chr1	839741	840250	839788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOC2L	52439	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr1	840753	841210	840812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOC2L	51479	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	918449	918555	918505	Y	NA	NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN	NA	NA	NA	NA	HES4	14997	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	945769	946034	945890	Y	CCNL2,ATAD3B	PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	ISG15	769	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	956563	956812	956665	Y	UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN	HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	AGRN	3060	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.96774413108555
chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RNF223	2701	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	1014834	1015095	1014859	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	RNF223	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RNF223	7147	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr1	1136075	1136463	1136398	Y	HES4,ISG15	SDF4,B3GALT6	NA	NA	NA	NA	SDF4	28948	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	1265677	1265980	1265829	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1	NA	NA	NA	NA	GLTPD1	7541	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	1295535	1296332	1296026	Y	MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8	CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	MXRA8	378	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr1	1343359	1343768	1343546	Y	NA	MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20,VWA1	NA	NA	NA	NA	MRPL20	2666	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	1368471	1368786	1368620	Y	RNF223,DVL1,NADK,LOC441869,TMEM88B,VWA1	CCNL2,MRPL20,VWA1,ATAD3B	NA	NA	NA	NA	VWA1	230	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr1	1611804	1612115	1611960	Y	NA	MMP23B,CDK11B,CDK11A	NA	NA	NA	NA	CDK11B	23331	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	1706859	1707124	1707007	Y	NA	NADK	NA	NA	NA	NA	NADK	2772	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	1708824	1709349	1708980	Y	NA	NADK	NA	NA	NA	NA	NADK	547	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	1803114	1803303	1803274	Y	NA	GNB1,TMEM52	NADK	IMR90	Hi-C	24141950	GNB1	17192	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr1	1814762	1815124	1815035	Y	SKI,C1orf86,MIB2	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	GNB1	5371	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	TMEM52	7877	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	4.86757758742215
chr1	2068660	2068858	2068763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf86	73301	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	2111429	2112079	2111937	Y	NA	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	30080	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	2177615	2177829	2177732	Y	NADK,GNB1,TNFRSF14,SKI	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	35456	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	2245775	2246116	2245876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	75030	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr1	2246556	2246763	2246722	Y	SKI	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	74383	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	2253622	2253773	2253699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	67373	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,FAM213B	NA	NA	NA	NA	PANK4	21376	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	2478276	2478817	2478474	Y	SKI,PANK4,TNFRSF14	PANK4,FAM213B	NA	NA	NA	NA	PANK4	22237	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	2574079	2574144	2574101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58149	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.21052989808695
chr1	3227700	3227783	3227742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	141207	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	3459907	3460197	3460078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	65862	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	3463934	3464260	3464145	Y	ARHGEF16	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	61799	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr1	3817648	3818071	3817969	Y	LRRC47	CEP104,DFFB,C1orf174	NA	NA	NA	NA	C1orf174	2791	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	6342321	6342466	6342446	Y	NA	ICMT,GPR153	NA	NA	NA	NA	GPR153	23286	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	6661008	6661639	6661311	Y	ZBTB48,KLHL21	NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3	NA	NA	NA	NA	PHF13	10106	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	6943772	6944262	6943813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	100388	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	7177733	7177848	7177794	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-8P	99572	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	7764543	7764931	7764717	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	64398	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	7843556	7843653	7843585	Y	PER3	VAMP3,PER3	NA	NA	NA	NA	PER3	1176	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	8070132	8070398	8070299	Y	PER3,SLC45A1,ERRFI1	ERRFI1,RP11-431K24.1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	13970	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	8076289	8076986	8076888	Y	NA	ERRFI1,RP11-431K24.1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	7382	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	8198088	8198334	8198235	Y	NA	NA	ERRFI1,SLC45A1,RERE,PARK7	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-7P	66323	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	8215795	8215905	8215839	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,SLC45A1,PARK7	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-7P	48752	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	8262223	8262541	8262360	Y	ERRFI1	RNU1-7P	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	2116	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.96774413108555
chr1	8264458	8264788	8264713	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	8272041	8272390	8272277	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	7384	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr1	8300045	8300389	8300198	Y	NA	RNU1-7P	PARK7,ERRFI1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	35388	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	8450820	8451072	8450834	Y	RERE,RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	74934	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	8487656	8487917	8487791	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	111770	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	8488165	8488317	8488222	Y	TNFRSF9,RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	112279	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	8499087	8499228	8499177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	123201	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	8571636	8571856	8571737	Y	SLC45A1,RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	195750	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	8686491	8686867	8686745	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	188835	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	8849339	8849636	8849462	Y	NA	RERE	NA	NA	NA	NA	RERE	26066	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	8933581	8933925	8933847	Y	NA	ENO1	NA	NA	NA	NA	ENO1	3383	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	9223692	9223875	9223840	Y	NA	GPR157,RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP3-510D11.2	16388	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	9318130	9318195	9318182	Y	NA	H6PD,SPSB1	NA	NA	NA	NA	H6PD	25296	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	9504221	9504505	9504342	Y	SPSB1	NA	SPSB1,H6PD,MIR34A,SLC25A33,TMEM201,PIK3CD	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	93036	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	10816030	10816223	10816138	Y	CASZ1	NA	NA	NA	NA	NA	TARDBP	254191	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	10927237	10927380	10927309	Y	CASZ1	NA	PEX14,CASZ1,APITD1-CORT,C1orf127	IMR90	Hi-C	24141950	TARDBP	143034	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	11798918	11799121	11798987	Y	FBXO6,AGTRAP,TNFRSF8,TNFRSF1B,MFN2,MTHFR,CLCN6	MAD2L2,AGTRAP	NA	NA	NA	NA	AGTRAP	4777	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	12546528	12546819	12546674	Y	DHRS3	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	128918	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	12589452	12589763	12589585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	85974	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	12609717	12610039	12609907	Y	DHRS3	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	65698	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	12614115	12614248	12614183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	61489	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	12674513	12674729	12674684	Y	NA	DHRS3	NA	NA	NA	NA	DHRS3	1008	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	15519488	15519688	15519655	Y	NA	TMEM51	NA	NA	NA	NA	TMEM51	42460	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	16030221	16030623	16030258	Y	NA	PLEKHM2,TMEM82	NA	NA	NA	NA	PLEKHM2	21394	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	16087189	16087372	16087266	Y	EPHA2,FBLIM1	TMEM82,FBLIM1	NA	NA	NA	NA	FBLIM1	6087	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	16125579	16125747	16125670	Y	FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2	FBLIM1,RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	26977	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3049	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	16212759	16213091	16212941	Y	EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	40117	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	16227810	16227873	16227842	Y	C1orf64,SPEN	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	55168	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	16339360	16339596	16339414	Y	NA	ZBTB17,HSPB7	NA	NA	NA	NA	HSPB7	4493	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.2427857670014
chr1	16339773	16339933	16339866	Y	CASP9,PLEKHM2,SPEN,ZBTB17	ZBTB17,HSPB7	NA	NA	NA	NA	HSPB7	4156	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	16470181	16470602	16470563	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	9104	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	16508402	16508642	16508565	Y	FBLIM1	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	EPHA2	27820	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	16670445	16670837	16670642	Y	SPEN,C1orf64,FBXO42	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	6112	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	16677236	16677843	16677569	Y	ZBTB17,FBXO42	FBXO42	RSG1	IMR90	Hi-C	24141950	FBXO42	287	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	16696032	16696399	16696223	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	19083	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	RNU1-1	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-1	12489	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr1	17027024	17027386	17027173	Y	NA	EIF1AXP1	NA	NA	NA	NA	EIF1AXP1	16474	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.96774413108555
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	RP11-108M9.4	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-108M9.4	17109	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-108M9.4	26044	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	17767804	17768710	17768126	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	3584	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	5.1782740291725
chr1	19336477	19336714	19336579	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	55297	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	19803336	19803680	19803404	Y	TMCO4,UBR4	CAPZB,RNU4-28P	NA	NA	NA	NA	CAPZB	6386	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	20091332	20091506	20091448	Y	PLA2G2A,TMCO4	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	32932	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	20111066	20111358	20111348	Y	NA	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	13080	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	21284001	21284025	21284019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	114221	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	21428050	21428147	21428101	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	29804	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	22002610	22002786	22002701	Y	NA	RAP1GAP	RAP1GAP	K562	ChIA-PET	22265404	RAP1GAP	8809	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	22066009	22066225	22066117	Y	NA	USP48	RAP1GAP	IMR90	Hi-C	24141950	USP48	41874	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	22076024	22076450	22076245	Y	NA	USP48	RAP1GAP	IMR90	Hi-C	24141950	USP48	31649	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	22089036	22089375	22089206	Y	NA	USP48	RAP1GAP	IMR90	Hi-C	24141950	USP48	18724	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	22829217	22829453	22829426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB40	52873	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	23448967	23449247	23449107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LUZP1	53054	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	23494015	23494642	23494449	Y	NA	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	7659	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	23669506	23669991	23669712	Y	NA	HNRNPR,C1orf213,ZNF436	NA	NA	NA	NA	HNRNPR	677	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	23748973	23749126	23749052	Y	NA	TCEA3	NA	NA	NA	NA	TCEA3	107	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	23849183	23849405	23849280	Y	PNRC2,RPL11	ASAP3,E2F2,ID3	NA	NA	NA	NA	E2F2	6307	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.071309611669
chr1	23888678	23889201	23888997	Y	ID3	E2F2,ID3	NA	NA	NA	NA	ID3	4393	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	23912037	23912393	23912293	Y	PNRC2,RPL11	ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	27752	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	24680333	24680598	24680466	Y	NA	GRHL3	NA	NA	NA	NA	GRHL3	36521	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	24890021	24890356	24890213	Y	C1orf130	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN3	62634	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	25051079	25051208	25051162	Y	NA	CLIC4	RUNX3,CLIC4,SRRM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLIC4	18640	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.4499167281683
chr1	25051605	25051987	25051744	Y	NA	CLIC4	RUNX3,CLIC4,SRRM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLIC4	17861	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	25559638	25560067	25559796	Y	RUNX3,SYF2,C1orf63	SYF2	NA	NA	NA	NA	SYF2	2645	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	25942744	25943208	25942998	Y	EXTL1,MAN1C1	NA	NA	NA	NA	NA	LDLRAP1	74673	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	25969249	25969578	25969407	Y	PDIK1L,SYF2,C1orf63,TMEM57,LDLRAP1,MAN1C1,FAM54B	NA	SEPN1	IMR90	Hi-C	24141950	LDLRAP1	101178	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	26201699	26201757	26201716	Y	SEPN1	RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	RP1-125I3.2	17595	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	26490998	26491259	26491133	Y	NA	FAM110D,ZNF593,CNKSR1	NA	NA	NA	NA	ZNF593	3103	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	26678060	26678317	26678200	Y	CNKSR1,AIM1L	UBXN11,AIM1L	NA	NA	NA	NA	AIM1L	304	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	26735858	26736255	26735942	Y	NA	LIN28A,DHDDS,RP3-476K8.4	NA	NA	NA	NA	LIN28A	589	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HMGN2	30291	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.13922028641795
chr1	26907862	26908015	26907938	Y	SH3BGRL3,UBXN11	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2	110921	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr1	27021406	27021810	27021509	Y	NA	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	882	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	27289282	27289295	27289289	Y	NA	C1orf172,RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	C1orf172	4385	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	27337570	27337809	27337727	Y	NA	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	FAM46B	243	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	27854575	27854919	27854692	Y	SYTL1,FGR,FGR,FGR,FAM76A,C1orf38	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	39906	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	27871123	27871471	27871363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WASF2	56454	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	27893464	27893671	27893490	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	35271	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	27893697	27893957	27893851	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	34985	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	27907931	27908052	27907995	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	20890	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	27922522	27922947	27922946	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	5995	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	27924204	27924421	27924302	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	4521	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	27963400	27963974	27963761	Y	EYA3,STX12,C1orf38,FGR,FGR,FGR	AHDC1,IFI6	NA	NA	NA	NA	IFI6	32755	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	27979244	27979520	27979318	Y	NA	IFI6	NA	NA	NA	NA	IFI6	17209	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.8641786505021
chr1	28640564	28640739	28640692	Y	C1orf38,XKR8,PTAFR,PTAFR,TAF12,GMEB1,SESN2,MED18	MED18	MED18	MCF7	ChIA-PET	22265404	MED18	12774	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	28641770	28641993	28641852	Y	C1orf38,XKR8,EYA3,PTAFR,PTAFR,TAF12,GMEB1,SESN2,MED18	MED18	MED18	MCF7	ChIA-PET	22265404	MED18	11520	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	29451057	29451462	29451431	Y	TMEM200B,TMEM200B	TMEM200B	NA	NA	NA	NA	TMEM200B	2610	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	29504261	29504387	29504317	Y	YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2112	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	29563709	29564430	29563877	Y	PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	2681	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	29564766	29564995	29564881	Y	NA	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	3738	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	29565762	29566055	29565979	Y	SRSF4,PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	4734	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	29598339	29598546	29598399	Y	NA	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	37311	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	4.45331566508835
chr1	31360609	31360977	31360897	Y	NA	SDC3	NA	NA	NA	NA	SDC3	18631	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	31504221	31504603	31504488	Y	NA	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	32235	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	31625313	31625543	31625426	Y	NA	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	88475	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	90728	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.5212263398373
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	91382	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.13922028641795
chr1	31643824	31643962	31643871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PUM1	106986	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr1	31770743	31770927	31770835	Y	NA	SNRNP40,ZCCHC17	NA	NA	NA	NA	ZCCHC17	2901	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	31943761	31943827	31943813	Y	NA	NA	SERINC2,SNRNP40,NKAIN1,ZCCHC17,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1,PEF1,SPOCD1,HCRTR1	IMR90	Hi-C	24141950	SERINC2	63349	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	31976608	31977048	31976952	Y	PUM1	NA	LOC284551	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-73M7.1	62126	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr1	32015159	32015590	32015321	Y	NA	RP11-73M7.1,TINAGL1	FABP3,SERINC2,LOC284551,PEF1,HCRTR1,NKAIN1,TINAGL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-73M7.1	23584	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	32108020	32108204	32108102	Y	NA	PEF1	NA	NA	NA	NA	PEF1	293	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr1	32180603	32180986	32180867	Y	PEF1,SPOCD1,COL16A1	BAI2	PEF1,COL16A1	IMR90	Hi-C	24141950	BAI2	47508	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	32420307	32420572	32420414	Y	TMEM234,PEF1,PTP4A2,PTP4A2	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	11850	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	32421622	32422096	32421696	Y	MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	13165	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	32423598	32423720	32423682	Y	PTP4A2	PTP4A2	SPOCD1,KHDRBS1,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,PTP4A2,TMEM39B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	15141	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr1	32966228	32966602	32966575	Y	FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8B,ZBTB8A	NA	NA	NA	NA	ZBTB8A	36426	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr1	33089029	33089046	33089038	Y	NA	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	25458	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	33202470	33202806	33202641	Y	ZBTB8OS,RBBP4,RBBP4,KIAA1522	SYNC,KIAA1522	KIAA1522	K562	ChIA-PET	22265404	KIAA1522	2680	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	33220297	33220575	33220521	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	14811	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	33220963	33221073	33221021	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	15477	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	33225777	33226084	33225890	Y	TMEM54,KIAA1522	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	20291	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	33454783	33455472	33455325	Y	RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	26497	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	33622437	33622835	33622675	Y	PHC2,TRIM62	TRIM62	NA	NA	NA	NA	TRIM62	22825	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	33685276	33685676	33685470	Y	NA	TRIM62,ZNF362	TRIM62,ZNF362,PHC2,ZSCAN20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF362	34470	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	33829513	33829825	33829684	Y	FNDC5,ZSCAN20	NA	NA	NA	NA	NA	PHC2	64828	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	35892196	35892421	35892350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCDN	128653	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	36103028	36103196	36103152	Y	NA	PSMB2	TFAP2E	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB2	2249	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	36183411	36183689	36183588	Y	C1orf216	C1orf216,CLSPN	NA	NA	NA	NA	C1orf216	338	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	38317043	38317898	38317556	Y	ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	5394	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	39357087	39357474	39357146	Y	MACF1,GJA9	RRAGC,RP5-864K19.4,MYCBP	NA	NA	NA	NA	MYCBP	11798	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	39516193	39516422	39516273	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	26203	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	39596184	39596482	39596236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	51196	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	39607620	39607869	39607817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	62632	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	40264988	40265120	40265045	Y	NA	BMP8B	HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BMP8B	12455	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	40331340	40331501	40331388	Y	PABPC4,PPIE,ZMPSTE24,RLF,PPT1,CAP1,BMP8B,TRIT1,MYCL1	TRIT1,RP1-118J21.5	NA	NA	NA	NA	TRIT1	15682	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	40561233	40561752	40561648	Y	SMAP2,RLF	NA	NA	NA	NA	NA	PPT1	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	40628781	40629153	40628997	Y	NA	RLF	NA	NA	NA	NA	RLF	3736	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	41005233	41005440	41005262	Y	RLF	RP11-656D10.3,ZNF684	NA	NA	NA	NA	ZNF684	10000	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	41365158	41365531	41365407	Y	NA	CITED4	CITED4,CTPS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED4	39140	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.7283573010042
chr1	41501908	41501999	41501966	Y	SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	175890	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	41650800	41651168	41651109	Y	KCNQ4,SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	54658	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	41825927	41826139	41826062	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	333	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.2784405728359
chr1	41826642	41826952	41826745	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	1048	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr1	41831444	41831806	41831485	Y	SCMH1	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	5850	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	41952015	41952273	41952132	Y	EDN2	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO6	126421	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr1	41961925	41962146	41962029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO6	136331	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	42272535	42272820	42272654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	226776	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	42774668	42774801	42774679	Y	CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	FOXJ3	NA	NA	NA	NA	FOXJ3	24747	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr1	42934748	42935131	42934805	Y	CCDC30,RIMKLA	PPCS,ZMYND12,CCDC30,TMSB4XP1	NA	NA	NA	NA	CCDC30	7747	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	43388597	43388971	43388887	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	33559	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	43405621	43405821	43405630	Y	CCDC30,CCDC23,ERMAP,SZT2,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	16709	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	43406108	43407009	43406836	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	15521	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	43471435	43471828	43471543	Y	SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	48715	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr1	43473183	43473398	43473279	Y	C1orf210,C1orf210,SLC2A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	50463	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	43839359	43839523	43839441	Y	NA	RP1-92O14.3,CDC20,ELOVL1,MED8,SZT2	NA	NA	NA	NA	ELOVL1	7663	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	43988888	43989038	43988936	Y	PTPRF	PTPRF	PTPRF	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRF	30	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr1	43997843	43998152	43997977	Y	PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	8985	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.4499167281683
chr1	44015731	44016125	44016031	Y	CCDC24,WDR65,C1orf210,C1orf210,PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	26873	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	44430681	44431060	44430788	Y	NA	ARTN,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24	NA	NA	NA	NA	DPH2	2612	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	44495684	44496307	44495779	Y	NA	CCDC24,SLC6A9	B4GALT2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A9	545	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	45167170	45167180	45167175	Y	NA	TMEM53,RNU5F-1,KIF2C	NA	NA	NA	NA	RNU5F-1	18394	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	45670767	45670868	45670821	Y	PTCH2,ZSWIM5	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM5	99013	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	46102450	46102810	46102714	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	12688	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	46111666	46112048	46111975	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	3450	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	46351629	46351956	46351793	Y	C1orf190	NA	NA	NA	NA	NA	MAST2	100970	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	46528388	46528566	46528496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	110179	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	46955737	46955918	46955906	Y	DMBX1	NA	FAAH,DMBX1,MKNK1	IMR90	Hi-C	24141950	FAAH	97800	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	47055088	47055141	47055115	Y	NA	MKNK1	NA	NA	NA	NA	MKNK1	25374	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	47522995	47523190	47523093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAL1	172702	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	48178329	48178566	48178448	Y	NA	NA	CYP4A22,CMPK1,FOXD2,MGC12982	IMR90	Hi-C	24141950	CMPK1	380860	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	50619908	50620155	50620032	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMRTA2	267017	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	51083951	51084011	51083988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMRTA2	196779	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	51245588	51245972	51245952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	177963	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	51261727	51261870	51261800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	162065	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	51415396	51415400	51415398	Y	NA	FAF1,CDKN2C	NA	NA	NA	NA	FAF1	8535	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	51703075	51703494	51703244	Y	OSBPL9	RNF11	NA	NA	NA	NA	RNF11	3132	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	51823993	51824400	51824363	Y	NA	TTC39A	NA	NA	NA	NA	TTC39A	15205	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	51935246	51935592	51935567	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15	NA	NA	NA	NA	RP11-191G24.1	46389	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	52035422	52035744	52035601	Y	NA	OSBPL9	OSBPL9,EPS15,NRD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL9	5107	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	52088228	52088763	52088412	Y	NA	OSBPL9	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	47377	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	52173889	52173954	52173921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	133038	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	52193179	52193464	52193255	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRD1	149013	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	52238666	52238881	52238774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRD1	103596	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	52341008	52341095	52341052	Y	CC2D1B,OSBPL9	NRD1	NA	NA	NA	NA	NRD1	1382	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	52390204	52390438	52390419	Y	NA	NRD1	NA	NA	NA	NA	NRD1	47727	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	52628189	52628583	52628480	Y	NA	ZFYVE9,RP4-800M22.2	NA	NA	NA	NA	RP4-800M22.2	1491	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	52999324	52999688	52999506	Y	NA	ZCCHC11	PRPF38A,ORC1	IMR90	Hi-C	24141950	ZCCHC11	17471	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	53020482	53020832	53020657	Y	BTF3L4,PRPF38A,ZYG11B,FAM159A,ZCCHC11	ZCCHC11,GPX7	NA	NA	NA	NA	ZCCHC11	3323	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	53168640	53169047	53168726	Y	NA	ZYG11B	SELRC1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ZYG11B	21079	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	53385696	53386052	53386029	Y	NA	ECHDC2,SCP2	NA	NA	NA	NA	ECHDC2	4832	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	53702100	53702340	53702220	Y	NA	CPT2,C1orf123	NA	NA	NA	NA	MAGOH	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	54260217	54260562	54260390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPF1	93845	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	54261078	54261111	54261098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPF1	93296	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr1	54286238	54286401	54286368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPF1	68006	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	54700132	54700688	54700499	Y	NA	CYB5RL	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	36423	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	54739679	54739787	54739710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	75970	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	54744858	54745090	54744974	Y	NA	NA	CYB5RL,MRPL37	IMR90	Hi-C	24141950	CYB5RL	81149	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	54749325	54749366	54749346	Y	NA	NA	CYB5RL,MRPL37	IMR90	Hi-C	24141950	CYB5RL	85616	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	54804829	54805209	54805022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP3	71943	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	54842500	54842749	54842625	Y	NA	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	34403	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	54844378	54844570	54844456	Y	NA	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	32582	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	54873075	54873515	54873406	Y	SSBP3,SSBP3	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	3637	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	54875187	54875373	54875227	Y	NA	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	1779	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	54941776	54941995	54941811	Y	NA	NA	TMEM59,TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2	IMR90	Hi-C	24141950	SSBP3	64624	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	54965893	54966212	54966053	Y	NA	NA	TCEANC2,SSBP3,MRPL37,CYB5RL,CDCP2,YIPF1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4,ACOT11,FAM151A	IMR90	Hi-C	24141950	SSBP3	88741	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	55327144	55327486	55327453	Y	NA	RP11-67L3.5,DHCR24	NA	NA	NA	NA	RP11-67L3.5	23062	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	57042744	57043185	57043024	Y	C8B,C8A,C1orf168,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	65789	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	57043287	57044160	57043621	Y	PRKAA2,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	64814	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	58317106	58317467	58317287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P15	202685	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	59083441	59083551	59083446	Y	NA	TACSTD2	TACSTD2,OMA1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TACSTD2	42275	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	59280364	59280505	59280397	Y	NA	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	32579	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	59280773	59281281	59281052	Y	FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	32988	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	59281510	59281579	59281545	Y	JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	33725	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	59281873	59282217	59282125	Y	MYSM1,FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	34088	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	59369049	59370138	59369602	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	JUN	121264	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	59394323	59394565	59394423	Y	NA	NA	FGGY,JUN,LOC100131060	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JUN	146538	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	59522982	59523218	59523118	Y	NA	NA	FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52	IMR90	Hi-C	24141950	FGGY	237092	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	59761390	59761720	59761439	Y	NA	FGGY	NA	NA	NA	NA	FGGY	1080	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	62208815	62209373	62208933	Y	NA	TM2D1,INADL	NA	NA	NA	NA	INADL	2666	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	62307827	62308113	62307970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INADL	101678	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	62605206	62605403	62605332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK4	177682	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	62609116	62609459	62609128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK4	173626	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	62726098	62726337	62726314	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK4	56748	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr1	62948948	62949316	62949132	Y	KANK4,USP1,ATG4C	USP1	NA	NA	NA	NA	USP1	48980	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	63151036	63151115	63151076	Y	NA	DOCK7,RP11-230B22.1	NA	NA	NA	NA	DOCK7	854	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	65389011	65389411	65389276	Y	NA	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	40776	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	65758796	65759173	65758995	Y	NA	DNAJC6	NA	NA	NA	NA	DNAJC6	46894	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	65891768	65892129	65891951	Y	NA	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	7498	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	65946781	65947169	65947001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEPROT	62511	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	66728047	66728190	66728184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR78	660380	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	67460593	67460710	67460683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35D1	57072	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	67494221	67494361	67494358	Y	SLC35D1,MIER1	SLC35D1	NA	NA	NA	NA	SLC35D1	23421	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	68166463	68166766	68166597	Y	NA	GADD45A	NA	NA	NA	NA	GADD45A	17719	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	68215256	68215932	68215330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45A	66512	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.1069644175035
chr1	68572958	68573227	68573176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIRAS3	57644	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	68639460	68639856	68639657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLS	56947	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	68657070	68657479	68657271	Y	NA	WLS,RPS7P4	NA	NA	NA	NA	WLS	39324	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	68961350	68961555	68961472	Y	NA	DEPDC1	NA	NA	NA	NA	DEPDC1	446	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	69441381	69441536	69441435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEPDC1	480477	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	70709017	70709466	70709138	Y	NA	LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	24311	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	70733839	70734223	70734057	Y	NA	RP4-677H15.4	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	49133	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	70806613	70806974	70806794	Y	NA	ANKRD13C,HHLA3,RP11-180O5.2	NA	NA	NA	NA	ANKRD13C	11443	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	70877943	70877992	70877968	Y	CTH	CTH	NA	NA	NA	NA	CTH	3042	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	72749220	72749791	72749447	Y	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NA	KRT8P21	818684	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	75168986	75169131	75169081	Y	NA	TYW3,CRYZ	NA	NA	NA	NA	TYW3	27705	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	76250721	76250813	76250769	Y	ACADM,RABGGTB	RABGGTB,SNORD45A	NA	NA	NA	NA	SNORD45A	761	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	76645391	76645540	76645467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD45A	393817	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	77595980	77596376	77595997	Y	NA	RP4-706A16.3	NA	NA	NA	NA	RP4-706A16.3	3212	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	77977128	77977445	77977326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	169659	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	78026939	78027232	78027062	Y	FAM73A	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	119872	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	78067790	78068312	78068066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	78792	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	78386302	78386347	78386324	Y	NEXN	NEXN	NA	NA	NA	NA	NEXN	34104	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	78404062	78404594	78404354	Y	NA	FUBP1,DNAJB4,GIPC2	NA	NA	NA	NA	FUBP1	38200	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIPC2	114120	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIPC2	772546	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	84120524	84120814	84120773	Y	PRKACB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	203892	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	168293	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	84971050	84971209	84971115	Y	MCOLN2,GNG5	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	802	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	85349108	85349420	85349289	Y	LPAR3	LPAR3	NA	NA	NA	NA	LPAR3	7476	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	85643319	85643587	85643547	Y	NA	SYDE2	MIR4423	IMR90	Hi-C	24141950	SYDE2	21142	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr1	85667688	85667915	85667906	Y	NA	SYDE2	NA	NA	NA	NA	SYDE2	2959	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	85795855	85796291	85796120	Y	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	55082	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	85810010	85810182	85810130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	69237	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	86077578	86077925	86077749	Y	DDAH1,CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYR61	33134	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	86968505	86968764	86968543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ODF2L	108482	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	87800631	87801610	87800748	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	8480	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	89358212	89358439	89358316	Y	PKN2,CCBL2	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	2585	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr1	89887466	89887838	89887537	Y	GBP3,GBP1,GBP2,GBP4,GBP5,LRRC8C,LRRC8B	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC8B	100557	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	90032556	90032702	90032627	Y	LRRC8D,GBP2,LRRC8C,LRRC8B,LRRC8B	LRRC8B	NA	NA	NA	NA	LRRC8B	44161	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	90274070	90274340	90274210	Y	NA	LRRC8D	GEMIN8P4,ZNF326,LRRC8D	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LRRC8D	10233	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.2427857670014
chr1	90319744	90319959	90319950	Y	NA	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	35171	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	90321378	90321621	90321467	Y	LRRC8C,ZNF326	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	36805	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	90376424	90376756	90376561	Y	LRRC8D,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	81124	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	91183313	91183764	91183661	Y	BARHL2	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-665J23.1	131443	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	91478571	91478975	91478771	Y	ZNF644,ZNF644	ZNF644	NA	NA	NA	NA	ZNF644	6854	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	92183243	92183457	92183382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	186435	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	92184014	92184251	92184134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	185641	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	92196214	92196626	92196448	Y	TGFBR3	NA	HSP90B3P	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBR3	173266	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	92198149	92198440	92198227	Y	TGFBR3	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	171452	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	92201825	92202076	92201951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	167816	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	92218581	92218971	92218958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	150921	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	92268637	92268946	92268791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	100946	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	92269494	92269966	92269778	Y	TGFBR3,RPAP2,GLMN	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	99926	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	93002551	93002867	93002761	Y	RPAP2,GLMN,GFI1	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-59P	161624	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	93170902	93171289	93171144	Y	NA	RNU4-59P	NA	NA	NA	NA	RNU4-59P	6411	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	93694062	93694249	93694102	Y	MTF2,CCDC18	TMED5	NA	NA	NA	NA	TMED5	49777	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	93773027	93773315	93773230	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	DR1	36130	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	93806739	93807078	93807070	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	DR1	2367	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	93914812	93914954	93914881	Y	FNBP1L	FNBP1L	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	3124	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr1	94007993	94008357	94008092	Y	FNBP1L,BCAR3	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	96305	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	94084336	94084510	94084423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	172648	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	94125861	94126246	94126059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAR3	184460	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	94127789	94128026	94127840	Y	GCLM,TMED5,DNTTIP2	NA	NA	NA	NA	NA	BCAR3	182680	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	94133922	94134283	94134103	Y	FNBP1L	NA	NA	NA	NA	NA	BCAR3	176423	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	94145547	94146118	94145739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAR3	164588	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	94527681	94527931	94527843	Y	ARHGAP29	NA	NA	NA	NA	NA	GCLM	154715	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr1	94581772	94581927	94581850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-148B18.1	129537	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	94583651	94584037	94583923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-148B18.1	127427	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.2427857670014
chr1	94676840	94677023	94676933	Y	NA	RP11-148B18.1	NA	NA	NA	NA	RP11-148B18.1	34441	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	94684511	94684818	94684682	Y	NA	RP11-148B18.1	NA	NA	NA	NA	RP11-148B18.1	26646	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	94701813	94701865	94701839	Y	ARHGAP29	RP11-148B18.1,ARHGAP29	NA	NA	NA	NA	RP11-148B18.1	9599	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	94788386	94788592	94788436	Y	ARHGAP29,F3	ARHGAP29	ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP29	49762	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	94891778	94892070	94891849	Y	NA	ABCD3	NA	NA	NA	NA	ABCD3	9845	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	94937052	94937396	94937225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCD3	55119	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	95060137	95060382	95060260	Y	NA	NA	F3,ALG14,SLC44A3	IMR90	Hi-C	24141950	F3	54781	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	95249173	95249377	95249275	Y	NA	LINC01057,SLC44A3	ABCD3,F3,ALG14	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	34460	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	95276451	95276463	95276457	Y	NA	LINC01057,SLC44A3	F3,ABCD3,CNN3,SLC44A3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01057	7374	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	95464838	95464926	95464881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALG14	71575	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	96822792	96822994	96822909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P11	87492	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	97199537	97199912	97199566	Y	NA	PTBP2	NA	NA	NA	NA	PTBP2	14316	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.34635124758485
chr1	100505302	100505632	100505358	Y	NA	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	3649	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	100512510	100512716	100512572	Y	HIAT1	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	10857	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	100678369	100678762	100678562	Y	NA	DBT	NA	NA	NA	NA	DBT	34628	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	100820585	100820838	100820683	Y	HIAT1,CDC14A	CDC14A	NA	NA	NA	NA	CDC14A	12001	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	100858865	100858991	100858930	Y	SLC35A3,HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	50281	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	100859089	100859486	100859291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	50505	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	100859593	100859940	100859621	Y	HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	51009	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	101392986	101393260	101393033	Y	S1PR1,SLC30A7,SLC30A7	EXTL2,SLC30A7	NA	NA	NA	NA	SLC30A7	33354	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	101469727	101469819	101469773	Y	NA	RP11-421L21.3,DPH5	NA	NA	NA	NA	RP11-421L21.3	19615	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	101486133	101486158	101486151	Y	NA	RP11-421L21.3,DPH5	NA	NA	NA	NA	RP11-421L21.3	3276	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	103126263	103126396	103126338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-556K13.1	874204	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.79626797575315
chr1	104884906	104885201	104885054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNPC3	818593	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	108695322	108695861	108695595	Y	FAM102B	SLC25A24	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	45610	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	109159407	109159722	109159520	Y	NA	HENMT1	NA	NA	NA	NA	HENMT1	42426	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr1	109467804	109468470	109468110	Y	GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	35636	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	109499781	109500180	109500079	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	3926	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	109515208	109515609	109515409	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	CLCC1	11097	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	109572587	109572654	109572620	Y	NA	WDR47,TAF13	NA	NA	NA	NA	WDR47	10196	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	109754796	109754995	109754880	Y	NA	SARS,CELSR2	NA	NA	NA	NA	SARS	256	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	109784080	109784425	109784202	Y	NA	SARS,CELSR2,PSRC1	CELSR2	IMR90	Hi-C	24141950	CELSR2	6216	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	109937534	109937767	109937651	Y	GSTM3,WDR47,CELSR2,PSRC1,SORT1,SORT1	SORT1,PSMA5	NA	NA	NA	NA	SORT1	806	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	110271520	110271826	110271755	Y	GSTM3	NA	NA	NA	NA	NA	GSTM2	62876	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.76061316991865
chr1	110320163	110320291	110320225	Y	NA	NA	CSF1,AHCYL1,CYB561D1,ATXN7L2,GPR61,GNAI3,AMIGO1,AMPD2,GNAT2,GSTM4,GSTM5,EPS8L3,FAM40A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GSTM2	111519	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	110333273	110333688	110333592	Y	GNAI3,AMPD2,AMPD2,CSF1	NA	CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GSTM2	124629	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	110334849	110335164	110334977	Y	NA	NA	CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GSTM2	126205	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	110355223	110355262	110355244	Y	NA	NA	CSF1,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	GSTM2	146579	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	110420039	110420145	110420092	Y	UBL4B	NA	CSF1,AHCYL1,EPS8L3,GNAI3,CYB561D1,ATXN7L2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AHCYL1	105163	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	110548379	110548612	110548408	Y	NA	AHCYL1	NA	NA	NA	NA	AHCYL1	23071	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	110879130	110879445	110879277	Y	CSF1	RBM15,LAMTOR5-AS1	NA	NA	NA	NA	RBM15	2	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	111163364	111163623	111163482	Y	PROK1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC16A4	231660	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	111489179	111489247	111489213	Y	NA	LRIF1	NA	NA	NA	NA	LRIF1	15454	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	111677638	111678032	111677835	Y	NA	CEPT1,DRAM2	NA	NA	NA	NA	CEPT1	2217	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	112196411	112196803	112196596	Y	C1orf183,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	DDX20	99064	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	112438367	112438956	112438733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM212B	141921	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	113369203	113369427	113369274	Y	SLC16A1,SLC16A1	RP3-522D1.1,RP11-426L16.8	RHOC,PPM1J,FAM19A3,LRIG2	IMR90	Hi-C	24141950	RP3-522D1.1	21223	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.4499167281683
chr1	113394964	113395159	113395070	Y	NA	RP3-522D1.1,RP11-426L16.8	FAM19A3,PPM1J	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-426L16.8	3699	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr1	113574968	113575168	113575068	Y	NA	RP11-31F15.2,LRIG2	CTTNBP2NL,PPM1J,MOV10,RHOC,SLC16A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-31F15.2	38559	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	113932415	113932748	113932683	Y	NA	MAGI3	NA	NA	NA	NA	MAGI3	1044	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	114236415	114236760	114236542	Y	MAGI3	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF1	63351	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	114244987	114245321	114245197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF1	54790	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	115046601	115046805	115046703	Y	NA	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	4976	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	115052481	115052766	115052572	Y	BCAS2,TRIM33	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	700	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr1	115605190	115605611	115605404	Y	BCAS2,SIKE1	TSPAN2	NA	NA	NA	NA	TSPAN2	24510	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	115605746	115606114	115606007	Y	BCAS2	TSPAN2	NA	NA	NA	NA	TSPAN2	24007	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	116087444	116087828	116087621	Y	NA	NA	NGF	IMR90	Hi-C	24141950	VANGL1	94746	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	116088478	116088732	116088606	Y	NA	NA	NGF,VANGL1,SYCP1	IMR90	Hi-C	24141950	VANGL1	93842	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	116221756	116221883	116221820	Y	NA	VANGL1	NA	NA	NA	NA	VANGL1	39182	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	116923407	116923493	116923480	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	10117	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	117112460	117112738	117112567	Y	TTF2,CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	NAP1L4P1,CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	799	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	117129425	117129671	117129544	Y	TTF2,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	17764	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	117814674	117814878	117814758	Y	NA	NA	VTCN1,TTF2,TRIM45	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	VTCN1	63118	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	119668351	119668628	119668490	Y	WARS2	RP11-418J17.1,WARS2	NA	NA	NA	NA	RP11-418J17.1	12391	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	120275491	120275880	120275569	Y	ADAM30	HMGCS2	NA	NA	NA	NA	HMGCS2	33648	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMBP1	225939	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	144533627	144534178	144533764	Y	PDE4DIP	RNU1-59P	PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNU1-59P	1589	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	144941125	144941602	144941408	Y	NA	RNU2-38P	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	1070	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr1	144986415	144987071	144986860	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP	RNU2-38P	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	43743	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	144987154	144987391	144987382	Y	NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	RNU2-38P	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	44482	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	144988079	144988414	144988189	Y	NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP	RNU2-38P	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	45407	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	144993199	144993244	144993232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	50527	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	145004446	145004804	145004625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	61774	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	145012331	145013054	145012678	Y	NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	61132	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	145030583	145030978	145030933	Y	NA	PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	43208	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	145036432	145036531	145036463	Y	NA	PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	37655	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	146774989	146775112	146775013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMO5	62289	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	146956714	146956895	146956804	Y	GPR89B	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	183723	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.76061316991865
chr1	149138053	149138113	149138087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNVU1-17	54156	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	149222771	149223127	149223106	Y	NA	RNVU1-17,RNU1-92P	NBPF10,SEC22B,NBPF15	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-92P	9471	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	149816287	149817606	149817166	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2BC	2733	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr1	149820361	149820952	149820609	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2AA4	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	149821015	149821647	149821349	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2AA4	372	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	149910900	149911536	149911461	Y	NA	SV2A,SF3B4,MTMR11	NA	NA	NA	NA	MTMR11	4109	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	150539630	150541082	150540777	Y	NA	ADAMTSL4,MCL1	NA	NA	NA	NA	MCL1	8984	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	150577042	150577503	150577391	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	22585	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	150585815	150586394	150586132	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,FAM63A,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	13694	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	150592182	150592667	150592572	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	7421	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	151166314	151166527	151166421	Y	NA	SEMA6C,SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	VPS72	517	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	151168916	151169086	151168995	Y	NA	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	491	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr1	151172142	151172526	151172243	Y	FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	3717	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	151172620	151173197	151172669	Y	TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	4195	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	151184646	151184728	151184696	Y	NA	LYSMD1,VPS72,PIP5K1A,PSMD4	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	16221	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	151418157	151418544	151418397	Y	NA	PSMB4,POGZ	NA	NA	NA	NA	POGZ	11397	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	151445792	151446161	151446000	Y	C1orf56,RIIAD1,OAZ3	POGZ,CGN	RIIAD1,LOC100132111,TUFT1,CGN,SNX27,POGZ,PI4KB,PSMB4,CELF3,OAZ3,TDRKH,MRPL9,RORC,C2CD4D	IMR90,MCF7,HELA,H1ESC,K562	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	POGZ	15851	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	151485676	151485841	151485746	Y	C2CD4D,CGN,TUFT1	CGN,SNORA44,TUFT1	NA	NA	NA	NA	CGN	4690	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr1	151579004	151579225	151579123	Y	NA	SNX27,RP11-404E16.1	RIIAD1,CELF3	IMR90	Hi-C	24141950	SNX27	3316	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	151580936	151581099	151580976	Y	NA	SNX27,RP11-404E16.1	RIIAD1,CELF3	IMR90	Hi-C	24141950	SNX27	1442	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	151809390	151809745	151809546	Y	RORC,C2CD4D	RP11-98D18.9,TDRKH,THEM5	NA	NA	NA	NA	THEM5	14428	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	151868154	151868386	151868273	Y	NA	THEM5,THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	11898	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	151877533	151877895	151877666	Y	THEM4	THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	2389	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	151918166	151918684	151918434	Y	NA	THEM4,S100A10,NBPF18P	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	37882	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	151945504	151945625	151945562	Y	NA	S100A10,NBPF18P	NA	NA	NA	NA	S100A10	19241	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	151960875	151961433	151961102	Y	S100A11,S100A10	S100A10,NBPF18P	NA	NA	NA	NA	S100A10	3433	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr1	151961675	151962369	151962069	Y	S100A11,S100A10	S100A10,NBPF18P	NA	NA	NA	NA	S100A10	2497	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	151962641	151962839	151962740	Y	NA	S100A10,NBPF18P	NA	NA	NA	NA	S100A10	2027	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	152006910	152007460	152006991	Y	SNX27,S100A11	S100A10,NBPF18P,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	10923	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	153285394	153285679	153285564	Y	NA	S100A9	NA	NA	NA	NA	S100A9	42651	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	153488459	153488748	153488622	Y	PGLYRP4,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14	S100A6,S100A4	NA	NA	NA	NA	S100A6	17972	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	153541018	153541368	153541269	Y	PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13	S100A6,S100A4,S100A16,S100A14	NA	NA	NA	NA	S100A4	20406	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	153583449	153583810	153583692	Y	PGLYRP3,PGLYRP4,S100A7A,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13	S100A14,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN	NA	NA	NA	NA	S100A16	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	153584539	153584862	153584750	Y	NA	S100A16,S100A14,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN	NA	NA	NA	NA	S100A16	918	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	153818420	153818667	153818544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A3	73590	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	153841080	153841191	153841137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	52260	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	153929776	153930098	153929954	Y	NA	GATAD2B,DENND4B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CRTC2	675	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,DENND4B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CREB3L4	1149	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.62479182042075
chr1	154154606	154155027	154154830	Y	SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	10097	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.34635124758485
chr1	154577703	154577929	154577737	Y	NA	UBE2Q1,CHRNB2,ADAR	NA	NA	NA	NA	ADAR	20546	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	154899922	154900189	154899933	Y	NA	PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1	NA	NA	NA	NA	PMVK	7278	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	154972628	154972915	154972668	Y	CLK2,DPM3,DPM3,PYGO2,FLAD1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	212	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	154973335	154973935	154973656	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	208	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	154977099	154977253	154977190	Y	ADAR,ADAR,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	3972	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	155064132	155064186	155064153	Y	NA	ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3	NA	NA	NA	NA	EFNA3	29908	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	155097183	155097419	155097260	Y	NA	EFNA1,SLC50A1,DPM3,TRIM46,KRTCAP2	NA	NA	NA	NA	EFNA1	517	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	155098409	155098801	155098460	Y	PKLR,PKLR,EFNA4,EFNA1	EFNA1,SLC50A1,DPM3,TRIM46,KRTCAP2	NA	NA	NA	NA	EFNA1	473	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	TRIM46,KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	155283531	155283932	155283776	Y	DCST1,EFNA1	HCN3,CLK2,FDPS,RUSC1	NA	NA	NA	NA	RUSC1	4755	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	155469100	155469412	155469293	Y	MTX1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2	NA	NA	NA	NA	NA	ASH1L-AS1	60409	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	155496665	155497012	155496914	Y	DCST1,HCN3,YY1AP1,ASH1L	ASH1L-AS1,ASH1L	NA	NA	NA	NA	ASH1L-AS1	32809	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	155535083	155535193	155535176	Y	HCN3	ASH1L-AS1,ASH1L,RP11-29H23.6	NA	NA	NA	NA	ASH1L	4485	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	155904830	155905033	155904931	Y	NA	RIT1,KIAA0907	NA	NA	NA	NA	KIAA0907	2639	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	156073854	156074351	156074085	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	RAB25,MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	23490	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	156074715	156075305	156075042	Y	YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	RAB25,MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	24351	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr1	156103413	156103690	156103594	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,LMNA	NA	NA	NA	NA	NA	LMNA	53049	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	156133837	156133883	156133860	Y	C1orf182,RHBG,HAPLN2,C1orf61,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,MEX3A,PAQR6,PAQR6	SLC25A44,PMF1-BGLAP,PMF1	NA	NA	NA	NA	SLC25A44	27997	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	41117	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	156473111	156473378	156473326	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4491	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	156718467	156719136	156718868	Y	C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	65	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	156719450	156719815	156719708	Y	ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	1048	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	156966343	156966626	156966486	Y	NA	ARHGEF11	NA	NA	NA	NA	ARHGEF11	46536	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	158942717	158942925	158942799	Y	OR10J1,OR10R2,OR6P1,OR10X1,OR10Z1,OR6K3,OR6N1,OR6N2,FCER1A,PYHIN1	IFI16	NA	NA	NA	NA	IFI16	24833	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	159880076	159880706	159880437	Y	FCRL6,DCAF8,TAGLN2	RP11-190A12.7,CCDC19,TAGLN2,IGSF9	NA	NA	NA	NA	CCDC19	12123	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	159886226	159886307	159886250	Y	NA	RP11-190A12.7,CCDC19,TAGLN2,IGSF9	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	7215	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	159907968	159908165	159908117	Y	NA	CCDC19,TAGLN2,IGSF9	NA	NA	NA	NA	IGSF9	5221	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	159910997	159911192	159911068	Y	CCDC19,ATP1A4	CCDC19,TAGLN2,IGSF9	NA	NA	NA	NA	IGSF9	2194	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	160158522	160158897	160158632	Y	NA	ATP1A4,PEA15	NA	NA	NA	NA	PEA15	14230	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	160332348	160332525	160332392	Y	SLAMF7,IGSF9,NHLH1,VANGL2	SUMO1P3,NCSTN,COPA,VANGL2	NA	NA	NA	NA	COPA	21158	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	160696081	160696317	160696161	Y	CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-312J18.5	166453	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	160881277	160881698	160881498	Y	NA	RP11-312J18.5	CD244,ITLN1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-312J18.5	18507	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.58913701458625
chr1	160972513	160972848	160972620	Y	SLAMF7,USF1,ARHGAP30	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	16290	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	160982920	160983992	160983766	Y	CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	5146	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	160989381	160990254	160990012	Y	NDUFS2,ADAMTS4,F11R	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	243	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	161324130	161324422	161324290	Y	NA	SDHC	NA	NA	NA	NA	SDHC	42083	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	NA	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	77619	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	NA	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	87026	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr1	161847357	161847565	161847361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF6	113273	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	161892699	161893027	161892754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOS1AP	144537	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	162511455	162511984	162511719	Y	UAP1,UHMK1	UHMK1,UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	17339	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	164717528	164717907	164717706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	194707	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	164734934	164735098	164735029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	212113	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	165868061	165868423	165868295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMCO1	73069	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	166828089	166828463	166828188	Y	POU2F1,POGK	POGK,TADA1	NA	NA	NA	NA	TADA1	15101	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	167035961	167036358	167035977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILDR2	93242	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr1	167730247	167730494	167730371	Y	NA	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	41818	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	167766380	167766616	167766548	Y	SFT2D2,CREG1	RP1-313L4.4	NA	NA	NA	NA	RP1-313L4.4	20870	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	167772811	167773182	167772825	Y	CREG1	RP1-313L4.4	NA	NA	NA	NA	RP1-313L4.4	14304	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	168050664	168051125	168050872	Y	SFT2D2	NA	NA	NA	NA	NA	GPR161	53696	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	168149052	168149361	168149233	Y	NA	GPR161,TIPRL,RPL34P1,SFT2D2	NA	NA	NA	NA	TIPRL	2881	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	168368318	168368620	168368438	Y	TBX19	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	120040	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	168409627	168409736	168409651	Y	NA	NA	F5	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	161349	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr1	168526950	168527356	168527080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	278672	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	168531443	168531650	168531547	Y	NA	NA	LOC100505918,NME7	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	283165	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	169834996	169835276	169835168	Y	NA	SCYL3	NA	NA	NA	NA	SCYL3	26132	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr1	172418117	172418641	172418353	Y	NA	C1orf105,PIGC	NA	NA	NA	NA	PIGC	6887	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	172500351	172500710	172500527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	89121	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	172507125	172507604	172507262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	95895	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	172606833	172606931	172606882	Y	FASLG,C1orf9	NA	C1orf9,FASLG	IMR90	Hi-C	24141950	PIGC	195603	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	172882769	172883147	172883123	Y	TNFSF18	NA	TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,PRDX6,CENPL,DARS2,SNORD75,GAS5,SNORD81,SNORD47,SNORD78,SNORD79,SNORD77,LOC100506046,SNORD44,SNORD76,SNORD80,ZBTB37	IMR90	Hi-C	24141950	PIGC	471539	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	173328578	173328674	173328661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	115731	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	173398914	173399297	173399234	Y	NA	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	45108	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	173447359	173447668	173447399	Y	PRDX6	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	2954	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	173909740	173909938	173909924	Y	RC3H1,ZBTB37	SERPINC1	NA	NA	NA	NA	SERPINC1	25224	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	174375242	174375457	174375350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RABGAP1L	248694	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	174503176	174503233	174503205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RABGAP1L	376628	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	175160901	175161109	175161018	Y	KIAA0040,KIAA0040	KIAA0040	NA	NA	NA	NA	KIAA0040	766	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	176601179	176601401	176601333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-195C7.1	426395	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	176786385	176786536	176786461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-35C21.1	532186	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	178901109	178901308	178901215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM20B	91631	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	178995927	178996290	178996175	Y	AXDND1,RALGPS2,TOR3A	FAM20B	NA	NA	NA	NA	FAM20B	2988	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	179290775	179290979	179290800	Y	NA	SOAT1	NA	NA	NA	NA	SOAT1	29850	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	179555221	179555646	179555325	Y	TDRD5,TDRD5,TDRD5	TDRD5	NA	NA	NA	NA	TDRD5	3102	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	179606990	179607135	179607063	Y	NA	TDRD5	NA	NA	NA	NA	TDRD5	48242	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	180200686	180200867	180200752	Y	NA	LHX4	NA	NA	NA	NA	LHX4	3265	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	180403880	180403893	180403887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD6	66196	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	180494187	180494417	180494302	Y	NA	ACBD6	XPR1,MR1,KIAA1614,STX6	IMR90	Hi-C	24141950	ACBD6	24098	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	180921044	180921090	180921069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX6	68957	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	181074349	181074924	181074645	Y	XPR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	18711	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	182274457	182274562	182274517	Y	NA	NA	GLUL	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GLUL	84779	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	182998797	182999044	182998924	Y	NA	LAMC1	NA	NA	NA	NA	LAMC1	8202	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	183129116	183129507	183129296	Y	LAMC2	LAMC2	LAMC2	IMR90	Hi-C	24141950	LAMC2	23866	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	183239968	183240242	183240112	Y	LAMC1	NA	LAMC2	IMR90	Hi-C	24141950	LAMC2	86595	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	183241451	183241867	183241650	Y	LAMC1	NA	LAMC2	IMR90	Hi-C	24141950	LAMC2	88078	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	183248987	183249454	183249212	Y	NCF2,NCF2,ARPC5,LAMC1	NA	NA	NA	NA	NA	LAMC2	95614	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	183310808	183311127	183310994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMNAT2	74610	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	183333168	183333467	183333301	Y	NCF2,NCF2,ARPC5	NA	NA	NA	NA	NA	NMNAT2	52270	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	183557915	183558504	183558249	Y	SMG7,NCF2,NCF2,ARPC5	ARPC5,RGL1	NA	NA	NA	NA	ARPC5	44388	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	183836661	183836955	183836765	Y	RGL1,GLT25D2	NA	NA	NA	NA	NA	TSEN15	181856	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	184033703	184034036	184033838	Y	NA	TSEN15	NA	NA	NA	NA	TSEN15	14892	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	184357629	184357933	184357738	Y	EDEM3	C1orf21	NA	NA	NA	NA	C1orf21	3437	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	184475712	184475981	184475798	Y	EDEM3	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf21	121520	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	184607018	184607429	184607184	Y	RNF2,FAM129A,EDEM3	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	114618	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	184794829	184794875	184794854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	72782	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	184810330	184810429	184810414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	88283	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	185109809	185110137	185110116	Y	IVNS1ABP	TRMT1L,SWT1	NA	NA	NA	NA	TRMT1L	14067	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	185344563	185345243	185344914	Y	FAM129A,RNF2,TRMT1L,SWT1,TRMT1L,SWT1,IVNS1ABP	NA	IVNS1ABP,LOC100288079	IMR90	Hi-C	24141950	IVNS1ABP	60102	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	185389591	185389741	185389658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	105130	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	185508482	185508840	185508659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	224021	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	186042920	186043354	186043253	Y	HMCN1,OCLM	NA	NA	NA	NA	NA	TPR	299471	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	187235320	187235513	187235392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	439235	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	191624673	191624706	191624690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4426	1058607	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	192924608	192924823	192924716	Y	NA	NA	RGS2	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP126	81493	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	193080839	193080969	193080896	Y	NA	GLRX2,CDC73	NA	NA	NA	NA	GLRX2	7595	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	197582182	197582565	197582448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1B	160261	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	197739507	197739631	197739601	Y	NA	DENND1B	NA	NA	NA	NA	DENND1B	3195	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	198128112	198128944	198128293	Y	PTPRC,DENND1B	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	4019	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	199436119	199436458	199436291	Y	NA	NA	PTPRC,LOC100131234	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF281	940726	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	200050544	200050911	200050727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF281	326273	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	200622357	200622464	200622411	Y	NA	KIF14,DDX59	NA	NA	NA	NA	DDX59	14633	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	200862818	200862950	200862864	Y	NA	C1orf106	NA	NA	NA	NA	C1orf106	4642	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr1	200865457	200866265	200866098	Y	TMEM9,IGFN1,C1orf106,C1orf106	C1orf106	NA	NA	NA	NA	C1orf106	7281	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	201472589	201472996	201472808	Y	LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	RP11-134G8.7	1373	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	201611388	201611697	201611489	Y	NA	NA	NAV1,CSRP1,RPS10P7,IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	CSRP1	134804	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	201613549	201613726	201613638	Y	NA	NA	NAV1,CSRP1,RPS10P7,IPO9	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CSRP1	136965	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	201717986	201718364	201718179	Y	NA	NA	IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	IPO9	77905	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	201992149	201992501	201992334	Y	NA	RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	14668	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	202075010	202075191	202075097	Y	PPP1R12B,ELF3,LGR6	ARL8A	RNPEP,LGR6,NAV1,ELF3,ARL8A,GPR37L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARL8A	36678	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.2427857670014
chr1	202077636	202077876	202077756	Y	ELF3,LGR6	ARL8A	NAV1,ARL8A,GPR37L1	MCF7	ChIA-PET	22265404	ARL8A	33993	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	202737599	202737762	202737681	Y	NA	RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6	NA	NA	NA	NA	RP11-480I12.2	3053	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	203297101	203297334	203297256	Y	LAX1,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	BTG2,FMOD	NA	NA	NA	NA	FMOD	21283	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	111155	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	203598711	203598999	203598777	Y	BTG2	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	5022	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	203723839	203723956	203723897	Y	NA	ZC3H11A	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	38826	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	204049581	204049822	204049645	Y	LAX1,PIK3C2B,SOX13	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	9338	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	204073791	204074252	204073934	Y	LAX1,PPP1R15B,SOX13	SOX13,ETNK2	NA	NA	NA	NA	SOX13	33548	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	204238647	204239007	204238820	Y	GOLT1A,PLEKHA6	NA	NA	NA	NA	NA	GOLT1A	57427	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	204254999	204255106	204255048	Y	PIK3C2B,PLEKHA6	NA	NA	NA	NA	NA	GOLT1A	73779	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	204289566	204289863	204289752	Y	SOX13,PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	89056	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	204363456	204363666	204363499	Y	NA	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	15253	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	204386444	204387188	204386898	Y	PPP1R15B	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	7525	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr1	204388302	204388627	204388415	Y	NA	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	9383	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	204434923	204435081	204435020	Y	SOX13,PPP1R15B,PIK3C2B	PIK3C2B,MDM4	NA	NA	NA	NA	PIK3C2B	26771	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	204435094	204435487	204435401	Y	NA	PIK3C2B,MDM4	NA	NA	NA	NA	PIK3C2B	26365	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	204531285	204531644	204531490	Y	MDM4	MDM4	NA	NA	NA	NA	MDM4	47774	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	205263599	205264019	205263855	Y	NA	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	24864	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	205265235	205265548	205265359	Y	TMEM81,KLHDC8A	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	23335	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	205267691	205267999	205267801	Y	NA	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	20884	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	205270500	205270865	205270692	Y	NA	NUAK2,SNRPGP10	NA	NA	NA	NA	NUAK2	18018	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	205410761	205411314	205411209	Y	NA	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	11768	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	205413132	205413367	205413271	Y	NA	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	9715	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	205415918	205416307	205416148	Y	NA	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	6775	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	205418015	205418182	205418073	Y	NA	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	4900	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	205420910	205421289	205421224	Y	NA	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	1793	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	206859136	206859493	206859328	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	2847	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	206859748	206860259	206859963	Y	IKBKE,RASSF5,FAIM3,FAIM3,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	3459	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	206890641	206891001	206890773	Y	NA	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	34352	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	206918122	206918360	206918230	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,DYRK3,IL19,MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	61833	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	208021631	208021781	208021738	Y	CR1,CD46,PLXNA2,CD34	C1orf132	CD34	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf132	18714	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	208136912	208137268	208137107	Y	NA	NA	CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf132	96417	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	208381145	208381344	208381321	Y	NA	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	34321	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	209606620	209606963	209606837	Y	NA	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	6455	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	210425971	210426288	210426079	Y	NA	SERTAD4	NA	NA	NA	NA	SERTAD4	21827	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.55348220875175
chr1	210468396	210468551	210468467	Y	HHAT	HHAT	SYT14,DIEXF,C1orf133,SERTAD4,HHAT	IMR90	Hi-C	24141950	HHAT	31045	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	211035320	211035533	211035504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-543B16.1	309286	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr1	211837893	211837920	211837910	Y	NA	NEK2,RP11-122M14.1	NA	NA	NA	NA	NEK2	9040	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	211988342	211989080	211989063	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	13034	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	211998326	211998558	211998442	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	3556	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	212458080	212458253	212458113	Y	INTS7,PPP2R5A,PPP2R5A	PPP2R5A,RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	PPP2R5A	1201	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	212513330	212513719	212513465	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206	RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	RP11-384C4.3	32470	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	212659054	212659720	212659497	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	54825	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.4855715340028
chr1	212780782	212781279	212780943	Y	NA	ATF3	NA	NA	NA	NA	ATF3	44106	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	213443269	213443475	213443372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KC1	220680	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	214163432	214163790	214163677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD2	288655	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	214601098	214601566	214601506	Y	PTPN14	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	122226	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	214612784	214613126	214613017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	110666	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	214614555	214614760	214614639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	109032	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	215741534	215741966	215741880	Y	KCTD3	KCTD3	NA	NA	NA	NA	KCTD3	2799	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	216826283	216826325	216826308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESRRG	482772	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	219632644	219633145	219633054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPLAL1	287458	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	220427006	220427444	220427299	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	2094	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	220868801	220868862	220868831	Y	C1orf115,MOSC2,MOSC1	C1orf115	NA	NA	NA	NA	C1orf115	7614	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr1	221048646	221048850	221048821	Y	NA	HLX	NA	NA	NA	NA	HLX	849	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	221201107	221201163	221201135	Y	HLX	NA	NA	NA	NA	NA	HLX	151408	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	221887766	221888016	221887890	Y	DUSP10	NA	NA	NA	NA	NA	HLX	838067	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	221899063	221899285	221899220	Y	DUSP10,DUSP10	NA	NA	NA	NA	NA	HLX	849364	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	222638782	222639204	222638963	Y	NA	NA	DUSP10,MIA3,AIDA,BROX	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-378J18.3	121963	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	222767372	222767396	222767384	Y	NA	RP11-378J18.3,TAF1A,MIA3	NA	NA	NA	NA	TAF1A	6097	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	223203713	223203863	223203798	Y	NA	NA	FAM177B	IMR90	Hi-C	24141950	TLR5	110761	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr1	223901276	223901546	223901311	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	13981	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	223907308	223907681	223907376	Y	NA	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	20013	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	223925260	223925580	223925340	Y	NA	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	37965	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	223964690	223965055	223964731	Y	TP53BP2,FBXO28	NA	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	66619	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	224012866	224013246	224013103	Y	NA	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	18428	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	224022197	224022347	224022288	Y	CAPN2,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	9327	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	224032316	224032686	224032418	Y	CAPN2,FBXO28,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	642	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	9.21732777192705
chr1	224633276	224633598	224633406	Y	NA	WDR26	WDR26,FBXO28,CNIH4	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	10541	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	226063760	226064118	226063778	Y	NA	TMEM63A,LEFTY1,PYCR2	NA	NA	NA	NA	TMEM63A	3951	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	226297611	226298113	226297674	Y	NA	NA	ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	H3F3A	50059	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	226315308	226315548	226315420	Y	PARP1	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56883	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	226315631	226315825	226315781	Y	PARP1,LIN9,PYCR2	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56606	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	226361229	226361382	226361305	Y	NA	ACBD3,MIXL1	NA	NA	NA	NA	ACBD3	11049	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	226435130	226435332	226435236	Y	PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A	MIXL1	NA	NA	NA	NA	MIXL1	25811	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	226443007	226443187	226443097	Y	NA	MIXL1	NA	NA	NA	NA	MIXL1	33688	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	226867580	226868182	226867972	Y	ITPKB	NA	NA	NA	NA	NA	ITPKB	56842	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	226890865	226891416	226891300	Y	ITPKB	ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB	33608	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr1	227751865	227752213	227752044	Y	ZNF678	ZNF678	NA	NA	NA	NA	ZNF678	2621	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	227976197	227976490	227976208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD4	55085	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.13922028641795
chr1	228079986	228080118	228080041	Y	ZNF678,WNT9A	NA	PRSS38	IMR90	Hi-C	24141950	WNT9A	53481	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr1	228398942	228399222	228399120	Y	TRIM17,GJC2	IBA57,C1orf145	NA	NA	NA	NA	C1orf145	143	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	228678228	228678435	228678266	Y	NA	HIST3H2A,HIST3H2BB,HIST3H2BA,RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	5466	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	228782602	228782886	228782775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	85938	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84925	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	7.14601816025805
chr1	228783962	228784250	228784107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84574	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	228917012	228917506	228917078	Y	RHOU	RHOU	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RHOU	48188	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	5.48897047092285
chr1	228945464	228945740	228945561	Y	RHOU	NA	RHOU,NUP133,RAB4A	IMR90	Hi-C	24141950	RHOU	76640	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr1	229229415	229229758	229229591	Y	RHOU	RP5-1065P14.2	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1065P14.2	763	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	229307664	229307899	229307845	Y	NA	NA	RHOU	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1065P14.2	79012	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr1	229335784	229335916	229335795	Y	RHOU,C1orf96	NA	RHOU,NUP133,RAB4A	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	68859	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr1	229388898	229389111	229388968	Y	URB2,TAF5L,NUP133,RAB4A,C1orf96	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,NUP133,ABCB10	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	15664	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr1	229473732	229474385	229474330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB4A	68910	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	231036878	231036937	231036909	Y	NA	C1orf198	NA	NA	NA	NA	C1orf198	33543	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	231038131	231038454	231038293	Y	COG2,TTC13,GNPAT,C1orf131	C1orf198	NA	NA	NA	NA	C1orf198	34796	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	231513422	231513769	231513758	Y	NA	EXOC8,EGLN1	NA	NA	NA	NA	EXOC8	41824	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	231531776	231531955	231531804	Y	NA	EGLN1	NA	NA	NA	NA	EGLN1	26835	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	231913853	231914038	231913997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DISC1	153292	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	233750790	233751092	233750957	Y	KCNK1	KCNK1	NA	NA	NA	NA	KCNK1	3040	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr1	234738546	234738834	234738624	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4437	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	234746093	234747674	234747395	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	2822	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	234881537	234881788	234881657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	138266	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	234908151	234908764	234908277	Y	IRF2BP2	NA	IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRF2BP2	164880	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	235122652	235122939	235122843	Y	NA	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	167312	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	235267591	235267744	235267678	Y	NA	TOMM20	NA	NA	NA	NA	TOMM20	22507	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	235390754	235391125	235391097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM34	67982	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	235460869	235461278	235461096	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	GGPS1,ARID4B	NA	NA	NA	NA	GGPS1	27387	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	235668656	235669018	235668830	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	B3GALNT2	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	2875	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	236109486	236110063	236109737	Y	LYST	NA	LYST,NID1,GNG4,B3GALNT2	IMR90	Hi-C	24141950	LYST	64546	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	236135691	236135959	236135881	Y	GPR137B	NA	LYST	IMR90	Hi-C	24141950	NID1	90503	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	236335410	236335565	236335488	Y	NA	GPR137B	NA	NA	NA	NA	GPR137B	31578	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	240306165	240306375	240306208	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	25080	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	240306412	240306787	240306695	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	24668	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	240308207	240308537	240308375	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22918	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr1	240308546	240308862	240308776	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22593	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	241781298	241781471	241781421	Y	NA	CHML	NA	NA	NA	NA	CHML	15761	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr1	242054721	242054907	242054820	Y	KMO	EXO1	NA	NA	NA	NA	EXO1	45452	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	242108255	242108348	242108324	Y	NA	NA	EXO1	IMR90	Hi-C	24141950	EXO1	98986	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	242609605	242610011	242609798	Y	PLD5,PLD5	NA	NA	NA	NA	NA	PLD5	75987	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	242627058	242627162	242627110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLD5	58836	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	242686520	242686699	242686610	Y	NA	PLD5	NA	NA	NA	NA	PLD5	522	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	243637125	243637295	243637255	Y	CEP170,AKT3,AKT3	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	219805	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	243997018	243997244	243997154	Y	NA	AKT3	NA	NA	NA	NA	AKT3	15137	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	244210956	244211944	244211575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	198575	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr1	244613820	244614139	244614120	Y	NA	ADSS	NA	NA	NA	NA	ADSS	384	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	245958364	245958743	245958685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	709871	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	246042512	246042669	246042578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	625945	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	247035132	247035504	247035470	Y	CNST,ZNF669,AHCTF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	57776	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	247297966	247298129	247298007	Y	NA	ZNF669	NA	NA	NA	NA	ZNF669	32292	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr1	247524183	247524555	247524546	Y	NLRP3,NLRP3	ZNF496	ZNF496,AHCTF1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF496	31035	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	593455	593774	593616	Y	DIP2C	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2C	139909	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr10	644331	644586	644526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2C	89097	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	733208	733342	733335	Y	NA	DIP2C	NA	NA	NA	NA	DIP2C	341	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	958233	958518	958406	Y	NA	LARP4B	DIP2C,GTPBP4,LARP4B	IMR90	Hi-C	24141950	LARP4B	17046	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	1240958	1241356	1241181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR37	147480	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	3497590	3497951	3497729	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	PITRM1	284587	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	3509617	3509911	3509759	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	296614	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	3510310	3510716	3510597	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	297307	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	3513215	3513223	3513219	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	300212	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	3524547	3524820	3524727	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	300653	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr10	3526849	3527147	3526890	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	298326	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr10	3542742	3543014	3542849	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	KLF6	282459	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	3568964	3569257	3569111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF6	256216	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	3598970	3599136	3599051	Y	KLF6	NA	NA	NA	NA	NA	KLF6	226337	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	3710838	3711066	3710976	Y	KLF6	NA	KLF6	K562	ChIA-PET	22265404	KLF6	114407	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr10	3751135	3751444	3751248	Y	KLF6	NA	NA	NA	NA	NA	KLF6	74029	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	3811743	3812009	3811888	Y	KLF6	KLF6	NA	NA	NA	NA	KLF6	13464	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	3932191	3932411	3932301	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	106718	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	3948614	3948936	3948805	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	123141	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr10	3987998	3988450	3988285	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	162525	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	4034997	4035363	4035214	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	KLF6	209524	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.13922028641795
chr10	4283808	4284356	4284092	Y	NA	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	KLF6	458335	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	4386754	4387085	4386858	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1E2	439736	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	5521591	5521814	5521622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NET1	69077	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	5530637	5531333	5530982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NET1	78123	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr10	5535635	5536039	5535950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NET1	83121	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.76061316991865
chr10	5553514	5553674	5553594	Y	NA	NA	FAM208B,NET1,CALML3,CALML5	IMR90	Hi-C	24141950	NET1	101000	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	5770570	5770836	5770703	Y	NA	FAM208B	NA	NA	NA	NA	FAM208B	45769	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	5783071	5783414	5783247	Y	NA	NA	GDI2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM208B	58270	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	6095822	6096104	6096032	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3,RBM17,RBM17,IL2RA	RBM17	NA	NA	NA	NA	RBM17	32846	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	6193489	6193806	6193647	Y	IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3	PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	8608	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	6206285	6206560	6206485	Y	NA	PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	21404	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr10	6242613	6242903	6242648	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	57732	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	6243287	6243821	6243659	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	58406	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr10	6333794	6333936	6333889	Y	PFKFB3,PRKCQ	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	148913	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	6339022	6339139	6339081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	154141	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	7583205	7583490	7583242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITIH5	123471	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr10	7583796	7584039	7583868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITIH5	122922	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr10	8088862	8088888	8088874	Y	ITIH5,GATA3	RP11-379F12.4,GATA3	NA	NA	NA	NA	RP11-379F12.4	2616	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	8089680	8090146	8089800	Y	ITIH5	RP11-379F12.4,GATA3	NA	NA	NA	NA	RP11-379F12.4	1358	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	8098275	8098603	8098313	Y	NA	RP11-379F12.4,GATA3	NA	NA	NA	NA	GATA3	4708	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr10	8098940	8099487	8099174	Y	TAF3,GATA3	RP11-379F12.4,GATA3	NA	NA	NA	NA	GATA3	5373	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr10	8103293	8103465	8103334	Y	TAF3,GATA3	RP11-379F12.4,GATA3	NA	NA	NA	NA	GATA3	9726	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	8103619	8104019	8103811	Y	KIN,TAF3,GATA3	RP11-379F12.4,GATA3	NA	NA	NA	NA	GATA3	10052	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	8139781	8140040	8139908	Y	NA	RP11-379F12.4,GATA3	NA	NA	NA	NA	GATA3	46214	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	8145104	8145382	8145246	Y	GATA3	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	51537	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.6927024951697
chr10	8323100	8323293	8323190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	229533	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.4499167281683
chr10	8373481	8373809	8373699	Y	GATA3	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	279914	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr10	8408171	8408387	8408297	Y	NA	NA	FLJ45983,GATA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GATA3	314604	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr10	8457951	8458678	8458502	Y	GATA3	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	364384	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	8662161	8662543	8662250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	568594	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	9139521	9139818	9139671	Y	NA	NA	TAF3	IMR90	Hi-C	24141950	GATA3	1045954	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	11652835	11653073	11652954	Y	CELF2,USP6NL	USP6NL	NA	NA	NA	NA	USP6NL	1082	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	11835953	11836243	11836176	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC3	53588	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	11866902	11867068	11866972	Y	C10orf47	NA	LOC219731	IMR90	Hi-C	24141950	PROSER2-AS1	67631	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	11917828	11918087	11917940	Y	C10orf47	PROSER2-AS1	NA	NA	NA	NA	PROSER2-AS1	16612	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	12195131	12195251	12195172	Y	CAMK1D	SEC61A2,CDC123,NUDT5	NA	NA	NA	NA	SEC61A2	25495	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	12987890	12988351	12988184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPTN	151098	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	13746905	13747107	13747006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	119978	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	13747807	13748143	13748006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	120880	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.4855715340028
chr10	13758221	13758456	13758339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	131294	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	13928984	13929094	13929038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-397C18.2	185189	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	14026617	14027027	14026853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-397C18.2	87256	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	14458446	14458565	14458455	Y	NA	FRMD4A	FRMD4A,MIR1265,FAM107B	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD4A	43576	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	14612513	14612879	14612833	Y	HSPA14	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	110372	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	14624029	14624329	14624184	Y	DCLRE1C	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	121888	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	14641847	14641963	14641950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	139706	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	14697070	14697400	14697259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM107B	117496	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	15158719	15159034	15158939	Y	NA	ACBD7,RPP38,C10orf111,NMT2	NA	NA	NA	NA	C10orf111	21401	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	15178441	15178844	15178745	Y	NA	ACBD7,RPP38,C10orf111,NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	29848	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	15416548	15416895	15416799	Y	NA	NA	FAM171A1,NMT2	IMR90	Hi-C	24141950	NMT2	207856	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	17429922	17430093	17430002	Y	NA	ST8SIA6-AS1	NA	NA	NA	NA	ST8SIA6-AS1	2987	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	17430166	17430520	17430415	Y	NA	ST8SIA6-AS1	NA	NA	NA	NA	ST8SIA6-AS1	3231	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	17470783	17471060	17470983	Y	TRDMT1,STAM,ST8SIA6	ST8SIA6-AS1	NA	NA	NA	NA	ST8SIA6-AS1	43848	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	18430951	18431281	18431116	Y	CACNB2,CACNB2	CACNB2	NA	NA	NA	NA	CACNB2	3345	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	18583664	18583897	18583754	Y	NSUN6,ARL5B	NA	NA	NA	NA	NA	CACNB2	156058	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	18860767	18861138	18861132	Y	NA	RP11-499P20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-499P20.2	28187	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	20518444	20518755	20518482	Y	PLXDC2	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	415276	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	21816029	21816444	21816223	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	4650	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.2427857670014
chr10	21991974	21992366	21992143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT10	170880	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	22569551	22569712	22569632	Y	NA	COMMD3,BMI1	ARMC3	IMR90	Hi-C	24141950	COMMD3	33191	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	22629825	22629981	22629966	Y	DNAJC1	COMMD3,BMI1,SPAG6	NA	NA	NA	NA	SPAG6	2418	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	22887940	22888243	22888209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	113241	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	22894974	22895386	22895290	Y	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	106098	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	22907073	22907416	22907362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	94068	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	22921960	22922313	22922139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	79171	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	22922432	22922728	22922682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	78756	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	22970665	22970972	22970902	Y	NA	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	30512	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	24772710	24773084	24772822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	237513	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	24993053	24993414	24993236	Y	GPR158,ARHGAP21	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	17183	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	25240272	25240935	25240716	Y	ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1	PRTFDC1	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	739	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	26775274	26775560	26775412	Y	APBB1IP,PDSS1,ABI1	NA	NA	NA	NA	NA	APBB1IP	50142	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	27027283	27027887	27027754	Y	NA	PDSS1	NA	NA	NA	NA	PDSS1	42695	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	27028326	27028583	27028339	Y	MASTL,PDSS1,ABI1	PDSS1	NA	NA	NA	NA	PDSS1	43738	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	27147453	27147834	27147772	Y	YME1L1,MASTL,ACBD5,APBB1IP,PDSS1,ABI1	ABI1	NA	NA	NA	NA	ABI1	182	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	27354652	27354729	27354695	Y	NA	ANKRD26	NA	NA	NA	NA	ANKRD26	32692	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	28957755	28957993	28957831	Y	BAMBI	BAMBI	BAMBI	K562	ChIA-PET	22265404	BAMBI	6278	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	29556183	29556410	29556298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	139921	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	29755539	29755855	29755808	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	59208	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	29877671	29877896	29877784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	181340	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	29909517	29909915	29909733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	213186	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	30073207	30073608	30073571	Y	SVIL	NA	SVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA1462	328815	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	30224610	30224950	30224780	Y	NA	NA	SVIL,KIAA1462,MTPAP	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1462	177473	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	30331172	30331392	30331282	Y	MAP3K8,KIAA1462	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1462	71031	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	30346409	30346565	30346487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1462	55858	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	30720407	30720642	30720475	Y	MAP3K8	MAP3K8	NA	NA	NA	NA	MAP3K8	224	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	31278125	31278259	31278204	Y	ZNF438,ZNF438	ZNF438	NA	NA	NA	NA	ZNF438	40607	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	31293680	31294164	31294019	Y	ZNF438,ZNF438	ZNF438	NA	NA	NA	NA	ZNF438	24702	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	31422679	31422989	31422772	Y	ZNF438,ZNF438	NA	ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	103813	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr10	31892273	31892723	31892643	Y	NA	NA	ZEB1	IMR90	Hi-C	24141950	ZEB1-AS1	284897	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr10	32047879	32048374	32048138	Y	ZEB1	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	167368	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr10	32215994	32216410	32215998	Y	NA	ARHGAP12	NA	NA	NA	NA	ARHGAP12	252	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	32301568	32301771	32301670	Y	NA	KIF5B	NA	NA	NA	NA	KIF5B	41588	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	32335843	32336217	32336161	Y	NA	KIF5B	NA	NA	NA	NA	KIF5B	7142	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	32621222	32621521	32621374	Y	ARHGAP12,CCDC7,C10orf68,EPC1	EPC1	NA	NA	NA	NA	EPC1	44205	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	33269452	33269916	33269602	Y	C10orf68	ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	22804	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	33541909	33542109	33542065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	81081	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	34815006	34815362	34815018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-8L18.3	135667	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	35070002	35070125	35070067	Y	CREM	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	32128	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	35421114	35421320	35421181	Y	CUL2,CUL2,CCNY,CREM,CREM	CUL2,CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	7395	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	35424812	35424825	35424819	Y	CCNY	CUL2,CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	11093	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	35431185	35431238	35431212	Y	NA	CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	17466	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	35438214	35438795	35438573	Y	CREM,CREM	CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	24495	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr10	35573688	35573878	35573784	Y	NA	CCNY	NA	NA	NA	NA	CCNY	39735	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	38325428	38325718	38325598	Y	ZNF25,ZNF37A	ZNF33A	NA	NA	NA	NA	ZNF33A	27850	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	43248764	43248842	43248800	Y	NA	BMS1	NA	NA	NA	NA	BMS1	27407	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	43249248	43249682	43249506	Y	NA	BMS1	NA	NA	NA	NA	BMS1	26567	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr10	43249715	43249807	43249770	Y	NA	BMS1	NA	NA	NA	NA	BMS1	26442	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr10	43600895	43601120	43601049	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	30814	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr10	43800197	43800376	43800318	Y	CSGALNACT2,HNRNPF,HNRNPF	RASGEF1A	ZNF487P	IMR90	Hi-C	24141950	RASGEF1A	39830	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	43846089	43846266	43846234	Y	RASGEF1A	FXYD4	RASGEF1A,HNRNPF,BMS1,ZNF487P	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FXYD4	18824	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	43905259	43905708	43905446	Y	HNRNPF,HNRNPF,HNRNPF	FXYD4,HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	HNRNPF	2645	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr10	43950893	43951349	43951098	Y	NA	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-517P14.2	36707	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.13922028641795
chr10	45470476	45470795	45470517	Y	NA	RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	C10orf10	1463	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	45871674	45871974	45871739	Y	FAM21C,ALOX5	ALOX5	NA	NA	NA	NA	ALOX5	4013	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	45965771	45965877	45965832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX5	98110	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	47092142	47092537	47092340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	122742	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	47113842	47114070	47114068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	144442	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	47128793	47129187	47128991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	159393	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	47137749	47138065	47137950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	168349	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr10	47149103	47149407	47149372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	179703	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	48323344	48323752	48323648	Y	NA	RP11-463P17.1,ZNF488	SYT15,GPRIN2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-463P17.1	6445	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.79626797575315
chr10	50742859	50743547	50743006	Y	NA	PGBD3,ERCC6	NA	NA	NA	NA	PGBD3	1539	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	51488946	51489392	51489137	Y	NCOA4,NCOA4,NCOA4	RP11-109G10.2	NA	NA	NA	NA	RP11-109G10.2	41180	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	52058471	52058580	52058526	Y	NA	DYNC1I2P1	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	35733	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	52082649	52082859	52082782	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	59911	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	52092316	52092324	52092320	Y	FAM21A,SGMS1	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	69578	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	52154516	52154956	52154688	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	131778	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	52167205	52167434	52167402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	144467	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	52261858	52262194	52262143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	120729	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	52266916	52267259	52267072	Y	SGMS1	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	115664	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	52270106	52270351	52270231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	112572	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	54774491	54774616	54774570	Y	MBL2	NA	NA	NA	NA	NA	CSTF2T	1317136	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr10	60026015	60026385	60026202	Y	UBE2D1,IPMK	IPMK,CISD1	NA	NA	NA	NA	IPMK	321	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	61664562	61664999	61664893	Y	CCDC6	CCDC6	NA	NA	NA	NA	CCDC6	148	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	62185134	62185430	62185353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK1	350659	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	62330469	62330833	62330827	Y	ANK3	NA	NA	NA	NA	NA	CDK1	205256	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	63839926	63839992	63839961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	180867	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	63859069	63859192	63859131	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	RTKN2	167274	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	64301554	64301902	64301727	Y	EGR2,EGR2	NA	NA	NA	NA	NA	ADO	260614	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	65053315	65053443	65053389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	131614	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	65078433	65078736	65078637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	106321	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	65149197	65149230	65149214	Y	NA	PRELID1P3	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	35827	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	65196810	65197156	65196994	Y	NA	PRELID1P3	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	11753	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	65231848	65231938	65231929	Y	NA	PRELID1P3,REEP3	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	46791	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	65269177	65269730	65269542	Y	NA	REEP3	REEP3,JMJD1C,LOC84989	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	REEP3	9393	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	65274637	65275000	65274913	Y	NA	REEP3	JMJD1C,REEP3	IMR90	Hi-C	24141950	REEP3	4123	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	65930110	65930546	65930307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-170M17.2	269105	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	69523317	69523417	69523404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRT1	119010	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	69523880	69524330	69524240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRT1	118097	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	SIRT1	33037	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr10	69658139	69658146	69658142	Y	HNRNPH3,SIRT1,SIRT1	SIRT1	HERC4	IMR90	Hi-C	24141950	SIRT1	15712	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	69778500	69778679	69778642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERC4	54426	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	69796463	69796828	69796573	Y	HERC4	HERC4	NA	NA	NA	NA	HERC4	36277	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	70782889	70783013	70782952	Y	NA	KIAA1279	NA	NA	NA	NA	KIAA1279	36402	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	70822086	70822440	70822167	Y	NA	NA	KIAA1279,DDX21,SRGN,VPS26A,SUPV3L1	IMR90	Hi-C	24141950	VPS26A	58828	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	71355649	71355822	71355737	Y	NA	C10orf35	HK1,TSPAN15,NEUROG3,COL13A1,HKDC1	IMR90	Hi-C	24141950	C10orf35	32185	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	71928097	71928630	71928606	Y	NA	AIFM2,TYSND1	TYSND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAR1A	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr10	72165059	72165574	72165379	Y	NA	LRRC20,EIF4EBP2	NA	NA	NA	NA	EIF4EBP2	2924	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	73109189	73109511	73109382	Y	SLC29A3	SLC29A3,CDH23	NA	NA	NA	NA	SLC29A3	32174	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	73398011	73398245	73398040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf54	133010	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	73526437	73526878	73526654	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	4377	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	73526896	73527242	73527133	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	4013	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	73595852	73596345	73596141	Y	C10orf54,PSAP	PSAP	CDH23	IMR90	Hi-C	24141950	PSAP	12781	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	73599936	73600188	73600059	Y	NA	PSAP	CDH23	IMR90	Hi-C	24141950	PSAP	8938	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr10	73722643	73722971	73722767	Y	NA	CHST3	NA	NA	NA	NA	CHST3	520	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.2427857670014
