chr1	839741	840250	839788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOC2L	52439	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	840753	841210	840812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOC2L	51479	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	945769	946034	945890	Y	CCNL2,ATAD3B	PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	ISG15	769	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	956563	956812	956665	Y	UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN	HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	AGRN	3060	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RP11-465B22.3,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	11532	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	1014834	1015095	1014859	Y	NA	RP11-465B22.3,C1orf159	RNF223	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RP11-465B22.3	21720	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	1286847	1286913	1286880	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1,CCNL2	NA	NA	NA	NA	DVL1	4117	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	1295535	1296332	1296026	Y	MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8	CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	AURKAIP1	12543	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr1	1456676	1456699	1456688	Y	NA	ATAD3A	NA	NA	NA	NA	ATAD3A	11145	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	1803114	1803303	1803274	Y	NA	GNB1,TMEM52	NADK	IMR90	Hi-C	24141950	GNB1	17192	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	1814762	1815124	1815035	Y	SKI,C1orf86,MIB2	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	GNB1	5371	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	TMEM52	7877	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.862915361159228
chr1	2140151	2140337	2140252	Y	C1orf86	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	1822	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	2162325	2162996	2162733	Y	TNFRSF14,SKI	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	20166	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,TNFRSF14,RP3-395M20.8,FAM213B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF14	7107	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr1	2478276	2478817	2478474	Y	SKI,PANK4,TNFRSF14	PANK4,TNFRSF14,RP3-395M20.8,FAM213B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF14	6261	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr1	2505035	2505361	2505108	Y	SKI,TNFRSF14	PANK4,TNFRSF14,RP3-395M20.8,FAM213B	NA	NA	NA	NA	FAM213B	10569	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	2509702	2510198	2509855	Y	SKI,TNFRSF14	TNFRSF14,RP3-395M20.8,FAM213B	NA	NA	NA	NA	FAM213B	5732	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr1	3325555	3326143	3325876	Y	NA	ARHGEF16	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	42847	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	3420761	3421065	3420920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	51771	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr1	3459907	3460197	3460078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	65862	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	3609276	3609439	3609360	Y	DFFB,CEP104,WRAP73,TP73,TP73,TP73	TP73,WRAP73	NA	NA	NA	NA	WRAP73	41951	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	3817648	3818071	3817969	Y	LRRC47	CEP104,DFFB,C1orf174	NA	NA	NA	NA	C1orf174	2791	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	6319998	6320272	6320169	Y	NA	ICMT,GPR153	NA	NA	NA	NA	GPR153	963	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	6661008	6661639	6661311	Y	ZBTB48,KLHL21	NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3	NA	NA	NA	NA	PHF13	10106	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr1	6943772	6944262	6943813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	100388	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	7177733	7177848	7177794	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-8P	99572	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	7313313	7313451	7313382	Y	NA	RNU1-8P	NA	NA	NA	NA	RNU1-8P	35893	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	7538871	7539273	7539100	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-8P	261451	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	7764543	7764931	7764717	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	64398	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	8070132	8070398	8070299	Y	PER3,SLC45A1,ERRFI1	ERRFI1,RP11-431K24.1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	13970	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	8076289	8076986	8076888	Y	NA	ERRFI1,RP11-431K24.1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	7382	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	8121436	8121582	8121497	Y	ERRFI1	ERRFI1,RP11-431K24.1	RERE,ERRFI1,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	36638	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	8154517	8154933	8154754	Y	VAMP3	NA	ERRFI1,RERE,PARK7,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	69719	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	8156648	8157003	8156918	Y	VAMP3	NA	ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	71850	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	8157417	8157780	8157543	Y	NA	NA	ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	72619	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	8254637	8254907	8254798	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,PARK7,RERE,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	9750	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	8457012	8457408	8457307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	81126	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	8487656	8487917	8487791	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	111770	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	8571636	8571856	8571737	Y	SLC45A1,RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	195750	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	8724042	8724475	8724233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	151227	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	8981771	8982005	8981888	Y	NA	ENO1-IT1,ENO1	ENO1-AS1,ENO1,CA6,SLC2A7,SLC2A5	IMR90	Hi-C	24141950	ENO1	44463	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	9335683	9335930	9335747	Y	SLC25A33	H6PD,SPSB1	NA	NA	NA	NA	SPSB1	15009	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	9473687	9473864	9473791	Y	NA	NA	H6PD,SPSB1,SLC25A33	IMR90	Hi-C	24141950	SPSB1	122748	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.38066457785476
chr1	9885367	9885695	9885655	Y	NA	CLSTN1	NA	NA	NA	NA	CLSTN1	2783	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	10269964	10270260	10269995	Y	RBP7,PGD,KIF1B	KIF1B	NA	NA	NA	NA	KIF1B	1101	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	10853986	10854555	10854168	Y	ANGPTL7,CASZ1	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	152	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	12493313	12493712	12493478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	182025	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	12589452	12589763	12589585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	85974	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	12599928	12600179	12600028	Y	DHRS3	NA	DHRS3,VPS13D	K562	ChIA-PET	22265404	DHRS3	75558	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	12600525	12600853	12600637	Y	DHRS3	NA	DHRS3,VPS13D	K562	ChIA-PET	22265404	DHRS3	74884	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr1	12609717	12610039	12609907	Y	DHRS3	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	65698	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	12674513	12674729	12674684	Y	NA	DHRS3	NA	NA	NA	NA	DHRS3	1008	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr1	14924209	14924351	14924269	Y	NA	KAZN	NA	NA	NA	NA	KAZN	1009	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	15587806	15588435	15587851	Y	NA	FHAD1	NA	NA	NA	NA	FHAD1	16038	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	15649550	15649749	15649647	Y	PLEKHM2,EFHD2,CASP9	NA	EFHD2	IMR90	Hi-C	24141950	FHAD1	77782	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	15666999	15667145	15667070	Y	NA	NA	CTRC,EFHD2	IMR90	Hi-C	24141950	EFHD2	67246	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	15743639	15744318	15744205	Y	NA	EFHD2	NA	NA	NA	NA	EFHD2	9248	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	15835354	15835624	15835499	Y	NA	CASP9,DNAJC16	NA	NA	NA	NA	CASP9	15405	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	16087189	16087372	16087266	Y	EPHA2,FBLIM1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	65352	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr1	16125579	16125747	16125670	Y	FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	26977	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3049	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr1	16212759	16213091	16212941	Y	EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	40117	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr1	16438237	16438733	16438326	Y	NA	FAM131C,RP11-276H7.2,EPHA2	FAM131C,CLCNKB	IMR90	Hi-C	24141950	FAM131C	40110	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	16442572	16442804	16442699	Y	HSPB7,SPATA21	FAM131C,RP11-276H7.2,EPHA2	FAM131C,CLCNKB	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-276H7.2	36902	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	16470181	16470602	16470563	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	9104	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr1	16479299	16479465	16479382	Y	FBLIM1,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	241	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	16499761	16499895	16499826	Y	SPEN,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	19179	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr1	16502532	16502678	16502612	Y	C1orf64	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	21950	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	16508402	16508642	16508565	Y	FBLIM1	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	EPHA2	27820	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	16669074	16669169	16669123	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	7780	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	16696032	16696399	16696223	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	19083	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	RNU1-1	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-1	12489	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.8984137945503
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	RP11-108M9.4	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-108M9.4	17109	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-108M9.4	26044	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	3.36536990852099
chr1	17454855	17455288	17455072	Y	PADI4	PADI2	PADI2,PADI1,PADI3	IMR90	Hi-C	24141950	PADI2	10907	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	17534687	17534794	17534729	Y	NA	PADI1,PADI3	NA	NA	NA	NA	PADI1	5066	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	17557386	17557571	17557478	Y	NA	PADI1,PADI3	NA	NA	NA	NA	PADI3	16022	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	17767804	17768710	17768126	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	3584	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr1	17865185	17865523	17865202	Y	ARHGEF10L	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	855	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	19336477	19336714	19336579	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	55297	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	19796024	19796128	19796080	Y	NA	CAPZB,RNU4-28P	NA	NA	NA	NA	CAPZB	13938	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	20091332	20091506	20091448	Y	PLA2G2A,TMCO4	TMCO4,RNF186	NA	NA	NA	NA	TMCO4	32932	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	20204786	20204981	20204970	Y	OTUD3	OTUD3	NA	NA	NA	NA	OTUD3	2025	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr1	21149682	21149798	21149749	Y	CAMK2N1,EIF4G3	HP1BP3	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	37866	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	21284001	21284025	21284019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	114221	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	21401731	21402159	21402110	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	3485	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	21428050	21428147	21428101	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	29804	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	21475659	21476054	21476002	Y	EIF4G3,EIF4G3	EIF4G3	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	25323	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	21588176	21588724	21588522	Y	ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	81273	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	22829217	22829453	22829426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB40	52873	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	23429944	23430077	23430039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LUZP1	72224	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	23494015	23494642	23494449	Y	NA	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	7659	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	23542417	23542518	23542468	Y	HTR1D	LUZP1	KDM1A,LUZP1	IMR90	Hi-C	24141950	LUZP1	40116	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr1	24063897	24064210	24064053	Y	PNRC2,RPL11	RPL11,TCEB3,PITHD1	RPL11	IMR90	Hi-C	24141950	TCEB3	3435	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	24229023	24229388	24229190	Y	NA	FUCA1,RP11-4M23.4	NA	NA	NA	NA	FUCA1	36239	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	24349340	24349488	24349411	Y	NA	RP11-4M23.7	LYPLA2,SRSF10,MYOM3,PNRC2,SRRM1,HMGCL,IL22RA1,LOC100506963,TCEB3,GALE,FUCA1,CNR2,IL28RA,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-4M23.7	16331	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	24691833	24692082	24691893	Y	PNRC2,GRHL3	GRHL3,NIPAL3	NA	NA	NA	NA	GRHL3	48021	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr1	24789793	24789894	24789844	Y	NA	NIPAL3,RCAN3	NA	NA	NA	NA	RCAN3	37493	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	25237596	25238132	25237861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RUNX3	51480	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	26201699	26201757	26201716	Y	SEPN1	RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	RP1-125I3.2	17595	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	26490998	26491259	26491133	Y	NA	ZNF593,CNKSR1	NA	NA	NA	NA	ZNF593	3103	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HMGN2	30291	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	26907862	26908015	26907938	Y	SH3BGRL3,UBXN11	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2	110921	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr1	27021406	27021810	27021509	Y	NA	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	882	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr1	27160002	27160387	27160288	Y	WDTC1,SLC9A1,RPS6KA1,ARID1A,PIGV,ZDHHC18	PIGV,ZDHHC18,SFN	NA	NA	NA	NA	ZDHHC18	8801	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	27175784	27176273	27175984	Y	C1orf172,AIM1L,ZNF683,RPS6KA1,SFN	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	11360	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr1	27321452	27321840	27321632	Y	TMEM222,TRNP1,FAM46B	C1orf172,RP11-344H11.4,TRNP1	NA	NA	NA	NA	TRNP1	3254	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr1	27561705	27561803	27561716	Y	NA	WDTC1	NA	NA	NA	NA	WDTC1	2698	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,GPR3	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	27854575	27854919	27854692	Y	SYTL1,FGR,FGR,FGR,FAM76A,C1orf38	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	39906	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	27924204	27924421	27924302	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	4521	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr1	29563709	29564430	29563877	Y	PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	2681	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr1	29564766	29564995	29564881	Y	NA	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	3738	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	82443	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.63953918620253
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	81944	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.20808150562292
chr1	31643824	31643962	31643871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKAIN1	66439	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	31921261	31921410	31921280	Y	NA	SERINC2	NA	NA	NA	NA	SERINC2	40849	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	31956203	31956482	31956384	Y	PEF1	NA	SERINC2,SNRNP40,HCRTR1,NKAIN1,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1	IMR90	Hi-C	24141950	SERINC2	75791	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	32180603	32180986	32180867	Y	PEF1,SPOCD1,COL16A1	BAI2	PEF1,COL16A1	IMR90	Hi-C	24141950	BAI2	47508	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	32250836	32250955	32250895	Y	IQCC	BAI2,SPOCD1	NA	NA	NA	NA	BAI2	22342	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	32354934	32355150	32354987	Y	LCK,PEF1,PTP4A2,PTP4A2	NA	NA	NA	NA	NA	PTP4A2	53307	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	32405536	32405898	32405618	Y	NA	PTP4A2	NA	NA	NA	NA	PTP4A2	2559	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	32420307	32420572	32420414	Y	TMEM234,PEF1,PTP4A2,PTP4A2	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	11850	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	32421622	32422096	32421696	Y	MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	13165	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr1	32966228	32966602	32966575	Y	FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8A	NA	NA	NA	NA	ZBTB8A	36426	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr1	33082385	33082406	33082394	Y	ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	32098	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	33221272	33221671	33221612	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	15786	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	33225056	33225508	33225256	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	19570	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	33225777	33226084	33225890	Y	TMEM54,KIAA1522	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	20291	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr1	33226574	33226719	33226667	Y	TMEM54,KIAA1522	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	21088	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	33373602	33373851	33373812	Y	RNF19B	TMEM54	NA	NA	NA	NA	TMEM54	8563	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	33428474	33429020	33428770	Y	NA	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	188	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	33438571	33438703	33438616	Y	KIAA1522,ADC	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	10285	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	33446816	33447482	33446950	Y	RNF19B	RNF19B	RNF19B,AK2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19B	18530	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr1	33454783	33455472	33455325	Y	RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	26497	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	33457914	33458607	33458311	Y	RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	29628	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	33515825	33516245	33515960	Y	RNF19B	AK2,ADC	AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AK2	28352	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.03549843339107
chr1	33564918	33565286	33565197	Y	NA	AK2,ADC	NA	NA	NA	NA	ADC	20213	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	33622437	33622835	33622675	Y	PHC2,TRIM62	TRIM62	NA	NA	NA	NA	TRIM62	22825	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	35294449	35294485	35294467	Y	NA	GJB3	NA	NA	NA	NA	GJB3	49659	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	35891843	35891965	35891904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCDN	129109	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	35892196	35892421	35892350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCDN	128653	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	36103028	36103196	36103152	Y	NA	PSMB2	TFAP2E	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB2	2249	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr1	36555347	36555633	36555606	Y	STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2	ADPRHL2,COL8A2	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	2871	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	36616485	36616868	36616577	Y	STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1	COL8A2,TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	2312	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	36626561	36626969	36626609	Y	STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2,MAP7D1,THRAP3	COL8A2,TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	7381	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	36839449	36839891	36839558	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	9606	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	36840093	36840535	36840445	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	8962	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	36849527	36849580	36849557	Y	EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	30	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	37937293	37937526	37937471	Y	YRDC,MTF1,C1orf122,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	LINC01137	486	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	37944084	37944971	37944382	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	5931	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	38009784	38010404	38010149	Y	SNIP1,MTF1,ZC3H12A	MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,DNALI1,GNL2	MEAF6	IMR90	Hi-C	24141950	SNIP1	7499	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	38010731	38010979	38010768	Y	ZC3H12A,MTF1	MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,DNALI1,GNL2	MEAF6	IMR90	Hi-C	24141950	SNIP1	6924	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	38391752	38391859	38391812	Y	NA	INPP5B	NA	NA	NA	NA	INPP5B	18870	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	38408316	38408623	38408470	Y	NA	INPP5B,SF3A3	NA	NA	NA	NA	INPP5B	2106	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	39509536	39509726	39509631	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	19546	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	39516193	39516422	39516273	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	26203	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	39736190	39736575	39736327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	137576	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	39791626	39791706	39791638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	82445	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	39874208	39874673	39874342	Y	KIAA0754	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	57	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr1	40295095	40295414	40295254	Y	NA	BMP8B	NA	NA	NA	NA	BMP8B	42562	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	40561233	40561752	40561648	Y	SMAP2,RLF	NA	NA	NA	NA	NA	PPT1	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	41005233	41005440	41005262	Y	RLF	RP11-656D10.3,ZNF684	NA	NA	NA	NA	ZNF684	10000	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	41501440	41501773	41501639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	175422	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	41650800	41651168	41651109	Y	KCNQ4,SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	54658	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	41831444	41831806	41831485	Y	SCMH1	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	5850	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	41915297	41915638	41915514	Y	HIVEP3	EDN2	EDN2	MCF7	ChIA-PET	22265404	EDN2	32706	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	41981831	41982007	41981926	Y	SLFNL1,SLFNL1	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	33487	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	179507	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr1	42774668	42774801	42774679	Y	CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	FOXJ3	NA	NA	NA	NA	FOXJ3	24747	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	42934748	42935131	42934805	Y	CCDC30,RIMKLA	PPCS,ZMYND12,CCDC30,TMSB4XP1	NA	NA	NA	NA	CCDC30	7747	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	43388597	43388971	43388887	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	33559	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	43405621	43405821	43405630	Y	CCDC30,CCDC23,ERMAP,SZT2,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	16709	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	43406108	43407009	43406836	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	15521	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	43839359	43839523	43839441	Y	NA	RP1-92O14.3,CDC20,ELOVL1,MED8,SZT2	NA	NA	NA	NA	ELOVL1	7663	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	44015731	44016125	44016031	Y	CCDC24,WDR65,C1orf210,C1orf210,PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	26873	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	44230271	44230532	44230402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	60776	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	44232152	44232509	44232262	Y	SLC6A9,IPO13,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	62657	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	44452990	44453115	44453039	Y	NA	RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9	NA	NA	NA	NA	CCDC24	1916	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	44495684	44496307	44495779	Y	NA	CCDC24,SLC6A9	B4GALT2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A9	545	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr1	45283789	45284126	45283958	Y	NA	RPS8,SNORD55,RPS15AP11,PLK3,TCTEX1D4,BTBD19,RNU5E-6P,PTCH2	NA	NA	NA	NA	RNU5E-6P	120	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	45670767	45670868	45670821	Y	PTCH2,ZSWIM5	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM5	99013	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	46102450	46102810	46102714	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	12688	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	46111666	46112048	46111975	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	3450	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	46555686	46555960	46555823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	82785	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	46689426	46689696	46689549	Y	FAAH,C1orf190	PIK3R3,POMGNT1,RAD54L	NA	NA	NA	NA	POMGNT1	5449	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	47800262	47800514	47800436	Y	NA	STIL,CMPK1	NA	NA	NA	NA	CMPK1	2793	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	51245588	51245972	51245952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	177963	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	51261727	51261870	51261800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	162065	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	51302197	51302583	51302391	Y	FAF1	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	121352	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	51312022	51312165	51312091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	111770	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	51703075	51703494	51703244	Y	OSBPL9	RNF11	NA	NA	NA	NA	RNF11	3132	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	51823993	51824400	51824363	Y	NA	TTC39A	NA	NA	NA	NA	TTC39A	15205	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	51935246	51935592	51935567	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15	NA	NA	NA	NA	RP11-191G24.1	46389	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	52173889	52173954	52173921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	133038	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	52193179	52193464	52193255	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRD1	149013	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	52507951	52508154	52508101	Y	NA	KTI12,BTF3L4,TXNDC12	NA	NA	NA	NA	KTI12	10463	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	53168640	53169047	53168726	Y	NA	ZYG11B	SELRC1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ZYG11B	21079	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	53385696	53386052	53386029	Y	NA	ECHDC2,SCP2	NA	NA	NA	NA	ECHDC2	4832	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	54441729	54442008	54441915	Y	NA	HSPB11,LRRC42	NA	NA	NA	NA	LRRC42	31979	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	54715450	54715803	54715579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	51741	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	54873075	54873515	54873406	Y	SSBP3,SSBP3	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	3637	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	54953784	54954325	54954090	Y	SSBP3,SSBP3	NA	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	76632	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	55594097	55594408	55594328	Y	NA	NA	PCSK9	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	84378	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	56991269	56991531	56991390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	117443	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	57043287	57044160	57043621	Y	PRKAA2,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	64814	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	59228706	59229186	59229035	Y	NA	JUN,LINC01135	NA	NA	NA	NA	JUN	18599	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	59280773	59281281	59281052	Y	FGGY,JUN	JUN,LINC01135	NA	NA	NA	NA	LINC01135	31950	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr1	59281873	59282217	59282125	Y	MYSM1,FGGY,JUN	JUN,LINC01135	NA	NA	NA	NA	LINC01135	33050	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr1	59369049	59370138	59369602	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01135	120226	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	60148393	60148656	60148541	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	HOOK1	129802	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	61517483	61517553	61517518	Y	NA	NA	INADL,NFIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFIA	188552	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	61579491	61579639	61579512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	250560	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	64254998	64255371	64255034	Y	ROR1	ROR1	NA	NA	NA	NA	ROR1	17305	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	65292575	65293034	65292898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAVER2	83797	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	65381647	65381826	65381744	Y	JAK1	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	48361	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	65389011	65389411	65389276	Y	NA	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	40776	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	65507944	65508037	65507991	Y	NA	RP4-535B20.1	NA	NA	NA	NA	RP4-535B20.1	23383	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	65527577	65527856	65527728	Y	NA	RP4-535B20.1	AK4	K562	ChIA-PET	22265404	RP4-535B20.1	3564	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	67029191	67029437	67029359	Y	NA	SGIP1	NA	NA	NA	NA	SGIP1	32125	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	67029939	67030347	67030122	Y	PDE4B	SGIP1	NA	NA	NA	NA	SGIP1	32873	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	67374841	67375185	67375111	Y	SGIP1,WDR78	WDR78,MIER1	NA	NA	NA	NA	WDR78	13385	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	67867795	67868154	67868057	Y	NA	SERBP1	NA	NA	NA	NA	SERBP1	25944	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	68189225	68189635	68189533	Y	NA	GADD45A	NA	NA	NA	NA	GADD45A	40481	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	68234822	68235039	68234951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG12	62111	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	68257383	68257657	68257565	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	39493	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	68572958	68573227	68573176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLS	123576	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	68639460	68639856	68639657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLS	56947	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	68663588	68663867	68663728	Y	NA	WLS,RPS7P4	NA	NA	NA	NA	WLS	32936	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	68849988	68850367	68850179	Y	NA	NA	LOC100289178,WLS,RPE65	IMR90	Hi-C	24141950	DEPDC1	110537	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	68858132	68858533	68858311	Y	NA	NA	WLS,LOC100289178	IMR90	Hi-C	24141950	DEPDC1	102371	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr1	70017370	70017628	70017440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC40	651675	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	4.57345141414391
chr1	70733839	70734223	70734057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF11	64474	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	70746826	70747040	70746993	Y	ANKRD13C	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD13C	71377	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	72749220	72749791	72749447	Y	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NA	KRT8P21	818684	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	75972237	75972619	75972428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACADM	215417	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	78026939	78027232	78027062	Y	FAM73A	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	119872	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIPC2	114120	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.03549843339107
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	102291	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr1	82268420	82269588	82268555	Y	LPHN2	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	83042	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	168293	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	84966686	84966774	84966730	Y	NA	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	3474	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	84971050	84971209	84971115	Y	MCOLN2,GNG5	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	802	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	85034322	85034489	85034405	Y	CTBS	CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	3674	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	85049005	85049203	85049109	Y	NA	CTBS	RPF1,GNG5	IMR90	Hi-C	24141950	CTBS	10842	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr1	85737728	85738105	85737917	Y	BCL10	C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	BCL10	2668	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr1	85744584	85744829	85744751	Y	BCL10	C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	BCL10	3811	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	85794698	85795078	85794848	Y	CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	53925	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	86049987	86050100	86050044	Y	NA	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	CYR61	5543	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	87800631	87801610	87800748	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	8480	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr1	89188530	89188764	89188647	Y	NA	PKN2	NA	NA	NA	NA	PKN2	40625	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	89303069	89303193	89303134	Y	GBP4,GBP2,GTF2B	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2B	52434	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	89358212	89358439	89358316	Y	PKN2,CCBL2	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	2585	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr1	89382528	89382593	89382561	Y	NA	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	26901	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	90309838	90310280	90310072	Y	LRRC8C,ZNF326	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	25265	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	90376424	90376756	90376561	Y	LRRC8D,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	81124	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	92184014	92184251	92184134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-91I11.1	120286	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	92198149	92198440	92198227	Y	TGFBR3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-91I11.1	134421	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	92202579	92202753	92202666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-91I11.1	138851	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	92295673	92296022	92295848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	73870	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	92496267	92496651	92496624	Y	NA	EPHX4,BTBD8	NA	NA	NA	NA	EPHX4	2728	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	92907492	92907607	92907552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLMN	144948	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr1	93003662	93004045	93003868	Y	RPAP2,GLMN,RPL5,GFI1	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-59P	160446	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	93427945	93428408	93428079	Y	MTF2,DR1,FAM69A	FAM69A	NA	NA	NA	NA	FAM69A	2888	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	93634565	93634982	93634927	Y	MTF2	CCDC18,TMED5	NA	NA	NA	NA	CCDC18	8494	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	93806739	93807078	93807070	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	DR1	2367	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	94007993	94008357	94008092	Y	FNBP1L,BCAR3	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	96305	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	94023703	94024059	94023930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	112015	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	94038553	94038921	94038737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	126865	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	94128177	94128297	94128262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAR3	182409	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	94158601	94159338	94158654	Y	GCLM,DNTTIP2,BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCAR3	151368	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr1	94244939	94245309	94245199	Y	ARHGAP29,FNBP1L,BCAR3	NA	BCAR3,MIR760,FNBP1L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCAR3	65397	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	94712395	94712617	94712502	Y	ARHGAP29	ARHGAP29	ABCA4,ARHGAP29,ABCD3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP29	26007	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	95008693	95008821	95008774	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	3337	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	95107584	95108052	95107918	Y	F3,SLC44A3,SLC44A3	NA	F3,ABCD3,SLC44A3	IMR90	Hi-C	24141950	F3	102228	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	95276451	95276463	95276457	Y	NA	LINC01057,SLC44A3	F3,ABCD3,CNN3,SLC44A3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01057	7374	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	95551114	95551338	95551185	Y	NA	ALG14,TMEM56	ALG14,TMEM56-RWDD3,SLC44A3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ALG14	14613	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	97291085	97291340	97291213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP2	105864	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	97596064	97596178	97596116	Y	PTBP2	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP2	410843	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	97656052	97656450	97656352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	352807	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	97994700	97995088	97995052	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	14169	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr1	98177967	98178251	98178164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	168710	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	98275580	98275856	98275718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	108749	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	98334223	98334553	98334370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	50052	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	98408796	98409171	98408982	Y	NA	DPYD	DPYD,MIR137HG	IMR90	Hi-C	24141950	DPYD	24191	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	98414430	98414798	98414662	Y	NA	DPYD	NA	NA	NA	NA	DPYD	29825	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	98494244	98494658	98494592	Y	NA	MIR137HG	NA	NA	NA	NA	MIR137HG	18761	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	98789496	98789901	98789701	Y	NA	NA	MIR137HG,MIR2682,LOC729987,DPYD	IMR90	Hi-C	24141950	MIR137HG	276077	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	100494312	100494735	100494498	Y	CDC14A,HIAT1	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	6918	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	100820585	100820838	100820683	Y	HIAT1,CDC14A	CDC14A	NA	NA	NA	NA	CDC14A	12001	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	100827551	100827774	100827683	Y	SLC35A3,HIAT1,CDC14A	CDC14A	NA	NA	NA	NA	CDC14A	18967	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	100859593	100859940	100859621	Y	HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	51009	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	101202267	101202571	101202418	Y	NA	VCAM1	NA	NA	NA	NA	VCAM1	18969	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	101392986	101393260	101393033	Y	S1PR1,SLC30A7,SLC30A7	EXTL2,SLC30A7	NA	NA	NA	NA	SLC30A7	33354	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	101485385	101485713	101485528	Y	NA	RP11-421L21.3,DPH5	NA	NA	NA	NA	RP11-421L21.3	3721	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	101486133	101486158	101486151	Y	NA	RP11-421L21.3,DPH5	NA	NA	NA	NA	RP11-421L21.3	3276	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	108673419	108673672	108673564	Y	FAM102B	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	67799	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	109246671	109246905	109246843	Y	FAM102B,TMEM167B,PRPF38B	HENMT1,PRPF38B,STXBP3	NA	NA	NA	NA	PRPF38B	13726	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	109937534	109937767	109937651	Y	GSTM3,WDR47,CELSR2,PSRC1,SORT1,SORT1	SORT1,PSMA5	NA	NA	NA	NA	SORT1	806	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	110320163	110320291	110320225	Y	NA	GSTM3,EPS8L3	CSF1,AHCYL1,CYB561D1,ATXN7L2,GPR61,GNAI3,AMIGO1,AMPD2,GNAT2,GSTM4,GSTM5,EPS8L3,FAM40A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPS8L3	15514	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	110334849	110335164	110334977	Y	NA	EPS8L3	CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPS8L3	30200	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	110548379	110548612	110548408	Y	NA	AHCYL1	NA	NA	NA	NA	AHCYL1	23071	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	110927812	110928210	110927883	Y	CD53,FAM40A,RBM15	RBM15,LAMTOR5-AS1,SLC16A4	NA	NA	NA	NA	SLC16A4	3494	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	112918897	112919196	112919049	Y	NA	CTTNBP2NL	WNT2B,ST7L,DDX20	IMR90	Hi-C	24141950	CTTNBP2NL	17607	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	113468568	113468671	113468620	Y	NA	SLC16A1-AS1,SLC16A1	NA	NA	NA	NA	SLC16A1-AS1	28366	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	113734243	113734639	113734494	Y	NA	RP11-389O22.4	NA	NA	NA	NA	RP11-389O22.4	24627	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	113932415	113932748	113932683	Y	NA	MAGI3	NA	NA	NA	NA	MAGI3	1044	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	114236415	114236760	114236542	Y	MAGI3	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF1	63351	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	114326143	114326379	114326237	Y	HIPK1,HIPK1,HIPK1,AP4B1,PHTF1,RSBN1,PTPN22	PHTF1,RSBN1	NA	NA	NA	NA	PHTF1	26032	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	115052481	115052766	115052572	Y	BCAS2,TRIM33	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	700	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	115296637	115296935	115296808	Y	NA	NRAS,CSDE1,SIKE1	NA	NA	NA	NA	CSDE1	2362	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	115605190	115605611	115605404	Y	BCAS2,SIKE1	TSPAN2	NA	NA	NA	NA	TSPAN2	24510	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	116520279	116520650	116520380	Y	ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,SLC22A15	SLC22A15	NA	NA	NA	NA	SLC22A15	3160	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	117100772	117101124	117100940	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	10537	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	117110819	117111247	117111136	Y	NA	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	414	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	117130518	117130699	117130624	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	18857	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	117526174	117526525	117526350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-27K13.3	73587	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	119503304	119503581	119503430	Y	NA	TBX15,RP4-712E4.1	NA	NA	NA	NA	TBX15	26598	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	120188395	120188927	120188667	Y	NA	PHGDH	NA	NA	NA	NA	ZNF697	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMBP1	225939	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	144533627	144534178	144533764	Y	PDE4DIP	RNU1-59P	PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNU1-59P	1589	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	144993199	144993244	144993232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	50527	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	145000077	145000849	145000623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	57405	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	145012331	145013054	145012678	Y	NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	61132	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	146612089	146612358	146612259	Y	CHD1L,PRKAB2	PRKAB2,PDIA3P1	NA	NA	NA	NA	PRKAB2	29771	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	146624494	146624779	146624637	Y	CHD1L,PRKAB2	PRKAB2,PDIA3P1	NA	NA	NA	NA	PRKAB2	17350	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.8984137945503
chr1	148000699	148000802	148000795	Y	NA	RNVU1-13	NA	NA	NA	NA	RNVU1-13	8553	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	3.27907837240507
chr1	149222771	149223127	149223106	Y	NA	RNVU1-17,RNU1-92P,RP11-403I13.5	NBPF10,SEC22B,NBPF15	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-403I13.5	5589	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr1	149816287	149817606	149817166	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H4A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H4B	13108	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	149821015	149821647	149821349	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H4A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H4B	9067	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	150135231	150135764	150135536	Y	PRPF3,MCL1,PLEKHO1	PLEKHO1	NA	NA	NA	NA	PLEKHO1	15858	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	150185878	150186128	150186012	Y	HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E	ANP32E,RNU2-17P	NA	NA	NA	NA	ANP32E	20376	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	150577042	150577503	150577391	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	22585	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	150585815	150586394	150586132	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,FAM63A,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	13694	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	150592182	150592667	150592572	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	7421	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	150600412	150600701	150600561	Y	CDC42SE1,BNIPL,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	324	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	150772798	150773105	150772952	Y	NA	CTSS	NA	NA	NA	NA	CTSS	36365	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	150949569	150950014	150949933	Y	ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A	CERS2,ANXA9,FAM63A,PRUNE	NA	NA	NA	NA	ANXA9	2479	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr1	151172620	151173197	151172669	Y	TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	4195	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	151184646	151184728	151184696	Y	NA	LYSMD1,VPS72,PIP5K1A,PSMD4	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	16221	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	151868154	151868386	151868273	Y	NA	THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	11898	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	151909443	151909536	151909490	Y	S100A10	THEM4	THEM4,S100A10,CELF3,RORC	IMR90	Hi-C	24141950	THEM4	29159	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	151913574	151913780	151913675	Y	S100A10	THEM4	S100A10,CELF3,THEM4,RORC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	33290	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	151913815	151914271	151914054	Y	S100A10	THEM4	S100A10,CELF3,THEM4,RORC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	33531	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	151918166	151918684	151918434	Y	NA	THEM4,S100A10	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	37882	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	151918898	151919222	151919024	Y	S100A10	THEM4,S100A10	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	38614	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	151949461	151949565	151949513	Y	NA	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	15301	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	151960875	151961433	151961102	Y	S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	3433	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr1	151961675	151962369	151962069	Y	S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	2497	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr1	152116191	152116374	152116281	Y	LCE3A	NA	NA	NA	NA	NA	S100A11	97808	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	153488459	153488748	153488622	Y	PGLYRP4,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14	BX470102.3,S100A6,S100A3,S100A4,S100A2	NA	NA	NA	NA	BX470102.3	15331	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	153504746	153504953	153504860	Y	PGLYRP3,S100A7L2,SLC39A1	BX470102.3,S100A6,S100A3,S100A4,S100A2	NA	NA	NA	NA	BX470102.3	667	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	153505144	153505346	153505245	Y	NA	BX470102.3,S100A6,S100A3,S100A4,S100A2	NA	NA	NA	NA	BX470102.3	1065	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	153584539	153584862	153584750	Y	NA	S100A2,S100A16,CHTOP,S100A13,SNAPIN	NA	NA	NA	NA	S100A16	918	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	153704694	153704943	153704839	Y	NA	INTS3,SLC27A3	NA	NA	NA	NA	INTS3	6151	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	153845025	153845089	153845058	Y	NA	GATAD2B	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	48362	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	153853385	153853782	153853590	Y	NA	GATAD2B	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	39669	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CREB3L4	1149	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr1	154151566	154151965	154151766	Y	NA	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	13159	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	154154606	154155027	154154830	Y	SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	10097	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	154899922	154900189	154899933	Y	NA	PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1	NA	NA	NA	NA	PMVK	7278	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	154972628	154972915	154972668	Y	CLK2,DPM3,DPM3,PYGO2,FLAD1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	212	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	154973335	154973935	154973656	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	208	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	155064132	155064186	155064153	Y	NA	ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3	NA	NA	NA	NA	EFNA3	29908	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	TRIM46,KRTCAP2,MUC1,MTX1,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MUC1	3476	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	155283531	155283932	155283776	Y	DCST1,EFNA1	HCN3,CLK2,FDPS,RUSC1	NA	NA	NA	NA	RUSC1	4755	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	155496665	155497012	155496914	Y	DCST1,HCN3,YY1AP1,ASH1L	ASH1L-AS1,ASH1L	NA	NA	NA	NA	ASH1L-AS1	32809	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	155535083	155535193	155535176	Y	HCN3	ASH1L-AS1,ASH1L	NA	NA	NA	NA	ASH1L	4485	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	155620238	155620623	155620432	Y	NA	DAP3,YY1AP1	NA	NA	NA	NA	DAP3	35128	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.20808150562292
chr1	155944562	155945214	155944815	Y	C1orf182,C1orf61,SYT11,PAQR6,PAQR6	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	NA	NA	NA	NA	ARHGEF2	29647	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	155945743	155946196	155946108	Y	C1orf182,ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	RXFP4,KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	28665	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	155946363	155946660	155946476	Y	ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	RXFP4,KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	28201	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	155951073	155951535	155951364	Y	NA	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	23326	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	156095033	156095181	156095051	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA	MEX3A,LMNA	NA	NA	NA	NA	LMNA	44669	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	156103413	156103690	156103594	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,LMNA	NA	NA	NA	NA	NA	LMNA	53049	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr1	156251648	156251762	156251690	Y	RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44	BGLAP,SMG5,TMEM79,C1orf85	NA	NA	NA	NA	TMEM79	922	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	41117	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr1	156468556	156468776	156468632	Y	MEF2D	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2D	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	156472693	156472952	156472780	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4073	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr1	156473111	156473378	156473326	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4491	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	156474686	156475018	156474923	Y	SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6066	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr1	156629760	156630406	156629967	Y	PAQR6,PAQR6,C1orf182,CCT3,ISG20L2,GPATCH4,HAPLN2	RP11-284F21.7,NES	NA	NA	NA	NA	RP11-284F21.7	544	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr1	156719450	156719815	156719708	Y	ETV3,ETV3,RRNAD1	RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	1048	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	157245880	157246130	157246005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV3	139614	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	157938818	157938961	157938889	Y	NA	KIRREL	AIM2,LOC646268,IFI16,KIRREL,CD1D	IMR90	Hi-C	24141950	KIRREL	22102	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	157964633	157965029	157964831	Y	OR10T2	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	3570	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	158147244	158147839	158147743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIRREL	186181	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	158994687	158995148	158994758	Y	OR6P1,OR10X1,OR10Z1,OR6K3,OR6N1,OR6N2,MNDA,IFI16,FCER1A	IFI16	NA	NA	NA	NA	IFI16	26929	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	159851477	159851987	159851825	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	C1orf204,CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	CCDC19	15966	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	159852272	159852569	159852526	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	C1orf204,CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	CCDC19	15384	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	159859603	159860031	159859945	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	C1orf204,CCDC19,TAGLN2	C1orf204,SLAMF8	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC19	7922	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	159880076	159880706	159880437	Y	FCRL6,DCAF8,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	CCDC19	12123	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	159886226	159886307	159886250	Y	NA	CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	7215	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	159892447	159892988	159892803	Y	NCSTN,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	534	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	160203977	160204039	160204035	Y	NA	PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8	NA	NA	NA	NA	RP11-574F21.2	25495	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	160242090	160242278	160242184	Y	NA	RP11-574F21.2,DCAF8,PEX19	NA	NA	NA	NA	DCAF8	10642	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	160759511	160759977	160759720	Y	CD84,CD48,FCER1G,CD244,ARHGAP30,SLAMF7,LY9	NA	NA	NA	NA	NA	CD48	79870	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	160982920	160983992	160983766	Y	CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	5146	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	161170260	161170636	161170567	Y	PCP4L1,ADAMTS4,NDUFS2	UFC1,USP21,PPOX,B4GALT3,NDUFS2,TOMM40L	NA	NA	NA	NA	NDUFS2	5366	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	NA	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	77619	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.38066457785476
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	NA	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	87026	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.03549843339107
chr1	161500608	161500899	161500816	Y	USF1,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A,ATF6,HSPA6,FCGR3B,FCGR3A,FCGR3A	NA	NA	NA	NA	NA	FCRLB	188454	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	162539981	162540420	162539994	Y	C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1	UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	10658	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	166828089	166828463	166828188	Y	POU2F1,POGK	POGK,TADA1	NA	NA	NA	NA	TADA1	15101	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr1	167424728	167425462	167425239	Y	POU2F1,RCSD1,CD247	NA	NA	NA	NA	NA	CREG1	95542	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	167683554	167683813	167683605	Y	POU2F1,CREG1	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	4616	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	167730247	167730494	167730371	Y	NA	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	41818	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	168149052	168149361	168149233	Y	NA	GPR161,TIPRL,RPL34P1,SFT2D2	NA	NA	NA	NA	TIPRL	2881	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	168409627	168409736	168409651	Y	NA	NA	F5	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	161349	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	169834996	169835276	169835168	Y	NA	SCYL3	NA	NA	NA	NA	SCYL3	26132	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	172327558	172328156	172327708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	83074	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	172369341	172369683	172369640	Y	NA	PIGC	NA	NA	NA	NA	PIGC	41547	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	172878579	172879356	172878831	Y	TNFSF18	NA	TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,SNORD81,GAS5,SNORD75,SNORD47,SNORD79,LOC100506046,SNORD77,DARS2,SNORD78,SNORD80,ZBTB37,SNORD44,SNORD76	IMR90	Hi-C	24141950	PIGC	467349	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	173370600	173370810	173370705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	73595	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	173382392	173382663	173382522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	61742	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	173447359	173447668	173447399	Y	PRDX6	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	2954	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	173909740	173909938	173909924	Y	RC3H1,ZBTB37	NA	NA	NA	NA	NA	GAS5	73720	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	174132741	174133010	174132876	Y	NA	RABGAP1L	NA	NA	NA	NA	RABGAP1L	6193	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	174788416	174788807	174788447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACYBP	177493	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	175145439	175145838	175145619	Y	KIAA0040,KIAA0040	KIAA0040	NA	NA	NA	NA	KIAA0040	14297	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr1	175158150	175158288	175158209	Y	KIAA0040,KIAA0040	KIAA0040	NA	NA	NA	NA	KIAA0040	1847	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	175159885	175160247	175160001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0040	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr1	175160901	175161109	175161018	Y	KIAA0040,KIAA0040	KIAA0040	NA	NA	NA	NA	KIAA0040	766	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	176501841	176501939	176501877	Y	PAPPA2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-195C7.1	327057	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	176601179	176601401	176601333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-195C7.1	426395	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	178231351	178231525	178231428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	170487	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	178305054	178305336	178305195	Y	RASAL2	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf220	204551	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	178903778	178903964	178903860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM20B	88975	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	178995927	178996290	178996175	Y	AXDND1,RALGPS2,TOR3A	FAM20B	NA	NA	NA	NA	FAM20B	2988	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	180200315	180200683	180200497	Y	LHX4	LHX4	NA	NA	NA	NA	LHX4	2894	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	180237101	180237317	180237140	Y	NA	LHX4	NA	NA	NA	NA	LHX4	39680	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	180250812	180250948	180250921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHX4	53391	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	180371123	180371295	180371283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD6	98794	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	180921044	180921090	180921069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX6	68957	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	181068595	181069000	181068732	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	12957	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	181074349	181074924	181074645	Y	XPR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	18711	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	182682922	182683008	182682965	Y	DHX9	NA	RGS8,RNASEL	IMR90	Hi-C	24141950	NPL	73420	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	182854499	182854851	182854644	Y	NA	DHX9	NA	NA	NA	NA	DHX9	47995	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	183526698	183527308	183526965	Y	SMG7,NCF2,NCF2,ARPC5	NCF2	NA	NA	NA	NA	NCF2	30703	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	183776671	183777014	183776784	Y	NCF2,NCF2,ARPC5	NA	NA	NA	NA	NA	RGL1	173451	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	184794829	184794875	184794854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	72782	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	184810330	184810429	184810414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	88283	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	184820980	184820991	184820986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	98933	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	184929910	184930144	184930114	Y	TRMT1L,SWT1,SWT1,IVNS1ABP,FAM129A	FAM129A	NA	NA	NA	NA	FAM129A	11538	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	192776947	192777226	192777096	Y	TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS1,RGS2	RGS2	NA	NA	NA	NA	RGS2	778	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	192783963	192784319	192784079	Y	TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS2	RGS2	NA	NA	NA	NA	RGS2	7794	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	197964894	197965254	197965077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHX9	85857	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	198237796	198237952	198237874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	113703	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	198850238	198850638	198850585	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	726145	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	200076437	200076447	200076441	Y	NR5A2	NA	NA	NA	NA	NA	NR5A2	81707	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr1	200321353	200321596	200321470	Y	DDX59,ZNF281	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF281	55588	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	200332454	200332650	200332616	Y	ZNF281	ZNF281	NA	NA	NA	NA	ZNF281	44534	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	200783735	200784105	200783920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf106	74071	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	200857233	200857815	200857711	Y	KIF21B	C1orf106	NA	NA	NA	NA	C1orf106	361	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	200862818	200862950	200862864	Y	NA	C1orf106	NA	NA	NA	NA	C1orf106	4642	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr1	200865264	200865418	200865332	Y	C1orf106,C1orf106	C1orf106	NA	NA	NA	NA	C1orf106	7088	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.46695611397069
chr1	200865457	200866265	200866098	Y	TMEM9,IGFN1,C1orf106,C1orf106	C1orf106	NA	NA	NA	NA	C1orf106	7281	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr1	201236006	201236165	201236054	Y	LAD1,C1orf106,PKP1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM9	97304	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	201683757	201684240	201683949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV1	93346	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	201709797	201710423	201710148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPO9	85846	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	201987611	201988279	201987793	Y	ELF3,LGR6	RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	10130	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr1	201992149	201992501	201992334	Y	NA	RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	14668	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	202003479	202003610	202003599	Y	NA	ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	25998	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	202075010	202075191	202075097	Y	PPP1R12B,ELF3,LGR6	ARL8A	RNPEP,LGR6,NAV1,ELF3,ARL8A,GPR37L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARL8A	36678	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	202161674	202161898	202161786	Y	NA	ARL8A,LGR6	NA	NA	NA	NA	LGR6	645	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	202217450	202217807	202217629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGR6	56421	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	202765097	202765528	202765162	Y	NA	RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6	NA	NA	NA	NA	KDM5B	11070	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	203101073	203101246	203101163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM183A	126559	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	203259429	203259985	203259729	Y	RABIF,KLHL12,ADIPOR1,ADIPOR1,BTG2	BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	12634	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	203296328	203297068	203296686	Y	LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	23709	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	111155	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	203794311	203794511	203794411	Y	NA	ZC3H11A,SNRPE	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	31529	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	204043987	204044379	204044133	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	3744	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	204049581	204049822	204049645	Y	LAX1,PIK3C2B,SOX13	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	9338	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	204071387	204071653	204071532	Y	LAX1,PPP1R15B,SOX13	SOX13,ETNK2	NA	NA	NA	NA	SOX13	31144	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	204238647	204239007	204238820	Y	GOLT1A,PLEKHA6	NA	NA	NA	NA	NA	GOLT1A	57427	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	204386444	204387188	204386898	Y	PPP1R15B	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	7525	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	204675739	204675945	204675909	Y	NA	NA	LRRN2,NFASC	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MDM4	192228	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	205179753	205180065	205179802	Y	NA	DSTYK,TMCC2	NA	NA	NA	NA	DSTYK	1026	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	205263599	205264019	205263855	Y	NA	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	24864	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	205410224	205410578	205410325	Y	DSTYK,TMCC2	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	12504	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	205442172	205442546	205442359	Y	CNTN2,TMEM81	LEMD1,CDK18	KLHDC8A,NUAK2,MIR135B,LOC284576,LEMD1,CDK18	IMR90	Hi-C	24141950	LEMD1	19090	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	205474556	205474866	205474575	Y	NA	CDK18	NA	NA	NA	NA	CDK18	2833	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	205475126	205475451	205475289	Y	NA	CDK18	NA	NA	NA	NA	CDK18	3403	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	205638734	205639222	205638979	Y	SLC45A3	ELK4,SLC45A3	NA	NA	NA	NA	SLC45A3	8365	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	206859136	206859493	206859328	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	2847	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	206859748	206860259	206859963	Y	IKBKE,RASSF5,FAIM3,FAIM3,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	3459	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	207064076	207064429	207064213	Y	NA	RP11-564A8.4	NA	NA	NA	NA	RP11-564A8.4	14535	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	207265739	207265906	207265769	Y	NA	PFKFB2,YOD1,C4BPB,C4BPA	NA	NA	NA	NA	C4BPB	5552	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	207509006	207509478	207509176	Y	CR1,CD46,CD55	CD55	NA	NA	NA	NA	CD55	16153	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	207551040	207551052	207551045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD55	58187	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	208021631	208021781	208021738	Y	CR1,CD46,PLXNA2,CD34	C1orf132	CD34	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf132	18714	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr1	210425971	210426288	210426079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HHAT	73308	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	211035320	211035533	211035504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNH1	269924	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	211590216	211590571	211590445	Y	NA	LINC00467	NA	NA	NA	NA	LINC00467	36071	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	211688648	211688771	211688711	Y	NA	NA	NEK2,RCOR3,TRAF5,LINC00467,RD3,SLC30A1,INTS7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC30A1	61313	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	211786767	211786829	211786805	Y	NA	SLC30A1	SLC30A1,NEK2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SLC30A1	36683	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	211950086	211950249	211950170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	51865	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	211964831	211965131	211964981	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	36983	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	211976591	211977124	211977068	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	24990	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	211988342	211989080	211989063	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	13034	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	211998326	211998558	211998442	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	3556	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	212513330	212513719	212513465	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206	RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	RP11-384C4.3	32470	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	214512112	214512120	214512117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD2	59667	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	214601098	214601566	214601506	Y	PTPN14	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	122226	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	216914036	216914339	216914195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	888085	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	218338759	218338973	218338866	Y	NA	NA	ESRRG	IMR90	Hi-C	24141950	RRP15	117656	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	220189685	220189943	220189814	Y	NA	EPRS	NA	NA	NA	NA	EPRS	28057	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	220427006	220427444	220427299	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	2094	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	221050798	221050949	221050931	Y	HLX	NA	NA	NA	NA	NA	MARC1	92697	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	221887766	221888016	221887890	Y	DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	25502	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	222638782	222639204	222638963	Y	NA	NA	DUSP10,MIA3,AIDA,BROX	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-378J18.3	121963	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	222814663	222814910	222814786	Y	NA	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	25235	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	223901276	223901546	223901311	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	13981	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	223907308	223907681	223907376	Y	NA	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	20013	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	223925260	223925580	223925340	Y	NA	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	37965	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	224012866	224013246	224013103	Y	NA	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	18428	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	224023477	224023773	224023693	Y	CAPN2,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	7901	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	224024642	224024959	224024902	Y	NA	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	6715	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	224025511	224025803	224025713	Y	NA	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	5871	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	4.22828526968022
chr1	224393253	224393414	224393305	Y	NA	RP11-365O16.1,DEGS1	NA	NA	NA	NA	DEGS1	31795	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	224458940	224459060	224459002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVL	57029	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	224685994	224686507	224686055	Y	NA	NA	WDR26,CNIH3	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	63259	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	224691192	224691563	224691423	Y	NA	NA	CNIH3	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	68457	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	224730441	224730985	224730669	Y	NA	NA	CNIH3	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	107706	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	224805633	224805908	224805866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR26	182898	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	224811590	224812043	224811760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR26	188855	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	224819300	224819585	224819443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR26	196565	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	225613143	225613456	225613257	Y	LBR,LBR	LBR	NA	NA	NA	NA	LBR	1171	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	225721902	225722011	225721957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LBR	107275	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	225780677	225780772	225780725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENAH	58072	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	226263544	226263865	226263697	Y	C1orf55	H3F3A	NA	NA	NA	NA	H3F3A	15992	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	226297611	226298113	226297674	Y	NA	NA	ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	H3F3A	50059	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr1	226315631	226315825	226315781	Y	PARP1,LIN9,PYCR2	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56606	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	226361229	226361382	226361305	Y	NA	ACBD3	NA	NA	NA	NA	ACBD3	11049	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	226866232	226866788	226866582	Y	ITPKB	NA	NA	NA	NA	NA	ITPKB	58236	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	226890865	226891416	226891300	Y	ITPKB	ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB	33608	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr1	227002760	227003096	227002965	Y	NA	NA	ITPKB,C1orf95	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PSEN2	52789	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr1	227315962	227315970	227315966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42BPA	188205	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	227936688	227936978	227936805	Y	ZNF678	SNAP47,JMJD4	NA	NA	NA	NA	JMJD4	15576	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	228350789	228351109	228350864	Y	JMJD4	GUK1,IBA57,C1orf145	NA	NA	NA	NA	IBA57	407	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	228398942	228399222	228399120	Y	TRIM17,GJC2	IBA57,C1orf145	NA	NA	NA	NA	C1orf145	143	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	228633222	228633907	228633608	Y	TRIM11,TRIM17,HIST3H2A	TRIM11,RP11-245P10.4,TRIM17,HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	HIST3H2A	9653	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	228678228	228678435	228678266	Y	NA	HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	5466	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	228782602	228782886	228782775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	85938	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.63953918620253
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84925	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	10.9590250867222
chr1	228783962	228784250	228784107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84574	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	228878269	228878481	228878411	Y	RHOU	RHOU	NA	NA	NA	NA	RHOU	9445	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	229335784	229335916	229335795	Y	RHOU,C1orf96	NA	RHOU,NUP133,RAB4A	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	68859	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	229366402	229366798	229366551	Y	C1orf96	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	37977	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	229388898	229389111	229388968	Y	URB2,TAF5L,NUP133,RAB4A,C1orf96	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,NUP133,ABCB10	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	15664	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	229473732	229474385	229474330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB4A	68910	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	230240540	230240902	230240735	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	49004	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	231038131	231038454	231038293	Y	COG2,TTC13,GNPAT,C1orf131	C1orf198	NA	NA	NA	NA	C1orf198	34796	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	231630305	231630490	231630353	Y	TSNAX	RP11-295G20.2,TSNAX	NA	NA	NA	NA	RP11-295G20.2	31812	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	232735038	232735290	232735230	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	230643	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	3.71053605298468
chr1	233234073	233234169	233234121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTPCR	149722	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	233249275	233249581	233249334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTPCR	164924	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr1	233472763	233473058	233472911	Y	NA	RPS7P3,PCNXL2	NA	NA	NA	NA	PCNXL2	43304	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	233750790	233751092	233750957	Y	KCNK1	KCNK1	NA	NA	NA	NA	KCNK1	3040	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	233763606	233763782	233763694	Y	NA	KCNK1	NA	NA	NA	NA	KCNK1	15856	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	233809261	233809638	233809364	Y	KCNK1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNK1	61511	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	234639993	234640263	234640100	Y	NA	TARBP1	LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TARBP1	27144	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	234728712	234729023	234728867	Y	NA	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	14248	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	234738546	234738834	234738624	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4437	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	234746093	234747674	234747395	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	2822	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	234767593	234767925	234767750	Y	TARBP1	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	RP4-781K5.4	12110	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	234792654	234793437	234793098	Y	NA	IRF2BP2,RP4-781K5.4	IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.4	12619	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr1	234858843	234859287	234859154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-781K5.4	78808	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	234908151	234908764	234908277	Y	IRF2BP2	NA	IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.4	128116	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	235096560	235096855	235096619	Y	ARID4B,ARID4B	RP11-443B7.3	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	17696	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	235097868	235098070	235097979	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	RP11-443B7.3	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	16481	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	235104770	235105153	235105099	Y	ARID4B,ARID4B	RP11-443B7.3	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	9398	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	235114050	235115068	235114636	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	235133014	235133422	235133155	Y	NA	RP11-443B7.3	LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	18463	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	235484403	235484795	235484782	Y	NA	GGPS1,ARID4B,TBCE	NA	NA	NA	NA	GGPS1	3870	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	235668656	235669018	235668830	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	B3GALNT2	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	2875	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	235805098	235806119	235805875	Y	LYST,RBM34,ARID4B,ARID4B	GNG4	NA	NA	NA	NA	GNG4	5935	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	236022682	236022818	236022763	Y	GPR137B,LYST	LYST	NA	NA	NA	NA	LYST	22122	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	236162583	236163199	236162893	Y	GPR137B	NA	NA	NA	NA	NA	NID1	63263	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	236431064	236431243	236431072	Y	LGALS8,ERO1LB	ERO1LB	NA	NA	NA	NA	ERO1LB	12076	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	237029172	237029469	237029246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	72562	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	237634251	237634535	237634324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	677641	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	2.07099686678215
chr1	239524689	239525075	239524869	Y	NA	CHRM3	NA	NA	NA	NA	CHRM3	22790	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr1	240306165	240306375	240306208	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	25080	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	240308207	240308537	240308375	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22918	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr1	240308546	240308862	240308776	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22593	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	242108255	242108348	242108324	Y	NA	NA	EXO1	IMR90	Hi-C	24141950	EXO1	98986	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	243451071	243451374	243451087	Y	CEP170,SDCCAG8	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	33751	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	243997018	243997244	243997154	Y	NA	AKT3	NA	NA	NA	NA	AKT3	15137	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	244210956	244211944	244211575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	198575	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	244613820	244614139	244614120	Y	NA	ADSS	NA	NA	NA	NA	ADSS	384	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr1	245196282	245196669	245196476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFCAB2	65275	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	245399077	245399186	245399185	Y	KIF26B	NA	NA	NA	NA	NA	EFCAB2	268070	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr1	247315116	247315371	247315289	Y	OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669	ZNF669,MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	47991	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	247326566	247327229	247326989	Y	NA	MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	36133	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr1	249157308	249157673	249157562	Y	OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692	MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2	NA	NA	NA	NA	ZNF692	5965	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	431640	432008	431824	Y	TUBB8,ZMYND11,DIP2C	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYND11	253235	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	699938	700531	700398	Y	DIP2C	DIP2C	NA	NA	NA	NA	DIP2C	33152	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	729218	729515	729367	Y	NA	DIP2C	NA	NA	NA	NA	DIP2C	4168	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	958233	958518	958406	Y	NA	LARP4B	DIP2C,GTPBP4,LARP4B	IMR90	Hi-C	24141950	LARP4B	17046	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr10	1100843	1101035	1100898	Y	NA	IDI1,WDR37	NA	NA	NA	NA	WDR37	7365	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	3028046	3028193	3028123	Y	NA	NA	LINC00200	IMR90	Hi-C	24141950	PFKP	78332	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	3123873	3124204	3123982	Y	NA	PFKP	NA	NA	NA	NA	PFKP	17348	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	3137708	3138098	3138049	Y	NA	PFKP	NA	NA	NA	NA	PFKP	31183	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	3239590	3239795	3239693	Y	NA	PITRM1	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	26587	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	3509617	3509911	3509759	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	296614	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr10	3510310	3510716	3510597	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	297307	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	3808656	3808872	3808754	Y	KLF6	KLF6	NA	NA	NA	NA	KLF6	16601	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	3845250	3845852	3845788	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	19777	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr10	3848037	3849536	3848891	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	22564	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr10	3850308	3850795	3850409	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	24835	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr10	3896143	3896475	3896326	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	70670	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	3984866	3985563	3985082	Y	KLF6	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	KLF6	159393	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	4705159	4705783	4705486	Y	NA	LINC00704	NA	NA	NA	NA	LINC00704	12563	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr10	4713647	4713873	4713697	Y	NA	LINC00704	NA	NA	NA	NA	LINC00704	4473	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.862915361159228
chr10	5333644	5334212	5333929	Y	NA	NA	AKR1E2,tAKR	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1C4	98219	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	5504427	5504665	5504478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NET1	51913	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr10	5577499	5577735	5577573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-336A10.5	73021	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	5587810	5588190	5587923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-336A10.5	62566	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr10	5588881	5589169	5589084	Y	NET1,CALML3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-336A10.5	61587	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	5590010	5590295	5590293	Y	NET1,CALML3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-336A10.5	60461	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	5590959	5591270	5591035	Y	NET1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-336A10.5	59486	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	5638863	5639270	5639216	Y	NET1,CALML3	RP11-336A10.5	NET1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-336A10.5	11486	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	5770570	5770836	5770703	Y	NA	FAM208B	NA	NA	NA	NA	FAM208B	45769	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	5783071	5783414	5783247	Y	NA	NA	GDI2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM208B	58270	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	6206285	6206560	6206485	Y	NA	PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	21404	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	6213842	6214122	6214025	Y	IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3	PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	28961	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	6237775	6238114	6237949	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	52894	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	6245814	6246792	6246043	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	60933	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	6321537	6321781	6321618	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	136656	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	6443408	6443712	6443449	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKCQ	176551	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr10	7248434	7248663	7248594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-554I8.2	471090	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	8098275	8098603	8098313	Y	NA	GATA3	NA	NA	NA	NA	GATA3	4708	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	8098940	8099487	8099174	Y	TAF3,GATA3	GATA3	NA	NA	NA	NA	GATA3	5373	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr10	8662161	8662543	8662250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	568594	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	9281291	9281530	9281414	Y	NA	NA	FLJ45983,GATA3,TAF3	IMR90	Hi-C	24141950	GATA3	1187724	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	11652835	11653073	11652954	Y	CELF2,USP6NL	USP6NL	NA	NA	NA	NA	USP6NL	1082	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	11835953	11836243	11836176	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	USP6NL	184200	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr10	11866902	11867068	11866972	Y	C10orf47	NA	LOC219731	IMR90	Hi-C	24141950	USP6NL	215149	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	11924114	11924319	11924232	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	UPF2	158850	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	12283843	12284276	12283949	Y	UPF2,UPF2,SEC61A2,CAMK1D	CDC123,NUDT5	NA	NA	NA	NA	NUDT5	47700	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	12455599	12455959	12455812	Y	SEC61A2,CAMK1D	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	66118	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	12490797	12491318	12490959	Y	SEC61A2,CAMK1D	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	101316	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	12749537	12749904	12749742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	360056	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	13142941	13143287	13143115	Y	NA	OPTN	NA	NA	NA	NA	OPTN	3492	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	13390886	13391219	13391148	Y	NA	PHYH,SEPHS1	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	2589	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	13391797	13392252	13392084	Y	SEPHS1	PHYH,SEPHS1	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	3500	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr10	13908290	13908478	13908416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	281363	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr10	14624029	14624329	14624184	Y	DCLRE1C	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	121888	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	14628830	14629278	14629071	Y	HSPA14	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	126689	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	14641847	14641963	14641950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	139706	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	14660821	14661040	14660871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM107B	153856	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	15158719	15159034	15158939	Y	NA	ACBD7,RPP38,C10orf111,NMT2	NA	NA	NA	NA	C10orf111	21401	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	15191044	15191371	15191092	Y	MEIG1,NMT2,C10orf111	NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	17321	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr10	15278281	15278573	15278465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMT2	69589	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	16557217	16557368	16557293	Y	NA	RNU2-18P	NA	NA	NA	NA	RNU2-18P	41215	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	17010242	17010673	17010572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSU1	152715	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	17105178	17105416	17105257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	136637	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	18567945	18568427	18568205	Y	NSUN6,ARL5B	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-499P20.2	264153	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	21386477	21386751	21386615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	74365	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr10	21816029	21816444	21816223	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	4650	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr10	21816987	21817223	21817104	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	3871	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	22629825	22629981	22629966	Y	DNAJC1	COMMD3,BMI1	NA	NA	NA	NA	BMI1	21685	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	22725331	22726270	22725901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	117191	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr10	22726811	22727194	22727116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	118671	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	22817226	22817294	22817260	Y	EBLN1	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	184190	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	22870490	22870524	22870509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	130960	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	22970665	22970972	22970902	Y	NA	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	30512	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	25786270	25786305	25786288	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THNSL1	482683	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	27354652	27354729	27354695	Y	NA	ANKRD26	NA	NA	NA	NA	ANKRD26	32692	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr10	27419520	27419901	27419745	Y	NA	ANKRD26,MASTL,YME1L1	NA	NA	NA	NA	MASTL	21852	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	27531769	27532240	27532024	Y	ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5	ACBD5	NA	NA	NA	NA	ACBD5	2710	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr10	28467299	28467468	28467383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP7	153947	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	29280500	29280692	29280596	Y	NA	NA	LYZL1,BAMBI,LOC100507605	IMR90	Hi-C	24141950	BAMBI	316229	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	30711320	30711474	30711381	Y	MAP3K8	MTPAP,MAP3K8	MAP3K8	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP3K8	9392	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	30720407	30720642	30720475	Y	MAP3K8	MAP3K8	NA	NA	NA	NA	MAP3K8	224	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr10	30742798	30743130	30743073	Y	NA	MAP3K8	NA	NA	NA	NA	MAP3K8	21932	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	31278125	31278259	31278204	Y	ZNF438,ZNF438	ZNF438	NA	NA	NA	NA	ZNF438	40607	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	31293680	31294164	31294019	Y	ZNF438,ZNF438	ZNF438	NA	NA	NA	NA	ZNF438	24702	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	31422679	31422989	31422772	Y	ZNF438,ZNF438	NA	ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	103813	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	31423488	31423889	31423800	Y	NA	NA	ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	104622	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr10	31770032	31770371	31770202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZEB1-AS1	162656	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	31870933	31871207	31871087	Y	NA	NA	ZNF438,ARHGAP12,ZEB1	IMR90	Hi-C	24141950	ZEB1-AS1	263557	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	31892273	31892723	31892643	Y	NA	NA	ZEB1	IMR90	Hi-C	24141950	ZEB1-AS1	284897	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	32047879	32048374	32048138	Y	ZEB1	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	167368	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.46695611397069
chr10	32100174	32100489	32100483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP12	115253	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	32316515	32316560	32316538	Y	NA	KIF5B	NA	NA	NA	NA	KIF5B	26799	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	32607439	32608014	32607606	Y	EPC1	NA	NA	NA	NA	NA	EPC1	57712	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	32611846	32612286	32612204	Y	EPC1	NA	NA	NA	NA	NA	EPC1	53440	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	32621222	32621521	32621374	Y	ARHGAP12,CCDC7,C10orf68,EPC1	EPC1	NA	NA	NA	NA	EPC1	44205	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr10	32626420	32626786	32626539	Y	NA	EPC1	NA	NA	NA	NA	EPC1	38940	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	32735821	32736068	32735865	Y	NA	CCDC7	C10orf68	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCDC7	2753	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr10	33250851	33251304	33251058	Y	NA	RP11-462L8.1,ITGB1	NA	NA	NA	NA	RP11-462L8.1	5078	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	33265376	33265557	33265464	Y	NA	RP11-462L8.1,ITGB1	ITGB1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-462L8.1	19603	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	33269452	33269916	33269602	Y	C10orf68	RP11-462L8.1,ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	22804	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	2.15728840289807
chr10	33272272	33272613	33272373	Y	ITGB1,ITGB1,ITGB1	RP11-462L8.1,ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	20107	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr10	33297744	33297972	33297858	Y	NA	ITGB1	ITGB1,C10orf68,PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	5024	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	33299093	33299340	33299217	Y	NA	ITGB1	ITGB1,C10orf68,PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	6373	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	33425894	33425989	33425946	Y	NA	NA	ITGB1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	133174	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	33503049	33503394	33503286	Y	ITGB1	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	119796	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	33541909	33542109	33542065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	81081	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	33547800	33548221	33548104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	74969	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	33562254	33562552	33562425	Y	ITGB1,ITGB1,NRP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	60638	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	33625950	33626342	33626167	Y	NA	NRP1	NA	NA	NA	NA	NRP1	2760	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	35070002	35070125	35070067	Y	CREM	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	32128	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	35080769	35081009	35080876	Y	NA	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	21244	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	35421114	35421320	35421181	Y	CUL2,CUL2,CCNY,CREM,CREM	CUL2,CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	7395	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	35438214	35438795	35438573	Y	CREM,CREM	CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	24495	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	35932153	35932694	35932189	Y	FZD8	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	398200	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	38149659	38150080	38149945	Y	ZNF248	RP11-162G10.1,RP11-162G10.5,ZNF248	NA	NA	NA	NA	ZNF248	4625	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr10	43248764	43248842	43248800	Y	NA	BMS1	NA	NA	NA	NA	BMS1	27407	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	43249248	43249682	43249506	Y	NA	BMS1	NA	NA	NA	NA	BMS1	26567	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr10	43249715	43249807	43249770	Y	NA	BMS1	NA	NA	NA	NA	BMS1	26442	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr10	43600895	43601120	43601049	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	30814	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.862915361159228
chr10	43817898	43817965	43817923	Y	NA	NA	ZNF487P	IMR90	Hi-C	24141950	RASGEF1A	57531	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	43936251	43936518	43936384	Y	NA	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-517P14.2	22065	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	43950893	43951349	43951098	Y	NA	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-517P14.2	36707	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr10	45904402	45904711	45904552	Y	FAM21C,ALOX5	ALOX5	NA	NA	NA	NA	ALOX5	36741	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	45914844	45915133	45915015	Y	NA	ALOX5	NA	NA	NA	NA	ALOX5	47183	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	45915972	45916032	45916026	Y	FAM21C,ALOX5	ALOX5	NA	NA	NA	NA	ALOX5	48311	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	45927566	45927962	45927775	Y	FAM21C,ANUBL1,ALOX5	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX5	59905	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	47034323	47034345	47034334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	64923	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	49433219	49433454	49433337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPK8	79244	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	49848485	49848580	49848572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPK8	335787	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	52079574	52079882	52079666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	56836	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	52385542	52385659	52385602	Y	NA	SGMS1	NA	NA	NA	NA	SGMS1	2619	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	60421235	60421505	60421242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICC1	150335	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	61580750	61581126	61580938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC6	83288	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	63203522	63203811	63203711	Y	ARID5B,TMEM26	NA	NA	NA	NA	NA	RHOBTB1	444324	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	63702592	63703184	63702855	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	43533	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	64982889	64983009	64982950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRBF2	91839	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	65125268	65125651	65125502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	59406	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	65269177	65269730	65269542	Y	NA	JMJD1C,REEP3	REEP3,JMJD1C,LOC84989	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	REEP3	9393	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr10	65930110	65930546	65930307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-170M17.2	269105	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	69523880	69524330	69524240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	71594	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC12	13236	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr10	69658139	69658146	69658142	Y	HNRNPH3,SIRT1,SIRT1	SIRT1	HERC4	IMR90	Hi-C	24141950	SIRT1	15712	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	69778500	69778679	69778642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERC4	54426	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	69822197	69822546	69822385	Y	NA	HERC4,MYPN	NA	NA	NA	NA	HERC4	10559	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	70088080	70088572	70088236	Y	SIRT1,PBLD,HNRNPH3	HNRNPH3,PBLD	NA	NA	NA	NA	HNRNPH3	359	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	70884620	70884824	70884718	Y	DDX21,SUPV3L1,SRGN	SRGN,VPS26A	NA	NA	NA	NA	VPS26A	3352	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	70976966	70977432	70977124	Y	DDX21,SRGN,VPS26A	SUPV3L1,HKDC1	NA	NA	NA	NA	HKDC1	627	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	71577107	71577330	71577210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf35	189100	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	71626507	71626840	71626632	Y	COL13A1	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFY2	183712	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	71928097	71928630	71928606	Y	NA	AIFM2,TYSND1,CALM2P2	TYSND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAR1A	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	71984000	71984297	71984282	Y	NA	PPA1	NA	NA	NA	NA	PPA1	7370	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	72117206	72117607	72117506	Y	NA	LRRC20,EIF4EBP2	NA	NA	NA	NA	LRRC20	22775	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	72973788	72974249	72973953	Y	UNC5B	UNC5B	NA	NA	NA	NA	UNC5B	3461	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr10	73398011	73398245	73398040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf54	133010	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	73489038	73489396	73489204	Y	PSAP,C10orf54	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	41859	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	73526437	73526878	73526654	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	4377	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	73526896	73527242	73527133	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	4013	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	73528339	73528873	73528813	Y	CDH23,SPOCK2,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	2382	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	73620184	73620641	73620392	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PSAP	11058	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	73986513	73986881	73986533	Y	C10orf105,C10orf54,CDH23,CDH23	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	NA	NA	NA	NA	ASCC1	11621	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	74032298	74032943	74032475	Y	NA	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	620	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	74056833	74058104	74057179	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	25155	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr10	74068319	74068595	74068530	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ASCC1,ANAPC16	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DDIT4	36641	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	74079380	74080359	74079580	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	32629	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	74080430	74080993	74080646	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	31995	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	74925047	74925060	74925055	Y	ANXA7,ECD	FAM149B1,ECD	NA	NA	NA	NA	FAM149B1	864	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	74991679	74992005	74991988	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	DNAJC9	14615	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	75022023	75022098	75022060	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	RP11-152N13.5	11474	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr10	75361338	75361489	75361457	Y	NA	USP54	USP54,PPP3CB,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L,MYOZ1,CHCHD1,TTC18,C10orf103	IMR90	Hi-C	24141950	USP54	22222	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	75386298	75386455	75386385	Y	NA	USP54	NA	NA	NA	NA	USP54	2587	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	75639469	75639705	75639592	Y	FUT11,NDST2	CAMK2G,PLAU	VCL,CAMK2G,NDST2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	CAMK2G	7126	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	75725888	75726135	75726026	Y	NA	VCL	CAMK2G,AP3M1,VCL,NDST2,C10orf55,PLAU,ADK	IMR90	Hi-C	24141950	VCL	29737	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	75768391	75768772	75768419	Y	NA	VCL	NA	NA	NA	NA	VCL	12519	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	75805462	75805520	75805491	Y	NA	VCL	NA	NA	NA	NA	VCL	49590	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	75887856	75888019	75887938	Y	NA	AP3M1,ADK	NA	NA	NA	NA	AP3M1	20802	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	76985148	76985510	76985329	Y	NA	VDAC2,COMTD1,HMGA1P5	NA	NA	NA	NA	COMTD1	8278	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	77165098	77165501	77165301	Y	C10orf11	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	5434	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	79123955	79124246	79124101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	560132	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	79636555	79636603	79636579	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	47775	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	80015034	80015301	80015187	Y	RPS24	NA	NA	NA	NA	NA	RPS24	223516	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	80626499	80626705	80626607	Y	NA	NA	LOC283050,ZMIZ1,RPS24,LOC100132987,POLR3A	IMR90	Hi-C	24141950	ZMIZ1	200087	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	92669	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	80734291	80734943	80734463	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	91849	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	80737664	80737999	80737882	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	88793	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr10	80830818	80831199	80831077	Y	ZMIZ1	ZMIZ1	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	4026	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	80911539	80911799	80911619	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	84747	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr10	81085771	81086240	81085963	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	18985	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	81158970	81159167	81159085	Y	NA	ZCCHC24	NA	NA	NA	NA	ZCCHC24	44216	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	81159335	81159579	81159503	Y	ZCCHC24	ZCCHC24	NA	NA	NA	NA	ZCCHC24	43804	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	81960969	81961796	81961521	Y	SH2D4B,ANXA11	ANXA11,EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	1532	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	81962798	81963579	81963388	Y	SH2D4B,ANXA11	EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	82214819	82214901	82214871	Y	TSPAN14	FAM213A,TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	2897	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	82253401	82253904	82253623	Y	NA	TSPAN14,RP11-137H2.4	NA	NA	NA	NA	RP11-137H2.4	39794	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	86108374	86108507	86108453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3AP5	209692	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	88160011	88160294	88160175	Y	NA	GRID1	WAPAL	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRID1	35761	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.862915361159228
chr10	88471302	88471860	88471725	Y	LDB3,LDB3,LDB3	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	42547	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	88517208	88517667	88517486	Y	GLUD1,BMPR1A	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	2801	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	88622539	88622751	88622747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	108132	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	88713984	88714363	88714198	Y	SNCG	AGAP11	NA	NA	NA	NA	AGAP11	35800	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	88866849	88867228	88867039	Y	NA	FAM35A,GLUD1	NA	NA	NA	NA	GLUD1	14226	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	89912666	89913039	89912909	Y	NA	NA	KLLN,PTEN,RNLS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-380G5.3	209407	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	90689067	90689322	90689158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAMBPL1	51576	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	90711253	90711764	90711560	Y	LIPF,CH25H,ACTA2	FAS	NA	NA	NA	NA	FAS	36650	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	91199827	91200195	91200013	Y	NA	IFIT1,LIPA,IFIT5	NA	NA	NA	NA	IFIT5	27484	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.03549843339107
