTMR10,KLF13 NA KLF13,OTUD7A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF13 116023 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 32030840 32030849 32030846 Y NA NA NA NA NA NA CHRNA7 289842 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 33004938 33004960 33004950 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP11A 99593 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 33153988 33154297 33154060 Y GREM1 NA NA NA NA NA ARHGAP11A 248643 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 33162710 33163027 33162926 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP11A 257365 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 33165962 33166239 33166177 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP11A 260617 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 33746972 33747043 33747010 Y NA NA NA NA NA NA AVEN 582334 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 34531616 34532056 34531745 Y NA NA NA NA NA NA SLC12A6 96205 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr15 34639079 34639478 34639279 Y NA SLC12A6,NOP10,LPCAT4 NA NA NA NA NOP10 5701 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 35014105 35014549 35014217 Y NA NA AQR,GJD2 IMR90 Hi-C 24141950 GOLGA8A,GOLGA8B 135401 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 35384953 35385239 35385081 Y NA RP11-323I15.2 ATPBD4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-323I15.2 2271 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 35590731 35591134 35590845 Y NA NA ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-323I15.2 208049 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 35989992 35990298 35990145 Y NA NA NA NA NA NA RP11-323I15.2 607310 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 36720333 36720777 36720654 Y NA NA ATPBD4,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf41 149035 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 38751078 38751316 38751209 Y NA FAM98B NA NA NA NA FAM98B 6750 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr15 39420923 39421276 39421056 Y NA NA THBS1,C15orf53,FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-265N7.1 63234 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr15 39432291 39432412 39432368 Y THBS1 NA THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-265N7.1 52098 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr15 39474254 39474447 39474377 Y THBS1 RP11-265N7.1 C15orf53,THBS1,FSIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-265N7.1 10063 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 39484062 39484453 39484282 Y NA RP11-265N7.1 THBS1,FSIP1,C15orf53 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-265N7.1 57 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 39559889 39560120 39560079 Y NA NA NA NA NA NA RP11-265N7.1 75379 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 39561378 39561942 39561743 Y THBS1 NA NA NA NA NA RP11-265N7.1 76868 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 39683457 39683798 39683639 Y NA NA THBS1,FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 187482 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 39722195 39722553 39722498 Y THBS1,C15orf54 NA C15orf53,FSIP1,THBS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THBS1 148727 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 40210900 40211252 40211013 Y GPR176 EIF2AK4 FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR176 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 40395466 40395787 40395613 Y NA BMF NA NA NA NA BMF 3306 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 40397040 40397227 40397203 Y BUB1B,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 1866 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 41074954 41075332 41075143 Y NA GCHFR,C15orf62,ZFYVE19,DNAJC17 NA NA NA NA C15orf62 14795 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 41138213 41138409 41138269 Y RHOV,SPINT1,SPINT1 ZFYVE19,DNAJC17,SPINT1,RHOV,VPS18 NA NA NA NA SPINT1 3997 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 41158071 41158384 41158228 Y RHOV SPINT1,RHOV,VPS18 NA NA NA NA RHOV 6103 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 41220555 41220912 41220794 Y NUSAP1,DLL4 VPS18,DLL4,CHAC1 NA NA NA NA DLL4 1017 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr15 41233721 41234461 41233781 Y C15orf57,VPS18 VPS18,DLL4,CHAC1 NA NA NA NA CHAC1 8699 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 41456018 41456111 41456065 Y NA INO80,FAM92A1P1 NA NA NA NA FAM92A1P1 2658 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 41788010 41788393 41788374 Y NA RPAP1 NA NA NA NA RPAP1 46074 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 41953918 41954236 41954127 Y EHD4,MGA MGA MAPKBP1 IMR90 Hi-C 24141950 MGA 42496 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr15 42083275 42083582 42083459 Y NA MAPKBP1,JMJD7,PLA2G4B,JMJD7-PLA2G4B NA NA NA NA MAPKBP1 18643 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 42327713 42327843 42327787 Y MAPKBP1,PLA2G4B NA EHD4 IMR90 Hi-C 24141950 EHD4 64937 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 42349424 42349982 42349743 Y MGA,JMJD7,EHD4,VPS39,TMEM87A,SNAP23 NA PLA2G4E IMR90 Hi-C 24141950 EHD4 86648 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 42549506 42549513 42549508 Y PLA2G4E GANC,TMEM87A NA NA NA NA GANC 13918 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 44592122 44592245 44592183 Y NA CASC4 NA NA NA NA CASC4 13195 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 44838663 44839045 44838853 Y NA EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 11408 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 44954800 44955080 44954968 Y CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11 SPG11,PATL2,B2M NA NA NA NA SPG11 924 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 45005185 45005759 45005376 Y CTDSPL2,SPG11,PATL2,B2M,TRIM69 PATL2,B2M,TRIM69 NA NA NA NA B2M 3510 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 45076532 45076874 45076594 Y B2M NA NA NA NA NA TRIM69 57346 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 45746745 45747578 45747238 Y SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN NA NA NA NA NA SPATA5L1 54216 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr15 45914427 45914634 45914531 Y NA SQRDL NA NA NA NA SQRDL 6712 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 47821798 47822190 47821994 Y SEMA6D NA NA NA NA NA CTD-2270N23.1 198942 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 48687688 48687982 48687829 Y FBN1 NA NA NA NA NA RP11-154J22.1 65635 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 48975243 48975418 48975260 Y NA NA FBN1,SHC4,CEP152 IMR90 Hi-C 24141950 CEP152 125925 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 50634288 50634665 50634477 Y NA GABPB1 NA NA NA NA GABPB1 10940 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 50995097 50995499 50995351 Y SPPL2A TRPM7 NA NA NA NA TRPM7 18085 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 51173397 51173629 51173520 Y USP8,SPPL2A AP4E1 TRPM7,SPPL2A,USP50,ASB18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323,22265404 AP4E1 25240 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 51177416 51177715 51177636 Y USP8,TRPM7,SPPL2A AP4E1 TRPM7,SPPL2A,USP50,AP4E1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP4E1 21154 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 51515990 51516083 51516067 Y SPPL2A,TNFAIP8L3,DMXL2 NA NA NA NA NA AP4E1 317121 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 51628727 51629122 51629096 Y TNFAIP8L3,CYP19A1 NA NA NA NA NA DMXL2 283908 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 52028351 52028526 52028483 Y MAPK6,DMXL2,LYSMD2 TMOD2,LYSMD2 NA NA NA NA TMOD2 13232 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 52148809 52148818 52148812 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 28984 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 52273738 52273979 52273778 Y NA MAPK6,LEO1 MAPK6,GNB5,MYO5C,BCL2L10 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LEO1 11735 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 52349753 52350120 52349937 Y NA CTD-2184D3.1,CTD-2184D3.5 NA NA NA NA CTD-2184D3.1 35372 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 52369278 52369628 52369325 Y MAPK6 CTD-2184D3.1,CTD-2184D3.5,BCL2L10 GNB5,BCL2L10,MYO5C IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2184D3.1 15864 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr15 55503902 55504218 55504040 Y RAB27A,PIGB RSL24D1 RSL24D1 K562 ChIA-PET 22265404 RSL24D1 16637 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 55614631 55614957 55614885 Y NA PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1 NA NA NA NA RP11-139H15.1 5272 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 56127522 56127639 56127539 Y NA NA NA NA NA NA NEDD4 156305 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 56332751 56332969 56332911 Y NA NEDD4 NEDD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD4 48807 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr15 56452441 56452566 56452504 Y RFX7 NA NA NA NA NA RFX7 80917 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 56475345 56475479 56475412 Y RFX7 NA NA NA NA NA RFX7 58004 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 57844002 57844282 57844063 Y NA GCOM1,MYZAP,POLR2M NA NA NA NA GCOM1 37824 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 57846695 57846878 57846787 Y NA GCOM1,MYZAP,POLR2M NA NA NA NA GCOM1 35228 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 58733027 58733372 58733200 Y NA NA NA NA NA NA ADAM10 306805 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 58884938 58885321 58885256 Y NA NA NA NA NA NA ADAM10 154856 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 58898092 58898418 58898348 Y NA NA NA NA NA NA ADAM10 141759 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 58939079 58939427 58939418 Y NA NA NA NA NA NA ADAM10 100750 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 59085961 59086460 59086218 Y NA ADAM10,FAM63B NA NA NA NA FAM63B 24570 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr15 59467791 59468085 59467937 Y ADAM10,RNF111 NA NA NA NA NA CCNB2 72514 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 59469464 59469853 59469728 Y ADAM10,RNF111 NA NA NA NA NA CCNB2 74187 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 59576201 59576407 59576333 Y GCNT3,MYO1E NA NA NA NA NA FAM81A 86485 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr15 59587320 59587393 59587357 Y NA NA NA NA NA NA FAM81A 75499 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 59642348 59642705 59642508 Y BNIP2,RNF111 FAM81A,MYO1E NA NA NA NA FAM81A 20187 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 59646072 59646468 59646249 Y NA FAM81A,MYO1E NA NA NA NA FAM81A 16424 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 60836612 60836644 60836628 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 67235 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 60839009 60839501 60839122 Y RORA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 69632 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 60861865 60862603 60862448 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 92488 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 60881604 60881753 60881652 Y RORA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 112227 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 61520020 61520614 61520340 Y RORA RORA NA NA NA NA RORA 502 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 63795379 63795825 63795543 Y NA USP3 NA NA NA NA USP3 586 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 63871063 63871418 63871089 Y NA USP3-AS1 NA NA NA NA USP3-AS1 20370 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 64385169 64385477 64385384 Y NA DAPK2,FAM96A,SNX1 NA NA NA NA SNX1 847 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 64538820 64539298 64539122 Y NA NA NA NA NA NA PPIB 85416 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 64753700 64753985 64753784 Y PLEKHO2 ZNF609 NA NA NA NA ZNF609 2759 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 65135268 65135743 65135404 Y TRIP4,ZNF609,OAZ2,SPG21,SPG21,PLEKHO2 PIF1,PLEKHO2 NA NA NA NA PLEKHO2 3180 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr15 65596702 65597188 65596889 Y DENND4A RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5746 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 65831867 65832220 65831871 Y NA DPP8,PTPLAD1 C15orf44 IMR90 Hi-C 24141950 PTPLAD1 11111 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 66060795 66060948 66060877 Y NA RAB11A,DENND4A NA NA NA NA DENND4A 21683 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 66162838 66163256 66163114 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80207 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 66163349 66163534 66163463 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80718 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 66707547 66707736 66707571 Y MAP2K1 TIPIN,MAP2K1 RPL4,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K1 30392 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 66764584 66765048 66764851 Y NA SNAPC5,ZWILCH,RPL4 NA NA NA NA SNAPC5 23103 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 66993287 66993569 66993487 Y MAP2K1,SMAD6 SMAD6 NA NA NA NA SMAD6 721 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 67095524 67095803 67095671 Y NA NA NA NA NA NA SMAD6 102958 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 67134448 67134928 67134631 Y NA NA SMAD6,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 141882 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr15 67359902 67360303 67360058 Y NA SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 5801 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr15 67366599 67366961 67366679 Y NA SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 12498 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 67399103 67399775 67399548 Y SMAD3 SMAD3,RP11-342M21.2 NA NA NA NA RP11-342M21.2 37502 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr15 67401891 67402640 67402087 Y SMAD3 SMAD3,RP11-342M21.2 NA NA NA NA RP11-342M21.2 34637 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 67413336 67413759 67413492 Y SMAD3 RP11-342M21.2 NA NA NA NA RP11-342M21.2 23518 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 67440032 67440420 67440131 Y NA RP11-342M21.2 NA NA NA NA RP11-342M21.2 2755 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 67440675 67441024 67440815 Y SMAD3 RP11-342M21.2 NA NA NA NA RP11-342M21.2 3398 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 67490281 67490446 67490307 Y SMAD3 NA NA NA NA NA RP11-342M21.2 53004 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 68132952 68133362 68133003 Y PIAS1,CALML4 NA NA NA NA NA PIAS1 211155 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 68564194 68564543 68564236 Y NA CLN6,FEM1B FEM1B,CLN6,ANP32A,CORO2B,ITGA11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FEM1B 3598 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 68564990 68565500 68565181 Y NA CLN6,FEM1B CLN6,ANP32A,CORO2B,FEM1B IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FEM1B 2641 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 68588456 68588855 68588647 Y ITGA11 CLN6,FEM1B NA NA NA NA FEM1B 20315 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 68771712 68772048 68771882 Y ITGA11 NA ITGA11,CORO2B,MIR548H4 IMR90 Hi-C 24141950 CORO2B 97260 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 68878617 68878894 68878756 Y CORO2B CORO2B NA NA NA NA CORO2B 9309 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 69376017 69376173 69376096 Y NA NA NA NA NA NA GLCE 74750 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 69385602 69385765 69385704 Y NA NA NA NA NA NA GLCE 65158 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 69724089 69724530 69724231 Y NA KIF23,RP11-253M7.1,RPLP1 NA NA NA NA RPLP1 18593 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 70391261 70391735 70391557 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 2746 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 70391851 70392235 70392005 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3336 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr15 70392397 70392607 70392502 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3882 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 70785060 70785587 70785260 Y TLE3 NA KIF23,LOC145837,TLE3,C15orf50,UACA IMR90 Hi-C 24141950 UACA 268345 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 70797214 70797333 70797235 Y TLE3 NA TLE3,KIF23,RPLP1 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 256599 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 70800143 70800820 70800577 Y NA NA KIF23,RPLP1,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 253112 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 71176892 71177111 71177002 Y NA LRRC49,LARP6,THAP10 NA NA NA NA THAP10 6013 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 71373131 71373408 71373250 Y NA NA LRRC49,THSD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THAP10 190007 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 71385768 71386181 71385996 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 202644 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 71408872 71409066 71408998 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 225748 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 71409431 71409745 71409525 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 226307 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 71571390 71571701 71571551 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 388266 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr15 71571969 71572363 71572175 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 388845 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 71615809 71616164 71615988 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 432685 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 71872548 71872837 71872596 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 531762 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 73926570 73926835 73926736 Y PML NPTN,CD276 C15orf60 IMR90 Hi-C 24141950 NPTN 2095 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 73978221 73978605 73978367 Y NA CD276 NA NA NA NA CD276 3914 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 74412993 74413248 74413104 Y STRA6,CCDC33,C15orf59,TBC1D21 NA NA NA NA NA RP11-60L3.1 79798 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 74666695 74666987 74666837 Y CLK3,ARID3B NA NA NA NA NA SEMA7A 57821 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 74677413 74677899 74677622 Y SEMA7A,SEMA7A,CSK,CLK3,ARID3B SEMA7A SEMA7A K562 ChIA-PET 22265404 SEMA7A 46909 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.78721207838333 chr15 74689389 74689592 74689450 Y SEMA7A,SEMA7A SEMA7A NA NA NA NA SEMA7A 35216 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr15 74823971 74824076 74824015 Y NA ARID3B ARID3B MCF7 ChIA-PET 22265404 ARID3B 7442 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 74834290 74834419 74834369 Y ULK3,CSK,CLK3,ARID3B ARID3B NA NA NA NA ARID3B 2772 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 74908840 74909023 74908946 Y NA CLK3 NA NA NA NA CLK3 19999 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 75018665 75019349 75018947 Y SCAMP2,C15orf39,CYP1A1 EDC3,CYP1A1 NA NA NA NA CYP1A1 2714 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 75075558 75076065 75075775 Y ARID3B,CLK3,CLK3,SCAMP2,C15orf39,CSK CSK NA NA NA NA CSK 3160 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 75081771 75082003 75081872 Y ARID3B,CLK3,C15orf39,CSK CSK NA NA NA NA CSK 9373 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 75400106 75401427 75400997 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,C15orf39 NA C15orf39,SCAMP5,PPCDC MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C15orf39 84557 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 75744907 75745094 75744993 Y C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1089 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr15 75746315 75746749 75746512 Y PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 132 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr15 75747348 75747533 75747407 Y RPP25,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1165 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 75959061 75959441 75959310 Y SNX33 SNUPN,SNX33,IMP3,CSPG4 NA NA NA NA IMP3 20014 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr15 76639120 76639380 76639270 Y NA ETFA,ISL2 NA NA NA NA ISL2 12055 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 77351977 77352357 77352309 Y NA TSPAN3 PSTPIP1 IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN3 21969 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 78343418 78343565 78343498 Y IREB2,TBC1D2B TBC1D2B,SNORA63 NA NA NA NA TBC1D2B 24501 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 78361071 78361580 78361229 Y IREB2,TBC1D2B TBC1D2B,SNORA63 NA NA NA NA TBC1D2B 6486 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 79216586 79216987 79216944 Y RASGRF1 CTSH NA NA NA NA CTSH 22929 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 79272176 79272521 79272351 Y NA CTSH NA NA NA NA CTSH 32260 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 79280826 79281229 79281127 Y CTSH CTSH NA NA NA NA CTSH 40910 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 80258107 80258932 80258427 Y MTHFS,MTHFS,ST20,ST20-MTHFS,ST20,ZFAND6,BCL2A1 C15ORF37,ST20,BCL2A1 NA NA NA NA BCL2A1 2856 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 80261486 80261590 80261586 Y NA C15ORF37,ST20,BCL2A1 NA NA NA NA BCL2A1 198 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 80303455 80303586 80303521 Y ZFAND6,BCL2A1 BCL2A1,ZFAND6 FAH,ZFAND6,ST20-MTHFS,MTHFS IMR90 Hi-C 24141950 BCL2A1 41667 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 80880322 80880600 80880404 Y ARNT2 NA NA NA NA NA KIAA1199 189084 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 80881213 80881527 80881378 Y MESDC1 NA NA NA NA NA KIAA1199 188157 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 83680959 83681167 83681099 Y NA HOMER2,FAM103A1,C15orf40 NA NA NA NA C15orf40 2566 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 83683180 83683566 83683373 Y NA HOMER2,FAM103A1,C15orf40 NA NA NA NA C15orf40 4787 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 83777211 83777631 83777545 Y NA BTBD1 NA NA NA NA BTBD1 43105 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 83778085 83778410 83778297 Y NA BTBD1 NA NA NA NA BTBD1 43979 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 83857531 83857848 83857643 Y AP3B2,HDGFRP3 HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 16922 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 83869144 83869263 83869183 Y NA HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 5507 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 83879617 83879962 83879641 Y NA HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 4847 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 83954950 83955303 83955151 Y BNC1 BNC1 NA NA NA NA BNC1 3484 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr15 83956370 83956763 83956596 Y BNC1 BNC1 NA NA NA NA BNC1 4904 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr15 84040858 84041607 84041233 Y NA NA SH3GL3,BNC1 IMR90 Hi-C 24141950 SH3GL3 72373 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 84048302 84048583 84048506 Y BNC1 NA SH3GL3,BNC1 IMR90 Hi-C 24141950 SH3GL3 65397 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr15 85131508 85131753 85131631 Y PDE8A ZSCAN2 NA NA NA NA ZSCAN2 10464 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 85455479 85455863 85455740 Y SLC28A1 NA NA NA NA NA PDE8A 65808 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 85458286 85458507 85458420 Y NA NA NA NA NA NA PDE8A 63164 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 85645018 85645768 85645040 Y NA NA NA NA NA NA PDE8A 123347 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 85711891 85712151 85712051 Y NA NA PDE8A MCF7 ChIA-PET 22265404 PDE8A 190220 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 85725231 85725336 85725284 Y NA NA NA NA NA NA AKAP13 196466 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 85886798 85887001 85886900 Y NA AKAP13 AKAP13 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP13 34801 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 85956762 85957097 85956878 Y AKAP13,PDE8A AKAP13,CTD-2262B20.1 NA NA NA NA CTD-2262B20.1 303 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 86163966 86164265 86164150 Y NA NA NA NA NA NA KLHL25 171996 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 86211201 86211615 86211423 Y AKAP13,KLHL25 NA NA NA NA NA KLHL25 124646 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr15 86321738 86321858 86321816 Y NA KLHL25 NA NA NA NA KLHL25 14403 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 86337060 86337529 86337372 Y NA KLHL25 NA NA NA NA KLHL25 799 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 89532902 89533939 89533555 Y NA NA MFGE8,ABHD2 IMR90 Hi-C 24141950 MFGE8 78260 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 89856537 89857272 89856853 Y NA POLG,LINC00925 NA NA NA NA POLG 18820 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 89923171 89923194 89923182 Y NA POLG,LINC00925 NA NA NA NA LINC00925 20361 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 90197559 90197639 90197586 Y KIF7 KIF7,PEX11A,WDR93 NA NA NA NA KIF7 877 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 90223736 90224077 90223949 Y NA KIF7,PEX11A,WDR93 NA NA NA NA PEX11A 7937 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 90441878 90442278 90442169 Y C15orf38 AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38 NA NA NA NA AP3S2 6304 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 90547918 90548344 90548145 Y NA ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 5294 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 90754464 90755447 90755260 Y SEMA4B,SEMA4B,CIB1 CIB1 NA NA NA NA CIB1 19832 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 90944087 90944636 90944284 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 14637 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 91191799 91192162 91191976 Y UNC45A,FES,FES,FES,C15orf58,IQGAP1 NA NA NA NA NA RP11-387D10.2 66210 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 91412875 91413318 91412960 Y IQGAP1,FURIN,UNC45A,FES,FES,FES FURIN,MAN2A2 NA NA NA NA FURIN 3053 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 92293461 92293635 92293548 Y NA NA NA NA NA NA SLCO3A1 101290 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 92481402 92481730 92481524 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA SLCO3A1 86477 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 92486330 92486707 92486433 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA SLCO3A1 91405 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 93347056 93347810 93347183 Y CHD2 NA NA NA NA NA RP11-386M24.4 71631 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 93354824 93354998 93354897 Y CHD2 NA NA NA NA NA CHD2 69528 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 93374780 93375598 93375185 Y NA CHD2 CHD2,LOC100507217,ASB9P1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD2 48928 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 93520042 93520437 93520098 Y CHD2 NA NA NA NA NA CHD2 95516 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 94815502 94815543 94815523 Y NA MCTP2 NA NA NA NA MCTP2 42735 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 95802916 95802946 95802933 Y NA NA NA NA NA NA MCTP2 1030149 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 96703320 96703585 96703453 Y NA NA LOC400456,NR2F2 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F2 163582 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 96807705 96807805 96807755 Y NA NA LOC400456 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F2 59362 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 96867848 96868085 96868000 Y NR2F2,NR2F2,NR2F2 NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3 NA NA NA NA NR2F2-AS1 505 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 96884042 96884481 96884402 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3 NA NA NA NA RP11-522B15.3 10985 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 96884534 96884884 96884709 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3 NA NA NA NA RP11-522B15.3 10582 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 98545444 98546413 98546248 Y NA NA NA NA NA NA ARRDC4 84660 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 98698078 98698430 98698265 Y IGF1R NA NA NA NA NA ARRDC4 237294 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 99091450 99092159 99091603 Y NA NA IGF1R,SYNM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IGF1R 98041 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 99193577 99194531 99194069 Y IGF1R IGF1R NA NA NA NA IGF1R 3377 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.4505489918951 chr15 99366453 99366700 99366460 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 176253 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 99387029 99387216 99387183 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 196829 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 99387614 99387887 99387660 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 197414 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 99394435 99394579 99394453 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 204235 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 99396507 99396665 99396608 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 206307 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 99397047 99397167 99397105 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 206847 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr15 99401021 99401241 99401076 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 210821 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 99409255 99409515 99409377 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 219055 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr15 99409834 99409977 99409865 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 219634 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 99416036 99416369 99416103 Y IGF1R NA NA NA NA NA SYNM 220051 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr15 99450086 99450215 99450157 Y IGF1R NA NA NA NA NA SYNM 186205 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr15 99965380 99965718 99965580 Y MEF2A,MEF2A MEF2A LRRC28,MEF2A,LYSMD4 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 49652 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 99973623 99973819 99973721 Y MEF2A,MEF2A MEF2A LRRC28,LYSMD4,MEF2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MEF2A 41551 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr15 99975346 99975780 99975666 Y NA MEF2A LRRC28,LYSMD4,MEF2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MEF2A 39590 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 99995215 99995527 99995307 Y MEF2A,MEF2A MEF2A MEF2A,LRRC28 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 19843 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr15 100026499 100026994 100026794 Y MEF2A,MEF2A MEF2A MEF2A,LRRC28,LYSMD4 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 11129 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 101233795 101233911 101233855 Y ASB7,ALDH1A3 NA ALDH1A3,LRRK1,SELS IMR90 Hi-C 24141950 LINS 92360 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 101253659 101254026 101253922 Y ALDH1A3 NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90 Hi-C 24141950 LINS 112224 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr15 101261253 101261648 101261594 Y NA NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINS 119818 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr15 101261855 101262549 101262221 Y NA NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINS 120420 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.4505489918951 chr15 101265417 101265591 101265495 Y ALDH1A3 NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-66B24.2 122175 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr15 101462538 101462736 101462613 Y NA ALDH1A3,LRRK1 NA NA NA NA LRRK1 5118 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr15 101783359 101783726 101783540 Y CHSY1 CHSY1,SNRPA1 NA NA NA NA CHSY1 6411 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr15 101860934 101861170 101861021 Y CHSY1,TM2D3 SNRPA1 NA NA NA NA SNRPA1 27447 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 121563 121849 121614 Y TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA RHBDF1 2505 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr16 578748 579156 578911 Y LUC7L PIGQ NA NA NA NA PIGQ 35839 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr16 643606 643989 643708 Y SSTR5,RAB40C,RAB40C PIGQ,RAB40C,C16orf13,FAM195A NA NA NA NA RAB40C 6249 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 756470 756692 756669 Y NA RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,METRN,FAM173A,HAGHL,NARFL NA NA NA NA METRN 6423 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 1132307 1132794 1132674 Y RAB40C,RAB40C,WDR90,CACNA1H,SSTR5 SSTR5 NA NA NA NA SSTR5 11551 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.78221744865098 chr16 1381826 1382192 1381930 Y UNKL,SPSB3,MAPK8IP3,EME2,BAIAP3,BAIAP3 UBE2I,GNPTG NA NA NA NA GNPTG 17732 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 2041117 2041468 2041266 Y MAPK8IP3,EME2,SPSB3 NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,NPW,SLC9A3R2 NA NA NA NA SYNGR3 3456 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 2057211 2057401 2057386 Y NA NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,NPW,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 NA NA NA NA ZNF598 423 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 2057818 2059084 2058234 Y TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598 SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 NA NA NA NA ZNF598,NPW 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr16 2743231 2743530 2743363 Y NA ERVK13-1,KCTD5 NA NA NA NA KCTD5 12755 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 3053798 3054225 3053960 Y NA KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1,CCDC64B,MMP25 NA NA NA NA CLDN9 6232 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 3060017 3060177 3060084 Y NAT15,PRSS22,CCDC64B,THOC6,CLDN9 KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1,CCDC64B,MMP25 NA NA NA NA CLDN9 280 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 IL32,ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 3624 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chr16 3200393 3200919 3200597 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 22615 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 3221173 3221513 3221502 Y NA ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 43395 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr16 3237977 3238591 3238121 Y NA ZNF200 ZNF200 K562 ChIA-PET 22265404 ZNF200 45630 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 3285972 3286117 3286070 Y PRSS22,ZSCAN10,ZNF200,ZNF200,ZNF200,ZNF75A,ZNF263 ZNF200,ZNF263 NA NA NA NA ZNF200 1751 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 3796349 3796366 3796358 Y NA TRAP1 NA NA NA NA TRAP1 30751 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 4233647 4234082 4234013 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 69461 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr16 4321625 4322178 4321908 Y ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4 TFAP4 NA NA NA NA TFAP4 549 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr16 4349200 4349352 4349284 Y NA TFAP4 ADCY9,TFAP4,CREBBP,VASN,CORO7-PAM16 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 28124 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 4427155 4427449 4427262 Y NA PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3 NA NA NA NA VASN 7306 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 4666118 4666710 4666381 Y NA MGRN1 NA NA NA NA MGRN1 1624 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 4985283 4985359 4985321 Y NA SEC14L5,PPL NA NA NA NA SEC14L5 20959 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 4993356 4993730 4993477 Y PPL SEC14L5,PPL UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEC14L5 12588 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 6132184 6132568 6132193 Y NA NA NA NA NA NA FAM86A 986375 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 8931520 8931573 8931545 Y NA TMEM186,CARHSP1 NA NA NA NA CARHSP1 29293 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 10672618 10672930 10672712 Y NA EMP2 NA NA NA NA EMP2 63 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 10688488 10688836 10688661 Y NA EMP2 EMP2,TEKT5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EMP2 15933 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 10844975 10845319 10845147 Y NA NUBP1 NA NA NA NA NUBP1 9332 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 10956294 10956664 10956435 Y NUBP1,CIITA CIITA CIITA IMR90 Hi-C 24141950 CIITA 12391 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 11277053 11277355 11277217 Y LITAF NA NA NA NA NA RMI2 64121 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 11295999 11296122 11296015 Y SNN,LITAF,LITAF,NUBP1,CIITA,SOCS1 RMI2 NA NA NA NA RMI2 45354 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 11296512 11296770 11296676 Y SNN,LITAF,NUBP1 RMI2 NA NA NA NA RMI2 44706 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 11336726 11336842 11336760 Y LITAF,LITAF RMI2,SOCS1 NA NA NA NA RMI2 4634 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 11391500 11391628 11391615 Y ZC3H7A,TXNDC11,LITAF,CIITA,SOCS1 SOCS1 SOCS1,DEXI,CLEC16A,PRM2,PRM3,TNP2,RMI2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SOCS1 43464 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 11397402 11397565 11397484 Y NA SOCS1 CLEC16A,TNP2,RMI2,ZC3H7A,BCAR4,SOCS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SOCS1 49366 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 11407202 11407368 11407306 Y NA NA CLEC16A IMR90 Hi-C 24141950 SOCS1 59166 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 11591931 11591962 11591945 Y NA NA SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF IMR90 Hi-C 24141950 LITAF 136275 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr16 11662178 11662507 11662365 Y NA NA NA NA NA NA LITAF 65730 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 11677764 11678427 11678146 Y SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,SNN,LITAF,LITAF LITAF NA NA NA NA LITAF 49810 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 11707277 11708060 11707802 Y SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF TXNDC11,CLEC16A,LITAF,RSL1D1,BCAR4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LITAF 20177 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 11709603 11709900 11709765 Y RUNDC2A LITAF TXNDC11,CLEC16A,LITAF,RSL1D1,BCAR4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LITAF 18337 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 11713232 11713400 11713276 Y SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF,SNN TXNDC11,CLEC16A,LITAF,RSL1D1,BCAR4 IMR90 Hi-C 24141950 LITAF 14837 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 11726508 11726794 11726693 Y NA LITAF,SNN CLEC16A,LITAF,TXNDC11,SNN IMR90 Hi-C 24141950 LITAF 1443 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 11734091 11734770 11734262 Y SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF,SNN TXNDC11,SNN,CLEC16A,LITAF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LITAF 5854 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr16 11955170 11955449 11955310 Y NA RSL1D1 ZC3H7A,RSL1D1,BCAR4 IMR90 Hi-C 24141950 RSL1D1 11728 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 11968147 11968344 11968329 Y ZC3H7A RSL1D1,GSPT1 RSL1D1 IMR90 Hi-C 24141950 RSL1D1 24705 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 12008398 12008797 12008598 Y NA GSPT1 NA NA NA NA GSPT1 459 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 13711555 13711851 13711703 Y NA NA NA NA NA NA ERCC4 300163 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 14379572 14379808 14379698 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 216394 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 15684514 15685137 15684868 Y NDE1,NDE1,KIAA0430 KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA KIAA0430 49886 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 19532119 19532450 19532314 Y CCP110 RNU4-46P,GDE1,CCP110,C16orf62 NA NA NA NA GDE1 652 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 19714468 19714843 19714656 Y NA IQCK NA NA NA NA IQCK 10935 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 20877631 20877934 20877768 Y NA LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA LYRM1 31256 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 20908672 20908960 20908809 Y CRYM,LYRM1,DCUN1D3 LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA LYRM1 230 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 20910424 20910792 20910538 Y NA LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA DCUN1D3 718 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 20917792 20918142 20917892 Y NA LYRM1,ERI2,DCUN1D3 DNAH3 IMR90 Hi-C 24141950 DCUN1D3 8086 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 21313038 21313456 21313158 Y NA CRYM-AS1 NA NA NA NA CRYM-AS1 2868 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 22046502 22046742 22046619 Y NA C16orf52 NA NA NA NA C16orf52 29543 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 22202596 22202946 22202679 Y POLR3E,CDR2 EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 12657 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr16 22207042 22207397 22207176 Y NA EEF2K POLR3E,EEF2K,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 8206 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr16 22349127 22349159 22349143 Y POLR3E POLR3E NA NA NA NA POLR3E 42397 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 23291084 23291445 23291261 Y USP31 NA SCNN1B,SCNN1G,COG7 IMR90 Hi-C 24141950 SCNN1G 99048 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 23831613 23831716 23831661 Y NA NA NA NA NA NA PLK1 144636 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 25740472 25740795 25740634 Y ZKSCAN2,HS3ST4 NA NA NA NA NA ZKSCAN2 473220 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 27275592 27275718 27275658 Y NA NSMCE1,IL4R NA NA NA NA NSMCE1 2397 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 27326906 27327374 27327287 Y KIAA0556,IL4R NSMCE1,IL4R NA NA NA NA IL4R 3917 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr16 27338285 27338559 27338369 Y KIAA0556,IL4R IL4R NA NA NA NA IL4R 15296 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 28160349 28160575 28160437 Y SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6 NA NA NA NA NA XPO6 60666 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 28179891 28180117 28180009 Y SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6 XPO6 NA NA NA NA XPO6 41124 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 29168403 29168702 29168538 Y SPNS1 NA RRN3P2 IMR90 Hi-C 24141950 SPNS1 184861 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 29283104 29283213 29283156 Y SPNS1 NA NA NA NA NA SPNS1 299562 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 29954900 29955228 29955066 Y NA SEZ6L2,ASPHD1,KCTD13,TMEM219,TAOK2,INO80E MVP,KCTD13,ZG16,PRRT2,MAZ,KIF22,C16orf54,LOC440356,ASPHD1,SEZ6L2,CDIPT,TMEM219,TAOK2,HIRIP3,INO80E,ALDOA IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM219 4694 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE SAS hg19 FANTOM5 5.12387516487157 chr16 30726552 30726958 30726731 Y ZNF668,ZNF646,STX4,MYST1,FUS SRCAP,PHKG2,RNF40,C16orf93 RNF40,PHKG2,C16orf93 IMR90 Hi-C 24141950 SRCAP 19022 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 30876491 30876606 30876548 Y NA MIR4519,BCL7C,CTF1 NA NA NA NA MIR4519 8038 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 31888684 31889219 31888998 Y ARMC5,ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 5605 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 31905713 31906088 31906002 Y ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 22634 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr16 34956727 34956933 34956830 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 3073648 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 46392244 46392645 46392447 Y NA NA NA NA NA NA SHCBP1 260893 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 47175603 47175949 47175815 Y NETO2 NA NA NA NA NA NETO2 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr16 47669133 47669265 47669199 Y NA NA NA NA NA NA ITFG1 173073 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 48373783 48374217 48374017 Y LONP2,N4BP1,SIAH1 NA NA NA NA NA LONP2 97576 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 48645394 48646040 48645807 Y SIAH1,N4BP1 N4BP1 NA NA NA NA N4BP1 6019 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 49056369 49056621 49056485 Y NA NA NA NA NA NA N4BP1 404310 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 50280304 50280568 50280347 Y NA ADCY7 NA NA NA NA ADCY7 2256 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 50287533 50287795 50287656 Y NA ADCY7 NA NA NA NA ADCY7 9485 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 50424981 50425490 50425226 Y NKD1 BRD7 NA NA NA NA BRD7 24136 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 50554457 50554868 50554623 Y BRD7,NKD1 NA NKD1 IMR90 Hi-C 24141950 BRD7 153612 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 52854151 52854308 52854232 Y NA NA NA NA NA NA RP11-297L17.6 166935 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 53089565 53089820 53089729 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 2620 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 53114402 53114975 53114686 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 27457 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 53802432 53802770 53802659 Y NA NA NA NA NA NA FTO 66557 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 53915459 53915524 53915492 Y NA NA NA NA NA NA FTO 179584 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 53947888 53947948 53947918 Y NA NA NA NA NA NA FTO 212013 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 56406318 56406482 56406386 Y NA NA NA NA NA NA AMFR 50968 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 56641054 56641530 56641359 Y MT2A,MT1E MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A,MT1F NA NA NA NA MT2A 943 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr16 56644047 56644457 56644379 Y NLRC5,HERPUD1 MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A,MT1F NA NA NA NA MT2A 3936 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr16 57034523 57034824 57034736 Y NLRC5 NLRC5 NA NA NA NA NLRC5 13126 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 57294233 57294672 57294611 Y CPNE2,GPR56 ARL2BP,PLLP NA NA NA NA ARL2BP 17223 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 57573031 57573089 57573067 Y GPR114 CCDC102A NA NA NA NA CCDC102A 4520 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 57654867 57655271 57654917 Y NA GPR56 NA NA NA NA GPR56 12303 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 57655846 57656393 57655974 Y FAM192A,COQ9,CIAPIN1,GPR56 GPR56 NA NA NA NA GPR56 13282 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 57657206 57657412 57657318 Y NA GPR56 NA NA NA NA GPR56 14642 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 57680678 57681373 57680764 Y NA GPR56 NA NA NA NA GPR56 38114 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 57717053 57717380 57717096 Y FAM192A,ZNF319,GPR97 NA NA NA NA NA KATNB1 50262 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chr16 57841964 57842337 57842236 Y NA NA NA NA NA NA KIFC3 52620 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr16 58160772 58161211 58161024 Y C16orf80 C16orf80 NA NA NA NA C16orf80 143 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 58445622 58445902 58445848 Y NA NDRG4 NA NA NA NA NDRG4 48848 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 65378012 65378388 65378200 Y NA NA NA NA NA NA LINC00920 1062039 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 66170755 66170866 66170865 Y NA NA CDH11,LOC283867 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00920 269561 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 66402291 66402426 66402363 Y NA LINC00920 NA NA NA NA LINC00920 38001 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 66416297 66416567 66416426 Y CDH5 LINC00920 NA NA NA NA LINC00920 23860 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr16 66416918 66416958 66416940 Y NA LINC00920 NA NA NA NA LINC00920 23469 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 66440915 66440994 66440955 Y CMTM3,CMTM3 LINC00920 NA NA NA NA LINC00920 488 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 66555983 66556387 66556198 Y CKLF TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1 NA NA NA NA TK2 28060 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 66557840 66558108 66558016 Y CKLF TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1 NA NA NA NA TK2 26339 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 66659405 66659873 66659770 Y NA CMTM3 NA NA NA NA CMTM3 23628 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 66709355 66709374 66709366 Y DYNC1LI2 CMTM4 NA NA NA NA CMTM4 19236 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 66906996 66907469 66907329 Y SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2 NAE1,PDP2 NA NA NA NA NAE1 1837 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr16 66960903 66961306 66961106 Y PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD RRAD,FAM96B,CES2,CES3 NA NA NA NA RRAD 3356 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.55944026756961 chr16 66988106 66988414 66988274 Y NA RRAD,FAM96B,CES2,CES3,CES4A NA NA NA NA CES3 4726 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 67011641 67011860 67011695 Y NA FAM96B,CES2,CES3,CES4A,CBFB NA NA NA NA CES4A 8632 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 67250789 67251131 67250954 Y NA NOL3,KIAA0895L,E2F4,ELMO3,LRRC29,TMEM208,FHOD1 NA NA NA NA LRRC29 7820 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 67345616 67346198 67345888 Y RRAD,CBFB,FAM65A,FHOD1,PLEKHG4 PLEKHG4 NA NA NA NA PLEKHG4 36203 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 67435763 67435871 67435819 Y NA TPPP3,ZDHHC1 NA NA NA NA TPPP3 10325 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr16 67597304 67597932 67597899 Y THAP11,RLTPR,ACD FAM65A,CTCF NA NA NA NA CTCF 2994 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 67867011 67867153 67867060 Y TPPP3,CENPT RANBP10,TSNAXIP1,THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,NRN1L NA NA NA NA THAP11 7060 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 67891676 67892114 67891889 Y RLTPR,ACD,PSMB10,NFATC3,EDC4,THAP11 THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,NRN1L,PSKH1 NA NA NA NA CENPT 11962 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 67892470 67892795 67892734 Y RLTPR,ACD,NFATC3,EDC4,THAP11 THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,NRN1L,PSKH1 NA NA NA NA EDC4 12131 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 68268995 68269119 68269015 Y NA ESRP2,PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA ESRP2 886 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr16 68271348 68271876 68271591 Y TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2 ESRP2,PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA ESRP2 1343 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr16 68303268 68303682 68303412 Y THAP11,EDC4,PSMB10,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7 ESRP2,PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7 NA NA NA NA SLC7A6 6835 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 68320405 68320913 68320608 Y ZFP90,SMPD3 PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P NA NA NA NA SLC7A6OS 21936 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 68418958 68419037 68419019 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-30P 57526 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr16 68503731 68504029 68503905 Y NA SMPD3 PRMT7,SMPD3 IMR90 Hi-C 24141950 SMPD3 23140 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 68699559 68699790 68699677 Y ESRP2 CDH3 NA NA NA NA CDH3 31467 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr16 68702238 68702569 68702370 Y NA CDH3 NA NA NA NA CDH3 34146 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 68794775 68795028 68794920 Y NA CDH1 NA NA NA NA CDH1 25647 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr16 68804487 68804868 68804749 Y NA CDH1 NA NA NA NA CDH1 35359 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 68818214 68818347 68818232 Y CDH1 CDH1 NA NA NA NA CDH1 49086 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 68824913 68825217 68824976 Y NA NA NA NA NA NA CDH1 55785 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 69060339 69060481 69060445 Y NA NA NA NA NA NA HAS3 76986 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr16 69351854 69351929 69351891 Y NA VPS4A,PDF,NIP7,COG8 NA NA NA NA VPS4A 8595 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 69432325 69432475 69432421 Y TERF2 TERF2,CYB5B NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TERF2 7999 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 69563572 69563696 69563627 Y NA NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFAT5 33301 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 69564577 69564882 69564731 Y WWP2 NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFAT5 32115 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 69601109 69601332 69601245 Y WWP2 NFAT5 NA NA NA NA NFAT5 4112 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 69603393 69603628 69603450 Y NA NFAT5 NA NA NA NA NFAT5 6396 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 69777344 69777472 69777408 Y NA NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA NOB1 9371 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.67082885811029 chr16 69796957 69797361 69797156 Y EXOSC6,WWP2 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2748 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 70461908 70462625 70462132 Y ST3GAL2 ST3GAL2,FUK NA NA NA NA ST3GAL2 8515 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr16 70470997 70471281 70471214 Y NA FUK NA NA NA NA ST3GAL2 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 70530551 70530780 70530688 Y NA FUK,COG4,SF3B3,SNORD111B NA NA NA NA COG4 24688 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 70779915 70780216 70780046 Y NA NA NA NA NA NA VAC14 52848 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 71046758 71046771 71046763 Y NA NA NA NA NA NA VAC14 213694 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 71070712 71070940 71070844 Y NA NA NA NA NA NA VAC14 237648 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 72459158 72459630 72459377 Y NA NA NA NA NA NA TXNL4B 332828 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr16 72671878 72672163 72672013 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 419434 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 73088640 73089206 73088991 Y NA ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 2391 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 73104505 73104770 73104567 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 12908 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 74353064 74353398 74353241 Y FA2H PSMD7,RP11-252A24.2 NA NA NA NA PSMD7 24391 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 74701397 74701877 74701440 Y RFWD3 RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 2618 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 74702224 74702291 74702259 Y NA RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 3445 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr16 74777612 74777799 74777727 Y NA MLKL,FA2H NA NA NA NA FA2H 28930 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 74791303 74791619 74791461 Y NA FA2H NA NA NA NA FA2H 15110 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 75045854 75046060 75045918 Y TMEM170A,MLKL ZNRF1,WDR59 NA NA NA NA WDR59 13783 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 75278988 75279894 75279594 Y CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1 BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 20057 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr16 75283958 75284369 75284078 Y NA BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 15582 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 75286788 75287025 75286897 Y NA BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 12926 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 75290169 75290488 75290250 Y NA BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 9463 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 75410566 75410863 75410755 Y BCAR1 NA NA NA NA NA CFDP1 54520 CAGE SAS hg19 FANTOM5 7.01748120406323 chr16 75411958 75412267 75412159 Y NA NA NA NA NA NA CFDP1 53116 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr16 75598847 75599270 75599139 Y TMEM170A TMEM231,GABARAPL2 NA NA NA NA GABARAPL2 598 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 78498317 78498699 78498508 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 367007 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 79692252 79692530 79692298 Y NA NA WWOX IMR90 Hi-C 24141950 DYNLRB2 880101 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 80060890 80061347 80061153 Y NA NA NA NA NA NA DYNLRB2 511284 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 80208286 80208441 80208438 Y NA NA NA NA NA NA DYNLRB2 364190 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 80710391 80710578 80710565 Y NA NA NA NA NA NA CDYL2 125648 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 80838768 80839127 80839024 Y CENPN,C16orf61,ATMIN,CDYL2 CDYL2 NA NA NA NA CDYL2 2542 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 81026963 81027197 81027054 Y NA CENPN,ATMIN NA NA NA NA CENPN 10906 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 81434776 81434850 81434813 Y NA CMIP NA NA NA NA CMIP 41925 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr16 81436864 81437191 81437044 Y NA CMIP NA NA NA NA CMIP 39584 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr16 81439497 81439896 81439576 Y NA CMIP NA NA NA NA CMIP 36879 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr16 81491583 81491773 81491678 Y NA CMIP NA NA NA NA CMIP 14808 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 81514966 81515415 81515191 Y NA CMIP NA NA NA NA CMIP 38191 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 81555726 81556034 81555821 Y CMIP NA NA NA NA NA CMIP 78951 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 81560583 81561027 81560837 Y PLCG2,CMIP,CMIP NA NA NA NA NA CMIP 83808 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr16 81617620 81618040 81617835 Y NA NA NA NA NA NA CMIP 140845 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 81634791 81634955 81634874 Y GAN NA NA NA NA NA PLCG2 135747 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr16 81659418 81659741 81659491 Y PLCG2,CMIP NA NA NA NA NA PLCG2 110961 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 81659842 81660553 81660320 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 110149 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 81660645 81660993 81660973 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 109709 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 81701284 81701528 81701406 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 69174 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 81763852 81764387 81764185 Y NA PLCG2 NA NA NA NA PLCG2 6315 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 81875278 81875726 81875461 Y PLCG2 NA NA NA NA NA PLCG2 104576 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 82661526 82661961 82661896 Y CDH13 CDH13 NA NA NA NA CDH13 3118 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr16 82662605 82662975 82662756 Y CDH13 CDH13 NA NA NA NA CDH13 4197 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 82667775 82667948 82667787 Y NA CDH13 NA NA NA NA CDH13 9367 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr16 82685978 82686417 82686161 Y NA CDH13 HSBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CDH13 27570 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 82686651 82686853 82686732 Y NA CDH13 HSBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CDH13 28243 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 82687467 82688028 82687715 Y NA CDH13 HSBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CDH13 29059 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr16 82689057 82689347 82689181 Y NA CDH13 NA NA NA NA CDH13 30649 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr16 82693893 82694152 82693974 Y NA CDH13 NA NA NA NA CDH13 35485 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 82733427 82733620 82733554 Y NA NA NA NA NA NA CDH13 75019 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 83069400 83069774 83069647 Y NA NA NA NA NA NA CDH13 410992 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 83136521 83136871 83136696 Y NA NA NA NA NA NA CDH13 478113 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 83159856 83159879 83159868 Y NA NA NA NA NA NA CDH13 501448 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 83835897 83836084 83835978 Y NA HSBP1 HSBP1 IMR90 Hi-C 24141950 HSBP1 3364 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 84130238 84130438 84130330 Y NA MBTPS1,HSDL1 NA NA NA NA MBTPS1 18073 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 84208911 84209121 84208992 Y OSGIN1,COTL1,HSDL1,TAF1C HSDL1,TAF1C,RP11-486L19.2 NA NA NA NA TAF1C 9548 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 84523883 84523965 84523925 Y NA NA NA NA NA NA ATP2C2 123750 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 84624738 84624752 84624744 Y HSDL1,COTL1 COTL1 NA NA NA NA COTL1 24931 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 84631160 84631348 84631297 Y ZDHHC7,KIAA0513,CRISPLD2,COTL1 COTL1,KLHL36 NA NA NA NA COTL1 18335 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 84634431 84634711 84634540 Y ZDHHC7,KIAA0513,CRISPLD2,COTL1 COTL1,KLHL36 NA NA NA NA COTL1 14972 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 84785578 84785829 84785712 Y KIAA0513,COTL1 NA CRISPLD2,ZDHHC7 IMR90 Hi-C 24141950 USP10 53994 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 84862837 84863219 84863017 Y CRISPLD2 CRISPLD2 NA NA NA NA CRISPLD2 11247 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 84869763 84870234 84870125 Y CRISPLD2 CRISPLD2 NA NA NA NA CRISPLD2 18173 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 85037797 85037883 85037799 Y NA ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA ZDHHC7 5258 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 85185210 85185759 85185517 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 125835 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr16 85202555 85203049 85202710 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 143180 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.11888053513921 chr16 85346294 85346686 85346622 Y FAM92B NA KIAA0513,FAM92B,LOC400548,LINC00311,LOC727710,KIAA0182,GINS2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA0513 286919 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 85405119 85405354 85405237 Y NA NA KIAA0513,FAM92B,LINC00311,LOC727710,KIAA0182 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 316325 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 85418434 85418651 85418593 Y NA NA LOC727710,LINC00311,KIAA0182,GINS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 303028 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 85424430 85424739 85424585 Y NA NA LOC727710,LINC00311,GINS2,KIAA0182,FAM92B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 296940 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 85428961 85429169 85429067 Y NA NA LOC727710,LINC00311,GINS2,KIAA0182,FAM92B IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 292510 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr16 85450092 85450367 85450166 Y NA NA LOC727710,GINS2,KIAA0182,FAM92B,LOC400548,C16orf74 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 271312 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 85497347 85497685 85497518 Y KIAA0182,GINS2 NA KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 223994 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 85548685 85548970 85548791 Y NA NA KIAA0182 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 172709 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 85557334 85557622 85557547 Y NA NA KIAA0182,LOC727710 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 164057 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 85558121 85558453 85558347 Y KIAA0182,KIAA0182 NA KIAA0182,LOC727710 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 163226 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 85586399 85586765 85586561 Y KIAA0182,KIAA0182,GINS2 NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134914 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 85586938 85587370 85587020 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134309 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 85604470 85605423 85604746 Y NA NA LINC00311,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 116256 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 85648720 85648939 85648787 Y NA NA NA NA NA NA GINS2 72740 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr16 85783425 85783755 85783547 Y NA C16orf74,COX4I1 NA NA NA NA C16orf74 690 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 85785568 85785942 85785758 Y C16orf74 C16orf74,COX4I1 NA NA NA NA C16orf74 2833 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 86029450 86029748 86029582 Y IRF8 NA MTHFSD,FLJ30679,IRF8,COX4I1,COX4NB,C16orf74,LOC732275,LOC400550,FOXF1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-568J23.1 181308 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 86962886 86963146 86962899 Y NA NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFSD 376045 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 86964858 86965748 86965178 Y NA NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFSD 378017 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr16 87498995 87499259 87499135 Y BANP,BANP,MAP1LC3B,ZCCHC14 NA NA NA NA NA FBXO31 75247 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 87774219 87774566 87774531 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 23032 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 87810498 87810587 87810524 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 12900 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 87811234 87811383 87811309 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 13636 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 87839693 87840050 87839856 Y SLC7A5 KLHDC4 SLC7A5 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLHDC4 42095 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr16 87840547 87840941 87840913 Y SLC7A5 KLHDC4 SLC7A5 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLHDC4 42949 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 87886258 87886670 87886593 Y MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 14424 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 87888208 87888468 87888297 Y KLHDC4,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 12626 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 87978906 87979489 87979213 Y ZCCHC14,BANP,BANP BANP CA5A,KLHDC4 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BANP 1361 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 88365536 88366092 88365805 Y ZNF469 NA BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 151633 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 88701263 88701663 88701374 Y SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZC3H18,CYBA CYBA,MVD,SNAI3 NA NA NA NA CYBA 13897 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 88857121 88857244 88857196 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 7502 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr16 88988977 88989104 88989054 Y NA NA TRAPPC2L,GALNS MCF7 ChIA-PET 22265404 GALNS 67599 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 88991704 88992157 88991819 Y NA NA TRAPPC2L,GALNS MCF7 ChIA-PET 22265404 GALNS 70326 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr16 89370103 89370259 89370211 Y NA NA NA NA NA NA ZNF778 87985 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 89410388 89410772 89410415 Y NA NA NA NA NA NA ZNF778 128270 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 89474257 89474602 89474526 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD11 80367 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 89555521 89555997 89555713 Y ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 196 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr16 89557852 89558189 89558050 Y NA ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 2527 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 89571786 89572109 89572034 Y ACSF3,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 16461 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 89573610 89573931 89573734 Y NA ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 18285 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 89579992 89580270 89580045 Y ACSF3,ZNF778,DBNDD1,ZNF276,SPG7 ANKRD11,SPG7,RPL13,SNORD68 NA NA NA NA SPG7 24667 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr16 89672117 89672737 89672683 Y NA RPL13,SNORD68,CPNE7,CHMP1A NA NA NA NA CPNE7 31941 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr16 90087429 90087721 90087595 Y TUBB3,DBNDD1,PRDM7 GAS8,DBNDD1 NA NA NA NA DBNDD1 2893 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 473610 473838 473725 Y FAM101B NA NA NA NA NA RPS4XP17 84949 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 594616 594984 594846 Y NA RPS4XP17,VPS53,FAM57A NA NA NA NA VPS53 27973 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 597415 597783 597745 Y NA RPS4XP17,VPS53,FAM57A NA NA NA NA VPS53 25174 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 693293 693510 693390 Y RNMTL1 DBIL5P,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4 NA NA NA NA GLOD4 9712 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 698193 698349 698271 Y NA DBIL5P,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4 NA NA NA NA GLOD4 14612 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 872760 873162 873150 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 7848 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 881410 881576 881449 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 400 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr17 881812 881896 881869 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 802 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 932596 932954 932809 Y NA TIMM22 NXN IMR90 Hi-C 24141950 TIMM22 34239 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 1171565 1171808 1171610 Y WDR81,PITPNA,ABR,ABR ABR NA NA NA NA ABR 41250 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 1254718 1255084 1255034 Y NA YWHAE NA NA NA NA YWHAE 46588 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 1267059 1267122 1267091 Y NA YWHAE NA NA NA NA YWHAE 34550 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 1358484 1358816 1358590 Y NA CRK,MYO1C NA NA NA NA CRK 5640 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 1390195 1390341 1390268 Y MYO1C,MYO1C,MYO1C CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 3765 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 1391218 1391783 1391434 Y NA CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 2323 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr17 1953067 1954207 1953327 Y TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1 RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 1241 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chr17 1970904 1971232 1971070 Y HIC1 RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 15456 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 1974774 1975359 1974921 Y SCARF1,HIC1,HIC1 RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 19326 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 2095819 2096093 2095903 Y WDR81 NA NA NA NA NA SRR 108584 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 2300026 2300553 2300288 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 1859 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr17 2302778 2303366 2303033 Y SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT MNT NA NA NA NA MNT 366 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr17 2305266 2305571 2305415 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 2854 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 2627618 2628097 2628087 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 133114 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 2757819 2758227 2758154 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 263315 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 2795960 2796135 2796054 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 301456 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr17 2863545 2863659 2863602 Y OR3A2,OR1G1 NA NA NA NA NA PAFAH1B1 369041 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 3453416 3453706 3453615 Y OR1G1,OR1A2,OR1A1,OR1E2,TRPV3 TRPV3 NA NA NA NA TRPV3 5583 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 3791812 3792145 3792008 Y GSG2 C17orf85,CAMKK1 NA NA NA NA CAMKK1 4040 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 4064613 4064785 4064717 Y NA ZZEF1,CYB5D2 NA NA NA NA CYB5D2 20151 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 4125491 4125809 4125534 Y NA ANKFY1 NA NA NA NA ANKFY1 39465 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 4244674 4245003 4244975 Y NA UBE2G1 NA NA NA NA UBE2G1 22920 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr17 4278382 4278689 4278533 Y UBE2G1 UBE2G1 NA NA NA NA UBE2G1 10459 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 4297300 4297441 4297368 Y NA UBE2G1,SPNS3 UBE2G1,SPNS3,ANKFY1,ZZEF1,CYB5D2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2G1 29377 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 4297689 4298014 4297723 Y NA UBE2G1,SPNS3 UBE2G1,SPNS3,ANKFY1,ZZEF1,CYB5D2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2G1 29766 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 4753672 4753828 4753714 Y UBE2G1,ARRB2,CXCL16,ZMYND15,ZMYND15,MINK1,RNF167,C17orf107 PLD2,MINK1 NA NA NA NA MINK1 18989 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 4811647 4812042 4811731 Y NA RNF167,SLC25A11,PFN1 NA NA NA NA RNF167 29261 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 5140050 5140412 5140231 Y NA ZNF594,RABEP1 NA NA NA NA RABEP1 43146 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 5412379 5412497 5412422 Y USP6 DHX33,MIS12,DERL2 NA NA NA NA DERL2 24248 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 5736283 5736492 5736391 Y NA NA NA NA NA NA NLRP1 215539 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 6082341 6082630 6082487 Y WSCD1 NA NA NA NA NA FAM64A 263105 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 6655808 6656203 6655969 Y RNASEK,GABARAP,XAF1 NA XAF1,MIR4520A,ALOX15P1,MIR4520B,MED31,C17orf100,FBXO39,TEKT1 IMR90 Hi-C 24141950 ALOX12P2 98977 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 6814987 6815378 6815170 Y DLG4 NA NA NA NA NA ALOX12P2 59807 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 6818045 6818590 6818345 Y NA NA NA NA NA NA ALOX12P2 62865 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 6821400 6821836 6821600 Y NA NA NA NA NA NA ALOX12P2 66220 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 6822767 6822872 6822855 Y NA NA NA NA NA NA ALOX12P2 67587 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 6842907 6843154 6843090 Y NA NA ALOX12,LOC100506713 K562 ChIA-PET 22265404 AC027763.2 70514 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 7389589 7389989 7389739 Y C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A CHRNB1,ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA POLR2A 3904 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 7737438 7738736 7737971 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 2486 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 608 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chr17 7745337 7745870 7745591 Y NA KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4115 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr17 7745915 7746944 7746139 Y NA KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4693 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.78221744865098 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 5769 CAGE SAS hg19 FANTOM5 10.2477503297431 chr17 7790181 7790340 7790322 Y POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3 KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,CNTROB,TRAPPC1 NA NA NA NA LSMD1 3625 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 8029634 8030116 8029995 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107 NA NA NA NA HES7 4224 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr17 8041932 8042438 8042328 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 15386 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 8057335 8058055 8057702 Y KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59 HES7,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 8090038 8090540 8090163 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 1024 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 8090795 8091158 8090849 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 406 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 8095551 8095762 8095658 Y KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2 PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 3987 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr17 8762730 8763052 8762926 Y NDEL1,PIK3R5,PIK3R6 NA NA NA NA NA NTN1 159807 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 9741106 9741641 9741382 Y NA NA RCVRN,GAS7 IMR90 Hi-C 24141950 USP43 195091 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 11928413 11928725 11928507 Y NA ZNF18,MAP2K4 NA NA NA NA MAP2K4 6272 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 14206072 14206436 14206180 Y HS3ST3B1 HS3ST3B1 NA NA NA NA HS3ST3B1 3672 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 15313128 15313509 15313354 Y NA NA NA NA NA NA SNORA74 161824 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 15849102 15849709 15849209 Y ZSWIM7,TTC19,ADORA2B ADORA2B NA NA NA NA ADORA2B 2871 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr17 15850564 15850918 15850801 Y ADORA2B ADORA2B,TTC19 NA NA NA NA ADORA2B 4333 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr17 15860629 15861165 15860792 Y ADORA2B,ZSWIM7,TTC19 ADORA2B,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ADORA2B 14398 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 15862469 15862773 15862614 Y ADORA2B,ZSWIM7,TTC19 ADORA2B,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ADORA2B 16238 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 15869590 15869983 15869922 Y NA ADORA2B,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ADORA2B 23359 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 15923170 15923610 15923287 Y FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 22139 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 16189250 16189597 16189494 Y NCOR1,TRPV2 NA NA NA NA NA CENPV 65373 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 16191035 16191327 16191109 Y TRPV2 NA CENPV IMR90 Hi-C 24141950 CENPV 63643 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 16375722 16375971 16375775 Y TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV NA NA NA NA NA UBB 93610 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 16438910 16439232 16439111 Y NA NA NA NA NA NA AC005822.1 79963 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr17 16922074 16922240 16922157 Y NA MPRIP FLCN,MPRIP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MPRIP 21619 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 16924574 16924970 16924629 Y NA MPRIP FLCN,MPRIP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MPRIP 18889 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 16944636 16944769 16944688 Y NA MPRIP NA NA NA NA MPRIP 777 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 16948336 16948515 16948428 Y ZNF287,ZNF624,PLD6,NT5M,MED9,FLCN,COPS3,COPS3,MPRIP MPRIP NA NA NA NA MPRIP 4477 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 17596410 17596829 17596636 Y NA RAI1 NA NA NA NA RAI1 13623 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 17597479 17598220 17598134 Y ALKBH5,FLCN,COPS3 RAI1 NA NA NA NA RAI1 14692 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr17 17615930 17616232 17616056 Y NA RAI1 NA NA NA NA RAI1 33143 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 17628792 17629315 17629145 Y NA RAI1 NA NA NA NA RAI1 46005 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 17655489 17655938 17655636 Y DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9 NA NA NA NA NA RAI1 72702 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 17743258 17743857 17743527 Y SMCR8 SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 4933 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr17 19141562 19141875 19141665 Y RNF112,EPN2 NA NA NA NA NA SNORD3D 127613 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 19627830 19628049 19627942 Y MAPK7,MAPK7 NA NA NA NA NA ALDH3A2 78381 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 19656390 19656618 19656531 Y MAPK7,MAPK7 NA NA NA NA NA ALDH3A2 106941 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 19913206 19913926 19913276 Y ULK2,AKAP10 AKAP10,SPECC1 NA NA NA NA SPECC1 2549 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 20012372 20012672 20012482 Y NA NA NA NA NA NA SPECC1 101715 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 20688064 20688832 20688343 Y NA OLA1P2,SCDP1 NA NA NA NA SCDP1 2106 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 21002403 21002809 21002523 Y KCNJ18 DHRS7B USP22,C17orf103 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHRS7B 21868 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 21179100 21179414 21179208 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 6570 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 21188812 21189500 21189174 Y MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 NA NA NA NA MAP2K3 2828 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr17 21189600 21190105 21189864 Y MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 NA NA NA NA MAP2K3 3616 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr17 21314266 21314623 21314560 Y NA KCNJ12 NA NA NA NA KCNJ12 36757 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 25568498 25568933 25568830 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 50169 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 25572576 25572861 25572643 Y WSB1 WSB1 WSB1,KSR1,MIR4522 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 46241 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr17 25659975 25660361 25659997 Y NA WSB1 NA NA NA NA WSB1 40873 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr17 25676124 25676302 25676192 Y LGALS9,WSB1 NA KSR1 IMR90 Hi-C 24141950 WSB1 57022 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr17 25821459 25821654 25821516 Y NA KSR1 NA NA NA NA KSR1 39789 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 25821729 25821988 25821800 Y NA KSR1 NA NA NA NA KSR1 40059 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 25981784 25982180 25981982 Y NA LGALS9 NA NA NA NA LGALS9 26960 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 27072804 27073286 27072989 Y TRAF4 PROCA1,RAB34,RPL23A,SNORD42B,SNORD42A,NEK8,TLCD1,TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 3802 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 27104790 27105049 27104918 Y SEBOX TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 35788 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 27116093 27116114 27116106 Y NA TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 47091 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 27129097 27129445 27129306 Y NA NA NA NA NA NA ERAL1 50511 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 27429797 27430178 27430111 Y NA NA NA NA NA NA MYO18A 75252 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 27506307 27506816 27506504 Y TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A MYO18A NA NA NA NA MYO18A 877 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 27530741 27530989 27530946 Y NA MYO18A MYO18A,TAOK1,NUFIP2 IMR90 Hi-C 24141950 MYO18A 25311 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 27539560 27540084 27539811 Y NEK8,TIAF1,MYO18A,TAOK1,GIT1 MYO18A MYO18A,NUFIP2,SEZ6,CRYBA1,TAOK1,ABHD15 IMR90 Hi-C 24141950 MYO18A 34130 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 27619094 27619880 27619581 Y TAOK1 NA NA NA NA NA NUFIP2 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 27814311 27814661 27814484 Y NA NA NA NA NA NA TP53I13 76409 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 27918115 27918172 27918144 Y GIT1,ANKRD13B TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6 NA NA NA NA GIT1 900 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 27966112 27966641 27966332 Y NA GIT1,CORO6 NA NA NA NA CORO6 18187 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 28049478 28050072 28049903 Y NUFIP2,TAOK1,SSH2 NA NA NA NA NA CORO6 101553 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 28053660 28054255 28054185 Y NUFIP2,TAOK1 NA NA NA NA NA CORO6 105735 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 28258246 28258478 28258304 Y NA SSH2 NA NA NA NA SSH2 2952 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 160050 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 30923806 30924081 30923942 Y NA NA NA NA NA NA CDK5R1 112169 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 32581116 32581488 32581294 Y NA CCL2 NA NA NA NA CCL2 812 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 33300552 33300861 33300820 Y NA ZNF830,LIG3,CCT6B NA NA NA NA LIG3 4652 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 33572314 33572864 33572356 Y NA SLFN5 NA NA NA NA SLFN5 4259 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr17 33787408 33787803 33787736 Y ZNF830,SLFN5,CCL5,SLFN12L SLFN12 NA NA NA NA SLFN12 29106 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr17 34160214 34160648 34160302 Y NA MMP28,TAF15,CCL5 NA NA NA NA TAF15 25755 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 34871446 34871455 34871448 Y NA ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2 NA NA NA NA PIGW 17392 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 34875469 34875747 34875679 Y NA ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2 NA NA NA NA PIGW 13100 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 35184574 35184592 35184583 Y NA NA AATF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-445F12.1 107368 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 35278050 35278157 35278104 Y MRM1 RP11-445F12.1,AATF LHX1,AATF MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-445F12.1 13803 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 35520107 35520138 35520123 Y ACACA NA NA NA NA NA AATF 215932 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 36412216 36412471 36412263 Y NA RP11-1407O15.2,MRPL45 NA NA NA NA RP11-1407O15.2 7387 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr17 36480536 36480738 36480637 Y NA MRPL45,SOCS7 NA NA NA NA SOCS7 25373 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 36571646 36572076 36571709 Y C17orf96 ARHGAP23 NA NA NA NA ARHGAP23 10586 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr17 36758537 36758835 36758687 Y NA SRCIN1 NA NA NA NA SRCIN1 1348 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 36907984 36908100 36908042 Y NA MLLT6,CISD3,PCGF2,PSMB3,PIP4K2B NA NA NA NA PSMB3 995 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 37558786 37559227 37559071 Y NA FBXL20,MED1 NA NA NA NA FBXL20 2010 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 37832582 37832871 37832624 Y NA STARD3,ERBB2,PGAP3 NA NA NA NA ERBB2 9296 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 37896808 37897181 37897022 Y GRB7,GRB7,GRB7,GRB7 PGAP3,MIEN1,GRB7 NA NA NA NA GRB7 4628 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 37910411 37911394 37910787 Y FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3 MIEN1,GRB7 NA NA NA NA GRB7 18231 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr17 37926144 37926589 37926429 Y FBXL20,CDK12,WIPF2,IKZF3,CASC3 MIEN1,GRB7 NA NA NA NA GRB7 33964 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 38084566 38084955 38084762 Y NA ORMDL3 NA NA NA NA ORMDL3 2712 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 38170793 38171091 38171022 Y CSF3 PSMD3,THRA,MED24 NA NA NA NA PSMD3 35743 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 38464298 38464708 38464402 Y MSL1,WIPF2,RARA,RARA CDC6,RARA NA NA NA NA RARA 854 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 38466457 38466702 38466562 Y IKZF3 CDC6,RARA NA NA NA NA RARA 3013 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 38468655 38468865 38468706 Y IKZF3,CCR7 CDC6,RARA NA NA NA NA RARA 5211 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 38607821 38607996 38607876 Y NA TOP2A,IGFBP4,TNS4 NA NA NA NA IGFBP4 10119 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 38646848 38646954 38646881 Y KRT222,THRA,RAPGEFL1 IGFBP4,TNS4 NA NA NA NA TNS4 8895 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 38655848 38656036 38655907 Y GJD3,IGFBP4,TNS4 NA NA NA NA NA TNS4 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr17 38656717 38656888 38656754 Y KRT24,KRT10,TNS4 TNS4 NA NA NA NA TNS4 868 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 38674878 38675250 38674921 Y TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4 TNS4 IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS4 19029 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr17 38689625 38689996 38689764 Y NA TNS4 NA NA NA NA TNS4 33776 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 38699205 38699580 38699386 Y RARA,CCR7 TNS4 NA NA NA NA TNS4 43356 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr17 38705273 38706158 38705806 Y GJD3,IGFBP4 TNS4 NA NA NA NA TNS4 49424 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 39066622 39066986 39066860 Y IGFBP4,KRTAP1-1,KRTAP1-5 KRT23 NA NA NA NA KRT23 24900 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 39069125 39069341 39069249 Y KRTAP3-2 KRT23 NA NA NA NA KRT23 22545 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 39108843 39109211 39109026 Y KRTAP9-2,KRTAP2-1,KRTAP3-2 KRT23 KRT23 IMR90 Hi-C 24141950 KRT23 16957 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 39110175 39110404 39110304 Y KRTAP3-2 KRT23 NA NA NA NA KRT23 18289 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.33916040135441 chr17 39113005 39113367 39113263 Y NA KRT23 NA NA NA NA KRT23 21119 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 39653134 39653351 39653234 Y NA KRT15,KRT19 NA NA NA NA KRT15 23430 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr17 39683248 39683750 39683386 Y NA KRT15,KRT19 NA NA NA NA KRT19 688 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 39686458 39686891 39686666 Y KRT19 KRT15,KRT19 NA NA NA NA KRT19 3898 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 39692337 39692600 39692431 Y KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9,KRT37 KRT15,KRT19,KRT14 KRT15,KRT19,KRT13,KRT36 IMR90 Hi-C 24141950 KRT19 9777 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr17 39703664 39703881 39703736 Y NA KRT15,KRT19,KRT14 NA NA NA NA KRT19 21104 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr17 39703962 39704520 39704217 Y NA KRT15,KRT19,KRT14 NA NA NA NA KRT19 21402 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.67082885811029 chr17 39705098 39705383 39705310 Y NA KRT15,KRT19,KRT14 NA NA NA NA KRT19 22538 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr17 39735892 39736012 39735959 Y JUP,KRT36,KRT13,KRT15,KRT19,KRT9,KRT17,KRT16,KRT14 KRT14,KRT16,KRT17 NA NA NA NA KRT14 5161 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr17 39782029 39782271 39782148 Y JUP,KRT36,KRT13,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17 KRT14,KRT16,KRT17 NA NA NA NA KRT17 2935 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr17 39807728 39808143 39807934 Y JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17 KRT16,KRT17,EIF1 KRT19,KRT15,LOC147093 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT17 28634 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 39810156 39810822 39810530 Y JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17 KRT16,KRT17,EIF1 KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KRT17 31062 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chr17 39811785 39812247 39811996 Y JUP,KRT37,KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17 KRT16,KRT17,EIF1 KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 30890 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr17 39822130 39822941 39822323 Y NA KRT17,EIF1 KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 20196 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 39823354 39823685 39823437 Y NA KRT17,EIF1 KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 19452 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 39949116 39949497 39949168 Y KRT14,JUP JUP,LEPREL4,FKBP10 NA NA NA NA JUP 7933 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr17 39949517 39949745 39949566 Y KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP JUP,LEPREL4,FKBP10 NA NA NA NA JUP 8334 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr17 39956975 39957353 39957171 Y KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17,JUP JUP,LEPREL4,FKBP10 NA NA NA NA LEPREL4 9503 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr17 40559988 40560462 40560227 Y RAMP2,CNP STAT3,PTRF,ATP6V0A1 NA NA NA NA PTRF 13073 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 40573451 40573881 40573544 Y AOC3,GHDC,PLEKHH3,NAGLU,PTRF STAT3,ATP6V0A1 NA NA NA NA PTRF 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 40608913 40609089 40609017 Y NA PTRF,ATP6V0A1 NA NA NA NA ATP6V0A1 51 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 40670495 40670831 40670653 Y WNK4,RAB5C,PTRF NAGLU,COASY,MLX NA NA NA NA NAGLU 15359 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 40671173 40671319 40671240 Y PTRF NAGLU,COASY,MLX NA NA NA NA NAGLU 14871 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 41409196 41409569 41409556 Y TMEM106A TMEM106A IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM106A 47342 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 41410079 41410140 41410127 Y NA TMEM106A IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM106A 48225 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 41428275 41428596 41428403 Y NA ARL4D NA NA NA NA ARL4D 45731 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 41441650 41441788 41441734 Y NA ARL4D NA NA NA NA ARL4D 32539 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 41478754 41478975 41478864 Y ARL4D ARL4D NA NA NA NA ARL4D 4427 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 41657407 41657423 41657415 Y MPP2 ETV4 DHX8,MIR2117,MPP2 IMR90 Hi-C 24141950 ETV4 2419 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 41685770 41686110 41685943 Y TMEM106A,DHX8,DUSP3 ETV4 DHX8,MEOX1,SOST IMR90 Hi-C 24141950 ETV4 30782 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 41796772 41797488 41797204 Y TMUB2,TMEM106A,DHX8,DUSP3 NA LOC100130581,MPP3,DUSP3,DHX8,ETV4,MEOX1,C17orf105,SOST,CD300LG,HDAC5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP3 56868 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 42173050 42173151 42173101 Y TMEM101,G6PC3 LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25919 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 42173326 42173627 42173470 Y NA LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25443 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr17 42174643 42174888 42174769 Y NA LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 24182 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 42215472 42215904 42215679 Y C17orf53 HDAC5,C17orf53,TMUB2 C17orf53 MCF7 ChIA-PET 22265404 C17orf53 1370 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.11888053513921 chr17 42619291 42619496 42619449 Y NA GPATCH8,FZD2 GPATCH8,FZD2,C17orf104,CCDC43,DBF4B,ITGA2B IMR90 Hi-C 24141950 FZD2 13429 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 42634020 42634172 42634095 Y TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2 FZD2 NA NA NA NA FZD2 1095 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 42797981 42798248 42798116 Y CCDC43 CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1,ADAM11 NA NA NA NA RP11-1072C15.1 2016 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 43084352 43084694 43084637 Y NA C1QL1,NMT1 NA NA NA NA C1QL1 40913 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 43170304 43170536 43170449 Y ADAM11,HIGD1B,GFAP NMT1,DCAKD,ACBD4,PLCD3 NA NA NA NA DCAKD 33831 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 43201428 43201633 43201517 Y NA ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2 NA NA NA NA ACBD4 6334 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 43303050 43303852 43303644 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 FMNL1,CTD-2020K17.3 NA NA NA NA FMNL1 6239 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 43304336 43305039 43304628 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 FMNL1,CTD-2020K17.3 NA NA NA NA FMNL1 7525 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 43305165 43306978 43306453 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 FMNL1,CTD-2020K17.3 NA NA NA NA FMNL1 8354 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr17 43309202 43309383 43309263 Y MAP3K14,FMNL1 FMNL1,CTD-2020K17.3 NA NA NA NA CTD-2020K17.3 7718 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 43370974 43371161 43371063 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 MAP3K14 NA NA NA NA MAP3K14 21253 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 43385085 43385291 43385153 Y HEXIM1,FMNL1,PLEKHM1,MAP3K14,ARHGAP27 MAP3K14 LOC100133991,FMNL1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K14 7123 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 43398309 43398621 43398414 Y NA MAP3K14 LOC100133991,FMNL1,MAP3K14,TEX34,ARHGAP27 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K14 5895 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 43449108 43449433 43449167 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K14 56694 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr17 43660811 43661173 43660906 Y ACBD4,FMNL1,PLEKHM1 NA NA NA NA NA PLEKHM1 94696 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 43919032 43919225 43919129 Y STH NA NA NA NA NA MAPT 50523 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 44113965 44114105 44114069 Y KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA MAPT 144217 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 44240473 44240874 44240856 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 270725 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 44342171 44342447 44342244 Y KIAA1267,KIAA1267 NA MAPT,KANSL1,KANSL1-AS1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAPT 372423 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 44848199 44848613 44848371 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 50666 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 44848812 44849347 44849259 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 51279 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr17 45021726 45021957 45021796 Y NA GOSR2 NA NA NA NA GOSR2 23243 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 45282976 45283116 45283053 Y NA CDC27,ITGB3 MYL4 K562 ChIA-PET 22265404 CDC27 18188 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 45317390 45317724 45317566 Y TBKBP1 ITGB3 NA NA NA NA ITGB3 11539 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 45609469 45609601 45609554 Y NA NPEPPS NA NA NA NA NPEPPS 11161 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr17 46101351 46101579 46101379 Y NA COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 11813 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 46102426 46102830 46102617 Y NA COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 10562 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 46289129 46289412 46289274 Y NA NA NA NA NA NA SNX11 110410 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 46314423 46314444 46314434 Y NA NA NA NA NA NA SNX11 135704 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 46662684 46663231 46662943 Y HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5 HOXB9 NA NA NA NA HOXB9 38608 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 46702579 46702749 46702606 Y HOXB2,HOXB3,SNF8,HOXB5,HOXB6,HOXB7,HOXB8,HOXB9 HOXB9,RP11-357H14.17 NA NA NA NA HOXB9 740 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 46767725 46768126 46768067 Y NA RP11-357H14.17 NA NA NA NA RP11-357H14.17 45340 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 47425065 47425127 47425096 Y MYST2,ZNF652,ZNF652 ZNF652 NA NA NA NA ZNF652 12708 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 47585577 47585730 47585714 Y NA NGFR NA NA NA NA NGFR 14922 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr17 47586040 47586243 47586212 Y NA NGFR NA NA NA NA NGFR 15385 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 48105016 