chr10	73744363	73744592	73744410	Y	NA	CHST3	NA	NA	NA	NA	CHST3	22240	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	73790594	73790943	73790840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST3	68471	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	73954988	73955333	73955161	Y	NA	RP11-570G20.1,ANAPC16,ASCC1	NA	NA	NA	NA	RP11-570G20.1	7289	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr10	73986513	73986881	73986533	Y	C10orf105,C10orf54,CDH23,CDH23	RP11-570G20.1,ANAPC16,ASCC1,DDIT4	NA	NA	NA	NA	ASCC1	11621	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	74020239	74021717	74020385	Y	C10orf54,PSAP,DNAJB12,DDIT4	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	DNAJB12	K562	ChIA-PET	22265404	DDIT4	9961	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	74032298	74032943	74032475	Y	NA	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	620	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr10	74079380	74080359	74079580	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	32629	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	74080430	74080993	74080646	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	31995	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	74174604	74174793	74174677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	61616	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	74385233	74385288	74385261	Y	NA	MICU1,HMGN2P34	NA	NA	NA	NA	MICU1	1334	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	74925047	74925060	74925055	Y	ANXA7,ECD	FAM149B1,ECD	NA	NA	NA	NA	FAM149B1	864	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	75004761	75005017	75004932	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	DNAJC9	1603	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	75211378	75211476	75211427	Y	NA	ANXA7,RP11-345K20.2,RP11-137L10.6,PPP3CB	NA	NA	NA	NA	RP11-345K20.2	30924	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	75240023	75240096	75240089	Y	NA	RP11-137L10.6,PPP3CB	NA	NA	NA	NA	RP11-137L10.6	13187	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	75253773	75253975	75253905	Y	NA	RP11-137L10.6	NA	NA	NA	NA	PPP3CB	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	75348138	75348289	75348214	Y	NA	NA	FAM149B1,PPP3CB,USP54,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L	IMR90	Hi-C	24141950	PPP3CB	94356	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	75931649	75931916	75931783	Y	NA	AP3M1,ADK	NA	NA	NA	NA	ADK	22689	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	76053029	76053199	76053114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADK	144069	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	76985148	76985510	76985329	Y	NA	VDAC2,COMTD1,HMGA1P5	NA	NA	NA	NA	COMTD1	8278	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	77418041	77418318	77418185	Y	C10orf11	NA	C10orf11	IMR90	Hi-C	24141950	C10orf11	59043	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	77664306	77664573	77664408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf11	305308	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	79006844	79007202	79006984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	677176	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	79538272	79538371	79538344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	146007	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr10	79670022	79670276	79670149	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	14102	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr10	80166856	80166996	80166943	Y	NA	NA	LOC283050,ZMIZ1,RPS24,LOC100132987	IMR90	Hi-C	24141950	RPS24	375338	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	80626499	80626705	80626607	Y	NA	NA	LOC283050,ZMIZ1,RPS24,LOC100132987,POLR3A	IMR90	Hi-C	24141950	ZMIZ1	200087	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	80917330	80917751	80917473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	90538	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr10	81001444	81002226	81001825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	102999	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr10	81005366	81005598	81005460	Y	PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	99627	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	81006414	81006827	81006670	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	98398	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	82214819	82214901	82214871	Y	TSPAN14	FAM213A,TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	2897	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	LDB3,BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr10	89519838	89520126	89519981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFL1P1	55559	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	89802399	89802689	89802412	Y	NA	NA	RNLS,CFL1P1,ATAD1,KLLN,PTEN,LIPF,LIPM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-380G5.3	99140	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr10	89856855	89857187	89857031	Y	KLLN,PTEN	NA	RNLS,PTEN,KLLN	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-380G5.3	153596	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	90862586	90862629	90862625	Y	NA	NA	CH25H,LIPA,FAS	IMR90	Hi-C	24141950	ACTA2	113439	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	91173615	91173677	91173627	Y	NA	IFIT1,LIPA,IFIT5	NA	NA	NA	NA	IFIT5	1272	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	91199827	91200195	91200013	Y	NA	IFIT1,LIPA,IFIT5	NA	NA	NA	NA	IFIT5	27484	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	91462035	91462111	91462091	Y	NA	KIF20B	NA	NA	NA	NA	KIF20B	2668	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	91647685	91647987	91647742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNRPD2P1	88487	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	92792748	92792914	92792813	Y	NA	NA	ANKRD1,PCGF5	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD1	113715	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	93647022	93647304	93647153	Y	FGFBP3	FGFBP3,BTAF1	NA	NA	NA	NA	FGFBP3	19936	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	94831659	94831948	94831694	Y	CYP26A1,CYP26A1	CYP26A1	NA	NA	NA	NA	CYP26A1	427	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr10	95198614	95198817	95198708	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	41257	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr10	95200243	95200778	95200520	Y	CYP26C1,MYOF	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	39296	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	95205346	95205630	95205524	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	34444	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr10	95218561	95218998	95218660	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	21076	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	95226262	95226423	95226291	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	13651	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	95228207	95228553	95228471	Y	MYOF,CEP55,CEP55	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	11521	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr10	95766976	95767368	95767096	Y	NA	PLCE1	NA	NA	NA	NA	PLCE1	15230	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	96943397	96943661	96943560	Y	SORBS1,SORBS1	NA	C10orf129,SORBS1	IMR90	Hi-C	24141950	PDLIM1	105120	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr10	97024100	97024800	97024493	Y	NA	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	23981	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr10	97026412	97026787	97026670	Y	NA	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	21994	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	97038434	97038774	97038645	Y	NA	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	10007	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	97048077	97048324	97048201	Y	SORBS1	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	457	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	97120063	97120328	97120194	Y	SORBS1	NA	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	71282	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	97308667	97309047	97308880	Y	NA	SORBS1	NA	NA	NA	NA	SORBS1	10124	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	97547373	97547492	97547422	Y	ENTPD1,ENTPD1	NA	NA	NA	NA	NA	ENTPD1	77837	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	97809290	97809583	97809571	Y	NA	CCNJ,ENTPD1-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNJ	8139	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	98029055	98029227	98029121	Y	NA	BLNK	NA	NA	NA	NA	BLNK	117	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	98032542	98032692	98032630	Y	ZNF518A,BLNK	BLNK	NA	NA	NA	NA	BLNK	3198	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	98044443	98044614	98044529	Y	CC2D2B	BLNK	LOC728558,CC2D2B,DNTT,BLNK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BLNK	15099	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr10	98332019	98332237	98332217	Y	NA	NPM1P26,TM9SF3	NA	NA	NA	NA	TM9SF3	12972	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	99096745	99096901	99096835	Y	NA	ARHGAP19,FRAT1,RP11-452K12.4,FRAT2	NA	NA	NA	NA	FRAT2	4287	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	99302007	99302242	99302124	Y	RRP12,PI4K2A	MMS19,UBTD1,PI4K2A	HOGA1,ANKRD2	IMR90	Hi-C	24141950	PI4K2A	39889	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	101170653	101170798	101170732	Y	SLC25A28	GOT1,RP11-441O15.3	NA	NA	NA	NA	GOT1	17583	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	101425049	101425416	101425233	Y	NA	SLC25A28,ENTPD7,CUTC	NA	NA	NA	NA	ENTPD7	7786	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	101475394	101475766	101475528	Y	NA	CUTC,COX15	NA	NA	NA	NA	COX15	14091	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	101539519	101539906	101539726	Y	NA	COX15	NA	NA	NA	NA	COX15	49662	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	101942179	101942274	101942224	Y	CWF19L1,BLOC1S2,BLOC1S2,ERLIN1,ERLIN1	ERLIN1,CHUK,RP11-316M21.6	NA	NA	NA	NA	ERLIN1	3817	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	102130783	102131327	102130955	Y	CWF19L1	SCD,AL139819.1,LINC00263	NA	NA	NA	NA	LINC00263	45	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	102284617	102284981	102284927	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	1848	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	102284995	102285353	102285150	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	1476	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	103124623	103124787	103124739	Y	FBXW4	BTRC	DPCD,POLL	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	12803	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	103575139	103575373	103575256	Y	NA	NPM3,MGEA5	NA	NA	NA	NA	MGEA5	1323	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	103591495	103591519	103591507	Y	BTRC,KCNIP2,KCNIP2	MGEA5	NA	NA	NA	NA	MGEA5	14799	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	103656859	103657173	103657045	Y	NA	NA	MGEA5,LOC100289509,KCNIP2	IMR90	Hi-C	24141950	MGEA5	80163	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr10	104504643	104504897	104504711	Y	NA	ARL3,SFXN2	NA	NA	NA	NA	SFXN2	32348	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	104578857	104579126	104578947	Y	NT5C2,NFKB2,NFKB2,NFKB2,C10orf32	C10orf32,AS3MT	NA	NA	NA	NA	C10orf32	32854	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	104769429	104769711	104769602	Y	INA	NA	NT5C2	IMR90	Hi-C	24141950	CNNM2	93379	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	104838794	104839158	104838851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT5C2	111898	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	104903006	104903392	104903228	Y	C10orf32,NT5C2	NT5C2	NA	NA	NA	NA	NT5C2	47664	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	104964563	104964973	104964825	Y	NA	NT5C2	NA	NA	NA	NA	NT5C2	13507	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	105000216	105000261	105000251	Y	NA	NT5C2,INA	INA,PCGF6,NT5C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INA	34659	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	105001544	105001968	105001663	Y	C10orf32,NT5C2	INA	INA,PCGF6,NT5C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INA	32952	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	105436153	105436400	105436275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	176901	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr10	105532054	105532211	105532109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	81090	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	105650011	105650288	105650237	Y	GSTO2,GSTO1,MEIR5,MEIR5,COL17A1,SLK	SH3PXD2A,OBFC1	SH3PXD2A	IMR90	Hi-C	24141950	OBFC1	25675	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	105725440	105725838	105725745	Y	NA	OBFC1,SLK	NA	NA	NA	NA	SLK	481	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	106052804	106053054	106052846	Y	MEIR5,MEIR5,GSTO1	MIR4482-1,GSTO2,ITPRIP	NA	NA	NA	NA	GSTO2	26173	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	106096287	106096870	106096611	Y	SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147	ITPRIP,CCDC147-AS1	ITPRIP,GSTO1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ITPRIP	125	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr10	106399315	106399424	106399359	Y	WDR96,SORCS3	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC147-AS1	287982	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	112170161	112170538	112170357	Y	DUSP5	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	85058	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	112582466	112582715	112582708	Y	SMC3,ADRA2A	PDCD4,PDCD4-AS1	NA	NA	NA	NA	PDCD4	46850	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	112602862	112603073	112603000	Y	SMC3,PDCD4	PDCD4,PDCD4-AS1	NA	NA	NA	NA	PDCD4	26492	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	112668861	112669237	112669049	Y	PDCD4,SHOC2,BBIP1,BBIP1	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	7795	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr10	112674359	112675211	112674854	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	1821	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	113639834	113639959	113639897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAM	333176	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	114109921	114110133	114110011	Y	NA	ACSL5	NA	NA	NA	NA	ACSL5	21643	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	114531236	114531374	114531260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-25C19.3	95658	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	114570405	114570790	114570582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-25C19.3	134827	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	114693939	114693964	114693952	Y	NA	TCF7L2	TCF7L2,VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	TCF7L2	14045	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	114709018	114709405	114709296	Y	TCF7L2	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	1009	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr10	114715800	114716132	114715855	Y	NA	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	7791	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr10	114718173	114718547	114718195	Y	NA	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	10164	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	114745782	114746117	114745950	Y	TCF7L2	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	37773	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	114823270	114823456	114823363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	115261	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	114823862	114824125	114823994	Y	HABP2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	115853	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	114847181	114847492	114847280	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	139172	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	114853789	114854299	114853993	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	145780	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	114929772	114930211	114930015	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	221763	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	115122408	115122600	115122509	Y	TCF7L2	NA	VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	CASP7	314342	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	115732074	115732090	115732082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADRB1	69716	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	115923622	115923898	115923760	Y	C10orf81	MIR2110,C10orf118	NA	NA	NA	NA	MIR2110	8040	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	116161021	116161267	116161255	Y	NA	AFAP1L2	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	1248	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	116394389	116394785	116394496	Y	ABLIM1	ABLIM1	NA	NA	NA	NA	ABLIM1	47977	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	117502747	117502760	117502754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRUB1	806795	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	119069713	119069747	119069730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD8	63231	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	119300827	119301053	119300919	Y	VAX1,EMX2	EMX2OS	NA	NA	NA	NA	EMX2OS	1526	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	120692616	120692979	120692798	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NANOS1	94249	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	120997743	120998072	120997908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX3	61398	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	121173391	121173574	121173483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS10	126646	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	121829686	121829950	121829715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACAP2	74465	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	122836934	122837187	122837105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-159H3.1	54050	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	4.7640121068387
chr10	122839838	122839978	122839873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-159H3.1	51259	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	123268724	123269025	123268893	Y	FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2	NA	NA	NA	NA	NA	FGFR2	86947	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	123626359	123626403	123626376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATE1-AS1	59424	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	123777331	123777486	123777408	Y	PLEKHA1,TACC2	NSMCE4A	NA	NA	NA	NA	NSMCE4A	44599	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	124133234	124133500	124133290	Y	NA	PLEKHA1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA1	1022	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	124196519	124196712	124196524	Y	TACC2,PLEKHA1,PLEKHA1,PLEKHA1	HTRA1	NA	NA	NA	NA	HTRA1	22329	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	124872431	124872708	124872570	Y	NA	BUB3	NA	NA	NA	NA	BUB3	39085	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	125730230	125730378	125730329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OAT	375167	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	125754916	125755682	125755196	Y	CHST15	NA	NA	NA	NA	NA	OAT	349863	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	126212520	126212862	126212532	Y	NA	RPS10P18	NA	NA	NA	NA	RPS10P18	35373	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	126339460	126339914	126339618	Y	ZRANB1,FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	90924	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	126354654	126355022	126354738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	75816	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr10	126373894	126374059	126373997	Y	ZRANB1,FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	56779	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	126445536	126445891	126445571	Y	ZRANB1	FAM53B,METTL10,FAM175B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	14698	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	127432481	127432807	127432790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UROS	77010	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	127576052	127576450	127576389	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	RNU2-42P	797	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr10	127583558	127583978	127583747	Y	MMP21	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	FANK1	450	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr10	129828153	129828186	129828170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	94463	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	129851192	129851341	129851267	Y	PTPRE	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	71308	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	133794080	133794414	133794353	Y	NA	BNIP3	PPP2R2D	IMR90	Hi-C	24141950	BNIP3	645	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	134221496	134221692	134221620	Y	PWWP2B	PWWP2B	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	12824	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr10	134260341	134260546	134260485	Y	C10orf91	NA	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	51669	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr10	134330832	134331178	134331005	Y	NA	INPP5A	INPP5A,ADAM8,C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	INPP5A	18146	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr10	135107749	135108037	135107982	Y	ADAM8,TUBGCP2	ADAM8,ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ZNF511	11942	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	334344	334553	334421	Y	NA	ATHL1,IFITM2,IFITM1,IFITM3,B4GALNT4	NA	NA	NA	NA	IFITM3	8807	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	11072	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr11	629192	629570	629436	Y	IRF7,IRF7,SCT,DRD4	IRF7	NA	NA	NA	NA	IRF7	15193	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr11	738048	738285	738171	Y	PKP3,SIGIRR	EPS8L2,TMEM80,DEAF1,TALDO1,PDDC1,AP006621.5	NA	NA	NA	NA	TALDO1	7044	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.8641786505021
chr11	926738	926879	926801	Y	BRSK2,CEND1,AP2A2	CHID1,AP2A2	NA	NA	NA	NA	AP2A2	3844	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	944711	944765	944751	Y	NA	CHID1,AP2A2	NA	NA	NA	NA	AP2A2	21817	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	1015139	1015297	1015218	Y	NA	MUC6	NA	NA	NA	NA	MUC6	19409	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	1404403	1404794	1404637	Y	DUSP8,BRSK2	NA	TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOLLIP	75519	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	2009660	2010154	2009976	Y	IGF2,IGF2,SYT8	MRPL23,MRPL23-AS1,H19	NA	NA	NA	NA	MRPL23-AS1	510	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	2223798	2223980	2223871	Y	ASCL2	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2	54965	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr11	2226111	2226485	2226212	Y	ASCL2	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2	57278	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	2669931	2670236	2670070	Y	INS,ASCL2,TRPM5	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	48988	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	2907965	2908172	2908071	Y	NA	CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	CDKN1C	2854	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	2951529	2951649	2951619	Y	KCNQ1,PHLDA2	CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	PHLDA2	2844	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	3035655	3035952	3035816	Y	MRGPRG	NAP1L4,RNU1-91P,CARS	NA	NA	NA	NA	NAP1L4	24048	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	4505648	4505760	4505741	Y	TRIM21,OR51G1,OR51D1,OR51T1,OR51F2,OR52K2,OR52K1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM21	92722	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	5539705	5539835	5539765	Y	UBQLN3,UBQLNL	HBE1	OR51B5	K562	ChIA-PET	22265404	HBE1	14858	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	5567409	5567542	5567475	Y	OR52J3,OR52E2,OR52A1,OR51V1,OR51B2,OR51B6,OR51M1,OR51Q1,OR52E4,OR56A3,OR56A1,OR52N2,OR52E6,OR56B1,OR52N4,OR52E8,OR56A5,OR56A4,OR52N5,OR52N1,OR52D1,OR52H1	HBE1,TRIM6,TRIM6-TRIM34	NA	NA	NA	NA	HBE1	42562	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	6290237	6290402	6290320	Y	NA	FAM160A2,CCKBR	NA	NA	NA	NA	CCKBR	11271	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	6884595	6884618	6884606	Y	DCHS1,OR2AG2,OR2AG1,OR6A2,OR2D2,OR10A4,OR2D3,OR10A2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF215	61017	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	7624372	7624649	7624458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB5R2	71804	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	7636630	7636941	7636786	Y	PPFIBP2,OR5P3	NA	NA	NA	NA	NA	CYB5R2	59512	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	7697344	7697564	7697416	Y	NA	CYB5R2	NA	NA	NA	NA	CYB5R2	891	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	7913705	7913868	7913824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3F	75930	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	8166799	8166849	8166831	Y	NA	RIC3	NA	NA	NA	NA	RIC3	21753	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	8857868	8857938	8857900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKIP1	72748	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	9185386	9185638	9185566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND5A	99299	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr11	9587499	9588027	9587720	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1	ZNF143,LOC644656	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	WEE1	5201	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr11	9590279	9590748	9590469	Y	WEE1,WEE1	WEE1	LOC644656,ZNF143	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	WEE1	2480	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr11	9635436	9636077	9635827	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1,SWAP70	WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WEE1	42208	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	9786985	9787566	9787311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWAP70	103361	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr11	10323282	10323617	10323398	Y	NA	SBF2,ADM	NA	NA	NA	NA	ADM	610	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	11864878	11865300	11864975	Y	NA	USP47	NA	NA	NA	NA	USP47	3908	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	11899555	11899888	11899585	Y	NA	USP47	NA	NA	NA	NA	USP47	38585	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	12013824	12014110	12014066	Y	DKK3,DKK3,DKK3	DKK3	NA	NA	NA	NA	DKK3	15206	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	12146355	12146795	12146568	Y	NA	MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	32812	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	12181262	12181458	12181363	Y	MICALCL,MICAL2	NA	MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	67719	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	12188567	12188982	12188726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	75024	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	12204570	12205016	12204699	Y	MICAL2	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	91027	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	12438419	12438761	12438595	Y	NA	PARVA	NA	NA	NA	NA	PARVA	41687	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	12697923	12698543	12698251	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	3954	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr11	12698857	12698926	12698896	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	4888	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	12701917	12702070	12702017	Y	TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	7948	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	12821812	12822118	12821851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	127843	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	12824175	12824668	12824395	Y	TEAD1	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	130206	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.34635124758485
chr11	12884715	12885004	12884787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	190746	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	12973520	12973623	12973568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	279551	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	13468446	13468721	13468666	Y	NA	BTBD10	NA	NA	NA	NA	BTBD10	14123	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	14306265	14306627	14306419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRAS2	77425	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	14874249	14874576	14874405	Y	CYP2R1	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	37222	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr11	16762334	16762684	16762509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	129655	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	16817853	16818086	16817948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-466H18.1	176474	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	16945489	16945781	16945647	Y	NA	RP11-466H18.1	NA	NA	NA	NA	RP11-466H18.1	48779	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr11	17099866	17100401	17100030	Y	NA	SNORD14A,RPS13	NA	NA	NA	NA	RPS13	2532	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	18646989	18647318	18647154	Y	NA	UEVLD,SPTY2D1	NA	NA	NA	NA	SPTY2D1	7020	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	20053197	20053569	20053404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	329662	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr11	20072115	20072502	20072253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	310729	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	27023421	27023808	27023612	Y	NA	FIBIN	NA	NA	NA	NA	FIBIN	9793	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	27140468	27140646	27140558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIBIN	126840	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	27350498	27350718	27350608	Y	BDNF	NA	NA	NA	NA	NA	LGR4	141604	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	28063321	28063497	28063482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL15	64298	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	28128920	28129110	28128941	Y	METTL15	METTL15,KIF18A	NA	NA	NA	NA	KIF18A	1065	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	33096691	33097088	33096864	Y	NA	TCP11L1	NA	NA	NA	NA	TCP11L1	37728	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	33146392	33146678	33146610	Y	NA	CSTF3	NA	NA	NA	NA	CSTF3	35239	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	34125347	34125667	34125520	Y	NA	NAT10	NA	NA	NA	NA	NAT10	198	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	34236527	34236812	34236617	Y	ABTB2	NA	NA	NA	NA	NA	NAT10	111378	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	34331523	34331863	34331783	Y	NA	RP1-145M24.1,ABTB2	NA	NA	NA	NA	RP1-145M24.1	23687	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	34356172	34356320	34356246	Y	NA	RP1-145M24.1,ABTB2	NA	NA	NA	NA	RP1-145M24.1	622	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	35296640	35296760	35296715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD44	138223	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	43360196	43360553	43360375	Y	TTC17	API5,TTC17	NA	NA	NA	NA	TTC17	17929	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr11	43760547	43760939	43760743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALKBH3	139422	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	44221715	44221986	44221792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT2	106616	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	46015298	46015560	46015479	Y	NA	NA	GYLTL1B,PEX16	K562	ChIA-PET	22265404	GYLTL1B	74126	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	46135373	46135563	46135504	Y	PHF21A,AMBRA1	PHF21A	NA	NA	NA	NA	PHF21A	5422	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	46143609	46143973	46143928	Y	NA	PHF21A	NA	NA	NA	NA	PHF21A	2624	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	CREB3L1	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	32014	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr11	47125777	47126225	47125967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGAP2	70451	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	47208524	47208884	47208580	Y	PACSIN3,PACSIN3,NR1H3	ARFGAP2,PACSIN3,DDB2	NA	NA	NA	NA	PACSIN3	2530	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	47421735	47422128	47421819	Y	MADD,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1	SLC39A13,PSMC3	SLC39A13	IMR90	Hi-C	24141950	SLC39A13	4555	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr11	47789923	47790126	47789984	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	2928	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	47799022	47799247	47799135	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	12027	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	47867685	47867881	47867783	Y	OR4X1	NUP160	NA	NA	NA	NA	NUP160	226	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	47939528	47939960	47939626	Y	OR4B1,OR4S1,NUP160	RP11-793I11.1	PTPRJ,NUP160	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-793I11.1	14369	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	47968538	47968912	47968651	Y	CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	RP11-793I11.1,PTPRJ	PTPRJ	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPRJ	31201	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	57083068	57083441	57083322	Y	NA	TNKS1BP1,SSRP1	NA	NA	NA	NA	TNKS1BP1	6985	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	57224938	57225034	57225001	Y	SLC43A1,SLC43A1,SERPING1,PRG3	SLC43A3,RTN4RL2	NA	NA	NA	NA	RTN4RL2	988	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	57371918	57372022	57371970	Y	SLC43A1,SERPING1	UBE2L6,SERPING1,AP000662.4,CLP1	NA	NA	NA	NA	SERPING1	9058	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	57406709	57407290	57406997	Y	OR9I1,OR9Q1,PRG3,YPEL4,UBE2L6	SERPING1,AP000662.4,CLP1,ZDHHC5	NA	NA	NA	NA	AP000662.4	3212	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr11	57542885	57543297	57542929	Y	NA	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	24170	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	57546018	57546724	57546105	Y	MED19,C11orf31	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	27303	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.38200605341935
chr11	57549936	57550183	57550060	Y	NA	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	31221	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr11	57559748	57559971	57559868	Y	SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,UBE2L6,CLP1,ZDHHC5	CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	41033	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	58319737	58319877	58319834	Y	NA	ZFP91,ZFP91-CNTF	NA	NA	NA	NA	ZFP91	24707	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	58340867	58341571	58341167	Y	OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN	ZFP91,ZFP91-CNTF	NA	NA	NA	NA	ZFP91	3013	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	58942854	58942992	58942911	Y	OR4D6,OR5A2,OR5A1	FAM111A,DTX4	NA	NA	NA	NA	DTX4	5951	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	58967466	58967980	58967724	Y	OR4D6,PATL1,MPEG1	DTX4	NA	NA	NA	NA	DTX4	30563	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	59323878	59323962	59323920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBP	57655	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	59537612	59537828	59537719	Y	PATL1,STX3	MRPL16	NA	NA	NA	NA	MRPL16	38517	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	59651741	59651793	59651768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL16	75396	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	60499458	60499898	60499803	Y	MS4A6E,MS4A14,MS4A5,MS4A13	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC86	107646	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	60741663	60741747	60741705	Y	CD5,CD6	SLC15A3	NA	NA	NA	NA	SLC15A3	23661	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	60926054	60926399	60926274	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	690	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr11	61074897	61075402	61075197	Y	CD6	VWCE,DAK,DDB1	NA	NA	NA	NA	VWCE	14001	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	61146248	61146454	61146376	Y	SLC15A3,VPS37C,DAGLA,CYBASC3,TMEM138,CYBASC3,SDHAF2,CPSF7,CPSF7	DAK,DDB1,TMEM138,TMEM216,CPSF7,SDHAF2	NA	NA	NA	NA	TMEM216	10705	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	61394263	61394463	61394368	Y	NA	SYT7	NA	NA	NA	NA	SYT7	47643	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	61446826	61446957	61446891	Y	CYBASC3,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,SDHAF2,FTH1,DAGLA	DAGLA	NA	NA	NA	NA	DAGLA	921	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	61565191	61565522	61565357	Y	NA	FEN1,TMEM258,FADS2,FADS1	NA	NA	NA	NA	FADS2	6739	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	61739990	61740514	61740301	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	6858	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	62164133	62164439	62164244	Y	NA	RCC2P6	NA	NA	NA	NA	RCC2P6	27515	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr11	62248272	62248499	62248283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	62972	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr11	62267084	62267180	62267134	Y	WDR74,STX5,SLC3A2,NXF1,AHNAK	RP11-864I4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	44291	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	62267714	62268111	62267986	Y	NA	RP11-864I4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	43360	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	7.4567146020084
chr11	62272728	62273223	62272788	Y	ROM1	RP11-864I4.4,AHNAK	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	38248	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	62306762	62307027	62306934	Y	WDR74,STX5,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	4444	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	62311446	62311797	62311501	Y	WDR74,STX5,NXF1,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	62312037	62312397	62312245	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	566	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	62319122	62319673	62319430	Y	WDR74,UBXN1,STX5,NXF1,AHNAK,EML3	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	AHNAK	IMR90	Hi-C	24141950	AHNAK	2034	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr11	62320979	62321244	62321106	Y	NA	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	463	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	62413039	62413428	62413234	Y	NA	MTA2,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,SNORA57,C11orf83,C11orf48,UBXN1	NA	NA	NA	NA	GANAB	935	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	62625165	62625549	62625272	Y	TUT1,METTL12,HNRNPUL2,SLC3A2	STX5,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	SLC3A2	3647	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr11	63272383	63272701	63272618	Y	NA	HRASLS5,RARRES3	NA	NA	NA	NA	HRASLS5	15717	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	63298876	63299223	63298998	Y	OTUB1,MARK2,RARRES3	HRASLS5,RARRES3	NA	NA	NA	NA	RARRES3	3058	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	63496405	63496421	63496415	Y	NAA40	RTN3,C11orf95	NA	NA	NA	NA	C11orf95	37692	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	63639638	63639903	63639715	Y	NA	MARK2,RCOR2	NA	NA	NA	NA	MARK2	35238	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	63744435	63744483	63744459	Y	KCNK4	NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	AP000721.4	4343	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	63858567	63858836	63858756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACROD1	72742	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	63949132	63949273	63949224	Y	NA	MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4	NA	NA	NA	NA	STIP1	1471	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	64102702	64102834	64102750	Y	NA	ESRRA,TRMT112,PRDX5,RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	PRDX5	19142	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr11	64140304	64140795	64140552	Y	RCOR2,NAA40,GPR137,KCNK4,NRXN2,NRXN2,CDC42BPG	RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	RPS6KA4	15684	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr11	64205023	64205244	64205073	Y	CDC42BPG,RPS6KA4	NA	NRXN2,SLC22A12,RASGRP2,PYGM	IMR90,K562,H1ESC,HELA,GM12878	Hi-C,5C	24141950,22955621	RPS6KA4	80403	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.76061316991865
chr11	64206746	64206963	64206855	Y	NA	NA	NRXN2,SLC22A12	IMR90	Hi-C	24141950	RPS6KA4	82126	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr11	64478696	64479026	64478934	Y	NA	NRXN2,RASGRP2	NA	NA	NA	NA	NRXN2	9634	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	64916686	64916783	64916734	Y	NRXN2,C11orf85	TM7SF2,ZNHIT2,MRPL49,FAU,SYVN1,SPDYC,CAPN1	SYVN1,CAPN1,SPDYC	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SYVN1	16682	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	64987523	64987676	64987600	Y	NA	CAPN1,POLA2	NA	NA	NA	NA	POLA2	39557	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	65076655	65076852	65076688	Y	EHD1,BATF2,FAU,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2,TIGD3	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	3437	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.41766085925385
chr11	65248969	65249218	65249208	Y	SNX32	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	FRMD8,SLC25A45,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	14015	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	65252951	65253044	65253026	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	10189	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	65254949	65255610	65255242	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	7623	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	65256318	65257363	65256982	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612,POLA2,DPF2,SLC25A45,TIGD3,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	5870	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr11	65263684	65264604	65263856	Y	SNX32	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	451	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	7.6638455631753
chr11	65333490	65333816	65333671	Y	SLC25A45,SIPA1,SIPA1,EIF1AD,CTSW,PCNXL3	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3	NA	NA	NA	NA	SSSCA1	2085	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr11	65581703	65581968	65581801	Y	CDC42EP2,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,DKFZp761E198	OVOL1,MUS81,CFL1	NA	NA	NA	NA	OVOL1	29210	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	65852297	65852657	65852298	Y	TMEM151A,CNIH2	SF3B2,PACS1	NA	NA	NA	NA	PACS1	16463	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	65903912	65904457	65904250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACS1	68078	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	66511038	66511198	66511076	Y	KLC2,KLC2,KLC2,CNIH2,RBM4B,SPTBN2	C11orf80	NA	NA	NA	NA	C11orf80	1116	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	66717584	66717809	66717709	Y	CLCF1,ADRBK1	PC	NA	NA	NA	NA	PC	6038	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	66844888	66845141	66844944	Y	RHOD	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	22599	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	66845907	66846062	66845990	Y	PITPNM1,CLCF1,CLCF1,RBM4,KDM2A,ADRBK1,RHOD	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	23618	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	67253659	67253853	67253760	Y	PTPRCAP,NUDT8,AIP	CORO1B,TMEM134,AIP,PITPNM1,CDK2AP2	NA	NA	NA	NA	AIP	5147	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	67388322	67388349	67388342	Y	NA	GSTP1,NDUFV1,DOC2GP,NUDT8,ACY3	NA	NA	NA	NA	DOC2GP	6594	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	67895703	67896078	67896017	Y	CHKA	CHKA	CHKA,SUV420H1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHKA	8792	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	68110280	68110464	68110374	Y	NA	LRP5	PPP6R3	IMR90	Hi-C	24141950	LRP5	32203	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr11	68121765	68121884	68121804	Y	ALDH3B1,C11orf24	LRP5	NA	NA	NA	NA	LRP5	43688	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr11	68138300	68138548	68138435	Y	UNC93B1,TCIRG1,TCIRG1	NA	NA	NA	NA	NA	LRP5	60223	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	68139622	68139837	68139714	Y	TCIRG1,TCIRG1	NA	NA	NA	NA	NA	LRP5	61545	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	68141745	68141881	68141821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP5	63668	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	68238826	68238975	68238901	Y	TCIRG1,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,IGHMBP2,PPP6R3	PPP6R3	NA	NA	NA	NA	PPP6R3	12640	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	68778534	68778789	68778694	Y	MRGPRF	TPCN2	NA	NA	NA	NA	TPCN2	35576	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	68832799	68833131	68832982	Y	IGHMBP2,MRGPRD,TPCN2	TPCN2	NA	NA	NA	NA	TPCN2	18434	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	69197125	69197542	69197234	Y	ORAOV1,MYEOV	NA	MYEOV,CCND1	IMR90	Hi-C	24141950	MYEOV	137520	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr11	69235389	69235576	69235517	Y	NA	NA	MYEOV,ORAOV1,CCND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYEOV	175784	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	69250208	69250340	69250290	Y	NA	NA	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYEOV	190603	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	69451342	69451588	69451394	Y	NA	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	2267	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	69794643	69794820	69794756	Y	FADD,ANO1	NA	ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD	IMR90	Hi-C	24141950	ANO1	127588	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	69811990	69812239	69812133	Y	FGF4	NA	ANO1,ORAOV1,FGF4,FGF19	IMR90	Hi-C	24141950	ANO1	110169	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	70079442	70079825	70079633	Y	ANO1,CTTN,FADD,PPFIA1	FADD,PPFIA1	FADD,PPFIA1,ORAOV1,ANO1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FADD	32173	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	70245269	70246141	70245676	Y	ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN	CTTN,AP000487.5	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	2675	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	71493756	71493898	71493829	Y	NA	FAM86C1	NA	NA	NA	NA	FAM86C1	2658	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	71650610	71650763	71650692	Y	NA	RP11-849H4.2,RNF121	NUMA1,IL18BP	IMR90	Hi-C	24141950	RNF121	12863	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr11	71658678	71659025	71658708	Y	NA	RP11-849H4.2,RNF121	NA	NA	NA	NA	RNF121	20931	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	71769812	71769929	71769891	Y	NA	LRTOMT,NUMA1,LAMTOR1	NA	NA	NA	NA	LRTOMT	19453	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	71936800	71937067	71937009	Y	INPPL1	FOLR1,INPPL1,PHOX2A	NA	NA	NA	NA	INPPL1	4055	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	72003135	72003262	72003223	Y	NA	PHOX2A	NA	NA	NA	NA	PHOX2A	48427	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	72430170	72430475	72430364	Y	P2RY2,P2RY2,ATG16L2,ARAP1,ARAP1	PDE2A	NA	NA	NA	NA	PDE2A	46535	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	72452508	72452870	72452656	Y	STARD10,ATG16L2,ARAP1	ARAP1,STARD10	NA	NA	NA	NA	ARAP1	49774	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	72462370	72462747	72462399	Y	NA	ARAP1,STARD10	NA	NA	NA	NA	ARAP1	39897	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr11	72686902	72687109	72687004	Y	RELT,RELT	NA	NA	NA	NA	NA	ATG16L2	163549	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	72854261	72854849	72854638	Y	PDE2A,ARAP1,ATG16L2,RELT,RELT,FCHSD2	FCHSD2	NA	NA	NA	NA	FCHSD2	2955	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr11	72868553	72869130	72868609	Y	NA	FCHSD2	STARD10,FCHSD2,ATG16L2,ARAP1,MIR4692,P2RY2,P2RY6,ARHGEF17	IMR90	Hi-C	24141950	FCHSD2	17247	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr11	72968455	72968625	72968568	Y	NA	P2RY2,P2RY6,ARHGEF17	P2RY6	MCF7	ChIA-PET	22265404	P2RY6	4925	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	73014768	73014913	73014905	Y	NA	P2RY6,ARHGEF17	NA	NA	NA	NA	ARHGEF17	2421	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	73088357	73088912	73088439	Y	NA	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	3048	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	73180484	73180765	73180625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELT	95175	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	73490470	73490918	73490608	Y	UCP2	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	5443	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr11	74534779	74535147	74534795	Y	XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	RNF169	76866	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	74578028	74578161	74578096	Y	OR2AT4,XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	XRRA1	80084	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	74609449	74609745	74609637	Y	LOC441617,XRRA1	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	48500	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	74609863	74609988	74609926	Y	NA	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	48257	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	75060875	75061139	75061045	Y	UVRAG,SPCS2,NEU3,DGAT2,ARRB1	ARRB1,RPS3	NA	NA	NA	NA	ARRB1	2	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	75061558	75062072	75061823	Y	NA	ARRB1,RPS3	NA	NA	NA	NA	ARRB1	685	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	75919893	75920246	75919996	Y	WNT11	WNT11	NA	NA	NA	NA	WNT11	113	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.00339893692005
chr11	75920696	75920900	75920748	Y	NA	WNT11	NA	NA	NA	NA	WNT11	916	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr11	75946013	75946323	75946187	Y	NA	WNT11	C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WNT11	26233	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	76166443	76166917	76166638	Y	NA	RP11-111M22.3,C11orf30	NA	NA	NA	NA	C11orf30	12476	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	76285451	76285730	76285592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC32	94061	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	76463883	76464042	76463970	Y	NA	TSKU,RP11-21L23.3	ACER3,TSKU,B3GNT6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSKU	27253	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	76721586	76721786	76721728	Y	ACER3	NA	NA	NA	NA	NA	CAPN5	54193	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	76883031	76883248	76883107	Y	NA	MYO7A	NA	NA	NA	NA	MYO7A	45721	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr11	77837663	77837947	77837805	Y	NA	NDUFC2-KCTD14,NDUFC2,ALG8,KCTD21-AS1	NA	NA	NA	NA	ALG8	10759	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	77938673	77938848	77938785	Y	NA	USP35,KCTD21	NA	NA	NA	NA	KCTD21	40805	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	4.24618470392145
chr11	77958364	77958560	77958462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	60496	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	77960482	77960781	77960725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	62614	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	78001305	78001608	78001428	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	103437	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr11	78002337	78002637	78002489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	104469	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.6570476893352
chr11	78003105	78003596	78003355	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	105237	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr11	78029499	78029864	78029682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	97530	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr11	78050611	78050886	78050840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	76508	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	78051007	78051295	78051151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	76099	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	78051625	78051814	78051807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	75580	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr11	78060066	78060579	78060413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	66815	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	78061236	78062132	78061949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	65262	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	78073883	78074276	78074154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	53118	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	78089939	78090271	78090187	Y	GAB2	GAB2	NA	NA	NA	NA	GAB2	37123	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr11	78091808	78092073	78091933	Y	GAB2,GAB2	GAB2	NA	NA	NA	NA	GAB2	35321	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr11	78113040	78113383	78113360	Y	NA	GAB2	NA	NA	NA	NA	GAB2	14011	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr11	78947816	78948005	78947917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	663897	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	79148505	79148822	79148543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	864586	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	81696174	81696306	81696246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-742N3.1	702265	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	82805889	82806270	82806080	Y	NA	RAB30	NA	NA	NA	NA	RAB30	24924	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	83203378	83203797	83203488	Y	DLG2	AP003026.1	NA	NA	NA	NA	AP003026.1	37122	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	83222070	83222081	83222077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP003026.1	55814	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	83264586	83264960	83264849	Y	DLG2	NA	NA	NA	NA	NA	AP003026.1	98330	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	83337920	83338003	83337962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP003026.1	171664	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	83350861	83351261	83351066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP003026.1	184605	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	85046447	85046583	85046515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM126B	291046	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	85757330	85757451	85757391	Y	NA	PICALM	NA	NA	NA	NA	PICALM	21473	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	86214866	86215096	86214981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ME3	166582	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	87043104	87043447	87043253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM135	296218	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	88288248	88288652	88288406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTSC	219293	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	89893119	89893512	89893349	Y	NAALAD2	NAALAD2	NA	NA	NA	NA	NAALAD2	30436	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	93343191	93343552	93343372	Y	NA	KIAA1731	NA	NA	NA	NA	KIAA1731	49253	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	93446176	93446355	93446266	Y	NA	SCARNA9,SNORD5,C11orf54	NA	NA	NA	NA	SCARNA9	6324	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	94480491	94481212	94480556	Y	AMOTL1	AMOTL1	AMOTL1,PIWIL4	IMR90	Hi-C	24141950	AMOTL1	42894	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	94882788	94883137	94883023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENDOD1	61814	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	95557234	95557451	95557366	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	35661	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	95867848	95868058	95867952	Y	FAM76B,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	206286	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	95976157	95976737	95976478	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	97607	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr11	95982466	95982894	95982863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	91450	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	95990308	95990455	95990418	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	83889	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	95991442	95991675	95991614	Y	FAM76B,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	82669	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	96001743	96002080	96001866	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	72264	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	96006843	96007267	96007082	Y	FAM76B,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	67077	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	96071900	96072294	96072196	Y	MAML2,JRKL,CCDC82	MAML2,CCDC82,JRKL	NA	NA	NA	NA	MAML2	2050	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	101881929	101882102	101882031	Y	NA	C11orf70	NA	NA	NA	NA	C11orf70	34072	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.071309611669
chr11	102175501	102175731	102175600	Y	BIRC2	BIRC3,BIRC2	MMP7,BIRC2	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC3	10484	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	102330262	102330405	102330334	Y	NA	TMEM123	TMEM123	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM123	8710	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	102678364	102678503	102678434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D5	282441	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	105061488	105061502	105061495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CARD16	91330	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	105090888	105091203	105091058	Y	CASP4,CASP4,CASP5,CARD16,CARD17	NA	NA	NA	NA	NA	CARD16	120730	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr11	106629947	106630142	106630045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUCY1A2	257108	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	107187292	107187599	107187573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWF19L2	138973	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	108679072	108679281	108679081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX10	145320	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	109965770	109966113	109965869	Y	RDX,FDX1,ZC3H12C	ZC3H12C	NA	NA	NA	NA	ZC3H12C	3683	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	110326620	110326859	110326678	Y	NA	FDX1	NA	NA	NA	NA	FDX1	28013	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	111560054	111560414	111560322	Y	NA	NA	PPP2R1B	IMR90	Hi-C	24141950	PPP2R1B	74737	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	111692318	111692670	111692505	Y	NA	NA	PPP2R1B	IMR90	Hi-C	24141950	C11orf1	54989	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	111929773	111930099	111929899	Y	DIXDC1	DLAT,C11orf57,PIH1D2,TIMM8B,SDHD	NA	NA	NA	NA	C11orf57	12711	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	113708252	113709087	113708915	Y	CLDN25	USP28	NA	NA	NA	NA	USP28	35205	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	114224881	114225192	114225037	Y	NA	RBM7,C11orf71	FAM55B,REXO2,C11orf71,RBM7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBM7	43560	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	114312879	114313299	114312892	Y	NA	RBM7,C11orf71,REXO2	NA	NA	NA	NA	REXO2	4771	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	115373347	115373590	115373469	Y	NA	CADM1	NA	NA	NA	NA	CADM1	85	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	115741521	115741886	115741709	Y	NA	NA	CADM1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-136I14.5	290506	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	116722234	116722744	116722542	Y	NA	APOC3	NA	NA	NA	NA	APOC3	23812	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	116790672	116791048	116790863	Y	NA	NA	APOA4,APOA1,APOC3	IMR90	Hi-C	24141950	APOC3	92250	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr11	116857252	116857500	116857432	Y	SIK3	AP000936.1	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	47267	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	117015877	117016035	117015996	Y	SIK3,PAFAH1B2	SIK3,PAFAH1B2,SIDT2	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B2	2894	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	118251385	118251554	118251508	Y	NA	UBE4A,ATP5L	NA	NA	NA	NA	ATP5L	18315	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	118663387	118663780	118663691	Y	NA	DDX6	NA	NA	NA	NA	DDX6	3529	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	9.42445873309395
chr11	118784118	118784508	118784405	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	4701	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	118788249	118788453	118788294	Y	MLL,PHLDB1,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	5420	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	118791529	118792348	118792152	Y	PHLDB1,BCL9L	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	1525	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.55348220875175
chr11	118793665	118793922	118793750	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	118800245	118800827	118800413	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5928	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr11	118800879	118801266	118801161	Y	MLL,DDX6,VPS11,CBL,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	6562	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	119612950	119613345	119613188	Y	NA	PVRL1	PVRL1,TRIM29	IMR90	Hi-C	24141950	PVRL1	15156	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr11	120083069	120083545	120083438	Y	GRIK4,ARHGEF12,OAF	TRIM29,OAF,POU2F3	NA	NA	NA	NA	OAF	3594	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	120089762	120089841	120089801	Y	NA	TRIM29,OAF,POU2F3	NA	NA	NA	NA	OAF	10287	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	120895811	120895984	120895886	Y	GRIK4,TBCEL,TBCEL,TECTA	TBCEL	NA	NA	NA	NA	TBCEL	3030	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr11	121289334	121289764	121289479	Y	SORL1	SORL1	SORL1	IMR90	Hi-C	24141950	SORL1	31148	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	121526040	121526695	121526415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SORL1	205128	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	121526794	121527145	121526879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SORL1	205882	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	122608190	122608588	122608260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	83807	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	123013120	123013348	123013342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLMP	50641	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	123015903	123016112	123016008	Y	NA	CLMP	NA	NA	NA	NA	CLMP	47877	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	123077641	123077822	123077735	Y	NA	CLMP	CLMP	IMR90	Hi-C	24141950	CLMP	13652	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	123173564	123173848	123173613	Y	NA	NA	CLMP	IMR90	Hi-C	24141950	CLMP	109575	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	123468998	123469339	123469251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCN3B	54613	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	124333152	124333516	124333336	Y	NA	NA	OR10G9	IMR90	Hi-C	24141950	TBRG1	157216	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	124403880	124404281	124404167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBRG1	86451	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	124458771	124459153	124459140	Y	OR8G2,OR8G1,OR8D1,OR8D2,OR8B8,OR8B12,OR8A1	TBRG1	NA	NA	NA	NA	TBRG1	31579	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	124611800	124612504	124612072	Y	NA	SIAE,NRGN,RP11-677M14.2,RP11-677M14.3,ESAM	NA	NA	NA	NA	RP11-677M14.2	1729	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	125384251	125384436	125384328	Y	SLC37A2	FEZ1	EI24,STT3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FEZ1	20038	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	125670081	125670467	125670312	Y	CHEK1,PATE4,PATE1,PATE2	NA	NA	NA	NA	NA	HYLS1	81042	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	125937888	125938141	125938004	Y	NA	CDON	NA	NA	NA	NA	CDON	6658	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr11	126084365	126084425	126084397	Y	NA	FAM118B,RPUSD4	NA	NA	NA	NA	RPUSD4	4778	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	126180283	126180636	126180409	Y	NA	FOXRED1,SRPR,TIRAP,DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4	NA	NA	NA	NA	RP11-712L6.5	8070	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	128159118	128159435	128159277	Y	NA	NA	ETS1,FLI1,LOC100507392	IMR90	Hi-C	24141950	ETS1	296018	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	128346619	128346923	128346838	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	108530	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	128419505	128419554	128419521	Y	NA	ETS1	NA	NA	NA	NA	ETS1	35899	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	128584156	128584534	128584279	Y	NA	FLI1	NA	NA	NA	NA	FLI1	29726	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	128588753	128589006	128588882	Y	FLI1,FLI1,KCNJ5	FLI1	NA	NA	NA	NA	FLI1	34323	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	128589113	128589189	128589151	Y	NA	FLI1	NA	NA	NA	NA	FLI1	34683	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	128608811	128609066	128608964	Y	FLI1,FLI1	NA	NA	NA	NA	NA	FLI1	54381	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr11	128927593	128927968	128927781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP32	219251	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	129013172	129013631	129013445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP32	133588	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	129185836	129186114	129185975	Y	NA	ARHGAP32	ARHGAP32,KCNJ1	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP32	38617	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	129730176	129730501	129730339	Y	TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	32984	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	129731747	129732130	129731880	Y	ST14,NFRKB,TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	31355	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	6.52462527675735
chr11	129871629	129871941	129871631	Y	NA	PRDM10,TCEB2P2	NA	NA	NA	NA	PRDM10	899	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr11	130062798	130062918	130062846	Y	NA	ST14	NA	NA	NA	NA	ST14	35341	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	130253238	130253357	130253298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS15	63512	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	130767627	130768066	130767878	Y	NA	SNX19	NA	NA	NA	NA	SNX19	16338	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	133823506	133823792	133823624	Y	NA	IGSF9B	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	1088	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr11	133920876	133920983	133920947	Y	B3GAT1,SPATA19,JAM3	JAM3	NA	NA	NA	NA	JAM3	15837	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr11	134708086	134708460	134708277	Y	NA	NA	LOC283177	IMR90	Hi-C	24141950	GLB1L2	508318	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	398927	399098	399013	Y	NA	SLC6A13	NA	NA	NA	NA	SLC6A13	28888	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	690377	690646	690594	Y	NA	RP11-218M22.1	NA	NA	NA	NA	RP11-218M22.1	47411	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	860254	860664	860544	Y	RAD52,NINJ2,WNK1	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	495	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	864034	864343	864158	Y	CCDC77,KDM5A	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	4275	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	905489	905920	905534	Y	NA	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	45730	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	1024438	1024795	1024721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	72424	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr12	1208361	1208617	1208550	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERC1	110686	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	1532185	1532472	1532256	Y	ERC1	NA	NA	NA	NA	NA	WNT5B	104585	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	1584094	1584332	1584168	Y	NA	NA	LOC100292680	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5B	52725	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	1698560	1698670	1698614	Y	FBXL14	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	2661	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	1770869	1771337	1771069	Y	LRTM2,ADIPOR2	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	24403	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr12	1876861	1877254	1877034	Y	NA	RPS4XP14	NA	NA	NA	NA	RPS4XP14	11684	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	2031257	2031345	2031320	Y	NA	CACNA1C	NA	NA	NA	NA	CACNA1C	46607	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.55348220875175
chr12	2374154	2374447	2374269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP1B	262453	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	3340124	3340182	3340154	Y	NRIP2	RP11-543P15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-543P15.1	21028	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	3450642	3450947	3450795	Y	NA	NA	PRMT8,EFCAB4B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-543P15.1	131546	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	3913952	3914004	3913978	Y	NA	EFCAB4B	NA	NA	NA	NA	EFCAB4B	41967	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	4140182	4140815	4140542	Y	CCND2,PARP11	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	PARP11	159574	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr12	4380607	4381576	4381205	Y	PARP11,CCND2	CCND2-AS2,C12orf5	NA	NA	NA	NA	CCND2	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	4448343	4448720	4448381	Y	PARP11,CCND2,C12orf5	C12orf5	NA	NA	NA	NA	C12orf5	19972	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	4770172	4770413	4770176	Y	NA	AKAP3,NDUFA9	NA	NA	NA	NA	NDUFA9	13911	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr12	6332021	6332332	6332117	Y	LPAR5	CD9,RP1-96H9.5	NA	NA	NA	NA	CD9	25140	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr12	6387822	6388153	6388049	Y	NA	RP1-96H9.5,PLEKHG6	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP1-96H9.5	10231	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	6389072	6389528	6389363	Y	CD9,PLEKHG6,PLEKHG6	RP1-96H9.5,PLEKHG6	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP1-96H9.5	11481	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	6403662	6404056	6403860	Y	PLEKHG6,PLEKHG6,PLEKHG6	RP1-96H9.5,PLEKHG6,TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHG6	13546	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr12	6404239	6404667	6404531	Y	NA	RP1-96H9.5,PLEKHG6,TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHG6	12935	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.34635124758485
chr12	6432315	6432644	6432443	Y	NA	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	PLEKHG6	14713	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	6616640	6616858	6616680	Y	NA	VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH,IFFO1	NA	NA	NA	NA	SCARNA10	530	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	6721904	6722326	6722186	Y	GPR162,ENO2,C12orf53	NOP2,CHD4,LPAR5,ACRBP,ING4	NA	NA	NA	NA	CHD4	7262	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	6873427	6873901	6873603	Y	C12orf53,ENO2,CLSTN3,ATN1,PTMS,GPR162	COPS7A,PTMS,MLF2	LEPREL2,CDCA3,TPI1,CD4,GPR162,SPSB2,GNB3,USP5	IMR90	Hi-C	24141950	MLF2	740	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	7000184	7000641	7000294	Y	PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6	CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57	NA	NA	NA	NA	SPSB2	3662	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	7592182	7592797	7592685	Y	PEX5,NANOG	RP11-157G21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-157G21.2	1596	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.4855715340028
chr12	7858113	7858526	7858208	Y	NA	GDF3,DPPA3	NA	NA	NA	NA	DPPA3	3524	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr12	7865522	7865674	7865603	Y	DPPA3,SLC2A3,NANOG	GDF3,DPPA3	NA	NA	NA	NA	DPPA3	3472	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.13922028641795
chr12	7978463	7978836	7978682	Y	DPPA3,SLC2A3,NANOG	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A14	62908	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.13922028641795
chr12	7987438	7987606	7987534	Y	SLC2A3,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A14	54138	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr12	8112195	8112747	8112462	Y	NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3	K562	ChIA-PET	22265404	SLC2A3	25324	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr12	8119309	8119505	8119404	Y	CLEC6A,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3,FOXJ2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SLC2A3	32438	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A3	36298	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	16.8811733351024
chr12	8136037	8136329	8136183	Y	NA	SLC2A3,FOXJ2	SLC2A3,FOXJ2	IMR90	Hi-C	24141950	FOXJ2	46970	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr12	8813796	8814159	8813977	Y	MFAP5	MFAP5,RIMKLB	NA	NA	NA	NA	MFAP5	312	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	9185999	9186130	9186065	Y	CLEC4E,M6PR,KLRG1	NA	NA	NA	NA	NA	M6PR	85448	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	9271887	9272280	9271908	Y	NA	NA	PZP	IMR90	Hi-C	24141950	PZP	86686	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	9855016	9855380	9855049	Y	KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2B,CLECL1,CD69	CLEC2D	NA	NA	NA	NA	CLEC2D	39451	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	10517487	10517775	10517755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABARAPL1	154430	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr12	11221356	11221421	11221389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAS2R14	100751	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	11851043	11851172	11851118	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	50255	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	11951921	11952163	11952067	Y	ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	151133	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	11966137	11966507	11966203	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	165349	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	12298245	12298581	12298464	Y	LRP6	NA	NA	NA	NA	NA	LRP6	119365	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	12408234	12408471	12408413	Y	NA	LRP6	NA	NA	NA	NA	LRP6	9475	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	12711400	12711706	12711553	Y	BCL2L14,DUSP16	DUSP16	LOH12CR1	MCF7	ChIA-PET	22265404	DUSP16	1611	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	13034551	13034650	13034602	Y	DDX47,GPRC5A	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	7066	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	13050548	13050563	13050554	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	8832	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	13124934	13124993	13124963	Y	NA	RP11-392P7.6,HTR7P1,HEBP1	GPRC5D	IMR90	Hi-C	24141950	HTR7P1	25819	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	13253893	13254547	13254171	Y	CDKN1B,EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	58675	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr12	15408630	15408974	15408946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGDIB	295968	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	15899366	15899730	15899546	Y	PTPRO	NA	NA	NA	NA	NA	EPS8	133533	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	16553699	16554214	16553898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	55623	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr12	18511225	18511610	18511392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	769038	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	19557871	19558201	19558036	Y	NA	AEBP2	AEBP2	IMR90	Hi-C	24141950	AEBP2	2892	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	20004635	20004650	20004642	Y	NA	NA	PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-405A12.2	78250	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	20047799	20048015	20047920	Y	NA	RP11-405A12.1	PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-405A12.1	44440	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	20124309	20124606	20124452	Y	PDE3A	RP11-405A12.1	PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-405A12.1	31854	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	20543386	20543422	20543406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-405A12.1	450931	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	22428776	22428931	22428867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMAS	231668	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	22779557	22779668	22779574	Y	NA	ETNK1	NA	NA	NA	NA	ETNK1	3548	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	25058340	25058627	25058484	Y	BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	41766	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	25086735	25086929	25086817	Y	NA	BCAT1,RP11-662I13.1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	13464	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	25099512	25100288	25099550	Y	BCAT1	BCAT1,RP11-662I13.1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	105	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	25402760	25403150	25403054	Y	LRMP,CASC1,KRAS	KRAS	NA	NA	NA	NA	KRAS	890	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	15955	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.7283573010042
chr12	26267263	26267811	26267415	Y	NA	BHLHE41,RP11-283G6.3	NA	NA	NA	NA	BHLHE41	8249	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr12	26538001	26538320	26538173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.3	260451	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	26805266	26805775	26805502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPR2	178356	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	27484254	27484540	27484416	Y	FGFR1OP2,STK38L	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	467	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	27678028	27678417	27678221	Y	C12orf71	PPFIBP1	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	3664	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	31469690	31470116	31469962	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	7876	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	31523025	31523181	31523129	Y	METTL20,FAM60A,FAM60A	FAM60A,RP11-771K4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-771K4.1	2790	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	31523933	31524084	31523973	Y	DDX11,METTL20,FAM60A,FAM60A	FAM60A,RP11-771K4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-771K4.1	3698	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	31804886	31805136	31805063	Y	NA	METTL20	NA	NA	NA	NA	METTL20	6792	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr12	33044985	33045279	33045082	Y	NA	PKP2	NA	NA	NA	NA	PKP2	2495	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr12	34500403	34500725	34500579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-7D7.1	99987	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr12	38493611	38493806	38493706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALG10B	214574	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	39539251	39539539	39539453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF21A	295653	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	42825856	42826146	42826103	Y	YAF2,YAF2,YAF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	107936	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	42984702	42985091	42984897	Y	GXYLT1,PRICKLE1,PRICKLE1,PRICKLE1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-25I15.1	85835	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	44463301	44463607	44463454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM117	235531	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	44936022	44936417	44936038	Y	NELL2,NELL2,NELL2	NA	NA	NA	NA	NA	NELL2	377214	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	44983046	44983051	44983049	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NELL2	330580	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	45626822	45627300	45627014	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	18998	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	45654086	45654401	45654190	Y	NA	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	46262	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr12	45703000	45703363	45703138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	95176	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	45820263	45820702	45820515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	212439	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	46272544	46272693	46272552	Y	ARID2,SLC38A1,SCAF11	NA	NA	NA	NA	NA	SCAF11	111210	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	46609835	46610258	46610179	Y	ARID2,SCAF11,SLC38A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	51542	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	46636369	46636708	46636589	Y	SCAF11,SLC38A1	SLC38A1	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	25092	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr12	46844808	46845174	46844835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	69346	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	46845656	46846014	46845792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	70194	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	46848355	46848425	46848370	Y	NA	NA	SLC38A2	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-96H19.1	72893	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	46886273	46886657	46886465	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	110811	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	46888080	46888552	46888358	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	112618	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	46951455	46951753	46951519	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	175993	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	47033293	47033660	47033445	Y	NA	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	257831	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	47053760	47053887	47053821	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	278298	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr12	47074564	47074850	47074707	Y	NA	NA	SLC38A1,SLC38A2,SLC38A4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	299102	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	49276307	49276420	49276362	Y	OR8S1,RND1	DDX23,RND1,CCDC65,FKBP11	RND1,CACNB3,DDX23,ARF3,WNT10B,FKBP11,DDN,WNT1,PRKAG1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RND1	18626	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	49641026	49641246	49641136	Y	NA	NA	RHEBL1,TUBA1C,TUBA1A,LMBR1L,DHH,MLL2,TUBA1B,SPATS2,MCRS1,FAM186B,PRPH	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	59919	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	49646906	49646981	49646941	Y	NA	NA	RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,DHH,LMBR1L	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	65799	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr12	49972592	49972801	49972676	Y	NA	MCRS1,PRPF40B	MCRS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PRPF40B	12591	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	50097438	50097851	50097618	Y	NCKAP5L,TMBIM6,TMBIM6,FMNL3	TMBIM6,FMNL3	NA	NA	NA	NA	TMBIM6	1657	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	50899744	50900179	50899947	Y	DIP2B	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	2976	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	50900445	50901076	50900765	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	3677	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	50931365	50931732	50931390	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	34597	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	51180627	51180997	51180727	Y	SMAGP	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	25134	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr12	51720540	51720949	51720738	Y	SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,DAZAP2,GALNT6	BIN2	NA	NA	NA	NA	BIN2	4088	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	51741969	51742183	51742075	Y	NA	BIN2,SLC4A8,GALNT6	NA	NA	NA	NA	BIN2	25517	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	52241099	52241559	52241297	Y	NA	ANKRD33	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	38185	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	52241760	52242326	52241842	Y	SLC4A8,FIGNL2	ANKRD33	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	37418	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.58913701458625
chr12	52242460	52242886	52242778	Y	SLC4A8,ANKRD33	ANKRD33	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	36858	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr12	52243040	52243117	52243080	Y	SCN8A,ACVRL1,FIGNL2	ANKRD33	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	36627	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	52249721	52249808	52249784	Y	SLC4A8,FIGNL2	ANKRD33	BIN2,SCN8A,SLC4A8,ANKRD33,ACVR1B,GALNT6,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	29936	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	52262826	52263308	52263216	Y	NA	ANKRD33	SCN8A,ACVR1B,SLC4A8	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	16436	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr12	52426547	52427164	52426822	Y	NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11931	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	52438699	52439014	52438738	Y	ACVR1B,NR4A1	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	C12orf44	22016	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	52439738	52439919	52439767	Y	GRASP,NR4A1,NR4A1	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	C12orf44	21111	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	52557711	52558022	52557822	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	25762	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr12	52588987	52589174	52589068	Y	ACVR1B,NR4A1	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	5203	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	52629756	52630207	52629959	Y	NA	KRT80,KRT7,KRT86	NA	NA	NA	NA	KRT7	5452	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	52674043	52674518	52674247	Y	NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80	KRT7,KRT86	NA	NA	NA	NA	KRT86	32959	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	52950129	52950435	52950283	Y	KRT82	NA	NA	NA	NA	NA	KRT86	309045	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	53267781	53268340	53268093	Y	PFDN5	NA	KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT18	72315	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	53312254	53312405	53312393	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	28250	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	53318665	53319069	53319016	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	21586	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr12	53336677	53336830	53336786	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	3825	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	53338460	53338676	53338568	Y	KRT18,KRT18	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	1979	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr12	53339346	53339557	53339459	Y	EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	1098	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr12	53359181	53359363	53359294	Y	PCBP2,AMHR2,KRT8,KRT18,KRT18	KRT18,KRT8,EIF4B	NA	NA	NA	NA	KRT8	17443	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.071309611669
chr12	53365695	53366044	53365885	Y	NA	KRT18,KRT8,EIF4B	NA	NA	NA	NA	KRT8	23957	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	53368990	53369278	53369065	Y	NA	KRT18,KRT8,EIF4B	KRT8,EIF4B,KRT18	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT8	27252	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr12	53398446	53398634	53398511	Y	NA	EIF4B	NA	NA	NA	NA	EIF4B	504	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	53615195	53615822	53615501	Y	CSAD,SP1,PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	8942	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	53726510	53726905	53726727	Y	NA	PFDN5,C12orf10,RP11-680A11.5,AAAS,SP1	NA	NA	NA	NA	AAAS	9862	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	53765037	53765535	53765115	Y	CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13	AAAS,SP1	SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP1	6425	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	53795240	53795255	53795248	Y	ATP5G2,ATF7	SP1,PRR13,PCBP2	NA	NA	NA	NA	SP1	23280	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	53885903	53886227	53886219	Y	NA	TARBP2	NA	NA	NA	NA	TARBP2	6478	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	54052823	54053029	54052960	Y	NA	ATF7,ATP5G2	NA	NA	NA	NA	ATP5G2	16163	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	54090300	54090537	54090319	Y	NA	ATP5G2,CALCOCO1	NA	NA	NA	NA	ATP5G2	21108	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	54293361	54293678	54293520	Y	NA	HOXC13,HOXC13-AS	NA	NA	NA	NA	HOXC13	36857	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	54413422	54413659	54413446	Y	ATP5G2,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5	HOXC11,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	10978	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	54749329	54749578	54749455	Y	NA	ZNF385A	NA	NA	NA	NA	ZNF385A	33504	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	54752421	54752649	54752549	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	ZNF385A	NA	NA	NA	NA	ZNF385A	30433	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	54752671	54753884	54753119	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	ZNF385A	NA	NA	NA	NA	ZNF385A	29198	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	55806634	55807051	55806823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL7B	266279	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	55807914	55808439	55808095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL7B	264891	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	55808460	55808880	55808766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL7B	264450	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	56147551	56147694	56147624	Y	NA	BLOC1S1,ITGA7,RP11-644F5.11,CD63,GDF11	NA	NA	NA	NA	GDF11	12487	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	56831514	56831759	56831654	Y	IKZF4	TIMELESS,SPRYD4,GLS2	NA	NA	NA	NA	TIMELESS	9428	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	57026164	57026397	57026368	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	2203	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	20.9202270778569
chr12	57402902	57402987	57402944	Y	NA	ZBTB39,TAC3	NA	NA	NA	NA	ZBTB39	4672	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	57462088	57462242	57462164	Y	R3HDM2,MBD6,ARHGAP9,ARHGAP9,ARHGAP9,BAZ2A,STAT6,STAT6	TAC3,TMEM194A,NAB2	TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM194A	17604	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	57520981	57521279	57521090	Y	NA	TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	LRP1	705	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	57557421	57557508	57557464	Y	NA	LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	STAT6	33499	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	57672745	57672985	57672868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHMT2	51635	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	57813803	57814254	57814252	Y	NA	R3HDM2,INHBE,GLI1	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	8534	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	57822292	57822475	57822384	Y	NA	R3HDM2,INHBE,GLI1,MARS	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	313	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	57986482	57986782	57986634	Y	R3HDM2,AGAP2,KIF5A,DTX3,B4GALNT1,ARHGEF25	DCTN2,PIP4K2C,DTX3,ARHGEF25,B4GALNT1	NA	NA	NA	NA	PIP4K2C	3525	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	58238225	58238735	58238639	Y	AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,XRCC6BP1,CTDSP2	NA	NA	NA	NA	NA	CTDSP2	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr12	58281637	58282038	58281777	Y	CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM	CTDSP2	CTDSP2,TSFM,AVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTDSP2	43115	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	59300729	59300915	59300862	Y	LRIG3,LRIG3	LRIG3	NA	NA	NA	NA	LRIG3	11388	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	59544706	59545022	59544844	Y	NA	NA	LRIG3	IMR90	Hi-C	24141950	LRIG3	232403	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	62772980	62773240	62773147	Y	MON2,USP15	NA	NA	NA	NA	NA	MON2	85357	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	62983522	62983540	62983531	Y	NA	RP11-631N16.2	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	10992	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	63051832	63051994	63051914	Y	MON2,PPM1H	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	57300	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr12	63067118	63067447	63067283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	72586	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	63115696	63115706	63115701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	121164	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	63118880	63119001	63118911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	124348	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr12	63133542	63133622	63133582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	139010	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	63149457	63149757	63149616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	154925	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	63177678	63177947	63177765	Y	C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1H	148870	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	63179567	63180349	63179723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1H	146468	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	63256455	63256601	63256528	Y	PPM1H	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1H	70216	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	63294376	63294638	63294612	Y	NA	PPM1H	NA	NA	NA	NA	PPM1H	32179	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	64544712	64545066	64544890	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	69010	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr12	64574864	64574988	64574911	Y	NA	C12orf66,RPS11P6	NA	NA	NA	NA	C12orf66	39088	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	64850943	64851361	64850994	Y	NA	TBK1	NA	NA	NA	NA	TBK1	7283	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	65019058	65019979	65019210	Y	TBK1,RASSF3,GNS	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	16765	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	65077868	65077886	65077879	Y	RASSF3,LEMD3	NA	NA	NA	NA	NA	GNS	73341	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	65140575	65140710	65140636	Y	TBK1,RASSF3,LEMD3,GNS	GNS,TBC1D30	NA	NA	NA	NA	GNS	10517	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	RBMS1P1	NA	NA	NA	NA	RBMS1P1	1278	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	67274459	67274765	67274734	Y	GRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	186177	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	67362694	67363196	67363004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	97746	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	67392180	67392257	67392219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	68685	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	68705850	68706149	68706026	Y	IL22,SLC35E3,NUP107,MDM2,MDM1	MDM1	NA	NA	NA	NA	MDM1	18012	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	69019747	69019936	69019838	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	14837	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr12	69150078	69150205	69150130	Y	NA	SLC35E3,MDM2	NA	NA	NA	NA	SLC35E3	12192	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	69316243	69316419	69316405	Y	RAP1B,CPM,CPM	CPM	NA	NA	NA	NA	CPM	46931	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	69634325	69634686	69634559	Y	SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6	CPSF6	NA	NA	NA	NA	CPSF6	3008	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	70630767	70631060	70630914	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	CNOT2	3714	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	70648828	70649035	70648891	Y	RAB3IP,CNOT2,CNOT2,CNOT2	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-611E13.2	13688	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	74437082	74437415	74437248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3B	492136	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	75900907	75901415	75901091	Y	KRR1	KRR1	NA	NA	NA	NA	KRR1	2001	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	76209246	76209451	76209339	Y	NA	NA	PHLDA1,NAP1L1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PHLDA1	216261	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	76429051	76429248	76429150	Y	NA	PHLDA1,NAP1L1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	3339	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	76751627	76751939	76751780	Y	NA	BBS10	NA	NA	NA	NA	BBS10	11405	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	79804284	79804517	79804401	Y	PAWR	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	278360	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	80219716	80220141	80220058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-84G21.1	106540	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	80327802	80327850	80327826	Y	NA	RP11-84G21.1,PPP1R12A	NA	NA	NA	NA	PPP1R12A	562	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	81405150	81405419	81405285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIN7A	75446	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	82155346	82155393	82155380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC59	595191	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	83461267	83461506	83461387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P25	81604	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	86658149	86658358	86658243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTS	392076	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	87130786	87131140	87131095	Y	MGAT4C	NA	NA	NA	NA	NA	NTS	864713	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	87554185	87554198	87554192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf29	871425	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	87657900	87657914	87657909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf29	767709	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr12	87724582	87724754	87724682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf29	700869	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	6.73175623792425
chr12	91972476	91973067	91972734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	564282	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	93709037	93709216	93709174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT4	60443	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr12	93770329	93770575	93770474	Y	NUDT4	NUDT4	NA	NA	NA	NA	NUDT4	670	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	93890331	93890756	93890540	Y	NA	MRPL42	NA	NA	NA	NA	MRPL42	31067	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	94172136	94172517	94172167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	102985	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	94201755	94201874	94201816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	132604	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	94696122	94696451	94696433	Y	PLXNC1,TMCC3	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	120294	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	94817703	94818348	94818256	Y	NA	RBMS2P1,CCDC41	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	958	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr12	94954640	94954945	94954835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMCC3	87393	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	95034280	95034617	95034465	Y	PLXNC1,TMCC3	TMCC3	NA	NA	NA	NA	TMCC3	7721	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	95404686	95404921	95404803	Y	NA	NDUFA12	NA	NA	NA	NA	NDUFA12	9140	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	95411707	95411975	95411841	Y	NA	NDUFA12	NA	NA	NA	NA	NDUFA12	16161	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	95680646	95681018	95680718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEZT	71124	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	97664926	97665039	97664983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD1	365925	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	99786605	99786971	99786790	Y	ANKS1B,ANKS1B,ANKS1B	NA	NA	NA	NA	NA	UHRF1BP1L	747655	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	99960384	99960647	99960516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UHRF1BP1L	573979	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	100596885	100596960	100596910	Y	NA	ACTR6,RP11-175P13.3	NA	NA	NA	NA	RP11-175P13.3	5324	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr12	100628061	100628323	100628191	Y	NA	ACTR6,RP11-175P13.3,SCYL2	NA	NA	NA	NA	SCYL2	30595	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr12	102187051	102187461	102187342	Y	DRAM1,GNPTAB	GNPTAB	NA	NA	NA	NA	GNPTAB	35255	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	102269445	102269658	102269578	Y	DRAM1	GNPTAB,DRAM1	NA	NA	NA	NA	DRAM1	316	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	102734344	102734692	102734517	Y	NA	NA	IGF1	IMR90	Hi-C	24141950	NUP37	222442	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	104199621	104199645	104199634	Y	NA	NT5DC3	NA	NA	NA	NA	NT5DC3	33330	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	104613052	104613575	104613267	Y	CHST11,TXNRD1,TXNRD1	TXNRD1,RPL18AP3	NA	NA	NA	NA	TXNRD1	5495	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	104658660	104659046	104658853	Y	NA	RPL18AP3	NA	NA	NA	NA	RPL18AP3	1604	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	104791559	104791875	104791716	Y	TXNRD1	NA	CHST11,SLC41A2,C12orf45	IMR90	Hi-C	24141950	CHST11	55198	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	104997803	104998291	104998125	Y	TXNRD1,TXNRD1,CHST11	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	150730	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	105477471	105477556	105477526	Y	ALDH1L2	ALDH1L2,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	ALDH1L2	1116	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	105620091	105620351	105620275	Y	APPL2	C12orf75,APPL2	NA	NA	NA	NA	C12orf75	6717	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	107363542	107363991	107363752	Y	NA	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	14953	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	108297283	108297694	108297638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM4	144234	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.58913701458625
chr12	109035890	109036155	109035901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISCU	81532	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	109088465	109088864	109088838	Y	SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	34508	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	109120887	109121218	109121134	Y	NA	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	2154	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	109209396	109209677	109209591	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	39689	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	109227089	109227462	109227320	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	21904	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	110682622	110683080	110682796	Y	ATP2A2	ATP2A2	ATP2A2	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP2A2	33481	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	110809213	110809452	110809351	Y	NA	ANAPC7	NA	NA	NA	NA	ANAPC7	30083	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	110867136	110867499	110867318	Y	NA	ANAPC7,HMGA1P3,ARPC3,RPL31P49,GPN3	NA	NA	NA	NA	HMGA1P3	1049	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	111019873	111020249	111019900	Y	MYL2,ATP2A2,PPTC7	PPTC7,TCTN1	RAD9B	IMR90	Hi-C	24141950	PPTC7	748	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	111842634	111842962	111842759	Y	NA	FAM109A,SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	882	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr12	112341708	112342051	112341878	Y	ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	63926	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	112529504	112529724	112529616	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	15102	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr12	112741741	112742068	112741904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	112087	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	112759768	112760224	112759930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	93931	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	113667617	113667862	113667654	Y	DTX1,IQCD,TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	10718	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	115130244	115130426	115130316	Y	TBX3	TBX3	TBX3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBX3	10275	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr12	116308098	116308555	116308414	Y	NA	NA	RBM19,TBX3	IMR90	Hi-C	24141950	MED13L	404588	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	116661909	116662288	116662266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	50855	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	116701070	116701373	116701314	Y	MAP1LC3B2,MED13L	MED13L	NA	NA	NA	NA	MED13L	11770	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	116864232	116864472	116864363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00173	104755	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	116872040	116872309	116872217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00173	96918	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	116946674	116946880	116946778	Y	NA	LINC00173	LINC00173,MED13L,MAP1LC3B2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00173	22347	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	117277511	117277610	117277564	Y	NOS1,RNFT2,HRK	HRK	NA	NA	NA	NA	HRK	39636	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	118263351	118263381	118263366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSR2	141407	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	118278853	118278970	118278912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSR2	125818	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	118497379	118497776	118497426	Y	NA	RFC5,WSB2	NA	NA	NA	NA	WSB2	459	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	119632995	119633391	119633197	Y	TMEM233	HSPB8	NA	NA	NA	NA	HSPB8	18548	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	119824446	119824698	119824572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPB8	209999	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	120153680	120153798	120153737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAB1	50122	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr12	120451614	120452059	120451867	Y	CCDC64	NA	NA	NA	NA	NA	RAB35	101247	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	120668258	120668871	120668569	Y	RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	31164	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr12	120672500	120673016	120672699	Y	PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	28558	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	120689817	120690140	120689965	Y	CCDC64,RAB35,RNF10,PXN	PXN,NME2P1,RNU4-2,RNU4-1	NA	NA	NA	NA	PXN	11434	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	120700935	120701192	120701121	Y	NA	PXN,NME2P1,RNU4-2,RNU4-1	NA	NA	NA	NA	PXN	382	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	120906143	120906276	120906236	Y	RAB35	COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1	NA	NA	NA	NA	DYNLL1	490	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	121310801	121311113	121311060	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	29061	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	121322345	121322363	121322358	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	17811	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	121497390	121497638	121497514	Y	OASL	C12orf43	SPPL3,UNC119B,ACADS,C12orf43,HNF1A,OASL,LOC100506668,DYNLL1,MLEC,P2RX7,P2RX4,CAMKK2	IMR90	Hi-C	24141950	C12orf43	45085	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	121714857	121715111	121714996	Y	OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2	CAMKK2	NA	NA	NA	NA	CAMKK2	19000	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	121864200	121864449	121864234	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	28356	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	121866033	121866226	121866130	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	30189	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	122014724	122015549	122015007	Y	NA	KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	1371	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr12	122771781	122771848	122771815	Y	NA	VPS33A	NA	NA	NA	NA	VPS33A	22713	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	54.5790082674782
chr12	122952702	122952803	122952758	Y	CLIP1,HCAR1	CLIP1,ZCCHC8	LOC100507066,CLIP1	IMR90	Hi-C	24141950	ZCCHC8	30715	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr12	123362987	123363145	123363088	Y	NA	HIP1R,VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	15846	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	123615846	123616275	123616026	Y	NA	PITPNM2	PITPNM2,ARL6IP4,ABCB9,OGFOD2,LOC100507091,MPHOSPH9	IMR90	Hi-C	24141950	PITPNM2	16287	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	124823049	124823325	124823212	Y	FAM101A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM101A	367261	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	124916261	124916578	124916546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	448636	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	313839	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr12	125197556	125198099	125197767	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	167115	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	125229298	125229517	125229417	Y	NA	NA	NCOR2	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	135697	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	125353523	125353887	125353860	Y	NA	SCARB1,UBC	NA	NA	NA	NA	SCARB1	11327	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	125424077	125424667	125424516	Y	NA	UBC,RPL22P19,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22P19	5636	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr12	125425237	125425455	125425374	Y	NA	UBC,RPL22P19,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22P19	6796	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	125534116	125534467	125534247	Y	NA	AACS	AACS	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	AACS	13458	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	125550830	125551017	125550923	Y	NA	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	2905	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	127567979	127568114	127568034	Y	NA	RP11-575F12.1	NA	NA	NA	NA	RP11-575F12.1	25033	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	129314364	129314712	129314516	Y	SLC15A4,GLT1D1	SLC15A4	SLC15A4	K562	ChIA-PET	22265404	SLC15A4	7836	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	131702988	131703123	131703024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR133	266536	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	132232542	132232780	132232661	Y	DDX51	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	38916	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	132293483	132293821	132293495	Y	NA	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	17117	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	132315038	132315239	132315115	Y	MMP17	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	4100	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	132345340	132345736	132345589	Y	SFSWAP,ULK1	MMP17,ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	31460	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	132368164	132368433	132368235	Y	NA	ULK1,PUS1	SFSWAP,ULK1,EP400,PUS1	IMR90	Hi-C	24141950	ULK1	8763	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr12	132558778	132559145	132558825	Y	NA	SNORA49,EP400NL	NA	NA	NA	NA	EP400NL	7683	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	132899646	132899852	132899767	Y	GALNT9	NA	NA	NA	NA	NA	MUC8	148874	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr12	133021534	133022956	133022670	Y	POLE,DDX51,FBRSL1	MUC8,FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MUC8	25770	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr12	133029955	133030417	133030330	Y	NA	MUC8,FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MUC8	18309	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	19643994	19644193	19644094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH8	561595	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	20137811	20138146	20137910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH8	67642	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr13	20624080	20624132	20624092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	93270	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	20644269	20644474	20644387	Y	ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2	NA	NA	NA	NA	NA	GJA3	88714	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr13	20693405	20693544	20693484	Y	CRYL1	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	39644	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr13	20735697	20735843	20735813	Y	PSPC1,ZMYM5	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	2509	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	21214778	21214798	21214788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL17D	59468	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	21398890	21399124	21398998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT2	52793	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	21405905	21405971	21405953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT2	59808	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	21607254	21607660	21607524	Y	NA	LATS2	NA	NA	NA	NA	LATS2	26026	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	21632492	21632727	21632640	Y	NA	LATS2	NA	NA	NA	NA	LATS2	959	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	22009901	22010336	22010211	Y	NA	ZDHHC20	NA	NA	NA	NA	ZDHHC20	21173	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	24528296	24528692	24528455	Y	PCOTH	RP11-309I15.1	SPATA13,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-309I15.1	23257	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr13	24624435	24624605	24624500	Y	PARP4	NA	SPATA13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-309I15.1	72486	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	24697003	24697328	24697264	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-309I15.1	145054	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	25859422	25859518	25859470	Y	NUPL1,MTMR6	MTMR6,NUPL1	NA	NA	NA	NA	MTMR6	629	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	26456265	26456499	26456340	Y	CDK8	NA	NA	NA	NA	NA	RNF6	338292	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	26558733	26558979	26558920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF6	235812	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	26760531	26760858	26760712	Y	WASF3	RNF6	WASF3,RNF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF6	33933	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	27557231	27557465	27557334	Y	USP12,RPL21,RASL11A	NA	RASL11A,USP12,RPL21,MTIF3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP12	186568	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	27608814	27608959	27608884	Y	WASF3,GPR12	NA	RASL11A,USP12,RPL21	IMR90	Hi-C	24141950	USP12	135074	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	28005406	28005795	28005597	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	GTF3A	8725	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	28025291	28025563	28025486	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	MTIF3	2552	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr13	28167075	28167372	28167253	Y	NA	LNX2,POLR1D	NA	NA	NA	NA	LNX2	25169	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	28534904	28535178	28535096	Y	LNX2,FLT3,PRHOXNB	PDX1,CDX2	NA	NA	NA	NA	CDX2	8098	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr13	28540285	28540611	28540449	Y	LNX2,CDX2	PDX1,CDX2	NA	NA	NA	NA	CDX2	2665	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	28787263	28787277	28787270	Y	NA	EEF1A1P3	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P3	613	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	30415465	30415864	30415857	Y	NA	UBL3	NA	NA	NA	NA	UBL3	6957	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.21052989808695
chr13	30722241	30722391	30722328	Y	USPL1	LINC00365	HMGB1,LINC00426,KATNAL1,UBL3	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00365	41229	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	31483566	31483936	31483755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPH1	250589	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	33051019	33051050	33051035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP2L1	50704	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	33728009	33728149	33728045	Y	STARD13	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	194618	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr13	33744347	33744745	33744546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	178022	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	33762622	33762899	33762709	Y	STARD13,STARD13	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	159868	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	33781660	33782051	33781892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	140716	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	33822427	33822802	33822649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	99965	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	33841256	33841381	33841376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	81386	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	33858244	33858802	33858357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	63965	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	34116442	34117241	34116673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	193675	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr13	36853236	36853259	36853249	Y	CCNA1,C13orf38	CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2	NA	NA	NA	NA	CCDC169	16718	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr13	36918283	36918673	36918579	Y	NA	CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2,SPG20	NA	NA	NA	NA	SPG20	23644	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	40331110	40331478	40331245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG6	103346	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	41554566	41554842	41554704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1P3	60656	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	41591294	41591779	41591504	Y	C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1	WBP4,ELF1	NA	NA	NA	NA	WBP4	41631	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	41651625	41651882	41651685	Y	NA	WBP4,ELF1	NA	NA	NA	NA	ELF1	18049	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	41751912	41752021	41751942	Y	NA	KBTBD6,CALM2P3,KBTBD7	NA	NA	NA	NA	CALM2P3	8628	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	41811647	41811915	41811781	Y	NA	KBTBD7,MTRF1	NA	NA	NA	NA	MTRF1	23827	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	41958200	41958754	41958408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	74859	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	42143744	42143800	42143772	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	260403	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	42646001	42646399	42646206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	197890	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	42855017	42855240	42855076	Y	AKAP11	AKAP11	NA	NA	NA	NA	AKAP11	10728	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	43617981	43618110	43618046	Y	TNFSF11	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	22642	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	43632661	43632965	43632672	Y	NA	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	37322	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr13	43656094	43656342	43656191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	60755	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	43662550	43662935	43662749	Y	EPSTI1	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	67211	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	43767614	43767674	43767644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	172275	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	44436870	44437053	44436962	Y	ENOX1	LACC1,CCDC122	NA	NA	NA	NA	LACC1	14367	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	44446151	44446617	44446342	Y	NA	LACC1,CCDC122	NA	NA	NA	NA	LACC1	4803	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	44542732	44543742	44543446	Y	SERP2	NA	SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC122	90905	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	44620658	44620684	44620670	Y	ENOX1	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC122	168831	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	45059021	45059160	45059095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSC22D1	90123	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	45928010	45928281	45928087	Y	NA	TPT1-AS1,TPT1	NA	NA	NA	NA	TPT1	14505	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr13	46082201	46082375	46082214	Y	NA	COG3	NA	NA	NA	NA	COG3	45141	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	46557145	46557532	46557508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H13	67362	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	46709325	46709604	46709495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCP1	74402	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr13	47128564	47128952	47128887	Y	LCP1,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	3261	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr13	48464437	48464519	48464469	Y	NA	NA	HTR2A	IMR90	Hi-C	24141950	NAP1L4P3	128842	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	48526121	48526135	48526130	Y	MED4,SUCLA2	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT15	83568	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	48636284	48636323	48636312	Y	NA	NUDT15,SUCLA2,MED4	NA	NA	NA	NA	SUCLA2	26159	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	50094191	50094472	50094332	Y	CAB39L,SETDB2,PHF11,PHF11	PHF11	NA	NA	NA	NA	PHF11	26445	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	50597476	50597810	50597661	Y	RCBTB1,TRIM13	TRIM13,MIR16-1	NA	NA	NA	NA	MIR16-1	23387	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	51168515	51168827	51168588	Y	RNASEH2B	NA	DLEU2,DLEU1,DLEU7	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34P26	234616	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	51200392	51200766	51200454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P26	266493	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	51210187	51210463	51210320	Y	NA	NA	DLEU2	IMR90	Hi-C	24141950	RNASEH2B	271351	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	52319871	52320068	52319946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	56225	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	52406665	52407091	52406817	Y	NA	DHRS12,RP11-327P2.5	NA	NA	NA	NA	RP11-327P2.5	30232	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	52475447	52475592	52475577	Y	NA	NA	INTS6,ATP7B,ALG11,NEK5,NEK3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-327P2.5	99014	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	52494302	52494692	52494497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP7B	88938	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	52505834	52506318	52505967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP7B	77312	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr13	52537870	52538200	52538035	Y	UTP14C	ATP7B,ALG11	NA	NA	NA	NA	ATP7B	45430	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr13	52769647	52769861	52769811	Y	NA	NEK3	NA	NA	NA	NA	NEK3	37651	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.13922028641795