chr10	94459466	94459797	94459609	Y	HHEX	HHEX	NA	NA	NA	NA	HHEX	13521	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr10	95146698	95147164	95146872	Y	MYOF	NA	NA	NA	NA	NA	MYOF	92910	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	95193537	95193891	95193765	Y	MYOF	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	46183	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	95196959	95197603	95197264	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42471	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	95200243	95200778	95200520	Y	CYP26C1,MYOF	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	39296	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr10	95205346	95205630	95205524	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	34444	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	95218561	95218998	95218660	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	21076	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr10	95223953	95224101	95224023	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	15973	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	95224149	95224369	95224367	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	15705	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	95224699	95224811	95224754	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	15263	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	95225325	95225770	95225711	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	14304	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr10	95226262	95226423	95226291	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	13651	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr10	95228207	95228553	95228471	Y	MYOF,CEP55,CEP55	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	11521	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.63953918620253
chr10	97026412	97026787	97026670	Y	NA	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	21994	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	97038434	97038774	97038645	Y	NA	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	10007	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	98308552	98308827	98308687	Y	LCOR,C10orf12,ZNF518A,PIK3AP1,TM9SF3	TLL2,NPM1P26,TM9SF3	NA	NA	NA	NA	NPM1P26	9115	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	98332019	98332237	98332217	Y	NA	NPM1P26,TM9SF3	NA	NA	NA	NA	TM9SF3	12972	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	98956083	98956405	98956104	Y	C10orf62	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP19	94008	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	99401742	99402052	99401841	Y	C10orf28,RRP12,ZFYVE27,PI4K2A	MORN4,AVPI1	NA	NA	NA	NA	MORN4	10398	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	100020230	100020246	100020237	Y	NA	LOXL4	NA	NA	NA	NA	LOXL4	5761	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	100153138	100153356	100153248	Y	NA	PYROXD2	NA	NA	NA	NA	PYROXD2	19585	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	100153906	100154210	100154161	Y	NA	PYROXD2	NA	NA	NA	NA	PYROXD2	18731	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	101300631	101300706	101300670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A28	77660	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	101417166	101417530	101417347	Y	NA	SLC25A28,CUTC	NA	NA	NA	NA	ENTPD7	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	101475394	101475766	101475528	Y	NA	CUTC,COX15	NA	NA	NA	NA	COX15	14091	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	101537826	101537964	101537919	Y	ABCC2	COX15,ABCC2	NA	NA	NA	NA	ABCC2	2525	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	101539519	101539906	101539726	Y	NA	COX15,ABCC2	NA	NA	NA	NA	ABCC2	583	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	101677861	101678026	101677917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNMBP	89650	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	101765990	101766360	101766233	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	1316	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr10	102130336	102130669	102130535	Y	NA	SCD,AL139819.1,LINC00263	NA	NA	NA	NA	LINC00263	703	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr10	102130783	102131327	102130955	Y	CWF19L1	SCD,AL139819.1,LINC00263	NA	NA	NA	NA	LINC00263	45	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	102284617	102284981	102284927	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	1848	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	103124623	103124787	103124739	Y	FBXW4	BTRC	DPCD,POLL	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	12803	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr10	103538980	103539052	103538998	Y	NA	NPM3,MGEA5	NA	NA	NA	NA	NPM3	2118	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	103717791	103718012	103717910	Y	C10orf76	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf76	95938	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	104196250	104196338	104196269	Y	NA	NFKB2,FBXL15,CUEDC2,TMEM180	NA	NA	NA	NA	CUEDC2	5832	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	104238092	104238376	104238328	Y	NA	CUEDC2,TMEM180,ACTR1A,SUFU	NA	NA	NA	NA	TMEM180	18943	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr10	104406463	104406725	104406695	Y	NFKB2,NFKB2,TRIM8	TRIM8	NA	NA	NA	NA	TRIM8	4210	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	104473144	104473537	104473339	Y	NA	ARL3,SFXN2	NA	NA	NA	NA	SFXN2	849	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	104556220	104556459	104556323	Y	NT5C2,NFKB2,NFKB2,NFKB2,C10orf32	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf32	55521	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	104953975	104954222	104954115	Y	C10orf26,C10orf32,NT5C2	NT5C2	NA	NA	NA	NA	NT5C2	2919	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	105001224	105001453	105001331	Y	C10orf32,NT5C2	NA	INA,PCGF6,NT5C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NT5C2	50168	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	105208274	105208534	105208404	Y	NA	CALHM2	NA	NA	NA	NA	CALHM2	2126	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	105419490	105419843	105419666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	193458	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	105451160	105451473	105451219	Y	INA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	161828	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	105456300	105456542	105456434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	156759	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	105650011	105650288	105650237	Y	GSTO2,GSTO1,MEIR5,MEIR5,COL17A1,SLK	SH3PXD2A,OBFC1	SH3PXD2A	IMR90	Hi-C	24141950	OBFC1	25675	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	3.45166144463691
chr10	105667581	105667905	105667745	Y	NA	OBFC1	NA	NA	NA	NA	OBFC1	8058	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	105667994	105668449	105668210	Y	GSTO1,GSTO1,SLK	OBFC1	NA	NA	NA	NA	OBFC1	7514	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr10	106065321	106065564	106065443	Y	NA	MIR4482-1,GSTO2,ITPRIP,CCDC147-AS1	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	30598	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	106065731	106065880	106065781	Y	NA	MIR4482-1,GSTO2,ITPRIP,CCDC147-AS1	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	30282	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr10	106085298	106085504	106085412	Y	SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147	ITPRIP,CCDC147-AS1	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	10658	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	111666185	111666517	111666351	Y	NA	XPNPEP1	NA	NA	NA	NA	XPNPEP1	14794	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	112010766	112010816	112010791	Y	NA	MXI1	SMNDC1	IMR90	Hi-C	24141950	MXI1	45403	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	112116359	112116685	112116467	Y	DUSP5,MXI1	NA	SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMNDC1	53650	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr10	112155518	112156031	112155808	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	92809	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	112158460	112158738	112158533	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	95751	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr10	112168008	112168205	112168118	Y	DUSP5	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	87391	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	112169656	112169922	112169805	Y	SMC3	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	85674	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	112170161	112170538	112170357	Y	DUSP5	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	85058	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr10	112174147	112174523	112174256	Y	SMC3,DUSP5	NA	DUSP5,SMC3,SMNDC1	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	81073	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	112259301	112259712	112259445	Y	MXI1,PDCD4,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	3705	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr10	112263780	112264181	112263965	Y	SHOC2,PDCD4,BBIP1,BBIP1,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	8184	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	112272592	112272848	112272747	Y	SHOC2,BBIP1,BBIP1,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	16996	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	112668159	112668425	112668161	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	8607	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	112668861	112669237	112669049	Y	PDCD4,SHOC2,BBIP1,BBIP1	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	7795	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	114139786	114140040	114139910	Y	VTI1A,ACSL5,ACSL5	ACSL5	NA	NA	NA	NA	ACSL5	8010	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	114148894	114149633	114149365	Y	VTI1A,ACSL5,ACSL5	ACSL5	NA	NA	NA	NA	ACSL5	17118	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	114292106	114292272	114292196	Y	ZDHHC6,VTI1A	NA	NA	NA	NA	NA	VTI1A	87350	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	114693939	114693964	114693952	Y	NA	TCF7L2	TCF7L2,VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	TCF7L2	14045	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	114709018	114709405	114709296	Y	TCF7L2	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	1009	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr10	114818562	114818849	114818630	Y	HABP2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	110553	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	114823270	114823456	114823363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	115261	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	114847181	114847492	114847280	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	139172	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	114852259	114852332	114852313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	144250	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	114853789	114854299	114853993	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	145780	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	114859283	114859636	114859547	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	151274	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	116080506	116080782	116080645	Y	AFAP1L2	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	81733	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr10	116163429	116163722	116163475	Y	AFAP1L2	AFAP1L2	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	914	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	118500407	118500818	118500725	Y	NA	HSPA12A	NA	NA	NA	NA	HSPA12A	322	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	118656077	118656284	118656258	Y	NA	ENO4,RP11-539I5.1	NA	NA	NA	NA	RP11-539I5.1	48361	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	118714609	118714623	118714617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-539I5.1	106893	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	119113606	119113787	119113696	Y	NA	PDZD8	NA	NA	NA	NA	PDZD8	19191	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	120968752	120969030	120968753	Y	EIF3A,GRK5	SFXN4,PRDX3,GRK5	NA	NA	NA	NA	GRK5	3651	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	121030438	121030814	121030688	Y	GRK5	NA	NA	NA	NA	NA	GRK5	65337	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr10	121065390	121065964	121065436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRK5	100289	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	121075171	121075335	121075278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRK5	110070	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	121412148	121412380	121412196	Y	BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	3266	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	123494191	123494316	123494254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATE1-AS1	191511	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	123526019	123526096	123526058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATE1-AS1	159731	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	123539603	123539774	123539689	Y	TACC2,ATE1	NA	NA	NA	NA	NA	ATE1-AS1	146053	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	123822805	123823045	123822957	Y	ATE1,DMBT1	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	76116	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	123873239	123873409	123873290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	126550	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr10	123900074	123900243	123900143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	153385	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	124067478	124067825	124067684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA1	64387	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr10	124070319	124070720	124070447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA1	61492	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	124196519	124196712	124196524	Y	TACC2,PLEKHA1,PLEKHA1,PLEKHA1	HTRA1	NA	NA	NA	NA	HTRA1	22329	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	124231405	124231614	124231490	Y	NA	HTRA1	NA	NA	NA	NA	HTRA1	12364	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	124613518	124613778	124613722	Y	NA	FAM24B	NA	NA	NA	NA	FAM24B	23379	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	124636899	124637143	124637021	Y	NA	FAM24B	NA	NA	NA	NA	FAM24B	14	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	125730230	125730378	125730329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST15	120828	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	125754916	125755682	125755196	Y	CHST15	NA	NA	NA	NA	NA	CHST15	95524	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	126315526	126315929	126315823	Y	FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	114909	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	127574091	127574564	127574346	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	RNU2-42P	2683	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	127576052	127576450	127576389	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	RNU2-42P	797	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	127583558	127583978	127583747	Y	MMP21	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	FANK1	450	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	127587236	127587432	127587340	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	FANK1	4128	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	128943463	128943803	128943552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK1	351485	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	129707008	129707239	129707127	Y	PTPRE,PTPRE	CLRN3,PTPRE	NA	NA	NA	NA	PTPRE	3683	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	129742865	129742981	129742943	Y	NPS	PTPRE	NA	NA	NA	NA	PTPRE	39540	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	129775759	129776314	129776065	Y	PTPRE,PTPRE	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRE	72434	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	129851192	129851341	129851267	Y	PTPRE	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	71308	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	130833688	130833933	130833754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGMT	429515	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	131436691	131436981	131436883	Y	MGMT	NA	NA	NA	NA	NA	MGMT	173243	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	132099901	132100191	132100002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRX3	167238	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	134122010	134122092	134122081	Y	NA	STK32C,LRRC27	DPYSL4	IMR90	Hi-C	24141950	STK32C	21259	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	134221496	134221692	134221620	Y	PWWP2B	PWWP2B,RP11-432J24.2,C10orf91	NA	NA	NA	NA	RP11-432J24.2	8895	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr10	134221970	134222202	134222031	Y	PWWP2B	PWWP2B,RP11-432J24.2,C10orf91	NA	NA	NA	NA	RP11-432J24.2	8385	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr10	134234707	134235257	134234764	Y	STK32C,PWWP2B	PWWP2B,RP11-432J24.2,C10orf91	C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-432J24.2	4120	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	134260341	134260546	134260485	Y	C10orf91	RP11-432J24.2,C10orf91	NA	NA	NA	NA	C10orf91	4510	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr10	134349556	134349919	134349753	Y	JAKMIP3,NKX6-2,C10orf92,INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	232	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	134364689	134365427	134365071	Y	INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	15365	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	134826942	134827305	134827042	Y	NA	NA	LOC399829,INPP5A	IMR90	Hi-C	24141950	KNDC1	144646	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	135072735	135073128	135072895	Y	TUBGCP2,ADAM8	ADAM8,ZNF511	NA	NA	NA	NA	ADAM8	15244	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr10	135074691	135075148	135074934	Y	TUBGCP2,ADAM8	ADAM8,ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ADAM8	13224	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr10	135092436	135092746	135092593	Y	ADAM8,TUBGCP2	ADAM8,ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ADAM8	4064	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	11072	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr11	589256	589485	589371	Y	SIGIRR	RASSF7,C11orf35,MIR210HG,PHRF1,IRF7,CDHR5,DRD4	NA	NA	NA	NA	PHRF1	14770	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	1073369	1073545	1073512	Y	DRD4,EFCAB4A	NA	NA	NA	NA	NA	MUC5AC	76035	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	1241085	1241212	1241149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOLLIP	87672	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	1404403	1404794	1404637	Y	DUSP8,BRSK2	BRSK2	TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BRSK2	4335	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	1409546	1409852	1409608	Y	KRTAP5-1,KRTAP5-6,KRTAP5-5,KRTAP5-3	BRSK2	NA	NA	NA	NA	BRSK2	417	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr11	2082720	2083054	2082737	Y	NA	NA	MOB2,IGF2-AS1,IGF2,INS-IGF2,LSP1,TH,MIR4686	IMR90,K562,GM12878,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	IGF2	85779	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	2238005	2238048	2238027	Y	NA	NA	KCNQ1	IMR90	Hi-C	24141950	IGF2	69172	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	2919958	2920393	2920124	Y	KCNQ1	CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	SLC22A18	1007	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	2951529	2951649	2951619	Y	KCNQ1,PHLDA2	CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	PHLDA2	2844	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	2988914	2989223	2989024	Y	MRGPRG,SLC22A18	PHLDA2,NAP1L4	NA	NA	NA	NA	NAP1L4	22384	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	3035655	3035952	3035816	Y	MRGPRG	NAP1L4,RNU1-91P,CARS	NA	NA	NA	NA	NAP1L4	24048	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	3077664	3078057	3077925	Y	NA	RNU1-91P,CARS	NAP1L4	K562	ChIA-PET	22265404	CARS	821	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	3833340	3833454	3833393	Y	RRM1,NUP98,PGAP2,PGAP2,RHOG	PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,MIR4687	NA	NA	NA	NA	NUP98	16318	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	6224718	6224948	6224898	Y	TPP1,FAM160A2	FAM160A2	NA	NA	NA	NA	FAM160A2	28993	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	6240600	6240982	6240757	Y	TPP1,FAM160A2	FAM160A2	NA	NA	NA	NA	FAM160A2	12959	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	6489893	6490567	6490471	Y	OR56A4,OR56A1,OR56B4,OR52W1,OR2AG1,OR2AG2,OR10A5,OR10A4,OR10A2,OR6A2,DCHS1	TRIM3,ARFIP2	NA	NA	NA	NA	TRIM3	3122	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	7697344	7697564	7697416	Y	NA	CYB5R2	NA	NA	NA	NA	CYB5R2	891	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	8041450	8041887	8041518	Y	OR10A3,RIC3,TUB,TUB	TUB	TUB	IMR90	Hi-C	24141950	TUB	2659	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	8679125	8679412	8679143	Y	NA	RPL27A	NA	NA	NA	NA	RPL27A	22546	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	8723535	8723638	8723587	Y	STK33	RPL27A	NA	NA	NA	NA	RPL27A	21577	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	9181747	9182009	9181839	Y	ZNF143,RPL27A,TMEM9B,NRIP3,TMEM41B,IPO7,DENND5A	NA	NA	NA	NA	NA	DENND5A	102928	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	9185386	9185638	9185566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND5A	99299	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr11	9587499	9588027	9587720	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1	ZNF143,LOC644656	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	WEE1	5201	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	9623030	9623285	9623166	Y	ZNF143,WEE1,WEE1	WEE1	NA	NA	NA	NA	WEE1	29802	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	9635436	9636077	9635827	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1,SWAP70	WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WEE1	42208	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr11	9703256	9703389	9703323	Y	WEE1	SWAP70	NA	NA	NA	NA	SWAP70	19632	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	9907928	9908258	9908093	Y	NA	NA	SWAP70,LOC440028,LOC283104	IMR90	Hi-C	24141950	SWAP70	224304	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	10388178	10388602	10388329	Y	ADM	NA	SBF2,ADM,LOC283104,AMPD3,MRVI1,MRVI1-AS1,CTR9,SWAP70,LOC440028	IMR90	Hi-C	24141950	ADM	63951	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	10510755	10511001	10510868	Y	ZBED5	MTRNR2L8,RNF141,MRVI1-AS1	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L8	17722	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	10921943	10922208	10922068	Y	AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,EIF4G2,ZBED5	ZBED5,CTD-2003C8.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2003C8.2	3074	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	10955517	10955651	10955533	Y	NA	CTD-2003C8.2	EIF4G2,MICALCL,CTR9,GALNTL4,LOC729013,ZBED5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2003C8.2	36648	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr11	12146355	12146795	12146568	Y	NA	MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	32812	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	12188567	12188982	12188726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	75024	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	12197316	12197738	12197633	Y	MICAL2,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	83773	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	12697923	12698543	12698251	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	3954	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	12701917	12702070	12702017	Y	TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	7948	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	12973520	12973623	12973568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF10	55073	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	13238046	13238305	13238120	Y	NA	NA	ARNTL,BTBD10,LOC100506305	IMR90	Hi-C	24141950	ARNTL	57894	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	13299973	13300299	13300022	Y	FAR1,ARNTL	ARNTL	NA	NA	NA	NA	ARNTL	3774	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	13986123	13986466	13986328	Y	SPON1	NA	NA	NA	NA	NA	FAR1	297906	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	14356156	14356413	14356247	Y	NA	RRAS2	NA	NA	NA	NA	RRAS2	27639	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	14564922	14565133	14565013	Y	PSMA1	COPB1,PSMA1	NA	NA	NA	NA	PSMA1	25032	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	14874249	14874576	14874405	Y	CYP2R1	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	37222	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	15837558	15838109	15837858	Y	NA	NA	C11orf58	IMR90	Hi-C	24141950	C11orf58	794570	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	15987256	15987361	15987309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	645318	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	16625688	16626709	16626131	Y	SOX6,SOX6	C11orf58	SOX6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C11orf58	5970	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	17008586	17008989	17008853	Y	PLEKHA7	RP11-466H18.1,OR7E14P,PLEKHA7	NA	NA	NA	NA	RP11-466H18.1	14026	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	17374298	17375700	17374969	Y	RPS13,B7H6	KCNJ11	NA	NA	NA	NA	KCNJ11	33178	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr11	17674309	17674393	17674351	Y	MYOD1	NA	ABCC8,MYOD1,SERGEF	IMR90	Hi-C	24141950	USH1C	110346	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	18404883	18405218	18405078	Y	LDHA	LDHA,AC084117.3	NA	NA	NA	NA	LDHA	8717	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr11	19957110	19957424	19957380	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	425807	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	27739901	27740316	27740092	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	1289	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr11	33313001	33313236	33313097	Y	NA	HIPK3	NA	NA	NA	NA	HIPK3	36783	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	33342450	33342853	33342574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK3	66232	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	33394151	33394320	33394196	Y	C11orf41	RP1-130L23.1	NA	NA	NA	NA	RP1-130L23.1	28442	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr11	33468371	33468737	33468467	Y	NA	RP1-130L23.1	C11orf41,LOC338739	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-130L23.1	45609	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	33711808	33712191	33712002	Y	CD59	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	43800	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	33713598	33714029	33713919	Y	CD59	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	41962	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	33723473	33723762	33723676	Y	NA	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	32229	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	34675579	34675977	34675664	Y	ABTB2,CD44	EHF	NA	NA	NA	NA	EHF	34939	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	34676467	34676782	34676555	Y	ABTB2,ELF5,ELF5,CD44,EHF	EHF	NA	NA	NA	NA	EHF	35827	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	34931457	34931889	34931828	Y	NA	PDHX,APIP	NA	NA	NA	NA	PDHX	3487	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	35052236	35052689	35052493	Y	CD44	NA	SLC1A2,CD44,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	105728	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	35180596	35180888	35180668	Y	CD44	CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	22179	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	35186946	35187176	35187019	Y	CD44	CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	28529	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	36442519	36442687	36442604	Y	COMMD9,PRR5L,PRR5L,TRAF6	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF6	87135	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	40223760	40223865	40223814	Y	LRRC4C	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124G5.1	1334119	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	40472791	40472955	40472873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124G5.1	1085029	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	43955473	43955506	43955502	Y	NA	C11orf96	NA	NA	NA	NA	C11orf96	10581	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	44326982	44327326	44327154	Y	ALX4	NA	NA	NA	NA	NA	EXT2	211883	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	44341406	44341701	44341459	Y	ALX4	NA	EXT2,ALX4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EXT2	226307	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	45201958	45202605	45202216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT13	103265	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr11	46258702	46259233	46258865	Y	DGKZ	CREB3L1	PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	37979	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	CREB3L1	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	32014	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	47168963	47169205	47169084	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP2	27471	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4,C1QTNF4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	47789923	47790126	47789984	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	2928	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	47844695	47845036	47844861	Y	NA	NUP160	NA	NA	NA	NA	NUP160	23071	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	48102794	48103200	48102989	Y	FNBP4,PTPRJ	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	102681	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	57542885	57543297	57542929	Y	NA	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	24170	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	57546018	57546724	57546105	Y	MED19,C11orf31	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	27303	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr11	59524471	59524655	59524596	Y	MS4A6A,MS4A6A,OSBP,PATL1,STX3	STX3	NA	NA	NA	NA	STX3	45542	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	60753567	60754105	60753691	Y	SDHAF2,CD5,CD6	SLC15A3	NA	NA	NA	NA	SLC15A3	35565	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	61523945	61524112	61524089	Y	INCENP,DAK,C11orf9	FEN1,TMEM258	NA	NA	NA	NA	FEN1	33997	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr11	61781118	61781313	61781282	Y	DAGLA,FTH1	FTH1	FADS1,BEST1,FTH1,FADS3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	47986	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	61792928	61793609	61793204	Y	DAGLA,FTH1	NA	FADS3,FADS2,FTH1,BEST1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	59796	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	62248272	62248499	62248283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHNAK	73208	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	62310227	62311393	62310863	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	AHNAK	10314	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr11	62312037	62312397	62312245	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	AHNAK	9310	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr11	62320979	62321244	62321106	Y	NA	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	463	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr11	62321348	62321821	62321541	Y	NA	EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	62625165	62625549	62625272	Y	TUT1,METTL12,HNRNPUL2,SLC3A2	STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	SLC3A2	3647	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	63334518	63335083	63334716	Y	RARRES3,OTUB1	RARRES3,PLA2G16	NA	NA	NA	NA	RARRES3	32237	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr11	63337722	63338129	63338119	Y	NA	RARRES3,PLA2G16	NA	NA	NA	NA	RARRES3	35441	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.20808150562292
chr11	63366734	63367020	63366890	Y	NA	PLA2G16	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	15335	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	63377789	63377920	63377869	Y	PLA2G16,PLA2G16	PLA2G16	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	4435	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	63705603	63705837	63705685	Y	NA	RCOR2,NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	NAA40	1172	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	63775286	63775368	63775342	Y	KCNK4	COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	OTUB1	23961	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	63858567	63858836	63858756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACROD1	72742	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr11	63949132	63949273	63949224	Y	NA	MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4	NA	NA	NA	NA	STIP1	1471	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr11	64102702	64102834	64102750	Y	NA	ESRRA,TRMT112,PRDX5,RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	PRDX5	19142	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	64125464	64125650	64125510	Y	MARK2,NUDT22,FKBP2,PPP1R14B,PLCB3,BAD,ESRRA,TRMT112,PRDX5,CDC42BPG,RPS6KA4	TRMT112,PRDX5,RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	RPS6KA4	844	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	64140304	64140795	64140552	Y	RCOR2,NAA40,GPR137,KCNK4,NRXN2,NRXN2,CDC42BPG	RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	RPS6KA4	15684	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	64363562	64364093	64364079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SF1	180165	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	64987523	64987676	64987600	Y	NA	CAPN1,POLA2	NA	NA	NA	NA	POLA2	39557	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	65151984	65152145	65152131	Y	NA	TIGD3,NEAT1	NA	NA	NA	NA	FRMD8	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.46695611397069
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	2.93391222794138
chr11	65234874	65235172	65234954	Y	SNX32	NEAT1,AP000769.1,MALAT1	NA	NA	NA	NA	AP000769.1	14146	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	65239550	65239870	65239751	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1	TIGD3,SCYL1	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18822	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	4.40086834191206
chr11	65246279	65246484	65246387	Y	SCYL1,LTBP3,EFEMP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	16749	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr11	65252951	65253044	65253026	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	10189	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	65259217	65259522	65259389	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3711	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	65261229	65261625	65261527	Y	CDC42EP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	1608	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr11	65263684	65264604	65263856	Y	SNX32	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	451	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	9.49206897275151
chr11	65323331	65323567	65323509	Y	FOSL1	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,KCNK7	NA	NA	NA	NA	LTBP3	834	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr11	65328084	65328375	65328271	Y	NA	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,KCNK7	NA	NA	NA	NA	LTBP3	3683	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	65379476	65379605	65379541	Y	FAU,CAPN1,RNASEH2C,EFEMP2,CCDC85B,C11orf68,FAM89B,MAP3K11	SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	MAP3K11	1248	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr11	65492459	65492791	65492625	Y	NA	KAT5,RNASEH2C	RNASEH2C	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RNASEH2C	6041	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	65656792	65657262	65656985	Y	NA	MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	CCDC85B	917	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	4.48715987802799
chr11	65670692	65670945	65670845	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1	MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	4648	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr11	65678943	65679154	65679019	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,CFL1,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,KLC2,FOSL1,SART1,DRAP1,C11orf68,BANF1	FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	5434	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	2.32987147512992
chr11	65679250	65679576	65679373	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1	FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	5012	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.862915361159228
chr11	65683105	65683625	65683322	Y	NA	FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	963	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	2.67503761959361
chr11	65695608	65695878	65695746	Y	EHBP1L1,MAP3K11,RELA,DKFZp761E198	FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	DRAP1	10880	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	65739201	65739551	65739464	Y	NA	SART1,BANF1,EIF1AD,CST6	NA	NA	NA	NA	SART1	12041	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	65782974	65783337	65783107	Y	FOSL1	BANF1,EIF1AD,CST6,CATSPER1,SF3B2	NA	NA	NA	NA	CST6	5662	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	65894211	65894464	65894385	Y	NA	NA	RAB1B,KLC2	IMR90	Hi-C	24141950	PACS1	58377	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	66487767	66487982	66487867	Y	NA	RBM4B,C11orf80	NA	NA	NA	NA	C11orf80	21940	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr11	66494780	66495327	66494982	Y	SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2	C11orf80	C11orf80	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	C11orf80	14595	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr11	66845907	66846062	66845990	Y	PITPNM1,CLCF1,CLCF1,RBM4,KDM2A,ADRBK1,RHOD	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	23618	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	67037275	67037527	67037373	Y	TBC1D10C,RAD9A,PITPNM1,KDM2A,ADRBK1,ANKRD13D	ADRBK1,ANKRD13D,SSH3	NA	NA	NA	NA	ADRBK1	5394	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	67103841	67103862	67103852	Y	NA	ANKRD13D,SSH3,POLD4,AP003419.11	NA	NA	NA	NA	POLD4	18581	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	67121988	67122388	67122127	Y	POLD4,CLCF1	POLD4,AP003419.11,RAD9A	NA	NA	NA	NA	POLD4	55	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr11	67138301	67138677	67138619	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	378	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr11	67138852	67139479	67139267	Y	NA	POLD4,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr11	67139742	67140272	67140082	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	687	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	3.53795298075283
chr11	67142500	67143040	67142970	Y	CDK2AP2,CLCF1,PPP1CA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	3445	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	67146992	67147327	67147282	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA,RPS6KB2	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	7937	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	67955066	67955423	67955397	Y	TCIRG1,SUV420H1	SUV420H1	NA	NA	NA	NA	SUV420H1	23872	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	68065646	68065898	68065824	Y	CHKA,LRP5	C11orf24,LRP5	SUV420H1,C11orf24,LRP5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LRP5	12179	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	68121765	68121884	68121804	Y	ALDH3B1,C11orf24	LRP5	NA	NA	NA	NA	LRP5	43688	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	68139622	68139837	68139714	Y	TCIRG1,TCIRG1	NA	NA	NA	NA	NA	LRP5	61545	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	68140094	68140551	68140382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP5	62017	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	68141745	68141881	68141821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP5	63668	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	68147876	68148306	68148095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP5	69799	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr11	68387136	68387210	68387173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAL	62037	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	68608164	68608616	68608368	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1262	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr11	68611298	68611611	68611498	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1420	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	68776292	68776545	68776410	Y	MRGPRF	TPCN2	MRGPRD	IMR90	Hi-C	24141950	TPCN2	37820	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr11	68778534	68778789	68778694	Y	MRGPRF	TPCN2	NA	NA	NA	NA	TPCN2	35576	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr11	69067534	69068152	69067999	Y	TPCN2	MYEOV	NA	NA	NA	NA	MYEOV	7929	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	69069522	69069665	69069598	Y	TPCN2	MYEOV	NA	NA	NA	NA	MYEOV	9917	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	69089155	69089700	69089444	Y	MRGPRD	MYEOV	CCND1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYEOV	29550	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	69182957	69183170	69183095	Y	ORAOV1,CCND1,MYEOV	NA	CCND1,MYEOV	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AP000439.3	109538	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.862915361159228
chr11	69197125	69197542	69197234	Y	ORAOV1,MYEOV	NA	MYEOV,CCND1	IMR90	Hi-C	24141950	AP000439.3	95166	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr11	69235389	69235576	69235517	Y	NA	NA	MYEOV,ORAOV1,CCND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.3	57132	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	69452524	69453230	69453220	Y	CCND1	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	625	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	69453520	69454472	69453912	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr11	69632815	69633180	69632998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ORAOV1	144631	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	69795546	69795838	69795683	Y	ANO1	NA	ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD	IMR90	Hi-C	24141950	FADD	251431	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	70245269	70246141	70245676	Y	ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN	CTTN,AP000487.5	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	2675	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr11	70575636	70576014	70576009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	333042	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	71704625	71704847	71704670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF121	66878	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	72003135	72003262	72003223	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPPL1	70390	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	72335834	72336122	72335917	Y	PDE2A	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP1	166522	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	72449101	72449742	72449392	Y	P2RY2,P2RY2,FCHSD2,ATG16L2,PDE2A,ARAP1,ARAP1	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP1	52902	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	72452508	72452870	72452656	Y	STARD10,ATG16L2,ARAP1	ARAP1,STARD10	NA	NA	NA	NA	ARAP1	49774	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	72686902	72687109	72687004	Y	RELT,RELT	NA	NA	NA	NA	NA	ATG16L2	163549	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	73088357	73088912	73088439	Y	NA	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	3048	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr11	73490470	73490918	73490608	Y	UCP2	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	5443	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	74257729	74258089	74257917	Y	KCNE3	NA	KCNE3,P4HA3,LIPT2,PPME1,C2CD3,CHRDL2,RNF169,POLD3,PGM2L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	POLD3	54833	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	74465903	74466299	74466070	Y	POLD3,RNF169	RP11-864N7.2,RNF169	XRRA1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF169	7990	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	74534779	74535147	74534795	Y	XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	RNF169	76866	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	74578028	74578161	74578096	Y	OR2AT4,XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	XRRA1	80084	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	74609449	74609745	74609637	Y	LOC441617,XRRA1	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	48500	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	74857404	74857707	74857556	Y	SLCO2B1	NA	NA	NA	NA	NA	NEU3	160225	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	75061558	75062072	75061823	Y	NA	ARRB1,RPS3	NA	NA	NA	NA	ARRB1	685	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	75748582	75748924	75748753	Y	UVRAG	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-535A19.2	224131	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	76480789	76480971	76480905	Y	NA	TSKU,RP11-21L23.3	B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSKU	10324	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	76534548	76534939	76534880	Y	GDPD4	TSKU,RP11-21L23.3,ACER3	ACER3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACER3	34972	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	76721586	76721786	76721728	Y	ACER3	NA	NA	NA	NA	NA	CAPN5	54193	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	76802149	76802401	76802277	Y	NA	CAPN5	NA	NA	NA	NA	CAPN5	26170	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr11	77445522	77445800	77445629	Y	NA	FTH1P16	NA	NA	NA	NA	FTH1P16	1451	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	77751153	77751354	77751183	Y	NA	INTS4,KCTD14,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2	NA	NA	NA	NA	KCTD14	3883	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	77898869	77899120	77899016	Y	RSF1,INTS4	USP35,KCTD21	NA	NA	NA	NA	KCTD21	1001	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	77938673	77938848	77938785	Y	NA	USP35,KCTD21	NA	NA	NA	NA	KCTD21	40805	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr11	78051625	78051814	78051807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	75580	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	79130045	79130391	79130200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	846126	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	83264586	83264960	83264849	Y	DLG2	NA	NA	NA	NA	NA	AP003026.1	98330	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	83278002	83278167	83278160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP003026.1	111746	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	83312125	83312420	83312330	Y	DLG2	NA	NA	NA	NA	NA	AP003026.1	145869	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	84093911	84093923	84093916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP003026.1	927655	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	85160814	85160851	85160833	Y	DLG2	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM126B	176778	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	85310773	85310968	85310871	Y	NA	TMEM126B,TMEM126A	NA	NA	NA	NA	TMEM126B	26661	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	85419491	85419865	85419792	Y	SYTL2	CREBZF	NA	NA	NA	NA	CREBZF	27540	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	85463912	85464270	85464111	Y	CREBZF,SYTL2,SYTL2,EED,SYTL2,SYTL2	NA	CCDC89	IMR90	Hi-C	24141950	SYTL2	55914	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr11	86178922	86179317	86178974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf73	167669	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	86222200	86222363	86222315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ME3	159315	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr11	86262463	86262643	86262563	Y	FZD4	NA	NA	NA	NA	NA	ME3	119035	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	86381936	86382132	86382071	Y	NA	ME3	NA	NA	NA	NA	ME3	258	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	86454484	86454767	86454607	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	45334	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr11	86527382	86527750	86527626	Y	FZD4,PRSS23	PRSS23	NA	NA	NA	NA	PRSS23	27281	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	86642953	86643307	86643130	Y	NA	FZD4,RP11-736K20.6	NA	NA	NA	NA	FZD4	21126	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	86792626	86792948	86792684	Y	NA	TMEM135	NA	NA	NA	NA	TMEM135	45740	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	88069705	88069944	88069773	Y	CTSC	CTSC	NA	NA	NA	NA	CTSC	750	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	88071526	88071793	88071707	Y	NA	CTSC	NA	NA	NA	NA	CTSC	2571	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	89937153	89937335	89937244	Y	NA	CHORDC1	NA	NA	NA	NA	CHORDC1	17197	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	91525740	91526132	91525936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A4	1402998	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	92648784	92648892	92648852	Y	CCDC67	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A4	280238	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	93446176	93446355	93446266	Y	NA	SCARNA9,C11orf54	NA	NA	NA	NA	SCARNA9	6324	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	93868403	93868611	93868483	Y	FUT4,PANX1	PANX1	NA	NA	NA	NA	PANX1	8309	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	95557234	95557451	95557366	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	35661	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	95610217	95610530	95610374	Y	NA	MTMR2	NA	NA	NA	NA	MTMR2	45949	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	95801750	95802104	95801927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR2	145271	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	95808686	95809082	95808927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR2	152207	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	95976157	95976737	95976478	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	97607	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	95982466	95982894	95982863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	91450	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr11	95987343	95987574	95987537	Y	FAM76B,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	86770	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	95995362	95995593	95995538	Y	FAM76B,MAML2	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	78751	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	96024131	96024308	96024240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	50036	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	96040167	96040456	96040282	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	33888	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr11	96047326	96047750	96047695	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	26594	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	96071900	96072294	96072196	Y	MAML2,JRKL,CCDC82	MAML2,CCDC82,JRKL	NA	NA	NA	NA	MAML2	2050	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	99734583	99734830	99734707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP42	821554	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.121789969507
chr11	102189237	102189699	102189428	Y	TMEM123,BIRC3,BIRC2	BIRC3,BIRC2	NA	NA	NA	NA	BIRC3	3022	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	102216514	102216961	102216815	Y	TMEM123,BIRC3,BIRC2	BIRC3,BIRC2	NA	NA	NA	NA	BIRC2	572	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	103321873	103321933	103321886	Y	NA	RP11-37O16.8	NA	NA	NA	NA	RP11-37O16.8	43488	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	105090888	105091203	105091058	Y	CASP4,CASP4,CASP5,CARD16,CARD17	NA	NA	NA	NA	NA	CARD16,CASP1	120730	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	107966906	107967320	107967120	Y	NA	ACAT1	ACAT1	IMR90	Hi-C	24141950	ACAT1	22923	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	108519095	108519272	108519184	Y	NA	DDX10	ATM,ACAT1,NPAT	IMR90	Hi-C	24141950	DDX10	14480	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	108679072	108679281	108679081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX10	145320	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	109965770	109966113	109965869	Y	RDX,FDX1,ZC3H12C	ZC3H12C	NA	NA	NA	NA	ZC3H12C	3683	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	112031842	112032080	112031914	Y	IL18,BCO2	IL18,BCO2	NA	NA	NA	NA	IL18	760	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	112375624	112375994	112375809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-356J5.12	236152	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	113219738	113219923	113219793	Y	NA	TTC12	NA	NA	NA	NA	TTC12	36487	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	113945404	113945849	113945581	Y	ZBTB16,ZBTB16	NA	NA	NA	NA	NA	NNMT	180660	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr11	114288977	114289308	114289144	Y	NA	RBM7,C11orf71,REXO2	NA	NA	NA	NA	REXO2	18800	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	114309073	114309125	114309098	Y	NA	RBM7,C11orf71,REXO2	NA	NA	NA	NA	REXO2	965	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	114312879	114313299	114312892	Y	NA	RBM7,C11orf71,REXO2	NA	NA	NA	NA	REXO2	4771	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr11	115741521	115741886	115741709	Y	NA	NA	CADM1	IMR90	Hi-C	24141950	CADM1	367846	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr11	116741935	116742274	116742188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF259	85169	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	116867531	116867975	116867966	Y	NA	AP000936.1	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	36792	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	117679991	117680281	117680071	Y	IL10RA	FXYD2	NA	NA	NA	NA	FXYD2	17132	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	118489703	118490017	118489779	Y	NA	ARCN1,IFT46,PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	14548	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr11	118490168	118490609	118490335	Y	PHLDB1	ARCN1,IFT46,PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	15013	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr11	118493108	118493651	118493460	Y	NA	PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	17953	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr11	118783640	118784096	118783954	Y	NA	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	4223	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	118785112	118785368	118785332	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	5695	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	118788249	118788453	118788294	Y	MLL,PHLDB1,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	5420	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	118790377	118790895	118790660	Y	NA	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	2978	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr11	118791529	118792348	118792152	Y	PHLDB1,BCL9L	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	1525	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr11	118800245	118800827	118800413	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5928	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr11	119612950	119613345	119613188	Y	NA	PVRL1	PVRL1,TRIM29	IMR90	Hi-C	24141950	PVRL1	15156	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	120079363	120079802	120079708	Y	NA	POU2F3	NA	NA	NA	NA	OAF	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr11	120083069	120083545	120083438	Y	GRIK4,ARHGEF12,OAF	OAF,POU2F3	NA	NA	NA	NA	OAF	3594	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	120512132	120512391	120512245	Y	NA	NA	GRIK4	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF12	306345	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr11	120895811	120895984	120895886	Y	GRIK4,TBCEL,TBCEL,TECTA	TBCEL	NA	NA	NA	NA	TBCEL	3030	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	121337416	121337512	121337466	Y	NA	SORL1,RP11-730K11.1	NA	NA	NA	NA	RP11-730K11.1	15694	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr11	121355865	121356201	121356100	Y	SORL1	SORL1,RP11-730K11.1	NA	NA	NA	NA	RP11-730K11.1	34143	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	121947541	121947705	121947629	Y	NA	MIR125B1	NA	NA	NA	NA	MIR125B1	20847	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr11	121983293	121983692	121983594	Y	NA	MIR125B1,MIRLET7A2,MIR100	NA	NA	NA	NA	MIR125B1	14741	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	122059856	122060218	122060121	Y	NA	MIRLET7A2,MIR100	NA	NA	NA	NA	MIR100	38840	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	122568426	122568832	122568574	Y	UBASH3B	UBASH3B	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	44043	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	122614600	122615453	122614815	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	90217	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	122956299	122956503	122956402	Y	NA	SNORD14C,HSPA8	NA	NA	NA	NA	HSPA8	24361	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	123036966	123037072	123037020	Y	NA	CLMP	NA	NA	NA	NA	CLMP	26917	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	123605051	123605192	123605122	Y	NA	ZNF202,RNU1-21P	NA	NA	NA	NA	ZNF202	5191	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	124668888	124669222	124669022	Y	NA	ESAM	NA	NA	NA	NA	ESAM	38702	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	125037243	125037532	125037366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM218	57584	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	125983623	125983738	125983673	Y	CDON	NA	HYLS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	52393	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	125985923	125986168	125986013	Y	NA	NA	HYLS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	54693	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	126084365	126084425	126084397	Y	NA	FAM118B,RPUSD4	NA	NA	NA	NA	RPUSD4	4778	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr11	126286483	126286630	126286572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	62948	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	126322273	126322455	126322358	Y	NA	NA	ST3GAL4	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL4	98738	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	126790922	126791265	126791130	Y	KIRREL3	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	567387	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	128318387	128318699	128318622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	136754	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	128373673	128373898	128373813	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	81555	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	128374504	128374665	128374585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	80788	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	128376891	128377234	128377096	Y	ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	78219	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	128377315	128377487	128377422	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	77966	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr11	128385518	128386026	128385881	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	69427	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	128387749	128388099	128387998	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	67354	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	128388897	128389626	128389454	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	65827	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	128419505	128419554	128419521	Y	NA	ETS1	NA	NA	NA	NA	ETS1	35899	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	129102482	129102753	129102618	Y	NA	ARHGAP32	NA	NA	NA	NA	ARHGAP32	44466	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	129716429	129716681	129716540	Y	TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	TMEM45B	32715	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	129731747	129732130	129731880	Y	ST14,NFRKB,TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	31355	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr11	129871629	129871941	129871631	Y	NA	PRDM10,TCEB2P2	NA	NA	NA	NA	PRDM10	899	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	129942098	129942391	129942179	Y	PRDM10	TCEB2P2,APLP2	NA	NA	NA	NA	APLP2	4366	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	129993921	129994394	129994167	Y	PRDM10,APLP2	ST14	NA	NA	NA	NA	ST14	33063	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	130321179	130321606	130321259	Y	ADAMTS15	ADAMTS15	NA	NA	NA	NA	ADAMTS15	4310	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	130505078	130505260	130505180	Y	NA	NA	ADAMTS8,ADAMTS15,SNX19	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS15	188209	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	130860257	130860277	130860267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	75853	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	132774283	132774643	132774625	Y	OPCML	NA	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	1050237	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	133804654	133804943	133804849	Y	NA	IGSF9B	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	19937	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr11	133814977	133815479	133815368	Y	NCAPD3,IGSF9B	IGSF9B	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	9401	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr11	133823506	133823792	133823624	Y	NA	IGSF9B	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	1088	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	133920876	133920983	133920947	Y	B3GAT1,SPATA19,JAM3	RP11-713P17.3,JAM3	NA	NA	NA	NA	JAM3	15837	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr11	134124453	134124658	134124640	Y	NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2	VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8	NA	NA	NA	NA	ACAD8	3064	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr12	398927	399098	399013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC77	97341	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	680187	680377	680237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-218M22.1	57680	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	905489	905920	905534	Y	NA	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	45730	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	1029926	1030313	1030120	Y	WNK1	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	66906	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	1208361	1208617	1208550	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERC1	110686	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	1770869	1771337	1771069	Y	LRTM2,ADIPOR2	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	24403	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr12	2749982	2750016	2749999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP4	152103	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	4140182	4140815	4140542	Y	CCND2,PARP11	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	PARP11	159574	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	4448343	4448720	4448381	Y	PARP11,CCND2,C12orf5	C12orf5	NA	NA	NA	NA	C12orf5	19972	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	4770172	4770413	4770176	Y	NA	AKAP3,NDUFA9	NA	NA	NA	NA	NDUFA9	13911	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	5198025	5198415	5198167	Y	NA	NA	NTF3,KCNA6,ANO2,VWF	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFA9	441764	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	6276820	6277298	6277162	Y	VAMP1,TNFRSF1A,TAPBPL	CD9	VWF,CD9,PLEKHG6	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	29583	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	6288535	6288780	6288632	Y	CD9,VWF	CD9	VWF,PLEKHG6,CD9	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	18101	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	6291358	6291755	6291562	Y	VWF,CD9	CD9	VWF,PLEKHG6,CD9	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	15126	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr12	6311406	6311775	6311432	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	4525	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	6325035	6325634	6325452	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	18154	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr12	6387822	6388153	6388049	Y	NA	PLEKHG6	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLEKHG6	29449	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	6389072	6389528	6389363	Y	CD9,PLEKHG6,PLEKHG6	PLEKHG6	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLEKHG6	28074	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr12	6403662	6404056	6403860	Y	PLEKHG6,PLEKHG6,PLEKHG6	PLEKHG6,TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHG6	13546	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	6404239	6404667	6404531	Y	NA	PLEKHG6,TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHG6	12935	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr12	6432315	6432644	6432443	Y	NA	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	PLEKHG6	14713	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	6444583	6445131	6444861	Y	CD4,CD4,TNFRSF1A	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	4149	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	6445143	6445640	6445507	Y	VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	3640	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	6539566	6540029	6539921	Y	NA	RP1-102E24.9,TAPBPL,VAMP1	NA	NA	NA	NA	RP1-102E24.9	5635	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	6684613	6684668	6684641	Y	NA	GAPDH,NOP2,CHD4	NA	NA	NA	NA	NOP2	8756	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	7000184	7000641	7000294	Y	PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6	CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57	NA	NA	NA	NA	SPSB2	3662	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	7034730	7034838	7034794	Y	ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1	SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	3104	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr12	7058563	7058923	7058712	Y	PEX5,VAMP1,CD4,CD4,PTPN6	ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2,C1S	NA	NA	NA	NA	RNU7-1	7584	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	7104040	7104360	7104246	Y	NA	EMG1,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3	NA	NA	NA	NA	C1S	9689	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A3	36298	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr12	9308932	9309318	9309073	Y	KLRB1,M6PR,KLRG1,PZP	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP4	81609	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	9982493	9982805	9982658	Y	KLRB1,CD69,KLRD1,KLRD1,KLRF1	CLEC2B	NA	NA	NA	NA	CLEC2B	37930	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	9986583	9986922	9986755	Y	NA	CLEC2B	NA	NA	NA	NA	CLEC2B	33813	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	10515405	10515669	10515567	Y	NA	RP11-277P12.20	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	1037	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	10517487	10517775	10517755	Y	NA	RP11-277P12.20	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	3119	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	10833157	10833219	10833190	Y	NA	STYK1	NA	NA	NA	NA	STYK1	8240	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr12	10869298	10869573	10869459	Y	NA	STYK1	NA	NA	NA	NA	STYK1	44381	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	11221356	11221421	11221389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAS2R14	100751	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	11828862	11829235	11828994	Y	NA	ETV6	NA	NA	NA	NA	ETV6	28074	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	11898142	11898564	11898233	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	97354	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	11911642	11913422	11912121	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	110854	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	11949422	11949819	11949574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	148634	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	12009987	12010279	12010170	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L14	190499	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	12016846	12017194	12017120	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L14	183584	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	12111679	12111898	12111693	Y	ETV6,BCL2L14	NA	ETV6,LOC338817	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L14	88880	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	12185852	12185959	12185898	Y	ETV6,BCL2L14	BCL2L14	ETV6,LOC338817,CDKN1B,BCL2L14,MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCL2L14	14819	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	12646905	12646967	12646936	Y	LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B	NA	LOH12CR1	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP16	66350	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	12711175	12711335	12711320	Y	NA	DUSP16	NA	NA	NA	NA	DUSP16	1982	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	12911881	12912260	12911941	Y	NA	CDKN1B,APOLD1	NA	NA	NA	NA	APOLD1	35030	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr12	12956264	12956405	12956396	Y	GPRC5A,DDX47	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	7845	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	12957478	12957757	12957559	Y	GPRC5A	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	6493	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	13025126	13025347	13025203	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	RPL13AP20	1086	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr12	13049170	13049423	13049295	Y	DUSP16	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	7454	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	13056884	13057235	13057060	Y	GPRC5A	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	MIR614	9528	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr12	13075067	13075388	13075228	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	RP11-392P7.6	3272	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr12	13357534	13357828	13357577	Y	NA	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	9884	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	13359236	13359687	13359415	Y	EMP1	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	11586	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	15758880	15759078	15758989	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERG	259271	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	15782024	15782386	15782102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPS8	250877	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	15853599	15853765	15853693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPS8	179498	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr12	15899366	15899730	15899546	Y	PTPRO	NA	NA	NA	NA	NA	EPS8	133533	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	16553699	16554214	16553898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	55623	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	16554253	16554721	16554664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	56177	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr12	16698348	16698413	16698381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	200272	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	16817876	16817986	16817888	Y	LMO3	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	319800	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	19048962	19049238	19049131	Y	NA	NA	PIK3C2G	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHA5	231410	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	19291558	19291779	19291581	Y	AEBP2,PLEKHA5	PLEKHA5	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	10910	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	19566135	19566181	19566158	Y	NA	AEBP2,EEF1A1P4	NA	NA	NA	NA	AEBP2	11156	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	20975224	20975562	20975349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	612987	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr12	21666002	21666378	21666190	Y	NA	RECQL,GOLT1B	NA	NA	NA	NA	GOLT1B	13287	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	22779557	22779668	22779574	Y	NA	ETNK1	NA	NA	NA	NA	ETNK1	3548	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	24673435	24673806	24673663	Y	SOX5	RP11-444D3.1	NA	NA	NA	NA	RP11-444D3.1	39718	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	137212	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr12	26267263	26267811	26267415	Y	NA	BHLHE41	NA	NA	NA	NA	BHLHE41	8249	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	27174273	27174510	27174392	Y	C12orf71	TM7SF3,MED21	NA	NA	NA	NA	MED21	794	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	27678028	27678417	27678221	Y	C12orf71	PPFIBP1	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	3664	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	27748114	27748496	27748421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	73750	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	28119724	28120118	28120115	Y	MANSC4,PTHLH,PTHLH	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC91	164064	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	28283625	28284072	28283761	Y	PTHLH,PTHLH	CCDC91	PTHLH	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC91	110	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	29194633	29194954	29194755	Y	NA	NA	CCDC91	IMR90	Hi-C	24141950	FAR2	105082	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	29395025	29395583	29395357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAR2	94989	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	29487594	29487680	29487637	Y	NA	ERGIC2	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	44442	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	30945631	30945953	30945771	Y	NA	CAPRIN2,RP11-77I22.2,LINC00941	NA	NA	NA	NA	LINC00941	24	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr12	30949517	30949896	30949519	Y	CAPRIN2	CAPRIN2,RP11-77I22.2,LINC00941	NA	NA	NA	NA	LINC00941	3540	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr12	31469690	31470116	31469962	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	7876	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	31602301	31602617	31602553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM60A	124309	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	31902136	31902566	31902240	Y	C12orf35,AMN1,H3F3C	AMN1,RP11-467L13.5,H3F3C	AMN1	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-467L13.5	3085	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	32738766	32738845	32738790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNM1L	91289	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	38493611	38493806	38493706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALG10B	214574	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	39104065	39104215	39104143	Y	CPNE8	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	195017	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	45703000	45703363	45703138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	95176	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	46571353	46571525	46571439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	90275	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr12	46603605	46603977	46603918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	57823	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	46609835	46610258	46610179	Y	ARID2,SCAF11,SLC38A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	51542	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr12	46614251	46614418	46614333	Y	NA	SLC38A1	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	47382	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	46786554	46786766	46786571	Y	NA	SLC38A2,RP11-96H19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	11092	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr12	46824163	46824471	46824386	Y	NA	RP11-96H19.1	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	48701	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	46844808	46845174	46844835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	69346	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	46866769	46866797	46866784	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	91307	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	46917975	46918280	46918143	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	142513	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	46951455	46951753	46951519	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	175993	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	46956105	46956322	46956188	Y	NA	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	180643	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	47185736	47186095	47186020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	285639	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	47191369	47191677	47191464	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	280057	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	47474423	47475249	47474825	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	2689	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	6.55815674481013
chr12	47476610	47477096	47476829	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	4876	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	47482441	47482676	47482559	Y	NA	AMIGO2	AMIGO2	K562	ChIA-PET	22265404	AMIGO2	10707	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	47596373	47596459	47596419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	124639	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	47612205	47612473	47612375	Y	FAM113B	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	140471	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	47670448	47670925	47670783	Y	NA	NA	AMIGO2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AMIGO2	198714	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr12	47671815	47672221	47672059	Y	NA	NA	AMIGO2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AMIGO2	200081	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	47701468	47701752	47701723	Y	NA	NA	AMIGO2,MIR4698,LOC100233209,FAM113B	IMR90	Hi-C	24141950	AMIGO2	229734	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.38066457785476
chr12	48053201	48053247	48053224	Y	ASB8	RPAP3,RP1-197B17.3	NA	NA	NA	NA	RPAP3	44597	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	48297772	48297979	48297886	Y	ZNF641,ZNF641,ASB8,VDR	VDR	NA	NA	NA	NA	VDR	36852	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	48579978	48580344	48580161	Y	OR8S1,OR10AD1	ASB8,DKFZP779L1853	NA	NA	NA	NA	ASB8	6982	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	49678404	49678529	49678467	Y	NA	TROAP	NA	NA	NA	NA	TROAP	36490	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	49762011	49762098	49762055	Y	TUBA1A,PRPF40B	TROAP,C1QL4,SPATS2	NA	NA	NA	NA	SPATS2	3644	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	50286298	50286441	50286370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCDIN3D	51386	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	50507967	50508334	50508141	Y	NA	SMARCD1	NA	NA	NA	NA	SMARCD1	31212	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	50899744	50900179	50899947	Y	DIP2B	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	2976	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	50900445	50901076	50900765	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	3677	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	50913232	50913640	50913328	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	16464	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	50931365	50931732	50931390	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	34597	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	51177941	51178161	51178051	Y	POU6F1,FAM186A,LARP4,DIP2B,HIGD1C	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	22448	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	51180627	51180997	51180727	Y	SMAGP	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	25134	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	51536826	51537135	51537116	Y	CSRNP2	RP11-416A17.1,TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	27791	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	51608031	51608240	51608135	Y	BIN2	TFCP2,POU6F1,DAZAP2	NA	NA	NA	NA	POU6F1	1237	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	52426305	52426422	52426334	Y	NR4A1,GRASP,NR4A1	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11689	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	52426547	52427164	52426822	Y	NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11931	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr12	52539319	52539712	52539621	Y	KRT84,KRT80,KRT6A,KRT5	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	44072	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	52540237	52540565	52540533	Y	NA	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	43219	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	42258	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.46695611397069
chr12	52542210	52542726	52542513	Y	KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	41058	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr12	52557711	52558022	52557822	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	25762	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	52584709	52584955	52584807	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	925	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	52596776	52597514	52597151	Y	NR4A1	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	12992	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr12	52674043	52674518	52674247	Y	NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80	KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT7	49739	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr12	53267781	53268340	53268093	Y	PFDN5	NA	KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT18	72315	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr12	53273269	53273433	53273418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	67222	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	53281915	53282052	53282044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	58603	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr12	53284889	53285178	53285173	Y	ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	55477	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.862915361159228
chr12	53288883	53289427	53289224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	51228	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr12	53312254	53312405	53312393	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	28250	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	53318665	53319069	53319016	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	21586	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	53339346	53339557	53339459	Y	EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	1098	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	53359181	53359363	53359294	Y	PCBP2,AMHR2,KRT8,KRT18,KRT18	KRT18,KRT8,EIF4B	NA	NA	NA	NA	KRT8	17443	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	53611077	53612140	53611274	Y	PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	12624	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	53612468	53612778	53612580	Y	TENC1,TENC1,TENC1,IGFBP6,RARG,C12orf10	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	11986	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	53615195	53615822	53615501	Y	CSAD,SP1,PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	8942	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr12	53765037	53765535	53765115	Y	CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13	AAAS,SP1	SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP1	6425	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr12	53891661	53891873	53891767	Y	NA	TARBP2	NA	NA	NA	NA	MAP3K12	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	54052823	54053029	54052960	Y	NA	ATF7,RP11-972K6.1,ATP5G2	NA	NA	NA	NA	ATP5G2	16163	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	54411861	54412590	54411908	Y	COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4	HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC8	11029	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr12	54698103	54698502	54698288	Y	NFE2,NFE2	CBX5,HNRNPA1,COPZ1	NA	NA	NA	NA	COPZ1	5117	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	54752421	54752649	54752549	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA5	58595	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr12	54752671	54753884	54753119	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA5	57360	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	54810296	54811355	54811225	Y	GPR84,ZNF385A,NCKAP1L,ITGA5	NA	ZNF385A	IMR90	Hi-C	24141950	ITGA5	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	55435077	55435406	55435254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA5	623833	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	55807914	55808439	55808095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL7B	264891	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	55808460	55808880	55808766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL7B	264450	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	56147551	56147694	56147624	Y	NA	BLOC1S1,ITGA7,RDH5,RP11-644F5.11,CD63,GDF11	NA	NA	NA	NA	GDF11	12487	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	56218960	56219310	56218990	Y	OR6C3,OR6C65,OR6C2,OR6C4,OR10P1,IKZF4	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14,MMP19	NA	NA	NA	NA	TMEM198B	2219	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	56219844	56220081	56219962	Y	OR6C3	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14,MMP19	NA	NA	NA	NA	TMEM198B	1448	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	56239244	56239483	56239338	Y	IL23A,ZC3H10,MMP19	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14,MMP19	NA	NA	NA	NA	MMP19	4494	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	56294124	56294208	56294164	Y	NA	DGKA,WIBG	NA	NA	NA	NA	DGKA	24895	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	56474601	56474862	56474633	Y	SLC39A5,APOF,OR10P1,METTL7B,ERBB3,ERBB3	RPS26,ERBB3,PA2G4,RPL41,ZC3H10,ESYT1	NA	NA	NA	NA	ERBB3	2960	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,SNORD59A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	17.0857241509527
chr12	57077806	57078249	57078184	Y	COQ10A,PAN2,PAN2	BAZ2A,SNORD59A,ATP5B,PTGES3,NACA	NA	NA	NA	NA	PTGES3	1910	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	57079143	57079532	57079338	Y	NA	SNORD59A,ATP5B,PTGES3,NACA	NA	NA	NA	NA	PTGES3	627	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	57458942	57459239	57459094	Y	NA	MYO1A,TMEM194A,NAB2	TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182	IMR90	Hi-C	24141950	MYO1A	15960	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	57520981	57521279	57521090	Y	NA	TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	LRP1	705	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	57635972	57636429	57636328	Y	SLC26A10,R3HDM2,DTX3,B4GALNT1,ARHGEF25,NDUFA4L2	NXPH4,SHMT2	NA	NA	NA	NA	SHMT2	14862	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	57751585	57751906	57751872	Y	R3HDM2	NA	INHBC	IMR90	Hi-C	24141950	R3HDM2	70882	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	57812894	57812946	57812929	Y	NA	R3HDM2,INHBE,GLI1	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	9842	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	57813803	57814254	57814252	Y	NA	R3HDM2,INHBE,GLI1	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	8534	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	58094555	58094631	58094593	Y	NA	OS9,AGAP2-AS1,TSPAN31,AGAP2	NA	NA	NA	NA	OS9	8817	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	58168960	58169095	58169042	Y	TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM	TSPAN31,AGAP2,MARCH9,CDK4,METTL21B,METTL1,RP11-571M6.15,TSFM	NA	NA	NA	NA	RP11-571M6.15	4149	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	58259163	58259391	58259220	Y	TSPAN31,CDK4,METTL21B,CTDSP2	CTDSP2	CTDSP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	CTDSP2	20641	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	58349067	58349080	58349075	Y	XRCC6BP1	RP11-620J15.3,XRCC6BP1	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	15743	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	62680768	62680820	62680794	Y	NA	USP15,FAM19A2	NA	NA	NA	NA	FAM19A2	9837	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	62772980	62773240	62773147	Y	MON2,USP15	NA	NA	NA	NA	NA	MON2	85357	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	62796049	62796447	62796072	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MON2	62150	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	62983522	62983540	62983531	Y	NA	RP11-631N16.2,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	10992	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	62998747	62999127	62998791	Y	NA	RP11-631N16.2,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	3281	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	63118880	63119001	63118911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	123414	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	63124974	63125146	63125033	Y	C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	129508	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	63126917	63127025	63126971	Y	C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	131451	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	63149457	63149757	63149616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	153991	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	63294376	63294638	63294612	Y	NA	PPM1H	NA	NA	NA	NA	PPM1H	32179	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	64312639	64312950	64312683	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	76566	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr12	64386107	64386411	64386216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	150034	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr12	64544712	64545066	64544890	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	69010	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	64850943	64851361	64850994	Y	NA	TBK1	NA	NA	NA	NA	TBK1	7283	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	65019058	65019979	65019210	Y	TBK1,RASSF3,GNS	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	16765	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	65037414	65037710	65037562	Y	NA	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	35121	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	65074143	65074354	65074186	Y	RASSF3,LEMD3	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF3	71850	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	65076423	65076649	65076481	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF3	74130	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	65194398	65194833	65194618	Y	TBK1,RASSF3,LEMD3,GNS	GNS	TBC1D30,FLJ41278	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNS	43171	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	65930655	65931175	65930934	Y	HMGA2	NA	MSRB3,HMGA2,RPSAP52	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	63474	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	65997532	65998101	65997899	Y	HMGA2	RP11-221N13.3	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	2883	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	66012877	66013074	66012996	Y	NA	RP11-221N13.3	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	18228	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	66028423	66029056	66028712	Y	NA	RP11-221N13.3	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	33774	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	66048868	66049228	66049091	Y	NA	NA	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	54219	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr12	66050559	66051086	66050841	Y	LEMD3	NA	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	55910	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	66135126	66135637	66135353	Y	HMGA2	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	80274	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.03549843339107
chr12	66136008	66136292	66136116	Y	HMGA2	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	79619	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	2.07099686678215
chr12	66216365	66216749	66216512	Y	HMGA2	HMGA2,RPSAP52	NA	NA	NA	NA	HMGA2	454	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	66237933	66238219	66238043	Y	HMGA2	HMGA2,RPSAP52	NA	NA	NA	NA	RPSAP52	19179	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr12	66242690	66243107	66242729	Y	HMGA2	HMGA2,RPSAP52	NA	NA	NA	NA	RPSAP52	23936	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr12	66285844	66286273	66285967	Y	IRAK3	NA	NA	NA	NA	NA	RPSAP52	67090	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	66286698	66286979	66286899	Y	IRAK3	NA	NA	NA	NA	NA	RPSAP52	67944	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	66311039	66311339	66311117	Y	HMGA2	NA	NA	NA	NA	NA	RPSAP52	92285	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	66316992	66317322	66317175	Y	IRAK3	NA	NA	NA	NA	NA	RPSAP52	98238	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	IRAK3,RBMS1P1	NA	NA	NA	NA	RBMS1P1	1278	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr12	68221654	68222227	68222103	Y	NA	NA	DYRK2	IMR90	Hi-C	24141950	DYRK2	181536	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	68661732	68662103	68661918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDM1	62058	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	68705850	68706149	68706026	Y	IL22,SLC35E3,NUP107,MDM2,MDM1	MDM1	NA	NA	NA	NA	MDM1	18012	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	68758917	68759565	68759229	Y	IFNG,RAP1B	MDM1	RAP1B,NUP107,LOC100507250	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MDM1	34756	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.03549843339107
chr12	69180946	69181662	69181342	Y	NA	SLC35E3,MDM2	SLC35E3	IMR90	Hi-C	24141950	MDM2	18294	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	69723846	69724038	69723894	Y	LYZ	LYZ,YEATS4	CPSF6,YEATS4	K562	ChIA-PET	22265404	LYZ	16083	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	69724869	69725108	69724964	Y	LYZ	LYZ,YEATS4	YEATS4	K562	ChIA-PET	22265404	LYZ	15013	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	69806775	69807146	69806965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRS2	54983	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	70644560	70644959	70644584	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-611E13.2	9420	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	72146884	72146940	72146912	Y	NA	RAB21	NA	NA	NA	NA	RAB21	230	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	72165791	72165958	72165868	Y	NA	RAB21	NA	NA	NA	NA	RAB21	19137	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	72236663	72237026	72236820	Y	NA	TBC1D15	NA	NA	NA	NA	TBC1D15	5176	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	72946616	72946959	72946788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRHDE-AS1	279929	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	75900907	75901415	75901091	Y	KRR1	GLIPR1,KRR1	NA	NA	NA	NA	KRR1	2001	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	76219425	76219952	76219684	Y	PHLDA1	NA	PHLDA1,NAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA1	205760	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr12	76250053	76250409	76250231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	175303	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	76272060	76272354	76272328	Y	PHLDA1	NA	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	153358	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	76337836	76338217	76338130	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PHLDA1	87495	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr12	76352762	76353194	76352954	Y	NA	NA	KRR1,PHLDA1,OSBPL8	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA1	72518	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	76371613	76372127	76371872	Y	NA	NA	OSBPL8,PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	53585	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr12	76375899	76376264	76376114	Y	NA	PHLDA1	PHLDA1,KRR1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PHLDA1	49448	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr12	76414095	76414311	76414227	Y	NA	PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	11401	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	76414369	76415079	76414685	Y	NA	PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	10633	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr12	76429051	76429248	76429150	Y	NA	PHLDA1,NAP1L1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	3339	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	76751627	76751939	76751780	Y	NA	BBS10	NA	NA	NA	NA	BBS10	11405	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr12	78412779	78412965	78412883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV3	190094	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	78544842	78545234	78545038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV3	322157	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	79356068	79356388	79356099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	726489	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	80032366	80032529	80032417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	50348	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	80219716	80220141	80220058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R12A	107099	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	86051841	86052071	86051956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF9	176277	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	88968059	88968366	88968242	Y	NA	KITLG	NA	NA	NA	NA	KITLG	4262	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr12	89727563	89727887	89727725	Y	ATP2B1,DUSP6	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	17161	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	89740427	89740813	89740638	Y	POC1B,ATP2B1,DUSP6	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	4235	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	89747699	89748479	89748073	Y	NA	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	2651	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr12	90484866	90485476	90485213	Y	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B1	383789	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr12	90498149	90498315	90498232	Y	NA	NA	C12orf37,ATP2B1,POC1B	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B1	397072	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	92427755	92427874	92427825	Y	CLLU1,BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	106816	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	92469930	92470196	92470132	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	64494	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	92500767	92501208	92501155	Y	NA	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	33482	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	92509431	92509711	92509674	Y	NA	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	24979	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	92517978	92518398	92518142	Y	BTG1	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	16292	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	92528487	92528918	92528861	Y	BTG1	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	5772	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	92836682	92836892	92836798	Y	EEA1,BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	BTG1	299009	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	92894401	92894722	92894556	Y	NA	NA	LOC256021	MCF7	ChIA-PET	22265404	BTG1	356728	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	93709037	93709216	93709174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT4	60443	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	93805604	93805748	93805676	Y	CRADD	NUDT4,UBE2N	NA	NA	NA	NA	UBE2N	28290	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	94172136	94172517	94172167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	102985	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	94178297	94178734	94178344	Y	CRADD	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	109146	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	94201755	94201874	94201816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	132604	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	94696122	94696451	94696433	Y	PLXNC1,TMCC3	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	120294	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	94773845	94774167	94774046	Y	PLXNC1,TMCC3	RBMS2P1	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	42578	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	94817703	94818348	94818256	Y	NA	RBMS2P1,CCDC41	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	958	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	94827148	94827488	94827330	Y	NA	RBMS2P1,CCDC41	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	10403	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	94954640	94954945	94954835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMCC3	87393	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	95043067	95043319	95043087	Y	TMCC3	TMCC3	NA	NA	NA	NA	TMCC3	729	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	95411707	95411975	95411841	Y	NA	NDUFA12	NA	NA	NA	NA	NDUFA12	16161	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	95609786	95609977	95609896	Y	FGD6	FGD6,VEZT	NA	NA	NA	NA	VEZT	264	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	95680646	95681018	95680718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEZT	71124	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	96589359	96589977	96589479	Y	LTA4H,ELK3	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	3199	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	96613519	96613922	96613765	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	27359	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr12	96627063	96627293	96627178	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	40903	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	96636403	96636783	96636456	Y	CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	50243	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	96648142	96648594	96648361	Y	ELK3,CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	61982	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	96810217	96810461	96810410	Y	LTA4H,ELK3	CDK17	CDK17,ELK3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CDK17	17879	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	102169550	102169734	102169688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNPTAB	52982	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	102187051	102187461	102187342	Y	DRAM1,GNPTAB	GNPTAB	NA	NA	NA	NA	GNPTAB	35255	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	102253465	102253916	102253642	Y	DRAM1	GNPTAB,DRAM1	GNPTAB,DRAM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DRAM1	15213	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	104330398	104330552	104330475	Y	NA	HSP90B1,C12orf73,TDG	NA	NA	NA	NA	HSP90B1	8513	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	104671230	104671489	104671317	Y	TXNRD1	RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3	NA	NA	NA	NA	RP11-818F20.5	1011	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	104693849	104694220	104693862	Y	NA	RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3	NA	NA	NA	NA	EID3	1297	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr12	105064571	105065844	105065441	Y	EID3,CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	217498	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr12	105711063	105711549	105711425	Y	C12orf75	RP11-474B16.1	C12orf75,APPL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-474B16.1	7246	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	107363542	107363991	107363752	Y	NA	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	14953	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	108699402	108699607	108699511	Y	CORO1C,SELPLG	NA	NA	NA	NA	NA	FICD	207355	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	108700100	108700298	108700252	Y	CORO1C,SELPLG	NA	NA	NA	NA	NA	FICD	206664	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	108783050	108783376	108783111	Y	NA	NA	WSCD2,CMKLR1	IMR90	Hi-C	24141950	FICD	123586	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	108877904	108878160	108878033	Y	SSH1,SELPLG,SELPLG	FICD	NA	NA	NA	NA	FICD	28802	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	109084686	109085066	109084867	Y	SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	38306	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	109209396	109209677	109209591	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	39689	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	109232143	109232504	109232328	Y	FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	16862	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr12	109249958	109250678	109250397	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	592	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr12	109570576	109570747	109570637	Y	ACACB	ALKBH2,UNG,RP11-968O1.5	NA	NA	NA	NA	RP11-968O1.5	23553	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	109899131	109899209	109899162	Y	TRPV4,TRPV4,TRPV4	UBE3B,KCTD10	NA	NA	NA	NA	UBE3B	13998	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	110687741	110688014	110687886	Y	TRPV4,ATP2A2	ATP2A2	ATP2A2,C12orf76,IFT81,ANAPC7,ANKRD13A,GIT2,ARPC3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ATP2A2	28547	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	110707461	110707714	110707625	Y	NA	ATP2A2	ANKRD13A,ATP2A2,C12orf76,GIT2,IFT81	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2A2	8847	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	110750652	110751139	110750939	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	34091	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	110867136	110867499	110867318	Y	NA	ANAPC7,HMGA1P3,ARPC3,RPL31P49,GPN3	NA	NA	NA	NA	HMGA1P3	1049	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr12	111016111	111016444	111016311	Y	PPTC7,ARPC3	PPTC7,TCTN1	NA	NA	NA	NA	PPTC7	2681	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	111842634	111842962	111842759	Y	NA	FAM109A,SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	882	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	111939312	111939650	111939575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN2	95830	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	112018937	112019235	112019073	Y	NA	ATXN2	NA	NA	NA	NA	ATXN2	16245	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	112341708	112342051	112341878	Y	ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	63926	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr12	112529504	112529724	112529616	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	15102	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	112759768	112760224	112759930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	93931	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	113652796	113652994	113652903	Y	OAS1,OAS3,OAS2,SLC24A6,SDSL,TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	TPCN1	3861	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	113660919	113661318	113661188	Y	TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	4020	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	114200256	114200532	114200390	Y	NA	RP11-438N16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-438N16.1	8956	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr12	116561417	116561596	116561452	Y	MED13L,MAP1LC3B2	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	151547	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	116570796	116571229	116571121	Y	MED13L,MAP1LC3B2	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	141914	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	116572704	116573066	116572889	Y	MED13L	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	140077	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	116661909	116662288	116662266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	50855	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	116701070	116701373	116701314	Y	MAP1LC3B2,MED13L	MED13L	NA	NA	NA	NA	MED13L	11770	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	118123457	118123641	118123524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC5	325752	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	118632324	118632442	118632383	Y	NA	RPS2P5	PEBP1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS2P5	49435	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr12	118784975	118784984	118784980	Y	NA	TAOK3,SUDS3	NA	NA	NA	NA	TAOK3	23766	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	120426531	120426889	120426594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIT	113436	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr12	120639993	120640274	120640078	Y	NA	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	2899	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	120668258	120668871	120668569	Y	RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	31164	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	120700086	120700381	120700233	Y	RAB35,PXN,PXN	PXN,NME2P1,RNU4-2,RNU4-1	NA	NA	NA	NA	PXN	1193	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	120728531	120728703	120728617	Y	NA	PXN,NME2P1,RNU4-2,RNU4-1	PXN,GCN1L1,LOC100506649,RPLP0,RAB35,SIRT4,CCDC64,DYNLL1,SRSF9,RNF10,COX6A1,PLA2G1B,MSI1,LOC100506668,COQ5,TRIAP1,GATC	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-1	337	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	120906143	120906276	120906236	Y	RAB35	COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1	NA	NA	NA	NA	DYNLL1	490	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	120926786	120926862	120926830	Y	SIRT4	TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1,RNF10,COQ5	NA	NA	NA	NA	DYNLL1	21133	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	121282265	121283301	121283112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	56873	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	121402785	121402795	121402791	Y	HNF1A	HNF1A,HNF1A-AS1,C12orf43	NA	NA	NA	NA	HNF1A	11551	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	121839154	121839422	121839290	Y	C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	3310	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	121841505	121841570	121841538	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	5661	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	121864200	121864449	121864234	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	28356	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	121904317	121904475	121904368	Y	SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B	NA	RNF34	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF34	68473	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	122028609	122028883	122028798	Y	RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1	KDM2B,ORAI1	KDM2B	K562	ChIA-PET	22265404	KDM2B	11689	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	122067749	122067897	122067832	Y	ORAI1	ORAI1,MORN3	NA	NA	NA	NA	ORAI1	5294	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr12	122224293	122224471	122224351	Y	CAMKK2,KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,AC084018.1,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	14838	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	122227473	122227629	122227504	Y	CAMKK2,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,AC084018.1,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	11680	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	122227826	122228273	122227974	Y	CAMKK2,KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,AC084018.1,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	11036	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	122229588	122230472	122229850	Y	KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,AC084018.1,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	8837	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	122462187	122462386	122462358	Y	BCL7A	BCL7A,AC156455.1	NA	NA	NA	NA	BCL7A	6859	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	122518432	122518585	122518507	Y	MLXIP	AC156455.1,MLXIP	NA	NA	NA	NA	MLXIP	3804	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	122897459	122897572	122897541	Y	NA	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	7607	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr12	123320749	123321200	123320858	Y	NA	HIP1R	NA	NA	NA	NA	HIP1R	3749	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	123362987	123363145	123363088	Y	NA	HIP1R,VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	15846	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	123377732	123378127	123378026	Y	NA	VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	864	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	123627472	123627989	123627683	Y	C12orf65,C12orf65,C12orf65	PITPNM2	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	4573	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	124907545	124908050	124907792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC92	452167	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	124937911	124938596	124938282	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	426618	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	124991138	124991309	124991172	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	373905	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	125026162	125026505	125026332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	338709	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	125027797	125027993	125027883	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	337221	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	313839	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	5.26378370307129
chr12	125110562	125110683	125110642	Y	UBC,NCOR2	NA	NCOR2	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	254531	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	125110878	125111184	125111029	Y	UBC,NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	254030	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr12	125117895	125118180	125118038	Y	NA	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	247034	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	125124773	125124965	125124867	Y	UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	240249	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	125165952	125166242	125166057	Y	UBC,NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A,SCARB1	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	198972	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	125204801	125205082	125204928	Y	UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	160132	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	125221717	125221873	125221796	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	143341	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.20808150562292
