chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	C1orf159	NA	NA	NA	NA	C1orf159	44755	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr1	2232428	2232896	2232683	Y	SKI,TNFRSF14	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	88250	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	3817648	3818071	3817969	Y	LRRC47	CEP104,DFFB,C1orf174	NA	NA	NA	NA	C1orf174	2791	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	6053603	6054107	6053839	Y	CHD5,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2	KCNAB2,NPHP4	NA	NA	NA	NA	NPHP4	3070	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr1	6894689	6894717	6894703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	51305	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	8810273	8810466	8810370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	65236	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	8986862	8987075	8987025	Y	NA	ENO1	SLC2A5,SLC2A7	IMR90	Hi-C	24141950	ENO1	49554	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	9760502	9760837	9760631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3CD	50712	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	11798209	11798600	11798405	Y	FBXO6,AGTRAP,TNFRSF8,TNFRSF1B,MFN2,MTHFR,CLCN6	MAD2L2,AGTRAP	NA	NA	NA	NA	AGTRAP	4068	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	12240401	12240902	12240499	Y	AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF1B	VPS13D	VPS13D	IMR90	Hi-C	24141950	VPS13D	47222	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	16176617	16176801	16176705	Y	RSC1A1,C1orf64,SPEN	RP11-169K16.8,SPEN	NA	NA	NA	NA	SPEN	4258	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	NA	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP13A2	104719	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	NA	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	ATP13A2	95640	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr1	17767804	17768710	17768126	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	3584	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	20204786	20204981	20204970	Y	OTUD3	OTUD3	NA	NA	NA	NA	OTUD3	2025	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr1	21194399	21194490	21194445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	82583	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	21664400	21664833	21664668	Y	EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	5164	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	22366226	22366841	22366516	Y	USP48,ZBTB40	LINC00339,CDC42	CDC42	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42	10279	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr1	24854734	24855006	24854870	Y	NA	RCAN3	NA	NA	NA	NA	RCAN3	27347	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	26615016	26615421	26615346	Y	SH3BGRL3,ARID1A,UBXN11,UBXN11	SH3BGRL3,CD52,UBXN11	NA	NA	NA	NA	SH3BGRL3	11349	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr1	27165490	27165816	27165600	Y	NA	ZDHHC18,GPN2	NA	NA	NA	NA	ZDHHC18	14289	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	GPN2	22861	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr1	27848725	27849287	27848935	Y	WDTC1,SYTL1,FAM76A	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	34056	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	6.86700531967237
chr1	27916292	27916674	27916513	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	12268	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr1	29370205	29370321	29370263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-604A21.1	63085	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	90728	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr1	31956203	31956482	31956384	Y	PEF1	NA	SERINC2,SNRNP40,HCRTR1,NKAIN1,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1	IMR90	Hi-C	24141950	PEF1	152015	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	32423598	32423720	32423682	Y	PTP4A2	PTP4A2	SPOCD1,KHDRBS1,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,PTP4A2,TMEM39B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	15141	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	32715599	32716062	32715681	Y	PTP4A2,BSDC1,LCK,LCK	IQCC,EIF3I,TMEM234,LCK,HDAC1	NA	NA	NA	NA	LCK	759	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr1	33131314	33131452	33131383	Y	NA	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	RBBP4	16571	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	33428474	33429020	33428770	Y	NA	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	188	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	36103028	36103196	36103152	Y	NA	PSMB2	TFAP2E	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB2	2249	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	36555347	36555633	36555606	Y	STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2	ADPRHL2	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	2871	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	36952484	36952865	36952715	Y	MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	MRPS15	NA	NA	NA	NA	MRPS15	24446	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	39662647	39663006	39662738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	117659	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	39874208	39874673	39874342	Y	KIAA0754	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	57	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	41501908	41501999	41501966	Y	SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	203827	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	41564044	41564297	41564171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	141529	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	41622480	41622650	41622563	Y	NA	NA	CTPS,LOC100507178	IMR90	Hi-C	24141950	SCMH1	83176	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	41633074	41633562	41633301	Y	SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	72264	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO6	302257	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr1	42180382	42180624	42180465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	318972	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	42354251	42354647	42354385	Y	RIMKLA,HIVEP3	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	144949	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	43406108	43407009	43406836	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	15521	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	44232152	44232509	44232262	Y	SLC6A9,IPO13,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	62657	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	47729037	47729382	47729210	Y	NA	TAL1,STIL	TAL1	K562	ChIA-PET	22265404	TAL1	33145	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	51454917	51455119	51455049	Y	NA	FAF1,CDKN2C	NA	NA	NA	NA	CDKN2C	30500	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	51809780	51810107	51809799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF11	109837	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	54441729	54442008	54441915	Y	NA	HSPB11,LRRC42	NA	NA	NA	NA	LRRC42	31979	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	54873075	54873515	54873406	Y	SSBP3,SSBP3	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	3637	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	54941159	54941412	54941231	Y	TCEANC2,SSBP3,SSBP3	NA	TMEM59,TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	64007	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	54941776	54941995	54941811	Y	NA	NA	TMEM59,TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2	IMR90	Hi-C	24141950	SSBP3	64624	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	59910700	59911009	59910820	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	150390	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	61415107	61415301	61415257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	86176	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	65387772	65388547	65388120	Y	JAK1	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	41640	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	67460593	67460710	67460683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIER1	72015	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr1	68961350	68961555	68961472	Y	NA	DEPDC1	NA	NA	NA	NA	DEPDC1	446	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	70691921	70692281	70691982	Y	ANKRD13C,LRRC40,SRSF11	LRRC40,SRSF11	NA	NA	NA	NA	SRSF11	22556	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	78132928	78133068	78133059	Y	NA	ZZZ3	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	14036	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	78240205	78240392	78240373	Y	NA	USP33,RP4-706L14.2,FAM73A	USP33,ZZZ3,FAM73A	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-706L14.2	1656	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	82796843	82797145	82796994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	1744600	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	84757421	84757614	84757534	Y	DNASE2B,DNASE2B,SAMD13,SAMD13	NA	UOX,DNASE2B	IMR90	Hi-C	24141950	RPF1	185328	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	85005554	85005595	85005576	Y	NA	GNG5,CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	32568	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	85643319	85643587	85643547	Y	NA	SYDE2	MIR4423	IMR90	Hi-C	24141950	SYDE2	21142	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	89744927	89745106	89745039	Y	GTF2B,GBP3,GBP1,GBP2,LRRC8C,GBP4,GBP5	GBP5	NA	NA	NA	NA	GBP5	8383	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	93634565	93634982	93634927	Y	MTF2	CCDC18,TMED5	NA	NA	NA	NA	CCDC18	8494	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr1	94189333	94189558	94189472	Y	FNBP1L	NA	BCAR3,MIR760	IMR90	Hi-C	24141950	DNTTIP2	153916	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	94557832	94558157	94557998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLM	184866	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	97656052	97656450	97656352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP2	470831	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	100911126	100911538	100911291	Y	SLC35A3,HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	102542	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	100918231	100918546	100918401	Y	SLC35A3,HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	109647	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr1	101392986	101393260	101393033	Y	S1PR1,SLC30A7,SLC30A7	EXTL2,SLC30A7	NA	NA	NA	NA	SLC30A7	33354	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr1	101469727	101469819	101469773	Y	NA	RP11-421L21.3,DPH5	NA	NA	NA	NA	RP11-421L21.3	19615	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	101775588	101775858	101775753	Y	S1PR1	NA	NA	NA	NA	NA	S1PR1	75144	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	108347574	108347600	108347587	Y	VAV3	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3-AS1	157465	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	109104473	109104583	109104556	Y	PRPF38B,FAM102B	NA	NA	NA	NA	NA	HENMT1	97565	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	109133120	109133338	109133232	Y	STXBP3,PRPF38B,FAM102B	NA	NA	NA	NA	NA	HENMT1	68810	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	111178912	111179243	111179089	Y	RBM15,CD53	KCNA3	KCNA2	K562	ChIA-PET	22265404	KCNA3	36412	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr1	111329904	111330079	111330010	Y	KCNA2	NA	KCNA2	IMR90	Hi-C	24141950	CD53	83696	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	111733520	111733879	111733740	Y	NA	DENND2D	NA	NA	NA	NA	DENND2D	11278	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	111735691	111736003	111735892	Y	CD53,LRIF1,RAP1A,C1orf162	DENND2D	NA	NA	NA	NA	DENND2D	9154	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	111757482	111757860	111757552	Y	CEPT1,DENND2D	DENND2D	WDR77	IMR90	Hi-C	24141950	DENND2D	12325	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	111762260	111762740	111762451	Y	CD53,CEPT1,DENND2D,CHI3L2	DENND2D	C1orf88,CEPT1,PGCP1,RAP1A,DRAM2	IMR90	Hi-C	24141950	DENND2D	17103	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	112276731	112276883	112276807	Y	C1orf162,RAP1A,C1orf183,C1orf183	DDX20,FAM212B	NA	NA	NA	NA	DDX20	18984	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	113684444	113684648	113684532	Y	NA	RP11-389O22.4	NA	NA	NA	NA	RP11-389O22.4	24968	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	114950620	114950667	114950644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM33	101114	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	115920870	115920887	115920879	Y	NA	NA	NGF	IMR90	Hi-C	24141950	VANGL1	261687	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	116920378	116921129	116920740	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	7088	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	117047053	117047428	117047164	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58	NA	NA	NA	NA	NA	CD58	64233	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	117110819	117111247	117111136	Y	NA	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	414	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	117313335	117313579	117313532	Y	TTF2,CD2	CD2	NA	NA	NA	NA	CD2	18328	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	117359174	117359463	117359379	Y	TTF2,CD2	NA	NA	NA	NA	NA	CD2	64167	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr1	146774989	146775112	146775013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD1L	62698	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	149816287	149817606	149817166	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H3A	4575	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	149821015	149821647	149821349	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H3A	534	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	151249767	151250096	151249960	Y	FAM63A,CDC42SE1,RFX5,PI4KB,PI4KB,TNFAIP8L2,ZNF687	PSMD4,ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB	NA	NA	NA	NA	ZNF687	1998	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	153845025	153845089	153845058	Y	NA	GATAD2B	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	48362	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	154154606	154155027	154154830	Y	SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	10097	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr1	154699087	154699216	154699140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAR	100612	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr1	154910155	154910399	154910216	Y	ADAR,PBXIP1,MTX1	PMVK,PBXIP1,PYGO2,FLAD1	NA	NA	NA	NA	PMVK	2688	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	TRIM46,KRTCAP2,MTX1,GBA	NA	NA	NA	NA	MTX1	11531	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr1	155535083	155535193	155535176	Y	HCN3	ASH1L	NA	NA	NA	NA	ASH1L	4485	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	156474686	156475018	156474923	Y	SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6066	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	158217835	158218199	158218078	Y	OR10T2,CD1D,CD1E,CD1C,CD1B	RP11-404O13.5	NA	NA	NA	NA	RP11-404O13.5	46168	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	13.7340106393447
chr1	158942717	158942925	158942799	Y	OR10J1,OR10R2,OR6P1,OR10X1,OR10Z1,OR6K3,OR6N1,OR6N2,FCER1A,PYHIN1	PYHIN1,IFI16	NA	NA	NA	NA	IFI16	24833	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	158994687	158995148	158994758	Y	OR6P1,OR10X1,OR10Z1,OR6K3,OR6N1,OR6N2,MNDA,IFI16,FCER1A	IFI16	NA	NA	NA	NA	IFI16	26929	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	159083627	159083815	159083767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI16	115869	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	159880076	159880706	159880437	Y	FCRL6,DCAF8,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	CCDC19	12123	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	160641547	160642117	160641798	Y	NA	SLAMF1,CD48	NA	NA	NA	NA	SLAMF1	26462	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	160680775	160680900	160680839	Y	SLAMF7,CD244,ARHGAP30,CD48	CD48	NA	NA	NA	NA	CD48	1134	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	160982920	160983992	160983766	Y	CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	5146	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr1	162709795	162709973	162709884	Y	NOS1AP,DDR2	NA	NA	NA	NA	NA	UAP1	180472	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	166828089	166828463	166828188	Y	POU2F1,POGK	POGK,TADA1	NA	NA	NA	NA	TADA1	15101	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	167035961	167036358	167035977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ILDR2	93242	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	167424728	167425462	167425239	Y	POU2F1,RCSD1,CD247	NA	NA	NA	NA	NA	CD247	60385	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	167434195	167434584	167434555	Y	POU2F1,RCSD1,CD247	NA	NA	NA	NA	NA	CD247	51263	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	167486210	167486705	167486392	Y	POU2F1,RCSD1,CD247	CD247,CREG1	NA	NA	NA	NA	CD247	363	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	167649050	167649342	167649168	Y	RCSD1	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	39087	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	167683554	167683813	167683605	Y	POU2F1,CREG1	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	4616	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	168594082	168594481	168594282	Y	NA	NA	DPT,F5	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	345804	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	175158150	175158288	175158209	Y	KIAA0040,KIAA0040	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS14	167589	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	181069151	181069617	181069305	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	13513	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	182538682	182538808	182538746	Y	NA	RNASEL,RGS16	NA	NA	NA	NA	RNASEL	17583	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	184265554	184265938	184265708	Y	NA	NA	C1orf21,EDEM3,TSEN15	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf21	88254	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	184506061	184506260	184506127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf21	151869	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	185253692	185254037	185253865	Y	HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	30424	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	185536131	185536449	185536350	Y	NA	NA	IVNS1ABP,SWT1,MIR548F1,HMCN1	IMR90	Hi-C	24141950	IVNS1ABP	251670	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	198128112	198128944	198128293	Y	PTPRC,DENND1B	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	4019	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr1	198488746	198489088	198489022	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRC	116713	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	12.7530098793915
chr1	198625518	198626374	198625745	Y	PTPRC	PTPRC	NA	NA	NA	NA	PTPRC	19717	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	198647552	198647977	198647839	Y	PTPRC	PTPRC	NA	NA	NA	NA	PTPRC	41751	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	198840125	198840497	198840438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-16L9.4	142765	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	198979759	198979985	198979807	Y	NA	RP11-16L9.4,RP11-16L9.3	NA	NA	NA	NA	RP11-16L9.4	3277	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	7.84800607962556
chr1	200857233	200857815	200857711	Y	KIF21B	NA	NA	NA	NA	NA	KIF21B	133013	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr1	202872285	202872308	202872297	Y	NA	RABIF,HNRNPA1P59,KLHL12	RABIF	MCF7	ChIA-PET	22265404	HNRNPA1P59	6632	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	203101073	203101246	203101163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM183A	126559	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	203643182	203643803	203643474	Y	BTG2,LAX1	ATP2B4	LAX1	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B4	49493	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	204363456	204363666	204363499	Y	NA	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	15253	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	205090261	205090406	205090392	Y	NA	RBBP5	CNTN2	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP5	1118	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	205253892	205254222	205253971	Y	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NA	SNRPGP10	64153	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	206290243	206290662	206290573	Y	C1orf186	C1orf186,RP11-38J22.6	NA	NA	NA	NA	C1orf186	3596	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	206736469	206736632	206736474	Y	NA	RP11-534L20.4,EIF2D	NA	NA	NA	NA	RP11-534L20.4	36221	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr1	206859748	206860259	206859963	Y	IKBKE,RASSF5,FAIM3,FAIM3,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	3459	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	207064076	207064429	207064213	Y	NA	FAIM3	NA	NA	NA	NA	FAIM3	30163	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	210567003	210567330	210567209	Y	SYT14	NA	NA	NA	NA	NA	DIEXF	567651	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	211998326	211998558	211998442	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	3556	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	221877654	221878134	221877871	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	35384	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	221882292	221882723	221882499	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	30795	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	223964690	223965055	223964731	Y	TP53BP2,FBXO28	NA	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	66619	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	224023477	224023773	224023693	Y	CAPN2,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	7901	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	224811590	224812043	224811760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR26	188855	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	226841173	226841776	226841263	Y	ITPKB	ITPKB-IT1	NA	NA	NA	NA	ITPKB-IT1	18992	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr1	228783962	228784250	228784107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84574	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr1	228878269	228878481	228878411	Y	RHOU	RHOU	NA	NA	NA	NA	RHOU	9445	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	229473732	229474385	229474330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP133	167718	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	230978470	230978520	230978495	Y	NA	C1orf198	NA	NA	NA	NA	C1orf198	24815	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	231347338	231347496	231347363	Y	C1orf124	C1orf131,GNPAT	NA	NA	NA	NA	C1orf131	27437	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr1	234980393	234980645	234980479	Y	IRF2BP2	NA	LOC100506810,IRF2BP2,LINC00184	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BP2	237122	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	235390754	235391125	235391097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM34	67982	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr1	235668656	235669018	235668830	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	B3GALNT2	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	2875	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	241771916	241772216	241772151	Y	KMO	CHML	NA	NA	NA	NA	CHML	25016	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	243641103	243641443	243641320	Y	CEP170,SDCCAG8,AKT3,AKT3	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	223783	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	243688123	243688227	243688212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	270803	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	244210956	244211944	244211575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	198575	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	244215508	244215901	244215527	Y	AKT3,ZNF238,ZNF238	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	203127	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	244613820	244614139	244614120	Y	NA	ADSS	NA	NA	NA	NA	ADSS	384	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	246456441	246456840	246456713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	211774	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	246469940	246470214	246470139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	198400	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	247326566	247327229	247326989	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF669	60892	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr1	247608966	247609716	247609354	Y	NLRP3,NLRP3	NLRP3	NA	NA	NA	NA	NLRP3	31508	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr1	249157308	249157673	249157562	Y	OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692	SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2	NA	NA	NA	NA	ZNF692	5965	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	2951238	2951396	2951317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFKP	155129	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	3845250	3845852	3845788	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	19777	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	5334474	5334640	5334544	Y	NA	NA	AKR1E2,tAKR	IMR90	Hi-C	24141950	ASB13	371918	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr10	6114381	6114875	6114579	Y	IL2RA,RBM17,RBM17	IL2RA,RBM17	IL2RA,LOC399715,RBM17	IMR90	Hi-C	24141950	IL2RA	12093	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	6170843	6171197	6171089	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3	RBM17,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	13684	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	6242613	6242903	6242648	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	57732	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	6243287	6243821	6243659	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	58406	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	6438616	6439009	6438869	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3	NA	LOC399715,IL2RA,PFKFB3,RBM17,FBXO18,IL15RA,PRKCQ	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKCQ	181254	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	7226649	7227021	7226812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIN	600969	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	7362038	7362350	7362337	Y	SFMBT2,SFMBT2	NA	NA	NA	NA	NA	KIN	465640	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	8103619	8104019	8103811	Y	KIN,TAF3,GATA3	GATA3	NA	NA	NA	NA	GATA3	10052	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	8446683	8447080	8446823	Y	GATA3	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	353116	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	8662161	8662543	8662250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	568594	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	8952501	8952629	8952565	Y	NA	NA	GATA3,FLJ45983	MCF7	ChIA-PET	22265404	GATA3	858934	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	11205067	11205773	11205317	Y	CELF2	NA	NA	NA	NA	NA	CELF2	159808	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	11222222	11222709	11222492	Y	CELF2	NA	NA	NA	NA	NA	CELF2	176963	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	14624029	14624329	14624184	Y	DCLRE1C	NA	NA	NA	NA	NA	FAM107B	190567	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	14955590	14955884	14955736	Y	HSPA14,SUV39H2,SUV39H2,SUV39H2	SUV39H2,DCLRE1C,MEIG1	NA	NA	NA	NA	SUV39H2	36771	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	17037933	17038521	17038161	Y	VIM,TRDMT1,ST8SIA6	NA	NA	NA	NA	NA	RSU1	180406	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	17044035	17044524	17044318	Y	VIM,TRDMT1,ST8SIA6	NA	NA	NA	NA	NA	RSU1	186508	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	22046684	22046874	22046779	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT10	225590	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	22519481	22519667	22519580	Y	BMI1,EBLN1	NA	COMMD3-BMI1,PIP4K2A,ARMC3,DNAJC1,LOC100499489	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COMMD3	83236	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	22725331	22726270	22725901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	117191	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	28694229	28694387	28694304	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP7	72814	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	30818244	30819051	30818562	Y	MAP3K8,ZNF438	NA	MAP3K8,KIAA1462,MTPAP,LOC729668,LYZL2	IMR90	Hi-C	24141950	MTPAP	156867	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	32607439	32608014	32607606	Y	EPC1	NA	NA	NA	NA	NA	EPC1	57712	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	34569605	34569879	34569742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARD3	532374	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	34907489	34907514	34907502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARD3	194739	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	35717658	35717859	35717796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	183705	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	38264185	38264489	38264470	Y	ZNF37A,ZNF248,ZNF25	ZNF33A	NA	NA	NA	NA	ZNF33A	33089	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr10	43950893	43951349	43951098	Y	NA	HNRNPF	NA	NA	NA	NA	HNRNPF	48279	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	45464299	45464380	45464314	Y	ZNF22,C10orf25	RASSF4,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	RASSF4	11444	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr10	47031609	47031850	47031726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM21C	810961	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	52083052	52083210	52083101	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	60314	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	63778860	63779091	63779011	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	RTKN2	247375	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	65149197	65149230	65149214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD1C	74492	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	71109104	71109433	71109270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HK1	81364	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	71928097	71928630	71928606	Y	NA	TYSND1	TYSND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAR1A	0	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	73599936	73600188	73600059	Y	NA	PSAP,RP11-472G21.2	CDH23	IMR90	Hi-C	24141950	PSAP	8938	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	73843647	73844125	73844033	Y	ANAPC16,SPOCK2	SPOCK2	NA	NA	NA	NA	SPOCK2	2665	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr10	74056833	74058104	74057179	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	25155	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr10	74063512	74063738	74063656	Y	NA	DDIT4,DNAJB12	ANAPC16,DDIT4	IMR90	Hi-C	24141950	DDIT4	31834	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	74076833	74077036	74076912	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	35952	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	74079380	74080359	74079580	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	32629	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	76985148	76985510	76985329	Y	NA	VDAC2,COMTD1,HMGA1P5	NA	NA	NA	NA	COMTD1	8278	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	79166166	79166289	79166224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR3A	621014	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	80734291	80734943	80734463	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	91849	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	80897644	80897901	80897807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	70852	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr10	80997251	80997825	80997438	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	107400	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	81085771	81086240	81085963	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	18985	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	88160347	88160841	88160714	Y	OPN4,GRID1	NA	WAPAL	MCF7	ChIA-PET	22265404	WAPAL	118731	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	89868014	89868342	89868247	Y	KLLN,PTEN	NA	PTEN,KLLN,RNLS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-380G5.3	164755	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	90145688	90145942	90145819	Y	LIPK	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-380G5.3	442429	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	90689067	90689322	90689158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAMBPL1	51576	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	93283444	93283748	93283596	Y	HECTD2	NA	NA	NA	NA	NA	HECTD2	115348	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	94608884	94609046	94608952	Y	NA	EXOC6	NA	NA	NA	NA	EXOC6	19949	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	96143397	96143573	96143482	Y	TBC1D12	NOC3L	NOC3L	IMR90	Hi-C	24141950	NOC3L	22681	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	97809290	97809583	97809571	Y	NA	CCNJ,ENTPD1-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNJ	8139	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	98848414	98848738	98848576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLIT1	94939	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	100020230	100020246	100020237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD2	152695	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr10	104504643	104504897	104504711	Y	NA	ARL3,SFXN2	NA	NA	NA	NA	SFXN2	32348	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	111203728	111203803	111203765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XPNPEP1	477508	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	111841715	111842020	111841846	Y	ADD3,SMNDC1,MXI1	NA	NA	NA	NA	NA	ADD3	87589	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	112620419	112620691	112620560	Y	SHOC2,PDCD4,BBIP1,BBIP1	PDCD4,PDCD4-AS1	NA	NA	NA	NA	PDCD4	8874	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr10	112674359	112675211	112674854	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	1821	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	114570405	114570790	114570582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTI1A	365649	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	114852259	114852332	114852313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASP7	584610	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	116561110	116561522	116561275	Y	NA	FAM160B1	AFAP1L2,ABLIM1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM160B1	17981	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	7.84800607962556
