chr1 918449 918555 918505 Y NA NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN NA NA NA NA HES4 14997 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 945769 946034 945890 Y CCNL2,ATAD3B PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA ISG15 769 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 956563 956812 956665 Y UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA AGRN 3060 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 1004646 1004986 1004766 Y NA RP11-465B22.3,C1orf159 NA NA NA NA RP11-465B22.3 11532 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 1295535 1296332 1296026 Y MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8 CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20 NA NA NA NA MXRA8 378 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr1 1803114 1803303 1803274 Y NA GNB1 NADK IMR90 Hi-C 24141950 GNB1 17192 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 1840449 1840835 1840668 Y SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD GNB1 NA NA NA NA GNB1 19954 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr1 2135885 2136186 2135927 Y NA C1orf86 NA NA NA NA C1orf86 5973 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 2140151 2140337 2140252 Y C1orf86 C1orf86 NA NA NA NA C1orf86 1822 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 2177615 2177829 2177732 Y NADK,GNB1,TNFRSF14,SKI C1orf86 NA NA NA NA C1orf86 35456 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 2221868 2222548 2222316 Y TNFRSF14,SKI NA NA NA NA NA C1orf86 79709 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 2253622 2253773 2253699 Y NA NA NA NA NA NA MORN1 67373 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 2477415 2477971 2477660 Y NA PANK4,TNFRSF14,FAM213B NA NA NA NA TNFRSF14 7107 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr1 2478276 2478817 2478474 Y SKI,PANK4,TNFRSF14 PANK4,TNFRSF14,FAM213B NA NA NA NA TNFRSF14 6261 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 2509702 2510198 2509855 Y SKI,TNFRSF14 TNFRSF14,FAM213B NA NA NA NA FAM213B 5732 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 2574343 2574764 2574705 Y MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1 NA NA NA NA NA FAM213B 58413 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 3086923 3087330 3087113 Y PRDM16 NA NA NA NA NA PRDM16 103191 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 3227700 3227783 3227742 Y NA NA NA NA NA NA PRDM16 243968 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 3229711 3230157 3229865 Y NA NA NA NA NA NA PRDM16 245979 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 3232812 3232866 3232839 Y PRDM16 NA NA NA NA NA PRDM16 249080 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 3420761 3421065 3420920 Y NA NA NA NA NA NA MEGF6 104994 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 3817648 3818071 3817969 Y LRRC47 CEP104,DFFB,C1orf174 NA NA NA NA C1orf174 2791 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 5483188 5483543 5483374 Y NA NA NA NA NA NA NPHP4 566990 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 6040561 6040806 6040680 Y NA NPHP4 NA NA NA NA NPHP4 9727 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 6053603 6054107 6053839 Y CHD5,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2 NPHP4 NA NA NA NA NPHP4 3070 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 6661008 6661639 6661311 Y ZBTB48,KLHL21 NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3 NA NA NA NA PHF13 10106 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 6943772 6944262 6943813 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 100388 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 7177733 7177848 7177794 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 334349 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 7359415 7359679 7359556 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 469650 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 7461964 7462325 7462107 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 367004 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 7531062 7531540 7531160 Y PARK7 NA NA NA NA NA VAMP3 297789 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 7551468 7551846 7551701 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 277483 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 7609389 7609632 7609504 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 219697 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 7764543 7764931 7764717 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 64398 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 7843556 7843653 7843585 Y PER3 VAMP3,PER3 NA NA NA NA PER3 1176 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 8070132 8070398 8070299 Y PER3,SLC45A1,ERRFI1 ERRFI1,RP11-431K24.1 NA NA NA NA ERRFI1 13970 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 8107848 8108157 8108001 Y NA ERRFI1,RP11-431K24.1 ERRFI1,RERE,SLC45A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-431K24.1 23050 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 8137301 8137521 8137361 Y NA NA ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 52503 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr1 8194345 8194402 8194374 Y NA NA ERRFI1,SLC45A1,RERE,PARK7 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-431K24.1 109547 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 8257762 8258040 8257906 Y NA NA ERRFI1,RERE,PARK7,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC45A1 117846 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 8272041 8272390 8272277 Y NA NA ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC45A1 103496 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 8487656 8487917 8487791 Y RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 111770 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 8810273 8810466 8810370 Y NA NA NA NA NA NA RERE 65236 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 8953388 8953557 8953428 Y NA ENO1-IT1,ENO1 NA NA NA NA ENO1 16080 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 9488839 9489227 9489154 Y NA NA SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 108314 CAGE T98G hg19 FANTOM5 2.17488083636167 chr1 10127211 10127315 10127266 Y KIF1B UBE4B NA NA NA NA UBE4B 36321 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 10447707 10448369 10448247 Y NA PGD,APITD1,APITD1-CORT NA NA NA NA PGD 8280 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 10557233 10557456 10557348 Y NA PEX14,DFFA CASZ1 IMR90 Hi-C 24141950 DFFA 26650 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 11122928 11123178 11122962 Y NA SRM,EXOSC10 NA NA NA NA SRM 4847 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 11410602 11410834 11410718 Y NA NA FBXO2,FBXO44,UBIAD1 IMR90 Hi-C 24141950 UBIAD1 79339 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 11791882 11792060 11791938 Y NA MAD2L2,AGTRAP AGTRAP IMR90 Hi-C 24141950 AGTRAP 2081 CAGE T98G hg19 FANTOM5 2.47145549586554 chr1 11968510 11969143 11969021 Y MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP RNU5E-1,KIAA2013,PLOD1 NA NA NA NA RNU5E-1 2301 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr1 12221931 12222397 12222091 Y FBXO6,AGTRAP,MTHFR,CLCN6,MFN2,TNFRSF8,TNFRSF1B TNFRSF1B NA NA NA NA TNFRSF1B 2663 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 12599928 12600179 12600028 Y DHRS3 NA DHRS3,VPS13D K562 ChIA-PET 22265404 DHRS3 75558 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 14880204 14880538 14880413 Y NA KAZN KAZN IMR90 Hi-C 24141950 KAZN 42662 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 15111272 15111486 15111395 Y NA NA NA NA NA NA KAZN 188072 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 15664307 15664455 15664338 Y NA NA EFHD2,CTRC,CELA2A,CELA2B IMR90 Hi-C 24141950 EFHD2 69936 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 16087189 16087372 16087266 Y EPHA2,FBLIM1 FBLIM1 NA NA NA NA FBLIM1 6087 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 16125579 16125747 16125670 Y FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2 FBLIM1,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA FBLIM1 44477 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 16175691 16176294 16176100 Y NA SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3049 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.988582198346214 chr1 16176617 16176801 16176705 Y RSC1A1,C1orf64,SPEN SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3975 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 16212759 16213091 16212941 Y EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 40117 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr1 16276028 16276482 16276329 Y CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17 ZBTB17 NA NA NA NA ZBTB17 24145 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 16339360 16339596 16339414 Y NA ZBTB17 NA NA NA NA ZBTB17 38733 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 16502532 16502678 16502612 Y C1orf64 RP11-276H7.2,EPHA2 CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHA2 21950 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 16508402 16508642 16508565 Y FBLIM1 RP11-276H7.2,EPHA2 NA NA NA NA EPHA2 27820 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 16511251 16511623 16511321 Y NA RP11-276H7.2,EPHA2 NA NA NA NA EPHA2 30669 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 16553276 16553594 16553536 Y NA RSG1 NA NA NA NA RSG1 8063 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 16696032 16696399 16696223 Y NA FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 19083 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA NA SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 60166 CAGE T98G hg19 FANTOM5 2.66917193553478 chr1 17231253 17231704 17231392 Y PADI4,PADI2 RP11-108M9.4 CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-108M9.4 17109 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA RP11-108M9.4 CROCC K562 ChIA-PET 22265404 RP11-108M9.4 26044 CAGE T98G hg19 FANTOM5 3.06460481487326 chr1 17494378 17494745 17494634 Y NA NA PADI2,PADI1,PADI3,PADI6 IMR90 Hi-C 24141950 SDHB 115713 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 17495208 17495390 17495300 Y NA NA PADI2,PADI1,PADI3,PADI6 IMR90 Hi-C 24141950 SDHB 116543 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 17534687 17534794 17534729 Y NA NA NA NA NA NA SDHB 156022 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 17578205 17578469 17578334 Y NA NA NA NA NA NA RCC2 185751 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr1 17867253 17867735 17867370 Y NA ARHGEF10L NA NA NA NA ARHGEF10L 2923 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 19274997 19275345 19275068 Y IFFO2 ALDH4A1,IFFO2 NA NA NA NA IFFO2 5835 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 19276270 19276542 19276361 Y AKR7A2 ALDH4A1,IFFO2 NA NA NA NA IFFO2 4638 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 19277155 19277462 19277361 Y UBR4,IFFO2 ALDH4A1,IFFO2 NA NA NA NA IFFO2 3718 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 19278388 19278892 19278719 Y UBR4,IFFO2 IFFO2 NA NA NA NA IFFO2 2288 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 19324821 19325090 19324988 Y TAS1R2,IFFO2 IFFO2 ALDH4A1,IFFO2,UBR4 IMR90 Hi-C 24141950 IFFO2 43641 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 19336477 19336714 19336579 Y NA NA UBR4,IFFO2,ALDH4A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFFO2 55297 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 19337577 19337942 19337698 Y NA NA UBR4,IFFO2,ALDH4A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFFO2 56397 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 20091332 20091506 20091448 Y PLA2G2A,TMCO4 TMCO4 NA NA NA NA TMCO4 32932 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr1 20204786 20204981 20204970 Y OTUD3 OTUD3 NA NA NA NA OTUD3 2025 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 20808010 20808395 20808205 Y NA CAMK2N1,MUL1 NA NA NA NA CAMK2N1 2318 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 21348947 21349299 21348998 Y CDA,ECE1,ECE1 RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 48947 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 21349725 21349786 21349755 Y EIF4G3 RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 48460 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 21475659 21476054 21476002 Y EIF4G3,EIF4G3 EIF4G3 NA NA NA NA EIF4G3 25323 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 21476251 21476624 21476546 Y NA EIF4G3 NA NA NA NA EIF4G3 24753 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 21588176 21588724 21588522 Y ECE1,ECE1 NA NA NA NA NA ECE1 81273 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr1 21618792 21618804 21618798 Y EIF4G3,ECE1,ALPL,ECE1,ECE1 NA NA NA NA NA ECE1 51193 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 21649091 21649481 21649332 Y EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1 ECE1 NA NA NA NA ECE1 20516 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 21966400 21966607 21966504 Y NA NA NA NA NA NA USP48 141492 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 22106565 22106957 22106761 Y NA USP48 NA NA NA NA USP48 1142 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 22692086 22692330 22692263 Y NA NA C1QC,C1QB,EPHB2,EPHA8,WNT4,C1QA IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB40 84014 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 23076914 23077145 23077061 Y NA EPHB2 NA NA NA NA EPHB2 41582 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 23387479 23387794 23387637 Y ZNF436 KDM1A LUZP1 IMR90 Hi-C 24141950 KDM1A 43538 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 23494015 23494642 23494449 Y NA LUZP1 NA NA NA NA LUZP1 7659 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 23523350 23523682 23523502 Y LUZP1,HTR1D LUZP1 NA NA NA NA LUZP1 21049 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 23669506 23669991 23669712 Y NA HNRNPR,C1orf213,ZNF436 NA NA NA NA HNRNPR 677 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 23721090 23721462 23721458 Y ZNF436 C1orf213,ZNF436 HNRNPR,ZNF436 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF436 27155 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 23881180 23881765 23881497 Y NA E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 2520 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 23882500 23882866 23882600 Y NA E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 1419 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 23888678 23889201 23888997 Y ID3 E2F2,ID3 NA NA NA NA ID3 4393 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 23961555 23961694 23961621 Y NA NA NA NA NA NA RPL11 54575 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 24349340 24349488 24349411 Y NA RP11-4M23.7 LYPLA2,SRSF10,MYOM3,PNRC2,SRRM1,HMGCL,IL22RA1,LOC100506963,TCEB3,GALE,FUCA1,CNR2,IL28RA,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-4M23.7 16331 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 24680333 24680598 24680466 Y NA NA NA NA NA NA NIPAL3 59686 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 24691833 24692082 24691893 Y PNRC2,GRHL3 NIPAL3 NA NA NA NA NIPAL3 48202 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.3840150776847 chr1 25051605 25051987 25051744 Y NA CLIC4 RUNX3,CLIC4,SRRM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIC4 17861 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 25566618 25566670 25566639 Y NA SYF2 SYF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SYF2 9625 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 25942744 25943208 25942998 Y EXTL1,MAN1C1 NA NA NA NA NA LDLRAP1 74673 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 26201699 26201757 26201716 Y SEPN1 RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1 NA NA NA NA RP1-125I3.2 17595 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 26452850 26453250 26452988 Y FAM54B,RPS6KA1,HMGN2,CEP85,CD52,PDIK1L PDIK1L,FAM110D,ZNF593 NA NA NA NA PDIK1L 17186 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 26827232 26827869 26827508 Y PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A RP3-476K8.4,HMGN2 HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HMGN2 30291 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 26907862 26908015 26907938 Y SH3BGRL3,UBXN11 NA NA NA NA NA HMGN2 110921 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 26946837 26947249 26947076 Y CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 73275 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 26947342 26948198 26947481 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72326 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr1 27024638 27025138 27024825 Y SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV ARID1A NA NA NA NA ARID1A 4114 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr1 27175784 27176273 27175984 Y C1orf172,AIM1L,ZNF683,RPS6KA1,SFN ZDHHC18,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA ZDHHC18 24583 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA GPN2 22861 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.3840150776847 chr1 27527451 27527688 27527509 Y NA SLC9A1,WDTC1 WDTC1,SLC9A1,C1orf172 IMR90 Hi-C 24141950 WDTC1 31319 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 27691785 27692261 27692091 Y TMEM222,MAP3K6 TMEM222,RP11-4K3__A.5,MAP3K6,GPR3 NA NA NA NA MAP3K6 402 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr1 27831022 27831314 27831199 Y NA WASF2 SYTL1,GPR3,WASF2,AHDC1,FGR IMR90 Hi-C 24141950 WASF2 16353 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 27853337 27854089 27853858 Y NA WASF2 NA NA NA NA WASF2 38668 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 27907931 27908052 27907995 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 20890 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 27916292 27916674 27916513 Y XKR8,AHDC1 AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 12268 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 27924204 27924421 27924302 Y XKR8,AHDC1 AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 4521 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 27985480 27985709 27985578 Y EYA3,STX12,C1orf38,FGR,FGR,FGR IFI6 NA NA NA NA IFI6 11020 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 28189568 28190269 28189912 Y SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,EYA3,WASF2,FGR,FGR,FGR,STX12,XKR8,C1orf38 PPP1R8,SCARNA1,RPA2 NA NA NA NA SCARNA1 30656 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 28573636 28574084 28573917 Y NA DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 9954 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr1 28576012 28576248 28576109 Y STX12,C1orf38,EYA3,PTAFR,PTAFR,GMEB1,SESN2,MED18 DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 7790 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 29451057 29451462 29451431 Y TMEM200B,TMEM200B NA NA NA NA NA SRSF4 55037 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 29504261 29504387 29504317 Y YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4 SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2112 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 29517304 29517322 29517313 Y NA SRSF4,MECR,PTPRU NA NA NA NA SRSF4 10805 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 29564766 29564995 29564881 Y NA MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 3738 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 29565762 29566055 29565979 Y SRSF4,PTPRU MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 4734 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 31231730 31232072 31231886 Y NA LAPTM5 NA NA NA NA LAPTM5 3063 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NKAIN1 82443 CAGE T98G hg19 FANTOM5 2.57031371570016 chr1 31628220 31628457 31628359 Y NA NA PUM1,NKAIN1,SERINC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NKAIN1 81944 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr1 31643824 31643962 31643871 Y NA NA NA NA NA NA NKAIN1 66439 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 32180603 32180986 32180867 Y PEF1,SPOCD1,COL16A1 COL16A1,BAI2 PEF1,COL16A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL16A1 12683 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 32253647 32254040 32253861 Y LCK BAI2,SPOCD1 NA NA NA NA BAI2 25153 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 32420307 32420572 32420414 Y TMEM234,PEF1,PTP4A2,PTP4A2 PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A2 11850 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 32421622 32422096 32421696 Y MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1 PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A2 13165 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 32732571 32732683 32732626 Y LCK EIF3I,TMEM234,MTMR9LP,HDAC1 NA NA NA NA HDAC1 23004 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 32966228 32966602 32966575 Y FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A ZBTB8B,ZBTB8A NA NA NA NA ZBTB8A 36426 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 33131314 33131452 33131383 Y NA ZBTB8OS,RBBP4,SYNC NA NA NA NA RBBP4 16571 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 33225777 33226084 33225890 Y TMEM54,KIAA1522 KIAA1522 NA NA NA NA KIAA1522 20291 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 33427851 33428169 33427991 Y PHC2,RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 117 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 33428474 33429020 33428770 Y NA RNF19B NA NA NA NA RNF19B 188 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 33457914 33458607 33458311 Y RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 29628 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 33564918 33565286 33565197 Y NA AK2,ADC NA NA NA NA ADC 20213 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 33829513 33829825 33829684 Y FNDC5,ZSCAN20 NA NA NA NA NA PHC2 64828 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 35394262 35394654 35394275 Y NA NA NA NA NA NA ZMYM6NB 54300 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 35891843 35891965 35891904 Y NA NA NA NA NA NA NCDN 129109 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 35892196 35892421 35892350 Y NA NA NA NA NA NA NCDN 128653 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 35935390 35935771 35935662 Y NA NA NA NA NA NA NCDN 85303 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 36103028 36103196 36103152 Y NA PSMB2 TFAP2E IMR90 Hi-C 24141950 PSMB2 2249 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.18629863801546 chr1 36183411 36183689 36183588 Y C1orf216 C1orf216,CLSPN NA NA NA NA C1orf216 338 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 36428229 36428381 36428320 Y STK40,EIF2C4,THRAP3,EIF2C1,EIF2C3 NA NA NA NA NA ADPRHL2 124095 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 36616485 36616868 36616577 Y STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1 TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 2312 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 36626561 36626969 36626609 Y STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2,MAP7D1,THRAP3 TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 7381 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 36815580 36815775 36815719 Y NA SH3D21,STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 33722 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 36839449 36839891 36839558 Y EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 9606 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 36840093 36840535 36840445 Y EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 8962 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 36849527 36849580 36849557 Y EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 30 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 36866636 36866899 36866720 Y LSM10 STK40,LSM10,OSCP1 NA NA NA NA LSM10 5143 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 37937293 37937526 37937471 Y YRDC,MTF1,C1orf122,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA LINC01137 486 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 37944084 37944971 37944382 Y YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA ZC3H12A 5931 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 38317043 38317898 38317556 Y ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1 C1orf122,YRDC,MTF1 NA NA NA NA MTF1 5394 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 38466019 38466413 38466271 Y NA SF3A3,FHL3,UTP11L,POU3F1,RP5-884C9.2 NA NA NA NA FHL3 2865 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 39516193 39516422 39516273 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 26203 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 39596184 39596482 39596236 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 51196 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 39736190 39736575 39736327 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0754 137576 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 40628781 40629153 40628997 Y NA RLF NA NA NA NA RLF 3736 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 40848967 40849502 40849291 Y MFSD2A,RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2 SMAP2 NA NA NA NA SMAP2 40445 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 40866111 40866454 40866257 Y RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2,SMAP2 NA NA NA NA NA SMAP2 57589 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 41178788 41178979 41178866 Y ZMPSTE24,SMAP2,SMAP2,ZNF642,DEM1,ZNF684,CITED4,NFYC,NFYC RIMS3,NFYC KCNQ4 IMR90 Hi-C 24141950 NFYC 23468 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 41343431 41343839 41343651 Y NA CITED4 KCNQ4,CTPS,NFYC,CITED4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED4 17413 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 41501440 41501773 41501639 Y NA NA NA NA NA NA CITED4 175422 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 41501908 41501999 41501966 Y SCMH1 NA NA NA NA NA CITED4 175890 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 41564044 41564297 41564171 Y NA NA NA NA NA NA SCMH1 141529 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 41622480 41622650 41622563 Y NA NA CTPS,LOC100507178 IMR90 Hi-C 24141950 SCMH1 83176 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 41650800 41651168 41651109 Y KCNQ4,SCMH1,SCMH1,SCMH1 NA NA NA NA NA SCMH1 54658 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 41826642 41826952 41826745 Y NA FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 1048 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 41831444 41831806 41831485 Y SCMH1 FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 5850 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 41961925 41962146 41962029 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 136331 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 41981831 41982007 41981926 Y SLFNL1,SLFNL1 NA NA NA NA NA FOXO6 156237 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 42071739 42071927 42071841 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 246145 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 42127851 42128791 42128091 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 302257 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.18629863801546 chr1 42328578 42328878 42328730 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 170718 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 42356899 42357259 42356906 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 142337 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 42367142 42367456 42367439 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 132140 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 42774668 42774801 42774679 Y CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3 FOXJ3 NA NA NA NA FOXJ3 24747 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 43389220 43390772 43390027 Y NA SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 31758 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 43405621 43405821 43405630 Y CCDC30,CCDC23,ERMAP,SZT2,SLC2A1 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 16709 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 43406108 43407009 43406836 Y YBX1,ERMAP,SZT2 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 15521 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr1 43428386 43429108 43428580 Y CLDN19,CCDC23,ERMAP,SLC2A1 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1-AS1 5666 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 43429290 43429917 43429491 Y CCDC23,ERMAP,SLC2A1 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1-AS1 6570 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 43432863 43433109 43432938 Y CCDC30,SLC2A1 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1-AS1 10143 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 44150815 44151139 44150977 Y ST3GAL3,SLC6A9,IPO13 KDM4A,ST3GAL3 NA NA NA NA ST3GAL3 18356 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 44452990 44453115 44453039 Y NA RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9 NA NA NA NA CCDC24 1916 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 44495684 44496307 44495779 Y NA CCDC24,SLC6A9 B4GALT2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC6A9 545 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 44950888 44951090 44950987 Y NA NA NA NA NA NA RNF220 82022 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 45192729 45193123 45192925 Y NA RNU5F-1,RNU5D-1,KIF2C,RPS8,SNORD55 KIF2C IMR90 Hi-C 24141950 RNU5D-1 1719 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 45283789 45284126 45283958 Y NA RPS8,SNORD55,RPS15AP11,PLK3,TCTEX1D4,BTBD19,RNU5E-6P,PTCH2 NA NA NA NA RNU5E-6P 120 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 45787067 45787234 45787139 Y NA ZSWIM5,TOE1,MUTYH NA NA NA NA TOE1 16108 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 45990749 45991039 45990946 Y NA TESK2,MMACHC,CCDC163P,PRDX1,AKR1A1 NA NA NA NA PRDX1 4030 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr1 46111666 46112048 46111975 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 3450 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 46268583 46268737 46268651 Y NA MAST2 NA NA NA NA MAST2 17924 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 46575103 46575175 46575140 Y PIK3R3,PIK3R3 NA NA NA NA NA TSPAN1 63570 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 47800262 47800514 47800436 Y NA STIL,CMPK1 NA NA NA NA CMPK1 2793 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 51245588 51245972 51245952 Y NA NA NA NA NA NA CFL1P2 376171 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 51312022 51312165 51312091 Y NA NA NA NA NA NA CFL1P2 309978 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 51703075 51703494 51703244 Y OSBPL9 RNF11 NA NA NA NA RNF11 3132 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 51809780 51810107 51809799 Y NA NA NA NA NA NA RNF11 109837 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 51986075 51986410 51986173 Y NA RP11-191G24.1,EPS15 NA NA NA NA EPS15 3075 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 52173889 52173954 52173921 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL9 133038 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 52193179 52193464 52193255 Y NA NA NA NA NA NA NRD1 149013 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 52885344 52885737 52885540 Y ZCCHC11 ORC1,PRPF38A NA NA NA NA PRPF38A 17108 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 53403571 53403705 53403636 Y NA SCP2 NA NA NA NA SCP2 12670 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 53702100 53702340 53702220 Y NA CPT2,C1orf123 NA NA NA NA MAGOH 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 54286238 54286401 54286368 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 68006 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 54441729 54442008 54441915 Y NA HSPB11,LRRC42 NA NA NA NA LRRC42 31979 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 54700132 54700688 54700499 Y NA CYB5RL NA NA NA NA CYB5RL 36423 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 54873075 54873515 54873406 Y SSBP3,SSBP3 SSBP3 NA NA NA NA SSBP3 3637 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 54953784 54954325 54954090 Y SSBP3,SSBP3 NA TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP3 76632 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 55594097 55594408 55594328 Y NA NA PCSK9 IMR90 Hi-C 24141950 USP24 84378 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 55894779 55895033 55894906 Y NA NA PPAP2B IMR90 Hi-C 24141950 USP24 215993 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 56184456 56184884 56184686 Y NA NA PRKAA2,PPAP2B IMR90 Hi-C 24141950 USP24 505670 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 57043287 57044160 57043621 Y PRKAA2,PPAP2B NA NA NA NA NA PPAP2B 64814 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 57995135 57995251 57995193 Y NA NA NA NA NA NA PPAP2B 886161 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 58317106 58317467 58317287 Y NA NA NA NA NA NA DAB1 692939 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 59050239 59050578 59050488 Y NA DAB1,OMA1 MYSM1,FGGY,OMA1 IMR90 Hi-C 24141950 OMA1 39765 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 59221049 59221462 59221387 Y NA JUN FGGY,HSD52,LOC100131060,JUN,MIR4711 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JUN 26323 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 59228706 59229186 59229035 Y NA JUN NA NA NA NA JUN 18599 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 59232576 59232611 59232594 Y NA JUN NA NA NA NA JUN 15174 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 59281873 59282217 59282125 Y MYSM1,FGGY,JUN JUN NA NA NA NA JUN 34088 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 59369049 59370138 59369602 Y FGGY NA NA NA NA NA RP4-794H19.4 113921 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 59522982 59523218 59523118 Y NA RP4-794H19.4 FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-794H19.4 38923 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 59608749 59609120 59609039 Y NA NA NA NA NA NA RP4-794H19.4 124690 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 60142118 60142218 60142180 Y FGGY NA NA NA NA NA FGGY 381808 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 60144543 60144796 60144669 Y FGGY NA NA NA NA NA FGGY 384233 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr1 60148393 60148656 60148541 Y FGGY NA NA NA NA NA FGGY 388083 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 60157078 60157331 60157204 Y NA NA NA NA NA NA FGGY 396768 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 60172811 60173111 60172976 Y NA NA NA NA NA NA FGGY 412501 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 60196566 60196799 60196671 Y NA NA NA NA NA NA FGGY 436256 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 61369297 61369400 61369351 Y NA NFIA NA NA NA NA NFIA 40366 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 61918819 61919182 61919004 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA TM2D1 269913 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 62119868 62120084 62119981 Y NA NA TM2D1,INADL IMR90 Hi-C 24141950 TM2D1 69011 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 62208815 62209373 62208933 Y NA TM2D1,INADL NA NA NA NA INADL 2666 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 63022251 63022602 63022448 Y NA NA NA NA NA NA USP1 122283 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 63151036 63151115 63151076 Y NA DOCK7,RP11-230B22.1 NA NA NA NA DOCK7 854 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 64223023 64223051 64223037 Y NA ROR1 ROR1 IMR90 Hi-C 24141950 ROR1 14642 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 64254998 64255371 64255034 Y ROR1 ROR1 NA NA NA NA ROR1 17305 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 65292575 65293034 65292898 Y NA NA NA NA NA NA RAVER2 83797 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 65381647 65381826 65381744 Y JAK1 JAK1 NA NA NA NA JAK1 48361 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 65387772 65388547 65388120 Y JAK1 JAK1 NA NA NA NA JAK1 41640 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 65421731 65422136 65422135 Y NA JAK1 NA NA NA NA JAK1 8051 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 66770897 66771283 66771085 Y NA NA NA NA NA NA SGIP1 225783 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 67029191 67029437 67029359 Y NA SGIP1 NA NA NA NA SGIP1 32125 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 67029939 67030347 67030122 Y PDE4B SGIP1 NA NA NA NA SGIP1 32873 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 67374841 67375185 67375111 Y SGIP1,WDR78 WDR78,MIER1 NA NA NA NA WDR78 13385 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 67460593 67460710 67460683 Y NA NA NA NA NA NA SLC35D1 57072 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 68036173 68036524 68036291 Y NA NA GADD45A,GNG12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GADD45A 112220 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 68118588 68118809 68118774 Y GADD45A GADD45A GADD45A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GADD45A 29935 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 68257383 68257657 68257565 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 39493 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 68285768 68286070 68285946 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 11080 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 68849988 68850367 68850179 Y NA NA LOC100289178,WLS,RPE65 IMR90 Hi-C 24141950 DEPDC1 110537 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 68945486 68945782 68945636 Y NA DEPDC1 NA NA NA NA DEPDC1 15122 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 68961350 68961555 68961472 Y NA DEPDC1 NA NA NA NA DEPDC1 446 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 70017370 70017628 70017440 Y NA LRRC7 NA NA NA NA LRRC7 14453 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 70034819 70036254 70034877 Y NA LRRC7 NA NA NA NA LRRC7 2738 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 70691921 70692281 70691982 Y ANKRD13C,LRRC40,SRSF11 LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4 NA NA NA NA RP4-677H15.4 7215 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 70709017 70709466 70709138 Y NA LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4 NA NA NA NA RP4-677H15.4 24311 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 70746826 70747040 70746993 Y ANKRD13C NA NA NA NA NA RP4-677H15.4 62120 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 71480052 71480316 71480184 Y NA PTGER3 NA NA NA NA PTGER3 31175 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 72749220 72749791 72749447 Y NEGR1 NEGR1 NA NA NA NA NEGR1 2803 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr1 75435312 75435653 75435508 Y NA NA NA NA NA NA LHX8 156466 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 77595980 77596376 77595997 Y NA RP4-706A16.3 NA NA NA NA RP4-706A16.3 3212 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 77713696 77713788 77713742 Y NA PIGK,AK5 PIGK,AK5,ZZZ3 IMR90 Hi-C 24141950 PIGK 30581 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 77872388 77872776 77872582 Y NA NA NA NA NA NA AK5 126652 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 78002564 78002920 78002661 Y NA NA ZZZ3 IMR90 Hi-C 24141950 ZZZ3 144184 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 78021710 78022056 78021808 Y AK5,AK5,FAM73A NA NA NA NA NA ZZZ3 125048 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 78067790 78068312 78068066 Y NA NA NA NA NA NA ZZZ3 78792 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 78348123 78348428 78348274 Y ZZZ3,FAM73A NEXN NA NA NA NA NEXN 3770 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 78350506 78350835 78350671 Y FAM73A NEXN NA NA NA NA NEXN 1363 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 78404062 78404594 78404354 Y NA FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA FUBP1 38200 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 78441093 78441406 78441347 Y NA FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA FUBP1 1388 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 78469106 78469287 78469191 Y DNAJB4 FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA DNAJB4 26247 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 78557346 78557710 78557476 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 114487 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 78567287 78567595 78567375 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 124428 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 78957462 78957762 78957688 Y PTGFR NA NA NA NA NA IFI44L 125845 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr1 79215772 79216132 79215819 Y NA NA NA NA NA NA IFI44 102291 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 82268420 82269588 82268555 Y LPHN2 NA NA NA NA NA ST13P20 83042 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 84710038 84710507 84710127 Y NA NA NA NA NA NA PRKACB 168293 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 84970111 84970722 84970500 Y NA RPF1 NA NA NA NA GNG5 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 84971050 84971209 84971115 Y MCOLN2,GNG5 RPF1,GNG5 NA NA NA NA GNG5 802 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr1 85038681 85038996 85038864 Y MCOLN2,GNG5,CTBS CTBS NA NA NA NA CTBS 518 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 85448315 85448716 85448516 Y NA MCOLN2,WDR63 NA NA NA NA MCOLN2 12080 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 85643319 85643587 85643547 Y NA SYDE2 MIR4423 IMR90 Hi-C 24141950 SYDE2 21142 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 85667688 85667915 85667906 Y NA SYDE2 NA NA NA NA SYDE2 2959 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 85744584 85744829 85744751 Y BCL10 C1orf52,BCL10 NA NA NA NA BCL10 3811 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 85992810 85993270 85993105 Y NA DDAH1 NA NA NA NA DDAH1 48663 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 86010067 86010444 86010393 Y NA DDAH1,CYR61 NA NA NA NA DDAH1 31489 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 86016463 86016866 86016755 Y NA DDAH1,CYR61,RP11-290M5.2 NA NA NA NA DDAH1 25067 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 86035824 86036171 86035900 Y NA DDAH1,CYR61,RP11-290M5.2 NA NA NA NA DDAH1 5762 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 86049987 86050100 86050044 Y NA DDAH1,CYR61,RP11-290M5.2 NA NA NA NA CYR61 5543 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 86072885 86073441 86073156 Y CYR61 DDAH1,CYR61,RP11-290M5.2 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-290M5.2 10071 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 86077578 86077925 86077749 Y DDAH1,CYR61 DDAH1,CYR61,RP11-290M5.2 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-290M5.2 14764 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 86078461 86078819 86078680 Y DDAH1,CYR61 DDAH1,CYR61,RP11-290M5.2 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-290M5.2 15647 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 87355999 87356364 87356182 Y NA SEP15,HS2ST1 NA NA NA NA SEP15 21743 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 87799623 87799998 87799801 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 7472 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 87800631 87801610 87800748 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 8480 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 88150561 88150732 88150650 Y NA NA LMO4 IMR90 Hi-C 24141950 LMO4 358410 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 88292387 88292883 88292561 Y NA NA LMO4 IMR90 Hi-C 24141950 LMO4 500236 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 89303069 89303193 89303134 Y GBP4,GBP2,GTF2B NA NA NA NA NA GTF2B 52434 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 89466934 89467175 89467138 Y GTF2B,GBP2,GBP3 CCBL2,RBMXL1,GBP3 NA NA NA NA RBMXL1 10291 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 89739985 89740544 89740197 Y GTF2B,GBP3,GBP1,GBP2,LRRC8C,GBP4,GBP5 GBP5 NA NA NA NA GBP5 3441 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 90101821 90102213 90101853 Y ZNF326,LRRC8D,GBP4,GBP5,LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C LRRC8C NA NA NA NA LRRC8C 5190 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 90321378 90321621 90321467 Y LRRC8C,ZNF326 LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 36805 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 90372321 90372729 90372378 Y LRRC8B,LRRC8C,LRRC8D,ZNF326 NA NA NA NA NA GEMIN8P4 85151 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 90376424 90376756 90376561 Y LRRC8D,LRRC8D,ZNF326 NA NA NA NA NA GEMIN8P4 81124 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 91472225 91472812 91472773 Y NA ZNF644 NA NA NA NA ZNF644 13017 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 92201825 92202076 92201951 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR3 167816 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 92218581 92218971 92218958 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR3 150921 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 92270160 92270686 92270504 Y RPAP2,GLMN NA NA NA NA NA TGFBR3 99206 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 92295673 92296022 92295848 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR3 73870 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 92725087 92725311 92725273 Y RPAP2,GLMN RPAP2,GLMN NA NA NA NA RPAP2 37211 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 93003662 93004045 93003868 Y RPAP2,GLMN,RPL5,GFI1 NA NA NA NA NA RNU4-59P 160446 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 93427945 93428408 93428079 Y MTF2,DR1,FAM69A FAM69A NA NA NA NA FAM69A 2888 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 93694062 93694249 93694102 Y MTF2,CCDC18 TMED5 NA NA NA NA TMED5 49777 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 93773027 93773315 93773230 Y NA DR1,RP4-717I23.3 NA NA NA NA DR1 36130 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 93812976 93813243 93813111 Y NA DR1,RP4-717I23.3 NA NA NA NA RP4-717I23.3 3394 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 93914812 93914954 93914881 Y FNBP1L FNBP1L NA NA NA NA FNBP1L 3124 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 94007993 94008357 94008092 Y FNBP1L,BCAR3 NA NA NA NA NA FNBP1L 96305 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 94021310 94021626 94021469 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 109622 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 94023703 94024059 94023930 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 112015 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 94038553 94038921 94038737 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 126865 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 94084336 94084510 94084423 Y NA NA NA NA NA NA RP11-488P3.1 154490 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 94127789 94128026 94127840 Y GCLM,TMED5,DNTTIP2 NA NA NA NA NA RP11-488P3.1 110974 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.988582198346214 chr1 94133922 94134283 94134103 Y FNBP1L NA NA NA NA NA RP11-488P3.1 104717 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 94145547 94146118 94145739 Y NA NA NA NA NA NA RP11-488P3.1 92882 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 94158601 94159338 94158654 Y GCLM,DNTTIP2,BCAR3 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488P3.1 79662 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.988582198346214 chr1 94168203 94168325 94168229 Y NA NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488P3.1 70675 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 94224546 94224929 94224684 Y DNTTIP2 RP11-488P3.1 MIR760,BCAR3,LOC100129046,FNBP1L IMR90 Hi-C 24141950 RP11-488P3.1 14071 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 94371317 94371601 94371445 Y NA DNTTIP2,GCLM NA NA NA NA GCLM 1365 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 94429275 94429464 94429371 Y GCLM NA ABCA4,ARHGAP29 IMR90 Hi-C 24141950 GCLM 56309 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 94701813 94701865 94701839 Y ARHGAP29 ARHGAP29 NA NA NA NA ARHGAP29 36759 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 94712395 94712617 94712502 Y ARHGAP29 ARHGAP29 ABCA4,ARHGAP29,ABCD3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP29 26007 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 94792807 94793133 94793077 Y ARHGAP29 NA ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP29 54183 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 95007995 95008302 95008221 Y NA F3 NA NA NA NA F3 2639 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 95113814 95114327 95114013 Y F3 NA F3,ABCD3,SLC44A3 IMR90 Hi-C 24141950 F3 108458 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 95221261 95221551 95221307 Y NA NA F3,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 62286 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 95551114 95551338 95551185 Y NA ALG14,TMEM56 ALG14,TMEM56-RWDD3,SLC44A3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ALG14 14613 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 96828119 96828533 96828302 Y NA NA PTBP2 IMR90 Hi-C 24141950 EEF1A1P11 81953 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 97679239 97679556 97679405 Y NA NA NA NA NA NA SEC63P1 329701 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 98011760 98012364 98012119 Y NA SEC63P1 NA NA NA NA SEC63P1 2503 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 98177967 98178251 98178164 Y NA NA NA NA NA NA SEC63P1 168710 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 98373500 98373836 98373707 Y NA DPYD NA NA NA NA DPYD 10769 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 98606055 98606462 98606113 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1070A16.1 67841 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 100169951 100170218 100170031 Y NA NA NA NA NA NA FRRS1 59969 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 100502622 100502881 100502754 Y NA HIAT1 NA NA NA NA HIAT1 969 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 100555117 100555459 100555393 Y NA SASS6 NA NA NA NA SASS6 41052 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 100703358 100703606 100703422 Y NA DBT,RP11-305E17.6 NA NA NA NA DBT 9784 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 100827551 100827774 100827683 Y SLC35A3,HIAT1,CDC14A CDC14A NA NA NA NA CDC14A 18967 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 100966297 100966321 100966309 Y NA NA NA NA NA NA CDC14A 157713 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 101202267 101202571 101202418 Y NA VCAM1 NA NA NA NA VCAM1 18969 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 101757305 101757513 101757430 Y NA NA SLC30A7,DPH5 IMR90 Hi-C 24141950 S1PR1 56861 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 108132692 108133060 108132878 Y NTNG1,NTNG1,VAV3 NA NA NA NA NA PRMT6 535425 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 108143362 108143805 108143489 Y NA NA NA NA NA NA PRMT6 546095 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 108673419 108673672 108673564 Y FAM102B NA NA NA NA NA SLC25A24 67799 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 108741685 108742156 108741931 Y FAM102B SLC25A24 NA NA NA NA SLC25A24 214 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 109079557 109079899 109079743 Y NA FAM102B NA NA NA NA FAM102B 20812 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 109133637 109134097 109133761 Y TMEM167B,STXBP3,PRPF38B,FAM102B FAM102B NA NA NA NA FAM102B 32926 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 109262615 109262764 109262672 Y NA PRPF38B,STXBP3 NA NA NA NA STXBP3 24532 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 109467804 109468470 109468110 Y GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1 AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 35636 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 109499781 109500180 109500079 Y NA AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 3926 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 109784080 109784425 109784202 Y NA SARS,CELSR2,PSRC1 CELSR2 IMR90 Hi-C 24141950 CELSR2 6216 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 109788948 109789150 109789063 Y GSTM3 SARS,CELSR2,PSRC1 CELSR2 IMR90 Hi-C 24141950 CELSR2 1491 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 109841804 109842152 109841978 Y SORT1 PSRC1 NA NA NA NA PSRC1 17996 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 110320163 110320291 110320225 Y NA GSTM3 CSF1,AHCYL1,CYB561D1,ATXN7L2,GPR61,GNAI3,AMIGO1,AMPD2,GNAT2,GSTM4,GSTM5,EPS8L3,FAM40A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GSTM3 37779 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 110334849 110335164 110334977 Y NA NA CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GSTM3 52465 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 110363861 110364229 110364029 Y GNAI3,AMPD2 NA CSF1,AHCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 GSTM3 81477 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 110366477 110366702 110366587 Y GSTM2,CSF1 NA CSF1,AHCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 GSTM3 84093 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 110406868 110407271 110407021 Y GNAI3,CSF1 CSF1 CSF1,GSTM2,GSTM4,GNAI3,AHCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 CSF1 43593 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 110420039 110420145 110420092 Y UBL4B CSF1 CSF1,AHCYL1,EPS8L3,GNAI3,CYB561D1,ATXN7L2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CSF1 30719 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 110927812 110928210 110927883 Y CD53,FAM40A,RBM15 RBM15,LAMTOR5-AS1,SLC16A4 NA NA NA NA SLC16A4 3494 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 111189973 111190443 111190155 Y LRIF1,CD53,KCNA3 NA NA NA NA NA SLC16A4 258269 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 112013331 112014031 112013881 Y C1orf183,C1orf183,RAP1A,C1orf162 OVGP1,ATP5F1,WDR77 NA NA NA NA WDR77 23333 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 112050044 112050594 112050328 Y C1orf183,C1orf183,CEPT1,DRAM2,RAP1A,C1orf162,ADORA3 RAP1A NA NA NA NA RAP1A 32246 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 112163826 112164071 112163877 Y C1orf183,C1orf183,C1orf162,RAP1A NA NA NA NA NA RAP1A 80986 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 113072370 113072489 113072380 Y NA NA NA NA NA NA CAPZA1 87306 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 113086746 113087141 113086830 Y NA NA NA NA NA NA CAPZA1 72654 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 114950620 114950667 114950644 Y NA NA NA NA NA NA TRIM33 101114 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 115605190 115605611 115605404 Y BCAS2,SIKE1 TSPAN2,RP4-666F24.3 NA NA NA NA TSPAN2 24510 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 115722074 115722498 115722181 Y NGF NA NGF IMR90 Hi-C 24141950 RP4-666F24.3 81781 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 115732772 115733197 115732900 Y NGF NA NGF IMR90 Hi-C 24141950 RP4-666F24.3 92479 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 116088478 116088732 116088606 Y NA NA NGF,VANGL1,SYCP1 IMR90 Hi-C 24141950 VANGL1 93842 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 116520279 116520650 116520380 Y ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,SLC22A15 SLC22A15 NA NA NA NA SLC22A15 3160 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 116918317 116918655 116918398 Y NA ATP1A1,ATP1A1OS NA NA NA NA ATP1A1 5027 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 116918925 116919548 116919274 Y SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1 ATP1A1,ATP1A1OS NA NA NA NA ATP1A1 5635 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 117256857 117256976 117256917 Y NA IGSF3 CD101,TTF2 IMR90 Hi-C 24141950 IGSF3 48482 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 117493512 117493635 117493571 Y NA PTGFRN CD101 IMR90 Hi-C 24141950 PTGFRN 42833 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 118153815 118153988 118153913 Y FAM46C FAM46C NA NA NA NA FAM46C 7259 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 118653984 118654263 118654124 Y NA NA NA NA NA NA WDR3 183641 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 120188395 120188927 120188667 Y NA PHGDH NA NA NA NA ZNF697 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr1 144533627 144534178 144533764 Y PDE4DIP RNU1-59P PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNU1-59P 1589 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr1 144871122 144871347 144871255 Y PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10 NA NA NA NA NA NBPF9 61378 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 144941125 144941602 144941408 Y NA RNU2-38P NA NA NA NA RNU2-38P 1070 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr1 144993199 144993244 144993232 Y NA NA NA NA NA NA RNU2-38P 50527 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 145000077 145000849 145000623 Y NA NA NA NA NA NA RNU2-38P 57405 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 145012331 145013054 145012678 Y NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 61132 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 145090155 145090603 145090483 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP PDE4DIP,SEC22B NBPF9,LOC653513,PDE4DIP,NOTCH2NL,SEC22B,LOC728875,NBPF10 IMR90 Hi-C 24141950 SEC22B 3617 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 145092450 145092883 145092733 Y SEC22B,PDE4DIP PDE4DIP,SEC22B NBPF9,LOC653513,PDE4DIP,NOTCH2NL,SEC22B,LOC728875,NBPF10 IMR90 Hi-C 24141950 SEC22B 1337 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNVU1-6 16003 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr1 145455122 145455741 145455465 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L,RBM8A NA NA NA NA POLR3GL 12647 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr1 146999335 146999532 146999436 Y NA BCL9 BCL9 IMR90 Hi-C 24141950 BCL9 11650 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 147080043 147080251 147080097 Y PRKAB2,CHD1L,BCL9 NA NA NA NA NA ACP6 60367 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 147104963 147105320 147105142 Y NA ACP6 NA NA NA NA ACP6 35298 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 147806841 147807184 147807140 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 1955 CAGE T98G hg19 FANTOM5 4.54747811239258 chr1 148000699 148000802 148000795 Y NA RNVU1-13 NA NA NA NA RNVU1-13 8553 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 149821015 149821647 149821349 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 372 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 150135231 150135764 150135536 Y PRPF3,MCL1,PLEKHO1 PLEKHO1 NA NA NA NA PLEKHO1 15858 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 150185878 150186128 150186012 Y HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E ANP32E,RNU2-17P NA NA NA NA ANP32E 20376 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 150577042 150577503 150577391 Y CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 22585 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 150800498 150800843 150800671 Y NA ARNT NA NA NA NA ARNT 46401 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 150949569 150950014 150949933 Y ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A CERS2,FAM63A,PRUNE NA NA NA NA CERS2 4090 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 151168297 151168505 151168391 Y BNIPL,TUFT1,SCNM1 SCNM1,LYSMD1,VPS72 NA NA NA NA PIP5K1A 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 151168916 151169086 151168995 Y NA SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 491 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 151172142 151172526 151172243 Y FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4 SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 3717 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 151184646 151184728 151184696 Y NA LYSMD1,VPS72,PIP5K1A,PSMD4 NA NA NA NA PIP5K1A 16221 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 151284018 151284391 151284246 Y FAM63A,CDC42SE1,TNFAIP8L2,ZNF687,RFX5,PI4KB,PI4KB ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB,RP11-126K1.6,RFX5 NA NA NA NA PI4KB 13800 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 151913815 151914271 151914054 Y S100A10 THEM4 S100A10,CELF3,THEM4,RORC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THEM4 33531 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 151918166 151918684 151918434 Y NA THEM4,S100A10,NBPF18P S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THEM4 37882 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 151960875 151961433 151961102 Y S100A11,S100A10 S100A10,NBPF18P NA NA NA NA S100A10 3433 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 152140379 152140745 152140485 Y NA NA NA NA NA NA S100A11 121996 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 153504746 153504953 153504860 Y PGLYRP3,S100A7L2,SLC39A1 BX470102.3,S100A6,S100A3,S100A4,S100A2 NA NA NA NA BX470102.3 667 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 153767353 153767730 153767624 Y NA SLC27A3 NA NA NA NA SLC27A3 22523 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 153841080 153841191 153841137 Y NA NA NA NA NA NA GATAD2B 52260 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 153853385 153853782 153853590 Y NA GATAD2B NA NA NA NA GATAD2B 39669 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 153936554 153936861 153936642 Y UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4 GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9 NA NA NA NA CREB3L4 1149 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr1 154154606 154155027 154154830 Y SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3 TPM3,UBAP2L,C1orf43 NA NA NA NA TPM3 10097 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 154302207 154302441 154302288 Y CHRNB2,ATP8B2 ATP8B2 NA NA NA NA ATP8B2 6178 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 154699087 154699216 154699140 Y NA NA NA NA NA NA ADAR 100612 CAGE T98G hg19 FANTOM5 4.94291099173107 chr1 154957258 154957622 154957425 Y NA PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B NA NA NA NA FLAD1 3444 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 154973036 154973200 154973120 Y CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1 PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr1 154973335 154973935 154973656 Y ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 208 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 155164183 155164959 155164537 Y NA TRIM46,KRTCAP2,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA NA NA NA NA MIR92B 1215 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr1 155496665 155497012 155496914 Y DCST1,HCN3,YY1AP1,ASH1L ASH1L-AS1,ASH1L NA NA NA NA ASH1L-AS1 32809 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 155535083 155535193 155535176 Y HCN3 ASH1L-AS1,ASH1L NA NA NA NA ASH1L 4485 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 155620238 155620623 155620432 Y NA DAP3,YY1AP1 NA NA NA NA DAP3 35128 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 155944562 155945214 155944815 Y C1orf182,C1orf61,SYT11,PAQR6,PAQR6 KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 NA NA NA NA ARHGEF2 29647 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 155946363 155946660 155946476 Y ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2 KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 RXFP4,KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 28201 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 156072500 156072641 156072571 Y NA LAMTOR2,MEX3A,LMNA LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3 IMR90 Hi-C 24141950 LMNA 22136 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 156073854 156074351 156074085 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA MEX3A,LMNA LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LMNA 23490 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 156074715 156075305 156075042 Y YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA MEX3A,LMNA LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LMNA 24351 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 156089405 156089622 156089466 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,ARHGEF2,LMNA MEX3A,LMNA NA NA NA NA LMNA 39041 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 156103413 156103690 156103594 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,LMNA NA NA NA NA NA LMNA 53049 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 156118146 156118395 156118328 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2 SLC25A44 NA NA NA NA SLC25A44 43485 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 156251648 156251762 156251690 Y RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44 BGLAP,SMG5,TMEM79,C1orf85 NA NA NA NA TMEM79 922 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 156426931 156427503 156427197 Y ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 41117 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 156472693 156472952 156472780 Y LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 4073 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 156474686 156475018 156474923 Y SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6066 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr1 156478154 156478558 156478328 Y NA MEF2D NA NA NA NA MEF2D 9534 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 156632199 156632473 156632320 Y NA RP11-284F21.7,CRABP2 NA NA NA NA RP11-284F21.7 2983 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 156718467 156719136 156718868 Y C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1 CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF NA NA NA NA PRCC 65 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 156966343 156966626 156966486 Y NA ARHGEF11 NA NA NA NA ARHGEF11 46536 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 157980631 157980890 157980708 Y KIRREL KIRREL NA NA NA NA KIRREL 19568 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr1 157989414 157989935 157989469 Y KIRREL KIRREL NA NA NA NA KIRREL 28351 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 157990877 157991211 157991044 Y NA KIRREL NA NA NA NA KIRREL 29814 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 158146699 158147069 158146946 Y NA ELL2P1,CD1D NA NA NA NA CD1D 668 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr1 158147244 158147839 158147743 Y NA ELL2P1 NA NA NA NA CD1D 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.48287329751932 chr1 159083627 159083815 159083767 Y NA AIM2 NA NA NA NA AIM2 31071 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 159851477 159851987 159851825 Y SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2 C1orf204,CCDC19,TAGLN2 NA NA NA NA CCDC19 15966 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 159859603 159860031 159859945 Y SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2 C1orf204,CCDC19,TAGLN2 C1orf204,SLAMF8 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC19 7922 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr1 159880076 159880706 159880437 Y FCRL6,DCAF8,TAGLN2 CCDC19,TAGLN2 NA NA NA NA CCDC19 12123 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 160242090 160242278 160242184 Y NA RP11-574F21.2,DCAF8,PEX19,SUMO1P3 NA NA NA NA DCAF8 10642 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 160696081 160696317 160696161 Y CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7 NA NA NA NA NA RP11-312J18.5 166453 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 160982920 160983992 160983766 Y CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30 F11R,USF1 NA NA NA NA F11R 5146 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 161359666 161360218 161359899 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 77619 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr1 161369073 161369991 161369486 Y NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 87026 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr1 161500608 161500899 161500816 Y USF1,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A,ATF6,HSPA6,FCGR3B,FCGR3A,FCGR3A NA NA NA NA NA DUSP12 216649 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 161582212 161582506 161582417 Y HSPA6,FCGR3A NA NA NA NA NA DUSP12 135042 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 161973003 161973384 161973069 Y NA OLFML2B NA NA NA NA OLFML2B 18260 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 161991847 161991976 161991911 Y OLFML2B OLFML2B,NOS1AP NA NA NA NA OLFML2B 203 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 162709795 162709973 162709884 Y NOS1AP,DDR2 NA NA NA NA NA DDR2 110632 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 165797615 165798367 165798308 Y UCK2 UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 2623 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 166828089 166828463 166828188 Y POU2F1,POGK POGK,TADA1 NA NA NA NA TADA1 15101 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 167191021 167191933 167191618 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 2955 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 167192959 167193266 167193111 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 4893 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 167322904 167323093 167323001 Y NA NA NA NA NA NA POU2F1 134838 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 167683554 167683813 167683605 Y POU2F1,CREG1 MPZL1 NA NA NA NA MPZL1 4616 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 167772811 167773182 167772825 Y CREG1 RP1-313L4.4 NA NA NA NA RP1-313L4.4 14304 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 168149052 168149361 168149233 Y NA GPR161,TIPRL,RPL34P1,SFT2D2 NA NA NA NA TIPRL 2881 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 168338134 168338331 168338175 Y NA NA NA NA NA NA TBX19 89856 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 168368318 168368620 168368438 Y TBX19 NA NA NA NA NA TBX19 120040 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 168526950 168527356 168527080 Y NA NA NA NA NA NA TBX19 278672 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 169834996 169835276 169835168 Y NA SCYL3 NA NA NA NA SCYL3 26132 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 169860308 169860488 169860348 Y KIFAP3,SCYL3 SCYL3 NA NA NA NA SCYL3 920 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 170042588 170042670 170042627 Y C1orf112 KIFAP3 NA NA NA NA KIFAP3 9679 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 170677232 170677374 170677311 Y PRRX1 NA NA NA NA NA GORAB 177962 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 171111810 171112100 171111910 Y NA NA NA NA NA NA FMO4 169247 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 171189238 171189444 171189341 Y NA NA NA NA NA NA FMO4 91903 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 171712214 171712716 171712399 Y FMO4,PRRC2C VAMP4,METTL13 NA NA NA NA VAMP4 2827 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 172291507 172291926 172291559 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 119304 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 172327558 172328156 172327708 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 83074 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 172466564 172466703 172466653 Y NA NA DNM3,DARS2,CENPL,C1orf9,C1orf105,FASLG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIGC 55334 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 172507125 172507604 172507262 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 95895 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 172804293 172804464 172804387 Y NA NA CENPL,DARS2,TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18 IMR90 Hi-C 24141950 PIGC 393063 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 172872881 172872916 172872899 Y NA NA TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,SNORD47,SNORD81,GAS5,SNORD75,ZBTB37,SNORD80,SNORD76,SNORD44,LOC100506046,SNORD77,SNORD79,SNORD78,DARS2 IMR90 Hi-C 24141950 PIGC 461651 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 172878579 172879356 172878831 Y TNFSF18 NA TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,SNORD81,GAS5,SNORD75,SNORD47,SNORD79,LOC100506046,SNORD77,DARS2,SNORD78,SNORD80,ZBTB37,SNORD44,SNORD76 IMR90 Hi-C 24141950 PIGC 467349 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr1 172903010 172903534 172903241 Y TNFSF18,TNFSF4 NA TNFSF4,LOC100506023,ZBTB37,GAS5,DARS2,CENPL IMR90 Hi-C 24141950 PIGC 491780 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 173328578 173328674 173328661 Y NA NA NA NA NA NA PRDX6 115731 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 173447359 173447668 173447399 Y PRDX6 PRDX6 NA NA NA NA PRDX6 2954 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 173909740 173909938 173909924 Y RC3H1,ZBTB37 NA NA NA NA NA GAS5 73720 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 174220636 174220943 174220783 Y RABGAP1L NA NA NA NA NA RABGAP1L 94088 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 174937322 174937525 174937409 Y KIAA0040,KIAA0040 CACYBP NA NA NA NA CACYBP 28775 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 175546934 175547327 175547131 Y NA NA NA NA NA NA RP11-318C24.1 341784 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 176601179 176601401 176601333 Y NA NA NA NA NA NA RP11-195C7.1 426395 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 177178348 177178736 177178542 Y NA NA NA NA NA NA RASAL2 882128 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 178231351 178231525 178231428 Y NA NA NA NA NA NA RASAL2 170487 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 178901109 178901308 178901215 Y NA NA NA NA NA NA ANGPTL1 62922 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 178995927 178996290 178996175 Y AXDND1,RALGPS2,TOR3A FAM20B NA NA NA NA FAM20B 2988 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 179098871 179099008 179098957 Y NA NA NA NA NA NA TOR3A 50359 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 179290775 179290979 179290800 Y NA SOAT1 NA NA NA NA SOAT1 29850 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 180200315 180200683 180200497 Y LHX4 NA NA NA NA NA QSOX1 78346 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 180200686 180200867 180200752 Y NA NA NA NA NA NA QSOX1 78717 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 180249791 180250006 180249913 Y NA NA NA NA NA NA QSOX1 127822 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 180250812 180250948 180250921 Y NA NA NA NA NA NA QSOX1 128843 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 180251899 180252130 180252121 Y NA NA NA NA NA NA QSOX1 129930 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 180403880 180403893 180403887 Y NA NA NA NA NA NA ACBD6 66196 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 180613229 180613603 180613357 Y NA XPR1 NA NA NA NA XPR1 14089 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 180921044 180921090 180921069 Y NA NA NA NA NA NA STX6 68957 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 181046810 181047186 181046999 Y NA MR1,IER5 NA NA NA NA IER5 8452 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 181065454 181065797 181065538 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 9816 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 181068595 181069000 181068732 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 12957 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 181069151 181069617 181069305 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 13513 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 181074349 181074924 181074645 Y XPR1,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 18711 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 181104265 181104352 181104277 Y NA IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48627 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 181104473 181105818 181105427 Y STX6,MR1,IER5 IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48835 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 182176105 182176350 182176203 Y NA NA CACNA1E IMR90 Hi-C 24141950 GLUL 182991 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 183132366 183132749 183132653 Y LAMC2 NA NA NA NA NA LAMC1 141771 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 183133608 183133779 183133664 Y LAMC2 NA NA NA NA NA LAMC1 143013 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 183149947 183150219 183150157 Y LAMC2 NA NA NA NA NA LAMC1 159352 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 183241451 183241867 183241650 Y LAMC1 NA LAMC2 IMR90 Hi-C 24141950 NMNAT2 143870 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 183248987 183249454 183249212 Y NCF2,NCF2,ARPC5,LAMC1 NA NA NA NA NA NMNAT2 136283 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 183836661 183836955 183836765 Y RGL1,GLT25D2 NA NA NA NA NA TSEN15 181856 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 183839940 183840077 183840009 Y NCF2,NCF2 NA NA NA NA NA TSEN15 178734 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 183861530 183861762 183861690 Y NCF2,NCF2,ARPC5 NA NA NA NA NA TSEN15 157049 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 183912062 183912419 183912241 Y NA NA NA NA NA NA TSEN15 106392 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 184033703 184034036 184033838 Y NA TSEN15 NA NA NA NA TSEN15 14892 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 184810330 184810429 184810414 Y NA NA NA NA NA NA EDEM3 88283 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 184852237 184852590 184852311 Y NA NA NA NA NA NA FAM129A 89092 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 185109809 185110137 185110116 Y IVNS1ABP TRMT1L,SWT1 NA NA NA NA TRMT1L 14067 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 192507991 192508486 192508241 Y NA NA UCHL5,RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4426 174827 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 192514282 192514417 192514323 Y RGS1 NA RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4426 168896 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 193080839 193080969 193080896 Y NA GLRX2,CDC73 NA NA NA NA GLRX2 7595 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 193726401 193726456 193726429 Y NA NA NA NA NA NA CDC73 637254 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 198124316 198124670 198124458 Y C1orf53,NEK7 NEK7 NA NA NA NA NEK7 223 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 198127475 198127965 198127580 Y NA NEK7 NA NA NA NA NEK7 3382 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 198128112 198128944 198128293 Y PTPRC,DENND1B NEK7 NA NA NA NA NEK7 4019 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr1 198650930 198651643 198651116 Y PTPRC NA NA NA NA NA NEK7 526837 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 198884632 198885024 198884962 Y NA NA NA NA NA NA RP11-104D3.2 469245 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 198894891 198894966 198894922 Y NA NA NA NA NA NA RP11-104D3.2 459303 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 200783735 200784105 200783920 Y NA NA NA NA NA NA CAMSAP2 77049 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 201426190 201426373 201426369 Y NA PHLDA3,RP11-134G8.7 NA NA NA NA PHLDA3 9992 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 201472589 201472996 201472808 Y LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1 PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA RP11-134G8.7 1373 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 201508517 201509575 201509484 Y NA RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA CSRP1 31933 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 201520953 201521395 201521173 Y NA RP11-134G8.7,CSRP1 NAV1,RPS10P7,IPO9 IMR90 Hi-C 24141950 CSRP1 44369 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 201619383 201619798 201619705 Y SHISA4,GPR37L1,NAV1 NA NA NA NA NA CSRP1 142799 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 201683757 201684240 201683949 Y NA NA NA NA NA NA IPO9 112029 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 201768733 201769083 201768901 Y NA IPO9,IPO9-AS1 IPO9 IMR90 Hi-C 24141950 IPO9 27186 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 202217450 202217807 202217629 Y NA NA NA NA NA NA UBE2T 91301 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 203481982 203482534 203482093 Y BTG2,ATP2B4 PRELP NA NA NA NA PRELP 39026 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 203599092 203599518 203599142 Y BTG2,LAX1 ATP2B4 NA NA NA NA ATP2B4 5403 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 203789427 203789442 203789436 Y NA ZC3H11A,SNRPE NA NA NA NA ZC3H11A 26645 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 203794311 203794511 203794411 Y NA ZC3H11A,SNRPE NA NA NA NA ZC3H11A 31529 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 203965652 203965916 203965843 Y NA NA ETNK2,SNRPE,LINC00303,SOX13 IMR90 Hi-C 24141950 SOX13 74327 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 204238647 204239007 204238820 Y GOLT1A,PLEKHA6 NA NA NA NA NA PLEKHA6 105786 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 204255998 204256379 204256352 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA6 88414 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 204289566 204289863 204289752 Y SOX13,PPP1R15B NA NA NA NA NA PLEKHA6 54930 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 204383374 204383435 204383377 Y PPP1R15B PLEKHA6,PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 4455 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 204386444 204387188 204386898 Y PPP1R15B PLEKHA6,PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 7525 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr1 204388302 204388627 204388415 Y NA PLEKHA6,PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 9383 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 204653343 204653636 204653438 Y PLEKHA6,TMEM81,NFASC,NFASC,LRRN2,LRRN2 LRRN2 NA NA NA NA LRRN2 482 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 205090261 205090406 205090392 Y NA RBBP5 CNTN2 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP5 1118 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 205144631 205144860 205144785 Y NA DSTYK NA NA NA NA DSTYK 33867 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 205254805 205255191 205255039 Y RAB7L1,RBBP5,NUAK2,DSTYK NUAK2 NA NA NA NA NUAK2 33692 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 205263599 205264019 205263855 Y NA NUAK2 NA NA NA NA NUAK2 24864 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 205270500 205270865 205270692 Y NA NUAK2 NA NA NA NA NUAK2 18018 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 205709805 205710150 205710085 Y NA NUCKS1,RAB7L1 NA NA NA NA NUCKS1 7254 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 206859748 206860259 206859963 Y IKBKE,RASSF5,FAIM3,FAIM3,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 3459 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 206861410 206861458 206861434 Y NA MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 5121 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 206918122 206918360 206918230 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,DYRK3,IL19,MAPKAPK2 NA NA NA NA NA MAPKAPK2 61833 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 207063537 207063710 207063660 Y RASSF5,DYRK3,MAPKAPK2,CD55,IL24 RP11-564A8.4 NA NA NA NA RP11-564A8.4 15254 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 207064076 207064429 207064213 Y NA RP11-564A8.4 NA NA NA NA RP11-564A8.4 14535 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr1 207999163 207999611 207999292 Y CR1,CD46 C1orf132 NA NA NA NA C1orf132 40884 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 208136912 208137268 208137107 Y NA NA CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C1orf132 96417 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 208314292 208314663 208314422 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA2 101002 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 208381145 208381344 208381321 Y NA PLXNA2 NA NA NA NA PLXNA2 34321 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 208388887 208389573 208389450 Y NA PLXNA2 NA NA NA NA PLXNA2 26092 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 208412497 208412696 208412591 Y PLXNA2 PLXNA2 NA NA NA NA PLXNA2 2969 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 208418631 208418859 208418806 Y PLXNA2 PLXNA2 NA NA NA NA PLXNA2 2966 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 208443226 208443424 208443350 Y NA PLXNA2 PLXNA2,CD34 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNA2 27561 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 209578512 209578819 209578654 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,HSD11B1,LOC642587 NA NA NA NA NA ATP5G2P1 138944 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 209915892 209916078 209915980 Y NA RP1-28O10.1,C1orf74 NA NA NA NA RP1-28O10.1 20422 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 209942657 209943400 209942924 Y LAMB3,G0S2,TRAF3IP3 RP1-28O10.1,C1orf74 NA NA NA NA C1orf74 12504 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 211035320 211035533 211035504 Y NA NA NA NA NA NA KCNH1 269924 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 211786767 211786829 211786805 Y NA SLC30A1 SLC30A1,NEK2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC30A1 36683 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 211837893 211837920 211837910 Y NA NEK2,RP11-122M14.1 NA NA NA NA NEK2 9040 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 211950086 211950249 211950170 Y NA NA NA NA NA NA LPGAT1 51865 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 211976591 211977124 211977068 Y NA LPGAT1 NA NA NA NA LPGAT1 24990 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 211988342 211989080 211989063 Y PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1 LPGAT1 NA NA NA NA LPGAT1 13034 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 212102475 212102639 212102508 Y NA NA NA NA NA NA LPGAT1 100361 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 212256975 212257253 212257095 Y DTL,INTS7 RPL21P28 NA NA NA NA RPL21P28 33604 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 212513330 212513719 212513465 Y PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206 RP11-384C4.3 NA NA NA NA RP11-384C4.3 32470 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 212643548 212643711 212643612 Y NA NENF ATF3 K562 ChIA-PET 22265404 NENF 39319 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 212661846 212662402 212662104 Y ATF3,ATF3,ATF3 NA ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 57617 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 212731490 212732709 212732386 Y NA ATF3 ATF3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ATF3 3967 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr1 212769584 212769966 212769788 Y ANGEL2,PPP2R5A,ATF3,ATF3,ATF3 ATF3 NA NA NA NA ATF3 32908 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 212840606 212841015 212840787 Y C1orf227,BATF3,PPP2R5A,ATF3,FAM71A BATF3 NA NA NA NA BATF3 30312 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 213443269 213443475 213443372 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KC1 220680 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 214512112 214512120 214512117 Y NA NA NA NA NA NA SMYD2 59667 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 214601098 214601566 214601506 Y PTPN14 NA NA NA NA NA PTPN14 122226 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 214612784 214613126 214613017 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 110666 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 215741534 215741966 215741880 Y KCTD3 KCTD3 NA NA NA NA KCTD3 2799 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 216826283 216826325 216826308 Y NA NA NA NA NA NA GPATCH2 976099 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 218523725 218524123 218523798 Y NA RP11-224O19.2,TGFB2 NA NA NA NA TGFB2 6148 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 218550674 218551089 218550794 Y NA RP11-224O19.2,TGFB2 NA NA NA NA TGFB2 33097 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 218633382 218633612 218633512 Y NA NA NA NA NA NA TGFB2 115805 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 218648559 218648794 218648717 Y NA NA TGFB2,LOC728463,RRP15 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TGFB2 130982 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 218662454 218662669 218662563 Y NA NA TGFB2,LOC728463,LOC643723 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TGFB2 144877 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 218669910 218670282 218669996 Y NA NA TGFB2,LOC643723,LOC728463 IMR90 Hi-C 24141950 TGFB2 152333 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 218671989 218672275 218672071 Y NA NA TGFB2,LOC643723,LOC728463 IMR90 Hi-C 24141950 TGFB2 154412 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr1 218774491 218774602 218774534 Y NA NA NA NA NA NA TGFB2 256914 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 218847947 218848245 218848113 Y NA NA NA NA NA NA TGFB2 330370 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 219240049 219240272 219240170 Y NA NA NA NA NA NA LYPLAL1 104914 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 219547203 219547495 219547349 Y NA NA LOC728463,TGFB2 IMR90 Hi-C 24141950 LYPLAL1 202017 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 220427006 220427444 220427299 Y NA MORF4L1P1,RAB3GAP2 NA NA NA NA MORF4L1P1 2094 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr1 221882292 221882723 221882499 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 30795 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 221916049 221916599 221916319 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 2531 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr1 222638782 222639204 222638963 Y NA NA DUSP10,MIA3,AIDA,BROX IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HHIPL2 80241 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 223326849 223326980 223326946 Y NA NA TLR5,SUSD4,CAPN8 IMR90 Hi-C 24141950 SUSD4 208564 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 223903033 223903347 223903117 Y TP53BP2,CAPN2 CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 15738 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 223914239 223914747 223914523 Y TP53BP2,FBXO28,CAPN2 CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 26944 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 223964690 223965055 223964731 Y TP53BP2,FBXO28 NA NA NA NA NA TP53BP2 66619 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 224012866 224013246 224013103 Y NA TP53BP2 NA NA NA NA TP53BP2 18428 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 224023477 224023773 224023693 Y CAPN2,TP53BP2 TP53BP2 NA NA NA NA TP53BP2 7901 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE T98G hg19 FANTOM5 3.65775413388099 chr1 224690718 224691054 224690869 Y WDR26 NA CNIH3 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 67983 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 225843222 225843438 225843341 Y NA ENAH,RP11-145A3.1 NA NA NA NA ENAH 4378 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 226007337 226007385 226007361 Y NA SRP9,EPHX1 NA NA NA NA EPHX1 11543 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 226014145 226014403 226014226 Y EPHX1,EPHX1 EPHX1 NA NA NA NA EPHX1 18351 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 226315308 226315548 226315420 Y PARP1 NA NA NA NA NA ACBD3 56883 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 226435130 226435332 226435236 Y PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A NA NA NA NA NA LIN9 60238 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 226890865 226891416 226891300 Y ITPKB ITPKB-IT1,ITPKB NA NA NA NA ITPKB-IT1 30097 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr1 228272073 228272409 228272248 Y NA ARF1,C1orf35,MRPL55 NA NA NA NA ARF1 3712 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 228782602 228782886 228782775 Y NA NA NA NA NA NA RNF187 109840 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 228783266 228783899 228783495 Y C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU NA NA NA NA NA RNF187 110504 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 229196056 229196102 229196080 Y NA NA RHOU IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1061H20.4 208673 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 229473732 229474385 229474330 Y NA NA NA NA NA NA RAB4A 68910 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 229601636 229601883 229601761 Y NA NUP133,RP4-613A2.1 NA NA NA NA NUP133 40220 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 230089577 230089803 230089690 Y NA NA NA NA NA NA GALNT2 101733 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 230220164 230220401 230220223 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 28628 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 230220475 230220731 230220560 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 28939 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 230561990 230562633 230562303 Y NA NA NA NA NA NA COG2 213602 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr1 231083969 231084208 231084171 Y NA TTC13,ARV1 NA NA NA NA TTC13 28413 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 232106545 232106680 232106599 Y NA NA NA NA NA NA DISC1 345984 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 232117893 232118046 232117970 Y TSNAX NA NA NA NA NA DISC1 357332 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 232671774 232671885 232671830 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-74P 294048 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 232735038 232735290 232735230 Y NA NA TSNAX-DISC1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 230643 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.18629863801546 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 199806 CAGE T98G hg19 FANTOM5 18.0910542297357 chr1 233248043 233248219 233248131 Y NA NA NA NA NA NA NTPCR 163692 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 233249275 233249581 233249334 Y NA NA NA NA NA NA NTPCR 164924 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 233472763 233473058 233472911 Y NA RPS7P3,PCNXL2 NA NA NA NA PCNXL2 43304 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 234630919 234631525 234631418 Y TARBP1 TARBP1 LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,ARID4B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TARBP1 18070 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 234639993 234640263 234640100 Y NA TARBP1 LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TARBP1 27144 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 234658291 234658851 234658374 Y NA TARBP1 NA NA NA NA TARBP1 45442 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 234659231 234659760 234659519 Y IRF2BP2 TARBP1 NA NA NA NA TARBP1 46382 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 234728712 234729023 234728867 Y NA IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 14248 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 234738546 234738834 234738624 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4437 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 234746093 234747674 234747395 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 2822 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 234748100 234748931 234748566 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4829 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr1 234749342 234749645 234749570 Y IRF2BP2 IRF2BP2 LINC00184,LOC100506810,ARID4B IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BP2 6071 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 234792654 234793437 234793098 Y NA IRF2BP2 IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRF2BP2 49383 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 234812067 234812214 234812141 Y NA NA LOC100506810,IRF2BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2BP2 68796 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 234908151 234908764 234908277 Y IRF2BP2 NA IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRF2BP2 164880 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 235097868 235098070 235097979 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 16481 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr1 235106929 235107153 235107059 Y TARBP1,IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 7398 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 235110834 235111403 235111103 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 3148 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr1 235114050 235115068 235114636 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 235120162 235120433 235120341 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 5611 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 235133014 235133422 235133155 Y NA RP11-443B7.3 LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 18463 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 235242252 235242564 235242410 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B TOMM20 IRF2BP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TOMM20 47687 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 235246558 235246857 235246620 Y ARID4B,ARID4B TOMM20 IRF2BP2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TOMM20 43394 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 235484403 235484795 235484782 Y NA GGPS1,ARID4B,TBCE NA NA NA NA GGPS1 3870 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 235668656 235669018 235668830 Y RBM34,ARID4B,ARID4B B3GALNT2 NA NA NA NA B3GALNT2 2875 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 236022682 236022818 236022763 Y GPR137B,LYST LYST NA NA NA NA LYST 22122 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 236080566 236081247 236080933 Y LYST,GPR137B LYST B3GALNT2,LYST,NID1 IMR90 Hi-C 24141950 LYST 35626 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr1 236083263 236083651 236083332 Y GPR137B LYST LYST,NID1 IMR90 Hi-C 24141950 LYST 38323 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 240306165 240306375 240306208 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 25080 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 240306412 240306787 240306695 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 24668 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 240306890 240307603 240307416 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23852 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 240307621 240308162 240308005 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23293 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 240308207 240308537 240308375 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22918 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 240308546 240308862 240308776 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22593 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 241781298 241781471 241781421 Y NA CHML NA NA NA NA CHML 15761 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 242054721 242054907 242054820 Y KMO EXO1 NA NA NA NA EXO1 45452 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 244210956 244211944 244211575 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 198575 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 244462616 244463099 244462949 Y AKT3,AKT3,ADSS NA AKT3,SDCCAG8,LOC339529,C1orf100,ADSS IMR90 Hi-C 24141950 ADSS 150337 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 244613820 244614139 244614120 Y NA ADSS NA NA NA NA ADSS 384 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 245971113 245971386 245971357 Y NA NA NA NA NA NA KIF26B 654826 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 246038342 246038749 246038555 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 629865 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 246086594 246086610 246086602 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 582004 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 246147829 246148201 246147973 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 520413 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 246183399 246183819 246183679 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 484795 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 246436053 246436378 246436216 Y SMYD3,SMYD3 NA NA NA NA NA SMYD3 232236 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 246469940 246470214 246470139 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 198400 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 246591935 246592203 246592010 Y SMYD3 NA NA NA NA NA SMYD3 76411 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 246862505 246862699 246862612 Y SCCPDH SCCPDH NA NA NA NA SCCPDH 22650 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 247035132 247035504 247035470 Y CNST,ZNF669,AHCTF1 NA NA NA NA NA AHCTF1 57776 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr1 247093396 247093478 247093437 Y NA AHCTF1 NA NA NA NA AHCTF1 116 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 247125260 247125664 247125417 Y NLRP3,NLRP3,AHCTF1 AHCTF1,ZNF695 NA NA NA NA AHCTF1 31980 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 247206107 247206337 247206222 Y NA ZNF695,ZNF670 NA NA NA NA ZNF670 33776 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 247315116 247315371 247315289 Y OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669 ZNF669,MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 47991 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 247325578 247326237 247325673 Y NA MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 37125 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr1 247326566 247327229 247326989 Y NA MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 36133 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 248894360 248894532 248894495 Y NA NA NA NA NA NA MIR3124 224044 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr1 249157308 249157673 249157562 Y OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692 MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2 NA NA NA NA ZNF692 5965 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 354662 355000 354689 Y NA NA NA NA NA NA ZMYND11 176257 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 441699 442088 441894 Y NA NA NA NA NA NA ZMYND11 263294 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 564401 564761 564664 Y ZMYND11,ZMYND11 NA NA NA NA NA DIP2C 168922 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 729218 729515 729367 Y NA DIP2C NA NA NA NA DIP2C 4168 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 975785 976368 976035 Y NA LARP4B DIP2C,LARP4B,GTPBP4,IDI1,IDI2-AS1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LARP4B 221 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 3137708 3138098 3138049 Y NA PFKP NA NA NA NA PFKP 31183 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 3284966 3285255 3285136 Y NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 PITRM1 71963 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 3509617 3509911 3509759 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 296614 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 3510310 3510716 3510597 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 297307 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.18629863801546 chr10 3511181 3511689 3511507 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 298178 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 3524547 3524820 3524727 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 300653 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 3526849 3527147 3526890 Y NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 298326 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 4705159 4705783 4705486 Y NA LINC00704 NA NA NA NA LINC00704 12563 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 4713647 4713873 4713697 Y NA LINC00704 NA NA NA NA LINC00704 4473 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr10 5113786 5114179 5114065 Y AKR1C1,AKR1C2,AKR1C3 AKR1C3 NA NA NA NA AKR1C3 38240 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 5333644 5334212 5333929 Y NA NA AKR1E2,tAKR IMR90 Hi-C 24141950 AKR1C3 258098 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.18629863801546 chr10 5334474 5334640 5334544 Y NA NA AKR1E2,tAKR IMR90 Hi-C 24141950 AKR1C3 258928 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 5336164 5336286 5336241 Y NA NA AKR1E2,tAKR IMR90 Hi-C 24141950 AKR1C3 260618 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 5504427 5504665 5504478 Y NA NA NA NA NA NA RP13-463N16.6 131416 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 6093148 6093558 6093320 Y IL15RA,PFKFB3,PFKFB3,RBM17,RBM17 RBM17 NA NA NA NA RBM17 35392 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 6163143 6163430 6163287 Y IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3 RBM17,PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 21451 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 6183553 6183785 6183703 Y NA PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 1096 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 6206285 6206560 6206485 Y NA PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 21404 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 6212827 6212938 6212883 Y FBXO18 PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 27946 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 6242613 6242903 6242648 Y IL15RA,PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 57732 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 6245814 6246792 6246043 Y PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 60933 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr10 6281305 6281494 6281382 Y IL15RA,PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 96424 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 6424082 6424357 6424201 Y PFKFB3,PFKFB3 NA LOC399715,RBM17,PFKFB3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFKFB3 239201 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 6443408 6443712 6443449 Y PFKFB3,PFKFB3 NA IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFKFB3 258527 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr10 6516020 6516190 6516056 Y IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA RP11-554I8.2 261154 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 7998591 7998768 7998645 Y NA NA NA NA NA NA GATA3 94799 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 8098940 8099487 8099174 Y TAF3,GATA3 GATA3 NA NA NA NA GATA3 5373 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 8374227 8374893 8374382 Y GATA3 NA NA NA NA NA GATA3 280660 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 12195131 12195251 12195172 Y CAMK1D SEC61A2,CDC123,NUDT5 NA NA NA NA SEC61A2 25495 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 12283843 12284276 12283949 Y UPF2,UPF2,SEC61A2,CAMK1D CDC123,NUDT5 NA NA NA NA NUDT5 47700 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 12490797 12491318 12490959 Y SEC61A2,CAMK1D NA NA NA NA NA CAMK1D 101316 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 13390886 13391219 13391148 Y NA PHYH,SEPHS1 NA NA NA NA SEPHS1 2589 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 13391797 13392252 13392084 Y SEPHS1 PHYH,SEPHS1 NA NA NA NA SEPHS1 3500 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 13908290 13908478 13908416 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 281363 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 14051386 14052060 14051814 Y PRPF18 NA NA NA NA NA PRPF18 424459 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 14447046 14447458 14447244 Y NA NA FRMD4A,FAM107B IMR90 Hi-C 24141950 FAM107B 367438 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 14602319 14602604 14602483 Y NA NA NA NA NA NA FAM107B 212292 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 14641847 14641963 14641950 Y NA NA NA NA NA NA FAM107B 172933 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 15157630 15158203 15157954 Y NA ACBD7,RPP38,C10orf111 NA NA NA NA C10orf111 20312 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 15191044 15191371 15191092 Y MEIG1,NMT2,C10orf111 NMT2 NA NA NA NA NMT2 17321 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 15250805 15251188 15250997 Y CDNF,MEIG1,C10orf111 NMT2 NA NA NA NA NMT2 42113 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 15278281 15278573 15278465 Y NA NA NA NA NA NA NMT2 69589 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 16946653 16946941 16946801 Y NA NA NA NA NA NA RSU1 89126 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 17010683 17011063 17010996 Y VIM NA NA NA NA NA RSU1 153156 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 17028207 17028677 17028581 Y NA NA NA NA NA NA RSU1 170680 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 17074095 17074546 17074466 Y VIM NA NA NA NA NA TRDMT1 167507 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 17104584 17104750 17104681 Y NA NA NA NA NA NA TRDMT1 137303 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 17105178 17105416 17105257 Y NA NA NA NA NA NA TRDMT1 136637 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 17652629 17652974 17652802 Y NA PTPLA,STAM NA NA NA NA PTPLA 4402 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 17707752 17708081 17707913 Y VIM,ST8SIA6,STAM STAM NA NA NA NA STAM 23628 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 20450242 20450397 20450276 Y PLXDC2 NA NA NA NA NA PLXDC2 347074 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 21386477 21386751 21386615 Y NA NA NA NA NA NA MLLT10 434343 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr10 21390009 21390197 21390106 Y MLLT10,MLLT10,C10orf113 NA NA NA NA NA MLLT10 430897 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 21581688 21582509 21582285 Y NA NA C10orf114,C10orf140,MLLT10,PIP4K2A IMR90 Hi-C 24141950 MLLT10 238585 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr10 21809167 21809536 21809441 Y C10orf114,C10orf140 MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 11558 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr10 21816029 21816444 21816223 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 4650 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr10 21816987 21817223 21817104 