chr12	125229298	125229517	125229417	Y	NA	NA	NCOR2	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	135697	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	125230587	125231048	125230629	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	134166	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	125231951	125232267	125232149	Y	UBC	NA	NCOR2	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	132947	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	125395122	125395522	125395138	Y	NA	SCARB1,UBC,RPL22P19	NA	NA	NA	NA	UBC	4392	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	125400956	125401141	125401046	Y	UBC	SCARB1,UBC,RPL22P19	NA	NA	NA	NA	UBC	1042	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	125424077	125424667	125424516	Y	NA	UBC,RPL22P19,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22P19	5636	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	125425237	125425455	125425374	Y	NA	UBC,RPL22P19,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22P19	6796	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	129054843	129055190	129054997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC15A4	251338	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	130824673	130824982	130824768	Y	PIWIL1	NA	NA	NA	NA	NA	RIMBP2	373844	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	132315038	132315239	132315115	Y	MMP17	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	4100	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	132345340	132345736	132345589	Y	SFSWAP,ULK1	MMP17,ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	31460	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr12	132904307	132904701	132904477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MUC8	144025	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	132970087	132970237	132970177	Y	CHFR,ANKLE2,FBRSL1	NA	GALNT9,LOC100130238,P2RX2,POLE,DDX51,NOC4L,LOC100507055,FBRSL1,EP400NL	IMR90	Hi-C	24141950	MUC8	78489	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr12	133021534	133022956	133022670	Y	POLE,DDX51,FBRSL1	MUC8,FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MUC8	25770	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr12	133029955	133030417	133030330	Y	NA	MUC8,FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MUC8	18309	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr12	133528012	133528357	133528019	Y	NA	CHFR,ZNF605	NA	NA	NA	NA	CHFR	2533	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	20137811	20138146	20137910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH8	67642	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	20644269	20644474	20644387	Y	ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2	NA	NA	NA	NA	NA	GJA3	88714	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	20693405	20693544	20693484	Y	CRYL1	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	39644	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr13	20701926	20702100	20701958	Y	PSPC1,ZMYM5	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	31088	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	20735697	20735843	20735813	Y	PSPC1,ZMYM5	GJA3,GJB2	NA	NA	NA	NA	GJA3	2509	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr13	20993930	20994321	20994126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRYL1	103675	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	22000564	22000681	22000573	Y	NA	ZDHHC20	NA	NA	NA	NA	ZDHHC20	30828	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	22111458	22111566	22111512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC20	79949	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr13	22243438	22243610	22243458	Y	FGF9	RPS7P10	NA	NA	NA	NA	FGF9	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr13	22249979	22250230	22250030	Y	NA	RPS7P10,FGF9	NA	NA	NA	NA	FGF9	6457	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr13	22635626	22635842	22635673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF9	392104	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	24440474	24440724	24440677	Y	NA	C1QTNF9B-AS1,MIPEP	NA	NA	NA	NA	C1QTNF9B-AS1	20304	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	24697003	24697328	24697264	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90	Hi-C	24141950	SPATA13	145059	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr13	24845538	24846279	24845979	Y	PARP4	NA	NA	NA	NA	NA	PARP4	238669	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	24850457	24850700	24850616	Y	PARP4	NA	NA	NA	NA	NA	PARP4	234248	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	25082319	25082682	25082572	Y	PARP4	PARP4	NA	NA	NA	NA	PARP4	2266	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	26551633	26551678	26551661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF6	243113	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.72583072231846
chr13	26760531	26760858	26760712	Y	WASF3	RNF6	WASF3,RNF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF6	33933	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	27843033	27843378	27843206	Y	NA	RPL21,RASL11A	NA	NA	NA	NA	RASL11A	569	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	28006253	28006341	28006297	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	GTF3A	9572	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	28025291	28025563	28025486	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	MTIF3	2552	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr13	28470399	28470626	28470551	Y	NA	PDX1	NA	NA	NA	NA	PDX1	21531	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	28496959	28497228	28497151	Y	NA	PDX1,CDX2	NA	NA	NA	NA	PDX1	4802	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	28725313	28725682	28725498	Y	PAN3	PAN3-AS1,PAN3	NA	NA	NA	NA	PAN3	14670	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	30415465	30415864	30415857	Y	NA	UBL3	NA	NA	NA	NA	UBL3	6957	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	30812389	30812594	30812492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX2P1	55690	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	30969684	30969817	30969776	Y	USPL1	LINC01058	LINC00426,KATNAL1,USPL1,UBL3,HMGB1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01058	24557	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	31264554	31264674	31264586	Y	USPL1,ALOX5AP,ALOX5AP	NA	HMGB1,USPL1,ALOX5AP,TEX26-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	USPL1	74724	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	31483566	31483936	31483755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPH1	250589	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	31746734	31747017	31746876	Y	NA	HSPH1,B3GALTL	NA	NA	NA	NA	HSPH1	12209	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	33788488	33788595	33788542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	134172	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	34116442	34117241	34116673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	193675	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr13	34731212	34731445	34731362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	341026	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	40331110	40331478	40331245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG6	103346	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	41173351	41173594	41173358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO1	65140	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	41229483	41229797	41229615	Y	NA	FOXO1	NA	NA	NA	NA	FOXO1	8937	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr13	41560539	41560879	41560717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1P3	66629	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	41581586	41581700	41581679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WBP4	51710	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	42035432	42035829	42035442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	152091	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	42222511	42222753	42222632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	339170	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	42228867	42229175	42229114	Y	NAA16,C13orf15	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	345526	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	42453037	42453433	42453235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKH	158743	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	43099384	43099709	43099478	Y	DGKH,AKAP11,TNFSF11,TNFSF11	NA	ENOX1	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP11	255095	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr13	43451555	43451845	43451701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSTI1	112562	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr13	43570775	43570983	43570833	Y	EPSTI1	EPSTI1,DNAJC15	EPSTI1,ENOX1	IMR90	Hi-C	24141950	EPSTI1	6368	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	43632661	43632965	43632672	Y	NA	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	37322	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr13	43662550	43662935	43662749	Y	EPSTI1	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	67211	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	44436870	44437053	44436962	Y	ENOX1	LACC1,CCDC122	NA	NA	NA	NA	LACC1	14367	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	44446151	44446617	44446342	Y	NA	LACC1,CCDC122	NA	NA	NA	NA	LACC1	4803	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr13	44542732	44543742	44543446	Y	SERP2	DGKZP1	SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	DGKZP1	2172	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr13	44848357	44848873	44848719	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	SERP2,NUFIP1,TSC22D1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	300410	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	44880536	44881091	44880742	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,LACC1,SERP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	268192	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr13	44887042	44887399	44887172	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	261884	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	45268219	45268248	45268234	Y	NA	NA	KIAA1704,NUFIP1,TSC22D1,TSC22D1-AS1,LINC00330	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	118936	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	45492137	45492940	45492235	Y	TSC22D1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP1	68678	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr13	45548667	45548813	45548740	Y	NA	NUFIP1	NA	NA	NA	NA	NUFIP1	12805	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	45745052	45745233	45745142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	52402	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	45774024	45774110	45774098	Y	KCTD4	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	81374	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	45813210	45813281	45813243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPT1-AS1	100199	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	45941510	45941762	45941695	Y	COG3,TPT1	TPT1-AS1,TPT1,SLC25A30	NA	NA	NA	NA	TPT1	28005	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	47128078	47128394	47128310	Y	LCP1,C13orf18,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	2775	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	47128564	47128952	47128887	Y	LCP1,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	3261	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr13	47129209	47129516	47129266	Y	NA	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	3906	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	48718696	48718843	48718708	Y	RCBTB2,RB1,ITM2B,MED4	POLR2KP2	NA	NA	NA	NA	POLR2KP2	12026	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	49074869	49075392	49075112	Y	FNDC3A,RB1,LPAR6,RCBTB2	RCBTB2	NA	NA	NA	NA	RCBTB2	29977	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	49365956	49366344	49366103	Y	RB1,RCBTB2,FNDC3A	PSME2P2	FNDC3A,MLNR	IMR90	Hi-C	24141950	PSME2P2	22692	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	49563041	49563333	49563220	Y	RCBTB2,CYSLTR2,SETDB2,SETDB2,CDADC1,FNDC3A	FNDC3A	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	14993	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	49761885	49761908	49761899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDADC1	58139	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr13	50209681	50209984	50209832	Y	SETDB2,ARL11	NA	NA	NA	NA	NA	RCBTB1	51962	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr13	50602874	50603059	50603020	Y	NA	TRIM13,MIR3613	NA	NA	NA	NA	MIR3613	34237	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	50704264	50704590	50704561	Y	NA	DLEU1,DLEU2	DLEU7,DLEU1,DLEU2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DLEU2	6408	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr13	51200392	51200766	51200454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P26	266493	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	52303239	52303556	52303323	Y	WDFY2	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	72737	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	52956042	52956135	52956089	Y	NA	THSD1	NA	NA	NA	NA	THSD1	22494	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	53190916	53191040	53191000	Y	NA	HNRNPA1L2,MRPS31P4,SUGT1	NA	NA	NA	NA	MRPS31P4	1223	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	55515473	55515560	55515510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	2290629	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	72419778	72420070	72419973	Y	DACH1	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	172579	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	73768530	73768732	73768575	Y	NA	RNU4-10P	NA	NA	NA	NA	RNU4-10P	4865	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr13	74184794	74185193	74184838	Y	NA	NA	PIBF1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-10P	421129	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr13	74228674	74228703	74228690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-10P	465009	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	74326809	74326882	74326846	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	379512	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	74339681	74339964	74339912	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	366430	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	74708897	74709334	74709161	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	2503	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr13	74709487	74710034	74709735	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	3093	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr13	76279211	76279429	76279239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	86641	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr13	76279599	76280073	76279764	Y	LMO7	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	87029	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr13	76390114	76390391	76390144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	197544	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	76447173	76447412	76447299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	254603	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	80122895	80122985	80122937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDFIP2	69608	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	80916096	80916414	80916232	Y	NA	SPRY2	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3010	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr13	80916799	80917232	80917156	Y	NA	SPRY2	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3713	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	90486324	90486483	90486404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	1511591	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	92874267	92874578	92874398	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	164170	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	95753354	95753450	95753358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC4	198237	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	95932787	95933077	95933010	Y	NA	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	18610	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	96350660	96350996	96350828	Y	NA	DNAJC3-AS1,DNAJC3	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	23267	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	96427402	96427645	96427445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	100009	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	98921705	98921995	98921808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARP1	128889	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	99128638	99129073	99128919	Y	STK24	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	99121	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr13	99161455	99162128	99161863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	66066	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	99403586	99403810	99403698	Y	SLC15A1	SLC15A1	NA	NA	NA	NA	SLC15A1	678	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr13	99628165	99628894	99628676	Y	DOCK9	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK9	107985	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	99935844	99936009	99935907	Y	GPR183	GPR183	NA	NA	NA	NA	GPR183	21650	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	99950103	99950501	99950500	Y	GPR18,GPR183	GPR183	NA	NA	NA	NA	GPR183	7158	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	99957911	99958107	99958020	Y	DOCK9,CLYBL,GPR18,GPR183	GPR183	NA	NA	NA	NA	GPR183	252	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	100013491	100013836	100013585	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL	NA	NA	NA	NA	NA	GPR183	55832	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	100278698	100278861	100278780	Y	NA	CLYBL	NA	NA	NA	NA	CLYBL	21779	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	100620497	100620786	100620718	Y	ZIC5,ZIC2	ZIC5,ZIC2	NA	NA	NA	NA	ZIC5	1377	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr13	100738422	100738621	100738542	Y	NA	PCCA	NA	NA	NA	NA	PCCA	648	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	100928465	100928851	100928516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL15P18	127119	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr13	101163000	101163083	101163042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC4	162264	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	103249969	103250343	103250155	Y	ERCC5,TPP2	TPP2	NA	NA	NA	NA	TPP2	2616	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr13	104371816	104371919	104371873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC5	876622	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	105792553	105792815	105792695	Y	DAOA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00460	1234096	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	106803810	106804031	106803901	Y	NA	NA	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00460	222880	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	107160222	107160504	107160362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	58008	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	107170805	107171068	107170962	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	47444	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr13	107173594	107173915	107173796	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	44597	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr13	107182699	107183083	107182911	Y	EFNB2	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	35429	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr13	107186008	107186474	107186341	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	32038	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr13	107188808	107188962	107188940	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	29550	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	107222796	107223196	107222998	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	4284	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	109568044	109568430	109568179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD13	699317	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr13	109909294	109909814	109909611	Y	NA	NA	MYO16,IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	495801	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	109921804	109922211	109922051	Y	NA	NA	IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	483404	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr13	110055406	110055637	110055557	Y	IRS2	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	349978	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	110439676	110440079	110439929	Y	IRS2	AL162497.1,IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	2761	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr13	110746992	110747342	110747118	Y	NA	NA	MYO16,IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	310077	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	110790027	110791241	110790617	Y	RAB20,IRS2	NA	NA	NA	NA	NA	IRS2	353112	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	110932842	110933175	110933069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB20	278905	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	111039905	111040155	111040082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB20	171925	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	111172874	111173635	111173314	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	RAB20	NA	NA	NA	NA	RAB20	38445	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	111176913	111177121	111177092	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	RAB20	NA	NA	NA	NA	RAB20	34959	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr13	111212014	111212166	111212090	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	NA	COL4A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAB20	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr13	111212967	111213224	111213111	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	RAB20	COL4A2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RAB20	887	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr13	111526935	111527249	111527195	Y	RAB20	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	LINC00346	6773	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr13	111719893	111720066	111720029	Y	NA	ARHGEF7	ANKRD10,ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF7	44840	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr13	112729016	112729315	112729166	Y	SOX1	SNORD44	NA	NA	NA	NA	SNORD44	24624	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	113588902	113588931	113588917	Y	NA	MCF2L-AS1	MCF2L,MCF2L-AS1,F10,F7,CUL4A	H1ESC,HELA,K562,IMR90	5C,Hi-C	22955621,24141950	MCF2L-AS1	32207	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	113806516	113806910	113806731	Y	ATP11A,CUL4A	F10	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	F10	31388	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr13	114064803	114065029	114064948	Y	NA	GRTP1	NA	NA	NA	NA	GRTP1	48357	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	114147699	114148153	114147800	Y	F7,F10,PROZ,GRTP1	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	TMCO3	4389	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	3.62424451686876
chr13	114770181	114770639	114770503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	125447	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr13	114830489	114831626	114831334	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	64460	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.03549843339107
chr13	114864762	114865011	114864824	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	31075	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr13	114876029	114876284	114876205	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	19802	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	114881275	114881557	114881414	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	14529	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr13	114884280	114884926	114884814	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	11160	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr13	114892702	114892820	114892783	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	3266	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr13	114894223	114894969	114894576	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	1117	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr13	114906463	114906564	114906535	Y	RASA3	RASA3	RASA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	RASA3	10377	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	114908058	114908380	114908196	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	11972	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr13	115046177	115046319	115046229	Y	RASA3	CDC16,UPF3A,CHAMP1	NA	NA	NA	NA	UPF3A	1118	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr14	21150605	21151121	21150987	Y	TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	269	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr14	21151333	21151694	21151411	Y	NA	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	997	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr14	21439863	21440073	21439999	Y	NA	METTL17	NA	NA	NA	NA	METTL17	15856	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr14	21540493	21540634	21540528	Y	RNASE6,TOX4,HNRNPC,ARHGEF40	ARHGEF40,NDRG2,ZNF219	NA	NA	NA	NA	NDRG2	3462	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	23358205	23358555	23358381	Y	NA	LRP10,RBM23,PRMT5-AS1,PRMT5,RP11-298I3.1	NA	NA	NA	NA	LRP10	19383	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr14	23449757	23450231	23450060	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB	MIR4707,HAUS4,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr14	24481106	24481351	24481229	Y	NA	DHRS4L2,LRRC16B	NA	NA	NA	NA	LRRC16B	37855	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	24604383	24604748	24604550	Y	NA	PCK2,DCAF11,PSME1,RNF31,PSME2,IRF9	NA	NA	NA	NA	PSME1	1016	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	24861663	24861718	24861669	Y	IPO4,RABGGTA,RABGGTA	NYNRIN,KHNYN,SDR39U1	NA	NA	NA	NA	NYNRIN	4274	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	31101250	31101606	31101429	Y	NA	SCFD1	NA	NA	NA	NA	SCFD1	11932	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	31400109	31400220	31400192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COCH	58389	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr14	32597823	32598061	32597946	Y	NUBPL	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP5-AS1	53824	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr14	33151520	33151608	33151564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	199514	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	34529400	34529785	34529476	Y	EGLN3	NA	EGLN3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	399777	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr14	35235794	35235835	35235815	Y	FAM177A1,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	NA	CFL2	53765	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	35400009	35400627	35400547	Y	NFKBIA,EAPP,BAZ1A,PPP2R3C,KIAA0391,FAM177A1	SRP54,RP11-85K15.2	BAZ1A	IMR90	Hi-C	24141950	SRP54	48536	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	35628271	35628433	35628369	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	38516	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr14	35802308	35802726	35802409	Y	BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	53549	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	35854902	35855043	35854959	Y	NA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	1232	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	35865196	35865330	35865211	Y	RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	6625	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr14	36073737	36073816	36073791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	201782	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	36277376	36277519	36277444	Y	NFKBIA,RALGAPA1	RALGAPA1,NUTF2P2,BRMS1L	NA	NA	NA	NA	RALGAPA1	866	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	36778207	36778309	36778259	Y	NA	MBIP	NA	NA	NA	NA	MBIP	9573	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	38057887	38058022	38057995	Y	FOXA1	TTC6,FOXA1	NA	NA	NA	NA	TTC6	5030	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	39559553	39559840	39559693	Y	NA	SEC23A,GEMIN2	NA	NA	NA	NA	SEC23A	17010	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	39768270	39768447	39768359	Y	PNN,MIA2	CTAGE5	NA	NA	NA	NA	CTAGE5	35782	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	39890491	39890736	39890687	Y	NA	FBXO33	NA	NA	NA	NA	FBXO33	8968	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	39900071	39900466	39900211	Y	PNN,CTAGE5,FBXO33	FBXO33	NA	NA	NA	NA	FBXO33	367	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr14	39954969	39955272	39955039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	55265	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	39958924	39958943	39958934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	59220	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr14	50437883	50438206	50438091	Y	RPS29,RPL36AL,DNAAF2,NEMF,SOS2,METTL21D,ATP5S,ARF6	NA	NA	NA	NA	NA	ARF6	80073	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	50465888	50466432	50466066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARF6	108078	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	50467375	50468846	50468075	Y	RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D	NA	NA	NA	NA	NA	ARF6	109565	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr14	50681069	50681448	50681362	Y	NA	SOS2	NA	NA	NA	NA	SOS2	14828	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	50799629	50799645	50799635	Y	NA	ATP5S,L2HGDH	NA	NA	NA	NA	L2HGDH	22363	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr14	52119936	52120349	52120008	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	166118	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	52335735	52335782	52335759	Y	PTGER2,GNG2	GNG2	NA	NA	NA	NA	GNG2	44822	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	52584121	52584359	52584179	Y	NA	NA	NID2,C14orf166	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf166	129928	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	52622606	52622722	52622664	Y	NA	NA	C14orf166,NID2,PTGDR	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf166	168413	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	53257268	53257587	53257438	Y	NA	GNPNAT1	NA	NA	NA	NA	GNPNAT1	882	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	53416335	53416646	53416599	Y	GPR137C	FERMT2	NA	NA	NA	NA	FERMT2	507	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	54444458	54444658	54444588	Y	NA	BMP4	BMP4	MCF7	ChIA-PET	22265404	BMP4	20979	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr14	54833964	54834357	54834051	Y	NA	CDKN3	NA	NA	NA	NA	CDKN3	27210	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.20808150562292
chr14	55073001	55073254	55073103	Y	NA	SAMD4A	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	41186	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	55541499	55541595	55541574	Y	NA	WDHD1,SOCS4,MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	25150	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.63953918620253
chr14	55596570	55597156	55596587	Y	NA	LGALS3	NA	NA	NA	NA	LGALS3	7742	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	55765939	55766288	55766115	Y	GCH1	FBXO34,RP11-665C16.6	NA	NA	NA	NA	RP11-665C16.6	29146	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr14	55770530	55770967	55770803	Y	GCH1,MAPK1IP1L,LGALS3,FBXO34,FBXO34	FBXO34,RP11-665C16.6	NA	NA	NA	NA	RP11-665C16.6	33737	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	55841053	55841315	55841186	Y	MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,ATG14	ATG14	NA	NA	NA	NA	ATG14	35261	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	57953486	57953857	57953604	Y	C14orf105	C14orf105	NA	NA	NA	NA	C14orf105	4728	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	58748134	58748542	58748422	Y	ARID4A	PSMA3,RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A	NA	NA	NA	NA	RP11-349A22.5	14310	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr14	59216036	59216189	59216096	Y	ARID4A	RP11-112J1.1	DACT1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-112J1.1	43183	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr14	59656513	59656908	59656842	Y	DAAM1	DAAM1	NA	NA	NA	NA	DAAM1	3149	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	59744882	59745126	59745004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAAM1	91518	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr14	59768078	59768328	59768116	Y	RTN1,DAAM1	NA	NA	NA	NA	NA	DAAM1	114714	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	59949393	59949731	59949550	Y	C14orf149	GPR135,JKAMP	NA	NA	NA	NA	JKAMP	232	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	60679186	60679974	60679676	Y	NA	DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2	NA	NA	NA	NA	PPM1A	30496	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr14	61645426	61645731	61645594	Y	NA	NA	SLC38A6,SIX1,MNAT1,TRMT5,SIX4	IMR90	Hi-C	24141950	TRMT5	199350	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	61865216	61865457	61865337	Y	PRKCH	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	294774	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr14	64320785	64320937	64320842	Y	PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	3102	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	64975156	64975343	64975202	Y	NA	AKAP5,ZBTB1,ZBTB25,HSPA2	NA	NA	NA	NA	ZBTB25	5225	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	64976158	64976191	64976175	Y	ZBTB25,ZBTB1	AKAP5,ZBTB1,ZBTB25,HSPA2	NA	NA	NA	NA	ZBTB25	6227	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	65746592	65747003	65746788	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90	Hi-C	24141950	FUT8	128307	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	66126309	66126626	66126333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	250999	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr14	66912712	66912753	66912717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPHN	59372	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	68161499	68161767	68161616	Y	PLEK2	VTI1B,RDH11	NA	NA	NA	NA	RDH11	968	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr14	68408350	68408505	68408421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	123854	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr14	68614207	68614598	68614344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	272315	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	68827959	68828328	68828144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	58585	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	68884830	68884917	68884875	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	1996	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	68961774	68962026	68961864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	74861	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	69014304	69014714	69014453	Y	ACTN1	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	127391	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	70020113	70020453	70020282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	55860	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr14	70251267	70251371	70251319	Y	SLC10A1	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF5	59650	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr14	70251545	70251918	70251732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF5	59928	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	71349940	71350165	71350035	Y	MED6,PCNX	PCNX	NA	NA	NA	NA	PCNX	21957	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	71797093	71797681	71797289	Y	PCNX	SIPA1L1,RP1-261D10.2	SIPA1L1,LOC145474	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-261D10.2	10562	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr14	72650490	72650870	72650581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCAF4	740170	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	73824884	73825148	73825019	Y	ZFYVE1,ZFYVE1,RBM25,PSEN1,NUMB	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-240K6.3	101981	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	74207610	74207866	74207660	Y	C14orf43	PNMA1,MIR4505,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	MIR4505	15584	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	75761897	75762132	75762064	Y	FOS,JDP2,JDP2,JDP2,FLVCR2,FLVCR2	RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5	NA	NA	NA	NA	RP11-293M10.5	2790	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr14	76513976	76514095	76514005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFT43	147497	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	76843326	76843356	76843341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-187O7.1	256648	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr14	77384980	77385465	77385224	Y	VASH1	RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	33887	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	77422240	77422571	77422458	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,KIAA1737	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	1410	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr14	77423763	77424258	77424192	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.1	IRF2BPL,KIAA1737	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	77428060	77428442	77428341	Y	NA	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	4079	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	77488566	77488578	77488572	Y	NA	IRF2BPL	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	4456	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	77489818	77490087	77489881	Y	NA	IRF2BPL	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	2947	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr14	79464675	79465065	79464871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCK1	1200249	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	SNORA79,DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	3.19278683628914
chr14	88445167	88445328	88445280	Y	GPR65,GALC,GALC	GALC	NA	NA	NA	NA	GALC	12681	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	90083286	90083622	90083526	Y	TDP1,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	90378938	90379536	90379158	Y	FOXN3,FOXN3,KCNK13	EFCAB11,TDP1	NA	NA	NA	NA	EFCAB11	39585	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	91134460	91134696	91134603	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7B	146127	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	91393752	91394149	91393951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7B	112929	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	91683304	91683542	91683359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	158324	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	91697855	91698086	91698043	Y	C14orf159,SMEK1,GPR68	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	172875	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	91716270	91716863	91716728	Y	RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C,GPR68,GPR68	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	165325	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	91863961	91864070	91864025	Y	C14orf159,CCDC88C	CCDC88C	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	18118	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	91869322	91869469	91869402	Y	TC2N,RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C	CCDC88C	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	12719	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	91926776	91927002	91926960	Y	NA	CCDC88C,SMEK1	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	44588	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr14	92997430	92998230	92997929	Y	ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	RIN3	NA	NA	NA	NA	RIN3	19312	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	93193771	93194035	93193928	Y	MOAP1,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	LGMN	NA	NA	NA	NA	LGMN	19012	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	93509801	93510236	93510094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	70429	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr14	93511721	93512085	93511905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	68580	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr14	93569992	93570233	93570210	Y	KIAA1409,C14orf109,C14orf109	ITPK1	NA	NA	NA	NA	ITPK1	10432	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	94679415	94679751	94679563	Y	SERPINA1	NA	NA	NA	NA	NA	PPP4R4	68950	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	95066800	95067322	95067074	Y	SERPINA10,SERPINA10,SERPINA6,SERPINA1,SERPINA11,SERPINA4,SERPINA5,SERPINA3	SERPINA5,SERPINA3	NA	NA	NA	NA	SERPINA3	9392	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	95731733	95732288	95732036	Y	DICER1,CLMN	NA	NA	NA	NA	NA	CLMN	51955	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr14	95949683	95949787	95949735	Y	NA	RP11-1070N10.3,GLRX5,SCARNA13,SNHG10	C14orf49	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-1070N10.3	30686	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	97043507	97043643	97043575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPOLA	77737	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11B	296223	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr14	99711955	99712816	99712233	Y	NA	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	23045	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	99734295	99735130	99734633	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	731	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	99735950	99736476	99736276	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	89	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	100071651	100072022	100071781	Y	NA	CCDC85C	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	3288	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	100659173	100659604	100659490	Y	NA	DEGS2,YY1,RP11-638I2.4	DEGS2,YY1,EVL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DEGS2	34673	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	100751761	100751840	100751790	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	19044	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr14	101020509	101020866	101020628	Y	WARS,WARS,WDR25,WDR25,BEGAIN	BEGAIN	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	30884	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr14	101155057	101155401	101155388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	103307	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	101159258	101159870	101159708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	107508	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr14	101370822	101370975	101370899	Y	BEGAIN,RTL1	NA	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	319072	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	102001660	102001854	102001726	Y	PPP2R5C,PPP2R5C,DYNC1H1	DIO3OS,DIO3	NA	NA	NA	NA	DIO3OS	22914	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.03549843339107
chr14	102176439	102176788	102176690	Y	PPP2R5C	RP11-1029J19.5,PPP2R5C	PPP2R5C,LINC00239	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-1029J19.5	18657	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	102188292	102188876	102188640	Y	WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C	RP11-1029J19.5,PPP2R5C	LINC00239	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-1029J19.5	6569	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	102226478	102227031	102226824	Y	HSP90AA1	RP11-1029J19.5,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	343	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	102288392	102288845	102288491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	62257	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	102292259	102292630	102292392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	66124	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	2.24357993901399
chr14	102415545	102415736	102415629	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13129	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	102438747	102439113	102438818	Y	PPP2R5C,DYNC1H1	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	9882	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	102544859	102545271	102545048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR20	58569	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	102662808	102663069	102662945	Y	TECPR2,HSP90AA1,WDR20	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90AA1	58772	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	102989903	102989915	102989909	Y	NA	ANKRD9,CTD-2555C10.3	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	15767	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	102991046	102991386	102991124	Y	NA	ANKRD9,CTD-2555C10.3	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	16910	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr14	102991831	102991939	102991900	Y	NA	ANKRD9,CTD-2555C10.3	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2555C10.3	17652	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr14	102997284	102997579	102997375	Y	TRAF3,RCOR1	ANKRD9,CTD-2555C10.3	MIR4309,RCOR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2555C10.3	12012	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr14	103537585	103537989	103537775	Y	NA	CDC42BPB,RP11-736N17.8,TNFAIP2	CDC42BPB,EIF5	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42BPB	15786	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	103539359	103539722	103539623	Y	NA	CDC42BPB,RP11-736N17.8,TNFAIP2	CDC42BPB,EIF5	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42BPB	17560	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr14	103540554	103540738	103540645	Y	NA	CDC42BPB,RP11-736N17.8,TNFAIP2	CDC42BPB,EIF5	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-736N17.8	18322	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	103541337	103541574	103541446	Y	NA	CDC42BPB,RP11-736N17.8,TNFAIP2	CDC42BPB,EIF5	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-736N17.8	17486	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr14	103575159	103575514	103575439	Y	MARK3,BAG5,BAG5,TRAF3,EIF5,EIF5,TNFAIP2	RP11-736N17.8,TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	12265	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	103710310	103710630	103710449	Y	NA	NA	LOC100131366,EIF5,TNFAIP2,CDC42BPB,RCOR1,EXOC3L4	IMR90	Hi-C	24141950	EIF5	87251	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	103781496	103782004	103781810	Y	EXOC3L4,TNFAIP2	EIF5	RCOR1,EIF5,MARK3,CDC42BPB,LOC100131366,TNFAIP2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EIF5	15877	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	103929089	103929460	103929098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRMT61A	64061	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	103954462	103954719	103954539	Y	MARK3,KLC1	TRMT61A	NA	NA	NA	NA	TRMT61A	38802	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	104228992	104229118	104229080	Y	NA	XRCC3,ZFYVE21	NA	NA	NA	NA	ZFYVE21	48925	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	105144100	105144955	105144117	Y	GPR132,AKT1	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	RP11-982M15.6	528	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr14	105148231	105148612	105148591	Y	INF2	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	RP11-982M15.6	2748	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr14	105154013	105154712	105154273	Y	ADSSL1	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	70	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	105327046	105327788	105327205	Y	NA	RPS26P49	NA	NA	NA	NA	RPS26P49	31538	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr14	105433766	105434012	105433864	Y	KIAA0284,JAG2,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	8682	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	105434660	105434907	105434734	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	7787	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	105435117	105435479	105435281	Y	KIAA0284	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	7215	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr14	105438668	105438757	105438725	Y	KIAA0284,JAG2,CDCA4,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	AHNAK2	3937	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr14	105439556	105439771	105439692	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2923	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr14	105491233	105491512	105491453	Y	NA	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	5748	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	105557924	105558306	105558075	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,JAG2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	72439	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr14	105653618	105653649	105653635	Y	NA	JAG2,NUDT14	NA	NA	NA	NA	NUDT14	7958	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	105947921	105948133	105948082	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	3403	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	2511	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.862915361159228
chr14	107252931	107253417	107253022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM121	1261991	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr14	107253494	107254031	107253700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM121	1262554	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	20616457	20616559	20616506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP5	2214836	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	22908894	22909338	22909142	Y	NA	CYFIP1	NA	NA	NA	NA	CYFIP1	18889	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	22938552	22938923	22938737	Y	CYFIP1	CYFIP1	NIPA2	IMR90	Hi-C	24141950	CYFIP1	48547	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	25209245	25209272	25209252	Y	NA	SNURF,SNHG14,SNORD64	NA	NA	NA	NA	SNURF	11064	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	25555752	25555966	25555813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	126162	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	25564293	25564526	25564383	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	117602	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	25565589	25566847	25566046	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	115281	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	25586903	25587047	25586976	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	95081	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	25597069	25597306	25597188	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	84822	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	25604152	25604594	25604190	Y	SNURF,SNRPN,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	77534	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	25614491	25614606	25614563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	67522	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	25623423	25623523	25623473	Y	SNURF,SNRPN	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	58605	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	25641447	25641749	25641585	Y	NA	UBE3A	NA	NA	NA	NA	UBE3A	40379	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	30022522	30022814	30022806	Y	FAM189A1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-680F8.1	57328	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	31555534	31555833	31555755	Y	MTMR10,KLF13	RP11-16E12.1	LOC283710,OTUD7A,KLF13	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-16E12.1	49311	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	31680805	31681075	31680940	Y	MTMR10	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	63747	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	33111010	33111355	33111242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	205665	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	33494122	33494379	33494251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP11A	588777	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	35384953	35385239	35385081	Y	NA	NA	ATPBD4	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	106465	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	35590731	35591134	35590845	Y	NA	NA	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	312243	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr15	37253162	37253269	37253223	Y	MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-128A17.1	136271	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	38751078	38751316	38751209	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	6750	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	38784019	38784367	38784201	Y	RASGRP1	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	39691	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	39559889	39560120	39560079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THBS1	311160	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	40385571	40385715	40385643	Y	BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	13378	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	40391032	40391342	40391133	Y	PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	7751	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	40803808	40804249	40803896	Y	NA	CHST14	NA	NA	NA	NA	CHST14	42648	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	41139695	41139794	41139738	Y	NA	ZFYVE19,DNAJC17,SPINT1,RHOV,VPS18	NA	NA	NA	NA	SPINT1	5479	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	41220555	41220912	41220794	Y	NUSAP1,DLL4	VPS18,DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	DLL4	1017	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	41233721	41234461	41233781	Y	C15orf57,VPS18	VPS18,DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	8699	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	41456018	41456111	41456065	Y	NA	INO80	NA	NA	NA	NA	INO80	49466	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	41788010	41788393	41788374	Y	NA	ITPKA,RPAP1	NA	NA	NA	NA	ITPKA	4419	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	MGA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MGA	42496	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr15	42083275	42083582	42083459	Y	NA	MAPKBP1,JMJD7,PLA2G4B,JMJD7-PLA2G4B	NA	NA	NA	NA	MAPKBP1	18643	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	42213328	42213713	42213448	Y	NA	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	49063	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	42226071	42226526	42226165	Y	EHD4	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	36250	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	42260184	42260317	42260307	Y	EHD4	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	2459	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	42349424	42349982	42349743	Y	MGA,JMJD7,EHD4,VPS39,TMEM87A,SNAP23	NA	PLA2G4E	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	86648	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	42535686	42535733	42535710	Y	NA	VPS39,GANC,TMEM87A	NA	NA	NA	NA	GANC	27698	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	43415014	43415563	43415337	Y	NA	UBR1,RPS3AP47,TMEM62	NA	NA	NA	NA	TMEM62	1537	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr15	44161980	44162105	44162047	Y	NA	MFAP1,WDR76,PIN4P1	NA	NA	NA	NA	PIN4P1	4337	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	44524937	44524986	44524960	Y	NA	FRMD5	CTDSPL2,WDR76,FRMD5,CASC4	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD5	39487	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	44837233	44837387	44837300	Y	CTDSPL2,PATL2	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	9978	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	44838663	44839045	44838853	Y	NA	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	11408	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr15	44869897	44870156	44869963	Y	NA	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	42642	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	44954800	44955080	44954968	Y	CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11	SPG11,PATL2,B2M	NA	NA	NA	NA	SPG11	924	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.55324765008661
chr15	45004703	45005017	45004887	Y	CASC4,CTDSPL2,SPG11,PATL2,B2M,TRIM69	PATL2,B2M,TRIM69	NA	NA	NA	NA	B2M	3028	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	45016631	45017046	45016657	Y	SPG11,B2M,TRIM69	PATL2,B2M,TRIM69	NA	NA	NA	NA	TRIM69	2140	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	45076532	45076874	45076594	Y	B2M	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM69	57346	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.862915361159228
chr15	45746745	45747578	45747238	Y	SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN	C15orf48	NA	NA	NA	NA	C15orf48	26018	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	45784407	45784611	45784453	Y	C15orf48,SQRDL,PLDN	SLC30A4	NA	NA	NA	NA	SLC30A4	28394	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	45875981	45876250	45876116	Y	C15orf48,SQRDL,PLDN	SQRDL	NA	NA	NA	NA	SQRDL	45096	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	45929603	45930187	45929917	Y	C15orf48,PLDN,SQRDL	SQRDL	NA	NA	NA	NA	SQRDL	8257	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	48023492	48023830	48023661	Y	NA	CTD-2270N23.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2270N23.1	2360	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	48821826	48821860	48821843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBN1	114186	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	49488021	49488225	49488024	Y	NA	GALK2,COPS2	NA	NA	NA	NA	COPS2	42163	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	49598906	49599159	49599033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS2	153048	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	50350203	50350407	50350311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A2	121986	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	50793550	50793719	50793635	Y	USP8,TRPM7	NA	NA	NA	NA	NA	USP8	78973	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	50995097	50995499	50995351	Y	SPPL2A	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	18085	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr15	52228372	52228625	52228515	Y	NA	MAPK6,LEO1	NA	NA	NA	NA	MAPK6	13678	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr15	52235970	52236006	52235989	Y	DMXL2,MAPK6	MAPK6,LEO1	NA	NA	NA	NA	MAPK6	6297	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	55487267	55487658	55487506	Y	NA	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	2	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	55874454	55874613	55874565	Y	PRTG	PYGO1	NA	NA	NA	NA	PYGO1	4532	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	56162319	56162688	56162565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4	121256	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	56330366	56330465	56330418	Y	NA	NEDD4	NEDD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD4	46422	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	56341448	56341541	56341527	Y	NA	NA	NEDD4	IMR90	Hi-C	24141950	NEDD4	57504	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	56475850	56476168	56476009	Y	MNS1	NA	NA	NA	NA	NA	RFX7	57315	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	56940397	56940741	56940580	Y	ZNF280D,TCF12	NA	NA	NA	NA	NA	MNS1	185062	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	57261737	57262096	57261746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF12	52916	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	57529031	57529296	57529123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF12	320210	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	57853638	57853874	57853726	Y	NA	GCOM1,MYZAP,POLR2M	NA	NA	NA	NA	GCOM1	28232	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	58307957	58308317	58308137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR2M	425726	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	58606934	58606946	58606940	Y	NA	NA	LIPC,FAM63B,ADAM10	IMR90	Hi-C	24141950	ADAM10	433231	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	58884938	58885321	58885256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	154856	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	58898092	58898418	58898348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	141759	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	59023904	59024166	59024035	Y	RNF111	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	ADAM10	16011	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	59085961	59086460	59086218	Y	NA	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	FAM63B	24570	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	59576201	59576407	59576333	Y	GCNT3,MYO1E	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	86485	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	59649595	59649770	59649683	Y	NA	FAM81A,MYO1E,RP11-356M20.1	NA	NA	NA	NA	FAM81A	13122	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	59848106	59848258	59848124	Y	GCNT3	RP11-112N19.2,GCNT3	NA	NA	NA	NA	RP11-112N19.2	4814	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	59917748	59917987	59917921	Y	NA	GCNT3,GTF2A2	NA	NA	NA	NA	GTF2A2	29753	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	60700608	60701055	60700809	Y	NA	ANXA2	NA	NA	NA	NA	ANXA2	7526	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	60865969	60866384	60866286	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	96592	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	60883059	60884017	60883872	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	113682	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	61191372	61191904	61191714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RORA	327614	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	61298105	61298485	61298295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RORA	221033	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	62207321	62207567	62207441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	143105	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	62215780	62216024	62215899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	134648	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	63439577	63439949	63439764	Y	NA	LACTB,RPS27L,RAB8B	NA	NA	NA	NA	RPS27L	8271	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	63773261	63773631	63773483	Y	LACTB,RAB8B,USP3	USP3	APH1B,RAB8B,CA12,USP3,HERC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP3	21162	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	63789918	63790251	63790145	Y	HERC1,LACTB,RAB8B,APH1B,USP3	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	4542	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	63795379	63795825	63795543	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	586	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr15	64397616	64397971	64397713	Y	SNX1	DAPK2,FAM96A,SNX1	NA	NA	NA	NA	SNX1	13294	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	64601637	64601745	64601727	Y	NA	CSNK1G1	NA	NA	NA	NA	CSNK1G1	44697	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	64753700	64753985	64753784	Y	PLEKHO2	ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	2759	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	64754012	64754177	64754162	Y	NA	ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	3071	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	65127928	65128208	65128016	Y	NA	PIF1,AC069368.3,PLEKHO2	PIF1	K562	ChIA-PET	22265404	AC069368.3	3874	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	65135268	65135743	65135404	Y	TRIP4,ZNF609,OAZ2,SPG21,SPG21,PLEKHO2	PIF1,AC069368.3,PLEKHO2	NA	NA	NA	NA	PLEKHO2	3180	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	65162702	65162861	65162782	Y	OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21	PIF1,AC069368.3,PLEKHO2,ANKDD1A	NA	NA	NA	NA	PLEKHO2	30614	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.72583072231846
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.38066457785476
chr15	65823475	65823857	65823545	Y	IGDCC4	DPP8,PTPLAD1	NA	NA	NA	NA	PTPLAD1	2719	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	65951559	65951691	65951625	Y	NA	SLC24A1	NA	NA	NA	NA	SLC24A1	49855	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	66060795	66060948	66060877	Y	NA	RAB11A,DENND4A	NA	NA	NA	NA	DENND4A	21683	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	66125063	66125305	66125185	Y	NA	DENND4A	SLC24A1,DENND4A,RAB11A,C15orf44,MEGF11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND4A	42432	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	66162838	66163256	66163114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80207	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	66993287	66993569	66993487	Y	MAP2K1,SMAD6	SMAD6	NA	NA	NA	NA	SMAD6	721	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	67077622	67077754	67077688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD6	85056	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	67095524	67095803	67095671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD6	102958	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	141882	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.8984137945503
chr15	67325888	67326210	67325950	Y	NA	SMAD3	SMAD3,SKOR1,AAGAB,IQCH,LOC100506686	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD3	27891	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	67359902	67360303	67360058	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	5801	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	4.65974295025983
chr15	67366599	67366961	67366679	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	12498	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	67393197	67393867	67393527	Y	SMAD3	SMAD3,RP11-342M21.2	NA	NA	NA	NA	SMAD3	39096	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	67399103	67399775	67399548	Y	SMAD3	SMAD3,RP11-342M21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-342M21.2	37502	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr15	67401891	67402640	67402087	Y	SMAD3	SMAD3,RP11-342M21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-342M21.2	34637	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	67413336	67413759	67413492	Y	SMAD3	RP11-342M21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-342M21.2	23518	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	67423316	67423661	67423503	Y	NA	RP11-342M21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-342M21.2	13616	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	67426476	67426864	67426547	Y	SMAD3	RP11-342M21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-342M21.2	10413	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr15	67440675	67441024	67440815	Y	SMAD3	RP11-342M21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-342M21.2	3398	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr15	67442347	67443164	67443030	Y	SMAD3	RP11-342M21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-342M21.2	5070	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr15	67490281	67490446	67490307	Y	SMAD3	RPS24P16	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	32338	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr15	67516633	67516865	67516859	Y	NA	RPS24P16,IQCH,AAGAB	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	5919	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	68132387	68132778	68132514	Y	PIAS1	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	211739	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	68588456	68588855	68588647	Y	ITGA11	CLN6,FEM1B	NA	NA	NA	NA	FEM1B	20315	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	68878617	68878894	68878756	Y	CORO2B	CORO2B	NA	NA	NA	NA	CORO2B	9309	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr15	69047234	69047604	69047293	Y	NA	NA	ITGA11,CORO2B,MIR4312,ANP32A,MIR548H4	IMR90	Hi-C	24141950	SPESP1	60956	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	69453904	69454158	69454121	Y	GLCE	GLCE	NA	NA	NA	NA	GLCE	2981	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	69650842	69650990	69650924	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF23	53595	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr15	70432931	70433327	70433204	Y	TLE3	TLE3	LOC145837,TLE3,C15orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TLE3	44416	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	70436319	70436687	70436503	Y	NA	TLE3	LOC145837,TLE3,C15orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TLE3	47804	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	70785060	70785587	70785260	Y	TLE3	NA	KIF23,LOC145837,TLE3,C15orf50,UACA	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	268345	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	70800143	70800820	70800577	Y	NA	NA	KIF23,RPLP1,TLE3	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	253112	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	70924070	70924122	70924096	Y	NA	NA	C15orf50,UACA	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	129810	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	71084406	71084742	71084644	Y	UACA,LARP6	UACA	UACA,LARP6,LRRC49	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	30474	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	71126164	71126470	71126369	Y	NA	LRRC49,LARP6	NA	NA	NA	NA	LRRC49	17108	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	71149072	71149436	71149201	Y	LARP6	LRRC49,LARP6,THAP10	NA	NA	NA	NA	LARP6	4574	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr15	71408872	71409066	71408998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	225748	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr15	71409431	71409745	71409525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	226307	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	71615809	71616164	71615988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	432685	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	71657535	71657734	71657662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	474411	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	72041767	72041974	72041871	Y	SENP8	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	362625	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	72124774	72125030	72124885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	279569	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	72198564	72199008	72198773	Y	PARP6,MYO9A,CELF6,CELF6,CELF6	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	205591	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	72518614	72519346	72519221	Y	ARIH1,PKM2	GRAMD2	NA	NA	NA	NA	GRAMD2	30488	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	72617371	72617435	72617389	Y	MYO9A,SENP8,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6	HEXA	NA	NA	NA	NA	HEXA	49382	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	74289381	74289564	74289454	Y	PML	STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	PML	4367	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	74492868	74493054	74492979	Y	NA	STRA6	NA	NA	NA	NA	STRA6	9554	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	74677413	74677899	74677622	Y	SEMA7A,SEMA7A,CSK,CLK3,ARID3B	SEMA7A	SEMA7A	K562	ChIA-PET	22265404	SEMA7A	46909	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	74908840	74909023	74908946	Y	NA	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	19999	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	75018665	75019349	75018947	Y	SCAMP2,C15orf39,CYP1A1	EDC3,CYP1A1	NA	NA	NA	NA	CYP1A1	2714	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	75069783	75070047	75069931	Y	ARID3B,CLK3,C15orf39,CSK	CSK	NA	NA	NA	NA	CSK	2351	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	75250602	75250974	75250783	Y	RPP25	COX5A,SCAMP5,RPP25	NA	NA	NA	NA	RPP25	2797	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	75288966	75289325	75289146	Y	CPLX3,ULK3,SCAMP5	SCAMP5,RPP25,PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	24571	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	75326958	75327212	75327152	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,ARID3B,CLK3,CSK,SCAMP2,C15orf39	PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	13062	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	75328661	75328897	75328778	Y	MAN2C1,C15orf39	PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	14765	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	75339281	75339878	75339595	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,SCAMP2,C15orf39	PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	25385	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	75460054	75460405	75460311	Y	NA	C15orf39	SCAMP5,PPCDC,C15orf39	IMR90	Hi-C	24141950	C15orf39	25579	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	75496316	75496728	75496439	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CSK,SCAMP2,C15orf39	C15orf39	NA	NA	NA	NA	C15orf39	10332	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	75742568	75742962	75742713	Y	NA	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	3221	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	75744907	75745094	75744993	Y	C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1089	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	75867013	75867354	75867182	Y	C15orf39,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,UBE2Q2,ODF3L1	PTPN9,SNUPN	NA	NA	NA	NA	PTPN9	2276	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	76050803	76051078	76050853	Y	NA	DNM1P35	NA	NA	NA	NA	DNM1P35	21839	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	76639120	76639380	76639270	Y	NA	ETFA,ISL2	NA	NA	NA	NA	ISL2	12055	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	78110975	78112297	78111796	Y	HMG20A,LINGO1,DNAJA4,ACSBG1	NA	NA	NA	NA	NA	LINGO1	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	79152508	79152900	79152703	Y	IREB2	RPL21P116	MORF4L1,ADAMTS7	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPL21P116	1171	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	79381600	79382164	79381699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTSH	141684	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	80211933	80212232	80212185	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1275	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	82302959	82303245	82303102	Y	NA	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	33237	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	83730539	83730760	83730650	Y	NA	BTBD1	NA	NA	NA	NA	BTBD1	3346	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	83857531	83857848	83857643	Y	AP3B2,HDGFRP3	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	16922	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	84118150	84118486	84118331	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	243380	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	85547085	85547484	85547285	Y	NA	PDE8A	NA	NA	NA	NA	PDE8A	25414	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	85662697	85662918	85662803	Y	PDE8A	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	141026	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	85861581	85861931	85861753	Y	PDE8A,AKAP13	NA	AKAP13	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP13	59871	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	85887676	85888027	85887852	Y	NA	AKAP13	AKAP13	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP13	33775	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	85956762	85957097	85956878	Y	AKAP13,PDE8A	AKAP13	NA	NA	NA	NA	AKAP13	34960	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	85987048	85987479	85987219	Y	AKAP13,AKAP13	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	65246	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	86131454	86131632	86131493	Y	AKAP13	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	204629	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	86211201	86211615	86211423	Y	AKAP13,KLHL25	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	124646	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	86267591	86267810	86267701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	68451	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	89014009	89014390	89014200	Y	NA	MRPL46,MRPS11	NA	NA	NA	NA	MRPS11	5325	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	89532902	89533939	89533555	Y	NA	NA	MFGE8,ABHD2	IMR90	Hi-C	24141950	MFGE8	78260	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	89638395	89638800	89638498	Y	ISG20,HAPLN3,ABHD2	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	ABHD2	9705	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	89663203	89663358	89663281	Y	NA	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	14368	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	89672226	89672631	89672291	Y	ABHD2	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	5095	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	89856537	89857272	89856853	Y	NA	POLG	NA	NA	NA	NA	POLG	18820	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	90005846	90006063	90005954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLG	129754	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr15	90197559	90197639	90197586	Y	KIF7	KIF7,PEX11A,WDR93	NA	NA	NA	NA	KIF7	877	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	90363996	90364798	90364610	Y	POLG,ZNF710,CIB1,ANPEP,AP3S2	ANPEP	NA	NA	NA	NA	ANPEP	7363	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	90371902	90372049	90371963	Y	ZNF710,CIB1,ANPEP,AP3S2	ANPEP	NA	NA	NA	NA	ANPEP	15269	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	90402022	90402269	90402146	Y	NA	ANPEP,AP3S2	NA	NA	NA	NA	AP3S2	33305	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	90419728	90419914	90419806	Y	ZNF710,SEMA4B,ANPEP,AP3S2	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	15660	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	90441878	90442278	90442169	Y	C15orf38	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	6304	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	90578762	90579351	90578884	Y	ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	36138	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	90701535	90701765	90701609	Y	ZNF710,SEMA4B,IQGAP1,CIB1	SEMA4B	IDH2,ZNF710,C15orf58,TTLL13,NGRN,SEMA4B,IQGAP1,CIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEMA4B	71	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	90754464	90755447	90755260	Y	SEMA4B,SEMA4B,CIB1	CIB1,TTLL13	NA	NA	NA	NA	CIB1	19832	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr15	90958026	90958305	90958134	Y	ZNF710,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	28576	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	91190174	91190180	91190177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	68192	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	91208661	91208996	91208948	Y	NA	RP11-387D10.2,BLM	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	49376	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	92404418	92404854	92404606	Y	SLCO3A1	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	9493	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	92437865	92438181	92438023	Y	ST8SIA2	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	42940	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	92486330	92486707	92486433	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	91405	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	ASB9P1	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	ASB9P1	26620	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	93374780	93375598	93375185	Y	NA	ASB9P1,CHD2	CHD2,LOC100507217,ASB9P1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ASB9P1	37903	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	93520042	93520437	93520098	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	95516	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	96867031	96867104	96867071	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	NR2F2	63	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	96867848	96868085	96868000	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	505	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	96884042	96884481	96884402	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	10985	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr15	96900187	96900329	96900243	Y	NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	4721	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	96900508	96900866	96900583	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	5042	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	99214674	99215061	99214732	Y	NA	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	24474	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	99270923	99271213	99270975	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	80723	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	99366453	99366700	99366460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	176253	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	99387029	99387216	99387183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	196829	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	100026499	100026994	100026794	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	MEF2A,LRRC28,LYSMD4	IMR90	Hi-C	24141950	MEF2A	11129	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr15	100216338	100216615	100216373	Y	MEF2A,MEF2A	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD4	55151	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr15	100651295	100651582	100651483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS17	228628	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr15	100782475	100782658	100782574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS17	97552	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	101261855	101262549	101262221	Y	NA	NA	ALDH1A3,LRRK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINS	120420	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	101741612	101741900	101741753	Y	TM2D3,CHSY1	CHSY1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	48237	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	101818299	101818511	101818407	Y	NA	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	SNRPA1	14976	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	101834172	101834455	101834316	Y	TM2D3,TARSL2,SNRPA1	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	SNRPA1	685	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	101979646	101980007	101979833	Y	PCSK6	NA	NA	NA	NA	NA	PCSK6	83398	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr15	102023301	102023573	102023437	Y	NA	PCSK6	NA	NA	NA	NA	PCSK6	39832	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	121563	121849	121614	Y	TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	RHBDF1	2505	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.20808150562292
chr16	124533	124922	124605	Y	NA	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	MPG	84	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	151121	151408	151265	Y	NA	POLR3K,RHBDF1,MPG,NPRL3	NA	NA	NA	NA	MPG	26115	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	377235	377950	377755	Y	SOLH,RHOT2,NHLRC4,AXIN1,LUC7L	AXIN1,MRPL28	NA	NA	NA	NA	AXIN1	22723	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	578748	579156	578911	Y	LUC7L	PIGQ	NA	NA	NA	NA	PIGQ	35839	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.46695611397069
chr16	756470	756692	756669	Y	NA	RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,METRN,FAM173A,HAGHL,NARFL	NA	NA	NA	NA	METRN	6423	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	1132307	1132794	1132674	Y	RAB40C,RAB40C,WDR90,CACNA1H,SSTR5	SSTR5	NA	NA	NA	NA	SSTR5	11551	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	3.71053605298468
chr16	1133120	1133226	1133175	Y	RAB40C,RAB40C,FAM195A,WDR90,CACNA1H,SSTR5	SSTR5	NA	NA	NA	NA	SSTR5	12364	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr16	1344323	1344595	1344461	Y	NA	UBE2I,BAIAP3	UNKL	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2I	8953	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	1347371	1347380	1347376	Y	NA	UBE2I,BAIAP3	NA	NA	NA	NA	UBE2I	6168	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	1349375	1349723	1349678	Y	NA	UBE2I,BAIAP3	NA	NA	NA	NA	UBE2I	3825	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	1979729	1980160	1979842	Y	TSC2,MLST8,DNASE1L2,C16orf79,ABCA3,CCDC154,NME3,NUBP2,TBL3,RNF151	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3	NUBP2,FAHD1,IGFALS,C16orf73,HS3ST6,MAPK8IP3,SPSB3,EME2,NME3,MRPS34,HAGH,LINC00254	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB10	27349	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	2057818	2059084	2058234	Y	TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598	SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr16	2065446	2065768	2065545	Y	NA	TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	RAB26	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC9A3R2	7589	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr16	2478608	2478672	2478640	Y	RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2	CCNF,C16orf59,TBC1D24	NA	NA	NA	NA	CCNF	1213	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	2845811	2846048	2845884	Y	OR1F1,ZNF200,ZNF200,ZNF200,MEFV,ATP6V0C,ATP6V0C,PDPK1,SRRM2	SRRM2,TCEB2,PRSS21	NA	NA	NA	NA	PRSS21	19116	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr16	2885761	2886144	2885824	Y	NA	PRSS21,FLYWCH2	NA	NA	NA	NA	PRSS21	20597	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FLYWCH2	12914	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr16	3053798	3054225	3053960	Y	NA	PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1,MMP25	NA	NA	NA	NA	TNFRSF12A	12221	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	3156056	3156304	3156227	Y	PAQR4,OR2C1,CLUAP1,OR1F1	IL32,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	4257	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	IL32,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr16	3202363	3202472	3202417	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	24585	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	3237977	3238591	3238121	Y	NA	ZNF200	ZNF200	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF200	45630	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	3414643	3415237	3414919	Y	NA	MTRNR2L4,ZNF174	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L4	5046	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.121789969507
chr16	3730332	3730635	3730484	Y	NA	TRAP1	NA	NA	NA	NA	TRAP1	34963	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	3931357	3931444	3931401	Y	C16orf90	CREBBP	NA	NA	NA	NA	CREBBP	2630	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr16	4349200	4349352	4349284	Y	NA	TFAP4	ADCY9,TFAP4,CREBBP,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	28124	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	4357393	4358110	4357824	Y	CORO7	TFAP4,PAM16	ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	36317	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	4424244	4424335	4424249	Y	CREBBP,UBN1,UBN1,MGRN1,CORO7,GLIS2	PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	VASN	4395	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	4818680	4818913	4818758	Y	C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI	C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI	NA	NA	NA	NA	ZNF500	3055	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	6882597	6882937	6882663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1736788	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	8939360	8939674	8939516	Y	USP7	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	21192	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	8985326	8985575	8985451	Y	NA	CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	24460	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	10221722	10221780	10221751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF7IP2	196511	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	10973961	10974260	10974041	Y	EMP2,CIITA	CIITA	NA	NA	NA	NA	CIITA	4906	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	11295999	11296122	11296015	Y	SNN,LITAF,LITAF,NUBP1,CIITA,SOCS1	RMI2	NA	NA	NA	NA	RMI2	45354	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	11345704	11346020	11345999	Y	NA	RMI2,SOCS1	NA	NA	NA	NA	SOCS1	2016	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	11409407	11409806	11409472	Y	NA	NA	CLEC16A	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	61371	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	11489659	11490054	11489857	Y	NA	NA	BCAR4,LITAF,TXNDC11,SNN	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	141623	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	11591931	11591962	11591945	Y	NA	NA	SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	136275	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	11968147	11968344	11968329	Y	ZC3H7A	RSL1D1,GSPT1	RSL1D1	IMR90	Hi-C	24141950	RSL1D1	24705	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	12008398	12008797	12008598	Y	NA	GSPT1	NA	NA	NA	NA	GSPT1	459	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr16	14423689	14423899	14423743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	260511	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	14424623	14424858	14424825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	261445	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	15085192	15085402	15085309	Y	C16orf45	PDXDC1	NTAN1	IMR90	Hi-C	24141950	PDXDC1	18744	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	15140552	15140757	15140655	Y	NA	NTAN1	NA	NA	NA	NA	NTAN1	7164	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	15576237	15576428	15576343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf45	50085	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	15615028	15616079	15615654	Y	KIAA0430	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf45	88876	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	15670640	15671032	15670885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0430	63991	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr16	15684514	15685137	15684868	Y	NDE1,NDE1,KIAA0430	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	KIAA0430	49886	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr16	15738027	15738375	15738313	Y	NA	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	2903	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	15769690	15769796	15769712	Y	NA	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	34566	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	16081407	16081580	16081462	Y	NDE1	ABCC1	NA	NA	NA	NA	ABCC1	39973	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	19106464	19106699	19106563	Y	NA	COQ7,ITPRIPL2	NA	NA	NA	NA	ITPRIPL2	16555	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	20729381	20729771	20729568	Y	LYRM1,DCUN1D3	THUMPD1	NA	NA	NA	NA	THUMPD1	21635	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	21295163	21295477	21295440	Y	NA	CRYM-AS1,CRYM	NA	NA	NA	NA	CRYM-AS1	14693	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	21313038	21313456	21313158	Y	NA	CRYM-AS1,CRYM	NA	NA	NA	NA	CRYM	634	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	21611842	21611954	21611919	Y	CRYM,IGSF6,METTL9	METTL9	NA	NA	NA	NA	METTL9	5303	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	21637887	21638686	21638408	Y	CRYM,METTL9,IGSF6	METTL9	NA	NA	NA	NA	METTL9	31348	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	22046502	22046742	22046619	Y	NA	C16orf52	NA	NA	NA	NA	C16orf52	29543	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr16	22406960	22407340	22407096	Y	NA	SMG1P1,CDR2,RRN3P3	POLR3E,CDR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMG1P1	38989	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	22421466	22421891	22421890	Y	NA	SMG1P1,CDR2,RRN3P3	NA	NA	NA	NA	SMG1P1	24438	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	22767811	22767852	22767832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRN3P3	320775	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	23516061	23516396	23516252	Y	PRKCB,GGA2	GGA2,UBFD1	NA	NA	NA	NA	GGA2	14920	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	24879548	24879926	24879737	Y	SLC5A11	NA	ARHGAP17	IMR90	Hi-C	24141950	TNRC6A	140532	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	25005690	25005854	25005767	Y	NA	ARHGAP17	NA	NA	NA	NA	ARHGAP17	19133	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	25025498	25025977	25025718	Y	NA	ARHGAP17	NA	NA	NA	NA	ARHGAP17	511	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	25072371	25072507	25072437	Y	SLC5A11	ARHGAP17,LCMT1	LCMT1,LOC100506655	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP17	47384	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	27577101	27577365	27577280	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	KIAA0556	17647	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	27620703	27620731	27620720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0556	61249	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	28160349	28160575	28160437	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	NA	NA	NA	NA	NA	XPO6	60666	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	29126776	29127012	29126904	Y	SPNS1	RRN3P2	NA	NA	NA	NA	RRN3P2	42613	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	30427925	30428543	30428281	Y	HIRIP3,ZNF48	TBC1D10B,ZNF48,ZNF771,SNORA42,DCTPP1,SEPHS2	NA	NA	NA	NA	SNORA42	537	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	3.19278683628914
chr16	30825606	30826012	30825883	Y	NA	ZNF629	ZNF629,RNF40,MIR4519	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF629	29083	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr16	31264985	31265278	31265093	Y	STX4,ZNF668,ZNF646,MYST1,ITGAX,PYCARD,ITGAM	NA	NA	NA	NA	NA	PYCARD	52214	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	31888684	31889219	31888998	Y	ARMC5,ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	5605	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	31905713	31906088	31906002	Y	ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	22634	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr16	33509690	33509798	33509723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	1626611	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	33959236	33959284	33959270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2076157	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	34956727	34956933	34956830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	3073648	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	46671518	46671564	46671541	Y	NA	SHCBP1,VPS35,ORC6	NA	NA	NA	NA	SHCBP1	17980	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	48417730	48418013	48418003	Y	N4BP1,SIAH1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	62300	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	50101332	50101352	50101341	Y	NA	HEATR3	NA	NA	NA	NA	HEATR3	3480	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	50236881	50237262	50237048	Y	NA	ADCY7	NA	NA	NA	NA	ADCY7	40786	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	51670868	51671078	51670973	Y	NA	HNRNPA1P48	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P48	6589	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	51795949	51796284	51796182	Y	NA	NA	SALL1,CYLD,LOC388276	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPA1P48	118282	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	51797343	51797505	51797414	Y	NA	NA	SALL1,CYLD,LOC388276	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPA1P48	119676	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	51909181	51909528	51909355	Y	NA	NA	SALL1	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPA1P48	231514	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	53075249	53075847	53075790	Y	NA	CHD9	CHD9	IMR90	Hi-C	24141950	CHD9	11098	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	53077641	53077824	53077723	Y	NA	CHD9	CHD9	IMR90	Hi-C	24141950	CHD9	9121	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr16	53086726	53087108	53087065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	53095278	53095286	53095282	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	8333	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	53908172	53908236	53908205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTO	172297	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	57422451	57422745	57422598	Y	CCL17	NA	NA	NA	NA	NA	COQ9	56592	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	57541705	57541726	57541715	Y	NA	POLR2C,DOK4,CCDC102A	POLR2C,DOK4,COQ9,CIAPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	DOK4	22466	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	57564039	57564411	57564096	Y	ZNF319,GPR114	DOK4,CCDC102A	NA	NA	NA	NA	CCDC102A	4100	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	57717053	57717380	57717096	Y	FAM192A,ZNF319,GPR97	CCDC135	NA	NA	NA	NA	CCDC135	9325	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.63953918620253
chr16	57841964	57842337	57842236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIFC3	52620	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr16	57924208	57924586	57924493	Y	NA	KIFC3	NA	NA	NA	NA	KIFC3	29251	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	57927623	57928192	57928041	Y	GPR97,ZNF319	KIFC3	NA	NA	NA	NA	KIFC3	32666	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	65020062	65020376	65020219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00920	1420051	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	66555983	66556387	66556198	Y	CKLF	TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1	NA	NA	NA	NA	TK2	28060	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr16	66587187	66587393	66587288	Y	NA	TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1,CMTM3	NA	NA	NA	NA	CKLF-CMTM1	2697	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	66784501	66784840	66784671	Y	NA	DYNC1LI2	NA	NA	NA	NA	DYNC1LI2	800	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr16	66960903	66961306	66961106	Y	PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD	RRAD,FAM96B,CES2,CES3	NA	NA	NA	NA	RRAD	3356	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	67250789	67251131	67250954	Y	NA	NOL3,KIAA0895L,E2F4,LRRC29,TMEM208,FHOD1	NA	NA	NA	NA	LRRC29	7820	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	67561753	67561884	67561820	Y	HSF4,SLC9A5,TPPP3,FAM65A	ATP6V0D1,FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	FAM65A	11432	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	67689330	67689673	67689514	Y	NA	RLTPR,ACD,PARD6A,C16orf86	NA	NA	NA	NA	ACD	3040	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	67892470	67892795	67892734	Y	RLTPR,ACD,NFATC3,EDC4,THAP11	THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,PSKH1	NA	NA	NA	NA	EDC4	12131	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	68113537	68113949	68113713	Y	SLC7A6OS,RLTPR,RANBP10,PSMB10,DPEP2,NFATC3	NFATC3	NA	NA	NA	NA	NFATC3	2705	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	68268995	68269119	68269015	Y	NA	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	886	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	1343	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.03549843339107
chr16	69345968	69346332	69346034	Y	NA	VPS4A,PDF,NIP7,COG8	NA	NA	NA	NA	VPS4A	2709	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	69432325	69432475	69432421	Y	TERF2	TERF2,CYB5B	NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TERF2	7999	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr16	69442470	69442627	69442557	Y	NA	TERF2,CYB5B	NFAT5,CYB5B	IMR90	Hi-C	24141950	TERF2	1996	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	69444205	69444538	69444372	Y	NA	TERF2,CYB5B	NFAT5,CYB5B,TERF2,COG8,NIP7,TMED6,MIR1538,NQO1,WWP2,NOB1	IMR90	Hi-C	24141950	TERF2	3731	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	69506405	69506529	69506498	Y	NA	CYB5B	NA	NA	NA	NA	CYB5B	49977	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	69516681	69516730	69516706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB5B	60253	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr16	69563572	69563696	69563627	Y	NA	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	33301	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr16	69564577	69564882	69564731	Y	WWP2	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	32115	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr16	69751128	69751528	69751345	Y	PDF,TERF2,NQO1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NQO1	7326	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr16	69761641	69762033	69761837	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NQO1	2787	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	69777344	69777472	69777408	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NOB1	9371	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr16	70356792	70356812	70356803	Y	NA	AARS,DDX19B,DDX19A	NA	NA	NA	NA	DDX19A	21920	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	71931018	71931097	71931057	Y	DHX38,ATXN1L,KIAA0174	ZNF821	NA	NA	NA	NA	ZNF821	3779	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	72958517	72958769	72958627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	132828	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	72966138	72966319	72966212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	125278	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	73102955	73103191	73103082	Y	ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	11358	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	73104505	73104770	73104567	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	12908	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr16	74353064	74353398	74353241	Y	FA2H	PSMD7,RP11-252A24.2	NA	NA	NA	NA	PSMD7	24391	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr16	74772099	74772485	74772392	Y	NA	MLKL,FA2H	NA	NA	NA	NA	FA2H	34244	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	74774732	74775110	74775064	Y	FA2H	MLKL,FA2H	NA	NA	NA	NA	FA2H	31619	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr16	74777612	74777799	74777727	Y	NA	MLKL,FA2H	NA	NA	NA	NA	FA2H	28930	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr16	75278988	75279894	75279594	Y	CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	20057	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr16	75411958	75412267	75412159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFDP1	53116	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	75628076	75628219	75628207	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2,ADAT1	NA	NA	NA	NA	ADAT1	26979	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	76269107	76269317	76269211	Y	NA	RPL18P13	NA	NA	NA	NA	RPL18P13	1586	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr16	80401381	80401567	80401473	Y	NA	NA	WWOX	IMR90	Hi-C	24141950	DYNLRB2	171064	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	80571434	80571574	80571570	Y	NA	DYNLRB2	DYNLRB2	K562	ChIA-PET	22265404	DYNLRB2	1057	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	80648932	80649251	80648956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLRB2	76301	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	80694679	80694985	80694832	Y	CDYL2	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLRB2	122048	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	80838768	80839127	80839024	Y	CENPN,C16orf61,ATMIN,CDYL2	CDYL2	NA	NA	NA	NA	CDYL2	2542	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	81038389	81038511	81038494	Y	NA	CENPN,ATMIN	NA	NA	NA	NA	CENPN	286	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	81309341	81309748	81309489	Y	NA	BCMO1,GAN	GAN	IMR90	Hi-C	24141950	GAN	36809	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	81649296	81649780	81649593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	120922	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	81659842	81660553	81660320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	110149	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	81660645	81660993	81660973	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	109709	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	81875278	81875726	81875461	Y	PLCG2	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	104576	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	81876424	81876656	81876582	Y	CMIP,CMIP,PLCG2	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	105722	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	82071348	82071461	82071424	Y	HSD17B2	SDR42E1,HSD17B2	NA	NA	NA	NA	HSD17B2	4739	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	82084098	82084340	82084124	Y	NA	SDR42E1,HSD17B2	NA	NA	NA	NA	HSD17B2	17489	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr16	82172740	82172851	82172799	Y	SDR42E1	MPHOSPH6	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH6	28980	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	82687467	82688028	82687715	Y	NA	NA	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MPHOSPH6	485636	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	84624738	84624752	84624744	Y	HSDL1,COTL1	COTL1	NA	NA	NA	NA	COTL1	24931	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	84628696	84628964	84628830	Y	ZDHHC7,KIAA0513,KLHL36,CRISPLD2,COTL1	COTL1	NA	NA	NA	NA	COTL1	20719	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	84633541	84633938	84633771	Y	NA	COTL1,KLHL36	NA	NA	NA	NA	COTL1	15745	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	84636685	84637090	84636875	Y	ZDHHC7,KIAA0513,HSDL1,CRISPLD2,COTL1	COTL1,KLHL36	NA	NA	NA	NA	COTL1	12593	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	85038009	85038299	85038256	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	4842	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	85185210	85185759	85185517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	125835	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	85586399	85586765	85586561	Y	KIAA0182,KIAA0182,GINS2	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134914	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	85586938	85587370	85587020	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134309	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr16	86609499	86609840	86609550	Y	FOXC2	MTHFSD,FOXC2,FOXL1	NA	NA	NA	NA	FOXL1	1525	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	86619952	86620235	86620073	Y	FOXC2	MTHFSD,FOXC2,FOXL1	NA	NA	NA	NA	FOXL1	11978	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	86653031	86653193	86653112	Y	NA	FOXL1	FOXL1,FOXC2	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	45057	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	86698129	86698417	86698281	Y	NA	NA	FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,FOXC2,C16orf95,FBXO31	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	90155	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr16	86698644	86698785	86698699	Y	FOXL1	NA	FOXL1,C16orf95,MTHFSD,FLJ30679,FOXC2	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	90670	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.29437304173884
chr16	86775121	86775409	86775225	Y	NA	NA	FOXC2,FOXL1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	167147	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr16	86795224	86795595	86795410	Y	NA	NA	FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,C16orf95,FOXC2,FBXO31	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	187250	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	87428114	87428209	87428177	Y	NA	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	FBXO31	4366	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	87773499	87773902	87773849	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	23696	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	87781357	87781475	87781397	Y	C16orf95	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	16123	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	87811234	87811383	87811309	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	13636	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	87823236	87823449	87823367	Y	FBXO31,CA5A	KLHDC4	JPH3,KLHDC4,ZCCHC14,SLC7A5,CA5A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	25638	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	87839693	87840050	87839856	Y	SLC7A5	KLHDC4	SLC7A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLHDC4	42095	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	87840547	87840941	87840913	Y	SLC7A5	KLHDC4	SLC7A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLHDC4	42949	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	87886258	87886670	87886593	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	14424	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr16	88338212	88338634	88338285	Y	ZNF469	NA	BANP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	179091	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	88837093	88837695	88837443	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	11924	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr16	88866491	88866710	88866640	Y	ACSF3,CBFA2T3	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	CDT1	911	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	89126677	89126907	89126800	Y	CBFA2T3	CTD-2555A7.2,ACSF3	CBFA2T3,ACSF3,CDH15,PIEZO1,LOC400558,SLC22A31	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2555A7.2	9304	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	89313669	89314138	89313993	Y	ZNF276,ZNF778	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	31551	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	89380978	89381130	89380989	Y	ZNF276,ZNF276,SPATA2L,ANKRD11,ZNF778	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	98860	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	89382240	89382290	89382256	Y	ZNF276,ZNF276,SPATA2L,ANKRD11,ZNF778	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	100122	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	89410388	89410772	89410415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	128270	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr16	89474257	89474602	89474526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	80367	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.46695611397069
chr16	89557852	89558189	89558050	Y	NA	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	2527	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	89564919	89565211	89565067	Y	NA	ANKRD11,SPG7	ANKRD11,SPG7	IMR90	Hi-C	24141950	SPG7	9594	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	89571786	89572109	89572034	Y	ACSF3,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	16461	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr16	89573610	89573931	89573734	Y	NA	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	18285	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr16	89579992	89580270	89580045	Y	ACSF3,ZNF778,DBNDD1,ZNF276,SPG7	ANKRD11,SPG7,RPL13,SNORD68	NA	NA	NA	NA	SPG7	24667	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr16	89688213	89688598	89688406	Y	NA	CPNE7,DPEP1,CHMP1A	NA	NA	NA	NA	DPEP1	10497	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr16	89904172	89904600	89904272	Y	MC1R,SPIRE2	FANCA,SPIRE2,TCF25	NA	NA	NA	NA	SPIRE2	21585	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr16	90024486	90024764	90024610	Y	NA	MC1R,AC092143.1,TUBB3,DEF8,CENPBD1,AFG3L1P	NA	NA	NA	NA	DEF8	12153	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr17	873777	873849	873813	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	7161	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	1011015	1011228	1011147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM22	112658	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	1014015	1014933	1014151	Y	PITPNA,CRK,ABR	NA	NA	NA	NA	NA	ABR	115382	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	1157102	1157245	1157179	Y	NA	ABR	ABR,YWHAE,PITPNA,INPP5K,LOC100306951,SCARF1,RILP,TUSC5,BHLHA9,CRK,SLC43A2	IMR90	Hi-C	24141950	ABR	26787	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	1171565	1171808	1171610	Y	WDR81,PITPNA,ABR,ABR	ABR	NA	NA	NA	NA	ABR	41250	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	1254718	1255084	1255034	Y	NA	YWHAE	NA	NA	NA	NA	YWHAE	46588	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	1390195	1390341	1390268	Y	MYO1C,MYO1C,MYO1C	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	3765	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.121789969507
chr17	1533068	1533815	1533453	Y	CRK,INPP5K,WDR81,WDR81,WDR81,PITPNA,SLC43A2,SCARF1	SLC43A2,RILP	NA	NA	NA	NA	SLC43A2	2888	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	1620806	1621089	1620895	Y	PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81	PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG	NA	NA	NA	NA	MIR22HG	2338	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr17	1773985	1774184	1774050	Y	SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,WDR81,WDR81,SMYD4	RPA1,SMYD4,AC016292.3	NA	NA	NA	NA	AC016292.3	14245	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	1241	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	2087949	2088276	2088112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	116401	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	2198811	2198924	2198868	Y	NA	SRR,SMG6,SGSM2,TSR1	NA	NA	NA	NA	SRR	5753	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	2299235	2299531	2299372	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	2881	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	2300026	2300553	2300288	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	1859	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr17	2302108	2302510	2302261	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	NA	NA	NA	NA	NA	MNT	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr17	2305266	2305571	2305415	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	2854	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	2614073	2614260	2614119	Y	KIAA0664	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	64090	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr17	4244674	4245003	4244975	Y	NA	UBE2G1	NA	NA	NA	NA	UBE2G1	22920	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	6542489	6542952	6542608	Y	NA	TXNDC17,KIAA0753,MED31,C17orf100	NA	NA	NA	NA	KIAA0753	242	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	6660646	6660876	6660666	Y	NA	XAF1	NA	NA	NA	NA	XAF1	3880	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	6897797	6898308	6898020	Y	NA	AC027763.2,RNASEK,C17orf49,SLC16A13	NA	NA	NA	NA	AC027763.2	15360	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	6925152	6925653	6925481	Y	PLSCR3,C17orf49,BCL6B	AC027763.2,RNASEK,C17orf49,SLC16A13	NA	NA	NA	NA	C17orf49	9338	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	7381310	7382154	7381844	Y	KCTD11,TNK1,SOX15,KDM6B,ZBTB4,ZBTB4	TMEM102,CHRNB1,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	ZBTB4	3428	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	7389589	7389989	7389739	Y	C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A	CHRNB1,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	POLR2A	3904	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr17	7657457	7657665	7657600	Y	NLGN2,AMAC1L3,WRAP53	NA	NA	NA	NA	NA	EFNB3	50937	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	7737438	7738736	7737971	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	2486	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	608	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4115	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4693	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	2.07099686678215
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	5769	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	2.41616301124584