48105270 48105136 Y XYLT2,LRRC59,ITGA3 DLX3,ITGA3 LOC284080,ITGA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 ITGA3 26062 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 48105546 48105721 48105634 Y ITGA3 DLX3,ITGA3 LOC284080,ITGA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 ITGA3 25611 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 48139711 48140314 48140012 Y XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3 ITGA3,PDK2 NA NA NA NA ITGA3 8379 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 48228924 48229616 48229504 Y SPATA20,SAMD14 PPP1R9B NA NA NA NA PPP1R9B 2933 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 48255388 48256117 48255676 Y NA PPP1R9B NA NA NA NA PPP1R9B 29397 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr17 48282931 48283079 48283012 Y COL1A1,TMEM92 NA SGCA,HILS1 IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R9B 56940 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 48367346 48367814 48367643 Y PPP1R9B TMEM92 NA NA NA NA TMEM92 20579 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 48716257 48716537 48716480 Y NA ABCC3 NA NA NA NA ABCC3 6119 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr17 48716691 48717083 48716761 Y CHAD,SPAG9 ABCC3 NA NA NA NA ABCC3 6553 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 48726648 48726741 48726695 Y NA ABCC3 NA NA NA NA ABCC3 16510 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 48942663 48943085 48943016 Y NA TOB1 NA NA NA NA TOB1 254 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 48981540 48981884 48981711 Y RSAD1 TOB1 TOB1,SPAG9,LINC00483,LOC400604,SPATA20,EPN3 IMR90 Hi-C 24141950 TOB1 38201 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 49196679 49197214 49196965 Y NA SPAG9,NME1,NME1-NME2,NME2 NA NA NA NA SPAG9 453 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 50561518 50561825 50561670 Y NA NA NA NA NA NA UTP18 1225629 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 51165674 51166028 51165821 Y NA NA NA NA NA NA RPS2P48 667203 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 53017345 53017570 53017451 Y TOM1L1 TOM1L1,STXBP4,COX11 NA NA NA NA STXBP4 26518 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 53034991 53035170 53035032 Y NA STXBP4,COX11 NA NA NA NA STXBP4 8918 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 53394900 53394943 53394922 Y NA NA NA NA NA NA MMD 102410 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 53535750 53535979 53535892 Y NA MMD NA NA NA NA MMD 38397 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr17 54864431 54864801 54864568 Y TRIM25,SCPEP1 DGKE,C17orf67 NA NA NA NA DGKE 44659 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 54890834 54891042 54890937 Y NA DGKE,C17orf67 NA NA NA NA DGKE 18418 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 55763716 55764071 55763861 Y MSI2,MSI2 NA NA NA NA NA MRPS23 161346 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 56025910 56026308 56026041 Y SUPT4H1 CUEDC1,VEZF1 NA NA NA NA CUEDC1 4376 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 56064193 56064677 56064258 Y NA CUEDC1,VEZF1,SRSF1 NA NA NA NA VEZF1 573 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 56391648 56391970 56391957 Y NA SUPT4H1 NA NA NA NA SUPT4H1 36484 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 56419503 56419633 56419507 Y OR4D2 SUPT4H1 NA NA NA NA SUPT4H1 8821 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 56428194 56428499 56428372 Y VEZF1,MTMR4,SUPT4H1 NA NA NA NA NA SUPT4H1 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 56468859 56469318 56469005 Y RNF43 SUPT4H1,RNF43 NA NA NA NA RNF43 23638 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 57012711 57013103 57012907 Y SEPT4 NA NA NA NA NA TRIM37 169179 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 57203741 57203833 57203787 Y NA TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA TRIM37 21459 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 57831888 57832338 57832062 Y VMP1,RNFT1 VMP1,PTRH2 NA NA NA NA PTRH2 48901 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr17 57841314 57841767 57841379 Y NA NA NA NA NA NA PTRH2 58327 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr17 57860256 57860659 57860446 Y DHX40,VMP1,CA4 NA NA NA NA NA MIR21 55968 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 57861698 57862055 57862024 Y RNFT1 NA NA NA NA NA MIR21 54572 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr17 57863159 57864676 57863979 Y NA NA NA NA NA NA MIR21 51951 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.89360603919167 chr17 57906379 57907270 57906882 Y RNFT1 MIR21 NA NA NA NA MIR21 9357 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.11638322027304 chr17 57907420 57907736 57907558 Y NA MIR21 NA NA NA NA MIR21 8891 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr17 57922999 57923843 57923122 Y PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6 MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 6372 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 57925185 57925429 57925290 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 8558 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 57930626 57931026 57930760 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 13999 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 57962596 57962816 57962625 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA TUBD1 5488 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 58678620 58678973 58678714 Y PPM1D PPM1D NA NA NA NA PPM1D 3076 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 59150035 59150103 59150069 Y BCAS3 NA NA NA NA NA TBX2 325154 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 59488217 59488528 59488332 Y NA TBX2 NA NA NA NA TBX2 12960 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 59491856 59491969 59491928 Y NA TBX2 NA NA NA NA TBX2 16599 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 59939507 59939855 59939761 Y BRIP1 BRIP1 NA NA NA NA BRIP1 625 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 60085676 60086036 60086030 Y NACA2,MED13 NA NA NA NA NA MED13 54607 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 60557252 60557333 60557299 Y NA RP11-464D20.2 MRC2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-464D20.2 34795 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 60780424 60780717 60780568 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 77662 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr17 60856273 60856623 60856561 Y EFCAB3 NA NA NA NA NA MRC2 153511 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 60868052 60868313 60868162 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 165290 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 60877951 60878269 60878188 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 175189 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr17 60970243 60970809 60970465 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 267481 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 61043121 61043648 61043243 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 340359 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 61243701 61244044 61243838 Y NA NA NA NA NA NA CYB561 277695 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 61323201 61323584 61323320 Y NA NA MIR548W IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 198155 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 61431510 61431613 61431567 Y STRADA,ACE NA MIR548W,MARCH10,DCAF7,TACO1,MRC2 IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 90126 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 61787185 61787371 61787278 Y NA LIMD2,STRADA NA NA NA NA LIMD2 10653 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 62159440 62159790 62159613 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 46389 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr17 62161129 62161576 62161448 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 44603 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 62484790 62485162 62485096 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA POLG2 5992 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 62487438 62487665 62487534 Y ICAM2 POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA POLG2 3489 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 62675748 62676312 62676051 Y SMURF2 SMURF2 SMURF2,LOC146880 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMURF2 19562 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 62703261 62703596 62703473 Y SMURF2 SMURF2 SMURF2 IMR90 Hi-C 24141950 SMURF2 47075 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 62984651 62984886 62984756 Y GNA13 AMZ2P1 NA NA NA NA AMZ2P1 14957 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 63044063 63044405 63044261 Y GNA13 GNA13 NA NA NA NA GNA13 6552 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 63060882 63060952 63060917 Y GNA13 GNA13 GNA13,RGS9 IMR90 Hi-C 24141950 GNA13 9925 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 63119249 63119621 63119552 Y GNA13 NA RGS9,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNA13 68292 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 63639930 63640399 63640359 Y NA NA NA NA NA NA CEP112 545803 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 63654769 63655153 63655091 Y NA NA NA NA NA NA CEP112 531049 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 64194072 64194322 64194164 Y NA CEP112 NA NA NA NA CEP112 7870 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr17 64370414 64370595 64370515 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 73660 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 64463185 64463416 64463350 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 166431 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 64948296 64948612 64948339 Y CACNG4 CACNG4 CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CACNG4 10414 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 64961597 64961937 64961768 Y CACNG4 CACNG4 NA NA NA NA CACNG4 2571 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 64963064 64963179 64963122 Y NA CACNG4 NA NA NA NA CACNG4 4038 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 65847253 65847408 65847335 Y NA BPTF NA NA NA NA BPTF 27613 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr17 66311166 66311345 66311242 Y BPTF,PRKAR1A,PRKAR1A,SLC16A6 SLC16A6 NA NA NA NA SLC16A6 25758 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 66374219 66374806 66374507 Y SLC16A6 NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 76848 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 66374808 66375131 66375016 Y SLC16A6 NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 76523 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr17 66376984 66377775 66377396 Y NA NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 73879 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.67082885811029 chr17 66379549 66379922 66379702 Y SLC16A6,WIPI1 NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 71732 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 67729924 67730199 67729927 Y NA NA KCNJ2-AS1,KCNJ2,KCNJ16 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K6 321085 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 67757945 67758523 67758299 Y KCNJ2 NA KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2,MAP2K6 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K6 349106 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr17 69068010 69068257 69068112 Y NA NA NA NA NA NA LOC124685 546862 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 69437254 69437446 69437407 Y NA NA SOX9,LOC100499467,SLC39A11 IMR90 Hi-C 24141950 LOC124685 177673 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 69629735 69629997 69629863 Y NA LOC124685 LOC100499467,LINC00511 IMR90 Hi-C 24141950 LOC124685 14616 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr17 70395717 70396043 70395724 Y NA NA NA NA NA NA SOX9-AS1 179740 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 70403681 70403886 70403813 Y SOX9 NA NA NA NA NA SOX9-AS1 187704 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 70407350 70407568 70407445 Y NA NA NA NA NA NA SOX9-AS1 191373 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 70417215 70417683 70417549 Y SOX9 NA NA NA NA NA SOX9-AS1 201238 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr17 70442621 70442708 70442666 Y SOX9 NA NA NA NA NA RPL32P33 178662 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 70443498 70443728 70443613 Y SOX9 NA NA NA NA NA RPL32P33 177642 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 70461830 70461987 70461862 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 159383 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr17 70462396 70462597 70462589 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 158773 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 70464411 70464702 70464656 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 156668 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 70585200 70585480 70585419 Y NA RPL32P33,LINC00511 NA NA NA NA RPL32P33 35890 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 70585924 70586379 70586141 Y NA RPL32P33,LINC00511 NA NA NA NA RPL32P33 34991 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 70610080 70610203 70610142 Y NA RPL32P33,LINC00511 LOC100499467 MCF7 ChIA-PET 22265404 RPL32P33 11167 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 70680022 70680249 70680147 Y NA LINC00511 NA NA NA NA LINC00511 45411 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 70712408 70712674 70712489 Y NA NA NA NA NA NA LINC00511 77797 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 71200352 71200549 71200451 Y NA COG1,C17orf80,FAM104A NA NA NA NA COG1 13223 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 71304431 71304616 71304518 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 1698 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 71739470 71739821 71739643 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP4 433156 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 72564769 72564992 72564860 Y NA NA NA NA NA NA GPRC5C 145779 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 72565404 72566131 72565833 Y TTYH2,TTYH2,CD300A,TMEM104,CD300LF,CD300E,CD300LB,CD300C,CD300LD NA NA NA NA NA GPRC5C 146414 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr17 72746451 72746964 72746655 Y NA SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA SLC9A3R1 3660 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 72780618 72780981 72780928 Y GPR142 SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA TMEM104 9996 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 72978355 72978661 72978434 Y KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CDR2L 3066 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 73009835 73009966 73009891 Y NA CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H NA NA NA NA ICT1 3070 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 73087456 73087829 73087515 Y NA ATP5H,SLC16A5,ARMC7,NT5C NA NA NA NA SLC16A5 5634 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chr17 73120387 73120767 73120528 Y GRB2,GRB2,CD300LF,HN1,HN1,SLC16A5,NT5C SLC16A5,ARMC7,NT5C,HN1 NA NA NA NA NT5C 5123 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 73391809 73391943 73391876 Y NA GRB2,KIAA0195 NA NA NA NA GRB2 7847 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 73641652 73641951 73641723 Y CASKIN2,LLGL2,FOXJ1,EVPL,LOC100130933 SAP30BP,RECQL5 NA NA NA NA SAP30BP 19245 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 73684314 73684419 73684412 Y NA SAP30BP,RECQL5,ITGB4 NA NA NA NA RECQL5 23045 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 73685500 73685825 73685750 Y GGA3,MIF4GD,SAP30BP,ITGB4,ITGB4 SAP30BP,RECQL5,ITGB4 NA NA NA NA RECQL5 24231 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr17 73696530 73696897 73696707 Y SAP30BP,ITGB4,ITGB4 SAP30BP,RECQL5,ITGB4 NA NA NA NA ITGB4 18511 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 73718198 73718514 73718306 Y NA ITGB4,GALK1 NA NA NA NA ITGB4 2790 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr17 73719261 73719909 73719549 Y MRPS7,LLGL2,LOC100130933,EVPL,ITGB4,ITGB4 ITGB4,GALK1 NA NA NA NA ITGB4 3853 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr17 73860608 73860975 73860910 Y NA UNC13D,WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38 UNC13D,UNK,WBP2 IMR90 Hi-C 24141950 WBP2 10020 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 73868951 73869202 73869040 Y TRIM47 UNC13D,WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38 NA NA NA NA TRIM47 3454 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr17 73891396 73891618 73891569 Y NA WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1 NA NA NA NA TRIM65 312 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 73992927 73993207 73992957 Y NA TEN1,ACOX1,CDK3,EVPL NA NA NA NA CDK3 1780 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 74117633 74117738 74117682 Y NA EXOC7 NA NA NA NA EXOC7 1976 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 74128444 74128992 74128680 Y LOC100130933,RECQL5,RECQL5,FOXJ1 EXOC7 NA NA NA NA EXOC7 12787 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr17 74440987 74441354 74441087 Y NA UBE2O NA NA NA NA UBE2O 5934 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr17 74583031 74583415 74583256 Y NA CYGB,ST6GALNAC2 NA NA NA NA ST6GALNAC2 1993 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr17 74593355 74593659 74593547 Y FAM100B,SPHK1,SPHK1,RHBDF2,RHBDF2,JMJD6 CYGB,ST6GALNAC2 ST6GALNAC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 ST6GALNAC2 12317 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr17 74723995 74724371 74724344 Y FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA METTL23 3083 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr17 74836829 74837207 74837140 Y UBE2O,MGAT5B MGAT5B MFSD11,MGAT5B,SEC14L1,SRSF2,SEPT9 IMR90 Hi-C 24141950 MGAT5B 25331 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 75120383 75120864 75120582 Y JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 39585 CAGE SAS hg19 FANTOM5 6.34914966081911 chr17 75199050 75199385 75199187 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 75266 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 75251434 75251777 75251766 Y NA SEPT9 SEPT9,SRSF2,METTL23,MFSD11,SEC14L1,MGAT5B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEPT9 22874 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 75278845 75279720 75279369 Y NA SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 4194 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 75281811 75282557 75281917 Y SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 7160 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 75282703 75283463 75282995 Y SEPT9,SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 8052 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr17 75284936 75285118 75285041 Y NA SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 10285 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 75319028 75319523 75319372 Y SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 44377 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 75321712 75322201 75321955 Y SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 47061 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 75384636 75384998 75384811 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 109985 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 75417194 75417582 75417357 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 142543 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 75461802 75462176 75461947 Y SEC14L1,SEC14L1 NA NA NA NA NA SEPT9 187151 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 75504499 75504824 75504660 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 229848 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 75830749 75830836 75830793 Y TMC8,TMC6 NA TNRC6C,LOC100507351 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-80P 83344 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 75883563 75884329 75884163 Y TNRC6C,TMC8,TMC6,TMC6,SOCS3,PGS1 RNU1-80P NA NA NA NA RNU1-80P 29851 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA RNU1-80P,TNRC6C TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-80P 40213 CAGE SAS hg19 FANTOM5 5.23526375541225 chr17 76195016 76195360 76195224 Y TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1 SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5 BIRC5 IMR90 Hi-C 24141950 BIRC5 12907 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 76268764 76268973 76268872 Y TNRC6C,TMC6,TMC8,TMC6,SOCS3,PGS1 NA TK1,AFMID,CYTH1,TMC6,LOC100131096,TNRC6C,SOCS3,DNAH17,PGS1 IMR90 Hi-C 24141950 BIRC5 60497 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 76312866 76313241 76313131 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3 SOCS3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SOCS3 40917 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 76325206 76325964 76325662 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 28194 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 76330688 76331173 76330803 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 22985 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr17 76335027 76335218 76335120 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 18940 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr17 76337607 76338208 76338068 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 15950 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr17 76338337 76338836 76338651 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 15322 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr17 76346001 76346457 76346186 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 7701 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 76348964 76349371 76349046 Y USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 4787 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 76349549 76349649 76349633 Y NA SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 4509 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 76379911 76380778 76380428 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA PGS1 7190 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 76662391 76662551 76662479 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 NA NA NA NA NA CYTH1 113828 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 76731686 76732147 76732043 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 CYTH1 NA NA NA NA CYTH1 44232 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 76764263 76764724 76764556 Y SOCS3,PGS1,USP36,CANT1,CYTH1 CYTH1 NA NA NA NA CYTH1 11655 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 76775899 76776536 76776049 Y USP36,ENGASE,CYTH1 NA NA NA NA NA CYTH1 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 76858403 76858717 76858585 Y PGS1,CYTH1,ENGASE,USP36 USP36 NA NA NA NA USP36 22880 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 76929562 76929807 76929665 Y CANT1 TIMP2,LGALS3BP TIMP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TIMP2 10093 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 76930060 76930674 76930419 Y NA TIMP2,LGALS3BP TIMP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TIMP2 10591 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 76992140 76992468 76992317 Y NA LGALS3BP,CANT1,C1QTNF1 NA NA NA NA CANT1 11481 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 77032690 77033106 77032818 Y CYTH1,ENGASE CANT1,C1QTNF1,ENGASE NA NA NA NA C1QTNF1 15794 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 77034665 77035262 77034914 Y CYTH1,USP36,ENGASE CANT1,C1QTNF1,ENGASE NA NA NA NA C1QTNF1 17769 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 77783959 77784243 77784073 Y CBX2,CBX8 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 10477 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 77787297 77787609 77787349 Y NA CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 13815 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 77788517 77788922 77788877 Y NA CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 15035 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 77814369 77814482 77814427 Y NA CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX4 3141 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 77916401 77916581 77916489 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D16 91066 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 77952311 77952542 77952488 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D16 55105 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 78098181 78098723 78098426 Y NA GAA,EIF4A3 NA NA NA NA EIF4A3 20259 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 78149249 78149503 78149364 Y NA EIF4A3,SLC26A11,SGSH EIF4A3 MCF7 ChIA-PET 22265404 EIF4A3 30267 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 78228476 78228940 78228764 Y GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213 SLC26A11,SGSH,RNF213 NA NA NA NA RNF213 3725 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV,NPTX1 NA NA NA NA NPTX1 20369 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.56193758243578 chr17 78734428 78734929 78734574 Y C17orf56 NA NA NA NA NA RPTOR 217809 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 78735331 78735538 78735429 Y NA NA NA NA NA NA RPTOR 218712 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 78754047 78754707 78754061 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 208691 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 78830209 78830686 78830492 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 132712 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 78847470 78847710 78847638 Y C17orf56 NA NA NA NA NA CHMP6 115688 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 78853513 78853762 78853623 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 109636 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 79017666 79018027 79017910 Y AZI1,BAIAP2 BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 10718 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr17 79018501 79018654 79018571 Y BAIAP2 BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 11553 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 79024187 79024380 79024262 Y BAIAP2 BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 17239 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 79046413 79046604 79046526 Y NA BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 39465 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 79068878 79069252 79068906 Y C17orf56 NA NA NA NA NA BAIAP2 61930 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 79317785 79317948 79317891 Y FAM195B,C17orf70,ACTG1,BAHCC1 TMEM105 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM105 15311 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 79319325 79319648 79319507 Y FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1 TMEM105 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM105 16851 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr17 79319812 79320225 79320116 Y FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1 TMEM105 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM105 17338 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 79339701 79340108 79339894 Y NA TMEM105 SLC38A10,NPLOC4 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM105 37227 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 79360408 79361324 79361141 Y ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10 NA NA NA NA NA TMEM105 57934 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 79369574 79370687 79370597 Y NA NA NA NA NA NA TMEM105 67100 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr17 79447256 79447494 79447327 Y NA RP13-766D20.1,RP13-766D20.2,ACTG1 NA NA NA NA RP13-766D20.1 30595 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 79451287 79451558 79451462 Y AATK,AZI1,BAHCC1 RP13-766D20.1,RP13-766D20.2,ACTG1 NA NA NA NA RP13-766D20.1 26531 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 79942701 79942868 79942785 Y SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62 PYCR1,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3 NA NA NA NA ASPSCR1 10018 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 79949658 79950000 79949804 Y SLC25A10,STRA13,LRRC45,FASN,DCXR,PCYT2,NOTUM,ASPSCR1 ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR NA NA NA NA ASPSCR1 16975 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 80052713 80052821 80052782 Y MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN GPS1,RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 1387 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 80056613 80056910 80056718 Y C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 2405 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr17 80060759 80061000 80060880 Y NA DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 6551 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 80164087 80164383 80164236 Y SIRT7,MAFG,MAFG,SECTM1,NARF,CSNK1D,C17orf62,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CCDC57 CCDC57,SLC16A3 NA NA NA NA CCDC57 4323 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 80188750 80189250 80189000 Y NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3 CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA SLC16A3 4477 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 80199457 80199968 80199484 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA SLC16A3 15184 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr17 80215337 80215590 80215470 Y SIRT7,WDR45L,NARF,CSNK1D,CD7,C17orf62,C17orf62,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3 CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 14017 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 80239829 80239997 80239937 Y NA CSNK1D,SECTM1 CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1D 10222 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 80245965 80246238 80246057 Y MAFG,MAFG,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1 CSNK1D,SECTM1 CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1D 16358 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr17 80255798 80256475 80256187 Y SIRT7,MAFG,MAFG,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,HEXDC,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7 CSNK1D,SECTM1 NA NA NA NA CSNK1D 26191 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 80290802 80291044 80290895 Y MAFG,MAFG,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1 SECTM1,TEX19 NA NA NA NA SECTM1 852 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 80296831 80297318 80297085 Y NA SECTM1,TEX19 SECTM1,CCDC57,SLC16A3,CSNK1D,CD7,TEX19,C17orf62,C17orf101,NARF,HEXDC,FOXK2,WDR45L MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SECTM1 6881 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 80453708 80453979 80453866 Y LRRC45,DUS1L,FASN,UTS2R,TBCD,FOXK2 C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 21610 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 80454894 80455238 80455175 Y LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 20351 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr17 80592968 80593241 80593234 Y NA NA NA NA NA NA RAB40B 61363 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 80745153 80745621 80745526 Y ZNF750 TBCD NA NA NA NA TBCD 37213 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 80794045 80794420 80794166 Y ZNF750 ZNF750 NA NA NA NA ZNF750 2034 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 80796209 80796714 80796435 Y METRNL,ZNF750 NA NA NA NA NA ZNF750 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 80805995 80806457 80806155 Y NA ZNF750 NA NA NA NA ZNF750 9541 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 80817363 80817528 80817446 Y HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF,NARF ZNF750 NA NA NA NA ZNF750 20909 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr17 80817904 80818262 80818042 Y C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL ZNF750 NA NA NA NA ZNF750 21450 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 80832515 80832930 80832613 Y NA ZNF750 NA NA NA NA ZNF750 36061 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chr17 80833209 80833609 80833394 Y ZNF750 ZNF750 NA NA NA NA ZNF750 36755 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.00749194459853 chr17 80834043 80834346 80834307 Y ZNF750 ZNF750 NA NA NA NA ZNF750 37589 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 80834580 80834819 80834710 Y NA ZNF750 NA NA NA NA ZNF750 38126 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr17 80842917 80843211 80843101 Y C17orf62,NARF ZNF750 NA NA NA NA ZNF750 46463 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 81031472 81031760 81031658 Y METRNL B3GNTL1,METRNL B3GNTL1 K562 ChIA-PET 22265404 METRNL 3807 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 81038687 81040054 81039707 Y B3GNTL1,METRNL B3GNTL1,METRNL NA NA NA NA METRNL 3120 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr17 81067352 81067511 81067418 Y NA METRNL NA NA NA NA METRNL 31785 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 228420 228816 228694 Y THOC1 THOC1 NA NA NA NA THOC1 37234 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 666183 666708 666437 Y THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 9843 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.55944026756961 chr18 668283 668526 668405 Y THOC1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11943 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr18 2516331 2516615 2516492 Y NA NA NA NA NA NA METTL4 52893 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 2855586 2855865 2855617 Y NA NA LPIN2 IMR90 Hi-C 24141950 LPIN2 155448 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 3015219 3015501 3015351 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,METTL4,EMILIN2 LPIN2 LPIN2 K562 ChIA-PET 22265404 LPIN2 3906 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 3276279 3276423 3276302 Y NA MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12B 16372 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr18 3305401 3305555 3305478 Y MYL12B,TGIF1 MYL12B DLGAP1,TGIF1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYL12B 45494 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 3594733 3596177 3595596 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 185127 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr18 3623872 3624258 3624140 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214266 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr18 3624338 3624601 3624482 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214732 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 3624841 3625119 3625035 Y MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 215235 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr18 3665613 3666165 3665884 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 256007 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 3816827 3817202 3817015 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 407221 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 7751060 7751343 7751235 Y NA NA NA NA NA NA RAB12 856100 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 8412266 8412506 8412385 Y NA NA NA NA NA NA RAB12 194937 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 8730480 8730718 8730581 Y NA NA NA NA NA NA RAB12 123037 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 8801229 8801479 8801315 Y CCDC165 NA NA NA NA NA RAB12 193786 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 8948545 8948913 8948824 Y TWSG1 NA CCDC165 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 151715 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr18 8949015 8949649 8949122 Y TWSG1 NA CCDC165 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 150979 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr18 8949988 8950319 8950097 Y NA NA CCDC165,RAB12 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 150309 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 9017103 9017601 9017310 Y ANKRD12 NA CCDC165,ANKRD12,RALBP1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 83027 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 9017601 9018155 9017805 Y NA NA CCDC165,ANKRD12,RALBP1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 82473 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 9494685 9495048 9494827 Y ANKRD12,ANKRD12,VAPA,RAB31 RALBP1 NA NA NA NA RALBP1 21678 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 9548277 9548390 9548335 Y ANKRD12,VAPA,RAB31,PPP4R1 NA NA NA NA NA PPP4R1 64848 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr18 9613164 9613539 9613352 Y NA NA NA NA NA NA PPP4R1 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 9658069 9658457 9658201 Y PPP4R1 PPP4R1,RAB31 PPP4R1,VAPA,ANKRD12 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP4R1 44831 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 9829152 9829470 9829321 Y PPP4R1,VAPA,RAB31 NA TXNDC2,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 82529 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 9914998 9915501 9915128 Y PPP4R1,RAB31,VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 2999 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr18 11005597 11005922 11005792 Y NA NA NA NA NA NA NAPG 481695 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.78221744865098 chr18 11849903 11850727 11850169 Y MPPE1,CHMP1B CHMP1B NA NA NA NA CHMP1B 508 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr18 11947272 11947721 11947412 Y CHMP1B MPPE1,IMPA2 IMPA2,GNAL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IMPA2 31303 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr18 12288068 12288497 12288213 Y NA TUBB6 TUBB6 IMR90 Hi-C 24141950 TUBB6 17171 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr18 12306995 12307375 12307158 Y CHMP1B TUBB6 NA NA NA NA TUBB6 1327 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 12336380 12336603 12336512 Y NA TUBB6,AFG3L2 NA NA NA NA TUBB6 30712 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 12606965 12607268 12607096 Y PTPN2,SPIRE1 AP005482.1,SPIRE1,PSMG2 NA NA NA NA AP005482.1 48774 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 12641281 12641332 12641311 Y SPIRE1,SPIRE1,PSMG2 AP005482.1,SPIRE1,PSMG2 NA NA NA NA AP005482.1 14710 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 12763760 12763785 12763774 Y CEP192,C18orf1 NA PTPN2 IMR90 Hi-C 24141950 CEP76 62984 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr18 12837862 12838421 12838235 Y PTPN2 NA NA NA NA NA PTPN2 89221 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 13220671 13221282 13220939 Y NA NA NA NA NA NA CEP192 231310 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 18512291 18512341 18512327 Y NA NA NA NA NA NA ROCK1 177471 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 18515990 18516559 18516297 Y NA NA NA NA NA NA ROCK1 173253 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 19862450 19862773 19862669 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 GATA6 115046 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 20046739 20046926 20046743 Y GATA6 NA GATA6,CTAGE1 IMR90 Hi-C 24141950 GATA6 299335 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr18 20131932 20132167 20132050 Y NA NA CTAGE1,GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 244057 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 20138967 20139156 20139093 Y GATA6 NA CTAGE1,GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 237068 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 20139802 20140256 20140003 Y GATA6 NA CTAGE1,GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 235968 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 20855209 20855599 20855401 Y NA NA NA NA NA NA CABLES1 142681 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 21091625 21091887 21091629 Y C18orf8 C18orf8 NA NA NA NA C18orf8 10152 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 21153994 21154335 21154180 Y NA NPC1 NA NA NA NA NPC1 10527 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 21165246 21165762 21165429 Y C18orf8,NPC1 NPC1 NA NA NA NA NPC1 384 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr18 23836366 23836416 23836389 Y TAF4B TAF4B NA NA NA NA TAF4B 32466 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr18 26231611 26231936 26231774 Y NA NA NA NA NA NA KCTD1 1996246 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr18 26734222 26734368 26734294 Y NA NA NA NA NA NA DSC3 1886413 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 26735180 26735449 26735256 Y NA NA NA NA NA NA DSC3 1885332 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr18 26744101 26744374 26744185 Y NA NA NA NA NA NA DSC3 1876407 CAGE SAS hg19 FANTOM5 7.79720133784804 chr18 28786845 28787168 28787084 Y DSC3,DSC2,DSG3,DSG2,DSG1,DSC1 NA DSC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 DSC2 106467 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 29034115 29034481 29034298 Y DSC3,DSG3 DSG3,DSG2 NA NA NA NA DSG3 8357 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 29092491 29092685 29092630 Y DSC3,DSC2,DSG1,DSG2 DSG2 NA NA NA NA DSG2 16485 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 29542474 29542964 29542885 Y RNF138 TRAPPC8 NA NA NA NA TRAPPC8 11375 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr18 29599439 29599921 29599769 Y RNF138,RNF138,TRAPPC8,RNF125 NA NA NA NA NA TRAPPC8 68340 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 32436094 32436130 32436112 Y DTNA NA NA NA NA NA MAPRE2 118762 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 33876540 33877026 33876703 Y NA FHOD3 NA NA NA NA FHOD3 863 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr18 35000619 35000729 35000675 Y CELF4 NA NA NA NA NA TPGS2 593461 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr18 35024297 35024529 35024426 Y NA NA NA NA NA NA TPGS2 617139 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 37629293 37629563 37629339 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 715654 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 38229341 38229542 38229442 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C3 1303629 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 38655284 38655543 38655423 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C3 877628 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 42262294 42262512 42262376 Y SETBP1,SETBP1 SETBP1 NA NA NA NA SETBP1 4156 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 43307603 43307620 43307613 Y NA NA NA NA NA NA EPG5 237620 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 43543003 43543287 43543010 Y PSTPIP2,EPG5 EPG5 NA NA NA NA EPG5 1953 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 43588594 43588867 43588609 Y SLC14A2,PSTPIP2,EPG5 EPG5 NA NA NA NA EPG5 43354 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 43608916 43609273 43609243 Y PSTPIP2,EPG5 PSTPIP2 NA NA NA NA PSTPIP2 40965 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 43830546 43830877 43830624 Y EPG5,PSTPIP2 NA NA NA NA NA RNF165 73895 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 44394118 44394485 44394384 Y NA NA NA NA NA NA KATNAL2 100970 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 45472001 45472124 45472045 Y NA SMAD2 SMAD2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SMAD2 16486 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 45687716 45687836 45687757 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232201 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr18 45688048 45688324 45688110 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232533 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 45828290 45828381 45828336 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 235036 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 46066779 46067121 46067052 Y CTIF CTIF NA NA NA NA CTIF 3362 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr18 46259226 46259357 46259315 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 195809 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 46456597 46456819 46456703 Y SMAD7,SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 18262 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr18 46460097 46460351 46460248 Y NA SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 14730 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 46461141 46461770 46461393 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 13311 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 46478230 46479206 46479122 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 3149 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr18 46481699 46482044 46481791 Y NA SMAD7 SMAD7 K562 ChIA-PET 22265404 SMAD7 6618 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr18 46482158 46482454 46482304 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 SMAD7 K562 ChIA-PET 22265404 SMAD7 7077 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 46482815 46483020 46482939 Y NA SMAD7 SMAD7 K562 ChIA-PET 22265404 SMAD7 7734 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 46502180 46502412 46502333 Y SMAD7 SMAD7 SMAD7,CTIF MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SMAD7 27099 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr18 46518186 46518409 46518369 Y NA SMAD7 CTIF,SMAD7,DYM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD7 43105 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr18 46523478 46523814 46523611 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 CTIF,SMAD7,DYM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD7 48397 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr18 46524155 46524830 46524741 Y NA SMAD7 CTIF,SMAD7,DYM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD7 49074 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 46543550 46543788 46543750 Y NA NA SMAD7 MCF7 ChIA-PET 22265404 SMAD7 68469 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr18 46547875 46548139 46548027 Y NA NA SMAD7 MCF7 ChIA-PET 22265404 SMAD7 72794 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.22777181081372 chr18 46754603 46754925 46754865 Y DYM NA NA NA NA NA DYM 230792 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 47626417 47626670 47626561 Y MYO5B,MBD1,MBD1 NA NA NA NA NA MYO5B 92793 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr18 47785953 47786324 47786143 Y NA MBD1,CXXC1 NA NA NA NA MBD1 19820 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 47834061 47834491 47834223 Y CCDC11,MBD1,MBD1 MBD1,CXXC1 CCDC11,CXXC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXXC1 21387 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 47834587 47834811 47834691 Y NA MBD1,CXXC1 CCDC11,CXXC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXXC1 21913 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 48721492 48722312 48721913 Y SMAD4,MEX3C MEX3C NA NA NA NA MEX3C 20362 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 51773425 51773767 51773527 Y NA MBD2,POLI POLI MCF7 ChIA-PET 22265404 POLI 20007 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 55101559 55101949 55101758 Y NA NA NA NA NA NA FECH 150055 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 55448232 55448442 55448350 Y NA ATP8B1 NA NA NA NA ATP8B1 19891 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr18 55474402 55474444 55474420 Y NA ATP8B1 ATP8B1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP8B1 6069 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 55880754 55881007 55880894 Y MALT1 NA NA NA NA NA NEDD4L 171155 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr18 55881305 55881780 55881408 Y MALT1 NA NA NA NA NA NEDD4L 171706 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 55889534 55890049 55889817 Y MALT1 NA NA NA NA NA NEDD4L 179935 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 55890970 55891630 55891068 Y NEDD4L,NEDD4L NA NA NA NA NA NEDD4L 181371 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 55893671 55893850 55893725 Y MALT1 NA NA NA NA NA NEDD4L 184072 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 55957381 55957780 55957581 Y NA NA NA NA NA NA NEDD4L 247782 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 56074480 56074676 56074577 Y NEDD4L NA NA NA NA NA SNORD28 191187 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 56339458 56339877 56339543 Y MALT1 MALT1 NA NA NA NA MALT1 2840 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr18 57566379 57566616 57566437 Y NA PMAIP1 NA NA NA NA PMAIP1 1199 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 59617219 59617435 59617354 Y NA NA CDH20,PIGN IMR90 Hi-C 24141950 PIGN 234916 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr18 60189219 60189514 60189362 Y TNFRSF11A,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 979 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 60193382 60194139 60194065 Y KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 5142 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr18 60221448 60221638 60221488 Y NA ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 33208 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 61033511 61033750 61033687 Y NA BCL2,KDSR NA NA NA NA KDSR 768 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr18 61185797 61185958 61185852 Y KDSR,SERPINB12 SERPINB5 NA NA NA NA SERPINB5 43803 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 61350519 61350880 61350698 Y SERPINB5,SERPINB12,SERPINB3,SERPINB11 SERPINB4,SERPINB3 SERPINB10,SERPINB7 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINB3 23322 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 61537611 61537785 61537630 Y NA SERPINB2,SERPINB10 SERPINB5 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINB2 685 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 61546959 61547303 61547088 Y VPS4B,SERPINB8,SERPINB2 SERPINB2,SERPINB10 HMSD,SERPINB8 HELA 5C 22955621 SERPINB2 10033 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 61549169 61549580 61549348 Y VPS4B,SERPINB8,SERPINB2 SERPINB2,SERPINB10 SERPINB7 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINB2 12243 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr18 61549883 61550442 61550030 Y VPS4B,SERPINB8,SERPINB2 SERPINB2,SERPINB10 SERPINB7 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINB10 11966 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr18 61565801 61566233 61565950 Y NA SERPINB2,SERPINB10,HMSD NA NA NA NA SERPINB10 3393 CAGE SAS hg19 FANTOM5 4.23276644054608 chr18 61576212 61576423 61576320 Y VPS4B,SERPINB8,SERPINB2 SERPINB2,SERPINB10,HMSD SERPINB10 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINB10 13804 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 61642248 61642613 61642430 Y NA HMSD,SERPINB8 NA NA NA NA SERPINB8 7089 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 68004496 68004658 68004562 Y NA NA NA NA NA NA SOCS6 50359 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr18 71910001 71910146 71910074 Y NA NA NA NA NA NA TIMM21 96255 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 72676291 72676559 72676424 Y ZNF407,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 242744 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 74204839 74205357 74205296 Y NA RP11-17M16.1 NA NA NA NA ZNF516 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 74205649 74206020 74205889 Y NA ZNF516,RP11-17M16.1 NA NA NA NA RP11-17M16.1 172 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr18 74237245 74237630 74237448 Y NA ZNF516,RP11-17M16.1 NA NA NA NA RP11-17M16.1 31768 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 74276166 74276377 74276252 Y ZNF516 NA NA NA NA NA RP11-17M16.1 70689 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 74277239 74277430 74277301 Y NA NA NA NA NA NA RP11-17M16.1 71762 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 74767591 74768136 74768025 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 235028 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr18 74775208 74775557 74775363 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 242645 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 74803559 74803662 74803615 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 270996 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr18 74804015 74805088 74804856 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 271452 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 74813361 74814191 74813850 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 280798 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 74819276 74819721 74819374 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 286713 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr18 74825736 74826105 74826060 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 293173 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 74826312 74827078 74826635 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 293749 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr18 74830215 74830809 74830560 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 297652 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chr18 77551694 77552094 77551810 Y PQLC1,CTDP1 NA KCNG2,PQLC1,CTDP1,RBFA,TXNL4A IMR90 Hi-C 24141950 CTDP1 113893 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr18 77721815 77722347 77722078 Y PQLC1 PQLC1,HSBP1L1 NA NA NA NA HSBP1L1 214 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 289700 289869 289784 Y C2CD4C,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C PPAP2C NA NA NA NA PPAP2C 307 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr19 290136 290651 290316 Y RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C PPAP2C NA NA NA NA PPAP2C 743 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.89360603919167 chr19 342831 343179 342882 Y MIER2 MIER2,THEG NA NA NA NA MIER2 33 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 384369 384669 384409 Y SHC2,C2CD4C,MIER2 MIER2,THEG,C2CD4C NA NA NA NA THEG 10356 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 441805 442098 441996 Y PALM,HCN2,FGF22,C2CD4C,SHC2,ODF3L2 C2CD4C NA NA NA NA C2CD4C 34666 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 485856 486161 485966 Y PALM,HCN2,FGF22,C2CD4C,SHC2 TPGS1,CDC34 ODF3L2,SHC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TPGS1 19138 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 567332 567750 567473 Y NA CDC34,BSG,HCN2 NA NA NA NA BSG 1547 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 661410 661735 661571 Y HMHA1,GZMM,C19orf6,ABCA7,RNF126 POLRMT,RNF126,FSTL3 NA NA NA NA RNF126 133 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 675402 675838 675677 Y FSTL3 POLRMT,RNF126,FSTL3 NA NA NA NA FSTL3 1010 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 751766 752111 751822 Y PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21 PTBP1 NA NA NA NA PTBP1 42964 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr19 782330 783005 782707 Y NA PTBP1,MIR4745 NA NA NA NA PTBP1 12070 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr19 789308 789721 789469 Y NA PTBP1,MIR4745 NA NA NA NA PTBP1 5354 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr19 800594 800755 800691 Y NA PTBP1,MIR4745 NA NA NA NA MIR4745 2185 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 958944 959162 959060 Y NA R3HDM4,ARID3A,WDR18 NA NA NA NA WDR18 22012 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 1028160 1028923 1028240 Y SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7 WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7,HMHA1 NA NA NA NA CNN2 3862 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 1133542 1133865 1133752 Y C19orf22,ARID3A,C19orf6,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2 POLR2E,GPX4,SBNO2 NA NA NA NA GPX4 31606 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 1140329 1140530 1140433 Y NA POLR2E,GPX4,SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 31752 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 1161691 1161983 1161922 Y NA SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 10299 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 1169743 1170349 1170015 Y NA SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 1933 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr19 1171027 1171165 1171096 Y NA SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 1117 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 1171933 1172315 1172045 Y NA STK11 NA NA NA NA SBNO2 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 1183874 1184237 1184064 Y SBNO2 SBNO2,STK11 ATP5D,MIDN,SBNO2,STK11,GPX4 MCF7 ChIA-PET 22265404 STK11 3169 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 1252961 1253429 1253036 Y C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA CIRBP 3955 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 1260732 1261171 1260912 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA CIRBP 3348 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr19 1262305 1262850 1262469 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA CIRBP 4921 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 1265810 1266064 1265967 Y C19orf6,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA C19orf24 6962 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 1266359 1266798 1266589 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA C19orf24 6228 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.67082885811029 chr19 1408607 1408695 1408655 Y CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15 NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 3039 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 1408835 1409120 1409078 Y NA NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 3267 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 1725719 1725877 1725796 Y C19orf26,MUM1,APC2 NA TCF3,C19orf25,ONECUT3,PLK5,UQCR11,ATP8B3,LOC100288123,REXO1 IMR90 Hi-C 24141950 TCF3 75115 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 1747200 1747550 1747426 Y PLEKHJ1,DAZAP1,RPS15,ONECUT3 NA TCF3,ONECUT3,ADAMTSL5,PLK5,UQCR11,ATP8B3,REXO1,LOC100288123 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP8B3 62725 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 1942393 1942508 1942451 Y OAZ1,DOT1L,C19orf35,MOBKL2A,MKNK2,REXO1,KLF16,CSNK1G2 SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2 NA NA NA NA CSNK1G2 3205 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 2032329 2032652 2032524 Y LINGO3,C19orf35 BTBD2,MKNK2 NA NA NA NA BTBD2 228 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 2049976 2050209 2050080 Y OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2 BTBD2,MKNK2,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 733 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 2059605 2060167 2060113 Y REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2 BTBD2,MKNK2,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 10362 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr19 2061356 2061737 2061654 Y SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 12113 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 2165096 2165788 2165320 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 2632 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 2168890 2169464 2169082 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 6426 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 2452794 2453150 2452981 Y NA TIMM13,LMNB2,GADD45B NA NA NA NA LMNB2 1844 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 2524971 2525260 2525066 Y NA NA NA NA NA NA GADD45B 50851 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr19 2529574 2529858 2529677 Y NA NA NA NA NA NA GADD45B 55454 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 2540691 2541097 2540881 Y TIMM13 NA NA NA NA NA GADD45B 66571 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chr19 2543618 2543970 2543682 Y DOT1L,GADD45B NA NA NA NA NA GADD45B 69498 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 2627461 2627884 2627646 Y DOT1L,OAZ1,GADD45B NA NA NA NA NA SLC39A3 110266 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 3035530 3035851 3035686 Y NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2 TLE2,AES NA NA NA NA TLE2 9782 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 3360183 3360356 3360294 Y TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 2622 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 3367171 3367852 3367502 Y NFIC,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 9610 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 3387730 3388119 3388011 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 30169 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 3458286 3458426 3458380 Y NA DOHH,FZR1 NA NA NA NA DOHH 40512 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 3520804 3521051 3520913 Y NA DOHH,FZR1,HMG20B NA NA NA NA FZR1 16533 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 3562421 3562565 3562489 Y NA HMG20B,MFSD12,TBXA2R NA NA NA NA HMG20B 8210 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 4053092 4053572 4053301 Y CCDC94,ZBTB7A PIAS4,ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 11371 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 4057405 4058198 4058044 Y CCDC94,ZBTB7A ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 6745 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 4059877 4060289 4060128 Y SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6 ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 4654 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 4061996 4062359 4062178 Y NA ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 2584 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 4064475 4064868 4064603 Y SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6 ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 75 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 4123124 4123351 4123249 Y MATK,ZFR2,ATCAY MAP2K2 NA NA NA NA MAP2K2 998 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 4375126 4375688 4375404 Y NA STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A NA NA NA NA SH3GL1 22856 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 4375735 4376107 4375790 Y ZBTB7A,EBI3 STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A NA NA NA NA SH3GL1 22437 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 4381377 4381710 4381643 Y NA STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A NA NA NA NA SH3GL1 16834 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 4393849 4394251 4394129 Y NA SH3GL1,CHAF1A NA NA NA NA SH3GL1 4293 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 4456035 4456301 4456168 Y NA UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 216 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 4456385 4456784 4456737 Y UBXN6,UBXN6 UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 566 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 4812881 4813376 4813265 Y SEMA6B,TICAM1 FEM1A,TICAM1 NA NA NA NA TICAM1 16340 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 4912030 4912419 4912247 Y NA PLIN3,UHRF1 NA NA NA NA UHRF1 10938 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 4970760 4971027 4970931 Y NA KDM4B NA NA NA NA KDM4B 3635 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 5435162 5435432 5435167 Y NA NA KDM4B,PTPRS IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPRS 96348 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr19 5624052 5624252 5624226 Y VMAC,RFX2,DUS3L,SAFB2,SAFB SAFB,SAFB2,RPL36 NA NA NA NA SAFB2 1995 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 6056849 6057757 6057360 Y DENND1C,SAFB2,SAFB,VMAC,RFX2 NA NA NA NA NA RANBP3 80696 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr19 6060958 6061480 6061122 Y RFX2 NA NA NA NA NA RANBP3 84805 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 6066698 6067208 6066827 Y SLC25A41,TMEM146,PRR22,DUS3L,RFX2,ACSBG2 NA NA NA NA NA RANBP3 90545 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 6092440 6092966 6092758 Y RFX2 NA NA NA NA NA RFX2 104617 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 6108978 6109271 6109224 Y NA NA NA NA NA NA RFX2 88312 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr19 6189136 6189412 6189274 Y NA RFX2 NA NA NA NA RFX2 8171 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 6738802 6739114 6738954 Y NA C3,GPR108,TRIP10,SH2D3A NA NA NA NA TRIP10 2866 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 6766042 6766297 6766158 Y NA C3,GPR108,TRIP10,SH2D3A NA NA NA NA SH2D3A 443 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr19 7483723 7483869 7483787 Y NA ARHGEF18 NA NA NA NA ARHGEF18 25724 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 8051436 8051456 8051449 Y NA TIMM44,ELAVL1 NA NA NA NA ELAVL1 17087 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 8060665 8061040 8060896 Y FLJ22184,FBN3 ELAVL1 NA NA NA NA ELAVL1 7503 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 8518703 8518940 8518821 Y NA MARCH2,HNRNPM NA NA NA NA HNRNPM 11052 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 9420483 9420931 9420837 Y NA ZNF559 NA NA NA NA ZNF559 11517 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 9783821 9783976 9783959 Y NA ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 45 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 9896233 9896620 9896495 Y ZNF266,COL5A3,ZNF846 FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA FBXL12 39872 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 9903168 9903577 9903239 Y NA FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA FBXL12 32915 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 9937602 9937876 9937738 Y NA FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA UBL5 1034 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 10513154 10513331 10513243 Y ICAM1,DNM2,C19orf38,TYK2,PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 940 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 10992105 10992492 10992295 Y NA TMED1,CARM1,YIPF2,C19orf52 NA NA NA NA CARM1 11916 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 11044199 11044446 11044323 Y NA YIPF2,C19orf52,SMARCA4 NA NA NA NA C19orf52 6790 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 11202212 11202837 11202668 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 4174 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 11205696 11206011 11205901 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 7658 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 11253991 11254271 11254206 Y PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6 SPC24 NA NA NA NA SPC24 10213 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 11375157 11375492 11375297 Y DOCK6 DOCK6 TSPAN16 MCF7 ChIA-PET 22265404 DOCK6 4000 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 11642939 11643084 11643012 Y CCDC159 ZNF653,CTC-398G3.2,ECSIT,ELOF1,ZNF627 NA NA NA NA ECSIT 4950 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 11804467 11804940 11804795 Y ZNF878,ZNF823,ZNF491 HNRNPA1P10,ZNF823 NA NA NA NA HNRNPA1P10 28622 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 12404552 12404928 12404719 Y ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44 CTD-2666L21.3,ZNF44,ZNF563 NA NA NA NA ZNF44 850 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr19 12724614 12724901 12724730 Y ZNF136,ZNF44,ZNF563,ZNF564,JUNB,C19orf43,ZNF490,ZNF791,MAN2B1 ZNF791,ZNF490,CTD-2192J16.15 NA NA NA NA ZNF791 4882 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.00749194459853 chr19 12889371 12889726 12889619 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10584 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 12892961 12894040 12893343 Y ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 6270 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 12894545 12895330 12894818 Y ZNF44,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 4980 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 12899457 12901460 12900777 Y NA PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr19 12901644 12901726 12901699 Y NA JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 1334 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 12957682 12957886 12957783 Y NA PRDX2,RNASEH2A,MAST1,HOOK2,DNASE2,GCDH NA NA NA NA MAST1 14917 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 13123653 13124120 13123822 Y WDR83,TNPO2,TNPO2,NFIX,CACNA1A NFIX NA NA NA NA NFIX 19231 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr19 13238145 13238217 13238180 Y NA TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA NACC1 11228 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE SAS hg19 FANTOM5 4.56693221216814 chr19 13266326 13267156 13266576 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 7097 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr19 13267779 13268208 13267877 Y MAN2B1,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 8550 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 13274586 13275096 13274696 Y GADD45GIP1,NACC1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 15357 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 13944359 13944683 13944571 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15 ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 40085 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 13954357 13954714 13954441 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM4 50083 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 13955108 13955589 13955298 Y CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4 NA NA NA NA NA ZSWIM4 50834 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr19 13957204 13959386 13957586 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM4 52930 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr19 13959901 13960035 13959978 Y CCDC130,RFX1,ZSWIM4 NA NA NA NA NA CC2D1A 54979 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 13972364 13973309 13972780 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4 CC2D1A NA NA NA NA CC2D1A 41705 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr19 14126359 14126500 14126444 Y NANOS3,IL27RA RFX1,IL27RA NA NA NA NA RFX1 10508 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 14528800 14529217 14529142 Y ZNF333,EMR2,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,CD97,DDX39A CD97,DDX39A,PKN1 NA NA NA NA DDX39A 608 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 14597679 14597949 14597721 Y NA GIPC1,TECR,DNAJB1 NA NA NA NA GIPC1 6995 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 14616908 14617174 14617017 Y GIPC1 GIPC1,TECR,DNAJB1 GIPC1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TECR 8723 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr19 14789611 14789897 14789753 Y OR7A17,OR1I1,SLC1A6 ZNF333 NA NA NA NA ZNF333 8716 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 15974006 15974442 15974280 Y NA UCA1 NA NA NA NA UCA1 36235 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.45304630676127 chr19 16181046 16181841 16181607 Y OR10H2,OR10H3,OR10H4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 5215 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 16188924 16190024 16189835 Y TPM4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 13093 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr19 17218539 17219391 17218963 Y MED26,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 33948 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 17791017 17791370 17791235 Y MAP1S,IFI30,ARRDC2,ARRDC2 MAP1S NA NA NA NA MAP1S 36681 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 18133045 18133309 18133130 Y FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2 ARRDC2 NA NA NA NA ARRDC2 23104 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 18439179 18439536 18439334 Y NA JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1,GDF15 PGPEP1 K562 ChIA-PET 22265404 LSM4 7095 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 18485152 18485556 18485412 Y ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25 PGPEP1,GDF15,SSBP4 NA NA NA NA GDF15 1611 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 18497624 18497977 18497708 Y PDE4C,GDF15 PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA GDF15 14083 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr19 18527701 18528040 18527800 Y KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 27 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr19 18528263 18528792 18528577 Y UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 589 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 18630929 18631259 18631008 Y UPF1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,ELL FKBP8,KXD1,UBA52 NA NA NA NA ELL 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 18852715 18852875 18852814 Y GDF1,GDF15 NA NA NA NA NA CRTC1 60228 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 18874702 18875152 18875024 Y NA NA NA NA NA NA UPF1 65595 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 19432213 19432594 19432445 Y SUGP2,NCAN,ZNF14,PBX4,SUGP1,MAU2 MAU2,SUGP1 NA NA NA NA SUGP1 2560 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 19488658 19488936 19488750 Y NA GATAD2A NA NA NA NA GATAD2A 5699 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 19514283 19514636 19514393 Y HOMER3,RFXANK,GMIP,GATAD2A GATAD2A NA NA NA NA GATAD2A 19648 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 23310606 23310980 23310793 Y NA NA NA NA NA NA ZNF724P 120212 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 23530488 23530791 23530760 Y NA ZNF91 NA NA NA NA ZNF91 45571 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 23732304 23732710 23732386 Y NA NA NA NA NA NA ZNF675 135312 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 24216985 24217321 24217111 Y ZNF254 ZNF254 NA NA NA NA ZNF254 2709 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 28248561 28250861 28250165 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1451587 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 28265126 28266155 28265940 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1436293 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 30157267 30157499 30157417 Y PLEKHF1,C19orf12,C19orf12 PLEKHF1,C19orf12 NA NA NA NA PLEKHF1 3304 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 30336581 30336824 30336781 Y C19orf2,C19orf2 CCNE1 NA NA NA NA CCNE1 35776 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 30447917 30448294 30448014 Y NA URI1 NA NA NA NA URI1 35366 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 31371885 31372199 31372043 Y NA NA NA NA NA NA TSHZ3 466254 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 31705006 31705320 31705186 Y NA NA TSHZ3 IMR90 Hi-C 24141950 TSHZ3 133133 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 32863977 32864267 32864121 Y NA ZNF507,DPY19L3 NA NA NA NA ZNF507 29477 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 33532238 33532582 33532339 Y RHPN2,GPATCH1,PDCD5,ANKRD27,NUDT19,CEP89,C19orf40 RHPN2,GPATCH1 NA NA NA NA RHPN2 21212 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr19 33538325 33538659 33538479 Y RHPN2,GPATCH1,NUDT19,CEP89,C19orf40 RHPN2,GPATCH1 NA NA NA NA RHPN2 15135 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr19 33541924 33542310 33542117 Y NA RHPN2,GPATCH1 NA NA NA NA RHPN2 11484 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 33740333 33740640 33740371 Y NA NA CHST8,CEBPA,LOC80054,PEPD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CEBPA 50830 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 33789888 33790286 33790087 Y NA CEBPA NA NA NA NA CEBPA 1184 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 33841444 33841736 33841590 Y NA CEBPA,CEBPG CEBPA,CEBPG,WDR88,LRP3,SLC7A10,LOC80054,PEPD,CHST8 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CEBPG 20500 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 33996867 33997517 33996997 Y LRP3 PEPD NA NA NA NA PEPD 13183 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 34310855 34311133 34311012 Y NA KCTD15 NA NA NA NA KCTD15 26017 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 34311417 34311691 34311576 Y KCTD15 KCTD15 NA NA NA NA KCTD15 26579 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 34396925 34397389 34397012 Y NA NA KCTD15 MCF7 ChIA-PET 22265404 KCTD15 112087 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.67082885811029 chr19 34625713 34625998 34625854 Y PDCD2L LSM14A CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD IMR90 Hi-C 24141950 LSM14A 35411 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr19 34850085 34850642 34850351 Y ZNF599,ZNF302,ZNF181 GPI,PDCD2L NA NA NA NA GPI 1700 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr19 35704787 35705279 35704999 Y NA LSR NA NA NA NA LSR 31954 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 35809679 35810380 35810036 Y GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,IGFLR1,FFAR3 NA NA NA NA NA USF2 51798 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 36193251 36193562 36193412 Y USF2,CD22,FFAR1,HAUS5,ETV2,WDR62,HCST,ZBTB32,U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,ARHGAP33 IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37 MLL4,ZBTB32 K562 ChIA-PET 22265404 IGFLR1 37792 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 36519340 36519516 36519376 Y ZNF565 SDHAF1,ALKBH6,WDR62 NA NA NA NA ALKBH6 16199 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 36618643 36619171 36618835 Y NA TBCB,POLR2I,CAPNS1 NA NA NA NA CAPNS1 9306 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 38433320 38433698 38433507 Y ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1 SIPA1L3 NA NA NA NA SIPA1L3 37452 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 38490005 38490506 38490269 Y YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3 NA NA NA NA NA SIPA1L3 94137 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr19 38493976 38494435 38494152 Y YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3 NA NA NA NA NA SIPA1L3 98108 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 38539064 38539251 38539168 Y ZNF571 NA NA NA NA NA SIPA1L3 143196 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 38717073 38717581 38717079 Y NA SPINT2 NA NA NA NA SPINT2 15094 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 39148533 39148920 39148613 Y C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4 EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 12244 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr19 39149253 39149575 39149354 Y SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4 EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 12964 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr19 39152764 39152958 39152839 Y NA EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 16475 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 39167742 39168127 39167771 Y NA ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 31453 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 39175000 39175365 39175141 Y NFKBIB,HNRNPL,EIF3K ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 38711 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr19 39179503 39179787 39179628 Y RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 43214 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr19 39184148 39184440 39184342 Y C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 47859 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr19 39189644 39189919 39189773 Y RINL NA NA NA NA NA ACTN4 53355 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr19 39831946 39832143 39832027 Y NA SAMD4B,PAF1,MED29 NA NA NA NA SAMD4B 910 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 39894353 39894945 39894613 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H NA NA NA NA ZFP36 508 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 39921308 39921946 39921495 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H,TIMM50 NA NA NA NA RPS16 2642 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 40283749 40284047 40283932 Y NA NA NA NA NA NA FBL 51007 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 40823184 40823546 40823487 Y NA AKT2,PLD3,C19orf47 NA NA NA NA PLD3 28817 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 41108162 41108528 41108432 Y NA SHKBP1,LTBP4 NA NA NA NA LTBP4 11373 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 41152132 41152466 41152220 Y NA NUMBL NA NA NA NA NUMBL 42411 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 41701582 41701929 41701850 Y CYP2A13,CYP2F1 RPL36P16,CYP2S1,AXL NA NA NA NA CYP2S1 4628 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 41729438 41729579 41729517 Y ATP5SL,ATP5SL,AXL CYP2S1,AXL,HNRNPUL1 NA NA NA NA AXL 6330 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr19 41731541 41731893 41731762 Y NA CYP2S1,AXL,HNRNPUL1 NA NA NA NA AXL 8433 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 41771602 41771660 41771636 Y CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1 AXL,HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA HNRNPUL1 5201 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 41804006 41804567 41804366 Y TGFB1,B9D2,HNRNPUL1 HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA CCDC97 9527 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 41827649 41828097 41827915 Y HNRNPUL1,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 NA NA NA NA CCDC97 13555 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 41849661 41849907 41849784 Y HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA TMEM91 4909 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 42028325 42028365 42028354 Y NA NA CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 83703 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 42379575 42379860 42379642 Y ZNF574,DEDD2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1 RPS19,ARHGEF1 NA NA NA NA ARHGEF1 5368 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr19 42419916 42420316 42420067 Y ZNF574,GRIK5,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1 ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA ARHGEF1 34688 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 42429105 42429824 42429205 Y DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1 ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 31718 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 42440101 42440390 42440246 Y ARHGEF1,ARHGEF1 RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 21152 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 42440713 42441005 42440837 Y ZNF574,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1 RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 20537 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 42444277 42444712 42444407 Y POU2F2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1 RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 16830 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 42444727 42445027 42444981 Y NA RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 16515 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 42514619 42514744 42514681 Y ATP1A3 ATP1A3 NA NA NA NA ATP1A3 14970 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 42710307 42710321 42710316 Y NA DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF NA NA NA NA DEDD2 11971 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 42722677 42722859 42722787 Y NA DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC NA NA NA NA ZNF526 254 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 42772295 42772768 42772477 Y NA ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 1606 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 42774379 42774759 42774668 Y CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 3690 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 42775992 42776735 42776352 Y NA GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 NA NA NA NA CIC 5303 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 42784527 42784991 42784716 Y ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13838 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr19 42789863 42790090 42789919 Y CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,DEDD2,CIC GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA PRR19 14160 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 42913594 42913985 42913852 Y NA CXCL17 NA NA NA NA CXCL17 31215 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 43241725 43242137 43241944 Y NA PSG3 NA NA NA NA PSG3 584 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 43355116 43355369 43355287 Y NA PSG8,PSG1 NA NA NA NA PSG8 2474 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 43525971 43526126 43526036 Y NA NA NA NA NA NA PSG6 104256 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 44165978 44166186 44166121 Y NA ZNF428,CADM4,PLAUR NA NA NA NA PLAUR 6513 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 44178912 44179361 44178991 Y IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61 CADM4,PLAUR PLAUR MCF7 ChIA-PET 22265404 PLAUR 6213 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 44179506 44179853 44179716 Y TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61 CADM4,PLAUR PLAUR MCF7 ChIA-PET 22265404 PLAUR 6807 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chr19 44249305 44249426 44249352 Y IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61 SMG9,KCNN4 NA NA NA NA SMG9 7716 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 44261449 44261664 44261525 Y IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4 SMG9,KCNN4 NA NA NA NA SMG9 4307 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 44269192 44269953 44269534 Y IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4 SMG9,KCNN4 NA NA NA NA SMG9 12050 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 44281524 44282142 44281780 Y IRGQ,ZNF230,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4 SMG9,KCNN4,ZNF283 NA NA NA NA KCNN4 1267 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 44287065 44287299 44287223 Y NA SMG9,KCNN4,ZNF283 NA NA NA NA KCNN4 3656 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 44711538 44711905 44711597 Y NA ZNF226,ZNF227 NA NA NA NA ZNF227 1838 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr19 45095975 45096232 45096112 Y CLASRP,BCL3 PVR CEACAM16,TOMM40,PVR,MIR4531,IGSF23 IMR90 Hi-C 24141950 PVR 48866 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 45129392 45129792 45129578 Y PVRL2,GEMIN7,GEMIN7,PVR PVR NA NA NA NA PVR 15306 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 45228436 45228775 45228695 Y IGSF23,RELB,APOE,APOC4,APOC2,BCL3 BCL3 NA NA NA NA BCL3 20187 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 45248499 45249479 45248793 Y NA CBLC NA NA NA NA BCL3 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr19 45256546 45257099 45256742 Y ZNF296,RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3 BCL3,CBLC NA NA NA NA BCL3 7584 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr19 45279679 45279961 45279836 Y CEACAM19,CBLC,BCAM BCL3,CBLC,BCAM NA NA NA NA CBLC 553 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr19 45350775 45351289 45350997 Y BCL3,PVRL2,RELB BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 3343 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.00499462973235 chr19 45352107 45352544 45352311 Y NA BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 4675 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 45352951 45353140 45353112 Y NA BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 5519 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 45393623 45393866 45393750 Y ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40 PVRL2,TOMM40,APOE NA NA NA NA TOMM40 1797 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 45601584 45601804 45601678 Y FOSB ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37 NA NA NA NA PPP1R37 8930 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 45755637 45756189 45755812 Y RELB,CLASRP,VASP NA NA NA NA NA BLOC1S3 75634 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 45826869 45827146 45827057 Y DMPK,RTN2,CKM KLC3,ERCC2 NA NA NA NA KLC3 7546 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 45879605 45879880 45879744 Y NA KLC3,ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L NA NA NA NA ERCC2 7429 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 45905744 45905944 45905844 Y EML2,KLC3,PPP1R13L,ERCC1,ERCC1 ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L NA NA NA NA CD3EAP 1523 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr19 45931993 45932316 45932152 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1 NA NA NA NA PPP1R13L 24386 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 45945937 45946679 45946251 Y GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22574 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 45946690 45947113 45946759 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22140 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr19 45952039 45952594 45952534 Y GIPR,RELB,CLASRP,PPM1N,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 16659 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 45953764 45954783 45954182 Y NA CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 14470 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr19 45980345 45980732 45980359 Y GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP NA NA NA NA ERCC1 259 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr19 46011701 46012269 46011904 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP NA NA NA NA VASP 3864 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 46014236 46014617 46014413 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP NA NA NA NA VASP 6399 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 46133845 46134220 46134022 Y NANOS2,IGFL4,NKPD1,EXOC3L2 OPA3,EML2,GIPR NA NA NA NA EML2 12667 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 46361761 46362096 46361929 Y NA SYMPK,IRF2BP1,MYPOP NA NA NA NA SYMPK 2452 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 46877153 46877367 46877269 Y NA PPP5C,CCDC8 NA NA NA NA PPP5C 28902 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.55944026756961 chr19 47142195 47142976 47142503 Y NA CALM3 NA NA NA NA CALM3 39864 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 47269374 47269772 47269575 Y LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5 FKRP,STRN4,SLC1A5 NA NA NA NA SLC1A5 20079 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr19 47363167 47364689 47363471 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 AP2S1 SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 10918 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 47458912 47459233 47458939 Y ZC3H4,CCDC9 NA NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM160 90655 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 47599577 47599849 47599731 Y NA TMEM160,SAE1,ZC3H4 NA NA NA NA SAE1 14682 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr19 47662714 47662828 47662771 Y NA SAE1,ZC3H4 NA NA NA NA ZC3H4 47705 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 47776748 47776969 47776841 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1 BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA PRR24 606 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 47792934 47793257 47793053 Y NA CCDC9,PRR24 NA NA NA NA PRR24 16792 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr19 47818553 47819137 47818792 Y ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,C5AR1,GPR77 PRR24,DHX34 NA NA NA NA DHX34 31401 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 47867147 47867265 47867191 Y ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34 DHX34 NA NA NA NA DHX34 16609 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 48101913 48102072 48101991 Y NA NA SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAPA 85416 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.00749194459853 chr19 48102180 48102576 48102418 Y NA NA SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAPA 85683 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 48103581 48103982 48103689 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA GLTSCR1,NAPA MCF7 ChIA-PET 22265404 NAPA 87084 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr19 48166987 48167048 48167018 Y NA EHD2 NA NA NA NA EHD2 47552 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 48222362 48222481 48222377 Y SEPW1,PLA2G4C,MEIS3,SLC8A2 EHD2,GLTSCR2 NA NA NA NA EHD2 7762 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 48226445 48226596 48226537 Y NA EHD2,GLTSCR2 NA NA NA NA EHD2 11845 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 49046614 49046906 49046677 Y NA SULT2B1 SULT2B1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SULT2B1 6426 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 49092091 49092636 49092297 Y BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11 SULT2B1,SPHK2,RPL18,DBP NA NA NA NA SPHK2 27912 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 49430301 49430612 49430410 Y IZUMO1,PPP1R15A,FTL NUCB1,DHDH,BAX,FTL NA NA NA NA DHDH 4327 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 49465555 49466264 49465736 Y IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA FTL 294 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 49466802 49467527 49467169 Y IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA FTL 244 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 49493898 49494273 49494153 Y NA BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA GYS1 294 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 49495555 49495708 49495609 Y SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4 BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 850 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 49521043 49521282 49521101 Y NA GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 26338 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 49524183 49524468 49524237 Y CGB5 GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 29478 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 49590520 49590786 49590652 Y NA SNRNP70,LIN7B,C19orf73 NA NA NA NA SNRNP70 3844 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 49924099 49924476 49924276 Y TBC1D17,RRAS,RCN3,PRR12,NOSIP,AP2A1 ALDH16A1,PIH1D1 NA NA NA NA ALDH16A1 29950 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 50231635 50231822 50231729 Y NA AP2A1 NA NA NA NA AP2A1 36403 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 50993680 50994951 50994565 Y NA FAM71E1,JOSD2 NA NA NA NA FAM71E1 15670 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 51003635 51004295 51004006 Y MYH14,MYBPC2 FAM71E1,JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 8315 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 51287900 51288107 51288100 Y NA C19orf48 NA NA NA NA C19orf48 18079 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr19 51339255 51339614 51339393 Y KLK14,IGLON5,LRRC4B,SYT3,SYT3 C19orf48 NA NA NA NA C19orf48 33069 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 51465501 51465788 51465642 Y SYT3,SYT3,LOC342918,ACPT,KLK14,IGLON5,ETFB,C19orf75,KLK4 KLK5,KLK6,KLK7,KLK8,KLK9 NA NA NA NA KLK6 5141 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 52171455 52171952 52171620 Y ZNF350,CD33,SIGLEC14,FPR3,FPR2,FPR1 NA ZNF175,MIRLET7E,LINC00085,MIR125A,MIR99B,FPR2,FPR1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF175 98904 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 52192085 52192767 52192400 Y ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577 NA NA NA NA NA ZNF175 119534 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr19 52194056 52194504 52194155 Y ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1 NA NA NA NA NA ZNF175 121505 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 52194594 52195259 52195000 Y ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1 NA NA NA NA NA ZNF175 122043 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 52229316 52229816 52229631 Y HAS1 NA NA NA NA NA ZNF175 156765 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 53426305 53426488 53426354 Y ZNF765,ZNF468,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 17366 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr19 53592651 53593387 53593361 Y NA ZNF160 NA NA NA NA ZNF160 11302 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 53727403 53727861 53727738 Y NA NA NA NA NA NA ZNF845 107141 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr19 53917190 53917573 53917346 Y NA ZNF765,ZNF761 NA NA NA NA ZNF761 15654 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 54523388 54523781 54523608 Y TARM1,VSTM1,RPS9,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LENG8,LAIR2,LAIR1,ZNF331,ZNF331,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM NA NA NA NA NA NDUFA3 80255 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 54714720 54715094 54714879 Y NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6 TMC4,MBOAT7,TSEN34,RPS9 NA NA NA NA RPS9 12110 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 54772917 54773137 54772927 Y NLRP12,MYADM,VSTM1,TARM1,OSCAR,KIR3DL3,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR2,LAIR1,LILRB3,LILRB2 NA NA NA NA NA RPS9 70307 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 55627475 55627790 55627718 Y LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C RDH13,EPS8L1,PPP1R12C NA NA NA NA PPP1R12C 548 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr19 55850120 55850505 55850225 Y KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564 SUV420H2,COX6B2,IL11,TMEM238,RPL28 NA NA NA NA SUV420H2 899 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr19 55880979 55881171 55881094 Y ZNF579,NAT14,COX6B2,IL11 SUV420H2,COX6B2,IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA IL11 1148 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr19 55885541 55885905 55885786 Y NA SUV420H2,COX6B2,IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA IL11 5710 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 55909655 55909755 55909754 Y PPP1R12C,TMEM150B COX6B2,IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA UBE2S 7390 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 55917170 55917359 55917333 Y U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA UBE2S 25 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr19 55983917 55984059 55984005 Y RDH13,HSPBP1,ISOC2 ISOC2,ZNF628,NAT14 ZNF628,ISOC2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF628 1640 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 56060798 56061018 56060898 Y NA ZNF579,ZNF524 SGK110 K562 ChIA-PET 22265404 ZNF579 29193 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 56061327 56061704 56061673 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1 SGK110 K562 ChIA-PET 22265404 ZNF579 28507 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 4872 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr19 56218548 56218666 56218607 Y SUV420H2,NLRP9,U2AF2 EPN1 NA NA NA NA EPN1 33956 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 56603212 56603388 56603235 Y ZSCAN5A,NLRP11,NLRP8,NLRP5 ZNF787,ZNF444 NA NA NA NA ZNF787 27261 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 56621885 56622165 56622061 Y NA ZNF787,ZNF444 NA NA NA NA ZNF787 8484 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 58175767 58176046 58175802 Y ZNF460,ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,ZNF772,ZNF549,ZSCAN18,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF776,ZNF671,ZNF586,ZNF418,ZNF417,ZNF256,ZNF135,ZNF550,ZNF211,ZNF551 ZNF211,ZNF551 NA NA NA NA ZNF551 15291 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 58398826 58399093 58399050 Y ZNF548,ZNF772,ZNF549,ZNF134,ZSCAN4,ZNF154,ZNF671,ZNF776,ZSCAN1,ZNF606,ZNF329,ZNF256,ZNF135,ZNF418 ZNF587,ZNF417 NA NA NA NA ZNF417 26885 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 58715620 58715769 58715675 Y LOC100293516,C19orf18 ZNF274,ZNF544 NA NA NA NA ZNF544 22191 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr19 59029635 59029989 59029796 Y NA SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M SLC27A5 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC27A5 7855 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr19 59078228 59078288 59078258 Y CHMP2A,CHMP2A ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752 NA NA NA NA CENPBD1P1 4582 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 393939 394227 394175 Y SH3YL1 NA NA NA NA NA SH3YL1 129541 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 628526 628919 628630 Y NA TMEM18 FAM150B IMR90 Hi-C 24141950 TMEM18 46520 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 739928 740199 740059 Y NA NA TMEM18 MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM18 64489 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 1679499 1679591 1679561 Y NA NA NA NA NA NA PXDN 67033 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 1722150 1722351 1722236 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 24273 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 1725053 1725311 1725239 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 21313 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 1725652 1725860 1725698 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 20764 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr2 1742676 1742796 1742704 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 3828 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 1810384 1810763 1810574 Y NA NA NA NA NA NA PXDN 63760 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 2850815 2851100 2850821 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 528553 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 3340825 3341028 3341010 Y NA TSSC1,TRAPPC12 NA NA NA NA TSSC1 38625 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 3483837 3484086 3483869 Y NA ADI1 NA NA NA NA ADI1 37421 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 6997134 6997480 6997307 Y RSAD2,CMPK2 RSAD2,CMPK2 NA NA NA NA RSAD2 6457 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 8422131 8422275 8422172 Y ID2 NA NA NA NA NA ID2 394700 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 8726254 8726639 8726348 Y ID2 NA LOC100506274,LINC00299,ID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID2 90336 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 8767111 8767480 8767322 Y NA ID2 LINC00299,LOC339788,LOC100506274 IMR90 Hi-C 24141950 ID2 49495 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 9142736 9142998 9142867 Y NA MBOAT2 NA NA NA NA MBOAT2 794 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 9347909 9348072 9347942 Y NA ASAP2 NA NA NA NA ASAP2 3015 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 