chr13	53028749	53028807	53028779	Y	NA	VPS36,CKAP2	NA	NA	NA	NA	CKAP2	1185	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	53814883	53815070	53814977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH8	394108	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	56150088	56150466	56150451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH8	2729313	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	57309762	57309863	57309815	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	3426258	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	59432708	59433064	59432886	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	1303057	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr13	60338539	60338813	60338676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	397308	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	60635732	60636010	60635830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	100111	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	60679231	60679569	60679243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	56552	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr13	60716670	60717071	60716778	Y	NA	DIAPH3	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	19050	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	60723538	60723946	60723707	Y	NA	DIAPH3	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	12175	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	60736273	60736548	60736444	Y	NA	DIAPH3	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	152	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	63861440	63861454	63861447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	786690	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	64508473	64508866	64508848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	139278	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	64596462	64596642	64596562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	51502	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	64623751	64624068	64623941	Y	NA	LINC00355	NA	NA	NA	NA	LINC00355	24076	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr13	64652316	64652644	64652373	Y	NA	LINC00355	NA	NA	NA	NA	LINC00355	4172	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	4.9711430680056
chr13	67493315	67493487	67493401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	2845171	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	67674730	67675228	67675034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	3026586	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr13	67730122	67730387	67730193	Y	PCDH9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	3081978	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	72419778	72420070	72419973	Y	DACH1	DACH1	NA	NA	NA	NA	DACH1	19260	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	74508678	74508943	74508854	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	197451	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	74709487	74710034	74709735	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	3093	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	76138851	76139260	76139031	Y	NA	COMMD6,UCHL3	NA	NA	NA	NA	UCHL3	17232	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	76159377	76159493	76159435	Y	NA	COMMD6,UCHL3,LMO7	NA	NA	NA	NA	LMO7	33077	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	76279211	76279429	76279239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	86641	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	76290964	76291186	76291007	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	98394	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	77548213	77548408	77548323	Y	NA	RPL7P44,DHX9P1,CLN5	NA	NA	NA	NA	RPL7P44	5643	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr13	77599424	77599520	77599503	Y	NA	RPL7P44,DHX9P1,CLN5,FBXL3	NA	NA	NA	NA	FBXL3	94	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	77898193	77898346	77898226	Y	NA	MYCBP2	NA	NA	NA	NA	MYCBP2	839	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	79232403	79232753	79232546	Y	NA	RNF219	NA	NA	NA	NA	RNF219	1089	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr13	80030193	80030565	80030379	Y	NA	NDFIP2	NA	NA	NA	NA	NDFIP2	22722	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	80614628	80615478	80614937	Y	NA	NA	SPRY2	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY2	297608	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	80743577	80743798	80743732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	169288	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	80850687	80850824	80850736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	62262	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	81622662	81622676	81622669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	709576	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	81824429	81824558	81824494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	911343	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	81913928	81913973	81913949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	1000842	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.071309611669
chr13	87444403	87444606	87444585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	4553468	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.55348220875175
chr13	90486324	90486483	90486404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	1511591	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	91580553	91580648	91580601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	417426	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	92868650	92868886	92868807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	158553	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	92871734	92872145	92872019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	161637	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	93001340	93001722	93001531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	291243	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr13	93083293	93083662	93083475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	373196	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr13	93096966	93097333	93097096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	386869	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr13	93361116	93361155	93361136	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	651019	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	94706563	94706645	94706604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	539866	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	95201580	95202169	95201893	Y	NA	TGDS,GPR180	NA	NA	NA	NA	TGDS	44342	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	96284564	96284961	96284763	Y	NA	DZIP1,DNAJC3-AS1,DNAJC3	NA	NA	NA	NA	DZIP1	9996	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	96488083	96488280	96488182	Y	NA	NA	DNAJC3	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJC3	160690	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	96498991	96499334	96499248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	171598	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	97636174	97636720	97636457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00456	193156	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	97765837	97765979	97765909	Y	NA	NA	MBNL2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00456	63897	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	97864377	97864530	97864454	Y	NA	LINC00456,MBNL2	MBNL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MBNL2	7158	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr13	97877294	97877762	97877400	Y	NA	LINC00456,MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	5606	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr13	97879082	97879401	97879140	Y	NA	LINC00456,MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	7394	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	97913986	97914316	97914087	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	42298	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	97991476	97991911	97991864	Y	MBNL2	NA	NA	NA	NA	NA	RAP2A	92565	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	98824155	98824526	98824341	Y	FARP1	FARP1	NA	NA	NA	NA	FARP1	31339	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	99403586	99403810	99403698	Y	SLC15A1	SLC15A1	NA	NA	NA	NA	SLC15A1	678	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr13	99562711	99562955	99562841	Y	GPR183,STK24	NA	NA	NA	NA	NA	SLC15A1	159803	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	99599525	99599781	99599653	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK9	137098	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	99647205	99647378	99647259	Y	UBAC2,UBAC2,GPR18,DOCK9	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK9	89501	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	99698656	99698961	99698809	Y	DOCK9	DOCK9	NA	NA	NA	NA	DOCK9	37918	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	99922932	99923366	99923036	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	56920	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	99935844	99936009	99935907	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	69832	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	99963491	99964160	99963691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	97479	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	99991522	99991909	99991574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	125510	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	100013491	100013836	100013585	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	137835	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	100738422	100738621	100738542	Y	NA	PCCA	NA	NA	NA	NA	PCCA	648	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	101253370	101253509	101253428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P47	62842	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	102784457	102784806	102784790	Y	FGF14	NA	NA	NA	NA	NA	TPP2	462547	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	107078443	107078580	107078574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	139932	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	107569449	107569874	107569676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G1P5	255664	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	108310994	108311341	108311278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD13	557386	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	108919755	108919960	108919910	Y	TNFSF13B,LIG4,ABHD13	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD13	51028	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	110439676	110440079	110439929	Y	IRS2	AL162497.1,IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	2761	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	110522374	110522680	110522537	Y	NA	NA	MYO16,IRS2,COL4A1	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	85459	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	110631754	110631774	110631764	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	194839	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr13	110850022	110850027	110850025	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A2	106132	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	110965035	110965206	110965124	Y	COL4A1,COL4A2	COL4A2,COL4A1	NA	NA	NA	NA	COL4A1	7539	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr13	110969695	110970088	110969892	Y	NA	COL4A2,COL4A1	NA	NA	NA	NA	COL4A1	12199	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	111040636	111040786	111040716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	83140	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	111068169	111068419	111068294	Y	RAB20,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	110673	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	111278486	111278706	111278495	Y	NA	CARKD	NA	NA	NA	NA	CARKD	12605	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	111544033	111544176	111544105	Y	ING1,ING1	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	21240	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr13	112726762	112727353	112726963	Y	NA	SNORD44	NA	NA	NA	NA	SNORD44	22370	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	113377120	113377559	113377252	Y	NA	ATP11A	NA	NA	NA	NA	ATP11A	34477	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	113585588	113585716	113585676	Y	CUL4A,CUL4A	MCF2L-AS1	C13orf35,ATP11A,MCF2L	GM12878,HELA,K562,H1ESC	5C	22955621	MCF2L-AS1	35422	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr13	114119812	114119949	114119881	Y	NA	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D2	23318	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	114810103	114810577	114810313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	85509	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr13	114926752	114926846	114926794	Y	NA	RASA3	LOC100506394,GAS6,RASA3,CDC16,CHAMP1,FLJ44054,ATP4B	IMR90	Hi-C	24141950	RASA3	30666	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr14	20803011	20803143	20803077	Y	NA	TTC5,CCNB1IP1,PARP2,RPPH1	NA	NA	NA	NA	CCNB1IP1	3540	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr14	21150605	21151121	21150987	Y	TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	269	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	21268104	21268276	21268208	Y	NA	RNASE1	NA	NA	NA	NA	RNASE1	1161	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr14	21684818	21685080	21685024	Y	OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	50573	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	22757693	22757837	22757724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAD1	298338	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	23222866	23223018	23222950	Y	NA	OXA1L,CTD-2555K7.2	NA	NA	NA	NA	OXA1L	10713	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	23307440	23308274	23307581	Y	SLC7A8,PSMB5,PSMB5,LRP10,MRPL52,MMP14	SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10	NA	NA	NA	NA	MMP14	3674	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	23308431	23309148	23308805	Y	NA	SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10	NA	NA	NA	NA	MMP14	4665	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	23449757	23450231	23450060	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB	MIR4707,HAUS4,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr14	23466494	23466910	23466688	Y	CDH24,C14orf93	MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93,PSMB5	NA	NA	NA	NA	C14orf93	10465	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	24163763	24164098	24163827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS2	66439	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.4499167281683
chr14	24712544	24712898	24712739	Y	DHRS4L1,DCAF11,DCAF11,PSME1,RNF31,IRF9,RIPK3,LTB4R,KHNYN,CIDEB,TINF2	TM9SF1,CHMP4A,MDP1,NEDD8-MDP1,GMPR2,NEDD8,TINF2,TGM1,RABGGTA	NA	NA	NA	NA	TINF2	2664	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	24743214	24743836	24743517	Y	DCAF11,PSME1,IRF9,KHNYN,TINF2	NEDD8-MDP1,GMPR2,NEDD8,TINF2,TGM1,RABGGTA,DHRS1	NA	NA	NA	NA	RABGGTA	4269	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	24755187	24755313	24755250	Y	DHRS4L1	TINF2,TGM1,RABGGTA,DHRS1	NA	NA	NA	NA	DHRS1	11726	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	24861663	24861718	24861669	Y	IPO4,RABGGTA,RABGGTA	NFATC4,NYNRIN,KHNYN,SDR39U1	NA	NA	NA	NA	NYNRIN	4274	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	24988131	24988270	24988206	Y	CTSG,CMA1	NA	NA	NA	NA	NA	SDR39U1	78020	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	26369871	26369995	26369970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2P6	635329	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	27631441	27631502	27631472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOVA1	566481	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	28957970	28957982	28957974	Y	NA	RPL26P3	NA	NA	NA	NA	RPL26P3	854	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	29228603	29228912	29228757	Y	FOXG1	FOXG1	NA	NA	NA	NA	FOXG1	4138	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	29345370	29345639	29345447	Y	FOXG1	CTD-2384A14.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2384A14.1	47920	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	31360303	31360625	31360494	Y	NA	COCH	NA	NA	NA	NA	COCH	18583	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	31455672	31455729	31455709	Y	NA	AP4S1,STRN3	NA	NA	NA	NA	AP4S1	36583	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	31698850	31699225	31699035	Y	STRN3	HECTD1	AP4S1,HECTD1,STRN3,HEATR5A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HECTD1	23840	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	32420109	32420203	32420156	Y	NA	NA	AKAP6	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP5	123117	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr14	32670916	32671247	32671221	Y	NA	NA	NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AKAP6	125232	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr14	34479811	34480147	34480032	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSA	449415	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	34801443	34801630	34801553	Y	NA	NA	SPTSSA	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	127932	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	34837330	34837452	34837391	Y	NA	NA	SPTSSA	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SPTSSA	92110	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	35084533	35084797	35084665	Y	EAPP	RPS19P3,SNX6	NA	NA	NA	NA	SNX6	12592	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr14	35090811	35090907	35090859	Y	NA	SNX6	NA	NA	NA	NA	SNX6	6482	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr14	35120187	35120582	35120411	Y	SNX6,SNX6	SNX6	SNX6,BAZ1A,CFL2,PPP2R3C	IMR90	Hi-C	24141950	SNX6	22798	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	4.24618470392145
chr14	35250371	35250766	35250653	Y	SRP54,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	NA	CFL2	68342	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	35353391	35353625	35353508	Y	NA	RP11-73E17.2,BAZ1A	BAZ1A,SRP54,SNX6,CFL2,IGBP1P1,FAM177A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BAZ1A	10538	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	35575000	35575033	35575017	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	PPP2R3C	14690	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	35628271	35628433	35628369	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	38516	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr14	35755529	35755685	35755573	Y	BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,NFKBIA,PSMA6	PSMA6	NA	NA	NA	NA	PSMA6	9690	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	35800965	35801124	35801022	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMA6	55126	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	35801463	35801750	35801570	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	54525	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr14	35869907	35870271	35870165	Y	FAM177A1,PPP2R3C,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	1684	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	35875293	35875611	35875452	Y	NA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	3338	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	36073737	36073816	36073791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	201782	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	37317346	37317701	37317507	Y	NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1	NA	NA	NA	NA	NA	PAX9	192573	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr14	37465189	37465490	37465428	Y	NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A21	174581	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	37586141	37586465	37586450	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A21	53606	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	38052089	38052429	38052199	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPOL1	386971	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	38057887	38058022	38057995	Y	FOXA1	NA	NA	NA	NA	NA	MIPOL1	392769	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	39958924	39958943	39958934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	59220	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr14	41099089	41099243	41099183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	1199385	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.58913701458625
chr14	45554390	45554749	45554468	Y	NA	KLHL28,PRPF39,FKBP3,FANCM	NA	NA	NA	NA	PRPF39	3088	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	45723245	45723364	45723320	Y	NA	MIS18BP1	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	2502	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	46620797	46620809	46620803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	900054	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	48184413	48184780	48184597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL13AP2	516106	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	50237132	50237443	50237218	Y	KLHDC2	KLHDC2	NA	NA	NA	NA	KLHDC2	4806	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	50328432	50328642	50328440	Y	METTL21D,ARF6,RPL36AL,DNAAF2	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	10511	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	50328882	50329315	50329091	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	10961	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.4855715340028
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.2784405728359
chr14	50439731	50439867	50439806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	66080	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	50465888	50466432	50466066	Y	NA	RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	39515	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	50467375	50468846	50468075	Y	RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D	RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	37101	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr14	50475850	50475934	50475889	Y	ARF6,C14orf182	RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	30013	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr14	50799629	50799645	50799635	Y	NA	ATP5S,L2HGDH	NA	NA	NA	NA	L2HGDH	22363	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	51410207	51410388	51410282	Y	NIN,PYGL	PYGL	NA	NA	NA	NA	PYGL	753	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	52547300	52547782	52547649	Y	NA	NID2	NID2,C14orf166,TXNDC16	IMR90	Hi-C	24141950	NID2	13588	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	52584121	52584359	52584179	Y	NA	NA	NID2,C14orf166	IMR90	Hi-C	24141950	NID2	50409	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	53533673	53533892	53533783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDHD1	84108	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	54954614	54954684	54954648	Y	NA	GMFB,CGRRF1	NA	NA	NA	NA	GMFB	700	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr14	55116749	55117607	55117330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	84934	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	55173516	55173842	55173679	Y	SAMD4A	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	141701	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr14	55439267	55439511	55439438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDHD1	52312	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	55541499	55541595	55541574	Y	NA	WDHD1,SOCS4,MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	25150	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	55544097	55544118	55544108	Y	NA	MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	27748	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	55544307	55544654	55544518	Y	NA	MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	27958	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr14	55565587	55565828	55565708	Y	NA	MAPK1IP1L,LGALS3	LGALS3,DLGAP5	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	23000	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	12.7385541117644
chr14	55765939	55766288	55766115	Y	GCH1	FBXO34,RP11-665C16.6	NA	NA	NA	NA	RP11-665C16.6	29146	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	56047594	56047945	56047904	Y	NA	KTN1,KTN1-AS1	NA	NA	NA	NA	KTN1-AS1	2766	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	57282014	57282348	57282082	Y	OTX2,OTX2	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC5	451378	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	57459148	57459304	57459264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC5	274422	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr14	59744882	59745126	59745004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAAM1	91518	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	59768078	59768328	59768116	Y	RTN1,DAAM1	NA	NA	NA	NA	NA	DAAM1	114714	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	60679186	60679974	60679676	Y	NA	DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2	NA	NA	NA	NA	PPM1A	30496	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	61108188	61108290	61108236	Y	NA	SIX1	NA	NA	NA	NA	SIX1	14687	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	61804524	61805115	61804707	Y	PRKCH	RP11-902B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	16988	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	61808896	61809049	61808907	Y	PRKCH	RP11-902B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	21360	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	61811731	61812149	61812030	Y	PRKCH	RP11-902B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	24195	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	61822624	61823005	61822699	Y	PRKCH	RP11-902B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	35088	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	61831813	61832066	61831889	Y	PRKCH	RP11-902B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	44277	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	61855306	61855686	61855500	Y	PRKCH	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	67770	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	61865216	61865457	61865337	Y	PRKCH	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	77680	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	61926511	61926958	61926677	Y	PRKCH	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	138975	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	61939634	61940081	61939867	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	152098	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	61946614	61946719	61946667	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	159078	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	61969529	61970113	61969734	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	181993	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr14	61978878	61979019	61978952	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	181212	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr14	61985151	61985397	61985317	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	174834	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	62015577	62015884	62015776	Y	PRKCH	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	144347	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	62061169	62061631	62061310	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	98600	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	62298450	62298645	62298529	Y	NA	COX4I1P1	PRKCH,FLJ22447,HIF1A-AS2,HIF1A,SNAPC1	IMR90	Hi-C	24141950	COX4I1P1	1363	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	63983921	63984319	63984190	Y	NA	PPP2R5E	NA	NA	NA	NA	PPP2R5E	23773	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	64144701	64144896	64144792	Y	NA	WDR89,SGPP1	NA	NA	NA	NA	WDR89	38122	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	64170371	64170528	64170450	Y	NA	SGPP1	NA	NA	NA	NA	SGPP1	22229	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr14	64180685	64181078	64180882	Y	NA	SGPP1,RP11-804M7.2	NA	NA	NA	NA	SGPP1	11679	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	64185455	64185764	64185678	Y	PPP2R5E,SYNE2,WDR89,WDR89,SGPP1	SGPP1,RP11-804M7.2	NA	NA	NA	NA	SGPP1	6993	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr14	64214663	64214998	64214720	Y	SGPP1	SGPP1,RP11-804M7.2	NA	NA	NA	NA	RP11-804M7.2	11733	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	64279695	64279796	64279746	Y	NA	SYNE2	SYNE2	IMR90	Hi-C	24141950	SYNE2	37887	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr14	64320785	64320937	64320842	Y	PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	3102	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	64324216	64324732	64324422	Y	PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	6533	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	64670198	64670275	64670237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHFD1	182474	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	64705009	64705329	64705170	Y	PLEKHG3,SYNE2	NA	NA	NA	NA	NA	MTHFD1	147420	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	64968114	64968655	64968380	Y	ZBTB25,ZBTB1	AKAP5,ZBTB25,HSPA2	NA	NA	NA	NA	ZBTB1	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	64976158	64976191	64976175	Y	ZBTB25,ZBTB1	AKAP5,ZBTB1,ZBTB25,HSPA2	NA	NA	NA	NA	ZBTB25	6227	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	65169606	65170310	65170032	Y	NA	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	786	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	65172114	65172865	65172414	Y	SYNE2,ZBTB1,MAX,CHURC1,PLEKHG3	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	3294	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	65525721	65526064	65525893	Y	NA	MAX	NA	NA	NA	NA	MAX	41349	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	65710565	65711133	65711131	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAX	143152	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	65722117	65722532	65722424	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FUT8	152778	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr14	65746592	65747003	65746788	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90	Hi-C	24141950	FUT8	128307	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	65801624	65801887	65801778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	73423	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr14	66126309	66126626	66126333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	250999	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	66313303	66313471	66313387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	437993	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	66856568	66856818	66856763	Y	GPHN	NA	NA	NA	NA	NA	GPHN	115307	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	67562927	67563276	67562937	Y	TMEM229B,PLEKHH1	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	142550	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	67774949	67775062	67775003	Y	PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	49652	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	68320437	68320759	68320587	Y	ZFYVE26	ZFYVE26,RAD51B	NA	NA	NA	NA	RAD51B	35941	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	68407691	68408026	68407854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	123195	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	68408350	68408505	68408421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	123854	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	68431145	68431760	68431180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	146649	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	68529528	68529897	68529655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	245032	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	68607037	68607479	68607161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	322541	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	68634149	68634509	68634347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	349653	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	68666573	68666719	68666628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	382077	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	69013502	69013901	69013730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2325P2.4	79261	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	69053850	69054170	69053954	Y	NA	CTD-2325P2.4	NA	NA	NA	NA	CTD-2325P2.4	38992	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	69076965	69077322	69077310	Y	NA	CTD-2325P2.4	NA	NA	NA	NA	CTD-2325P2.4	15840	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	69149155	69149350	69149272	Y	ZFP36L1,DCAF5	NA	RAD51B,ZFP36L1	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2325P2.4	55993	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	69203432	69203557	69203504	Y	ZFP36L1,DCAF5	NA	RAD51B,ZFP36L1,ZFYVE26	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L1	57633	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr14	69576488	69576915	69576681	Y	NA	DCAF5	NA	NA	NA	NA	DCAF5	40952	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	69618210	69618757	69618360	Y	NA	DCAF5,EXD2	NA	NA	NA	NA	DCAF5	343	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr14	69851262	69851639	69851451	Y	NA	SLC39A9,ERH	NA	NA	NA	NA	SLC39A9	11093	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	69867695	69867997	69867846	Y	NA	SLC39A9,ERH	NA	NA	NA	NA	ERH	4351	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	70251267	70251371	70251319	Y	SLC10A1	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF5	59650	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	70251545	70251918	70251732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF5	59928	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	70387825	70388214	70387982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMOC1	68977	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	70803999	70804244	70804143	Y	NA	COX16	NA	NA	NA	NA	COX16	20204	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	70844763	70845165	70845114	Y	NA	COX16,SYNJ2BP-COX16,SYNJ2BP	NA	NA	NA	NA	COX16	20315	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	71132254	71132379	71132336	Y	TTC9	TTC9	NA	NA	NA	NA	TTC9	25750	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr14	71811948	71812060	71812004	Y	NA	SIPA1L1	SIPA1L1	IMR90	Hi-C	24141950	SIPA1L1	26782	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	71838643	71839069	71838909	Y	PCNX,SIPA1L1	NA	SIPA1L1	IMR90	Hi-C	24141950	SIPA1L1	53477	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	71839144	71839386	71839257	Y	PCNX,SIPA1L1	NA	SIPA1L1	IMR90	Hi-C	24141950	SIPA1L1	53978	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	73100225	73100572	73100516	Y	NA	NA	RGS6,DPF3	IMR90	Hi-C	24141950	DPF3	258237	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	74140666	74140779	74140723	Y	FAM161B	RP3-414A15.10,DNAL1,PNMA1	NA	NA	NA	NA	DNAL1	31088	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	74207610	74207866	74207660	Y	C14orf43	PNMA1,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	PNMA1	28482	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	74228325	74228451	74228378	Y	NUMB,ZNF410,C14orf43	PNMA1,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1021I20.1	23612	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	74235090	74235238	74235164	Y	C14orf43	RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1021I20.1	16825	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	74252099	74252503	74252342	Y	NA	RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1021I20.1	36	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr14	74918684	74918707	74918696	Y	NA	MIR4709,ISCA2,NPC2	VRTN	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4709	26200	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	75491919	75492089	75492033	Y	NA	EIF2B2,MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	24146	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	75607767	75608156	75607957	Y	FOS	RP11-950C14.7,NEK9,TMED10	NEK9	IMR90	Hi-C	24141950	NEK9	15720	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	75649674	75650038	75649826	Y	FOS	TMED10	TMED10,LOC731223,FOS,RPS6KL1,NEK9	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TMED10	8340	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr14	75655329	75655670	75655519	Y	FOS	TMED10	TMED10,LOC731223,FOS,JDP2	IMR90	Hi-C	24141950	TMED10	13995	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	75697272	75697400	75697329	Y	NA	RP11-293M10.2,RP11-293M10.1,FOS	TMED10,NEK9,LOC731223,ZC2HC1C,FOS,BATF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-293M10.2	26714	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	75721756	75722023	75721798	Y	NA	RP11-293M10.2,RP11-293M10.1,FOS,RP11-293M10.5	TMED10,RPS6KL1,EIF2B2,NEK9,LOC731223,FOS,JDP2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-293M10.2	2091	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	75761897	75762132	75762064	Y	FOS,JDP2,JDP2,JDP2,FLVCR2,FLVCR2	RP11-293M10.2,RP11-293M10.1,FOS,RP11-293M10.5	NA	NA	NA	NA	RP11-293M10.5	2790	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	76734272	76734379	76734290	Y	ESRRB	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB3	286938	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	76843326	76843356	76843341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-187O7.1	256648	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	77381505	77381598	77381569	Y	NA	RP11-488C13.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	30412	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	77428060	77428442	77428341	Y	NA	RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.1	4584	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	77431067	77431579	77431238	Y	NA	RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.1	1447	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr14	77554689	77554897	77554781	Y	NA	TMEM63C	KIAA1737,ANGEL1,C14orf166B,IRF2BPL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM63C	26014	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr14	77639599	77639692	77639653	Y	NA	NA	C14orf166B,ZDHHC22,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,TMEM63C,NGB,MIR1260A,TMED8	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM63C	58688	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	78031689	78031913	78031801	Y	SPTLC2	SPTLC2	NA	NA	NA	NA	SPTLC2	49203	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	79941274	79941440	79941360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIO2	910660	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	81484958	81485153	81484991	Y	TSHR	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	61097	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	SNORA79,DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.4855715340028
chr14	81867255	81867616	81867435	Y	GTF2A1,GTF2A1,STON2	STON2,RP11-299L17.3	NA	NA	NA	NA	STON2	33193	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.6570476893352
chr14	88884161	88884478	88884321	Y	NA	SPATA7	NA	NA	NA	NA	SPATA7	34893	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	89881748	89882141	89882044	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	125810	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	89935615	89935871	89935745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	147622	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	89959649	89959712	89959681	Y	TDP1,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	123781	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	90083286	90083622	90083526	Y	TDP1,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	90465200	90465384	90465297	Y	NA	EFCAB11,TDP1	NA	NA	NA	NA	TDP1	45917	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	90765988	90766106	90766043	Y	KCNK13	PSMC1	NA	NA	NA	NA	PSMC1	45149	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	90975200	90975474	90975336	Y	NA	NA	LOC400238,CALM1,C14orf102,TTC7B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CALM1	114354	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr14	91102939	91103218	91103079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7B	177605	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	91127365	91127751	91127558	Y	RPS6KA5,CALM1	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7B	153072	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	91269936	91270352	91270297	Y	NA	TTC7B	NA	NA	NA	NA	TTC7B	10471	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	91752749	91752962	91752855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	129226	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	91863961	91864070	91864025	Y	C14orf159,CCDC88C	CCDC88C	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	18118	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	91926776	91927002	91926960	Y	NA	CCDC88C,SMEK1	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	44588	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	92929701	92929788	92929745	Y	ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	RIN3	NA	NA	NA	NA	RIN3	48330	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	92970203	92970533	92970302	Y	ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	RIN3	NA	NA	NA	NA	RIN3	7585	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr14	93044640	93044810	93044725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIN3	66522	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	93121718	93122010	93121905	Y	ITPK1,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	NA	NA	NA	NA	NA	LGMN	91037	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	93552204	93552427	93552400	Y	NA	ITPK1	NA	NA	NA	NA	ITPK1	28238	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	95861859	95861987	95861923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLMN	77616	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	95946356	95946810	95946552	Y	NA	RP11-1070N10.3	NA	NA	NA	NA	RP11-1070N10.3	33663	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	95992355	95992583	95992552	Y	NA	RP11-1070N10.3,GLRX5,SCARNA13,SNHG10	NA	NA	NA	NA	GLRX5	5257	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	97043507	97043643	97043575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPOLA	77737	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	97465115	97465271	97465193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK1	203474	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	505578	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr14	99504493	99504629	99504577	Y	CCNK	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	440587	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	99713000	99713727	99713367	Y	BCL11B	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	231489	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	99827366	99827674	99827539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	117542	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr14	99934490	99934508	99934499	Y	EML1	SETD3,CCNK	NA	NA	NA	NA	SETD3	10708	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr14	100040610	100041006	100040947	Y	SETD3,CCDC85C	CCDC85C,RP11-543C4.1	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	27357	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr14	100045606	100045757	100045663	Y	CCDC85C	CCDC85C,RP11-543C4.1	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	22606	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr14	100071651	100072022	100071781	Y	NA	CCDC85C,RP11-543C4.1,HHIPL1	NA	NA	NA	NA	RP11-543C4.1	2758	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	100220531	100220629	100220588	Y	NA	EML1	CYP46A1,EML1	IMR90	Hi-C	24141950	EML1	18501	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	100478682	100479045	100478865	Y	NA	NA	EVL	IMR90	Hi-C	24141950	DEGS2	145455	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	100486645	100486967	100486738	Y	NA	NA	EVL,DEGS2	IMR90	Hi-C	24141950	DEGS2	137533	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	100495518	100495795	100495680	Y	NA	NA	EVL,YY1,DEGS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DEGS2	128705	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	100751761	100751840	100751790	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	19044	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr14	101151381	101151698	101151540	Y	RTL1,DLK1	NA	NA	NA	NA	NA	WARS	310239	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	101539526	101539734	101539702	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIO3OS	485034	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	102277268	102277494	102277347	Y	PPP2R5C,WDR20,DYNC1H1,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	51133	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	102340393	102340589	102340458	Y	PPP2R5C,WDR20,DYNC1H1,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	88276	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	5.3854049903394
chr14	102415545	102415736	102415629	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13129	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	102554875	102555215	102555129	Y	HSP90AA1	WDR20,HSP90AA1	NA	NA	NA	NA	WDR20	48625	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr14	102991046	102991386	102991124	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	16910	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr14	102991831	102991939	102991900	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	17695	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	103051810	103052039	103051996	Y	NA	RCOR1	TECPR2,TRAF3,RCOR1,AMN	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RCOR1	4959	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr14	103097343	103097523	103097412	Y	NA	RCOR1	NA	NA	NA	NA	RCOR1	40345	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	103112299	103112666	103112355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCOR1	55301	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	103221108	103221258	103221164	Y	NA	TRAF3	NA	NA	NA	NA	TRAF3	20555	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	103490121	103490395	103490347	Y	NA	CDC42BPB	NA	NA	NA	NA	CDC42BPB	31404	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	103672309	103672597	103672449	Y	EXOC3L4	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	84530	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	103673427	103673966	103673589	Y	CDC42BPB	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	85648	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr14	103781496	103782004	103781810	Y	EXOC3L4,TNFAIP2	EIF5	RCOR1,EIF5,MARK3,CDC42BPB,LOC100131366,TNFAIP2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EIF5	15877	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	104567152	104567615	104567473	Y	NA	ASPG,MIR203,KIF26A	NA	NA	NA	NA	MIR203	14127	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	104582105	104582467	104582315	Y	NA	ASPG,MIR203,KIF26A	NA	NA	NA	NA	MIR203	363	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr14	104583053	104583460	104583371	Y	NA	ASPG,MIR203,KIF26A	NA	NA	NA	NA	MIR203	1311	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	10.9779409418457
chr14	105144100	105144955	105144117	Y	GPR132,AKT1	INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	8988	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	105148231	105148612	105148591	Y	INF2	INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	5331	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr14	105154013	105154712	105154273	Y	ADSSL1	INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	70	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	105163052	105163361	105163217	Y	NA	INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	9109	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	105198821	105199110	105199005	Y	C14orf180,ADSSL1	INF2,ADSSL1,SIVA1	NA	NA	NA	NA	ADSSL1	10298	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr14	105327046	105327788	105327205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT1	66958	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.55348220875175
chr14	105435117	105435479	105435281	Y	KIAA0284	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	7215	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	105947921	105948133	105948082	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80	NA	NA	NA	NA	CRIP1	3403	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80	NA	NA	NA	NA	CRIP1	2511	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.8998334563366
chr14	106857348	106857526	106857389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00221	78919	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.2427857670014
chr14	107252931	107253417	107253022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00221	316486	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.41766085925385
chr14	107254436	107254688	107254673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00221	317991	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	20500145	20500389	20500187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-603B24.2	2043700	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	20596893	20597220	20597190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-603B24.2	1946869	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	20612710	20612766	20612738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-603B24.2	1931323	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	21905791	21906130	21906013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-603B24.2	637959	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.071309611669
chr15	22897960	22898211	22898128	Y	CYFIP1,CYFIP1	CYFIP1	NIPA2	IMR90	Hi-C	24141950	CYFIP1	7955	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	24114794	24115156	24114976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDN	184344	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	25563100	25563402	25563110	Y	SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	118726	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	25565589	25566847	25566046	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	115281	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr15	25577365	25577592	25577422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	104536	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	25586903	25587047	25586976	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	95081	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr15	25604152	25604594	25604190	Y	SNURF,SNRPN,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	77534	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	25608093	25608225	25608159	Y	SNURF,SNRPN	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	73903	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	25614491	25614606	25614563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	67522	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	25646289	25646668	25646556	Y	SNURF,SNRPN,UBE3A	UBE3A	NA	NA	NA	NA	UBE3A	35460	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	26327449	26327665	26327505	Y	NA	NA	ATP10A,LOC100128714	IMR90	Hi-C	24141950	ATP10A	219132	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr15	28233683	28233845	28233764	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OCA2	108659	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	29949236	29949642	29949365	Y	NA	RP11-680F8.1	NA	NA	NA	NA	RP11-680F8.1	15552	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr15	30022522	30022814	30022806	Y	FAM189A1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-680F8.1	57328	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	30213334	30213722	30213356	Y	NA	TJP1	TJP1,FAM189A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TJP1	45346	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	30216999	30217403	30217070	Y	TJP1	TJP1	TJP1,FAM189A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TJP1	41665	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr15	31372759	31373034	31372889	Y	MTMR10	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR10	90949	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr15	31693984	31694232	31694076	Y	NA	NA	KLF13	IMR90	Hi-C	24141950	KLF13	76926	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	34277588	34277641	34277608	Y	C15orf55	NA	NA	NA	NA	NA	AVEN	51736	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	34421770	34422050	34421910	Y	NA	PGBD4	NA	NA	NA	NA	PGBD4	29496	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	34639079	34639478	34639279	Y	NA	SLC12A6,NOP10,LPCAT4	NA	NA	NA	NA	NOP10	5701	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	35014105	35014549	35014217	Y	NA	NA	AQR,GJD2	IMR90	Hi-C	24141950	GOLGA8A,GOLGA8B	135401	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	35335893	35336175	35336034	Y	NA	NA	ATPBD4	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	57405	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	35361327	35361523	35361425	Y	NA	NA	ATPBD4,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	82839	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	35384953	35385239	35385081	Y	NA	NA	ATPBD4	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	106465	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr15	35588902	35588944	35588923	Y	NA	NA	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	310414	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	35590731	35591134	35590845	Y	NA	NA	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	312243	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr15	35650165	35650403	35650284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF770	371677	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	35803904	35804280	35804092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF770	525416	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	36720333	36720777	36720654	Y	NA	NA	ATPBD4,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	C15orf41	149035	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	36910960	36911073	36911017	Y	MEIS2,C15orf41	C15orf41	NA	NA	NA	NA	C15orf41	41148	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	37046763	37047120	37046943	Y	C15orf41	NA	NA	NA	NA	NA	C15orf41	176951	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	37207397	37207450	37207424	Y	C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-128A17.1	182090	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	39432449	39432903	39432696	Y	C15orf54	NA	THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	438377	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	39527316	39527429	39527373	Y	NA	NA	C15orf54	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	343851	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	39650604	39651044	39650772	Y	THBS1	NA	THBS1,C15orf53,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	220236	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr15	40077574	40077698	40077636	Y	NA	FSIP1	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	FSIP1	4543	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	40339886	40340243	40340062	Y	PLCB2,BMF,BMF,BMF	SRP14	NA	NA	NA	NA	SRP14	10497	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	40373777	40374114	40374053	Y	FSIP1,BAHD1,BMF,BMF,BMF	SRP14,BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	24979	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	40463815	40464014	40463832	Y	NA	BUB1B,PAK6	NA	NA	NA	NA	BUB1B	12591	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	40601054	40601299	40601247	Y	BMF,BMF,C15orf57,BAHD1,PLCB2	ANKRD63,C15orf52,PHGR1,DISP2	PAK6	K562	ChIA-PET	22265404	ANKRD63	28267	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	40728458	40728872	40728667	Y	NA	IVD,BAHD1,CHST14	NA	NA	NA	NA	BAHD1	1048	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	40803808	40804249	40803896	Y	NA	CHST14	NA	NA	NA	NA	CHST14	42648	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	41074954	41075332	41075143	Y	NA	GCHFR,ZFYVE19,DNAJC17,PPP1R14D	NA	NA	NA	NA	GCHFR	20736	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	41138213	41138409	41138269	Y	RHOV,SPINT1,SPINT1	ZFYVE19,DNAJC17,PPP1R14D,SPINT1,RHOV,VPS18	NA	NA	NA	NA	SPINT1	3997	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	41203373	41203552	41203463	Y	NA	RHOV,VPS18,DLL4,CHAC1	DLL4	IMR90	Hi-C	24141950	DLL4	15986	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	41878002	41878382	41878246	Y	NA	RPAP1,TYRO3	NA	NA	NA	NA	TYRO3	30129	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	NA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	TYRO3	106045	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	42091432	42091661	42091502	Y	NA	MAPKBP1,JMJD7,PLA2G4B,JMJD7-PLA2G4B	NA	NA	NA	NA	JMJD7,PLA2G4B	26622	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	42221521	42221787	42221671	Y	MGA	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	40989	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	42228791	42229215	42228969	Y	MGA,JMJD7,TMEM87A,EHD4	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	33561	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	42232566	42232958	42232887	Y	EHD4	EHD4	SPTBN5	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	29818	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	42349424	42349982	42349743	Y	MGA,JMJD7,EHD4,VPS39,TMEM87A,SNAP23	NA	PLA2G4E	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	86648	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr15	42814906	42815063	42814960	Y	NA	SNAP23,LRRC57,HAUS2	NA	NA	NA	NA	LRRC57	23937	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	43356735	43357067	43356746	Y	NA	UBR1,RPS3AP47	NA	NA	NA	NA	UBR1	39244	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	43415014	43415563	43415337	Y	NA	UBR1,RPS3AP47,TMEM62	NA	NA	NA	NA	TMEM62	1537	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	44161980	44162105	44162047	Y	NA	MFAP1,WDR76,PIN4P1	NA	NA	NA	NA	PIN4P1	4337	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	44760894	44761150	44760908	Y	NA	CTDSPL2	NA	NA	NA	NA	CTDSPL2	43462	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	44837233	44837387	44837300	Y	CTDSPL2,PATL2	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	9978	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	44838663	44839045	44838853	Y	NA	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	11408	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr15	44901910	44902120	44902015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPG11	51756	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	44954800	44955080	44954968	Y	CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11	SPG11,PATL2,B2M	NA	NA	NA	NA	SPG11	924	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr15	44965907	44966042	44965975	Y	PATL2	SPG11,PATL2,B2M	NA	NA	NA	NA	SPG11	12031	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	45748469	45749175	45748989	Y	SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN	C15orf48	NA	NA	NA	NA	C15orf48	27742	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	5.1782740291725
chr15	45784407	45784611	45784453	Y	C15orf48,SQRDL,PLDN	SLC30A4	NA	NA	NA	NA	SLC30A4	28394	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	47659982	47660177	47660079	Y	SEMA6D,SEMA6D	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA6D	185684	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	5.5925359515063
chr15	47821798	47822190	47821994	Y	SEMA6D	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2270N23.1	198942	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	47894451	47894745	47894501	Y	SEMA6D,SEMA6D	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2270N23.1	126387	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr15	47979261	47979603	47979432	Y	MYEF2	CTD-2270N23.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2270N23.1	41529	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.2427857670014
chr15	48104672	48105061	48104769	Y	NA	NA	SEMA6D	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2270N23.1	83540	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr15	48289986	48290099	48290023	Y	SLC24A5	NA	SEMA6D,SLC12A1	IMR90	Hi-C	24141950	MYEF2	178615	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	48975243	48975418	48975260	Y	NA	FBN1	FBN1,SHC4,CEP152	IMR90	Hi-C	24141950	FBN1	39197	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	49087141	49087279	49087204	Y	NA	CEP152	NA	NA	NA	NA	CEP152	14064	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	49488021	49488225	49488024	Y	NA	GALK2,COPS2	NA	NA	NA	NA	COPS2	42163	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	50201915	50201939	50201930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2647E9.1	117472	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	50620432	50620711	50620437	Y	NA	GABPB1-AS1,GABPB1	NA	NA	NA	NA	GABPB1-AS1	24814	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	50793550	50793719	50793635	Y	USP8,TRPM7	NA	NA	NA	NA	NA	USP8	78973	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	50876708	50877085	50876843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPM7	99927	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	50995097	50995499	50995351	Y	SPPL2A	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	18085	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	52153526	52153874	52153708	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	33701	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	52228372	52228625	52228515	Y	NA	MAPK6,LEO1	NA	NA	NA	NA	MAPK6	13678	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.2427857670014
chr15	52330351	52330361	52330356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2184D3.1	55131	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	52587042	52587046	52587044	Y	NA	MYO5C	NA	NA	NA	NA	MYO5C	1047	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	52797123	52797448	52797286	Y	NA	MYO5A	NA	NA	NA	NA	MYO5A	21799	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	53010328	53010576	53010452	Y	NA	FAM214A	MYO5C,FAM214A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM214A	10314	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	55463152	55463211	55463182	Y	NA	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	24054	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	55487983	55488563	55488357	Y	RAB27A,PIGB,RSL24D1	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	718	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	55581016	55581448	55581368	Y	RAB27A,PIGB,CCPG1,CCPG1	PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1	NA	NA	NA	NA	PIGB	27710	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	55986919	55987071	55986980	Y	NA	PRTG	NA	NA	NA	NA	PRTG	46217	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	56332751	56332969	56332911	Y	NA	NEDD4	NEDD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD4	48807	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr15	56513902	56514185	56514176	Y	NA	RFX7,TEX9	NA	NA	NA	NA	RFX7	19298	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	57261737	57262096	57261746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF12	52916	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	57798359	57798473	57798399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCOM1	83633	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr15	58605616	58605894	58605707	Y	NA	NA	LIPC,FAM63B,ADAM10	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH1A2	182171	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	58733027	58733372	58733200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH1A2	54693	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	58761932	58762090	58762054	Y	NA	ALDH1A2	ADAM10	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH1A2	25975	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	58843747	58844122	58843864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH1A2	55682	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	58884938	58885321	58885256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH1A2	96873	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	58898092	58898418	58898348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH1A2	110027	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	59085961	59086460	59086218	Y	NA	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	FAM63B	24570	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.071309611669
chr15	59138361	59138756	59138559	Y	NA	RNF111	NA	NA	NA	NA	RNF111	16618	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	60818402	60818756	60818740	Y	RORA	NARG2,RP11-219B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	49025	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	60839009	60839501	60839122	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	69632	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	61113423	61113507	61113465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	344046	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	61501689	61502023	61501856	Y	NA	RORA	NA	NA	NA	NA	RORA	17495	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	61520020	61520614	61520340	Y	RORA	RORA	NA	NA	NA	NA	RORA	502	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	62896766	62896914	62896838	Y	NA	NA	TLN2	IMR90	Hi-C	24141950	TLN2	216041	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	63142999	63143362	63143082	Y	NA	RP11-1069G10.2	NA	NA	NA	NA	RP11-1069G10.2	42649	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	63427902	63428515	63428147	Y	USP3,RAB8B,LACTB	LACTB,RPS27L	NA	NA	NA	NA	LACTB	15903	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	63795379	63795825	63795543	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	586	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	63871063	63871418	63871089	Y	NA	USP3-AS1	NA	NA	NA	NA	USP3-AS1	20370	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	64000367	64000635	64000532	Y	USP3,HERC1	NA	NA	NA	NA	NA	USP3-AS1	108579	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	64722485	64722825	64722650	Y	NA	KIAA0101,TRIP4,ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	28116	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	64991554	64991938	64991797	Y	NA	OAZ2	NA	NA	NA	NA	OAZ2	1542	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.8641786505021
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.6570476893352
chr15	65657580	65657851	65657711	Y	NA	IGDCC3	NA	NA	NA	NA	IGDCC3	10527	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr15	65713781	65714189	65713985	Y	IGDCC3,IGDCC4	IGDCC3,IGDCC4	NA	NA	NA	NA	IGDCC4	371	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	65951559	65951691	65951625	Y	NA	SLC24A1	NA	NA	NA	NA	SLC24A1	49855	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr15	66162838	66163256	66163114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80207	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr15	66177095	66177419	66177152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	94464	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	66707547	66707736	66707571	Y	MAP2K1	TIPIN,MAP2K1	RPL4,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K1	30392	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr15	66993287	66993569	66993487	Y	MAP2K1,SMAD6	NA	NA	NA	NA	NA	RPL4	178417	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	67095524	67095803	67095671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	258298	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	67341124	67341334	67341261	Y	NA	SMAD3	SMAD3,IQCH,LOC100506686,AAGAB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD3	12767	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	68132387	68132778	68132514	Y	PIAS1	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	211739	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr15	68207456	68207574	68207516	Y	NA	NA	CALML4,CLN6,PIAS1,LOC100506686,IQCH	IMR90	Hi-C	24141950	PIAS1	136943	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	68265864	68265976	68265920	Y	NA	NA	PIAS1,LOC100506686,C15orf61,IQCH	IMR90	Hi-C	24141950	PIAS1	78541	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	68366463	68366575	68366519	Y	NA	PIAS1	NA	NA	NA	NA	PIAS1	21946	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	68441418	68441688	68441529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	96901	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	69114506	69114876	69114758	Y	NA	SPESP1,ANP32A	NA	NA	NA	NA	ANP32A	3270	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	69724089	69724530	69724231	Y	NA	KIF23,RP11-253M7.1,RPLP1	NA	NA	NA	NA	RPLP1	18593	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	70073189	70073508	70073349	Y	TLE3	NA	NA	NA	NA	NA	TLE3	315007	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	70436319	70436687	70436503	Y	NA	TLE3	LOC145837,TLE3,C15orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TLE3	47804	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	72101101	72101317	72101168	Y	NR2E3	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	303282	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	72124774	72125030	72124885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	279569	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	72198564	72199008	72198773	Y	PARP6,MYO9A,CELF6,CELF6,CELF6	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	205591	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	72265573	72265641	72265607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	138958	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	72270951	72271133	72271042	Y	GRAMD2	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	133466	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	72318611	72318818	72318715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	85781	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	72518614	72519346	72519221	Y	ARIH1,PKM2	GRAMD2	NA	NA	NA	NA	GRAMD2	30488	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	72617371	72617435	72617389	Y	MYO9A,SENP8,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6	HEXA	NA	NA	NA	NA	HEXA	49382	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	73939698	73939908	73939794	Y	NA	NPTN,CD276	C15orf60	IMR90	Hi-C	24141950	NPTN	15223	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.4499167281683
chr15	73983569	73983946	73983758	Y	NA	CD276	NA	NA	NA	NA	CD276	9262	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	74661495	74661657	74661620	Y	NA	CYP11A1	NA	NA	NA	NA	CYP11A1	3414	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	74666695	74666987	74666837	Y	CLK3,ARID3B	CYP11A1	NA	NA	NA	NA	CYP11A1	8614	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr15	74683456	74683642	74683549	Y	SEMA7A,SEMA7A,CLK3,ARID3B	CYP11A1,SEMA7A	NA	NA	NA	NA	CYP11A1	25375	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	74693719	74694069	74694004	Y	NA	CYP11A1,SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	30739	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr15	74834290	74834419	74834369	Y	ULK3,CSK,CLK3,ARID3B	ARID3B	NA	NA	NA	NA	ARID3B	2772	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	74899091	74899429	74899332	Y	PPCDC,CLK3,CLK3	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	10250	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	74930641	74931010	74930809	Y	ARID3B,CSK	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	41800	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	75018665	75019349	75018947	Y	SCAMP2,C15orf39,CYP1A1	EDC3,CYP1A1	NA	NA	NA	NA	CYP1A1	2714	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.4499167281683
chr15	75328661	75328897	75328778	Y	MAN2C1,C15orf39	PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	14765	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	75398506	75398605	75398540	Y	MAN2C1,CLK3,C15orf39	NA	C15orf39	MCF7	ChIA-PET	22265404	PPCDC	84610	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	75404629	75405178	75404816	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,C15orf39	NA	SCAMP5,PPCDC,C15orf39	IMR90	Hi-C	24141950	C15orf39	80806	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	75430605	75430778	75430735	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,C15orf39	NA	PPCDC,RPP25,C15orf39,SCAMP5	IMR90	Hi-C	24141950	C15orf39	55206	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	75470847	75471095	75470955	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CSK,C15orf39	C15orf39	C15orf39	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C15orf39	14889	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	76050803	76051078	76050853	Y	NA	CSPG4,ODF3L1,DNM1P35,RP11-24M17.5	NA	NA	NA	NA	RP11-24M17.5	14816	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	76218014	76218024	76218019	Y	NA	FBXO22	NA	NA	NA	NA	FBXO22	23814	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	76543637	76543996	76543963	Y	NA	NA	C15orf27	IMR90	Hi-C	24141950	ETFA	57817	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	76639120	76639380	76639270	Y	NA	ETFA,ISL2	NA	NA	NA	NA	ISL2	12055	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr15	76639629	76639850	76639740	Y	NA	ETFA,ISL2	NA	NA	NA	NA	ISL2	12564	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	76819835	76820201	76820099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISL2	192770	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	77055500	77055901	77055892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAPER	139884	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	77579824	77580262	77579914	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEAK1	130224	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	77785821	77785911	77785867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMG20A	75067	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	78110975	78112297	78111796	Y	HMG20A,LINGO1,DNAJA4,ACSBG1	NA	NA	NA	NA	NA	LINGO1	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	78343418	78343565	78343498	Y	IREB2,TBC1D2B	TBC1D2B,SNORA63	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	24501	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	78356048	78356390	78356219	Y	NA	TBC1D2B,SNORA63	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	11676	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	78357095	78357144	78357119	Y	NA	TBC1D2B,SNORA63	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	10922	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	78535918	78535943	78535931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR61	54193	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	79234527	79234916	79234688	Y	CTSH	CTSH	NA	NA	NA	NA	CTSH	5000	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	79315517	79315838	79315652	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASGRF1	65277	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	80211506	80211893	80211588	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1614	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	80211933	80212232	80212185	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1275	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr15	81219891	81220152	81220022	Y	STARD5	NA	NA	NA	NA	NA	MESDC2	60067	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	82050341	82050360	82050353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEX3B	286122	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	82170277	82170527	82170385	Y	NA	NA	EFTUD1	IMR90	Hi-C	24141950	MEX3B	165955	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	82374943	82375242	82374985	Y	NA	MEX3B	MEX3B,EFTUD1	IMR90	Hi-C	24141950	MEX3B	38461	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	83712711	83713060	83712967	Y	NA	C15orf40,BTBD1	C15orf40	IMR90	Hi-C	24141950	BTBD1	21046	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	83731534	83731663	83731576	Y	WHAMM,BTBD1	BTBD1	NA	NA	NA	NA	BTBD1	2443	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	83954950	83955303	83955151	Y	BNC1	BNC1	NA	NA	NA	NA	BNC1	3484	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	84118150	84118486	84118331	Y	NA	SH3GL3	NA	NA	NA	NA	SH3GL3	4170	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr15	85290443	85290837	85290532	Y	PDE8A,ZNF592	SEC11A,ZNF592	NA	NA	NA	NA	ZNF592	577	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	85645018	85645768	85645040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	123347	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	85890027	85890200	85890120	Y	AKAP13	AKAP13	AKAP13	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP13	31602	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr15	85921275	85921668	85921378	Y	NA	AKAP13	NA	NA	NA	NA	AKAP13	134	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	85951204	85951442	85951357	Y	AKAP13,PDE8A,AKAP13	AKAP13	NA	NA	NA	NA	AKAP13	29402	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	85956762	85957097	85956878	Y	AKAP13,PDE8A	AKAP13	NA	NA	NA	NA	AKAP13	34960	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	85987048	85987479	85987219	Y	AKAP13,AKAP13	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	65246	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr15	86165783	86166027	86165915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	170234	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	86211201	86211615	86211423	Y	AKAP13,KLHL25	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	124646	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	86315137	86315409	86315289	Y	KLHL25	KLHL25	NA	NA	NA	NA	KLHL25	20852	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	89532902	89533939	89533555	Y	NA	NA	MFGE8,ABHD2	IMR90	Hi-C	24141950	MFGE8	78260	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	89856537	89857272	89856853	Y	NA	POLG	NA	NA	NA	NA	POLG	18820	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	89923171	89923194	89923182	Y	NA	POLG,MIR9-3	NA	NA	NA	NA	MIR9-3	13923	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr15	90418263	90418454	90418325	Y	NA	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	17120	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	90419728	90419914	90419806	Y	ZNF710,SEMA4B,ANPEP,AP3S2	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	15660	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	90436374	90436604	90436501	Y	NA	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	800	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	90547619	90547737	90547660	Y	ANPEP,IQGAP1,ZNF710	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	4995	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	90581471	90581912	90581727	Y	AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	38847	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	90641433	90641611	90641526	Y	NA	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	2125	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	90669829	90670140	90669985	Y	NA	IDH2,SEMA4B	IQGAP1,IDH2,MESP1,SEMA4B,C15orf58,CIB1,NGRN,TTLL13,ZNF710,C15orf38-AP3S2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IDH2	26093	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr15	90754464	90755447	90755260	Y	SEMA4B,SEMA4B,CIB1	CIB1	NA	NA	NA	NA	CIB1	19832	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	90944087	90944636	90944284	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	14637	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	90950706	90950784	90950761	Y	FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	21256	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	90951105	90951410	90951208	Y	FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	21655	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	90955763	90956502	90956124	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	26313	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.13922028641795
chr15	90956663	90957019	90956743	Y	NA	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	27213	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	4.142619223338
chr15	90958026	90958305	90958134	Y	ZNF710,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	28576	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	91208661	91208996	91208948	Y	NA	RP11-387D10.2,BLM	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	49376	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr15	91412875	91413318	91412960	Y	IQGAP1,FURIN,UNC45A,FES,FES,FES	CTD-3094K11.1,FURIN,FES,MAN2A2	NA	NA	NA	NA	FURIN	3053	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	92486040	92486252	92486096	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	91115	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	92486330	92486707	92486433	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	91405	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr15	92490454	92490951	92490737	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	95529	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	92612839	92613223	92613006	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P5	213848	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	92674353	92674494	92674375	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P5	152577	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	93131436	93131762	93131609	Y	RGMA,C15orf32,FAM174B	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN1P38	121215	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	93344993	93345488	93345070	Y	CHD2	FAM174B	NA	NA	NA	NA	FAM174B	5626	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	93347056	93347810	93347183	Y	CHD2	FAM174B	NA	NA	NA	NA	FAM174B	3304	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	93354824	93354998	93354897	Y	CHD2	FAM174B	NA	NA	NA	NA	FAM174B	3710	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	FAM174B	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	FAM174B	12383	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr15	93365801	93366193	93365997	Y	NA	FAM174B	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	FAM174B	14687	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	93374780	93375598	93375185	Y	NA	FAM174B,CHD2	CHD2,LOC100507217,ASB9P1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM174B	23666	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr15	93458042	93458417	93458141	Y	NA	CHD2,MIR3175	NA	NA	NA	NA	MIR3175	12413	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	93603832	93604174	93604003	Y	NA	RGMA	NA	NA	NA	NA	RGMA	26259	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	95388455	95388700	95388578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP2	615688	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	96807705	96807805	96807755	Y	NA	NA	LOC400456	IMR90	Hi-C	24141950	NR2F2	59362	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	96867031	96867104	96867071	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1	NA	NA	NA	NA	NR2F2	63	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr15	96872860	96873000	96872921	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	4270	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	96884042	96884481	96884402	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	15452	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	96890448	96891058	96890571	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	21858	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	96896232	96896529	96896359	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	27642	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	97129304	97129480	97129390	Y	NA	NA	NR2F2	MCF7	ChIA-PET	22265404	NR2F2-AS1	260714	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	99395486	99396002	99395689	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	205286	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	99408611	99408985	99408683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	218411	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	99409255	99409515	99409377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	219055	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	99703355	99703683	99703484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNM	66935	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	99914657	99915195	99914962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2A	100175	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	100216338	100216615	100216373	Y	MEF2A,MEF2A	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD4	55151	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	100782475	100782658	100782574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS17	97552	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	101783359	101783726	101783540	Y	CHSY1	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	6411	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	101979646	101980007	101979833	Y	PCSK6	NA	NA	NA	NA	NA	PCSK6	83398	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr15	102023301	102023573	102023437	Y	NA	PCSK6	NA	NA	NA	NA	PCSK6	39832	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr16	121563	121849	121614	Y	TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	RHBDF1	2505	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr16	130955	131250	131103	Y	NA	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	MPG	5949	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	154913	155267	155125	Y	NHLRC4,HBQ1,HBM	RHBDF1,MPG,NPRL3	NA	NA	NA	NA	MPG	29907	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	369599	369830	369715	Y	NA	RGS11,PDIA2,AXIN1,MRPL28	NA	NA	NA	NA	AXIN1	30843	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	374352	374895	374583	Y	RHOT2,NHLRC4,AXIN1,LUC7L	PDIA2,AXIN1,MRPL28	NA	NA	NA	NA	AXIN1	25778	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr16	381616	381944	381764	Y	NHLRC4,HAGHL,AXIN1	AXIN1,MRPL28	NA	NA	NA	NA	AXIN1	18729	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr16	643606	643989	643708	Y	SSTR5,RAB40C,RAB40C	PIGQ,RAB40C,C16orf13,FAM195A	NA	NA	NA	NA	RAB40C	6249	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	1344323	1344595	1344461	Y	NA	UBE2I,BAIAP3	UNKL	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2I	8953	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	1347371	1347380	1347376	Y	NA	UBE2I,BAIAP3	NA	NA	NA	NA	UBE2I	6168	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	1349375	1349723	1349678	Y	NA	UBE2I,BAIAP3	NA	NA	NA	NA	UBE2I	3825	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	1381826	1382192	1381930	Y	UNKL,SPSB3,MAPK8IP3,EME2,BAIAP3,BAIAP3	UBE2I,BAIAP3,GNPTG	NA	NA	NA	NA	BAIAP3	224	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr16	1696376	1696557	1696439	Y	NA	IFT140,CRAMP1L,HN1L	NA	NA	NA	NA	HN1L	29700	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	2057211	2057401	2057386	Y	NA	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,NPW,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598	423	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	2478608	2478672	2478640	Y	RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2	CCNF,C16orf59,TBC1D24	NA	NA	NA	NA	CCNF	1213	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr16	2518760	2519270	2519088	Y	RAB26,E4F1,SRRM2,C16orf59,TBC1D24,NTN3	CCNF,C16orf59,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2	NA	NA	NA	NA	TBC1D24	3877	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	2582505	2583298	2582685	Y	RAB26,E4F1,SRRM2,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,CEMP1,PDPK1	ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1	NA	NA	NA	NA	PDPK1	2667	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.34635124758485
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRSS22	11760	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr16	3031604	3031823	3031757	Y	PAQR4	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1	NA	NA	NA	NA	PKMYT1	3064	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	3053798	3054225	3053960	Y	NA	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1,CCDC64B	NA	NA	NA	NA	CLDN9	6232	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr16	3060017	3060177	3060084	Y	NAT15,PRSS22,CCDC64B,THOC6,CLDN9	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1,CCDC64B	NA	NA	NA	NA	CLDN9	280	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	IL32,RNU1-125P,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.00339893692005
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.4499167281683
chr16	3207486	3207903	3207712	Y	SRRM2,ZNF75A,ZNF597,ZNF200,ZNF200,ZNF200,NLRC3,MEFV	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	29708	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	3237977	3238591	3238121	Y	NA	ZNF200	ZNF200	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF200	45630	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	3285972	3286117	3286070	Y	PRSS22,ZSCAN10,ZNF200,ZNF200,ZNF200,ZNF75A,ZNF263	ZNF200,ZNF263	NA	NA	NA	NA	ZNF200	1751	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr16	3414643	3415237	3414919	Y	NA	MTRNR2L4,ZNF174	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L4	5046	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr16	3796349	3796366	3796358	Y	NA	TRAP1	NA	NA	NA	NA	TRAP1	30751	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	3908512	3908774	3908643	Y	NA	CREBBP	NA	NA	NA	NA	CREBBP	19953	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	4229194	4229369	4229282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	65008	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr16	4349200	4349352	4349284	Y	NA	TFAP4	ADCY9,TFAP4,CREBBP,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	28124	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr16	4357393	4358110	4357824	Y	CORO7	TFAP4,PAM16	ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	36317	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.2427857670014
chr16	4818680	4818913	4818758	Y	C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI	ANKS3,ZNF500,ROGDI	NA	NA	NA	NA	ZNF500	3055	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr16	4880649	4880773	4880729	Y	NA	ROGDI,UBN1,GLYR1	NA	NA	NA	NA	UBN1	13893	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr16	4993356	4993730	4993477	Y	PPL	PPL	UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPL	15012	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	6882597	6882937	6882663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1736788	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	9055639	9056008	9055791	Y	C16orf72,USP7	USP7	NA	NA	NA	NA	USP7	363	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	9147014	9147397	9147240	Y	ABAT	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	36108	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	9208363	9208890	9208559	Y	NA	C16orf72	NA	NA	NA	NA	C16orf72	24858	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	9325793	9326174	9325910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf72	142288	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	10221037	10221156	10221120	Y	ATF7IP2	NA	NA	NA	NA	NA	ATF7IP2	197135	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	10549193	10549271	10549232	Y	EMP2	NA	NA	NA	NA	NA	EMP2	123284	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	10563450	10564010	10563797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMP2	108545	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	10596760	10596940	10596850	Y	EMP2	NA	NA	NA	NA	NA	EMP2	75615	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	10672211	10672611	10672411	Y	ATF7IP2,EMP2	NA	NA	NA	NA	NA	EMP2	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	10710369	10710537	10710438	Y	NA	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	37814	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	11032093	11032474	11032340	Y	NA	DEXI,CLEC16A	NA	NA	NA	NA	DEXI	1843	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	11345704	11346020	11345999	Y	NA	RMI2,SOCS1	NA	NA	NA	NA	SOCS1	2016	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	11397402	11397565	11397484	Y	NA	SOCS1	CLEC16A,TNP2,RMI2,ZC3H7A,BCAR4,SOCS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SOCS1	49366	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	11484891	11485075	11484982	Y	NA	NA	BCAR4,LITAF,TXNDC11,SNN	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	136855	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	11666045	11666804	11666319	Y	ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,SNN,LITAF,LITAF	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	61433	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	11705983	11706695	11706338	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF	LITAF,TXNDC11,SNN,CLEC16A,RSL1D1,BCAR4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LITAF	21542	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	12008398	12008797	12008598	Y	NA	GSPT1	NA	NA	NA	NA	GSPT1	459	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	12071486	12071797	12071761	Y	NA	RP11-166B2.1,SNX29	NA	NA	NA	NA	SNX29	2892	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	14097024	14097356	14097296	Y	NA	NA	MKL2,ERCC4,MIR193B	IMR90	Hi-C	24141950	MKL2	65822	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	14326449	14326637	14326520	Y	MKL2	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	163271	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	14379572	14379808	14379698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	216394	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr16	14395683	14396371	14395873	Y	MKL2	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	232505	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr16	14397958	14398068	14398015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	234780	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	14423689	14423899	14423743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	260511	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	14472258	14472411	14472327	Y	NA	NA	PARN,MIR365A,MIR193B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARN	252174	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	14529113	14529156	14529135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	195429	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	14603035	14603210	14603110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	121375	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	14752031	14752218	14752119	Y	NA	PARN,BFAR	NA	NA	NA	NA	BFAR	27359	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	15140552	15140757	15140655	Y	NA	NTAN1	NA	NA	NA	NA	NTAN1	7164	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	15766632	15767024	15766843	Y	KIAA0430,NDE1,NDE1	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	31508	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	17257893	17258025	17257960	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	304713	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	17341896	17342078	17341982	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	220660	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr16	17472962	17473160	17473138	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	89578	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	17857901	17858183	17858087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	295163	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	18811720	18812078	18811899	Y	SMG1,COQ7,COQ7	RPS15A,ARL6IP1	NA	NA	NA	NA	ARL6IP1	720	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	19103583	19103758	19103655	Y	NA	COQ7,ITPRIPL2	NA	NA	NA	NA	ITPRIPL2	19496	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	19221625	19221975	19221736	Y	SMG1,COQ7	SYT17	NA	NA	NA	NA	SYT17	44332	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	20729381	20729771	20729568	Y	LYRM1,DCUN1D3	THUMPD1	NA	NA	NA	NA	THUMPD1	21635	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	20913163	20913441	20913303	Y	CRYM,DCUN1D3,LYRM1	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	3457	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	20922860	20922979	20922921	Y	CRYM,DCUN1D3,LYRM1	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	13154	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	22046502	22046742	22046619	Y	NA	C16orf52	NA	NA	NA	NA	C16orf52	29543	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	22207042	22207397	22207176	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K,C16orf52	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	8206	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	22229382	22229580	22229448	Y	NA	EEF2K	NA	NA	NA	NA	EEF2K	13779	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	23516061	23516396	23516252	Y	PRKCB,GGA2	GGA2,UBFD1	NA	NA	NA	NA	GGA2	14920	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	27265638	27265791	27265719	Y	KIAA0556,IL4R	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	12324	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	27297334	27297620	27297361	Y	NA	NSMCE1,IL4R	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	19219	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	27334573	27334825	27334616	Y	NA	IL4R	NA	NA	NA	NA	IL4R	11584	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr16	27532420	27532769	27532492	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	26465	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	27546889	27546978	27546937	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	12256	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr16	28179891	28180117	28180009	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	XPO6	NA	NA	NA	NA	XPO6	41124	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	28204572	28204722	28204690	Y	CCDC101,APOBR,XPO6,SBK1	XPO6	NA	NA	NA	NA	XPO6	16519	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	28496890	28497119	28497100	Y	NA	APOBR,CLN3	NA	NA	NA	NA	APOBR	6851	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	28543579	28543953	28543732	Y	EIF3CL,EIF3C,SPNS1,IL27	APOBR,CLN3,NUPR1,CCDC101	IL27	IMR90	Hi-C	24141950	NUPR1	4542	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr16	28871082	28871475	28871117	Y	NA	ATXN2L,TUFM,SH2B1	NA	NA	NA	NA	SH2B1	15161	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	29702683	29703007	29702845	Y	NA	QPRT	NA	NA	NA	NA	QPRT	30083	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	29709853	29709969	29709906	Y	QPRT	QPRT	NA	NA	NA	NA	QPRT	37253	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.6570476893352
chr16	30825606	30826012	30825883	Y	NA	ZNF629	ZNF629,RNF40,MIR4519	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF629	29083	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	30885980	30886229	30886174	Y	ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668	MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1	NA	NA	NA	NA	MIR4519	1336	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr16	30927821	30927845	30927833	Y	NA	MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1,ORAI3,SETD1A	NA	NA	NA	NA	FBXL19	4531	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr16	31905713	31906088	31906002	Y	ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	22634	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr16	33509690	33509798	33509723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	1626611	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.071309611669
chr16	34377841	34378195	34377988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2494762	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.2427857670014
chr16	34956727	34956933	34956830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	3073648	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr16	46776803	46777018	46776928	Y	MYLK3	MYLK3	ORC6,VPS35	K562	ChIA-PET	22265404	MYLK3	45301	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	46780849	46781142	46780994	Y	MYLK3	MYLK3	NA	NA	NA	NA	MYLK3	41177	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr16	46791398	46792001	46791737	Y	C16orf87,ORC6	MYLK3	MYLK3,C16orf87	IMR90	Hi-C	24141950	MYLK3	30318	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	46823783	46824029	46823881	Y	NA	MYLK3,C16orf87	NA	NA	NA	NA	MYLK3	1464	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr16	46839113	46839505	46839309	Y	NA	MYLK3,C16orf87	NA	NA	NA	NA	MYLK3	16794	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	48400459	48400723	48400564	Y	LONP2,N4BP1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	79590	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	48417730	48418013	48418003	Y	N4BP1,SIAH1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	62300	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	48545095	48545474	48545284	Y	SIAH1	NA	SIAH1,MIR548AE2,N4BP1	IMR90	Hi-C	24141950	SIAH1	64782	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	48592202	48592453	48592359	Y	SIAH1,N4BP1	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	59606	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	48593216	48593689	48593553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	58370	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	49542422	49542557	49542490	Y	ZNF423	NA	NA	NA	NA	NA	HEATR3	555295	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	50101332	50101352	50101341	Y	NA	HEATR3	NA	NA	NA	NA	HEATR3	3480	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	50229271	50229507	50229375	Y	NA	PAPD5	NA	NA	NA	NA	PAPD5	44442	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	52854151	52854308	52854232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-297L17.6	166935	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	53086726	53087108	53087065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	53517834	53518098	53518006	Y	NA	AKTIP	NA	NA	NA	NA	AKTIP	18225	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	55921292	55921652	55921472	Y	MMP2	NA	NA	NA	NA	NA	SLC6A2	233776	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	56406318	56406482	56406386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMFR	50968	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	56645516	56645845	56645554	Y	MT2A,MT1M,MT1E,MT1A	MT4,MT2A,MT1E,MT1A,MT1B,MT1F	NA	NA	NA	NA	MT2A	5405	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	57338123	57338348	57338237	Y	NA	PLLP	NLRC5,CPNE2,PLLP,CIAPIN1,FAM192A,RSPRY1,ARL2BP,COQ9,CX3CL1,CCL22,POLR2C,GPR114,CCDC102A	IMR90	Hi-C	24141950	PLLP	21524	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	57488914	57489209	57489062	Y	NA	COQ9,CIAPIN1,POLR2C,DOK4	NA	NA	NA	NA	POLR2C	5090	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	57518028	57518100	57518073	Y	DOK4	COQ9,CIAPIN1,POLR2C,DOK4	NA	NA	NA	NA	DOK4	1139	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.6570476893352
chr16	57655846	57656393	57655974	Y	FAM192A,COQ9,CIAPIN1,GPR56	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	13282	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr16	57670999	57671200	57671100	Y	GPR56,PLLP,CX3CL1,CCL17,GPR56	GPR56	NA	NA	NA	NA	GPR56	28435	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	57701111	57701632	57701437	Y	FAM192A,ZNF319,C16orf57,GPR97	CCDC135	NA	NA	NA	NA	CCDC135	25073	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr16	57717053	57717380	57717096	Y	FAM192A,ZNF319,GPR97	CCDC135	NA	NA	NA	NA	CCDC135	9325	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.55348220875175
chr16	58555953	58556233	58556187	Y	NA	SETD6	NA	NA	NA	NA	SETD6	8570	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	62230179	62230192	62230186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOT2	3463918	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	62889367	62889697	62889532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00920	3550730	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	63275323	63275660	63275492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00920	3164767	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	64377838	64377886	64377853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00920	2062541	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.34635124758485
chr16	65020062	65020376	65020219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00920	1420051	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	66587187	66587393	66587288	Y	NA	TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1,CMTM3	NA	NA	NA	NA	CKLF-CMTM1	2697	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	67186810	67187094	67186952	Y	NA	C16orf70,FBXL8,TRADD,HSF4,NOL3,KIAA0895L,E2F4,ELMO3	NA	NA	NA	NA	FBXL8	4740	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	67891676	67892114	67891889	Y	RLTPR,ACD,PSMB10,NFATC3,EDC4,THAP11	THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,NRN1L,PSKH1	NA	NA	NA	NA	CENPT	11962	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr16	67892470	67892795	67892734	Y	RLTPR,ACD,NFATC3,EDC4,THAP11	THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,NRN1L,PSKH1	NA	NA	NA	NA	EDC4	12131	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	68039646	68040046	68039896	Y	SLC7A6OS,RANBP10,PSMB10,DPEP2,NFATC3,DDX28	SLC12A4,DPEP3,DDX28	DPEP3,DPEP2	IMR90	Hi-C	24141950	DDX28	15724	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	68049692	68049950	68049796	Y	C16orf86,TSNAXIP1,SLC12A4,DPEP3	SLC12A4,DPEP3,DDX28	NA	NA	NA	NA	DDX28	5820	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	68113537	68113949	68113713	Y	SLC7A6OS,RLTPR,RANBP10,PSMB10,DPEP2,NFATC3	NFATC3	NA	NA	NA	NA	NFATC3	2705	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	68268995	68269119	68269015	Y	NA	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	886	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	1343	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.4499167281683
chr16	68303268	68303682	68303412	Y	THAP11,EDC4,PSMB10,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	NA	NA	NA	NA	SLC7A6	6835	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	68415381	68415552	68415488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMPD3	65039	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr16	68433458	68433594	68433558	Y	NA	SMPD3	NA	NA	NA	NA	SMPD3	46997	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	68503731	68504029	68503905	Y	NA	SMPD3	PRMT7,SMPD3	IMR90	Hi-C	24141950	SMPD3	23140	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	68804487	68804868	68804749	Y	NA	CDH1	NA	NA	NA	NA	CDH1	35359	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	69060339	69060481	69060445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAS3	76986	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr16	69121214	69121414	69121257	Y	NA	HAS3,CHTF8,CIRH1A	HAS3	IMR90	Hi-C	24141950	HAS3	16053	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	69345968	69346332	69346034	Y	NA	VPS4A,PDF,NIP7,COG8	NA	NA	NA	NA	VPS4A	2709	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	69351854	69351929	69351891	Y	NA	VPS4A,PDF,NIP7,COG8	NA	NA	NA	NA	VPS4A	8595	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	69506405	69506529	69506498	Y	NA	CYB5B	NA	NA	NA	NA	CYB5B	49977	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	69563572	69563696	69563627	Y	NA	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	33301	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	69564577	69564882	69564731	Y	WWP2	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	32115	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	69601109	69601332	69601245	Y	WWP2	NFAT5	NA	NA	NA	NA	NFAT5	4112	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr16	70356792	70356812	70356803	Y	NA	AARS,DDX19B,DDX19A	NA	NA	NA	NA	DDX19A	21920	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr16	70424558	70424975	70424714	Y	NA	DDX19A,ST3GAL2	NA	NA	NA	NA	DDX19A	45826	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	70444676	70444732	70444694	Y	NA	ST3GAL2,FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	26408	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	70451023	70451476	70451223	Y	NA	ST3GAL2,FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	19664	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	70461908	70462625	70462132	Y	ST3GAL2	ST3GAL2,FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	8515	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	70467076	70467247	70467197	Y	NA	ST3GAL2,FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	3893	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr16	70470997	70471281	70471214	Y	NA	FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.76061316991865
chr16	70712649	70712861	70712739	Y	NA	MTSS1L	NA	NA	NA	NA	MTSS1L	5108	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	70727989	70728270	70728171	Y	NA	MTSS1L	MTSS1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	MTSS1L	10020	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr16	70759138	70759547	70759396	Y	MTSS1L	MTSS1L	MTSS1L,IL34	IMR90	Hi-C	24141950	MTSS1L	41169	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	71828659	71828769	71828714	Y	NA	SNORD71,AP1G1,ATXN1L,IST1	NA	NA	NA	NA	AP1G1	12335	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.4499167281683
chr16	72671878	72672163	72672013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	419434	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	72912475	72912642	72912542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	178955	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr16	72972740	72973001	72972925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	118596	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	73076128	73076469	73076445	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	15128	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr16	73088640	73089206	73088991	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	2391	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	73104505	73104770	73104567	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	12908	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr16	73846352	73846469	73846405	Y	NA	NA	LOC100506172,ZFHX3	IMR90	Hi-C	24141950	PSMD7	482204	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	74083907	74083919	74083914	Y	NA	NA	HPR	IMR90	Hi-C	24141950	PSMD7	244754	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr16	74278766	74278883	74278825	Y	NA	PSMD7	NA	NA	NA	NA	PSMD7	49790	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	74353064	74353398	74353241	Y	FA2H	PSMD7,RP11-252A24.2	NA	NA	NA	NA	PSMD7	24391	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr16	74672577	74672957	74672890	Y	NA	GLG1,RFWD3	NA	NA	NA	NA	RFWD3	25822	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr16	74702224	74702291	74702259	Y	NA	RFWD3,MLKL	NA	NA	NA	NA	RFWD3	3445	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	74777612	74777799	74777727	Y	NA	MLKL,FA2H	NA	NA	NA	NA	FA2H	28930	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	75034712	75035106	75034867	Y	NA	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	WDR59	2641	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	75359436	75359702	75359569	Y	NA	NA	BCAR1	IMR90	Hi-C	24141950	BCAR1	59485	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	75410566	75410863	75410755	Y	BCAR1	NA	NA	NA	NA	NA	CFDP1	54520	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr16	75411958	75412267	75412159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFDP1	53116	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	75420812	75420988	75420900	Y	NA	CFDP1	CTRB1,BCAR1,CTRB2	IMR90	Hi-C	24141950	CFDP1	44395	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	75483148	75483204	75483176	Y	NA	CFDP1,TMEM170A	NA	NA	NA	NA	TMEM170A	14191	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	75636745	75636762	75636754	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2,ADAT1,TERF2IP,KARS	NA	NA	NA	NA	ADAT1	18436	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	75683626	75683906	75683817	Y	NA	ADAT1,TERF2IP,KARS	NA	NA	NA	NA	KARS	3085	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	76269107	76269317	76269211	Y	NA	RPL18P13	NA	NA	NA	NA	RPL18P13	1586	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr16	77708958	77709175	77709081	Y	NA	NUDT7	CLEC3A,WWOX,VAT1L	IMR90	Hi-C	24141950	NUDT7	45236	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	77868575	77868689	77868637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT7	114164	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	78179636	78179783	78179719	Y	NA	WWOX	NA	NA	NA	NA	WWOX	48326	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	78199099	78199491	78199298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	67789	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	78565966	78565983	78565974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	434656	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	78802745	78802853	78802799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	671435	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	78832287	78832508	78832373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	700977	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr16	78876925	78876962	78876944	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	745615	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	78908280	78908607	78908407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAF	724004	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	81026963	81027197	81027054	Y	NA	CENPN,ATMIN	NA	NA	NA	NA	CENPN	10906	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr16	81311371	81311608	81311483	Y	NA	GAN	NA	NA	NA	NA	GAN	34949	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	81512608	81512902	81512703	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	35833	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr16	81560583	81561027	81560837	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	CMIP	83808	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	81649296	81649780	81649593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	120922	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr16	81659842	81660553	81660320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	110149	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	81763852	81764387	81764185	Y	NA	PLCG2	NA	NA	NA	NA	PLCG2	6315	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr16	81831837	81832216	81831920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	61135	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	81876424	81876656	81876582	Y	CMIP,CMIP,PLCG2	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	105722	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	81877175	81877498	81877479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	106473	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	83953538	83953937	83953606	Y	NA	MLYCD,OSGIN1	NA	NA	NA	NA	MLYCD	22807	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr16	83960761	83960901	83960832	Y	NA	MLYCD,OSGIN1	NA	NA	NA	NA	OSGIN1	18986	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	84177434	84177775	84177582	Y	NA	MBTPS1,HSDL1,TAF1C	NA	NA	NA	NA	HSDL1	637	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	84674948	84675055	84674964	Y	KLHL36	COTL1,KLHL36	KIAA1609,COTL1,USP10,KLHL36,ZDHHC7	IMR90	Hi-C	24141950	KLHL36	5076	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	84785578	84785829	84785712	Y	KIAA0513,COTL1	NA	CRISPLD2,ZDHHC7	IMR90	Hi-C	24141950	USP10	53994	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	84866015	84866457	84866298	Y	NA	CRISPLD2	NA	NA	NA	NA	CRISPLD2	14425	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	85020713	85021068	85020917	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	22073	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr16	85387544	85387685	85387655	Y	NA	NA	LOC727710,LOC400548,KIAA0182,GINS2,FAM92B,LINC00311	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA0513	328169	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr16	85471045	85471389	85471119	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC400548,FAM92B,LINC00311,LOC727710,GINS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	250290	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	85557334	85557622	85557547	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	164057	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr16	85558121	85558453	85558347	Y	KIAA0182,KIAA0182	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	163226	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr16	85569070	85569366	85569223	Y	KIAA0182,KIAA0182,GINS2,COX4NB	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	152313	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.2784405728359
chr16	85570517	85570742	85570617	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	150937	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr16	85586399	85586765	85586561	Y	KIAA0182,KIAA0182,GINS2	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134914	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	85586938	85587370	85587020	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134309	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr16	85623714	85624085	85623926	Y	NA	NA	LOC727710,LOC400548,LINC00311,KIAA0182,C16orf74	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	97594	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	85648720	85648939	85648787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINS2	72740	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr16	85650361	85650613	85650432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINS2	71066	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	85783855	85783992	85783913	Y	NA	C16orf74,COX4I1	NA	NA	NA	NA	C16orf74	1120	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr16	85903471	85903703	85903566	Y	NA	IRF8	IRF8,COX4I1,FOXF1,LOC400550,MTHFSD,FLJ30679	IMR90	Hi-C	24141950	IRF8	26706	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	85925591	85925670	85925608	Y	NA	IRF8	COX4NB,COX4I1,IRF8,MTHFSD	IMR90	Hi-C	24141950	IRF8	4739	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	85950196	85950424	85950316	Y	COX4I1,IRF8	IRF8	NA	NA	NA	NA	IRF8	19787	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	87072481	87072526	87072504	Y	NA	NA	FOXC2,FLJ30679,MTHFSD,FOXL1,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	MAP1LC3B	343075	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	87083742	87083830	87083787	Y	NA	NA	FOXC2,FLJ30679,MTHFSD,FOXL1,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	MAP1LC3B	331771	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	87780321	87780693	87780507	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	16905	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	87807027	87807287	87807138	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	9429	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	87812654	87813065	87812978	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	15056	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr16	87823236	87823449	87823367	Y	FBXO31,CA5A	KLHDC4	JPH3,KLHDC4,ZCCHC14,SLC7A5,CA5A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	25638	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	87875229	87875683	87875262	Y	CA5A	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	25411	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	87886258	87886670	87886593	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	14424	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr16	87889826	87890140	87890011	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	10954	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	87978906	87979489	87979213	Y	ZCCHC14,BANP,BANP	BANP	CA5A,KLHDC4	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BANP	1361	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.4855715340028
chr16	87987504	87988357	87987703	Y	ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	BANP	NA	NA	NA	NA	BANP	6654	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	88063556	88063600	88063578	Y	BANP,BANP,BANP	NA	NA	NA	NA	NA	BANP	82706	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	88701263	88701663	88701374	Y	SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZC3H18,CYBA	CYBA,MVD,SNAI3	NA	NA	NA	NA	CYBA	13897	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	88829964	88830251	88830166	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	19368	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	88831388	88831665	88831630	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	17954	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	8.9066313301767
chr16	88835950	88836275	88836191	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	RNF166,CTU2	K562	ChIA-PET	22265404	PIEZO1	13344	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	28.6876381216157
chr16	88836450	88836610	88836518	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	13009	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	88837093	88837695	88837443	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	11924	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	13.4635124758485
chr16	88839181	88839507	88839410	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	10112	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr16	88839973	88840262	88840126	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	9357	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	88919657	88920044	88919827	Y	SNAI3,RNF166,RNF166,CBFA2T3	APRT,TRAPPC2L,GALNS	NA	NA	NA	NA	TRAPPC2L	584	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	89268043	89268411	89268231	Y	NA	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	13707	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.2784405728359
chr16	89313669	89314138	89313993	Y	ZNF276,ZNF778	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	31551	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr16	89370103	89370259	89370211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	87985	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	89423849	89423969	89423923	Y	CBFA2T3,ZNF276,SPATA2L,ANKRD11	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	131000	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr16	89451016	89451317	89451295	Y	CBFA2T3,ACSF3,ZNF778,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPG7,SPATA2L,ANKRD11	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	103652	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	89468980	89469266	89469225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	85703	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	89474257	89474602	89474526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	80367	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	89507848	89508195	89508050	Y	ZNF778	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	46774	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr16	89557852	89558189	89558050	Y	NA	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	2527	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	89564919	89565211	89565067	Y	NA	ANKRD11,SPG7	ANKRD11,SPG7	IMR90	Hi-C	24141950	SPG7	9594	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr16	89568763	89569125	89568979	Y	NA	ANKRD11,SPG7	ANKRD11,SPG7,LOC100287036,RPL13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPG7	13438	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr16	89573610	89573931	89573734	Y	NA	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	18285	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr16	89579992	89580270	89580045	Y	ACSF3,ZNF778,DBNDD1,ZNF276,SPG7	ANKRD11,SPG7,RPL13,SNORD68	NA	NA	NA	NA	SPG7	24667	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr16	89688213	89688598	89688406	Y	NA	CPNE7,CHMP1A	NA	NA	NA	NA	CHMP1A	33655	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	505873	506062	505986	Y	VPS53	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	52725	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr17	693293	693510	693390	Y	RNMTL1	DBIL5P,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4	NA	NA	NA	NA	GLOD4	9712	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	1046722	1046841	1046786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABR	83474	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	1157102	1157245	1157179	Y	NA	ABR	ABR,YWHAE,PITPNA,INPP5K,LOC100306951,SCARF1,RILP,TUSC5,BHLHA9,CRK,SLC43A2	IMR90	Hi-C	24141950	ABR	26787	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	1171565	1171808	1171610	Y	WDR81,PITPNA,ABR,ABR	ABR	NA	NA	NA	NA	ABR	41250	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	1390195	1390341	1390268	Y	MYO1C,MYO1C,MYO1C	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	3765	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.6570476893352
