chr1	1294735	1294982	1294877	Y	NA	CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	MXRA8	175	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	FAM213B	NA	NA	NA	NA	FAM213B	37959	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr1	8070132	8070398	8070299	Y	PER3,SLC45A1,ERRFI1	ERRFI1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	13970	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	8121436	8121582	8121497	Y	ERRFI1	ERRFI1	RERE,ERRFI1,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERRFI1	37068	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	8933581	8933925	8933847	Y	NA	ENO1	NA	NA	NA	NA	ENO1	3383	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	14765058	14765382	14765172	Y	NA	NA	KAZN	IMR90	Hi-C	24141950	KAZN	157818	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN	NA	NA	NA	NA	SPEN	3332	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	16696032	16696399	16696223	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	19083	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	NA	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	NECAP2	60166	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	NA	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	ATP13A2	95640	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr1	21428050	21428147	21428101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	73230	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr1	21588176	21588724	21588522	Y	ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	81273	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	23494015	23494642	23494449	Y	NA	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	7659	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	23888678	23889201	23888997	Y	ID3	ID3	NA	NA	NA	NA	ID3	4393	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	4.38785308832655
chr1	23903714	23904323	23904234	Y	ID3	ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	19429	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr1	24691833	24692082	24691893	Y	PNRC2,GRHL3	NIPAL3	NA	NA	NA	NA	NIPAL3	48202	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	25566195	25566411	25566257	Y	TMEM57	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9202	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	26120852	26121165	26120974	Y	NA	SEPN1	SEPN1	IMR90	Hi-C	24141950	SEPN1	3502	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HMGN2	30291	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	GPN2	22861	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	27321452	27321840	27321632	Y	TMEM222,TRNP1,FAM46B	TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	TRNP1	3254	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr1	27625914	27626081	27626007	Y	TRNP1,MAP3K6,TMEM222	TMEM222,RP11-4K3__A.5	NA	NA	NA	NA	TMEM222	20570	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,RP11-4K3__A.5,MAP3K6,GPR3	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr1	27848725	27849287	27848935	Y	WDTC1,SYTL1,FAM76A	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	34056	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	27907931	27908052	27907995	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	20890	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	27922522	27922947	27922946	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	5995	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	90728	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	32253647	32254040	32253861	Y	LCK	SPOCD1	NA	NA	NA	NA	SPOCD1	25612	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	32420307	32420572	32420414	Y	TMEM234,PEF1,PTP4A2,PTP4A2	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	11850	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	32732571	32732683	32732626	Y	LCK	EIF3I,TMEM234,HDAC1	NA	NA	NA	NA	HDAC1	23004	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	36489072	36489418	36489191	Y	NA	NA	COL8A2,TEKT2,ADPRHL2	IMR90	Hi-C	24141950	ADPRHL2	63058	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	39874208	39874673	39874342	Y	KIAA0754	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	57	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	40841336	40841595	40841379	Y	RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2,SMAP2	SMAP2	ZNF643	IMR90	Hi-C	24141950	SMAP2	32814	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	41826642	41826952	41826745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	120816	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	370805	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	3.29088981624491
chr1	44240162	44240471	44240217	Y	ATP6V0B	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	70667	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	45746932	45746947	45746939	Y	NA	ZSWIM5	ZSWIM5,UROD,HECTD3	IMR90	Hi-C	24141950	ZSWIM5	22934	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	50902653	50903020	50902837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	520915	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	54260217	54260562	54260390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPF1	93845	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	55753963	55754247	55754107	Y	USP24	NA	PPAP2B,USP24	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	75177	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	55909250	55909597	55909489	Y	NA	NA	PPAP2B,PRKAA2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-466L17.1	135113	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	57024882	57025247	57025166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	83727	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	57043287	57044160	57043621	Y	PRKAA2,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	64814	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	61369297	61369400	61369351	Y	NA	NFIA	NA	NA	NA	NA	NFIA	40366	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	61543611	61543877	61543752	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	214680	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	62119868	62120084	62119981	Y	NA	NA	TM2D1,INADL	IMR90	Hi-C	24141950	TM2D1	69011	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	62928310	62928608	62928459	Y	KANK4,USP1,USP1,ATG4C	USP1	NA	NA	NA	NA	USP1	28342	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	64254998	64255371	64255034	Y	ROR1	ROR1	NA	NA	NA	NA	ROR1	17305	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	65398951	65399446	65399123	Y	LEPROT,LEPROT,LEPR,JAK1	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	30741	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	65888047	65888596	65888066	Y	LEPR,LEPROT,LEPR,LEPROT	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	3777	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr1	66770897	66771283	66771085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGIP1	225783	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	67029191	67029437	67029359	Y	NA	SGIP1	NA	NA	NA	NA	SGIP1	32125	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	67029939	67030347	67030122	Y	PDE4B	SGIP1	NA	NA	NA	NA	SGIP1	32873	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr1	68257383	68257657	68257565	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	39493	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr1	70017370	70017628	70017440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC40	651675	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	70238650	70238794	70238722	Y	LRRC7	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC40	430509	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	70733839	70734223	70734057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF11	64474	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	72749220	72749791	72749447	Y	NEGR1	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	2803	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr1	81344955	81344988	81344971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	840390	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	168293	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	84971050	84971209	84971115	Y	MCOLN2,GNG5	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	802	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	85643319	85643587	85643547	Y	NA	NA	MIR4423	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf52	79768	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	85836666	85837017	85836916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	95893	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	87359712	87359873	87359793	Y	NA	SEP15,HS2ST1	NA	NA	NA	NA	SEP15	18234	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	94158601	94159338	94158654	Y	GCLM,DNTTIP2,BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCAR3	151368	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	3.29088981624491
chr1	95484238	95484316	95484279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALG14	52185	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	97594209	97594479	97594411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP2	408988	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	100858865	100858991	100858930	Y	SLC35A3,HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	50281	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	101213359	101213467	101213413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXTL2	146087	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	109933790	109934137	109934039	Y	TMEM167B,GNAI3,SORT1,SORT1	SORT1,PSMA5	NA	NA	NA	NA	SORT1	4436	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	110366477	110366702	110366587	Y	GSTM2,CSF1	NA	CSF1,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	GSTM3	84093	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	114477404	114477721	114477665	Y	RSBN1,HIPK1,HIPK1,HIPK1	DCLRE1B,AP4B1,HIPK1,OLFML3	NA	NA	NA	NA	HIPK1	7590	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	115732772	115733197	115732900	Y	NGF	NA	NGF	IMR90	Hi-C	24141950	NGF	145660	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	115873164	115873576	115873409	Y	NGF	NGF	NA	NA	NA	NA	NGF	5281	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	117493512	117493635	117493571	Y	NA	PTGFRN	CD101	IMR90	Hi-C	24141950	PTGFRN	42833	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	118197868	118198044	118197956	Y	NA	NA	FAM46C	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GDAP2	272209	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	121154332	121154613	121154395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST2H2BA	250304	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	121285922	121286152	121286038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST2H2BA	381894	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST2H2BA	581054	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	146694437	146694614	146694526	Y	NA	CHD1L	NA	NA	NA	NA	CHD1L	17677	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	TRIM46,KRTCAP2,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	155443130	155443303	155443253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASH1L	87295	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	156103413	156103690	156103594	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,LMNA	NA	NA	NA	NA	NA	LMNA	53049	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	156118146	156118395	156118328	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2	SLC25A44	NA	NA	NA	NA	SLC25A44	43485	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	156461502	156461819	156461755	Y	MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6801	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	156478154	156478558	156478328	Y	NA	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	9534	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	158147244	158147839	158147743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIRREL	186181	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	159859603	159860031	159859945	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2	C1orf204,SLAMF8	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC19	7922	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	3.29088981624491
chr1	162511455	162511984	162511719	Y	UAP1,UHMK1	UHMK1,UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	17339	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	162539981	162540420	162539994	Y	C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1	UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	10658	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	170677232	170677374	170677311	Y	PRRX1	PRRX1	NA	NA	NA	NA	PRRX1	47363	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	174220636	174220943	174220783	Y	RABGAP1L	NA	NA	NA	NA	NA	RABGAP1L	94088	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	176174471	176174980	176174673	Y	RFWD2	NA	NA	NA	NA	NA	RFWD2	0	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	178305054	178305336	178305195	Y	RASAL2	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	244190	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	180200315	180200683	180200497	Y	LHX4	NA	NA	NA	NA	NA	QSOX1	78346	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	183248987	183249454	183249212	Y	NCF2,NCF2,ARPC5,LAMC1	NA	NA	NA	NA	NA	SMG7	189897	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr1	185453251	185453699	185453469	Y	RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	168790	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	192776947	192777226	192777096	Y	TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS1,RGS2	RGS2	NA	NA	NA	NA	RGS2	778	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	200379777	200379959	200379899	Y	NA	ZNF281	NA	NA	NA	NA	ZNF281	2593	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	4.38785308832655
chr1	202324768	202324787	202324778	Y	NA	UBE2T,PPP1R12B	NA	NA	NA	NA	PPP1R12B	8941	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	111155	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr1	206859136	206859493	206859328	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	2847	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	207064076	207064429	207064213	Y	NA	IL24	NA	NA	NA	NA	IL24	4359	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	4.38785308832655
chr1	207509006	207509478	207509176	Y	CR1,CD46,CD55	CD55	NA	NA	NA	NA	CD55	16153	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	208021631	208021781	208021738	Y	CR1,CD46,PLXNA2,CD34	NA	CD34	IMR90	Hi-C	24141950	CD46	98229	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	208136912	208137268	208137107	Y	NA	NA	CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD46	213510	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	208377298	208378003	208377521	Y	PLXNA2	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	37662	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	209942657	209943400	209942924	Y	LAMB3,G0S2,TRAF3IP3	NA	NA	NA	NA	NA	DIEXF	55952	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	210056461	210057439	210056772	Y	NA	NA	DIEXF,SYT14	IMR90	Hi-C	24141950	DIEXF	57109	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	214620076	214620672	214620502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	103120	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr1	222830626	222830783	222830705	Y	TAF1A,MIA3	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	41198	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	224032316	224032686	224032418	Y	CAPN2,FBXO28,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	642	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	224691192	224691563	224691423	Y	NA	NA	CNIH3	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	68457	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	225934674	225934968	225934833	Y	ENAH	RP11-145A3.1,SRP9	NA	NA	NA	NA	SRP9	28563	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	226361229	226361382	226361305	Y	NA	ACBD3	NA	NA	NA	NA	ACBD3	11049	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	12.066595992898
chr1	234275805	234276023	234275906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.1	214864	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	234639993	234640263	234640100	Y	NA	TARBP1	LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TARBP1	27144	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	238817061	238817213	238817137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01139	169738	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	240306412	240306787	240306695	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	24668	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	244210956	244211944	244211575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	198575	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	246772310	246772610	246772421	Y	NA	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	44564	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	246862505	246862699	246862612	Y	SCCPDH	SCCPDH	NA	NA	NA	NA	SCCPDH	22650	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr1	248894360	248894532	248894495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP5L	224300	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	7.67874290457147
chr10	516106	516519	516355	Y	ZMYND11,ZMYND11,ZMYND11,ZMYND11,DIP2C	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2C	217164	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr10	3524547	3524820	3524727	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	300653	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	3848037	3849536	3848891	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	22564	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr10	3881297	3881662	3881434	Y	NA	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF6	55824	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	3893365	3894190	3893886	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	67892	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	3899382	3899877	3899626	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	73909	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	4283808	4284356	4284092	Y	NA	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	0	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr10	4289203	4289519	4289251	Y	NA	LINC00702	KLF6,LOC338588,LOC100216001	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	5099	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	10831008	10831167	10831105	Y	NA	SFTA1P	NA	NA	NA	NA	SFTA1P	3776	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	14647138	14647588	14647478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM107B	167308	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	15178441	15178844	15178745	Y	NA	ACBD7,RPP38,NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	29848	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	17034715	17035049	17034848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSU1	177188	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	20388455	20388625	20388609	Y	PLXDC2	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	285287	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	20389150	20389455	20389350	Y	PLXDC2	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	285982	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	22628998	22629520	22629110	Y	EBLN1	COMMD3,BMI1	NA	NA	NA	NA	BMI1	20858	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	22725331	22726270	22725901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	117191	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	23138140	23138676	23138512	Y	PIP4K2A,ARMC3	NA	ARMC3,PIP4K2A	IMR90	Hi-C	24141950	PIP4K2A	136656	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	24745312	24745555	24745448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	265042	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	25155940	25156492	25156271	Y	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	83041	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	26775885	26776759	26776046	Y	APBB1IP,ABI1	NA	NA	NA	NA	NA	PDSS1	207829	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	27032794	27033066	27033024	Y	NA	PDSS1	NA	NA	NA	NA	PDSS1	48206	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	30792755	30793221	30793026	Y	ZNF438,MAP3K8	NA	MAP3K8,LOC729668	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K8	71889	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	31364412	31364707	31364567	Y	NA	ZNF438	ZEB1,ARHGAP12,ZEB1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	45546	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	32438322	32438553	32438446	Y	NA	NA	KIF5B,ARHGAP12,EPC1	IMR90	Hi-C	24141950	KIF5B	94963	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	33562254	33562552	33562425	Y	ITGB1,ITGB1,NRP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	60638	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr10	45434472	45434743	45434608	Y	OR13A1,ALOX5	C10orf10	NA	NA	NA	NA	C10orf10	37515	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	50776206	50776746	50776485	Y	PGBD3,ERCC6,CHAT,SLC18A3	PGBD3,ERCC6	NA	NA	NA	NA	ERCC6	30622	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	60935384	60935742	60935425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC16A9	558018	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	63814731	63815034	63814907	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	155672	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	64024468	64024613	64024559	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	365409	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	65125268	65125651	65125502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD1C	98071	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	69854882	69855277	69855187	Y	HERC4	HERC4	ATOH7,HNRNPH3,PBLD,MYPN,HERC4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HERC4	21777	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	70849672	70851282	70850023	Y	DDX21,SUPV3L1,SRGN,VPS26A	SRGN,VPS26A	NA	NA	NA	NA	SRGN	3810	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	71840822	71841222	71841056	Y	NA	H2AFY2,AIFM2	NA	NA	NA	NA	H2AFY2	30270	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	73954988	73955333	73955161	Y	NA	ANAPC16,ASCC1	NA	NA	NA	NA	ANAPC16	18454	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	74056833	74058104	74057179	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	25155	