chr17	7781804	7782205	7782005	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,KCNAB3	NA	NA	NA	NA	CHD3	3919	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	HES7	4224	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	8041932	8042438	8042328	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	15386	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	8057335	8058055	8057702	Y	KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59	HES7,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	8090038	8090540	8090163	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	1024	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	8090795	8091158	8090849	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	406	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr17	8672520	8672694	8672607	Y	ODF4,CCDC42,SPDYE4,MFSD6L	NA	NA	NA	NA	NA	MYH10	140441	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	11928413	11928725	11928507	Y	NA	ZNF18,MAP2K4	NA	NA	NA	NA	MAP2K4	6272	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	14105008	14105251	14105153	Y	COX10,HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	97149	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	15862469	15862773	15862614	Y	ADORA2B,ZSWIM7,TTC19	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	16238	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	15923170	15923610	15923287	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	22139	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	15925215	15925448	15925362	Y	ZNF286A,NCOR1	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	24184	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	15959345	15959465	15959410	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	58314	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	16189250	16189597	16189494	Y	NCOR1,TRPV2	NA	NA	NA	NA	NA	CENPV	65373	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	16191035	16191327	16191109	Y	TRPV2	NA	CENPV	IMR90	Hi-C	24141950	CENPV	63643	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	16319642	16320463	16320033	Y	NA	UBB,TRPV2	NA	NA	NA	NA	TRPV2	2786	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	16375722	16375971	16375775	Y	TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	17496	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	16438910	16439232	16439111	Y	NA	FAM211A,ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	31288	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	16440164	16440317	16440266	Y	ZNF624,CCDC144A	FAM211A,ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	30203	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr17	16924574	16924970	16924629	Y	NA	MPRIP	FLCN,MPRIP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MPRIP	18889	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	16944636	16944769	16944688	Y	NA	MPRIP	NA	NA	NA	NA	MPRIP	777	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	16948336	16948515	16948428	Y	ZNF287,ZNF624,PLD6,NT5M,MED9,FLCN,COPS3,COPS3,MPRIP	MPRIP	NA	NA	NA	NA	MPRIP	4477	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr17	17484274	17484547	17484424	Y	NA	PEMT	NA	NA	NA	NA	PEMT	8475	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	17601204	17601406	17601306	Y	NA	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	18417	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	17725605	17725781	17725666	Y	NA	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	12544	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	17874756	17875050	17874778	Y	NA	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	LRRC48	629	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	18804175	18804500	18804326	Y	PRPSAP2	NA	NA	NA	NA	NA	PRPSAP2	62777	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	19141562	19141875	19141665	Y	RNF112,EPN2	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD3D	127613	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	19656390	19656618	19656531	Y	MAPK7,MAPK7	ALDH3A1	NA	NA	NA	NA	ALDH3A1	6134	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	19834604	19834673	19834639	Y	NA	AKAP10	NA	NA	NA	NA	AKAP10	44983	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	20688064	20688832	20688343	Y	NA	OLA1P2,SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	2106	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	20943914	20944165	20944106	Y	NA	USP22	NA	NA	NA	NA	USP22	908	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	21188812	21189500	21189174	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	2828	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	2.58874608347768
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	25410571	25410806	25410743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208296	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	25659975	25660361	25659997	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40873	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	25672386	25672687	25672621	Y	NA	NA	KSR1,MIR4522,WSB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	53284	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.46695611397069
chr17	25707009	25707412	25707348	Y	NA	NA	KSR1	IMR90	Hi-C	24141950	KSR1	74258	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	25805507	25805777	25805623	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	23837	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	25821729	25821988	25821800	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	40059	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	26368091	26368384	26368254	Y	NA	NLK	NA	NA	NA	NA	NLK	1328	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	26712546	26712820	26712749	Y	NA	POLDIP2,TMEM199,SARM1,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	SLC46A1	19395	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	26718724	26718918	26718801	Y	FOXN1,C17orf63,SEBOX,SARM1	POLDIP2,TMEM199,SARM1,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	SLC46A1	13297	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	27116093	27116114	27116106	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	47091	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	27129097	27129445	27129306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERAL1	50511	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	27138672	27138846	27138777	Y	NA	ERAL1	NA	NA	NA	NA	ERAL1	41110	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	27220048	27220212	27220121	Y	NA	ERAL1,FLOT2,DHRS13	NA	NA	NA	NA	FLOT2	2485	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	27255195	27255444	27255376	Y	PHF12,NUFIP2,UNC119,SDF2,PROCA1,NEK8,FLOT2	FLOT2,DHRS13,PHF12	NA	NA	NA	NA	PHF12	21345	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	27439260	27439514	27439393	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO18A	65916	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	27475765	27476166	27476073	Y	NEK8,PHF12	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	29264	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	27506307	27506816	27506504	Y	TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	877	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	27530741	27530989	27530946	Y	NA	MYO18A	MYO18A,TAOK1,NUFIP2	IMR90	Hi-C	24141950	MYO18A	25311	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	27619094	27619880	27619581	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	27824938	27824945	27824941	Y	TIAF1,MYO18A,TAOK1,EFCAB5,ANKRD13B	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I13	66125	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	28210608	28210734	28210655	Y	NA	SSH2	NA	NA	NA	NA	SSH2	44560	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	28258246	28258478	28258304	Y	NA	SSH2	NA	NA	NA	NA	SSH2	2952	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	28431711	28432027	28431733	Y	NA	NSRP1	NA	NA	NA	NA	NSRP1	8512	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	28928053	28928382	28928251	Y	NA	SMURF2P1	NA	NA	NA	NA	SMURF2P1	2239	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	29609076	29609437	29609257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NF1	189131	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	29637373	29637640	29637434	Y	CRLF3,EVI2A	NA	NA	NA	NA	NA	NF1	217428	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	29787763	29788137	29787829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NF1	367818	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP6	349393	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	30724674	30725107	30724769	Y	RHOT1	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	44172	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	30778136	30778420	30778202	Y	ZNF207	PSMD11,CDK5R1	NA	NA	NA	NA	PSMD11	8857	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	32365538	32365912	32365713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF830	920637	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	33349623	33350064	33349994	Y	SLFN5,SLFN12L,CCT6B,ZNF830,RFFL	LIG3,CCT6B	NA	NA	NA	NA	CCT6B	43526	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	33373543	33373969	33373834	Y	SLFN5,SLFN12L,CCT6B,ZNF830	RFFL	NA	NA	NA	NA	RFFL	40369	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	33383216	33383365	33383329	Y	SLFN5,RFFL	RFFL	NA	NA	NA	NA	RFFL	30973	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	33414530	33415581	33415167	Y	SLFN5,ZNF830,RFFL	RFFL,RAD51D	NA	NA	NA	NA	RFFL	192	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	33572314	33572864	33572356	Y	NA	SLFN5	NA	NA	NA	NA	SLFN5	4259	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr17	33577736	33577912	33577824	Y	ZNF830,RFFL,SLFN5	SLFN5	NA	NA	NA	NA	SLFN5	9681	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	33786708	33787098	33786905	Y	NA	SLFN12,SLFN13	NA	NA	NA	NA	SLFN13	12852	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	33787408	33787803	33787736	Y	ZNF830,SLFN5,CCL5,SLFN12L	SLFN12,SLFN13	NA	NA	NA	NA	SLFN13	13552	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	33868194	33868343	33868266	Y	RFFL,SLFN5,SLFN11,SLFN12L,CCL5	AP2B1,PEX12	NA	NA	NA	NA	AP2B1	34722	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	34219582	34220299	34219858	Y	CCL5,CCL3L3,CCL3L1,CCL4,CCL3,CCL23	CCL5,RDM1	NA	NA	NA	NA	CCL5	13785	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	34227790	34227961	34227895	Y	SLFN12L,CCL5	CCL5,RDM1	NA	NA	NA	NA	CCL5	21993	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	34838937	34839070	34839023	Y	NA	ZNHIT3,PIGW	NA	NA	NA	NA	ZNHIT3	1403	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	35281857	35282039	35281949	Y	LHX1	RP11-445F12.1,AATF	NA	NA	NA	NA	RP11-445F12.1	9921	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	35292129	35292558	35292512	Y	ACACA,LHX1,AATF	RP11-445F12.1,AATF	NA	NA	NA	NA	RP11-445F12.1	169	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	4.31457680579614
chr17	35296825	35297078	35296886	Y	LHX1	RP11-445F12.1,AATF	NA	NA	NA	NA	RP11-445F12.1	4865	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	35520107	35520138	35520123	Y	ACACA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215932	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	36101828	36102076	36101951	Y	DDX52,HNF1B	RP11-115K3.1,HNF1B	NA	NA	NA	NA	RP11-115K3.1	1130	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	36102823	36103051	36102995	Y	ACACA,DDX52,HNF1B	RP11-115K3.1,HNF1B	NA	NA	NA	NA	RP11-115K3.1	155	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr17	36103612	36103841	36103732	Y	HNF1B	RP11-115K3.1,HNF1B	NA	NA	NA	NA	HNF1B	375	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	36412216	36412471	36412263	Y	NA	RP11-1407O15.2,MRPL45	NA	NA	NA	NA	RP11-1407O15.2	7387	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	36571646	36572076	36571709	Y	C17orf96	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	10586	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	36585417	36585600	36585486	Y	ARHGAP23	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	2755	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	36597301	36597559	36597449	Y	NA	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	14639	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	36859229	36859333	36859332	Y	NA	C17orf96,MLLT6,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	MLLT6	462	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	37366071	37366159	37366135	Y	STAC2	CACNB1,RPL19	NA	NA	NA	NA	RPL19	11535	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	37558786	37559227	37559071	Y	NA	FBXL20,MED1	NA	NA	NA	NA	FBXL20	2010	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	37621502	37621553	37621528	Y	NA	MED1,CDK12	NA	NA	NA	NA	CDK12	5738	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	37661852	37662117	37661985	Y	STAC2,FBXL20,MED1,CDK12	CDK12	NA	NA	NA	NA	CDK12	46088	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	37896808	37897181	37897022	Y	GRB7,GRB7,GRB7,GRB7	PGAP3,MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	4628	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	18231	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr17	38264417	38264842	38264667	Y	WIPF2,RARA,RARA,NR1D1	MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	9439	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	38477236	38480096	38479169	Y	IKZF3,ZPBP2,CASC3,WIPF2,CCR7,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	13792	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	38481659	38482183	38482002	Y	IKZF3,WIPF2,CCR7,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	18215	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	38509274	38509600	38509311	Y	NA	RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	45830	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	38601076	38601487	38601191	Y	GJD3,IGFBP4	TOP2A,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	3374	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	38674878	38675250	38674921	Y	TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4	TNS4	IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS4	19029	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	39682585	39682843	39682821	Y	JUP,KRTAP4-11,KRT19	KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	25	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	39683248	39683750	39683386	Y	NA	KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	688	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr17	39685394	39685532	39685463	Y	KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9	KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	2834	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	39686458	39686891	39686666	Y	KRT19	KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	3898	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	39703664	39703881	39703736	Y	NA	KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	21104	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	39703962	39704520	39704217	Y	NA	KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	21402	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.121789969507
chr17	39807728	39808143	39807934	Y	JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093	MCF7	ChIA-PET	22265404	EIF1	34994	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	39822130	39822941	39822323	Y	NA	EIF1,GAST	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	20196	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	39835188	39835696	39835517	Y	RAB5C,NKIRAS2,DHX58,EIF1	EIF1,GAST	SMARCE1,KRT222,KRT28,KRT26,KRT27,TMEM99,KRT10,KRT20,KRTAP3-2,KRTAP3-3,KRT19,EIF1,HAP1,JUP	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EIF1	7441	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	39949517	39949745	39949566	Y	KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	8334	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	40539110	40539537	40539349	Y	NA	STAT3,PTRF	NA	NA	NA	NA	STAT3	524	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	40942176	40942529	40942199	Y	NA	EZH1,RAMP2,VPS25,WNK4,PSME3,BECN1	NA	NA	NA	NA	WNK4	11480	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	41409196	41409569	41409556	Y	TMEM106A	TMEM106A	IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM106A	47342	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	41546701	41546836	41546769	Y	NA	DHX8	DHX8,ARL4D,LOC100130581	IMR90	Hi-C	24141950	DHX8	12397	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	41827198	41827473	41827372	Y	NA	DUSP3	NA	NA	NA	NA	DUSP3	26883	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	42173050	42173151	42173101	Y	TMEM101,G6PC3	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25919	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	42215472	42215904	42215679	Y	C17orf53	HDAC5,C17orf53,TMUB2	C17orf53	MCF7	ChIA-PET	22265404	C17orf53	1370	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	42245888	42246083	42245988	Y	NA	HDAC5,C17orf53,TMUB2,ATXN7L3	NA	NA	NA	NA	TMUB2	16255	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	3.27907837240507
chr17	42278333	42278607	42278473	Y	ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	2852	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	42634020	42634172	42634095	Y	TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2	FZD2	NA	NA	NA	NA	FZD2	1095	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1,ADAM11	NA	NA	NA	NA	RP11-1072C15.1	2016	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	43170304	43170536	43170449	Y	ADAM11,HIGD1B,GFAP	NMT1,DCAKD,ACBD4,PLCD3	NA	NA	NA	NA	DCAKD	33831	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	43200086	43200194	43200154	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2	NA	NA	NA	NA	ACBD4	7773	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	43201428	43201633	43201517	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2	NA	NA	NA	NA	ACBD4	6334	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	43249989	43250354	43250021	Y	ADAM11,HIGD1B,GFAP,DCAKD	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2,FMNL1	NA	NA	NA	NA	HEXIM2	13922	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	43309202	43309383	43309263	Y	MAP3K14,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	12391	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	44131950	44132178	44132002	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	162202	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	44198532	44198560	44198547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	228784	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	44234299	44234706	44234578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	264551	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	44240473	44240874	44240856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	270725	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MAPT	374423	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr17	44847625	44847956	44847902	Y	WNT3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	50092	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	44848199	44848613	44848371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	50666	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr17	45609469	45609601	45609554	Y	NA	NPEPPS	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	11161	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr17	45771013	45771467	45771041	Y	NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1	KPNB1	NA	NA	NA	NA	KPNB1	46171	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	45980057	45980402	45980230	Y	NA	SP6,SP2,AC003665.1,PNPO	NA	NA	NA	NA	SP2	8541	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	45983662	45984115	45983847	Y	CDK5RAP3	SP2,AC003665.1,PNPO,PRR15L	PNPO	IMR90	Hi-C	24141950	SP2	12146	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	46043736	46043949	46043771	Y	PRR15L	AC003665.1,PNPO,PRR15L,CDK5RAP3	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP3	560	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	46101351	46101579	46101379	Y	NA	COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	11813	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	46102426	46102830	46102617	Y	NA	COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	10562	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	46644443	46644754	46644601	Y	HOXB9,HOXB8,HOXB6	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB5,HOXB6	NA	NA	NA	NA	HOXB-AS3	19451	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	46662223	46662405	46662377	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB5,HOXB6,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB5	6918	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	46662684	46663231	46662943	Y	HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB5,HOXB6,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB5	6092	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr17	46680378	46680812	46680678	Y	NA	HOXB5,HOXB6,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17	NA	NA	NA	NA	HOXB6	24	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	46702579	46702749	46702606	Y	HOXB2,HOXB3,SNF8,HOXB5,HOXB6,HOXB7,HOXB8,HOXB9	HOXB5,HOXB6,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17	NA	NA	NA	NA	HOXB9	740	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	PHOSPHO1	35619	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	47913501	47913854	47913589	Y	TMEM92	KAT7,FAM117A,RP11-613C6.4	NA	NA	NA	NA	RP11-613C6.4	42796	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	48066634	48067004	48066930	Y	NA	DLX4,DLX3	NA	NA	NA	NA	DLX3	3584	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	48105016	48105270	48105136	Y	XYLT2,LRRC59,ITGA3	DLX3,ITGA3	LOC284080,ITGA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	ITGA3	26062	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	48105546	48105721	48105634	Y	ITGA3	DLX3,ITGA3	LOC284080,ITGA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	ITGA3	25611	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	48139711	48140314	48140012	Y	XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3	ITGA3,PDK2	NA	NA	NA	NA	ITGA3	8379	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	SAMD14,PPP1R9B	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	48716257	48716537	48716480	Y	NA	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	6119	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	48726648	48726741	48726695	Y	NA	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	16510	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	48942663	48943085	48943016	Y	NA	TOB1	NA	NA	NA	NA	TOB1	254	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	49028088	49028439	49028211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOB1	84749	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	49301885	49301958	49301926	Y	NA	MBTD1,UTP18	NA	NA	NA	NA	MBTD1	33566	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	53315618	53315983	53315841	Y	HLF	HLF	STXBP4,HLF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HLF	24390	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	53497797	53498268	53498065	Y	NA	MMD	NA	NA	NA	NA	MMD	444	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	54987224	54987877	54987630	Y	SCPEP1,TRIM25	TRIM25,COIL	NA	NA	NA	NA	TRIM25	1522	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	54994598	54994773	54994687	Y	SCPEP1,TRIM25	TRIM25,COIL	NA	NA	NA	NA	TRIM25	5199	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	55101345	55101678	55101512	Y	NA	SCPEP1	NA	NA	NA	NA	SCPEP1	47879	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	55472969	55473349	55473111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	141757	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	55734748	55734863	55734779	Y	DYNLL2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	190554	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	55970352	55970806	55970481	Y	SUPT4H1,VEZF1	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	44935	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	55993641	55993992	55993778	Y	NA	CUEDC1	VEZF1,CUEDC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CUEDC1	36692	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	56020686	56021039	56020762	Y	NA	CUEDC1,VEZF1	VEZF1,CUEDC1,SRSF1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	9645	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	56419503	56419633	56419507	Y	OR4D2	SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	8821	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	56428194	56428499	56428372	Y	VEZF1,MTMR4,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	56600012	56600151	56600118	Y	DYNLL2,OR4D2,SEPT4,SEPT4	MTMR4,SEPT4	NA	NA	NA	NA	MTMR4	6746	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	56701235	56701661	56701522	Y	OR4D1,BZRAP1	RNU1-60P	NA	NA	NA	NA	RNU1-60P	33005	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	56706902	56707296	56707107	Y	MKS1,MKS1,RAD51C	RNU1-60P,RNU1-85P	SEPT4,MTMR4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	27370	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	56736656	56737064	56736885	Y	MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E	RNU1-60P,RNU1-85P,RAD51C	SEPT4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	1990	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	57231102	57231481	57231293	Y	C17orf71	AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	242	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	57409690	57409997	57409875	Y	YPEL2	YPEL2	NA	NA	NA	NA	YPEL2	2640	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	57518143	57518390	57518285	Y	YPEL2	NA	YPEL2,GDPD1,SMG8,CLTC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-13P	94470	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	57698412	57698732	57698592	Y	YPEL2,RNFT1,VMP1	CLTC	NA	NA	NA	NA	CLTC	3193	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	57831888	57832338	57832062	Y	VMP1,RNFT1	VMP1,PTRH2	NA	NA	NA	NA	PTRH2	48901	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	57841314	57841767	57841379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTRH2	58327	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	57853705	57854627	57854148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	62000	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	57860256	57860659	57860446	Y	DHX40,VMP1,CA4	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	55968	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	57861698	57862055	57862024	Y	RNFT1	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	54572	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	57863159	57864676	57863979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	51951	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr17	57866887	57867071	57866969	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	49556	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	57905350	57905555	57905420	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	11072	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr17	57906379	57907270	57906882	Y	RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	9357	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	57907420	57907736	57907558	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	8891	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	57922999	57923843	57923122	Y	PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	6372	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr17	57925185	57925429	57925290	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	8558	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	57929068	57929265	57929192	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	12441	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	57930626	57931026	57930760	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	13999	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr17	57962596	57962816	57962625	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	TUBD1	5488	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	58172215	58172508	58172351	Y	RNFT1	HEATR6	HEATR6,LOC645638	IMR90	Hi-C	24141950	HEATR6	17923	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	58212242	58212405	58212344	Y	NA	NA	C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEATR6	57950	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr17	58240902	58241117	58241010	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEATR6	86610	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	59532462	59532698	59532510	Y	NA	C17orf82	NA	NA	NA	NA	C17orf82	45350	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	59956289	59956463	59956377	Y	NA	BRIP1,INTS2	BRIP1	IMR90	Hi-C	24141950	BRIP1	17407	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	60058924	60058941	60058933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTS2	55547	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	60085676	60086036	60086030	Y	NACA2,MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	54607	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	60141349	60141594	60141514	Y	NACA2,MED13	MED13	INTS2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MED13	706	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	60247601	60248070	60247921	Y	MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	106958	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	60555037	60555507	60555099	Y	NA	RP11-464D20.2	MRC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-464D20.2	36621	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	60729712	60730300	60729931	Y	NA	MRC2	NA	NA	NA	NA	MRC2	26950	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	60780424	60780717	60780568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	77662	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	60869162	60869387	60869275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	166400	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	61043121	61043648	61043243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	340359	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	61796482	61796787	61796636	Y	NA	LIMD2,STRADA	NA	NA	NA	NA	LIMD2	19950	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	62134316	62134543	62134430	Y	MAP3K3,LIMD2,PECAM1,DDX5,ERN1	ICAM2	NA	NA	NA	NA	ICAM2	38322	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	62138721	62138967	62138947	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,DDX5,ERN1	ICAM2	NA	NA	NA	NA	ICAM2	42727	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	62159440	62159790	62159613	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	46389	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.29437304173884
chr17	62161129	62161576	62161448	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	44603	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	62484790	62485162	62485096	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	POLG2	5992	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	62703261	62703596	62703473	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF2	47075	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	63043139	63043174	63043152	Y	NA	GNA13	NA	NA	NA	NA	GNA13	7783	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	84165	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr17	64194072	64194322	64194164	Y	NA	CEP112	NA	NA	NA	NA	CEP112	7870	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	64463185	64463416	64463350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	166431	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	64499082	64499411	64499095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	202328	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	64505568	64505880	64505716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	208814	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	64646348	64646488	64646431	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG4	312538	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	64708425	64708706	64708566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG4	250320	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	65386872	65387224	65386898	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	15297	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	65389377	65389540	65389482	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	17802	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	65418011	65418377	65418257	Y	HELZ,PSMD12,PITPNC1,BPTF	PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	46436	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	65437128	65437554	65437154	Y	HELZ,PITPNC1,BPTF	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	65553	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	65847253	65847408	65847335	Y	NA	BPTF	NA	NA	NA	NA	BPTF	27613	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr17	66016382	66016768	66016696	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	12867	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	66419326	66419636	66419592	Y	NA	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	32018	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	66509186	66509763	66509535	Y	SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A	PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	PRKAR1A	3265	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	66818173	66818316	66818245	Y	NA	NA	ABCA8	IMR90	Hi-C	24141950	FAM20A	222643	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	67315191	67315526	67315500	Y	NA	ABCA5	NA	NA	NA	NA	ABCA5	5859	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	67757945	67758523	67758299	Y	KCNJ2	NA	KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2,MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	349106	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	68078545	68078943	68078744	Y	KCNJ16	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ2	83871	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	70335121	70335458	70335290	Y	NA	NA	LOC100499467,SOX9	IMR90	Hi-C	24141950	SOX9	219960	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	70417215	70417683	70417549	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	203687	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	70442621	70442708	70442666	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	178662	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	70461830	70461987	70461862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	159383	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	70462396	70462597	70462589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	158773	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	70499253	70499546	70499535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	121824	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	70587266	70587776	70587444	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	33594	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	71200352	71200549	71200451	Y	NA	COG1,C17orf80,FAM104A	NA	NA	NA	NA	COG1	13223	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	71287548	71287861	71287762	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	18453	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	71301216	71301553	71301269	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	4761	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	71305759	71306422	71306099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	72745955	72746124	72746086	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3164	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	72746451	72746964	72746655	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3660	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	72776079	72776526	72776246	Y	CD300A,CD300LB,CD300C,CD300E,CD300LF,RAB37,SLC9A3R1,SLC16A5,GGA3,TMEM104	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	TMEM104	5457	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr17	72984795	72985307	72985001	Y	RAB37,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	NA	NA	NA	NA	CDR2L	3068	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	73009835	73009966	73009891	Y	NA	CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H	NA	NA	NA	NA	ICT1	3070	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	73087456	73087829	73087515	Y	NA	ATP5H,SLC16A5,ARMC7,NT5C	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	5634	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	3.88311912521653
chr17	73120387	73120767	73120528	Y	GRB2,GRB2,CD300LF,HN1,HN1,SLC16A5,NT5C	SLC16A5,ARMC7,NT5C,HN1	NA	NA	NA	NA	NT5C	5123	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	73133469	73133809	73133510	Y	NA	ARMC7,NT5C,HN1,SUMO2	NA	NA	NA	NA	NT5C	7579	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	73304838	73305233	73305159	Y	UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19	MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19	NA	NA	NA	NA	SLC25A19	21247	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	73319762	73319905	73319788	Y	SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19	SLC25A19	NA	NA	NA	NA	SLC25A19	36171	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	73684314	73684419	73684412	Y	NA	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	RECQL5	23045	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	73696530	73696897	73696707	Y	SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	ITGB4	18511	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	73718198	73718514	73718306	Y	NA	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	2790	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	3.53795298075283
chr17	73719261	73719909	73719549	Y	MRPS7,LLGL2,LOC100130933,EVPL,ITGB4,ITGB4	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	3853	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	3.88311912521653
chr17	73805010	73805399	73805102	Y	NA	GALK1,UNK,H3F3B,WBP2	NA	NA	NA	NA	H3F3B	25036	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	73891396	73891618	73891569	Y	NA	WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1	NA	NA	NA	NA	TRIM65	312	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	73992927	73993207	73992957	Y	NA	TEN1,ACOX1,CDK3,EVPL	NA	NA	NA	NA	CDK3	1780	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	74025620	74025914	74025713	Y	H3F3B,TRIM47,EVPL	CDK3,EVPL,SRP68,GALR2	NA	NA	NA	NA	EVPL	4087	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	74341579	74341976	74341749	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	28689	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	6.73073981704198
chr17	74525516	74525637	74525615	Y	NA	RHBDF2	NA	NA	NA	NA	RHBDF2	29644	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	74723995	74724371	74724344	Y	FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	METTL23	3083	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	75118026	75118235	75118074	Y	NA	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	37228	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	75120383	75120864	75120582	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	39585	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	75278845	75279720	75279369	Y	NA	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	4194	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	75281811	75282557	75281917	Y	SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	7160	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.03549843339107
chr17	75282703	75283463	75282995	Y	SEPT9,SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	8052	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr17	75318595	75318736	75318679	Y	SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	43944	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	75319028	75319523	75319372	Y	SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	44377	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr17	75319670	75320031	75319742	Y	MGAT5B,SEPT9,SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	45019	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	75384636	75384998	75384811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	109985	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	75402047	75402301	75402134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	127396	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	75461802	75462176	75461947	Y	SEC14L1,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	187151	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	75504499	75504824	75504660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	229848	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	RNU1-80P	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-80P	40213	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	7.50736364208528
chr17	76165603	76166001	76165654	Y	SYNGR2	TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	NA	NA	NA	NA	SYNGR2	2964	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	76312866	76313241	76313131	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	SOCS3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SOCS3	40917	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	76384421	76384943	76384751	Y	USP36,CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	11700	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	76858403	76858717	76858585	Y	PGS1,CYTH1,ENGASE,USP36	USP36	NA	NA	NA	NA	USP36	22880	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	76879007	76879631	76879400	Y	CYTH1,ENGASE,CANT1,USP36	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39838	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	76879876	76880180	76879977	Y	NA	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39289	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	76992140	76992468	76992317	Y	NA	LGALS3BP,CANT1,C1QTNF1	NA	NA	NA	NA	CANT1	11481	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	77117014	77117407	77117247	Y	NA	ENGASE	NA	NA	NA	NA	ENGASE	47993	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	77776510	77776898	77776679	Y	CCDC40	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	3028	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	77778056	77778248	77778123	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	4574	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	77783959	77784243	77784073	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	10477	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	77787297	77787609	77787349	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	13815	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	77817686	77818105	77817998	Y	NA	CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX4	6458	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	77959820	77960211	77960016	Y	NA	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	47436	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	77967532	77967765	77967641	Y	CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	39882	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr17	77970749	77971301	77971166	Y	CBX4,SGSH,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	36346	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	78087852	78088239	78088062	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	GAA	14497	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	41238	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr17	78431372	78431666	78431608	Y	GAA,EIF4A3,SGSH,SLC26A11	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	44407	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	78806684	78807307	78807121	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	156091	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	78824691	78824852	78824790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	138546	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	78830209	78830686	78830492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	132712	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	78853513	78853762	78853623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	109636	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	79017666	79018027	79017910	Y	AZI1,BAIAP2	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	10718	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr17	79302809	79302914	79302847	Y	NA	SLC38A10,LINC00482,TMEM105	NA	NA	NA	NA	TMEM105	335	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	79316253	79317268	79317090	Y	NA	SLC38A10,LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,C17orf56,C17orf89,LINC00482,MIR3186,C17orf70,FSCN2,NPLOC4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	13779	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	79317785	79317948	79317891	Y	FAM195B,C17orf70,ACTG1,BAHCC1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	15311	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	16851	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.29437304173884
chr17	79319812	79320225	79320116	Y	FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	17338	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	79339701	79340108	79339894	Y	NA	TMEM105	SLC38A10,NPLOC4	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM105	37227	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	79360408	79361324	79361141	Y	ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	57934	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr17	79365060	79367456	79365203	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	62586	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	79369574	79370687	79370597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	67100	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr17	79370754	79371569	79371407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	68280	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr17	79482562	79482804	79482728	Y	NA	RP13-766D20.1,RP13-766D20.2,ACTG1,C17orf70	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.2	3489	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	79546845	79547000	79546944	Y	PCYT2	C17orf70	NA	NA	NA	NA	C17orf70	27858	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	79942701	79942868	79942785	Y	SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62	PYCR1,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	10018	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	79949658	79950000	79949804	Y	SLC25A10,STRA13,LRRC45,FASN,DCXR,PCYT2,NOTUM,ASPSCR1	ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	16975	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr17	80068190	80068440	80068326	Y	NA	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	13982	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	80068913	80069274	80069094	Y	NARF,HEXDC,CCDC57	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	14705	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	80188750	80189250	80189000	Y	NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	SLC16A3	4477	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr17	80214734	80215057	80214944	Y	NA	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	14550	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	80216124	80216440	80216314	Y	NA	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	13167	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	80255299	80255755	80255478	Y	SIRT7,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7	CSNK1D,SECTM1	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	25692	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	80255798	80256475	80256187	Y	SIRT7,MAFG,MAFG,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,HEXDC,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7	CSNK1D,SECTM1	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	26191	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	80592968	80593241	80593234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB40B	61363	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr17	80655375	80655626	80655561	Y	RAB40B,FN3K	RAB40B,FN3KRP,FN3K	NA	NA	NA	NA	RAB40B	771	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr17	81049749	81049909	81049815	Y	NA	B3GNTL1,METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	14182	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr17	81067352	81067511	81067418	Y	NA	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	31785	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	228420	228816	228694	Y	THOC1	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	37234	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	235900	236290	236249	Y	NA	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	29760	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	9843	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.862915361159228
chr18	781638	782117	782009	Y	NA	RNU1-109P,YES1	NA	NA	NA	NA	RNU1-109P	14019	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	2605641	2605936	2605854	Y	NA	METTL4,NDC80,CBX3P2,SMCHD1	NA	NA	NA	NA	NDC80	36131	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr18	2658254	2658560	2658346	Y	METTL4,LPIN2,EMILIN2,SMCHD1	CBX3P2,SMCHD1	NA	NA	NA	NA	SMCHD1	4517	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	2897860	2897994	2897926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPIN2	113319	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr18	3250721	3251122	3250738	Y	NA	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12A	5242	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	3276279	3276423	3276302	Y	NA	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12B	16372	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	3527351	3527432	3527391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	117745	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	3594733	3596177	3595596	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	185127	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	3623872	3624258	3624140	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214266	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr18	3624338	3624601	3624482	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214732	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr18	3624841	3625119	3625035	Y	MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215235	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr18	3625326	3625427	3625380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215720	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	3665613	3666165	3665884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	256007	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	3676188	3676369	3676278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	266582	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	5542461	5543034	5542604	Y	EPB41L3	NA	NA	NA	NA	NA	L3MBTL4	870202	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	8704447	8704767	8704559	Y	NA	NA	CCDC165,NDUFV2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB12	97004	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr18	9375216	9375438	9375327	Y	NA	TWSG1	NA	NA	NA	NA	TWSG1	42451	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	9812085	9812326	9812208	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	99673	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	9824351	9824715	9824532	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	87284	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	9838439	9838883	9838628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	73116	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	3.96941066133245
chr18	10528233	10528593	10528264	Y	NA	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	4331	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	11005597	11005922	11005792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	481695	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	11846235	11846388	11846281	Y	GNAL,GNAL	CHMP1B	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	3007	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	11859926	11860218	11860181	Y	CHMP1B	CHMP1B,MPPE1	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	10531	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	11947272	11947721	11947412	Y	CHMP1B	MPPE1,IMPA2	IMPA2,GNAL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IMPA2	31303	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr18	12059774	12060081	12059918	Y	NA	NA	GNAL,IMPA2	IMR90	Hi-C	24141950	IMPA2	80750	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr18	12288068	12288497	12288213	Y	NA	TUBB6	TUBB6	IMR90	Hi-C	24141950	TUBB6	17171	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr18	12306995	12307375	12307158	Y	CHMP1B	TUBB6	NA	NA	NA	NA	TUBB6	1327	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	12330841	12331244	12331045	Y	NA	TUBB6,AFG3L2	NA	NA	NA	NA	TUBB6	25173	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	12471098	12471401	12471374	Y	PSMG2	NA	NA	NA	NA	NA	SLMO1	65203	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	12606965	12607268	12607096	Y	PTPN2,SPIRE1	AP005482.1,SPIRE1,PSMG2	NA	NA	NA	NA	AP005482.1	48774	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	13137958	13138425	13138153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	148597	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	13313521	13313917	13313675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	324160	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	19090172	19090203	19090178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESCO1	88642	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	19397108	19397142	19397125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIB1	114190	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	19453532	19453543	19453538	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIB1	170614	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	20046739	20046926	20046743	Y	GATA6	NA	GATA6,CTAGE1	IMR90	Hi-C	24141950	GATA6	299335	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr18	20138967	20139156	20139093	Y	GATA6	NA	CTAGE1,GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	237068	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	20139802	20140256	20140003	Y	GATA6	NA	CTAGE1,GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	235968	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr18	20263132	20263811	20263406	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	112413	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	21002815	21003000	21002900	Y	RBBP8,RBBP8,NPC1,C18orf8	TMEM241,RIOK3	NA	NA	NA	NA	TMEM241	12925	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr18	21165246	21165762	21165429	Y	C18orf8,NPC1	NPC1	NA	NA	NA	NA	NPC1	384	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr18	22677788	22677963	22677875	Y	ZNF521	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF521	252191	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	23657156	23657540	23657507	Y	NA	SS18	NA	NA	NA	NA	SS18	11641	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	24107807	24108046	24107927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD1	127319	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	24120849	24120961	24120907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD1	114404	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	29441885	29441939	29441912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	89160	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	29542474	29542964	29542885	Y	RNF138	TRAPPC8	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	11375	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	32436094	32436130	32436112	Y	DTNA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	118762	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	32527945	32528002	32527974	Y	DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,ZNF397,MAPRE2	MAPRE2	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	26890	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	32591696	32592078	32591800	Y	NA	MAPRE2	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	36804	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	32671998	32672517	32672048	Y	MAPRE2,MAPRE2,ZNF397,ZNF24	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	117106	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	32829674	32829781	32829775	Y	ZNF397,ZSCAN30	ZNF397,ZSCAN30,ZNF271	NA	NA	NA	NA	ZNF397	10680	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	33311016	33311295	33311162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT1	151935	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	33711406	33711801	33711526	Y	NA	SLC39A6,ELP2	NA	NA	NA	NA	ELP2	3999	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	33876540	33877026	33876703	Y	NA	FHOD3	NA	NA	NA	NA	FHOD3	863	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	42262294	42262512	42262376	Y	SETBP1,SETBP1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC14A1	1039580	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	43381768	43381900	43381886	Y	NA	NA	EPG5,SLC14A2,SLC14A1,SIGLEC15	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC14A1	79676	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr18	43536054	43536394	43536224	Y	PSTPIP2,EPG5	EPG5	NA	NA	NA	NA	EPG5	8846	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	44392877	44393138	44393020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KATNAL2	102317	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr18	44394118	44394485	44394384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KATNAL2	100970	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	44487034	44487390	44487355	Y	NA	KATNAL2,PIAS2	NA	NA	NA	NA	KATNAL2	8065	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	44675442	44676177	44675810	Y	NA	HDHD2,IER3IP1	NA	NA	NA	NA	HDHD2	551	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	45353824	45354074	45353943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	101441	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	45454827	45455289	45455128	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	226	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	45687716	45687836	45687757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232201	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr18	45688048	45688324	45688110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232533	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr18	45828290	45828381	45828336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB7C	106742	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	46066779	46067121	46067052	Y	CTIF	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	3362	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr18	46451209	46451517	46451363	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	23564	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	46461141	46461770	46461393	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	13311	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	46478230	46479206	46479122	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	3149	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	46502180	46502412	46502333	Y	SMAD7	SMAD7	SMAD7,CTIF	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SMAD7	27099	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr18	46523478	46523814	46523611	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD7	48397	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	46547875	46548139	46548027	Y	NA	NA	SMAD7	MCF7	ChIA-PET	22265404	SMAD7	72794	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	46739298	46739521	46739417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYM	246196	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	47628723	47629107	47629104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO5B	90356	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	47785953	47786324	47786143	Y	NA	CCDC11,MBD1,CXXC1	NA	NA	NA	NA	CCDC11	4568	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr18	47834587	47834811	47834691	Y	NA	CCDC11,MBD1,CXXC1	CCDC11,CXXC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CXXC1	21913	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	54070241	54070409	54070308	Y	NA	NA	TCF4,LOC100505474	IMR90	Hi-C	24141950	WDR7	246165	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	55095005	55095410	55095044	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	5507	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.55324765008661
chr18	55098490	55098766	55098627	Y	NA	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	2151	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr18	55101559	55101949	55101758	Y	NA	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	642	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	55102016	55102207	55102112	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	1099	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	55104670	55104954	55104730	Y	NA	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	3753	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr18	55105190	55105288	55105239	Y	ST8SIA3,ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	4273	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	55108186	55108329	55108231	Y	NA	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	7269	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	55108837	55109086	55108936	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	7920	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr18	55109141	55109496	55109318	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	8224	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr18	55872819	55873190	55873005	Y	NEDD4L,NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	163220	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	56161690	56161866	56161857	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	103997	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	56339458	56339877	56339543	Y	MALT1	MALT1	NA	NA	NA	NA	MALT1	2840	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr18	56499009	56499169	56499089	Y	NA	ZNF532	NA	NA	NA	NA	ZNF532	28663	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	57552932	57553277	57553219	Y	PMAIP1	PMAIP1	PMAIP1	K562	ChIA-PET	22265404	PMAIP1	11903	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	57566379	57566616	57566437	Y	NA	PMAIP1	NA	NA	NA	NA	PMAIP1	1199	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr18	57572110	57572452	57572282	Y	PMAIP1	PMAIP1	NA	NA	NA	NA	PMAIP1	6930	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	60118389	60118639	60118544	Y	KIAA1468,ZCCHC2	NA	PHLPP1,ZCCHC2	IMR90	Hi-C	24141950	ZCCHC2	69601	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	60189219	60189514	60189362	Y	TNFRSF11A,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	979	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	60973604	60973976	60973940	Y	NA	BCL2	NA	NA	NA	NA	BCL2	11385	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	61033511	61033750	61033687	Y	NA	BCL2,KDSR	NA	NA	NA	NA	KDSR	768	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	61642248	61642613	61642430	Y	NA	SERPINB8	NA	NA	NA	NA	SERPINB8	7089	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	65623585	65623778	65623682	Y	NA	NA	LOC643542,DSEL	IMR90	Hi-C	24141950	DSEL	441368	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	67957012	67957306	67957264	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	2875	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr18	68087534	68087889	68087601	Y	CD226,SOCS6	NA	RTTN,SOCS6	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS6	133397	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	68089361	68089784	68089523	Y	SOCS6	NA	RTTN,SOCS6	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS6	135224	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	70998412	70998732	70998572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO15	814368	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr18	72501282	72501640	72501447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF407	238176	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	72676291	72676559	72676424	Y	ZNF407,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	242744	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr18	72836429	72836681	72836646	Y	NA	NA	ZNF407	IMR90	Hi-C	24141950	ZADH2	82622	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	74767033	74767545	74767189	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	234470	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	74767591	74768136	74768025	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	235028	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	74768655	74769369	74768895	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	236092	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	74779066	74780013	74779875	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	246503	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	74826312	74827078	74826635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	293749	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	74829789	74830209	74830033	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	297226	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr18	74830215	74830809	74830560	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	297652	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.03549843339107
chr18	76582553	76582919	76582735	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	244366	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr18	76734377	76734736	76734420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	92549	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr18	77153646	77154504	77153944	Y	ATP9B,NFATC1,NFATC1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	289700	289869	289784	Y	C2CD4C,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	307	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr19	290136	290651	290316	Y	RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	743	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr19	604629	604764	604680	Y	THEG	BSG,HCN2,POLRMT	NA	NA	NA	NA	HCN2	16736	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	661410	661735	661571	Y	HMHA1,GZMM,C19orf6,ABCA7,RNF126	POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	RNF126	133	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	675402	675838	675677	Y	FSTL3	POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	FSTL3	1010	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	751766	752111	751822	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PALM,PTBP1	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42964	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.8984137945503
chr19	752652	753043	752777	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PALM,PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42032	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr19	753188	753320	753238	Y	C19orf20	PALM,PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	41755	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	778993	779222	779048	Y	GPX4,BSG,CNN2	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	15853	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	782330	783005	782707	Y	NA	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	12070	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	10.096109725563
chr19	789308	789721	789469	Y	NA	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	5354	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	823657	823956	823874	Y	BSG,PRSS57,PTBP1,LPPR3,PRTN3,ELANE,AZU1	PTBP1,MIR4745,MIR3187,CFD	NA	NA	NA	NA	MIR3187	12073	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	863983	864016	863999	Y	NA	CFD,MED16,RNU6-9,R3HDM4	NA	NA	NA	NA	CFD	6530	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	908605	908810	908775	Y	NA	MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	R3HDM4	2430	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	958944	959162	959060	Y	NA	R3HDM4,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	WDR18	22012	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	996390	996745	996544	Y	HMHA1,CIRBP,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7	WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7	NA	NA	NA	NA	WDR18	15216	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	1028160	1028923	1028240	Y	SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7	WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7,HMHA1	NA	NA	NA	NA	CNN2	3862	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr19	1101850	1102062	1101942	Y	C19orf6,MIDN,HMHA1,SBNO2,SBNO2	HMHA1,POLR2E	NA	NA	NA	NA	GPX4	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr19	1161691	1161983	1161922	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	10299	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	1169743	1170349	1170015	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1933	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr19	1171027	1171165	1171096	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1117	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	1172839	1173266	1172915	Y	CFD,ATP5D,GPX4,GPX4	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	557	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	1183874	1184237	1184064	Y	SBNO2	SBNO2,STK11	ATP5D,MIDN,SBNO2,STK11,GPX4	MCF7	ChIA-PET	22265404	STK11	3169	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr19	1240232	1240534	1240365	Y	MUM1,APC2,C19orf26	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	ATP5D	483	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	1252961	1253429	1253036	Y	C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3955	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr19	1260732	1261171	1260912	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3348	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	1262305	1262850	1262469	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	CIRBP	4921	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr19	1284432	1284856	1284552	Y	REEP6,ONECUT3,GAMT,EFNA2	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	EFNA2	279	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	1408607	1408695	1408655	Y	CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3039	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr19	1445282	1445452	1445336	Y	C19orf26,EFNA2,MUM1,APC2	GAMT,DAZAP1,RPS15,C19orf25,PCSK4,REEP6	NA	NA	NA	NA	RPS15	8924	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	1747200	1747550	1747426	Y	PLEKHJ1,DAZAP1,RPS15,ONECUT3	ONECUT3	TCF3,ONECUT3,ADAMTSL5,PLK5,UQCR11,ATP8B3,REXO1,LOC100288123	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ONECUT3	2822	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	1855247	1855761	1855485	Y	SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	5806	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr19	2032329	2032652	2032524	Y	LINGO3,C19orf35	BTBD2,MKNK2	NA	NA	NA	NA	BTBD2	228	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	2056461	2056895	2056707	Y	OAZ1,C19orf35,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	7218	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr19	2059605	2060167	2060113	Y	REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	10362	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr19	2165096	2165788	2165320	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	2632	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	2168890	2169464	2169082	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	6426	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	2330710	2331138	2330903	Y	NA	SPPL2B,LSM7	NA	NA	NA	NA	LSM7	4091	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr19	2494705	2495117	2494880	Y	DOT1L,GADD45B	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	20585	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	2507206	2507458	2507335	Y	DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B	GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	33086	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr19	2524971	2525260	2525066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	50851	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	2529574	2529858	2529677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	55454	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	2540691	2541097	2540881	Y	TIMM13	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	66571	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr19	2543618	2543970	2543682	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	69498	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	2775891	2776162	2776129	Y	NA	SLC39A3,SGTA,THOP1,ZNF554	NA	NA	NA	NA	SGTA	5207	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	2974450	2974580	2974523	Y	NFIC,TLE2,TLE2	ZNF77,TLE6	NA	NA	NA	NA	TLE6	864	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	3177322	3177366	3177344	Y	AES,S1PR4	GNA15,NCLN	NA	NA	NA	NA	NCLN	6195	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	3360183	3360356	3360294	Y	TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	2622	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	3367171	3367852	3367502	Y	NFIC,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	9610	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	3617364	3617743	3617529	Y	NA	HMG20B,MFSD12	NA	NA	NA	NA	MFSD12	45076	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	3969049	3969183	3969116	Y	NA	SNORD37,EEF2,PIAS4	NA	NA	NA	NA	DAPK3	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	4008398	4008778	4008498	Y	MATK,ZFR2,ATCAY	DAPK3,SNORD37,EEF2,PIAS4	NA	NA	NA	NA	PIAS4	2754	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	4052414	4052757	4052628	Y	CCDC94,ZBTB7A	PIAS4,ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	12186	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	4059877	4060289	4060128	Y	SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	4654	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr19	4061318	4061457	4061400	Y	SEMA6B,PLIN5,ZBTB7A	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	3486	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	4061604	4061945	4061775	Y	SEMA6B,PLIN5	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	2998	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	4064475	4064868	4064603	Y	SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	75	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	4089074	4089290	4089084	Y	NA	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	24131	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	4636294	4636441	4636384	Y	ANKRD24,SH3GL1,SH3GL1,SEMA6B,TICAM1,TNFAIP8L1,TNFAIP8L1	TNFAIP8L1,C19orf10	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L1	1089	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	4744883	4745173	4745028	Y	NA	DPP9,FEM1A	DPP9,UHRF1,MIR7-3HG,ARRDC5,PLIN3	IMR90	Hi-C	24141950	DPP9	22198	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	4812881	4813376	4813265	Y	SEMA6B,TICAM1	FEM1A,TICAM1	NA	NA	NA	NA	TICAM1	16340	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	5322399	5322569	5322473	Y	PTPRS	RPL32P34,PTPRS	NA	NA	NA	NA	PTPRS	16245	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	5339517	5339797	5339748	Y	HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,PTPRS	PTPRS	NA	NA	NA	NA	PTPRS	703	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	5478179	5478421	5478273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRS	139365	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	6087956	6088249	6088075	Y	PSPN,SAFB2,FUT5,RFX2	NA	RANBP3,LOC100128568	IMR90	Hi-C	24141950	RFX2	109334	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	6092440	6092966	6092758	Y	RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	104617	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr19	6189136	6189412	6189274	Y	NA	RFX2	NA	NA	NA	NA	RFX2	8171	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	6423549	6423953	6423663	Y	NA	GTF2F1,KHSRP,CRB3,SLC25A23	NA	NA	NA	NA	KHSRP	744	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	6516969	6517178	6517079	Y	NA	TUBB4A,TNFSF9	TNFSF9	K562	ChIA-PET	22265404	TNFSF9	11832	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	6539979	6540238	6540076	Y	NA	TUBB4A,TNFSF9	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	10969	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	7427436	7427895	7427614	Y	ZNF557,XAB2,STXBP2,PNPLA6,LOC100131801,ARHGEF18	ARHGEF18	INSR,ARHGEF18,PNPLA6,MCOLN1,ZNF358,C19orf45,CD209,CLEC4G	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF18	30104	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	7756040	7757119	7756175	Y	ARHGEF18,FBN3,MAP2K7,FLJ22184,EVI5L,FCER2,FCER2	TRAPPC5	NA	NA	NA	NA	TRAPPC5	12311	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	7907381	7907869	7907475	Y	PNPLA6,PNPLA6,KIAA1543,FBN3,LASS4,EVI5L,FLJ22184,CTXN1	EVI5L,LRRC8E	NA	NA	NA	NA	EVI5L	14262	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	8518703	8518940	8518821	Y	NA	MARCH2,HNRNPM	NA	NA	NA	NA	HNRNPM	11052	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	9783821	9783976	9783959	Y	NA	ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	45	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	9855997	9856274	9856136	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP22	63248	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	9895815	9895899	9895870	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	40593	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	9896233	9896620	9896495	Y	ZNF266,COL5A3,ZNF846	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	39872	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	9902440	9902843	9902543	Y	ZNF699,ZNF266,ICAM1,ZNF846	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	33649	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr19	9903168	9903577	9903239	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	32915	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	9937602	9937876	9937738	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	UBL5	1034	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	10766466	10766790	10766534	Y	NA	ILF3,QTRT1	NA	NA	NA	NA	ILF3	3529	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	10865897	10866291	10865968	Y	ICAM1,ICAM3,TYK2,PDE4A,PDE4A,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2,C19orf38,DNM2	DNM2	NA	NA	NA	NA	DNM2	39142	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4174	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr19	11205696	11206011	11205901	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	7658	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	11206953	11207150	11207057	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	8915	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	11253262	11253482	11253341	Y	TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	11002	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr19	11253991	11254271	11254206	Y	PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	10213	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr19	11404382	11404791	11404593	Y	ACP5,ACP5,C19orf38,LPPR2,CCDC159	DOCK6,CCDC159	NA	NA	NA	NA	DOCK6	33225	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	11804467	11804940	11804795	Y	ZNF878,ZNF823,ZNF491	HNRNPA1P10,ZNF823	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P10	28622	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	11878639	11879058	11878901	Y	NA	ZNF823,ZNF441,ZNF491,ZNF440	NA	NA	NA	NA	ZNF441	2824	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	11925678	11926080	11925867	Y	NA	ZNF441,ZNF491,ZNF440,ZNF439	NA	NA	NA	NA	ZNF440	2579	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	12404552	12404928	12404719	Y	ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44	CTD-2666L21.3,ZNF44,ZNF563	NA	NA	NA	NA	ZNF44	850	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.29437304173884
chr19	12892961	12894040	12893343	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	6270	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr19	12894545	12895330	12894818	Y	ZNF44,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	4980	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	12896372	12896781	12896659	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF490,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,STX10,LYL1,DNASE2,JUNB	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	3529	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	12899457	12901460	12900777	Y	NA	PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr19	13024998	13025376	13025029	Y	NA	HOOK2,DNASE2,GCDH,FARSA,CALR,RAD23A,GADD45GIP1	NA	NA	NA	NA	FARSA	17475	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	4.14199373356429
chr19	13266326	13267156	13266576	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	7097	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	13267779	13268208	13267877	Y	MAN2B1,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	8550	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr19	13273540	13274187	13273840	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	14311	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	13274586	13275096	13274696	Y	GADD45GIP1,NACC1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	15357	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr19	13275397	13275802	13275486	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	16168	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr19	13278382	13278991	13278445	Y	BEST2,JUNB,LYL1,STX10	STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	19153	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr19	13917794	13918010	13917903	Y	RFX1,ZSWIM4,NANOS3	MRI1,C19orf53,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	13520	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	13957204	13959386	13957586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	52930	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr19	13972364	13973309	13972780	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	41705	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	14545997	14546246	14546106	Y	NA	DDX39A,PKN1	NA	NA	NA	NA	PKN1	4132	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.46695611397069
chr19	15333627	15333747	15333631	Y	SYDE1,NOTCH3	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	23835	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	15666666	15666804	15666739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP4F3	82903	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	15947617	15948119	15947980	Y	AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1	NA	NA	NA	NA	NA	CYP4F11	95558	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr19	16181046	16181841	16181607	Y	OR10H2,OR10H3,OR10H4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	5215	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr19	16193841	16194249	16194048	Y	NA	TPM4,RAB8A,HSH2D	NA	NA	NA	NA	TPM4	18010	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	16442138	16442160	16442149	Y	NA	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	8510	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	17190539	17191239	17190954	Y	HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	5948	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	17218539	17219391	17218963	Y	MED26,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	33948	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	17225282	17225997	17225467	Y	SIN3B,CPAMD8	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	40691	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	17249466	17249780	17249541	Y	FAM129C,HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9B	64875	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	17667126	17667426	17667289	Y	MAP1S,ARRDC2,MYO9B,SLC27A1,PGLS,GLT25D1	PGLS	NA	NA	NA	NA	PGLS	46688	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr19	17791017	17791370	17791235	Y	MAP1S,IFI30,ARRDC2,ARRDC2	UNC13A,MAP1S	NA	NA	NA	NA	UNC13A	6031	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr19	18133045	18133309	18133130	Y	FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2	ARRDC2	NA	NA	NA	NA	ARRDC2	23104	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr19	18395702	18395850	18395798	Y	NA	KIAA1683,JUND,LSM4	NA	NA	NA	NA	JUND	5270	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	18415031	18416060	18415513	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	16024	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr19	18485152	18485556	18485412	Y	ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25	PGPEP1,GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	GDF15	1611	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	18497624	18497977	18497708	Y	PDE4C,GDF15	PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	GDF15	14083	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr19	18527231	18527472	18527362	Y	LSM4,SSBP4,ISYNA1,ISYNA1	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	202	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	18527701	18528040	18527800	Y	KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	27	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr19	18528263	18528792	18528577	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	589	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr19	18722417	18722765	18722581	Y	GDF1,RAB3A,PDE4C,CRTC1,TMEM59L	UBA52,C19orf60,TMEM59L,KLHL26	NA	NA	NA	NA	TMEM59L	6177	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	19432213	19432594	19432445	Y	SUGP2,NCAN,ZNF14,PBX4,SUGP1,MAU2	MAU2,SUGP1	NA	NA	NA	NA	SUGP1	2560	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	19514283	19514636	19514393	Y	HOMER3,RFXANK,GMIP,GATAD2A	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	19648	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	19977247	19977754	19977315	Y	PBX4,LPAR2,ZNF101,ZNF14,ZNF682,ZNF682,ZNF506,ZNF253	ZNF506,ZNF253,ZNF93	NA	NA	NA	NA	ZNF253	2552	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	21511296	21511520	21511376	Y	NA	ZNF708,ZNF738	NA	NA	NA	NA	ZNF708	1069	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	23310606	23310980	23310793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF724P	120212	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	23530488	23530791	23530760	Y	NA	ZNF91	NA	NA	NA	NA	ZNF91	45571	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	28219787	28220540	28220091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1481908	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	28232492	28232748	28232631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1469700	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr19	28234930	28234990	28234960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1467458	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	28252106	28252716	28252616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1449732	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	28274249	28275061	28274473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1427387	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	29875607	29875962	29875787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	173159	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	30157267	30157499	30157417	Y	PLEKHF1,C19orf12,C19orf12	PLEKHF1,C19orf12	NA	NA	NA	NA	PLEKHF1	3304	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	30447917	30448294	30448014	Y	NA	URI1	NA	NA	NA	NA	URI1	35366	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	33538325	33538659	33538479	Y	RHPN2,GPATCH1,NUDT19,CEP89,C19orf40	RHPN2,GPATCH1	NA	NA	NA	NA	RHPN2	15135	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	33996867	33997517	33996997	Y	LRP3	PEPD	NA	NA	NA	NA	PEPD	13183	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr19	34310855	34311133	34311012	Y	NA	KCTD15	NA	NA	NA	NA	KCTD15	26017	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	34850085	34850642	34850351	Y	ZNF599,ZNF302,ZNF181	GPI,PDCD2L	NA	NA	NA	NA	GPI	1700	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	35491833	35492367	35492256	Y	FFAR3,FFAR2,USF2,FXYD5,FXYD5,FXYD5,GRAMD1A	ZNF792,GRAMD1A,SCN1B	NA	NA	NA	NA	GRAMD1A	8145	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	35809679	35810380	35810036	Y	GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,IGFLR1,FFAR3	NA	NA	NA	NA	NA	USF2	51798	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	36618643	36619171	36618835	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	9306	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	36720266	36720641	36720459	Y	ARHGAP33,APLP1,CLIP3,CLIP3,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF382,ZNF260,ZFP14,ZNF565,ZNF565	ZNF146,ZNF565	NA	NA	NA	NA	ZNF565	14518	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	36863070	36863255	36863179	Y	NA	ZFP14,ZFP82	NA	NA	NA	NA	ZFP14	4846	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	37424676	37424848	37424761	Y	ZNF527,HKR1,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF461,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF585B,ZNF420,ZNF383,ZNF829,ZNF829,ZNF568	ZNF829,ZNF568	NA	NA	NA	NA	ZNF568	19445	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	38433320	38433698	38433507	Y	ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1	SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	37452	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	38524876	38525374	38525157	Y	GGN,CATSPERG,ZNF540,ZNF607,WDR87	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	129008	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	38791297	38791661	38791416	Y	C19orf33	C19orf33,YIF1B,KCNK6,CATSPERG	NA	NA	NA	NA	C19orf33	1140	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr19	38807798	38808031	38807971	Y	MAP4K1,EIF3K,RASGRP4,FAM98C	C19orf33,YIF1B,KCNK6,CATSPERG	NA	NA	NA	NA	KCNK6	453	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	39148533	39148920	39148613	Y	C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12244	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr19	39149253	39149575	39149354	Y	SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12964	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	39150238	39150530	39150365	Y	NA	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	13949	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	39167742	39168127	39167771	Y	NA	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	31453	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	39182594	39182977	39182723	Y	PAK4,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	46305	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	39184148	39184440	39184342	Y	C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	47859	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr19	40751869	40752087	40752041	Y	NA	AKT2	NA	NA	NA	NA	AKT2	37356	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	40923099	40923282	40923196	Y	SHKBP1,EGLN2,EGLN2,C19orf54	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB	NA	NA	NA	NA	PRX	5826	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	41108162	41108528	41108432	Y	NA	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	11373	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	41109606	41110134	41110046	Y	SERTAD1,ITPKC,EGLN2,EGLN2,C19orf54,ADCK4,SHKBP1	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	12817	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	41120897	41121111	41120992	Y	NA	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	24108	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	41289050	41289265	41289158	Y	SERTAD3,SHKBP1,ADCK4,RAB4B,EGLN2,EGLN2	SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	RAB4B	6929	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	41681944	41682199	41682187	Y	NA	RPL36P16,CYP2S1,AXL	CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	RPL36P16	8178	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr19	41695552	41695583	41695568	Y	NA	RPL36P16,CYP2S1,AXL	NA	NA	NA	NA	CYP2S1	1371	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	41729438	41729579	41729517	Y	ATP5SL,ATP5SL,AXL	CYP2S1,AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	6330	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	41731541	41731893	41731762	Y	NA	CYP2S1,AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	8433	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr19	41814398	41814719	41814610	Y	HNRNPUL1,TMEM91,TGFB1,CCDC97,B9D2	HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1	NA	NA	NA	NA	CCDC97	304	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	41831643	41832527	41831971	Y	CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA	NA	NA	NA	NA	CCDC97	17549	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	42027706	42027846	42027786	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83084	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83703	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	42037922	42038313	42037990	Y	CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1	NA	LOC100505495	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	93300	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	42404902	42404963	42404932	Y	NA	RPS19,ARHGEF1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	19674	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	42440713	42441005	42440837	Y	ZNF574,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	20537	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	42493914	42494230	42494205	Y	TMEM145,MEGF8,GRIK5,ATP1A3	RABAC1,ATP1A3	NA	NA	NA	NA	ATP1A3	5419	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	42693167	42693275	42693248	Y	NA	DEDD2,ZNF526	NA	NA	NA	NA	DEDD2	29017	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.03549843339107
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	NA	NA	NA	NA	CIC	5303	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	42902919	42903213	42903066	Y	TMEM145	NA	CNFN	MCF7	ChIA-PET	22265404	MEGF8	75158	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	44113081	44113405	44113330	Y	NA	XRCC1,IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4	NA	NA	NA	NA	ZNF428	8621	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	44152096	44152277	44152103	Y	ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61,IRGQ	ZNF428,CADM4,PLAUR	CADM4	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	CADM4	10105	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	44179506	44179853	44179716	Y	TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61	CADM4,PLAUR	PLAUR	MCF7	ChIA-PET	22265404	PLAUR	6807	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	44281170	44281414	44281217	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	1995	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	44281524	44282142	44281780	Y	IRGQ,ZNF230,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	1267	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	44283400	44283793	44283490	Y	TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	44284114	44284247	44284152	Y	TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	705	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	44287065	44287299	44287223	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	3656	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	44288540	44288860	44288798	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	5131	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr19	44711538	44711905	44711597	Y	NA	ZNF226,ZNF227,ZNF233	NA	NA	NA	NA	ZNF227	1838	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	45189303	45189576	45189367	Y	RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3	PVR	NA	NA	NA	NA	PVR	44205	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	45195366	45195649	45195556	Y	RELB,CLASRP,BCL3	NA	NA	NA	NA	NA	PVR	50268	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	45221919	45222313	45222185	Y	NA	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	26649	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.46695611397069
chr19	45228436	45228775	45228695	Y	IGSF23,RELB,APOE,APOC4,APOC2,BCL3	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	20187	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr19	45231729	45232033	45231881	Y	IGSF23,CLASRP,APOC2	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	16929	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr19	45248499	45249479	45248793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL3	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr19	45256546	45257099	45256742	Y	ZNF296,RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	7584	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.46695611397069
chr19	45755637	45756189	45755812	Y	RELB,CLASRP,VASP	NA	NA	NA	NA	NA	BLOC1S3	75634	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	45803954	45804164	45804074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC2	68012	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr19	45844650	45844836	45844820	Y	FBXO46,PPP1R13L	ERCC2	NA	NA	NA	NA	ERCC2	27340	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	45943163	45943490	45943268	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP,FOSB,CD3EAP,PPP1R13L	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	25763	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	45945937	45946679	45946251	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22574	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr19	45980345	45980732	45980359	Y	GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	ERCC1	259	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr19	45987073	45987327	45987197	Y	NOVA2,RELB,CLASRP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	PPM1N	2708	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	45995542	45995743	45995643	Y	NANOS2,NKPD1,EXOC3L2	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	RTN2	2576	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	46012498	46012899	46012640	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	4661	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	46386037	46386278	46386146	Y	OPA3,GIPR,FBXO46,SYMPK,FOXA3	SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	IRF2BP1	1098	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr19	46683956	46684315	46684191	Y	NA	IGFL1	NA	NA	NA	NA	IGFL1	46694	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	46990645	46990746	46990709	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP38	69152	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	46992955	46993234	46993212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP38	66664	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	47062362	47062544	47062453	Y	NA	GAPDHP38,CALM3	NA	NA	NA	NA	GAPDHP38	2464	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	47142195	47142976	47142503	Y	NA	CALM3	NA	NA	NA	NA	CALM3	39864	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	47221635	47221817	47221775	Y	ZC3H4,PRKD2	PRKD2,FKRP,STRN4	NA	NA	NA	NA	PRKD2	3251	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	47394206	47394341	47394251	Y	NA	AP2S1	ARHGAP35,SAE1,NPAS1,TMEM160,ZC3H4,FKRP,STRN4,PRKD2,SLC1A5,SNAR-E,AP2S1	IMR90	Hi-C	24141950	AP2S1	41957	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	47610820	47611121	47611012	Y	NA	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	3410	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	47613231	47613789	47613256	Y	PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	742	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr19	47662714	47662828	47662771	Y	NA	SAE1,ZC3H4	NA	NA	NA	NA	ZC3H4	47705	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	47729030	47729228	47729064	Y	NA	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	BBC3	4795	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	47746329	47746738	47746506	Y	SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	CCDC9	10499	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	606	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.862915361159228
chr19	47783225	47783533	47783379	Y	ZNF541	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	7083	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	47792934	47793257	47793053	Y	NA	CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	16792	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr19	47818553	47819137	47818792	Y	ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,C5AR1,GPR77	PRR24,DHX34	NA	NA	NA	NA	DHX34	31401	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	47874632	47874802	47874721	Y	GLTSCR2,ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,GLTSCR1,DHX34	DHX34,MEIS3	NA	NA	NA	NA	DHX34	24094	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	47950200	47950556	47950503	Y	SLC8A2	MEIS3,KPTN	NA	NA	NA	NA	MEIS3	29420	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	48016024	48016351	48016088	Y	SULT2A1,CCDC9,GPR77,DHX34,NAPA	KPTN,NAPA	NA	NA	NA	NA	NAPA	146	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.03549843339107
chr19	48101913	48102072	48101991	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85416	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	48903013	48903207	48903134	Y	PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1	TMEM143,SYNGR4,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10203	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr19	48927915	48927964	48927940	Y	NA	KDELR1,GRWD1,CYTH2	NA	NA	NA	NA	GRWD1	19066	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	49092091	49092636	49092297	Y	BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11	SPHK2,RPL18,DBP	NA	NA	NA	NA	SPHK2	27912	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	49315464	49315783	49315738	Y	NA	BCAT2	NA	NA	NA	NA	BCAT2	3178	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr19	49465555	49466264	49465736	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	294	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr19	49482691	49482925	49482812	Y	NA	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	11642	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	49495555	49495708	49495609	Y	SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	850	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr19	49577003	49577438	49577313	Y	SULT2B1,MAMSTR,KCNA7	SNRNP70,LIN7B,C19orf73,PPFIA3	NA	NA	NA	NA	SNRNP70	9238	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	49710890	49711280	49711224	Y	IZUMO1,PPP1R15A,RPS11,FCGRT,CD37	NA	NA	NA	NA	NA	TRPM4	51892	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	49924099	49924476	49924276	Y	TBC1D17,RRAS,RCN3,PRR12,NOSIP,AP2A1	ALDH16A1,PIH1D1	NA	NA	NA	NA	ALDH16A1	29950	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	50116585	50116794	50116665	Y	NA	NOSIP,PRR12,RRAS,SCAF1	NA	NA	NA	NA	PRR12	23685	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr19	50141205	50141513	50141452	Y	AKT1S1,TRPM4,RCN3,AP2A1,RRAS	NOSIP,PRR12,SCAF1,BCL2L12,IRF3,PRMT1	NA	NA	NA	NA	RRAS	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr19	50640094	50640250	50640214	Y	KCNC3	MYH14	NA	NA	NA	NA	MYH14	49193	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	50825197	50825861	50825498	Y	NA	NR1H2,KCNC3	NA	NA	NA	NA	NR1H2	5049	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	50860908	50861268	50861186	Y	PNKP,VRK3,NR1H2	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	24193	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	50872495	50872846	50872654	Y	NA	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	12615	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr19	51010284	51010518	51010437	Y	KLK4,ACPT,SYT3,SHANK1,LOC342918	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	2092	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	51059089	51059663	51059341	Y	KLK4,KLK6,ACPT,SYT3,LOC342918,LRRC4B	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	46479	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	51059944	51060288	51060130	Y	NA	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	47334	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	51287900	51288107	51288100	Y	NA	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	18079	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	51339255	51339614	51339393	Y	KLK14,IGLON5,LRRC4B,SYT3,SYT3	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	33069	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr19	51640125	51640352	51640134	Y	SIGLEC12,SIGLEC10,CD33,SIGLEC9	CTU1	NA	NA	NA	NA	CTU1	30498	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	119534	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr19	52192842	52193550	52192951	Y	ZNF615,IGLON5,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	120291	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	52193633	52193945	52193814	Y	ZNF836,ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC8,SIGLEC6,FPR2,FPR2,FPR1	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	121082	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	52194594	52195259	52195000	Y	ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	122043	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	52697339	52697517	52697506	Y	ZNF350,ZNF432,ZNF836,ZNF83,ZNF808,ZNF766	ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	PPP2R1A	6047	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	53426305	53426488	53426354	Y	ZNF765,ZNF468,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	17366	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	53592651	53593387	53593361	Y	NA	ZNF160	NA	NA	NA	NA	ZNF160	11302	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	ZNF665	NA	NA	NA	NA	ZNF665	32764	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr19	53917190	53917573	53917346	Y	NA	ZNF765,ZNF761	NA	NA	NA	NA	ZNF761	15654	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	54523388	54523781	54523608	Y	TARM1,VSTM1,RPS9,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LENG8,LAIR2,LAIR1,ZNF331,ZNF331,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM	NA	NA	NA	NA	NA	OSCAR	80219	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	54714720	54715094	54714879	Y	NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6	MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	12110	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	55038222	55038527	55038355	Y	NA	NA	KIR3DX1	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP5	55811	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	55721470	55721547	55721521	Y	NA	PTPRH,PPP6R1	NA	NA	NA	NA	PTPRH	2596	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	55917170	55917359	55917333	Y	U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S	TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	UBE2S	25	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	55983917	55984059	55984005	Y	RDH13,HSPBP1,ISOC2	ISOC2,ZNF628,NAT14	ZNF628,ISOC2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF628	1640	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	56061327	56061704	56061673	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1	SGK110	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF579	28507	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr19	56117286	56117783	56117722	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	5950	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	56148080	56148375	56148228	Y	ZNF580	ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2,EPN1	NA	NA	NA	NA	CCDC106	2053	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr19	56218548	56218666	56218607	Y	SUV420H2,NLRP9,U2AF2	EPN1	NA	NA	NA	NA	EPN1	33956	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	56621885	56622165	56622061	Y	NA	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	8484	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	56795373	56795512	56795477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN5A	82240	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	56823857	56823998	56823922	Y	ZSCAN5A	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN5A	53754	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	56831287	56831644	56831534	Y	ZSCAN5A	ZSCAN5A	NA	NA	NA	NA	ZSCAN5A	46108	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	57944833	57945004	57944919	Y	NA	ZNF548,ZNF17,ZNF749,ZNF772	NA	NA	NA	NA	ZNF749	136	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	58162762	58163096	58162801	Y	NA	ZNF134,ZNF211,ZNF551	NA	NA	NA	NA	ZNF211	23001	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	58175767	58176046	58175802	Y	ZNF460,ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,ZNF772,ZNF549,ZSCAN18,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF776,ZNF671,ZNF586,ZNF418,ZNF417,ZNF256,ZNF135,ZNF550,ZNF211,ZNF551	ZNF211,ZNF551	NA	NA	NA	NA	ZNF551	15291	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	58315114	58315751	58315446	Y	ZNF543,ZNF549,ZNF418,ZNF135,ZNF154,ZNF552	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	8530	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	58413801	58413982	58413868	Y	ZNF154,ZNF418	ZNF417	NA	NA	NA	NA	ZNF417	11996	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	58415823	58415990	58415970	Y	NA	ZNF417	NA	NA	NA	NA	ZNF417	9988	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	58557282	58557656	58557471	Y	NA	CTD-2368P22.1,ZNF606	NA	NA	NA	NA	ZNF606	44565	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr19	59029635	59029989	59029796	Y	NA	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M	SLC27A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC27A5	7855	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	59050036	59050316	59050176	Y	ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,ZNF132,ZNF324B,ZNF324,TRIM28,MZF1	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752	NA	NA	NA	NA	ZBTB45	1758	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr19	59078228	59078288	59078258	Y	CHMP2A,CHMP2A	ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752	NA	NA	NA	NA	CENPBD1P1	4582	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	1608037	1608218	1608215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM18	932598	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	2850815	2851100	2850821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	528553	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	3226385	3226781	3226690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	152872	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	8274361	8274658	8274538	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC011747.4	447264	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	8872785	8872976	8872902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ID2	55810	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	9374844	9375591	9375054	Y	YWHAQ,ASAP2	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	29950	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr2	9411571	9411694	9411610	Y	ADAM17	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	66677	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	9427801	9428115	9428020	Y	YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	82907	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	9678248	9678641	9678477	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	15280	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	9688603	9688902	9688848	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	5019	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	9705660	9705808	9705714	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	11739	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr2	9879413	9880120	9879773	Y	ADAM17	NA	ADAM17,YWHAQ,IAH1,KLF11,ITGB1BP1	IMR90	Hi-C	24141950	TAF1B	101363	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	9893339	9893657	9893442	Y	ADAM17,KLF11,KLF11	NA	YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	TAF1B	87826	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	9894353	9894610	9894569	Y	ADAM17,KLF11,KLF11,GRHL1	NA	YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1,KLF11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TAF1B	86873	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	10075100	10075410	10075131	Y	TAF1B	GRHL1	GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL1	7931	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr2	10423423	10423670	10423576	Y	NA	HPCAL1	RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPCAL1	17345	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	10425680	10425925	10425803	Y	HPCAL1	HPCAL1	HPCAL1,RRM2,C2orf48,MIR4261	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPCAL1	15090	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	10430004	10430228	10430116	Y	NA	HPCAL1	HPCAL1,C2orf48,CYS1,RRM2,MIR4261,ODC1,NOL10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPCAL1	10787	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr2	10441145	10441558	10441458	Y	KLF11	HPCAL1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	HPCAL1	130	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	2.67503761959361