9374844 9375591 9375054 Y YWHAQ,ASAP2 ASAP2 NA NA NA NA ASAP2 29950 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 9391833 9392063 9392058 Y NA ASAP2 NA NA NA NA ASAP2 46939 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 9411571 9411694 9411610 Y ADAM17 NA NA NA NA NA ASAP2 66677 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 9427289 9427526 9427454 Y NA NA NA NA NA NA ASAP2 82395 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr2 9427801 9428115 9428020 Y YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2 NA NA NA NA NA ASAP2 82907 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.89360603919167 chr2 9428594 9428712 9428653 Y NA NA NA NA NA NA ASAP2 83700 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 9678248 9678641 9678477 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 15280 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 9688603 9688902 9688848 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 5019 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 9815627 9815977 9815711 Y NA YWHAQ NA NA NA NA YWHAQ 46484 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 9843184 9843905 9843528 Y KLF11,KLF11 NA ADAM17,GRHL1,ASAP2,CPSF3,ITGB1BP1,IAH1,YWHAQ IMR90 Hi-C 24141950 YWHAQ 74041 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 9893339 9893657 9893442 Y ADAM17,KLF11,KLF11 NA YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1 IMR90 Hi-C 24141950 TAF1B 87826 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 9894353 9894610 9894569 Y ADAM17,KLF11,KLF11,GRHL1 NA YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1,KLF11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF1B 86873 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr2 9920115 9920243 9920174 Y NA NA YWHAQ,KLF11,CYS1,ADAM17,GRHL1,RRM2,TAF1B IMR90 Hi-C 24141950 TAF1B 61240 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 9922366 9922715 9922451 Y NA NA YWHAQ,KLF11,CYS1,ADAM17,GRHL1,RRM2,TAF1B IMR90 Hi-C 24141950 TAF1B 58768 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 9941222 9941554 9941329 Y ADAM17,KLF11,KLF11 TAF1B YWHAQ,KLF11,CYS1,ADAM17,ODC1,RRM2,GRHL1,TAF1B,HPCAL1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF1B 39929 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr2 10075100 10075410 10075131 Y TAF1B GRHL1 GRHL1 IMR90 Hi-C 24141950 GRHL1 7931 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 10231138 10231270 10231204 Y NA RRM2 GRHL1,HPCAL1,NOL10,YWHAQ,RRM2,ODC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RRM2 29185 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 10260365 10260994 10260486 Y ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2 NA NA NA NA NA RRM2 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr2 10274411 10274722 10274506 Y TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48 RRM2 NA NA NA NA RRM2 13956 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 10430004 10430228 10430116 Y NA HPCAL1 HPCAL1,C2orf48,CYS1,RRM2,MIR4261,ODC1,NOL10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HPCAL1 10787 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 10633765 10634017 10633925 Y NOL10 ODC1,RP11-320M2.1 ODC1,HPCAL1,NOL10,CYS1,RRM2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-320M2.1 46945 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 11270081 11270242 11270156 Y KCNF1,C2orf50 PQLC3 NA NA NA NA PQLC3 23082 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 11443913 11444199 11444137 Y NA ROCK2 NA NA NA NA ROCK2 42257 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 12842829 12843040 12842916 Y NA TRIB2 LPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 11975 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 12856062 12856442 12856137 Y NA TRIB2 NA NA NA NA TRIB2 1047 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 15700375 15700622 15700454 Y DDX1,NBAS NBAS,DDX1 NA NA NA NA NBAS 921 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 16575995 16576348 16576051 Y NA NA NA NA NA NA FAM49A 269251 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 17554496 17554583 17554510 Y NA NA NA NA NA NA VSNL1 163810 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 19273463 19273583 19273517 Y NA NA OSR1 IMR90 Hi-C 24141950 RDH14 533517 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 19811541 19811934 19811810 Y NA NA NA NA NA NA LINC00954 254687 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 20249984 20250622 20250147 Y TTC32,PUM2 MATN3,LAPTM4A,RP11-644K8.1 NA NA NA NA RP11-644K8.1 89 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 20341243 20341467 20341355 Y NA NA PUM2,WDR35,MATN3,SDC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDC1 81727 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 20356621 20356779 20356666 Y NA NA SDC1,PUM2 IMR90 Hi-C 24141950 SDC1 66415 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 20372050 20372172 20372122 Y SDC1,SDC1 NA MATN3,SDC1,PUM2 IMR90 Hi-C 24141950 SDC1 51022 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 20385260 20385778 20385600 Y TTC32,HS1BP3 SDC1 NA NA NA NA SDC1 37416 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 20386283 20386578 20386422 Y TTC32,HS1BP3 SDC1 NA NA NA NA SDC1 36616 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 20412962 20413136 20413039 Y SDC1,SDC1 SDC1 NA NA NA NA SDC1 10058 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr2 20417309 20417694 20417511 Y SDC1,SDC1 SDC1 NA NA NA NA SDC1 5500 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 20431248 20431615 20431535 Y SDC1,SDC1 SDC1 NA NA NA NA SDC1 8054 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 20435780 20436055 20435965 Y SDC1,SDC1 SDC1 NA NA NA NA SDC1 12586 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr2 20534195 20534238 20534216 Y NA PUM2 NA NA NA NA PUM2 15757 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 20544740 20544866 20544805 Y NA PUM2 PUM2,HS1BP3 IMR90 Hi-C 24141950 PUM2 5129 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 20548410 20548604 20548507 Y NA PUM2 HS1BP3,PUM2 IMR90 Hi-C 24141950 PUM2 1391 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 20625227 20625401 20625349 Y NA RHOB HS1BP3,RHOB,PUM2 IMR90 Hi-C 24141950 RHOB 19434 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 20779015 20779511 20779185 Y NA NA HS1BP3,RHOB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HS1BP3 69338 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 20793103 20793496 20793437 Y APOB NA HS1BP3,RHOB,PUM2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HS1BP3 55353 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 20795868 20796230 20795893 Y RHOB,HS1BP3 NA HS1BP3,RHOB,PUM2 IMR90 Hi-C 24141950 HS1BP3 52619 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 20965440 20965780 20965672 Y NA NA NA NA NA NA C2orf43 55102 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 21691615 21691861 21691725 Y NA NA NA NA NA NA C2orf43 670733 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 23609943 23610311 23610250 Y KLHL29 KLHL29 NA NA NA NA KLHL29 3855 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 23681941 23682000 23681953 Y KLHL29 NA NA NA NA NA KLHL29 75853 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 23783139 23783161 23783150 Y NA NA NA NA NA NA KLHL29 177051 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 23923305 23923445 23923375 Y NA NA NA NA NA NA ATAD2B 224539 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 26220678 26220902 26220866 Y RAB10 KIF3C,RAB10 ASXL2,RAB10,FAM59B,KIF3C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIF3C 17060 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 26522632 26522929 26522714 Y NA EPT1,GPR113 NA NA NA NA EPT1 6486 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr2 26980806 26981182 26980970 Y C2orf18 CENPA OTOF,CENPA,C2orf70,CIB4,KCNK3,DPYSL5,MAPRE3,C2orf18 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CENPA 3975 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr2 27005355 27005756 27005547 Y NA CENPA NA NA NA NA CENPA 20198 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 27304052 27304486 27304234 Y CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1 AGBL5,OST4,KHK,ABHD1 NA NA NA NA KHK 3129 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 27543962 27544264 27544065 Y NA SLC30A3,MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17 NA NA NA NA MPV17 2283 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 27557346 27557529 27557503 Y DPYSL5,C2orf16 MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513 NA NA NA NA MPV17 10799 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 27574731 27574755 27574743 Y NA MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3 NA NA NA NA AC074117.10 2358 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 27631105 27631216 27631160 Y C2orf16 EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1 NA NA NA NA PPM1G 551 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 27878874 27879165 27879028 Y SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L NA NA NA NA SLC4A1AP 5173 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 27939854 27940151 27940111 Y NA AC074091.13 RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2,PLB1 IMR90 Hi-C 24141950 AC074091.13 3255 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 27958320 27958698 27958604 Y NA AC074091.13,MRPL33 BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC074091.13 21721 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr2 28021914 28022357 28022176 Y RBKS MRPL33 NA NA NA NA MRPL33 29330 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.67082885811029 chr2 28134368 28134411 28134390 Y NA BRE,RBKS NA NA NA NA RBKS 22403 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 28183212 28183402 28183309 Y FOSL2 NA NA NA NA NA RBKS 71247 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 28215985 28216067 28216026 Y NA NA NA NA NA NA RBKS 104020 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 28319174 28319559 28319300 Y NA NA NA NA NA NA RBKS 207209 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 28400759 28401210 28400868 Y RBKS,BRE,BRE,FOSL2 NA NA NA NA NA FOSL2 212105 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 28498872 28499304 28499073 Y RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 NA NA NA NA NA FOSL2 114011 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 28632075 28632521 28632225 Y PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 FOSL2,AC104695.3 NA NA NA NA AC104695.3 16536 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr2 28659517 28659673 28659646 Y NA FOSL2,AC104695.3 FOSL2 MCF7 ChIA-PET 22265404 AC104695.3 43978 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 28767576 28768254 28768064 Y WDR43,TRMT61B,SPDYA NA NA NA NA NA AC104695.3 152037 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 28844259 28844848 28844625 Y FOSL2,TRMT61B,PPP1CB,PPP1CB NA NA NA NA NA PPP1CB 127658 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 28856660 28856889 28856764 Y NA NA NA NA NA NA PPP1CB 115617 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 28903940 28904347 28904218 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB NA PPP1CB,SPDYA,PLB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP1CB 68159 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 29060448 29060640 29060540 Y PPP1CB,PPP1CB TRMT61B NA NA NA NA TRMT61B 30527 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 29173330 29173730 29173529 Y PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43 NA NA NA NA NA WDR43 57821 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 29331222 29331429 29331307 Y NA CLIP4 CLIP4 MCF7 ChIA-PET 22265404 CLIP4 12651 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 29339148 29339698 29339489 Y NA CLIP4 NA NA NA NA CLIP4 20577 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 30063514 30063882 30063849 Y NA NA NA NA NA NA YPEL5 303925 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr2 30458307 30458498 30458425 Y YPEL5,LBH LBH,AC104698.1 NA NA NA NA LBH 5910 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 30788063 30788262 30788163 Y NA NA NA NA NA NA LCLAT1 119971 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 31538679 31538700 31538690 Y NA NA NA NA NA NA EHD3 83799 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 33295461 33295712 33295665 Y NA NA NA NA NA NA TTC27 444362 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 33823609 33823729 33823667 Y RASGRP3 FAM98A NA NA NA NA FAM98A 1160 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 36584242 36585529 36584872 Y FEZ2,CRIM1 CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 3173 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr2 36603527 36603925 36603600 Y NA CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 22458 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr2 36688353 36688868 36688635 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 107284 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 36700444 36700711 36700553 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 119375 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 36713753 36714120 36713762 Y CRIM1,VIT,FEZ2 NA NA NA NA NA CRIM1 132684 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 36761840 36762400 36762263 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 108830 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 36790527 36791707 36791646 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 79523 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 36791809 36792197 36792002 Y CRIM1 NA NA NA NA NA FEZ2 79033 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 36795570 36795942 36795825 Y FEZ2 NA NA NA NA NA FEZ2 75288 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 37116938 37117262 37117216 Y NA NA NA NA NA NA STRN 74353 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 37489254 37489354 37489306 Y NA CEBPZ NA NA NA NA CEBPZ 32398 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 37851057 37851610 37851419 Y EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 112001 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 37879485 37879782 37879514 Y EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 83829 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 37884022 37884434 37884213 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP3 79177 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 37892431 37892964 37892857 Y QPCT,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 70647 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 37897080 37897760 37897461 Y QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 65851 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 37938546 37938819 37938725 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 24792 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 38008241 38008581 38008345 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3,PRKD3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 44630 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 38316576 38316959 38316768 Y CDC42EP3,FAM82A1,CYP1B1 CYP1B1 CYP1B1 MCF7 ChIA-PET 22265404 CYP1B1 18085 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 38373682 38374230 38374188 Y CDC42EP3,CYP1B1 CYP1B1 NA NA NA NA CYP1B1 38638 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 38417790 38418062 38417924 Y CYP1B1 RPL7P12 NA NA NA NA RPL7P12 38648 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 39079289 39079498 39079407 Y SRSF7,ARHGEF33 DHX57,MORN2 NA NA NA NA DHX57 21577 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 39665108 39665339 39665266 Y NA AC007246.3,MAP4K3 NA NA NA NA MAP4K3 2655 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr2 39683895 39683929 39683912 Y NA AC007246.3,MAP4K3 NA NA NA NA MAP4K3 21442 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 40628782 40629514 40629399 Y NA NA NA NA NA NA SLC8A1 206679 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 42161610 42162017 42161892 Y NA NA NA NA NA NA PKDCC 111143 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 42328958 42329862 42329543 Y NA NA EML4 IMR90 Hi-C 24141950 PKDCC 55798 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 42360195 42360705 42360352 Y EML4 EML4 EML4,COX7A2L,LOC388942 IMR90 Hi-C 24141950 EML4 33785 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 42481657 42481775 42481735 Y EML4 NA NA NA NA NA EML4 87167 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 42696554 42696964 42696742 Y NA COX7A2L,KCNG3,MTA3 NA NA NA NA KCNG3 22273 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 43037224 43037999 43037611 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC025750.7 278642 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 43158886 43159240 43159064 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L2 292508 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 43302253 43302513 43302383 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 149235 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr2 43313736 43313941 43313748 Y NA NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 137807 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr2 43385938 43386506 43386186 Y OXER1,ZFP36L2 NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 65242 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 43434759 43434952 43434875 Y OXER1 ZFP36L2 NA NA NA NA ZFP36L2 16796 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 43653578 43653957 43653847 Y NA NA LOC100129726,ZFP36L2 MCF7 ChIA-PET 22265404 THADA 167228 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 43685237 43685474 43685356 Y NA NA NA NA NA NA THADA 135711 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 44212195 44212421 44212308 Y NA LRPPRC NA NA NA NA LRPPRC 8723 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 44398343 44398537 44398440 Y NA PPM1B NA NA NA NA PPM1B 5235 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 44664975 44664991 44664983 Y NA NA NA NA NA NA CAMKMT 77886 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 45030101 45030473 45030141 Y NA NA NA NA NA NA AC012354.8 191079 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 45237112 45237533 45237325 Y SIX2 AC012354.8,SIX2 NA NA NA NA SIX2 2543 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 45405025 45405418 45405218 Y NA NA NA NA NA NA SIX2 170456 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 45411635 45411970 45411804 Y NA NA NA NA NA NA SIX2 177066 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr2 46125185 46125467 46125284 Y NA NA NA NA NA NA PRKCE 248701 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 46212455 46212485 46212471 Y PRKCE NA NA NA NA NA EPAS1 306321 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 46265425 46265774 46265513 Y NA NA NA NA NA NA EPAS1 253032 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 46292387 46292596 46292492 Y NA NA NA NA NA NA EPAS1 226210 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 46294979 46295300 46295093 Y NA NA NA NA NA NA EPAS1 223506 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 46303554 46303874 46303714 Y NA NA NA NA NA NA EPAS1 214932 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 46406206 46406535 46406438 Y NA NA NA NA NA NA EPAS1 112271 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr2 46536857 46537129 46536993 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 18051 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 46542401 46542637 46542520 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 23595 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 46561811 46562247 46561970 Y SOCS5,SOCS5 EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 43005 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 47031260 47031826 47031474 Y NA LINC01119 LOC388948,SOCS5,CRIPT,LOC100134259,MCFD2,TTC7A IMR90 Hi-C 24141950 LINC01119 10010 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 47075244 47075442 47075379 Y MCFD2,MCFD2 LINC01119 NA NA NA NA LINC01119 33408 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 47076896 47077421 47077187 Y SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2 LINC01119 NA NA NA NA LINC01119 35060 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr2 47077976 47078245 47078111 Y SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2 LINC01119 NA NA NA NA LINC01119 36140 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr2 47109327 47109734 47109459 Y SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2 TTC7A NA NA NA NA TTC7A 31562 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 47194379 47194775 47194547 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 27385 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 47195176 47195614 47195246 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 28182 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr2 47197841 47198107 47197954 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 30847 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 47210404 47210621 47210509 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 43410 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 47212237 47212567 47212294 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 45243 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 47212823 47213029 47212897 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 45829 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 47213827 47213985 47213928 Y NA MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 46833 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 47270774 47271231 47270943 Y NA NA NA NA NA NA MCFD2 103780 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.78221744865098 chr2 47296749 47297008 47296937 Y NA NA NA NA NA NA CALM2 104732 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 47297632 47297822 47297725 Y NA NA NA NA NA NA CALM2 103918 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 47298687 47298930 47298712 Y TTC7A,MCFD2 NA NA NA NA NA CALM2 102810 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 47418967 47419222 47419129 Y NA CALM2 TTC7A,C2orf61,SOCS5,MCFD2,CALM2,EPCAM IMR90 Hi-C 24141950 CALM2 17227 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 50778633 50778874 50778754 Y NRXN1,NRXN1 NA NA NA NA NA STON1 2024111 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 51010628 51010803 51010737 Y NRXN1,NRXN1 NA NA NA NA NA STON1 2256106 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 54751942 54752182 54752042 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 70520 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 54786900 54787386 54787056 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 105478 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr2 54787503 54787764 54787623 Y RTN4,SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 106081 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.78221744865098 chr2 54799241 54799892 54799606 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 117819 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 54801406 54802103 54801693 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 119984 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 55249584 55250267 55249993 Y NA NA NA NA NA NA RTN4 87490 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 55338983 55339153 55339057 Y CCDC88A,RTN4,RTN4 RTN4 C2orf63,RTN4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 1226 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 55767070 55767336 55767332 Y NA CCDC104 NA NA NA NA CCDC104 22330 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 56083172 56083316 56083296 Y EFEMP1 NA NA NA NA NA EFEMP1 65958 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 56089907 56090266 56090122 Y NA NA NA NA NA NA EFEMP1 59008 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr2 56968776 56968885 56968798 Y NA NA NA NA NA NA EFEMP1 819502 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 58334895 58335527 58335141 Y VRK2,VRK2,VRK2 NA NA NA NA NA FANCL 130980 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 60097696 60097843 60097770 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-32P 511897 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 60228228 60228402 60228315 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-32P 381338 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 60962204 60962802 60962781 Y NA PAPOLG NA NA NA NA PAPOLG 18563 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 61165363 61165465 61165452 Y NA NA NA NA NA NA REL 58707 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 61428317 61428371 61428344 Y USP34,AHSA2 AHSA2 NA NA NA NA AHSA2 25764 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 61580039 61580318 61580309 Y NA NA NA NA NA NA USP34 115586 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 61757728 61758222 61758112 Y NA XPO1 NA NA NA NA XPO1 5539 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 61921641 61922071 61921953 Y NA NA NA NA NA NA FAM161A 157207 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 61990946 61991094 61991044 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 88184 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 87618 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.67082885811029 chr2 62424513 62424632 62424578 Y B3GNT2 B3GNT2 NA NA NA NA B3GNT2 3265 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 62519354 62519381 62519368 Y NA NA COMMD1,B3GNT2 IMR90 Hi-C 24141950 B3GNT2 98106 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 62531997 62532204 62532030 Y B3GNT2 NA COMMD1 IMR90 Hi-C 24141950 B3GNT2 110749 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 62534127 62534336 62534147 Y NA NA COMMD1 IMR90 Hi-C 24141950 B3GNT2 112879 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 62803591 62803729 62803643 Y NA NA EHBP1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM17 66562 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 62881470 62881867 62881666 Y NA EHBP1 EHBP1,TMEM17 IMR90 Hi-C 24141950 EHBP1 17119 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 63285480 63285937 63285754 Y OTX1 OTX1 NA NA NA NA OTX1 10288 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 63842322 63842740 63842368 Y UGP2 MDH1 NA NA NA NA MDH1 28579 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 64587056 64587400 64587325 Y NA NA AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 AFTPH 162065 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 64978173 64978610 64978385 Y CEP68 SERTAD2 SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 2034 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 64994926 64995226 64995021 Y SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 18787 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr2 65058327 65058875 65058618 Y AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 82188 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 65065938 65066285 65066136 Y AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 89799 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 65086968 65087262 65087080 Y AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 110829 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 65093958 65094266 65094153 Y NA NA SERTAD2,AFTPH,LOC339807 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SERTAD2 117819 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 65326595 65326952 65326834 Y NA CEP68,RAB1A NA NA NA NA RAB1A 28288 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 65328578 65328848 65328754 Y NA CEP68,RAB1A NA NA NA NA RAB1A 26392 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 65440417 65440444 65440431 Y NA AC007318.5,ACTR2 LOC400958,CEP68,ACTR2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC007318.5 10280 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 65656801 65657217 65657146 Y NA SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 554 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 65657861 65658229 65658008 Y SLC1A4,SPRED2,SPRED2 SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 90 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr2 65804222 65804385 65804306 Y RAB1A NA ACTR2,SPRED2 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED2 146451 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 66652427 66652950 66652646 Y MEIS1 MEIS1,MEIS1-AS3 LOC644838 IMR90 Hi-C 24141950 MEIS1 5634 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 66801899 66802241 66801940 Y MEIS1 NA NA NA NA NA MEIS1-AS3 143297 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 67067097 67067512 67067390 Y NA AC009474.2 LOC644838,MEIS1 IMR90 Hi-C 24141950 AC009474.2 38842 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr2 67486839 67487275 67486977 Y NA NA MEIS1,ETAA1,LOC644838,C1D IMR90 Hi-C 24141950 ETAA1 135176 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 67517733 67518064 67517835 Y NA NA MEIS1,ETAA1 IMR90 Hi-C 24141950 ETAA1 104387 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr2 68472906 68473226 68473141 Y PPP3R1 PPP3R1 NA NA NA NA PPP3R1 8143 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 69036777 69036835 69036806 Y ARHGAP25 NA NA NA NA NA GKN1 162870 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 69135600 69135857 69135778 Y NA NA ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10 IMR90 Hi-C 24141950 GKN1 63848 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 69309666 69309994 69309927 Y NA NA NA NA NA NA GKN1 109961 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 69424670 69425029 69424849 Y NA NA NA NA NA NA GFPT1 187353 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 70048617 70048893 70048741 Y ANXA4 GMCL1 NA NA NA NA GMCL1 5881 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 70057532 70057914 70057667 Y C2orf42,AAK1,GMCL1 GMCL1 NA NA NA NA GMCL1 2758 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 70141198 70141461 70141241 Y NA SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA MXD1 18378 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 70144957 70145388 70145176 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA MXD1 22137 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 70160460 70161117 70160745 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 SNRNP27,MXD1,ASPRV1 PCBP1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ASPRV1 26280 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 70161598 70161791 70161659 Y PCBP1,C2orf42,MXD1,ASPRV1 SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA ASPRV1 25606 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 70270545 70270983 70270722 Y MXD1,ASPRV1,C2orf42,PCBP1 PCBP1,PCBP1-AS1 NA NA NA NA PCBP1 41602 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 70363059 70363462 70363144 Y MXD1,C2orf42,PCBP1 PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 35376 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 70608938 70609447 70609175 Y TGFA NA NA NA NA NA FAM136A 81716 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chr2 70667389 70667575 70667482 Y NA NA NA NA NA NA TGFA 111750 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 70823463 70823663 70823562 Y TGFA TGFA NA NA NA NA TGFA 44138 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr2 71129017 71129173 71129049 Y NA VAX2,ATP6V1B1 NA NA NA NA VAX2 3297 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 71679813 71679928 71679869 Y NAGK,ZNF638,DYSF DYSF NA NA NA NA DYSF 961 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 73233755 73233809 73233782 Y NA NA EMX1 IMR90 Hi-C 24141950 SFXN5 66938 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 73338552 73338952 73338867 Y RAB11FIP5 SFXN5,RAB11FIP5 NA NA NA NA SFXN5 37805 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 73613683 73613856 73613817 Y DUSP11,ALMS1 ALMS1 NA NA NA NA ALMS1 2797 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 74152201 74152400 74152268 Y NA DGUOK NA NA NA NA DGUOK 248 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 75063027 75063135 75063034 Y HK2 HK2 NA NA NA NA HK2 3919 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 75071156 75071353 75071277 Y LBX2,HK2 HK2 NA NA NA NA HK2 12048 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 75072652 75072899 75072736 Y HK2 HK2 NA NA NA NA HK2 13544 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 75114636 75114786 75114714 Y NA AC104135.3 NA NA NA NA AC104135.3 28489 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.56193758243578 chr2 81709176 81709459 81709306 Y NA NA NA NA NA NA AC016716.1 1320915 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr2 84878729 84879090 84878910 Y NA NA NA NA NA NA DNAH6 137150 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 85034355 85034669 85034421 Y NA NA NA NA NA NA TMSB10 96080 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 85057054 85057454 85057405 Y NA NA NA NA NA NA TMSB10 73295 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 85066726 85066734 85066730 Y NA NA NA NA NA NA TMSB10 64015 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 85116002 85116322 85116077 Y C2orf89,TMSB10 TMSB10 TMSB10 MCF7 ChIA-PET 22265404 TMSB10 14427 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 85147093 85147556 85147171 Y TMSB10 TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 16344 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 85173188 85173797 85173736 Y TMSB10 TMSB10,KCMF1 KCMF1,TMSB10 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KCMF1 22419 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 85483180 85483288 85483234 Y NA NA NA NA NA NA TGOLN2 70260 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 85567649 85568034 85567918 Y NA TGOLN2,ELMOD3,RETSAT TGOLN2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ELMOD3 11483 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 85664544 85665596 85664830 Y KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6 CAPG NA NA NA NA CAPG 20989 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 85764802 85765239 85764815 Y SH2D6,USP39 MAT2A,GGCX,VAMP8 NA NA NA NA MAT2A 514 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 85969500 85969917 85969748 Y VAMP5,TMEM150A,ATOH8 RNU1-38P,ATOH8 ATOH8,POLR1A,USP39,C2orf68,SFTPB,LOC284950,ST3GAL5,LOC90784,PTCD3 IMR90 Hi-C 24141950 ATOH8 6550 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 85982713 85983043 85983025 Y NA RNU1-38P,ATOH8 NA NA NA NA ATOH8 6246 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 85993562 85993638 85993601 Y NA RNU1-38P,ATOH8 NA NA NA NA ATOH8 17095 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 86163596 86163679 86163638 Y NA ST3GAL5 POLR1A,ST3GAL5,ATOH8,LOC90784,LOC284950 IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL5 49459 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 86761300 86761347 86761323 Y REEP1,REEP1 NA NA NA NA NA RNF103 87642 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 88374618 88374677 88374648 Y NA KRCC1 NA NA NA NA KRCC1 21370 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 88629818 88629863 88629841 Y NA NA NA NA NA NA FOXI3 120268 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 88899554 88899981 88899832 Y EIF2AK3 EIF2AK3 NA NA NA NA EIF2AK3 25113 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 91759872 91760090 91759934 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2770710 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 91815672 91815808 91815787 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2826510 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chr2 91821438 91821799 91821741 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2832276 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 91936197 91936406 91936290 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2947035 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr2 95925847 95925871 95925861 Y NA PROM2 PROM2 IMR90 Hi-C 24141950 PROM2 12330 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr2 95961879 95962169 95961976 Y TRIM43,KCNIP3 PROM2 NA NA NA NA PROM2 23678 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 96190968 96191044 96191006 Y NA NA NA NA NA NA FAHD2A 124499 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 96348390 96348623 96348461 Y NA NA NA NA NA NA FAHD2A 281921 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 96782666 96782871 96782861 Y NA DUSP2 NA NA NA NA DUSP2 26308 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 97206009 97206227 97206118 Y NA NEURL3,ARID5A NA NA NA NA ARID5A 5529 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 97211723 97211896 97211824 Y ASTL,DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,CNNM3,ARID5A NEURL3,ARID5A NA NA NA NA ARID5A 11243 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 97291626 97292008 97291852 Y NA FER1L5,KANSL3 NA NA NA NA FER1L5 14466 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 97554359 97554681 97554500 Y NA ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C NA NA NA NA SEMA4C 19865 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 97587789 97588030 97587916 Y NA NA NA NA NA NA SEMA4C 53295 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 98443211 98443622 98443475 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-8P 164017 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 98465985 98466159 98466067 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 144229 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 98822932 98823207 98823080 Y NA NA NA NA NA NA VWA3B 121353 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 99064911 99065194 99064955 Y MGAT4A,MGAT4A,INPP4A INPP4A NA NA NA NA INPP4A 5594 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 99072105 99072338 99072215 Y TMEM131,MGAT4A,MGAT4A,INPP4A INPP4A NA NA NA NA INPP4A 12788 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 100484034 100484497 100484368 Y NA NA NA NA NA NA REV1 379537 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 100498420 100498601 100498511 Y AFF3 NA NA NA NA NA REV1 393923 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 100907600 100907945 100907823 Y NA NA NA NA NA NA CHST10 124173 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr2 100908504 100908788 100908727 Y NA NA NA NA NA NA CHST10 123330 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr2 101270237 101270473 101270387 Y RPL31 NA NPAS2 IMR90 Hi-C 24141950 PDCL3 93085 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 101884483 101884674 101884578 Y MAP4K4,MAP4K4,RNF149 TBC1D8,RNF149 NA NA NA NA TBC1D8 17155 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 101923239 101923757 101923472 Y RPL31,MAP4K4,MAP4K4,RNF149 RNF149 NA NA NA NA RNF149 76 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 102133779 102134093 102133972 Y MAP4K4,MAP4K4 NA MAP4K4,RFX8,CREG2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREG2 131722 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 102383406 102383725 102383568 Y MAP4K4,MAP4K4 NA NA NA NA NA MAP4K4 72094 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 102492851 102493221 102493042 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K4 181539 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 102744535 102744807 102744707 Y IL1RL2,IL1R1,MAP4K4,MAP4K4 NA IL1RL2,IL1R2,IL1R1,IL1RL1,IL18RAP IMR90 Hi-C 24141950 IL1R1 65531 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 102844003 102844653 102844435 Y IL1R2,IL18RAP,IL1R1 NA NA NA NA NA IL1RL1 81309 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 105973379 105973614 105973553 Y NA TGFBRAP1,C2orf49 NA NA NA NA C2orf49 21563 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 106008939 106009297 106009286 Y NA FHL2 NA NA NA NA FHL2 43673 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 106020017 106020290 106020154 Y NA FHL2 NA NA NA NA FHL2 32680 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 106020631 106021071 106020783 Y FHL2,FHL2 FHL2 NA NA NA NA FHL2 31899 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 106026144 106026496 106026333 Y GPR45,FHL2 FHL2 NA NA NA NA FHL2 26474 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 109210699 109211038 109210811 Y LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1 NA NA NA NA NA LIMS1 61842 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 109211421 109211903 109211563 Y LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1 NA NA NA NA NA LIMS1 62564 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 109228635 109228941 109228810 Y GCC2,RANBP2,LIMS1 NA NA NA NA NA LIMS1 79778 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 109514642 109514975 109514799 Y NA NA NA NA NA NA CCDC138 113429 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 109706111 109706459 109706286 Y NA NA EDAR,SEPT10,SH3RF3,LOC100287216 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC138 304898 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 110271705 110271931 110271836 Y NA NA NA NA NA NA SEPT10 97852 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 110318153 110318301 110318244 Y NA NA NA NA NA NA SEPT10 51482 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 110859077 110859497 110859213 Y NA MALL NA NA NA NA MALL 12646 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr2 111879046 111879315 111879118 Y NA BCL2L11 NA NA NA NA BCL2L11 4091 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 112375521 112375561 112375551 Y NA NA NA NA NA NA ANAPC1 264706 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 112417011 112417329 112417184 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90 Hi-C 24141950 ANAPC1 222938 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr2 112459778 112460151 112459873 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANAPC1 180116 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 112462014 112462125 112462055 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANAPC1 178142 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 113058633 113059002 113058901 Y NA ZC3H8,ZC3H6 NA NA NA NA ZC3H6 27462 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 113384986 113385271 113385131 Y NA CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1 NA NA NA NA AC079922.2 7242 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 113448603 113448987 113448785 Y IL36B,IL36G,IL1RN,IL1B,IL1A SLC20A1,NT5DC4 POLR1B,CHCHD5,SLC20A1,CKAP2L,FLJ42351 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5DC4 28076 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 113450039 113450435 113450231 Y IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A SLC20A1,NT5DC4 SLC20A1,FLJ42351 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5DC4 26628 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 113450750 113451037 113450852 Y NA SLC20A1,NT5DC4 SLC20A1,FLJ42351 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5DC4 26026 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 113544894 113545271 113545075 Y IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L,IL1A,IL1B NA NA NA NA IL1A 4727 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 113550957 113551489 113551296 Y IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L,IL1A,IL1B CKAP2L,IL37,IL1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IL1A 10790 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 113551784 113552157 113551927 Y IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L,IL1A,IL1B CKAP2L,IL37,IL1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IL1A 11617 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 113552525 113552798 113552647 Y IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L,IL1A,IL1B CKAP2L,IL37,IL1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IL1A 12358 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 113556767 113557612 113557074 Y IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L,IL1A,IL1B IL37,CKAP2L,CHCHD5,IL1A,IL1B IMR90 Hi-C 24141950 IL1A 16600 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 113561817 113562080 113561958 Y NA CKAP2L,IL1A,IL1B CKAP2L IMR90 Hi-C 24141950 IL1A 21650 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 113562551 113562581 113562567 Y IL1A CKAP2L,IL1A,IL1B CKAP2L IMR90 Hi-C 24141950 IL1A 22384 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr2 113563232 113563409 113563324 Y IL36G,IL1RN CKAP2L,IL1A,IL1B NA NA NA NA IL1A 23065 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 113569466 113569945 113569683 Y IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L,IL1A,IL1B NA NA NA NA IL1B 22535 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr2 113570329 113570602 113570498 Y IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B IL1A,IL1B NA NA NA NA IL1B 21878 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr2 113571140 113571483 113571425 Y IL37,IL1A IL1A,IL1B NA NA NA NA IL1B 20997 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 113571813 113572166 113571903 Y NA IL1A,IL1B NA NA NA NA IL1B 20314 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr2 113573367 113573750 113573559 Y IL1A IL1A,IL1B NA NA NA NA IL1B 18730 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 113576216 113576532 113576373 Y IL36G,PSD4,IL1RN,IL1A,IL1B IL1A,IL1B NA NA NA NA IL1B 15948 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 113581693 113582026 113582010 Y NA IL1A,IL1B NA NA NA NA IL1B 10454 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chr2 113582240 113582548 113582356 Y NA IL1A,IL1B NA NA NA NA IL1B 9932 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 113583112 113583470 113583291 Y IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B IL1A,IL1B NA NA NA NA IL1B 9010 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 113629155 113629320 113629193 Y IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B IL1B IL1B,CKAP2L,IL1A IMR90 Hi-C 24141950 IL1B 36675 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 113635122 113635394 113635287 Y NA IL1B IL1B,CKAP2L,IL37,IL1A IMR90 Hi-C 24141950 IL1B 42642 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 113638257 113639193 113638961 Y IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B IL1B CKAP2L,IL1A IMR90 Hi-C 24141950 IL1B 45777 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 113643095 113643585 113643305 Y IL1A,IL1B,IL36B,IL36RN,IL1RN,IL36G NA CKAP2L,IL1A,IL1B,IL37 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IL1B 50615 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 113649129 113649319 113649248 Y TTL,IL1A,IL1B,IL36B,IL36RN,IL1RN,IL36G NA CKAP2L,IL1A,IL1B,IL37 IMR90 Hi-C 24141950 IL1B 56649 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 113835949 113836406 113836219 Y IL1A,IL1B,IL36G,CBWD2,IL36B,IL36RN,IL1RN NA NA NA NA NA IL36G 107169 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 113881199 113882653 113881886 Y IL1A,IL1B,IL36G,IL36B,IL1RN NA NA NA NA NA IL36G 152419 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 114082449 114082815 114082523 Y NA NA PAX8,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 RABL2A 299991 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr2 114469366 114469830 114469722 Y SLC35F5 SLC35F5 NA NA NA NA SLC35F5 42570 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 114644100 114644364 114644199 Y CBWD2,ACTR3 ACTR3 NA NA NA NA ACTR3 1173 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 118578074 118578451 118578195 Y CCDC93,DDX18 DDX18 NA NA NA NA DDX18 7848 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 118739522 118739775 118739730 Y DDX18,CCDC93 CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 29934 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 118847045 118847263 118847087 Y INSIG2 INSIG2 NA NA NA NA INSIG2 3017 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr2 119067655 119067950 119067737 Y NA NA NA NA NA NA AC093901.1 125693 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 119311902 119312304 119312144 Y NA NA NA NA NA NA EN1 290950 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 119731021 119731371 119731347 Y NA NA NA NA NA NA EN1 127767 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 120996274 120996566 120996498 Y NA TMEM185B,RALB EPB41L5,RALB,TMEM185B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RALB 634 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 122275440 122275469 122275455 Y NA RNU4ATAC NA NA NA NA RNU4ATAC 10988 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 122456992 122457582 122457167 Y CLASP1 TSN NA NA NA NA TSN 35097 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 122479618 122479882 122479768 Y NA TSN NA NA NA NA TSN 12797 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 126400932 126401173 126401056 Y NA NA NA NA NA NA YWHAZP2 912566 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 127772292 127772580 127772500 Y MAP3K2 NA NA NA NA NA BIN1 90351 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 127840546 127840814 127840619 Y NA BIN1 NA NA NA NA BIN1 22117 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 128169566 128169991 128169902 Y NA MAP3K2 NA NA NA NA MAP3K2 25525 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 128173465 128174362 128173731 Y SFT2D3,AMMECR1L,MAP3K2,PROC MAP3K2 NA NA NA NA MAP3K2 29424 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 128258405 128258697 128258648 Y NA RNU4-48P,IWS1 NA NA NA NA IWS1 23765 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 128617356 128617514 128617464 Y NA POLR2D NA NA NA NA POLR2D 3625 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 129073927 129074235 129074112 Y NA NA NA NA NA NA HS6ST1 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 129074706 129075071 129074888 Y NA HS6ST1 NA NA NA NA HS6ST1 555 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 131112712 131112965 131112906 Y NA IMP4,CCDC115,PTPN18 NA NA NA NA PTPN18 1132 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 131485043 131485533 131485339 Y NA NA NA NA NA NA FAM168B 363500 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 131555592 131555820 131555689 Y CCDC115 NA PLEKHB2,FAM168B K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM168B 293213 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 131582042 131582382 131582235 Y NA NA ARHGEF4 IMR90 Hi-C 24141950 FAM168B 266651 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr2 131828545 131828813 131828794 Y NA FAM168B,PLEKHB2 NA NA NA NA FAM168B 20220 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 133433715 133433886 133433800 Y NA LYPD1 NA NA NA NA LYPD1 6563 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 134878523 134878632 134878609 Y MGAT5 MGAT5 NA NA NA NA MGAT5 2969 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 135691118 135691392 135691265 Y TMEM163,ACMSD,CCNT2 CCNT2,CCNT2-AS1 NA NA NA NA CCNT2-AS1 16838 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 136632932 136633416 136633308 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 MCM6 NA NA NA NA MCM6 936 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 139226248 139226635 139226522 Y NA AC097721.2,SPOPL NA NA NA NA AC097721.2 30633 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 139342135 139342417 139342276 Y NA NA NA NA NA NA SPOPL 84764 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 141284265 141284563 141284414 Y NA NA NA NA NA NA SPOPL 2026894 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 143624367 143624985 143624879 Y KYNU KYNU KYNU MCF7 ChIA-PET 22265404 KYNU 8082 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 143630782 143631707 143631171 Y KYNU KYNU NA NA NA NA KYNU 1360 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr2 145116388 145116823 145116635 Y NA GTDC1 ZEB2,ARHGAP15,GTDC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTDC1 28253 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 146510109 146510425 146510227 Y NA NA DKFZp686O1327,ZEB2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL6P5 417311 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 149403654 149404182 149403820 Y NA EPC2 NA NA NA NA EPC2 3645 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 149416749 149416956 149416876 Y NA EPC2 NA NA NA NA EPC2 16740 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 149566291 149566547 149566419 Y NA NA NA NA NA NA KIF5C 64272 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 150184579 150184898 150184643 Y NA LYPD6 NA NA NA NA LYPD6 80 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 150278954 150279172 150279087 Y NA NA NA NA NA NA LYPD6 94455 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 150644765 150645076 150644921 Y NA NA RND3 IMR90 Hi-C 24141950 MMADHC 202435 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 150993565 150993771 150993668 Y NA NA RND3,RBM43,MMADHC IMR90 Hi-C 24141950 RND3 399754 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 150999106 150999378 150999253 Y RND3 NA RND3,MMADHC,RBM43 IMR90 Hi-C 24141950 RND3 394147 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr2 150999673 151000010 150999769 Y NA NA RND3,MMADHC,RBM43 IMR90 Hi-C 24141950 RND3 393515 CAGE SAS hg19 FANTOM5 4.23276644054608 chr2 151022837 151023057 151022971 Y NA NA RND3 MCF7 ChIA-PET 22265404 RND3 370468 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 151323622 151323873 151323744 Y NA NA NA NA NA NA RND3 69652 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 151330104 151330756 151330441 Y NA NA NA NA NA NA RND3 62769 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr2 151377866 151378135 151377929 Y RND3 RND3 RND3,RBM43 IMR90 Hi-C 24141950 RND3 15390 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 151383394 151383753 151383509 Y RND3 RND3 RND3,RBM43 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RND3 9772 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr2 151385444 151385651 151385488 Y RND3 RND3 RND3,RBM43 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RND3 7874 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 151385999 151386295 151386059 Y RND3 RND3 RND3,RBM43 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RND3 7230 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr2 151477368 151477581 151477492 Y RND3 NA RBM43 IMR90 Hi-C 24141950 RND3 83843 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 153277978 153278373 153278235 Y NA NA NA NA NA NA FMNL2 88227 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 153318771 153319092 153318943 Y NA NA NA NA NA NA FMNL2 129020 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 153354098 153354480 153354204 Y NA NA NA NA NA NA FMNL2 164347 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 153362104 153362315 153362141 Y FMNL2 NA NA NA NA NA FMNL2 172353 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 157190328 157191531 157191235 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 5329 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr2 157659765 157659881 157659802 Y NA NA NA NA NA NA GPD2 369963 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr2 158102968 158103210 158103130 Y NA NA NR4A2,GALNT5 IMR90 Hi-C 24141950 ACVR1 627164 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr2 158117931 158118105 158118018 Y GALNT5 NA NA NA NA NA ACVR1 612269 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 159853491 159853713 159853657 Y NA TANC1 NA NA NA NA TANC1 30345 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 159996824 159997456 159997123 Y NA NA NA NA NA NA WDSUB1 143854 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 161064664 161064880 161064794 Y NA NA ITGB6,RBMS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ITGB6 61519 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 161071101 161071394 161071301 Y ITGB6 NA ITGB6,RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB6 55005 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 161077067 161077509 161077240 Y ITGB6 ITGB6 RBMS1,ITGB6,TANK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB6 48890 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 161098241 161098623 161098428 Y ITGB6 ITGB6 TANK,ITGB6,RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB6 27776 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.56193758243578 chr2 161348201 161348679 161348535 Y RBMS1 NA NA NA NA NA RBMS1 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 162095171 162095411 162095272 Y TBR1,SLC4A10 AC009299.3 NA NA NA NA AC009299.3 3839 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 162197345 162197490 162197464 Y NA PSMD14,AC009299.5 NA NA NA NA AC009299.5 1508 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 164204698 164204962 164204800 Y NA NA FIGN IMR90 Hi-C 24141950 FIGN 385560 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 164534395 164534690 164534543 Y FIGN NA NA NA NA NA FIGN 55832 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 165430240 165430431 165430256 Y NA GRB14 NA NA NA NA GRB14 45927 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 165683192 165683287 165683237 Y NA COBLL1 NA NA NA NA COBLL1 14902 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 165777057 165777208 165777083 Y NA NA NA NA NA NA COBLL1 78868 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 166734901 166734996 166734949 Y NA NA NA NA NA NA TTC21B 73357 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 168822360 168822564 168822456 Y NA NA NA NA NA NA STK39 280087 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 168977927 168978148 168978038 Y NA NA NA NA NA NA STK39 124503 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 169409032 169409398 169409117 Y NA NA NA NA NA NA CERS6 98660 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 170684911 170685465 170685124 Y PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3 SSB,METTL5,UBR3 NA NA NA NA UBR3 2943 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 170998137 170998714 170998492 Y NA NA UBR3 IMR90 Hi-C 24141950 UBR3 316169 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 171786835 171787228 171786978 Y TLK1 GORASP2 NA NA NA NA GORASP2 3861 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 171830049 171830396 171830113 Y NA GORASP2 NA NA NA NA GORASP2 47075 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 171977769 171978174 171977980 Y NA NA NA NA NA NA TLK1 107650 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 172693152 172693396 172693274 Y NA NA NA NA NA NA HAT1 83562 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 172960097 172960530 172960322 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 5098 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr2 172961367 172961608 172961457 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 4020 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr2 172961678 172962145 172962061 Y NA DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 3483 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 173061382 173062264 173061777 Y NA NA ITGA6 IMR90 Hi-C 24141950 DLX2 95754 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 173111540 173111762 173111691 Y ITGA6 NA ITGA6 IMR90 Hi-C 24141950 DLX2 145912 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 173647954 173648254 173648105 Y NA NA NA NA NA NA AC093818.1 228630 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 173942556 173942831 173942720 Y NA NA NA NA NA NA CDCA7 274717 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 175085975 175086128 175086062 Y NA OLA1 NA NA NA NA OLA1 25298 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 175708423 175708587 175708507 Y NA NA NA NA NA NA H3F3AP4 125918 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr2 175837054 175837318 175837218 Y NA CHN1 NA NA NA NA CHN1 30779 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr2 176866139 176866392 176866261 Y KIAA1715 KIAA1715 NA NA NA NA KIAA1715 572 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 176969861 176970296 176970124 Y HOXD13,HOXD9,HOXD8,HOXD8,HOXD3,HOXD11,HOXD10 HOXD13,HOXD11,HOXD3,HOXD-AS2,HOXD4 NA NA NA NA HOXD11 2917 CAGE SAS hg19 FANTOM5 8.13136710947009 chr2 178104644 178105169 178104872 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128 NA NA NA NA MIR3128 13569 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 178116726 178117036 178116927 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128 NA NA NA NA MIR3128 1702 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 180625658 180625928 180625899 Y ZNF385B NA NA NA NA NA CWC22 243912 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 180724883 180725244 180725071 Y ZNF385B NA NA NA NA NA CWC22 144596 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 182311485 182311704 182311492 Y NA ITGA4 NA NA NA NA ITGA4 8225 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 182675600 182675877 182675735 Y SSFA2 NA SSFA2 IMR90 Hi-C 24141950 SSFA2 78683 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 182741385 182741846 182741532 Y SSFA2 SSFA2 PPP1R1C IMR90 Hi-C 24141950 SSFA2 12714 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 183839050 183839414 183839395 Y NA NA NA NA NA NA NCKAP1 62172 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 183877830 183878146 183878099 Y NA NCKAP1 NA NA NA NA NCKAP1 23440 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 184392405 184392418 184392412 Y NA NA NA NA NA NA CACYBPP2 78429 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 187263813 187264095 187263899 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 84788 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 187390995 187391341 187391159 Y NA ZC3H15 NA NA NA NA ZC3H15 42112 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 187420042 187420288 187420183 Y ITGAV,ITGAV,ZC3H15 ITGAV ZC3H15,ITGAV IMR90 Hi-C 24141950 ITGAV 32504 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 187455745 187456210 187455889 Y NA ITGAV NA NA NA NA ITGAV 2953 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 187601377 187601405 187601389 Y ZSWIM2,FAM171B FAM171B NA NA NA NA FAM171B 44679 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 188389811 188390126 188390006 Y NA TFPI NA NA NA NA TFPI 38361 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 188464486 188464724 188464607 Y NA TFPI GULP1 IMR90 Hi-C 24141950 TFPI 35999 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 191075616 191075973 191075872 Y NA NA NA NA NA NA INPP1 130223 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 191447882 191447975 191447929 Y NA NA TMEM194B,NAB1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM194B 50434 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 191583583 191583867 191583725 Y STAT4,NAB1 NA PMS1,MFSD6,TMEM194B,NAB1,GLS,STAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NAB1 74111 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 191814146 191814507 191814301 Y STAT1 AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 41786 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 191815156 191815612 191815322 Y GLS AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 40681 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 192030894 192031017 192030956 Y NA STAT4 STAT1,MYO1B,STAT4,OBFC2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STAT4 16572 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 192031058 192031440 192031249 Y NA STAT4 STAT1,MYO1B,STAT4,OBFC2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STAT4 16736 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 192034233 192034465 192034355 Y MYO1B,MYO1B STAT4 MYO1B,STAT4,OBFC2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STAT4 19911 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 192066963 192067214 192067088 Y STAT4,MYO1B,MYO1B MYO1B MYO1B,STAT4 IMR90 Hi-C 24141950 MYO1B 40697 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr2 192067598 192067966 192067844 Y NA MYO1B MYO1B,STAT4 IMR90 Hi-C 24141950 MYO1B 39945 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 192082382 192082563 192082473 Y MYO1B,MYO1B MYO1B MYO1B,STAT4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYO1B 25348 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr2 192084344 192084437 192084391 Y NA MYO1B MYO1B,STAT4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYO1B 23474 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 192112527 192112680 192112632 Y NA MYO1B NA NA NA NA MYO1B 4616 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 192123995 192124097 192124046 Y NA MYO1B NA NA NA NA MYO1B 16084 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr2 192170125 192170408 192170266 Y NA NA NA NA NA NA MYO1B 62214 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 192500525 192500897 192500643 Y NA NA OBFC2A K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AC098617.1 208368 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr2 192503383 192503649 192503532 Y OBFC2A NA OBFC2A K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AC098617.1 205616 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr2 192544982 192545232 192545125 Y OBFC2A NA NA NA NA NA AC098617.1 164033 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr2 192562556 192562918 192562693 Y NA NA NA NA NA NA AC098617.1 146347 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 192717272 192717408 192717316 Y NA AC098617.1,SDPR NA NA NA NA SDPR 7291 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 192870555 192870805 192870799 Y NA NA NA NA NA NA SDPR 160574 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 192915570 192915970 192915770 Y NA NA NA NA NA NA SDPR 205589 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 193054279 193054640 193054459 Y NA NA NA NA NA NA SDPR 344298 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 197097649 197097961 197097892 Y NA NA NA NA NA NA STK17B 58422 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 197104380 197104716 197104446 Y STK17B NA NA NA NA NA STK17B 65153 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 197787148 197787421 197787192 Y NA PGAP1 NA NA NA NA PGAP1 3099 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 197934286 197934620 197934500 Y NA NA NA NA NA NA PGAP1 143766 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 200209653 200209909 200209897 Y SATB2,SATB2,SATB2 NA NA NA NA NA SATB2 124080 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 200800298 200800427 200800328 Y SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69 C2orf69,C2orf47,TYW5 NA NA NA NA C2orf47 17613 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 200839985 200840279 200840201 Y NA C2orf47,TYW5 NA NA NA NA TYW5 21526 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 200946029 200946235 200946132 Y NA NA SPATS2L,KCTD18,C2orf47,TYW5,SGOL2 IMR90 Hi-C 24141950 TYW5 127570 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 201167757 201168004 201167857 Y SPATS2L,SPATS2L SPATS2L NA NA NA NA SPATS2L 600 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr2 201262818 201262970 201262894 Y NA NA NA NA NA NA SPATS2L 94214 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 201289842 201289940 201289893 Y NA NA NA NA NA NA SGOL2 82791 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 201403171 201403461 201403317 Y NA SGOL2,KCTD18,AOX1 NA NA NA NA KCTD18 20664 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 201652202 201652395 201652320 Y NA BZW1 BZW1 IMR90 Hi-C 24141950 BZW1 20922 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 201777095 201777270 201777183 Y FAM126B,CFLAR,CFLAR CLK1,PPIL3,NIF3L1,AC005037.3,ORC2 NA NA NA NA NIF3L1 25045 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 202302698 202302857 202302778 Y FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR TRAK2 NA NA NA NA TRAK2 11445 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 202560879 202561324 202561082 Y NA NA NA NA NA NA TMEM237 54586 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 202898182 202898685 202898353 Y TMEM237,FZD7 FZD7 NA NA NA NA FZD7 872 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr2 203006192 203006277 203006235 Y NA PSMA2P3 FZD7,ALS2,CDK15 IMR90 Hi-C 24141950 PSMA2P3 35743 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 203159775 203160145 203159798 Y NA NOP58 NA NA NA NA NOP58 31336 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 203239784 203239912 203239798 Y NA BMPR2 NA NA NA NA BMPR2 125 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 203726604 203726681 203726643 Y FAM117B,CYP20A1,ABI2,ICA1L,ICA1L,ALS2CR8,ALS2CR8 KRT8P15,ICA1L NA NA NA NA ICA1L 8027 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 203830057 203830223 203830140 Y NA WDR12,NBEAL1 NA NA NA NA WDR12 47298 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 204311629 204311925 204311741 Y NBEAL1,CYP20A1,ABI2 NA NA NA NA NA RAPH1 86208 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 204315265 204315638 204315451 Y NA NA NA NA NA NA RAPH1 82495 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 204362935 204363240 204363075 Y NA RAPH1 NA NA NA NA RAPH1 34893 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 204448549 204448751 204448649 Y NA NA CD28,RAPH1,CTLA4,ABI2,CYP20A1 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 50416 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 204551904 204552157 204552089 Y NA NA RAPH1,CD28 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 153771 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 206571507 206572136 206571741 Y NRP2,INO80D NRP2 NA NA NA NA NRP2 26793 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 206572878 206573110 206572995 Y NRP2 NRP2 NA NA NA NA NRP2 28164 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 206944485 206944991 206944704 Y NA AC007383.3,INO80D NA NA NA NA AC007383.3 2338 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 206948392 206948813 206948647 Y NA AC007383.3,INO80D NA NA NA NA INO80D 214 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 207981292 207981447 207981370 Y NA KLF7 NA NA NA NA KLF7 48544 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 208007936 208008436 208008192 Y METTL21A,METTL21A,KLF7,CREB1 KLF7 NA NA NA NA KLF7 21555 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 208027980 208028625 208028335 Y CREB1,KLF7 KLF7 NA NA NA NA KLF7 1366 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.00749194459853 chr2 208028732 208029438 208029179 Y METTL21A,CREB1,KLF7 KLF7 NA NA NA NA KLF7 553 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 208123048 208123437 208123243 Y NA AC007879.7 KLF7,CREB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC007879.7 20674 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 208195614 208195873 208195761 Y NA NA KLF7,CREB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC007879.7 93240 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 208198321 208198507 208198422 Y NA NA KLF7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC007879.7 95947 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 208198821 208199856 208199157 Y KLF7 NA KLF7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC007879.7 96447 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 208200012 208200111 208200057 Y NA NA KLF7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC007879.7 97638 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 208259563 208259980 208259919 Y NA NA KLF7 IMR90 Hi-C 24141950 CREB1 132481 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 208348288 208348659 208348648 Y NA CREB1,AC007879.5 KLF7,CCNYL1,FASTKD2,METTL21A,CREB1,FZD5 IMR90 Hi-C 24141950 CREB1 43802 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 208369274 208369395 208369347 Y NA CREB1,AC007879.5 KLF7,CREB1,METTL21A,CCNYL1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB1 23066 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 208378687 208378932 208378791 Y CREB1 CREB1,AC007879.5 KLF7,CREB1,METTL21A,CCNYL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB1 13529 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr2 208395422 208395980 208395659 Y PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1 CREB1,AC007879.5 NA NA NA NA AC007879.5 2903 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr2 210046809 210047163 210046986 Y MAP2 NA NA NA NA NA MAP2 239619 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 210233724 210233884 210233805 Y NA NA NA NA NA NA MAP2 52898 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 216865894 216866240 216866102 Y TMEM169,PECR,MREG MREG NA NA NA NA MREG 30579 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 216876845 216877231 216877087 Y MREG MREG NA NA NA NA MREG 19588 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 217180784 217180970 217180877 Y NA NA NA NA NA NA MARCH4 53780 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 217557565 217558269 217557956 Y NA NA NA NA NA NA IGFBP2 62014 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 218799602 218799844 218799683 Y TMBIM1,SLC11A1,PNKD,ARPC2,ARPC2 NA NA NA NA NA CXCR2 188168 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 219270976 219271406 219271230 Y CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1 AC021016.6,CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 9997 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 219271996 219272374 219272308 Y USP37 AC021016.6,CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 11017 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 219759139 219759434 219759370 Y WNT6,WNT10A WNT6,WNT10A NA NA NA NA WNT10A 16054 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.67082885811029 chr2 219760047 219760178 219760137 Y WNT10A WNT6,WNT10A NA NA NA NA WNT10A 16962 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 219761045 219761550 219761369 Y USP37,ZNF142,ZFAND2B,TUBA4A,CNPPD1,ANKZF1,ANKZF1,WNT10A WNT6,WNT10A NA NA NA NA WNT10A 17960 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 219773515 219774011 219773826 Y USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A WNT10A,CDK5R2 NA NA NA NA WNT10A 30430 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr2 219774108 219774202 219774159 Y USP37,TTLL4,NHEJ1,ANKZF1,ANKZF1 WNT10A,CDK5R2 NA NA NA NA WNT10A 31023 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 219827943 219828258 219828078 Y USP37,STK36,PTPRN,PTPRN,CDK5R2,FEV CDK5R2 NA NA NA NA CDK5R2 5566 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr2 220138813 220139187 220138862 Y INHA,CCDC108,ATG9A,GLB1L ATG9A,ANKZF1,STK16,TUBA4A,DNAJB2 NA NA NA NA TUBA4A 1705 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 220400310 220400471 220400469 Y NA GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1 NA NA NA NA TMEM198 5914 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 220553753 220554082 220553876 Y NA AC009502.1 DES,SLC4A3 K562 5C 22955621 AC009502.1 6236 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr2 221093432 221093609 221093525 Y NA NA EPHA4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AC009502.1 545915 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 221484317 221484590 221484474 Y NA NA NA NA NA NA AC009502.1 936800 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 221802042 221802413 221802264 Y NA NA NA NA NA NA EPHA4 634509 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 222435699 222436339 222436058 Y EPHA4 EPHA4 NA NA NA NA EPHA4 583 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 222826690 222827411 222827014 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 EPHA4 389768 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr2 223170887 223171031 223170916 Y NA NA NA NA NA NA FARSB 348025 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 223823432 223823602 223823532 Y NA NA NA NA NA NA ACSL3 99780 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 224808298 224808709 224808400 Y WDFY1 WDFY1,MRPL44 NA NA NA NA WDFY1 194 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 225392496 225392764 225392746 Y NA NA NA NA NA NA CUL3 55346 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 225841174 225841410 225841405 Y NA NA NA NA NA NA DOCK10 63752 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 226858171 226858617 226858345 Y NA NA IRS1 IMR90 Hi-C 24141950 AC068138.1 189470 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 226979861 226980232 226980018 Y NA NA IRS1,LOC646736 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AC068138.1 67855 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr2 227002262 227002653 227002458 Y NA AC068138.1 LOC646736,IRS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AC068138.1 45434 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr2 227032212 227032233 227032223 Y NA AC068138.1 NA NA NA NA AC068138.1 15854 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 227110529 227110615 227110572 Y NA NA IRS1,RHBDD1 IMR90 Hi-C 24141950 AC068138.1 62442 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 227276579 227276895 227276743 Y NA NA NYAP2,IRS1 IMR90 Hi-C 24141950 AC068138.1 228492 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 227292366 227292516 227292441 Y NA NA IRS1,LOC646736,RHBDD1 IMR90 Hi-C 24141950 AC068138.1 244279 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr2 227331006 227331180 227331162 Y NA NA IRS1 IMR90 Hi-C 24141950 AC068138.1 282919 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 227508782 227509042 227508912 Y NA NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 153433 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 227514922 227515156 227515015 Y NA NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 147319 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 227517160 227517436 227517301 Y IRS1 NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 145039 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chr2 227526564 227526855 227526789 Y IRS1 NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 135620 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr2 227665142 227665696 227665306 Y IRS1 IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 2667 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr2 227665859 227666449 227665964 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 3384 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 228232228 228232344 228232275 Y CCL20,AGFG1 MFF NA NA NA NA MFF 44361 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 228253438 228253721 228253534 Y CCL20,AGFG1 NA TM4SF20,AGFG1 IMR90 Hi-C 24141950 MFF 65571 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 228276107 228276256 228276208 Y AGFG1 NA C2orf83,AGFG1 IMR90 Hi-C 24141950 AGFG1 58612 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 228280402 228280578 228280475 Y CCL20,AGFG1 NA C2orf83,AGFG1 IMR90 Hi-C 24141950 AGFG1 54290 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 228331050 228331499 228331159 Y NA AGFG1 AGFG1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AGFG1 3369 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 228437239 228437625 228437329 Y NA NA NA NA NA NA AGFG1 102371 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 228670402 228670815 228670563 Y AGFG1,CCL20 CCL20 NA NA NA NA CCL20 5743 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 228713173 228713709 228713566 Y NA CCL20 NA NA NA NA CCL20 36615 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 228717939 228718338 228718141 Y NA CCL20 WDR69 IMR90 Hi-C 24141950 CCL20 41381 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 230273013 230273684 230273347 Y PID1 NA NA NA NA NA FBXO36 511334 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 230784453 230784592 230784556 Y NA FBXO36,TRIP12 NA NA NA NA FBXO36 426 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 231838825 231839283 231839059 Y NA NA NA NA NA NA PSMD1 80295 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 231922388 231922877 231922602 Y NA PSMD1 NA NA NA NA PSMD1 2810 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 232106599 232106881 232106746 Y B3GNT7 ARMC9,AC018738.2 NA NA NA NA AC018738.2 11929 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 232176754 232176953 232176854 Y NA NA NA NA NA NA AC018738.2 57944 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 232229850 232230117 232229960 Y NA B3GNT7 NA NA NA NA B3GNT7 28137 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 232277113 232277443 232277206 Y C2orf72 B3GNT7,SNORD82 NA NA NA NA B3GNT7 18859 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 232468888 232470128 232469532 Y DIS3L2,PTMA,NMUR1 NA NA NA NA NA LINC00471 91838 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr2 232478392 232478857 232478528 Y DIS3L2,PTMA NA NA NA NA NA PTMA 90748 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 232526700 232527324 232527119 Y DIS3L2 PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 42281 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 232530920 232531416 232531295 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 38189 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr2 232542757 232542767 232542764 Y NA PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 26838 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 232545684 232546083 232545868 Y COPS7B PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 23522 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr2 232547138 232547293 232547212 Y PTMA PTMA PTMA,PDE6D K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTMA 22312 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 232566219 232566469 232566340 Y NA PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 3136 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chr2 232580827 232581056 232580891 Y NA PTMA NA NA NA NA PTMA 11222 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 232582048 232582308 232582138 Y NCL,PTMA PTMA NA NA NA NA PTMA 12443 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 233367792 233368150 233367876 Y ALPP,GIGYF2,ALPI,ECEL1,PRSS56,TIGD1 EIF4E2,TIGD1 MIR1471,ECEL1P2 IMR90 Hi-C 24141950 EIF4E2 44612 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 233563344 233563704 233563468 Y NA GIGYF2 NA NA NA NA GIGYF2 3335 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 234465976 234466363 234466311 Y HJURP USP40 NA NA NA NA USP40 7065 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 234608579 234609196 234608912 Y NA UGT1A6 NA NA NA NA UGT1A6 10326 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 234673088 234673246 234673167 Y NA NA NA NA NA NA UGT1A6 74835 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 235160532 235160873 235160730 Y NA NA TRPM8,AGAP1,SH3BP4,ARL4C,SPP2 IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 242824 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 235354817 235355457 235355266 Y ARL4C ARL4C SPP2 IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 48240 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 235872484 235872869 235872649 Y NA SH3BP4 NA NA NA NA SH3BP4 13867 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 235935583 235936015 235935761 Y NA NA NA NA NA NA SH3BP4 76966 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.2302691256799 chr2 235952893 235953060 235952916 Y NA NA NA NA NA NA SH3BP4 94276 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 235959667 235960159 235959834 Y NA NA NA NA NA NA SH3BP4 101050 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 236842338 236842740 236842449 Y NA NA NA NA NA NA AC079135.1 231350 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 237640726 237641053 237640951 Y NA NA IQCA1,CXCR7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COPS8 350902 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 237654357 237654656 237654652 Y CXCR7 NA CXCR7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COPS8 337299 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 237657869 237658188 237658029 Y NA NA CXCR7 MCF7 ChIA-PET 22265404 COPS8 333767 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 238036930 238037258 238037105 Y NA COPS8,AC105760.2 COPS8,COL6A3,MLPH,PRLH,RAB17,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 44470 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 238199102 238199242 238199209 Y COL6A3 NA COL6A3,COPS8,MLPH,LRRFIP1,PRLH,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 206642 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 238383141 238383356 238383272 Y NA NA LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB17 124901 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr2 238582267 238582825 238582560 Y LRRFIP1 LRRFIP1 NA NA NA NA LRRFIP1 48048 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 238583352 238583931 238583637 Y UBE2F,LRRFIP1 LRRFIP1 NA NA NA NA LRRFIP1 49133 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 238876433 238876638 238876539 Y LRRFIP1,UBE2F UBE2F NA NA NA NA UBE2F 2964 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 239034841 239035063 239035020 Y LRRFIP1,KLHL30 FAM132B NA NA NA NA FAM132B 30560 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 239050654 239050828 239050729 Y KLHL30 FAM132B NA NA NA NA FAM132B 14795 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr2 239194414 239194788 239194667 Y NA HES6,PER2,TRAF3IP1 LOC643387,LOC151174,HES6 IMR90 Hi-C 24141950 PER2 1955 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 239287999 239288325 239288245 Y NA ASB1 NA NA NA NA ASB1 45058 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 239347857 239348510 239348285 Y ASB1 ASB1 NA NA NA NA ASB1 14474 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.55944026756961 chr2 239631175 239631419 239631288 Y NA NA LOC151171,TRAF3IP1,LOC150935 IMR90 Hi-C 24141950 TWIST2 123254 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 239779123 239779526 239779330 Y TWIST2 TWIST2 NA NA NA NA TWIST2 24450 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 240144176 240144295 240144274 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 176835 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 240196933 240197336 240197049 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 123794 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 240201720 240202445 240202126 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 118685 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 240386953 240387173 240387118 Y NA NA NDUFA10,HDAC4,LOC150935 IMR90 Hi-C 24141950 HDAC4 65605 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 241190569 241190767 241190645 Y NA NA GPC1,ANKMY1,PP14571 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYEOV2 116345 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 241259629 241259983 241259806 Y NA NA NA NA NA NA GPC1 113105 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 241309624 241309945 241309791 Y GPC1 NA PP14571,GPC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPC1 63143 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.2302691256799 chr2 241313615 241314182 241313884 Y NA NA GPC1 IMR90 Hi-C 24141950 GPC1 58906 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 241366341 241366661 241366471 Y GPR35,GPC1 GPC1,AC110619.2 NA NA NA NA GPC1 6427 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 241373489 241373922 241373594 Y GPC1 GPC1,AC110619.2 NA NA NA NA GPC1 401 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr2 241374162 241374480 241374229 Y GPC1 GPC1,AC110619.2 NA NA NA NA GPC1 1074 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr2 241395144 241395496 241395485 Y NA GPC1,AC110619.2 NA NA NA NA AC110619.2 1013 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 241960934 241960944 241960939 Y AQP12A,PASK SNED1 NA NA NA NA SNED1 24679 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr2 242030281 242030580 242030300 Y SNED1,PASK MTERFD2 NA NA NA NA MTERFD2 9167 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 242304310 242304654 242304483 Y FARP2 HDLBP,FARP2 NA NA NA NA FARP2 10652 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr2 242679689 242679905 242679763 Y ATG4B,D2HGDH ING5,D2HGDH NA NA NA NA D2HGDH 7695 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr2 242805912 242805984 242805949 Y ATG4B,ING5,GAL3ST2,PDCD1 PDCD1,AC131097.3 PDCD1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 PDCD1 6852 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 321375 321752 321587 Y NA ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3 NA NA NA NA NRSN2 3674 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 382514 382753 382693 Y CSNK2A1,ZCCHC3,TRIB3,RBCK1 TRIB3,RBCK1 NA NA NA NA RBCK1 3389 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr20 823028 823308 823133 Y FAM110A FAM110A NA NA NA NA FAM110A 10670 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 1167289 1167675 1167648 Y NA TMEM74B NA NA NA NA TMEM74B 3230 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 1168274 1168908 1168417 Y NA TMEM74B NA NA NA NA TMEM74B 4215 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 1307828 1308261 1308086 Y SDCBP2 NA NA NA NA NA SNPH 62868 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 1332285 1332772 1332374 Y C20orf46,SDCBP2 FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 39034 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 1338546 1338920 1338732 Y NA FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 32886 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 1372569 1372994 1372930 Y PSMF1,SDCBP2,SIRPB2,SIRPB1 FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 763 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr20 1757222 1757297 1757260 Y NA NA NA NA NA NA SIRPA 115857 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 1790289 1790734 1790591 Y NA NA SIRPA,STK35 IMR90 Hi-C 24141950 SIRPA 82420 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.00749194459853 chr20 1792448 1792844 1792660 Y NA NA STK35,SIRPA,LOC100507495,SNPH,FKBP1A-SDCBP2 IMR90 Hi-C 24141950 SIRPA 80310 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 1869680 1870159 1869931 Y NSFL1C,SIRPB2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA SIRPA NA NA NA NA SIRPA 2995 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 2648841 2649036 2648938 Y NA NOP56,SNORD86,SNORD57,IDH3B,RP4-686C3.7,EBF4 EBF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-686C3.7 5843 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 3155446 3155862 3155811 Y EBF4,PTPRA,C20orf194 FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA NA NA NA NA UBOX5 16604 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 3159596 3159937 3159912 Y PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194 FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA NA NA NA NA UBOX5 20754 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 3200687 3201082 3200885 Y NA DDRGK1,ITPA,SLC4A11 NA NA NA NA ITPA 13173 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 3788108 3788452 3788409 Y NA C20orf27,SPEF1,CENPB,CDC25B,MAVS NA NA NA NA CDC25B 22530 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 3909447 3909819 3909642 Y RNF24,RNF24,PANK2 PANK2 NA NA NA NA PANK2 41961 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 4108169 4108199 4108184 Y NA SMOX LOC728228,ADRA1D,SMOX,RNF24 IMR90 Hi-C 24141950 SMOX 8542 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 4198420 4198722 4198592 Y SMOX,ADRA1D NA NA NA NA NA SMOX 98793 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 4206645 4206924 4206784 Y NA NA NA NA NA NA SMOX 107018 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 4674724 4674919 4674762 Y NA PRNP NA NA NA NA PRNP 9842 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 5512444 5512652 5512587 Y CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1 NA NA NA NA NA GPCPD1 77020 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 5589880 5590681 5590650 Y CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 208 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr20 5635212 5635550 5635485 Y TRMT6,GPCPD1 GPCPD1 C20orf196,GPCPD1,TRMT6 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 45540 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 5637936 5638327 5638312 Y NA GPCPD1 C20orf196,GPCPD1,TRMT6 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 48264 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr20 5741425 5741673 5741600 Y NA C20orf196 NA NA NA NA C20orf196 12386 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 6802700 6802711 6802706 Y NA NA HAO1 IMR90 Hi-C 24141950 BMP2 56389 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 7058177 7058257 7058218 Y NA NA NA NA NA NA BMP2 311866 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 7978054 7978163 7978110 Y NA TMX4 NA NA NA NA TMX4 20313 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 8464613 8464952 8464618 Y PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 353789 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 9112642 9112699 9112675 Y PLCB4,PLCB4,PLCB4 NA NA NA NA NA PLCB1 1001818 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 10492212 10492484 10492413 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 79342 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 10652083 10652420 10652292 Y JAG1 JAG1 NA NA NA NA JAG1 27069 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 10735371 10735385 10735378 Y NA NA NA NA NA NA JAG1 110357 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 13035099 13035480 13035216 Y SPTLC3 SPTLC3 NA NA NA NA SPTLC3 47472 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 13221839 13221847 13221843 Y NA ISM1 NA NA NA NA ISM1 21421 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 13380021 13380161 13380091 Y NA NA NA NA NA NA ISM1 179603 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 13427146 13427424 13427285 Y NA NA NA NA NA NA TASP1 190163 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 14697041 14697213 14697128 Y NA NA NA NA NA NA ESF1 933509 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 17538189 17538505 17538334 Y NA BFSP1,DSTN NA NA NA NA BFSP1 9360 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 17554539 17554936 17554702 Y NA BFSP1,DSTN NA NA NA NA DSTN 6031 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 17557154 17557457 17557241 Y NA BFSP1,DSTN NA NA NA NA DSTN 8646 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 17824958 17825344 17825106 Y ZNF133,CSRP2BP NA BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD17 116245 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 17830512 17830807 17830760 Y NA NA BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD17 110782 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 17946136 17946538 17946496 Y SNX5,SNX5 SNORD17,SNX5 NA NA NA NA SNX5 1085 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 18276093 18276447 18276109 Y CSRP2BP ZNF133 NA NA NA NA ZNF133 8972 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 19660392 19660672 19660518 Y NA NA NA NA NA NA RP1-122P22.2 75680 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 19716018 19716528 19716293 Y NA RP1-122P22.2 NA NA NA NA RP1-122P22.2 19824 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 19717747 19718119 19717916 Y NA RP1-122P22.2 NA NA NA NA RP1-122P22.2 18233 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 19783112 19783320 19783290 Y NA RP1-122P22.2 RIN2,SLC24A3 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-122P22.2 46760 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr20 19796265 19796476 19796342 Y RIN2,RIN2 NA RIN2,SLC24A3,NAA20 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-122P22.2 59913 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 19804713 19804972 19804782 Y NA NA RIN2,SLC24A3,NAA20 IMR90 Hi-C 24141950 RIN2 60193 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 19881587 19881718 19881652 Y RIN2,RIN2 RIN2 NA NA NA NA RIN2 16422 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 19890524 19890778 19890583 Y NA RIN2 NA NA NA NA RIN2 25359 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 22555806 22556424 22556290 Y NA FOXA2 NA NA NA NA FOXA2 7669 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 22743134 22743499 22743315 Y NA NA THBD,NXT1,NAPB IMR90 Hi-C 24141950 FOXA2 179041 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 22744166 22744500 22744407 Y THBD NA THBD,NXT1,NAPB IMR90 Hi-C 24141950 FOXA2 180073 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.78221744865098 chr20 22776496 22776845 22776664 Y NA NA GZF1,NXT1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXA2 212403 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 23008232 23008345 23008289 Y NA THBD NA NA NA NA THBD 20033 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 23031353 23032100 23031620 Y GZF1,THBD,CD93 THBD NA NA NA NA THBD 2975 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 23075489 23075921 23075757 Y THBD,CD93,GZF1 THBD SSTR4 IMR90 Hi-C 24141950 THBD 47111 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr20 23077676 23077974 23077860 Y THBD THBD NA NA NA NA THBD 49298 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr20 23117564 23117783 23117655 Y NA NA NA NA NA NA THBD 89186 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 23122999 23123199 23123050 Y THBD,CD93,NXT1,GZF1,CST3 NA LOC200261 IMR90 Hi-C 24141950 THBD 94621 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 23136585 23137102 23136883 Y THBD,CD93,GZF1 NA NA NA NA NA THBD 108207 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 23138539 23138715 23138586 Y THBD,CD93,GZF1 NA NA NA NA NA THBD 110161 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 23140057 23140426 23140138 Y THBD,CD93,NXT1,GZF1 NA NA NA NA NA THBD 111679 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 23174478 23174828 23174732 Y CD93 NA NA NA NA NA THBD 146100 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 24969855 24970103 24969979 Y NA NA NA NA NA NA ACSS1 67513 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 25047846 25048544 25048538 Y NA ACSS1 ACSS1 IMR90 Hi-C 24141950 ACSS1 10230 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 25218471 25218756 25218634 Y NA ENTPD6,PYGB NA NA NA NA PYGB 7949 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 25291624 25291957 25291812 Y NA NA NA NA NA NA PYGB 64919 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 25305837 25305970 25305904 Y NA NA NA NA NA NA ABHD12 63649 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 25445422 25445550 25445504 Y ACSS1,ABHD12 NA NA NA NA NA GINS1 59059 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 25671297 25671837 25671511 Y NA ZNF337 NA NA NA NA ZNF337 3640 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 25842208 25842444 25842317 Y ZNF337 NA NA NA NA NA ZNF337 166731 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 30161920 30162316 30162154 Y NA ID1 NA NA NA NA ID1 28770 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 30175524 30175854 30175562 Y NA ID1 NA NA NA NA ID1 15232 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 30191850 30192346 30192159 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 764 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 30194967 30195344 30195216 Y NA ID1 NA NA NA NA ID1 3881 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 30196293 30196740 30196417 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 5207 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 30255856 30255976 30255884 Y NA NA NA NA NA NA BCL2L1 53816 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 30260311 30260679 30260495 Y NA BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 49113 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 30263480 30263875 30263840 Y NA BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 45917 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 30292336 30292785 30292516 Y NA BCL2L1,TPX2 COX4I2 IMR90 Hi-C 24141950 BCL2L1 17007 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr20 30298803 30298834 30298814 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 10958 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr20 30300504 30300973 30300648 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 8819 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 30301047 30301377 30301326 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 8415 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr20 30700574 30701059 30700820 Y HCK,C20orf112,TM9SF4,PLAGL2 TM9SF4 NA NA NA NA TM9SF4 5265 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 30705137 30705472 30705281 Y HCK,PLAGL2 TM9SF4 NA NA NA NA TM9SF4 9828 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 31044923 31045080 31044970 Y NA NA NA NA NA NA ASXL1 100768 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 31063072 31063625 31063366 Y NA NA ASXL1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf112 107251 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr20 31352490 31352753 31352633 Y C20orf203,DNMT3B,DNMT3B COMMD7,DNMT3B MAPRE1 IMR90 Hi-C 24141950 DNMT3B 4299 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 31373290 31373636 31373312 Y C20orf185,DNMT3B,DNMT3B COMMD7,DNMT3B,MAPRE1 MAPRE1 IMR90 Hi-C 24141950 DNMT3B 25099 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 32093960 32094027 32093984 Y NA CBFA2T2 NA NA NA NA CBFA2T2 18079 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 32321714 32321896 32321832 Y NA E2F1,PXMP4,ZNF341 NA NA NA NA ZNF341 4251 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 32803456 32803920 32803688 Y NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 93688 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 32989671 32989803 32989744 Y NA ITCH NA NA NA NA ITCH 40630 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 33064297 33064587 33064427 Y ACSS2 DYNLRB1 NA NA NA NA DYNLRB1 37627 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 33100877 33101215 33100990 Y NA DYNLRB1 NA NA NA NA DYNLRB1 999 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 33699049 33699250 33699220 Y TRPC4AP,EDEM2 TRPC4AP NA NA NA NA TRPC4AP 20375 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 33896147 33896435 33896303 Y EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 NA NA NA NA EIF6 25359 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 33899361 33899545 33899443 Y EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 NA NA NA NA EIF6 28573 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 33900177 33900484 33900409 Y GSS,EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 NA NA NA NA EIF6 29389 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 33906285 33906606 33906471 Y GSS,EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 35497 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr20 33908268 33908438 33908376 Y NA EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 37480 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.22777181081372 chr20 34217204 34217560 34217502 Y NA FER1L4,SPAG4,CPNE1,RBM12 NA NA NA NA SPAG4 15390 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 34303643 34304038 34303890 Y NA ROMO1,NFS1,RBM39 NA NA NA NA NFS1 18362 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 