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 3871 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 22025175 22025497 22025336 Y NA NA NA NA NA NA RN7SKP37 194575 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 22628998 22629520 22629110 Y EBLN1 COMMD3,BMI1 NA NA NA NA BMI1 20858 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 22629825 22629981 22629966 Y DNAJC1 COMMD3,BMI1 NA NA NA NA BMI1 21685 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 22725331 22726270 22725901 Y NA NA NA NA NA NA BMI1 117191 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr10 23344774 23344811 23344800 Y NA MSRB2 NA NA NA NA MSRB2 37624 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 23737770 23738059 23737888 Y OTUD1 OTUD1 NA NA NA NA OTUD1 11572 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 24746901 24747210 24747047 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 263387 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 24754185 24754590 24754306 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 256007 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 24917417 24917574 24917542 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 93023 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 25240272 25240935 25240716 Y ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1 PRTFDC1 NA NA NA NA PRTFDC1 739 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 25348919 25349256 25349121 Y NA ENKUR,THNSL1 ARHGAP21,PRTFDC1,ENKUR,THNSL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THNSL1 45332 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 27419520 27419901 27419745 Y NA ANKRD26,MASTL,YME1L1 NA NA NA NA MASTL 21852 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 29228763 29229094 29228981 Y NA NA BAMBI,LOC100507605,LYZL1 IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 264492 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 29421778 29421876 29421872 Y NA NA BAMBI,LYZL1,LOC100507605,WAC IMR90 Hi-C 24141950 PTCHD3P1 274455 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 29948331 29948643 29948337 Y NA NA NA NA NA NA PTCHD3P1 252000 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 30092989 30093361 30093263 Y SVIL NA SVIL,KIAA1462,MIR604 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA1462 309062 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 30331172 30331392 30331282 Y MAP3K8,KIAA1462 NA NA NA NA NA KIAA1462 71031 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 30441068 30441357 30441150 Y NA KIAA1462 MTPAP,KIAA1462 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1462 38645 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr10 30471133 30471514 30471212 Y KIAA1462 NA KIAA1462,SVIL IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1462 68710 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 31025766 31026097 31025992 Y NA NA ZEB1,ARHGAP12,ZEB1-AS1,KIF5B,ZNF438 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 292769 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 31422679 31422989 31422772 Y ZNF438,ZNF438 NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 103813 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr10 31423488 31423889 31423800 Y NA NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 104622 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 31892273 31892723 31892643 Y NA NA ZEB1 IMR90 Hi-C 24141950 ZEB1-AS1 284897 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 32048872 32049424 32049213 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 166318 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.988582198346214 chr10 32735821 32736068 32735865 Y NA CCDC7 C10orf68 MCF7 ChIA-PET 22265404 CCDC7 2753 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr10 33250851 33251304 33251058 Y NA ITGB1 NA NA NA NA ITGB1 41416 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 33269452 33269916 33269602 Y C10orf68 ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 22804 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr10 33272272 33272613 33272373 Y ITGB1,ITGB1,ITGB1 ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 20107 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 33411139 33411539 33411218 Y NA NA ITGB1 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB1 118419 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 33537661 33538041 33537751 Y NA NA NA NA NA NA NRP1 85149 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 33547800 33548221 33548104 Y NA NA NA NA NA NA NRP1 74969 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 33562254 33562552 33562425 Y ITGB1,ITGB1,NRP1 NA NA NA NA NA NRP1 60638 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr10 33621123 33621423 33621243 Y NRP1 NRP1 NA NA NA NA NRP1 1767 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 35424812 35424825 35424819 Y CCNY CUL2,CREM NA NA NA NA CREM 11093 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 35717658 35717859 35717796 Y NA NA NA NA NA NA CCNY 183705 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 37778060 37778402 37778231 Y NA NA NA NA NA NA RP11-162G10.1 329508 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr10 43633157 43633403 43633253 Y RASGEF1A CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 1223 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr10 43950893 43951349 43951098 Y NA HNRNPF,RP11-517P14.2 NA NA NA NA RP11-517P14.2 36707 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 44046358 44046416 44046387 Y NA ZNF239 NA NA NA NA ZNF239 21650 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 45441757 45442014 45441853 Y ALOX5 RASSF4,C10orf10 NA NA NA NA RASSF4 10841 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 45849565 45849969 45849854 Y ALOX5 NA NA NA NA NA MARCH8 238385 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 47057375 47057652 47057526 Y NA NA GPRIN2,ZNF488,LOC643650,SYT15,ANTXRL IMR90 Hi-C 24141950 RP11-38L15.3 107903 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 47092142 47092537 47092340 Y NA NA NA NA NA NA RP11-38L15.3 142670 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 47113842 47114070 47114068 Y NA NA NA NA NA NA RP11-38L15.3 164370 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 47655672 47656071 47655889 Y NA NA AGAP7 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF488 696953 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr10 49542005 49542407 49542075 Y NA MAPK8 ARHGAP22,MAPK8 IMR90 Hi-C 24141950 MAPK8 29307 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 49564940 49565014 49564977 Y NA NA ARHGAP22 IMR90 Hi-C 24141950 MAPK8 52242 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 49745028 49745223 49745126 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP22 117087 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 50791340 50791620 50791497 Y NA PGBD3,ERCC6 NA NA NA NA ERCC6 45756 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr10 51488946 51489392 51489137 Y NCOA4,NCOA4,NCOA4 RP11-109G10.2 NA NA NA NA RP11-109G10.2 41180 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 52270106 52270351 52270231 Y NA NA NA NA NA NA SGMS1 112572 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 52385542 52385659 52385602 Y NA SGMS1 NA NA NA NA SGMS1 2619 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 60935384 60935742 60935425 Y NA NA NA NA NA NA FAM13C 185197 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 62174641 62174784 62174750 Y NA NA NA NA NA NA CDK1 361305 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 63658924 63659147 63659031 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr10 63663540 63663817 63663641 Y ARID5B ARID5B NA NA NA NA ARID5B 4481 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 63702592 63703184 63702855 Y ARID5B ARID5B NA NA NA NA ARID5B 43533 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 63736420 63736602 63736437 Y NA NA NA NA NA NA ARID5B 77361 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 63747685 63748213 63747937 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 88626 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 63752119 63752912 63752632 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 93060 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 63814731 63815034 63814907 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 155672 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 64292101 64292416 64292208 Y NA NA NA NA NA NA ZNF365 160150 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 64324371 64324598 64324504 Y NA NA NA NA NA NA ZNF365 192420 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 64373293 64373504 64373411 Y EGR2,EGR2 NA NA NA NA NA ADO 189012 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 64875678 64875783 64875732 Y NA NRBF2 ZNF365,ADO,NRBF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NRBF2 15267 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 65389747 65390882 65390384 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 110624 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr10 65467084 65467405 65467282 Y JMJD1C NA JMJD1C,NRBF2,REEP3,ZNF365 IMR90 Hi-C 24141950 REEP3 187961 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 65930110 65930546 65930307 Y NA NA NA NA NA NA RP11-170M17.2 269105 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr10 69578155 69578433 69578238 Y NA DNAJC12 NA NA NA NA DNAJC12 17491 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 69609160 69609390 69609211 Y NA DNAJC12,SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 DNAJC12 13236 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.988582198346214 chr10 69658139 69658146 69658142 Y HNRNPH3,SIRT1,SIRT1 SIRT1 HERC4 IMR90 Hi-C 24141950 SIRT1 15712 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 70821151 70821852 70821361 Y DDX21,VPS26A,SRGN SRGN KIAA1279,DDX21,SRGN,VPS26A,SUPV3L1 IMR90 Hi-C 24141950 SRGN 24010 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 70849672 70851282 70850023 Y DDX21,SUPV3L1,SRGN,VPS26A SRGN,VPS26A NA NA NA NA SRGN 3810 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 71928097 71928630 71928606 Y NA AIFM2,TYSND1,CALM2P2 TYSND1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SAR1A 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 72165059 72165574 72165379 Y NA LRRC20,EIF4EBP2 NA NA NA NA EIF4EBP2 2924 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 72973788 72974249 72973953 Y UNC5B UNC5B NA NA NA NA UNC5B 3461 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 73526437 73526878 73526654 Y CDH23,C10orf54,C10orf105 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 4377 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 73526896 73527242 73527133 Y CDH23,C10orf54,C10orf105 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 4013 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 73531831 73532355 73532130 Y C10orf105,CDH23,PSAP,C10orf54 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 576 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 73620184 73620641 73620392 Y DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP PSAP PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PSAP 11058 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr10 74032298 74032943 74032475 Y NA DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 620 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr10 74056833 74058104 74057179 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 25155 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr10 74079380 74080359 74079580 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 32629 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 74544491 74544662 74544597 Y NA NA NA NA NA NA MCU 94602 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 74877758 74878048 74877901 Y NA P4HA1,NUDT13,FAM149B1,ECD NA NA NA NA NUDT13 9541 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 75666465 75666800 75666554 Y ANXA7,NDST2 CAMK2G,PLAU NA NA NA NA PLAU 135 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr10 75725888 75726135 75726026 Y NA VCL CAMK2G,AP3M1,VCL,NDST2,C10orf55,PLAU,ADK IMR90 Hi-C 24141950 VCL 29737 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 75805462 75805520 75805491 Y NA VCL NA NA NA NA VCL 49590 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 78974815 78975138 78974939 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA KCNMA1 421215 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 79002896 79003188 79003042 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 393165 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 79176142 79176460 79176291 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 219893 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 79265772 79266169 79265902 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA KCNMA1 130184 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 79291885 79292096 79291976 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA KCNMA1 104257 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 79389440 79389814 79389806 Y NA KCNMA1 NA NA NA NA KCNMA1 6539 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 79538272 79538371 79538344 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 141919 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr10 79651191 79651354 79651229 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 33024 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 79670022 79670276 79670149 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 14102 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 80626499 80626705 80626607 Y NA NA LOC283050,ZMIZ1,RPS24,LOC100132987,POLR3A IMR90 Hi-C 24141950 ZMIZ1 200087 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 80685644 80685960 80685827 Y NA NA NA NA NA NA ZMIZ1 140832 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 80732492 80734123 80733460 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 92669 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 80734291 80734943 80734463 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 91849 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 80737664 80737999 80737882 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 88793 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.3840150776847 chr10 80830818 80831199 80831077 Y ZMIZ1 ZMIZ1 NA NA NA NA ZMIZ1 4026 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr10 80841621 80841843 80841705 Y NA ZMIZ1 NA NA NA NA ZMIZ1 14829 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr10 80911539 80911799 80911619 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 84747 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 80917330 80917751 80917473 Y NA NA NA NA NA NA ZMIZ1 90538 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 80998898 81000011 80999247 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 105214 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 81077317 81078576 81077648 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 26649 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 81080868 81081434 81081104 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 23791 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 81158970 81159167 81159085 Y NA ZCCHC24 NA NA NA NA ZCCHC24 44216 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 81159335 81159579 81159503 Y ZCCHC24 ZCCHC24 NA NA NA NA ZCCHC24 43804 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr10 81962798 81963579 81963388 Y SH2D4B,ANXA11 EIF5AP4 NA NA NA NA ANXA11 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr10 82214819 82214901 82214871 Y TSPAN14 TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 2897 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 82258642 82258780 82258737 Y TSPAN14 TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 46720 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 88004394 88004782 88004588 Y NA NA NA NA NA NA WAPAL 274790 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 88160011 88160294 88160175 Y NA NA WAPAL MCF7 ChIA-PET 22265404 WAPAL 119278 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 88470805 88471213 88471023 Y NA LDB3,BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 43194 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr10 88804079 88804159 88804119 Y NA FAM35A,GLUD1 NA NA NA NA FAM35A 47759 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 89519838 89520126 89519981 Y NA NA NA NA NA NA CFL1P1 55559 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 89602886 89603081 89603056 Y NA CFL1P1,ATAD1,PTEN NA NA NA NA ATAD1 3786 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 89802399 89802689 89802412 Y NA NA RNLS,CFL1P1,ATAD1,KLLN,PTEN,LIPF,LIPM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-380G5.3 99140 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 91199827 91200195 91200013 Y NA IFIT1,LIPA,IFIT5 NA NA NA NA IFIT5 27484 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 91275289 91275484 91275456 Y NA NA NA NA NA NA IFIT5 102946 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 91939509 91939869 91939615 Y NA NA NA NA NA NA SNRPD2P1 203035 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 92690903 92691268 92691118 Y NA ANKRD1 ANKRD1,PCGF5 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD1 11870 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 92921990 92922253 92922075 Y HECTD2 NA ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PCGF5 55655 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 93373465 93373915 93373562 Y PPP1R3C PPP1R3C NA NA NA NA PPP1R3C 16896 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 94351391 94351691 94351485 Y CPEB3 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 348 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr10 94459466 94459797 94459609 Y HHEX NA NA NA NA NA KIF11 108423 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 94520397 94520594 94520523 Y NA NA EXOC6,HHEX IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EXOC6 68341 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr10 95193537 95193891 95193765 Y MYOF MYOF NA NA NA NA MYOF 46183 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 95196959 95197603 95197264 Y NA MYOF NA NA NA NA MYOF 42471 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr10 95218561 95218998 95218660 Y MYOF MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 21076 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr10 95223953 95224101 95224023 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 15973 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 95224149 95224369 95224367 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 15705 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 95228207 95228553 95228471 Y MYOF,CEP55,CEP55 MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 11521 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 95851610 95851772 95851690 Y NA NA NA NA NA NA PLCE1 99864 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 97308667 97309047 97308880 Y NA SORBS1 NA NA NA NA SORBS1 10124 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 97809134 97809259 97809196 Y NA CCNJ,ENTPD1-AS1 NA NA NA NA CCNJ 7983 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 99449337 99449738 99449607 Y C10orf28,RRP12,PI4K2A AVPI1,MARVELD1,ZFYVE27 NA NA NA NA AVPI1 4257 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 99497485 99497673 99497579 Y NA MARVELD1,ZFYVE27 NA NA NA NA ZFYVE27 2607 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 100120877 100121283 100120897 Y PYROXD2,LOXL4 NA PYROXD2,C10orf28,LOXL4,HPS1 IMR90 Hi-C 24141950 PYROXD2 51658 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 101539519 101539906 101539726 Y NA COX15 NA NA NA NA COX15 49662 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 101543856 101543953 101543936 Y COX15,ABCC2 NA NA NA NA NA COX15 53999 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 101666342 101666477 101666411 Y NA NA NA NA NA NA DNMBP 101199 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 101765990 101766360 101766233 Y NA DNMBP NA NA NA NA DNMBP 1316 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 101944283 101944461 101944347 Y DNMBP,CWF19L1,CHUK,BLOC1S2,BLOC1S2,ERLIN1,ERLIN1 ERLIN1,CHUK,RP11-316M21.6 NA NA NA NA ERLIN1 1630 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 102488726 102488983 102488821 Y NA PAX2 PAX2 IMR90 Hi-C 24141950 PAX2 4377 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 102792815 102793017 102792917 Y NA C10orf2,MRPL43,LZTS2,PDZD7,SFXN3,KAZALD1 NA NA NA NA SFXN3 3824 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 103124623 103124787 103124739 Y FBXW4 BTRC DPCD,POLL IMR90 Hi-C 24141950 BTRC 12803 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 103591495 103591519 103591507 Y BTRC,KCNIP2,KCNIP2 MGEA5 NA NA NA NA MGEA5 14799 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 103699141 103699397 103699242 Y NA NA NA NA NA NA C10orf76 114553 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 103717791 103718012 103717910 Y C10orf76 NA NA NA NA NA C10orf76 95938 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 103878662 103879287 103878814 Y NA LDB1,PPRC1,NOLC1 NA NA NA NA LDB1 452 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 103937930 103938271 103938070 Y NA PPRC1,NOLC1 NA NA NA NA NOLC1 27997 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 104406463 104406725 104406695 Y NFKB2,NFKB2,TRIM8 TRIM8 NA NA NA NA TRIM8 4210 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 104472705 104472855 104472743 Y NA ARL3,SFXN2 NA NA NA NA SFXN2 410 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 104473144 104473537 104473339 Y NA ARL3,SFXN2 NA NA NA NA SFXN2 849 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 104892620 104892981 104892840 Y C10orf32,NT5C2 NA NA NA NA NA NT5C2 58075 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 104956992 104957240 104957082 Y C10orf32,NT5C2 NT5C2 NA NA NA NA NT5C2 5936 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 104990991 104991184 104991120 Y NA NT5C2 SFXN2,C10orf32-AS3MT,CYP17A1,NT5C2,CNNM2,LOC729020 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5C2 39935 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr10 105001224 105001453 105001331 Y C10orf32,NT5C2 NA INA,PCGF6,NT5C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5C2 50168 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 105419490 105419843 105419666 Y NA NA NA NA NA NA OBFC1 256120 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 105456300 105456542 105456434 Y NA NA NA NA NA NA OBFC1 219421 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr10 106065321 106065564 106065443 Y NA ITPRIP NA NA NA NA ITPRIP 30598 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 106096287 106096870 106096611 Y SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147 ITPRIP ITPRIP,GSTO1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ITPRIP 125 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 111834173 111834352 111834276 Y ADD3,SMNDC1,MXI1,MXI1 NA NA NA NA NA ADD3 80047 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 112158460 112158738 112158533 Y DUSP5 NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 95751 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 112185759 112186089 112185825 Y SHOC2,DUSP5,BBIP1,BBIP1 NA SMNDC1,DUSP5,SMC3 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 69507 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 112272592 112272848 112272747 Y SHOC2,BBIP1,BBIP1,DUSP5 DUSP5 NA NA NA NA DUSP5 16996 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 112622155 112622422 112622262 Y DUSP5,SHOC2,PDCD4,BBIP1,BBIP1 PDCD4,PDCD4-AS1 NA NA NA NA PDCD4 7143 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 115085951 115086304 115086160 Y CASP7,TCF7L2 NA VTI1A IMR90 Hi-C 24141950 CASP7 350638 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 116163429 116163722 116163475 Y AFAP1L2 AFAP1L2 NA NA NA NA AFAP1L2 914 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 116255200 116255589 116255576 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1L2 92685 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 116303427 116303555 116303470 Y ABLIM1 NA NA NA NA NA AFAP1L2 140912 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 116392908 116393338 116393223 Y ABLIM1 NA NA NA NA NA FAM160B1 186165 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 118034123 118034494 118034359 Y GFRA1,GFRA1,GFRA1 GFRA1 NA NA NA NA GFRA1 3144 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 118922718 118922822 118922754 Y VAX1 KIAA1598 NA NA NA NA KIAA1598 38621 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 119046334 119046783 119046648 Y NA NA NA NA NA NA PDZD8 86195 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 120968752 120969030 120968753 Y EIF3A,GRK5 SFXN4,PRDX3,GRK5 NA NA NA NA GRK5 3651 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 121075171 121075335 121075278 Y NA NA NA NA NA NA GRK5 110070 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 121161203 121161864 121161442 Y EIF3A NA NA NA NA NA RGS10 138356 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 121412148 121412380 121412196 Y BAG3 RP11-179H18.5,BAG3 NA NA NA NA BAG3 3266 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 121415317 121415432 121415359 Y GRK5,BAG3 RP11-179H18.5,BAG3 NA NA NA NA BAG3 6435 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 121417930 121418047 121417978 Y BAG3 RP11-179H18.5,BAG3 NA NA NA NA BAG3 9048 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr10 121829686 121829950 121829715 Y NA NA NA NA NA NA NACAP2 74465 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr10 125754916 125755682 125755196 Y CHST15 NA NA NA NA NA CHST15 95524 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 126236352 126236744 126236559 Y NA NA NA NA NA NA LHPP 87949 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 127577281 127577575 127577428 Y NA RNU2-42P,DHX32,FANK1 NA NA NA NA RNU2-42P 34 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 127860130 127860500 127860453 Y ADAM12 NA NA NA NA NA LINC00601 247948 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 128947297 128947480 128947351 Y NA NA NA NA NA NA DOCK1 355319 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 131436691 131436981 131436883 Y MGMT NA NA NA NA NA MGMT 173243 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 132011680 132011894 132011722 Y NA NA NA NA NA NA GLRX3 79017 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 133776164 133776302 133776237 Y NA BNIP3 NA NA NA NA BNIP3 17133 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr10 133793049 133793425 133793362 Y NA BNIP3 PPP2R2D IMR90 Hi-C 24141950 BNIP3 10 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 133794080 133794414 133794353 Y NA BNIP3 PPP2R2D IMR90 Hi-C 24141950 BNIP3 645 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 133879247 133879524 133879406 Y NA NA BNIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BNIP3 85812 CAGE T98G hg19 FANTOM5 3.06460481487326 chr10 134122010 134122092 134122081 Y NA STK32C,LRRC27 DPYSL4 IMR90 Hi-C 24141950 STK32C 21259 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 134234707 134235257 134234764 Y STK32C,PWWP2B PWWP2B C10orf91 IMR90 Hi-C 24141950 PWWP2B 26035 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 134330832 134331178 134331005 Y NA RP11-432J24.5,INPP5A INPP5A,ADAM8,C10orf91 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-432J24.5 1137 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr10 134388737 134389185 134389009 Y PWWP2B,INPP5A INPP5A NA NA NA NA INPP5A 39413 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 269337 269903 269511 Y TMEM80,TALDO1,SIGIRR,DEAF1,IFITM2,IFITM1,ATHL1 PSMD13,SIRT3,ATHL1,IFITM2,IFITM1 NA NA NA NA ATHL1 17232 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 350841 351091 350968 Y NA IFITM2,IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3 SIRT3,RIC8A,SCGB1C1,ODF3,BET1L,PSMD13,NLRP6,ATHL1,IFITM1,SIGIRR,ANO9,PKP3,IFITM2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 B4GALNT4 16705 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 355877 356724 356385 Y NA IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3 IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 B4GALNT4 11072 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr11 469770 469895 469845 Y B4GALNT4,CEND1 PTDSS2,RNH1 NA NA NA NA PTDSS2 23502 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr11 629192 629570 629436 Y IRF7,IRF7,SCT,DRD4 IRF7 NA NA NA NA IRF7 15193 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 749835 750077 749967 Y IFITM2,IRF7,IRF7,TMEM80,DEAF1,TALDO1 DEAF1,TALDO1,PDDC1,AP006621.5,CEND1,SLC25A22 NA NA NA NA TALDO1 4506 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 1015139 1015297 1015218 Y NA NA NA NA NA NA AP2A2 92245 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 1147842 1148157 1148045 Y NA NA MUC5B MCF7 ChIA-PET 22265404 TOLLIP 180727 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 1285805 1285940 1285877 Y TOLLIP TOLLIP NA NA NA NA TOLLIP 42944 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 1357863 1358286 1357997 Y TOLLIP,BRSK2 TOLLIP TOLLIP,LOC255512 K562 ChIA-PET 22265404 TOLLIP 28979 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr11 1404202 1404317 1404259 Y IFITM10,DUSP8 BRSK2 TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BRSK2 4812 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 1404403 1404794 1404637 Y DUSP8,BRSK2 BRSK2 TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BRSK2 4335 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 1569740 1569888 1569766 Y TNNT3,TNNI2,TNNI2,DUSP8 DUSP8 NA NA NA NA DUSP8 21262 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 1773349 1773482 1773395 Y IFITM10 IFITM10,RP11-295K3.1,CTSD,AC068580.7,RPL36AP39,AC139143.2 NA NA NA NA IFITM10 3528 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 2643075 2643474 2643317 Y NA NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 75750 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 2655024 2655339 2655183 Y TRPM5,KCNQ1 NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 63885 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 2717684 2718130 2717946 Y TSSC4,TRPM5,KCNQ1 KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 1094 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 2847272 2847432 2847347 Y NA NA NA NA NA NA CDKN1C 57679 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 2883658 2883963 2883768 Y NA CDKN1C,SLC22A18,SLC22A18AS NA NA NA NA CDKN1C 21148 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 2913617 2913951 2913751 Y NA CDKN1C,SLC22A18,SLC22A18AS,PHLDA2 NA NA NA NA SLC22A18 5000 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 3077664 3078057 3077925 Y NA CARS NAP1L4 K562 ChIA-PET 22265404 CARS 821 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 3190882 3191107 3191009 Y NA OSBPL5 NA NA NA NA OSBPL5 4913 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 3855847 3856061 3855976 Y NUP98,STIM1,RHOG PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,MIR4687 NA NA NA NA RHOG 4152 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 3972663 3972822 3972742 Y STIM1 NA NA NA NA NA MIR4687 97371 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 6489893 6490567 6490471 Y OR56A4,OR56A1,OR56B4,OR52W1,OR2AG1,OR2AG2,OR10A5,OR10A4,OR10A2,OR6A2,DCHS1 TRIM3,ARFIP2 NA NA NA NA TRIM3 3122 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 6699628 6699937 6699850 Y OR52W1,OR10A4,OR10A2,OR6A2,OR2AG1,OR2AG2 MRPL17 NA NA NA NA MRPL17 2695 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 8727919 8728019 8727969 Y ASCL3 RPL27A NA NA NA NA RPL27A 25961 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 8889520 8889803 8889779 Y ST5 ST5,AKIP1 NA NA NA NA ST5 40695 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 9181747 9182009 9181839 Y ZNF143,RPL27A,TMEM9B,NRIP3,TMEM41B,IPO7,DENND5A NA NA NA NA NA DENND5A 102928 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 9185386 9185638 9185566 Y NA NA NA NA NA NA DENND5A 99299 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 9385760 9386326 9386092 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 17843 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr11 9422844 9423055 9422950 Y NRIP3,IPO7 IPO7 NA NA NA NA IPO7 18675 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 9587499 9588027 9587720 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1 ZNF143,LOC644656 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 WEE1 5201 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr11 9590279 9590748 9590469 Y WEE1,WEE1 WEE1 LOC644656,ZNF143 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 WEE1 2480 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr11 9623030 9623285 9623166 Y ZNF143,WEE1,WEE1 WEE1 NA NA NA NA WEE1 29802 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 9635436 9636077 9635827 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1,SWAP70 WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WEE1 42208 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 9703256 9703389 9703323 Y WEE1 SWAP70 NA NA NA NA SWAP70 19632 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 10246047 10246060 10246054 Y NA NA NA NA NA NA SBF2 67694 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 10373282 10373523 10373408 Y ADM,AMPD3 ADM,AMPD3 SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104 IMR90 Hi-C 24141950 AMPD3 45422 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 10388178 10388602 10388329 Y ADM NA SBF2,ADM,LOC283104,AMPD3,MRVI1,MRVI1-AS1,CTR9,SWAP70,LOC440028 IMR90 Hi-C 24141950 AMPD3 60318 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 10614045 10614168 10614107 Y AMPD3,AMPD3,AMPD3 NA NA NA NA NA MRVI1-AS1 53226 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 10619660 10619757 10619708 Y NA NA NA NA NA NA MRVI1-AS1 58841 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 10955665 10956051 10955935 Y NA CTD-2003C8.2 EIF4G2,MICALCL,CTR9,GALNTL4,LOC729013,ZBED5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2003C8.2 36796 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 11326137 11326382 11326218 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2003C8.2 407268 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 11998818 11999068 11999003 Y MICALCL DKK3 NA NA NA NA DKK3 30248 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 12013824 12014110 12014066 Y DKK3,DKK3,DKK3 DKK3 NA NA NA NA DKK3 15206 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 12101706 12102070 12101803 Y DKK3,DKK3,PARVA,MICALCL,MICAL2 RP13-631K18.5,MICAL2 MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 RP13-631K18.5 4368 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 12111660 12111980 12111765 Y NA RP13-631K18.5,MICAL2 MICAL2,TEAD1,MICALCL,DKK3,USP47 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MICAL2 1563 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 12132692 12132808 12132735 Y MICAL2 RP13-631K18.5,MICAL2 NA NA NA NA MICAL2 19149 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 12181262 12181458 12181363 Y MICALCL,MICAL2 NA MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 MICAL2 67719 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 12184848 12185162 12185016 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 71305 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 12188567 12188982 12188726 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 75024 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 12204570 12205016 12204699 Y MICAL2 NA NA NA NA NA MICAL2 91027 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 12306799 12307179 12306992 Y MICAL2,PARVA NA NA NA NA NA PARVA 89553 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr11 12309352 12309734 12309588 Y TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL NA NA NA NA NA PARVA 86998 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 12455335 12455581 12455453 Y PARVA NA NA NA NA NA PARVA 58603 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr11 12697923 12698543 12698251 Y PARVA,TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 3954 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 12701917 12702070 12702017 Y TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 7948 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr11 12824175 12824668 12824395 Y TEAD1 NA NA NA NA NA TEAD1 130206 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 12884715 12885004 12884787 Y NA NA NA NA NA NA TEAD1 190746 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 13238046 13238305 13238120 Y NA NA ARNTL,BTBD10,LOC100506305 IMR90 Hi-C 24141950 ARNTL 57894 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 13283262 13283494 13283392 Y NA ARNTL ARNTL IMR90 Hi-C 24141950 ARNTL 12705 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 13327996 13328024 13328011 Y NA ARNTL NA NA NA NA ARNTL 31797 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 14443887 14444060 14443964 Y RRAS2 NA RRAS2,COPB1,SPON1 IMR90 Hi-C 24141950 RRAS2 59835 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 15821579 15821866 15821680 Y NA NA SOX6 IMR90 Hi-C 24141950 C11orf58 810813 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 17230717 17231092 17230803 Y NA PIK3C2A,NUCB2 NA NA NA NA NUCB2 3017 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 17374298 17375700 17374969 Y RPS13,B7H6 NA NA NA NA NA ABCC8 120749 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr11 18404883 18405218 18405078 Y LDHA LDHA NA NA NA NA LDHA 8717 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr11 18405328 18405801 18405464 Y HPS5,TSG101,SPTY2D1 LDHA NA NA NA NA LDHA 8134 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 18426412 18426598 18426470 Y NA LDHA NA NA NA NA LDHA 12477 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 19454203 19454380 19454292 Y NAV2 NA NA NA NA NA NAV2 83932 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 22631991 22632283 22632136 Y NA FANCF NA NA NA NA FANCF 13104 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 27223366 27223795 27223565 Y NA RP11-1L12.3 LGR4,LIN7C IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1L12.3 15865 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 27231187 27231325 27231258 Y NA RP11-1L12.3 LIN7C,LGR4,CCDC34,BDNF-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1L12.3 8335 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 27255766 27256168 27256011 Y NA RP11-1L12.3 NA NA NA NA RP11-1L12.3 16106 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 27263345 27263487 27263411 Y NA RP11-1L12.3 LGR4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1L12.3 23685 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 27739901 27740316 27740092 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF BDNF NA NA NA NA BDNF 1289 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr11 27740535 27740662 27740569 Y NA BDNF NA NA NA NA BDNF 943 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 27956455 27956618 27956527 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF RP11-1033A18.1 BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1033A18.1 45875 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 28063321 28063497 28063482 Y NA NA NA NA NA NA METTL15 64298 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 28128920 28129110 28128941 Y METTL15 METTL15,KIF18A NA NA NA NA KIF18A 1065 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 28132530 28132826 28132694 Y NA METTL15,KIF18A NA NA NA NA KIF18A 4675 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 28778513 28778891 28778701 Y NA NA BDNF,BDNF-AS1,KIF18A IMR90 Hi-C 24141950 KIF18A 650658 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 28853592 28853798 28853653 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 KIF18A 725737 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 29141601 29141895 29141706 Y NA NA BDNF,BDNF-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 KIF18A 1013746 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 30510063 30510254 30510126 Y FSHB,MPPED2,MPPED2 NA NA NA NA NA MPPED2 96165 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 32109882 32110285 32110029 Y NA NA NA NA NA NA PAX6 272373 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 32915475 32916456 32915913 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 2751 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.18629863801546 chr11 33146392 33146678 33146610 Y NA CSTF3 NA NA NA NA CSTF3 35239 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 33313001 33313236 33313097 Y NA HIPK3 NA NA NA NA HIPK3 36783 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 33394151 33394320 33394196 Y C11orf41 NA NA NA NA NA HIPK3 117933 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 33711808 33712191 33712002 Y CD59 CD59 NA NA NA NA CD59 43800 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 33713598 33714029 33713919 Y CD59 CD59 NA NA NA NA CD59 41962 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 33742880 33743486 33743237 Y NA CD59 NA NA NA NA CD59 12505 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 33958868 33959233 33959043 Y NA NA LMO2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CAPRIN1 111997 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 34125347 34125667 34125520 Y NA NAT10 NA NA NA NA NAT10 198 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr11 34272631 34272979 34272746 Y LMO2,LMO2,ABTB2 NA NA NA NA NA ABTB2 104576 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 34368265 34368539 34368419 Y NA ABTB2 NAT10,CAPRIN1 IMR90 Hi-C 24141950 ABTB2 9016 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 34393112 34393337 34393189 Y ABTB2 ABTB2 ABTB2,ELF5,NAT10,CAT IMR90 Hi-C 24141950 ABTB2 15557 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 34426692 34426969 34426750 Y ABTB2 ABTB2,CAT ABTB2,NAT10,CAT IMR90 Hi-C 24141950 CAT 31503 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 34706877 34707176 34707110 Y ABTB2,EHF NA NA NA NA NA PDHX 228200 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 34931457 34931889 34931828 Y NA PDHX,APIP NA NA NA NA PDHX 3487 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 35028328 35028731 35028507 Y CD44 NA NA NA NA NA APIP 92282 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 35052236 35052689 35052493 Y CD44 NA SLC1A2,CD44,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 RP4-607I7.1 104890 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 35061713 35062540 35061871 Y CD44 NA CD44,SLC1A2,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 RP4-607I7.1 95039 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 35094290 35094666 35094566 Y NA NA CD44,PDHX,APIP IMR90 Hi-C 24141950 RP4-607I7.1 62913 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 35103874 35105511 35104330 Y CD44 NA CD44,PDHX,APIP,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-607I7.1 52068 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr11 35132711 35132959 35132793 Y CD44 RP4-607I7.1,CD44 PDHX,CD44,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-607I7.1 24620 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 35165614 35166208 35165794 Y CD44 RP4-607I7.1,CD44 NA NA NA NA CD44 7197 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr11 35186946 35187176 35187019 Y CD44 RP4-607I7.1,CD44 NA NA NA NA CD44 28529 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr11 35187357 35188072 35187739 Y NA RP4-607I7.1,CD44 NA NA NA NA CD44 28940 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 35188303 35189153 35188420 Y CD44 RP4-607I7.1,CD44 NA NA NA NA CD44 29886 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 35204984 35205337 35205050 Y CD44 RP4-607I7.1,CD44 NA NA NA NA CD44 46567 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 35249361 35250020 35249669 Y CD44 NA NA NA NA NA CD44 90944 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr11 35258280 35258546 35258460 Y CD44 NA NA NA NA NA CD44 99863 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 35268470 35268664 35268567 Y NA NA NA NA NA NA CD44 110053 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 35309902 35310085 35310021 Y CD44 NA NA NA NA NA CD44 151485 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 35508759 35508774 35508766 Y NA PAMR1 NA NA NA NA PAMR1 41074 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 35575444 35575679 35575584 Y PAMR1,FJX1 PAMR1 PAMR1,TRIM44,LDLRAD3,FJX1 IMR90 Hi-C 24141950 PAMR1 25596 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 36521882 36522155 36522112 Y NA TRAF6 NA NA NA NA TRAF6 7667 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 40350817 40351004 40350911 Y NA NA NA NA NA NA RP11-124G5.1 1206980 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 43757440 43757801 43757621 Y NA NA NA NA NA NA ALKBH3 142560 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 44702928 44703040 44702985 Y NA NA EXT2 IMR90 Hi-C 24141950 CD82 118951 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 45201958 45202605 45202216 Y NA NA NA NA NA NA RP11-430H10.1 172317 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr11 45680274 45680465 45680372 Y NA CHST1 NA NA NA NA CHST1 4707 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr11 45864713 45865116 45864826 Y NA SLC35C1,CRY2,MAPK8IP1 NA NA NA NA CRY2 1553 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 46058881 46059222 46059206 Y NA NA NA NA NA NA PHF21A 81763 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 46264726 46265198 46265009 Y NA CREB3L1 DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 32014 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr11 46270167 46270467 46270346 Y CREB3L1 CREB3L1 CREB3L1,PHF21A,DGKZ IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 26745 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 46410888 46411787 46411136 Y NA MDK NA NA NA NA MDK 10582 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 47173206 47173550 47173416 Y NA ARFGAP2,PACSIN3 NA NA NA NA ARFGAP2 23126 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 47215723 47215949 47215852 Y NA ARFGAP2,PACSIN3,DDB2 PACSIN3 MCF7 ChIA-PET 22265404 PACSIN3 9729 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 47252770 47253009 47252890 Y NA PACSIN3,DDB2,NR1H3,ACP2,MADD NA NA NA NA NR1H3 14842 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 47531687 47531996 47531879 Y SPI1,PTPRJ,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1 NA RAPSN IMR90 Hi-C 24141950 NDUFS3 52892 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 47573563 47574025 47573747 Y NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1 NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4 NA NA NA NA NDUFS3 10863 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 47789923 47790126 47789984 Y NA FNBP4 NA NA NA NA FNBP4 2928 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 47939528 47939960 47939626 Y OR4B1,OR4S1,NUP160 RP11-793I11.1 PTPRJ,NUP160 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-793I11.1 14369 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 47968538 47968912 47968651 Y CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ RP11-793I11.1,PTPRJ PTPRJ IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPRJ 31201 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 48004294 48004631 48004323 Y CELF1,CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ PTPRJ NA NA NA NA PTPRJ 4181 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 48009293 48009653 48009420 Y CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ PTPRJ NA NA NA NA PTPRJ 9180 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 48030442 48030739 48030501 Y OR4X1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ PTPRJ NA NA NA NA PTPRJ 30329 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 48041550 48042058 48041874 Y CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ PTPRJ NA NA NA NA PTPRJ 41437 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 48077375 48077584 48077563 Y FNBP4,PTPRJ NA NA NA NA NA PTPRJ 77262 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 48102794 48103200 48102989 Y FNBP4,PTPRJ NA NA NA NA NA PTPRJ 102681 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 48163334 48163507 48163430 Y OR4C45,OR4B1,OR4X2,OR4S1,FNBP4,PTPRJ NA NA NA NA NA PTPRJ 163221 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 56038127 56038363 56038266 Y NA NA NA NA NA NA RP11-59K5.1 417578 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 57083068 57083441 57083322 Y NA TNKS1BP1,SSRP1 NA NA NA NA TNKS1BP1 6985 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 57242995 57243389 57243187 Y OR5AK2,SSRP1,BTBD18,UBE2L6 SLC43A3,RTN4RL2,SLC43A1 NA NA NA NA RTN4RL2 16973 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 57333685 57333973 57333758 Y SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,ZDHHC5,UBE2L6 TIMM10 NA NA NA NA UBE2L6 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 57546018 57546724 57546105 Y MED19,C11orf31 C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 27303 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr11 57559748 57559971 57559868 Y SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,UBE2L6,CLP1,ZDHHC5 CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 41033 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 59315294 59315558 59315429 Y MPEG1,OR4D6,STX3,PATL1 NA NA NA NA NA OSBP 66059 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 60499458 60499898 60499803 Y MS4A6E,MS4A14,MS4A5,MS4A13 NA NA NA NA NA CCDC86 107646 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 61565191 61565522 61565357 Y NA FEN1,FADS2,FADS1 NA NA NA NA FADS2 6739 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 61602064 61602538 61602257 Y INCENP,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,FEN1 FEN1,FADS2,FADS1 NA NA NA NA FADS1 7274 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 61738760 61739751 61739487 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 5628 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr11 61739990 61740514 61740301 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 6858 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr11 61780516 61780626 61780618 Y NA FTH1 FADS1,BEST1,FTH1,FADS3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FTH1 47384 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 61781118 61781313 61781282 Y DAGLA,FTH1 FTH1 FADS1,BEST1,FTH1,FADS3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FTH1 47986 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr11 61792928 61793609 61793204 Y DAGLA,FTH1 NA FADS3,FADS2,FTH1,BEST1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FTH1 59796 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 62225896 62226091 62226018 Y FTH1,WDR74,STX5,SLC3A2,NXF1 CTD-2531D15.4 NA NA NA NA CTD-2531D15.4 33700 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 62226637 62226898 62226739 Y FTH1,WDR74,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK CTD-2531D15.4 NA NA NA NA CTD-2531D15.4 34441 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 62248272 62248499 62248283 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2531D15.4 56076 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 62267084 62267180 62267134 Y WDR74,STX5,SLC3A2,NXF1,AHNAK RP11-864I4.4 NA NA NA NA RP11-864I4.4 44291 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 62306762 62307027 62306934 Y WDR74,STX5,NXF1,EML3,AHNAK RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654 NA NA NA NA RP11-864I4.4 4444 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 62308532 62308826 62308693 Y WDR74,NXF1 RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1 NA NA NA NA RP11-864I4.4 2645 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 62310227 62311393 62310863 Y WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1 NA NA NA NA RP11-864I4.4 78 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 62311446 62311797 62311501 Y WDR74,STX5,NXF1,AHNAK AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1 NA NA NA NA RP11-864I4.4 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 62312037 62312397 62312245 Y WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1 NA NA NA NA RP11-864I4.4 566 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr11 62320979 62321244 62321106 Y NA RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 NA NA NA NA AHNAK 463 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 62587560 62587930 62587905 Y NA TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA STX5 9630 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 62624183 62624258 62624224 Y NA STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA SLC3A2 2665 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 62625165 62625549 62625272 Y TUT1,METTL12,HNRNPUL2,SLC3A2 STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA SLC3A2 3647 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 63298876 63299223 63298998 Y OTUB1,MARK2,RARRES3 RARRES3 NA NA NA NA RARRES3 3058 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr11 63328335 63328557 63328446 Y NA RARRES3 NA NA NA NA RARRES3 26054 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 63639638 63639903 63639715 Y NA MARK2,RCOR2 NA NA NA NA MARK2 35238 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 63686695 63687182 63686923 Y NA RCOR2,NAA40 NA NA NA NA RCOR2 4379 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 63687620 63687907 63687858 Y LGALS12,RCOR2 RCOR2,NAA40 NA NA NA NA RCOR2 5304 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 63858567 63858836 63858756 Y NA NA NA NA NA NA RP11-21A7A.2 57125 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.77944795702319 chr11 63949132 63949273 63949224 Y NA MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4 NA NA NA NA STIP1 1471 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr11 65042835 65043130 65042858 Y EHD1,C11orf85,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2 NA NA NA NA POLA2 15602 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 65059026 65059409 65059335 Y EHD1,BATF2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2 NA NA NA NA CDC42EP2 20880 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 65059737 65059988 65059827 Y EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2 NA NA NA NA CDC42EP2 20301 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr11 65076655 65076852 65076688 Y EHD1,BATF2,FAU,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2,TIGD3 NA NA NA NA CDC42EP2 3437 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 65185589 65187086 65186338 Y NA SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 1159 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr11 65187297 65188198 65187553 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 47 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr11 65239550 65239870 65239751 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1 TIGD3,SCYL1 K562 ChIA-PET 22265404 AP000769.1 18822 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE T98G hg19 FANTOM5 2.07602261652705 chr11 65252951 65253044 65253026 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 10189 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 65254949 65255610 65255242 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 7623 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 65256318 65257363 65256982 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612,POLA2,DPF2,SLC25A45,TIGD3,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 5870 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 65259217 65259522 65259389 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 3711 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE T98G hg19 FANTOM5 3.16346303470788 chr11 65273934 65274467 65274182 Y NA MALAT1,SCYL1,LTBP3 LTBP3,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 10701 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr11 65323331 65323567 65323509 Y FOSL1 SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1 NA NA NA NA LTBP3 834 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 65419981 65420225 65420142 Y CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 8340 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 65420425 65420654 65420491 Y TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 7911 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr11 65537213 65537543 65537499 Y NA NA NA NA NA NA RNASEH2C 50795 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 65666492 65667203 65666864 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B MUS81,CFL1,EFEMP2,CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 448 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.87830617685781 chr11 65670692 65670945 65670845 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1 MUS81,CFL1,EFEMP2,CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 4648 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 65678943 65679154 65679019 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,CFL1,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,KLC2,FOSL1,SART1,DRAP1,C11orf68,BANF1 EFEMP2,CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 5434 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr11 65679250 65679576 65679373 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1 EFEMP2,CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 5012 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr11 65683105 65683625 65683322 Y NA EFEMP2,CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 963 CAGE T98G hg19 FANTOM5 2.86688837520402 chr11 65782974 65783337 65783107 Y FOSL1 BANF1,EIF1AD,CATSPER1,SF3B2 NA NA NA NA CATSPER1 8651 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.28515685785008 chr11 66047866 66048291 66048031 Y NA KLC2,RAB1B,CNIH2,YIF1A,RP11-867G23.13 NA NA NA NA CNIH2 4205 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 66374477 66374855 66374526 Y NA CTSF,CCS,CCDC87,RBM14,RBM14-RBM4,RBM4 RBM14-RBM4 IMR90 Hi-C 24141950 RBM14 7198 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 66487767 66487982 66487867 Y NA RBM4B,C11orf80 NA NA NA NA C11orf80 21940 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 66738286 66738892 66738415 Y POLD4,CLCF1,CLCF1,KDM2A,ADRBK1 PC PC,SYT12,RHOD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PC 14439 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr11 67039199 67039528 67039325 Y TBC1D10C,PITPNM1,KDM2A,ADRBK1,ANKRD13D ADRBK1,ANKRD13D,SSH3 NA NA NA NA ADRBK1 7318 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 67139742 67140272 67140082 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 687 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 67146992 67147327 67147282 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA,RPS6KB2 NA NA NA NA AP003419.11 7937 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 67270751 67271055 67270865 Y NA TMEM134,AIP,PITPNM1,CDK2AP2 NA NA NA NA PITPNM1 679 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 67827034 67827402 67827396 Y PPP6R3,ACY3,SUV420H1,CHKA NDUFS8,TCIRG1 NA NA NA NA TCIRG1 22551 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 68121765 68121884 68121804 Y ALDH3B1,C11orf24 LRP5 NA NA NA NA LRP5 43688 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 68147876 68148306 68148095 Y NA NA NA NA NA NA LRP5 69799 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 68714020 68714198 68714127 Y NA MRPL21,IGHMBP2 NA NA NA NA IGHMBP2 44710 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 68776292 68776545 68776410 Y MRGPRF TPCN2 MRGPRD IMR90 Hi-C 24141950 TPCN2 37820 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 68823304 68823521 68823445 Y NA TPCN2 NA NA NA NA TPCN2 8939 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 69257578 69257894 69257648 Y NA NA CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFITM9P 188304 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 69258094 69258432 69258217 Y CCND1 NA CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFITM9P 188820 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 69451342 69451588 69451394 Y NA CCND1,ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 2267 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 69453520 69454472 69453912 Y NA ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 70232495 70232810 70232653 Y NA CTTN,AP000487.5 NA NA NA NA CTTN 9700 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 71658678 71659025 71658708 Y NA RP11-849H4.2,RNF121 NA NA NA NA RNF121 20931 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 71702677 71703050 71702869 Y FOLR3,IL18BP,IL18BP NA NA NA NA NA RNF121 64930 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 71990969 71991411 71991180 Y NA NA NA NA NA NA INPPL1 58224 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 72452508 72452870 72452656 Y STARD10,ATG16L2,ARAP1 ARAP1,STARD10 NA NA NA NA ARAP1 49774 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 72854261 72854849 72854638 Y PDE2A,ARAP1,ATG16L2,RELT,RELT,FCHSD2 FCHSD2 NA NA NA NA FCHSD2 2955 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 73088357 73088912 73088439 Y NA RELT NA NA NA NA RELT 3048 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr11 73221521 73221768 73221630 Y PLEKHB1,PLEKHB1,FAM168A NA NA NA NA NA FAM168A 85466 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr11 73490470 73490918 73490608 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 5443 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr11 74465903 74466299 74466070 Y POLD3,RNF169 RP11-864N7.2,RNF169 XRRA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF169 7990 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 74578028 74578161 74578096 Y OR2AT4,XRRA1,RNF169 NA NA NA NA NA XRRA1 80084 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 75061558 75062072 75061823 Y NA ARRB1,RPS3 NA NA NA NA ARRB1 685 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 75265416 75265853 75265464 Y SERPINH1 GDPD5,SERPINH1 RPS3,GDPD5,KLHL35 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINH1 5248 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 75748582 75748924 75748753 Y UVRAG NA NA NA NA NA RP11-535A19.2 224131 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 75946013 75946323 75946187 Y NA NA C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKRIR 143692 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 76463883 76464042 76463970 Y NA RP11-21L23.4,TSKU,RP11-21L23.3 ACER3,TSKU,B3GNT6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-21L23.4 13225 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr11 76480789 76480971 76480905 Y NA RP11-21L23.4,TSKU,RP11-21L23.3 B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-21L23.4 3522 CAGE T98G hg19 FANTOM5 7.61208292726585 chr11 77445522 77445800 77445629 Y NA FTH1P16 NA NA NA NA FTH1P16 1451 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 77762280 77762565 77762352 Y NA KCTD14,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2 NA NA NA NA KCTD14 7043 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 77837663 77837947 77837805 Y NA NDUFC2-KCTD14,NDUFC2,ALG8,KCTD21-AS1 NA NA NA NA ALG8 10759 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 79794635 79795000 79794859 Y NA NA NA NA NA NA NARS2 1510716 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 81696174 81696306 81696246 Y NA NA NA NA NA NA RP11-742N3.1 702265 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 82781050 82781223 82781203 Y NA RAB30 NA NA NA NA RAB30 85 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 83203378 83203797 83203488 Y DLG2 NA NA NA NA NA CCDC90B 207928 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 83278002 83278167 83278160 Y NA NA NA NA NA NA CCDC90B 282552 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 85451857 85452132 85451995 Y NA NA NA NA NA NA CCDC89 56537 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 85463912 85464270 85464111 Y CREBZF,SYTL2,SYTL2,EED,SYTL2,SYTL2 NA CCDC89 IMR90 Hi-C 24141950 SYTL2 55914 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 85702937 85703343 85703240 Y NA NA NA NA NA NA PICALM 75581 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 85802534 85802824 85802626 Y NA PICALM PICALM IMR90 Hi-C 24141950 PICALM 23610 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 86171239 86171469 86171359 Y NA NA NA NA NA NA C11orf73 159986 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 86262463 86262643 86262563 Y FZD4 NA NA NA NA NA PRSS23 237458 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 86454484 86454767 86454607 Y NA PRSS23 PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 45334 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 86454778 86455149 86454967 Y PRSS23 PRSS23 PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 44952 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr11 86804343 86804452 86804398 Y NA NA NA NA NA NA TMEM135 57457 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 88153223 88153558 88153356 Y NA NA GRM5 IMR90 Hi-C 24141950 CTSC 84268 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 88288248 88288652 88288406 Y NA NA NA NA NA NA CTSC 219293 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 91958948 91959142 91959077 Y FAT3 NA FAT3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC36A4 969988 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 92767972 92767992 92767983 Y NA NA SLC36A4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC36A4 161138 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 92818375 92818514 92818426 Y SLC36A4,C11orf75 NA SLC36A4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC36A4 110616 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 93446176 93446355 93446266 Y NA SCARNA9,SNORD5,C11orf54 NA NA NA NA SCARNA9 6324 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 95557234 95557451 95557366 Y NA CEP57,FAM76B NA NA NA NA FAM76B 35661 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 95745158 95745721 95745455 Y FAM76B,MAML2,CCDC82 NA NA NA NA NA MTMR2 88679 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 95801750 95802104 95801927 Y NA NA NA NA NA NA MTMR2 145271 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 95808686 95809082 95808927 Y NA NA NA NA NA NA MTMR2 152207 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 95886290 95886343 95886317 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 188001 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 95938142 95938441 95938252 Y FAM76B,MAML2,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 135903 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 95976157 95976737 95976478 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 97607 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 95982466 95982894 95982863 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 91450 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr11 95987343 95987574 95987537 Y FAM76B,MAML2,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 86770 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 95990308 95990455 95990418 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 83889 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 95994127 95994433 95994401 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 79911 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 96006843 96007267 96007082 Y FAM76B,MAML2,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 67077 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 96024131 96024308 96024240 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 50036 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 96040167 96040456 96040282 Y MAML2 MAML2 NA NA NA NA MAML2 33888 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr11 96047326 96047750 96047695 Y MAML2 MAML2 NA NA NA NA MAML2 26594 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 96072423 96072630 96072557 Y MAML2,JRKL,CCDC82 MAML2,CCDC82,JRKL NA NA NA NA MAML2 1714 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 100590591 100590889 100590693 Y NA ARHGAP42 NA NA NA NA ARHGAP42 34207 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 100747572 100748094 100747776 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP42 191188 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 102042993 102043398 102043047 Y C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1 NA NA NA NA NA YAP1 63801 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr11 102216514 102216961 102216815 Y TMEM123,BIRC3,BIRC2 BIRC3,BIRC2 NA NA NA NA BIRC2 572 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 102231981 102232209 102232014 Y TMEM123,BIRC3,BIRC2 BIRC3,BIRC2 NA NA NA NA BIRC2 16039 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 102283995 102284326 102284226 Y BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123 NA BIRC2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 54789 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 102297400 102297813 102297636 Y BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123 TMEM123 BIRC2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 41302 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 103316988 103317242 103317115 Y NA RP11-37O16.8 NA NA NA NA RP11-37O16.8 38603 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 103495901 103496466 103496275 Y NA NA DYNC2H1,PDGFD IMR90 Hi-C 24141950 RP11-37O16.8 217516 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 103742967 103742991 103742981 Y NA NA NA NA NA NA PDGFD 290116 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr11 103801275 103801290 103801283 Y NA NA NA NA NA NA PDGFD 231817 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 103964860 103965229 103965142 Y NA NA NA NA NA NA PDGFD 67878 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 104838372 104838510 104838471 Y CARD17,CASP5,CARD16,CASP4,CASP4 CASP4 NA NA NA NA CASP4 209 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 105579191 105579256 105579211 Y KBTBD3,GRIA4,GRIA4,KIAA1826 NA NA NA NA NA GRIA4 100470 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 108487361 108487672 108487557 Y EXPH5 EXPH5,DDX10 NPAT,EXPH5,ATM IMR90 Hi-C 24141950 EXPH5 24896 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 109939977 109940512 109940366 Y FDX1,ZC3H12C ZC3H12C ZC3H12C K562 ChIA-PET 22265404 ZC3H12C 21575 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 109958650 109959379 109958908 Y NA ZC3H12C ZC3H12C IMR90 Hi-C 24141950 ZC3H12C 2708 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 109990513 109990553 109990536 Y NA ZC3H12C NA NA NA NA ZC3H12C 28426 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 110067293 110067585 110067439 Y NA NA ZC3H12C,RDX,FDX1 IMR90 Hi-C 24141950 RDX 97862 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 111824557 111824693 111824689 Y NA CRYAB,DIXDC1 NA NA NA NA DIXDC1 28689 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 113375857 113376013 113375967 Y CLDN25 DRD2 TTC12,DRD2 IMR90 Hi-C 24141950 DRD2 31444 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 113945404 113945849 113945581 Y ZBTB16,ZBTB16 NA NA NA NA NA NNMT 180660 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 114162155 114162496 114162247 Y NA NNMT NA NA NA NA NNMT 35646 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 114162916 114163328 114163238 Y NA NNMT NA NA NA NA NNMT 36407 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 114309073 114309125 114309098 Y NA RBM7,C11orf71,REXO2 NA NA NA NA REXO2 965 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr11 114312879 114313299 114312892 Y NA RBM7,C11orf71,REXO2 NA NA NA NA REXO2 4771 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 115017965 115018296 115018131 Y NA NA NA NA NA NA CADM1 355379 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 115372753 115373113 115372889 Y CADM1 CADM1 NA NA NA NA CADM1 562 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 115632209 115632334 115632272 Y NA NA NA NA NA NA CADM1 258534 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 116867531 116867975 116867966 Y NA AP000936.1 NA NA NA NA AP000936.1 36792 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 117015877 117016035 117015996 Y SIK3,PAFAH1B2 SIK3,PAFAH1B2,SIDT2 NA NA NA NA PAFAH1B2 2894 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 117853654 117853757 117853706 Y NA NA IL10RA K562 ChIA-PET 22265404 FXYD6 107453 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 117878914 117879095 117878954 Y AMICA1,UBE4A,MPZL3,CD3G,CD3E,CD3D,ATP5L,AMICA1,IL10RA NA NA NA NA NA FXYD6 132713 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 118493849 118494041 118493911 Y NA PHLDB1 NA NA NA NA PHLDB1 18694 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 118782911 118783378 118783221 Y SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 3494 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 118784118 118784508 118784405 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 4701 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 118788249 118788453 118788294 Y MLL,PHLDB1,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5864 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 118791529 118792348 118792152 Y PHLDB1,BCL9L MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 1969 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 118793665 118793922 118793750 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 395 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr11 118794621 118795305 118795013 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 304 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 118800245 118800827 118800413 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5928 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 119454963 119455433 119455083 Y NA NA TRIM29,USP2,LOC100499227 IMR90 Hi-C 24141950 PVRL1 142361 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr11 119595869 119596204 119596037 Y NA PVRL1 NA NA NA NA PVRL1 1590 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 120463888 120464227 120463894 Y GRIK4 NA GRIK4 IMR90 Hi-C 24141950 GRIK4 83420 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 121593077 121593718 121593342 Y NA NA MIR100HG,MIR125B1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 272165 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 122059856 122060218 122060121 Y NA MIRLET7A2,MIR100 NA NA NA NA MIR100 38840 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 122888881 122889273 122889127 Y NA RPL34P23,SNORD14D,SNORD14C,HSPA8 NA NA NA NA RPL34P23 15302 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 122949899 122950101 122950094 Y CLMP RPL34P23,SNORD14D,SNORD14C,HSPA8 NA NA NA NA HSPA8 17961 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 122956299 122956503 122956402 Y NA SNORD14D,SNORD14C,HSPA8 NA NA NA NA HSPA8 24361 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 123013120 123013348 123013342 Y NA NA NA NA NA NA CLMP 50641 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 125898187 125898226 125898207 Y CDON CDON NA NA NA NA CDON 33004 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 125904022 125904031 125904027 Y NA CDON NA NA NA NA CDON 27199 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 125983623 125983738 125983673 Y CDON NA HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 CDON 52393 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr11 125985923 125986168 125986013 Y NA NA HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 CDON 54693 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 126029421 126029682 126029619 Y NA FAM118B,RPUSD4 HYLS1,CDON IMR90 Hi-C 24141950 FAM118B 49627 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 126191145 126191518 126191332 Y NA TIRAP,DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4 NA NA NA NA RP11-712L6.5 18932 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 126571241 126571490 126571472 Y ST3GAL4 NA NA NA NA NA ST3GAL4 347706 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 128169091 128169261 128169176 Y NA NA ETS1,FLI1,KCNJ1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 286192 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 128366966 128367159 128367092 Y ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 88294 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr11 128367325 128367539 128367441 Y NA NA NA NA NA NA ETS1 87914 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr11 128373673 128373898 128373813 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 81555 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 128376891 128377234 128377096 Y ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 78219 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr11 128377315 128377487 128377422 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 77966 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr11 128382635 128382833 128382761 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 72620 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 129013172 129013631 129013445 Y NA NA NA NA NA NA FLI1 458742 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 129716429 129716681 129716540 Y TMEM45B NFRKB NA NA NA NA NFRKB 46804 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 129723853 129724184 129723902 Y NFRKB NFRKB NA NA NA NA NFRKB 39301 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 129731747 129732130 129731880 Y ST14,NFRKB,TMEM45B NFRKB NA NA NA NA NFRKB 31355 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr11 129871629 129871941 129871631 Y NA PRDM10,TCEB2P2 NA NA NA NA PRDM10 899 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr11 130392180 130392594 130392285 Y NA NA SNX19,ADAMTS15 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS15 75311 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr11 130506997 130507161 130507118 Y NA NA ADAMTS15,ADAMTS8 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS15 190128 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 130743628 130743895 130743754 Y NA SNX19 NA NA NA NA SNX19 40509 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 130767172 130767510 130767285 Y NA SNX19 NA NA NA NA SNX19 16894 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 132502586 132503019 132502881 Y NA NA NA NA NA NA IGSF9B 1321861 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 133903772 133904156 133904071 Y NA RP11-713P17.3,JAM3 NA NA NA NA RP11-713P17.3 3605 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 133969165 133969269 133969217 Y IGSF9B JAM3 NA NA NA NA JAM3 32345 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr11 134124453 134124658 134124640 Y NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2 VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8 NA NA NA NA ACAD8 3064 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 680187 680377 680237 Y NA NA NA NA NA NA WNK1 179382 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 685193 685500 685436 Y NA NA NA NA NA NA WNK1 174259 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 860254 860664 860544 Y RAD52,NINJ2,WNK1 WNK1 NA NA NA NA WNK1 495 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 864034 864343 864158 Y CCDC77,KDM5A WNK1 NA NA NA NA WNK1 4275 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 1026879 1027238 1027070 Y NA NA NA NA NA NA RAD52 69981 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 1407863 1408257 1407945 Y NA NA NA NA NA NA WNT5B 228800 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 1642572 1643085 1642916 Y NA WNT5B ERC1,LOC100292680,FBXL14 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5B 5515 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 1643252 1643620 1643470 Y NA WNT5B ERC1,LOC100292680,FBXL14 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5B 6195 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 1698560 1698670 1698614 Y FBXL14 FBXL14 NA NA NA NA FBXL14 2661 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr12 1698978 1699322 1699295 Y NA FBXL14 NA NA NA NA FBXL14 2009 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 1714275 1714637 1714592 Y NA FBXL14 FBXL14,RAD52,ERC1,WNT5B,WNK1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FBXL14 12944 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr12 1769649 1770205 1769686 Y NA ADIPOR2 NA NA NA NA ADIPOR2 25535 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 1770869 1771337 1771069 Y LRTM2,ADIPOR2 ADIPOR2 NA NA NA NA ADIPOR2 24403 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr12 2364427 2364812 2364581 Y LRTM2 NA NA NA NA NA RP5-1096D14.6 252595 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 2374154 2374447 2374269 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1096D14.6 262322 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 2393331 2393479 2393338 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1096D14.6 281499 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 2401865 2402116 2401991 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1096D14.6 290033 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 2445525 2445973 2445758 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1096D14.6 333693 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 2454250 2454342 2454280 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1096D14.6 342418 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 2467250 2467467 2467306 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1096D14.6 355418 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 2467815 2468125 2467879 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1096D14.6 355983 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 2555271 2555641 2555456 Y NA NA NA NA NA NA FKBP4 346478 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 3948349 3948613 3948479 Y NA PARP11 NA NA NA NA PARP11 31995 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 4448343 4448720 4448381 Y PARP11,CCND2,C12orf5 C12orf5 NA NA NA NA C12orf5 19972 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 4770172 4770413 4770176 Y NA AKAP3,NDUFA9 NA NA NA NA NDUFA9 13911 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 6311406 6311775 6311432 Y NA CD9 NA NA NA NA CD9 4525 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 6325035 6325634 6325452 Y NA CD9 NA NA NA NA CD9 18154 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.988582198346214 chr12 6339954 6340271 6340062 Y VAMP1,TAPBPL,IFFO1 CD9 NA NA NA NA CD9 33073 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 6432315 6432644 6432443 Y NA TNFRSF1A,LTBR NA NA NA NA TNFRSF1A 16636 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 6444583 6445131 6444861 Y CD4,CD4,TNFRSF1A TNFRSF1A,LTBR NA NA NA NA TNFRSF1A 4149 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 6445143 6445640 6445507 Y VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A TNFRSF1A,LTBR NA NA NA NA TNFRSF1A 3640 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr12 6713710 6714101 6713905 Y PTPN6,ZNF384,LPAR5,CHD4 NOP2,CHD4,LPAR5 NA NA NA NA CHD4 541 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 6873427 6873901 6873603 Y C12orf53,ENO2,CLSTN3,ATN1,PTMS,GPR162 COPS7A,PTMS,MLF2,CD4 LEPREL2,CDCA3,TPI1,CD4,GPR162,SPSB2,GNB3,USP5 IMR90 Hi-C 24141950 MLF2 740 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 6962211 6962407 6962304 Y GAPDH,COPS7A,COPS7A,COPS7A,COPS7A,LEPREL2,USP5,USP5,TPI1,TPI1 GPR162,LEPREL2,CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2 NA NA NA NA USP5 2919 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr12 7000184 7000641 7000294 Y PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6 CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57 NA NA NA NA SPSB2 3662 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr12 7034730 7034838 7034794 Y ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1 SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2 NA NA NA NA ATN1 3104 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr12 7592182 7592797 7592685 Y PEX5,NANOG RP11-157G21.2,CD163L1 NA NA NA NA RP11-157G21.2 1596 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 8013004 8013217 8013212 Y NA NA NA NA NA NA SLC2A3 73654 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 8123169 8123746 8123395 Y CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3 SLC2A3 SLC2A3,FOXJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC2A3 36298 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr12 8179132 8179551 8179335 Y NA FOXJ2,C3AR1 PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 3748 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.988582198346214 chr12 9931938 9932092 9931986 Y NA CD69 NA NA NA NA CD69 20441 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr12 10833157 10833219 10833190 Y NA STYK1 NA NA NA NA STYK1 8240 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 11043114 11043456 11043318 Y TAS2R7,TAS2R8,TAS2R31,TAS2R20,TAS2R14,TAS2R13 NA NA NA NA NA STYK1 218197 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 11755379 11755464 11755421 Y NA ETV6 ETV6 IMR90 Hi-C 24141950 ETV6 45324 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 11872628 11873141 11872822 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 71840 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 11919566 11919967 11919675 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 118778 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 11950553 11950830 11950618 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 149765 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 11987992 11988316 11988087 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 187204 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 12646905 12646967 12646936 Y LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B NA LOH12CR1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP16 66350 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 12872470 12873013 12872652 Y MANSC1,LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B,APOLD1 CDKN1B NA NA NA NA CDKN1B 6478 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 12883612 12883681 12883638 Y APOLD1 CDKN1B NA NA NA NA CDKN1B 17620 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 12957478 12957757 12957559 Y GPRC5A DDX47 NA NA NA NA DDX47 6493 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr12 12960939 12961466 12961074 Y NA DDX47 NA NA NA NA DDX47 2784 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 13025126 13025347 13025203 Y NA RPL13AP20,GPRC5A,MIR614 NA NA NA NA RPL13AP20 1086 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr12 13124934 13124993 13124963 Y NA HTR7P1,HEBP1 GPRC5D IMR90 Hi-C 24141950 HTR7P1 25819 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr12 13145446 13145954 13145521 Y DUSP16,EMP1 HTR7P1,HEBP1,KIAA1467 NA NA NA NA HTR7P1 4858 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 13253893 13254547 13254171 Y CDKN1B,EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 58675 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr12 13359236 13359687 13359415 Y EMP1 EMP1 NA NA NA NA EMP1 11586 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 13403402 13403764 13403583 Y NA NA NA NA NA NA EMP1 55752 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 14413561 14413925 14413703 Y NA RP11-134N1.2 ATF7IP IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-134N1.2 46037 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 14426552 14426694 14426609 Y PLBD1,ATF7IP NA NA NA NA NA RP11-134N1.2 59028 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 15853599 15853765 15853693 Y NA NA NA NA NA NA EPS8 179498 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 16553699 16554214 16553898 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 55623 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 16554253 16554721 16554664 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 56177 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 19291558 19291779 19291581 Y AEBP2,PLEKHA5 PLEKHA5 NA NA NA NA PLEKHA5 10910 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 19566135 19566181 19566158 Y NA AEBP2,EEF1A1P4 NA NA NA NA AEBP2 11156 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 20099675 20099840 20099742 Y PDE3A RP11-405A12.1 LOC100506393,PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-405A12.1 7220 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 21625286 21625603 21625493 Y NA PYROXD1,TCEB1P31,RECQL,GOLT1B NA NA NA NA TCEB1P31 26038 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 22428776 22428931 22428867 Y NA NA NA NA NA NA ST8SIA1 159044 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 24673435 24673806 24673663 Y SOX5 RP11-444D3.1 NA NA NA NA RP11-444D3.1 39718 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 24752569 24752849 24752709 Y BCAT1 RP11-444D3.1 SOX5 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-444D3.1 39045 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 25008843 25009219 25009048 Y NA NA NA NA NA NA BCAT1 91174 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 25099512 25100288 25099550 Y BCAT1 BCAT1 NA NA NA NA BCAT1 105 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 25537800 25538060 25537930 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 135930 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 137212 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr12 26267263 26267811 26267415 Y NA SSPN,BHLHE41,RP11-283G6.3 NA NA NA NA SSPN 5113 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 26427494 26428032 26427844 Y NA NA SSPN,BHLHE41,ITPR2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-283G6.3 149944 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 26538001 26538320 26538173 Y NA NA NA NA NA NA RP11-283G6.3 260451 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 26658315 26658658 26658486 Y NA NA NA NA NA NA ITPR2 325473 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 26663094 26663473 26663334 Y NA NA NA NA NA NA ITPR2 320658 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 26945295 26945340 26945320 Y C12orf71,ITPR2 ITPR2 NA NA NA NA ITPR2 38791 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 27346815 27347118 27346987 Y NA STK38L STK38L,REP15,PPFIBP1,C12orf71 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STK38L 47783 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 27678444 27678624 27678473 Y PPFIBP1 PPFIBP1 NA NA NA NA PPFIBP1 4080 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr12 27702695 27702969 27702865 Y NA PPFIBP1 NA NA NA NA PPFIBP1 28331 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 28179755 28179885 28179817 Y PTHLH,PTHLH NA PTHLH IMR90 Hi-C 24141950 CCDC91 104297 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 28283625 28284072 28283761 Y PTHLH,PTHLH CCDC91 PTHLH IMR90 Hi-C 24141950 CCDC91 110 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 31899631 31900083 31899901 Y AMN1,H3F3C AMN1,RP11-467L13.5,H3F3C METTL20,AMN1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-467L13.5 5568 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 31902136 31902566 31902240 Y C12orf35,AMN1,H3F3C AMN1,RP11-467L13.5,H3F3C AMN1 K562 ChIA-PET 22265404 RP11-467L13.5 3085 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 38493611 38493806 38493706 Y NA NA NA NA NA NA ALG10B 214574 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 39808802 39808894 39808882 Y NA KIF21A NA NA NA NA KIF21A 26298 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 42598855 42599145 42599001 Y YAF2,YAF2,YAF2 YAF2,PPHLN1 NA NA NA NA YAF2 31006 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 42825856 42826146 42826103 Y YAF2,YAF2,YAF2 NA NA NA NA NA ZCRB1 107936 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 45626822 45627300 45627014 Y ANO6,ANO6 ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 18998 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 45628991 45629732 45629167 Y ANO6,ANO6 ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 21167 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 45644542 45644793 45644668 Y ANO6 ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 36718 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 45820263 45820702 45820515 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA8P1 212439 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 46380247 46380714 46380477 Y SCAF11 SCAF11 NA NA NA NA SCAF11 3189 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 46571353 46571525 46571439 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A1 90275 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 46786554 46786766 46786571 Y NA SLC38A2,RP11-96H19.1 NA NA NA NA RP11-96H19.1 11092 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 46809510 46809878 46809694 Y NA SLC38A2,RP11-96H19.1 SLC38A4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 34048 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 46824163 46824471 46824386 Y NA RP11-96H19.1 SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 48701 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 46848355 46848425 46848370 Y NA NA SLC38A2 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-96H19.1 72893 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 46888080 46888552 46888358 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 112618 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.18629863801546 chr12 46917975 46918280 46918143 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 142513 CAGE T98G hg19 FANTOM5 4.34976167272334 chr12 46947043 46947401 46947166 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 171581 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 46949913 46950236 46950181 Y NA NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 174451 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 46951455 46951753 46951519 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 175993 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 46956686 46956942 46956800 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 181224 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 47074564 47074850 47074707 Y NA NA SLC38A1,SLC38A2,SLC38A4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 299102 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 47185736 47186095 47186020 Y NA NA NA NA NA NA AMIGO2 285639 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 47191369 47191677 47191464 Y NA NA NA NA NA NA AMIGO2 280057 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 47474423 47475249 47474825 Y NA AMIGO2 NA NA NA NA AMIGO2 2689 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.988582198346214 chr12 47612205 47612473 47612375 Y FAM113B NA NA NA NA NA AMIGO2 140471 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 47670448 47670925 47670783 Y NA NA AMIGO2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMIGO2 198714 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 47701468 47701752 47701723 Y NA NA AMIGO2,MIR4698,LOC100233209,FAM113B IMR90 Hi-C 24141950 AMIGO2 229734 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr12 48076459 48076736 48076534 Y NA RPAP3,RP1-197B17.3 NA NA NA NA RPAP3 21108 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 49678404 49678529 49678467 Y NA TROAP NA NA NA NA TROAP 36490 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 50020601 50020960 50020800 Y FMNL3,PRPF40B NA NA NA NA NA PRPF40B 60600 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 50067341 50067888 50067543 Y TUBA1A,NCKAP5L,FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 31620 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr12 50092156 50092464 50092310 Y FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 7044 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 50092738 50092974 50092805 Y AQP2,FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 6534 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 50221084 50221421 50221231 Y NCKAP5L NCKAP5L,BCDIN3D NA NA NA NA NCKAP5L 551 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 50507967 50508334 50508141 Y NA SMARCD1 NA NA NA NA SMARCD1 31212 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 50913232 50913640 50913328 Y NA DIP2B NA NA NA NA DIP2B 16464 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 51180627 51180997 51180727 Y SMAGP ATF1 TMPRSS12 IMR90 Hi-C 24141950 ATF1 25134 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr12 51534048 51534251 51534150 Y POU6F1 RP11-416A17.1,TFCP2 NA NA NA NA TFCP2 30675 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 52241760 52242326 52241842 Y SLC4A8,FIGNL2 NA SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACVR1B 101125 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 52423514 52423824 52423679 Y NA GRASP,NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 8898 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 52426547 52427164 52426822 Y NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP GRASP,NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 11931 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr12 52540964 52541526 52541224 Y KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44 KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 42258 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 52557711 52558022 52557822 Y NA KRT80 NA NA NA NA KRT80 25762 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 52596776 52597514 52597151 Y NR4A1 KRT80,KRT86 NA NA NA NA KRT80 12992 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr12 52674043 52674518 52674247 Y NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80 KRT86,KRT81 NA NA NA NA KRT81 8800 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr12 52674655 52675081 52674843 Y C12orf44,KRT80,KRT7 KRT86,KRT81 NA NA NA NA KRT81 8237 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 53267781 53268340 53268093 Y PFDN5 NA KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT18 72315 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 53612468 53612778 53612580 Y TENC1,TENC1,TENC1,IGFBP6,RARG,C12orf10 ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1 NA NA NA NA RARG 11986 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr12 53615195 53615822 53615501 Y CSAD,SP1,PRR13,PFDN5 ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1 NA NA NA NA RARG 8942 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr12 53765037 53765535 53765115 Y CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13 AAAS,SP1 SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP1 6425 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 53885903 53886227 53886219 Y NA MAP3K12,TARBP2 NA NA NA NA MAP3K12 5620 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 53890170 53890360 53890251 Y MFSD5 MAP3K12,TARBP2 NA NA NA NA MAP3K12 1487 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 54017367 54017528 54017445 Y NA ATF7,RP11-972K6.1 NA NA NA NA ATF7 671 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 54198975 54199124 54199050 Y NA SNORD81 HOXC12,HOXC13,SMUG1,HOTAIR,HOXC11,HOXC8,HOXC9,MIR196A2,HOXC10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNORD81 15886 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 54589708 54589846 54589777 Y CALCOCO1,NCKAP1L,GPR84 SMUG1 SMUG1,HOXC4,HOXC9 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SMUG1 8930 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 54610828 54611089 54611007 Y NA SMUG1 NA NA NA NA SMUG1 30050 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr12 54752671 54753884 54753119 Y NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84 GPR84 NA NA NA NA GPR84 2387 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 55808460 55808880 55808766 Y NA NA NA NA NA NA METTL7B 264450 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 56132069 56132385 56132308 Y OR6C4,OR10P1,SMARCC2,IKZF4 BLOC1S1,RP11-644F5.10,RP11-644F5.11,CD63,GDF11 NA NA NA NA GDF11 2679 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 56147551 56147694 56147624 Y NA BLOC1S1,RP11-644F5.10,RP11-644F5.11,CD63,GDF11 NA NA NA NA GDF11 12487 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 56150085 56150369 56150213 Y OR6C6,IKZF4 BLOC1S1,RP11-644F5.10,RP11-644F5.11,CD63,GDF11 NA NA NA NA GDF11 15021 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 56219844 56220081 56219962 Y OR6C3 SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14,MMP19,RNU1-69P NA NA NA NA TMEM198B 1448 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 56294124 56294208 56294164 Y NA RNU1-69P,DGKA,WIBG NA NA NA NA DGKA 24895 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 56614575 56614693 56614609 Y NA SMARCC2,RP11-977G19.5,RNF41,ANKRD52,COQ10A NA NA NA NA RNF41 858 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 56729298 56729459 56729406 Y NA RP11-977G19.11,CS,RP11-977G19.10,CNPY2,PAN2,STAT2 NA NA NA NA PAN2 3461 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 56914338 56914532 56914358 Y NA RP11-153M3.1,RBMS2 NA NA NA NA RBMS2 625 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.18629863801546 chr12 57077806 57078249 57078184 Y COQ10A,PAN2,PAN2 BAZ2A,ATP5B,PTGES3,NACA NA NA NA NA PTGES3 1910 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 57458942 57459239 57459094 Y NA TMEM194A,NAB2 TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM194A 20607 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 57462088 57462242 57462164 Y R3HDM2,MBD6,ARHGAP9,ARHGAP9,ARHGAP9,BAZ2A,STAT6,STAT6 TMEM194A,NAB2 TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM194A 17604 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 57520981 57521279 57521090 Y NA TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6 NA NA NA NA LRP1 705 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 57986482 57986782 57986634 Y R3HDM2,AGAP2,KIF5A,DTX3,B4GALNT1,ARHGEF25 DCTN2,KIF5A,PIP4K2C,DTX3,ARHGEF25,B4GALNT1 NA NA NA NA PIP4K2C 3525 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 58094555 58094631 58094593 Y NA OS9,AGAP2-AS1,TSPAN31 NA NA NA NA OS9 8817 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 58238225 58238735 58238639 Y AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,XRCC6BP1,CTDSP2 NA NA NA NA NA CTDSP2 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 58259163 58259391 58259220 Y TSPAN31,CDK4,METTL21B,CTDSP2 CTDSP2 CTDSP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 CTDSP2 20641 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 58281637 58282038 58281777 Y CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM CTDSP2,RP11-620J15.3 CTDSP2,TSFM,AVIL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTDSP2 43115 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr12 58349067 58349080 58349075 Y XRCC6BP1 RP11-620J15.3,XRCC6BP1 NA NA NA NA XRCC6BP1 15743 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 58819259 58819609 58819396 Y LRIG3,LRIG3 NA NA NA NA NA XRCC6BP1 485935 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 58923778 58923975 58923913 Y LRIG3,LRIG3 NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG3 388328 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr12 59310774 59310957 59310933 Y LRIG3,LRIG3 LRIG3 NA NA NA NA LRIG3 1346 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 59462086 59462470 59462278 Y LRIG3,LRIG3 NA NA NA NA NA LRIG3 149783 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 62796049 62796447 62796072 Y NA NA NA NA NA NA MON2 62150 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 63118880 63119001 63118911 Y NA NA NA NA NA NA MIRLET7I 123414 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr12 63149457 63149757 63149616 Y NA NA NA NA NA NA MIRLET7I 153991 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 64311746 64312216 64311964 Y NA NA NA NA NA NA SRGAP1 75673 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 65005842 65006280 65005896 Y GNS,C12orf66,TBK1,RASSF3 RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 3549 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 65262498 65262651 65262575 Y NA NA NA NA NA NA GNS 111271 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 65926688 65927190 65926918 Y NA NA MSRB3,HMGA2,RPSAP52 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 67459 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 65930655 65931175 65930934 Y HMGA2 NA MSRB3,HMGA2,RPSAP52 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 63474 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 65959414 65959817 65959668 Y NA RP11-221N13.3 HMGA2,MSRB3,RPSAP52 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 34832 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 66237933 66238219 66238043 Y HMGA2 HMGA2,RPSAP52 NA NA NA NA RPSAP52 19179 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 66628292 66629290 66628922 Y TMBIM4,IRAK3,HELB RBMS1P1 NA NA NA NA RBMS1P1 1278 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr12 67828762 67829103 67828960 Y NA NA DYRK2 MCF7 ChIA-PET 22265404 CAND1 167701 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 68705850 68706149 68706026 Y IL22,SLC35E3,NUP107,MDM2,MDM1 MDM1 NA NA NA NA MDM1 18012 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 68758917 68759565 68759229 Y IFNG,RAP1B MDM1 RAP1B,NUP107,LOC100507250 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MDM1 34756 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 68932536 68932735 68932704 Y NA NA MDM1 IMR90 Hi-C 24141950 RAP1B 69884 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr12 69122207 69122406 69122269 Y NA RPL7P42,NUP107,SLC35E3 NA NA NA NA SLC35E3 15480 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 69163885 69164101 69163897 Y SLC35E3 SLC35E3,MDM2 NA NA NA NA SLC35E3 25999 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 75878955 75879237 75879096 Y NA GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA GLIPR1 6495 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 75885817 75885886 75885852 Y KRR1 GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA GLIPR1 13357 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 75900907 75901415 75901091 Y KRR1 GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA KRR1 2001 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 75902459 75902855 75902619 Y KRR1 GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA KRR1 561 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 76414095 76414311 76414227 Y NA RP11-114H23.1,PHLDA1 NA NA NA NA PHLDA1 11401 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 76414369 76415079 76414685 Y NA RP11-114H23.1,PHLDA1 NA NA NA NA PHLDA1 10633 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 76429051 76429248 76429150 Y NA PHLDA1,NAP1L1 NA NA NA NA PHLDA1 3339 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 77456593 77456922 77456786 Y E2F7 E2F7 NA NA NA NA E2F7 438 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr12 79759610 79759960 79759786 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 322917 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 79943391 79943637 79943513 Y NA NA SYT1,PPP1R12A,PAWR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAWR 139240 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 80327802 80327850 80327826 Y NA PPP1R12A NA NA NA NA PPP1R12A 562 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 80974115 80974384 80974233 Y MYF5 NA NA NA NA NA ACSS3 355210 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 88968059 88968366 88968242 Y NA KITLG NA NA NA NA KITLG 4262 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 89747699 89748479 89748073 Y NA DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 2651 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 90345013 90345239 90345184 Y POC1B,ATP2B1 NA LOC338758 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP2B1 243936 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 92427755 92427874 92427825 Y CLLU1,BTG1 NA NA NA NA NA C12orf79 106816 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 92517978 92518398 92518142 Y BTG1 C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA C12orf79 16292 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr12 92528487 92528918 92528861 Y BTG1 C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA C12orf79 5772 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 93277124 93277496 93277306 Y NA EEA1 NA NA NA NA EEA1 43611 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 93805604 93805748 93805676 Y CRADD NUDT4,UBE2N NA NA NA NA UBE2N 28290 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 94678246 94678308 94678278 Y PLXNC1,TMCC3 NA NA NA NA NA RBMS2P1 138437 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 95404686 95404921 95404803 Y NA NDUFA12 NA NA NA NA NDUFA12 9140 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 96613519 96613922 96613765 Y NA ELK3 NA NA NA NA ELK3 27359 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 96631530 96631765 96631742 Y CDK17 ELK3 NA NA NA NA ELK3 45370 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 96650909 96650966 96650937 Y NA NA NA NA NA NA ELK3 64749 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 96664847 96665248 96665048 Y NA NA NA NA NA NA ELK3 78687 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 96794959 96795305 96795211 Y CDK17 CDK17,RN7SKP11 NA NA NA NA CDK17 2621 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 96839212 96840356 96839676 Y NEDD1,NEDD1,CDK17 CDK17,RN7SKP11 CDK17 IMR90 Hi-C 24141950 RN7SKP11 19948 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 98793447 98793582 98793503 Y NA NA NA NA NA NA TMPO 113708 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 99103586 99103986 99103782 Y NA NA NA NA NA NA APAF1 66667 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 100628061 100628323 100628191 Y NA ACTR6,RP11-175P13.3,SCYL2 NA NA NA NA SCYL2 30595 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 102909608 102909974 102909790 Y PAH NA NA NA NA NA NUP37 397706 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 103358686 103358916 103358881 Y NA NA NA NA NA NA NUP37 846784 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 104301376 104301628 104301530 Y NA HSP90B1 NA NA NA NA HSP90B1 20257 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 104671230 104671489 104671317 Y TXNRD1 RPL18AP3,RP11-818F20.5 NA NA NA NA RP11-818F20.5 1011 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 104675995 104676292 104676137 Y GLT8D2,TXNRD1 RPL18AP3,RP11-818F20.5 NA NA NA NA RP11-818F20.5 3495 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr12 104693849 104694220 104693862 Y NA RPL18AP3,RP11-818F20.5 NA NA NA NA RP11-818F20.5 21349 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr12 104791559 104791875 104791716 Y TXNRD1 NA CHST11,SLC41A2,C12orf45 IMR90 Hi-C 24141950 CHST11 55198 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr12 105062941 105063154 105062961 Y NA NA NA NA NA NA CHST11 215868 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 105064571 105065844 105065441 Y EID3,CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 217498 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 105089120 105089756 105089331 Y CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 242047 