chr10	117830248	117830294	117830271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1598	1053803	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	119028396	119028853	119028412	Y	SLC18A2	SLC18A2,RP11-501J20.5	NA	NA	NA	NA	RP11-501J20.5	28962	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	121065390	121065964	121065436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX3	129045	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	121261864	121262026	121262018	Y	NA	RGS10	NA	NA	NA	NA	RGS10	38194	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	4.90500379976598
chr10	123707273	123707432	123707353	Y	PLEKHA1,BTBD16	ATE1-AS1,ATE1,NSMCE4A	NA	NA	NA	NA	ATE1	20957	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	126382372	126382711	126382460	Y	ZRANB1,FAM53B	FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	48127	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr10	127915196	127915439	127915419	Y	ADAM12,MMP21	NA	NA	NA	NA	NA	BCCIP	405081	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	269337	269903	269511	Y	TMEM80,TALDO1,SIGIRR,DEAF1,IFITM2,IFITM1,ATHL1	PSMD13,SIRT3,RP11-326C3.2,ATHL1,IFITM2,IFITM1	NA	NA	NA	NA	RP11-326C3.2	15402	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	3833340	3833454	3833393	Y	RRM1,NUP98,PGAP2,PGAP2,RHOG	PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,AC090587.4	NA	NA	NA	NA	NUP98	16318	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	3860220	3860837	3860518	Y	NA	PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,AC090587.4	NA	NA	NA	NA	RHOG	7	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	8727919	8728019	8727969	Y	ASCL3	RPL27A	NA	NA	NA	NA	RPL27A	25961	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	10924337	10924628	10924550	Y	RNF141	ZBED5	EIF4G2	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZBED5	45994	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	12218036	12218499	12218053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP47	357066	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	18404883	18405218	18405078	Y	LDHA	LDHA	NA	NA	NA	NA	LDHA	8717	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	23142638	23142950	23142794	Y	FANCF	NA	NA	NA	NA	NA	SVIP	292793	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	27693843	27694020	27693988	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	NA	NA	NA	NA	NA	LIN7C	167523	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	28128920	28129110	28128941	Y	METTL15	METTL15,KIF18A	NA	NA	NA	NA	KIF18A	1065	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	32442373	32442742	32442611	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3M	160602	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	33342450	33342853	33342574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK3	66232	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	34125347	34125667	34125520	Y	NA	NAT10	NA	NA	NA	NA	NAT10	198	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	35257615	35257771	35257693	Y	CD44	NA	NA	NA	NA	NA	CD44	99198	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	35825533	35825614	35825574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM44	143180	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	44613702	44614051	44613788	Y	CD82	CD82	NA	NA	NA	NA	CD82	29725	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	46753121	46753488	46753304	Y	F2	ARHGAP1,ZNF408	NA	NA	NA	NA	ZNF408	32753	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	58340867	58341571	58341167	Y	OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN	LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF	NA	NA	NA	NA	LPXN	2122	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	59537612	59537828	59537719	Y	PATL1,STX3	MRPL16	NA	NA	NA	NA	MRPL16	38517	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	60931528	60932206	60931841	Y	SLC15A3,SDHAF2,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,VPS37C	NA	VPS37C	K562	ChIA-PET	22265404	CD5	63661	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	61602064	61602538	61602257	Y	INCENP,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,FEN1	FEN1,FADS2,FADS1	NA	NA	NA	NA	FADS1	7274	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr11	62169834	62169958	62169927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASRGL1	66914	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	62588127	62588383	62588260	Y	NA	TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	STX5	9177	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	63319099	63319170	63319152	Y	NA	RARRES3	NA	NA	NA	NA	RARRES3	16818	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	63321382	63321591	63321464	Y	RARRES3,OTUB1	RARRES3	NA	NA	NA	NA	RARRES3	19101	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	65849089	65849462	65849117	Y	KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,SIPA1,RELA,DKFZp761E198,CTSW,PACS1	SF3B2,PACS1	NA	NA	NA	NA	PACS1	13255	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	66085302	66085580	66085502	Y	RBM14	YIF1A,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8	NA	NA	NA	NA	BRMS1	25016	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	66697442	66697531	66697487	Y	SPTBN2	PC	NA	NA	NA	NA	PC	26316	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	67253659	67253853	67253760	Y	PTPRCAP,NUDT8,AIP	CORO1B,TMEM134,AIP,PITPNM1,CDK2AP2	NA	NA	NA	NA	AIP	5147	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr11	68611298	68611611	68611498	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1420	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	69079523	69079702	69079574	Y	IGHMBP2,TPCN2	NA	NA	NA	NA	NA	AP000439.1	158756	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	70159213	70159451	70159301	Y	PPFIA1	PPFIA1	NA	NA	NA	NA	PPFIA1	44407	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	71650610	71650763	71650692	Y	NA	RP11-849H4.2,RNF121	NUMA1,IL18BP	IMR90	Hi-C	24141950	RNF121	12863	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	71749092	71749250	71749171	Y	NA	IL18BP,LRTOMT,NUMA1	NA	NA	NA	NA	LRTOMT	40132	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	75051761	75052000	75051847	Y	UVRAG,SPCS2,NEU3,DGAT2,ARRB1	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3	56530	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	76480789	76480971	76480905	Y	NA	RP11-21L23.3	B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-21L23.3	11135	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	78144030	78144327	78144179	Y	NA	GAB2,RP11-452H21.4	NA	NA	NA	NA	RP11-452H21.4	5148	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	83668458	83668564	83668511	Y	DLG2,DLG2,DLG2	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC90B	673008	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	88041244	88041443	88041379	Y	NA	CTSC	NA	NA	NA	NA	CTSC	27512	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	88071526	88071793	88071707	Y	NA	CTSC	NA	NA	NA	NA	CTSC	2571	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	91338604	91338624	91338614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-121L10.3	1324876	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	95893318	95893469	95893394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	180875	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	95982466	95982894	95982863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	91450	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	101386837	101386845	101386841	Y	TRPC6	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1377	396901	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	111195136	111195460	111195333	Y	C11orf93	NA	NA	NA	NA	NA	POU2AF1	128895	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	111990973	111991528	111991378	Y	IL18	C11orf57,PIH1D2,TIMM8B,SDHD	NA	NA	NA	NA	SDHD	35346	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	113502036	113502415	113502165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZW10	140118	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	113999597	113999969	113999698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP28	255305	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	116790672	116791048	116790863	Y	NA	NA	APOA4,APOA1,APOC3	IMR90	Hi-C	24141950	AP000936.1	113719	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr11	116802235	116802679	116802498	Y	SIK3,PCSK7	NA	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	102088	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	118187372	118187677	118187544	Y	DDX6,UBE4A,MLL,MPZL3,CD3E,CD3G,CD3D	CD3E,CD3D,CD3G,UBE4A	NA	NA	NA	NA	CD3E	14112	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	118740767	118741727	118741016	Y	MLL,VPS11,RPS25,CXCR5,CXCR5,CCDC84,CCDC153,CBL,DDX6	NA	DDX6,CXCR5,BCL9L,MIR4492	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BCL9L	52590	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	118763139	118763505	118763387	Y	NA	BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	30812	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	121353016	121353670	121353326	Y	SORL1	SORL1	NA	NA	NA	NA	SORL1	32104	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	122584764	122585535	122585367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	60381	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	126790922	126791265	126791130	Y	KIRREL3	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	567387	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	128132461	128132807	128132596	Y	NA	NA	KCNJ1,FLI1,ETS1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS1	322646	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	128323342	128323695	128323510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	131758	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	128341794	128342415	128342241	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	113038	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr11	128344618	128344676	128344650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	110777	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	769284	769483	769468	Y	NINJ2	NINJ2	NA	NA	NA	NA	NINJ2	1462	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	860254	860664	860544	Y	RAD52,NINJ2,WNK1	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	495	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	4935579	4936010	4935701	Y	KCNA1,KCNA6	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA9	179318	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr12	4938668	4939292	4938830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA9	182407	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr12	6339954	6340271	6340062	Y	VAMP1,TAPBPL,IFFO1	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	33073	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	6717352	6717716	6717682	Y	SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP	NOP2,CHD4	NA	NA	NA	NA	CHD4	2710	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	7792912	7793287	7793081	Y	PEX5,PEX5,NANOG,DPPA3,SLC2A14,GDF3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A3	293584	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A3	36298	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	9917181	9917686	9917498	Y	KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D,OLR1,KLRF1,GABARAPL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CD69	CD69	NA	NA	NA	NA	CD69	5684	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr12	11221356	11221421	11221389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAS2R14	100751	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	12654210	12654272	12654270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREBL2	108489	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	19260911	19261231	19261176	Y	NA	PLEKHA5	PIK3C2G	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHA5	19417	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	23195038	23195059	23195050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETNK1	419029	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	25053045	25053436	25053335	Y	KRAS,BCAT1,BCAT1,BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	46957	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	25538390	25538869	25538521	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	16493	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	15955	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr12	26805266	26805775	26805502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPR2	178356	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	29601520	29601624	29601572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	69398	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	31804886	31805136	31805063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMN1	74972	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	8.82900683957876
chr12	38493611	38493806	38493706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALG10B	214574	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	42825856	42826146	42826103	Y	YAF2,YAF2,YAF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	107936	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	46609835	46610258	46610179	Y	ARID2,SCAF11,SLC38A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	51542	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	46786554	46786766	46786571	Y	NA	SLC38A2	NA	NA	NA	NA	SLC38A2	21904	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	46917975	46918280	46918143	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC38A2	153325	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	47295020	47295376	47295198	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90	Hi-C	24141950	PCED1B-AS1	312863	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	47601157	47601488	47601298	Y	FAM113B	PCED1B-AS1	NA	NA	NA	NA	PCED1B-AS1	6751	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	48053201	48053247	48053224	Y	ASB8	RPAP3,RP1-197B17.3	NA	NA	NA	NA	RPAP3	44597	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	48282882	48283045	48282955	Y	ZNF641,ZNF641,ASB8,VDR	NA	NA	NA	NA	NA	VDR	51786	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	48294417	48294695	48294497	Y	OR10AD1,ZNF641,ZNF641,VDR	VDR	NA	NA	NA	NA	VDR	40136	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	49370069	49370445	49370342	Y	NA	ARF3,PRKAG1	NA	NA	NA	NA	ARF3	20735	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	49626851	49627096	49626872	Y	NA	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	45744	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	49695692	49695788	49695732	Y	RHEBL1	TROAP,C1QL4	NA	NA	NA	NA	TROAP	19231	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	50019010	50019299	50019155	Y	FMNL3	NA	NA	NA	NA	NA	MCRS1	59074	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	50064771	50065019	50064886	Y	C12orf62,FMNL3	TMBIM6,FMNL3	NA	NA	NA	NA	TMBIM6	34489	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr12	50460197	50460562	50460363	Y	NA	RACGAP1,SMARCD1	NA	NA	NA	NA	SMARCD1	16193	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	51536826	51537135	51537116	Y	CSRNP2	TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	27791	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	51608031	51608240	51608135	Y	BIN2	TFCP2,DAZAP2	NA	NA	NA	NA	DAZAP2	21836	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	51720540	51720949	51720738	Y	SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,DAZAP2,GALNT6	BIN2	NA	NA	NA	NA	BIN2	4088	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr12	51786511	51786834	51786676	Y	SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,CSRNP2,DAZAP2,BIN2,GALNT6	SLC4A8,GALNT6	NA	NA	NA	NA	GALNT6	1860	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	53056178	53056504	53056341	Y	NA	KRT1	NA	NA	NA	NA	KRT1	15687	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	53515585	53515944	53515597	Y	NA	SPRYD3,SOAT2	NA	NA	NA	NA	SOAT2	20283	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	53765037	53765535	53765115	Y	CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13	AAAS,SP1	SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP1	6425	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	56323148	56323586	56323313	Y	PAN2,PAN2,DGKA	DGKA,WIBG,CDK2,RAB5B	NA	NA	NA	NA	WIBG	816	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr12	58134915	58135263	58135010	Y	ARHGAP9,ARHGAP9,ARHGAP9,DDIT3,MBD6,MARCH9,AGAP2	OS9,TSPAN31,AGAP2,MARCH9,CDK4,METTL1,TSFM	NA	NA	NA	NA	AGAP2	975	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr12	59434557	59434696	59434648	Y	LRIG3,LRIG3	NA	LRIG3	IMR90	Hi-C	24141950	LRIG3	122254	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	65176068	65176517	65176160	Y	TBK1,RASSF3,LEMD3,GNS	GNS	NA	NA	NA	NA	GNS	24841	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	65528086	65528453	65528315	Y	NA	LEMD3	WIF1,TBC1D30,LEMD3,FLJ41278	IMR90	Hi-C	24141950	LEMD3	32898	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	67404997	67405349	67405173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAND1	255712	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	68705071	68705359	68705215	Y	IL22	MDM1	NA	NA	NA	NA	MDM1	18802	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	68758917	68759565	68759229	Y	IFNG,RAP1B	MDM1	RAP1B,NUP107,LOC100507250	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MDM1	34756	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr12	69163885	69164101	69163897	Y	SLC35E3	SLC35E3,MDM2	NA	NA	NA	NA	SLC35E3	25999	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	69227269	69227544	69227345	Y	SLC35E3	MDM2	NA	NA	NA	NA	MDM2	27313	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	69634325	69634686	69634559	Y	SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6	CPSF6	NA	NA	NA	NA	CPSF6	3008	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr12	70603919	70603997	70603958	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	CNOT2	30777	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	70630767	70631060	70630914	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	CNOT2	3714	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	73660341	73660575	73660458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3B	1268976	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	76919848	76920276	76920185	Y	ZDHHC17,OSBPL8	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	31313	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr12	79608943	79609085	79609014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	473792	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	85344886	85345065	85345044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P25	1801776	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	89856198	89856331	89856264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POC1B	61470	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	92517420	92517830	92517671	Y	BTG1	RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	19519	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	92517978	92518398	92518142	Y	BTG1	RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	18951	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	92899278	92900031	92899712	Y	EEA1,BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	BTG1	361605	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	93320988	93321201	93321103	Y	EEA1	NA	NA	NA	NA	NA	EEA1	0	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	93382025	93382373	93382199	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEA1	60918	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	94581330	94581746	94581508	Y	TMCC3,PLXNC1	PLXNC1	CCDC41	IMR90	Hi-C	24141950	PLXNC1	40831	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	94678246	94678308	94678278	Y	PLXNC1,TMCC3	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNC1	137747	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	95680646	95681018	95680718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEZT	71124	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	95836236	95836346	95836307	Y	USP44	METAP2	NR2C1,VEZT	IMR90	Hi-C	24141950	METAP2	28950	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	96664847	96665248	96665048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK17	127090	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	102187051	102187461	102187342	Y	DRAM1,GNPTAB	GNPTAB	NA	NA	NA	NA	GNPTAB	35255	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	105020354	105020448	105020373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	173281	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	105031434	105031802	105031612	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	184361	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	105035767	105036007	105035871	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	188694	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	105037664	105038031	105037900	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	190591	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	105101205	105101513	105101338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC41A2	249009	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	107153976	107154194	107154103	Y	RFX4,RIC8B	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf23	193303	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	107723329	107723653	107723513	Y	NA	BTBD11	NA	NA	NA	NA	BTBD11	13139	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	108054666	108054768	108054732	Y	NA	PWP1	NA	NA	NA	NA	PWP1	22741	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	108520922	108521230	108521111	Y	NA	NA	WSCD2	K562	ChIA-PET	22265404	PRDM4	367873	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	115105863	115106455	115106375	Y	TBX3	NA	NA	NA	NA	NA	RBM19	703687	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	116570796	116571229	116571121	Y	MED13L,MAP1LC3B2	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	141914	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	116661909	116662288	116662266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	50855	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	116666460	116666763	116666749	Y	NA	MED13L	NA	NA	NA	NA	MED13L	46380	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	117029905	117030297	117030145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf49	143578	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	118209559	118209890	118209580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC5	239503	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	121282265	121283301	121283112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	56873	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	121310801	121311113	121311060	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	29061	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	121866033	121866226	121866130	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	30189	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr12	122067749	122067897	122067832	Y	ORAI1	ORAI1,MORN3	NA	NA	NA	NA	ORAI1	5294	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	14.7150113992979
chr12	122086492	122086728	122086610	Y	KDM2B,SETD1B,ORAI1	ORAI1,MORN3	NA	NA	NA	NA	MORN3	21809	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	122444524	122444823	122444769	Y	BCL7A	BCL7A	NA	NA	NA	NA	BCL7A	10505	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr12	122771781	122771848	122771815	Y	NA	VPS33A	NA	NA	NA	NA	VPS33A	22713	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	123352500	123352698	123352696	Y	VPS37B	HIP1R,VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	26293	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	123528001	123528432	123528293	Y	C12orf65,C12orf65,C12orf65	NA	NA	NA	NA	NA	ABCB9	63805	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr12	123627472	123627989	123627683	Y	C12orf65,C12orf65,C12orf65	PITPNM2	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	4573	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	124951666	124951729	124951686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	413485	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	125052829	125053041	125052928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	312173	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr12	131111744	131112133	131112105	Y	RIMBP2	NA	RIMBP2	IMR90	Hi-C	24141950	STX2	209678	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	20284953	20285344	20285149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSPC1	69798	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	30963439	30963783	30963499	Y	NA	LINC00426	LINC00426,KATNAL1,HMGB1,USPL1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00426	14157	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	34116442	34117241	34116673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	272945	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	35923856	35924125	35924012	Y	NBEA	NA	NA	NA	NA	NA	RFXAP	1467236	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	40962857	40963140	40963012	Y	FOXO1	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS31	380169	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr13	41581586	41581700	41581679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WBP4	51710	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	41589057	41589218	41589148	Y	NA	WBP4,ELF1	NA	NA	NA	NA	WBP4	44192	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	41825625	41825697	41825634	Y	KBTBD7,NAA16	MTRF1	NA	NA	NA	NA	MTRF1	10045	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	42422497	42422720	42422629	Y	C13orf15,DGKH	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	421569	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	42721459	42721826	42721635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	122463	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	42969347	42969590	42969439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	125058	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	45338378	45338728	45338554	Y	NA	NA	TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1,LINC00330	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	189095	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	46739572	46740633	46739908	Y	NA	LCP1,LRRC63	NA	NA	NA	NA	LCP1	43373	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	47128078	47128394	47128310	Y	LCP1,C13orf18,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	2775	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	49074869	49075392	49075112	Y	FNDC3A,RB1,LPAR6,RCBTB2	RCBTB2	NA	NA	NA	NA	RCBTB2	29977	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	49105819	49106173	49105865	Y	RB1,LPAR6,RCBTB2	RCBTB2	NA	NA	NA	NA	RCBTB2	450	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	9.81000759953196
chr13	49130835	49131251	49131085	Y	FNDC3A,RB1,LPAR6,RCBTB2	RCBTB2	NA	NA	NA	NA	RCBTB2	25466	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	50661413	50661685	50661628	Y	NA	DLEU1,DLEU2	NA	NA	NA	NA	DLEU1	7106	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr13	50675373	50675756	50675618	Y	NA	DLEU1,DLEU2	NA	NA	NA	NA	DLEU1	21066	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	51103280	51103738	51103647	Y	NA	NA	DLEU1,DLEU2,EBPL,TRIM13,MIR3613	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL34P26	169381	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	52319871	52320068	52319946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDFY2	163227	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	61754011	61754066	61754041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRD3	785420	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	64491531	64491783	64491579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRD3	3522940	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	67461334	67461726	67461614	Y	PCDH9	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	4785473	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	74339681	74339964	74339912	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	FABP5P1	666558	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	74341263	74341518	74341389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FABP5P1	668140	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	80916096	80916414	80916232	Y	NA	SPRY2	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3010	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr13	87409604	87409993	87409691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	4588081	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr13	87414604	87414810	87414734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	4583264	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	11.7720091194383