34357066 34357356 34357208 Y NA RBM39,PHF20 NA NA NA NA PHF20 540 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 34463368 34463773 34463624 Y NFS1 RNU4-40P NA NA NA NA RNU4-40P 9808 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 34471781 34472424 34472101 Y NA RNU4-40P NA NA NA NA RNU4-40P 1157 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 34652590 34653055 34652672 Y NA EPB41L1 LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EPB41L1 24371 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr20 34658286 34658599 34658390 Y EPB41L1 EPB41L1 LOC647979,C20orf152,EPB41L1,PHF20 IMR90 Hi-C 24141950 EPB41L1 18827 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 34790985 34791133 34791034 Y NA NA NA NA NA NA DLGAP4 101125 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 35464098 35464342 35464182 Y RBL1,DSN1,DSN1 NA NA NA NA NA DSN1 63877 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 35490387 35490628 35490526 Y MANBAL,KIAA0889 NA KIAA0889 MCF7 ChIA-PET 22265404 SAMHD1 87618 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 35583660 35583902 35583783 Y TGIF2,TGIF2,TGIF2 SAMHD1 NA NA NA NA SAMHD1 5414 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 35821029 35821195 35821110 Y NA RPN2 GHRH IMR90 Hi-C 24141950 RPN2 16216 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 35922737 35923093 35922847 Y SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC MANBAL,SRC NA NA NA NA MANBAL 6696 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 35985970 35986139 35986055 Y NA SRC NA NA NA NA SRC 14882 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 36034782 36035452 36035129 Y C20orf132,VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 36484 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 36132626 36132893 36132840 Y NA BLCAP NA NA NA NA BLCAP 21440 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr20 36135409 36135682 36135567 Y NA BLCAP NA NA NA NA BLCAP 18651 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 36154671 36154957 36154793 Y BLCAP,BLCAP,BLCAP BLCAP NA NA NA NA BLCAP 338 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr20 36389387 36389716 36389551 Y NA NA VSTM2L IMR90 Hi-C 24141950 CTNNBL1 68979 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 36763112 36763416 36763201 Y NA TGM2 NA NA NA NA TGM2 29564 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 36772576 36772945 36772677 Y RPRD1B,BPI TGM2 NA NA NA NA TGM2 20035 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 36780859 36781241 36781066 Y RPRD1B,RALGAPB,BPI TGM2 NA NA NA NA TGM2 11739 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 36831796 36832119 36831958 Y NA TGM2 NA NA NA NA TGM2 38816 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 37229958 37230063 37230010 Y ARHGAP40 ARHGAP40 NA NA NA NA ARHGAP40 1381 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.89360603919167 chr20 37398577 37398739 37398665 Y NA ACTR5 NA NA NA NA ACTR5 23492 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 37499452 37499626 37499537 Y RALGAPB,ACTR5,PPP1R16B,DHX35 NA NA NA NA NA FAM83D 53329 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 39632234 39632572 39632465 Y MAFB,TOP1 RNU2-52P,TOP1 PLCG1,TOP1,ZHX3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU2-52P 18273 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 39785946 39786458 39785968 Y CHD6,PLCG1 PLCG1 NA NA NA NA PLCG1 22346 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 41687154 41687522 41687506 Y NA NA NA NA NA NA SRSF6 397046 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 42096541 42096705 42096586 Y NA SRSF6 NA NA NA NA SRSF6 11973 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 42286061 42286420 42286177 Y SRSF6,L3MBTL1,MYBL2 MYBL2 MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 7334 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr20 42780306 42780638 42780459 Y NA JPH2 NA NA NA NA JPH2 33580 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 43123975 43124199 43124088 Y C20orf111,STK4,ADA,SERINC3 RPL37AP1,TTPAL,SERINC3,PKIG NA NA NA NA TTPAL 21449 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 43238683 43239068 43238831 Y NA ADA NA NA NA NA ADA 39806 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 43271158 43271637 43271427 Y NA ADA NA NA NA NA ADA 7237 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 43321614 43322020 43321838 Y WISP2,KCNK15 ADA,RP11-445H22.3,WISP2 LOC79015,YWHAB,WISP2,SERINC3,TTPAL,PKIG,ADA,KCNK15,RIMS4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-445H22.3 717 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 43517782 43518230 43517943 Y NA YWHAB,PABPC1L PABPC1L IMR90 Hi-C 24141950 YWHAB 5465 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 43596220 43596403 43596301 Y SERINC3,YWHAB,SYS1,STK4 TOMM34,STK4 NA NA NA NA STK4 3105 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 43689990 43690348 43690045 Y NA KCNS1 NA NA NA NA KCNS1 37405 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 43767332 43767709 43767669 Y NA KCNS1,PI3 STK4,MATN4,RBPJL IMR90 Hi-C 24141950 PI3 33808 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 43876988 43877346 43877094 Y NA SLPI NA NA NA NA SLPI 3859 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 43965327 43965544 43965453 Y SDC4 SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 9520 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr20 43970100 43970351 43970215 Y NA SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 4713 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 43972821 43973151 43973055 Y SYS1,SDC4 SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 1913 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 44410242 44410504 44410445 Y NA WFDC3,DNTTIP1,UBE2C,SNX21 NA NA NA NA WFDC3 8067 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 45870109 45870518 45870490 Y ZMYND8,NCOA3 NA NA NA NA NA ZMYND8 113049 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 45946049 45946481 45946179 Y NA ZMYND8 NA NA NA NA ZMYND8 37086 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr20 45987479 45988292 45987961 Y NA ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 3912 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr20 45988883 45989283 45988988 Y SULF2 ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 5316 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 45989347 45989834 45989660 Y SULF2 ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 5780 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 46067688 46067974 46067774 Y NCOA3 NA NCOA3,ZMYND8 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA3 60627 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 46115894 46116142 46116064 Y NCOA3 NCOA3 NCOA3,ZMYND8,EYA2 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA3 12459 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 46299616 46300006 46299878 Y NCOA3,SULF2,SULF2 NA NA NA NA NA SULF2 113354 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 46370826 46370984 46370910 Y NA SULF2 NA NA NA NA SULF2 42376 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 46601191 46601469 46601377 Y SULF2,SULF2 NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SULF2 187831 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 46653872 46653986 46653882 Y NA NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SULF2 240512 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 46924305 46924474 46924390 Y NA NA SULF2,NCOA3,PREX1,ARFGEF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SULF2 510945 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 47343676 47344035 47343854 Y NA NA NA NA NA NA ARFGEF2 192392 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 47344986 47345424 47345132 Y NA NA NA NA NA NA ARFGEF2 191003 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 47547466 47547777 47547635 Y ZNFX1,ARFGEF2 ARFGEF2 NA NA NA NA ARFGEF2 11039 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 47750965 47751079 47750977 Y ZNFX1 NA NA NA NA NA STAU1 51825 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 47803381 47804147 47803544 Y PREX1,STAU1 STAU1,DDX27 NA NA NA NA STAU1 477 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 47893075 47893400 47893157 Y B4GALT5,ZNFX1 ZNFX1,SNORD12B,SNORD12 NA NA NA NA ZNFX1 112 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 48201281 48201539 48201531 Y PTGIS NA ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 B4GALT5 126876 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 48221158 48221415 48221229 Y PTGIS NA ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 B4GALT5 107000 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 48315836 48316073 48315912 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 12342 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 48317219 48317517 48317348 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 10898 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 48317822 48318037 48318021 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 10378 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 48385312 48385495 48385398 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNRPFP1 40933 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 48388811 48389348 48388940 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC9A8 37902 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 48391675 48392320 48391995 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC9A8 34930 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chr20 48467762 48467975 48467793 Y NA SLC9A8 NA NA NA NA SLC9A8 40512 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 48532841 48533167 48533004 Y SPATA2,SPATA2 SPATA2,RNF114 NA NA NA NA SPATA2 2761 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 48533898 48534043 48533948 Y B4GALT5,SLC9A8,CEBPB,SPATA2,SNAI1,RNF114 SPATA2,RNF114 NA NA NA NA SPATA2 3818 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 48688468 48688637 48688554 Y NA UBE2V1 NA NA NA NA UBE2V1 41859 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 48903106 48903611 48903352 Y NA RP11-290F20.3 LOC284751,PARD6B,PTPN1,FAM65C,MIR645,CEBPB IMR90 Hi-C 24141950 RP11-290F20.3 21083 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 48924890 48925591 48925260 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 RP11-290F20.3 NA NA NA NA RP11-290F20.3 42867 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chr20 48951795 48951969 48951898 Y NA NA NA NA NA NA RP11-290F20.3 69772 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 49047228 49047674 49047434 Y NA NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 77217 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.67082885811029 chr20 49055532 49055924 49055757 Y SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 68967 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 49100027 49100544 49100221 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 24347 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 49341306 49341865 49341532 Y NA FAM65C,PARD6B NCOA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 PARD6B 4216 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 49345638 49345902 49345710 Y MOCS3,PARD6B FAM65C,PARD6B NA NA NA NA PARD6B 179 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chr20 49346260 49347200 49346344 Y NA FAM65C,PARD6B NA NA NA NA PARD6B 179 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 49378032 49378227 49378094 Y PARD6B,BCAS4 PARD6B,BCAS4 NA NA NA NA BCAS4 31204 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 49378305 49378754 49378413 Y DPM1,PARD6B,BCAS4 PARD6B,BCAS4 NA NA NA NA BCAS4 30677 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 49516325 49516426 49516399 Y ADNP RP5-914P20.5,ADNP NA NA NA NA RP5-914P20.5 29095 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 49539044 49539098 49539071 Y NA RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA RP5-914P20.5 6423 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 49574418 49574471 49574465 Y PTPN1,ADNP RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA MOCS3 1055 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 49596851 49597164 49596956 Y PTPN1 DPM1,MOCS3,KCNG1 NA NA NA NA MOCS3 23488 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 49598879 49599145 49599015 Y PTPN1 DPM1,MOCS3,KCNG1 NA NA NA NA MOCS3 25516 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr20 49650336 49650514 49650422 Y NA KCNG1 KCNG1,NFATC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KCNG1 12670 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 49947847 49948420 49948354 Y NA NA KCNG1,NFATC2,ATP9A,BCAS4,DPM1,MOCS3 IMR90 Hi-C 24141950 KCNG1 310181 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 49963208 49963745 49963374 Y NFATC2 NA KCNG1,ATP9A,NFATC2 IMR90 Hi-C 24141950 KCNG1 325542 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr20 49976918 49977375 49977162 Y NFATC2 NA NA NA NA NA KCNG1 339252 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr20 49982226 49982434 49982404 Y NA NA NA NA NA NA KCNG1 344560 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 49982609 49983533 49983215 Y KCNG1 NA NA NA NA NA KCNG1 344943 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr20 50063853 50064072 50063963 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 285000 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 50072988 50073809 50073517 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 275263 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 50178083 50178314 50178273 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 170758 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 50247670 50248383 50248096 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 100689 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr20 50252715 50253081 50252915 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 95991 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.45304630676127 chr20 50366772 50367203 50366881 Y ZFP64,ATP9A RP5-827A12.2,ATP9A NA NA NA NA ATP9A 15970 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr20 50383575 50384083 50383723 Y ATP9A RP5-827A12.2,ATP9A NA NA NA NA ATP9A 402 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr20 50692863 50693237 50693120 Y NA NA NA NA NA NA ZFP64 125610 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 52238527 52238650 52238555 Y NA ZNF217 SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 14081 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 52239995 52240318 52240062 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BMP7,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 15549 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 52355086 52355238 52355182 Y NA NA ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 130640 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr20 52356771 52357178 52357063 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 132325 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 52371075 52371265 52371223 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 146629 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 52374184 52374569 52374228 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 149738 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 52390351 52390640 52390407 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 165905 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr20 52391089 52391563 52391364 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 166643 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr20 52407558 52407732 52407573 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 183112 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 52444580 52444892 52444748 Y NA NA ZNF217,SUMO1P1,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 220134 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 52445043 52445455 52445100 Y NA NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 220597 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 52445816 52446339 52446069 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 221370 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 52482655 52483054 52482957 Y NA NA NA NA NA NA ZNF217 258209 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 52532315 52532889 52532591 Y ZNF217 NA SUMO1P1,BMP7,ZNF217 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYP24A1 255623 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 52543055 52543571 52543250 Y ZNF217 NA NA NA NA NA CYP24A1 244941 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 52547344 52547891 52547567 Y ZNF217 NA NA NA NA NA CYP24A1 240621 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 52565886 52566139 52565988 Y ZNF217 NA NA NA NA NA CYP24A1 222373 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 52740107 52740637 52740253 Y NA CYP24A1 DOK5,SULF2,ZMYND8,BMP7,PTPRT IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYP24A1 47875 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 52749215 52749597 52749386 Y NA CYP24A1 DOK5 IMR90 Hi-C 24141950 CYP24A1 38915 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr20 52749873 52750284 52750109 Y NA CYP24A1 NA NA NA NA CYP24A1 38228 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 52757453 52757742 52757598 Y NA CYP24A1 NA NA NA NA CYP24A1 30770 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 52784442 52785020 52784595 Y PFDN4 CYP24A1,PFDN4 NA NA NA NA CYP24A1 3492 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr20 55362710 55362938 55362792 Y AURKA,TFAP2C NA TFAP2C MCF7 ChIA-PET 22265404 TFAP2C 160352 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 55363467 55363682 55363577 Y NA NA TFAP2C MCF7 ChIA-PET 22265404 TFAP2C 161109 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 55379556 55380011 55379738 Y TFAP2C NA TFAP2C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP2C 177198 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 55780606 55780977 55780774 Y NA NA NA NA NA NA BMP7 58708 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 55976268 55976716 55976350 Y RBM38,ZBP1,PMEPA1 MTRNR2L3,RBM38 NA NA NA NA RBM38 11805 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 56008066 56008273 56008156 Y ZBP1 RBM38 NA NA NA NA RBM38 43603 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 56010646 56011025 56010972 Y NA RBM38 NA NA NA NA RBM38 46183 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 56255217 56255759 56255498 Y ZBP1,PMEPA1 PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 28833 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 56270075 56270492 56270216 Y PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1 PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 14100 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 56273255 56273697 56273462 Y PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1 PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 10895 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 56550215 56550469 56550425 Y NA NA ZBP1,CTCFL,PCK1,PMEPA1 IMR90 Hi-C 24141950 PMEPA1 265623 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 57198784 57199334 57199089 Y NA STX16,STX16-NPEPL1 NA NA NA NA STX16 24994 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 57557787 57558211 57558054 Y ZNF831,STX16 CTSZ,ATP5E NA NA NA NA CTSZ 22091 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 57585788 57586041 57585915 Y NA CTSZ,ATP5E,SLMO2 NA NA NA NA CTSZ 5486 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 57596187 57596442 57596344 Y NA CTSZ,ATP5E,SLMO2 NA NA NA NA ATP5E 8995 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr20 58402426 58402798 58402570 Y NA NA NA NA NA NA PPP1R3D 110554 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 59702468 59702886 59702731 Y NA NA LOC284757,CDH4 IMR90 Hi-C 24141950 CDH4 122596 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 59736933 59737143 59737103 Y NA NA LOC284757,CDH26 IMR90 Hi-C 24141950 CDH4 88339 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 60256764 60257074 60256889 Y CDH4 NA NA NA NA NA TAF4 381792 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 60500389 60500694 60500636 Y NA NA NA NA NA NA TAF4 138172 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 60719468 60719634 60719593 Y SS18L1,GTPBP5 LSM14B,PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 2646 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 60735261 60735480 60735370 Y NA LSM14B,PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 18439 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 60924549 60924827 60924688 Y TAF4,SS18L1,SLCO4A1,C20orf151,LAMA5 ADRM1,MIR4758,LAMA5,RPS21 NA NA NA NA LAMA5 15541 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 60933408 60933760 60933692 Y NA MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2 ADRM1 K562 ChIA-PET 22265404 LAMA5 6608 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 60934143 60934390 60934309 Y TAF4,PSMA7,SS18L1,RPS21,NTSR1,CABLES2,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5 MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2 ADRM1 K562 ChIA-PET 22265404 LAMA5 5978 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr20 60940876 60941209 60940968 Y PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5 MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 508 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr20 60941528 60941750 60941608 Y SLCO4A1,ADRM1,LAMA5 MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 1160 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 60943690 60943839 60943760 Y NA MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 3322 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 60944265 60944566 60944463 Y NA MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 3897 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 60956313 60956720 60956445 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA RPS21 3452 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 60956743 60957219 60956871 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA RPS21 2953 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 60972798 60973035 60972874 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA CABLES2 7306 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 61282674 61283033 61282738 Y OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1 SLCO4A1 NA NA NA NA SLCO4A1 10877 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 61283206 61283870 61283565 Y OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1 SLCO4A1 NA NA NA NA SLCO4A1 11409 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr20 61371540 61371927 61371747 Y DPH3P1,DIDO1,OGFR NA NA NA NA NA OGFR 62260 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 61425509 61425950 61425706 Y DPH3P1,DIDO1,OGFR OGFR,COL9A3 NA NA NA NA OGFR 8237 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 61505589 61505880 61505712 Y BHLHE23,DIDO1,C20orf11 TCFL5 TCFL5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TCFL5 14474 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 61554875 61554902 61554887 Y DIDO1 DIDO1 NA NA NA NA DIDO1 12402 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 61639302 61639436 61639344 Y TCFL5,DIDO1,BHLHE23 NA NA NA NA NA DIDO1 71998 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 61810748 61810860 61810807 Y STMN3,NKAIN4,KCNQ2,EEF1A2,COL20A1,CHRNA4 YTHDF1 NA NA NA NA YTHDF1 34726 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 61822824 61823015 61822948 Y NA YTHDF1 NA NA NA NA YTHDF1 22571 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 62085174 62085706 62085468 Y BHLHE23,NKAIN4,CHRNA4,SRMS,UCKL1,STMN3,RTEL1,EEF1A2,KCNQ2 RP11-358D14.2,KCNQ2,EEF1A2 NA NA NA NA RP11-358D14.2 7770 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr20 62138486 62138705 62138596 Y NA KCNQ2,EEF1A2,PPDPF,PTK6 NA NA NA NA EEF1A2 9981 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 62150785 62151100 62150943 Y CHRNA4,KCNQ2,STMN3,EEF1A2 KCNQ2,EEF1A2,PPDPF,PTK6 NA NA NA NA PPDPF 708 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 62285983 62286092 62286038 Y NA GMEB2,CTD-3184A7.4,STMN3,RTEL1,TNFRSF6B NA NA NA NA RTEL1 1071 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 62313782 62314225 62314041 Y NA STMN3,RTEL1,TNFRSF6B,ZGPAT,ARFRP1 NA NA NA NA TNFRSF6B 11796 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.33916040135441 chr20 62527317 62528264 62527831 Y PRIC285,PRIC285,GMEB2,ZGPAT,ZGPAT,LIME1,TPD52L2,RGS19,RGS19,OPRL1,DNAJC5 TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA DNAJC5 2799 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr20 62545436 62545544 62545492 Y NA DNAJC5,RNU1-134P,UCKL1 NA NA NA NA RNU1-134P 7128 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 62609214 62609358 62609321 Y SAMD10 UCKL1,SAMD10,PRPF6 NA NA NA NA SAMD10 3 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 62676233 62676312 62676273 Y SLC2A4RG,TCEA2,SOX18 ZNF512B,SOX18,TCEA2 NA NA NA NA ZNF512B 1801 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 62685313 62685625 62685427 Y UCKL1,SOX18,TCEA2 ZNF512B,SOX18,TCEA2 NA NA NA NA TCEA2 6124 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr20 62887659 62888425 62887862 Y SAMD10,PCMTD2 PCMTD2 NA NA NA NA PCMTD2 2565 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr21 15450488 15450803 15450511 Y NA NA NA NA NA NA HSPA13 303002 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 16288986 16289227 16289075 Y NA AF127936.7 NA NA NA NA AF127936.7 36690 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 16354668 16355055 16354876 Y NA NA NA NA NA NA NRIP1 80266 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 16435480 16435873 16435862 Y NRIP1 NRIP1 NA NA NA NA NRIP1 159 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 17054611 17055027 17054700 Y USP25 USP25 USP25 IMR90 Hi-C 24141950 USP25 45317 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 17264124 17264427 17264344 Y NA NA NA NA NA NA USP25 163780 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 17959400 17959753 17959559 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 304311 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 17960667 17961305 17960883 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 305578 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr21 18984370 18984546 18984496 Y NA BTG3 NA NA NA NA BTG3 1105 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 26829799 26830175 26829911 Y NA NA MIR155HG IMR90 Hi-C 24141950 MIR155HG 102046 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 26962945 26963646 26963455 Y NA MIR155HG,MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 14183 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 27242944 27243154 27243052 Y NA NA NA NA NA NA ATP5J 136960 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 28206130 28206252 28206191 Y NA ADAMTS1 NA NA NA NA ADAMTS1 9476 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr21 28207147 28207505 28207325 Y NA ADAMTS1 NA NA NA NA ADAMTS1 8223 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr21 28218728 28219247 28219071 Y ADAMTS5,ADAMTS1 ADAMTS1 NA NA NA NA ADAMTS1 3000 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr21 28221663 28222017 28221832 Y NA ADAMTS1 LINC00113 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS1 5935 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr21 28942556 28942990 28942803 Y NA NA ADAMTS1,ADAMTS5,MIR4759 IMR90 Hi-C 24141950 AL035610.1 475743 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr21 28945118 28945334 28945247 Y NA NA ADAMTS1,ADAMTS5,MIR4759 IMR90 Hi-C 24141950 AL035610.1 473399 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr21 29765694 29766009 29765812 Y NA NA NA NA NA NA AL035610.1 346961 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 30006167 30006692 30006407 Y NA NA ADAMTS1,LINC00161 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 249001 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr21 30009773 30009970 30009799 Y NA NA ADAMTS1,LINC00161 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 245723 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr21 30276081 30276287 30276184 Y C21orf7 N6AMT1 NA NA NA NA N6AMT1 20388 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr21 30567933 30569654 30568878 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,BACH1 NA NA NA NA BACH1 3541 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 30590117 30590529 30590261 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,BACH1 NA NA NA NA BACH1 25725 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 30754427 30754628 30754578 Y NA NA NA NA NA NA BACH1 190035 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 30967382 30967686 30967533 Y GRIK1 NA NA NA NA NA BACH1 402990 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 32531402 32531778 32531665 Y NA NA NA NA NA NA AP000251.3 397780 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 32929453 32930069 32929726 Y TIAM1 TIAM1 NA NA NA NA AP000251.3 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 33042550 33042842 33042696 Y NA SOD1 NA NA NA NA SOD1 12615 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 34718616 34718973 34718794 Y OLIG2,OLIG1 IFNAR1 NA NA NA NA IFNAR1 23882 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 34733678 34734189 34733958 Y OLIG1,IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,IFNGR2,GART,GART IFNAR1,IFNGR2 NA NA NA NA IFNAR1 38944 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 35319562 35320491 35320153 Y NA ATP5O NA NA NA NA ATP5O 33278 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr21 36143971 36144119 36144107 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 158530 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr21 36174477 36174817 36174756 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 189036 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 36185927 36186112 36186038 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 200486 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr21 36214787 36216208 36215152 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 229346 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr21 36219873 36220239 36220187 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 234432 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 36233216 36233747 36233583 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 247775 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr21 36234553 36234896 36234857 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 249112 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 36254204 36254725 36254297 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 268763 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 36281882 36282257 36282001 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 296441 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr21 36326686 36327019 36326981 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 341245 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr21 36349860 36350141 36349984 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 364419 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 36356108 36356416 36356285 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 370667 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr21 36419290 36419780 36419662 Y RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 433849 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr21 36423642 36423856 36423739 Y RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 438201 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr21 36458819 36458923 36458887 Y NA NA RUNX1 IMR90 Hi-C 24141950 RCAN1 473378 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr21 36604888 36605215 36605097 Y NA NA RUNX1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RCAN1 619447 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 36936186 36936505 36936342 Y NA NA RUNX1,LOC100506385 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1 438460 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 37485408 37485566 37485491 Y NA CBR1,SETD4,CBR3,DOPEY2 NA NA NA NA CBR3 19644 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 37486095 37486219 37486157 Y NA CBR1,SETD4,CBR3,DOPEY2 NA NA NA NA CBR3 18991 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 38232574 38232719 38232637 Y NA NA NA NA NA NA AP000704.5 104093 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 38282263 38282520 38282368 Y CLDN14 NA NA NA NA NA AP000704.5 54292 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 38629602 38630247 38630025 Y NA AP001432.14,DSCR3 NA NA NA NA DSCR3 8015 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 38630405 38630786 38630710 Y DYRK1A,DYRK1A AP001432.14,DSCR3 NA NA NA NA DSCR3 7476 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr21 38801876 38802213 38802018 Y DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A NA NA NA NA NA DYRK1A 65784 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 38935728 38936411 38936235 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 199636 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr21 38936686 38937128 38936852 Y DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 200594 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 39189154 39189496 39189325 Y NA NA NA NA NA NA KCNJ15 337632 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 39606574 39606948 39606733 Y NA NA KCNJ6,ERG IMR90 Hi-C 24141950 KCNJ15 79446 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 39675119 39675662 39675396 Y NA NA NA NA NA NA KCNJ15 147991 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 39683359 39683503 39683360 Y NA NA NA NA NA NA KCNJ15 156231 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 39848171 39848499 39848471 Y ERG NA NA NA NA NA KCNJ15 321043 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 39866663 39867062 39866792 Y NA NA NA NA NA NA ETS2 308169 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 40018484 40018900 40018698 Y NA NA NA NA NA NA ETS2 156331 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr21 40182920 40183779 40183392 Y ETS2 ETS2 NA NA NA NA ETS2 7689 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 40202751 40202888 40202797 Y ETS2 ETS2 NA NA NA NA ETS2 27520 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 40211972 40212276 40212079 Y ETS2 ETS2 NA NA NA NA ETS2 36741 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 40225341 40225561 40225501 Y ETS2 NA LINC00114,ETS2,PSMG1,BRWD1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS2 50110 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 40270254 40270530 40270471 Y NA NA ETS2 IMR90 Hi-C 24141950 ETS2 95023 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 40277371 40277733 40277541 Y NA NA ETS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ETS2 102140 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr21 40278958 40279421 40279192 Y NA NA ETS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ETS2 103727 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr21 40386657 40387043 40386856 Y NA NA ETS2,LINC00114 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 166734 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr21 40393264 40393350 40393326 Y NA NA ETS2,LINC00114 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 160427 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr21 40395176 40395277 40395227 Y NA NA ETS2,LINC00114 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 158500 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr21 40455445 40455742 40455689 Y ETS2 NA ETS2 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 98035 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 40673787 40673929 40673891 Y NA BRWD1,HMGN1 NA NA NA NA BRWD1 17556 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 42217662 42218038 42217903 Y DSCAM DSCAM NA NA NA NA DSCAM 597 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 43061172 43061376 43061276 Y NA NA PRDM15,RIPK4 IMR90 Hi-C 24141950 RIPK4 123890 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 43062216 43062499 43062352 Y MX1 NA PRDM15,RIPK4 IMR90 Hi-C 24141950 RIPK4 122767 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 43188787 43189188 43188843 Y RIPK4 RIPK4 NA NA NA NA RIPK4 3521 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 43214290 43214658 43214474 Y NA RIPK4 NA NA NA NA RIPK4 29024 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 43431472 43431831 43431677 Y NA NA NA NA NA NA C2CD2 59473 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 43460613 43461088 43460825 Y C2CD2,SLC37A1 NA NA NA NA NA C2CD2 88614 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr21 43477244 43477358 43477313 Y NA NA ZNF295,UMODL1,C2CD2 MCF7 ChIA-PET 22265404 C2CD2 105245 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr21 43654635 43655282 43654967 Y NA ABCG1 TFF3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCG1 36836 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 43832072 43832298 43832177 Y NA NA NA NA NA NA SLC37A1 81820 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 43835171 43835549 43835341 Y C2CD2,ZNF295,UMODL1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,UBASH3A NA NA NA NA NA SLC37A1 78569 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 44395922 44396228 44396080 Y WDR4,U2AF1,CBS PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 3302 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr21 44631329 44631684 44631488 Y NA NA LINC00313,SIK1,HSF2BP,LINC00319 IMR90 Hi-C 24141950 U2AF1 105632 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 44753292 44753457 44753456 Y NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 91551 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr21 44753663 44753942 44753875 Y NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 91066 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 44761192 44761567 44761446 Y CRYAA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319,CRYAA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 83441 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 44816664 44817004 44816885 Y NA SIK1,LINC00319 NA NA NA NA SIK1 28004 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr21 44832284 44832425 44832365 Y SIK1 SIK1,LINC00319 NA NA NA NA SIK1 12583 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 44908266 44908370 44908324 Y NA LINC00319,LINC00313 LINC00319,SIK1 MCF7 ChIA-PET 22265404 LINC00313 10852 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr21 44913472 44913707 44913565 Y PDXK LINC00319,LINC00313 CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00313 16058 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr21 44918002 44918401 44918083 Y NA LINC00313 CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00313 20588 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr21 44930607 44930875 44930782 Y PDXK,SIK1 LINC00313 NA NA NA NA LINC00313 33193 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr21 44936784 44937143 44936907 Y PDXK LINC00313 NA NA NA NA LINC00313 39370 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr21 44937659 44937875 44937741 Y PDXK LINC00313 NA NA NA NA LINC00313 40245 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr21 44942511 44942810 44942777 Y PDXK LINC00313 NA NA NA NA LINC00313 45097 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 45020604 45020960 45020754 Y NA NA NA NA NA NA HSF2BP 56414 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.22777181081372 chr21 45187861 45188442 45188176 Y ICOSLG,PDXK,CSTB CSTB,RRP1 NA NA NA NA CSTB 5884 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr21 45337582 45337952 45337767 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT3 54515 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 45604332 45605113 45604833 Y PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG NA ICOSLG,PWP2,DNMT3L,PFKL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C21orf33 52845 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 46097395 46097576 46097539 Y KRTAP10-7,KRTAP10-12 NA NA NA NA NA UBE2G2 122358 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 46185657 46185775 46185721 Y NA UBE2G2 NA NA NA NA UBE2G2 34159 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 46336832 46337112 46336960 Y NA PTTG1IP,FAM207A NA NA NA NA FAM207A 20813 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 46501791 46502122 46501857 Y NA ADARB1 NA NA NA NA ADARB1 10023 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr21 46737459 46737695 46737585 Y COL18A1 POFUT2 COL18A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 POFUT2 31646 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 46749567 46749782 46749739 Y NA POFUT2 COL18A1,LINC00315,LOC642852,POFUT2,COL18A1-AS1,LOC100129027,PCBP3,ADARB1,SLC19A1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 POFUT2 43754 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 46891281 46891413 46891347 Y NA NA SLC19A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL18A1 68229 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 46982041 46982418 46982230 Y NA SLC19A1 PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,LINC00315,LOC642852 IMR90 Hi-C 24141950 SLC19A1 19716 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr21 47238270 47238607 47238438 Y NA NA NA NA NA NA COL6A1 161044 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 17652206 17652871 17652785 Y NA CECR5-AS1,CECR5,AC005300.5 NA NA NA NA CECR5 8029 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 18280978 18281337 18281098 Y BID,BID BID NA NA NA NA BID 25442 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 18506386 18506784 18506419 Y MICAL3 MICAL3 NA NA NA NA MICAL3 1061 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 18538907 18539143 18539025 Y NA MICAL3,PEX26 NA NA NA NA PEX26 19546 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 18916909 18917370 18917163 Y MICAL3,TUBA8,DGCR6,PRODH,PRODH DGCR6,DGCR5 NA NA NA NA DGCR6 25368 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.67332617297647 chr22 19410653 19410889 19410838 Y HIRA MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39 NA NA NA NA MRPL40 6536 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 19869401 19869687 19869604 Y NA C22orf29,GNB1L,AC000078.5 NA NA NA NA AC000078.5 3125 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 19874514 19874924 19874610 Y TRMT2A,C22orf29,GNB1L C22orf29,GNB1L,AC000078.5 GNB1L MCF7 ChIA-PET 22265404 AC000078.5 1702 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 19941739 19941814 19941777 Y NA COMT,TXNRD2 NA NA NA NA TXNRD2 14398 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 20772547 20772776 20772578 Y PI4KA ZNF74 NA NA NA NA ZNF74 26142 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 20863506 20864089 20863850 Y MED15 KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 15306 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr22 21285744 21286048 21285865 Y NA CRKL,XXbac-B135H6.15,LZTR1 NA NA NA NA CRKL 16030 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 21979927 21980091 21980009 Y NA YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA YDJC 2262 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 22170870 22171333 22171102 Y HIC2,PPM1F,MAPK1 MAPK1 NA NA NA NA MAPK1 48637 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 24255997 24256450 24256302 Y C22orf43,CABIN1,CABIN1 MIF NA NA NA NA MIF 21806 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr22 24752898 24753006 24752951 Y UPB1 NA NA NA NA NA SPECC1L-ADORA2A 88032 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 24795656 24796304 24795694 Y NA NA NA NA NA NA SPECC1L-ADORA2A 130790 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 25082452 25082825 25082629 Y ADORA2A,GGT1 NA PIWIL3 IMR90 Hi-C 24141950 FAM211B 95277 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 25381840 25382180 25381995 Y NA NA KIAA1671 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD56 86659 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 25390259 25390306 25390285 Y NA NA KIAA1671 MCF7 ChIA-PET 22265404 SNORD56 95078 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr22 25551532 25551738 25551635 Y NA NA NA NA NA NA LRP5L 247606 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 26967025 26967265 26967145 Y TFIP11 HMGB1P10,TPST2 NA NA NA NA HMGB1P10 12533 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 27041081 27041748 27041447 Y SEZ6L,ASPHD2 CTA-211A9.5 MIAT IMR90 Hi-C 24141950 CTA-211A9.5 24982 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 27508990 27509624 27509325 Y NA NA PITPNB,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1172A22.1 109064 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr22 27511834 27512126 27511988 Y NA NA PITPNB,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1172A22.1 106562 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 27530003 27530818 27530508 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1172A22.1 87870 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 27870917 27871291 27871105 Y NA NA PITPNB,MN1,TTC28,TTC28-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1172A22.1 252229 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 27872779 27873029 27872871 Y NA NA PITPNB,TTC28,TTC28-AS1,MN1,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1172A22.1 254091 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr22 28304832 28305219 28305193 Y NA TTC28-AS1,PITPNB NA NA NA NA TTC28-AS1 8145 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 28314180 28314595 28314448 Y PITPNB TTC28-AS1,PITPNB NA NA NA NA PITPNB 58 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 29601085 29601300 29601289 Y NA EMID1 NA NA NA NA EMID1 1245 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 30014203 30014547 30014300 Y NA NIPSNAP1,NF2 NA NA NA NA NF2 16658 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 30591785 30593544 30592394 Y NA LIF NA NA NA NA LIF 47296 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr22 30601535 30602099 30601994 Y MTMR3,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF LIF HORMAD2,LIF,GATSL3 IMR90 Hi-C 24141950 LIF 38741 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr22 30604572 30605275 30604996 Y NA LIF HORMAD2,LIF,GATSL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIF 35565 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr22 30631749 30632163 30631958 Y RNF215,MTFP1,GAL3ST1 LIF NA NA NA NA LIF 8677 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 30643780 30644513 30644215 Y GAL3ST1,LIF LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 2940 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr22 30644816 30645407 30645321 Y NA LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 3976 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr22 30646485 30646883 30646861 Y SEC14L2,RNF215,LIF LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 5645 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 30647782 30648063 30647863 Y SEC14L2,RNF215,GAL3ST1,LIF LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 6942 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 30648392 30648767 30648580 Y SF3A1 LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 7552 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 30649196 30649657 30649496 Y MTMR3,TBC1D10A,SF3A1,DUSP18,LIF,OSM LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 8356 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr22 30651841 30652045 30651989 Y RNF215 LIF,GATSL3 LIF IMR90 Hi-C 24141950 LIF 11001 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 30653574 30654311 30654075 Y RNF215,GAL3ST1 LIF,GATSL3 LIF IMR90 Hi-C 24141950 LIF 12734 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr22 30721148 30721367 30721290 Y MTMR3,OSM,SLC35E4,TBC1D10A GATSL3,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1 NA NA NA NA TBC1D10A 113 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 30938421 30938985 30938910 Y LIF,OSM,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1,DUSP18 SIRPAP1 NA NA NA NA SIRPAP1 1898 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 31030399 31030736 31030505 Y SMTN,OSM,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1,DUSP18,SLC35E4 PES1,SLC35E4,CTA-963H5.5,DUSP18 NA NA NA NA SLC35E4 760 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 31226011 31226350 31226247 Y NA NA NA NA NA NA MORC2 135934 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr22 31229455 31229575 31229536 Y NA NA NA NA NA NA MORC2 132709 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 32042427 32042918 32042716 Y RNF185,LIMK2 PISD NA NA NA NA PISD 13500 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 32446579 32447120 32446852 Y NA SC22CB-1E7.1 NA NA NA NA SC22CB-1E7.1 13102 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 32819656 32819735 32819695 Y RFPL3,TIMP3 FBXO7 NA NA NA NA FBXO7 48928 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 32928366 32928835 32928615 Y NA NA NA NA NA NA FBXO7 59703 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 33052745 33052826 33052803 Y RFPL2,RFPL3,TIMP3,SYN3 NA NA NA NA NA TIMP3 142861 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 33202971 33203258 33203149 Y NA TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 7284 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 33248825 33249077 33248981 Y SYN3 Z98256.1 NA NA NA NA Z98256.1 5343 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 33265683 33265702 33265692 Y TIMP3 Z98256.1 NA NA NA NA Z98256.1 11263 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 34238519 34238784 34238666 Y NA NA NA NA NA NA Z98256.1 984099 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 36727482 36728450 36727733 Y APOL3 NA NA NA NA NA MYH9 53613 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.33916040135441 chr22 36728624 36729163 36728912 Y IFT27 NA NA NA NA NA MYH9 52900 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chr22 36765300 36765605 36765487 Y APOL3,NCF4,MYH9 MYH9 NA NA NA NA MYH9 16458 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 36766615 36766810 36766723 Y NCF4,MYH9 MYH9 NA NA NA NA MYH9 15253 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 36858236 36858440 36858372 Y MYH9 TXN2,FOXRED2 NA NA NA NA TXN2 17637 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr22 37316628 37317004 37316672 Y NA NA NA NA NA NA MPST 96672 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 37445416 37445556 37445486 Y NA MPST,TST,KCTD17 NA NA NA NA KCTD17 223 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 37490501 37490532 37490517 Y NA KCTD17 NA NA NA NA KCTD17 44722 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 37518077 37518635 37518386 Y MFNG,MFNG,RAC2,IL2RB NA NA NA NA NA KCTD17 72298 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 37582993 37583226 37583109 Y NA C1QTNF6,Z82188.1 NA NA NA NA C1QTNF6 10199 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 37585028 37585323 37585113 Y NA C1QTNF6,Z82188.1 NA NA NA NA C1QTNF6 8102 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 37638328 37638951 37638750 Y SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4 C1QTNF6,Z82188.1 NA NA NA NA RAC2 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chr22 37655075 37655389 37655235 Y NA Z82188.1,RAC2 CARD10,C1QTNF6,CYTH4,ELFN2 IMR90 Hi-C 24141950 RAC2 16587 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr22 37937864 37938255 37937972 Y SH3BP1,LGALS2,GGA1,GGA1 CARD10,CDC42EP1 CARD10,MFNG,LGALS2,PDXP,TRIOBP,ELFN2,CDC42EP1,GGA1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC42EP1 16199 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr22 37942064 37942352 37942192 Y KCTD17,TRIOBP,POLR2F,MICALL1,LGALS1,ANKRD54,CARD10,CDC42EP1 CARD10,CDC42EP1 ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC42EP1 12102 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 37957606 37958042 37957847 Y NA CARD10,CDC42EP1,GGA1 NA NA NA NA CDC42EP1 3152 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr22 38137969 38138286 38138127 Y TRIOBP TRIOBP H1F0,GCAT IMR90 Hi-C 24141950 TRIOBP 46958 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 38142899 38142964 38142949 Y CDC42EP1,LGALS1,TRIOBP,POLR2F,GCAT,ANKRD54 NA NA NA NA NA TRIOBP 51888 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 38143248 38143734 38143618 Y LGALS1,TRIOBP,POLR2F NA NA NA NA NA TRIOBP 52237 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 38148564 38148886 38148725 Y CDC42EP1 NA NA NA NA NA H1F0 50228 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr22 38351215 38351232 38351224 Y NA POLR2F,C22orf23 NA NA NA NA C22orf23 3539 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 38599886 38600218 38600032 Y NA MAFF,PLA2G6 NA NA NA NA PLA2G6 189 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 38614588 38614867 38614785 Y MICALL1,TMEM184B,TMEM184B,CSNK1E,MAFF,MAFF MAFF,PLA2G6 NA NA NA NA PLA2G6 14891 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr22 38624836 38625209 38625138 Y JOSD1,GTPBP1,CSNK1E,MAFF MAFF,PLA2G6,TMEM184B NA NA NA NA PLA2G6 25139 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 38705287 38705445 38705426 Y NA TMEM184B NA NA NA NA TMEM184B 38247 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 38846181 38846564 38846216 Y NA KDELR3 NA NA NA NA KDELR3 15503 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 38857668 38857748 38857703 Y NA KDELR3,DDX17 KCNJ4 K562 ChIA-PET 22265404 KDELR3 4319 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 39377467 39377527 39377498 Y DNAL4,CBX6,APOBEC3B APOBEC3B,APOBEC3C,APOBEC3D NA NA NA NA APOBEC3B 1115 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr22 39486366 39486808 39486580 Y LOC646851,JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3D,APOBEC3G,APOBEC3H APOBEC3H NA NA NA NA APOBEC3H 4421 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 39570081 39570473 39570178 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,APOBEC3H CBX7 PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3 MCF7 ChIA-PET 22265404 CBX7 23402 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 39610460 39610820 39610697 Y NA PDGFB NA NA NA NA PDGFB 27936 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr22 39635664 39635940 39635710 Y NA PDGFB NA NA NA NA PDGFB 2816 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 39637977 39638270 39638005 Y MGAT3,MGAT3,SUN2,SUN2,NPTXR,CBX7,SYNGR1,PDGFB PDGFB NA NA NA NA PDGFB 486 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr22 39649567 39649736 39649595 Y SUN2,APOBEC3A,PDGFB PDGFB CBX7,RNU86,RPL3,SNORD83A,PDGFB IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDGFB 10811 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 39686679 39687117 39686848 Y NA PDGFB,RPL3 CBX7 IMR90 Hi-C 24141950 RPL3 27277 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 39693596 39693744 39693670 Y MGAT3 RPL3 NA NA NA NA RPL3 20650 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 39695935 39696099 39695991 Y ATF4,APOBEC3A RPL3,SYNGR1 NA NA NA NA RPL3 18295 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 39696256 39696487 39696398 Y ATF4,APOBEC3A RPL3,SYNGR1 NA NA NA NA RPL3 17907 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 39704707 39705214 39704970 Y ATF4,APOBEC3A RPL3,SYNGR1 NA NA NA NA RPL3 9180 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr22 39923809 39924011 39923907 Y NA ATF4,RPS19BP1 NA NA NA NA RPS19BP1 2849 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 40908486 40908830 40908701 Y NA NA NA NA NA NA MKL1 121876 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 41047729 41047883 41047796 Y NA MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17023 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr22 41048065 41048352 41048232 Y EP300,MKL1 MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17359 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr22 41417973 41418366 41418067 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39690 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 41418482 41418837 41418726 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39219 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 41460471 41460696 41460583 Y NA RP11-12M9.3,EP300 RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-12M9.3 2415 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 41684313 41684541 41684479 Y PPPDE2,RANGAP1 RANGAP1,ZC3H7B NA NA NA NA RANGAP1 4058 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 41840300 41840792 41840564 Y NA TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 235 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 42839941 42840323 42840234 Y POLDIP3,C22orf32,TCF20,RRP7A,NFAM1 CTA-126B4.7 MEI1,TCF20,NDUFA6,LOC100132273,C22orf32,CYP2D6,NFAM1,WBP2NL,RNU12,POLDIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTA-126B4.7 7912 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 43100819 43101017 43100994 Y NA A4GALT NA NA NA NA A4GALT 14287 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 43333511 43333722 43333661 Y POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2 NA NA NA NA NA PACSIN2 75429 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 44756999 44757252 44757125 Y NA NA KIAA1644,PARVB,LINC00207,SAMM50,LINC00229 IMR90 Hi-C 24141950 LDOC1L 134926 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 44757371 44757617 44757493 Y NA NA KIAA1644,PARVB,LINC00207,SAMM50,LINC00229 IMR90 Hi-C 24141950 LDOC1L 134561 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 44759236 44759683 44759589 Y NA NA KIAA1644,PARVB,LINC00207,SAMM50,LINC00229 IMR90 Hi-C 24141950 LDOC1L 132495 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 45016324 45016531 45016433 Y PARVG,PARVG,PRR5 PRR5 NA NA NA NA PRR5 46062 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 45081354 45081559 45081463 Y NA PRR5,PRR5-ARHGAP8,ARHGAP8 PARVB,KIAA1644,SAMM50 IMR90 Hi-C 24141950 PRR5-ARHGAP8 14554 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 45254258 45254434 45254345 Y PHF21B NA NA NA NA NA PHF21B 149446 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 45543738 45543876 45543815 Y PHF21B,NUP50,NUP50 CTA-217C2.1,NUP50 NA NA NA NA CTA-217C2.1 13786 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 45642150 45642482 45642292 Y NA KIAA0930 LOC100506714,NUP50,KIAA0930,UPK3A,FBLN1,SMC1B IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0930 7500 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 45944996 45945587 45945178 Y NA FBLN1 NA NA NA NA FBLN1 48878 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 46035019 46035329 46035174 Y NA ATXN10 NA NA NA NA ATXN10 30349 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr22 46041491 46041960 46041628 Y NA ATXN10 ATXN10,WNT7B,FAM118A,SMC1B,FBLN1,LOC730668,LOC100271722,MIRLET7BHG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATXN10 23718 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr22 46330758 46331082 46331012 Y NA WI2-85898F10.1,WNT7B NA NA NA NA WNT7B 39927 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 46370456 46370600 46370533 Y NA WNT7B NA NA NA NA WNT7B 409 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr22 46374166 46374684 46374539 Y NA WNT7B NA NA NA NA WNT7B 3157 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 46374858 46375446 46375153 Y NA WNT7B NA NA NA NA WNT7B 3849 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr22 46441533 46441708 46441621 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4 NA NA NA NA RP6-109B7.3 5877 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 46464940 46465203 46464976 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 1169 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 46467914 46468476 46468052 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 4143 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr22 46470082 46470656 46470309 Y C22orf26 RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 6311 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 46480881 46481264 46481017 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 17110 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.55944026756961 chr22 46495432 46495673 46495573 Y C22orf26 RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,PPARA NA NA NA NA MIR4763 11773 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 46745093 46745309 46745201 Y NA TRMU NA NA NA NA TRMU 20321 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 46853394 46853669 46853532 Y NA NA NA NA NA NA CELSR1 77398 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr22 46928379 46928595 46928487 Y NA CELSR1,GRAMD4 NA NA NA NA CELSR1 2472 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 46934347 46934575 46934459 Y CELSR1 CELSR1,GRAMD4 NA NA NA NA CELSR1 3280 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr22 46934777 46935027 46934877 Y NA CELSR1,GRAMD4 NA NA NA NA CELSR1 3710 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 46935060 46935431 46935290 Y CELSR1 CELSR1,GRAMD4 NA NA NA NA CELSR1 3993 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 46957537 46957704 46957620 Y NA CELSR1,GRAMD4 TRMU,CELSR1,GRAMD4 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 12205 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 47145806 47146214 47146075 Y CERK,TBC1D22A CERK,TBC1D22A CERK MCF7 ChIA-PET 22265404 TBC1D22A 10304 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 47149923 47150411 47150155 Y NA CERK,TBC1D22A CERK MCF7 ChIA-PET 22265404 TBC1D22A 6107 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 47150443 47150659 47150583 Y CERK,TBC1D22A CERK,TBC1D22A CERK MCF7 ChIA-PET 22265404 TBC1D22A 5859 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 47338470 47338938 47338889 Y CERK,TBC1D22A NA NA NA NA NA TBC1D22A 181952 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 49009124 49009326 49009225 Y NA NA NA NA NA NA BRD1 1209834 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 50327730 50328489 50328002 Y TRABD,SELO,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1 CRELD2,ALG12,PIM3 NA NA NA NA ALG12 17624 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr22 50329443 50330313 50330025 Y TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1 CRELD2,ALG12,PIM3 NA NA NA NA ALG12 19337 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 50342658 50342932 50342773 Y NA CRELD2,ALG12,PIM3 PLXNB2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PIM3 9229 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr22 50344780 50345228 50344944 Y NA CRELD2,ALG12,PIM3 PLXNB2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PIM3 6933 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 50364171 50364294 50364188 Y NA PIM3 NA NA NA NA PIM3 12010 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 50364350 50364715 50364589 Y NA PIM3 NA NA NA NA PIM3 12189 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 50710173 50710402 50710310 Y MLC1,MOV10L1,MOV10L1,MOV10L1,SHANK3,SBF1,PPP6R2,MAPK8IP2,MAPK8IP2,FAM116B,ACR,MAPK11 TUBGCP6,HDAC10,MAPK12,MAPK11,PLXNB2,XX-C283C717.1 NA NA NA NA MAPK11 2977 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 50742925 50743370 50743124 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,XX-C283C717.1,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 686 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 50743986 50744741 50744427 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,XX-C283C717.1,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr22 50744748 50744986 50744827 Y PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,XX-C283C717.1,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 692 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 50747003 50747284 50747232 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,XX-C283C717.1,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 2947 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr22 50891150 50891343 50891221 Y MOV10L1,TUBGCP6,HDAC10,PPP6R2,CHKB,SBF1,NCAPH2 SBF1,ADM2 NA NA NA NA SBF1 20111 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 50976592 50977006 50976816 Y PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B LMF2,NCAPH2,SCO2,ODF3B,SYCE3,CHKB-CPT1B NA NA NA NA ODF3B 7583 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr22 50977955 50978429 50978214 Y PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B LMF2,NCAPH2,SCO2,ODF3B,SYCE3,CHKB-CPT1B NA NA NA NA ODF3B 8946 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr22 51051274 51051666 51051314 Y NA CHKB-CPT1B,MAPK8IP2,CHKB,ARSA NA NA NA NA ARSA 12941 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 4780474 4780964 4780800 Y EDEM1,BHLHE40,ARL8B NA NA NA NA NA AC018816.3 146013 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 4783422 4783695 4783523 Y EDEM1,BHLHE40,ARL8B NA NA NA NA NA AC018816.3 143282 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 5027453 5027635 5027574 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 7807 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr3 5028534 5029013 5028702 Y ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 8888 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr3 5035978 5036317 5036132 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 16332 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 5036570 5037120 5036867 Y NA BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 16924 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr3 5054958 5055470 5055112 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 BHLHE40 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 BHLHE40-AS1 35312 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 5058332 5058543 5058409 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 BHLHE40 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BHLHE40-AS1 38686 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 5059566 5059965 5059743 Y ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40-AS1 39920 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 5063521 5063694 5063575 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40-AS1 43875 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 5065036 5065378 5065161 Y BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40-AS1 45390 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr3 5067974 5068590 5068209 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40-AS1 48328 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr3 5182623 5182897 5182737 Y BHLHE40,ARL8B,EDEM1 ARL8B,EDEM1 EDEM1 IMR90 Hi-C 24141950 ARL8B 20718 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 5237403 5237551 5237430 Y BHLHE40,ARL8B,EDEM1 EDEM1 NA NA NA NA EDEM1 10072 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 8500443 8500771 8500604 Y NA LMCD1 NA NA NA NA LMCD1 40622 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 8781836 8782151 8782020 Y NA OXTR NA NA NA NA OXTR 27163 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr3 8783302 8783537 8783436 Y NA OXTR NA NA NA NA OXTR 25777 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.55944026756961 chr3 8911307 8911734 8911565 Y OXTR NA NA NA NA NA RAD18 91723 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 9422978 9423353 9423146 Y SETD5,RAD18,THUMPD3 THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1 NA NA NA NA SETD5 13946 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 9995528 9995903 9995716 Y NA IL17RC,CRELD1,PRRT3-AS1,PRRT3,EMC3-AS1 NA NA NA NA PRRT3 3450 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 10157932 10158133 10158106 Y NA BRK1,VHL,IRAK2 NA NA NA NA BRK1 2656 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 10231143 10231913 10231419 Y ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 26594 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 10233695 10234220 10233931 Y VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 29146 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 10234749 10235085 10234824 Y ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 30200 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 10240437 10240684 10240523 Y ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2,TATDN2 NA NA NA NA IRAK2 35888 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 10240691 10241307 10240999 Y ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2,TATDN2 NA NA NA NA IRAK2 36142 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr3 10266595 10266861 10266739 Y VHL,IRAK2,TATDN2 TATDN2 NA NA NA NA TATDN2 20846 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 10402355 10402452 10402401 Y FANCD2 SEC13 NA NA NA NA SEC13 41493 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 11187629 11187920 11187792 Y HRH1 HRH1 NA NA NA NA HRH1 10850 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 11230556 11230841 11230699 Y NA NA NA NA NA NA HRH1 53777 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 11279893 11280094 11280011 Y NA ATG7 NA NA NA NA ATG7 31901 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 11688028 11688035 11688032 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 72185 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 11759856 11760132 11759896 Y NA VGLL4 NA NA NA NA VGLL4 88 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 11812040 11812191 11812115 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 51820 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 12235782 12236012 12235937 Y RAF1,PPARG,PPARG,PPARG TIMP4 NA NA NA NA TIMP4 36931 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 13035460 13035932 13035883 Y CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1 NA NA NA NA NA IQSEC1 76685 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 13493281 13493606 13493395 Y NA NUP210,HDAC11,HDAC11-AS1 IQSEC1,NUP210 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HDAC11 25618 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 13555627 13555924 13555826 Y NA HDAC11,HDAC11-AS1,FBLN2 NA NA NA NA FBLN2 15900 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 13884272 13884624 13884569 Y WNT7A WNT7A NA NA NA NA WNT7A 34994 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 13932354 13932493 13932424 Y NA WNT7A C3orf19,WNT7A,TMEM43,CHCHD4 IMR90 Hi-C 24141950 WNT7A 12736 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 13936849 13937176 13936976 Y NA WNT7A C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WNT7A 17231 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 14167210 14167731 14167391 Y TMEM43,XPC CHCHD4,TMEM43 NA NA NA NA TMEM43 2770 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr3 14257734 14258042 14257871 Y NA LSM3,XPC NA NA NA NA XPC 39451 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 14848047 14848355 14848186 Y SLC6A6 NA NA NA NA NA C3orf20 133441 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 15450643 15451124 15450971 Y ANKRD28,NR2C2,CAPN7,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5 EAF1,METTL6 NA NA NA NA EAF1 15738 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 15712856 15713111 15712984 Y NA NA NA NA NA NA HACL1 71518 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 15780032 15780074 15780052 Y SH3BP5,EAF1 NA BTD IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD28 119204 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 15813744 15814005 15813933 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,ANKRD28 NA BTD IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD28 85273 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 15835826 15836097 15835987 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28 NA NA NA NA NA ANKRD28 63181 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 15901875 15902313 15902310 Y METTL6,ANKRD28 ANKRD28 NA NA NA NA ANKRD28 2597 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 16101834 16102183 16102049 Y NA NA GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28 IMR90 Hi-C 24141950 DPH3 202296 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 16890755 16891188 16890921 Y PLCL2 NA TBC1D5,PLCL2 IMR90 Hi-C 24141950 RFTN1 337222 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 17505233 17505390 17505312 Y TBC1D5,TBC1D5 NA NA NA NA NA RFTN1 951700 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 17542863 17543019 17542979 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 941290 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 17543312 17543623 17543461 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 940686 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 17913596 17913897 17913750 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 570412 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA RAD23BP1 NA NA NA NA RAD23BP1 2077 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.78221744865098 chr3 19188369 19188866 19188531 Y NA NA NA NA NA NA RAD23BP1 610204 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 20098670 20099049 20098920 Y RAB5A KAT2B NA NA NA NA KAT2B 19155 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 20122748 20122899 20122825 Y NA KAT2B NA NA NA NA KAT2B 43233 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 20190984 20191185 20191115 Y SGOL1,SGOL1 SGOL1 NA NA NA NA SGOL1 34599 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 20201632 20201832 20201780 Y KAT2B SGOL1 NA NA NA NA SGOL1 23952 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 23206478 23206499 23206488 Y NA UBE2E2 UBE2E1,UBE2E2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E2 36012 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 23782023 23782329 23782145 Y NR1D2,UBE2E1 NA UBE2E2,UBE2E1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 63065 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 24197996 24198283 24198140 Y NA NA NA NA NA NA NKIRAS1 211914 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 24506233 24506581 24506477 Y NA THRB NA NA NA NA THRB 28192 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 25790563 25790933 25790768 Y NA OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 31475 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 26758769 26758926 26758778 Y LRRC3B NA NA NA NA NA SLC4A7 764985 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 27448460 27448581 27448568 Y NA NA NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 75330 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 27524458 27524952 27524717 Y NA SLC4A7 NA NA NA NA SLC4A7 547 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 27595774 27595869 27595845 Y NA NA SLC4A7 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 71863 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA AC098614.2 SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 AC098614.2 2140 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr3 27984483 27984771 27984759 Y ZCWPW2,EOMES NA NA NA NA NA EOMES 222277 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 29496223 29496522 29496266 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 175750 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 29531228 29531586 29531407 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 210755 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 29568670 29568984 29568828 Y RBMS3 NA NA NA NA NA RBMS3 248197 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 29735360 29735534 29735491 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 414887 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 29799751 29800074 29799882 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 479278 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 29983920 29984245 29984164 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR2 661749 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 30389148 30389362 30389271 Y TGFBR2 NA TGFBR2 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBR2 256632 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 30646968 30647109 30647039 Y TGFBR2 TGFBR2 NA NA NA NA TGFBR2 974 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 32461951 32462075 32462013 Y CMTM7 CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 30788 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 32501642 32502196 32501852 Y CNOT10,CCR4,CMTM7 CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 40704 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 32535422 32535827 32535806 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 7073 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 32549205 32549429 32549313 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 6305 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 33436260 33436332 33436276 Y CLASP2,FBXL2,FBXL2 UBP1 NA NA NA NA UBP1 44531 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 33590851 33591213 33591209 Y NA NA NA NA NA NA UBP1 109988 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 33837400 33837658 33837523 Y CLASP2,PDCD6IP PDCD6IP NA NA NA NA PDCD6IP 186 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 36953847 36954333 36954176 Y TRANK1,MLH1,LRRFIP2,GOLGA4,EPM2AIP1 TRANK1 NA NA NA NA TRANK1 30215 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 37304089 37304216 37304152 Y GOLGA4 GOLGA4,AC097359.1,TCEA1P2 NA NA NA NA TCEA1P2 10871 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 37901883 37902306 37902042 Y CTDSPL AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 432 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.89360603919167 chr3 37940881 37941115 37940985 Y NA AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 39430 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 38193404 38193826 38193575 Y VILL,ACAA1,MYD88,OXSR1 ACAA1,MYD88,OXSR1 OXSR1 IMR90 Hi-C 24141950 OXSR1 10754 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 38568637 38569221 38568871 Y SCN10A,SCN11A,SLC22A14,EXOG EXOG NA NA NA NA EXOG 33019 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 39191403 39191804 39191748 Y NA TTC21A,GORASP1,CSRNP1 NA NA NA NA CSRNP1 2249 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 39192381 39192719 39192586 Y WDR48,CSRNP1 TTC21A,GORASP1,CSRNP1 NA NA NA NA CSRNP1 1334 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr3 39193999 39194528 39194467 Y NA TTC21A,GORASP1 NA NA NA NA CSRNP1 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr3 42062353 42062651 42062504 Y NA TRAK1 TRAK1,ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 9059 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr3 42220925 42221235 42221114 Y TRAK1 NA NA NA NA NA TRAK1 167631 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr3 42725545 42725856 42725623 Y LYZL4,KRBOX1,HHATL,CCDC13 RP4-613B23.1 NA NA NA NA RP4-613B23.1 31665 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 43437259 43437582 43437422 Y ZNF662,ZNF662,FAM198A NA NA NA NA NA RP11-353H3.1 87790 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 44040259 44040834 44040651 Y NA NA ANO10 IMR90 Hi-C 24141950 ANO10 309173 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr3 44621262 44622718 44622436 Y NA ZNF197 NA NA NA NA ZNF197 1662 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr3 44925504 44925895 44925674 Y NA TMEM42,MIR564 NA NA NA NA MIR564 24124 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 44972207 44972481 44972421 Y NA EXOSC7,ZDHHC3 NA NA NA NA EXOSC7 42252 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 45106273 45106458 45106405 Y NA NA NA NA NA NA CDCP1 79456 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 45109274 45109492 45109385 Y NA NA NA NA NA NA CDCP1 76422 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 45138887 45139080 45139004 Y NA CDCP1 NA NA NA NA CDCP1 46834 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 45140818 45140977 45140897 Y NA CDCP1 NA NA NA NA CDCP1 44937 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 45157727 45158120 45157925 Y CDCP1 CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 27794 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr3 45164613 45164770 45164669 Y NA CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 21144 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 45165344 45165812 45165623 Y NA CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 20102 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 45165992 45166137 45166089 Y NA CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 19777 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 45175300 45175656 45175542 Y NA CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 10258 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 45209101 45209416 45209191 Y LIMD1 CDCP1,RPS24P8 LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS24P8 9434 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 46152557 46153082 46152773 Y CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR3,CCR1 NA CCR5,FYCO1,CCR1,CCR2 IMR90 Hi-C 24141950 FYCO1 117241 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 46427756 46428118 46427902 Y CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2 NA CCRL2 IMR90 Hi-C 24141950 ALS2CL 305076 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 46704560 46704953 46704713 Y NA ALS2CL NA NA NA NA ALS2CL 28241 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 46995135 46995433 46995392 Y NA NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 23740 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 47078393 47078462 47078449 Y NA NA NA NA NA NA CCDC12 56893 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 47201175 47201471 47201342 Y CSPG5,SETD2 SETD2,KIF9-AS1 NA NA NA NA SETD2 1986 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 47203467 47203704 47203598 Y NA SETD2,KIF9-AS1 NA NA NA NA SETD2 10 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 47421570 47421869 47421711 Y NA PTPN23 NA NA NA NA PTPN23 1069 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 47991974 47992099 47992083 Y CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A NA NA NA NA NA MAP4 136670 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.89360603919167 chr3 48332679 48332937 48332732 Y SPINK8 NME6 NA NA NA NA NME6 8238 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 49123301 49123671 49123633 Y NA QRICH1,QARS,USP19,LAMB2 NA NA NA NA QRICH1 6125 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 49286239 49286578 49286497 Y ARIH2,DALRD3,NDUFAF3,RHOA,USP4 NA NA NA NA NA KLHDC8B 79195 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 49358291 49358883 49358713 Y ARIH2,C3orf71,NDUFAF3,DALRD3,QRICH1,USP19,UBA7,IP6K1,USP4 USP4,GPX1 NA NA NA NA USP4 17262 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 50201601 50201845 50201760 Y TUSC2,HYAL2,C3orf54,MST1R,MON1A,SEMA3F,IFRD2 SEMA3F NA NA NA NA SEMA3F 11123 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 50204844 50205012 50204945 Y NA SEMA3F NA NA NA NA SEMA3F 14366 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 50274525 50274666 50274593 Y RASSF1,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2 GNAI2,SEMA3B NA NA NA NA GNAI2 12801 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 50302065 50302532 50302296 Y SEMA3B GNAI2,SEMA3B,IFRD2,NAT6,HYAL3 NA NA NA NA SEMA3B 458 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 50354393 50354598 50354449 Y MST1R IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL2,TUSC2,RASSF1,ZMYND10,CYB561D2,NPRL2,TMEM115 NA NA NA NA HYAL2 3739 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr3 50377372 50377700 50377536 Y NA IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL2,TUSC2,RASSF1,ZMYND10,CYB561D2,NPRL2,TMEM115 NA NA NA NA RASSF1 961 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 50487622 50487847 50487731 Y RBM5,GNAI2,GNAI2,RASSF1,RASSF1,CYB561D2,MAPKAPK3 NA CYB561D2,TMEM115,NPRL2 IMR90 Hi-C 24141950 CACNA2D2 51828 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 50638353 50638905 50638586 Y MAPKAPK3,CISH HEMK1,MAPKAPK3,CISH NA NA NA NA MAPKAPK3 8046 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 51573530 51573858 51573781 Y VPRBP,RAD54L2 VPRBP NA NA NA NA VPRBP 41520 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 52079728 52079827 52079778 Y DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 8739 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 52080287 52080923 52080751 Y NT5DC2,TWF2,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 7643 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr3 52081342 52081690 52081545 Y GPR62,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 6876 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 52088878 52089257 52089156 Y ACY1,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 312 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 52091161 52091675 52091445 Y TWF2,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 2595 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 52590623 52590962 52590793 Y NA NT5DC2 NA NA NA NA NT5DC2 23553 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 52704686 52705129 52704984 Y WDR82,GLYCTK,TMEM110,PRKCD,PBRM1 GNL3,PBRM1,SNORD69,SPCS1,GLT8D1 NA NA NA NA GNL3 8043 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 53136597 53136930 53136874 Y PBRM1,PBRM1,TMEM110,DCP1A,PRKCD RFT1 NA NA NA NA RFT1 25548 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 53272912 53273168 53273085 Y TMEM110,PRKCD,DCP1A TKT NA NA NA NA TKT 14900 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 53304049 53304491 53304265 Y PRKCD,DCP1A,TKT TKT NA NA NA NA TKT 15981 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 53360286 53360418 53360351 Y NA DCP1A NA NA NA NA DCP1A 19236 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 55517501 55517653 55517577 Y NA NA NA NA NA NA RPS15P5 859259 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 57096152 57096374 57096203 Y ASB14 SPATA12,ARHGEF3 NA NA NA NA SPATA12 3683 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 57555554 57555589 57555572 Y FAM116A,PDE12 PDE12,ARF4 NA NA NA NA PDE12 15551 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 57562103 57562255 57562188 Y SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12 PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 19692 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 57566206 57566518 57566262 Y NA PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 15429 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 57572232 57572342 57572306 Y NA PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 9605 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 57955527 57955938 57955800 Y FLNB FLNB FLNB,ARF4 IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 36189 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 57960548 57960842 57960815 Y FLNB FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 31285 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 57995654 57995894 57995762 Y NA FLNB NA NA NA NA FLNB 3527 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 57995926 57996426 57996121 Y NA FLNB NA NA NA NA FLNB 3799 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 58035006 58035314 58035102 Y FLNB FLNB NA NA NA NA FLNB 42879 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 58038147 58038335 58038213 Y FLNB FLNB NA NA NA NA FLNB 46020 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 58984210 58984527 58984399 Y NA C3orf67 NA NA NA NA C3orf67 49283 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 64200446 64200649 64200513 Y NA NA NA NA NA NA PSMD6 192788 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 65013149 65013388 65013334 Y NA NA NA NA NA NA RP11-14D22.2 583997 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 66348485 66348581 66348534 Y SLC25A26 NA LRIG1 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG1 201106 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 67420914 67421310 67421112 Y NA NA NA NA NA NA SUCLG2 281728 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 69135158 69135511 69135504 Y NA TMF1,UBA3,ARL6IP5 NA NA NA NA ARL6IP5 3063 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 69218338 69218527 69218433 Y FRMD4B NA NA NA NA NA ARL6IP5 86243 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 69228052 69228449 69228187 Y NA NA NA NA NA NA ARL6IP5 95957 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 69789363 69789667 69789441 Y MITF MITF NA NA NA NA MITF 2777 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 70898973 70899254 70899114 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 731886 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 71150221 71150629 71150383 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 480511 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 71151319 71151713 71151657 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 479427 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 71267437 71267786 71267612 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 363354 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 71478043 71478236 71478134 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 152904 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 71863099 71863325 71863212 Y NA NA NA NA NA NA EIF4E3 61175 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 72536556 72536893 72536709 Y RYBP RYBP PPP4R2,SHQ1,LOC201617,RYBP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RYBP 42487 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 72977666 72978074 72977791 Y RYBP GXYLT2,FTH1P23 NA NA NA NA FTH1P23 1471 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 73159773 73160145 73159855 Y EBLN2 NA PDZRN3,CACNA1D IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC75P1 70297 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 77273270 77273652 77273462 Y ROBO2,ROBO2 NA NA NA NA NA RP11-550F7.1 792101 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 79674571 79674688 79674630 Y ROBO1 NA NA NA NA NA ROBO1 140277 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 80739978 80740361 80740170 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 925013 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 83268139 83268257 83268189 Y NA NA NA NA NA NA GBE1 1458827 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 86972169 86972375 86972272 Y VGLL3 NA NA NA NA NA VGLL3 65894 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr3 86999128 86999300 86999212 Y CHMP2B VGLL3 NA NA NA NA VGLL3 38969 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr3 87022678 87022843 87022761 Y VGLL3 VGLL3 NA NA NA NA VGLL3 15426 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr3 87038252 87038431 87038423 Y NA NA NA NA NA NA VGLL3 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr3 87038753 87038992 87038799 Y VGLL3 VGLL3 NA NA NA NA VGLL3 484 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chr3 87382490 87382853 87382616 Y NA NA NA NA NA NA CHMP2B 108069 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 88208920 88209337 88209164 Y CGGBP1,C3orf38 C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA CGGBP1 11885 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 96336052 96336669 96336607 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPKP4 269654 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr3 97508761 97509065 97508913 Y NA ARL6 NA NA NA NA ARL6 27396 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 98504725 98505044 98504856 Y OR5K4,ST3GAL6 NA NA NA NA NA DCBLD2 113489 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 98505158 98505735 98505540 Y ST3GAL6 NA NA NA NA NA DCBLD2 112798 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 98544884 98545154 98545150 Y NA NA NA NA NA NA DCBLD2 73379 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 98549481 98549862 98549828 Y NA NA NA NA NA NA DCBLD2 68671 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 98689970 98690253 98690112 Y DCBLD2 LINC00973 DCBLD2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00973 7649 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 98691142 98691300 98691170 Y DCBLD2 LINC00973 DCBLD2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00973 6602 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 98848000 98848317 98848116 Y DCBLD2 NA COL8A1,MIR548G IMR90 Hi-C 24141950 LINC00973 150098 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 99356024 99356457 99356227 Y NA COL8A1 NA NA NA NA COL8A1 705 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 99555247 99555560 99555404 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 199928 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 99570772 99571127 99571120 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 215453 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 99579150 99579217 99579184 Y FILIP1L NA NA NA NA NA COL8A1 223831 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 99581173 99581391 99581282 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 225854 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 99582587 99582828 99582708 Y FILIP1L NA NA NA NA NA COL8A1 227268 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 99584293 99584813 99584482 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 228974 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 99614794 99615242 99614937 Y TBC1D23 NA NA NA NA NA FILIP1L 216115 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 99620045 99620512 99620235 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 210845 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 99751196 99751332 99751292 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 80025 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 99761045 99761306 99761215 Y TMEM45A NA TMEM30C IMR90 Hi-C 24141950 FILIP1L 70051 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 99766371 99766625 99766459 Y NA NA TMEM30C IMR90 Hi-C 24141950 FILIP1L 64732 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 99944403 99944723 99944568 Y NA TBC1D23 C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D23 33121 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 100244695 100244934 100244873 Y NA TMEM45A NA NA NA NA TMEM45A 35232 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr3 100418212 100418409 100418233 Y GPR128 TFG NA NA NA NA TFG 7796 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 100482455 100482783 100482461 Y NA NA NA NA NA NA TFG 56250 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 101403455 101403770 101403678 Y SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24 ZBTB11,CEP97 NA NA NA NA RPL24 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr3 101592355 101592794 101592687 Y NFKBIZ,NFKBIZ NFKBIZ NA NA NA NA NFKBIZ 47520 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 101598094 101598345 101598104 Y ZBTB11,NFKBIZ,NFKBIZ NA NA NA NA NA NFKBIZ 53259 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 101620912 101621401 101621096 Y NFKBIZ,NFKBIZ NA LOC152225 IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIZ 76077 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 103188921 103189148 103189133 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-43P 312117 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 103522825 103523125 103522973 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-43P 646021 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 105087492 105087848 105087688 Y NA ALCAM NA NA NA NA ALCAM 3739 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.56443489730196 chr3 105087916 105088171 105088021 Y ALCAM ALCAM NA NA NA NA ALCAM 4163 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr3 105088270 105088514 105088471 Y ALCAM ALCAM NA NA NA NA ALCAM 4517 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 107085712 107085944 107085942 Y NA NA LOC344595,LOC100302640 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00883 128173 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 107148336 107148412 107148401 Y NA NA LOC344595,BBX,LOC100302640 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BBX 91371 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 107705661 107706042 107705959 Y CD47 NA MYH15,IFT57,CD47,LOC285205 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD47 101830 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr3 107706134 107706639 107706380 Y NA NA MYH15,IFT57,CD47,LOC285205 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD47 101233 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 107807468 107807936 107807811 Y MYH15,CD47 NA NA NA NA NA CD47 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 107850030 107850463 107850156 Y MYH15,CD47 CD47 CD47,IFT57,MYH15 IMR90 Hi-C 24141950 CD47 42158 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr3 107871244 107871518 107871381 Y MYH15,HHLA2 NA NA NA NA NA CD47 63372 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 111449138 111449249 111449194 Y NA PHLDB2 NA NA NA NA PHLDB2 95 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 111454124 111454225 111454190 Y C3orf52,PHLDB2 PHLDB2 NA NA NA NA PHLDB2 4780 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.33916040135441 chr3 111456632 111456831 111456661 Y NA PHLDB2 NA NA NA NA PHLDB2 7288 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 111480028 111480653 111480348 Y NA PHLDB2 NA NA NA NA PHLDB2 30684 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr3 111481970 111482358 111482172 Y PHLDB2 PHLDB2 NA NA NA NA PHLDB2 32626 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr3 111484180 111484533 111484208 Y NA PHLDB2 NA NA NA NA PHLDB2 34836 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr3 111521164 111521550 111521388 Y PHLDB2,PHLDB2 NA NA NA NA NA PHLDB2 71820 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 111583903 111584464 111583984 Y PHLDB2,PHLDB2 NA NA NA NA NA ABHD10 111393 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 111623667 111623869 111623803 Y NA NA NA NA NA NA ABHD10 71988 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr3 111655124 111655265 111655201 Y NA ABHD10 NA NA NA NA ABHD10 40592 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 111721363 111721636 111721520 Y NA ABHD10,TAGLN3 NA NA NA NA TAGLN3 5852 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 111723588 111723714 111723651 Y SLC9A10,TAGLN3,TAGLN3 ABHD10,TAGLN3 NA NA NA NA TAGLN3 8077 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 111816359 111816505 111816432 Y C3orf52 C3orf52 NA NA NA NA C3orf52 13177 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 112097877 112098105 112098057 Y ATG3 NA NA NA NA NA SLC35A5 180451 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 112351265 112351470 112351440 Y NA CCDC80 NA NA NA NA CCDC80 14907 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 112366095 112366266 112366169 Y NA CCDC80 CCDC80,CD200R1L,GTPBP8,CD200R1,C3orf17 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CCDC80 111 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 112370377 112370712 112370567 Y CCDC80 CCDC80 CCDC80 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC80 4000 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 112372486 112372667 112372577 Y NA CCDC80 CCDC80,CD200R1L IMR90 Hi-C 24141950 CCDC80 6109 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr3 112390838 112391135 112390988 Y CCDC80 CCDC80 NA NA NA NA CCDC80 24461 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 112395778 112395997 112395824 Y CCDC80 CCDC80 CCDC80 MCF7 ChIA-PET 22265404 CCDC80 29401 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 113638745 113638778 113638762 Y NA NA NA NA NA NA QTRTD1 83902 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 113701770 113701838 113701802 Y KIAA1407,DRD3,ZDHHC23 QTRTD1 NA NA NA NA QTRTD1 20842 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 114289543 114289832 114289667 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1407 516083 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 115503263 115503751 115503546 Y NA NA NA NA NA NA GAP43 163092 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 115503837 115504240 115504182 Y NA NA NA NA NA NA GAP43 163666 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 115545713 115545826 115545800 Y NA NA NA NA NA NA GAP43 205542 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.67082885811029 chr3 115556507 115556695 115556650 Y NA NA NA NA NA NA GAP43 216336 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 115558428 115558819 115558693 Y GAP43 NA NA NA NA NA GAP43 218257 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 115595102 115595314 115595123 Y GAP43 NA NA NA NA NA GAP43 254931 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr3 115790074 115790198 115790193 Y NA NA NA NA NA NA GAP43 449903 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 117441288 117441601 117441524 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 697743 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 117708320 117708646 117708547 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 964775 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 119144576 119144994 119144966 Y ARHGAP31,COX17,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 40683 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 119157549 119157626 119157588 Y NA TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 28051 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 119237356 119237846 119237595 Y ARHGAP31,COX17,CD80,ADPRH,TMEM39A,POGLUT1 TIMMDC1 NA NA NA NA TIMMDC1 21977 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 119357693 119358081 119357897 Y GSK3B,ARHGAP31,ADPRH RP11-190C22.1,COX17 NA NA NA NA RP11-190C22.1 4696 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 119798224 119798287 119798255 Y NA GSK3B,RP11-18H7.1 NA NA NA NA GSK3B 12977 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 120277715 120278240 120277932 Y NA NDUFB4 FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB4 34916 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr3 120492875 120493095 120492951 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33035 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 121257379 121257441 121257436 Y NA RPL7AP11,POLQ NA NA NA NA POLQ 5412 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 121520314 121520680 121520641 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 31246 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 121550824 121551193 121550988 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 733 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 121638049 121638246 121638101 Y CSTA,ILDR1 SLC15A2 NA NA NA NA SLC15A2 27113 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 121807586 121807708 121807647 Y NA NA NA NA NA NA SLC15A2 196650 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 122201925 122202222 122202174 Y NA KPNA1 NA NA NA NA KPNA1 29570 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr3 122208819 122209075 122208974 Y NA KPNA1 NA NA NA NA KPNA1 22717 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 122493180 122493752 122493620 Y CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2 