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr10	78826666	78827029	78826848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	569324	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	78923836	78924098	78923933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	472255	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	78974815	78975138	78974939	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	421215	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	79291052	79291779	79291330	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	104574	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	79291885	79292096	79291976	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	104257	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	79346819	79347304	79347005	Y	KCNMA1	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	49049	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	80516479	80516892	80516667	Y	ZMIZ1	NA	LOC283050,RPS24,ZMIZ1,POLR3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZMIZ1	309900	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	80830818	80831199	80831077	Y	ZMIZ1	ZMIZ1	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	4026	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	81006414	81006827	81006670	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	98398	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	81946319	81946704	81946639	Y	ANXA11	ANXA11	NA	NA	NA	NA	ANXA11	16624	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	81959510	81960003	81959818	Y	TSPAN14,SH2D4B,ANXA11	ANXA11	NA	NA	NA	NA	ANXA11	3325	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	LDB3,BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	90711253	90711764	90711560	Y	LIPF,CH25H,ACTA2	FAS,ACTA2	NA	NA	NA	NA	FAS	36650	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	91010610	91010883	91010698	Y	NA	RP11-149I23.3,IFIT2	NA	NA	NA	NA	RP11-149I23.3	30639	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	91275289	91275484	91275456	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFIT5	102946	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	92921990	92922253	92922075	Y	HECTD2	NA	ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PCGF5	55655	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	92923893	92924265	92924064	Y	NA	NA	RPP30,NUDT9P1,PCGF5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PCGF5	53643	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	95035130	95035576	95035308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC6P1	67746	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	95196959	95197603	95197264	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42471	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	95197787	95197992	95197919	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42082	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	95228207	95228553	95228471	Y	MYOF,CEP55,CEP55	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	11521	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr10	101539519	101539906	101539726	Y	NA	COX15	NA	NA	NA	NA	COX15	49662	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	101765990	101766360	101766233	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	1316	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	104238092	104238376	104238328	Y	NA	CUEDC2,TMEM180,ACTR1A,SUFU	NA	NA	NA	NA	TMEM180	18943	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	106402075	106402201	106402120	Y	WDR96,SORCS3	NA	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	305913	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	112158460	112158738	112158533	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	95751	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr10	112207134	112207519	112207380	Y	NA	DUSP5	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	48077	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	4.38785308832655
chr10	112290201	112290297	112290249	Y	NA	DUSP5,SMC3	NA	NA	NA	NA	DUSP5	34605	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	114025637	114025952	114025790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPAM	52502	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	114823270	114823456	114823363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	115261	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	123914446	123914761	123914722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	167757	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	124254349	124254758	124254614	Y	NA	HTRA1	NA	NA	NA	NA	HTRA1	35308	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	5.48481636040819
chr10	125754916	125755682	125755196	Y	CHST15	NA	NA	NA	NA	NA	OAT	349863	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	127860130	127860500	127860453	Y	ADAM12	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM12	214524	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	127932254	127933051	127932680	Y	ADAM12	NA	FANK1	IMR90	Hi-C	24141950	ADAM12	141973	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	127941447	127942303	127942296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM12	132721	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	133742915	133743140	133742982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BNIP3	50295	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	133794080	133794414	133794353	Y	NA	BNIP3	PPP2R2D	IMR90	Hi-C	24141950	BNIP3	645	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	133879247	133879524	133879406	Y	NA	NA	BNIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BNIP3	85812	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr10	135092117	135092276	135092147	Y	ADAM8,TUBGCP2	ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ZNF511	27703	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,IFITM3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	IFITM3	30340	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	3742975	3743362	3743342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP2	73592	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	9587499	9588027	9587720	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1	ZNF143,LOC644656	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	WEE1	5201	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr11	10627707	10627864	10627812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF141	66930	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	12186762	12187077	12186920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	73219	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	12204570	12205016	12204699	Y	MICAL2	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	91027	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	12309352	12309734	12309588	Y	TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	PARVA	86998	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr11	12697923	12698543	12698251	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	3954	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	13238046	13238305	13238120	Y	NA	NA	ARNTL,BTBD10,LOC100506305	IMR90	Hi-C	24141950	ARNTL	57894	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr11	13327996	13328024	13328011	Y	NA	ARNTL	NA	NA	NA	NA	ARNTL	31797	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	18404883	18405218	18405078	Y	LDHA	LDHA,AC084117.3	NA	NA	NA	NA	LDHA	8717	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	19717488	19717496	19717492	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	347217	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	28063321	28063497	28063482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL15	64298	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	28855204	28855664	28855372	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	133042	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	29207165	29207501	29207312	Y	NA	NA	BDNF,BDNF-AS1,KIF18A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	485003	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr11	35103874	35105511	35104330	Y	CD44	NA	CD44,PDHX,APIP,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	52906	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	36173587	36173879	36173626	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD9	135120	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	37497688	37497965	37497690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf74	883637	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	39183372	39183493	39183434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124G5.1	2374491	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	13.1635592649797
chr11	48102794	48103200	48102989	Y	FNBP4,PTPRJ	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	102681	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	57336823	57337050	57336962	Y	SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,ZDHHC5,UBE2L6	TIMM10,UBE2L6,SERPING1	NA	NA	NA	NA	UBE2L6	3066	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	58340867	58341571	58341167	Y	OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN	LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF	NA	NA	NA	NA	LPXN	2122	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	62312037	62312397	62312245	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	566	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	63350815	63351029	63350927	Y	RTN3,PLA2G16,PLA2G16	RARRES3,PLA2G16	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	31326	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	64363562	64364093	64364079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SF1	180165	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	65076655	65076852	65076688	Y	EHD1,BATF2,FAU,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	3437	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	3.29088981624491
chr11	65220740	65221001	65220852	Y	NA	NEAT1,AP000769.1,MALAT1	NA	NA	NA	NA	AP000769.1	12	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	65261229	65261625	65261527	Y	CDC42EP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	1608	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr11	65323331	65323567	65323509	Y	FOSL1	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1	NA	NA	NA	NA	LTBP3	834	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	65683105	65683625	65683322	Y	NA	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	963	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr11	65782974	65783337	65783107	Y	FOSL1	BANF1,EIF1AD,CATSPER1,SF3B2	NA	NA	NA	NA	CATSPER1	8651	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	7.67874290457147
chr11	65849089	65849462	65849117	Y	KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,SIPA1,RELA,DKFZp761E198,CTSW,PACS1	SF3B2,PACS1	NA	NA	NA	NA	PACS1	13255	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	67139742	67140272	67140082	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	687	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	4.38785308832655
chr11	67326019	67326271	67326133	Y	CDK2AP2	GSTP1,NDUFV1	NA	NA	NA	NA	GSTP1	22795	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	69067534	69068152	69067999	Y	TPCN2	MYEOV	NA	NA	NA	NA	MYEOV	7929	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	72868553	72869130	72868609	Y	NA	FCHSD2	STARD10,FCHSD2,ATG16L2,ARAP1,MIR4692,P2RY2,P2RY6,ARHGEF17	IMR90	Hi-C	24141950	FCHSD2	17247	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	74465903	74466299	74466070	Y	POLD3,RNF169	RNF169	XRRA1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF169	7990	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr11	75781411	75781582	75781473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UVRAG	257199	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	75946917	75947052	75946991	Y	NA	NA	C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKRIR	142963	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	77958364	77958560	77958462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	60496	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	79148505	79148822	79148543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	864586	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	86454778	86455149	86454967	Y	PRSS23	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	44952	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	86664236	86664677	86664307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FZD4	0	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	88069705	88069944	88069773	Y	CTSC	CTSC	NA	NA	NA	NA	CTSC	750	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	89937153	89937335	89937244	Y	NA	CHORDC1	NA	NA	NA	NA	CHORDC1	17197	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	95557234	95557451	95557366	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	35661	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	95982466	95982894	95982863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	91450	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	100590591	100590889	100590693	Y	NA	ARHGAP42	NA	NA	NA	NA	ARHGAP42	34207	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr11	114030720	114031134	114030934	Y	ZBTB16,ZBTB16	NA	NA	NA	NA	NA	NNMT	95375	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	114033536	114034161	114033636	Y	ZBTB16,ZBTB16	NA	NA	NA	NA	NA	NNMT	92348	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	114037766	114038216	114037805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NNMT	88293	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	118490168	118490609	118490335	Y	PHLDB1	ARCN1,IFT46,PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	15013	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	124391253	124391530	124391392	Y	OR10G7,OR8G2,OR8G1,OR8D1,OR8D2,OR8B8,OR8B12,OR8A1	NA	NA	NA	NA	NA	TBRG1	99202	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	126328697	126328821	126328735	Y	NA	NA	ST3GAL4	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL4	105162	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	126337982	126338153	126338089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	114447	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	128367325	128367539	128367441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	87914	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	128445940	128446213	128446123	Y	FLI1,FLI1	ETS1	NA	NA	NA	NA	ETS1	9240	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	128586554	128587109	128586817	Y	FLI1,FLI1	FLI1	NA	NA	NA	NA	FLI1	32124	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr11	132502586	132503019	132502881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS26B	1589520	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	1407863	1408257	1407945	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNT5B	228800	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	2364427	2364812	2364581	Y	LRTM2	NA	NA	NA	NA	NA	DCP1B	252726	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	5198025	5198415	5198167	Y	NA	NA	NTF3,KCNA6,ANO2,VWF	IMR90	Hi-C	24141950	NTF3	340863	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	6403662	6404056	6403860	Y	PLEKHG6,PLEKHG6,PLEKHG6	TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF1A	45224	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	6854848	6855156	6854990	Y	TAPBPL,VAMP1,CHD4,ZNF384,PTPN6,CD4,CD4	COPS7A,PTMS,MLF2	NA	NA	NA	NA	PTMS	17526	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	6962211	6962407	6962304	Y	GAPDH,COPS7A,COPS7A,COPS7A,COPS7A,LEPREL2,USP5,USP5,TPI1,TPI1	LEPREL2,CDCA3,USP5,TPI1,LRRC23,SPSB2	NA	NA	NA	NA	USP5	2919	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	7592182	7592797	7592685	Y	PEX5,NANOG	RP11-157G21.2,CD163L1	NA	NA	NA	NA	RP11-157G21.2	1596	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	11950553	11950830	11950618	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	149765	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	20975224	20975562	20975349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE3A	455045	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	30570849	30571198	30571024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPO8	275722	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	3.29088981624491
chr12	30975226	30975478	30975347	Y	NA	LINC00941	NA	NA	NA	NA	LINC00941	29249	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	41350746	41350817	41350787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRK2	762200	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	46888080	46888552	46888358	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	112618	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	46917975	46918280	46918143	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	142513	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	13.1635592649797
chr12	46943558	46944140	46943794	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	168096	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	47482441	47482676	47482559	Y	NA	AMIGO2	AMIGO2	K562	ChIA-PET	22265404	AMIGO2	10707	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	50221084	50221421	50221231	Y	NCKAP5L	NCKAP5L,BCDIN3D	NA	NA	NA	NA	NCKAP5L	551	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	51180627	51180997	51180727	Y	SMAGP	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	25134	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	52557711	52558022	52557822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT86	83062	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	52580785	52580889	52580797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT86	60195	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	52674655	52675081	52674843	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	KRT86	NA	NA	NA	NA	KRT86	33571	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	54400493	54400742	54400596	Y	HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC6,HOXC4	HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC8	90	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	54413878	54414161	54414065	Y	HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5	HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	10476	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	54446030	54446105	54446068	Y	NA	HOXC8,HOXC5,HOXC4	FLJ12825	IMR90	Hi-C	24141950	HOXC4	369	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	54810296	54811355	54811225	Y	GPR84,ZNF385A,NCKAP1L,ITGA5	NA	ZNF385A	IMR90	Hi-C	24141950	ITGA5	0	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	56240862	56241188	56240984	Y	IL23A,ZC3H10,MMP19	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14,MMP19	MMP19	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MMP19	6112	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	59441566	59441855	59441676	Y	LRIG3,LRIG3	NA	LRIG3	IMR90	Hi-C	24141950	LRIG3	129263	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	63118880	63119001	63118911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	123414	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	63124974	63125146	63125033	Y	C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	129508	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	NA	NA	NA	NA	NA	HELB	65035	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	3.29088981624491
chr12	67828762	67829103	67828960	Y	NA	NA	DYRK2	MCF7	ChIA-PET	22265404	CAND1	167701	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	70940880	70941156	70941028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-611E13.2	305740	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	74257635	74257658	74257647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3B	671893	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	76811286	76811641	76811626	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBS10	71064	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	78551172	78551540	78551259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV3	328487	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	79670829	79671264	79670913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	411613	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	79848111	79848561	79848284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	234316	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	80032366	80032529	80032417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	50348	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	80974115	80974384	80974233	Y	MYF5	NA	NA	NA	NA	NA	ACSS3	355210	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	3.29088981624491
chr12	83422828	83423206	83423017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P25	119904	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	88968059	88968366	88968242	Y	NA	KITLG	NA	NA	NA	NA	KITLG	4262	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	3.29088981624491