chr17	1533068	1533815	1533453	Y	CRK,INPP5K,WDR81,WDR81,WDR81,PITPNA,SLC43A2,SCARF1	SLC43A2,RILP	NA	NA	NA	NA	SLC43A2	2888	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	1620806	1621089	1620895	Y	PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81	PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG,SERPINF1	NA	NA	NA	NA	MIR22HG	2338	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	1974774	1975359	1974921	Y	SCARF1,HIC1,HIC1	DPH1,OVCA2	NA	NA	NA	NA	OVCA2	31447	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	2084621	2084734	2084671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	119943	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	2291927	2292298	2292113	Y	NA	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	10114	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	2300026	2300553	2300288	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	1859	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr17	2305266	2305571	2305415	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	2854	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr17	2397010	2397265	2397138	Y	NA	METTL16	LOC284009	IMR90	Hi-C	24141950	METTL16	15920	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	2627139	2627523	2627311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	132635	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	2627618	2628097	2628087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	133114	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	2952123	2952503	2952284	Y	ASPA,ASPA,PAFAH1B1	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	457619	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	3173253	3173388	3173321	Y	RAP1GAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TRPV3	285901	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	3289388	3289823	3289641	Y	SPATA22,SPATA22,SPATA22,SPATA22,SPATA22,ASPA,ASPA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPV3	169466	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	3453416	3453706	3453615	Y	OR1G1,OR1A2,OR1A1,OR1E2,TRPV3	TRPV3	NA	NA	NA	NA	TRPV3	5583	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr17	3534813	3534835	3534825	Y	OR1A2,OR1A1,OR3A2,OR1E1,OR1E2	SHPK,CTNS,TAX1BP3	TRPV1	IMR90	Hi-C	24141950	SHPK	2781	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	3706173	3706587	3706405	Y	NA	ITGAE,C17orf85	NA	NA	NA	NA	ITGAE	3636	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	4064613	4064785	4064717	Y	NA	ZZEF1,CYB5D2	NA	NA	NA	NA	CYB5D2	20151	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr17	4204226	4204625	4204419	Y	CAMKK1	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	38952	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	4386875	4387235	4387089	Y	NA	SPNS2	NA	NA	NA	NA	SPNS2	12898	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	4663304	4663479	4663372	Y	ZNF232,C17orf87,ARRB2,CXCL16,ZMYND15,ZMYND15	MED11,CXCL16,GLTPD2,PSMB6,PLD2	NA	NA	NA	NA	CXCL16	22087	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	4737531	4737755	4737558	Y	PLD2,MINK1	GLTPD2,PSMB6,PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	2848	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	4752478	4752731	4752552	Y	ZNF232,RABEP1,CAMTA2,CAMTA2	PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	17795	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr17	4753672	4753828	4753714	Y	UBE2G1,ARRB2,CXCL16,ZMYND15,ZMYND15,MINK1,RNF167,C17orf107	PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	18989	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	4934963	4935218	4935186	Y	NA	CAMTA2,KIF1C,ZFP3	NA	NA	NA	NA	KIF1C	35720	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr17	5000892	5001205	5000989	Y	NA	ZFP3,AC012146.7,ZNF232	NA	NA	NA	NA	AC012146.7	11558	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr17	5412379	5412497	5412422	Y	USP6	DHX33,MIS12,DERL2	NA	NA	NA	NA	DERL2	24248	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	5813088	5813344	5813243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSCD1	139534	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	4.9711430680056
chr17	5854578	5854683	5854630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSCD1	181024	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	7115018	7115437	7115195	Y	NA	ACADVL,DLG4,DVL2,PHF23,GABARAP,CTDNEP1,CLDN7	NA	NA	NA	NA	ACADVL	3007	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	7389589	7389989	7389739	Y	C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A	FGF11,CHRNB1,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	POLR2A	3904	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	7456067	7456382	7456285	Y	ACAP1,WRAP53,CD68,CD68,TNFSF12	TNFSF12,TNFSF12-TNFSF13,SENP3,EIF4A1,SNORD10,MPDU1,AC113189.5,SOX15	NA	NA	NA	NA	TNFSF12-TNFSF13	5651	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	7737438	7738736	7737971	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	2486	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	608	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4115	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.76061316991865
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	5769	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.21052989808695
chr17	7790181	7790340	7790322	Y	POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,KCNAB3,CNTROB,TRAPPC1	NA	NA	NA	NA	LSMD1	3625	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	HES7	4224	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr17	8057335	8058055	8057702	Y	KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59	HES7,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	8090038	8090540	8090163	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	1024	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	8517371	8517653	8517512	Y	NA	MYH10	NA	NA	NA	NA	MYH10	14426	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	8531412	8531868	8531658	Y	NA	MYH10	NA	NA	NA	NA	MYH10	211	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	8532647	8532776	8532657	Y	KRBA2	MYH10	NA	NA	NA	NA	MYH10	568	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	8560756	8560835	8560796	Y	ODF4	MYH10	CCDC42,MYH10	IMR90	Hi-C	24141950	MYH10	28677	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr17	8597334	8597547	8597441	Y	NA	NA	MYH10	IMR90	Hi-C	24141950	MYH10	65255	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr17	8600572	8600969	8600801	Y	MYH10	NA	MYH10,RPL26,RNF222	IMR90	Hi-C	24141950	MYH10	68493	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	8602115	8602249	8602166	Y	MYH10	NA	MYH10	IMR90	Hi-C	24141950	MYH10	70036	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	8649167	8649702	8649446	Y	ODF4,SPDYE4,MFSD6L,CCDC42	NA	NA	NA	NA	NA	MYH10	117088	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	8869986	8870720	8870441	Y	PIK3R5,PIK3R5	PIK3R5	NA	NA	NA	NA	PIK3R5	2957	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	9133558	9133821	9133662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTN1	210699	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	9258278	9258564	9258422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX8	219344	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	9875435	9875567	9875515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	284512	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	9981257	9981536	9981397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	178543	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	10023147	10023510	10023462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	136569	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	10029003	10029256	10029103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	130823	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	10030524	10030763	10030601	Y	GAS7	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	129316	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	10075775	10076068	10075982	Y	GAS7,GAS7	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	84011	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	10581804	10582199	10582113	Y	MYH4	SCO1,TMEM220	NA	NA	NA	NA	SCO1	17493	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	13575065	13575361	13575332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	71821	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	14105008	14105251	14105153	Y	COX10,HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	97149	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	15895023	15895192	15895111	Y	NA	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	TTC19	5502	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	15923170	15923610	15923287	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	22139	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	15925215	15925448	15925362	Y	ZNF286A,NCOR1	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	24184	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	15925706	15925935	15925791	Y	FAM18B2,PIGL,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	24675	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	15959345	15959465	15959410	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	58314	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	16189250	16189597	16189494	Y	NCOR1,TRPV2	NA	NA	NA	NA	NA	CENPV	65373	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	16249780	16250130	16249956	Y	CENPV	CENPV,UBB	NA	NA	NA	NA	CENPV	4840	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	16375722	16375971	16375775	Y	TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV	NA	NA	NA	NA	NA	TRPV2	58866	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	16438910	16439232	16439111	Y	NA	ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	31288	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr17	16440164	16440317	16440266	Y	ZNF624,CCDC144A	ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	30203	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	16487545	16487788	16487743	Y	NA	ZNF287,AC005822.1	NA	NA	NA	NA	ZNF287	17025	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	16922074	16922240	16922157	Y	NA	TNFRSF13B,MPRIP	FLCN,MPRIP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MPRIP	21619	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	16924574	16924970	16924629	Y	NA	MPRIP	FLCN,MPRIP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MPRIP	18889	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	16944636	16944769	16944688	Y	NA	MPRIP	NA	NA	NA	NA	MPRIP	777	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	17054009	17054176	17054093	Y	ZNF624,PEMT,COPS3,FLCN	NA	NA	NA	NA	NA	PLD6	53453	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	17484274	17484547	17484424	Y	NA	PEMT	NA	NA	NA	NA	PEMT	8475	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	17615930	17616232	17616056	Y	NA	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	33143	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr17	17677876	17678068	17678030	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREBF1	60257	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	19883392	19883621	19883525	Y	NA	AKAP10,SPECC1	NA	NA	NA	NA	AKAP10	3736	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	19913206	19913926	19913276	Y	ULK2,AKAP10	AKAP10,SPECC1	NA	NA	NA	NA	SPECC1	2549	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	20688064	20688832	20688343	Y	NA	OLA1P2,SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	2106	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr17	20814751	20814975	20814753	Y	KCNJ18	RP11-344E13.3,CCDC144NL	NA	NA	NA	NA	CCDC144NL	17298	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	21002403	21002809	21002523	Y	KCNJ18	DHRS7B	USP22,C17orf103	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DHRS7B	21868	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr17	21515861	21516199	21516031	Y	NA	C17orf51	CCDC144NL	K562	ChIA-PET	22265404	C17orf51	40139	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	25410571	25410806	25410743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208296	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	25415234	25415538	25415430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	203564	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr17	25415760	25416041	25415903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	203061	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	25416172	25416581	25416426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	202521	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	23.0951021701094
chr17	25558342	25558695	25558519	Y	NA	NA	KSR1,WSB1	IMR90	Hi-C	24141950	WSB1	60407	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	25568498	25568933	25568830	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	50169	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	7.6638455631753
chr17	25659360	25659787	25659571	Y	LGALS9,WSB1	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40258	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	25659975	25660361	25659997	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40873	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	25676124	25676302	25676192	Y	LGALS9,WSB1	NA	KSR1	IMR90	Hi-C	24141950	WSB1	57022	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.79626797575315
chr17	25793795	25793989	25793936	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	12125	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	25794670	25794745	25794710	Y	NA	KSR1	TBC1D3P5,KSR1	IMR90	Hi-C	24141950	KSR1	13000	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr17	25805507	25805777	25805623	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	23837	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	25816130	25816488	25816250	Y	WSB1,LGALS9	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	34460	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr17	25821459	25821654	25821516	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	39789	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	25821729	25821988	25821800	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	40059	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr17	25823612	25823763	25823676	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	41942	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr17	25833655	25833928	25833707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSR1	51985	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	4.3497501845049
chr17	25859435	25859718	25859540	Y	WSB1,LGALS9	NA	NA	NA	NA	NA	KSR1	77765	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr17	26216019	26216352	26216295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLK	150411	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	8.0781074855091
chr17	27072804	27073286	27072989	Y	TRAF4	PROCA1,RAB34,RPL23A,SNORD42B,SNORD42A,NEK8,TLCD1,TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	3802	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	27116093	27116114	27116106	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	47091	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	27199839	27200032	27199936	Y	DHRS13	ERAL1,FLOT2,DHRS13	NA	NA	NA	NA	ERAL1	19883	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	27299558	27299805	27299699	Y	NA	PHF12	NA	NA	NA	NA	PHF12	22769	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	27475765	27476166	27476073	Y	NEK8,PHF12	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	29264	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	27506307	27506816	27506504	Y	TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	877	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	27619094	27619880	27619581	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	27824938	27824945	27824941	Y	TIAF1,MYO18A,TAOK1,EFCAB5,ANKRD13B	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I13	66125	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr17	28037853	28038223	28038205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	89928	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	28431711	28432027	28431733	Y	NA	NSRP1	NA	NA	NA	NA	NSRP1	8512	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	28533256	28533617	28533437	Y	SLC6A4	SLC6A4,SNORD63	NA	NA	NA	NA	SLC6A4	27403	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	29334745	29335135	29334940	Y	RAB11FIP4,OMG	RNF135	NA	NA	NA	NA	RNF135	40942	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	29637373	29637640	29637434	Y	CRLF3,EVI2A	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	79002	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	29816760	29817002	29816913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	100118	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr17	29820298	29820473	29820377	Y	EVI2B,EVI2A,SUZ12	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	103656	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	160050	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr17	30723443	30723679	30723561	Y	NA	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	45600	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	30724674	30725107	30724769	Y	RHOT1	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	44172	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	31906834	31907097	31906966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM98	653906	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	32549838	32550038	32549929	Y	CCL8,CCL7	CCL2	CCL13	IMR90	Hi-C	24141950	CCL2	30266	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	32979074	32979302	32979236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF830	307247	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	4.86757758742215
chr17	33300552	33300861	33300820	Y	NA	ZNF830,LIG3,CCT6B	NA	NA	NA	NA	LIG3	4652	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	33577736	33577912	33577824	Y	ZNF830,RFFL,SLFN5	SLFN5	NA	NA	NA	NA	SLFN5	9681	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	33787408	33787803	33787736	Y	ZNF830,SLFN5,CCL5,SLFN12L	NA	NA	NA	NA	NA	AP2B1	115262	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	34160214	34160648	34160302	Y	NA	MMP28,TAF15,CCL5	NA	NA	NA	NA	TAF15	25755	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr17	34217615	34217957	34217919	Y	SLFN12L,CCL5,LYZL6	CCL5,RDM1	NA	NA	NA	NA	CCL5	11818	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr17	34219004	34219427	34219294	Y	NA	CCL5,RDM1	NA	NA	NA	NA	CCL5	13207	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	34219582	34220299	34219858	Y	CCL5,CCL3L3,CCL3L1,CCL4,CCL3,CCL23	CCL5,RDM1	NA	NA	NA	NA	CCL5	13785	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	34838937	34839070	34839023	Y	NA	ZNHIT3,PIGW	NA	NA	NA	NA	ZNHIT3	1403	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	34871446	34871455	34871448	Y	NA	ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2	NA	NA	NA	NA	PIGW	17392	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	34875469	34875747	34875679	Y	NA	ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2	NA	NA	NA	NA	PIGW	13100	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	35078576	35079010	35078700	Y	NA	NA	LHX1,AATF,ACACA,MRM1,DHRS11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRM1	122575	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	35184574	35184592	35184583	Y	NA	NA	AATF	IMR90	Hi-C	24141950	AATF	119583	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	35446954	35447324	35447190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	142779	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	35492690	35492856	35492817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	188515	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	35514299	35514470	35514425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	210124	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	35519679	35519723	35519693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215504	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	35520107	35520138	35520123	Y	ACACA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215932	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	35682301	35682446	35682421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACACA	82463	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	36101828	36102076	36101951	Y	DDX52,HNF1B	NA	NA	NA	NA	NA	DDX52	100335	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	36207397	36207662	36207528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX52	205904	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	36412216	36412471	36412263	Y	NA	RP11-1407O15.2,MRPL45	NA	NA	NA	NA	RP11-1407O15.2	7387	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr17	36571646	36572076	36571709	Y	C17orf96	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS7	65535	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr17	36610879	36611283	36611138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS7	104768	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	37024501	37024874	37024707	Y	NA	CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	389	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr17	37056956	37057300	37057070	Y	NA	SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	32844	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	37661852	37662117	37661985	Y	STAC2,FBXL20,MED1,CDK12	CDK12	NA	NA	NA	NA	CDK12	46088	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	38263317	38263642	38263602	Y	NA	MED24,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	MSL1	12909	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	38754802	38755132	38754943	Y	NA	CCR7,SMARCE1	KRT14,KRT42P,KRT26,GJD3,TOP2A,TNS4,KRT27,KRT28,RARA,CDC6,IGFBP4,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT9,LOC147093,KRT17	IMR90	Hi-C	24141950	CCR7	35078	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	38763906	38764295	38764082	Y	CASC3,WIPF2,CCR7	CCR7,SMARCE1	NA	NA	NA	NA	SMARCE1	38465	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	38764452	38764926	38764574	Y	CASC3,CCR7	CCR7,SMARCE1	NA	NA	NA	NA	SMARCE1	37834	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	39066622	39066986	39066860	Y	IGFBP4,KRTAP1-1,KRTAP1-5	KRT23	NA	NA	NA	NA	KRT23	24900	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	39662733	39662908	39662821	Y	JUP,KRTAP3-1,KRT9,KRT36,KRT13,KRT19	KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	19652	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr17	39667444	39667684	39667594	Y	NA	KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	14876	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	39683248	39683750	39683386	Y	NA	KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	688	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr17	39686458	39686891	39686666	Y	KRT19	KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	3898	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr17	39692337	39692600	39692431	Y	KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9,KRT37	KRT19	KRT15,KRT19,KRT13,KRT36	IMR90	Hi-C	24141950	KRT19	9777	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr17	39713397	39713795	39713596	Y	KRTAP2-4,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9,KRT37,KRT38,KRT35	KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	30837	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	39735892	39736012	39735959	Y	JUP,KRT36,KRT13,KRT15,KRT19,KRT9,KRT17,KRT16,KRT14	KRT17	NA	NA	NA	NA	KRT17	43082	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	39822130	39822941	39822323	Y	NA	KRT17,EIF1,GAST	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	20196	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr17	39949116	39949497	39949168	Y	KRT14,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	7933	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr17	39949517	39949745	39949566	Y	KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	8334	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr17	39956975	39957353	39957171	Y	KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	LEPREL4	9503	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	40748943	40749226	40749085	Y	STAT5B,STAT3,STAT3	HSD17B1,COASY,MLX,PSMC3IP,TUBG1,FAM134C	NA	NA	NA	NA	TUBG1	10468	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	41162878	41163074	41162972	Y	TUBG1,CNTD1,NBR1,NBR1,ETV4	AARSD1,RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1,RND2	NA	NA	NA	NA	IFI35	6136	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr17	41173099	41173334	41173293	Y	NAGLU,VAT1	RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1,RND2	NA	NA	NA	NA	VAT1	1806	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr17	41242207	41242334	41242271	Y	NA	BRCA1,NBR2	NA	NA	NA	NA	BRCA1	33166	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	41409196	41409569	41409556	Y	TMEM106A	NA	IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARL4D	64758	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	41421158	41421352	41421255	Y	NA	NA	NBR1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4D	52975	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	41441650	41441788	41441734	Y	NA	ARL4D	NA	NA	NA	NA	ARL4D	32539	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	41827198	41827473	41827372	Y	NA	DUSP3	NA	NA	NA	NA	DUSP3	26883	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	6.52462527675735
chr17	42278333	42278607	42278473	Y	ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	2852	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	42404001	42404290	42404282	Y	C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39	RUNDC3A,SLC25A39,GRN,FAM171A2	NA	NA	NA	NA	SLC25A39	3763	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr17	42620927	42621257	42621090	Y	FZD2	GPATCH8,FZD2	GPATCH8,FZD2,ITGA2B,DBF4B,C17orf104,CCDC43	IMR90	Hi-C	24141950	FZD2	11668	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	42634020	42634172	42634095	Y	TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2	FZD2	NA	NA	NA	NA	FZD2	1095	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.55348220875175
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1,ADAM11	NA	NA	NA	NA	RP11-1072C15.1	2016	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr17	43253543	43253622	43253574	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2,FMNL1	NA	NA	NA	NA	HEXIM2	17476	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	43303050	43303852	43303644	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	6239	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	43304336	43305039	43304628	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	7525	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	43305165	43306978	43306453	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	8354	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.6927024951697
chr17	43449108	43449433	43449167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K14	56694	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr17	43951029	43951274	43951198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P8	267120	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	44131950	44132178	44132002	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P8	448041	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr17	44155479	44155559	44155517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P8	471570	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	44198532	44198560	44198547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P8	514623	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	44232468	44232502	44232485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P8	548559	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	44268679	44268848	44268762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	528685	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPS7P11	453062	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr17	45021726	45021957	45021796	Y	NA	GOSR2,RPRML	NA	NA	NA	NA	GOSR2	23243	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	45144155	45144236	45144196	Y	NA	NA	NPEPPS	IMR90	Hi-C	24141950	RPRML	89541	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	45302836	45303175	45303013	Y	NA	CDC27,ITGB3	NA	NA	NA	NA	ITGB3	26088	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	45609469	45609601	45609554	Y	NA	NPEPPS	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	11161	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr17	45717975	45718065	45718017	Y	NA	KPNB1	NA	NA	NA	NA	KPNB1	6777	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	45771013	45771467	45771041	Y	NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1	KPNB1	NA	NA	NA	NA	KPNB1	46171	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr17	45778272	45778788	45778511	Y	SNX11,SNX11,ITGB3,C17orf57,NPEPPS,SP2,OSBPL7,CDK5RAP3,TBKBP1,TBX21	NA	NA	NA	NA	NA	KPNB1	53430	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	45953013	45953226	45953169	Y	NA	MRPL10,LRRC46,SCRN2,SP6,SP2	SCRN2,MRPL10,LRRC46,SP6,SP2,CDK5RAP3	IMR90	Hi-C	24141950	SP2	18290	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.5212263398373
chr17	45983662	45984115	45983847	Y	CDK5RAP3	SP2,AC003665.1,PNPO,PRR15L	PNPO	IMR90	Hi-C	24141950	SP2	12146	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	46034209	46034446	46034327	Y	NA	AC003665.1,PNPO,PRR15L,CDK5RAP3	NA	NA	NA	NA	PRR15L	965	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	46102426	46102830	46102617	Y	NA	COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	10562	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	46289129	46289412	46289274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX11	110410	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	46662223	46662405	46662377	Y	NA	HOXB2,HOXB4,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB4	6750	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	46696942	46697254	46696999	Y	NA	HOXB4,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB9	4585	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	47113510	47113580	47113552	Y	NA	IGF2BP1	NA	NA	NA	NA	IGF2BP1	40736	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	PHOSPHO1	35619	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr17	47467973	47468124	47468044	Y	ABI3,PHOSPHO1,ZNF652,ZNF652,SPOP,MYST2,FAM117A	ZNF652,PHB,AC004797.1	NA	NA	NA	NA	PHB	22122	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	47647130	47647802	47647650	Y	NA	NXPH3	ZNF652,NGFR,SPOP,SLC35B1,NXPH3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NXPH3	3418	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	47913501	47913854	47913589	Y	TMEM92	KAT7,FAM117A,RP11-613C6.4	NA	NA	NA	NA	RP11-613C6.4	42796	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	47966905	47967224	47967101	Y	DLX4,DLX3,TAC4	NA	LOC284080,ITGA3,SPOP,NXPH3,SLC35B1,DLX3,NGFR,FAM117A,KAT7,FLJ45513,TAC4,DLX4,PDK2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DLX4	77110	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr17	47972520	47972640	47972580	Y	NA	NA	LOC284080,ITGA3,NXPH3,SLC35B1,FAM117A,KAT7,TAC4,PDK2,NGFR,SPOP,FLJ45513,DLX4,DLX3	IMR90	Hi-C	24141950	DLX4	71694	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	48013600	48013625	48013613	Y	DLX4,DLX4,DLX3	DLX4	NGFR,SPOP,KAT7,ITGA3,SLC35B1,FLJ45513,TAC4,NXPH3,FAM117A,DLX4,DLX3	IMR90	Hi-C	24141950	DLX4	30709	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	48206052	48206167	48206088	Y	NA	PDK2,SAMD14,PPP1R9B,SGCA	NA	NA	NA	NA	SAMD14	806	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	SAMD14,PPP1R9B,SGCA	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	48942663	48943085	48943016	Y	NA	TOB1	NA	NA	NA	NA	TOB1	254	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	49182545	49182921	49182907	Y	NA	SPAG9,NME1,NME1-NME2,NME2	NA	NA	NA	NA	SPAG9	13305	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	49668971	49669311	49669002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP18	333082	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	50561518	50561825	50561670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP18	1225629	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	50795913	50796132	50795928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS2P48	1037099	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	50838489	50838508	50838499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS2P48	994723	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	53006732	53007120	53006925	Y	NA	TOM1L1,STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	TOM1L1	31984	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	53315618	53315983	53315841	Y	HLF	NA	STXBP4,HLF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MMD	181370	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	53497202	53497618	53497598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMD	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	53875650	53875676	53875663	Y	NA	PCTP	NA	NA	NA	NA	PCTP	49310	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	55504815	55504992	55504904	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	173603	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	55763716	55764071	55763861	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	161346	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	55801190	55801558	55801374	Y	NA	NA	MSI2,AKAP1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS23	123859	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	56428194	56428499	56428372	Y	VEZF1,MTMR4,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr17	56441767	56441894	56441848	Y	NA	SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	13313	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	56587640	56587744	56587729	Y	PPM1E,DYNLL2,MKS1,SEPT4,MTMR4	MTMR4,SEPT4	NA	NA	NA	NA	MTMR4	5522	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	56701235	56701661	56701522	Y	OR4D1,BZRAP1	RNU1-60P,RNU1-108P	NA	NA	NA	NA	RNU1-60P	33005	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	56736656	56737064	56736885	Y	MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E	RNU1-60P,RNU1-108P,RNU1-85P,RAD51C	SEPT4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	1990	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.55348220875175
chr17	56744054	56744558	56744332	Y	SUPT4H1	RNU1-60P,RNU1-108P,RNU1-85P,RAD51C	NA	NA	NA	NA	RNU1-108P	1996	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.96774413108555
chr17	57231530	57231848	57231723	Y	NA	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	670	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr17	57298532	57298798	57298672	Y	NA	SMG8,GDPD1	NA	NA	NA	NA	GDPD1	2704	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	57831888	57832338	57832062	Y	VMP1,RNFT1	VMP1,PTRH2	NA	NA	NA	NA	PTRH2	48901	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	57844650	57844791	57844732	Y	YPEL2	NA	NA	NA	NA	NA	PTRH2	61663	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	57853705	57854627	57854148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	62000	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	57962596	57962816	57962625	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	TUBD1	5488	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr17	58212242	58212405	58212344	Y	NA	NA	C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEATR6	57950	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	59232853	59233252	59232919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	242005	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	59434096	59434461	59434196	Y	NA	TBX2	NA	NA	NA	NA	TBX2	40796	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	59473431	59474098	59473741	Y	TBX2,C17orf82	TBX2	NA	NA	NA	NA	TBX2	1159	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	59474585	59474918	59474715	Y	NA	TBX2	NA	NA	NA	NA	TBX2	339	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	60085676	60086036	60086030	Y	NACA2,MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	54607	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	60555037	60555507	60555099	Y	NA	RP11-464D20.2	MRC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-464D20.2	36621	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	60938326	60938715	60938420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	235564	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	61043121	61043648	61043243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	340359	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	61243701	61244044	61243838	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB561	277695	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	61282907	61283291	61283099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB561	238448	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	61920991	61921115	61921104	Y	NA	PSMC5,FTSJ3,SMARCD2,TCAM1P,GH2	NA	NA	NA	NA	SMARCD2	2566	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	62159440	62159790	62159613	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	46389	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	62161129	62161576	62161448	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	44603	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	62169387	62169789	62169751	Y	MAP3K3,LIMD2,PECAM1,DDX5,ERN1	ERN1	ICAM2,C17orf72	IMR90	Hi-C	24141950	ERN1	36390	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	62252131	62252624	62252334	Y	LIMD2,ICAM2,DDX5,ERN1	ERN1,SNORD104	NA	NA	NA	NA	SNORD104	30688	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	62484790	62485162	62485096	Y	NA	POLG2,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	POLG2	5992	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	62534383	62534677	62534525	Y	NA	POLG2,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	DDX5	32066	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	63050573	63051275	63051229	Y	NA	NA	AMZ2P1	IMR90	Hi-C	24141950	GNA13	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	63119249	63119621	63119552	Y	GNA13	NA	RGS9,GNA13,AMZ2P1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNA13	68292	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	84165	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr17	64194072	64194322	64194164	Y	NA	CEP112	NA	NA	NA	NA	CEP112	7870	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr17	64499082	64499411	64499095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	202328	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	64690651	64690854	64690753	Y	PRKCA,CACNG4	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG4	268172	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	64947420	64948018	64947947	Y	NA	CACNG4	CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CACNG4	11008	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	64948296	64948612	64948339	Y	CACNG4	CACNG4	CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CACNG4	10414	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	64959449	64959766	64959607	Y	NA	CACNG4	NA	NA	NA	NA	CACNG4	423	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	64963064	64963179	64963122	Y	NA	CACNG4	NA	NA	NA	NA	CACNG4	4038	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	65242250	65242562	65242536	Y	NA	HELZ,SNORA8	NA	NA	NA	NA	HELZ	2145	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	65339190	65339485	65339338	Y	BPTF	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PSMD12	21258	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	65386872	65387224	65386898	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	15297	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	65389377	65389540	65389482	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	17802	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	65432676	65433054	65432865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	61101	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	65897183	65897370	65897273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BPTF	77543	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	65990543	65990874	65990748	Y	AMZ2,BPTF,C17orf58	C17orf58,KPNA2	NA	NA	NA	NA	C17orf58	2778	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	65991969	65992126	65992052	Y	NA	C17orf58,KPNA2	NA	NA	NA	NA	C17orf58	4204	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr17	66016382	66016768	66016696	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	12867	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	66193656	66193741	66193699	Y	NA	AMZ2	NA	NA	NA	NA	AMZ2	47974	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr17	66322964	66323100	66323038	Y	SLC16A6	SLC16A6	NA	NA	NA	NA	SLC16A6	37556	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	66374808	66375131	66375016	Y	SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	76523	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	66452519	66452682	66452605	Y	SLC16A6,WIPI1	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	865	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	66509186	66509763	66509535	Y	SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A	PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	PRKAR1A	3265	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	67315191	67315526	67315500	Y	NA	ABCA5	NA	NA	NA	NA	ABCA5	5859	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	67463547	67463710	67463574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2K6	54708	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	68153518	68153744	68153613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2K6	744679	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	68310261	68311057	68310836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2K6	901422	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	70423161	70423493	70423326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	197877	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	70878407	70878514	70878507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	208337	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	71152430	71152655	71152530	Y	C17orf80,SSTR2	COG1	NA	NA	NA	NA	COG1	34474	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	71227425	71227646	71227536	Y	NA	COG1,C17orf80,FAM104A	NA	NA	NA	NA	C17orf80	1053	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	71301216	71301553	71301269	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	4761	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	71304431	71304616	71304518	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	1698	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	71639437	71639585	71639501	Y	SDK2	SDK2	NA	NA	NA	NA	SDK2	1209	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	72728741	72729539	72729096	Y	KIF19,KCTD2,GRIN2C,FADS6,RAB37,RAB37,RAB37	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	13252	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	72809186	72809552	72809426	Y	KIF19,RAB37,KCTD2,FADS6,GRIN2C	NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	TMEM104	38564	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	72837172	72837380	72837244	Y	NA	FDXR	NA	NA	NA	NA	FDXR	29776	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	73007152	73007476	73007237	Y	RAB37,GRIN2C,C17orf28,CDR2L,SUMO2,NUP85,KCTD2,ARMC7	CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H	NA	NA	NA	NA	ICT1	387	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	73009835	73009966	73009891	Y	NA	CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H	NA	NA	NA	NA	ICT1	3070	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	73074678	73074996	73074848	Y	LLGL2,C17orf28,ARMC7	KCTD2,ATP5H,SLC16A5,ARMC7	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	6826	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	73087456	73087829	73087515	Y	NA	ATP5H,SLC16A5,ARMC7,NT5C	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	5634	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr17	73304838	73305233	73305159	Y	UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19	MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	8177	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	73333353	73333637	73333600	Y	H3F3B,GRB2,GRB2,GGA3	SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	19943	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	73351805	73351921	73351820	Y	NA	AC011933.1,GRB2	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	38395	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	73426423	73426691	73426652	Y	MRPS7	GRB2,KIAA0195	NA	NA	NA	NA	KIAA0195	8549	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr17	73456096	73456218	73456157	Y	KIAA0195	KIAA0195	NA	NA	NA	NA	KIAA0195	20856	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr17	73641652	73641951	73641723	Y	CASKIN2,LLGL2,FOXJ1,EVPL,LOC100130933	SAP30BP,RECQL5	NA	NA	NA	NA	SAP30BP	19245	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	73685500	73685825	73685750	Y	GGA3,MIF4GD,SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	RECQL5	24231	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	73689850	73690283	73690148	Y	KIAA0195,CASKIN2,WBP2	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	ITGB4	25125	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	73696530	73696897	73696707	Y	SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	ITGB4	18511	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	73719261	73719909	73719549	Y	MRPS7,LLGL2,LOC100130933,EVPL,ITGB4,ITGB4	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	3853	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr17	73734249	73734591	73734388	Y	GGA3,GRB2,GRB2,WBP2,UNC13D,ACOX1,RECQL5,RECQL5,SAP30BP,H3F3B	ITGB4,GALK1,UNK,H3F3B	NA	NA	NA	NA	ITGB4	18841	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	73805010	73805399	73805102	Y	NA	GALK1,UNK,H3F3B,UNC13D,WBP2	NA	NA	NA	NA	H3F3B	25036	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	74128444	74128992	74128680	Y	LOC100130933,RECQL5,RECQL5,FOXJ1	EXOC7	NA	NA	NA	NA	EXOC7	12787	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	74341579	74341976	74341749	Y	NA	PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	PRPSAP1	36626	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	4.3497501845049
chr17	74415585	74415933	74415760	Y	MFSD11,RNF157	PRPSAP1,UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	31355	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	74583031	74583415	74583256	Y	NA	ST6GALNAC2	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC2	1993	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	74664017	74664029	74664023	Y	NA	ST6GALNAC1,MXRA7	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC1	26097	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	74993480	74993636	74993537	Y	NA	NA	MFSD11,MGAT5B,SEC14L1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00338,SEC14L1	87162	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	75120383	75120864	75120582	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	39585	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	75199050	75199385	75199187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	75266	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	75384636	75384998	75384811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	109985	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr17	75385660	75386043	75385777	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	111009	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	RNU1-80P	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-80P	40213	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	4.03905374275455
chr17	76165603	76166001	76165654	Y	SYNGR2	TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	NA	NA	NA	NA	SYNGR2	2964	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	76195016	76195360	76195224	Y	TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	BIRC5	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC5	12907	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	76254688	76254992	76254867	Y	TNRC6C,TMC6,TMC8,TMC6,C17orf99,SOCS3,PGS1	BIRC5	NA	NA	NA	NA	BIRC5	46421	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	76268764	76268973	76268872	Y	TNRC6C,TMC6,TMC8,TMC6,SOCS3,PGS1	NA	TK1,AFMID,CYTH1,TMC6,LOC100131096,TNRC6C,SOCS3,DNAH17,PGS1	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC5	60497	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	76310071	76310633	76310436	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	PGS1,DNAH17,SOCS3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SOCS3	43525	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	76312866	76313241	76313131	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	SOCS3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SOCS3	40917	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	76348964	76349371	76349046	Y	USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4787	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	76356993	76357093	76357047	Y	SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	2835	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr17	76357167	76357466	76357379	Y	NA	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	3009	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	76361692	76362147	76361865	Y	NA	SOCS3,PGS1	PGS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOCS3	7534	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr17	76412850	76413399	76413170	Y	CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1	PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	40129	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	76669540	76669658	76669599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYTH1	106721	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	76879876	76880180	76879977	Y	NA	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39289	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	76919844	76920193	76919970	Y	CYTH1,CANT1	TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	375	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr17	77783959	77784243	77784073	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	10477	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	77788517	77788922	77788877	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	15035	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	77803693	77803802	77803748	Y	NA	CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX4	7426	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	77817686	77818105	77817998	Y	NA	CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX4	6458	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	77965696	77966573	77966281	Y	CBX2,CBX8,CBX4,CCDC40	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	41074	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	78087852	78088239	78088062	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	GAA	14497	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	78121490	78121818	78121740	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	EIF4A3	2508	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	78149249	78149503	78149364	Y	NA	EIF4A3,SLC26A11,SGSH	EIF4A3	MCF7	ChIA-PET	22265404	EIF4A3	30267	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	78198081	78198434	78198366	Y	NA	SLC26A11,SGSH,RNF213	NA	NA	NA	NA	SGSH	5359	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV,NPTX1	NA	NA	NA	NA	NPTX1	20369	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.2427857670014
chr17	78724836	78725014	78724914	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPTOR	208217	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	78793273	78793673	78793356	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	169725	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	78835173	78835495	78835379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	127903	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	78853513	78853762	78853623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	109636	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	78901796	78901941	78901869	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	61457	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	79017666	79018027	79017910	Y	AZI1,BAIAP2	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	10718	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr17	79018501	79018654	79018571	Y	BAIAP2	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	11553	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	79107096	79107396	79107264	Y	AATK	NA	NA	NA	NA	NA	AZI1	87403	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	79317785	79317948	79317891	Y	FAM195B,C17orf70,ACTG1,BAHCC1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	15311	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	16851	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr17	79319812	79320225	79320116	Y	FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	17338	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr17	79360408	79361324	79361141	Y	ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	57934	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr17	79362745	79363068	79363048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	60271	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr17	79365060	79367456	79365203	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	62586	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr17	79399639	79399699	79399664	Y	GCGR,BAHCC1	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	78390	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	79439092	79439387	79439261	Y	PCYT2,FAM195B,C17orf90,C17orf70,ACTG1	RP13-766D20.1,RP13-766D20.2,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	38702	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	79942701	79942868	79942785	Y	SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62	PYCR1,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	10018	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr17	79979263	79979824	79979465	Y	NA	ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR,GPS1,RFNG,DUS1L	NA	NA	NA	NA	LRRC45	85	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.6927024951697
chr17	80068913	80069274	80069094	Y	NARF,HEXDC,CCDC57	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	14705	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	80104775	80104822	80104796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FASN	50567	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	80164087	80164383	80164236	Y	SIRT7,MAFG,MAFG,SECTM1,NARF,CSNK1D,C17orf62,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CCDC57	CCDC57,SLC16A3	NA	NA	NA	NA	CCDC57	4323	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr17	80188750	80189250	80189000	Y	NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	SLC16A3	4477	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr17	80214734	80215057	80214944	Y	NA	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	14550	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr17	80494129	80494268	80494139	Y	NA	FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	18540	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	80592968	80593241	80593234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB40B	61363	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	80594524	80594906	80594740	Y	UTS2R,WDR45L	NA	NA	NA	NA	NA	RAB40B	59698	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.76061316991865
chr17	80796209	80796714	80796435	Y	METRNL,ZNF750	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF750	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	80805995	80806457	80806155	Y	NA	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	9541	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr17	80833209	80833609	80833394	Y	ZNF750	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	36755	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.2427857670014
chr17	81049749	81049909	81049815	Y	NA	B3GNTL1,METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	14182	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	5.3854049903394
chr17	81063257	81063563	81063336	Y	NA	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	27690	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr18	10894	11221	11019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP14	145162	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr18	159482	159743	159659	Y	CETN1	USP14	NA	NA	NA	NA	USP14	3099	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	235900	236290	236249	Y	NA	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	29760	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	9843	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr18	679559	679568	679564	Y	NA	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	23219	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	711356	711474	711397	Y	ENOSF1,ENOSF1	ENOSF1	NA	NA	NA	NA	ENOSF1	680	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	781638	782117	782009	Y	NA	RNU1-109P,YES1	NA	NA	NA	NA	RNU1-109P	14019	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	813044	813594	813404	Y	YES1	RNU1-109P,YES1	NA	NA	NA	NA	YES1	2497	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr18	1503663	1503683	1503673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP72	181577	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	1888648	1888915	1888782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP72	566562	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr18	2056727	2056859	2056778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	512649	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr18	2549022	2549121	2549072	Y	NA	METTL4,NDC80	NA	NA	NA	NA	METTL4	20387	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	2636727	2637126	2636786	Y	NA	CBX3P2,SMCHD1	NA	NA	NA	NA	CBX3P2	16268	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	2797990	2798254	2798233	Y	NA	EMILIN2	NA	NA	NA	NA	EMILIN2	46774	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	2848392	2848824	2848619	Y	EMILIN2	EMILIN2	LPIN2	IMR90	Hi-C	24141950	EMILIN2	3364	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	2851086	2851429	2851256	Y	EMILIN2	EMILIN2	LPIN2	IMR90	Hi-C	24141950	EMILIN2	6058	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr18	2855586	2855865	2855617	Y	NA	EMILIN2	LPIN2	IMR90	Hi-C	24141950	EMILIN2	10558	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr18	2893280	2893456	2893355	Y	NA	EMILIN2	NA	NA	NA	NA	EMILIN2	48252	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr18	2894355	2894543	2894452	Y	EMILIN2	EMILIN2	NA	NA	NA	NA	EMILIN2	49327	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr18	3276279	3276423	3276302	Y	NA	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12B	16372	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	3383416	3383792	3383691	Y	TGIF1,TGIF1	TGIF1	TGIF1	K562	ChIA-PET	22265404	TGIF1	25814	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	4.5568811456718
chr18	3594733	3596177	3595596	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	185127	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	3624338	3624601	3624482	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214732	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr18	3630146	3630509	3630328	Y	DLGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	220540	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr18	3639477	3639730	3639610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	229871	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr18	3665613	3666165	3665884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	256007	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	4356734	4357177	4357014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	947128	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	5629750	5630120	5629929	Y	NA	EPB41L3	NA	NA	NA	NA	EPB41L3	1051	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr18	5895274	5895803	5895585	Y	TMEM200C	NA	L3MBTL4	IMR90	Hi-C	24141950	EPB41L3	266575	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	6556939	6557309	6557113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P27	95925	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.55348220875175
chr18	6661988	6662345	6662167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P27	200974	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr18	6752571	6752962	6752632	Y	NA	NA	ARHGAP28	IMR90	Hi-C	24141950	RPL6P27	291557	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	7048074	7048376	7048212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAMA1	67437	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr18	7116326	7116685	7116423	Y	NA	LAMA1	NA	NA	NA	NA	LAMA1	513	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	7273554	7273981	7273852	Y	NA	SNORA48	PTPRM	IMR90	Hi-C	24141950	SNORA48	25170	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	8140065	8140370	8140233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	467073	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	8412266	8412506	8412385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	194937	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	9128926	9129321	9129124	Y	NDUFV2,ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	ANKRD12	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD12	4905	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr18	9138526	9138911	9138547	Y	ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	NA	NA	NA	NA	ANKRD12	4300	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	9554563	9554587	9554575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	58651	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	9604214	9604566	9604459	Y	NA	PPP4R1	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	8672	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr18	9613164	9613539	9613352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	9707499	9707519	9707509	Y	NA	RAB31	NA	NA	NA	NA	RAB31	1337	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	9782521	9782650	9782587	Y	RAB31	NA	NA	NA	NA	NA	RAB31	76359	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	9835366	9835644	9835528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	76355	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr18	9849459	9849859	9849589	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	62140	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr18	9850032	9850097	9850065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	61902	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	11431991	11432229	11432112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	417166	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	11849903	11850727	11850169	Y	MPPE1,CHMP1B	CHMP1B	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	508	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr18	11859926	11860218	11860181	Y	CHMP1B	CHMP1B,MPPE1	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	10531	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	11947272	11947721	11947412	Y	CHMP1B	MPPE1,IMPA2	IMPA2,GNAL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IMPA2	31303	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr18	12076743	12076871	12076848	Y	NA	NA	GNAL	IMR90	Hi-C	24141950	IMPA2	97719	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	12288068	12288497	12288213	Y	NA	TUBB6	TUBB6	IMR90	Hi-C	24141950	TUBB6	17171	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	12306995	12307375	12307158	Y	CHMP1B	TUBB6	NA	NA	NA	NA	TUBB6	1327	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	12408700	12408821	12408736	Y	NA	AFG3L2,SLMO1	SPIRE1	IMR90	Hi-C	24141950	SLMO1	2805	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	12679329	12679437	12679359	Y	NA	SPIRE1,PSMG2,CEP76	NA	NA	NA	NA	CEP76	21339	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	12765132	12765369	12765274	Y	CEP76	NA	NA	NA	NA	NA	CEP76	64356	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	12864190	12864369	12864245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN2	63273	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr18	13824016	13824345	13824089	Y	MC5R	NA	NA	NA	NA	NA	FAM210A	99354	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr18	18942831	18943125	18942978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREB1L	122628	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	19090172	19090203	19090178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESCO1	88642	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	19397108	19397142	19397125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIB1	114190	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	19746222	19746392	19746310	Y	GATA6	GATA6	NA	NA	NA	NA	GATA6	1012	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.2784405728359
chr18	21780839	21781231	21781002	Y	OSBPL1A	NA	NA	NA	NA	NA	CABYR	63897	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	21808250	21808465	21808434	Y	OSBPL1A	NA	NA	NA	NA	NA	CABYR	91308	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	23609881	23610142	23609962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SS18	59039	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	23836366	23836416	23836389	Y	TAF4B	TAF4B	NA	NA	NA	NA	TAF4B	32466	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	26231611	26231936	26231774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD1	1996246	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr18	26347956	26348190	26348041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD1	2112591	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	29080100	29080413	29080257	Y	NA	DSG2	NA	NA	NA	NA	DSG2	4094	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	29952485	29952862	29952679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138	282667	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	32829674	32829781	32829775	Y	ZNF397,ZSCAN30	ZNF397,ZSCAN30,ZNF271	NA	NA	NA	NA	ZNF397	10680	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	34813677	34814006	34813844	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	406519	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr18	37101421	37101610	37101545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	187782	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	40112047	40112330	40112189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	578876	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	42262294	42262512	42262376	Y	SETBP1,SETBP1	SETBP1	NA	NA	NA	NA	SETBP1	4156	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr18	43210324	43210708	43210352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPG5	334532	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	43307603	43307620	43307613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPG5	237620	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr18	43363455	43363582	43363533	Y	NA	NA	SIGLEC15,EPG5,SLC14A1,SLC14A2	IMR90	Hi-C	24141950	EPG5	181658	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	43608916	43609273	43609243	Y	PSTPIP2,EPG5	PSTPIP2	NA	NA	NA	NA	PSTPIP2	40965	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	45444466	45444807	45444662	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	10708	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	45688048	45688324	45688110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232533	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.2427857670014
chr18	46204089	46204193	46204141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	140672	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	46242460	46242735	46242629	Y	SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	179043	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	46297484	46297823	46297654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	234067	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	46349762	46350033	46349891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	286345	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	46404939	46405048	46404994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	341522	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr18	46428346	46428737	46428479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	364929	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	46465508	46465942	46465798	Y	SMAD7,SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	402091	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	46478230	46479206	46479122	Y	SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	414813	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr18	46502180	46502412	46502333	Y	SMAD7	NA	SMAD7,CTIF	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CTIF	438763	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr18	46518186	46518409	46518369	Y	NA	NA	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTIF	454769	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.83192278158765
chr18	46519156	46519437	46519250	Y	DYM,SMAD7	NA	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTIF	455739	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	46523478	46523814	46523611	Y	SMAD7,SMAD7	NA	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTIF	460061	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr18	46547875	46548139	46548027	Y	NA	NA	SMAD7	MCF7	ChIA-PET	22265404	DYM	437578	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr18	46733107	46733359	46733209	Y	DYM	NA	NA	NA	NA	NA	DYM	252358	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	47512458	47512491	47512475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACAA2	174128	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	47688363	47688450	47688407	Y	NA	MYO5B	NA	NA	NA	NA	MYO5B	31013	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	48274760	48275068	48274915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRO	74704	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr18	48301659	48301815	48301762	Y	NA	MRO	NA	NA	NA	NA	MRO	47957	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	4.03905374275455
chr18	49922017	49922168	49922058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEX3C	1179343	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	50018417	50018889	50018438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEX3C	1275743	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	51675484	51675804	51675634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBD2	73354	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	51699489	51699550	51699520	Y	NA	MBD2	NA	NA	NA	NA	MBD2	49608	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr18	53041931	53042230	53042160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	287788	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	53107364	53107398	53107375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	222620	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	53180110	53180413	53180343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	149605	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	53332836	53333181	53332979	Y	NA	TCF4	NA	NA	NA	NA	TCF4	2818	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.3140953786704
chr18	53355940	53355975	53355958	Y	NA	TCF4	TXNL1,TCF4	IMR90	Hi-C	24141950	TCF4	25922	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	54487568	54487957	54487622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL1	170737	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	55267032	55267261	55267214	Y	NEDD4L	FECH,NARS	NA	NA	NA	NA	FECH	15028	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	55382886	55383034	55382958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP8B1	85299	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	55881305	55881780	55881408	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	171706	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	56537923	56538093	56537956	Y	ZNF532	ZNF532	NA	NA	NA	NA	ZNF532	10091	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	56579254	56579314	56579284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF532	51422	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	57274287	57274609	57274551	Y	CCBE1	NA	NA	NA	NA	NA	CCBE1	88003	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	60189219	60189514	60189362	Y	TNFRSF11A,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	979	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr18	60598497	60598585	60598560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLPP1	217825	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	60854025	60854354	60854177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	131007	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	60891499	60892086	60892002	Y	VPS4B	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	93275	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	61033511	61033750	61033687	Y	NA	BCL2,KDSR	NA	NA	NA	NA	KDSR	768	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr18	61549883	61550442	61550030	Y	VPS4B,SERPINB8,SERPINB2	SERPINB2	SERPINB7	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINB2	12957	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	65945074	65945279	65945262	Y	NA	NA	LOC643542	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC102B	435167	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	72706567	72706772	72706660	Y	ZNF407,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	212531	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	73966259	73966767	73966600	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF516	238379	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	74204839	74205357	74205296	Y	NA	RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	74556264	74556608	74556436	Y	NA	ZNF236	NA	NA	NA	NA	ZNF236	23701	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	74764902	74765159	74765004	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	232339	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	74829789	74830209	74830033	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	297226	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	75688457	75688848	75688673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	1138437	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	75697384	75697771	75697683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	1129514	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	6.11036335442355
chr18	76736885	76737229	76736941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	90056	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	76831132	76831674	76831321	Y	NFATC1,NFATC1,ATP9B	ATP9B	NA	NA	NA	NA	ATP9B	3847	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	77218531	77218849	77218576	Y	NFATC1,CTDP1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	64675	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr18	77721815	77722347	77722078	Y	PQLC1	PQLC1,HSBP1L1	NA	NA	NA	NA	HSBP1L1	214	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	532930	533293	533259	Y	C19orf6,C19orf22,ARID3A	MADCAM1,TPGS1,CDC34,BSG	NA	NA	NA	NA	CDC34	3216	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	555976	556322	556024	Y	NA	CDC34,BSG	NA	NA	NA	NA	BSG	12975	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	662216	662510	662281	Y	HMHA1,GZMM,C19orf6,C19orf22,ABCA7,RNF126	POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	RNF126	939	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	751766	752111	751822	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PALM,PTBP1	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42964	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	752652	753043	752777	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PALM,PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42032	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr19	778993	779222	779048	Y	GPX4,BSG,CNN2	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	15853	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr19	782330	783005	782707	Y	NA	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	12070	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	7.6638455631753
chr19	863983	864016	863999	Y	NA	CFD,MED16,RNU6-9,R3HDM4	NA	NA	NA	NA	CFD	6530	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	867005	867400	867203	Y	GPX4,GPX4,C19orf24,ATP5D,ODF3L2,C19orf20,BSG,POLRMT,CNN2,CFD	CFD,MED16,RNU6-9,R3HDM4	NA	NA	NA	NA	CFD	9552	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	888565	888780	888647	Y	SBNO2,HMHA1,CIRBP,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7	CFD,MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	MED16	2438	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	928103	928378	928301	Y	SBNO2,MIDN,HMHA1,C19orf22,KISS1R,ARID3A	MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	ARID3A	4322	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	953220	953565	953383	Y	EFNA2,MADCAM1,KISS1R,ARID3A	R3HDM4,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	WDR18	27609	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.071309611669
chr19	954903	955312	954982	Y	KISS1R,ARID3A	R3HDM4,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	WDR18	25862	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr19	958944	959162	959060	Y	NA	R3HDM4,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	WDR18	22012	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	980601	980803	980725	Y	NA	WDR18,CNN2	NA	NA	NA	NA	WDR18	371	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.76061316991865
chr19	1028160	1028923	1028240	Y	SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7	WDR18,CNN2,ABCA7,HMHA1	NA	NA	NA	NA	CNN2	3862	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	1161691	1161983	1161922	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	10299	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	1169743	1170349	1170015	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1933	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	1172839	1173266	1172915	Y	CFD,ATP5D,GPX4,GPX4	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	557	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	1183874	1184237	1184064	Y	SBNO2	SBNO2,STK11	ATP5D,MIDN,SBNO2,STK11,GPX4	MCF7	ChIA-PET	22265404	STK11	3169	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	1240232	1240534	1240365	Y	MUM1,APC2,C19orf26	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	ATP5D	483	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	1260732	1261171	1260912	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3348	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	1408607	1408695	1408655	Y	CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3039	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	1632932	1633212	1633140	Y	STK11	MBD3,UQCR11,TCF3	NA	NA	NA	NA	TCF3	17392	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	1855247	1855761	1855485	Y	SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3	REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	5806	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	2059605	2060167	2060113	Y	REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	10362	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.34635124758485
chr19	2162744	2162943	2162860	Y	CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	280	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr19	2165096	2165788	2165320	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	2632	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr19	2168890	2169464	2169082	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	6426	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	2171641	2172019	2171832	Y	NA	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	9177	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	2189110	2189498	2189160	Y	NA	DOT1L,AP3D1,SF3A2,PLEKHJ1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	26646	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	2287726	2288039	2287937	Y	KLF16,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A,DOT1L,OAZ1,C19orf35	OAZ1,SPPL2B,LSM7	NA	NA	NA	NA	OAZ1	20241	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	2452794	2453150	2452981	Y	NA	TIMM13,LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	LMNB2	1844	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	2494705	2495117	2494880	Y	DOT1L,GADD45B	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	20585	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr19	2524971	2525260	2525066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	50851	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	2528875	2529093	2529033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	54755	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.2427857670014
chr19	2540691	2541097	2540881	Y	TIMM13	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	66571	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	2543618	2543970	2543682	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	69498	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	2770206	2770498	2770360	Y	DIRAS1,AES	SLC39A3,SGTA,THOP1,ZNF554	NA	NA	NA	NA	SGTA	10871	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	2888802	2889178	2888846	Y	NA	ZNF555,ZNF556,ZNF57	NA	NA	NA	NA	ZNF57	9718	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	3035530	3035851	3035686	Y	NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2	TLE2,AES	NA	NA	NA	NA	TLE2	9782	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr19	3459088	3459397	3459251	Y	NA	DOHH,FZR1	NA	NA	NA	NA	DOHH	39541	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	3520804	3521051	3520913	Y	NA	DOHH,FZR1,HMG20B	NA	NA	NA	NA	FZR1	16533	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.6570476893352
chr19	3570616	3571018	3570829	Y	C19orf28,HMG20B,GIPC3	MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	HMG20B	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	3603116	3603307	3603197	Y	GIPC3,TBXA2R	HMG20B,MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	TBXA2R	1531	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	3603456	3603548	3603535	Y	NA	HMG20B,MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	TBXA2R	1290	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr19	3687832	3687894	3687862	Y	FZR1,APBA3	PIP5K1C,TJP3	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	10583	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	4014917	4015042	4014976	Y	NA	DAPK3,SNORD37,EEF2,PIAS4,ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	PIAS4	9273	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	4053092	4053572	4053301	Y	CCDC94,ZBTB7A	PIAS4,ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	11371	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	4084320	4084813	4084566	Y	NA	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	19377	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	4089074	4089290	4089084	Y	NA	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	24131	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	4089506	4089868	4089573	Y	ZBTB7A	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	24563	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr19	4375126	4375688	4375404	Y	NA	STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	22856	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	4456385	4456784	4456737	Y	UBXN6,UBXN6	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	566	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	4568924	4569300	4569153	Y	TICAM1,KDM4B,SEMA6B	PLIN5,LRG1	NA	NA	NA	NA	LRG1	30438	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	4936813	4936840	4936828	Y	NA	UHRF1,KDM4B	NA	NA	NA	NA	KDM4B	30285	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	5336072	5336705	5336347	Y	PTPRS	PTPRS	NA	NA	NA	NA	PTPRS	2109	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	5338459	5338816	5338637	Y	PTPRS	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRS	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	5536566	5536826	5536635	Y	NA	NA	PTPRS,ZNRF4,PLAC2	IMR90	Hi-C	24141950	SAFB	84220	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	5880679	5880918	5880789	Y	NA	FUT3,FUT5,NDUFA11,VMAC,CAPS	NA	NA	NA	NA	FUT5	20880	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	5953003	5953253	5953208	Y	SAFB2,FUT5	CAPS,RANBP3	NA	NA	NA	NA	RANBP3	22900	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	6056849	6057757	6057360	Y	DENND1C,SAFB2,SAFB,VMAC,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	80696	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	6238228	6238618	6238539	Y	RFX2	RFX2,MLLT1	NA	NA	NA	NA	MLLT1	39341	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	6738802	6739114	6738954	Y	NA	C3,GPR108,TRIP10,SH2D3A	NA	NA	NA	NA	TRIP10	2866	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	6766042	6766297	6766158	Y	NA	C3,GPR108,TRIP10,SH2D3A	NA	NA	NA	NA	SH2D3A	443	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	7197339	7197547	7197388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSR	94498	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	7402747	7403030	7402887	Y	FCER2	NA	INSR,ZNF557	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF18	54969	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	7547905	7548376	7548024	Y	STXBP2,CD209,PEX11G,MCOLN1	PEX11G,ZNF358,MCOLN1,PNPLA6	NA	NA	NA	NA	PEX11G	11959	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr19	7665007	7665263	7665135	Y	INSR,PNPLA6,FLJ22184,KIAA1543	CAMSAP3,XAB2,STXBP2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP3	6219	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	7723326	7723586	7723448	Y	PEX11G,MCOLN1,C19orf59,LOC100131801,STXBP2	XAB2,STXBP2,TRAPPC5	NA	NA	NA	NA	TRAPPC5	20143	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	8075966	8076193	8076120	Y	NA	ELAVL1,CCL25	NA	NA	NA	NA	ELAVL1	7423	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	8115456	8115774	8115631	Y	PRAM1,STXBP2,C19orf59	ELAVL1	NA	NA	NA	NA	CCL25	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr19	8226134	8226320	8226231	Y	NA	CERS4	FBN3,TIMM44	IMR90	Hi-C	24141950	CERS4	43300	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	8989058	8989241	8989188	Y	ZNF177,ACTL9,MUC16,OR7G1	ZNF558	NA	NA	NA	NA	ZNF558	48054	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	9128934	9129115	9129008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF317	119941	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	9420483	9420931	9420837	Y	NA	ZNF559	NA	NA	NA	NA	ZNF559	11517	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	9684452	9684634	9684543	Y	NA	ZNF426,ZNF121,ZNF561	NA	NA	NA	NA	ZNF121	8575	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	9757386	9757713	9757550	Y	NA	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	26063	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	9776683	9777096	9776903	Y	OR7D4,ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF177,ZNF426,ZNF121,ZNF846,OLFM2	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	6680	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	9783821	9783976	9783959	Y	NA	ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	45	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr19	9896233	9896620	9896495	Y	ZNF266,COL5A3,ZNF846	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	39872	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	10349944	10350302	10350123	Y	NA	S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM1,ICAM4,ICAM5	MRPL4,ICAM1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT1	9982	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	10513154	10513331	10513243	Y	ICAM1,DNM2,C19orf38,TYK2,PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	940	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	10766466	10766790	10766534	Y	NA	ILF3,QTRT1	NA	NA	NA	NA	ILF3	3529	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	11044199	11044446	11044323	Y	NA	YIPF2,C19orf52,SMARCA4	NA	NA	NA	NA	C19orf52	6790	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4174	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	11404382	11404791	11404593	Y	ACP5,ACP5,C19orf38,LPPR2,CCDC159	DOCK6,CCDC159	NA	NA	NA	NA	DOCK6	33225	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	11484314	11484469	11484411	Y	ZNF439,ZNF653,ZNF627,ZNF491,ZNF441,ELAVL3,CCDC151,SMARCA4,SMARCA4	CCDC159,RAB3D,TMEM205,SWSAP1,EPOR,RGL3	NA	NA	NA	NA	SWSAP1	953	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	11601973	11602308	11602059	Y	ZNF491,ZNF441	ZNF653,CTC-398G3.2,ECSIT,CNN1	NA	NA	NA	NA	ZNF653	12430	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	11675625	11675958	11675811	Y	CCDC159,ACP5,ACP5	CTC-398G3.2,ECSIT,CNN1,ELOF1,ZNF627,ACP5	NA	NA	NA	NA	ZNF627	7436	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr19	11804467	11804940	11804795	Y	ZNF878,ZNF823,ZNF491	HNRNPA1P10,ZNF823	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P10	28622	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	11925678	11926080	11925867	Y	NA	ZNF441,ZNF491,ZNF440,ZNF439	NA	NA	NA	NA	ZNF440	2579	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr19	12065633	12065838	12065735	Y	NA	ZNF700,ZNF763,CTD-2006C1.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2006C1.2	30594	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	12131760	12131812	12131786	Y	NA	CTD-2006C1.2,ZNF433,ZNF878,ZNF844	NA	NA	NA	NA	ZNF433	12744	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	12245844	12245929	12245887	Y	NA	ZNF788,ZNF20,CTC-359D24.3,ZNF625,ZNF136	NA	NA	NA	NA	ZNF20	3293	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	12404552	12404928	12404719	Y	ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44	CTD-2666L21.3,ZNF44,ZNF563	NA	NA	NA	NA	ZNF44	850	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr19	12889371	12889726	12889619	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10584	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	12896372	12896781	12896659	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF490,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,STX10,LYL1,DNASE2,JUNB	JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	3529	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	12899457	12901460	12900777	Y	NA	PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	12901644	12901726	12901699	Y	NA	JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	1334	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	13094405	13094796	13094616	Y	ZNF709,TNPO2,TNPO2,MAST1,DAND5	CALR,RAD23A,GADD45GIP1,NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	9626	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	13123653	13124120	13123822	Y	WDR83,TNPO2,TNPO2,NFIX,CACNA1A	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	19231	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr19	13266326	13267156	13266576	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	7097	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	13274586	13275096	13274696	Y	GADD45GIP1,NACC1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	15357	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	13278382	13278991	13278445	Y	BEST2,JUNB,LYL1,STX10	STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	19153	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.76061316991865
chr19	13917794	13918010	13917903	Y	RFX1,ZSWIM4,NANOS3	MRI1,C19orf53,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	13520	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	13944359	13944683	13944571	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15	ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	40085	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	13957204	13959386	13957586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	52930	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	13972364	13973309	13972780	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	41705	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	14089228	14089566	14089336	Y	CCDC130,PKN1,CD97,RFX1	DCAF15,RFX1	NA	NA	NA	NA	RFX1	26285	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	14172809	14173223	14173004	Y	NA	IL27RA,EEF1DP1,C19orf67,SAMD1	NA	NA	NA	NA	EEF1DP1	5931	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.4499167281683
chr19	14274504	14274771	14274661	Y	C19orf57,RFX1,LPHN1	PRKACA,ASF1B,LPHN1	NA	NA	NA	NA	ASF1B	28736	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	14320325	14320686	14320360	Y	NA	LPHN1	NA	NA	NA	NA	LPHN1	5326	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	14404408	14404769	14404597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD97	84544	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	14616908	14617174	14617017	Y	GIPC1	GIPC1,TECR,DNAJB1	GIPC1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TECR	8723	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	14869692	14869911	14869839	Y	NA	EMR2,AC005255.3	NA	NA	NA	NA	EMR2	17442	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr19	15310768	15311119	15311001	Y	NA	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	976	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	15492858	15492952	15492905	Y	NA	AKAP8,AKAP8L	NA	NA	NA	NA	AKAP8	4249	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	15505627	15505808	15505718	Y	NA	AKAP8,AKAP8L	NA	NA	NA	NA	AKAP8	17018	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	15947617	15948119	15947980	Y	AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1	UCA1	NA	NA	NA	NA	UCA1	9846	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr19	16205409	16205807	16205414	Y	EPS15L1,RAB8A,HSH2D	TPM4,RAB8A,HSH2D	NA	NA	NA	NA	RAB8A	14632	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr19	16462018	16462188	16462137	Y	CIB3	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	28390	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	16479678	16480242	16479985	Y	MED26,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	46050	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	16510195	16510544	16510471	Y	RAB8A,HSH2D,MED26,EPS15L1,KLF2	NA	NA	NA	NA	NA	EPS15L1	70352	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	16560891	16561165	16561157	Y	NA	EPS15L1,CALR3,C19orf44	NA	NA	NA	NA	EPS15L1	19731	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	16574808	16575111	16574962	Y	NA	EPS15L1,CALR3,C19orf44	NA	NA	NA	NA	EPS15L1	5785	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	16576710	16576784	16576751	Y	NA	EPS15L1,CALR3,C19orf44	NA	NA	NA	NA	EPS15L1	4112	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	17124642	17124654	17124646	Y	NA	CPAMD8	NA	NA	NA	NA	CPAMD8	10971	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr19	17131732	17132248	17131919	Y	NA	CPAMD8	NA	NA	NA	NA	CPAMD8	3377	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	17200566	17201240	17200825	Y	MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	15975	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr19	17218539	17219391	17218963	Y	MED26,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	33948	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	17246297	17246722	17246423	Y	SLC27A1,PGLS,OCEL1,MYO9B	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9B	61706	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	17345747	17345835	17345791	Y	NA	USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1,ANKLE1,USHBP1	NA	NA	NA	NA	NR2F6	8914	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	17371801	17372164	17371849	Y	NXNL1,GTPBP3	USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1,ANKLE1,USHBP1,MRPL34,DDA1,ABHD8	NR2F6	K562	ChIA-PET	22265404	BABAM1	3995	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	17604234	17604409	17604322	Y	NA	TMEM221,SLC27A1,PGLS	NA	NA	NA	NA	PGLS	16029	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	18315989	18316123	18316056	Y	NA	IFI30,MPV17L2,RAB3A,PDE4C	NA	NA	NA	NA	RAB3A	3105	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	18402387	18403564	18402535	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1	PDE4C,KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	11500	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr19	18404099	18404539	18404373	Y	NA	PDE4C,KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	13212	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr19	18405326	18405850	18405541	Y	JAK3,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,C19orf60,JUND	PDE4C,KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	14439	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	18430446	18430898	18430653	Y	ARRDC2,IL12RB1,IFI30,LRRC25	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	1186	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	18439179	18439536	18439334	Y	NA	JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1,GDF15	PGPEP1	K562	ChIA-PET	22265404	LSM4	7095	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	18485152	18485556	18485412	Y	ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25	PGPEP1,GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	GDF15	1611	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	18497624	18497977	18497708	Y	PDE4C,GDF15	PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	GDF15	14083	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	18527701	18528040	18527800	Y	KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	27	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	18528263	18528792	18528577	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	589	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr19	18594405	18594611	18594516	Y	HOMER3,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25	ISYNA1,ELL	NA	NA	NA	NA	ELL	36326	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	18614213	18614397	18614285	Y	IL12RB1,JUND,LRRC25,ELL	ELL,FKBP8	NA	NA	NA	NA	ELL	16540	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	18722417	18722765	18722581	Y	GDF1,RAB3A,PDE4C,CRTC1,TMEM59L	UBA52,C19orf60,CRLF1,KLHL26	NA	NA	NA	NA	CRLF1	5866	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	19143307	19143510	19143378	Y	DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6	ARMC6,SUGP2,SLC25A42	NA	NA	NA	NA	SUGP2	475	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	19432680	19432782	19432710	Y	NA	MAU2,SUGP1	NA	NA	NA	NA	SUGP1	3027	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	19483893	19484092	19484012	Y	NA	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	10543	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	19488658	19488936	19488750	Y	NA	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	5699	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.34635124758485
chr19	19562909	19563265	19563209	Y	RFXANK,MEF2BNB,MAU2,GATAD2A,GMIP	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	61280	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	19623798	19624201	19624001	Y	NA	NDUFA13,TSSK6,YJEFN3,CILP2	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	344	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	20128543	20128860	20128736	Y	NA	ZNF682	NA	NA	NA	NA	ZNF682	19455	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	20162886	20163252	20163139	Y	ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682	ZNF682,ZNF90,AC006539.2	ZNF682,LOC284440	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF682	14571	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	21678211	21678382	21678297	Y	ZNF430,ZNF100,ZNF429	ZNF429	NA	NA	NA	NA	ZNF429	727	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	21689202	21689645	21689487	Y	ZNF430,ZNF708,ZNF493,ZNF100,ZNF429	ZNF429	NA	NA	NA	NA	ZNF429	11718	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	22610267	22610542	22610420	Y	ZNF208,ZNF257,ZNF676,ZNF492,ZNF98	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P34	60513	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	22715195	22715609	22715437	Y	NA	ZNF98	NA	NA	NA	NA	ZNF98	1908	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.2784405728359
chr19	23309445	23309479	23309469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF730	53433	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	23416597	23416606	23416602	Y	NA	ZNF724P	NA	NA	NA	NA	ZNF724P	14586	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	23530488	23530791	23530760	Y	NA	ZNF91	NA	NA	NA	NA	ZNF91	45571	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr19	23732304	23732710	23732386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF675	135312	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	17.70969717977
chr19	28170167	28170385	28170313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1532063	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	28208615	28209033	28208726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1493415	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	28232492	28232748	28232631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1469700	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	29210558	29210810	29210684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	491638	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	29896046	29896124	29896085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	193598	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	30157267	30157499	30157417	Y	PLEKHF1,C19orf12,C19orf12	PLEKHF1,C19orf12	NA	NA	NA	NA	PLEKHF1	3304	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr19	30187610	30187930	30187770	Y	NA	PLEKHF1,C19orf12	NA	NA	NA	NA	C19orf12	16434	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	30198391	30198719	30198555	Y	NA	PLEKHF1,C19orf12	NA	NA	NA	NA	C19orf12	5645	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	30336581	30336824	30336781	Y	C19orf2,C19orf2	CCNE1	NA	NA	NA	NA	CCNE1	35776	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	31415761	31415844	31415821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSHZ3	422609	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	32866000	32866258	32866129	Y	NA	ZNF507,DPY19L3	NA	NA	NA	NA	DPY19L3	28191	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	33144460	33144707	33144584	Y	NA	RGS9BP,ANKRD27,NUDT19	NA	NA	NA	NA	RGS9BP	19606	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr19	33532238	33532582	33532339	Y	RHPN2,GPATCH1,PDCD5,ANKRD27,NUDT19,CEP89,C19orf40	RHPN2,GPATCH1	NA	NA	NA	NA	RHPN2	21212	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	33538325	33538659	33538479	Y	RHPN2,GPATCH1,NUDT19,CEP89,C19orf40	RHPN2,GPATCH1	NA	NA	NA	NA	RHPN2	15135	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr19	33541924	33542310	33542117	Y	NA	RHPN2,GPATCH1	NA	NA	NA	NA	RHPN2	11484	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	33740333	33740640	33740371	Y	NA	SLC7A10	CHST8,CEBPA,LOC80054,PEPD	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC7A10	25577	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	33750621	33750673	33750623	Y	CEBPA	SLC7A10,CEBPA	CHST8,PEPD,LOC80054,CEBPA	IMR90	Hi-C	24141950	SLC7A10	35865	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	33789888	33790286	33790087	Y	NA	CEBPA	NA	NA	NA	NA	CEBPA	1184	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	33796303	33796393	33796348	Y	SLC7A9,CEBPA	CEBPA	NA	NA	NA	NA	CEBPA	4833	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	33996867	33997517	33996997	Y	LRP3	PEPD	NA	NA	NA	NA	PEPD	13183	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	34396925	34397389	34397012	Y	NA	NA	KCTD15	MCF7	ChIA-PET	22265404	KCTD15	112087	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr19	34625713	34625998	34625854	Y	PDCD2L	LSM14A	CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	LSM14A	35411	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	34664379	34664787	34664699	Y	SCGBL,KIAA0355,LSM14A	LSM14A	NA	NA	NA	NA	LSM14A	2970	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	34752762	34752909	34752837	Y	NA	KIAA0355	NA	NA	NA	NA	KIAA0355	9320	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	34850085	34850642	34850351	Y	ZNF599,ZNF302,ZNF181	GPI,PDCD2L	NA	NA	NA	NA	GPI	1700	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr19	35453242	35453666	35453504	Y	ZNF792	ZNF30,GRAMD1A	NA	NA	NA	NA	GRAMD1A	30022	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	35643836	35643967	35643905	Y	FFAR3,USF2,MAG,HPN,LGI4	FXYD3,FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD5	203	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	35763394	35763606	35763496	Y	U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,USF2	LSR,USF2	NA	NA	NA	NA	USF2	5513	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	36135988	36136183	36136108	Y	ARHGAP33	HAUS5,RBM42,COX6B1,UPK1A,UPK1A-AS1	NA	NA	NA	NA	COX6B1	942	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	36241217	36241384	36241301	Y	MAG,LRFN3	IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37,C19orf55,ARHGAP33	NA	NA	NA	NA	LIN37	3955	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr19	36519340	36519516	36519376	Y	ZNF565	SDHAF1,ALKBH6,THAP8,WDR62	NA	NA	NA	NA	ALKBH6	16199	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	36618643	36619171	36618835	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	9306	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	36748454	36748637	36748519	Y	ARHGAP33,APLP1,CLIP3,CLIP3,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF461,ZNF382,ZFP82,ZFP14,ZNF565,ZNF565	ZNF146,ZNF565	NA	NA	NA	NA	ZNF565	13295	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	36757480	36757645	36757542	Y	NA	ZNF565	ZNF146	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF565	22321	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.17487509225245
chr19	36879565	36879874	36879872	Y	NA	ZFP14,ZFP82	NA	NA	NA	NA	ZFP14	11464	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	36882143	36882391	36882267	Y	NA	ZFP14,ZFP82	NA	NA	NA	NA	ZFP14	14042	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	37156610	37156902	37156838	Y	ZNF565,ZNF565,ZFP14,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF790,ZNF420,ZNF345,ZNF345,ZNF529,ZNF382,ZNF567,ZNF461	AC074138.3,ZNF567	NA	NA	NA	NA	AC074138.3	19449	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	37171128	37171323	37171227	Y	NA	AC074138.3,ZNF567	ZNF383,ZNF461,ZNF567,ZNF850	IMR90	Hi-C	24141950	AC074138.3	5028	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	37246589	37246720	37246657	Y	NA	ZNF850	NA	NA	NA	NA	ZNF850	15007	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	37262228	37262609	37262419	Y	NA	ZNF850	NA	NA	NA	NA	ZNF850	501	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	37322216	37322466	37322299	Y	ZFP14,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF829,ZNF829,ZNF585B,ZNF568,ZNF420,ZNF383,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345	ZNF345,ZNF790	NA	NA	NA	NA	ZNF345	16797	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	37795242	37795359	37795301	Y	ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF829,ZNF568,ZNF420,ZNF585B,ZNF793,ZNF781,ZNF607,ZNF607,ZNF573,ZNF570,ZNF569,ZNF540,ZNF527,HKR1	HKR1	NA	NA	NA	NA	HKR1	6380	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	37822125	37822150	37822138	Y	NA	HKR1,ZNF527	NA	NA	NA	NA	HKR1	20386	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	38482400	38482784	38482644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	86532	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr19	38674383	38674545	38674477	Y	ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1	NA	NA	NA	NA	NA	SPINT2	58130	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	38796841	38796867	38796854	Y	NA	C19orf33,YIF1B,KCNK6,CATSPERG	NA	NA	NA	NA	C19orf33	4040	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	38925195	38925518	38925467	Y	NA	FAM98C,RYR1	NA	NA	NA	NA	RYR1	2856	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	39148533	39148920	39148613	Y	C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12244	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	39149253	39149575	39149354	Y	SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12964	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	39167742	39168127	39167771	Y	NA	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	31453	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	39175000	39175365	39175141	Y	NFKBIB,HNRNPL,EIF3K	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	38711	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	39179503	39179787	39179628	Y	RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	43214	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	39189644	39189919	39189773	Y	RINL	NA	NA	NA	NA	NA	ACTN4	53355	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	39411140	39411539	39411467	Y	LGALS7	RINL,NFKBIB,SIRT2,MRPS12,SARS2	NA	NA	NA	NA	MRPS12	7649	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.55348220875175
chr19	39453898	39453904	39453901	Y	NA	MRPS12,SARS2,FBXO17	NA	NA	NA	NA	FBXO17	10646	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	39627416	39627544	39627474	Y	NA	PAK4	NA	NA	NA	NA	PAK4	13006	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr19	39645312	39645609	39645461	Y	LGALS7B	PAK4,NCCRP1	NA	NA	NA	NA	PAK4	30902	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	39810585	39810976	39810672	Y	CLC,LRFN1	SAMD4B	NA	NA	NA	NA	SAMD4B	20060	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	39831946	39832143	39832027	Y	NA	SAMD4B,PAF1,MED29	NA	NA	NA	NA	SAMD4B	910	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr19	40649626	40649776	40649709	Y	NA	MAP3K10	TTC9B,CNTD2,MAP3K10,ZNF780A,AKT2,ZNF546,ZNF780B,SPTBN4	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K10	45875	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	40823184	40823546	40823487	Y	NA	AKT2,PLD3,C19orf47	NA	NA	NA	NA	PLD3	28817	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	40849279	40849406	40849342	Y	NA	PLD3,C19orf47	NA	NA	NA	NA	PLD3	2957	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	40939716	40940068	40940022	Y	SERTAD1	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	8544	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr19	40951707	40952008	40951966	Y	NA	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	3095	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	41120897	41121111	41120992	Y	NA	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	24108	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	41169097	41169273	41169245	Y	NA	NUMBL	NA	NA	NA	NA	NUMBL	25604	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	41226531	41226793	41226653	Y	PLD3,SPTBN4,LTBP4,EGLN2,EGLN2,CYP2B6,ITPKC,RAB4B	NUMBL,ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA	NA	NA	NA	NA	ADCK4	4419	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	41260796	41261188	41261093	Y	SERTAD1,CYP2A13,CYP2B6,CYP2A6,ADCK4,ITPKC	ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	C19orf54	5338	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	41267029	41267391	41267210	Y	NA	ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	MIA	8162	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	41289050	41289265	41289158	Y	SERTAD3,SHKBP1,ADCK4,RAB4B,EGLN2,EGLN2	SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	RAB4B	6929	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	41304071	41304255	41304136	Y	SERTAD1,SERTAD3,SHKBP1,ADCK4,ADCK4,RAB4B,HNRNPUL1	SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	EGLN2	1170	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	41680959	41681276	41681150	Y	NA	RPL36P16,CYP2S1	CYP2A13,CYP2B7P1,HNRNPUL1,AXL,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	RPL36P16	7193	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	41681944	41682199	41682187	Y	NA	RPL36P16,CYP2S1	CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	RPL36P16	8178	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	7.6638455631753
chr19	41731541	41731893	41731762	Y	NA	CYP2S1,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	HNRNPUL1	34508	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	41771602	41771660	41771636	Y	CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	HNRNPUL1	5201	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr19	41795419	41795640	41795447	Y	CYP2A13,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	18454	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	41804006	41804567	41804366	Y	TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	9527	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	41814398	41814719	41814610	Y	HNRNPUL1,TMEM91,TGFB1,CCDC97,B9D2	HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1	NA	NA	NA	NA	CCDC97	304	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	41827649	41828097	41827915	Y	HNRNPUL1,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	NA	NA	NA	NA	CCDC97	13555	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	41831643	41832527	41831971	Y	CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA	NA	NA	NA	NA	CCDC97	17549	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	41915515	41915996	41915671	Y	ARHGEF1,HNRNPUL1,TGFB1	B9D2,BCKDHA,EXOSC5,ATP5SL	NA	NA	NA	NA	EXOSC5	14131	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	42037922	42038313	42037990	Y	CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1	NA	LOC100505495	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	93300	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr19	42444727	42445027	42444981	Y	NA	RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	16515	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr19	42710307	42710321	42710316	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF	NA	NA	NA	NA	DEDD2	11971	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	42711906	42712521	42712423	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,POU2F2,DEDD2	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF	NA	NA	NA	NA	DEDD2	9771	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr19	42722677	42722859	42722787	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC	NA	NA	NA	NA	ZNF526	254	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	42750338	42750718	42750490	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC	NA	NA	NA	NA	GSK3A	5561	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	42756581	42756634	42756608	Y	ATP1A3,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	ERF	675	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	42756723	42757090	42756966	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	ERF	219	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	2115	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	42774379	42774759	42774668	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	3690	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	CIC	5303	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	42784087	42784212	42784170	Y	CEACAM8,CEACAM3,DEDD2	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13398	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13838	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	42902919	42903213	42903066	Y	TMEM145	NA	CNFN	MCF7	ChIA-PET	22265404	MEGF8	75158	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	44152096	44152277	44152103	Y	ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61,IRGQ	ZNF428,CADM4,PLAUR	CADM4	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	CADM4	10105	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	44281524	44282142	44281780	Y	IRGQ,ZNF230,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	1267	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	44284114	44284247	44284152	Y	TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	705	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	44288540	44288860	44288798	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	5131	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr19	44711538	44711905	44711597	Y	NA	ZNF226,ZNF227	NA	NA	NA	NA	ZNF227	1838	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	44749585	44749846	44749685	Y	LYPD5,ZNF221,ZNF223,ZNF284,ZNF224,ZNF234,ZNF226,ZNF226,ZNF226,ZNF285,ZNF229,ZFP112,ZNF227,ZNF235,ZNF233,ZNF233	ZNF227	NA	NA	NA	NA	ZNF227	39885	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	45279679	45279961	45279836	Y	CEACAM19,CBLC,BCAM	BCL3,CBLC,BCAM	NA	NA	NA	NA	CBLC	553	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr19	45352951	45353140	45353112	Y	NA	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	5519	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40,APOE	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	45584780	45584791	45584786	Y	CEACAM16,NKPD1	CLASRP,ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	MARK4	4234	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	45663964	45664347	45664315	Y	NA	TRAPPC6A,BLOC1S3	NA	NA	NA	NA	TRAPPC6A	15148	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	45905744	45905944	45905844	Y	EML2,KLC3,PPP1R13L,ERCC1,ERCC1	ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	CD3EAP	1523	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	45906934	45907335	45907067	Y	NA	ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	CD3EAP	132	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	45943163	45943490	45943268	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP,FOSB,CD3EAP,PPP1R13L	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	25763	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	45945937	45946679	45946251	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22574	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.17487509225245
chr19	45953262	45953678	45953446	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,PPM1N,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	15575	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.6927024951697
chr19	45987073	45987327	45987197	Y	NOVA2,RELB,CLASRP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	PPM1N	2708	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	45995542	45995743	45995643	Y	NANOS2,NKPD1,EXOC3L2	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	RTN2	2576	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	46011701	46012269	46011904	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	3864	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	46012498	46012899	46012640	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	4661	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	46014236	46014617	46014413	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	6399	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	46133845	46134220	46134022	Y	NANOS2,IGFL4,NKPD1,EXOC3L2	OPA3,EML2	NA	NA	NA	NA	EML2	12667	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	46361761	46362096	46361929	Y	NA	SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	SYMPK	2452	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	46386037	46386278	46386146	Y	OPA3,GIPR,FBXO46,SYMPK,FOXA3	SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	IRF2BP1	1098	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr19	46504246	46504437	46504355	Y	EML2,PNMAL2,PNMAL1,NOVA2	CCDC61	NA	NA	NA	NA	CCDC61	7907	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	46907328	46907649	46907570	Y	NA	CCDC8	NA	NA	NA	NA	CCDC8	7192	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	47062362	47062544	47062453	Y	NA	GAPDHP38,CALM3	NA	NA	NA	NA	GAPDHP38	2464	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	47269374	47269772	47269575	Y	LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5	FKRP,STRN4,SLC1A5	NA	NA	NA	NA	SLC1A5	20079	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	47613231	47613789	47613256	Y	PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	742	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	47662714	47662828	47662771	Y	NA	SAE1,ZC3H4	NA	NA	NA	NA	ZC3H4	47705	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	47742856	47743228	47743000	Y	NA	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	BBC3	8833	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	47746329	47746738	47746506	Y	SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	CCDC9	10499	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.6570476893352
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	606	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	47792934	47793257	47793053	Y	NA	CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	16792	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	47805638	47805769	47805718	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,GPR77,C5AR1	CCDC9,PRR24,DHX34	PRR24,DHX34,SLC8A2,MEIS3,GLTSCR2,GLTSCR1,EHD2	IMR90	Hi-C	24141950	PRR24	29496	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	47873037	47873766	47873365	Y	ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34	DHX34,MEIS3	NA	NA	NA	NA	DHX34	22499	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	48016569	48017036	48016994	Y	GLTSCR2,ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,DHX34,GLTSCR1,NAPA	KPTN,NAPA	NA	NA	NA	NA	NAPA	72	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	48076356	48076760	48076653	Y	SLC8A2,ZNF541	NA	GLTSCR1,KPTN,MEIS3,SLC8A2,NAPA,LOC100505681,ZNF541	IMR90	Hi-C	24141950	NAPA	59859	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr19	48101913	48102072	48101991	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85416	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	48102180	48102576	48102418	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85683	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr19	48277326	48277623	48277440	Y	SLC8A2,PLA2G4C	GLTSCR2,SEPW1,RPL23AP80	NA	NA	NA	NA	SEPW1	2206	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	48896382	48896733	48896528	Y	GRIN2D	TMEM143,SYNGR4,KDELR1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	3572	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	49092091	49092636	49092297	Y	BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11	SPHK2,RPL18,DBP	NA	NA	NA	NA	SPHK2	27912	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.34635124758485
chr19	49315464	49315783	49315738	Y	NA	BCAT2,HSD17B14	NA	NA	NA	NA	BCAT2	3178	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.2427857670014
chr19	49486890	49487028	49486959	Y	NA	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	7539	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	49493898	49494273	49494153	Y	NA	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	294	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	49495555	49495708	49495609	Y	SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2,CGB5	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	850	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.55348220875175
chr19	49524183	49524468	49524237	Y	CGB5	GYS1,RUVBL2,CGB5	NA	NA	NA	NA	CGB5	20673	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	50090402	50090603	50090503	Y	NA	PRRG2,NOSIP,PRR12	NA	NA	NA	NA	NOSIP	916	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	50092384	50092705	50092545	Y	BCL2L12	PRRG2,NOSIP,PRR12,RRAS	NA	NA	NA	NA	PRR12	195	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	50141205	50141513	50141452	Y	AKT1S1,TRPM4,RCN3,AP2A1,RRAS	NOSIP,PRR12,SCAF1,BCL2L12,IRF3,PRMT1	NA	NA	NA	NA	RRAS	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr19	50276330	50276635	50276461	Y	VRK3,BCL2L12,AP2A1,MED25	AP2A1,FUZ,MED25	NA	NA	NA	NA	AP2A1	8105	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	50414628	50414884	50414779	Y	RPS11,FCGRT,NR1H2,IL4I1,NUP62,NUP62,NUP62,NUP62,IL4I1,ATF5	PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62	NA	NA	NA	NA	ATF5	15075	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	50670716	50671002	50670859	Y	NA	MYH14	NA	NA	NA	NA	MYH14	18441	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	50833837	50834367	50834143	Y	MYH14,GPR32,SYT3,SYT3,SHANK1,LRRC4B,ASPDH,KCNC3	NR1H2,KCNC3	NA	NA	NA	NA	KCNC3	405	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.96774413108555
chr19	50835103	50835475	50835356	Y	NA	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	KCNC3	331	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	50835948	50836015	50835982	Y	IL4I1,NR1H2,KCNC3	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	KCNC3	1176	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr19	50860908	50861268	50861186	Y	PNKP,VRK3,NR1H2	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	24193	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	50872495	50872846	50872654	Y	NA	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	12615	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.13922028641795
chr19	51059089	51059663	51059341	Y	KLK4,KLK6,ACPT,SYT3,LOC342918,LRRC4B	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	46479	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	51339255	51339614	51339393	Y	KLK14,IGLON5,LRRC4B,SYT3,SYT3	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	33069	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	1272	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr19	52192842	52193550	52192951	Y	ZNF615,IGLON5,ZNF577,ZNF577	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	489	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	52194594	52195259	52195000	Y	ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	555	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	52310413	52310785	52310550	Y	ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC12,SIGLEC14,FPR1,FPR2,FPR3	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF577	81418	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	52996616	52996734	52996658	Y	NA	ZNF578,ZNF808	NA	NA	NA	NA	ZNF808	32171	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.76061316991865
chr19	53129559	53129725	53129643	Y	ZNF160,ZNF616,ZNF766,ZNF808,ZNF701,ZNF611,ZNF611,ZNF83	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF83	62024	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	53145294	53145545	53145446	Y	NA	ZNF83	NA	NA	NA	NA	ZNF83	46204	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	53150651	53150972	53150733	Y	NA	ZNF83	ZNF137P	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF83	40777	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	53237186	53237523	53237297	Y	ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611	ZNF83,ZNF611	NA	NA	NA	NA	ZNF611	860	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr19	53239075	53239317	53239102	Y	NA	ZNF83,ZNF611,ZNF600	NA	NA	NA	NA	ZNF611	2749	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr19	53425304	53425713	53425359	Y	ERVV-1,ZNF320	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	18141	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	53444729	53445104	53444918	Y	ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	875	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	53449736	53449992	53449814	Y	ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF347,ZNF347,ZNF83	ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	5882	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.2427857670014