HSPBAP1,DIRC2 NA NA NA NA HSPBAP1 16919 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 123229622 123229815 123229688 Y NA NA NA NA NA NA PTPLB 72217 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 123263878 123263964 123263921 Y ADCY5,ADCY5 PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA PTPLB 38068 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 123304962 123305362 123305193 Y PTPLB PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA MYLK-AS1 2573 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 123321303 123321432 123321369 Y ADCY5 PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA MYLK-AS1 18914 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 123324068 123324437 123324253 Y PTPLB PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA MYLK-AS1 21679 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 123356199 123356268 123356234 Y NA NA NA NA NA NA MYLK-AS1 53810 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 123398747 123398958 123398853 Y NA NA NA NA NA NA MYLK-AS1 96358 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 123407272 123407514 123407399 Y NA NA NA NA NA NA MYLK-AS1 104883 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 123459149 123459385 123459267 Y NA NA NA NA NA NA MYLK-AS1 156760 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 123469666 123469916 123469803 Y MYLK NA NA NA NA NA MYLK-AS1 167277 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 123553686 123553794 123553787 Y NA NA NA NA NA NA CCDC14 124770 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 123587912 123588093 123588031 Y ADCY5 NA NA NA NA NA CCDC14 90471 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 124779995 124780351 124780112 Y ITGB5,HEG1 HEG1 NA NA NA NA HEG1 7193 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 124781797 124782117 124781832 Y NA HEG1 NA NA NA NA HEG1 8995 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 125231315 125231583 125231558 Y NA SNX4 NA NA NA NA SNX4 5458 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 125709142 125709481 125709414 Y ZXDC,CCDC37 NA NA NA NA NA FAM86JP 75679 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 126074775 126075511 126074965 Y ALDH1L1,UROC1,CCDC37,KLF15 NA NA NA NA NA ZXDC 117251 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 126359707 126359720 126359714 Y NA TXNRD3NB,TXNRD3 NA NA NA NA TXNRD3 12278 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 126391611 126391660 126391640 Y NA TXNRD3,CHCHD6 NA NA NA NA TXNRD3 19613 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 126630341 126630598 126630469 Y ZXDC NA NA NA NA NA PLXNA1 74839 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 126701397 126702091 126701497 Y PLXNA1 PLXNA1 CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PLXNA1 3346 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 126702933 126703224 126703109 Y NA PLXNA1 CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PLXNA1 2213 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 126945431 126945830 126945484 Y MCM2 NA NUP210P1 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNA1 239994 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 126945882 126946306 126946211 Y MCM2 NA NUP210P1 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNA1 240445 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 127244302 127244595 127244437 Y NA NA UROC1,CHST13,NUP210P1,CHCHD6 IMR90 Hi-C 24141950 MCM2 70471 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 127487223 127487760 127487461 Y TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL NA NA NA NA NA MGLL 52291 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 127522578 127522702 127522699 Y TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL MGLL NA NA NA NA MGLL 17349 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr3 127536409 127536633 127536521 Y TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL,KBTBD12 MGLL NA NA NA NA MGLL 3418 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr3 127799227 127799458 127799344 Y GATA2,GATA2,GATA2,DNAJB8 SEC61A1 NA NA NA NA SEC61A1 30743 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 128152586 128152939 128152776 Y NA NA EEFSEC,DNAJB8-AS1,DNAJB8,LOC90246,GATA2,C3orf27 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-475N22.4 53116 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 128153952 128154067 128154030 Y GATA2 NA EEFSEC,C3orf27,GATA2,LOC90246,DNAJB8-AS1,DNAJB8 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-475N22.4 51988 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 128214371 128214730 128214426 Y EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2 RP11-475N22.4 DNAJB8,DNAJB8-AS1,GATA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-475N22.4 8316 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 128216520 128216923 128216625 Y EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2 RP11-475N22.4 GATA2,C3orf27,RUVBL1,EEFSEC,DNAJB8,DNAJB8-AS1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-475N22.4 10465 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 128366732 128367045 128366901 Y NA RPN1 NA NA NA NA RPN1 30873 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 128475272 128475670 128475352 Y RAB7A,ISY1,CNBP RAB7A,FTH1P4 NA NA NA NA FTH1P4 6191 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr3 128745839 128746109 128746044 Y NA KIAA1257 NA NA NA NA KIAA1257 26306 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 128838520 128838686 128838629 Y MBD4,C3orf37,C3orf37,RAB7A,KIAA1257,ISY1,CNBP,GP9,RAB43,RAB43,RAB43,RAB43 RAB43,ISY1-RAB43,ISY1 NA NA NA NA RAB43 958 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 128964355 128964687 128964560 Y NA NA KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNBP 63590 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 129245456 129245718 129245564 Y RHO NA NA NA NA NA PLXND1 77943 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 129346331 129346490 129346427 Y PLXND1 PLXND1 NA NA NA NA PLXND1 22670 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 129436791 129437287 129437073 Y NA NA NA NA NA NA PLXND1 113130 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 130539887 130540309 130539974 Y ATP2C1 ATP2C1 ATP2C1 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2C1 27130 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 131197540 131197572 131197556 Y NA MRPL3 NA NA NA NA MRPL3 22255 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 131853355 131853723 131853539 Y NA NA CPNE4 IMR90 Hi-C 24141950 RPL7P16 107386 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 131854898 131855187 131855050 Y NA NA CPNE4 IMR90 Hi-C 24141950 RPL7P16 105922 CAGE SAS hg19 FANTOM5 5.79220670811568 chr3 133289121 133289251 133289178 Y SRPRB CDV3 CDV3 MCF7 ChIA-PET 22265404 CDV3 1323 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 133968581 133968789 133968685 Y NA RYK NA NA NA NA RYK 892 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 134034499 134034569 134034531 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5 ANAPC13,C3orf36,SLCO2A1,AMOTL2,CEP63 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-200A1.1 4081 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 134045700 134046050 134045958 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RP11-200A1.1 15282 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr3 134047160 134047394 134047241 Y ANAPC13,ANAPC13,ANAPC13,AMOTL2 RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RP11-200A1.1 16742 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr3 134050159 134050571 134050486 Y AMOTL2 RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RP11-200A1.1 19741 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 134051149 134051359 134051254 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RP11-200A1.1 20731 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 134067109 134067364 134067237 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 6039 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 134068231 134068586 134068519 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 4817 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 134069780 134070244 134070081 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 3159 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr3 134082893 134083489 134083439 Y AMOTL2 RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA AMOTL2 8832 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 134100770 134101008 134100801 Y NA RPL39P5,AMOTL2 AMOTL2,MIR4788,ANAPC13,CEP63 IMR90 Hi-C 24141950 AMOTL2 8449 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 134145641 134145965 134145857 Y NA NA ANAPC13,AMOTL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMOTL2 53320 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 135827453 135827844 135827484 Y PPP2R3A NA NA NA NA NA MSL2 86239 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 135828343 135828732 135828538 Y PPP2R3A NA NA NA NA NA MSL2 85351 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 136448168 136448437 136448423 Y NA STAG1 NA NA NA NA STAG1 20783 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 136492102 136492187 136492145 Y NA STAG1 NCK1,IL20RB IMR90 Hi-C 24141950 STAG1 22882 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 136521386 136521500 136521443 Y NA NA NCK1 IMR90 Hi-C 24141950 STAG1 52166 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 136571906 136572239 136572061 Y TMEM22 RP11-85F14.5,NCK1 NA NA NA NA RP11-85F14.5 6657 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 138109159 138109469 138109274 Y NA ESYT3 NA NA NA NA ESYT3 41959 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 138581757 138582253 138582041 Y NA PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 29977 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 138582294 138582582 138582441 Y MRPS22 PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 30514 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.11888053513921 chr3 139253953 139254145 139254018 Y NA RBP1 NA NA NA NA RBP1 2526 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 140077980 140078337 140078159 Y CLSTN2 NA NA NA NA NA CLSTN2 425953 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 141118771 141119120 141118811 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB38 77716 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr3 141204930 141205324 141205031 Y NA RASA2 NA NA NA NA RASA2 1041 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr3 141217752 141218175 141217834 Y ATP1B3,RASA2 RASA2 NA NA NA NA RASA2 13863 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 141230074 141230471 141230125 Y NA RASA2 NA NA NA NA RASA2 26185 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 141319185 141319480 141319327 Y RASA2 NA NA NA NA NA RASA2 115296 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 141458120 141458481 141458300 Y RASA2 RNF7 NA NA NA NA RNF7 3074 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 141482175 141482451 141482314 Y NA RNF7 NA NA NA NA RNF7 27129 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 141610914 141611173 141610928 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 17948 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 141611491 141611772 141611584 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 18525 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 141758636 141758867 141758743 Y NA RP11-343B5.1 NA NA NA NA RP11-343B5.1 2173 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 142723898 142724007 142723903 Y NA U2SURP NA NA NA NA U2SURP 42559 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 143352573 143352896 143352700 Y NA NA NA NA NA NA SLC9A9 212477 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 145883195 145883481 145883360 Y PLOD2,PLSCR4 PLOD2 PLOD2,PLSCR4,PLSCR1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PLOD2 3755 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 146224364 146224853 146224698 Y NA PLSCR2,PLSCR1 NA NA NA NA PLSCR2 12586 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 146259909 146260381 146260206 Y PLSCR1 PLSCR2,PLSCR1 NA NA NA NA PLSCR1 270 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 146693286 146693521 146693406 Y ZIC4,ZIC4,ZIC4,ZIC1 NA NA NA NA NA PLSCR1 432635 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 146955604 146955955 146955778 Y NA NA NA NA NA NA PLSCR1 694953 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 148704982 148705163 148705084 Y NA GYG1 HLTF,GYG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GYG1 1965 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 148942843 148943311 148943144 Y NA NA NA NA NA NA HPS3 97472 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 149104739 149105065 149104981 Y COMMD2,TM4SF1 TM4SF1 GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM4SF1 11087 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr3 149180653 149180836 149180808 Y RNF13 RP11-278L15.6 HPS3,TM4SF18,TM4SF1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-278L15.6 29611 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 149271786 149271997 149271800 Y NA NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 61339 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 149284462 149284628 149284613 Y NA NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 74015 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 149333585 149333911 149333859 Y TM4SF18,TM4SF18,TM4SF1,WWTR1,WWTR1 NA NA NA NA NA WWTR1 118590 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 149356424 149356747 149356622 Y NA NA NA NA NA NA WWTR1 95754 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 149361418 149361700 149361559 Y WWTR1 NA NA NA NA NA WWTR1 90801 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 149657313 149657850 149657694 Y TSC22D2,RNF13 ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 26322 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 149665230 149665637 149665395 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 18535 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 149901549 149901792 149901671 Y NA NA PFN2,LOC646903,TSC22D2,RNF13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFN2 134974 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 149933925 149934322 149934006 Y NA NA PFN2,RNF13,TSC22D2,LOC646903,ANKUB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFN2 167350 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 150089534 150090066 150089791 Y NA TSC22D2 TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 34056 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr3 150102610 150102865 150102834 Y SIAH2,SERP1,TSC22D2 TSC22D2 PFN2,RNF13,TSC22D2,SERP1,EIF2A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 21257 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 150329194 150329427 150329421 Y NA SELT,SERP1 NA NA NA NA SERP1 10179 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 150456267 150456381 150456351 Y NA RP11-103G8.2,FAM194A,SIAH2-AS1,SIAH2 NA NA NA NA SIAH2-AS1 21343 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 150714222 150714233 150714228 Y CLRN1 NA NA NA NA NA MED12L 87251 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 151016558 151016712 151016648 Y MED12L,P2RY12,GPR87 GPR87 NA NA NA NA GPR87 16028 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 151486383 151486557 151486470 Y NA RP11-64D22.2,AADAC NA NA NA NA RP11-64D22.2 167 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 151507223 151507685 151507381 Y NA RP11-64D22.2,AADAC NA NA NA NA RP11-64D22.2 21007 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 151739734 151740181 151739895 Y NA NA MBNL1 IMR90 Hi-C 24141950 AADAC 209909 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 151923088 151923367 151923343 Y MBNL1 MBNL1 MBNL1,LOC401093 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MBNL1 36250 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 151975130 151975682 151975593 Y NA MBNL1,MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 9662 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 151976173 151976628 151976408 Y NA MBNL1,MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 8716 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 152121454 152121974 152121660 Y MBNL1 NA NA NA NA NA MBNL1-AS1 136110 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 152848416 152848799 152848521 Y RAP2B RAP2B NA NA NA NA RAP2B 29230 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr3 152878171 152878732 152878352 Y P2RY1,RAP2B RAP2B NA NA NA NA RAP2B 142 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.00749194459853 chr3 153017510 153017568 153017539 Y NA NA NA NA NA NA RAP2B 139481 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 156202207 156202259 156202239 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1 NA NA NA NA NA SSR3 68714 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 156268270 156268550 156268410 Y NA SSR3 NA NA NA NA SSR3 2423 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 156402848 156403019 156402937 Y LEKR1,LEKR1,CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP TIPARP,TIPARP-AS1 NA NA NA NA TIPARP-AS1 12681 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 156403084 156403595 156403347 Y LEKR1,LEKR1,CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP TIPARP,TIPARP-AS1 NA NA NA NA TIPARP-AS1 12917 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 156442773 156442811 156442792 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP NA NA NA NA NA TIPARP-AS1 52606 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 156443600 156443618 156443611 Y LEKR1,LEKR1,CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP NA NA NA NA NA TIPARP-AS1 53433 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 156444390 156444661 156444493 Y NA NA NA NA NA NA TIPARP-AS1 54223 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 156453441 156453522 156453482 Y CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP NA NA NA NA NA TIPARP-AS1 63274 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 156502026 156502257 156502105 Y SSR3 PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA PA2G4P4 24264 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 156506058 156506346 156506123 Y SSR3 PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA PA2G4P4 20175 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr3 156529352 156529637 156529452 Y NA PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA PA2G4P4 2831 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 156530301 156530778 156530576 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1 PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA LINC00886 2073 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr3 156558833 156558838 156558836 Y NA PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA LEKR1 17563 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 156837520 156837824 156837670 Y NA RP11-6F2.5,CCNL1 NA NA NA NA CCNL1 38725 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 156846039 156846735 156846192 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1,CCNL1 RP11-6F2.5,CCNL1,RP11-550I24.2 NA NA NA NA CCNL1 29814 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 156849691 156850000 156849844 Y NA CCNL1,RP11-550I24.2 NA NA NA NA CCNL1 26549 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 157935893 157935900 157935896 Y NA NA NA NA NA NA SHOX2 113601 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 158226530 158226854 158226539 Y NA NA NA NA NA NA MLF1 60098 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 159175843 159176214 159175971 Y NA NA NA NA NA NA SCHIP1 379436 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr3 159465414 159465509 159465463 Y NA NA NA NA NA NA SCHIP1 90141 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 159493461 159493761 159493605 Y NA NA NA NA NA NA SCHIP1 61889 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 159514645 159514911 159514780 Y NA SCHIP1 NA NA NA NA SCHIP1 40739 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 159538960 159539273 159539207 Y NA SCHIP1 NA NA NA NA SCHIP1 16377 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 159540179 159540477 159540438 Y NA SCHIP1 NA NA NA NA SCHIP1 15173 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr3 159542121 159542517 159542198 Y NA SCHIP1 NA NA NA NA SCHIP1 13133 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 159572503 159572920 159572729 Y NA SCHIP1 NA NA NA NA SCHIP1 16853 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 159597816 159598076 159597925 Y NA SCHIP1 NA NA NA NA SCHIP1 42166 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 159983948 159984179 159984064 Y NA NA NA NA NA NA SMC4 130883 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 160267928 160268193 160268163 Y NA SCARNA7,KPNA4 NA NA NA NA KPNA4 13183 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 160949185 160949470 160949344 Y OTOL1 NA NA NA NA NA B3GALNT1 128013 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 163153271 163153291 163153281 Y NA NA NA NA NA NA SPTSSB 2064603 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 168930237 168930275 168930257 Y NA NA NA NA NA NA MECOM 449131 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 169075984 169076327 169076322 Y NA NA NA NA NA NA MECOM 303079 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 169376858 169377055 169376957 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 2351 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 169377431 169377952 169377740 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 1454 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 169379063 169379412 169379208 Y MECOM NA NA NA NA NA MECOM 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 169379831 169380308 169379976 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 425 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 169482089 169482431 169482154 Y NA TERC,MYNN,LRRC34 NA NA NA NA TERC 1241 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr3 170442364 170442688 170442585 Y CLDN11 RP11-373E16.4 CLDN11,SLC7A14 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 14466 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 170444418 170445820 170444586 Y CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2 RP11-373E16.4 CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 11334 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr3 170527099 170527304 170527203 Y EIF5A2 NA SLC7A14,CLDN11,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 58968 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 170584649 170585013 170584680 Y NA RPL22L1,EIF5A2 NA NA NA NA RPL22L1 1259 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 171592038 171592451 171592208 Y FNDC3B NA NA NA NA NA PLD1 65298 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 171594447 171594730 171594655 Y NA NA NA NA NA NA PLD1 67707 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 171678764 171678932 171678818 Y NA NA PLD1,FNDC3B,TMEM212,TNIK IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3B 76486 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr3 171684878 171685278 171685188 Y PLD1,FNDC3B NA PLD1,FNDC3B,TMEM212 IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3B 70140 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 171856568 171857271 171856877 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 101150 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 171870963 171871593 171871291 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 115545 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr3 172234609 172234750 172234680 Y FNDC3B,TNFSF10,TNFSF10 TNFSF10 NA NA NA NA TNFSF10 4547 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 172325180 172325357 172325227 Y NA NA TNFSF10 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF10 85883 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 172344996 172345137 172345044 Y NA NA NA NA NA NA NCEH1 81871 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 172418207 172418359 172418236 Y NA NCEH1,ECT2 NA NA NA NA NCEH1 8649 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 172467147 172467552 172467259 Y NA NCEH1,ECT2,RNU4-4P NCEH1,ECT2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ECT2 675 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 173650294 173650720 173650491 Y NA NA NA NA NA NA RP11-393N4.2 442314 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 177076157 177076922 177076435 Y TBL1XR1 NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 162896 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 177167081 177167399 177167234 Y NA NA TBL1XR1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TBL1XR1 253820 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr3 177167478 177167833 177167747 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 254217 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 177170399 177170552 177170483 Y NA NA TBL1XR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 257138 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 177307615 177308089 177307887 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 394354 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 177313306 177313318 177313312 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 400045 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 177383116 177383499 177383118 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 469855 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 177979552 177979945 177979765 Y NA NA NA NA NA NA ZMAT3 808122 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 178236576 178236655 178236649 Y KCNMB2 NA KCNMB2 IMR90 Hi-C 24141950 ZMAT3 551412 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 178787910 178788066 178787991 Y ZMAT3 ZMAT3 NA NA NA NA ZMAT3 1 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 178978348 178978737 178978528 Y PIK3CA,MFN1,GNB4 LRRFIP1P1 NA NA NA NA LRRFIP1P1 1287 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 179309053 179309431 179309273 Y NA ACTL6A,MRPL47,NDUFB5 NA NA NA NA MRPL47 11011 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 181418145 181418802 181418404 Y SOX2 SOX2 NA NA NA NA SOX2 8912 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 181444404 181445128 181444694 Y NA SOX2 NA NA NA NA SOX2 16690 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 182825824 182825958 182825903 Y NA MCCC1 NA NA NA NA MCCC1 5905 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr3 182980670 182980835 182980709 Y NA B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 11638 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 183003579 183004143 183003750 Y ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 34547 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chr3 184458237 184458578 184458314 Y NA MAGEF1 VPS8,EPHB3,POLR2H,CLCN2,FAM131A,EIF4G1,THPO,CHRD,MAGEF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAGEF1 30401 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr3 184727770 184727947 184727859 Y NA NA NA NA NA NA VPS8 199839 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 185050290 185050463 185050301 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K13 51561 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 185448917 185448986 185448952 Y NA C3orf65 NA NA NA NA C3orf65 20601 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 185463229 185463551 185463382 Y NA C3orf65 NA NA NA NA C3orf65 34913 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 185484664 185484670 185484667 Y NA NA NA NA NA NA IGF2BP2 56174 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 185533882 185534105 185533994 Y NA IGF2BP2 SENP2 IMR90 Hi-C 24141950 IGF2BP2 6739 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 185825302 185825582 185825395 Y NA ETV5 NA NA NA NA ETV5 525 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr3 186892076 186892095 186892086 Y NA RPL39L LOC100131635 IMR90 Hi-C 24141950 RPL39L 4601 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 187459288 187459644 187459469 Y RTP4,BCL6,BCL6,BCL6 BCL6 NA NA NA NA BCL6 1871 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 187574248 187574709 187574377 Y NA NA NA NA NA NA BCL6 112733 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 187607399 187607588 187607479 Y BCL6 NA BCL6,LPP IMR90 Hi-C 24141950 BCL6 145884 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 187697421 187697657 187697609 Y NA NA BCL6,LPP,LPP-AS2,LOC100131635 IMR90 Hi-C 24141950 LPP 171415 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 188002342 188002742 188002584 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 132497 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 188012691 188013249 188012784 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 142846 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 188155903 188156126 188156022 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 286058 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 188224984 188225450 188225214 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 355139 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 188291512 188291633 188291575 Y NA NA NA NA NA NA TPRG1 371370 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 188618525 188618672 188618589 Y NA TPRG1 NA NA NA NA TPRG1 44331 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 188906400 188906598 188906499 Y NA NA NA NA NA NA TPRG1 243397 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 189544866 189545241 189545054 Y NA NA NA NA NA NA TP63 197661 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 189557440 189557782 189557660 Y TP63 NA NA NA NA NA TP63 210235 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr3 189559377 189559697 189559485 Y CLDN1,TP63 NA NA NA NA NA TP63 212172 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.56193758243578 chr3 189626513 189626760 189626607 Y TP63 NA NA NA NA NA LEPREL1-AS1 209993 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 189627444 189627802 189627598 Y CLDN1,TP63 NA NA NA NA NA LEPREL1-AS1 208951 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 189632708 189632930 189632825 Y TP63 NA NA NA NA NA LEPREL1-AS1 203823 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 189654011 189654252 189654134 Y NA NA NA NA NA NA LEPREL1-AS1 182501 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 189794828 189795104 189794939 Y NA LEPREL1-AS1,LEPREL1 NA NA NA NA LEPREL1-AS1 41649 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 190041292 190041577 190041442 Y NA CLDN1 NA NA NA NA CLDN1 3028 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr3 190062904 190063381 190063085 Y LEPREL1,CLDN1,CLDN16 CLDN1 LEPREL1,CLDN1,CLDN16 IMR90 Hi-C 24141950 CLDN1 24640 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.34165771622059 chr3 190251387 190251779 190251471 Y CLDN1 IL1RAP NA NA NA NA IL1RAP 21547 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr3 190956161 190956506 190956333 Y NA NA NA NA NA NA CCDC50 88360 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 192604773 192605048 192605023 Y NA MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 28902 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 192605604 192605670 192605648 Y NA MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 28280 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 192608372 192608637 192608617 Y NA MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 25313 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 192610862 192611520 192611033 Y MB21D2 MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 22430 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 192634153 192634990 192634777 Y MB21D2 MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 203 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr3 192873675 192873788 192873739 Y NA NA NA NA NA NA HRASLS 83126 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 193546369 193546601 193546485 Y NA NA LOC100131551,LOC647323,HES1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OPA1 237436 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr3 193548514 193548983 193548724 Y NA NA LOC100131551,LOC647323,HES1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OPA1 239581 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chr3 193587539 193587846 193587782 Y NA NA LOC100131551,LOC647323,HES1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HES1 264088 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr3 193588211 193588236 193588227 Y NA NA LOC100131551,LOC647323,HES1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HES1 263698 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr3 193588375 193588843 193588631 Y NA NA LOC100131551,LOC647323,HES1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HES1 263091 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 193590130 193590422 193590276 Y NA NA LOC100131551,LOC647323,HES1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HES1 261512 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr3 193807302 193807696 193807488 Y ATP13A3,HES1 HES1 HES1,LOC100131551,LOC647323 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HES1 44238 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr3 193851636 193853009 193852912 Y ATP13A3,HES1 NA NA NA NA NA HES1 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 193858651 193858843 193858731 Y NA HES1 NA NA NA NA HES1 6717 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 193859199 193859624 193859359 Y TMEM44 HES1 NA NA NA NA HES1 7265 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr3 193876735 193877026 193876899 Y NA HES1 NA NA NA NA HES1 24801 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.89610335405784 chr3 194022185 194022450 194022442 Y NA NA NA NA NA NA HES1 170251 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 194040514 194040910 194040840 Y HES1 NA NA NA NA NA ATP13A3 176183 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr3 194153543 194153935 194153911 Y ATP13A3 NA NA NA NA NA ATP13A3 63158 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 194298758 194299295 194298977 Y NA TMEM44-AS1 ATP13A3,FLJ34208 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM44-AS1 3445 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 194850291 194850713 194850430 Y PPP1R2,LSG1 NA NA NA NA NA XXYLT1 139183 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 194898663 194899282 194898930 Y NA NA NA NA NA NA XXYLT1 90614 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 195573980 195574341 195574135 Y MUC20,MUC4 NA NA NA NA NA TNK2 62475 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 195627582 195627903 195627662 Y ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2,TNK2 TNK2 NA NA NA NA TNK2 8913 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 195632869 195633225 195632990 Y ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2 TNK2 NA NA NA NA TNK2 3591 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 195633702 195634304 195633876 Y ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2,TNK2 TNK2 NA NA NA NA TNK2 2512 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 196757369 196757726 196757658 Y LRRC33,SENP5,MFI2,MFI2 AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2 NA NA NA NA MFI2 2682 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 196758283 196758681 196758467 Y NA AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2 NA NA NA NA MFI2 3596 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 196761683 196762044 196761813 Y NA AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2 MFI2-AS1,MFI2 IMR90 Hi-C 24141950 MFI2 6996 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 197007663 197007913 197007866 Y NA DLG1 NA NA NA NA DLG1 16258 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr3 197033346 197033465 197033406 Y DLG1 DLG1 NA NA NA NA DLG1 9175 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 197044593 197044660 197044627 Y NA DLG1 NA NA NA NA DLG1 20422 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chr3 197121526 197121880 197121703 Y DLG1 NA DLG1,LOC100507086,BDH1 IMR90 Hi-C 24141950 DLG1 97355 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr3 197439165 197439566 197439302 Y IQCG,LRCH3,KIAA0226 MIR922,FYTTD1,KIAA0226 NA NA NA NA FYTTD1 22484 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr3 197478210 197478491 197478305 Y IQCG,KIAA0226,FYTTD1,FYTTD1,LRCH3 FYTTD1,KIAA0226,LRCH3 NA NA NA NA KIAA0226 3612 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr4 693278 693552 693364 Y GAK,MFSD7,PCGF3 MYL5,ATP5I,PCGF3 NA NA NA NA PCGF3 3985 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 924714 925388 925028 Y MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,IDUA,GAK GAK,TMEM175 NA NA NA NA TMEM175 539 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 1037465 1037841 1037534 Y MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,GAK,IDUA FGFRL1 NA NA NA NA FGFRL1 35741 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr4 1339592 1340250 1339850 Y NA NA NA NA NA NA MAEA 57953 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 1753782 1754101 1753962 Y FGFR3 SLBP,TMEM129,TACC3,FGFR3 NA NA NA NA TACC3 32555 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr4 1875191 1875366 1875328 Y NA LETM1,WHSC1 NA NA NA NA WHSC1 4040 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 2414575 2415364 2414914 Y HAUS3,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,RNF4,RNF4,LOC402160 RNF4 NA NA NA NA RNF4 46583 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 2538945 2539718 2539367 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 76998 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 2765898 2766146 2766030 Y NA TNIP2,SH3BP2 TNIP2,NOP14-AS1,NOP14,MFSD10 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TNIP2 9795 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 2805465 2805723 2805581 Y ZFYVE28,LOC402160,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2 TNIP2,SH3BP2,ADD1 NA NA NA NA SH3BP2 12715 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 3085381 3085754 3085447 Y NA HTT NA NA NA NA HTT 10973 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 3389642 3390154 3389980 Y HTT,RGS12 NA NA NA NA NA RGS12 96887 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 3391112 3391254 3391201 Y RGS12 NA NA NA NA NA RGS12 98357 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 3469404 3469760 3469670 Y NA NA NA NA NA NA LRPAP1 62526 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 3483238 3483365 3483266 Y NA LRPAP1 NA NA NA NA LRPAP1 48921 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 3484611 3485071 3484896 Y NA LRPAP1 NA NA NA NA LRPAP1 47215 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 3485407 3485559 3485410 Y DOK7 LRPAP1 NA NA NA NA LRPAP1 46727 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 3488499 3488826 3488767 Y NA LRPAP1 NA NA NA NA LRPAP1 43460 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 3492056 3492792 3492287 Y DOK7 LRPAP1 NA NA NA NA LRPAP1 39494 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 3493312 3493795 3493528 Y NA LRPAP1 NA NA NA NA LRPAP1 38491 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 4272259 4272533 4272507 Y ZBTB49 TMEM128,LYAR,ZBTB49 NA NA NA NA LYAR 17363 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 4577048 4577566 4577357 Y NA STX18-AS1,STX18 NA NA NA NA STX18 34975 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 4854782 4854915 4854832 Y NA MSX1 MSX1 K562 ChIA-PET 22265404 MSX1 4478 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 6592942 6593078 6593012 Y NA PPP2R2C,MAN2B2,MRFAP1 NA NA NA NA MAN2B2 18040 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 6785099 6785509 6785391 Y TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232 KIAA0232 NA NA NA NA KIAA0232 3997 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr4 6887984 6888235 6888115 Y NA TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 20734 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 6959680 6959690 6959685 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D14 50711 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 6964947 6965065 6964958 Y CCDC96 NA NA NA NA NA TBC1D14 55978 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 6989470 6989868 6989678 Y TBC1D14 NA NA NA NA NA TADA2B 51758 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 7012933 7013112 7013014 Y NA TADA2B,CCDC96 NA NA NA NA TADA2B 28514 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 7648496 7648718 7648592 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1 290935 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 7830043 7830393 7830208 Y SH3TC1 NA NA NA NA NA AFAP1 109260 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 7833117 7833393 7833178 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 106260 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 7834057 7834311 7834184 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 105342 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 7846072 7846237 7846145 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 93416 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 7858938 7859554 7859231 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 80099 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 8247542 8247920 8247851 Y NA HTRA3 NA NA NA NA HTRA3 21572 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 8614691 8614733 8614712 Y NA CPZ NA NA NA NA CPZ 22304 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 9154755 9155069 9154900 Y NA NA NA NA NA NA CPZ 562368 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 10830954 10831154 10831060 Y NA NA NA NA NA NA ZNF518B 373920 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 11702526 11702838 11702684 Y NA NA CLNK,HS3ST1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-281P23.2 77188 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 12642016 12642195 12642111 Y NA RP11-352E6.2 NA NA NA NA RP11-352E6.2 1755 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.2302691256799 chr4 13486596 13486918 13486821 Y BOD1L,RAB28 RAB28 NA NA NA NA RAB28 2607 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 13613048 13613249 13613164 Y NA AC006445.7 NA NA NA NA AC006445.7 18974 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 13894956 13895300 13895128 Y NA NA CPEB2,LOC441009 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01085 216292 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 13908947 13909321 13909089 Y NA NA LOC441009,CPEB2,LOC152742 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01085 202271 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 13922430 13922925 13922628 Y NA NA LOC441009,CPEB2,C1QTNF7 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01085 188667 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.00499462973235 chr4 15036867 15037072 15036952 Y NA CPEB2 NA NA NA NA CPEB2 34569 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 15590411 15590648 15590624 Y FBXL5 NA NA NA NA NA FAM200B 90637 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 15594702 15595080 15594956 Y FBXL5 NA NA NA NA NA FAM200B 86205 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 15655935 15656313 15656300 Y FBXL5,BST1 FAM200B,FBXL5 NA NA NA NA FAM200B 24972 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 15757957 15758240 15758119 Y FBXL5,TAPT1,CD38 RP11-115L11.1 C1QTNF7,CD38,FGFBP2,PROM1,CC2D2A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115L11.1 26707 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 15907638 15908044 15907859 Y FBXL5,BST1,FGFBP1 FGFBP1 BST1 IMR90 Hi-C 24141950 FGFBP1 30319 CAGE SAS hg19 FANTOM5 5.45804093649363 chr4 15915213 15915572 15915412 Y FGFBP1 FGFBP1 NA NA NA NA FGFBP1 22791 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.67082885811029 chr4 15922988 15923279 15923080 Y FGFBP1 FGFBP1 NA NA NA NA FGFBP1 15084 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chr4 17853657 17853735 17853696 Y NA DCAF16,NCAPG NA NA NA NA NCAPG 43132 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr4 20627000 20627372 20627197 Y NA NA NA NA NA NA PACRGL 68533 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 21602576 21603408 21603328 Y KCNIP4,KCNIP4,KCNIP4 NA NA NA NA NA PACRGL 906671 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 23299933 23300259 23300096 Y NA NA NA NA NA NA CDC42P6 572360 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 24660007 24660225 24660117 Y NA ATP5LP3 CCDC149,MIR573 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5LP3 2009 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 26175759 26175971 26175925 Y NA RBPJ RBPJ IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 12682 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 28460749 28460765 28460756 Y NA NA NA NA NA NA RP11-293A21.1 1600528 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 30718904 30719447 30718947 Y PCDH7,PCDH7 PCDH7 NA NA NA NA PCDH7 590 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr4 30719661 30720023 30719741 Y PCDH7,PCDH7 PCDH7 NA NA NA NA PCDH7 14 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 32142342 32142554 32142470 Y NA NA NA NA NA NA PCDH7 1422305 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 36191564 36191723 36191675 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 52408 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 37581972 37582372 37582240 Y NA NA NA NA NA NA RELL1 103626 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 37887233 37887434 37887366 Y TBC1D1 TBC1D1 NA NA NA NA TBC1D1 3274 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 38083648 38084173 38083860 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 123592 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 38162192 38162313 38162253 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 202136 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 38162520 38162833 38162765 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 202464 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr4 38664467 38664838 38664653 Y TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3 KLF3 NA NA NA NA RP11-617D20.1 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 38665008 38665204 38665059 Y TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3 KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA RP11-617D20.1 504 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 38668617 38669179 38668850 Y KLF3 KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA RP11-617D20.1 4113 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 38674773 38675062 38674906 Y KLF3 KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA RP11-617D20.1 10269 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 38859134 38859762 38859410 Y KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6 TLR1,TLR6,FAM114A1 NA NA NA NA TLR1,TLR6 2696 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr4 38871281 38871430 38871296 Y NA TLR1,TLR6,FAM114A1 NA NA NA NA FAM114A1 3983 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 39045195 39045532 39045360 Y NA TMEM156,KLHL5 NA NA NA NA KLHL5 536 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 39048044 39048301 39048173 Y KLF3,TLR1,TLR6 TMEM156,KLHL5 NA NA NA NA KLHL5 3385 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 39908966 39909133 39909103 Y NA NA NA NA NA NA PDS5A 68443 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 39933245 39933555 39933419 Y NA PDS5A NA NA NA NA PDS5A 44021 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 40519982 40520039 40520011 Y RBM47 NA NA NA NA NA RBM47 110853 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 40533771 40533999 40533881 Y NA NA NA NA NA NA RBM47 96893 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 40674929 40675349 40675137 Y RBM47 RBM47 RBM47 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBM47 44037 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 40992630 40993044 40992776 Y APBB2 NA NA NA NA NA APBB2 223687 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 41000829 41000972 41000906 Y RBM47 NA NA NA NA NA APBB2 215759 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr4 41197133 41197282 41197239 Y NA APBB2 NA NA NA NA APBB2 19449 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 41509451 41509766 41509557 Y LIMCH1 NA NA NA NA NA LIMCH1 149827 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 47121817 47122010 47121920 Y NA NA NA NA NA NA COMMD8 341726 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 48532180 48532355 48532269 Y NA NA NA NA NA NA SLAIN2 190841 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 48700290 48700744 48700528 Y NA NA NA NA NA NA FRYL 79595 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr4 48851417 48851730 48851443 Y ZAR1,FRYL OCIAD1 NA NA NA NA OCIAD1 46188 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 53879042 53879203 53879109 Y NA NA NA NA NA NA RASL11B 152585 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 54338842 54339193 54339023 Y NA NA NA NA NA NA FIP1L1 97032 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 54798924 54799227 54799060 Y NA NA SCFD2,PDGFRA,CHIC2,LNX1,RPL21P44,FIP1L1,GSX2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 129630 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 54871626 54871896 54871863 Y NA NA NA NA NA NA CHIC2 56961 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 55093767 55093987 55093860 Y NA PDGFRA NA NA NA NA PDGFRA 503 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 57132335 57132393 57132366 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP31 87908 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 57947514 57947824 57947684 Y NA IGFBP7-AS1,IGFBP7 NA NA NA NA IGFBP7-AS1 26104 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 64353119 64353291 64353223 Y NA NA NA NA NA NA RP11-204H9.2 941336 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 68266370 68266649 68266476 Y NA RP11-584P21.4 NA NA NA NA RP11-584P21.4 43336 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 68281708 68281730 68281719 Y NA RP11-584P21.4 NA NA NA NA RP11-584P21.4 28255 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 72459056 72459408 72459224 Y NA NA NA NA NA NA DCK 602801 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 72978297 72978597 72978489 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS3 453919 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 74593361 74593798 74593698 Y NA IL8 IL8,RASSF6,PF4V1,CXCL3,CXCL2,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IL8 10425 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 74628298 74628465 74628372 Y PPBP,PF4V1,PF4,IL8 IL8 NA NA NA NA IL8 24075 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 74974850 74975280 74974976 Y IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L CXCL2,MTHFD2L RASSF6 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 2611 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 74975298 74975961 74975834 Y CXCL1,AREG CXCL2,MTHFD2L RASSF6 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 1930 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr4 74977575 74978125 74977847 Y NA CXCL2 RASSF6 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr4 74982637 74982975 74982882 Y IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L CXCL2,MTHFD2L RASSF6,IL8,CXCL3,MTHFD2L,PF4,PPBPL2 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 4746 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 75097904 75098121 75097961 Y IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L NA NA NA NA NA MTHFD2L 120013 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 75257879 75258118 75257951 Y CXCL3,CXCL2,MTHFD2L,EREG EREG NA NA NA NA EREG 29019 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr4 75274406 75274726 75274555 Y AREG EREG NA NA NA NA EREG 45546 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 75409847 75410209 75409849 Y NA NA EREG MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EREG 180987 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 75411825 75412170 75412032 Y NA NA EREG MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EREG 182965 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 75550011 75550323 75550221 Y NA NA EREG,MTHFD2L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BTC 167573 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 75557908 75558335 75558035 Y EREG,AREG NA EREG,MTHFD2L IMR90 Hi-C 24141950 BTC 159561 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.11638322027304 chr4 75585032 75585282 75585171 Y NA NA EREG,MTHFD2L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BTC 132614 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 75955084 75955470 75955277 Y NA NA NA NA NA NA PARM1 98779 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 76750745 76750859 76750802 Y NA NA NA NA NA NA USO1 102968 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 77011342 77011736 77011528 Y NAAA,CXCL9,CXCL10,CXCL11 NA NA NA NA NA NUP54 55932 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 77129675 77129810 77129753 Y NAAA SCARB2,FAM47E NA NA NA NA SCARB2 3236 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 77511406 77511861 77511558 Y ANKRD56,SHROOM3 NA NA NA NA NA SHROOM3 157153 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 77543952 77543974 77543961 Y NA NA NA NA NA NA SHROOM3 189699 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 77724798 77724936 77724862 Y NA NA NA NA NA NA SOWAHB 92066 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 77752154 77752315 77752229 Y NA NA SHROOM3,SEPT11,SOWAHB IMR90 Hi-C 24141950 SOWAHB 64687 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr4 77814769 77814983 77814876 Y NA SOWAHB NA NA NA NA SOWAHB 2019 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 77869398 77869850 77869619 Y SEPT11 SEPT11 NA NA NA NA SEPT11 542 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 77931984 77932418 77932077 Y NA NA NA NA NA NA CCNI 62740 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 78096366 78096378 78096373 Y NA CCNG2 NA NA NA NA CCNG2 20062 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 78708574 78708903 78708795 Y CNOT6L CNOT6L NA NA NA NA CNOT6L 29866 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 78977894 78978171 78977912 Y FRAS1 FRAS1 NA NA NA NA FRAS1 1170 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 78979777 78980204 78980085 Y NA FRAS1 NA NA NA NA FRAS1 3053 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 79473983 79474151 79474067 Y ANXA3 ANXA3 NA NA NA NA ANXA3 3310 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 80998878 80999095 80998994 Y PRDM8,ANTXR2 ANTXR2 NA NA NA NA ANTXR2 45513 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 81229160 81229644 81229481 Y NA FGF5 NA NA NA NA FGF5 43407 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 82553061 82553360 82553250 Y RASGEF1B NA NA NA NA NA RASGEF1B,RP11-689K5.3 410037 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 83205148 83205451 83205300 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPD 88205 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 83681282 83681423 83681411 Y NA SCD5 NA NA NA NA SCD5 36587 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 83755588 83755973 83755970 Y NA SCD5 NA NA NA NA SCD5 37578 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 84466595 84466890 84466743 Y NA FAM175A,AGPAT9 NA NA NA NA AGPAT9 11528 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 84776291 84776536 84776414 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT9 321224 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 85420434 85420908 85420714 Y NA NA NA NA NA NA CDS1 81224 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 87626625 87626818 87626720 Y PTPN13 NA NA NA NA NA PTPN13 113157 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 87932880 87932928 87932888 Y AFF1,AFF1 NA NA NA NA NA TECRP1 63604 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 88074850 88075090 88074969 Y DSPP NA NA NA NA NA KLHL8 84376 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 88817372 88817671 88817543 Y NA NA NA NA NA NA SPP1 77148 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 90212945 90213002 90212979 Y GPRIN3 NA NA NA NA NA FAM13A 182396 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 90391330 90391567 90391434 Y NA NA NA NA NA NA RP11-115D19.1 78940 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 91049597 91049943 91049669 Y FAM190A NA NA NA NA NA SNCA 292131 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 93104192 93104578 93104286 Y NA NA NA NA NA NA SMARCAD1 2022184 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 95373822 95374139 95373960 Y PDLIM5 PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 2785 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr4 95374521 95374795 95374668 Y NA PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 3484 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 95437375 95437547 95437461 Y PDLIM5 NA NA NA NA NA PDLIM5 66338 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 95469761 95469962 95469859 Y HPGDS,PDLIM5 NA NA NA NA NA PDLIM5 98724 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 99845137 99845196 99845164 Y NA AC019131.1,EIF4E NA NA NA NA AC019131.1 3942 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 99848541 99848872 99848707 Y NA AC019131.1,EIF4E NA NA NA NA AC019131.1 266 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 101977991 101978172 101977999 Y NA NA NA NA NA NA AP001816.1 288765 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 104888285 104888590 104888438 Y NA NA NA NA NA NA CXXC4 525468 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 106887801 106887968 106887883 Y NPNT NA NA NA NA NA INTS12 72658 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 108760061 108760236 108760128 Y NA SGMS2 NA NA NA NA SGMS2 16342 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 108783895 108784172 108784033 Y SGMS2 SGMS2 NA NA NA NA SGMS2 40176 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 108819119 108819373 108819246 Y NA CYP2U1 NA NA NA NA CYP2U1 31152 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 108821168 108821439 108821243 Y NA CYP2U1 NA NA NA NA CYP2U1 29086 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 110623287 110623426 110623357 Y LRIT3 CASP6,PLA2G12A NA NA NA NA CASP6 548 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 111117471 111117868 111117585 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 487 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr4 112732930 112733119 112733025 Y NA NA NA NA NA NA RP11-269F21.3 258735 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 112797429 112797439 112797434 Y NA NA NA NA NA NA RP11-269F21.3 194415 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 112814304 112814659 112814583 Y NA NA NA NA NA NA RP11-269F21.3 177195 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 113095488 113095850 113095539 Y NA C4orf32 NA NA NA NA C4orf32 30935 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 113181018 113181306 113181029 Y AP1AR,TIFA AP1AR,ALPK1,TIFA NA NA NA NA ALPK1 23359 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 113572868 113573168 113573031 Y NA LARP7,C4orf21 NA NA NA NA C4orf21 16717 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 114389425 114389805 114389547 Y NA RNU1-138P NA NA NA NA RNU1-138P 49946 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr4 117519495 117520605 117520296 Y NA ACTN4P1 NA NA NA NA ACTN4P1 2178 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 119756174 119756657 119756269 Y NA SEC24D NA NA NA NA SEC24D 1181 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 119890642 119890944 119890758 Y NA NA NA NA NA NA SEC24D 132804 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 120024463 120024846 120024696 Y NA NA SYNPO2,USP53,MYOZ2 IMR90 Hi-C 24141950 USP53 106896 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr4 120130181 120130604 120130427 Y NA USP53 NA NA NA NA USP53 1138 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 122611926 122612330 122612120 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 3938 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr4 123685251 123685615 123685333 Y FGF2 CETN4P,BBS12 NA NA NA NA BBS12 33394 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 123792983 123793156 123793069 Y NA FGF2,NUDT6,SPATA5 NA NA NA NA FGF2 47120 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 124410194 124410374 124410218 Y NA NA SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY1 94244 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 129088221 129088417 129088319 Y NA NA NA NA NA NA LARP1B 107798 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 129733811 129733921 129733891 Y NA NA NA NA NA NA C4orf33 278551 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 129965980 129966229 129966106 Y NA C4orf33,SCLT1 NA NA NA NA C4orf33 46243 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 138975341 138975477 138975408 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A11 186026 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 139221168 139221437 139221260 Y SLC7A11 NA NA NA NA NA SLC7A11 59665 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 139250529 139250714 139250650 Y SLC7A11 NA NA NA NA NA SLC7A11 89026 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 139326439 139326794 139326543 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A11 164936 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 139814320 139814623 139814472 Y NA NA SLC7A11,LOC641365 IMR90 Hi-C 24141950 CCRN4L 120320 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 140003738 140004448 140004114 Y CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2 NA CCRN4L K562 ChIA-PET 22265404 CCRN4L 68795 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr4 140235316 140235657 140235500 Y ELF2,RAB33B NAA15,NDUFC1 NA NA NA NA NDUFC1 13611 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 140278994 140279360 140279178 Y NA NA NA NA NA NA NDUFC1 57289 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 140321405 140321719 140321434 Y ELF2,NAA15,RAB33B NA NA NA NA NA RAB33B 50667 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr4 140727942 140728268 140728103 Y MAML3 NA NA NA NA NA MGST2 143020 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 140967961 140968185 140967999 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 105153 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 141071687 141072625 141072041 Y MAML3 MAML3 NA NA NA NA MAML3 713 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 141174275 141174653 141174618 Y NA SCOC MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SCOC 1787 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 141218386 141218686 141218436 Y MAML3,SCOC SCOC NA NA NA NA SCOC 41946 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 142347756 142348088 142347922 Y NA NA NA NA NA NA IL15 207664 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 143162001 143162155 143162078 Y NA NA NA NA NA NA INPP4B 604430 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 143325385 143325488 143325414 Y NA NA NA NA NA NA INPP4B 441097 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 143337797 143338156 143337961 Y NA NA NA NA NA NA INPP4B 428429 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 143471391 143471615 143471483 Y NA NA NA NA NA NA INPP4B 294970 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 143608710 143609035 143608873 Y NA NA NA NA NA NA INPP4B 157550 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 144271294 144271615 144271412 Y NA GAB1 NA NA NA NA GAB1 15379 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr4 144276815 144277022 144276900 Y NA GAB1 NA NA NA NA GAB1 20900 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 144280232 144280410 144280287 Y USP38,SMARCA5,GAB1 GAB1 NA NA NA NA GAB1 24317 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 146655718 146656086 146655845 Y NA NA NA NA NA NA MMAA 118303 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 146656396 146656737 146656614 Y NA NA NA NA NA NA MMAA 118981 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr4 146726845 146727018 146726937 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 130769 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 146729401 146729770 146729628 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 128017 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr4 146856855 146857112 146856936 Y NA ZNF827 NA NA NA NA ZNF827 675 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr4 148654111 148654384 148654270 Y PRMT10 ARHGAP10 NA NA NA NA ARHGAP10 2897 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 148677279 148677473 148677309 Y NA ARHGAP10 NA NA NA NA ARHGAP10 26065 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 150756513 150756641 150756613 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 1178238 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.56193758243578 chr4 151405544 151405555 151405550 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 529324 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 152047125 152047385 152047255 Y NA RPS3A NA NA NA NA RPS3A 28400 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 152048107 152048440 152048274 Y LRBA,LRBA RPS3A NA NA NA NA RPS3A 29382 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 152117073 152117218 152117121 Y FAM160A1,SH3D19 NA NA NA NA NA RPS3A 98348 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 152226044 152226315 152226216 Y NA NA NA NA NA NA RP11-610P16.1 101672 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr4 152246032 152246165 152246086 Y FAM160A1 NA FAM160A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-610P16.1 81822 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr4 152367520 152367754 152367585 Y NA RP11-610P16.1,FAM160A1 NA NA NA NA FAM160A1 39152 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 153265183 153265560 153265526 Y FBXW7 NA NA NA NA NA FBXW7 189693 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 153445736 153446128 153446118 Y NA FBXW7,MIR4453 NA NA NA NA FBXW7 9125 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 153717992 153718074 153718038 Y NA TIGD4,ARFIP1 NA NA NA NA ARFIP1 18903 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 153858553 153859077 153858605 Y TRIM2,FHDC1 RP11-206F17.2,FHDC1 ARFIP1,FHDC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FHDC1 3049 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 153884926 153884958 153884941 Y NA RP11-206F17.2,FHDC1 NA NA NA NA FHDC1 29422 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 154244307 154244410 154244359 Y NA MND1 NA NA NA NA MND1 19391 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 154408922 154409996 154409474 Y NA KIAA0922 NA NA NA NA KIAA0922 23424 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 154580466 154580842 154580627 Y TLR2 TLR2 NA NA NA NA TLR2 39810 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 157867687 157867968 157867878 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 22578 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 157870715 157871133 157870964 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 19413 CAGE SAS hg19 FANTOM5 6.23776107027843 chr4 158125886 158126027 158125941 Y NA NA NA NA NA NA GLRB 130677 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 159643443 159643599 159643521 Y FNIP2,PPID PPID,FNIP2 NA NA NA NA PPID 895 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 162371144 162371411 162371278 Y NA NA NA NA NA NA NAF1 1714662 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr4 162590696 162590746 162590721 Y NA NA NA NA NA NA NAF1 1495327 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 164414222 164414415 164414319 Y TKTL2,C4orf43 NA NA NA NA NA NAF1 328149 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 164464203 164464350 164464219 Y NPY1R,NPY5R,MARCH1 NA NA NA NA NA NAF1 378130 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 169479701 169480223 169479961 Y NA DDX60L NA NA NA NA DDX60L 22764 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 169509077 169509260 169509148 Y NA NA NA NA NA NA DDX60L 52140 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 169658786 169659496 169659136 Y NA NA NA NA NA NA DDX60L 201849 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 169718415 169718594 169718475 Y DDX60,DDX60L NA NA NA NA NA CBR4 210832 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 169991170 169991417 169991322 Y NA NA SH3RF1,NEK1 IMR90 Hi-C 24141950 CBR4 61744 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 169992046 169992220 169992129 Y NA NA SH3RF1,NEK1 IMR90 Hi-C 24141950 CBR4 62620 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 170132939 170133158 170133049 Y SH3RF1 NA NA NA NA NA SH3RF1 57098 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 173917824 173917970 173917931 Y NA NA NA NA NA NA GALNT7 169934 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 174112816 174113032 174112924 Y NA GALNT7,RP11-10K16.1 NA NA NA NA RP11-10K16.1 24013 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 174422100 174422381 174422300 Y NA NA NA NA NA NA RANP6 131141 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 177710943 177711419 177711262 Y VEGFC VEGFC NA NA NA NA VEGFC 462 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 177824075 177824477 177824359 Y NA NA VEGFC IMR90 Hi-C 24141950 VEGFC 112194 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 177931617 177931727 177931725 Y NA NA VEGFC IMR90 Hi-C 24141950 VEGFC 219736 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 180979740 180980372 180979835 Y NA NA NA NA NA NA AGA 2618083 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 182397139 182397379 182397259 Y NA NA NA NA NA NA DCTD 1439710 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 183758006 183758378 183758192 Y NA NA ODZ3 IMR90 Hi-C 24141950 DCTD 78711 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 184256615 184256836 184256706 Y NA NA CLDN24,CLDN22 IMR90 Hi-C 24141950 CDKN2AIP 106908 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 184270201 184270461 184270317 Y NA NA CLDN24,CLDN22 IMR90 Hi-C 24141950 CDKN2AIP 93283 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 184270914 184271169 184271084 Y NA NA CLDN24,CLDN22 IMR90 Hi-C 24141950 CDKN2AIP 92575 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chr4 184643961 184644129 184644061 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC11 65541 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 184718887 184719489 184719407 Y NA NA ENPP6,CASP3 IMR90 Hi-C 24141950 STOX2 53095 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr4 185115354 185115759 185115584 Y NA NA NA NA NA NA IRF2 277975 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 185189191 185189340 185189323 Y IRF2,CASP3 NA IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111,MLF1IP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2 204394 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr4 185296048 185296446 185296396 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 97288 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 185298493 185298859 185298858 Y NA NA NA NA NA NA IRF2 94875 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 185304654 185305034 185304819 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 88700 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr4 185331771 185332231 185332067 Y NA NA NA NA NA NA IRF2 61503 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 185382837 185383066 185382954 Y NA IRF2 NA NA NA NA IRF2 10668 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 185609676 185609967 185609740 Y NA CASP3 NA NA NA NA CASP3 41013 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 185613623 185613900 185613762 Y CCDC111 CASP3 NA NA NA NA CASP3 44960 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 185771166 185771424 185771307 Y NA ACSL1 LOC731424 K562 ChIA-PET 22265404 ACSL1 25194 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 185781182 185781867 185781492 Y IRF2,ACSL1 ACSL1 NA NA NA NA ACSL1 35210 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 186227102 186227608 186227442 Y NA NA NA NA NA NA LRP2BP 87445 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr4 186495067 186495245 186495187 Y NA PDLIM3 NA NA NA NA PDLIM3 40301 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr4 189048639 189048958 189048819 Y NA RP11-713C19.1,TRIML2,TRIML1,RP11-366H4.1 NA NA NA NA TRIML1 9615 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr4 189101565 189101968 189101694 Y TRIML2 TRIML1,RP11-366H4.1 TRIML1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-366H4.1 22346 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr4 190937232 190937266 190937251 Y NA NA NA NA NA NA FRG1 77289 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 53990 54174 54063 Y PLEKHG4B,C5orf55 CTD-2231H16.1 LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2231H16.1 36092 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.89360603919167 chr5 373695 374160 373984 Y EXOC3 NA NA NA NA NA C5orf55 67098 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.00749194459853 chr5 392668 393182 392808 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 48076 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 395451 395827 395512 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 45431 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 399875 400445 400189 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 40813 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr5 413817 414070 413960 Y NA C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 27188 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 424842 424963 424905 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5 NA NA NA NA C5orf55 16295 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 426647 427011 426980 Y NA C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5 NA NA NA NA C5orf55 14247 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 671573 671920 671762 Y TPPP TPPP NA NA NA NA TPPP 19590 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 672237 672545 672500 Y EXOC3,CEP72 TPPP NA NA NA NA TPPP 18965 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr5 672861 673336 673024 Y NA TPPP NA NA NA NA TPPP 18174 CAGE SAS hg19 FANTOM5 4.90109798379019 chr5 784651 785023 784908 Y ZDHHC11,TPPP NA NA NA NA NA TPPP 93141 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr5 957591 958302 957640 Y NKD2 NKD2 NA NA NA NA NKD2 48642 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 1103805 1104368 1103973 Y LPCAT1,SLC12A7 SLC12A7 NA NA NA NA SLC12A7 5782 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 1129967 1130071 1130019 Y SLC12A7 SLC12A7 BRD9,LOC100506688,TRIP13,SLC12A7,NKD2,SLC6A18,CLPTM1L,MIR4457,ZDHHC11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC12A7 19817 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 1139780 1140172 1139929 Y NA SLC12A7 BRD9,LOC100506688,SLC12A7,TRIP13,ZDHHC11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC12A7 29630 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 1182870 1183091 1183042 Y SLC6A19,SLC6A18 NA LOC100506688,TERT,SLC6A19,TRIP13 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC12A7 72720 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 1503544 1504024 1503726 Y LPCAT1 LPCAT1 NA NA NA NA LPCAT1 18068 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 1522529 1522699 1522639 Y NA LPCAT1 NA NA NA NA LPCAT1 437 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 1536479 1536809 1536604 Y SLC12A7,LPCAT1 LPCAT1 SLC6A3 IMR90 Hi-C 24141950 LPCAT1 14387 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 1930136 1931342 1930853 Y NA CTD-2194D22.3,IRX4 NA NA NA NA IRX4 44786 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.55944026756961 chr5 2669640 2670190 2669944 Y NA NA NA NA NA NA C5orf38 80055 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 2719879 2719902 2719892 Y NA C5orf38,IRX2 NA NA NA NA C5orf38 30343 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 2740702 2741010 2740867 Y NA C5orf38,IRX2 NA NA NA NA C5orf38 9235 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 2758153 2758545 2758351 Y NA C5orf38,IRX2 NA NA NA NA IRX2 7184 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr5 2780518 2780773 2780623 Y NA C5orf38,IRX2 NA NA NA NA IRX2 29549 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr5 3304230 3304631 3304430 Y NA NA NA NA NA NA IRX2 553261 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 3311711 3311862 3311757 Y NA NA NA NA NA NA IRX2 560742 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 5026027 5026363 5026168 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS16 112080 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 5376440 5376820 5376639 Y NA KIAA0947 NA NA NA NA KIAA0947 41957 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA SRD5A1 81417 CAGE SAS hg19 FANTOM5 7.12886979460392 chr5 10229611 10229778 10229690 Y NA FAM173B,CCT5 NA NA NA NA FAM173B 18231 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 10352620 10352938 10352732 Y NA CMBL,MARCH6 NA NA NA NA MARCH6 805 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 10585111 10585259 10585181 Y NA ANKRD33B NA NA NA NA ANKRD33B 22669 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 10601684 10601853 10601839 Y ANKRD33B ANKRD33B NA NA NA NA ANKRD33B 39242 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr5 10632197 10632744 10632366 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD33B 69755 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 11857558 11857701 11857631 Y NA NA NA NA NA NA DAP 1098174 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 14011107 14011342 14011264 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 68455 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 14034644 14034850 14034764 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 91992 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 14035955 14036534 14036234 Y TRIO NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 93303 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr5 14036813 14036909 14036843 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 94161 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr5 14037218 14037324 14037271 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 94566 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 14037561 14037744 14037653 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 94909 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr5 14038478 14038912 14038655 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 95826 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr5 14039774 14040034 14039980 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 97122 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 14107708 14107995 14107845 Y NA TRIO TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIO 33816 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 14108761 14108933 14108800 Y TRIO TRIO TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIO 32878 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 14110836 14111023 14110985 Y NA TRIO TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIO 30788 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 14142332 14142650 14142445 Y NA TRIO NA NA NA NA TRIO 521 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 14142803 14143164 14142969 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 992 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 14154284 14154671 14154327 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 12473 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr5 14174472 14174896 14174531 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 32661 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 14178655 14179133 14178814 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 36844 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 14185691 14186191 14185984 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 43880 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 14186205 14186627 14186374 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 44394 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 14208272 14208510 14208423 Y FAM105B NA NA NA NA NA TRIO 66461 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 14251046 14251256 14251151 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 109235 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 14264855 14265210 14264930 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 123044 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.22777181081372 chr5 14268390 14268821 14268476 Y NA NA NA NA NA NA TRIO 126579 CAGE SAS hg19 FANTOM5 4.78970939324951 chr5 14489488 14489835 14489662 Y NA NA NA NA NA NA FAM105A 90049 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 14639692 14640047 14639871 Y NA EEF1A1P13,FAM105B TRIO,FAM105A IMR90 Hi-C 24141950 EEF1A1P13 11391 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 14666216 14666664 14666270 Y FAM105A,FAM105B EEF1A1P13,FAM105B NA NA NA NA FAM105B 3443 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 14926139 14926359 14926282 Y NA NA FAM105B,ANKH,FAM105A,LOC100130744 IMR90 Hi-C 24141950 ANKH 56252 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 16492574 16492683 16492630 Y FAM134B ZNF622 NA NA NA NA ZNF622 28673 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 16539355 16539674 16539525 Y FAM134B NA NA NA NA NA ZNF622 75454 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 16540564 16540752 16540655 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 74415 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 16698370 16698703 16698671 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 83203 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 16735791 16735955 16735874 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 120624 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 16898106 16898497 16898302 Y MYO10 CTB-55B8.1,MYO10 NA NA NA NA CTB-55B8.1 2253 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 17255490 17256325 17255691 Y BASP1 NA NA NA NA NA RN7SKP133 87400 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 17282496 17282827 17282587 Y BASP1 NA NA NA NA NA RN7SKP133 60898 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 18391290 18391435 18391363 Y NA NA NA NA NA NA RPL36AP21 343631 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 25910581 25911176 25910785 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 721816 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 31894536 31894834 31894609 Y NA NA NA NA NA NA PDZD2 257019 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 32018645 32018923 32018679 Y NA NA NA NA NA NA GOLPH3 153533 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 32592950 32593432 32593186 Y NA NA NA NA NA NA SUB1 63211 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr5 33312073 33312323 33312255 Y NA CTD-2066L21.3 NPR3,LOC340113 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2066L21.3 16057 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 33442170 33442454 33442303 Y NA CTD-2203K17.1,TARS NA NA NA NA TARS 3368 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 34001406 34001643 34001533 Y AMACR AMACR NA NA NA NA AMACR 4577 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 34585438 34585952 34585758 Y RAI14,RAI14 NA RAI14 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAI14 68390 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chr5 34586139 34586737 34586416 Y NA NA RAI14 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAI14 67605 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 34587608 34588326 34587915 Y NA NA RAI14 IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 66016 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 35405015 35405048 35405025 Y NA NA SPEF2 IMR90 Hi-C 24141950 PRLR 176221 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 35853494 35854024 35853833 Y SPEF2,IL7R IL7R SPEF2 IMR90 Hi-C 24141950 IL7R 2697 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 35857994 35858411 35858032 Y IL7R IL7R NA NA NA NA IL7R 7197 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 35859478 35859884 35859711 Y NA IL7R NA NA NA NA IL7R 8681 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 35884312 35884698 35884400 Y NA IL7R NA NA NA NA IL7R 33515 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 35924372 35924674 35924571 Y NA NA NA NA NA NA IL7R 73575 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr5 36030784 36031024 36030904 Y UGT3A2 NA NA NA NA NA LMBRD2 119039 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 36151218 36151404 36151252 Y C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA SKP2 1127 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 36690488 36690876 36690655 Y NIPBL NA NA NA NA NA SLC1A3 86031 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 36898243 36898633 36898363 Y NIPBL NIPBL NA NA NA NA NIPBL 23382 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 37029618 37029862 37029736 Y NA NA NA NA NA NA RPS4XP6 53296 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 37209037 37209204 37209072 Y C5orf42 C5orf42 NA NA NA NA C5orf42 38326 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 37718043 37718447 37718273 Y NA NA NA NA NA NA WDR70 340729 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 38660472 38660667 38660594 Y LIFR NA EGFLAM,LIFR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIFR 54016 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr5 38846956 38846992 38846979 Y OSMR,OSMR CTD-2127H9.1,OSMR NA NA NA NA OSMR 2996 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 38854077 38854436 38854323 Y OSMR,OSMR CTD-2127H9.1,OSMR NA NA NA NA OSMR 10117 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 38866844 38867106 38866976 Y NA CTD-2127H9.1,OSMR NA NA NA NA OSMR 22884 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 38872248 38872554 38872396 Y NA CTD-2127H9.1,OSMR NA NA NA NA OSMR 28288 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 38968924 38969094 38969009 Y NA NA NA NA NA NA RICTOR 103416 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 39072904 39073873 39073587 Y FYB,RICTOR RICTOR NA NA NA NA RICTOR 394 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 39197782 39197949 39197879 Y RICTOR,FYB NA NA NA NA NA FYB 74681 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 39256594 39256894 39256792 Y RICTOR,FYB FYB NA NA NA NA FYB 15736 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr5 39716547 39716931 39716737 Y NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 256145 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 39721328 39721512 39721418 Y NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 260926 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 40384315 40384536 40384395 Y PTGER4,PRKAA1 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 293064 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 40411118 40411409 40411246 Y PTGER4,CARD6 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 266191 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr5 40437600 40437979 40437839 Y PTGER4,CARD6 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 239621 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 40688188 40688473 40688414 Y PRKAA1,PTGER4 PTGER4 NA NA NA NA PTGER4 10588 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 41446274 41446654 41446465 Y NA NA NA NA NA NA OXCT1 421967 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 41845041 41845055 41845050 Y OXCT1,FBXO4 OXCT1 NA NA NA NA OXCT1 23566 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 41856929 41857024 41856977 Y NA OXCT1,C5orf51 NA NA NA NA OXCT1 11597 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 42949793 42950117 42950048 Y ZNF131,C5orf39 NA LOC648987,LOC153684 IMR90 Hi-C 24141950 SEPP1 64299 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 43007637 43008177 43007831 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 8354 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 43010298 43010802 43010620 Y GHR,ZNF131,C5orf39 CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 5729 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 43034859 43034967 43034962 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 LOC648987 MCF7 ChIA-PET 22265404 AC025171.1 4710 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 43061828 43062062 43061945 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA ZNF131 1216 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 43303282 43303485 43303367 Y NA HMGCS1 NA NA NA NA HMGCS1 8129 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 44483168 44483474 44483321 Y NA NA NA NA NA NA RP11-53O19.1 323405 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 44821100 44821499 44821234 Y NA RP11-53O19.1,MRPS30 NA NA NA NA MRPS30 14073 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 49719324 49719499 49719409 Y PARP8 EMB NA NA NA NA EMB 17583 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 52327592 52327905 52327807 Y ITGA2 ITGA2,CTD-2175A23.1 NA NA NA NA CTD-2175A23.1 43484 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 52332019 52332357 52332083 Y FST,ITGA2 ITGA2,CTD-2175A23.1 NA NA NA NA CTD-2175A23.1 47911 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr5 52333334 52333832 52333660 Y NA CTD-2175A23.1 NA NA NA NA CTD-2175A23.1 49226 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 52545484 52545615 52545603 Y ITGA2,FST NA ARL15,FST IMR90 Hi-C 24141950 MOCS2 141591 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 52615248 52615546 52615363 Y ITGA2,FST NA ARL15 IMR90 Hi-C 24141950 FST 158693 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 52619379 52619641 52619531 Y ITGA2,FST NA ARL15 IMR90 Hi-C 24141950 FST 154598 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chr5 52620136 52620468 52620357 Y FST NA ARL15 IMR90 Hi-C 24141950 FST 153771 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 52627320 52627670 52627488 Y ITGA2,FST NA ARL15,FST,NDUFS4 IMR90 Hi-C 24141950 FST 146569 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr5 52629043 52629307 52629159 Y ITGA2,FST NA ARL15,FST IMR90 Hi-C 24141950 FST 144932 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr5 52630176 52630365 52630298 Y NA NA ARL15 IMR90 Hi-C 24141950 FST 143874 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr5 52633703 52633938 52633784 Y ITGA2,FST NA ARL15,FST IMR90 Hi-C 24141950 FST 140301 CAGE SAS hg19 FANTOM5 8.68831006217353 chr5 52636023 52636219 52636115 Y ITGA2,FST NA ARL15,FST IMR90 Hi-C 24141950 FST 138020 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 52656041 52656180 52656111 Y NA NA ARL15,FST IMR90 Hi-C 24141950 FST 118059 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 52656733 52657108 52656801 Y FST NA ARL15 IMR90 Hi-C 24141950 FST 117131 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 52662185 52662487 52662317 Y NA NA ARL15 IMR90 Hi-C 24141950 FST 111752 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 52693799 52694135 52693979 Y NA NA ARL15,LOC257396 IMR90 Hi-C 24141950 FST 80104 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 52714720 52715039 52714904 Y NA NA ARL15 IMR90 Hi-C 24141950 FST 59200 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.11638322027304 chr5 52745223 52745242 52745233 Y NA FST ARL15 IMR90 Hi-C 24141950 FST 28997 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 53460447 53460703 53460575 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 143709 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 53879713 53879860 53879787 Y NA NA SNX18 IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 68124 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 54120977 54121197 54121092 Y NA NA SNX18 IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 309388 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 54132110 54132304 54132199 Y NA NA SNX18,ARL15,HSPB3 IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 320521 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 54722913 54723133 54723024 Y SKIV2L2 NA NA NA NA NA RNF138P1 101396 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 54729958 54730125 54730050 Y SKIV2L2,DDX4 NA NA NA NA NA RNF138P1 94404 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 54741987 54742107 54742028 Y NA NA NA NA NA NA RNF138P1 82422 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 54759780 54760082 54759933 Y NA NA SKIV2L2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF138P1 64447 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 55199167 55199571 55199365 Y NA NA NA NA NA NA IL31RA 53960 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 55287334 55287994 55287973 Y NA IL6ST,CTD-2031P19.3 NA NA NA NA IL6ST 827 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 55289605 55289989 55289924 Y IL6ST IL6ST,CTD-2031P19.3 NA NA NA NA CTD-2031P19.3 610 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 55655118 55655221 55655151 Y NA NA MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC022431.1 143678 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 55786817 55787069 55786944 Y NA AC022431.1 MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC022431.1 11830 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 56468272 56468727 56468348 Y MAP3K1,C5orf35,GPBP1,GPBP1,GPBP1 GPBP1 NA NA NA NA GPBP1 497 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 57111915 57112364 57112128 Y ACTBL2 NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 335279 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 57112814 57113117 57112881 Y ACTBL2 NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 336178 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 57120821 57121296 57121146 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 344185 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 57133445 57133721 57133581 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 356809 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 57137483 57137861 57137645 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 360847 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 57158264 57158637 57158547 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 381628 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 57537303 57537570 57537449 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 PLK2 216517 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 57758033 57758252 57758173 Y NA PLK2 NA NA NA NA PLK2 3946 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 58952543 58952885 58952791 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 863062 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 59041159 59041490 59041319 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 774457 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 59057056 59057135 59057102 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 758812 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 59086263 59086677 59086406 Y PDE4D NA NA NA NA NA PDE4D 729270 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr5 60526663 60526879 60526778 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM6 99221 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 60571773 60571988 60571884 Y ZSWIM6 NA NDUFAF2 IMR90 Hi-C 24141950 ZSWIM6 54112 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 60597691 60598057 60597813 Y NA ZSWIM6 ZSWIM6,C5orf43 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZSWIM6 28043 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 60624078 60624207 60624180 Y ELOVL7,ZSWIM6 ZSWIM6 ZSWIM6 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZSWIM6 1893 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 60626321 60626538 60626370 Y ZSWIM6 ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 221 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 60626678 60627139 60626902 Y ZSWIM6 ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 578 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 60629089 60629454 60629159 Y NA ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 2989 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 60629701 60630027 60629731 Y ZSWIM6 ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 3601 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 60704594 60705129 60704691 Y NA RPL3P6 NA NA NA NA RPL3P6 18896 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 61917589 61917885 61917879 Y NA NA NA NA NA NA CKS1B 111280 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 64062074 64062237 64062149 Y NA SREK1IP1,CWC27 NA NA NA NA SREK1IP1 275 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 64062726 64062917 64062822 Y NA SREK1IP1 NA NA NA NA CWC27 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 64309059 64309061 64309060 Y NA NA NA NA NA NA CWC27 246302 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 64331292 64332267 64331637 Y NA NA NA NA NA NA CWC27 268535 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 64398874 64399506 64398924 Y NA NA ADAMTS6,CWC27,PPWD1,CENPK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CWC27 336117 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 64459611 64459838 64459685 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS6 315909 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 64505244 64505511 64505327 Y ADAMTS6 NA NA NA NA NA ADAMTS6 270236 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 64710773 64711167 64710966 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS6 64580 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 64809602 64809952 64809754 Y NA ADAMTS6,CENPK,PPWD1 NA NA NA NA ADAMTS6 33855 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 65220429 65221204 65220462 Y NA ERBB2IP NA NA NA NA ERBB2IP 126 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 65878342 65878574 65878477 Y MAST4 MAST4 NA NA NA NA MAST4 11602 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 66145750 66145926 66145797 Y NA NA CD180 IMR90 Hi-C 24141950 MAST4-AS1 151855 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 66178568 66178972 66178612 Y NA NA NA NA NA NA MAST4-AS1 118809 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr5 66306628 66307107 66306725 Y NA MAST4-AS1 NA NA NA NA MAST4-AS1 8847 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 66500752 66500937 66500779 Y NA NA MAST4,CD180 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAST4-AS1 202971 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 66502779 66503107 66502965 Y NA NA MAST4,CD180,PIK3R1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAST4-AS1 204998 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 68338463 68338878 68338699 Y NA CTC-498J12.1,SLC30A5 NA NA NA NA CTC-498J12.1 815 CAGE SAS hg19 FANTOM5 5.56942952703431 chr5 71218510 71218673 71218589 Y NA NA NA NA NA NA MAP1B 182388 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 71505945 71506221 71506083 Y NA NA NA NA NA NA MAP1B 104884 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 71659094 71659472 71659166 Y NA PTCD2,MRPS27 NA NA NA NA MRPS27 44621 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 72511984 72512100 72512037 Y FOXD1 NA FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3 IMR90 Hi-C 24141950 FOXD1 230252 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 72512311 72512636 72512493 Y FOXD1 NA FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3 IMR90 Hi-C 24141950 FOXD1 229716 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 72764124 72764182 72764153 Y NA FOXD1,BTF3 FCHO2,TMEM174,FOXD1,BTF3 IMR90 Hi-C 24141950 FOXD1 21772 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 72934554 72934908 72934667 Y RGNEF NA NA NA NA NA ANKRA2 75043 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr5 73330710 73331077 73330894 Y NA NA FAM169A,ENC1 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRA2 471199 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 73611863 73612159 73611974 Y NA NA RGNEF,ENC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEXB 321689 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 73612322 73612454 73612340 Y NA NA RGNEF,ENC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEXB 321394 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr5 73926262 73926632 73926507 Y FAM169A HEXB,ENC1 NA NA NA NA HEXB 7216 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 73965689 73966079 73965884 Y NA HEXB,ENC1 RGNEF IMR90 Hi-C 24141950 ENC1 30440 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 74212679 74213001 74212847 Y NA CTD-2503O16.1 NA NA NA NA CTD-2503O16.1 12486 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 76033105 76033222 76033164 Y IQGAP2 F2R NA NA NA NA F2R 23237 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 76034658 76035100 76034908 Y IQGAP2 F2R NA NA NA NA F2R 24790 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 76086514 76086772 76086643 Y F2R F2RL1 NCRUPAR,F2R,IQGAP2 IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 25986 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 76086859 76087104 76086921 Y F2R,F2RL1 F2RL1 NCRUPAR,F2R,IQGAP2 IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 25654 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 76102045 76102389 76102284 Y F2RL1 F2RL1 F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 10369 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chr5 76103019 76103387 76103332 Y F2RL1 F2RL1 F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 9371 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 76110007 76110333 76110205 Y NA F2RL1 NA NA NA NA F2RL1 2425 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 77374282 77374304 77374295 Y NA NA NA NA NA NA TBCA 211678 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 77792703 77793028 77792954 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 138364 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 77825252 77825732 77825631 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 170913 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 77890894 77891278 77891114 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA CTD-2073O6.1 118627 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 78270986 78271091 78271032 Y NA ARSB NA NA NA NA ARSB 8819 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 79421543 79422183 79421865 Y ZFYVE16,FAM151B NA NA NA NA NA SERINC5 127715 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 79543086 79543324 79543242 Y ZFYVE16,SERINC5 SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 