chr13	91931030	91931288	91931161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	66786	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	96427402	96427645	96427445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	100009	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	99123285	99123381	99123333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	104813	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	99867739	99867834	99867779	Y	DOCK9,GPR18,CLYBL,UBAC2,UBAC2	UBAC2-AS1,UBAC2	NA	NA	NA	NA	UBAC2	16711	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	99957500	99957664	99957598	Y	DOCK9,UBAC2,GPR18,GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	UBAC2	106472	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	100154383	100154610	100154487	Y	GPR183	TM9SF2	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	2712	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	101253370	101253509	101253428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P47	62842	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	102627010	102627363	102627187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPP2	619990	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	107186008	107186474	107186341	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	32038	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	110439676	110440079	110439929	Y	IRS2	IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	2761	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr13	111976415	111976735	111976477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF7	211509	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr13	114876029	114876284	114876205	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC16	122078	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	20803011	20803143	20803077	Y	NA	TTC5,CCNB1IP1,PARP2,RPPH1	NA	NA	NA	NA	CCNB1IP1	3540	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	21150605	21151121	21150987	Y	TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40	NA	NA	NA	NA	NA	RNASE6	96089	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr14	23033088	23033184	23033134	Y	NA	DAD1	NA	NA	NA	NA	DAD1	22991	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	23056506	23056666	23056661	Y	REM2	DAD1	NA	NA	NA	NA	DAD1	331	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	25142710	25142963	25142951	Y	CMA1,CTSG,GZMB	NA	NA	NA	NA	NA	CTSG	99244	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr14	35767605	35767844	35767749	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,NFKBIA,PSMA6	PSMA6	NA	NA	NA	NA	PSMA6	21766	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	35875293	35875611	35875452	Y	NA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	3338	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	39892906	39893200	39893154	Y	FBXO33	FBXO33	NA	NA	NA	NA	FBXO33	6504	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	39954969	39955272	39955039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	55265	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	42075138	42075996	42075609	Y	LRFN5	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	2175434	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr14	50528497	50528810	50528555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOS2	167466	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	52063277	52063629	52063461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG2	227284	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	52332665	52333559	52333252	Y	PTGER2,PTGDR,GNG2	GNG2	NA	NA	NA	NA	GNG2	41752	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	53020677	53020806	53020735	Y	PTGDR,TXNDC16,GPR137C	TXNDC16	NA	NA	NA	NA	TXNDC16	3437	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	54649490	54649642	54649566	Y	NA	NA	BMP4	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN3	211925	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	55439267	55439511	55439438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDHD1	52312	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	NA	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAPK1IP1L	53384	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	55584452	55585250	55584591	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	NA	MAPK1IP1L,SOCS4,LGALS3,DLGAP5	IMR90	Hi-C	24141950	MAPK1IP1L	68103	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	61802565	61803086	61802823	Y	PRKCH	RP11-902B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	15029	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	61803783	61804036	61803882	Y	PRKCH	RP11-902B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	16247	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	61808896	61809049	61808907	Y	PRKCH	RP11-902B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	21360	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	61809267	61809583	61809345	Y	PRKCH	RP11-902B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	21731	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	61865216	61865457	61865337	Y	PRKCH	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	77680	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	61928092	61928322	61928207	Y	SLC38A6,PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	140556	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	61939634	61940081	61939867	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	152098	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	61969529	61970113	61969734	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	181993	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr14	62058743	62058958	62058799	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	101273	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	65546452	65546770	65546602	Y	NA	MAX	NA	NA	NA	NA	MAX	20643	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	67416708	67417057	67416792	Y	GPHN	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	288769	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	68529528	68529897	68529655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	245032	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	69247986	69248278	69248131	Y	DCAF5	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	12912	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	69328763	69329130	69328947	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	67573	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	74208106	74208498	74208298	Y	C14orf43	PNMA1,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	PNMA1	28978	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	74252099	74252503	74252342	Y	NA	RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1021I20.1	36	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	76564687	76564726	76564707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFT43	198208	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	77381505	77381598	77381569	Y	NA	RP11-488C13.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	30412	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	79941274	79941440	79941360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSHR	1477893	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	81595278	81595532	81595318	Y	STON2,TSHR	RP11-114N19.3	NA	NA	NA	NA	RP11-114N19.3	39226	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	81597072	81597358	81597215	Y	STON2,TSHR	RP11-114N19.3	NA	NA	NA	NA	RP11-114N19.3	37400	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr14	88515678	88515933	88515842	Y	NA	GPR65	NA	NA	NA	NA	GPR65	46210	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	90083286	90083622	90083526	Y	TDP1,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	0	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	91406372	91406636	91406631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf159	118041	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	91528012	91528136	91528074	Y	SMEK1,CCDC88C,RPS6KA5	C14orf159,RPS6KA5	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	3032	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	91694873	91695058	91694948	Y	RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C,GPR68	GPR68	NA	NA	NA	NA	GPR68	23211	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	91734470	91734656	91734563	Y	NA	GPR68	GPR68	K562	ChIA-PET	22265404	GPR68	16201	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	95946356	95946810	95946552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRX5	51030	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	96739430	96739734	96739582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG2B	88473	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	98655813	98656445	98655938	Y	NA	RP11-61O1.1	NA	NA	NA	NA	RP11-61O1.1	13035	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr14	99725559	99726087	99725887	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	9774	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	99726837	99727734	99727584	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	8127	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	99732829	99733287	99733049	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	2574	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	99734295	99735130	99734633	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	731	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr14	99735950	99736476	99736276	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	89	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr14	99739493	99739630	99739557	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	3632	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	100495518	100495795	100495680	Y	NA	NA	EVL,YY1,DEGS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EVL	59732	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	100539339	100539601	100539490	Y	WARS,EVL	NA	NA	NA	NA	NA	EVL	103553	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	102991046	102991386	102991124	Y	NA	NA	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RCOR1	65612	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr14	105947921	105948133	105948082	Y	NA	CRIP1,C14orf80	NA	NA	NA	NA	CRIP1	3403	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP1,C14orf80	NA	NA	NA	NA	CRIP1	2511	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr14	107252931	107253417	107253022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGHV2-70	75593	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr15	20616457	20616559	20616506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP5	2214836	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	22449488	22449632	22449579	Y	NA	NA	HERC2P3	IMR90	Hi-C	24141950	TUBGCP5	381763	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr15	22450316	22450421	22450369	Y	OR4N4	NA	HERC2P3	IMR90	Hi-C	24141950	TUBGCP5	380974	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr15	25123469	25123644	25123557	Y	SNURF,SNRPN,C15orf2,SNRPN,SNRPN	NA	NA	NA	NA	NA	SNRPN	56675	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	25565589	25566847	25566046	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	115281	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr15	25614491	25614606	25614563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	67522	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	30022522	30022814	30022806	Y	FAM189A1	NA	NA	NA	NA	NA	NDNL2	462489	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	31555534	31555833	31555755	Y	MTMR10,KLF13	RP11-16E12.1	LOC283710,OTUD7A,KLF13	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-16E12.1	49311	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	31653483	31654056	31653579	Y	MTMR10,KLF13	KLF13	NA	NA	NA	NA	KLF13	36425	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	33266942	33267258	33267072	Y	GREM1	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	361597	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	38784019	38784367	38784201	Y	RASGRP1	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	39691	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	39866856	39867109	39867069	Y	FSIP1	THBS1	THBS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	THBS1	4171	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	40164744	40164978	40164948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF2AK4	59369	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	40346483	40347151	40346778	Y	NA	SRP14	NA	NA	NA	NA	SRP14	17094	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	40601054	40601299	40601247	Y	BMF,BMF,C15orf57,BAHD1,PLCB2	PLCB2	PAK6	K562	ChIA-PET	22265404	PLCB2	2918	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr15	41139695	41139794	41139738	Y	NA	ZFYVE19,DNAJC17,SPINT1,VPS18	NA	NA	NA	NA	SPINT1	5479	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	50551577	50551761	50551665	Y	ATP8B4,GABPB1,SLC27A2,HDC	NA	NA	NA	NA	NA	GABPB1-AS1	93764	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	51515990	51516083	51516067	Y	SPPL2A,TNFAIP8L3,DMXL2	NA	NA	NA	NA	NA	AP4E1	317121	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	52122599	52122915	52122757	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	2774	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	55543162	55543346	55543241	Y	RAB27A,PIGB,CCPG1,CCPG1,RAB27A	NA	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	55897	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	60700608	60701055	60700809	Y	NA	ANXA2	NA	NA	NA	NA	ANXA2	7526	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	60757802	60757969	60757886	Y	NA	NARG2,RP11-219B17.1	NA	NA	NA	NA	NARG2	11390	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	60943205	60943249	60943239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	173828	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	63368396	63368491	63368444	Y	NA	LACTB	NA	NA	NA	NA	LACTB	43508	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	63484209	63484716	63484320	Y	LACTB,USP3,RAB8B	RPS27L,RAB8B	APH1B	IMR90	Hi-C	24141950	RAB8B	4541	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	63871063	63871418	63871089	Y	NA	USP3-AS1	NA	NA	NA	NA	USP3-AS1	20370	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	65127928	65128208	65128016	Y	NA	PIF1,PLEKHO2	PIF1	K562	ChIA-PET	22265404	PLEKHO2	3880	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	65186654	65187183	65187027	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHO2	54566	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	65596266	65596532	65596409	Y	NA	RNU5A-1,PARP16	PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP16	5310	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	65596702	65597188	65596889	Y	DENND4A	RNU5A-1,PARP16	PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP16	5746	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	66446289	66446658	66446570	Y	DIS3L,DIS3L	NA	NA	NA	NA	NA	DIS3L	136897	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	66993287	66993569	66993487	Y	MAP2K1,SMAD6	NA	NA	NA	NA	NA	RPL4	178417	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr15	68441418	68441688	68441529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	96901	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	69826034	69826378	69826206	Y	NA	NA	C15orf50,TLE3	IMR90	Hi-C	24141950	RPLP1	82911	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	70850665	70850865	70850772	Y	NA	NA	KIF23	IMR90	Hi-C	24141950	LARP6	293633	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	72270951	72271133	72271042	Y	GRAMD2	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	133466	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	74343707	74344076	74343754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PML	58693	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	74693719	74694069	74694004	Y	NA	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	30739	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	74721161	74721821	74721539	Y	SEMA7A,SEMA7A	SEMA7A,UBL7	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	2987	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	75081771	75082003	75081872	Y	ARID3B,CLK3,C15orf39,CSK	CSK	NA	NA	NA	NA	CSK	9373	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	75742568	75742962	75742713	Y	NA	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	3221	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	75745296	75745530	75745399	Y	PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	653	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr15	76543637	76543996	76543963	Y	NA	NA	C15orf27	IMR90	Hi-C	24141950	ETFA	57817	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	77055500	77055901	77055892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAPER	139884	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr15	78361071	78361580	78361229	Y	IREB2,TBC1D2B	TBC1D2B,SNORA63	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	6486	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	81578935	81579102	81579036	Y	MESDC1,STARD5	STARD5	NA	NA	NA	NA	STARD5	35422	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	83777211	83777631	83777545	Y	NA	BTBD1,TM6SF1	NA	NA	NA	NA	TM6SF1	3052	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr15	84118150	84118486	84118331	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	243380	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	85493235	85493615	85493435	Y	SLC28A1,PDE8A	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF592	203369	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	89878895	89879173	89879043	Y	NA	POLG	NA	NA	NA	NA	POLG	2803	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	90402022	90402269	90402146	Y	NA	AP3S2	NA	NA	NA	NA	AP3S2	33305	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	90418263	90418454	90418325	Y	NA	AP3S2,C15orf38-AP3S2	NA	NA	NA	NA	AP3S2	17120	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	90944087	90944636	90944284	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	14637	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	91153046	91153352	91153276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRTC3	81889	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	NA	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	CHD2	60372	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	94815502	94815543	94815523	Y	NA	MCTP2	NA	NA	NA	NA	MCTP2	42735	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	101253659	101254026	101253922	Y	ALDH1A3	NA	ALDH1A3,LRRK1	IMR90	Hi-C	24141950	LINS	112224	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	101783359	101783726	101783540	Y	CHSY1	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	6411	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	101834172	101834455	101834316	Y	TM2D3,TARSL2,SNRPA1	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	SNRPA1	685	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	101860934	101861170	101861021	Y	CHSY1,TM2D3	SNRPA1	NA	NA	NA	NA	SNRPA1	27447	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr15	102202329	102202647	102202484	Y	OR4F15	TM2D3	NA	NA	NA	NA	TM2D3	11735	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr16	6353433	6353832	6353638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf89	1239322	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	6423893	6424234	6424064	Y	RBFOX1,RBFOX1	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf89	1309782	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	9055639	9056008	9055791	Y	C16orf72,USP7	USP7	NA	NA	NA	NA	USP7	363	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	11024597	11024619	11024608	Y	NA	DEXI,CLEC16A	NA	NA	NA	NA	DEXI	9698	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	11448700	11449053	11448750	Y	ZC3H7A,TXNDC11,CIITA,SOCS1	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS1	100664	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	12008398	12008797	12008598	Y	NA	GSPT1	NA	NA	NA	NA	GSPT1	459	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	14088591	14088730	14088643	Y	NA	NA	PARN,MKL2	IMR90	Hi-C	24141950	RPS26P52	74055	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	19714468	19714843	19714656	Y	NA	IQCK	NA	NA	NA	NA	IQCK	10935	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr16	20922860	20922979	20922921	Y	CRYM,DCUN1D3,LYRM1	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	13154	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	23867520	23867900	23867586	Y	GGA2,PRKCB	PRKCB	NA	NA	NA	NA	PRKCB	22198	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr16	23871062	23871733	23871381	Y	GGA2,PRKCB	PRKCB	NA	NA	NA	NA	PRKCB	25740	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	24538501	24538703	24538598	Y	RBBP6	RBBP6	NA	NA	NA	NA	RBBP6	8311	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	27242037	27242327	27242262	Y	NA	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	35788	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr16	28860977	28861369	28861174	Y	NA	ATXN2L,TUFM,SH2B1	NA	NA	NA	NA	SH2B1	5056	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	29166546	29166864	29166704	Y	SPNS1	NA	RRN3P2	IMR90	Hi-C	24141950	LAT	172399	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	30885980	30886229	30886174	Y	ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668	BCL7C,FBXL19,FBXL19-AS1	NA	NA	NA	NA	BCL7C	18052	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr16	48400459	48400723	48400564	Y	LONP2,N4BP1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	79590	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	57073128	57073339	57073201	Y	FAM192A,NLRC5	NA	NA	NA	NA	NA	NLRC5	51731	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	57622732	57623027	57622920	Y	GPR114	GPR114	NA	NA	NA	NA	GPR114	48399	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	57680678	57681373	57680764	Y	NA	CCDC135	NA	NA	NA	NA	CCDC135	45332	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr16	58445622	58445902	58445848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINS3	118638	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	58451447	58451830	58451588	Y	GOT2,NDRG4	NA	NA	NA	NA	NA	GINS3	124463	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	66508767	66508904	66508846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00920	68340	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	66554316	66555209	66554867	Y	CMTM1,CKLF	TK2,CKLF,CKLF-CMTM1	NA	NA	NA	NA	TK2	29238	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	66557840	66558108	66558016	Y	CKLF	TK2,CKLF,CKLF-CMTM1	NA	NA	NA	NA	TK2	26339	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	66558803	66559094	66558929	Y	CKLF	TK2,CKLF,CKLF-CMTM1	NA	NA	NA	NA	TK2	25353	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	66587187	66587393	66587288	Y	NA	TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM3	NA	NA	NA	NA	CKLF-CMTM1	2697	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr16	67581625	67581971	67581838	Y	RLTPR,CTCF	CTCF	NA	NA	NA	NA	CTCF	12339	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr16	67597304	67597932	67597899	Y	THAP11,RLTPR,ACD	CTCF	NA	NA	NA	NA	CTCF	2994	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr16	67689330	67689673	67689514	Y	NA	ACD,PARD6A	NA	NA	NA	NA	ACD	3040	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	68268995	68269119	68269015	Y	NA	PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	PLA2G15	8088	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	5.88600455971917
chr16	72671878	72672163	72672013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	545548	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	74494901	74495019	74494960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-252A24.2	94763	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	74702224	74702291	74702259	Y	NA	RFWD3,MLKL	NA	NA	NA	NA	RFWD3	3445	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	75109200	75109655	75109345	Y	TMEM170A,ZNRF1	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP1	70735	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	78565966	78565983	78565974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	434656	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	79040745	79040971	79040807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	909435	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	80965900	80966145	80965922	Y	NA	NA	CMC2	IMR90	Hi-C	24141950	CENPN	71958	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	81649296	81649780	81649593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	120922	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	81832236	81832757	81832339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	61534	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr16	81865379	81865629	81865509	Y	CMIP,CMIP,PLCG2	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	94677	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	82689057	82689347	82689181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH6	487226	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	84704578	84704887	84704734	Y	NA	USP10	NA	NA	NA	NA	USP10	26697	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	85037797	85037883	85037799	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	5258	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	85137226	85137296	85137261	Y	COTL1,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	77851	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	85497347	85497685	85497518	Y	KIAA0182,GINS2	NA	KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	223994	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	85603902	85604423	85603949	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	117256	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	85783855	85783992	85783913	Y	NA	C16orf74,COX4I1	NA	NA	NA	NA	C16orf74	1120	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	87378694	87379151	87378934	Y	FBXO31	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	MAP1LC3B	36450	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	87812654	87813065	87812978	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	15056	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	87931288	87931492	87931437	Y	KLHDC4,BANP	SLC7A5,BANP	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	30194	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	88299166	88299470	88299262	Y	BANP,BANP,ZC3H18,RNF166,RNF166,RNF166,CYBA	NA	BANP,ZNF469	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	218255	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	88857121	88857244	88857196	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	7502	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr16	88860126	88860280	88860179	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	CDT1	7341	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr16	88955496	88955935	88955760	Y	NA	TRAPPC2L,GALNS	NA	NA	NA	NA	GALNS	34118	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	89181535	89182183	89181777	Y	CYBA,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,CBFA2T3,CBFA2T3,RPL13,RPL13,ACSF3	ACSF3	NA	NA	NA	NA	ACSF3	28752	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr16	89571786	89572109	89572034	Y	ACSF3,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	16461	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr16	89672117	89672737	89672683	Y	NA	RPL13,SNORD68,CPNE7,CHMP1A	NA	NA	NA	NA	CPNE7	31941	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	2074761	2075171	2074968	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	129506	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	2718511	2718548	2718518	Y	TSR1,MNT,METTL16,RAP1GAP2	RAP1GAP2	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	40161	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	3641791	3642428	3642283	Y	ITGAE,ATP2A3	P2RX5-TAX1BP3,P2RX5,GSG2	NA	NA	NA	NA	GSG2	16580	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr17	4934963	4935218	4935186	Y	NA	CAMTA2,KIF1C	NA	NA	NA	NA	KIF1C	35720	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	7236036	7236269	7236153	Y	POLR2A,ACAP1	YBX2,EIF5A,GPS2,NEURL4,ACAP1	NA	NA	NA	NA	ACAP1	1579	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	18450	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	PER1	27708	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	8041932	8042438	8042328	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	15386	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	8865882	8866269	8866223	Y	NA	PIK3R5	NA	NA	NA	NA	PIK3R5	760	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	10029003	10029256	10029103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	130823	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	10099377	10099732	10099544	Y	MYH4,GAS7	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	60347	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	15225977	15226377	15226177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA74	248956	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	15923170	15923610	15923287	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	22139	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr17	15959345	15959465	15959410	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	58314	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	16249780	16250130	16249956	Y	CENPV	CENPV,UBB	NA	NA	NA	NA	CENPV	4840	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	16319642	16320463	16320033	Y	NA	UBB,TRPV2	NA	NA	NA	NA	TRPV2	2786	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	17208754	17209324	17209000	Y	PLD6,COPS3,COPS3,NT5M	COPS3,NT5M	NA	NA	NA	NA	NT5M	4105	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr17	17677876	17678068	17678030	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREBF1	60257	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	25410571	25410806	25410743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208296	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	25572576	25572861	25572643	Y	WSB1	WSB1	WSB1,KSR1,MIR4522	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	46241	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	26718724	26718918	26718801	Y	FOXN1,C17orf63,SEBOX,SARM1	POLDIP2,TMEM199,SARM1	NA	NA	NA	NA	SARM1	29346	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	26929593	26929935	26929764	Y	TIAF1,PHF12,FLOT2,UNC119	PIGS,ALDOC,SPAG5,KIAA0100	NA	NA	NA	NA	SPAG5	5296	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	27405810	27406234	27406188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO18A	99196	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	27918115	27918172	27918144	Y	GIT1,ANKRD13B	TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	GIT1	900	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	29212303	29212381	29212342	Y	OMG,NF1,C17orf42	TEFM	NA	NA	NA	NA	TEFM	19457	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	29637373	29637640	29637434	Y	CRLF3,EVI2A	EVI2B,EVI2A	NA	NA	NA	NA	EVI2B	1490	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr17	33640144	33640597	33640233	Y	CCT6B,ZNF830,SLFN12L,SLFN5	NA	PEX12,SLFN14,SLC35G3,SLFN12L,SLFN12,SNORD7,AP2B1	IMR90	Hi-C	24141950	SLFN11	58123	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	34227790	34227961	34227895	Y	SLFN12L,CCL5	RDM1	NA	NA	NA	NA	RDM1	27816	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	34871446	34871455	34871448	Y	NA	ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2	NA	NA	NA	NA	PIGW	17392	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr17	36748013	36748410	36748212	Y	NA	NA	ARHGAP23	IMR90	Hi-C	24141950	C17orf96	80777	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1	NA	NA	NA	NA	MIEN1	25371	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	38494493	38494615	38494527	Y	MSL1,CASC3,WIPF2,RARA,RARA	RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	31049	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	38674878	38675250	38674921	Y	TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4	CCR7	IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCR7	44474	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	38678609	38678667	38678638	Y	NA	CCR7	IGFBP4,KRT42P,CCR7,TOP2A,TNS4,RAPGEFL1,WIPF2,CDC6,RARA,GJD3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCR7	41057	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	38703564	38704159	38703879	Y	SMARCE1,MED24,CASC3,TOP2A,CCR7	CCR7	NA	NA	NA	NA	CCR7	15565	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr17	40608913	40609089	40609017	Y	NA	ATP6V0A1	NA	NA	NA	NA	ATP6V0A1	51	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	41428275	41428596	41428403	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM106A	66421	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	42404001	42404290	42404282	Y	C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39	SLC25A39,GRN,FAM171A2	NA	NA	NA	NA	SLC25A39	3763	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	42634020	42634172	42634095	Y	TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH8	