chr12	90091098	90091469	90091453	Y	NA	ATP2B1	ATP2B1,LOC338758	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2B1	9608	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	92172749	92173207	92172879	Y	BTG1	NA	LOC256021	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BTG1	364466	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	92517978	92518398	92518142	Y	BTG1	BTG1	NA	NA	NA	NA	BTG1	19275	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	96613519	96613922	96613765	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	27359	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	96828064	96828263	96828182	Y	NEDD1,NEDD1,CDK17	CDK17,RN7SKP11	LTA4H,ELK3,CDK17	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP11	8800	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	104972349	104972459	104972427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	125276	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	105812004	105812354	105812179	Y	NA	NA	NUAK1,CKAP4,C12orf75,TCP11L2,POLR3B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-474B16.1	93209	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	108103294	108103307	108103300	Y	PRDM4	PWP1,PRDM4	NA	NA	NA	NA	PWP1	25785	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	108783050	108783376	108783111	Y	NA	NA	WSCD2,CMKLR1	IMR90	Hi-C	24141950	FICD	123586	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	109117977	109118365	109118310	Y	SELPLG,SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	5007	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	109227089	109227462	109227320	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	21904	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	109232143	109232504	109232328	Y	FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	16862	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	109249958	109250678	109250397	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	592	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	109900993	109901418	109901152	Y	KCTD10	UBE3B,KCTD10	NA	NA	NA	NA	UBE3B	11789	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	112018937	112019235	112019073	Y	NA	ATXN2	NA	NA	NA	NA	ATXN2	16245	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	112633664	112633952	112633817	Y	NA	NA	TRAFD1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAFD1	72359	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	112759768	112760224	112759930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	93931	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	112809864	112809925	112809895	Y	C12orf51	PTPN11,RPL6	NA	NA	NA	NA	PTPN11	44230	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	115354392	115354675	115354479	Y	NA	NA	TBX3	IMR90	Hi-C	24141950	TBX3	234423	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	115791856	115792156	115792052	Y	NA	NA	TBX3	IMR90	Hi-C	24141950	TBX3	671887	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	116701070	116701373	116701314	Y	MAP1LC3B2,MED13L	MED13L	NA	NA	NA	NA	MED13L	11770	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	116821073	116821333	116821156	Y	NA	NA	MED13L,LINC00173,MIR4472-2,MAP1LC3B2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MED13L	107930	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr12	120912483	120912692	120912652	Y	NA	COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1	NA	NA	NA	NA	DYNLL1	6830	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	121268399	121268878	121268839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	71296	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	121533843	121533975	121533917	Y	NA	NA	ACADS,UNC119B,P2RX4,POP5,CABP1,MLEC,SPPL3,C12orf43,OASL,P2RX7,CAMKK2	IMR90	Hi-C	24141950	C12orf43	81538	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	121714857	121715111	121714996	Y	OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2	CAMKK2	NA	NA	NA	NA	CAMKK2	19000	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	124926476	124926613	124926576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	123522	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	125259292	125259624	125259541	Y	UBC	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	105590	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	125424077	125424667	125424516	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	24163	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr12	132904307	132904701	132904477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBRSL1	159436	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr13	29460778	29461116	29460949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC46A3	169671	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr13	31438859	31439207	31438915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USPL1	249029	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr13	32699240	32700118	32699476	Y	N4BP2L2,N4BP2L2,N4BP2L1,BRCA2	NA	NA	NA	NA	NA	BRCA2	187493	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr13	33822427	33822802	33822649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	99965	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr13	42276592	42276928	42276845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	393251	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr13	44811516	44811943	44811701	Y	NA	NA	TSC22D1,SERP2,NUFIP1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TSC22D1	337340	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr13	47688288	47688343	47688330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESD	318921	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	3.29088981624491
chr13	50897882	50898235	50898046	Y	NA	RPL34P26	DLEU2,DLEU1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34P26	35664	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	5.48481636040819
chr13	55208577	55208909	55208656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	1983733	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr13	90568619	90568996	90568823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPC6	3308099	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr13	98599587	98599881	98599659	Y	NA	IPO5	NA	NA	NA	NA	IPO5	4031	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr13	99302784	99302934	99302858	Y	SLC15A1	NA	FARP1,STK24,SLC15A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STK24	74590	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr13	100630794	100630989	100630800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCCA	108280	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr13	102437700	102438037	102437893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGBL1	334734	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr13	109921804	109922211	109922051	Y	NA	NA	IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	514704	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr13	110353585	110353767	110353676	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	83148	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr13	110902548	110902879	110902758	Y	COL4A2,COL4A1	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A2	53280	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr13	110950675	110951614	110951198	Y	NA	COL4A2,COL4A1	NA	NA	NA	NA	COL4A2	4545	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr13	113607211	113607493	113607342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL4A	253059	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr13	114600157	114600520	114600358	Y	GAS6	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	35111	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr13	114809032	114809271	114809129	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	86815	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr13	114991757	114991940	114991861	Y	RASA3	CDC16	FAM70B,FLJ44054,RASA3,CDC16,GAS6,FLJ41484,LOC100506394	IMR90	Hi-C	24141950	CDC16	6422	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	22954399	22954440	22954420	Y	NA	NA	DAD1	IMR90	Hi-C	24141950	DAD1	101735	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	23320228	23321035	23320800	Y	RBM23,C14orf119,ACIN1,SLC7A7,SLC7A7	MRPL52,MMP14,LRP10	NA	NA	NA	NA	MMP14	16462	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	26693643	26693690	26693667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP6	1176140	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	31455672	31455729	31455709	Y	NA	STRN3	NA	NA	NA	NA	STRN3	37878	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	35628271	35628433	35628369	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	38516	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	41099089	41099243	41099183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	1199385	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	5.48481636040819
chr14	49375724	49376075	49375898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SL1	675222	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	50926261	50926342	50926322	Y	MAP4K5,ATL1,ATL1,CDKL1	CDKL1	NA	NA	NA	NA	CDKL1	45082	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	50988191	50988449	50988343	Y	NA	ATL1,MAP4K5	NA	NA	NA	NA	ATL1	8778	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	51066593	51066625	51066609	Y	TRIM9,CDKL1,ATL1	MAP4K5	SAV1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP4K5	40749	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	51074312	51074388	51074350	Y	TRIM9,ATL1	MAP4K5	SAV1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP4K5	48468	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	51992800	51993196	51992853	Y	NA	FRMD6	NA	NA	NA	NA	FRMD6	38982	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	52733578	52733826	52733624	Y	NA	PTGER2	NA	NA	NA	NA	PTGER2	45197	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	53575786	53575939	53575850	Y	DDHD1	DDHD1	NA	NA	NA	NA	DDHD1	42061	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	54678344	54678458	54678399	Y	NA	NA	DDHD1	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN3	183109	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	55152891	55153126	55153104	Y	SAMD4A	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	121076	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr14	56733293	56733420	56733313	Y	PELI2	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00520	471887	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	61938268	61939375	61939158	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	220856	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	62018127	62018466	62018303	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	141765	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	62040859	62041355	62041035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	118876	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	65746592	65747003	65746788	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90	Hi-C	24141950	FUT8	128307	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	68933312	68933746	68933512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	327444	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	70387825	70388214	70387982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMOC1	68977	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr14	71797093	71797681	71797289	Y	PCNX	SIPA1L1,RP1-261D10.2	SIPA1L1,LOC145474	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-261D10.2	10562	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	73373247	73373392	73373372	Y	NA	DPF3,DCAF4	RGS6,DPF3,DCAF4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DPF3	14438	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	75015716	75015962	75015839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPC2	56836	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	75777354	75777713	75777592	Y	NA	FOS	NA	NA	NA	NA	FOS	33877	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	87930298	87930498	87930398	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALC	527511	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	91127365	91127751	91127558	Y	RPS6KA5,CALM1	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7B	153072	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	91791698	91791809	91791759	Y	RPS6KA5,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	SMEK1	183089	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	91926776	91927002	91926960	Y	NA	SMEK1	NA	NA	NA	NA	SMEK1	47896	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	95680303	95680655	95680479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DICER1	57956	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	96520330	96520568	96520450	Y	NA	C14orf132	NA	NA	NA	NA	C14orf132	16669	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	97647218	97647514	97647331	Y	NA	NA	C14orf177	IMR90	Hi-C	24141950	VRK1	385577	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	98102690	98102710	98102700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK1	841049	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	101151381	101151698	101151540	Y	RTL1,DLK1	NA	NA	NA	NA	NA	WDR25	310626	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	101159258	101159870	101159708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR25	318503	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	105439556	105439771	105439692	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2923	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr14	105491233	105491512	105491453	Y	NA	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	5748	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr14	107254436	107254688	107254673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00221	317991	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr15	26131844	26132173	26132009	Y	NA	ATP10A	ATP10A,LOC100128714	IMR90	Hi-C	24141950	ATP10A	23527	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr15	31680805	31681075	31680940	Y	MTMR10	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	63747	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr15	33418806	33419006	33418854	Y	NA	NA	FMN1,SCG5,ARHGAP11A,GREM1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-758N13.1	409598	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	3.29088981624491
chr15	39563210	39563560	39563357	Y	THBS1	NA	NA	NA	NA	NA	THBS1	307720	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr15	40164744	40164978	40164948	Y	NA	GPR176	NA	NA	NA	NA	GPR176	46115	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr15	41456018	41456111	41456065	Y	NA	INO80	NA	NA	NA	NA	INO80	49466	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr15	42213328	42213713	42213448	Y	NA	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	49063	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr15	44965907	44966042	44965975	Y	PATL2	SPG11,B2M	NA	NA	NA	NA	SPG11	12031	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr15	52395777	52396019	52395882	Y	DMXL2,TMOD3,MAPK6	CTD-2184D3.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2184D3.1	10285	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr15	58761932	58762090	58762054	Y	NA	RP11-355N15.1	ADAM10	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-355N15.1	26844	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr15	62207321	62207567	62207441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	143105	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr15	64601637	64601745	64601727	Y	NA	CSNK1G1	NA	NA	NA	NA	CSNK1G1	44697	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr15	66993287	66993569	66993487	Y	MAP2K1,SMAD6	SMAD6	NA	NA	NA	NA	SMAD6	721	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr15	67359902	67360303	67360058	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	5801	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	3.29088981624491
chr15	67442347	67443164	67443030	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	88246	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr15	71344757	71344812	71344802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	161633	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr15	71385768	71386181	71385996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	202644	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr15	74217117	74217259	74217188	Y	LOXL1	LOXL1	NA	NA	NA	NA	LOXL1	787	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr15	74221354	74221537	74221415	Y	NA	LOXL1	NA	NA	NA	NA	LOXL1	5024	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr15	74274053	74274479	74274311	Y	PML	STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	STOML1	10484	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr15	74332904	74333192	74333031	Y	NA	STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	PML	47890	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr15	74908840	74909023	74908946	Y	NA	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	19999	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr15	75338663	75338960	75338803	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,SCAMP2,C15orf39	PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	24767	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr15	76543637	76543996	76543963	Y	NA	NA	C15orf27	IMR90	Hi-C	24141950	ETFA	57817	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr15	83847712	83847957	83847821	Y	NA	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	26813	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr15	90419728	90419914	90419806	Y	ZNF710,SEMA4B,ANPEP,AP3S2	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	15660	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr15	93542371	93542660	93542397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	117845	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr15	99193577	99194531	99194069	Y	IGF1R	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	3377	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr15	99270923	99271213	99270975	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	80723	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr15	100216338	100216615	100216373	Y	MEF2A,MEF2A	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD4	55151	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr15	102202329	102202647	102202484	Y	OR4F15	TM2D3	NA	NA	NA	NA	TM2D3	11735	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr16	1132307	1132794	1132674	Y	RAB40C,RAB40C,WDR90,CACNA1H,SSTR5	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2I	220754	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	IL32,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	3996199	3996445	3996330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREBBP	67472	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	6537672	6538042	6537854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAGPA	1455530	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	8159340	8159643	8159579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	553897	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	3.29088981624491
chr16	12071486	12071797	12071761	Y	NA	RP11-166B2.1,SNX29	NA	NA	NA	NA	SNX29	2892	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	12224376	12224580	12224411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX29	155782	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	14424623	14424858	14424825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	261445	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	17270464	17270719	17270563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	292019	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	17543225	17543492	17543435	Y	XYLT1	XYLT1	NA	NA	NA	NA	XYLT1	19246	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	22046502	22046742	22046619	Y	NA	C16orf52	NA	NA	NA	NA	C16orf52	29543	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	23431856	23432257	23432204	Y	USP31,COG7	COG7	SCNN1B	IMR90	Hi-C	24141950	COG7	30244	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	27419263	27419728	27419506	Y	JMJD5,JMJD5,IL21R,IL21R	IL21R	NA	NA	NA	NA	IL21R	7780	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	27546889	27546978	27546937	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	12256	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	29836551	29836761	29836656	Y	NA	KIF22,MAZ,MVP,CDIPT	NA	NA	NA	NA	MVP	6836	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	29954900	29955228	29955066	Y	NA	SEZ6L2,KCTD13,TMEM219,TAOK2,INO80E	MVP,KCTD13,ZG16,PRRT2,MAZ,KIF22,C16orf54,LOC440356,ASPHD1,SEZ6L2,CDIPT,TMEM219,TAOK2,HIRIP3,INO80E,ALDOA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM219	4694	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRR14	14153	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	31887367	31887596	31887374	Y	NA	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	4288	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	46839113	46839505	46839309	Y	NA	C16orf87	NA	NA	NA	NA	C16orf87	23818	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	55521029	55521357	55521152	Y	MMP2	LPCAT2	NA	NA	NA	NA	LPCAT2	19553	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	69751128	69751528	69751345	Y	PDF,TERF2,NQO1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NQO1	7326	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr16	73090044	73090191	73090091	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	1406	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	73353192	73353326	73353259	Y	NA	NA	HPR,HP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	261595	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	75278988	75279894	75279594	Y	CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	20057	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	76269107	76269317	76269211	Y	NA	RPL18P13	NA	NA	NA	NA	RPL18P13	1586	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	77708958	77709175	77709081	Y	NA	NA	CLEC3A,WWOX,VAT1L	IMR90	Hi-C	24141950	WWOX	422135	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	79613452	79613848	79613650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYL2	1222378	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	79802428	79802570	79802497	Y	NA	NA	WWOX	IMR90	Hi-C	24141950	CDYL2	1033656	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	80769912	80770006	80769968	Y	DYNLRB2,C16orf46	NA	NA	NA	NA	NA	CDYL2	66220	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	85978806	85979044	85978907	Y	NA	NA	COX4I1,IRF8,COX4NB	IMR90	Hi-C	24141950	COX4I1	148567	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr16	86421149	86421325	86421222	Y	FOXF1,FOXC2	NA	LOC400550,LOC732275,LOC146513,FOXF1	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	165516	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr16	86985410	86985767	86985608	Y	FOXC2,FOXL1	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC2	386553	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	24.133191985796