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 106328094 106328476 106328238 Y CKAP4 NA NUAK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NUAK1 203335 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 106640032 106640193 106640140 Y NA NA NA NA NA NA TCP11L2 53514 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 106682328 106682503 106682422 Y NA TCP11L2,CKAP4 CKAP4,NUAK1,TCP11L2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TCP11L2 11204 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 107377522 107377900 107377585 Y RFX4,RIC8B,MTERFD3 C12orf23,MTERFD3 NA NA NA NA MTERFD3 1044 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 108103294 108103307 108103300 Y PRDM4 PWP1,PRDM4 NA NA NA NA PWP1 25785 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 108699402 108699607 108699511 Y CORO1C,SELPLG NA NA NA NA NA FICD 207355 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr12 108996890 108997233 108997080 Y NA SART3,ISCU,TMEM119,SELPLG NA NA NA NA TMEM119 6794 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 109037814 109037911 109037861 Y SSH1,SELPLG TMEM119,SELPLG NA NA NA NA SELPLG 12079 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 109058635 109058851 109058743 Y NA SELPLG NA NA NA NA SELPLG 32900 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 109083720 109083964 109083780 Y SSH1 CORO1C NA NA NA NA CORO1C 39408 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 109227089 109227462 109227320 Y NA SSH1 NA NA NA NA SSH1 21904 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 109232143 109232504 109232328 Y FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 16862 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.58173151735394 chr12 109248007 109248657 109248411 Y SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 709 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.988582198346214 chr12 109249958 109250678 109250397 Y NA SSH1 NA NA NA NA SSH1 592 CAGE T98G hg19 FANTOM5 3.95432879338486 chr12 109899131 109899209 109899162 Y TRPV4,TRPV4,TRPV4 UBE3B,KCTD10 NA NA NA NA UBE3B 13998 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 109900993 109901418 109901152 Y KCTD10 UBE3B,KCTD10 NA NA NA NA UBE3B 11789 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 110517549 110517856 110517740 Y GIT2,RAD9B,C12orf76 C12orf76,IFT81 C12orf76 K562 ChIA-PET 22265404 C12orf76 8058 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 111015565 111016027 111015682 Y PPTC7,ARPC3 PPTC7,TCTN1 NA NA NA NA PPTC7 3098 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 111028698 111029042 111028796 Y ARPC3,PPTC7,HVCN1 PPTC7,TCTN1 PPTC7,GPN3,FAM216A,VPS29,RAD9B,PPP1CC,TCTN1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPTC7 9573 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 112018937 112019235 112019073 Y NA ATXN2 NA NA NA NA ATXN2 16245 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr12 112341708 112342051 112341878 Y ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116 NA NA NA NA NA MAPKAPK5 63926 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 112529504 112529724 112529616 Y NA NAA25,TRAFD1 NA NA NA NA NAA25 15102 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr12 113652796 113652994 113652903 Y OAS1,OAS3,OAS2,SLC24A6,SDSL,TPCN1 DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA TPCN1 3861 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 113660919 113661318 113661188 Y TPCN1 DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA IQCD 4020 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 115103963 115104215 115104201 Y TBX3 TBX3 NA NA NA NA TBX3 15754 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr12 115105863 115106455 115106375 Y TBX3 TBX3 NA NA NA NA TBX3 13514 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 115107232 115107509 115107392 Y TBX3 TBX3 NA NA NA NA TBX3 12460 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 115354392 115354675 115354479 Y NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 234423 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.28515685785008 chr12 115791856 115792156 115792052 Y NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 671887 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 116498439 116498839 116498749 Y MED13L,MAP1LC3B2 NA NA NA NA NA MED13L 214304 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 116864232 116864472 116864363 Y NA NA NA NA NA NA LINC00173 104755 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 116872040 116872309 116872217 Y NA NA NA NA NA NA LINC00173 96918 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 116872632 116872752 116872692 Y NA NA MED13L,LINC00173,MIR4472-2,MAP1LC3B2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00173 96475 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 117029905 117030297 117030145 Y NA NA NA NA NA NA LINC00173 60678 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 118123457 118123641 118123524 Y NA NA NA NA NA NA RFC5 325752 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 118349165 118349453 118349309 Y NA NA NA NA NA NA RFC5 99940 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 118632324 118632442 118632383 Y NA RPS2P5 PEBP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPS2P5 49435 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 118744725 118745093 118744968 Y TAOK3 NA NA NA NA NA RPS2P5 62848 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 118745418 118745709 118745623 Y NA NA NA NA NA NA TAOK3 63041 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr12 118815733 118815925 118815736 Y TAOK3 TAOK3,SUDS3 NA NA NA NA SUDS3 3548 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 120728531 120728703 120728617 Y NA PXN,NME2P1,RNU4-2 PXN,GCN1L1,LOC100506649,RPLP0,RAB35,SIRT4,CCDC64,DYNLL1,SRSF9,RNF10,COX6A1,PLA2G1B,MSI1,LOC100506668,COQ5,TRIAP1,GATC IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-2 825 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 120926786 120926862 120926830 Y SIRT4 TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1,RNF10,COQ5 NA NA NA NA DYNLL1 21133 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 120956227 120956384 120956265 Y COQ5 RNF10,COQ5 NA NA NA NA RNF10 12899 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 121310801 121311113 121311060 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 29061 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 121533843 121533975 121533917 Y NA P2RX7 ACADS,UNC119B,P2RX4,POP5,CABP1,MLEC,SPPL3,C12orf43,OASL,P2RX7,CAMKK2 IMR90 Hi-C 24141950 P2RX7 34647 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 121714857 121715111 121714996 Y OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2 CAMKK2 NA NA NA NA CAMKK2 19000 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 121838748 121839039 121838846 Y SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 2904 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 121839154 121839422 121839290 Y C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 3310 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 121864200 121864449 121864234 Y NA ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 28356 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 121866033 121866226 121866130 Y NA ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 30189 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 122020162 122020238 122020212 Y RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3242 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr12 122028609 122028883 122028798 Y RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1 RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 KDM2B K562 ChIA-PET 22265404 KDM2B 11689 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 122124782 122125118 122124936 Y P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3 MORN3,TMEM120B MORN3,LOC338799,SETD1B K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 MORN3 16245 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 122908043 122908483 122908329 Y ZCCHC8,DENR,CLIP1 CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 2864 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.988582198346214 chr12 123362987 123363145 123363088 Y NA HIP1R,VPS37B NA NA NA NA VPS37B 15846 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 123367402 123367963 123367875 Y VPS37B VPS37B NA NA NA NA VPS37B 11028 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 123528001 123528432 123528293 Y C12orf65,C12orf65,C12orf65 NA NA NA NA NA ABCB9 63805 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 123930588 123930862 123930771 Y RILPL2 RILPL2,SNRNP35 SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SNRNP35 9326 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 124823049 124823325 124823212 Y FAM101A NA NA NA NA NA NCOR2 226810 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 124916261 124916578 124916546 Y NA NA NA NA NA NA NCOR2 133557 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 124926088 124926324 124926239 Y NA NA NA NA NA NA NCOR2 123811 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 124937911 124938596 124938282 Y UBC,NCOR2 NA NA NA NA NA NCOR2 111539 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 125033431 125034089 125033755 Y UBC NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 16046 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 125050856 125051375 125051213 Y UBC,NCOR2 NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 721 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr12 125259292 125259624 125259541 Y UBC NA NA NA NA NA SCARB1 105590 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 125404545 125404922 125404790 Y UBC SCARB1,UBC,RPL22P19 NCOR2,SCARB1,UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 4631 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 125423202 125423335 125423285 Y NA UBC,RPL22P19,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 RPL22P19 4761 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 125940224 125940232 125940227 Y TMEM132B NA NA NA NA NA TMEM132B 270842 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 127567979 127568114 127568034 Y NA NA NA NA NA NA AC079949.1 80558 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 130824673 130824982 130824768 Y PIWIL1 NA NA NA NA NA STX2 496829 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 131261153 131261348 131261240 Y NA NA NA NA NA NA STX2 60463 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 132315038 132315239 132315115 Y MMP17 MMP17 NA NA NA NA MMP17 4100 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr12 132315862 132315946 132315904 Y MMP17 MMP17 NA NA NA NA MMP17 4924 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 132345340 132345736 132345589 Y SFSWAP,ULK1 MMP17,ULK1 NA NA NA NA ULK1 31460 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 132558778 132559145 132558825 Y NA EP400NL NA NA NA NA EP400NL 7683 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 132903795 132904258 132904060 Y GALNT9 NA NA NA NA NA GALNT9 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr12 132904307 132904701 132904477 Y NA GALNT9 NA NA NA NA GALNT9 372 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 132970087 132970237 132970177 Y CHFR,ANKLE2,FBRSL1 NA GALNT9,LOC100130238,P2RX2,POLE,DDX51,NOC4L,LOC100507055,FBRSL1,EP400NL IMR90 Hi-C 24141950 GALNT9 66152 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr12 133029955 133030417 133030330 Y NA FBRSL1 LOC100507055,FBRSL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FBRSL1 33720 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr12 133414550 133414990 133414881 Y NA RPS11P5,GOLGA3 GOLGA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GOLGA3 11106 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 20271500 20271544 20271543 Y NA NA NA NA NA NA MPHOSPH8 65712 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 20624080 20624132 20624092 Y NA NA NA NA NA NA ZMYM2 93270 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 20875474 20875741 20875720 Y NA NA NA NA NA NA CRYL1 222255 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 21241518 21241702 21241584 Y NA NA NA NA NA NA IFT88 102933 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 21405905 21405971 21405953 Y NA NA NA NA NA NA N6AMT2 59808 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 21517643 21517924 21517794 Y LATS2 XPO4 CRYL1,SKA3,MRP63,LATS2,SAP18 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 XPO4 42456 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr13 21653965 21654176 21654071 Y LATS2 LATS2 LATS2,SAP18 IMR90 Hi-C 24141950 LATS2 20279 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 21748962 21749145 21749040 Y NA SAP18,SKA3,MRP63 NA NA NA NA MRP63 178 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 22107257 22107449 22107379 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC20 75748 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 23168627 23169009 23168951 Y NA NA NA NA NA NA FTH1P7 99704 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 24062649 24062979 24062814 Y NA NA NA NA NA NA SACS 56808 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 24133122 24133556 24133337 Y NA TNFRSF19 MIPEP,TNFRSF19 IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF19 8953 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr13 24191778 24192157 24192102 Y NA TNFRSF19 NA NA NA NA TNFRSF19 49269 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 24697003 24697328 24697264 Y NA NA SPATA13 IMR90 Hi-C 24141950 SPATA13 145059 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 24722927 24723324 24723037 Y NA NA SPATA13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPATA13 170983 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr13 25880585 25880813 25880618 Y MTMR6,NUPL1 MTMR6,NUPL1 NA NA NA NA NUPL1 6923 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 25886402 25886789 25886419 Y NA MTMR6,NUPL1 NA NA NA NA NUPL1 12740 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 27557231 27557465 27557334 Y USP12,RPL21,RASL11A NA RASL11A,USP12,RPL21,MTIF3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP12 186568 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr13 27608814 27608959 27608884 Y WASF3,GPR12 NA RASL11A,USP12,RPL21 IMR90 Hi-C 24141950 USP12 135074 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 27706563 27707017 27706898 Y NA USP12 NA NA NA NA USP12 37016 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 27834117 27834352 27834235 Y USP12 RPL21,RASL11A NA NA NA NA RASL11A 8112 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 28025291 28025563 28025486 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA MTIF3 2552 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr13 29148829 29149214 29148994 Y POMP EIF4A1P7 FLT1 IMR90 Hi-C 24141950 EIF4A1P7 21756 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 29327742 29327905 29327792 Y NA SLC46A3 NA NA NA NA SLC46A3 36635 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr13 31370248 31370547 31370398 Y ALOX5AP NA ALOX5AP,USPL1,KATNAL1,HMGB1,UBL3,TEX26-AS1,C13orf33,TEX26 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ALOX5AP 62603 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 31444557 31445090 31444788 Y C13orf26 NA NA NA NA NA ALOX5AP 136912 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 31472880 31473382 31473215 Y C13orf33 NA NA NA NA NA ALOX5AP 165235 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 31783730 31783901 31783816 Y NA HSPH1,B3GALTL NA NA NA NA B3GALTL 11657 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 32620673 32620873 32620777 Y N4BP2L2,N4BP2L2,N4BP2L1,BRCA2,FRY FRY NA NA NA NA FRY 17236 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr13 32780608 32781010 32780825 Y FRY,ZAR1L NA NA NA NA NA BRCA2 106601 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 34116442 34117241 34116673 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 193675 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr13 34217614 34217741 34217660 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 172445 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 34253090 34253722 34253494 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 136464 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.87830617685781 chr13 34729958 34730262 34730146 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 339772 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 34731212 34731445 34731362 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 341026 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr13 35574872 35575244 35575038 Y NBEA NA NA NA NA NA NBEA 60448 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 36918283 36918673 36918579 Y NA CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2,SPG20 NA NA NA NA SPG20 23644 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 37493371 37493714 37493499 Y C13orf36,RFXAP,SMAD9 SMAD9 NA NA NA NA SMAD9 469 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr13 41229483 41229797 41229615 Y NA FOXO1 NA NA NA NA FOXO1 8937 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 41558714 41559024 41558959 Y C13orf15,FOXO1,NAA16,ELF1,ELF1 NA NA NA NA NA SUGT1P3 64804 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 41627549 41627939 41627788 Y C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1 WBP4,ELF1 ELF1,MTRF1,NAA16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WBP4 5471 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 42188044 42188379 42188211 Y NA NA NA NA NA NA NAA16 304703 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 42269057 42269475 42269218 Y C13orf15,DGKH NA NA NA NA NA NAA16 385716 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 42453037 42453433 42453235 Y NA NA NA NA NA NA AKAP11 390856 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 42849254 42849451 42849396 Y TNFSF11,TNFSF11,DGKH,AKAP11 AKAP11 NA NA NA NA AKAP11 4965 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 42967379 42967658 42967522 Y TNFSF11,DGKH NA NA NA NA NA AKAP11 123090 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 43378134 43378246 43378162 Y NA NA NA NA NA NA EPSTI1 186161 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 43451555 43451845 43451701 Y NA NA NA NA NA NA EPSTI1 112562 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr13 43632661 43632965 43632672 Y NA DNAJC15 NA NA NA NA DNAJC15 37322 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.18629863801546 chr13 43727960 43728297 43728107 Y NA NA ENOX1,DNAJC15,CCDC122,LACC1 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJC15 132621 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr13 44542732 44543742 44543446 Y SERP2 NA SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00284 61882 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr13 45338378 45338728 45338554 Y NA NA TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1,LINC00330 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 189095 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 45389747 45390055 45389901 Y NA NA TSC22D1,TSC22D1-AS1,LINC00330,NUFIP1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NUFIP1 171563 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 45745052 45745233 45745142 Y NA KCTD4 NA NA NA NA KCTD4 27942 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr13 47128078 47128394 47128310 Y LCP1,C13orf18,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 2775 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 47128564 47128952 47128887 Y LCP1,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 3261 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr13 48639735 48640044 48639890 Y NA NUDT15,SUCLA2,MED4 NA NA NA NA MED4 27223 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 50217217 50217337 50217325 Y SETDB2,SETDB2,PHF11,PHF11,ARL11 EBPL NA NA NA NA EBPL 46274 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 50602874 50603059 50603020 Y NA TRIM13,MIR16-1 NA NA NA NA MIR16-1 18138 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 50671086 50671325 50671206 Y NA MIR16-1,DLEU1,DLEU2 NA NA NA NA DLEU1 16779 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 51103280 51103738 51103647 Y NA RP11-175B12.2 DLEU1,DLEU2,EBPL,TRIM13,MIR3613 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-175B12.2 3695 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 52218212 52218391 52218309 Y NA NA NA NA NA NA WDFY2 61568 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr13 52218923 52219366 52219003 Y WDFY2,DHRS12,DHRS12 NA NA NA NA NA WDFY2 62279 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 52303239 52303556 52303323 Y WDFY2 NA NA NA NA NA DHRS12 72737 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr13 53775107 53775689 53775457 Y NA NA NA NA NA NA SUGT1 550263 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 59685905 59686157 59686031 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 1049964 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 60679231 60679569 60679243 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 56552 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 60723538 60723946 60723707 Y NA DIAPH3 NA NA NA NA DIAPH3 12175 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 61157781 61157905 61157871 Y NA NA NA NA NA NA TDRD3 189190 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 64652316 64652644 64652373 Y NA LINC00355 NA NA NA NA LINC00355 4172 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 72419778 72420070 72419973 Y DACH1 NA NA NA NA NA H3F3BP1 172579 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 74326809 74326882 74326846 Y KLF12 NA NA NA NA NA KLF12 379512 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 74550144 74550303 74550225 Y NA NA NA NA NA NA KLF12 156091 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 74708897 74709334 74709161 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 2503 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr13 74709487 74710034 74709735 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 3093 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 76279599 76280073 76279764 Y LMO7 NA NA NA NA NA LMO7 87029 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 76336754 76337033 76336914 Y COMMD6,LMO7 NA NA NA NA NA LMO7 144184 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 77897670 77898015 77897832 Y NA MYCBP2 NA NA NA NA MYCBP2 1170 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 77898193 77898346 77898226 Y NA MYCBP2 NA NA NA NA MYCBP2 839 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr13 79232403 79232753 79232546 Y NA RNF219 NA NA NA NA RNF219 1089 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 80319311 80319640 80319476 Y NA NA SPRY2 IMR90 Hi-C 24141950 NDFIP2 266024 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 80916096 80916414 80916232 Y NA SPRY2 NA NA NA NA SPRY2 3010 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr13 95201580 95202169 95201893 Y NA TGDS,GPR180 NA NA NA NA TGDS 44342 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr13 95932787 95933077 95933010 Y NA ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 18610 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 95951518 95951672 95951596 Y ABCC4 ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 15 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 96498991 96499334 96499248 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC3 171598 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr13 97143722 97143959 97143730 Y NA NA NA NA NA NA UGGT2 439986 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 97263096 97263285 97263191 Y NA NA NA NA NA NA UGGT2 559360 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 97908706 97909024 97908751 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 37018 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 97912286 97912462 97912389 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 40598 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 97991476 97991911 97991864 Y MBNL2 NA NA NA NA NA RAP2A 92565 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 98926557 98926890 98926623 Y NA NA NA NA NA NA FARP1 133741 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 99128638 99129073 99128919 Y STK24 NA NA NA NA NA STK24 99121 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr13 99130571 99130717 99130631 Y STK24 NA NA NA NA NA STK24 97477 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr13 99933141 99933542 99933359 Y GPR183 GPR183 NA NA NA NA GPR183 24117 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 99935844 99936009 99935907 Y GPR183 GPR183 NA NA NA NA GPR183 21650 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 99962652 99963115 99962844 Y GPR183 GPR183 NA NA NA NA GPR183 4993 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 100008605 100009044 100008755 Y DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL NA NA NA NA NA GPR183 50946 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 100115582 100115885 100115820 Y NA TM9SF2 MIR548AN,UBAC2 IMR90 Hi-C 24141950 TM9SF2 35786 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 100312355 100312691 100312364 Y NA NA NA NA NA NA CLYBL 55436 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 101046682 101046918 101046816 Y A2LD1 NA NA NA NA NA RPS26P47 143610 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 103249969 103250343 103250155 Y ERCC5,TPP2 TPP2 NA NA NA NA TPP2 2616 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 108520131 108520835 108520801 Y LIG4,FAM155A FAM155A NA NA NA NA FAM155A 3048 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 109807507 109807975 109807755 Y NA NA NA NA NA NA AL162497.1 597640 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 110664530 110664847 110664695 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 227615 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr13 110669788 110670084 110669997 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 232873 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.3840150776847 chr13 110746992 110747342 110747118 Y NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 COL4A2 208817 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 111016537 111016818 111016564 Y NA NA NA NA NA NA COL4A1 59041 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 111064452 111064750 111064655 Y RAB20 NA NA NA NA NA COL4A1 106956 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 111176913 111177121 111177092 Y ING1,ING1,ANKRD10,RAB20 RAB20 NA NA NA NA RAB20 34959 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 111212014 111212166 111212090 Y ING1,ING1,ANKRD10,RAB20 NA COL4A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB20 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 111410023 111410076 111410050 Y NA ING1,CARS2 CARS2,LINC00346,ING1,COL4A2 IMR90 Hi-C 24141950 CARS2 46073 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 111589420 111590157 111589779 Y NA ANKRD10 ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 24004 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr13 111863058 111863169 111863068 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF7 98152 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 113377120 113377559 113377252 Y NA ATP11A NA NA NA NA ATP11A 34477 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr13 113806516 113806910 113806731 Y ATP11A,CUL4A NA PROZ IMR90 Hi-C 24141950 CUL4A 53642 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 113928610 113928824 113928747 Y CUL4A LAMP1 NA NA NA NA LAMP1 20732 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 114064803 114065029 114064948 Y NA NA NA NA NA NA DCUN1D2 78238 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr13 114065698 114065892 114065794 Y MCF2L,ADPRHL1 NA NA NA NA NA DCUN1D2 77375 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr13 114068135 114068518 114068472 Y ADPRHL1 NA NA NA NA NA DCUN1D2 74749 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 114147699 114148153 114147800 Y F7,F10,PROZ,GRTP1 DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA TMCO3 4389 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr13 114600157 114600520 114600358 Y GAS6 GAS6 NA NA NA NA GAS6 35111 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr13 114830489 114831626 114831334 Y RASA3 NA NA NA NA NA RASA3 64460 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr13 114894223 114894969 114894576 Y RASA3 RASA3 NA NA NA NA RASA3 1117 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 20803011 20803143 20803077 Y NA TTC5,CCNB1IP1,PARP2,RPPH1 NA NA NA NA CCNB1IP1 3540 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 21151333 21151694 21151411 Y NA RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 997 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 21684818 21685080 21685024 Y OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1 NA NA NA NA NA HNRNPC 50573 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 23293879 23294567 23294288 Y RBM23,C14orf119,SLC7A7,SLC7A7 SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10 REM2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC7A7 2462 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr14 23307440 23308274 23307581 Y SLC7A8,PSMB5,PSMB5,LRP10,MRPL52,MMP14 SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10 NA NA NA NA MMP14 3674 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 23320228 23321035 23320800 Y RBM23,C14orf119,ACIN1,SLC7A7,SLC7A7 SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10 NA NA NA NA MMP14 16462 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 23358205 23358555 23358381 Y NA LRP10,RBM23,PRMT5-AS1,PRMT5,RP11-298I3.1 NA NA NA NA LRP10 19383 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 23449151 23449315 23449234 Y MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB HAUS4,AJUBA,C14orf93 NA NA NA NA AJUBA 536 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 23449757 23450231 23450060 Y MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB HAUS4,C14orf93 NA NA NA NA AJUBA 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr14 23466494 23466910 23466688 Y CDH24,C14orf93 HAUS4,AJUBA,C14orf93,PSMB5 NA NA NA NA C14orf93 10465 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 24604383 24604748 24604550 Y NA PCK2,DCAF11,PSME1,RNF31,PSME2,IRF9 NA NA NA NA PSME1 1016 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 24934340 24934390 24934365 Y NA KHNYN,SDR39U1 NA NA NA NA SDR39U1 24229 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 29228603 29228912 29228757 Y FOXG1 FOXG1,C14orf23 NA NA NA NA FOXG1 4138 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 29229981 29230346 29230164 Y NA FOXG1,C14orf23 NA NA NA NA FOXG1 2704 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 29243702 29244197 29243854 Y FOXG1 FOXG1,C14orf23 NA NA NA NA C14orf23 3792 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr14 29706068 29706381 29706228 Y NA NA NA NA NA NA C14orf23 466158 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 31478440 31478826 31478753 Y NA AP4S1,STRN3 NA NA NA NA AP4S1 13486 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 32597823 32598061 32597946 Y NUBPL NA NA NA NA NA ARHGAP5-AS1 53824 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 32672212 32672871 32672506 Y ARHGAP5 NA NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP5-AS1 128213 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 32953597 32954289 32954012 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 1591 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr14 32979007 32979394 32979291 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 27001 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 33093045 33093198 33093106 Y NA NA NA NA NA NA RP11-320M16.1 141039 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 33106586 33106949 33106623 Y NA NA NA NA NA NA RP11-320M16.1 154580 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 33126424 33126565 33126444 Y NA NA NA NA NA NA RP11-320M16.1 174418 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 33402784 33403168 33402896 Y NPAS3 NPAS3 NA NA NA NA NPAS3 645 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 33406991 33407386 33407042 Y NA NPAS3 NA NA NA NA NPAS3 4852 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 33950978 33951281 33951079 Y NA NA NA NA NA NA NPAS3 548839 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 35628271 35628433 35628369 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA KIAA0391 38516 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 35805683 35806194 35806003 Y BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA NA NA NA NA NA RP11-561B11.1 50081 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 35810635 35811251 35810911 Y BAZ1A,FAM177A1,RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1 PPP2R3C,KIAA0391,PSMA6,NFKBIA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-561B11.1 45024 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 35839188 35839529 35839227 Y NA RP11-561B11.1,NFKBIA NFKBIA K562 ChIA-PET 22265404 RP11-561B11.1 16746 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 36235126 36235268 36235197 Y NA RALGAPA1 NA NA NA NA RALGAPA1 41242 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 36277376 36277519 36277444 Y NFKBIA,RALGAPA1 RALGAPA1,NUTF2P2,BRMS1L NA NA NA NA RALGAPA1 866 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 37445830 37445969 37445900 Y NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1 NA NA NA NA NA MIPOL1 219149 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 37785804 37785829 37785809 Y NA NA NA NA NA NA MIPOL1 120686 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 38057887 38058022 38057995 Y FOXA1 RP11-356O9.2,TTC6,FOXA1 NA NA NA NA TTC6 5030 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 38614811 38615058 38614936 Y NA NA NA NA NA NA FOXA1 547566 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 39559553 39559840 39559693 Y NA SEC23A,GEMIN2 NA NA NA NA SEC23A 17010 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 39768270 39768447 39768359 Y PNN,MIA2 CTAGE5 NA NA NA NA CTAGE5 35782 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 39890491 39890736 39890687 Y NA FBXO33 NA NA NA NA FBXO33 8968 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 39958924 39958943 39958934 Y NA NA NA NA NA NA FBXO33 59220 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr14 50237132 50237443 50237218 Y KLHDC2 KLHDC2 NA NA NA NA KLHDC2 4806 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 50328432 50328642 50328440 Y METTL21D,ARF6,RPL36AL,DNAAF2 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 10511 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr14 50334846 50335244 50334992 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 16925 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr14 50467375 50468846 50468075 Y RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D NA NA NA NA NA ARF6 109565 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 50511824 50512400 50511896 Y RPL36AL,ARF6,SOS2,C14orf182 NA C14orf182,ARF6 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARF6 154014 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 50527611 50528257 50527921 Y RPL36AL,ARF6,C14orf182 NA NA NA NA NA SOS2 168019 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 50681069 50681448 50681362 Y NA SOS2 NA NA NA NA SOS2 14828 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 50799629 50799645 50799635 Y NA ATP5S,L2HGDH NA NA NA NA L2HGDH 22363 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 51066593 51066625 51066609 Y TRIM9,CDKL1,ATL1 MAP4K5 SAV1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP4K5 40749 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 51286113 51286196 51286155 Y PYGL,NIN NIN NA NA NA NA NIN 9643 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 51302196 51302378 51302287 Y NIN NIN NA NA NA NA NIN 6357 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 51460024 51460383 51460203 Y TRIM9 NA NA NA NA NA PYGL 50570 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 52006399 52006758 52006578 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 52581 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 52119936 52120349 52120008 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 166118 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr14 52145900 52146294 52146052 Y NA NA NA NA NA NA GNG2 144619 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 52339910 52340287 52340136 Y PTGER2,PTGDR,GNG2 GNG2 NA NA NA NA GNG2 48997 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 52349798 52350236 52349885 Y PTGDR,GNG2 NA NA NA NA NA GNG2 58885 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 52584121 52584359 52584179 Y NA NA NID2,C14orf166 IMR90 Hi-C 24141950 NID2 50409 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 52622606 52622722 52622664 Y NA NA C14orf166,NID2,PTGDR IMR90 Hi-C 24141950 NID2 88894 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 53020677 53020806 53020735 Y PTGDR,TXNDC16,GPR137C TXNDC16,GPR137C NA NA NA NA GPR137C 2811 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 53416335 53416646 53416599 Y GPR137C FERMT2 NA NA NA NA FERMT2 507 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 53575786 53575939 53575850 Y DDHD1 DDHD1 NA NA NA NA DDHD1 42061 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 54640534 54640974 54640637 Y NA NA BMP4 IMR90 Hi-C 24141950 CDKN3 220593 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 54810392 54810416 54810404 Y NA NA DDHD1 IMR90 Hi-C 24141950 CDKN3 51151 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 54833964 54834357 54834051 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 27210 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.988582198346214 chr14 55035984 55036343 55036300 Y SAMD4A SAMD4A NA NA NA NA SAMD4A 4169 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 55120784 55121076 55120951 Y NA NA NA NA NA NA SAMD4A 88969 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 55166048 55166175 55166112 Y SAMD4A NA NA NA NA NA SAMD4A 134233 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 55173516 55173842 55173679 Y SAMD4A NA NA NA NA NA SAMD4A 141701 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 55197259 55197652 55197332 Y NA NA NA NA NA NA SAMD4A 165444 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 55569733 55570176 55570087 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 18652 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr14 55584452 55585250 55584591 Y GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3 LGALS3 MAPK1IP1L,SOCS4,LGALS3,DLGAP5 IMR90 Hi-C 24141950 LGALS3 3578 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 55592942 55593103 55593023 Y GCH1,FBXO34,FBXO34 LGALS3 NA NA NA NA LGALS3 4114 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 55593915 55594674 55594041 Y GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3 LGALS3 NA NA NA NA LGALS3 5087 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 55765939 55766288 55766115 Y GCH1 FBXO34,RP11-665C16.6 NA NA NA NA RP11-665C16.6 29146 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 56047594 56047945 56047904 Y NA KTN1,KTN1-AS1 NA NA NA NA KTN1-AS1 2766 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr14 56800514 56800817 56800666 Y NA NA KTN1,RPL13AP3,PELI2,LINC00520 IMR90 Hi-C 24141950 PELI2 217982 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 57047832 57047974 57047932 Y PELI2,C14orf101 NA NA NA NA NA PELI2 465300 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 58748134 58748542 58748422 Y ARID4A PSMA3,RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A NA NA NA NA RP11-349A22.5 14310 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 59216036 59216189 59216096 Y ARID4A RP11-112J1.1 DACT1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-112J1.1 43183 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 59656513 59656908 59656842 Y DAAM1 DAAM1 NA NA NA NA DAAM1 3149 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 59744882 59745126 59745004 Y NA NA NA NA NA NA DAAM1 91518 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 59949393 59949731 59949550 Y C14orf149 GPR135,JKAMP NA NA NA NA JKAMP 232 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 60330001 60330562 60330397 Y NA NA NA NA NA NA DHRS7 304012 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 60629133 60629293 60629144 Y NA DHRS7 NA NA NA NA DHRS7 5281 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 60679186 60679974 60679676 Y NA DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2 NA NA NA NA PPM1A 30496 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 61108188 61108290 61108236 Y NA SIX1 NA NA NA NA SIX1 14687 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 61456427 61456721 61456474 Y SLC38A6 RP11-193F5.4,SLC38A6,TRMT5 NA NA NA NA TRMT5 10351 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 61570265 61570959 61570637 Y SLC38A6 NA NA NA NA NA TRMT5 124189 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 61612107 61612325 61612234 Y SIX1 NA SLC38A6,SIX1,SIX4,MNAT1,TRMT5 IMR90 Hi-C 24141950 TRMT5 166031 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 61645426 61645731 61645594 Y NA NA SLC38A6,SIX1,MNAT1,TRMT5,SIX4 IMR90 Hi-C 24141950 TRMT5 199350 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 61865216 61865457 61865337 Y PRKCH NA NA NA NA NA RP11-47I22.3 169801 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 61938268 61939375 61939158 Y HIF1A NA NA NA NA NA RP11-47I22.3 95883 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 61978357 61978646 61978426 Y HIF1A NA NA NA NA NA RP11-47I22.3 56612 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 62069550 62069793 62069672 Y NA RP11-47I22.3 NA NA NA NA RP11-47I22.3 34292 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 62157799 62158071 62157921 Y HIF1A HIF1A,HIF1A-AS1,RP11-618G20.1 NA NA NA NA HIF1A 2160 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 62298450 62298645 62298529 Y NA COX4I1P1 PRKCH,FLJ22447,HIF1A-AS2,HIF1A,SNAPC1 IMR90 Hi-C 24141950 COX4I1P1 1363 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 63894419 63894585 63894502 Y PPP2R5E,KCNH5,GPHB5 NA NA NA NA NA PPP2R5E 113507 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 64117169 64117293 64117244 Y SYNE2,WDR89,WDR89 WDR89 WDR89 MCF7 ChIA-PET 22265404 WDR89 10590 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 64185455 64185764 64185678 Y PPP2R5E,SYNE2,WDR89,WDR89,SGPP1 SGPP1,RP11-804M7.2 NA NA NA NA SGPP1 6993 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 64975156 64975343 64975202 Y NA AKAP5,ZBTB1,ZBTB25 NA NA NA NA ZBTB25 5225 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 65525721 65526064 65525893 Y NA MAX NA NA NA NA MAX 41349 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 65749378 65749653 65749574 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2509G16.2 62313 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 66126309 66126626 66126333 Y NA NA NA NA NA NA FUT8 250999 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 66511264 66511273 66511269 Y GPHN NA NA NA NA NA GPHN 460852 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 67735210 67735475 67735304 Y NA MPP5 NA NA NA NA MPP5 29384 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 67763359 67763655 67763501 Y NA NA NA NA NA NA MPP5 57533 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 68161499 68161767 68161616 Y PLEK2 VTI1B,RDH11 NA NA NA NA RDH11 968 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 68320437 68320759 68320587 Y ZFYVE26 ZFYVE26,RAD51B NA NA NA NA RAD51B 35941 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 68431145 68431760 68431180 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 146649 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 68604521 68604895 68604639 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 282018 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr14 68607037 68607479 68607161 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 279434 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 68943032 68943562 68943135 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 56119 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 69013502 69013901 69013730 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 126589 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 69076965 69077322 69077310 Y NA NA NA NA NA NA ZFP36L1 183868 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 69241519 69241814 69241672 Y NA ZFP36L1 NA NA NA NA ZFP36L1 19376 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 69246726 69246992 69246942 Y DCAF5 ZFP36L1 NA NA NA NA ZFP36L1 14198 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 69247587 69247770 69247677 Y DCAF5,ZFP36L1 ZFP36L1 NA NA NA NA ZFP36L1 13420 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 69274132 69274272 69274201 Y NA ZFP36L1 RAD51B,ZFP36L1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L1 12942 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 69377319 69377610 69377464 Y NA NA NA NA NA NA ACTN1 66547 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 69417007 69417266 69417043 Y NA ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 26891 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr14 69417780 69418181 69417964 Y NA ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 25976 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 69618210 69618757 69618360 Y NA DCAF5,EXD2 NA NA NA NA DCAF5 343 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 70116783 70116977 70116879 Y DCAF5,SRSF5,SRSF5,KIAA0247 KIAA0247 NA NA NA NA KIAA0247 40470 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 70844763 70845165 70845114 Y NA COX16,SYNJ2BP NA NA NA NA COX16 20315 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 71249264 71249522 71249393 Y NA MAP3K9,RP6-65G23.3 NA NA NA NA MAP3K9 24729 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 71797093 71797681 71797289 Y PCNX SIPA1L1,RP1-261D10.2 SIPA1L1,LOC145474 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-261D10.2 10562 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 71996595 71997083 71996703 Y NA NA NA NA NA NA RP1-261D10.2 210064 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 74207610 74207866 74207660 Y C14orf43 PNMA1 NA NA NA NA PNMA1 28482 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 74981330 74981609 74981543 Y NPC2 MIR4709,ISCA2,NPC2 NA NA NA NA NPC2 22450 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 75038441 75039020 75038725 Y NPC2,DLST NA NA NA NA NA NPC2 79561 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 75086409 75086922 75086553 Y PGF NA LTBP2,KIAA0317,FCF1,YLPM1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FCF1 90925 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr14 75087327 75087770 75087539 Y PGF,EIF2B2,LTBP2 NA YLPM1,NPC2,ISCA2,LTBP2,KIAA0317,FCF1 IMR90 Hi-C 24141950 FCF1 90077 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 75592667 75593037 75593004 Y NA RP11-950C14.7,NEK9,TMED10 NA NA NA NA NEK9 620 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 75607767 75608156 75607957 Y FOS RP11-950C14.7,NEK9,TMED10 NEK9 IMR90 Hi-C 24141950 NEK9 15720 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 75644862 75644871 75644867 Y NA TMED10 NA NA NA NA TMED10 3528 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 75714210 75714571 75714299 Y NEK9,FOS RP11-293M10.2,FOS TMED10,LOC731223,NEK9,ZC2HC1C,FOS,BATF,JDP2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-293M10.2 9543 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 75761897 75762132 75762064 Y FOS,JDP2,JDP2,JDP2,FLVCR2,FLVCR2 RP11-293M10.2,FOS NA NA NA NA FOS 18420 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 75768536 75769006 75768683 Y NA RP11-293M10.2,FOS NA NA NA NA FOS 25059 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 75777354 75777713 75777592 Y NA FOS NA NA NA NA FOS 33877 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 75920164 75920191 75920178 Y JDP2 JDP2 NA NA NA NA JDP2 27745 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr14 76513976 76514095 76514005 Y NA NA NA NA NA NA IFT43 147497 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 77384980 77385465 77385224 Y VASH1 RP11-488C13.1,RP11-7F17.1 IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488C13.1 33887 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 77386302 77386621 77386483 Y IRF2BPL RP11-488C13.1,RP11-7F17.1 IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488C13.1 35209 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 77423763 77424258 77424192 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL RP11-7F17.1 IRF2BPL,KIAA1737 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.1 8768 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 77428060 77428442 77428341 Y NA RP11-7F17.1 IRF2BPL MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.1 4584 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 77499482 77500543 77500476 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL IRF2BPL KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 6448 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr14 77500544 77500911 77500765 Y NA IRF2BPL KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 7510 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 77509664 77510215 77509840 Y IRF2BPL IRF2BPL IRF2BPL IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BPL 16630 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 77577466 77577695 77577651 Y NA TMEM63C,ZDHHC22 NA NA NA NA TMEM63C 3216 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 78651844 78652230 78652037 Y NA NA NA NA NA NA NRXN3 54504 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 81019191 81019257 81019224 Y DIO2,CEP128 NA NA NA NA NA DIO2 167091 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 DYNLL1P1 NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 2.07602261652705 chr14 81867255 81867616 81867435 Y GTF2A1,GTF2A1,STON2 NA NA NA NA NA RP11-299L17.1 69550 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 86066316 86066619 86066414 Y NA NA NA NA NA NA FLRT2 71828 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 89881748 89882141 89882044 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA CAP2P1 125810 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 89933895 89934174 89934034 Y FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 149319 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 90465200 90465384 90465297 Y NA EFCAB11,TDP1 NA NA NA NA TDP1 45917 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 90875651 90876041 90875751 Y NA RPL21P11,CALM1 NA NA NA NA CALM1 14805 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 92970203 92970533 92970302 Y ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 RIN3 NA NA NA NA RIN3 7585 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr14 93114264 93114489 93114415 Y ITPK1,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 NA NA NA NA NA LGMN 98558 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 93193771 93194035 93193928 Y MOAP1,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 LGMN NA NA NA NA LGMN 19012 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 93552204 93552427 93552400 Y NA ITPK1,RP11-371E8.2 NA NA NA NA ITPK1 28238 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 93569992 93570233 93570210 Y KIAA1409,C14orf109,C14orf109 ITPK1,RP11-371E8.2 NA NA NA NA ITPK1 10432 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 93738394 93738720 93738557 Y NA NA NA NA NA NA BTBD7 58718 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 93776910 93777138 93777024 Y PRIMA1 BTBD7 NA NA NA NA BTBD7 20300 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 94840163 94840451 94840311 Y SERPINA1 NA NA NA NA NA SERPINA6 52432 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 95068378 95068532 95068464 Y NA SERPINA5 NA NA NA NA SERPINA5 42599 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 95691488 95691499 95691495 Y NA NA NA NA NA NA DICER1 69141 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 95946356 95946810 95946552 Y NA RP11-1070N10.3 NA NA NA NA RP11-1070N10.3 33663 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 99073187 99073437 99073313 Y NA NA NA NA NA NA C14orf64 630726 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 99283105 99283111 99283108 Y NA NA C14orf64 IMR90 Hi-C 24141950 SETD3 662105 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 99439262 99439638 99439565 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 505578 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr14 99827366 99827674 99827539 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 117542 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 99934490 99934508 99934499 Y EML1 SETD3,CCNK NA NA NA NA SETD3 10708 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 100071651 100072022 100071781 Y NA CCDC85C NA NA NA NA CCDC85C 3288 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr14 100497913 100498157 100498035 Y NA NA EVL,YY1,DEGS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 204478 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 100659173 100659604 100659490 Y NA YY1,RP11-638I2.4 DEGS2,YY1,EVL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 43031 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 100751761 100751840 100751790 Y NA YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29 NA NA NA NA SLC25A29 19044 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 101283054 101283176 101283121 Y NA MEG3 NA NA NA NA MEG3 39307 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 102188292 102188876 102188640 Y WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C PPP2R5C LINC00239 K562 ChIA-PET 22265404 PPP2R5C 37259 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr14 102288392 102288845 102288491 Y NA NA NA NA NA NA PPP2R5C 62257 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 102340393 102340589 102340458 Y PPP2R5C,WDR20,DYNC1H1,PPP2R5C NA NA NA NA NA DYNC1H1 88276 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.77944795702319 chr14 102415545 102415736 102415629 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13129 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 102438747 102439113 102438818 Y PPP2R5C,DYNC1H1 DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 9882 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 102544859 102545271 102545048 Y NA NA NA NA NA NA WDR20 58569 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 102977207 102977381 102977329 Y AMN ANKRD9 NA NA NA NA ANKRD9 3071 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 102991046 102991386 102991124 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 16910 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 102991831 102991939 102991900 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 17695 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 103575159 103575514 103575439 Y MARK3,BAG5,BAG5,TRAF3,EIF5,EIF5,TNFAIP2 TNFAIP2 NA NA NA NA TNFAIP2 12265 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 103577820 103578081 103577991 Y MARK3,BAG5,BAG5,TRAF3,EIF5,EIF5,TNFAIP2 TNFAIP2 NA NA NA NA TNFAIP2 9698 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 103828242 103828602 103828384 Y TNFAIP2,EIF5,EIF5,MARK3 EIF5,MARK3 NA NA NA NA MARK3 21127 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 105144100 105144955 105144117 Y GPR132,AKT1 INF2,ADSSL1 NA NA NA NA INF2 8988 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 105154013 105154712 105154273 Y ADSSL1 INF2,ADSSL1 NA NA NA NA INF2 70 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 105290315 105290696 105290451 Y GPR132 AKT1,RPS26P49 NA NA NA NA RPS26P49 4812 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr14 105493379 105493756 105493698 Y NA C14orf79,CDCA4 NA NA NA NA CDCA4 7894 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 105557924 105558306 105558075 Y NA NA BTBD6,BRF1,JAG2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDCA4 72439 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr14 105947921 105948133 105948082 Y NA CRIP2,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA C14orf80 6059 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr14 105948139 105949025 105948432 Y NA CRIP2,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA C14orf80 5167 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr15 20547295 20547641 20547374 Y NA NA LOC348120,REREP3,POTEB IMR90 Hi-C 24141950 TUBGCP5 2283754 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 25554216 25554517 25554319 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 127611 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 25563100 25563402 25563110 Y SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 118726 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 25564293 25564526 25564383 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 117602 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr15 25565589 25566847 25566046 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 115281 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 25586903 25587047 25586976 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 95081 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr15 26327449 26327665 26327505 Y NA NA ATP10A,LOC100128714 IMR90 Hi-C 24141950 ATP10A 219132 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 26864879 26864942 26864916 Y NA NA NA NA NA NA GABRB3 317744 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 29266500 29266713 29266607 Y NA NA NA NA NA NA APBA2 138871 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 30022522 30022814 30022806 Y FAM189A1 NA NA NA NA NA TJP1 236254 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 32962221 32962756 32962661 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP11A 56876 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr15 33083952 33084023 33083988 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP11A 178607 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 33111010 33111355 33111242 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP11A 205665 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr15 33120518 33121018 33120854 Y GREM1 NA NA NA NA NA ARHGAP11A 215173 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 33122479 33122828 33122652 Y GREM1 NA NA NA NA NA ARHGAP11A 217134 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 33133022 33133309 33133285 Y GREM1 NA GREM1 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP11A 227677 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 33134248 33134560 33134512 Y NA NA GREM1 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP11A 228903 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 33135808 33135977 33135886 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP11A 230463 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 33148173 33148432 33148370 Y GREM1 NA NA NA NA NA ARHGAP11A 242828 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 33162710 33163027 33162926 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP11A 257365 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 33212194 33212596 33212424 Y GREM1 NA NA NA NA NA ARHGAP11A 306849 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 35384953 35385239 35385081 Y NA NA ATPBD4 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 106465 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 37249666 37249815 37249741 Y NA NA NA NA NA NA RP11-128A17.1 139725 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 39174117 39174200 39174140 Y C15orf53 NA FSIP1,THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 RASGRP1 318341 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 39342673 39342985 39342799 Y RASGRP1,C15orf53 NA FSIP1,C15orf53,THBS1,C15orf54 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 374411 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 39361992 39362177 39362006 Y NA NA FSIP1,C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 355219 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 39420923 39421276 39421056 Y NA NA THBS1,C15orf53,FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 296120 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 39432449 39432903 39432696 Y C15orf54 NA THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 284493 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 39474254 39474447 39474377 Y THBS1 NA C15orf53,THBS1,FSIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-624L4.1 242949 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 39593792 39594300 39594108 Y THBS1 NA FSIP1,C15orf53,THBS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-624L4.1 123096 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 40179429 40179904 40179805 Y NA GPR176,EIF2AK4 FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR176 31189 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 40180090 40180249 40180216 Y NA GPR176,EIF2AK4 FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR176 30844 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 40210900 40211252 40211013 Y GPR176 EIF2AK4 FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR176 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr15 40373777 40374114 40374053 Y FSIP1,BAHD1,BMF,BMF,BMF SRP14,BMF NA NA NA NA BMF 24979 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 40391032 40391342 40391133 Y PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 7751 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 40728458 40728872 40728667 Y NA IVD,BAHD1,CHST14 NA NA NA NA BAHD1 1048 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 41254301 41254691 41254494 Y NA DLL4,CHAC1 NA NA NA NA CHAC1 11141 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 41701982 41702123 41702037 Y INO80,CHP NDUFAF1,RTF1 RTF1 MCF7 ChIA-PET 22265404 RTF1 3376 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 41920606 41920652 41920629 Y NA NA TYRO3,MAPKBP1,MGA IMR90 Hi-C 24141950 TYRO3 72733 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 41953918 41954236 41954127 Y EHD4,MGA NA MAPKBP1 IMR90 Hi-C 24141950 TYRO3 106045 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 42236399 42236774 42236695 Y NA EHD4 SPTBN5 IMR90 Hi-C 24141950 EHD4 26002 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 42262075 42262564 42262366 Y MGA,JMJD7,VPS39,EHD4 EHD4 NA NA NA NA EHD4 212 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 42814906 42815063 42814960 Y NA SNAP23,LRRC57,HAUS2 NA NA NA NA LRRC57 23937 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 43135579 43135976 43135778 Y TGM7 NA NA NA NA NA TTBK2 75031 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 43415014 43415563 43415337 Y NA UBR1,TMEM62 NA NA NA NA TMEM62 1537 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 43757406 43757566 43757505 Y NA TP53BP1 NA NA NA NA TP53BP1 43360 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 44592122 44592245 44592183 Y NA CASC4 NA NA NA NA CASC4 13195 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 44838663 44839045 44838853 Y NA EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 11408 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 44954800 44955080 44954968 Y CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11 SPG11,PATL2,B2M NA NA NA NA SPG11 924 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 45748469 45749175 45748989 Y SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN NA NA NA NA NA SPATA5L1 55940 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr15 45784407 45784611 45784453 Y C15orf48,SQRDL,PLDN SLC30A4 NA NA NA NA SLC30A4 28394 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 46758762 46759114 46758953 Y NA NA NA NA NA NA SEMA6D 715184 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 48011445 48011769 48011637 Y NA CTD-2270N23.1 NA NA NA NA CTD-2270N23.1 9363 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 48605520 48605711 48605648 Y NA DUT,RP11-154J22.1 NA NA NA NA DUT 15497 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 50633863 50634132 50634006 Y ATP8B4,HDC,USP8,GABPB1 GABPB1-AS1,GABPB1 NA NA NA NA GABPB1-AS1 11393 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 50995097 50995499 50995351 Y SPPL2A TRPM7 NA NA NA NA TRPM7 18085 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 51171970 51172368 51172169 Y NA AP4E1 TRPM7,SPPL2A,USP50,ASB18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323,22265404 AP4E1 26501 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 51481875 51482198 51481995 Y SPPL2A,DMXL2 NA NA NA NA NA TNFAIP8L3 86402 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 52024012 52024470 52024199 Y TMOD3,MAPK6,DMXL2,LYSMD2 TMOD2,LYSMD2 NA NA NA NA TMOD2 17288 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 52273738 52273979 52273778 Y NA MAPK6,LEO1 MAPK6,GNB5,MYO5C,BCL2L10 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LEO1 11735 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 52349753 52350120 52349937 Y NA CTD-2184D3.1 NA NA NA NA CTD-2184D3.1 35372 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 52385766 52385957 52385877 Y DMXL2,MAPK6 CTD-2184D3.1 NA NA NA NA CTD-2184D3.1 274 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 52438848 52438958 52438938 Y NA GNB5 NA NA NA NA GNB5 42608 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 55095328 55096039 55095750 Y RAB27A,RSL24D1 NA NA NA NA NA RSL24D1 391226 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 55487983 55488563 55488357 Y RAB27A,PIGB,RSL24D1 RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 718 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 55574844 55574949 55574897 Y NA PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1 NA NA NA NA PIGB 34209 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 55581016 55581448 55581368 Y RAB27A,PIGB,CCPG1,CCPG1 PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1 NA NA NA NA PIGB 27710 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 55977497 55977782 55977636 Y NA NA NA NA NA NA PRTG 55506 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 56127522 56127639 56127539 Y NA NA NA NA NA NA PRTG 94234 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 56162319 56162688 56162565 Y NA NA NA NA NA NA NEDD4 121256 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 56332751 56332969 56332911 Y NA NEDD4 NEDD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD4 48807 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 58402084 58402260 58402225 Y NA NA ALDH1A2 K562 ChIA-PET 22265404 POLR2M 519853 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 58761932 58762090 58762054 Y NA NA ADAM10 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM10 278087 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 58884938 58885321 58885256 Y NA NA NA NA NA NA ADAM10 154856 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 59138361 59138756 59138559 Y NA RNF111 NA NA NA NA RNF111 16618 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 59478138 59478489 59478268 Y ADAM10,SLTM,RNF111 NA NA NA NA NA CCNB2 82861 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 59576201 59576407 59576333 Y GCNT3,MYO1E NA NA NA NA NA FAM81A 86485 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 63142999 63143362 63143082 Y NA NA NA NA NA NA RP11-244F12.1 100010 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr15 63386917 63387072 63386993 Y RPS27L,TPM1 RP11-244F12.3,LACTB NA NA NA NA LACTB 24927 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 63427902 63428515 63428147 Y USP3,RAB8B,LACTB LACTB,RPS27L NA NA NA NA LACTB 15903 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 63663812 63664001 63663921 Y LACTB,RAB8B CA12 NA NA NA NA CA12 8359 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 63664402 63664810 63664706 Y LACTB,CA12 CA12 NA NA NA NA CA12 7550 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 63771566 63772233 63772016 Y HERC1,USP3 USP3 APH1B,RAB8B,CA12,USP3,HERC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP3 22560 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 63794488 63794915 63794759 Y NA NA NA NA NA NA USP3 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 63795379 63795825 63795543 Y NA USP3 NA NA NA NA USP3 586 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr15 64385169 64385477 64385384 Y NA DAPK2,FAM96A,SNX1 NA NA NA NA SNX1 847 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 64601637 64601745 64601727 Y NA CSNK1G1 NA NA NA NA CSNK1G1 44697 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 64654607 64654901 64654754 Y PIF1,KIAA0101 CSNK1G1,KIAA0101,TRIP4 CSNK1G1 IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1G1 8165 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 64753700 64753985 64753784 Y PLEKHO2 ZNF609 NA NA NA NA ZNF609 2759 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 64919514 64919887 64919625 Y NA NA NA NA NA NA OAZ2 73593 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 64920832 64921228 64921023 Y ZNF609,OAZ2 NA NA NA NA NA OAZ2 72252 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 64940943 64941327 64941079 Y NA NA NA NA NA NA OAZ2 52153 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 65135268 65135743 65135404 Y TRIP4,ZNF609,OAZ2,SPG21,SPG21,PLEKHO2 PIF1,AC069368.3,PLEKHO2 NA NA NA NA PLEKHO2 3180 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr15 65589242 65589632 65589437 Y NA RNU5A-1,PARP16 MTFMT,IGDCC4,PDCD7,RASL12,IGDCC3,OSTBETA,CILP,PARP16,CLPX,UBAP1L,DPP8,PTPLAD1,SPG21,KBTBD13 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PARP16 1324 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 65596266 65596532 65596409 Y NA RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5310 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 65596702 65597188 65596889 Y DENND4A RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5746 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr15 65823475 65823857 65823545 Y IGDCC4 DPP8,PTPLAD1 NA NA NA NA PTPLAD1 2719 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 66060795 66060948 66060877 Y NA RAB11A,DENND4A NA NA NA NA DENND4A 21683 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 66177095 66177419 66177152 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 94464 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 66707547 66707736 66707571 Y MAP2K1 TIPIN,MAP2K1 RPL4,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K1 30392 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 66910064 66910181 66910152 Y SMAD3,MAP2K1 NA SMAD6 IMR90 Hi-C 24141950 LCTL 53747 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 66993287 66993569 66993487 Y MAP2K1,SMAD6 SMAD6 NA NA NA NA SMAD6 721 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 67095524 67095803 67095671 Y NA NA NA NA NA NA SMAD6 102958 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr15 67134448 67134928 67134631 Y NA NA SMAD6,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 141882 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr15 67341124 67341334 67341261 Y NA SMAD3 SMAD3,IQCH,LOC100506686,AAGAB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD3 12767 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 67359902 67360303 67360058 Y NA SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 5801 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.3840150776847 chr15 67366599 67366961 67366679 Y NA SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 12498 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 67373443 67373710 67373534 Y SMAD3 SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 19342 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 67378105 67378547 67378289 Y SMAD3 SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 24004 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 67393197 67393867 67393527 Y SMAD3 SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 39096 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 67394592 67394967 67394687 Y NA SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 40491 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 67399103 67399775 67399548 Y SMAD3 SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 45002 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr15 67401891 67402640 67402087 Y SMAD3 SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 47790 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 67413336 67413759 67413492 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 59235 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 67426476 67426864 67426547 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 72375 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 67440675 67441024 67440815 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 86574 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 67442347 67443164 67443030 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 88246 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 67468171 67468380 67468281 Y SMAD3 NA NA NA NA NA IQCH 76758 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 67488498 67488886 67488594 Y SMAD3 NA NA NA NA NA IQCH 56252 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 67490281 67490446 67490307 Y SMAD3 NA NA NA NA NA IQCH 54692 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 68132387 68132778 68132514 Y PIAS1 NA NA NA NA NA PIAS1 211739 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 68238127 68238678 68238396 Y NA NA PIAS1,CALML4,CLN6,C15orf61,LOC100506686 IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 105839 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 68441418 68441688 68441529 Y NA NA NA NA NA NA PIAS1 96901 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 68564194 68564543 68564236 Y NA CLN6,FEM1B FEM1B,CLN6,ANP32A,CORO2B,ITGA11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FEM1B 3598 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 68579972 68580192 68580087 Y ITGA11 CLN6,FEM1B NA NA NA NA FEM1B 11831 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 68588456 68588855 68588647 Y ITGA11 CLN6,FEM1B NA NA NA NA FEM1B 20315 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 68589122 68589626 68589166 Y ITGA11 CLN6,FEM1B NA NA NA NA FEM1B 20981 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 68644845 68645256 68644912 Y PIAS1 NA NA NA NA NA FEM1B 76704 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 68821473 68821531 68821481 Y NA CORO2B ITGA11,FEM1B IMR90 Hi-C 24141950 CORO2B 47777 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 69385602 69385765 69385704 Y NA NA NA NA NA NA GLCE 65158 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr15 70391851 70392235 70392005 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3336 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr15 70679327 70679587 70679457 Y NA NA NA NA NA NA TLE3 290812 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 70755364 70755766 70755549 Y TLE3 NA TLE3,C15orf50,KIF23,LOC145837 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 298166 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 70767457 70767783 70767604 Y TLE3 NA C15orf50,KIF23,LOC145837,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 286149 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 70867778 70867861 70867857 Y NA NA NA NA NA NA UACA 186071 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr15 71144876 71145062 71144944 Y NA LRRC49,LARP6,THAP10 NA NA NA NA LARP6 378 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 71149072 71149436 71149201 Y LARP6 LRRC49,LARP6,THAP10 NA NA NA NA LARP6 4574 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 71371688 71372044 71371801 Y THSD4 NA LRRC49,THSD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THAP10 188564 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 71571390 71571701 71571551 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 388266 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 72101101 72101317 72101168 Y NR2E3 NA NA NA NA NA SENP8 303282 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 72198564 72199008 72198773 Y PARP6,MYO9A,CELF6,CELF6,CELF6 NA NA NA NA NA SENP8 205591 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr15 72318611 72318818 72318715 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 85781 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 72518614 72519346 72519221 Y ARIH1,PKM2 NA NA NA NA NA MYO9A 109696 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr15 74217117 74217259 74217188 Y LOXL1 LOXL1 NA NA NA NA LOXL1 787 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 74249257 74249448 74249278 Y NA LOXL1,STOML1,PML NA NA NA NA LOXL1 32927 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr15 74289381 74289564 74289454 Y PML STOML1,PML NA NA NA NA PML 4367 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 74332904 74333192 74333031 Y NA STOML1,PML NA NA NA NA PML 47890 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 74343707 74344076 74343754 Y NA NA NA NA NA NA PML 58693 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 74412993 74413248 74413104 Y STRA6,CCDC33,C15orf59,TBC1D21 NA NA NA NA NA ISLR 50764 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 74464511 74464760 74464636 Y CD276,LOXL1,PML,UBL7,UBL7,ISLR,ISLR ISLR,RP11-60L3.1,STRA6 NA NA NA NA ISLR 499 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 74908840 74909023 74908946 Y NA CLK3 NA NA NA NA CLK3 19999 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 74930641 74931010 74930809 Y ARID3B,CSK CLK3 NA NA NA NA CLK3 41800 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 75018665 75019349 75018947 Y SCAMP2,C15orf39,CYP1A1 EDC3,CYP1A1 NA NA NA NA CYP1A1 2714 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 75339281 75339878 75339595 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,SCAMP2,C15orf39 PPCDC NA NA NA NA PPCDC 25385 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 75495544 75495835 75495599 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CSK,SCAMP2,C15orf39 C15orf39 NA NA NA NA C15orf39 9560 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 75742568 75742962 75742713 Y NA SIN3A NA NA NA NA SIN3A 3221 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 75744907 75745094 75744993 Y C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1089 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr15 75745296 75745530 75745399 Y PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 653 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 75746315 75746749 75746512 Y PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 132 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr15 75747348 75747533 75747407 Y RPP25,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1165 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr15 75959061 75959441 75959310 Y SNX33 SNUPN,SNX33,IMP3 NA NA NA NA IMP3 20014 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 76050803 76051078 76050853 Y NA ODF3L1,DNM1P35 NA NA NA NA DNM1P35 21839 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 76639629 76639850 76639740 Y NA ETFA,ISL2 NA NA NA NA ISL2 12564 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 77711297 77711794 77711478 Y NA PEAK1,HMG20A NA NA NA NA HMG20A 543 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 77785821 77785911 77785867 Y NA NA NA NA NA NA HMG20A 75067 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 78619959 78620089 78620013 Y DNAJA4 WDR61 WDR61,DNAJA4 IMR90 Hi-C 24141950 WDR61 29823 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 79280826 79281229 79281127 Y CTSH CTSH NA NA NA NA CTSH 40910 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 80211933 80212232 80212185 Y NA MTHFS,C15ORF37,ST20,ST20-MTHFS NA NA NA NA C15ORF37 1275 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 80247139 80247277 80247201 Y NA C15ORF37,ST20,ST20-MTHFS NA NA NA NA ST20-MTHFS 33043 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 80772387 80772765 80772517 Y ARNT2,KIAA1199 NA NA NA NA NA ARNT2 77695 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 80786706 80787081 80786777 Y KIAA1199 NA NA NA NA NA ARNT2 92014 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr15 81099060 81099288 81099113 Y NA KIAA1199 NA NA NA NA KIAA1199 29376 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 81277111 81277444 81277389 Y STARD5,MESDC1 MESDC2,MESDC1 NA NA NA NA MESDC2 2775 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 81607386 81607689 81607446 Y MESDC1,IL16,IL16,STARD5 STARD5,RP11-761I4.3 NA NA NA NA STARD5 6835 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 82374943 82375242 82374985 Y NA MEX3B MEX3B,EFTUD1 IMR90 Hi-C 24141950 MEX3B 38461 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 83857860 83858021 83857985 Y NA HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 16749 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 83869144 83869263 83869183 Y NA HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 5507 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 83869308 83869629 83869461 Y SH3GL3 HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 5141 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 83954950 83955303 83955151 Y BNC1 NA NA NA NA NA HDGFRP3 80180 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 83956370 83956763 83956596 Y BNC1 NA NA NA NA NA HDGFRP3 81600 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 84048302 84048583 84048506 Y BNC1 NA SH3GL3,BNC1 IMR90 Hi-C 24141950 SH3GL3 65397 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 85455479 85455863 85455740 Y SLC28A1 NA NA NA NA NA PDE8A 65808 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 85645018 85645768 85645040 Y NA NA NA NA NA NA PDE8A 123347 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 85874454 85874742 85874552 Y NA AKAP13 AKAP13 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP13 47060 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 85987048 85987479 85987219 Y AKAP13,AKAP13 NA NA NA NA NA AKAP13 65246 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 86211201 86211615 86211423 Y AKAP13,KLHL25 NA NA NA NA NA KLHL25 124646 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr15 87053184 87053194 87053189 Y NA NA NA NA NA NA KLHL25 716923 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 89183856 89184198 89184027 Y NA AEN,ISG20 NA NA NA NA ISG20 6472 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 89532902 89533939 89533555 Y NA NA MFGE8,ABHD2 IMR90 Hi-C 24141950 MFGE8 78260 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 89856537 89857272 89856853 Y NA POLG NA NA NA NA POLG 18820 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 90005846 90006063 90005954 Y NA NA NA NA NA NA POLG 129754 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr15 90365179 90365539 90365285 Y POLG,ZNF710,SEMA4B,CIB1,ANPEP,AP3S2 ANPEP NA NA NA NA ANPEP 8546 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 90371902 90372049 90371963 Y ZNF710,CIB1,ANPEP,AP3S2 ANPEP NA NA NA NA ANPEP 15269 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 90419728 90419914 90419806 Y ZNF710,SEMA4B,ANPEP,AP3S2 AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38 NA NA NA NA AP3S2 15660 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 90441878 90442278 90442169 Y C15orf38 AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38 NA NA NA NA AP3S2 6304 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 90574620 90575072 90574763 Y ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1 ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 31996 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 90641433 90641611 90641526 Y NA IDH2 NA NA NA NA IDH2 2125 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 90938187 90938493 90938325 Y NA ZNF774,IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 8737 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 90944087 90944636 90944284 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 14637 CAGE T98G hg19 FANTOM5 2.07602261652705 chr15 90945502 90945781 90945680 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 16052 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 90951105 90951410 90951208 Y FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 21655 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 90955763 90956502 90956124 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 26313 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 91153046 91153352 91153276 Y NA NA NA NA NA NA CRTC3 81889 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 91190174 91190180 91190177 Y NA NA NA NA NA NA RP11-387D10.2 68192 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 91541068 91541209 91541180 Y NA RCCD1,PRC1,VPS33B NA NA NA NA PRC1 4209 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 92293461 92293635 92293548 Y NA NA NA NA NA NA SLCO3A1 101290 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 92509194 92509613 92509420 Y NA NA NA NA NA NA SLCO3A1 114269 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 93344993 93345488 93345070 Y CHD2 ASB9P1 NA NA NA NA ASB9P1 8116 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 93354824 93354998 93354897 Y CHD2 ASB9P1 NA NA NA NA ASB9P1 17947 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 93363497 93364154 93363735 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 ASB9P1 ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 ASB9P1 26620 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr15 93374780 93375598 93375185 Y NA ASB9P1,CHD2 CHD2,LOC100507217,ASB9P1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ASB9P1 37903 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr15 93424689 93424786 93424732 Y CHD2 CHD2 NA NA NA NA CHD2 163 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 93458042 93458417 93458141 Y NA CHD2 NA NA NA NA CHD2 33516 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 93520042 93520437 93520098 Y CHD2 NA NA NA NA NA CHD2 95516 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 93542371 93542660 93542397 Y NA NA NA NA NA NA CHD2 117845 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 94749757 94750344 94749943 Y NA MCTP2 NA NA NA NA MCTP2 22423 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 96867031 96867104 96867071 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3 NA NA NA NA NR2F2 63 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 96884042 96884481 96884402 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3 NA NA NA NA RP11-522B15.3 10985 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 96896232 96896529 96896359 Y NR2F2,NR2F2,NR2F2 NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3 NA NA NA NA RP11-522B15.3 766 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 98964843 98965105 98964974 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 225095 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 99091450 99092159 99091603 Y NA NA IGF1R,SYNM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IGF1R 98041 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 99193577 99194531 99194069 Y IGF1R IGF1R NA NA NA NA IGF1R 3377 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 99270923 99271213 99270975 Y IGF1R NA NA NA NA NA IGF1R 80723 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 99298945 99299364 99299005 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 108745 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 99387614 99387887 99387660 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 197414 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 99395486 99396002 99395689 Y IGF1R NA NA NA NA NA IGF1R 205286 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 99396507 99396665 99396608 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 206307 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 99409255 99409515 99409377 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 219055 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr15 99409834 99409977 99409865 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 219634 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 99416036 99416369 99416103 Y IGF1R NA NA NA NA NA SYNM 220051 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 99444571 99445210 99444854 Y NA NA NA NA NA NA SYNM 191210 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 100026499 100026994 100026794 Y MEF2A,MEF2A MEF2A MEF2A,LRRC28,LYSMD4 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 11129 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr15 100782475 100782658 100782574 Y NA NA NA NA NA NA ASB7 358081 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 101261855 101262549 101262221 Y NA NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINS 120420 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr15 101499118 101499600 101499493 Y LRRK1 LRRK1 NA NA NA NA LRRK1 41698 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr15 101711330 101711507 101711419 Y NA NA NA NA NA NA CHSY1 78630 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 101723592 101723961 101723926 Y NA NA NA NA NA NA CHSY1 66176 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 101739961 101740273 101740216 Y TM2D3,CHSY1 CHSY1 NA NA NA NA CHSY1 49864 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 101741612 101741900 101741753 Y TM2D3,CHSY1 CHSY1 NA NA NA NA CHSY1 48237 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr15 101807515 101807673 101807594 Y NA CHSY1,SNRPA1 NA NA NA NA CHSY1 17378 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr15 101834172 101834455 101834316 Y TM2D3,TARSL2,SNRPA1 CHSY1,SNRPA1 NA NA NA NA SNRPA1 685 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr15 101860934 101861170 101861021 Y CHSY1,TM2D3 SNRPA1 NA NA NA NA SNRPA1 27447 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 121563 121849 121614 Y TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA RHBDF1 2505 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr16 145023 145249 145139 Y NHLRC4 SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG,NPRL3 NA NA NA NA MPG 20017 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 377235 377950 377755 Y SOLH,RHOT2,NHLRC4,AXIN1,LUC7L AXIN1,MRPL28 NA NA NA NA AXIN1 22723 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 578748 579156 578911 Y LUC7L PIGQ NA NA NA NA PIGQ 35839 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr16 651803 652154 651979 Y NA PIGQ,RAB40C,C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90 NA NA NA NA RAB40C 14446 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 729341 729555 729445 Y NA C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,FBXL16,METRN,FAM173A,HAGHL NA NA NA NA STUB1 1117 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr16 858833 859023 858927 Y RHBDL1,FBXL16,SOX8 CHTF18,RPUSD1 NA NA NA NA RPUSD1 22436 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 2065446 2065768 2065545 Y NA TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 RAB26 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC9A3R2 7589 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 2175102 2175363 2175212 Y NME3,NUBP2,TBL3,GFER,SLC9A3R2,MLST8,MLST8,DNASE1L2,NTHL1,TSC2 RAB26,SNORD60,TRAF7 NA NA NA NA RAB26 13441 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 2917931 2918273 2918246 Y NA FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FLYWCH2 12914 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr16 3031604 3031823 3031757 Y PAQR4 KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1 NA NA NA NA PKMYT1 3064 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 3053798 3054225 3053960 Y NA KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1,MMP25 NA NA NA NA TNFRSF12A 12221 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 IL32,ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 3624 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr16 3200393 3200919 3200597 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 22615 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr16 3202363 3202472 3202417 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 24585 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 3309129 3309539 3309316 Y MMP25,NAT15,NAT15,ZNF200,ZNF200,ZNF200,MEFV ZNF200,ZNF263,ZNF75A,TIGD7 NA NA NA NA ZNF263 2204 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 3763227 3763392 3763351 Y NA TRAP1 NA NA NA NA TRAP1 2206 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 3996199 3996445 3996330 Y NA NA NA NA NA NA CREBBP 67472 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.28515685785008 chr16 4063476 4063638 4063556 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 100548 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 4233647 4234082 4234013 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 69461 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr16 4321625 4322178 4321908 Y ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4 TFAP4 NA NA NA NA TFAP4 549 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 4420946 4421237 4421026 Y NA PAM16,VASN NA NA NA NA VASN 1097 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 4666118 4666710 4666381 Y NA MGRN1 NA NA NA NA MGRN1 1624 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr16 4818680 4818913 4818758 Y C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI NA NA NA NA ZNF500 3055 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr16 4993356 4993730 4993477 Y PPL NA UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ALG1 87973 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 8939360 8939674 8939516 Y USP7 TMEM186,CARHSP1 NA NA NA NA CARHSP1 21192 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 9171086 9171431 9171335 Y C16orf72,USP7 C16orf72 USP7,C16orf72 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C16orf72 12074 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr16 9237080 9237205 9237143 Y NA NA NA NA NA NA C16orf72 53575 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 10133348 10133947 10133667 Y NA NA NA NA NA NA GRIN2A 140664 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 10956294 10956664 10956435 Y NUBP1,CIITA CIITA CIITA IMR90 Hi-C 24141950 CIITA 12391 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr16 11590987 11591512 11591296 Y NA NA SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF IMR90 Hi-C 24141950 LITAF 136725 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 11591931 11591962 11591945 Y NA NA SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF IMR90 Hi-C 24141950 LITAF 136275 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr16 11691003 11692063 11691252 Y SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF LITAF MCF7 ChIA-PET 22265404 LITAF 36174 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 11734091 11734770 11734262 Y SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF,SNN TXNDC11,SNN,CLEC16A,LITAF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LITAF 5854 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 11890330 11890418 11890367 Y LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A ZC3H7A NA NA NA NA ZC3H7A 1207 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 11960558 11960748 11960653 Y NA RSL1D1,GSPT1 ZC3H7A,RSL1D1,BCAR4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RSL1D1 17116 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 11968147 11968344 11968329 Y ZC3H7A RSL1D1,GSPT1 RSL1D1 IMR90 Hi-C 24141950 RSL1D1 24705 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 12008398 12008797 12008598 Y NA GSPT1 NA NA NA NA GSPT1 459 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 12071486 12071797 12071761 Y NA RP11-166B2.1,SNX29 NA NA NA NA SNX29 2892 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr16 13864619 13864804 13864717 Y NA NA NA NA NA NA ERCC4 147210 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 14050567 14050869 14050623 Y MKL2 ERCC4,RPS26P52 NA NA NA NA RPS26P52 36031 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 14051699 14052037 14051838 Y NA ERCC4,RPS26P52 NA NA NA NA RPS26P52 37163 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 14395683 14396371 14395873 Y MKL2 NA NA NA NA NA MKL2 232505 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 14396583 14397514 14397260 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 233405 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 14397958 14398068 14398015 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 234780 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr16 14402100 14402342 14402181 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 238922 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 14423320 14423633 14423477 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 260142 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr16 14423689 14423899 14423743 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 260511 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 14424623 14424858 14424825 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 261445 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 14529113 14529156 14529135 Y NA NA NA NA NA NA PARN 195429 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 14599774 14599935 14599866 Y NA NA NA NA NA NA PARN 124650 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 14621757 14621928 14621847 Y NA NA NA NA NA NA PARN 102657 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 15069619 15069687 15069631 Y PDXDC1 PDXDC1 NA NA NA NA PDXDC1 3171 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 15085192 15085402 15085309 Y C16orf45 PDXDC1 NTAN1 IMR90 Hi-C 24141950 PDXDC1 18744 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 15766632 15767024 15766843 Y KIAA0430,NDE1,NDE1 KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA NDE1 31508 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr16 16055043 16055430 16055122 Y NDE1,NDE1,ABCC1 RPL15P20,ABCC1 NA NA NA NA ABCC1 13609 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 16070854 16071189 16071093 Y NDE1 RPL15P20,ABCC1 NA NA NA NA ABCC1 29420 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr16 16092294 16092782 16092512 Y NDE1 NA NA NA NA NA ABCC1 50860 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 16097959 16098303 16098187 Y NA NA NA NA NA NA ABCC1 56525 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr16 16115976 16116215 16116101 Y NA NA NA NA NA NA ABCC1 74542 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 17231064 17231355 17231210 Y NA NA NA NA NA NA XYLT1 331383 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 17256252 17256784 17256587 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 305954 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 17257893 17258025 17257960 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 304713 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 17328915 17329184 17329121 Y NA NA NA NA NA NA XYLT1 233554 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 17366939 17367350 17367135 Y NA NA NA NA NA NA XYLT1 195388 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 17485561 17485736 17485646 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 77002 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 17499199 17499488 17499485 Y NA NA NA NA NA NA XYLT1 63250 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr16 17543225 17543492 17543435 Y XYLT1 XYLT1 NA NA NA NA XYLT1 19246 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 17685725 17686159 17686027 Y NA NA NA NA NA NA XYLT1 122987 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 17930871 17931209 17931043 Y NA NA NA NA NA NA XYLT1 368133 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 19532119 19532450 19532314 Y CCP110 GDE1,CCP110,C16orf62 NA NA NA NA GDE1 652 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 19710173 19710469 19710241 Y NA IQCK NA NA NA NA IQCK 15309 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.988582198346214 chr16 20877631 20877934 20877768 Y NA LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA LYRM1 31256 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 20915885 20916169 20915941 Y CRYM,DCUN1D3,LYRM1 LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA DCUN1D3 6179 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 21637887 21638686 21638408 Y CRYM,METTL9,IGSF6 METTL9 NA NA NA NA METTL9 31348 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 22046502 22046742 22046619 Y NA C16orf52 NA NA NA NA C16orf52 29543 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 22202596 22202946 22202679 Y POLR3E,CDR2 EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 12657 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr16 22203475 22203890 22203761 Y POLR3E EEF2K UQCRC2,POLR3E,EEF2K,PDZD9,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 11713 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 22207042 22207397 22207176 Y NA EEF2K POLR3E,EEF2K,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 8206 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr16 22349127 22349159 22349143 Y POLR3E POLR3E NA NA NA NA POLR3E 42397 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 22406960 22407340 22407096 Y NA CDR2,RRN3P3 POLR3E,CDR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDR2 39146 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 22421466 22421891 22421890 Y NA CDR2,RRN3P3 NA NA NA NA CDR2 24595 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 22432961 22433094 22433028 Y NA CDR2,RRN3P3 NA NA NA NA CDR2 13392 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 23431856 23432257 23432204 Y USP31,COG7 COG7 SCNN1B IMR90 Hi-C 24141950 COG7 30244 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr16 23463654 23463771 23463713 Y NA COG7 NA NA NA NA COG7 1153 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 23531974 23532033 23532005 Y NA GGA2,UBFD1,EARS2 NA NA NA NA GGA2 658 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 24865270 24865636 24865496 Y SLC5A11 NA ARHGAP17 IMR90 Hi-C 24141950 TNRC6A 126254 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 24879548 24879926 24879737 Y SLC5A11 NA ARHGAP17 IMR90 Hi-C 24141950 TNRC6A 140532 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 25005690 25005854 25005767 Y NA ARHGAP17 NA NA NA NA ARHGAP17 19133 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 25060889 25061147 25061001 Y NA ARHGAP17 NA NA NA NA ARHGAP17 35902 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 25564339 25564353 25564346 Y NA NA NA NA NA NA ZKSCAN2 297087 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 27541388 27541697 27541538 Y NA GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 17537 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 27577101 27577365 27577280 Y NA GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA KIAA0556 17647 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 27763534 27763923 27763729 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0556 204080 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 28108728 28108802 28108745 Y APOBR,XPO6 NA NA NA NA NA XPO6 112439 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 28543579 28543953 28543732 Y EIF3CL,EIF3C,SPNS1,IL27 CLN3,NUPR1,CCDC101 IL27 IMR90 Hi-C 24141950 NUPR1 4542 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 29709853 29709969 29709906 Y QPRT QPRT,C16orf54 NA NA NA NA QPRT 37253 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 30427925 30428543 30428281 Y HIRIP3,ZNF48 TBC1D10B,ZNF48,ZNF771,DCTPP1,SEPHS2 NA NA NA NA DCTPP1 10853 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 30579441 30579843 30579693 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,SEPT1,ITGAL,STX4,ZNF689 ZNF768,AC002310.12,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF785 NA NA NA NA ZNF688 2212 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE T98G hg19 FANTOM5 4.74519455206183 chr16 30726552 30726958 30726731 Y ZNF668,ZNF646,STX4,MYST1,FUS SRCAP,PHKG2,RNF40,C16orf93 RNF40,PHKG2,C16orf93 IMR90 Hi-C 24141950 SRCAP 19022 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 30825606 30826012 30825883 Y NA ZNF629 ZNF629,RNF40,MIR4519 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF629 29083 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 30885980 30886229 30886174 Y ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668 MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1 NA NA NA NA MIR4519 1336 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 31005740 31006063 31006002 Y ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,ITGAX,ITGAM,FUS,STX4 ORAI3,SETD1A,HSD3B7,STX1B,STX4 NA NA NA NA HSD3B7 11221 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 31083220 31083516 31083291 Y NA STX4,ZNF668,ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8 NA NA NA NA ZNF646 227 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 31125100 31125333 31125167 Y STX4,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8 NA NA NA NA KAT8 25 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 31129616 31130225 31129940 Y ARMC5,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8 NA NA NA NA KAT8 4541 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 31264985 31265278 31265093 Y STX4,ZNF668,ZNF646,MYST1,ITGAX,PYCARD,ITGAM NA NA NA NA NA PYCARD 52214 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 31887367 31887596 31887374 Y NA ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 4288 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 31888166 31888535 31888469 Y ARMC5,ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 5087 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 31905713 31906088 31906002 Y ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 22634 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 31955307 31955602 31955455 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 72228 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 46780849 46781142 46780994 Y MYLK3 NA NA NA NA NA ORC6 59294 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 47669133 47669265 47669199 Y NA NA NA NA NA NA ITFG1 173073 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 48592202 48592453 48592359 Y SIAH1,N4BP1 NA NA NA NA NA N4BP1 59606 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 48593216 48593689 48593553 Y NA NA NA NA NA NA N4BP1 58370 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 48657602 48657960 48657802 Y SIAH1,N4BP1 N4BP1 ABCC11,SIAH1,MIR548AE2,N4BP1 IMR90 Hi-C 24141950 N4BP1 5543 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr16 50236881 50237262 50237048 Y NA ADCY7 NA NA NA NA ADCY7 40786 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr16 50376082 50376389 50376371 Y NA BRD7 NA NA NA NA BRD7 24456 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 50679822 50680132 50679910 Y NA NA NA NA NA NA CYLD 93829 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 51183106 51183414 51183179 Y SALL1,SALL1 NA NA NA NA NA SALL1 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr16 51186041 51186738 51186313 Y NA SALL1 NA NA NA NA SALL1 2763 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr16 51186928 51187269 51186986 Y NA SALL1 NA NA NA NA SALL1 3650 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr16 51187930 51188326 51188194 Y NA SALL1 NA NA NA NA SALL1 4652 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr16 51189377 51189768 51189573 Y NA SALL1 NA NA NA NA SALL1 6099 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 51909181 51909528 51909355 Y NA NA SALL1 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPA1P48 231514 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 53086726 53087108 53087065 Y NA NA NA NA NA NA CHD9 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr16 53089565 53089820 53089729 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 2620 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 53124874 53125001 53124924 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 37929 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 53125869 53126178 53125948 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 38924 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 53134908 53135206 53135001 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 47963 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 53552731 53552904 53552850 Y LOC643802,RBL2,AKTIP AKTIP NA NA NA NA AKTIP 16408 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 53947888 53947948 53947918 Y NA NA NA NA NA NA FTO 212013 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 54114585 54114959 54114772 Y NA NA NA NA NA NA IRX3 203716 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 55740914 55740956 55740934 Y SLC6A2,SLC6A2 NA NA NA NA NA CES1 124293 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 55870128 55870546 55870373 Y NA CES1 NA NA NA NA CES1 4879 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 56641054 56641530 56641359 Y MT2A,MT1E MT2A,MT1E,MT1A,MT1F NA NA NA NA MT2A 943 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 56985400 56985562 56985481 Y NA HERPUD1,NLRC5 CETP IMR90 Hi-C 24141950 HERPUD1 21440 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 57034523 57034824 57034736 Y NLRC5 NLRC5 NA NA NA NA NLRC5 13126 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 57841964 57842337 57842236 Y NA NA NA NA NA NA KIFC3 52620 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr16 57927623 57928192 57928041 Y GPR97,ZNF319 KIFC3 NA NA NA NA KIFC3 32666 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 58160772 58161211 58161024 Y C16orf80 C16orf80 NA NA NA NA C16orf80 143 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 64944348 64944657 64944578 Y NA NA NA NA NA NA CDH11 213358 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr16 65153548 65154160 65153979 Y CDH11 CDH11 NA NA NA NA CDH11 3855 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr16 66440915 66440994 66440955 Y CMTM3,CMTM3 LINC00920,BEAN1 NA NA NA NA LINC00920 488 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 66536058 66536398 66536347 Y CES3 TK2,CKLF,CKLF-CMTM1 NA NA NA NA TK2 48049 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr16 66555983 66556387 66556198 Y CKLF TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1 NA NA NA NA TK2 28060 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 66587187 66587393 66587288 Y NA TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1,CMTM3 NA NA NA NA CKLF-CMTM1 2697 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 66906996 66907469 66907329 Y SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2 NAE1,PDP2 NA NA NA NA NAE1 1837 CAGE T98G hg19 FANTOM5 4.25090345288872 chr16 66960903 66961306 66961106 Y PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD RRAD,FAM96B,CES2,CES3 NA NA NA NA RRAD 3356 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 67150652 67150777 67150712 Y LRRC29,LRRC29,FHOD1,FAM65A,ATP6V0D1,C16orf70 C16orf70,B3GNT9,FBXL8,TRADD,HSF4 NA NA NA NA C16orf70 8791 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 67278264 67278626 