chr19	53592651	53593387	53593361	Y	NA	ERVV-2,ZNF160,ZNF415	NA	NA	NA	NA	ZNF160	11302	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	ZNF665,ZNF677	NA	NA	NA	NA	ZNF677	28290	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	54048513	54048640	54048574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF813	79524	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	54116077	54116235	54116154	Y	NA	NA	DPRX	IMR90	Hi-C	24141950	MIR526B	79412	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr19	54145720	54146081	54145890	Y	NA	MIR526B	NA	NA	NA	NA	MIR526B	49566	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr19	54168099	54168226	54168160	Y	ZNF765,ZNF761,ZNF813,DPRX	MIR526B,MIR519B	NA	NA	NA	NA	MIR526B	27421	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr19	54288550	54288757	54288603	Y	ZNF765,ZNF813,ZNF331,DPRX	AC008753.3,MIR371A	NA	NA	NA	NA	MIR371A	172	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr19	55182524	55182669	55182597	Y	LILRB3,LILRA6,LILRB2,LILRA3,LILRA3,LILRA5,LAIR1,LILRA2,LILRA1,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,KIR3DL3	NA	NA	NA	NA	NA	LAIR2	175424	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	55464646	55464913	55464780	Y	EPS8L1,NLRP2,NLRP2	NLRP2,NLRP7	NA	NA	NA	NA	NLRP2	2148	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr19	55582606	55582776	55582718	Y	NA	RDH13,EPS8L1,PPP1R12C	NA	NA	NA	NA	EPS8L1	1218	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	55787779	55788010	55787914	Y	KIR3DL1,KIR2DS4,KIR3DL2,NCR1,ZNF628,SUV420H2,EPN1,PPP6R1	PPP6R1,HSPBP1,BRSK1	NA	NA	NA	NA	HSPBP1	1739	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	55983917	55984059	55984005	Y	RDH13,HSPBP1,ISOC2	ISOC2,ZNF628,NAT14	ZNF628,ISOC2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF628	1640	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	56061327	56061704	56061673	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1	SGK110	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF579	28507	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr19	56097081	56097467	56097273	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581	SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF579	6870	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	56118803	56119132	56118967	Y	COX6B2	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	7467	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	57020241	57020583	57020445	Y	ZNF582,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF835,ZIM2,PEG3,PEG3,LOC147670,ZNF471,ZNF71,ZNF470,ZFP28	ZNF667,ZNF471	NA	NA	NA	NA	ZNF471	3029	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	57351144	57351414	57351350	Y	ZNF543,AURKC,AURKC,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF471,ZFP28,ZNF470,LOC147670,ZNF835,PEG3,ZIM2,PEG3	PEG3,ZIM2	NA	NA	NA	NA	ZIM2	1047	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr19	57965552	57965851	57965609	Y	NA	ZNF17,ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773	NA	NA	NA	NA	ZNF749	20855	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	57976528	57976751	57976646	Y	NA	ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773	NA	NA	NA	NA	ZNF772	10187	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	57980425	57980680	57980553	Y	NA	ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773	NA	NA	NA	NA	ZNF772	6258	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	58162762	58163096	58162801	Y	NA	ZNF134,ZNF211,ZNF551	NA	NA	NA	NA	ZNF211	23001	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	58315114	58315751	58315446	Y	ZNF543,ZNF549,ZNF418,ZNF135,ZNF154,ZNF552	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	8530	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	58321012	58321020	58321017	Y	VN1R1,ZNF211,ZNF587,ZNF417,ZNF776,ZNF586,ZNF552	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	3261	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	58413801	58413982	58413868	Y	ZNF154,ZNF418	ZNF417,ZNF256	NA	NA	NA	NA	ZNF417	11996	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	58415823	58415990	58415970	Y	NA	ZNF417,ZNF256	NA	NA	NA	NA	ZNF417	9988	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	58557282	58557656	58557471	Y	NA	CTD-2368P22.1,ZNF606,ZSCAN1	NA	NA	NA	NA	ZSCAN1	13882	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr19	58742086	58742094	58742090	Y	NA	ZNF274,ZNF544,ZNF8	NA	NA	NA	NA	ZNF544	4126	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr19	59050036	59050316	59050176	Y	ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,ZNF132,ZNF324B,ZNF324,TRIM28,MZF1	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	ZBTB45	1758	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr2	393939	394227	394175	Y	SH3YL1	NA	NA	NA	NA	NA	SH3YL1	129541	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	605283	605589	605326	Y	NA	NA	TPO,MYT1L	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM18	69850	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	857378	857399	857389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM18	181939	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	915949	916124	916037	Y	NA	NA	TPO,SNTG2,MYT1L	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM18	240510	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	1608037	1608218	1608215	Y	NA	AC144450.2	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	18973	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	1659182	1659769	1659438	Y	NA	AC144450.2	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	31991	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	1722150	1722351	1722236	Y	NA	PXDN	NA	NA	NA	NA	PXDN	24273	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	1725053	1725311	1725239	Y	NA	PXDN	NA	NA	NA	NA	PXDN	21313	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	2617084	2617480	2617333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	762173	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	2850815	2851100	2850821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	528553	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	3528781	3528909	3528848	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	7274	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	5650103	5650571	5650382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX11	180228	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	6091756	6092149	6091862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX11	260957	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	7086912	7087171	7087063	Y	CMPK2,RSAD2	RNF144A	NA	NA	NA	NA	RNF144A	31389	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	7191649	7191931	7191786	Y	RNF144A	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144A	136126	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	7571177	7571382	7571249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144A	515654	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	8143779	8144081	8144017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC011747.4	577841	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	8198915	8199123	8199032	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC011747.4	522799	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	8259183	8259343	8259265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC011747.4	462579	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	8259720	8260124	8259943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC011747.4	461798	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	8597253	8597584	8597383	Y	KIDINS220	NA	LOC100506274,LINC00299,LOC339788	IMR90	Hi-C	24141950	AC011747.4	124338	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.6570476893352
chr2	8676767	8677094	8676914	Y	NA	AC011747.4	LOC100506274,LINC00299,ID2,LOC339788	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC011747.4	44828	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	8713737	8713978	8713829	Y	NA	AC011747.4	LOC100506274,ID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC011747.4	7944	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	9142736	9142998	9142867	Y	NA	MBOAT2	NA	NA	NA	NA	MBOAT2	794	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	9347909	9348072	9347942	Y	NA	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	3015	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	9374844	9375591	9375054	Y	YWHAQ,ASAP2	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	29950	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	9427801	9428115	9428020	Y	YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	82907	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	9641378	9641587	9641543	Y	NA	IAH1	NA	NA	NA	NA	IAH1	29591	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	10075100	10075410	10075131	Y	TAF1B	GRHL1	GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL1	7931	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.55348220875175
chr2	10153127	10153217	10153171	Y	NA	KLF11	NA	NA	NA	NA	KLF11	27759	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	CYS1	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr2	10330449	10330626	10330557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	69994	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	10341486	10341905	10341708	Y	KLF11	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	81031	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	11270081	11270242	11270156	Y	KCNF1,C2orf50	PQLC3	NA	NA	NA	NA	PQLC3	23082	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	11483029	11483376	11483266	Y	NA	ROCK2	NA	NA	NA	NA	ROCK2	3080	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	11624930	11625118	11625003	Y	ROCK2,GREB1,GREB1,GREB1	E2F6,GREB1	NTSR2,GREB1,MIR4429,FLJ33534,C2orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	E2F6	20633	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	11884050	11884543	11884432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPIN1	68329	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr2	14921579	14921878	14921874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84A	150769	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	15464031	15464396	15464252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	235058	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	15481171	15481552	15481362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	217902	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	15966617	15966728	15966673	Y	NA	RP11-120J4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-120J4.1	41335	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	16243100	16243429	16243303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCNOS	162729	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	16421806	16421992	16421870	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCNOS	341435	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	16575995	16576348	16576051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49A	269251	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	16827046	16827326	16827275	Y	FAM49A	FAM49A	NA	NA	NA	NA	FAM49A	18273	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	19150904	19151018	19150988	Y	NA	NA	MIR4757,OSR1	IMR90	Hi-C	24141950	RDH14	410958	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	20407883	20408194	20408074	Y	RHOB,SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	15000	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	20431248	20431615	20431535	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	8054	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	20432677	20432919	20432791	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	9483	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	20491517	20491908	20491876	Y	NA	NA	SDC1	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	58087	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	20534195	20534238	20534216	Y	NA	PUM2	NA	NA	NA	NA	PUM2	15757	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	20544740	20544866	20544805	Y	NA	PUM2	PUM2,HS1BP3	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	5129	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	22538536	22538625	22538581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	1067463	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	23275216	23275518	23275368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	330570	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	23412802	23412834	23412819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	193254	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr2	23631132	23631189	23631161	Y	NA	KLHL29	NA	NA	NA	NA	KLHL29	25044	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	23681941	23682000	23681953	Y	KLHL29	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	75853	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	24122171	24122336	24122254	Y	NA	ATAD2B,UBXN2A	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	25648	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	24213695	24213947	24213707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf44	56498	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	24324329	24324521	24324426	Y	NA	SF3B14,TP53I3,PFN4	NA	NA	NA	NA	TP53I3	17598	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	24491623	24491942	24491630	Y	ATAD2B,NCOA1,ITSN2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL36AP13	63439	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	24495048	24495317	24495183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL36AP13	60064	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	24512394	24512744	24512638	Y	NA	RPL36AP13	NA	NA	NA	NA	RPL36AP13	42637	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	24852047	24852369	24852206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOA1	139264	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	25438901	25439135	25438983	Y	PTRHD1,ADCY3	POMC	NA	NA	NA	NA	POMC	49129	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	25545894	25546051	25546003	Y	NA	DNMT3A	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	17408	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	25701614	25701880	25701747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	138155	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	26220678	26220902	26220866	Y	RAB10	KIF3C,UQCRHP2,RAB10	ASXL2,RAB10,FAM59B,KIF3C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UQCRHP2	5015	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	26259161	26259559	26259360	Y	RAB10	UQCRHP2,RAB10	NA	NA	NA	NA	RAB10	4185	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	26328559	26328812	26328686	Y	FAM59B,RAB10	NA	NA	NA	NA	NA	RAB10	73583	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	26522632	26522929	26522714	Y	NA	EPT1,GPR113	NA	NA	NA	NA	EPT1	6486	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	26567616	26567683	26567653	Y	NA	EPT1,GPR113	NA	NA	NA	NA	GPR113	2	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	26980806	26981182	26980970	Y	C2orf18	CENPA	OTOF,CENPA,C2orf70,CIB4,KCNK3,DPYSL5,MAPRE3,C2orf18	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CENPA	3975	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	27005355	27005756	27005547	Y	NA	CENPA	NA	NA	NA	NA	CENPA	20198	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	27194386	27194503	27194476	Y	NA	MAPRE3	NA	NA	NA	NA	MAPRE3	2906	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	27304052	27304486	27304234	Y	CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1	AGBL5,OST4,KHK,CGREF1,ABHD1	NA	NA	NA	NA	KHK	3129	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	27432989	27433207	27433072	Y	NA	SLC5A6,CAD	NA	NA	NA	NA	SLC5A6	619	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	27878874	27879165	27879028	Y	SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP	GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L	NA	NA	NA	NA	SLC4A1AP	5173	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	27988549	27989353	27988873	Y	NA	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	3231	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	28003613	28003725	28003670	Y	NA	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	11029	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	28319174	28319559	28319300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBKS	207209	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	28400759	28401210	28400868	Y	RBKS,BRE,BRE,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	212105	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	28492228	28492339	28492284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	120976	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	28567642	28567818	28567722	Y	NA	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	FOSL2	45497	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	28585996	28586077	28586031	Y	NA	FOSL2,AC104695.3	SLC4A1AP,MRPL33,RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2	IMR90	Hi-C	24141950	FOSL2	27238	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	28767576	28768254	28768064	Y	WDR43,TRMT61B,SPDYA	NA	NA	NA	NA	NA	AC104695.3	152037	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	29055098	29055343	29055221	Y	SPDYA	TRMT61B	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	35824	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	29075660	29075992	29075826	Y	TRMT61B	TRMT61B,WDR43	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	15175	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	29173330	29173730	29173529	Y	PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43	NA	NA	NA	NA	NA	WDR43	57821	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	29636095	29636359	29636230	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIP4	317524	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	29879383	29879747	29879565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YPEL5	488060	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	30440662	30440911	30440739	Y	NA	LBH,AC104698.1	LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	LBH	11486	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	30704285	30704557	30704478	Y	NA	LCLAT1	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	36193	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	30788740	30788786	30788763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	120648	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	30850038	30850385	30850172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	181946	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	33163246	33163288	33163260	Y	NA	NA	LTBP1	IMR90	Hi-C	24141950	TTC27	312147	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	36189102	36189392	36189167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	391677	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr2	36584242	36585529	36584872	Y	FEZ2,CRIM1	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	3173	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	36687110	36687380	36687132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	106041	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	36790527	36791707	36791646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79523	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr2	36795570	36795942	36795825	Y	FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	75288	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	36934290	36934412	36934353	Y	NA	VIT	NA	NA	NA	NA	VIT	12457	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	37383262	37383336	37383288	Y	NA	EIF2AK2,AC007390.4	NA	NA	NA	NA	EIF2AK2	1054	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	37763005	37763322	37763129	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	200289	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	37763462	37763512	37763507	Y	FAM82A1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	200099	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr2	37880894	37881162	37881056	Y	EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	82449	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	37884022	37884434	37884213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	79177	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	37893644	37893973	37893812	Y	QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	69638	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	37897080	37897760	37897461	Y	QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	65851	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	37938546	37938819	37938725	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	24792	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	37972203	37972477	37972340	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	8592	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	37989393	37989693	37989581	Y	QPCT,CDC42EP3	CDC42EP3	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	25782	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	38409612	38409978	38409795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATL2	192449	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	39334876	39335293	39335230	Y	NA	SOS1	NA	NA	NA	NA	SOS1	14193	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	39340813	39341200	39341198	Y	NA	SOS1	NA	NA	NA	NA	SOS1	8286	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	39665108	39665339	39665266	Y	NA	AC007246.3,MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	2655	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	39695061	39695250	39695144	Y	NA	AC007246.3,MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	32608	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	39722003	39722381	39722147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	59550	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	40767004	40767399	40767181	Y	NA	NA	SLC8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC8A1	68794	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	40899157	40899397	40899276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC8A1	62964	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	42161610	42162017	42161892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKDCC	111143	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	42329971	42330163	42329978	Y	NA	NA	EML4	IMR90	Hi-C	24141950	PKDCC	56811	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr2	42368874	42369229	42369001	Y	EML4	EML4	EML4,LOC388942,C2orf91,COX7A2L	IMR90	Hi-C	24141950	EML4	25261	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	42481657	42481775	42481735	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	EML4	87167	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	42567305	42567366	42567336	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	COX7A2L	82862	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	42696554	42696964	42696742	Y	NA	COX7A2L,KCNG3,MTA3	NA	NA	NA	NA	KCNG3	22273	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	43020336	43020977	43020619	Y	HAAO	HAAO	NA	NA	NA	NA	HAAO	2603	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	43037224	43037999	43037611	Y	NA	HAAO	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HAAO	19491	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr2	43265724	43265951	43265843	Y	NA	AC016735.2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90	Hi-C	24141950	AC016735.2	1038	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr2	43269026	43269323	43269208	Y	NA	AC016735.2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC016735.2	4340	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	43405877	43406433	43406206	Y	OXER1	ZFP36L2	ZFP36L2,THADA,LOC100129726	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	45315	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	43421229	43421631	43421263	Y	HAAO,THADA,THADA	ZFP36L2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	30117	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	43496273	43496611	43496398	Y	NA	ZFP36L2	NA	NA	NA	NA	ZFP36L2	44525	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	43686078	43686091	43686085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THADA	135094	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	43692800	43693176	43692988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THADA	128009	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	44007303	44007575	44007439	Y	NA	DYNC2LI1	NA	NA	NA	NA	DYNC2LI1	8125	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	44212195	44212421	44212308	Y	NA	LRPPRC	NA	NA	NA	NA	LRPPRC	8723	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	44718441	44718530	44718486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMKMT	131352	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	45160746	45160936	45160765	Y	SIX3	RP11-89K21.1	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	3402	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	45811183	45811373	45811272	Y	NA	SRBD1	NA	NA	NA	NA	SRBD1	25931	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	45974142	45974515	45974197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCE	97658	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	46265425	46265774	46265513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	253032	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	46303554	46303874	46303714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	214932	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	46456791	46456944	46456828	Y	NA	NA	PRKCE,EPAS1,PIGF	IMR90	Hi-C	24141950	EPAS1	61862	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	46525633	46526278	46526263	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	6827	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr2	46536857	46537129	46536993	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	18051	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	46542401	46542637	46542520	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	23595	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	46542843	46542999	46542890	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	24037	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	46554101	46554217	46554159	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	35295	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	46557036	46557117	46557077	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	38230	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	46586439	46586863	46586504	Y	EPAS1	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	67633	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	46614603	46614745	46614671	Y	RHOQ	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	95797	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	46993562	46993962	46993767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS5	69471	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	47171092	47171539	47171232	Y	TTC7A,MCFD2	TTC7A,MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	4098	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	47197841	47198107	47197954	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	30847	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	47229826	47230084	47229931	Y	TTC7A	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	62832	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	47282124	47282371	47282214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	115130	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	47296749	47297008	47296937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2	104732	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	47298687	47298930	47298712	Y	TTC7A,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2	102810	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	47499706	47499760	47499719	Y	C2orf61	NA	TTC7A,CALM2,SOCS5,MCFD2,C2orf61	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPCAM	70537	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	47790557	47790758	47790693	Y	KCNK12	KCNK12	NA	NA	NA	NA	KCNK12	5320	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	47795442	47795451	47795448	Y	MSH2,MSH6,FBXO11,KCNK12	KCNK12	NA	NA	NA	NA	KCNK12	627	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	47796567	47796699	47796698	Y	NA	KCNK12	NA	NA	NA	NA	KCNK12	489	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	48709527	48709805	48709665	Y	FOXN2,KLRAQ1	PPP1R21,STON1	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	43790	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr2	48941628	48941642	48941634	Y	STON1-GTF2A1L,STON1,STON1-GTF2A1L,LHCGR	NA	NA	NA	NA	NA	STON1	187106	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	54019039	54019374	54019207	Y	ACYP2,ASB3,ASB3,GPR75	CHAC2,ERLEC1	NA	NA	NA	NA	ERLEC1	6858	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr2	54196339	54196842	54196524	Y	ASB3,ASB3,PSME4	ACYP2,PSME4	NA	NA	NA	NA	PSME4	362	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	54796924	54797237	54797074	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	115502	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	54799241	54799892	54799606	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	117819	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	54801406	54802103	54801693	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	119984	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	55193261	55193511	55193360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	144246	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	55249584	55250267	55249993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	87490	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	55327778	55327923	55327859	Y	NA	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	9834	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	55379709	55379882	55379800	Y	SMEK2,RTN4	RTN4	NA	NA	NA	NA	RTN4	41952	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	55388870	55389267	55389215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	51113	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	57947710	57947899	57947805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	184887	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	58002154	58002414	58002211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	130372	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	58271974	58272513	58272036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	139188	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr2	58339709	58340405	58340032	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	126102	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	58384642	58384701	58384672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	81806	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	59983827	59983888	59983858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	625852	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	60962204	60962802	60962781	Y	NA	PAPOLG	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	18563	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	61112067	61112568	61112226	Y	REL	REL,RNU4-51P	NA	NA	NA	NA	REL	5411	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	61126778	61127091	61126822	Y	REL	REL,RNU4-51P	NA	NA	NA	NA	RNU4-51P	9347	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	61580039	61580318	61580309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	115586	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	61757728	61758222	61758112	Y	NA	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	5539	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	61921641	61922071	61921953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM161A	157207	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	61990946	61991094	61991044	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	88184	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.8641786505021
chr2	62422210	62422461	62422453	Y	NA	B3GNT2	NA	NA	NA	NA	B3GNT2	962	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.13922028641795
chr2	62492233	62492490	62492397	Y	B3GNT2	NA	COMMD1	IMR90	Hi-C	24141950	B3GNT2	70985	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	63122149	63122353	63122251	Y	EHBP1,EHBP1,OTX1	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	152839	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	63452850	63453196	63453026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	177658	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	63841794	63842078	63841905	Y	NA	MDH1	NA	NA	NA	NA	MDH1	28051	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	63842322	63842740	63842368	Y	UGP2	MDH1	NA	NA	NA	NA	MDH1	28579	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	13.7742089175989
chr2	63961711	63961835	63961773	Y	NA	NA	UGP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC096664.1	52272	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	64016874	64017257	64016918	Y	PELI1	WDPCP,UGP2	UGP2	IMR90	Hi-C	24141950	WDPCP	35720	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	64239166	64239247	64239208	Y	PELI1	VPS54	NA	NA	NA	NA	VPS54	4959	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	64245195	64245602	64245370	Y	NA	VPS54	NA	NA	NA	NA	VPS54	989	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	64504356	64504878	64504479	Y	NA	NA	PELI1,LINC00309	IMR90	Hi-C	24141950	PELI1	134768	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr2	64618667	64618950	64618804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGALSL	60153	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	64756167	64756526	64756224	Y	NA	AFTPH	NA	NA	NA	NA	AFTPH	6702	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	64772977	64773339	64773158	Y	SLC1A4,AFTPH	AFTPH	NA	NA	NA	NA	AFTPH	23512	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	64879120	64879608	64879340	Y	NA	NA	LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	96531	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	64978173	64978610	64978385	Y	CEP68	SERTAD2	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	2034	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr2	64994926	64995226	64995021	Y	SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2	SERTAD2	SERTAD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	18787	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr2	65086968	65087262	65087080	Y	AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	110829	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	65214378	65214996	65214823	Y	NA	SLC1A4	NA	NA	NA	NA	SLC1A4	767	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	65326595	65326952	65326834	Y	NA	CEP68,RAB1A	NA	NA	NA	NA	RAB1A	28288	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	66801899	66802241	66801940	Y	MEIS1	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS1-AS3	143297	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.17487509225245
chr2	68263709	68263719	68263714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1D	72361	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	68278313	68278683	68278526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1D	57397	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	68472906	68473226	68473141	Y	PPP3R1	PPP3R1	NA	NA	NA	NA	PPP3R1	8143	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	69036777	69036835	69036806	Y	ARHGAP25	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	201475	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	69663778	69663884	69663817	Y	AAK1	NFU1	NA	NA	NA	NA	NFU1	1018	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	69811685	69812001	69811856	Y	MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA4	57556	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	69857892	69858266	69858093	Y	NA	ANXA4,AAK1	NA	NA	NA	NA	ANXA4	11291	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr2	70000495	70000634	70000556	Y	MXD1	NA	NA	NA	NA	NA	GMCL1	54140	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	70057532	70057914	70057667	Y	C2orf42,AAK1,GMCL1	GMCL1	NA	NA	NA	NA	GMCL1	2758	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	70202880	70203539	70203203	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	15483	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	70205559	70206094	70205928	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	18162	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	70226911	70227071	70226991	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	39514	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	70294861	70295138	70295000	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	PCBP1	17447	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	70335985	70336314	70336204	Y	AAK1,C2orf42,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	8302	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr2	70350372	70350687	70350608	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	22689	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	70363059	70363462	70363144	Y	MXD1,C2orf42,PCBP1	PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	35376	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr2	70388970	70389092	70389031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	61287	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	71050473	71050659	71050592	Y	FIGLA,NAGK	NA	NA	NA	NA	NA	ADD2	57116	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	71129017	71129173	71129049	Y	NA	VAX2,ATP6V1B1	NA	NA	NA	NA	VAX2	3297	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	71679813	71679928	71679869	Y	NAGK,ZNF638,DYSF	DYSF	NA	NA	NA	NA	DYSF	961	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	71863629	71863881	71863809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYSF	184777	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	72012191	72012365	72012276	Y	NA	NA	DYSF	IMR90	Hi-C	24141950	DYSF	333339	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	72416850	72417011	72416931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	634159	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	72541323	72541406	72541365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	509764	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	72732418	72732763	72732614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	318407	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	73402910	73403369	73403123	Y	SFXN5	RAB11FIP5,NOTO,SMYD5	EMX1,RAB11FIP5,SFXN5,NOTO,PRADC1,CCT7,SMYD5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAB11FIP5	21061	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	73404053	73404270	73404162	Y	EGR4	RAB11FIP5,NOTO,SMYD5	EMX1,RAB11FIP5,SFXN5,NOTO,PRADC1,CCT7,SMYD5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAB11FIP5	22204	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	74152201	74152400	74152268	Y	NA	ACTG2,DGUOK	NA	NA	NA	NA	DGUOK	248	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.8641786505021
chr2	74153090	74153262	74153147	Y	NA	ACTG2,DGUOK	NA	NA	NA	NA	DGUOK	1137	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.13922028641795
chr2	74237302	74237493	74237398	Y	NA	DGUOK-AS1,AC073046.25,TET3	DGUOK	IMR90	Hi-C	24141950	TET3	9462	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	74276054	74276330	74276211	Y	NA	TET3	NA	NA	NA	NA	TET3	48214	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	74778065	74778079	74778072	Y	NA	PCGF1,DQX1,HTRA2,AUP1	NA	NA	NA	NA	AUP1	22999	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	75102185	75102665	75102322	Y	HK2	HK2,AC104135.3	NA	NA	NA	NA	AC104135.3	40610	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	75103488	75103536	75103515	Y	LBX2,HK2	HK2,AC104135.3	NA	NA	NA	NA	AC104135.3	39739	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	75114636	75114786	75114714	Y	NA	AC104135.3	NA	NA	NA	NA	AC104135.3	28489	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	75427361	75427621	75427415	Y	TACR1	TACR1	NA	NA	NA	NA	TACR1	2535	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	75894065	75894458	75894192	Y	NA	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	22156	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	75903279	75903482	75903481	Y	C2orf3,C2orf3	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	31370	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	76357037	76357141	76357089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCFC2	420922	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	80016891	80017267	80017079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	370994	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	81709176	81709459	81709306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	1320915	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr2	81781528	81781694	81781559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC098817.3	1261561	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	81820947	81821308	81821128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC098817.3	1221947	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	83460597	83460801	83460699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC098817.3	417342	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	83744068	83744130	83744079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC098817.3	700813	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr2	84908864	84908877	84908871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAH6	167285	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	85116002	85116322	85116077	Y	C2orf89,TMSB10	TMSB10	TMSB10	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB10	14427	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.38200605341935
chr2	85267777	85267839	85267811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM3P3	59978	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	86225018	86225303	86225260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	105975	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	86562971	86563338	86563025	Y	REEP1,REEP1	NA	NA	NA	NA	NA	REEP1	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	88913679	88914090	88914022	Y	EIF2AK3	EIF2AK3	NA	NA	NA	NA	EIF2AK3	11004	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	88988290	88988604	88988447	Y	NA	RPIA	NA	NA	NA	NA	RPIA	558	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	91815672	91815808	91815787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC096579.7	2652019	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	97291626	97292008	97291852	Y	NA	KANSL3	NA	NA	NA	NA	KANSL3	14516	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	97522669	97523105	97522935	Y	NA	CNNM3,ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	ANKRD39	837	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	97551553	97551756	97551659	Y	ARID5A,KIAA1310,CNNM4	ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	17059	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	98364129	98364314	98364298	Y	TMEM131,ZAP70,ZAP70	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-8P	84935	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-8P	164017	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr2	98598628	98598759	98598694	Y	NA	TMEM131	NA	NA	NA	NA	TMEM131	11629	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWA3B	121353	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	99064911	99065194	99064955	Y	MGAT4A,MGAT4A,INPP4A	INPP4A	NA	NA	NA	NA	INPP4A	5594	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	99118904	99119212	99119061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4A	59587	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	99213145	99213306	99213215	Y	INPP4A	COA5,UNC50	NA	NA	NA	NA	COA5	9672	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	99250910	99251133	99251091	Y	NA	COA5,UNC50	NA	NA	NA	NA	UNC50	27868	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	99452356	99452772	99452668	Y	TSGA10,LIPT1,LIPT1,INPP4A,MGAT4A,MGAT4A	NA	NA	NA	NA	NA	MGAT4A	106767	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	99453667	99453923	99453920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAT4A	108078	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	100026434	100026453	100026444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNDC9	71269	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	100937334	100937484	100937407	Y	LONRF2	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	94634	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	101791736	101791919	101791833	Y	RNF149	NA	TBC1D8,RPL31	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D8	75409	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	102353138	102353817	102353456	Y	IL1R1,RNF149,MAP4K4,MAP4K4	MAP4K4	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	41826	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	102478902	102479140	102479043	Y	MAP4K4,MAP4K4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	167590	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	105430210	105430587	105430504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS9	221854	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	105655685	105655967	105655739	Y	NA	MRPS9	NA	NA	NA	NA	MRPS9	3244	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	106008939	106009297	106009286	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	43673	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	106020017	106020290	106020154	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	32680	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	106364522	106364900	106364611	Y	TGFBRAP1,C2orf49,NCK2	NCK2	NA	NA	NA	NA	NCK2	5168	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	106474357	106474542	106474414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	115003	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	107886980	107887341	107887161	Y	ST6GAL2,ST6GAL2	NA	NA	NA	NA	NA	AC114755.2	983471	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	108841436	108841459	108841449	Y	NA	NA	SULT1C2P1	IMR90	Hi-C	24141950	GCC2	221558	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	110431985	110432251	110432119	Y	NA	NA	EDAR,SEPT10	IMR90	Hi-C	24141950	SOWAHC	62074	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	111879046	111879315	111879118	Y	NA	BCL2L11	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	4091	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	112699155	112699419	112699287	Y	NA	MERTK	NA	NA	NA	NA	MERTK	45099	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	113657771	113658101	113657937	Y	NA	NA	CKAP2L,IL1A,IL37,IL1B	IMR90	Hi-C	24141950	IL1A	117604	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	113847761	113847860	113847813	Y	IL1A,IL1B,IL37,IL36G,CBWD2,IL36B,IL1F10,IL1RN	IL36RN	NA	NA	NA	NA	IL36RN	33546	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	114457868	114458149	114458009	Y	ACTR3	MIR4782	NA	NA	NA	NA	MIR4782	18796	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	114469366	114469830	114469722	Y	SLC35F5	MIR4782,SLC35F5	NA	NA	NA	NA	MIR4782	7115	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr2	114634434	114634643	114634539	Y	NA	ACTR3	ACTR3	IMR90	Hi-C	24141950	ACTR3	10894	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	114672841	114673224	114672915	Y	NA	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	27304	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	115177421	115177704	115177562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR3	531884	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	116027244	116027630	116027326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR3	1381707	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	118432554	118432885	118432720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX18	137341	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	119661238	119661644	119661313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STEAP3	317740	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	120025136	120025424	120025403	Y	DBI	STEAP3	NA	NA	NA	NA	STEAP3	45752	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	120887789	120888032	120887910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM185B	90952	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	120905923	120906046	120905986	Y	EPB41L5,EPB41L5	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM185B	72938	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	120971736	120972136	120971936	Y	NA	TMEM185B,RALB	NA	NA	NA	NA	TMEM185B	6848	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	122536391	122536587	122536559	Y	NA	TSN	NA	NA	NA	NA	TSN	43712	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr2	122862808	122863193	122863011	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSN	370129	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	122905373	122905708	122905509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSN	412694	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	122994452	122994784	122994618	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSN	501773	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	127841716	127842041	127841975	Y	NA	BIN1	NA	NA	NA	NA	BIN1	20890	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	127863441	127863795	127863513	Y	NA	BIN1	NA	NA	NA	NA	BIN1	510	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	128090505	128090721	128090714	Y	NA	ERCC3	NA	NA	NA	NA	ERCC3	40753	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	128119420	128119722	128119576	Y	NA	MAP3K2	IWS1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K2	24319	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	128143711	128144108	128144023	Y	SFT2D3,MAP3K2	NA	CYP27C1,IWS1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K2	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	128258405	128258697	128258648	Y	NA	RNU4-48P,IWS1	NA	NA	NA	NA	IWS1	23765	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	128283052	128283292	128283172	Y	MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L	IWS1	NA	NA	NA	NA	IWS1	590	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	128562322	128562673	128562571	Y	NA	WDR33	LIMS2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR33	4088	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	128598749	128599093	128599053	Y	IWS1,SFT2D3,AMMECR1L	WDR33,POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	14638	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	128617356	128617514	128617464	Y	NA	POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	3625	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr2	129038080	129038421	129038313	Y	NA	HS6ST1	NA	NA	NA	NA	HS6ST1	35730	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	130928401	130928722	130928538	Y	NA	MZT2B,SMPD4	NA	NA	NA	NA	MZT2B	8588	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	131148815	131149203	131148908	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C,CCDC115,PTPN18	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37235	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	131149333	131149678	131149410	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37753	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	131828545	131828813	131828794	Y	NA	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	FAM168B	20220	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	132152335	132152426	132152381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MZT2A	95890	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	133025188	133025675	133025588	Y	NA	NA	GPR39,ANKRD30BL,CEP68,STAMBP,NRXN1,KCNIP3,ADCY3,EML4,DDX1,MIR4778,STARD7,TGOLN2,MAP3K2,RNU4ATAC,GCC2,CNNM3,LHCGR,LOC100189589,CLASP1,GMCL1,SULT6B1,ANKRD20A8P,MRPS9,NMS,RHOQ,CAPG,DGUOK,SMYD5,MPHOSPH10,ARID5A,HAAO,RMND5A,LOC440905,LIMS2,FOXN2,GPAT2,CIB4,LOC100216479,FEZ2,LOC729121,TTC7A,RTKN,CDKL4,POLR2D,LOC339803,EMILIN1,LYG1,MYCNOS,STEAP3,FAM49A,CKAP2L,EFR3B,OTOF,HK2,CNGA3,GEMIN6,ALK,SPR,LOC440895,IL18RAP,LOC375190,PTRHD1,C2orf81,MATN3,PEX13,FABP1,NPHP1,FAM161A,DDX18,ADRA2B,KRCC1,BIRC6,CCDC74B,C2orf49,THNSL2,ST3GAL5,NAT8B,ERCC3,CCDC88A,QPCT,LOC100506123,TLX2,REG1A,LOC284950,CHCHD5,SMC6,LOC254128,PNPT1,DBI,LOC100505716,LOC285103,TMSB10,RAD51AP2,MGAT4A,PLEKHH2,ELMOD3,PKDCC,GALM,GLI2,LIMS3-LOC440895,RPL31,ASXL2,LOC100132215,SMEK2,FBLN7,EPT1,SRSF7,DUSP2,CYP4F30P,LOC100131320,LOC388948,ATOH8,GCFC2,ACTR2,C2orf27B,IWS1,GPR17,MTIF2,LBX2,POU3F3,SUPT7L,SPDYA,TEKT4,ANKRD39,WDR54,RAB1A,IL36A,FAM123C,LOC285000,REV1,GPR148,MRPL33,EPB41L5,RPS27A,CEBPZ,EHBP1,RALB,APOB,DUSP11,LOC400958,CRIPT,CYP1B1-AS1,CHAC2,GFPT1,NPAS2,PTCD3,LOC389023,TRIM54,SFXN5,MALL,NT5C1B-RDH14,LOC100507334,POLE4,C2orf18,IL1A,C2orf73,CD8A,ATL2,LOC654342,UNC50,ITPRIPL1,HADHB,IL1R1,ZFP36L2,MAP4K3,FIGLA,LOC440900,ZNF512,POTEE,PDCL3,ABCG8,CCDC142,MYADML,MIR4783,PCBP1-AS1,PFN4,LOC150568,SEMA4F,TMEM177,LOC401010,MRPL19,GCKR,TTC32,GGCX,LOC151009,THUMPD2,LOC728537,IL36B,PCDP1,VAMP5,LRRTM4,SF3B14,SULT1C2,RGPD4,MCEE,AAK1,SFTPB,SLC5A7,SCTR,ACTR1B,CIAO1,DNAJC5G,SIX3,SERTAD2,PIGF,CD8B,GGT8P,SLC9A2,NFU1,SNAR-H,POTEKP,VWA3B,SH3RF3,FAHD2B,UBXN2A,LOC284998,MEIS1,FAM98A,LOC90784,LAPTM4A,CCDC104,LOC100499194,MAPRE3,PPP1R21,ANXA4,LOC440910,LOC100506421,FAM84A,GKN2,TMEM185B,RASGRP3,ABHD1,AFF3,CRIM1,MOGS,BOLA3,DNAJC27,MZT2B,MAL,NRBP1,UXS1,PRKD3,SOCS5,FLJ30838,TTC31,RNF103-CHMP3,HADHA,MIR4435-1,NOTO,RPL23AP7,C1QL2,CHMP3,RNF149,AUP1,TBC1D8,AGBL5,GYPC,MSH6,LOC728730,VPS54,EIF5B,GALNT14,PLEK,GEN1,LOC100505876,MIR4432,VAMP8,ST6GAL2,C2orf91,KIAA1841,MORN2,LOC100128590,IL1RL2,BMP10,EIF2B4,ARHGEF4,REG3A,SULT1C3,ADD2,TSN,IFT172,TSGA10,HNRPLL,DPY30,LGALSL,ZNF2,ZNF638,IMP4,CCDC138,INSIG2,ACOXL,FBXO41,DYSF,C2orf51,TMEM214,TMEM127,ALMS1P,CDC42EP3,MZT2A,TMEM150A,EGR4,FOXI3,C2orf16,FOSL2,OR7E91P,UGGT1,TMEM87B,TXNDC9,NBAS,CREG2,RGPD6,ABCG5,PUM2,RNF181,LINC00116,LOC646743,MIR4757,C2orf78,MRPL35,LOC541471,INHBB,RHOB,LOC388942,STON1-GTF2A1L,DCTN1,CCDC115,LOC100129726,KCNS3,UNQ6975,ZAP70,NAGK,C2orf53,MIR4436A,C2orf76,THADA,VRK2,SLC5A6,RABL2A,CCDC75,PLEKHB2,MXD1,ANKRD36BP2,REG1P,MIR217,C2orf63,ASTL,WDR33,NLRC4,XPO1,RETSAT,TUBA3E,TRIM43B,CAMKMT,BCL2L11,PUS10,PAIP2B,RPIA,SH2D6,PCBP1,USP39,REG3G,FSHR,MYCN,SEMA4C,ANKRD23,C1D,IL1R2,MKI67IP,MOB1A,LOC389043,ACTR3BP2,EPCAM,MAT2A,PCGF1,RGPD2,BIN1,KANSL3,LOC100287010,LOXL3,CD207,DPYSL5,VAX2,PPP1CB,POLR1A,LOC644838,BCL11A,SULT1C4,ANKRD36,DBIL5P2,B3GNT2,LINC00309,ARHGEF33,TFCP2L1,C2orf89,IL1F10,OTX1,PPM1B,GKN1,ANTXR1,FKBP1B,ATP6V1B1,CCT7,CCDC74A,TEX261,MTA3,MFSD9,COX5B,RGPD1,FOXD4L1,FLJ42351,EFEMP1,SLC30A6,FAM168B,GDF7,NEURL3,TUBA3D,POLR1B,USP34,MSH2,MFSD2B,EXOC6B,RANBP2,LRRTM1,LOC100286979,C2orf84,KCNK12,MIR4267,CAD,FAM138B,SPRED2,HTRA2,ACTG2,AHSA2,SLC30A3,RBKS,NCK2,MIR548AD,FLJ16341,TRMT61B,SLC1A4,PROKR1,ATAD2B,LOC100630918,LCLAT1,CAPN14,LMAN2L,C2orf65,CTNNA2,SRD5A2,MIR4265,CCT4,INPP4A,SLC20A1,COX7A2L,SNRNP27,TMEM178,MIR4266,SULT1C2P1,MIR4436B1,MRPS5,IMMT,ALMS1,CYP27C1,HS6ST1,LOC728819,WTH3DI,CHST10,LOC375196,SMPD4,OSR1,PAPOLG,KRTCAP3,EPAS1,MDH1,C2orf74,IL18R1,LOC1720,CCDC164,LOC285074,VIT,PLGLB2,C2orf61,LONRF2,CCDC85A,UCN,C2orf28,DQX1,FAM178B,CENPA,MRPL30,MERTK,TCF23,DNAJC27-AS1,FAM176A,IL36G,IL1B,LIPT1,ZNF513,COA5,CLEC4F,PPP3R1,BRE,C2orf15,RAB6C,DOK1,PLGLA,GPR45,MIR4780,TMEM131,CBWD2,TSPYL6,LOC388946,CLIP4,C2orf42,SNRPG,LOC654433,LOC100505624,PTPN18,C2orf71,POMC,EML6,KIF3C,WASH2P,LOC150776,GTF3C2,WDR43,MEMO1,ETAA1,TRIM43,MRPL53,CAPN13,MIR4264,TIA1,SPTBN1,CENPO,C2orf55,FLJ12334,HS1BP3,COMMD1,IL1RN,LOC285033,ANKRD36B,LOC440894,PRADC1,C2orf68,TCF7L1,TMEM37,ATP6V1E2,SIX2,REG1B,CYP26B1,PREPL,WDR35,PAX8,OST4,CGREF1,PELI1,REL,POTEF,ZC3H8,KLHL29,DHX57,C2orf40,CNTNAP5,C2orf44,TGFBRAP1,PRKCE,LRPPRC,SLC35F5,FBXO48,GPR113,SUCLG1,LOC100288911,NCAPH,WDR92,TACR1,MARCO,MIR216A,CALM2,BUB1,ANKRD53,SLC4A1AP,DDX11L2,LOC100134259,FANCL,ACYP2,ITSN2,DNMT3A,PROM2,LYG2,LOC100287216,GPR75-ASB3,PCYOX1,MAP4K4,PNO1,LOC151534,YIPF4,PREB,ANAPC1,EMX1,REEP1,GPN1,PRORSD1P,ZNF514,WDPCP,KDM3A,NAT8,KCMF1,YPEL5,C2orf27A,LIMS1,EDAR,DYNC2LI1,LOC339807,SEPT10,FUNDC2P2,EHD3,SLC9A4,RAB10,FAM179A,HEATR5B,IL37,OXER1,SOWAHC,AFTPH,LOC389033,LOC729234,DNAH6,TET3,SMYD1,RGPD8,UGP2,LOC442028,STRN,CFC1B,LTBP1,FNDC4,MIR3682,MYO7B,ZC3H6,SNX17,TGFA,C2orf56,TPRKB,TMEM17,SAP130,FBXO11,AMMECR1L,RFX8,EIF2AK3,GNLY,PLB1,MSGN1,SLC3A1,TMEM182,C2orf29,LINC00486,FAM59B,PTPN4,CNNM4,RTN4,ACTR3,MITD1,LOC645949,IL1RL1,PPM1G,ASB3,INO80B-WBP1,CNRIP1,XDH,LBH,IL36RN,SLC8A1,PROC,LINC00152,KHK,EN1,NCOA1,FAM82A1,KCNK3,FAM136A,FER1L5,PSD4,SNORD89,SLC4A5,MPV17,SDC1,SPAST,VSNL1,ERLEC1,MIR216B,SRBD1,APLF,CCDC93,LOC84931,CCDC121,C2orf43,SFT2D3,DTNB,RGPD3,TTL,FHL2,LOC100133985,SOS1,TP53I3,RAB11FIP5,ARHGAP25,MTHFD2,BOLA3-AS1,KCNG3,EIF2AK2,DPP10,CYP1B1,C2orf70,TTC27,SNRNP200,PSME4,FAHD2A,MCFD2	IMR90	Hi-C	24141950	GPR39	146472	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr2	133914495	133914622	133914567	Y	NCKAP5	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD1	487343	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	135691118	135691392	135691265	Y	TMEM163,ACMSD,CCNT2	CCNT2,CCNT2-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNT2-AS1	16838	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	135701216	135701448	135701313	Y	NA	CCNT2,CCNT2-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNT2-AS1	26936	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	136268329	136268541	136268430	Y	NA	ZRANB3,R3HDM1	NA	NA	NA	NA	ZRANB3	18265	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	136774526	136774651	136774592	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	AC093391.2,DARS	NA	NA	NA	NA	DARS	32856	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	138909425	138909801	138909599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC097721.2	347467	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	139198512	139198615	139198564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC097721.2	58653	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	139226248	139226635	139226522	Y	NA	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	AC097721.2	30633	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	139260181	139260311	139260246	Y	SPOPL	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	SPOPL	2810	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	139289140	139289372	139289256	Y	NA	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	SPOPL	31769	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	140168949	140169074	140169000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOPL	911578	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	4.5568811456718
chr2	140478818	140479210	140479014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOPL	1221447	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	141613060	141613069	141613065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	1274201	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	141930622	141930813	141930718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	956457	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	143787887	143787977	143787916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	900617	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	147562975	147563022	147563002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PABPC1P2	219963	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	148671388	148671433	148671412	Y	ORC4,ORC4,ORC4,ORC4,ORC4	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR2A	71302	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	149267026	149267240	149267133	Y	EPC2	NA	NA	NA	NA	NA	EPC2	132769	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	149403654	149404182	149403820	Y	NA	EPC2	NA	NA	NA	NA	EPC2	3645	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	149527542	149527937	149527740	Y	EPC2	NA	NA	NA	NA	NA	EPC2	127533	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	149925246	149925613	149925433	Y	NA	LYPD6B	NA	NA	NA	NA	LYPD6B	32625	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	150505364	150505670	150505432	Y	NA	NA	RBM43,RND3	IMR90	Hi-C	24141950	MMADHC	63034	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	152144821	152144962	152144854	Y	RIF1,RIF1,RIF1,NMI	RBM43,NMI	NA	NA	NA	NA	NMI	250	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.34635124758485
chr2	153275296	153275683	153275311	Y	FMNL2	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	85545	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	153347389	153347769	153347704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	157638	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	159354074	159354382	159354127	Y	NA	PKP4	NA	NA	NA	NA	PKP4	42598	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	160095412	160095531	160095474	Y	NA	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	45779	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	160097747	160098072	160097910	Y	TANC1	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	43238	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	162197345	162197490	162197464	Y	NA	PSMD14,AC009299.5	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	1508	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	164563373	164563497	164563435	Y	FIGN	FIGN	NA	NA	NA	NA	FIGN	27025	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	165371083	165371396	165371192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COBLL1	326793	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	165430240	165430431	165430256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COBLL1	267758	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	166161416	166161745	166161474	Y	SCN2A,SCN2A	NA	NA	NA	NA	NA	COBLL1	463227	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	170218108	170218468	170218381	Y	NA	LRP2	NA	NA	NA	NA	LRP2	913	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr2	170221024	170221462	170221353	Y	NA	LRP2	NA	NA	NA	NA	LRP2	3829	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	170856738	170857087	170856755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBR3	174770	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	171786835	171787228	171786978	Y	TLK1	GORASP2	NA	NA	NA	NA	GORASP2	3861	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	172083820	172084110	172083935	Y	NA	TLK1	NA	NA	NA	NA	TLK1	1714	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	172792873	172793084	172792979	Y	NA	HAT1	NA	NA	NA	NA	HAT1	15915	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	172960097	172960530	172960322	Y	DLX1,DLX2	DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5098	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	173302497	173302807	173302540	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	12415	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	173306862	173307108	173306983	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	16780	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	174884477	174884877	174884864	Y	SP3,SP3	NA	CIR1,SP3,ZAK	IMR90	Hi-C	24141950	SP3	56047	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	174885561	174886314	174885772	Y	SP3	NA	CIR1,SP3,ZAK	IMR90	Hi-C	24141950	SP3	57131	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	174886492	174886884	174886848	Y	SP3	NA	CIR1,SP3,ZAK,OLA1	IMR90	Hi-C	24141950	SP3	58062	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	174888201	174889400	174889077	Y	SP3,SP3	NA	SP3,OLA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP3	59771	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	174889919	174890381	174890067	Y	NA	NA	SP3,OLA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP3	61489	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	174900688	174901381	174900887	Y	SP3,SP3	NA	SP3,CDCA7,OLA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP3	72258	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	174903325	174903468	174903398	Y	SP3,SP3	NA	CDCA7,OLA1,SP3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP3	74895	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	175248509	175248787	175248661	Y	SP3,SP3	CIR1,SCRN3	NA	NA	NA	NA	CIR1	9656	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	175519164	175519290	175519227	Y	NA	WIPF1	NA	NA	NA	NA	WIPF1	26354	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	176866139	176866392	176866261	Y	KIAA1715	KIAA1715	NA	NA	NA	NA	KIAA1715	572	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	177426339	177426739	177426504	Y	NA	NA	HOXD-AS2,HOXD8,MIR10B,HOXD9,HOXD4,HOXD3,HOXD-AS1,HOXD1,LOC375295	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01117	73699	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	179692765	179693175	179692935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC141	219638	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	179923228	179923504	179923450	Y	NA	CCDC141	NA	NA	NA	NA	CCDC141	10415	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	187390995	187391341	187391159	Y	NA	ZC3H15	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	42112	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	187953968	187954250	187954072	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007319.1	88021	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	188326523	188326725	188326579	Y	NA	CALCRL	NA	NA	NA	NA	CALCRL	15336	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	191075616	191075973	191075872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP1	130223	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	191814146	191814507	191814301	Y	STAT1	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	41786	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	191825811	191826187	191826065	Y	NAB1,GLS,STAT1	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	30106	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	191826753	191827142	191827070	Y	NA	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	29151	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	191876125	191876480	191876302	Y	NA	AC067945.3,STAT1	NA	NA	NA	NA	STAT1	7206	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	191984586	191984681	191984634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAT1	100900	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	192059001	192059141	192059071	Y	STAT4	MYO1B	MYO1B,STAT4	IMR90	Hi-C	24141950	MYO1B	48770	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	192544982	192545232	192545125	Y	OBFC2A	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1B	437071	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	192562556	192562918	192562693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1B	454645	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	196478695	196478993	196478847	Y	NA	SLC39A10	SLC39A10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC39A10	39994	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.6570476893352
chr2	196523919	196524096	196523991	Y	SLC39A10	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	85218	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	196531201	196531576	196531334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	92500	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	197934286	197934620	197934500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC013264.2	126095	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr2	198123324	198123674	198123472	Y	SF3B1,COQ10B,ANKRD44	ATP5G2P3	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P3	2161	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	201172384	201172536	201172446	Y	NA	SPATS2L	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	3780	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	201829288	201829721	201829590	Y	KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2	AC005037.3,ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	2885	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	202897639	202898135	202897874	Y	FZD7	FZD7	NA	NA	NA	NA	FZD7	329	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	FZD7	NA	NA	NA	NA	FZD7	872	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr2	203830574	203830808	203830669	Y	NA	WDR12,NBEAL1	NA	NA	NA	NA	WDR12	46713	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	205836059	205836159	205836109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARD3B	427543	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	206005178	206005232	206005204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	539482	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	206545726	206545923	206545825	Y	NA	NRP2	NA	NA	NA	NA	NRP2	1012	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	206948392	206948813	206948647	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	INO80D	214	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr2	208041079	208041402	208041259	Y	CREB1	NA	KLF7	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB1	351059	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	208348288	208348659	208348648	Y	NA	CREB1	KLF7,CCNYL1,FASTKD2,METTL21A,CREB1,FZD5	IMR90	Hi-C	24141950	CREB1	43802	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	208366657	208366920	208366770	Y	METTL21A,CREB1	CREB1	KLF7,CREB1,METTL21A,CCNYL1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB1	25541	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	208395422	208395980	208395659	Y	PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1	CREB1	NA	NA	NA	NA	CREB1	2961	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	208472249	208472458	208472354	Y	NA	METTL21A	NA	NA	NA	NA	METTL21A	16194	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	208484440	208484730	208484623	Y	PLEKHM3,CREB1,METTL21A,METTL21A	METTL21A	NA	NA	NA	NA	METTL21A	3922	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	208609048	208609450	208609191	Y	NA	CCNYL1,FZD5	NA	NA	NA	NA	FZD5	22837	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	208622865	208623146	208623006	Y	NA	CCNYL1,FZD5	NA	NA	NA	NA	FZD5	9141	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	208656928	208657357	208657034	Y	FZD5	FZD5	PLEKHM3,CCNYL1,FZD5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FZD5	24641	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr2	208839036	208839224	208839180	Y	CREB1,FZD5,PIKFYVE,PLEKHM3	PLEKHM3	NA	NA	NA	NA	PLEKHM3	49060	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.6570476893352
chr2	208977857	208977982	208977919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHM3	89573	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	210872654	210873081	210872784	Y	C2orf67	RPE	NA	NA	NA	NA	RPE	7365	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	211404935	211405006	211404955	Y	CPS1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL1	64559	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	216216233	216216482	216216439	Y	NA	ATIC	NA	NA	NA	NA	ATIC	41693	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	216222058	216222324	216222191	Y	FN1	ATIC	NA	NA	NA	NA	ATIC	47518	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	217556283	217557311	217557110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMB3P2	82601	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	218479224	218479603	218479411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIRC3	139713	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	218698867	218699220	218699042	Y	PNKD	NA	NA	NA	NA	NA	DIRC3	79551	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	219177286	219177625	219177456	Y	NA	AAMP,PNKD,TMBIM1,AC021016.7,C2orf62	NA	NA	NA	NA	TMBIM1	21977	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	219188663	219189129	219189071	Y	ARPC2,ARPC2,TTLL4,CYP27A1,TMBIM1,PNKD,SLC11A1	TMBIM1,AC021016.7,C2orf62,AC021016.6	NA	NA	NA	NA	AC021016.7	27669	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	219270976	219271406	219271230	Y	CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1	AC021016.6,CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	9997	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	219271996	219272374	219272308	Y	USP37	AC021016.6,CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	11017	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	219434664	219435146	219434778	Y	USP37	USP37,RQCD1	NA	NA	NA	NA	RQCD1	3361	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	219759139	219759434	219759370	Y	WNT6,WNT10A	WNT6,WNT10A	NA	NA	NA	NA	WNT10A	16054	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr2	219760047	219760178	219760137	Y	WNT10A	WNT6,WNT10A	NA	NA	NA	NA	WNT10A	16962	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	219761045	219761550	219761369	Y	USP37,ZNF142,ZFAND2B,TUBA4A,CNPPD1,ANKZF1,ANKZF1,WNT10A	WNT6,WNT10A	NA	NA	NA	NA	WNT10A	17960	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	219773515	219774011	219773826	Y	USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A	WNT10A	NA	NA	NA	NA	WNT10A	30430	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.76061316991865
chr2	219774108	219774202	219774159	Y	USP37,TTLL4,NHEJ1,ANKZF1,ANKZF1	WNT10A	NA	NA	NA	NA	WNT10A	31023	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	220460061	220460205	220460133	Y	NA	INHA,OBSL1,STK11IP,SLC4A3	NA	NA	NA	NA	STK11IP	377	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	FARSB	691645	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.2427857670014
chr2	223462160	223462364	223462326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	56692	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	224569350	224569680	224569515	Y	NA	NA	AP1S3	IMR90	Hi-C	24141950	AP1S3	131064	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	224761528	224761781	224761678	Y	WDFY1	WDFY1	NA	NA	NA	NA	WDFY1	46323	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	225392496	225392764	225392746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	55346	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	228578021	228578290	228578242	Y	NA	SLC19A3	NA	NA	NA	NA	SLC19A3	2438	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	231822084	231822525	231822233	Y	GPR55	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf72	77680	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	231922388	231922877	231922602	Y	NA	C2orf72,PSMD1	NA	NA	NA	NA	PSMD1	2810	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	231965808	231966135	231965987	Y	NA	PSMD1	NA	NA	NA	NA	PSMD1	46230	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	232276597	232276762	232276665	Y	B3GNT7	B3GNT7,SNORD82	NA	NA	NA	NA	B3GNT7	18343	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr2	232277113	232277443	232277206	Y	C2orf72	B3GNT7,SNORD82	NA	NA	NA	NA	B3GNT7	18859	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00471	91838	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr2	232478392	232478857	232478528	Y	DIS3L2,PTMA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90748	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	232478879	232479328	232479053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90277	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	232479434	232479727	232479552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	89878	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	232485741	232486244	232485851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	83361	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	232507409	232507767	232507481	Y	NA	NA	PDE6D	IMR90	Hi-C	24141950	PTMA	61838	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr2	232526700	232527324	232527119	Y	DIS3L2	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	42281	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr2	232537656	232538064	232537748	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	31541	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	232545684	232546083	232545868	Y	COPS7B	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	23522	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	232551717	232552221	232552147	Y	NPPC	PTMA	PTMA,PDE6D	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTMA	17384	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	232566219	232566469	232566340	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	3136	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	233250431	233250842	233250658	Y	NA	ALPP,AC068134.8,ALPPL2	NA	NA	NA	NA	AC068134.8	6047	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	233252147	233252689	233252515	Y	NA	ALPP,AC068134.8,ALPPL2	NA	NA	NA	NA	AC068134.8	7763	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.00339893692005
chr2	233279498	233279714	233279606	Y	NA	ALPP,AC068134.8,ALPPL2	NA	NA	NA	NA	ALPPL2	9945	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	235073247	235073563	235073459	Y	ARL4C	NA	NA	NA	NA	NA	MSL3P1	298157	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	235748055	235748426	235748121	Y	NA	NA	TRPM8,SH3BP4	IMR90	Hi-C	24141950	SH3BP4	110191	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	235863329	235863490	235863430	Y	SH3BP4	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	4712	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	236453392	236453640	236453439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	52659	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	236489079	236489125	236489102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	88346	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	236552972	236553189	236553098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	152239	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	236910231	236910384	236910319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	163706	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	237485035	237485347	237485185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQCA1	70850	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	237764752	237765407	237765371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS8	226548	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	239194414	239194788	239194667	Y	NA	HES6,PER2,TRAF3IP1	LOC643387,LOC151174,HES6	IMR90	Hi-C	24141950	PER2	1955	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	240080723	240081253	240081085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	239877	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	241190569	241190767	241190645	Y	NA	AC124861.1	GPC1,ANKMY1,PP14571	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC124861.1	2685	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr2	241366341	241366661	241366471	Y	GPR35,GPC1	GPC1,AC110619.2	NA	NA	NA	NA	GPC1	6427	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr2	241395144	241395496	241395485	Y	NA	GPC1,AC110619.2	NA	NA	NA	NA	AC110619.2	1013	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr2	242262018	242262304	242262161	Y	NA	SEPT2,HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	HDLBP	7542	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr2	242480531	242480899	242480752	Y	NA	STK25,BOK	NA	NA	NA	NA	BOK	15237	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	242696673	242697059	242696869	Y	ATG4B,D2HGDH	D2HGDH,GAL3ST2	NA	NA	NA	NA	GAL3ST2	17181	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr2	242702443	242702859	242702736	Y	ATG4B,PDCD1,D2HGDH	D2HGDH,GAL3ST2	NA	NA	NA	NA	GAL3ST2	11381	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	351057	351207	351131	Y	NA	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	8054	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	352488	352859	352625	Y	SRXN1,FAM110A,RBCK1	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	6402	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr20	483361	483443	483402	Y	NA	TBC1D20,CSNK2A1	NA	NA	NA	NA	CSNK2A1	39022	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	641092	641461	641194	Y	NA	SRXN1	SRXN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SRXN1	9078	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr20	709042	709425	709354	Y	NA	NA	CSNK2A1,RSPO4,SRXN1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SRXN1	77028	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	823028	823308	823133	Y	FAM110A	FAM110A	NA	NA	NA	NA	FAM110A	10670	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr20	1083260	1083345	1083304	Y	SCRT2	PSMF1	RSPO4	IMR90	Hi-C	24141950	PSMF1	8561	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr20	1119535	1119804	1119673	Y	NA	PSMF1,TMEM74B	NA	NA	NA	NA	PSMF1	27629	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	1167289	1167675	1167648	Y	NA	TMEM74B	NA	NA	NA	NA	TMEM74B	3230	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	1307828	1308261	1308086	Y	SDCBP2	NA	NA	NA	NA	NA	SNPH	62868	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	1332285	1332772	1332374	Y	C20orf46,SDCBP2	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	39034	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr20	1372355	1372517	1372472	Y	NA	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	549	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	1372569	1372994	1372930	Y	PSMF1,SDCBP2,SIRPB2,SIRPB1	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	763	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	1398801	1399138	1399021	Y	FKBP1A	FKBP1A	SNPH,RAD21L1,FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495	IMR90	Hi-C	24141950	FKBP1A	26995	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr20	1757792	1758093	1758078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSFL1C	305305	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	2802059	2802221	2802148	Y	CPXM1	CPXM1,TMEM239,C20orf141,VPS16,PTPRA	NA	NA	NA	NA	C20orf141	8426	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr20	3155446	3155862	3155811	Y	EBF4,PTPRA,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	16604	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr20	3156363	3156554	3156472	Y	EBF4,PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	17521	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	3200687	3201082	3200885	Y	NA	DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	ITPA	13173	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	3472887	3473113	3473000	Y	NA	ATRN	NA	NA	NA	NA	ATRN	23200	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr20	3932717	3933076	3932937	Y	NA	NA	MIR103B2,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF24	61153	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr20	4116351	4116485	4116423	Y	PANK2,PANK2,SMOX	SMOX	ADRA1D,SMOX	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	16724	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr20	4203123	4203484	4203336	Y	NA	ADRA1D	NA	NA	NA	NA	ADRA1D	24237	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	4792276	4792776	4792707	Y	SLC23A2,CDS2,RASSF2,RASSF2	RASSF2	NA	NA	NA	NA	RASSF2	9515	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	4941641	4941708	4941700	Y	NA	SLC23A2	RASSF2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC23A2	47231	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr20	5079708	5080023	5079866	Y	NA	PCNA,CDS2	NA	NA	NA	NA	PCNA	25249	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	5512444	5512652	5512587	Y	CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1	NA	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	77020	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	6015657	6015992	6015825	Y	NA	CRLS1	NA	NA	NA	NA	CRLS1	30921	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr20	6032121	6032454	6032230	Y	LRRN4	CRLS1	NA	NA	NA	NA	CRLS1	47385	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	8534755	8534925	8534840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	423931	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	10197196	10197344	10197281	Y	SNAP25	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	215526	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	10466571	10466854	10466711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	53701	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	10471502	10471750	10471599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	58632	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	10472654	10473100	10472965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	59784	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	11859194	11859309	11859279	Y	NA	BTBD3	NA	NA	NA	NA	BTBD3	10062	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	12250218	12250236	12250226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD3	380847	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	12374037	12374068	12374053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD3	504666	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	13434936	13435260	13435184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TASP1	182327	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	13705752	13706023	13705888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESF1	57509	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr20	13734374	13734725	13734663	Y	NA	ESF1	NA	NA	NA	NA	ESF1	28807	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	17557154	17557457	17557241	Y	NA	DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	8646	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr20	18034343	18034358	18034351	Y	NA	PTMAP3,OVOL2	NA	NA	NA	NA	OVOL2	3474	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	18276093	18276447	18276109	Y	CSRP2BP	ZNF133	NA	NA	NA	NA	ZNF133	8972	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr20	18650258	18650491	18650292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTD1	83721	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	19213558	19213957	19213665	Y	SLC24A3	SLC24A3	NA	NA	NA	NA	SLC24A3	22268	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	19408281	19408453	19408368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC24A3	216991	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	19797665	19798070	19797910	Y	RIN2,RIN2	NA	RIN2,SLC24A3,NAA20	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-122P22.2	61313	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	19848562	19849136	19848901	Y	NA	RIN2	RIN2	IMR90	Hi-C	24141950	RIN2	16029	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	19860938	19861220	19861002	Y	NA	RIN2	SLC24A3,RIN2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RIN2	3945	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	19881587	19881718	19881652	Y	RIN2,RIN2	RIN2	NA	NA	NA	NA	RIN2	16422	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	19917216	19917720	19917223	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIN2	52051	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	19922797	19923187	19922871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIN2	57632	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	20033883	20033924	20033904	Y	NA	NAA20,CRNKL1	NA	NA	NA	NA	CRNKL1	766	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	20586775	20587103	20586803	Y	RALGAPA2	NA	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	104028	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr20	20590950	20591282	20591151	Y	RALGAPA2	NA	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	99849	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	20605285	20605597	20605591	Y	RALGAPA2	NA	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	85534	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	20652620	20652826	20652771	Y	NA	RALGAPA2	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	38305	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr20	21082914	21083089	21083038	Y	NA	PLK1S1	PLK1S1,NKX2-2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLK1S1	21535	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr20	23031353	23032100	23031620	Y	GZF1,THBD,CD93	THBD	NA	NA	NA	NA	THBD	2975	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	23347147	23347295	23347221	Y	THBD,CD93,GZF1	NXT1,RP3-322G13.7,RP3-322G13.5,GZF1	NA	NA	NA	NA	GZF1	6360	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	24941460	24941976	24941729	Y	CST7,C20orf3	NA	NA	NA	NA	NA	ACSS1	95640	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	25291624	25291957	25291812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYGB	64919	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr20	25440750	25441053	25440935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINS1	54387	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	25671297	25671837	25671511	Y	NA	ZNF337	NA	NA	NA	NA	ZNF337	3640	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	29637104	29637239	29637172	Y	DEFB121,DEFB116	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	27247	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	30175524	30175854	30175562	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	15232	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	30200712	30201016	30200864	Y	TTLL9,DUSP15,DEFB116,DEFB121	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	9626	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	30255856	30255976	30255884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	53816	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	30300504	30300973	30300648	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8819	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	30307720	30308274	30308104	Y	POFUT1	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	1518	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr20	30624710	30624829	30624798	Y	PLAGL2,C20orf112,HCK	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF4	70480	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	30699679	30699866	30699769	Y	BCL2L1,HCK,C20orf112,TM9SF4,PLAGL2	TM9SF4	NA	NA	NA	NA	TM9SF4	4370	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	30700574	30701059	30700820	Y	HCK,C20orf112,TM9SF4,PLAGL2	TM9SF4	NA	NA	NA	NA	TM9SF4	5265	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	31044923	31045080	31044970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASXL1	100768	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	31063072	31063625	31063366	Y	NA	NA	ASXL1	IMR90	Hi-C	24141950	ASXL1	118917	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr20	31350973	31351317	31351235	Y	C20orf185,DNMT3B,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B	MAPRE1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT3B	2782	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr20	31410946	31411262	31411169	Y	NA	MAPRE1	NA	NA	NA	NA	MAPRE1	5247	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	31998840	31999088	31998873	Y	C20orf185	CDK5RAP1,SNTA1	CDK5RAP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDK5RAP1	11473	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	32321714	32321896	32321832	Y	NA	E2F1,PXMP4,ZNF341	NA	NA	NA	NA	ZNF341	4251	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr20	32623943	32624156	32623948	Y	NA	RALY,RP5-1125A11.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1125A11.1	43780	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	32690137	32690399	32690268	Y	NA	EIF2S2,RPS2P1	NA	NA	NA	NA	EIF2S2	7739	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	32753335	32753546	32753441	Y	NA	RPS2P1	ITCH,AHCY,PXMP4,ZNF341,DYNLRB1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS2P1	45059	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	32803033	32803441	32803244	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	94167	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	32989671	32989803	32989744	Y	NA	ITCH	NA	NA	NA	NA	ITCH	40630	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr20	33064297	33064587	33064427	Y	ACSS2	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	FDX1P1	2018	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr20	33100877	33101215	33100990	Y	NA	FDX1P1,DYNLRB1,MAP1LC3A	NA	NA	NA	NA	DYNLRB1	999	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	33263826	33263865	33263846	Y	MYH7B	PIGU,TP53INP2	NA	NA	NA	NA	PIGU	916	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	33699049	33699250	33699220	Y	TRPC4AP,EDEM2	TRPC4AP	NA	NA	NA	NA	TRPC4AP	20375	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	34127589	34128004	34127717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERGIC3	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	34217204	34217560	34217502	Y	NA	SPAG4,CPNE1,RBM12	NA	NA	NA	NA	SPAG4	15390	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr20	34379775	34380017	34379908	Y	SPAG4,RBM39,PHF20	RPF2P1,PHF20	NA	NA	NA	NA	PHF20	21879	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	34384504	34384863	34384702	Y	SPAG4,RBM39,SCAND1,PHF20	RPF2P1,PHF20	NA	NA	NA	NA	PHF20	26608	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	34463368	34463773	34463624	Y	NFS1	RNU4-40P	NA	NA	NA	NA	RNU4-40P	9808	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	NA	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SCAND1	107196	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr20	34681523	34681969	34681863	Y	EPB41L1,DLGAP4,EPB41L1	NA	LOC647979,PHF20,EPB41L1,C20orf4,C20orf152	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SCAND1	136129	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	34685769	34686042	34685906	Y	NA	NA	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1,DLGAP4	IMR90	Hi-C	24141950	SCAND1	140375	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr20	35821029	35821195	35821110	Y	NA	RPN2	GHRH	IMR90	Hi-C	24141950	RPN2	16216	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	35922737	35923093	35922847	Y	SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC	MANBAL,SRC	NA	NA	NA	NA	MANBAL	6696	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr20	36008343	36008504	36008424	Y	SAMHD1,MANBAL,SRC	SRC	NA	NA	NA	NA	SRC	37255	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	36034782	36035452	36035129	Y	C20orf132,VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	36484	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	36045421	36045655	36045607	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	26281	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	36135409	36135682	36135567	Y	NA	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	18651	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	36339461	36339780	36339670	Y	GHRH,CTNNBL1	CTNNBL1	NA	NA	NA	NA	CTNNBL1	19053	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr20	36343336	36343680	36343577	Y	MANBAL,SRC,RPRD1B,CTNNBL1	CTNNBL1	NA	NA	NA	NA	CTNNBL1	22928	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr20	36616982	36617239	36617111	Y	NA	TTI1,RPRD1B	NA	NA	NA	NA	TTI1	42631	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	36618785	36619379	36619133	Y	RALGAPB,RPRD1B	TTI1,RPRD1B	NA	NA	NA	NA	TTI1	40491	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	36621379	36621533	36621455	Y	NNAT,VSTM2L	TTI1,RPRD1B	NA	NA	NA	NA	TTI1	38337	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr20	36829853	36829966	36829912	Y	BPI	TGM2	NA	NA	NA	NA	TGM2	36873	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	37229958	37230063	37230010	Y	ARHGAP40	ARHGAP40	NA	NA	NA	NA	ARHGAP40	1381	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	37280609	37280856	37280791	Y	SLC32A1	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP40	52032	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	37302978	37303466	37303191	Y	ACTR5,SLC32A1	NA	ARHGAP40,ACTR5,SLC32A1,PPP1R16B	IMR90	Hi-C	24141950	ACTR5	71619	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr20	37398577	37398739	37398665	Y	NA	ACTR5	NA	NA	NA	NA	ACTR5	23492	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	37512879	37513131	37513021	Y	ACTR5,PPP1R16B	FAM83D	NA	NA	NA	NA	FAM83D	39824	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	37678805	37678873	37678867	Y	SLC32A1,PPP1R16B	NA	NA	NA	NA	NA	DHX35	89863	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	38908222	38908337	38908279	Y	MAFB	NA	NA	NA	NA	NA	MAFB	407543	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	39221402	39221512	39221504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFB	94368	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	39785946	39786458	39785968	Y	CHD6,PLCG1	PLCG1	NA	NA	NA	NA	PLCG1	22346	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	39787054	39787387	39787188	Y	NA	PLCG1	NA	NA	NA	NA	PLCG1	23454	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	39826598	39826945	39826630	Y	CHD6	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG1	62998	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	40321359	40321668	40321514	Y	NA	NA	CHD6	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHD6	76226	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	7334	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr20	42780306	42780638	42780459	Y	NA	JPH2	NA	NA	NA	NA	JPH2	33580	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	43.9117637673828
chr20	43238683	43239068	43238831	Y	NA	ADA	NA	NA	NA	NA	ADA	39806	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	43540233	43540373	43540312	Y	DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,PABPC1L	YWHAB,PABPC1L,TOMM34	NA	NA	NA	NA	PABPC1L	3530	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr20	43582253	43582415	43582335	Y	NA	PABPC1L,TOMM34,STK4	NA	NA	NA	NA	TOMM34	4712	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr20	43974041	43974470	43974334	Y	NA	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	594	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr20	45960088	45960376	45960270	Y	ZMYND8	ZMYND8	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	23191	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	45987479	45988292	45987961	Y	NA	ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	3912	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr20	45989347	45989834	45989660	Y	SULF2	ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5780	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr20	46057073	46057256	46057165	Y	NA	NA	NCOA3,EYA2,ZMYND8	IMR90	Hi-C	24141950	NCOA3	71345	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	46067997	46068157	46068096	Y	NCOA3	NA	NCOA3,ZMYND8	IMR90	Hi-C	24141950	NCOA3	60444	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	46082300	46082410	46082355	Y	NA	NCOA3	NCOA3,ZMYND8	IMR90	Hi-C	24141950	NCOA3	46191	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	46438543	46438763	46438619	Y	SULF2,SULF2	SULF2	NA	NA	NA	NA	SULF2	25183	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	47455528	47455923	47455726	Y	NA	PREX1	PREX1,ARFGEF2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PREX1	13108	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	47547466	47547777	47547635	Y	ZNFX1,ARFGEF2	ARFGEF2	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	11039	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr20	47803381	47804147	47803544	Y	PREX1,STAU1	STAU1,DDX27	NA	NA	NA	NA	STAU1	477	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr20	48200445	48200486	48200453	Y	NA	PTGIS	ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	PTGIS	17762	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	48285223	48285402	48285313	Y	SPATA2,SLC9A8	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	43013	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	48293445	48293839	48293746	Y	NA	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	34576	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	48311078	48311758	48311363	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	16657	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	48315836	48316073	48315912	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	12342	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr20	48327368	48328064	48327696	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	351	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	48381625	48382070	48381853	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,RNF114,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNRPFP1	37246	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr20	48496798	48497000	48496896	Y	NA	SPATA2	NA	NA	NA	NA	SPATA2	33080	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	48532841	48533167	48533004	Y	SPATA2,SPATA2	SPATA2,RNF114	NA	NA	NA	NA	SPATA2	2761	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	48841053	48841720	48841386	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	CEBPB	PTPN1,CEBPB,LOC284751,FAM65C,MIR645	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPB	35677	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	48951795	48951969	48951898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPB	146419	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	49137019	49137081	49137050	Y	PTPN1	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	12128	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	49350102	49350473	49350150	Y	NA	PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	4021	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	49358421	49358698	49358635	Y	NA	PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	12340	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	49378032	49378227	49378094	Y	PARD6B,BCAS4	PARD6B,BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	31204	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr20	49406894	49407134	49407016	Y	NA	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	2297	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	49407275	49407470	49407371	Y	MOCS3	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	1961	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr20	49487134	49487591	49487436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	57930	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.2784405728359
chr20	49524499	49524706	49524614	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	20815	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	49574418	49574471	49574465	Y	PTPN1,ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	MOCS3	1055	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	49838536	49838841	49838768	Y	NA	NA	KCNG1	IMR90	Hi-C	24141950	KCNG1	200870	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	50054102	50054305	50054204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	123065	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	50063853	50064072	50063963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	113298	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr20	50141744	50142683	50142582	Y	NA	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NFATC2	34687	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	50145650	50145911	50145725	Y	NA	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NFATC2	31459	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	50146423	50146676	50146612	Y	NA	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NFATC2	30694	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	50383575	50384083	50383723	Y	ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	ATP9A	402	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	50416342	50416699	50416509	Y	NA	ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	SALL4	360	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	50416703	50416783	50416765	Y	ZFP64,SALL4	ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	SALL4	276	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr20	50416861	50417288	50417180	Y	ZFP64,SALL4	ATP9A	NA	NA	NA	NA	SALL4	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr20	52201463	52201802	52201714	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	22644	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr20	52212842	52213180	52212942	Y	ZNF217	ZNF217	BMP7,SUMO1P1,BCAS1,CYP24A1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF217	11266	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	52239995	52240318	52240062	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	15549	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr20	52294676	52294905	52294769	Y	NA	NA	BMP7,SUMO1P1,BCAS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF217	70230	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr20	52364781	52365137	52364834	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	140335	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr20	52482655	52483054	52482957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	258209	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.34635124758485
chr20	52532315	52532889	52532591	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	255623	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	52565886	52566139	52565988	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	CYP24A1	222373	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	55264382	55264603	55264519	Y	NA	PTMAP6	BMP7,TFAP2C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMAP6	9967	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.4499167281683
chr20	55379556	55380011	55379738	Y	TFAP2C	NA	TFAP2C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMAP6	104986	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.17487509225245
chr20	55434478	55434638	55434557	Y	NA	NA	TFAP2C	IMR90	Hi-C	24141950	PTMAP6	159908	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	55723431	55723679	55723544	Y	RAE1,RAE1,BMP7	NA	NA	NA	NA	NA	BMP7	116006	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	55838908	55839396	55838948	Y	NA	BMP7	NA	NA	NA	NA	BMP7	289	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr20	56416426	56416543	56416495	Y	RBM38	NA	PMEPA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HMGB1P1	354343	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	56550215	56550469	56550425	Y	NA	NA	ZBP1,CTCFL,PCK1,PMEPA1	IMR90	Hi-C	24141950	PPP4R1L	332026	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	57018014	57018479	57018179	Y	STX16	NA	NA	NA	NA	NA	VAPB	55836	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr20	57228113	57228577	57228221	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16-NPEPL1	3623	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	57750104	57750489	57750217	Y	ZNF831	NA	ZNF831	IMR90	Hi-C	24141950	EDN3	122993	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	58436515	58436843	58436553	Y	PHACTR3,PHACTR3,PHACTR3,SYCP2,C20orf177,C20orf177	NA	NA	NA	NA	NA	SYCP2	69867	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr20	58437773	58438005	58437846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYCP2	68705	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr20	58451421	58451787	58451564	Y	SYCP2,PPP1R3D,C20orf177,C20orf177	NA	NA	NA	NA	NA	SYCP2	54923	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr20	58459134	58459312	58459218	Y	PHACTR3,PHACTR3,PHACTR3,C20orf177	SYCP2	NA	NA	NA	NA	SYCP2	47398	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr20	58583578	58583859	58583737	Y	C20orf197,PPP1R3D	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3D	70226	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	60256764	60257074	60256889	Y	CDH4	NA	NA	NA	NA	NA	TAF4	381792	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr20	60875997	60876347	60876165	Y	GATA5,CABLES2	ADRM1,MIR4758	NA	NA	NA	NA	ADRM1	848	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	60924549	60924827	60924688	Y	TAF4,SS18L1,SLCO4A1,C20orf151,LAMA5	ADRM1,MIR4758,LAMA5,RPS21	NA	NA	NA	NA	LAMA5	15541	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr20	60935306	60935741	60935523	Y	NA	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	ADRM1	K562	ChIA-PET	22265404	LAMA5	4627	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr20	60940876	60941209	60940968	Y	PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	508	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr20	60941528	60941750	60941608	Y	SLCO4A1,ADRM1,LAMA5	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	1160	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr20	60943690	60943839	60943760	Y	NA	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	3322	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	61001783	61002051	61001918	Y	NA	RPS21,CABLES2,GATA5	NA	NA	NA	NA	CABLES2	21442	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr20	61425509	61425950	61425706	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	OGFR,COL9A3	NA	NA	NA	NA	OGFR	8237	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	61505589	61505880	61505712	Y	BHLHE23,DIDO1,C20orf11	TCFL5	TCFL5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TCFL5	14474	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr20	61555881	61556606	61556058	Y	DIDO1	DIDO1	NA	NA	NA	NA	DIDO1	10698	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	61585167	61585546	61585389	Y	NA	DIDO1	NA	NA	NA	NA	DIDO1	17863	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	61646020	61646413	61646169	Y	C20orf11,YTHDF1	NA	NA	NA	NA	NA	DIDO1	78716	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	61764397	61764626	61764512	Y	NA	NA	LOC63930,NKAIN4,BIRC7,HAR1B,HAR1A	IMR90	Hi-C	24141950	YTHDF1	80960	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	61899212	61899429	61899321	Y	NA	ARFGAP1	NA	NA	NA	NA	ARFGAP1	2708	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr20	62313782	62314225	62314041	Y	NA	STMN3,RTEL1,ZGPAT,ARFRP1	NA	NA	NA	NA	ZGPAT	22592	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.17487509225245
chr20	62527317	62528264	62527831	Y	PRIC285,PRIC285,GMEB2,ZGPAT,ZGPAT,LIME1,TPD52L2,RGS19,RGS19,OPRL1,DNAJC5	TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	DNAJC5	2799	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr20	62709200	62709458	62709264	Y	GMEB2,ZGPAT,LIME1,PCMTD2,RGS19,RGS19,OPRL1	ZNF512B,SOX18,TCEA2	NA	NA	NA	NA	RGS19	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr20	62908248	62908643	62908435	Y	NA	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	23154	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr20	62959416	62959580	62959492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	74322	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	15442714	15442952	15442833	Y	NA	AP001347.6	NA	NA	NA	NA	AP001347.6	44972	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr21	16129964	16130277	16130229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRIP1	305044	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	16251857	16252256	16251994	Y	SAMSN1,NRIP1	NA	NRIP1	IMR90	Hi-C	24141950	NRIP1	183065	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	16288986	16289227	16289075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRIP1	146094	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr21	16368229	16368687	16368553	Y	NRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRIP1	66634	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	17264124	17264427	17264344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	163780	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	18891260	18891546	18891459	Y	NA	CXADR	NA	NA	NA	NA	CXADR	8560	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr21	22510106	22510468	22510126	Y	NCAM2	NA	NA	NA	NA	NA	TUBAP	2268980	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	26952057	26952278	26952105	Y	JAM2	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	25551	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr21	26962945	26963646	26963455	Y	NA	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	14183	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	26980548	26980842	26980671	Y	NA	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	2719	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	27488837	27488970	27488850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	52476	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr21	27867729	27867957	27867835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYYR1	75646	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	29660800	29661042	29660922	Y	NA	NA	ADAMTS1,ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	594651	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	30669074	30669451	30669267	Y	BACH1,BACH1	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	104682	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	30684361	30684712	30684409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	119969	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	30751100	30751464	30751308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	186708	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	30754427	30754628	30754578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	190035	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	30758449	30758782	30758692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	194057	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	32532795	32532952	32532925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	396606	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	32654582	32654950	32654771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	274608	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	32662959	32662987	32662974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	266571	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	32727234	32727499	32727493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	202059	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	33105563	33105881	33105775	Y	SCAF4	SCAF4	NA	NA	NA	NA	SCAF4	3175	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	33247157	33247609	33247328	Y	NA	HUNK	NA	NA	NA	NA	HUNK	3529	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr21	34075111	34075304	34075194	Y	NA	SYNJ1	NA	NA	NA	NA	SYNJ1	23055	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	34181776	34182141	34181959	Y	OLIG1,C21orf62	C21orf49	NA	NA	NA	NA	C21orf49	39365	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	35099909	35100119	35099917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRYZL1	85677	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	35319562	35320491	35320153	Y	NA	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	33278	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr21	35322307	35322646	35322477	Y	NA	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	36023	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	35402450	35402634	35402553	Y	GART,GART	MRPS6,SLC5A3	MRPS6,LOC100506334	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS6	40890	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	35917479	35917977	35917777	Y	KCNE1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	67464	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	36216696	36217156	36217046	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	231255	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	36339843	36340239	36340159	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	354402	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	37694250	37694633	37694410	Y	NA	MORC3	NA	NA	NA	NA	MORC3	3763	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	37712607	37712952	37712729	Y	NA	MORC3,CHAF1B	NA	NA	NA	NA	MORC3	22120	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	38346647	38347014	38346835	Y	NA	AP000704.5,HLCS	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	9835	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr21	38590434	38590491	38590485	Y	NA	DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	47771	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr21	39430494	39430871	39430698	Y	DSCR4	NA	NA	NA	NA	NA	DSCR4	60583	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr21	39543838	39544086	39544003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSCR8	52293	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	39783656	39783977	39783909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSCR8	292111	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	40212954	40213097	40213043	Y	ETS2	ETS2	NA	NA	NA	NA	ETS2	37723	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	40278958	40279421	40279192	Y	NA	NA	ETS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ETS2	103727	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	40673787	40673929	40673891	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	17556	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	40690087	40690386	40690238	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	1099	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr21	40691878	40692008	40691991	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	393	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.13922028641795
chr21	40742482	40742667	40742571	Y	NA	HMGN1,WRB	BRWD1,BRWD1-IT2,WRB	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WRB	7503	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	43183711	43183960	43183836	Y	RIPK4	RIPK4	NA	NA	NA	NA	RIPK4	1306	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr21	43654635	43655282	43654967	Y	NA	ABCG1	TFF3	IMR90	Hi-C	24141950	ABCG1	36836	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	43784554	43784935	43784758	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFF1	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr21	43952961	43953452	43953160	Y	PKNOX1,ABCG1,ABCG1,ABCG1	SLC37A1	NA	NA	NA	NA	SLC37A1	38843	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	44087083	44087334	44087223	Y	NA	PDE9A	NA	NA	NA	NA	PDE9A	15337	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	44355985	44356328	44356154	Y	NA	ERVH48-1,PKNOX1	U2AF1	IMR90	Hi-C	24141950	ERVH48-1	12229	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr21	44395482	44395891	44395810	Y	NA	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	2862	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr21	44395922	44396228	44396080	Y	WDR4,U2AF1,CBS	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	3302	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	44573696	44574026	44573784	Y	NA	U2AF1	HSF2BP,LINC00319,LINC00313,SIK1,RRP1B,U2AF1,WDR4,NDUFV3,PDXK	IMR90	Hi-C	24141950	U2AF1	47999	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr21	44753292	44753457	44753456	Y	NA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	91551	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr21	44796506	44796705	44796660	Y	NA	SIK1	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B	IMR90	Hi-C	24141950	SIK1	48303	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr21	44816664	44817004	44816885	Y	NA	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	28004	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr21	44824532	44824624	44824590	Y	SIK1	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	20384	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	44918002	44918401	44918083	Y	NA	NA	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	H2BFS	64669	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	44937659	44937875	44937741	Y	PDXK	H2BFS	NA	NA	NA	NA	H2BFS	45195	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr21	45018693	45018962	45018883	Y	NA	H2BFS	NA	NA	NA	NA	H2BFS	35623	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	45020604	45020960	45020754	Y	NA	H2BFS	NA	NA	NA	NA	H2BFS	37534	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr21	45187861	45188442	45188176	Y	ICOSLG,PDXK,CSTB	CSTB,RRP1	NA	NA	NA	NA	CSTB	5884	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	45394155	45394780	45394371	Y	AGPAT3,TRPM2,C21orf33	TRAPPC10	NA	NA	NA	NA	TRAPPC10	35420	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr21	45543595	45544017	45543789	Y	KRTAP10-6,TRPM2	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	7470	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	45557942	45558217	45558021	Y	AGPAT3,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG,C21orf2	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	6455	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	45566076	45566451	45566257	Y	TRAPPC10,ICOSLG,C21orf2	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	14589	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	45943778	45945170	45944363	Y	NA	C21orf90	NA	NA	NA	NA	C21orf90	8679	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	46097395	46097576	46097539	Y	KRTAP10-7,KRTAP10-12	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2G2	122358	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr21	46302536	46302756	46302646	Y	NA	PTTG1IP	PTTG1IP	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTTG1IP	10784	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	46501791	46502122	46501857	Y	NA	ADARB1	NA	NA	NA	NA	ADARB1	10023	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr21	46823895	46824295	46824014	Y	COL18A1	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	843	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	47010868	47011351	47011033	Y	NA	SLC19A1	PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC19A1	48543	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	47554885	47555152	47555043	Y	FTCD	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	38874	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr21	47563985	47564239	47564071	Y	NA	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	47974	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	17091097	17091180	17091141	Y	IL17RA	TPTEP1	NA	NA	NA	NA	TPTEP1	10320	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	17528836	17529213	17528959	Y	NA	IL17RA	NA	NA	NA	NA	IL17RA	34631	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	17568441	17568522	17568513	Y	NA	IL17RA	NA	NA	NA	NA	IL17RA	4597	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	17652206	17652871	17652785	Y	NA	CECR5-AS1,CECR5,AC005300.5	NA	NA	NA	NA	CECR5	8029	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr22	17697692	17697885	17697853	Y	BCL2L13,IL17RA,CECR1	AC005300.5	NA	NA	NA	NA	AC005300.5	25866	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.5212263398373
chr22	19427862	19428165	19428014	Y	NA	MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39,UFD1L,CDC45	NA	NA	NA	NA	HIRA	5059	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	19433007	19433028	19433018	Y	NA	MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39,UFD1L,CDC45	NA	NA	NA	NA	HIRA	196	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	19811643	19811941	19811792	Y	NA	C22orf29,GNB1L	NA	NA	NA	NA	C22orf29	28478	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	19930770	19931097	19930953	Y	ZDHHC8,COMT	COMT,TXNRD2	NA	NA	NA	NA	TXNRD2	3429	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	19941739	19941814	19941777	Y	NA	COMT,TXNRD2	NA	NA	NA	NA	TXNRD2	14398	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	20068627	20068902	20068750	Y	COMT,DGCR8	DGCR8,RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8	NA	NA	NA	NA	DGCR8	2872	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	20772547	20772776	20772578	Y	PI4KA	ZNF74,SCARF2	NA	NA	NA	NA	SCARF2	17370	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	20848736	20849050	20848893	Y	NA	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	536	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	20863506	20864089	20863850	Y	MED15	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	15306	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	20911751	20912048	20911845	Y	PI4KA,THAP7,PI4KA,MED15	NA	NA	NA	NA	NA	MED15	63551	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	20923375	20923909	20923414	Y	THAP7,MED15	NA	NA	NA	NA	NA	MED15	75175	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr22	21117223	21117320	21117272	Y	AIFM3	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM191A	64003	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	22011632	22012115	22011859	Y	NA	YDJC,CCDC116,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	7073	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.4499167281683
chr22	22219429	22219677	22219523	Y	HIC2,MAPK1	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	293	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	22478098	22478432	22478244	Y	CCDC116,YPEL1,ZNF280B	NA	NA	NA	NA	NA	TOP3B	142885	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	13.6706434370154
chr22	23552686	23553004	23552762	Y	NA	BCR	NA	NA	NA	NA	BCR	32795	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	23863943	23864332	23864232	Y	GNAZ,RTDR1,BCR	NA	ZDHHC8P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC8P1	121030	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr22	24255997	24256450	24256302	Y	C22orf43,CABIN1,CABIN1	MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	21806	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr22	24752898	24753006	24752951	Y	UPB1	NA	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	58841	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	24756229	24756614	24756466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	55233	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	24796747	24798216	24797446	Y	GGT1	ADORA2A	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	13631	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	24897452	24897663	24897568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNRPD3	51808	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	25348731	25349104	25348989	Y	NA	KIAA1671	SGSM1,KIAA1671,TMEM211	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA1671	2034	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr22	25844657	25845002	25844694	Y	NA	LRP5L,CRYBB2P1	NA	NA	NA	NA	CRYBB2P1	2585	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	26150935	26151135	26151006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADRBK2	192119	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	26455753	26456126	26455940	Y	MYO18B	NA	MYO18B,SEZ6L	IMR90	Hi-C	24141950	ASPHD2	367113	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr22	27041081	27041748	27041447	Y	SEZ6L,ASPHD2	CTA-211A9.5	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-211A9.5	24982	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr22	28314180	28314595	28314448	Y	PITPNB	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	PITPNB	58	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr22	28837872	28838192	28838073	Y	TTC28	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	297827	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr22	29194018	29194404	29194339	Y	NA	CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6	NA	NA	NA	NA	XBP1	181	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	29280564	29280869	29280661	Y	NA	ZNRF3	NA	NA	NA	NA	ZNRF3	2984	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr22	29339124	29339474	29339174	Y	NA	NA	KREMEN1,C22orf31	IMR90	Hi-C	24141950	ZNRF3	61544	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.96774413108555
chr22	29428666	29428910	29428854	Y	C22orf31	KREMEN1	NA	NA	NA	NA	KREMEN1	38156	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	29705410	29705600	29705517	Y	GAS2L1	EWSR1,RHBDD3,GAS2L1	NA	NA	NA	NA	GAS2L1	4838	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	30279863	30280214	30279898	Y	NA	ASCC2,MTMR3	NA	NA	NA	NA	MTMR3	2719	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	30801557	30801812	30801706	Y	OSM,CCDC157,SF3A1	RNF215,MTFP1	NA	NA	NA	NA	RNF215	13948	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr22	30808332	30808723	30808528	Y	NA	RNF215,MTFP1	NA	NA	NA	NA	RNF215	7037	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	31298089	31298190	31298144	Y	NA	NA	MORC2,MORC2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	TUG1	66473	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr22	31626331	31627201	31626769	Y	SMTN,RNF185,LIMK2	LIMK2	NA	NA	NA	NA	LIMK2	20106	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	31629034	31629491	31629163	Y	SMTN,RNF185,LIMK2	LIMK2	NA	NA	NA	NA	LIMK2	22809	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	31639719	31639839	31639804	Y	LIMK2	LIMK2,PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	LIMK2	33494	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	31639861	31640267	31640177	Y	NA	LIMK2,PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	LIMK2	33636	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr22	31665995	31666466	31666007	Y	NA	PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	PIK3IP1	20054	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	31689398	31689773	31689585	Y	SMTN,DEPDC5	PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	PIK3IP1	2878	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	32042427	32042918	32042716	Y	RNF185,LIMK2	PISD	NA	NA	NA	NA	PISD	13500	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr22	32615051	32615519	32615197	Y	DEPDC5	NA	RFPL2	IMR90	Hi-C	24141950	SC22CB-1E7.1	181574	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	33202971	33203258	33203149	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	7284	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	33221390	33221677	33221534	Y	SYN3	TIMP3,Z98256.1	NA	NA	NA	NA	TIMP3	25703	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	33248825	33249077	33248981	Y	SYN3	Z98256.1	NA	NA	NA	NA	Z98256.1	5343	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	33866683	33867033	33866858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA76	231873	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	35710736	35710808	35710790	Y	APOL6,TOM1,TOM1	TOM1	NA	NA	NA	NA	TOM1	17468	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	35767811	35768194	35767985	Y	APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1	HMOX1,MCM5	NA	NA	NA	NA	HMOX1	6160	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	35772921	35773272	35773050	Y	APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1	HMOX1,MCM5	TOM1,MCM5,HMOX1,RASD2,MB,APOL6,APOL5,RBFOX2	IMR90	Hi-C	24141950	HMOX1	1082	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	36149671	36149849	36149827	Y	NA	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	APOL6	107229	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr22	36299462	36299943	36299718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	122530	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr22	36325608	36325959	36325784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	96514	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr22	36385915	36386246	36386112	Y	NA	RBFOX2	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	36227	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	36396636	36396729	36396643	Y	NA	RBFOX2	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	25744	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	36621171	36621450	36621368	Y	NA	APOL2,APOL1	NA	NA	NA	NA	APOL2	12550	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	36727482	36728450	36727733	Y	APOL3	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	53613	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr22	36728624	36729163	36728912	Y	IFT27	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	52900	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr22	36748222	36748386	36748297	Y	NA	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	33677	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr22	36766615	36766810	36766723	Y	NCF4,MYH9	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	15253	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.4499167281683