chr17	1014015	1014933	1014151	Y	PITPNA,CRK,ABR	NA	NA	NA	NA	NA	ABR	115382	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	1390195	1390341	1390268	Y	MYO1C,MYO1C,MYO1C	CRK,MYO1C,INPP5K	NA	NA	NA	NA	MYO1C	3765	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr17	1970904	1971232	1971070	Y	HIC1	RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	15456	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	1974774	1975359	1974921	Y	SCARF1,HIC1,HIC1	RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	19326	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	2300026	2300553	2300288	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	1859	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	6925152	6925653	6925481	Y	PLSCR3,C17orf49,BCL6B	RNASEK,C17orf49,SLC16A11	NA	NA	NA	NA	C17orf49	9338	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	7381310	7382154	7381844	Y	KCTD11,TNK1,SOX15,KDM6B,ZBTB4,ZBTB4	TMEM102,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	ZBTB4	3428	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	18450	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	PER1	27708	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	9155924	9156306	9156115	Y	PIK3R5	NA	NA	NA	NA	NA	STX8	321602	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	14254817	14255197	14255011	Y	HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	52417	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	16355497	16355695	16355534	Y	TTC19,PIGL	TRPV2	NA	NA	NA	NA	TRPV2	38641	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	16375722	16375971	16375775	Y	TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV	NA	NA	NA	NA	NA	TRPV2	58866	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	17302391	17302480	17302436	Y	NA	RPL13P12	MED9,SMCR9,SREBF1,TOM1L2,PEMT,RAI1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL13P12	17065	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	19834604	19834673	19834639	Y	NA	AKAP10	NA	NA	NA	NA	AKAP10	44983	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	25620233	25620423	25620280	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	1131	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	27100910	27101180	27101019	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	31908	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	28009923	28010244	28010118	Y	SSH2	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	61998	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	30726822	30727202	30727012	Y	NA	PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	42077	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	33179831	33179955	33179851	Y	NA	NA	SLC35G3	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF830	106594	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	36585417	36585600	36585486	Y	ARHGAP23	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	2755	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	38085522	38085789	38085697	Y	ERBB2,IKZF3,ORMDL3	ORMDL3,PSMD3	NA	NA	NA	NA	ORMDL3	3668	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	38264417	38264842	38264667	Y	WIPF2,RARA,RARA,NR1D1	MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	9439	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	38440755	38440955	38440855	Y	NA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	CDC6	930	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	38470934	38471197	38471090	Y	IKZF3,WIPF2,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	7490	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	38483867	38484266	38484015	Y	NA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	20423	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	38648531	38648872	38648707	Y	KRT10,MSL1,TNS4	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	50829	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	38705273	38706158	38705806	Y	GJD3,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCE1	96602	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	38707495	38707811	38707586	Y	KRTAP1-5,GJD3,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCE1	94949	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr17	38708057	38709216	38708396	Y	KRTAP1-5,GJD3,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCE1	93544	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	6.58177963248983
chr17	39656265	39656585	39656468	Y	KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP2-4,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9,KRT37	NA	NA	NA	NA	NA	EIF1	186552	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	40539110	40539537	40539349	Y	NA	STAT3,PTRF	NA	NA	NA	NA	STAT3	524	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	41827198	41827473	41827372	Y	NA	DUSP3	NA	NA	NA	NA	DUSP3	26883	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	42634020	42634172	42634095	Y	TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2	FZD2	NA	NA	NA	NA	FZD2	1095	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPS7P11	453062	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	46642274	46642589	46642562	Y	NA	HOXB4,HOXB6	NA	NA	NA	NA	HOXB4	12884	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF652	167326	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr17	47647130	47647802	47647650	Y	NA	NXPH3	ZNF652,NGFR,SPOP,SLC35B1,NXPH3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NXPH3	3418	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	48139711	48140314	48140012	Y	XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3	ITGA3,PDK2	NA	NA	NA	NA	ITGA3	8379	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	48255388	48256117	48255676	Y	NA	PPP1R9B,COL1A1	NA	NA	NA	NA	COL1A1	20876	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	48287695	48288075	48287880	Y	XYLT2,LRRC59,COL1A1	COL1A1	PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A1	10702	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	48348027	48348139	48348077	Y	COL1A1,TMEM92	NA	NA	NA	NA	NA	COL1A1	71034	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	48367346	48367814	48367643	Y	PPP1R9B	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT2	53639	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	49324611	49324828	49324669	Y	MBTD1	MBTD1,UTP18	NA	NA	NA	NA	MBTD1	10696	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	56705180	56705300	56705276	Y	NA	RNU1-60P,RNU1-85P	SEPT4,MTMR4	K562	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	29366	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	56706902	56707296	56707107	Y	MKS1,MKS1,RAD51C	RNU1-60P,RNU1-85P	SEPT4,MTMR4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	27370	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	57203741	57203833	57203787	Y	NA	TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	TRIM37	21459	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	57882537	57882682	57882623	Y	YPEL2,VMP1,RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	33945	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	60868640	60868941	60868827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	165878	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	60897286	60897580	60897414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	194524	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	4.38785308832655
chr17	62491373	62491767	62491605	Y	NA	MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	MIR3064	3190	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	62744260	62744559	62744528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMURF2	88074	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP112	545803	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	64380133	64380302	64380218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	83379	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	64463185	64463416	64463350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	166431	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	64690651	64690854	64690753	Y	PRKCA,CACNG4	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	393897	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	69493983	69494025	69494004	Y	NA	NA	SOX9,LOC100499467	IMR90	Hi-C	24141950	LOC124685	121094	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	69617489	69617539	69617508	Y	NA	LOC124685	LOC100499467	IMR90	Hi-C	24141950	LOC124685	2370	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	70706379	70706638	70706553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	380213	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	72984795	72985307	72985001	Y	RAB37,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	NA	NA	NA	NA	CDR2L	3068	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr17	73167917	73168048	73167983	Y	NA	NT5C,HN1,SUMO2,NUP85	HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HN1	5541	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	74444372	74444742	74444506	Y	NA	UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	2546	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	74664017	74664029	74664023	Y	NA	MXRA7	NA	NA	NA	NA	MXRA7	41069	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	75120383	75120864	75120582	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	39585	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	12.066595992898
chr17	75281811	75282557	75281917	Y	SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	7160	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	75282703	75283463	75282995	Y	SEPT9,SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	8052	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	75319028	75319523	75319372	Y	SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	44377	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	4.38785308832655
chr17	75872051	75872295	75872261	Y	TMC6,SOCS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNRC6C	125954	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	TNRC6C	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNRC6C	43453	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	5.48481636040819
chr17	78121490	78121818	78121740	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	EIF4A3	2508	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	79360408	79361324	79361141	Y	ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	93061	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	79362745	79363068	79363048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	95398	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	79370754	79371569	79371407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	103407	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr17	80216124	80216440	80216314	Y	NA	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	13167	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	80255299	80255755	80255478	Y	SIRT7,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7	CSNK1D,SECTM1	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	25692	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr17	80494129	80494268	80494139	Y	NA	FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	18540	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr18	3623872	3624258	3624140	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214266	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr18	3624841	3625119	3625035	Y	MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215235	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr18	9129786	9129925	9129855	Y	PPP4R1,ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	ANKRD12	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD12	4301	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr18	9219810	9220134	9219877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD12	85584	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr18	12330841	12331244	12331045	Y	NA	TUBB6,AFG3L2	NA	NA	NA	NA	TUBB6	25173	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr18	12679329	12679437	12679359	Y	NA	SPIRE1,PSMG2	NA	NA	NA	NA	PSMG2	22592	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr18	19279600	19279639	19279620	Y	NA	ABHD3	NA	NA	NA	NA	ABHD3	3127	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr18	21417655	21417852	21417722	Y	NPC1,LAMA3	NA	NA	NA	NA	NA	TTC39C	152885	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr18	26744101	26744374	26744185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	988691	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr18	32289089	32289403	32289194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNA	217835	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr18	46253142	46253362	46253168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	189725	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr18	46375185	46375303	46375244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	311768	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr18	46455103	46455621	46455353	Y	SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	391686	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr18	46478230	46479206	46479122	Y	SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	414813	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr18	56161690	56161866	56161857	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	ALPK2	132323	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr18	56206749	56207237	56207038	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	ALPK2	86952	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr18	60944557	60944827	60944760	Y	NA	BCL2	NA	NA	NA	NA	BCL2	40534	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr18	67285857	67286143	67286048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTTN	585038	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	3.29088981624491
chr18	67711885	67712217	67712098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTTN	158964	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr18	67957012	67957306	67957264	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	2875	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr18	72424911	72425171	72425041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF407	161805	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr18	74755425	74755811	74755618	Y	MBP,MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	222862	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr18	76734377	76734736	76734420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	92549	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr18	77153646	77154504	77153944	Y	ATP9B,NFATC1,NFATC1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	0	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	778993	779222	779048	Y	GPX4,BSG,CNN2	PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	15853	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	782330	783005	782707	Y	NA	PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	12070	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	1172839	1173266	1172915	Y	CFD,ATP5D,GPX4,GPX4	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	557	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	1445282	1445452	1445336	Y	C19orf26,EFNA2,MUM1,APC2	GAMT,DAZAP1,RPS15,C19orf25,PCSK4	NA	NA	NA	NA	RPS15	8924	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	1855247	1855761	1855485	Y	SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	5806	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	2330710	2331138	2330903	Y	NA	SPPL2B,LSM7	NA	NA	NA	NA	LSM7	4091	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	4456385	4456784	4456737	Y	UBXN6,UBXN6	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	566	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	3.29088981624491
chr19	4584891	4584944	4584918	Y	NA	NA	EBI3,CCDC94,ANKRD24,TNFAIP8L1,C19orf10	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP8L1	52586	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	5898990	5899031	5899011	Y	FUT5	FUT5,NDUFA11,VMAC	NA	NA	NA	NA	FUT5	2767	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	6071128	6071397	6071200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	94975	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	6271729	6272422	6272353	Y	NDUFA11,MLLT1	MLLT1	NA	NA	NA	NA	MLLT1	5537	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	8488784	8489136	8488939	Y	PRAM1,MYO1F	RAB11B,MARCH2,HNRNPM	NA	NA	NA	NA	MARCH2	12630	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	8674150	8674979	8674636	Y	ADAMTS10	MYO1F,ADAMTS10	NA	NA	NA	NA	ADAMTS10	530	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	5.48481636040819
chr19	10056236	10056512	10056406	Y	ZNF846,COL5A3,OLFM2	NA	NA	NA	NA	NA	COL5A3	62635	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	12899457	12901460	12900777	Y	NA	PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	0	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr19	14089228	14089566	14089336	Y	CCDC130,PKN1,CD97,RFX1	DCAF15,PODNL1,RFX1	NA	NA	NA	NA	RFX1	26285	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	15334094	15334476	15334286	Y	SLC1A6,WIZ	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	24302	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	17218539	17219391	17218963	Y	MED26,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	33948	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr19	18131070	18131394	18131314	Y	FCHO1,PDE4C,ARRDC2,MAST3	NA	NA	NA	NA	NA	MAST3	75209	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	18382556	18382948	18382783	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4	NA	NA	NA	NA	KIAA1683	371	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr19	18415031	18416060	18415513	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	16024	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	22787306	22787691	22787499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P34	237552	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	23732304	23732710	23732386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF675	135312	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr19	29011348	29011742	29011545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	690706	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	30447917	30448294	30448014	Y	NA	URI1	NA	NA	NA	NA	URI1	35366	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	32863977	32864267	32864121	Y	NA	ZNF507,DPY19L3	NA	NA	NA	NA	ZNF507	29477	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	33841444	33841736	33841590	Y	NA	CEBPG	CEBPA,CEBPG,WDR88,LRP3,SLC7A10,LOC80054,PEPD,CHST8	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPG	20500	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	35809679	35810380	35810036	Y	GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,IGFLR1,FFAR3	NA	NA	NA	NA	NA	USF2	51798	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	37156610	37156902	37156838	Y	ZNF565,ZNF565,ZFP14,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF790,ZNF420,ZNF345,ZNF345,ZNF529,ZNF382,ZNF567,ZNF461	ZNF461,AC074138.3,ZNF567	NA	NA	NA	NA	ZNF461	855	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	39184148	39184440	39184342	Y	C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	47859	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	41831643	41832527	41831971	Y	CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA	NA	NA	NA	NA	CCDC97	17549	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	42239278	42239383	42239331	Y	CEACAM7	NA	NA	NA	NA	NA	RPS19	122605	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	42379575	42379860	42379642	Y	ZNF574,DEDD2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1	RPS19,ARHGEF1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	5368	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	42444727	42445027	42444981	Y	NA	RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	16515	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	ERF	15495	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	45248499	45249479	45248793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL3	0	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,FOSB,ERCC1,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr19	46803943	46804533	46804229	Y	IRF2BP1,MYPOP,HIF3A,HIF3A,HIF3A,CCDC8	PPP5C	NA	NA	NA	NA	PPP5C	43718	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	48016024	48016351	48016088	Y	SULT2A1,CCDC9,GPR77,DHX34,NAPA	KPTN,NAPA	NA	NA	NA	NA	NAPA	146	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	51287900	51288107	51288100	Y	NA	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	18079	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	52052884	52053120	52052983	Y	NA	ZNF175	ZNF175,SIGLEC10,SIGLEC8,SIGLEC6,SIGLEC5	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF175	19431	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	52229316	52229816	52229631	Y	HAS1	NA	NA	NA	NA	NA	FPR1	75547	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr19	53426305	53426488	53426354	Y	ZNF765,ZNF468,ZNF816	ZNF320	NA	NA	NA	NA	ZNF320	27359	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	53592651	53593387	53593361	Y	NA	ZNF160,ZNF415	NA	NA	NA	NA	ZNF160	11302	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	54048513	54048640	54048574	Y	NA	ZNF331	NA	NA	NA	NA	ZNF331	26278	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	55627475	55627790	55627718	Y	LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C	RDH13,PPP1R12C	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	548	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr2	1735614	1736022	1735851	Y	PXDN	PXDN	NA	NA	NA	NA	PXDN	10602	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	2027188	2027378	2027302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PXDN	280564	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	9427801	9428115	9428020	Y	YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	82907	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	9688603	9688902	9688848	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	5019	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	13447993	13448374	13448173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB2	592978	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	17554496	17554583	17554510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSNL1	163810	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	19340591	19340734	19340664	Y	OSR1	NA	OSR1,MIR4757	IMR90	Hi-C	24141950	OSR1	215680	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	19986322	19986559	19986384	Y	TTC32	NA	NA	NA	NA	NA	TTC32	113188	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	20252703	20252899	20252848	Y	NA	MATN3,LAPTM4A,RP11-644K8.1	NA	NA	NA	NA	RP11-644K8.1	2808	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	20629438	20629618	20629512	Y	HS1BP3	RHOB	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RHOB	15217	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	27958320	27958698	27958604	Y	NA	MRPL33	BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL33	33886	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	29075660	29075992	29075826	Y	TRMT61B	TRMT61B,WDR43	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	15175	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr2	33295461	33295712	33295665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTBP1	125422	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	37103475	37103824	37103655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	87791	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	37884022	37884434	37884213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	79177	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	37885188	37885619	37885408	