55222	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	42706147	42706421	42706320	Y	NA	NA	GPATCH8,C17orf104,RUNDC3A,CCDC43,DBF4B,ITGA2B,FZD2	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC43	58726	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B	NA	NA	NA	NA	DBF4B	14005	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	42872286	42872458	42872432	Y	FMNL1,GRN	NA	NA	NA	NA	NA	DBF4B	88310	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	43249989	43250354	43250021	Y	ADAM11,HIGD1B,GFAP,DCAKD	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2,FMNL1	NA	NA	NA	NA	HEXIM2	13922	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	43951029	43951274	43951198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP27	441242	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	44113965	44114105	44114069	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP27	604178	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	44131950	44132178	44132002	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP27	622163	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	44135698	44135955	44135827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP27	625911	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPS7P11	453062	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr17	45609469	45609601	45609554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPNB1	115241	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	45771013	45771467	45771041	Y	NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1	KPNB1	NA	NA	NA	NA	KPNB1	46171	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	45778272	45778788	45778511	Y	SNX11,SNX11,ITGB3,C17orf57,NPEPPS,SP2,OSBPL7,CDK5RAP3,TBKBP1,TBX21	NA	NA	NA	NA	NA	KPNB1	53430	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	45796870	45797334	45797030	Y	TBKBP1,TBX21	NA	NA	NA	NA	NA	KPNB1	72028	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	46314423	46314444	46314434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX11	135704	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	46662684	46663231	46662943	Y	HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5	HOXB4	NA	NA	NA	NA	HOXB4	7211	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	47765495	47765594	47765536	Y	ABI3,GNGT2,PHOSPHO1,ZNF652,ZNF652,PPP1R9B,MYST2,FAM117A,SPOP	SPOP,SLC35B1	NA	NA	NA	NA	SPOP	11899	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr17	47816909	47817569	47817208	Y	ZNF652,ZNF652,PPP1R9B,MYST2,FAM117A	SLC35B1,KAT7,FAM117A	NA	NA	NA	NA	SLC35B1	32533	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	47838770	47839156	47838963	Y	NA	KAT7,FAM117A,RP11-613C6.4	NA	NA	NA	NA	KAT7	24761	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	48981540	48981884	48981711	Y	RSAD1	TOB1,RP11-700H6.1	TOB1,SPAG9,LINC00483,LOC400604,SPATA20,EPN3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-700H6.1	38190	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	48996377	48996488	48996474	Y	RSAD1	RP11-700H6.1	LOC400604,TOB1,WFIKKN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-700H6.1	23586	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	53047778	53047982	53047880	Y	NA	STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	COX11	3632	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	53497202	53497618	53497598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMD	0	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	54367618	54367784	54367724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCTP	541278	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	55101345	55101678	55101512	Y	NA	SCPEP1	NA	NA	NA	NA	SCPEP1	47879	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	56410599	56410851	56410735	Y	RAD51C,SRSF1,MPO,MTMR4,SUPT4H1	MIR142,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	MIR142	2730	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr17	56736656	56737064	56736885	Y	MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E	RNU1-85P,RAD51C	SEPT4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-85P	17987	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	57841314	57841767	57841379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTRH2	58327	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	57962596	57962816	57962625	Y	NA	TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	TUBD1	5488	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	59802247	59802551	59802410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACA2	135684	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	59939507	59939855	59939761	Y	BRIP1	BRIP1	NA	NA	NA	NA	BRIP1	625	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr17	60250221	60250413	60250340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTS2	246844	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	63119249	63119621	63119552	Y	GNA13	NA	RGS9,GNA13,AMZ2P1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNA13	68292	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	84165	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	64418368	64418393	64418381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	121614	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	67900401	67900565	67900472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2K6	491562	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	68127333	68127525	68127373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2K6	718494	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	71064440	71064923	71064668	Y	CPSF4L	SLC39A11	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	21928	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	72734256	72734824	72734605	Y	DNAI2,CD300A,CD300LB,SLC9A3R1,CD300LF,RAB37,RAB37	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	7967	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	72746451	72746964	72746655	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3660	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	72776079	72776526	72776246	Y	CD300A,CD300LB,CD300C,CD300E,CD300LF,RAB37,SLC9A3R1,SLC16A5,GGA3,TMEM104	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	TMEM104	5457	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	73685500	73685825	73685750	Y	GGA3,MIF4GD,SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	RECQL5	24231	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	74413626	74413718	74413672	Y	NA	PRPSAP1,UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	33570	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	75405377	75405733	75405639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	130726	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	75868419	75868817	75868480	Y	TMC6	NA	NA	NA	NA	NA	TMC8	256034	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	75953939	75954304	75954190	Y	TMEM235,TMC8,TMC6,TMC6,SOCS3,PGS1,TNRC6C	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMC8	170547	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMC8	170055	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	38.2590296381746
chr17	76125814	76126042	76125869	Y	TNRC6C,PGS1,TMC6,TMC8,TMC6	TMC8,TMC6,SYNGR2	NA	NA	NA	NA	TMC6	446	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	76247657	76247919	76247750	Y	TNRC6C,TMC6,TMC8,TMC6	BIRC5,RP11-219G17.4	NA	NA	NA	NA	RP11-219G17.4	24654	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	76379911	76380778	76380428	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	7190	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	76434499	76434541	76434520	Y	TMEM235	NA	NA	NA	NA	NA	PGS1	61778	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	77959820	77960211	77960016	Y	NA	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	47436	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	77967532	77967765	77967641	Y	CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	39882	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	6.86700531967237
chr17	78725388	78725609	78725479	Y	AATK	NA	NA	NA	NA	NA	RPTOR	208769	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	78744627	78744900	78744734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	218498	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr17	80029941	80030069	80030002	Y	HEXDC	STRA13,RAC3,DCXR,GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	DUS1L	8178	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	80158664	80158910	80158860	Y	DUS1L,NARF,HEXDC,CD7,CCDC57	CCDC57,SLC16A3	FASN	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC57	9796	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	80216124	80216440	80216314	Y	NA	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	13167	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr17	80817363	80817528	80817446	Y	HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF,NARF	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	109423	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	6.86700531967237
chr17	80840475	80841074	80840735	Y	HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	132535	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	781638	782117	782009	Y	NA	RNU1-109P,YES1	NA	NA	NA	NA	RNU1-109P	14019	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	830446	830703	830580	Y	NA	RNU1-109P,YES1	CLUL1,ENOSF1,YES1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YES1	19899	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	9129786	9129925	9129855	Y	PPP4R1,ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	ANKRD12	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD12	4301	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	10708268	10708433	10708298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	184366	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	12864190	12864369	12864245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN2	63273	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	13217020	13217525	13217240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	227659	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr18	13274084	13274183	13274139	Y	RNMT,PTPN2,CEP192	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	284723	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr18	13452540	13452718	13452594	Y	C18orf1,C18orf1	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	271941	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	20835223	20835287	20835255	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM241	180638	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	21945811	21945986	21945899	Y	NA	OSBPL1A	NA	NA	NA	NA	OSBPL1A	29858	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	26734222	26734368	26734294	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSG2	2341638	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	29092491	29092685	29092630	Y	DSC3,DSC2,DSG1,DSG2	DSG2	NA	NA	NA	NA	DSG2	16485	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	32671998	32672517	32672048	Y	MAPRE2,MAPRE2,ZNF397,ZNF24	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	117106	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	35230475	35230627	35230551	Y	CELF4	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	823317	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	37629293	37629563	37629339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	715654	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	42556167	42556181	42556174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPG5	989059	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	43266827	43267110	43266932	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPG5	278130	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	14.7150113992979
chr18	43268301	43268510	43268479	Y	EPG5	NA	NA	NA	NA	NA	EPG5	276730	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	44605074	44605239	44605157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDHD2	69652	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	45420480	45420806	45420653	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	34709	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	45454827	45455289	45455128	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	226	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	46297484	46297823	46297654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYM	687894	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	47785953	47786324	47786143	Y	NA	MBD1,CXXC1	NA	NA	NA	NA	MBD1	19820	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	48333504	48333739	48333711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ME2	69680	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	55255652	55255824	55255739	Y	FECH	FECH,NARS	NA	NA	NA	NA	FECH	3648	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	60825008	60825274	60825179	Y	SERPINB12,BCL2	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	160087	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	67682034	67682164	67682099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTTN	189017	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	72704413	72704615	72704528	Y	TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	214688	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	72782580	72783607	72783115	Y	ZNF407,ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	135696	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	7.84800607962556
chr18	74773141	74773504	74773389	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	240578	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	74774000	74774964	74774473	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	241437	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	74803559	74803662	74803615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	270996	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr18	77282333	77282684	77282593	Y	ATP9B,NFATC1,CTDP1	NA	NA	NA	NA	NA	CTDP1	155117	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr18	77283764	77284286	77283852	Y	ATP9B,NFATC1,CTDP1	NA	NA	NA	NA	NA	CTDP1	153515	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr18	77284524	77284884	77284797	Y	ATP9B,NFATC1,CTDP1	NA	NA	NA	NA	NA	CTDP1	152917	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	8.82900683957876
chr19	662216	662510	662281	Y	HMHA1,GZMM,C19orf6,C19orf22,ABCA7,RNF126	POLRMT,RNF126	NA	NA	NA	NA	RNF126	939	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	867005	867400	867203	Y	GPX4,GPX4,C19orf24,ATP5D,ODF3L2,C19orf20,BSG,POLRMT,CNN2,CFD	PRTN3,MED16,R3HDM4	NA	NA	NA	NA	MED16	23818	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	1028160	1028923	1028240	Y	SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7	WDR18,CNN2,ABCA7,HMHA1	NA	NA	NA	NA	CNN2	3862	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	1408607	1408695	1408655	Y	CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3039	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	1855247	1855761	1855485	Y	SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	5806	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	2095281	2095723	2095416	Y	NA	MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MOB3A	609	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	2616819	2617162	2616940	Y	DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A3	120988	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	2621859	2622002	2621918	Y	DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B,TLE2	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A3	116148	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	4108837	4109162	4109070	Y	TMIGD2,CCDC94,C19orf29,APBA3,MRPL54,MATK,ZBTB7A	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	MAP2K2	12964	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	4374109	4374366	4374283	Y	TICAM1,SEMA6B	MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	24178	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	4568924	4569300	4569153	Y	TICAM1,KDM4B,SEMA6B	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L1	68230	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	4912030	4912419	4912247	Y	NA	PLIN3,UHRF1	NA	NA	NA	NA	UHRF1	10938	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	6132012	6132373	6132181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	65210	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	6189136	6189412	6189274	Y	NA	RFX2	NA	NA	NA	NA	RFX2	8171	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	6394891	6395218	6395055	Y	NA	CLPP,ALKBH7,GTF2F1,KHSRP	NA	NA	NA	NA	GTF2F1	2899	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	6773738	6774101	6773933	Y	DENND1C,ZNF557,EMR1,GPR108,VAV1	GPR108,SH2D3A,VAV1	NA	NA	NA	NA	VAV1	3013	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	7427436	7427895	7427614	Y	ZNF557,XAB2,STXBP2,PNPLA6,LOC100131801,ARHGEF18	ARHGEF18	INSR,ARHGEF18,PNPLA6,MCOLN1,ZNF358,C19orf45,CD209,CLEC4G	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF18	30104	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	7756040	7757119	7756175	Y	ARHGEF18,FBN3,MAP2K7,FLJ22184,EVI5L,FCER2,FCER2	RETN,C19orf59,TRAPPC5	NA	NA	NA	NA	TRAPPC5	12311	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	9747838	9748099	9747855	Y	ZNF559,ZNF559,ZNF846	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF561	17763	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	10215397	10215725	10215533	Y	TYK2,S1PR5,S1PR5,ATG4D,FBXL12,ICAM3,C19orf66,PPAN	C19orf66,PPAN-P2RY11,PPAN,EIF3G	NA	NA	NA	NA	PPAN	432	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr19	10215832	10216068	10215900	Y	S1PR5,S1PR5,ANGPTL6	C19orf66,PPAN-P2RY11,PPAN,EIF3G	NA	NA	NA	NA	PPAN	867	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr19	10346765	10347120	10347031	Y	TYK2,S1PR5,S1PR5,DNM2,ATG4D,ZNF846,FBXL12,C19orf66,PPAN,ICAM3	S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM1,ICAM4	NA	NA	NA	NA	DNMT1	6803	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	10515339	10515636	10515481	Y	PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	3125	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	11205696	11206011	11205901	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	7658	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	12270640	12270828	12270733	Y	NA	ZNF136	NA	NA	NA	NA	ZNF136	1051	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	12404552	12404928	12404719	Y	ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44	CTD-2666L21.3,ZNF44,ZNF563	NA	NA	NA	NA	ZNF44	850	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	13024998	13025376	13025029	Y	NA	DNASE2,GCDH,SYCE2,FARSA,CALR,RAD23A,GADD45GIP1	NA	NA	NA	NA	SYCE2	2714	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	13957204	13959386	13957586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	52930	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr19	14617819	14618098	14617969	Y	IL27RA,DDX39A,PKN1,DNAJB1	GIPC1,TECR,DNAJB1	GIPC1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TECR	7799	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	15334094	15334476	15334286	Y	SLC1A6,WIZ	NA	NA	NA	NA	NA	ILVBL	99498	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	15947617	15948119	15947980	Y	AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1	NA	NA	NA	NA	NA	TPM4	227712	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	18414244	18414595	18414365	Y	NA	JUND,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	17489	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr19	18533547	18533601	18533574	Y	ARRDC2,IL12RB1	SSBP4	NA	NA	NA	NA	SSBP4	5873	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	19570650	19571032	19570761	Y	ZNF506,RFXANK,MAU2,GATAD2A,ZNF14,PBX4,GMIP	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	53513	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	28335206	28335537	28335292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1366911	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	30215159	30215467	30215313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHF1	61196	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	36882143	36882391	36882267	Y	NA	ZFP14,ZFP82	NA	NA	NA	NA	ZFP14	14042	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	38807798	38808031	38807971	Y	MAP4K1,EIF3K,RASGRP4,FAM98C	YIF1B,KCNK6	NA	NA	NA	NA	KCNK6	453	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr19	41915515	41915996	41915671	Y	ARHGEF1,HNRNPUL1,TGFB1	B9D2,BCKDHA,EXOSC5,ATP5SL	NA	NA	NA	NA	EXOSC5	14131	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	42037922	42038313	42037990	Y	CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1	CEACAM21	LOC100505495	IMR90	Hi-C	24141950	CEACAM21	15573	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	ERF	14986	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	42784087	42784212	42784170	Y	CEACAM8,CEACAM3,DEDD2	GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,MEGF8	NA	NA	NA	NA	PRR19	20038	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,MEGF8	NA	NA	NA	NA	PRR19	19259	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	44066872	44067293	44067141	Y	ZNF230,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61,IRGQ	ZNF575,ETHE1,XRCC1,IRGQ,ZNF576,SRRM5	NA	NA	NA	NA	XRCC1	15332	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	44178912	44179361	44178991	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61	PLAUR	PLAUR	MCF7	ChIA-PET	22265404	PLAUR	6213	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	45352951	45353140	45353112	Y	NA	PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	5519	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,FOSB,ERCC1	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr19	47448240	47448462	47448420	Y	PNMAL1,PNMAL2,DACT3,ARHGAP35,MEIS3,NPAS1	NA	NA	NA	NA	NA	AP2S1	95991	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	47613231	47613789	47613256	Y	PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	742	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	BBC3,CCDC9	NA	NA	NA	NA	CCDC9	19511	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr19	48101913	48102072	48101991	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85416	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	48657871	48658185	48658028	Y	NA	LIG1	NA	NA	NA	NA	LIG1	13675	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	51059944	51060288	51060130	Y	NA	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	47334	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	51198423	51198838	51198828	Y	KLK6,KCNC3,ASPDH,LRRC4B,SYT3,SYT3,SHANK1	C19orf81,SHANK1	NA	NA	NA	NA	SHANK1	21869	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	51221435	51221859	51221691	Y	KCNC3,ASPDH,LRRC4B,SYT3,SYT3,SHANK1	SHANK1	NA	NA	NA	NA	SHANK1	728	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	51287900	51288107	51288100	Y	NA	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	18079	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr19	52051924	52052067	52051980	Y	ZNF175	ZNF175	ZNF175,SIGLEC10,SIGLEC8,SIGLEC6,SIGLEC5	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF175	20484	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	52302339	52303044	52302768	Y	ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC12,SIGLEC12,SIGLEC14,FPR1,FPR2,FPR3	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF649	103249	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	53237186	53237523	53237297	Y	ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611	ZNF83,ZNF611	NA	NA	NA	NA	ZNF611	860	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	ZNF665	NA	NA	NA	NA	ZNF665	32764	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr19	54714720	54715094	54714879	Y	NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6	MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	12110	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	54884057	54884427	54884221	Y	VSTM1,OSCAR,LILRB3,LILRB2,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR2,LILRA3,LILRA3,LILRA5,LAIR1	LAIR1	PRKCG,CACNG7,CACNG6,VSTM1,TSEN34,MBOAT7,RPS9	K562,HELA	5C	22955621	LAIR1	3892	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	54885175	54886148	54885583	Y	VSTM1,OSCAR,LILRB3,LILRA6,LILRB2,KIR3DL3,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR2,FCAR,LILRA3,LILRA3,LILRA5,LAIR1	LAIR1	PRKCG,CACNG7,CACNG6,VSTM1,TSEN34,MBOAT7,RPS9	K562,HELA	5C	22955621	LAIR1	5010	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	54886806	54887123	54887067	Y	VSTM1,TARM1,OSCAR,LILRB3,LILRB2,KIR3DL3,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR2,FCAR,LILRA3,LILRA3,LILRA5,LAIR1	LAIR1	PRKCG,CACNG7,CACNG6,VSTM1,TSEN34,MBOAT7,RPS9	K562,HELA	5C	22955621	LAIR1	6641	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr19	55850120	55850505	55850225	Y	KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564	SUV420H2,TMEM238,RPL28	NA	NA	NA	NA	SUV420H2	899	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	55885541	55885905	55885786	Y	NA	SUV420H2,TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	TMEM238	8061	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	58315114	58315751	58315446	Y	ZNF543,ZNF549,ZNF418,ZNF135,ZNF154,ZNF552	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	8530	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr19	59050036	59050316	59050176	Y	ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,ZNF132,ZNF324B,ZNF324,TRIM28,MZF1	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	ZBTB45	1758	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	1719023	1719384	1719170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTG2	774469	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	3583560	3583858	3583796	Y	NA	AC108488.4,RNASEH1-AS1,RNASEH1,RPS7	NA	NA	NA	NA	AC108488.4	1097	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	7100927	7101152	7100993	Y	NA	RNF144A	NA	NA	NA	NA	RNF144A	45404	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	8661100	8661349	8661222	Y	ID2	NA	LOC100506274,LINC00299,ID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID2	155626	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	9688603	9688902	9688848	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	5019	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	11270081	11270242	11270156	Y	KCNF1,C2orf50	AC062028.1,PQLC3	NA	NA	NA	NA	AC062028.1	705	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	11483029	11483376	11483266	Y	NA	ROCK2	NA	NA	NA	NA	ROCK2	3080	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	12291470	12291837	12291654	Y	NA	NA	TRIB2,LOC100506474	IMR90	Hi-C	24141950	LPIN1	475749	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	12856062	12856442	12856137	Y	NA	TRIB2	NA	NA	NA	NA	TRIB2	1047	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	15282327	15282677	15282506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	416777	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	18066155	18066219	18066212	Y	MSGN1	NA	NA	NA	NA	NA	SMC6	86646	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	20421306	20421667	20421468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PUM2	128328	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	23681941	23682000	23681953	Y	KLHL29	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	465984	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	24852047	24852369	24852206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOA1	139264	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	25193628	25193634	25193631	Y	NA	DNAJC27-AS1,DNAJC27	NA	NA	NA	NA	DNAJC27	665	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	25518028	25518279	25518198	Y	DNAJC27,DNMT3A	DNMT3A	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	45180	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	26567616	26567683	26567653	Y	NA	EPT1	NA	NA	NA	NA	EPT1	38201	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	27304052	27304486	27304234	Y	CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1	AGBL5,OST4,KHK,ABHD1	NA	NA	NA	NA	KHK	3129	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	27631105	27631216	27631160	Y	C2orf16	EIF2B4,SNX17,FTH1P3,PPM1G,NRBP1	NA	NA	NA	NA	PPM1G	551	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	30448125	30448425	30448217	Y	YPEL5,LBH	LBH	LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	LBH	3972	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	37308622	37308977	37308800	Y	NA	HEATR5B	NA	NA	NA	NA	HEATR5B	508	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	37763005	37763322	37763129	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	200289	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	38538303	38538646	38538475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATL2	63781	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	40147483	40147654	40147555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC8A1-AS1	135890	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	40647677	40648234	40647999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC8A1-AS1	636084	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	40701403	40701746	40701584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC8A1-AS1	689810	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	43020336	43020977	43020619	Y	HAAO	NA	NA	NA	NA	NA	MTA3	300627	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	43195156	43195444	43195331	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	256304	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	43359752	43360119	43360054	Y	NA	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	91629	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	43364025	43364471	43364316	Y	ZFP36L2,THADA,THADA	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	87277	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	43422005	43422472	43422185	Y	THADA,THADA,ZFP36L2	ZFP36L2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	29276	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr2	43672480	43672679	43672609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THADA	148506	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	44664975	44664991	44664983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMKMT	77886	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	48718676	48719233	48718981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	52939	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	50701819	50701837	50701828	Y	NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	2036082	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	54786900	54787386	54787056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	550371	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	549993	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	54796924	54797237	54797074	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	540520	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	54801406	54802103	54801693	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	535654	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	56267618	56267636	56267627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNPT1	348573	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	59983827	59983888	59983858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	625852	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	60153513	60153663	60153622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	456077	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	60327078	60327537	60327382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	282203	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	62531997	62532204	62532030	Y	B3GNT2	NA	COMMD1	IMR90	Hi-C	24141950	B3GNT2	110749	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	64439546	64439941	64439735	Y	SERTAD2,AFTPH,PELI1	NA	NA	NA	NA	NA	PELI1	69958	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	64552666	64552842	64552755	Y	PELI1,SERTAD2,AFTPH	NA	PELI1,AFTPH,LINC00309	IMR90	Hi-C	24141950	PELI1	183078	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	65151416	65151594	65151536	Y	AFTPH,RAB1A,ACTR2,SLC1A4	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A4	62017	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	65173308	65173867	65173558	Y	AFTPH,SERTAD2	SLC1A4	SERTAD2,AFTPH,LOC339807,LOC400958,SLC1A4,CEP68,ACTR2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC1A4	39744	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	