chr22	36806147	36806450	36806256	Y	NA	MYH9,RP4-633O19__A.1,RP5-1119A7.14	MYH9,FOXRED2,TXN2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP4-633O19__A.1	23476	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr22	37299850	37299981	37299916	Y	C1QTNF6	CTA-833B7.2,CSF2RB	NA	NA	NA	NA	CSF2RB	7689	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.13922028641795
chr22	37323767	37324006	37323876	Y	RAC2,CYTH4,NCF4,CSF2RB	CSF2RB	NA	NA	NA	NA	CSF2RB	16097	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	37582993	37583226	37583109	Y	NA	RP1-151B14.6,C1QTNF6	NA	NA	NA	NA	C1QTNF6	10199	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr22	37585028	37585323	37585113	Y	NA	RP1-151B14.6,C1QTNF6	NA	NA	NA	NA	C1QTNF6	8102	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr22	37663226	37663580	37663275	Y	MFNG,MFNG,NCF4,RAC2	RAC2	CARD10,C1QTNF6,SSTR3,RAC2,CYTH4,ELFN2,MFNG,CDC42EP1,LGALS2	IMR90	Hi-C	24141950	RAC2	24738	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	37942064	37942352	37942192	Y	KCTD17,TRIOBP,POLR2F,MICALL1,LGALS1,ANKRD54,CARD10,CDC42EP1	CARD10,CDC42EP1	ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42EP1	12102	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.76061316991865
chr22	37948648	37948841	37948736	Y	NA	CARD10,CDC42EP1	NA	NA	NA	NA	CDC42EP1	5613	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	37957606	37958042	37957847	Y	NA	CARD10,CDC42EP1,GGA1	NA	NA	NA	NA	CDC42EP1	3152	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr22	38003646	38003923	38003656	Y	GGA1,GGA1	CDC42EP1,GGA1,SH3BP1,PDXP	NA	NA	NA	NA	GGA1	1165	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr22	38139873	38139989	38139967	Y	NA	TRIOBP	H1F0,GCAT	IMR90	Hi-C	24141950	TRIOBP	48862	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr22	38142899	38142964	38142949	Y	CDC42EP1,LGALS1,TRIOBP,POLR2F,GCAT,ANKRD54	NA	NA	NA	NA	NA	TRIOBP	51888	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	38148564	38148886	38148725	Y	CDC42EP1	NA	NA	NA	NA	NA	H1F0	50228	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	38292237	38292573	38292408	Y	CARD10,SH3BP1,MICALL1	EIF3L,ANKRD54,MICALL1	NA	NA	NA	NA	MICALL1	7091	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	38294842	38295023	38294932	Y	CARD10,CDC42EP1,SH3BP1,MICALL1	MICALL1	NA	NA	NA	NA	MICALL1	4641	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	38859370	38859653	38859488	Y	NA	KDELR3,DDX17	NA	NA	NA	NA	KDELR3	2414	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr22	39349987	39350551	39350215	Y	DDX17,JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3A	APOBEC3B	CBX6	IMR90	Hi-C	24141950	APOBEC3B	25801	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	39541576	39542088	39541730	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7	CBX7	NA	NA	NA	NA	CBX7	4591	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr22	39610460	39610820	39610697	Y	NA	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	27936	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr22	39637977	39638270	39638005	Y	MGAT3,MGAT3,SUN2,SUN2,NPTXR,CBX7,SYNGR1,PDGFB	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	486	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr22	39649567	39649736	39649595	Y	SUN2,APOBEC3A,PDGFB	PDGFB	CBX7,RNU86,RPL3,SNORD83A,PDGFB	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDGFB	10811	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	39695935	39696099	39695991	Y	ATF4,APOBEC3A	RPL3,SYNGR1	NA	NA	NA	NA	RPL3	18295	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	39784258	39784471	39784339	Y	MGAT3,MGAT3,CBX7,SYNGR1	SYNGR1,TAB1	NA	NA	NA	NA	TAB1	9275	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr22	39842406	39842658	39842493	Y	NA	TAB1,MGAT3	NA	NA	NA	NA	MGAT3	8691	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	39854172	39854554	39854368	Y	CBX7,SYNGR1,MGAT3,MGAT3	MGAT3	NA	NA	NA	NA	MGAT3	2823	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	40589903	40590338	40589971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P52	88833	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	40958851	40958976	40958969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL1	71730	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	40982487	40982801	40982645	Y	NA	MKL1	NA	NA	NA	NA	MKL1	47905	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	41003149	41003516	41003333	Y	NA	MKL1	NA	NA	NA	NA	MKL1	27190	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	41047729	41047883	41047796	Y	NA	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17023	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.76061316991865
chr22	41048065	41048352	41048232	Y	EP300,MKL1	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17359	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr22	41080878	41081122	41080979	Y	NA	GAPDHP37	NA	NA	NA	NA	GAPDHP37	12423	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	41128851	41129054	41128911	Y	NA	NA	XPNPEP3,MKL1,MCHR1,SLC25A17	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP37	60396	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr22	41417973	41418366	41418067	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39690	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.071309611669
chr22	41418482	41418837	41418726	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39219	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr22	41460471	41460696	41460583	Y	NA	RP11-12M9.3,EP300	RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-12M9.3	2415	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	41776948	41777130	41776981	Y	NA	TEF	NA	NA	NA	NA	TEF	15611	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	4.24618470392145
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr22	41844337	41844774	41844650	Y	SHISA8,TEF,TEF,TOB2	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	3310	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	42073632	42073949	42073667	Y	TOB2	C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	8994	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	43067495	43067636	43067590	Y	NFAM1,ARFGAP3	CYB5R3,A4GALT	NA	NA	NA	NA	CYB5R3	23921	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	43100819	43101017	43100994	Y	NA	A4GALT	NA	NA	NA	NA	A4GALT	14287	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr22	43116155	43116318	43116237	Y	CYB5R3,A4GALT	A4GALT	NA	NA	NA	NA	A4GALT	851	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	43130388	43130736	43130634	Y	NA	A4GALT	CYB5R3,ARFGAP3,PACSIN2	IMR90	Hi-C	24141950	A4GALT	15084	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr22	43369248	43369530	43369410	Y	PACSIN2,PACSIN2	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	39621	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	43738207	43738555	43738223	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL12	157068	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	44321391	44321759	44321599	Y	PNPLA3	PNPLA3,SAMM50,RP4-796I17.5	NA	NA	NA	NA	PNPLA3	3772	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	45081354	45081559	45081463	Y	NA	PRR5,PRR5-ARHGAP8,ARHGAP8	PARVB,KIAA1644,SAMM50	IMR90	Hi-C	24141950	PRR5-ARHGAP8	14554	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr22	45106642	45106985	45106689	Y	NA	PRR5,PRR5-ARHGAP8,ARHGAP8	NA	NA	NA	NA	ARHGAP8	10287	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	5.1782740291725
chr22	45254258	45254434	45254345	Y	PHF21B	NA	NA	NA	NA	NA	PHF21B	149446	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr22	45543738	45543876	45543815	Y	PHF21B,NUP50,NUP50	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	13786	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr22	45879926	45880282	45880095	Y	NA	FBLN1	FBLN1,NUP50,UPK3A,FAM118A,SMC1B	IMR90	Hi-C	24141950	FBLN1	15836	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr22	46374166	46374684	46374539	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	3157	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	46374858	46375446	46375153	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	3849	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr22	46423205	46423605	46423251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNT7B	52196	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	46745093	46745309	46745201	Y	NA	TRMU	NA	NA	NA	NA	TRMU	20321	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr22	46853394	46853669	46853532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CELSR1	77398	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	46957537	46957704	46957620	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	TRMU,CELSR1,GRAMD4	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	12205	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr22	47145245	47145535	47145456	Y	TRMU,CERK,TBC1D22A	CERK,TBC1D22A	CERK,TBC1D22A	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TBC1D22A	10983	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr22	47498045	47498267	47498202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	341527	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	48146543	48146838	48146641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-191L9.4	121120	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	48184441	48184585	48184513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-191L9.4	159018	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	50232497	50232886	50232656	Y	TUBGCP6,BRD1,ZBED4,CRELD2	BRD1,ZBED4	ZBED4	K562	ChIA-PET	22265404	ZBED4	12604	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.13922028641795
chr22	50242140	50242406	50242374	Y	MLC1,HDAC10	BRD1,ZBED4	ZBED4,BRD1	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZBED4	3084	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.13922028641795
chr22	50262824	50262951	50262946	Y	TUBGCP6,MLC1	BRD1,ZBED4,CRELD2,ALG12	NA	NA	NA	NA	ZBED4	17334	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr22	50265281	50265672	50265496	Y	MOV10L1,MOV10L1	BRD1,ZBED4,CRELD2,ALG12	CRELD2,ALG12	IMR90	Hi-C	24141950	ZBED4	19791	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	50330725	50331030	50330945	Y	MAPK12,MAPK11	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	20619	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	50344780	50345228	50344944	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	6933	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.62479182042075
chr22	50345940	50346570	50346146	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	5591	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	50346860	50347243	50347174	Y	BRD1,PANX2,HDAC10,PIM3	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	4918	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	50364350	50364715	50364589	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12189	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr22	50667232	50667412	50667320	Y	NA	TRABD,SELO,TUBGCP6,HDAC10,MAPK12,MAPK11	NA	NA	NA	NA	TUBGCP6	14009	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	50744748	50744986	50744827	Y	PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	692	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	50784754	50785397	50785059	Y	PPP6R2	PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PPP6R2	5021	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr22	50815545	50815813	50815668	Y	MOV10L1,MOV10L1,SELO,MAPK8IP2,FAM116B	PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PPP6R2	35812	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	50838232	50838664	50838480	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	NA	NA	NA	NA	NA	PPP6R2	58499	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr22	50977955	50978429	50978214	Y	PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B	LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,SYCE3,CPT1B,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	ODF3B	8946	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	2139427	2139840	2139639	Y	NA	CNTN4	NA	NA	NA	NA	CNTN4	930	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.071309611669
chr3	2194214	2194440	2194327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTN4	55717	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	2462645	2462952	2462798	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTN4	324148	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	2938260	2938635	2938449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL5RA	227662	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	3177157	3177268	3177188	Y	CRBN	IL5RA,TRNT1,CRBN	NA	NA	NA	NA	TRNT1	10557	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	3854493	3854653	3854575	Y	NA	LRRN1	NA	NA	NA	NA	LRRN1	15372	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	4392615	4392774	4392664	Y	ITPR1	SETMAR	NA	NA	NA	NA	SETMAR	49627	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	5027453	5027635	5027574	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	8652	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	5028534	5029013	5028702	Y	ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	9733	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	5038569	5038695	5038648	Y	BHLHE40	BHLHE40	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	19768	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	5063521	5063694	5063575	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40	44720	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	5067974	5068590	5068209	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40	49173	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	5181258	5181597	5181446	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	ARL8B,AC026202.3,EDEM1	EDEM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL8B	19353	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	6573697	6574039	6573711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM1	1346366	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	6741976	6742157	6742067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM1	1514645	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	7393024	7393352	7393188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMCD1	1148041	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	8524896	8525313	8525187	Y	LMCD1	LMCD1	NA	NA	NA	NA	LMCD1	16080	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	8783302	8783537	8783436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD18	219920	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	9721492	9721576	9721535	Y	IL17RC,IL17RC,CIDEC,CIDEC	MTMR14,BRPF1	NA	NA	NA	NA	MTMR14	32375	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	9904404	9904624	9904511	Y	OGG1,LOC401052,ARPC4,ARPC4,TADA3,RPUSD3,CIDEC,JAGN1,IL17RE,IL17RE,IL17RC,IL17RC,CIDEC,CIDEC	RPUSD3,JAGN1,IL17RE	NA	NA	NA	NA	RPUSD3	20118	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	9926228	9926446	9926367	Y	LOC401052,ARPC4,TADA3,RPUSD3,CIDEC,CIDEC,CIDEC,JAGN1,IL17RE,IL17RE,IL17RC,IL17RC	RPUSD3,JAGN1,IL17RE,IL17RC,CRELD1	IL17RE,IL17RC,JAGN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	JAGN1	3792	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	10157932	10158133	10158106	Y	NA	BRK1,VHL,IRAK2	NA	NA	NA	NA	BRK1	2656	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	11316376	11316801	11316733	Y	NA	ATG7	NA	NA	NA	NA	ATG7	4381	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	11688028	11688035	11688032	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAMM41	198358	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	11812040	11812191	11812115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAMM41	74202	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	12036535	12036797	12036666	Y	NA	SYN2	NA	NA	NA	NA	SYN2	7079	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	12219674	12219854	12219759	Y	RAF1,PPARG,PPARG,PPARG	TIMP4	NA	NA	NA	NA	TIMP4	20823	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	12398616	12399008	12398699	Y	RAF1,PPARG,PPARG	NA	NA	NA	NA	NA	PPARG	71749	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	12723455	12723677	12723573	Y	RAF1	RAF1	TMEM40,RAF1,MKRN2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAF1	19730	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	13035460	13035932	13035883	Y	CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	76685	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	8.285238446676
chr3	13493281	13493606	13493395	Y	NA	NUP210,HDAC11,HDAC11-AS1	IQSEC1,NUP210	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HDAC11	25618	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr3	13876231	13876614	13876422	Y	WNT7A	WNT7A	NA	NA	NA	NA	WNT7A	43004	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr3	13877889	13878107	13877998	Y	NA	WNT7A	NA	NA	NA	NA	WNT7A	41511	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr3	13884272	13884624	13884569	Y	WNT7A	WNT7A	NA	NA	NA	NA	WNT7A	34994	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	13920516	13920583	13920566	Y	WNT7A	WNT7A	NA	NA	NA	NA	WNT7A	898	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr3	13936849	13937176	13936976	Y	NA	WNT7A	C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WNT7A	17231	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.13922028641795
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr3	14715115	14715196	14715168	Y	NR2C2,C3orf20	C3orf20	NA	NA	NA	NA	C3orf20	509	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	15286616	15286745	15286681	Y	NR2C2,ZFYVE20,SH3BP5,EAF1,COLQ,CAPN7	CAPN7	NA	NA	NA	NA	CAPN7	40957	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	15334615	15334919	15334862	Y	NR2C2,SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,CAPN7	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	45956	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	15335582	15336799	15336677	Y	NR2C2,CAPN7,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	44076	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	15337572	15337812	15337795	Y	NA	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	43063	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	15338366	15338748	15338633	Y	NA	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	42127	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	15352253	15352542	15352441	Y	NA	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	28333	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	15358234	15358387	15358263	Y	ANKRD28,NR2C2,CAPN7,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	22488	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr3	15443040	15443420	15443273	Y	ANKRD28,METTL6,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5	EAF1,METTL6	NA	NA	NA	NA	EAF1	23442	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	15702831	15703150	15702848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	61493	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	15704167	15704382	15704274	Y	ANKRD28,CAPN7	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	62829	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	15847096	15847637	15847448	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	205758	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	15901875	15902313	15902310	Y	METTL6,ANKRD28	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	260537	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	16097736	16098110	16098018	Y	NA	NA	GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28	IMR90	Hi-C	24141950	DPH3	206369	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	16101834	16102183	16102049	Y	NA	NA	GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28	IMR90	Hi-C	24141950	DPH3	202296	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	16324333	16324353	16324342	Y	NA	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	19627	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr3	16351640	16351656	16351648	Y	RFTN1,OXNAD1	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	46934	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	16352603	16353027	16352777	Y	RFTN1,OXNAD1	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	47897	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	16373323	16373612	16373405	Y	ANKRD28,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	68617	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	17020237	17020570	17020404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	178078	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	17193194	17193470	17193300	Y	PLCL2	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	351035	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	17248138	17248312	17248225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	405979	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	17345014	17345355	17345310	Y	TBC1D5,TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	502855	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	17378312	17378639	17378476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	536153	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	17441926	17442172	17442040	Y	PLCL2	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	599767	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	17505233	17505390	17505312	Y	TBC1D5,TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	663074	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	17506581	17506846	17506713	Y	TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	664422	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	17542863	17543019	17542979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	700704	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	17543312	17543623	17543461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	701153	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr3	17650424	17650697	17650561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	808265	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	17679954	17680161	17680022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	804148	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	18403160	18403568	18403352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	80741	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	18571233	18571621	18571333	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	6544	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.4499167281683
chr3	19188369	19188866	19188531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	610204	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr3	19379484	19379512	19379499	Y	KCNH8	NA	NA	NA	NA	NA	EFHB	607005	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	19648890	19649201	19649045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFHB	337316	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	19687209	19687217	19687213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFHB	299300	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	19993428	19993925	19993635	Y	KAT2B,RAB5A	EFHB,RAB5A	NA	NA	NA	NA	RAB5A	6857	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	20082717	20083237	20083200	Y	RAB5A,KAT2B	KAT2B	NA	NA	NA	NA	KAT2B	3202	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	20096680	20097177	20096685	Y	NA	KAT2B	NA	NA	NA	NA	KAT2B	17165	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	20190984	20191185	20191115	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	34599	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	20200050	20200329	20200065	Y	NA	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	25455	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	20201632	20201832	20201780	Y	KAT2B	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	23952	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	20205868	20206079	20206039	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	19705	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	23432118	23432366	23432242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2E2	189607	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	23898490	23898770	23898565	Y	NA	NA	NKIRAS1,RPL15	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E1	53096	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	23935594	23935945	23935770	Y	NA	RPL15,NR1D2	NA	NA	NA	NA	RPL15	20091	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	24211422	24211442	24211432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKIRAS1	225340	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	24340917	24341295	24341106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THRB	193478	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	24370369	24370393	24370381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THRB	164380	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	24459735	24459834	24459785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THRB	74939	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	24525285	24525656	24525591	Y	NA	THRB	NA	NA	NA	NA	THRB	9117	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	25767387	25767675	25767610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OXSM	54733	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	25796078	25796406	25796226	Y	NGLY1	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	26002	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr3	27448460	27448581	27448568	Y	NA	NA	NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	SLC4A7	75330	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.8998334563366
chr3	27969490	27969763	27969630	Y	AZI2	NA	NA	NA	NA	NA	EOMES	207284	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	29288264	29288669	29288439	Y	NA	NA	RBMS3	IMR90	Hi-C	24141950	ZCWPW2	899627	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	29321469	29321877	29321696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZCWPW2	932832	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	31149741	31150063	31149903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	422067	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	31690891	31691368	31691073	Y	ZNF860,OSBPL10	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	118761	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	31737462	31737733	31737598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	165332	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	32426467	32426762	32426639	Y	NA	CMTM7	CMTM7	IMR90	Hi-C	24141950	CMTM7	4401	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	32549205	32549429	32549313	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	6305	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	32557705	32558097	32557882	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	14805	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	32822383	32822764	32822428	Y	TRIM71	AC139452.2,TRIM71	NA	NA	NA	NA	AC139452.2	2374	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr3	32823053	32823413	32823146	Y	NA	AC139452.2,TRIM71	NA	NA	NA	NA	AC139452.2	1725	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	32857811	32858132	32857909	Y	NA	AC139452.2,TRIM71	NA	NA	NA	NA	TRIM71	301	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.4499167281683
chr3	33063733	33064078	33063817	Y	NA	SEC13P1	NA	NA	NA	NA	SEC13P1	9277	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	33081513	33081785	33081661	Y	NA	SEC13P1	NA	NA	NA	NA	SEC13P1	8158	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	33086079	33086426	33086309	Y	CCR4	SEC13P1,TMPPE	NA	NA	NA	NA	SEC13P1	12724	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	33089398	33089551	33089467	Y	CCR4	SEC13P1,TMPPE,GLB1	NA	NA	NA	NA	SEC13P1	16043	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	33190938	33191178	33190994	Y	NA	CRTAP	NA	NA	NA	NA	CRTAP	37467	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	33639579	33639904	33639592	Y	CLASP2	NA	NA	NA	NA	NA	CLASP2	117944	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	33758685	33758853	33758767	Y	UBP1,UBP1,CLASP2	CLASP2	NA	NA	NA	NA	CLASP2	837	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	37901883	37902306	37902042	Y	CTDSPL	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	432	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr3	37904355	37904605	37904570	Y	NA	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	2904	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	37949474	37949626	37949550	Y	SLC22A14	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	48023	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	38209266	38209592	38209336	Y	VILL,PLCD1,SLC22A14,ACAA1,MYD88,OXSR1	ACAA1,MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	4686	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	38216296	38216490	38216393	Y	NA	ACAA1,MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	11716	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	39193999	39194528	39194467	Y	NA	TTC21A,GORASP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	39222162	39222653	39222434	Y	NA	CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	28109	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	39819819	39820214	39820017	Y	NA	MYRIP	NA	NA	NA	NA	MYRIP	28191	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	41624626	41624831	41624729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ULK4	377091	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	41725291	41725392	41725346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ULK4	276530	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	42237448	42237989	42237678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCK	67710	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	42725545	42725856	42725623	Y	LYZL4,KRBOX1,HHATL,CCDC13	NA	NA	NA	NA	NA	SEC22C	84973	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	42889474	42889730	42889711	Y	CCBP2	HIGD1A,KRBOX1	NA	NA	NA	NA	KRBOX1	40499	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	42922564	42922793	42922612	Y	C3orf39	NA	NA	NA	NA	NA	KRBOX1	73589	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	43368782	43368949	43368860	Y	NA	SNRK	NA	NA	NA	NA	SNRK	42778	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	43427917	43428246	43428244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-353H3.1	97126	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	43437259	43437582	43437422	Y	ZNF662,ZNF662,FAM198A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-353H3.1	87790	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	43519107	43519315	43519279	Y	SNRK	RP11-353H3.1	NA	NA	NA	NA	RP11-353H3.1	6057	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	44040259	44040834	44040651	Y	NA	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	ANO10	309173	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.4499167281683
chr3	44621262	44622718	44622436	Y	NA	ZNF660,ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF197	1662	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	44652575	44652865	44652702	Y	ZNF445,ZNF502,ZNF501,ZNF167,ZNF660,ZNF197	ZNF660,ZNF197,ZNF35	NA	NA	NA	NA	ZNF197	28195	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	45140818	45140977	45140897	Y	NA	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	44937	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	45165992	45166137	45166089	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	19777	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	46135224	46135371	46135312	Y	CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1	NA	CXCR6,FYCO1,CCR5,SACM1L,SLC6A20,CCR1,CCR3,CCRL2	IMR90	Hi-C	24141950	FYCO1	99908	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	46224873	46225198	46225066	Y	CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1	NA	NA	NA	NA	NA	FYCO1	189557	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	46226019	46226276	46226128	Y	CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1	NA	NA	NA	NA	NA	FYCO1	190703	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	46229441	46229694	46229475	Y	CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1	NA	NA	NA	NA	NA	FYCO1	194125	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	46254679	46255280	46254912	Y	CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1	NA	SLC6A20,CCR1,CCR5,CCRL2	IMR90	Hi-C	24141950	CCRL2	191374	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	46365618	46366089	46365745	Y	CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2	NA	CCR1	IMR90	Hi-C	24141950	CCRL2	80565	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	46600040	46600219	46600077	Y	NA	LRRC2	NA	NA	NA	NA	LRRC2	19370	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr3	46971519	46971826	46971651	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	MYL3,NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	47347	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	47004561	47004925	47004746	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	14248	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	47203467	47203704	47203598	Y	NA	SETD2	NA	NA	NA	NA	SETD2	10	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	47204029	47204492	47204291	Y	NA	SETD2	NA	NA	NA	NA	SETD2	572	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	47420724	47420876	47420775	Y	NA	PTPN23	NA	NA	NA	NA	PTPN23	223	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	47421570	47421869	47421711	Y	NA	PTPN23	NA	NA	NA	NA	PTPN23	1069	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	47466111	47466297	47466204	Y	NA	PTPN23	NA	NA	NA	NA	PTPN23	45610	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	47879431	47879730	47879653	Y	SPINK8	DHX30	NA	NA	NA	NA	DHX30	37032	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr3	48734201	48734270	48734236	Y	NA	NCKIPSD,IP6K2	NA	NA	NA	NA	NCKIPSD	12404	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	48990226	48990305	48990298	Y	USP4	ARIH2	NA	NA	NA	NA	ARIH2	35972	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	49123301	49123671	49123633	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2	NA	NA	NA	NA	QRICH1	6125	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	50194710	50194859	50194796	Y	TUSC2,HYAL2,GMPPB,C3orf54,MST1R,MON1A,IFRD2,SEMA3F	SEMA3F,SLC38A3	NA	NA	NA	NA	SEMA3F	4232	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	50264852	50265230	50265012	Y	TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2	SLC38A3,GNAI2,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	3128	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr3	50370591	50370860	50370724	Y	RBM6,SEMA3B,RASSF1	IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL2,TUSC2,RASSF1,CYB561D2,NPRL2,TMEM115	NA	NA	NA	NA	RASSF1	5551	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	50625949	50626261	50626110	Y	RBM5,RASSF1,RASSF1,CACNA2D2	HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	C3orf18	19491	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	51573530	51573858	51573781	Y	VPRBP,RAD54L2	VPRBP	NA	NA	NA	NA	VPRBP	41520	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	52009750	52010220	52010093	Y	NA	RRP9,PARP3,PCBP4,ABHD14A,ABHD14A-ACY1,ACY1,ABHD14B,RPL29	NA	NA	NA	NA	ABHD14A-ACY1,ACY1	2684	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	52287340	52287625	52287477	Y	PBRM1,NISCH,WDR82,GLYCTK,PPM1M,PPM1M	RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82	NA	NA	NA	NA	PPM1M	9499	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	52704686	52705129	52704984	Y	WDR82,GLYCTK,TMEM110,PRKCD,PBRM1	GNL3,PBRM1,SPCS1,GLT8D1	NA	NA	NA	NA	GNL3	8043	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	53107324	53107487	53107433	Y	TMEM110,SFMBT1,SFMBT1,DCP1A	SFMBT1	NA	NA	NA	NA	SFMBT1	28558	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	53136597	53136930	53136874	Y	PBRM1,PBRM1,TMEM110,DCP1A,PRKCD	RFT1	NA	NA	NA	NA	RFT1	25548	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	53270281	53270430	53270371	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	17638	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	53272912	53273168	53273085	Y	TMEM110,PRKCD,DCP1A	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	14900	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	53288705	53289353	53289077	Y	NA	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	637	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	53362706	53362961	53362819	Y	NA	DCP1A	NA	NA	NA	NA	DCP1A	16693	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	53380883	53380907	53380896	Y	TMEM110,PRKCD,DCP1A	DCP1A	NA	NA	NA	NA	DCP1A	1229	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	53723669	53724036	53723853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHDH	154381	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	53859957	53860202	53860080	Y	CACNA1D,CHDH	CHDH,IL17RB	NA	NA	NA	NA	CHDH	18215	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	54990078	54990247	54990161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D3-AS1	56796	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	56864313	56864691	56864516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM208A	149048	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	57051619	57051945	57051783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF3	59412	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	57562103	57562255	57562188	Y	SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12	DNAH12,PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	19692	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	57572232	57572342	57572306	Y	NA	DNAH12,PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	9605	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	57818713	57819025	57818868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLMAP	79536	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	57960548	57960842	57960815	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	31285	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	57968397	57968639	57968468	Y	PDE12,PXK	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	23488	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	57971589	57971767	57971672	Y	PDE12,PXK	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	20360	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	57995654	57995894	57995762	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	3527	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	57995926	57996426	57996121	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	3799	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	58029786	58030054	58029903	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	37659	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	58035006	58035314	58035102	Y	FLNB	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	42879	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr3	58457172	58457525	58457255	Y	RPP14,RPP14,KCTD6	PDHB,KCTD6	PXK,RPP14,KCTD6,ACOX2,PDHB	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD6	18316	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	58585428	58585740	58585446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACOX2	64382	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	59803830	59804011	59803964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	770020	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	60131975	60132178	60132077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	1098165	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	60360991	60361355	60361182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	873778	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	60501466	60501824	60501659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	733309	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr3	60654100	60654144	60654124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	580989	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr3	60695765	60695821	60695814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	539312	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	60715683	60716344	60716091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	518789	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	60804439	60804744	60804592	Y	FHIT	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	430389	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	61548977	61549431	61549203	Y	NA	PTPRG	NA	NA	NA	NA	PTPRG	3734	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	61828479	61828865	61828501	Y	PTPRG	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	101699	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	62246165	62246189	62246177	Y	C3orf14	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf14	56459	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	64313187	64313399	64313330	Y	PRICKLE2	NA	PRICKLE2	IMR90	Hi-C	24141950	PRICKLE2,RP11-14D22.2	115753	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	64901523	64901822	64901674	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS9	229847	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	65013149	65013388	65013334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS9	341473	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	65690412	65690419	65690417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	332090	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	65744738	65744801	65744770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	277708	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr3	65939140	65939412	65939262	Y	MAGI1	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	83097	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	66021951	66022397	66022084	Y	NA	MAGI1	NA	NA	NA	NA	MAGI1	112	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr3	66022863	66023161	66022996	Y	MAGI1	MAGI1	NA	NA	NA	NA	MAGI1	354	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	66279224	66279373	66279285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A26	161939	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	67050514	67050733	67050633	Y	KBTBD8	KBTBD8	NA	NA	NA	NA	KBTBD8	3787	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	67323380	67323617	67323499	Y	NA	NA	FAM19A4	IMR90	Hi-C	24141950	KBTBD8	276653	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	69135158	69135511	69135504	Y	NA	TMF1,UBA3,ARL6IP5	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	3063	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	71150221	71150629	71150383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	480511	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	71151319	71151713	71151657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	479427	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	71293394	71293605	71293527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	337535	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	71439009	71439199	71439166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	191941	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	71490469	71490633	71490551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	140507	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	71509041	71509324	71509198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	121816	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	71551472	71551754	71551609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	79386	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	72936024	72936237	72936180	Y	RYBP,EBLN2	SHQ1,GXYLT2,FTH1P23	NA	NA	NA	NA	GXYLT2	800	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	73022372	73022552	73022446	Y	PPP4R2,EBLN2	FTH1P23,PPP4R2	NA	NA	NA	NA	PPP4R2	21384	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	73159773	73160145	73159855	Y	EBLN2	NA	PDZRN3,CACNA1D	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC75P1	70297	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr3	74641204	74641330	74641267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86DP	840931	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	77273270	77273652	77273462	Y	ROBO2,ROBO2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	792101	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	78934560	78934824	78934693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	880141	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr3	80630991	80631014	80631005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	816026	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr3	80819406	80819881	80819642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBE1	989431	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	14.9134292040168
chr3	80820355	80820528	80820440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBE1	988784	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.071309611669
chr3	83266585	83266839	83266721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBE1	1457273	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	83268139	83268257	83268189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBE1	1458827	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	85930839	85930993	85930916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL3	1107276	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	88151728	88152092	88151734	Y	NA	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	C3orf38	44801	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	88208920	88209337	88209164	Y	CGGBP1,C3orf38	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	CGGBP1	11885	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr3	88367245	88367614	88367269	Y	NA	ABCF2P1	NA	NA	NA	NA	ABCF2P1	2939	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6	1144696	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	98504725	98505044	98504856	Y	OR5K4,ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	113489	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	98505158	98505735	98505540	Y	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	112798	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	98544884	98545154	98545150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	73379	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	99555247	99555560	99555404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	275797	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	99575221	99575605	99575379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	255752	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	99752092	99752383	99752194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	78974	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	99944403	99944723	99944568	Y	NA	TBC1D23	C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D23	33121	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	100519297	100519336	100519310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFG	93092	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	101146332	101146443	101146386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP7	83642	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	101403455	101403770	101403678	Y	SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24	ZBTB11,CEP97	NA	NA	NA	NA	RPL24	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	105395533	105395739	105395657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	190657	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	107706134	107706639	107706380	Y	NA	NA	MYH15,IFT57,CD47,LOC285205	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD47	101233	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	107720264	107720547	107720441	Y	NA	NA	CD47,IFT57,HHLA2,MYH15	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD47	87325	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	107803224	107803878	107803522	Y	NA	CD47	NA	NA	NA	NA	CD47	3994	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	109525861	109526042	109525944	Y	NA	NA	PVRL3	IMR90	Hi-C	24141950	DZIP3	1219332	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	111816359	111816505	111816432	Y	C3orf52	C3orf52	NA	NA	NA	NA	C3orf52	13177	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	112097877	112098105	112098057	Y	ATG3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35A5	180451	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	112182390	112182567	112182476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35A5	95989	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	112258715	112258936	112258847	Y	SLC35A5,ATG3	SLC35A5,ATG3	NA	NA	NA	NA	SLC35A5	19620	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	112274528	112274888	112274746	Y	SLC35A5,ATG3	SLC35A5,ATG3	NA	NA	NA	NA	SLC35A5	3668	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	113638745	113638778	113638762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-435F17.1	71167	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr3	113941944	113942320	113942165	Y	ZNF80,TIGIT	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	168484	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	114144881	114145214	114145066	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	371421	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	114354102	114354718	114354116	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	580642	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	114373701	114374062	114373901	Y	ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	600241	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	117175008	117175053	117175027	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	431463	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	118561016	118561389	118561159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B4GALT4	396561	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	119144576	119144994	119144966	Y	ARHGAP31,COX17,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	40683	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	119147570	119147724	119147648	Y	NA	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	37953	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	119238487	119238668	119238501	Y	NA	TIMMDC1	NA	NA	NA	NA	TIMMDC1	23108	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	119514057	119514298	119514132	Y	NR1I2,NR1I2	NA	NA	NA	NA	NA	COX17	119756	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	119644387	119644860	119644721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	166404	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	119866352	119866515	119866428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-18H7.1	54610	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	119876721	119876867	119876800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-18H7.1	64979	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	120277715	120278240	120277932	Y	NA	NDUFB4	FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB4	34916	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	120492875	120493095	120492951	Y	NA	GTF2E1,RABL3	NA	NA	NA	NA	RABL3	33035	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	120493479	120494008	120493729	Y	NA	GTF2E1,RABL3	NA	NA	NA	NA	RABL3	33639	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	121520314	121520680	121520641	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	31246	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	121539764	121539854	121539811	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	12072	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	121664489	121664635	121664539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC15A2	53553	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	122201925	122202222	122202174	Y	NA	KPNA1	NA	NA	NA	NA	KPNA1	29570	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	122208819	122209075	122208974	Y	NA	KPNA1	NA	NA	NA	NA	KPNA1	22717	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	122467278	122467457	122467368	Y	NA	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	43214	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	122489447	122489759	122489603	Y	CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	20912	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	122493180	122493752	122493620	Y	CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	16919	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	122516218	122516436	122516387	Y	CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	DIRC2	4576	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	123229622	123229815	123229688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPLB	72217	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	123241172	123241525	123241376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPLB	60507	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	123263878	123263964	123263921	Y	ADCY5,ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	PTPLB	38068	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr3	123321303	123321432	123321369	Y	ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	18914	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	123324068	123324437	123324253	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	21679	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	123391718	123392030	123392015	Y	ADCY5,MYLK	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	89329	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	123398747	123398958	123398853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	96358	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	124553626	124554125	124554004	Y	KALRN	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	64140	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.4499167281683
chr3	124605050	124605342	124605178	Y	ITGB5	ITGB5	NA	NA	NA	NA	ITGB5	12923	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	124779995	124780351	124780112	Y	ITGB5,HEG1	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	7193	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr3	124786089	124786383	124786283	Y	NA	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	13287	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	125231315	125231583	125231558	Y	NA	SNX4	NA	NA	NA	NA	SNX4	5458	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86JP	75679	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr3	125986265	125986571	125986320	Y	NA	NA	KLF15,ZXDC,ALDH1L1,CCDC37	IMR90	Hi-C	24141950	KLF15	87714	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	126074775	126075511	126074965	Y	ALDH1L1,UROC1,CCDC37,KLF15	KLF15	NA	NA	NA	NA	KLF15	490	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	126391611	126391660	126391640	Y	NA	TXNRD3,CHCHD6	NA	NA	NA	NA	TXNRD3	19613	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	126569545	126569928	126569643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA1	135509	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr3	126701397	126702091	126701497	Y	PLXNA1	PLXNA1	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PLXNA1	3346	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr3	126702933	126703224	126703109	Y	NA	PLXNA1	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PLXNA1	2213	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	127404993	127405883	127405741	Y	MGLL	ABTB1	NA	NA	NA	NA	ABTB1	15215	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	127448420	127448704	127448528	Y	TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	NA	NA	NA	NA	NA	ABTB1	58642	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	127465577	127465875	127465733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLL	74176	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.17487509225245
chr3	127536409	127536633	127536521	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL,KBTBD12	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	3418	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr3	127813021	127813267	127813144	Y	NA	SEC61A1	NA	NA	NA	NA	SEC61A1	44537	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	128054461	128054660	128054529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475N22.4	151395	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	128152586	128152939	128152776	Y	NA	NA	EEFSEC,DNAJB8-AS1,DNAJB8,LOC90246,GATA2,C3orf27	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-475N22.4	53116	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	128153952	128154067	128154030	Y	GATA2	NA	EEFSEC,C3orf27,GATA2,LOC90246,DNAJB8-AS1,DNAJB8	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-475N22.4	51988	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	128216520	128216923	128216625	Y	EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2	RP11-475N22.4	GATA2,C3orf27,RUVBL1,EEFSEC,DNAJB8,DNAJB8-AS1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-475N22.4	10465	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	128417695	128417825	128417815	Y	NA	RPN1,RAB7A	RAB7A,LOC653712,RPN1,KIAA1257	IMR90	Hi-C	24141950	RPN1	19777	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr3	128475272	128475670	128475352	Y	RAB7A,ISY1,CNBP	RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	6191	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	128745839	128746109	128746044	Y	NA	KIAA1257	NA	NA	NA	NA	KIAA1257	26306	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	128837764	128838022	128837873	Y	MBD4,H1FX,C3orf37,C3orf37,KIAA1257,ISY1,CNBP,RAB43,RAB43,RAB43,RAB43	RAB43,ISY1-RAB43,ISY1	NA	NA	NA	NA	RAB43	1622	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	130637982	130638444	130638066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2C1	70543	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	131197540	131197572	131197556	Y	NA	MRPL3	NA	NA	NA	NA	MRPL3	22255	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	131515446	131515652	131515549	Y	CPNE4	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL3	295619	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	132137953	132138107	132138033	Y	DNAJC13	DNAJC13	NA	NA	NA	NA	DNAJC13	3583	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	133147395	133147694	133147637	Y	NA	BFSP2-AS1	NA	NA	NA	NA	BFSP2-AS1	24926	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr3	133180256	133180441	133180371	Y	NA	BFSP2-AS1	NA	NA	NA	NA	BFSP2-AS1	7636	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	133289121	133289251	133289178	Y	SRPRB	CDV3	CDV3	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDV3	1323	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	133295128	133295300	133295215	Y	NA	CDV3	NA	NA	NA	NA	CDV3	4554	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	133686653	133686998	133686826	Y	SLCO2A1,C3orf36	NA	NA	NA	NA	NA	RAB6B	73973	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	133747879	133748000	133747885	Y	C3orf36,SLCO2A1	SLCO2A1	NA	NA	NA	NA	SLCO2A1	21028	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	134045700	134046050	134045958	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	15282	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr3	134047160	134047394	134047241	Y	ANAPC13,ANAPC13,ANAPC13,AMOTL2	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	16742	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr3	134050159	134050571	134050486	Y	AMOTL2	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	19741	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr3	134067109	134067364	134067237	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	6039	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	134068231	134068586	134068519	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	4817	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	134069780	134070244	134070081	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	3159	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	4.03905374275455
chr3	134082893	134083489	134083439	Y	AMOTL2	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	AMOTL2	8832	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr3	134182898	134183261	134183039	Y	AMOTL2	CEP63,ANAPC13	NA	NA	NA	NA	CEP63	19324	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	135615560	135615771	135615666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R3A	66744	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	135827453	135827844	135827484	Y	PPP2R3A	NA	NA	NA	NA	NA	MSL2	86239	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr3	135861520	135861675	135861598	Y	MSL2,MSL2	NA	NA	NA	NA	NA	MSL2	52408	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	136153802	136154197	136154172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCCB	186654	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	136327517	136327655	136327647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG1	141565	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	136448168	136448437	136448423	Y	NA	STAG1	NA	NA	NA	NA	STAG1	20783	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	136492102	136492187	136492145	Y	NA	STAG1	NCK1,IL20RB	IMR90	Hi-C	24141950	STAG1	22882	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	136631651	136631818	136631718	Y	NA	IL20RB	NA	NA	NA	NA	IL20RB	31254	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	137938227	137938395	137938336	Y	ARMC8	DBR1,ARMC8	NA	NA	NA	NA	ARMC8	34118	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	137990064	137990319	137990141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAS	74220	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	138364761	138365360	138365102	Y	PIK3CB,ARMC8	FAIM	NA	NA	NA	NA	FAIM	39313	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	138581550	138581663	138581597	Y	NA	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	29770	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	139064285	139064552	139064299	Y	NA	COPB2,RP11-319G6.1	NA	NA	NA	NA	COPB2	42022	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	139344390	139344678	139344552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMNAT3	50181	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	141056151	141056465	141056211	Y	NA	ZBTB38	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	15096	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	141174545	141175038	141174891	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	28851	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr3	141230074	141230471	141230125	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	26185	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	141319185	141319480	141319327	Y	RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	115296	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	141458120	141458481	141458300	Y	RASA2	RNF7	NA	NA	NA	NA	RNF7	3074	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	141610914	141611173	141610928	Y	NA	ATP1B3	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	17948	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	141693372	141693614	141693574	Y	TFDP2,TFDP2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-343B5.1	67426	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	141707258	141707451	141707397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-343B5.1	53589	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	146259909	146260381	146260206	Y	PLSCR1	PLSCR2,PLSCR1	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	270	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	146745799	146745822	146745813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZIC1	363387	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	146955604	146955955	146955778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZIC1	153254	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	149265788	149265935	149265852	Y	WWTR1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	55341	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	149284462	149284628	149284613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	74015	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	149356424	149356747	149356622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	95754	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	149533104	149533741	149533325	Y	RNF13	RNF13	NA	NA	NA	NA	RNF13	4609	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	150086629	150086866	150086749	Y	NA	TSC22D2	RNF13,PFN2,TSC22D2,SERP1,EIF2A,LOC646903	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D2	37256	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr3	150453151	150453509	150453478	Y	CLRN1	RP11-103G8.2,FAM194A,SIAH2-AS1,SIAH2	NA	NA	NA	NA	SIAH2-AS1	24215	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	150482569	150482635	150482602	Y	NA	SIAH2-AS1,SIAH2	NA	NA	NA	NA	SIAH2	3305	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	150943935	150944361	150944164	Y	P2RY14	NA	NA	NA	NA	NA	MED12L	142451	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	150987276	150987626	150987385	Y	P2RY12,MED12L	NA	NA	NA	NA	NA	MED12L	185792	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	151918966	151919116	151919042	Y	NA	MBNL1	NA	NA	NA	NA	MBNL1	40501	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	153017510	153017568	153017539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP2B	139481	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	154787580	154787808	154787649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PABPC1P10	237788	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	156268270	156268550	156268410	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	2423	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	156432757	156433079	156432845	Y	CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	TIPARP,TIPARP-AS1	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	42590	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	156828715	156829105	156828910	Y	NA	RP11-6F2.5,CCNL1	NA	NA	NA	NA	RP11-6F2.5	31085	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	157935893	157935900	157935896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSRC1	114249	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	158226530	158226854	158226539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-538P18.2	60001	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	158431050	158431280	158431158	Y	NA	LXN,MFSD1	NA	NA	NA	NA	MFSD1	16707	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	158435101	158435147	158435125	Y	NA	LXN,MFSD1	NA	NA	NA	NA	MFSD1	12840	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	158447066	158447110	158447086	Y	NA	MFSD1	NA	NA	NA	NA	MFSD1	877	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	158466226	158466540	158466401	Y	MFSD1	MFSD1	NA	NA	NA	NA	MFSD1	18239	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	158491929	158492257	158492161	Y	NA	MFSD1	RARRES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MFSD1	43942	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	159493461	159493761	159493605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC4	621301	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	159532172	159532274	159532246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC4	582788	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	159542121	159542517	159542198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC4	572545	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	159656528	159656799	159656753	Y	NA	NA	IQCJ-SCHIP1,IL12A	IMR90	Hi-C	24141950	SMC4	458263	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	160267928	160268193	160268163	Y	NA	SCARNA7,KPNA4	NA	NA	NA	NA	KPNA4	13183	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	160714920	160715128	160715024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMD3	105356	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	160735129	160735256	160735193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMD3	85228	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	160949185	160949470	160949344	Y	OTOL1	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALNT1	128013	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	165102012	165102226	165102071	Y	SLITRK3	NA	NA	NA	NA	NA	BCHE	451034	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	167737805	167738014	167737910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOLIM4	73749	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	168939202	168939471	168939359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TERC	541377	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	169379831	169380308	169379976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TERC	100540	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	169872442	169872609	169872497	Y	NA	PHC3	NA	NA	NA	NA	PHC3	24928	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	170073991	170074311	170074218	Y	SKIL,SKIL	SKIL	NA	NA	NA	NA	SKIL	525	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	170435342	170435619	170435400	Y	NA	NA	CLDN11,SLC7A14,RPL22L1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22L1	150653	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	170444418	170445820	170444586	Y	CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2	NA	CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22L1	140452	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	170883066	170883220	170883212	Y	TNIK	NA	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	258584	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	170979718	170979982	170979850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	196215	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	171074101	171074325	171074213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	101872	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	171146057	171146176	171146159	Y	NA	TNIK	NA	NA	NA	NA	TNIK	30021	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	171175851	171176236	171176082	Y	TNIK	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	171529898	171530084	171530030	Y	FNDC3B,PLD1	PP13439,PLD1	NA	NA	NA	NA	PLD1	3158	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.55348220875175
chr3	171542633	171542898	171542814	Y	FNDC3B,PLD1	PP13439,PLD1	FNDC3B,PLD1,TMEM212	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLD1	15893	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	171543191	171543627	171543455	Y	FNDC3B,PLD1	PP13439,PLD1	FNDC3B,PLD1,TMEM212	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLD1	16451	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	171847438	171848726	171847798	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	92020	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	171858231	171859026	171858504	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	102813	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr3	171870963	171871593	171871291	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	115545	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	171897555	171897878	171897648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	142137	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	172038895	172038985	172038971	Y	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	BZW1P1	103894	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	172467147	172467552	172467259	Y	NA	NCEH1,ECT2,RNU4-4P	NCEH1,ECT2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ECT2	675	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	172510084	172510259	172510171	Y	NA	ECT2,RNU4-4P	NA	NA	NA	NA	RNU4-4P	2089	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	174159946	174160135	174160080	Y	NA	NAALADL2	NAALADL2	IMR90	Hi-C	24141950	NAALADL2	5583	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	176504226	176504517	176504371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	408744	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	176774167	176774584	176774367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	138677	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	177076157	177076922	177076435	Y	TBL1XR1	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	162896	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	177297513	177297662	177297588	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90	Hi-C	24141950	TBL1XR1	384252	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	178532692	178532946	178532777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	255121	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	178699167	178699475	178699434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	88592	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	LRRFIP1P1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1P1	1287	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr3	179165833	179166212	179166067	Y	NA	GNB4	NA	NA	NA	NA	GNB4	1166	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr3	179182237	179182507	179182372	Y	NA	GNB4	GNB4	IMR90	Hi-C	24141950	GNB4	14859	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	179309053	179309431	179309273	Y	NA	ACTL6A,MRPL47,NDUFB5	NA	NA	NA	NA	MRPL47	11011	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	179431401	179431712	179431563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP13	62858	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	179446932	179447182	179447058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP13	78389	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	181418145	181418802	181418404	Y	SOX2	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC19	712583	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	182550667	182550775	182550721	Y	ATP11B	ATP11B	NA	NA	NA	NA	ATP11B	41379	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	182645862	182646115	182645990	Y	MCF2L2,MCCC1	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	55626	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	182727471	182727797	182727625	Y	NA	DCUN1D1	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	25730	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	183098974	183099227	183099069	Y	B3GNT5,KLHL6,KLHL24	MCF2L2	NA	NA	NA	NA	MCF2L2	45339	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	184560038	184560430	184560098	Y	VPS8	VPS8	NA	NA	NA	NA	VPS8	32107	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	184727770	184727947	184727859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf70	140855	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	185339016	185339200	185339107	Y	NA	SENP2	NA	NA	NA	NA	SENP2	40732	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	185374091	185374577	185374335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP2	75807	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	185482318	185482647	185482554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2BP2	58197	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	185842493	185842801	185842568	Y	NA	ETV5	ETV5	K562	ChIA-PET	22265404	ETV5	16386	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	185903604	185903898	185903751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV5	77497	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	187304327	187304487	187304407	Y	NA	NA	ST6GAL1,MASP1	IMR90	Hi-C	24141950	SST	81700	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	187467867	187468249	187468141	Y	BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	6352	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	187607399	187607588	187607479	Y	BCL6	NA	BCL6,LPP	IMR90	Hi-C	24141950	BCL6	145884	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	187682660	187682900	187682757	Y	BCL6,BCL6	NA	BCL6,LPP,LPP-AS2	IMR90	Hi-C	24141950	LPP	186172	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	187749863	187749880	187749872	Y	RTP2	NA	BCL6,LPP	IMR90	Hi-C	24141950	LPP	119192	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	188065570	188065751	188065619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	195725	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	188151524	188151812	188151760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	281679	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	188291512	188291633	188291575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	421667	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	188667737	188668123	188668016	Y	NA	NA	LPP,BCL6,LPP-AS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LPP-AS2	797892	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	191873125	191873377	191873252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MB21D2	760573	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	192561492	192561800	192561547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MB21D2	72150	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	192610862	192611520	192611033	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	22430	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	192634153	192634990	192634777	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	203	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	192873675	192873788	192873739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRASLS	83126	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	193587539	193587846	193587782	Y	NA	NA	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HES1	264088	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	193588211	193588236	193588227	Y	NA	NA	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HES1	263698	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	193597420	193597611	193597456	Y	NA	NA	HES1,OPA1,LOC647323	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HES1	254323	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	193851636	193853009	193852912	Y	ATP13A3,HES1	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	193859199	193859624	193859359	Y	TMEM44	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	7265	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	193993457	193993565	193993509	Y	NA	NA	LOC647323,LOC100131551	IMR90	Hi-C	24141950	HES1	141523	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr3	194153543	194153935	194153911	Y	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	63158	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	194210438	194211060	194210799	Y	HES1,ATP13A3	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	6033	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	194360985	194361172	194361065	Y	NA	TMEM44,LSG1,FAM43A	NA	NA	NA	NA	TMEM44	8567	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	194461690	194461887	194461800	Y	FAM43A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM43A	57068	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	194503840	194504106	194503965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM43A	99218	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	194882926	194883249	194883145	Y	FAM43A	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	106647	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	195073897	195074088	195073990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	84001	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	195153778	195154174	195153996	Y	NA	ACAP2	NA	NA	NA	NA	ACAP2	7633	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	195849521	195850263	195850145	Y	TFRC,TFRC	TFRC	LOC401109,PCYT1A,TFRC,MIR570,MUC20,UBXN7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFRC	42461	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr3	195854063	195854320	195854202	Y	TFRC,TFRC	TFRC	LOC401109,PCYT1A,TFRC,MIR570,MUC20,UBXN7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFRC	47003	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	195891844	195892227	195892035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFRC	84784	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	196208308	196208582	196208445	Y	NA	RNF168	NA	NA	NA	NA	RNF168	20057	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr3	196255741	196255873	196255820	Y	NA	RNF168,FBXO45,WDR53	UBXN7,MUC20,RNF168,C3orf43,PCYT1A,TM4SF19-TCTEX1D2,WDR53,FBXO45,CEP19	IMR90	Hi-C	24141950	RNF168	27102	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr3	196389876	196389952	196389914	Y	LRRC33	LINC01063,PIGX,CEP19	NA	NA	NA	NA	PIGX	25230	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	196635737	196635948	196635847	Y	UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5	SENP5,NCBP2	NA	NA	NA	NA	NCBP2	31520	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	196694427	196694825	196694642	Y	NA	NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1	NA	NA	NA	NA	PIGZ	496	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	197007663	197007913	197007866	Y	NA	DLG1	NA	NA	NA	NA	DLG1	16258	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	197216995	197217339	197217145	Y	DLG1	NA	NA	NA	NA	NA	BDH1	80855	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr3	197247664	197248059	197247722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BDH1	50135	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	257243	257573	257339	Y	PDE6B	ZNF732	NA	NA	NA	NA	ZNF732	39537	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr4	640356	640557	640503	Y	ZNF141,ZNF721,TMEM175,CPLX1,PDE6B	PDE6B,MYL5,ATP5I	NA	NA	NA	NA	PDE6B	22983	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr4	742666	742733	742699	Y	NA	PCGF3,RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	30904	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	751950	752022	752014	Y	NA	RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	21615	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	770204	770556	770391	Y	ZNF141	RP11-440L14.1,CPLX1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	3081	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	789468	789689	789607	Y	NA	RP11-440L14.1,CPLX1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	15831	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	1036795	1036974	1036954	Y	CRIPAK,SLC26A1	FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	35071	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	1181039	1181331	1181185	Y	DGKQ,RNF212	SPON2	NA	NA	NA	NA	SPON2	19419	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	1184509	1184886	1184846	Y	RNF212,CRIPAK	SPON2	NA	NA	NA	NA	SPON2	15864	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	1237849	1238004	1237927	Y	NA	SPON2,CTBP1,MAEA	NA	NA	NA	NA	CTBP1	3737	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	1339592	1340250	1339850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEA	57953	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	1710531	1710811	1710671	Y	NA	SLBP,TMEM129,TACC3	NA	NA	NA	NA	SLBP	1471	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	1712467	1712893	1712787	Y	WHSC1	SLBP,TMEM129,TACC3	NA	NA	NA	NA	SLBP	185	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	1769544	1769746	1769644	Y	FGFR3	TMEM129,TACC3,FGFR3	FGFR3	MCF7	ChIA-PET	22265404	FGFR3	23288	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr4	1796551	1796852	1796752	Y	NA	FGFR3	NA	NA	NA	NA	FGFR3	3517	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	1875191	1875366	1875328	Y	NA	LETM1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	WHSC1	4040	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	1966776	1967112	1967086	Y	WHSC1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf48	74577	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	1970462	1970680	1970571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf48	71009	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	2537711	2538436	2538089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	75764	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr4	2538945	2539718	2539367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	76998	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	2574508	2574529	2574516	Y	NA	NA	POLN,MXD4,LOC402160,RNF4,FAM193A,TNIP2,ADD1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF4	112561	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	3085381	3085754	3085447	Y	NA	HTT	NA	NA	NA	NA	HTT	10973	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	3357519	3357800	3357660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS12	64764	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	3391112	3391254	3391201	Y	RGS12	NA	NA	NA	NA	NA	RGS12	98357	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	3493312	3493795	3493528	Y	NA	LRPAP1	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	38491	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr4	4855584	4855774	4855697	Y	NA	MSX1	MSX1	K562	ChIA-PET	22265404	MSX1	3619	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	5587454	5587568	5587511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVC2	121707	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	6635412	6635534	6635472	Y	NA	MRFAP1,AC093323.3,RP11-539L10.3	NA	NA	NA	NA	MRFAP1	4284	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	6734442	6734743	6734533	Y	KIAA0232	S100P,MRFAP1L1,KIAA0232	NA	NA	NA	NA	MRFAP1L1	24835	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	6754865	6755056	6754928	Y	NA	MRFAP1L1,KIAA0232	LOC100129931,TADA2B,KIAA0232,TBC1D14	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA0232	26046	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.13922028641795
chr4	6785099	6785509	6785391	Y	TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232	KIAA0232	NA	NA	NA	NA	KIAA0232	3997	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr4	6920106	6920340	6920183	Y	MAN2B2,S100P,KIAA0232,TADA2B,GRPEL1,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	11137	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	6974782	6974959	6974886	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	65813	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	7012933	7013112	7013014	Y	NA	TADA2B,CCDC96	NA	NA	NA	NA	TADA2B	28514	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	7648496	7648718	7648592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	290935	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.13922028641795
chr4	7649791	7650390	7650086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	289263	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	7833117	7833393	7833178	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	106260	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	8551076	8551407	8551242	Y	NA	GPR78,CPZ	GPR78	IMR90	Hi-C	24141950	GPR78	7045	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	8561379	8561777	8561592	Y	GPR78	GPR78,CPZ	NA	NA	NA	NA	GPR78	2927	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr4	8614691	8614733	8614712	Y	NA	CPZ	NA	NA	NA	NA	CPZ	22304	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	8617311	8617700	8617508	Y	NA	CPZ	NA	NA	NA	NA	CPZ	24924	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	9154755	9155069	9154900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPZ	562368	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	10188451	10188753	10188602	Y	NA	NA	WDR1,CLNK	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WDR1	71878	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	12642016	12642195	12642111	Y	NA	RP11-352E6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-352E6.2	1755	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	13282552	13282692	13282688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90AB2P	50346	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	13329661	13329866	13329822	Y	NA	HSP90AB2P	HSP90AB2P	IMR90	Hi-C	24141950	HSP90AB2P	3172	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	13483063	13483398	13483224	Y	NA	RAB28	NA	NA	NA	NA	RAB28	591	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	13623241	13623510	13623376	Y	NA	AC006445.7	NA	NA	NA	NA	AC006445.7	8713	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	15533007	15533164	15533086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CC2D2A	63518	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	15590411	15590648	15590624	Y	FBXL5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	90637	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	15651682	15652058	15651870	Y	NA	FAM200B,FBXL5	NA	NA	NA	NA	FAM200B	29227	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	16003610	16004023	16003987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGFBP1	65247	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	18578786	18579116	18578810	Y	NA	NA	FAM184B	IMR90	Hi-C	24141950	LCORL	557287	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	19620943	19621209	19621076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-3J1.1	164326	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	19825132	19825140	19825136	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-3J1.1	368515	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	20445202	20445303	20445235	Y	KCNIP4	NA	NA	NA	NA	NA	PACRGL	250602	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	22636233	22636363	22636286	Y	NA	RP11-10G12.1	NA	NA	NA	NA	RP11-10G12.1	42414	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	23890635	23890864	23890849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX15	693309	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	24220772	24221175	24221047	Y	PPARGC1A	NA	NA	NA	NA	NA	DHX15	362998	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	24227575	24227894	24227795	Y	NA	NA	PPARGC1A	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	356279	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	24262994	24263251	24263044	Y	NA	NA	PPARGC1A	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	320922	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	25175369	25175577	25175408	Y	NA	SEPSECS,PI4K2B	NA	NA	NA	NA	PI4K2B	15106	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	25877100	25877320	25877119	Y	NA	SEL1L3	C4orf52	IMR90	Hi-C	24141950	SEL1L3	13718	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	26082532	26082681	26082657	Y	NA	NA	RBPJ,TBC1D19	IMR90	Hi-C	24141950	RBPJ	80396	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	26087064	26087357	26087217	Y	NA	NA	RBPJ,TBC1D19	IMR90	Hi-C	24141950	RBPJ	75720	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	26175759	26175971	26175925	Y	NA	RBPJ	RBPJ	IMR90	Hi-C	24141950	RBPJ	12682	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	26214365	26214515	26214442	Y	NA	NA	RBPJ,STIM2	IMR90	Hi-C	24141950	RBPJ	51288	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr4	26219568	26220289	26219918	Y	RBPJ,RBPJ	NA	RBPJ,STIM2	IMR90	Hi-C	24141950	RBPJ	56491	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	28621646	28621809	28621725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	1761425	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	36183139	36183486	36183313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	60645	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	37581972	37582372	37582240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELL1	103626	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	38084338	38084956	38084492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	124282	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	38102941	38103486	38103298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	142885	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	38320550	38320897	38320770	Y	NA	NA	FLJ13197,KLF3,TBC1D1,TLR10	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF3	342920	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	38665008	38665204	38665059	Y	TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	504	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	39038547	39038755	39038651	Y	NA	KLHL5	NA	NA	NA	NA	KLHL5	5904	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	40285086	40285251	40285162	Y	N4BP2,RHOH	NA	N4BP2,RHOH	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CHRNA9	50095	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	40519982	40520039	40520011	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	RBM47	110853	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	40533771	40533999	40533881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM47	96893	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	40564357	40564512	40564451	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	RBM47	66380	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	40620437	40620847	40620835	Y	NA	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	10045	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	40623743	40623952	40623867	Y	RBM47	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	6940	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	40628320	40628499	40628391	Y	NA	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	2393	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr4	40628627	40628976	40628881	Y	NA	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	1916	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	40674578	40674731	40674666	Y	RBM47	RBM47	RBM47	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBM47	43686	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.2427857670014
chr4	40674929	40675349	40675137	Y	RBM47	RBM47	RBM47	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBM47	44037	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.4499167281683
chr4	40684955	40685070	40685013	Y	NA	NA	RBM47,NSUN7	IMR90	Hi-C	24141950	RBM47	54063	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr4	40765283	40765623	40765452	Y	RBM47	NSUN7	NA	NA	NA	NA	NSUN7	15369	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	40791893	40792102	40791997	Y	NSUN7	NSUN7	NA	NA	NA	NA	NSUN7	41979	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	40943410	40943552	40943502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSUN7	193496	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	40994779	40995404	40995184	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	221327	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	40998550	40998604	40998585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	218127	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	41000829	41000972	41000906	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	215759	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	41162074	41162440	41162321	Y	APBB2	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	54291	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr4	41469951	41470276	41469966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	110327	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	41704988	41705115	41705052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM33	230022	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	41936193	41936441	41936268	Y	TMEM33	TMEM33	NA	NA	NA	NA	TMEM33	1056	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	42181977	42182059	42182018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC30A9	191488	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	44712631	44712762	44712670	Y	NA	GUF1,GNPDA2	NA	NA	NA	NA	GNPDA2	13850	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	47464691	47464980	47464836	Y	NA	COMMD8,ATP10D	NA	NA	NA	NA	COMMD8	955	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	48757987	48758274	48758261	Y	NA	FRYL,OCIAD1	NA	NA	NA	NA	FRYL	22065	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	48851417	48851730	48851443	Y	ZAR1,FRYL	OCIAD1	NA	NA	NA	NA	OCIAD1	46188	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	53023897	53024042	53023970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGCB	121249	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	53985720	53986039	53985931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-752D24.2	175904	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	54906868	54907157	54907139	Y	NA	CHIC2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	21700	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	54958023	54958135	54958077	Y	NA	CHIC2	SCFD2,CHIC2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	29166	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	55100480	55100923	55100634	Y	PDGFRA	PDGFRA	NA	NA	NA	NA	PDGFRA	7216	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	57278248	57278433	57278373	Y	NA	AASDH,PPAT,PAICS	NA	NA	NA	NA	PPAT	21348	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	57459098	57459424	57459263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THEGL	64323	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr4	57831930	57832208	57832081	Y	NA	POLR2B,NOA1	NA	NA	NA	NA	POLR2B	9680	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	66107153	66107671	66107555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-204H9.2	812526	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	5.07470854858905
chr4	76487136	76487403	76487267	Y	NA	THAP6,RCHY1,C4orf26	NA	NA	NA	NA	C4orf26	7878	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr4	76623783	76624179	76623867	Y	RCHY1,G3BP2,G3BP2	G3BP2,USO1	NA	NA	NA	NA	G3BP2	23530	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	76963504	76963670	76963541	Y	NAAA,CXCL9,CXCL10,CXCL11	NA	NA	NA	NA	NA	SDAD1	53389	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	77511406	77511861	77511558	Y	ANKRD56,SHROOM3	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	157153	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr4	77522680	77522954	77522817	Y	SHROOM3	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	168427	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	77546849	77546886	77546883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	192596	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	77868010	77868840	77868612	Y	NA	SEPT11	NA	NA	NA	NA	SEPT11	16	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	77869398	77869850	77869619	Y	SEPT11	SEPT11	NA	NA	NA	NA	SEPT11	542	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	77974492	77974926	77974738	Y	CCNI	CCNI	NA	NA	NA	NA	CCNI	20232	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	78656019	78656351	78656260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNOT6L	82418	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	78977894	78978171	78977912	Y	FRAS1	FRAS1	NA	NA	NA	NA	FRAS1	1170	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	79083838	79083918	79083865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRAS1	107114	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.00339893692005
chr4	79521197	79521480	79521236	Y	NA	LINC01094	NA	NA	NA	NA	LINC01094	43577	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	79550555	79550802	79550658	Y	NA	LINC01094	NA	NA	NA	NA	LINC01094	14255	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	82388876	82389215	82389175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASGEF1B,RP11-689K5.3	574182	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	83205945	83206187	83206036	Y	NA	BIN2P1	NA	NA	NA	NA	BIN2P1	11721	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	83681282	83681423	83681411	Y	NA	SCD5	NA	NA	NA	NA	SCD5	36587	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr4	84029980	84030193	84029996	Y	NA	PLAC8	NA	NA	NA	NA	PLAC8	26035	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	84033440	84033690	84033502	Y	THAP9,LIN54,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,COQ2,PLAC8,PLAC8	PLAC8	NA	NA	NA	NA	PLAC8	22538	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	84034119	84034423	84034342	Y	THAP9,LIN54,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,COQ2,PLAC8,PLAC8	PLAC8	NA	NA	NA	NA	PLAC8	21805	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr4	84111590	84111978	84111921	Y	THAP9,HPSE,HPSE,HPSE,COQ2,PLAC8	NA	PLAC8	IMR90	Hi-C	24141950	PLAC8	55362	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	86435968	86436285	86436110	Y	NA	ARHGAP24	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	41701	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	86927841	86928538	86928361	Y	MAPK10,MAPK10,MAPK10	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	533574	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	87838829	87839174	87839055	Y	NA	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	AFF1	14980	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	87839773	87840193	87839957	Y	HSD17B11	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	AFF1	13961	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	87880821	87880990	87880863	Y	NA	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	TECRP1	11545	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	87894121	87894618	87894307	Y	NA	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	TECRP1	24845	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	88128179	88128500	88128218	Y	NA	KLHL8	NA	NA	NA	NA	KLHL8	30966	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	89099576	89099877	89099636	Y	HERC6,HERC5	NA	PKD2	IMR90	Hi-C	24141950	ABCG2	50597	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	89117936	89118179	89117940	Y	MEPE	ABCG2	PKD2,ABCG2	IMR90	Hi-C	24141950	ABCG2	32295	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	91049597	91049943	91049669	Y	FAM190A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13A	1019048	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.21052989808695
chr4	91453996	91454262	91454133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13A	1423447	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	92218724	92218762	92218742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13A	2188175	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	99848541	99848872	99848707	Y	NA	EIF4E	NA	NA	NA	NA	EIF4E	916	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	100861794	100861850	100861822	Y	NA	LAMTOR3,DNAJB14,RP11-15B17.1,H2AFZ	NA	NA	NA	NA	DNAJB14	4033	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	103596395	103596588	103596491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANBA	83563	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	103608721	103609347	103609253	Y	NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA	NA	NA	NA	NA	NA	MANBA	70804	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	103750426	103750532	103750434	Y	NHEDC1,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3	RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2	NA	NA	NA	NA	RP11-10L12.4	3214	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	103788773	103788886	103788830	Y	NA	RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2	NA	NA	NA	NA	CISD2	638	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	106628155	106628490	106628322	Y	NA	GSTCD	NA	NA	NA	NA	GSTCD	220	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	106635528	106635690	106635582	Y	NA	GSTCD	NA	NA	NA	NA	GSTCD	7593	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	109001369	109002122	109002058	Y	LEF1,LEF1	NA	NA	NA	NA	NA	HADH	92499	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	111086740	111086853	111086804	Y	NA	RP11-115A14.1,ELOVL6	NA	NA	NA	NA	RP11-115A14.1	21210	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	111117471	111117868	111117585	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	487	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr4	113181018	113181306	113181029	Y	AP1AR,TIFA	AP1AR,ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	ALPK1	23359	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr4	113201272	113201525	113201422	Y	TIFA	ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	ALPK1	3140	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr4	115198943	115199113	115199023	Y	NA	NA	ARSJ,ANK2	IMR90	Hi-C	24141950	UGT8	318498	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	117519495	117520605	117520296	Y	NA	ACTN4P1	NA	NA	NA	NA	ACTN4P1	2178	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr4	119032604	119032667	119032636	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDST3	79831	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	119115424	119115493	119115457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNHG8	82371	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	119187150	119187543	119187362	Y	NA	SNHG8	NA	NA	NA	NA	SNHG8	10321	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr4	119629667	119629850	119629760	Y	NA	METTL14	NA	NA	NA	NA	METTL14	25144	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	121010657	121011025	121010845	Y	NA	RP11-679C8.2,MAD2L1	NDNF	IMR90	Hi-C	24141950	MAD2L1	24428	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr4	121323328	121323687	121323508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD2L1	337099	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	121561847	121561947	121561897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM5	280078	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	122606332	122606884	122606598	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	9384	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	122611926	122612330	122612120	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	3938	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr4	123792983	123793156	123793069	Y	NA	NUDT6,SPATA5	NA	NA	NA	NA	NUDT6	48967	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	124661039	124661237	124661155	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY1	345089	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	128752654	128753022	128752839	Y	HSPA4L	PLK4	NA	NA	NA	NA	PLK4	46994	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	128990801	128990842	128990822	Y	NA	LARP1B	NA	NA	NA	NA	LARP1B	10378	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	129244135	129244496	129244419	Y	NA	PGRMC2	PGRMC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PGRMC2	36151	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	129254148	129254471	129254310	Y	NA	PGRMC2	PHF17,LARP1B	IMR90	Hi-C	24141950	PGRMC2	46164	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	134046475	134046584	134046530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-400D2.2	1200044	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	139903137	139903538	139903344	Y	NA	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	31405	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	139960222	139960706	139960403	Y	CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25279	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	139960939	139961173	139961057	Y	NAA15,CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25996	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	140003738	140004448	140004114	Y	CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2	NA	CCRN4L	K562	ChIA-PET	22265404	CCRN4L	68795	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	140235316	140235657	140235500	Y	ELF2,RAB33B	NAA15,NDUFC1	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	13611	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	140334690	140334958	140334824	Y	ELF2	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	37428	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	140886001	140886373	140886187	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	186965	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	140891718	140892054	140891918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	181284	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	141016837	141017139	141016990	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	56199	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	141071687	141072625	141072041	Y	MAML3	MAML3	NA	NA	NA	NA	MAML3	713	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr4	141174275	141174653	141174618	Y	NA	NA	MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAML3	100937	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr4	141287573	141287758	141287638	Y	NA	RP11-425I13.1	NA	NA	NA	NA	RP11-425I13.1	1558	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	141712099	141712307	141712229	Y	TBC1D9,ZNF330	TBC1D9	TBC1D9,UCP1	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D9	36825	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	141779541	141779551	141779546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D9	104267	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	144276815	144277022	144276900	Y	NA	GAB1	NA	NA	NA	NA	GAB1	20900	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.4855715340028
chr4	144332697	144332829	144332792	Y	GAB1	NA	NA	NA	NA	NA	GAB1	76782	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	145956046	145956369	145956259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCE1	60715	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	146656396	146656737	146656614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAA	118981	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	148374725	148374999	148374823	Y	TMEM184C	NA	TMEM184C	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM184C	161535	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	148426409	148426782	148426596	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM184C	109752	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	148654111	148654384	148654270	Y	PRMT10	ARHGAP10	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	2897	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr4	148746659	148746986	148746792	Y	PRMT10,ARHGAP10	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	95445	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	148752985	148753384	148753090	Y	PRMT10	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	101771	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	149467274	149467593	149467420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	816060	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	151316952	151317347	151317150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	617532	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	151681778	151681989	151681952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	252890	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	151873741	151873900	151873783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	60979	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	152090134	152090652	152090546	Y	SH3D19	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	71409	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr4	152105959	152106222	152106091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	87234	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	152117073	152117218	152117121	Y	FAM160A1,SH3D19	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	98348	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	153265183	153265560	153265526	Y	FBXW7	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4453	189856	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	153313306	153313343	153313324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4453	142073	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	153858553	153859077	153858605	Y	TRIM2,FHDC1	RP11-206F17.2,FHDC1	ARFIP1,FHDC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FHDC1	3049	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr4	153884926	153884958	153884941	Y	NA	RP11-206F17.2,FHDC1	NA	NA	NA	NA	FHDC1	29422	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	154170296	154170804	154170469	Y	TIGD4,KIAA0922	NA	NA	NA	NA	NA	MND1	92997	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	154244307	154244410	154244359	Y	NA	MND1	NA	NA	NA	NA	MND1	19391	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	154548347	154548481	154548383	Y	KIAA0922,TLR2	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0922	162849	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	154577062	154577591	154577315	Y	TLR2	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0922	191564	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	154580466	154580842	154580627	Y	TLR2	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0922	194968	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	159169271	159169555	159169414	Y	TMEM144	NA	NA	NA	NA	NA	FAM198B	76801	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	159592059	159592445	159592194	Y	NA	ETFDH,C4orf46	NA	NA	NA	NA	C4orf46	652	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	159643443	159643599	159643521	Y	FNIP2,PPID	PPID,FNIP2	NA	NA	NA	NA	PPID	895	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	160195976	160196239	160196029	Y	RAPGEF2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	507686	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	164464203	164464350	164464219	Y	NPY1R,NPY5R,MARCH1	NA	NA	NA	NA	NA	NAF1	378130	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	164876357	164876532	164876526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAF1	790284	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	165210734	165210789	165210744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-366M4.3	585367	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	169557546	169558299	169557820	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	100609	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	169705913	169706245	169706080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	223181	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr4	169802596	169802736	169802661	Y	PALLD	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	126690	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	170023521	170023783	170023621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	94095	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	170096424	170096523	170096474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3RF1	93733	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	170547481	170547627	170547562	Y	CLCN3	NEK1,CLCN3	C4orf27	IMR90	Hi-C	24141950	CLCN3	15697	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	170570348	170570457	170570384	Y	NA	NEK1,CLCN3	NA	NA	NA	NA	CLCN3	38564	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	176452577	176452812	176452695	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR17	532173	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	177191849	177192202	177191988	Y	ASB5	SPCS3,RP11-87F15.2	SPATA4	IMR90	Hi-C	24141950	SPCS3	46913	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	178469887	178470022	178469954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-130F10.1	105754	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	183110695	183110955	183110887	Y	NA	AC108142.1	NA	NA	NA	NA	AC108142.1	46293	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	183133398	183133793	183133630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC108142.1	68996	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	183161464	183161792	183161628	Y	ODZ3	NA	ODZ3	IMR90	Hi-C	24141950	AC108142.1	97062	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr4	183353287	183353302	183353295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC108142.1	288885	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr4	183397757	183397986	183397872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC108142.1	333355	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	183418367	183418505	183418425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC108142.1	353965	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	183439666	183439879	183439717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC108142.1	375264	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	183481652	183481875	183481779	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCTD	355214	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	183515054	183515204	183515166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCTD	321885	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr4	183536176	183536411	183536208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCTD	300678	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr4	185671621	185671780	185671770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL1	74192	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	187027199	187027350	187027289	Y	SORBS2,FAM149A	TLR3	NA	NA	NA	NA	TLR3	38893	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	187810272	187810501	187810328	Y	NA	NA	FAT1	IMR90	Hi-C	24141950	FAT1	164396	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	10.2529825777616
chr4	189029344	189029687	189029466	Y	ZFP42,TRIML2	TRIML2,TRIML1	FAT1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIML2	587	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr4	190285262	190285611	190285472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	343257	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.96774413108555
chr4	190942271	190942591	190942322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	82328	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	53990	54174	54063	Y	PLEKHG4B,C5orf55	CTD-2231H16.1	LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2231H16.1	36092	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.6927024951697
chr5	148457	148511	148484	Y	NA	PLEKHG4B	NA	NA	NA	NA	PLEKHG4B	10084	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	175502	175522	175512	Y	NA	PLEKHG4B,CCDC127,SDHA	NA	NA	NA	NA	PLEKHG4B	37129	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	354736	354943	354840	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	AHRR	52445	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	400756	401055	400906	Y	NA	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	40203	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	426647	427011	426980	Y	NA	C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5	NA	NA	NA	NA	C5orf55	14247	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	656184	656577	656381	Y	SLC9A3,ZDHHC11,TPPP	CEP72,TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	34933	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr5	672861	673336	673024	Y	NA	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18174	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.5212263398373
chr5	757060	757343	757251	Y	TPPP	NA	ZDHHC11,SLC9A3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TPPP	65550	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr5	758121	758535	758359	Y	TPPP	NA	SLC9A3,ZDHHC11,BRD9,CEP72,TRIP13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TPPP	66611	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr5	759096	759567	759320	Y	TPPP	NA	SLC9A3,ZDHHC11,CEP72,BRD9,TRIP13	IMR90	Hi-C	24141950	TPPP	67586	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.00339893692005
chr5	777448	777883	777776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC11	71218	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC11	64078	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	11.3922028641795
chr5	1007986	1008378	1008075	Y	NA	RP11-43F13.3,NKD2	NA	NA	NA	NA	NKD2	1042	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	1041596	1043550	1041859	Y	NA	RP11-43F13.3,NKD2	NA	NA	NA	NA	NKD2	34652	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.34635124758485
chr5	1110480	1111164	1110500	Y	LPCAT1,SLC12A7	SLC12A7	NA	NA	NA	NA	SLC12A7	330	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	1130725	1130985	1130924	Y	NA	SLC12A7	BRD9,LOC100506688,TRIP13,SLC12A7,NKD2,SLC6A18,CLPTM1L,MIR4457,ZDHHC11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC12A7	20575	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	1200004	1200495	1200211	Y	NA	SLC6A19	NA	NA	NA	NA	SLC6A19	294	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	1470037	1470319	1470275	Y	SLC12A7,LPCAT1	SLC6A3	NA	NA	NA	NA	SLC6A3	26492	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	1478329	1478968	1478499	Y	LPCAT1	SLC6A3,LPCAT1	SLC6A3	IMR90	Hi-C	24141950	SLC6A3	34784	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	1498250	1498484	1498297	Y	LPCAT1	LPCAT1	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	23608	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	1501941	1502569	1502322	Y	LPCAT1	LPCAT1,CTD-2245E15.3	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	19523	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr5	1504118	1504272	1504189	Y	SLC12A7,LPCAT1	LPCAT1,CTD-2245E15.3	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	17820	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	1514952	1515327	1515072	Y	NA	LPCAT1,CTD-2245E15.3	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	6765	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.34635124758485
chr5	1516282	1516761	1516468	Y	SLC12A7,LPCAT1	LPCAT1,CTD-2245E15.3	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	5331	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	1522529	1522699	1522639	Y	NA	LPCAT1,CTD-2245E15.3	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	437	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	1562820	1563021	1562959	Y	SLC12A7,LPCAT1	LPCAT1,CTD-2245E15.3,SDHAP3	NA	NA	NA	NA	CTD-2245E15.3	12995	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	1876782	1877128	1876955	Y	NA	CTD-2194D22.3,IRX4	NA	NA	NA	NA	CTD-2194D22.3	4952	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	2780518	2780773	2780623	Y	NA	C5orf38,IRX2	NA	NA	NA	NA	IRX2	29549	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr5	3304230	3304631	3304430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRX2	553261	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	5376440	5376820	5376639	Y	NA	KIAA0947	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	41957	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	5423578	5423857	5423693	Y	KIAA0947	KIAA0947	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	4801	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	81417	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.41766085925385
chr5	9544480	9544834	9544772	Y	SEMA5A	SEMA5A,SNHG18	NA	NA	NA	NA	SNHG18	168	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	9547741	9548115	9547963	Y	NA	SEMA5A,SNHG18	NA	NA	NA	NA	SNHG18	3429	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	9681641	9681655	9681648	Y	NA	NA	TAS2R1	IMR90	Hi-C	24141950	SNHG18	137329	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	10352620	10352938	10352732	Y	NA	CMBL,MARCH6	NA	NA	NA	NA	MARCH6	805	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr5	10422961	10423316	10423021	Y	NA	ROPN1L	NA	NA	NA	NA	ROPN1L	16320	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	10692588	10692818	10692805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	66566	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	12060867	12061015	12060936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	1301483	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	12099131	12099529	12099330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	1339747	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	12314219	12314247	12314235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	1554835	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	13325974	13326290	13326142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAH5	616362	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	14142803	14143164	14142969	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	992	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	14178655	14179133	14178814	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	36844	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	14199302	14199513	14199379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	57491	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	14268390	14268821	14268476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	126579	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	14404233	14404452	14404428	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	FAM105A	175432	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	14408020	14408375	14408038	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	FAM105A	171509	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	14639692	14640047	14639871	Y	NA	EEF1A1P13,FAM105B	TRIO,FAM105A	IMR90	Hi-C	24141950	EEF1A1P13	11391	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	16309962	16310362	16310162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF622	153539	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	16492574	16492683	16492630	Y	FAM134B	ZNF622	NA	NA	NA	NA	ZNF622	28673	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr5	16715199	16715528	16715435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	100032	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	16727981	16728387	16728161	Y	FAM134B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	112814	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	16735791	16735955	16735874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	120624	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	16894604	16895174	16894829	Y	NA	CTB-55B8.1,MYO10	NA	NA	NA	NA	CTB-55B8.1	5576	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.96774413108555