Y	QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	77992	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	38023099	38023324	38023154	Y	NA	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	59488	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	38264530	38264933	38264752	Y	CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	70111	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	38398414	38398595	38398505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	63370	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	39917142	39917449	39917282	Y	TMEM178,TMEM178	NA	NA	NA	NA	NA	THUMPD2	86958	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	40260196	40260378	40260267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THUMPD2	255789	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	40676536	40676854	40676845	Y	NA	NA	LOC100128590	IMR90	Hi-C	24141950	SLC8A1	159339	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	42245014	42245155	42245121	Y	PKDCC	PKDCC	LOC388942,C2orf91	IMR90	Hi-C	24141950	PKDCC	28005	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	43762812	43762910	43762862	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726	MCF7	ChIA-PET	22265404	THADA	58275	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	46542843	46542999	46542890	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	24037	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	46825586	46825695	46825639	Y	NA	CRIPT,PIGF	NA	NA	NA	NA	CRIPT	15860	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr2	47213827	47213985	47213928	Y	NA	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	46833	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	48737563	48737807	48737675	Y	STON1-GTF2A1L,STON1	STON1	NA	NA	NA	NA	STON1	16715	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	58334895	58335527	58335141	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	130980	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr2	58336722	58337105	58336916	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	129402	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	61140048	61140151	61140100	Y	REL	REL	NA	NA	NA	NA	REL	33392	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	64352533	64352773	64352693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS54	108327	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	65085914	65086269	65086077	Y	AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	109775	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr2	73233755	73233809	73233782	Y	NA	NA	EMX1	IMR90	Hi-C	24141950	SFXN5	66938	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	74939422	74939597	74939510	Y	NA	NA	HK2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEMA4F	60067	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	78464924	78465229	78465077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	451416	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	81709176	81709459	81709306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG1	2975710	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	85972206	85972706	85972281	Y	NA	ATOH8	NA	NA	NA	NA	ATOH8	3761	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	85982713	85983043	85983025	Y	NA	ATOH8	NA	NA	NA	NA	ATOH8	6246	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr2	86299445	86299644	86299569	Y	NA	POLR1A,PTCD3	NA	NA	NA	NA	POLR1A	31634	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	106026144	106026496	106026333	Y	GPR45,FHL2	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	26474	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	106484597	106484940	106484748	Y	UXS1	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	125243	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	109859358	109859584	109859496	Y	SH3RF3	NA	NA	NA	NA	NA	SH3RF3	115554	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	114469366	114469830	114469722	Y	SLC35F5	SLC35F5	NA	NA	NA	NA	SLC35F5	42570	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	121624920	121625080	121625001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	133721	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	131148815	131149203	131148908	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C,CCDC115,PTPN18	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37235	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	140168949	140169074	140169000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DARS	3427279	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	7.67874290457147
chr2	145795788	145796304	145796070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEX41	372254	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	151383394	151383753	151383509	Y	RND3	RND3	RND3,RBM43	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RND3	9772	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	159996824	159997456	159997123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	143854	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	160350650	160351006	160350912	Y	MARCH7,CD302,BAZ2B	AC009506.2	NA	NA	NA	NA	AC009506.2	32883	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	162197345	162197490	162197464	Y	NA	PSMD14,AC009299.5	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	1508	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	164991272	164991524	164991400	Y	FIGN	NA	NA	NA	NA	NA	FIGN	400750	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	165777057	165777208	165777083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COBLL1	78868	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	166161416	166161745	166161474	Y	SCN2A,SCN2A	NA	NA	NA	NA	NA	SCN3A	102839	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	174963658	174963852	174963755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP3	135228	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	175248509	175248787	175248661	Y	SP3,SP3	CIR1,SCRN3	NA	NA	NA	NA	CIR1	9656	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	180625658	180625928	180625899	Y	ZNF385B	NA	NA	NA	NA	NA	CWC22	243912	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	182170258	182170790	182170550	Y	ITGA4	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA4	149139	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	182437511	182437525	182437518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA4	117582	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	188464486	188464724	188464607	Y	NA	TFPI	GULP1	IMR90	Hi-C	24141950	TFPI	35999	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr2	190043432	190043827	190043588	Y	DIRC1,COL3A1,COL5A2	COL5A2	NA	NA	NA	NA	COL5A2	827	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	191406346	191406617	191406448	Y	NA	TMEM194B	INPP1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM194B	8898	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	191709136	191709198	191709167	Y	STAT4,NAB1,STAT1,GLS	GLS	GLS,STAT1,NAB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLS	34355	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	192112527	192112680	192112632	Y	NA	MYO1B	NA	NA	NA	NA	MYO1B	4616	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	3.29088981624491
chr2	200611214	200611528	200611373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf69	162451	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	202752724	202752776	202752749	Y	ALS2	NA	NA	NA	NA	NA	CDK15	99540	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	NA	NA	NA	NA	NA	PSMA2P3	143335	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	204668913	204669218	204669026	Y	NA	NA	RAPH1,CD28,ABI2	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	270780	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	205054126	205054419	205054273	Y	NA	NA	PARD3B	IMR90	Hi-C	24141950	PARD3B	354097	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	208198821	208199856	208199157	Y	KLF7	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007879.7	96447	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	211406237	211406446	211406310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL1	65861	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	214053041	214053239	214053088	Y	NA	IKZF2	NA	NA	NA	NA	IKZF2	37890	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	216558345	216558652	216558547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012462.1	259369	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr2	223439256	223439394	223439332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	79662	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	231838825	231839283	231839059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD1	80295	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr2	237482983	237483115	237483021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS8	508840	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	238292882	238293292	238292932	Y	COPS8,LRRFIP1,COL6A3	COL6A3,AC112721.2	NA	NA	NA	NA	COL6A3	27726	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	239347857	239348510	239348285	Y	ASB1	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	14474	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr2	240250439	240250711	240250592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	70419	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr2	241313615	241314182	241313884	Y	NA	NA	GPC1	IMR90	Hi-C	24141950	GPC1	58906	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	1398801	1399138	1399021	Y	FKBP1A	FKBP1A	SNPH,RAD21L1,FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495	IMR90	Hi-C	24141950	FKBP1A	26995	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	7.67874290457147
chr20	1790289	1790734	1790591	Y	NA	NA	SIRPA,STK35	IMR90	Hi-C	24141950	SIRPA	82420	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	3286864	3286977	3286928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC4A11	69028	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	3377596	3377907	3377772	Y	C20orf194	NA	NA	NA	NA	NA	ATRN	71780	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	4072203	4072410	4072307	Y	NA	SMOX	RNF24,PANK2,MAVS,LOC728228,CDC25B,C20orf29,MIR103B2,SMOX,ADRA1D	IMR90	Hi-C	24141950	SMOX	27217	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	7502070	7502079	7502075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMX4	496397	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	8464613	8464952	8464618	Y	PLCB1	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	353789	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	9291356	9291748	9291412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	243946	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	10652083	10652420	10652292	Y	JAG1	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	27069	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	13035099	13035480	13035216	Y	SPTLC3	SPTLC3	NA	NA	NA	NA	SPTLC3	47472	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	19837391	19837690	19837414	Y	NA	NA	RIN2	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-122P22.2	101039	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	23008232	23008345	23008289	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NXT1	321028	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	23031353	23032100	23031620	Y	GZF1,THBD,CD93	NA	NA	NA	NA	NA	NXT1	297273	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	25218471	25218756	25218634	Y	NA	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	7949	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	25291624	25291957	25291812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYGB	64919	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	30300504	30300973	30300648	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8819	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	31063072	31063625	31063366	Y	NA	NA	ASXL1	IMR90	Hi-C	24141950	ASXL1	118917	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	33699049	33699250	33699220	Y	TRPC4AP,EDEM2	TRPC4AP	NA	NA	NA	NA	TRPC4AP	20375	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	33908268	33908438	33908376	Y	NA	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	37480	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	34463368	34463773	34463624	Y	NFS1	RNU4-40P	NA	NA	NA	NA	RNU4-40P	9808	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	35572677	35573004	35572914	Y	RBL1,TGIF2,TGIF2,SLA2,SAMHD1	SAMHD1	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	5242	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	43181587	43181787	43181669	Y	NA	SERINC3,PKIG	NA	NA	NA	NA	PKIG	23161	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	43965327	43965544	43965453	Y	SDC4	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	9520	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	45987479	45988292	45987961	Y	NA	ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	3912	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	49100027	49100544	49100221	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	24347	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr20	50366772	50367203	50366881	Y	ZFP64,ATP9A	ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	15970	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	52195908	52196455	52196142	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	625931	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	52444580	52444892	52444748	Y	NA	NA	ZNF217,SUMO1P1,BCAS1,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	377494	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	52445816	52446339	52446069	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	376047	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	52482655	52483054	52482957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	339332	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	52550838	52551665	52551067	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	270721	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	57236406	57236742	57236622	Y	RAB22A,STX16	STX16,STX16-NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16-NPEPL1	11916	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	57325812	57326010	57325911	Y	NA	NA	GNAS,GNAS-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	GNAS	86763	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	59325352	59325574	59325428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH4	499908	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	61560348	61560848	61560731	Y	NA	DIDO1,SLC17A9	NA	NA	NA	NA	DIDO1	6456	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr21	17960667	17961305	17960883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	860323	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr21	22545026	22545343	22545185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP22	2316929	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr21	28942556	28942990	28942803	Y	NA	NA	ADAMTS1,ADAMTS5,MIR4759	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS5	605724	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	4.38785308832655
chr21	30567218	30567411	30567380	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	2826	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr21	36222572	36222954	36222768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	237131	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr21	36281882	36282257	36282001	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	296441	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr21	37712607	37712952	37712729	Y	NA	MORC3,CHAF1B	NA	NA	NA	NA	MORC3	22120	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr21	38936686	38937128	38936852	Y	DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	200594	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr21	39723755	39724311	39724014	Y	ETS2	AP001422.3	NA	NA	NA	NA	AP001422.3	20412	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr21	40388041	40388127	40388084	Y	ETS2	NA	ETS2,LINC00114	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	165650	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr21	40393264	40393350	40393326	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	160427	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr21	40673787	40673929	40673891	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	17556	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr21	40860443	40860729	40860586	Y	NA	LCA5L	NA	NA	NA	NA	LCA5L	44712	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr21	44761192	44761567	44761446	Y	CRYAA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319,CRYAA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	83441	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr21	44913472	44913707	44913565	Y	PDXK	NA	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	68464	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr21	45020604	45020960	45020754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRP1B	56469	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr21	45662608	45662724	45662682	Y	TRAPPC10,C21orf2,ICOSLG	NA	NA	NA	NA	NA	PFKL	55210	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr21	46461202	46461645	46461341	Y	ITGB2,ADARB1	ADARB1	ADARB1,SSR4P1	K562	ChIA-PET	22265404	ADARB1	30123	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	7.67874290457147
chr21	46496242	46496452	46496442	Y	NA	ADARB1	NA	NA	NA	NA	ADARB1	4474	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr21	47167832	47168236	47167895	Y	NA	NA	PCBP3,LOC100129027	IMR90	Hi-C	24141950	SLC19A1	205507	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr21	47411286	47411466	47411356	Y	NA	COL6A1	NA	NA	NA	NA	COL6A1	11635	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr22	17697692	17697885	17697853	Y	BCL2L13,IL17RA,CECR1	AC005300.5	NA	NA	NA	NA	AC005300.5	25866	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr22	25381840	25382180	25381995	Y	NA	NA	KIAA1671	IMR90	Hi-C	24141950	FAM211B	394665	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr22	27616278	27616656	27616487	Y	NA	RP5-1172A22.1	MIAT,PITPNB	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1172A22.1	2032	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr22	28114157	28114741	28114406	Y	PITPNB,MN1	NA	NA	NA	NA	NA	MN1	80745	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr22	30601535	30602099	30601994	Y	MTMR3,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF	LIF	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	38741	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr22	31226011	31226350	31226247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUG1	138313	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr22	31689398	31689773	31689585	Y	SMTN,DEPDC5	PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	PIK3IP1	2878	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr22	33248825	33249077	33248981	Y	SYN3	NA	NA	NA	NA	NA	TIMP3	53138	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr22	35708559	35708961	35708654	Y	APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1	TOM1	NA	NA	NA	NA	TOM1	15291	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr22	35709404	35709640	35709485	Y	APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1	TOM1	NA	NA	NA	NA	TOM1	16136	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr22	40982487	40982801	40982645	Y	NA	MKL1	NA	NA	NA	NA	MKL1	47905	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr22	42062739	42062953	42062873	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19990	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr22	43100819	43101017	43100994	Y	NA	A4GALT	NA	NA	NA	NA	A4GALT	14287	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr22	43415245	43415535	43415390	Y	NA	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	6094	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr22	45944996	45945587	45945178	Y	NA	FBLN1	NA	NA	NA	NA	FBLN1	48878	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr22	46474643	46475112	46474791	Y	C22orf26	RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	10872	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr22	47848340	47848433	47848387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	691822	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr22	49768624	49768992	49768711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C22orf34	280198	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	18.6483756253878
chr22	50364350	50364715	50364589	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12189	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr22	50742925	50743370	50743124	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	686	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr22	50747003	50747284	50747232	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	2947	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	14457192	14457307	14457247	Y	NA	SLC6A6	NA	NA	NA	NA	SLC6A6	15116	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	16379433	16379643	16379566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	74727	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	18399008	18399057	18399033	Y	SATB1	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	85252	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	20190984	20191185	20191115	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	34599	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	23991964	23992189	23991965	Y	NA	RPL15,NR1D2,NKIRAS1	NA	NA	NA	NA	NKIRAS1	5882	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr3	27984483	27984771	27984759	Y	ZCWPW2,EOMES	NA	NA	NA	NA	NA	CMC1	296304	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	28534381	28534544	28534465	Y	ZCWPW2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCWPW2	145744	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	30700179	30700500	30700249	Y	TGFBR2	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR2	54185	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	37218637	37218971	37218954	Y	DCLK3,TRANK1,C3orf35	LRRFIP2	MLH1	IMR90	Hi-C	24141950	LRRFIP2	4209	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	39191403	39191804	39191748	Y	NA	TTC21A,GORASP1,CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	2249	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	39315967	39316315	39316143	Y	SCN10A,MOBP	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A38	106524	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	42067110	42067525	42067205	Y	ULK4	TRAK1	TRAK1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	13816	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	44040259	44040834	44040651	Y	NA	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	ANO10	309173	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	18.6483756253878