67278472 Y RRAD,C16orf70,FAM65A,ATP6V0D1,ACD,LRRC29,LRRC29,PLEKHG4,FHOD1 LRRC29,TMEM208,SLC9A5,FHOD1 NA NA NA NA FHOD1 935 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 67597304 67597932 67597899 Y THAP11,RLTPR,ACD FAM65A,CTCF NA NA NA NA CTCF 2994 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr16 67867011 67867153 67867060 Y TPPP3,CENPT RANBP10,TSNAXIP1,THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,NRN1L NA NA NA NA THAP11 7060 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 68271348 68271876 68271591 Y TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2 PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA PLA2G15 5331 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr16 68303268 68303682 68303412 Y THAP11,EDC4,PSMB10,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7 PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7 NA NA NA NA SLC7A6 6835 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 68320188 68320357 68320233 Y RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7 PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7 NA NA NA NA SLC7A6OS 22492 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 68320405 68320913 68320608 Y ZFP90,SMPD3 PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7 NA NA NA NA SLC7A6OS 21936 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 69121214 69121414 69121257 Y NA HAS3,CHTF8,CIRH1A HAS3 IMR90 Hi-C 24141950 HAS3 16053 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 69432325 69432475 69432421 Y TERF2 TERF2,CYB5B NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TERF2 7999 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 69751128 69751528 69751345 Y PDF,TERF2,NQO1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA NQO1 7326 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr16 69790083 69790481 69790284 Y NA NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA NOB1 3240 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE T98G hg19 FANTOM5 2.17488083636167 chr16 70444676 70444732 70444694 Y NA ST3GAL2,FUK NA NA NA NA ST3GAL2 26408 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 70461908 70462625 70462132 Y ST3GAL2 ST3GAL2,FUK NA NA NA NA ST3GAL2 8515 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 70470997 70471281 70471214 Y NA FUK NA NA NA NA ST3GAL2 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 70712649 70712861 70712739 Y NA MTSS1L NA NA NA NA MTSS1L 5108 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 70740989 70741599 70741286 Y NA MTSS1L NA NA NA NA MTSS1L 23020 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 70749058 70749400 70749223 Y NA MTSS1L MTSS1L,IL34 IMR90 Hi-C 24141950 MTSS1L 31089 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 70771415 70771759 70771684 Y EXOSC6 NA NA NA NA NA MTSS1L 53446 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 70779915 70780216 70780046 Y NA NA NA NA NA NA VAC14 52848 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 70780634 70780961 70780786 Y MTSS1L NA NA NA NA NA VAC14 52103 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 71070712 71070940 71070844 Y NA NA NA NA NA NA HYDIN 191685 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 71072056 71072175 71072116 Y NA NA NA NA NA NA HYDIN 190450 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 71731364 71731710 71731537 Y NA PHLPP2 NA NA NA NA PHLPP2 24894 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 71828659 71828769 71828714 Y NA SNORD71,AP1G1,ATXN1L,IST1 NA NA NA NA AP1G1 12335 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 72459158 72459630 72459377 Y NA NA NA NA NA NA TXNL4B 332828 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.28515685785008 chr16 72882732 72883050 72882991 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 208547 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 72897745 72898023 72897884 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 193574 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 72958517 72958769 72958627 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 132828 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 73104505 73104770 73104567 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 12908 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 74353064 74353398 74353241 Y FA2H PSMD7,RP11-252A24.2 NA NA NA NA PSMD7 24391 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 74356396 74356719 74356558 Y NA PSMD7,RP11-252A24.2 NA NA NA NA PSMD7 27723 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 74509119 74509400 74509260 Y NA NA NA NA NA NA RP11-252A24.2 108981 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 74701397 74701877 74701440 Y RFWD3 RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 2618 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 74702224 74702291 74702259 Y NA RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 3445 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 74774732 74775110 74775064 Y FA2H MLKL NA NA NA NA MLKL 41874 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 75278988 75279894 75279594 Y CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1 BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 20057 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr16 75420812 75420988 75420900 Y NA CFDP1 CTRB1,BCAR1,CTRB2 IMR90 Hi-C 24141950 CFDP1 44395 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 75628076 75628219 75628207 Y NA TMEM231,GABARAPL2,ADAT1 NA NA NA NA ADAT1 26979 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 79406334 79406749 79406484 Y MAF NA MAF MCF7 ChIA-PET 22265404 MAF 225862 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 79614531 79614668 79614573 Y MAF MAF NA NA NA NA MAF 17943 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 79615515 79615737 79615615 Y MAF MAF NA NA NA NA MAF 16874 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 80060890 80061347 80061153 Y NA NA NA NA NA NA MAF 428279 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 80208286 80208441 80208438 Y NA NA NA NA NA NA DYNLRB2 364190 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 81038389 81038511 81038494 Y NA CENPN,ATMIN NA NA NA NA CENPN 286 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 81763852 81764387 81764185 Y NA PLCG2 NA NA NA NA PLCG2 6315 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 81785976 81786155 81786044 Y PLCG2,CMIP,CMIP PLCG2 ATMIN,PKD1L2,GAN,BCMO1,MIR4720 IMR90 Hi-C 24141950 PLCG2 15274 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 82661526 82661961 82661896 Y CDH13 CDH13 NA NA NA NA CDH13 3118 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 82663331 82663687 82663514 Y NA CDH13 NA NA NA NA CDH13 4923 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 82667775 82667948 82667787 Y NA CDH13 NA NA NA NA CDH13 9367 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 82685978 82686417 82686161 Y NA CDH13 HSBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CDH13 27570 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 82687467 82688028 82687715 Y NA CDH13 HSBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CDH13 29059 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr16 82689057 82689347 82689181 Y NA CDH13 NA NA NA NA CDH13 30649 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr16 82733427 82733620 82733554 Y NA NA NA NA NA NA CDH13 75019 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 83069400 83069774 83069647 Y NA NA NA NA NA NA CDH13 410992 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 83399347 83399604 83399475 Y NA NA NA NA NA NA HSBP1 439844 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 83777004 83777385 83777194 Y HSDL1 NA NA NA NA NA HSBP1 62063 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 83835897 83836084 83835978 Y NA HSBP1 HSBP1 IMR90 Hi-C 24141950 HSBP1 3364 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 83953538 83953937 83953606 Y NA MLYCD,OSGIN1,NECAB2 NA NA NA NA MLYCD 22807 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 83988181 83988500 83988282 Y NA OSGIN1,NECAB2 NA NA NA NA OSGIN1 8294 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 84172759 84173286 84173220 Y NA MBTPS1,HSDL1,TAF1C MBTPS1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HSDL1 3511 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr16 84545075 84545257 84545139 Y NA NA COTL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 COTL1 104426 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 84636685 84637090 84636875 Y ZDHHC7,KIAA0513,HSDL1,CRISPLD2,COTL1 COTL1,KLHL36 NA NA NA NA COTL1 12593 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 84676809 84677221 84677048 Y KIAA1609 COTL1,KLHL36 KIAA1609,COTL1,USP10,KLHL36,ZDHHC7 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL36 2910 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 84855927 84856178 84856013 Y CRISPLD2 CRISPLD2 NA NA NA NA CRISPLD2 4337 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 84862837 84863219 84863017 Y CRISPLD2 CRISPLD2 NA NA NA NA CRISPLD2 11247 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr16 84866015 84866457 84866298 Y NA CRISPLD2 NA NA NA NA CRISPLD2 14425 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 84866899 84867167 84866969 Y CRISPLD2 CRISPLD2 NA NA NA NA CRISPLD2 15309 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 84869763 84870234 84870125 Y CRISPLD2 CRISPLD2 NA NA NA NA CRISPLD2 18173 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 85028506 85028759 85028547 Y COTL1,CRISPLD2,ZDHHC7,KIAA0513 ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA ZDHHC7 14382 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 85185210 85185759 85185517 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 125835 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 85202555 85203049 85202710 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 143180 CAGE T98G hg19 FANTOM5 6.0303514099119 chr16 85397523 85397640 85397583 Y NA NA LOC727710,LOC400548,KIAA0182,GINS2,FAM92B,LINC00311 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 324039 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr16 85428961 85429169 85429067 Y NA NA LOC727710,LINC00311,GINS2,KIAA0182,FAM92B IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 292510 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 85548685 85548970 85548791 Y NA NA KIAA0182 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 172709 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 85558121 85558453 85558347 Y KIAA0182,KIAA0182 NA KIAA0182,LOC727710 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 163226 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 85586938 85587370 85587020 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134309 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr16 85603305 85603679 85603564 Y KIAA0182 NA LINC00311,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 118000 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 85604470 85605423 85604746 Y NA NA LINC00311,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 116256 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 85734545 85734806 85734797 Y NA GINS2,C16orf74 GINS2 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 12866 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 86108709 86108885 86108797 Y NA NA LOC400550,LOC732275,FOXF1,MTHFSD,FLJ30679,LOC146513 IMR90 Hi-C 24141950 IRF8 178300 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 86275441 86275860 86275551 Y NA NA LOC400550,FOXF1,LOC732275,LOC146513 IMR90 Hi-C 24141950 FOXF1 266273 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 86374799 86375066 86374872 Y IRF8 NA NA NA NA NA FOXF1 167067 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr16 86499961 86500190 86500098 Y FOXF1 FOXF1 NA NA NA NA FOXF1 41943 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 86541340 86541581 86541457 Y FOXF1 FOXF1,MTHFSD NA NA NA NA FOXF1 552 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr16 86698129 86698417 86698281 Y NA NA FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,FOXC2,C16orf95,FBXO31 IMR90 Hi-C 24141950 FOXC2 99272 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 86775121 86775409 86775225 Y NA NA FOXC2,FOXL1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXC2 176264 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr16 86795224 86795595 86795410 Y NA NA FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,C16orf95,FOXC2,FBXO31 IMR90 Hi-C 24141950 FOXC2 196367 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 86962886 86963146 86962899 Y NA NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679 IMR90 Hi-C 24141950 FOXC2 364029 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 86985410 86985767 86985608 Y FOXC2,FOXL1 NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf95 363255 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 87428114 87428209 87428177 Y NA MAP1LC3B,FBXO31 NA NA NA NA FBXO31 4366 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr16 87812654 87813065 87812978 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 15056 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr16 87823592 87823837 87823720 Y NA KLHDC4 JPH3,KLHDC4,ZCCHC14,SLC7A5,CA5A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 25994 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 87870717 87871153 87871035 Y NA SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 29941 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 87904170 87904524 87904347 Y FBXO31 SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 3076 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 87980577 87980839 87980700 Y NA BANP CA5A MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BANP 11 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 87987504 87988357 87987703 Y ZCCHC14,BANP,BANP,BANP BANP NA NA NA NA BANP 6654 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 88338212 88338634 88338285 Y ZNF469 NA BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 179091 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 88365536 88366092 88365805 Y ZNF469 NA BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 151633 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr16 88450186 88450490 88450462 Y NA NA CA5A,SLC7A5,BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 67235 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 88857121 88857244 88857196 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 7502 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 88991704 88992157 88991819 Y NA CBFA2T3 TRAPPC2L,GALNS MCF7 ChIA-PET 22265404 CBFA2T3 49455 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 89181535 89182183 89181777 Y CYBA,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,CBFA2T3,CBFA2T3,RPL13,RPL13,ACSF3 ACSF3 NA NA NA NA ACSF3 28752 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 89241276 89241597 89241419 Y NA CDH15,ZNF778 NA NA NA NA CDH15 5101 CAGE T98G hg19 FANTOM5 4.84405277189645 chr16 89313669 89314138 89313993 Y ZNF276,ZNF778 ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 31551 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 89370103 89370259 89370211 Y NA NA NA NA NA NA ZNF778 87985 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 89382399 89382987 89382651 Y ZNF276,ZNF276,SPATA2L,C16orf7,ANKRD11 NA NA NA NA NA ZNF778 100281 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 89392350 89392997 89392648 Y NA NA NA NA NA NA ZNF778 110232 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 89468980 89469266 89469225 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD11 85703 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr16 89474257 89474602 89474526 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD11 80367 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 89475542 89475927 89475838 Y CBFA2T3,ACSF3,ZNF778,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,ANKRD11 NA NA NA NA NA ANKRD11 79042 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 89555521 89555997 89555713 Y ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 196 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr16 89557852 89558189 89558050 Y NA ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 2527 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr16 89564919 89565211 89565067 Y NA ANKRD11,SPG7 ANKRD11,SPG7 IMR90 Hi-C 24141950 SPG7 9594 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr16 89579992 89580270 89580045 Y ACSF3,ZNF778,DBNDD1,ZNF276,SPG7 ANKRD11,SPG7,RPL13 NA NA NA NA SPG7 24667 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr16 90087429 90087721 90087595 Y TUBB3,DBNDD1,PRDM7 GAS8,DBNDD1 NA NA NA NA DBNDD1 2893 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 597415 597783 597745 Y NA RPS4XP17,VPS53,FAM57A NA NA NA NA VPS53 25174 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 654300 654699 654470 Y NA VPS53,FAM57A,DBIL5P,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4 NA NA NA NA DBIL5P 400 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 851603 851932 851829 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 29078 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 873777 873849 873813 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 7161 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 881410 881576 881449 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 400 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 881812 881896 881869 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 802 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 1171565 1171808 1171610 Y WDR81,PITPNA,ABR,ABR ABR NA NA NA NA ABR 41250 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr17 1391218 1391783 1391434 Y NA CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 2323 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr17 1620806 1621089 1620895 Y PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81 PRPF8,WDR81,MIR22HG,SERPINF1 NA NA NA NA MIR22HG 2338 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 1926126 1926449 1926286 Y NA RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA RTN4RL1 190 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 1929262 1929538 1929498 Y NA RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA DPH1 1866 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 1953067 1954207 1953327 Y TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1 RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 1241 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr17 1974774 1975359 1974921 Y SCARF1,HIC1,HIC1 RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 19326 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr17 1992717 1993096 1992933 Y SLC43A2,SCARF1,WDR81 OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 37269 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr17 2078039 2078451 2078156 Y TSR1,HIC1,HIC1 NA NA NA NA NA HIC1 122591 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 2084810 2085252 2085043 Y HIC1,HIC1 NA NA NA NA NA SRR 119425 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 2300026 2300553 2300288 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 1859 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr17 2302108 2302510 2302261 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT NA NA NA NA NA MNT 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 2302778 2303366 2303033 Y SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT MNT NA NA NA NA MNT 366 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr17 2307434 2307709 2307574 Y NA MNT NA NA NA NA MNT 5022 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 2627618 2628097 2628087 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GAP2 50253 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 3706608 3706865 3706766 Y NA ITGAE,C17orf85 NA NA NA NA ITGAE 4071 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 4064613 4064785 4064717 Y NA ZZEF1,CYB5D2 NA NA NA NA CYB5D2 20151 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 4412786 4412979 4412855 Y NA MYBBP1A NA NA NA NA MYBBP1A 43947 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 4704497 4704876 4704590 Y ZNF232,KIF1C PSMB6,PLD2,MINK1 NA NA NA NA PLD2 3515 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 4811647 4812042 4811731 Y NA RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1 NA NA NA NA RNF167 29261 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr17 4812526 4812616 4812571 Y SMTNL2,ZNF232,KIF1C RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1 NA NA NA NA RNF167 28687 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 5140050 5140412 5140231 Y NA ZNF594,RABEP1 NA NA NA NA RABEP1 43146 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 5245508 5245890 5245691 Y NA NA NA NA NA NA RABEP1 61950 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 6614362 6614643 6614518 Y SLC16A13,SLC16A11,ASGR2,ASGR2,ASGR1,SLC13A5 XAF1 MIR4520A,ALOX15P1,MIR4520B,MED31,C17orf100 IMR90 Hi-C 24141950 XAF1 42123 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 6655808 6656203 6655969 Y RNASEK,GABARAP,XAF1 XAF1 XAF1,MIR4520A,ALOX15P1,MIR4520B,MED31,C17orf100,FBXO39,TEKT1 IMR90 Hi-C 24141950 XAF1 563 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr17 6656419 6656747 6656461 Y RNASEK,GABARAP,XAF1 XAF1 NA NA NA NA XAF1 19 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 6790647 6790875 6790776 Y SLC16A11,DLG4,DLG4 NA NA NA NA NA AC027763.2 122793 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr17 6821400 6821836 6821600 Y NA NA NA NA NA NA AC027763.2 91832 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 6822767 6822872 6822855 Y NA NA NA NA NA NA AC027763.2 90796 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 6829288 6829561 6829425 Y SLC13A5,NLGN2,DLG4,ASGR2,ASGR2,ASGR1 NA ALOX12P2,ASGR1 IMR90 Hi-C 24141950 AC027763.2 84107 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 6829755 6829811 6829784 Y NA NA ALOX12P2,ASGR1 IMR90 Hi-C 24141950 AC027763.2 83857 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 6839831 6840063 6839905 Y XAF1,GPS2,GABARAP,EIF5A,ACAP1,RNASEK,C17orf49 NA LOC100506713,ALOX12,ALOX12P2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC027763.2 73605 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 7119118 7119286 7119174 Y WRAP53,EFNB3,AMAC1L3,NLGN2,NEURL4,DLG4 ACADVL,DLG4,DVL2,PHF23,GABARAP,CTDNEP1 NA NA NA NA ACADVL 674 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr17 7381310 7382154 7381844 Y KCTD11,TNK1,SOX15,KDM6B,ZBTB4,ZBTB4 TMEM102,ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA ZBTB4 3428 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 7389589 7389989 7389739 Y C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA POLR2A 3904 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr17 7737438 7738736 7737971 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 20328 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 18450 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr17 7745337 7745870 7745591 Y NA CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 13194 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr17 7745915 7746944 7746139 Y NA CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 12120 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA CYB5D1 11508 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.3840150776847 chr17 8029634 8030116 8029995 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107 NA NA NA NA HES7 4224 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr17 8041932 8042438 8042328 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 15386 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 8056609 8057167 8057155 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 657 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 8090038 8090540 8090163 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 1024 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr17 8090795 8091158 8090849 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 406 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr17 8095551 8095762 8095658 Y KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2 PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 3987 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr17 8103328 8103700 8103595 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1 NA NA NA NA AURKB 8218 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 9258278 9258564 9258422 Y NA NA NA NA NA NA STX8 219344 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 10672260 10672535 10672473 Y MYH4,SHISA6,PIRT RP11-963H4.2 ZNF18,MYH3,LOC100289255 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-963H4.2 24400 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 11928413 11928725 11928507 Y NA ZNF18,MAP2K4 NA NA NA NA MAP2K4 6272 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 13575065 13575361 13575332 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST3A1 71821 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.18629863801546 chr17 14641682 14642082 14641822 Y HS3ST3B1 RPS18P12 HS3ST3B1 IMR90 Hi-C 24141950 RPS18P12 34831 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 15313128 15313509 15313354 Y NA NA NA NA NA NA PMP22 146485 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 15393997 15394379 15394217 Y PMP22,FAM18B2 NA NA NA NA NA SNORA74 80954 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 15787021 15787553 15787332 Y ZSWIM7,TTC19,ADORA2B NA NA NA NA NA ADORA2B 58678 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr17 15862469 15862773 15862614 Y ADORA2B,ZSWIM7,TTC19 ADORA2B,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ADORA2B 16238 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 15923170 15923610 15923287 Y FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 22139 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 15925706 15925935 15925791 Y FAM18B2,PIGL,NCOR1,TTC19,ZSWIM7 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 24675 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 16189250 16189597 16189494 Y NCOR1,TRPV2 NA NA NA NA NA NCOR1 69751 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr17 16191035 16191327 16191109 Y TRPV2 NA CENPV IMR90 Hi-C 24141950 NCOR1 71536 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 16438910 16439232 16439111 Y NA ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 31288 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr17 16440164 16440317 16440266 Y ZNF624,CCDC144A ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 30203 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 16948336 16948515 16948428 Y ZNF287,ZNF624,PLD6,NT5M,MED9,FLCN,COPS3,COPS3,MPRIP MPRIP NA NA NA NA MPRIP 4477 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr17 17319893 17320013 17319952 Y FLCN RPL13P12 NA NA NA NA RPL13P12 34567 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 17597479 17598220 17598134 Y ALKBH5,FLCN,COPS3 RAI1 NA NA NA NA RAI1 14692 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr17 17655489 17655938 17655636 Y DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9 NA NA NA NA NA RAI1 72702 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.28515685785008 chr17 17725605 17725781 17725666 Y NA SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 12544 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 17743258 17743857 17743527 Y SMCR8 SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 4933 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr17 17861466 17861608 17861562 Y SMCR8 TOM1L2,LRRC48 NA NA NA NA TOM1L2 12128 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 17862888 17863023 17862956 Y NA TOM1L2,LRRC48 NA NA NA NA TOM1L2 10713 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 18032331 18032623 18032472 Y TOM1L2,MYO15A DRG2 NA NA NA NA DRG2 43131 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 18242712 18242812 18242762 Y FBXW10,SHMT1 TOP3A,SMCR8,SHMT1 NA NA NA NA SHMT1 22044 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 19141562 19141875 19141665 Y RNF112,EPN2 NA NA NA NA NA SNORD3D 127613 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 19630628 19631028 19630955 Y MAPK7,MAPK7 SLC47A2,ALDH3A1 NA NA NA NA SLC47A2 10336 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 19656390 19656618 19656531 Y MAPK7,MAPK7 SLC47A2,ALDH3A1 NA NA NA NA ALDH3A1 6134 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.988582198346214 chr17 19913206 19913926 19913276 Y ULK2,AKAP10 AKAP10,SPECC1 NA NA NA NA SPECC1 2549 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 20012372 20012672 20012482 Y NA NA NA NA NA NA SPECC1 101715 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 20688064 20688832 20688343 Y NA OLA1P2,SCDP1 NA NA NA NA SCDP1 2106 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr17 21002403 21002809 21002523 Y KCNJ18 DHRS7B USP22,C17orf103 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHRS7B 21868 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 21179100 21179414 21179208 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 6570 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr17 21189600 21190105 21189864 Y MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 NA NA NA NA MAP2K3 3616 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr17 21314266 21314623 21314560 Y NA NA NA NA NA NA MAP2K3 128282 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 25409900 25410125 25410078 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208977 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 25571981 25572190 25572120 Y LGALS9,WSB1 WSB1 WSB1,KSR1,MIR4522 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 46912 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 25659975 25660361 25659997 Y NA WSB1 NA NA NA NA WSB1 40873 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE T98G hg19 FANTOM5 2.27373905619629 chr17 25805507 25805777 25805623 Y NA KSR1 NA NA NA NA KSR1 23837 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 26368091 26368384 26368254 Y NA NLK NA NA NA NA NLK 1328 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 26718724 26718918 26718801 Y FOXN1,C17orf63,SEBOX,SARM1 POLDIP2,TMEM199,SARM1,SLC46A1 NA NA NA NA SLC46A1 13297 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr17 27116093 27116114 27116106 Y NA TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 47091 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 27475765 27476166 27476073 Y NEK8,PHF12 MYO18A NA NA NA NA MYO18A 29264 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 27482450 27482602 27482543 Y NA MYO18A NA NA NA NA MYO18A 22828 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 27506307 27506816 27506504 Y TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A MYO18A NA NA NA NA MYO18A 877 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr17 27530741 27530989 27530946 Y NA MYO18A MYO18A,TAOK1,NUFIP2 IMR90 Hi-C 24141950 MYO18A 25311 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 27568035 27568215 27568131 Y NA NA NA NA NA NA NUFIP2 50921 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 27619094 27619880 27619581 Y TAOK1 NA NA NA NA NA NUFIP2 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr17 27824938 27824945 27824941 Y TIAF1,MYO18A,TAOK1,EFCAB5,ANKRD13B NA NA NA NA NA TP53I13 66125 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr17 27918115 27918172 27918144 Y GIT1,ANKRD13B TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1 NA NA NA NA GIT1 900 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 28019224 28019454 28019389 Y NSRP1,NUFIP2,TAOK1,SSH2 NA NA NA NA NA GIT1 100152 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 28258246 28258478 28258304 Y NA SSH2 NA NA NA NA SSH2 2952 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 29115484 29115559 29115508 Y NA CRLF3,CTD-2349P21.1,ATAD5 NA NA NA NA CRLF3 34235 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 29596751 29597032 29596911 Y NA EVI2B,EVI2A NA NA NA NA EVI2B 42098 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 29599453 29600092 29599789 Y NA EVI2B,EVI2A NA NA NA NA EVI2B 39038 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 29609076 29609437 29609257 Y NA EVI2B,EVI2A NA NA NA NA EVI2B 29693 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 29759240 29759393 29759318 Y NA NA NA NA NA NA EVI2A 112338 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA EVI2A 229790 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr17 29892134 29892258 29892202 Y EVI2A NA NA NA NA NA EVI2A 245232 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 29909272 29909544 29909457 Y EVI2B,EVI2A NA NA NA NA NA EVI2A 262370 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 29923737 29923924 29923895 Y EVI2A NA NA NA NA NA EVI2A 276835 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 30170148 30170249 30170215 Y NA NA NA NA NA NA UTP6 56535 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 30253386 30253637 30253512 Y NA UTP6,SUZ12 SUZ12 K562 ChIA-PET 22265404 SUZ12 8400 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 30335785 30336145 30335965 Y NA NA NA NA NA NA SUZ12 73748 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 30588630 30588823 30588726 Y NA RHBDL3 NA NA NA NA RHBDL3 2372 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 30602097 30602417 30602219 Y NA RHBDL3 NA NA NA NA RHBDL3 10902 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 30724674 30725107 30724769 Y RHOT1 C17orf75,ZNF207,PSMD11 NA NA NA NA PSMD11 44172 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 30846365 30846870 30846526 Y NA CDK5R1 NA NA NA NA CDK5R1 34728 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 30847234 30847756 30847477 Y NA CDK5R1 NA NA NA NA CDK5R1 35597 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 32579434 32580053 32579676 Y CCL8,CCL7 CCL2,CCL11 NA NA NA NA CCL2 251 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 32586301 32586443 32586414 Y NA CCL2,CCL11 NA NA NA NA CCL2 5997 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 32740110 32740340 32740257 Y NA NA NLE1,TMEM132E,CCT6B,ZNF830 IMR90 Hi-C 24141950 CCL8 96055 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 33300552 33300861 33300820 Y NA ZNF830,LIG3,CCT6B NA NA NA NA LIG3 4652 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 33414530 33415581 33415167 Y SLFN5,ZNF830,RFFL RFFL,RAD51D NA NA NA NA RFFL 192 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 33572314 33572864 33572356 Y NA SLFN5 NA NA NA NA SLFN5 4259 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr17 33577736 33577912 33577824 Y ZNF830,RFFL,SLFN5 SLFN5 NA NA NA NA SLFN5 9681 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 33786708 33787098 33786905 Y NA SLFN12 NA NA NA NA SLFN12 28406 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 33867743 33868178 33867841 Y RFFL,SLFN5,SLFN11,CCL5,CCL23 AP2B1,PEX12 NA NA NA NA AP2B1 34887 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 33923571 33923796 33923685 Y NA AP2B1,PEX12 NA NA NA NA PEX12 19689 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 34160214 34160648 34160302 Y NA MMP28,TAF15 NA NA NA NA TAF15 25755 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 35078576 35079010 35078700 Y NA NA LHX1,AATF,ACACA,MRM1,DHRS11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRM1 122575 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 35288156 35288415 35288296 Y LHX1 RP11-445F12.1,AATF AATF K562 ChIA-PET 22265404 RP11-445F12.1 3545 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 35292129 35292558 35292512 Y ACACA,LHX1,AATF RP11-445F12.1,AATF NA NA NA NA RP11-445F12.1 169 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.988582198346214 chr17 35446954 35447324 35447190 Y NA NA NA NA NA NA AATF 142779 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 35492690 35492856 35492817 Y NA NA NA NA NA NA AATF 188515 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 35520107 35520138 35520123 Y ACACA NA NA NA NA NA AATF 215932 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 36412216 36412471 36412263 Y NA RP11-1407O15.2,MRPL45 NA NA NA NA RP11-1407O15.2 7387 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr17 37910411 37911394 37910787 Y FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3 MIEN1 NA NA NA NA MIEN1 25371 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 38231838 38232188 38231911 Y NA THRA,MED24,NR1D1,MSL1 NA NA NA NA MED24 16370 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 38263980 38264229 38263993 Y RARA,RARA,MSL1 MED24,NR1D1,MSL1,CASC3 NA NA NA NA NR1D1 9002 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 38707495 38707811 38707586 Y KRTAP1-5,GJD3,IGFBP4 NA NA NA NA NA SMARCE1 94949 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr17 38708057 38709216 38708396 Y KRTAP1-5,GJD3,IGFBP4 NA NA NA NA NA SMARCE1 93544 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr17 39653134 39653351 39653234 Y NA KRT15 NA NA NA NA KRT15 23430 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 39686458 39686891 39686666 Y KRT19 KRT15,KRT9 NA NA NA NA KRT15 9677 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 39703962 39704520 39704217 Y NA KRT15,KRT9 NA NA NA NA KRT9 21790 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 39822130 39822941 39822323 Y NA EIF1 KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 20196 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 39835188 39835696 39835517 Y RAB5C,NKIRAS2,DHX58,EIF1 EIF1 SMARCE1,KRT222,KRT28,KRT26,KRT27,TMEM99,KRT10,KRT20,KRTAP3-2,KRTAP3-3,KRT19,EIF1,HAP1,JUP IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EIF1 7441 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 39949116 39949497 39949168 Y KRT14,JUP JUP,LEPREL4,FKBP10 NA NA NA NA JUP 7933 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 39949517 39949745 39949566 Y KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP JUP,LEPREL4,FKBP10 NA NA NA NA JUP 8334 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 40155760 40155995 40155877 Y STAT5A CNP,NKIRAS2,DNAJC7 NA NA NA NA NKIRAS2 5405 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 40163251 40163440 40163343 Y NA CNP,NKIRAS2,DNAJC7 NA NA NA NA NKIRAS2 1851 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 40573451 40573881 40573544 Y AOC3,GHDC,PLEKHH3,NAGLU,PTRF STAT3,ATP6V0A1 NA NA NA NA PTRF 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 40670495 40670831 40670653 Y WNK4,RAB5C,PTRF NAGLU,COASY,MLX NA NA NA NA NAGLU 15359 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 40816292 40816343 40816318 Y NA TUBG2,PLEKHH3,CNTNAP1 NA NA NA NA TUBG2 6969 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 41173099 41173334 41173293 Y NAGLU,VAT1 RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1 NA NA NA NA VAT1 1806 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 41242207 41242334 41242271 Y NA BRCA1,NBR2 NA NA NA NA BRCA1 33166 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 41428275 41428596 41428403 Y NA ARL4D NA NA NA NA ARL4D 45731 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 41478754 41478975 41478864 Y ARL4D ARL4D NA NA NA NA ARL4D 4427 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 41656262 41656390 41656311 Y G6PC3 ETV4 DHX8,MIR2117,MPP2 IMR90 Hi-C 24141950 ETV4 1274 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 41778909 41778996 41778931 Y NA NA MPP2,LOC100130581,MPP3,MEOX1,DUSP3,DHX8,ARL4D,MIR2117,ETV4,C17orf105,SOST,CD300LG IMR90 Hi-C 24141950 SOST 55160 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 41796772 41797488 41797204 Y TMUB2,TMEM106A,DHX8,DUSP3 SOST LOC100130581,MPP3,DUSP3,DHX8,ETV4,MEOX1,C17orf105,SOST,CD300LG,HDAC5 IMR90 Hi-C 24141950 SOST 36668 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 42173050 42173151 42173101 Y TMEM101,G6PC3 LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25919 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 42173326 42173627 42173470 Y NA LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25443 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr17 42174643 42174888 42174769 Y NA LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 24182 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 42215472 42215904 42215679 Y C17orf53 HDAC5,C17orf53,TMUB2 C17orf53 MCF7 ChIA-PET 22265404 C17orf53 1370 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.97716439669243 chr17 42620579 42620851 42620665 Y GJC1,FZD2 GPATCH8,FZD2 GPATCH8,FZD2,C17orf104,CCDC43,DBF4B,ITGA2B IMR90 Hi-C 24141950 FZD2 12074 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 42634020 42634172 42634095 Y TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2 FZD2 NA NA NA NA FZD2 1095 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr17 42797981 42798248 42798116 Y CCDC43 CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1,ADAM11 NA NA NA NA RP11-1072C15.1 2016 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 43018379 43018606 43018493 Y NA CCDC103,EFTUD2,FAM187A,KIF18B,C1QL1 NA NA NA NA KIF18B 4476 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 43170304 43170536 43170449 Y ADAM11,HIGD1B,GFAP NMT1,DCAKD,ACBD4,PLCD3 NA NA NA NA DCAKD 33831 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 43230123 43230516 43230320 Y NA ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2 NA NA NA NA HEXIM2 5551 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr17 43305165 43306978 43306453 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 8354 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 43370974 43371161 43371063 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 MAP3K14 NA NA NA NA MAP3K14 21253 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 43389475 43389771 43389724 Y FMNL1,PLEKHM1,MAP3K14 MAP3K14 TEX34,LOC100133991 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K14 2643 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 43398309 43398621 43398414 Y NA MAP3K14 LOC100133991,FMNL1,MAP3K14,TEX34,ARHGAP27 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K14 5895 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 43423230 43423453 43423342 Y NA MAP3K14 HEXIM1,MAP3K14,FMNL1,LOC100133991,TEX34,ARHGAP27 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP3K14 30816 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 43449108 43449433 43449167 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K14 56694 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr17 43951029 43951274 43951198 Y NA MAPT NA NA NA NA MAPT 18474 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 44131950 44132178 44132002 Y KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA MAPT 162202 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 44135698 44135955 44135827 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 165950 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 44198532 44198560 44198547 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 228784 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 44342171 44342447 44342244 Y KIAA1267,KIAA1267 NA MAPT,KANSL1,KANSL1-AS1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAPT 372423 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 44344171 44344471 44344293 Y NA NA KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAPT 374423 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.3840150776847 chr17 44848199 44848613 44848371 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 50666 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 44848812 44849347 44849259 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 51279 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr17 45302836 45303175 45303013 Y NA CDC27,ITGB3 NA NA NA NA ITGB3 26088 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 45317390 45317724 45317566 Y TBKBP1 ITGB3 NA NA NA NA ITGB3 11539 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 45356357 45357027 45356891 Y NA ITGB3 NA NA NA NA ITGB3 27094 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 45609469 45609601 45609554 Y NA NPEPPS NA NA NA NA NPEPPS 11161 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 45717975 45718065 45718017 Y NA KPNB1 NA NA NA NA KPNB1 6777 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 45771013 45771467 45771041 Y NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1 KPNB1,TBX21 NA NA NA NA TBX21 37143 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 46072548 46072940 46072729 Y NA CDK5RAP3,COPZ2 NA NA NA NA CDK5RAP3 29372 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 46079914 46080281 46080131 Y NPEPPS,TBKBP1,TBX21,SP2 CDK5RAP3,COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 33111 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 46101351 46101579 46101379 Y NA COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 11813 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 46102426 46102830 46102617 Y NA COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 10562 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 46168455 46168716 46168586 Y NA NFE2L1,CBX1,SNX11 NA NA NA NA CBX1 8167 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 46289129 46289412 46289274 Y NA NA NA NA NA NA SNX11 110410 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 46644443 46644754 46644601 Y HOXB9,HOXB8,HOXB6 HOXB4,HOXB6,HOXB8 NA NA NA NA HOXB4 10719 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 46654606 46654947 46654902 Y NA HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB9 NA NA NA NA HOXB4 526 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 46662684 46663231 46662943 Y HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5 HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB9 NA NA NA NA HOXB4 7211 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 46664992 46665342 46665097 Y NA HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB9 NA NA NA NA HOXB4 9519 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 46680378 46680812 46680678 Y NA HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB9 NA NA NA NA HOXB6 24 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 46702579 46702749 46702606 Y HOXB2,HOXB3,SNF8,HOXB5,HOXB6,HOXB7,HOXB8,HOXB9 HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB9 NA NA NA NA HOXB9 740 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 47049793 47049986 47049890 Y IGF2BP1,SNF8 SNF8,IGF2BP1 IGF2BP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IGF2BP1 22788 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr17 47270202 47270509 47270359 Y CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3 PHOSPHO1 NA NA NA NA PHOSPHO1 35619 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr17 47468290 47468719 47468487 Y ZNF652,ZNF652 RP11-1079K10.3,ZNF652,PHB,AC004797.1 NA NA NA NA PHB 21527 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 47765495 47765594 47765536 Y ABI3,GNGT2,PHOSPHO1,ZNF652,ZNF652,PPP1R9B,MYST2,FAM117A,SPOP SPOP,SLC35B1 NA NA NA NA SPOP 11899 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 47913501 47913854 47913589 Y TMEM92 KAT7,FAM117A,RP11-613C6.4 NA NA NA NA RP11-613C6.4 42796 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 47928830 47928921 47928887 Y FAM117A NA NA NA NA NA RP11-613C6.4 58125 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 48139711 48140314 48140012 Y XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3 ITGA3,PDK2 NA NA NA NA ITGA3 8379 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr17 48228924 48229616 48229504 Y SPATA20,SAMD14 SAMD14,PPP1R9B,COL1A1 NA NA NA NA PPP1R9B 2933 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 48255388 48256117 48255676 Y NA PPP1R9B,COL1A1 NA NA NA NA COL1A1 20876 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 48287695 48288075 48287880 Y XYLT2,LRRC59,COL1A1 COL1A1 PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2 IMR90 Hi-C 24141950 COL1A1 10702 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr17 48367346 48367814 48367643 Y PPP1R9B TMEM92 NA NA NA NA TMEM92 20579 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr17 48716257 48716537 48716480 Y NA ABCC3 NA NA NA NA ABCC3 6119 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 48726648 48726741 48726695 Y NA ABCC3 NA NA NA NA ABCC3 16510 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 48942663 48943085 48943016 Y NA TOB1 NA NA NA NA TOB1 254 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr17 48996944 48997365 48997235 Y UTP18,RSAD1,TOB1 NA LOC400604,TOB1,WFIKKN2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOB1 53605 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 49075036 49075414 49075227 Y NA NA NA NA NA NA SPAG9 120812 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 49196679 49197214 49196965 Y NA SPAG9,NME1,NME1-NME2,NME2 NA NA NA NA SPAG9 453 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 53006732 53007120 53006925 Y NA TOM1L1,STXBP4,COX11 NA NA NA NA TOM1L1 31984 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 53017345 53017570 53017451 Y TOM1L1 TOM1L1,STXBP4,COX11 NA NA NA NA STXBP4 26518 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 53034991 53035170 53035032 Y NA STXBP4,COX11 NA NA NA NA STXBP4 8918 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 53394900 53394943 53394922 Y NA NA NA NA NA NA HLF 54527 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 53497202 53497618 53497598 Y NA NA NA NA NA NA MMD 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 53654184 53654435 53654393 Y NA NA PCTP IMR90 Hi-C 24141950 TMEM100 153047 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 54263832 54264049 54263912 Y NA NA NA NA NA NA NOG 405011 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 55056156 55056413 55056229 Y NA COIL,SCPEP1 NA NA NA NA SCPEP1 2690 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 55540558 55540950 55540705 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 209346 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 55740175 55740776 55740501 Y MSI2,MSI2,DYNLL2 NA NA NA NA NA MRPS23 184641 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 55912487 55912699 55912681 Y NA MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 12718 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 55938337 55938724 55938439 Y SUPT4H1,CUEDC1 MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 12920 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 55951789 55952442 55952113 Y SRSF1,MKS1,MKS1,BZRAP1,MRPS23 MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 26372 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr17 55952714 55953105 55953007 Y NA MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 27297 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 55969951 55970070 55970020 Y NA MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 44534 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 55970352 55970806 55970481 Y SUPT4H1,VEZF1 MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 44935 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr17 56013342 56013699 56013370 Y NA CUEDC1,VEZF1 VEZF1,CUEDC1,SRSF1 IMR90 Hi-C 24141950 CUEDC1 16985 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 56023350 56023692 56023525 Y NA CUEDC1,VEZF1 CUEDC1,VEZF1 IMR90 Hi-C 24141950 CUEDC1 6992 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 56025910 56026308 56026041 Y SUPT4H1 CUEDC1,VEZF1 NA NA NA NA CUEDC1 4376 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 56064193 56064677 56064258 Y NA CUEDC1,VEZF1,SRSF1 NA NA NA NA VEZF1 573 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 56110025 56110231 56110193 Y NA VEZF1,SRSF1,DYNLL2 AKAP1 IMR90 Hi-C 24141950 SRSF1 27318 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 56701235 56701661 56701522 Y OR4D1,BZRAP1 RNU1-60P NA NA NA NA RNU1-60P 33005 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr17 56705180 56705300 56705276 Y NA RNU1-60P,RNU1-85P SEPT4,MTMR4 K562 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 29366 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr17 56706902 56707296 56707107 Y MKS1,MKS1,RAD51C RNU1-60P,RNU1-85P SEPT4,MTMR4,C17orf47 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 27370 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.97716439669243 chr17 57231530 57231848 57231723 Y NA AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA PRR11 670 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 57831888 57832338 57832062 Y VMP1,RNFT1 VMP1,PTRH2 NA NA NA NA PTRH2 48901 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr17 57861698 57862055 57862024 Y RNFT1 NA NA NA NA NA MIR21 54572 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 57863159 57864676 57863979 Y NA NA NA NA NA NA MIR21 51951 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr17 57906379 57907270 57906882 Y RNFT1 MIR21 NA NA NA NA MIR21 9357 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr17 57922999 57923843 57923122 Y PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6 MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 6372 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 57925185 57925429 57925290 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 8558 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 57929068 57929265 57929192 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 12441 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 57930626 57931026 57930760 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 13999 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 57962596 57962816 57962625 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA TUBD1 5488 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 58212242 58212405 58212344 Y NA NA C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEATR6 57950 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 58804933 58805128 58805031 Y NA NA NA NA NA NA BCAS3 52119 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 59956289 59956463 59956377 Y NA BRIP1,INTS2 BRIP1 IMR90 Hi-C 24141950 BRIP1 17407 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 60085676 60086036 60086030 Y NACA2,MED13 NA NA NA NA NA MED13 54607 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 60555037 60555507 60555099 Y NA RP11-464D20.2 MRC2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-464D20.2 36621 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 60729712 60730300 60729931 Y NA MRC2 NA NA NA NA MRC2 26950 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 60780424 60780717 60780568 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 77662 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 60869162 60869387 60869275 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 166400 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 60973132 60973339 60973182 Y TLK2 NA NA NA NA NA MRC2 270370 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 61043121 61043648 61043243 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 340359 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 61153436 61153733 61153585 Y NA NA NA NA NA NA CYB561 368006 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 61451328 61451417 61451341 Y NA NA MIR548W,MARCH10 IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 70322 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 61639369 61639739 61639552 Y NA KCNH6,DCAF7,TACO1 NA NA NA NA DCAF7 13547 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 61920991 61921115 61921104 Y NA PSMC5,FTSJ3,SMARCD2 NA NA NA NA SMARCD2 2566 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 62159440 62159790 62159613 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 46389 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 62161129 62161576 62161448 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 44603 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 62256473 62256785 62256630 Y DDX5,ERN1 SNORD104 NA NA NA NA SNORD104 35030 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 62487438 62487665 62487534 Y ICAM2 POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA POLG2 3489 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 62491373 62491767 62491605 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA POLG2 219 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 62526246 62526643 62526459 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA DDX5 23929 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr17 62612826 62613207 62613064 Y NA SMURF2 NA NA NA NA SMURF2 42979 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 62675748 62676312 62676051 Y SMURF2 SMURF2 SMURF2,LOC146880 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMURF2 19562 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr17 62705157 62705447 62705234 Y SMURF2 SMURF2 SMURF2 IMR90 Hi-C 24141950 SMURF2 48971 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 63030127 63030512 63030385 Y NA GNA13 AMZ2P1 IMR90 Hi-C 24141950 GNA13 20445 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 63038886 63039290 63039133 Y GNA13 GNA13 NA NA NA NA GNA13 11667 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 63060882 63060952 63060917 Y GNA13 GNA13 GNA13,RGS9 IMR90 Hi-C 24141950 GNA13 9925 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 63119249 63119621 63119552 Y GNA13 RGS9 RGS9,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RGS9 11928 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 63179961 63180187 63180056 Y NA RGS9 NA NA NA NA RGS9 48412 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 63639930 63640399 63640359 Y NA NA NA NA NA NA AXIN2 84165 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr17 64128284 64128318 64128301 Y CEP112,CEP112 NA NA NA NA NA CEP112 57884 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 64194072 64194322 64194164 Y NA CEP112 NA NA NA NA CEP112 7870 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 64463185 64463416 64463350 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 166431 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 64503657 64504241 64503882 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 206903 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 64708077 64708220 64708107 Y NA NA NA NA NA NA CACNG4 250806 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 64948296 64948612 64948339 Y CACNG4 CACNG4 CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CACNG4 10414 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 65386872 65387224 65386898 Y HELZ,BPTF,PITPNC1 PSMD12,PITPNC1 NA NA NA NA PITPNC1 15297 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 65990543 65990874 65990748 Y AMZ2,BPTF,C17orf58 C17orf58,KPNA2 NA NA NA NA C17orf58 2778 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr17 66374219 66374806 66374507 Y SLC16A6 NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 76848 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 66374808 66375131 66375016 Y SLC16A6 NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 76523 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr17 66376984 66377775 66377396 Y NA NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 73879 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 66421215 66421317 66421250 Y NA WIPI1 NA NA NA NA WIPI1 30337 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 66434083 66434422 66434387 Y NA WIPI1 NA NA NA NA WIPI1 17232 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 66452519 66452682 66452605 Y SLC16A6,WIPI1 WIPI1 NA NA NA NA WIPI1 865 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 67729924 67730199 67729927 Y NA NA KCNJ2-AS1,KCNJ2,KCNJ16 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K6 321085 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 67758996 67759121 67759059 Y KCNJ2 NA KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2,MAP2K6 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K6 350157 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 69824557 69824843 69824637 Y NA NA NA NA NA NA LINC01152 199589 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 70122851 70122907 70122879 Y NA SOX9 NA NA NA NA SOX9 7690 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 70147771 70147892 70147832 Y NA SOX9 SOX9,LOC100499467 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SOX9 32610 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 70416079 70416357 70416132 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 205013 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 70512872 70513243 70513164 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 108127 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 70585200 70585480 70585419 Y NA RPL32P33,LINC00511 NA NA NA NA RPL32P33 35890 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 70587266 70587776 70587444 Y NA RPL32P33,LINC00511 NA NA NA NA RPL32P33 33594 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 70664433 70664574 70664507 Y NA RPL32P33,LINC00511 NA NA NA NA LINC00511 29822 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 70706379 70706638 70706553 Y NA NA NA NA NA NA LINC00511 71768 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 71287548 71287861 71287762 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 18453 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 71336325 71336719 71336454 Y NA CDC42EP4 CDC42EP4 MCF7 ChIA-PET 22265404 CDC42EP4 30011 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr17 71338137 71338558 71338458 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 31823 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 71339324 71339501 71339471 Y SSTR2,CDC42EP4 CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 33010 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 72564769 72564992 72564860 Y NA NA NA NA NA NA GPRC5C 145779 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 72565404 72566131 72565833 Y TTYH2,TTYH2,CD300A,TMEM104,CD300LF,CD300E,CD300LB,CD300C,CD300LD NA NA NA NA NA GPRC5C 146414 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr17 72633570 72634215 72633653 Y TTYH2,TTYH2,CD300A,CD300LB,CD300C,CD300LD,TMEM104,SLC16A5,CD300E,CD300LF NA GPRC5C,C17orf77,CD300LD,RAB37,CD300LF,CD300E IMR90 Hi-C 24141950 SLC9A3R1 108576 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 72746451 72746964 72746655 Y NA SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA SLC9A3R1 3660 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr17 72978355 72978661 72978434 Y KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CDR2L 3066 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr17 73009835 73009966 73009891 Y NA CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H NA NA NA NA ICT1 3070 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 73120387 73120767 73120528 Y GRB2,GRB2,CD300LF,HN1,HN1,SLC16A5,NT5C SLC16A5,ARMC7,NT5C,HN1 NA NA NA NA NT5C 5123 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 73304838 73305233 73305159 Y UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19 MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1 NA NA NA NA AC011933.1 8177 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr17 73696530 73696897 73696707 Y SAP30BP,ITGB4,ITGB4 SAP30BP,RECQL5,ITGB4 NA NA NA NA ITGB4 18511 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 73860608 73860975 73860910 Y NA WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38 UNC13D,UNK,WBP2 IMR90 Hi-C 24141950 WBP2 10020 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 73868951 73869202 73869040 Y TRIM47 WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38 NA NA NA NA TRIM47 3454 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr17 73992927 73993207 73992957 Y NA TEN1,ACOX1,CDK3 NA NA NA NA CDK3 1780 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 74341579 74341976 74341749 Y NA SPHK1,PRPSAP1 NA NA NA NA SPHK1 28689 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 74440987 74441354 74441087 Y NA UBE2O NA NA NA NA UBE2O 5934 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 74494294 74494838 74494393 Y NA UBE2O,RHBDF2 NA NA NA NA RHBDF2 1034 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 74525125 74525268 74525197 Y NA RHBDF2,CYGB NA NA NA NA CYGB 19989 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 74525744 74526079 74526045 Y ST6GALNAC2,MGAT5B,CYGB RHBDF2,CYGB NA NA NA NA CYGB 19178 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 74526422 74526750 74526585 Y CYGB RHBDF2,CYGB NA NA NA NA CYGB 18507 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 74664017 74664029 74664023 Y NA MXRA7 NA NA NA NA MXRA7 41069 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 74705254 74705618 74705431 Y MXRA7 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA MXRA7 156 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr17 74723995 74724371 74724344 Y FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA METTL23 3083 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 75120383 75120864 75120582 Y JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 39585 CAGE T98G hg19 FANTOM5 2.96574659503864 chr17 75170939 75171192 75170955 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 90141 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 75251434 75251777 75251766 Y NA SEPT9 SEPT9,SRSF2,METTL23,MFSD11,SEC14L1,MGAT5B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEPT9 22874 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 75281811 75282557 75281917 Y SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 7160 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr17 75282703 75283463 75282995 Y SEPT9,SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 8052 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 75318595 75318736 75318679 Y SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 43944 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 75319028 75319523 75319372 Y SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 44377 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr17 75319670 75320031 75319742 Y MGAT5B,SEPT9,SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 45019 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.58173151735394 chr17 75361925 75362048 75361987 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 87274 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 75387909 75388384 75388205 Y SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA SEPT9 113258 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr17 75388510 75388802 75388677 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 113859 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 75417194 75417582 75417357 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 142543 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 75421302 75421687 75421325 Y SEPT9,SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA SEPT9 146651 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 75422359 75422648 75422577 Y SEPT9,SEPT9,SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA SEPT9 147708 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 75431413 75431687 75431621 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 156762 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 75830749 75830836 75830793 Y TMC8,TMC6 NA TNRC6C,LOC100507351 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-80P 83344 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 75872051 75872295 75872261 Y TMC6,SOCS3 RNU1-80P NA NA NA NA RNU1-80P 41885 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 75883563 75884329 75884163 Y TNRC6C,TMC8,TMC6,TMC6,SOCS3,PGS1 RNU1-80P NA NA NA NA RNU1-80P 29851 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA RNU1-80P,TNRC6C TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-80P 40213 CAGE T98G hg19 FANTOM5 13.1481432380046 chr17 76310071 76310633 76310436 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3 PGS1,DNAH17,SOCS3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SOCS3 43525 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 76320464 76321292 76320695 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3 NA NA NA NA SOCS3 32866 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 76325206 76325964 76325662 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 28194 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 76337607 76338208 76338068 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 15950 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 76348964 76349371 76349046 Y USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 4787 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 76412850 76413399 76413170 Y CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1 PGS1 NA NA NA NA PGS1 40129 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 76669540 76669658 76669599 Y NA NA NA NA NA NA CYTH1 106721 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 76767876 76768189 76768026 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 CYTH1 NA NA NA NA CYTH1 8190 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 76858403 76858717 76858585 Y PGS1,CYTH1,ENGASE,USP36 USP36 NA NA NA NA USP36 22880 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr17 76875667 76876103 76875916 Y CYTH1,ENGASE,CANT1 USP36,TIMP2 NA NA NA NA USP36 40144 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr17 76879007 76879631 76879400 Y CYTH1,ENGASE,CANT1,USP36 USP36,TIMP2 NA NA NA NA TIMP2 39838 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 76879876 76880180 76879977 Y NA USP36,TIMP2 NA NA NA NA TIMP2 39289 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 76929562 76929807 76929665 Y CANT1 TIMP2,LGALS3BP TIMP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TIMP2 10093 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 76930060 76930674 76930419 Y NA TIMP2,LGALS3BP TIMP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TIMP2 10591 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 77361775 77362127 77361951 Y RBFOX3 NA NA NA NA NA ENGASE 292754 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 77481345 77481685 77481515 Y NA NA NA NA NA NA CBX2 268246 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 77730841 77731207 77731024 Y CBX8,CBX2 CBX2,CBX8 NA NA NA NA CBX2 18724 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr17 77783959 77784243 77784073 Y CBX2,CBX8 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 10477 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr17 77787297 77787609 77787349 Y NA CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 13815 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 77803693 77803802 77803748 Y NA CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX4 7426 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr17 77961931 77962339 77962251 Y NA TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 45308 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 77967532 77967765 77967641 Y CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 39882 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 78008584 78008924 78008651 Y TBC1D16,GAA TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA CCDC40 149 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 78087852 78088239 78088062 Y NA GAA,EIF4A3 NA NA NA NA GAA 14497 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 78228476 78228940 78228764 Y GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213 SLC26A11,SGSH,RNF213 NA NA NA NA RNF213 3725 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV,NPTX1 NA NA NA NA NPTX1 20369 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr17 78652497 78652856 78652573 Y SGSH,RNF213 NA NA NA NA NA RPTOR 135878 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 78735331 78735538 78735429 Y NA NA NA NA NA NA RPTOR 218712 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 78747049 78747482 78747085 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 215916 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 78754047 78754707 78754061 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 208691 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 78806684 78807307 78807121 Y C17orf56 NA NA NA NA NA CHMP6 156091 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr17 78847470 78847710 78847638 Y C17orf56 NA NA NA NA NA CHMP6 115688 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 78992000 78992331 78992033 Y C17orf56 CHMP6,BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 14617 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 79068878 79069252 79068906 Y C17orf56 NA NA NA NA NA BAIAP2 61930 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 79317785 79317948 79317891 Y FAM195B,C17orf70,ACTG1,BAHCC1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 50438 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 79318144 79318304 79318226 Y TMEM105,BAHCC1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 50797 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 79319325 79319648 79319507 Y FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 51978 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr17 79319812 79320225 79320116 Y FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 52465 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 79360408 79361324 79361141 Y ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10 NA NA NA NA NA SLC38A10 93061 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 79362745 79363068 79363048 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A10 95398 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 79365060 79367456 79365203 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A10 97713 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 79369574 79370687 79370597 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A10 102227 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 79546845 79547000 79546944 Y PCYT2 C17orf70 NA NA NA NA C17orf70 27858 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 79789691 79790066 79789800 Y NA FAM195B,P4HB,ARHGDIA NA NA NA NA FAM195B 513 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 80056613 80056910 80056718 Y C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 2405 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr17 80188750 80189250 80189000 Y NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3 CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA SLC16A3 4477 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 80199457 80199968 80199484 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA SLC16A3 15184 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 80216124 80216440 80216314 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 13167 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 80255299 80255755 80255478 Y SIRT7,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7 CSNK1D,SECTM1 NA NA NA NA CSNK1D 25692 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 80255798 80256475 80256187 Y SIRT7,MAFG,MAFG,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,HEXDC,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7 CSNK1D,SECTM1 NA NA NA NA CSNK1D 26191 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr17 80454894 80455238 80455175 Y LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 20351 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 81066773 81067186 81066924 Y NA METRNL NA NA NA NA METRNL 31206 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr17 81067352 81067511 81067418 Y NA METRNL NA NA NA NA METRNL 31785 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr17 81143253 81144043 81143500 Y NA NA METRNL MCF7 ChIA-PET 22265404 METRNL 107686 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr18 394915 395311 395219 Y NA NA NA NA NA NA COLEC12 103411 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr18 395862 395959 395924 Y NA NA NA NA NA NA COLEC12 102763 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 666183 666708 666437 Y THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 9843 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr18 668283 668526 668405 Y THOC1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11943 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 2548368 2548472 2548420 Y NA METTL4,NDC80 NA NA NA NA METTL4 21036 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 2605641 2605936 2605854 Y NA METTL4,NDC80,CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA NDC80 36131 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr18 2658254 2658560 2658346 Y METTL4,LPIN2,EMILIN2,SMCHD1 CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA SMCHD1 4517 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr18 2972158 2972493 2972361 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,MYL12B,SMCHD1,EMILIN2 LPIN2 NA NA NA NA LPIN2 38820 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 3015219 3015501 3015351 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,METTL4,EMILIN2 LPIN2 LPIN2 K562 ChIA-PET 22265404 LPIN2 3906 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 3276279 3276423 3276302 Y NA MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12B 16372 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 3490071 3490183 3490142 Y DLGAP1 NA NA NA NA NA TGIF1 80465 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr18 3623872 3624258 3624140 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214266 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr18 3624338 3624601 3624482 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214732 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr18 3624841 3625119 3625035 Y MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 215235 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr18 5895274 5895803 5895585 Y TMEM200C NA L3MBTL4 IMR90 Hi-C 24141950 RPL6P27 565211 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr18 6624543 6624930 6624551 Y NA NA LOC100130480,ARHGAP28 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP28 102787 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 6922958 6923281 6923120 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP28 195241 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 8704447 8704767 8704559 Y NA NA CCDC165,NDUFV2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB12 97004 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 8801229 8801479 8801315 Y CCDC165 NA NA NA NA NA RAB12 193786 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr18 9017103 9017601 9017310 Y ANKRD12 NA CCDC165,ANKRD12,RALBP1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 83027 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr18 9017601 9018155 9017805 Y NA NA CCDC165,ANKRD12,RALBP1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 82473 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 9128926 9129321 9129124 Y NDUFV2,ANKRD12,ANKRD12 NDUFV2,ANKRD12 ANKRD12 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD12 4905 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 9138526 9138911 9138547 Y ANKRD12,ANKRD12 NDUFV2,ANKRD12 NA NA NA NA ANKRD12 4300 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 9643596 9643835 9643765 Y NA PPP4R1 PPP4R1,VAPA,ANKRD12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP4R1 30358 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr18 9743544 9744009 9743684 Y VAPA,RAB31 RAB31 NA NA NA NA RAB31 37382 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 9755700 9755941 9755783 Y RAB31 RAB31 TXNDC2,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 RAB31 49538 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 9869849 9870152 9869995 Y VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 41847 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr18 9877272 9877635 9877453 Y VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 34364 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 9914998 9915501 9915128 Y PPP4R1,RAB31,VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 2999 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr18 10545349 10545498 10545424 Y NA NAPG NA NA NA NA NAPG 21447 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 10726542 10726663 10726595 Y NAPG NA NA NA NA NA NAPG 202640 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 10852460 10852708 10852534 Y NA NA NA NA NA NA NAPG 328558 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 11005597 11005922 11005792 Y NA NA NA NA NA NA NAPG 481695 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr18 11849903 11850727 11850169 Y MPPE1,CHMP1B CHMP1B NA NA NA NA CHMP1B 508 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 11859926 11860218 11860181 Y CHMP1B CHMP1B,MPPE1 NA NA NA NA CHMP1B 10531 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 11947272 11947721 11947412 Y CHMP1B MPPE1,IMPA2 IMPA2,GNAL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IMPA2 31303 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 12048672 12049055 12049000 Y NA NA NA NA NA NA IMPA2 69648 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 13313521 13313917 13313675 Y NA NA NA NA NA NA CEP192 324160 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 13500609 13500835 13500766 Y NA NA NA NA NA NA RNMT 223824 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 13824016 13824345 13824089 Y MC5R NA NA NA NA NA FAM210A 99354 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 18596588 18597119 18596879 Y NA NA NA NA NA NA ROCK1 92693 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 19926493 19926623 19926531 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 449601 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 20139802 20140256 20140003 Y GATA6 NA CTAGE1,GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 235968 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 20274994 20275099 20275066 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 101125 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr18 21228672 21228807 21228737 Y LAMA3,ANKRD29 ANKRD29 NA NA NA NA ANKRD29 12042 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 21562247 21562750 21562607 Y NA TTC39C TTC39C IMR90 Hi-C 24141950 TTC39C 7987 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 22236656 22237046 22236769 Y NA NA NA NA NA NA IMPACT 232076 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr18 22813900 22814028 22813957 Y ZNF521 NA NA NA NA NA ZNF521 116126 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 22828001 22828237 22828119 Y NA NA NA NA NA NA ZNF521 101917 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 22879484 22879663 22879574 Y NA NA NA NA NA NA ZNF521 50491 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 24120849 24120961 24120907 Y NA NA NA NA NA NA KCTD1 114404 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 25691984 25692409 25692174 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 63001 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 26231611 26231936 26231774 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 476201 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 26761381 26761904 26761619 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 1005971 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 29542474 29542964 29542885 Y RNF138 TRAPPC8 NA NA NA NA TRAPPC8 11375 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr18 32239709 32239834 32239782 Y MAPRE2,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA NA NA NA NA NA DTNA 168455 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 32622568 32623026 32622758 Y ZNF24,MAPRE2 NA NA NA NA NA MAPRE2 67676 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 32829674 32829781 32829775 Y ZNF397,ZSCAN30 ZNF397,ZSCAN30,ZNF271 NA NA NA NA ZNF397 10680 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr18 33185452 33185527 33185471 Y ZNF397,GALNT1 GALNT1 NA NA NA NA GALNT1 26371 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 33311016 33311295 33311162 Y NA NA NA NA NA NA GALNT1 151935 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 37033966 37034182 37034037 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 120327 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr18 38447528 38447658 38447616 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C3 1085513 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 42305633 42305950 42305768 Y SETBP1 SETBP1 NA NA NA NA SETBP1 47495 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 43307603 43307620 43307613 Y NA SLC14A1 NA NA NA NA SLC14A1 5511 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr18 43874380 43874525 43874458 Y NA RNF165 RNF165,LOXHD1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF165 30247 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 43992467 43992610 43992545 Y RNF165 NA NA NA NA NA RNF165 87695 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 44372138 44372406 44372272 Y RNF165,PIAS2 NA NA NA NA NA KATNAL2 123049 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 44675442 44676177 44675810 Y NA HDHD2,IER3IP1 NA NA NA NA HDHD2 551 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 45398335 45398609 45398472 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 56906 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 45529364 45529594 45529519 Y NA NA SMAD2,ZBTB7C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD2 73849 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr18 45530162 45530545 45530368 Y SMAD2,SMAD2 NA SMAD2,ZBTB7C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD2 74647 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 45687716 45687836 45687757 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232201 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr18 45688048 45688324 45688110 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232533 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr18 45915673 45915749 45915744 Y NA ZBTB7C NA NA NA NA ZBTB7C 19374 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 46066779 46067121 46067052 Y CTIF CTIF NA NA NA NA CTIF 3362 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr18 46074456 46074621 46074556 Y NA CTIF NA NA NA NA CTIF 11039 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 46254756 46255278 46254982 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 191339 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 46308878 46309205 46308934 Y NA NA NA NA NA NA SMAD7 165876 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 46375185 46375303 46375244 Y NA NA NA NA NA NA SMAD7 99778 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 46461141 46461770 46461393 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 13311 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr18 46473942 46474323 46474293 Y NA SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 758 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 46478230 46479206 46479122 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 3149 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 46520518 46520924 46520659 Y NA SMAD7 CTIF,SMAD7,DYM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD7 45437 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr18 46524155 46524830 46524741 Y NA SMAD7 CTIF,SMAD7,DYM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD7 49074 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 46739298 46739521 46739417 Y NA NA NA NA NA NA DYM 246196 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 47250062 47250416 47250239 Y NA NA ACAA2,SCARNA17,MYO5B,LIPG IMR90 Hi-C 24141950 ACAA2 87914 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 47834061 47834491 47834223 Y CCDC11,MBD1,MBD1 CCDC11,MBD1,CXXC1 CCDC11,CXXC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXXC1 21387 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 48541861 48541894 48541878 Y NA ELAC1,SMAD4 NA NA NA NA SMAD4 49451 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 48680027 48680136 48680067 Y MEX3C NA NA NA NA NA MEX3C 62538 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 51699489 51699550 51699520 Y NA MBD2 NA NA NA NA MBD2 49608 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 51883843 51884006 51883925 Y NA NA NA NA NA NA POLI 90069 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr18 53041931 53042230 53042160 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 287788 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr18 53060777 53060994 53060923 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 269024 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 53167517 53167871 53167822 Y TCF4 NA NA NA NA NA TCF4 162147 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 53180110 53180413 53180343 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 149605 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 55109141 55109496 55109318 Y ONECUT2 ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 8224 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 55255652 55255824 55255739 Y FECH FECH,NARS NA NA NA NA FECH 3648 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 55448232 55448442 55448350 Y NA ATP8B1 NA NA NA NA ATP8B1 19891 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr18 55474402 55474444 55474420 Y NA ATP8B1 ATP8B1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP8B1 6069 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 56159165 56159246 56159180 Y NA NA NA NA NA NA SNORD28 106617 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 56161690 56161866 56161857 Y MALT1 NA NA NA NA NA SNORD28 103997 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr18 56188177 56188434 56188359 Y MALT1 NA NA NA NA NA SNORD28 77429 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr18 56188664 56188776 56188720 Y NEDD4L NA NA NA NA NA SNORD28 77087 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr18 56193191 56193601 56193321 Y MALT1 NA NA NA NA NA SNORD28 72262 CAGE T98G hg19 FANTOM5 2.47145549586554 chr18 56212323 56212488 56212463 Y MALT1 NA NA NA NA NA SNORD28 53375 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr18 56248728 56248836 56248808 Y NA SNORD28,ALPK2 NA NA NA NA SNORD28 17027 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 56394566 56394962 56394680 Y MALT1 NA NA NA NA NA MALT1 57948 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 57566379 57566616 57566437 Y NA PMAIP1 NA NA NA NA PMAIP1 1199 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 60189219 60189514 60189362 Y TNFRSF11A,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 979 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 60193382 60194139 60194065 Y KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 5142 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr18 60598497 60598585 60598560 Y NA NA NA NA NA NA PHLPP1 217825 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 60877535 60878009 60877922 Y SERPINB12,BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 107352 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 60984165 60984609 60984519 Y BCL2 BCL2,KDSR NA NA NA NA BCL2 752 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 61033511 61033750 61033687 Y NA BCL2,KDSR NA NA NA NA KDSR 768 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr18 63434118 63434346 63434234 Y CDH7 NA NA NA NA NA DSEL 1747871 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 66405862 66406252 66406056 Y NA CCDC102B,TMX3 NA NA NA NA TMX3 25327 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 67957012 67957306 67957264 Y NA SOCS6 NA NA NA NA SOCS6 2875 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr18 68001159 68001386 68001197 Y NA SOCS6 NA NA NA NA SOCS6 47022 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 68004496 68004658 68004562 Y NA NA NA NA NA NA SOCS6 50359 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 68772419 68772586 68772499 Y NA NA NA NA NA NA SOCS6 818282 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 71819121 71819367 71819268 Y C18orf55 FBXO15,TIMM21 NA NA NA NA TIMM21 5375 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 72694471 72694659 72694499 Y ZNF407 NA NA NA NA NA ZADH2 224644 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 72782580 72783607 72783115 Y ZNF407,ZADH2,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 135696 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr18 72919988 72920296 72920123 Y ZADH2,TSHZ1 ZADH2,TSHZ1 NA NA NA NA TSHZ1 414 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 73944750 73944917 73944845 Y NA NA NA NA NA NA ZNF516 260229 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 74089053 74089202 74089130 Y NA NA NA NA NA NA ZNF516 115944 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 74171783 74172228 74172071 Y NA ZNF516,RP11-17M16.1 NA NA NA NA ZNF516 32918 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 74277239 74277430 74277301 Y NA NA NA NA NA NA RP11-17M16.1 71762 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr18 74277589 74278024 74277906 Y NA NA NA NA NA NA RP11-17M16.1 72112 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 74766602 74767022 74766743 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 234039 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr18 74767033 74767545 74767189 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 234470 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 74808374 74808713 74808562 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 275811 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 74814335 74814742 74814712 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 281772 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 74921028 74921148 74921053 Y MBP NA MBP IMR90 Hi-C 24141950 ZNF236 388465 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 75149077 75149342 75149210 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 616514 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr18 77153646 77154504 77153944 Y ATP9B,NFATC1,NFATC1 NA NA NA NA NA NFATC1 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 290136 290651 290316 Y RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C PPAP2C NA NA NA NA PPAP2C 743 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 555976 556322 556024 Y NA CDC34,BSG,HCN2 NA NA NA NA BSG 12975 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 567332 567750 567473 Y NA CDC34,BSG,HCN2 NA NA NA NA BSG 1547 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 662216 662510 662281 Y HMHA1,GZMM,C19orf6,C19orf22,ABCA7,RNF126 POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM NA NA NA NA RNF126 939 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 778993 779222 779048 Y GPX4,BSG,CNN2 PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 15853 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr19 782330 783005 782707 Y NA PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 12070 CAGE T98G hg19 FANTOM5 5.63491853057342 chr19 800594 800755 800691 Y NA PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA MIR4745 2185 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 823657 823956 823874 Y BSG,PRSS57,PTBP1,LPPR3,PRTN3,ELANE,AZU1 PTBP1,MIR4745,MIR3187,CFD NA NA NA NA MIR3187 12073 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr19 867005 867400 867203 Y GPX4,GPX4,C19orf24,ATP5D,ODF3L2,C19orf20,BSG,POLRMT,CNN2,CFD CFD,MED16,RNU6-9,R3HDM4 NA NA NA NA CFD 9552 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 888565 888780 888647 Y SBNO2,HMHA1,CIRBP,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7 CFD,MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A NA NA NA NA MED16 2438 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 1101850 1102062 1101942 Y C19orf6,MIDN,HMHA1,SBNO2,SBNO2 POLR2E NA NA NA NA GPX4 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 1161691 1161983 1161922 Y NA SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 10299 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 1169743 1170349 1170015 Y NA SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 1933 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.3840150776847 chr19 1172839 1173266 1172915 Y CFD,ATP5D,GPX4,GPX4 SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 557 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr19 1189532 1189666 1189566 Y NA SBNO2,STK11,C19orf26 NA NA NA NA STK11 2126 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 1214932 1215433 1215243 Y NA SBNO2,STK11,C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP NA NA NA NA C19orf26 20593 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 1240232 1240534 1240365 Y MUM1,APC2,C19orf26 C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA ATP5D 483 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 1252961 1253429 1253036 Y C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA CIRBP 3955 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 1260732 1261171 1260912 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA CIRBP 3348 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 1266359 1266798 1266589 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA C19orf24 6228 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr19 1400453 1400832 1400746 Y NA NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA GAMT 884 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 1408607 1408695 1408655 Y CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15 NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 3039 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr19 1445282 1445452 1445336 Y C19orf26,EFNA2,MUM1,APC2 GAMT,DAZAP1,RPS15,C19orf25,PCSK4,REEP6 NA NA NA NA RPS15 8924 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr19 1855247 1855761 1855485 Y SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3 ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3 NA NA NA NA KLF16 5806 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 1857160 1857480 1857446 Y NA ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3 NA NA NA NA KLF16 4087 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 1942393 1942508 1942451 Y OAZ1,DOT1L,C19orf35,MOBKL2A,MKNK2,REXO1,KLF16,CSNK1G2 SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2 NA NA NA NA CSNK1G2 3205 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 2049976 2050209 2050080 Y OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2 BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 733 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 2056461 2056895 2056707 Y OAZ1,C19orf35,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 7218 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 2059605 2060167 2060113 Y REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2 BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 10362 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr19 2061356 2061737 2061654 Y SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 12113 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr19 2095281 2095723 2095416 Y NA MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MOB3A 609 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 2168890 2169464 2169082 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 6426 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 2264561 2264657 2264590 Y TMPRSS9,SPPL2B SF3A2,PLEKHJ1,OAZ1,C19orf35 NA NA NA NA OAZ1 2828 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 2266489 2266732 2266611 Y NA SF3A2,PLEKHJ1,OAZ1,C19orf35 NA NA NA NA OAZ1 753 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 2494705 2495117 2494880 Y DOT1L,GADD45B LMNB2,GADD45B NA NA NA NA GADD45B 20585 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 2507206 2507458 2507335 Y DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B GADD45B NA NA NA NA GADD45B 33086 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 2540691 2541097 2540881 Y TIMM13 NA NA NA NA NA GADD45B 66571 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr19 2543618 2543970 2543682 Y DOT1L,GADD45B NA NA NA NA NA GADD45B 69498 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr19 2544084 2544261 2544159 Y NA NA NA NA NA NA GADD45B 69964 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 3035530 3035851 3035686 Y NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2 TLE2,AES NA NA NA NA TLE2 9782 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 3338656 3338812 3338733 Y NA NFIC ZNF77,CELF5,NFIC,DOHH,FZR1,C19orf77,C19orf29-AS1,GIPC3,TBXA2R,C19orf29,PIP5K1C,APBA3,MRPL54 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFIC 18749 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 3344211 3344472 3344340 Y TLE2,TLE2,TLE2,AES,GNA11,PIP5K1C,DOHH,DOHH,NFIC,NFIC NFIC NFIC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 NFIC 13089 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr19 3360183 3360356 3360294 Y TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 2622 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 3360896 3361804 3361247 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 3335 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 3367171 3367852 3367502 Y NFIC,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 9610 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 3369394 3369884 3369615 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 11833 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 3397236 3397600 3397594 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 39675 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 3398670 3398894 3398830 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 41109 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 3404656 3404792 3404728 Y TLE2,TLE2,PIP5K1C,ATCAY,NFIC,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 47095 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 3969049 3969183 3969116 Y NA SNORD37,EEF2,PIAS4 NA NA NA NA DAPK3 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 4089506 4089868 4089573 Y ZBTB7A ZBTB7A,MAP2K2 NA NA NA NA ZBTB7A 24563 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 4393849 4394251 4394129 Y NA SH3GL1,CHAF1A NA NA NA NA SH3GL1 4293 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 4456385 4456784 4456737 Y UBXN6,UBXN6 UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 566 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 4567148 4567365 4567215 Y TICAM1,SEMA6B NA NA NA NA NA TNFAIP8L1 70165 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 4575288 4575908 4575613 Y CCDC94,TICAM1,SEMA6B NA EBI3,CCDC94,ANKRD24,TNFAIP8L1,C19orf10 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP8L1 61622 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr19 4812881 4813376 4813265 Y SEMA6B,TICAM1 FEM1A,TICAM1 NA NA NA NA TICAM1 16340 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 4976440 4976890 4976638 Y TICAM1,KDM4B KDM4B NA NA NA NA KDM4B 9315 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.18629863801546 chr19 5968077 5968307 5968208 Y NA RANBP3 NA NA NA NA RANBP3 7846 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 6056849 6057757 6057360 Y DENND1C,SAFB2,SAFB,VMAC,RFX2 NA NA NA NA NA RANBP3 80696 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr19 6092440 6092966 6092758 Y RFX2 NA NA NA NA NA RFX2 104617 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 6108978 6109271 6109224 Y NA NA NA NA NA NA RFX2 88312 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 6271729 6272422 6272353 Y NDUFA11,MLLT1 MLLT1 NA NA NA NA MLLT1 5537 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr19 6273754 6274259 6273940 Y VAV1,GPR108,DENND1C,RFX2,MLLT1 MLLT1 NA NA NA NA MLLT1 3700 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr19 6528964 6529120 6528979 Y NA NA NA NA NA NA TNFSF9 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 6539979 6540238 6540076 Y NA TNFSF9 NA NA NA NA TNFSF9 10969 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 6587274 6587651 6587637 Y DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70 CD70 NA NA NA NA CD70 14463 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 6801116 6801467 6801221 Y SH2D3A,VAV1 NA NA NA NA NA TRIP10 65180 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 7197339 7197547 7197388 Y NA NA NA NA NA NA INSR 94498 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 7427436 7427895 7427614 Y ZNF557,XAB2,STXBP2,PNPLA6,LOC100131801,ARHGEF18 ARHGEF18 INSR,ARHGEF18,PNPLA6,MCOLN1,ZNF358,C19orf45,CD209,CLEC4G IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 30104 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 7563641 7563779 7563686 Y PCP2,EVI5L,C19orf45,PNPLA6,PNPLA6 PEX11G,ZNF358,MCOLN1,PNPLA6 NA NA NA NA PEX11G 3306 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 8488784 8489136 8488939 Y PRAM1,MYO1F RAB11B,MARCH2,HNRNPM NA NA NA NA MARCH2 12630 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 8635978 8636196 8636014 Y MARCH2,PRAM1,MYO1F ADAMTS10 NA NA NA NA ADAMTS10 37424 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 9748883 9749171 9749027 Y OR7D4,OR7E24,ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF177,ZNF177,ZNF426,ZNF846,OLFM2,ZNF562 ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF561 18808 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 9757386 9757713 9757550 Y NA ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 26063 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 9777343 9777681 9777659 Y ZNF559,ZNF559,ZNF177,ZNF846 ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 6095 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 10056236 10056512 10056406 Y ZNF846,COL5A3,OLFM2 NA NA NA NA NA PIN1 112303 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr19 10513154 10513331 10513243 Y ICAM1,DNM2,C19orf38,TYK2,PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 940 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 10515339 10515636 10515481 Y PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 3125 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr19 11202212 11202837 11202668 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 4174 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr19 11202963 11203178 11203054 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 4925 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 11205696 11206011 11205901 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 7658 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 11248443 11248964 11248826 Y NA SPC24 NA NA NA NA SPC24 15520 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 11253262 11253482 11253341 Y TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6 SPC24 NA NA NA NA SPC24 11002 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 11253991 11254271 11254206 Y PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6 SPC24 NA NA NA NA SPC24 10213 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 11592904 11593323 11593025 Y ZNF491,ZNF441,CCDC151,ELAVL3,ZNF653 PRKCSH,CCDC151,ZNF653,CTC-398G3.2,ECSIT NA NA NA NA ZNF653 21415 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 12404552 12404928 12404719 Y ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44 CTD-2666L21.3,ZNF44,ZNF563 NA NA NA NA ZNF44 850 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.48287329751932 chr19 12889371 12889726 12889619 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10584 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 12896870 12897372 12897198 Y ZNF44,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,STX10,LYL1,DNASE2,JUNB JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 2938 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 12899457 12901460 12900777 Y NA PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr19 13129050 13129163 13129107 Y MAST1,NFIX,CACNA1A NFIX NA NA NA NA NFIX 24628 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 13147424 13147812 13147700 Y WDR83,FBXW9,TNPO2,TNPO2 NFIX NA NA NA NA NFIX 43002 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 13164647 13164970 13164763 Y NA NA NA NA NA NA NFIX 60225 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 13166882 13167358 13167036 Y NA NA NA NA NA NA TRMT1 59023 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr19 13238145 13238217 13238180 Y NA TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA NACC1 11228 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.48287329751932 chr19 13267779 13268208 13267877 Y MAN2B1,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 8550 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 13273540 13274187 13273840 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 14311 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 13275397 13275802 13275486 Y NA TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 16168 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 13278382 13278991 13278445 Y BEST2,JUNB,LYL1,STX10 STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 19153 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr19 13743837 13744244 13743993 Y NA NA CACNA1A IMR90 Hi-C 24141950 CCDC130 96330 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 13855893 13856042 13855968 Y NA CCDC130,MRI1,C19orf53,ZSWIM4 MRI1,C19orf53 K562 ChIA-PET 22265404 CCDC130 15319 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 13957204 13959386 13957586 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM4 52930 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr19 13972364 13973309 13972780 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4 CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 41705 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 14249278 14249642 14249460 Y NA SAMD1,PRKACA,ASF1B NA NA NA NA ASF1B 3510 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 14528800 14529217 14529142 Y ZNF333,EMR2,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,CD97,DDX39A CD97,DDX39A,PKN1 NA NA NA NA DDX39A 608 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 14545997 14546246 14546106 Y NA DDX39A,PKN1 NA NA NA NA PKN1 4132 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 14616908 14617174 14617017 Y GIPC1 GIPC1,TECR,DNAJB1 GIPC1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TECR 8723 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr19 14636614 14636887 14636775 Y OR7C2 GIPC1,TECR,DNAJB1,NDUFB7 NA NA NA NA DNAJB1 1695 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 14732511 14733275 14733016 Y SYDE1 NA NA NA NA NA NDUFB7 51637 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 15334094 15334476 15334286 Y SLC1A6,WIZ NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 24302 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 15492858 15492952 15492905 Y NA AKAP8,AKAP8L NA NA NA NA AKAP8 4249 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 15947617 15948119 15947980 Y AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1 NA NA NA NA NA CYP4F24P 58898 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 16181046 16181841 16181607 Y OR10H2,OR10H3,OR10H4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 5215 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 16188924 16190024 16189835 Y TPM4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 13093 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.28515685785008 chr19 16205409 16205807 16205414 Y EPS15L1,RAB8A,HSH2D TPM4,RAB8A NA NA NA NA RAB8A 14632 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 16453203 16453340 16453316 Y NWD1,MED26,KLF2 KLF2 NA NA NA NA KLF2 19575 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 