6574 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr5 80260404 80260721 80260547 Y NA NA NA NA NA NA DHFR 311602 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 81465137 81465359 81465307 Y ATP6AP1L NA NA NA NA NA RPS23 107037 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 81653126 81653457 81653257 Y RPS23 NA ATP6AP1L,XRCC4,VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 80730 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.67582348784265 chr5 81655341 81655441 81655346 Y NA NA VCAN,ATP6AP1L,XRCC4 IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 82945 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 81701396 81701769 81701673 Y NA NA VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 129000 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 81702078 81702394 81702360 Y NA NA VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 129682 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 81717066 81717283 81717174 Y NA NA VCAN,ATP6AP1L IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 144670 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 82768927 82769141 82769084 Y VCAN VCAN NA NA NA NA VCAN 3643 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 82769254 82769739 82769524 Y VCAN VCAN NA NA NA NA VCAN 3970 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 82770174 82770695 82770300 Y NA VCAN NA NA NA NA VCAN 4890 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 82807080 82807411 82807109 Y XRCC4,VCAN VCAN NA NA NA NA VCAN 41796 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 86417249 86417398 86417310 Y CCNH,CCNH NA MIR4280 K562 ChIA-PET 22265404 RASA1 144307 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 88609683 88609884 88609784 Y MEF2C NA NA NA NA NA RPS3AP22 933909 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 90673049 90673245 90673226 Y ARRDC3 ARRDC3 NA NA NA NA ARRDC3 3931 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 92593669 92593984 92593827 Y NA NA FLJ42709 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F1 323059 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr5 92914746 92915169 92914912 Y NR2F1 NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 1874 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 95048086 95048445 95048385 Y NA RHOBTB3,CTD-2154I11.2 RHOBTB3,ARSK,SPATA9,RFESD IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOBTB3 860 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 95063779 95063897 95063838 Y NA RHOBTB3,CTD-2154I11.2 NA NA NA NA CTD-2154I11.2 2102 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 95113820 95114121 95113969 Y NA CTD-2154I11.2,GLRX NA NA NA NA GLRX 42588 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 95170754 95171173 95170855 Y GLRX,ELL2 GLRX RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 14045 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 95294794 95295285 95294896 Y ELL2 CTD-2337A12.1,ELL2 NA NA NA NA CTD-2337A12.1 420 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 95295681 95296335 95296056 Y ELL2 NA NA NA NA NA CTD-2337A12.1,ELL2 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 95403711 95404019 95403912 Y ELL2 NA ELL2,CAST,MIR583,C5orf27 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ELL2 107936 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 95555701 95555931 95555845 Y NA NA ELL2,RHOBTB3 IMR90 Hi-C 24141950 ELL2 259926 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 95986710 95987017 95986807 Y CAST,CAST NA CAST IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CAST 127739 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 96022483 96022592 96022538 Y NA NA NA NA NA NA ERAP1 119211 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 96159684 96160037 96159828 Y CAST,CAST ERAP1,ERAP2 CAST,RIOK2,ERAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERAP1 17881 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 98262747 98263243 98263080 Y CHD1 NA NA NA NA NA CTD-2007H13.3 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 99382569 99383254 99382906 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 485712 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 102091646 102092087 102091846 Y NA PAM NA NA NA NA PAM 3961 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr5 102304978 102305194 102305031 Y NA NA NA NA NA NA PPIP5K2 148659 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 105733568 105733839 105733591 Y NA NA EFNA5 IMR90 Hi-C 24141950 EFNA5 1270757 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 106802102 106802350 106802226 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 202246 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr5 106803068 106803432 106803267 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 201164 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 106805205 106805528 106805416 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 199068 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr5 106806041 106806198 106806107 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 198398 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 106823409 106823505 106823457 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 181091 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 106855785 106855959 106855826 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 148637 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 106878561 106878904 106878854 Y EFNA5 NA NA NA NA NA EFNA5 125692 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 106900103 106900354 106900202 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 104242 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 106907307 106907511 106907485 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 97085 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 106931094 106931453 106931417 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 73143 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 106967635 106967784 106967710 Y NA EFNA5 NA NA NA NA EFNA5 36812 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 107004755 107005118 107004922 Y NA EFNA5 NA NA NA NA EFNA5 159 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 107272988 107273215 107273140 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 268392 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 108170397 108170414 108170406 Y FER NA NA NA NA NA FER 88874 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 108329034 108329385 108329210 Y NA NA NA NA NA NA FER 247511 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 108791627 108791782 108791705 Y NA PJA2 PJA2 IMR90 Hi-C 24141950 PJA2 47932 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 109207541 109207704 109207623 Y NA NA NA NA NA NA MAN2A1 184474 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 110865894 110866475 110866210 Y STARD4 STARD4 NA NA NA NA STARD4 19606 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 111502817 111502914 111502867 Y C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,EPB41L4A EPB41L4A-AS1 NA NA NA NA EPB41L4A-AS1 8594 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 112218687 112219263 112218745 Y APC SRP19,REEP5 NA NA NA NA SRP19 23768 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 112242412 112242755 112242610 Y NA SRP19,REEP5 NA NA NA NA REEP5 13481 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 112251574 112251628 112251601 Y NA REEP5 NA NA NA NA REEP5 4608 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 112602603 112602927 112602766 Y MCC,MCC NA NA NA NA NA MCC 219600 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 112628840 112629057 112628905 Y MCC,MCC NA NA NA NA NA MCC 193470 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 112629156 112629538 112629463 Y NA NA NA NA NA NA MCC 192989 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 114847596 114847935 114847760 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 30656 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 114848957 114849251 114849109 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 29340 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 118610393 118610883 118610628 Y DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8 TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 8006 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 118703348 118703546 118703439 Y NA NA NA NA NA NA HSD17B4 82592 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 119940626 119940961 119940736 Y NA NA NA NA NA NA PRR16 142653 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 121435613 121435728 121435671 Y NA LOX ZNF474,LOC100505841,LOX,SRFBP1 IMR90 Hi-C 24141950 LOX 23633 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 121499580 121499890 121499735 Y NA NA NA NA NA NA LOX 87600 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 121506435 121506655 121506507 Y NA NA NA NA NA NA LOX 94455 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 121516793 121517196 121516968 Y LOX,LOX NA NA NA NA NA LOX 104813 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 122690309 122690381 122690346 Y NA NA NA NA NA NA CEP120 66905 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 124006979 124007355 124007057 Y NA NA NA NA NA NA ZNF608 75145 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 124085012 124085124 124085092 Y NA ZNF608 ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 2512 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 125690030 125690185 125690123 Y GRAMD3,GRAMD3 GRAMD3 GRAMD3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GRAMD3 3639 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 125704201 125704675 125704554 Y C5orf48 GRAMD3 NA NA NA NA GRAMD3 10377 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 125782209 125782552 125782386 Y NA NA NA NA NA NA GRAMD3 88385 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 126478879 126479210 126479043 Y NA NA NA NA NA NA C5orf63 71695 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 126847905 126848122 126848004 Y NA PRRC1 PRRC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 PRRC1 3179 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 130750368 130750574 130750471 Y CDC42SE2,RAPGEF6 NA NA NA NA NA CDC42SE2 171182 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 130976279 130976499 130976398 Y FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6 RAPGEF6 NA NA NA NA RAPGEF6 7350 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 131074214 131074509 131074363 Y NA NA NA NA NA NA FNIP1 56201 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 131108111 131108375 131108174 Y NA FNIP1 NA NA NA NA FNIP1 22335 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 131430055 131430830 131430575 Y RAPGEF6,FNIP1,SLC22A4,IRF1 CSF2 NA NA NA NA CSF2 22572 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 131560740 131561286 131561173 Y IL3,CSF2,PDLIM4,P4HA2,P4HA2 PDLIM4 NA NA NA NA PDLIM4 30078 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 131594769 131595694 131595371 Y PDLIM4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA PDLIM4 3405 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 131595834 131595951 131595900 Y KIF3A,PDLIM4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA PDLIM4 4470 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 131601385 131601782 131601639 Y P4HA2 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA PDLIM4 10021 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 131629178 131629624 131629352 Y FNIP1,IRF1,SLC22A4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 170 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 131763102 131763516 131763179 Y SLC22A4,IRF1 C5orf56,AC116366.5,AC116366.6 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 AC116366.5 2696 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 131763542 131763915 131763870 Y SLC22A4,IRF1 C5orf56,AC116366.5,AC116366.6 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 AC116366.5 3136 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 132323487 132323535 132323508 Y NA AFF4,AC010240.3,ZCCHC10 NA NA NA NA AC010240.3 1685 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 132576270 132576709 132576388 Y AFF4,ZCCHC10 NA NA NA NA NA HSPA4 190616 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 133435759 133436442 133436277 Y PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7 TCF7 TCF7,SKP1 IMR90 Hi-C 24141950 TCF7 11960 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr5 133460352 133460406 133460379 Y UBE2B,PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7 TCF7 NA NA NA NA TCF7 11950 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 133775971 133776293 133776132 Y NA CDKN2AIPNL PHF15,SKP1,UBE2B,CDKN2AIPNL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 30382 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 133802349 133802592 133802584 Y PPP2CA,SEC24A,UBE2B AC005355.2 PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC005355.2 37651 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 133839310 133839404 133839346 Y NA AC005355.2 PHF15,PPP2CA,CDKL3,CDKN2AIPNL,SAR1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC005355.2 839 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr5 133847692 133847829 133847767 Y NA AC005355.2 PHF15,CDKN2AIPNL,CDKL3,UBE2B,SKP1,PPP2CA IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC005355.2 7449 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 133863130 133863560 133863438 Y NA AC005355.2 NA NA NA NA AC005355.2 22887 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 133890161 133890536 133890268 Y TCF7,PPP2CA,CDKL3,UBE2B,SEC24A,CAMLG,PHF15 AC005355.2 NA NA NA NA AC005355.2 49918 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 133891612 133892163 133891823 Y PPP2CA,UBE2B,SEC24A NA NA NA NA NA AC005355.2 51369 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461 NA NA NA NA MTND5P11 246 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11 NA NA NA NA MTND4P12,MIR4461 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 134469772 134469821 134469797 Y C5orf20 NA PCBD2,LOC340073,PITX1,CATSPER3,H2AFY IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTC-276P9.1 96035 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 134471631 134472059 134471710 Y C5orf20,PITX1 NA PCBD2,LOC340073,CATSPER3,H2AFY,PITX1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTC-276P9.1 97894 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 134602658 134602833 134602747 Y NA NA H2AFY,LOC340073,CATSPER3 IMR90 Hi-C 24141950 H2AFY 130771 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 134727973 134728292 134728105 Y H2AFY H2AFY NA NA NA NA H2AFY 5312 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 135335114 135335504 135335269 Y NA TGFBI TGFBI,VTRNA2-1,FBXL21 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBI 27080 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 135341804 135342193 135341990 Y FBXL21,TGFBI TGFBI TGFBI,VTRNA2-1,FBXL21 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBI 20391 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 135353008 135353244 135353057 Y NA TGFBI VTRNA2-1,TGFBI IMR90 Hi-C 24141950 TGFBI 9340 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 135356057 135356513 135356322 Y NA TGFBI VTRNA2-1,TGFBI,FBXL21,LECT2,SMAD5 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBI 6071 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 135416297 135416409 135416350 Y NA NA NA NA NA NA SMAD5 50125 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 136478407 136478752 136478599 Y NA NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 287090 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 136482104 136482426 136482383 Y SPOCK1 NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 290787 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr5 137075973 137076263 137076118 Y NA HNRNPA0 NA NA NA NA HNRNPA0 11776 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 137799770 137800154 137799916 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 591 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 137800317 137800564 137800421 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 1138 CAGE SAS hg19 FANTOM5 7.68581274730735 chr5 137815410 137815785 137815600 Y BRD8,HSPA9 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 16231 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 137826508 137826985 137826545 Y NA EGR1 NA NA NA NA EGR1 27329 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 137827710 137828119 137827817 Y EGR1 EGR1,ETF1 NA NA NA NA EGR1 28531 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 138620359 138620541 138620439 Y UBE2D2,MATR3 MATR3,SIL1 NA NA NA NA SIL1 6705 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 138786651 138786712 138786682 Y NA SPATA24,DNAJC18 NA NA NA NA DNAJC18 8471 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 138897527 138897822 138897662 Y MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2 TMEM173,UBE2D2 DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2D2 6194 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 138965572 138965797 138965632 Y NA NA NA NA NA NA CXXC5 59087 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 139022530 139022885 139022670 Y NA CXXC5 CXXC5 IMR90 Hi-C 24141950 CXXC5 1999 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 139031397 139032095 139031636 Y C5orf53,PSD2,NRG2,CXXC5 CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 6513 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 139040519 139041115 139040855 Y PAIP2 CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 15635 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 139046727 139046903 139046804 Y NA CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 21843 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 139077054 139077268 139077188 Y CXXC5 NA NA NA NA NA CXXC5 52170 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 139078128 139078514 139078502 Y C5orf53,DNAJC18,CXXC5,NRG2,PSD2 NA NA NA NA NA CXXC5 53244 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 139167686 139167904 139167758 Y NA NA CXXC5,UBE2D2,DNAJC18,NRG2,PSD2,CYSTM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXXC5 142802 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 139464204 139464218 139464211 Y NA NRG2,PURA CYSTM1,NRG2 IMR90 Hi-C 24141950 PURA 21144 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 139631101 139631601 139631302 Y SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 49105 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 139633683 139634086 139633757 Y SRA1,IK,HBEGF,EIF4EBP3,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 46620 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 139636160 139636260 139636251 Y SRA1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 44446 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr5 139638984 139639383 139639269 Y C5orf32,ZMAT2,SRA1,IK,HARS2,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 41323 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 139690215 139690793 139690721 Y NA PFDN1,HBEGF NA NA NA NA PFDN1 9509 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 139724210 139724515 139724457 Y SRA1,CD14,CD14,APBB3,HBEGF,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA HBEGF 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 139782360 139782578 139782471 Y NA ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3 NA NA NA NA ANKHD1-EIF4EBP3 2867 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 140090601 140091006 140090806 Y NA WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3 NA NA NA NA VTRNA1-1 1741 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 140098281 140098628 140098472 Y NA HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3 NA NA NA NA VTRNA1-3 5115 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr5 140875639 140876085 140875835 Y PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1 PCDHGC3,PCDHGC4 NA NA NA NA PCDHGC4 12898 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 140893513 140893891 140893828 Y PCDH12,KIAA0141,DIAPH1 PCDHGC3,PCDHGC4 NA NA NA NA PCDHGC4 30772 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 140894023 140894210 140894163 Y NA PCDHGC3,PCDHGC4 NA NA NA NA PCDHGC4 31282 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 140900821 140901187 140900923 Y PCDH12,KIAA0141,DIAPH1 PCDHGC3,PCDHGC4 NA NA NA NA PCDHGC4 38080 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 140910138 140910894 140910494 Y NA PCDHGC4 NA NA NA NA PCDHGC4 47397 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 141256552 141256862 141256814 Y PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1,PCDH1 KIAA0141 NA NA NA NA PCDH1 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 141404371 141404781 141404694 Y DIAPH1,FCHSD1 GNPDA1 GNPDA1,NDFIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNPDA1 13765 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 141736379 141736797 141736670 Y ARHGAP26 SPRY4 NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPRY4 32359 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 141851932 141852283 141852109 Y NA NA SPRY4,GNPDA1,NDFIP1,FGF1,RNF14 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY4 147912 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 142221928 142222177 142222053 Y ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 73979 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 142388287 142389194 142388887 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 240338 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 142623562 142623962 142623719 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P21 86208 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 142808754 142808879 142808817 Y NR3C1,NR3C1 NR3C1 NA NA NA NA NR3C1 4198 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 142974978 142975222 142975128 Y NR3C1,NR3C1 NA ARHGAP26,NR3C1,KCTD16,YIPF5,HMHB1 IMR90 Hi-C 24141950 NR3C1 161901 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 143300463 143300651 143300509 Y NA NA ARHGAP26,NR3C1 IMR90 Hi-C 24141950 YIPF5 247627 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr5 145166780 145167167 145167131 Y GRXCR2 PRELID2 NA NA NA NA PRELID2 45765 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 145498086 145498488 145498483 Y NA NA NA NA NA NA LARS 61735 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 146151261 146151436 146151381 Y PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B NA NA NA NA NA KRT8P48 66098 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 146200379 146200464 146200463 Y PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B NA NA NA NA NA KRT8P48 115216 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 146242419 146242610 146242553 Y NA NA NA NA NA NA KRT8P48 157256 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 146242854 146243152 146243003 Y GPR151,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B NA NA NA NA NA KRT8P48 157691 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 147565828 147566233 147565944 Y FBXO38 NA NA NA NA NA FBXO38 195265 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 147722722 147723108 147722793 Y SPINK14,SPINK7 FBXO38 NA NA NA NA FBXO38 38390 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 147777538 147777934 147777556 Y NA FBXO38 NA NA NA NA FBXO38 16040 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 148185507 148185821 148185751 Y FBXO38,ADRB2 ADRB2 SH3TC2,ABLIM3 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 18335 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 148230110 148230196 148230153 Y NA ADRB2 NA NA NA NA ADRB2 25954 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 148290314 148290586 148290452 Y NA NA SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 86158 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr5 148292484 148292904 148292843 Y NA NA SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 88328 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr5 148293572 148293925 148293745 Y NA NA SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 89416 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.78471476351716 chr5 148300139 148300552 148300446 Y NA NA SH3TC2,AFAP1L1,ADRB2 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 95983 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 148336270 148336420 148336344 Y NA NA ADRB2,ABLIM3,SH3TC2 IMR90 Hi-C 24141950 SH3TC2 104306 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr5 148349939 148350092 148350025 Y NA NA NA NA NA NA SH3TC2 90634 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 148352583 148352893 148352766 Y ADRB2 NA NA NA NA NA SH3TC2 87833 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 148505231 148505419 148505389 Y NA ABLIM3 ADRB2,AFAP1L1,ABLIM3,SH3TC2 IMR90 Hi-C 24141950 ABLIM3 13627 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 149110531 149110757 149110649 Y PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2670 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 149110836 149111455 149111198 Y ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2975 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 149317888 149318128 149317985 Y CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3 SLC26A2 NA NA NA NA SLC26A2 20172 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 149318595 149318961 149318771 Y CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3 SLC26A2 NA NA NA NA SLC26A2 19339 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 149319494 149320025 149319793 Y CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3 SLC26A2 NA NA NA NA SLC26A2 18275 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 149339062 149339484 149339111 Y CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3 SLC26A2,HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA SLC26A2 762 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 149696810 149697163 149696894 Y SYNPO,PDGFRB ARSI,TCOF1 SLC6A7,TCOF1,HMGXB3,CSF1R,CD74,PPARGC1B,PDGFRB,CDX1,ARSI,CAMK2A,RPS14,NDST1,TIGD6 IMR90 Hi-C 24141950 ARSI 19707 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 149945724 149945760 149945742 Y SYNPO,ZNF300 SYNPO NA NA NA NA SYNPO 32882 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 149979570 149980059 149979818 Y NA SYNPO NA NA NA NA SYNPO 928 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 149985154 149985492 149985203 Y NA SYNPO NA NA NA NA SYNPO 6512 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 150167184 150167440 150167321 Y CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,C5orf62 DCTN4 NA NA NA NA DCTN4 30513 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 150169826 150170319 150169982 Y CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62 DCTN4 NA NA NA NA DCTN4 33155 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 150462985 150463261 150463131 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 7877 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 150873344 150873758 150873456 Y NA NA NA NA NA NA SLC36A1 58737 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 151017311 151017607 151017366 Y FAT2 SPARC SLC36A1,FAT2,ATOX1 IMR90 Hi-C 24141950 SPARC 47119 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 151108065 151108456 151108379 Y NA SPARC,RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1 NA NA NA NA RP11-54C4.1 35483 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 151129219 151129502 151129338 Y SLC36A1 RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1 NA NA NA NA RP11-54C4.1 14437 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 151200780 151201112 151200835 Y GLRA1 NA NA NA NA NA ATOX1 50687 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 151213355 151213633 151213423 Y NA NA NA NA NA NA ATOX1 63262 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 151470527 151470867 151470697 Y NA NA NA NA NA NA ATOX1 320434 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 152822087 152822411 152822258 Y NA NA GRIA1 IMR90 Hi-C 24141950 MFAP3 594055 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 153990009 153990256 153990067 Y NA NA GRIA1,FAM114A2,MFAP3,GALNT10,FLJ38109,SAP30L,HAND1,C5orf4 IMR90 Hi-C 24141950 LARP1 100206 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 154062607 154063000 154062805 Y GEMIN5 LARP1 LARP1,C5orf4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LARP1 27462 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr5 154205315 154205569 154205444 Y KIF4B,GEMIN5 CNOT8 NA NA NA NA CNOT8 29544 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 154871450 154872048 154871744 Y KIF4B NA NA NA NA NA MRPL22 552820 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 157257409 157257732 157257678 Y NA CLINT1 NA NA NA NA CLINT1 26451 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 157521038 157521096 157521067 Y NA NA EBF1 IMR90 Hi-C 24141950 CLINT1 236855 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 158611896 158612266 158612182 Y IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145 CTB-11I22.1,RNF145 NA NA NA NA CTB-11I22.1 22663 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 158876999 158877252 158877089 Y NA NA NA NA NA NA UBLCP1 188910 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 159402452 159402764 159402629 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 31356 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 159414162 159414427 159414404 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 19693 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 159592107 159592427 159592336 Y NA PWWP2A TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PWWP2A 47677 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 159637065 159637397 159637293 Y FABP6 RP11-34P1.2 NA NA NA NA RP11-34P1.2 45863 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 159815159 159815328 159815245 Y NA CCNJL,C5orf54,SLU7,PTTG1 NA NA NA NA C5orf54 9776 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 162483984 162483999 162483992 Y NA NA NA NA NA NA RP11-541P9.3 378333 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 162811410 162811429 162811421 Y NA NA NA NA NA NA RP11-541P9.3 50903 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 164057443 164057448 164057446 Y NA NA NA NA NA NA MAT2B 1129323 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 167126470 167126930 167126675 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 589726 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr5 167157088 167157552 167157214 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 559104 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr5 167171330 167171561 167171437 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 545095 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr5 167224919 167225220 167225022 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 491436 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 167230041 167230378 167230210 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 486278 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 167241894 167242222 167242118 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 474434 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.78221744865098 chr5 167243466 167243587 167243564 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 473069 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr5 167243967 167244280 167244072 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 472376 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 167327544 167327856 167327700 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 388800 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 167343894 167343960 167343927 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 372696 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 167372516 167372785 167372694 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 343871 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr5 167716783 167717259 167717053 Y NA WWC1 NA NA NA NA WWC1 127 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 167741798 167742197 167741960 Y WWC1 WWC1 NA NA NA NA WWC1 25142 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr5 167744761 167745078 167744891 Y WWC1 WWC1 NA NA NA NA WWC1 28105 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr5 167752204 167752623 167752553 Y PANK3 WWC1 RARS IMR90 Hi-C 24141950 WWC1 35548 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 168472035 168472299 168472205 Y NA NA NA NA NA NA SLIT3 253834 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 169398141 169398453 169398335 Y NA FAM196B NA NA NA NA FAM196B 7291 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 169404223 169404546 169404350 Y FAM196B FAM196B NA NA NA NA FAM196B 1198 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 170060615 170060931 170060764 Y RANBP17 NA NA NA NA NA GABRP 127423 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 170179191 170179549 170179383 Y GABRP GABRP NA NA NA NA GABRP 8805 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 171135787 171136029 171135908 Y NA NA FGF18 IMR90 Hi-C 24141950 FGF18 291127 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 171432610 171432692 171432660 Y NA FBXW11 NA NA NA NA FBXW11 733 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 171529769 171530204 171529991 Y NA NA NA NA NA NA STK10 83186 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 171540284 171540310 171540295 Y STK10 NA NA NA NA NA STK10 73080 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 171600987 171601129 171601000 Y STK10 STK10 NA NA NA NA STK10 12261 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 171668306 171668431 171668369 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 40644 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 171681735 171682053 171681977 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 27022 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 171709316 171709633 171709569 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 241 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 171788471 171789086 171788773 Y DUSP1,STK10,UBTD2 NA NA NA NA NA UBTD2 79396 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 172160417 172160946 172160788 Y ATP6V0E1 DUSP1 ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 35252 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr5 172167900 172168183 172168030 Y UBTD2,DUSP1 DUSP1 ERGIC1,DUSP1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 28015 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 172192263 172193766 172192583 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2432 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 172193800 172194232 172193914 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 1966 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 172198749 172199959 172199636 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2551 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 172202171 172203025 172202666 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 5973 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 172205264 172205447 172205353 Y UBTD2,C5orf41,DUSP1 DUSP1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,ATP6V0E1,RPL26L1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP1 9066 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr5 172208951 172208972 172208964 Y UBTD2 DUSP1 ERGIC1,DUSP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 12753 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 172228151 172228566 172228394 Y DUSP1 DUSP1,ERGIC1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERGIC1 30712 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 172234136 172234644 172234380 Y NA DUSP1,ERGIC1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERGIC1 24634 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 172288216 172288483 172288386 Y DUSP1,C5orf41,ERGIC1 ERGIC1 NA NA NA NA ERGIC1 28938 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 172327024 172327318 172327167 Y NA NA NA NA NA NA RPL26L1 56414 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 172329840 172330200 172330006 Y DUSP1,C5orf41,ATP6V0E1,ERGIC1 NA NA NA NA NA RPL26L1 53532 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 173193377 173193650 173193560 Y NA NA CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 119633 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 173346462 173346760 173346662 Y NA CPEB4 NA NA NA NA CPEB4 33179 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 173909800 173909986 173909867 Y NA NA MIR4634,MSX2 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 596517 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 176250127 176250448 176250189 Y GPRIN1,SNCB,EIF4E1B,NSD1,UNC5A NA NA NA NA NA TSPAN17 177739 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 176808266 176808459 176808400 Y PRR7,DBN1,PRELID1 LMAN2,RGS14,GRK6 NA NA NA NA GRK6 19746 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 176856256 176856655 176856453 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,NSD1,RAB24,RGS14,FAM193B,GRK6,PRR7,DOK3,DOK3 GRK6,PRR7,PRR7-AS1,DBN1 NA NA NA NA PRR7 14791 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 176973275 176973657 176973542 Y NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3 DDX41,FAM193B,TMED9 NA NA NA NA FAM193B 5885 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 177041998 177042331 177042024 Y NSD1 TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 16897 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 177607687 177607881 177607743 Y NA NHP2,HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 21627 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 177645267 177645446 177645363 Y N4BP3,CLK4,AGXT2L2 HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 15759 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr5 177647239 177647603 177647383 Y CLK4,AGXT2L2 HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 17731 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr5 178052813 178053238 178053128 Y AGXT2L2,CLK4 CLK4 COL23A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLK4 2378 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 178069436 178069827 178069736 Y NA CLK4 ZFP2,COL23A1,ZNF879,AACSP1,GRM6 IMR90 Hi-C 24141950 CLK4 13820 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 179188972 179189165 179189138 Y NA MAML1,SQSTM1,MGAT4B NA NA NA NA MAML1 31121 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr5 180285670 180285966 180285744 Y NA MGAT1,LINC00847,ZFP62 NA NA NA NA ZFP62 320 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr5 180615864 180616079 180615972 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 845 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr5 180634441 180634803 180634658 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM7 4148 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 290595 290748 290658 Y IRF4,DUSP22 DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 965 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 297557 297773 297630 Y DUSP22 DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 7927 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 440153 440531 440212 Y NA NA IRF4 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP22 150523 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 710742 711015 710979 Y HUS1B EXOC2 NA NA NA NA EXOC2 19625 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 711154 711526 711478 Y DUSP22,EXOC2 EXOC2 NA NA NA NA EXOC2 20037 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 1131986 1132306 1132130 Y NA NA LOC285768 IMR90 Hi-C 24141950 FOXQ1 178369 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 1311552 1311897 1311757 Y NA FOXQ1 NA NA NA NA FOXQ1 877 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 1702305 1702315 1702310 Y NA NA NA NA NA NA FOXC1 93624 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 1953013 1953362 1953197 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 290564 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 2330490 2330806 2330587 Y NA NA NA NA NA NA GMDS-AS1 86508 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 2790944 2791090 2791014 Y NA WRNIP1,SERPINB1 SERPINB1 IMR90 Hi-C 24141950 WRNIP1 27296 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 2818084 2818421 2818253 Y SERPINB9 SERPINB1 NA NA NA NA SERPINB1 21819 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 2877769 2878087 2877933 Y SERPINB9,NQO2,SERPINB1 SERPINB1,SERPINB9 NA NA NA NA SERPINB9 23427 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 2901720 2902211 2901908 Y NA SERPINB9 MGC39372,MIR4645,SERPINB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERPINB9 206 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 3209395 3209963 3209634 Y SERPINB9 PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA PSMG4 19674 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 3238745 3238826 3238788 Y NA PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 8781 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 3254273 3254642 3254472 Y SLC22A23 PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 24309 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 3259939 3260435 3260206 Y NA PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 29975 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 3356099 3356749 3356628 Y NA NA NA NA NA NA SLC22A23 98507 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 3403581 3403822 3403689 Y BPHL,SLC22A23 NA NA NA NA NA SLC22A23 51434 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 3511713 3512018 3511866 Y NA NA PXDC1,SLC22A23 IMR90 Hi-C 24141950 SLC22A23 56457 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 3592685 3593043 3592856 Y NA NA SLC22A23 IMR90 Hi-C 24141950 SLC22A23 137429 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 3826272 3826513 3826435 Y C6orf145 FAM50B SLC22A23,TUBB2B IMR90 Hi-C 24141950 FAM50B 21107 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 4317088 4317563 4317434 Y CDYL NA RPP40,CDYL,LYRM4 IMR90 Hi-C 24141950 ECI2 183257 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 4358823 4359231 4358978 Y CDYL NA CDYL,RPP40 IMR90 Hi-C 24141950 ECI2 224992 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 4990656 4990905 4990781 Y NA RPP40 NA NA NA NA RPP40 11392 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 5660943 5661332 5661178 Y NA NA NA NA NA NA FARS2 401666 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 5966118 5966226 5966172 Y NA NA NA NA NA NA FARS2 706841 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 6467672 6467854 6467760 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 637976 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 6687140 6687567 6687361 Y NA NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 418263 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 6803868 6804205 6804018 Y RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 301625 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 6811454 6812228 6812086 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 293602 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 6856813 6857789 6856950 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 248041 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 7058764 7058925 7058840 Y DSP RREB1 RREB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RREB1 46905 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 7174134 7174405 7174138 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 68304 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 7261407 7261720 7261663 Y NA NA NA NA NA NA RP11-69L16.5 76081 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 7528818 7529102 7528955 Y NA DSP CAGE1,RIOK1,DSP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DSP 10706 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 7618671 7618993 7618833 Y NA SNRNP48 NA NA NA NA SNRNP48 30239 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr6 9503675 9503928 9503802 Y NA NA NA NA NA NA TFAP2A 913964 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 9516527 9516706 9516607 Y NA NA LOC100130275,TFAP2A,LINC00518 IMR90 Hi-C 24141950 TFAP2A 901186 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 10355646 10355875 10355765 Y NA NA NA NA NA NA TFAP2A 62017 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 10383571 10383981 10383824 Y TFAP2A,TFAP2A TFAP2A,LINC00518 NA NA NA NA TFAP2A 33911 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 10403752 10404250 10404030 Y TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A,LINC00518 NA NA NA NA TFAP2A 13642 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr6 10407698 10407754 10407725 Y PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A,LINC00518 NA NA NA NA TFAP2A 10138 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 10441526 10441791 10441655 Y TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,GCNT2,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A,LINC00518 NA NA NA NA LINC00518 8419 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr6 10458287 10458428 10458359 Y NA TFAP2A,LINC00518 NA NA NA NA LINC00518 25180 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 11139608 11139936 11139820 Y TMEM170B,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 240645 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 11144047 11144288 11144135 Y TMEM170B,C6orf52,NEDD9,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 236293 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr6 11170049 11170298 11170253 Y NA NA NA NA NA NA NEDD9 210283 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 11197003 11197299 11197017 Y ERVFRD-1,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 183282 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 11210069 11210603 11210460 Y NA NA NA NA NA NA NEDD9 169978 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 11229489 11229708 11229675 Y TMEM170B,MAK,ELOVL2,NEDD9,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 150873 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 11316345 11316699 11316437 Y TMEM170B,NEDD9,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 63882 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 11318376 11319012 11318732 Y TMEM170B,MAK,LOC221710,NEDD9,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 61569 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr6 11342197 11342524 11342271 Y TMEM170B,NEDD9,NEDD9 NEDD9 NA NA NA NA NEDD9 38057 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 11344526 11344935 11344784 Y TMEM170B,NEDD9 NEDD9 NA NA NA NA NEDD9 35646 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr6 11414898 11415336 11414989 Y TMEM170B,NEDD9 NEDD9 NEDD9,C6orf228 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD9 34317 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 11713061 11713450 11713265 Y NEDD9,NEDD9,TMEM170B,HIVEP1 NA NA NA NA NA TMEM170B 177123 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 11769423 11769725 11769659 Y HIVEP1 NA NA NA NA NA TMEM170B 233485 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 11772710 11773287 11772940 Y NEDD9,TMEM170B,HIVEP1 NA NA NA NA NA HIVEP1 233708 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 12183004 12183212 12183108 Y HIVEP1,EDN1 NA NA NA NA NA EDN1 105384 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 12287477 12287842 12287503 Y NA EDN1 TMEM170B,ADTRP,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 754 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 12288026 12288260 12288136 Y NA EDN1 NA NA NA NA EDN1 336 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 12324386 12324755 12324542 Y NA EDN1 EDN1 MCF7 ChIA-PET 22265404 EDN1 35790 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr6 12328741 12329205 12329092 Y NA EDN1 EDN1 MCF7 ChIA-PET 22265404 EDN1 40145 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 12472967 12473281 12473124 Y NA RPL15P3 NA NA NA NA RPL15P3 39061 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 12484193 12484504 12484246 Y EDN1 RPL15P3 EDN1,TMEM170B,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL15P3 27838 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr6 12577591 12578036 12577836 Y NA NA EDN1,TMEM170B IMR90 Hi-C 24141950 RPL15P3 65249 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr6 12592849 12593177 12593094 Y EDN1 NA TMEM170B,EDN1,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL15P3 80507 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 13302642 13303798 13303216 Y GFOD1,GFOD1,TBC1D7 TBC1D7 NA NA NA NA TBC1D7 23017 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 13602068 13602103 13602086 Y NA SIRT5,NOL7 NA NA NA NA NOL7 11456 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 13636617 13636971 13636795 Y TBC1D7,GFOD1,CD83 NOL7 NA NA NA NA NOL7 23058 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 14217203 14217412 14217308 Y CD83 NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 101331 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 14271187 14271701 14271310 Y CD83 NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 155315 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 14733801 14734229 14733883 Y NA NA DTNBP1,JARID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JARID2 510298 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 15062704 15063082 15062942 Y JARID2 NA JARID2,DTNBP1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JARID2 181445 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 15063756 15063967 15063834 Y JARID2 NA JARID2,DTNBP1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JARID2 180560 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 15066743 15067555 15067031 Y NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JARID2 176972 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 16151584 16151748 16151704 Y NA MYLIP NA NA NA NA MYLIP 24228 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 16181886 16182201 16182062 Y NA NA DTNBP1,MYLIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYLIP 54530 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 16420932 16421664 16421198 Y MYLIP,ATXN1 NA NA NA NA NA GMPR 184121 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 16481404 16481763 16481500 Y MYLIP,ATXN1 NA NA NA NA NA GMPR 244593 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 16488193 16488587 16488526 Y MYLIP NA NA NA NA NA GMPR 251382 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 16724246 16724395 16724344 Y ATXN1 RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 34974 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 16741302 16741617 16741570 Y NA RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 17752 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 17864491 17864751 17864619 Y NA NA NA NA NA NA KIF13A 121103 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 18343795 18344357 18344138 Y RNF144B RNF144B RNF144B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNF144B 22422 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 18350965 18351333 18351089 Y KDM1B,RNF144B RNF144B NA NA NA NA RNF144B 15446 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 18405939 18406237 18405987 Y KIF13A,KDM1B,RNF144B RNF144B NA NA NA NA RNF144B 39160 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 20404913 20405227 20404970 Y MBOAT1 E2F3 NA NA NA NA E2F3 4515 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 20418274 20418752 20418425 Y NA E2F3 NA NA NA NA E2F3 17876 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 20444927 20445761 20445060 Y MBOAT1 E2F3 NA NA NA NA E2F3 44529 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 20811412 20811642 20811580 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 278724 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 20877706 20877968 20877723 Y CDKAL1 NA NA NA NA NA CDKAL1 345018 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 21022706 21023638 21022736 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 490018 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr6 21264288 21264471 21264361 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 327501 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 21587723 21589288 21589205 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2684 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 21589338 21589711 21589681 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2261 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 22181735 22182137 22181931 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 589763 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 22222867 22222924 22222901 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 630895 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 22892698 22893030 22892864 Y NA NA SOX4,LINC00340,LOC729177 IMR90 Hi-C 24141950 SOX4 1300726 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2 NA NA NA NA HIST1H1A 22967 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.78471476351716 chr6 26016753 26016987 26016816 Y HIST1H1A HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H1A 713 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 26126352 26126787 26126533 Y HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E HFE,HIST1H4C,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD NA NA NA NA HIST1H2AC 3979 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr6 26169489 26169538 26169514 Y BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1 HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H2BE,HIST1H4D,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE NA NA NA NA HIST1H2BE 12420 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 26232920 26233434 26233137 Y NA HIST1H4D,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI NA NA NA NA HIST1H1D 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 26521003 26521206 26521108 Y HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1 HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HCG11 927 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 26521444 26521777 26521577 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HCG11 1368 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 26522673 26522990 26522813 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HCG11 2597 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 26533222 26533398 26533310 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 3235 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 27065086 27065154 27065121 Y NA HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH NA NA NA NA HIST1H2AG 33678 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 27136362 27136689 27136526 Y NA HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 NA NA NA NA HIST1H2AH 23501 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 27156271 27156423 27156401 Y NA HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 20600 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 27300679 27301026 27300902 Y NA ZNF204P,ZNF391 NA NA NA NA ZNF204P 36278 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 27637197 27637397 27637297 Y OR2B6,OR2B2 NA ZNF391,PRSS16 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BL 136312 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 27655687 27656083 27655918 Y NA NA LOC100507173 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HIST1H2BL 117626 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 27706104 27706357 27706299 Y NA NA NA NA NA NA HIST1H2BL 67352 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 27759985 27760333 27760032 Y ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN NA NA NA NA HIST1H2BL 13376 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr6 27807310 27807672 27807617 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L NA NA NA NA HIST1H2BN 2987 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 27863298 27863662 27863535 Y ZKSCAN3,ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZNF323,ZNF193,ZNF192,ZKSCAN4,PGBD1,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 4095 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 28072476 28072872 28072543 Y HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192 ZNF165 NA NA NA NA ZNF165 25723 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 28457225 28458028 28457315 Y NA ZSCAN23 NA NA NA NA ZSCAN23 47946 CAGE SAS hg19 FANTOM5 4.12137785000539 chr6 28565127 28565440 28565259 Y NA SCAND3 SCAND3 MCF7 ChIA-PET 22265404 SCAND3 16549 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 28715387 28715696 28715451 Y NA NA NA NA NA NA SCAND3 133398 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 28805076 28805418 28805247 Y NA NA NA NA NA NA TRIM27 84348 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 29568471 29568641 29568556 Y MOG,GABBR1 UBD NA NA NA NA UBD 42769 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 29935319 29935652 29935489 Y NA HLA-K,HLA-A,HLA-J NA NA NA NA HLA-A 28282 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 30069810 30070038 30069951 Y HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39 ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39 NA NA NA NA RNF39 28146 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr6 30177609 30178061 30177863 Y NA TRIM26 NA NA NA NA TRIM26 1143 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 30453844 30454132 30453996 Y ZNRD1,TUBB RANP1,HLA-E HLA-E MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HLA-E 1112 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 30495647 30495976 30495809 Y PPP1R11,TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3,FLOT1,HLA-E RANP1,HLA-E,PRR3,GNL1,ABCF1 NA NA NA NA PRR3 26687 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 30716597 30717062 30716912 Y IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3 PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1 IMR90 Hi-C 24141950 IER3 6266 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 30717441 30717627 30717503 Y RPP21,SFTA2,PSORS1C1 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3 PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1 IMR90 Hi-C 24141950 IER3 7110 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 30720004 30720713 30720325 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3 DPCR1,NRM,PPP1R18,MDC1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,VARS2,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 9673 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 30736850 30737361 30737156 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3 FLOT1,IER3 DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 26519 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 30737456 30737900 30737560 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3 FLOT1,IER3 DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A,MRPS18B,PPP1R10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 27125 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 30785907 30786494 30786279 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,FLOT1,IER3 NA FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDR1 55704 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 30840574 30840974 30840689 Y ABCF1,C6orf136 DDR1,GTF2H4,VARS2 DHX16,VARS2,DPCR1,DDR1,MUC22,CCHCR1,MDC1,PPP1R18,NRM,TUBB,IER3,FLOT1,SFTA2,PSORS1C1,C6orf15,PSORS1C2 IMR90 Hi-C 24141950 DDR1 1224 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 30923441 30923743 30923649 Y GNL1,CCHCR1,CCHCR1,DDR1 GTF2H4,VARS2 NA NA NA NA VARS2 49422 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 31705604 31706142 31705906 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1,VWA7 NA NA NA NA MSH5 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,SNORD52,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 3244 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.11638322027304 chr6 31942054 31942322 31942254 Y NA CFB,SKIV2L,STK19 NA NA NA NA STK19 5186 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 32081652 32082042 32081917 Y NA TNXB,ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8 NA NA NA NA TNXB 541 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 32114130 32114430 32114186 Y GPANK1,GPANK1,LY6G5C,DOM3Z,FKBPL TNXB,ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8,AGPAT1,RNF5,XXbac-BPG300A18.13,PBX2,GPSM3 NA NA NA NA PPT2 4788 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 32577297 32577935 32577770 Y GPSM3,HLA-DRA,HLA-DRB5,TAP2,TAP1,PSMB9,PSMB8,PSMB8,HLA-DQB2,HLA-DQA2,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DOB,HLA-DOA,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,HLA-DRB1,HLA-DQB1,HLA-DQA1 NA NA NA NA NA HLA-DRB5 81233 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 32956037 32956271 32956088 Y NA HLA-DMB,BRD2,HLA-DMA,BRD2-IT1 NA NA NA NA BRD2-IT1 20028 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 33159164 33159383 33159309 Y NA SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1 NA NA NA NA SLC39A7 6839 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 33392796 33393285 33393082 Y SYNGAP1 KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9 NA NA NA NA SYNGAP1 6949 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 33538378 33538887 33538702 Y LEMD2,LEMD2,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1 BAK1,LINC00336,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 7132 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 33558672 33558897 33558785 Y NA BAK1,LINC00336,ITPR3 NA NA NA NA LINC00336 218 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 33684801 33685193 33684861 Y NA IP6K3 MNF1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IP6K3 27569 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 34102440 34102470 34102458 Y NA NA NA NA NA NA CYCSP55 82746 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 34202925 34203288 34202990 Y NA CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2 NA NA NA NA HMGA1 275 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 34625381 34625487 34625387 Y HMGA1 C6orf106 NA NA NA NA C6orf106 37149 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 35270455 35270931 35270541 Y TAF11,ANKS1A,ZNF76,DEF6,PPARD ZNF76,DEF6,PPARD NA NA NA NA DEF6 6860 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 35336013 35336129 35336059 Y NA PPARD NA NA NA NA PPARD 27678 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 35336371 35336758 35336422 Y NA PPARD NA NA NA NA PPARD 28036 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 35337950 35338511 35338285 Y ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD PPARD NA NA NA NA PPARD 29615 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 35445364 35445634 35445501 Y RPL10A FANCE,RPL10A,TEAD3 NA NA NA NA RPL10A 11179 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr6 35453228 35453566 35453395 Y NA FANCE,RPL10A,TEAD3 NA NA NA NA TEAD3 9287 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 35569141 35569999 35569809 Y FKBP5,SLC26A8,SLC26A8,SLC26A8,MAPK14,FKBP5,FKBP5,ZNF76,DEF6 RP3-340B19.2 NA NA NA NA RP3-340B19.2 47491 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 35632268 35633036 35633003 Y NA NA NA NA NA NA FKBP5 61324 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 35681097 35681517 35681302 Y FKBP5 FKBP5 NA NA NA NA FKBP5 12843 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 36332774 36332909 36332842 Y NA ETV7 NA NA NA NA ETV7 21255 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 36409257 36409482 36409373 Y MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20 KCTD20 NA NA NA NA KCTD20 713 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 36737758 36737957 36737899 Y ETV7,ETV7,PXT1,PIM1 NA NA NA NA NA CDKN1A 95453 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 36997320 36997527 36997354 Y STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,C6orf89,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FGD2 MTCH1 NA NA NA NA MTCH1 45246 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 37024161 37024556 37024514 Y NA NA CPNE5,C6orf89,FGD2,PIM1,TMEM217,TBC1D22B IMR90 Hi-C 24141950 MTCH1 72087 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr6 37025964 37026081 37026014 Y SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,PIM1 NA CPNE5,C6orf89,FGD2,PIM1,TMEM217,TBC1D22B IMR90 Hi-C 24141950 MTCH1 73890 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 37070053 37070857 37070460 Y CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2 NA PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 65122 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr6 37102324 37102775 37102642 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 33204 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr6 37104071 37104158 37104105 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 31821 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 37104908 37105418 37105405 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 30561 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr6 37210217 37210497 37210343 Y TMEM217,TMEM217 TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TBC1D22B 13051 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 37210643 37210874 37210721 Y TMEM217,TMEM217 TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TBC1D22B 12674 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 37212541 37212901 37212835 Y NA TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TBC1D22B 10647 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 37269905 37270172 37270040 Y C6orf89,TBC1D22B TBC1D22B,TMEM217,RNF8 NA NA NA NA TMEM217 45974 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 37271813 37272101 37271931 Y PIM1,TBC1D22B TBC1D22B,TMEM217,RNF8 NA NA NA NA RNF8 47647 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 37464858 37465170 37465019 Y NA CCDC167 NA NA NA NA CCDC167 528 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 39329332 39329605 39329533 Y NA NA NA NA NA NA KCNK5 134106 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 41252445 41252761 41252675 Y NFYA,TFEB,TREML2,TREML4,TREM1 NA NA NA NA NA TREM1 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 41608113 41608435 41608156 Y NA MDFI NA NA NA NA MDFI 5493 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 41623844 41623904 41623860 Y NA MDFI NA NA NA NA MDFI 21224 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 41649853 41650127 41649990 Y NA MDFI NA NA NA NA MDFI 47233 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 41698347 41698506 41698456 Y TFEB TFEB,PRICKLE4 NA NA NA NA TFEB 3491 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 42086253 42086632 42086383 Y NA C6orf132 NA NA NA NA C6orf132 21725 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 42090479 42090803 42090657 Y NA C6orf132 NA NA NA NA C6orf132 17554 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 42219475 42219699 42219588 Y NA MRPS10 NA NA NA NA MRPS10 35872 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 42255073 42255501 42255249 Y NA NA NA NA NA NA MRPS10 71470 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 42283170 42283354 42283262 Y NA NA NA NA NA NA MRPS10 99567 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 42306418 42306926 42306742 Y UBR2,TRERF1 NA NA NA NA NA TRERF1 110863 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 42409399 42409623 42409499 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 8166 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 42413186 42413554 42413522 Y NA TRERF1 GUCA1B,MRPS10 IMR90 Hi-C 24141950 TRERF1 4235 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 42420719 42421067 42420926 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 2930 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 42898508 42898648 42898552 Y NA C6orf226,CNPY3,RPL24P4,PEX6 NA NA NA NA CNPY3 3570 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 43692783 43693195 43692965 Y TJAP1,MAD2L1BP MRPS18A,VEGFA MRPS18A,LOC100132354,RSPH9,MRPL14,CAPN11,TMEM63B,POLH,VEGFA,XPO5,MAD2L1BP,GTPBP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPS18A 39255 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 43978439 43978901 43978686 Y NFKBIE NA NA NA NA NA TMEM63B 113750 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 43979820 43980209 43980006 Y NFKBIE,MAD2L1BP NA NA NA NA NA TMEM63B 112442 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 44002049 44002379 44002368 Y NFKBIE,GTPBP2 NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 TMEM63B 90272 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 44009201 44009753 44009484 Y SLC35B2,MRPL14 NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 TMEM63B 82898 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 44011946 44012485 44012109 Y NA NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 TMEM63B 80166 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 44022822 44022968 44022901 Y NA NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM63B 69683 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 44040704 44041103 44040711 Y C6orf223,NFKBIE NA POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,MRPS18A,HSP90AB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM63B 51548 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 44070488 44070804 44070651 Y NA TMEM63B,MRPL14 NA NA NA NA TMEM63B 21847 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 44184938 44185313 44184944 Y MRPL14 HSP90AB1,SLC35B2,NFKBIE NA NA NA NA SLC29A1 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 45302184 45302302 45302245 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 41388 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 45330194 45330521 45330358 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 13169 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 45390987 45391259 45391097 Y RUNX2 SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 47297 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 45391331 45391628 45391429 Y RUNX2 SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 47641 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr6 45391820 45391891 45391857 Y RUNX2 SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 48130 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 45392235 45392572 45392528 Y RUNX2 SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 48545 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 45404651 45404813 45404715 Y RUNX2 NA NA NA NA NA SUPT3H 60961 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 45618234 45618676 45618425 Y RUNX2 NA RUNX2,SUPT3H,CLIC5 IMR90 Hi-C 24141950 SUPT3H 274544 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr6 45623562 45623937 45623654 Y NA NA RUNX2,SUPT3H,CLIC5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SUPT3H 279872 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 45665421 45665594 45665503 Y NA NA RUNX2,CDC5L,CLIC5 IMR90 Hi-C 24141950 SUPT3H 321731 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 47102503 47102708 47102571 Y NA NA TNFRSF21 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPR110 94404 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 47263537 47263554 47263549 Y NA TNFRSF21 NA NA NA NA TNFRSF21 12087 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 47618805 47618920 47618863 Y OPN5 GPR115 NA NA NA NA GPR115 32680 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 48794608 48794845 48794713 Y NA NA NA NA NA NA MUT 634059 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr6 51738790 51738977 51738878 Y NA NA NA NA NA NA MCM3 408702 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 52217307 52217701 52217502 Y NA PAQR8 PAQR8,MCM3,EFHC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAQR8 6518 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 52952230 52952503 52952367 Y NA FBXO9,ICK NA NA NA NA ICK 27630 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 53226308 53226528 53226441 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 14361 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 53412768 53413364 53413026 Y GCLC NA NA NA NA NA GCLC 66404 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 53678166 53678361 53678262 Y NA LRRC1 NA NA NA NA LRRC1 20871 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 53838542 53838554 53838548 Y NA NA NA NA NA NA LRRC1 181247 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 53919215 53919239 53919233 Y NA NA NA NA NA NA LRRC1 261920 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 54604535 54604549 54604543 Y NA NA NA NA NA NA FAM83B 105020 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 56297273 56297383 56297328 Y NA NA NA NA NA NA DST 520043 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 56459514 56459884 56459699 Y NA NA NA NA NA NA DST 357542 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 57004936 57005232 57005084 Y NA BAG2 NA NA NA NA BAG2 29892 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 57216540 57216887 57216780 Y NA PRIM2 NA NA NA NA PRIM2 38937 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 57478986 57479248 57479117 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 301383 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 58778631 58779245 58778717 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 524062 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 64398084 64398491 64398303 Y PHF3 NA NA NA NA NA PHF3 54359 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 70479579 70479974 70479889 Y NA LMBRD1 NA NA NA NA LMBRD1 25029 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 70808594 70808991 70808795 Y NA NA NA NA NA NA RP11-462G2.1 293599 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 72044589 72044818 72044676 Y OGFRL1 OGFRL1 NA NA NA NA OGFRL1 48083 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 72114373 72114910 72114587 Y NA MIR30A,LINC00472 NA NA NA NA MIR30A 3049 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 72179171 72179414 72179328 Y NA NA OGFRL1,MIR30C2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00472 50699 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 72188537 72188902 72188719 Y NA NA OGFRL1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00472 60065 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 72294841 72295504 72295148 Y NA KRT19P1 RIMS1 IMR90 Hi-C 24141950 KRT19P1 2417 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 73335940 73336259 73335964 Y NA KCNQ5 NA NA NA NA KCNQ5 6420 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 73889907 73890177 73890065 Y NA NA NA NA NA NA RP11-398K22.12 80761 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 73987583 73987923 73987651 Y NA RP11-398K22.12,KHDC1 KHDC1L IMR90 Hi-C 24141950 RP11-398K22.12 16645 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 74289769 74290568 74290415 Y MB21D1,SLC17A5,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA EEF1A1 58249 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 74295249 74295764 74295450 Y MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA EEF1A1 63729 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 75853490 75853812 75853630 Y COL12A1 NA NA NA NA NA COL12A1 59955 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 75914223 75914620 75914578 Y COL12A1 COL12A1,COX7A2 NA NA NA NA COL12A1 456 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 79773928 79774085 79774072 Y NA PHIP NA NA NA NA PHIP 11868 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 80013382 80013562 80013472 Y NA NA NA NA NA NA HMGN3 70976 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 80663174 80663336 80663221 Y NA ELOVL4,TTK NA NA NA NA ELOVL4 7877 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 82648128 82648420 82648330 Y NA NA NA NA NA NA FAM46A 187637 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr6 83737150 83737334 83737242 Y NA DOPEY1 NA NA NA NA DOPEY1 38051 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 83893224 83893469 83893362 Y RWDD2A,PGM3,PGM3 RWDD2A,PGM3 NA NA NA NA RWDD2A 7629 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 83931407 83931579 83931543 Y UBE2CBP,PRSS35,RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 IMR90 Hi-C 24141950 PGM3 29752 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 85825649 85825818 85825750 Y NA NA NA NA NA NA NT5E 331991 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 86074188 86074341 86074265 Y NA NA NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 NT5E 83468 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 86113432 86113601 86113525 Y NT5E NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 NT5E 44208 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 86114496 86114829 86114663 Y NT5E NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 NT5E 42980 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr6 86377022 86377042 86377037 Y NA SYNCRIP,SNHG5 NA NA NA NA SNHG5 9409 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 88183289 88183642 88183572 Y NA SLC35A1 NA NA NA NA SLC35A1 4948 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 88414970 88415193 88415174 Y NA AKIRIN2 NA NA NA NA AKIRIN2 5043 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 88442140 88442415 88442293 Y AKIRIN2 AKIRIN2 AKIRIN2,AKIRIN2-AS1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 AKIRIN2 32213 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 89084006 89084236 89084119 Y NA NA NA NA NA NA ACTBP8 99298 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 89591363 89591365 89591364 Y NA NA NA NA NA NA RNGTT 79983 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 90754756 90755156 90755038 Y NA NA NA NA NA NA CASP8AP2 217143 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 90856849 90857084 90856969 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 147543 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 90943674 90944075 90943895 Y MDN1,BACH2,BACH2 NA NA NA NA NA BACH2 60552 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 90983807 90984597 90984358 Y MDN1,BACH2,BACH2 BACH2 NA NA NA NA BACH2 20030 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 90994449 90994671 90994572 Y MDN1,BACH2,BACH2 BACH2 NA NA NA NA BACH2 9956 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 91004830 91005121 91005041 Y MDN1,BACH2,BACH2 BACH2 NA NA NA NA BACH2 203 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 91078844 91079184 91078980 Y NA NA BACH2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BACH2 74217 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 91121051 91121489 91121257 Y BACH2,BACH2 NA BACH2,MIR4464 IMR90 Hi-C 24141950 BACH2 116424 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr6 93802046 93802077 93802062 Y NA NA NA NA NA NA MANEA 2221342 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 95887569 95887862 95887716 Y NA NA NA NA NA NA MANEA 135557 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 97632369 97632997 97632691 Y NA NA NA NA NA NA MMS22L 96096 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 99975087 99975427 99975257 Y NA USP45,CCNC NA NA NA NA USP45 7483 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 99995359 99995841 99995579 Y PNISR USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 19008 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 100007525 100007878 100007702 Y LOC100130890 USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 6971 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 101149750 101149957 101149936 Y NA NA NA NA NA NA RP1-121G13.3 173598 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 106047524 106047990 106047829 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 198565 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 106048262 106048533 106048347 Y NA NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 199303 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 106233418 106233647 106233482 Y PRDM1 NA ATG5,PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 298548 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 106440406 106440671 106440473 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 91524 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 106582399 106582514 106582457 Y AIM1 NA NA NA NA NA PRDM1 50204 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 108440032 108440340 108440122 Y NA OSTM1 LACE1,NR2E1,ARMC2,SESN1 IMR90 Hi-C 24141950 OSTM1 44718 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 108455044 108455377 108455332 Y NA OSTM1 LACE1,ARMC2,NR2E1 IMR90 Hi-C 24141950 OSTM1 29681 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 108879521 108879931 108879808 Y SESN1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 483 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr6 108883670 108884545 108884024 Y OSTM1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 4632 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.67332617297647 chr6 109059217 109059645 109059338 Y FOXO3 NA FOXO3,LINC00222 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARMC2 107974 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 109680867 109680881 109680874 Y SMPD2 CD164 NA NA NA NA CD164 20881 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 110418117 110418342 110418281 Y NA NA NA NA NA NA WASF1 80865 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 110502951 110503352 110503102 Y FIG4,CDC40 WASF1,CDC40 NA NA NA NA CDC40 3607 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 111733320 111733976 111733973 Y NA NA NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 68738 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 111925507 111925888 111925538 Y REV3L,TRAF3IP2 TRAF3IP2 NA NA NA NA TRAF3IP2 26 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 112364338 112364486 112364397 Y TRAF3IP2,FYN,FYN,FYN TUBE1 FYN,TRAF3IP2-AS1,TRAF3IP2,REV3L IMR90 Hi-C 24141950 TUBE1 42246 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 112525181 112525504 112525289 Y LAMA4 LAMA4 NA NA NA NA LAMA4 48637 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 112824431 112824764 112824616 Y NA NA FLJ34503 IMR90 Hi-C 24141950 LAMA4 250290 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 113748852 113749029 113748940 Y NA RP1-124C6.1 MARCKS,FLJ34503 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-124C6.1 3594 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 113966016 113966399 113966296 Y MARCKS RP11-367G18.1 MARCKS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-367G18.1 2877 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 113966975 113967088 113966980 Y MARCKS RP11-367G18.1 MARCKS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-367G18.1 2188 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 113974523 113974815 113974721 Y MARCKS RP11-367G18.1 MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 RP11-367G18.1 5247 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 113975639 113976185 113975774 Y MARCKS RP11-367G18.1 MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 RP11-367G18.1 6363 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.67582348784265 chr6 114005806 114006016 114005966 Y NA RP11-367G18.1 NA NA NA NA RP11-367G18.1 36530 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.78221744865098 chr6 114176108 114176553 114176196 Y MARCKS NA NA NA NA NA MARCKS 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr6 115163170 115163515 115163320 Y NA NA NA NA NA NA HDAC2 832698 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 116469368 116469398 116469382 Y NA NT5DC1 NA NA NA NA NT5DC1 49356 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 116731085 116731228 116731157 Y NA FAM26F NA NA NA NA FAM26F 49305 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 117804575 117804878 117804739 Y NA DCBLD1 NA NA NA NA DCBLD1 31595 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 118009013 118009297 118009155 Y NA NUS1 NA NA NA NA NUS1 14348 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 118964875 118965125 118965000 Y MCM9,C6orf204 NA NA NA NA NA CEP85L 64113 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 119029991 119030657 119030634 Y C6orf204,MCM9,C6orf204 CEP85L NA NA NA NA CEP85L 753 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 119523776 119524187 119523976 Y FAM184A NA NA NA NA NA MAN1A1 144739 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 121396728 121397112 121396920 Y C6orf170 NA NA NA NA NA RNU1-18P 1133682 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 125347013 125347309 125347174 Y NA NA NA NA NA NA RP11-510H23.1 64828 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 125420883 125421200 125421024 Y NA TPD52L1 NA NA NA NA TPD52L1 16995 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 125424080 125424400 125424202 Y NA TPD52L1 NA NA NA NA TPD52L1 13795 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 126112858 126113033 126112985 Y TRMT11,HINT3,NCOA7 HEY2,NCOA7 NA NA NA NA NCOA7 12551 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 126241150 126241321 126241235 Y NCOA7 HINT3 NA NA NA NA HINT3 34606 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 126265741 126265870 126265827 Y NCOA7 HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 10057 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr6 126267356 126267782 126267584 Y NCOA7 HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 8145 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chr6 126271537 126271736 126271680 Y NA HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 4191 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 127638757 127639069 127638966 Y NA ECHDC1,YWHAZP4 NA NA NA NA ECHDC1 23685 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 127719126 127719428 127719248 Y RNF146 YWHAZP4,RP3-403A15.1 ECHDC1 IMR90 Hi-C 24141950 RP3-403A15.1 35353 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 127805440 127805627 127805534 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 50659 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 127980874 127981174 127981075 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 226093 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 127981338 127981402 127981371 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 226557 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr6 128040125 128040343 128040234 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 285344 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 128331151 128331455 128331303 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 508415 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 128637396 128637725 128637581 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 202145 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 128793943 128794334 128794205 Y NA PTPRK NA NA NA NA PTPRK 45536 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 128840669 128840970 128840936 Y PTPRK,PTPRK PTPRK NA NA NA NA PTPRK 799 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 129822485 129822770 129822701 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP18 206600 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 130030425 130030727 130030721 Y ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 1055 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 130922387 130922557 130922422 Y NA NA NA NA NA NA TMEM200A 237508 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 133839183 133839299 133839241 Y EYA4 NA NA NA NA NA TBPL1 432009 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 133890779 133890909 133890844 Y NA NA MGC34034,TBPL1,SLC2A12,TCF21 IMR90 Hi-C 24141950 TBPL1 380399 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 133930803 133931089 133930946 Y NA NA MGC34034,TCF21 IMR90 Hi-C 24141950 TBPL1 340219 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 134088671 134088966 134088914 Y NA NA MGC34034,TCF21 IMR90 Hi-C 24141950 TBPL1 182342 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 134616841 134617592 134617239 Y SGK1,SGK1,SGK1 SGK1 NA NA NA NA SGK1 19658 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 134684660 134684778 134684697 Y SGK1,SGK1 SGK1 SGK1,ALDH8A1,LOC154092 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 47410 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 134700193 134700599 134700296 Y SGK1,SGK1 NA ALDH8A1,LOC154092,SGK1,HBS1L,MIR3662 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 62943 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 134741718 134742020 134741875 Y SGK1,SGK1,SGK1 NA SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 104468 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr6 134742048 134742399 134742278 Y SGK1,SGK1 NA SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 104798 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 134743944 134744382 134744175 Y SGK1,SGK1,SGK1 NA SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 106694 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr6 135503898 135504621 135504156 Y HBS1L,AHI1,MYB MYB NA NA NA NA MYB 3445 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr6 136716338 136716450 136716395 Y MAP7,MAP7,MAP7 NA NA NA NA NA BCLAF1 107349 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 136839838 136840084 136840036 Y NA MAP7 NA NA NA NA MAP7 29873 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 137114423 137114806 137114737 Y NA MAP3K5,PEX7 NA NA NA NA MAP3K5 2767 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 137558650 137558845 137558763 Y MAP3K5,IFNGR1 IFNGR1 IFNGR1,OLIG3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IFNGR1 20064 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 138049891 138050457 138050087 Y TNFAIP3 NA TNFAIP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 135894 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 138129336 138129581 138129459 Y TNFAIP3 NA TNFAIP3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 56770 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 138131793 138132158 138131947 Y TNFAIP3 NA TNFAIP3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 54193 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 138132277 138133056 138132650 Y TNFAIP3 NA TNFAIP3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 53295 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr6 138150613 138151141 138151010 Y OLIG3,TNFAIP3 TNFAIP3 TNFAIP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 35210 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 138153323 138153539 138153451 Y NA TNFAIP3 TNFAIP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 32812 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 138353138 138353418 138353320 Y PERP NA PERP MCF7 ChIA-PET 22265404 PERP 73230 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 138356192 138356530 138356352 Y NA NA PERP MCF7 ChIA-PET 22265404 PERP 70118 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 138426575 138426770 138426671 Y PERP NA NA NA NA NA PERP 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 138427134 138427492 138427302 Y PERP PERP NA NA NA NA PERP 486 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 138821349 138821443 138821380 Y REPS1,NHSL1 NA NA NA NA NA HEBP2 98681 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 139213986 139214343 139214165 Y NA NA NA NA NA NA REPS1 93055 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 139348964 139349250 139349073 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 41566 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 139697079 139697371 139697327 Y NA CITED2 NA NA NA NA CITED2 3322 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 139899473 139899647 139899531 Y CITED2,CITED2,CITED2 NA CITED2,LOC645434 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 205716 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 140064888 140065017 140064953 Y CITED2,CITED2,CITED2 NA CITED2,LOC645434 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 371131 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 140085604 140086085 140085978 Y CITED2,CITED2,CITED2 NA TXLNB,CITED2,LOC645434,LOC100132735 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 391847 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 141873662 141873944 141873832 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 592423 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 142290502 142290595 142290549 Y VTA1 NA NA NA NA NA VTA1 175772 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 142335769 142335959 142335859 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 130408 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 142644630 142644955 142644766 Y NA GPR126 NA NA NA NA GPR126 23639 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 142698366 142698689 142698587 Y NA NA NA NA NA NA GPR126 77375 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 143124343 143124671 143124507 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 139667 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 143130260 143130659 143130530 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 133679 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 143150171 143150307 143150239 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 114031 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 143200640 143200895 143200768 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 63443 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 143206296 143206927 143206703 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 57411 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 143234166 143234456 143234293 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 29882 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 143247398 143248213 143248022 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 16125 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 143286973 143287055 143287014 Y NA HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 22635 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 143503002 143503176 143503018 Y NA NA NA NA NA NA AIG1 123369 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 143770817 143770943 143770879 Y ADAT2 ADAT2,PEX3 NA NA NA NA PEX3 873 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 143994840 143994998 143994919 Y NA NA NA NA NA NA PHACTR2 138858 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 144007310 144007644 144007477 Y NA NA NA NA NA NA PHACTR2 151328 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 144283195 144283286 144283251 Y NA NA NA NA NA NA PLAGL1 100449 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 144284201 144284585 144284512 Y NA NA NA NA NA NA PLAGL1 99150 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 144384858 144385125 144384924 Y NA PLAGL1,SF3B5 NA NA NA NA PLAGL1 1123 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 144537313 144537754 144537668 Y NA TPT1P4 STX11,SF3B5 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TPT1P4 17211 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 147200051 147200365 147200196 Y NA NA NA NA NA NA STXBP5 323196 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 147235088 147235549 147235197 Y RAB32,STXBP5 NA NA NA NA NA STXBP5 288012 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 147235645 147236230 147236149 Y RAB32,STXBP5 NA NA NA NA NA STXBP5 287331 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 148443958 148444368 148444103 Y NA NA SAMD5 IMR90 Hi-C 24141950 SASH1 147072 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 149082428 149082821 149082685 Y NA UST NA NA NA NA UST 15964 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 149352415 149352625 149352483 Y ZC3H12D,TAB2,SUMO4 RP11-162J8.3 NA NA NA NA RP11-162J8.3 706 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 149368124 149368336 149368236 Y NA RP11-162J8.3 NA NA NA NA RP11-162J8.3 16415 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 149376073 149376391 149376158 Y NA RP11-162J8.3 NA NA NA NA RP11-162J8.3 24364 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 149554491 149554815 149554668 Y ZC3H12D TAB2 UST,TAB2 IMR90 Hi-C 24141950 TAB2 16714 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 150075680 150075936 150075837 Y SUMO4 LATS1,PCMT1,NUP43 NA NA NA NA NUP43 6879 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 150176203 150176399 150176290 Y NA LRP11,RAET1E NA NA NA NA LRP11 7800 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 150183311 150183513 150183478 Y NA LRP11,RAET1E NA NA NA NA LRP11 686 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 150482510 150482848 150482609 Y NA PPP1R14C NA NA NA NA PPP1R14C 20298 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 150577051 150577247 150577096 Y RAET1G,ULBP2,RAET1L,PPP1R14C NA NA NA NA NA RNU4-7P 68652 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr6 150588952 150589102 150589017 Y RAET1G,PPP1R14C NA NA NA NA NA RNU4-7P 56797 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr6 150590987 150591352 150591048 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-7P 54547 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 150739160 150739823 150739483 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-7P 93261 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 151178746 151179109 151178841 Y NA MTHFD1L NA NA NA NA MTHFD1L 5576 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chr6 151302311 151302568 151302430 Y PLEKHG1 NA NA NA NA NA RP1-292B18.1 116097 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 151365804 151366060 151365928 Y NA NA NA NA NA NA RP1-292B18.1 52605 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 151366767 151366942 151366858 Y NA NA NA NA NA NA RP1-292B18.1 51723 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 151366985 151367228 151367157 Y NA NA NA NA NA NA RP1-292B18.1 51437 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr6 151381285 151381592 151381452 Y NA RP1-292B18.1 NA NA NA NA RP1-292B18.1 37073 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr6 151730569 151730753 151730690 Y NA ZBTB2,RMND1,C6orf211 NA NA NA NA ZBTB2 19886 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 152085145 152085342 152085266 Y ESR1,ESR1,ESR1,ESR1 NA NA NA NA NA C6orf211 313723 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr6 153358098 153358156 153358117 Y SYNE1,RGS17 MTRF1L NA NA NA NA MTRF1L 36278 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 154830409 154830718 154830573 Y CNKSR3 CNKSR3 NA NA NA NA CNKSR3 616 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 157007979 157008724 157008580 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88339 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 157041058 157041538 157041248 Y ARID1B NA ARID1B,MIR4466 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 55525 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 157101566 157102083 157101700 Y ARID1B ARID1B NA NA NA NA ARID1B 4503 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 157162870 157163071 157163026 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 65807 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 157163922 157164341 157164233 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 66859 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 157267788 157267851 157267817 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 170725 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 157342507 157343524 157343342 Y ARID1B,ZDHHC14 NA NA NA NA NA ARID1B 245444 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 157421397 157421571 157421514 Y ARID1B NA NA NA NA NA TMEM242 321062 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 157542479 157542718 157542566 Y NA NA NA NA NA NA TMEM242 199915 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 158184460 158184689 158184561 Y SNX9 NA SNX9,TMEM242,ZDHHC14,SYNJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNX9 57607 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr6 158185393 158186221 158185862 Y SNX9 NA SNX9,TMEM242,SYNJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNX9 56075 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 158190286 158190548 158190467 Y SNX9 NA SNX9,SYNJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNX9 51748 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 158478416 158478907 158478642 Y NA NA NA NA NA NA SYNJ2 77528 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 158481547 158481708 158481650 Y SNX9 NA NA NA NA NA SYNJ2 80659 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 158981403 158981866 158981661 Y NA NA NA NA NA NA DYNLT1 81905 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr6 158987674 158988091 158987879 Y NA NA NA NA NA NA DYNLT1 75680 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 159141436 159141829 159141621 Y TAGAP,DYNLT1,SYTL3,C6orf99,EZR,EZR NA NA NA NA NA DYNLT1 77665 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.11888053513921 chr6 159171374 159171393 159171384 Y NA NA NA NA NA NA EZR 67051 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 159195572 159195684 159195582 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 42760 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 159211450 159211647 159211549 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 26797 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 159226894 159227283 159227272 Y NA EZR NA NA NA NA EZR 11161 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 159229924 159230242 159230166 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 8202 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 159234698 159235091 159235070 Y NA EZR NA NA NA NA EZR 3353 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 159237852 159238517 159238245 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR NA NA NA NA NA EZR 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 159270971 159271326 159271104 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR,C6orf99 NA NA NA NA C6orf99 17645 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr6 159271429 159272000 159271674 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR,C6orf99 NA NA NA NA C6orf99 16971 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr6 159273925 159274893 159274526 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR,C6orf99 NA NA NA NA C6orf99 14078 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.78471476351716 chr6 159315379 159315577 159315478 Y NA C6orf99 NA NA NA NA C6orf99 26408 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 159434370 159434675 159434475 Y TAGAP RSPH3,TAGAP NA NA NA NA RSPH3 15151 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 160141572 160141909 160141740 Y MAS1,IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP WTAP,ACAT2,SOD2 LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WTAP 2708 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 160425266 160425362 160425272 Y NA IGF2R