chr2	10471190	10471549	10471320	Y	HPCAL1,HPCAL1	HPCAL1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	HPCAL1	30175	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	10489892	10489997	10489924	Y	HPCAL1	HPCAL1	NA	NA	NA	NA	HPCAL1	48877	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	10501440	10501782	10501611	Y	C2orf48	NA	NA	NA	NA	NA	HPCAL1	60425	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	10549320	10549595	10549372	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	NA	NA	NA	NA	ODC1	37035	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	10550434	10550795	10550555	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	ODC1	35835	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr2	10572027	10572239	10572154	Y	NA	ODC1,RP11-320M2.1	NA	NA	NA	NA	ODC1	14391	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	10633765	10634017	10633925	Y	NOL10	ODC1,RP11-320M2.1	ODC1,HPCAL1,NOL10,CYS1,RRM2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-320M2.1	46945	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	11270081	11270242	11270156	Y	KCNF1,C2orf50	PQLC3	NA	NA	NA	NA	PQLC3	23082	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	11352501	11352895	11352887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLC3	59177	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	11970305	11970612	11970555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPIN1	154584	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	12596433	12596805	12596535	Y	NA	NA	LPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	258210	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	12633247	12633315	12633291	Y	NA	NA	TRIB2,LPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	221700	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	12703835	12703993	12703936	Y	NA	NA	TRIB2	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	151022	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	12856062	12856442	12856137	Y	NA	TRIB2	NA	NA	NA	NA	TRIB2	1047	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr2	15282327	15282677	15282506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	416777	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	15332010	15332377	15332192	Y	DDX1,NBAS	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	367077	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	15481171	15481552	15481362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	217902	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	15561739	15562014	15561765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	137440	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	16576517	16576693	16576605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49A	268906	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	19464609	19464927	19464768	Y	NA	NA	NT5C1B-RDH14	IMR90	Hi-C	24141950	OSR1	91487	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	19547126	19547267	19547173	Y	NA	OSR1	NA	NA	NA	NA	OSR1	9147	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	20176136	20176469	20176303	Y	WDR35	WDR35	NA	NA	NA	NA	WDR35	11423	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	20491517	20491908	20491876	Y	NA	NA	SDC1	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	58087	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	20534195	20534238	20534216	Y	NA	PUM2	NA	NA	NA	NA	PUM2	15757	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	20624612	20624982	20624777	Y	HS1BP3	RHOB	HS1BP3,RHOB,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	RHOB	19853	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	20638245	20638508	20638456	Y	HS1BP3	RHOB	HS1BP3,GDF7	IMR90	Hi-C	24141950	RHOB	6327	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	20793103	20793496	20793437	Y	APOB	NA	HS1BP3,RHOB,PUM2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	55353	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	20817015	20817334	20817182	Y	RHOB,GDF7	HS1BP3	NA	NA	NA	NA	HS1BP3	31515	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	20965440	20965780	20965672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf43	55102	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	23901267	23901426	23901347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	246558	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	24213695	24213947	24213707	Y	NA	SDHCP3	NA	NA	NA	NA	SDHCP3	48979	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	24491623	24491942	24491630	Y	ATAD2B,NCOA1,ITSN2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL36AP13	63439	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	24491972	24492409	24492370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL36AP13	62972	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	24941895	24942247	24942153	Y	NCOA1	NA	NA	NA	NA	NA	CENPO	71758	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	25545894	25546051	25546003	Y	NA	DNMT3A	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	17408	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	25701614	25701880	25701747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	138155	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	26220678	26220902	26220866	Y	RAB10	KIF3C,UQCRHP2,RAB10	ASXL2,RAB10,FAM59B,KIF3C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UQCRHP2	5015	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	26352135	26352230	26352183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB10	97159	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	26521727	26522029	26521734	Y	NA	EPT1,GPR113	NA	NA	NA	NA	EPT1	7386	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	26946934	26947339	26946998	Y	C2orf28,C2orf28,HADHA,HADHB,C2orf18	AC015977.5,CENPA	NA	NA	NA	NA	CENPA	37818	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	26980806	26981182	26980970	Y	C2orf18	CENPA	OTOF,CENPA,C2orf70,CIB4,KCNK3,DPYSL5,MAPRE3,C2orf18	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CENPA	3975	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	27005355	27005756	27005547	Y	NA	CENPA	NA	NA	NA	NA	CENPA	20198	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	27304052	27304486	27304234	Y	CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1	AGBL5,OST4,KHK,CGREF1,ABHD1	NA	NA	NA	NA	KHK	3129	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	27557346	27557529	27557503	Y	DPYSL5,C2orf16	MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513	NA	NA	NA	NA	MPV17	10799	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	27958320	27958698	27958604	Y	NA	MRPL33	BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL33	33886	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr2	28383730	28384110	28383893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	229205	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	28668874	28669088	28668964	Y	PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	BRE,RBKS,PLB1	IMR90	Hi-C	24141950	FOSL2	55559	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	29055098	29055343	29055221	Y	SPDYA	TRMT61B	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	35824	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	29173330	29173730	29173529	Y	PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43	NA	NA	NA	NA	NA	WDR43	57821	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	29339148	29339698	29339489	Y	NA	CLIP4	NA	NA	NA	NA	CLIP4	20577	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	29485561	29485725	29485698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIP4	166990	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	30458307	30458498	30458425	Y	YPEL5,LBH	LBH,AC104698.1	NA	NA	NA	NA	LBH	5910	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	30704285	30704557	30704478	Y	NA	LCLAT1	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	36193	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	32166229	32166498	32166237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMO1	67801	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	33702756	33702976	33702846	Y	RASGRP3,RASGRP3	RASGRP3	NA	NA	NA	NA	RASGRP3	43365	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	33805444	33805464	33805454	Y	RASGRP3	FAM98A	NA	NA	NA	NA	FAM98A	16985	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	36584242	36585529	36584872	Y	FEZ2,CRIM1	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	3173	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr2	36761840	36762400	36762263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	108830	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	36790527	36791707	36791646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79523	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	37103475	37103824	37103655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	87791	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	37383262	37383336	37383288	Y	NA	EIF2AK2,AC007390.4	NA	NA	NA	NA	EIF2AK2	1054	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	37491311	37491687	37491498	Y	NA	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	34455	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	37789550	37789826	37789587	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	173785	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	37864248	37864629	37864487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	98982	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	37884022	37884434	37884213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	79177	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	38315585	38315885	38315608	Y	CDC42EP3,CYP1B1	CYP1B1	CYP1B1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CYP1B1	19159	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	38398414	38398595	38398505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P12	58115	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	38552581	38552739	38552658	Y	NA	ATL2	NA	NA	NA	NA	ATL2	49688	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	38621174	38621326	38621250	Y	NA	ATL2	ATL2,HNRPLL,SRSF7,DHX57,FAM82A1,GALM	IMR90	Hi-C	24141950	ATL2	18747	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	39079289	39079498	39079407	Y	SRSF7,ARHGEF33	DHX57,MORN2	NA	NA	NA	NA	DHX57	21577	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	39334876	39335293	39335230	Y	NA	SOS1	NA	NA	NA	NA	SOS1	14193	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	40899157	40899397	40899276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THUMPD2	894750	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	42068299	42068635	42068587	Y	NA	NA	EML4	IMR90	Hi-C	24141950	PKDCC	204525	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	42329971	42330163	42329978	Y	NA	NA	EML4	IMR90	Hi-C	24141950	PKDCC	56811	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	42360195	42360705	42360352	Y	EML4	EML4	EML4,COX7A2L,LOC388942	IMR90	Hi-C	24141950	EML4	33785	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	42412542	42412681	42412587	Y	NA	EML4	NA	NA	NA	NA	EML4	18052	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	42481657	42481775	42481735	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	EML4	87167	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	43037224	43037999	43037611	Y	NA	HAAO	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HAAO	19491	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr2	43302253	43302513	43302383	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	149235	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	43385938	43386506	43386186	Y	OXER1,ZFP36L2	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	65242	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr2	43405877	43406433	43406206	Y	OXER1	ZFP36L2	ZFP36L2,THADA,LOC100129726	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	45315	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	43421229	43421631	43421263	Y	HAAO,THADA,THADA	ZFP36L2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	30117	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	43422005	43422472	43422185	Y	THADA,THADA,ZFP36L2	ZFP36L2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	29276	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	43440136	43440508	43440361	Y	OXER1,ZFP36L2	ZFP36L2	NA	NA	NA	NA	ZFP36L2	11240	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	43686078	43686091	43686085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THADA	135094	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	43705862	43706134	43705998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THADA	115051	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	44007303	44007575	44007439	Y	NA	DYNC2LI1	NA	NA	NA	NA	DYNC2LI1	8125	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	44518633	44519032	44518761	Y	NA	SLC3A1	NA	NA	NA	NA	SLC3A1	18034	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	45160746	45160936	45160765	Y	SIX3	RP11-89K21.1,SIX3,SIX3-AS1	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	3402	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	45161073	45161475	45161220	Y	SIX3	RP11-89K21.1,SIX3,SIX3-AS1	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	2863	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	45164223	45164580	45164499	Y	NA	SIX3,SIX3-AS1	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	45164818	45165169	45165126	Y	NA	RP11-89K21.1,SIX3,SIX3-AS1	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	480	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.46695611397069
chr2	46825586	46825695	46825639	Y	NA	CRIPT,PIGF	NA	NA	NA	NA	CRIPT	15860	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	47195176	47195614	47195246	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	28182	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	47197841	47198107	47197954	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	30847	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	47213827	47213985	47213928	Y	NA	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	46833	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	47229826	47230084	47229931	Y	TTC7A	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	62832	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	47270774	47271231	47270943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	103780	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	47499706	47499760	47499719	Y	C2orf61	NA	TTC7A,CALM2,SOCS5,MCFD2,C2orf61	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC073283.4	70453	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	47946812	47947044	47946928	Y	NA	AC079250.1,MSH6	KCNK12	IMR90	Hi-C	24141950	MSH6	26143	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	47979563	47979754	47979705	Y	NA	NA	KCNK12,MSH2,MSH6	IMR90	Hi-C	24141950	MSH6	58894	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	48737563	48737807	48737675	Y	STON1-GTF2A1L,STON1	STON1	NA	NA	NA	NA	STON1	16715	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	51010628	51010803	51010737	Y	NRXN1,NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	STON1	2256106	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	53162553	53162576	53162564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHAC2	830353	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	53966054	53966447	53966241	Y	PSME4	CHAC2,ERLEC1	NA	NA	NA	NA	CHAC2	26482	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	54019039	54019374	54019207	Y	ACYP2,ASB3,ASB3,GPR75	CHAC2,ERLEC1	NA	NA	NA	NA	ERLEC1	6858	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	54285444	54285567	54285472	Y	NA	NA	SPTBN1,EML6,PSME4	IMR90	Hi-C	24141950	PSME4	89467	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	54682152	54682577	54682442	Y	NA	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	730	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	54786900	54787386	54787056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	105478	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	2.32987147512992
chr2	54796924	54797237	54797074	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	115502	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	54799241	54799892	54799606	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	117819	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	54800045	54800558	54800206	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	118623	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	54816609	54817000	54816923	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	EML6	131636	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	54845847	54845943	54845895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EML6	102693	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	55249584	55250267	55249993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	87490	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	55360803	55361407	55361172	Y	SMEK2,CCDC88A,RTN4	RTN4	RTN4,C2orf63,EML6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RTN4	23046	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr2	55450545	55450658	55450592	Y	CCDC88A,EML6,RTN4	RPS27A,MTIF2	NA	NA	NA	NA	RPS27A	6381	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	56276359	56276680	56276532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFEMP1	127085	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	58002154	58002414	58002211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	130372	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	58334895	58335527	58335141	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	130980	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	58336722	58337105	58336916	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	129402	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr2	58339709	58340405	58340032	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	126102	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	58384642	58384701	58384672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	81806	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	60962204	60962802	60962781	Y	NA	PAPOLG	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	18563	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	61204524	61204872	61204698	Y	NA	PEX13,PUS10	REL	IMR90	Hi-C	24141950	PEX13	37488	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	61466894	61467158	61467026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHSA2	64341	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	61580039	61580318	61580309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	115586	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	61757728	61758222	61758112	Y	NA	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	5539	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	61921641	61922071	61921953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM161A	157207	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	61990946	61991094	61991044	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	88184	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.38066457785476
chr2	62424513	62424632	62424578	Y	B3GNT2	B3GNT2	NA	NA	NA	NA	B3GNT2	3265	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	62805190	62805410	62805295	Y	NA	NA	EHBP1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM17	68161	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	63122149	63122353	63122251	Y	EHBP1,EHBP1,OTX1	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	152839	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	63446182	63446204	63446197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	170990	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	64239166	64239247	64239208	Y	PELI1	VPS54	NA	NA	NA	NA	VPS54	4959	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	64364775	64365257	64365170	Y	NA	AC074289.1,PELI1	NA	NA	NA	NA	AC074289.1	3116	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	64756167	64756526	64756224	Y	NA	AFTPH	NA	NA	NA	NA	AFTPH	6702	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	64836549	64836646	64836605	Y	SLC1A4,PELI1,SERTAD2,AFTPH	NA	NA	NA	NA	NA	AFTPH	87084	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	64879615	64879792	64879667	Y	SERTAD2	NA	LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	96347	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	64978173	64978610	64978385	Y	CEP68	SERTAD2	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	2034	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	64994926	64995226	64995021	Y	SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2	SERTAD2	SERTAD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	18787	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr2	65058327	65058875	65058618	Y	AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	82188	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	65065938	65066285	65066136	Y	AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	89799	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	65086968	65087262	65087080	Y	AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	110829	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	65093958	65094266	65094153	Y	NA	NA	SERTAD2,AFTPH,LOC339807	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SERTAD2	117819	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	65583296	65583698	65583484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRED2	74073	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	65634027	65634394	65634212	Y	NA	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	23377	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.03549843339107
chr2	65804222	65804385	65804306	Y	RAB1A	NA	ACTR2,SPRED2	IMR90	Hi-C	24141950	SPRED2	146451	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	66673073	66673647	66673570	Y	NA	MEIS1	NA	NA	NA	NA	MEIS1	14489	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr2	68428934	68429266	68429100	Y	NA	WDR92,PNO1	NA	NA	NA	NA	PNO1	45958	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	68432380	68432395	68432387	Y	NA	WDR92,PNO1,PPP3R1	NA	NA	NA	NA	PPP3R1	48974	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	68472906	68473226	68473141	Y	PPP3R1	PPP3R1	NA	NA	NA	NA	PPP3R1	8143	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	68654356	68654764	68654592	Y	FBXO48,APLF,PLEK	FBXO48,APLF	NA	NA	NA	NA	FBXO48	37626	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	69135600	69135857	69135778	Y	NA	NA	ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10	IMR90	Hi-C	24141950	APLF	442907	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	69533320	69533461	69533391	Y	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	NA	GFPT1	78921	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	69536922	69537085	69537004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFPT1	75297	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	69989990	69990667	69990520	Y	NA	NA	GMCL1	IMR90	Hi-C	24141950	GMCL1	64107	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	69997386	69997753	69997552	Y	PCBP1,MXD1	NA	NA	NA	NA	NA	GMCL1	57021	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	70048617	70048893	70048741	Y	ANXA4	GMCL1	NA	NA	NA	NA	GMCL1	5881	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	70057532	70057914	70057667	Y	C2orf42,AAK1,GMCL1	GMCL1	NA	NA	NA	NA	GMCL1	2758	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	70141198	70141461	70141241	Y	NA	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	18378	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	70144957	70145388	70145176	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	22137	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	70608938	70609447	70609175	Y	TGFA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM136A	81716	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	70667389	70667575	70667482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFA	111750	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	70823463	70823663	70823562	Y	TGFA	TGFA	NA	NA	NA	NA	TGFA	44138	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	73337911	73338195	73338053	Y	NA	SFXN5,RAB11FIP5	NA	NA	NA	NA	SFXN5	37164	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	73338552	73338952	73338867	Y	RAB11FIP5	SFXN5,RAB11FIP5	NA	NA	NA	NA	SFXN5	37805	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	73404053	73404270	73404162	Y	EGR4	RAB11FIP5,SMYD5	EMX1,RAB11FIP5,SFXN5,NOTO,PRADC1,CCT7,SMYD5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAB11FIP5	22204	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	74152201	74152400	74152268	Y	NA	DGUOK	NA	NA	NA	NA	DGUOK	248	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	74259703	74260366	74260024	Y	NA	AC073046.25,TET3	TET3,ACTG2,BOLA3	IMR90	Hi-C	24141950	TET3	31863	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	74765672	74765911	74765792	Y	WBP1,LBX2,LOXL3,DOK1	LBX2,PCGF1,TLX2,HTRA2,AUP1,DOK1	NA	NA	NA	NA	DOK1	8242	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	75063027	75063135	75063034	Y	HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	3919	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	75072652	75072899	75072736	Y	HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	13544	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	75912574	75912759	75912685	Y	NA	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	GCFC2	23356	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	77536393	77536550	77536540	Y	LRRTM4	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	476958	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	85147093	85147556	85147171	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	16344	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	85154234	85154422	85154323	Y	NA	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	23485	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	85173188	85173797	85173736	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	KCMF1,TMSB10	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KCMF1	22419	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr2	85664544	85665596	85664830	Y	KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6	CAPG	NA	NA	NA	NA	CAPG	20989	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	85764802	85765239	85764815	Y	SH2D6,USP39	MAT2A,GGCX,VAMP8,VAMP5	NA	NA	NA	NA	MAT2A	514	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	85887180	85887589	85887391	Y	SH2D6,SFTPB	C2orf68	NA	NA	NA	NA	C2orf68	49991	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	86113603	86114063	86113862	Y	CAPG,GNLY,ST3GAL5	ST3GAL5	LOC284950	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL5	74	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	86284876	86285205	86285126	Y	NA	POLR1A,PTCD3	NA	NA	NA	NA	POLR1A	46073	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	86388217	86388607	86388413	Y	NA	IMMT,MRPL35	NA	NA	NA	NA	IMMT	32286	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	86922220	86922584	86922381	Y	NA	RMND5A,CHMP3,RNF103-CHMP3	NA	NA	NA	NA	RMND5A	22712	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	89871741	89871869	89871793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	882579	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	91815672	91815808	91815787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2826510	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	96348390	96348623	96348461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAHD2A	281921	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	96782666	96782871	96782861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD7	89692	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	96922307	96922515	96922363	Y	DUSP2,KIAA1310,ARID5A,TMEM127	STARD7,TMEM127,CIAO1,SNRNP200	NA	NA	NA	NA	TMEM127	7217	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	97206009	97206227	97206118	Y	NA	NEURL3,ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	5529	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	97291626	97292008	97291852	Y	NA	FER1L5,KANSL3	NA	NA	NA	NA	FER1L5	14466	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	97330891	97331185	97331060	Y	TMEM127,ARID5A,KIAA1310	FER1L5,KANSL3	NA	NA	NA	NA	KANSL3	24367	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-8P	164017	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	98485830	98486136	98485916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	124252	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VWA3B	121353	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr2	99064911	99065194	99064955	Y	MGAT4A,MGAT4A,INPP4A	INPP4A	NA	NA	NA	NA	INPP4A	5594	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	99121825	99122251	99122089	Y	INPP4A	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4A	62508	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	99213145	99213306	99213215	Y	INPP4A	COA5,UNC50	NA	NA	NA	NA	COA5	9672	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	100082054	100082282	100082201	Y	NA	REV1	NA	NA	NA	NA	REV1	22215	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	100104968	100105518	100105262	Y	REV1	REV1	NA	NA	NA	NA	REV1	471	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	100907600	100907945	100907823	Y	NA	LONRF2	NA	NA	NA	NA	LONRF2	29250	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	100908504	100908788	100908727	Y	NA	LONRF2	NA	NA	NA	NA	LONRF2	28407	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	100937334	100937484	100937407	Y	LONRF2	LONRF2	NA	NA	NA	NA	LONRF2	139	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr2	101435496	101435968	101435616	Y	NPAS2	NPAS2	NA	NA	NA	NA	NPAS2	882	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr2	101680419	101680493	101680454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL31	64242	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	101712877	101712902	101712892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL31	96700	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	101872333	101872649	101872491	Y	RNF149	TBC1D8,SNORD89	NA	NA	NA	NA	TBC1D8	5005	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	102669658	102669754	102669731	Y	IL1R1	IL1R1	IL1R2,IL1R1,IL1RL2	IMR90	Hi-C	24141950	IL1R1	9250	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	102854655	102855173	102854991	Y	IL1R1	NA	NA	NA	NA	NA	IL18R1	70816	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	105973379	105973614	105973553	Y	NA	TGFBRAP1,C2orf49	NA	NA	NA	NA	C2orf49	21563	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	106008939	106009297	106009286	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	43673	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.121789969507
chr2	106009982	106010344	106010250	Y	FHL2,FHL2	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	42626	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	106020017	106020290	106020154	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	32680	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	106020631	106021071	106020783	Y	FHL2,FHL2	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	31899	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	106474357	106474542	106474414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	115003	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	108841436	108841459	108841449	Y	NA	NA	SULT1C2P1	IMR90	Hi-C	24141950	SULT1C2	61636	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	109201604	109202307	109201998	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	52747	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	109206329	109206788	109206425	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	57472	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	109506497	109506716	109506551	Y	LIMS1,CCDC138,EDAR	NA	NA	NA	NA	NA	EDAR	97112	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	110318153	110318301	110318244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT10	51482	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	110319562	110319852	110319693	Y	NA	SEPT10	NA	NA	NA	NA	SEPT10	49931	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	110859077	110859497	110859213	Y	NA	MALL	NA	NA	NA	NA	MALL	12646	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	110871797	110872011	110872000	Y	MALL	MALL	NA	NA	NA	NA	MALL	132	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	2.93391222794138
chr2	112417011	112417329	112417184	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90	Hi-C	24141950	ANAPC1	222938	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr2	112456456	112456792	112456629	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	183475	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	112811776	112811937	112811878	Y	ZC3H6	TMEM87B	NA	NA	NA	NA	TMEM87B	976	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	113292630	113292957	113292832	Y	IL1A	POLR1B,CHCHD5	NA	NA	NA	NA	POLR1B	4535	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	113380153	113380493	113380323	Y	IL1A	CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	AC079922.2	2409	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	113384986	113385271	113385131	Y	NA	CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	AC079922.2	7242	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr2	113388786	113388926	113388836	Y	NA	CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	AC079922.2	11042	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr2	113450039	113450435	113450231	Y	IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A	SLC20A1	SLC20A1,FLJ42351	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC20A1	48605	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	113450750	113451037	113450852	Y	NA	SLC20A1	SLC20A1,FLJ42351	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC20A1	49316	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	114014908	114015299	114015271	Y	NA	PAX8-AS1	NA	NA	NA	NA	PAX8-AS1	47809	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	114082449	114082815	114082523	Y	NA	NA	PAX8,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	PAX8-AS1	115350	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr2	114469366	114469830	114469722	Y	SLC35F5	MIR4782,SLC35F5	NA	NA	NA	NA	MIR4782	7115	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr2	118309015	118309417	118309218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX18	260809	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	118847045	118847263	118847087	Y	INSIG2	INSIG2	NA	NA	NA	NA	INSIG2	3017	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	119067655	119067950	119067737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC093901.1	125693	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	119068196	119068550	119068541	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC093901.1	126234	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	120960813	120961129	120961026	Y	TMEM185B,RALB	AC012363.4,TMEM185B,RALB	NA	NA	NA	NA	AC012363.4	10991	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	120996274	120996566	120996498	Y	NA	AC012363.4,TMEM185B,RALB	EPB41L5,RALB,TMEM185B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RALB	634	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr2	121011894	121012098	121011996	Y	TMEM185B,RALB	AC012363.4,TMEM185B,RALB	NA	NA	NA	NA	RALB	16254	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	121495235	121495636	121495561	Y	NA	GLI2	GLI2	IMR90	Hi-C	24141950	GLI2	4036	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	121614859	121615272	121615044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	123660	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	121624920	121625080	121625001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	133721	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr2	122297511	122297730	122297621	Y	NA	RNU4ATAC	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC	11054	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	122480192	122480543	122480332	Y	NA	TSN	NA	NA	NA	NA	TSN	12136	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	127824493	127824859	127824771	Y	MAP3K2,IWS1,BIN1	BIN1	NA	NA	NA	NA	BIN1	38072	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	127975624	127975823	127975720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP27C1	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	128090505	128090721	128090714	Y	NA	ERCC3	NA	NA	NA	NA	ERCC3	40753	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	128136277	128136580	128136554	Y	NA	MAP3K2	CYP27C1,IWS1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K2	7461	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	128143711	128144108	128144023	Y	SFT2D3,MAP3K2	NA	CYP27C1,IWS1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K2	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	128258405	128258697	128258648	Y	NA	RNU4-48P,IWS1,MYO7B	NA	NA	NA	NA	IWS1	23765	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	128283052	128283292	128283172	Y	MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L	IWS1,MYO7B	NA	NA	NA	NA	IWS1	590	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	128562322	128562673	128562571	Y	NA	WDR33	LIMS2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR33	4088	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	128598749	128599093	128599053	Y	IWS1,SFT2D3,AMMECR1L	WDR33,POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	14638	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	129073927	129074235	129074112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS6ST1	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	131485043	131485533	131485339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM168B	363500	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	131555592	131555820	131555689	Y	CCDC115	NA	PLEKHB2,FAM168B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM168B	293213	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	131828545	131828813	131828794	Y	NA	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	FAM168B	20220	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	133204437	133204733	133204517	Y	LYPD1	GPR39	NA	NA	NA	NA	GPR39	32290	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	133226429	133226806	133226618	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR39	54282	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	133319536	133319741	133319639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD1	107411	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	133407314	133407482	133407398	Y	LYPD1,LYPD1	LYPD1	NA	NA	NA	NA	LYPD1	19670	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	133433715	133433886	133433800	Y	NA	LYPD1	NA	NA	NA	NA	LYPD1	6563	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr2	134878523	134878632	134878609	Y	MGAT5	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	2969	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	134878887	134879265	134878997	Y	NA	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	3333	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	135691118	135691392	135691265	Y	TMEM163,ACMSD,CCNT2	CCNT2,CCNT2-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNT2-AS1	16838	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	135701216	135701448	135701313	Y	NA	CCNT2,CCNT2-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNT2-AS1	26936	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	136268329	136268541	136268430	Y	NA	ZRANB3,R3HDM1	NA	NA	NA	NA	ZRANB3	18265	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	136632932	136633416	136633308	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	MCM6	NA	NA	NA	NA	MCM6	936	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	136720209	136720558	136720339	Y	NA	AC093391.2,DARS	NA	NA	NA	NA	AC093391.2	20188	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	136870879	136871100	136870977	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	CXCR4	NA	NA	NA	NA	CXCR4	2635	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	137003597	137004126	137003957	Y	CXCR4,CXCR4	NA	NA	NA	NA	NA	CXCR4	129862	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	139112246	139112514	139112380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC097721.2	144754	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	139226248	139226635	139226522	Y	NA	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	AC097721.2	30633	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	142385646	142386021	142386018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	501249	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	142471212	142471452	142471332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	415818	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	143580379	143580549	143580472	Y	KYNU	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	52518	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	143630782	143631707	143631171	Y	KYNU	KYNU	NA	NA	NA	NA	KYNU	1360	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	143852347	143852525	143852358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	219280	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	145116388	145116823	145116635	Y	NA	GTDC1	ZEB2,ARHGAP15,GTDC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GTDC1	28253	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	145444229	145444926	145444607	Y	ZEB2	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	356094	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	148279824	148280174	148279855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009480.4	285741	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	149017229	149017560	149017414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ORC4	240082	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	150222263	150222576	150222421	Y	NA	LYPD6	NA	NA	NA	NA	LYPD6	37764	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	151078693	151078902	151078798	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RND3	314623	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	151330104	151330756	151330441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RND3	62769	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	152144821	152144962	152144854	Y	RIF1,RIF1,RIF1,NMI	RBM43,NMI	NA	NA	NA	NA	NMI	250	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	153309679	153309745	153309721	Y	CACNB4,CACNB4,CACNB4,FMNL2,ARL6IP6	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	119928	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	153429708	153430091	153429909	Y	PRPF40A	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6IP6	142316	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	158039321	158039798	158039630	Y	NA	NA	NR4A2,GALNT5,GPD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GALNT5	72312	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	158117931	158118105	158118018	Y	GALNT5	GALNT5	NA	NA	NA	NA	GALNT5	5821	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	158118717	158119062	158118890	Y	GALNT5	GALNT5	NA	NA	NA	NA	GALNT5	6607	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	158325372	158325693	158325539	Y	CYTIP	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR1C	157824	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	158549329	158549574	158549452	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR1C	65812	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	158658740	158658947	158658861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR1	71427	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	158970320	158970633	158970479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR1	239946	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	159749466	159749905	159749830	Y	NA	NA	LY75-CD302,TANC1,WDSUB1,BAZ2B	IMR90	Hi-C	24141950	TANC1	73241	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	160100045	160100277	160100255	Y	NA	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	41033	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	160106082	160106269	160106215	Y	MARCH7	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	35041	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	160350650	160351006	160350912	Y	MARCH7,CD302,BAZ2B	AC009506.2	NA	NA	NA	NA	AC009506.2	32883	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	160371940	160372153	160372033	Y	MARCH7,LY75,CD302,BAZ2B	NA	NA	NA	NA	NA	AC009506.2	54173	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	160411225	160411529	160411489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009506.1	58278	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	160646880	160647090	160646985	Y	NA	CD302	NA	NA	NA	NA	CD302	5663	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	160858239	160858486	160858430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2R1	58635	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	161064664	161064880	161064794	Y	NA	NA	ITGB6,RBMS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ITGB6	61519	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	161078300	161078513	161078433	Y	ITGB6	ITGB6	RBMS1,ITGB6,TANK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB6	47886	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	161083916	161084239	161083958	Y	CD302,ITGB6	ITGB6	ITGB6,TANK,RBMS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB6	42160	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	161098241	161098623	161098428	Y	ITGB6	ITGB6	TANK,ITGB6,RBMS1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB6	27776	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr2	161141907	161142179	161141926	Y	NA	ITGB6	NA	NA	NA	NA	ITGB6	15508	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	161150962	161151085	161151045	Y	CD302	ITGB6	NA	NA	NA	NA	ITGB6	24563	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	161201536	161201707	161201641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4785	60686	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	161232354	161232597	161232498	Y	NA	MIR4785	NA	NA	NA	NA	MIR4785	29796	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	161522878	161523352	161523066	Y	TANK,TANK	NA	ITGB6,RBMS1	IMR90	Hi-C	24141950	RBMS1	174573	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	161995122	161995254	161995230	Y	TANK,TANK	TANK	NA	NA	NA	NA	TANK	3703	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr2	162197345	162197490	162197464	Y	NA	PSMD14,AC009299.5	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	1508	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	162565636	162565807	162565722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPP4	363245	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	164204698	164204962	164204800	Y	NA	NA	FIGN	IMR90	Hi-C	24141950	FIGN	385560	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	164553215	164553632	164553445	Y	NA	FIGN	NA	NA	NA	NA	FIGN	36890	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	165430240	165430431	165430256	Y	NA	GRB14	NA	NA	NA	NA	GRB14	45927	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	166734901	166734996	166734949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC21B	73357	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	168858571	168859104	168858832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK39	243547	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	168977927	168978148	168978038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK39	124503	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	169409032	169409398	169409117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CERS6	98660	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	170684911	170685465	170685124	Y	PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3	SSB,METTL5,UBR3	NA	NA	NA	NA	UBR3	2943	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	171997679	171997950	171997833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLK1	87874	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	172621126	172621511	172621230	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2	79207	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	172959536	172959659	172959591	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5969	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	172960097	172960530	172960322	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5098	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	173302497	173302807	173302540	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	12415	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	173306862	173307108	173306983	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	16780	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr2	173316258	173316587	173316571	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	26176	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	174776201	174776462	174776332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP3	51968	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	174896632	174897390	174896767	Y	SP3,SP3	NA	SP3,OLA1,CDCA7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP3	68202	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	174900688	174901381	174900887	Y	SP3,SP3	NA	SP3,CDCA7,OLA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP3	72258	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	175248509	175248787	175248661	Y	SP3,SP3	CIR1,SCRN3	NA	NA	NA	NA	CIR1	9656	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	175459812	175460479	175460357	Y	CIR1,GPR155,WIPF1	NA	NA	NA	NA	NA	WIPF1	85165	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	175519164	175519290	175519227	Y	NA	WIPF1	NA	NA	NA	NA	WIPF1	26354	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	175540530	175540594	175540562	Y	CIR1,GPR155,WIPF1,WIPF1	WIPF1,H3F3AP4	NA	NA	NA	NA	WIPF1	5050	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	176866139	176866392	176866261	Y	KIAA1715	KIAA1715	NA	NA	NA	NA	KIAA1715	572	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	178100990	178101571	178101482	Y	NA	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10	NA	NA	NA	NA	MIR3128	17167	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr2	178116726	178117036	178116927	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10	NA	NA	NA	NA	MIR3128	1702	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr2	179864853	179864962	179864908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESTD1	262555	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	180006156	180006503	180006499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESTD1	121014	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	180098781	180098979	180098880	Y	NA	SESTD1	NA	NA	NA	NA	SESTD1	28538	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	182741385	182741846	182741532	Y	SSFA2	SSFA2	PPP1R1C	IMR90	Hi-C	24141950	SSFA2	12714	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	183839050	183839414	183839395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	62172	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	183950583	183950613	183950599	Y	NA	NCKAP1,DUSP19,NUP35	NA	NA	NA	NA	DUSP19	9296	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	185595976	185596316	185596146	Y	ZNF804A	NA	NA	NA	NA	NA	CACYBPP2	1125129	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	187390995	187391341	187391159	Y	NA	ZC3H15	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	42112	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	187409105	187409391	187409239	Y	ITGAV,ITGAV	ITGAV	ITGAV	MCF7	ChIA-PET	22265404	ITGAV	43401	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	187455745	187456210	187455889	Y	NA	ITGAV	NA	NA	NA	NA	ITGAV	2953	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	188326523	188326725	188326579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFPI	101762	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr2	188404228	188404596	188404560	Y	TFPI	TFPI	NA	NA	NA	NA	TFPI	23891	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	191030826	191031069	191031046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP1	175127	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	191075616	191075973	191075872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP1	130223	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	191443312	191443866	191443668	Y	NA	TMEM194B	TMEM194B	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM194B	45864	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	191815156	191815612	191815322	Y	GLS	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	40681	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	191984586	191984681	191984634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAT1	100900	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	192123995	192124097	192124046	Y	NA	MYO1B	NA	NA	NA	NA	MYO1B	16084	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	192503383	192503649	192503532	Y	OBFC2A	NA	OBFC2A	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SDPR	206332	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	192544982	192545232	192545125	Y	OBFC2A	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	164749	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	192562556	192562918	192562693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	147063	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	196427017	196427173	196427106	Y	NA	SLC39A10	SLC39A10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC39A10	11528	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	197023417	197023933	197023871	Y	NA	STK17B	NA	NA	NA	NA	STK17B	15294	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	197094907	197095094	197095003	Y	STK17B	NA	NA	NA	NA	NA	STK17B	55680	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	197097649	197097961	197097892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK17B	58422	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	197623019	197623245	197623231	Y	NA	GTF3C3	NA	NA	NA	NA	GTF3C3	39204	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	197934286	197934620	197934500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP1	143766	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	197936511	197936873	197936784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP1	145991	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	200209653	200209909	200209897	Y	SATB2,SATB2,SATB2	NA	NA	NA	NA	NA	SATB2-AS1	110514	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	200328214	200328741	200328463	Y	SATB2,SATB2,SATB2	SATB2-AS1,SATB2	NA	NA	NA	NA	SATB2	5248	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	200839985	200840279	200840201	Y	NA	C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	TYW5	21526	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	201172384	201172536	201172446	Y	NA	SPATS2L	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	3780	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	201273148	201273356	201273255	Y	CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1	NA	NA	NA	NA	NA	SGOL2	99375	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	201289842	201289940	201289893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGOL2	82791	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	201403171	201403461	201403317	Y	NA	SGOL2,KCTD18,AOX1	NA	NA	NA	NA	KCTD18	20664	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	201829288	201829721	201829590	Y	KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2	ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	2885	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	201989489	201990098	201989672	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	10662	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	201990242	201990732	201990460	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	11415	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr2	201991403	201992374	201991715	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	12576	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	201995421	201995893	201995513	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR,CASP10	NA	NA	NA	NA	CFLAR	16594	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	202078581	202078959	202078777	Y	CASP10	CASP10,CASP8	NA	NA	NA	NA	CASP8	17207	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	NA	NA	NA	NA	NA	PSMA2P3	143335	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr2	203176830	203176888	203176863	Y	NA	NOP58	NA	NA	NA	NA	NOP58	48391	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	206005178	206005232	206005204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	539482	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	206439575	206439768	206439663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	104946	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	206564438	206564682	206564481	Y	INO80D,NRP2	NRP2	NA	NA	NA	NA	NRP2	19724	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	206948392	206948813	206948647	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	INO80D	214	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	208027980	208028625	208028335	Y	CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	1366	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	208395422	208395980	208395659	Y	PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1	CREB1,AC007879.5	NA	NA	NA	NA	AC007879.5	2903	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	208609048	208609450	208609191	Y	NA	CCNYL1,FZD5	NA	NA	NA	NA	FZD5	22837	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	208622865	208623146	208623006	Y	NA	CCNYL1,FZD5	NA	NA	NA	NA	FZD5	9141	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	210046809	210047163	210046986	Y	MAP2	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2	239619	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	210872654	210873081	210872784	Y	C2orf67	RPE	NA	NA	NA	NA	RPE	7365	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	211404935	211405006	211404955	Y	CPS1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL1	64559	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	216216233	216216482	216216439	Y	NA	ATIC	NA	NA	NA	NA	ATIC	41693	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	216865894	216866240	216866102	Y	TMEM169,PECR,MREG	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	30579	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	217312390	217312696	217312543	Y	NA	SMARCAL1,RPL37A,AC098820.3	NA	NA	NA	NA	SMARCAL1	37253	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	217556283	217557311	217557110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMB3P2	82601	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	218477691	218477907	218477799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARPC2	601910	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	219198042	219198221	219198149	Y	CXCR2,ARPC2,ARPC2,CYP27A1,TMBIM1,PNKD,SLC11A1	TMBIM1,AC021016.7,AC021016.6	NA	NA	NA	NA	AC021016.7	18577	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	219270976	219271406	219271230	Y	CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1	AC021016.6,CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	9997	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	219773515	219774011	219773826	Y	USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A	CDK5R2	NA	NA	NA	NA	CDK5R2	48366	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	219774108	219774202	219774159	Y	USP37,TTLL4,NHEJ1,ANKZF1,ANKZF1	CDK5R2	NA	NA	NA	NA	CDK5R2	48175	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	220385870	220386219	220385945	Y	ACCN4	GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1	NA	NA	NA	NA	TMEM198	20166	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	220400310	220400471	220400469	Y	NA	GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1	NA	NA	NA	NA	TMEM198	5914	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	220553753	220554082	220553876	Y	NA	AC009502.1	DES,SLC4A3	K562	5C	22955621	AC009502.1	6236	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	221093432	221093609	221093525	Y	NA	NA	EPHA4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC009502.1	545915	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	221802042	221802413	221802264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	634509	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	222312152	222312375	222312261	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	124547	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	222382501	222382744	222382664	Y	EPHA4	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	54178	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	222383007	222383509	222383204	Y	EPHA4	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	53413	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	222435699	222436339	222436058	Y	EPHA4	EPHA4	NA	NA	NA	NA	EPHA4	583	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	EPHA4	389768	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.862915361159228
chr2	223170887	223171031	223170916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGPP2	116205	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	223292241	223292356	223292299	Y	NA	SGPP2	NA	NA	NA	NA	SGPP2	5005	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	223429708	223429962	223429836	Y	FARSB	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	89094	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	223462160	223462364	223462326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	56692	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	224413942	224414282	224414142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCG2	50939	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	224452508	224452858	224452683	Y	SCG2	SCG2	NA	NA	NA	NA	SCG2	12363	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	224477772	224478078	224477872	Y	NA	SCG2	AP1S3,KCNE4,SCG2	IMR90	Hi-C	24141950	SCG2	12551	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	224569350	224569680	224569515	Y	NA	NA	AP1S3	IMR90	Hi-C	24141950	SCG2	104129	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	224773224	224773437	224773430	Y	WDFY1	WDFY1,MRPL44	NA	NA	NA	NA	WDFY1	34667	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	224808298	224808709	224808400	Y	WDFY1	WDFY1,MRPL44	NA	NA	NA	NA	WDFY1	194	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	224852422	224852838	224852675	Y	NA	WDFY1,MRPL44,SERPINE2	NA	NA	NA	NA	MRPL44	32301	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	225010758	225010857	225010808	Y	NA	NA	SERPINE2	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINE2	108722	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	225340678	225341017	225340847	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	107093	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	225392496	225392764	225392746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	55346	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	225641346	225641365	225641350	Y	CUL3,DOCK10	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	193236	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	227514922	227515156	227515015	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	147319	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	227517160	227517436	227517301	Y	IRS1	NA	IRS1,LOC646736	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	145039	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	227656309	227656561	227656437	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	5914	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	227665142	227665696	227665306	Y	IRS1	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	2667	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	227665859	227666449	227665964	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	3384	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	227781487	227781745	227781553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHBDD1	83190	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	228232228	228232344	228232275	Y	CCL20,AGFG1	MFF,TM4SF20	NA	NA	NA	NA	TM4SF20	12367	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	230736228	230736612	230736477	Y	SP110	FBXO36,TRIP12	NA	NA	NA	NA	FBXO36	48406	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	231277179	231277351	231277276	Y	NA	SP100	NA	NA	NA	NA	SP100	1306	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	232277113	232277443	232277206	Y	C2orf72	SNORD82	NA	NA	NA	NA	SNORD82	45708	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00471	91838	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.03549843339107
chr2	232478879	232479328	232479053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90277	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	232526700	232527324	232527119	Y	DIS3L2	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	42281	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr2	232531704	232531853	232531745	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	37752	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	232537656	232538064	232537748	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	31541	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	232545684	232546083	232545868	Y	COPS7B	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	23522	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	232582048	232582308	232582138	Y	NCL,PTMA	PTMA	NA	NA	NA	NA	PTMA	12443	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	233283707	233283952	233283753	Y	ALPPL2	ALPP,ALPPL2	NA	NA	NA	NA	ALPPL2	14154	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	233703407	233703613	233703510	Y	NEU2	C2orf82	NA	NA	NA	NA	C2orf82	16367	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	233763823	233764207	233764133	Y	EFHD1,NGEF	C2orf82	NA	NA	NA	NA	C2orf82	43843	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	233766797	233767190	233766879	Y	NA	C2orf82	NA	NA	NA	NA	C2orf82	46817	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr2	233796443	233796630	233796537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf82	76463	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	234074569	234074943	234074824	Y	NA	ATG16L1	NA	NA	NA	NA	ATG16L1	41754	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	234330770	234331121	234330825	Y	INPP5D,ATG16L1	NA	USP40	IMR90	Hi-C	24141950	DGKD	69617	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	234465976	234466363	234466311	Y	HJURP	USP40	NA	NA	NA	NA	USP40	7065	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	234670163	234670438	234670239	Y	NA	UGT1A1	NA	NA	NA	NA	UGT1A1	3269	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	234673088	234673246	234673167	Y	NA	UGT1A1	NA	NA	NA	NA	UGT1A1	6194	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr2	235935583	235936015	235935761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	76966	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	235959667	235960159	235959834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	101050	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	236547901	236548387	236548201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	147168	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	236663549	236663825	236663687	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	262816	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	236842338	236842740	236842449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	441605	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	237765492	237765769	237765631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS8	226186	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	238036930	238037258	238037105	Y	NA	COPS8,AC105760.2	COPS8,COL6A3,MLPH,PRLH,RAB17,LRRFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	44470	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	238374283	238374521	238374346	Y	COL6A3	MLPH	LRRFIP1,MLPH,PRLH,COL6A3,RAB17	IMR90	Hi-C	24141950	MLPH	17550	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	238383141	238383356	238383272	Y	NA	MLPH	LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MLPH	8715	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	238392046	238392381	238392184	Y	LRRFIP1,MLPH	NA	NA	NA	NA	NA	MLPH	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	238398938	238399241	238399144	Y	NA	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	6867	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	238581844	238582251	238582110	Y	LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	47625	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	238582267	238582825	238582560	Y	LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	48048	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	238616188	238616491	238616226	Y	ILKAP,LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	81969	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	238968617	238969014	238968782	Y	NA	SCLY	NA	NA	NA	NA	SCLY	1087	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	239050654	239050828	239050729	Y	KLHL30	KLHL30,FAM132B	NA	NA	NA	NA	KLHL30	5291	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr2	239347857	239348510	239348285	Y	ASB1	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	14474	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.72583072231846
chr2	239552819	239552999	239552910	Y	PER2	NA	LOC151171	IMR90	Hi-C	24141950	ASB1	219436	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	239593183	239593431	239593307	Y	NA	NA	LOC151171	IMR90	Hi-C	24141950	ASB1	259800	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	239870450	239870747	239870599	Y	NA	NA	LOC151171,TRAF3IP1,FLJ43879,MIR4786,TWIST2,HDAC4	IMR90	Hi-C	24141950	AC062017.1	450383	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	240080723	240081253	240081085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	239877	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	240196255	240196671	240196554	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	124459	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr2	240201720	240202445	240202126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	118685	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	240213505	240213689	240213606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	107441	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	241309624	241309945	241309791	Y	GPC1	NA	PP14571,GPC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPC1	63143	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr2	241313615	241314182	241313884	Y	NA	NA	GPC1	IMR90	Hi-C	24141950	GPC1	58906	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	241374162	241374480	241374229	Y	GPC1	GPC1	NA	NA	NA	NA	GPC1	1074	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	241561048	241561275	241561167	Y	DUSP28,RNPEPL1,CAPN10,GPR35	CAPN10	NA	NA	NA	NA	CAPN10	36915	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	242267084	242267405	242267274	Y	MTERFD2	SEPT2,HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	HDLBP	12608	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr2	242304310	242304654	242304483	Y	FARP2	HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	FARP2	10652	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	242480531	242480899	242480752	Y	NA	STK25,BOK	NA	NA	NA	NA	BOK	15237	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	242549642	242550327	242549774	Y	ATG4B	ATG4B,THAP4	NA	NA	NA	NA	ATG4B	24301	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	242698564	242698745	242698671	Y	THAP4,ATG4B,PDCD1,D2HGDH	D2HGDH	NA	NA	NA	NA	D2HGDH	26570	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	242711564	242711834	242711650	Y	NEU4,GAL3ST2	D2HGDH	NA	NA	NA	NA	D2HGDH	39570	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr2	242833644	242833731	242833683	Y	NA	AC131097.3	NA	NA	NA	NA	AC131097.3	12130	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	268547	268840	268655	Y	NA	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12	NA	NA	NA	NA	C20orf96	550	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	352488	352859	352625	Y	SRXN1,FAM110A,RBCK1	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	6402	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr20	1119535	1119804	1119673	Y	NA	PSMF1,TMEM74B	NA	NA	NA	NA	PSMF1	27629	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	1258531	1258969	1258603	Y	NA	SNPH	FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495	IMR90	Hi-C	24141950	SNPH	13571	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	1332285	1332772	1332374	Y	C20orf46,SDCBP2	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	39034	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	2855066	2855678	2855300	Y	NA	VPS16,PTPRA	NA	NA	NA	NA	PTPRA	12236	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	3200687	3201082	3200885	Y	NA	DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	ITPA	13173	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	3472887	3473113	3473000	Y	NA	ATRN	NA	NA	NA	NA	ATRN	23200	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	4116351	4116485	4116423	Y	PANK2,PANK2,SMOX	SMOX	ADRA1D,SMOX	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	16724	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	4206645	4206924	4206784	Y	NA	ADRA1D	NA	NA	NA	NA	ADRA1D	20797	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	5512444	5512652	5512587	Y	CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1	NA	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	77020	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	5553446	5553705	5553635	Y	NA	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	35967	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr20	5717960	5718260	5718168	Y	C20orf196	C20orf196	NA	NA	NA	NA	C20orf196	10779	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	5816621	5816994	5816701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-55P	51707	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	10492212	10492484	10492413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	79342	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	10651368	10651598	10651475	Y	NA	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	26354	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	10652083	10652420	10652292	Y	JAG1	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	27069	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	13035099	13035480	13035216	Y	SPTLC3	SPTLC3	NA	NA	NA	NA	SPTLC3	47472	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	15889669	15890127	15890029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF16B	661951	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	16331149	16331548	16331320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF16B	220530	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	17402450	17402801	17402626	Y	PCSK2,BANF2	NA	NA	NA	NA	NA	BFSP1	145064	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	17591305	17591483	17591343	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	42797	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	17876337	17876490	17876431	Y	NA	NA	BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5,C20orf72	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORD17	65099	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	18276093	18276447	18276109	Y	CSRP2BP	ZNF133	NA	NA	NA	NA	ZNF133	8972	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	19724032	19724214	19724159	Y	NA	RP1-122P22.2	NA	NA	NA	NA	RP1-122P22.2	12138	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	19796265	19796476	19796342	Y	RIN2,RIN2	NA	RIN2,SLC24A3,NAA20	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-122P22.2	59913	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	19797665	19798070	19797910	Y	RIN2,RIN2	NA	RIN2,SLC24A3,NAA20	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-122P22.2	61313	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	19881587	19881718	19881652	Y	RIN2,RIN2	RIN2	NA	NA	NA	NA	RIN2	16422	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	19884253	19884519	19884436	Y	NA	RIN2	NA	NA	NA	NA	RIN2	19088	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	19889354	19889507	19889429	Y	NA	RIN2	NA	NA	NA	NA	RIN2	24189	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	19890524	19890778	19890583	Y	NA	RIN2	NA	NA	NA	NA	RIN2	25359	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	19895665	19896589	19896325	Y	NA	RIN2	NA	NA	NA	NA	RIN2	30500	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	19898701	19898830	19898754	Y	NA	RIN2	NA	NA	NA	NA	RIN2	33536	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	19967147	19967464	19967305	Y	NA	NAA20	NA	NA	NA	NA	NAA20	28296	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	20033883	20033924	20033904	Y	NA	NAA20,CRNKL1	NA	NA	NA	NA	CRNKL1	766	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	21058164	21058497	21058329	Y	NA	PLK1S1	NA	NA	NA	NA	PLK1S1	46127	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	25214082	25214352	25214216	Y	ENTPD6,PYGB	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	12353	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr20	25218471	25218756	25218634	Y	NA	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	7949	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr20	25226687	25226893	25226791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYGB	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	25227226	25227454	25227251	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	521	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr20	25227906	25228088	25227908	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	1201	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr20	25229395	25229593	25229494	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	2690	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	25671297	25671837	25671511	Y	NA	ZNF337	NA	NA	NA	NA	ZNF337	3640	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	29647996	29648434	29648295	Y	DEFB121,DEFB116	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	38139	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	30105267	30105465	30105369	Y	HM13	HM13	NA	NA	NA	NA	HM13	5036	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	30109241	30109638	30109448	Y	HM13	HM13	NA	NA	NA	NA	HM13	9010	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	30111445	30111879	30111615	Y	HM13	HM13	NA	NA	NA	NA	HM13	11214	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	30161920	30162316	30162154	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	28770	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	30175524	30175854	30175562	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	15232	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr20	30191850	30192346	30192159	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	764	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr20	30194967	30195344	30195216	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	3881	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr20	30196293	30196740	30196417	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	5207	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr20	30200712	30201016	30200864	Y	TTLL9,DUSP15,DEFB116,DEFB121	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	9626	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	30249247	30249862	30249570	Y	TTLL9	NA	NA	NA	NA	NA	ID1	58161	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr20	30255856	30255976	30255884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	53816	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	30260311	30260679	30260495	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	49113	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	30262675	30263005	30262853	Y	HCK,BCL2L1	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	46787	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	30263216	30263335	30263276	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	46457	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	30266315	30266710	30266574	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	43082	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	30292336	30292785	30292516	Y	NA	BCL2L1,TPX2	COX4I2	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L1	17007	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	30300504	30300973	30300648	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8819	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr20	30301047	30301377	30301326	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8415	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	30303594	30303801	30303667	Y	TTLL9,DUSP15	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	5991	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	30307720	30308274	30308104	Y	POFUT1	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	1518	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.862915361159228
chr20	30624710	30624829	30624798	Y	PLAGL2,C20orf112,HCK	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF4	70480	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	31063072	31063625	31063366	Y	NA	NA	ASXL1	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf112	107251	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	2.15728840289807
chr20	31998840	31999088	31998873	Y	C20orf185	CDK5RAP1,SNTA1	CDK5RAP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDK5RAP1	11473	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	32321714	32321896	32321832	Y	NA	E2F1,PXMP4,ZNF341	NA	NA	NA	NA	ZNF341	4251	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	32400902	32401106	32400958	Y	CHMP4B	CHMP4B	NA	NA	NA	NA	CHMP4B	3792	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr20	32694090	32694253	32694172	Y	NA	EIF2S2	NA	NA	NA	NA	EIF2S2	3885	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	32803456	32803920	32803688	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	93688	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr20	33055325	33055363	33055345	Y	NA	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	FDX1P1	6916	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	33064297	33064587	33064427	Y	ACSS2	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	FDX1P1	2018	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr20	33840961	33841098	33841051	Y	SPAG4,RBM39	MT1P3,MMP24,EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EDEM2	22830	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	33861234	33861630	33861491	Y	NA	MMP24,EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EDEM2	2298	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	33900177	33900484	33900409	Y	GSS,EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EIF6	29389	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	33908268	33908438	33908376	Y	NA	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	37480	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	34217204	34217560	34217502	Y	NA	FER1L4,SPAG4,CPNE1,RBM12	NA	NA	NA	NA	SPAG4	15390	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr20	34303643	34304038	34303890	Y	NA	ROMO1,NFS1,RBM39,RPF2P1	NA	NA	NA	NA	NFS1	18362	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	34470947	34471302	34471125	Y	NA	RNU4-40P	NA	NA	NA	NA	RNU4-40P	2279	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	34471781	34472424	34472101	Y	NA	RNU4-40P	NA	NA	NA	NA	RNU4-40P	1157	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	NA	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SCAND1	107196	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.38066457785476
chr20	34681523	34681969	34681863	Y	EPB41L1,DLGAP4,EPB41L1	NA	LOC647979,PHF20,EPB41L1,C20orf4,C20orf152	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SCAND1	136129	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	34685769	34686042	34685906	Y	NA	NA	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1,DLGAP4	IMR90	Hi-C	24141950	SCAND1	140375	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	34790985	34791133	34791034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLGAP4	101125	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	35102828	35103254	35103050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYL9	64633	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	35112957	35113192	35113075	Y	TGIF2	NA	NA	NA	NA	NA	MYL9	54695	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	35234952	35235695	35235080	Y	NA	TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	2815	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr20	35290523	35290606	35290565	Y	DLGAP4	NA	SLA2,TGIF2-C20ORF24	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf24	58386	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	35490387	35490628	35490526	Y	MANBAL,KIAA0889	NA	KIAA0889	MCF7	ChIA-PET	22265404	SAMHD1	87618	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr20	35978324	35978819	35978616	Y	SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC	SRC	NA	NA	NA	NA	SRC	7236	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	36034782	36035452	36035129	Y	C20orf132,VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	36484	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	36389387	36389716	36389551	Y	NA	NA	VSTM2L	IMR90	Hi-C	24141950	CTNNBL1	68979	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	36693519	36693713	36693616	Y	RPRD1B	TTI1,RPRD1B	NA	NA	NA	NA	RPRD1B	33571	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	36772576	36772945	36772677	Y	RPRD1B,BPI	TGM2	NA	NA	NA	NA	TGM2	20035	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	36780859	36781241	36781066	Y	RPRD1B,RALGAPB,BPI	TGM2	NA	NA	NA	NA	TGM2	11739	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	37398577	37398739	37398665	Y	NA	ACTR5	NA	NA	NA	NA	ACTR5	23492	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	38120202	38120215	38120209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX35	531260	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	39632234	39632572	39632465	Y	MAFB,TOP1	RNU2-52P,TOP1	PLCG1,TOP1,ZHX3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU2-52P	18273	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	40188226	40188487	40188477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD6	56646	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	40193452	40193754	40193691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD6	51379	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	42096541	42096705	42096586	Y	NA	SRSF6,L3MBTL1	NA	NA	NA	NA	SRSF6	11973	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	RPL27AP,MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL27AP	6898	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr20	42554497	42554746	42554685	Y	IFT52,TOX2	TOX2	NA	NA	NA	NA	TOX2	12993	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr20	42833040	42833424	42833233	Y	C20orf111	JPH2,OSER1-AS1	NA	NA	NA	NA	OSER1-AS1	4176	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr20	42938917	42939166	42938990	Y	NA	FITM2,HNF4A	GDAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	FITM2	1108	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	43272135	43272561	43272438	Y	C20orf111,STK4	ADA	NA	NA	NA	NA	ADA	6313	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	43321614	43322020	43321838	Y	WISP2,KCNK15	ADA	LOC79015,YWHAB,WISP2,SERINC3,TTPAL,PKIG,ADA,KCNK15,RIMS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ADA	42740	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	43517782	43518230	43517943	Y	NA	YWHAB,PABPC1L	PABPC1L	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAB	5465	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	43540233	43540373	43540312	Y	DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,PABPC1L	YWHAB,PABPC1L,TOMM34	NA	NA	NA	NA	PABPC1L	3530	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	2.32987147512992
chr20	43582253	43582415	43582335	Y	NA	PABPC1L,TOMM34,STK4	NA	NA	NA	NA	TOMM34	4712	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	43596220	43596403	43596301	Y	SERINC3,YWHAB,SYS1,STK4	TOMM34,STK4	NA	NA	NA	NA	STK4	3105	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	43970100	43970351	43970215	Y	NA	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	4713	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	43974041	43974470	43974334	Y	NA	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	594	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	44001576	44001658	44001579	Y	WFDC11,KCNS1,TP53TG5,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2,PIGT	NA	NA	NA	NA	SYS1-DBNDD2	11736	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	44056635	44056652	44056644	Y	NA	PIGT	NA	NA	NA	NA	PIGT	13918	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	45006307	45006609	45006393	Y	PCIF1,ZNF335	SLC35C2	NA	NA	NA	NA	SLC35C2	15264	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr20	45870109	45870518	45870490	Y	ZMYND8,NCOA3	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	113049	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr20	45946049	45946481	45946179	Y	NA	ZMYND8	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	37086	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.03549843339107
chr20	45962816	45963214	45963054	Y	NA	ZMYND8	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	20353	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr20	45987479	45988292	45987961	Y	NA	ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	3912	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr20	45988883	45989283	45988988	Y	SULF2	ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5316	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	45989347	45989834	45989660	Y	SULF2	ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5780	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr20	46021549	46021674	46021604	Y	NA	ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,SLC2A10,EYA2,NCOA3,PARD6B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZMYND8	37982	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	46299616	46300006	46299878	Y	NCOA3,SULF2,SULF2	NA	NA	NA	NA	NA	SULF2	113354	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr20	46390354	46390743	46390546	Y	NA	SULF2	NA	NA	NA	NA	SULF2	22617	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	46420724	46421103	46420967	Y	NA	SULF2	SULF2,PREX1,ARFGEF2	IMR90	Hi-C	24141950	SULF2	7364	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr20	46438543	46438763	46438619	Y	SULF2,SULF2	SULF2	NA	NA	NA	NA	SULF2	25183	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.46695611397069
chr20	46523491	46523897	46523893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF2	110131	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	46601191	46601469	46601377	Y	SULF2,SULF2	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SULF2	187831	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	46653872	46653986	46653882	Y	NA	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SULF2	240512	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	47547466	47547777	47547635	Y	ZNFX1,ARFGEF2	ARFGEF2	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	11039	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr20	47750965	47751079	47750977	Y	ZNFX1	NA	NA	NA	NA	NA	STAU1	51825	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	47803381	47804147	47803544	Y	PREX1,STAU1	STAU1,DDX27	NA	NA	NA	NA	STAU1	477	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr20	48236919	48237304	48237112	Y	SPATA2	NA	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	91111	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	48291121	48291501	48291391	Y	ZNFX1,SNAI1,SLC9A8,B4GALT5	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	36914	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	48293445	48293839	48293746	Y	NA	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	34576	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr20	48311078	48311758	48311363	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	16657	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	48313235	48313496	48313350	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	14919	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	48315836	48316073	48315912	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	12342	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr20	48327368	48328064	48327696	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	351	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	48334324	48334539	48334447	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	B4GALT5	K562	ChIA-PET	22265404	B4GALT5	5909	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	48391675	48392320	48391995	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC9A8	34930	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	2.07099686678215
chr20	48650281	48650896	48650575	Y	NA	NA	TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,SNAI1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNAI1	52745	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	48717588	48717974	48717858	Y	NA	UBE2V1	NA	NA	NA	NA	UBE2V1	12522	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	48810888	48811172	48811109	Y	B4GALT5,SLC9A8,SPATA2,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB	NA	NA	NA	NA	CEBPB	5512	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	48900220	48901229	48900600	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	RP11-290F20.3	PTPN1,LOC284751,PARD6B,FAM65C,MIR645,CEBPB,TMEM189-UBE2V1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-290F20.3	18197	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr20	48924890	48925591	48925260	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	RP11-290F20.3	NA	NA	NA	NA	RP11-290F20.3	42867	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	49032230	49032497	49032297	Y	NA	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	92394	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr20	49055532	49055924	49055757	Y	SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	68967	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.29437304173884
chr20	49130261	49130753	49130448	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	5370	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	49137019	49137081	49137050	Y	PTPN1	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	12128	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	49170357	49170595	49170426	Y	NA	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	45466	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	49345638	49345902	49345710	Y	MOCS3,PARD6B	PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	179	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	49378305	49378754	49378413	Y	DPM1,PARD6B,BCAS4	PARD6B,BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	30677	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	49407275	49407470	49407371	Y	MOCS3	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	1961	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr20	49454379	49454475	49454388	Y	NA	BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	44948	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	49524499	49524706	49524614	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	20815	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	49539044	49539098	49539071	Y	NA	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	6423	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	49553399	49553600	49553500	Y	NA	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	ADNP	7441	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	49710089	49710352	49710221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNG1	72423	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	50072988	50073809	50073517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	103561	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	50098116	50098381	50098249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	78989	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	50180369	50180507	50180463	Y	NFATC2	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NFATC2	2999	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	50247670	50248383	50248096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	70300	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.38066457785476
chr20	50252715	50253081	50252915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	75345	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	50272756	50273155	50272761	Y	ATP9A	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	75917	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	50323593	50323814	50323640	Y	NA	RP5-827A12.2	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	25258	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	50366772	50367203	50366881	Y	ZFP64,ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	15970	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.8984137945503
chr20	50383575	50384083	50383723	Y	ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	402	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr20	50416703	50416783	50416765	Y	ZFP64,SALL4	ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	33530	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	50665033	50665229	50665099	Y	NA	NA	ATP9A,NFATC2,SALL4,ZFP64	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP64	153618	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	50692863	50693237	50693120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP64	125610	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	52195908	52196455	52196142	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	27991	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	52239995	52240318	52240062	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	15549	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	52355086	52355238	52355182	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	130640	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr20	52356771	52357178	52357063	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	132325	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	52445816	52446339	52446069	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	221370	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr20	52519942	52520105	52520009	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,ZNF217,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	295496	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	52532315	52532889	52532591	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	289497	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	52565886	52566139	52565988	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	256247	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr20	52718989	52719002	52718996	Y	NA	NA	PFDN4,SULF2,CYP24A1,DOK5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	103384	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	52740107	52740637	52740253	Y	NA	NA	DOK5,SULF2,ZMYND8,BMP7,PTPRT	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	81749	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	55362710	55362938	55362792	Y	AURKA,TFAP2C	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	TFAP2C	160352	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	55363467	55363682	55363577	Y	NA	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	TFAP2C	161109	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	55780606	55780977	55780774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP7	58708	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	55838908	55839396	55838948	Y	NA	BMP7	NA	NA	NA	NA	BMP7	289	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	56232830	56233085	56232989	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	51507	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	56270075	56270492	56270216	Y	PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	14100	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	56273255	56273697	56273462	Y	PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	10895	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	56293544	56293843	56293665	Y	NA	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	8952	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	56323662	56324029	56323724	Y	NA	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	39070	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	57018014	57018479	57018179	Y	STX16	NA	NA	NA	NA	NA	VAPB	55836	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	57228113	57228577	57228221	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16-NPEPL1	3623	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	57236406	57236742	57236622	Y	RAB22A,STX16	STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16-NPEPL1	11916	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	57596187	57596442	57596344	Y	NA	CTSZ,ATP5E,SLMO2	NA	NA	NA	NA	ATP5E	8995	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	58451421	58451787	58451564	Y	SYCP2,PPP1R3D,C20orf177,C20orf177	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3D	61565	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	59325352	59325574	59325428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3D	812000	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	60033866	60034028	60033960	Y	CDH4	NA	NA	NA	NA	NA	TAF4	604838	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.121789969507
chr20	60758632	60758689	60758683	Y	GATA5,CABLES2	PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	41810	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	60914790	60915105	60914838	Y	NA	ADRM1,MIR4758,LAMA5,RPS21	NA	NA	NA	NA	MIR4758	9177	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	60933408	60933760	60933692	Y	NA	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	ADRM1	K562	ChIA-PET	22265404	LAMA5	6608	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr20	60934143	60934390	60934309	Y	TAF4,PSMA7,SS18L1,RPS21,NTSR1,CABLES2,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	ADRM1	K562	ChIA-PET	22265404	LAMA5	5978	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	2.32987147512992
chr20	60939635	60939778	60939673	Y	SLCO4A1,NTSR1,LAMA5	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	590	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.03549843339107
chr20	60940876	60941209	60940968	Y	PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	508	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	2.76132915570953
chr20	60941528	60941750	60941608	Y	SLCO4A1,ADRM1,LAMA5	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	1160	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr20	60956313	60956720	60956445	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	RPS21	3452	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	60956743	60957219	60956871	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	RPS21	2953	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	61192605	61193059	61192901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO4A1	78738	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	61283206	61283870	61283565	Y	OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1	SLCO4A1	NA	NA	NA	NA	SLCO4A1	11409	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr20	61335955	61336196	61336080	Y	NA	NA	C20orf20,LOC100652730,SLCO4A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLCO4A1	64158	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	61371540	61371927	61371747	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	NA	NA	NA	NA	NA	OGFR	62260	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr20	61425509	61425950	61425706	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	OGFR,OGFR-AS1,COL9A3	NA	NA	NA	NA	OGFR	8237	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr20	61554875	61554902	61554887	Y	DIDO1	DIDO1,SLC17A9	NA	NA	NA	NA	DIDO1	12402	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr20	61560348	61560848	61560731	Y	NA	DIDO1,SLC17A9	NA	NA	NA	NA	DIDO1	6456	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	61687989	61688195	61688101	Y	NA	HAR1B	NA	NA	NA	NA	HAR1B	43476	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	62176586	62176848	62176717	Y	NA	EEF1A2,PPDPF,PTK6,C20orf195	NA	NA	NA	NA	C20orf195	5525	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	62313782	62314225	62314041	Y	NA	STMN3,RTEL1,TNFRSF6B,ZGPAT,ARFRP1	NA	NA	NA	NA	TNFRSF6B	11796	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	62482031	62482202	62482150	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5	SLC2A4RG,ZBTB46,LIME1,ZGPAT,TPD52L2,UCKL1,MIR1914	IMR90	Hi-C	24141950	TPD52L2	12394	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	6.64444828092606
chr20	62527317	62528264	62527831	Y	PRIC285,PRIC285,GMEB2,ZGPAT,ZGPAT,LIME1,TPD52L2,RGS19,RGS19,OPRL1,DNAJC5	TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	DNAJC5	2799	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr20	62739506	62739724	62739570	Y	NA	RGS19	NA	NA	NA	NA	RGS19	30183	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.862915361159228
chr21	16368229	16368687	16368553	Y	NRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRIP1	66634	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	16431175	16431558	16431528	Y	NA	NRIP1	NA	NA	NA	NA	NRIP1	3763	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	17125389	17125620	17125425	Y	USP25	USP25	NA	NA	NA	NA	USP25	25045	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	17264124	17264427	17264344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	163780	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	26962945	26963646	26963455	Y	NA	MIR155HG,MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	14183	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	27242944	27243154	27243052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5J	136960	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	27275894	27276232	27276045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5J	169910	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	27298348	27298650	27298452	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5J	192364	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	27335144	27335525	27335335	Y	APP	NA	NA	NA	NA	NA	APP	205921	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	27488837	27488970	27488850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	52476	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	28018634	28018812	28018723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	477188	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	2.41616301124584
chr21	30555048	30555502	30555259	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,BACH1	NA	NA	NA	NA	U3	4088	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	30684361	30684712	30684409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	119969	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	31029045	31029571	31029224	Y	BACH1,BACH1	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	464653	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr21	32532795	32532952	32532925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIAM1	397338	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	33042550	33042842	33042696	Y	NA	SOD1,SNORA81	NA	NA	NA	NA	SNORA81	7931	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	33822696	33822707	33822702	Y	C21orf63,C21orf62	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf119	59257	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	33836273	33836551	33836412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf119	72834	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	34733678	34734189	34733958	Y	OLIG1,IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,IFNGR2,GART,GART	IFNAR1,IFNGR2	NA	NA	NA	NA	IFNAR1	38944	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	34752926	34753284	34753094	Y	IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2	IFNGR2	NA	NA	NA	NA	IFNGR2	19918	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr21	35319562	35320491	35320153	Y	NA	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	33278	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr21	35395270	35395520	35395430	Y	GART,GART,SON	MRPS6,SLC5A3	MRPS6,ATP5O,LOC100506334	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS6	48004	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	35863434	35863747	35863591	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	121694	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	35891449	35891717	35891494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	93724	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	36143971	36144119	36144107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC6	104283	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr21	36179679	36180279	36179996	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC6	139991	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	36208387	36209191	36208566	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC6	168699	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.63953918620253
chr21	36214787	36216208	36215152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC6	175099	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	2.76132915570953
chr21	36216696	36217156	36217046	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC6	177008	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr21	36217934	36218360	36217961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC6	178246	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr21	36219873	36220239	36220187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC6	180185	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr21	36220332	36220721	36220527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC6	180644	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr21	36220749	36221095	36220890	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC6	181061	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr21	36222572	36222954	36222768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC6	182884	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr21	36223731	36223900	36223856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC6	184043	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr21	36227422	36227493	36227482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC6	187734	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr21	36233216	36233747	36233583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC6	193528	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	36234553	36234896	36234857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC6	194865	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr21	36367475	36367815	36367753	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC6	327787	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	36638663	36638676	36638670	Y	NA	NA	RUNX1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CLIC6	598975	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	36847397	36847674	36847465	Y	RUNX1	NA	RUNX1,LOC100506385,CLIC6	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX1	527291	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	37486095	37486219	37486157	Y	NA	CBR1,SETD4,AP000688.29,CBR3,DOPEY2	NA	NA	NA	NA	AP000688.29	10916	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	37694250	37694633	37694410	Y	NA	MORC3	NA	NA	NA	NA	MORC3	3763	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr21	38072912	38073314	38073050	Y	SIM2	SIM2	HLCS	IMR90	Hi-C	24141950	SIM2	3479	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	38235070	38235202	38235136	Y	TTC3,HLCS	NA	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	101610	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.862915361159228
chr21	38936686	38937128	38936852	Y	DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	200594	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr21	39630445	39631374	39631216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS2	543857	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	39723755	39724311	39724014	Y	ETS2	NA	NA	NA	NA	NA	ETS2	450920	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	40159439	40159794	40159507	Y	NA	ETS2	ETS2,LINC00114	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ETS2	15437	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	40753076	40753485	40753292	Y	WRB	HMGN1,WRB	NA	NA	NA	NA	WRB	2906	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	40860443	40860729	40860586	Y	NA	LCA5L,SH3BGR	NA	NA	NA	NA	SH3BGR	44662	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	40983593	40983719	40983659	Y	LCA5L,SH3BGR,PCP4	C21orf88	NA	NA	NA	NA	C21orf88	845	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	41003318	41003469	41003395	Y	NA	C21orf88	NA	NA	NA	NA	C21orf88	20570	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr21	41005118	41005297	41005205	Y	NA	C21orf88	SH3BGR	IMR90	Hi-C	24141950	C21orf88	22370	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr21	41146916	41147071	41146994	Y	LCA5L	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf88	164168	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr21	41872740	41872794	41872767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACE2	664934	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	43062216	43062499	43062352	Y	MX1	NA	PRDM15,RIPK4	IMR90	Hi-C	24141950	RIPK4	122767	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	43641830	43642232	43641888	Y	ZNF295,UMODL1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1	ABCG1	TFF3	IMR90	Hi-C	24141950	ABCG1	24031	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	43654635	43655282	43654967	Y	NA	ABCG1	TFF3	IMR90	Hi-C	24141950	ABCG1	36836	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr21	43662181	43662433	43662307	Y	NA	ABCG1	TFF3	IMR90	Hi-C	24141950	ABCG1	44382	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr21	44072717	44073208	44072832	Y	NA	PDE9A	NA	NA	NA	NA	PDE9A	971	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	44278308	44278654	44278481	Y	NA	WDR4,NDUFV3	NA	NA	NA	NA	WDR4	19024	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	44395482	44395891	44395810	Y	NA	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	2862	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	44395922	44396228	44396080	Y	WDR4,U2AF1,CBS	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	3302	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr21	44597156	44597534	44597315	Y	SIK1	NA	NA	NA	NA	NA	U2AF1	71459	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	44816664	44817004	44816885	Y	NA	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	28004	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr21	44860778	44861412	44860950	Y	SIK1	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	15770	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	44914466	44914931	44914660	Y	PDXK,U2AF1,SIK1	NA	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	69458	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	45029471	45029828	45029593	Y	PDXK	HSF2BP,RRP1B	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	47546	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	45080522	45080871	45080626	Y	TRAPPC10,PWP2,SIK1,RRP1B	HSF2BP,RRP1B	NA	NA	NA	NA	RRP1B	3093	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	45117744	45118082	45118052	Y	NA	HSF2BP,RRP1B,PDXK	PDXK	IMR90	Hi-C	24141950	PDXK	18893	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	45132062	45132504	45132250	Y	HSF2BP,PDXK	PDXK	NA	NA	NA	NA	PDXK	4471	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr21	45187861	45188442	45188176	Y	ICOSLG,PDXK,CSTB	CSTB,RRP1	NA	NA	NA	NA	CSTB	5884	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr21	45198694	45199238	45199184	Y	NA	CSTB,RRP1	NA	NA	NA	NA	CSTB	4368	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr21	45237788	45238060	45237872	Y	TRAPPC10,ICOSLG,AGPAT3	CSTB,RRP1,MYL6P1,AGPAT3	NA	NA	NA	NA	RRP1	30394	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	45394155	45394780	45394371	Y	AGPAT3,TRPM2,C21orf33	TRAPPC10	NA	NA	NA	NA	TRAPPC10	35420	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	45943778	45945170	45944363	Y	NA	AP001065.15,C21orf90	NA	NA	NA	NA	C21orf90	8679	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr21	46097395	46097576	46097539	Y	KRTAP10-7,KRTAP10-12	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2G2	122358	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr21	46726845	46727332	46727050	Y	NA	POFUT2	NA	NA	NA	NA	POFUT2	21032	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	46749567	46749782	46749739	Y	NA	POFUT2	COL18A1,LINC00315,LOC642852,POFUT2,COL18A1-AS1,LOC100129027,PCBP3,ADARB1,SLC19A1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	POFUT2	43754	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr21	46786853	46787266	46786994	Y	COL18A1,POFUT2	COL18A1	ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL18A1	35786	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	46823895	46824295	46824014	Y	COL18A1	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	843	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	46824359	46824541	46824457	Y	COL18A1	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	1307	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	46831544	46831752	46831652	Y	NA	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	8492	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr21	47035179	47035682	47035497	Y	NA	AL133493.2	PCBP3,POFUT2,SLC19A1,COL18A1,LOC100129027,ADARB1	IMR90	Hi-C	24141950	AL133493.2	23611	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	47480637	47481027	47480832	Y	COL6A1,COL6A2	COL6A2	COL6A2,FTCD,C21orf56,MCM3AP-AS1,MCM3AP,COL6A1,LSS	IMR90	Hi-C	24141950	COL6A2	34984	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr21	47563985	47564239	47564071	Y	NA	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	47974	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr22	17652206	17652871	17652785	Y	NA	CECR5,AC005300.5	NA	NA	NA	NA	CECR5	8029	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr22	17717917	17718257	17717979	Y	CECR2,BCL2L13,IL17RA,CECR1	AC005300.5,CECR3	NA	NA	NA	NA	CECR3	27366	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	17745323	17745619	17745476	Y	NA	CECR3	NA	NA	NA	NA	CECR3	4	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	18264435	18264847	18264620	Y	CECR2,ATP6V1E1,BCL2L13,USP18,BID,BID	BID	NA	NA	NA	NA	BID	8899	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	18916909	18917370	18917163	Y	MICAL3,TUBA8,DGCR6,PRODH,PRODH	DGCR6,PRODH,DGCR5	NA	NA	NA	NA	PRODH	4696	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	2.07099686678215
chr22	19337870	19338225	19337898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLTCL1	60631	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr22	19378121	19378382	19378253	Y	NA	MRPL40	NA	NA	NA	NA	MRPL40	39043	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr22	19433007	19433028	19433018	Y	NA	MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39,UFD1L,CDC45	NA	NA	NA	NA	HIRA	196	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	20009239	20009629	20009574	Y	NA	ARVCF	NA	NA	NA	NA	ARVCF	6908	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	20068627	20068902	20068750	Y	COMT,DGCR8	DGCR8,RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8	NA	NA	NA	NA	DGCR8	2872	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr22	20863506	20864089	20863850	Y	MED15	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	15306	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	21131289	21131349	21131319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM191A	78069	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	22011632	22012115	22011859	Y	NA	YDJC,CCDC116,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	7073	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.63953918620253
chr22	22170870	22171333	22171102	Y	HIC2,PPM1F,MAPK1	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	48637	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	23863943	23864332	23864232	Y	GNAZ,RTDR1,BCR	NA	ZDHHC8P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC8P1	121030	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	24153288	24153648	24153392	Y	RGL4,LOC391322	MMP11,CHCHD10,SMARCB1,DERL3,SLC2A11	DERL3	IMR90	Hi-C	24141950	DERL3	25667	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	24255997	24256450	24256302	Y	C22orf43,CABIN1,CABIN1	MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	21806	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr22	24603797	24604355	24604162	Y	GGT1,ADORA2A	SUSD2	NA	NA	NA	NA	SUSD2	28570	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	24752898	24753006	24752951	Y	UPB1	NA	NA	NA	NA	NA	SPECC1L-ADORA2A	88032	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	24767148	24767407	24767278	Y	GGT1	NA	NA	NA	NA	NA	SPECC1L-ADORA2A	102282	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	24948988	24949121	24949055	Y	ADORA2A	SNRPD3,FAM211B	NA	NA	NA	NA	SNRPD3	350	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	25349333	25349980	25349695	Y	NA	NA	SGSM1,KIAA1671,TMEM211	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SGSM1	149097	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	25381840	25382180	25381995	Y	NA	NA	KIAA1671	IMR90	Hi-C	24141950	SGSM1	181604	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	26921035	26921055	26921043	Y	TPST2	HPS4,SRRD,TFIP11	NA	NA	NA	NA	TFIP11	14564	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	27041081	27041748	27041447	Y	SEZ6L,ASPHD2	MIAT,CTA-211A9.5	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	MIAT	689	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	27043800	27044733	27044318	Y	SEZ6L	MIAT,CTA-211A9.5	NA	NA	NA	NA	MIAT	3408	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	27508990	27509624	27509325	Y	NA	NA	PITPNB,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-40G4P.1	227479	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr22	28115717	28115905	28115775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MN1	79581	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	28314180	28314595	28314448	Y	PITPNB	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	PITPNB	58	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	28837872	28838192	28838073	Y	TTC28	NA	NA	NA	NA	NA	TTC28	235661	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr22	28956104	28956479	28956470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC28	117374	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	29365910	29365950	29365937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF3	88330	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	29601085	29601300	29601289	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EWSR1	60698	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	30643780	30644513	30644215	Y	GAL3ST1,LIF	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	2940	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr22	30644816	30645407	30645321	Y	NA	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	3976	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr22	30648392	30648767	30648580	Y	SF3A1	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	7552	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr22	30649196	30649657	30649496	Y	MTMR3,TBC1D10A,SF3A1,DUSP18,LIF,OSM	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	8356	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr22	30650339	30650644	30650477	Y	LIF	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	9499	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr22	30651841	30652045	30651989	Y	RNF215	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	11001	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr22	30652191	30652351	30652329	Y	RNF215,GAL3ST1	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	11351	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr22	30653574	30654311	30654075	Y	RNF215,GAL3ST1	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	12734	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	3.96941066133245