69025646	69026018	69025855	Y	PLEK,FBXO48,APLF,ARHGAP25,ARHGAP25	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP25	120913	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	69040869	69041120	69040946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP25	136136	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	69062805	69062948	69062879	Y	PLEK,FBXO48,APLF,ARHGAP25	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP25	158072	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	69135600	69135857	69135778	Y	NA	NA	ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10	IMR90	Hi-C	24141950	ANTXR1	102453	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	69750715	69750748	69750731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFU1	87955	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	72748040	72748317	72748179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	302853	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	73233755	73233809	73233782	Y	NA	NA	EMX1	IMR90	Hi-C	24141950	SFXN5	66938	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	74206209	74206465	74206360	Y	SLC4A5,MOBKL1B,TET3	DGUOK-AS1,TET3	DGUOK	MCF7	ChIA-PET	22265404	DGUOK-AS1	103	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	77555136	77555510	77555330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	457998	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	86722014	86722392	86722297	Y	RMND5A	NA	NA	NA	NA	NA	KDM3A	56244	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	87019569	87019949	87019758	Y	CD8B,CD8A,CD8A	CD8A	NA	NA	NA	NA	CD8A	13570	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	87036674	87037618	87036781	Y	CD8A,CD8A,CD8B	CD8A	NA	NA	NA	NA	CD8A	3155	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	88374618	88374677	88374648	Y	NA	KRCC1	NA	NA	NA	NA	KRCC1	21370	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	91936197	91936406	91936290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2947035	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	96829653	96829922	96829703	Y	KIAA1310,ITPRIPL1,ITPRIPL1,ARID5A,DUSP2	DUSP2,STARD7	NA	NA	NA	NA	DUSP2	20474	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr2	96830596	96830784	96830751	Y	DUSP2	DUSP2,STARD7	NA	NA	NA	NA	DUSP2	21417	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	97204407	97205263	97204568	Y	NA	ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	3927	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr2	97522669	97523105	97522935	Y	NA	CNNM3,ANKRD23,ANKRD39	NA	NA	NA	NA	ANKRD39	837	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr2	98335130	98335273	98335200	Y	ACTR1B,ZAP70,ZAP70	ZAP70	NA	NA	NA	NA	ZAP70	7107	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	98352519	98352655	98352554	Y	NA	ZAP70	NA	NA	NA	NA	ZAP70	24496	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	98364129	98364314	98364298	Y	TMEM131,ZAP70,ZAP70	ZAP70	NA	NA	NA	NA	ZAP70	36106	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZAP70	115188	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	99173119	99173416	99173284	Y	INPP4A	COA5,UNC50	UNC50,COA5	IMR90	Hi-C	24141950	COA5	49562	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	99387536	99387795	99387553	Y	TSGA10,TSGA10,LIPT1,LIPT1,INPP4A,MGAT4A,MGAT4A	MGAT4A	MGAT4A	MCF7	ChIA-PET	22265404	MGAT4A	41947	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	102133779	102134093	102133972	Y	MAP4K4,MAP4K4	RFX8	MAP4K4,RFX8,CREG2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RFX8	44614	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	106412674	106413002	106412675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	53320	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	106416912	106417146	106416970	Y	C2orf49,NCK2	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	57558	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	106474357	106474542	106474414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	115003	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	109229262	109229375	109229308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	80405	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	109648298	109648660	109648428	Y	LIMS1,RANBP2	NA	MALL,EDAR	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC138	247085	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	112811776	112811937	112811878	Y	ZC3H6	TMEM87B	NA	NA	NA	NA	TMEM87B	976	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	114649026	114649412	114649076	Y	CBWD2,ACTR3	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	3489	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	119667637	119667656	119667647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf76	454748	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	119989660	119989833	119989766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf76	132571	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	122298770	122299123	122298947	Y	NA	RNU4ATAC	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC	12313	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	122456992	122457582	122457167	Y	CLASP1	TSN	NA	NA	NA	NA	TSN	35097	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr2	129074706	129075071	129074888	Y	NA	HS6ST1	NA	NA	NA	NA	HS6ST1	555	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	129381655	129381863	129381711	Y	NA	NA	UGGT1,HS6ST1	IMR90	Hi-C	24141950	HS6ST1	307504	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	129492302	129492674	129492575	Y	NA	NA	HS6ST1,UGGT1	IMR90	Hi-C	24141950	HS6ST1	418151	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr2	130201021	130201117	130201085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MZT2B	736193	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	131555592	131555820	131555689	Y	CCDC115	NA	PLEKHB2,FAM168B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM168B	293213	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	135701216	135701448	135701313	Y	NA	CCNT2,CCNT2-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNT2-AS1	26936	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	136880226	136880532	136880413	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	CXCR4	NA	NA	NA	NA	CXCR4	6491	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	136893434	136894485	136893919	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	CXCR4	NA	NA	NA	NA	CXCR4	19699	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	140168949	140169074	140169000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXCR4	3295214	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	141613060	141613069	141613065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP15	2233862	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	144013747	144014085	144013828	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP15	166816	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr2	148094719	148094877	148094798	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009480.4	471038	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	152144821	152144962	152144854	Y	RIF1,RIF1,RIF1,NMI	RBM43,NMI	NA	NA	NA	NA	NMI	250	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr2	160353770	160354019	160353895	Y	MARCH7,CD302	AC009506.2	NA	NA	NA	NA	AC009506.2	36003	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	164425693	164425701	164425698	Y	FIGN	NA	NA	NA	NA	NA	GCA	1252343	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	166779898	166780276	166780103	Y	NA	TTC21B	NA	NA	NA	NA	TTC21B	28077	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	168994093	168994243	168994234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK39	108408	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr2	172649817	172649933	172649875	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2	107898	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	175036157	175036485	175036321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OLA1	74941	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	175458304	175458790	175458407	Y	CIR1,GPR155,WIPF1	NA	NA	NA	NA	NA	AC010894.3	108187	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	175459812	175460479	175460357	Y	CIR1,GPR155,WIPF1	NA	NA	NA	NA	NA	AC010894.3	109695	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	182089643	182089935	182089741	Y	ITGA4	NA	NA	NA	NA	NA	AC104820.2	124984	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	182170258	182170790	182170550	Y	ITGA4	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA4	149139	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	182177649	182177833	182177744	Y	ITGA4	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA4	142096	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	182258262	182258376	182258308	Y	ITGA4	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA4	61553	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	182367881	182368047	182367964	Y	ITGA4	ITGA4	NA	NA	NA	NA	ITGA4	47952	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	182418889	182419281	182419085	Y	NEUROD1,CERKL	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA4	98960	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	198144443	198144693	198144592	Y	NA	ANKRD44	NA	NA	NA	NA	ANKRD44	29204	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	200839985	200840279	200840201	Y	NA	C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	TYW5	21526	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	201829288	201829721	201829590	Y	KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2	AC005037.3,ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	2885	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr2	208395422	208395980	208395659	Y	PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1	CREB1	NA	NA	NA	NA	CREB1	2961	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	208609048	208609450	208609191	Y	NA	CCNYL1	NA	NA	NA	NA	CCNYL1	34784	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	216223263	216223304	216223303	Y	NA	ATIC	NA	NA	NA	NA	ATIC	48723	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	217035180	217035407	217035275	Y	NA	NA	PKI55	IMR90	Hi-C	24141950	XRCC5	64993	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	219760047	219760178	219760137	Y	WNT10A	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL4	186479	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	FARSB	691645	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	223784632	223784923	223784806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL3	60980	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	224569350	224569680	224569515	Y	NA	NA	AP1S3	IMR90	Hi-C	24141950	AP1S3	131064	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	225875465	225875930	225875836	Y	DOCK10	DOCK10	NA	NA	NA	NA	DOCK10	29232	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	225905656	225906528	225906251	Y	CUL3,DOCK10	DOCK10	NA	NA	NA	NA	DOCK10	494	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	227656309	227656561	227656437	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	5914	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr2	227849549	227849707	227849645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHBDD1	151252	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	230133790	230134515	230134391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO36	650503	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	231523854	231524330	231524235	Y	GPR55,SP110,SP140,SP140L,CAB39	NA	CAB39	K562	ChIA-PET	22265404	CAB39	51230	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr2	232330093	232330255	232330170	Y	NA	SNORD82,NCL	NA	NA	NA	NA	SNORD82	6942	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	232478392	232478857	232478528	Y	DIS3L2,PTMA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90748	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr2	232478879	232479328	232479053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90277	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	232479434	232479727	232479552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	89878	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	232580827	232581056	232580891	Y	NA	PTMA	NA	NA	NA	NA	PTMA	11222	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	235199266	235199754	235199416	Y	ARL4C	NA	TRPM8,ARL4C	IMR90	Hi-C	24141950	AC097713.4	161485	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	238582267	238582825	238582560	Y	LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	48048	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	238616188	238616491	238616226	Y	ILKAP,LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	81969	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	238876433	238876638	238876539	Y	LRRFIP1,UBE2F	UBE2F	NA	NA	NA	NA	UBE2F	2964	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	240196933	240197336	240197049	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	124012	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	240243731	240244004	240243870	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	77344	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	6.86700531967237
chr2	240291335	240291754	240291620	Y	HDAC4	HDAC4	NA	NA	NA	NA	HDAC4	29594	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr2	242549642	242550327	242549774	Y	ATG4B	ATG4B,THAP4	NA	NA	NA	NA	ATG4B	24301	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	1168274	1168908	1168417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNPH	76052	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	1338546	1338920	1338732	Y	NA	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	32886	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	1792448	1792844	1792660	Y	NA	NA	STK35,SIRPA,LOC100507495,SNPH,FKBP1A-SDCBP2	IMR90	Hi-C	24141950	SIRPG	156023	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	3170247	3170648	3170474	Y	NA	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	DDRGK1	12683	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	5155364	5155504	5155434	Y	NA	CDS2	NA	NA	NA	NA	CDS2	49932	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	5553446	5553705	5553635	Y	NA	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	35967	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	5695211	5695702	5695385	Y	C20orf196	C20orf196	GPCPD1,C20orf196	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf196	33337	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr20	10482481	10482747	10482670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	69611	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	13427146	13427424	13427285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TASP1	190163	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	17591305	17591483	17591343	Y	NA	DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	42797	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	17637776	17637930	17637851	Y	BANF2	RRBP1	NA	NA	NA	NA	RRBP1	23010	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	19737104	19737460	19737269	Y	NA	NA	SLC24A3,RIN2,C20orf26,CRNKL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAA20	258300	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	20432950	20433312	20432989	Y	C20orf26,INSM1	NA	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	257819	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	25071353	25071583	25071428	Y	GINS1	ACSS1	ACSS1,VSX1,ENTPD6,PYGB	IMR90	Hi-C	24141950	ACSS1	33737	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr20	25071819	25071933	25071899	Y	GINS1	ACSS1	ACSS1,VSX1,ENTPD6,PYGB	IMR90	Hi-C	24141950	ACSS1	34203	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr20	25671297	25671837	25671511	Y	NA	ZNF337	NA	NA	NA	NA	ZNF337	3640	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr20	30255856	30255976	30255884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	53816	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	30262675	30263005	30262853	Y	HCK,BCL2L1	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	46787	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	31127706	31127839	31127777	Y	ASXL1	C20orf112	NA	NA	NA	NA	C20orf112	43037	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	31560072	31560429	31560192	Y	CDK5RAP1	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE1	154373	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr20	32966378	32966977	32966403	Y	GGT7	ITCH	NA	NA	NA	NA	ITCH	17337	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	33064297	33064587	33064427	Y	ACSS2	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	FDX1P1	2018	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	35272770	35272992	35272906	Y	RBL1,SAMHD1,SLA2	C20orf24,SLA2	NA	NA	NA	NA	SLA2	151	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	35572677	35573004	35572914	Y	RBL1,TGIF2,TGIF2,SLA2,SAMHD1	NA	NA	NA	NA	NA	RBL1	149184	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	39631777	39632207	39632178	Y	NA	TOP1	PLCG1,TOP1,ZHX3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOP1	23251	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	39826598	39826945	39826630	Y	CHD6	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG1	62998	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	43273413	43273648	43273594	Y	C20orf111,STK4	ADA	NA	NA	NA	NA	ADA	5226	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	45960088	45960376	45960270	Y	ZMYND8	ZMYND8	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	23191	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	46057073	46057256	46057165	Y	NA	NA	NCOA3,EYA2,ZMYND8	IMR90	Hi-C	24141950	NCOA3	71345	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	46356086	46356757	46356412	Y	SULF2,SULF2	NA	NA	NA	NA	NA	NCOA3	227485	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	47547466	47547777	47547635	Y	ZNFX1,ARFGEF2	ARFGEF2	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	11039	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	48770876	48771106	48770991	Y	NA	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,CEBPB	NA	NA	NA	NA	TMEM189	2541	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	48950504	48950697	48950581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPB	145128	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	49650336	49650514	49650422	Y	NA	NA	KCNG1,NFATC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MOCS3	76973	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	52294676	52294905	52294769	Y	NA	NA	BMP7,SUMO1P1,BCAS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PFDN4	527481	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr20	52346173	52346470	52346387	Y	NA	NA	ZNF217	IMR90	Hi-C	24141950	PFDN4	475916	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	52634574	52634959	52634648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	187427	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	56881560	56881733	56881657	Y	STX16,RAB22A	RAB22A	NA	NA	NA	NA	RAB22A	1019	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	57018014	57018479	57018179	Y	STX16	NA	NA	NA	NA	NA	VAPB	55836	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	57677920	57678303	57678192	Y	STX16	NA	ZNF831,GNAS-AS1,GNAS	IMR90	Hi-C	24141950	SLMO2	61956	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	57735475	57736078	57735576	Y	TUBB1,ZNF831	NA	NA	NA	NA	NA	SLMO2	119511	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	57738628	57739096	57738774	Y	ZNF831	NA	NA	NA	NA	NA	SLMO2	122664	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr20	57750104	57750489	57750217	Y	ZNF831	NA	ZNF831	IMR90	Hi-C	24141950	SLMO2	134140	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	58964846	58965478	58965226	Y	NA	NA	LOC284757	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1043L13.1	303951	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	60076760	60076823	60076763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF4	562043	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr20	60256764	60257074	60256889	Y	CDH4	NA	NA	NA	NA	NA	TAF4	381792	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	61371540	61371927	61371747	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	NA	NA	NA	NA	NA	OGFR	62260	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	61560348	61560848	61560731	Y	NA	DIDO1	NA	NA	NA	NA	DIDO1	6456	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	61641732	61642015	61641970	Y	DIDO1,BHLHE23	NA	NA	NA	NA	NA	DIDO1	74428	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr20	61764397	61764626	61764512	Y	NA	NA	LOC63930,NKAIN4,BIRC7,HAR1B,HAR1A	IMR90	Hi-C	24141950	YTHDF1	80960	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr21	9881917	9882087	9882000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEKT4P2	84498	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr21	11090314	11090328	11090319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEKT4P2	1123729	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr21	17276028	17276063	17276046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	175684	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr21	18212520	18212612	18212566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTG3	770653	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr21	30451583	30451905	30451778	Y	USP16,BACH1,BACH1,C21orf7	CCT8	NA	NA	NA	NA	CCT8	7465	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr21	30607939	30608477	30608249	Y	USP16,BACH1,BACH1	BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	43547	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr21	33104933	33105321	33105127	Y	NA	SCAF4	NA	NA	NA	NA	SCAF4	2545	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr21	35322307	35322646	35322477	Y	NA	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	36023	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr21	36214787	36216208	36215152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	770917	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr21	36257911	36258724	36258067	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	814041	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr21	36326686	36327019	36326981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	882816	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr21	36342558	36342757	36342568	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	898688	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr21	37909542	37909917	37909766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHAF1B	153866	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr21	40277371	40277733	40277541	Y	NA	NA	ETS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ETS2	102140	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr21	41759918	41760275	41760196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACE2	777453	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr21	42598872	42599018	42598944	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACE2	61144	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr21	43654635	43655282	43654967	Y	NA	ABCG1	TFF3	IMR90	Hi-C	24141950	ABCG1	36836	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr21	43881012	43881164	43881098	Y	ZNF295,UMODL1,ABCG1,ABCG1,UBASH3A	SLC37A1	NA	NA	NA	NA	SLC37A1	32954	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr21	43881255	43881524	43881384	Y	NA	SLC37A1	NA	NA	NA	NA	SLC37A1	32594	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr21	44103716	44104369	44104011	Y	UBASH3A,WDR4	PDE9A	NA	NA	NA	NA	PDE9A	31970	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	5.88600455971917
chr21	44529146	44529448	44529286	Y	U2AF1	U2AF1	NA	NA	NA	NA	U2AF1	3449	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr21	44850435	44851222	44850996	Y	CBS	SIK1	CRYAA,SIK1,HSF2BP,LINC00313,LINC00319,RRP1B	IMR90	Hi-C	24141950	SIK1	5427	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr21	45198694	45199238	45199184	Y	NA	CSTB,RRP1	NA	NA	NA	NA	CSTB	4368	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr21	46274069	46274460	46274264	Y	KRTAP12-4,UBE2G2,SUMO3	SUMO3,PTTG1IP	NA	NA	NA	NA	PTTG1IP	17292	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr21	46300808	46301095	46300927	Y	ITGB2	PTTG1IP,ITGB2-AS1,ITGB2	PTTG1IP	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTTG1IP	9056	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr21	46676975	46677154	46677045	Y	NA	POFUT2	NA	NA	NA	NA	POFUT2	28659	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr21	47010868	47011351	47011033	Y	NA	SLC19A1	PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC19A1	48543	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr21	47167832	47168236	47167895	Y	NA	NA	PCBP3,LOC100129027	IMR90	Hi-C	24141950	PCBP3	106224	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	17568441	17568522	17568513	Y	NA	IL17RA	NA	NA	NA	NA	IL17RA	4597	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	18264097	18264299	18264131	Y	CECR2,BCL2L13,BID,BID	BID,LINC00528	NA	NA	NA	NA	LINC00528	6009	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	19043288	19043502	19043327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGCR2	64465	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	20232624	20232972	20232704	Y	TRMT2A	NA	NA	NA	NA	NA	DGCR6L	72631	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	22011632	22012115	22011859	Y	NA	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	7073	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	22170870	22171333	22171102	Y	HIC2,PPM1F,MAPK1	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	48637	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	22187099	22187411	22187395	Y	PPM1F,MAPK1	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	32559	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	24795656	24796304	24795694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPECC1L-ADORA2A	130790	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	24821513	24821637	24821577	Y	GGT1,ADORA2A	NA	NA	NA	NA	NA	SNRPD3	127834	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr22	25815594	25815803	25815685	Y	ADRBK2,LRP5L	LRP5L,CRYBB2P1	MYO18B,CRYBB2P1,LRP5L,SEZ6L,KIAA1671	IMR90	Hi-C	24141950	LRP5L	16250	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	26921035	26921055	26921043	Y	TPST2	HPS4,SRRD,TFIP11,HMGB1P10	NA	NA	NA	NA	TFIP11	14564	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	27131212	27131584	27131334	Y	NA	NA	MN1,PITPNB,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-211A9.5	64482	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	29206791	29206989	29206921	Y	EMID1,CCDC117,XBP1	CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6	XBP1	K562	ChIA-PET	22265404	CTA-292E10.6	12120	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	29207861	29207973	29207910	Y	EMID1	CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6	XBP1,CHEK2,HSCB,C22orf31,ZNRF3,KREMEN1,TTC28,TTC28-AS1,EMID1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CTA-292E10.6	13190	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr22	29600744	29600965	29600829	Y	CHEK2,EWSR1,EMID1	EMID1	NA	NA	NA	NA	EMID1	904	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	29601085	29601300	29601289	Y	NA	EMID1	NA	NA	NA	NA	EMID1	1245	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	30721148	30721367	30721290	Y	MTMR3,OSM,SLC35E4,TBC1D10A	GATSL3,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1	NA	NA	NA	NA	TBC1D10A	113	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	35528321	35528338	35528332	Y	NA	NA	LARGE	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-714B7.5	96711	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	36385915	36386246	36386112	Y	NA	RBFOX2	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	36227	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	36847830	36847945	36847861	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2,NCF4,CSF2RB	TXN2	NA	NA	NA	NA	TXN2	28132	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	36866824	36867261	36867092	Y	NA	TXN2,FOXRED2	NA	NA	NA	NA	TXN2	8816	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	37638328	37638951	37638750	Y	SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4	Z82188.1,CYTH4	NA	NA	NA	NA	RAC2	0	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	37679516	37679652	37679588	Y	SH3BP1,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4	RAC2,CYTH4	NA	NA	NA	NA	CYTH4	3448	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	37703985	37704250	37704217	Y	SH3BP1,MFNG,MFNG,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,IL2RB,RAC2,CYTH4	CYTH4	NA	NA	NA	NA	CYTH4	27917	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr22	39486366	39486808	39486580	Y	LOC646851,JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3D,APOBEC3G,APOBEC3H	APOBEC3H	NA	NA	NA	NA	APOBEC3H	4421	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	39784774	39784929	39784841	Y	APOBEC3D,APOBEC3G,CBX7	SYNGR1,TAB1	NA	NA	NA	NA	TAB1	8817	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr22	39923809	39924011	39923907	Y	NA	ATF4,RPS19BP1	NA	NA	NA	NA	RPS19BP1	2849	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	40323368	40324104	40323679	Y	GRAP2	GRAP2	NA	NA	NA	NA	GRAP2	28282	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	40451411	40451463	40451437	Y	NA	TNRC6B,RPL7P52	NA	NA	NA	NA	TNRC6B	12590	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	40781478	40781596	40781515	Y	NA	ADSL,SGSM3	NA	NA	NA	NA	SGSM3	16883	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	42839941	42840323	42840234	Y	POLDIP3,C22orf32,TCF20,RRP7A,NFAM1	NA	MEI1,TCF20,NDUFA6,LOC100132273,C22orf32,CYP2D6,NFAM1,WBP2NL,RNU12,POLDIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RRP7A	73485	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	47330872	47331057	47330965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	174354	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	49031660	49032049	49031799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	1187111	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	50232497	50232886	50232656	Y	TUBGCP6,BRD1,ZBED4,CRELD2	BRD1,ZBED4	ZBED4	K562	ChIA-PET	22265404	ZBED4	12604	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	50262824	50262951	50262946	Y	TUBGCP6,MLC1	BRD1,ZBED4,CRELD2,ALG12	NA	NA	NA	NA	ZBED4	17334	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	50364350	50364715	50364589	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12189	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr22	50976592	50977006	50976816	Y	PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B	LMF2,NCAPH2,SCO2,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	SCO2	13724	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	3177157	3177268	3177188	Y	CRBN	TRNT1,CRBN	NA	NA	NA	NA	TRNT1	10557	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	4909917	4910799	4910503	Y	ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	108002	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	5237403	5237551	5237430	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	EDEM1	NA	NA	NA	NA	EDEM1	10072	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	9050336	9050687	9050476	Y	NA	RAD18	NA	NA	NA	NA	RAD18	46879	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	10228924	10229327	10229283	Y	VHL,IRAK2,TATDN2	VHL	NA	NA	NA	NA	VHL	48232	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	10273840	10274164	10273944	Y	VHL,IRAK2,TATDN2	TATDN2	NA	NA	NA	NA	TATDN2	13543	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	12688995	12689498	12689361	Y	RAF1	RAF1	NA	NA	NA	NA	RAF1	14227	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	13111176	13111312	13111239	Y	NUP210,IQSEC1	IQSEC1	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	1305	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	13305478	13305792	13305632	Y	NA	NA	NUP210	IMR90	Hi-C	24141950	NUP210	154017	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	13457131	13457321	13457226	Y	NUP210	NUP210	NA	NA	NA	NA	NUP210	2488	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	13599112	13599483	13599298	Y	FBLN2	FBLN2	NA	NA	NA	NA	FBLN2	27288	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	15677848	15678314	15678139	Y	ANKRD28,SH3BP5,SH3BP5,EAF1	BTD,HACL1	NA	NA	NA	NA	HACL1	36510	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	15712856	15713111	15712984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	71518	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	16342509	16342839	16342720	Y	OXNAD1	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	37803	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	5.88600455971917