NA NA NA NA IGF2R 37135 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 161536644 161536718 161536688 Y AGPAT4 NA NA NA NA NA MAP3K4 125885 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 161549553 161550030 161549828 Y AGPAT4 NA NA NA NA NA MAP3K4 138794 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 161790443 161790679 161790575 Y AGPAT4 NA NA NA NA NA AGPAT4 97350 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 161796504 161796762 161796717 Y AGPAT4 NA NA NA NA NA AGPAT4 103411 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 163776294 163776859 163776538 Y QKI NA DKFZp451B082,PACRG IMR90 Hi-C 24141950 QKI 56173 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 166422302 166422862 166422743 Y NA NA NA NA NA NA SFT2D1 331217 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 166689031 166689408 166689363 Y PRR18 NA RPS6KA2 IMR90 Hi-C 24141950 SFT2D1 64671 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 166795008 166795404 166795174 Y NA SFT2D1 NA NA NA NA SFT2D1 40929 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 168250541 168251043 168250675 Y NA MLLT4 NA NA NA NA MLLT4 24939 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr6 168356861 168357132 168356996 Y NA NA NA NA NA NA MLLT4 131259 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 169308928 169309266 169309084 Y THBS2 NA WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 251753 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr6 169361499 169361602 169361564 Y NA NA PHF10,WDR27,C6orf70,TCTE3,FAM120B,THBS2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 199417 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 169568038 169568505 169568172 Y NA RP11-417E7.1 C6orf70,THBS2,PHF10,WDR27 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 7019 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr6 169569548 169569688 169569622 Y NA RP11-417E7.1 C6orf70,THBS2,PHF10,WDR27 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 8529 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.22777181081372 chr6 169572627 169572772 169572742 Y NA RP11-417E7.1 THBS2,WDR27 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 11608 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr6 169573934 169574190 169574061 Y NA RP11-417E7.1 THBS2,WDR27 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 12915 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chr6 170364764 170365251 170365177 Y NA NA DLL1 IMR90 Hi-C 24141950 TCTE3 215109 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 170491997 170492052 170492021 Y NA NA NA NA NA NA DLL1 105509 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chr6 170492436 170492647 170492551 Y NA NA NA NA NA NA DLL1 104914 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr6 170501868 170502090 170502073 Y DLL1 NA NA NA NA NA DLL1 95471 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chr6 170589556 170589600 170589578 Y WDR27,TCTE3,TBP DLL1,FAM120B NA NA NA NA DLL1 7961 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr6 170600439 170600921 170600644 Y NA DLL1,FAM120B NA NA NA NA FAM120B 2648 CAGE SAS hg19 FANTOM5 9.57941878649902 chr7 89354 89662 89513 Y NA NA FAM20C,HEATR2 IMR90 Hi-C 24141950 AC093627.10 57935 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 90161 90450 90245 Y FAM20C NA FAM20C,HEATR2 IMR90 Hi-C 24141950 AC093627.10 57147 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 191531 191871 191582 Y FAM20C AC093627.10,FAM20C,AC093627.12 NA NA NA NA AC093627.12 309 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.67082885811029 chr7 373094 373351 373247 Y PRKAR1B NA FLJ44511,PDGFA MCF7 ChIA-PET 22265404 AC093627.12 180914 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 409137 409513 409244 Y NA NA NA NA NA NA PDGFA 148420 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 416236 416525 416371 Y NA NA NA NA NA NA PDGFA 141408 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 577876 578141 578015 Y PRKAR1B,PRKAR1B,HEATR2,GET4,PDGFA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 19943 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 579426 579712 579625 Y PRKAR1B,PRKAR1B,GET4,PDGFA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 21493 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 652642 652893 652768 Y PRKAR1B,ADAP1 NA NA NA NA NA PDGFA 94709 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 655576 655910 655797 Y NA NA NA NA NA NA PDGFA 97643 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 949613 949923 949864 Y NA GET4,ADAP1 NA NA NA NA GET4 35424 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 964406 964697 964471 Y ZFAND2A,COX19,ADAP1 ADAP1,COX19 NA NA NA NA ADAP1 28346 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 988760 989207 989097 Y ADAP1 ADAP1,COX19 NA NA NA NA ADAP1 3836 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 1329910 1330257 1330187 Y NA NA UNCX IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND2A 131515 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 1416814 1417157 1416984 Y NA NA NA NA NA NA MICALL2 79981 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 1456103 1456158 1456132 Y NA MICALL2 NA NA NA NA MICALL2 40980 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 1495047 1495214 1495102 Y NA MICALL2,INTS1 NA NA NA NA MICALL2 1924 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr7 1560213 1560697 1560426 Y C7orf50,TMEM184A,PSMG3,PSMG3,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 7653 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr7 1571273 1571500 1571366 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 2923 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr7 1572262 1572844 1572636 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 3912 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.00749194459853 chr7 1573524 1573718 1573598 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 5174 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr7 1574153 1574602 1574313 Y NA INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 5803 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 1598591 1598955 1598779 Y NA MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA TMEM184A 134 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr7 1990940 1991132 1991045 Y SNX8,MAFK NA NA NA NA NA AC074389.9 211013 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 2006506 2006818 2006734 Y NA NA NA NA NA NA AC074389.9 226579 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 2569438 2569603 2569498 Y LFNG,LFNG,IQCE,BRAT1 LFNG,BRAT1,IQCE NA NA NA NA LFNG 19275 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 2744937 2745164 2745051 Y NA AMZ1 NA NA NA NA AMZ1 27781 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 2797465 2798227 2798113 Y SNX8,LFNG,GNA12 NA NA NA NA NA AC006028.11 75028 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 2903227 2903785 2903462 Y LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12 AC006028.11,GNA12 GNA12 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNA12 21269 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 2960647 2961036 2960906 Y NA NA NA NA NA NA GNA12 78689 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 2980860 2981267 2981182 Y NA NA NA NA NA NA GNA12 98902 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 3307587 3307977 3307629 Y NA NA SDK1 IMR90 Hi-C 24141950 CARD11 226008 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 4723112 4724257 4723950 Y NA FOXK1 NA NA NA NA FOXK1 41724 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 4765280 4765661 4765569 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 83892 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 4773446 4773760 4773608 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 92058 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 5231323 5231672 5231498 Y WIPI2 WIPI2 NA NA NA NA WIPI2 3504 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 5452779 5453024 5452968 Y NA TNRC18 NA NA NA NA TNRC18 10021 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 5492663 5492953 5492758 Y MMD2,SLC29A4 TNRC18 TNRC18 MCF7 ChIA-PET 22265404 TNRC18 29618 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 5594554 5594977 5594837 Y WIPI2 FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 6438 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 5595490 5596184 5595557 Y CCZ1,ACTB FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 5231 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 5609221 5609424 5609333 Y FBXL18 ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 7806 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 5609541 5610012 5609880 Y SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 8126 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 5634980 5635411 5634989 Y AIMP2,FBXL18,ACTB,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216 IMR90 Hi-C 24141950 FSCN1 4541 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 5635420 5636238 5635862 Y NA ACTB,FSCN1 NA NA NA NA FSCN1 4981 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 6145406 6145878 6145682 Y USP42 EIF2AK1,AC004895.4,USP42 NA NA NA NA USP42 2891 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 6467944 6468137 6468104 Y NA NA NA NA NA NA DAGLB 53684 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 6473446 6473633 6473567 Y DAGLB DAGLB,KDELR2 NA NA NA NA DAGLB 48188 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 6677371 6677641 6677424 Y DAGLB,ZNF12,C7orf26 C7orf26,ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 2418 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr7 6682292 6682670 6682512 Y C7orf26 ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 7339 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 6741580 6741996 6741754 Y C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12 ZNF12,PMS2CL NA NA NA NA ZNF12 2558 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr7 7216835 7216977 7216903 Y NA C1GALT1 C1GALT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 C1GALT1 22270 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 7604061 7604281 7604173 Y MIOS MIOS NA NA NA NA MIOS 222 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 7605671 7605858 7605804 Y NA MIOS NA NA NA NA MIOS 1168 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr7 8550473 8550803 8550530 Y NA NA NA NA NA NA GLCCI1 544048 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 13057101 13057487 13057331 Y NA NA ARL4A IMR90 Hi-C 24141950 ARL4A 332620 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 16707771 16707941 16707875 Y NA ANKMY2,BZW2 NA NA NA NA BZW2 24015 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 17094571 17094955 17094779 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AGR2 223514 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 17409796 17409963 17409863 Y AHR NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC003075.4 72815 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 17412000 17412058 17412028 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC003075.4 75019 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr7 17446496 17446663 17446580 Y AHR NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC003075.4 109515 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 17564000 17564574 17564249 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC003075.4 227019 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.22777181081372 chr7 18548166 18548343 18548284 Y NA NA NA NA NA NA SNX13 570042 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 19146147 19146774 19146493 Y FERD3L,TWIST1 TWIST1 NA NA NA NA TWIST1 8521 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 20154173 20154365 20154304 Y TWISTNB NA NA NA NA NA MACC1 100662 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 20163699 20164108 20163996 Y NA NA NA NA NA NA MACC1 90919 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 20191913 20192270 20192088 Y TWISTNB NA NA NA NA NA MACC1 62757 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 20197239 20197492 20197368 Y NA NA NA NA NA NA MACC1 57535 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 20202226 20202605 20202544 Y NA NA NA NA NA NA MACC1 52422 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 20217388 20217681 20217578 Y TWISTNB,MACC1 MACC1,AC005083.1 NA NA NA NA MACC1 37346 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 20228342 20228547 20228441 Y TWISTNB,ITGB8 MACC1,AC005083.1 NA NA NA NA MACC1 26480 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 20239036 20239390 20239182 Y TWISTNB MACC1,AC005083.1 NA NA NA NA MACC1 15637 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 20240719 20241217 20240796 Y TWISTNB MACC1,AC005083.1 NA NA NA NA MACC1 13810 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 20242848 20242947 20242898 Y NA MACC1,AC005083.1 NA NA NA NA MACC1 12080 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 20254261 20255002 20254926 Y MACC1 MACC1,AC005083.1 NA NA NA NA MACC1 25 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 20386006 20386499 20386153 Y ITGB8 ITGB8 NA NA NA NA ITGB8 17681 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 20439186 20439753 20439406 Y NA NA NA NA NA NA ITGB8 70861 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 20582388 20582432 20582424 Y ITGB8 NA NA NA NA NA ITGB8 214063 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 20837430 20837819 20837731 Y SP8 RPL23P8 SP8 K562 ChIA-PET 22265404 RPL23P8 27126 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 22122614 22122929 22122771 Y NA NA RAPGEF5 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA7L 138912 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 22219345 22219577 22219472 Y NA NA NA NA NA NA CDCA7L 235643 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 22609345 22610034 22609690 Y IL6 NA NA NA NA NA EEF1A1P6 59727 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 22614875 22615270 22614981 Y IL6 NA NA NA NA NA STEAP1B 55274 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 22616988 22617783 22617407 Y IL6 NA NA NA NA NA STEAP1B 52761 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr7 22622740 22623204 22623070 Y NA STEAP1B NA NA NA NA STEAP1B 47340 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 22631710 22632105 22631870 Y IL6 STEAP1B NA NA NA NA STEAP1B 38439 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 22894313 22894860 22894668 Y STEAP1B,TOMM7 TOMM7,AC005682.5 NA NA NA NA AC005682.5 2516 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr7 23060438 23060786 23060654 Y IL6 FAM126A LOC100506178,IL6,SNORD93,TOMM7,FAM126A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM126A 8689 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 23060904 23061101 23061016 Y IL6,FAM126A FAM126A LOC100506178,IL6,SNORD93,TOMM7,FAM126A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM126A 9155 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 23084280 23084501 23084407 Y NA FAM126A SNORD93,LOC100506178,TOMM7 IMR90 Hi-C 24141950 FAM126A 32531 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 23168039 23168122 23168081 Y NA KLHL7-AS1,KLHL7 NA NA NA NA KLHL7 24686 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 23229571 23229876 23229614 Y NA NUPL2,GPNMB NA NA NA NA NUPL2 10125 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 23348040 23348443 23348292 Y KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3 NA NA NA NA NA GPNMB 74454 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 23501559 23501943 23501874 Y NUPL2,IGF2BP3 IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 6143 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 23504984 23505316 23505313 Y NA IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2770 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 23510676 23511223 23510889 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2590 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 23513815 23514383 23514045 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 MALSU1 K562 ChIA-PET 22265404 IGF2BP3 5729 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 24795767 24795828 24795792 Y C7orf31,DFNA5,DFNA5 DFNA5 NA NA NA NA DFNA5 11416 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 24860577 24860798 24860662 Y C7orf31,DFNA5 NA NA NA NA NA DFNA5 53333 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 24861129 24861331 24861204 Y C7orf31,DFNA5 NA NA NA NA NA DFNA5 53885 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 24947142 24947425 24947387 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL3 71828 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 25009429 25009748 25009721 Y NA OSBPL3 NA NA NA NA OSBPL3 9505 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 25064852 25065012 25064919 Y NA OSBPL3 OSBPL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OSBPL3 45599 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr7 25068217 25068495 25068356 Y NA OSBPL3 OSBPL3 IMR90 Hi-C 24141950 OSBPL3 48964 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 25894654 25894946 25894846 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 294914 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr7 25896245 25896461 25896419 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 293399 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chr7 25899920 25900213 25900190 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90 Hi-C 24141950 NFE2L3 289647 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 25980642 25980887 25980804 Y NA NA NA NA NA NA NFE2L3 208973 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 25990725 25991211 25991018 Y NA NA NA NA NA NA NFE2L3 198649 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 26460550 26460642 26460600 Y NA AC004540.5 NA NA NA NA AC004540.5 24337 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 27143635 27143783 27143725 Y NA HOTAIRM1,HOXA1,HOXA2,HOXA-AS2,HOXA5,HOXA6 NA NA NA NA HOXA-AS2 1613 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chr7 27231816 27231998 27231907 Y HOXA10,HOXA11,HOXA13 HOXA6,HOXA7,HOXA10-AS NA NA NA NA HOXA10-AS 25578 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 28076890 28077172 28076964 Y CREB5 NA NA NA NA NA JAZF1-AS1 140769 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 28450839 28451193 28451101 Y CREB5 NA NA NA NA NA CREB5 113899 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 28471608 28471631 28471619 Y CREB5,CREB5 NA NA NA NA NA CREB5 134668 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 28520361 28520389 28520375 Y NA NA NA NA NA NA CREB5 183421 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 30188805 30188913 30188846 Y NA AC007036.5 NA NA NA NA AC007036.5 6234 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr7 30203047 30203422 30203138 Y NA AC007036.5 NA NA NA NA AC007036.5 7900 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr7 30206134 30206379 30206282 Y ZNRF2 AC007036.5 NA NA NA NA AC007036.5 10987 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 30208837 30209260 30209012 Y ZNRF2 AC007036.5 NA NA NA NA AC007036.5 13690 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 30211441 30211675 30211604 Y ZNRF2 AC007036.5 NA NA NA NA AC007036.5 16294 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 30257510 30257901 30257519 Y NA NA NA NA NA NA AC007036.5 62363 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 30264220 30264659 30264440 Y ZNRF2 NA NA NA NA NA ZNRF2 57264 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 30265497 30265992 30265714 Y ZNRF2 NA NA NA NA NA ZNRF2 55931 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 32026855 32027150 32027002 Y NA NA NA NA NA NA LSM5 505745 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 34026970 34027411 34027080 Y BMPER NA NA NA NA NA BMPER 84447 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 35075861 35076697 35076367 Y NA NA NA NA NA NA HERPUD2 656484 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 36480174 36480717 36480189 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0895 52440 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 36698240 36698520 36698401 Y AOAH NA NA NA NA NA NPM1P18 158044 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 38379769 38380269 38379922 Y NA AC006033.22 NA NA NA NA AC006033.22 30785 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 39774001 39774145 39774098 Y CDK13,RALA LINC00265 NA NA NA NA LINC00265 2770 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 40088776 40089159 40088837 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 101140 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 41046291 41046547 41046419 Y NA NA LOC285954,INHBA,C7orf10 IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 694159 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 41147789 41147992 41147892 Y NA NA LOC285954,INHBA,C7orf10 IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 592714 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 41668666 41669019 41668694 Y NA NA C7orf10 IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 71687 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 42174635 42174902 42174765 Y NA NA NA NA NA NA GLI3 100567 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 42896548 42896903 42896642 Y NA NA GLI3 IMR90 Hi-C 24141950 C7orf25 53001 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 42927750 42928726 42928340 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 NA NA NA NA C7orf25 21178 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 43625905 43626316 43625996 Y URGCP,STK17A STK17A C7orf44 IMR90 Hi-C 24141950 STK17A 5548 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 43626451 43626626 43626528 Y URGCP,STK17A STK17A C7orf44 IMR90 Hi-C 24141950 STK17A 6094 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 43644873 43645023 43645002 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 24516 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 43654812 43655175 43654945 Y POLM,DBNL,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 34455 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 43657815 43658085 43657951 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 37458 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 43658377 43658532 43658408 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 38020 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr7 43659947 43660692 43660336 Y DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 39590 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 43670120 43670185 43670135 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 49763 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 43676905 43677264 43677045 Y POLM,DBNL,STK17A,URGCP NA NA NA NA NA STK17A 56548 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 43714128 43714419 43714274 Y NA NA NA NA NA NA BLVRA 81860 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 43732901 43733056 43732913 Y DBNL,STK17A NA NA NA NA NA BLVRA 63223 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 43740255 43740653 43740556 Y GCK NA NA NA NA NA BLVRA 55626 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 43801940 43802267 43802061 Y NA BLVRA NA NA NA NA BLVRA 5661 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 43854418 43854699 43854515 Y NA NA NA NA NA NA MRPS24 52793 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 44085815 44086626 44086335 Y STK17A,DBNL,POLM POLR2J4,DBNL,POLM NA NA NA NA DBNL 3576 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 44297372 44297806 44297600 Y NA NA NA NA NA NA YKT6 58805 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 44436686 44437032 44436900 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2B 64510 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 44677628 44678244 44677873 Y ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH OGDH ZMIZ2 IMR90 Hi-C 24141950 OGDH 33457 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 44678622 44679047 44678972 Y ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH OGDH NA NA NA NA OGDH 34451 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr7 44679392 44679514 44679453 Y ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH OGDH NA NA NA NA OGDH 35221 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 44855333 44855416 44855373 Y TBRG4,H2AFV PPIA,H2AFV NA NA NA NA PPIA 21054 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 44884505 44884603 44884554 Y NA H2AFV,PURB NA NA NA NA H2AFV 1079 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 45442455 45442729 45442646 Y MYO1G NA NA NA NA NA ADCY1 169010 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 45633722 45633912 45633893 Y ADCY1 ADCY1 NA NA NA NA ADCY1 21983 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 45947887 45948101 45948023 Y NA IGFBP1,IGFBP3 NA NA NA NA IGFBP3 11372 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr7 45963987 45964294 45964096 Y NA IGFBP1,IGFBP3 NA NA NA NA IGFBP3 4514 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 46072625 46072971 46072717 Y NA NA NA NA NA NA IGFBP3 113152 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.67082885811029 chr7 46184955 46185274 46185142 Y NA NA NA NA NA NA IGFBP3 225482 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 46186122 46186484 46186177 Y IGFBP3 NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP3 226649 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 46186512 46186858 46186578 Y IGFBP3 NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP3 227039 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr7 46691155 46691159 46691157 Y NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 AC004870.4 316141 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr7 46691314 46691685 46691473 Y NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 AC004870.4 315615 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr7 46972513 46972753 46972628 Y NA AC004870.4 IGFBP3,IGFBP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC004870.4 34547 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 47293209 47293414 47293276 Y NA NA NA NA NA NA AC004870.4 285909 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 47391456 47391672 47391564 Y C7orf65 NA NA NA NA NA TNS3 228484 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 47510195 47510559 47510444 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 109597 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 47514732 47515208 47514929 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 104948 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr7 47579966 47580265 47580181 Y NA TNS3 NA NA NA NA TNS3 39891 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 47611156 47611689 47611507 Y C7orf69,TNS3 TNS3 NA NA NA NA TNS3 8467 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 47620098 47620164 47620135 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 47675013 47675155 47675094 Y TNS3 NA TNS3,C7orf69,PKD1L1,C7orf65,LINC00525 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS3 54857 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.11638322027304 chr7 48122110 48122308 48122209 Y NA C7orf57,UPP1 UPP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 UPP1 3917 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 48126389 48126700 48126545 Y NA UPP1 NA NA NA NA UPP1 164 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 48127053 48127182 48127123 Y HUS1,UPP1,UPP1 UPP1 NA NA NA NA UPP1 828 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 50328982 50329153 50329068 Y GRB10,C7orf72 NA IKZF1 K562 ChIA-PET 22265404 FIGNL1 186935 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 50615386 50615579 50615483 Y GRB10 NA NA NA NA NA FIGNL1 99298 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 51370562 51370701 51370648 Y COBL COBL NA NA NA NA COBL 11814 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 55035120 55035446 55035284 Y EGFR EGFR EGFR IMR90 Hi-C 24141950 EGFR 49268 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 55063452 55063479 55063466 Y NA EGFR EGFR IMR90 Hi-C 24141950 EGFR 21235 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 55063666 55063958 55063856 Y EGFR EGFR EGFR IMR90 Hi-C 24141950 EGFR 20756 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr7 55131480 55131905 55131522 Y EGFR EGFR NA NA NA NA EGFR 46766 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr7 55132578 55133258 55132929 Y SEC61G,EGFR EGFR NA NA NA NA EGFR 47864 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 55134555 55134962 55134733 Y NA EGFR NA NA NA NA EGFR 49841 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 55141624 55142112 55141893 Y SEC61G,EGFR NA NA NA NA NA EGFR 56910 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 55142882 55143327 55143024 Y NA NA NA NA NA NA EGFR 58168 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 55146809 55147410 55146997 Y NA NA NA NA NA NA EGFR 62095 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 55155188 55155533 55155358 Y EGFR NA NA NA NA NA EGFR 70474 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 55167745 55167964 55167855 Y NA NA NA NA NA NA EGFR 83031 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 55198488 55198937 55198616 Y SEC61G NA NA NA NA NA EGFR 113774 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 55200352 55201043 55200686 Y SEC61G,EGFR NA NA NA NA NA EGFR 115638 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 55201472 55201858 55201601 Y SEC61G NA NA NA NA NA EGFR 116758 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr7 55230228 55230334 55230281 Y NA NA NA NA NA NA EGFR 145514 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 55235458 55235690 55235573 Y NA NA NA NA NA NA EGFR 150744 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 55253994 55254266 55254079 Y SEC61G NA NA NA NA NA EGFR 169280 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 55322570 55322956 55322611 Y EGFR NA EGFR,SEC61G IMR90 Hi-C 24141950 LANCL2 108185 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr7 55529793 55530311 55530129 Y ZNF713,VOPP1 NA NA NA NA NA LANCL2 98652 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 55601949 55602581 55602160 Y VOPP1 VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 36100 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 55603072 55603362 55603151 Y VOPP1 VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 35319 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 55637465 55637727 55637601 Y VOPP1 VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 954 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 55638699 55638887 55638779 Y VOPP1 VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 18 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 56168682 56168929 56168809 Y ZNF713 SUMF2,CHCHD2 NA NA NA NA CHCHD2 3340 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 56173322 56173423 56173410 Y NA SUMF2,CHCHD2 NA NA NA NA CHCHD2 1053 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 56243524 56243790 56243559 Y LOC389493 NA NA NA NA NA CHCHD2 71255 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 61968807 61969730 61969008 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPCP7 1989473 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 64196878 64197130 64197096 Y NA NA NA NA NA NA ZNF138 55636 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 66096553 66096745 66096681 Y NA KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1 NA NA NA NA KCTD7 4685 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 66152523 66152575 66152558 Y RABGEF1,KCTD7 RP4-756H11.3,RABGEF1 KCTD7,LOC493754,RABGEF1 IMR90 Hi-C 24141950 RABGEF1 7372 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 66206459 66206659 66206557 Y KCTD7,C7orf42,RABGEF1 NA NA NA NA NA RABGEF1 61308 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 69069799 69069881 69069840 Y NA NA NA NA NA NA RP5-859M6.1 966014 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 70113143 70113470 70113265 Y NA NA NA NA NA NA RP5-859M6.1 2009358 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 72929530 72929887 72929777 Y NA BAZ1B,BCL7B NA NA NA NA BAZ1B 4721 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 72934537 72934921 72934642 Y NA BCL7B NA NA NA NA BAZ1B 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 73002313 73002519 73002399 Y BCL7B BCL7B,TBL2 TBL2 K562 ChIA-PET 22265404 TBL2 11192 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 73015142 73015298 73015257 Y NA BCL7B,TBL2 NA NA NA NA TBL2 24021 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 73062013 73062614 73062579 Y BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A WBSCR22,DNAJC30 MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A IMR90 Hi-C 24141950 WBSCR22 32741 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.00749194459853 chr7 73133049 73133354 73133303 Y NA WBSCR22,DNAJC30,STX1A,ABHD11,CLDN3 NA NA NA NA STX1A 1047 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 73157180 73157738 73157420 Y FZD9,BAZ1B,TBL2,MLXIPL,ABHD11,CLDN4,CLDN3 STX1A,ABHD11,CLDN3 NA NA NA NA ABHD11 5983 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 73236868 73237278 73236968 Y CLDN3,CLDN4 CLDN4,WBSCR27 NA NA NA NA WBSCR27 17587 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr7 73239407 73239632 73239469 Y NA CLDN4,WBSCR27 NA NA NA NA WBSCR27 15233 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 73265870 73266203 73266092 Y BCL7B WBSCR27 NA NA NA NA WBSCR27 11005 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 73512377 73512557 73512465 Y NA LIMK1 NA NA NA NA LIMK1 17114 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 73547862 73548178 73548020 Y NA EIF4H NA NA NA NA EIF4H 38397 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 73686940 73687240 73687175 Y LAT2 RFC2,CLIP2 RFC2,LAT2,CLIP2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIP2 14565 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 73694024 73694283 73694118 Y LAT2 RFC2,CLIP2 CLIP2 IMR90 Hi-C 24141950 CLIP2 7522 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 73704690 73704803 73704747 Y CLIP2 RFC2,CLIP2 NA NA NA NA CLIP2 2885 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 73866647 73867033 73866768 Y LAT2 GTF2IRD1 NA NA NA NA GTF2IRD1 527 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 73897037 73897256 73897156 Y NA GTF2IRD1 NA NA NA NA GTF2IRD1 30917 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 74050043 74050194 74050049 Y GTF2IRD2B GTF2I GTF2IRD1,GTF2I IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTF2I 19800 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 74064444 74064957 74064539 Y GTF2IRD2B,LAT2 GTF2I NA NA NA NA GTF2I 5037 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 74138320 74138615 74138328 Y NA NA NA NA NA NA GTF2I 68326 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 75268782 75269322 75269061 Y NA NA NA NA NA NA HIP1 96958 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 75522158 75522529 75522343 Y RHBDD2 POR NA NA NA NA POR 3989 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 75546128 75546229 75546156 Y NA POR STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 POR 19610 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 75563701 75564093 75563872 Y POR POR NA NA NA NA POR 37183 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 75795833 75796053 75795969 Y RHBDD2,POR SRRM3 SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 SRRM3 33163 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr7 75923846 75924306 75924205 Y HSPB1 HSPB1 NA NA NA NA HSPB1 5555 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 75934206 75934543 75934471 Y NA HSPB1 NA NA NA NA HSPB1 4345 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 75940045 75940212 75940167 Y NA HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 10184 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 75947305 75947626 75947472 Y RHBDD2,SRRM3 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 17444 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr7 75948116 75948327 75948250 Y RHBDD2 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 18255 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 75993825 75994303 75994024 Y NA YWHAG,ZP3 YWHAG MCF7 ChIA-PET 22265404 YWHAG 7477 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 76052692 76053023 76052931 Y NA ZP3 NA NA NA NA ZP3 27857 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 77428722 77429286 77429067 Y PION,PTPN12,RSBN1L,PHTF2,PHTF2 TMEM60,PHTF2 NA NA NA NA PHTF2 2600 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 78922771 78923130 78923056 Y MAGI2 NA NA NA NA NA GNAI1 838141 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 79776985 79777288 79777110 Y NA GNAI1 NA NA NA NA GNAI1 15714 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr7 79803492 79803786 79803598 Y NA GNAI1 NA NA NA NA GNAI1 42221 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 80128570 80128822 80128710 Y NA NA NA NA NA NA GNAI1 367299 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 80352083 80352704 80352185 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3C 196971 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 80441834 80442054 80441993 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3C 107621 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 80550378 80550824 80550614 Y NA SEMA3C NA NA NA NA SEMA3C 703 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr7 80571600 80571811 80571745 Y NA SEMA3C NA NA NA NA SEMA3C 21925 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr7 80704469 80704743 80704590 Y SEMA3C NA SEMA3C MCF7 ChIA-PET 22265404 SEMA3C 154794 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 83688045 83688341 83688303 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3E 411719 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 83865799 83865921 83865847 Y NA NA SEMA3A,SEMA3D IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3A 254119 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 83866816 83867276 83866988 Y NA NA SEMA3A,SEMA3D IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3A 252764 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 84165433 84165798 84165584 Y NA SEMA3A NA NA NA NA SEMA3A 45393 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 84267436 84267624 84267532 Y NA NA SEMA3A IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3A 147396 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 86948267 86948659 86948457 Y CROT TP53TG1,CROT NA NA NA NA TP53TG1 24172 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 87886356 87886519 87886436 Y STEAP4 SRI,STEAP4 NA NA NA NA SRI 32048 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 87918906 87919150 87919043 Y SRI STEAP4 NA NA NA NA STEAP4 15056 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.67082885811029 chr7 90637974 90638276 90638003 Y NA NA NA NA NA NA FZD1 253507 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 90861359 90861732 90861539 Y NA FZD1 NA NA NA NA FZD1 30051 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 91456025 91456190 91456079 Y NA NA NA NA NA NA MTERF 51844 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 92156983 92157235 92157087 Y CDK6,CDK6,PEX1,FAM133B,C7orf64 PEX1,RBM48 NA NA NA NA RBM48 896 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 92217809 92218139 92217980 Y NA FAM133B NA NA NA NA FAM133B 101 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 92227351 92227620 92227450 Y CDK6,CDK6 FAM133B FAM133B K562 ChIA-PET 22265404 FAM133B 9643 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 92233387 92233691 92233548 Y NA FAM133B FAM133B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 FAM133B 15679 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 92260832 92261202 92261012 Y NA FAM133B FAM133B K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 43124 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 92261439 92261837 92261823 Y NA FAM133B FAM133B K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 43731 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 92263416 92263696 92263624 Y SAMD9,CDK6 FAM133B FAM133B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 45708 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 92282305 92282698 92282463 Y LRRD1,KRIT1,KRIT1,KRIT1,SAMD9L,SAMD9 NA NA NA NA NA FAM133B 64597 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 92382003 92382200 92382102 Y CDK6 NA NA NA NA NA AC002454.1 81597 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 92437286 92437617 92437517 Y SAMD9 AC002454.1,CDK6 NA NA NA NA AC002454.1 26180 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 92463754 92464079 92463922 Y CDK6,CDK6 NA NA NA NA NA AC002454.1,CDK6 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 92533719 92534002 92533863 Y SAMD9 NA FAM133B IMR90 Hi-C 24141950 CDK6 69811 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 92745192 92745375 92745297 Y SAMD9 SAMD9L NA NA NA NA SAMD9 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 93812688 93813130 93812921 Y NA NA TFPI2,BET1,GNGT1 IMR90 Hi-C 24141950 BET1 180994 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 94286949 94287416 94287082 Y PPP1R9A,PPP1R9A,CASD1,PEG10,PEG10 SGCE,PEG10 NA NA NA NA PEG10 3312 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 95546532 95546890 95546577 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 402569 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 95835254 95835261 95835258 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 114198 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 97763037 97763356 97763224 Y BRI3,LMTK2 LMTK2 NA NA NA NA LMTK2 28840 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr7 97915595 97916070 97915699 Y LMTK2,BRI3 TECPR1,BRI3 NA NA NA NA BRI3 35904 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 97994295 97994325 97994312 Y BAIAP2L1 RPS3AP26,BAIAP2L1 BRI3 IMR90 Hi-C 24141950 RPS3AP26 19571 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 97995155 97995543 97995349 Y NA RPS3AP26,BAIAP2L1 BRI3 IMR90 Hi-C 24141950 RPS3AP26 18353 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 98048213 98048460 98048408 Y BRI3 RPS3AP26,BAIAP2L1 BAIAP2L1,TRRAP,TMEM130 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BAIAP2L1 19833 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 98557558 98557720 98557639 Y KPNA7 NA NA NA NA NA MIR3609 80285 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 98809347 98809684 98809536 Y ZNF655,ZNF655,ZKSCAN5,PTCD1,PDAP1,FAM200A,CPSF4,BUD31,ATP5J2,ARPC1A,SMURF1,KPNA7 NA SMURF1 IMR90 Hi-C 24141950 SMURF1 69624 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 98990795 98991133 98991082 Y NA ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4 NA NA NA NA BUD31 13131 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 99000499 99000617 99000560 Y NA ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4 NA NA NA NA BUD31 3647 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 99957855 99958254 99957887 Y NA PILRB,PMS2P1 NA NA NA NA PMS2P1 20324 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 100140069 100140501 100140294 Y NA AGFG2,LRCH4 NA NA NA NA AGFG2 5235 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 100143295 100143664 100143516 Y NA AGFG2,LRCH4 NA NA NA NA AGFG2 8461 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 100144113 100144628 100144364 Y NA AGFG2,LRCH4 NA NA NA NA AGFG2 9279 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 100167857 100168189 100168134 Y NA AGFG2,LRCH4,MOSPD3 NA NA NA NA LRCH4 13587 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 100743461 100743946 100743576 Y GNB2,TRIM56 TRIM56,SERPINE1 SERPINE1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM56 16741 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 100752309 100752636 100752570 Y NA TRIM56,SERPINE1,AP1S1 NA NA NA NA SERPINE1 15734 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 100760673 100761017 100760905 Y GNB2,EPHB4,ZNHIT1,PLOD3,AP1S1,SERPINE1 TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF AP1S1,VGF MCF7 ChIA-PET 22265404 SERPINE1 7353 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 100765253 100766084 100765924 Y TRIM56,SERPINE1 TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF NA NA NA NA SERPINE1 2286 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr7 100772573 100772742 100772614 Y SERPINE1 TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF NA NA NA NA SERPINE1 4203 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 100772917 100773243 100773005 Y SERPINE1 TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF NA NA NA NA SERPINE1 4547 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 101372678 101373024 101372861 Y NA NA CUX1,EMID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUX1 83935 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 101525517 101525682 101525579 Y SH2B2,CUX1,CUX1 NA NA NA NA NA CUX1 68558 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 101585210 101585567 101585389 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 128251 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 101609189 101609564 101609377 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 152230 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 101678350 101678537 101678444 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 221391 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 101690848 101690892 101690861 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 233889 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 101705228 101705677 101705492 Y SH2B2,ORAI2,CUX1,CUX1 NA NA NA NA NA CUX1 248269 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 101707897 101708291 101708217 Y SH2B2,CUX1,CUX1 NA NA NA NA NA CUX1 250938 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 101775527 101775981 101775908 Y CUX1,CUX1,SH2B2,ORAI2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 226338 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 101929501 101929660 101929574 Y CUX1,CUX1,CUX1,POLR2J3,ORAI2,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72659 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72006 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.00749194459853 chr7 101931211 101931437 101931291 Y CUX1,CUX1,CUX1,ORAI2,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 70882 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 102104317 102104602 102104460 Y NA ORAI2,ALKBH4,LRWD1,POLR2J NA NA NA NA LRWD1 941 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 102959356 102959407 102959404 Y PMPCB,DNAJC2 DPY19L2P2,PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4 NA NA NA NA PSMC2 23294 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 103277543 103277794 103277680 Y NA NA NA NA NA NA CTA-276O3.4 290495 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 104585458 104586124 104585640 Y MLL5 RP11-325F22.2 LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-325F22.2 5948 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 104603312 104603563 104603438 Y MLL5 RP11-325F22.2,LINC01004 NA NA NA NA RP11-325F22.2 23802 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 104607797 104607862 104607830 Y NA RP11-325F22.2,LINC01004 NA NA NA NA RP11-325F22.2 28287 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 104608110 104608364 104608281 Y NA RP11-325F22.2,LINC01004 NA NA NA NA RP11-325F22.2 28600 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 104612836 104613032 104612935 Y NA RP11-325F22.2,LINC01004 NA NA NA NA RP11-325F22.2 33326 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 104614051 104614727 104614598 Y NA RP11-325F22.2,LINC01004 NA NA NA NA RP11-325F22.2 34541 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 104771248 104771300 104771252 Y NA NA NA NA NA NA LINC01004 119757 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 105459888 105460220 105459903 Y NA CTA-351J1.1 NA NA NA NA CTA-351J1.1 1950 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 105705488 105705603 105705542 Y NA SYPL1 ATXN7L1,SYPL1,CDHR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SYPL1 45419 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 105856842 105857229 105857099 Y NA NA NAMPT,CCDC71L IMR90 Hi-C 24141950 NAMPT 67543 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 105984735 105985626 105985459 Y FLJ36031,NAMPT NA NAMPT,CCDC71L,PIK3CG K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NAMPT 59963 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 106057745 106058020 106057851 Y NA NA NAMPT,CCDC71L,CDHR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAMPT 132973 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 106280912 106281173 106281054 Y NAMPT,PIK3CG AC004917.1,CCDC71L NA NA NA NA AC004917.1 18169 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 106358724 106358979 106358846 Y NAMPT,PIK3CG,HBP1,FLJ36031 NA CCDC71L,NAMPT IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP5-884M6.1 54478 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 106398803 106399173 106398917 Y FLJ36031 RP5-884M6.1 CCDC71L,PIK3CG,PRKAR2B,HBP1 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-884M6.1 14284 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 106413227 106413352 106413289 Y FLJ36031 RP5-884M6.1 CCDC71L,HBP1,NAMPT,CBLL1,PIK3CG,PRKAR2B IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP5-884M6.1 105 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr7 106808132 106808705 106808532 Y NA HBP1 NA NA NA NA HBP1 726 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 106838325 106838672 106838499 Y NA HBP1 NA NA NA NA HBP1 30919 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 106901302 106901364 106901333 Y NA NA NA NA NA NA HBP1 93896 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 107205466 107205592 107205534 Y COG5 DUS4L,COG5,BCAP29 NA NA NA NA COG5 2507 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 107573965 107574445 107574339 Y LAMB1 DLD NA NA NA NA DLD 44550 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 110849154 110849473 110849333 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 351100 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 110856868 110857086 110856977 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 343487 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 110956734 110956926 110956906 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 243647 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 115957025 115957120 115957073 Y NA CAV2,AC073130.3 CAV1,CAV2,TES,CAPZA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC073130.3 8830 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr7 115957232 115957778 115957588 Y NA CAV2,AC073130.3 CAV1,CAV2,TES,CAPZA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC073130.3 8172 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 115995232 115995555 115995330 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 AC073130.3 CAV2,CAV1,TES,MET IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC073130.3 29282 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.11638322027304 chr7 116035470 116035688 116035648 Y NA NA CAV1 IMR90 Hi-C 24141950 AC073130.3 69520 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 116081825 116082043 116081830 Y NA NA TES,CAV2,CAV1,MET IMR90,MCF7,HELA Hi-C,ChIA-PET,5C 24141950,22265404,22955621 AC002066.1 55476 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 116083167 116083483 116083344 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 NA TES,CAV2,CAV1,MET IMR90,MCF7,HELA Hi-C,ChIA-PET,5C 24141950,22265404,22955621 AC002066.1 54036 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.55944026756961 chr7 116135780 116136169 116135975 Y NA AC002066.1,CAV1 NA NA NA NA AC002066.1 1350 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 116152142 116152412 116152205 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1 AC002066.1,CAV1 CAV1 IMR90 Hi-C 24141950 CAV1 10427 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 116168216 116168790 116168273 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 AC002066.1,CAV1 NA NA NA NA CAV1 5377 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 116202174 116202561 116202326 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 CAV1 NA NA NA NA CAV1 39335 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr7 116223147 116223399 116223366 Y CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 NA TES,MET,CAV2,CAV1 GM12878,H1ESC,IMR90 5C,Hi-C 22955621,24141950 CAV1 60308 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 116292970 116293085 116293033 Y NA MET MET IMR90 Hi-C 24141950 MET 17359 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 116314942 116315351 116315128 Y ST7,TES,CAV2,CAV2,MET MET NA NA NA NA MET 4498 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 116319612 116319902 116319758 Y NA MET NA NA NA NA MET 9168 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 116328034 116328226 116328184 Y ST7,CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,MET MET NA NA NA NA MET 17590 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 116332814 116332936 116332875 Y CAPZA2,TES MET NA NA NA NA MET 22370 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 116356493 116356879 116356812 Y NA MET NA NA NA NA MET 46049 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 116504290 116504456 116504319 Y NA NA NA NA NA NA CAPZA2 55166 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 116523983 116524309 116524052 Y NA NA NA NA NA NA ST7 66983 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 116651956 116652355 116652105 Y NA NA NA NA NA NA ST7-AS1 59568 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 116804623 116804954 116804811 Y NA NA NA NA NA NA ST7-AS1 212235 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 120723269 120723399 120723324 Y C7orf58 NA NA NA NA NA ING3 134466 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 120724784 120725242 120725000 Y C7orf58 NA NA NA NA NA ING3 135981 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 120938122 120938485 120938307 Y FAM3C NA NA NA NA NA FAM3C 95933 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 121025846 121026096 121025939 Y ING3 FAM3C NA NA NA NA FAM3C 8322 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 121170486 121170616 121170551 Y NA NA FAM3C,WNT16 IMR90 Hi-C 24141950 FAM3C 136068 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 121874177 121874561 121874390 Y NA NA NA NA NA NA AASS 91843 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 122148231 122148536 122148406 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P31 170808 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 123283866 123284127 123283979 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA5 87557 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 123387767 123387941 123387854 Y NA WASL NA NA NA NA WASL 646 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 127807416 127807928 127807646 Y LRRC4 NA SND1 IMR90 Hi-C 24141950 RBM28 174034 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 127808367 127808804 127808463 Y LRRC4 NA SND1 IMR90 Hi-C 24141950 RBM28 173158 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.56193758243578 chr7 128468302 128468509 128468385 Y FLNC CCDC136,ATP6V1F NA NA NA NA FLNC 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 129078824 129079119 129078920 Y NA RP11-305M3.2,RNU1-72P NA NA NA NA RP11-305M3.2 30613 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 129418602 129418801 129418733 Y NA NA UBE2H,NRF1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 169047 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 129419118 129419176 129419138 Y NA NA UBE2H,NRF1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 169563 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 129419876 129420343 129420085 Y NA NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 170321 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr7 129460659 129460706 129460683 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 130083 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 129464915 129465297 129464948 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 125492 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 129465628 129465864 129465722 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 124925 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 129469996 129470292 129470140 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 120497 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 129508183 129508482 129508331 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 82307 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 129508753 129509075 129508928 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 81714 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 129598516 129598781 129598654 Y NRF1,UBE2H,UBE2H UBE2H UBE2H,NRF1,AHCYL2,SMO,ZC3HC1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 UBE2H 7727 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 129609674 129609888 129609791 Y NA UBE2H AHCYL2,ZC3HC1,SMO,UBE2H IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2H 18885 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 129649203 129649568 129649512 Y NRF1 ZC3HC1 NA NA NA NA ZC3HC1 39723 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 129650131 129650429 129650342 Y NRF1 ZC3HC1 NA NA NA NA ZC3HC1 38862 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 130005430 130005716 130005580 Y TMEM209 NA NA NA NA NA CPA4 74456 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr7 130005893 130006126 130006010 Y MEST NA NA NA NA NA CEP41 74148 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 130013597 130013906 130013823 Y CPA2,CPA1 NA NA NA NA NA CEP41 66368 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 130552122 130552429 130552276 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 43640 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 130571851 130572495 130572306 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 23574 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 130575591 130576512 130576394 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 19557 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr7 130581597 130582393 130581985 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 13676 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 130583676 130584341 130584164 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 11728 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 130586004 130586434 130586371 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 9635 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.33916040135441 chr7 130588239 130588699 130588531 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 7370 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr7 130589567 130590049 130589961 Y NA MIR29A MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 6020 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr7 130593505 130595916 130594870 Y NA MIR29A MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 153 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr7 130601178 130601963 130601463 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A FLJ43663 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 5109 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 130602337 130602820 130602733 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A FLJ43663 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 6268 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 130614674 130615489 130615212 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 18605 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 130633473 130633870 130633858 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 37404 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 130636331 130636776 130636707 Y MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 40262 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 130641725 130642119 130642041 Y MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 45656 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 130644314 130644883 130644570 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 48245 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 130645057 130645459 130645325 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 48988 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 130695403 130695870 130695708 Y MKLN1 NA NA NA NA NA MKLN1 96985 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 130756735 130757090 130757043 Y NA MKLN1,LINC-PINT NA NA NA NA MKLN1 35765 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 130873403 130873921 130873619 Y MKLN1,MKLN1 NA NA NA NA NA AC009362.2 51428 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 130920397 130920794 130920689 Y MKLN1,MKLN1 AC009362.2 NA NA NA NA AC009362.2 4555 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 132441115 132441141 132441128 Y NA NA FLJ40288 IMR90 Hi-C 24141950 CHCHD3 323707 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 134117156 134117311 134117298 Y NA AKR1B1 NA NA NA NA AKR1B1 24725 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr7 134475089 134475514 134475151 Y CALD1 CALD1 NA NA NA NA CALD1 48086 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 134677531 134677740 134677636 Y AGBL3 AGBL3 NA NA NA NA AGBL3 8272 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 134862087 134862457 134862329 Y NA TMEM140,C7orf49,WDR91 NA NA NA NA C7orf49 8540 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr7 135443440 135443607 135443468 Y FAM180A NA C7orf73,SLC13A4 IMR90 Hi-C 24141950 C7orf73 98196 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 136900611 136900746 136900679 Y NA NA NA NA NA NA CREB3L2 784067 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 138643234 138643648 138643551 Y TRIM24,SVOPL,UBN2,LUC7L2,KIAA1549 KIAA1549 NA NA NA NA KIAA1549 20416 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 138791748 138791993 138791908 Y UBN2,LUC7L2,ZC3HAV1 ZC3HAV1,TTC26 NA NA NA NA ZC3HAV1 472 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 138917056 138917428 138917261 Y ZC3HAV1,UBN2 UBN2 NA NA NA NA UBN2 3954 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 139365521 139365926 139365718 Y NA NA NA NA NA NA HIPK2 109651 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 139425752 139426584 139426362 Y TBXAS1,JHDM1D HIPK2 NA NA NA NA HIPK2 48993 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 139930863 139931473 139931211 Y TBXAS1,JHDM1D NA LOC100134229,JHDM1D MCF7 ChIA-PET 22265404 PARP12 169342 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 140947588 140947591 140947590 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-74P 197539 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 141804639 141804894 141804740 Y CLEC5A,TAS2R38 NA NA NA NA NA SSBP1 368518 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 142246179 142246560 142246372 Y EPHB6 NA EPHB6 IMR90 Hi-C 24141950 TRBV30 262524 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 143072489 143072836 143072701 Y GSTK1,FAM115C AC093673.5,ZYX,EPHA1 NA NA NA NA AC093673.5 2752 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 143083267 143084129 143083354 Y TAS2R40,FAM131B,FAM131B AC093673.5,ZYX,EPHA1 NA NA NA NA ZYX 7094 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr7 148269293 148269443 148269383 Y NA AC005229.5 NA NA NA NA AC005229.5 6050 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.56193758243578 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA RNY5 EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNY5 1693 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr7 148680544 148680840 148680694 Y NA RNY5,PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 42893 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 148684338 148684706 148684475 Y NA RNY5,PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 39027 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 148685182 148685277 148685231 Y NA RNY5,PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 38456 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 148788414 148788490 148788418 Y CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398 ZNF786,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2540 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 148788628 148788884 148788863 Y ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398 ZNF786,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2754 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 149323228 149323272 149323250 Y NA ZNF767 NA NA NA NA ZNF767 3385 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 149468740 149469267 149468803 Y NA ZNF467 NA NA NA NA ZNF467 172 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 149471511 149471709 149471700 Y ATP6V0E2,SSPO ZNF467 NA NA NA NA ZNF467 2943 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 151157060 151157432 151157203 Y NA NA CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 57774 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 151182414 151182755 151182660 Y AGAP3,PRKAG2 RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 32451 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 151184518 151184840 151184768 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 30366 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 151193551 151193826 151193799 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 21380 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 151198552 151198933 151198803 Y AGAP3,PRKAG2,PRKAG2 RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 16273 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 151199311 151199621 151199557 Y NA RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 15585 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 151442202 151442898 151442523 Y NA NA CRYGN,RHEB IMR90 Hi-C 24141950 PRKAG2-AS1 129229 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 151453235 151453789 151453377 Y SMARCD3,SMARCD3,RHEB,PRKAG2,PRKAG2 NA NA NA NA NA PRKAG2-AS1 118338 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 151458371 151458727 151458520 Y SMARCD3,SMARCD3,PRKAG2 NA NA NA NA NA PRKAG2-AS1 113400 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 151479942 151479960 151479953 Y NA NA NA NA NA NA PRKAG2-AS1 92167 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 152065077 152065428 152065152 Y NA NA NA NA NA NA FABP5P3 66552 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 152105895 152106094 152106005 Y NA FABP5P3 NA NA NA NA FABP5P3 25886 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 152123020 152123275 152123182 Y NA FABP5P3 NA NA NA NA FABP5P3 8705 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA FABP5P3 NA NA NA NA FABP5P3 28735 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 152161348 152162014 152161594 Y NA FABP5P3 NA NA NA NA FABP5P3 29368 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 152338571 152338711 152338613 Y NA XRCC2 NA NA NA NA XRCC2 32539 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 153585684 153585818 153585716 Y DPP6,DPP6,DPP6 NA NA NA NA NA ACTR3B 1130850 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 154730644 154730988 154730877 Y NA NA NA NA NA NA PAXIP1 61806 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 154742897 154743129 154742996 Y NA PAXIP1 NA NA NA NA PAXIP1 49665 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 154999343 155001070 155000829 Y NA NA INSIG1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 INSIG1 86416 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 155006028 155006426 155006187 Y NA NA NA NA NA NA INSIG1 81060 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 155141940 155142097 155142021 Y NA NA INSIG1,LOC100128264,HTR5A,PAXIP1,LOC100132707,LOC202781 IMR90 Hi-C 24141950 INSIG1 54454 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 155276719 155276807 155276762 Y PAXIP1,CNPY1 NA NA NA NA NA RBM33 158338 CAGE SAS hg19 FANTOM5 4.67832080270882 chr7 155580383 155580450 155580415 Y NA SHH NA NA NA NA SHH 22517 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 155744375 155744769 155744531 Y NA NA LOC285889,SHH,LMBR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SHH 141408 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 155752755 155752934 155752845 Y SHH NA LOC285889 IMR90 Hi-C 24141950 SHH 149788 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 155754558 155754796 155754722 Y NA NA LOC285889 IMR90 Hi-C 24141950 SHH 151591 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr7 156409241 156409518 156409427 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-31P 253254 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 156444597 156444947 156444772 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-31P 217825 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 156735476 156735625 156735551 Y MNX1 NOM1 LMBR1 K562 ChIA-PET 22265404 NOM1 4792 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 156932490 156932855 156932681 Y NA UBE3C NA NA NA NA UBE3C 2883 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 157034052 157034373 157034213 Y NA NA NA NA NA NA RP4-814D15.2 50990 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 157082177 157082296 157082243 Y NA DNAJB6 NA NA NA NA DNAJB6 43779 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 157082402 157082699 157082633 Y NA DNAJB6 NA NA NA NA DNAJB6 43376 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 157085416 157085724 157085621 Y DNAJB6,DNAJB6 DNAJB6 NA NA NA NA DNAJB6 40351 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 157092515 157093215 157092989 Y DNAJB6,DNAJB6 DNAJB6 UBE3C,DNAJB6 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB6 32860 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 157110858 157111344 157110968 Y NA DNAJB6 UBE3C,DNAJB6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAJB6 14731 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 157956905 157957265 157957085 Y PTPRN2 NA NA NA NA NA NCAPG2 538255 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 158167398 158167566 158167494 Y NA NA NA NA NA NA NCAPG2 327954 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 158196067 158196294 158196241 Y NA NA NA NA NA NA NCAPG2 299226 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 158224670 158224991 158224878 Y NA NA NA NA NA NA NCAPG2 270529 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr7 158225517 158225999 158225657 Y NA NA NA NA NA NA NCAPG2 269521 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr7 158387429 158387829 158387629 Y WDR60 NA PTPRN2 K562 ChIA-PET 22265404 NCAPG2 107691 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr7 158493510 158493807 158493659 Y NCAPG2 NCAPG2 NA NA NA NA NCAPG2 1713 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr7 158765978 158766170 158766074 Y NA NA NCAPG2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR60 118709 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 479972 480137 480087 Y NA NA NA NA NA NA FBXO25 125544 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 1780723 1781665 1781560 Y NA ARHGEF10 NA NA NA NA ARHGEF10 10581 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 2263330 2263439 2263406 Y NA NA NA NA NA NA RP11-439C15.4 342527 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 6443237 6443295 6443265 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2541M15.1 120435 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 6481206 6481441 6481325 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2541M15.1 82289 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 6490542 6490767 6490601 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2541M15.1 72963 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 6536860 6537447 6537204 Y NA CTD-2541M15.1,AGPAT5 LOC100287015,MCPH1,ANGPT2 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2541M15.1 26283 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 6575644 6576065 6575803 Y MCPH1,AGPAT5 CTD-2541M15.1,AGPAT5 NA NA NA NA AGPAT5 11766 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 8147008 8147233 8147135 Y NA NA SGK223,MFHAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SGK223 94775 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 8153597 8154098 8153801 Y NA NA MFHAS1,SGK223,CLDN23,FLJ10661 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SGK223 87910 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr8 8746516 8746997 8746809 Y CLDN23 MFHAS1 NA NA NA NA MFHAS1 2158 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 8878847 8879137 8878870 Y NA ERI1 NA NA NA NA ERI1 21190 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 8897951 8898142 8898036 Y NA ERI1 MIR4660 IMR90 Hi-C 24141950 ERI1 40294 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 8932382 8932915 8932599 Y CLDN23,PPP1R3B NA PPP1R3B,ERI1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PPP1R3B 74169 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 8939736 8940088 8939838 Y CLDN23,ERI1,PPP1R3B NA ERI1,PPP1R3B,TNKS IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R3B 66996 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 9764051 9764441 9764391 Y MSRA NA NA NA NA NA MSRA 145337 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 10573649 10573859 10573801 Y SOX7 C8orf74 NA NA NA NA C8orf74 45502 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 10591008 10591121 10591065 Y RP1L1,SOX7 NA NA NA NA NA C8orf74 62861 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 10659261 10659473 10659367 Y NA SOX7,PINX1 NA NA NA NA SOX7 35884 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 11312887 11313950 11313920 Y NA FAM167A NA NA NA NA FAM167A 16274 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr8 11314255 11315026 11314813 Y XKR6,MTMR9,FAM167A FAM167A NA NA NA NA FAM167A 15198 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 11337266 11337614 11337440 Y FAM167A FAM167A C8orf12,BLK IMR90 Hi-C 24141950 FAM167A 7042 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 13210778 13210972 13210875 Y NA NA NA NA NA NA DLC1 160195 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 13224231 13224684 13224410 Y NA NA NA NA NA NA DLC1 146483 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr8 15546823 15547116 15546970 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC2 1464422 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 16609902 16609923 16609912 Y VPS37A NA TUSC3,MSR1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC2 401615 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 16629867 16630175 16630011 Y ZDHHC2 NA TUSC3,MSR1,SGCZ,ZDHHC2 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC2 381363 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 17165650 17166030 17165840 Y PDGFRL NA NA NA NA NA CNOT7 63263 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 19266409 19266742 19266623 Y CSGALNACT1 NA NA NA NA NA SH2D4A 97281 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 20126353 20126692 20126612 Y NA NA DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1 IMR90 Hi-C 24141950 ATP6V1B2 73475 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr8 21775759 21776194 21775973 Y PHYHIP,DOK2,NPM2 XPO7 NA NA NA NA XPO7 579 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 21804083 21804253 21804128 Y NA XPO7 NA NA NA NA XPO7 28903 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 21999982 22000221 22000101 Y POLR3D NUDT18,HR,REEP4,BMP1 NA NA NA NA REEP4 2518 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr8 22439546 22439823 22439672 Y NA SORBS3,C8orf58 NA NA NA NA C8orf58 15291 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 22522684 22522941 22522886 Y NA BIN3,EGR3 NA NA NA NA BIN3 1720 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 22535910 22536200 22536167 Y NA BIN3,EGR3 NA NA NA NA BIN3 11249 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 22551843 22553123 22552848 Y PPP3CC,PDLIM2,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10C,EGR3 BIN3,EGR3 NA NA NA NA EGR3 3028 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr8 22561043 22561327 22561142 Y PPP3CC,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10B,EGR3 BIN3,EGR3 NA NA NA NA EGR3 12228 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr8 22573211 22573477 22573404 Y PPP3CC,PDLIM2,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10C,TNFRSF10B,EGR3 BIN3,EGR3 NA NA NA NA EGR3 24396 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 22710401 22710511 22710455 Y NA NA NA NA NA NA RHOBTB2 132419 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 22858322 22858618 22858470 Y EGR3,EGR3,RHOBTB2,RHOBTB2 RHOBTB2 NA NA NA NA RHOBTB2 15392 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 23020215 23020436 23020325 Y NA TNFRSF10D NA NA NA NA TNFRSF10D 672 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 23202733 23203217 23203148 Y LOXL2 NA NA NA NA NA R3HCC1 77100 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 23210314 23210863 23210698 Y NA NA NA NA NA NA LOXL2 69978 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 23245818 23245947 23245883 Y NA LOXL2 NA NA NA NA LOXL2 34894 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 23353842 23353942 23353892 Y TNFRSF10C,SLC25A37 ENTPD4,SLC25A37 NKX3-1,SLC25A37,NKX2-6 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A37 30376 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 23618921 23619563 23619216 Y ENTPD4,ENTPD4 NA STC1,ENTPD4 IMR90 Hi-C 24141950 NKX3-1 80481 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 23655999 23656321 23656218 Y STC1 NA STC1,SLC25A37 IMR90 Hi-C 24141950 STC1 53999 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 24013716 24014104 24013764 Y STC1 NA STC1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-148P 81045 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 25092167 25092564 25092364 Y NA NA NA NA NA NA DOCK5 51929 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 25284653 25284746 25284700 Y NA KCTD9,CDCA2 NA NA NA NA KCTD9 29246 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 26008929 26009154 26009015 Y NA NA PPP2R2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2R2A 137853 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 26162518 26162881 26162571 Y NA PPP2R2A NA NA NA NA PPP2R2A 15511 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 26306627 26307336 26307213 Y NA NA BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DPYSL2 62455 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 26437404 26437761 26437433 Y PNMA2,DPYSL2,DPYSL2 NA NA NA NA NA DPYSL2 67613 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 27076185 27076260 27076223 Y EPHX2,ADRA1A NA NA NA NA NA TRIM35 90576 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 27192227 27192436 27192262 Y PTK2B,PTK2B TRIM35,PTK2B NA NA NA NA PTK2B 25228 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 27200806 27201031 27200919 Y PTK2B,PTK2B TRIM35,PTK2B NA NA NA NA PTK2B 33807 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 27219305 27219672 27219420 Y PTK2B,PTK2B NA NA NA NA NA PTK2B 52306 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 27219743 27220043 27219778 Y PTK2B,PTK2B NA NA NA NA NA PTK2B 52744 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 27464961 27465271 27465267 Y NA CLU,SCARA3 NA NA NA NA CLU 5277 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 27474556 27474730 27474657 Y NA CLU,SCARA3 SCARA3,TRIM35,CLU,CCDC25,ESCO2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CLU 4008 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 28569820 28569970 28569874 Y ZNF395,FZD3,EXTL3 NA NA NA NA NA EXTL3 113834 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 28930417 28930501 28930459 Y NA CTD-2647L4.4 NA NA NA NA CTD-2647L4.4 18965 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 29144637 29144837 29144777 Y NA KIF13B KIF13B IMR90 Hi-C 24141950 KIF13B 25996 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 29213594 29213602 29213597 Y NA DUSP4 DUSP4 MCF7 ChIA-PET 22265404 DUSP4 7409 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 29248095 29248236 29248197 Y NA DUSP4 MIR3148 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 41910 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 29412862 29413263 29412985 Y DUSP4,DUSP4 NA DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR548O2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 206677 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 29413574 29413927 29413748 Y DUSP4 NA DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR548O2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 207389 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 29511970 29512365 29512072 Y KIF13B NA DUSP4,MIR3148,C8orf75,LOC286135 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 305785 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 29516615 29516871 29516762 Y KIF13B NA DUSP4,MIR3148,C8orf75,LOC286135 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 310430 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 29522725 29523096 29522814 Y KIF13B NA LOC286135,DUSP4,C8orf75 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 316540 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr8 29526859 29527039 29527017 Y NA NA LOC286135,DUSP4,C8orf75 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 320674 CAGE SAS hg19 FANTOM5 5.01248657433088 chr8 29533274 29533303 29533292 Y NA NA DUSP4 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 327089 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 29595040 29595214 29595121 Y KIF13B,DUSP4,DUSP4,TMEM66,LEPROTL1 NA NA NA NA NA TMEM66 343509 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 29705863 29706038 29705974 Y MBOAT4 NA NA NA NA NA TMEM66 232685 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 29758918 29759047 29759036 Y NA NA DUSP4,LOC286135,C8orf75 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM66 179676 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 29948448 29949236 29948548 Y TMEM66,LEPROTL1 TMEM66,LEPROTL1,RPS15AP24 NA NA NA NA LEPROTL1 1678 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 30015593 30015700 30015665 Y NA RPS15AP24,DCTN6 NA NA NA NA DCTN6 3780 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 30363851 30364149 30364000 Y NA NA NA NA NA NA RBPMS 123907 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 30580467 30580796 30580574 Y GSR GSR,UBXN8 NA NA NA NA GSR 2647 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 30892240 30892587 30892393 Y UBXN8 WRN NA NA NA NA WRN 2923 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 30892930 30893420 30892948 Y NA WRN NA NA NA NA WRN 3613 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 32084575 32084724 32084674 Y NRG1,NRG1 NA NA NA NA NA NRG1 589673 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 32191944 32192171 32192069 Y NRG1 NA NA NA NA NA NRG1 697042 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 32508172 32508500 32508337 Y NRG1,NRG1 NA NA NA NA NA FUT10 820440 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.34165771622059 chr8 32553058 32553329 32553194 Y NA NA NA NA NA NA FUT10 775611 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 32572764 32572916 32572840 Y NA NA NA NA NA NA FUT10 756024 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 32603273 32603561 32603417 Y NA NA NA NA NA NA FUT10 725379 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA LSM12P1 NA NA NA NA LSM12P1 1527 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.67332617297647 chr8 37000181 37000618 37000483 Y NA NA KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-150O12.1 409083 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 37002327 37002551 37002443 Y NA NA KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-150O12.1 407150 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 37005639 37005772 37005739 Y NA NA KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-150O12.1 403929 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 37748183 37748461 37748291 Y WHSC1L1,RAB11FIP1,LETM2,LETM2 BRF2,RAB11FIP1 NA NA NA NA RAB11FIP1 6524 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 37751458 37752024 37751766 Y NA BRF2,RAB11FIP1 NA NA NA NA RAB11FIP1 2961 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 37761676 37761790 37761689 Y NA RAB11FIP1 RAB11FIP1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RAB11FIP1 6691 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 37928414 37928535 37928451 Y ADRB3,WHSC1L1 EIF4EBP1,ASH2L NA NA NA NA ASH2L 32225 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 38035023 38035257 38035173 Y WHSC1L1,LETM2,LETM2,BAG4 BAG4,LSM1,DDHD2 NA NA NA NA LSM1 2775 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 38647998 38648343 38648132 Y LETM2,LETM2,PLEKHA2,TACC1 NA NA NA NA NA TACC1 64294 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 38794203 38794537 38794324 Y TACC1,PLEKHA2 PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 37450 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 38794582 38795442 38794757 Y TACC1,PLEKHA2 PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 37829 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr8 38856419 38857534 38856583 Y NA TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA ADAM9 4031 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr8 39800131 39800493 39800357 Y NA NA NA NA NA NA ADAM9 947743 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 39956643 39956887 39956760 Y C8orf4 NA C8orf4 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM9 1104255 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 40032102 40032537 40032342 Y IDO1 NA NA NA NA NA ADAM9 1179714 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr8 41628099 41628173 41628135 Y ANK1 NA NA NA NA NA RP11-360L9.4 194212 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 41908079 41908836 41908505 Y POLB,IKBKB,IKBKB,AP3M2,AGPAT6,MYST3 KAT6A NA NA NA NA KAT6A 571 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 42053833 42054135 42053951 Y NA AP3M2,PLAT NA NA NA NA PLAT 9107 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 42149533 42149606 42149596 Y NA IKBKB,POLB NA NA NA NA IKBKB 22713 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 42184337 42184357 42184347 Y NA POLB NA NA NA NA POLB 9615 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 42270426 42270603 42270558 Y NA VDAC3 NA NA NA NA VDAC3 23284 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr8 42356471 42356680 42356560 Y NA SLC20A2 NA NA NA NA SLC20A2 38389 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 42377318 42377512 42377415 Y NA SLC20A2 NA NA NA NA SLC20A2 17557 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 43092918 43093442 43093017 Y HOOK3 NA NA NA NA NA HGSNAT 99362 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 47885401 47885427 47885415 Y NA NA NA NA NA NA RPL10AP2 181314 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 48265617 48265884 48265750 Y CEBPD NA NA NA NA NA NDUFA5P12 191124 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 48265920 48266584 48265994 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA5P12 191427 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr8 48294076 48294490 48294332 Y NA NA NA NA NA NA RP11-697N18.2 208681 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 48295911 48296182 48296008 Y NA NA NA NA NA NA RP11-697N18.2 206989 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 48343978 48344357 48344119 Y CEBPD NA NA NA NA NA RP11-697N18.2 158814 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 48424795 48425379 48425168 Y NA NA NA NA NA NA RP11-697N18.2 77792 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 48581816 48581989 48581954 Y CEBPD NA NA NA NA NA CEBPD 67659 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 48746170 48746340 48746217 Y MCM4 NA NA NA NA NA CEBPD 96522 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 48903451 48903743 48903597 Y NA PRKDC,MCM4,UBE2V2 NA NA NA NA UBE2V2 15217 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 48910578 48910837 48910684 Y NA PRKDC,MCM4,UBE2V2 NA NA NA NA UBE2V2 8123 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 49086776 49087078 49086884 Y NA NA SNAI2,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 167816 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 49229155 49229573 49229245 Y NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 65577 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 49320367 49320668 49320511 Y NA RPL29P19 SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 25217 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr8 49321878 49322114 49322046 Y NA RPL29P19 SNAI2,MCM4,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 26728 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 49426952 49427328 49427172 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 131802 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 49427546 49427722 49427633 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 132396 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 49541228 49541500 49541360 Y SNAI2 NA SNAI2,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 EFCAB1 104370 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 49550038 49550119 49550080 Y SNAI2 NA SNAI2,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 EFCAB1 95751 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr8 49611840 49612006 49611979 Y SNAI2 EFCAB1 NA NA NA NA EFCAB1 33864 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 49701443 49701572 49701502 Y NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 EFCAB1 55573 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 49783004 49783154 49783067 Y SNAI2 SNAI2 NA NA NA NA SNAI2 49145 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 49835974 49836286 49836197 Y SNAI2 SNAI2 NA NA NA NA SNAI2 3675 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.4505489918951 chr8 52747281 52747589 52747434 Y NA NA NA NA NA NA PCMTD1 62146 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 52797055 52797111 52797083 Y NA PCMTD1,RP11-110G21.1 NA NA NA NA PCMTD1 12624 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 53188453 53188874 53188470 Y NA NA NA NA NA NA RP11-110G21.1 378568 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 53607875 53608327 53608179 Y RB1CC1 RB1CC1 NA NA NA NA RB1CC1 48076 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 53625473 53626379 53625848 Y RB1CC1 RB1CC1 NA NA NA NA RB1CC1 30024 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 54256811 54256964 54256882 Y NA NA NA NA NA NA RP11-400K9.4 177527 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 54798731 54798762 54798749 Y NA ATP6V1H,RGS20 NA NA NA NA RGS20 36363 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr8 55065365 55066496 55065716 Y ATP6V1H,ATP6V1H MRPL15 NA NA NA NA MRPL15 19595 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 56744320 56744391 56744354 Y TGS1 LYN NA NA NA NA LYN 45981 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 56791431 56791783 56791438 Y LYN LYN NA NA NA NA LYN 1059 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 56798106 56798776 56798363 Y LYN LYN NA NA NA NA LYN 7734 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 56818311 56818706 56818376 Y NA LYN NA NA NA NA LYN 27939 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 56887750 56888682 56888353 Y LYN NA NA NA NA NA RPS20 96387 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 56916302 56916441 56916350 Y LYN NA NA NA NA NA RPS20 68628 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 59476129 59476409 59476167 Y NA SDCBP NA NA NA NA SDCBP 12646 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 59499727 59499886 59499762 Y UBXN2B,NSMAF,NSMAF,SDCBP SDCBP NA NA NA NA SDCBP 36244 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 59763369 59763610 59763548 Y NA RNU4-50P NA NA NA NA RNU4-50P 38258 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 60028775 60028875 60028825 Y NA TOX NA NA NA NA TOX 892 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 61564243 61564650 61564285 Y CA8,CHD7 CHD7 CHD7,RAB2A MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD7 24687 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 61592861 61593584 61592948 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 3524 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 61627150 61627529 61627187 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 37813 CAGE SAS hg19 FANTOM5 4.34415503108676 chr8 61657043 61657068 61657053 Y CHD7 NA NA NA NA NA CHD7 67706 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 61825257 61825601 61825298 Y NA NA NA NA NA NA CHD7 235920 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 61850490 61850754 61850677 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261153 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 61850776 61851191 61851141 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261439 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 62445230 62445580 62445420 Y CLVS1,ASPH NA NA NA NA NA ASPH 179575 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 62600598 62600698 62600684 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA ASPH 24457 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 62606389 62606706 62606619 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA ASPH 18449 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr8 62620817 62621622 62621526 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA ASPH 3533 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 64133013 64133210 64133061 Y NA NA NA NA NA NA YTHDF3 53901 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 66863902 66864441 66863992 Y RRS1,PDE7A NA PDE7A MCF7 ChIA-PET 22265404 PDE7A 111345 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 66935018 66935363 66935175 Y PDE7A NA NA NA NA NA AC084082.3 87539 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 67035997 67036639 67036283 Y NA AC084082.3,TRIM55 NA NA NA NA TRIM55 492 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 67042054 67042413 67042255 Y NA AC084082.3,TRIM55 NA NA NA NA TRIM55 4923 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 67045701 67045983 67045786 Y NA AC084082.3,TRIM55 NA NA NA NA TRIM55 8570 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 67055533 67055834 67055559 Y NA AC084082.3,TRIM55 CRH IMR90 Hi-C 24141950 TRIM55 18402 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 67419818 67420060 67419977 Y NA NA NA NA NA NA RRS1 80555 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 67425057 67425564 67425100 Y NA NA NA NA NA NA RRS1 85794 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 67433991 67434613 67434592 Y NA NA NA NA NA NA MYBL1 89869 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 67434763 67435122 67434951 Y NA NA NA NA NA NA MYBL1 89360 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 67445791 67446197 67446047 Y ADHFE1,VCPIP1,MYBL1 NA NA NA NA NA MYBL1 78285 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 67694398 67694637 67694506 Y VCPIP1,SGK3,SGK3 PTTG3P NA NA NA NA PTTG3P 16158 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 71084923 71085298 71085131 Y NCOA2 NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 70509 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 71149519 71149670 71149631 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 135105 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 71158637 71159069 71158929 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 144223 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 71522610 71523035 71522826 Y NA TRAM1,RP11-382J12.1 NA NA NA NA RP11-382J12.1 3798 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 71569342 71569635 71569535 Y NA LACTB2,XKR9 NA NA NA NA LACTB2 9774 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 72743502 72744020 72743667 Y NA MSC NA NA NA NA MSC 10683 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 72753377 72753463 72753388 Y NA MSC NA NA NA NA MSC 1240 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 72772671 72773228 72772951 Y NA MSC NA NA NA NA MSC 17968 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 73008234 73008433 73008334 Y NA NA TRPA1,LOC100132891 IMR90 Hi-C 24141950 MSC 253531 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 73785443 73785827 73785649 Y KCNB2 RP11-1145L24.1 NA NA NA NA RP11-1145L24.1 6148 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 74371877 74372089 74371987 Y RDH10 NA NA NA NA NA RPL7 165853 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chr8 77589671 77589739 77589705 Y NA ZFHX4,ZFHX4-AS1 NA NA NA NA ZFHX4 1715 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 77731385 77731402 77731393 Y ZFHX4 NA NA NA NA NA ZFHX4-AS1 137872 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 79578942 79579038 79579012 Y IL7,FAM164A NA NA NA NA NA PKIA 152568 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 79674578 79674862 79674701 Y NA NA NA NA NA NA PKIA 248204 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 80705910 80706255 80706054 Y HEY1 NA HEY1,MRPS28 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS28 234269 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 80996547 80996769 80996670 Y TPD52 NA NA NA NA NA MRPS28 56023 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 81050951 81051119 81051010 Y TPD52 NA NA NA NA NA TPD52 90348 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 81639602 81640013 81639931 Y ZNF704 NA NA NA NA NA ZBTB10 243748 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 82673208 82673424 82673316 Y NA CHMP4C,ZFAND1 NA NA NA NA ZFAND1 30070 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 87014840 87015227 87015062 Y NA NA NA NA NA NA WWP1 337740 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 88655608 88655638 88655622 Y NA NA NA NA NA NA AF121898.3 110308 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 89352633 89352940 89352786 Y NA NA NA NA NA NA AF121898.3 586687 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 90105251 90105649 90105450 Y NA NA NA NA NA NA RP11-37B2.1 662306 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 90154564 90154929 90154750 Y NA NA NA NA NA NA RP11-37B2.1 613026 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 90270902 90271148 90271067 Y NA NA NA NA NA NA RP11-37B2.1 496807 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 90556024 90556173 90556098 Y NA NA NA NA NA NA RP11-37B2.1 211782 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 90627835 90627903 90627892 Y NA NA MMP16 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-37B2.1 140052 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr8 90741352 90741628 90741481 Y OSGIN2,RIPK2 RP11-37B2.1,RIPK2 DECR1,RIPK2,NBN IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-37B2.1 26327 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 90776453 90776674 90776498 Y OSGIN2,RIPK2 RP11-37B2.1,RIPK2 NA NA NA NA RIPK2 8478 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 90787257 90787620 90787439 Y OSGIN2,RIPK2 RP11-37B2.1,RIPK2 NA NA NA NA RIPK2 19282 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 90899646 90899998 90899819 Y RIPK2,OSGIN2 OSGIN2 OSGIN2,RIPK2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 OSGIN2 12089 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 91064955 91065319 91065136 Y NA NA NA NA NA NA NBN 51499 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 94728357 94728657 94728477 Y NA FAM92A1,LINC00535,RBM12B,TMEM67 NA NA NA NA LINC00535 17696 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 94850124 94850307 94850200 Y PDP1,PDP1,PDP1,PDP1,GEM PDP1 NA NA NA NA PDP1 17728 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr8 94892570 94892797 94892694 Y NA PDP1 TMEM67,PDP1,MIR378D2 IMR90 Hi-C 24141950 PDP1 24535 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr8 94928107 94928427 94928252 Y NA NA NA NA NA NA PDP1 60072 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr8 94944837 94944971 94944904 Y GEM NA NA NA NA NA PDP1 76802 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 94971751 94971853 94971800 Y GEM NA RBM12B,FAM92A1,PDP1,TMEM67,MIR378D2,RAD54B,C8orf39,LINC00535 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDP1 103716 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 95003706 95004122 95004001 Y NA NA LINC00535,RBM12B,RAD54B,CDH17,GEM IMR90 Hi-C 24141950 PDP1 135671 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 95246535 95247070 95246768 Y GEM KB-1247B1.1,GEM CDH17 IMR90 Hi-C 24141950 GEM 25508 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 95429933 95430227 95430143 Y NA NA NA NA NA NA RAD54B 55110 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 95896385 95896691 95896542 Y NA CCNE2 NA NA NA NA CCNE2 10215 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 96197025 96197314 96197170 Y NA NA PLEKHF2,C8orf69 IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHF2 52993 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 96814161 96814420 96814290 Y NA NA NA NA NA NA UQCRB 431442 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 98843865 98843962 98843914 Y NA RPS23P1,MATN2 NA NA NA NA RPS23P1 31320 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 98865970 98866240 98866105 Y NA RPS23P1,MATN2 NA NA NA NA RPS23P1 9042 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 99225483 99225848 99225614 Y NA NA NA NA NA NA NIPAL2 78773 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 99478821 99479039 99478921 Y NA NA NA NA NA NA NIPAL2 174200 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.33916040135441 chr8 99952429 99952792 99952702 Y NA STK3,OSR2 NA NA NA NA STK3 263 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 99953302 99954000 99953407 Y STK3,OSR2 STK3,OSR2 NA NA NA NA STK3 247 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 101222720 101222891 101222806 Y NA NA NA NA NA NA SPAG1 54586 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 101427912 101428321 101428112 Y SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A NA SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF19A 81466 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.00499462973235 chr8 101428409 101428827 101428524 Y RNF19A,RNF19A NA SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF19A 81963 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 101455424 101455703 101455525 Y PABPC1,SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A NA SPAG1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF19A 108978 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 101476271 101476730 101476459 Y YWHAZ,SPAG1,RNF19A,RNF19A NA SPAG1 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD46 93282 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 101500158 