chr22	31030399	31030736	31030505	Y	SMTN,OSM,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1,DUSP18,SLC35E4	TCN2,PES1,SLC35E4,CTA-963H5.5,DUSP18	NA	NA	NA	NA	SLC35E4	760	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	31226011	31226350	31226247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORC2	135934	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr22	31298089	31298190	31298144	Y	NA	NA	MORC2,MORC2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	MORC2	64094	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	32446579	32447120	32446852	Y	NA	SC22CB-1E7.1	NA	NA	NA	NA	SC22CB-1E7.1	13102	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	32869636	32869823	32869707	Y	C22orf42,RFPL2,RFPL3	FBXO7	NA	NA	NA	NA	FBXO7	973	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	33862454	33862588	33862512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMP3	666767	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	34317541	34317731	34317667	Y	LARGE	NA	NA	NA	NA	NA	TIMP3	1121854	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr22	35983528	35983815	35983759	Y	NA	RASD2	NA	NA	NA	NA	RASD2	48613	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.55324765008661
chr22	35998340	35998679	35998418	Y	TOM1,TOM1,HMOX1,APOL6,MB,MB	APOL6	NA	NA	NA	NA	APOL6	43763	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	36009004	36009234	36009123	Y	MB,MB,MB	APOL6	NA	NA	NA	NA	APOL6	33208	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	36172767	36172943	36172931	Y	MB,MB,RBFOX2,RBFOX2	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	APOL6	130325	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	36396636	36396729	36396643	Y	NA	RBFOX2	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	25744	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	36759233	36759313	36759256	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2,NCF4	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	22750	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	36766615	36766810	36766723	Y	NCF4,MYH9	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	15253	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	36806147	36806450	36806256	Y	NA	MYH9,RP5-1119A7.14	MYH9,FOXRED2,TXN2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYH9	24084	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	36847830	36847945	36847861	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2,NCF4,CSF2RB	RP5-1119A7.14,TXN2	NA	NA	NA	NA	RP5-1119A7.14	1046	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr22	37428831	37429188	37428927	Y	CARD10,TMPRSS6,TST,MPST	MPST,TST,KCTD17	KCTD17,TMPRSS6	IMR90	Hi-C	24141950	TST	15150	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr22	37638328	37638951	37638750	Y	SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4	C1QTNF6	NA	NA	NA	NA	RAC2	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	37897761	37897917	37897872	Y	NA	CARD10	NA	NA	NA	NA	CARD10	15632	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr22	37942064	37942352	37942192	Y	KCTD17,TRIOBP,POLR2F,MICALL1,LGALS1,ANKRD54,CARD10,CDC42EP1	CARD10,CDC42EP1,LGALS2	ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42EP1	12102	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr22	37957606	37958042	37957847	Y	NA	CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1	NA	NA	NA	NA	CDC42EP1	3152	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	38139873	38139989	38139967	Y	NA	TRIOBP	H1F0,GCAT	IMR90	Hi-C	24141950	TRIOBP	48862	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	38142899	38142964	38142949	Y	CDC42EP1,LGALS1,TRIOBP,POLR2F,GCAT,ANKRD54	NA	NA	NA	NA	NA	TRIOBP	51888	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	38143248	38143734	38143618	Y	LGALS1,TRIOBP,POLR2F	NA	NA	NA	NA	NA	TRIOBP	52237	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr22	38148564	38148886	38148725	Y	CDC42EP1	NA	NA	NA	NA	NA	H1F0	50228	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr22	38573037	38573156	38573097	Y	EIF3L,PLA2G6,PLA2G6,MAFF,MAFF	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	MAFF	22733	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	38614588	38614867	38614785	Y	MICALL1,TMEM184B,TMEM184B,CSNK1E,MAFF,MAFF	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	14891	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr22	38624836	38625209	38625138	Y	JOSD1,GTPBP1,CSNK1E,MAFF	MAFF,PLA2G6,TMEM184B	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	25139	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr22	39253318	39253463	39253391	Y	KCNJ4,LOC646851	NPTXR,CBX6	NA	NA	NA	NA	CBX6	12856	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	39704707	39705214	39704970	Y	ATF4,APOBEC3A	RPL3,SYNGR1	NA	NA	NA	NA	RPL3	9180	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr22	39923809	39924011	39923907	Y	NA	ATF4,RPS19BP1	NA	NA	NA	NA	RPS19BP1	2849	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	40384673	40384943	40384833	Y	FAM83F	NA	NA	NA	NA	NA	TNRC6B	53878	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	40589903	40590338	40589971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P52	88833	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	40885973	40886127	40886071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSM3	121378	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	40958851	40958976	40958969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL1	71730	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr22	41047729	41047883	41047796	Y	NA	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17023	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	41048065	41048352	41048232	Y	EP300,MKL1	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17359	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	41346258	41346618	41346399	Y	EP300	RBX1	NA	NA	NA	NA	RBX1	907	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	41417973	41418366	41418067	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39690	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr22	41418482	41418837	41418726	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39219	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	41460471	41460696	41460583	Y	NA	RP11-12M9.3,EP300	RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-12M9.3	2415	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	41684313	41684541	41684479	Y	PPPDE2,RANGAP1	RANGAP1,ZC3H7B	NA	NA	NA	NA	RANGAP1	4058	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.03549843339107
chr22	41839332	41839605	41839469	Y	TOB2	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	1422	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr22	42063539	42063782	42063553	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19161	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr22	42696005	42696062	42696030	Y	SEPT3,NFAM1	NA	TCF20,NFAM1	IMR90	Hi-C	24141950	Z83851.1	67180	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	42840483	42840921	42840577	Y	SEPT3	CTA-126B4.7	MEI1,TCF20,NDUFA6,LOC100132273,C22orf32,CYP2D6,NFAM1,WBP2NL,RNU12,POLDIP3,FAM109B,NAGA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTA-126B4.7	8454	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	43116155	43116318	43116237	Y	CYB5R3,A4GALT	A4GALT	NA	NA	NA	NA	A4GALT	851	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	43233624	43233705	43233665	Y	NA	ARFGAP3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP3	18407	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	43269385	43269620	43269503	Y	NFAM1,ARFGAP3,PACSIN2	ARFGAP3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP3	17273	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	43333511	43333722	43333661	Y	POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2	NA	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	75429	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr22	43400219	43400728	43400510	Y	NA	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	8423	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	43415245	43415535	43415390	Y	NA	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	6094	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	43740111	43740598	43740319	Y	NA	SCUBE1	NA	NA	NA	NA	SCUBE1	2717	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	44218722	44218869	44218865	Y	NA	EFCAB6	NA	NA	NA	NA	EFCAB6	12505	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	44321391	44321759	44321599	Y	PNPLA3	PNPLA3,SAMM50,RP4-796I17.5	NA	NA	NA	NA	PNPLA3	3772	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	44443702	44443981	44443822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARVB	50611	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	45403389	45403735	45403573	Y	KIAA0930,PHF21B,PHF21B,PHF21B	NA	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	153927	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	45489638	45489739	45489689	Y	NA	NA	LOC100506714,PHF21B,PRR5-ARHGAP8,NUP50,FAM118A,KIAA0930,UPK3A,SMC1B,RIBC2,FBLN1	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-217C2.1	67923	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	45543738	45543876	45543815	Y	PHF21B,NUP50,NUP50	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	13786	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	45664918	45665214	45665118	Y	NA	KIAA0930,FAM118A	LOC100506714,SMC1B,PHF21B,FBLN1,KIAA0930,FAM118A,RIBC2,UPK3A,ATXN10	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0930	30268	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	45944996	45945587	45945178	Y	NA	FBLN1	NA	NA	NA	NA	FBLN1	48878	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.121789969507
chr22	46028588	46028889	46028879	Y	WNT7B	CTA-941F9.9,ATXN10	NA	NA	NA	NA	CTA-941F9.9	29087	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr22	46035019	46035329	46035174	Y	NA	CTA-941F9.9,ATXN10	NA	NA	NA	NA	ATXN10	30349	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr22	46041491	46041960	46041628	Y	NA	CTA-941F9.9,ATXN10	ATXN10,WNT7B,FAM118A,SMC1B,FBLN1,LOC730668,LOC100271722,MIRLET7BHG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATXN10	23718	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.38066457785476
chr22	46325366	46325760	46325504	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	45249	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr22	46370456	46370600	46370533	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	409	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr22	46374858	46375446	46375153	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	3849	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.121789969507
chr22	46444150	46444589	46444370	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	2996	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	46462776	46462894	46462836	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	877	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	46464940	46465203	46464976	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	1169	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	46467914	46468476	46468052	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	4143	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.29437304173884
chr22	46472616	46472825	46472697	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	8845	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr22	46474643	46475112	46474791	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	10872	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	46480881	46481264	46481017	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	17110	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	4.05570219744837
chr22	46495432	46495673	46495573	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,PPARA	NA	NA	NA	NA	MIR4763	11773	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr22	46775439	46775628	46775534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRMU	50667	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	46924162	46924396	46924177	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	NA	NA	NA	NA	CELSR1	6671	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr22	46934347	46934575	46934459	Y	CELSR1	CELSR1,GRAMD4	NA	NA	NA	NA	CELSR1	3280	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	46957537	46957704	46957620	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	TRMU,CELSR1,GRAMD4	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	12205	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	46996273	46996482	46996334	Y	CERK	GRAMD4	CELSR1,GRAMD4	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	26364	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	47150443	47150659	47150583	Y	CERK,TBC1D22A	CERK,TBC1D22A	CERK	MCF7	ChIA-PET	22265404	TBC1D22A	5859	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr22	47330872	47331057	47330965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	174354	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	47525665	47525872	47525801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	369147	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr22	49768624	49768992	49768711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C22orf34	280198	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr22	50262824	50262951	50262946	Y	TUBGCP6,MLC1	BRD1,ZBED4,CRELD2,ALG12	NA	NA	NA	NA	ZBED4	17334	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr22	50329443	50330313	50330025	Y	TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	19337	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	50342658	50342932	50342773	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	9229	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr22	50364171	50364294	50364188	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12010	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr22	50364350	50364715	50364589	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12189	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.121789969507
chr22	50554222	50554639	50554443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PANX2	52521	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	50710173	50710402	50710310	Y	MLC1,MOV10L1,MOV10L1,MOV10L1,SHANK3,SBF1,PPP6R2,MAPK8IP2,MAPK8IP2,FAM116B,ACR,MAPK11	TUBGCP6,HDAC10,MAPK12,MAPK11,PLXNB2,XX-C283C717.1	NA	NA	NA	NA	MAPK11	2977	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	50738042	50738272	50738161	Y	NA	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,XX-C283C717.1,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	5784	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr22	50741799	50742849	50742615	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,XX-C283C717.1,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	1207	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	50742925	50743370	50743124	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,XX-C283C717.1,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	686	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr22	50743436	50743850	50743726	Y	PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,XX-C283C717.1,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	206	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,XX-C283C717.1,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr22	50744748	50744986	50744827	Y	PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,XX-C283C717.1,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	692	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr22	50908246	50908896	50908576	Y	IL17REL,TRABD,SELO,TUBGCP6,HDAC10,PPP6R2,CHKB,SBF1,NCAPH2	SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2	NA	NA	NA	NA	SBF1	2558	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr22	50912071	50912698	50912340	Y	NA	SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2	NA	NA	NA	NA	SBF1	617	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr22	50977955	50978429	50978214	Y	PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B	LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,CTA-384D8.31,SYCE3,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	CTA-384D8.31	4415	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr22	50982591	50982963	50982680	Y	NA	LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,SYCE3,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	CTA-384D8.31	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	4392615	4392774	4392664	Y	ITPR1	SETMAR	NA	NA	NA	NA	SETMAR	49627	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	4908577	4908896	4908639	Y	BHLHE40	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	109905	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	5027453	5027635	5027574	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	7807	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	5028534	5029013	5028702	Y	ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	8888	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	5050429	5050605	5050534	Y	EDEM1,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	30783	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	5054958	5055470	5055112	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	BHLHE40-AS1	35312	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	5059566	5059965	5059743	Y	ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	39920	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	5067974	5068590	5068209	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	48328	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr3	9926228	9926446	9926367	Y	LOC401052,ARPC4,TADA3,RPUSD3,CIDEC,CIDEC,CIDEC,JAGN1,IL17RE,IL17RE,IL17RC,IL17RC	RPUSD3,CIDEC,JAGN1,IL17RE,IL17RC,CRELD1	IL17RE,IL17RC,JAGN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	JAGN1	3792	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	10215234	10216150	10215734	Y	NA	VHL,IRAK2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	10685	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	10231143	10231913	10231419	Y	ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	26594	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	10238203	10238635	10238546	Y	ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2,TATDN2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	33654	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	10240691	10241307	10240999	Y	ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2,TATDN2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	36142	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	11230556	11230841	11230699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRH1	53777	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	11237617	11237805	11237677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRH1	60838	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	11261398	11261658	11261529	Y	HRH1	NA	NA	NA	NA	NA	ATG7	50337	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	11314967	11316155	11315793	Y	HRH1,ATG7	ATG7	NA	NA	NA	NA	ATG7	2972	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	11609664	11609798	11609746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	150422	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	12350153	12350305	12350183	Y	NA	PPARG	NA	NA	NA	NA	PPARG	23286	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	13035460	13035932	13035883	Y	CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	76685	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr3	13460446	13460799	13460651	Y	NA	NUP210	NA	NA	NA	NA	NUP210	637	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr3	13493281	13493606	13493395	Y	NA	NUP210,HDAC11,HDAC11-AS1	IQSEC1,NUP210	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HDAC11	25618	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	13936849	13937176	13936976	Y	NA	WNT7A	C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WNT7A	17231	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43,AC093495.4	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr3	14257734	14258042	14257871	Y	NA	LSM3,XPC	NA	NA	NA	NA	XPC	39451	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr3	14730155	14730277	14730196	Y	NA	C3orf20	NA	NA	NA	NA	C3orf20	15549	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	14845285	14845503	14845389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf20	130679	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	15813744	15814005	15813933	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,ANKRD28	NA	BTD	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD28	85273	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	15845201	15845372	15845268	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,DPH3,ANKRD28	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD28	53906	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	16379697	16380223	16379925	Y	DPH3	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	74991	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	16429150	16429271	16429247	Y	RFTN1	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	124444	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	16647619	16647698	16647658	Y	DAZL,DAZL	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	194461	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	17441926	17442172	17442040	Y	PLCL2	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	599767	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	17506581	17506846	17506713	Y	TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	664422	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	17674085	17674191	17674137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	810118	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	17913596	17913897	17913750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	570412	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	18237686	18238028	18237782	Y	TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	246281	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	18409984	18410150	18410103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	74159	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	18485117	18485365	18485120	Y	NA	TBC1D5,AC144521.1,SATB1	NA	NA	NA	NA	SATB1	37	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr3	19188369	19188866	19188531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	610204	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	19379484	19379512	19379499	Y	KCNH8	NA	NA	NA	NA	NA	EFHB	607005	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	19993428	19993925	19993635	Y	KAT2B,RAB5A	EFHB,RAB5A	NA	NA	NA	NA	RAB5A	6857	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr3	20012721	20012798	20012760	Y	NA	EFHB,RAB5A	NA	NA	NA	NA	RAB5A	26150	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	21898256	21898481	21898369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB1P5	522829	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	23206478	23206499	23206488	Y	NA	UBE2E2	UBE2E1,UBE2E2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E2	36012	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	23898490	23898770	23898565	Y	NA	NA	NKIRAS1,RPL15	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E1	53096	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	23946487	23946815	23946592	Y	NA	RPL15,NR1D2,NKIRAS1	NA	NA	NA	NA	RPL15	9221	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	24364500	24364733	24364617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THRB	170040	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	24525285	24525656	24525591	Y	NA	THRB	NA	NA	NA	NA	THRB	9117	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	27396607	27396872	27396740	Y	NA	NEK10	NA	NA	NA	NA	NEK10	12079	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	27524458	27524952	27524717	Y	NA	SLC4A7,RNU1-96P	NA	NA	NA	NA	SLC4A7	547	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.03549843339107
chr3	31690891	31691368	31691073	Y	ZNF860,OSBPL10	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	118761	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	32434248	32434406	32434345	Y	NA	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	3085	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	32443431	32443555	32443473	Y	CMTM7	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	12268	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	32549205	32549429	32549313	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	6305	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	32822383	32822764	32822428	Y	TRIM71	AC139452.2	NA	NA	NA	NA	AC139452.2	2374	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	33436260	33436332	33436276	Y	CLASP2,FBXL2,FBXL2	UBP1	NA	NA	NA	NA	UBP1	44531	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	33590851	33591213	33591209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBP1	109988	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	33638872	33639200	33639124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLASP2	118648	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr3	37011455	37011827	37011685	Y	LRRFIP2,ITGA9,GOLGA4,MLH1,MLH1,EPM2AIP1	TRANK1,EPM2AIP1,MLH1,RPL29P11	NA	NA	NA	NA	EPM2AIP1	20968	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	37901883	37902306	37902042	Y	CTDSPL	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	432	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr3	37904355	37904605	37904570	Y	NA	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	2904	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	37939195	37939560	37939378	Y	NA	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	37744	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	38193404	38193826	38193575	Y	VILL,ACAA1,MYD88,OXSR1	ACAA1,MYD88,OXSR1	OXSR1	IMR90	Hi-C	24141950	OXSR1	10754	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	38207945	38208258	38208101	Y	VILL,PLCD1,DLEC1,MYD88,OXSR1	ACAA1,MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	3365	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	38216296	38216490	38216393	Y	NA	ACAA1,MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	11716	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	38497232	38497482	38497354	Y	NA	ACVR2B,EXOG	NA	NA	NA	NA	ACVR2B	3890	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	39193999	39194528	39194467	Y	NA	TTC21A,GORASP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr3	39399859	39400185	39399921	Y	CCR8,SLC25A38	SLC25A38,RPSA	NA	NA	NA	NA	SLC25A38	22654	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	42062353	42062651	42062504	Y	NA	TRAK1	TRAK1,ULK4	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	9059	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr3	42067110	42067525	42067205	Y	ULK4	TRAK1	TRAK1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	13816	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	42220925	42221235	42221114	Y	TRAK1	NA	NA	NA	NA	NA	TRAK1	167631	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr3	42237448	42237989	42237678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAK1	184154	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	42518371	42518582	42518469	Y	NA	RP11-219I21.1,VIPR1	TRAK1,VIPR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-219I21.1	9239	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	42549446	42549661	42549578	Y	NA	RP11-219I21.1,VIPR1	NA	NA	NA	NA	VIPR1	20655	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	42725545	42725856	42725623	Y	LYZL4,KRBOX1,HHATL,CCDC13	RP4-613B23.1	NA	NA	NA	NA	RP4-613B23.1	31665	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	43221606	43221805	43221773	Y	CCDC13,SNRK	NA	SNRK,ANO10,FAM198A,ABHD5	IMR90	Hi-C	24141950	SNRK	104199	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	43368782	43368949	43368860	Y	NA	SNRK	NA	NA	NA	NA	SNRK	42778	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr3	43427917	43428246	43428244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-353H3.1	97126	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	43431181	43431702	43431413	Y	SNRK,ABHD5	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-353H3.1	93670	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	44621262	44622718	44622436	Y	NA	ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF197	1662	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr3	44972207	44972481	44972421	Y	NA	EXOSC7,ZDHHC3	NA	NA	NA	NA	EXOSC7	42252	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	45108122	45108262	45108201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCP1	77652	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	45138887	45139080	45139004	Y	NA	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	46834	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr3	45140818	45140977	45140897	Y	NA	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	44937	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	45141662	45142027	45141978	Y	NA	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	43887	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	45142532	45142787	45142664	Y	NA	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	43127	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	45155178	45155398	45155286	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	30516	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	45157727	45158120	45157925	Y	CDCP1	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	27794	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr3	45161726	45162069	45161866	Y	TMEM158	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	23845	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	45164613	45164770	45164669	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	21144	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	45165992	45166137	45166089	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	19777	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	45175300	45175656	45175542	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	10258	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	45209101	45209416	45209191	Y	LIMD1	CDCP1,RPS24P8	LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS24P8	9434	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	46135224	46135371	46135312	Y	CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1	NA	CXCR6,FYCO1,CCR5,SACM1L,SLC6A20,CCR1,CCR3,CCRL2	IMR90	Hi-C	24141950	FYCO1	99908	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	46971519	46971826	46971651	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	47347	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr3	46973216	46973514	46973421	Y	KLHL18,NBEAL2	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	45659	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	46988775	46989017	46988932	Y	SETD2,KLHL18,KIF9,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	30156	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr3	46989736	46990203	46989983	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	28970	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr3	46990572	46990937	46990863	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	28236	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	47026763	47026874	47026817	Y	KLHL18,NBEAL2	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	CCDC12	5263	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	47201175	47201471	47201342	Y	CSPG5,SETD2	SETD2,KIF9-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD2	1986	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	47421570	47421869	47421711	Y	NA	PTPN23	NA	NA	NA	NA	PTPN23	1069	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr3	47704557	47705253	47705047	Y	SETD2	NA	NA	NA	NA	NA	CSPG5	84275	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	47879431	47879730	47879653	Y	SPINK8	DHX30	NA	NA	NA	NA	DHX30	37032	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr3	48469321	48469953	48469633	Y	NA	CCDC51,ATRIP,TREX1	NA	NA	NA	NA	PLXNB1	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	49123301	49123671	49123633	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2	NA	NA	NA	NA	QRICH1	6125	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr3	49425171	49425361	49425266	Y	ARIH2,QRICH1,USP4,UBA7	USP4,GPX1,TCTA,RHOA,NICN1	NA	NA	NA	NA	TCTA	22278	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	49938038	49938186	49938111	Y	TUSC2,APEH,GMPPB,SEMA3F,MST1R,MON1A,IFRD2,C3orf54	TRAIP,MST1R,MON1A,RBM6	NA	NA	NA	NA	MST1R	1113	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	50302065	50302532	50302296	Y	SEMA3B	GNAI2,SEMA3B-AS1,SEMA3B,IFRD2,NAT6,HYAL3	NA	NA	NA	NA	SEMA3B-AS1	271	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	50354393	50354598	50354449	Y	MST1R	IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL2,TUSC2,RASSF1,CYB561D2,NPRL2,TMEM115	NA	NA	NA	NA	HYAL2	3739	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	51728520	51728585	51728552	Y	NA	TEX264	NA	NA	NA	NA	TEX264	33811	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	52277820	52278098	52277967	Y	PHF7,PBRM1,GLT8D1,IQCF6,IQCF2,IQCF5,IQCF1,WDR82,GLYCTK,DNAH1,PPM1M,PPM1M	ALAS1,RP5-1157M23.2,TWF2,GLYCTK,WDR82	NA	NA	NA	NA	PPM1M	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	52652258	52652629	52652403	Y	GLYCTK,MUSTN1,GLT8D1	NA	NA	NA	NA	NA	GNL3	60543	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	53136597	53136930	53136874	Y	PBRM1,PBRM1,TMEM110,DCP1A,PRKCD	RFT1	NA	NA	NA	NA	RFT1	25548	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	53270281	53270430	53270371	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	17638	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	53304049	53304491	53304265	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	15981	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr3	53380883	53380907	53380896	Y	TMEM110,PRKCD,DCP1A	DCP1A	NA	NA	NA	NA	DCP1A	1229	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	56106137	56106188	56106158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERC2	394203	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	56814931	56815295	56815113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM208A	99666	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	56864313	56864691	56864516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM208A	149048	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	56873709	56874050	56874038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM208A	158444	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	57555554	57555589	57555572	Y	FAM116A,PDE12	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	PDE12	15551	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	57562103	57562255	57562188	Y	SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	19692	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	57564978	57565360	57565163	Y	FAM116A,PDE12	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	16587	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	57566206	57566518	57566262	Y	NA	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	15429	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr3	57572232	57572342	57572306	Y	NA	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	9605	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr3	57945627	57945950	57945779	Y	PDE12	FLNB	FLNB,ARF4	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	46177	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	57955527	57955938	57955800	Y	FLNB	FLNB	FLNB,ARF4	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	36189	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	57958534	57958833	57958768	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	33294	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	57960548	57960842	57960815	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	31285	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	57964155	57964263	57964209	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	27864	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	57995654	57995894	57995762	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	3527	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	57995926	57996426	57996121	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	3799	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	58035006	58035314	58035102	Y	FLNB	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	42879	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	58038147	58038335	58038213	Y	FLNB	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	46020	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	58162589	58162663	58162637	Y	KCTD6	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD6	58570	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	58163548	58163776	58163593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD6	57457	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	58412465	58412623	58412544	Y	NA	PDHB	NA	NA	NA	NA	PDHB	4961	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	59526553	59526908	59526731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	492743	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	60715683	60716344	60716091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	518789	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	61728117	61728514	61728321	Y	NA	RPL10AP6	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	1337	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	61828479	61828865	61828501	Y	PTPRG	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	101699	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	62590103	62590230	62590174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRG-AS1	237098	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	63848274	63848561	63848418	Y	NA	THOC7	NA	NA	NA	NA	THOC7	695	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	63942094	63942115	63942105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD6	65543	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	64330217	64330685	64330502	Y	NA	NA	PRICKLE2,LOC100652759,LOC100287879	IMR90	Hi-C	24141950	PSMD6	322559	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	65744738	65744801	65744770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	277708	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr3	66022863	66023161	66022996	Y	MAGI1	MAGI1	NA	NA	NA	NA	MAGI1	354	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	67711705	67712002	67711881	Y	NA	SUCLG2,RP11-81N13.1	NA	NA	NA	NA	RP11-81N13.1	8584	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	69135158	69135511	69135504	Y	NA	TMF1,UBA3,ARL6IP5	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	3063	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	69790676	69790712	69790690	Y	MITF	MITF	NA	NA	NA	NA	MITF	4090	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	71031841	71032211	71032107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	598929	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	71447361	71447554	71447492	Y	EIF4E3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	183586	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	71564915	71565059	71565002	Y	PROK2,GPR27,FOXP1,EIF4E3,EIF4E3,EIF4E3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	66081	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	72309271	72309689	72309414	Y	RYBP	NA	SHQ1,RYBP	IMR90	Hi-C	24141950	RYBP	184380	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	72977666	72978074	72977791	Y	RYBP	GXYLT2,FTH1P23	NA	NA	NA	NA	FTH1P23	1471	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	73022372	73022552	73022446	Y	PPP4R2,EBLN2	FTH1P23,PPP4R2	NA	NA	NA	NA	PPP4R2	21384	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	73159773	73160145	73159855	Y	EBLN2	NA	PDZRN3,CACNA1D	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC75P1	70297	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr3	77129404	77129782	77129499	Y	ROBO2,ROBO2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	648235	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	77273270	77273652	77273462	Y	ROBO2,ROBO2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	792101	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	78934560	78934824	78934693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	880141	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	85930839	85930993	85930916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM2	924707	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	88208920	88209337	88209164	Y	CGGBP1,C3orf38	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	CGGBP1	11885	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPKP4	269654	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr3	98504725	98505044	98504856	Y	OR5K4,ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	113489	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr3	98528384	98528734	98528634	Y	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	89799	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	98544884	98545154	98545150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	73379	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	98549481	98549862	98549828	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	68671	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	98685741	98686133	98685825	Y	NA	LINC00973	DCBLD2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00973	11769	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr3	99555247	99555560	99555404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	275797	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	99579229	99579736	99579484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	251621	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	99944403	99944723	99944568	Y	NA	TBC1D23	C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D23	33121	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	100077983	100078198	100078091	Y	FILIP1L	NIT2,LNP1,TOMM70A	NA	NA	NA	NA	NIT2	26438	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	100482455	100482783	100482461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFG	56250	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr3	101109184	101109394	101109269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP7	120691	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	101403455	101403770	101403678	Y	SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24	ZBTB11,CEP97	NA	NA	NA	NA	RPL24	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr3	105087492	105087848	105087688	Y	NA	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	3739	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	105087916	105088171	105088021	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	4163	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr3	105486064	105486421	105486242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	99975	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	107111079	107111236	107111158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	128547	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	107705661	107706042	107705959	Y	CD47	NA	MYH15,IFT57,CD47,LOC285205	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD47	101830	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	110490435	110490524	110490469	Y	NA	NA	PVRL3-AS1,PVRL3	IMR90	Hi-C	24141950	PVRL3	296394	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	111420857	111420932	111420895	Y	NA	PLCXD2,PHLDB2	PHLDB2,CD96,ABHD10	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDB2	28412	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	111623667	111623869	111623803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	71988	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr3	111723588	111723714	111723651	Y	SLC9A10,TAGLN3,TAGLN3	ABHD10,TAGLN3	NA	NA	NA	NA	TAGLN3	8077	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	111877933	111878040	111878010	Y	SLC9A10	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf52	74751	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	112577470	112577712	112577653	Y	NA	NA	CD200R1L,CD200R1	IMR90	Hi-C	24141950	GTPBP8	130053	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	113078924	113079182	113079053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BOC	151074	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	114078948	114079017	114078985	Y	NA	ZBTB20-AS1	NA	NA	NA	NA	ZBTB20-AS1	10290	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	114246828	114247170	114246841	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20-AS1	178170	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	114289543	114289832	114289667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20-AS1	220885	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	114358213	114358332	114358238	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20-AS1	289555	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	114563365	114563725	114563545	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	300393	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	114681173	114681431	114681302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	182687	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	114724447	114724794	114724621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	139324	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	115231466	115231705	115231586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	108466	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	115503263	115503751	115503546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	163092	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr3	115511576	115511993	115511793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	171405	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	115545713	115545826	115545800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	205542	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr3	115558428	115558819	115558693	Y	GAP43	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	218257	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr3	115595102	115595314	115595123	Y	GAP43	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	254931	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	115776361	115776759	115776562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	436190	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	115790074	115790198	115790193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	449903	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr3	115831620	115831831	115831726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	491449	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	115918215	115918449	115918332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	578044	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	119039607	119039839	119039731	Y	ARHGAP31,COX17,CD80,ADPRH	ARHGAP31	NA	NA	NA	NA	ARHGAP31-AS1	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	119142297	119142580	119142348	Y	ARHGAP31,NR1I2,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	43097	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	119146429	119146829	119146680	Y	ARHGAP31,CD80,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	38848	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	119147570	119147724	119147648	Y	NA	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	37953	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	119613107	119613331	119613219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR1I2	115776	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	121380323	121380507	121380462	Y	CD86,HCLS1,GOLGB1	NA	NA	NA	NA	NA	GOLGB1	86095	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	121664489	121664635	121664539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAF2	112459	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	122787344	122787648	122787385	Y	SEMA5B,PDIA5	PDIA5	NA	NA	NA	NA	PDIA5	3435	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	124553626	124554125	124554004	Y	KALRN	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	64140	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr3	124605050	124605342	124605178	Y	ITGB5	ITGB5	NA	NA	NA	NA	ITGB5	12923	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.46695611397069
chr3	124779995	124780351	124780112	Y	ITGB5,HEG1	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	7193	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	124964412	124964802	124964608	Y	NA	NA	SLC12A8	IMR90	Hi-C	24141950	HEG1	191610	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	126126680	126126867	126126779	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF15	52395	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	126359707	126359720	126359714	Y	NA	TXNRD3NB,TXNRD3	NA	NA	NA	NA	TXNRD3	12278	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	126391611	126391660	126391640	Y	NA	TXNRD3,CHCHD6	NA	NA	NA	NA	TXNRD3	19613	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	126701397	126702091	126701497	Y	PLXNA1	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	280334	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	126702933	126703224	126703109	Y	NA	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	281870	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	127404993	127405883	127405741	Y	MGLL	ABTB1	NA	NA	NA	NA	ABTB1	15215	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr3	127465577	127465875	127465733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLL	74176	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	127494264	127494411	127494370	Y	NA	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	45640	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	127795566	127796407	127795838	Y	GATA2,GATA2,GATA2,DNAJB8	SEC61A1	NA	NA	NA	NA	SEC61A1	27082	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	128325000	128325227	128325090	Y	DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2,KIAA1257	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	72691	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	128336521	128336831	128336572	Y	DNAJB8	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	61087	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	128338287	128338590	128338558	Y	RAB7A	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	59328	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	128475272	128475670	128475352	Y	RAB7A,ISY1,CNBP	RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	6191	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	128745839	128746109	128746044	Y	NA	KIAA1257	NA	NA	NA	NA	KIAA1257	26306	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	128945338	128945482	128945420	Y	MBD4,ISY1,CNBP	CNBP	KIAA1257,CCDC48,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1,GP9,C3orf37	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNBP	44573	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	128957834	128958071	128957930	Y	NA	NA	KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNBP	57069	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	129346331	129346490	129346427	Y	PLXND1	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	22670	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	129543558	129543741	129543650	Y	MBD4,H1FOO,TMCC1,TMCC1	NA	NA	NA	NA	NA	TMCC1	66678	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	131090710	131090810	131090760	Y	NA	NUDT16P1,RP11-933H2.4,NUDT16	NA	NA	NA	NA	RP11-933H2.4	7509	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	131096350	131096447	131096399	Y	NA	NUDT16P1,RP11-933H2.4,NUDT16	NA	NA	NA	NA	RP11-933H2.4	1872	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	131197540	131197572	131197556	Y	NA	MRPL3	NA	NA	NA	NA	MRPL3	22255	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	131854898	131855187	131855050	Y	NA	NA	CPNE4	IMR90	Hi-C	24141950	RPL7P16	105922	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	133289121	133289251	133289178	Y	SRPRB	CDV3	CDV3	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDV3	1323	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	133295128	133295300	133295215	Y	NA	CDV3	NA	NA	NA	NA	CDV3	4554	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	133537876	133537890	133537883	Y	NA	SRPRB	NA	NA	NA	NA	SRPRB	36999	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	133646484	133646682	133646583	Y	NA	RAB6B	NA	NA	NA	NA	RAB6B	33804	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	133968581	133968789	133968685	Y	NA	RYK	NA	NA	NA	NA	RYK	892	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	134068231	134068586	134068519	Y	NA	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	4817	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	134082893	134083489	134083439	Y	AMOTL2	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	AMOTL2	8832	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	135890782	135891068	135890882	Y	NA	MSL2	NA	NA	NA	NA	MSL2	23015	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	136327517	136327655	136327647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG1	141565	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	136448168	136448437	136448423	Y	NA	STAG1	NA	NA	NA	NA	STAG1	20783	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	136533824	136534225	136534025	Y	NA	RP11-85F14.5,NCK1	NA	NA	NA	NA	RP11-85F14.5	44671	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	138581757	138582253	138582041	Y	NA	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	29977	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	138582294	138582582	138582441	Y	MRPS22	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	30514	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.8984137945503
chr3	139018358	139018692	139018412	Y	FOXL2,C3orf72	NA	BPESC1	IMR90	Hi-C	24141950	COPB2	87882	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	139344390	139344678	139344552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMNAT3	50181	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	141065863	141066028	141065983	Y	NA	ZBTB38	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	24808	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	141130337	141130617	141130393	Y	RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	73272	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	141230074	141230471	141230125	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	26185	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	141240287	141240651	141240396	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	36398	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	141458120	141458481	141458300	Y	RASA2	RNF7	NA	NA	NA	NA	RNF7	3074	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	141610914	141611173	141610928	Y	NA	ATP1B3	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	17948	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	141746457	141746834	141746789	Y	NA	RP11-343B5.1	NA	NA	NA	NA	RP11-343B5.1	14206	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	142804014	142804376	142804307	Y	NA	CHST2	CHST2	K562	ChIA-PET	22265404	CHST2	31797	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	143705621	143705974	143705695	Y	C3orf58,C3orf58	C3orf58	NA	NA	NA	NA	C3orf58	16981	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	148332840	148332859	148332850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYG1	374269	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	148704982	148705163	148705084	Y	NA	GYG1	HLTF,GYG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GYG1	1965	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	148942843	148943311	148943144	Y	NA	CP	NA	NA	NA	NA	CP	5001	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	149104739	149105065	149104981	Y	COMMD2,TM4SF1	TM4SF1	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM4SF1	11087	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr3	149284462	149284628	149284613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	74015	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	149356424	149356747	149356622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	95754	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	149361418	149361700	149361559	Y	WWTR1	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	90801	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	149657313	149657850	149657694	Y	TSC22D2,RNF13	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	26322	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	149665014	149665210	149665089	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	18962	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	149665230	149665637	149665395	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	18535	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	150453151	150453509	150453478	Y	CLRN1	RP11-103G8.2,FAM194A,SIAH2-AS1,SIAH2	NA	NA	NA	NA	SIAH2-AS1	24215	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	151507223	151507685	151507381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1	451932	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	152121454	152121974	152121660	Y	MBNL1	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	136110	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	152313972	152314194	152314081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	P2RY1	236542	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	152878171	152878732	152878352	Y	P2RY1,RAP2B	RAP2B	NA	NA	NA	NA	RAP2B	142	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	155705974	155706059	155706016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMPS	119649	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	156229646	156229758	156229715	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	41215	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	156252887	156253352	156253202	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	17621	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	156268270	156268550	156268410	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	2423	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	156402848	156403019	156402937	Y	LEKR1,LEKR1,CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	TIPARP,TIPARP-AS1	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	12681	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	156432757	156433079	156432845	Y	CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	TIPARP,TIPARP-AS1	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	42590	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	156442773	156442811	156442792	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	52606	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	156443600	156443618	156443611	Y	LEKR1,LEKR1,CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	53433	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	156453441	156453522	156453482	Y	CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	63274	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	156527707	156527883	156527795	Y	NA	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	1186	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	156538683	156538849	156538764	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	LEKR1	2421	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	156849691	156850000	156849844	Y	NA	CCNL1,RP11-550I24.2	NA	NA	NA	NA	CCNL1	26549	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	156852547	156853124	156852850	Y	NA	CCNL1,RP11-550I24.2	NA	NA	NA	NA	CCNL1	23425	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	159514645	159514911	159514780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	189626	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	159647586	159647883	159647684	Y	NA	NA	IQCJ-SCHIP1,IL12A,IFT80,SMC4	IMR90	Hi-C	24141950	IL12A	56654	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	160949185	160949470	160949344	Y	OTOL1	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALNT1	128013	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	165215447	165215733	165215492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCHE	337527	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.121789969507
chr3	165215973	165216343	165216172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCHE	336917	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	168449002	168449381	168449192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFEM1P	483692	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	168939202	168939471	168939359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	439935	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	169075984	169076327	169076322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	303079	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	169300300	169300658	169300540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	78748	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	169377431	169377952	169377740	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	1454	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	169379063	169379412	169379208	Y	MECOM	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	169379831	169380308	169379976	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	425	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr3	169482089	169482431	169482154	Y	NA	TERC,MYNN	NA	NA	NA	NA	TERC	1241	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	169494029	169494036	169494033	Y	NA	TERC,MYNN	NA	NA	NA	NA	MYNN	5410	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	170213950	170214069	170214025	Y	NA	KRT8P13	NA	NA	NA	NA	KRT8P13	2534	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	170883066	170883220	170883212	Y	TNIK	NA	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	258584	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	171175851	171176236	171176082	Y	TNIK	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	171594447	171594730	171594655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLD1	67707	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	171611345	171611619	171611482	Y	NA	NA	PLD1,FNDC3B,TMEM212	IMR90	Hi-C	24141950	PLD1	84605	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	171678764	171678932	171678818	Y	NA	NA	PLD1,FNDC3B,TMEM212,TNIK	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	76486	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	171684878	171685278	171685188	Y	PLD1,FNDC3B	NA	PLD1,FNDC3B,TMEM212	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	70140	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	171816708	171816982	171816800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	61290	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	171820468	171820770	171820540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	65050	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	171847438	171848726	171847798	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	92020	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	171853185	171854055	171853751	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	97767	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	171855430	171855856	171855550	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	100012	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	171948409	171948713	171948561	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	192991	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	172418207	172418359	172418236	Y	NA	NCEH1,ECT2	NA	NA	NA	NA	NCEH1	8649	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	172423916	172424228	172424139	Y	NA	NCEH1,ECT2	NA	NA	NA	NA	NCEH1	2780	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	172467147	172467552	172467259	Y	NA	NCEH1,ECT2,RNU4-4P	NCEH1,ECT2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ECT2	675	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	173650294	173650720	173650491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	442314	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	173747920	173748305	173748100	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	344729	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	175695899	175696046	175695968	Y	NA	NA	NLGN1	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2V1P2	261441	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	177076157	177076922	177076435	Y	TBL1XR1	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	162896	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	178754661	178754788	178754723	Y	KCNMB3	ZMAT3	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	33279	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	LRRFIP1P1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1P1	1287	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr3	179182237	179182507	179182372	Y	NA	GNB4	GNB4	IMR90	Hi-C	24141950	GNB4	14859	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	179309053	179309431	179309273	Y	NA	ACTL6A,MRPL47,NDUFB5	NA	NA	NA	NA	MRPL47	11011	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	179659956	179660305	179660211	Y	PEX5L	NA	NA	NA	NA	NA	USP13	291413	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	180040639	180040822	180040650	Y	NA	NA	PEX5L	IMR90	Hi-C	24141950	TTC14	277096	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	182642205	182642465	182642335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	59276	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	182645862	182646115	182645990	Y	MCF2L2,MCCC1	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	55626	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	183003579	183004143	183003750	Y	ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	34547	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.98470533066622
chr3	184078263	184078665	184078465	Y	NA	EIF4G1,FAM131A,CLCN2,POLR2H,CHRD	NA	NA	NA	NA	POLR2H	757	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	184560038	184560430	184560098	Y	VPS8	VPS8	NA	NA	NA	NA	VPS8	32107	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	185821581	185821963	185821920	Y	NA	ETV5	NA	NA	NA	NA	ETV5	4144	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	185825302	185825582	185825395	Y	NA	ETV5	NA	NA	NA	NA	ETV5	525	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr3	185948324	185948597	185948503	Y	DGKG	NA	NA	NA	NA	NA	ETV5	122217	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	186746012	186746360	186746185	Y	RTP1,ST6GAL1	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GAL1	99738	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	187457681	187458370	187457991	Y	RTP4,BCL6,BCL6,BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	3145	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	187495200	187495392	187495316	Y	RTP4,BCL6,BCL6,BCL6	BCL6	BCL6,LPP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCL6	33685	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	187607399	187607588	187607479	Y	BCL6	NA	BCL6,LPP	IMR90	Hi-C	24141950	BCL6	145884	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	188012018	188012343	188012183	Y	LPP,LPP	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	142173	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	188234530	188234788	188234659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	364685	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	188475500	188475699	188475599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	605655	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	188537744	188538118	188537883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	667899	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	188618525	188618672	188618589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	748680	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	189793562	189793947	189793945	Y	LEPREL1	LEPREL1	NA	NA	NA	NA	LEPREL1	44279	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	190041292	190041577	190041442	Y	NA	CLDN1	NA	NA	NA	NA	CLDN1	3028	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	190062904	190063381	190063085	Y	LEPREL1,CLDN1,CLDN16	CLDN1	LEPREL1,CLDN1,CLDN16	IMR90	Hi-C	24141950	CLDN1	24640	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr3	190104242	190104447	190104367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLDN1	65978	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr3	190251387	190251779	190251471	Y	CLDN1	IL1RAP	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	21547	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	192873675	192873788	192873739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MB21D2	239725	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	193587539	193587846	193587782	Y	NA	RP11-528A4.2	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-528A4.2	27726	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr3	193590130	193590422	193590276	Y	NA	RP11-528A4.2	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-528A4.2	30317	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	193807302	193807696	193807488	Y	ATP13A3,HES1	HES1	HES1,LOC100131551,LOC647323	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HES1	44238	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	193851636	193853009	193852912	Y	ATP13A3,HES1	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr3	193857372	193857551	193857481	Y	HES1	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	5438	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	193858651	193858843	193858731	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	6717	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	193859199	193859624	193859359	Y	TMEM44	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	7265	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr3	193876735	193877026	193876899	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	24801	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr3	193988501	193988592	193988547	Y	FAM43A	NA	HES1,LOC647323,LOC100131551	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LRRC15	99880	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	194040514	194040910	194040840	Y	HES1	LRRC15	NA	NA	NA	NA	LRRC15	47562	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr3	194247870	194248550	194248205	Y	HES1,ATP13A3	ATP13A3	ATP13A3,GP5,TMEM44,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	ATP13A3	30777	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr3	194298758	194299295	194298977	Y	NA	TMEM44-AS1	ATP13A3,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM44-AS1	3445	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	194693694	194693898	194693796	Y	NA	NA	LOC100507391,XXYLT1,PPP1R2,FAM43A,LSG1	IMR90	Hi-C	24141950	XXYLT1-AS2	172702	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	194871039	194871493	194871089	Y	FAM43A,C3orf21	XXYLT1-AS2	NA	NA	NA	NA	XXYLT1-AS2	4439	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	194898663	194899282	194898930	Y	NA	XXYLT1-AS2	NA	NA	NA	NA	XXYLT1-AS2	32063	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	195034615	195034891	195034753	Y	NA	XXYLT1	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	44719	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	195073897	195074088	195073990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	84001	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	195153778	195154174	195153996	Y	NA	ACAP2	NA	NA	NA	NA	ACAP2	7633	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	195264699	195265107	195264994	Y	ACAP2,TNK2,PPP1R2	PPP1R2	NA	NA	NA	NA	PPP1R2	3102	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	195633702	195634304	195633876	Y	ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2,TNK2	TNK2	NA	NA	NA	NA	TNK2	2512	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	196047617	196047878	196047747	Y	NA	PCYT1A,TCTEX1D2	NA	NA	NA	NA	TCTEX1D2	4447	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	196758283	196758681	196758467	Y	NA	AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2	NA	NA	NA	NA	MFI2	3596	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	197216995	197217339	197217145	Y	DLG1	NA	NA	NA	NA	NA	BDH1	80855	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr3	197247664	197248059	197247722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BDH1	50135	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr3	197478210	197478491	197478305	Y	IQCG,KIAA0226,FYTTD1,FYTTD1,LRCH3	FYTTD1,KIAA0226,LRCH3	NA	NA	NA	NA	KIAA0226	3612	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	742666	742733	742699	Y	NA	PCGF3,RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	30904	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	751950	752022	752014	Y	NA	RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	21615	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	899253	899541	899397	Y	NA	GAK,TMEM175	NA	NA	NA	NA	GAK	24620	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	924714	925388	925028	Y	MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,IDUA,GAK	GAK,TMEM175	NA	NA	NA	NA	TMEM175	539	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	991255	991645	991565	Y	ZNF721,PDE6B,CPLX1,TMEM175	DGKQ,IDUA,SLC26A1,FGFRL1	NA	NA	NA	NA	SLC26A1	6027	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	1036795	1036974	1036954	Y	CRIPAK,SLC26A1	FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	35071	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	1037465	1037841	1037534	Y	MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,GAK,IDUA	FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	35741	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	1339592	1340250	1339850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEA	57953	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	1712467	1712893	1712787	Y	WHSC1	SLBP,TMEM129,TACC3	NA	NA	NA	NA	SLBP	185	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr4	1796551	1796852	1796752	Y	NA	FGFR3	NA	NA	NA	NA	FGFR3	3517	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	1875191	1875366	1875328	Y	NA	LETM1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	WHSC1	4040	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	2389037	2389223	2389089	Y	LOC402160	ZFYVE28	NA	NA	NA	NA	ZFYVE28	29167	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	2389711	2390014	2389863	Y	NAT8L,SH3BP2	ZFYVE28	NA	NA	NA	NA	ZFYVE28	28376	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	2414575	2415364	2414914	Y	HAUS3,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,RNF4,RNF4,LOC402160	ZFYVE28,RNF4	NA	NA	NA	NA	ZFYVE28	3026	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr4	2537711	2538436	2538089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	75764	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr4	2574508	2574529	2574516	Y	NA	NA	POLN,MXD4,LOC402160,RNF4,FAM193A,TNIP2,ADD1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF4	112561	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	2788784	2789423	2789092	Y	NA	TNIP2,SH3BP2	SH3BP2,NOP14-AS1,MFSD10	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SH3BP2	3327	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	2805465	2805723	2805581	Y	ZFYVE28,LOC402160,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2	TNIP2,SH3BP2,ADD1	NA	NA	NA	NA	SH3BP2	12715	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	3293872	3294174	3294028	Y	NA	RGS12	RGS12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RGS12	1117	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	3303883	3304472	3304061	Y	NA	RGS12	RGS12,HTT,HGFAC	IMR90	Hi-C	24141950	RGS12	11128	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	3374732	3375130	3374899	Y	RGS12	NA	NA	NA	NA	NA	RGS12	81977	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	4542716	4543043	4542880	Y	ZBTB49,STX18	STX18-AS1,STX18	NA	NA	NA	NA	STX18	643	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	6785099	6785509	6785391	Y	TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232	KIAA0232	NA	NA	NA	NA	KIAA0232	3997	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	6887984	6888235	6888115	Y	NA	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	20734	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	6893983	6894399	6894044	Y	KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	14570	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	6928884	6929127	6929009	Y	KIAA0232,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	19915	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	7868592	7868926	7868734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	70727	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	8119010	8119317	8119178	Y	ABLIM2	ABLIM2	NA	NA	NA	NA	ABLIM2	39242	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	9154755	9155069	9154900	Y	NA	FAM86KP	NA	NA	NA	NA	FAM86KP	1733	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	10116801	10117310	10116981	Y	WDR1	WDR1	NA	NA	NA	NA	WDR1	228	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	10830954	10831154	10831060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF518B	373920	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	10956396	10956801	10956583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR572	411650	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	11029361	11029726	11029544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR572	338725	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	11410203	11410376	11410250	Y	HS3ST1	MIR572,HS3ST1	NA	NA	NA	NA	HS3ST1	19013	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr4	11426480	11426816	11426649	Y	NA	HS3ST1	NA	NA	NA	NA	HS3ST1	2573	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr4	11428604	11428950	11428674	Y	NA	HS3ST1	NA	NA	NA	NA	HS3ST1	439	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	11603431	11603452	11603441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST1	174042	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	12547084	12547157	12547119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-352E6.2	93104	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	12642016	12642195	12642111	Y	NA	RP11-352E6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-352E6.2	1755	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr4	13922430	13922925	13922628	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,C1QTNF7	IMR90	Hi-C	24141950	AC006445.7	290207	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr4	13981901	13982273	13982087	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,BOD1L	IMR90	Hi-C	24141950	AC006445.7	349678	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	15036867	15037072	15036952	Y	NA	CPEB2	NA	NA	NA	NA	CPEB2	34569	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	15074859	15075210	15075035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB2	72561	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	15594702	15595080	15594956	Y	FBXL5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	86205	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	15651682	15652058	15651870	Y	NA	FAM200B,FBXL5	NA	NA	NA	NA	FAM200B	29227	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	15655935	15656313	15656300	Y	FBXL5,BST1	FAM200B,FBXL5,BST1	NA	NA	NA	NA	FAM200B	24972	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	17829390	17829398	17829394	Y	CLRN2,NCAPG	DCAF16,NCAPG	NA	NA	NA	NA	NCAPG	18865	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	22732539	22732617	22732578	Y	NA	CDC42P6	NA	NA	NA	NA	CDC42P6	4966	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	24472474	24473298	24472910	Y	NA	NA	PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	110875	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	24599702	24600087	24599863	Y	NA	DHX15	SOD3,CCDC149	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	15529	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	25175369	25175577	25175408	Y	NA	SEPSECS,PI4K2B	NA	NA	NA	NA	PI4K2B	15106	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	28607417	28607640	28607532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	1747196	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	30718904	30719447	30718947	Y	PCDH7,PCDH7	PCDH7	NA	NA	NA	NA	PCDH7	590	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr4	30954313	30954516	30954336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH7	234276	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	36191564	36191723	36191675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	52408	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	37668347	37668621	37668474	Y	NA	RELL1	NA	NA	NA	NA	RELL1	17377	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	37990345	37990694	37990415	Y	NA	PTTG2	NA	NA	NA	NA	PTTG2	30289	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	38665008	38665204	38665059	Y	TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	504	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	38668617	38669179	38668850	Y	KLF3	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	4113	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr4	38673994	38674276	38674074	Y	NA	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	9490	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr4	38674773	38675062	38674906	Y	KLF3	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	10269	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	38859134	38859762	38859410	Y	KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6	TLR1,TLR6,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	TLR1,TLR6	2696	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	3.88311912521653
chr4	38871281	38871430	38871296	Y	NA	TLR1,TLR6,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	FAM114A1	3983	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	39285630	39285978	39285919	Y	RFC1	NA	NA	NA	NA	NA	RFC1	80017	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	39354929	39355678	39355646	Y	NA	RFC1	WDR19	IMR90	Hi-C	24141950	RFC1	10317	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	39894546	39894889	39894718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDS5A	82687	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	39908966	39909133	39909103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDS5A	68443	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	39913580	39913628	39913604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDS5A	63948	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	39933245	39933555	39933419	Y	NA	PDS5A	NA	NA	NA	NA	PDS5A	44021	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	40578690	40579499	40579160	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	RBM47	51393	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	40609271	40609510	40609444	Y	NA	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	21382	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	40628320	40628499	40628391	Y	NA	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	2393	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	40791893	40792102	40791997	Y	NSUN7	NSUN7	NA	NA	NA	NA	NSUN7	41979	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr4	41000829	41000972	41000906	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	215759	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	41197133	41197282	41197239	Y	NA	APBB2	NA	NA	NA	NA	APBB2	19449	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	41363966	41364137	41364015	Y	LIMCH1,LIMCH1	LIMCH1	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	4342	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	41936193	41936441	41936268	Y	TMEM33	TMEM33	NA	NA	NA	NA	TMEM33	1056	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	44727575	44727855	44727678	Y	KCTD8,GNPDA2	GUF1,GNPDA2	NA	NA	NA	NA	GNPDA2	963	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	54137122	54137385	54137364	Y	SCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	SCFD2	92857	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	54794044	54794386	54794192	Y	NA	NA	SCFD2,PDGFRA,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	134471	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	54871626	54871896	54871863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHIC2	56961	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	54928262	54928437	54928381	Y	NA	CHIC2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	420	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	54929171	54929915	54929573	Y	CHIC2	CHIC2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	314	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	54958023	54958135	54958077	Y	NA	CHIC2	SCFD2,CHIC2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	29166	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	57132335	57132393	57132366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP31	87908	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	57313900	57314193	57314047	Y	NA	PPAT,PAICS,SRP72	NA	NA	NA	NA	PAICS	13993	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	57947514	57947824	57947684	Y	NA	IGFBP7-AS1,IGFBP7	NA	NA	NA	NA	IGFBP7-AS1	26104	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	57960936	57961321	57961171	Y	NA	IGFBP7-AS1,IGFBP7	NA	NA	NA	NA	IGFBP7-AS1	12607	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	65475793	65476032	65475913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-204H9.2	181166	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	69598714	69599110	69598795	Y	UGT2B10,UGT2B7,UGT2A3	NA	NA	NA	NA	NA	UGT2A3	216399	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	74881912	74882135	74882023	Y	IL8,MTHFD2L,EREG,CXCL3,CXCL2	CXCL5,CXCL3	NA	NA	NA	NA	CXCL5	19416	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	74922344	74922785	74922568	Y	IL8,MTHFD2L,EREG,CXCL3,CXCL2	CXCL3,CXCL2	CXCL3	K562	ChIA-PET	22265404	CXCL3	19820	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	74974850	74975280	74974976	Y	IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L	CXCL2,MTHFD2L	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	2611	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	74975298	74975961	74975834	Y	CXCL1,AREG	CXCL2,MTHFD2L	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	1930	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr4	75257879	75258118	75257951	Y	CXCL3,CXCL2,MTHFD2L,EREG	EREG	NA	NA	NA	NA	EREG	29019	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr4	75409847	75410209	75409849	Y	NA	NA	EREG	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EREG	180987	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	75554137	75554451	75554233	Y	NA	NA	EREG,MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	BTC	163445	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	76837000	76837401	76837201	Y	NA	NAAA	NA	NA	NA	NA	NAAA	22803	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	77522680	77522954	77522817	Y	SHROOM3	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	168427	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	77543952	77543974	77543961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	189699	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	77611633	77612016	77611712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOWAHB	204986	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	77869398	77869850	77869619	Y	SEPT11	SEPT11	NA	NA	NA	NA	SEPT11	542	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	79083838	79083918	79083865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRAS1	107114	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	83755588	83755973	83755970	Y	NA	SCD5	NA	NA	NA	NA	SCD5	37578	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	84034119	84034423	84034342	Y	THAP9,LIN54,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,COQ2,PLAC8,PLAC8	PLAC8	NA	NA	NA	NA	PLAC8	21805	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	84071761	84071998	84071930	Y	THAP9,HPSE,HPSE,HPSE,COQ2,AGPAT9,PLAC8	PLAC8	NA	NA	NA	NA	PLAC8	15533	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	84073969	84074156	84074073	Y	THAP9,LIN54,HPSE,HPSE,HPSE,COQ2,AGPAT9,PLAC8	PLAC8	NA	NA	NA	NA	PLAC8	17741	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	84196492	84196601	84196547	Y	NA	COQ2	NA	NA	NA	NA	COQ2	7466	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	85420434	85420908	85420714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDFY3-AS2	464630	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr4	85799806	85800014	85799906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDFY3-AS2	85524	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	85868944	85869302	85869263	Y	NA	WDFY3-AS2,WDFY3	NA	NA	NA	NA	WDFY3-AS2	16236	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	87626625	87626818	87626720	Y	PTPN13	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN13	113157	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	87829502	87829621	87829563	Y	HSD17B11,AFF1	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	AFF1	24533	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	87838829	87839174	87839055	Y	NA	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	AFF1	14980	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	87932880	87932928	87932888	Y	AFF1,AFF1	NA	NA	NA	NA	NA	TECRP1	63604	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	87960081	87960248	87960138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TECRP1	90805	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	88128695	88128755	88128733	Y	NA	KLHL8	NA	NA	NA	NA	KLHL8	30711	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	88670885	88671377	88671233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPP1	223442	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	89302401	89302730	89302543	Y	HERC6,HERC5	HERC6	NA	NA	NA	NA	HERC6	4510	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	90212945	90213002	90212979	Y	GPRIN3	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13A	182396	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	95373822	95374139	95373960	Y	PDLIM5	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	2785	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr4	95374521	95374795	95374668	Y	NA	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	3484	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr4	95406092	95406259	95406175	Y	NA	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	35055	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	95457390	95457546	95457468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	86353	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	99319477	99319794	99319573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GDS1	138942	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	100272514	100272898	100272713	Y	ADH4,ADH6,ADH1A,ADH1B,ADH1C	ADH1C	NA	NA	NA	NA	ADH1C	330	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	100325584	100326020	100325850	Y	ADH5,ADH4,ADH6,ADH1A,ADH1B,ADH1C	NA	NA	NA	NA	NA	ADH1C	53400	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr4	100861794	100861850	100861822	Y	NA	LAMTOR3,DNAJB14,RP11-15B17.1,H2AFZ	NA	NA	NA	NA	DNAJB14	4033	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	101977991	101978172	101977999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	288765	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	102266716	102267419	102267189	Y	NA	PPP3CA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	103485535	103485935	103485588	Y	NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA,NFKB1	NA	NA	NA	NA	NA	NFKB1	65049	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	103608721	103609347	103609253	Y	NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA	NA	NA	NA	NA	NA	MANBA	70804	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	103701783	103702159	103702029	Y	NA	MANBA,RP11-10L12.4	NA	NA	NA	NA	MANBA	21632	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	103967476	103967511	103967493	Y	NA	SLC9B1,SLC9B2	NA	NA	NA	NA	SLC9B1	28580	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	106391866	106392288	106392204	Y	TET2,TET2	PPA2	NA	NA	NA	NA	PPA2	950	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	106635528	106635690	106635582	Y	NA	GSTCD	NA	NA	NA	NA	GSTCD	7593	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	106841550	106841937	106841687	Y	TBCK,LOC100507096	NPNT,INTS12	NA	NA	NA	NA	INTS12	26407	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	106846669	106847134	106846803	Y	NA	NPNT,INTS12	NA	NA	NA	NA	INTS12	31526	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	108758517	108758852	108758585	Y	SGMS2,SGMS2	SGMS2	NA	NA	NA	NA	SGMS2	14798	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	108760061	108760236	108760128	Y	NA	SGMS2	NA	NA	NA	NA	SGMS2	16342	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	108783895	108784172	108784033	Y	SGMS2	SGMS2	NA	NA	NA	NA	SGMS2	40176	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	109037834	109038179	109038007	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HADH	128964	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	109044329	109044618	109044592	Y	LEF1,LEF1	NA	NA	NA	NA	NA	HADH	135459	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	111117471	111117868	111117585	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	487	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr4	113172339	113172711	113172527	Y	NEUROG2	AP1AR,ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	AP1AR	21446	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	113181018	113181306	113181029	Y	AP1AR,TIFA	AP1AR,ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	ALPK1	23359	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr4	113208440	113208624	113208493	Y	NA	ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	TIFA	3381	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	114389425	114389805	114389547	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	49946	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	117519495	117520605	117520296	Y	NA	ACTN4P1	NA	NA	NA	NA	ACTN4P1	2178	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.862915361159228
chr4	119629667	119629850	119629760	Y	NA	METTL14	NA	NA	NA	NA	METTL14	25144	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	119756174	119756657	119756269	Y	NA	SEC24D	NA	NA	NA	NA	SEC24D	1181	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr4	120205306	120205694	120205553	Y	NA	C4orf3,FABP2	NA	NA	NA	NA	C4orf3	17906	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	122611926	122612330	122612120	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	3938	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	122632771	122633033	122632919	Y	NA	ANXA5	ANXA5,BBS7,CCNA2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ANXA5	16503	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	123074024	123074337	123074286	Y	KIAA1109,IL21,IL2	KIAA1109	KIAA1109	K562	ChIA-PET	22265404	KIAA1109	2536	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	123685251	123685615	123685333	Y	FGF2	CETN4P,BBS12	NA	NA	NA	NA	BBS12	33394	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	128990801	128990842	128990822	Y	NA	LARP1B	NA	NA	NA	NA	LARP1B	10378	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	131958409	131958454	131958432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCLT1	1945645	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	139158628	139158837	139158817	Y	SLC7A11	SLC7A11	NA	NA	NA	NA	SLC7A11	2666	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	139960222	139960706	139960403	Y	CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25279	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	139960939	139961173	139961057	Y	NAA15,CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25996	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	140003738	140004448	140004114	Y	CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2	NA	CCRN4L	K562	ChIA-PET	22265404	CCRN4L	68795	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr4	140278994	140279360	140279178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	57289	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	140321405	140321719	140321434	Y	ELF2,NAA15,RAB33B	NA	NA	NA	NA	NA	RAB33B	50667	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	140334690	140334958	140334824	Y	ELF2	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	37428	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	140967961	140968185	140967999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	105153	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	141012548	141012827	141012747	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	60511	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	141015706	141016341	141016156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	56997	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	141174275	141174653	141174618	Y	NA	SCOC	MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SCOC	1787	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	141639566	141639883	141639758	Y	TBC1D9	TBC1D9	NA	NA	NA	NA	TBC1D9	35391	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	143185718	143186074	143185891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	580511	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	143186679	143186969	143186824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	579616	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	143471391	143471615	143471483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	294970	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	143488504	143488630	143488569	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	277955	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	143536371	143536723	143536559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	229862	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	143608710	143609035	143608873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	157550	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	143742944	143743236	143743092	Y	NA	INPP4B	NA	NA	NA	NA	INPP4B	23349	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	144271294	144271615	144271412	Y	NA	GAB1	NA	NA	NA	NA	GAB1	15379	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	144280232	144280410	144280287	Y	USP38,SMARCA5,GAB1	GAB1	NA	NA	NA	NA	GAB1	24317	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	145975837	145976119	145976108	Y	NA	ABCE1,ANAPC10	NA	NA	NA	NA	ABCE1	40965	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	146024258	146024314	146024286	Y	NA	ABCE1,ANAPC10	NA	NA	NA	NA	ANAPC10	6565	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	146101946	146102251	146102199	Y	NA	OTUD4	ABCE1	K562	ChIA-PET	22265404	OTUD4	2633	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	146674591	146674889	146674740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAA	137176	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	146729401	146729770	146729628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF827	128017	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	146764373	146764705	146764540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF827	93082	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	148374725	148374999	148374823	Y	TMEM184C	EDNRA	TMEM184C	IMR90	Hi-C	24141950	EDNRA	25070	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	148752985	148753384	148753090	Y	PRMT10	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	101771	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	152048107	152048440	152048274	Y	LRBA,LRBA	RPS3A	NA	NA	NA	NA	RPS3A	29382	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	152105959	152106222	152106091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	87234	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	153265183	153265560	153265526	Y	FBXW7	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4453	189856	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	153313306	153313343	153313324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4453	142073	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	153858553	153859077	153858605	Y	TRIM2,FHDC1	RP11-206F17.2,FHDC1	ARFIP1,FHDC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FHDC1	3049	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	154235645	154236052	154235798	Y	TRIM2,TRIM2,RNF175	MND1	NA	NA	NA	NA	MND1	27749	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	154253952	154254140	154254046	Y	NA	MND1	NA	NA	NA	NA	MND1	9661	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	154269495	154269528	154269512	Y	TRIM2,MND1	MND1	NA	NA	NA	NA	MND1	5694	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	154580466	154580842	154580627	Y	TLR2	TLR2	NA	NA	NA	NA	TLR2	39810	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr4	157692679	157692824	157692748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFC	197722	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	157811355	157811573	157811537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFC	78973	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	157867687	157867968	157867878	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	22578	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	157870715	157871133	157870964	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	19413	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.38066457785476
chr4	157889828	157890031	157889884	Y	PDGFC	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	515	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	158125886	158126027	158125941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRB	130677	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	159731152	159732543	159732097	Y	PPID,RAPGEF2,FNIP2	FNIP2	NA	NA	NA	NA	FNIP2	42862	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr4	159746098	159746434	159746194	Y	PPID,RAPGEF2,FNIP2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	57808	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	159925060	159925429	159925240	Y	FNIP2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	236770	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	166315734	166315907	166315821	Y	NA	CPE	NA	NA	NA	NA	CPE	35388	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	169361585	169362025	169361769	Y	DDX60,DDX60L	NA	NA	NA	NA	NA	PALLD	54192	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	170132939	170133158	170133049	Y	SH3RF1	NA	NA	NA	NA	NA	SH3RF1	57098	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr4	170172551	170172946	170172870	Y	NA	SH3RF1	NA	NA	NA	NA	SH3RF1	17310	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	174210504	174211007	174210885	Y	GALNT7	HMGB2	NA	NA	NA	NA	HMGB2	43269	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	178362238	178362457	178362307	Y	NA	AGA	NA	NA	NA	NA	AGA	581	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	178849873	178850023	178850005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGA	488216	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	180585671	180585931	180585800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGA	2224014	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	183730445	183730610	183730498	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCTD	106479	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr4	184042355	184042696	184042526	Y	NA	WWC2	NA	NA	NA	NA	WWC2	23909	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	184256615	184256836	184256706	Y	NA	NA	CLDN24,CLDN22	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN2AIP	106908	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	184319940	184320161	184319981	Y	NA	CDKN2AIP	WWC2,CLDN22,CDKN2AIP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIP	43583	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	184328356	184328744	184328447	Y	CDKN2AIP	CDKN2AIP	WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIP	35000	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr4	184330014	184330225	184330125	Y	CDKN2AIP	CDKN2AIP	WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIP	33519	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr4	185186820	185187542	185187472	Y	IRF2,CASP3	NA	IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2	206192	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr4	185609676	185609967	185609740	Y	NA	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	41013	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	186594730	186595126	186594900	Y	SORBS2,SORBS2,SORBS2,SORBS2,SORBS2,SNX25	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-279O9.4	204060	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	187050395	187050604	187050500	Y	SORBS2	FAM149A	SORBS2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM149A	26822	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	187591076	187591113	187591095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAT1	54763	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	187597728	187597911	187597833	Y	NA	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	47965	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	187614690	187615080	187614853	Y	NA	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	30796	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr4	187762182	187762435	187762391	Y	NA	NA	FAT1,LOC339975	IMR90	Hi-C	24141950	FAT1	116306	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr4	187766570	187766763	187766651	Y	NA	NA	FAT1,LOC339975	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAT1	120694	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	190498601	190498949	190498697	Y	FRG1	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	129919	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	190708637	190708848	190708802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	79769	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr4	190937232	190937266	190937251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	77289	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	53990	54174	54063	Y	PLEKHG4B,C5orf55	NA	LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC127	162156	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	175502	175522	175512	Y	NA	CCDC127,SDHA	NA	NA	NA	NA	CCDC127	40808	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	333938	334337	334088	Y	NA	AHRR	NA	NA	NA	NA	AHRR	31647	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	354736	354943	354840	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	AHRR	52445	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	373392	373627	373429	Y	EXOC3,C5orf55,PDCD6	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67631	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	373695	374160	373984	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67098	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	379590	379862	379712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	61396	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	389983	390379	390026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	50879	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr5	399875	400445	400189	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	40813	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	413817	414070	413960	Y	NA	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	27188	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr5	426647	427011	426980	Y	NA	C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5	NA	NA	NA	NA	C5orf55	14247	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr5	672861	673336	673024	Y	NA	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18174	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	TPPP	93141	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.121789969507
chr5	1111223	1111556	1111501	Y	LPCAT1,SLC12A7	SLC12A7	NA	NA	NA	NA	SLC12A7	1073	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	1155287	1155504	1155358	Y	NA	SLC12A7	SLC12A7,TRIP13,SLC6A18,BRD9	IMR90	Hi-C	24141950	SLC12A7	45137	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	1522529	1522699	1522639	Y	NA	LPCAT1	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	437	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	2669640	2670190	2669944	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf38	80055	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-332J15.3	50027	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	2.50245454736176
chr5	7742239	7742282	7742261	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTRR	107017	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	10270287	10270466	10270406	Y	NA	FAM173B,CCT5,CMBL	NA	NA	NA	NA	CCT5	22254	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	10352620	10352938	10352732	Y	NA	CMBL,MARCH6	NA	NA	NA	NA	MARCH6	805	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	10422961	10423316	10423021	Y	NA	ROPN1L	NA	NA	NA	NA	ROPN1L	16320	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr5	14035955	14036534	14036234	Y	TRIO	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	93303	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	14142332	14142650	14142445	Y	NA	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	521	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	14142803	14143164	14142969	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	992	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	14154284	14154671	14154327	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	12473	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	14185691	14186191	14185984	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	43880	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	14268390	14268821	14268476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	126579	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	14404233	14404452	14404428	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	FAM105A	175432	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	14739809	14739939	14739877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBBP4P1	56570	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	14809867	14810211	14810035	Y	FAM105A,FAM105B	RBBP4P1	NA	NA	NA	NA	RBBP4P1	13358	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	14872714	14873077	14873012	Y	NA	ANKH	NA	NA	NA	NA	ANKH	2827	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	16492574	16492683	16492630	Y	FAM134B	ZNF622	NA	NA	NA	NA	ZNF622	28673	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr5	16715199	16715528	16715435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	100032	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	16733521	16733894	16733888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	118354	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	16894604	16895174	16894829	Y	NA	CTB-55B8.1,MYO10	NA	NA	NA	NA	CTB-55B8.1	5576	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	17282496	17282827	17282587	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	60898	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	23303766	23303789	23303778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPD1P1	1423072	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	721816	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr5	27309667	27310060	27309866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	2120902	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	31894536	31894834	31894609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOLPH3	277622	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	32164142	32164348	32164245	Y	ZFR	GOLPH3	NA	NA	NA	NA	GOLPH3	8108	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	33003912	33004012	33003962	Y	NA	NA	NPR3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-36C20.1	156273	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	34564903	34565130	34565039	Y	RAI14,RAI14	NA	RAI14,TTC23L,RAD1,BRIX1	IMR90	Hi-C	24141950	RAI14	89212	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	34949030	34949157	34949062	Y	NA	BRIX1,RAD1,DNAJC21	NA	NA	NA	NA	DNAJC21	21332	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	36151218	36151404	36151252	Y	C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	1127	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	36690488	36690876	36690655	Y	NIPBL	CTD-2353F22.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2353F22.1	32421	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	37272795	37272956	37272876	Y	C5orf42	C5orf42	NA	NA	NA	NA	C5orf42	25265	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	37718043	37718447	37718273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR70	340729	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	37776965	37777327	37776998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR70	399651	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	38660472	38660667	38660594	Y	LIFR	NA	EGFLAM,LIFR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIFR	54016	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	38872248	38872554	38872396	Y	NA	CTD-2127H9.1,OSMR	NA	NA	NA	NA	OSMR	28288	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	39072904	39073873	39073587	Y	FYB,RICTOR	RICTOR	NA	NA	NA	NA	RICTOR	394	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	39185861	39186166	39186014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	113351	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	39486280	39486288	39486284	Y	NA	DAB2	DAB2,C9	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	25878	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	40682862	40683125	40682898	Y	CARD6,PTGER4	PTGER4	NA	NA	NA	NA	PTGER4	5262	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	40688188	40688473	40688414	Y	PRKAA1,PTGER4	PTGER4	NA	NA	NA	NA	PTGER4	10588	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	40754670	40754884	40754791	Y	PTGER4	TTC33,PRKAA1	NA	NA	NA	NA	TTC33	593	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	40967939	40968194	40968008	Y	C6,C7	NA	NA	NA	NA	NA	CARD6	128653	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	41845041	41845055	41845050	Y	OXCT1,FBXO4	OXCT1	NA	NA	NA	NA	OXCT1	23566	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	42465969	42466319	42466144	Y	GHR,GHR,GHR,GHR,GHR,GHR,GHR	GHR	NA	NA	NA	NA	GHR	44090	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	43020158	43020617	43020275	Y	C5orf28,ZNF131,C5orf39	AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	AC025171.1	19060	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	43034859	43034967	43034962	Y	NA	AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	LOC648987	MCF7	ChIA-PET	22265404	AC025171.1	4710	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	43061828	43062062	43061945	Y	NA	AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	ZNF131	1216	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	43105884	43106284	43106088	Y	NA	ZNF131,CTD-2201E18.3	LOC153684,LOC100132356,ZNF131	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2201E18.3	40363	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	49719324	49719499	49719409	Y	PARP8	EMB	NA	NA	NA	NA	EMB	17583	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	51211467	51211491	51211480	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISL1	534546	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	52319874	52320078	52320019	Y	NA	ITGA2,CTD-2175A23.1	LOC257396	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2175A23.1	35766	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	52332019	52332357	52332083	Y	FST,ITGA2	ITGA2,CTD-2175A23.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2175A23.1	47911	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	53298305	53298413	53298402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	305999	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	54472215	54472598	54472476	Y	NA	GPX8	NA	NA	NA	NA	GPX8	18269	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	54722913	54723133	54723024	Y	SKIV2L2	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	101396	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	55287334	55287994	55287973	Y	NA	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	IL6ST	827	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	55289605	55289989	55289924	Y	IL6ST	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2031P19.3	610	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	55654713	55655022	55654890	Y	NA	NA	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC022431.1	143877	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	55655118	55655221	55655151	Y	NA	NA	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC022431.1	143678	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	56131312	56131556	56131415	Y	GPBP1,GPBP1,GPBP1,MAP3K1	MAP3K1	NA	NA	NA	NA	MAP3K1	21911	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	56468272	56468727	56468348	Y	MAP3K1,C5orf35,GPBP1,GPBP1,GPBP1	GPBP1	NA	NA	NA	NA	GPBP1	497	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	57120821	57121296	57121146	Y	NA	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	PLK2	632791	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	58418380	58418697	58418552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	664293	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	58575824	58576193	58576112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	821737	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	58746343	58746348	58746346	Y	PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	992256	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	58816932	58817290	58817225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	998657	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	58874550	58874813	58874554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	941134	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	58926109	58926323	58926216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	889624	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	58951498	58952014	58951831	Y	PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	863933	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	59045613	59045932	59045792	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	770015	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	59057056	59057135	59057102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	758812	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	59086263	59086677	59086406	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	729270	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	59505321	59505489	59505391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	310458	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	60239574	60239836	60239702	Y	ELOVL7,ZSWIM6,ERCC8	ERCC8,NDUFAF2	NA	NA	NA	NA	NDUFAF2	618	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	60315642	60315784	60315678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFAF2	76686	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	60597691	60598057	60597813	Y	NA	ZSWIM6	ZSWIM6,C5orf43	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZSWIM6	28043	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	60626678	60627139	60626902	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	578	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr5	60629089	60629454	60629159	Y	NA	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	2989	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	60704594	60705129	60704691	Y	NA	RPL3P6	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	18896	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	64062074	64062237	64062149	Y	NA	SREK1IP1,CWC27	NA	NA	NA	NA	SREK1IP1	275	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	64331292	64332267	64331637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWC27	268535	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	64796548	64796879	64796719	Y	PPWD1,CENPK	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	20801	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	64947553	64947709	64947631	Y	NA	CTC-534A2.2,TRIM23	NA	NA	NA	NA	TRIM23	27751	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	65447669	65447962	65447814	Y	SREK1,SREK1	SREK1	NA	NA	NA	NA	SREK1	13870	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	CTC-498J12.1,SLC30A5	NA	NA	NA	NA	CTC-498J12.1	815	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr5	70772003	70772134	70772073	Y	NA	BDP1	NA	NA	NA	NA	BDP1	22561	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	70938164	70938422	70938252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCC2	57049	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	71218510	71218673	71218589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	182388	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr5	71462643	71462861	71462688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	61582	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	71481497	71481884	71481610	Y	MAP1B	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	80436	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	72218346	72218584	72218427	Y	NA	FCHO2	NA	NA	NA	NA	FCHO2	31224	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	72511984	72512100	72512037	Y	FOXD1	NA	FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM171	97865	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr5	72512311	72512636	72512493	Y	FOXD1	NA	FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM171	98192	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	72607592	72607820	72607706	Y	NA	NA	FCHO2,FOXD1,TMEM171,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	FOXD1	134532	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	72672825	72672912	72672868	Y	NA	NA	FOXD1,FCHO2,TMEM171,TMEM174	IMR90	Hi-C	24141950	FOXD1	69440	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	74020638	74021005	74020822	Y	NA	NSA2,GFM2	NA	NA	NA	NA	NSA2	39812	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	76034658	76035100	76034908	Y	IQGAP2	F2R	NA	NA	NA	NA	F2R	24790	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	76086859	76087104	76086921	Y	F2R,F2RL1	F2RL1	NCRUPAR,F2R,IQGAP2	IMR90	Hi-C	24141950	F2RL1	25654	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	77140620	77140840	77140736	Y	NA	TBCA	NA	NA	NA	NA	TBCA	21764	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	77374282	77374304	77374295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBCA	211678	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	77582031	77582256	77582186	Y	AP3B1	AP3B1	NA	NA	NA	NA	AP3B1	6323	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	77765293	77765351	77765322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	110954	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	77792703	77793028	77792954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	138364	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	77810178	77810481	77810268	Y	AP3B1	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	155839	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	77814404	77814787	77814528	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	160065	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	77890894	77891278	77891114	Y	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2073O6.1	118627	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	77940704	77941073	77940964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2073O6.1	68832	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	78355695	78355721	78355708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARSB	75785	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	79418428	79418727	79418619	Y	ZFYVE16,FAM151B	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	131171	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	79480253	79480678	79480326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	69220	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	79543086	79543324	79543242	Y	ZFYVE16,SERINC5	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	6574	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.862915361159228