chr3	45068504	45068742	45068611	Y	NA	CLEC3B	NA	NA	NA	NA	CLEC3B	27464	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	46546407	46546628	46546504	Y	CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC12	474872	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr3	47120016	47120037	47120026	Y	SETD2,KLHL18,PRSS45,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NA	SETD2	83420	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	50201601	50201845	50201760	Y	TUSC2,HYAL2,C3orf54,MST1R,MON1A,SEMA3F,IFRD2	SEMA3F	NA	NA	NA	NA	SEMA3F	11123	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	50204844	50205012	50204945	Y	NA	SEMA3F	NA	NA	NA	NA	SEMA3F	14366	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	50208155	50208394	50208279	Y	MAPKAPK3,RBM5,GNAI2	SEMA3F	GNAT1,SLC38A3,GNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	SEMA3F	17677	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	50480518	50480758	50480638	Y	TMEM115	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM115	85477	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	52073968	52074235	52074157	Y	GPR62	RPL29,DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	14331	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	53897423	53897785	53897604	Y	NA	ACTR8,SELK	NA	NA	NA	NA	ACTR8	16444	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	55377694	55377830	55377728	Y	NA	NA	WNT5A,CACNA2D3	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC66	1211359	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	3.29088981624491
chr3	58457172	58457525	58457255	Y	RPP14,RPP14,KCTD6	PDHB,KCTD6	PXK,RPP14,KCTD6,ACOX2,PDHB	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD6	18316	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	62572991	62573174	62573036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf14	270343	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	3.29088981624491
chr3	67050514	67050733	67050633	Y	KBTBD8	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG1	500827	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	80100853	80101105	80100983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	285888	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	5.48481636040819
chr3	80819406	80819881	80819642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBE1	989431	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr3	86842931	86843272	86843115	Y	VGLL3	NA	VGLL3	IMR90	Hi-C	24141950	VGLL3	194997	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	88151728	88152092	88151734	Y	NA	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	C3orf38	44801	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	98505158	98505735	98505540	Y	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	112798	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	99137555	99137782	99137653	Y	NA	NA	MIR548G,COL8A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL8A1	217537	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	99377938	99378211	99378054	Y	COL8A1	COL8A1	NA	NA	NA	NA	COL8A1	22619	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	100492916	100493238	100493125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFG	66711	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	101359268	101359291	101359280	Y	NA	ZBTB11,RPL24	NA	NA	NA	NA	ZBTB11	35048	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	107871244	107871518	107871381	Y	MYH15,HHLA2	NA	NA	NA	NA	NA	CD47	63372	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr3	112351265	112351470	112351440	Y	NA	CCDC80	NA	NA	NA	NA	CCDC80	14907	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	117379734	117380078	117379965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-384F7.2	334361	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	120167583	120167922	120167648	Y	NA	FSTL1	NA	NA	NA	NA	FSTL1	178	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	8.7757061766531
chr3	120493479	120494008	120493729	Y	NA	GTF2E1,RABL3	NA	NA	NA	NA	RABL3	33639	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	123324068	123324437	123324253	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	21679	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	124553626	124554125	124554004	Y	KALRN	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	64140	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr3	124564415	124564677	124564502	Y	HEG1,ITGB5	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	53588	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	126721076	126721245	126721142	Y	PLXNA1	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	300013	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	4.38785308832655
chr3	126945431	126945830	126945484	Y	MCM2	NA	NUP210P1	IMR90	Hi-C	24141950	MCM2	369236	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	126945882	126946306	126946211	Y	MCM2	NA	NUP210P1	IMR90	Hi-C	24141950	MCM2	368760	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	4.38785308832655
chr3	131503475	131503510	131503493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL3	283648	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	131854898	131855187	131855050	Y	NA	NA	CPNE4	IMR90	Hi-C	24141950	RPL7P16	105922	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	134031444	134031760	134031541	Y	NA	RPL39P5	ANAPC13,C3orf36,SLCO2A1,AMOTL2,CEP63	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL39P5	41643	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	135615560	135615771	135615666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R3A	66744	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	136327517	136327655	136327647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG1	141565	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	143352573	143352896	143352700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A9	212477	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	143705621	143705974	143705695	Y	C3orf58,C3orf58	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A9	140248	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	151914650	151914811	151914728	Y	NA	MBNL1	MBNL1	IMR90	Hi-C	24141950	MBNL1	44806	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	156502026	156502257	156502105	Y	SSR3	LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	LINC00886	30594	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	157248554	157248748	157248629	Y	VEPH1	VEPH1,C3orf55	C3orf55,RSRC1,SHOX2,MFSD1,VEPH1,RARRES1	IMR90	Hi-C	24141950	VEPH1	660	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	157248921	157249245	157249148	Y	NA	VEPH1,C3orf55	C3orf55,RSRC1,SHOX2,MFSD1,VEPH1,RARRES1	IMR90	Hi-C	24141950	VEPH1	163	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	168616433	168616445	168616439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFEM1P	651123	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	169379831	169380308	169379976	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	425	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	170444418	170445820	170444586	Y	CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2	RP11-373E16.4	CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	11334	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	3.29088981624491
chr3	170584649	170585013	170584680	Y	NA	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	RPL22L1	1259	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	171594447	171594730	171594655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLD1	67707	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	171954526	171954782	171954635	Y	FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	199108	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	3.29088981624491
chr3	172510084	172510259	172510171	Y	NA	ECT2	NA	NA	NA	NA	ECT2	43612	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	173580437	173580663	173580550	Y	NLGN1	NA	NA	NA	NA	NA	NLGN1	468363	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	173650294	173650720	173650491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	442314	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	187984257	187984703	187984570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	114412	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	188103161	188103345	188103235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	233316	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	188324508	188324886	188324659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	454663	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	190581013	190581092	190581053	Y	NA	GMNC	NA	NA	NA	NA	GMNC	27126	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr3	190957563	190957649	190957606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC50	87217	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	193851636	193853009	193852912	Y	ATP13A3,HES1	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	0	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	194153543	194153935	194153911	Y	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	63158	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	194247870	194248550	194248205	Y	HES1,ATP13A3	ATP13A3	ATP13A3,GP5,TMEM44,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	ATP13A3	30777	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr3	197007663	197007913	197007866	Y	NA	DLG1	NA	NA	NA	NA	DLG1	16258	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr3	197461391	197461841	197461700	Y	IQCG,LRCH3,KIAA0226	FYTTD1,KIAA0226	NA	NA	NA	NA	FYTTD1	209	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	1966776	1967112	1967086	Y	WHSC1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf48	74577	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	5786154	5786273	5786214	Y	CRMP1	NA	NA	NA	NA	NA	EVC	75230	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	7962509	7962775	7962724	Y	NA	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	22856	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	13920582	13920969	13920807	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,C1QTNF7	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01085	190623	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	13922430	13922925	13922628	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,C1QTNF7	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01085	188667	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	4.38785308832655
chr4	13923595	13923747	13923678	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,C1QTNF7	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01085	187845	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	15036867	15037072	15036952	Y	NA	CPEB2	NA	NA	NA	NA	CPEB2	34569	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr4	15684115	15684561	15684231	Y	FBXL5,FAM200B,BST1	FAM200B,FBXL5,BST1	NA	NA	NA	NA	FBXL5	2813	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr4	19875292	19875467	19875380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLIT2	377416	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	24107474	24107652	24107563	Y	NA	NA	PPARGC1A	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	476521	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	25175369	25175577	25175408	Y	NA	PI4K2B	NA	NA	NA	NA	PI4K2B	15106	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	26123354	26123506	26123386	Y	NA	RBPJ	RBPJ,STIM2	IMR90	Hi-C	24141950	RBPJ	39571	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	26240784	26241159	26240972	Y	NA	NA	RBPJ	IMR90	Hi-C	24141950	RBPJ	77707	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	29920835	29921205	29921020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH7	798832	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	35022631	35023155	35023089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-79E3.3	983116	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	9.87266944873474
chr4	35023480	35024130	35023783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-79E3.3	983965	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	35027106	35027343	35027234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-79E3.3	987591	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	10.9696327208164
chr4	40910052	40910602	40910542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	306129	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	41704988	41705115	41705052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM33	230022	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	45914442	45914779	45914611	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNPDA2	1187830	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	55093767	55093987	55093860	Y	NA	PDGFRA	NA	NA	NA	NA	PDGFRA	503	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	61590476	61590574	61590525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-621K7.1	1048994	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	65475793	65476032	65475913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-807H7.1	1057647	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	77133814	77134170	77133987	Y	NAAA,CXCL10,CXCL11	SCARB2	NA	NA	NA	NA	SCARB2	768	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	77674311	77674688	77674546	Y	SEPT11	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT11	194168	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	77974492	77974926	77974738	Y	CCNI	CCNI	NA	NA	NA	NA	CCNI	20232	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	80520005	80520295	80520150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA11	274801	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	83383009	83383387	83383198	Y	NA	ENOPH1	NA	NA	NA	NA	ENOPH1	33294	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	84776291	84776536	84776414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT9	321224	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	84887961	84887976	84887969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT9	432894	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	85324628	85324862	85324745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDFY3-AS2	560676	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	86704673	86705059	86704806	Y	ARHGAP24	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	310406	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	88765103	88765413	88765203	Y	HSD17B11	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-36P	153976	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	95319673	95319909	95319791	Y	NA	NA	PDLIM5	IMR90	Hi-C	24141950	PDLIM5	51128	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	95527874	95528162	95527964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMPR1B	148957	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	102266716	102267419	102267189	Y	NA	PPP3CA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	0	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	103360468	103360812	103360586	Y	SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,NFKB1,MANBA	SLC39A8	BDH2,NFKB1,SLC9B1,UBE2D3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC39A8	10053	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	114554794	114555018	114554909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	126065	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	114563561	114563906	114563734	Y	CAMK2D	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	117177	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	119629667	119629850	119629760	Y	NA	METTL14	NA	NA	NA	NA	METTL14	25144	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	119756174	119756657	119756269	Y	NA	SEC24D	NA	NA	NA	NA	SEC24D	1181	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	122606332	122606884	122606598	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	9384	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	133266182	133266225	133266204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-9G1.3	802046	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	140292626	140292906	140292778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	70921	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	141071687	141072625	141072041	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	SCOC	103815	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	143162001	143162155	143162078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	604430	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	146015172	146015244	146015208	Y	NA	ABCE1,ANAPC10	NA	NA	NA	NA	ABCE1	1840	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	146655718	146656086	146655845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF827	201701	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	146656396	146656737	146656614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF827	201050	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	148471887	148472162	148471983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM184C	64372	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	3.29088981624491
chr4	149467274	149467593	149467420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	816060	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	151204830	151205055	151204941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLK2	207404	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	152226044	152226315	152226216	Y	NA	SH3D19	NA	NA	NA	NA	SH3D19	18469	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr4	153023305	153023605	153023314	Y	NA	NA	SH3D19,FBXW7,RPS3A,PET112	IMR90	Hi-C	24141950	PET112	343130	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	153717992	153718074	153718038	Y	NA	ARFIP1	NA	NA	NA	NA	ARFIP1	18903	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	154584497	154584872	154584724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0922	198999	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	157870715	157871133	157870964	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	19413	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	164414222	164414415	164414319	Y	TKTL2,C4orf43	NA	NA	NA	NA	NA	NAF1	328149	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	169705913	169706245	169706080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	223181	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	177760403	177760587	177760468	Y	NA	VEGFC	VEGFC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	VEGFC	48522	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	185115354	185115759	185115584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	277975	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	187614690	187615080	187614853	Y	NA	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	30796	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	189361062	189361328	189361166	Y	NA	LINC01060	NA	NA	NA	NA	LINC01060	41172	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr4	190485123	190485226	190485156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	143642	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	372694	372970	372922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC3	68303	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	81417	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	6927514	6927543	6927527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	296058	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	10996392	10996605	10996573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	237008	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	14108761	14108933	14108800	Y	TRIO	TRIO	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIO	32878	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	14142803	14143164	14142969	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	992	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr5	14154284	14154671	14154327	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	12473	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	14186205	14186627	14186374	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	44394	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	14208272	14208510	14208423	Y	FAM105B	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	66461	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	14268390	14268821	14268476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	126579	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	16733521	16733894	16733888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-55B8.1	166856	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	17157273	17157661	17157421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BASP1	93566	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	17184758	17185051	17184904	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	BASP1	121051	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	33313222	33313474	33313360	Y	NA	CTD-2066L21.3	NPR3,TARS	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2066L21.3	17206	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	36277859	36278299	36278119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKP2	127768	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	38446340	38446486	38446390	Y	EGFLAM	CTD-2263F21.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2263F21.1	19955	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	38854077	38854436	38854323	Y	OSMR,OSMR	CTD-2127H9.1,OSMR	NA	NA	NA	NA	OSMR	10117	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	39760848	39761179	39761033	Y	NA	NA	PTGER4,PRKAA1,TTC33	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	300446	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	43051482	43051716	43051600	Y	NA	AC025171.1,ZNF131	NA	NA	NA	NA	ZNF131	11562	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	52714720	52715039	52714904	Y	NA	NA	ARL15	IMR90	Hi-C	24141950	FST	59200	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	54622279	54622499	54622328	Y	NA	DHX29,SKIV2L2	NA	NA	NA	NA	SKIV2L2	20691	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	58186995	58187365	58187085	Y	PDE4D	NA	PDE4D	IMR90	Hi-C	24141950	PLK2	432908	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	59004737	59004748	59004743	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	DEPDC1B	989269	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	60526663	60526879	60526778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	99221	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	60597691	60598057	60597813	Y	NA	ZSWIM6	ZSWIM6,C5orf43	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZSWIM6	28043	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr5	64459611	64459838	64459685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	315909	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	67242397	67242498	67242448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	267050	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	SLC30A5	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	48595	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	4.38785308832655