chr3	16373323	16373612	16373405	Y	ANKRD28,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	68617	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	16508881	16509222	16509075	Y	PLCL2,DPH3,RFTN1	RFTN1	NA	NA	NA	NA	RFTN1	44311	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	18409984	18410150	18410103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	74159	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	18453300	18453576	18453481	Y	NA	TBC1D5,SATB1	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	30733	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	20082717	20083237	20083200	Y	RAB5A,KAT2B	RNU4-85P,KAT2B	NA	NA	NA	NA	KAT2B	3202	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	20190984	20191185	20191115	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	34599	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	23389835	23390198	23389844	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2E2	147324	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	23818113	23818374	23818285	Y	UBE2E1	UBE2E1	UBE2E2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E1	27020	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	23935594	23935945	23935770	Y	NA	RPL15	NA	NA	NA	NA	RPL15	20091	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	25790563	25790933	25790768	Y	NA	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	31475	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	25796078	25796406	25796226	Y	NGLY1	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	26002	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	27448684	27449023	27448831	Y	NA	NA	NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	SLC4A7	74888	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	NA	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	EOMES	87236	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr3	31267763	31268179	31268080	Y	STT3B	NA	GADL1	IMR90	Hi-C	24141950	STT3B	303951	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	32501642	32502196	32501852	Y	CNOT10,CCR4,CMTM7	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	40704	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	33089398	33089551	33089467	Y	CCR4	SEC13P1,TMPPE,GLB1	NA	NA	NA	NA	SEC13P1	16043	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	33638872	33639200	33639124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLASP2	118648	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr3	38046580	38046956	38046768	Y	SLC22A14	VILL	NA	NA	NA	NA	VILL	19030	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	41624626	41624831	41624729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ULK4	377091	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	45953510	45953801	45953609	Y	SACM1L,FYCO1	LZTFL1,CXCR6	NA	NA	NA	NA	LZTFL1	1733	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	46587372	46587917	46587474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCRL2	140718	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	4.90500379976598
chr3	47704557	47705253	47705047	Y	SETD2	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCC1	116343	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr3	50274525	50274666	50274593	Y	RASSF1,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2	GNAI2	NA	NA	NA	NA	GNAI2	12801	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	51720527	51720790	51720691	Y	VPRBP	TEX264	NA	NA	NA	NA	TEX264	25818	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	52625235	52625395	52625315	Y	DNAH1,PBRM1	NA	NA	NA	NA	NA	NT5DC2	58165	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	53174758	53175140	53175000	Y	PBRM1,TKT,DCP1A,PRKCD	RFT1,PRKCD	RFT1,PRKCD,TKT	IMR90	Hi-C	24141950	RFT1	12280	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	53288705	53289353	53289077	Y	NA	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	637	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	57971589	57971767	57971672	Y	PDE12,PXK	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	20360	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	58163548	58163776	58163593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD6	57457	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	58192298	58192649	58192549	Y	NA	ABHD6	NA	NA	NA	NA	ABHD6	28584	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	58335663	58335765	58335715	Y	PXK	RPP14,PXK	NA	NA	NA	NA	PXK	19056	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	58339773	58340193	58340113	Y	NA	RPP14,PXK	NA	NA	NA	NA	PXK	23166	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	58585428	58585740	58585446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD6	109587	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	59315299	59315451	59315374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD6	839458	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	68183215	68183532	68183374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG2	480177	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	71436688	71437201	71436910	Y	EIF4E3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	193939	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	71439009	71439199	71439166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	191941	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	71588104	71588187	71588146	Y	NA	FOXP1	NA	NA	NA	NA	FOXP1	42953	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	72936024	72936237	72936180	Y	RYBP,EBLN2	SHQ1,GXYLT2,FTH1P23	NA	NA	NA	NA	GXYLT2	800	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	73159773	73160145	73159855	Y	EBLN2	NA	PDZRN3,CACNA1D	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP4R2	115837	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr3	86999128	86999300	86999212	Y	CHMP2B	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP2B	275121	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6	1144696	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr3	99782957	99783256	99783070	Y	NA	NA	TMEM30C	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D23	194588	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	100088429	100088702	100088566	Y	NA	NIT2,LNP1,TOMM70A	NA	NA	NA	NA	LNP1	29335	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	103188921	103189148	103189133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-43P	312117	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	105087492	105087848	105087688	Y	NA	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	3739	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	105087916	105088171	105088021	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	4163	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	106632759	106633104	106632932	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00883	324435	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	107843189	107843582	107843382	Y	MYH15,CD47	CD47	CD47,IFT57,MYH15	IMR90	Hi-C	24141950	CD47	35317	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	107844539	107845078	107844606	Y	DZIP3,IFT57,CD47	CD47	CD47,IFT57,MYH15	IMR90	Hi-C	24141950	CD47	36667	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr3	111287302	111287434	111287368	Y	CD96,PLCXD2	NA	NA	NA	NA	NA	PLCXD2	104089	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	111289781	111290083	111289847	Y	CD96	NA	NA	NA	NA	NA	PLCXD2	101440	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	112315835	112316301	112316186	Y	NA	SLC35A5,ATG3	NA	NA	NA	NA	ATG3	36942	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	114798123	114798367	114798245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	1024663	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	117482430	117482643	117482537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-384F7.2	231796	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	117508368	117508625	117508497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-384F7.2	205814	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	117708320	117708646	117708547	Y	NA	RP11-384F7.2	NA	NA	NA	NA	RP11-384F7.2	5793	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	119052576	119052960	119052743	Y	NA	ARHGAP31	NA	NA	NA	NA	ARHGAP31	41356	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	120065370	120065692	120065535	Y	NA	LRRC58	NA	NA	NA	NA	LRRC58	494	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	120277715	120278240	120277932	Y	NA	NDUFB4	FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB4	34916	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	121374377	121374548	121374517	Y	EAF2,HCLS1,GOLGB1	HCLS1	NA	NA	NA	NA	HCLS1	3226	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	121550824	121551193	121550988	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	733	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124N2.1	91582	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr3	130073130	130073578	130073320	Y	ATP2C1	NA	NA	NA	NA	NA	ALG1L2	274456	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	133180256	133180441	133180371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDV3	110133	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	134286307	134286601	134286455	Y	CEP63,CEP63,CEP63	EPHB1	NA	NA	NA	NA	EPHB1	28042	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	141482175	141482451	141482314	Y	NA	RNF7	NA	NA	NA	NA	RNF7	27129	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	141707258	141707451	141707397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-343B5.1	53589	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	146955604	146955955	146955778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	694953	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	151016558	151016712	151016648	Y	MED12L,P2RY12,GPR87	NA	NA	NA	NA	NA	MED12L	215074	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	151070003	151070178	151070091	Y	P2RY14	NA	NA	NA	NA	NA	MED12L	268519	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	151589492	151589804	151589672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1	369813	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	151993494	151994006	151993570	Y	NA	MBNL1	NA	NA	NA	NA	MBNL1	33877	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	152026905	152027295	152026911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1	67288	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	152030036	152030551	152030147	Y	MBNL1,MBNL1	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1	70419	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr3	152121454	152121974	152121660	Y	MBNL1	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1	161837	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	155316441	155316741	155316588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf33	205399	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	156558833	156558838	156558836	Y	NA	PA2G4P4	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	32312	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	158070419	158070585	158070503	Y	MFSD1	NA	NA	NA	NA	NA	RSRC1	248775	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	165287004	165287078	165287041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD10	2163649	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	171078129	171078522	171078326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	97675	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	171175851	171176236	171176082	Y	TNIK	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	0	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	172229975	172230511	172230380	Y	FNDC3B,TNFSF10,TNFSF10	TNFSF10	NA	NA	NA	NA	TNFSF10	8786	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	178755149	178755598	178755383	Y	NA	ZMAT3	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	32469	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	178786594	178786786	178786690	Y	NA	ZMAT3	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	1281	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	181414061	181414442	181414162	Y	SOX2	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC19	708499	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	182645862	182646115	182645990	Y	MCF2L2,MCCC1	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	55626	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr3	186490704	186490868	186490793	Y	ST6GAL1,TBCCD1,TBCCD1,EIF4A2	EIF4A2,RFC4	NA	NA	NA	NA	EIF4A2	8126	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	186745346	186745889	186745388	Y	TBCCD1,EIF4A2,RTP4,ST6GAL1	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GAL1	99072	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	187980692	187981197	187980748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP	111620	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	188017658	188018009	188017791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP	148586	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	193689142	193689560	193689382	Y	ATP13A3,OPA1	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	162374	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	196208308	196208582	196208445	Y	NA	RNF168	NA	NA	NA	NA	RNF168	20057	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr3	196378860	196378951	196378906	Y	LRRC33	PIGX	NA	NA	NA	NA	PIGX	14214	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	1049620	1049756	1049677	Y	NA	FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	47896	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr4	1305077	1305367	1305246	Y	DGKQ,KIAA1530	MAEA	KIAA1530	IMR90	Hi-C	24141950	MAEA	23438	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr4	1968542	1968629	1968571	Y	WHSC1,WHSC1	SCARNA22	NA	NA	NA	NA	SCARNA22	5734	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	2292648	2292996	2292766	Y	ZFYVE28,ZFYVE28,TNIP2,RNF4,RNF4,LOC402160,HAUS3	MXD4	NA	NA	NA	NA	MXD4	30627	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	2537711	2538436	2538089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	75764	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	2574508	2574529	2574516	Y	NA	NA	POLN,MXD4,LOC402160,RNF4,FAM193A,TNIP2,ADD1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF4	112561	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	2764467	2764789	2764630	Y	LOC402160	TNIP2	TNIP2,NOP14-AS1,NOP14,MFSD10	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TNIP2	8364	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	3374732	3375130	3374899	Y	RGS12	NA	NA	NA	NA	NA	RGS12	81977	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	4679221	4679437	4679332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX18	137148	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	6179706	6179940	6179759	Y	JAKMIP1	JAKMIP1	NA	NA	NA	NA	JAKMIP1	20378	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	6437206	6437596	6437541	Y	JAKMIP1,PPP2R2C,PPP2R2C	NA	NA	NA	NA	NA	MAN2B2	137306	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	6785099	6785509	6785391	Y	TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232	KIAA0232	NA	NA	NA	NA	KIAA0232	3997	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	9693091	9693174	9693121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR1	423399	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	12642016	12642195	12642111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90AB2P	690843	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr4	13250215	13250573	13250395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90AB2P	82465	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	13484540	13485001	13484899	Y	NA	RAB28	NA	NA	NA	NA	RAB28	551	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	15757957	15758240	15758119	Y	FBXL5,TAPT1,CD38	CD38	C1QTNF7,CD38,FGFBP2,PROM1,CC2D2A	IMR90	Hi-C	24141950	CD38	19658	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr4	15783833	15784027	15783892	Y	CD38	CD38	NA	NA	NA	NA	CD38	5935	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	17829390	17829398	17829394	Y	CLRN2,NCAPG	DCAF16,NCAPG	NA	NA	NA	NA	NCAPG	18865	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	36324523	36324972	36324771	Y	ARAP2	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	80392	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	38496068	38496343	38496206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM156	536199	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	39048044	39048301	39048173	Y	KLF3,TLR1,TLR6	TMEM156,KLHL5	NA	NA	NA	NA	KLHL5	3385	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	39316114	39316675	39316347	Y	NA	RFC1	NA	NA	NA	NA	RFC1	49320	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	39641402	39641506	39641505	Y	NA	RP11-539G18.2	NA	NA	NA	NA	RP11-539G18.2	2642	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	40200608	40201022	40200625	Y	NA	RHOH	NA	NA	NA	NA	RHOH	9935	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	40313713	40314128	40314012	Y	PDS5A,N4BP2,RHOH,RBM47	NA	N4BP2,RHOH,RBM47,LOC344967,NSUN7,CHRNA9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RHOH	123040	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	47473680	47473878	47473784	Y	NA	COMMD8,ATP10D	NA	NA	NA	NA	COMMD8	9944	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	55262269	55262515	55262404	Y	KIT	NA	KIT	IMR90	Hi-C	24141950	PDGFRA	169005	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	71638038	71638166	71638102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRSF1	65496	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	78842671	78842943	78842808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL1	60997	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	81048415	81048773	81048660	Y	ANTXR2,PRDM8	NA	PAQR3,ANTXR2,PRDM8,FGF5	IMR90	Hi-C	24141950	PAQR3	1189823	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	84033440	84033690	84033502	Y	THAP9,LIN54,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,COQ2,PLAC8,PLAC8	PLAC8	NA	NA	NA	NA	PLAC8	22538	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	84138724	84139183	84138985	Y	THAP9,LIN54,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,COQ2,AGPAT9,PLAC8,PLAC8	NA	PLAC8,COPS4,COQ2	IMR90	Hi-C	24141950	COQ2	64884	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	87882810	87883321	87882982	Y	KLHL8,AFF1,AFF1	AFF1	NA	NA	NA	NA	AFF1	28656	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	87960081	87960248	87960138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFF1	105927	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	89747458	89747948	89747469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGY	306518	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	89922113	89922454	89922284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGY	481173	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	102121858	102122120	102121969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP3CA	145315	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	102266716	102267419	102267189	Y	NA	PPP3CA	NA	NA	NA	NA	PPP3CA	16	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	103937289	103937350	103937320	Y	NA	SLC9B1	NA	NA	NA	NA	SLC9B1	1546	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	109044329	109044618	109044592	Y	LEF1,LEF1	LEF1-AS1,LEF1	NA	NA	NA	NA	LEF1-AS1	42063	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	109047956	109048357	109048341	Y	NA	LEF1-AS1,LEF1	NA	NA	NA	NA	LEF1-AS1	38324	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr4	109078014	109078240	109078233	Y	NA	LEF1-AS1,LEF1	NA	NA	NA	NA	LEF1-AS1	8441	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	111114926	111115298	111115104	Y	GAR1,ELOVL6,ELOVL6	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	3057	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr4	111116750	111117174	111116883	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	1181	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	112732930	112733119	112733025	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf32	331434	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr4	113181018	113181306	113181029	Y	AP1AR,TIFA	AP1AR,ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	ALPK1	23359	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	113547591	113547910	113547748	Y	NA	LARP7,C4orf21	NA	NA	NA	NA	LARP7	8210	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	119629667	119629850	119629760	Y	NA	METTL14	NA	NA	NA	NA	METTL14	25144	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	120476359	120476426	120476393	Y	PDE5A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	102413	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	120962747	120963053	120963021	Y	NA	MAD2L1	NA	NA	NA	NA	MAD2L1	23176	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr4	122606332	122606884	122606598	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	9384	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	124521229	124521410	124521292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY1	205279	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	130544465	130544701	130544586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCLT1	531701	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	139182736	139183009	139182873	Y	SLC7A11	NA	SLC7A11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCRN4L	751934	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	139865200	139865393	139865387	Y	NA	NA	SLC7A11	IMR90	Hi-C	24141950	CCRN4L	69550	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	139960222	139960706	139960403	Y	CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25279	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	140331152	140331480	140331316	Y	NA	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	40906	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr4	141016837	141017139	141016990	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	56199	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	141859083	141859381	141859282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D9	183809	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	142564611	142565296	142564927	Y	ZNF330,IL15	IL15	NA	NA	NA	NA	IL15	8859	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	144271294	144271615	144271412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA5	161001	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	146856855	146857112	146856936	Y	NA	ZNF827	NA	NA	NA	NA	ZNF827	675	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	151681778	151681989	151681952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	252890	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	152047125	152047385	152047255	Y	NA	RPS3A	NA	NA	NA	NA	RPS3A	28400	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	153412522	153412921	153412842	Y	NA	FBXW7	NA	NA	NA	NA	FBXW7	42332	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	153445736	153446128	153446118	Y	NA	FBXW7	NA	NA	NA	NA	FBXW7	9125	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	153717992	153718074	153718038	Y	NA	TIGD4,ARFIP1	NA	NA	NA	NA	ARFIP1	18903	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	154360422	154360809	154360778	Y	MND1,KIAA0922	KIAA0922	MND1,TRIM2,KIAA0922	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA0922	24689	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	154548347	154548481	154548383	Y	KIAA0922,TLR2	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0922	162849	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	157867687	157867968	157867878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTSO	994618	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	170548136	170548389	170548218	Y	NEK1,CLCN3	NEK1,CLCN3	C4orf27	IMR90	Hi-C	24141950	CLCN3	16352	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	172348866	172349231	172348878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AADAT	1338016	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	176672960	176673333	176673201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR17	311652	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr4	185605803	185606253	185606149	Y	IRF2,CASP3,CCDC111	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	37140	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	672861	673336	673024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP72	62474	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr5	964244	964536	964396	Y	NKD2	RP11-43F13.3,NKD2	SLC12A7,TRIP13,BRD9,LOC100506688	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-43F13.3	30887	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	1067872	1068133	1067963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKD2	60928	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	1315765	1316275	1315843	Y	TERT	TERT,CLPTM1L	TERT	IMR90	Hi-C	24141950	TERT	22581	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	1316464	1316882	1316563	Y	TERT,SLC6A3	TERT,CLPTM1L	TERT	IMR90	Hi-C	24141950	TERT	23280	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	81417	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	4.90500379976598
chr5	10229611	10229778	10229690	Y	NA	FAM173B,CCT5	NA	NA	NA	NA	FAM173B	18231	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	12331154	12331499	12331312	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	1571770	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	14639692	14640047	14639871	Y	NA	EEF1A1P13,FAM105B	TRIO,FAM105A	IMR90	Hi-C	24141950	EEF1A1P13	11391	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	15451801	15451916	15451863	Y	NA	NA	FBXL7	IMR90	Hi-C	24141950	ANKH	581914	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	17282496	17282827	17282587	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	60898	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	24132806	24133151	24133050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	1055614	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	721816	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr5	30099812	30100097	30099950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL19P11	951575	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	34877157	34877486	34877355	Y	NA	BRIX1,RAD1	NA	NA	NA	NA	BRIX1	35995	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	36119586	36119746	36119728	Y	SLC1A3,SLC1A3,C5orf33,C5orf33,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	LMBRD2	30317	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	36151218	36151404	36151252	Y	C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	1127	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	37615302	37615631	37615482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR70	237988	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	42858219	42858363	42858303	Y	NIM1	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC152	103316	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	42994649	42995346	42995172	Y	NA	AC025171.1	NA	NA	NA	NA	AC025171.1	44331	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	4.90500379976598
chr5	43008201	43008438	43008332	Y	NA	AC025171.1	NA	NA	NA	NA	AC025171.1	31239	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr5	43020158	43020617	43020275	Y	C5orf28,ZNF131,C5orf39	AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	AC025171.1	19060	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	43099724	43100011	43099805	Y	NA	ZNF131,CTD-2201E18.3	ZNF131,LOC648987	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2201E18.3	34203	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	52094372	52094720	52094546	Y	NA	ITGA1,PELO	NA	NA	NA	NA	PELO	12598	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	52155124	52155267	52155195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PELO	73350	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	53317506	53317866	53317808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	286546	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	54722913	54723133	54723024	Y	SKIV2L2	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	101396	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	64796548	64796879	64796719	Y	PPWD1,CENPK	NA	NA	NA	NA	NA	CENPK	60119	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	66187482	66187743	66187625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAST4-AS1	110038	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	77231954	77232009	77231997	Y	NA	NA	OTP	IMR90	Hi-C	24141950	TBCA	69350	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	77792703	77793028	77792954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	138364	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	78993167	78993488	78993350	Y	THBS4,CMYA5	NA	NA	NA	NA	NA	PAPD4	87224	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	79440817	79441220	79441029	Y	ZFYVE16,FAM151B,SERINC5	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	108678	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	80316439	80316828	80316634	Y	RASGRF2	NA	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	278551	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	80898051	80898414	80898329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP2	147202	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr5	81045433	81045821	81045530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP2	0	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	NA	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP2	102021	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	81722343	81722631	81722487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS23	149947	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	82677091	82677103	82677097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM167A	305409	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	86524222	86524964	86524759	Y	RASA1,RASA1	RASA1	MIR4280,RASA1	IMR90	Hi-C	24141950	RASA1	36741	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	86619148	86619498	86619336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA1	57443	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	95170754	95171173	95170855	Y	GLRX,ELL2	GLRX	RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	14045	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	96152147	96152486	96152312	Y	LNPEP,ERAP1	ERAP1	ERAP1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ERAP1	10344	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	96902008	96902041	96902023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2278B20.1	231264	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr5	102091646	102092087	102091846	Y	NA	PAM	NA	NA	NA	NA	PAM	3961	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	109257413	109257833	109257636	Y	MAN2A1	NA	TMEM232	IMR90	Hi-C	24141950	MAN2A1	234346	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr5	114959651	114959879	114959766	Y	COMMD10	TMED7	NA	NA	NA	NA	TMED7-TICAM2	0	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	115676265	115676288	115676277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-118N6.1	219970	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	118605337	118605637	118605457	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	2950	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	118610393	118610883	118610628	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	8006	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr5	118627745	118627943	118627845	Y	NA	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	25358	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	118667521	118667660	118667595	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	65134	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	118678067	118678220	118678144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	75680	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	122322384	122322589	122322416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX2	213693	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	126015927	126016326	126016055	Y	LMNB1,LMNB1	NA	LMNB1,MEGF10	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-395C3.1	53916	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	127295109	127295375	