17190539 17191239 17190954 Y HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 5948 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr19 17200078 17200517 17200217 Y MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 15487 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 17200566 17201240 17200825 Y MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 15975 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 17246297 17246722 17246423 Y SLC27A1,PGLS,OCEL1,MYO9B NA NA NA NA NA MYO9B 61706 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr19 17791017 17791370 17791235 Y MAP1S,IFI30,ARRDC2,ARRDC2 MAP1S NA NA NA NA MAP1S 36681 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 18125171 18125343 18125265 Y FCHO1,JAK3,JUND,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1 NA NA NA NA NA MAST3 81260 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 18133045 18133309 18133130 Y FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2 NA NA NA NA NA MAST3 73294 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr19 18155923 18156099 18156029 Y NA NA NA NA NA NA MAST3 50504 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 18315989 18316123 18316056 Y NA IFI30,MPV17L2,RAB3A NA NA NA NA RAB3A 3105 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 18393747 18393881 18393780 Y NA KIAA1683,JUND,LSM4 NA NA NA NA JUND 3315 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 18414244 18414595 18414365 Y NA KIAA1683,JUND,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 17489 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr19 18415031 18416060 18415513 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND KIAA1683,JUND,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 16024 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr19 18439179 18439536 18439334 Y NA JUND,LSM4,PGPEP1,GDF15 PGPEP1 K562 ChIA-PET 22265404 LSM4 7095 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 18485152 18485556 18485412 Y ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25 PGPEP1,GDF15,SSBP4 NA NA NA NA GDF15 1611 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 18497624 18497977 18497708 Y PDE4C,GDF15 PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA GDF15 14083 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr19 18526337 18526644 18526408 Y CCDC124,IFI30,KLHL26,CRLF1,C19orf60,C19orf50,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 1030 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr19 18527701 18528040 18527800 Y KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 27 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr19 18528263 18528792 18528577 Y UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 589 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 18589714 18590055 18589946 Y UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,ELL,LRRC25 ISYNA1,ELL NA NA NA NA ELL 40882 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 18590516 18590939 18590817 Y ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25 ISYNA1,ELL NA NA NA NA ELL 39998 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 18614213 18614397 18614285 Y IL12RB1,JUND,LRRC25,ELL ELL,FKBP8 NA NA NA NA ELL 16540 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 18625662 18626077 18625893 Y UPF1,IL12RB1,IFI30,JUND,LRRC25,KLHL26,UBA52,FKBP8,ELL ELL,FKBP8,KXD1 NA NA NA NA ELL 4860 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 18631384 18632027 18631497 Y ELL ELL,FKBP8,KXD1,UBA52 NA NA NA NA ELL 447 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 19083211 19083621 19083297 Y ELL,RFXANK,MAU2,GATAD2A,HOMER3,HOMER3,HOMER3,HOMER3 HOMER3 NA NA NA NA HOMER3 33141 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 19143307 19143510 19143378 Y DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6 ARMC6,SUGP2,SLC25A42 NA NA NA NA SUGP2 475 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 19600012 19600395 19600260 Y RFXANK,MAU2,GATAD2A,PBX4,GMIP NDUFA13,TSSK6,YJEFN3 NA NA NA NA NDUFA13 24150 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 19977247 19977754 19977315 Y PBX4,LPAR2,ZNF101,ZNF14,ZNF682,ZNF682,ZNF506,ZNF253 ZNF506,ZNF253,ZNF93 NA NA NA NA ZNF253 2552 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 20747496 20747853 20747738 Y NA ZNF737 NA NA NA NA ZNF737 881 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 21678211 21678382 21678297 Y ZNF430,ZNF100,ZNF429 ZNF429 NA NA NA NA ZNF429 727 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 21689202 21689645 21689487 Y ZNF430,ZNF708,ZNF493,ZNF100,ZNF429 ZNF429 NA NA NA NA ZNF429 11718 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 23732304 23732710 23732386 Y NA NA NA NA NA NA ZNF675 135312 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.77944795702319 chr19 28208615 28209033 28208726 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1493415 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 28232492 28232748 28232631 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1469700 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 28234447 28234748 28234598 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1467700 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 28242746 28243185 28242855 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1459263 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 28265126 28266155 28265940 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1436293 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr19 28270762 28271411 28271062 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1431037 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 28274249 28275061 28274473 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1427387 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 28463343 28463461 28463402 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1238987 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 30157267 30157499 30157417 Y PLEKHF1,C19orf12,C19orf12 PLEKHF1,C19orf12 NA NA NA NA PLEKHF1 3304 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr19 30336581 30336824 30336781 Y C19orf2,C19orf2 CCNE1 NA NA NA NA CCNE1 35776 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 30447917 30448294 30448014 Y NA URI1 NA NA NA NA URI1 35366 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 31705006 31705320 31705186 Y NA NA TSHZ3 IMR90 Hi-C 24141950 TSHZ3 133133 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 32866000 32866258 32866129 Y NA ZNF507,DPY19L3 NA NA NA NA DPY19L3 28191 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 34396925 34397389 34397012 Y NA NA KCTD15 MCF7 ChIA-PET 22265404 KCTD15 112087 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 34850085 34850642 34850351 Y ZNF599,ZNF302,ZNF181 GPI,PDCD2L NA NA NA NA GPI 1700 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr19 35600610 35600880 35600779 Y MAG,ZNF302,ZNF181,ZNF30,SCN1B,HPN,LGI4,FXYD7,FXYD1 FXYD7,FXYD5 LOC100128675 K562 ChIA-PET 22265404 FXYD7 31274 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 35809679 35810380 35810036 Y GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,IGFLR1,FFAR3 NA NA NA NA NA USF2 51798 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr19 35810927 35811613 35811484 Y GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,FFAR3 NA NA NA NA NA USF2 53046 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 36202440 36202452 36202444 Y CD22,FFAR1,NFKBID,ZBTB32,U2AF1L4 IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37,HSPB6,C19orf55 NA NA NA NA IGFLR1 28902 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 36519340 36519516 36519376 Y ZNF565 SDHAF1,ALKBH6,CLIP3,THAP8,WDR62 NA NA NA NA CLIP3 2729 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 36648389 36648571 36648491 Y NA TBCB,POLR2I,CAPNS1 NA NA NA NA CAPNS1 19912 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 36666444 36666524 36666464 Y NA CAPNS1,ZNF146 NA NA NA NA ZNF146 36980 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 36882143 36882391 36882267 Y NA ZFP14,ZFP82 NA NA NA NA ZFP14 14042 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 37822125 37822150 37822138 Y NA HKR1,ZNF527 NA NA NA NA HKR1 20386 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 38433320 38433698 38433507 Y ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1 SIPA1L3 NA NA NA NA SIPA1L3 37452 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 39184148 39184440 39184342 Y C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 47859 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr19 39453898 39453904 39453901 Y NA MRPS12,SARS2,FBXO17 NA NA NA NA FBXO17 10646 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 39479991 39480220 39480106 Y NA SARS2,FBXO17,FBXO27 FBXO17 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO17 15441 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 39831946 39832143 39832027 Y NA GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29 NA NA NA NA SAMD4B 910 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 39863077 39863463 39863179 Y NA GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2 NA NA NA NA PAF1 16372 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 39921308 39921946 39921495 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H,TIMM50 NA NA NA NA RPS16 2642 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 40696507 40696680 40696594 Y SERTAD1 MAP3K10 NA NA NA NA MAP3K10 856 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 40923099 40923282 40923196 Y SHKBP1,EGLN2,EGLN2,C19orf54 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB NA NA NA NA PRX 5826 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 40939716 40940068 40940022 Y SERTAD1 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB NA NA NA NA SERTAD3 8544 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 40942693 40943017 40942855 Y NA PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB NA NA NA NA SERTAD3 5595 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 40951707 40952008 40951966 Y NA PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB NA NA NA NA SERTAD3 3095 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 40969437 40969789 40969613 Y BLVRB SERTAD1,SERTAD3 NA NA NA NA BLVRB 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 41108162 41108528 41108432 Y NA SHKBP1,LTBP4 NA NA NA NA LTBP4 11373 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 41109606 41110134 41110046 Y SERTAD1,ITPKC,EGLN2,EGLN2,C19orf54,ADCK4,SHKBP1 SHKBP1,LTBP4 NA NA NA NA LTBP4 12817 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 41152132 41152466 41152220 Y NA NUMBL NA NA NA NA NUMBL 42411 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 41304071 41304255 41304136 Y SERTAD1,SERTAD3,SHKBP1,ADCK4,ADCK4,RAB4B,HNRNPUL1 SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2 NA NA NA NA EGLN2 1170 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 41681944 41682199 41682187 Y NA RPL36P16,CYP2S1,AXL CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8 IMR90 Hi-C 24141950 RPL36P16 8178 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr19 41729438 41729579 41729517 Y ATP5SL,ATP5SL,AXL CYP2S1,AXL,HNRNPUL1 NA NA NA NA AXL 6330 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 41731541 41731893 41731762 Y NA CYP2S1,AXL,HNRNPUL1 NA NA NA NA AXL 8433 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr19 41771602 41771660 41771636 Y CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1 AXL,HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA HNRNPUL1 5201 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 41795419 41795640 41795447 Y CYP2A13,B9D2,HNRNPUL1 HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA CCDC97 18454 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr19 41803374 41803837 41803699 Y B9D2,HNRNPUL1 HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA CCDC97 10257 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 41804006 41804567 41804366 Y TGFB1,B9D2,HNRNPUL1 HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA CCDC97 9527 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 41814398 41814719 41814610 Y HNRNPUL1,TMEM91,TGFB1,CCDC97,B9D2 HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1 NA NA NA NA CCDC97 304 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 41827649 41828097 41827915 Y HNRNPUL1,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 NA NA NA NA CCDC97 13555 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 41831643 41832527 41831971 Y CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA CCDC97 17549 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 42028325 42028365 42028354 Y NA NA CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 83703 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 42037922 42038313 42037990 Y CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1 NA LOC100505495 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 93300 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr19 42419916 42420316 42420067 Y ZNF574,GRIK5,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1 ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA ARHGEF1 34688 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 42429105 42429824 42429205 Y DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1 ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 31718 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 42432096 42432209 42432128 Y NA ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 29333 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 42514619 42514744 42514681 Y ATP1A3 ATP1A3 NA NA NA NA ATP1A3 14970 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr19 42693167 42693275 42693248 Y NA DEDD2,ZNF526 NA NA NA NA DEDD2 29017 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 42756581 42756634 42756608 Y ATP1A3,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3 NA NA NA NA ERF 675 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 42772295 42772768 42772477 Y NA ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 1606 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr19 42772804 42773312 42773020 Y CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 2115 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr19 42774379 42774759 42774668 Y CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 3690 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr19 42775992 42776735 42776352 Y NA GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 NA NA NA NA CIC 5303 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 42784087 42784212 42784170 Y CEACAM8,CEACAM3,DEDD2 GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13398 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 42784527 42784991 42784716 Y ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13838 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.3840150776847 chr19 42902919 42903213 42903066 Y TMEM145 NA CNFN MCF7 ChIA-PET 22265404 MEGF8 75158 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 44066872 44067293 44067141 Y ZNF230,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61,IRGQ ZNF575,ETHE1,XRCC1,IRGQ,ZNF576,SRRM5 NA NA NA NA XRCC1 15332 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 44288540 44288860 44288798 Y NA SMG9,KCNN4,ZNF283 NA NA NA NA KCNN4 5131 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 44711538 44711905 44711597 Y NA ZNF226,ZNF227 NA NA NA NA ZNF227 1838 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr19 45221919 45222313 45222185 Y NA BCL3 NA NA NA NA BCL3 26649 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr19 45240026 45240191 45240078 Y RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3 BCL3 BCL3 K562 ChIA-PET 22265404 BCL3 8771 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 45248499 45249479 45248793 Y NA NA NA NA NA NA BCL3 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 45256546 45257099 45256742 Y ZNF296,RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3 BCL3 NA NA NA NA BCL3 7584 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 45350775 45351289 45350997 Y BCL3,PVRL2,RELB BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 3343 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.28515685785008 chr19 45352951 45353140 45353112 Y NA BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 5519 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 45393623 45393866 45393750 Y ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40 PVRL2,TOMM40,APOE NA NA NA NA TOMM40 1797 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr19 45584780 45584791 45584786 Y CEACAM16,NKPD1 CLASRP,GEMIN7,MARK4,PPP1R37 NA NA NA NA MARK4 4234 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 45755637 45756189 45755812 Y RELB,CLASRP,VASP NA NA NA NA NA BLOC1S3 75634 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 45946690 45947113 45946759 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22140 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 45953764 45954783 45954182 Y NA CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 14470 CAGE T98G hg19 FANTOM5 2.47145549586554 chr19 45959420 45959846 45959631 Y GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP FOSB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 9407 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 45980345 45980732 45980359 Y GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP NA NA NA NA ERCC1 259 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr19 46011701 46012269 46011904 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP NA NA NA NA VASP 3864 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 46012498 46012899 46012640 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP NA NA NA NA VASP 4661 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 46877153 46877367 46877269 Y NA PPP5C NA NA NA NA PPP5C 28902 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr19 47033456 47033629 47033471 Y NA GAPDHP38 NA NA NA NA GAPDHP38 26269 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 47142195 47142976 47142503 Y NA CALM3,DACT3 NA NA NA NA DACT3 19419 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 47269374 47269772 47269575 Y LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5 FKRP,STRN4,SLC1A5 NA NA NA NA SLC1A5 20079 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 47363167 47364689 47363471 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 AP2S1 SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 10918 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr19 47367294 47367354 47367334 Y NA AP2S1 SLC1A5,ARHGAP35,ZC3H4 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 15045 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 47610820 47611121 47611012 Y NA SAE1,ZC3H4 TMEM160,NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 SAE1 3410 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 47662714 47662828 47662771 Y NA SAE1,ZC3H4 NA NA NA NA ZC3H4 47705 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 47729030 47729228 47729064 Y NA BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA BBC3 4795 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 47742856 47743228 47743000 Y NA BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA BBC3 8833 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 47744387 47744529 47744512 Y SLC8A2 BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA BBC3 10364 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 47746329 47746738 47746506 Y SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24 BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA CCDC9 10499 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 47776748 47776969 47776841 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1 BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA PRR24 606 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.3840150776847 chr19 47792934 47793257 47793053 Y NA CCDC9,PRR24 NA NA NA NA PRR24 16792 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 48016024 48016351 48016088 Y SULT2A1,CCDC9,GPR77,DHX34,NAPA SLC8A2,KPTN,NAPA NA NA NA NA NAPA 146 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr19 48101913 48102072 48101991 Y NA NA SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAPA 85416 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr19 48103581 48103982 48103689 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA GLTSCR1,NAPA MCF7 ChIA-PET 22265404 NAPA 87084 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr19 48494541 48494691 48494555 Y ELSPBP1,BSPH1 ELSPBP1 NA NA NA NA ELSPBP1 1217 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr19 48996099 48996379 48996219 Y NA GRWD1,CYTH2 NA NA NA NA CYTH2 25810 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 49092091 49092636 49092297 Y BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11 SPHK2,RPL18,DBP NA NA NA NA SPHK2 27912 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr19 49386525 49386775 49386581 Y CD37,PPP1R15A HSD17B14,PLEKHA4,PPP1R15A,NUCB1,DHDH NA NA NA NA PPP1R15A 12876 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr19 49466802 49467527 49467169 Y IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA FTL 244 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr19 49495555 49495708 49495609 Y SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4 BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 850 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr19 49521043 49521282 49521101 Y NA GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 26338 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 49896315 49896677 49896489 Y BCL2L12 TEAD2 NA NA NA NA TEAD2 32601 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 49924099 49924476 49924276 Y TBC1D17,RRAS,RCN3,PRR12,NOSIP,AP2A1 ALDH16A1,PIH1D1 NA NA NA NA ALDH16A1 29950 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 50141205 50141513 50141452 Y AKT1S1,TRPM4,RCN3,AP2A1,RRAS NOSIP,PRR12,SCAF1,BCL2L12,IRF3,PRMT1 NA NA NA NA RRAS 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 50205874 50206272 50205974 Y NA BCL2L12,IRF3,PRMT1,CPT1C NA NA NA NA CPT1C 13719 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr19 50872495 50872846 50872654 Y NA NR1H2,POLD1 NA NA NA NA POLD1 12615 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 51010284 51010518 51010437 Y KLK4,ACPT,SYT3,SHANK1,LOC342918 JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 2092 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 51012062 51012382 51012222 Y KLK6,SYT3,SHANK1 JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 228 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 51197974 51198378 51198356 Y NA CLEC11A NA NA NA NA CLEC11A 26208 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 51287900 51288107 51288100 Y NA C19orf48 NA NA NA NA C19orf48 18079 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr19 51898753 51899047 51898851 Y SIGLEC9,CD33,FPR2,SIGLEC14,SIGLEC10,FPR3,FPR2,FPR1 ETFB NA NA NA NA ETFB 31081 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 52154810 52155171 52154887 Y ZNF350,CD33,FPR2,FPR1,SIGLEC14 MIRLET7E SIGLEC10,LOC100129083,CEACAM18,SIGLEC6,ZNF175,FLJ30403,SIGLEC5,FPR1 IMR90 Hi-C 24141950 MIRLET7E 38868 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 52192085 52192767 52192400 Y ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577 MIRLET7E NA NA NA NA MIRLET7E 1272 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr19 52194056 52194504 52194155 Y ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1 MIRLET7E NA NA NA NA MIRLET7E 17 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 52194594 52195259 52195000 Y ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1 MIRLET7E NA NA NA NA MIRLET7E 555 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr19 52641935 52642117 52642107 Y ZNF649,ZNF610,ZNF528,ZNF836,ZNF616 ZNF432,ZNF841,ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A NA NA NA NA ZNF616 760 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 52697339 52697517 52697506 Y ZNF350,ZNF432,ZNF836,ZNF83,ZNF808,ZNF766 ZNF836,PPP2R1A NA NA NA NA PPP2R1A 6047 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 53150651 53150972 53150733 Y NA ZNF83 ZNF137P IMR90 Hi-C 24141950 ZNF83 40777 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 53237186 53237523 53237297 Y ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611 ZNF83,ZNF611 NA NA NA NA ZNF611 860 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 53425304 53425713 53425359 Y ERVV-1,ZNF320 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 18141 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 53426305 53426488 53426354 Y ZNF765,ZNF468,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 17366 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr19 53444729 53445104 53444918 Y ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 875 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 53727403 53727861 53727738 Y NA ZNF665 NA NA NA NA ZNF665 32764 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr19 54373735 54373974 54373935 Y VSTM1,TFPT,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,CNOT3,ZNF765,ZNF761,ZNF813,NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM MYADM,AC008753.6 NA NA NA NA AC008753.6 3374 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 54465243 54465494 54465291 Y TFPT,PRPF31,NDUFA3,MYADM,CACNG7,CACNG8 NA NA NA NA NA AC008753.6 94882 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr19 54523388 54523781 54523608 Y TARM1,VSTM1,RPS9,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LENG8,LAIR2,LAIR1,ZNF331,ZNF331,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM NA NA NA NA NA OSCAR 80219 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 54713468 54714085 54713942 Y NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,TARM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6 MBOAT7,TSEN34,RPS9 NA NA NA NA RPS9 10858 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 54714720 54715094 54714879 Y NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6 MBOAT7,TSEN34,RPS9 NA NA NA NA RPS9 12110 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 55540419 55540558 55540460 Y SHISA7,KIR2DL3,NCR1 RDH13 NA NA NA NA RDH13 40101 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 55619280 55619321 55619308 Y NA RDH13,PPP1R12C,TNNT1 NA NA NA NA PPP1R12C 7606 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 55627475 55627790 55627718 Y LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C RDH13,PPP1R12C,TNNT1 NA NA NA NA PPP1R12C 548 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr19 55885541 55885905 55885786 Y NA SUV420H2,TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA TMEM238 8061 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 55958750 55959125 55958938 Y SYT5,BRSK1,COX6B2,FAM71E2,SHISA7 UBE2S,ISOC2,ZNF628,NAT14 NA NA NA NA ISOC2 12585 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 55983917 55984059 55984005 Y RDH13,HSPBP1,ISOC2 ISOC2,ZNF628,NAT14 ZNF628,ISOC2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF628 1640 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 55985101 55985287 55985184 Y ISOC2,SSC5D ISOC2,ZNF628,NAT14 NA NA NA NA ZNF628 412 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 4872 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.3840150776847 chr19 56118803 56119132 56118967 Y COX6B2 ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 7467 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 56218548 56218666 56218607 Y SUV420H2,NLRP9,U2AF2 EPN1 NA NA NA NA EPN1 33956 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 56623049 56623274 56623140 Y NA ZNF787,ZNF444 NA NA NA NA ZNF787 7375 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 56833034 56833496 56833435 Y ZSCAN5A ZNF542,ZSCAN5A NA NA NA NA ZNF542 43972 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 57020241 57020583 57020445 Y ZNF582,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF835,ZIM2,PEG3,PEG3,LOC147670,ZNF471,ZNF71,ZNF470,ZFP28 ZNF667-AS1,ZNF667,ZNF471 NA NA NA NA ZNF471 3029 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr19 57965552 57965851 57965609 Y NA ZNF17,ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773 NA NA NA NA ZNF749 20855 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 58315114 58315751 58315446 Y ZNF543,ZNF549,ZNF418,ZNF135,ZNF154,ZNF552 ZNF586,ZNF552,ZNF587 NA NA NA NA ZNF552 8530 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr19 58501905 58502197 58501915 Y ZNF8,ZNF132,ZNF773,ZNF549,ZNF550,ZNF416,ZIK1,ZNF134,ZSCAN4,ZNF154,ZNF671,ZNF776,ZNF814,ZNF417,ZNF418,ZSCAN18,ZNF329,ZNF256,ZSCAN1,ZNF606,ZNF135 ZNF256,CTD-2368P22.1,ZNF606 NA NA NA NA CTD-2368P22.1 9232 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 58557282 58557656 58557471 Y NA CTD-2368P22.1,ZNF606 NA NA NA NA ZNF606 44565 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 58742086 58742094 58742090 Y NA ZNF274,ZNF544,ZNF8 NA NA NA NA ZNF544 4126 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 58911739 58912056 58911822 Y NA A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 868 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE T98G hg19 FANTOM5 2.37259727603091 chr19 59058033 59058475 59058195 Y NA SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752 NA NA NA NA TRIM28 4575 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr19 59087419 59087864 59087514 Y NA ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752 NA NA NA NA MGC2752 3527 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 289560 289860 289743 Y SH3YL1,FAM150B ACP1 NA NA NA NA ACP1 27420 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 314323 314661 314512 Y NA NA SNTG2 IMR90 Hi-C 24141950 ACP1 52183 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 393939 394227 394175 Y SH3YL1 NA NA NA NA NA ACP1 131799 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 1725053 1725311 1725239 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 21313 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 1725652 1725860 1725698 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 20764 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 2686059 2686257 2686158 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 693396 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 3340825 3341028 3341010 Y NA TSSC1,TRAPPC12 NA NA NA NA TSSC1 38625 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 3483837 3484086 3483869 Y NA ADI1 NA NA NA NA ADI1 37421 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 3583560 3583858 3583796 Y NA AC108488.4,RNASEH1-AS1,RNASEH1,RPS7 NA NA NA NA AC108488.4 1097 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 7191649 7191931 7191786 Y RNF144A NA NA NA NA NA RNF144A 136126 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 9427801 9428115 9428020 Y YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2 NA NA NA NA NA ASAP2 82907 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr2 9428594 9428712 9428653 Y NA NA NA NA NA NA ASAP2 83700 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 9678248 9678641 9678477 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 15280 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 9686288 9686554 9686518 Y NA ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 7367 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 9705660 9705808 9705714 Y NA ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 11739 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 9815627 9815977 9815711 Y NA YWHAQ,RP11-521D12.1 NA NA NA NA RP11-521D12.1 38726 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 10075100 10075410 10075131 Y TAF1B GRHL1 GRHL1 IMR90 Hi-C 24141950 GRHL1 7931 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 10260365 10260994 10260486 Y ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2 CYS1 NA NA NA NA RRM2 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr2 10418251 10419155 10418675 Y NA HPCAL1 RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HPCAL1 21860 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 10423423 10423670 10423576 Y NA HPCAL1 RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HPCAL1 17345 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 10501440 10501782 10501611 Y C2orf48 NA NA NA NA NA HPCAL1 60425 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 10540655 10540950 10540779 Y KLF11,KLF11,HPCAL1 ODC1 NA NA NA NA ODC1 45680 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 10550434 10550795 10550555 Y HPCAL1,HPCAL1 ODC1 ODC1 IMR90 Hi-C 24141950 ODC1 35835 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr2 11072089 11072388 11072239 Y NA NA NA NA NA NA PDIA6 95986 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 11352501 11352895 11352887 Y NA NA NA NA NA NA PQLC3 59177 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 11483029 11483376 11483266 Y NA ROCK2 NA NA NA NA ROCK2 3080 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 11514785 11514933 11514926 Y NA ROCK2 ROCK2,E2F6,PQLC3,PDIA6,C2orf50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ROCK2 28329 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 11884050 11884543 11884432 Y NA NA NA NA NA NA AC106875.1 64464 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 11893649 11894247 11893895 Y LPIN1 NA NA NA NA NA AC106875.1 74063 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 11970136 11970284 11970210 Y NA AC096559.1 NA NA NA NA AC096559.1 16464 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 11970305 11970612 11970555 Y NA AC096559.1 NA NA NA NA AC096559.1 16136 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 12308947 12309431 12309189 Y LPIN1 NA TRIB2,LOC100506474 IMR90 Hi-C 24141950 AC096559.1 322199 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 12309855 12310149 12310048 Y LPIN1 NA TRIB2,LOC100506474 IMR90 Hi-C 24141950 AC096559.1 323107 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 12856062 12856442 12856137 Y NA TRIB2 NA NA NA NA TRIB2 1047 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr2 15199994 15200355 15200088 Y NA NA NA NA NA NA FAM84A 429184 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 15561739 15562014 15561765 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 137440 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 15570627 15571117 15570982 Y DDX1,NBAS NA NA NA NA NA NBAS 128337 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 16639581 16639836 16639709 Y NA NA NA NA NA NA FAM49A 205763 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 19340591 19340734 19340664 Y OSR1 NA OSR1,MIR4757 IMR90 Hi-C 24141950 OSR1 215680 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 19811541 19811934 19811810 Y NA NA NA NA NA NA OSR1 255127 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 19985229 19985530 19985434 Y NA NA NA NA NA NA TTC32 114217 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 19986322 19986559 19986384 Y TTC32 NA NA NA NA NA TTC32 113188 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 20252703 20252899 20252848 Y NA MATN3,LAPTM4A NA NA NA NA LAPTM4A 2914 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 20432677 20432919 20432791 Y SDC1,SDC1 SDC1 NA NA NA NA SDC1 9483 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 20778645 20778883 20778839 Y NA NA HS1BP3,RHOB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HS1BP3 69966 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 20779015 20779511 20779185 Y NA NA HS1BP3,RHOB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HS1BP3 69338 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 20784084 20784557 20784460 Y NA NA HS1BP3,RHOB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HS1BP3 64292 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 20795868 20796230 20795893 Y RHOB,HS1BP3 NA HS1BP3,RHOB,PUM2 IMR90 Hi-C 24141950 HS1BP3 52619 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 20965440 20965780 20965672 Y NA NA NA NA NA NA C2orf43 55102 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 23901919 23902357 23902230 Y UBXN2A NA NA NA NA NA ATAD2B 245627 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 24491623 24491942 24491630 Y ATAD2B,NCOA1,ITSN2 NA NA NA NA NA ITSN2 89641 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 24713346 24713697 24713476 Y DNAJC27,ITSN2 NA CENPO,NCOA1 IMR90 Hi-C 24141950 ITSN2 131763 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 24941895 24942247 24942153 Y NCOA1 NA NA NA NA NA CENPO 71758 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 24944371 24944796 24944454 Y NA NA NA NA NA NA CENPO 69209 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 25502146 25502454 25502309 Y DNAJC27 NA NA NA NA NA DNMT3A 61005 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 26220678 26220902 26220866 Y RAB10 KIF3C,RAB10 ASXL2,RAB10,FAM59B,KIF3C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIF3C 17060 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 26241064 26241266 26241191 Y RAB10 KIF3C,RAB10 ASXL2,RAB10,FAM59B,HADHB,KIF3C,HADHA IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB10 13710 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 26521727 26522029 26521734 Y NA EPT1,GPR113 NA NA NA NA EPT1 7386 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 26522632 26522929 26522714 Y NA EPT1,GPR113 NA NA NA NA EPT1 6486 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr2 27005355 27005756 27005547 Y NA CENPA NA NA NA NA CENPA 20198 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 27304052 27304486 27304234 Y CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1 AGBL5,OST4,EMILIN1,KHK,ABHD1 NA NA NA NA KHK 3129 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 27574731 27574755 27574743 Y NA MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3 NA NA NA NA AC074117.10 2358 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 27631105 27631216 27631160 Y C2orf16 EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1 NA NA NA NA PPM1G 551 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 28003613 28003725 28003670 Y NA MRPL33 NA NA NA NA MRPL33 11029 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 28021914 28022357 28022176 Y RBKS MRPL33 NA NA NA NA MRPL33 29330 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr2 28183212 28183402 28183309 Y FOSL2 NA NA NA NA NA RBKS 71247 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 28215985 28216067 28216026 Y NA NA NA NA NA NA RBKS 104020 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 28492228 28492339 28492284 Y NA NA NA NA NA NA FOSL2 120976 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 28492364 28492732 28492561 Y NA NA NA NA NA NA FOSL2 120583 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 28579030 28579220 28579083 Y RBKS,FOSL2 FOSL2,AC104695.3 NA NA NA NA FOSL2 34095 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 28583371 28583537 28583468 Y RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 FOSL2,AC104695.3 SLC4A1AP,MRPL33,RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2 IMR90 Hi-C 24141950 FOSL2 29778 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 28583784 28584228 28583975 Y RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 FOSL2,AC104695.3 SLC4A1AP,MRPL33,RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2 IMR90 Hi-C 24141950 FOSL2 29087 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 28632075 28632521 28632225 Y PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 FOSL2,AC104695.3 NA NA NA NA AC104695.3 16536 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 28653761 28654131 28653949 Y PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 FOSL2,AC104695.3 NA NA NA NA AC104695.3 38222 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 28668874 28669088 28668964 Y PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 NA BRE,RBKS,PLB1 IMR90 Hi-C 24141950 AC104695.3 53335 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 28976141 28976573 28976382 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B PPP1CB SPDYA IMR90 Hi-C 24141950 PPP1CB 3635 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 29055098 29055343 29055221 Y SPDYA TRMT61B NA NA NA NA TRMT61B 35824 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 29060448 29060640 29060540 Y PPP1CB,PPP1CB TRMT61B NA NA NA NA TRMT61B 30527 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 29075660 29075992 29075826 Y TRMT61B TRMT61B,WDR43 NA NA NA NA TRMT61B 15175 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 29173330 29173730 29173529 Y PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43 NA NA NA NA NA WDR43 57821 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 29331222 29331429 29331307 Y NA CLIP4 CLIP4 MCF7 ChIA-PET 22265404 CLIP4 12651 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr2 29339148 29339698 29339489 Y NA CLIP4 NA NA NA NA CLIP4 20577 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 29349196 29349466 29349333 Y NA CLIP4 NA NA NA NA CLIP4 30625 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 29439591 29440302 29440265 Y NA NA NA NA NA NA CLIP4 121020 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 30448125 30448425 30448217 Y YPEL5,LBH LBH LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LBH 3972 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 30458307 30458498 30458425 Y YPEL5,LBH LBH NA NA NA NA LBH 5910 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 30631915 30632243 30632028 Y LBH LCLAT1 LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LCLAT1 35849 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 30807812 30808169 30807846 Y NA NA NA NA NA NA LCLAT1 139720 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 30850038 30850385 30850172 Y NA NA NA NA NA NA LCLAT1 181946 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 30887906 30888094 30887998 Y NA NA NA NA NA NA LCLAT1 219814 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 33435749 33436022 33435923 Y FAM98A,LTBP1 NA NA NA NA NA RASGRP3 223369 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 36584242 36585529 36584872 Y FEZ2,CRIM1 CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 3173 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.18629863801546 chr2 36603527 36603925 36603600 Y NA CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 22458 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 36688353 36688868 36688635 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 107284 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 36713753 36714120 36713762 Y CRIM1,VIT,FEZ2 NA NA NA NA NA CRIM1 132684 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 36761840 36762400 36762263 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 108830 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 36790527 36791707 36791646 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 79523 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 36791809 36792197 36792002 Y CRIM1 NA NA NA NA NA FEZ2 79033 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 37103475 37103824 37103655 Y NA NA NA NA NA NA STRN 87791 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 37489254 37489354 37489306 Y NA CEBPZ NA NA NA NA CEBPZ 32398 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 37603882 37604154 37604086 Y QPCT QPCT NA NA NA NA QPCT 34165 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 37797953 37798358 37798079 Y EIF2AK2,CDC42EP3 NA CDC42EP3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 165253 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 37847073 37847432 37847190 Y EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 116179 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 37858321 37858709 37858681 Y EIF2AK2,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 104902 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr2 37868257 37868517 37868387 Y EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 95094 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 37879485 37879782 37879514 Y EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 83829 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 37880894 37881162 37881056 Y EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 82449 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 37884022 37884434 37884213 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP3 79177 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 37885188 37885619 37885408 Y QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 77992 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 37893644 37893973 37893812 Y QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 69638 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 37897080 37897760 37897461 Y QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 65851 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 37938546 37938819 37938725 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 24792 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr2 37995727 37996117 37995888 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3,PRKD3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 32116 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 38003710 38004005 38003838 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3,PRKD3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 40099 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 38008241 38008581 38008345 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3,PRKD3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 44630 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 38023099 38023324 38023154 Y NA NA CDC42EP3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 59488 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 38323202 38323810 38323564 Y CDC42EP3,CYP1B1 CYP1B1 CYP1B1,FAM82A1,CYP1B1-AS1,HNRPLL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CYP1B1 11234 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 38333760 38333892 38333836 Y CDC42EP3,CYP1B1 CYP1B1 FAM82A1,CYP1B1,CYP1B1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 CYP1B1 1152 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 38375670 38375904 38375803 Y CDC42EP3,CYP1B1 CYP1B1 NA NA NA NA CYP1B1 40626 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 38405386 38405542 38405477 Y CYP1B1 NA NA NA NA NA RPL7P12 51168 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 38417790 38418062 38417924 Y CYP1B1 RPL7P12 NA NA NA NA RPL7P12 38648 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 38735582 38735946 38735766 Y NA RPLP0P6 ATL2,GALM,SRSF7 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPLP0P6 28662 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 39227784 39228037 39227911 Y NA NA NA NA NA NA SOS1 121449 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 39334876 39335293 39335230 Y NA SOS1 NA NA NA NA SOS1 14193 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 39340813 39341200 39341198 Y NA SOS1 NA NA NA NA SOS1 8286 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 39443973 39444333 39444109 Y SOS1 NA NA NA NA NA SOS1 94487 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 39722003 39722381 39722147 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K3 59550 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 40958599 40958755 40958677 Y NA NA LOC100128590,SLC8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC8A1 122406 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 41955228 41955283 41955256 Y NA NA NA NA NA NA AC104654.2 203580 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 42149327 42149700 42149496 Y PKDCC AC104654.2 NA NA NA NA AC104654.2 9163 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 42167971 42168174 42168100 Y NA AC104654.2 NA NA NA NA AC104654.2 9108 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 42278314 42278459 42278342 Y NA PKDCC NA NA NA NA PKDCC 5154 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 42329971 42330163 42329978 Y NA NA EML4 IMR90 Hi-C 24141950 PKDCC 56811 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 42360195 42360705 42360352 Y EML4 EML4 EML4,COX7A2L,LOC388942 IMR90 Hi-C 24141950 EML4 33785 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 42368874 42369229 42369001 Y EML4 EML4 EML4,LOC388942,C2orf91,COX7A2L IMR90 Hi-C 24141950 EML4 25261 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 42412542 42412681 42412587 Y NA EML4 NA NA NA NA EML4 18052 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 42567305 42567366 42567336 Y EML4 NA NA NA NA NA COX7A2L 82862 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 43037224 43037999 43037611 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC025750.7 278642 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 43302253 43302513 43302383 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 149235 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 43313736 43313941 43313748 Y NA NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 137807 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 43385938 43386506 43386186 Y OXER1,ZFP36L2 NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 65242 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 44849210 44849529 44849370 Y NA NA NA NA NA NA CAMKMT 262121 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 45405025 45405418 45405218 Y NA NA NA NA NA NA AC012354.8 183473 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 45881346 45881543 45881445 Y NA SRBD1,PRKCE NA NA NA NA PRKCE 4862 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 46294979 46295300 46295093 Y NA NA NA NA NA NA EPAS1 223506 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr2 46536857 46537129 46536993 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 18051 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 46542401 46542637 46542520 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 23595 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 46542843 46542999 46542890 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 24037 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 46578990 46579175 46579103 Y EPAS1 NA NA NA NA NA EPAS1 60184 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 46593968 46594050 46594011 Y EPAS1 NA NA NA NA NA EPAS1 75162 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 46797577 46797967 46797772 Y NA RHOQ,ATP6V1E2,CRIPT,PIGF NA NA NA NA ATP6V1E2 29881 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 46825586 46825695 46825639 Y NA CRIPT,PIGF NA NA NA NA CRIPT 15860 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 46931823 46932125 46932006 Y NA SOCS5 NA NA NA NA SOCS5 7732 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 46993562 46993962 46993767 Y NA NA NA NA NA NA SOCS5 69471 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 46997897 46997963 46997932 Y MCFD2,MCFD2,SOCS5,SOCS5 NA NA NA NA NA SOCS5 73806 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 47039745 47040099 47039914 Y MCFD2,MCFD2,SOCS5,SOCS5 NA NA NA NA NA TTC7A 101197 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 47194379 47194775 47194547 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 27385 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 47195176 47195614 47195246 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 28182 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.18629863801546 chr2 47229826 47230084 47229931 Y TTC7A NA NA NA NA NA MCFD2 62832 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 47270774 47271231 47270943 Y NA NA NA NA NA NA MCFD2 103780 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr2 47296749 47297008 47296937 Y NA NA NA NA NA NA CALM2 104732 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 47297632 47297822 47297725 Y NA NA NA NA NA NA CALM2 103918 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 47418967 47419222 47419129 Y NA CALM2 TTC7A,C2orf61,SOCS5,MCFD2,CALM2,EPCAM IMR90 Hi-C 24141950 CALM2 17227 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 47496922 47497231 47497077 Y NA NA TTC7A,CALM2,C2orf61,MCFD2,SOCS5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC073283.4 72982 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 48373241 48373406 48373298 Y FOXN2 NA FOXN2,PPP1R21 IMR90 Hi-C 24141950 FOXN2 166370 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 48584014 48584658 48584325 Y FBXO11,FOXN2 FOXN2 NA NA NA NA FOXN2 44238 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 54019039 54019374 54019207 Y ACYP2,ASB3,ASB3,GPR75 CHAC2,ERLEC1 NA NA NA NA ERLEC1 6858 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 54165408 54165630 54165519 Y NA ACYP2,PSME4 NA NA NA NA ACYP2 30345 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 54196339 54196842 54196524 Y ASB3,ASB3,PSME4 ACYP2,PSME4 NA NA NA NA PSME4 362 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 54714209 54714329 54714214 Y NA SPTBN1 NA NA NA NA SPTBN1 32787 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 54751942 54752182 54752042 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 70520 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 54786900 54787386 54787056 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 105478 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 54787503 54787764 54787623 Y RTN4,SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 106081 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr2 54799241 54799892 54799606 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 117819 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 54800045 54800558 54800206 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 118623 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 55320625 55320761 55320684 Y RTN4 RTN4 C2orf63,EML6,RTN4 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 16996 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 55327095 55327368 55327210 Y RTN4 RTN4 C2orf63,RTN4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 10389 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 55327778 55327923 55327859 Y NA RTN4 C2orf63,RTN4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 9834 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr2 55338983 55339153 55339057 Y CCDC88A,RTN4,RTN4 RTN4 C2orf63,RTN4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 1226 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 55360803 55361407 55361172 Y SMEK2,CCDC88A,RTN4 RTN4 RTN4,C2orf63,EML6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RTN4 23046 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 55450545 55450658 55450592 Y CCDC88A,EML6,RTN4 RPS27A,MTIF2 NA NA NA NA RPS27A 6381 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 56070301 56070618 56070423 Y NA NA EFEMP1 IMR90 Hi-C 24141950 EFEMP1 78656 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 56089907 56090266 56090122 Y NA NA NA NA NA NA EFEMP1 59008 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 56112478 56112793 56112711 Y NA EFEMP1 NA NA NA NA EFEMP1 36481 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 57579954 57580103 57580029 Y NA NA NA NA NA NA VRK2 552683 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 57660599 57660912 57660881 Y NA NA NA NA NA NA VRK2 471874 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 59983827 59983888 59983858 Y NA NA NA NA NA NA BCL11A 794814 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 60962204 60962802 60962781 Y NA PAPOLG NA NA NA NA PAPOLG 18563 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 61140048 61140151 61140100 Y REL REL NA NA NA NA REL 33392 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 61580039 61580318 61580309 Y NA NA NA NA NA NA USP34 115586 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 61586795 61586939 61586907 Y AHSA2,USP34 NA NA NA NA NA USP34 108965 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 61644750 61644896 61644823 Y NA NA NA NA NA NA USP34 51008 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 87618 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr2 62375163 62375426 62375211 Y B3GNT2 B3GNT2 NA NA NA NA B3GNT2 45822 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 62519354 62519381 62519368 Y NA NA COMMD1,B3GNT2 IMR90 Hi-C 24141950 B3GNT2 98106 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 62881470 62881867 62881666 Y NA EHBP1 EHBP1,TMEM17 IMR90 Hi-C 24141950 EHBP1 17119 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr2 63122149 63122353 63122251 Y EHBP1,EHBP1,OTX1 NA NA NA NA NA OTX1 152839 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 64925964 64926159 64926058 Y SLC1A4,RAB1A,AFTPH,SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 49980 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 64927379 64927577 64927485 Y SLC1A4,RAB1A,AFTPH,SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 48562 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 64978173 64978610 64978385 Y CEP68 SERTAD2 SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 2034 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 64994926 64995226 64995021 Y SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 18787 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 65093958 65094266 65094153 Y NA NA SERTAD2,AFTPH,LOC339807 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SERTAD2 117819 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 65173308 65173867 65173558 Y AFTPH,SERTAD2 SLC1A4 SERTAD2,AFTPH,LOC339807,LOC400958,SLC1A4,CEP68,ACTR2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC1A4 39744 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 65303160 65303240 65303200 Y SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A CEP68 NA NA NA NA CEP68 21660 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 65657861 65658229 65658008 Y SLC1A4,SPRED2,SPRED2 SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 90 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr2 65782552 65782570 65782560 Y NA NA SPRED2,ACTR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPRED2 124781 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 65849750 65849939 65849914 Y NA NA MEIS1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED2 191979 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 66801899 66802241 66801940 Y MEIS1 NA NA NA NA NA MEIS1-AS3 143297 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 67067097 67067512 67067390 Y NA AC009474.2 LOC644838,MEIS1 IMR90 Hi-C 24141950 AC009474.2 38842 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 67486839 67487275 67486977 Y NA NA MEIS1,ETAA1,LOC644838,C1D IMR90 Hi-C 24141950 ETAA1 135176 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.28515685785008 chr2 68428934 68429266 68429100 Y NA WDR92,PNO1 NA NA NA NA PNO1 45958 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 68654356 68654764 68654592 Y FBXO48,APLF,PLEK FBXO48,APLF NA NA NA NA FBXO48 37626 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 68964895 68965352 68965007 Y PLEK,FBXO48,APLF NA NA NA NA NA APLF 272202 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 69135600 69135857 69135778 Y NA NA ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10 IMR90 Hi-C 24141950 ANTXR1 102453 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr2 69241314 69241782 69241454 Y ANTXR1 ANTXR1 NA NA NA NA ANTXR1 3004 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 69309666 69309994 69309927 Y NA NA NA NA NA NA ANTXR1 71356 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 69717115 69717269 69717170 Y NA NA NA NA NA NA NFU1 54355 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 70057532 70057914 70057667 Y C2orf42,AAK1,GMCL1 GMCL1 NA NA NA NA GMCL1 2758 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 70173540 70174234 70173890 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 ASPRV1 NA NA NA NA ASPRV1 13163 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 70294861 70295138 70295000 Y NA PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA PCBP1 17447 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 70335985 70336314 70336204 Y AAK1,C2orf42,PCBP1 PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 8302 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 70350372 70350687 70350608 Y NA PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 22689 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 70363059 70363462 70363144 Y MXD1,C2orf42,PCBP1 PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 35376 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.3840150776847 chr2 71129017 71129173 71129049 Y NA VAX2 NA NA NA NA VAX2 3297 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 72058319 72058599 72058494 Y NA NA EXOC6B,DYSF,CYP26B1 IMR90 Hi-C 24141950 DYSF 379467 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 73337911 73338195 73338053 Y NA SFXN5,RAB11FIP5 NA NA NA NA SFXN5 37164 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 73338552 73338952 73338867 Y RAB11FIP5 SFXN5,RAB11FIP5 NA NA NA NA SFXN5 37805 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 74060180 74060503 74060342 Y NA STAMBP NA NA NA NA STAMBP 6094 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 74968770 74968998 74968973 Y TLX2,HK2 AC007387.2 HK2,SEMA4F IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC007387.2 10948 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 75072652 75072899 75072736 Y HK2 HK2 NA NA NA NA HK2 13544 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 75141745 75142080 75142074 Y NA AC104135.3,POLE4 NA NA NA NA AC104135.3 1195 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 75427361 75427621 75427415 Y TACR1 TACR1 NA NA NA NA TACR1 2535 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 75834246 75834589 75834429 Y NA MRPL19 FAM176A,TACR1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL19 37320 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 75836166 75836348 75836343 Y NA MRPL19 FAM176A,TACR1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL19 35561 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 85034355 85034669 85034421 Y NA NA NA NA NA NA TMSB10 96080 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 85116002 85116322 85116077 Y C2orf89,TMSB10 TMSB10 TMSB10 MCF7 ChIA-PET 22265404 TMSB10 14427 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 85147093 85147556 85147171 Y TMSB10 TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 16344 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 85160217 85160224 85160221 Y NA TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 29468 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 85267777 85267839 85267811 Y NA NA NA NA NA NA LSM3P3 59978 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 85442728 85442944 85442894 Y NA NA NA NA NA NA TCF7L1 84195 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 85664544 85665596 85664830 Y KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6 NA NA NA NA NA RETSAT 84801 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 85673142 85673285 85673214 Y NA NA NA NA NA NA MAT2A 91003 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 85969500 85969917 85969748 Y VAMP5,TMEM150A,ATOH8 RNU1-38P,ATOH8 ATOH8,POLR1A,USP39,C2orf68,SFTPB,LOC284950,ST3GAL5,LOC90784,PTCD3 IMR90 Hi-C 24141950 ATOH8 6550 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 85982713 85983043 85983025 Y NA RNU1-38P,ATOH8 NA NA NA NA ATOH8 6246 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 85993562 85993638 85993601 Y NA RNU1-38P,ATOH8 NA NA NA NA ATOH8 17095 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 86030361 86030633 86030487 Y SH2D6 NA LOC284950 IMR90 Hi-C 24141950 ATOH8 53894 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 86299445 86299644 86299569 Y NA POLR1A,PTCD3 NA NA NA NA POLR1A 31634 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 86388217 86388607 86388413 Y NA IMMT,MRPL35 NA NA NA NA IMMT 32286 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 88923115 88923478 88923431 Y NA EIF2AK3 NA NA NA NA EIF2AK3 1616 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 91815672 91815808 91815787 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2826510 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 91821438 91821799 91821741 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2832276 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 91936197 91936406 91936290 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2947035 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr2 96198442 96198677 96198560 Y NA NA NA NA NA NA FAHD2A 131973 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 96348390 96348623 96348461 Y NA NA NA NA NA NA FAHD2A 281921 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 96911483 96911666 96911570 Y DUSP2,KIAA1310,ARID5A,TMEM127 STARD7,TMEM127,CIAO1 NA NA NA NA TMEM127 18066 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 97151625 97152085 97151839 Y ASTL,DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,ARID5A ARID5A NA NA NA NA ARID5A 48395 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 97330891 97331185 97331060 Y TMEM127,ARID5A,KIAA1310 FER1L5,KANSL3 NA NA NA NA KANSL3 24367 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 97522669 97523105 97522935 Y NA CNNM3,ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C NA NA NA NA ANKRD39 837 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 98443211 98443622 98443475 Y NA NA NA NA NA NA ACTR1B 164641 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 98822932 98823207 98823080 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 212544 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 99064911 99065194 99064955 Y MGAT4A,MGAT4A,INPP4A INPP4A NA NA NA NA INPP4A 5594 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 99173119 99173416 99173284 Y INPP4A COA5,UNC50 UNC50,COA5 IMR90 Hi-C 24141950 COA5 49562 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 100287433 100287833 100287631 Y NA NA NA NA NA NA REV1 182936 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 100323852 100324185 100324151 Y NA NA NA NA NA NA REV1 219355 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr2 100630312 100630613 100630507 Y AFF3 NA NA NA NA NA CHST10 401505 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 100907600 100907945 100907823 Y NA NA NA NA NA NA CHST10 124173 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 100908504 100908788 100908727 Y NA NA NA NA NA NA CHST10 123330 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 101872333 101872649 101872491 Y RNF149 TBC1D8 NA NA NA NA TBC1D8 5005 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 101884483 101884674 101884578 Y MAP4K4,MAP4K4,RNF149 TBC1D8,RNF149 NA NA NA NA TBC1D8 17155 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 101923239 101923757 101923472 Y RPL31,MAP4K4,MAP4K4,RNF149 RNF149 NA NA NA NA RNF149 76 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 102133779 102134093 102133972 Y MAP4K4,MAP4K4 RFX8 MAP4K4,RFX8,CREG2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RFX8 44614 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 102332970 102333042 102333006 Y MAP4K4,MAP4K4 MAP4K4 NA NA NA NA MAP4K4 21658 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 102383406 102383725 102383568 Y MAP4K4,MAP4K4 NA NA NA NA NA MAP4K4 72094 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.988582198346214 chr2 102649919 102650192 102650054 Y IL1RL2,IL1R1,IL18RAP,IL18R1,MAP4K4,MAP4K4,IL1R2 NA NA NA NA NA MAP4K4 338607 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 102665619 102665971 102665795 Y NA NA IL1R2,IL1R1,IL1RL2 IMR90 Hi-C 24141950 MAP4K4 354307 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 102744535 102744807 102744707 Y IL1RL2,IL1R1,MAP4K4,MAP4K4 NA IL1RL2,IL1R2,IL1R1,IL1RL1,IL18RAP IMR90 Hi-C 24141950 MAP4K4 433223 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 105913488 105913594 105913541 Y NA TGFBRAP1,C2orf49 NA NA NA NA TGFBRAP1 30897 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 106020631 106021071 106020783 Y FHL2,FHL2 FHL2 NA NA NA NA FHL2 31899 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 106364522 106364900 106364611 Y TGFBRAP1,C2orf49,NCK2 NCK2 NA NA NA NA NCK2 5168 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 106414093 106414226 106414159 Y C2orf49,NCK2 NA NA NA NA NA NCK2 54739 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 106417583 106417937 106417755 Y TGFBRAP1,C2orf49,NCK2 NA NA NA NA NA NCK2 58229 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 107886980 107887341 107887161 Y ST6GAL2,ST6GAL2 NA NA NA NA NA AC114755.2 983471 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 108883612 108883815 108883711 Y NA SULT1C2 NA NA NA NA SULT1C2 19280 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 109211421 109211903 109211563 Y LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1 NA NA NA NA NA LIMS1 62564 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 110318153 110318301 110318244 Y NA NA NA NA NA NA SEPT10 51482 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 110319562 110319852 110319693 Y NA SEPT10 NA NA NA NA SEPT10 49931 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 110859077 110859497 110859213 Y NA NA NA NA NA NA NPHP1 101146 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr2 111879046 111879315 111879118 Y NA BCL2L11 NA NA NA NA BCL2L11 4091 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 111976914 111977297 111977138 Y BCL2L11 NA NA NA NA NA BCL2L11 101959 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 112253383 112253436 112253410 Y NA NA NA NA NA NA BCL2L11 378428 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 113384986 113385271 113385131 Y NA CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1 NA NA NA NA AC079922.2 7242 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 113398370 113398650 113398523 Y NA AC079922.2,SLC20A1 NA NA NA NA SLC20A1 2784 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 113448603 113448987 113448785 Y IL36B,IL36G,IL1RN,IL1B,IL1A SLC20A1 POLR1B,CHCHD5,SLC20A1,CKAP2L,FLJ42351 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC20A1 47169 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 113450039 113450435 113450231 Y IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A SLC20A1 SLC20A1,FLJ42351 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC20A1 48605 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 113569466 113569945 113569683 Y IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L,IL1B NA NA NA NA IL1B 22535 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 113573367 113573750 113573559 Y IL1A IL1B NA NA NA NA IL1B 18730 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 113576216 113576532 113576373 Y IL36G,PSD4,IL1RN,IL1A,IL1B IL1B NA NA NA NA IL1B 15948 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 113657771 113658101 113657937 Y NA NA CKAP2L,IL1A,IL37,IL1B IMR90 Hi-C 24141950 IL1B 65291 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 114039556 114039944 114039632 Y NA NA NA NA NA NA RP11-395L14.5 257570 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 114082449 114082815 114082523 Y NA NA PAX8,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-395L14.5 214699 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr2 114126317 114126521 114126419 Y IL1F10,IL1F10 NA PAX8,LOC654433,IL1RN,PSD4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-395L14.5 170993 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 114469366 114469830 114469722 Y SLC35F5 MIR4782,SLC35F5 NA NA NA NA MIR4782 7115 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 114649026 114649412 114649076 Y CBWD2,ACTR3 ACTR3 NA NA NA NA ACTR3 3489 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 114652011 114652405 114652035 Y CBWD2,ACTR3 ACTR3 NA NA NA NA ACTR3 6474 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 114672841 114673224 114672915 Y NA ACTR3 NA NA NA NA ACTR3 27304 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 118722673 118722961 118722817 Y NA CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 46748 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 118741787 118742055 118741993 Y CCDC93 CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 27654 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 120041416 120041980 120041717 Y DBI NA NA NA NA NA STEAP3 62032 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 120192847 120193082 120192954 Y TMEM37 TMEM37 NA NA NA NA TMEM37 7370 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 121523492 121523901 121523763 Y GLI2 GLI2 GLI2 IMR90 Hi-C 24141950 GLI2 32293 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 121585967 121586372 121586071 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 94768 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 121614859 121615272 121615044 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 123660 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 121624920 121625080 121625001 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 133721 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 122297511 122297730 122297621 Y NA RNU4ATAC NA NA NA NA RNU4ATAC 11054 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 122458148 122458329 122458303 Y CLASP1 TSN NA NA NA NA TSN 34350 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 122994452 122994784 122994618 Y NA NA NA NA NA NA TSN 501773 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 127824493 127824859 127824771 Y MAP3K2,IWS1,BIN1 BIN1 NA NA NA NA BIN1 38072 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 127840546 127840814 127840619 Y NA BIN1 NA NA NA NA BIN1 22117 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 127844543 127844919 127844728 Y NA BIN1 NA NA NA NA BIN1 18012 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 127862933 127863341 127863123 Y NA BIN1 NA NA NA NA BIN1 2 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 127863441 127863795 127863513 Y NA BIN1 NA NA NA NA BIN1 510 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 127934423 127934665 127934539 Y MAP3K2 NA NA NA NA NA BIN1 71492 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 128171512 128171657 128171580 Y SFT2D3,IWS1,AMMECR1L,MAP3K2 MAP3K2 NA NA NA NA MAP3K2 27471 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 128266210 128266439 128266348 Y MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L,IWS1 IWS1 NA NA NA NA IWS1 16023 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 128562322 128562673 128562571 Y NA WDR33 LIMS2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR33 4088 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 129381655 129381863 129381711 Y NA NA UGGT1,HS6ST1 IMR90 Hi-C 24141950 HS6ST1 307504 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr2 129396260 129396677 129396538 Y NA NA NA NA NA NA HS6ST1 322109 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 130201021 130201117 130201085 Y NA NA NA NA NA NA AC079776.4 494673 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.988582198346214 chr2 132152335 132152426 132152381 Y NA NA NA NA NA NA MZT2A 95890 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 133111183 133111270 133111216 Y NA NA NA NA NA NA GPR39 60877 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 133381074 133381177 133381126 Y NA LYPD1 NA NA NA NA LYPD1 45975 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 133433715 133433886 133433800 Y NA LYPD1 NA NA NA NA LYPD1 6563 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr2 134433950 134434204 134434157 Y NA NA NCKAP5 IMR90 Hi-C 24141950 NCKAP5 109916 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 134472410 134472432 134472421 Y NA NA NCKAP5 IMR90 Hi-C 24141950 NCKAP5 148376 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 134575786 134576043 134575915 Y NA NA NCKAP5 IMR90 Hi-C 24141950 NCKAP5 251752 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 134878523 134878632 134878609 Y MGAT5 MGAT5 NA NA NA NA MGAT5 2969 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 136404449 136404849 136404497 Y R3HDM1 NA NA NA NA NA UBXN4 92340 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 136632932 136633416 136633308 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 MCM6 NA NA NA NA MCM6 936 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 138845772 138845790 138845781 Y NA NA HNMT IMR90 Hi-C 24141950 HNMT 126182 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 139260181 139260311 139260246 Y SPOPL AC097721.2,SPOPL NA NA NA NA SPOPL 2810 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 143077888 143078204 143078046 Y NA NA NA NA NA NA KYNU 554863 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 143625721 143626570 143625926 Y KYNU KYNU KYNU MCF7 ChIA-PET 22265404 KYNU 6497 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 143630782 143631707 143631171 Y KYNU KYNU NA NA NA NA KYNU 1360 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.18629863801546 chr2 143697269 143697638 143697450 Y KYNU NA NA NA NA NA KYNU 64202 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 143756654 143756995 143756685 Y NA NA NA NA NA NA KYNU 123587 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 144499811 144499873 144499842 Y NA NA NA NA NA NA GTDC1 588262 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 145212298 145212826 145212615 Y GTDC1,GTDC1,GTDC1,ZEB2 NA NA NA NA NA ZEB2 67321 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 145416857 145417708 145417448 Y ZEB2 NA ZEB2 K562 ChIA-PET 22265404 ZEB2 136710 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 146396367 146396517 146396425 Y NA NA ZEB2,DKFZp686O1327 IMR90 Hi-C 24141950 RPL6P5 303569 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 148317004 148317196 148317075 Y ACVR2A NA NA NA NA NA AC009480.4 248719 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 148671388 148671433 148671412 Y ORC4,ORC4,ORC4,ORC4,ORC4 NA NA NA NA NA ACVR2A 71302 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 149017229 149017560 149017414 Y NA NA NA NA NA NA ORC4 240082 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 149403654 149404182 149403820 Y NA EPC2 NA NA NA NA EPC2 3645 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 149925246 149925613 149925433 Y NA LYPD6B NA NA NA NA LYPD6B 32625 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 150184579 150184898 150184643 Y NA LYPD6 NA NA NA NA LYPD6 80 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 150505364 150505670 150505432 Y NA NA RBM43,RND3 IMR90 Hi-C 24141950 MMADHC 63034 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 151022837 151023057 151022971 Y NA NA RND3 MCF7 ChIA-PET 22265404 RND3 370468 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 151383394 151383753 151383509 Y RND3 RND3 RND3,RBM43 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RND3 9772 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 151385444 151385651 151385488 Y RND3 RND3 RND3,RBM43 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RND3 7874 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 152789657 152790028 152790018 Y FMNL2 NA NA NA NA NA ARL5A 106651 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 153057173 153057360 153057266 Y FMNL2 STAM2 FMNL2 IMR90 Hi-C 24141950 STAM2 26667 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 153356449 153356753 153356698 Y NA NA NA NA NA NA FMNL2 166698 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 153568262 153568351 153568307 Y NA ARL6IP6,PRPF40A NA NA NA NA ARL6IP6 4056 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 154379200 154379581 154379374 Y NA NA NA NA NA NA AC012501.2 68220 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 157190328 157191531 157191235 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 5329 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 157257270 157257340 157257305 Y NA GPD2 NR4A2,GALNT5,GPD2 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GPD2 32462 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 157262022 157262267 157262175 Y GPD2,NR4A2 GPD2 NR4A2,GALNT5,GPD2 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GPD2 27535 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 157287649 157287933 157287736 Y NR4A2,GPD2 GPD2 GPD2 K562 ChIA-PET 22265404 GPD2 1869 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 159749466 159749905 159749830 Y NA NA LY75-CD302,TANC1,WDSUB1,BAZ2B IMR90 Hi-C 24141950 TANC1 73241 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 159853491 159853713 159853657 Y NA TANC1 NA NA NA NA TANC1 30345 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 159908773 159909006 159908845 Y NA NA NA NA NA NA TANC1 85627 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 159951081 159951241 159951194 Y NA NA NA NA NA NA TANC1 127935 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 160100045 160100277 160100255 Y NA WDSUB1 NA NA NA NA WDSUB1 41033 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 161064664 161064880 161064794 Y NA NA ITGB6,RBMS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MIR4785 197513 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 161098241 161098623 161098428 Y ITGB6 NA TANK,ITGB6,RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4785 163770 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 161277229 161277590 161277411 Y NA MIR4785 NA NA NA NA MIR4785 14836 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 161348201 161348679 161348535 Y RBMS1 NA NA NA NA NA RBMS1 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 161431402 161431575 161431468 Y NA NA ITGB6,RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 RBMS1 83097 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 161522878 161523352 161523066 Y TANK,TANK NA ITGB6,RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 RBMS1 174573 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 161979819 161979978 161979936 Y TANK,TANK TANK PLA2R1,RBMS1,LY75-CD302,TANK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TANK 11441 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 164204698 164204962 164204800 Y NA NA FIGN IMR90 Hi-C 24141950 FIGN 385560 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 165430240 165430431 165430256 Y NA NA NA NA NA NA COBLL1 267758 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 166779898 166780276 166780103 Y NA TTC21B NA NA NA NA TTC21B 28077 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 168822360 168822564 168822456 Y NA NA NA NA NA NA STK39 280087 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 169219824 169220222 169219967 Y NA NA CERS6 Islet 4C 24413736 CERS6 90150 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 170684911 170685465 170685124 Y PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3 SSB,METTL5,UBR3 NA NA NA NA UBR3 2943 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 170856738 170857087 170856755 Y NA NA NA NA NA NA UBR3 174770 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 171786835 171787228 171786978 Y TLK1 GORASP2 NA NA NA NA GORASP2 3861 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 172958586 172958929 172958756 Y DYNC1I2,DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 6699 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 172959536 172959659 172959591 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 5969 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 172960097 172960530 172960322 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 5098 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr2 172961367 172961608 172961457 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 4020 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 172962291 172962684 172962615 Y NA DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 2944 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 173116941 173117298 173117012 Y NA NA ITGA6 IMR90 Hi-C 24141950 DLX2 151313 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 173557830 173558066 173557982 Y ZAK NA RAPGEF4,PDK1 IMR90 Hi-C 24141950 AC093818.1 138506 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 173647954 173648254 173648105 Y NA NA NA NA NA NA AC093818.1 228630 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 173796243 173796588 173796342 Y NA NA NA NA NA NA AC093818.1 376919 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 173928912 173929130 173929086 Y ZAK NA NA NA NA NA CDCA7 288418 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 173941754 173942308 173942062 Y ZAK NA NA NA NA NA CDCA7 275240 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 173942556 173942831 173942720 Y NA NA NA NA NA NA CDCA7 274717 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 174900688 174901381 174900887 Y SP3,SP3 NA SP3,CDCA7,OLA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP3 72258 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 174963658 174963852 174963755 Y NA NA NA NA NA NA SP3 135228 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 175036157 175036485 175036321 Y NA NA NA NA NA NA OLA1 74941 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 175459812 175460479 175460357 Y CIR1,GPR155,WIPF1 NA NA NA NA NA WIPF1 85165 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 175643140 175643660 175643376 Y CIR1 NA NA NA NA NA H3F3AP4 60635 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr2 175700542 175700958 175700833 Y CHRNA1 NA NA NA NA NA H3F3AP4 118037 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 175831323 175831425 175831374 Y NA CHN1 CHRNA1 IMR90 Hi-C 24141950 CHN1 36672 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 175837054 175837318 175837218 Y NA CHN1 NA NA NA NA CHN1 30779 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 176846427 176846539 176846507 Y NA KIAA1715 NA NA NA NA KIAA1715 19028 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 176969861 176970296 176970124 Y HOXD13,HOXD9,HOXD8,HOXD8,HOXD3,HOXD11,HOXD10 HOXD13,HOXD11,HOXD8,HOXD3,HOXD-AS2,HOXD4 NA NA NA NA HOXD11 2917 CAGE T98G hg19 FANTOM5 5.5360603107388 chr2 178030872 178031290 178031011 Y NFE2L2,NFE2L2 HNRNPA3,AC079305.8 HOXD-AS2,LOC100130691,AGPS,PDE11A,NFE2L2,HNRNPA3,TTC30A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HNRNPA3 44001 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 178100990 178101571 178101482 Y NA HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10 NA NA NA NA MIR3128 17167 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 178104644 178105169 178104872 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10 NA NA NA NA MIR3128 13569 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.48287329751932 chr2 178116726 178117036 178116927 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10 NA NA NA NA MIR3128 1702 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 178176683 178176989 178176836 Y NA AC079305.10 NA NA NA NA AC079305.10 49596 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 178261376 178261686 178261570 Y NA AGPS,AC074286.1,NFE2L2 NA NA NA NA NFE2L2 5951 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 182258262 182258376 182258308 Y ITGA4 NA NA NA NA NA ITGA4 61553 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 182942372 182942392 182942382 Y NA NA NA NA NA NA SSFA2 187812 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 183876955 183877317 183877185 Y NA NCKAP1 NA NA NA NA NCKAP1 24269 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 187015061 187015446 187015349 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 333437 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 187263813 187264095 187263899 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 84788 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 188347584 188347786 188347681 Y NA CALCRL NA NA NA NA CALCRL 36397 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 188414787 188415077 188415012 Y NA TFPI NA NA NA NA TFPI 13410 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 189155414 189155583 189155499 Y NA GULP1 NA NA NA NA GULP1 1018 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 190043432 190043827 190043588 Y DIRC1,COL3A1,COL5A2 COL5A2 NA NA NA NA COL5A2 827 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 190118899 190119326 190119165 Y NA NA COL5A2,COL3A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A2 76294 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 190729809 190730106 190729887 Y OSGEPL1,PMS1 NA NA NA NA NA PMS1 82702 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 191075616 191075973 191075872 Y NA NA NA NA NA NA INPP1 130223 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 191708638 191708846 191708778 Y STAT4,NAB1,STAT1,GLS GLS GLS,STAT1,NAB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLS 34707 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 191814146 191814507 191814301 Y STAT1 AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 41786 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 191815156 191815612 191815322 Y GLS AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 40681 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 191861736 191862119 191861929 Y NA AC067945.3,STAT1 NA NA NA NA AC067945.3 5443 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 192082382 192082563 192082473 Y MYO1B,MYO1B NA MYO1B,STAT4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STAT1 198696 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 192500525 192500897 192500643 Y NA NA OBFC2A K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 STAT1 616839 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 192503383 192503649 192503532 Y OBFC2A NA OBFC2A K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 STAT1 619697 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 192562556 192562918 192562693 Y NA NA NA NA NA NA STAT1 678870 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 196400983 196401214 196401085 Y NA SLC39A10 SLC39A10 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC39A10 37487 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 197195800 197196140 197196081 Y NA NA NA NA NA NA AC020571.3 73052 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 197264939 197265165 197265058 Y STK17B NA NA NA NA NA AC020571.3 142191 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 197466180 197466534 197466307 Y NA HECW2,CCDC150 CCDC150,HECW2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HECW2 9764 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 197962665 197962866 197962743 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G2P3 162969 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 198350765 198350931 198350852 Y NA COQ10B,HSPE1,MOB4,HSPD1 NA NA NA NA HSPE1 11787 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 200270966 200271332 200271300 Y NA SATB2-AS1 NA NA NA NA SATB2-AS1 49091 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 200800298 200800427 200800328 Y SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69 C2orf69,C2orf47,TYW5 NA NA NA NA C2orf47 17613 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 201039971 201040241 201040105 Y NA NA SPATS2L,KCTD18,SGOL2 IMR90 Hi-C 24141950 SPATS2L 128363 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 201270357 201270484 201270442 Y CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1 NA NA NA NA NA SPATS2L 101753 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 201411222 201411458 201411252 Y PPIL3,NIF3L1,NIF3L1,SGOL2 SGOL2,KCTD18 NA NA NA NA KCTD18 28715 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 201829288 201829721 201829590 Y KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2 ORC2 NA NA NA NA ORC2 2885 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 201830040 201830326 201830203 Y KCTD18,FAM126B,CASP8,CLK1,CLK1 ORC2 NA NA NA NA ORC2 3637 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 202517448 202517800 202517452 Y NA TMEM237 NA NA NA NA TMEM237 11155 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 202723656 202723936 202723797 Y NA NA NA NA NA NA CDK15 70472 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 202898182 202898685 202898353 Y TMEM237,FZD7 FZD7 NA NA NA NA FZD7 872 CAGE T98G hg19 FANTOM5 3.36117947437713 chr2 203935433 203935668 203935572 Y NBEAL1 NA NA NA NA NA NBEAL1 57831 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 204373438 204373815 204373626 Y NA RAPH1 NA NA NA NA RAPH1 24318 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 204548440 204549024 204548878 Y NA NA RAPH1,CD28 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 150307 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 204816181 204816619 204816422 Y CD28,ICOS NA NA NA NA NA RAPH1 418048 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 206005178 206005232 206005204 Y NA NA NA NA NA NA NRP2 539482 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 206564438 206564682 206564481 Y INO80D,NRP2 NRP2 NA NA NA NA NRP2 19724 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 206569997 206570271 206570078 Y NA NRP2 NA NA NA NA NRP2 25283 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 208004399 208004541 208004470 Y CREB1 KLF7 NA NA NA NA KLF7 25450 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 208007936 208008436 208008192 Y METTL21A,METTL21A,KLF7,CREB1 KLF7 NA NA NA NA KLF7 21555 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 208027980 208028625 208028335 Y CREB1,KLF7 KLF7 NA NA NA NA KLF7 1366 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr2 208028732 208029438 208029179 Y METTL21A,CREB1,KLF7 KLF7 NA NA NA NA KLF7 553 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 208395422 208395980 208395659 Y PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1 CREB1,AC007879.5 NA NA NA NA AC007879.5 2903 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr2 208656928 208657357 208657034 Y FZD5 FZD5 PLEKHM3,CCNYL1,FZD5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FZD5 24641 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 210872654 210873081 210872784 Y C2orf67 RPE NA NA NA NA RPE 7365 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 214053041 214053239 214053088 Y NA NA NA NA NA NA SPAG16 93874 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 215735917 215736192 215736055 Y NA NA NA NA NA NA BARD1 63489 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 216216233 216216482 216216439 Y NA ATIC NA NA NA NA ATIC 41693 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 216394093 216394338 216394216 Y NA NA LOC646324,FN1 IMR90 Hi-C 24141950 AC012462.1 95117 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 216563363 216563707 216563549 Y NA NA NA NA NA NA AC012462.1 264387 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 216636605 216637052 216636855 Y NA NA NA NA NA NA MREG 259767 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 217106974 217107312 217107143 Y TMEM169 NA NA NA NA NA XRCC5 136787 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 217443055 217443423 217443239 Y NA PSMB3P2 IGFBP2,DIRC3,IGFBP5 IMR90 Hi-C 24141950 PSMB3P2 30259 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 217556283 217557311 217557110 Y NA IGFBP5 NA NA NA NA AC007563.5 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 217557565 217558269 217557956 Y NA AC007563.5 NA NA NA NA IGFBP5 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 217639400 217639563 217639456 Y NA NA DIRC3,TNS1,IGFBP5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IGFBP5 81152 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 217639856 217640183 217640035 Y NA NA DIRC3,TNS1,IGFBP5 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 81608 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 217797120 217797464 217797294 Y NA NA DIRC3,TNP1,IGFBP5 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 238872 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 217934616 217935002 217934772 Y NA NA DIRC3,IGFBP5,TNP1 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 376368 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 217936161 217936583 217936312 Y NA NA DIRC3,IGFBP5 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 377913 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 217970488 217971016 217970653 Y NA NA IGFBP5,DIRC3,IGFBP2,TNP1 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 412240 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 218027339 218027548 218027469 Y NA NA DIRC3,IGFBP5,IGFBP2,TNP1 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 469091 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr2 218088198 218088590 218088283 Y NA NA DIRC3,IGFBP5,IGFBP2 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 529950 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 218258363 218258761 218258688 Y NA NA NA NA NA NA IGFBP5 700115 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 218518007 218518420 218518200 Y NA NA NA NA NA NA ARPC2 561397 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr2 218549825 218550302 218550107 Y NA NA NA NA NA NA ARPC2 529515 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 219270976 219271406 219271230 Y CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1 CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 9997 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 219596297 219596622 219596516 Y TMBIM1,PNKD,SLC11A1,USP37,TTLL4,CYP27A1 TTLL4,CYP27A1 NA NA NA NA TTLL4 22729 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 219761045 219761550 219761369 Y USP37,ZNF142,ZFAND2B,TUBA4A,CNPPD1,ANKZF1,ANKZF1,WNT10A WNT6 NA NA NA NA WNT6 38501 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 219773515 219774011 219773826 Y USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A CDK5R2 NA NA NA NA CDK5R2 48366 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 220400310 220400471 220400469 Y NA GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1 NA NA NA NA TMEM198 5914 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 220553753 220554082 220553876 Y NA AC009502.1 DES,SLC4A3 K562 5C 22955621 AC009502.1 6236 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 221000091 221000153 221000122 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 AC009502.1 452574 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 221093432 221093609 221093525 Y NA NA EPHA4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AC009502.1 545915 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 222312152 222312375 222312261 Y NA NA NA NA NA NA EPHA4 124547 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 222356179 222356366 222356273 Y NA NA NA NA NA NA EPHA4 80556 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 222392667 222392822 222392760 Y EPHA4 EPHA4 NA NA NA NA EPHA4 44100 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 222435699 222436339 222436058 Y EPHA4 EPHA4 NA NA NA NA EPHA4 583 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr2 222826690 222827411 222827014 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 PAX3 334304 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr2 223429708 223429962 223429836 Y FARSB NA NA NA NA NA FARSB 89094 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 223957413 223957625 223957519 Y NA KCNE4 AP1S3 IMR90 Hi-C 24141950 KCNE4 42881 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 224413942 224414282 224414142 Y NA NA NA NA NA NA SCG2 50939 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 224428219 224428432 224428353 Y NA SCG2 SCG2 IMR90 Hi-C 24141950 SCG2 36789 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 224477772 224478078 224477872 Y NA SCG2 AP1S3,KCNE4,SCG2 IMR90 Hi-C 24141950 SCG2 12551 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 224761528 224761781 224761678 Y WDFY1 WDFY1 NA NA NA NA WDFY1 46323 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 224773224 224773437 224773430 Y WDFY1 WDFY1,MRPL44 NA NA NA NA WDFY1 34667 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 224808298 224808709 224808400 Y WDFY1 WDFY1,MRPL44 NA NA NA NA WDFY1 194 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr2 224871549 224871941 224871745 Y NA SERPINE2 NA NA NA NA SERPINE2 30095 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 225392496 225392764 225392746 Y NA NA NA NA NA NA CUL3 55346 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 225841174 225841410 225841405 Y NA NA NA NA NA NA DOCK10 63752 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 225851171 225851334 225851274 Y DOCK10 NA NA NA NA NA DOCK10 53828 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 225864044 225864445 225864307 Y DOCK10 DOCK10 NA NA NA NA DOCK10 40717 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 225878647 225879031 225878803 Y DOCK10 DOCK10 NA NA NA NA DOCK10 26131 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 225965618 225965990 225965841 Y NA NA DOCK10 IMR90 Hi-C 24141950 DOCK10 60456 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 226867162 226867478 226867316 Y NA NA IRS1,COL4A4,RHBDD1 IMR90 Hi-C 24141950 AC068138.1 180609 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 226983188 226983709 226983518 Y NA NA IRS1,LOC646736 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AC068138.1 64378 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 227172292 227172683 227172618 Y NA NA IRS1 IMR90 Hi-C 24141950 AC068138.1 124205 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 227292366 227292516 227292441 Y NA NA IRS1,LOC646736,RHBDD1 IMR90 Hi-C 24141950 AC068138.1 244279 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 227448462 227448628 227448535 Y NA NA IRS1,LOC646736,NYAP2 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 213847 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 227526564 227526855 227526789 Y IRS1 NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 135620 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 227580904 227581301 227581103 Y NA NA NA NA NA NA IRS1 81174 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 227656309 227656561 227656437 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 5914 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 228331050 228331499 228331159 Y NA AGFG1 AGFG1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AGFG1 3369 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 228437239 228437625 228437329 Y NA NA NA NA NA NA AGFG1 102371 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 230133790 230134515 230134391 Y NA NA NA NA NA NA PID1 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 230274489 230274615 230274507 Y PID1 NA NA NA NA NA PID1 140488 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 231276384 231276790 231276706 Y NA SP100 NA NA NA NA SP100 1867 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr2 231299753 231300176 231299905 Y SP110,SP110,SP140,SP140L,CAB39,SP100,SP100 SP100 NA NA NA NA SP100 21096 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 231649547 231649844 231649697 Y NA NA NA NA NA NA BANF1P3 61429 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 231838825 231839283 231839059 Y NA NA NA NA NA NA C2orf72 60922 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 231922388 231922877 231922602 Y NA C2orf72,PSMD1 NA NA NA NA PSMD1 2810 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 232026724 232026986 232026907 Y NA HTR2B,ARMC9 NA NA NA NA ARMC9 34274 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 232046537 232047112 232046768 Y NA ARMC9 NA NA NA NA ARMC9 14148 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 232106599 232106881 232106746 Y B3GNT7 ARMC9,AC018738.2 NA NA NA NA AC018738.2 11929 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 232176481 232176522 232176502 Y NA NA NA NA NA NA AC018738.2 57671 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 232176754 232176953 232176854 Y NA NA NA NA NA NA AC018738.2 57944 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 232276597 232276762 232276665 Y B3GNT7 SNORD82 NA NA NA NA SNORD82 46389 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 232277113 232277443 232277206 Y C2orf72 SNORD82 NA NA NA NA SNORD82 45708 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 232468888 232470128 232469532 Y DIS3L2,PTMA,NMUR1 NA NA NA NA NA LINC00471 91838 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr2 232478879 232479328 232479053 Y NA NA NA NA NA NA PTMA 90277 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 232531704 232531853 232531745 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 37752 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 232545684 232546083 232545868 Y COPS7B PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 23522 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 232580827 232581056 232580891 Y NA PTMA NA NA NA NA PTMA 11222 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 233096331 233096791 233096507 Y NA NA NA NA NA NA DIS3L2 272376 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 233180259 233180746 233180485 Y NA NA NA NA NA NA EIF4E2 232016 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 233250431 233250842 233250658 Y NA NA NA NA NA NA EIF4E2 161920 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 233377568 233377661 233377601 Y ECEL1,PRSS56 EIF4E2,TIGD1 MIR1471,ECEL1P2 IMR90 Hi-C 24141950 EIF4E2 35101 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 233763823 233764207 233764133 Y EFHD1,NGEF NA NA NA NA NA NGEF 111775 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 234074569 234074943 234074824 Y NA ATG16L1 NA NA NA NA ATG16L1 41754 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 234465976 234466363 234466311 Y HJURP USP40 NA NA NA NA USP40 7065 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr2 234608579 234609196 234608912 Y NA UGT1A6 NA NA NA NA UGT1A6 10326 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr2 234614877 234615153 234615015 Y NA UGT1A6 NA NA NA NA UGT1A6 16624 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 234670163 234670438 234670239 Y NA NA NA NA NA NA UGT1A6 71910 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 234673088 234673246 234673167 Y NA NA NA NA NA NA UGT1A6 74835 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr2 234882556 234882776 234882660 Y TRPM8 NA NA NA NA NA HJURP 121344 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 235353626 235353934 235353758 Y ARL4C ARL4C NA NA NA NA ARL4C 49763 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 235862299 235862667 235862586 Y SH3BP4 SH3BP4 NA NA NA NA SH3BP4 3682 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr2 235959667 235960159 235959834 Y NA NA NA NA NA NA SH3BP4 101050 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 237482983 237483115 237483021 Y NA NA NA NA NA NA GBX2 407971 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 237677514 237677881 237677605 Y NA NA IQCA1,CXCR7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COPS8 314074 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 237678524 237678883 237678772 Y NA NA IQCA1,CXCR7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COPS8 313072 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 237685373 237686074 237685499 Y CXCR7 NA IQCA1,CXCR7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COPS8 305881 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 237933842 237934085 237933935 Y NA NA CXCR7,IQCA1,ASB18 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 COPS8 57870 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 238036930 238037258 238037105 Y NA COPS8,AC105760.2 COPS8,COL6A3,MLPH,PRLH,RAB17,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 44470 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr2 238064626 238064865 238064744 Y COL6A3 NA COL6A3,COPS8,MLPH,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 72166 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 238092955 238093156 238093082 Y NA NA COL6A3,MLPH,LRRFIP1,RAB17,PRLH IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 100495 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.18629863801546 chr2 238131951 238132217 238132070 Y COL6A3 NA COL6A3,PRLH,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 139491 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 238163095 238163472 238163243 Y COL6A3 NA COL6A3 IMR90 Hi-C 24141950 COL6A3 157546 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 238168767 238169127 238169034 Y NA NA NA NA NA NA COL6A3 151891 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 238188791 238189175 238189021 Y COL6A3 NA MLPH,COL6A3,COPS8 IMR90 Hi-C 24141950 COL6A3 131843 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 238190645 238190921 238190759 Y NA NA MLPH,COL6A3,COPS8,RAB17,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 COL6A3 130097 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 238199102 238199242 238199209 Y COL6A3 NA COL6A3,COPS8,MLPH,LRRFIP1,PRLH,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 COL6A3 121776 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 238223884 238224369 238224058 Y COL6A3 NA NA NA NA NA COL6A3 96649 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 238292882 238293292 238292932 Y COPS8,LRRFIP1,COL6A3 COL6A3,AC112721.2 NA NA NA NA COL6A3 27726 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 238299841 238300132 238300017 Y COPS8,LRRFIP1,COL6A3 COL6A3,AC112721.2 NA NA NA NA COL6A3 20886 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr2 238317023 238317337 238317240 Y COPS8,COL6A3 COL6A3,AC112721.2 NA NA NA NA COL6A3 3681 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 238320410 238321055 238320789 Y COL6A3 AC112721.2 NA NA NA NA COL6A3 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 238321382 238321708 238321611 Y COL6A3 COL6A3,AC112721.2 NA NA NA NA COL6A3 364 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 238383141 238383356 238383272 Y NA AC112721.2,MLPH LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MLPH 8715 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr2 238392046 238392381 238392184 Y LRRFIP1,MLPH NA NA NA NA NA MLPH 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 238512238 238512938 238512467 Y LRRFIP1 LRRFIP1 LRRFIP1,MLPH,PRLH,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 LRRFIP1 21281 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 238582267 238582825 238582560 Y LRRFIP1 LRRFIP1 NA NA NA NA LRRFIP1 48048 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr2 238595538 238595801 238595647 Y LRRFIP1 NA NA NA NA NA LRRFIP1 61319 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 238596328 238596696 238596497 Y LRRFIP1 NA NA NA NA NA LRRFIP1 62109 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 238968617 238969014 238968782 Y NA SCLY NA NA NA NA SCLY 1087 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 239078028 239078257 239078143 Y NA FAM132B,ILKAP NA NA NA NA FAM132B 12405 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 239194414 239194788 239194667 Y NA HES6,PER2,TRAF3IP1 LOC643387,LOC151174,HES6 IMR90 Hi-C 24141950 PER2 1955 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 239347857 239348510 239348285 Y ASB1 ASB1 NA NA NA NA ASB1 14474 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 239593183 239593431 239593307 Y NA NA LOC151171 IMR90 Hi-C 24141950 TWIST2 161242 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 239758150 239758505 239758333 Y NA TWIST2 NA NA NA NA TWIST2 3477 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 239870450 