chr5	71462643	71462861	71462688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	61582	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr5	73926262	73926632	73926507	Y	FAM169A	HEXB,ENC1	NA	NA	NA	NA	HEXB	7216	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	74861939	74862072	74862007	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A3BP	55976	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	77825252	77825732	77825631	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	170913	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	80055694	80056072	80055883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHFR	106892	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	80564528	80564843	80564784	Y	NA	CKMT2-AS1,ZCCHC9	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	30536	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	81045433	81045821	81045530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP2	0	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	82005927	82005935	82005931	Y	ATP6AP1L	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC4	365382	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	83668796	83668857	83668813	Y	NA	CTD-2269F5.1,EDIL3	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	9388	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	83670446	83670810	83670539	Y	EDIL3	CTD-2269F5.1,EDIL3	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	7435	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	7.67874290457147
chr5	86610420	86610785	86610768	Y	NA	RASA1	NA	NA	NA	NA	RASA1	48715	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	87956632	87957169	87956907	Y	MEF2C,MEF2C	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2C	240753	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	88171082	88171456	88171409	Y	MEF2C	MEF2C	NA	NA	NA	NA	MEF2C	26466	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	92913655	92914013	92913834	Y	NA	NR2F1	NA	NA	NA	NA	NR2F1	3030	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	95179469	95179934	95179619	Y	NA	GLRX	GLRX,SPATA9,RFESD,RHOBTB3,C5orf27	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	22760	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	95414896	95415105	95415065	Y	GLRX,ELL2	NA	NA	NA	NA	NA	ELL2	119121	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	97445347	97445652	97445445	Y	NA	NA	FLJ35946,RGMB	IMR90	Hi-C	24141950	CH17-12M21.1	226796	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	121516793	121517196	121516968	Y	LOX,LOX	CTC-441N14.2	NA	NA	NA	NA	CTC-441N14.2	28242	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	122322384	122322589	122322416	Y	NA	PPIC	NA	NA	NA	NA	PPIC	47847	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	133839310	133839404	133839346	Y	NA	NA	PHF15,PPP2CA,CDKL3,CDKN2AIPNL,SAR1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.1	68908	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	133863130	133863560	133863438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005355.1	92728	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	133864116	133864195	133864168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005355.1	93714	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	135416297	135416409	135416350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD5	50125	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	136482104	136482426	136482383	Y	SPOCK1	NA	NA	NA	NA	NA	SPOCK1	449642	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	138440633	138440869	138440757	Y	LRRTM2,MATR3,MATR3,DNAJC18	NA	NA	NA	NA	NA	MATR3	166572	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	139070074	139070356	139070181	Y	NA	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	45190	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	139077054	139077268	139077188	Y	CXXC5	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	52170	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	139488718	139489038	139488945	Y	NA	PURA	NRG2,CYSTM1,IGIP	IMR90	Hi-C	24141950	PURA	3356	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	140098281	140098628	140098472	Y	NA	HARS2,HARS,ZMAT2	NA	NA	NA	NA	ZMAT2	22016	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	140888509	140888855	140888756	Y	PCDH12,PCDHGA11,PCDHGA12	PCDHGC3	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	34929	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	140893513	140893891	140893828	Y	PCDH12,KIAA0141,DIAPH1	PCDHGC3	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	39933	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	143300463	143300651	143300509	Y	NA	NA	ARHGAP26,NR3C1	IMR90	Hi-C	24141950	YIPF5	247627	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	147283651	147283737	147283694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	396032	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	148700478	148700631	148700542	Y	NA	GRPEL2,PCYOX1L	GRPEL2,PCYOX1L	IMR90	Hi-C	24141950	GRPEL2	22362	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	149945724	149945760	149945742	Y	SYNPO,ZNF300	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-367J11.1	82193	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	158245937	158246321	158246106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EBF1	278448	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	158325217	158325461	158325285	Y	EBF1	NA	NA	NA	NA	NA	EBF1	199308	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	158605991	158606398	158606265	Y	NA	RNF145	NA	NA	NA	NA	RNF145	28663	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	158938695	158938959	158938847	Y	EBF1	NA	ADRA1B,LOC285627,TTC1	IMR90	Hi-C	24141950	UBLCP1	250606	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	15.3574858091429
chr5	159434366	159434726	159434546	Y	FABP6	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	246	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	163767017	163767182	163767164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAT2B	838897	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	169404223	169404546	169404350	Y	FAM196B	FAM196B	NA	NA	NA	NA	FAM196B	1198	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	170662332	170662346	170662338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1	149774	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	171879589	171880295	171879961	Y	SH3PXD2B	SH3PXD2B	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2B	62	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	172160417	172160946	172160788	Y	ATP6V0E1	DUSP1	ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	35252	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	172192263	172193766	172192583	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2432	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	172226784	172227709	172227394	Y	ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1,ERGIC1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	30586	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	172901872	172902293	172901982	Y	ATP6V0E1	NA	LOC285593,STC2,BOD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BOD1	139370	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr5	173237626	173237876	173237751	Y	NA	NA	BOD1	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	75407	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	173765324	173765497	173765445	Y	MSX2	RP11-267A15.1	HMP19,MIR4634,MSX2,FLJ16171	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-267A15.1	4026	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr5	173815215	173815442	173815329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-267A15.1	53917	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	2932472	2932683	2932609	Y	SERPINB1,RIPK1,SERPINB9	SERPINB6	NA	NA	NA	NA	SERPINB6	37407	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	2952080	2952258	2952142	Y	SERPINB1,RIPK1,SERPINB9,NQO2	SERPINB6,NQO2	NA	NA	NA	NA	SERPINB6	17832	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	3389811	3390490	3390264	Y	SERPINB6,SLC22A23,C6orf145	NA	NA	NA	NA	NA	PSMG4	160174	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	4.38785308832655
chr6	4317088	4317563	4317434	Y	CDYL	NA	RPP40,CDYL,LYRM4	IMR90	Hi-C	24141950	ECI2	183257	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	4582137	4582541	4582469	Y	NA	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	CDYL	121852	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	7618671	7618993	7618833	Y	NA	SNRNP48	NA	NA	NA	NA	SNRNP48	30239	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr6	7692548	7692711	7692643	Y	NA	BMP6	PIP5K1P1,MUTED-TXNDC5,BMP6,TXNDC5,EEF1E1-MUTED,SSR1	IMR90	Hi-C	24141950	BMP6	32319	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	11072389	11072644	11072517	Y	NA	NA	C6orf228	IMR90	Hi-C	24141950	NEDD9	307937	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	13391107	13391478	13391293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	64292	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	14735052	14735658	14735282	Y	NA	NA	DTNBP1,JARID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	508869	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	18153083	18153444	18153238	Y	RNF144B,NHLRC1,KDM1B	KDM1B	NA	NA	NA	NA	TPMT	0	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr6	20877706	20877968	20877723	Y	CDKAL1	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	345018	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB	NA	NA	NA	NA	HIST1H3A	25645	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	3.29088981624491
chr6	26304989	26305345	26305268	Y	NA	HIST1H3G,HIST1H2BI,HIST1H4H	HCG11,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H2AE,HIST1H2BF,HIST1H2BG,HIST1H3D,HIST1H4E,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H4G,HIST1H2BI,HIST1H3G,HIST1H4H,BTN3A2,BTN2A2,BTN1A1,HMGN4,BTN3A3,HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,ABT1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HIST1H4H	21227	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	26533222	26533398	26533310	Y	NA	HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	3235	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	27145585	27145720	27145705	Y	FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HIST1H2AH	32724	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	27156271	27156423	27156401	Y	NA	HIST1H2BK,HIST1H2AH	HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HIST1H2AH	43410	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	27759985	27760333	27760032	Y	ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	13376	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	29932777	29932958	29932802	Y	HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A	HLA-K,HLA-A	NA	NA	NA	NA	HLA-A	25740	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	30276337	30276699	30276532	Y	ATAT1,ATAT1	TRIM39,HCG18,RPP21	NA	NA	NA	NA	TRIM39	15557	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	32834766	32835076	32834920	Y	BRD2,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9	TAP2,PSMB9,PSMB8,TAP1	NA	NA	NA	NA	TAP1	15011	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	37070053	37070857	37070460	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	65122	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	39850347	39850811	39850571	Y	NA	MOCS1	NA	NA	NA	NA	MOCS1	49479	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	39886697	39886822	39886760	Y	NA	MOCS1,RP1-278E11.3	NA	NA	NA	NA	MOCS1	13468	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	42090479	42090803	42090657	Y	NA	C6orf132	NA	NA	NA	NA	C6orf132	17554	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	45390987	45391259	45391097	Y	RUNX2	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	47297	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	45404651	45404813	45404715	Y	RUNX2	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	60961	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	45623562	45623937	45623654	Y	NA	NA	RUNX2,SUPT3H,CLIC5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUPT3H	279872	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	46021255	46021630	46021408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENPP4	74100	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	50643793	50644039	50643916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFAP2B	140397	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	52377018	52377269	52377212	Y	GSTA5,TRAM2	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	62444	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	52404444	52404567	52404560	Y	NA	TRAM2	EFHC1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAM2	35146	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	53925678	53925800	53925739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC1	268383	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	54604535	54604549	54604543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC1	947240	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	55228034	55228050	55228042	Y	HMGCLL1,GFRAL	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC1	1570739	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	56594458	56594846	56594652	Y	NA	NA	DST,BEND6,KIAA1586,PRIM2	IMR90	Hi-C	24141950	BEND6	222927	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	57561032	57561048	57561040	Y	NA	NA	PRIM2	IMR90	Hi-C	24141950	PRIM2	383429	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	58777244	58778438	58777771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	522675	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	65227331	65227644	65227620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	883606	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	72179171	72179414	72179328	Y	NA	NA	OGFRL1,MIR30C2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00472	50699	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	74289769	74290568	74290415	Y	MB21D1,SLC17A5,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	58249	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	74432369	74432753	74432573	Y	MB21D1,EEF1A1,SLC17A5,CD109,CD109	CD109	NA	NA	NA	NA	CD109	28861	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr6	81253590	81253803	81253687	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	439226	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	4.38785308832655
chr6	86114496	86114829	86114663	Y	NT5E	NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	NT5E	42980	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	89084006	89084236	89084119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNGTT	587112	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	96278764	96279091	96278932	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEA	255345	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	106540002	106540199	106540101	Y	PRDM1	PRDM1	NA	NA	NA	NA	PRDM1	7807	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	106776793	106776822	106776808	Y	NA	ATG5	NA	NA	NA	NA	ATG5	5127	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	108143478	108143727	108143556	Y	SCML4	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63	133666	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	111733320	111733976	111733973	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV3L	68942	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	112428707	112428734	112428721	Y	LAMA4	TUBE1	NA	NA	NA	NA	TUBE1	21975	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	117804575	117804878	117804739	Y	NA	DCBLD1	NA	NA	NA	NA	DCBLD1	31595	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	119896932	119897123	119897095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAN1A1	228006	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	121759226	121759877	121759689	Y	GJA1	GJA1	NA	NA	NA	NA	GJA1	4388	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	127892310	127892704	127892511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC1	229556	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr6	127980874	127981174	127981075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC1	318120	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	128637396	128637725	128637581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	202145	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	128840669	128840970	128840936	Y	PTPRK,PTPRK	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	799	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	131929733	131930009	131929873	Y	NA	MED23	NA	NA	NA	NA	MED23	17360	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	134669516	134669878	134669820	Y	NA	SGK1	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	32266	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	136174498	136174747	136174644	Y	PDE7B	PDE7B	NA	NA	NA	NA	PDE7B	3664	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	140299062	140299512	140299364	Y	NA	NA	CITED2,HECA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	605305	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	143247398	143248213	143248022	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	16125	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	152583976	152584217	152584151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE1	372719	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	152597170	152597189	152597180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE1	359747	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	152634983	152635621	152635105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE1	321315	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	156717523	156717937	156717690	Y	ARID1B	NA	NOX3	IMR90	Hi-C	24141950	ARID1B	379126	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	158136804	158137189	158136890	Y	NA	NA	TMEM242,SNX9,ZDHHC14	IMR90	Hi-C	24141950	SNX9	105107	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	158452388	158452885	158452569	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	51500	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	159195572	159195684	159195582	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	42760	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	163833938	163834442	163834340	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	906	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	163881453	163881850	163881463	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	48421	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	164758879	164759308	164759212	Y	NA	NA	PARK2,DKFZp451B082,PACRG	IMR90	Hi-C	24141950	QKI	925847	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr6	166422302	166422862	166422743	Y	NA	PDE10A	NA	NA	NA	NA	PDE10A	24211	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	166970262	166970784	166970543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	216183	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr6	170600439	170600921	170600644	Y	NA	FAM120B	NA	NA	NA	NA	FAM120B	2648	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	1572262	1572844	1572636	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3912	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	1573524	1573718	1573598	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	5174	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	1959743	1960348	1960159	Y	SNX8,MAFK	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	310530	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	2673416	2673872	2673677	Y	NA	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	3831	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	6467944	6468137	6468104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAGLB	53684	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	6677371	6677641	6677424	Y	DAGLB,ZNF12,C7orf26	C7orf26,ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	2418	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	16886935	16887473	16887050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BZW2	203179	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	17029591	17029925	17029620	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AHR	306321	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	4.38785308832655