chr5	80372631	80372748	80372736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-459I6.1	117905	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	80394008	80394030	80394018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKMT2	133074	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	81045433	81045821	81045530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP2	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	CTD-2249K22.1	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2249K22.1	2217	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr5	81469981	81470152	81470091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS23	102244	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	81653126	81653457	81653257	Y	RPS23	NA	ATP6AP1L,XRCC4,VCAN	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	80730	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.8984137945503
chr5	81661583	81662026	81661933	Y	NA	NA	VCAN	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	89187	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	82768927	82769141	82769084	Y	VCAN	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	3643	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	82770174	82770695	82770300	Y	NA	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	4890	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	82807080	82807411	82807109	Y	XRCC4,VCAN	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	41796	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr5	86619148	86619498	86619336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA1	57443	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	86620547	86620785	86620574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA1	58842	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	86649300	86650123	86649885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNH	56713	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	88171082	88171456	88171409	Y	MEF2C	MEF2C-AS1,MEF2C	NA	NA	NA	NA	MEF2C-AS1	5689	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	88177466	88177636	88177509	Y	NA	MEF2C-AS1,MEF2C	NA	NA	NA	NA	MEF2C-AS1	321	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	90579794	90579971	90579883	Y	ARRDC3	RNU4-90P,LUCAT1	ARRDC3,LOC100129716,GPR98	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-90P	15250	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	90662566	90662573	90662570	Y	NA	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	14603	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	90673049	90673245	90673226	Y	ARRDC3	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	3931	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	90772639	90772960	90772848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	95463	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	92914746	92915169	92914912	Y	NR2F1	NR2F1	NA	NA	NA	NA	NR2F1	1874	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	94380006	94380293	94380145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP1	237986	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	95007981	95008178	95008080	Y	NA	RFESD,RHOBTB3	NA	NA	NA	NA	RFESD	27523	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	95170754	95171173	95170855	Y	GLRX,ELL2	GLRX	RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	14045	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr5	98175322	98175662	98175493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGMB-AS1	68149	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	98197255	98197391	98197342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	65484	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	98262747	98263243	98263080	Y	CHD1	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	99382569	99383254	99382906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	485712	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	102091646	102092087	102091846	Y	NA	PAM	NA	NA	NA	NA	PAM	3961	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	102194504	102194814	102194701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAM	106819	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	102544271	102544391	102544342	Y	NA	C5orf30	NA	NA	NA	NA	C5orf30	48012	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	106724874	106725113	106725059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	279483	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	106803890	106804202	106804046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	200394	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	106806041	106806198	106806107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	198398	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	106822252	106822471	106822392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	182125	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	106862612	106863005	106862809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	141591	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	106878561	106878904	106878854	Y	EFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	125692	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	106906858	106907181	106907119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	97415	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	106907307	106907511	106907485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	97085	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	106931094	106931453	106931417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	73143	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	106967635	106967784	106967710	Y	NA	EFNA5	NA	NA	NA	NA	EFNA5	36812	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	107004755	107005118	107004922	Y	NA	EFNA5	NA	NA	NA	NA	EFNA5	159	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	108747394	108747617	108747516	Y	MAN2A1	PJA2	NA	NA	NA	NA	PJA2	3699	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	109079577	109079706	109079642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAN2A1	56510	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	109125780	109125881	109125831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAN2A1	102713	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	109837910	109838241	109838076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A46	233596	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	111502817	111502914	111502867	Y	C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,EPB41L4A	EPB41L4A-AS1	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	8594	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	112219334	112219897	112219506	Y	NA	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	24415	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	112509140	112509432	112509369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP2	198741	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	114726097	114726311	114726134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC112	95569	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	114750887	114751289	114751050	Y	NA	NA	FEM1C	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC112	120359	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr5	114913600	114913827	114913746	Y	NA	FEM1C,AC010226.4,TMED7-TICAM2,TICAM2	NA	NA	NA	NA	AC010226.4	21927	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	114959651	114959879	114959766	Y	COMMD10	AC010226.4,TMED7	NA	NA	NA	NA	TMED7-TICAM2,TICAM2	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	115412236	115412448	115412328	Y	NA	CTD-2287O16.1,COMMD10	NA	NA	NA	NA	COMMD10	6240	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	115420076	115420175	115420113	Y	LOC644100	CTD-2287O16.1,COMMD10	NA	NA	NA	NA	COMMD10	1388	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	118453384	118453586	118453485	Y	NA	CTB-161M19.4,RP11-950K24.2	NA	NA	NA	NA	RP11-950K24.2	8553	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr5	118610393	118610883	118610628	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	8006	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	118664608	118664762	118664738	Y	DMXL1,TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	62221	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	120396721	120396798	120396760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRFBP1	898858	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	122177778	122177931	122177816	Y	NA	SNX24	NA	NA	NA	NA	SNX24	644	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	122690309	122690381	122690346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP120	66905	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	122885327	122885717	122885442	Y	CEP120,CSNK1G3	CSNK1G3	NA	NA	NA	NA	CSNK1G3	39534	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	123738017	123738276	123738143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	344224	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr5	124029260	124029627	124029444	Y	ZNF608	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	52873	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	124748569	124748778	124748675	Y	NA	NA	ZNF608	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-436H11.1	605643	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr5	125709518	125709709	125709633	Y	GRAMD3	GRAMD3	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	15694	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	125773418	125773804	125773609	Y	GRAMD3	NA	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	79594	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	125779791	125780174	125779834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	85967	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	126181513	126181654	126181594	Y	MARCH3	NA	NA	NA	NA	NA	LMNB1	71198	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr5	126847905	126848122	126848004	Y	NA	PRRC1	PRRC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	PRRC1	3179	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	130718102	130718482	130718270	Y	FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42SE2	138916	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	130739357	130739526	130739407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42SE2	160171	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	131601385	131601782	131601639	Y	P4HA2	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	10021	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	131747457	131747923	131747553	Y	NA	SLC22A5,AC034220.3,C5orf56	NA	NA	NA	NA	C5orf56	3129	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	131832561	131832909	131832704	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8071	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr5	131833441	131833717	131833513	Y	IRF1	IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8951	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	131833993	131834254	131834119	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	9503	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	131835833	131835962	131835893	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	IRF1	IRF1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF1	11343	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,AC010240.3,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AC010240.3	1685	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr5	133290184	133290209	133290197	Y	NA	C5orf15,VDAC1	NA	NA	NA	NA	C5orf15	12269	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	133330374	133330645	133330542	Y	NA	C5orf15,VDAC1	C5orf15	IMR90	Hi-C	24141950	VDAC1	8179	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	133463152	133463566	133463254	Y	PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7,SKP1	NA	NA	NA	NA	TCF7	14750	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	133540709	133541017	133540863	Y	NA	SKP1,MIR3661,PPP2CA	NA	NA	NA	NA	MIR3661	18431	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	133562679	133563046	133562870	Y	NA	MIR3661,PPP2CA	NA	NA	NA	NA	PPP2CA	2846	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	133801466	133801754	133801589	Y	NA	AC005355.2	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.2	38489	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	133839310	133839404	133839346	Y	NA	AC005355.2	PHF15,PPP2CA,CDKL3,CDKN2AIPNL,SAR1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.2	839	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	133890594	133890960	133890666	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	50351	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	133891612	133892163	133891823	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	51369	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	246	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12,MIR4461	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr5	134729736	134729896	134729816	Y	NA	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	3708	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	134733668	134734080	134733976	Y	H2AFY	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	64	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	135416297	135416409	135416350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD5	50125	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.20808150562292
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	5.00490909472352
chr5	137810438	137810840	137810496	Y	NA	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	11259	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr5	137815410	137815785	137815600	Y	BRD8,HSPA9	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	16231	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	137822279	137822351	137822306	Y	NA	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	23100	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	137827710	137828119	137827817	Y	EGR1	EGR1,ETF1	NA	NA	NA	NA	EGR1	28531	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr5	137868208	137868538	137868536	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	8451	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	137881069	137881276	137881109	Y	WNT8A,FAM53C,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	4080	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	137908044	137908328	137908223	Y	NA	ETF1,HSPA9,CTNNA1	NA	NA	NA	NA	HSPA9	805	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr5	138248139	138248403	138248239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNNA1	303483	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	138277949	138278244	138278038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATR3	329197	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr5	138620359	138620541	138620439	Y	UBE2D2,MATR3	MATR3,SIL1	NA	NA	NA	NA	SIL1	6705	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr5	138897527	138897822	138897662	Y	MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2	TMEM173,UBE2D2	DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2D2	6194	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr5	139031397	139032095	139031636	Y	C5orf53,PSD2,NRG2,CXXC5	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	6513	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	139078128	139078514	139078502	Y	C5orf53,DNAJC18,CXXC5,NRG2,PSD2	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	53244	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	139568486	139568801	139568644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGIP	64965	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	139598972	139599011	139598993	Y	ANKHD1	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN1	81695	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	139631101	139631601	139631302	Y	SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	49105	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	139636160	139636260	139636251	Y	SRA1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	44446	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	139782360	139782578	139782471	Y	NA	RNU4-14P,ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3	NA	NA	NA	NA	ANKHD1-EIF4EBP3	2867	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	139933633	139933898	139933723	Y	ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3	EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3	NA	NA	NA	NA	SRA1	1997	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	140090601	140091006	140090806	Y	NA	WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-1	1741	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	140098281	140098628	140098472	Y	NA	HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-3	5115	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	140420005	140420137	140420073	Y	NA	NA	PCDHA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PCDHB3	58097	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	140648312	140648399	140648356	Y	NA	PCDHB14,PCDHB15,TAF7	NA	NA	NA	NA	PCDHB15	25165	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	140875639	140876085	140875835	Y	PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1	PCDHGC3	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	22059	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	140900821	140901187	140900923	Y	PCDH12,KIAA0141,DIAPH1	PCDHGC3	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	47241	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	140910138	140910894	140910494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	56558	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr5	140983787	140984197	140984031	Y	PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1	DIAPH1,HDAC3,RELL2,FCHSD1	NA	NA	NA	NA	DIAPH1	12425	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	141201064	141201327	141201197	Y	PCDH1	NA	PCDH1,LOC729080,FCHSD1,ARAP3,KIAA0141,PCDH12,RNF14	IMR90	Hi-C	24141950	PCDH1	55484	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	141256552	141256862	141256814	Y	PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1,PCDH1	KIAA0141	NA	NA	NA	NA	PCDH1	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	141311332	141311399	141311366	Y	NA	KIAA0141,RNF14	NA	NA	NA	NA	KIAA0141	9959	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	141375136	141375383	141375261	Y	NA	RNF14,GNPDA1	NA	NA	NA	NA	GNPDA1	15223	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	141404371	141404781	141404694	Y	DIAPH1,FCHSD1	GNPDA1	GNPDA1,NDFIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNPDA1	13765	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	141736379	141736797	141736670	Y	ARHGAP26	AC005592.2,SPRY4	NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPRY4	32359	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr5	141824245	141824298	141824272	Y	NA	NA	NDFIP1,SPRY4,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	120225	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	142174275	142174448	142174377	Y	ARHGAP26	ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	26326	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	142216734	142217104	142216831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	68785	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	142331900	142332061	142331967	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	183951	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	142378250	142378447	142378318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	230301	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	142623562	142623962	142623719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	86208	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	142701946	142702250	142702195	Y	NR3C1,NR3C1	RPL7P21	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	7920	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	144920892	144921143	144921082	Y	NA	NA	KCTD16	IMR90	Hi-C	24141950	PRELID2	291789	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	145319403	145319467	145319435	Y	NA	SH3RF2	NA	NA	NA	NA	SH3RF2	5261	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	145326011	145326414	145326305	Y	NA	SH3RF2	NA	NA	NA	NA	SH3RF2	11869	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	145498086	145498488	145498483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	61735	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	145827727	145827826	145827802	Y	NA	TCERG1	GPR151	IMR90	Hi-C	24141950	TCERG1	2853	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	146200379	146200464	146200463	Y	PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B	NA	NA	NA	NA	NA	KRT8P48	115216	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	147218600	147219023	147218871	Y	SPINK1	NA	JAKMIP2	IMR90	Hi-C	24141950	DPYSL3	330981	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	147777538	147777934	147777556	Y	NA	RP11-373N22.3,FBXO38	NA	NA	NA	NA	FBXO38	16040	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	148292484	148292904	148292843	Y	NA	NA	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	88328	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	148352583	148352893	148352766	Y	ADRB2	NA	NA	NA	NA	NA	SH3TC2	87833	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	148869266	148869383	148869317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1	59624	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	149110836	149111455	149111198	Y	ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2975	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr5	149111581	149111664	149111645	Y	NA	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	3720	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	149379132	149379170	149379142	Y	NA	SLC26A2,HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	TIGD6	402	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	149838456	149838698	149838517	Y	SYNPO,ZNF300,SLC6A7	CD74,RPS14,NDST1	NDST1,MYOZ3,SYNPO,RPS14	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS14	11137	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	150159490	150160262	150159991	Y	CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62	DCTN4	NA	NA	NA	NA	DCTN4	22819	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	150163031	150163501	150163387	Y	TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,C5orf62	DCTN4	NA	NA	NA	NA	DCTN4	26360	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	150462985	150463261	150463131	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	7877	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	150474739	150475397	150475230	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62,TNIP1,SLC36A1,CCDC69	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	3601	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	151213355	151213633	151213423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	63262	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	154062607	154063000	154062805	Y	GEMIN5	LARP1	LARP1,C5orf4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LARP1	27462	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	154205315	154205569	154205444	Y	KIF4B,GEMIN5	CNOT8	NA	NA	NA	NA	CNOT8	29544	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr5	155202123	155202494	155202309	Y	NA	NA	PPP1R2P3	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL22	883493	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	157097652	157097963	157097872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THG1L	58242	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr5	158611896	158612266	158612182	Y	IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145	CTB-11I22.1,RNF145	NA	NA	NA	NA	CTB-11I22.1	22663	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	159355194	159355367	159355277	Y	NA	ADRA1B	NA	NA	NA	NA	ADRA1B	13404	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	159414162	159414427	159414404	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	19693	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr5	159451021	159451194	159451125	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	16901	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	159480874	159481257	159481243	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	46754	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	159533500	159533764	159533742	Y	NA	PWWP2A	NA	NA	NA	NA	PWWP2A	10666	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	159592107	159592427	159592336	Y	NA	PWWP2A,FABP6	TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FABP6	19947	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr5	159714411	159714605	159714509	Y	NA	RP11-34P1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-34P1.2	31151	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	159732256	159732561	159732409	Y	NA	RP11-34P1.2,CCNJL	FABP6	IMR90	Hi-C	24141950	CCNJL	37842	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	167716783	167717259	167717053	Y	NA	WWC1	NA	NA	NA	NA	WWC1	127	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	167752204	167752623	167752553	Y	PANK3	WWC1	RARS	IMR90	Hi-C	24141950	WWC1	35548	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	169082703	169082936	169082819	Y	DOCK2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM196B	322808	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	169696407	169697161	169696865	Y	KCNMB1,LCP2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM196B	290663	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	170060615	170060931	170060764	Y	RANBP17	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP17	225943	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	171602273	171602685	171602548	Y	STK10	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	10705	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	171681735	171682053	171681977	Y	NA	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	27022	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr5	172193800	172194232	172193914	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	1966	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	172208951	172208972	172208964	Y	UBTD2	DUSP1	ERGIC1,DUSP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	12753	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	172234136	172234644	172234380	Y	NA	DUSP1,ERGIC1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERGIC1	24634	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr5	172463160	172463425	172463226	Y	NA	NA	C5orf41	IMR90	Hi-C	24141950	ATP6V0E1	54400	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	172882283	172882785	172882503	Y	NA	NA	LOC285593,STC2,BOD1,NKX2-5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STC2	127777	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	172883833	172884047	172883943	Y	CPEB4	NA	LOC285593,STC2,BOD1,NKX2-5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STC2	129327	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	173251298	173251668	173251379	Y	NA	NA	BOD1,CPEB4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CPEB4	61615	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	173293319	173293521	173293407	Y	CPEB4	CPEB4	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	19762	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	173391031	173391183	173391109	Y	HMP19	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB4	77748	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	173391394	173391777	173391587	Y	CPEB4	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB4	78111	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	173846140	173846257	173846227	Y	NA	NA	MSX2,MIR4634	IMR90	Hi-C	24141950	MSX2	303279	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	173846628	173846975	173846845	Y	NA	NA	MSX2,MIR4634	IMR90	Hi-C	24141950	MSX2	302561	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	174906234	174906555	174906308	Y	NA	DRD1,SFXN1	NA	NA	NA	NA	SFXN1	4169	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	175974830	175975038	175974917	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,HK3,C5orf25,RNF44,CDHR2	RNF44,CDHR2	NA	NA	NA	NA	CDHR2	7318	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	176790168	176790403	176790363	Y	DOK3,RGS14	LMAN2,RGS14,GRK6	NA	NA	NA	NA	RGS14	7330	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	176972522	176972758	176972729	Y	NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3	PDLIM7,DDX41,FAM193B,TMED9	NA	NA	NA	NA	FAM193B	6784	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	176973275	176973657	176973542	Y	NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3	DDX41,FAM193B,TMED9	NA	NA	NA	NA	FAM193B	5885	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	177645267	177645446	177645363	Y	N4BP3,CLK4,AGXT2L2	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15759	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	177645477	177646261	177645593	Y	NA	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15969	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr5	177647239	177647603	177647383	Y	CLK4,AGXT2L2	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	17731	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	179188972	179189165	179189138	Y	NA	MAML1,SQSTM1,MGAT4B	NA	NA	NA	NA	MAML1	31121	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	179350502	179350731	179350619	Y	RUFY1,HNRNPH1,MAML1,SQSTM1,RNF130	TBC1D9B	RNF130	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D9B	17643	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	179859627	179859895	179859761	Y	NA	CTC-573N18.1	NA	NA	NA	NA	CTC-573N18.1	6664	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	180541875	180541994	180541989	Y	OR2Y1	NA	BTNL8,MGAT1	IMR90	Hi-C	24141950	CTC-338M12.5	74930	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	180611137	180611357	180611292	Y	MGAT1	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	5567	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	180615864	180616079	180615972	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	845	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	180616521	180617006	180616799	Y	ZFP62,TRIM52,TRIM41	TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr5	180633694	180634117	180633980	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM7	3401	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr5	180634441	180634803	180634658	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM7	4148	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr6	321888	322261	322075	Y	NA	DUSP22	NA	NA	NA	NA	DUSP22	32258	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	710742	711015	710979	Y	HUS1B	EXOC2	NA	NA	NA	NA	EXOC2	19625	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	711154	711526	711478	Y	DUSP22,EXOC2	EXOC2	NA	NA	NA	NA	EXOC2	20037	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	1298118	1298254	1298186	Y	NA	FOXQ1	EXOC2,LOC285768,FOXF2	IMR90	Hi-C	24141950	FOXQ1	12421	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	1311143	1311466	1311342	Y	NA	FOXQ1	NA	NA	NA	NA	FOXQ1	468	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	2038182	2038509	2038345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	205417	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	2429511	2429720	2429615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS-AS1	185529	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	2818912	2819151	2819031	Y	SERPINB1	SERPINB1	NA	NA	NA	NA	SERPINB1	21089	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	3069574	3070273	3069674	Y	NA	HTATSF1P2,RIPK1,BPHL	LOC100507194,WRNIP1	K562	ChIA-PET	22265404	RIPK1	7349	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	3072108	3072295	3072201	Y	NA	RIPK1,BPHL	NA	NA	NA	NA	RIPK1	9883	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	3163246	3163428	3163368	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	7486	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	3209395	3209963	3209634	Y	SERPINB9	PSMG4	NA	NA	NA	NA	PSMG4	19674	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	3238745	3238826	3238788	Y	NA	PSMG4	NA	NA	NA	NA	PSMG4	9108	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr6	3749707	3750120	3749911	Y	C6orf145	PXDC1	NA	NA	NA	NA	PXDC1	140	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr6	4352111	4352211	4352192	Y	CDYL	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	ECI2	218280	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	4728304	4728573	4728482	Y	NA	CDYL	NA	NA	NA	NA	CDYL	23911	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	5031190	5031205	5031197	Y	NA	RPP40	RPP40	MCF7	ChIA-PET	22265404	RPP40	28893	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	6687140	6687567	6687361	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	418263	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr6	6811454	6812228	6812086	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	293602	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	7052517	7053280	7052961	Y	LY86	NA	RREB1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RREB1	52550	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	7618671	7618993	7618833	Y	NA	SNRNP48	NA	NA	NA	NA	SNRNP48	30239	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	10316491	10316897	10316818	Y	TFAP2A,TFAP2A	NA	LOC100506207,TFAP2A,LOC100130275	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP2A	100995	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	10403752	10404250	10404030	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	13642	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	10407698	10407754	10407725	Y	PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	10138	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	10441526	10441791	10441655	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,GCNT2,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A,GCNT2	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	23634	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr6	10970926	10971179	10971053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYCP2L	224899	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	11769423	11769725	11769659	Y	HIVEP1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM170B	233485	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	12288471	12288892	12288524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN1	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	12324386	12324755	12324542	Y	NA	EDN1	EDN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	EDN1	35790	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	12328741	12329205	12329092	Y	NA	EDN1	EDN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	EDN1	40145	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	13391107	13391478	13391293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	64292	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	13630387	13630831	13630754	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	16828	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	13811144	13811203	13811174	Y	RNF182,RNF182	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP9	101348	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	14211061	14211714	14211398	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD83	95189	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	14271187	14271701	14271310	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	155315	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	14638705	14639298	14639002	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	522833	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	14744083	14744613	14744392	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	499914	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	14826835	14827098	14826967	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	417429	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	16151584	16151748	16151704	Y	NA	MYLIP	NA	NA	NA	NA	MYLIP	24228	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	16256823	16257099	16256961	Y	NA	GMPR	NA	NA	NA	NA	GMPR	20012	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	16481928	16482422	16482245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	245117	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	16694939	16695287	16695185	Y	ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	64082	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	16714644	16714961	16714802	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	44408	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	16741302	16741617	16741570	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	17752	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	16766520	16766751	16766672	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	ATXN1	K562	ChIA-PET	22265404	ATXN1	6798	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	18153083	18153444	18153238	Y	RNF144B,NHLRC1,KDM1B	NHLRC1,KDM1B	NA	NA	NA	NA	TPMT	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	18700371	18700729	18700516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEK	437317	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	20174199	20174610	20174442	Y	MBOAT1	MBOAT1	NA	NA	NA	NA	MBOAT1	36060	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	20211469	20211688	20211565	Y	NA	MBOAT1	NA	NA	NA	NA	MBOAT1	799	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	20404913	20405227	20404970	Y	MBOAT1	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	4515	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	20444927	20445761	20445060	Y	MBOAT1	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	44529	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	21022706	21023638	21022736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	490018	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr6	21587723	21589288	21589205	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2684	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	24743523	24743742	24743610	Y	TDP2,C6orf62	C6orf62,GMNN	GMNN,CMAHP,C6orf62	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C6orf62	24459	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	25405177	25405324	25405251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	127871	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB	NA	NA	NA	NA	HIST1H3A	25645	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.55324765008661
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr6	26143490	26143769	26143630	Y	NA	HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H2BE,HIST1H4D	NA	NA	NA	NA	HIST1H1E	10790	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	26521003	26521206	26521108	Y	HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	927	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	26521444	26521777	26521577	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	1368	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	26533222	26533398	26533310	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	3235	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	26536966	26537248	26536997	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	333	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	27145729	27146130	27146023	Y	ZNF184	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	30893	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	27156271	27156423	27156401	Y	NA	HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	20600	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr6	27300679	27301026	27300902	Y	NA	ZNF204P,ZNF391	NA	NA	NA	NA	ZNF204P	36278	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr6	27640311	27640352	27640335	Y	NA	NA	ZNF391,PRSS16	IMR90	Hi-C	24141950	HIST1H2BL	133357	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	27655152	27655475	27655306	Y	FKSG83,ZNF391,ZNF184,ZNF192,HIST1H3H,HIST1H2BO,HIST1H2BN,HIST1H2AM	NA	LOC100507173,ZNF184	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HIST1H2BL	118234	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	27655687	27656083	27655918	Y	NA	NA	LOC100507173	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HIST1H2BL	117626	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	27759985	27760333	27760032	Y	ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	13376	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	27807310	27807672	27807617	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BN	2987	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	27862895	27863061	27863012	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BO	3692	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	27863298	27863662	27863535	Y	ZKSCAN3,ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZNF323,ZNF193,ZNF192,ZKSCAN4,PGBD1,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BO	4095	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr6	28080593	28080792	28080693	Y	NA	ZNF165,ZSCAN16,ZNF192P1	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	9546	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	28099505	28099599	28099552	Y	OR2B2,OR2B6,ZNF187,ZSCAN16	ZSCAN16,ZNF192P1	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	9167	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	28280351	28280639	28280495	Y	NA	PGBD1,ZKSCAN3	NA	NA	NA	NA	PGBD1	33037	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	28715387	28715696	28715451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXbac-BPG308K3.5	89087	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	28805076	28805418	28805247	Y	NA	XXbac-BPG308K3.5	NA	NA	NA	NA	XXbac-BPG308K3.5	293	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	28834475	28834586	28834545	Y	NA	XXbac-BPG308K3.5	NA	NA	NA	NA	XXbac-BPG308K3.5	29692	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	29568471	29568641	29568556	Y	MOG,GABBR1	UBD	NA	NA	NA	NA	UBD	42769	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	29932777	29932958	29932802	Y	HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A	HLA-K,HLA-A,HLA-J	NA	NA	NA	NA	HLA-A	25740	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr6	30068638	30068845	30068662	Y	NA	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,TRIM31	NA	NA	NA	NA	TRIM31	10038	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	30069810	30070038	30069951	Y	HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,TRIM31	NA	NA	NA	NA	TRIM31	8845	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr6	30177609	30178061	30177863	Y	NA	TRIM15,TRIM26,HLA-L	NA	NA	NA	NA	TRIM26	1143	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	30434534	30434831	30434712	Y	DDR1,DDR1,DDR1,DDR1	RANP1,HLA-E	PPP1R10,HLA-E,GNL1,PRR3,MRPS18B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RANP1	16886	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr6	30495647	30495976	30495809	Y	PPP1R11,TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3,FLOT1,HLA-E	RANP1,HLA-E,PRR3,GNL1,ABCF1	NA	NA	NA	NA	PRR3	26687	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	30649746	30650798	30650074	Y	TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949	C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB	NA	NA	NA	NA	PPP1R18	2874	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr6	30651242	30651620	30651357	Y	TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949	C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB	NA	NA	NA	NA	PPP1R18	2052	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	30716597	30717062	30716912	Y	IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	6266	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr6	30717441	30717627	30717503	Y	RPP21,SFTA2,PSORS1C1	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	7110	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	30720004	30720713	30720325	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20	DPCR1,NRM,PPP1R18,MDC1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,VARS2,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	9673	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr6	30731781	30732171	30732168	Y	NA	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20	DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A	IMR90	Hi-C	24141950	HCG20	431	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	30736850	30737361	30737156	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3	FLOT1,IER3,HCG20	DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HCG20	4248	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	30787859	30788252	30788206	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,IER3	NA	FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DDR1	53946	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	30845366	30845734	30845666	Y	PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3	DDR1,GTF2H4,VARS2	NA	NA	NA	NA	DDR1	3168	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	30901201	30901293	30901247	Y	DDR1,DDR1,DDR1,DDR1	GTF2H4,VARS2	NA	NA	NA	NA	VARS2	27182	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	30923441	30923743	30923649	Y	GNL1,CCHCR1,CCHCR1,DDR1	GTF2H4,VARS2	NA	NA	NA	NA	VARS2	49422	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	31140737	31140986	31140881	Y	NA	CCHCR1,TCF19	NA	NA	NA	NA	TCF19	16418	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	31276281	31276390	31276356	Y	NA	HLA-C,RPL3P2,HLA-B	MUC22,PSORS1C1,C6orf15,PSORS1C2,CCHCR1,HCG26	IMR90	Hi-C	24141950	RPL3P2	30187	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	31702368	31703528	31702658	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5,VWA7	NA	NA	NA	NA	CLIC1	2012	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.862915361159228
chr6	31705604	31706142	31705906	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1,VWA7	NA	NA	NA	NA	MSH5	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr6	31789098	31789184	31789146	Y	TNF,HSPA1L,HSPA1A,NEU1,HSPA1B	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,SNORD52,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	4328	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,SNORD52,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr6	31942054	31942322	31942254	Y	NA	CFB,SKIV2L,STK19	NA	NA	NA	NA	STK19	5186	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	32114130	32114430	32114186	Y	GPANK1,GPANK1,LY6G5C,DOM3Z,FKBPL	ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8,AGPAT1,RNF5,XXbac-BPG300A18.13,PBX2,GPSM3	NA	NA	NA	NA	PPT2	4788	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	32789030	32789171	32789101	Y	HSD17B8,PSMB8	TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1	NA	NA	NA	NA	TAP2	15386	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	32802290	32802518	32802510	Y	NA	TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1	NA	NA	NA	NA	TAP2	2039	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	33216178	33216307	33216243	Y	NA	SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1,HCG25,RPS18,VPS52,B3GALT4,PFDN6,WDR46,RGL2	NA	NA	NA	NA	HCG25	867	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	33950913	33951144	33951041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEMD2	196000	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	34191726	34192136	34191830	Y	C6orf1,HMGA1	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CYCSP55	6510	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr6	34202925	34203288	34202990	Y	NA	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	NA	NA	NA	NA	HMGA1	275	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	34358644	34359014	34358829	Y	NA	NUDT3,RPS10	NA	NA	NA	NA	NUDT3	193	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	34514432	34514838	34514655	Y	NA	RP3-391O22.3	NA	NA	NA	NA	RP3-391O22.3	27595	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	34624445	34624747	34624649	Y	TAF11	C6orf106	NA	NA	NA	NA	C6orf106	37889	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	35035271	35035638	35035433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCP11	78749	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	35228332	35228733	35228603	Y	PPARD,ZNF76	ZNF76,DEF6	NA	NA	NA	NA	ZNF76	3646	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	35311267	35311540	35311417	Y	ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD	DEF6,PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	2932	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	35336371	35336758	35336422	Y	NA	PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	28036	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	35445364	35445634	35445501	Y	RPL10A	FANCE,RPL10A,TEAD3	NA	NA	NA	NA	RPL10A	11179	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	36391024	36391283	36391227	Y	SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,PXT1	KCTD20	NA	NA	NA	NA	KCTD20	17261	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	36628616	36629003	36628769	Y	ETV7,ETV7,KCTD20,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A	RNU1-88P,LAP3P2,CDKN1A	CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1	IMR90	Hi-C	24141950	LAP3P2	10591	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	36656050	36656213	36656132	Y	ETV7,ETV7,KCTD20,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A	LAP3P2,CDKN1A	NA	NA	NA	NA	CDKN1A	13745	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	36812029	36812445	36812409	Y	NA	C6orf89,PPIL1	NA	NA	NA	NA	C6orf89	25201	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	37070053	37070857	37070460	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	65122	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	37098455	37099411	37099295	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2	IMR90	Hi-C	24141950	PIM1	36568	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	37102324	37102775	37102642	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	33204	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr6	37104908	37105418	37105405	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	30561	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr6	37210643	37210874	37210721	Y	TMEM217,TMEM217	TBC1D22B,TMEM217	NA	NA	NA	NA	TBC1D22B	12674	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	37212541	37212901	37212835	Y	NA	TBC1D22B,TMEM217	NA	NA	NA	NA	TBC1D22B	10647	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	37464858	37465170	37465019	Y	NA	CCDC167	NA	NA	NA	NA	CCDC167	528	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	37879889	37880256	37879963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	94614	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	39736908	39737107	39737039	Y	KIF6,DAAM2,DAAM2	NA	KIF6	IMR90	Hi-C	24141950	MOCS1	163183	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	40132230	40132456	40132336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-278E11.3	207658	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	40215028	40215342	40215185	Y	NA	NA	KIF6	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-278E11.3	290456	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	41341728	41341773	41341752	Y	FRS3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP4	170391	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	42067343	42067714	42067701	Y	NA	C6orf132	NA	NA	NA	NA	C6orf132	40643	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	42086253	42086632	42086383	Y	NA	C6orf132	NA	NA	NA	NA	C6orf132	21725	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr6	42090479	42090803	42090657	Y	NA	C6orf132	NA	NA	NA	NA	C6orf132	17554	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr6	42255073	42255501	42255249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS10	71470	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	42283170	42283354	42283262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS10	99567	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	42306418	42306926	42306742	Y	UBR2,TRERF1	NA	NA	NA	NA	NA	TRERF1	110863	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	42372266	42372455	42372353	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	45334	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr6	42375139	42375533	42375327	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	42256	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	42390239	42390257	42390249	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	27532	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	42421408	42421762	42421484	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	3619	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	42515407	42515543	42515467	Y	NA	UBR2	TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBR2	14257	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	43295599	43295850	43295834	Y	TJAP1	ZNF318	NA	NA	NA	NA	ZNF318	39366	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	43692783	43693195	43692965	Y	TJAP1,MAD2L1BP	MRPS18A,VEGFA	MRPS18A,LOC100132354,RSPH9,MRPL14,CAPN11,TMEM63B,POLH,VEGFA,XPO5,MAD2L1BP,GTPBP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPS18A	39255	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	43774176	43774478	43774332	Y	NA	VEGFA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	38255	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	43878497	43878687	43878563	Y	GTPBP2,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf223	87630	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr6	44205272	44205504	44205346	Y	NFKBIE	SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	HSP90AB1	7320	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr6	44230828	44231731	44231363	Y	NFKBIE	SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,AARS2	NA	NA	NA	NA	NFKBIE	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr6	44887030	44887214	44887174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	456476	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	45302184	45302302	45302245	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	41388	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr6	45317803	45318343	45317888	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	25347	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	45322429	45322774	45322605	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	20916	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	45390987	45391259	45391097	Y	RUNX2	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	47297	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	45391820	45391891	45391857	Y	RUNX2	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	48130	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	45428920	45429031	45428964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	85230	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	45503698	45503963	45503769	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	160008	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	46628141	46628475	46628252	Y	NA	CYP39A1,SLC25A27	NA	NA	NA	NA	SLC25A27	9463	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	46640633	46640732	46640698	Y	NA	CYP39A1,SLC25A27	NA	NA	NA	NA	SLC25A27	21955	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	47102503	47102708	47102571	Y	NA	NA	TNFRSF21	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPR110	94404	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	47382599	47382792	47382666	Y	NA	NA	CD2AP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD2AP	60733	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	47618805	47618920	47618863	Y	OPN5	NA	NA	NA	NA	NA	CD2AP	175280	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	48794608	48794845	48794713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MUT	634059	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	49521190	49521511	49521254	Y	NA	C6orf141	NA	NA	NA	NA	C6orf141	5077	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr6	49533704	49534052	49533813	Y	C6orf141	C6orf141	NA	NA	NA	NA	C6orf141	17591	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.38066457785476
chr6	52383934	52384018	52383972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	55695	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	53199994	53200715	53200310	Y	FBXO9,FBXO9,FBXO9,ELOVL5	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	11232	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	53297739	53297913	53297859	Y	NA	NA	GCM1,FBXO9,ELOVL5	IMR90	Hi-C	24141950	ELOVL5	85792	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	53348299	53348382	53348306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	131386	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	53376137	53376766	53376496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	103002	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	56296413	56296568	56296543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BEND6	521205	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr6	56543882	56543906	56543894	Y	NA	NA	DST	IMR90	Hi-C	24141950	BEND6	273867	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	64398084	64398491	64398303	Y	PHF3	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	54359	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	70479579	70479974	70479889	Y	NA	LMBRD1	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	25029	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	71314897	71314915	71314906	Y	NA	C6orf57	NA	NA	NA	NA	C6orf57	40277	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	72294841	72295504	72295148	Y	NA	KRT19P1	RIMS1	IMR90	Hi-C	24141950	KRT19P1	2417	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr6	76494746	76495208	76494920	Y	NA	MYO6	NA	NA	NA	NA	MYO6	37837	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	79773928	79774085	79774072	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	11868	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	79779425	79779709	79779568	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	6244	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	80246020	80246303	80246162	Y	NA	LCA5	NA	NA	NA	NA	LCA5	845	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	80663174	80663336	80663221	Y	NA	ELOVL4,TTK	NA	NA	NA	NA	ELOVL4	7877	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	82648128	82648420	82648330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM46A	187637	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	84101816	84101824	84101820	Y	NA	ME1	NA	NA	NA	NA	ME1	36973	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	86114496	86114829	86114663	Y	NT5E	RP11-30P6.6,NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-30P6.6	16592	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr6	86174491	86174911	86174693	Y	NA	NT5E	NA	NA	NA	NA	NT5E	16682	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr6	88213981	88214157	88214070	Y	GJB7	SLC35A1	NA	NA	NA	NA	SLC35A1	35640	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr6	89591363	89591365	89591364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNGTT	79983	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	89796215	89796534	89796231	Y	NA	PNRC1,SRSF12	NA	NA	NA	NA	PNRC1	7745	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr6	90550185	90550523	90550354	Y	NA	MDN1,CASP8AP2	NA	NA	NA	NA	CASP8AP2	12572	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	92192227	92192613	92192374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K7	897463	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	93255659	93255903	93255781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA7	871362	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	93802046	93802077	93802062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA7	325188	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	99275631	99275937	99275716	Y	POU3F2	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL4	117912	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	100002359	100002730	100002672	Y	PNISR,USP45,LOC100130890	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	12119	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	101211686	101211775	101211752	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCC3	115473	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	104462253	104462528	104462438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HACE1	843266	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	107014040	107014053	107014047	Y	BEND3,RTN4IP1	NA	NA	NA	NA	NA	AIM1	56310	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	107047078	107047343	107047210	Y	BEND3	RTN4IP1,QRSL1	NA	NA	NA	NA	RTN4IP1	28030	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	108455044	108455377	108455332	Y	NA	OSTM1	LACE1,ARMC2,NR2E1	IMR90	Hi-C	24141950	OSTM1	29681	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	108728233	108728375	108728296	Y	ARMC2	NA	NA	NA	NA	NA	LACE1	114135	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	108879521	108879931	108879808	Y	SESN1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	483	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	108883670	108884545	108884024	Y	OSTM1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	4632	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr6	108895400	108895781	108895496	Y	NA	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	16362	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	109558807	109559007	109558956	Y	SMPD2,MICAL1,CD164	NA	CD164,CCDC162P	K562	ChIA-PET	22265404	CD164	142755	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	111675383	111675464	111675424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1919	96832	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	111795712	111796054	111795883	Y	NA	TRAF3IP2-AS1,REV3L	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	6660	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	111808995	111809308	111809091	Y	REV3L,FYN,TRAF3IP2	TRAF3IP2-AS1,REV3L	NA	NA	NA	NA	REV3L	6077	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	112428707	112428734	112428721	Y	LAMA4	TUBE1	NA	NA	NA	NA	TUBE1	21975	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	112449250	112449618	112449554	Y	NA	TUBE1	NA	NA	NA	NA	TUBE1	42518	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	112471062	112471110	112471086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBE1	64330	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	112523729	112524008	112523937	Y	LAMA4	NA	NA	NA	NA	NA	LAMA4	50133	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	112524017	112524402	112524328	Y	NA	LAMA4	NA	NA	NA	NA	LAMA4	49739	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	112535932	112536093	112536020	Y	NA	LAMA4	NA	NA	NA	NA	LAMA4	38048	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	112570641	112571001	112570894	Y	LAMA4	LAMA4	NA	NA	NA	NA	LAMA4	3140	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	112572856	112573086	112572969	Y	LAMA4	LAMA4	NA	NA	NA	NA	LAMA4	1055	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	113988036	113988158	113988108	Y	HS3ST5,MARCKS	RP11-367G18.1	MARCKS	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-367G18.1	18760	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	114005806	114006016	114005966	Y	NA	RP11-367G18.1	NA	NA	NA	NA	RP11-367G18.1	36530	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	114176108	114176553	114176196	Y	MARCKS	NA	NA	NA	NA	NA	MARCKS	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	116247686	116248075	116247881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRK	131846	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	119151345	119151482	119151449	Y	MCM9	NA	NA	NA	NA	NA	ASF1A	61902	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	119214275	119214495	119214295	Y	C6orf204,C6orf204,FAM184A,MCM9,ASF1A	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	891	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	119217591	119217640	119217616	Y	NA	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	4207	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	119661427	119661533	119661480	Y	MAN1A1	MAN1A1	NA	NA	NA	NA	MAN1A1	7393	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	121396728	121397112	121396920	Y	C6orf170	NA	NA	NA	NA	NA	GJA1	357726	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	121398601	121398951	121398918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GJA1	355887	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	121758280	121758805	121758450	Y	GJA1	GJA1,RNU4-35P	NA	NA	NA	NA	GJA1	3442	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	122769670	122769957	122769896	Y	HSF2,PKIB	SERINC1,PKIB	NA	NA	NA	NA	SERINC1	21010	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	123111983	123112340	123112183	Y	PKIB,SMPDL3A	SMPDL3A	NA	NA	NA	NA	SMPDL3A	3668	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr6	125205098	125205436	125205268	Y	NA	NA	HEY2,RNF217,TPD52L1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF217	76255	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	125335634	125335813	125335724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF217	53943	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	125426714	125426967	125426959	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	11228	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	126108316	126108682	126108499	Y	NA	HEY2,NCOA7	NA	NA	NA	NA	NCOA7	8009	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	126112858	126113033	126112985	Y	TRMT11,HINT3,NCOA7	HEY2,NCOA7	NA	NA	NA	NA	NCOA7	12551	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	126241150	126241321	126241235	Y	NCOA7	HINT3	NA	NA	NA	NA	HINT3	34606	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr6	127481688	127482073	127481881	Y	RNF146,C6orf174,RSPO3	NA	NA	NA	NA	NA	RNF146	103682	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	127638757	127639069	127638966	Y	NA	ECHDC1	NA	NA	NA	NA	ECHDC1	23685	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	127980874	127981174	127981075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226093	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr6	128607751	128608140	128608092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	231730	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	128637396	128637725	128637581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	202145	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	128840669	128840970	128840936	Y	PTPRK,PTPRK	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	799	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	130005105	130005433	130005370	Y	L3MBTL3,ARHGAP18	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	23937	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	130069572	130069764	130069691	Y	NA	ARHGAP18	ARHGAP18,L3MBTL3	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP18	40202	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	131375294	131375442	131375382	Y	NA	EPB41L2	NA	NA	NA	NA	EPB41L2	7020	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	131594186	131594488	131594335	Y	AKAP7,MED23,AKAP7	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP7	139380	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	133077551	133077890	133077782	Y	STX7,VNN2,VNN2,VNN2	VNN1	NA	NA	NA	NA	VNN1	44363	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	133134288	133134908	133134317	Y	NA	RPS12	NA	NA	NA	NA	SNORD101	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	133843297	133843543	133843427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYA4	283561	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	133932660	133932952	133932806	Y	NA	NA	MGC34034,TCF21	IMR90	Hi-C	24141950	TBPL1	338356	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	135352829	135352991	135352910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBS1L	69203	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	135804002	135804049	135804028	Y	NA	LINC00271,AHI1	NA	NA	NA	NA	LINC00271	12440	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	136390405	136390550	136390494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	218439	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	136912004	136912367	136912204	Y	NA	MAP7	NA	NA	NA	NA	MAP7	42047	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	137181238	137181571	137181404	Y	PEX7	PEX7	NA	NA	NA	NA	PEX7	39521	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	137517813	137517908	137517861	Y	NA	IFNGR1	NA	NA	NA	NA	IFNGR1	20678	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	138136995	138137931	138137315	Y	NA	TNFAIP3	TNFAIP3,PERP	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	48420	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	138426575	138426770	138426671	Y	PERP	NA	NA	NA	NA	NA	PERP	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	138427134	138427492	138427302	Y	PERP	PERP	NA	NA	NA	NA	PERP	486	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	138821349	138821443	138821380	Y	REPS1,NHSL1	NA	NA	NA	NA	NA	HEBP2	98681	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.29437304173884
chr6	138914342	138914559	138914540	Y	NA	NA	HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906	IMR90	Hi-C	24141950	NHSL1	97149	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	139348964	139349250	139349073	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	41566	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	140085604	140086085	140085978	Y	CITED2,CITED2,CITED2	NA	TXLNB,CITED2,LOC645434,LOC100132735	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	391847	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	141204403	141204777	141204486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	1261590	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	141873662	141873944	141873832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	592423	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr6	142091291	142091499	142091406	Y	VTA1	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	374868	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr6	142290502	142290595	142290549	Y	VTA1	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	175772	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	142335769	142335959	142335859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	130408	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	143117753	143118019	143117854	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	146319	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	143174967	143175237	143175142	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	89101	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	143206296	143206927	143206703	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	57411	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr6	143247398	143248213	143248022	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	16125	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr6	143471502	143471640	143471571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	91869	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	143770817	143770943	143770879	Y	ADAT2	ADAT2,PEX3	NA	NA	NA	NA	PEX3	873	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	144015519	144015660	144015590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTV1	146821	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	144302032	144302409	144302359	Y	PLAGL1	NA	NA	NA	NA	NA	PLAGL1	81326	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	145136843	145137199	145137021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTRN	532006	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	148588961	148589218	148589102	Y	UST	SASH1	SASH1	IMR90	Hi-C	24141950	SASH1	2222	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	149069640	149070024	149069807	Y	UST	UST	NA	NA	NA	NA	UST	3176	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	149080716	149081059	149080880	Y	NA	UST	NA	NA	NA	NA	UST	14252	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	149081701	149082266	149082198	Y	UST	UST	NA	NA	NA	NA	UST	15237	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	149082428	149082821	149082685	Y	NA	UST	NA	NA	NA	NA	UST	15964	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	149554491	149554815	149554668	Y	ZC3H12D	TAB2	UST,TAB2	IMR90	Hi-C	24141950	TAB2	16714	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	150183311	150183513	150183478	Y	NA	LRP11	NA	NA	NA	NA	LRP11	686	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	150963010	150963101	150963056	Y	PLEKHG1	PLEKHG1	NA	NA	NA	NA	PLEKHG1	44011	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	151325792	151326084	151325926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	92581	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	151381285	151381592	151381452	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	37073	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr6	151647622	151647708	151647665	Y	NA	NA	ZBTB2	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB2	62975	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	153358098	153358156	153358117	Y	SYNE1,RGS17	MTRF1L	NA	NA	NA	NA	MTRF1L	36278	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	153411582	153411939	153411751	Y	MTRF1L	RGS17	NA	NA	NA	NA	RGS17	38445	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr6	155590165	155590417	155590245	Y	NA	TFB1M	NA	NA	NA	NA	TFB1M	43210	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	157007979	157008724	157008580	Y	ARID1B	NA	MIR4466,ARID1B,NOX3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	88339	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	157096939	157097165	157097038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	157101566	157102083	157101700	Y	ARID1B	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	4503	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	157110744	157110907	157110826	Y	NA	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	13681	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	157160663	157161314	157160954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	63600	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	157342507	157343524	157343342	Y	ARID1B,ZDHHC14	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	245444	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	157542479	157542718	157542566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	199915	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr6	157609644	157610034	157609839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	132599	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	157738321	157738749	157738506	Y	NA	TMEM242	NA	NA	NA	NA	TMEM242	3884	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	158184460	158184689	158184561	Y	SNX9	NA	SNX9,TMEM242,ZDHHC14,SYNJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNX9	57607	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	158185393	158186221	158185862	Y	SNX9	NA	SNX9,TMEM242,SYNJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNX9	56075	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	158254729	158255396	158255020	Y	NA	SNX9	NA	NA	NA	NA	SNX9	12433	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr6	158375265	158375579	158375328	Y	NA	SYNJ2	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	25309	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	158452388	158452885	158452569	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	51500	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	TMEM181	NA	NA	NA	NA	TMEM181	25935	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr6	159141436	159141829	159141621	Y	TAGAP,DYNLT1,SYTL3,C6orf99,EZR,EZR	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	77665	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	159195572	159195684	159195582	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	42760	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	159226894	159227283	159227272	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	11161	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	159270971	159271326	159271104	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	17645	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr6	159271429	159272000	159271674	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	16971	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	159273925	159274893	159274526	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	14078	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr6	159383408	159383511	159383422	Y	NA	RSPH3	NA	NA	NA	NA	RSPH3	35708	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	159434370	159434675	159434475	Y	TAGAP	RSPH3	NA	NA	NA	NA	RSPH3	15151	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	160136031	160136425	160136369	Y	IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP	WTAP,ACAT2,SOD2	LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WTAP	8192	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	160141572	160141909	160141740	Y	MAS1,IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP	WTAP,ACAT2,SOD2	LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WTAP	2708	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	160144181	160144267	160144224	Y	NA	WTAP,ACAT2,SOD2	NA	NA	NA	NA	WTAP	350	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	160395204	160395414	160395271	Y	SOD2,WTAP,WTAP,MAS1,IGF2R	IGF2R	NA	NA	NA	NA	IGF2R	7073	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	161663097	161663478	161663211	Y	AGPAT4	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	29615	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	163833938	163834442	163834340	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	906	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	163881453	163881850	163881463	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	48421	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	166419567	166419719	166419697	Y	PRR18	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	334360	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	166672303	166672771	166672615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	81308	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	166795008	166795404	166795174	Y	NA	SFT2D1	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	40929	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	166970262	166970784	166970543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	216183	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr6	166998471	166998754	166998610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	244392	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	167038809	167038976	167038893	Y	RPS6KA2	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA2	278963	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	167115544	167115618	167115576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA2	202321	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	168558082	168558596	168558447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DACT2	159838	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	169308928	169309266	169309084	Y	THBS2	NA	WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	342873	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	170054470	170055295	170054892	Y	TCTE3	WDR27,C6orf120	NA	NA	NA	NA	WDR27	44864	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	170203615	170204008	170203729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCTE3	53960	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	170208297	170208700	170208496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCTE3	58642	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr6	170468202	170468424	170468316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLL1	129137	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	191531	191871	191582	Y	FAM20C	AC093627.10,FAM20C	NA	NA	NA	NA	FAM20C	562	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	556288	556672	556400	Y	LOC100288524,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	1261	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	577876	578141	578015	Y	PRKAR1B,PRKAR1B,HEATR2,GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	19943	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	579426	579712	579625	Y	PRKAR1B,PRKAR1B,GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	21493	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	965289	965600	965408	Y	ZFAND2A,ADAP1	ADAP1,COX19	NA	NA	NA	NA	ADAP1	27443	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr7	968255	968622	968448	Y	ZFAND2A,COX19,ADAP1	ADAP1,COX19	NA	NA	NA	NA	ADAP1	24421	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	988760	989207	989097	Y	ADAP1	ADAP1,COX19	NA	NA	NA	NA	ADAP1	3836	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	1037816	1038118	1037953	Y	NA	ADAP1,COX19,GPR146	NA	NA	NA	NA	COX19	24581	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	1416814	1417157	1416984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICALL2	79981	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	1560213	1560697	1560426	Y	C7orf50,TMEM184A,PSMG3,PSMG3,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	7653	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr7	1571273	1571500	1571366	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	2923	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr7	1571848	1572026	1571934	Y	ZFAND2A,TMEM184A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3498	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	1572262	1572844	1572636	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3912	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	3.0202037640573
chr7	1573524	1573718	1573598	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	5174	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.03549843339107
chr7	1945683	1945719	1945693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074389.9	165756	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	1970944	1971123	1971068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074389.9	191017	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	2150639	2150902	2150796	Y	SNX8,LFNG	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	119976	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr7	2185604	2185706	2185655	Y	SNX8,LFNG	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	85172	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	2306623	2306831	2306646	Y	MAD1L1	MAD1L1,FTSJ2,NUDT1	NA	NA	NA	NA	NUDT1	26766	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	2569854	2570215	2570046	Y	LFNG,LFNG,IQCE,BRAT1	LFNG,BRAT1,IQCE	NA	NA	NA	NA	LFNG	19691	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	2647516	2647699	2647608	Y	SNX8,TTYH3	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	21886	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	2673416	2673872	2673677	Y	NA	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	3831	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	2795099	2795530	2795383	Y	LFNG,GNA12	NA	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	77725	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	2812534	2812892	2812775	Y	SNX8,LFNG,LFNG,GNA12	NA	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	60363	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	2827851	2827916	2827884	Y	NA	AC006028.11	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	45339	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	2903227	2903785	2903462	Y	LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12	AC006028.11,GNA12	GNA12	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNA12	21269	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr7	2960647	2961036	2960906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNA12	78689	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	2980860	2981267	2981182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNA12	98902	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr7	3350976	3351346	3351174	Y	NA	SDK1	NA	NA	NA	NA	SDK1	11896	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	4287329	4287662	4287450	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	393726	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr7	4723112	4724257	4723950	Y	NA	FOXK1	NA	NA	NA	NA	FOXK1	41724	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr7	4764796	4765177	4765030	Y	KIAA0415	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	83408	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr7	4778448	4778853	4778548	Y	KIAA0415	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	97060	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	4784652	4785031	4784763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	103264	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	5419074	5419498	5419154	Y	NA	TNRC18	NA	NA	NA	NA	TNRC18	43547	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	5492663	5492953	5492758	Y	MMD2,SLC29A4	TNRC18	TNRC18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TNRC18	29618	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr7	5594554	5594977	5594837	Y	WIPI2	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	6438	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr7	5609221	5609424	5609333	Y	FBXL18	ACTB,FSCN1	RNF216,FSCN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	7806	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	5609541	5610012	5609880	Y	SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216,FSCN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	8126	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	5634980	5635411	5634989	Y	AIMP2,FBXL18,ACTB,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	FSCN1	4541	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr7	6049655	6049813	6049700	Y	NA	PMS2,AIMP2,EIF2AK1	NA	NA	NA	NA	AIMP2	2779	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	6145406	6145878	6145682	Y	USP42	EIF2AK1,USP42	NA	NA	NA	NA	USP42	2891	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	6425136	6425343	6425226	Y	CCZ1,USP42	RAC1	NA	NA	NA	NA	RAC1	12982	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	6467944	6468137	6468104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAGLB	53684	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	6677371	6677641	6677424	Y	DAGLB,ZNF12,C7orf26	C7orf26,ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	2418	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	6682292	6682670	6682512	Y	C7orf26	ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	7339	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr7	6741580	6741996	6741754	Y	C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12	ZNF12,PMS2CL	NA	NA	NA	NA	ZNF12	2558	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	7605671	7605858	7605804	Y	NA	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	1168	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	8300852	8301132	8300960	Y	ICA1,ICA1,ICA1	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	ICA1	535	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	8482629	8482725	8482675	Y	NXPH1	NA	NA	NA	NA	NA	ICA1	182312	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	8550473	8550803	8550530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICA1	250156	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	10276978	10277222	10277208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA8P8	211716	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	12624573	12625024	12624751	Y	NA	SCIN	NA	NA	NA	NA	SCIN	16370	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	13057101	13057487	13057331	Y	NA	NA	ARL4A	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4A	332620	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	17029591	17029925	17029620	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AGR2	158534	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	17276329	17276492	17276431	Y	AHR	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AHR	59754	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	17360383	17360757	17360401	Y	NA	AHR,AC003075.4	NA	NA	NA	NA	AC003075.4	23402	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	17412000	17412058	17412028	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC003075.4	75019	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	17564000	17564574	17564249	Y	NA	AC017060.1	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC017060.1	31959	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr7	19640371	19640397	19640383	Y	TMEM196	NA	NA	NA	NA	NA	TWISTNB	106313	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	20239036	20239390	20239182	Y	TWISTNB	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB8	128935	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	20447290	20447655	20447472	Y	ITGB8	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB8	78965	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	20837430	20837819	20837731	Y	SP8	RPL23P8	SP8	K562	ChIA-PET	22265404	RPL23P8	27126	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr7	22122614	22122929	22122771	Y	NA	NA	RAPGEF5	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA7L	138912	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	22122992	22123068	22123014	Y	NA	NA	RAPGEF5	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA7L	139290	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	22894313	22894860	22894668	Y	STEAP1B,TOMM7	TOMM7	NA	NA	NA	NA	TOMM7	33843	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr7	23346374	23346675	23346525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUPL2	126928	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	23348040	23348443	23348292	Y	KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	NA	NUPL2	128594	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	23501559	23501943	23501874	Y	NUPL2,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	6143	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	23504984	23505316	23505313	Y	NA	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2770	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	23510676	23511223	23510889	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2590	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr7	23513815	23514383	23514045	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	MALSU1	K562	ChIA-PET	22265404	IGF2BP3	5729	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	23694687	23694939	23694813	Y	NA	AC006026.13	NA	NA	NA	NA	AC006026.13	23466	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	24861129	24861331	24861204	Y	C7orf31,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	53885	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr7	24963944	24964392	24964187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	54861	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	25002827	25003181	25002973	Y	C7orf31,OSBPL3	OSBPL3	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	16072	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	25894654	25894946	25894846	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	294914	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr7	25896245	25896461	25896419	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	293399	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr7	25896515	25897081	25896801	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	292779	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	25897167	25897316	25897282	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	292544	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	25901745	25902114	25902023	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	287746	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr7	26220261	26220628	26220627	Y	CBX3	NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1	NA	NA	NA	NA	CBX3	18154	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	27573880	27573985	27573933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4HP1	77412	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	27876967	27877264	27877116	Y	CREB5	NA	NA	NA	NA	NA	AC004549.6	98953	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	28172246	28172388	28172317	Y	NA	JAZF1-AS1,JAZF1	NA	NA	NA	NA	JAZF1-AS1	45553	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	29892822	29892880	29892851	Y	NA	WIPF3	NA	NA	NA	NA	WIPF3	48720	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	29995785	29995993	29995963	Y	NA	AC007285.6,SCRN1	NA	NA	NA	NA	AC007285.6	30223	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	30005426	30005693	30005606	Y	NA	AC007285.6,SCRN1	NA	NA	NA	NA	AC007285.6	20523	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	30636092	30636194	30636111	Y	NA	GGCT,GARS	NA	NA	NA	NA	GARS	3795	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	30658764	30658962	30658863	Y	NA	GARS	NA	NA	NA	NA	GARS	26467	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	32551548	32551619	32551584	Y	NA	LSM5,AVL9	NA	NA	NA	NA	AVL9	18510	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	32929600	32929824	32929751	Y	NA	KBTBD2	NA	NA	NA	NA	KBTBD2	1919	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	33079333	33079582	33079400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP9	67431	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	33316298	33316594	33316442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBS9	149442	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	35075861	35076697	35076367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPY19L2P1	147237	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.862915361159228
chr7	36331807	36331936	36331811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANLN	95479	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr7	39653266	39653514	39653363	Y	RALA	YAE1D1,RALA	NA	NA	NA	NA	RALA	7568	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	39661947	39662014	39661981	Y	NA	RALA	NA	NA	NA	NA	RALA	865	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	40007110	40007159	40007135	Y	NA	CDK13	NA	NA	NA	NA	CDK13	19474	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	40747688	40748041	40747865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	760052	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	42927750	42928726	42928340	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	NA	NA	NA	NA	C7orf25	21178	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.862915361159228
chr7	43625293	43625372	43625313	Y	URGCP,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	4936	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	43654812	43655175	43654945	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	34455	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	43657815	43658085	43657951	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	37458	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	43658377	43658532	43658408	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	38020	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	43670120	43670185	43670135	Y	POLM,DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	49763	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	43676905	43677264	43677045	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	NA	NA	NA	NA	NA	STK17A	56548	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	43683947	43684262	43684105	Y	POLM,DBNL,STK17A	NA	NA	NA	NA	NA	STK17A	63590	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	43732901	43733056	43732913	Y	DBNL,STK17A	NA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	63223	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	43996825	43996925	43996859	Y	NA	URGCP,UBE2D4	NA	NA	NA	NA	UBE2D4	32788	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	44085815	44086626	44086335	Y	STK17A,DBNL,POLM	POLR2J4,DBNL,PGAM2,POLM	NA	NA	NA	NA	DBNL	3576	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	44549904	44550285	44550054	Y	NA	AC004453.8,NUDCD3	NA	NA	NA	NA	NUDCD3	21425	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	44677628	44678244	44677873	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	ZMIZ2	IMR90	Hi-C	24141950	OGDH	33457	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr7	44678622	44679047	44678972	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	34451	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	44775082	44775384	44775244	Y	OGDH,PURB,MYO1G,ZMIZ2,ZMIZ2	ZMIZ2	DDX56,TMED4,OGDH,PPIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZMIZ2	10796	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	45928899	45929352	45929108	Y	IGFBP1	IGFBP1,IGFBP3	NA	NA	NA	NA	IGFBP1	2943	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr7	46691155	46691159	46691157	Y	NA	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	AC004870.4	316141	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	46803788	46804144	46803966	Y	NA	NA	IGFBP1,IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	AC004870.4	203156	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	46972513	46972753	46972628	Y	NA	AC004870.4	IGFBP3,IGFBP1	IMR90	Hi-C	24141950	AC004870.4	34547	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	47037255	47037600	47037428	Y	NA	AC004870.4	NA	NA	NA	NA	AC004870.4	29955	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	47390589	47390737	47390670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	229419	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	47391456	47391672	47391564	Y	C7orf65	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	228484	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	47510195	47510559	47510444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	109597	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr7	47514732	47515208	47514929	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104948	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr7	47548092	47548390	47548234	Y	HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	71766	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	47579966	47580265	47580181	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	39891	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	47588229	47588393	47588311	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	31763	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	47612587	47612873	47612749	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	7283	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	47620098	47620164	47620135	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	47675013	47675155	47675094	Y	TNS3	NA	TNS3,C7orf69,PKD1L1,C7orf65,LINC00525	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	54857	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	50666851	50666964	50666921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	150763	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	54731630	54731797	54731714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-745C15.2	93321	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	55131480	55131905	55131522	Y	EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	46766	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	55132578	55133258	55132929	Y	SEC61G,EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	47864	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	55134555	55134962	55134733	Y	NA	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	49841	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	55141624	55142112	55141893	Y	SEC61G,EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	56910	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	55146809	55147410	55146997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	62095	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	55155188	55155533	55155358	Y	EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	70474	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	55200352	55201043	55200686	Y	SEC61G,EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	115638	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	55543241	55543436	55543358	Y	VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	VOPP1	95245	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	56606357	56606502	56606382	Y	LOC389493	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	434088	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	65878387	65878723	65878560	Y	RABGEF1,KCTD7	NA	ASL,CRCP,TPST1,LINC00174	IMR90	Hi-C	24141950	GS1-124K5.3	77830	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	66056218	66056609	66056384	Y	NA	KCTD7	KCTD7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KCTD7	35259	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	66120269	66120628	66120390	Y	RABGEF1,KCTD7	KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	RP4-756H11.3	2744	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	66152523	66152575	66152558	Y	RABGEF1,KCTD7	RP4-756H11.3,RABGEF1	KCTD7,LOC493754,RABGEF1	IMR90	Hi-C	24141950	RABGEF1	7372	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr7	66184244	66184571	66184390	Y	NA	RABGEF1	LOC493754,RABGEF1,LOC729156	IMR90	Hi-C	24141950	RABGEF1	39093	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	69213443	69213490	69213467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMS2P4	2447549	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	70358448	70358664	70358566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYW1B	1938113	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	72990459	72990574	72990513	Y	NA	BCL7B,TBL2,MLXIPL	NA	NA	NA	NA	TBL2	547	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	73132412	73132545	73132481	Y	LAT2,BCL7B	WBSCR22,DNAJC30,STX1A,ABHD11	NA	NA	NA	NA	STX1A	410	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	73311055	73311352	73311116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	56190	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	73704690	73704803	73704747	Y	CLIP2	RFC2,CLIP2	NA	NA	NA	NA	CLIP2	2885	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	73785571	73785673	73785623	Y	CLIP2	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	80447	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	73869161	73869472	73869346	Y	NA	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	3041	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	74064444	74064957	74064539	Y	GTF2IRD2B,LAT2	GTF2I	NA	NA	NA	NA	GTF2I	5037	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr7	75465283	75465439	75465360	Y	MDH2	RHBDD2	STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR	IMR90	Hi-C	24141950	RHBDD2	4481	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	75546128	75546229	75546156	Y	NA	POR	STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	POR	19610	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	75598574	75598701	75598640	Y	NA	TMEM120A	NA	NA	NA	NA	TMEM120A	23276	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	75599122	75599360	75599199	Y	NA	TMEM120A	NA	NA	NA	NA	TMEM120A	22617	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	75795833	75796053	75795969	Y	RHBDD2,POR	NA	SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	AC005077.12	59736	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	17444	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	75948116	75948327	75948250	Y	RHBDD2	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	18255	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	77428722	77429286	77429067	Y	PION,PTPN12,RSBN1L,PHTF2,PHTF2	TMEM60,PHTF2	NA	NA	NA	NA	PHTF2	2600	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	79803492	79803786	79803598	Y	NA	GNAI1	NA	NA	NA	NA	GNAI1	42221	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	79844591	79844960	79844776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAI1	83320	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr7	80441834	80442054	80441993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	107621	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	81070726	81071084	81070905	Y	NA	NA	SEMA3C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEMA3C	521051	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	81655164	81655347	81655329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	415767	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	81894820	81895003	81894975	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	176111	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	84248657	84248668	84248663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3A	128617	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	86320673	86320677	86320675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMTF1	459000	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	87571513	87571795	87571654	Y	NA	ADAM22	NA	NA	NA	NA	ADAM22	10055	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	90253502	90253813	90253671	Y	NA	NA	CDK14	IMR90	Hi-C	24141950	CDK14	159764	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	92227351	92227620	92227450	Y	CDK6,CDK6	FAM133B	FAM133B	K562	ChIA-PET	22265404	FAM133B	9643	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	92290698	92291011	92290856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	72990	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	92439060	92439368	92439205	Y	PEX1,C7orf64,FAM133B,SAMD9	CDK6	NA	NA	NA	NA	CDK6	24540	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	93204906	93205045	93204997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG11	343966	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	93812688	93813130	93812921	Y	NA	NA	TFPI2,BET1,GNGT1	IMR90	Hi-C	24141950	AC003092.1	162543	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	94687971	94688075	94688023	Y	NA	RNU4-16P	NA	NA	NA	NA	RNU4-16P	37464	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	95807779	95807791	95807785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	141668	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	95877265	95877280	95877275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	72179	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	95913909	95914253	95914081	Y	SLC25A13	SLC25A13	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	35206	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	97913424	97913987	97913861	Y	LMTK2,BRI3	TECPR1,BRI3	NA	NA	NA	NA	BRI3	33733	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	97915595	97916070	97915699	Y	LMTK2,BRI3	TECPR1,BRI3	NA	NA	NA	NA	BRI3	35904	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	97994295	97994325	97994312	Y	BAIAP2L1	RPS3AP26,BAIAP2L1	BRI3	IMR90	Hi-C	24141950	RPS3AP26	19571	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	98028342	98028618	98028511	Y	BRI3	RPS3AP26	NA	NA	NA	NA	BAIAP2L1	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	98048213	98048460	98048408	Y	BRI3	RPS3AP26,BAIAP2L1	BAIAP2L1,TRRAP,TMEM130	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BAIAP2L1	19833	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	98383358	98383761	98383522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRRAP	89795	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	98650927	98651298	98651264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMURF1	88425	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	98809347	98809684	98809536	Y	ZNF655,ZNF655,ZKSCAN5,PTCD1,PDAP1,FAM200A,CPSF4,BUD31,ATP5J2,ARPC1A,SMURF1,KPNA7	NA	SMURF1	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF1	69624	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.38066457785476
chr7	98871923	98872129	98871984	Y	NA	ARPC1A	NA	NA	NA	NA	ARPC1A	49392	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr7	98973055	98973209	98973129	Y	ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B	ARPC1B,BUD31,PDAP1	NA	NA	NA	NA	ARPC1B	3183	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	99000499	99000617	99000560	Y	NA	ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4	NA	NA	NA	NA	BUD31	3647	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	99957855	99958254	99957887	Y	NA	PILRB,PMS2P1	NA	NA	NA	NA	PMS2P1	20324	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr7	99961767	99962035	99961969	Y	NA	PILRB,PMS2P1	PILRA	IMR90	Hi-C	24141950	PMS2P1	24236	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	100144720	100144853	100144769	Y	NA	AGFG2,LRCH4	NA	NA	NA	NA	AGFG2	9886	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	100342957	100343164	100343095	Y	NA	POP7	NA	NA	NA	NA	POP7	41281	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr7	100765253	100766084	100765924	Y	TRIM56,SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	2286	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	100809834	100810470	100810178	Y	NA	SERPINE1,AP1S1,VGF,MOGAT3,ZNHIT1,PLOD3	NA	NA	NA	NA	VGF	2960	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	101525517	101525682	101525579	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	68558	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	101526005	101526525	101526438	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	69046	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	101775527	101775981	101775908	Y	CUX1,CUX1,SH2B2,ORAI2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	226338	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.55324765008661