101500422 101500292 Y NA NA RNF19A,GRHL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD46 69590 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.78221744865098 chr8 101502356 101502514 101502451 Y SPAG1,SPAG1 NA RNF19A,GRHL2,SPAG1,ANKRD46 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD46 67498 CAGE SAS hg19 FANTOM5 6.68331543244117 chr8 101512336 101512720 101512423 Y SPAG1,SPAG1 NA NA NA NA NA ANKRD46 57292 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 101618931 101618997 101618964 Y NA ANKRD46 NA NA NA NA ANKRD46 48919 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 101731045 101731633 101731441 Y NA PABPC1 NA NA NA NA PABPC1 1404 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr8 101773934 101774280 101774106 Y NA PABPC1 SNX31,PABPC1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PABPC1 40897 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 101801288 101801504 101801352 Y NA NA PABPC1,SNX31 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PABPC1 68251 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 101880714 101880933 101880768 Y ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ NA YWHAZ,ZNF706 IMR90 Hi-C 24141950 YWHAZ 82683 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 101894360 101894526 101894414 Y ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ NA YWHAZ,ZNF706 IMR90 Hi-C 24141950 YWHAZ 69090 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 101912406 101912993 101912785 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ NA NA NA NA NA YWHAZ 50623 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 101913945 101914105 101914022 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 49511 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 101920723 101921107 101920870 Y NA YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 42509 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr8 101927731 101928052 101928034 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 35564 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 102015928 102016078 102016021 Y NA NA FLJ42969,YWHAZ,ZNF706 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 52312 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chr8 102038562 102039020 102038731 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 74946 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr8 102039589 102039925 102039833 Y GRHL2 NA ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 75973 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr8 102092753 102093116 102092848 Y GRHL2 NA NA NA NA NA ZNF706 123305 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 102100153 102100310 102100232 Y YWHAZ NA NA NA NA NA ZNF706 116111 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr8 102103047 102103317 102103255 Y YWHAZ NA NA NA NA NA ZNF706 113104 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 102110720 102110996 102110973 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA FLJ42969 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF706 105425 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 102167683 102167913 102167765 Y NA ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 48508 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 102171133 102171473 102171263 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 44948 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 102171817 102172037 102171960 Y YWHAZ,ZNF706,ZNF706 ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 44384 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 102185716 102186115 102186035 Y NA ZNF706 YWHAZ,FLJ42969,ZNF706 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 30306 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 102373140 102373427 102373201 Y NA NACAP1 GRHL2,NACAP1,NCALD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NACAP1 1118 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 102388506 102388737 102388522 Y NA NACAP1 NA NA NA NA NACAP1 16484 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 102450789 102450808 102450799 Y GRHL2 NA NACAP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 GRHL2 51852 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 102505547 102505759 102505677 Y GRHL2 GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 2887 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.55944026756961 chr8 102505982 102506363 102506168 Y GRHL2 GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 3322 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.67332617297647 chr8 102516990 102517159 102517011 Y GRHL2 GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 14330 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr8 102543448 102543645 102543547 Y NA GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 40788 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 102665065 102665479 102665281 Y NA NA NA NA NA NA GRHL2 162405 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 103209350 103209650 103209520 Y KLF10,KLF10 RRM2B,KB-431C1.4 NA NA NA NA RRM2B 39696 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 103422542 103423104 103422992 Y NA NA NA NA NA NA UBR5 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 103549220 103549421 103549330 Y NA NA UBR5,ODF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF10 116709 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 103649732 103649974 103649861 Y AZIN1,KLF10,KLF10 KLF10 NA NA NA NA KLF10 16156 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 103669513 103669869 103669680 Y AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10 KLF10 NA NA NA NA KLF10 3383 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 103750893 103751082 103750980 Y AZIN1,KLF10,KLF10 NA UBR5,KLF10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KB-1732A1.1 64663 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 103757592 103757997 103757773 Y NA NA KLF10,UBR5 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KB-1732A1.1 57748 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 103766474 103766656 103766574 Y NA KB-1732A1.1 KLF10,UBR5 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KB-1732A1.1 49089 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 103801151 103801773 103801337 Y NA KB-1732A1.1 KLF10,UBR5,ODF1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KB-1732A1.1 13972 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr8 103803215 103803631 103803453 Y AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10 KB-1732A1.1 KLF10,UBR5,ODF1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KB-1732A1.1 12114 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 103825525 103825897 103825586 Y NA KB-1732A1.1,KB-1507C5.2 NA NA NA NA KB-1732A1.1 9780 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 103918538 103918841 103918687 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 ATP6V1C1,AZIN1 IMR90 Hi-C 24141950 AZIN1 14446 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 103922083 103922307 103922186 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 AZIN1 IMR90 Hi-C 24141950 AZIN1 17991 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 104043647 104043928 104043793 Y KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1 ATP6V1C1,KB-1639H6.2 NA NA NA NA KB-1639H6.2 11991 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 104059632 104059708 104059689 Y NA ATP6V1C1,KB-1639H6.2 NA NA NA NA KB-1639H6.2 27976 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 104117409 104117806 104117725 Y KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1,SLC25A32 NA FZD6,BAALC,SLC25A32,LOC100499183,ATP6V1C1,C8orf56,DCAF13,RIMS2,CTHRC1 IMR90 Hi-C 24141950 KB-1639H6.2 85753 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 104198945 104199161 104199050 Y NA NA NA NA NA NA FZD6 109500 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 104331705 104332089 104331783 Y RIMS2 FZD6,RP11-318M2.2,CTHRC1 NA NA NA NA RP11-318M2.2 22705 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 105677496 105678173 105677683 Y TM7SF4,LRP12 NA LRP12 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRP12 78244 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 106290444 106290757 106290601 Y NA NA ZFPM2 IMR90 Hi-C 24141950 LRP12 691192 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 107665296 107665542 107665419 Y NA TAGLN2P1 NA NA NA NA TAGLN2P1 42699 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 107775174 107775515 107775345 Y NA NA NA NA NA NA TAGLN2P1 66933 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 109132004 109132262 109132106 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 313300 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 109222483 109222836 109222544 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 222726 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 109230205 109230491 109230349 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 215071 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 109230729 109230920 109230833 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 214642 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 111381887 111381916 111381903 Y NA NA NA NA NA NA SYBU 679867 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 117456775 117457003 117456919 Y NA NA TRPS1,LINC00536 IMR90 Hi-C 24141950 UTP23 319739 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.67082885811029 chr8 117744101 117744355 117744228 Y NA UTP23,EIF3H NA NA NA NA UTP23 32387 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 117883999 117884137 117884073 Y UTP23,RAD21 MIR3610,RAD21 NA NA NA NA MIR3610 902 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 118072404 118072549 118072412 Y NA NA NA NA NA NA RAD21 187299 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 118743302 118743393 118743321 Y NA NA EXT1,MED30,SAMD12 IMR90 Hi-C 24141950 MED30 212350 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 118776615 118776789 118776702 Y NA NA MED30,EXT1,SAMD12 IMR90 Hi-C 24141950 MED30 245663 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 118801002 118801354 118801210 Y NA NA NA NA NA NA MED30 270050 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 118958698 118959000 118958912 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 163092 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 118969079 118969407 118969255 Y MED30 NA NA NA NA NA EXT1 152685 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 119013126 119013396 119013387 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 108696 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr8 119023512 119024035 119023740 Y EXT1 NA NA NA NA NA EXT1 98057 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.4505489918951 chr8 119047899 119048328 119048216 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 73764 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 119049251 119049636 119049444 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 72456 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 119068312 119068746 119068717 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 53346 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.67082885811029 chr8 119071597 119071694 119071650 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 50398 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 119117518 119117887 119117807 Y NA EXT1 NA NA NA NA EXT1 4205 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 119345117 119345386 119345219 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 223025 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 119536200 119536581 119536442 Y NA NA NA NA NA NA SAMD12 95653 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 120063756 120064086 120063927 Y NA NA SAMD12,SAMD12-AS1,TNFRSF11B IMR90 Hi-C 24141950 MAL2 111187 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 120217398 120217670 120217528 Y MAL2 MAL2 NA NA NA NA MAL2 42125 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chr8 120232000 120232286 120232044 Y NA NA NA NA NA NA MAL2 56727 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 121080226 121080708 121080602 Y NA NA NA NA NA NA DEPTOR 196269 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 121092888 121093091 121092967 Y DEPTOR NA DEPTOR,DSCC1,COL14A1,TAF2,MRPL13 IMR90 Hi-C 24141950 DEPTOR 208931 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 121456351 121456697 121456524 Y SNTB1,MTBP,MRPL13 MTBP,MRPL13 NA NA NA NA MRPL13 709 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 122335950 122336427 122336136 Y NA NA HAS2,HAS2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 HAS2 315203 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 122347057 122347434 122347232 Y NA NA NA NA NA NA HAS2 304196 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 122598745 122598874 122598810 Y NA NA NA NA NA NA HAS2 52756 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 122755244 122755615 122755430 Y NA NA NA NA NA NA HAS2 103614 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr8 123122948 123123294 123123119 Y NA NA HAS2 IMR90 Hi-C 24141950 HAS2 471318 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 123908169 123908483 123908299 Y NA NA NA NA NA NA ZHX2 116536 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 124169504 124169661 124169520 Y NA FAM83A NA NA NA NA FAM83A 19539 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 124179869 124179997 124179932 Y NA FAM83A NA NA NA NA FAM83A 9203 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 124248679 124249062 124248866 Y NA C8orf76,ZHX1 NA NA NA NA C8orf76 2576 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 124363606 124363931 124363783 Y NA NA NA NA NA NA ATAD2 62659 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 124524433 124524792 124524749 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 26654 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 124529265 124529734 124529486 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 21712 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 124547812 124548082 124548041 Y NA FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 3364 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 124549741 124550229 124550044 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 1217 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 124552481 124552488 124552485 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 1035 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 124642629 124642836 124642770 Y NA NA NA NA NA NA FBXO32 91183 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 124645197 124645433 124645315 Y NA NA NA NA NA NA FBXO32 93751 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 124816728 124816894 124816751 Y NA FAM91A1 NA NA NA NA FAM91A1 38032 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 124934433 124934622 124934528 Y NA NA NA NA NA NA FAM91A1 155737 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 125193673 125194016 125193878 Y NA ARF1P3 TMEM65,FER1L6,FER1L6-AS1,FAM91A1,TRMT12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARF1P3 31509 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 125212215 125212575 125212395 Y NA NA TMEM65,FAM91A1,FER1L6,FER1L6-AS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARF1P3 50051 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 125367728 125368050 125367886 Y TRMT12,TATDN1,NDUFB9 TMEM65 NA NA NA NA TMEM65 14883 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chr8 125513273 125513673 125513472 Y NA RNF139-AS1,RNF139,NDUFB9,TATDN1 NA NA NA NA RNF139 28294 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 125649664 125650232 125649981 Y ZNF572,RNF139 NA NA NA NA NA MTSS1 88498 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 125656235 125656588 125656492 Y ZNF572,RNF139,MTSS1 NA NA NA NA NA MTSS1 82142 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 125878645 125879203 125878949 Y RNF139,MTSS1,ZNF572,NSMCE2,KIAA0196 LINC00964,RP11-1082L8.3 MTSS1,NDUFB9,TATDN1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1082L8.3 10887 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 126037665 126038021 126037843 Y NA SQLE NA NA NA NA SQLE 28926 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 126112372 126112753 126112532 Y TRIB1,NSMCE2 NSMCE2,KIAA0196 NA NA NA NA KIAA0196 10290 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 126231490 126231859 126231657 Y MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 129408 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 126238973 126239274 126239019 Y NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 136891 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 126285545 126285900 126285649 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 154663 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 126286229 126286368 126286299 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 154195 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.67082885811029 chr8 126290719 126290948 126290836 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 149615 CAGE SAS hg19 FANTOM5 5.01248657433088 chr8 126322031 126322772 126322054 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 117791 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 126441416 126441734 126441625 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 853 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 126446642 126447323 126446973 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 6079 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 126452500 126452812 126452633 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 11937 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 126526927 126527334 126527200 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 86364 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 126556751 126557301 126556981 Y NA NA NSMCE2,KIAA0196,TRIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 116188 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.11888053513921 chr8 126649729 126649959 126649891 Y TRIB1 NA NSMCE2,KIAA0196,TRIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 209166 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 126710957 126711330 126711190 Y TRIB1 NA NSMCE2,TRIB1,KIAA0196 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 270394 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 127445901 127446376 127445998 Y NA NA NA NA NA NA RP11-89K10.1 121744 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr8 127837362 127837443 127837401 Y FAM84B NA PVT1,MYC,LOC727677 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM84B 268724 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 128048074 128048382 128048201 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 180951 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 128070328 128070629 128070508 Y FAM84B NA NA NA NA NA CCAT1 158704 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 128099457 128099542 128099514 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 129791 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 128112845 128113195 128113019 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 116138 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 128167127 128167527 128167484 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 61806 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 128179610 128179821 128179807 Y NA CCAT1 PCAT1,POU5F1B,LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 49512 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 128180134 128180587 128180334 Y NA CCAT1 PCAT1,POU5F1B,LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 48746 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 128193341 128193750 128193748 Y NA CCAT1 MYC MCF7 ChIA-PET 22265404 CCAT1 35583 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 128196669 128197128 128196955 Y NA CCAT1 NA NA NA NA CCAT1 32205 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 128203137 128203490 128203390 Y NA CCAT1 NA NA NA NA CCAT1 25843 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 128218099 128218752 128218687 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 10581 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.34165771622059 chr8 128219153 128219489 128219426 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCAT1 9844 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr8 128227053 128227754 128227491 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCAT1 1579 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 128227982 128228299 128228180 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCAT1 1034 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 128231853 128232218 128232163 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 2520 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.56443489730196 chr8 128237300 128237732 128237515 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 7967 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.22777181081372 chr8 128253341 128253569 128253504 Y NA CCAT1 LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 24008 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 128257606 128258262 128257899 Y NA CCAT1 PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 28273 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 128305149 128305567 128305521 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 75816 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr8 128306934 128307283 128307196 Y MYC NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 77601 CAGE SAS hg19 FANTOM5 4.90109798379019 chr8 128309901 128310145 128310009 Y MYC NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 80568 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr8 128352367 128352670 128352528 Y MYC NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 123034 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr8 128403573 128403875 128403698 Y MYC NA NA NA NA NA CCAT1 174240 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 128413471 128413778 128413602 Y MYC NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 184138 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr8 128435102 128435271 128435258 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 205769 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 128519696 128520090 128519909 Y NA NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 225590 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 128678694 128678799 128678726 Y MYC NA MYC,PVT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 MYC 66881 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 128680448 128680536 128680487 Y MYC NA MYC,PVT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 MYC 65144 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 128680816 128681380 128681307 Y MYC NA MYC,PVT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 MYC 64300 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr8 128768623 128768723 128768690 Y NA MYC,PVT1 NA NA NA NA MYC 22943 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 128811691 128811973 128811933 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 6912 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 128822019 128822203 128822035 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 17240 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 128822251 128823013 128822500 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 17472 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 128843918 128844302 128844002 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 39139 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 128871975 128872421 128872033 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 67196 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr8 128879185 128879808 128879466 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 74406 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chr8 128888391 128888698 128888485 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 83612 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 128919831 128920544 128920233 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 100313 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr8 128930937 128931257 128931067 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 89600 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 128944008 128944415 128944139 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 76442 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 129002909 129003328 129003001 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 17529 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 129036981 129037022 129036995 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 16124 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 129047466 129047656 129047576 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 26609 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 129053712 129054462 129054053 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 32855 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 129061512 129061955 129061598 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 40655 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 129121216 129121486 129121350 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 100359 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 129129719 129130040 129129840 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 108862 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 129139934 129140421 129140284 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 119077 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 129180047 129180432 129180183 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 159190 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 129180743 129180870 129180780 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 159886 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 129185963 129186138 129186049 Y NA NA MYC,PVT1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-25P 165106 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 129188825 129189407 129189075 Y NA NA MYC,PVT1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-25P 167968 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chr8 129195465 129196052 129195562 Y NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 174608 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 129196843 129197355 129196931 Y NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 175986 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chr8 129205979 129206284 129206246 Y NA NA PVT1,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-25P 185122 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 129264139 129264333 129264192 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 243282 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 129339245 129339624 129339435 Y NA NA PVT1,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-25P 318388 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 129593885 129594223 129593976 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 573028 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 129874065 129874230 129874161 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 853208 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 129888455 129888974 129888966 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 867598 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 130566808 130567296 130566886 Y FAM49B NA NA NA NA NA GSDMC 229838 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 130996669 130996803 130996748 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 30572 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 131012344 131012436 131012358 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 14939 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 131024148 131024528 131024501 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 2847 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 131054431 131054834 131054758 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 27056 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 131134027 131134054 131134041 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 106652 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 131206055 131206375 131206165 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 178680 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 131218440 131218995 131218822 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 191065 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 131245360 131245556 131245456 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 208350 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 131271729 131272058 131271952 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 181848 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 131296023 131296343 131296248 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 157563 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 131354482 131354860 131354810 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 99046 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 131364558 131364729 131364627 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 89177 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 131454495 131454885 131454765 Y NA ASAP1 NA NA NA NA ASAP1 589 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 131467153 131467172 131467163 Y NA ASAP1 ASAP1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ASAP1 13247 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 131495645 131495684 131495664 Y NA ASAP1 ASAP1 IMR90 Hi-C 24141950 ASAP1 41739 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 132870393 132870759 132870576 Y HHLA1 EFR3A ADCY8 IMR90 Hi-C 24141950 EFR3A 43576 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 132928633 132929053 132928845 Y NA EFR3A NA NA NA NA EFR3A 14298 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 133231946 133232036 133231991 Y KCNQ3,KCNQ3 NA NA NA NA NA EFR3A 317611 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 133490570 133490736 133490650 Y NA NA NA NA NA NA PHF20L1 294882 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 133765736 133766089 133765913 Y SLA,TMEM71,PHF20L1 PHF20L1 NA NA NA NA PHF20L1 19529 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 134094333 134095052 134094858 Y ST3GAL1,TMEM71,PHF20L1 NA NA NA NA NA NDRG1 217213 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 134206657 134207025 134206839 Y NA NA NA NA NA NA NDRG1 105240 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 135628946 135629314 135629008 Y NA NA NA NA NA NA ZFAT 93978 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 135635794 135636288 135636020 Y NA NA NA NA NA NA ZFAT 87004 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 135843585 135843751 135843688 Y ZFAT MIR30D ZFAT,MIR30D,MIR30B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR30D 28397 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr8 137937938 137938287 137938113 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-35P 1185200 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 139799567 139799714 139799659 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 1666964 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 139965234 139965366 139965265 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 1501312 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 141108529 141108796 141108710 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 357882 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 141189770 141190115 141189943 Y TRAPPC9,TRAPPC9 NA NA NA NA NA TRAPPC9 276563 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 141358966 141359028 141358983 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 107650 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 141454964 141454973 141454969 Y NA TRAPPC9 NA NA NA NA TRAPPC9 11705 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 141474376 141475403 141474918 Y NA TRAPPC9,CHRAC1 TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TRAPPC9 7698 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 141598802 141599709 141599120 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 79405 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 141606825 141607480 141607253 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 87428 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 141607900 141608150 141608005 Y NA NA NA NA NA NA CHRAC1 88503 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 141608422 141608817 141608788 Y NA NA NA NA NA NA CHRAC1 89025 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 141707505 141707982 141707957 Y NA NA NA NA NA NA CHRAC1 188108 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 141800912 141801386 141801027 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA PTK2 208929 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 141804565 141804680 141804623 Y NA NA NA NA NA NA PTK2 205635 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 141886994 141887102 141887066 Y PTK2 NA NA NA NA NA PTK2 123213 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr8 141945462 141945818 141945641 Y NA NA NA NA NA NA PTK2 64497 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 141972530 141972881 141972765 Y NA PTK2 NA NA NA NA PTK2 37434 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 142047873 142048201 142048171 Y PTK2 PTK2 PTK2,DENND3,SLC45A4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTK2 37558 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 142082969 142083325 142083150 Y NA DENND3 PTK2,DENND3,EIF2C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DENND3 42052 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 142084181 142084412 142084295 Y PTK2 DENND3 PTK2,DENND3,EIF2C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DENND3 40965 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 142141816 142141930 142141883 Y EIF2C2,SLC45A4,DENND3 DENND3 NA NA NA NA DENND3 16439 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 142163740 142163864 142163753 Y NA DENND3 NA NA NA NA DENND3 38363 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 142215999 142216277 142216212 Y DENND3,SLC45A4 NA NA NA NA NA DENND3 90622 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chr8 142386413 142386490 142386444 Y GPR20 PTP4A3 NA NA NA NA PTP4A3 13603 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 142424633 142425265 142424919 Y NA PTP4A3,HNRNPA1P38 NA NA NA NA PTP4A3 24540 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 143353648 143353818 143353814 Y TSNARE1,BAI1 NA NA NA NA NA TSNARE1 128783 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 143475217 143475483 143475350 Y NA TSNARE1 NA NA NA NA TSNARE1 7118 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 143553509 143553834 143553672 Y NA NA NA NA NA NA TSNARE1 70908 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr8 143696778 143697162 143696893 Y NA ARC NA NA NA NA ARC 1945 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 143757526 143757895 143757616 Y NA PSCA,JRK,LY6K NA NA NA NA JRK 3491 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 143837804 143838151 143837954 Y NA SLURP1,LYPD2 NA NA NA NA LYPD2 5852 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 143864627 143864692 143864660 Y NA SLURP1,LYPD2 NA NA NA NA LYPD2 32675 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 143897219 143897551 143897306 Y LY6E,GLI4 NA LY6D,LYNX1,PSCA,JRK,C8orf55,LOC100288181,SLURP1,LY6E,LOC100133669 MCF7 ChIA-PET 22265404 LYPD2 65267 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 144094701 144094997 144094860 Y LY6K,C8orf55 LY6E,RP11-273G15.2,C8orf31 NA NA NA NA LY6E 2402 CAGE SAS hg19 FANTOM5 3.00749194459853 chr8 144107532 144108153 144107940 Y MAFA LY6E,RP11-273G15.2,C8orf31 NA NA NA NA RP11-273G15.2 9678 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 144360422 144361034 144360946 Y ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696 NA NA NA NA RP13-582O9.5 826 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.78221744865098 chr8 144820199 144820570 144820386 Y RHPN1,C8orf73,FAM83H MAPK15,FAM83H,FAM83H-AS1 NA NA NA NA FAM83H-AS1 5889 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 144950990 144951185 144951055 Y C8orf73,NAPRT1,FAM83H,EXOSC4,CYC1,SCRIB,PUF60,PUF60,EPPK1 PUF60,NRBP2,EPPK1 NRBP2,PLEC,LOC100128338,FAM83H IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPPK1 358 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr8 145015768 145015971 145015849 Y FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 32931 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr8 145022492 145023108 145022824 Y PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 25794 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 145025737 145026802 145026365 Y ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10 PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 22100 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr8 145070098 145070262 145070188 Y NA PLEC,GRINA,PARP10,OPLAH NA NA NA NA GRINA 7872 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 145071465 145071788 145071627 Y NA PLEC,GRINA,PARP10,OPLAH NA NA NA NA GRINA 9239 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 145257344 145257608 145257476 Y NA NA NA NA NA NA SHARPIN 96317 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 145549095 145549459 145549304 Y NA BOP1,HSF1,DGAT1,FBXL6,ADCK5 NA NA NA NA DGAT1 522 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 145909879 145909957 145909931 Y SCRT1,KIFC2,LRRC24,ARHGAP39,ZNF517,ZNF34 ARHGAP39 ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP39 685 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr8 145995593 145996127 145996081 Y COMMD5,COMMD5,COMMD5,ZNF34 ZNF251,ZNF34,RPL8 NA NA NA NA ZNF34 14603 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr8 146010487 146010786 146010731 Y NA ZNF251,RPL8,ZNF7 NA NA NA NA ZNF34 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr8 146125688 146125902 146125777 Y ZNF250 COMMD5,ZNF250,ZNF16 NA NA NA NA ZNF250 135 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 683421 683495 683457 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA2 1329847 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 972038 972418 972053 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA2 1040924 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 2839342 2839735 2839533 Y NA KIAA0020 NA NA NA NA KIAA0020 2506 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 2875811 2876206 2875956 Y NA KIAA0020 NA NA NA NA KIAA0020 33570 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 3508264 3508975 3508586 Y RFX3 RFX3,RP11-509J21.1 NA NA NA NA RFX3 15029 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 4334414 4334840 4334611 Y NA NA GLIS3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC1A1 153604 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 4656742 4656927 4656747 Y PPAPDC2,CDC37L1,C9orf68 PPAPDC2,CDC37L1 NA NA NA NA PPAPDC2 3371 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 4715214 4715412 4715290 Y AK3 CDC37L1,AK3 NA NA NA NA AK3 24631 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 4738592 4738723 4738708 Y NA AK3 NA NA NA NA AK3 1320 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 4835219 4835506 4835309 Y CDC37L1,RCL1 RCL1 NA NA NA NA RCL1 44350 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 5086081 5086478 5086137 Y CD274,CDC37L1,INSL6,JAK2 NA NA NA NA NA JAK2 103048 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 5460253 5460626 5460389 Y JAK2,KIAA1432,C9orf46,CD274 CD274,PDCD1LG2 PDCD1LG2 IMR90 Hi-C 24141950 CD274 11750 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 5478337 5478574 5478428 Y JAK2,KIAA1432,C9orf46,CD274 CD274,PDCD1LG2 NA NA NA NA CD274 29834 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 5509549 5510003 5509837 Y C9orf46,CD274,PDCD1LG2 PDCD1LG2 NA NA NA NA PDCD1LG2 1004 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr9 5851473 5851729 5851648 Y C9orf46,CD274,KIAA1432 ERMP1 ERMP1 IMR90 Hi-C 24141950 ERMP1 20356 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 5893266 5893397 5893330 Y MLANA NA NA NA NA NA ERMP1 62149 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 5901129 5901190 5901160 Y NA NA NA NA NA NA ERMP1 70012 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 6564380 6564534 6564488 Y NA NA NA NA NA NA RP11-106A1.2 72605 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 6680895 6681975 6681336 Y UHRF2,KDM4C RP11-106A1.2,RP11-390F4.6,KDM4C KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 36888 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr9 6788210 6788382 6788241 Y NA NA NA NA NA NA KDM4C 69347 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 9912233 9912588 9912411 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P3 823357 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 11065025 11065362 11065124 Y NA NA NA NA NA NA RP11-3L8.3 1746982 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr9 12779203 12779569 12779249 Y NA RP11-3L8.3 NA NA NA NA RP11-3L8.3 32775 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr9 12784417 12784967 12784682 Y C9orf150 RP11-3L8.3 NA NA NA NA RP11-3L8.3 27377 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr9 13349077 13349432 13349255 Y NA NA NFIB IMR90 Hi-C 24141950 MPDZ 71488 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 14233168 14233395 14233282 Y NFIB NA NA NA NA NA NFIB 163587 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 14251419 14251628 14251514 Y NA NA NA NA NA NA NFIB 145354 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 14322295 14322910 14322674 Y ZDHHC21,NFIB NA NA NA NA NA NFIB 74072 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr9 14992180 14992514 14992235 Y NA NA NA NA NA NA LDHAP4 71848 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr9 17520540 17520838 17520658 Y NA NA NA NA NA NA CNTLN 387560 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 17742097 17742364 17742226 Y SH3GL2 NA NA NA NA NA CNTLN 609117 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 18490587 18490949 18490797 Y ADAMTSL1 NA NA NA NA NA RP11-296P7.4 533941 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 20532398 20532530 20532463 Y MLLT3 NA NA NA NA NA MLLT3 88012 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 20793724 20794222 20793867 Y NA NA NA NA NA NA MLLT3 173182 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 21096394 21096639 21096525 Y KIAA1797 NA MLLT3,KIAA1797 IMR90 Hi-C 24141950 PTPLAD2 66759 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr9 21496569 21496909 21496764 Y NA MIR31 NA NA NA NA MIR31 13275 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 21576231 21576644 21576439 Y NA MIR31HG MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MIR31HG 18563 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 21677834 21678156 21678014 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MIR31HG 120166 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr9 21688773 21688952 21688863 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 111590 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 21695810 21696232 21696052 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 104310 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 21696521 21696698 21696606 Y IFNA6,IFNA1 NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 103844 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 21836477 21836868 21836612 Y NA MTAP NA NA NA NA MTAP 35935 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr9 21996110 21996456 21996153 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 2810 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 21996542 21996712 21996656 Y MTAP,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2B CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 3242 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr9 22083926 22084220 22084073 Y NA NA NA NA NA NA UBA52P6 73772 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 22084782 22085031 22084907 Y NA NA NA NA NA NA UBA52P6 74628 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 22085335 22085732 22085534 Y NA NA NA NA NA NA UBA52P6 75181 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 22103396 22103678 22103511 Y MTAP,CDKN2A,CDKN2B NA NA NA NA NA UBA52P6 93242 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 22107166 22107413 22107256 Y NA NA NA NA NA NA UBA52P6 97012 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 22408637 22408662 22408639 Y NA NA NA NA NA NA UBA52P6 398483 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 23639161 23639473 23639317 Y NA NA NA NA NA NA ELAVL2 184862 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 25344326 25344345 25344335 Y NA NA NA NA NA NA TUSC1 332511 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 26243860 26243998 26243927 Y NA NA NA NA NA NA TUSC1 567004 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 26922057 26922297 26922177 Y NA IFT74,PLAA NA NA NA NA IFT74 22740 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 27155069 27155179 27155099 Y TEK NA NA NA NA NA PLAA 209608 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 27333351 27333416 27333383 Y IFT74,IFT74,MOBKL2B,C9orf72,C9orf72 NA NA NA NA NA MOB3B 194363 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 27434079 27434197 27434145 Y NA NA NA NA NA NA MOB3B 93582 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 32395934 32396350 32396089 Y NA ACO1 NA NA NA NA ACO1 13316 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 32453982 32454272 32454141 Y NA NA NA NA NA NA DDX58 70050 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 33023891 33023961 33023926 Y NA APTX,DNAJA1 NA NA NA NA DNAJA1 682 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 33028063 33028460 33028077 Y NA APTX,DNAJA1,SMU1 NA NA NA NA DNAJA1 4854 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 33159697 33160189 33160012 Y NA B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 5165 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 33160944 33161390 33161236 Y DNAJA1,SMU1,B4GALT1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 3964 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr9 33165457 33166051 33165900 Y DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 103 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr9 33329062 33329543 33329355 Y NA NFX1 NA NA NA NA NFX1 40553 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 33458514 33458840 33458724 Y NA AQP3,NOL6 NA NA NA NA AQP3 12905 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 34179799 34180083 34180009 Y UBE2R2,UBAP1 UBAP1,AL353662.2,RP11-571F15.3 NA NA NA NA UBAP1 2796 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 34375136 34375287 34375212 Y NA KIF24,NUDT2,KIAA1161 NA NA NA NA KIAA1161 285 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 35114116 35114547 35114222 Y DNAJB5,KIAA1539 VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B NA NA NA NA FAM214B 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 35492185 35492605 35492350 Y RUSC2 NA NA NA NA NA TESK1 110762 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 35518041 35518590 35518314 Y CREB3,VCP,STOML2,RUSC2 NA NA NA NA NA TESK1 84777 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 35520478 35520852 35520494 Y NA NA NA NA NA NA TESK1 82515 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 35603992 35604628 35604112 Y TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2 TESK1 NA NA NA NA TESK1 625 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 35726275 35726587 35726326 Y NA TPM2,CREB3,TLN1,RGP1,GBA2 NA NA NA NA CREB3 3745 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 36037997 36038326 36038187 Y NA RECK NA NA NA NA RECK 3567 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 36924974 36925090 36925030 Y MELK NA NA NA NA NA ZCCHC7 193446 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr9 37036641 37037011 37036829 Y ZCCHC7,ZBTB5,PAX5 NA NA NA NA NA ZCCHC7 81525 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 37835930 37836292 37836154 Y NA DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA EXOSC3 36496 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr9 37859471 37859543 37859507 Y NA NA NA NA NA NA EXOSC3 60037 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 37914600 37914735 37914730 Y NA NA NA NA NA NA EXOSC3 115166 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 37938183 37938323 37938277 Y SHB NA NA NA NA NA RP11-613M10.9 128361 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 68419808 68420298 68419990 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 33077 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 1886 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chr9 71784003 71784073 71784064 Y TJP2 TJP2 NA NA NA NA TJP2 49794 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 71789916 71790363 71790201 Y TJP2 NA NA NA NA NA TJP2 55707 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chr9 71791709 71792066 71791753 Y TJP2 NA NA NA NA NA TJP2 57500 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr9 71793410 71793781 71793424 Y NA NA NA NA NA NA TJP2 59201 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 71825244 71825637 71825441 Y NA NA NA NA NA NA TJP2 91035 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 72027379 72027424 72027413 Y PRKACG NA NA NA NA NA TJP2 293170 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.00499462973235 chr9 73035561 73035945 73035863 Y KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8021 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr9 74371995 74372048 74372016 Y NA NA NA NA NA NA TMEM2 57558 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 75172533 75172850 75172692 Y NA NA NA NA NA NA ZFAND5 194370 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 75731054 75731296 75731180 Y ANXA1 ANXA1 ANXA1 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA1 33377 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 75747117 75747734 75747349 Y ANXA1 ANXA1 ANXA1 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA1 16939 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 75791521 75791823 75791639 Y NA ANXA1 NA NA NA NA ANXA1 26848 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr9 75819791 75820342 75820052 Y ANXA1 NA RORB IMR90 Hi-C 24141950 ANXA1 55118 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 79018113 79018533 79018297 Y NA RFK,GCNT1 NA NA NA NA RFK 10680 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 79185914 79186293 79186104 Y NA AL161626.1 PRUNE2 IMR90 Hi-C 24141950 AL161626.1 1183 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 80354506 80354684 80354595 Y NA NA NA NA NA NA GNAQ 289690 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 80911003 80911373 80911119 Y PSAT1 PSAT1 NA NA NA NA PSAT1 944 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 81486579 81486867 81486725 Y NA NA TLE4 IMR90 Hi-C 24141950 CHCHD2P9 517352 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 81637955 81638246 81638090 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD2P9 365973 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 82213229 82213622 82213243 Y NA TLE4 NA NA NA NA TLE4 28541 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 84004399 84004744 84004646 Y NA NA NA NA NA NA TLE1 297476 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 84236979 84237179 84237078 Y NA NA NA NA NA NA TLE1 65041 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 84889033 84889227 84889130 Y FAM75D1 NA NA NA NA NA SNORD95 387200 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 87374322 87374598 87374427 Y NTRK2,NTRK2,NTRK2 NA NA NA NA NA RMI1 780696 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 88045835 88046030 88046000 Y NA NA NTRK2 IMR90 Hi-C 24141950 AGTPBP1 308914 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 89626902 89626982 89626949 Y NA CDC20P1 NA NA NA NA CDC20P1 2335 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 89627893 89628105 89627999 Y NA CDC20P1 NA NA NA NA CDC20P1 3326 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 90328172 90328868 90328486 Y DAPK1,CTSL1 NA CTSL1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-40C6.2 189955 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 91381840 91381977 91381906 Y NA NA SHC3,MIR4289,LOC286238,SPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 S1PR3 222385 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 91795136 91795669 91795494 Y C9orf47,SHC3 NA NA NA NA NA CKS2 128444 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.11638322027304 chr9 92004867 92005103 92005008 Y NA NA NA NA NA NA SECISBP2 73446 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 93602327 93602707 93602517 Y SYK,SYK SYK NA NA NA NA SYK 40258 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 93847721 93848063 93847983 Y NA NA LOC100129316,ROR2,AUH IMR90 Hi-C 24141950 AUH 274132 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 93955991 93956732 93956142 Y NA NA NA NA NA NA AUH 165463 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 94282129 94282472 94282345 Y NA NA NA NA NA NA NFIL3 97985 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 95383874 95384172 95384023 Y NA IPPK NA NA NA NA IPPK 46375 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 95452860 95453088 95452974 Y NA IPPK NA NA NA NA IPPK 22313 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 95536839 95537017 95536928 Y NA BICD2 BICD2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BICD2 11745 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr9 95880555 95880921 95880640 Y NA C9orf89,NINJ1 NA NA NA NA NINJ1 13649 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 96723182 96723238 96723197 Y NA BARX1 BARX1 MCF7 ChIA-PET 22265404 BARX1 7528 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 96928143 96928630 96928259 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 10486 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 9706 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.78221744865098 chr9 97622499 97622697 97622598 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 135516 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 97629577 97629759 97629671 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 142594 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 97679079 97679413 97679326 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 192096 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 97684288 97685133 97684708 Y NA NA FANCC IMR90 Hi-C 24141950 C9orf3 197305 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 97699905 97700054 97699963 Y NA NA FANCC IMR90 Hi-C 24141950 C9orf3 212922 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 97715207 97715319 97715263 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 228224 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 97852724 97853044 97852860 Y NA NA NA NA NA NA FANCC 224947 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 97968410 97968794 97968763 Y NA NA NA NA NA NA FANCC 109197 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 98173547 98173783 98173614 Y NA RP11-435O5.2 NA NA NA NA RP11-435O5.2 13295 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 98237628 98237804 98237716 Y NA PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 39535 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 98273012 98273438 98273114 Y C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1 PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 3901 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 98273818 98274186 98273872 Y NA PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 3153 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 99106686 99107122 99106995 Y NA SLC35D2 NA NA NA NA SLC35D2 36870 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 99181547 99181719 99181643 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA ZNF367 2936 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr9 100565577 100566264 100565821 Y CORO2A,FOXE1 FOXE1 FOXE1,C9orf156 IMR90 Hi-C 24141950 FOXE1 47272 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr9 100747732 100748046 100747912 Y NA ANP32B NA NA NA NA ANP32B 4089 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 100880203 100880431 100880317 Y C9orf156,HEMGN,TRIM14,TRIM14 TRIM14 NA NA NA NA TRIM14 709 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 100985595 100985973 100985751 Y TBC1D2 CORO2A,TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 29942 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 101011075 101011589 101011252 Y C9orf156,NANS,TBC1D2 TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 4326 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr9 101136906 101136938 101136922 Y ANKS6 NA NA NA NA NA TBC1D2 120991 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 101573359 101573810 101573605 Y NA ANKS6,GALNT12 NA NA NA NA GALNT12 5378 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 101973951 101974336 101974174 Y NA ALG2,SEC61B NA NA NA NA ALG2 7902 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 102006739 102006945 102006777 Y NA ALG2,SEC61B NA NA NA NA SEC61B 24393 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 102585833 102586368 102586147 Y ERP44,NR4A3 RP11-554F20.1,NR4A3 NA NA NA NA NR4A3 3696 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr9 102646895 102646933 102646914 Y NA STX17 NA NA NA NA STX17 19982 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 104805727 104805738 104805734 Y NA NA NA NA NA NA RNF20 511594 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 105957487 105957816 105957647 Y NA NA NA NA NA NA SMC2 896725 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 108284643 108284789 108284719 Y NA FKTN NA NA NA NA FKTN 33622 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 108621964 108622364 108622354 Y NA NA MIR548Q,ZNF462 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM38B 167139 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 109626456 109627144 109627032 Y NA ZNF462 NA NA NA NA ZNF462 3078 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr9 109714113 109714149 109714131 Y NA NA NA NA NA NA ZNF462 90735 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 109975791 109976065 109975989 Y KLF4 NA NA NA NA NA RAD23B 67353 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr9 110109718 110109795 110109757 Y NA NA NA NA NA NA RAD23B 66300 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 110266981 110267369 110267173 Y NA KLF4,RP11-438P9.1 KLF4 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLF4 16218 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 110474119 110474209 110474164 Y KLF4 NA KLF4 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-438P9.1 179448 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 110512153 110512586 110512216 Y KLF4 NA KLF4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-438P9.1 217482 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr9 110514044 110514454 110514287 Y KLF4 NA KLF4 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-438P9.1 219373 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 110811401 110811623 110811540 Y NA NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-438P9.1 516730 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 111313727 111314112 111313882 Y NA NA KLF4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-220D10.1 73001 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr9 111315008 111315237 111315108 Y NA NA KLF4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-220D10.1 71876 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 111482488 111482546 111482517 Y NA NA NA NA NA NA RP11-220D10.1 95375 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 111774521 111775173 111774726 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 712 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chr9 112091755 112092133 112091802 Y PTPN3 EPB41L4B EPB41L4B MCF7 ChIA-PET 22265404 EPB41L4B 10511 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr9 112162175 112162241 112162208 Y NA NA NA NA NA NA EPB41L4B 80931 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 112580267 112580505 112580395 Y PALM2 PALM2-AKAP2,AKAP2 C9orf152 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP2 39498 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 112813346 112813601 112813470 Y AKAP2 RP11-151F5.2 NA NA NA NA RP11-151F5.2 27708 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 112864001 112864218 112864083 Y NA NA NA NA NA NA RP11-151F5.2 78363 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 113507067 113507395 113507232 Y NA NA NA NA NA NA MUSK 78016 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 113515835 113516213 113516024 Y NA NA NA NA NA NA MUSK 86784 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 114111620 114111657 114111640 Y OR2K2 NA NA NA NA NA KIAA0368 133368 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 114505631 114505796 114505739 Y NA C9orf84 NA NA NA NA C9orf84 49492 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 114700203 114700566 114700273 Y DNAJC25,GNG10,SUSD1,ROD1,HSDL2 UGCG NA NA NA NA UGCG 43157 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 114707434 114708001 114707643 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 50388 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 114720285 114720825 114720474 Y UGCG NA C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGCG 63239 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chr9 114721832 114722310 114722097 Y UGCG NA C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGCG 64786 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr9 114748589 114748829 114748711 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 91543 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 114783014 114783329 114783192 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 125968 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr9 114784464 114784581 114784539 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 127418 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 114792518 114792641 114792625 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 135472 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 114805021 114805139 114805071 Y NA NA NA NA NA NA SUSD1 130549 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 114812842 114813221 114813099 Y NA NA NA NA NA NA SUSD1 122467 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 114823556 114823978 114823803 Y GNG10,SUSD1 NA NA NA NA NA SUSD1 111710 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr9 114828005 114828556 114828288 Y UGCG NA NA NA NA NA SUSD1 107132 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chr9 114831912 114832228 114831995 Y GNG10,SUSD1 NA NA NA NA NA SUSD1 103460 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 115258728 115258879 115258816 Y SNX30,SUSD1,ROD1 KIAA1958,C9orf147 NA NA NA NA C9orf147 11244 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 115470219 115470249 115470232 Y ROD1,HSDL2,C9orf80 RP11-276E15.4,SNX30 NA NA NA NA RP11-276E15.4 40487 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 115605913 115605928 115605920 Y ZFP37 NA NA NA NA NA SNX30 94795 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 116385277 116385518 116385372 Y RGS3 RP11-18B16.2 NA NA NA NA RP11-18B16.2 25718 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 116728685 116728905 116728795 Y AMBP NA NA NA NA NA ZNF618 92123 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 116918999 116919461 116919193 Y NA COL27A1 NA NA NA NA COL27A1 3159 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 117040965 117041219 117041139 Y NA NA NA NA NA NA COL27A1 125125 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 117351016 117351370 117351316 Y TNFSF8,AKNA,DFNB31,DFNB31,ATP6V1G1 ATP6V1G1,C9orf91 NA NA NA NA ATP6V1G1 2990 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr9 117481130 117481475 117481264 Y TNFSF8 NA NA NA NA NA TNFSF15 84931 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 117566825 117567042 117566994 Y TNFSF15 TNFSF15 NA NA NA NA TNFSF15 419 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.89360603919167 chr9 117657108 117657611 117657338 Y DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8 NA NA NA NA NA TNFSF15 90702 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 117670443 117671027 117670891 Y TNFSF15,TNFSF8 NA NA NA NA NA TNFSF15 104037 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 117671276 117671580 117671329 Y DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8 NA NA NA NA NA TNFSF15 104870 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 117778655 117778961 117778811 Y ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8 NA NA NA NA NA TNC 99575 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 117785314 117785612 117785505 Y NA NA NA NA NA NA TNC 92924 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr9 117845711 117845781 117845750 Y TNFSF15 TNC NA NA NA NA TNC 32755 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 117860552 117860777 117860665 Y NA TNC NA NA NA NA TNC 17759 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 117878279 117878434 117878355 Y NA TNC NA NA NA NA TNC 102 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 117967486 117967725 117967595 Y NA NA NA NA NA NA TNC 88950 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 117976093 117976379 117976336 Y NA NA NA NA NA NA TNC 97557 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 118024698 118025071 118024956 Y NA NA NA NA NA NA TNC 146162 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr9 118028504 118028557 118028531 Y NA NA NA NA NA NA TNC 149968 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 118403305 118403595 118403372 Y NA NA PAPPA,ASTN2,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 524769 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 118434933 118435213 118435118 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 556397 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 118435271 118435690 118435488 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 556735 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 118473939 118474297 118474118 Y NA NA PAPPA,ASTN2,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA-AS2 574751 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 118634403 118634418 118634411 Y NA NA NA NA NA NA PAPPA-AS2 414630 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 118701397 118701694 118701515 Y NA NA ASTN2,LINC00474,PAPPA IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA-AS2 347354 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 120507373 120507587 120507563 Y NA TLR4 NA NA NA NA TLR4 42763 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 123251976 123252022 123252001 Y CDK5RAP2 NA NA NA NA NA CDK5RAP2 88426 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 124161523 124161647 124161545 Y NA STOM GSN,RAB14,GGTA1P,CNTRL,STOM IMR90 Hi-C 24141950 STOM 30992 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr9 124260871 124261375 124261091 Y GSN NA NA NA NA NA DAB2IP 65961 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 124361597 124361984 124361689 Y NA DAB2IP NA NA NA NA DAB2IP 34261 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr9 124704763 124705076 124704868 Y TTLL11,MRRF,DAB2IP NA NA NA NA NA TTLL11 148809 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 125869246 125869355 125869301 Y OR1L3,OR1K1,GPR21 NA NA NA NA NA STRBP 159500 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 125956755 125956816 125956769 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 72039 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 126105825 126105916 126105882 Y NA NA RC3H2,RABGAP1,MIR600HG,STRBP,CRB2,DENND1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STRBP 76970 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 126119304 126119701 126119598 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 90449 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 126154038 126154354 126154284 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 125183 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 126237774 126237937 126237796 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 208919 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 126302696 126302988 126302896 Y LHX2 NA NA NA NA NA STRBP 273841 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 126690123 126690365 126690192 Y DENND1A DENND1A NA NA NA NA DENND1A 66 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 127110676 127110867 127110772 Y NA NA NA NA NA NA PSMB7 64856 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 127155102 127155374 127155331 Y DENND1A PSMB7 NA NA NA NA PSMB7 20349 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chr9 127433186 127433516 127433351 Y NR6A1 MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 14440 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 127475055 127475439 127475319 Y NA NA NA NA NA NA NR6A1 56150 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 127519728 127520109 127519909 Y NA NR6A1,OLFML2A NA NA NA NA NR6A1 11480 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 127621077 127621225 127621167 Y NA WDR38,RPL35,ARPC5L,RNU4-82P NA NA NA NA RPL35 1035 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 127947242 127947259 127947251 Y NA SCAI,PPP6C,RABEPK NA NA NA NA PPP6C 2959 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 127980597 127980978 127980790 Y NA PPP6C,RABEPK,HSPA5,RP11-65N13.8,GAPVD1 NA NA NA NA RABEPK 19776 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr9 128394575 128395007 128394820 Y PPP6C NA NA NA NA NA MAPKAP1 72506 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 129263295 129263658 129263477 Y FAM125B,RALGPS1,RALGPS1,LMX1B NA NA NA NA NA LMX1B 111064 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 129484571 129485188 129484881 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB43 80097 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 129485609 129485808 129485757 Y FAM125B,ZBTB34 NA NA NA NA NA ZBTB43 79477 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 130329548 130329691 130329605 Y PTRH1,FPGS,FPGS,ENG,CDK9,FAM129B,FAM129B FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 9577 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 130336494 130336746 130336628 Y TOR2A,FPGS,FPGS,CDK9,FAM129B FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 2522 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 130600573 130601245 130600861 Y FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS FPGS,AK1 NA NA NA NA AK1 36777 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr9 130764123 130764312 130764223 Y FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS FAM102A FAM102A,DPM2,PIP5KL1,SLC25A25,NAIF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM102A 23331 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 131316865 131317367 131316977 Y NA SPTAN1 NA NA NA NA SPTAN1 3999 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr9 131645612 131645749 131645679 Y NA LRRC8A,CCBL1,PHYHD1 NA NA NA NA CCBL1 2839 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 131929021 131929365 131929193 Y NA IER5L NA NA NA NA IER5L 9175 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 131929415 131929566 131929473 Y METTL11A,C9orf106 IER5L NA NA NA NA IER5L 8974 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr9 132040752 132040968 132040856 Y NA RP11-344B5.2 C9orf106,IER5L,LOC100506190,PPP2R4,CRAT,C9orf50,METTL11A IMR90,MCF7,HELA,K562 Hi-C,ChIA-PET,5C 24141950,22265404,22955621 RP11-344B5.2 1769 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chr9 132115283 132115797 132115318 Y NA RP11-65J3.1 PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A,C9orf50 MCF7,HELA,K562,IMR90 ChIA-PET,5C,Hi-C 22265404,22955621,24141950 RP11-65J3.1 22704 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 132145857 132146151 132146146 Y FAM73B,C9orf106,USP20,USP20,TOR1B,C9orf78,ASB6 NA C9orf106,LOC100506190,IER5L,C9orf50,PPP2R4,CRAT IMR90,MCF7,K562,HELA Hi-C,ChIA-PET,5C 24141950,22265404,22955621 RP11-65J3.1 53278 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 67404 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chr9 132244062 132244824 132244277 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 332 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 132247452 132247693 132247545 Y C9orf106 LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 3722 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 132249735 132250094 132249903 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 6005 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 132257886 132258547 132258348 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 14156 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 132369856 132370376 132370136 Y CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107 ASB6 NA NA NA NA ASB6 32068 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.55944026756961 chr9 132429420 132429769 132429595 Y C9orf50,PRRX2 ASB6,PRRX2 NA NA NA NA PRRX2 3500 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr9 132505331 132505539 132505390 Y PTGES PTGES NA NA NA NA PTGES 7787 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 132512351 132512751 132512561 Y PTGES PTGES NA NA NA NA PTGES 575 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 132514052 132514155 132514104 Y NA PTGES,TOR1B NA NA NA NA PTGES 726 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 132648080 132648314 132648193 Y ASB6,TOR1B,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1 NA NA NA NA NA C9orf78 51938 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 132712659 132713039 132713009 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1 90434 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 132785309 132785843 132785545 Y USP20,USP20,FNBP1 FNBP1,GPR107 NA NA NA NA FNBP1 17630 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 132814142 132814504 132814316 Y TOR1B FNBP1,GPR107 NCS1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR107 437 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr9 133321021 133321306 133321114 Y ASS1 ASS1 NA NA NA NA ASS1 2705 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 133565449 133565699 133565571 Y NA RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1 NA NA NA NA EXOSC2 1409 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.67082885811029 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr9 134498956 134499243 134499097 Y NA NA NA NA NA NA UCK1 94301 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 134508781 134509131 134508955 Y NA NA NA NA NA NA UCK1 104126 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr9 134510539 134511032 134510903 Y RAPGEF1,RAPGEF1 NA NA NA NA NA RAPGEF1 102429 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 134553923 134554245 134554041 Y FAM78A,PRRC2B,RAPGEF1,MED27,RAPGEF1 NA NA NA NA NA RAPGEF1 59216 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 134608936 134609538 134609242 Y RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 3923 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 134613837 134614689 134614350 Y RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 376 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 134774819 134775116 134774968 Y NA NA NA NA NA NA RAPGEF1 161358 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 134913456 134913470 134913463 Y NA MED27 NA NA NA NA MED27 39825 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 134950793 134951083 134950938 Y NA MED27 NA NA NA NA MED27 2212 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 134953880 134954115 134953996 Y MED27 MED27 NA NA NA NA MED27 585 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 135279793 135280144 135280078 Y TTF1 TTF1 NA NA NA NA TTF1 65 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 135818615 135818626 135818622 Y RALGDS,C9orf96 TSC1 NA NA NA NA TSC1 595 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 136009131 136009458 136009277 Y GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS RALGDS NA NA NA NA RALGDS 27843 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.22777181081372 chr9 136009735 136010292 136009932 Y GTF3C4,DDX31,RALGDS RALGDS NA NA NA NA RALGDS 27009 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 136010510 136011124 136011032 Y RPL7A,RALGDS,RALGDS RALGDS NA NA NA NA RALGDS 26177 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr9 136226163 136226469 136226316 Y NA SURF6,MED22,RPL7A,SNORD36A,SNORD36C,SURF2,SURF1,SURF4 NA NA NA NA SURF1 4611 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 136576519 136576779 136576603 Y SURF4 SARDH NA NA NA NA SARDH 26298 CAGE SAS hg19 FANTOM5 2.00499462973235 chr9 136739075 136739598 136739373 Y VAV2 NA NA NA NA NA VAV2 116128 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr9 136746393 136746610 136746453 Y VAV2 NA NA NA NA NA VAV2 109116 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr9 136856624 136856782 136856656 Y VAV2 VAV2,LINC00094 NA NA NA NA VAV2 898 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr9 137030495 137030803 137030732 Y NA WDR5 NA NA NA NA WDR5 32008 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 137257724 137257990 137257923 Y RXRA NA NA NA NA NA RXRA 50780 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr9 137264490 137265116 137264820 Y RXRA NA NA NA NA NA RXRA 57546 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr9 137272864 137273054 137272976 Y RXRA NA NA NA NA NA RXRA 65920 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 137285570 137286195 137285918 Y NA NA NA NA NA NA RXRA 78626 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 137367331 137367474 137367390 Y COL5A1 NA COL5A1 IMR90 Hi-C 24141950 RXRA 160387 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 137536549 137536868 137536739 Y COL5A1 COL5A1 NA NA NA NA COL5A1 4929 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 138348639 138348707 138348673 Y NA PPP1R26,MRPS2,C9orf116 NA NA NA NA PPP1R26 20218 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr9 138778583 138778765 138778659 Y KCNT1 CAMSAP1,RP11-432J22.2 NA NA NA NA CAMSAP1 18309 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 138780125 138780291 138780208 Y CAMSAP1 CAMSAP1,RP11-432J22.2 NA NA NA NA CAMSAP1 16783 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 138796932 138797111 138797062 Y CAMSAP1 RP11-432J22.2 NA NA NA NA CAMSAP1 0 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.779720133784804 chr9 138797876 138798018 138797978 Y CAMSAP1 CAMSAP1,RP11-432J22.2 NA NA NA NA RP11-432J22.2 218 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 138915703 138915918 138915811 Y NA NA NA NA NA NA UBAC1 64477 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 138986008 138986159 138986118 Y NACC2 NACC2,C9orf69 NA NA NA NA NACC2 877 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 139136338 139136616 139136467 Y QSOX2 QSOX2 NA NA NA NA QSOX2 651 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr9 139294189 139294305 139294248 Y TRAF2,FAM69B,INPP5E DNLZ,SDCCAG3,PMPCA,INPP5E NA NA NA NA SDCCAG3 8756 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 139427023 139427107 139427058 Y NACC2,SEC16A,NOTCH1 NOTCH1,RP11-611D20.2 NA NA NA NA NOTCH1 11207 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 139445894 139446087 139445949 Y SEC16A,NOTCH1 NOTCH1,RP11-611D20.2 MIR4674,NOTCH1 K562 ChIA-PET 22265404 RP11-611D20.2 7230 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 139493398 139493576 139493438 Y NA NA MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-611D20.2 54734 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 139591698 139592004 139591952 Y C8G AGPAT2,SNHG7 NA NA NA NA AGPAT2 11823 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr9 139826661 139826850 139826762 Y NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2 FBXW5 NA NA NA NA FBXW5 10298 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr9 140023271 140023604 140023504 Y EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,MIR3621 NA NA NA NA DPP7 15642 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7,MIR3621 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE SAS hg19 FANTOM5 9.24525301487696 chr9 140134697 140134985 140134927 Y C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3 TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 1032 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chr9 140189199 140189592 140189229 Y NA NRARP NA NA NA NA NRARP 5111 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.22527449594755 chr9 140200054 140200221 140200146 Y EXD3,NRARP NRARP NA NA NA NA NRARP 5351 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 140205114 140205300 140205216 Y PNPLA7,NOXA1,NRARP NRARP NA NA NA NA NRARP 10411 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chr9 140205908 140206072 140205991 Y NRARP NRARP NA NA NA NA NRARP 11205 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 140274735 140275080 140274933 Y CACNA1B,PTGDS,ABCA2,GRIN1,RNF208,PNPLA7 EXD3,NOXA1 NA NA NA NA EXD3 40634 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 140301516 140301688 140301630 Y CACNA1B,NRARP EXD3,NOXA1 NA NA NA NA EXD3 14026 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 140306093 140306345 140306289 Y NRARP EXD3,NOXA1 NA NA NA NA EXD3 9369 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 140341522 140341675 140341601 Y EHMT1,ANAPC2,NELF EXD3,NOXA1 NA NA NA NA NOXA1 25720 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 140388730 140388770 140388753 Y FUT7,C9orf140,UAP1L1,DPP7,NDOR1,NOXA1 NA NA NA NA NA MRPL41 54881 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chr9 140463644 140464019 140463889 Y FAM166A,C9orf173 MRPL41,ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1 NA NA NA NA ZMYND19 18923 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 140565381 140565755 140565635 Y NRARP NA NA NA NA NA EHMT1 53937 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chr9 140689053 140689448 140689207 Y NA NA NA NA NA NA EHMT1 177609 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 3732525 3732707 3732561 Y NA NA NA NA NA NA PRKX 102876 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chrX 3732842 3733263 3733002 Y PRKX NA NA NA NA NA PRKX 103193 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.78221744865098 chrX 3870962 3871082 3871022 Y NA NA NA NA NA NA PRKX 241313 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 9786668 9786951 9786810 Y NA SHROOM2,RP11-98L4.1 NA NA NA NA RP11-98L4.1 1159 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chrX 10161663 10162021 10162010 Y NA CLCN4 NA NA NA NA CLCN4 38639 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 10547215 10547494 10547354 Y NA NA NA NA NA NA MID1 302279 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chrX 10586151 10586408 10586285 Y NA NA NA NA NA NA MID1 263365 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chrX 12228582 12228906 12228588 Y NA NA NA NA NA NA MSL3 454304 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chrX 12965371 12965491 12965432 Y NA TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 25736 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chrX 12968289 12968795 12968434 Y TMSB4X,TLR7,TLR8 TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 22432 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chrX 12969061 12969258 12969197 Y TMSB4X,TLR7,TLR8 TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 21969 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chrX 12972600 12972806 12972677 Y NA TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 18421 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 12974184 12974672 12974538 Y TMSB4X,TLR7,TLR8 TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 16555 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 13017682 13017863 13017801 Y TLR7,TMSB4X TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 26455 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 13105363 13105695 13105563 Y TLR7,TLR8,TMSB4X NA TMSB4X,FAM9C MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TMSB4X 114136 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 13119924 13120175 13120039 Y NA NA TMSB4X MCF7 ChIA-PET 22265404 TMSB4X 128697 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chrX 13306086 13306254 13306170 Y NA NA TMSB4X,LOC100133123 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPX1P1 89205 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chrX 13416625 13416882 13416754 Y NA GPX1P1 FAM9C,TMSB4X,LOC100133123 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPX1P1 21166 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chrX 13687345 13687715 13687534 Y TCEANC,RAB9A TCEANC,RAB9A NA NA NA NA RAB9A 17529 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 15695028 15695432 15695331 Y ZRSR2,AP1S2,PIGA CA5BP1,CA5B NA NA NA NA CA5BP1 3973 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 16805192 16805460 16805250 Y TXLNG TXLNG NA NA NA NA TXLNG 2642 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chrX 16900871 16900973 16900947 Y TXLNG RBBP7,RNU4-6P RBBP7,TXLNG MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNU4-6P 9481 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 17395556 17395647 17395622 Y NHS NHS NA NA NA NA NHS 4013 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chrX 17415371 17415448 17415410 Y NA NHS NA NA NA NA NHS 23828 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chrX 19643767 19644028 19643952 Y SH3KBP1 NA NA NA NA NA SH3KBP1 259691 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chrX 19693983 19694199 19694048 Y NA NA NA NA NA NA SH3KBP1 209520 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chrX 20534229 20534626 20534565 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KA3 250706 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chrX 20628422 20628647 20628433 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KA3 344899 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 21945015 21945333 21945248 Y NA SMS SMS,MBTPS2 IMR90 Hi-C 24141950 SMS 11358 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chrX 22538340 22538693 22538516 Y NA NA NA NA NA NA SMS 581649 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 23919211 23919551 23919376 Y ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,ACOT9,SAT1 APOO NA NA NA NA APOO 4506 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chrX 28999435 28999810 28999466 Y NA NA NA NA NA NA FTLP2 1646605 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 29610847 29611180 29610948 Y NA NA NA NA NA NA FTLP2 1035235 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chrX 29678122 29678339 29678241 Y NA NA NA NA NA NA FTLP2 968076 CAGE SAS hg19 FANTOM5 15.4830140851554 chrX 29681325 29681360 29681343 Y NA NA NA NA NA NA FTLP2 965055 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 29699916 29700254 29699978 Y NA NA NA NA NA NA FTLP2 946161 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 36981340 36981727 36981708 Y PRRG1,PRRG1 NA NA NA NA NA PRRG1 224801 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 39018443 39018533 39018484 Y NA NA NA NA NA NA MID1IP1 359758 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 39719139 39719410 39719301 Y BCOR NA BCOR IMR90 Hi-C 24141950 GAPDHP1 73749 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 39767458 39767957 39767519 Y NA NA BCOR IMR90 Hi-C 24141950 GAPDHP1 122068 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 39872499 39873023 39872596 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 161559 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chrX 39953769 39954197 39953849 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 80385 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 39964938 39965503 39965246 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 69079 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chrX 39965558 39965902 39965820 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 68680 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 40012729 40012965 40012840 Y BCOR,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 21617 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 40013089 40013254 40013186 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 21328 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 40030956 40031200 40030978 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2 BCOR NA NA NA NA BCOR 3382 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chrX 40032962 40033837 40033453 Y BCOR,CXorf38,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 745 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 40869896 40870061 40869955 Y ATP6AP2 NA MED14,USP9X IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP9X 72827 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chrX 40943673 40944218 40943773 Y CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X USP9X NA NA NA NA USP9X 785 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chrX 41182589 41182765 41182693 Y NA DDX3X DDX3X IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDX3X 7886 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chrX 41538171 41538545 41538500 Y CASK NA NA NA NA NA CASK 242171 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 41594711 41594837 41594774 Y NA NA NA NA NA NA CASK 185879 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 42588439 42588616 42588528 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G2P4 632013 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 43888590 43889088 43888779 Y EFHC2 NA NA NA NA NA MAOB 148897 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chrX 44168721 44168911 44168853 Y NA EFHC2 NA NA NA NA EFHC2 32007 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 44174118 44174402 44174260 Y MAOB,EFHC2 EFHC2 NA NA NA NA EFHC2 26516 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 45305345 45305614 45305509 Y NA NA NA NA NA NA RP11-245M24.1 57019 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.556942952703431 chrX 45338516 45338773 45338583 Y NA RP11-245M24.1 MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-245M24.1 23860 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.44805167702892 chrX 45366261 45366615 45366438 Y NA RP11-245M24.1 MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-245M24.1 3628 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 45374628 45375077 45374937 Y NA RP11-245M24.1 MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-245M24.1 11995 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chrX 45375128 45375452 45375290 Y NA RP11-245M24.1 MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-245M24.1 12495 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 45376807 45376988 45376867 Y NA RP11-245M24.1 MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-245M24.1 14174 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chrX 45493055 45493058 45493057 Y NA NA NA NA NA NA MIR221 110636 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 45568719 45568861 45568812 Y NA MIR221,MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR221 34833 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chrX 45617544 45618196 45618069 Y NA MIR221,MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR222 13014 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chrX 45618389 45618809 45618683 Y NA MIR221,MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR222 13859 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chrX 45626471 45627108 45626806 Y NA MIR221,MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR222 21941 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chrX 45645081 45645275 45645187 Y NA MIR221,MIR222 NA NA NA NA MIR222 40551 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chrX 45647781 45648040 45647909 Y NA MIR221,MIR222 NA NA NA NA MIR222 43251 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chrX 45648299 45648762 45648585 Y NA MIR221,MIR222 NA NA NA NA MIR222 43769 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 45663739 45663972 45663886 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 44948 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 45665386 45665505 45665456 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 43415 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 45667637 45667718 45667664 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 41202 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 45702877 45703292 45703236 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 5628 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chrX 46120012 46120235 46120091 Y NA NA NA NA NA NA RP1-30G7.2 64845 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.11388590540686 chrX 46125056 46125409 46125233 Y NA NA NA NA NA NA RP1-30G7.2 59671 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.00249731486618 chrX 46182516 46182747 46182636 Y NA RP1-30G7.2 NA NA NA NA RP1-30G7.2 2333 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 46316161 46316444 46316394 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 18012 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chrX 46495805 46496079 46496076 Y NA NA NA NA NA NA CHST7 64586 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 46773328 46773680 46773526 Y NA NA NA NA NA NA RP2 78953 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 46989082 46989431 46989227 Y NA RBM10,NDUFB11 NA NA NA NA RBM10 12837 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 47382833 47383145 47382966 Y SYN1,SPACA5,CFP,CFP ZNF41,ARAF UBA1,ZNF41,USP11,CDK16 IMR90 Hi-C 24141950 ARAF 35371 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 47438054 47438403 47438273 Y CFP,CFP,ARAF ARAF,TIMP1 NA NA NA NA TIMP1 1309 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 48348956 48349364 48349102 Y PORCN,PORCN,FTSJ1 FTSJ1,PORCN,EBP,TBC1D25 NA NA NA NA PORCN 15986 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.668331543244117 chrX 48350817 48351213 48350906 Y WAS,RBM3,PORCN,OTUD5 FTSJ1,PORCN,EBP,TBC1D25 NA NA NA NA PORCN 14137 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chrX 49012442 49012818 49012676 Y NA GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP MAGIX,PLP2 IMR90 Hi-C 24141950 PLP2 13455 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 49108550 49108714 49108667 Y PIM2,PPP1R3F,FOXP3 HSPB1P2,CCDC22,PPP1R3F NA NA NA NA PPP1R3F 15592 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 52004971 52005124 52005057 Y NA NA NA NA NA NA MAGED1 460868 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 52964244 52964539 52964367 Y TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 45908 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chrX 53428419 53428681 53428625 Y NA RIBC1,SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA RIBC1 18958 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chrX 53467837 53468052 53468003 Y KDM5C RIBC1,SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA HSD17B10 8517 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chrX 56791132 56791384 56791234 Y NA RP11-622K12.1,UQCRBP1 NA NA NA NA UQCRBP1 29122 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 56839801 56840427 56840156 Y NA NA NA NA NA NA UQCRBP1 77791 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 58292059 58292236 58292148 Y NA NA NA NA NA NA KRT8P17 282939 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 64898955 64899156 64899089 Y MSN NA NA NA NA NA MSN 92698 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 67352579 67352916 67352601 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 298839 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 67624994 67625390 67625192 Y NA OPHN1 NA NA NA NA OPHN1 26365 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 67724193 67724408 67724299 Y NA YIPF6 NA NA NA NA YIPF6 8028 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 68004355 68004677 68004478 Y NA SERBP1P1,EFNB1 NA NA NA NA SERBP1P1 3040 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chrX 69654278 69654566 69654417 Y DLG3 DLG3 NA NA NA NA DLG3 8145 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 73338544 73338621 73338582 Y NA NA NA NA NA NA USMG5P1 53104 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 73350281 73350820 73350789 Y RLIM USMG5P1 JPX IMR90 Hi-C 24141950 USMG5P1 40905 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chrX 73756210 73756567 73756298 Y NA NA NA NA NA NA RLIM 75885 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chrX 74033137 74033450 74033294 Y NA NA NA NA NA NA RLIM 200685 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 74259170 74259182 74259176 Y NA NA NA NA NA NA ABCB7 115385 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 79965324 79965547 79965436 Y BRWD3 NA NA NA NA NA BRWD3 97640 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 85339971 85340972 85340615 Y NA CHM NA NA NA NA CHM 39405 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.89110872432549 chrX 87351546 87351899 87351791 Y NA RP3-452M16.1 NA NA NA NA RP3-452M16.1 1320 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 92479084 92479478 92479382 Y NA RP13-88F20.1 NA NA NA NA RP13-88F20.1 1070 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 95940743 95941133 95941025 Y DIAPH2 DIAPH2 NA NA NA NA DIAPH2 3081 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chrX 96454742 96455056 96454899 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH2 517080 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 105809036 105809195 105809116 Y NA CXorf57 NA NA NA NA CXorf57 43965 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 106595212 106595632 106595477 Y NA NA NA NA NA NA NUP62CL 147542 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 106595667 106595822 106595802 Y NA NA NA NA NA NA NUP62CL 147997 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chrX 106920003 106920801 106920325 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 50266 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chrX 106954265 106954667 106954451 Y TSC22D3,TSC22D3,ATG4A NA NA NA NA NA TSC22D3 63905 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 106985108 106985412 106985307 Y TSC22D3,TSC22D3,TSC22D3 TSC22D3 NA NA NA NA TSC22D3 33160 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 107639720 107640073 107639886 Y COL4A6 COL4A6,COL4A5 NA NA NA NA COL4A6 40654 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chrX 114948087 114948383 114948235 Y NA EEF1GP5 NA NA NA NA EEF1GP5 12956 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 115238483 115238690 115238635 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 155061 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 117487110 117487426 117487273 Y DOCK11,WDR44 WDR44 NA NA NA NA WDR44 9074 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 117658077 117658215 117658146 Y WDR44,DOCK11 NA NA NA NA NA WDR44 180041 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 118149361 118149839 118149621 Y LONRF3 LONRF3 NA NA NA NA LONRF3 42780 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chrX 118890270 118890420 118890345 Y SEPT6,ZBTB33,ZBTB33,RNF113A RPL39 SEPT6 IMR90 Hi-C 24141950 RPL39 33186 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 119619980 119620335 119620161 Y NA LAMP2 LAMP2 K562 ChIA-PET 22265404 LAMP2 18760 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 120337126 120337342 120337247 Y NA NA NA NA NA NA C1GALT1C1 575121 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.78221744865098 chrX 126864134 126864535 126864335 Y NA NA NA NA NA NA MTND4P24 1259266 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 127434305 127434453 127434370 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA1 1221024 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 129118011 129118370 129118054 Y NA BCORL1 BCORL1,UTP14A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCORL1 4928 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 129216343 129216741 129216485 Y SASH3,ELF4,ELF4,BCORL1 ELF4 NA NA NA NA ELF4 25950 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 129245756 129246153 129246006 Y NA ELF4 NA NA NA NA ELF4 3065 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chrX 129255072 129255259 129255158 Y SASH3,ELF4,ELF4 ELF4,AIFM1 ELF4 K562 ChIA-PET 22265404 ELF4 12381 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chrX 129400519 129400680 129400638 Y NA ZNF280C NA NA NA NA ZNF280C 193 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chrX 130880517 130880959 130880705 Y NA NA NA NA NA NA MST4 274334 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 130952432 130952771 130952603 Y NA NA NA NA NA NA MST4 202522 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.445554362162745 chrX 135940631 135940874 135940833 Y HTATSF1 RBMX,RP11-308D16.4 NA NA NA NA RBMX 20049 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 139858514 139858763 139858620 Y NA NA NA NA NA NA ATP11C 833079 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 149862815 149863170 149863006 Y MTMR1 MTMR1 NA NA NA NA MTMR1 3380 CAGE SAS hg19 FANTOM5 1.33666308648823 chrX 149996146 149996459 149996317 Y NA NA NA NA NA NA CD99L2 68830 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 150152595 150153067 150152778 Y NA HMGB3,RPL19P21 NA NA NA NA HMGB3 5613 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chrX 152065195 152065303 152065205 Y NA NA CETN2,NSDHL MCF7 ChIA-PET 22265404 NSDHL 67684 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 152648727 152649001 152648990 Y SLC6A8,ZNF275 NA NA NA NA NA ZNF275 51114 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 153596671 153598676 153598064 Y NA FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1 NA NA NA NA FLNA 2330 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 153755432 153755621 153755566 Y NA LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD FAM3A MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 IKBKG 11793 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 153828728 153829141 153828914 Y NA NA NA NA NA NA G6PD 54941 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrX 153829365 153829583 153829391 Y NA NA NA NA NA NA G6PD 55578 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.334165771622059 chrX 153956289 153956510 153956418 Y TKTL1,IKBKG,IKBKG,F8A2,F8A1,GAB3 GAB3,DKC1 NA NA NA NA GAB3 21348 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.222777181081372 chrX 154365480 154365529 154365504 Y NA MTCP1 NA NA NA NA MTCP1 8683 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686 chrY 15207344 15207441 15207401 Y NA NA NA NA NA NA AGKP1 1541535 CAGE SAS hg19 FANTOM5 0.111388590540686