chr7	17082630	17082968	17082726	Y	AHR	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AHR	253278	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	22048509	22048800	22048655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7L	64807	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	23168039	23168122	23168081	Y	NA	KLHL7	NA	NA	NA	NA	KLHL7	24686	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	25064852	25065012	25064919	Y	NA	OSBPL3	OSBPL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL3	45599	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	25582500	25582683	25582592	Y	NPVF	NA	NA	NA	NA	NA	CYCS	419520	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	25896245	25896461	25896419	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	293399	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	25896515	25897081	25896801	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	292779	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	27206716	27206932	27206874	Y	HOXA7,HOXA9,HOXA13,HOXA11,HOXA10	HOXA10-AS,HOXA9	NA	NA	NA	NA	HOXA10-AS	478	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	35075861	35076697	35076367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERPUD2	656484	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr7	35420402	35420642	35420525	Y	HERPUD2	NA	NA	NA	NA	NA	HERPUD2	312539	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	36843340	36843728	36843600	Y	ELMO1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	415606	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	41738328	41738691	41738507	Y	INHBA	INHBA	NA	NA	NA	NA	INHBA	2015	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	41771654	41771750	41771721	Y	NA	INHBA	NA	NA	NA	NA	INHBA	30948	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	46385021	46385087	46385052	Y	NA	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	425548	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	46894770	46895049	46894960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	725107	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	47709189	47709374	47709294	Y	UPP1,UPP1,HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	89033	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	47797544	47797859	47797606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	177388	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	55063452	55063479	55063466	Y	NA	EGFR	EGFR	IMR90	Hi-C	24141950	EGFR	21235	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	55141624	55142112	55141893	Y	SEC61G,EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	56910	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	55155188	55155533	55155358	Y	EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	70474	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	55543241	55543436	55543358	Y	VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	VOPP1	95245	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	57577552	57577783	57577653	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	1405283	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	63924105	63924304	63924148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF680	97180	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	3.29088981624491
chr7	68877694	68877897	68877796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	184008	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	73180066	73180446	73180256	Y	NA	STX1A,ABHD11	NA	NA	NA	NA	ABHD11	28869	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	73987997	73988205	73988054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2I	81789	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	81927516	81927685	81927601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	143429	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	87918906	87919150	87919043	Y	SRI	STEAP4	NA	NA	NA	NA	STEAP4	15056	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	90861359	90861732	90861539	Y	NA	FZD1	NA	NA	NA	NA	FZD1	30051	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	94280099	94280356	94280228	Y	NA	SGCE,PEG10	NA	NA	NA	NA	SGCE	3165	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	97913424	97913987	97913861	Y	LMTK2,BRI3	BRI3	NA	NA	NA	NA	BRI3	33733	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr7	97915595	97916070	97915699	Y	LMTK2,BRI3	BRI3	NA	NA	NA	NA	BRI3	35904	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	98189463	98189580	98189522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BAIAP2L1	161083	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	98199346	98199589	98199468	Y	NA	NA	NPTX2	IMR90	Hi-C	24141950	BAIAP2L1	170966	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	99551289	99551506	99551376	Y	ZCWPW1,PILRA,MEPCE,C7orf59,ZNF655,ZNF655	TRIM4	NA	NA	NA	NA	TRIM4	36066	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	102773056	102773346	102773244	Y	NA	NAPEPLD	ARMC10	IMR90	Hi-C	24141950	NAPEPLD	14661	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	104771634	104771765	104771700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	120143	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	113439597	113439601	113439599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00998	682929	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	116328034	116328226	116328184	Y	ST7,CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,MET	MET	NA	NA	NA	NA	MET	17590	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	128468302	128468509	128468385	Y	FLNC	CCDC136,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	0	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	128471531	128472043	128471766	Y	FLNC	CCDC136,FLNC,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	3100	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	130588239	130588699	130588531	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	7370	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	130606000	130606565	130606293	Y	NA	MIR29A	LOC646329	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR29A	9931	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	132656149	132656423	132656408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	108425	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	135430585	135430983	135430863	Y	FAM180A	FAM180A	NA	NA	NA	NA	FAM180A	611	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr7	135446640	135446883	135446777	Y	FAM180A	FAM180A	C7orf73,SLC13A4	IMR90	Hi-C	24141950	FAM180A	15046	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr7	135874032	135874250	135874141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPN	213931	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	137418965	137419308	137419135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKI	110530	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	137505466	137505823	137505684	Y	NA	DGKI	NA	NA	NA	NA	DGKI	24015	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr7	137659854	137660135	137660099	Y	NA	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	24678	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	137685065	137685809	137685664	Y	TRIM24,CREB3L2	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	252	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	139420496	139420947	139420749	Y	TBXAS1,JHDM1D,HIPK2	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	54630	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	139431881	139432226	139432135	Y	TBXAS1,JHDM1D,HIPK2	HIPK2	NA	NA	NA	NA	HIPK2	43351	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	139448885	139449073	139448951	Y	JHDM1D	HIPK2	NA	NA	NA	NA	HIPK2	26504	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	143856214	143856503	143856359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM115A	258923	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	147109889	147110169	147110008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005229.5	1165324	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	148424586	148424815	148424779	Y	NA	CUL1	NA	NA	NA	NA	CUL1	31580	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	NA	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EZH2	58860	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr7	149112304	149112563	149112312	Y	ZNF862	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF746	80345	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr7	156544134	156544345	156544262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMBR1	139579	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	1452379	1452383	1452381	Y	KBTBD11	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2336O2.1	258285	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	11315246	11315781	11315560	Y	XKR6,MTMR9	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	14443	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr8	11367839	11367991	11367915	Y	BLK	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	37615	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	11373324	11373814	11373559	Y	FAM167A	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	43100	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	13224231	13224684	13224410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLC1	146483	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	16479323	16479556	16479440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC2	531982	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	20182767	20183137	20182952	Y	NA	NA	ATP6V1B2,LZTS1	IMR90	Hi-C	24141950	ATP6V1B2	129889	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	22469003	22469432	22469219	Y	NA	PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	C8orf58	13889	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	23138717	23138953	23138815	Y	LOXL2	CHMP7,R3HCC1	NA	NA	NA	NA	R3HCC1	13084	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	25059177	25059384	25059268	Y	DOCK5	DOCK5	NA	NA	NA	NA	DOCK5	18939	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	33071283	33071444	33071366	Y	NA	NA	NRG1	IMR90	Hi-C	24141950	FUT10	257496	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	3.29088981624491
chr8	49320367	49320668	49320511	Y	NA	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2V2	401407	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	49815340	49815765	49815552	Y	SNAI2	SNAI2	NA	NA	NA	NA	SNAI2	16534	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	67433991	67434613	67434592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	89869	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	69672075	69672426	69672227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF1	704433	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr8	69879881	69880245	69880105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF1	496614	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	79674578	79674862	79674701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKIA	248204	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	87673960	87674305	87674138	Y	CNGB3	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE3	178901	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	91926136	91926682	91926246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM55A	124610	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	97136855	97137003	97136873	Y	NA	GDF6	NA	NA	NA	NA	GDF6	34017	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	97171094	97171453	97171221	Y	GDF6	GDF6	NA	NA	NA	NA	GDF6	74	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	97869514	97869680	97869584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDC2	365935	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	99637150	99637421	99637401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK3	315634	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	101801288	101801504	101801352	Y	NA	NA	PABPC1,SNX31	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PABPC1	68251	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	101920723	101921107	101920870	Y	NA	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	42509	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	102423654	102423774	102423714	Y	NA	NA	GRHL2	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF706	207233	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	103750893	103751082	103750980	Y	AZIN1,KLF10,KLF10	NA	UBR5,KLF10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF10	84763	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	103766474	103766656	103766574	Y	NA	NA	KLF10,UBR5	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF10	100344	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr8	107485450	107485801	107485626	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OXR1	204977	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	114779444	114779746	114779595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	2040153	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	116660380	116660747	116660648	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	159152	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	117456775	117457003	117456919	Y	NA	NA	TRPS1,LINC00536	IMR90	Hi-C	24141950	UTP23	319739	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	118309433	118309561	118309497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED30	221391	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	119469054	119469434	119469101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	346962	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr8	124665857	124666229	124666132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM91A1	112467	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	125815161	125815353	125815255	Y	ZNF572,NSMCE2,KIAA0196,RNF139,MTSS1	NA	MTSS1,ZNF572	IMR90	Hi-C	24141950	MTSS1	76431	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	129348203	129348321	129348262	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	327346	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	131218440	131218995	131218822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	191065	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	131276645	131276741	131276715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	177165	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	3.29088981624491
chr8	133231946	133232036	133231991	Y	KCNQ3,KCNQ3	NA	NA	NA	NA	NA	EFR3A	317611	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	134914879	134915101	134914942	Y	ST3GAL1	NA	ST3GAL1,ZFAT	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL1	332696	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	135843585	135843751	135843688	Y	ZFAT	NA	ZFAT,MIR30D,MIR30B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFAT	120293	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	135984758	135985124	135984941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAT	261466	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	140843827	140843872	140843850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	622806	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	141108929	141109987	141109387	Y	KCNK9,TRAPPC9	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	356691	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr8	144301806	144302247	144302025	Y	MAFA	ZFP41,GLI4	NA	NA	NA	NA	ZFP41	25033	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	2875811	2876206	2875956	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	33570	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr9	4738592	4738723	4738708	Y	NA	AK3	NA	NA	NA	NA	AK3	1320	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	14263032	14263410	14263221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	133572	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	14322295	14322910	14322674	Y	ZDHHC21,NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	74072	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr9	18490587	18490949	18490797	Y	ADAMTSL1	ADAMTSL1	NA	NA	NA	NA	ADAMTSL1	18695	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr9	24920693	24920988	24920699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC1	755868	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	32556634	32556872	32556767	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	TOPORS	6083	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	33033161	33033386	33033274	Y	TOPORS,DNAJA1,NFX1,SMU1	APTX,DNAJA1,SMU1	NA	NA	NA	NA	DNAJA1	9952	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	33160944	33161390	33161236	Y	DNAJA1,SMU1,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	3964	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	35520478	35520852	35520494	Y	NA	RUSC2	NA	NA	NA	NA	RUSC2	32354	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	36166552	36166755	36166690	Y	CREB3,TLN1	GLIPR2,CLTA	NA	NA	NA	NA	CLTA	22098	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	37859471	37859543	37859507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	60037	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	37924173	37924321	37924247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	124739	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	66455332	66455763	66455668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1997612	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	4.38785308832655
chr9	71789916	71790363	71790201	Y	TJP2	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	55707	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	71793410	71793781	71793424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	59201	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	73021810	73022419	73022127	Y	NA	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	5121	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	5.48481636040819
chr9	73196795	73197009	73196903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	169255	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	73215942	73217043	73216172	Y	KLF9	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	188402	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	79383801	79384093	79383990	Y	PRUNE2	NA	NA	NA	NA	NA	PRUNE2	134910	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	90216174	90216503	90216403	Y	DAPK1,CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	77957	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	90328172	90328868	90328486	Y	DAPK1,CTSL1	NA	CTSL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-40C6.2	189955	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	93862627	93863018	93862659	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	AUH,ROR2,LOC100129316,NFIL3,MIR3910-1,MIR3910-2	IMR90	Hi-C	24141950	AUH	259177	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr9	93955991	93956732	93956142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	165463	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	99106686	99107122	99106995	Y	NA	SLC35D2	NA	NA	NA	NA	SLC35D2	36870	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	101137509	101137713	101137616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	121594	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	105966405	105966781	105966517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC2	887760	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	113504925	113505178	113505015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVEP1	164765	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	114720285	114720825	114720474	Y	UGCG	NA	C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UGCG	63239	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	114811444	114811737	114811486	Y	UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	123951	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	119066427	119066819	119066625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	152344	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	122670497	122670869	122670683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	669579	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	125811144	125811514	125811213	Y	NA	NA	MIR600HG	IMR90	Hi-C	24141950	RABGAP1	110032	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	127944437	127944756	127944696	Y	NR6A1,GOLGA1,PPP6C,GAPVD1	PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	5462	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	129484571	129485188	129484881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	80097	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	130304237	130304411	130304308	Y	FAM129B,FAM129B	FAM129B	NA	NA	NA	NA	FAM129B	34857	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	130764123	130764312	130764223	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS	FAM102A	FAM102A,DPM2,PIP5KL1,SLC25A25,NAIF1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM102A	23331	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	131937094	131937487	131937262	Y	PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1053	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-65J3.1	83347	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chr9	132519435	132519464	132519450	Y	ASB6,FNBP1	PTGES,TOR1B	NA	NA	NA	NA	PTGES	6109	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	3.29088981624491
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	15308	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chrX	10161663	10162021	10162010	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC3	180061	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chrX	19701008	19701387	19701257	Y	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	202332	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chrX	19774987	19775285	19775138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	128434	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chrX	39118729	39118972	39118855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1IP1	460044	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chrX	39873339	39874259	39873676	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	160323	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chrX	39968308	39968728	39968376	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65854	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	2.19392654416328
chrX	40031344	40032243	40032130	Y	BCOR,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	2339	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chrX	43844766	43845116	43844971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAOA	331299	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chrX	46436763	46437171	46436936	Y	RP2,ZNF674,CHST7	ZNF674,CHST7	NA	NA	NA	NA	CHST7	5544	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chrX	48350817	48351213	48350906	Y	WAS,RBM3,PORCN,OTUD5	FTSJ1,PORCN,EBP,TBC1D25	NA	NA	NA	NA	PORCN	14137	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chrX	85196824	85197022	85197001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHM	103544	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chrX	103019589	103020004	103019883	Y	NA	NA	LOC340544,MORF4L2,GLRA4,TMEM31,PLP1	IMR90	Hi-C	24141950	MORF4L2	78503	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chrX	106920003	106920801	106920325	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	50266	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	3.29088981624491
chrX	114007508	114007791	114007650	Y	RBMXL3	NA	NA	NA	NA	NA	PLS3	785710	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chrX	129065451	129065820	129065554	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	27354	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chrX	129066097	129066492	129066260	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	28000	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chrY	7329896	7330254	7330052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKY	189883	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164
chrY	7388236	7388597	7388417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKY	248223	CAGE	StromaNKtert	hg19	FANTOM5	1.09696327208164