chr5	16898106	16898497	16898302	Y	MYO10	CTB-55B8.1,MYO10	NA	NA	NA	NA	CTB-55B8.1	2253	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	17177639	17177702	17177672	Y	NA	AC091878.1	NA	NA	NA	NA	AC091878.1	37454	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr5	17184758	17185051	17184904	Y	BASP1	AC091878.1	NA	NA	NA	NA	AC091878.1	30105	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	17185868	17186222	17185997	Y	NA	AC091878.1	NA	NA	NA	NA	AC091878.1	28934	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	17224986	17225514	17225115	Y	BASP1	AC091878.1	NA	NA	NA	NA	AC091878.1	9830	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr5	17249327	17249860	17249454	Y	NA	AC091878.1	NA	NA	NA	NA	AC091878.1	34171	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	17282496	17282827	17282587	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	60898	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	17402383	17402599	17402496	Y	NA	FTH1P10,RP11-321E2.3	BASP1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-321E2.3	255	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	19288299	19288682	19288500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2023M8.1	544017	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr5	19315150	19315342	19315248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2023M8.1	570868	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	20447344	20447494	20447490	Y	CDH18	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-774D14.1	162455	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	21396018	21396126	21396072	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP1	56076	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	21551190	21551442	21551193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP1	211248	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	24272966	24273308	24273185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD29	536282	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD29	1100991	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	26513622	26513644	26513633	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD29	1704032	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	29758752	29759069	29758903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2134P3.1	951396	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	32164142	32164348	32164245	Y	ZFR	GOLPH3	NA	NA	NA	NA	GOLPH3	8108	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	32175167	32175567	32175368	Y	NA	GOLPH3,CTD-2186M15.1	NA	NA	NA	NA	GOLPH3	2711	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	32366924	32367006	32366965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR12	55809	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	32592950	32593432	32593186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUB1	63211	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	33442170	33442454	33442303	Y	NA	CTD-2203K17.1,TARS	NA	NA	NA	NA	TARS	3368	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	33805217	33805258	33805238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMACR	200962	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	34949030	34949157	34949062	Y	NA	BRIX1,RAD1,DNAJC21	NA	NA	NA	NA	DNAJC21	21332	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	36151218	36151404	36151252	Y	C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	1127	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr5	36174356	36174616	36174412	Y	SLC1A3,SLC1A3,RANBP3L,C5orf33,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	24265	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	36229884	36229947	36229916	Y	UGT3A1,C5orf33,C5orf33	NA	NA	NA	NA	NA	SKP2	79793	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	36657665	36658163	36657813	Y	NIPBL	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A3	53208	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	36690488	36690876	36690655	Y	NIPBL	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A3	86031	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	37311676	37311784	37311730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP155	57499	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	38546436	38546759	38546707	Y	NA	MIR3650	NA	NA	NA	NA	MIR3650	8904	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	38660472	38660667	38660594	Y	LIFR	NA	EGFLAM,LIFR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIFR	54016	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	38672702	38672722	38672712	Y	NA	NA	EGFLAM,LIFR	IMR90	Hi-C	24141950	LIFR	66246	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	38866844	38867106	38866976	Y	NA	CTD-2127H9.1,OSMR	NA	NA	NA	NA	OSMR	22884	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	39395044	39395463	39395161	Y	NA	C9	NA	NA	NA	NA	C9	27507	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	39721328	39721512	39721418	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	260926	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	41856929	41857024	41856977	Y	NA	OXCT1,C5orf51	NA	NA	NA	NA	OXCT1	11597	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	43051482	43051716	43051600	Y	NA	AC025171.1,ZNF131	NA	NA	NA	NA	ZNF131	11562	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	43480579	43480813	43480696	Y	NA	C5orf28,RP11-159F24.3,C5orf34	NA	NA	NA	NA	C5orf28	1182	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	53358665	53359272	53358974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	245140	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	53585796	53586153	53585818	Y	NA	ARL15	NA	NA	NA	NA	ARL15	18259	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	53886377	53886761	53886569	Y	SNX18,SNX18	NA	SNX18	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	74788	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	54622279	54622499	54622328	Y	NA	DHX29,SKIV2L2	NA	NA	NA	NA	SKIV2L2	20691	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	54729958	54730125	54730050	Y	SKIV2L2,DDX4	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2A	98753	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	55287334	55287994	55287973	Y	NA	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	IL6ST	827	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	55289605	55289989	55289924	Y	IL6ST	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2031P19.3	610	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	55711184	55711637	55711363	Y	MAP3K1	NA	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC022431.1	87262	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	58314415	58314788	58314579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	560328	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	59045613	59045932	59045792	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	735608	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	60710257	60710608	60710433	Y	NA	RPL3P6	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	24559	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	61843905	61844215	61843940	Y	NA	CKS1B	NA	NA	NA	NA	CKS1B	37596	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	64796548	64796879	64796719	Y	PPWD1,CENPK	NA	NA	NA	NA	NA	CENPK	60119	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	64947553	64947709	64947631	Y	NA	CTC-534A2.2,TRIM23	NA	NA	NA	NA	TRIM23	27751	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	65097290	65097569	65097365	Y	ERBB2IP,SGTB	NA	NA	NA	NA	NA	SGTB	80428	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	65447669	65447962	65447814	Y	SREK1,SREK1	SREK1	NA	NA	NA	NA	SREK1	13870	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	65918246	65918267	65918259	Y	MAST4	MAST4	NA	NA	NA	NA	MAST4	28070	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	SLC30A5	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	48595	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	68823946	68824105	68824026	Y	NA	OCLN	NA	NA	NA	NA	OCLN	37827	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	70772003	70772134	70772073	Y	NA	BDP1	NA	NA	NA	NA	BDP1	22561	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	71404360	71404518	71404455	Y	MAP1B	MAP1B	NA	NA	NA	NA	MAP1B	3299	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	72792808	72793048	72792966	Y	NA	BTF3	NA	NA	NA	NA	BTF3	575	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	73611863	73612159	73611974	Y	NA	NA	RGNEF,ENC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEXB	321689	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	74020638	74021005	74020822	Y	NA	NSA2,GFM2	NA	NA	NA	NA	NSA2	39812	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	75206184	75206581	75206350	Y	IQGAP2,COL4A3BP,POLK,COL4A3BP	NA	SV2C	IMR90	Hi-C	24141950	POC5	194871	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	75878112	75878410	75878232	Y	IQGAP2,S100Z	NA	NA	NA	NA	NA	F2R	131458	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	76958449	76958840	76958645	Y	NA	WDR41	NA	NA	NA	NA	WDR41	44013	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	77175908	77176078	77175986	Y	NA	TBCA	NA	NA	NA	NA	TBCA	13304	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	77940704	77941073	77940964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHFPL2	122771	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	77974245	77974379	77974312	Y	NA	NA	SCAMP1,LHFPL2,ARSB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LHFPL2	89465	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	78612719	78612843	78612781	Y	JMY	CTC-451P13.1	NA	NA	NA	NA	CTC-451P13.1	33978	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	78843402	78843606	78843502	Y	CMYA5,HOMER1	HOMER1	THBS4,BHMT2,HOMER1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HOMER1	35362	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr5	78843882	78844075	78843988	Y	NA	HOMER1	THBS4,BHMT2,HOMER1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HOMER1	35842	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	78990549	78990790	78990669	Y	THBS4,CMYA5	NA	NA	NA	NA	NA	PAPD4	84606	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	78993167	78993488	78993350	Y	THBS4,CMYA5	NA	NA	NA	NA	NA	PAPD4	87224	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr5	79480253	79480678	79480326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	69220	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	79584551	79584948	79584750	Y	NA	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	34653	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	80316439	80316828	80316634	Y	RASGRF2	NA	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	278551	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	80579237	80579431	80579394	Y	NA	CKMT2-AS1,ZCCHC9	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	15948	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	CTD-2249K22.1	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2249K22.1	2217	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr5	81469981	81470152	81470091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS23	102244	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	81655341	81655441	81655346	Y	NA	NA	VCAN,ATP6AP1L,XRCC4	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	82945	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	82636435	82636494	82636447	Y	XRCC4,VCAN	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM167A	264753	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	86653612	86653965	86653789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNH	52871	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	86662563	86662890	86662661	Y	RASA1,RASA1	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	43946	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	86667091	86667409	86667357	Y	NA	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	39427	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	89259292	89259660	89259475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CETN3	443943	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr5	90679835	90680013	90679955	Y	ARRDC3	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	2659	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	90680524	90680637	90680608	Y	ARRDC3	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	3348	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	90772639	90772960	90772848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	95463	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	92593669	92593984	92593827	Y	NA	NA	FLJ42709	IMR90	Hi-C	24141950	NPM1P27	423389	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	93256507	93256894	93256879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	188510	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	94038768	94039036	94038830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0825	86459	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	94380006	94380293	94380145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81B	344755	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	95048086	95048445	95048385	Y	NA	RHOBTB3	RHOBTB3,ARSK,SPATA9,RFESD	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RHOBTB3	860	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	95170754	95171173	95170855	Y	GLRX,ELL2	GLRX	RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	14045	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr5	96475990	96476170	96476132	Y	NA	RIOK2	NA	NA	NA	NA	RIOK2	40794	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	98197255	98197391	98197342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	65484	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	98253335	98253735	98253703	Y	CHD1	CTD-2007H13.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	9140	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	99382569	99383254	99382906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	485712	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr5	101404486	101404751	101404619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO4C1	225502	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	102091646	102092087	102091846	Y	NA	PAM	NA	NA	NA	NA	PAM	3961	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	102121468	102121525	102121497	Y	PPIP5K2	PAM	NA	NA	NA	NA	PAM	33783	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	103465253	103465580	103465434	Y	NA	RNU1-140P	NA	NA	NA	NA	RNU1-140P	32678	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr5	106931094	106931453	106931417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL17	784346	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	108137615	108137706	108137661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FER	56092	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	108329034	108329385	108329210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FER	247511	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	108391550	108391948	108391605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FER	310027	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	108460806	108460908	108460857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PJA2	282787	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	110252904	110253068	110253014	Y	NA	NA	TSLP	IMR90	Hi-C	24141950	TSLP	150692	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	110846985	110847356	110847238	Y	WDR36,STARD4	STARD4	NA	NA	NA	NA	STARD4	697	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	110865894	110866475	110866210	Y	STARD4	STARD4	NA	NA	NA	NA	STARD4	19606	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr5	112054250	112054372	112054293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRP19	140547	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	112218687	112219263	112218745	Y	APC	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	23768	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	112219334	112219897	112219506	Y	NA	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	24415	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	112251574	112251628	112251601	Y	NA	REEP5	NA	NA	NA	NA	REEP5	4608	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	112383528	112383665	112383560	Y	DCP2,YTHDC2	NA	NA	NA	NA	NA	DCP2	73129	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	112509140	112509432	112509369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP2	198741	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	114726097	114726311	114726134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC112	95569	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr5	114848957	114849251	114849109	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	29340	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	115346892	115346904	115346897	Y	AQPEP	CTD-2287O16.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2287O16.1	39082	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	115794810	115794877	115794844	Y	COMMD10,SEMA6A	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-118N6.1	101381	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	115855956	115855969	115855965	Y	NA	CTB-118N6.1	NA	NA	NA	NA	CTB-118N6.1	40289	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	115911792	115912152	115911976	Y	SEMA6A	CTB-118N6.1,SEMA6A	NA	NA	NA	NA	SEMA6A	3162	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	118399353	118399657	118399513	Y	NA	DMXL1,CTB-161M19.4	DMXL1	K562	ChIA-PET	22265404	CTB-161M19.4	4928	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	118610393	118610883	118610628	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	8006	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.8641786505021
chr5	118659966	118660476	118660173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	57579	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	118666017	118666217	118666120	Y	DMXL1,TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	63630	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	118670685	118671156	118670901	Y	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	68298	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	118678067	118678220	118678144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	75680	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	118701841	118702237	118702039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSD17B4	83901	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	118703348	118703546	118703439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSD17B4	82592	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	118725501	118725774	118725509	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	NA	HSD17B4	60364	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	120004624	120004640	120004633	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-507E12.1	990732	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	120609806	120610048	120609927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRFBP1	685608	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	122034407	122034744	122034604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX2	73947	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr5	122087226	122087448	122087366	Y	NA	SNX2	PRDM6	IMR90	Hi-C	24141950	SNX2	21243	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr5	122108155	122108524	122108401	Y	SNX24,SNX2	SNX2	NA	NA	NA	NA	SNX2	167	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr5	122177778	122177931	122177816	Y	NA	SNX24	NA	NA	NA	NA	SNX24	644	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	122322384	122322589	122322416	Y	NA	PPIC	NA	NA	NA	NA	PPIC	47847	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	123996464	123996708	123996619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-436H11.1	146218	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	123997171	123997561	123997207	Y	ZNF608	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-436H11.1	145365	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	124006979	124007355	124007057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-436H11.1	135571	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	125701796	125702121	125701959	Y	GRAMD3	GRAMD3	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	7972	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	125773418	125773804	125773609	Y	GRAMD3	NA	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	79594	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	126181513	126181654	126181594	Y	MARCH3	NA	NA	NA	NA	NA	LMNB1	71198	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	126478879	126479210	126479043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf63	71695	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	126847905	126848122	126848004	Y	NA	PRRC1	PRRC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	PRRC1	3179	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr5	129563384	129563648	129563470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-114H7.1	759942	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	130718102	130718482	130718270	Y	FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42SE2	138916	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	131074214	131074509	131074363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP1	56201	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	131108111	131108375	131108174	Y	NA	FNIP1	NA	NA	NA	NA	FNIP1	22335	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	131601385	131601782	131601639	Y	P4HA2	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	10021	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	131604535	131604860	131604707	Y	NA	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	13171	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	131763542	131763915	131763870	Y	SLC22A4,IRF1	C5orf56,AC116366.6	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	C5orf56	19214	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	131774835	131775712	131775188	Y	SLC22A4,IRF1	C5orf56,AC116366.6,IRF1	NA	NA	NA	NA	C5orf56	30507	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	131795302	131795488	131795309	Y	NA	AC116366.6,IRF1	NA	NA	NA	NA	AC116366.6	11247	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	131832561	131832909	131832704	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8071	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.55348220875175
chr5	131989640	131989693	131989667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF3A	81637	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,AC010240.3,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AC010240.3	1685	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr5	132576270	132576709	132576388	Y	AFF4,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA4	190616	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	133463735	133464046	133463858	Y	PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7,SKP1	NA	NA	NA	NA	TCF7	15333	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	133466882	133467138	133467027	Y	PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7,SKP1	NA	NA	NA	NA	TCF7	18480	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	133562679	133563046	133562870	Y	NA	MIR3661,PPP2CA	NA	NA	NA	NA	PPP2CA	2846	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	133585407	133585743	133585572	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	MIR3661,PPP2CA	SKP1,PPP2CA,MIR3661	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	PPP2CA	25574	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	133681629	133682059	133681927	Y	NA	CDKL3,UBE2B	NA	NA	NA	NA	CDKL3	22679	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	133775971	133776293	133776132	Y	NA	CDKN2AIPNL	PHF15,SKP1,UBE2B,CDKN2AIPNL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIPNL	30382	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	133801466	133801754	133801589	Y	NA	AC005355.2	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.2	38489	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	133802349	133802592	133802584	Y	PPP2CA,SEC24A,UBE2B	AC005355.2	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.2	37651	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	133847692	133847829	133847767	Y	NA	AC005355.2	PHF15,CDKN2AIPNL,CDKL3,UBE2B,SKP1,PPP2CA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.2	7449	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr5	133863130	133863560	133863438	Y	NA	AC005355.2	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	22887	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	133891612	133892163	133891823	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	51369	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	246	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12,MIR4461	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	134729023	134729250	134729122	Y	H2AFY	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	4354	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	134824618	134825007	134824746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXCL14	87962	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	135097584	135097864	135097724	Y	NA	NA	TRPC7	IMR90	Hi-C	24141950	CXCL14	184615	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	135416297	135416409	135416350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD5	50125	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	135955852	135956149	135955964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-1I21.2	235168	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	136359479	136359669	136359574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-1I21.2	168162	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	137833063	137833252	137833158	Y	FAM53C,EGR1	EGR1,ETF1	NA	NA	NA	NA	EGR1	33884	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	137868208	137868538	137868536	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	8451	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	137881069	137881276	137881109	Y	WNT8A,FAM53C,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	4080	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	137908044	137908328	137908223	Y	NA	ETF1,HSPA9,CTNNA1	NA	NA	NA	NA	HSPA9	805	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	138058227	138058591	138058405	Y	NA	AC034243.1	CTNNA1,SIL1,MATR3,LRRTM2	IMR90	Hi-C	24141950	AC034243.1	28407	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr5	138078029	138078389	138078209	Y	NA	AC034243.1	CTNNA1,SIL1,HSPA9,MATR3	IMR90	Hi-C	24141950	AC034243.1	8609	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	138127302	138127500	138127374	Y	NA	AC034243.1	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	40304	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	138241399	138241693	138241546	Y	NA	NA	SIL1	IMR90	Hi-C	24141950	AC034243.1	154401	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	138248139	138248403	138248239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	161141	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr5	138263528	138263871	138263700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	176530	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	138277949	138278244	138278038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	190951	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	138541195	138541588	138541435	Y	NA	NA	SIL1,HSPA9,CTNNA1,LRRTM2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MATR3	65853	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr5	138620359	138620541	138620439	Y	UBE2D2,MATR3	MATR3,SIL1	NA	NA	NA	NA	SIL1	6705	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	138686401	138686737	138686569	Y	NA	PAIP2	NA	NA	NA	NA	PAIP2	11125	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	138727034	138727338	138727139	Y	LOC389333	SPATA24	NA	NA	NA	NA	SPATA24	10439	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	138786651	138786712	138786682	Y	NA	SPATA24,DNAJC18	NA	NA	NA	NA	DNAJC18	8471	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	138897527	138897822	138897662	Y	MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2	UBE2D2	DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2D2	6194	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr5	138965572	138965797	138965632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	59087	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr5	139017086	139017541	139017145	Y	CXXC5	CXXC5	CXXC5	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC5	7343	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	139132414	139132610	139132513	Y	NA	NA	UBE2D2,CXXC5,DNAJC18,NRG2,CYSTM1	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC5	107530	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	139208183	139208517	139208350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	183299	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	139636160	139636260	139636251	Y	SRA1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	44446	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	139638984	139639383	139639269	Y	C5orf32,ZMAT2,SRA1,IK,HARS2,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	41323	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	139782360	139782578	139782471	Y	NA	RNU4-14P,ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3	NA	NA	NA	NA	ANKHD1-EIF4EBP3	2867	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr5	140090601	140091006	140090806	Y	NA	WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-1	1741	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	140098281	140098628	140098472	Y	NA	HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-3	5115	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr5	140322933	140323011	140322970	Y	PCDHGA8,PCDHGB6,PCDHGA9,PCDHGA6,PCDHB16,PCDHB15,PCDHB12,PCDHA1,PCDHA2,PCDHA3,PCDHA4,PCDHA5,PCDHA7,PCDHB4,PCDHA13,PCDHAC2	NA	NA	NA	NA	NA	PCDHA12	69875	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	140464698	140465034	140464866	Y	SLC25A2,PCDHGC4,PCDHGC3,PCDHGB7,PCDHGB7,PCDHGB6,PCDHGA9,PCDHGA7,PCDHGA2,PCDHB7,PCDHB6,PCDHB15,PCDHB12,PCDHB10,PCDHAC1,PCDHB1,PCDHB4	PCDHB2,PCDHB3,PCDHB5	PCDHB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PCDHB2	7193	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	140910138	140910894	140910494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	56558	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr5	140983787	140984197	140984031	Y	PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1	DIAPH1,HDAC3,FCHSD1	NA	NA	NA	NA	DIAPH1	12425	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr5	141256552	141256862	141256814	Y	PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1,PCDH1	KIAA0141	NA	NA	NA	NA	PCDH1	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr5	141615988	141616150	141616110	Y	NA	NA	FGF1,NDFIP1,SPRY4	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	87870	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr5	141659754	141659954	141659854	Y	NA	SPRY4	SPRY4,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	44066	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	142349397	142349744	142349637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	201448	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	142541504	142541934	142541585	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	168236	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	145498086	145498488	145498483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	61735	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	145827727	145827826	145827802	Y	NA	TCERG1	GPR151	IMR90	Hi-C	24141950	TCERG1	2853	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	147160341	147160727	147160571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	272722	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	147283651	147283737	147283694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	396032	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	147463828	147464105	147463998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	576209	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	148172345	148172765	148172447	Y	FBXO38,ADRB2	NA	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3	IMR90	Hi-C	24141950	SH3TC2	267961	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr5	148505231	148505419	148505389	Y	NA	ABLIM3	ADRB2,AFAP1L1,ABLIM3,SH3TC2	IMR90	Hi-C	24141950	ABLIM3	13627	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.34635124758485
chr5	148738164	148738422	148738235	Y	PCYOX1L	GRPEL2,PCYOX1L	NA	NA	NA	NA	PCYOX1L	2594	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	148835583	148835880	148835720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1	93127	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	149110836	149111455	149111198	Y	ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2975	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr5	149266675	149266795	149266735	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC26A2	71505	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	149318595	149318961	149318771	Y	CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3	SLC26A2	NA	NA	NA	NA	SLC26A2	19339	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	149522462	149523132	149522666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIGD6	143732	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr5	149852669	149852742	149852704	Y	NA	RPS14,NDST1	SYNPO,MYOZ3,C5orf62,RPS14,NDST1,DCTN4,RBM22	IMR90	Hi-C	24141950	NDST1	10639	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	150108879	150109189	150109172	Y	SYNPO	RBM22,DCTN4	NA	NA	NA	NA	DCTN4	27482	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	150454717	150454894	150454780	Y	NA	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	16244	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	150873344	150873758	150873456	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A1	58737	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	153743049	153743076	153743063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAP30L-AS1	80334	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	153807428	153807565	153807497	Y	NA	SAP30L-AS1,SAP30L,HAND1	NA	NA	NA	NA	SAP30L-AS1	15845	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	153809274	153809597	153809436	Y	NA	SAP30L-AS1,SAP30L,HAND1	NA	NA	NA	NA	SAP30L-AS1	13813	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	153862086	153862603	153862319	Y	NA	SAP30L-AS1,SAP30L,HAND1	HAND1,FAM114A2,MFAP3,LARP1,C5orf4	IMR90	Hi-C	24141950	HAND1	6262	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	154062607	154063000	154062805	Y	GEMIN5	LARP1	LARP1,C5orf4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LARP1	27462	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	154071115	154071211	154071188	Y	NA	LARP1	LARP1,C5orf4	IMR90	Hi-C	24141950	LARP1	19251	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	154205315	154205569	154205444	Y	KIF4B,GEMIN5	CNOT8	NA	NA	NA	NA	CNOT8	29544	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr5	154219246	154219480	154219363	Y	NA	CNOT8	NA	NA	NA	NA	CNOT8	15633	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr5	155202123	155202494	155202309	Y	NA	NA	PPP1R2P3	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL22	883493	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	156700202	156700407	156700238	Y	HAVCR2,NIPAL4,ADAM19,CYFIP2,CYFIP2,CYFIP2	CYFIP2	NA	NA	NA	NA	CYFIP2	9113	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	156718541	156718931	156718583	Y	HAVCR2,ADAM19,CYFIP2,CYFIP2,CYFIP2	CYFIP2	NA	NA	NA	NA	CYFIP2	27452	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	157040513	157041041	157040628	Y	NIPAL4,ADAM19	ADAM19	NA	NA	NA	NA	ADAM19	39730	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	157257409	157257732	157257678	Y	NA	CLINT1	NA	NA	NA	NA	CLINT1	26451	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	158611896	158612266	158612182	Y	IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145	RNF145	NA	NA	NA	NA	RNF145	22795	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	158839407	158839958	158839513	Y	RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,IL12B	NA	ADRA1B,IL12B,LOC285627	IMR90	Hi-C	24141950	UBLCP1	151318	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	159414162	159414427	159414404	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	19693	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	159480874	159481257	159481243	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	46754	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	159533500	159533764	159533742	Y	NA	PWWP2A	NA	NA	NA	NA	PWWP2A	10666	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	159592617	159593055	159592885	Y	NA	PWWP2A,FABP6	TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FABP6	19319	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	159688113	159688294	159688164	Y	CCNJL	RP11-34P1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-34P1.2	4853	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr5	159933217	159933309	159933265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG1	86388	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	159951614	159951766	159951649	Y	FABP6	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG1	104785	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	163767017	163767182	163767164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAT2B	838897	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	167126470	167126930	167126675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	589726	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr5	167343894	167343960	167343927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	372696	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	167741798	167742197	167741960	Y	WWC1	WWC1	NA	NA	NA	NA	WWC1	25142	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	167744761	167745078	167744891	Y	WWC1	WWC1	NA	NA	NA	NA	WWC1	28105	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr5	167752204	167752623	167752553	Y	PANK3	WWC1	RARS	IMR90	Hi-C	24141950	WWC1	35548	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	168055373	168055394	168055384	Y	NA	CTC-575D19.1	NA	NA	NA	NA	CTC-575D19.1	14056	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	170060615	170060931	170060764	Y	RANBP17	NA	NA	NA	NA	NA	GABRP	127423	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	170662332	170662346	170662338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLX3	71942	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	171039588	171039891	171039740	Y	NA	NA	FBXW11	IMR90	Hi-C	24141950	NPM1	227468	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	171326428	171326478	171326475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW11	105399	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	171432610	171432692	171432660	Y	NA	FBXW11	NA	NA	NA	NA	FBXW11	733	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	171529769	171530204	171529991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK10	83186	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	171560333	171560981	171560496	Y	UBTD2,STK10	NA	NA	NA	NA	NA	STK10	52409	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	171577546	171577959	171577717	Y	STK10	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	35431	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	171681735	171682053	171681977	Y	NA	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	27022	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr5	171709316	171709633	171709569	Y	NA	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	241	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	171788471	171789086	171788773	Y	DUSP1,STK10,UBTD2	NA	NA	NA	NA	NA	UBTD2	79396	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	171838601	171839062	171838738	Y	DUSP1,STK10,UBTD2	SH3PXD2B	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2B	40465	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	172192263	172193766	172192583	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2432	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	172283530	172283741	172283563	Y	NA	ERGIC1	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	24252	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	172308731	172309533	172309021	Y	DUSP1,C5orf41	ERGIC1	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	49453	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	172370220	172370579	172370385	Y	ERGIC1,ATP6V0E1	RPL26L1,ATP6V0E1	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	13153	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	172729503	172729731	172729610	Y	NA	STC2	NA	NA	NA	NA	STC2	24775	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	173572937	173573111	173573024	Y	HMP19	NA	HMP19	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	259654	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	173586705	173586920	173586830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB4	273422	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	173846140	173846257	173846227	Y	NA	NA	MSX2,MIR4634	IMR90	Hi-C	24141950	MSX2	303279	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr5	173846628	173846975	173846845	Y	NA	NA	MSX2,MIR4634	IMR90	Hi-C	24141950	MSX2	302561	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	174148035	174148467	174148121	Y	MSX2	MSX2	NA	NA	NA	NA	MSX2	1069	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr5	174194382	174194672	174194467	Y	NA	MSX2	NA	NA	NA	NA	MSX2	44846	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	175974830	175975038	175974917	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,HK3,C5orf25,RNF44,CDHR2	RNF44	NA	NA	NA	NA	RNF44	11804	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	176337374	176337559	176337468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UNC5A	101896	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	176359562	176359884	176359876	Y	RNF44,UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,GRK6	NA	NA	NA	NA	NA	UIMC1	87750	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	176422952	176423155	176423071	Y	HK3,UIMC1,UIMC1,UIMC1,RAB24,GRK6	UIMC1,ZNF346	NA	NA	NA	NA	UIMC1	24479	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	176790168	176790403	176790363	Y	DOK3,RGS14	LMAN2,GRK6	NA	NA	NA	NA	LMAN2	13315	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	176972522	176972758	176972729	Y	NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3	PDLIM7,DDX41,FAM193B,TMED9	NA	NA	NA	NA	FAM193B	6784	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	176973275	176973657	176973542	Y	NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3	DDX41,FAM193B,TMED9	NA	NA	NA	NA	FAM193B	5885	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	177541057	177541427	177541157	Y	N4BP3	N4BP3,RMND5B,NHP2	NA	NA	NA	NA	N4BP3	2613	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	177645267	177645446	177645363	Y	N4BP3,CLK4,AGXT2L2	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15759	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	178034122	178034420	178034258	Y	ZNF354B,AGXT2L2,CLK4	CLK4	NA	NA	NA	NA	CLK4	21196	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	180244025	180244427	180244181	Y	MGAT1,MGAT1	MGAT1,LINC00847,ZFP62	NA	NA	NA	NA	MGAT1	3373	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	180541875	180541994	180541989	Y	OR2Y1	NA	BTNL8,MGAT1	IMR90	Hi-C	24141950	CTC-338M12.5	74930	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	180611137	180611357	180611292	Y	MGAT1	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	5567	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr5	180615864	180616079	180615972	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	845	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr5	180634441	180634803	180634658	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM7	4148	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	1641578	1641903	1641733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXF2	253509	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	2767771	2767941	2767856	Y	NA	WRNIP1	NA	NA	NA	NA	WRNIP1	4123	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	2875221	2875651	2875270	Y	SERPINB9,RIPK1,NQO2,SERPINB1	SERPINB1,SERPINB9	NA	NA	NA	NA	SERPINB9	25863	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	2921060	2921305	2921156	Y	NA	SERPINB9,SERPINB6	SERPINB9,SERPINB6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERPINB9	19546	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.13922028641795
chr6	3069574	3070273	3069674	Y	NA	HTATSF1P2,RIPK1,BPHL	LOC100507194,WRNIP1	K562	ChIA-PET	22265404	RIPK1	7349	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	3163246	3163428	3163368	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	7486	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	3248062	3248427	3248198	Y	SLC22A23,TUBB2A,TUBB2B	PSMG4,TUBB2B	TUBB2A,BPHL,RIPK1,LOC100507194,TUBB2B	IMR90	Hi-C	24141950	TUBB2B	18098	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	3254273	3254642	3254472	Y	SLC22A23	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	24309	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	3259939	3260435	3260206	Y	NA	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	29975	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	3308463	3308483	3308477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	78499	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	3356099	3356749	3356628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	98507	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	3403581	3403822	3403689	Y	BPHL,SLC22A23	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	51434	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	3511713	3512018	3511866	Y	NA	NA	PXDC1,SLC22A23	IMR90	Hi-C	24141950	SLC22A23	56457	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	3749707	3750120	3749911	Y	C6orf145	PXDC1	NA	NA	NA	NA	PXDC1	140	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	3789456	3789809	3789635	Y	NA	PXDC1	SLC22A23,PXDC1,FAM50B	IMR90	Hi-C	24141950	PXDC1	39196	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	3797931	3798162	3798051	Y	NA	PXDC1,FAM50B	SLC22A23,FAM50B,TUBB2B,RIPK1,BPHL	IMR90	Hi-C	24141950	PXDC1	47671	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	3987035	3987350	3987158	Y	NA	PRPF4B	SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194	IMR90	Hi-C	24141950	PRPF4B	32151	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	4582137	4582541	4582469	Y	NA	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	CDYL	121852	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr6	4778036	4778769	4778420	Y	CDYL	NA	NA	NA	NA	NA	CDYL	73643	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	5179288	5179492	5179391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYRM4	79680	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	5206171	5206360	5206265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYRM4	52812	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	5246431	5246752	5246693	Y	NA	LYRM4,FARS2	NA	NA	NA	NA	LYRM4	12420	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	5660943	5661332	5661178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRN1	343868	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	5671479	5671687	5671530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRN1	333513	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	5996432	5996750	5996575	Y	NA	NRN1	NA	NA	NA	NA	NRN1	8450	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr6	6005714	6006036	6005928	Y	NRN1	NRN1	NA	NA	NA	NA	NRN1	514	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	6008887	6009261	6009138	Y	NRN1	NRN1	NA	NA	NA	NA	NRN1	3687	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr6	6687140	6687567	6687361	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	418263	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.8641786505021
chr6	6702168	6702420	6702249	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	403410	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	6856813	6857789	6856950	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	248041	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	6881907	6882296	6882232	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	223534	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	6885637	6886125	6885854	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	219705	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	6928196	6928339	6928298	Y	RREB1,RREB1	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	177491	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	6970116	6970321	6970219	Y	NA	NA	LY86	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	135509	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	7058764	7058925	7058840	Y	DSP	RREB1	RREB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RREB1	46905	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	7112981	7113125	7113000	Y	RIOK1,CAGE1,RREB1,RREB1	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	7151	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	7126223	7126536	7126378	Y	NA	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	20393	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	7143191	7143555	7143322	Y	NA	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	37361	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	7157997	7158379	7158000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	52167	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	7166669	7166920	7166778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	60839	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr6	7174134	7174405	7174138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	68304	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr6	7202193	7202713	7202370	Y	RIOK1,SSR1,RREB1,RREB1	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	96363	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	7261407	7261720	7261663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-69L16.5	76081	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	7392474	7392879	7392481	Y	NA	SSR1,RIOK1,CAGE1	NA	NA	NA	NA	CAGE1	4498	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr6	7480187	7480515	7480351	Y	DSP	NA	DSP	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DSP	59293	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	7532623	7532708	7532667	Y	NA	DSP	CAGE1	IMR90	Hi-C	24141950	DSP	7100	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	7544425	7544740	7544519	Y	NA	DSP,SNRNP48	NA	NA	NA	NA	DSP	4617	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	8180632	8181260	8180704	Y	NA	NA	EEF1E1-MUTED	IMR90	Hi-C	24141950	EEF1E1	79821	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	8182620	8183022	8182908	Y	NA	NA	EEF1E1-MUTED	IMR90	Hi-C	24141950	EEF1E1	81809	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	10088027	10088453	10088237	Y	NA	NA	LOC100506207	IMR90	Hi-C	24141950	TFAP2A	329439	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	10315279	10315501	10315368	Y	PAK1IP1,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	NA	LOC100506207,TFAP2A,LOC100130275	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP2A	102391	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	10316491	10316897	10316818	Y	TFAP2A,TFAP2A	NA	LOC100506207,TFAP2A,LOC100130275	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP2A	100995	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	10441526	10441791	10441655	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,GCNT2,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	23634	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	10458287	10458428	10458359	Y	NA	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	40395	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr6	10552532	10552740	10552636	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	134640	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	10587786	10588136	10587948	Y	TMEM14B,GCNT2	NA	NA	NA	NA	NA	PAK1IP1	104792	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	10771427	10771996	10771700	Y	ELOVL2,MAK	TMEM14B,SYCP2L	NA	NA	NA	NA	SYCP2L	25400	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	11197003	11197299	11197017	Y	ERVFRD-1,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	ERVFRD-1	87038	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	11210069	11210603	11210460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERVFRD-1	100104	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	11217429	11217753	11217578	Y	MAK,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	ERVFRD-1	107464	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	11229489	11229708	11229675	Y	TMEM170B,MAK,ELOVL2,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	ERVFRD-1	119524	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	11344526	11344935	11344784	Y	TMEM170B,NEDD9	NEDD9	NA	NA	NA	NA	NEDD9	35646	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	11374970	11375161	11375093	Y	NA	NEDD9	NA	NA	NA	NA	NEDD9	5420	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	11390283	11390548	11390416	Y	NEDD9	NEDD9	NEDD9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	NEDD9	9702	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	11523168	11523305	11523200	Y	TMEM170B,HIVEP1	TMEM170B	NEDD9,SYCP2L,C6orf228,ELOVL2,LOC100506409,GCM2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM170B	12633	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	12729754	12730156	12729835	Y	NA	PHACTR1	NA	NA	NA	NA	PHACTR1	13861	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	13391107	13391478	13391293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	64292	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	13649579	13649948	13649702	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	36020	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	13651430	13651585	13651505	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	37871	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	13709903	13710182	13710119	Y	TBC1D7,CD83,RANBP9	RANBP9	SIRT5,NOL7	K562	ChIA-PET	22265404	RANBP9	107	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	14596764	14596944	14596823	Y	CD83	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	480892	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	14661271	14661715	14661503	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	545399	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	14889640	14889747	14889684	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	354780	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	14921244	14921932	14921499	Y	JARID2	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	322595	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	14975402	14975457	14975430	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	269070	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	15365610	15365867	15365688	Y	JARID2,DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2-AS1	118745	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	15516223	15516554	15516389	Y	DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	144735	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	15580663	15580900	15580755	Y	JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	80389	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	15908447	15908579	15908514	Y	NA	NA	MYLIP	K562	ChIA-PET	22265404	MYLIP	218777	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	16244335	16244343	16244339	Y	NA	GMPR	NA	NA	NA	NA	GMPR	7524	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	16481928	16482422	16482245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	245117	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	16636472	16636800	16636538	Y	ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	122569	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	16687739	16687973	16687884	Y	ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	71396	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	16741302	16741617	16741570	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	17752	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	17418097	17418389	17418210	Y	NA	CAP2	NA	NA	NA	NA	CAP2	26650	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr6	17430018	17430227	17430123	Y	NA	CAP2	NA	NA	NA	NA	CAP2	38571	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	17473157	17473283	17473220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P26	56600	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	17614611	17614952	17614695	Y	KIF13A,NUP153,FAM8A1	FAM8A1	NA	NA	NA	NA	FAM8A1	16025	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	17712711	17712926	17712817	Y	NA	NUP153	FAM8A1,NUP153,KIF13A	IMR90	Hi-C	24141950	NUP153	8055	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	17925685	17925969	17925835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF13A	59885	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	18022998	18023444	18023299	Y	NA	KIF13A	KIF13A,NHLRC1,TPMT	IMR90	Hi-C	24141950	KIF13A	37144	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	18405939	18406237	18405987	Y	KIF13A,KDM1B,RNF144B	RNF144B	NA	NA	NA	NA	RNF144B	39160	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	18406770	18407159	18406964	Y	KIF13A,KDM1B,RNF144B	RNF144B	NA	NA	NA	NA	RNF144B	39991	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	20404913	20405227	20404970	Y	MBOAT1	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	4515	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	20604004	20604027	20604016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	71316	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	20910575	20910817	20910696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	377887	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	20994795	20995087	20994932	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	462107	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	21141154	21141340	21141254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	450632	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	21587723	21589288	21589205	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2684	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	21740205	21740397	21740265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	148233	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	5.5925359515063
chr6	22181735	22182137	22181931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	589763	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	24348668	24348920	24348794	Y	DCDC2,KAAG1,DCDC2	DCDC2	NA	NA	NA	NA	DCDC2	7360	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	24659946	24660207	24660006	Y	TDP2,C6orf62	TDP2,ACOT13	NA	NA	NA	NA	TDP2	5054	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	24879563	24879866	24879842	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP29	94781	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	24927472	24927654	24927651	Y	ALDH5A1,TDP2,C6orf62	PPIAP29	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	PPIAP29	46993	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	25089428	25090170	25089848	Y	TDP2,C6orf62	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP29	114781	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	25094713	25094741	25094729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP29	120066	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	25177828	25178052	25177914	Y	C6orf62	NA	CMAHP,FAM65B,LRRC16A	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC16A	99254	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	25303199	25303368	25303284	Y	NA	LRRC16A	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	25893	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB	NA	NA	NA	NA	HIST1H3A	25645	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.2784405728359
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr6	26521444	26521777	26521577	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	1368	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	26536966	26537248	26536997	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	333	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	26550694	26551000	26550826	Y	NA	HCG11,HMGN4,ABT1	NA	NA	NA	NA	HMGN4	14061	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	27065086	27065154	27065121	Y	NA	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BJ	33387	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	27143830	27144149	27143885	Y	NA	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AH	30969	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	27145729	27146130	27146023	Y	ZNF184	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	30893	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.58913701458625
chr6	27146789	27146995	27146901	Y	NA	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	30028	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	27585757	27586130	27585944	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF184	146860	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	27759985	27760333	27760032	Y	ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	13376	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	27798416	27798741	27798578	Y	NA	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H4K	1111	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	27807310	27807672	27807617	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BN	2987	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	27862895	27863061	27863012	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BO	3692	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	27863298	27863662	27863535	Y	ZKSCAN3,ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZNF323,ZNF193,ZNF192,ZKSCAN4,PGBD1,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BO	4095	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	28072476	28072872	28072543	Y	HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192	ZNF165,ZSCAN16	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	17466	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	28101066	28101269	28101177	Y	OR2B2,ZNF187,ZKSCAN4,ZSCAN16	ZSCAN16,ZNF192P1	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	10728	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	28457225	28458028	28457315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN12	91714	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.62479182042075
chr6	28782096	28782213	28782183	Y	ZSCAN12,GPX6,SCAND3,OR2J3,OR14J1,OR2W1,OR2B3,TRIM27	XXbac-BPG308K3.5	NA	NA	NA	NA	XXbac-BPG308K3.5	22570	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr6	28834475	28834586	28834545	Y	NA	XXbac-BPG308K3.5,HCG14	NA	NA	NA	NA	HCG14	27721	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	28956602	28956848	28956725	Y	NA	HCG15	NA	NA	NA	NA	HCG15	4622	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	28985048	28985267	28985158	Y	NA	HCG15	TRIM27,LOC401242	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HCG15	33068	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	29932777	29932958	29932802	Y	HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A	HLA-K,HLA-A,HLA-J	NA	NA	NA	NA	HLA-A	25740	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	30010922	30011054	30010960	Y	NA	HLA-J,ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39	NA	NA	NA	NA	ZNRD1	13622	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	30019374	30019509	30019439	Y	NA	HLA-J,ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39	NA	NA	NA	NA	ZNRD1	5167	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	30069810	30070038	30069951	Y	HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39	NA	NA	NA	NA	RNF39	28146	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	30177609	30178061	30177863	Y	NA	TRIM26,HLA-L	NA	NA	NA	NA	TRIM26	1143	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	30254050	30254472	30254356	Y	NA	HLA-L,TRIM39,HCG18	NA	NA	NA	NA	HLA-L	28689	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	30276337	30276699	30276532	Y	ATAT1,ATAT1	TRIM39,HCG18,RPP21	NA	NA	NA	NA	TRIM39	15557	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	30434534	30434831	30434712	Y	DDR1,DDR1,DDR1,DDR1	RANP1,HLA-E	PPP1R10,HLA-E,GNL1,PRR3,MRPS18B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RANP1	16886	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	30453844	30454132	30453996	Y	ZNRD1,TUBB	RANP1,HLA-E	HLA-E	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HLA-E	1112	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	30455675	30455831	30455686	Y	NA	RANP1,HLA-E	NA	NA	NA	NA	HLA-E	431	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	30604064	30604457	30604261	Y	NA	MRPS18B,PPP1R10,ATAT1,PTMAP1,C6orf136,DHX16,PPP1R18	NA	NA	NA	NA	PTMAP1	4655	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	30774085	30774428	30774395	Y	NA	NA	FLOT1,C6orf15,PSORS1C1,TUBB,DDR1,VARS2,DHX16,SFTA2,PPP1R18,NRM,IER3,MUC22	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	63754	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	30811913	30812084	30812025	Y	NA	DDR1	FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,C6orf15,PSORS1C1	IMR90	Hi-C	24141950	DDR1	30114	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr6	30910531	30910726	30910623	Y	NA	GTF2H4,VARS2	NA	NA	NA	NA	VARS2	36512	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	31275830	31276119	31275994	Y	NA	HLA-C,RPL3P2,HLA-B	MUC22,PSORS1C1,C6orf15,PSORS1C2,CCHCR1,HCG26	IMR90	Hi-C	24141950	RPL3P2	29736	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.6570476893352
chr6	31276281	31276390	31276356	Y	NA	HLA-C,RPL3P2,HLA-B	MUC22,PSORS1C1,C6orf15,PSORS1C2,CCHCR1,HCG26	IMR90	Hi-C	24141950	RPL3P2	30187	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	31702368	31703528	31702658	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,LY6G6C,DDAH2,CLIC1,MSH5	NA	NA	NA	NA	CLIC1	2012	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	31705604	31706142	31705906	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,LY6G6C,DDAH2,CLIC1	NA	NA	NA	NA	MSH5	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	31789098	31789184	31789146	Y	TNF,HSPA1L,HSPA1A,NEU1,HSPA1B	VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,SNORD52,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	4328	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,SNORD52,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	10.1494170971781
chr6	32075999	32076179	32076125	Y	LY6G6C,TNXB,RNF5,EGFL8,TNXB	ATF6B,FKBPL,PPT2	NA	NA	NA	NA	ATF6B	17851	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	32427743	32428120	32427936	Y	PRRT1	NA	NA	NA	NA	NA	HLA-DRB5	67944	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	32996316	32996705	32996419	Y	HLA-DRB5,HLA-DRB1,HLA-DQA1,HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DQB2,HLA-DOB,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9,TAPBP,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,HLA-DOA	NA	HLA-DPB2,VPS52,HLA-DPB1	IMR90	Hi-C	24141950	BRD2-IT1	60307	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	33392796	33393285	33393082	Y	SYNGAP1	KIFC1,PHF1,CUTA,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	CUTA	8702	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	34060373	34060777	34060697	Y	LEMD2,LEMD2	NA	MIR1275	IMR90	Hi-C	24141950	CYCSP55	124439	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr6	34191726	34192136	34191830	Y	C6orf1,HMGA1	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CYCSP55	6510	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	34202925	34203288	34202990	Y	NA	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	NA	NA	NA	NA	HMGA1	275	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	34760607	34760986	34760926	Y	UHRF1BP1	SNRPC,UHRF1BP1	NA	NA	NA	NA	UHRF1BP1	2750	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	35185451	35185811	35185631	Y	NA	SCUBE3,ZNF76	NA	NA	NA	NA	SCUBE3	5261	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr6	35331114	35331538	35331252	Y	PPARD	PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	22779	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr6	35445364	35445634	35445501	Y	RPL10A	FANCE,RPL10A,TEAD3	NA	NA	NA	NA	RPL10A	11179	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	35453228	35453566	35453395	Y	NA	FANCE,RPL10A,TEAD3	NA	NA	NA	NA	TEAD3	9287	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	36005886	36006030	36005958	Y	NA	MAPK14	NA	NA	NA	NA	MAPK14	12398	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	36010041	36010276	36010159	Y	NA	MAPK14	NA	NA	NA	NA	MAPK14	16553	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	36391779	36391863	36391821	Y	NA	KCTD20,PXT1	NA	NA	NA	NA	KCTD20	16681	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr6	36399958	36400295	36400126	Y	NA	KCTD20,PXT1	NA	NA	NA	NA	KCTD20	8249	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	36409257	36409482	36409373	Y	MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20	KCTD20,PXT1	NA	NA	NA	NA	PXT1	591	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	36634782	36635224	36635042	Y	MTCH1,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A	RNU1-88P,LAP3P2,CDKN1A	CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LAP3P2	4370	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	36802429	36803020	36802653	Y	PI16,CPNE5	C6orf89,PPIL1	NA	NA	NA	NA	C6orf89	34626	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	37067331	37067581	37067437	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,PIM1,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90	Hi-C	24141950	PIM1	68398	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	37070053	37070857	37070460	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	65122	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr6	37077622	37078018	37077795	Y	C6orf89,TBC1D22B,PIM1	NA	PIM1,PPIL1,TMEM217,CPNE5,FGD2,C6orf89,TBC1D22B	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	57961	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	37093441	37093739	37093580	Y	NA	PIM1	PIM1,PPIL1,FGD2,C6orf89,TMEM217,CPNE5,MTCH1,TBC1D22B,CDKN1A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	42240	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr6	37094186	37094408	37094276	Y	PPIL1	PIM1	PIM1,PPIL1,FGD2,C6orf89,TMEM217,CPNE5,MTCH1,TBC1D22B,CDKN1A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	41571	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.4499167281683
chr6	37095912	37096089	37096014	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	39890	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr6	37102324	37102775	37102642	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	33204	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	37104071	37104158	37104105	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	31821	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	37104908	37105418	37105405	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	30561	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr6	37109258	37109689	37109648	Y	PI16	PIM1	PIM1,C6orf89,FGD2,PPIL1,CPNE5,MTCH1,TBC1D22B,TMEM217	IMR90	Hi-C	24141950	PIM1	26290	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	37190361	37190574	37190538	Y	NA	TBC1D22B,TMEM217	NA	NA	NA	NA	TBC1D22B	32974	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	37271813	37272101	37271931	Y	PIM1,TBC1D22B	TBC1D22B,TMEM217,RNF8	NA	NA	NA	NA	RNF8	47647	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	37424991	37425195	37425093	Y	NA	CCDC167	CCDC167	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC167	40503	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	37745135	37745338	37745265	Y	NA	ZFAND3	BTBD9,ZFAND3,FTSJD2,MDGA1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND3	39937	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	38514218	38514357	38514288	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD9	91567	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	41472054	41472459	41472263	Y	NA	FOXP4,RP11-328M4.2	FOXP4	IMR90	Hi-C	24141950	FOXP4	39705	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	41546441	41546593	41546496	Y	FRS3	FOXP4,RP11-328M4.2	NA	NA	NA	NA	RP11-328M4.2	32082	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	41686086	41686432	41686391	Y	NA	TFEB	NA	NA	NA	NA	TFEB	15565	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	41915002	41915406	41915199	Y	NA	MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	28076	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	41929474	41929675	41929644	Y	NA	MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	42548	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr6	42011738	42011769	42011754	Y	NA	CCND3,TAF8	NA	NA	NA	NA	CCND3	4326	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	42067343	42067714	42067701	Y	NA	C6orf132	NA	NA	NA	NA	C6orf132	40643	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	42255073	42255501	42255249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS10	71470	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	42259187	42259201	42259195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS10	75584	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	42306418	42306926	42306742	Y	UBR2,TRERF1	NA	NA	NA	NA	NA	TRERF1	110863	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	42361651	42361664	42361659	Y	TRERF1	NA	NA	NA	NA	NA	TRERF1	56125	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	42390239	42390257	42390249	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	27532	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	42409399	42409623	42409499	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	8166	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	42413186	42413554	42413522	Y	NA	TRERF1	GUCA1B,MRPS10	IMR90	Hi-C	24141950	TRERF1	4235	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	42420719	42421067	42420926	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	2930	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr6	42421408	42421762	42421484	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	3619	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	42722931	42723177	42723029	Y	NA	ATP6V0CP3,TBCC	UBR2,KIAA0240,TBCC,PRPH2,RPL7L1,KLHDC3,RRP36,GUCA1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBCC	10373	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	42735698	42735757	42735728	Y	NA	ATP6V0CP3,TBCC	TBCC,KIAA0240,GUCA1A,PRPH2,UBR2,ATP6V0CP3,RPL7L1,C6orf226,CNPY3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBCC	23140	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	42743007	42743021	42743017	Y	CUL9,TRERF1,UBR2,TBCC,C6orf226	TBCC	KIAA0240,UBR2,RPL7L1,C6orf226,PTCRA,TBCC,PRPH2,KLHDC3,MEA1,PPP2R5D	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBCC	30449	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	43085846	43085863	43085854	Y	NA	PTK7	NA	NA	NA	NA	PTK7	43840	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	43635973	43636240	43636108	Y	NA	GTPBP2,MAD2L1BP,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	MRPS18A	17288	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	43766474	43766976	43766784	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	VEGFA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	30553	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	43771690	43772179	43771963	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	VEGFA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	35769	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	43774176	43774478	43774332	Y	NA	VEGFA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	38255	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	43878497	43878687	43878563	Y	GTPBP2,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	142576	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr6	43894411	43894725	43894584	Y	NFKBIE,TJAP1,GTPBP2,MAD2L1BP	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1120P11.1	145664	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	44011469	44011879	44011690	Y	NA	RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.1	28510	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	44011946	44012485	44012109	Y	NA	RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.1	27904	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	44026121	44027353	44026480	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1120P11.1	13036	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	44039522	44039890	44039644	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	RP5-1120P11.1	POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,MRPS18A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1120P11.1	499	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	44184938	44185313	44184944	Y	MRPL14	HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	SLC29A1	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	44205272	44205504	44205346	Y	NFKBIE	SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	HSP90AB1	7320	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	44230828	44231731	44231363	Y	NFKBIE	SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,AARS2	NA	NA	NA	NA	NFKBIE	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	44628436	44628745	44628591	Y	NA	NA	CLIC5,RUNX2,SUPT3H,CDC5L	IMR90	Hi-C	24141950	CDC5L	275174	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	44783475	44783845	44783660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC5L	430213	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	45083481	45083547	45083514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	260143	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	45299904	45300369	45300004	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	43321	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	45301191	45301441	45301316	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	42249	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	45306825	45307168	45307007	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	36522	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	45313959	45314320	45314140	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	29370	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	45404651	45404813	45404715	Y	RUNX2	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	60961	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	45919439	45919785	45919549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC5	126347	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	47214948	47215452	47215060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	60189	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	47220408	47220656	47220576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	54985	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	47263537	47263554	47263549	Y	NA	TNFRSF21	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	12087	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	47550559	47550935	47550672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR115	100665	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	49302208	49302375	49302292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MUT	126529	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	51275260	51275721	51275608	Y	NA	RP3-437C15.1	NA	NA	NA	NA	RP3-437C15.1	1925	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	51738790	51738977	51738878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCM3	408702	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	52382425	52382779	52382512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	56934	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	52389241	52389494	52389368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	50219	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	52431726	52432083	52432005	Y	TRAM2	TRAM2	EFHC1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAM2	7630	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	52438177	52438308	52438243	Y	NA	TRAM2	NA	NA	NA	NA	TRAM2	1405	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	52952230	52952503	52952367	Y	NA	FBXO9,ICK	NA	NA	NA	NA	ICK	27630	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	52972904	52973327	52973040	Y	NA	ICK,GCM1	NA	NA	NA	NA	GCM1	38300	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	53167531	53167800	53167691	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	44147	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	53191249	53191636	53191614	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	20311	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	53195071	53195341	53195324	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	16606	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	53199994	53200715	53200310	Y	FBXO9,FBXO9,FBXO9,ELOVL5	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	11232	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	53205102	53205427	53205266	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	6520	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	53224045	53224723	53224315	Y	NA	ELOVL5	ELOVL5	K562	ChIA-PET	22265404	ELOVL5	12098	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr6	53376137	53376766	53376496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	103002	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	53412768	53413364	53413026	Y	GCLC	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	66404	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	53660581	53660848	53660781	Y	LRRC1	LRRC1	NA	NA	NA	NA	LRRC1	3286	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr6	53678166	53678361	53678262	Y	NA	LRRC1	NA	NA	NA	NA	LRRC1	20871	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	56103224	56103241	56103234	Y	COL21A1	NA	NA	NA	NA	NA	BEND6	714532	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	56811664	56812033	56811848	Y	NA	BEND6	BEND6,KIAA1586,ZNF451,PRIM2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BEND6	5740	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	57354557	57355032	57354719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	176954	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	57389697	57390070	57389732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	212094	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	58776280	58777091	58777029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	521711	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	58777244	58778438	58777771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	522675	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	58778631	58779245	58778717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	524062	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	64088639	64088972	64088831	Y	NA	NA	EYS	IMR90	Hi-C	24141950	PTP4A1	140694	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	64151294	64151779	64151706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTP4A1	77887	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr6	64308595	64308777	64308676	Y	NA	PHF3	NA	NA	NA	NA	PHF3	34948	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	64386722	64387357	64386973	Y	PHF3	PHF3	NA	NA	NA	NA	PHF3	42997	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	64398084	64398491	64398303	Y	PHF3	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	54359	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	67322312	67322659	67322486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	2978587	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	69905412	69905430	69905421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	599573	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	70489653	70490034	70489967	Y	NA	LMBRD1	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	14969	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	72233830	72234188	72234009	Y	NA	NA	RIMS1	IMR90	Hi-C	24141950	KRT19P1	58236	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	72294841	72295504	72295148	Y	NA	KRT19P1	RIMS1	IMR90	Hi-C	24141950	KRT19P1	2417	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr6	73354930	73355043	73354987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	615895	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	76494746	76495208	76494920	Y	NA	MYO6	NA	NA	NA	NA	MYO6	37837	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	79773928	79774085	79774072	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	11868	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	80487784	80488033	80487927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BGRL2	148784	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	80777050	80777287	80777243	Y	NA	BCKDHB	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	37077	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	81134610	81134899	81134794	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	320246	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	82956000	82956181	82956090	Y	NA	IBTK	NA	NA	NA	NA	IBTK	529	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	84877511	84877669	84877594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	57684	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	85218127	85218200	85218164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	282774	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	87433521	87433927	87433716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGA	368897	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	88635405	88635681	88635510	Y	NA	NA	RNGTT	IMR90	Hi-C	24141950	AKIRIN2	225478	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	89315918	89316052	89315985	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTBP8	331210	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	89619427	89619693	89619690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNGTT	51655	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	90550185	90550523	90550354	Y	NA	MDN1,CASP8AP2	NA	NA	NA	NA	CASP8AP2	12572	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	90878882	90879095	90878991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH2	125532	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	93802046	93802077	93802062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEA	2221342	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	96292932	96293309	96293121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEA	269513	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	99280317	99280875	99280652	Y	POU3F2	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL4	112974	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	99886915	99887218	99887074	Y	NA	COQ3,RP11-98I9.4,PNISR	NA	NA	NA	NA	PNISR	15708	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	99975087	99975427	99975257	Y	NA	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	USP45	7483	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	99995359	99995841	99995579	Y	PNISR	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	19008	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	100012296	100012415	100012356	Y	NA	USP45,CCNC,PRDM13	NA	NA	NA	NA	CCNC	2434	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	105214871	105215235	105215053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HACE1	90559	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	106196612	106197041	106196882	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PREP	347653	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	106768988	106769157	106769073	Y	NA	ATG5	NA	NA	NA	NA	ATG5	2509	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	107230465	107230834	107230696	Y	NA	RP1-60O19.1	NA	NA	NA	NA	RP1-60O19.1	2582	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	107272036	107272194	107272059	Y	NA	RP1-60O19.1	NA	NA	NA	NA	RP1-60O19.1	38620	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	107774853	107775271	107775085	Y	BEND3	PDSS2,SOBP	NA	NA	NA	NA	PDSS2	3497	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr6	108169525	108169909	108169631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63	107484	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	108879164	108879427	108879300	Y	SESN1,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	126	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	108879521	108879931	108879808	Y	SESN1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	483	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	108883670	108884545	108884024	Y	OSTM1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	4632	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	108895400	108895781	108895496	Y	NA	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	16362	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	108961437	108961619	108961493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO3	82399	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	111049772	111049981	111049963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK19	85180	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	111612312	111612528	111612438	Y	AMD1,AMD1,SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L,KIAA1919	KIAA1919	NA	NA	NA	NA	KIAA1919	33761	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	111614404	111614762	111614615	Y	NA	KIAA1919	NA	NA	NA	NA	KIAA1919	35853	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	111666861	111666999	111666959	Y	REV3L,FYN	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1919	88310	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr6	111675383	111675464	111675424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1919	96832	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	111795712	111796054	111795883	Y	NA	TRAF3IP2-AS1,REV3L	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	6660	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	111841823	111842197	111842010	Y	NA	TRAF3IP2-AS1,REV3L	NA	NA	NA	NA	REV3L	38905	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	113748852	113749029	113748940	Y	NA	RP1-124C6.1	MARCKS,FLJ34503	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-124C6.1	3594	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	114176108	114176553	114176196	Y	MARCKS	NA	NA	NA	NA	NA	MARCKS	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	115163170	115163515	115163320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC2	832698	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	116731952	116732286	116732048	Y	DSE,FAM26F	FAM26F	NA	NA	NA	NA	FAM26F	48247	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	116988703	116988966	116988944	Y	DSE,ZUFSP,KPNA5	ZUFSP,KPNA5	NA	NA	NA	NA	ZUFSP	746	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	117804575	117804878	117804739	Y	NA	DCBLD1	NA	NA	NA	NA	DCBLD1	31595	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	119129812	119130192	119130083	Y	C6orf204,MCM9,C6orf204	NA	NA	NA	NA	NA	ASF1A	83192	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	119210409	119210579	119210468	Y	NA	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	2805	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	119218988	119219366	119219177	Y	MCM9	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	5604	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	121399720	121399938	121399829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-35P	373329	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	122664813	122664822	122664818	Y	FABP7	NA	NA	NA	NA	NA	HSF2	53869	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	122769670	122769957	122769896	Y	HSF2,PKIB	SERINC1,PKIB	NA	NA	NA	NA	SERINC1	21010	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	125420389	125420754	125420652	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	17441	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	125420883	125421200	125421024	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	16995	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	125426714	125426967	125426959	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	11228	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	126112858	126113033	126112985	Y	TRMT11,HINT3,NCOA7	NCOA7,NCOA7-AS1	NA	NA	NA	NA	NCOA7	12551	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr6	126167488	126167529	126167508	Y	NCOA7	NCOA7-AS1	NA	NA	NA	NA	NCOA7-AS1	29484	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	127638757	127639069	127638966	Y	NA	ECHDC1	NA	NA	NA	NA	ECHDC1	23685	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	127980874	127981174	127981075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226093	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr6	127981338	127981402	127981371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226557	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr6	129250577	129251100	129251039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	410707	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	129822485	129822770	129822701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	206600	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	129994496	129994751	129994657	Y	ARHGAP18	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	34619	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	130022144	130022554	130022402	Y	L3MBTL3,ARHGAP18	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	6816	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	130029105	130029310	130029206	Y	NA	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	60	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	130342212	130342458	130342393	Y	SAMD3,SAMD3,L3MBTL3	L3MBTL3	NA	NA	NA	NA	L3MBTL3	9368	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr6	130513480	130513753	130513616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	L3MBTL3	180636	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	132787299	132787948	132787832	Y	NA	STX7	NA	NA	NA	NA	STX7	44389	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	132811730	132811823	132811772	Y	NA	STX7	NA	NA	NA	NA	STX7	20514	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	132832416	132832580	132832524	Y	VNN1,STX7	STX7	NA	NA	NA	NA	STX7	79	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	133134288	133134908	133134317	Y	NA	RPS12	NA	NA	NA	NA	SNORD101	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	136657752	136658013	136658001	Y	NA	BCLAF1	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	48763	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	136724164	136724966	136724405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	115175	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	138115195	138115471	138115327	Y	NA	NA	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	70880	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	138427134	138427492	138427302	Y	PERP	PERP	NA	NA	NA	NA	PERP	486	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	139300314	139300341	139300327	Y	NHSL1	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	7057	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	139304978	139305148	139305081	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	2250	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	139350632	139351255	139350885	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	43234	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	140929042	140929323	140929183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED2	1235285	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	143140738	143141058	143140895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	123280	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	143166332	143166721	143166456	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	97617	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	143221710	143222285	143222093	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	42053	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	143247398	143248213	143248022	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	16125	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	144007310	144007644	144007477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHACTR2	151328	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	144129010	144129242	144129156	Y	STX11,PLAGL1	LTV1	NA	NA	NA	NA	LTV1	33239	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	144302032	144302409	144302359	Y	PLAGL1	NA	NA	NA	NA	NA	PLAGL1	81326	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	144474457	144475387	144474631	Y	PLAGL1,STX11	TPT1P4	NA	NA	NA	NA	TPT1P4	44715	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	144657152	144657284	144657222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPT1P4	137050	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	144931961	144932452	144932213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPT1P4	411859	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	144975415	144975576	144975532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPT1P4	455313	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	145147432	145147802	145147573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPT1P4	627330	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	149802219	149802342	149802288	Y	LATS1,KATNA1,TAB2,PPIL4,SUMO4,ZC3H12D	NA	NA	NA	NA	NA	PPIL4	62832	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	149829691	149830032	149829852	Y	LATS1,KATNA1,TAB2,SUMO4,ZC3H12D,PPIL4	PPIL4	NA	NA	NA	NA	PPIL4	35142	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	151037354	151037386	151037370	Y	PLEKHG1	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHG1	118355	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	151302311	151302568	151302430	Y	PLEKHG1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	116097	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	151325792	151326084	151325926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	92581	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	151373285	151373500	151373395	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	45165	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	151647622	151647708	151647665	Y	NA	NA	ZBTB2	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB2	62975	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	151701197	151701769	151701451	Y	C6orf97,ZBTB2	ZBTB2	NA	NA	NA	NA	ZBTB2	8914	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	151730569	151730753	151730690	Y	NA	ZBTB2,RMND1,C6orf211	NA	NA	NA	NA	ZBTB2	19886	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	151770191	151770744	151770510	Y	NA	RMND1,C6orf211	NA	NA	NA	NA	RMND1	515	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	152085145	152085342	152085266	Y	ESR1,ESR1,ESR1,ESR1	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf211	313723	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.2784405728359
chr6	152634983	152635621	152635105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO5	667093	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr6	155179611	155179904	155179758	Y	NA	NA	TIAM2	IMR90	Hi-C	24141950	SCAF8	127152	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	155193821	155194059	155193913	Y	NA	NA	TIAM2,TFB1M,CLDN20	IMR90	Hi-C	24141950	SCAF8	141362	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	155590165	155590417	155590245	Y	NA	RP11-477D19.2,TFB1M	NA	NA	NA	NA	RP11-477D19.2	14307	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	157007979	157008724	157008580	Y	ARID1B	NA	MIR4466,ARID1B,NOX3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	88339	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr6	157041058	157041538	157041248	Y	ARID1B	NA	ARID1B,MIR4466	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	55525	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr6	157096939	157097165	157097038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	157110744	157110907	157110826	Y	NA	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	13681	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	157160663	157161314	157160954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	63600	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	157163922	157164341	157164233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	66859	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	157267788	157267851	157267817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	170725	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	157342507	157343524	157343342	Y	ARID1B,ZDHHC14	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	245444	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr6	157738321	157738749	157738506	Y	NA	TMEM242	NA	NA	NA	NA	TMEM242	3884	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	158146371	158146650	158146511	Y	NA	NA	SNX9,TMEM242,ZDHHC14	IMR90	Hi-C	24141950	SNX9	95646	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	158184460	158184689	158184561	Y	SNX9	NA	SNX9,TMEM242,ZDHHC14,SYNJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNX9	57607	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	158254729	158255396	158255020	Y	NA	SNX9	NA	NA	NA	NA	SNX9	12433	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	158314373	158314686	158314419	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SNX9	72077	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	158375265	158375579	158375328	Y	NA	SYNJ2	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	25309	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	158463343	158463878	158463391	Y	SNX9,SYNJ2	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	62455	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	158481547	158481708	158481650	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	80659	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	158670119	158670409	158670245	Y	NA	NA	TULP4,TMEM181	IMR90	Hi-C	24141950	GTF2H5	82735	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	158784092	158784407	158784250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2H5	196708	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	158895983	158896180	158896053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	167591	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	81905	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	158982051	158982465	158982168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	81306	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	159141436	159141829	159141621	Y	TAGAP,DYNLT1,SYTL3,C6orf99,EZR,EZR	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	77665	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	159195572	159195684	159195582	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	42760	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr6	159211450	159211647	159211549	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	26797	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	159226894	159227283	159227272	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	11161	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	159229924	159230242	159230166	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	8202	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr6	159234698	159235091	159235070	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	3353	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr6	159237852	159238517	159238245	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	NA	NA	NA	NA	NA	EZR	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	159268112	159268313	159268204	Y	NA	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	20658	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr6	159270971	159271326	159271104	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	17645	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	159271429	159272000	159271674	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	16971	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr6	159273925	159274893	159274526	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	14078	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	5.5925359515063
chr6	159284894	159285253	159285074	Y	NA	EZR,C6orf99	OSTCP1	K562	ChIA-PET	22265404	C6orf99	3718	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	159461134	159461312	159461148	Y	DYNLT1,SYTL3,TAGAP	RSPH3	NA	NA	NA	NA	RSPH3	41915	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	160141572	160141909	160141740	Y	MAS1,IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP	WTAP,ACAT2,SOD2	LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WTAP	2708	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	160144181	160144267	160144224	Y	NA	WTAP,ACAT2,SOD2	NA	NA	NA	NA	WTAP	350	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	161829346	161829532	161829475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	136253	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	161855973	161856365	161856002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	162880	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	163098494	163098513	163098505	Y	PARK2,PACRG,PACRG	PARK2	NA	NA	NA	NA	PARK2	48290	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	163107728	163108018	163107873	Y	PARK2,PACRG	PARK2	NA	NA	NA	NA	PARK2	38785	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	163833338	163833600	163833428	Y	QKI	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	306	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	163833938	163834442	163834340	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	906	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr6	163840967	163841346	163841003	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	7935	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	163976539	163976874	163976679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKI	143507	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	164520797	164520864	164520831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKI	687765	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	166364914	166365167	166365041	Y	T	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	PDE10A	32924	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	166378442	166378825	166378818	Y	NA	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	PDE10A	19266	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	166385606	166385834	166385795	Y	NA	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	PDE10A	12257	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	166419567	166419719	166419697	Y	PRR18	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	LINC00473	20031	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	166420168	166420416	166420184	Y	T	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	LINC00473	20632	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	166422302	166422862	166422743	Y	NA	PDE10A,LINC00473	NA	NA	NA	NA	LINC00473	22766	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	166964478	166964522	166964502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	210399	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	167115544	167115618	167115576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA2	202321	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr6	167395299	167395692	167395496	Y	NA	RP11-514O12.4,RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP	NA	NA	NA	NA	RP1-167A14.2	14861	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	167411692	167411848	167411735	Y	RNASET2,GPR31	RP11-514O12.4,RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP	NA	NA	NA	NA	FGFR1OP	1022	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	167837583	167837890	167837668	Y	FGFR1OP,UNC93A,MLLT4	NA	SMOC2	IMR90	Hi-C	24141950	CCR6	314288	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr6	168198261	168198623	168198456	Y	NA	MLLT4	NA	NA	NA	NA	MLLT4	26979	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.13922028641795
chr6	168216462	168216639	168216532	Y	NA	MLLT4	NA	NA	NA	NA	MLLT4	8963	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	4.5568811456718
chr6	168250541	168251043	168250675	Y	NA	MLLT4	NA	NA	NA	NA	MLLT4	24939	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	168356861	168357132	168356996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT4	131259	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	168813720	168814071	168813897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DACT2	95286	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	25.3735427429453
chr6	169308928	169309266	169309084	Y	THBS2	NA	WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242	IMR90	Hi-C	24141950	DACT2	590494	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	169473606	169473776	169473633	Y	THBS2	NA	WDR27,PHF10,FAM120B,THBS2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR27	626383	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	169827902	169828288	169828095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR27	271871	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	170338493	170338711	170338563	Y	TCTE3,FAM120B	NA	SMOC2,LOC154449,DLL1	IMR90	Hi-C	24141950	TCTE3	188838	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr6	170452843	170452974	170452889	Y	NA	NA	DLL1,LINC00574	IMR90	Hi-C	24141950	DLL1	144587	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	170461964	170462067	170462016	Y	NA	NA	LINC00574,LOC154449	IMR90	Hi-C	24141950	DLL1	135494	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	170468202	170468424	170468316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLL1	129137	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr6	170482866	170483129	170482933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLL1	114432	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr6	170600439	170600921	170600644	Y	NA	DLL1,FAM120B	NA	NA	NA	NA	FAM120B	2648	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.6570476893352
chr6	170692180	170692479	170692329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM120B	94389	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	115581	115835	115665	Y	NA	NA	FAM20C	IMR90	Hi-C	24141950	FAM20C	75134	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	373094	373351	373247	Y	PRKAR1B	NA	FLJ44511,PDGFA	MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM20C	182125	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	377359	377570	377416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	180363	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	475920	475996	475984	Y	NA	NA	HEATR2,PRKAR1B	MCF7	ChIA-PET	22265404	PDGFA	81937	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	555332	555565	555456	Y	GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	2368	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr7	556288	556672	556400	Y	LOC100288524,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	1261	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr7	577876	578141	578015	Y	PRKAR1B,PRKAR1B,HEATR2,GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	19943	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	627421	627837	627508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	69488	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.1069644175035
chr7	652642	652893	652768	Y	PRKAR1B,ADAP1	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	94709	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	850307	850449	850380	Y	SUN1,SUN1	SUN1	NA	NA	NA	NA	SUN1	3079	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	1013884	1014155	1013955	Y	NA	ADAP1,COX19,CYP2W1	NA	NA	NA	NA	COX19	649	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	1274384	1274791	1274446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND2A	75989	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	1416814	1417157	1416984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICALL2	79981	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	1501148	1501314	1501260	Y	NA	MICALL2,AC102953.4,INTS1	NA	NA	NA	NA	AC102953.4	3575	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	1546424	1546775	1546565	Y	NA	MICALL2,AC102953.4,INTS1,MAFK	NA	NA	NA	NA	INTS1	2935	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	1572262	1572844	1572636	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3912	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	1573524	1573718	1573598	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	5174	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	1709256	1709641	1709356	Y	NA	NA	MAD1L1,KIAA1908	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG3	100615	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	2351826	2352447	2352374	Y	SNX8	EIF3B,SNX8	NA	NA	NA	NA	EIF3B	39274	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	2353156	2353455	2353307	Y	NA	EIF3B,SNX8	NA	NA	NA	NA	EIF3B	38266	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	2744937	2745164	2745051	Y	NA	AMZ1	NA	NA	NA	NA	AMZ1	27781	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	2750956	2751140	2751041	Y	LFNG,LFNG,CARD11	AMZ1	NA	NA	NA	NA	AMZ1	33800	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	2812534	2812892	2812775	Y	SNX8,LFNG,LFNG,GNA12	NA	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	60363	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	2836098	2836460	2836342	Y	SNX8,LFNG	AC006028.11,GNA12	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	36795	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	2838950	2839257	2839071	Y	SNX8,LFNG,GNA12	AC006028.11,GNA12	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	33998	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	2843425	2843709	2843567	Y	NA	AC006028.11,GNA12	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	29546	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	2860040	2860490	2860319	Y	LFNG,LFNG,GNA12	AC006028.11,GNA12	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	12765	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	2875013	2875360	2875015	Y	NA	AC006028.11,GNA12	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	1758	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	2980860	2981267	2981182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNA12	98902	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	3453682	3454067	3453904	Y	SDK1	NA	NA	NA	NA	NA	SDK1	114602	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	3522204	3522406	3522287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDK1	183124	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr7	4723112	4724257	4723950	Y	NA	FOXK1	NA	NA	NA	NA	FOXK1	41724	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	4765280	4765661	4765569	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	83892	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	4784652	4785031	4784763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	103264	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	4913549	4913687	4913618	Y	NA	PAPOLB,AC092610.12,RADIL	NA	NA	NA	NA	RADIL	7663	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	5452779	5453024	5452968	Y	NA	TNRC18	NA	NA	NA	NA	TNRC18	10021	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr7	5458136	5458686	5458477	Y	FBXL18,TNRC18	TNRC18	NA	NA	NA	NA	TNRC18	4359	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	5469639	5470034	5469987	Y	NA	TNRC18	TNRC18,FBXL18,ACTB	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TNRC18	6594	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	5571351	5571818	5571666	Y	WIPI2,ACTB	FBXL18,ACTB	NA	NA	NA	NA	FBXL18	19922	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	5594554	5594977	5594837	Y	WIPI2	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	6438	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr7	5595490	5596184	5595557	Y	CCZ1,ACTB	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	5231	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr7	5596196	5596581	5596543	Y	CCZ1,ACTB	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	4834	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	5609541	5610012	5609880	Y	SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216,FSCN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	8126	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	6049655	6049813	6049700	Y	NA	PMS2,AIMP2,EIF2AK1	NA	NA	NA	NA	AIMP2	2779	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	6425136	6425343	6425226	Y	CCZ1,USP42	RAC1	NA	NA	NA	NA	RAC1	12982	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	6677371	6677641	6677424	Y	DAGLB,ZNF12,C7orf26	C7orf26,ZNF316,AC073343.13	NA	NA	NA	NA	ZNF316	2418	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	6682292	6682670	6682512	Y	C7orf26	ZNF316,AC073343.13	NA	NA	NA	NA	ZNF316	7339	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	6741580	6741996	6741754	Y	C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12	AC073343.13,ZNF12,PMS2CL	NA	NA	NA	NA	ZNF12	2558	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr7	7268746	7268912	7268835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1	74181	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	7604061	7604281	7604173	Y	MIOS	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	222	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr7	7605671	7605858	7605804	Y	NA	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	1168	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr7	8218168	8218233	8218201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007009.1	81630	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	8295276	8295343	8295310	Y	NA	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	AC007009.1	4520	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	8300852	8301132	8300960	Y	ICA1,ICA1,ICA1	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	ICA1	535	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	8550473	8550803	8550530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICA1	250156	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	13592138	13592417	13592278	Y	NA	NA	DGKB	IMR90	Hi-C	24141950	RPL6P21	516588	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	14042792	14042945	14042854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P21	66060	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.6927024951697
chr7	17170041	17170200	17170099	Y	AHR	NA	NA	NA	NA	NA	AHR	166046	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	19746950	19747169	19747121	Y	NA	TWISTNB	NA	NA	NA	NA	TWISTNB	240	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	22609345	22610034	22609690	Y	IL6	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P6	59727	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	22614875	22615270	22614981	Y	IL6	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P6	65257	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	22622740	22623204	22623070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P6	73122	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	22631710	22632105	22631870	Y	IL6	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P6	82092	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	22742818	22742960	22742910	Y	NA	IL6	FAM126A,LOC100506178	IMR90	Hi-C	24141950	IL6	20543	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	22742975	22743282	22743130	Y	NA	IL6	FAM126A,LOC100506178	IMR90	Hi-C	24141950	IL6	20221	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	22861021	22861212	22861181	Y	NA	TOMM7	NA	NA	NA	NA	TOMM7	551	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	23084280	23084501	23084407	Y	NA	FAM126A	SNORD93,LOC100506178,TOMM7	IMR90	Hi-C	24141950	FAM126A	32531	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr7	23229571	23229876	23229614	Y	NA	NUPL2	NA	NA	NA	NA	NUPL2	10125	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	23346374	23346675	23346525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUPL2	126928	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	23348040	23348443	23348292	Y	KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	NA	NUPL2	128594	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	23375804	23376081	23376055	Y	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	132005	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	23501559	23501943	23501874	Y	NUPL2,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	6143	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	23504984	23505316	23505313	Y	NA	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2770	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr7	23510676	23511223	23510889	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2590	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.2784405728359
chr7	23513815	23514383	23514045	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	MALSU1	K562	ChIA-PET	22265404	IGF2BP3	5729	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.13922028641795
chr7	24229401	24229422	24229412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPY	92360	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	24626460	24626850	24626473	Y	NA	MPP6	NA	NA	NA	NA	MPP6	15573	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	24813861	24813988	24813926	Y	OSBPL3	NA	DFNA5,OSBPL3	IMR90	Hi-C	24141950	MPP6	202974	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	24820839	24820982	24820878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	198271	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	24824166	24824267	24824230	Y	DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	194986	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	24924727	24925102	24925076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	94151	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	24947142	24947425	24947387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	71828	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	25064852	25065012	25064919	Y	NA	OSBPL3	OSBPL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL3	45599	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	25894654	25894946	25894846	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	294914	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	25896245	25896461	25896419	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	293399	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	25896515	25897081	25896801	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	292779	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr7	25990725	25991211	25991018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	198649	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	26140883	26141586	26141235	Y	SNX10,SNX10,SNX10,HNRNPA2B1	NFE2L3	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	48274	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	26220261	26220628	26220627	Y	CBX3	NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1	NA	NA	NA	NA	CBX3	18154	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	26317891	26318244	26318068	Y	NA	AC010677.5,SNX10	HNRNPA2B1,CBX3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	AC010677.5	4076	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	26361230	26361345	26361289	Y	SNX10,SNX10,SNX10	AC010677.5,SNX10	NA	NA	NA	NA	SNX10	31689	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	27573880	27573985	27573933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4HP1	77412	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	29115131	29115317	29115226	Y	NA	CHN2	NA	NA	NA	NA	CHN2	44573	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr7	29163209	29163338	29163275	Y	NA	CHN2	NA	NA	NA	NA	CHN2	3319	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	29217860	29218383	29218096	Y	CHN2,CPVL	CPVL	CHN2	IMR90	Hi-C	24141950	CPVL	14684	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	29534563	29534631	29534599	Y	WIPF3	NA	NA	NA	NA	NA	AC007255.8	66655	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	29645878	29645994	29645936	Y	NA	AC007255.8,PRR15	PRR15	MCF7	ChIA-PET	22265404	PRR15	44451	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	30208837	30209260	30209012	Y	ZNRF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF2	112663	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	30500037	30500161	30500099	Y	NA	NOD1	NA	NA	NA	NA	NOD1	16239	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	32546004	32546038	32546035	Y	NA	LSM5,AVL9	NA	NA	NA	NA	AVL9	12966	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	32929600	32929824	32929751	Y	NA	KBTBD2	NA	NA	NA	NA	KBTBD2	1919	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	32944853	32945232	32945065	Y	KBTBD2	KBTBD2,RP9P,FKBP9	NA	NA	NA	NA	KBTBD2	13110	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	33316298	33316594	33316442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBS9	149442	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	33943577	33943776	33943645	Y	NA	BMPER	NA	NA	NA	NA	BMPER	1054	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	34429750	34429913	34429832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMPER	487227	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	36776109	36776821	36776493	Y	ELMO1,AOAH	NA	ELMO1	IMR90	Hi-C	24141950	NPM1P18	79743	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	36849242	36849408	36849406	Y	ELMO1	NPM1P18	NA	NA	NA	NA	NPM1P18	7156	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	36998037	36998382	36998290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P18	141473	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	37118880	37119242	37119061	Y	ELMO1,ELMO1,ELMO1	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P18	262316	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	37465448	37465531	37465509	Y	GPR141,ELMO1,ELMO1	ELMO1	NA	NA	NA	NA	ELMO1	21321	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	37487081	37487482	37487160	Y	GPR141,ELMO1,ELMO1,ELMO1	ELMO1	NA	NA	NA	NA	ELMO1	229	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	37630466	37630784	37630541	Y	GPR141,ELMO1,ELMO1,ELMO1	NA	ELMO1	IMR90	Hi-C	24141950	ELMO1	143614	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr7	37635277	37635287	37635282	Y	NA	NA	ELMO1	IMR90	Hi-C	24141950	ELMO1	148425	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr7	37731277	37731583	37731449	Y	GPR141,STARD3NL,ELMO1,ELMO1	NA	NA	NA	NA	NA	ELMO1	244425	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	37733102	37733367	37733236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELMO1	246250	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	37775903	37776023	37775962	Y	ELMO1,ELMO1,TXNDC3,GPR141	NA	NA	NA	NA	NA	ELMO1	289051	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr7	37866533	37866785	37866612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD3NL	349039	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	38695355	38695603	38695479	Y	NA	NA	AMPH	IMR90	Hi-C	24141950	VPS41	274391	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	40138099	40138142	40138120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	150463	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	42026442	42026777	42026611	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI3	248692	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	42258020	42258279	42258155	Y	GLI3	GLI3	NA	NA	NA	NA	GLI3	17190	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	42896548	42896903	42896642	Y	NA	NA	GLI3	IMR90	Hi-C	24141950	C7orf25	53001	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	42927750	42928726	42928340	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	NA	NA	NA	NA	C7orf25	21178	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	43654812	43655175	43654945	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	34455	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	43657815	43658085	43657951	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	37458	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	43676905	43677264	43677045	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	NA	NA	NA	NA	NA	STK17A	56548	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	43732901	43733056	43732913	Y	DBNL,STK17A	NA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	63223	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	43959007	43959429	43959215	Y	NA	URGCP,UBE2D4	NA	NA	NA	NA	URGCP	4581	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	43996825	43996925	43996859	Y	NA	URGCP,UBE2D4	NA	NA	NA	NA	UBE2D4	32788	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	44654798	44655022	44654925	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	DDX56,TMED4,OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	10627	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	44658456	44658730	44658526	Y	PURB,TMED4,OGDH	DDX56,TMED4,OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	14285	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.5212263398373