chr7	101931211	101931437	101931291	Y	CUX1,CUX1,CUX1,ORAI2,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	70882	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	102056938	102057102	102057040	Y	ORAI2	ORAI2,ALKBH4,LRWD1	NA	NA	NA	NA	ORAI2	14451	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	102464517	102464880	102464701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM185A	77099	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	102514621	102514825	102514690	Y	NA	NA	FAM185A	IMR90	Hi-C	24141950	FAM185A	127203	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	102516226	102516619	102516429	Y	LRRC17	NA	FAM185A	IMR90	Hi-C	24141950	FAM185A	128808	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	103277543	103277794	103277680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTA-276O3.4	290495	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	104844953	104845066	104844998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	192689	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	104857177	104857523	104857432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	180232	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	104980501	104980737	104980707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	57018	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	105459888	105460220	105459903	Y	NA	CTA-351J1.1	NA	NA	NA	NA	CTA-351J1.1	1950	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	105602769	105602970	105602871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDHR3	87527	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	105856842	105857229	105857099	Y	NA	NA	NAMPT,CCDC71L	IMR90	Hi-C	24141950	NAMPT	67543	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	106065261	106066901	106065591	Y	NA	NA	NAMPT,CCDC71L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAMPT	140489	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	106413227	106413352	106413289	Y	FLJ36031	RP5-884M6.1	CCDC71L,HBP1,NAMPT,CBLL1,PIK3CG,PRKAR2B	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-884M6.1	105	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	106808132	106808705	106808532	Y	NA	HBP1	NA	NA	NA	NA	HBP1	726	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	106838325	106838672	106838499	Y	NA	HBP1	NA	NA	NA	NA	HBP1	30919	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	107562078	107562130	107562088	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	32663	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	108095684	108095814	108095727	Y	NRCAM,NRCAM	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P32	52863	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	110470494	110470759	110470627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	729814	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	111755402	111755532	111755467	Y	ZNF277,IFRD1,IFRD1,DOCK4	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK4	88934	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	113724652	113724941	113724845	Y	FOXP2	FOXP2	NA	NA	NA	NA	FOXP2	270	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	114056337	114056620	114056363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP2	331955	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	114301114	114301124	114301119	Y	FOXP2	NA	NA	NA	NA	NA	MDFIC	259085	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	114637628	114638014	114637704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFIC	77419	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	114677768	114677789	114677777	Y	MDFIC	NA	NA	NA	NA	NA	MDFIC	117559	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	115912136	115912451	115912327	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	CAV2	NA	NA	NA	NA	CAV2	12983	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	115957232	115957778	115957588	Y	NA	CAV2	CAV1,CAV2,TES,CAPZA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CAV2	31798	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	116314942	116315351	116315128	Y	ST7,TES,CAV2,CAV2,MET	MET	NA	NA	NA	NA	MET	4498	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	116328034	116328226	116328184	Y	ST7,CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,MET	MET	NA	NA	NA	NA	MET	17590	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	116452966	116453226	116453141	Y	CAPZA2	CAPZA2	NA	NA	NA	NA	CAPZA2	3842	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	116595969	116596160	116596016	Y	NA	ST7,ST7-AS1	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	3581	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	117290130	117290152	117290141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFTR	186292	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	117472298	117472618	117472458	Y	CTTNBP2	CTTNBP2	NA	NA	NA	NA	CTTNBP2	39575	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	117499357	117499593	117499472	Y	CTTNBP2	CTTNBP2	NA	NA	NA	NA	CTTNBP2	12600	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	117503464	117503620	117503542	Y	CTTNBP2	CTTNBP2	NA	NA	NA	NA	CTTNBP2	8573	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	120751060	120751219	120751140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ING3	162257	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	120938122	120938485	120938307	Y	FAM3C	WNT16	NA	NA	NA	NA	WNT16	24936	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr7	121008996	121009049	121009023	Y	NA	WNT16,FAM3C	NA	NA	NA	NA	FAM3C	25369	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr7	121025846	121026096	121025939	Y	ING3	FAM3C	NA	NA	NA	NA	FAM3C	8322	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	121170486	121170616	121170551	Y	NA	NA	FAM3C,WNT16	IMR90	Hi-C	24141950	FAM3C	136068	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	123387168	123387479	123387315	Y	NA	WASL	NA	NA	NA	NA	WASL	47	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	123387767	123387941	123387854	Y	NA	WASL	NA	NA	NA	NA	WASL	646	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	126341155	126341491	126341268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF800	728487	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	127665265	127665386	127665326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM28	316576	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	127876972	127877440	127877187	Y	IMPDH1,LRRC4	NA	PAX4,FSCN3,SND1,LEP,RBM28	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBM28	104522	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	2.58874608347768
chr7	128249599	128249637	128249625	Y	NA	RP11-212P7.1	FLJ45340,CALU,FAM71F1,IRF5	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-212P7.1	40857	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr7	128383172	128383597	128383318	Y	NA	CALU,CCDC136	NA	NA	NA	NA	CALU	5826	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	129418602	129418801	129418733	Y	NA	NA	UBE2H,NRF1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	169047	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	129419876	129420343	129420085	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	170321	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.03549843339107
chr7	129465628	129465864	129465722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	124925	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	129589680	129589810	129589737	Y	NA	UBE2H	NA	NA	NA	NA	UBE2H	979	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	129598516	129598781	129598654	Y	NRF1,UBE2H,UBE2H	UBE2H	UBE2H,NRF1,AHCYL2,SMO,ZC3HC1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	UBE2H	7727	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	130552122	130552429	130552276	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	43640	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	130571851	130572495	130572306	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	23574	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr7	130575591	130576512	130576394	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	19557	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr7	130581597	130582393	130581985	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	13676	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	130583676	130584341	130584164	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	11728	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	130586004	130586434	130586371	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	9635	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr7	130588239	130588699	130588531	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	7370	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	130589567	130590049	130589961	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6020	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	130593505	130595916	130594870	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	153	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr7	130601178	130601963	130601463	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	5109	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	130602337	130602820	130602733	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6268	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	130614674	130615489	130615212	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	18605	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	130633473	130633870	130633858	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	37404	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	130636331	130636776	130636707	Y	MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	40262	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	130644314	130644883	130644570	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	48245	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	130645057	130645459	130645325	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	48988	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	130697034	130697567	130697379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	95288	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	130763104	130763469	130763293	Y	NA	MKLN1,LINC-PINT	NA	NA	NA	NA	MKLN1	29386	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	130795999	130796263	130796171	Y	MKLN1,MKLN1	MKLN1,LINC-PINT	NA	NA	NA	NA	LINC-PINT	3064	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	130873403	130873921	130873619	Y	MKLN1,MKLN1	NA	NA	NA	NA	NA	AC009362.2	51428	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	130910382	130910723	130910553	Y	MKLN1	AC009362.2	NA	NA	NA	NA	AC009362.2	14626	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr7	130920397	130920794	130920689	Y	MKLN1,MKLN1	AC009362.2	NA	NA	NA	NA	AC009362.2	4555	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	132106504	132106703	132106622	Y	PLXNA4	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	658145	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	132660683	132660693	132660688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	104155	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	134117156	134117311	134117298	Y	NA	AKR1B1	NA	NA	NA	NA	AKR1B1	24725	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr7	135665513	135665767	135665568	Y	NA	MTPN	NA	NA	NA	NA	MTPN	5412	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	137685065	137685809	137685664	Y	TRIM24,CREB3L2	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	252	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	138250447	138250496	138250473	Y	AKR1D1,TRIM24	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM24	107368	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	138791748	138791993	138791908	Y	UBN2,LUC7L2,ZC3HAV1	ZC3HAV1,TTC26	NA	NA	NA	NA	ZC3HAV1	472	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	138917056	138917428	138917261	Y	ZC3HAV1,UBN2	UBN2	NA	NA	NA	NA	UBN2	3954	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	139420496	139420947	139420749	Y	TBXAS1,JHDM1D,HIPK2	NA	NA	NA	NA	NA	TBXAS1	53903	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	139865327	139865485	139865448	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	NA	NA	NA	NA	PARP12	103806	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	141679454	141679850	141679687	Y	OR9A4,CLEC5A,TAS2R38	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP1	243333	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	143083267	143084129	143083354	Y	TAS2R40,FAM131B,FAM131B	AC093673.5,ZYX	NA	NA	NA	NA	ZYX	7094	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	148334506	148334940	148334775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL1	58066	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	NA	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EZH2	58860	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr7	148680544	148680840	148680694	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	42893	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr7	148685182	148685277	148685231	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	38456	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	148788414	148788490	148788418	Y	CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2540	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	148788628	148788884	148788863	Y	ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2754	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	149468740	149469267	149468803	Y	NA	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	172	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr7	149471511	149471709	149471700	Y	ATP6V0E2,SSPO	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	2943	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	150944094	150944397	150944255	Y	NA	ABCF2,CHPF2,SMARCD3	NA	NA	NA	NA	CHPF2	16519	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	151039447	151039627	151039551	Y	SLC4A2,AGAP3,SMARCD3,SMARCD3,NUB1	NUB1	NA	NA	NA	NA	NUB1	2662	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	151157060	151157432	151157203	Y	NA	NA	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	57774	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	151184518	151184840	151184768	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	30366	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	151192969	151193321	151193145	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	21885	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	151198552	151198933	151198803	Y	AGAP3,PRKAG2,PRKAG2	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	16273	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	151986893	151987163	151987026	Y	MLL3	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT11	266134	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	152065077	152065428	152065152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	305822	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	152105895	152106094	152106005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	265156	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	152160343	152160554	152160402	Y	ACTR3B	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	210696	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr7	152160715	152161193	152160959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	210057	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	209236	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	154958521	154958650	154958585	Y	NA	NA	PAXIP1,HTR5A,LOC100128264,CNPY1	IMR90	Hi-C	24141950	INSIG1	128836	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	155049368	155049519	155049432	Y	NA	INSIG1	NA	NA	NA	NA	INSIG1	37967	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	155276719	155276807	155276762	Y	PAXIP1,CNPY1	NA	NA	NA	NA	NA	RBM33	158338	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	155744375	155744769	155744531	Y	NA	AC021218.2	LOC285889,SHH,LMBR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC021218.2	8557	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.862915361159228
chr7	155752755	155752934	155752845	Y	SHH	AC021218.2	LOC285889	IMR90	Hi-C	24141950	AC021218.2	392	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	155754558	155754796	155754722	Y	NA	AC021218.2	LOC285889	IMR90	Hi-C	24141950	AC021218.2	1232	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.81212225843438
chr7	156792805	156792864	156792835	Y	NA	MNX1	NA	NA	NA	NA	MNX1	8481	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	156804828	156804838	156804833	Y	NA	MNX1	NA	NA	NA	NA	MNX1	3483	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	157071910	157072285	157071928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	53790	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	157072331	157072686	157072549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	53389	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	157225296	157225625	157225465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	99221	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	157338058	157338440	157338352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	211983	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	157366883	157367406	157367099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	240808	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	157378993	157379067	157379007	Y	DNAJB6,DNAJB6	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	252918	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	158224670	158224991	158224878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	270529	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	158387429	158387829	158387629	Y	WDR60	NA	PTPRN2	K562	ChIA-PET	22265404	NCAPG2	107691	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	158500449	158500649	158500582	Y	NA	NCAPG2	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	4929	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr7	158603982	158604371	158604316	Y	NA	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	16573	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr7	158613624	158614053	158613981	Y	ESYT2	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	6891	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	638062	638589	638348	Y	ZNF596,ZNF596,ERICH1	ERICH1	NA	NA	NA	NA	ERICH1	47517	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr8	1113582	1113707	1113595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERICH1	427476	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	1873813	1874239	1874091	Y	KBTBD11	KBTBD11	NA	NA	NA	NA	KBTBD11	45805	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	6323096	6323426	6323195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPH1	60983	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	8153597	8154098	8153801	Y	NA	NA	MFHAS1,SGK223,CLDN23,FLJ10661	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SGK223	87910	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr8	8706541	8706605	8706573	Y	NA	MFHAS1	NA	NA	NA	NA	MFHAS1	42550	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr8	8746516	8746997	8746809	Y	CLDN23	MFHAS1	NA	NA	NA	NA	MFHAS1	2158	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	10170975	10171338	10171157	Y	MSRA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	261197	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	10193189	10193473	10193425	Y	MSRA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	283411	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	11312887	11313950	11313920	Y	NA	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	16274	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	13224231	13224684	13224410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLC1	146483	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	15546823	15547116	15546970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC3	274099	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr8	16898778	16899115	16898947	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC2	112423	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	17665479	17665814	17665519	Y	NA	RP11-156K13.1	NA	NA	NA	NA	RP11-156K13.1	8625	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	17708923	17709156	17709065	Y	MTMR7,MTUS1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-156K13.1	52069	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	18523718	18524110	18523921	Y	NAT1,NAT1,NAT2	NA	NA	NA	NA	NA	NAT2	276963	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	18585215	18585382	18585299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAT2	338460	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	18768857	18769292	18769046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	170948	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	18998257	18998415	18998308	Y	NA	NA	PSD3,LOC100128993	IMR90	Hi-C	24141950	PSD3	58017	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	19066932	19067320	19067099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH2D4A	101808	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr8	19075736	19075934	19075838	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH2D4A	93194	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	19797796	19798054	19797934	Y	LPL	NA	NA	NA	NA	NA	INTS10	125145	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	20126353	20126692	20126612	Y	NA	NA	DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1	IMR90	Hi-C	24141950	ATP6V1B2	73475	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	21775759	21776194	21775973	Y	PHYHIP,DOK2,NPM2	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	579	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr8	21867707	21867918	21867811	Y	PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2	NPM2	NA	NA	NA	NA	NPM2	11718	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr8	22516346	22516607	22516450	Y	NA	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	BIN3	8054	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	22551843	22553123	22552848	Y	PPP3CC,PDLIM2,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10C,EGR3	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	EGR3	3028	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	22561043	22561327	22561142	Y	PPP3CC,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10B,EGR3	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	EGR3	12228	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	22808149	22808394	22808223	Y	NA	RHOBTB2	PEBP4,TNFRSF10B,BIN3,EGR3,RHOBTB2	IMR90	Hi-C	24141950	RHOBTB2	34536	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	22867059	22867413	22867162	Y	NA	RHOBTB2	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	24129	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	23016406	23016568	23016458	Y	ENTPD4,ENTPD4,BIN3,TNFRSF10C	TNFRSF10D	NA	NA	NA	NA	TNFRSF10D	2975	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	23405243	23405645	23405476	Y	TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4	SLC25A37	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	20925	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	23411826	23412031	23411908	Y	TNFRSF10B,ENTPD4,ENTPD4	SLC25A37,RNU4-71P	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	27508	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	23436711	23436787	23436740	Y	NA	RNU4-71P	NA	NA	NA	NA	RNU4-71P	18864	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	24013716	24014104	24013764	Y	STC1	NA	STC1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-148P	81045	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	24176460	24176602	24176560	Y	ADAM28	ADAM28	NA	NA	NA	NA	ADAM28	26907	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	25242857	25243137	25242939	Y	NA	NA	KCTD9	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD9	70855	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	25356816	25356840	25356828	Y	NA	KCTD9,CDCA2	NA	NA	NA	NA	CDCA2	42303	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	26008929	26009154	26009015	Y	NA	NA	PPP2R2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EBF2	108016	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	26306627	26307336	26307213	Y	NA	NA	BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PNMA2	62272	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr8	26429509	26429959	26429867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	59718	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	26437404	26437761	26437433	Y	PNMA2,DPYSL2,DPYSL2	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	67613	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	26498541	26498935	26498595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-384C12.1	128372	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	28198305	28198911	28198312	Y	PNOC	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF395	59307	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr8	28884105	28884486	28884217	Y	HMBOX1,HMBOX1	CTD-2647L4.4	NA	NA	NA	NA	CTD-2647L4.4	26966	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	28890628	28890717	28890674	Y	KIF13B	CTD-2647L4.4	NA	NA	NA	NA	CTD-2647L4.4	20735	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	29144637	29144837	29144777	Y	NA	KIF13B	KIF13B	IMR90	Hi-C	24141950	KIF13B	25996	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	29202154	29202365	29202273	Y	DUSP4,DUSP4	DUSP4	NA	NA	NA	NA	DUSP4	3820	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	29204481	29204724	29204678	Y	NA	DUSP4	NA	NA	NA	NA	DUSP4	1461	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	29412011	29412162	29412114	Y	NA	NA	DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR3148	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	205826	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	29495067	29495424	29495202	Y	KIF13B	NA	DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR3148	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	288882	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	29513029	29513506	29513190	Y	KIF13B	NA	DUSP4,MIR3148,C8orf75,LOC286135	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	306844	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	29513867	29514215	29514082	Y	KIF13B	NA	DUSP4,MIR3148,C8orf75,LOC286135	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	307682	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	29522725	29523096	29522814	Y	KIF13B	NA	LOC286135,DUSP4,C8orf75	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	316540	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr8	29526859	29527039	29527017	Y	NA	NA	LOC286135,DUSP4,C8orf75	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	320674	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	7.33478056985344
chr8	29533274	29533303	29533292	Y	NA	NA	DUSP4	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	327089	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr8	30262933	30263230	30262977	Y	NA	RBPMS,RBPMS-AS1	NA	NA	NA	NA	RBPMS-AS1	22016	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	30506010	30506203	30506101	Y	NA	GTF2E2	NA	NA	NA	NA	GTF2E2	7565	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	30769723	30770025	30769859	Y	NA	NA	TEX15,WRN,PPP2CB,PURG	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2CB	99893	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	33245630	33245874	33245728	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT10	83066	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr8	33265826	33266145	33265940	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT10	62795	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	33287156	33287526	33287341	Y	NA	FUT10	NA	NA	NA	NA	FUT10	41414	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	33291442	33291793	33291639	Y	MAK16,FUT10,C8orf41,C8orf41	FUT10,MAK16	NA	NA	NA	NA	FUT10	37147	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.55324765008661
chr8	37738160	37738666	37738484	Y	RAB11FIP1	BRF2,RAB11FIP1	GPR124,BRF2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB11FIP1	16319	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	37749222	37749683	37749580	Y	WHSC1L1,LETM2,LETM2,RAB11FIP1	BRF2,RAB11FIP1	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP1	5302	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	37751458	37752024	37751766	Y	NA	BRF2,RAB11FIP1	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP1	2961	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	37889292	37889604	37889448	Y	NA	EIF4EBP1	NA	NA	NA	NA	EIF4EBP1	3433	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	37928414	37928535	37928451	Y	ADRB3,WHSC1L1	EIF4EBP1,ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	32225	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	37961561	37961954	37961758	Y	NA	ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	801	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	37992032	37992208	37992120	Y	NA	ASH2L,BAG4,LSM1	NA	NA	NA	NA	ASH2L	31272	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	38242599	38242872	38242674	Y	TACC1,WHSC1L1,LETM2,LETM2	WHSC1L1,LETM2	NA	NA	NA	NA	LETM2	874	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	38384926	38385302	38385064	Y	HTRA4,TACC1,PLEKHA2,C8orf86	NA	NA	NA	NA	NA	FGFR1	60574	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	38523213	38523472	38523342	Y	C8orf86	NA	C8orf86,FGFR1,WHSC1L1,RNF5P1,PPAPDC1B	IMR90	Hi-C	24141950	TACC1	60232	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	38895649	38895937	38895811	Y	TACC1,PLEKHA2,HTRA4	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	43261	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	39918999	39919284	39919148	Y	C8orf4	NA	C8orf4,ZMAT4	IMR90	Hi-C	24141950	C8orf4	89705	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	41445863	41446158	41445968	Y	NA	AGPAT6,RP11-360L9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-360L9.4	11976	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	41649689	41649828	41649744	Y	NKX6-3	NA	NA	NA	NA	NA	ANK1	102452	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	41775383	41775559	41775471	Y	NA	ANK1	ANK1	IMR90	Hi-C	24141950	ANK1	23103	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	41819161	41819283	41819222	Y	POLB	NA	NA	NA	NA	NA	ANK1	66881	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	41997279	41998522	41997937	Y	NA	AP3M2	KAT6A,ANK1,POLB,AP3M2,VDAC3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP3M2	9942	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	42383718	42383741	42383730	Y	NA	SLC20A2	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	11328	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	43092918	43093442	43093017	Y	HOOK3	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	99362	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	47962058	47962075	47962067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP2	104666	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	48350721	48350922	48350822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P12	276228	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	48910578	48910837	48910684	Y	NA	PRKDC,MCM4,UBE2V2	NA	NA	NA	NA	UBE2V2	8123	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	49426952	49427328	49427172	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131802	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	49495721	49496077	49496032	Y	SNAI2	NA	SNAI2,EFCAB1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	200571	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	49783004	49783154	49783067	Y	SNAI2	SNAI2	NA	NA	NA	NA	SNAI2	49145	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	52809491	52809887	52809877	Y	PCMTD1	NA	NA	NA	NA	NA	PCMTD1,RP11-110G21.1	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	53379796	53380092	53379874	Y	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	276311	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	54884595	54884649	54884642	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	48440	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	55125016	55125190	55125101	Y	ATP6V1H,ATP6V1H	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL15	79246	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	56831577	56831790	56831640	Y	NA	LYN	NA	NA	NA	NA	LYN	41205	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	59476129	59476409	59476167	Y	NA	SDCBP	NA	NA	NA	NA	SDCBP	12646	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	59499727	59499886	59499762	Y	UBXN2B,NSMAF,NSMAF,SDCBP	SDCBP	NA	NA	NA	NA	SDCBP	36244	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	60136019	60136081	60136050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-50P	410908	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	61564243	61564650	61564285	Y	CA8,CHD7	CHD7	CHD7,RAB2A	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHD7	24687	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	61626654	61626933	61626781	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37317	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr8	61627150	61627529	61627187	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37813	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	61660299	61660611	61660357	Y	CHD7	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	70962	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	61819241	61819611	61819429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	229904	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	61850490	61850754	61850677	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261153	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	62427686	62427987	62427837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	197168	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	62566892	62567143	62567071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	58012	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	62606389	62606706	62606619	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	18449	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr8	62620817	62621622	62621526	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	3533	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	62624516	62625412	62625017	Y	ASPH	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH,MIR4470	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	64133013	64133210	64133061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTHDF3	53901	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr8	66615323	66615688	66615531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	60354	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	67032130	67032353	67032272	Y	NA	AC084082.3	NA	NA	NA	NA	AC084082.3	9228	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	67035997	67036639	67036283	Y	NA	AC084082.3	NA	NA	NA	NA	AC084082.3	13095	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	68075038	68075412	68075329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	81020	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	71031909	71031920	71031915	Y	NA	RNU1-101P,RP11-152C15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	17495	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	71569342	71569635	71569535	Y	NA	LACTB2,XKR9	NA	NA	NA	NA	LACTB2	9774	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	74625237	74625516	74625377	Y	NA	STAU2	NA	NA	NA	NA	STAU2	32427	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	74637544	74637721	74637705	Y	NA	STAU2	NA	NA	NA	NA	STAU2	20222	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	76131324	76131607	76131526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNF4G	186542	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr8	76148779	76148868	76148824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNF4G	169281	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	79670742	79671103	79670995	Y	NA	IL7	NA	NA	NA	NA	IL7	44655	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	80696342	80696550	80696513	Y	HEY1	HEY1	MRPS28,HEY1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEY1	18244	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	80705910	80706255	80706054	Y	HEY1	HEY1	HEY1,MRPS28	IMR90	Hi-C	24141950	HEY1	27812	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.55324765008661
chr8	80996547	80996769	80996670	Y	TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	56023	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	81015641	81015664	81015650	Y	ZBTB10	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	75117	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	82673208	82673424	82673316	Y	NA	CHMP4C,ZFAND1	NA	NA	NA	NA	ZFAND1	30070	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr8	86090980	86091058	86091024	Y	E2F5,E2F5	E2F5,C8orf59,CA13	NA	NA	NA	NA	E2F5	3520	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	87484005	87484360	87484214	Y	NA	CPNE3	NA	NA	NA	NA	CPNE3	10699	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	87673960	87674305	87674138	Y	CNGB3	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE3	178901	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr8	90849173	90849652	90849503	Y	RIPK2,OSGIN2	NA	OSGIN2,NBN,RIPK2,DECR1	IMR90	Hi-C	24141950	OSGIN2	62435	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	90942619	90942853	90942786	Y	RIPK2,NBN,OSGIN2	OSGIN2	NA	NA	NA	NA	OSGIN2	30532	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	91020764	91021152	91020912	Y	NA	DECR1,NBN	NA	NA	NA	NA	NBN	7308	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	92112003	92112264	92112167	Y	NA	GS1-251I9.4,OTUD6B	NA	NA	NA	NA	OTUD6B	31579	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	94950843	94950973	94950908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDP1	82808	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	95271404	95271652	95271620	Y	GEM	CDH17,GEM	NA	NA	NA	NA	GEM	926	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	95786265	95786660	95786406	Y	RAD54B,KIAA1429	INTS8	NA	NA	NA	NA	INTS8	36879	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	95896385	95896691	95896542	Y	NA	CCNE2	NA	NA	NA	NA	CCNE2	10215	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	96180882	96181195	96181039	Y	PLEKHF2	PLEKHF2	NA	NA	NA	NA	PLEKHF2	36850	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	98572408	98572537	98572454	Y	NA	NA	PTDSS1,CPQ,SDC2,TSPYL5,MTDH	IMR90	Hi-C	24141950	MTDH	81870	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	98795675	98796209	98795739	Y	NA	LAPTM4B	NA	NA	NA	NA	LAPTM4B	10390	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	99637150	99637421	99637401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK3	315634	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	99643221	99643590	99643555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK3	309465	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	100594115	100594434	100594137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX6C	309856	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	101912406	101912993	101912785	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	50623	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	101920723	101921107	101920870	Y	NA	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	42509	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr8	101927731	101928052	101928034	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	35564	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr8	102015928	102016078	102016021	Y	NA	NA	FLJ42969,YWHAZ,ZNF706	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	52312	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	102038562	102039020	102038731	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	74946	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.862915361159228
chr8	102039589	102039925	102039833	Y	GRHL2	NA	ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	75973	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr8	102092753	102093116	102092848	Y	GRHL2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF706	123305	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	102103047	102103317	102103255	Y	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF706	113104	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	102135026	102135273	102135149	Y	NA	NA	YWHAZ,FLJ42969,ZNF706	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	81148	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	102171133	102171473	102171263	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	ZNF706	ZNF706,YWHAZ,FLJ42969	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	44948	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	102505547	102505759	102505677	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	2887	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr8	102505982	102506363	102506168	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	3322	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr8	103249003	103249378	103249091	Y	UBR5,KLF10,RRM2B,RRM2B	KB-431C1.4	NA	NA	NA	NA	RRM2B	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	103411260	103411483	103411351	Y	UBR5	UBR5	NA	NA	NA	NA	UBR5	11586	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	103669513	103669869	103669680	Y	AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10	KLF10	NA	NA	NA	NA	KLF10	3383	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr8	103669922	103670289	103670129	Y	ATP6V1C1,KLF10,KLF10	KLF10	NA	NA	NA	NA	KLF10	3792	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	103750893	103751082	103750980	Y	AZIN1,KLF10,KLF10	NA	UBR5,KLF10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KB-1732A1.1	64663	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr8	103766474	103766656	103766574	Y	NA	KB-1732A1.1	KLF10,UBR5	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1732A1.1	49089	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	103858397	103858789	103858587	Y	NA	KB-1732A1.1,KB-1507C5.2,AZIN1	NA	NA	NA	NA	KB-1507C5.2	15739	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	104059632	104059708	104059689	Y	NA	ATP6V1C1,KB-1639H6.2	NA	NA	NA	NA	KB-1639H6.2	27976	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	104331705	104332089	104331783	Y	RIMS2	FZD6,RP11-318M2.2,CTHRC1	NA	NA	NA	NA	RP11-318M2.2	22705	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	104406173	104406574	104406390	Y	NA	CTHRC1,DCAF13,SLC25A32	NA	NA	NA	NA	DCAF13	18368	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	106878097	106878155	106878126	Y	NA	NA	OXR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-152P17.2	192597	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	107740443	107740789	107740616	Y	NA	TAGLN2P1	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	32202	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	109222483	109222836	109222544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	222726	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	109230729	109230920	109230833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	214642	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	109455148	109455290	109455182	Y	NA	EIF3E	NA	NA	NA	NA	EIF3E	9586	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	110248064	110248088	110248074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENY2	96465	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	110602225	110602239	110602235	Y	SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,KCNV1	NA	NA	NA	NA	NA	EBAG9	52285	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	110647152	110647483	110647459	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYBU	54537	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	114266349	114266595	114266472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	120303	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	115322659	115322858	115322759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	935761	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	116441706	116441935	116441732	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	377964	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	116454411	116454736	116454628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	365163	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	116463689	116463880	116463766	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	356019	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	116507305	116507631	116507503	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	312268	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	116660380	116660747	116660648	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	159152	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	116678291	116678885	116678654	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	141014	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	116988617	116988643	116988632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	168718	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	117049380	117049760	117049565	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	229481	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr8	117456775	117457003	117456919	Y	NA	NA	TRPS1,LINC00536	IMR90	Hi-C	24141950	UTP23	319739	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	118801002	118801354	118801210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED30	270050	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	118958698	118959000	118958912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	163092	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	119317381	119317491	119317437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	195289	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr8	119339236	119339376	119339324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	217144	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	119536200	119536581	119536442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	95653	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	119536968	119537364	119537323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	94870	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	121702901	121703232	121703165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTB1	120281	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	121822442	121823157	121823030	Y	NA	SNTB1	NA	NA	NA	NA	SNTB1	356	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr8	122157265	122157468	122157378	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTB1	333752	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.121789969507
chr8	122347057	122347434	122347232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAS2	304196	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	122361097	122361402	122361250	Y	NA	NA	HAS2	IMR90	Hi-C	24141950	HAS2	290228	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	123908169	123908483	123908299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX2	116536	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	124013159	124013422	124013291	Y	NA	DERL1	NA	NA	NA	NA	DERL1	39241	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	124050911	124051177	124051044	Y	NA	DERL1	NA	NA	NA	NA	DERL1	1486	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	124248679	124249062	124248866	Y	NA	C8orf76,ZHX1	NA	NA	NA	NA	C8orf76	2576	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	124301303	124301534	124301414	Y	NA	C8orf76,ZHX1	ATAD2,ZHX1-C8ORF76	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZHX1	15522	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr8	124337288	124337362	124337325	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX1	51507	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	124407455	124407786	124407574	Y	FAM91A1,C8orf76,ZHX1,ATAD2	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	ATAD2	18804	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr8	124462485	124463022	124462596	Y	NA	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	WDYHV1	35520	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	125302460	125302812	125302637	Y	TMEM65,RNF139	RP11-383J24.1	NA	NA	NA	NA	RP11-383J24.1	20536	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	125304968	125305098	125305033	Y	NA	RP11-383J24.1	NA	NA	NA	NA	RP11-383J24.1	23044	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	125382714	125382961	125382953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM65	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	125466570	125466668	125466619	Y	NA	TRMT12,RNF139-AS1,RNF139	NA	NA	NA	NA	TRMT12	5522	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	125513273	125513673	125513472	Y	NA	RNF139-AS1,RNF139,NDUFB9,TATDN1	NA	NA	NA	NA	RNF139	28294	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	126231490	126231859	126231657	Y	MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	129408	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	126268557	126268681	126268622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	166475	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	126286229	126286368	126286299	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	154195	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	126290719	126290948	126290836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	149615	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	126335524	126335526	126335525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	105037	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	126365187	126365461	126365226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	75102	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	126441416	126441734	126441625	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	853	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr8	126446642	126447323	126446973	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	6079	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	126451967	126452238	126452064	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	11404	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	126452500	126452812	126452633	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	11937	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr8	128167127	128167527	128167484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	61806	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	128171088	128171312	128171255	Y	NA	NA	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	58021	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	128179610	128179821	128179807	Y	NA	CCAT1	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	49512	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	128180134	128180587	128180334	Y	NA	CCAT1	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	48746	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	128182261	128182424	128182343	Y	NA	CCAT1	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	46909	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	128185119	128185731	128185383	Y	NA	CCAT1	NA	NA	NA	NA	CCAT1	43602	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	128193341	128193750	128193748	Y	NA	CCAT1	MYC	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCAT1	35583	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	128196669	128197128	128196955	Y	NA	CCAT1	NA	NA	NA	NA	CCAT1	32205	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	128208934	128209645	128209301	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	19688	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	128218099	128218752	128218687	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	10581	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr8	128219153	128219489	128219426	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCAT1	9844	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr8	128227053	128227754	128227491	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCAT1	1579	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	128227982	128228299	128228180	Y	NA	CCAT1	LOC727677,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCAT1	1034	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	128259400	128259918	128259781	Y	MYC	CCAT1	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	30067	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	128306934	128307283	128307196	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	77601	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.29437304173884
chr8	128352367	128352670	128352528	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	CCAT1	123034	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	128407875	128408267	128408231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCAT1	178542	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	128680816	128681380	128681307	Y	MYC	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	64300	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	128822019	128822203	128822035	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	17240	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	128843918	128844302	128844002	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	39139	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	128910613	128910985	128910818	Y	MYC	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	105834	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	128919831	128920544	128920233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	100313	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	129188825	129189407	129189075	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-25P	167968	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	129205979	129206284	129206246	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-25P	185122	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	129981605	129981909	129981758	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	960748	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	130577240	130577439	130577294	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	449936	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	130876466	130876830	130876577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	150545	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	130975001	130975392	130975263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	51983	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	131007390	131007737	131007622	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	19638	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	131054431	131054834	131054758	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	27056	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	131080516	131080850	131080671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	53141	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	131134027	131134054	131134041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	106652	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	131201084	131201473	131201279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	173709	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	131218440	131218995	131218822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	191065	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	131259857	131260132	131260043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	193774	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	131271304	131271556	131271460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	182350	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	131289962	131290145	131290029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	163761	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	131454495	131454885	131454765	Y	NA	ASAP1	NA	NA	NA	NA	ASAP1	589	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	131456841	131457348	131457080	Y	NA	ASAP1	NA	NA	NA	NA	ASAP1	2935	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	133318227	133318435	133318380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC6	367403	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	133519987	133520123	133520064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC6	165715	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	133562041	133562364	133562205	Y	HHLA1,KCNQ3,KCNQ3	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC6	123474	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	134094333	134095052	134094858	Y	ST3GAL1,TMEM71,PHF20L1	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	217213	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	134233745	134234256	134234169	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	78009	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	134532639	134533046	134532970	Y	ST3GAL1	ST3GAL1	NA	NA	NA	NA	ST3GAL1	49137	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	134572976	134573374	134573175	Y	ST3GAL1	ST3GAL1	NA	NA	NA	NA	ST3GAL1	8809	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	134580779	134581429	134580915	Y	ST3GAL1	ST3GAL1	NA	NA	NA	NA	ST3GAL1	754	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	135635794	135636288	135636020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAT	87004	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	135842490	135842788	135842753	Y	NA	MIR30D	ZFAT	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR30D	27302	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	135984758	135985124	135984941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR30D	169570	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	141474376	141475403	141474918	Y	NA	TRAPPC9,CHRAC1	TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TRAPPC9	7698	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	141598802	141599709	141599120	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	79405	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.98470533066622
chr8	141606825	141607480	141607253	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	87428	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.38066457785476
chr8	141607900	141608150	141608005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	88503	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr8	141655804	141656158	141655981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	136407	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	141849368	141849592	141849371	Y	TRAPPC9	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	160723	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr8	141886994	141887102	141887066	Y	PTK2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	123213	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr8	141920743	141920803	141920776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	89512	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	141945462	141945818	141945641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	64497	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	142128241	142128488	142128412	Y	NA	DENND3	PTK2,DENND3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND3	2864	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	142215999	142216277	142216212	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	90622	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.20808150562292
chr8	142216641	142216829	142216751	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	91264	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr8	142278857	142279200	142279029	Y	NA	SLC45A4	DENND3,SLC45A4,PTK2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC45A4	37204	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	143282498	143282660	143282564	Y	TSNARE1	LINC00051	NA	NA	NA	NA	LINC00051	4781	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	143353648	143353818	143353814	Y	TSNARE1,BAI1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00051	75931	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	143809767	143809928	143809818	Y	C8orf55	JRK,LYPD2	NA	NA	NA	NA	LYPD2	22024	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	144107532	144108153	144107940	Y	MAFA	LY6E,C8orf31	NA	NA	NA	NA	LY6E	10133	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	144108350	144108468	144108378	Y	NA	LY6E,C8orf31	NA	NA	NA	NA	C8orf31	10158	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	144301806	144302247	144302025	Y	MAFA	ZFP41,GLI4	NA	NA	NA	NA	ZFP41	25033	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	144302525	144302816	144302585	Y	LY6H,LY6H,LY6H	ZFP41,GLI4	NA	NA	NA	NA	ZFP41	24464	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	144785317	144785390	144785376	Y	NA	ZNF707,MAPK15,FAM83H	NA	NA	NA	NA	MAPK15	11039	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	144820199	144820570	144820386	Y	RHPN1,C8orf73,FAM83H	MAPK15,FAM83H	NA	NA	NA	NA	FAM83H	6228	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	144843026	144843252	144843141	Y	NA	MAPK15,FAM83H	SCRIB,PUF60	IMR90	Hi-C	24141950	FAM83H	29055	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	145002494	145002937	145002709	Y	SPATC1,PLEC	PLEC	NA	NA	NA	NA	PLEC	45965	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr8	145015768	145015971	145015849	Y	FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	32931	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr8	145022492	145023108	145022824	Y	PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	25794	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	22100	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr8	145909522	145909717	145909620	Y	NA	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	328	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	145909879	145909957	145909931	Y	SCRT1,KIFC2,LRRC24,ARHGAP39,ZNF517,ZNF34	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	685	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr8	146010487	146010786	146010731	Y	NA	ZNF251,RPL8,ZNF7	NA	NA	NA	NA	ZNF34	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr9	226208	226591	226300	Y	NA	DOCK8	NA	NA	NA	NA	DOCK8	13354	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	2465114	2465154	2465134	Y	NA	NA	VLDLR,FLJ35024	IMR90	Hi-C	24141950	VLDLR	154680	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	2663518	2663568	2663543	Y	NA	VLDLR	NA	NA	NA	NA	VLDLR	43684	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	2875811	2876206	2875956	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	33570	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	3450123	3450354	3450276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX3	73650	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	4042913	4043209	4043135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3-AS1	146271	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	4083576	4083986	4083877	Y	GLIS3,GLIS3	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3-AS1	186934	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	4340074	4340431	4340362	Y	NA	GLIS3	GLIS3,RFX3,GLIS3-AS1,KIAA0020	IMR90	Hi-C	24141950	GLIS3	5961	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	4510954	4511309	4511045	Y	SLC1A1	SLC1A1	NA	NA	NA	NA	SLC1A1	22510	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	4530559	4530733	4530650	Y	NA	SLC1A1	NA	NA	NA	NA	SLC1A1	42115	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	4829866	4830028	4829909	Y	NA	RCL1,MIR101-2	NA	NA	NA	NA	MIR101-2	18263	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr9	6488249	6488567	6488283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UHRF2	77098	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,RP11-390F4.6,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr9	6788210	6788382	6788241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4C	69347	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	6926338	6926600	6926461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4C	207475	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	6958089	6958102	6958095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4C	239226	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	11065025	11065362	11065124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	1746982	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr9	12487595	12487982	12487864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	324362	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	12779203	12779569	12779249	Y	NA	RP11-3L8.3	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	32775	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	12784417	12784967	12784682	Y	C9orf150	RP11-3L8.3	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	27377	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	13237438	13237544	13237492	Y	NA	MPDZ	NA	NA	NA	NA	MPDZ	40045	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	14229495	14229796	14229646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	167186	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	14322295	14322910	14322674	Y	ZDHHC21,NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	74072	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr9	14343788	14343918	14343814	Y	ZDHHC21,NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	53064	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	15306066	15306408	15306119	Y	NA	TTC39B	NA	NA	NA	NA	TTC39B	708	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	16337405	16337786	16337534	Y	NA	NA	BNC2	IMR90	Hi-C	24141950	CNTLN	795194	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	18718417	18718817	18718751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-296P7.4	306073	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	19231297	19231777	19231673	Y	PLIN2	NA	DENND4C	IMR90	Hi-C	24141950	PLIN2	84009	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	19642332	19642566	19642449	Y	SLC24A2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-363E7.3	179810	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	19757840	19758157	19758155	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-363E7.3	295318	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	20532398	20532530	20532463	Y	MLLT3	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	88012	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	21479977	21480007	21479992	Y	NA	MIR31	NA	NA	NA	NA	MIR31	30177	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	21491701	21492113	21492049	Y	NA	MIR31	NA	NA	NA	NA	MIR31	18071	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr9	21496569	21496909	21496764	Y	NA	MIR31	NA	NA	NA	NA	MIR31	13275	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	21576231	21576644	21576439	Y	NA	MIR31HG	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR31HG	18563	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr9	21589940	21590292	21590223	Y	IFNW1,IFNA6,IFNA1	MIR31HG	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR31HG	32272	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr9	21605613	21605961	21605757	Y	NA	MIR31HG	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR31HG	47945	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	21677834	21678156	21678014	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR31HG	120166	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	21681581	21681928	21681849	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	118614	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	21685022	21685416	21685227	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	115126	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	21695810	21696232	21696052	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	104310	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr9	21696521	21696698	21696606	Y	IFNA6,IFNA1	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	103844	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	21809706	21810111	21809856	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	9164	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	21832056	21832478	21832164	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	31514	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	21836477	21836868	21836612	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	35935	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	22310596	22310829	22310637	Y	NA	NA	MTAP,DMRTA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DMRTA1	134011	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	22482961	22483350	22483156	Y	NA	DMRTA1	NA	NA	NA	NA	DMRTA1	38121	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	26946072	26946289	26946254	Y	PLAA,IFT74,IFT74	IFT74,PLAA	NA	NA	NA	NA	PLAA	611	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	28649799	28650020	28649948	Y	LINGO2	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf72	1077935	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	29211344	29211542	29211410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMXP2	1475561	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	29826048	29826378	29826215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMXP2	860725	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	30078257	30078387	30078322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMXP2	608716	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	32004800	32005157	32005020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACO1	377461	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	32437038	32437275	32437091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACO1	54420	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	32461734	32461764	32461747	Y	DDX58	NA	NA	NA	NA	NA	DDX58	62558	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	32524178	32524624	32524592	Y	DDX58	TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	32535412	32535514	32535462	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	11090	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	32535541	32535857	32535751	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	11219	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	33033161	33033386	33033274	Y	TOPORS,DNAJA1,NFX1,SMU1	APTX,DNAJA1,SMU1	NA	NA	NA	NA	DNAJA1	9952	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	33165457	33166051	33165900	Y	DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	103	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	33942829	33943199	33943013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBAP2	103748	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	33953868	33954185	33954034	Y	UBE2R2,UBAP1	NA	NA	NA	NA	NA	UBAP2	92762	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	35114116	35114547	35114222	Y	DNAJB5,KIAA1539	VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B	NA	NA	NA	NA	FAM214B	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	35490989	35491345	35491127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	112022	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr9	35726275	35726587	35726326	Y	NA	TPM2,CREB3,TLN1,RGP1,GBA2	NA	NA	NA	NA	CREB3	3745	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	35769980	35770349	35770169	Y	NA	CREB3,TLN1,RGP1,GBA2,SPAG8,TMEM8B,HINT2	NA	NA	NA	NA	GBA2	21997	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	35971862	35972364	35972237	Y	NA	YBX1P10	C9orf128,HRCT1,LOC158376,FP588,RECK	IMR90	Hi-C	24141950	YBX1P10	1547	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	36232002	36232125	36232063	Y	GNE	CLTA,RNU4-53P,GNE	NA	NA	NA	NA	RNU4-53P	33655	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	36232965	36233105	36233040	Y	NA	CLTA,RNU4-53P,GNE	NA	NA	NA	NA	RNU4-53P	32675	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	36471008	36471193	36471156	Y	NA	RNF38	RNF38,MELK	IMR90	Hi-C	24141950	RNF38	14352	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr9	36924974	36925090	36925030	Y	MELK	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	193446	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr9	37036641	37037011	37036829	Y	ZCCHC7,ZBTB5,PAX5	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	81525	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	37270797	37270994	37270913	Y	PAX5	NA	NA	NA	NA	NA	GRHPR	149669	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	37835930	37836292	37836154	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	36496	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr9	37954084	37954355	37954258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	112329	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	38016375	38016730	38016641	Y	NA	RP11-613M10.9	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	49954	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	38035956	38036107	38036020	Y	NA	RP11-613M10.9,SHB	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	30577	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr9	38066980	38067628	38067261	Y	SHB	RP11-613M10.9	NA	NA	NA	NA	SHB	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.55324765008661
chr9	68429583	68429926	68429755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM122A	2963038	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM122A	2937408	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr9	71728196	71728449	71728285	Y	NA	TJP2	NA	NA	NA	NA	TJP2	5760	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	71790550	71790929	71790586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	56341	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	71791709	71792066	71791753	Y	TJP2	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	57500	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	71793410	71793781	71793424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	59201	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	72101775	72101805	72101790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTAR1	271070	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr9	73404281	73404648	73404524	Y	TRPM3	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	376741	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	73701762	73702162	73701962	Y	TRPM3	NA	NA	NA	NA	NA	RPL35AP21	500355	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	74292775	74292963	74292884	Y	TMEM2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL35AP21	90258	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	74371995	74372048	74372016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM2	57558	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	74849498	74849569	74849533	Y	GDA,GDA,TMC1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-63P12.6	68777	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr9	75747117	75747734	75747349	Y	ANXA1	ANXA1	ANXA1	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA1	16939	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr9	79266452	79266571	79266515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL161626.1	81721	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	80559906	80560072	80560021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAQ	84302	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	88264467	88264715	88264594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	90229	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	88286391	88286647	88286519	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	68297	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	88294983	88295025	88294997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	59919	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	88346951	88347024	88346988	Y	NA	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	7920	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	90117444	90117744	90117580	Y	DAPK1	DAPK1,RP11-40C6.2	NA	NA	NA	NA	DAPK1	7301	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	90166692	90166955	90166778	Y	NA	RP11-40C6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	28475	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	90171863	90172233	90171972	Y	CTSL1,DAPK1	RP11-40C6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	33646	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	90216174	90216503	90216403	Y	DAPK1,CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	77957	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	90326659	90327327	90326985	Y	DAPK1,CTSL1	NA	CTSL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-40C6.2	188442	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	90328172	90328868	90328486	Y	DAPK1,CTSL1	NA	CTSL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-40C6.2	189955	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr9	91795136	91795669	91795494	Y	C9orf47,SHC3	NA	NA	NA	NA	NA	CKS2	128444	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.20808150562292
chr9	93822540	93822977	93822872	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	NA	NA	NA	NA	SYK	260471	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	93975322	93975401	93975365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	146794	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	94178668	94178865	94178761	Y	NFIL3	NFIL3	NA	NA	NA	NA	NFIL3	5279	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	94181531	94181930	94181720	Y	NFIL3	NFIL3	NA	NA	NA	NA	NFIL3	2214	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	95545605	95545731	95545668	Y	NA	BICD2	BICD2,NOL8,IPPK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BICD2	20511	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	95878204	95878686	95878424	Y	IPPK,PHF2,FAM120A,C9orf89,NINJ1	C9orf89,NINJ1	NA	NA	NA	NA	NINJ1	15884	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	96329605	96329732	96329668	Y	NA	PHF2	PHF2	IMR90	Hi-C	24141950	PHF2	6957	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	96335202	96335517	96335360	Y	NA	PHF2	NA	NA	NA	NA	PHF2	1172	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	96845736	96845997	96845867	Y	NA	CYCSP24	NA	NA	NA	NA	CYCSP24	47424	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	10486	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	9706	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	97630074	97630491	97630387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	143091	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	97853945	97854061	97854005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	223930	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	97881296	97881429	97881363	Y	FBP1	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	196562	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	98075518	98075673	98075591	Y	NA	FANCC	NA	NA	NA	NA	FANCC	2318	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	98262009	98262267	98262138	Y	PTCH1,PTCH1,PTCH1	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	15072	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	98273012	98273438	98273114	Y	C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	3901	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr9	98273818	98274186	98273872	Y	NA	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	3153	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	98744078	98744248	98744144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00476	107819	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	99106686	99107122	99106995	Y	NA	SLC35D2	NA	NA	NA	NA	SLC35D2	36870	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	2936	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	100264469	100265020	100264497	Y	NA	TMOD1	NA	NA	NA	NA	TMOD1	3007	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	100455337	100455352	100455343	Y	NA	XPA	NA	NA	NA	NA	XPA	2287	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	100565577	100566264	100565821	Y	CORO2A,FOXE1	NA	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	XPA	107938	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	100743401	100743685	100743451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANP32B	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	100772550	100772875	100772560	Y	NA	ANP32B,NANS	NANS,TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	ANP32B	28907	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr9	100841115	100841498	100841123	Y	C9orf156	NANS,TRIM14	NA	NA	NA	NA	NANS	24094	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	100908591	100908763	100908677	Y	NA	TRIM14,CORO2A	TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM14	29097	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	100993569	100993588	100993579	Y	NA	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	22327	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	101868249	101868435	101868378	Y	NA	TGFBR1	NA	NA	NA	NA	TGFBR1	3929	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	101973951	101974336	101974174	Y	NA	ALG2,SEC61B	NA	NA	NA	NA	ALG2	7902	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	102006739	102006945	102006777	Y	NA	ALG2,SEC61B	NA	NA	NA	NA	SEC61B	24393	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	102007294	102007527	102007424	Y	NA	ALG2,SEC61B	NA	NA	NA	NA	SEC61B	24948	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	102767343	102767551	102767505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERP44	91771	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	103317087	103317229	103317158	Y	C9orf30-TMEFF1,TMEFF1,LPPR1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEFF1	114527	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	104248590	104248780	104248669	Y	C9orf125	RNF20	NA	NA	NA	NA	RNF20	45353	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	107635337	107635884	107635542	Y	ABCA1	NA	NA	NA	NA	NA	ABCA1	52634	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	107730510	107730878	107730708	Y	SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1	ABCA1	ABCA1	IMR90	Hi-C	24141950	ABCA1	41992	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	108272295	108272828	108272406	Y	TMEM38B	FKTN	NA	NA	NA	NA	FKTN	45583	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	109647843	109648061	109647872	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	24465	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	109655091	109655246	109655169	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	31713	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	110254619	110254916	110254689	Y	NA	KLF4,RP11-438P9.1	NA	NA	NA	NA	KLF4	3856	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	110310627	110311050	110310826	Y	KLF4	RP11-438P9.1	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-438P9.1	15956	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	111773643	111773659	111773652	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	150	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	111774521	111775173	111774726	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	712	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr9	112076384	112076614	112076499	Y	NA	EPB41L4B	NA	NA	NA	NA	EPB41L4B	4630	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	112811971	112812606	112812251	Y	AKAP2	RP11-151F5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-151F5.2	26333	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	112827300	112827392	112827326	Y	AKAP2	RP11-151F5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-151F5.2	41662	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	112831833	112832445	112832154	Y	NA	RP11-151F5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-151F5.2	46195	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	113014576	113014999	113014920	Y	AKAP2,TXN	C9orf152,TXN	NA	NA	NA	NA	TXN	1921	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	114111620	114111657	114111640	Y	OR2K2	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0368	133368	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr9	114505631	114505796	114505739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG10	84016	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	114596249	114596662	114596321	Y	NA	NA	UGCG,MIR3134,HSDL2,SUSD1,C9orf84	IMR90	Hi-C	24141950	UGCG	60384	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	114720285	114720825	114720474	Y	UGCG	NA	C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UGCG	63239	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	114790542	114790702	114790622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	133496	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	114823556	114823978	114823803	Y	GNG10,SUSD1	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	111710	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	114836654	114837091	114837061	Y	PTGR1,PTGR1,UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	98597	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	114960117	114960327	114960222	Y	NA	SUSD1	NA	NA	NA	NA	SUSD1	24429	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	116031847	116032083	116031965	Y	NA	PRPF4,CDC26	NA	NA	NA	NA	PRPF4	3540	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	116036635	116036980	116036798	Y	SLC31A2,FKBP15,RGS3	PRPF4,CDC26	NA	NA	NA	NA	CDC26	766	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	116437693	116438045	116437945	Y	BSPRY,ZNF618	NA	RGS3,POLE3,C9orf43	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF618	198517	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	116728685	116728905	116728795	Y	AMBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF618	92123	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	117566825	117567042	117566994	Y	TNFSF15	TNFSF15	NA	NA	NA	NA	TNFSF15	419	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr9	117671276	117671580	117671329	Y	DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF15	104870	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	118353952	118354125	118354022	Y	TNC	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	475416	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	118358577	118359027	118358666	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	480041	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr9	118434933	118435213	118435118	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	556397	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr9	118473939	118474297	118474118	Y	NA	NA	PAPPA,ASTN2,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	595403	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	118634403	118634418	118634411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	755867	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	118917854	118918405	118917899	Y	PAPPA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	529176	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	119404408	119404429	119404420	Y	NA	TRIM32	NA	NA	NA	NA	TRIM32	43152	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	123237192	123237494	123237347	Y	MEGF9,FBXW2	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	102954	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	124040831	124041134	124040970	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	RAB14	57539	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	124361597	124361984	124361689	Y	NA	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	34261	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.60404075281146
chr9	124383753	124383935	124383823	Y	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	56417	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	124498744	124498978	124498839	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	171408	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr9	124499221	124499709	124499392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	171885	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr9	125654025	125654372	125654281	Y	NA	RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,RABGAP1	NA	NA	NA	NA	RC3H2	11248	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	126138103	126138404	126138241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	109248	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chr9	126154038	126154354	126154284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	125183	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	126237774	126237937	126237796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	208919	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	126297071	126297260	126297221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	268216	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	126448761	126449170	126449003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	241261	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	126468286	126468378	126468332	Y	STRBP,STRBP	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	222053	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	126632279	126632299	126632291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	58132	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	126644407	126644614	126644564	Y	LHX2	DENND1A	NA	NA	NA	NA	DENND1A	45817	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	127155102	127155374	127155331	Y	DENND1A	PSMB7	NA	NA	NA	NA	PSMB7	20349	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr9	127947242	127947259	127947251	Y	NA	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	2959	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	127976903	127977044	127976974	Y	NA	PPP6C,RABEPK,HSPA5,RP11-65N13.8,GAPVD1	NA	NA	NA	NA	RABEPK	16082	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	127980597	127980978	127980790	Y	NA	PPP6C,RABEPK,HSPA5,RP11-65N13.8,GAPVD1	NA	NA	NA	NA	RABEPK	19776	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	128170862	128170906	128170878	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	148789	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	128172483	128172773	128172647	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	150410	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.862915361159228
chr9	128298527	128298744	128298662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	168769	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	129185557	129185839	129185698	Y	FAM125B,ZBTB34	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	379446	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	129484571	129485188	129484881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	80097	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	130307843	130308200	130307973	Y	SLC2A8,FAM129B	FAM129B	NA	NA	NA	NA	FAM129B	31068	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chr9	130328926	130329278	130329070	Y	FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	9990	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	130329548	130329691	130329605	Y	PTRH1,FPGS,FPGS,ENG,CDK9,FAM129B,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	9577	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	130336494	130336746	130336628	Y	TOR2A,FPGS,FPGS,CDK9,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	2522	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	130341922	130342377	130342071	Y	NA	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	2654	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	130590782	130591142	130590862	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS	CDK9,FPGS,AK1	NA	NA	NA	NA	FPGS	35906	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	130675929	130676130	130676030	Y	NA	AK1,ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,PIP5KL1,DPM2	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC4	1187	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	130844598	130844860	130844677	Y	NA	SLC25A25,NAIF1,PTGES2	NA	NA	NA	NA	NAIF1	16113	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	130992546	130992666	130992589	Y	SPTAN1,SH2D3C,SH2D3C,ST6GALNAC6,SLC25A25,DNM1,CIZ1	DNM1,CIZ1,SWI5,GOLGA2	NA	NA	NA	NA	CIZ1	27884	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	131127114	131127521	131127297	Y	SLC25A25	COQ4,TRUB2,SLC27A4,URM1,CERCAM	NA	NA	NA	NA	URM1	4077	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	131316865	131317367	131316977	Y	NA	RP11-216B9.6,SPTAN1	NA	NA	NA	NA	SPTAN1	3999	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	131645612	131645749	131645679	Y	NA	LRRC8A,CCBL1	NA	NA	NA	NA	CCBL1	2839	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	131929415	131929566	131929473	Y	METTL11A,C9orf106	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8974	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	131937094	131937487	131937262	Y	PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1053	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	132145857	132146151	132146146	Y	FAM73B,C9orf106,USP20,USP20,TOR1B,C9orf78,ASB6	NA	C9orf106,LOC100506190,IER5L,C9orf50,PPP2R4,CRAT	IMR90,MCF7,K562,HELA	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	RP11-65J3.1	53278	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	132168772	132168919	132168823	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	74811	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr9	132223086	132223659	132223410	Y	C9orf106,TOR1B	LINC00963	PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106,C9orf50,METTL11A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	20071	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	132244062	132244824	132244277	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	332	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	132319720	132320056	132319894	Y	DOLPP1	NA	FAM73B,DOLPP1,IER5L,LOC100506190,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	75990	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	132330057	132330508	132330201	Y	NA	NA	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ASB6	71936	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	132330921	132331424	132331168	Y	IER5L,C9orf50	NA	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ASB6	71020	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	132331590	132331738	132331651	Y	CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	NA	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ASB6	70706	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	132359283	132359664	132359324	Y	CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L,PTGES,METTL11A,ASB6	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	42780	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	132369856	132370376	132370136	Y	CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	32068	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	132568357	132568650	132568524	Y	TOR1B	TOR1B,TOR1A,USP20,C9orf78	NA	NA	NA	NA	TOR1B	4925	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	132949592	132949704	132949653	Y	C9orf78	NCS1	NA	NA	NA	NA	NCS1	16735	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	133565449	133565699	133565571	Y	NA	RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1	NA	NA	NA	NA	EXOSC2	1409	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	3.19278683628914
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.03549843339107
chr9	134576377	134576829	134576707	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	36632	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	134600757	134600889	134600837	Y	RAPGEF1,NTNG2	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	12572	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	134608936	134609538	134609242	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	3923	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	134773213	134773507	134773412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	159752	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	135197315	135197652	135197484	Y	NA	SETX	NA	NA	NA	NA	SETX	30720	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	135226317	135226646	135226576	Y	NA	SETX	NA	NA	NA	NA	SETX	1726	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	135251810	135252069	135251940	Y	NA	SETX,TTF1,RNU5D-2P	NA	NA	NA	NA	SETX	23438	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	135999727	136000118	136000091	Y	SLC2A6,RPL7A,RALGDS,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	37183	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	136009131	136009458	136009277	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	27843	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chr9	136022907	136023306	136022967	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	13995	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	136075454	136075720	136075558	Y	NA	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	GBGT1	38122	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	136284309	136284583	136284382	Y	C9orf96	SURF4,C9orf96,REXO4	NA	NA	NA	NA	REXO4	3145	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	136387799	136387823	136387811	Y	NA	SLC2A6	NA	NA	NA	NA	SLC2A6	45540	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	136739075	136739598	136739373	Y	VAV2	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	116128	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	136856624	136856782	136856656	Y	VAV2	VAV2,LINC00094	NA	NA	NA	NA	VAV2	898	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	137220336	137220598	137220352	Y	NA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	13392	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	137221069	137221192	137221119	Y	RXRA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	14125	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	137257724	137257990	137257923	Y	RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	50780	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	137264490	137265116	137264820	Y	RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	57546	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.8984137945503
chr9	137267558	137268069	137267755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	60614	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chr9	137268826	137268961	137268858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	61882	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	138348639	138348707	138348673	Y	NA	PPP1R26,MRPS2,C9orf116	NA	NA	NA	NA	PPP1R26	20218	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	138370318	138370583	138370451	Y	NA	PPP1R26,MRPS2,C9orf116	NA	NA	NA	NA	PPP1R26	1393	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	138796932	138797111	138797062	Y	CAMSAP1	RP11-432J22.2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP1	0	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr9	138986008	138986159	138986118	Y	NACC2	NACC2,C9orf69	NA	NA	NA	NA	NACC2	877	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	139136338	139136616	139136467	Y	QSOX2	QSOX2	NA	NA	NA	NA	QSOX2	651	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chr9	139237317	139237472	139237398	Y	GPSM1	GPSM1,DNLZ	NA	NA	NA	NA	GPSM1	17385	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	139415789	139416380	139416258	Y	NA	SEC16A,NOTCH1,RP11-611D20.2	NA	NA	NA	NA	NOTCH1	21934	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	139608810	139609132	139608936	Y	SNAPC4,INPP5E,EGFL7,EGFL7,FAM69B	AGPAT2,FAM69B,SNHG7	NA	NA	NA	NA	FAM69B	3788	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	139826661	139826850	139826762	Y	NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2	MIR4479,FBXW5,PTGDS	NA	NA	NA	NA	FBXW5	10298	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	140022067	140022152	140022137	Y	EHMT1,WDR85,NDOR1,ANAPC2	MAN1B1,DPP7,MIR3621	NA	NA	NA	NA	DPP7	14438	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7,MIR3621	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	3.19278683628914
chr9	140101916	140102100	140102008	Y	C9orf172,FUT7	MIR3621,ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	NDOR1	3769	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	15308	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.949206897275151
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.29437304173884
chr9	140205908	140206072	140205991	Y	NRARP	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	11205	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	140221048	140221451	140221248	Y	UAP1L1,NRARP	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	26345	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	140294443	140294697	140294564	Y	UAP1L1,C9orf167,NRARP	EXD3,NOXA1	NA	NA	NA	NA	EXD3	21017	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	140301516	140301688	140301630	Y	CACNA1B,NRARP	EXD3,NOXA1	NA	NA	NA	NA	EXD3	14026	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chr9	140301767	140302162	140302062	Y	NA	EXD3,NOXA1	NA	NA	NA	NA	EXD3	13552	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chr9	140306093	140306345	140306289	Y	NRARP	EXD3,NOXA1	NA	NA	NA	NA	EXD3	9369	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chr9	140411407	140411807	140411605	Y	CACNA1B,ABCA2,ENTPD2,GRIN1,RNF208,PNPLA7	PNPLA7,MRPL41	NA	NA	NA	NA	PNPLA7	31179	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	3437014	3437322	3437139	Y	ARSF,MXRA5	NA	ARSF	IMR90	Hi-C	24141950	MXRA5	174332	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	3507652	3507856	3507754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	121793	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chrX	9433838	9434425	9434365	Y	TBL1X	TBL1X	NA	NA	NA	NA	TBL1X	4503	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chrX	9536624	9537203	9536862	Y	TBL1X,TBL1X	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1X	107289	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	9701264	9701389	9701313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM2	51107	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	10851081	10851118	10851099	Y	NA	MID1	NA	NA	NA	NA	MID1	1308	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	11444012	11444192	11444085	Y	ARHGAP6	NA	NA	NA	NA	NA	HCCS	316591	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	12974854	12975280	12975169	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	15947	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	12989837	12990050	12989934	Y	TLR7,TLR8,TMSB4X	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	1177	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	12996986	12997135	12997061	Y	TLR8,TMSB4X	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	5759	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	13119924	13120175	13120039	Y	NA	NA	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB4X	128697	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	13416625	13416882	13416754	Y	NA	GPX1P1	FAM9C,TMSB4X,LOC100133123	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPX1P1	21166	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	13709946	13709989	13709968	Y	RAB9A	TCEANC,RAB9A,TRAPPC2,OFD1	NA	NA	NA	NA	RAB9A	4702	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	13711501	13711681	13711616	Y	ATXN3L,RAB9A	TCEANC,RAB9A,TRAPPC2,OFD1	NA	NA	NA	NA	RAB9A	6257	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	14040371	14040544	14040433	Y	NA	GEMIN8	NA	NA	NA	NA	GEMIN8	5468	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	14262210	14262757	14262259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8	216198	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chrX	15852343	15852548	15852528	Y	NA	ZRSR2,AP1S2	NA	NA	NA	NA	AP1S2	18506	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	15871584	15871957	15871763	Y	CA5B,ZRSR2,AP1S2	AP1S2	ZRSR2	K562	ChIA-PET	22265404	AP1S2	530	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	17395556	17395647	17395622	Y	NHS	NHS	NA	NA	NA	NA	NHS	4013	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	17415371	17415448	17415410	Y	NA	NHS	NA	NA	NA	NA	NHS	23828	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	18693104	18693424	18693141	Y	PHKA2,CDKL5	NA	NA	NA	NA	NA	CDKL5	251401	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chrX	18904688	18905149	18904995	Y	PHKA2	NA	NA	NA	NA	NA	PHKA2	95567	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	20154251	20154286	20154269	Y	NA	EIF1AX	NA	NA	NA	NA	EIF1AX	3676	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	20628422	20628647	20628433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA3	344899	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	21962010	21962116	21962060	Y	NA	SMS	NA	NA	NA	NA	SMS	5319	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	23806806	23807042	23806932	Y	ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,ACOT9,SAT1	ACOT9,SAT1,RPL9P7	NA	NA	NA	NA	SAT1	7516	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	25029418	25029558	25029499	Y	PCYT1B,PCYT1B,ARX	NA	NA	NA	NA	NA	POLA1	319382	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	29496854	29497166	29496936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTLP2	1149249	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	29610847	29611180	29610948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTLP2	1035235	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chrX	29678122	29678339	29678241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTLP2	968076	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	23.0398401429514
chrX	30717069	30717144	30717107	Y	CXorf21,GK	GK	NA	NA	NA	NA	GK	47593	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	31848875	31849137	31848986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAB3	857674	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	38134878	38135257	38135079	Y	CYBB,RPGR	RPGR	NA	NA	NA	NA	RPGR	49560	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	39646201	39646652	39646229	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	811	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chrX	39872499	39873023	39872596	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	161559	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chrX	39873339	39874259	39873676	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	160323	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	39968308	39968728	39968376	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65854	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	40017598	40017727	40017669	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	16855	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	40030956	40031200	40030978	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	3382	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chrX	40032962	40033837	40033453	Y	BCOR,CXorf38,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	745	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	40869399	40869667	40869505	Y	USP9X,ATP6AP2,CXorf38,MED14	NA	MED14,USP9X	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP9X	73221	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chrX	40869896	40870061	40869955	Y	ATP6AP2	NA	MED14,USP9X	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP9X	72827	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	40943673	40944218	40943773	Y	CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X	USP9X	NA	NA	NA	NA	USP9X	785	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chrX	41182589	41182765	41182693	Y	NA	DDX3X	DDX3X	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DDX3X	7886	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chrX	41242516	41242827	41242698	Y	DDX3X	NA	DDX3X,USP9X	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DDX3X	51865	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	41301456	41301878	41301579	Y	NA	NA	DDX3X	K562	ChIA-PET	22265404	DDX3X	110805	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	NDP	57840	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chrX	45338516	45338773	45338583	Y	NA	RP11-245M24.1	MIR221,MIR222	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-245M24.1	23860	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chrX	45626471	45627108	45626806	Y	NA	MIR221,MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR222	21941	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chrX	45666628	45666834	45666726	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	42086	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	45702877	45703292	45703236	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	5628	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chrX	46278987	46279293	46279130	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18856	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	46316161	46316444	46316394	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18012	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	46773328	46773680	46773526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP2	78953	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	46989082	46989431	46989227	Y	NA	RBM10,NDUFB11	NA	NA	NA	NA	RBM10	12837	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	47221453	47221809	47221639	Y	USP11,ZNF81,SYN1	NA	UBA1,USP11	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF41	118536	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	47382833	47383145	47382966	Y	SYN1,SPACA5,CFP,CFP	ZNF41,ARAF	UBA1,ZNF41,USP11,CDK16	IMR90	Hi-C	24141950	ARAF	35371	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	47438054	47438403	47438273	Y	CFP,CFP,ARAF	ARAF,TIMP1	NA	NA	NA	NA	TIMP1	1309	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	47492098	47492440	47492261	Y	ARAF,CFP,CFP	ELK1,UXT	NA	NA	NA	NA	ELK1	15563	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	47701110	47701161	47701136	Y	NA	ZNF81	NA	NA	NA	NA	ZNF81	6809	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	48748167	48748450	48748403	Y	NA	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2	NA	NA	NA	NA	PQBP1	4745	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	48782253	48782568	48782411	Y	NA	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2,OTUD5,KCND1	NA	NA	NA	NA	PIM2	7952	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	49012442	49012818	49012676	Y	NA	GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	13455	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chrX	51633926	51634124	51634025	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGED1	89823	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	52949996	52950343	52950129	Y	TSPYL2,KDM5C,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	31660	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	45908	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chrX	53083409	53083784	53083564	Y	NA	GPR173,TSPYL2,LINC01155	NA	NA	NA	NA	GPR173	7136	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chrX	53468564	53468782	53468716	Y	IQSEC2	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	HSD17B10	9244	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chrX	56269843	56269989	56269918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBQLN2	318037	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	57421884	57422193	57422039	Y	FAAH2	NA	NA	NA	NA	NA	ZXDB	194076	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	58292059	58292236	58292148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT8P17	282939	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	64520324	64520642	64520384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAS1L	232013	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chrX	65114053	65114269	65114162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSN	307796	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	67291116	67291490	67291298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPHN1	360265	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	67905949	67906235	67906128	Y	NA	STARD8	NA	NA	NA	NA	STARD8	40441	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	SERBP1P1,EFNB1	NA	NA	NA	NA	SERBP1P1	3040	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.690332288927382
chrX	68215899	68216039	68215946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PJA1	167597	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chrX	69653784	69653948	69653832	Y	NA	DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8763	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	69654278	69654566	69654417	Y	DLG3	DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8145	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chrX	70401853	70402134	70401993	Y	IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO	GJB1	NA	NA	NA	NA	GJB1	30910	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	70640504	70640913	70640718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF1	56390	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	71635914	71636037	71635976	Y	HDAC8	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4X	140764	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	71761722	71762003	71761864	Y	NA	HDAC8	NA	NA	NA	NA	HDAC8	28950	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	73236075	73236382	73236224	Y	CHIC1	RP13-36G14.3	NA	NA	NA	NA	RP13-36G14.3	47536	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	73250242	73250558	73250399	Y	NA	RP13-36G14.3	NA	NA	NA	NA	RP13-36G14.3	33360	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.345166144463691
chrX	73507125	73507445	73507287	Y	NA	FTX	NA	NA	NA	NA	FTX	3964	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chrX	73755621	73755953	73755678	Y	RLIM	NA	NA	NA	NA	NA	RLIM	76499	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	73756210	73756567	73756298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLIM	75885	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	74960822	74961039	74960972	Y	NA	TTC3P1	NA	NA	NA	NA	TTC3P1	3710	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	85280770	85281145	85280958	Y	CHM	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	19421	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chrX	92479084	92479478	92479382	Y	NA	RP13-88F20.1	NA	NA	NA	NA	RP13-88F20.1	1070	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	97535019	97535198	97535109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	1597357	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	99913933	99914424	99914133	Y	SYTL4,SYTL4	TSPAN6,SRPX2	NA	NA	NA	NA	SRPX2	16718	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	100792680	100793554	100793013	Y	NA	ARMCX1	NA	NA	NA	NA	ARMCX1	9960	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chrX	101914784	101914936	101914847	Y	BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1	NA	NA	NA	NA	NA	GPRASP2	50168	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chrX	102063503	102063615	102063509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHB9	89887	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	102820880	102821034	102820957	Y	NA	TCEAL4,TCEAL3	NA	NA	NA	NA	TCEAL4	8125	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	106595212	106595632	106595477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147542	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chrX	106595667	106595822	106595802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147997	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chrX	106920003	106920801	106920325	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	50266	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chrX	109315579	109315956	109315731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM164	71720	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	116006387	116006717	116006592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	922965	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chrX	119619289	119619732	119619620	Y	ZBTB33,ZBTB33	LAMP2	LAMP2	K562	ChIA-PET	22265404	LAMP2	18069	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	122898767	122899176	122898998	Y	NA	THOC2	NA	NA	NA	NA	THOC2	33861	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chrX	123618525	123618532	123618529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG2	526463	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.121789969507
chrX	129065451	129065820	129065554	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	27354	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	129066097	129066492	129066260	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	28000	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	129118011	129118370	129118054	Y	NA	BCORL1	BCORL1,UTP14A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCORL1	4928	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.258874608347768
chrX	129245756	129246153	129246006	Y	NA	ELF4	NA	NA	NA	NA	ELF4	3065	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	129400519	129400680	129400638	Y	NA	ZNF280C	NA	NA	NA	NA	ZNF280C	193	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chrX	129982936	129983220	129983074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX2	51988	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	131159301	131159695	131159439	Y	RAP2C,MBNL3,MST4,MST4	MST4	NA	NA	NA	NA	MST4	4008	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	134485580	134485626	134485601	Y	ZNF449,CT45A6	ZNF75D,ZNF449	NA	NA	NA	NA	ZNF449	8859	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	139855409	139855570	139855490	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDOC1	413740	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	149369210	149369612	149369376	Y	MAMLD1	NA	MIR2114,LOC100272228	IMR90	Hi-C	24141950	MAMLD1	158077	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	149862815	149863170	149863006	Y	MTMR1	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	3380	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chrX	149863384	149863571	149863479	Y	NA	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	3949	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	149863588	149863865	149863755	Y	MTM1,MTMR1	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	4153	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	1.121789969507
chrX	151149745	151149882	151149808	Y	NA	GABRE	NA	NA	NA	NA	GABRE	8593	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.776623825043305
chrX	152127371	152127756	152127434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSDHL	129860	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	153166203	153166850	153166548	Y	ABCD1,PLXNB3,MECP2,ATP6AP1,RENBP	ARHGAP4,NAA10,RENBP	NA	NA	NA	NA	ARHGAP4	31602	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	153308986	153309188	153309114	Y	NA	IRAK1	IRAK1,MIR718	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRAK1	25555	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228
chrX	153596671	153598676	153598064	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	2330	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.517749216695537
chrY	10023047	10023682	10023281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGKP1	6725294	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.172583072231846
chrY	15207344	15207441	15207401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGKP1	1541535	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.431457680579614
chrY	15547664	15548123	15547956	Y	TMSB4Y	NA	NA	NA	NA	NA	AGKP1	1200853	CAGE	SUIT-2	hg19	FANTOM5	0.0862915361159228