127295239	Y	NA	NA	SLC12A2,FLJ33630,PRRC1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SLC12A2	122083	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	128462285	128462535	128462410	Y	NA	ISOC1	NA	NA	NA	NA	ISOC1	33841	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	130971517	130972046	130971999	Y	NA	RAPGEF6	NA	NA	NA	NA	RAPGEF6	2588	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	131763102	131763516	131763179	Y	SLC22A4,IRF1	C5orf56	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	C5orf56	18774	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	133456495	133456816	133456660	Y	UBE2B,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7	NA	NA	NA	NA	TCF7	8093	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr5	133466882	133467138	133467027	Y	PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7,SKP1	NA	NA	NA	NA	TCF7	18480	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	133468017	133468495	133468331	Y	PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7,SKP1	NA	NA	NA	NA	TCF7	19615	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	PCBD2,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	246	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	134733668	134734080	134733976	Y	H2AFY	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	64	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	138965572	138965797	138965632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2D2	61556	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	139031397	139032095	139031636	Y	C5orf53,PSD2,NRG2,CXXC5	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2D2	127381	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	139631101	139631601	139631302	Y	SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	49105	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr5	139636160	139636260	139636251	Y	SRA1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	44446	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr5	140875639	140876085	140875835	Y	PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH1	120537	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr5	140983787	140984197	140984031	Y	PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1	DIAPH1,HDAC3,RELL2	NA	NA	NA	NA	DIAPH1	12425	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	141404371	141404781	141404694	Y	DIAPH1,FCHSD1	GNPDA1	GNPDA1,NDFIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNPDA1	13765	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	141443513	141443887	141443583	Y	NA	NDFIP1	FGF1,NDFIP1,GNPDA1,ARAP3,FCHSD1	IMR90	Hi-C	24141950	NDFIP1	42183	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	141805995	141806051	141806008	Y	NA	NA	SPRY4,FGF1,NDFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	101975	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	142331900	142332061	142331967	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	183951	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	142349397	142349744	142349637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	201448	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	142356404	142356953	142356617	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	208455	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	148738164	148738422	148738235	Y	PCYOX1L	GRPEL2,PCYOX1L	NA	NA	NA	NA	PCYOX1L	2594	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	149110531	149110757	149110649	Y	PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2670	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	149456060	149456090	149456075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGXB3	78176	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	150261861	150262245	150261884	Y	IRGM	NA	NA	NA	NA	NA	DCTN4	125190	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	150593680	150594043	150593885	Y	DCTN4,DCTN4,TNIP1,SLC36A1,CCDC69	GM2A	NA	NA	NA	NA	GM2A	3969	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr5	150594261	150594451	150594361	Y	TNIP1,CCDC69,ANXA6	GM2A	NA	NA	NA	NA	GM2A	4550	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	151200780	151201112	151200835	Y	GLRA1	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	50687	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	156698884	156699173	156698941	Y	HAVCR2,NIPAL4,ADAM19,CYFIP2,CYFIP2,CYFIP2	CYFIP2	NA	NA	NA	NA	CYFIP2	7795	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	156724834	156725095	156724964	Y	NA	CYFIP2	NA	NA	NA	NA	CYFIP2	33745	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	156814689	156815040	156814693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYFIP2	123600	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	157019708	157019949	157019855	Y	HAVCR2,NIPAL4,ADAM19	NA	SOX30,FNDC9,CYFIP2,NIPAL4,ADAM19,C5orf52,THG1L,LSM11	IMR90	Hi-C	24141950	THG1L	136256	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	159451021	159451194	159451125	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	16901	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	168232470	168232861	168232812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-575D19.1	191153	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	169130299	169130340	169130320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK2	68048	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr5	169696407	169697161	169696865	Y	KCNMB1,LCP2	LCP2	NA	NA	NA	NA	LCP2	26070	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	171388246	171388386	171388315	Y	UBTD2,STK10	FBXW11	NA	NA	NA	NA	FBXW11	43491	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	171601698	171602038	171601921	Y	NA	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	11352	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	171602273	171602685	171602548	Y	STK10	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	10705	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr5	172192263	172193766	172192583	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2432	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	172226784	172227709	172227394	Y	ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1,ERGIC1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	30586	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	175960481	175960718	175960661	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,RNF44,CDHR2	RNF44	NA	NA	NA	NA	RNF44	2308	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	175962179	175962700	175962413	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,HK3,HIGD2A,RNF44,CDHR2	RNF44	FAF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNF44	326	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr5	176337374	176337559	176337468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UIMC1	110075	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr5	176791475	176791863	176791771	Y	DBN1	LMAN2,RGS14,GRK6	NA	NA	NA	NA	RGS14	8637	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	178698075	178698460	178698284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF354C	212659	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	180611137	180611357	180611292	Y	MGAT1	TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	TRIM41	36142	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr5	180616521	180617006	180616799	Y	ZFP62,TRIM52,TRIM41	TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	TRIM41	30493	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	711154	711526	711478	Y	DUSP22,EXOC2	EXOC2	NA	NA	NA	NA	EXOC2	20037	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr6	3254273	3254642	3254472	Y	SLC22A23	PSMG4	NA	NA	NA	NA	PSMG4	24636	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	3987035	3987350	3987158	Y	NA	PRPF4B	SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194	IMR90	Hi-C	24141950	PRPF4B	32151	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	5296297	5296648	5296345	Y	NA	LYRM4,FARS2	NA	NA	NA	NA	FARS2	37020	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	5660943	5661332	5661178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRN1	343868	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	6001980	6002334	6002157	Y	NRN1	NRN1	NA	NA	NA	NA	NRN1	2866	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	6657678	6658009	6657847	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	447821	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr6	7130548	7130794	7130662	Y	RREB1,RREB1	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	24718	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	13391107	13391478	13391293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	64292	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	13404217	13404579	13404523	Y	GFOD1	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	77402	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	13630387	13630831	13630754	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	16828	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	13636617	13636971	13636795	Y	TBC1D7,GFOD1,CD83	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	23058	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	13649579	13649948	13649702	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	36020	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr6	13662469	13662838	13662724	Y	NA	NOL7,RANBP9	NA	NA	NA	NA	RANBP9	46958	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	14271187	14271701	14271310	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	155315	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	14706582	14707144	14706813	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	537383	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	14733801	14734229	14733883	Y	NA	NA	DTNBP1,JARID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	510298	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	16474193	16474630	16474472	Y	MYLIP,ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN1	285092	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	16713666	16713734	16713668	Y	ATXN1	ATXN1	NA	NA	NA	NA	ATXN1	45988	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	16747394	16747788	16747685	Y	NA	ATXN1	NA	NA	NA	NA	ATXN1	11934	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	20418274	20418752	20418425	Y	NA	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	17876	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	21856086	21856579	21856474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	264114	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	22072015	22072158	22072069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	480043	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr6	22222867	22222924	22222901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	630895	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	24996712	24997040	24996893	Y	TDP2	FAM65B	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM65B	43198	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	26026306	26026795	26026679	Y	HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A	HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H4B	826	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	26034352	26034599	26034546	Y	NA	HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AB	2556	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	26232920	26233434	26233137	Y	NA	HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2BI	NA	NA	NA	NA	HIST1H1D	0	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	27145585	27145720	27145705	Y	FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	31303	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	27145729	27146130	27146023	Y	ZNF184	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	30893	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	27655152	27655475	27655306	Y	FKSG83,ZNF391,ZNF184,ZNF192,HIST1H3H,HIST1H2BO,HIST1H2BN,HIST1H2AM	NA	LOC100507173,ZNF184	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HIST1H2BL	118234	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	27655687	27656083	27655918	Y	NA	NA	LOC100507173	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HIST1H2BL	117626	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr6	27798416	27798741	27798578	Y	NA	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H4K	1111	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	27807310	27807672	27807617	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BN	2987	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr6	27862895	27863061	27863012	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BO	3692	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr6	28072476	28072872	28072543	Y	HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192	ZNF165	NA	NA	NA	NA	ZNF165	25723	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	28834475	28834586	28834545	Y	NA	HCG14	NA	NA	NA	NA	HCG14	27721	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	29932777	29932958	29932802	Y	HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A	HLA-K,HLA-A	NA	NA	NA	NA	HLA-A	25740	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	4.90500379976598
chr6	30175844	30176213	30176153	Y	NA	TRIM26,HLA-L	NA	NA	NA	NA	TRIM26	2991	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr6	30247447	30247451	30247450	Y	NA	HLA-L,TRIM39,HCG18	NA	NA	NA	NA	HLA-L	22086	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	30453844	30454132	30453996	Y	ZNRD1,TUBB	RANP1,HLA-E	HLA-E	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HLA-E	1112	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr6	31705604	31706142	31705906	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1	NA	NA	NA	NA	MSH5	0	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	32802290	32802518	32802510	Y	NA	TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1	NA	NA	NA	NA	TAP2	2039	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	32912229	32912629	32912303	Y	HLA-DRB5,HLA-DRB1,HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DOB,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9,TAPBP,RGL2,HLA-DPB1,HLA-DPA1,B3GALT4,HLA-DMB,HLA-DOA,HLA-DMA,BRD2,BRD2	HLA-DMB,BRD2,BRD2-IT1	NA	NA	NA	NA	HLA-DMB	5382	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	33181288	33181504	33181396	Y	NA	SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1	NA	NA	NA	NA	RING1	7016	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	33872168	33872571	33872419	Y	PHF1,ZBTB9,LEMD2	NA	NA	NA	NA	NA	LEMD2	117255	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	33872922	33873175	33873050	Y	PHF1	NA	NA	NA	NA	NA	LEMD2	118009	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	4.90500379976598
chr6	34150537	34150894	34150814	Y	HMGA1	CYCSP55	C6orf106,NUDT3,RPS10-NUDT3,PACSIN1,MNF1,ANKS1A,SPDEF,HMGA1,IP6K3,MLN,LEMD2,GRM4,UHRF1BP1,TAF11,SNRPC,C6orf1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYCSP55	34322	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	34191726	34192136	34191830	Y	C6orf1,HMGA1	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CYCSP55	6510	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	35279423	35279720	35279457	Y	FKBP5,TAF11,ZNF76,RPL10A,DEF6	DEF6,PPARD	NA	NA	NA	NA	DEF6	15828	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr6	35632268	35633036	35633003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP5	61324	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	35685740	35686068	35685867	Y	NA	FKBP5	NA	NA	NA	NA	FKBP5	8292	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	6.86700531967237
chr6	36086314	36086741	36086595	Y	SRPK1,SLC26A8,SLC26A8,SLC26A8,MAPK14,STK38,SRSF3,PXT1,KCTD20,BRPF3	NA	NA	NA	NA	NA	BRPF3	75780	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	37070053	37070857	37070460	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	65122	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	37484293	37484960	37484497	Y	NA	CCDC167	CCDC167,MDGA1,RNF8,FTSJD2,TBC1D22B,MIR4462,ZFAND3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC167	18595	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	11.7720091194383
chr6	41312816	41312959	41312881	Y	NA	NCR2	NA	NA	NA	NA	NCR2	11423	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	41907242	41907431	41907365	Y	TAF8,TFEB,CCND3	USP49,MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	20316	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr6	44783475	44783845	44783660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC5L	430213	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	45299468	45299716	45299591	Y	NA	RUNX2,SUPT3H	NA	NA	NA	NA	RUNX2	5574	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	45302184	45302302	45302245	Y	NA	RUNX2,SUPT3H	NA	NA	NA	NA	RUNX2	8290	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	45313959	45314320	45314140	Y	NA	RUNX2,SUPT3H	NA	NA	NA	NA	RUNX2	20065	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	45317803	45318343	45317888	Y	NA	RUNX2,SUPT3H	NA	NA	NA	NA	RUNX2	23909	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	47220408	47220656	47220576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD2AP	222869	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	53165916	53166137	53165996	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	45810	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	53174339	53174666	53174484	Y	FBXO9,ELOVL5	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	37281	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr6	53199994	53200715	53200310	Y	FBXO9,FBXO9,FBXO9,ELOVL5	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	11232	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	53225010	53225140	53225110	Y	NA	ELOVL5	ELOVL5	K562	ChIA-PET	22265404	ELOVL5	13063	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	53226308	53226528	53226441	Y	NA	ELOVL5	ELOVL5	K562	ChIA-PET	22265404	ELOVL5	14361	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	54604535	54604549	54604543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC1	947240	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	56297273	56297383	56297328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BEND6	520390	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	57389697	57390070	57389732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	212094	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	57454700	57454967	57454896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	277097	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	58776280	58777091	58777029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	521711	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr6	65227331	65227644	65227620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	883606	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	70483925	70484146	70484036	Y	NA	LMBRD1	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	20857	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	73329727	73330142	73329822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	640796	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	79054201	79054253	79054227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRAK1BP1	520936	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	79773928	79774085	79774072	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	11868	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	83793136	83793338	83793237	Y	PRSS35,DOPEY1	DOPEY1	NA	NA	NA	NA	DOPEY1	17751	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	83893224	83893469	83893362	Y	RWDD2A,PGM3,PGM3	RWDD2A,PGM3	NA	NA	NA	NA	RWDD2A	7629	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	87881047	87881581	87881092	Y	NA	ZNF292	NA	NA	NA	NA	ZNF292	20496	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	90059850	90060767	90060332	Y	RNGTT,PNRC1,UBE2J1,RRAGD	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2J1	0	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	90094957	90095218	90095193	Y	NA	UBE2J1,RRAGD	NA	NA	NA	NA	RRAGD	24771	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	90754756	90755156	90755038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASP8AP2	217143	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	90856849	90857084	90856969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH2	147543	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	90951466	90952108	90951796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH2	52519	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	90994449	90994671	90994572	Y	MDN1,BACH2,BACH2	BACH2	NA	NA	NA	NA	BACH2	9956	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	92009340	92009566	92009453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K7	714576	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	93802046	93802077	93802062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEA	2221342	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr6	99293549	99293815	99293794	Y	POU3F2	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL4	100034	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	99995359	99995841	99995579	Y	PNISR	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	19008	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	107437804	107438343	107438064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf203	90397	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	107621791	107622175	107621983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDSS2	156593	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	108879521	108879931	108879808	Y	SESN1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	483	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr6	110360700	110361043	110360911	Y	GPR6	NA	FIG4,AKD1,PPIL6,MICAL1,SMPD2,DDO,METTL24	IMR90	Hi-C	24141950	WASF1	138164	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	111409580	111409942	111409703	Y	AMD1,AMD1,REV3L,SLC16A10	SLC16A10	NA	NA	NA	NA	SLC16A10	2799	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	111748625	111749047	111748803	Y	SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	53667	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	112110273	112110463	112110418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	82192	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	112116190	112116657	112116390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	75998	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	112163238	112163349	112163330	Y	NA	FYN	NA	NA	NA	NA	FYN	29306	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	114478315	114478345	114478330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC2	147843	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	118964875	118965125	118965000	Y	MCM9,C6orf204	NA	NA	NA	NA	NA	CEP85L	64113	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	126241150	126241321	126241235	Y	NCOA7	HINT3	NA	NA	NA	NA	HINT3	34606	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	127778453	127778833	127778741	Y	NA	RP3-403A15.1	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	23672	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	127981338	127981402	127981371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226557	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr6	128058228	128058450	128058362	Y	THEMIS	NA	NA	NA	NA	NA	THEMIS	179326	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	128607751	128608140	128608092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	231730	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	128793943	128794334	128794205	Y	NA	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	45536	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	129989152	129989478	129989315	Y	NA	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	39892	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	130774409	130774738	130774531	Y	SAMD3,SAMD3	NA	NA	NA	NA	NA	L3MBTL3	441565	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	133134288	133134908	133134317	Y	NA	RPS12	NA	NA	NA	NA	SNORD101	0	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	135344059	135344242	135344151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBS1L	77952	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	135503898	135504621	135504156	Y	HBS1L,AHI1,MYB	MYB	NA	NA	NA	NA	MYB	3445	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	138057580	138057838	138057749	Y	PBOV1,TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	128513	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr6	138225639	138226065	138225836	Y	TNFAIP3	TNFAIP3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP3	39288	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	138280144	138280298	138280223	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3	K562	ChIA-PET	22265404	TNFAIP3	93793	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	138821349	138821443	138821380	Y	REPS1,NHSL1	NA	NA	NA	NA	NA	HEBP2	98681	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	139209045	139209410	139209228	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REPS1	97988	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	139348964	139349250	139349073	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	41566	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	141171716	141171869	141171793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	1294498	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	143223836	143224147	143224035	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	40191	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	143247398	143248213	143248022	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	16125	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	143503002	143503176	143503018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	123369	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	144376148	144376476	144376440	Y	NA	PLAGL1,SF3B5	NA	NA	NA	NA	PLAGL1	7259	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	149082428	149082821	149082685	Y	NA	UST	NA	NA	NA	NA	UST	15964	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	157173280	157173444	157173363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	76217	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	157542479	157542718	157542566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	199915	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr6	158525965	158526121	158526043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2H5	61263	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	158987674	158988091	158987879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	75680	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	159273925	159274893	159274526	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	35481	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	159454571	159454940	159454757	Y	TAGAP	RSPH3,TAGAP	NA	NA	NA	NA	TAGAP	9244	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	163840967	163841346	163841003	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	7935	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr6	169308928	169309266	169309084	Y	THBS2	NA	WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242	IMR90	Hi-C	24141950	WDR27	790893	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr6	170654095	170654292	170654195	Y	FAM120B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM120B	56304	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	633040	633441	633240	Y	ADAP1	NA	NA	NA	NA	NA	HEATR2	130897	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	657520	657797	657766	Y	CYP2W1	NA	NA	NA	NA	NA	HEATR2	106541	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	4.90500379976598
chr7	658155	658418	658267	Y	COX19	NA	NA	NA	NA	NA	HEATR2	105920	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	1546424	1546775	1546565	Y	NA	MICALL2,INTS1,MAFK	NA	NA	NA	NA	INTS1	2935	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr7	1571273	1571500	1571366	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	2923	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	1894449	1894968	1894908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMG3	285808	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	2106199	2106418	2106303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	164460	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	6.86700531967237