239870747 239870599 Y NA NA LOC151171,TRAF3IP1,FLJ43879,MIR4786,TWIST2,HDAC4 IMR90 Hi-C 24141950 TWIST2 115777 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 240144176 240144295 240144274 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 176835 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 240147854 240148066 240148024 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 173064 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 240195931 240196233 240196082 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 124897 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 240196255 240196671 240196554 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 124459 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr2 240196933 240197336 240197049 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 123794 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 240200846 240201180 240201020 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 119950 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 240210840 240211190 240211015 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 109940 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 240213505 240213689 240213606 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 107441 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 240321591 240321797 240321685 Y HDAC4 AC062017.1,HDAC4 NA NA NA NA HDAC4 243 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 241190569 241190767 241190645 Y NA NA GPC1,ANKMY1,PP14571 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYEOV2 116345 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 241313615 241314182 241313884 Y NA NA GPC1 IMR90 Hi-C 24141950 GPC1 58906 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 241373489 241373922 241373594 Y GPC1 GPC1 NA NA NA NA GPC1 401 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 241374162 241374480 241374229 Y GPC1 GPC1 NA NA NA NA GPC1 1074 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 241585712 241586190 241585819 Y DUSP28,CAPN10,GPR35,MTERFD2 GPR35 NA NA NA NA GPR35 42864 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 241860652 241861096 241860920 Y GPC1,SNED1 NA LOC200772,SNED1,MTERFD2 IMR90 Hi-C 24141950 SNED1 75159 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 242171569 242171970 242171814 Y AGXT ANO7 NA NA NA NA ANO7 45645 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 242262018 242262304 242262161 Y NA SEPT2,HDLBP,FARP2 NA NA NA NA HDLBP 7542 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 242267084 242267405 242267274 Y MTERFD2 SEPT2,HDLBP,FARP2 NA NA NA NA HDLBP 12608 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 242304310 242304654 242304483 Y FARP2 HDLBP,FARP2 NA NA NA NA FARP2 10652 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr2 242425566 242425726 242425646 Y NA STK25 NA NA NA NA STK25 21419 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 242484648 242485001 242484705 Y NA STK25,BOK NA NA NA NA BOK 11135 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr2 242698564 242698745 242698671 Y THAP4,ATG4B,PDCD1,D2HGDH D2HGDH NA NA NA NA D2HGDH 26570 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr2 242714145 242714474 242714395 Y NEU4,D2HGDH,GAL3ST2 D2HGDH NA NA NA NA D2HGDH 42151 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 247683 247718 247701 Y NA C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1 NA NA NA NA C20orf96 21672 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 290672 290826 290757 Y SOX12,NRSN2 C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4 NA NA NA NA SOX12 13381 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.48287329751932 chr20 290991 291448 291293 Y C20orf54 C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4 NA NA NA NA SOX12 12759 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr20 352488 352859 352625 Y SRXN1,FAM110A,RBCK1 SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1 NA NA NA NA TRIB3 6402 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr20 447394 447636 447634 Y NA TBC1D20 NA NA NA NA TBC1D20 6197 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 623492 623974 623709 Y NA SRXN1 NA NA NA NA SRXN1 8040 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 625872 626198 626085 Y NA SRXN1 NA NA NA NA SRXN1 5816 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 641092 641461 641194 Y NA SRXN1 SRXN1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SRXN1 9078 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr20 709042 709425 709354 Y NA NA CSNK2A1,RSPO4,SRXN1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRXN1 77028 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 1168274 1168908 1168417 Y NA NA NA NA NA NA SNPH 76052 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr20 1310858 1311228 1310987 Y SDCBP2,SDCBP2,SIRPG NA NA NA NA NA FKBP1A 60578 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 1332285 1332772 1332374 Y C20orf46,SDCBP2 FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 39034 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 1333009 1333271 1333126 Y NA FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 38535 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 1372569 1372994 1372930 Y PSMF1,SDCBP2,SIRPB2,SIRPB1 FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 763 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 1398801 1399138 1399021 Y FKBP1A FKBP1A SNPH,RAD21L1,FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495 IMR90 Hi-C 24141950 FKBP1A 26995 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 1782055 1782441 1782118 Y NA NA SIRPA,LOC100289473,PDYN,STK35 IMR90 Hi-C 24141950 SIRPA 90713 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 1873360 1873375 1873370 Y NA SIRPA NA NA NA NA SIRPA 206 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 1887501 1887776 1887639 Y NSFL1C,SIRPB2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA SIRPA NA NA NA NA SIRPA 14347 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 2295693 2295966 2295830 Y SIRPA,SIRPA,SIRPA NA NA NA NA NA SNRPB 153533 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr20 2648841 2649036 2648938 Y NA NOP56,SNORD110,SNORD86,SNORD57,IDH3B,RP4-686C3.7,EBF4 EBF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-686C3.7 5843 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 3200687 3201082 3200885 Y NA DDRGK1,ITPA,SLC4A11 NA NA NA NA ITPA 13173 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 3788108 3788452 3788409 Y NA C20orf27,SPEF1,CENPB,CDC25B,MAVS NA NA NA NA CDC25B 22530 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 3932717 3933076 3932937 Y NA NA MIR103B2,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF24 61153 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr20 3961377 3961729 3961667 Y PANK2,PANK2,RNF24,RNF24 RNF24,FTLP3 NA NA NA NA RNF24 32500 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 3993168 3993585 3993445 Y PANK2,PANK2,RNF24,RNF24 RNF24,FTLP3 NA NA NA NA RNF24 644 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 4018656 4019040 4018859 Y PANK2,PANK2,PANK2,RNF24,RNF24 RNF24,FTLP3 RNF24,CENPB,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 FTLP3 16104 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 4063526 4063882 4063813 Y NA SMOX RNF24,PANK2,MAVS IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMOX 35745 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr20 4063933 4064413 4064294 Y NA SMOX RNF24,PANK2,MAVS IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMOX 35214 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr20 4065883 4066158 4066005 Y PANK2,RNF24,RNF24 SMOX RNF24,PANK2,MAVS,MIR103B2,LOC728228 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMOX 33469 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 4070458 4070670 4070629 Y PANK2,RNF24,RNF24 SMOX RNF24,PANK2,MAVS,LOC728228,CDC25B,C20orf29,MIR103B2,SMOX,ADRA1D IMR90 Hi-C 24141950 SMOX 28957 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 4116351 4116485 4116423 Y PANK2,PANK2,SMOX SMOX ADRA1D,SMOX IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMOX 16724 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 4198420 4198722 4198592 Y SMOX,ADRA1D ADRA1D NA NA NA NA ADRA1D 28999 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 4203123 4203484 4203336 Y NA ADRA1D NA NA NA NA ADRA1D 24237 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 4206645 4206924 4206784 Y NA ADRA1D NA NA NA NA ADRA1D 20797 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 4211389 4211638 4211535 Y ADRA1D ADRA1D NA NA NA NA ADRA1D 16083 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 4444215 4444654 4444345 Y NA NA ADRA1D,PRNP IMR90 Hi-C 24141950 RPS4XP2 164211 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 4487937 4488131 4488040 Y NA NA ADRA1D IMR90 Hi-C 24141950 RPS4XP2 120734 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 4493607 4493844 4493709 Y NA NA ADRA1D IMR90 Hi-C 24141950 RPS4XP2 115021 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 4674724 4674919 4674762 Y NA PRNP NA NA NA NA PRNP 9842 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 4954142 4954446 4954407 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2 SLC23A2 NA NA NA NA SLC23A2 34493 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 5046140 5046913 5046758 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2 NA SLC23A2,C20orf30,RASSF2,PCNA,PCNA-AS1,PRND,PRNT,CDS2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC23A2 57201 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 5060940 5061369 5061194 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2 PCNA,CDS2 NA NA NA NA PCNA 43903 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 5512444 5512652 5512587 Y CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1 NA NA NA NA NA GPCPD1 77020 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 5589880 5590681 5590650 Y CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 208 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr20 5637936 5638327 5638312 Y NA GPCPD1 C20orf196,GPCPD1,TRMT6 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 48264 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr20 8464613 8464952 8464618 Y PLCB1 NA NA NA NA NA TMX4 466137 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 8737014 8737369 8737294 Y NA NA NA NA NA NA PLCB4 310041 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 9390788 9390859 9390825 Y PLCB4,PLCB4,PLCB4 NA NA NA NA NA PLCB4 343378 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 10466571 10466854 10466711 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 53701 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 10477280 10477577 10477381 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 64410 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 10482481 10482747 10482670 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 69611 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 10492212 10492484 10492413 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 79342 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr20 10532947 10533172 10533034 Y NA NA NA NA NA NA JAG1 91842 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 10585324 10585599 10585462 Y NA JAG1 NA NA NA NA JAG1 39415 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 10655214 10655688 10655561 Y NA JAG1 NA NA NA NA JAG1 30200 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 10735371 10735385 10735378 Y NA NA NA NA NA NA JAG1 110357 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 13142278 13142281 13142280 Y NA NA NA NA NA NA ISM1 58137 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 13380021 13380161 13380091 Y NA NA NA NA NA NA ISM1 179603 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 14248741 14249040 14248807 Y NA NA NA NA NA NA FLRT3 67222 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 16217961 16218181 16218074 Y NA NA NA NA NA NA KIF16B 333897 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 16555525 16555956 16555640 Y NA KIF16B NA NA NA NA KIF16B 3447 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 17557154 17557457 17557241 Y NA BFSP1,DSTN NA NA NA NA DSTN 8646 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 17591305 17591483 17591343 Y NA BFSP1,DSTN NA NA NA NA DSTN 42797 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 17637776 17637930 17637851 Y BANF2 RRBP1 NA NA NA NA RRBP1 23010 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 17830512 17830807 17830760 Y NA NA BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD17 110782 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 17946136 17946538 17946496 Y SNX5,SNX5 SNORD17,SNX5,PTMAP3 NA NA NA NA SNX5 1085 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 19783112 19783320 19783290 Y NA RP1-122P22.2 RIN2,SLC24A3 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-122P22.2 46760 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 19848562 19849136 19848901 Y NA NA RIN2 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-122P22.2 112210 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 19860938 19861220 19861002 Y NA NA SLC24A3,RIN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP1-122P22.2 124586 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 19897230 19897457 19897372 Y NA NA NA NA NA NA NAA20 98303 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 19898701 19898830 19898754 Y NA NA NA NA NA NA NAA20 96930 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 20605285 20605597 20605591 Y RALGAPA2 NA NA NA NA NA RALGAPA2 85534 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 20652620 20652826 20652771 Y NA RALGAPA2 NA NA NA NA RALGAPA2 38305 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 20724152 20724406 20724200 Y RALGAPA2 RALGAPA2 RALGAPA2 IMR90 Hi-C 24141950 RALGAPA2 33021 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 21417020 21417216 21417107 Y NA NA XRN2 IMR90 Hi-C 24141950 NKX2-2 75448 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 22744166 22744500 22744407 Y THBD NA THBD,NXT1,NAPB IMR90 Hi-C 24141950 FOXA2 180073 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 23087078 23087428 23087253 Y CD93,GZF1 NA NA NA NA NA NXT1 241945 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 23125768 23126430 23126237 Y THBD,CD93,GZF1,CST3 NA LOC200261 IMR90 Hi-C 24141950 NXT1 202943 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 23136585 23137102 23136883 Y THBD,CD93,GZF1 NA NA NA NA NA NXT1 192271 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr20 23206035 23206305 23206209 Y THBD,CD93,GZF1,CST3 NA THBD,CD93 IMR90 Hi-C 24141950 NXT1 123068 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 23360936 23361138 23361045 Y SSTR4,NAPB NXT1,RP3-322G13.7,RP3-322G13.5,GZF1,NAPB NA NA NA NA GZF1 20149 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 24451680 24451884 24451790 Y TMEM90B SYNDIG1 NA NA NA NA SYNDIG1 3845 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 25218471 25218756 25218634 Y NA ENTPD6,PYGB NA NA NA NA PYGB 7949 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr20 25671297 25671837 25671511 Y NA ZNF337 NA NA NA NA ZNF337 3640 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 25842208 25842444 25842317 Y ZNF337 NA NA NA NA NA ZNF337 166731 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 25846181 25846562 25846485 Y ZNF337 NA NA NA NA NA ZNF337 170704 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.18629863801546 chr20 30148718 30149081 30148825 Y HCK,HM13 HM13,ID1 NA NA NA NA ID1 42005 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 30183712 30184220 30184085 Y ID1 ID1 HM13 MCF7 ChIA-PET 22265404 ID1 6866 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 30190743 30190994 30190797 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 92 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 30191850 30192346 30192159 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 764 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.18629863801546 chr20 30194967 30195344 30195216 Y NA ID1 NA NA NA NA ID1 3881 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 30262675 30263005 30262853 Y HCK,BCL2L1 BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 46787 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr20 30298803 30298834 30298814 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 10958 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 30300504 30300973 30300648 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 8819 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr20 30301047 30301377 30301326 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 8415 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr20 30700574 30701059 30700820 Y HCK,C20orf112,TM9SF4,PLAGL2 TM9SF4 NA NA NA NA TM9SF4 5265 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 30705137 30705472 30705281 Y HCK,PLAGL2 TM9SF4 NA NA NA NA TM9SF4 9828 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 31063072 31063625 31063366 Y NA NA ASXL1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf112 107251 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr20 31099798 31099830 31099816 Y NA NA NA NA NA NA C20orf112 71046 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 31152951 31153099 31153025 Y PLAGL2,MAPRE1 C20orf112 NA NA NA NA C20orf112 17777 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 31410946 31411262 31411169 Y NA MAPRE1 NA NA NA NA MAPRE1 5247 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 31998840 31999088 31998873 Y C20orf185 CDK5RAP1,SNTA1 CDK5RAP1 IMR90 Hi-C 24141950 CDK5RAP1 11473 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 32142835 32143155 32142948 Y C20orf186,CDK5RAP1,CHMP4B NA NA NA NA NA CBFA2T2 66954 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr20 32690137 32690399 32690268 Y NA EIF2S2,RPS2P1 NA NA NA NA EIF2S2 7739 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 32694090 32694253 32694172 Y NA EIF2S2,RPS2P1 NA NA NA NA EIF2S2 3885 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 32803456 32803920 32803688 Y NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 93688 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr20 32826582 32826856 32826719 Y TP53INP2 NA EIF2S2,AHCY,ASIP,ITCH,DYNLRB1,PIGU IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 70752 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 33064297 33064587 33064427 Y ACSS2 FDX1P1,DYNLRB1 NA NA NA NA FDX1P1 2018 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 33100877 33101215 33100990 Y NA FDX1P1,DYNLRB1,MAP1LC3A NA NA NA NA DYNLRB1 999 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 33150860 33150919 33150894 Y NA DYNLRB1,MAP1LC3A NA NA NA NA MAP1LC3A 18202 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 33653192 33653349 33653271 Y NA TRPC4AP NA NA NA NA TRPC4AP 25325 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 33769921 33770187 33770054 Y NA PROCR,MT1P3 NA NA NA NA PROCR 12045 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 33900177 33900484 33900409 Y GSS,EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 NA NA NA NA EIF6 29389 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 34357066 34357356 34357208 Y NA RBM39,PHF20 NA NA NA NA PHF20 540 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr20 34470947 34471302 34471125 Y NA NA NA NA NA NA SCAND1 74092 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 34471781 34472424 34472101 Y NA NA NA NA NA NA SCAND1 72970 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 34790985 34791133 34791034 Y NA NA NA NA NA NA DLGAP4 101125 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 35234952 35235695 35235080 Y NA RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24 NA NA NA NA C20orf24 2815 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 35251667 35252083 35251778 Y NA C20orf24 NA NA NA NA C20orf24 19530 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 35464098 35464342 35464182 Y RBL1,DSN1,DSN1 NA NA NA NA NA DSN1 63877 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr20 35490387 35490628 35490526 Y MANBAL,KIAA0889 NA KIAA0889 MCF7 ChIA-PET 22265404 SAMHD1 87618 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr20 35612420 35612442 35612434 Y RBL1 SAMHD1 NA NA NA NA SAMHD1 34174 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 35821029 35821195 35821110 Y NA RPN2 GHRH IMR90 Hi-C 24141950 RPN2 16216 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 35905068 35905696 35905172 Y SAMHD1,SRC,MANBAL MANBAL RPN2,NNAT,BLCAP,MANBAL,GHRH,SRC,LOC100287792,VSTM2L,TTI1,RPRD1B IMR90 Hi-C 24141950 MANBAL 10345 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 35923453 35923684 35923588 Y SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC MANBAL,SRC NA NA NA NA MANBAL 7412 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 35943689 35943832 35943744 Y NA MANBAL,SRC NA NA NA NA SRC 27256 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 36034782 36035452 36035129 Y C20orf132,VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 36484 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 36040005 36040428 36040132 Y VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 31508 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 36040566 36040861 36040811 Y NA RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 31075 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 36042310 36042952 36042529 Y NA RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 28984 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 36045421 36045655 36045607 Y NA RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 26281 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 36389387 36389716 36389551 Y NA NA VSTM2L IMR90 Hi-C 24141950 CTNNBL1 68979 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 36763112 36763416 36763201 Y NA TGM2 NA NA NA NA TGM2 29564 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 36772576 36772945 36772677 Y RPRD1B,BPI TGM2 NA NA NA NA TGM2 20035 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 36796708 36797026 36796907 Y CTNNBL1,RPRD1B,RALGAPB,BPI TGM2 TGM2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TGM2 3728 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 37398577 37398739 37398665 Y NA ACTR5,PPP1R16B NA NA NA NA ACTR5 23492 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 37603521 37603525 37603523 Y NA DHX35 NA NA NA NA DHX35 14579 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 38970274 38970496 38970388 Y MAFB NA NA NA NA NA MAFB 345384 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 39826598 39826945 39826630 Y CHD6 NA NA NA NA NA PLCG1 62998 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr20 39878072 39878223 39878164 Y NA NA NA NA NA NA ZHX3 66089 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 39958158 39958419 39958360 Y NA ZHX3 PLCG1,ZHX3,LPIN3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZHX3 13846 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr20 40193452 40193754 40193691 Y NA NA NA NA NA NA CHD6 51379 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 42286061 42286420 42286177 Y SRSF6,L3MBTL1,MYBL2 RPL27AP,MYBL2 MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL27AP 6898 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr20 42381187 42381490 42381296 Y C20orf111 NA TOX2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 87433 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 42571412 42571561 42571487 Y C20orf111 TOX2 NA NA NA NA TOX2 29908 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr20 43271158 43271637 43271427 Y NA ADA NA NA NA NA ADA 7237 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 43876988 43877346 43877094 Y NA SLPI NA NA NA NA SLPI 3859 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 43970100 43970351 43970215 Y NA SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 4713 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 43972821 43973151 43973055 Y SYS1,SDC4 SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 1913 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr20 44410242 44410504 44410445 Y NA WFDC3,DNTTIP1,UBE2C,SNX21 NA NA NA NA WFDC3 8067 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 44632907 44633142 44632963 Y PCIF1,CD40,ZNF335 ZNF335,MMP9 SLC12A5,NCOA5 IMR90 Hi-C 24141950 MMP9 2405 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 44855330 44855616 44855473 Y ZNF334,SLC12A5,CDH22 NA NA NA NA NA RPL13P2 129173 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 45324546 45324927 45324721 Y TP53RK TP53RK,SLC2A10 SLC13A3,SLC2A10,C20orf123,EYA2,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 TP53RK 8128 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr20 45946049 45946481 45946179 Y NA RP4-569M23.2,ZMYND8 NA NA NA NA RP4-569M23.2 32824 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 45962816 45963214 45963054 Y NA RP4-569M23.2,ZMYND8 NA NA NA NA RP4-569M23.2 16091 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 45987479 45988292 45987961 Y NA RP4-569M23.2,ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 3912 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 45988883 45989283 45988988 Y SULF2 RP4-569M23.2,ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 5316 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 45989347 45989834 45989660 Y SULF2 RP4-569M23.2,ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 5780 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr20 46299616 46300006 46299878 Y NCOA3,SULF2,SULF2 NA NA NA NA NA SULF2 113354 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 46420724 46421103 46420967 Y NA SULF2 SULF2,PREX1,ARFGEF2 IMR90 Hi-C 24141950 SULF2 7364 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 46556797 46557054 46556926 Y NA NA NA NA NA NA SULF2 143437 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 46601191 46601469 46601377 Y SULF2,SULF2 NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SULF2 187831 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 46618615 46619022 46618889 Y NA NA SULF2,CMTM7,BCAS1 MCF7 ChIA-PET 22265404,19890323 SULF2 205255 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 46653872 46653986 46653882 Y NA NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SULF2 240512 CAGE T98G hg19 FANTOM5 6.52464250908501 chr20 47397993 47398168 47398081 Y NA PREX1 NA NA NA NA PREX1 44252 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 47803381 47804147 47803544 Y PREX1,STAU1 STAU1,DDX27 NA NA NA NA STAU1 477 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 47961628 47961789 47961714 Y NA NA B4GALT5 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD12 66408 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 48293445 48293839 48293746 Y NA B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 34576 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 48315836 48316073 48315912 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 12342 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 48334324 48334539 48334447 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 B4GALT5 K562 ChIA-PET 22265404 B4GALT5 5909 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 48385312 48385495 48385398 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNRPFP1 40933 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 48532841 48533167 48533004 Y SPATA2,SPATA2 SPATA2,RNF114 NA NA NA NA SPATA2 2761 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 48644508 48644680 48644594 Y B4GALT5,SLC9A8,SNAI1,TMEM189,PTPN1,CEBPB SNAI1 TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,SNAI1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNAI1 46972 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 48646361 48646933 48646559 Y NA SNAI1 TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,SNAI1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNAI1 48825 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr20 48663510 48663968 48663673 Y NA NA SNAI1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SNAI1 65974 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 48902426 48902799 48902722 Y CEBPB RP11-290F20.3 LOC284751,PARD6B,PTPN1,FAM65C,MIR645,CEBPB IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-290F20.3 20403 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 48922474 48922671 48922573 Y NA RP11-290F20.3 NA NA NA NA RP11-290F20.3 40451 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 48924890 48925591 48925260 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 RP11-290F20.3 NA NA NA NA RP11-290F20.3 42867 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr20 48951795 48951969 48951898 Y NA NA NA NA NA NA RP11-290F20.3 69772 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 49032230 49032497 49032297 Y NA NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 92394 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 49100027 49100544 49100221 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 24347 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr20 49157621 49157908 49157761 Y NA PTPN1 NA NA NA NA PTPN1 32730 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 49341306 49341865 49341532 Y NA FAM65C,PARD6B NCOA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 PARD6B 4216 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 49407275 49407470 49407371 Y MOCS3 BCAS4 ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCAS4 1961 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr20 49524499 49524706 49524614 Y ADNP RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA RP5-914P20.5 20815 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 49650336 49650514 49650422 Y NA KCNG1 KCNG1,NFATC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KCNG1 12670 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 49710089 49710352 49710221 Y NA NA NA NA NA NA KCNG1 72423 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 49838536 49838841 49838768 Y NA NA KCNG1 IMR90 Hi-C 24141950 KCNG1 200870 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 49947847 49948420 49948354 Y NA NA KCNG1,NFATC2,ATP9A,BCAS4,DPM1,MOCS3 IMR90 Hi-C 24141950 KCNG1 310181 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 49982609 49983533 49983215 Y KCNG1 NA NA NA NA NA KCNG1 344943 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 50072988 50073809 50073517 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 275263 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 50178083 50178314 50178273 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 170758 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 50180369 50180507 50180463 Y NFATC2 NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 168565 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr20 50247670 50248383 50248096 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 100689 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 50272756 50273155 50272761 Y ATP9A NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 75917 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 50366772 50367203 50366881 Y ZFP64,ATP9A RP5-827A12.2,ATP9A NA NA NA NA ATP9A 15970 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 50383575 50384083 50383723 Y ATP9A RP5-827A12.2,ATP9A NA NA NA NA ATP9A 402 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 51026712 51027212 51026874 Y NA NA NA NA NA NA ZFP64 207865 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 51071156 51071538 51071347 Y NA NA BCAS1,TSHZ2 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP64 252309 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 51962199 51962423 51962230 Y NA NA NA NA NA NA ZNF217 262023 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 52201463 52201802 52201714 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 22644 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr20 52239995 52240318 52240062 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BMP7,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 15549 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 52294676 52294905 52294769 Y NA NA BMP7,SUMO1P1,BCAS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF217 70230 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 52353948 52354213 52354172 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 129502 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 52355086 52355238 52355182 Y NA NA ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 130640 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr20 52356771 52357178 52357063 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 132325 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 52371075 52371265 52371223 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 146629 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 52390351 52390640 52390407 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 165905 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr20 52391089 52391563 52391364 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 166643 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 52407558 52407732 52407573 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 183112 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 52444580 52444892 52444748 Y NA NA ZNF217,SUMO1P1,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 220134 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 52445043 52445455 52445100 Y NA NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 220597 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 52445816 52446339 52446069 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 221370 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 52532315 52532889 52532591 Y ZNF217 NA SUMO1P1,BMP7,ZNF217 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFDN4 289497 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 52533564 52534521 52533763 Y ZNF217 NA SUMO1P1,BMP7,ZNF217 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFDN4 287865 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 52543055 52543571 52543250 Y ZNF217 NA NA NA NA NA PFDN4 278815 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 52565886 52566139 52565988 Y ZNF217 NA NA NA NA NA PFDN4 256247 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 53116440 53116542 53116504 Y DOK5 NA NA NA NA NA PFDN4 294054 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 55003565 55003931 55003789 Y NA AURKA,CSTF1 NA NA NA NA CSTF1 38138 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 55362710 55362938 55362792 Y AURKA,TFAP2C NA TFAP2C MCF7 ChIA-PET 22265404 TFAP2C 160352 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 55363467 55363682 55363577 Y NA NA TFAP2C MCF7 ChIA-PET 22265404 TFAP2C 161109 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 55976268 55976716 55976350 Y RBM38,ZBP1,PMEPA1 MTRNR2L3,RBM38 NA NA NA NA RBM38 11805 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 56273255 56273697 56273462 Y PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1 PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 10895 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 56293544 56293843 56293665 Y NA PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 8952 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 56592321 56592469 56592395 Y PMEPA1,PMEPA1 NA ZBP1 IMR90 Hi-C 24141950 RAB22A 290283 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 56592800 56593208 56592856 Y NA NA ZBP1,PMEPA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB22A 289544 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr20 56881907 56882420 56882011 Y STX16,RAB22A RAB22A NA NA NA NA RAB22A 332 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 57125775 57125866 57125821 Y NA APCDD1L,APCDD1L-AS1 NA NA NA NA APCDD1L-AS1 37340 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 57198784 57199334 57199089 Y NA STX16,STX16-NPEPL1 NA NA NA NA STX16 24994 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr20 57270107 57270808 57270490 Y NA STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1 NA NA NA NA NPEPL1 7920 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 57585788 57586041 57585915 Y NA CTSZ,ATP5E,SLMO2 NA NA NA NA CTSZ 5486 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 57586300 57586427 57586364 Y NA CTSZ,ATP5E,SLMO2 NA NA NA NA CTSZ 5998 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 58803424 58803657 58803451 Y PPP1R3D,C20orf177,C20orf197 NA NA NA NA NA PPP1R3D 290072 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 59761167 59761446 59761307 Y NA NA CDH26,LOC284757,C20orf197,CDH4 IMR90 Hi-C 24141950 CDH4 64036 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 60011356 60011607 60011563 Y CDH4 NA NA NA NA NA CDH4 185874 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 60095984 60096281 60096088 Y CDH4 NA NA NA NA NA CDH4 270502 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 60719468 60719634 60719593 Y SS18L1,GTPBP5 LSM14B,PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 2646 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 60956743 60957219 60956871 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA RPS21 2953 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 61192605 61193059 61192901 Y NA NA NA NA NA NA SLCO4A1 78738 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 61200879 61201219 61201079 Y NA NA RPS21,C20orf151,CABLES2,C20orf166,C20orf166-AS1,NTSR1,COL9A3,OGFR,C20orf20 IMR90 Hi-C 24141950 SLCO4A1 70578 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr20 61283206 61283870 61283565 Y OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1 SLCO4A1 NA NA NA NA SLCO4A1 11409 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr20 61425509 61425950 61425706 Y DPH3P1,DIDO1,OGFR OGFR NA NA NA NA OGFR 8237 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr20 61554875 61554902 61554887 Y DIDO1 DIDO1 NA NA NA NA DIDO1 12402 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 61555881 61556606 61556058 Y DIDO1 DIDO1 NA NA NA NA DIDO1 10698 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 61764397 61764626 61764512 Y NA HAR1B LOC63930,NKAIN4,BIRC7,HAR1B,HAR1A IMR90 Hi-C 24141950 HAR1B 32726 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 62313782 62314225 62314041 Y NA STMN3,RTEL1,ZGPAT,ARFRP1 NA NA NA NA ZGPAT 22592 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 62466212 62466776 62466445 Y OPRL1,ABHD16B ZBTB46,TPD52L2 PTK6,SLC2A4RG,ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,ABHD16B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZBTB46 5615 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.77944795702319 chr20 62676233 62676312 62676273 Y SLC2A4RG,TCEA2,SOX18 ZNF512B,SOX18,TCEA2,RGS19 NA NA NA NA ZNF512B 1801 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr20 62887659 62888425 62887862 Y SAMD10,PCMTD2 PCMTD2 NA NA NA NA PCMTD2 2565 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr21 11174514 11174910 11174556 Y NA NA BAGE5,TPTE IMR90 Hi-C 24141950 TEKT4P2 1207929 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr21 16241159 16241535 16241312 Y NRIP1 NA NRIP1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NRIP1 193786 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 17104761 17105053 17104812 Y USP25 USP25 NA NA NA NA USP25 4417 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 17276028 17276063 17276046 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 164779 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 17842479 17842645 17842562 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 187390 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 17958916 17959192 17958984 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 303827 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 18984370 18984546 18984496 Y NA BTG3 NA NA NA NA BTG3 1105 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 19156522 19156877 19156578 Y BTG3,C21orf91 C21orf91 NA NA NA NA C21orf91 32826 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 26952057 26952278 26952105 Y JAM2 MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 25551 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr21 26962945 26963646 26963455 Y NA MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 14183 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 27275894 27276232 27276045 Y NA NA NA NA NA NA ATP5J 169910 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 27285950 27286116 27286033 Y APP NA NA NA NA NA ATP5J 179966 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 27298348 27298650 27298452 Y NA NA NA NA NA NA ATP5J 192364 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 28207147 28207505 28207325 Y NA ADAMTS1 NA NA NA NA ADAMTS1 8223 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr21 28336800 28337144 28336952 Y ADAMTS1,ADAMTS5 NA NA NA NA NA ADAMTS5 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE T98G hg19 FANTOM5 2.17488083636167 chr21 30555048 30555502 30555259 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,BACH1 NA NA NA NA U3 4088 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 30567933 30569654 30568878 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,BACH1 NA NA NA NA BACH1 3541 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr21 30590117 30590529 30590261 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,BACH1 NA NA NA NA BACH1 25725 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 31029045 31029571 31029224 Y BACH1,BACH1 NA NA NA NA NA GRIK1 280780 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 32654582 32654950 32654771 Y NA NA NA NA NA NA AP000251.3 274608 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 33042550 33042842 33042696 Y NA SOD1 NA NA NA NA SOD1 12615 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 33105563 33105881 33105775 Y SCAF4 SCAF4 NA NA NA NA SCAF4 3175 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 33836273 33836551 33836412 Y NA NA NA NA NA NA C21orf119 72834 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 33853478 33853730 33853567 Y NA NA NA NA NA NA C21orf119 90039 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 33893754 33894020 33893930 Y C21orf63 NA NA NA NA NA C21orf59 89156 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr21 34181776 34182141 34181959 Y OLIG1,C21orf62 C21orf49 NA NA NA NA C21orf49 39365 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 34659541 34659728 34659635 Y NA IL10RB,IFNAR1 NA NA NA NA IL10RB 22878 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 34818143 34818502 34818323 Y OLIG2,OLIG1 IFNGR2,TMEM50B,DNAJC28 NA NA NA NA TMEM50B 31816 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 34836293 34836479 34836379 Y OLIG2,OLIG1,CRYZL1,TMEM50B TMEM50B,DNAJC28 NA NA NA NA TMEM50B 13839 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 35099909 35100119 35099917 Y NA NA NA NA NA NA CRYZL1 85677 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 35319562 35320491 35320153 Y NA ATP5O NA NA NA NA ATP5O 33278 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 35750965 35751183 35751074 Y KCNE1 AP000322.53 NA NA NA NA AP000322.53 43081 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 35917479 35917977 35917777 Y KCNE1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 67464 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr21 36143971 36144119 36144107 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 158530 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr21 36179679 36180279 36179996 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 194238 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 36208387 36209191 36208566 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 222946 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr21 36227422 36227493 36227482 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 241981 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 36254204 36254725 36254297 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 268763 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 36419290 36419780 36419662 Y RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 433849 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 37712607 37712952 37712729 Y NA MORC3,CHAF1B NA NA NA NA MORC3 22120 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 38072912 38073314 38073050 Y SIM2 SIM2 HLCS IMR90 Hi-C 24141950 SIM2 3479 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr21 38282263 38282520 38282368 Y CLDN14 NA NA NA NA NA AP000704.5 54292 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr21 38630405 38630786 38630710 Y DYRK1A,DYRK1A AP001432.14,DSCR3 NA NA NA NA DSCR3 7476 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr21 38935728 38936411 38936235 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 199636 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.77944795702319 chr21 38936686 38937128 38936852 Y DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 200594 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr21 39661705 39662059 39661845 Y KCNJ15 NA NA NA NA NA ETS2 513172 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 40317605 40318001 40317816 Y NA NA ETS2,LINC00114,ERG IMR90 Hi-C 24141950 ETS2 142374 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 40338093 40338255 40338153 Y NA NA ETS2,LINC00114,PSMG1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS2 162862 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 40386657 40387043 40386856 Y NA NA ETS2,LINC00114 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 166734 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr21 40673787 40673929 40673891 Y NA BRWD1,HMGN1 NA NA NA NA BRWD1 17556 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 40753076 40753485 40753292 Y WRB HMGN1,WRB NA NA NA NA WRB 2906 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr21 42485232 42485526 42485376 Y NA NA NA NA NA NA BACE2 52202 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr21 42610946 42611279 42611113 Y BACE2 NA NA NA NA NA BACE2 73218 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 42743414 42743752 42743584 Y NA MX2,MX1 NA NA NA NA MX2 11544 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 43068970 43069202 43069119 Y NA NA RIPK4,LINC00111,C2CD2 IMR90 Hi-C 24141950 RIPK4 116064 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 43174806 43174946 43174886 Y NA RIPK4 NA NA NA NA RIPK4 10320 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 43181534 43181711 43181623 Y MX2,MX1,MX1,MX1,ZNF295,ABCG1 RIPK4 NA NA NA NA RIPK4 3555 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr21 43188787 43189188 43188843 Y RIPK4 RIPK4 NA NA NA NA RIPK4 3521 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr21 43214290 43214658 43214474 Y NA RIPK4 NA NA NA NA RIPK4 29024 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr21 43431472 43431831 43431677 Y NA NA NA NA NA NA C2CD2 59473 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 43460613 43461088 43460825 Y C2CD2,SLC37A1 NA NA NA NA NA C2CD2 88614 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr21 43518001 43518239 43518148 Y ZNF295,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1 NA NA NA NA NA ABCG1 99560 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 44355985 44356328 44356154 Y NA PKNOX1 U2AF1 IMR90 Hi-C 24141950 PKNOX1 36292 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 44395482 44395891 44395810 Y NA PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 2862 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr21 44395922 44396228 44396080 Y WDR4,U2AF1,CBS PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 3302 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 44425410 44425661 44425536 Y NA PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 32790 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 44582937 44583304 44583126 Y NA NA HSF2BP,LINC00313,U2AF1 IMR90 Hi-C 24141950 U2AF1 57240 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 44631329 44631684 44631488 Y NA NA LINC00313,SIK1,HSF2BP,LINC00319 IMR90 Hi-C 24141950 U2AF1 105632 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 44753292 44753457 44753456 Y NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 91551 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 44753663 44753942 44753875 Y NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 91066 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr21 44775827 44776035 44775963 Y NA NA HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90 Hi-C 24141950 SIK1 68973 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 44816664 44817004 44816885 Y NA SIK1 NA NA NA NA SIK1 28004 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr21 44914466 44914931 44914660 Y PDXK,U2AF1,SIK1 NA CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 69458 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr21 44918002 44918401 44918083 Y NA NA CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 72994 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr21 45020604 45020960 45020754 Y NA NA NA NA NA NA HSF2BP 56414 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr21 45198694 45199238 45199184 Y NA CSTB,RRP1 NA NA NA NA CSTB 4368 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 45237788 45238060 45237872 Y TRAPPC10,ICOSLG,AGPAT3 CSTB,RRP1,MYL6P1,AGPAT3 NA NA NA NA RRP1 30394 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 45528208 45528453 45528331 Y NA PWP2,C21orf33 NA NA NA NA PWP2 3037 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 45566076 45566451 45566257 Y TRAPPC10,ICOSLG,C21orf2 PWP2,C21orf33 NA NA NA NA C21orf33 14589 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr21 45573584 45574271 45573954 Y PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG PWP2,C21orf33 NA NA NA NA C21orf33 22097 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 45614142 45614593 45614385 Y NA ICOSLG AIRE,PFKL,ICOSLG,C21orf33,PWP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ICOSLG 44256 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 46461202 46461645 46461341 Y ITGB2,ADARB1 ADARB1 ADARB1,SSR4P1 K562 ChIA-PET 22265404 ADARB1 30123 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 46470710 46471152 46470922 Y NA ADARB1 NA NA NA NA ADARB1 20616 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 46495480 46495526 46495490 Y KRTAP10-12,ADARB1 ADARB1 NA NA NA NA ADARB1 3712 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 46737459 46737695 46737585 Y COL18A1 POFUT2 COL18A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 POFUT2 31646 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 46738832 46739011 46738964 Y COL18A1 POFUT2 COL18A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 POFUT2 33019 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr21 46739517 46739788 46739671 Y NA POFUT2 COL18A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 POFUT2 33704 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 46783934 46784395 46784118 Y NA COL18A1 ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COL18A1 38657 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr21 46824359 46824541 46824457 Y COL18A1 COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 1307 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr21 46859041 46859207 46859093 Y NA COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 35989 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 46937763 46937981 46937791 Y POFUT2,SLC19A1,SLC19A1 SLC19A1 NA NA NA NA SLC19A1 24344 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 47295042 47295436 47295304 Y NA NA NA NA NA NA COL6A1 104215 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr21 47394030 47394545 47394409 Y LSS,COL6A2,C21orf56,COL6A1 COL6A1 COL6A1 K562 ChIA-PET 22265404 COL6A1 5106 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr21 47394721 47394936 47394787 Y NA COL6A1 COL6A1 K562 ChIA-PET 22265404 COL6A1 4715 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr21 47563985 47564239 47564071 Y NA COL6A2 NA NA NA NA COL6A2 47974 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 17567178 17567397 17567371 Y CECR2,IL17RA,CECR1 IL17RA,CECR6 NA NA NA NA IL17RA 3334 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 18264097 18264299 18264131 Y CECR2,BCL2L13,BID,BID BID NA NA NA NA BID 8561 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE T98G hg19 FANTOM5 2.47145549586554 chr22 19410653 19410889 19410838 Y HIRA MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39 NA NA NA NA MRPL40 6536 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 19427862 19428165 19428014 Y NA MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39,UFD1L,CDC45 NA NA NA NA HIRA 5059 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 19433007 19433028 19433018 Y NA MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39,UFD1L,CDC45 NA NA NA NA HIRA 196 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr22 19476851 19477107 19476979 Y NA HIRA,AC000068.5,C22orf39,UFD1L,CDC45 NA NA NA NA CDC45 11869 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 19564748 19565059 19564792 Y CLDN5 NA HIRA,CLDN5,LOC150185,CLTCL1,UFD1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC45 99766 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 19874514 19874924 19874610 Y TRMT2A,C22orf29,GNB1L C22orf29,GNB1L,AC000078.5 GNB1L MCF7 ChIA-PET 22265404 AC000078.5 1702 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr22 19930770 19931097 19930953 Y ZDHHC8,COMT COMT,TXNRD2 NA NA NA NA TXNRD2 3429 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 20009239 20009629 20009574 Y NA ARVCF NA NA NA NA ARVCF 6908 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr22 20142939 20143182 20143142 Y NA RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8 NA NA NA NA ZDHHC8 27960 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr22 20258205 20258516 20258358 Y NA RTN4R,DGCR6L NA NA NA NA RTN4R 10253 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr22 20848736 20849050 20848893 Y NA KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 536 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 20850844 20851071 20850923 Y PI4KA,AIFM3,AIFM3 KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 2644 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr22 20863506 20864089 20863850 Y MED15 KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 15306 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr22 21131289 21131349 21131319 Y NA NA NA NA NA NA TMEM191A 78069 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 22010846 22011267 22010978 Y YPEL1 YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 6287 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 22011632 22012115 22011859 Y NA YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 7073 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.48287329751932 chr22 22170870 22171333 22171102 Y HIC2,PPM1F,MAPK1 MAPK1 NA NA NA NA MAPK1 48637 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 23624437 23624690 23624563 Y BCR NA NA NA NA NA BCR 104546 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 23863249 23863551 23863355 Y NA NA ZDHHC8P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC8P1 120336 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 23863943 23864332 23864232 Y GNAZ,RTDR1,BCR NA ZDHHC8P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC8P1 121030 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr22 24080371 24080411 24080401 Y NA GUSBP11,ZNF70,CHCHD10,SMARCB1 NA NA NA NA ZNF70 10868 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 24234499 24234593 24234547 Y NA SLC2A11,MIF NA NA NA NA MIF 308 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 24255997 24256450 24256302 Y C22orf43,CABIN1,CABIN1 MIF NA NA NA NA MIF 21806 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr22 24767148 24767407 24767278 Y GGT1 NA NA NA NA NA SPECC1L-ADORA2A 102282 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr22 24870306 24870552 24870389 Y GGT1 NA NA NA NA NA SNRPD3 78919 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 25082452 25082825 25082629 Y ADORA2A,GGT1 NA PIWIL3 IMR90 Hi-C 24141950 FAM211B 95277 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 25587613 25587664 25587639 Y NA NA NA NA NA NA LRP5L 211680 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 25844657 25845002 25844694 Y NA LRP5L,CRYBB2P1 NA NA NA NA CRYBB2P1 2585 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 26967025 26967265 26967145 Y TFIP11 HMGB1P10,TPST2 NA NA NA NA HMGB1P10 12533 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 27107290 27107513 27107356 Y NA CTA-211A9.5 MIAT IMR90 Hi-C 24141950 CTA-211A9.5 40560 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr22 27508990 27509624 27509325 Y NA NA PITPNB,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1172A22.1 109064 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr22 28314180 28314595 28314448 Y PITPNB TTC28-AS1,PITPNB NA NA NA NA PITPNB 58 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr22 29188218 29188399 29188309 Y NA CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6 NA NA NA NA XBP1 6186 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr22 29428666 29428910 29428854 Y C22orf31 KREMEN1 NA NA NA NA KREMEN1 38156 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 29705410 29705600 29705517 Y GAS2L1 EWSR1,RHBDD3,GAS2L1,RASL10A NA NA NA NA GAS2L1 4838 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 30018031 30018407 30018261 Y NF2 NIPSNAP1,NF2 NA NA NA NA NF2 20486 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 30591785 30593544 30592394 Y NA LIF NA NA NA NA LIF 47296 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr22 30601535 30602099 30601994 Y MTMR3,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF LIF HORMAD2,LIF,GATSL3 IMR90 Hi-C 24141950 LIF 38741 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr22 30608541 30609106 30608754 Y MTMR3,TBC1D10A,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF LIF NA NA NA NA LIF 31734 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 30631749 30632163 30631958 Y RNF215,MTFP1,GAL3ST1 LIF NA NA NA NA LIF 8677 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 30647782 30648063 30647863 Y SEC14L2,RNF215,GAL3ST1,LIF LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 6942 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 30650339 30650644 30650477 Y LIF LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 9499 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 30651841 30652045 30651989 Y RNF215 LIF,GATSL3 LIF IMR90 Hi-C 24141950 LIF 11001 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 30653574 30654311 30654075 Y RNF215,GAL3ST1 LIF,GATSL3 LIF IMR90 Hi-C 24141950 LIF 12734 CAGE T98G hg19 FANTOM5 2.17488083636167 chr22 30657088 30657478 30657295 Y MTMR3,TBC1D10A,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM LIF,GATSL3 LIF IMR90 Hi-C 24141950 LIF 16248 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr22 30666798 30667328 30667040 Y MTMR3,TBC1D10A,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM LIF,GATSL3 NA NA NA NA GATSL3 16288 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 30702453 30702564 30702503 Y TBC1D10A,SF3A1,CCDC157 GATSL3,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1 NA NA NA NA TBC1D10A 18471 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 31005316 31005631 31005442 Y SMTN,OSM,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1,DUSP18,SLC35E4 TCN2,PES1,SLC35E4 NA NA NA NA PES1 4246 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 31606567 31606987 31606713 Y SMTN,RNF185,LIMK2 LIMK2 NA NA NA NA LIMK2 342 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 32048774 32049039 32049031 Y NA PISD SFI1,EIF4ENIF1,DEPDC5,YWHAH,C22orf24,C22orf28,LOC339666,RFPL3-AS1,PRR14L GM12878,K562,IMR90 5C,Hi-C 22955621,24141950 PISD 7379 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 32291389 32291694 32291650 Y RFPL2,SFI1,PRR14L,DEPDC5 YWHAH NA NA NA NA YWHAH 46753 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr22 32322992 32323244 32323115 Y RFPL2,EIF4ENIF1,EIF4ENIF1,YWHAH YWHAH NA NA NA NA YWHAH 15203 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 32819656 32819735 32819695 Y RFPL3,TIMP3 FBXO7 NA NA NA NA FBXO7 48928 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 32928366 32928835 32928615 Y NA NA NA NA NA NA FBXO7 59703 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr22 33164513 33164882 33164796 Y BPIL2,SYN3,SYN3 TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 30805 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 33199078 33199894 33199157 Y NA TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 3391 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr22 33202022 33202333 33202121 Y NA TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 6335 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr22 33202971 33203258 33203149 Y NA TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 7284 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr22 33238776 33239102 33239072 Y SYN3,SYN3 TIMP3,Z98256.1 NA NA NA NA Z98256.1 15318 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr22 33240240 33240586 33240349 Y NA TIMP3,Z98256.1 NA NA NA NA Z98256.1 13834 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr22 33265683 33265702 33265692 Y TIMP3 Z98256.1 NA NA NA NA Z98256.1 11263 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr22 33291094 33291121 33291108 Y TIMP3 Z98256.1 NA NA NA NA Z98256.1 36674 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 34249918 34249944 34249938 Y NA NA NA NA NA NA SNORA76 151012 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr22 35983528 35983815 35983759 Y NA NA NA NA NA NA APOL6 58627 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.97716439669243 chr22 36172767 36172943 36172931 Y MB,MB,RBFOX2,RBFOX2 NA APOL5 IMR90 Hi-C 24141950 APOL6 130325 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr22 36299462 36299943 36299718 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 122530 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 36343697 36344006 36343862 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 78467 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr22 36727482 36728450 36727733 Y APOL3 NA NA NA NA NA MYH9 53613 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr22 36746983 36747265 36747123 Y NA MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 34798 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr22 36748222 36748386 36748297 Y NA MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 33677 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr22 36750973 36751374 36751265 Y APOL3 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 30689 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr22 36765300 36765605 36765487 Y APOL3,NCF4,MYH9 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 16458 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 36766615 36766810 36766723 Y NCF4,MYH9 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 15253 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 36815362 36815553 36815536 Y NA MYH9,RP4-633O19__A.1 MYH9,FOXRED2,TXN2 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-633O19__A.1 32691 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 36858236 36858440 36858372 Y MYH9 TXN2,FOXRED2 NA NA NA NA TXN2 17637 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr22 36866824 36867261 36867092 Y NA TXN2,FOXRED2 NA NA NA NA TXN2 8816 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 37316628 37317004 37316672 Y NA NA NA NA NA NA MPST 96672 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 37428831 37429188 37428927 Y CARD10,TMPRSS6,TST,MPST MPST,TST,KCTD17 KCTD17,TMPRSS6 IMR90 Hi-C 24141950 TST 15150 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 37445416 37445556 37445486 Y NA MPST,TST,KCTD17 NA NA NA NA KCTD17 223 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 37544341 37544573 37544511 Y SH3BP1,MFNG,MFNG,RAC2,IL2RB IL2RB,C1QTNF6 NA NA NA NA IL2RB 24521 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 37638328 37638951 37638750 Y SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4 C1QTNF6,Z82188.1 NA NA NA NA RAC2 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr22 37663226 37663580 37663275 Y MFNG,MFNG,NCF4,RAC2 Z82188.1,RAC2 CARD10,C1QTNF6,SSTR3,RAC2,CYTH4,ELFN2,MFNG,CDC42EP1,LGALS2 IMR90 Hi-C 24141950 RAC2 24738 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr22 37703673 37703847 37703799 Y SH3BP1,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,IL2RB,RAC2,CYTH4 NA NA NA NA NA RAC2 65185 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 37703985 37704250 37704217 Y SH3BP1,MFNG,MFNG,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,IL2RB,RAC2,CYTH4 NA NA NA NA NA RAC2 65497 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 37942064 37942352 37942192 Y KCTD17,TRIOBP,POLR2F,MICALL1,LGALS1,ANKRD54,CARD10,CDC42EP1 CARD10,CDC42EP1 ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC42EP1 12102 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr22 37942978 37943343 37943114 Y NA CARD10,CDC42EP1 ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC42EP1 11111 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 37957606 37958042 37957847 Y NA CARD10,CDC42EP1,GGA1 NA NA NA NA CDC42EP1 3152 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 38142899 38142964 38142949 Y CDC42EP1,LGALS1,TRIOBP,POLR2F,GCAT,ANKRD54 NA NA NA NA NA TRIOBP 51888 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 38143248 38143734 38143618 Y LGALS1,TRIOBP,POLR2F NA NA NA NA NA TRIOBP 52237 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 38572177 38572681 38572373 Y DDX17,EIF3L,PLA2G6,PLA2G6,MAFF,MAFF MAFF,PLA2G6 NA NA NA NA MAFF 23208 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 38599886 38600218 38600032 Y NA MAFF,PLA2G6 NA NA NA NA PLA2G6 189 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 38614588 38614867 38614785 Y MICALL1,TMEM184B,TMEM184B,CSNK1E,MAFF,MAFF MAFF,PLA2G6 NA NA NA NA PLA2G6 14891 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 38624836 38625209 38625138 Y JOSD1,GTPBP1,CSNK1E,MAFF MAFF,PLA2G6,TMEM184B NA NA NA NA PLA2G6 25139 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 38711439 38711868 38711815 Y SUN2,SUN2,JOSD1,GTPBP1,PLA2G6,PLA2G6 TMEM184B NA NA NA NA TMEM184B 44399 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr22 38857668 38857748 38857703 Y NA KDELR3,DDX17 KCNJ4 K562 ChIA-PET 22265404 KDELR3 4319 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr22 39253318 39253463 39253391 Y KCNJ4,LOC646851 NPTXR,CBX6 NA NA NA NA CBX6 12856 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 39541576 39542088 39541730 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7 CBX7 NA NA NA NA CBX7 4591 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr22 39570081 39570473 39570178 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,APOBEC3H CBX7 PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3 MCF7 ChIA-PET 22265404 CBX7 23402 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr22 39570711 39571096 39570941 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,PDGFB,APOBEC3G,APOBEC3H CBX7 PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CBX7 24032 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr22 39572231 39572423 39572299 Y TOMM22,PDGFB CBX7 PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CBX7 25552 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 39649567 39649736 39649595 Y SUN2,APOBEC3A,PDGFB PDGFB CBX7,RNU86,RPL3,SNORD83A,PDGFB IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDGFB 10811 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 39679510 39679847 39679626 Y NA PDGFB,RPL3 CBX7,PDGFB,SNORD83A,SNORD83B,RNU86,RPL3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL3 34547 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 39705997 39706111 39706064 Y NA RPL3,SYNGR1 NA NA NA NA RPL3 8283 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 40357456 40357744 40357564 Y TNRC6B,GRAP2 NA NA NA NA NA TNRC6B 81077 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 40575185 40575584 40575306 Y TNRC6B,TNRC6B NA NA NA NA NA RPL7P52 74115 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 40908486 40908830 40908701 Y NA NA NA NA NA NA MKL1 121876 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 40958851 40958976 40958969 Y NA NA NA NA NA NA MKL1 71730 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 40982487 40982801 40982645 Y NA MKL1 NA NA NA NA MKL1 47905 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 41047729 41047883 41047796 Y NA MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17023 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr22 41048065 41048352 41048232 Y EP300,MKL1 MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17359 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.3840150776847 chr22 41417973 41418366 41418067 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39690 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr22 41684313 41684541 41684479 Y PPPDE2,RANGAP1 RANGAP1,ZC3H7B NA NA NA NA RANGAP1 4058 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 41776948 41777130 41776981 Y NA TEF NA NA NA NA TEF 15611 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.988582198346214 chr22 41840300 41840792 41840564 Y NA TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 235 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.3840150776847 chr22 41844337 41844774 41844650 Y SHISA8,TEF,TEF,TOB2 TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 3310 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 42063539 42063782 42063553 Y NA XRCC6,C22orf46,NHP2L1,MEI1 NA NA NA NA C22orf46 19161 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr22 42327988 42328313 42328152 Y NA CENPM,SEPT3 TNFRSF13C MCF7 ChIA-PET 22265404 CENPM 12855 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 42696920 42697075 42696965 Y NA NA TCF20,NFAM1 IMR90 Hi-C 24141950 Z83851.1 66167 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 42839941 42840323 42840234 Y POLDIP3,C22orf32,TCF20,RRP7A,NFAM1 NA MEI1,TCF20,NDUFA6,LOC100132273,C22orf32,CYP2D6,NFAM1,WBP2NL,RNU12,POLDIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RRP7A 73485 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 43084467 43084751 43084635 Y TSPO,MCAT,CYB5R3,A4GALT CYB5R3,A4GALT NA NA NA NA A4GALT 30553 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 43116155 43116318 43116237 Y CYB5R3,A4GALT A4GALT NA NA NA NA A4GALT 851 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 43144166 43144283 43144173 Y NA A4GALT CYB5R3,ARFGAP3,PACSIN2,A4GALT IMR90 Hi-C 24141950 A4GALT 28862 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 43165805 43166293 43166166 Y NFAM1,ARFGAP3 NA ARFGAP3,PACSIN2,CYB5R3 IMR90 Hi-C 24141950 A4GALT 50501 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr22 43178512 43178746 43178699 Y NA NA NA NA NA NA A4GALT 63208 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 43275806 43275917 43275862 Y ARFGAP3 ARFGAP3 NA NA NA NA ARFGAP3 23694 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 43369643 43369761 43369702 Y NA PACSIN2 NA NA NA NA PACSIN2 39390 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 43409761 43409918 43409853 Y PACSIN2,PACSIN2 PACSIN2 NA NA NA NA PACSIN2 610 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr22 44443702 44443981 44443822 Y NA NA NA NA NA NA PARVB 50611 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 44705061 44705332 44705192 Y PARVB,PARVG,PARVG NA NA NA NA NA LDOC1L 186846 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 44756999 44757252 44757125 Y NA NA KIAA1644,PARVB,LINC00207,SAMM50,LINC00229 IMR90 Hi-C 24141950 LDOC1L 134926 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 44759236 44759683 44759589 Y NA NA KIAA1644,PARVB,LINC00207,SAMM50,LINC00229 IMR90 Hi-C 24141950 LDOC1L 132495 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr22 45525658 45525880 45525792 Y PHF21B,NUP50,NUP50 CTA-217C2.1,NUP50 NA NA NA NA CTA-217C2.1 31782 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 45543738 45543876 45543815 Y PHF21B,NUP50,NUP50 CTA-217C2.1,NUP50 NA NA NA NA CTA-217C2.1 13786 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 45664918 45665214 45665118 Y NA KIAA0930,FAM118A LOC100506714,SMC1B,PHF21B,FBLN1,KIAA0930,FAM118A,RIBC2,UPK3A,ATXN10 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0930 30268 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 45944996 45945587 45945178 Y NA FBLN1 NA NA NA NA FBLN1 48878 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr22 46004834 46005031 46004922 Y C22orf26 NA NA NA NA NA ATXN10 60647 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 46008367 46008678 46008581 Y NA NA NA NA NA NA ATXN10 57000 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 46028588 46028889 46028879 Y WNT7B ATXN10 NA NA NA NA ATXN10 36789 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr22 46035019 46035329 46035174 Y NA ATXN10 NA NA NA NA ATXN10 30349 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 46041491 46041960 46041628 Y NA ATXN10 ATXN10,WNT7B,FAM118A,SMC1B,FBLN1,LOC730668,LOC100271722,MIRLET7BHG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATXN10 23718 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 46374858 46375446 46375153 Y NA WNT7B NA NA NA NA WNT7B 3849 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 46398693 46399004 46398848 Y NA WNT7B,RP6-109B7.3,C22orf26 MIRLET7BHG,LOC730668 K562 ChIA-PET 22265404 WNT7B 27684 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 46464940 46465203 46464976 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 1169 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr22 46467914 46468476 46468052 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 4143 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr22 46472616 46472825 46472697 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 8845 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr22 46474643 46475112 46474791 Y C22orf26 RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 10872 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr22 46480881 46481264 46481017 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 17110 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr22 46483894 46484294 46483949 Y C22orf26 RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 20123 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr22 46495432 46495673 46495573 Y C22orf26 RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B,PPARA NA NA NA NA MIR4763 11773 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 46516040 46516252 46516108 Y NA MIR4763,MIRLET7B,PPARA NA NA NA NA MIRLET7B 8474 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 46775439 46775628 46775534 Y NA NA NA NA NA NA TRMU 50667 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 46924162 46924396 46924177 Y NA CELSR1,GRAMD4 NA NA NA NA CELSR1 6671 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr22 46934347 46934575 46934459 Y CELSR1 CELSR1,GRAMD4 NA NA NA NA CELSR1 3280 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 47128172 47128501 47128260 Y NA CERK,TBC1D22A NA NA NA NA CERK 3657 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 47134957 47135355 47135288 Y NA CERK,TBC1D22A NA NA NA NA CERK 2799 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 47149923 47150411 47150155 Y NA CERK,TBC1D22A CERK MCF7 ChIA-PET 22265404 TBC1D22A 6107 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 47150443 47150659 47150583 Y CERK,TBC1D22A CERK,TBC1D22A CERK MCF7 ChIA-PET 22265404 TBC1D22A 5859 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr22 48035641 48035928 48035744 Y NA RP11-191L9.4 TBC1D22A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-191L9.4 10218 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr22 48185959 48186142 48186052 Y NA NA NA NA NA NA RP11-191L9.4 160536 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr22 49765184 49765573 49765231 Y NA NA NA NA NA NA BRD1 453587 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 49768624 49768992 49768711 Y NA NA NA NA NA NA BRD1 450168 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.48287329751932 chr22 50248429 50248807 50248623 Y TUBGCP6,TRABD,SELO,PIM3,MOV10L1,HDAC10,BRD1,ZBED4 BRD1,ZBED4 NA NA NA NA ZBED4 2939 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 50262824 50262951 50262946 Y TUBGCP6,MLC1 BRD1,ZBED4,CRELD2,ALG12 NA NA NA NA ZBED4 17334 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 50272789 50273094 50272966 Y NA ZBED4,CRELD2,ALG12 NA NA NA NA ZBED4 27299 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr22 50327213 50327243 50327226 Y PIM3 CRELD2,ALG12,PIM3 NA NA NA NA ALG12 17107 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 50327730 50328489 50328002 Y TRABD,SELO,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1 CRELD2,ALG12,PIM3 NA NA NA NA ALG12 17624 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr22 50364350 50364715 50364589 Y NA PIM3 NA NA NA NA PIM3 12189 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr22 50414821 50415138 50414874 Y BRD1,TUBGCP6,TRABD,PANX2,HDAC10,PIM3 NA NA NA NA NA PIM3 62660 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 50743986 50744741 50744427 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr22 50744748 50744986 50744827 Y PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 692 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr22 50747003 50747284 50747232 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 2947 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr22 50912071 50912698 50912340 Y NA SBF1,LMF2,NCAPH2 NA NA NA NA SBF1 617 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr22 50977955 50978429 50978214 Y PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B LMF2,NCAPH2,SCO2,ODF3B,CHKB-CPT1B NA NA NA NA ODF3B 8946 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr22 50982591 50982963 50982680 Y NA LMF2,NCAPH2,SCO2,ODF3B,CHKB-CPT1B NA NA NA NA ODF3B 13582 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 4575529 4575739 4575617 Y NA ITPR1-AS1,ITPR1 NA NA NA NA ITPR1 42497 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 4881719 4881745 4881731 Y ITPR1 AC018816.3 NA NA NA NA AC018816.3 45232 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 5028534 5029013 5028702 Y ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 8888 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr3 5065036 5065378 5065161 Y BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40-AS1 45390 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 5067974 5068590 5068209 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40-AS1 48328 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 8524896 8525313 8525187 Y LMCD1 LMCD1 NA NA NA NA LMCD1 16080 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 9422978 9423353 9423146 Y SETD5,RAD18,THUMPD3 THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1 NA NA NA NA SETD5 13946 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 9755464 9755857 9755670 Y LOC401052,C3orf24 BRPF1,OGG1 NA NA NA NA BRPF1 15556 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 9995528 9995903 9995716 Y NA IL17RC,CRELD1,PRRT3-AS1,PRRT3,EMC3-AS1 NA NA NA NA PRRT3 3450 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 10231143 10231913 10231419 Y ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 26594 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 10402355 10402452 10402401 Y FANCD2 SEC13 NA NA NA NA SEC13 41493 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 11187629 11187920 11187792 Y HRH1 HRH1 NA NA NA NA HRH1 10850 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 11237617 11237805 11237677 Y NA NA NA NA NA NA HRH1 60838 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 11609664 11609798 11609746 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 150422 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 11612359 11612503 11612424 Y HRH1,ATG7 NA NA NA NA NA VGLL4 147717 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 11632872 11633201 11633091 Y SYN2,VGLL4 NA NA NA NA NA VGLL4 127019 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 12584271 12584371 12584321 Y NA MKRN2 NA NA NA NA MKRN2 12142 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 12621651 12621927 12621686 Y RPL32 MKRN2 NA NA NA NA MKRN2 25138 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 13035460 13035932 13035883 Y CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1 NA NA NA NA NA RPL32 154373 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.3840150776847 chr3 13936849 13937176 13936976 Y NA NA C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CHCHD4 227194 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 14167210 14167731 14167391 Y TMEM43,XPC CHCHD4,TMEM43 NA NA NA NA TMEM43 2770 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 14444961 14445761 14445267 Y C3orf19,SLC6A6 SLC6A6 NA NA NA NA SLC6A6 2885 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr3 15060728 15061023 15060876 Y NR2C2 MRPS25 NA NA NA NA MRPS25 43819 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 15109564 15109704 15109605 Y ZFYVE20 MRPS25,ZFYVE20 NA NA NA NA MRPS25 4722 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 15285479 15285699 15285585 Y NR2C2,ZFYVE20,SH3BP5,CAPN7 CAPN7 NA NA NA NA CAPN7 39820 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 15358234 15358387 15358263 Y ANKRD28,NR2C2,CAPN7,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5 SH3BP5 NA NA NA NA SH3BP5 22488 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 15677848 15678314 15678139 Y ANKRD28,SH3BP5,SH3BP5,EAF1 BTD,HACL1 NA NA NA NA HACL1 36510 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 15704167 15704382 15704274 Y ANKRD28,CAPN7 NA NA NA NA NA HACL1 62829 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 15712856 15713111 15712984 Y NA NA NA NA NA NA HACL1 71518 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 15780032 15780074 15780052 Y SH3BP5,EAF1 NA BTD IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD28 119204 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 15813744 15814005 15813933 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,ANKRD28 NA BTD IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD28 85273 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 16324333 16324353 16324342 Y NA DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 19627 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 16351640 16351656 16351648 Y RFTN1,OXNAD1 DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 46934 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 16413996 16414432 16414126 Y DPH3,RFTN1 NA NA NA NA NA OXNAD1 109290 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 16508881 16509222 16509075 Y PLCL2,DPH3,RFTN1 RFTN1 NA NA NA NA RFTN1 44311 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 17622451 17622654 17622556 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 780292 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA RAD23BP1 NA NA NA NA RAD23BP1 2077 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 19993428 19993925 19993635 Y KAT2B,RAB5A EFHB,RAB5A NA NA NA NA RAB5A 6857 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 20200050 20200329 20200065 Y NA SGOL1 NA NA NA NA SGOL1 25455 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 20201632 20201832 20201780 Y KAT2B SGOL1 NA NA NA NA SGOL1 23952 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 22039046 22039346 22039196 Y NA NA NA NA NA NA ZNF385D 373466 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 23709947 23710120 23710034 Y UBE2E1 NA UBE2E2,UBE2E1,NKIRAS1,RPL15 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 135274 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 23898490 23898770 23898565 Y NA NA NKIRAS1,RPL15 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 53096 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 24197996 24198283 24198140 Y NA NA NA NA NA NA NKIRAS1 211914 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 24459735 24459834 24459785 Y NA NA NA NA NA NA THRB 74939 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr3 25623618 25623990 25623898 Y NA NA NA NA NA NA TOP2B 80408 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr3 25790563 25790933 25790768 Y NA OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 31475 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 27448460 27448581 27448568 Y NA NA NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 75330 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr3 27448684 27449023 27448831 Y NA NA NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 74888 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 27524458 27524952 27524717 Y NA SLC4A7 NA NA NA NA SLC4A7 547 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 27574847 27574895 27574871 Y NA NA AZI2,SLC4A7,NEK10,EOMES IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 50936 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 27575366 27575733 27575573 Y NA NA AZI2,SLC4A7,NEK10,EOMES IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 51455 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA AC098614.2 SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 AC098614.2 2140 CAGE T98G hg19 FANTOM5 2.07602261652705 chr3 29660032 29660218 29660060 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 339559 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 29660758 29661082 29660950 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 340285 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 29799751 29800074 29799882 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 479278 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 30269318 30269730 30269646 Y NA NA TGFBR2,GADL1 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBR2 376264 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 32412858 32413131 32413058 Y NA NA NA NA NA NA CMTM6 129769 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 32526070 32526309 32526138 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 16591 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 32823053 32823413 32823146 Y NA AC139452.2 NA NA NA NA AC139452.2 1725 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 33086079 33086426 33086309 Y CCR4 SEC13P1,TMPPE NA NA NA NA SEC13P1 12724 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 33758685 33758853 33758767 Y UBP1,UBP1,CLASP2 CLASP2 NA NA NA NA CLASP2 837 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 36937540 36937792 36937666 Y NA TRANK1 NA NA NA NA TRANK1 46756 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 37901883 37902306 37902042 Y CTDSPL AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 432 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr3 38207945 38208258 38208101 Y VILL,PLCD1,DLEC1,MYD88,OXSR1 ACAA1,MYD88,OXSR1 NA NA NA NA OXSR1 3365 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 38216296 38216490 38216393 Y NA ACAA1,MYD88,OXSR1 NA NA NA NA OXSR1 11716 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 38568637 38569221 38568871 Y SCN10A,SCN11A,SLC22A14,EXOG EXOG NA NA NA NA EXOG 33019 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 39192381 39192719 39192586 Y WDR48,CSRNP1 TTC21A,GORASP1,CSRNP1 NA NA NA NA CSRNP1 1334 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 39193999 39194528 39194467 Y NA TTC21A,GORASP1 NA NA NA NA CSRNP1 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 39222162 39222653 39222434 Y NA CSRNP1 NA NA NA NA CSRNP1 28109 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 41158856 41159369 41159156 Y NA NA ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 CTNNB1 74959 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 42062353 42062651 42062504 Y NA TRAK1 TRAK1,ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 9059 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr3 42514954 42515471 42515310 Y NA RP11-219I21.1,VIPR1 TRAK1,VIPR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-219I21.1 5822 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr3 42531634 42531985 42531932 Y NA RP11-219I21.1,VIPR1 NA NA NA NA VIPR1 2843 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 44040259 44040834 44040651 Y NA NA ANO10 IMR90 Hi-C 24141950 MIR138-1 112870 CAGE T98G hg19 FANTOM5 5.33834387106956 chr3 44621262 44622718 44622436 Y NA ZNF660,ZNF197 NA NA NA NA ZNF197 1662 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 45106273 45106458 45106405 Y NA NA NA NA NA NA CLEC3B 65233 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 45209101 45209416 45209191 Y LIMD1 RPS24P8 LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS24P8 9434 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 46135224 46135371 46135312 Y CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1 NA CXCR6,FYCO1,CCR5,SACM1L,SLC6A20,CCR1,CCR3,CCRL2 IMR90 Hi-C 24141950 FYCO1 99908 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 46150458 46151043 46150531 Y SACM1L,CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR3,CCR2,CCR1 NA CCR5,FYCO1,CCR1,CCR2 IMR90 Hi-C 24141950 FYCO1 115142 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 46995135 46995433 46995392 Y NA NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 23740 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 47002825 47003246 47003204 Y NA NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 15927 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 47072517 47072982 47072882 Y NBEAL2 NA NA NA NA NA CCDC12 51017 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 47204029 47204492 47204291 Y NA SETD2,KIF9-AS1 NA NA NA NA KIF9-AS1 42 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 47466111 47466297 47466204 Y NA PTPN23 NA NA NA NA PTPN23 45610 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 48128782 48129302 48129029 Y NA MAP4,RP11-1029M24.1 NA NA NA NA MAP4 13 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 49123301 49123671 49123633 Y NA QRICH1,QARS,USP19,LAMB2 NA NA NA NA QRICH1 6125 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr3 49218772 49219051 49218909 Y NA CCDC71,KLHDC8B NA NA NA NA KLHDC8B 11728 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 49358291 49358883 49358713 Y ARIH2,C3orf71,NDUFAF3,DALRD3,QRICH1,USP19,UBA7,IP6K1,USP4 USP4,GPX1 NA NA NA NA USP4 17262 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 49425171 49425361 49425266 Y ARIH2,QRICH1,USP4,UBA7 USP4,GPX1,TCTA,RHOA,NICN1 NA NA NA NA TCTA 22278 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 50040739 50040850 50040788 Y SEMA3B NA NA NA NA NA RBM6 65299 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 50201601 50201845 50201760 Y TUSC2,HYAL2,C3orf54,MST1R,MON1A,SEMA3F,IFRD2 SEMA3F,SLC38A3 NA NA NA NA SEMA3F 11123 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 50208155 50208394 50208279 Y MAPKAPK3,RBM5,GNAI2 SEMA3F,SLC38A3 GNAT1,SLC38A3,GNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3F 17677 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 50264852 50265230 50265012 Y TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2 SLC38A3,GNAI2,SEMA3B NA NA NA NA GNAI2 3128 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 50274525 50274666 50274593 Y RASSF1,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2 SLC38A3,GNAI2,SEMA3B NA NA NA NA GNAI2 12801 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 50354393 50354598 50354449 Y MST1R IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL1,HYAL2,TUSC2,RASSF1,ZMYND10,CYB561D2,NPRL2,TMEM115 NA NA NA NA HYAL2 3739 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 50625949 50626261 50626110 Y RBM5,RASSF1,RASSF1,CACNA2D2 HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH NA NA NA NA C3orf18 19491 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 51377903 51378233 51378113 Y NA MANF,RBM15B NA NA NA NA MANF 42245 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 51573530 51573858 51573781 Y VPRBP,RAD54L2 VPRBP NA NA NA NA VPRBP 41520 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 51628881 51628909 51628894 Y GPR62 NA NA NA NA NA TEX264 65800 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 51720527 51720790 51720691 Y VPRBP TEX264 NA NA NA NA TEX264 25818 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 52009750 52010220 52010093 Y NA RRP9,PARP3,PCBP4,ABHD14A,ABHD14A-ACY1,ACY1,ABHD14B,RPL29 NA NA NA NA ABHD14A-ACY1,ACY1 2684 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 52080287 52080923 52080751 Y NT5DC2,TWF2,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 7643 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 52209021 52209264 52209148 Y WDR82,GLYCTK,PPM1M,PPM1M POC1A,ALAS1 POC1A,RPL29,WDR82,DUSP7,ALAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ALAS1 20838 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 52287340 52287625 52287477 Y PBRM1,NISCH,WDR82,GLYCTK,PPM1M,PPM1M RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82 NA NA NA NA PPM1M 9499 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 52590623 52590962 52590793 Y NA NT5DC2 NA NA NA NA NT5DC2 23553 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 52704686 52705129 52704984 Y WDR82,GLYCTK,TMEM110,PRKCD,PBRM1 GNL3,PBRM1,SPCS1,GLT8D1 NA NA NA NA GNL3 8043 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr3 53024364 53024471 53024418 Y NA NA NA NA NA NA SFMBT1 54295 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 53200960 53201293 53201179 Y PBRM1,GLT8D1,TKT,DCP1A,PRKCD RFT1,PRKCD NA NA NA NA PRKCD 12935 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 53270281 53270430 53270371 Y PRKCD,DCP1A,TKT TKT NA NA NA NA TKT 17638 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr3 53288705 53289353 53289077 Y NA TKT NA NA NA NA TKT 637 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 53304049 53304491 53304265 Y PRKCD,DCP1A,TKT TKT NA NA NA NA TKT 15981 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr3 53362706 53362961 53362819 Y NA DCP1A NA NA NA NA DCP1A 16693 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 54477784 54478003 54477891 Y NA NA NA NA NA NA RPS15P5 180239 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 55194265 55194440 55194343 Y WNT5A NA WNT5A,CACNA2D3,ERC2 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5A 327533 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 55511418 55511654 55511489 Y WNT5A WNT5A,RP11-875H7.5 NA NA NA NA WNT5A 10319 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 55517501 55517653 55517577 Y NA WNT5A,RP11-875H7.5 NA NA NA NA WNT5A 4320 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 55518078 55518594 55518516 Y WNT5A WNT5A,RP11-875H7.5 NA NA NA NA WNT5A 3379 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 55654086 55654842 55654426 Y NA NA WNT5A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-875H7.5 116797 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 55658337 55658755 55658490 Y NA NA WNT5A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-875H7.5 121048 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 57555554 57555589 57555572 Y FAM116A,PDE12 PDE12,ARF4 NA NA NA NA PDE12 15551 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 57562103 57562255 57562188 Y SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12 PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 19692 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr3 57564978 57565360 57565163 Y FAM116A,PDE12 PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 16587 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 57566206 57566518 57566262 Y NA PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 15429 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 57572232 57572342 57572306 Y NA PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 9605 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 57937235 57937402 57937348 Y NA NA NA NA NA NA FLNB 54725 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 57955527 57955938 57955800 Y FLNB FLNB FLNB,ARF4 IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 36189 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 57960548 57960842 57960815 Y FLNB FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 31285 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr3 58035006 58035314 58035102 Y FLNB FLNB NA NA NA NA FLNB 42879 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 58321418 58321818 58321477 Y NA RPP14,PXK NA NA NA NA PXK 4811 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 58336517 58336871 58336595 Y PXK RPP14,PXK NA NA NA NA PXK 19910 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 58412465 58412623 58412544 Y NA PDHB NA NA NA NA PDHB 4961 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 61548977 61549431 61549203 Y NA PTPRG NA NA NA NA PTPRG 3734 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 61828479 61828865 61828501 Y PTPRG NA NA NA NA NA RPL10AP6 101699 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 63848274 63848561 63848418 Y NA THOC7,ATXN7 NA NA NA NA ATXN7 41 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 64147375 64147623 64147507 Y NA NA NA NA NA NA PSMD6 139717 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 64330217 64330685 64330502 Y NA NA PRICKLE2,LOC100652759,LOC100287879 IMR90 Hi-C 24141950 PRICKLE2,RP11-14D22.2 98467 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr3 66533474 66533812 66533569 Y NA LRIG1 NA NA NA NA LRIG1 15875 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 69135158 69135511 69135504 Y NA TMF1,UBA3,ARL6IP5 NA NA NA NA ARL6IP5 3063 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 69228052 69228449 69228187 Y NA NA NA NA NA NA ARL6IP5 95957 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 69853911 69854091 69854013 Y NA NA NA NA NA NA MITF 67325 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 71031841 71032211 71032107 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 598929 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 71099698 71099964 71099817 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 531176 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 71137411 71137566 71137489 Y FOXP1 NA NA NA NA NA FOXP1 493574 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 71151319 71151713 71151657 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 479427 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 71158778 71158960 71158907 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 472180 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 71267437 71267786 71267612 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 363354 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 71553174 71553740 71553492 Y EIF4E3 NA NA NA NA NA FOXP1 77400 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 71628829 71629563 71629383 Y EIF4E3 FOXP1 NA NA NA NA FOXP1 1577 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 71771089 71771328 71771261 Y FOXP1,PROK2,GPR27,EIF4E3,EIF4E3,EIF4E3 EIF4E3 NA NA NA NA EIF4E3 30596 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 72322807 72323018 72322913 Y NA NA RYBP,SHQ1,LOC201617 IMR90 Hi-C 24141950 RYBP 171051 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 72338130 72338451 72338187 Y NA NA SHQ1,RYBP IMR90 Hi-C 24141950 RYBP 155618 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 72386025 72386536 72386317 Y NA NA SHQ1,GXYLT2,RYBP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RYBP 107533 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 72397214 72397486 72397325 Y RYBP NA SHQ1,RYBP,GXYLT2 IMR90 Hi-C 24141950 RYBP 96583 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 72936024 72936237 72936180 Y RYBP,EBLN2 SHQ1,GXYLT2,FTH1P23 NA NA NA NA GXYLT2 800 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 73049169 73049333 73049244 Y PPP4R2,EBLN2 PPP4R2 NA NA NA NA PPP4R2 5233 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 73159773 73160145 73159855 Y EBLN2 NA PDZRN3,CACNA1D IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC75P1 70297 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 73697614 73697785 73697708 Y NA PDZRN3 NA NA NA NA PDZRN3 25523 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 76733416 76733612 76733511 Y ROBO2 NA NA NA NA NA RP11-550F7.1 252247 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 78934560 78934824 78934693 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 880141 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 81766105 81766391 81766248 Y NA GBE1 NA NA NA NA GBE1 42921 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 86842931 86843272 86843115 Y VGLL3 NA VGLL3 IMR90 Hi-C 24141950 CHMP2B 431149 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 87382490 87382853 87382616 Y NA NA NA NA NA NA CHMP2B 108069 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 88151728 88152092 88151734 Y NA C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA C3orf38 44801 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 88367245 88367614 88367269 Y NA ABCF2P1 NA NA NA NA ABCF2P1 2939 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 95940100 95940413 95940257 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPKP4 125985 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 96336052 96336669 96336607 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPKP4 269654 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr3 98504725 98505044 98504856 Y OR5K4,ST3GAL6 NA NA NA NA NA DCBLD2 113489 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 98505158 98505735 98505540 Y ST3GAL6 NA NA NA NA NA DCBLD2 112798 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 98544884 98545154 98545150 Y NA NA NA NA NA NA DCBLD2 73379 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr3 98848000 98848317 98848116 Y DCBLD2 NA COL8A1,MIR548G IMR90 Hi-C 24141950 LINC00973 150098 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr3 99254161 99254407 99254283 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 100912 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr3 99356024 99356457 99356227 Y NA COL8A1 NA NA NA NA COL8A1 705 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 99555247 99555560 99555404 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 199928 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 99579229 99579736 99579484 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 223910 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 99749892 99750279 99749982 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 81078 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 99768992 99769102 99769071 Y C3orf26 NA NA NA NA NA FILIP1L 62255 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 99782957 99783256 99783070 Y NA FILIP1L TMEM30C IMR90 Hi-C 24141950 FILIP1L 48101 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 99944403 99944723 99944568 Y NA TBC1D23 C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D23 33121 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr3 100054250 100054545 100054496 Y NA NIT2 NA NA NA NA NIT2 2705 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 100244695 100244934 100244873 Y NA TMEM45A NA NA NA NA TMEM45A 35232 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr3 100755056 100755464 100755248 Y NA ABI3BP ABI3BP IMR90 Hi-C 24141950 ABI3BP 44697 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 101403455 101403770 101403678 Y SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24 ZBTB11,CEP97 NA NA NA NA RPL24 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr3 101444542 101444901 101444615 Y FAM55C,FAM55C,CEP97 RPL24,CEP97 NA NA NA NA CEP97 3773 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 105087492 105087848 105087688 Y NA ALCAM NA NA NA NA ALCAM 3739 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 107085712 107085944 107085942 Y NA NA LOC344595,LOC100302640 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00883 128173 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 107376610 107376921 107376801 Y NA NA NA NA NA NA BBX 136827 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 107503481 107503523 107503501 Y NA NA NA NA NA NA BBX 263698 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 107657296 107657394 107657308 Y CD47 NA NA NA NA NA CD47 150478 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 110744004 110744030 110744017 Y NA PVRL3,PVRL3-AS1 NA NA NA NA PVRL3 42888 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 111454124 111454225 111454190 Y C3orf52,PHLDB2 PHLDB2 NA NA NA NA PHLDB2 4780 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 111456632 111456831 111456661 Y NA PHLDB2 NA NA NA NA PHLDB2 7288 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 111583903 111584464 111583984 Y PHLDB2,PHLDB2 NA NA NA NA NA ABHD10 111393 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr3 111623667 111623869 111623803 Y NA NA NA NA NA NA ABHD10 71988 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr3 111655124 111655265 111655201 Y NA ABHD10 NA NA NA NA ABHD10 40592 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 112348564 112348626 112348595 Y CCDC80 CCDC80 NA NA NA NA CCDC80 17751 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 112354601 112355057 112354782 Y CCDC80 CCDC80 NA NA NA NA CCDC80 11320 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 112395778 112395997 112395824 Y CCDC80 CCDC80 CCDC80 MCF7 ChIA-PET 22265404 CCDC80 29401 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 112994855 112995215 112995035 Y NA NA NA NA NA NA BOC 67005 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 113701770 113701838 113701802 Y KIAA1407,DRD3,ZDHHC23 QTRTD1 NA NA NA NA QTRTD1 20842 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 114078948 114079017 114078985 Y NA ZBTB20-AS1 NA NA NA NA ZBTB20-AS1 10290 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 114103176 114103363 114103329 Y NA ZBTB20-AS1 NA NA NA NA ZBTB20-AS1 34518 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 115776361 115776759 115776562 Y NA NA NA NA NA NA GAP43 436190 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 117632292 117632433 117632362 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 888747 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 119088312 119088468 119088390 Y NA ARHGAP31-AS1 NA NA NA NA ARHGAP31-AS1 48705 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 119142297 119142580 119142348 Y ARHGAP31,NR1I2,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 43097 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 119146429 119146829 119146680 Y ARHGAP31,CD80,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 38848 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 119147570 119147724 119147648 Y NA TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 37953 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 119157549 119157626 119157588 Y NA TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 28051 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 119237356 119237846 119237595 Y ARHGAP31,COX17,CD80,ADPRH,TMEM39A,POGLUT1 TIMMDC1 NA NA NA NA TIMMDC1 21977 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 119238487 119238668 119238501 Y NA TIMMDC1 NA NA NA NA TIMMDC1 23108 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 119356620 119357543 119356968 Y GSK3B,ARHGAP31,ADPRH,COX17 PLA1A,RP11-190C22.1,COX17 NA NA NA NA RP11-190C22.1 3623 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 119357693 119358081 119357897 Y GSK3B,ARHGAP31,ADPRH PLA1A,RP11-190C22.1,COX17 NA NA NA NA RP11-190C22.1 4696 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 119368834 119369205 119369020 Y NR1I2 RP11-190C22.1,COX17 NA NA NA NA RP11-190C22.1 15837 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 119613107 119613331 119613219 Y NA NA NA NA NA NA GSK3B 197933 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 119644387 119644860 119644721 Y NA NA NA NA NA NA GSK3B 166404 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 120277715 120278240 120277932 Y NA NDUFB4 FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB4 34916 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr3 120397505 120397688 120397597 Y NA NA NA NA NA NA GTF2E1 61796 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 120492875 120493095 120492951 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33035 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 121257379 121257441 121257436 Y NA RPL7AP11,POLQ NA NA NA NA POLQ 5412 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 121374377 121374548 121374517 Y EAF2,HCLS1,GOLGB1 HCLS1 NA NA NA NA HCLS1 3226 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 121520314 121520680 121520641 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 31246 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 121550824 121551193 121550988 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 733 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 123093901 123094149 123094025 Y ADCY5,ADCY5 NA NA NA NA NA SEC22A 175127 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 123263878 123263964 123263921 Y ADCY5,ADCY5 PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA PTPLB 38068 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 123304962 123305362 123305193 Y PTPLB PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA MYLK-AS1 2573 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 123371138 123371512 123371325 Y NA NA NA NA NA NA MYLK-AS1 68749 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 123372011 123372488 123372368 Y MYLK NA NA NA NA NA MYLK-AS1 69622 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr3 123407272 123407514 123407399 Y NA NA NA NA NA NA MYLK-AS1 104883 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 123508502 123508917 123508819 Y NA NA NA NA NA NA CCDC14 169647 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 123553686 123553794 123553787 Y NA NA NA NA NA NA CCDC14 124770 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 123762181 123762190 123762188 Y NA NA KALRN,ROPN1 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC14 83617 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 124553626 124554125 124554004 Y KALRN NA NA NA NA NA ITGB5 64140 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 124604448 124604779 124604703 Y NA ITGB5 NA NA NA NA ITGB5 13486 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 124708345 124708776 124708566 Y NA NA NA NA NA NA HEG1 64026 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 124779995 124780351 124780112 Y ITGB5,HEG1 HEG1 NA NA NA NA HEG1 7193 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 124823348 124823728 124823623 Y OSBPL11 NA HEG1 IMR90 Hi-C 24141950 HEG1 50546 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 125709142 125709481 125709414 Y ZXDC,CCDC37 NA NA NA NA NA FAM86JP 75679 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 125986265 125986571 125986320 Y NA NA KLF15,ZXDC,ALDH1L1,CCDC37 IMR90 Hi-C 24141950 KLF15 87714 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 126630341 126630598 126630469 Y ZXDC NA NA NA NA NA CHCHD6 209278 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 126701397 126702091 126701497 Y