chr7	45019224	45019585	45019470	Y	OGDH,ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G	SNHG15,CCM2	NA	NA	NA	NA	SNHG15	4975	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr7	47367058	47367181	47367120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	252975	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	47391456	47391672	47391564	Y	C7orf65	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	228484	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	47514732	47515208	47514929	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104948	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr7	47536985	47537239	47537063	Y	HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	82917	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	47575600	47575737	47575669	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	44419	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	47631233	47631542	47631345	Y	C7orf69,TNS3	TNS3	TNS3,LINC00525,C7orf69,PKD1L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	11077	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	48031393	48031616	48031481	Y	HUS1	HUS1,SUN3	HUS1	K562	ChIA-PET	22265404	HUS1	14215	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	48114005	48114152	48114079	Y	NA	SUN3,UPP1	NA	NA	NA	NA	UPP1	12073	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	50602565	50602886	50602809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	86477	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	50666851	50666964	50666921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	150763	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	50769181	50769534	50769358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRB10	89625	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	51370562	51370701	51370648	Y	COBL	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	11814	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	51382954	51383359	51383079	Y	COBL	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	439	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	55131480	55131905	55131522	Y	EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	46766	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	55132578	55133258	55132929	Y	SEC61G,EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	47864	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr7	55134555	55134962	55134733	Y	NA	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	49841	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr7	55141624	55142112	55141893	Y	SEC61G,EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	56910	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	55146809	55147410	55146997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	62095	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr7	55155188	55155533	55155358	Y	EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	70474	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	55201472	55201858	55201601	Y	SEC61G	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR-AS1	52769	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	55253994	55254266	55254079	Y	SEC61G	EGFR-AS1	NA	NA	NA	NA	EGFR-AS1	361	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	55322570	55322956	55322611	Y	EGFR	CALM1P2	EGFR,SEC61G	IMR90	Hi-C	24141950	CALM1P2	2993	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr7	55541787	55541962	55541880	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VOPP1	96719	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	55576461	55576688	55576528	Y	VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	VOPP1	61993	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	56013517	56013601	56013542	Y	ZNF713	GBAS,MRPS17	NA	NA	NA	NA	GBAS	3885	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr7	57471842	57471971	57471867	Y	NA	ZNF716	NA	NA	NA	NA	ZNF716	35912	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	61968807	61969730	61969008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF727	1534091	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	63775449	63776053	63775748	Y	NA	ZNF736	NA	NA	NA	NA	ZNF736	9612	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	64196878	64197130	64197096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF138	55636	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	65613460	65613645	65613556	Y	ASL,ASL	CRCP	NA	NA	NA	NA	CRCP	35869	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	66096553	66096745	66096681	Y	NA	KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	KCTD7	4685	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	66120269	66120628	66120390	Y	RABGEF1,KCTD7	KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	RP4-756H11.3	2744	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	66783772	66783944	66783858	Y	NA	STAG3L4,PMS2P4	NA	NA	NA	NA	PMS2P4	17878	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	70253382	70253537	70253463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	1191477	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	71473269	71473662	71473638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYW1B	823115	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	71803548	71803903	71803734	Y	CALN1	NA	NA	NA	NA	NA	TYW1B	492874	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	72929530	72929887	72929777	Y	NA	BAZ1B,BCL7B	NA	NA	NA	NA	BAZ1B	4721	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	72934537	72934921	72934642	Y	NA	BCL7B	NA	NA	NA	NA	BAZ1B	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	73062013	73062614	73062579	Y	BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A	MLXIPL,WBSCR22,DNAJC30	MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A	IMR90	Hi-C	24141950	MLXIPL	25140	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	73153813	73154099	73154081	Y	FZD9,STX1A,ABHD11,CLDN4,CLDN3	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	2616	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr7	73156679	73157033	73156789	Y	NA	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	5482	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr7	73157180	73157738	73157420	Y	FZD9,BAZ1B,TBL2,MLXIPL,ABHD11,CLDN4,CLDN3	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	5983	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr7	73180066	73180446	73180256	Y	NA	STX1A,ABHD11,CLDN3,CLDN4	NA	NA	NA	NA	CLDN3	2154	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	73232134	73232500	73232295	Y	NA	CLDN3,CLDN4,WBSCR27	NA	NA	NA	NA	CLDN4	20262	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr7	73236868	73237278	73236968	Y	CLDN3,CLDN4	CLDN4,WBSCR27	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	17587	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr7	73641053	73641366	73641100	Y	LIMK1,LAT2	RFC2	NA	NA	NA	NA	RFC2	25408	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	73694024	73694283	73694118	Y	LAT2	RFC2,CLIP2	CLIP2	IMR90	Hi-C	24141950	CLIP2	7522	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr7	73739145	73739306	73739226	Y	NA	CLIP2	NA	NA	NA	NA	CLIP2	37340	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	75268782	75269322	75269061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIP1	96958	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	75465283	75465439	75465360	Y	MDH2	RHBDD2	STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR	IMR90	Hi-C	24141950	RHBDD2	4481	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr7	75546128	75546229	75546156	Y	NA	POR	STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	POR	19610	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	75563701	75564093	75563872	Y	POR	POR	NA	NA	NA	NA	POR	37183	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr7	75567331	75567651	75567437	Y	POR	POR	NA	NA	NA	NA	POR	40813	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	75675722	75675985	75675853	Y	NA	STYXL1,MDH2	NA	NA	NA	NA	MDH2	353	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	75795833	75796053	75795969	Y	RHBDD2,POR	NA	SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	MDH2	120464	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr7	75833146	75833486	75833315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPB1	96375	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	75922960	75923105	75923022	Y	HSPB1	HSPB1	NA	NA	NA	NA	HSPB1	6756	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	75934206	75934543	75934471	Y	NA	HSPB1	NA	NA	NA	NA	HSPB1	4345	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	17444	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr7	76627484	76628238	76628092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM185BP	121195	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	84248657	84248668	84248663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074183.4	318893	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr7	86534596	86534997	86534797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1324L	152018	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	91142488	91142502	91142497	Y	MTERF	NA	NA	NA	NA	NA	FZD1	250705	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	92261439	92261837	92261823	Y	NA	FAM133B	FAM133B	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM133B	43731	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	92263416	92263696	92263624	Y	SAMD9,CDK6	FAM133B	FAM133B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM133B	45708	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	92271612	92271814	92271678	Y	SAMD9	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	53904	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	92282305	92282698	92282463	Y	LRRD1,KRIT1,KRIT1,KRIT1,SAMD9L,SAMD9	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	64597	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	92459714	92460134	92460069	Y	SAMD9	AC002454.1,CDK6	NA	NA	NA	NA	AC002454.1	3663	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	92488583	92488710	92488601	Y	CDK6,CDK6	AC002454.1,CDK6	NA	NA	NA	NA	CDK6	24675	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	94140158	94140537	94140353	Y	CASD1	CASD1	NA	NA	NA	NA	CASD1	3627	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	94751086	94751478	94751282	Y	NA	RNU4-16P	NA	NA	NA	NA	RNU4-16P	25547	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	95137857	95138175	95137904	Y	ASB4	NA	NA	NA	NA	NA	PON2	75347	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	95238124	95238400	95238252	Y	PON1,PON3	PDK4	NA	NA	NA	NA	PDK4	14321	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	95861904	95862185	95862172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	87274	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	96642423	96642668	96642630	Y	NA	DLX6,DLX5	NA	NA	NA	NA	DLX6	9563	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	96647181	96647459	96647313	Y	NA	DLX6,DLX5	NA	NA	NA	NA	DLX5	4950	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	97915595	97916070	97915699	Y	LMTK2,BRI3	TECPR1,BRI3	NA	NA	NA	NA	BRI3	35904	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr7	97994295	97994325	97994312	Y	BAIAP2L1	RPS3AP26,BAIAP2L1	BRI3	IMR90	Hi-C	24141950	RPS3AP26	19571	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr7	97995155	97995543	97995349	Y	NA	RPS3AP26,BAIAP2L1	BRI3	IMR90	Hi-C	24141950	RPS3AP26	18353	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	98099989	98100186	98100071	Y	TMEM130	NA	TMEM130	IMR90	Hi-C	24141950	BAIAP2L1	71609	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	98970307	98970479	98970399	Y	PTCD1,CPSF4	ARPC1A,ARPC1B,BUD31,PDAP1	NA	NA	NA	NA	ARPC1B	435	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr7	98973055	98973209	98973129	Y	ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B	ARPC1B,BUD31,PDAP1	NA	NA	NA	NA	ARPC1B	3183	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	99000499	99000617	99000560	Y	NA	ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4	NA	NA	NA	NA	BUD31	3647	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	99178135	99178365	99178354	Y	ZNF789	ZNF655,FAM200A	NA	NA	NA	NA	FAM200A	23976	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	99962576	99962959	99962740	Y	MCM7,C7orf43,ZCWPW1,TSC22D4,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,GIGYF1,PILRB,PILRA	PILRB,PMS2P1	PILRA	IMR90	Hi-C	24141950	PMS2P1	25045	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	100167857	100168189	100168134	Y	NA	AGFG2,LRCH4,MOSPD3	NA	NA	NA	NA	LRCH4	13587	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	100761754	100762006	100761835	Y	NA	TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF	AP1S1,VGF	MCF7	ChIA-PET	22265404	SERPINE1	6364	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	101526005	101526525	101526438	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	69046	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	101566593	101566799	101566736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	109634	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	101569375	101569771	101569405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	112416	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	101590034	101590314	101590170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	133075	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	101672273	101672589	101672281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	215314	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr7	101690848	101690892	101690861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	233889	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	101775527	101775981	101775908	Y	CUX1,CUX1,SH2B2,ORAI2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	226338	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	101929501	101929660	101929574	Y	CUX1,CUX1,CUX1,POLR2J3,ORAI2,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72659	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	14.3956018010996
chr7	101930729	101931104	101930861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	71215	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	102104317	102104602	102104460	Y	NA	ORAI2,ALKBH4,LRWD1,POLR2J	NA	NA	NA	NA	LRWD1	941	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	102790674	102790901	102790766	Y	NAPEPLD	RPL19P12,NAPEPLD	NA	NA	NA	NA	NAPEPLD	2667	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	102958965	102959200	102958983	Y	NA	PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4	NA	NA	NA	NA	PMPCB	23096	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	104482374	104482754	104482692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	168737	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	104585458	104586124	104585640	Y	MLL5	NA	LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01004	65367	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	104612836	104613032	104612935	Y	NA	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	38459	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	104626890	104627731	104627241	Y	MLL5	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	23760	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	104771248	104771300	104771252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	119757	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	104854124	104854334	104854271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	183421	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	104980501	104980737	104980707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	57018	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	105123568	105123582	105123575	Y	NA	PUS7,RINT1	NA	NA	NA	NA	PUS7	37132	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	105459888	105460220	105459903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L1	54830	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	106206962	106207238	106207108	Y	NA	NA	CCDC71L,NAMPT,ATXN7L1,PIK3CG	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC71L	92204	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	106808132	106808705	106808532	Y	NA	HBP1	NA	NA	NA	NA	HBP1	726	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	106901302	106901364	106901333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBP1	93896	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr7	107026511	107026865	107026723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	175064	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	107116622	107117169	107116900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	84760	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	107476895	107477090	107476948	Y	NA	NA	CBLL1	K562	ChIA-PET	22265404	DLD	52325	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	107562078	107562130	107562088	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	32663	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	107567511	107567568	107567540	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	38096	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	107573965	107574445	107574339	Y	LAMB1	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	44550	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.2427857670014
chr7	107606262	107606577	107606420	Y	NRCAM	LAMB1	NA	NA	NA	NA	LAMB1	35123	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr7	107644827	107645024	107644950	Y	LAMB1	LAMB1	NA	NA	NA	NA	LAMB1	3127	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.21052989808695
chr7	108118010	108118358	108118206	Y	NA	NRCAM,RPL7P32	NA	NA	NA	NA	NRCAM	22849	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	109682039	109682053	109682046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP5	1473845	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	110326819	110326998	110326909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	873575	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	110470494	110470759	110470627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	729814	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	110753766	110754103	110753883	Y	LRRN3	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	446470	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	110849154	110849473	110849333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	351100	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	110856868	110857086	110856977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	343487	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	110874557	110874601	110874588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	325972	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	110956734	110956926	110956906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	243647	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	111200844	111201149	111201059	Y	NA	IMMP2L	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	271	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	112404343	112404501	112404446	Y	NA	TMEM168	NA	NA	NA	NA	TMEM168	24146	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	113233852	113234207	113234027	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00998	477184	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.13922028641795
chr7	114571864	114572137	114571962	Y	MDFIC	MDFIC	NA	NA	NA	NA	MDFIC	11655	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	114677768	114677789	114677777	Y	MDFIC	NA	NA	NA	NA	NA	MDFIC	117559	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	115957232	115957778	115957588	Y	NA	CAV2	CAV1,CAV2,TES,CAPZA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CAV2	31798	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	116651956	116652355	116652105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	59568	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	116804623	116804954	116804811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	212235	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	117470735	117470951	117470843	Y	CTTNBP2	CTTNBP2	NA	NA	NA	NA	CTTNBP2	41242	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	121008996	121009049	121009023	Y	NA	FAM3C	NA	NA	NA	NA	FAM3C	25369	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	121874177	121874561	121874390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AASS	91843	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	123387767	123387941	123387854	Y	NA	WASL	NA	NA	NA	NA	WASL	646	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	124120610	124120698	124120659	Y	NA	NA	GPR37	IMR90	Hi-C	24141950	GPR37	282983	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	125279639	125279913	125279647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-420H19.3	340707	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	127455662	127455822	127455742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SND1	165428	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	127807416	127807928	127807646	Y	LRRC4	NA	SND1	IMR90	Hi-C	24141950	RBM28	174034	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	128094514	128094949	128094639	Y	LEP,C7orf68	IMPDH1,HILPDA,RP11-155G14.6,METTL2B	NA	NA	NA	NA	RP11-155G14.6	523	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.071309611669
chr7	128473793	128474194	128473994	Y	FLNC	CCDC136,FLNC,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	5362	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	129095634	129096008	129095821	Y	NA	RP11-305M3.2,RNU1-72P	NA	NA	NA	NA	RNU1-72P	26337	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	129419876	129420343	129420085	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	170321	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	129464915	129465297	129464948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	125492	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	129589680	129589810	129589737	Y	NA	UBE2H	NA	NA	NA	NA	UBE2H	979	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	129590044	129590333	129590306	Y	NA	UBE2H	NA	NA	NA	NA	UBE2H	456	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	129609674	129609888	129609791	Y	NA	UBE2H	AHCYL2,ZC3HC1,SMO,UBE2H	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2H	18885	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	129960010	129960125	129960069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM209	114400	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	130581597	130582393	130581985	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	210462	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	132488555	132488726	132488642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	276122	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	132656149	132656423	132656408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	108425	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	133223721	133224093	133223724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC083875.2	225554	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	134117156	134117311	134117298	Y	NA	AKR1B1	NA	NA	NA	NA	AKR1B1	24725	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.79626797575315
chr7	134422783	134423192	134423006	Y	NA	CALD1	CALD1,BPGM	IMR90	Hi-C	24141950	CALD1	3811	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	134550071	134550586	134550435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGBL3	118673	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	135395183	135395352	135395286	Y	NA	C7orf73,SLC13A4	NA	NA	NA	NA	SLC13A4	16654	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	136924573	136924814	136924694	Y	PTN	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	759999	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	137387266	137387617	137387499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	297196	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	137646084	137646360	137646126	Y	TRIM24,CREB3L2	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	38453	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	137659854	137660135	137660099	Y	NA	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	24678	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	137685065	137685809	137685664	Y	TRIM24,CREB3L2	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	252	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	138249829	138249954	138249896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM24	106750	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	138317555	138317877	138317771	Y	KIAA1549,TRIM24,SVOPL,SVOPL	NA	NA	NA	NA	NA	AC020983.5	53848	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	138403353	138403545	138403448	Y	ZC3HAV1	AC020983.5	NA	NA	NA	NA	AC020983.5	31628	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	139227178	139227349	139227257	Y	NA	ERHP1	NA	NA	NA	NA	ERHP1	10192	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	6.4210597961739
chr7	139929659	139930294	139929953	Y	TBXAS1,RAB19,JHDM1D	NA	JHDM1D,LOC100134229	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP12	168138	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	139930411	139930852	139930521	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	LOC100134229,JHDM1D	MCF7	ChIA-PET	22265404	PARP12	168890	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	139930863	139931473	139931211	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	LOC100134229,JHDM1D	MCF7	ChIA-PET	22265404	PARP12	169342	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	140188165	140188433	140188299	Y	NA	MKRN1	NA	NA	NA	NA	MKRN1	10796	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	141334636	141334647	141334642	Y	TAS2R3	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1147	65306	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	143083267	143084129	143083354	Y	TAS2R40,FAM131B,FAM131B	AC093673.5,ZYX,EPHA1	NA	NA	NA	NA	ZYX	7094	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr7	146230197	146230393	146230208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPK1	1698709	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	148093179	148093348	148093211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005229.5	182145	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	148334506	148334940	148334775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL1	58066	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	NA	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EZH2	58860	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.34635124758485
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr7	148788628	148788884	148788863	Y	ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2754	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	149468740	149469267	149468803	Y	NA	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	172	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	149471511	149471709	149471700	Y	ATP6V0E2,SSPO	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	2943	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	150520183	150520563	150520402	Y	REPIN1,ABP1	NA	NA	NA	NA	NA	GIMAP1	108538	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	151157060	151157432	151157203	Y	NA	NA	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	WDR86	51247	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr7	151184518	151184840	151184768	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	30366	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr7	151192969	151193321	151193145	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	21885	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	151198552	151198933	151198803	Y	AGAP3,PRKAG2,PRKAG2	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	16273	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	152065077	152065428	152065152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	305822	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	152160343	152160554	152160402	Y	ACTR3B	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	210696	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	152160715	152161193	152160959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	210057	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	209236	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr7	152219127	152219295	152219254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	151955	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	152235560	152235891	152235729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	135359	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	154999343	155001070	155000829	Y	NA	AC099552.3	INSIG1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	AC099552.3	5486	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	155006028	155006426	155006187	Y	NA	AC099552.3	NA	NA	NA	NA	AC099552.3	12171	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr7	155019709	155020044	155019877	Y	NA	AC099552.3	INSIG1	IMR90	Hi-C	24141950	AC099552.3	25852	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	155137693	155138087	155137815	Y	NA	NA	INSIG1,PAXIP1,LOC100132707,LOC100128264,HTR5A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INSIG1	50207	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	156544134	156544345	156544262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C7orf13	112786	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	156792805	156792864	156792835	Y	NA	MNX1	NA	NA	NA	NA	MNX1	8481	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	157071910	157072285	157071928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	53790	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr7	157082177	157082296	157082243	Y	NA	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	43779	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr7	157227632	157227698	157227667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	101557	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	157334866	157335140	157335002	Y	DNAJB6,DNAJB6	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	208791	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr7	158243394	158243763	158243659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	251757	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	158452829	158453067	158452948	Y	NA	NCAPG2	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	42453	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	158595763	158596162	158596010	Y	ESYT2	ESYT2	NA	NA	NA	NA	ESYT2	24782	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr7	158609735	158609944	158609833	Y	ESYT2	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	11000	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr7	158656529	158657066	158657015	Y	NA	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	WDR60	9260	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	638062	638589	638348	Y	ZNF596,ZNF596,ERICH1	ERICH1	NA	NA	NA	NA	ERICH1	47517	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr8	1780723	1781665	1781560	Y	NA	ARHGEF10	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	10581	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	1847894	1848163	1847920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KBTBD11	71881	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	1897074	1897760	1897667	Y	NA	KBTBD11,RP11-439C15.4	NA	NA	NA	NA	KBTBD11	22284	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	3252665	3252838	3252782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-439C15.4	1331862	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	6446868	6447162	6447015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2541M15.1	116568	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	6481206	6481441	6481325	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2541M15.1	82289	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	8153597	8154098	8153801	Y	NA	NA	MFHAS1,SGK223,CLDN23,FLJ10661	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ALG1L13P	53408	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	8935191	8935379	8935249	Y	NA	NA	ERI1,PPP1R3B,TNKS	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1R3B	71705	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr8	9219931	9220273	9220102	Y	PPP1R3B	NA	NA	NA	NA	NA	TNKS	191151	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	10267879	10268236	10267884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	358101	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	10659261	10659473	10659367	Y	NA	SOX7,PINX1	NA	NA	NA	NA	SOX7	35884	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	11032163	11032532	11032339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR9	107393	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	11310026	11310392	11310209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AF131216.5	107015	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	11312887	11313950	11313920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AF131216.5	109876	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	11558749	11558994	11558836	Y	GATA4	GATA4	NA	NA	NA	NA	GATA4	26281	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	12608373	12608831	12608472	Y	NA	LONRF1	NA	NA	NA	NA	LONRF1	2751	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	13122971	13123135	13123062	Y	DLC1	NA	NA	NA	NA	NA	DLC1	248032	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	13988363	13988798	13988479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C8orf48	566011	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	16898778	16899115	16898947	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC2	112423	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	17355613	17356072	17355737	Y	NA	SLC7A2	NA	NA	NA	NA	SLC7A2	3016	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr8	17385893	17386107	17386000	Y	SLC7A2,SLC7A2	SLC7A2,PDGFRL	NA	NA	NA	NA	SLC7A2	33296	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	18836263	18836433	18836318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	103807	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	21027025	21027231	21027110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XPO7	747949	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	21775759	21776194	21775973	Y	PHYHIP,DOK2,NPM2	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	579	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	21867707	21867918	21867811	Y	PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2	NPM2	NA	NA	NA	NA	NPM2	11718	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	22068132	22068339	22068246	Y	NA	BMP1,PHYHIP,MIR320A,POLR3D	NA	NA	NA	NA	PHYHIP	19515	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	22103553	22103662	22103605	Y	NA	PHYHIP,MIR320A,POLR3D	NA	NA	NA	NA	POLR3D	2936	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	22240884	22241560	22241218	Y	C8orf58	SLC39A14	NA	NA	NA	NA	SLC39A14	18122	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	22469003	22469432	22469219	Y	NA	PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	C8orf58	13889	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	22808149	22808394	22808223	Y	NA	RHOBTB2	PEBP4,TNFRSF10B,BIN3,EGR3,RHOBTB2	IMR90	Hi-C	24141950	RHOBTB2	34536	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.4499167281683
chr8	22854119	22854395	22854224	Y	EGR3,EGR3,RHOBTB2,RHOBTB2	RHOBTB2	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	11189	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	22858322	22858618	22858470	Y	EGR3,EGR3,RHOBTB2,RHOBTB2	RHOBTB2	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	15392	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	22858849	22858903	22858877	Y	NA	RHOBTB2	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	15919	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	23020215	23020436	23020325	Y	NA	TNFRSF10D	NA	NA	NA	NA	TNFRSF10D	672	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	23308133	23308499	23308237	Y	TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4	LOXL2,ENTPD4	NA	NA	NA	NA	ENTPD4	4709	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	23396383	23397127	23396699	Y	TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4,SLC25A37	SLC25A37	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	12065	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	23415988	23416142	23416060	Y	TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4	SLC25A37,RNU4-71P	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	31670	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	24624446	24624496	24624472	Y	NEFM,NEFM,NEFL	NA	NA	NA	NA	NA	NEFM	144029	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	24799462	24799718	24799592	Y	NEFL	NEFM,NEFL	NA	NA	NA	NA	NEFL	12906	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	25186094	25186253	25186181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD9	127739	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	25904215	25904335	25904275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R2A	242672	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	26008929	26009154	26009015	Y	NA	NA	PPP2R2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2R2A	137853	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	26305968	26306033	26305997	Y	NA	NA	BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PNMA2	63575	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr8	26306627	26307336	26307213	Y	NA	NA	BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PNMA2	62272	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr8	26661148	26661460	26661304	Y	NA	RP11-384C12.1	NA	NA	NA	NA	RP11-384C12.1	33841	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	27192227	27192436	27192262	Y	PTK2B,PTK2B	TRIM35,PTK2B	NA	NA	NA	NA	PTK2B	25228	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	27219743	27220043	27219778	Y	PTK2B,PTK2B	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2B	52744	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr8	27236352	27236561	27236406	Y	PTK2B,PTK2B	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2B	69353	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	27464961	27465271	27465267	Y	NA	CLU,SCARA3	NA	NA	NA	NA	CLU	5277	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	27494025	27494256	27494186	Y	STMN4,CHRNA2,CLU	CLU,SCARA3	NA	NA	NA	NA	SCARA3	4640	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	27517363	27517693	27517481	Y	NA	CLU,SCARA3	NA	NA	NA	NA	SCARA3	27978	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	27547704	27547787	27547746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARA3	58319	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.4855715340028
chr8	28565617	28566294	28565942	Y	EXTL3	EXTL3-AS1	NA	NA	NA	NA	EXTL3-AS1	8636	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	28635981	28636227	28636104	Y	EXTL3	NA	NA	NA	NA	NA	EXTL3-AS1	79000	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	30262933	30263230	30262977	Y	NA	RBPMS,RBPMS-AS1	NA	NA	NA	NA	RBPMS-AS1	22016	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	30273402	30273800	30273435	Y	NA	RBPMS,RBPMS-AS1	NA	NA	NA	NA	RBPMS-AS1	32485	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	30278706	30278862	30278761	Y	NA	RBPMS,RBPMS-AS1	NA	NA	NA	NA	RBPMS-AS1	37789	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	30363851	30364149	30364000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBPMS-AS1	122934	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	33265826	33266145	33265940	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT10	62795	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	33291442	33291793	33291639	Y	MAK16,FUT10,C8orf41,C8orf41	FUT10,MAK16	NA	NA	NA	NA	FUT10	37147	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.1069644175035
chr8	36441429	36441454	36441442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-962G15.1	193228	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr8	37372940	37373020	37372980	Y	NA	NA	KCNU1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-150O12.3	82356	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	37449026	37449149	37449088	Y	RAB11FIP1,ZNF703	RP11-150O12.3	ZNF703	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-150O12.3	6227	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	37761676	37761790	37761689	Y	NA	RAB11FIP1	RAB11FIP1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RAB11FIP1	6691	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr8	37773592	37773777	37773685	Y	NA	RAB11FIP1	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP1	18607	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	37928414	37928535	37928451	Y	ADRB3,WHSC1L1	EIF4EBP1,ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	32225	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	37961561	37961954	37961758	Y	NA	ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	801	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr8	38523213	38523472	38523342	Y	C8orf86	NA	C8orf86,FGFR1,WHSC1L1,RNF5P1,PPAPDC1B	IMR90	Hi-C	24141950	TACC1	60232	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	38762883	38763134	38762941	Y	TACC1,PLEKHA2	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	6130	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	38794582	38795442	38794757	Y	TACC1,PLEKHA2	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	37829	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	38856419	38857534	38856583	Y	NA	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	4031	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	40056491	40056661	40056575	Y	C8orf4	C8orf4	GOLGA7,ZMAT4,IDO2	IMR90	Hi-C	24141950	C8orf4	47502	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	41733569	41733873	41733722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAT6A	173635	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	41886687	41887061	41886965	Y	NA	KAT6A	NA	NA	NA	NA	KAT6A	20447	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	42370484	42370865	42370805	Y	NA	SLC20A2	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	24204	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	42749479	42749732	42749583	Y	NA	MIR4469,HOOK3,RNF170	NA	NA	NA	NA	MIR4469	61	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	43228534	43228608	43228571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	234978	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	47885401	47885427	47885415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP2	181314	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	48350721	48350922	48350822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-697N18.2	152249	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	48424795	48425379	48425168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-697N18.2	77792	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr8	49783004	49783154	49783067	Y	SNAI2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL29P19	487854	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	50653553	50653944	50653741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL29P19	1358403	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	53013780	53014013	53013897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-110G21.1	203895	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	54884977	54885679	54885327	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	47410	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	54932125	54932445	54932251	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	644	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	56753076	56753403	56753291	Y	NA	LYN	NA	NA	NA	NA	LYN	36969	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	56798106	56798776	56798363	Y	LYN	LYN	NA	NA	NA	NA	LYN	7734	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	56876027	56876489	56876217	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	LYN	85655	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	56887750	56888682	56888353	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD54	95778	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	56916302	56916441	56916350	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD54	68019	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	56919441	56919801	56919730	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD54	64659	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	59949464	59949741	59949603	Y	TOX	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-50P	224353	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	60054216	60054591	60054577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-50P	329105	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	61626654	61626933	61626781	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37317	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr8	61627150	61627529	61627187	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37813	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.6927024951697
chr8	61660299	61660611	61660357	Y	CHD7	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	70962	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	61850490	61850754	61850677	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261153	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr8	61850776	61851191	61851141	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261439	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	62606389	62606706	62606619	Y	NA	ASPH	NA	NA	NA	NA	ASPH	18449	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	62620817	62621622	62621526	Y	NA	ASPH	NA	NA	NA	NA	ASPH	3533	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	68090392	68090564	68090531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	96374	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	68147841	68148210	68148008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGEF1	105702	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	70042378	70042779	70042585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-101P	945488	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	71303418	71303670	71303544	Y	NA	NCOA2,RP11-333A23.1	NA	NA	NA	NA	NCOA2	10370	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	71503238	71503393	71503365	Y	NA	TRAM1	NA	NA	NA	NA	TRAM1	15229	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	71569342	71569635	71569535	Y	NA	LACTB2,XKR9	NA	NA	NA	NA	LACTB2	9774	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	73333960	73334345	73334224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPA1	348108	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	73559096	73559368	73559359	Y	KCNB2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-1145L24.1	232607	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	73819735	73820065	73819911	Y	NA	RP11-1145L24.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1145L24.1	27760	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	79674578	79674862	79674701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKIA	248204	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	80680806	80681178	80681064	Y	HEY1	HEY1	NA	NA	NA	NA	HEY1	2708	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	80696935	80697150	80697007	Y	HEY1	HEY1	MRPS28,HEY1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEY1	18837	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	80996547	80996769	80996670	Y	TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	56023	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	81478227	81478459	81478343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB10	82373	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	81489520	81489653	81489606	Y	NA	NA	ZBTB10	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZBTB10	93666	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	81695028	81695405	81695288	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB10	299174	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	81742521	81742946	81742703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB10	346667	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	81749885	81750162	81750025	Y	ZNF704	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB10	354031	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	81782792	81783006	81782996	Y	ZBTB10,ZNF704	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB10	386938	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	82167350	82167604	82167486	Y	NA	FABP5	ZNF704,PAG1,FABP12	IMR90	Hi-C	24141950	FABP5	22994	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	87404027	87404214	87404101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWP1	51060	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	87475103	87475472	87475288	Y	NA	CPNE3,SLC2A3P4	NA	NA	NA	NA	CPNE3	19587	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	87484005	87484360	87484214	Y	NA	CPNE3,SLC2A3P4	NA	NA	NA	NA	CPNE3	10699	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	87673960	87674305	87674138	Y	CNGB3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A3P4	160140	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	90741352	90741628	90741481	Y	OSGIN2,RIPK2	RP11-37B2.1,RIPK2	DECR1,RIPK2,NBN	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-37B2.1	26327	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	90942619	90942853	90942786	Y	RIPK2,NBN,OSGIN2	OSGIN2	NA	NA	NA	NA	OSGIN2	30532	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	96180882	96181195	96181039	Y	PLEKHF2	PLEKHF2	NA	NA	NA	NA	PLEKHF2	36850	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	96903752	96903767	96903760	Y	NA	NA	LOC100616530,UQCRB	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GDF6	267253	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	96960626	96960710	96960668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDF6	210310	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	97173806	97174188	97174149	Y	NA	GDF6	NA	NA	NA	NA	GDF6	2786	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	97272793	97273157	97272974	Y	NA	UQCRB,MTERFD1,PTDSS1	NA	NA	NA	NA	PTDSS1	850	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	97295015	97295255	97295133	Y	NA	UQCRB,MTERFD1,PTDSS1	NA	NA	NA	NA	PTDSS1	23072	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	97923635	97924111	97923770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPYL5	364065	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	98093424	98093753	98093689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPYL5	194423	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	98843865	98843962	98843914	Y	NA	RPS23P1,MATN2	NA	NA	NA	NA	RPS23P1	31320	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr8	98865970	98866240	98866105	Y	NA	RPS23P1,MATN2	NA	NA	NA	NA	RPS23P1	9042	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	99643221	99643590	99643555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK3	309465	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	99953302	99954000	99953407	Y	STK3,OSR2	STK3,OSR2	NA	NA	NA	NA	STK3	247	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr8	100808377	100808591	100808586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX6C	95699	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	101222720	101222891	101222806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAG1	54586	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	101422276	101422671	101422588	Y	RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1,RNF19A,ANKRD46	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19A	75830	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	101731045	101731633	101731441	Y	NA	PABPC1	NA	NA	NA	NA	PABPC1	1404	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr8	101927731	101928052	101928034	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ	RPS26P6,YWHAZ	NA	NA	NA	NA	RPS26P6	21757	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	102038562	102039020	102038731	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	74946	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	102039589	102039925	102039833	Y	GRHL2	NA	ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	75973	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr8	102075998	102076526	102076187	Y	GRHL2	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	112382	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr8	102103047	102103317	102103255	Y	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF706	113104	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	102140192	102140420	102140327	Y	YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	YWHAZ,FLJ42969,ZNF706,PABPC1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	76001	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	102167003	102167377	102167334	Y	NA	ZNF706	FLJ42969,YWHAZ,ZNF706	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	49044	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	102185716	102186115	102186035	Y	NA	ZNF706	YWHAZ,FLJ42969,ZNF706	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	30306	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	102467254	102467614	102467418	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	35046	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	102505547	102505759	102505677	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	2887	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr8	102505982	102506363	102506168	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	3322	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.8641786505021
chr8	102513804	102514123	102513992	Y	NA	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	11144	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	102665065	102665479	102665281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRHL2	162405	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	103120269	103120923	103120717	Y	UBR5,NCALD	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2B	128423	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	103401606	103401938	103401841	Y	NA	UBR5	NA	NA	NA	NA	UBR5	21131	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	103411260	103411483	103411351	Y	UBR5	UBR5	NA	NA	NA	NA	UBR5	11586	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	103766474	103766656	103766574	Y	NA	KB-1732A1.1	KLF10,UBR5	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1732A1.1	49089	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr8	103801151	103801773	103801337	Y	NA	KB-1732A1.1	KLF10,UBR5,ODF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1732A1.1	13972	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	103918538	103918841	103918687	Y	NA	KB-1507C5.2,AZIN1	ATP6V1C1,AZIN1	IMR90	Hi-C	24141950	AZIN1	14446	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	104059632	104059708	104059689	Y	NA	ATP6V1C1	NA	NA	NA	NA	ATP6V1C1	28341	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	104331705	104332089	104331783	Y	RIMS2	FZD6,RP11-318M2.2,CTHRC1	NA	NA	NA	NA	RP11-318M2.2	22705	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	105374220	105374445	105374333	Y	TM7SF4	NA	NA	NA	NA	NA	LRP12	224807	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	108508143	108508403	108508294	Y	ANGPT1	NA	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	799902	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	108848123	108848219	108848185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	597343	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	109230729	109230920	109230833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	214642	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	110248064	110248088	110248074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENY2	96465	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	110602225	110602239	110602235	Y	SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,KCNV1	NA	NA	NA	NA	NA	EBAG9	52285	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	110647152	110647483	110647459	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYBU	54537	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	115707569	115707650	115707588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	1320671	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr8	117664503	117664654	117664532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	112088	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	117711370	117711748	117711590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	64994	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	118072404	118072549	118072412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD21	187299	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	119047899	119048328	119048216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	73764	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	119317381	119317491	119317437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	195289	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr8	119443463	119443781	119443622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	188453	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	123811167	123811696	123811506	Y	C8orf76,ZHX2	ZHX2	NA	NA	NA	NA	ZHX2	19534	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	123883965	123883977	123883971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX2	92332	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	124013159	124013422	124013291	Y	NA	DERL1	NA	NA	NA	NA	DERL1	39241	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	124248679	124249062	124248866	Y	NA	C8orf76,ZHX1	NA	NA	NA	NA	C8orf76	2576	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	124524433	124524792	124524749	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	26654	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	125984707	125984742	125984718	Y	ZNF572	ZNF572,SQLE	NA	NA	NA	NA	ZNF572	1167	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr8	126083515	126083743	126083629	Y	NA	NSMCE2,KIAA0196	NA	NA	NA	NA	NSMCE2	18178	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	126193275	126193543	126193371	Y	NA	NA	TRIB1	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0196	91193	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	126283499	126283849	126283769	Y	NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	156714	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	126290719	126290948	126290836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	149615	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	126556751	126557301	126556981	Y	NA	NA	NSMCE2,KIAA0196,TRIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	116188	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	127124018	127124391	127124085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-89K10.1	443729	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	127837362	127837443	127837401	Y	FAM84B	NA	PVT1,MYC,LOC727677	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM84B	268724	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	127844573	127844851	127844712	Y	FAM84B	NA	PVT1,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	FAM84B	275935	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	128070328	128070629	128070508	Y	FAM84B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	501690	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	128099457	128099542	128099514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	530819	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	128182261	128182424	128182343	Y	NA	NA	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	563256	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	128684085	128684435	128684260	Y	NA	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	61245	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	128822019	128822203	128822035	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	17240	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr8	128822251	128823013	128822500	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	17472	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	128835085	128835527	128835341	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	30306	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	128871975	128872421	128872033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	67196	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr8	128910613	128910985	128910818	Y	MYC	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	105834	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	128923296	128923609	128923453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	97248	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	128926432	128926732	128926619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	94125	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	128930937	128931257	128931067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	89600	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr8	129053712	129054462	129054053	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	32855	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	129076309	129076777	129076518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	55452	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	129114844	129115073	129114937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	93987	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	129336748	129337038	129336807	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-25P	315891	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	129351022	129351309	129351127	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	330165	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	130461810	130462206	130462131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	565169	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	130501651	130501893	130501731	Y	NA	NA	MYC	IMR90	Hi-C	24141950	FAM49B	525482	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	130595168	130595596	130595537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	431779	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	130907129	130907396	130907263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	119979	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	130975001	130975392	130975263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	51983	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	130996669	130996803	130996748	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	30572	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	131054431	131054834	131054758	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	27056	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.41766085925385
chr8	131089372	131089764	131089568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	61997	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	131218440	131218995	131218822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	191065	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr8	131245360	131245556	131245456	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	208350	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	131269679	131269819	131269766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	184087	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	131271729	131272058	131271952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	181848	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	131289962	131290145	131290029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	163761	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	131291188	131291588	131291505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	162318	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	131296023	131296343	131296248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	157563	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	131296989	131297286	131297259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	156620	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	131354482	131354860	131354810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	99046	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	131364558	131364729	131364627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	89177	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	131454495	131454885	131454765	Y	NA	ASAP1	NA	NA	NA	NA	ASAP1	589	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.2784405728359
chr8	133562041	133562364	133562205	Y	HHLA1,KCNQ3,KCNQ3	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC6	123474	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr8	134135187	134135428	134135308	Y	TG,SLA	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	176837	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	134368494	134368766	134368633	Y	NDRG1	CTC-458A3.1,ST13P6	WISP1,NDRG1,TG,ST3GAL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTC-458A3.1	32254	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	134552406	134552812	134552641	Y	ST3GAL1	ST3GAL1	NA	NA	NA	NA	ST3GAL1	29371	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	135035920	135036152	135036031	Y	ST3GAL1	NA	ST3GAL1,ZFAT,ZFAT-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL1	453737	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	135842490	135842788	135842753	Y	NA	MIR30D	ZFAT	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR30D	27302	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr8	135843585	135843751	135843688	Y	ZFAT	MIR30D	ZFAT,MIR30D,MIR30B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR30D	28397	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	135869837	135869951	135869873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR30D	54649	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr8	136247051	136247262	136247121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHDRBS3	220438	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	136314208	136314428	136314340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHDRBS3	153272	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr8	137554492	137554791	137554642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-35P	801754	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	140830815	140831120	140830968	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNK9	117516	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	141172181	141172567	141172375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	294111	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	141212639	141212826	141212733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	253852	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	141474376	141475403	141474918	Y	NA	TRAPPC9,CHRAC1	TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TRAPPC9	7698	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr8	141475903	141476104	141476028	Y	NA	TRAPPC9,CHRAC1	TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TRAPPC9	9225	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	141725005	141725293	141725149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	205608	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	141886994	141887102	141887066	Y	PTK2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	123213	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	141945462	141945818	141945641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	64497	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	141972530	141972881	141972765	Y	NA	PTK2	NA	NA	NA	NA	PTK2	37434	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	142084181	142084412	142084295	Y	PTK2	DENND3	PTK2,DENND3,EIF2C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND3	40965	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	142215999	142216277	142216212	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	90622	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.2784405728359
chr8	142386413	142386490	142386444	Y	GPR20	GPR20,PTP4A3	NA	NA	NA	NA	GPR20	11046	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	142403963	142404243	142404183	Y	PTP4A3	GPR20,PTP4A3	FLJ43860,PSCA,JRK,PTP4A3	IMR90	Hi-C	24141950	PTP4A3	3870	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	143353648	143353818	143353814	Y	TSNARE1,BAI1	NA	NA	NA	NA	NA	TSNARE1	128783	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	143404071	143404506	143404336	Y	TSNARE1	NA	NA	NA	NA	NA	TSNARE1	78095	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	143533998	143534621	143534303	Y	LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1	NA	BAI1,TSNARE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TSNARE1	51397	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	143837804	143838151	143837954	Y	NA	LYPD2,RP11-706C16.7	NA	NA	NA	NA	RP11-706C16.7	4383	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr8	144072877	144073072	144072963	Y	LYPD2,C8orf31	LY6E,RP11-273G15.2,C8orf31	NA	NA	NA	NA	LY6E	24327	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	9.21732777192705
chr8	144094701	144094997	144094860	Y	LY6K,C8orf55	LY6E,RP11-273G15.2,C8orf31	NA	NA	NA	NA	LY6E	2402	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	144107532	144108153	144107940	Y	MAFA	LY6E,RP11-273G15.2,C8orf31	NA	NA	NA	NA	RP11-273G15.2	9678	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	144112654	144112974	144112830	Y	CYP11B2	LY6E,RP11-273G15.2,C8orf31	NA	NA	NA	NA	C8orf31	5652	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr8	144301806	144302247	144302025	Y	MAFA	ZFP41,GLI4	NA	NA	NA	NA	ZFP41	25033	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr8	144302525	144302816	144302585	Y	LY6H,LY6H,LY6H	ZFP41,GLI4	NA	NA	NA	NA	ZFP41	24464	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr8	144328155	144328364	144328211	Y	NA	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	ZFP41	875	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.8998334563366
chr8	144785317	144785390	144785376	Y	NA	ZNF707,MAPK15,FAM83H,FAM83H-AS1	NA	NA	NA	NA	MAPK15	11039	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	144799188	144799437	144799334	Y	MAPK15	ZNF707,MAPK15,FAM83H,FAM83H-AS1	NA	NA	NA	NA	MAPK15	2759	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	144948428	144948782	144948624	Y	EPPK1	PUF60,NRBP2,EPPK1	NRBP2	IMR90	Hi-C	24141950	EPPK1	1850	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr8	144950990	144951185	144951055	Y	C8orf73,NAPRT1,FAM83H,EXOSC4,CYC1,SCRIB,PUF60,PUF60,EPPK1	PUF60,NRBP2,EPPK1	NRBP2,PLEC,LOC100128338,FAM83H	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPPK1	358	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	145030645	145030911	145030698	Y	NA	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	17991	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr8	145040615	145041072	145040959	Y	GSDMD,EEF1D,PARP10	PLEC,GRINA,PARP10	NA	NA	NA	NA	PLEC	7830	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr8	145070098	145070262	145070188	Y	NA	PLEC,GRINA,PARP10,OPLAH	NA	NA	NA	NA	GRINA	7872	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	145257344	145257608	145257476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHARPIN	96317	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	145911932	145912089	145912059	Y	SCRT1,KIFC2,LRRC24,ZNF34	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF34	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	2738	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	145938520	145938651	145938564	Y	NA	ARHGAP39,ZNF251	NA	NA	NA	NA	ARHGAP39	29326	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr8	146010487	146010786	146010731	Y	NA	ZNF251,RPL8,ZNF7	NA	NA	NA	NA	ZNF34	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	278768	279182	278781	Y	DOCK8,DOCK8	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK8	65914	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	545729	545758	545741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	77438	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr9	614528	614756	614656	Y	DOCK8,C9orf66,KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	146237	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	708345	708423	708359	Y	KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	240054	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	972038	972418	972053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMRT2	75936	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr9	2875811	2876206	2875956	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	33570	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	3450123	3450354	3450276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX3	73650	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	4086123	4086410	4086330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A1	402034	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	4162852	4162875	4162864	Y	GLIS3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A1	325569	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	4241498	4241696	4241599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A1	246748	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	4340074	4340431	4340362	Y	NA	NA	GLIS3,RFX3,GLIS3-AS1,KIAA0020	IMR90	Hi-C	24141950	SLC1A1	148013	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.0356548058345
chr9	4656742	4656927	4656747	Y	PPAPDC2,CDC37L1,C9orf68	PPAPDC2,CDC37L1	NA	NA	NA	NA	PPAPDC2	3371	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	4738592	4738723	4738708	Y	NA	AK3	NA	NA	NA	NA	AK3	1320	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	4855592	4855625	4855609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCL1	64723	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	5459353	5459726	5459436	Y	JAK2,KIAA1432,C9orf46,CD274	CD274,PDCD1LG2	PDCD1LG2	IMR90	Hi-C	24141950	CD274	10850	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	5460253	5460626	5460389	Y	JAK2,KIAA1432,C9orf46,CD274	CD274,PDCD1LG2	PDCD1LG2	IMR90	Hi-C	24141950	CD274	11750	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	5558340	5558581	5558428	Y	CD274,KIAA2026,KIAA1432	PDCD1LG2	NA	NA	NA	NA	PDCD1LG2	49795	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	5586544	5586797	5586563	Y	C9orf46,CD274	KIAA1432	NA	NA	NA	NA	KIAA1432	40228	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	5627107	5627559	5627241	Y	CD274,RANBP6,KIAA2026,KIAA1432	KIAA1432	NA	NA	NA	NA	KIAA1432	82	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	5879621	5879741	5879699	Y	NA	ERMP1	ERMP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	ERMP1	48504	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	6485944	6485989	6485946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UHRF2	74793	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	6488249	6488567	6488283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UHRF2	77098	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	6564380	6564534	6564488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-106A1.2	72605	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,GLDC,RP11-390F4.6,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr9	6926338	6926600	6926461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4C	207475	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	14322295	14322910	14322674	Y	ZDHHC21,NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC21	368559	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	16729817	16729878	16729869	Y	BNC2	NA	NA	NA	NA	NA	BNC2	138963	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	16869534	16869976	16869661	Y	BNC2	BNC2	NA	NA	NA	NA	BNC2	693	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	18718417	18718817	18718751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-296P7.4	306073	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr9	21096394	21096639	21096525	Y	KIAA1797	IFNB1	MLLT3,KIAA1797	IMR90	Hi-C	24141950	IFNB1	20451	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	21695810	21696232	21696052	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	104310	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr9	21696521	21696698	21696606	Y	IFNA6,IFNA1	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	103844	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	27333351	27333416	27333383	Y	IFT74,IFT74,MOBKL2B,C9orf72,C9orf72	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	194363	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	27365157	27365383	27365271	Y	MOBKL2B	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	162396	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr9	27416206	27416570	27416389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	111209	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	27434079	27434197	27434145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	93582	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.79626797575315
chr9	29826048	29826378	29826215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P2	1003845	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	29826427	29826586	29826507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P2	1003637	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	32437038	32437275	32437091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACO1	54420	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	33023891	33023961	33023926	Y	NA	APTX,DNAJA1	NA	NA	NA	NA	DNAJA1	682	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	33028063	33028460	33028077	Y	NA	APTX,DNAJA1,SMU1	NA	NA	NA	NA	DNAJA1	4854	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	33159697	33160189	33160012	Y	NA	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	5165	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	33160944	33161390	33161236	Y	DNAJA1,SMU1,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	3964	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	33162668	33163130	33162954	Y	DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	2224	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	33164497	33164994	33164772	Y	APTX,APTX,APTX,SMU1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	360	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	33165457	33166051	33165900	Y	DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	103	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	3.41766085925385
chr9	33172218	33172440	33172320	Y	NA	B4GALT1,SPINK4	B4GALT1,SPINK4	IMR90	Hi-C	24141950	B4GALT1	6864	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	33268680	33268843	33268732	Y	NA	BAG1,CHMP5,NFX1	NA	NA	NA	NA	CHMP5	5740	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	34681857	34682174	34682025	Y	ARID3C,IL11RA,IL11RA	SIGMAR1,GALT,IL11RA,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5	NA	NA	NA	NA	RP11-195F19.5	17748	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	35114116	35114547	35114222	Y	DNAJB5,KIAA1539	VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B	NA	NA	NA	NA	FAM214B	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	35516545	35516820	35516591	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	86547	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	35518041	35518590	35518314	Y	CREB3,VCP,STOML2,RUSC2	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	84777	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	35520478	35520852	35520494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	82515	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.8285238446676
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr9	35726275	35726587	35726326	Y	NA	TPM2,CREB3,TLN1,RGP1,GBA2	NA	NA	NA	NA	CREB3	3745	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr9	35769980	35770349	35770169	Y	NA	CREB3,TLN1,RGP1,GBA2,TMEM8B,HINT2	NA	NA	NA	NA	GBA2	21997	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	36231547	36231666	36231607	Y	NA	CLTA,RNU4-53P	NA	NA	NA	NA	RNU4-53P	34114	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	36232965	36233105	36233040	Y	NA	CLTA,RNU4-53P	NA	NA	NA	NA	RNU4-53P	32675	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	36764220	36764685	36764538	Y	NA	NA	MELK	IMR90	Hi-C	24141950	MELK	193361	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	36764861	36764955	36764921	Y	RNF38	NA	MELK	IMR90	Hi-C	24141950	MELK	194002	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	36765862	36766252	36766147	Y	RNF38,RNF38	NA	MELK	IMR90	Hi-C	24141950	MELK	195003	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	36924974	36925090	36925030	Y	MELK	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	193446	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	37036641	37037011	37036829	Y	ZCCHC7,ZBTB5,PAX5	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	81525	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	37197498	37198123	37197885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	78962	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	37198449	37198887	37198604	Y	ZBTB5,ZCCHC7	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	79913	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	37324373	37324708	37324405	Y	PAX5,ZCCHC7,ZBTB5,FBXO10	NA	NA	NA	NA	NA	GRHPR	95955	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	37771609	37771892	37771762	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	26607	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	37773119	37773290	37773253	Y	FRMPD1	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	25209	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	37835930	37836292	37836154	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	36496	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr9	37924173	37924321	37924247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	124739	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	37938183	37938323	37938277	Y	SHB	NA	NA	NA	NA	NA	SHB	128887	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	38008217	38008489	38008387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHB	58721	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	38066980	38067628	38067261	Y	SHB	NA	NA	NA	NA	NA	SHB	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	68299584	68299663	68299624	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	153712	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	68417391	68418146	68417579	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	35229	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr9	68419808	68420298	68419990	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	33077	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	68423908	68424365	68424207	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	29010	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr9	68433806	68433981	68433894	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	19394	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	68436364	68436652	68436508	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	16723	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	12.3242921894306
chr9	71321592	71321773	71321683	Y	NA	PIP5K1B	NA	NA	NA	NA	PIP5K1B	3017	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	71336446	71336479	71336451	Y	NA	PIP5K1B	NA	NA	NA	NA	PIP5K1B	17871	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	71393578	71393897	71393631	Y	FAM122A	FAM122A	NA	NA	NA	NA	FAM122A	614	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	71413577	71413589	71413582	Y	NA	FAM122A	NA	NA	NA	NA	FAM122A	20613	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chr9	71476577	71476832	71476704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM122A	83613	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr9	71728196	71728449	71728285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FXN	80021	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	71734977	71735184	71735061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FXN	86802	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	71972716	71972762	71972739	Y	FAM189A2	NA	NA	NA	NA	NA	FXN	324541	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	72344996	72345326	72345161	Y	NA	PTAR1	NA	NA	NA	NA	PTAR1	27549	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	73025885	73026723	73026293	Y	KLF9	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	817	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.79626797575315
chr9	73035561	73035945	73035863	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8021	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr9	74103835	74104234	74104035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL35AP21	98283	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	74293239	74293379	74293310	Y	TMEM2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL35AP21	90722	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	75172533	75172850	75172692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND5	194370	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	77765912	77766310	77766149	Y	OSTF1	NA	NA	NA	NA	NA	OSTF1	64453	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	82213229	82213622	82213243	Y	NA	TLE4	NA	NA	NA	NA	TLE4	28541	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	84371953	84371963	84371958	Y	FAM75D1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-154D17.1	69325	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	86911270	86911583	86911478	Y	NA	SLC28A3	NA	NA	NA	NA	SLC28A3	42089	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	88544402	88544561	88544480	Y	NA	NAA35	NA	NA	NA	NA	NAA35	9500	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	88588670	88588806	88588674	Y	NA	NAA35	NA	NA	NA	NA	NAA35	34609	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	89422548	89422732	89422697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAS1	137372	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	89626902	89626982	89626949	Y	NA	CDC20P1	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	2335	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr9	89627893	89628105	89627999	Y	NA	CDC20P1	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	3326	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	90117444	90117744	90117580	Y	DAPK1	DAPK1,RP11-40C6.2	NA	NA	NA	NA	DAPK1	7301	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	90133886	90134005	90133888	Y	NA	DAPK1,RP11-40C6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	4212	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	90179803	90180066	90179945	Y	DAPK1,CTSL1	RP11-40C6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	41586	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	90216174	90216503	90216403	Y	DAPK1,CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	77957	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr9	90226779	90227017	90226862	Y	DAPK1,CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	88562	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	90300483	90300753	90300664	Y	CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	162266	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	90728260	90728622	90728394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK20	140592	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr9	91146731	91147178	91146985	Y	NA	NXNL2	NA	NA	NA	NA	NXNL2	838	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	91147328	91147523	91147436	Y	NXNL2	NXNL2	NA	NA	NA	NA	NXNL2	493	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	91148176	91148373	91148274	Y	NA	NXNL2	NA	NA	NA	NA	NXNL2	160	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	92218643	92218902	92218819	Y	GADD45G	GADD45G	NA	NA	NA	NA	GADD45G	715	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	92887274	92887574	92887411	Y	NA	NA	UNQ6494,SYK,DIRAS2	IMR90	Hi-C	24141950	DIRAS2	515812	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	93880356	93880696	93880620	Y	NA	NA	LOC100129316,AUH,ROR2	IMR90	Hi-C	24141950	AUH	241499	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr9	93892173	93892363	93892269	Y	NA	NA	LOC100129316,AUH	IMR90	Hi-C	24141950	AUH	229832	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	93955991	93956732	93956142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	165463	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr9	93959484	93959867	93959681	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	162328	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	93975322	93975401	93975365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	146794	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	94565955	94566119	94566028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROR2	144325	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	94587450	94587551	94587492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROR2	122893	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	94872861	94873095	94872978	Y	NA	SPTLC1	NA	NA	NA	NA	SPTLC1	2571	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	95029374	95029660	95029516	Y	NA	IARS	NA	NA	NA	NA	IARS	24378	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	95055002	95055331	95055316	Y	IPPK	IARS,CENPP,NOL8	NA	NA	NA	NA	IARS	964	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	95383874	95384172	95384023	Y	NA	IPPK	NA	NA	NA	NA	IPPK	46375	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	95860928	95861146	95861059	Y	IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1	SUSD3,C9orf89,NINJ1	NA	NA	NA	NA	C9orf89	4428	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	96845736	96845997	96845867	Y	NA	CYCSP24	NA	NA	NA	NA	CYCSP24	47424	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	10486	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	9706	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr9	97273853	97274253	97274073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBP1	126278	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	97574717	97574955	97574837	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	87734	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	97630074	97630491	97630387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	143091	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	97633078	97633398	97633277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	146095	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	97679079	97679413	97679326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	192096	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr9	97881296	97881429	97881363	Y	FBP1	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	196562	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	98054647	98055067	98054952	Y	NA	FANCC	NA	NA	NA	NA	FANCC	22924	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	98237628	98237804	98237716	Y	NA	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	39535	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	98642406	98642593	98642483	Y	PTCH1,PTCH1,C9orf102	LINC00476	NA	NA	NA	NA	LINC00476	6147	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	99106686	99107122	99106995	Y	NA	SLC35D2	NA	NA	NA	NA	SLC35D2	36870	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	2936	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr9	99182775	99182932	99182834	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	4164	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	100565577	100566264	100565821	Y	CORO2A,FOXE1	NA	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	XPA	107938	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr9	100681065	100681283	100681122	Y	TSTD2,XPA,TRIM14,TRIM14,C9orf156	C9orf156	NA	NA	NA	NA	C9orf156	1569	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	100772550	100772875	100772560	Y	NA	ANP32B,NANS	NANS,TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	ANP32B	28907	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	101136906	101136938	101136922	Y	ANKS6	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	120991	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	101372669	101373069	101372768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABBR2	96410	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	102391563	102391903	102391698	Y	ERP44,NR4A3	NA	SEC61B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-554F20.1	188268	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	102580616	102580992	102580865	Y	NA	RP11-554F20.1,NR4A3	NA	NA	NA	NA	RP11-554F20.1	445	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr9	102621794	102622137	102621866	Y	NA	RP11-554F20.1,NR4A3,STX17	NA	NA	NA	NA	NR4A3	39657	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	103173830	103174136	103174107	Y	NA	TMEFF1	C9orf30-TMEFF1,TEX10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEFF1	28424	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	105966405	105966781	105966517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC2	887760	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	109975791	109976065	109975989	Y	KLF4	NA	NA	NA	NA	NA	RAD23B	67353	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	110512153	110512586	110512216	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-438P9.1	217482	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	111774521	111775173	111774726	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	712	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	112580267	112580505	112580395	Y	PALM2	PALM2-AKAP2,AKAP2	C9orf152	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP2	39498	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	112802389	112802506	112802448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	214414	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	113493915	113494112	113494002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	476995	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	113753501	113753784	113753656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0368	491241	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	114505631	114505796	114505739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG10	84016	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	114678571	114678728	114678577	Y	NA	UGCG	NA	NA	NA	NA	UGCG	21525	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	114792518	114792641	114792625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	135472	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	114808602	114808743	114808666	Y	PTGR1,PTGR1,UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	126945	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	115031676	115032066	115031959	Y	KIAA1958	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP3	61881	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	116011576	116011925	116011593	Y	NA	FKBP15,SLC31A1,PRPF4,CDC26	NA	NA	NA	NA	PRPF4	23698	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	116031847	116032083	116031965	Y	NA	PRPF4,CDC26	NA	NA	NA	NA	PRPF4	3540	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	116281787	116282895	116282664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLE3	110835	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	116728685	116728905	116728795	Y	AMBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF618	92123	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	117131457	117132230	117131898	Y	DFNB31,DFNB31,AKNA	AKNA	NA	NA	NA	NA	AKNA	22455	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	117134599	117134885	117134873	Y	NA	AKNA	NA	NA	NA	NA	AKNA	19800	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	117152820	117152929	117152875	Y	NA	AKNA	NA	NA	NA	NA	AKNA	1756	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	117159955	117160026	117159991	Y	NA	AKNA	NA	NA	NA	NA	AKNA	5270	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	117351016	117351370	117351316	Y	TNFSF8,AKNA,DFNB31,DFNB31,ATP6V1G1	ATP6V1G1,C9orf91	NA	NA	NA	NA	ATP6V1G1	2990	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	117671276	117671580	117671329	Y	DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	206956	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	118350454	118350525	118350489	Y	DEC1	NA	ASTN2,PAPPA,TNC,DEC1,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	471918	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	121571098	121571456	121571292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	1768992	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	123251976	123252022	123252001	Y	CDK5RAP2	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	88426	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr9	123661924	123662231	123662224	Y	NA	PHF19	NA	NA	NA	NA	PHF19	24318	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	124361597	124361984	124361689	Y	NA	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	34261	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.34635124758485
chr9	124383753	124383935	124383823	Y	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	56417	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	124498744	124498978	124498839	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	171408	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	124499221	124499709	124499392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	171885	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr9	125654025	125654372	125654281	Y	NA	RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,RABGAP1	NA	NA	NA	NA	RC3H2	11248	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	126029655	126030141	126030108	Y	NA	STRBP	NA	NA	NA	NA	STRBP	800	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	126297071	126297260	126297221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	268216	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	126644407	126644614	126644564	Y	LHX2	DENND1A	NA	NA	NA	NA	DENND1A	45817	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	126978996	126979273	126979176	Y	DENND1A,NEK6,NEK6	NEK6	DENND1A,NEK6,PSMB7	IMR90	Hi-C	24141950	NEK6	38612	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	127040505	127040685	127040582	Y	NEK6,NEK6	NEK6	NA	NA	NA	NA	NEK6	22620	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	127329970	127330135	127330093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	88611	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr9	127356039	127356231	127356145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	62515	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	127424345	127424738	127424542	Y	NA	MIR181A2HG	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	5599	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	127837483	127837706	127837595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAI	66079	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	127944437	127944756	127944696	Y	NR6A1,GOLGA1,PPP6C,GAPVD1	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	5462	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	127947242	127947259	127947251	Y	NA	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	2959	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	128170862	128170906	128170878	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	148789	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	128172483	128172773	128172647	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	150410	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	5.7996669126732
chr9	128408655	128409172	128408692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	58341	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	129263295	129263658	129263477	Y	FAM125B,RALGPS1,RALGPS1,LMX1B	NA	NA	NA	NA	NA	LMX1B	111064	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	129286019	129286223	129286082	Y	FAM125B,ZBTB43,ZBTB34	NA	NA	NA	NA	NA	LMX1B	88499	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	130328926	130329278	130329070	Y	FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	9990	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	130461605	130461892	130461787	Y	GARNL3,STXBP1,ST6GALNAC6,SLC25A25,PIP5KL1,TTC16	C9orf117,PTRH1,TOR2A	NA	NA	NA	NA	C9orf117	5376	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	130590782	130591142	130590862	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS	CDK9,FPGS,ENG,AK1	NA	NA	NA	NA	ENG	23893	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	130736209	130736450	130736330	Y	NA	PIP5KL1,DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	FAM102A	4342	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	131316865	131317367	131316977	Y	NA	RP11-216B9.6,SPTAN1	NA	NA	NA	NA	SPTAN1	3999	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr9	131637939	131638335	131638137	Y	NA	C9orf114,LRRC8A,CCBL1,PHYHD1	C9orf114,ENDOG	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC8A	4056	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	131929415	131929566	131929473	Y	METTL11A,C9orf106	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8974	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	131988173	131988389	131988342	Y	NA	IER5L	LOC100506190,IER5L,METTL11A,PPP2R4,ASB6,SH3GLB2,CRAT,C9orf106,C9orf50	IMR90,K562,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	IER5L	49633	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	132040752	132040968	132040856	Y	NA	NA	C9orf106,IER5L,LOC100506190,PPP2R4,CRAT,C9orf50,METTL11A	IMR90,MCF7,HELA,K562	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	RP11-65J3.1	51611	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	132115283	132115797	132115318	Y	NA	RP11-65J3.1	PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A,C9orf50	MCF7,HELA,K562,IMR90	ChIA-PET,5C,Hi-C	22265404,22955621,24141950	RP11-65J3.1	22704	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	132145857	132146151	132146146	Y	FAM73B,C9orf106,USP20,USP20,TOR1B,C9orf78,ASB6	NA	C9orf106,LOC100506190,IER5L,C9orf50,PPP2R4,CRAT	IMR90,MCF7,K562,HELA	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	RP11-65J3.1	53278	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	132168772	132168919	132168823	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	74811	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chr9	132241150	132241608	132241414	Y	NA	LINC00963	PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,LOC100506190,C9orf50,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	2122	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	132244062	132244824	132244277	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	332	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	132247452	132247693	132247545	Y	C9orf106	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	3722	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	132257886	132258547	132258348	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	14156	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr9	132319720	132320056	132319894	Y	DOLPP1	NA	FAM73B,DOLPP1,IER5L,LOC100506190,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	75990	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	132331590	132331738	132331651	Y	CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	NA	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ASB6	70706	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	132349858	132350089	132350073	Y	NA	NA	LOC100506190,IER5L,C9orf50	MCF7	ChIA-PET	22265404	ASB6	52355	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	132372165	132372686	132372524	Y	NA	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	29758	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	132385793	132386123	132385875	Y	C9orf106,TOR1B,PRRX2	ASB6,PRRX2	NA	NA	NA	NA	ASB6	16321	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	132512351	132512751	132512561	Y	PTGES	PTGES	NA	NA	NA	NA	PTGES	575	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr9	132514052	132514155	132514104	Y	NA	PTGES,TOR1B	NA	NA	NA	NA	PTGES	726	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr9	132648080	132648314	132648193	Y	ASB6,TOR1B,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf78	51938	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	132772679	132773108	132773032	Y	ASB6,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	FNBP1	30365	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	132976727	132976899	132976847	Y	NA	NCS1	NA	NA	NA	NA	NCS1	43870	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	133565449	133565699	133565571	Y	NA	RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1	NA	NA	NA	NA	EXOSC2	1409	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	134150177	134150420	134150245	Y	RAPGEF1,RAPGEF1,QRFP,FAM78A	FAM78A,PPAPDC3	NA	NA	NA	NA	FAM78A	243	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	134206310	134206319	134206315	Y	NA	PPAPDC3	NUP214,PRRC2B	IMR90	Hi-C	24141950	PPAPDC3	43229	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.071309611669
chr9	134258707	134258891	134258799	Y	NA	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	8589	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	134316967	134317380	134317020	Y	NA	PRRC2B	NA	NA	NA	NA	PRRC2B	49487	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	134510539	134511032	134510903	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	102429	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	134511243	134511633	134511541	Y	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	101828	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	134515858	134516155	134515990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	97306	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	134527071	134527290	134527142	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	86171	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	134537317	134537597	134537547	Y	FAM78A,PRRC2B,RAPGEF1,RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	75864	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	134546094	134546583	134546259	Y	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	66878	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	134552911	134553181	134553024	Y	FAM78A,RAPGEF1,RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	60280	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	134573283	134574205	134573669	Y	FAM78A,RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	39256	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	134582403	134582762	134582583	Y	NA	RAPGEF1	PRRC2B,UCK1,POMT1	IMR90	Hi-C	24141950	RAPGEF1	30699	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	134602820	134603314	134602971	Y	PRRC2B,RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	10147	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	134610888	134611363	134611119	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	2098	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	134613837	134614689	134614350	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	376	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chr9	134774819	134775116	134774968	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	161358	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	134913456	134913470	134913463	Y	NA	MED27	NA	NA	NA	NA	MED27	39825	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	135068223	135068386	135068305	Y	NTNG2	NA	NA	NA	NA	NA	MED27	114928	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	135197315	135197652	135197484	Y	NA	SETX	NA	NA	NA	NA	SETX	30720	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	135481058	135481229	135481144	Y	CEL	NA	NA	NA	NA	NA	GTF3C4	62193	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	135995063	135995322	135995085	Y	RALGDS,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	41979	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	136022907	136023306	136022967	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	13995	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	136075454	136075720	136075558	Y	NA	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	GBGT1	38122	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	2.071309611669
chr9	136387799	136387823	136387811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REXO4	106635	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	136720858	136721171	136721081	Y	SLC2A6,RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	134555	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	136739075	136739598	136739373	Y	VAV2	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	116128	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr9	136856624	136856782	136856656	Y	VAV2	VAV2,LINC00094	NA	NA	NA	NA	VAV2	898	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	136996268	136996567	136996488	Y	NA	WDR5	WDR5	K562	ChIA-PET	22265404	WDR5	1920	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	137030495	137030803	137030732	Y	NA	WDR5	NA	NA	NA	NA	WDR5	32008	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	137220336	137220598	137220352	Y	NA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	13392	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	137247900	137248164	137247916	Y	NA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	40956	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chr9	138348639	138348707	138348673	Y	NA	MRPS2,C9orf116	NA	NA	NA	NA	MRPS2	41123	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	138986008	138986159	138986118	Y	NACC2	NACC2,C9orf69	NA	NA	NA	NA	NACC2	877	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	139613892	139613944	139613895	Y	NA	AGPAT2,FAM69B,SNHG7	NA	NA	NA	NA	SNHG7	6692	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	139826661	139826850	139826762	Y	NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2	MIR4479,FBXW5,PTGDS	NA	NA	NA	NA	FBXW5	10298	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	140023271	140023604	140023504	Y	EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2	MAN1B1,DPP7,MIR3621	NA	NA	NA	NA	DPP7	15642	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7,MIR3621	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	6.8353217185077
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	RNF208	3555	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	1.34635124758485
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	140189199	140189592	140189229	Y	NA	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	5111	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chr9	140205908	140206072	140205991	Y	NRARP	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	11205	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	140274735	140275080	140274933	Y	CACNA1B,PTGDS,ABCA2,GRIN1,RNF208,PNPLA7	EXD3,NOXA1	NA	NA	NA	NA	EXD3	40634	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chr9	140388730	140388770	140388753	Y	FUT7,C9orf140,UAP1L1,DPP7,NDOR1,NOXA1	NA	NA	NA	NA	NA	PNPLA7	54216	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	140412995	140413413	140413155	Y	CACNA1B,ABCA2,ENTPD2,GRIN1,RNF208,PNPLA7	PNPLA7,MRPL41	NA	NA	NA	NA	PNPLA7	29573	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	140526461	140526811	140526551	Y	NA	ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	EHMT1	15017	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chr9	140689053	140689448	140689207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHMT1	177609	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	3732525	3732707	3732561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	102876	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chrX	8955651	8955925	8955865	Y	TBL1X	NA	TBL1X	IMR90	Hi-C	24141950	KAL1	257424	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chrX	9433838	9434425	9434365	Y	TBL1X	TBL1X	NA	NA	NA	NA	TBL1X	4503	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	9536624	9537203	9536862	Y	TBL1X,TBL1X	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1X	107289	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chrX	9786668	9786951	9786810	Y	NA	SHROOM2,RP11-98L4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-98L4.1	1159	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chrX	10712546	10712862	10712704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1	136911	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	13119924	13120175	13120039	Y	NA	NA	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM9C	59123	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	13416625	13416882	13416754	Y	NA	NA	FAM9C,TMSB4X,LOC100133123	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TCEANC	252343	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	13687345	13687715	13687534	Y	TCEANC,RAB9A	TCEANC,RAB9A	NA	NA	NA	NA	RAB9A	17529	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	17395556	17395647	17395622	Y	NHS	NHS	NA	NA	NA	NA	NHS	4013	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	18693104	18693424	18693141	Y	PHKA2,CDKL5	NA	NA	NA	NA	NA	CDKL5	251401	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chrX	18904504	18904672	18904535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHKA2	96044	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	19407416	19407434	19407425	Y	NA	PDHA1	NA	NA	NA	NA	PDHA1	47405	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	19774987	19775285	19775138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	128434	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	19859063	19859320	19859184	Y	SH3KBP1	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	44399	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chrX	19865115	19865333	19865186	Y	SH3KBP1	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	38386	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	19874693	19875106	19874808	Y	SH3KBP1	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	28613	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	19893071	19893438	19893374	Y	NA	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	10281	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chrX	20154251	20154286	20154269	Y	NA	EIF1AX	NA	NA	NA	NA	EIF1AX	3676	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	20283183	20283718	20283506	Y	SH3KBP1,RPS6KA3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA3	0	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	21947998	21948242	21948120	Y	NA	SMS	MBTPS2,SMS	IMR90	Hi-C	24141950	SMS	8449	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	22013670	22013825	22013692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMS	56979	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	22152966	22153318	22153142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMS	196275	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	22346680	22346767	22346724	Y	NA	NA	PHEX	IMR90	Hi-C	24141950	SMS	389989	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	22670840	22671069	22670982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMS	714149	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	22909771	22909782	22909777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX4	770597	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	23368174	23368523	23368350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX4	311856	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	24187705	24188069	24187889	Y	NA	ZFX	NA	NA	NA	NA	ZFX	22415	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	39619041	39619197	39619186	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	26193	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	39646201	39646652	39646229	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	811	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chrX	39767458	39767957	39767519	Y	NA	NA	BCOR	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP1	122068	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chrX	39865489	39865898	39865566	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	168684	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chrX	39872499	39873023	39872596	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	161559	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	39873339	39874259	39873676	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	160323	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	39968308	39968728	39968376	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65854	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	40005202	40005365	40005305	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	29217	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	40034694	40035505	40035056	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	112	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chrX	40691770	40692090	40691930	Y	NA	MKRN4P	NA	NA	NA	NA	MKRN4P	32	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	40693990	40694519	40694253	Y	NA	MKRN4P	NA	NA	NA	NA	MKRN4P	2252	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	40943673	40944218	40943773	Y	CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X	USP9X	NA	NA	NA	NA	USP9X	785	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	41182589	41182765	41182693	Y	NA	DDX3X	DDX3X	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DDX3X	7886	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	41304581	41304641	41304611	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3X	113930	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	41480372	41480697	41480463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3X	289721	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAOB	148897	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chrX	44733657	44734406	44734027	Y	KDM6A	KDM6A	NA	NA	NA	NA	KDM6A	2900	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chrX	45645081	45645275	45645187	Y	NA	MIR221,MIR222	NA	NA	NA	NA	MIR222	40551	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	45702877	45703292	45703236	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	5628	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	46120012	46120235	46120091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	177914	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chrX	46278987	46279293	46279130	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18856	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chrX	46316672	46316948	46316811	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18523	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	47016809	47017199	47017004	Y	NA	RBM10,NDUFB11,UBA1	NA	NA	NA	NA	NDUFB11	13906	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chrX	48748801	48749222	48749175	Y	NA	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2	NA	NA	NA	NA	PQBP1	3973	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	49012442	49012818	49012676	Y	NA	GPKOW,PLP2,PRICKLE3	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	13455	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	51633926	51634124	51634025	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGED1	89823	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	52004971	52005124	52005057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XAGE2B	105049	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chrX	52949996	52950343	52950129	Y	TSPYL2,KDM5C,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	31660	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	45908	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chrX	53155305	53155690	53155322	Y	XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2	TSPYL2,LINC01155	KDM5C	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01155	33978	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chrX	53172968	53173150	53172985	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01155	51641	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chrX	53467837	53468052	53468003	Y	KDM5C	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	HSD17B10	8517	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	53468564	53468782	53468716	Y	IQSEC2	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	HSD17B10	9244	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chrX	53740949	53741249	53741172	Y	KDM5C,PHF8	HUWE1	HUWE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	HUWE1	29276	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	53741584	53742291	53741941	Y	KDM5C,SMC1A,HUWE1,PHF8	HUWE1	HUWE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	HUWE1	29911	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	54207248	54207470	54207359	Y	NA	FAM120C	NA	NA	NA	NA	FAM120C	244	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	54665732	54666388	54666226	Y	NA	NA	ITIH6,MAGED2	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNL3L	111088	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	56269843	56269989	56269918	Y	NA	KLF8	NA	NA	NA	NA	KLF8	12989	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chrX	57420009	57420263	57420031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAAH2	108870	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	62728532	62728688	62728610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-357C3.3	50263	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	67291116	67291490	67291298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPHN1	360265	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chrX	67382331	67382438	67382385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPHN1	269317	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	EFNB1	NA	NA	NA	NA	EFNB1	42163	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.6213928835007
chrX	69653784	69653948	69653832	Y	NA	DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8763	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	69654278	69654566	69654417	Y	DLG3	DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8145	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	70275409	70275661	70275633	Y	NA	RNU1-56P,SNX12,FOXO4,CXorf65	NA	NA	NA	NA	SNX12	10612	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chrX	70401853	70402134	70401993	Y	IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO	NLGN3	NA	NA	NA	NA	NLGN3	39172	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chrX	70640504	70640913	70640718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF1	56390	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chrX	71402877	71403170	71402921	Y	NA	PIN4	NA	NA	NA	NA	PIN4	3674	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	71635914	71636037	71635976	Y	HDAC8	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4X	140764	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	73236075	73236382	73236224	Y	CHIC1	RP13-36G14.3	NA	NA	NA	NA	RP13-36G14.3	47536	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	73338544	73338621	73338582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USMG5P1	53104	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	73340869	73341139	73340910	Y	RLIM	NA	NA	NA	NA	NA	USMG5P1	50586	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chrX	73507125	73507445	73507287	Y	NA	FTX	NA	NA	NA	NA	FTX	3964	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chrX	73755621	73755953	73755678	Y	RLIM	NA	NA	NA	NA	NA	RLIM	76499	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	73833460	73833840	73833652	Y	NA	RLIM	NA	NA	NA	NA	RLIM	1008	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chrX	74143858	74143903	74143869	Y	KIAA2022	NA	NA	NA	NA	NA	ABCB7	230664	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	74960822	74961039	74960972	Y	NA	TTC3P1	NA	NA	NA	NA	TTC3P1	3710	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chrX	77226253	77226302	77226278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP7A	62059	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chrX	78006102	78006454	78006278	Y	LPAR4	NA	NA	NA	NA	NA	TAF9B	612899	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	79827525	79827860	79827693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRWD3	235327	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	79830053	79830147	79830110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRWD3	233040	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	85280770	85281145	85280958	Y	CHM	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	19421	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.72495836408415
chrX	87351546	87351899	87351791	Y	NA	RP3-452M16.1	NA	NA	NA	NA	RP3-452M16.1	1320	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	92479084	92479478	92479382	Y	NA	RP13-88F20.1	NA	NA	NA	NA	RP13-88F20.1	1070	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chrX	93614717	93614730	93614724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAP1L3	688150	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	94559694	94559705	94559699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	1377957	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	100792680	100793554	100793013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARMCX6	77437	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chrX	106595212	106595632	106595477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147542	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chrX	106595667	106595822	106595802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147997	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chrX	106919078	106919623	106919349	Y	TSC22D3,TSC22D3	PRPS1	TSC22D3,PRPS1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	49341	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	106920003	106920801	106920325	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	50266	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chrX	106954265	106954667	106954451	Y	TSC22D3,TSC22D3,ATG4A	NA	NA	NA	NA	NA	TSC22D3	63905	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	107639720	107640073	107639886	Y	COL4A6	COL4A5	NA	NA	NA	NA	COL4A5	41001	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chrX	110863259	110863845	110863518	Y	NA	EIF4BP7,ALG13	NA	NA	NA	NA	EIF4BP7	542	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	112084647	112084962	112084847	Y	AMOT,AMOT	AMOT	NA	NA	NA	NA	AMOT	2604	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chrX	114819160	114819326	114819285	Y	NA	PLS3	NA	NA	NA	NA	PLS3	25659	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	115238483	115238690	115238635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	155061	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	116006387	116006717	116006592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	922965	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	118149361	118149839	118149621	Y	LONRF3	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P28	202906	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	119385485	119385791	119385733	Y	NA	NKAPP1,ZBTB33	NA	NA	NA	NA	ZBTB33	2878	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chrX	122898767	122899176	122898998	Y	NA	THOC2	NA	NA	NA	NA	THOC2	33861	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.93208932525105
chrX	128364824	128364943	128364883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA1	290534	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	128656237	128656454	128656444	Y	NA	SMARCA1,OCRL	NA	NA	NA	NA	SMARCA1	760	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338
chrX	128893807	128894053	128893941	Y	ELF4,ELF4,SASH3	NA	SASH3	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC9	81832	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	129118011	129118370	129118054	Y	NA	BCORL1	BCORL1,UTP14A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCORL1	4928	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	129400519	129400680	129400638	Y	NA	ZNF280C	NA	NA	NA	NA	ZNF280C	193	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	129982936	129983220	129983074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX2	51988	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	130706744	130706880	130706830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGSF1	175067	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chrX	130880517	130880959	130880705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MST4	274334	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	132089755	132090160	132089782	Y	NA	HS6ST2	NA	NA	NA	NA	HS6ST2	3263	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	133305762	133306165	133305903	Y	PHF6,CCDC160	NA	NA	NA	NA	NA	GPC3	187840	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.2071309611669
chrX	134048475	134048529	134048502	Y	MOSPD1	MOSPD1	NA	NA	NA	NA	MOSPD1	1178	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	134138094	134138444	134138243	Y	NA	FAM127C,FAM127A,FAM127B	NA	NA	NA	NA	FAM127C	16115	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	135631473	135631677	135631628	Y	HTATSF1	VGLL1	NA	NA	NA	NA	VGLL1	19162	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	149862815	149863170	149863006	Y	MTMR1	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	3380	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	149863588	149863865	149863755	Y	MTM1,MTMR1	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	4153	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	149865562	149865927	149865671	Y	NA	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	6127	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	150047001	150047063	150047035	Y	NA	CD99L2	NA	NA	NA	NA	CD99L2	18226	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chrX	151149745	151149882	151149808	Y	NA	GABRE	NA	NA	NA	NA	GABRE	8593	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	152127371	152127756	152127434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNMA3	95010	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrX	153596671	153598676	153598064	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	2330	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chrY	2872046	2872325	2872195	Y	RPS4Y1,ZFY,ZFY	ZFY-AS1,LINC00278	NA	NA	NA	NA	LINC00278	3093	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.31069644175035
chrY	15207344	15207441	15207401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3Y	193325	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.51782740291725
chrY	15547664	15548123	15547956	Y	TMSB4Y	UTY	NA	NA	NA	NA	UTY	42430	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrY	17567835	17568213	17567863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGKP1	818859	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.10356548058345
chrY	28555183	28555400	28555298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF1AY	5819572	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	6.11036335442355
chrY	28555690	28555797	28555743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF1AY	5820079	CAGE	SCH	hg19	FANTOM5	0.4142619223338