chr7	2980860	2981267	2981182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNA12	98902	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	3453682	3454067	3453904	Y	SDK1	NA	NA	NA	NA	NA	CARD11	372103	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	7804088	7804477	7804243	Y	NA	RPA3	NA	NA	NA	NA	RPA3	47850	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	12297328	12297575	12297487	Y	ARL4A	TMEM106B	NA	NA	NA	NA	TMEM106B	48461	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	22626962	22627257	22627168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P6	77344	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	24963944	24964392	24964187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	54861	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	25894654	25894946	25894846	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	294914	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	25901745	25902114	25902023	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	287746	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	28823277	28823529	28823406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHN2	336361	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	30188805	30188913	30188846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8	123785	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr7	32531348	32531711	32531530	Y	PDE1C,PDE1C,PDE1C	LSM5,AVL9	NA	NA	NA	NA	LSM5	1184	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	36827736	36827917	36827839	Y	AOAH	NA	NA	NA	NA	NA	AOAH	65582	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	36843340	36843728	36843600	Y	ELMO1	NA	NA	NA	NA	NA	AOAH	81186	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	36938916	36939307	36939244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AOAH	176762	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	37358703	37358798	37358755	Y	GPR141,ELMO1	NA	NA	NA	NA	NA	ELMO1	128054	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr7	40946906	40947042	40946974	Y	NA	NA	C7orf10,LOC285954,INHBA	IMR90	Hi-C	24141950	CDK13	959270	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	42927750	42928726	42928340	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	NA	NA	NA	NA	C7orf25	21178	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	42954351	42954549	42954430	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	C7orf25	K562	ChIA-PET	22265404	C7orf25	4447	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	43652779	43653072	43652905	Y	POLM,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	32422	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	43670120	43670185	43670135	Y	POLM,DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	49763	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	44931026	44931179	44931138	Y	DDX56,CCM2	H2AFV,PURB	PURB,TBRG4,OGDH	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PURB	8066	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	50306514	50306844	50306594	Y	IKZF1,FIGNL1	IKZF1	NA	NA	NA	NA	IKZF1	34876	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	50346623	50346926	50346749	Y	IKZF1	IKZF1	NA	NA	NA	NA	IKZF1	4903	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	50428255	50428613	50428317	Y	IKZF1	NA	NA	NA	NA	NA	IKZF1	86535	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	50948563	50948792	50948678	Y	GRB10	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	432475	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	69091011	69091330	69091153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-859M6.1	987226	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	70160459	70160922	70160898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-859M6.1	2056674	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	73062013	73062614	73062579	Y	BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A	WBSCR22,DNAJC30	MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A	IMR90	Hi-C	24141950	WBSCR22	32741	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	75465283	75465439	75465360	Y	MDH2	RHBDD2	STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR	IMR90	Hi-C	24141950	RHBDD2	4481	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr7	87306649	87306854	87306752	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P9	157872	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	92261439	92261837	92261823	Y	NA	NA	FAM133B	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RBM48	105352	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	92282305	92282698	92282463	Y	LRRD1,KRIT1,KRIT1,KRIT1,SAMD9L,SAMD9	NA	NA	NA	NA	NA	RBM48	126218	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	92373404	92373742	92373580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC002454.1	90055	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	93511378	93511666	93511551	Y	BET1,TFPI2	NA	NA	NA	NA	NA	BET1	120028	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	95765148	95765192	95765170	Y	DYNC1I1,FLJ42280	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	184267	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	98978423	98978863	98978747	Y	SMURF1,ZNF655,ZNF655,ZNF498,ZNF394,ZKSCAN5	ARPC1B,BUD31,PDAP1	NA	NA	NA	NA	ARPC1B	8551	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr7	99178135	99178365	99178354	Y	ZNF789	ZNF655,FAM200A	NA	NA	NA	NA	FAM200A	23976	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	99961767	99962035	99961969	Y	NA	PILRB,PMS2P1	PILRA	IMR90	Hi-C	24141950	PMS2P1	24236	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	99969754	99970252	99970079	Y	OR2AE1,C7orf59,ZCWPW1,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,PILRB,PILRA	PILRB,PMS2P1	NA	NA	NA	NA	PMS2P1	32223	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	99994747	99995042	99994880	Y	ACTL6B,PILRB	MEPCE,ZCWPW1,PPP1R35	NA	NA	NA	NA	MEPCE	29371	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	102056938	102057102	102057040	Y	ORAI2	ORAI2,ALKBH4,LRWD1	NA	NA	NA	NA	ORAI2	14451	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	104854124	104854334	104854271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	183421	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	104992589	104992852	104992773	Y	NA	SRPK2	NA	NA	NA	NA	SRPK2	44903	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	106901302	106901364	106901333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBP1	93896	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	107949313	107949798	107949569	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P32	198879	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	110956734	110956926	110956906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	243647	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	116504290	116504456	116504319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPZA2	55166	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	127455662	127455822	127455742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SND1	165428	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr7	130606000	130606565	130606293	Y	NA	NA	LOC646329	MCF7	ChIA-PET	22265404	MKLN1	186290	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	130916172	130916668	130916569	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1-AS	94313	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	135665513	135665767	135665568	Y	NA	MTPN	NA	NA	NA	NA	MTPN	5412	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr7	135825717	135825804	135825761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPN	165616	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	137264728	137264844	137264813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC008155.2	716385	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	138662189	138662362	138662288	Y	NA	KIAA1549	NA	NA	NA	NA	KIAA1549	1702	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr7	139320693	139321014	139320839	Y	PARP12,LUC7L2	NA	NA	NA	NA	NA	ERHP1	103707	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	NA	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EZH2	58860	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr7	148824928	148825234	148824952	Y	NA	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF398	3420	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	150214251	150214606	150214430	Y	GIMAP8,LOC100128542,TMEM176B,GIMAP5,GIMAP2,GIMAP1,GIMAP7,GIMAP6,GIMAP4	GIMAP7	NA	NA	NA	NA	GIMAP7	4333	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	29368	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr7	155580383	155580450	155580415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009403.2	144484	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	156544134	156544345	156544262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-31P	118427	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr7	157067817	157068138	157067978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	57937	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	582547	582966	582856	Y	ERICH1	NA	NA	NA	NA	NA	ERICH1	103140	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr8	1897074	1897760	1897667	Y	NA	KBTBD11	NA	NA	NA	NA	KBTBD11	22284	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	25.5060197587831
chr8	1898205	1898424	1898394	Y	NA	KBTBD11	NA	NA	NA	NA	KBTBD11	21620	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	2591169	2591450	2591225	Y	NA	RP11-134O21.1	NA	NA	NA	NA	RP11-134O21.1	7178	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	8878847	8879137	8878870	Y	NA	ERI1	NA	NA	NA	NA	ERI1	21190	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	8939736	8940088	8939838	Y	CLDN23,ERI1,PPP1R3B	NA	ERI1,PPP1R3B,TNKS	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1R3B	66996	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	10191869	10192038	10191953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PINX1	503356	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	10725251	10725387	10725347	Y	NA	PINX1	NA	NA	NA	NA	PINX1	29857	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	12887888	12888235	12887965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LONRF1	276306	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	16456679	16456744	16456714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC2	554794	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	19243434	19243614	19243539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT1	369926	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	19555269	19555638	19555536	Y	NA	NA	CSGALNACT1,SH2D4A	IMR90	Hi-C	24141950	CSGALNACT1	57902	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	20029424	20029730	20029577	Y	NA	ATP6V1B2	NA	NA	NA	NA	ATP6V1B2	23148	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	20294602	20294707	20294648	Y	NA	NA	ATP6V1B2	IMR90	Hi-C	24141950	LZTS1	135128	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	21804083	21804253	21804128	Y	NA	DOK2,XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	28903	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	22048643	22048944	22048828	Y	DOK2	BMP1	NA	NA	NA	NA	BMP1	28394	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	22469003	22469432	22469219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BIN3	55229	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	24799462	24799718	24799592	Y	NEFL	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD9	514274	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr8	25348135	25348483	25348309	Y	CDCA2	KCTD9,CDCA2	NA	NA	NA	NA	CDCA2	33622	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	26162518	26162881	26162571	Y	NA	PPP2R2A	NA	NA	NA	NA	PPP2R2A	15511	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	27209291	27209793	27209526	Y	PTK2B,PTK2B	TRIM35,PTK2B	NA	NA	NA	NA	PTK2B	42292	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	27261537	27262078	27261765	Y	PTK2B,PTK2B	NA	NA	NA	NA	NA	EPHX2	84218	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	27972693	27972953	27972823	Y	NA	ELP3	NA	NA	NA	NA	ELP3	27503	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	28201358	28201736	28201547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF395	56482	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	28859805	28860025	28859905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2647L4.4	51427	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	28890628	28890717	28890674	Y	KIF13B	CTD-2647L4.4	NA	NA	NA	NA	CTD-2647L4.4	20735	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	30262933	30263230	30262977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2E2	250538	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	31040746	31040774	31040760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRN	151429	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr8	37749222	37749683	37749580	Y	WHSC1L1,LETM2,LETM2,RAB11FIP1	BRF2,RAB11FIP1	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP1	5302	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	38242599	38242872	38242674	Y	TACC1,WHSC1L1,LETM2,LETM2	WHSC1L1,LETM2	NA	NA	NA	NA	LETM2	874	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	41775383	41775559	41775471	Y	NA	NA	ANK1	IMR90	Hi-C	24141950	KAT6A	131949	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	41908079	41908836	41908505	Y	POLB,IKBKB,IKBKB,AP3M2,AGPAT6,MYST3	KAT6A	NA	NA	NA	NA	KAT6A	571	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr8	48424795	48425379	48425168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P12	350302	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	48486280	48486631	48486481	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKDC	384112	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	48579999	48580070	48580036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKDC	290673	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	48814148	48814416	48814291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKDC	56327	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	52747281	52747589	52747434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCMTD1	62146	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	52797055	52797111	52797083	Y	NA	PCMTD1,RP11-110G21.1	NA	NA	NA	NA	PCMTD1	12624	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	53625473	53626379	53625848	Y	RB1CC1	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	30024	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	59849492	59849915	59849740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-50P	124381	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr8	61708880	61709194	61708899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	119543	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	63776641	63776831	63776733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGH	172899	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	65684237	65684466	65684340	Y	BHLHE22,CYP7B1	NA	NA	NA	NA	NA	ARMC1	859976	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	66749896	66750187	66749927	Y	PDE7A	PDE7A	NA	NA	NA	NA	PDE7A	2370	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	66863902	66864441	66863992	Y	RRS1,PDE7A	NA	PDE7A	MCF7	ChIA-PET	22265404	PDE7A	111345	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	68098646	68098899	68098873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	104628	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	71124105	71124438	71124275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	109691	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	72187885	72188197	72188041	Y	EYA1	NA	NA	NA	NA	NA	LACTB2	608476	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	73559096	73559368	73559359	Y	KCNB2	NA	NA	NA	NA	NA	TERF1	359731	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	74432524	74433240	74432853	Y	C8orf84,RDH10	NA	NA	NA	NA	NA	STAU2	224703	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	74637544	74637721	74637705	Y	NA	STAU2	NA	NA	NA	NA	STAU2	20222	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	75135577	75135926	75135753	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDAP1	95439	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr8	77515612	77515766	77515691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEX2	395514	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	82401055	82401287	82401171	Y	NA	FTH1P11	FABP5	IMR90	Hi-C	24141950	FTH1P11	31180	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	85296015	85296611	85296285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRCC1	720771	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	96146998	96147210	96147103	Y	TP53INP1,PLEKHF2	PLEKHF2	NA	NA	NA	NA	PLEKHF2	2966	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	96180882	96181195	96181039	Y	PLEKHF2	PLEKHF2	NA	NA	NA	NA	PLEKHF2	36850	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	96960626	96960710	96960668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRB	285152	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	98304769	98305167	98304968	Y	NA	NA	PTDSS1,CPQ,TSPYL5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MTDH	349240	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr8	100803946	100804239	100804046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX6C	100051	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	100808377	100808591	100808586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX6C	95699	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr8	101731045	101731633	101731441	Y	NA	PABPC1	NA	NA	NA	NA	PABPC1	1404	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	102120764	102121998	102120921	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	YWHAZ,FLJ42969,ZNF706	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF706	94423	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	103120269	103120923	103120717	Y	UBR5,NCALD	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2B	128423	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	105523001	105523289	105523222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP12	75963	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	105598029	105598284	105598149	Y	TM7SF4,LRP12	LRP12	NA	NA	NA	NA	LRP12	968	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	110589431	110589605	110589518	Y	NA	EBAG9	NA	NA	NA	NA	EBAG9	39491	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	111109081	111109287	111109184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EBAG9	559141	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	116231151	116231480	116231401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	588419	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	117744101	117744355	117744228	Y	NA	UTP23,EIF3H	NA	NA	NA	NA	UTP23	32387	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	117892449	117892609	117892487	Y	NA	MIR3610,RAD21	NA	NA	NA	NA	RAD21	7344	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	4.90500379976598
chr8	119068312	119068746	119068717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	53346	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	119189481	119189499	119189490	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	67389	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	119264701	119264795	119264748	Y	SAMD12	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	142609	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	121702901	121703232	121703165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTB1	120281	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	121809679	121809816	121809747	Y	NA	SNTB1	NA	NA	NA	NA	SNTB1	13697	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	121822442	121823157	121823030	Y	NA	SNTB1	NA	NA	NA	NA	SNTB1	356	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	123908169	123908483	123908299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DERL1	144180	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	124363606	124363931	124363783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2	62659	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr8	124407455	124407786	124407574	Y	FAM91A1,C8orf76,ZHX1,ATAD2	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	ATAD2	18804	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	124462485	124463022	124462596	Y	NA	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	WDYHV1	35520	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	126290719	126290948	126290836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	149615	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	126372255	126372562	126372409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	68001	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	128070328	128070629	128070508	Y	FAM84B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	501690	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	128182729	128182789	128182759	Y	NA	NA	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	562891	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	128258299	128258698	128258657	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	486982	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	131218440	131218995	131218822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	191065	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	133918146	133918614	133918311	Y	TG	NA	NA	NA	NA	NA	PHF20L1	132528	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	134058164	134058497	134058221	Y	TMEM71,PHF20L1,TG,SLA	NA	NA	NA	NA	NA	SLA	54801	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	134065338	134065765	134065507	Y	TMEM71,PHF20L1,TG,SLA	SLA	NA	NA	NA	NA	SLA	47533	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	134065970	134066513	134066049	Y	TMEM71,PHF20L1,TG	SLA	NA	NA	NA	NA	SLA	46785	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	141266447	141267055	141266903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	199623	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	141608422	141608817	141608788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	89025	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr8	144272609	144273113	144272936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI4	74490	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	6.86700531967237
chr8	144785317	144785390	144785376	Y	NA	ZNF707	NA	NA	NA	NA	ZNF707	20695	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	277612	278164	277810	Y	DOCK8	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK8	64758	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	337021	337163	337093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK8	124167	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	447782	447949	447838	Y	DOCK8,DOCK8	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK8	234928	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	631583	631920	631840	Y	KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK8	418729	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	642151	642448	642253	Y	DOCK8,C9orf66,KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK8	429297	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	749759	749963	749884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK8	536905	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	2655543	2655805	2655674	Y	NA	VLDLR	NA	NA	NA	NA	VLDLR	35709	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	2875811	2876206	2875956	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	33570	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	3575637	3575805	3575721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-509J21.1	50914	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	4530559	4530733	4530650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAPDC2	129565	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	4835219	4835506	4835309	Y	CDC37L1,RCL1	RCL1	NA	NA	NA	NA	RCL1	44350	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr9	5086081	5086478	5086137	Y	CD274,CDC37L1,INSL6,JAK2	NA	NA	NA	NA	NA	JAK2	103048	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	6958089	6958102	6958095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4C	239226	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	11065025	11065362	11065124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P3	1976149	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	14992180	14992514	14992235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDHAP4	71848	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	20215261	20215478	20215462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	405064	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	21696721	21697113	21696912	Y	IFNA8	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	103429	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	21699320	21699393	21699347	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	101149	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	3.92400303981278
chr9	21702719	21702756	21702738	Y	IFNA5,IFNA6,IFNA8,IFNA1	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	97786	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	21996542	21996712	21996656	Y	MTAP,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2B	CDKN2A,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	CDKN2A	3242	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	29826048	29826378	29826215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P2	1003845	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	37408940	37409704	37409210	Y	PAX5,ZCCHC7,TOMM5,POLR1E	GRHPR	PAX5,GRHPR,MIR4540	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GRHPR	10959	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	38066980	38067628	38067261	Y	SHB	NA	NA	NA	NA	NA	SHB	0	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	68417391	68418146	68417579	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	35229	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	71793410	71793781	71793424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FXN	145235	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	75978047	75978446	75978247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA1	213374	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	77207530	77207789	77207659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-171A24.3	95487	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	88184194	88184649	88184621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	170295	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	88346951	88347024	88346988	Y	NA	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	7920	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	88358353	88358730	88358394	Y	AGTPBP1	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	3409	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	91538614	91539111	91538717	Y	SECISBP2,S1PR3,C9orf47	NA	LOC286238,S1PR3,SHC3	IMR90	Hi-C	24141950	S1PR3	65251	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr9	92004867	92005103	92005008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SECISBP2	73446	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	92170883	92170999	92170941	Y	NA	GADD45G	SECISBP2,SEMA4D	IMR90	Hi-C	24141950	GADD45G	46929	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	92920928	92921083	92921004	Y	NA	NA	SYK	IMR90	Hi-C	24141950	SYK	640986	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	93879711	93879721	93879717	Y	NA	NA	LOC100129316,AUH,ROR2	IMR90	Hi-C	24141950	AUH	242474	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	93955243	93955725	93955362	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	166470	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	95168954	95169114	95169066	Y	OGN	OGN	NA	NA	NA	NA	OGN	3976	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF169	90963	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF169	90183	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	97679079	97679413	97679326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	398578	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	97963794	97964178	97964017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	113813	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	97966859	97967268	97967183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	110723	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	RP11-172F4.2,ZNF367	NA	NA	NA	NA	ZNF367	2936	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	100772550	100772875	100772560	Y	NA	ANP32B,NANS	NANS,TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	ANP32B	28907	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	111773643	111773659	111773652	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	150	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	111774521	111775173	111774726	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	712	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	112903621	112903940	112903708	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	112980	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	114707434	114708001	114707643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	50388	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	114792518	114792641	114792625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	135472	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	115031676	115032066	115031959	Y	KIAA1958	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP3	61881	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	117125723	117126093	117125808	Y	DFNB31,DFNB31,AKNA	AKNA	NA	NA	NA	NA	AKNA	28592	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	117152820	117152929	117152875	Y	NA	AKNA	NA	NA	NA	NA	AKNA	1756	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	118028504	118028557	118028531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF8	337807	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	127944437	127944756	127944696	Y	NR6A1,GOLGA1,PPP6C,GAPVD1	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	5462	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	130788612	130788994	130788712	Y	CDK9,SLC25A25,NAIF1,DPM2,FAM102A	FAM102A,SLC25A25,NAIF1	SLC25A25,NAIF1,FAM102A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC25A25	39486	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	132189846	132190422	132190182	Y	NA	NA	C9orf106,C9orf50,PPP2R4,LOC100506190	IMR90	Hi-C	24141950	ASB6	212022	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	132598761	132599163	132598839	Y	NA	TOR1B,TOR1A,USP20,C9orf78	NA	NA	NA	NA	C9orf78	2619	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	132646480	132646964	132646831	Y	ASB6,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf78	50338	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr9	132757819	132758165	132758070	Y	TOR1B,FNBP1	FNBP1	NA	NA	NA	NA	FNBP1	45308	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	132793561	132793711	132793627	Y	ASB6,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	FNBP1	9762	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	133721311	133721454	133721341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC2	154203	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chr9	134460892	134461019	134460973	Y	FAM78A,RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	POMT1	84603	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr9	135197315	135197652	135197484	Y	NA	SETX	NA	NA	NA	NA	SETX	30720	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	135279793	135280144	135280078	Y	TTF1	TTF1	NA	NA	NA	NA	TTF1	65	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chr9	136009131	136009458	136009277	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	27843	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	136009735	136010292	136009932	Y	GTF3C4,DDX31,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	27009	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	136548488	136549466	136548792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SARDH	53611	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	139595249	139595639	139595357	Y	SEC16A,FUT7,C9orf142,ANAPC2,ABCA2	AGPAT2,FAM69B,SNHG7	SNORA43,SNHG7	MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM69B	9383	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	15.6960121592511
chrX	3102520	3102927	3102578	Y	NA	NA	CXorf28	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4767	3960974	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4767	3330638	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chrX	12969061	12969258	12969197	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	21969	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chrX	12972600	12972806	12972677	Y	NA	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	18421	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chrX	13041801	13041932	13041889	Y	TMSB4X,FAM9C	NA	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	50574	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chrX	13170049	13170410	13170120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	178822	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chrX	19580626	19581004	19580815	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDHA1	220615	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chrX	40005202	40005365	40005305	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	29217	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chrX	40032962	40033837	40033453	Y	BCOR,CXorf38,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	745	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chrX	40034694	40035505	40035056	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	112	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chrX	40943673	40944218	40943773	Y	CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X	USP9X	NA	NA	NA	NA	USP9X	785	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chrX	41242516	41242827	41242698	Y	DDX3X	NA	DDX3X,USP9X	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DDX3X	51865	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	FUNDC1	511159	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chrX	53744165	53744436	53744325	Y	NA	HUWE1	HUWE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	HUWE1	32492	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chrX	64070524	64070939	64070785	Y	MTMR8	NA	NA	NA	NA	NA	ZC4H2	181654	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chrX	64815346	64815780	64815481	Y	MSN	MSN	MSN	IMR90	Hi-C	24141950	MSN	9089	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chrX	64818518	64818695	64818582	Y	NA	MSN	MSN	IMR90	Hi-C	24141950	MSN	12261	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	4.90500379976598
chrX	67291116	67291490	67291298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPF6	424675	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	EFNB1	NA	NA	NA	NA	EFNB1	42163	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chrX	77908831	77908963	77908901	Y	CYSLTR1	NA	NA	NA	NA	NA	P2RY10	289866	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chrX	85404728	85405017	85404880	Y	DACH2	NA	NA	NA	NA	NA	CHM	104162	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chrX	100111421	100111452	100111441	Y	NA	CSTF2	NA	NA	NA	NA	CSTF2	38037	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chrX	100664036	100664412	100664274	Y	NA	RPL36A,GLA,HNRNPH2	NA	NA	NA	NA	HNRNPH2	2753	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chrX	117896439	117896822	117896632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK11	268578	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chrX	123481168	123481384	123481200	Y	STAG2,SH2D1A	SH2D1A	NA	NA	NA	NA	SH2D1A	2974	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	2.94300227985959
chrX	131159301	131159695	131159439	Y	RAP2C,MBNL3,MST4,MST4	MST4	NA	NA	NA	NA	MST4	4008	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chrX	131222922	131223204	131223042	Y	MST4,MST4,RAP2C	RP1-305B16.3	NA	NA	NA	NA	RP1-305B16.3	40176	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	1.96200151990639
chrX	153755432	153755621	153755566	Y	NA	LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD	FAM3A	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	IKBKG	11793	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195
chrY	15207344	15207441	15207401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTY	383112	CAGE	SKW-3	hg19	FANTOM5	0.981000759953195