PLXNA1 NA CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CHCHD6 280334 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 126702933 126703224 126703109 Y NA NA CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CHCHD6 281870 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 126721076 126721245 126721142 Y PLXNA1 NA NA NA NA NA CHCHD6 300013 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr3 127404993 127405883 127405741 Y MGLL ABTB1 NA NA NA NA ABTB1 15215 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 127416375 127416550 127416435 Y NA ABTB1 NA NA NA NA ABTB1 26597 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 127453672 127453937 127453742 Y TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL NA NA NA NA NA ABTB1 63894 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 128336521 128336831 128336572 Y DNAJB8 NA NA NA NA NA RPN1 61087 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 128745839 128746109 128746044 Y NA NA NA NA NA NA RAB43 93535 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr3 128822143 128822374 128822225 Y H1FOO RAB43 NA NA NA NA RAB43 17270 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 129315034 129315445 129315335 Y COPG,PLXND1 PLXND1 NA NA NA NA PLXND1 8216 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 129315678 129315871 129315798 Y PLXND1 PLXND1 NA NA NA NA PLXND1 7790 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr3 129346331 129346490 129346427 Y PLXND1 PLXND1 NA NA NA NA PLXND1 22670 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 129655699 129655849 129655774 Y NA TMCC1 TMCC1,TRH,IFT122,MBD4,LOC100507032 IMR90 Hi-C 24141950 TMCC1 45280 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 130539887 130540309 130539974 Y ATP2C1 ATP2C1 ATP2C1 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2C1 27130 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 131854898 131855187 131855050 Y NA NA CPNE4 IMR90 Hi-C 24141950 RPL7P16 105922 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 133461507 133461687 133461597 Y NA SRPRB NA NA NA NA SRPRB 39190 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 134045700 134046050 134045958 Y NA RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 27353 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 134067109 134067364 134067237 Y NA RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 6039 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 134082893 134083489 134083439 Y AMOTL2 RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA AMOTL2 8832 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr3 135861520 135861675 135861598 Y MSL2,MSL2 NA NA NA NA NA MSL2 52408 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 136420425 136420819 136420623 Y NA STAG1 NA NA NA NA STAG1 48401 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 136563637 136563997 136563817 Y NA RP11-85F14.5,NCK1 NA NA NA NA RP11-85F14.5 14899 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 138582294 138582582 138582441 Y MRPS22 PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 30514 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr3 139018358 139018692 139018412 Y FOXL2,C3orf72 NA BPESC1 IMR90 Hi-C 24141950 COPB2 87882 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 139028849 139029030 139028940 Y NA NA BPESC1,FOXL2,C3orf72,MRPS22,COPB2 IMR90 Hi-C 24141950 COPB2 77544 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 139253953 139254145 139254018 Y NA NA NA NA NA NA RP11-319G6.1 147296 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 139491345 139491740 139491614 Y NA NA NA NA NA NA CLSTN2 160287 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 139922309 139922336 139922321 Y CLSTN2 NA NA NA NA NA CLSTN2 270282 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 141118771 141119120 141118811 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB38 77716 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 141129371 141129776 141129494 Y NA NA NA NA NA NA RASA2 74113 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 141319185 141319480 141319327 Y RASA2 NA NA NA NA NA RASA2 115296 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 141482175 141482451 141482314 Y NA RNF7 NA NA NA NA RNF7 27129 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 141610914 141611173 141610928 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 17948 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 141611491 141611772 141611584 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 18525 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 141758636 141758867 141758743 Y NA RP11-343B5.1 NA NA NA NA RP11-343B5.1 2173 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 142723898 142724007 142723903 Y NA U2SURP NA NA NA NA U2SURP 42559 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 145883195 145883481 145883360 Y PLOD2,PLSCR4 PLOD2 PLOD2,PLSCR4,PLSCR1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PLOD2 3755 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 146257874 146258309 146258204 Y NA PLSCR1 NA NA NA NA PLSCR1 2342 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 146259909 146260381 146260206 Y PLSCR1 PLSCR1 NA NA NA NA PLSCR1 270 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 148585310 148585526 148585462 Y CPA3 NA NA NA NA NA GYG1 121602 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 148704982 148705163 148705084 Y NA GYG1 HLTF,GYG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GYG1 1965 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 148781933 148782210 148782183 Y NA HLTF NA NA NA NA HLTF 20131 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 148942843 148943311 148943144 Y NA CP NA NA NA NA CP 5001 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 149057749 149057981 149057865 Y NA TM4SF1 NA NA NA NA TM4SF1 35671 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 149104739 149105065 149104981 Y COMMD2,TM4SF1 TM4SF1 GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM4SF1 11087 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr3 149225895 149226130 149226044 Y RNF13 RP11-278L15.6 NA NA NA NA RP11-278L15.6 15448 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 149284462 149284628 149284613 Y NA NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 74015 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr3 149330317 149330600 149330464 Y WWTR1,WWTR1,WWTR1 NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 119870 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 149356424 149356747 149356622 Y NA NA NA NA NA NA WWTR1 95754 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr3 149361418 149361700 149361559 Y WWTR1 NA NA NA NA NA WWTR1 90801 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 149533104 149533741 149533325 Y RNF13 RNF13 NA NA NA NA RNF13 4609 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 149657313 149657850 149657694 Y TSC22D2,RNF13 ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 26322 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 149665014 149665210 149665089 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 18962 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 149665230 149665637 149665395 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 18535 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 149865143 149865465 149865344 Y NA NA RNF13,LOC646903,PFN2,TSC22D2 IMR90 Hi-C 24141950 PFN2 98568 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 149933925 149934322 149934006 Y NA NA PFN2,RNF13,TSC22D2,LOC646903,ANKUB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFN2 167350 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 149960024 149960302 149960150 Y NA NA TSC22D2,RNF13,PFN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 163820 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 149966255 149966555 149966407 Y NA NA TSC22D2,RNF13,PFN2,TM4SF1,TM4SF4,LOC646903,EIF2A,SERP1 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D2 157567 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 150089534 150090066 150089791 Y NA TSC22D2 TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 34056 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.3840150776847 chr3 152100220 152100544 152100298 Y MBNL1 NA NA NA NA NA MBNL1-AS1 114876 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 152121454 152121974 152121660 Y MBNL1 NA NA NA NA NA MBNL1-AS1 136110 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 152856443 152856813 152856615 Y RAP2B RAP2B RAP2B MCF7 ChIA-PET 22265404 RAP2B 21216 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 152878171 152878732 152878352 Y P2RY1,RAP2B RAP2B NA NA NA NA RAP2B 142 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr3 153007263 153007499 153007331 Y P2RY1,RAP2B NA RAP2B IMR90 Hi-C 24141950 RAP2B 129234 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 156252887 156253352 156253202 Y NA SSR3 NA NA NA NA SSR3 17621 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr3 156402848 156403019 156402937 Y LEKR1,LEKR1,CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP TIPARP,TIPARP-AS1 NA NA NA NA TIPARP-AS1 12681 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 156432757 156433079 156432845 Y CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP TIPARP,TIPARP-AS1 NA NA NA NA TIPARP-AS1 42590 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 156442773 156442811 156442792 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP NA NA NA NA NA TIPARP-AS1 52606 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 156444390 156444661 156444493 Y NA NA NA NA NA NA TIPARP-AS1 54223 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 156453441 156453522 156453482 Y CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP NA NA NA NA NA TIPARP-AS1 63274 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 156502026 156502257 156502105 Y SSR3 PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA PA2G4P4 24264 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr3 156506058 156506346 156506123 Y SSR3 PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA PA2G4P4 20175 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 156530301 156530778 156530576 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1 PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA LINC00886 2073 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 156538683 156538849 156538764 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1 PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA LEKR1 2421 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 156839965 156840160 156840071 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1,CCNL1 RP11-6F2.5,CCNL1 NA NA NA NA CCNL1 36389 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 156852547 156853124 156852850 Y NA CCNL1,RP11-550I24.2 NA NA NA NA CCNL1 23425 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 158447066 158447110 158447086 Y NA MFSD1,RARRES1 NA NA NA NA MFSD1 877 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 158466226 158466540 158466401 Y MFSD1 MFSD1,RARRES1 NA NA NA NA RARRES1 17741 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 159493461 159493761 159493605 Y NA NA NA NA NA NA IL12A 210776 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 159514645 159514911 159514780 Y NA NA NA NA NA NA IL12A 189626 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 159540179 159540477 159540438 Y NA NA NA NA NA NA IL12A 164060 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 159542121 159542517 159542198 Y NA NA NA NA NA NA IL12A 162020 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 159647586 159647883 159647684 Y NA NA IQCJ-SCHIP1,IL12A,IFT80,SMC4 IMR90 Hi-C 24141950 IL12A 56654 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr3 160014353 160014630 160014494 Y NA NA NA NA NA NA SMC4 100432 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 163200280 163200389 163200295 Y NA NA NA NA NA NA NMD3 2379796 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 169379063 169379412 169379208 Y MECOM NA NA NA NA NA MECOM 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 169379831 169380308 169379976 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 425 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 169508571 169508792 169508647 Y NA TERC,MYNN,LRRC34 NA NA NA NA MYNN 19952 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 170444418 170445820 170444586 Y CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2 RP11-373E16.4 CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 11334 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.988582198346214 chr3 170469010 170469069 170469037 Y CLDN11,CLDN11,EIF5A2 RP11-373E16.4 SLC7A14,CLDN11,SKIL IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 11856 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 171592038 171592451 171592208 Y FNDC3B NA NA NA NA NA PLD1 65298 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 171684878 171685278 171685188 Y PLD1,FNDC3B NA PLD1,FNDC3B,TMEM212 IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3B 70140 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 171693285 171693478 171693411 Y FNDC3B NA PLD1,FNDC3B,TMEM212 IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3B 61940 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 171847438 171848726 171847798 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 92020 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 171849993 171850504 171850202 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 94575 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 171858231 171859026 171858504 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 102813 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr3 171863188 171863575 171863224 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 107770 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 171870963 171871593 171871291 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 115545 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr3 171927297 171927567 171927433 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 171879 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 171954526 171954782 171954635 Y FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 199108 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 172035782 172036031 172035880 Y FNDC3B NA NA NA NA NA TNFSF10 203266 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 172238180 172238555 172238252 Y NA TNFSF10 NA NA NA NA TNFSF10 742 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 172264557 172265002 172264759 Y NA TNFSF10 TNFSF10,NCEH1 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF10 25260 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 172280796 172281206 172280981 Y TNFSF10,TNFSF10 TNFSF10 NCEH1 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF10 41499 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr3 172418207 172418359 172418236 Y NA NCEH1,ECT2 NA NA NA NA NCEH1 8649 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 174984866 174985269 174985168 Y NA NA NA NA NA NA UBE2V1P2 449189 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 176912879 176913389 176913098 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 177077500 177078084 177077832 Y NA NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00578 79625 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 177548160 177548535 177548360 Y NA RP11-91K9.1 TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-91K9.1 15507 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr3 177623365 177623625 177623388 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-91K9.1 90712 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 178755149 178755598 178755383 Y NA ZMAT3 NA NA NA NA ZMAT3 32469 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 178787910 178788066 178787991 Y ZMAT3 ZMAT3 NA NA NA NA ZMAT3 1 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 178978348 178978737 178978528 Y PIK3CA,MFN1,GNB4 NA NA NA NA NA ZNF639 60042 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr3 179244857 179244994 179244926 Y NA ACTL6A GNB4 IMR90 Hi-C 24141950 ACTL6A 33674 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 179309053 179309431 179309273 Y NA ACTL6A,MRPL47,NDUFB5 NA NA NA NA MRPL47 11011 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 181876844 181877235 181877011 Y NA NA NA NA NA NA ATP11B 632053 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 182645862 182646115 182645990 Y MCF2L2,MCCC1 NA NA NA NA NA DCUN1D1 55626 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 183003579 183004143 183003750 Y ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 34547 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr3 183250743 183250943 183250799 Y HTR3D,B3GNT5,KLHL6,KLHL24 NA NA NA NA NA KLHL24 100413 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 183257675 183258009 183257756 Y B3GNT5,KLHL6,KLHL24 NA NA NA NA NA KLHL24 93347 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 183259653 183259899 183259705 Y B3GNT5,KLHL6,KLHL24 NA NA NA NA NA KLHL24 91457 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 184560038 184560430 184560098 Y VPS8 VPS8 NA NA NA NA VPS8 32107 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 185339016 185339200 185339107 Y NA SENP2 NA NA NA NA SENP2 40732 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 185821581 185821963 185821920 Y NA ETV5 NA NA NA NA ETV5 4144 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 186926447 186926523 186926484 Y NA RPL39L NA NA NA NA RPL39L 29751 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 187004502 187004623 187004526 Y MASP1 MASP1 NA NA NA NA MASP1 3187 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr3 187459288 187459644 187459469 Y RTP4,BCL6,BCL6,BCL6 BCL6 NA NA NA NA BCL6 1871 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 187980692 187981197 187980748 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 110847 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr3 187983465 187984215 187983993 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 113620 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 187988232 187988684 187988401 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 118387 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 188017658 188018009 188017791 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 147813 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 188109949 188110178 188110065 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 240104 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 188618525 188618672 188618589 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 748680 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 189794828 189795104 189794939 Y NA LEPREL1-AS1,LEPREL1 NA NA NA NA LEPREL1-AS1 41649 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 190251387 190251779 190251471 Y CLDN1 IL1RAP NA NA NA NA IL1RAP 21547 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 190336230 190336434 190336308 Y IL1RAP NA NA NA NA NA IL1RAP 106390 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 192634153 192634990 192634777 Y MB21D2 MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 203 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 192873675 192873788 192873739 Y NA NA NA NA NA NA MB21D2 239725 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 193851636 193853009 193852912 Y ATP13A3,HES1 NA NA NA NA NA HES1 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 193859199 193859624 193859359 Y TMEM44 HES1 NA NA NA NA HES1 7265 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 193876735 193877026 193876899 Y NA HES1 NA NA NA NA HES1 24801 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr3 194153543 194153935 194153911 Y ATP13A3 NA NA NA NA NA ATP13A3 63158 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 194247870 194248550 194248205 Y HES1,ATP13A3 ATP13A3 ATP13A3,GP5,TMEM44,FLJ34208 IMR90 Hi-C 24141950 ATP13A3 30777 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr3 194296552 194296878 194296640 Y HES1,ATP13A3 TMEM44-AS1 ATP13A3,FLJ34208 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM44-AS1 5862 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 194360985 194361172 194361065 Y NA AC046143.3,TMEM44,LSG1,FAM43A NA NA NA NA TMEM44 8567 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 194461690 194461887 194461800 Y FAM43A NA NA NA NA NA FAM43A 57068 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 194561866 194562021 194561957 Y FAM43A NA LOC100507391,XXYLT1,ACAP2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM43A 157244 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 194820742 194820949 194820800 Y PPP1R2,ACAP2 NA NA NA NA NA XXYLT1 168947 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 194909017 194909237 194909137 Y NA NA NA NA NA NA XXYLT1 80659 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 194925332 194925664 194925571 Y NA NA NA NA NA NA XXYLT1 64232 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 195073897 195074088 195073990 Y NA NA NA NA NA NA XXYLT1 84001 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 195542423 195542578 195542499 Y MUC20,MUC4 NA NA NA NA NA APOD 233347 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 195627582 195627903 195627662 Y ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2,TNK2 NA NA NA NA NA TFRC 179157 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr3 195946520 195946837 195946671 Y LRRC33,PCYT1A NA NA NA NA NA PCYT1A 65991 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 196437709 196437842 196437776 Y NA CEP19,PAK2 NA NA NA NA CEP19 545 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 196635737 196635948 196635847 Y UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5 SENP5,NCBP2 NA NA NA NA NCBP2 31520 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr3 196696811 196697020 196696957 Y LRRC33,PIGZ NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1 NA NA NA NA PIGZ 2880 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 196761683 196762044 196761813 Y NA AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2 MFI2-AS1,MFI2 IMR90 Hi-C 24141950 MFI2 6996 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 197033346 197033465 197033406 Y DLG1 DLG1 NA NA NA NA DLG1 9175 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 197035558 197035706 197035585 Y NA DLG1 NA NA NA NA DLG1 11387 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 197056302 197056596 197056442 Y KIAA0226,DLG1 DLG1 MFI2-AS1,MFI2,DLG1,LOC100507086,BDH1 IMR90 Hi-C 24141950 DLG1 32131 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 197121526 197121880 197121703 Y DLG1 NA DLG1,LOC100507086,BDH1 IMR90 Hi-C 24141950 DLG1 97355 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr3 197439165 197439566 197439302 Y IQCG,LRCH3,KIAA0226 MIR922,FYTTD1,KIAA0226 NA NA NA NA FYTTD1 22484 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr3 197478210 197478491 197478305 Y IQCG,KIAA0226,FYTTD1,FYTTD1,LRCH3 FYTTD1,KIAA0226,LRCH3 NA NA NA NA KIAA0226 3612 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr4 693278 693552 693364 Y GAK,MFSD7,PCGF3 MYL5,ATP5I,PCGF3 NA NA NA NA PCGF3 3985 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr4 926994 927308 927151 Y NA GAK,TMEM175 NA NA NA NA TMEM175 2819 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 991255 991645 991565 Y ZNF721,PDE6B,CPLX1,TMEM175 DGKQ,IDUA,FGFRL1 NA NA NA NA FGFRL1 10079 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 1037465 1037841 1037534 Y MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,GAK,IDUA FGFRL1 NA NA NA NA FGFRL1 35741 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr4 1339085 1339471 1339276 Y NA NA NA NA NA NA MAEA 57446 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 1710531 1710811 1710671 Y NA SLBP,TMEM129,TACC3 NA NA NA NA SLBP 1471 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 1712467 1712893 1712787 Y WHSC1 SLBP,TMEM129,TACC3 NA NA NA NA SLBP 185 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 1796551 1796852 1796752 Y NA FGFR3 NA NA NA NA FGFR3 3517 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 1966776 1967112 1967086 Y WHSC1,WHSC1 SCARNA22 NA NA NA NA SCARNA22 7251 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 2414575 2415364 2414914 Y HAUS3,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,RNF4,RNF4,LOC402160 ZFYVE28,RNF4 NA NA NA NA ZFYVE28 3026 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr4 2538945 2539718 2539367 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 76998 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr4 2691649 2691991 2691819 Y NA NA NA NA NA NA TNIP2 64112 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 3085381 3085754 3085447 Y NA HTT NA NA NA NA HTT 10973 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 3293872 3294174 3294028 Y NA RGS12 RGS12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RGS12 1117 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr4 3303883 3304472 3304061 Y NA RGS12 RGS12,HTT,HGFAC IMR90 Hi-C 24141950 RGS12 11128 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 3357519 3357800 3357660 Y NA NA NA NA NA NA RGS12 64764 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 3829290 3829379 3829335 Y LYAR,LYAR,ADRA2C NA LOC100133461 IMR90 Hi-C 24141950 ADRA2C 63215 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 5034935 5035238 5035206 Y NA CYTL1,STK32B STK32B,EVC2 IMR90 Hi-C 24141950 CYTL1 15736 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 6635412 6635534 6635472 Y NA MRFAP1,AC093323.3,RP11-539L10.3 NA NA NA NA MRFAP1 4284 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 6734442 6734743 6734533 Y KIAA0232 S100P,MRFAP1L1,KIAA0232 NA NA NA NA MRFAP1L1 24835 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr4 6785099 6785509 6785391 Y TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232 KIAA0232 NA NA NA NA KIAA0232 3997 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr4 6895356 6895637 6895499 Y KIAA0232 TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 13332 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 6964947 6965065 6964958 Y CCDC96 NA NA NA NA NA TBC1D14 55978 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 7649791 7650390 7650086 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1 289263 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 7807485 7807548 7807490 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1 132105 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 7830043 7830393 7830208 Y SH3TC1 NA NA NA NA NA AFAP1 109260 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 7833117 7833393 7833178 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 106260 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr4 10116801 10117310 10116981 Y WDR1 WDR1 NA NA NA NA WDR1 228 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 10182011 10182277 10182105 Y WDR1 NA WDR1,CLNK,ZNF518B K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WDR1 65438 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 10182678 10183260 10182921 Y WDR1 NA WDR1,CLNK,ZNF518B K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WDR1 66105 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 12642016 12642195 12642111 Y NA NA NA NA NA NA HSP90AB2P 690843 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 13486596 13486918 13486821 Y BOD1L,RAB28 RAB28 NA NA NA NA RAB28 2607 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 13894956 13895300 13895128 Y NA NA CPEB2,LOC441009 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01085 216292 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 13908947 13909321 13909089 Y NA NA LOC441009,CPEB2,LOC152742 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01085 202271 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 13920582 13920969 13920807 Y NA NA LOC441009,CPEB2,C1QTNF7 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01085 190623 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 13922430 13922925 13922628 Y NA NA LOC441009,CPEB2,C1QTNF7 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01085 188667 CAGE T98G hg19 FANTOM5 2.96574659503864 chr4 15036867 15037072 15036952 Y NA CPEB2 NA NA NA NA CPEB2 34569 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr4 15151544 15151754 15151565 Y NA NA CPEB2 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB2 149246 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 15485746 15486124 15486037 Y CC2D2A CC2D2A NA NA NA NA CC2D2A 16257 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 15488697 15488958 15488934 Y NA CC2D2A NA NA NA NA CC2D2A 19208 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 15594702 15595080 15594956 Y FBXL5 NA NA NA NA NA FAM200B 86205 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 15655935 15656313 15656300 Y FBXL5,BST1 FAM200B,FBXL5 NA NA NA NA FAM200B 24972 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 16226860 16227020 16226938 Y FGFBP2,TAPT1 TAPT1,RPS21P4 NA NA NA NA TAPT1 13 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 16609824 16610000 16609962 Y NA NA NA NA NA NA LDB2 288432 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr4 16629750 16630155 16629855 Y NA NA NA NA NA NA LDB2 268277 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 16728731 16729070 16728970 Y NA NA NA NA NA NA LDB2 169362 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 16898557 16898776 16898740 Y NA LDB2 NA NA NA NA LDB2 125 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 23947088 23947695 23947571 Y NA PPARGC1A NA NA NA NA PPARGC1A 43376 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 25175369 25175577 25175408 Y NA SEPSECS,PI4K2B NA NA NA NA PI4K2B 15106 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 26176928 26177300 26177214 Y RBPJ,RBPJ RBPJ RBPJ IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 13851 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 26449466 26449471 26449469 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D19 126588 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr4 26887004 26887397 26887051 Y STIM2 STIM2,RP11-293A21.1 NA NA NA NA RP11-293A21.1 26783 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 28621646 28621809 28621725 Y NA NA NA NA NA NA RP11-293A21.1 1761425 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 32142342 32142554 32142470 Y NA NA NA NA NA NA PCDH7 1422305 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 35022631 35023155 35023089 Y NA NA NA NA NA NA RELL1 2662843 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 36183139 36183486 36183313 Y NA NA NA NA NA NA RELL1 1502512 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 38069769 38070051 38069856 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 109713 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 38080568 38081008 38080843 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 120512 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 38668617 38669179 38668850 Y KLF3 KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA RP11-617D20.1 4113 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr4 38671040 38671097 38671090 Y NA KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA RP11-617D20.1 6536 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 38859134 38859762 38859410 Y KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6 TLR1,TLR6,FAM114A1 NA NA NA NA TLR1,TLR6 2696 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr4 39813102 39813401 39813252 Y NA NA NA NA NA NA UBE2K 115438 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 39933245 39933555 39933419 Y NA PDS5A NA NA NA NA PDS5A 44021 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 40181948 40182292 40182189 Y RBM47 NA NA NA NA NA N4BP2 125502 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 40324884 40325018 40324960 Y NA CHRNA9 LOC344967,N4BP2,CHRNA9 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHRNA9 10328 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 40533771 40533999 40533881 Y NA NA NA NA NA NA CHRNA9 198425 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 40674578 40674731 40674666 Y RBM47 NA RBM47 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CHRNA9 339232 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 40674929 40675349 40675137 Y RBM47 NA RBM47 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CHRNA9 339583 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr4 40684955 40685070 40685013 Y NA NA RBM47,NSUN7 IMR90 Hi-C 24141950 CHRNA9 349609 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 41148833 41148910 41148907 Y LIMCH1,LIMCH1 NA NA NA NA NA APBB2 67821 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 41363966 41364137 41364015 Y LIMCH1,LIMCH1 LIMCH1 NA NA NA NA LIMCH1 4342 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 41454099 41454301 41454195 Y NA NA NA NA NA NA LIMCH1 94475 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 41469951 41470276 41469966 Y NA NA NA NA NA NA LIMCH1 110327 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 41573569 41573937 41573753 Y NA NA NA NA NA NA LIMCH1 213945 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 41704988 41705115 41705052 Y NA NA NA NA NA NA TMEM33 230022 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 47464691 47464980 47464836 Y NA COMMD8,ATP10D NA NA NA NA COMMD8 955 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 48130124 48130516 48130320 Y TXK NA NA NA NA NA SLAIN2 210823 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 52873079 52873103 52873091 Y NA SGCB NA NA NA NA SGCB 29545 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr4 53703771 53704138 53703934 Y NA RASL11B NA NA NA NA RASL11B 22319 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 54055240 54055561 54055400 Y NA NA NA NA NA NA SCFD2 174681 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 54338842 54339193 54339023 Y NA NA NA NA NA NA FIP1L1 97032 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 54568898 54569145 54569018 Y CHIC2 NA SCFD2,LNX1,PDGFRA,FIP1L1,RPL21P44,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 FIP1L1 327088 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 54929171 54929915 54929573 Y CHIC2 CHIC2 NA NA NA NA CHIC2 314 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 54958023 54958135 54958077 Y NA CHIC2 SCFD2,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 29166 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 55093767 55093987 55093860 Y NA PDGFRA NA NA NA NA PDGFRA 503 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 55100480 55100923 55100634 Y PDGFRA PDGFRA NA NA NA NA PDGFRA 7216 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 56379806 56379963 56379885 Y NA CLOCK NA NA NA NA CLOCK 31342 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 56419632 56419978 56419838 Y NA CLOCK NA NA NA NA CLOCK 8327 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 57831930 57832208 57832081 Y NA POLR2B,NOA1 NA NA NA NA POLR2B 9680 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 67430351 67431255 67431078 Y NA NA NA NA NA NA RP11-396M11.1 472507 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 74055104 74055142 74055123 Y ANKRD17,ALB,AFM NA NA NA NA NA ANKRD17 67373 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 75072226 75072712 75072476 Y IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L NA NA NA NA NA MTHFD2L 94335 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 76106676 76106845 76106762 Y NA NA NA NA NA NA PARM1 250371 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 76981003 76981218 76981088 Y NAAA,CXCL9,CXCL10,CXCL11 CXCL10 NA NA NA NA CXCL10 38353 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 77011342 77011736 77011528 Y NAAA,CXCL9,CXCL10,CXCL11 NA NA NA NA NA NUP54 55932 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 77674311 77674688 77674546 Y SEPT11 NA NA NA NA NA SEPT11 194168 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 78014068 78014466 78014356 Y CCNG2 CCNI SHROOM3,CCNG2 IMR90 Hi-C 24141950 CCNI 18910 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 79083838 79083918 79083865 Y NA NA NA NA NA NA FRAS1 107114 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr4 80958042 80958450 80958250 Y NA NA NA NA NA NA ANTXR2 86158 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 84469544 84469879 84469660 Y PLAC8,COQ2,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,AGPAT9 FAM175A,AGPAT9 NA NA NA NA AGPAT9 14477 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 85420434 85420908 85420714 Y NA NA NA NA NA NA CDS1 81224 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.77944795702319 chr4 87835479 87835856 87835675 Y NA AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA AFF1 18298 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 87838829 87839174 87839055 Y NA AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA AFF1 14980 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 87960081 87960248 87960138 Y NA NA NA NA NA NA TECRP1 90805 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 89099576 89099877 89099636 Y HERC6,HERC5 NA PKD2 IMR90 Hi-C 24141950 ABCG2 50597 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr4 90238207 90238483 90238316 Y GPRIN3 GPRIN3 NA NA NA NA GPRIN3 11046 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 91238961 91239218 91239076 Y NA NA NA NA NA NA GPRIN3 1011800 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 91453996 91454262 91454133 Y NA NA NA NA NA NA GPRIN3 1226835 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 95373822 95374139 95373960 Y PDLIM5 PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 2785 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr4 99845137 99845196 99845164 Y NA EIF4E NA NA NA NA EIF4E 4592 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 100305157 100305451 100305304 Y ADH5 ADH1C,ADH7 ADH4,LOC100507053,ADH1A IMR90 Hi-C 24141950 ADH1C 32973 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 100325584 100326020 100325850 Y ADH5,ADH4,ADH6,ADH1A,ADH1B,ADH1C ADH7 NA NA NA NA ADH7 28874 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr4 106226051 106226420 106226239 Y TET2,TET2 NA NA NA NA NA TET2 161019 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 106305912 106306089 106306001 Y NA NA NA NA NA NA PPA2 87149 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 108544740 108545114 108544927 Y SGMS2 NA NA NA NA NA PAPSS1 94494 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 110449545 110449722 110449703 Y SEC24B CCDC109B CCDC109B IMR90 Hi-C 24141950 CCDC109B 29639 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 110464231 110464470 110464351 Y NA CCDC109B NA NA NA NA CCDC109B 14891 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 111085558 111085919 111085739 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 32436 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 111117471 111117868 111117585 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 487 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr4 113181018 113181306 113181029 Y AP1AR,TIFA AP1AR,ALPK1,TIFA NA NA NA NA ALPK1 23359 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 114366444 114366711 114366574 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2D 314372 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 114369024 114369155 114369101 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2D 311928 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 114382932 114383313 114383209 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2D 297770 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 117474098 117474276 117474187 Y NA ACTN4P1 NA NA NA NA ACTN4P1 43041 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 117519495 117520605 117520296 Y NA ACTN4P1 NA NA NA NA ACTN4P1 2178 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr4 119756174 119756657 119756269 Y NA SEC24D NA NA NA NA SEC24D 1181 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.48287329751932 chr4 120024463 120024846 120024696 Y NA NA SYNPO2,USP53,MYOZ2 IMR90 Hi-C 24141950 USP53 106896 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 120432594 120432728 120432661 Y PDE5A,PDE5A NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 58648 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 120437308 120437708 120437606 Y NA NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 63362 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr4 120439031 120439404 120439161 Y PDE5A,PDE5A NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 65085 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr4 120444503 120444790 120444647 Y NA NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 70557 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 120458820 120459280 120459019 Y PDE5A,PDE5A,PDE5A NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 84874 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.3840150776847 chr4 120493215 120493297 120493256 Y C4orf3 NA NA NA NA NA PDE5A 54849 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr4 120511055 120511277 120511169 Y NA PDE5A NA NA NA NA PDE5A 36869 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr4 122077221 122077584 122077249 Y TNIP3 NA NA NA NA NA ANXA5 538684 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 122606332 122606884 122606598 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 9384 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr4 122610538 122611647 122611314 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 4621 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr4 122611926 122612330 122612120 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 3938 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr4 122802111 122802121 122802116 Y NA BBS7 NA NA NA NA BBS7 12459 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 123074024 123074337 123074286 Y KIAA1109,IL21,IL2 KIAA1109 KIAA1109 K562 ChIA-PET 22265404 KIAA1109 2536 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr4 123686146 123686329 123686228 Y FGF2 CETN4P,BBS12 NA NA NA NA BBS12 34289 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr4 123704519 123704897 123704616 Y FGF2 FGF2 FGF2,NUDT6,SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 FGF2 40966 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 123792983 123793156 123793069 Y NA FGF2,NUDT6,SPATA5 NA NA NA NA FGF2 47120 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 124073506 124073670 124073588 Y NUDT6 NA NA NA NA NA SPATA5 231277 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 125224483 125224496 125224490 Y NA NA NA NA NA NA TECRP2 158449 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 125634465 125634726 125634691 Y NA ANKRD50 NA NA NA NA ANKRD50 2578 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 128990801 128990842 128990822 Y NA LARP1B NA NA NA NA LARP1B 10378 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 129244135 129244496 129244419 Y NA PGRMC2,RP11-420A23.1 PGRMC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-420A23.1 32229 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 129254148 129254471 129254310 Y NA PGRMC2,RP11-420A23.1 PHF17,LARP1B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-420A23.1 42242 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 129275726 129275798 129275762 Y NA NA PHF17,LARP1B,SCLT1,C4orf33,PGRMC2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-420A23.1 63820 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 129305373 129305758 129305535 Y NA NA PGRMC2,PHF17,LARP1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-420A23.1 93467 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 129733811 129733921 129733891 Y NA NA NA NA NA NA C4orf33 278551 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 129965980 129966229 129966106 Y NA C4orf33,SCLT1 NA NA NA NA C4orf33 46243 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 135287127 135287346 135287189 Y NA NA NA NA NA NA PCDH10 1218657 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr4 138585739 138585945 138585825 Y PCDH18 NA PCDH18 IMR90 Hi-C 24141950 PCDH18 134091 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 139067903 139068306 139067999 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A11 93197 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr4 139156559 139157143 139156950 Y SLC7A11 SLC7A11 NA NA NA NA SLC7A11 4360 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr4 139747631 139747907 139747769 Y NA NA LOC641365 IMR90 Hi-C 24141950 CCRN4L 187036 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 140003738 140004448 140004114 Y CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2 NA CCRN4L K562 ChIA-PET 22265404 CCRN4L 68795 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr4 140035787 140036142 140035958 Y NA NA NA NA NA NA ELF2 60230 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 140292626 140292906 140292778 Y NA NA NA NA NA NA NDUFC1 70921 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 140331152 140331480 140331316 Y NA RAB33B NA NA NA NA RAB33B 40906 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 143206374 143206633 143206590 Y NA NA NA NA NA NA INPP4B 559952 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 144271294 144271615 144271412 Y NA GAB1 NA NA NA NA GAB1 15379 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr4 145956046 145956369 145956259 Y NA NA NA NA NA NA ABCE1 60715 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 145975837 145976119 145976108 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ABCE1 40965 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 146655718 146656086 146655845 Y NA NA NA NA NA NA MMAA 118303 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 146656396 146656737 146656614 Y NA NA NA NA NA NA MMAA 118981 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 146764373 146764705 146764540 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 93082 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 147250249 147250611 147250430 Y NA NA NA NA NA NA LSM6 155412 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 148374725 148374999 148374823 Y TMEM184C EDNRA TMEM184C IMR90 Hi-C 24141950 EDNRA 25070 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 149709037 149709300 149709169 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP10 1057823 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 150977820 150977939 150977880 Y NA DCLK2 DCLK2 IMR90 Hi-C 24141950 DCLK2 19487 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 151146456 151146697 151146576 Y DCLK2 NA NA NA NA NA DCLK2 149030 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr4 151201811 151202040 151201910 Y NA NA NA NA NA NA DCLK2 204385 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 151641898 151642513 151641954 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 292366 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr4 153445736 153446128 153446118 Y NA MIR4453 NA NA NA NA MIR4453 9288 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr4 153717992 153718074 153718038 Y NA TIGD4,ARFIP1 NA NA NA NA ARFIP1 18903 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 153858553 153859077 153858605 Y TRIM2,FHDC1 RP11-206F17.2,FHDC1 ARFIP1,FHDC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FHDC1 3049 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr4 153884926 153884958 153884941 Y NA RP11-206F17.2,FHDC1 NA NA NA NA FHDC1 29422 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 153894415 153894544 153894479 Y NA RP11-206F17.2,FHDC1 NA NA NA NA FHDC1 38911 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 154235645 154236052 154235798 Y TRIM2,TRIM2,RNF175 MND1 NA NA NA NA MND1 27749 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 154248193 154248592 154248328 Y TRIM2,TRIM2,RNF175 MND1 NA NA NA NA MND1 15209 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 154361957 154362025 154361991 Y NA KIAA0922 MND1,TRIM2 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0922 23473 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 154580466 154580842 154580627 Y TLR2 NA NA NA NA NA RNF175 98545 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 157397521 157397868 157397695 Y NA NA GRIA2,PDGFC,GLRB IMR90 Hi-C 24141950 PDGFC 492678 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 157718385 157718680 157718607 Y NA NA NA NA NA NA PDGFC 171866 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 157870715 157871133 157870964 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 19413 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr4 159731152 159732543 159732097 Y PPID,RAPGEF2,FNIP2 FNIP2 NA NA NA NA FNIP2 42862 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 164465601 164465786 164465694 Y NA NA NA NA NA NA NAF1 379528 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 165882303 165882624 165882495 Y CPE,C4orf39 NACA3P NA NA NA NA NACA3P 19861 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 169479701 169480223 169479961 Y NA DDX60L NA NA NA NA DDX60L 22764 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr4 169555491 169556032 169555691 Y NA NA NA NA NA NA DDX60L 98554 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr4 169595912 169596309 169596196 Y NA NA NA NA NA NA DDX60L 138975 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr4 169705913 169706245 169706080 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 223181 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 169802596 169802736 169802661 Y PALLD NA NA NA NA NA CBR4 126690 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 169839395 169839702 169839549 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 89724 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 169849945 169850177 169850075 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 79249 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 169853850 169854103 169853858 Y PALLD NA NA NA NA NA CBR4 75323 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr4 169868186 169868202 169868194 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 61224 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 170030173 170030283 170030178 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 100747 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 170934636 170934767 170934702 Y NA NA NA NA NA NA AADAT 76083 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 174285204 174285286 174285258 Y NA HMGB2,SAP30 SAP30 K562 ChIA-PET 22265404 SAP30 3834 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 174422100 174422381 174422300 Y NA NA NA NA NA NA RANP6 131141 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 175138375 175138746 175138561 Y CEP44,CEP44 NA NA NA NA NA CEP44 64082 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 175263937 175264166 175264013 Y CEP44,CEP44,FBXO8 NA NA NA NA NA FBXO8 60522 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 175281816 175282139 175281824 Y CEP44,CEP44,FBXO8 NA NA NA NA NA FBXO8 78401 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 177191849 177192202 177191988 Y ASB5 ASB5,SPCS3,RP11-87F15.2 SPATA4 IMR90 Hi-C 24141950 ASB5 4520 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 177705907 177706270 177706189 Y NA VEGFC NA NA NA NA VEGFC 5611 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 183161464 183161792 183161628 Y ODZ3 NA ODZ3 IMR90 Hi-C 24141950 AC108142.1 97062 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 183439666 183439879 183439717 Y NA NA NA NA NA NA AC108142.1 375264 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 183826285 183826336 183826311 Y NA DCTD NA NA NA NA DCTD 10753 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 184208528 184208558 184208557 Y NA NA NA NA NA NA CDKN2AIP 155186 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 184270201 184270461 184270317 Y NA NA CLDN24,CLDN22 IMR90 Hi-C 24141950 CDKN2AIP 93283 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 184328356 184328744 184328447 Y CDKN2AIP CDKN2AIP WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 35000 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr4 184423820 184424211 184423984 Y STOX2 NA NA NA NA NA ING2 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 184718887 184719489 184719407 Y NA NA ENPP6,CASP3 IMR90 Hi-C 24141950 STOX2 53095 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 185296048 185296446 185296396 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 97288 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 185573558 185573933 185573744 Y NA CASP3 NA NA NA NA CASP3 4895 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 185589829 185589977 185589872 Y ACSL1,IRF2 CASP3 NA NA NA NA CASP3 21166 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 185613623 185613900 185613762 Y CCDC111 CASP3 NA NA NA NA CASP3 44960 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr4 186481104 186481365 186481225 Y NA PDLIM3 PDLIM3,SORBS2 IMR90 Hi-C 24141950 PDLIM3 26338 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 53990 54174 54063 Y PLEKHG4B,C5orf55 CTD-2231H16.1 LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2231H16.1 36092 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 190691 190901 190821 Y SDHA,LRRC14B CCDC127,SDHA NA NA NA NA CCDC127 25429 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 373695 374160 373984 Y EXOC3 NA NA NA NA NA C5orf55 67098 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr5 389983 390379 390026 Y NA NA NA NA NA NA C5orf55 50879 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr5 395451 395827 395512 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 45431 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 399875 400445 400189 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 40813 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr5 426647 427011 426980 Y NA C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5 NA NA NA NA C5orf55 14247 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr5 656184 656577 656381 Y SLC9A3,ZDHHC11,TPPP CEP72,TPPP NA NA NA NA TPPP 34933 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 672861 673336 673024 Y NA TPPP NA NA NA NA TPPP 18174 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.58173151735394 chr5 1041596 1043550 1041859 Y NA RP11-43F13.3,NKD2 NA NA NA NA NKD2 34652 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 1080709 1080898 1080802 Y NA SLC12A7 NA NA NA NA SLC12A7 29252 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 1152155 1152545 1152489 Y NA SLC12A7 SLC12A7,TRIP13,SLC6A18,BRD9 IMR90 Hi-C 24141950 SLC12A7 42005 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 1152929 1153246 1153088 Y NA SLC12A7 SLC12A7,TRIP13,SLC6A18,BRD9 IMR90 Hi-C 24141950 SLC12A7 42779 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr5 1468056 1468058 1468057 Y NA NA NA NA NA NA LPCAT1 54034 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 3304230 3304631 3304430 Y NA NA NA NA NA NA IRX1 289537 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr5 3311711 3311862 3311757 Y NA NA NA NA NA NA IRX1 282306 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr5 3595085 3595457 3595281 Y NA IRX1 NA NA NA NA IRX1 917 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 5026027 5026363 5026168 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS16 112080 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 5311411 5311643 5311527 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0947 107134 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 5340490 5340721 5340596 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0947 78056 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA RP11-332J15.3 50027 CAGE T98G hg19 FANTOM5 4.34976167272334 chr5 6927514 6927543 6927527 Y NA NA NA NA NA NA RP11-332J15.3 163510 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 10270287 10270466 10270406 Y NA FAM173B,CCT5,CMBL NA NA NA NA CCT5 22254 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 10371627 10371888 10371758 Y NA MARCH6 NA NA NA NA MARCH6 19812 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 10422961 10423316 10423021 Y NA ROPN1L NA NA NA NA ROPN1L 16320 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr5 10485180 10485474 10485337 Y NA ROPN1L,RPL30P7 NA NA NA NA RPL30P7 1458 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 10636353 10636579 10636473 Y ANKRD33B NA NA NA NA NA ANKRD33B 73911 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 10857093 10857358 10857239 Y NA NA ROPN1L,DAP,CTNND2,MARCH6,ANKRD33B IMR90 Hi-C 24141950 DAP 97709 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 14011107 14011342 14011264 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 68455 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 14035955 14036534 14036234 Y TRIO NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 93303 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 14037218 14037324 14037271 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 94566 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 14037561 14037744 14037653 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 94909 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr5 14038478 14038912 14038655 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 95826 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 14109130 14109647 14109337 Y NA TRIO TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIO 32164 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 14142332 14142650 14142445 Y NA TRIO NA NA NA NA TRIO 521 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr5 14142803 14143164 14142969 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 992 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 14154284 14154671 14154327 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 12473 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr5 14174472 14174896 14174531 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 32661 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 14178655 14179133 14178814 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 36844 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 14186205 14186627 14186374 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 44394 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 14250238 14250405 14250312 Y NA NA NA NA NA NA TRIO 108427 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr5 14264855 14265210 14264930 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 123044 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr5 14268390 14268821 14268476 Y NA NA NA NA NA NA TRIO 126579 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr5 14404233 14404452 14404428 Y TRIO NA NA NA NA NA FAM105A 175432 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 14408020 14408375 14408038 Y TRIO NA NA NA NA NA FAM105A 171509 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 14489488 14489835 14489662 Y NA NA NA NA NA NA FAM105A 90049 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 14742718 14742956 14742837 Y NA NA NA NA NA NA RBBP4P1 53553 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 16723637 16724009 16723823 Y BASP1 NA NA NA NA NA CTB-55B8.1 176741 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 16735791 16735955 16735874 Y NA NA NA NA NA NA CTB-55B8.1 164795 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 16736297 16736738 16736539 Y NA NA NA NA NA NA CTB-55B8.1 164012 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 17224986 17225514 17225115 Y BASP1 NA NA NA NA NA RN7SKP133 118211 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 25910581 25911176 25910785 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 721816 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.58173151735394 chr5 29796154 29796219 29796166 Y NA NA NA NA NA NA RPL19P11 1255453 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 32760271 32760413 32760371 Y SUB1 NA NA NA NA NA SUB1 230532 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr5 33442170 33442454 33442303 Y NA CTD-2203K17.1,TARS NA NA NA NA TARS 3368 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr5 34571249 34571361 34571303 Y NA NA RAI14,TTC23L IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 82981 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 34587608 34588326 34587915 Y NA NA RAI14 IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 66016 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 35857994 35858411 35858032 Y IL7R IL7R NA NA NA NA IL7R 7197 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 35924372 35924674 35924571 Y NA NA NA NA NA NA IL7R 73575 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr5 36151218 36151404 36151252 Y C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA SKP2 1127 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 36174356 36174616 36174412 Y SLC1A3,SLC1A3,RANBP3L,C5orf33,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA SKP2 24265 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 36229884 36229947 36229916 Y UGT3A1,C5orf33,C5orf33 NA NA NA NA NA RANBP3L 70269 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 36690488 36690876 36690655 Y NIPBL NA NA NA NA NA SLC1A3 86031 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 37029618 37029862 37029736 Y NA NA NA NA NA NA RPS4XP6 53296 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 37615302 37615631 37615482 Y NA NA NA NA NA NA WDR70 237988 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 37718043 37718447 37718273 Y NA NA NA NA NA NA WDR70 340729 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 37838047 37838605 37838394 Y GDNF,GDNF,GDNF NA NA NA NA NA WDR70 460733 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 38467529 38467846 38467689 Y NA NA NA NA NA NA MIR3650 87817 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 38866844 38867106 38866976 Y NA CTD-2127H9.1,OSMR NA NA NA NA OSMR 22884 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 39077105 39077361 39077230 Y FYB,RICTOR RICTOR NA NA NA NA RICTOR 4595 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 39256594 39256894 39256792 Y RICTOR,FYB FYB NA NA NA NA FYB 15736 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 39395044 39395463 39395161 Y NA C9 NA NA NA NA C9 27507 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 39399549 39400018 39399831 Y NA C9 NA NA NA NA C9 22952 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 39760848 39761179 39761033 Y NA NA PTGER4,PRKAA1,TTC33 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 300446 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr5 40263385 40263650 40263545 Y NA NA PTGER4,TTC33 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 413950 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 40385282 40385417 40385333 Y PTGER4,CARD6 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 292183 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 40689630 40689893 40689724 Y NA PTGER4 NA NA NA NA PTGER4 12030 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 42943717 42944113 42943855 Y NA NA LOC648987 IMR90 Hi-C 24141950 SEPP1 58223 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 42949793 42950117 42950048 Y ZNF131,C5orf39 NA LOC648987,LOC153684 IMR90 Hi-C 24141950 SEPP1 64299 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr5 42994649 42995346 42995172 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 21185 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.77944795702319 chr5 42999523 42999876 42999700 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 16655 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 43007637 43008177 43007831 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 8354 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 43020158 43020617 43020275 Y C5orf28,ZNF131,C5orf39 CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 3627 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr5 43020658 43020829 43020797 Y ZNF131,C5orf39 CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 4127 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 43034859 43034967 43034962 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 LOC648987 MCF7 ChIA-PET 22265404 AC025171.1 4710 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr5 43038627 43038828 43038720 Y ZNF131,C5orf39 CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA AC025171.1 849 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 43105884 43106284 43106088 Y NA ZNF131,CTD-2201E18.3 LOC153684,LOC100132356,ZNF131 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2201E18.3 40363 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 43773427 43773527 43773474 Y NA NA NA NA NA NA NNT-AS1 172095 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 50149268 50149286 50149277 Y NA NA NA NA NA NA PARP8 189535 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 52327592 52327905 52327807 Y ITGA2 ITGA2 NA NA NA NA ITGA2 44436 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 52545484 52545615 52545603 Y ITGA2,FST NA ARL15,FST IMR90 Hi-C 24141950 MOCS2 141591 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 52693799 52694135 52693979 Y NA NA ARL15,LOC257396 IMR90 Hi-C 24141950 FST 80104 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 53466021 53466779 53466401 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 137633 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 53585796 53586153 53585818 Y NA ARL15 NA NA NA NA ARL15 18259 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 53998804 53998843 53998825 Y NA NA HSPB3,SNX18 IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 187215 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 54033914 54034212 54034128 Y NA NA SNX18 IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 222325 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 54039991 54040439 54040234 Y SNX18,SNX18 NA SNX18,GPX8,CDC20B IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 228402 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr5 54132867 54133361 54133072 Y SNX18,SNX18,CDC20B NA SNX18,ARL15,HSPB3 IMR90 Hi-C 24141950 GPX8 320585 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 54722913 54723133 54723024 Y SKIV2L2 NA NA NA NA NA RNF138P1 101396 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 54897039 54897427 54897238 Y IL6ST,PPAP2A NA NA NA NA NA PPAP2A 68161 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 55288370 55289209 55288952 Y IL6ST NA NA NA NA NA IL6ST,CTD-2031P19.3 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 55289605 55289989 55289924 Y IL6ST IL6ST,CTD-2031P19.3 NA NA NA NA CTD-2031P19.3 610 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr5 55457979 55458137 55458083 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2031P19.3 168984 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 55461813 55461854 55461833 Y IL6ST NA NA NA NA NA CTD-2031P19.3 172818 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 55575946 55576115 55576004 Y NA NA MAP3K1,MIER3 IMR90 Hi-C 24141950 AC022431.1 222784 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 55654713 55655022 55654890 Y NA NA MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC022431.1 143877 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 55655118 55655221 55655151 Y NA NA MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC022431.1 143678 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 55711184 55711637 55711363 Y MAP3K1 NA MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC022431.1 87262 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 55737283 55737549 55737459 Y MAP3K1 NA MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC022431.1 61350 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 56731620 56731973 56731778 Y NA ACTBL2 PLK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTBL2 44663 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 57120821 57121296 57121146 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 344185 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 60597691 60598057 60597813 Y NA ZSWIM6 ZSWIM6,C5orf43 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZSWIM6 28043 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 60600910 60601202 60601013 Y ZSWIM6 ZSWIM6 ZSWIM6,C5orf43,NDUFAF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZSWIM6 24898 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 60624078 60624207 60624180 Y ELOVL7,ZSWIM6 ZSWIM6 ZSWIM6 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZSWIM6 1893 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 60626321 60626538 60626370 Y ZSWIM6 ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 221 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr5 60629701 60630027 60629731 Y ZSWIM6 ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 3601 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr5 60704594 60705129 60704691 Y NA RPL3P6 NA NA NA NA RPL3P6 18896 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 61917589 61917885 61917879 Y NA NA NA NA NA NA CKS1B 111280 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 64224703 64224806 64224755 Y NA NA NA NA NA NA CWC27 161946 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 64331292 64332267 64331637 Y NA NA NA NA NA NA CWC27 268535 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 64710773 64711167 64710966 Y NA NA NA NA NA NA CENPK 145831 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 64809602 64809952 64809754 Y NA CENPK,PPWD1 NA NA NA NA CENPK 47046 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 64821420 64821488 64821458 Y NA CENPK,PPWD1 NA NA NA NA CENPK 35510 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 66518350 66518491 66518422 Y CD180 NA NA NA NA NA PIK3R1 991057 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 66786490 66786676 66786582 Y NA NA NA NA NA NA PIK3R1 722872 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 67294770 67295126 67294965 Y PIK3R1 NA NA NA NA NA PIK3R1 214422 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 67875476 67875860 67875665 Y PIK3R1 NA NA NA NA NA CTC-537E7.3 147168 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 68338463 68338878 68338699 Y NA CTC-498J12.1,SLC30A5 NA NA NA NA CTC-498J12.1 815 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr5 71218510 71218673 71218589 Y NA NA NA NA NA NA MAP1B 182388 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 71404360 71404518 71404455 Y MAP1B MAP1B NA NA NA NA MAP1B 3299 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr5 71424352 71424432 71424374 Y NA MAP1B NA NA NA NA MAP1B 23291 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 71462643 71462861 71462688 Y NA NA NA NA NA NA MAP1B 61582 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 71748206 71748633 71748536 Y NA NA NA NA NA NA ZNF366 52921 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 71790679 71790815 71790747 Y NA ZNF366 NA NA NA NA ZNF366 10739 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr5 71800012 71800268 71800102 Y ZNF366 ZNF366 NA NA NA NA ZNF366 1286 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 71806748 71806963 71806875 Y ZNF366 ZNF366 NA NA NA NA ZNF366 5194 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 72234221 72234359 72234290 Y FCHO2 FCHO2 NA NA NA NA FCHO2 15449 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 72511984 72512100 72512037 Y FOXD1 NA FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM171 97865 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 72792808 72793048 72792966 Y NA BTF3 NA NA NA NA BTF3 575 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 72934554 72934908 72934667 Y RGNEF NA NA NA NA NA ANKRA2 75043 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 73611863 73612159 73611974 Y NA NA RGNEF,ENC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEXB 321689 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 73839049 73839165 73839086 Y NA NA CTIF,RGNEF,ENC1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 19890323,24141950 HEXB 94683 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 74883919 74884208 74884013 Y NA NA NA NA NA NA COL4A3BP 77956 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 76034658 76035100 76034908 Y IQGAP2 F2R NA NA NA NA F2R 24790 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 76086514 76086772 76086643 Y F2R F2RL1 NCRUPAR,F2R,IQGAP2 IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 25986 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 76102045 76102389 76102284 Y F2RL1 F2RL1 F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 10369 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 76958449 76958840 76958645 Y NA WDR41 NA NA NA NA WDR41 44013 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 77026226 77026494 77026313 Y NA NA NA NA NA NA ACTBP2 52211 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 77800435 77801147 77800993 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA SCAMP1 146096 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 77803150 77803526 77803443 Y AP3B1,LHFPL2,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 148811 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 77890894 77891278 77891114 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA CTD-2073O6.1 118627 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 78054058 78054218 78054140 Y NA CTD-2073O6.1,LHFPL2 NA NA NA NA LHFPL2 9626 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 78411121 78411135 78411130 Y NA NA NA NA NA NA DMGDH 118726 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 78429598 78429944 78429771 Y NA NA NA NA NA NA DMGDH 99917 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 79440817 79441220 79441029 Y ZFYVE16,FAM151B,SERINC5 NA NA NA NA NA SERINC5 108678 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 79543086 79543324 79543242 Y ZFYVE16,SERINC5 SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 6574 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr5 79695212 79695829 79695740 Y ZFYVE16,FAM151B ZFYVE16 THBS4,ZFYVE16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFYVE16 6003 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 79768084 79768333 79768119 Y NA FAM151B,CTD-2015H6.3,RPL7P24 NA NA NA NA FAM151B 13455 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 80253952 80254094 80254023 Y NA NA NA NA NA NA DHFR 305150 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 80260404 80260721 80260547 Y NA NA NA NA NA NA DHFR 311602 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 80707651 80707683 80707665 Y SSBP2 ACOT12 NA NA NA NA ACOT12 19653 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 80895638 80895717 80895678 Y NA NA NA NA NA NA SSBP2 149899 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 81147637 81148063 81147790 Y NA CTD-2249K22.1 ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2249K22.1 2217 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.48287329751932 chr5 81327233 81327622 81327332 Y NA NA NA NA NA NA ATG10 61389 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 81701396 81701769 81701673 Y NA NA VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 129000 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 82608517 82608916 82608727 Y TMEM167A,XRCC4,VCAN NA NA NA NA NA TMEM167A 236835 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 82770174 82770695 82770300 Y NA NA NA NA NA NA HAPLN1 244737 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 83140507 83140806 83140549 Y NA NA NA NA NA NA HAPLN1 125075 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 83214867 83215139 83214962 Y HAPLN1 NA NA NA NA NA HAPLN1 199435 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 83545538 83546053 83545791 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2269F5.1 132192 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 83583813 83583994 83583988 Y EDIL3 NA NA NA NA NA CTD-2269F5.1 94251 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 83585889 83586179 83586107 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2269F5.1 92066 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 83652187 83652571 83652379 Y EDIL3 CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 25674 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 83668796 83668857 83668813 Y NA CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 9388 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 83670446 83670810 83670539 Y EDIL3 CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 7435 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 83677578 83677928 83677708 Y EDIL3 CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 317 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 86417249 86417398 86417310 Y CCNH,CCNH NA MIR4280 K562 ChIA-PET 22265404 RASA1 144307 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 86417910 86418259 86418047 Y NA NA MIR4280 K562 ChIA-PET 22265404 RASA1 143446 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 86604017 86604207 86604034 Y RASA1,RASA1 RASA1 NA NA NA NA RASA1 42312 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 86619148 86619498 86619336 Y NA NA NA NA NA NA RASA1 57443 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 86620547 86620785 86620574 Y NA NA NA NA NA NA RASA1 58842 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 86662563 86662890 86662661 Y RASA1,RASA1 CCNH NA NA NA NA CCNH 43946 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 86667091 86667409 86667357 Y NA CCNH NA NA NA NA CCNH 39427 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 87798983 87799105 87799057 Y NA NA NA NA NA NA RPS3AP22 123209 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 87956632 87957169 87956907 Y MEF2C,MEF2C CTC-467M3.1,LINC00461 NA NA NA NA CTC-467M3.1 12867 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 88177466 88177636 88177509 Y NA NA NA NA NA NA LINC00461 192608 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 90485915 90486074 90486029 Y ARRDC3 NA GPR98,ARRDC3,LOC100129716 IMR90 Hi-C 24141950 LUCAT1 122145 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 90604425 90604632 90604611 Y NA LUCAT1 GPR98,ARRDC3,LOC100129716 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LUCAT1 3587 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 90673049 90673245 90673226 Y ARRDC3 ARRDC3 NA NA NA NA ARRDC3 3931 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 92914746 92915169 92914912 Y NR2F1 NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 1874 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr5 92932960 92933102 92933051 Y NA NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 15917 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 92935260 92935353 92935337 Y NA NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 18217 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 92949916 92950260 92950088 Y NA NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 32873 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 92958001 92958327 92958133 Y NA NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 40958 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr5 93256507 93256894 93256879 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 188510 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 95048086 95048445 95048385 Y NA RHOBTB3,CTD-2154I11.2 RHOBTB3,ARSK,SPATA9,RFESD IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOBTB3 860 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 95170754 95171173 95170855 Y GLRX,ELL2 GLRX RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 14045 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 95179469 95179934 95179619 Y NA GLRX GLRX,SPATA9,RFESD,RHOBTB3,C5orf27 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 22760 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.3840150776847 chr5 95205682 95206201 95205913 Y GLRX,ELL2 GLRX NA NA NA NA GLRX 48973 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 95207014 95207210 95207113 Y ELL2 NA NA NA NA NA GLRX 50305 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 95227563 95227763 95227704 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2337A12.1 67942 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 95240158 95240487 95240414 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2337A12.1 55218 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 95294794 95295285 95294896 Y ELL2 CTD-2337A12.1,ELL2 NA NA NA NA CTD-2337A12.1 420 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 95295681 95296335 95296056 Y ELL2 NA NA NA NA NA CTD-2337A12.1,ELL2 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr5 95298372 95298734 95298686 Y ELL2 CTD-2337A12.1,ELL2 NA NA NA NA ELL2 2597 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 95403711 95404019 95403912 Y ELL2 RP11-254I22.1 ELL2,CAST,MIR583,C5orf27 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-254I22.1 19892 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr5 95414896 95415105 95415065 Y GLRX,ELL2 RP11-254I22.1 NA NA NA NA RP11-254I22.1 31077 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 95419074 95419624 95419399 Y ELL2 RP11-254I22.1 NA NA NA NA RP11-254I22.1 35255 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 95482384 95482735 95482679 Y NA NA ELL2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-254I22.1 98565 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 95485310 95485563 95485437 Y GLRX,ELL2 NA ELL2,MIR583 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-254I22.1 101491 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 95555701 95555931 95555845 Y NA NA ELL2,RHOBTB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-254I22.1 171882 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 95562741 95563074 95562934 Y NA NA ELL2,RHOBTB3,GLRX,C5orf27,MIR583,PCSK1,SPATA9 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-254I22.1 178922 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 97645408 97646168 97645558 Y RGMB CH17-12M21.1 RGMB,FLJ35946 IMR90 Hi-C 24141950 CH17-12M21.1 26280 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 98175322 98175662 98175493 Y NA NA NA NA NA NA RGMB-AS1 68149 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 99387251 99388845 99388529 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 480121 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr5 102091646 102092087 102091846 Y NA PAM NA NA NA NA PAM 3961 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr5 106725486 106725757 106725607 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 278839 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 106803890 106804202 106804046 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 200394 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 106805205 106805528 106805416 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 199068 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 108137615 108137706 108137661 Y NA NA NA NA NA NA FER 56092 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 108391550 108391948 108391605 Y NA NA NA NA NA NA FER 310027 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 108735031 108735161 108735096 Y NA PJA2 NA NA NA NA PJA2 8534 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 109207541 109207704 109207623 Y NA NA NA NA NA NA MAN2A1 184474 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 110865894 110866475 110866210 Y STARD4 STARD4 NA NA NA NA STARD4 19606 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 111054290 111054596 111054444 Y C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13 NA NA NA NA NA STARD4 208002 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 112251574 112251628 112251601 Y NA REEP5 NA NA NA NA REEP5 4608 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 112314594 112314663 112314629 Y NA DCP2 NA NA NA NA DCP2 4195 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 114726097 114726311 114726134 Y NA NA NA NA NA NA CCDC112 95569 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 114755701 114755980 114755870 Y PGGT1B,TICAM2,FEM1C NA FEM1C,TMED7-TICAM2 IMR90 Hi-C 24141950 FEM1C 122611 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 114847596 114847935 114847760 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 30656 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 114970299 114970641 114970577 Y NA AC010226.4,TMED7-TICAM2,TICAM2,TMED7 NA NA NA NA TMED7 3610 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr5 118610393 118610883 118610628 Y DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8 TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 8006 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr5 119016321 119016356 119016339 Y NA NA NA NA NA NA HSD17B4 230183 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 119488072 119488536 119488287 Y NA NA PRR16 IMR90 Hi-C 24141950 PRR16 309437 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 119723949 119724386 119724234 Y NA NA NA NA NA NA PRR16 73587 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 119778960 119779078 119779019 Y NA PRR16 NA NA NA NA PRR16 18895 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 122177778 122177931 122177816 Y NA SNX24 NA NA NA NA SNX24 644 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 123738017 123738276 123738143 Y NA NA NA NA NA NA ZNF608 344224 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 123966351 123966687 123966497 Y NA NA NA NA NA NA ZNF608 115813 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 123987356 123987539 123987440 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 94961 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 123996464 123996708 123996619 Y NA NA NA NA NA NA ZNF608 85792 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 123997171 123997561 123997207 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 84939 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 124029260 124029627 124029444 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 52873 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 124077955 124078154 124078062 Y ZNF608 ZNF608 NA NA NA NA ZNF608 4346 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 124748569 124748778 124748675 Y NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-436H11.1 605643 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 125690030 125690185 125690123 Y GRAMD3,GRAMD3 GRAMD3 GRAMD3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GRAMD3 3639 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr5 126478879 126479210 126479043 Y NA NA NA NA NA NA MARCH3 114379 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 130711215 130711396 130711236 Y NA NA NA NA NA NA CDC42SE2 132029 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 130750368 130750574 130750471 Y CDC42SE2,RAPGEF6 NA NA NA NA NA CDC42SE2 171182 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 130976279 130976499 130976398 Y FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6 RAPGEF6 NA NA NA NA RAPGEF6 7350 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 131560740 131561286 131561173 Y IL3,CSF2,PDLIM4,P4HA2,P4HA2 NA NA NA NA NA SLC22A4 66850 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 131629178 131629624 131629352 Y FNIP1,IRF1,SLC22A4 SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 170 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr5 131757211 131757329 131757283 Y SLC22A4,IRF1 C5orf56,AC116366.5,AC116366.6 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 AC116366.5 3077 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 131763542 131763915 131763870 Y SLC22A4,IRF1 C5orf56,AC116366.5,AC116366.6 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 AC116366.5 3136 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 131832561 131832909 131832704 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 AC116366.6,IRF1 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 IRF1 8071 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr5 132323487 132323535 132323508 Y NA AFF4,ZCCHC10 NA NA NA NA AFF4 26161 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr5 132576270 132576709 132576388 Y AFF4,ZCCHC10 NA NA NA NA NA HSPA4 190616 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr5 133435759 133436442 133436277 Y PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7 TCF7 TCF7,SKP1 IMR90 Hi-C 24141950 TCF7 11960 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 133801466 133801754 133801589 Y NA AC005355.2 PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC005355.2 38489 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 133802349 133802592 133802584 Y PPP2CA,SEC24A,UBE2B AC005355.2 PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC005355.2 37651 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 133839310 133839404 133839346 Y NA AC005355.2 PHF15,PPP2CA,CDKL3,CDKN2AIPNL,SAR1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC005355.2 839 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 133863130 133863560 133863438 Y NA AC005355.2 NA NA NA NA AC005355.2 22887 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr5 133890161 133890536 133890268 Y TCF7,PPP2CA,CDKL3,UBE2B,SEC24A,CAMLG,PHF15 AC005355.2 NA NA NA NA AC005355.2 49918 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 133891612 133892163 133891823 Y PPP2CA,UBE2B,SEC24A NA NA NA NA NA AC005355.2 51369 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461 NA NA NA NA MTND5P11 246 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11 NA NA NA NA MTND4P12,MIR4461 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr5 134471631 134472059 134471710 Y C5orf20,PITX1 NA PCBD2,LOC340073,CATSPER3,H2AFY,PITX1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITX1 103128 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr5 134475601 134475808 134475692 Y PITX1 NA LOC340073,PCBD2,CATSPER3,H2AFY IMR90 Hi-C 24141950 PITX1 107098 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr5 134602658 134602833 134602747 Y NA NA H2AFY,LOC340073,CATSPER3 IMR90 Hi-C 24141950 H2AFY 130771 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 134791969 134792408 134792068 Y H2AFY NA H2AFY K562 ChIA-PET 22265404 H2AFY 58365 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 135357182 135357477 135357330 Y NA TGFBI VTRNA2-1,TGFBI,FBXL21,LECT2,SMAD5 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBI 5107 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 135372729 135373019 135372874 Y NA TGFBI NA NA NA NA TGFBI 10145 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 136482104 136482426 136482383 Y SPOCK1 NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 290787 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr5 136900041 136900222 136900186 Y NA SPOCK1 TRPC7 IMR90 Hi-C 24141950 SPOCK1 31846 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 136930873 136930924 136930899 Y NA SPOCK1 NA NA NA NA SPOCK1 1144 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 137333439 137333810 137333723 Y NA NA NA NA NA NA FAM13B 51840 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 137799770 137800154 137799916 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 591 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 137800317 137800564 137800421 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 1138 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.988582198346214 chr5 137827710 137828119 137827817 Y EGR1 EGR1,ETF1 NA NA NA NA EGR1 28531 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 137868208 137868538 137868536 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1 ETF1,HSPA9 NA NA NA NA ETF1 8451 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 137881069 137881276 137881109 Y WNT8A,FAM53C,ETF1 ETF1,HSPA9 NA NA NA NA ETF1 4080 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 138258617 138258897 138258757 Y NA LRRTM2 NA NA NA NA LRRTM2 49560 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 138262166 138262549 138262196 Y NA NA NA NA NA NA LRRTM2 53109 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 138277949 138278244 138278038 Y NA NA NA NA NA NA LRRTM2 68892 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 138325344 138325620 138325482 Y NA NA NA NA NA NA LRRTM2 116287 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 138620359 138620541 138620439 Y UBE2D2,MATR3 MATR3,SIL1 NA NA NA NA SIL1 6705 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr5 138851930 138852095 138852011 Y NA TMEM173 NA NA NA NA TMEM173 8425 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 139017086 139017541 139017145 Y CXXC5 CXXC5 CXXC5 IMR90 Hi-C 24141950 CXXC5 7343 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 139031397 139032095 139031636 Y C5orf53,PSD2,NRG2,CXXC5 CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 6513 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 139040519 139041115 139040855 Y PAIP2 CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 15635 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 139050998 139051193 139051098 Y NA CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 26114 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 139076374 139076603 139076510 Y CXXC5 NA NA NA NA NA CXXC5 51490 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 139077054 139077268 139077188 Y CXXC5 NA NA NA NA NA CXXC5 52170 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 139088295 139089196 139088669 Y NA NA CXXC5 K562 ChIA-PET 22265404 CXXC5 63411 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 139090416 139090834 139090571 Y MATR3,MATR3,CXXC5 NA CXXC5 K562 ChIA-PET 22265404 CXXC5 65532 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 139631101 139631601 139631302 Y SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 49105 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 139636160 139636260 139636251 Y SRA1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 44446 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 139933633 139933898 139933723 Y ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3 EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3 NA NA NA NA SRA1 1997 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 140090601 140091006 140090806 Y NA WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-3 NA NA NA NA VTRNA1-3 12737 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.3840150776847 chr5 140098281 140098628 140098472 Y NA HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-3 NA NA NA NA VTRNA1-3 5115 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr5 140420005 140420137 140420073 Y NA NA PCDHA1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PCDHB2 52090 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 140648312 140648399 140648356 Y NA PCDHB14,PCDHB15,TAF7 NA NA NA NA PCDHB15 25165 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 140875639 140876085 140875835 Y PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1 PCDHGC3 NA NA NA NA PCDHGC3 22059 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 140893513 140893891 140893828 Y PCDH12,KIAA0141,DIAPH1 PCDHGC3 NA NA NA NA PCDHGC3 39933 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr5 140900821 140901187 140900923 Y PCDH12,KIAA0141,DIAPH1 PCDHGC3 NA NA NA NA PCDHGC3 47241 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 140983787 140984197 140984031 Y PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1 DIAPH1,HDAC3,RELL2,FCHSD1 NA NA NA NA DIAPH1 12425 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 141851932 141852283 141852109 Y NA NA SPRY4,GNPDA1,NDFIP1,FGF1,RNF14 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY4 147912 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 142042808 142043187 142042997 Y NA FGF1 NA NA NA NA FGF1 32430 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 142331202 142331597 142331265 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP26 183253 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 142361615 142361922 142361810 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 213666 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 142362111 142362403 142362189 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP26 214162 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 142623562 142623962 142623719 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P21 86208 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr5 142694262 142694483 142694414 Y NR3C1,NR3C1 RPL7P21 NA NA NA NA RPL7P21 15687 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 145094622 145094634 145094628 Y GRXCR2 NA KCTD16 IMR90 Hi-C 24141950 PRELID2 118298 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 145447855 145448292 145447919 Y NA NA NA NA NA NA LARS 111931 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 145827727 145827826 145827802 Y NA TCERG1 GPR151 IMR90 Hi-C 24141950 TCERG1 2853 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 146151261 146151436 146151381 Y PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B NA NA NA NA NA PPP2R2B 310911 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 146242419 146242610 146242553 Y NA NA NA NA NA NA PPP2R2B 219737 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr5 146831561 146831956 146831686 Y PPP2R2B,JAKMIP2,DPYSL3 NA NA NA NA NA DPYSL3 55663 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 147782971 147782994 147782983 Y ADRB2,SPINK14,FBXO38 RP11-373N22.3,FBXO38 NA NA NA NA FBXO38 21473 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 148172345 148172765 148172447 Y FBXO38,ADRB2 ADRB2 SH3TC2,ADRB2,ABLIM3 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 31391 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 148290314 148290586 148290452 Y NA NA SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 86158 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 148352583 148352893 148352766 Y ADRB2 NA NA NA NA NA SH3TC2 87833 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr5 148514080 148514173 148514127 Y NA ABLIM3 ABLIM3,AFAP1L1,ADRB2,SH3TC2 IMR90 Hi-C 24141950 ABLIM3 4873 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr5 148551862 148552080 148551971 Y NA ABLIM3 AFAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 ABLIM3 32816 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 148591795 148592037 148591918 Y ABLIM3 NA NA NA NA NA AFAP1L1 57397 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 148835583 148835880 148835720 Y NA NA NA NA NA NA MIR143HG 51331 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 149110836 149111455 149111198 Y ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2975 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 149261958 149262272 149262115 Y NA NA NA NA NA NA SLC26A2 76028 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 149285101 149285395 149285344 Y PDE6A NA NA NA NA NA SLC26A2 52905 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 149445526 149445798 149445671 Y SLC26A2,HMGXB3,CD74,CD74 NA NA NA NA NA TIGD6 66796 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 149518246 149518623 149518550 Y NA PDGFRB NA NA NA NA PDGFRB 14812 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.988582198346214 chr5 149522462 149523132 149522666 Y NA PDGFRB NA NA NA NA PDGFRB 10303 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr5 149533722 149534084 149534015 Y SYNPO,SYNPO,PDGFRB PDGFRB NA NA NA NA PDGFRB 287 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.18629863801546 chr5 149660183 149660270 149660234 Y NA NA NA NA NA NA TCOF1 74932 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 149838456 149838698 149838517 Y SYNPO,ZNF300,SLC6A7 CD74,RPS14,NDST1,CTC-367J11.1 NDST1,MYOZ3,SYNPO,RPS14 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS14 11137 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 149849253 149849476 149849346 Y NA RPS14,NDST1,CTC-367J11.1 SYNPO,MYOZ3,C5orf62,RPS14,NDST1,DCTN4,RBM22 IMR90 Hi-C 24141950 NDST1 13905 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 150086779 150087134 150086956 Y RBM22,DCTN4,DCTN4 RBM22,DCTN4 MYOZ3,RBM22 IMR90 Hi-C 24141950 RBM22 8110 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 150169826 150170319 150169982 Y CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62 DCTN4 NA NA NA NA DCTN4 33155 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 150385694 150386089 150385927 Y SYNPO,GPX3 GPX3 NA NA NA NA GPX3 12035 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 150455023 150455538 150455407 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 15600 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 150464543 150466084 150465220 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 5054 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 150477506 150477962 150477585 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,TNIP1,CCDC69 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 6368 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 150505089 150505277 150505181 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,TNIP1,CCDC69,ANXA6 TNIP1,ANXA6 TNIP1 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA6 30166 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 151078700 151079028 151078874 Y ATOX1,SPARC SPARC SPARC,ATOX1 IMR90 Hi-C 24141950 SPARC 13974 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr5 151129219 151129502 151129338 Y SLC36A1 RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1 NA NA NA NA RP11-54C4.1 14437 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 151213355 151213633 151213423 Y NA NA NA NA NA NA ATOX1 63262 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 153939934 153940118 153940082 Y NA NA FAM114A2,MFAP3,SAP30L IMR90 Hi-C 24141950 SAP30L 116417 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 154062607 154063000 154062805 Y GEMIN5 LARP1 LARP1,C5orf4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LARP1 27462 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 154205315 154205569 154205444 Y KIF4B,GEMIN5 CNOT8 NA NA NA NA CNOT8 29544 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 154871450 154872048 154871744 Y KIF4B NA NA NA NA NA MRPL22 552820 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.18629863801546 chr5 156724834 156725095 156724964 Y NA CYFIP2 NA NA NA NA CYFIP2 33745 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 157030326 157030804 157030600 Y HAVCR2,NIPAL4,ADAM19 ADAM19 CYFIP2,FNDC9,NIPAL4,ADAM19,SOX30,C5orf52,THG1L,LSM11 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM19 29543 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 157833982 157834188 157834134 Y NA NA NA NA NA NA CLINT1 549799 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 158366953 158367057 158367005 Y NA NA NA NA NA NA EBF1 157712 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 158438022 158438330 158438136 Y RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,EBF1 NA NA NA NA NA EBF1 86439 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 158448175 158448456 158448348 Y RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,IL12B NA NA NA NA NA EBF1 76313 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 158478339 158478495 158478452 Y EBF1 EBF1,RP11-175K6.1 NA NA NA NA EBF1 46274 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 158481442 158481711 158481685 Y NA EBF1,RP11-175K6.1 NA NA NA NA EBF1 43058 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 158605991 158606398 158606265 Y NA RNF145 NA NA NA NA RNF145 28663 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 158611896 158612266 158612182 Y IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145 RNF145 NA NA NA NA RNF145 22795 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 158667490 158667750 158667579 Y IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145 RNF145,UBLCP1 ADRA1B IMR90 Hi-C 24141950 UBLCP1 20339 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 158839407 158839958 158839513 Y RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,IL12B NA ADRA1B,IL12B,LOC285627 IMR90 Hi-C 24141950 UBLCP1 151318 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 158876999 158877252 158877089 Y NA NA NA NA NA NA UBLCP1 188910 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 158878372 158878607 158878465 Y RNF145,RNF145,IL12B NA NA NA NA NA UBLCP1 190283 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 158938695 158938959 158938847 Y EBF1 NA ADRA1B,LOC285627,TTC1 IMR90 Hi-C 24141950 UBLCP1 250606 CAGE T98G hg19 FANTOM5 2.27373905619629 chr5 159451021 159451194 159451125 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 16901 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 159533500 159533764 159533742 Y NA PWWP2A NA NA NA NA PWWP2A 10666 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 159592107 159592427 159592336 Y NA PWWP2A,FABP6 TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FABP6 19947 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr5 159592617 159593055 159592885 Y NA PWWP2A,FABP6 TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FABP6 19319 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 159815159 159815328 159815245 Y NA CCNJL,C1QTNF2,C5orf54,SLU7,PTTG1 NA NA NA NA C5orf54 9776 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 167126470 167126930 167126675 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 589726 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 167157088 167157552 167157214 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 559104 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 167243466 167243587 167243564 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 473069 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 168588352 168588495 168588423 Y NA NA NA NA NA NA CTC-575D19.1 547035 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 169398752 169398877 169398815 Y NA FAM196B NA NA NA NA FAM196B 6867 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 169404223 169404546 169404350 Y FAM196B FAM196B NA NA NA NA FAM196B 1198 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr5 171094849 171095086 171094946 Y NA NA FBXW11,FGF18 IMR90 Hi-C 24141950 FGF18 250189 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 171540284 171540310 171540295 Y STK10 NA NA NA NA NA STK10 73080 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 171606484 171606964 171606720 Y UBTD2,STK10 STK10 NA NA NA NA STK10 6426 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 171681735 171682053 171681977 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 27022 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 171709316 171709633 171709569 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 241 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 171788471 171789086 171788773 Y DUSP1,STK10,UBTD2 NA NA NA NA NA UBTD2 79396 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 172127867 172128162 172128023 Y NEURL1B CTB-79E8.3 NA NA NA NA CTB-79E8.3 46151 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 172160417 172160946 172160788 Y ATP6V0E1 DUSP1 ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 35252 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 172167900 172168183 172168030 Y UBTD2,DUSP1 DUSP1 ERGIC1,DUSP1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 28015 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr5 172192263 172193766 172192583 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2432 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr5 172193800 172194232 172193914 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 1966 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr5 172198749 172199959 172199636 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2551 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr5 172228151 172228566 172228394 Y DUSP1 DUSP1,ERGIC1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERGIC1 30712 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 172234136 172234644 172234380 Y NA DUSP1,ERGIC1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERGIC1 24634 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr5 172328085 172328386 172328247 Y DUSP1 NA NA NA NA NA RPL26L1 55346 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 172710965 172711353 172711102 Y NA STC2 ATP6V0E1,BNIP1,LOC285593,NKX2-5,NEURL1B,RPL26L1,STC2,C5orf41 IMR90 Hi-C 24141950 STC2 43153 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 172879193 172879453 172879250 Y CPEB4 NA LOC285593,STC2,BOD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STC2 124687 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 172881373 172881649 172881564 Y CPEB4 NA LOC285593,STC2,BOD1,CPEB4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STC2 126867 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 172882283 172882785 172882503 Y NA NA LOC285593,STC2,BOD1,NKX2-5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STC2 127777 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr5 173153574 173153834 173153704 Y NA CTB-43E15.3 CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CTB-43E15.3 17380 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 173169995 173170330 173170163 Y NA CTB-43E15.3 CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CTB-43E15.3 884 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 173193377 173193650 173193560 Y NA CTB-43E15.3 CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CTB-43E15.3 22163 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 173586705 173586920 173586830 Y NA NA NA NA NA NA CPEB4 273422 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 175962179 175962700 175962413 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,HK3,HIGD2A,RNF44,CDHR2 RNF44 FAF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 RNF44 326 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 176699119 176699281 176699198 Y NSD1 RAB24,PRELID1,MXD3 NA NA NA NA RAB24 29464 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 176972522 176972758 176972729 Y NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3 PDLIM7,DDX41,FAM193B,TMED9 NA NA NA NA FAM193B 6784 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 177645477 177646261 177645593 Y NA HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 15969 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 177647239 177647603 177647383 Y CLK4,AGXT2L2 HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 17731 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr5 177933093 177933334 177933266 Y NHP2,HNRNPAB,COL23A1 NA NA NA NA NA CLK4 122282 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 178069436 178069827 178069736 Y NA CLK4 ZFP2,COL23A1,ZNF879,AACSP1,GRM6 IMR90 Hi-C 24141950 CLK4 13820 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 178692524 178692976 178692825 Y ADAMTS2 NA NA NA NA NA ADAMTS2 77455 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr5 179038504 179038699 179038602 Y NA HNRNPH1 NA NA NA NA HNRNPH1 21086 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 179188972 179189165 179189138 Y NA MAML1,LTC4S,SQSTM1,MGAT4B NA NA NA NA LTC4S 29816 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr5 179461499 179461900 179461782 Y RUFY1,HNRNPH1,MAML1,SQSTM1,RNF130 RNF130 NA NA NA NA RNF130 35218 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 179465387 179465429 179465409 Y MAML1,MGAT4B,RNF130 RNF130 NA NA NA NA RNF130 31689 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 179496400 179496705 179496553 Y NA RNF130 NA NA NA NA RNF130 413 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 179513863 179514025 179513944 Y NA RNF130 NA NA NA NA RNF130 16745 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 179532958 179533118 179533038 Y NA RNF130 NA NA NA NA RNF130 35840 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 180611137 180611357 180611292 Y MGAT1 CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 5567 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 180615428 180615595 180615512 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 1329 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr5 180615864 180616079 180615972 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 845 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr5 180634441 180634803 180634658 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM7 4148 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 446897 447289 446980 Y NA NA IRF4 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP22 157267 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 472688 472701 472695 Y HUS1B,EXOC2 NA NA NA NA NA DUSP22 183058 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 501922 502087 502051 Y NA NA NA NA NA NA EXOC2 189030 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 711154 711526 711478 Y DUSP22,EXOC2 EXOC2 NA NA NA NA EXOC2 20037 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr6 1250840 1251149 1250977 Y NA NA EXOC2,LOC285768 IMR90 Hi-C 24141950 FOXQ1 59526 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 1388566 1388906 1388736 Y NA FOXF2 NA NA NA NA FOXF2 497 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 2377151 2377429 2377354 Y NA NA NA NA NA NA GMDS-AS1 133169 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 3069574 3070273 3069674 Y NA HTATSF1P2,RIPK1,BPHL LOC100507194,WRNIP1 K562 ChIA-PET 22265404 RIPK1 7349 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 3163246 3163428 3163368 Y NA BPHL,TUBB2A NA NA NA NA TUBB2A 7486 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 3166310 3166878 3166542 Y NA BPHL,TUBB2A NA NA NA NA TUBB2A 10550 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 3356099 3356749 3356628 Y NA NA NA NA NA NA SLC22A23 98507 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 3426515 3426916 3426721 Y NA SLC22A23 NA NA NA NA SLC22A23 28340 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 3749707 3750120 3749911 Y C6orf145 PXDC1 NA NA NA NA PXDC1 140 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 3797931 3798162 3798051 Y NA PXDC1,FAM50B SLC22A23,FAM50B,TUBB2B,RIPK1,BPHL IMR90 Hi-C 24141950 PXDC1 47671 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 3826272 3826513 3826435 Y C6orf145 FAM50B SLC22A23,TUBB2B IMR90 Hi-C 24141950 FAM50B 21107 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 3913172 3913519 3913429 Y NA NA SLC22A23,FAM50B IMR90 Hi-C 24141950 FAM50B 65552 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 4358823 4359231 4358978 Y CDYL NA CDYL,RPP40 IMR90 Hi-C 24141950 ECI2 224992 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 4688350 4688741 4688427 Y NA CDYL CDYL,FAM217A,C6orf201,ECI2 IMR90 Hi-C 24141950 CDYL 15652 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 4990656 4990905 4990781 Y NA RPP40 NA NA NA NA RPP40 11392 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 5997075 5997523 5997169 Y NRN1 NRN1 NA NA NA NA NRN1 7677 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 6005714 6006036 6005928 Y NRN1 NRN1 NA NA NA NA NRN1 514 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 6885637 6886125 6885854 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 219705 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 7915829 7915944 7915887 Y SNRNP48 NA NA NA NA NA TXNDC5 108702 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 9516527 9516706 9516607 Y NA NA LOC100130275,TFAP2A,LINC00518 IMR90 Hi-C 24141950 TFAP2A 901186 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 10316491 10316897 10316818 Y TFAP2A,TFAP2A NA LOC100506207,TFAP2A,LOC100130275 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP2A 100995 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 10403752 10404250 10404030 Y TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A,LINC00518 NA NA NA NA TFAP2A 13642 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 10407698 10407754 10407725 Y PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A,LINC00518 NA NA NA NA TFAP2A 10138 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 10441526 10441791 10441655 Y TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,GCNT2,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A,LINC00518,GCNT2 NA NA NA NA LINC00518 8419 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 10771427 10771996 10771700 Y ELOVL2,MAK TMEM14B,SYCP2L NA NA NA NA SYCP2L 25400 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 10825104 10825395 10825250 Y ELOVL2 MAK NA NA NA NA MAK 11369 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 11072389 11072644 11072517 Y NA NA C6orf228 IMR90 Hi-C 24141950 MAK 235625 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 11197003 11197299 11197017 Y ERVFRD-1,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 183282 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 11212824 11213214 11213068 Y TMEM170B,NEDD9,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 167367 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 11609469 11609947 11609818 Y NA NA HIVEP1,EDN1,ADTRP IMR90 Hi-C 24141950 NEDD9 228888 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 11921182 11921467 11921322 Y NA NA ADTRP,HIVEP1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIVEP1 85528 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 12273843 12273861 12273852 Y NA EDN1 HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 14735 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 12595340 12595665 12595564 Y NA NA TMEM170B,EDN1,HIVEP1,ADTRP IMR90 Hi-C 24141950 RPL15P3 82998 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 13602068 13602103 13602086 Y NA SIRT5,NOL7 NA NA NA NA NOL7 11456 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr6 13649579 13649948 13649702 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 36020 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 13709903 13710182 13710119 Y TBC1D7,CD83,RANBP9 RANBP9 SIRT5,NOL7 K562 ChIA-PET 22265404 RANBP9 107 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 13762938 13763200 13763069 Y RNF182 NA NA NA NA NA RANBP9 53142 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 14075513 14075713 14075634 Y RANBP9,CD83 CD83 DTNBP1,RNF182 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 40159 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 14271187 14271701 14271310 Y CD83 NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 155315 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 14638705 14639298 14639002 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 522833 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 14713126 14713654 14713380 Y NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 530873 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 14725890 14726226 14726089 Y NA NA DTNBP1,JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 518301 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 14727219 14727672 14727501 Y NA NA DTNBP1,JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 516855 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 14735052 14735658 14735282 Y NA NA DTNBP1,JARID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JARID2 508869 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 14744083 14744613 14744392 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 499914 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 14766593 14766865 14766789 Y JARID2 NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 477662 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 14777704 14777964 14777898 Y JARID2 NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 466563 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.18629863801546 chr6 15022090 15022421 15022413 Y JARID2 NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 222106 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 15199575 15199598 15199586 Y NA JARID2,JARID2-AS1 JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 44929 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 15542142 15542162 15542152 Y JARID2 NA NA NA NA NA DTNBP1 119127 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 16256823 16257099 16256961 Y NA GMPR NA NA NA NA GMPR 20012 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 16320322 16320626 16320375 Y NA NA NA NA NA NA GMPR 83511 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 16436821 16437137 16436938 Y MYLIP,ATXN1 NA NA NA NA NA GMPR 200010 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 16477089 16477316 16477218 Y NA NA NA NA NA NA GMPR 240278 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 16481404 16481763 16481500 Y MYLIP,ATXN1 NA NA NA NA NA GMPR 244593 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 16588159 16588355 16588257 Y NA NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 171014 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 16673403 16673483 16673443 Y NA NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 85886 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 16694939 16695287 16695185 Y ATXN1 NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 64082 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 16699529 16700051 16699938 Y ATXN1 NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 59318 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 16712557 16713382 16713252 Y ATXN1 RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 45987 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr6 16766520 16766751 16766672 Y NA RP1-151F17.1,ATXN1 ATXN1 K562 ChIA-PET 22265404 ATXN1 6798 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 17418097 17418389 17418210 Y NA CAP2 NA NA NA NA CAP2 26650 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 17473157 17473283 17473220 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P26 56600 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 17703484 17703614 17703560 Y KDM1B,FAM8A1,NUP153 NUP153 NA NA NA NA NUP153 1042 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 17715315 17715544 17715493 Y NUP153 NUP153 NUP153,KIF13A IMR90 Hi-C 24141950 NUP153 10659 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr6 17993716 17994031 17993956 Y RNF144B,KDM1B KIF13A KIF13A,TPMT,NHLRC1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KIF13A 7862 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 18153083 18153444 18153238 Y RNF144B,NHLRC1,KDM1B KDM1B NA NA NA NA TPMT 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr6 18263099 18263635 18263391 Y RNF144B,DEK DEK NA NA NA NA DEK 45 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 20404913 20405227 20404970 Y MBOAT1 E2F3 NA NA NA NA E2F3 4515 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 20498349 20498567 20498410 Y MBOAT1 CDKAL1 NA NA NA NA CDKAL1 34121 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 20811412 20811642 20811580 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 278724 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 21022706 21023638 21022736 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 490018 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 21098770 21098791 21098780 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 493181 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 21587723 21589288 21589205 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2684 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 21603523 21603934 21603831 Y SOX4 SOX4 NA NA NA NA SOX4 11551 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 21947021 21947287 21947156 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 355049 CAGE T98G hg19 FANTOM5 3.75661235371561 chr6 21987708 21987959 21987863 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 395736 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 22892698 22893030 22892864 Y NA NA SOX4,LINC00340,LOC729177 IMR90 Hi-C 24141950 SOX4 1300726 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 24743523 24743742 24743610 Y TDP2,C6orf62 C6orf62,GMNN GMNN,CMAHP,C6orf62 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C6orf62 24459 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 25094713 25094741 25094729 Y NA NA NA NA NA NA LRRC16A 182565 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 25137169 25137503 25137225 Y C6orf62 NA NA NA NA NA LRRC16A 139803 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2 NA NA NA NA HIST1H1A 22967 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.87830617685781 chr6 26006011 26006046 26006038 Y HIST1H4G,HIST1H2AA,HIST1H2BA,HIST1H1T TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H1A 9994 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 26016753 26016987 26016816 Y HIST1H1A HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H1A 713 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 26025834 26026125 26026038 Y BTN2A1,BTN2A1,TRIM38 HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H4B 354 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr6 26026306 26026795 26026679 Y HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H4B 826 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr6 26029019 26029363 26029242 Y NA HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H3B 925 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 26034352 26034599 26034546 Y NA HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H2AB 2556 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 26126352 26126787 26126533 Y HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD NA NA NA NA HIST1H2AC 3979 CAGE T98G hg19 FANTOM5 2.27373905619629 chr6 26266741 26266990 26266911 Y NA HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2BI,HIST1H4H NA NA NA NA HIST1H3G 2622 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 26304989 26305345 26305268 Y NA HIST1H3G,HIST1H2BI,HIST1H4H HCG11,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H2AE,HIST1H2BF,HIST1H2BG,HIST1H3D,HIST1H4E,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H4G,HIST1H2BI,HIST1H3G,HIST1H4H,BTN3A2,BTN2A2,BTN1A1,HMGN4,BTN3A3,HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,ABT1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H4H 21227 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr6 26474981 26475187 26475084 Y NA BTN3A3,BTN2A1 NA NA NA NA BTN2A1 18831 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 26521003 26521206 26521108 Y HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1 HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 15427 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 26536966 26537248 26536997 Y NA HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 333 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 26537641 26538043 26537718 Y NA HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 1008 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 27145585 27145720 27145705 Y FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 31303 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr6 27145729 27146130 27146023 Y ZNF184 HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 30893 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr6 27156271 27156423 27156401 Y NA HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 20600 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr6 27446506 27447382 27447356 Y NA ZNF184 ZNF184,HIST1H2AG,MIR3143,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,PRSS16,LOC100131289,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,OR2B2,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2AM K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF184 7609 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr6 27759985 27760333 27760032 Y ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN NA NA NA NA HIST1H2BL 13376 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 27807310 27807672 27807617 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L NA NA NA NA HIST1H2BN 2987 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr6 27862895 27863061 27863012 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 3692 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr6 27863298 27863662 27863535 Y ZKSCAN3,ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZNF323,ZNF193,ZNF192,ZKSCAN4,PGBD1,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 4095 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr6 28072476 28072872 28072543 Y HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192 ZSCAN12P1,ZSCAN16 NA NA NA NA ZSCAN12P1 15544 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr6 28080593 28080792 28080693 Y NA ZSCAN12P1,ZSCAN16,ZNF192P1 NA NA NA NA ZSCAN16 9546 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 28280351 28280639 28280495 Y NA PGBD1,ZKSCAN3 NA NA NA NA PGBD1 33037 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 28280673 28280945 28280934 Y NKAPL PGBD1,ZKSCAN3 NA NA NA NA PGBD1 33359 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 28805076 28805418 28805247 Y NA XXbac-BPG308K3.5 NA NA NA NA XXbac-BPG308K3.5 293 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 28834475 28834586 28834545 Y NA XXbac-BPG308K3.5,HCG14 NA NA NA NA HCG14 27721 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 29568471 29568641 29568556 Y MOG,GABBR1 UBD,GABBR1 NA NA NA NA GABBR1 31112 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 29932777 29932958 29932802 Y HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A HLA-K,HLA-A NA NA NA NA HLA-A 25740 CAGE T98G hg19 FANTOM5 2.7680301553694 chr6 29933738 29934144 29933980 Y NA HLA-K,HLA-A NA NA NA NA HLA-A 26701 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 30068638 30068845 30068662 Y NA ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11 NA NA NA NA PPP1R11 36152 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr6 30069810 30070038 30069951 Y HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39 ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11 NA NA NA NA PPP1R11 37324 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr6 30247447 30247451 30247450 Y NA HLA-L,TRIM39,HCG18 NA NA NA NA HLA-L 22086 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 30254050 30254472 30254356 Y NA HLA-L,TRIM39,HCG18 NA NA NA NA HLA-L 28689 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr6 30276337 30276699 30276532 Y ATAT1,ATAT1 TRIM39,HCG18,RPP21 NA NA NA NA TRIM39 15557 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 30453844 30454132 30453996 Y ZNRD1,TUBB RANP1,HLA-E HLA-E MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HLA-E 1112 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 30649746 30650798 30650074 Y TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949 C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB NA NA NA NA PPP1R18 2874 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 30720004 30720713 30720325 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20 DPCR1,NRM,PPP1R18,MDC1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,VARS2,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 9673 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 30737456 30737900 30737560 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3 FLOT1,IER3,HCG20 DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A,MRPS18B,PPP1R10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HCG20 4854 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 30761567 30761766 30761739 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PRR3,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,PBMUCL1,HLA-C,FLOT1,IER3 HCG20 FLOT1,C6orf15,PSORS1C1,DHX16,PPP1R18,TUBB,NRM,MDC1,DDR1,IER3,DPCR1,SFTA2,VARS2,C6orf136,GTF2H4,MUC22,PSORS1C3,TCF19,POU5F1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HCG20 28965 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 30787859 30788252 30788206 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,IER3 NA FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDR1 53946 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 30804295 30804603 30804450 Y DDR1,DDR1 DDR1 FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,C6orf15,PSORS1C1 IMR90 Hi-C 24141950 DDR1 37595 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 30845366 30845734 30845666 Y PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3 DDR1,GTF2H4,VARS2 NA NA NA NA DDR1 3168 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 31334700 31334921 31334854 Y NFKBIL1,C6orf27,ATP6V1G2 HLA-B,MICA HCG27 MCF7 ChIA-PET 22265404 HLA-B 11735 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 31702368 31703528 31702658 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5,VWA7 NA NA NA NA CLIC1 2012 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 31705604 31706142 31705906 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1,VWA7 NA NA NA NA MSH5 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,SNORD52,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 3244 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.87830617685781 chr6 32081652 32082042 32081917 Y NA ATF6B,FKBPL,PPT2,PRRT1,EGFL8 NA NA NA NA ATF6B 11988 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 32789030 32789171 32789101 Y HSD17B8,PSMB8 TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1 NA NA NA NA TAP2 15386 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 32834766 32835076 32834920 Y BRD2,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9 TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1 NA NA NA NA TAP1 15011 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 32913033 32913520 32913400 Y HLA-DRB5,HLA-DRB1,HLA-DQA1,HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DQB2,HLA-DOB,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9,TAPBP,PHF1,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DMB,HLA-DOA,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2 HLA-DMB,BRD2,HLA-DMA,BRD2-IT1 HLA-DMB IMR90 Hi-C 24141950 HLA-DMB 6186 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 33216178 33216307 33216243 Y NA SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1,HCG25,RPS18,VPS52,B3GALT4,PFDN6,WDR46,RGL2 NA NA NA NA HCG25 867 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 33392796 33393285 33393082 Y SYNGAP1 KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9 NA NA NA NA SYNGAP1 6949 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 33396313 33396709 33396628 Y SYNGAP1 KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9 NA NA NA NA SYNGAP1 10466 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 33538378 33538887 33538702 Y LEMD2,LEMD2,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1 BAK1,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 7132 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 33538911 33539356 33539169 Y LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1 BAK1,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 6663 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 33590898 33591125 33590902 Y ITPR3 BAK1,ITPR3 NA NA NA NA ITPR3 4756 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 33684801 33685193 33684861 Y NA NA MNF1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LEMD2 69720 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 34191726 34192136 34191830 Y C6orf1,HMGA1 CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2 RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1 MCF7 ChIA-PET 22265404 CYCSP55 6510 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 34358644 34359014 34358829 Y NA NUDT3,RPS10 NA NA NA NA NUDT3 193 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 34521580 34522143 34521703 Y NA RP3-391O22.3 NA NA NA NA RP3-391O22.3 20290 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 34631608 34631780 34631736 Y HMGA1 C6orf106 NA NA NA NA C6orf106 30856 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 34663389 34663600 34663462 Y NA C6orf106,RP3-375P9.2 NA NA NA NA C6orf106 753 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 35337950 35338511 35338285 Y ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD PPARD NA NA NA NA PPARD 29615 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr6 35445364 35445634 35445501 Y RPL10A FANCE,RPL10A,TEAD3 NA NA NA NA RPL10A 11179 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 35453228 35453566 35453395 Y NA FANCE,RPL10A,TEAD3 NA NA NA NA TEAD3 9287 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 36409257 36409482 36409373 Y MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20 KCTD20 NA NA NA NA KCTD20 713 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 36737758 36737957 36737899 Y ETV7,ETV7,PXT1,PIM1 NA NA NA NA NA CPNE5 67821 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 37070053 37070857 37070460 Y CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2 NA PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 65122 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr6 37104908 37105418 37105405 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 30561 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 37155093 37155653 37155211 Y TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1 PIM1 NA NA NA NA PIM1 19114 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 37484293 37484960 37484497 Y NA CCDC167 CCDC167,MDGA1,RNF8,FTSJD2,TBC1D22B,MIR4462,ZFAND3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC167 18595 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr6 37485031 37485566 37485434 Y NA CCDC167 CCDC167,MDGA1,RNF8,FTSJD2,TBC1D22B,MIR4462,ZFAND3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC167 19333 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 37663186 37663424 37663272 Y MDGA1 MDGA1 NA NA NA NA MDGA1 1658 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 38229881 38230014 38229948 Y NA NA NA NA NA NA BTBD9 375910 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 38844345 38844470 38844408 Y BTBD9 NA NA NA NA NA GLO1 175428 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 40132230 40132456 40132336 Y NA NA NA NA NA NA RP1-278E11.3 207658 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr6 40445607 40445840 40445690 Y NA NA NA NA NA NA RP1-278E11.3 521035 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 40904550 40904902 40904649 Y UNC5CL NA APOBEC2,C6orf130,TSPO2,UNC5CL IMR90 Hi-C 24141950 NFYA 133782 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 40964017 40964029 40964023 Y NA NA UNC5CL,APOBEC2,C6orf130 IMR90 Hi-C 24141950 NFYA 74655 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 40965087 40965613 40965406 Y NA NA NA NA NA NA NFYA 73071 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 41341728 41341773 41341752 Y FRS3 NA NA NA NA NA TREM1 89271 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 41686086 41686432 41686391 Y NA TFEB NA NA NA NA TFEB 15565 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 41889955 41890338 41890119 Y FRS3 USP49,MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 3029 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 41929474 41929675 41929644 Y NA MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 42548 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 42283764 42284050 42283900 Y NA NA NA NA NA NA MRPS10 100161 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 42348376 42348588 42348501 Y TRERF1 NA NA NA NA NA TRERF1 69201 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 42361651 42361664 42361659 Y TRERF1 NA NA NA NA NA TRERF1 56125 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 42375139 42375533 42375327 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 42256 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 42515407 42515543 42515467 Y NA UBR2 TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBR2 14257 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 43073020 43073202 43073194 Y NA MRPL2,PTK7 NA NA NA NA PTK7 31014 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 43692783 43693195 43692965 Y TJAP1,MAD2L1BP MRPS18A,VEGFA MRPS18A,LOC100132354,RSPH9,MRPL14,CAPN11,TMEM63B,POLH,VEGFA,XPO5,MAD2L1BP,GTPBP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPS18A 39255 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 43766474 43766976 43766784 Y NFKBIE,MAD2L1BP VEGFA NA NA NA NA VEGFA 30553 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 43878497 43878687 43878563 Y GTPBP2,MRPS18A NA NA NA NA NA VEGFA 142576 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 43894411 43894725 43894584 Y NFKBIE,TJAP1,GTPBP2,MAD2L1BP NA NA NA NA NA VEGFA 158490 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr6 43979820 43980209 43980006 Y NFKBIE,MAD2L1BP NA NA NA NA NA TMEM63B 112442 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 44009201 44009753 44009484 Y SLC35B2,MRPL14 NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 TMEM63B 82898 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 44011946 44012485 44012109 Y NA NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 TMEM63B 80166 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 44022822 44022968 44022901 Y NA NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM63B 69683 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 44024667 44024914 44024806 Y SLC35B2 NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM63B 67737 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 44205272 44205504 44205346 Y NFKBIE SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE NA NA NA NA HSP90AB1 7320 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr6 44230828 44231731 44231363 Y NFKBIE SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,AARS2 NA NA NA NA NFKBIE 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 44251266 44251582 44251506 Y TMEM151B,TCTE1 HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE,AARS2 NA NA NA NA NFKBIE 19766 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 44396303 44396427 44396307 Y NA CDC5L NA NA NA NA CDC5L 43041 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 44634916 44635472 44635214 Y NA NA CLIC5,SUPT3H,RUNX2 IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 281654 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr6 45354242 45354498 45354371 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 10552 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 45390987 45391259 45391097 Y RUNX2 SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 47297 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr6 45391331 45391628 45391429 Y RUNX2 SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 47641 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr6 45392235 45392572 45392528 Y RUNX2 SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 48545 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 45413515 45413853 45413708 Y RUNX2 NA NA NA NA NA SUPT3H 69825 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 45428920 45429031 45428964 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 85230 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 45503403 45503548 45503462 Y RUNX2 NA NA NA NA NA SUPT3H 159713 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 45542832 45542991 45542883 Y NA NA RUNX2 IMR90 Hi-C 24141950 SUPT3H 199142 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 45623562 45623937 45623654 Y NA NA RUNX2,SUPT3H,CLIC5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SUPT3H 279872 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 45645081 45645602 45645424 Y NA NA RUNX2,CDC5L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SUPT3H 301391 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 45665421 45665594 45665503 Y NA NA RUNX2,CDC5L,CLIC5 IMR90 Hi-C 24141950 SUPT3H 321731 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 46628141 46628475 46628252 Y NA CYP39A1,SLC25A27 NA NA NA NA SLC25A27 9463 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 47263537 47263554 47263549 Y NA TNFRSF21 NA NA NA NA TNFRSF21 12087 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 47275760 47275938 47275849 Y NA TNFRSF21 NA NA NA NA TNFRSF21 119 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 47382599 47382792 47382666 Y NA NA CD2AP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD2AP 60733 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 48794608 48794845 48794713 Y NA NA NA NA NA NA MUT 634059 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 52217307 52217701 52217502 Y NA PAQR8 PAQR8,MCM3,EFHC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAQR8 6518 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr6 52242466 52242866 52242548 Y NA PAQR8,EFHC1 NA NA NA NA PAQR8 18247 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 52431726 52432083 52432005 Y TRAM2 TRAM2 EFHC1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAM2 7630 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 52460126 52460529 52460233 Y TRAM2 TRAM2 EFHC1,TRAM2,MCM3,ICK,LOC730101 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRAM2 20413 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 53167531 53167800 53167691 Y NA ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 44147 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 53175462 53175877 53175681 Y NA ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 36070 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 53205102 53205427 53205266 Y NA ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 6520 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr6 53224045 53224723 53224315 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 12098 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 53225493 53225821 53225675 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 13546 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 53412768 53413364 53413026 Y GCLC NA NA NA NA NA GCLC 66404 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr6 55905205 55905398 55905302 Y NA NA NA NA NA NA BMP5 166843 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 56296413 56296568 56296543 Y NA NA NA NA NA NA DST 520858 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr6 56315031 56315399 56315215 Y NA NA NA NA NA NA DST 502027 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 56811664 56812033 56811848 Y NA DST,BEND6 BEND6,KIAA1586,ZNF451,PRIM2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DST 5393 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 58776280 58777091 58777029 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 521711 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 58777244 58778438 58777771 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 522675 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 58778631 58779245 58778717 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 524062 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 64814643 64814659 64814650 Y NA NA NA NA NA NA PHF3 470918 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 72103736 72104124 72104114 Y NA MIR30A,LINC00472 NA NA NA NA MIR30A 7200 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 72178822 72179167 72178995 Y NA NA OGFRL1,MIR30C2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00472 50350 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 72179171 72179414 72179328 Y NA NA OGFRL1,MIR30C2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00472 50699 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 74289769 74290568 74290415 Y MB21D1,SLC17A5,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA RP11-505P4.5 55167 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr6 74295249 74295764 74295450 Y MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA RP11-505P4.5 60647 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 74295823 74296227 74295840 Y MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA RP11-505P4.5 61221 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 75853490 75853812 75853630 Y COL12A1 NA NA NA NA NA COL12A1 59955 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 75906514 75906841 75906796 Y NA COL12A1 NA NA NA NA COL12A1 6926 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 75911376 75911573 75911562 Y COL12A1 COL12A1,COX7A2 NA NA NA NA COL12A1 2194 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 75914223 75914620 75914578 Y COL12A1 COL12A1,COX7A2 NA NA NA NA COL12A1 456 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 76467215 76467333 76467230 Y NA MYO6 NA NA NA NA MYO6 10306 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 79758680 79758772 79758726 Y NA PHIP NA NA NA NA PHIP 27181 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 81348599 81348680 81348638 Y NA NA BCKDHB IMR90 Hi-C 24141950 BCKDHB 534235 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 82854780 82854947 82854862 Y NA NA NA NA NA NA IBTK 100524 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 84577292 84577766 84577526 Y CYB5R4 CYB5R4 NA NA NA NA CYB5R4 9930 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 84877511 84877669 84877594 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1009 57684 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 85834833 85835082 85834958 Y NA NA NA NA NA NA NT5E 322727 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 86113432 86113601 86113525 Y NT5E NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 NT5E 44208 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 86114496 86114829 86114663 Y NT5E NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 NT5E 42980 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 86370103 86370257 86370180 Y NA SYNCRIP,SNHG5 NA NA NA NA SNHG5 16194 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 86377022 86377042 86377037 Y NA SYNCRIP,SNHG5 NA NA NA NA SNHG5 9409 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 88213981 88214157 88214070 Y GJB7 SLC35A1 NA NA NA NA SLC35A1 35640 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 88398633 88398672 88398653 Y NA AKIRIN2 NA NA NA NA AKIRIN2 11255 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 88401154 88401337 88401278 Y NA AKIRIN2 NA NA NA NA AKIRIN2 8590 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 88408243 88408692 88408556 Y AKIRIN2 AKIRIN2 NA NA NA NA AKIRIN2 1235 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 88433013 88433258 88433054 Y AKIRIN2 AKIRIN2 AKIRIN2-AS1,AKIRIN2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 AKIRIN2 23086 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 88466651 88466901 88466810 Y AKIRIN2 NA RNGTT,AKIRIN2 IMR90 Hi-C 24141950 AKIRIN2 56724 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 89744998 89746016 89745827 Y UBE2J1,PNRC1 PNRC1 PNRC1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PNRC1 42454 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 89796215 89796534 89796231 Y NA PNRC1 NA NA NA NA PNRC1 7745 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 90994449 90994671 90994572 Y MDN1,BACH2,BACH2 BACH2 NA NA NA NA BACH2 9956 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 91078844 91079184 91078980 Y NA NA BACH2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BACH2 74217 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 92185644 92186055 92185825 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K7 890880 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 94496305 94496344 94496330 Y NA NA NA NA NA NA MANEA 1527075 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 97632369 97632997 97632691 Y NA NA NA NA NA NA MMS22L 96096 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 97911204 97911291 97911247 Y NA NA NA NA NA NA MMS22L 182111 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 100012296 100012415 100012356 Y NA USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 2434 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 100676865 100677032 100676949 Y NA NA SIM1 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-121G13.3 299120 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 101149750 101149957 101149936 Y NA NA NA NA NA NA RP1-121G13.3 173598 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 101311437 101311450 101311446 Y NA ASCC3 NA NA NA NA ASCC3 15798 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 105100220 105100270 105100246 Y NA NA NA NA NA NA HACE1 205524 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 105388915 105389637 105389155 Y HACE1 NA NA NA NA NA HACE1 83121 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 105947903 105948089 105948024 Y NA NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 98944 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 106049296 106049799 106049571 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 200337 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr6 106258484 106259193 106259052 Y NA NA ATG5,PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 273002 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 106440406 106440671 106440473 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 91524 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 106442778 106443178 106442990 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 89017 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 106611101 106611647 106611464 Y PRDM1 NA NA NA NA NA PRDM1 78906 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 106643011 106643217 106643065 Y PRDM1 NA NA NA NA NA PRDM1 110816 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 107022555 107023128 107022852 Y PRDM1 NA NA NA NA NA RTN4IP1 52245 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 107774853 107775271 107775085 Y BEND3 PDSS2,SOBP NA NA NA NA PDSS2 3497 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 108239964 108240066 108240015 Y NA SEC63 NA NA NA NA SEC63 37327 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 108455044 108455377 108455332 Y NA OSTM1 LACE1,ARMC2,NR2E1 IMR90 Hi-C 24141950 OSTM1 29681 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 108879164 108879427 108879300 Y SESN1,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 126 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 108879521 108879931 108879808 Y SESN1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 483 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 108883670 108884545 108884024 Y OSTM1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 4632 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 109011028 109011405 109011217 Y NA NA NA NA NA NA FOXO3 131990 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 109755732 109756057 109756030 Y CD164 SMPD2,PPIL6,MICAL1,ZBTB24 NA NA NA NA SMPD2 3909 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 110502951 110503352 110503102 Y FIG4,CDC40 WASF1,CDC40 NA NA NA NA CDC40 3607 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 111551650 111551849 111551726 Y NA KIAA1919 NA NA NA NA KIAA1919 26702 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 111612312 111612528 111612438 Y AMD1,AMD1,SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L,KIAA1919 KIAA1919 NA NA NA NA KIAA1919 33761 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 111727743 111727975 111727836 Y SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L NA NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 74739 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 111776910 111777281 111777179 Y NA TRAF3IP2-AS1,REV3L NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 25433 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 111841823 111842197 111842010 Y NA TRAF3IP2-AS1,REV3L NA NA NA NA REV3L 38905 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 111873587 111873978 111873729 Y NA NA NA NA NA NA TRAF3IP2 51503 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 112428707 112428734 112428721 Y LAMA4 TUBE1 NA NA NA NA TUBE1 21975 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 112449250 112449618 112449554 Y NA TUBE1 NA NA NA NA TUBE1 42518 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 112523729 112524008 112523937 Y LAMA4 NA NA NA NA NA LAMA4 50133 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 112572856 112573086 112572969 Y LAMA4 LAMA4 NA NA NA NA LAMA4 1055 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 112619249 112619579 112619380 Y LAMA4 LAMA4 LAMA4 IMR90 Hi-C 24141950 LAMA4 45108 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 113966975 113967088 113966980 Y MARCKS NA MARCKS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MARCKS 209453 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 114005806 114006016 114005966 Y NA NA NA NA NA NA MARCKS 170525 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr6 116988703 116988966 116988944 Y DSE,ZUFSP,KPNA5 ZUFSP,KPNA5 NA NA NA NA ZUFSP 746 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 117761832 117762028 117761987 Y NA DCBLD1 DCBLD1,GOPC IMR90 Hi-C 24141950 DCBLD1 10952 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 117769226 117769320 117769257 Y NA DCBLD1 DCBLD1,GOPC,ROS1 IMR90 Hi-C 24141950 DCBLD1 3660 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 117804575 117804878 117804739 Y NA DCBLD1 NA NA NA NA DCBLD1 31595 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 119217591 119217640 119217616 Y NA ASF1A,MCM9 NA NA NA NA ASF1A 4207 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr6 121396728 121397112 121396920 Y C6orf170 NA NA NA NA NA GJA1 357726 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 121530032 121530291 121530288 Y NA NA NA NA NA NA GJA1 224547 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 121758280 121758805 121758450 Y GJA1 GJA1 NA NA NA NA GJA1 3442 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 122253904 122254092 122253993 Y NA NA GJA1 IMR90 Hi-C 24141950 HSF2 464599 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 125420389 125420754 125420652 Y NA NA NA NA NA NA RP11-510H23.1 138204 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 125420883 125421200 125421024 Y NA NA NA NA NA NA RP11-510H23.1 138698 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 126167488 126167529 126167508 Y NCOA7 NA NA NA NA NA NCOA7 67181 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 126241150 126241321 126241235 Y NCOA7 HINT3 NA NA NA NA HINT3 34606 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 126267356 126267782 126267584 Y NCOA7 HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 8145 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr6 126279126 126279509 126279187 Y NCOA7 HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 3199 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 127745246 127745525 127745387 Y RNF146 RP3-403A15.1 NA NA NA NA RP3-403A15.1 9256 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 127980874 127981174 127981075 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 226093 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 127981338 127981402 127981371 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 226557 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 128607751 128608140 128608092 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 231730 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 128637396 128637725 128637581 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 202145 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 128675135 128675339 128675237 Y PTPRK,PTPRK NA NA NA NA NA PTPRK 164531 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 128921613 128921847 128921739 Y NA NA PTPRK MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTPRK 81743 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 129250577 129251100 129251039 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 410707 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 129480057 129480411 129480316 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP18 548959 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 130005105 130005433 130005370 Y L3MBTL3,ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 23937 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 130342212 130342458 130342393 Y SAMD3,SAMD3,L3MBTL3 L3MBTL3 NA NA NA NA L3MBTL3 9368 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr6 131427301 131427528 131427415 Y NA EPB41L2,AKAP7 EPB41L2 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP7 27278 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 131929733 131930009 131929873 Y NA MED23 NA NA NA NA MED23 17360 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 132787299 132787948 132787832 Y NA STX7 NA NA NA NA STX7 44389 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 133020075 133020153 133020114 Y NA NA NA NA NA NA RPS12 113427 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 133839183 133839299 133839241 Y EYA4 NA NA NA NA NA EYA4 279447 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 135636764 135637196 135637190 Y NA NA NA NA NA NA MYB 136311 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 135804002 135804049 135804028 Y NA LINC00271,AHI1 NA NA NA NA LINC00271 12440 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 136336050 136336507 136336258 Y NA NA NA NA NA NA PDE7B 165216 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 136927621 136927854 136927738 Y NA NA MAP7 MCF7 ChIA-PET 22265404 MAP7 57664 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 136983395 136983458 136983427 Y NA NA NA NA NA NA MAP7 113438 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 137109342 137109643 137109396 Y IFNGR1,BCLAF1,MAP3K5 MAP3K5,PEX7 NA NA NA NA MAP3K5 2013 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 138113661 138114081 138114010 Y OLIG3,TNFAIP3 NA TNFAIP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 72270 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 138153323 138153539 138153451 Y NA TNFAIP3 TNFAIP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 32812 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 138426575 138426770 138426671 Y PERP NA NA NA NA NA PERP 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 138786189 138786282 138786236 Y NA NA NA NA NA NA HEBP2 63521 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 138876782 138877039 138876959 Y NA NA NA NA NA NA HEBP2 154114 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 139909356 139909574 139909434 Y NA NA CITED2,LOC645434,LOC100132735,MIR3668 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CITED2 215599 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 140858869 140859245 140859045 Y NA NA LOC100132735 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 1165112 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr6 143130260 143130659 143130530 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 133679 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 143150171 143150307 143150239 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 114031 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 143206296 143206927 143206703 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 57411 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 143274620 143274763 143274640 Y NA HIVEP2 HIVEP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 HIVEP2 10282 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 143471502 143471640 143471571 Y NA NA NA NA NA NA AIG1 91869 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 143718495 143718881 143718689 Y NA NA AIG1 IMR90 Hi-C 24141950 ADAT2 50929 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 147235088 147235549 147235197 Y RAB32,STXBP5 NA NA NA NA NA STXBP5 288012 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 147643373 147644201 147643793 Y NA NA NA NA NA NA STXBP5 119812 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 148830845 148831563 148831298 Y UST NA NA NA NA NA UST 234901 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr6 149352415 149352625 149352483 Y ZC3H12D,TAB2,SUMO4 RP11-162J8.3 NA NA NA NA RP11-162J8.3 706 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 149376073 149376391 149376158 Y NA RP11-162J8.3 NA NA NA NA RP11-162J8.3 24364 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 149417128 149417333 149417214 Y TAB2 NA NA NA NA NA RP11-162J8.3 65419 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 149929442 149929538 149929496 Y NA RPS18P9,KATNA1 NA NA NA NA RPS18P9 16222 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 150183311 150183513 150183478 Y NA LRP11 NA NA NA NA LRP11 686 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 151178746 151179109 151178841 Y NA MTHFD1L NA NA NA NA MTHFD1L 5576 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 151248402 151248558 151248480 Y NA NA NA NA NA NA MTHFD1L 63717 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 151366985 151367228 151367157 Y NA NA NA NA NA NA RP1-292B18.1 51437 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 151373285 151373500 151373395 Y NA RP1-292B18.1 NA NA NA NA RP1-292B18.1 45165 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 154623242 154623554 154623472 Y NA NA NA NA NA NA CNKSR3 206239 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 154676071 154676546 154676403 Y NA NA NA NA NA NA CNKSR3 153247 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 154798068 154798417 154798243 Y NA CNKSR3 NA NA NA NA CNKSR3 31376 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 154830409 154830718 154830573 Y CNKSR3 CNKSR3 NA NA NA NA CNKSR3 616 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 157007979 157008724 157008580 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88339 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 157101566 157102083 157101700 Y ARID1B ARID1B NA NA NA NA ARID1B 4503 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr6 157110744 157110907 157110826 Y NA ARID1B NA NA NA NA ARID1B 13681 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 157160663 157161314 157160954 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 63600 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 157168828 157169241 157169084 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 71765 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 157342507 157343524 157343342 Y ARID1B,ZDHHC14 NA NA NA NA NA ARID1B 245444 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 157542479 157542718 157542566 Y NA NA NA NA NA NA TMEM242 199915 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 157738321 157738749 157738506 Y NA TMEM242 NA NA NA NA TMEM242 3884 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 157936149 157936334 157936215 Y SNX9 NA NA NA NA NA ZDHHC14 135984 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 158136804 158137189 158136890 Y NA NA TMEM242,SNX9,ZDHHC14 IMR90 Hi-C 24141950 SNX9 105107 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 158185393 158186221 158185862 Y SNX9 NA SNX9,TMEM242,SYNJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNX9 56075 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr6 158234848 158235220 158235034 Y SNX9 SNX9 SNX9,TMEM242,ZDHHC14,SYNJ2,SERAC1 IMR90 Hi-C 24141950 SNX9 7076 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 158254729 158255396 158255020 Y NA SNX9 NA NA NA NA SNX9 12433 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr6 158424430 158424803 158424679 Y SYNJ2 SYNJ2 NA NA NA NA SYNJ2 23542 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr6 158452388 158452885 158452569 Y SNX9 NA NA NA NA NA SYNJ2 51500 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr6 158463343 158463878 158463391 Y SNX9,SYNJ2 NA NA NA NA NA SYNJ2 62455 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 158515424 158515781 158515670 Y SYNJ2,SYNJ2 NA NA NA NA NA SERAC1 71531 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 158829552 158829958 158829805 Y NA NA NA NA NA NA TMEM181 125510 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 158896747 158897140 158897018 Y NA NA NA NA NA NA TMEM181 58328 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 158981403 158981866 158981661 Y NA TMEM181 NA NA NA NA TMEM181 25935 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 159226894 159227283 159227272 Y NA EZR NA NA NA NA EZR 11161 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 159270971 159271326 159271104 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 32527 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 159271429 159272000 159271674 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 32985 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 159315379 159315577 159315478 Y NA NA NA NA NA NA EZR 76935 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 160402732 160403272 160403091 Y SOD2,WTAP,WTAP,MAS1,IGF2R IGF2R NA NA NA NA IGF2R 14601 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 160532967 160533203 160533063 Y NA NA SLC22A1 IMR90 Hi-C 24141950 IGF2R 144836 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr6 161536644 161536718 161536688 Y AGPAT4 NA NA NA NA NA MAP3K4 125885 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 163776294 163776859 163776538 Y QKI NA DKFZp451B082,PACRG IMR90 Hi-C 24141950 CAHM 56133 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.18629863801546 chr6 163833938 163834442 163834340 Y NA CAHM,QKI NA NA NA NA QKI 906 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr6 166964478 166964522 166964502 Y NA NA NA NA NA NA SFT2D1 210399 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 167566314 167566582 167566478 Y RNASET2,GPR31 CCR6 NA NA NA NA CCR6 43019 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 168198261 168198623 168198456 Y NA MLLT4 NA NA NA NA MLLT4 26979 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 169308928 169309266 169309084 Y THBS2 NA WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242 IMR90 Hi-C 24141950 WDR27 790893 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 169588480 169588865 169588804 Y NA NA WDR27,THBS2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR27 511294 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 170020305 170020690 170020593 Y NA NA NA NA NA NA WDR27 79469 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 170403251 170403438 170403365 Y TCTE3,FAM120B NA NA NA NA NA DLL1 194123 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr6 170600439 170600921 170600644 Y NA DLL1,FAM120B NA NA NA NA FAM120B 2648 CAGE T98G hg19 FANTOM5 2.57031371570016 chr6 170838453 170838652 170838543 Y NA PSMB1,TBP NA NA NA NA PSMB1 21777 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 90161 90450 90245 Y FAM20C NA FAM20C,HEATR2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM20C 100519 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr7 191531 191871 191582 Y FAM20C FAM20C,AC093627.12 NA NA NA NA AC093627.12 309 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr7 579426 579712 579625 Y PRKAR1B,PRKAR1B,GET4,PDGFA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 21493 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 919141 919296 919237 Y NA GET4 NA NA NA NA GET4 4952 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 1013884 1014155 1013955 Y NA ADAP1,COX19 NA NA NA NA COX19 649 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 1039490 1039728 1039629 Y NA ADAP1,COX19,GPR146 NA NA NA NA COX19 26255 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 1456103 1456158 1456132 Y NA MICALL2,AC102953.4 NA NA NA NA MICALL2 40980 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 1500451 1500958 1500750 Y NA MICALL2,AC102953.4,INTS1 NA NA NA NA AC102953.4 2878 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 1553000 1553189 1553120 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK MICALL2,INTS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 INTS1 9511 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.988582198346214 chr7 1560213 1560697 1560426 Y C7orf50,TMEM184A,PSMG3,PSMG3,MAFK INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 7653 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr7 1572262 1572844 1572636 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 3912 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.18629863801546 chr7 1959266 1959659 1959487 Y SNX8,MAFK NA NA NA NA NA AC074389.9 179339 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 2561604 2562123 2561810 Y LFNG,LFNG LFNG,BRAT1,IQCE NA NA NA NA LFNG 11441 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 2661791 2662128 2661981 Y NA TTYH3 AMZ1,TTYH3 IMR90 Hi-C 24141950 TTYH3 7457 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 2681143 2681305 2681209 Y SNX8,LFNG,LFNG,TTYH3 TTYH3 NA NA NA NA TTYH3 11558 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 2749963 2750288 2750147 Y LFNG,LFNG,CARD11 NA NA NA NA NA TTYH3 80378 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 2778515 2778860 2778688 Y NA NA NA NA NA NA AC006028.11 94395 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 2797465 2798227 2798113 Y SNX8,LFNG,GNA12 NA NA NA NA NA AC006028.11 75028 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 2860040 2860490 2860319 Y LFNG,LFNG,GNA12 AC006028.11,GNA12 NA NA NA NA AC006028.11 12765 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr7 2903227 2903785 2903462 Y LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12 AC006028.11,GNA12 GNA12 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNA12 21269 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr7 3283908 3284312 3284215 Y SDK1 NA SDK1 IMR90 Hi-C 24141950 SDK1 54768 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 3490744 3491107 3491069 Y SDK1 NA NA NA NA NA SDK1 151664 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 3568098 3568478 3568121 Y SDK1 NA NA NA NA NA SDK1 229018 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 3885202 3885340 3885271 Y NA NA NA NA NA NA SDK1 546122 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 4501361 4501586 4501471 Y KIAA0415 NA SDK1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXK1 179802 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 4681329 4681565 4681443 Y MMD2 NA SDK1,FOXK1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXK1 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 4755132 4755354 4755253 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 73744 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 4764796 4765177 4765030 Y KIAA0415 NA NA NA NA NA FOXK1 83408 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr7 4778448 4778853 4778548 Y KIAA0415 NA NA NA NA NA FOXK1 97060 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr7 4779326 4779630 4779587 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 97938 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 4784652 4785031 4784763 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 103264 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 4913549 4913687 4913618 Y NA AC092610.12 NA NA NA NA AC092610.12 10114 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 5039702 5040026 5039789 Y NA RNF216P1,RBAK NA NA NA NA RNF216P1 28083 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 5452779 5453024 5452968 Y NA TNRC18 NA NA NA NA TNRC18 10021 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 5469639 5470034 5469987 Y NA TNRC18 TNRC18,FBXL18,ACTB MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TNRC18 6594 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 5492663 5492953 5492758 Y MMD2,SLC29A4 TNRC18 TNRC18 MCF7 ChIA-PET 22265404 TNRC18 29618 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 5596196 5596581 5596543 Y CCZ1,ACTB FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 4834 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 5609221 5609424 5609333 Y FBXL18 ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 7806 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 5609541 5610012 5609880 Y SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 8126 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr7 5638553 5639025 5638653 Y NA ACTB,FSCN1 NA NA NA NA FSCN1 8114 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 5724329 5724708 5724518 Y NA NA NA NA NA NA FSCN1 93890 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 5787686 5787972 5787829 Y NA RNF216 NA NA NA NA RNF216 31398 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 6145406 6145878 6145682 Y USP42 EIF2AK1,AC004895.4,USP42 NA NA NA NA USP42 2891 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 6425136 6425343 6425226 Y CCZ1,USP42 RAC1 NA NA NA NA RAC1 12982 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 6473446 6473633 6473567 Y DAGLB DAGLB,KDELR2 NA NA NA NA DAGLB 48188 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 6677371 6677641 6677424 Y DAGLB,ZNF12,C7orf26 C7orf26,ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 2418 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr7 6682292 6682670 6682512 Y C7orf26 ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 7339 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 6741580 6741996 6741754 Y C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12 ZNF12,PMS2CL NA NA NA NA ZNF12 2558 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr7 7605671 7605858 7605804 Y NA MIOS NA NA NA NA MIOS 1168 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 8216734 8217119 8217002 Y GLCCI1 NA NA NA NA NA GLCCI1 210309 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 9135754 9136028 9135891 Y NA NA NA NA NA NA GLCCI1 1129329 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 12297328 12297575 12297487 Y ARL4A TMEM106B NA NA NA NA TMEM106B 48461 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 12755276 12755712 12755432 Y VWDE,ARL4A ARL4A NA NA NA NA ARL4A 30795 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr7 12759260 12759464 12759402 Y NA ARL4A ARL4A K562 ChIA-PET 22265404 ARL4A 34779 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 12759659 12759934 12759702 Y ARL4A,ARL4A ARL4A ARL4A K562 ChIA-PET 22265404 ARL4A 35178 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 13368007 13368354 13368181 Y NA NA NA NA NA NA ARL4A 643526 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 17029591 17029925 17029620 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN13 238431 CAGE T98G hg19 FANTOM5 4.25090345288872 chr7 17049089 17049358 17049209 Y AHR NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN13 257929 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 17082630 17082968 17082726 Y AHR NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AHR 253278 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 17094571 17094955 17094779 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AHR 241291 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 17139132 17139382 17139242 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AHR 196864 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.3840150776847 chr7 17314276 17314419 17314335 Y AHR AHR,AC003075.4 NA NA NA NA AHR 21827 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 17315787 17316189 17315986 Y NA AHR,AC003075.4 AHR IMR90 Hi-C 24141950 AHR 20057 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 17409796 17409963 17409863 Y AHR NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC003075.4 72815 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr7 17412000 17412058 17412028 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC003075.4 75019 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 17564000 17564574 17564249 Y NA AC017060.1 AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC017060.1 31959 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 17729678 17729968 17729803 Y AHR NA HDAC9 IMR90 Hi-C 24141950 AC017060.1 133145 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 18560411 18560650 18560558 Y NA NA NA NA NA NA HDAC9 435839 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 19017733 19017917 19017790 Y TWIST1 NA NA NA NA NA TWIST1 137378 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 20191913 20192270 20192088 Y TWISTNB NA NA NA NA NA RPL21P75 151567 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr7 20239036 20239390 20239182 Y TWISTNB NA NA NA NA NA ITGB8 128935 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 20837430 20837819 20837731 Y SP8 SP8,RPL23P8 SP8 K562 ChIA-PET 22265404 SP8 12925 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr7 22122614 22122929 22122771 Y NA NA RAPGEF5 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA7L 138912 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 22616988 22617783 22617407 Y IL6 NA NA NA NA NA STEAP1B 52761 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 22622740 22623204 22623070 Y NA STEAP1B NA NA NA NA STEAP1B 47340 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 22851635 22851773 22851763 Y NA TOMM7,AC005682.5 NA NA NA NA TOMM7 8697 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 22894313 22894860 22894668 Y STEAP1B,TOMM7 TOMM7,AC005682.5 NA NA NA NA AC005682.5 2516 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 23229571 23229876 23229614 Y NA NUPL2,GPNMB NA NA NA NA NUPL2 10125 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 23346374 23346675 23346525 Y NA NA NA NA NA NA GPNMB 72788 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 23348040 23348443 23348292 Y KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3 NA NA NA NA NA GPNMB 74454 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 23375804 23376081 23376055 Y IGF2BP3 NA NA NA NA NA GPNMB 102218 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 23504984 23505316 23505313 Y NA IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2770 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 23510676 23511223 23510889 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2590 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.988582198346214 chr7 23513815 23514383 23514045 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 MALSU1 K562 ChIA-PET 22265404 IGF2BP3 5729 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr7 24626460 24626850 24626473 Y NA MPP6 NA NA NA NA MPP6 15573 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 24823380 24823654 24823545 Y C7orf31,DFNA5,DFNA5 DFNA5 NA NA NA NA DFNA5 16136 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 24824166 24824267 24824230 Y DFNA5 DFNA5 NA NA NA NA DFNA5 16922 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 24826484 24826966 24826807 Y C7orf31,DFNA5,DFNA5 DFNA5 NA NA NA NA DFNA5 19240 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 24861129 24861331 24861204 Y C7orf31,DFNA5 NA NA NA NA NA DFNA5 53885 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 25002827 25003181 25002973 Y C7orf31,OSBPL3 OSBPL3 NA NA NA NA OSBPL3 16072 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 25009429 25009748 25009721 Y NA OSBPL3 NA NA NA NA OSBPL3 9505 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 25064852 25065012 25064919 Y NA OSBPL3 OSBPL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OSBPL3 45599 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr7 25071903 25072051 25071977 Y NA NA OSBPL3 IMR90 Hi-C 24141950 OSBPL3 52650 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 25894654 25894946 25894846 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 294914 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr7 25896245 25896461 25896419 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 293399 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 25896515 25897081 25896801 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 292779 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 25901745 25902114 25902023 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 287746 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr7 26220261 26220628 26220627 Y CBX3 NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1 NA NA NA NA CBX3 18154 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr7 26523285 26523306 26523295 Y NA NA NA NA NA NA AC004540.5 87072 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 27573880 27573985 27573933 Y NA NA NA NA NA NA EIF4HP1 77412 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr7 27717680 27717897 27717733 Y NA HIBADH HOTTIP,HOXA13,HIBADH,TAX1BP1,JAZF1 IMR90 Hi-C 24141950 HIBADH 17066 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr7 27876967 27877264 27877116 Y CREB5 NA NA NA NA NA AC004549.6 98953 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 28076890 28077172 28076964 Y CREB5 NA NA NA NA NA JAZF1-AS1 140769 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr7 28122864 28123088 28122980 Y NA NA NA NA NA NA JAZF1-AS1 94853 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 28180762 28180941 28180859 Y NA JAZF1-AS1,JAZF1 NA NA NA NA JAZF1-AS1 37000 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 30211441 30211675 30211604 Y ZNRF2 NA NA NA NA NA ZNRF2 110248 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 30636092 30636194 30636111 Y NA GGCT,GARS NA NA NA NA GARS 3795 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 30658764 30658962 30658863 Y NA GARS NA NA NA NA GARS 26467 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 30954838 30955088 30954912 Y AQP1 NA NA NA NA NA FAM188B 145805 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 32026855 32027150 32027002 Y NA NA NA NA NA NA PDE1C 309791 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.58173151735394 chr7 32133021 32133498 32133272 Y NA NA NA NA NA NA PDE1C 203443 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr7 32202741 32202908 32202813 Y NA NA NA NA NA NA PDE1C 134033 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 32546004 32546038 32546035 Y NA LSM5,AVL9 NA NA NA NA AVL9 12966 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 33079333 33079582 33079400 Y NA NA NA NA NA NA RP9 67431 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 33316298 33316594 33316442 Y NA NA NA NA NA NA BBS9 149442 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 33598181 33598239 33598235 Y NA NA NA NA NA NA BBS9 431325 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 35075861 35076697 35076367 Y NA NA NA NA NA NA DPY19L2P1 147237 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr7 36480174 36480717 36480189 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0895 52440 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 37071492 37071821 37071657 Y AOAH,ELMO1,ELMO1 NA NA NA NA NA NPM1P18 214928 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 39454182 39454306 39454268 Y POU6F2 NA NA NA NA NA YAE1D1 149669 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 39774001 39774145 39774098 Y CDK13,RALA LINC00265 NA NA NA NA LINC00265 2770 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 40088776 40089159 40088837 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 101140 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr7 40611677 40611985 40611889 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 624041 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 40952368 40952631 40952468 Y NA NA C7orf10,INHBA,LOC285954 IMR90 Hi-C 24141950 CDK13 964732 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 41136491 41136863 41136697 Y NA NA LOC285954,INHBA,C7orf10 IMR90 Hi-C 24141950 GLI3 1138606 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 41738328 41738691 41738507 Y INHBA NA NA NA NA NA GLI3 536778 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 42533163 42533415 42533331 Y NA NA GLI3 IMR90 Hi-C 24141950 GLI3 257694 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 42954351 42954549 42954430 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 C7orf25 K562 ChIA-PET 22265404 C7orf25 4447 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 43117230 43117632 43117554 Y NA NA HECW1,MRPL32,PSMA2 IMR90 Hi-C 24141950 PSMA2 147408 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 43612098 43612408 43612297 Y DBNL STK17A NA NA NA NA STK17A 7949 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 43626451 43626626 43626528 Y URGCP,STK17A STK17A C7orf44 IMR90 Hi-C 24141950 STK17A 6094 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 43654812 43655175 43654945 Y POLM,DBNL,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 34455 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 43657815 43658085 43657951 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 37458 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 43658377 43658532 43658408 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 38020 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 43659947 43660692 43660336 Y DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 39590 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 43670120 43670185 43670135 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 49763 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr7 43996825 43996925 43996859 Y NA URGCP,UBE2D4 NA NA NA NA UBE2D4 32788 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr7 44436686 44437032 44436900 Y NA NA NA NA NA NA AC004453.8 68409 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 44616133 44616490 44616314 Y NA DDX56,TMED4,OGDH NA NA NA NA TMED4 3396 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 44884505 44884603 44884554 Y NA H2AFV,PURB NA NA NA NA H2AFV 1079 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 44931026 44931179 44931138 Y DDX56,CCM2 H2AFV,PURB PURB,TBRG4,OGDH MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PURB 8066 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 45442455 45442729 45442646 Y MYO1G NA NA NA NA NA ADCY1 169010 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 45595486 45595825 45595527 Y NA ADCY1 NA NA NA NA ADCY1 15914 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 45963987 45964294 45964096 Y NA IGFBP3 NA NA NA NA IGFBP3 4514 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 46186122 46186484 46186177 Y IGFBP3 NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP3 226649 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 46186512 46186858 46186578 Y IGFBP3 NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP3 227039 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 47391456 47391672 47391564 Y C7orf65 NA NA NA NA NA TNS3 228484 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 47475545 47475747 47475668 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 144409 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 47496897 47497228 47497063 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 122928 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 47514732 47515208 47514929 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 104948 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.988582198346214 chr7 47517591 47517776 47517700 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 102380 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 47521562 47522093 47521877 Y HUS1 NA NA NA NA NA TNS3 98063 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 47533820 47533921 47533853 Y HUS1 NA NA NA NA NA TNS3 86235 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 47542893 47543371 47543076 Y HUS1 NA NA NA NA NA TNS3 76785 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 47548092 47548390 47548234 Y HUS1 NA NA NA NA NA TNS3 71766 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 47553531 47553930 47553845 Y C7orf65 NA NA NA NA NA TNS3 66226 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr7 47554592 47554957 47554775 Y C7orf65 NA NA NA NA NA TNS3 65199 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 47575953 47576318 47576309 Y NA TNS3 NA NA NA NA TNS3 43838 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 47588229 47588393 47588311 Y NA TNS3 NA NA NA NA TNS3 31763 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 47604317 47604552 47604435 Y NA TNS3 NA NA NA NA TNS3 15604 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 47610205 47610436 47610283 Y NA TNS3 NA NA NA NA TNS3 9720 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 47611156 47611689 47611507 Y C7orf69,TNS3 TNS3 NA NA NA NA TNS3 8467 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr7 47612587 47612873 47612749 Y NA TNS3 NA NA NA NA TNS3 7283 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 47620098 47620164 47620135 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 47631233 47631542 47631345 Y C7orf69,TNS3 TNS3 TNS3,LINC00525,C7orf69,PKD1L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS3 11077 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr7 47644474 47644665 47644612 Y NA TNS3 TNS3,C7orf65,C7orf69,PKD1L1,LINC00525 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 24318 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 47675013 47675155 47675094 Y TNS3 NA TNS3,C7orf69,PKD1L1,C7orf65,LINC00525 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS3 54857 CAGE T98G hg19 FANTOM5 3.36117947437713 chr7 47688297 47688502 47688400 Y NA NA TNS3,PKD1L1,LINC00525,C7orf69 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 68141 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 47691174 47691510 47691360 Y C7orf69,TNS3,C7orf65 NA TNS3,PKD1L1,LINC00525,C7orf69 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 71018 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr7 47709618 47709974 47709946 Y UPP1,UPP1,HUS1 NA NA NA NA NA TNS3 89462 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 47797544 47797859 47797606 Y NA C7orf69 NA NA NA NA C7orf69 35030 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 47823605 47823820 47823740 Y TNS3 C7orf69 NA NA NA NA C7orf69 9069 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr7 47826128 47826596 47826342 Y NA C7orf69 NA NA NA NA C7orf69 6293 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr7 50666851 50666964 50666921 Y NA NA NA NA NA NA FIGNL1 150763 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 55063452 55063479 55063466 Y NA EGFR EGFR IMR90 Hi-C 24141950 EGFR 21235 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 55132578 55133258 55132929 Y SEC61G,EGFR EGFR NA NA NA NA EGFR 47864 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 55141624 55142112 55141893 Y SEC61G,EGFR NA NA NA NA NA EGFR 56910 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr7 55146809 55147410 55146997 Y NA NA NA NA NA NA EGFR 62095 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 55198488 55198937 55198616 Y SEC61G NA NA NA NA NA EGFR 113774 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 55200352 55201043 55200686 Y SEC61G,EGFR NA NA NA NA NA EGFR 115638 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 55201472 55201858 55201601 Y SEC61G NA NA NA NA NA EGFR 116758 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 55322570 55322956 55322611 Y EGFR NA EGFR,SEC61G IMR90 Hi-C 24141950 LANCL2 108185 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 55529793 55530311 55530129 Y ZNF713,VOPP1 NA NA NA NA NA LANCL2 98652 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 55600779 55601841 55601199 Y VOPP1 VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 36840 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 56168682 56168929 56168809 Y ZNF713 SUMF2,CHCHD2 NA NA NA NA CHCHD2 3340 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 56173322 56173423 56173410 Y NA SUMF2,CHCHD2 NA NA NA NA CHCHD2 1053 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 57471842 57471971 57471867 Y NA NA NA NA NA NA RP4-725G10.3 1243004 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr7 57639323 57639702 57639567 Y ZNF479,ZNF716 NA NA NA NA NA RP4-725G10.3 1410485 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 65761130 65761447 65761274 Y RABGEF1,KCTD7 NA NA NA NA NA TPST1 92944 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 65790150 65790379 65790243 Y RABGEF1,KCTD7,TPST1 NA LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 TPST1 121964 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr7 66056218 66056609 66056384 Y NA KCTD7 KCTD7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KCTD7 35259 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 66120269 66120628 66120390 Y RABGEF1,KCTD7 KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1 NA NA NA NA RP4-756H11.3 2744 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 68171287 68171584 68171440 Y NA NA NA NA NA NA RP5-859M6.1 67502 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 72929530 72929887 72929777 Y NA BAZ1B,BCL7B NA NA NA NA BAZ1B 4721 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 72939749 72940060 72940006 Y BAZ1B BAZ1B,BCL7B NA NA NA NA BAZ1B 5141 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 73037168 73037552 73037436 Y MLXIPL TBL2,MLXIPL NA NA NA NA MLXIPL 295 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 73236868 73237278 73236968 Y CLDN3,CLDN4 CLDN4,WBSCR27 NA NA NA NA WBSCR27 17587 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 73265870 73266203 73266092 Y BCL7B WBSCR27 NA NA NA NA WBSCR27 11005 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr7 73443567 73443942 73443908 Y CLIP2,ELN NA NA NA NA NA LIMK1 51321 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 73686776 73686884 73686792 Y LAT2 RFC2,CLIP2 RFC2,LAT2,CLIP2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIP2 14921 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 73694024 73694283 73694118 Y LAT2 RFC2,CLIP2 CLIP2 IMR90 Hi-C 24141950 CLIP2 7522 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 73897037 73897256 73897156 Y NA GTF2IRD1 NA NA NA NA GTF2IRD1 30917 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 74020286 74020548 74020393 Y NA GTF2I NA NA NA NA GTF2I 49446 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr7 74050043 74050194 74050049 Y GTF2IRD2B GTF2I GTF2IRD1,GTF2I IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTF2I 19800 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 74057565 74058043 74057767 Y LAT2 GTF2I GTF2I K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 GTF2I 11951 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 74064444 74064957 74064539 Y GTF2IRD2B,LAT2 GTF2I NA NA NA NA GTF2I 5037 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 75253450 75253956 75253637 Y POR NA NA NA NA NA PMS2P3 97972 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 75267293 75267635 75267464 Y NA NA NA NA NA NA HIP1 98645 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 75268782 75269322 75269061 Y NA NA NA NA NA NA HIP1 96958 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 75546128 75546229 75546156 Y NA POR STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 POR 19610 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 75580822 75581199 75581009 Y POR TMEM120A NA NA NA NA TMEM120A 40778 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 75795833 75796053 75795969 Y RHBDD2,POR NA SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 MDH2 120464 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr7 75923846 75924306 75924205 Y HSPB1 HSPB1 NA NA NA NA HSPB1 5555 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 75947305 75947626 75947472 Y RHBDD2,SRRM3 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 17444 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr7 75993529 75993613 75993570 Y POR YWHAG YWHAG MCF7 ChIA-PET 22265404 YWHAG 7181 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 75993825 75994303 75994024 Y NA YWHAG YWHAG MCF7 ChIA-PET 22265404 YWHAG 7477 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr7 76002661 76002791 76002762 Y POR YWHAG NA NA NA NA YWHAG 16313 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 76009173 76009680 76009431 Y POR YWHAG NA NA NA NA YWHAG 22825 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr7 76627484 76628238 76628092 Y NA NA NA NA NA NA FAM185BP 121195 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 77428722 77429286 77429067 Y PION,PTPN12,RSBN1L,PHTF2,PHTF2 TMEM60,PHTF2 NA NA NA NA PHTF2 2600 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 80251972 80252338 80252155 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3C 297337 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 80360559 80360752 80360740 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3C 188923 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 80399893 80400101 80400015 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3C 149574 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 83662977 83663317 83663147 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3A 456723 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 84613691 84613734 84613712 Y NA AC074183.4 NA NA NA NA AC074183.4 46130 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 85576189 85576390 85576289 Y NA NA NA NA NA NA AC074183.4 1008628 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 86948267 86948659 86948457 Y CROT TP53TG1,CROT NA NA NA NA TP53TG1 24172 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr7 90637974 90638276 90638003 Y NA NA NA NA NA NA FZD1 253507 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 91466585 91467314 91466893 Y NA MTERF NA NA NA NA MTERF 40720 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr7 92233387 92233691 92233548 Y NA FAM133B FAM133B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 FAM133B 15679 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr7 92261439 92261837 92261823 Y NA FAM133B FAM133B K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 43731 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 92263416 92263696 92263624 Y SAMD9,CDK6 FAM133B FAM133B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 45708 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 92271044 92271426 92271360 Y SAMD9 NA NA NA NA NA FAM133B 53336 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 92277080 92277232 92277129 Y ANKIB1,GATAD1,CDK6 NA NA NA NA NA FAM133B 59372 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 92279692 92280069 92279965 Y NA NA NA NA NA NA FAM133B 61984 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 92324544 92325563 92325510 Y NA NA FAM133B IMR90 Hi-C 24141950 FAM133B 106836 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr7 92373404 92373742 92373580 Y NA NA NA NA NA NA AC002454.1 90055 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 92383173 92383232 92383216 Y NA NA NA NA NA NA AC002454.1 80565 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 92384322 92384817 92384698 Y CDK6 NA NA NA NA NA AC002454.1 78980 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 92392967 92393205 92393086 Y PEX1,C7orf64,FAM133B,SAMD9,CDK6,CDK6 NA FAM133B IMR90 Hi-C 24141950 AC002454.1 70592 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 92437286 92437617 92437517 Y SAMD9 AC002454.1,CDK6 NA NA NA NA AC002454.1 26180 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 92439060 92439368 92439205 Y PEX1,C7orf64,FAM133B,SAMD9 AC002454.1,CDK6 NA NA NA NA AC002454.1 24429 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr7 92512382 92512474 92512428 Y NA AC002454.1,CDK6 NA NA NA NA CDK6 48474 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 93585573 93585617 93585595 Y NA GNG11,BET1 NA NA NA NA GNG11 36562 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 93812688 93813130 93812921 Y NA NA TFPI2,BET1,GNGT1 IMR90 Hi-C 24141950 AC003092.1 162543 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 93912832 93912844 93912838 Y NA NA TFPI2,COL1A2 IMR90 Hi-C 24141950 COL1A2 109029 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 93926616 93927074 93926886 Y SGCE,COL1A2 NA COL1A2,GNG11 IMR90 Hi-C 24141950 COL1A2 94799 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 93930998 93931300 93931121 Y NA NA COL1A2,GNG11 IMR90 Hi-C 24141950 COL1A2 90573 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 94003622 94003870 94003684 Y NA COL1A2 NA NA NA NA COL1A2 18003 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 94021237 94021945 94021560 Y NA NA NA NA NA NA COL1A2 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr7 94286949 94287416 94287082 Y PPP1R9A,PPP1R9A,CASD1,PEG10,PEG10 SGCE,PEG10 NA NA NA NA PEG10 3312 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 94557636 94557931 94557784 Y PPP1R9A NA NA NA NA NA PEG10 273999 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 95747900 95748043 95747945 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 201416 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 95765148 95765192 95765170 Y DYNC1I1,FLJ42280 NA NA NA NA NA SLC25A13 184267 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 95861904 95862185 95862172 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 87274 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 95877265 95877280 95877275 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 72179 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 96644857 96645287 96645147 Y NA DLX6,DLX5 NA NA NA NA DLX5 7122 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 97913424 97913987 97913861 Y LMTK2,BRI3 TECPR1,BRI3 NA NA NA NA BRI3 33733 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr7 98650927 98651298 98651264 Y NA NA NA NA NA NA SMURF1 88425 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 98739351 98739615 98739543 Y NA SMURF1 NA NA NA NA SMURF1 108 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 98871923 98872129 98871984 Y NA ARPC1A NA NA NA NA ARPC1A 49392 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 98973055 98973209 98973129 Y ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B ARPC1B,BUD31,PDAP1 NA NA NA NA ARPC1B 3183 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 99094567 99094648 99094634 Y NA PTCD1,ATP5J2-PTCD1,ATP5J2,ZNF789,ZNF394,ZKSCAN5 NA NA NA NA ZNF394 1299 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 99678619 99678725 99678657 Y NA ZSCAN21,ZNF3,COPS6,AP4M1,MCM7,CNPY4,TAF6,MBLAC1,RP11-506M12.1 NA NA NA NA ZNF3 448 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 99684818 99685168 99684993 Y TSC22D4,PILRB,PILRA ZSCAN21,ZNF3,COPS6,AP4M1,MCM7,CNPY4,TAF6,MBLAC1,RP11-506M12.1 NA NA NA NA COPS6 241 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 100743461 100743946 100743576 Y GNB2,TRIM56 TRIM56,SERPINE1 SERPINE1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM56 16741 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 100757831 100758077 100757885 Y NA TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF NA NA NA NA SERPINE1 10293 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 100765253 100766084 100765924 Y TRIM56,SERPINE1 TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF NA NA NA NA SERPINE1 2286 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 101361034 101362207 101361111 Y CUX1,CUX1 NA CUX1,EMID2,SH2B2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUX1 94752 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 101372678 101373024 101372861 Y NA NA CUX1,EMID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUX1 83935 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 101499743 101500539 101499888 Y SH2B2,CUX1,CUX1,CUX1 CUX1 NA NA NA NA CUX1 42784 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 101526005 101526525 101526438 Y SH2B2,CUX1,CUX1 NA NA NA NA NA CUX1 69046 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 101690848 101690892 101690861 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 233889 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 101775527 101775981 101775908 Y CUX1,CUX1,SH2B2,ORAI2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 226338 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 101784419 101784868 101784539 Y CUX1,CUX1,SH2B2,ORAI2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 217451 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 101929501 101929660 101929574 Y CUX1,CUX1,CUX1,POLR2J3,ORAI2,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72659 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72006 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.97716439669243 chr7 102081983 102082063 102082048 Y NA ORAI2,ALKBH4,LRWD1,POLR2J NA NA NA NA ORAI2 10430 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 102104317 102104602 102104460 Y NA ORAI2,ALKBH4,LRWD1,POLR2J NA NA NA NA LRWD1 941 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 102464517 102464880 102464701 Y NA NA NA NA NA NA FAM185A 77099 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 102516226 102516619 102516429 Y LRRC17 LRRC17 FAM185A IMR90 Hi-C 24141950 LRRC17 34819 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 102919685 102919710 102919698 Y NAPEPLD DPY19L2P2,PMPCB NA NA NA NA DPY19L2P2 828 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 102959356 102959407 102959404 Y PMPCB,DNAJC2 DPY19L2P2,PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4 NA NA NA NA PSMC2 23294 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 104597631 104597869 104597756 Y MLL5 NA NA NA NA NA LINC01004 53622 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 104618643 104618978 104618693 Y NA LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 32513 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 104771248 104771300 104771252 Y NA NA NA NA NA NA LINC01004 119757 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 104980501 104980737 104980707 Y NA NA NA NA NA NA SRPK2 57018 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 105705488 105705603 105705542 Y NA SYPL1 ATXN7L1,SYPL1,CDHR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SYPL1 45419 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 105856842 105857229 105857099 Y NA NA NAMPT,CCDC71L IMR90 Hi-C 24141950 NAMPT 67543 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 105922869 105923204 105923197 Y NA NAMPT NA NA NA NA NAMPT 1568 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 106089773 106090176 106089868 Y NAMPT,PIK3CG NA NAMPT IMR90 Hi-C 24141950 NAMPT 165001 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 106209189 106209713 106209400 Y NAMPT NA CCDC71L,NAMPT,ATXN7L1,PIK3CG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC004917.1 89629 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr7 106358724 106358979 106358846 Y NAMPT,PIK3CG,HBP1,FLJ36031 NA CCDC71L,NAMPT IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC71L 59282 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 106808132 106808705 106808532 Y NA HBP1 NA NA NA NA HBP1 726 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr7 106901302 106901364 106901333 Y NA NA NA NA NA NA HBP1 93896 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 107026511 107026865 107026723 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 175064 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 107567788 107568066 107567911 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 38373 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr7 107573965 107574445 107574339 Y LAMB1 DLD NA NA NA NA DLD 44550 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr7 107594636 107594797 107594717 Y NA LAMB1 NA NA NA NA LAMB1 46903 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 107644827 107645024 107644950 Y LAMB1 LAMB1 NA NA NA NA LAMB1 3127 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr7 108060932 108061217 108061051 Y PNPLA8,DNAJB9 NRCAM NA NA NA NA NRCAM 33944 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 112383831 112384204 112384019 Y NA TMEM168 NA NA NA NA TMEM168 44443 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 115912136 115912451 115912327 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 CAV2 NA NA NA NA CAV2 12983 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 115995232 115995555 115995330 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 NA CAV2,CAV1,TES,MET IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CAV2 69798 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr7 116058055 116058274 116058222 Y NA NA CAV2,TES,MET,CAV1 IMR90,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 AC002066.1 79245 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 116083167 116083483 116083344 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 NA TES,CAV2,CAV1,MET IMR90,MCF7,HELA Hi-C,ChIA-PET,5C 24141950,22265404,22955621 AC002066.1 54036 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 116152142 116152412 116152205 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1 AC002066.1,CAV1 CAV1 IMR90 Hi-C 24141950 CAV1 10427 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 116168216 116168790 116168273 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 AC002066.1,CAV1 NA NA NA NA CAV1 5377 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 116217100 116217359 116217210 Y CAV1,CAV1 NA NA NA NA NA CAV1 54261 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 116504290 116504456 116504319 Y NA NA NA NA NA NA CAPZA2 55166 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 120724784 120725242 120725000 Y C7orf58 NA NA NA NA NA ING3 135981 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 121783025 121783385 121783205 Y PTPRZ1,AASS AASS NA NA NA NA AASS 691 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 122253933 122254165 122254049 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P31 65179 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 123387767 123387941 123387854 Y NA WASL NA NA NA NA WASL 646 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 126341155 126341491 126341268 Y NA NA NA NA NA NA ZNF800 728487 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr7 126806014 126806101 126806058 Y GRM8 NA NA NA NA NA ZNF800 263877 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE T98G hg19 FANTOM5 3.26232125454251 chr7 128468302 128468509 128468385 Y FLNC CCDC136,ATP6V1F NA NA NA NA FLNC 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 128603332 128603696 128603619 Y ATP6V1F,IRF5,IRF5,IRF5,TSPAN33 IRF5 NA NA NA NA IRF5 27666 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 129419876 129420343 129420085 Y NA NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 170321 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr7 129589680 129589810 129589737 Y NA UBE2H NA NA NA NA UBE2H 979 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 129598516 129598781 129598654 Y NRF1,UBE2H,UBE2H UBE2H UBE2H,NRF1,AHCYL2,SMO,ZC3HC1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 UBE2H 7727 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 129609674 129609888 129609791 Y NA UBE2H AHCYL2,ZC3HC1,SMO,UBE2H IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2H 18885 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 130013597 130013906 130013823 Y CPA2,CPA1 NA NA NA NA NA CEP41 66368 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr7 130575591 130576512 130576394 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 19557 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 130586004 130586434 130586371 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 9635 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr7 130588239 130588699 130588531 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 7370 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 130589567 130590049 130589961 Y NA MIR29A MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 6020 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 130593505 130595916 130594870 Y NA MIR29A MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 153 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 130601178 130601963 130601463 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A FLJ43663 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 5109 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 130602337 130602820 130602733 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A FLJ43663 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 6268 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 130614674 130615489 130615212 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 18605 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr7 130633473 130633870 130633858 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 37404 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 130641725 130642119 130642041 Y MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 45656 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 130645057 130645459 130645325 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 48988 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr7 130741821 130742227 130742136 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 50628 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 130916172 130916668 130916569 Y NA AC009362.2 NA NA NA NA AC009362.2 8681 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 130920397 130920794 130920689 Y MKLN1,MKLN1 AC009362.2 NA NA NA NA AC009362.2 4555 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 132660683 132660693 132660688 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD3 104155 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 134117156 134117311 134117298 Y NA AKR1B1 NA NA NA NA AKR1B1 24725 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr7 134247089 134247493 134247269 Y LRGUK AKR1B10,AKR1B15 NA NA NA NA AKR1B15 15201 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 134287776 134287871 134287820 Y NA BPGM AKR1B1,AKR1B10,AKR1B15,BPGM IMR90 Hi-C 24141950 BPGM 41689 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 134397020 134397253 134397193 Y NA CALD1 CALD1,BPGM IMR90 Hi-C 24141950 CALD1 29750 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 134475089 134475514 134475151 Y CALD1 CALD1 NA NA NA NA CALD1 48086 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 134550071 134550586 134550435 Y NA NA NA NA NA NA AGBL3 118673 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 134836004 134836265 134836096 Y WDR91,CNOT4,TMEM140 TMEM140,C7orf49 NA NA NA NA TMEM140 5180 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 135430585 135430983 135430863 Y FAM180A NA NA NA NA NA C7orf73 85341 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 135443440 135443607 135443468 Y FAM180A NA C7orf73,SLC13A4 IMR90 Hi-C 24141950 C7orf73 98196 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 135459124 135459310 135459189 Y NA NA C7orf73,SLC13A4,FAM180A IMR90 Hi-C 24141950 C7orf73 113880 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr7 135665513 135665767 135665568 Y NA MTPN NA NA NA NA MTPN 5412 CAGE T98G hg19 FANTOM5 2.7680301553694 chr7 135708856 135709118 135708987 Y NA MTPN C7orf73 IMR90 Hi-C 24141950 MTPN 48755 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 135771654 135771794 135771701 Y NA NA NA NA NA NA MTPN 111553 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 137352437 137352725 137352566 Y NA NA NA NA NA NA PTN 325826 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 138917056 138917428 138917261 Y ZC3HAV1,UBN2 UBN2 NA NA NA NA UBN2 3954 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 139333682 139334086 139333875 Y TBXAS1,HIPK2 NA NA NA NA NA ERHP1 116696 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 139365521 139365926 139365718 Y NA NA NA NA NA NA TBXAS1 108924 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr7 139366770 139367125 139366961 Y TBXAS1 NA NA NA NA NA TBXAS1 107725 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 139410403 139410671 139410537 Y NA NA NA NA NA NA TBXAS1 64179 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 139498127 139498170 139498155 Y TBXAS1 TBXAS1,HIPK2 NA NA NA NA HIPK2 22550 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 139616229 139616509 139616457 Y NA NA NA NA NA NA HIPK2 140652 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 140024684 140024714 140024699 Y NA NA NA NA NA NA SLC37A3 77519 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 140267387 140267618 140267517 Y DENND2A NA NA NA NA NA MKRN1 90018 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 141285767 141286195 141285861 Y TAS2R38,AGK AGK NA NA NA NA AGK 36778 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 141380130 141380660 141380538 Y NA KIAA1147,RNU1-82P NA NA NA NA KIAA1147 19293 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 142191082 142191483 142191195 Y NA NA NA NA NA NA TRBV7-3 54132 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 143072489 143072836 143072701 Y GSTK1,FAM115C FAM131B,AC093673.5,ZYX NA NA NA NA AC093673.5 2752 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 143589612 143589642 143589628 Y OR2F1,OR2A2,OR2A25,OR2A12,TAS2R60,FAM115A,FAM115A,FAM115A FAM115A NA NA NA NA FAM115A 7649 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA NA EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZH2 58860 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr7 148680544 148680840 148680694 Y NA PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 42893 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr7 148684338 148684706 148684475 Y NA PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 39027 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr7 149193399 149193541 149193458 Y ZNF467,ZNF746 ZNF746 NA NA NA NA ZNF746 491 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 149468740 149469267 149468803 Y NA ZNF467 NA NA NA NA ZNF467 172 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr7 150075425 150075527 150075503 Y NA REPIN1,ZNF775 NA NA NA NA ZNF775 11546 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 151068443 151068736 151068590 Y SMARCD3,CRYGN,WDR86 NUB1 NA NA NA NA NUB1 31658 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 151157060 151157432 151157203 Y NA NA CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 57774 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 151184518 151184840 151184768 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 30366 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 151198552 151198933 151198803 Y AGAP3,PRKAG2,PRKAG2 RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 16273 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 151384772 151384923 151384848 Y NA NA NA NA NA NA RHEB 169566 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 151496256 151496476 151496337 Y RHEB,PRKAG2,PRKAG2 NA NA NA NA NA PRKAG2-AS1 75651 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 152065077 152065428 152065152 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 305822 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr7 152105895 152106094 152106005 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 265156 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 152160343 152160554 152160402 Y ACTR3B NA NA NA NA NA XRCC2 210696 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 210057 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr7 152161348 152162014 152161594 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 209236 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr7 154742897 154743129 154742996 Y NA PAXIP1 NA NA NA NA PAXIP1 49665 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 154958521 154958650 154958585 Y NA NA PAXIP1,HTR5A,LOC100128264,CNPY1 IMR90 Hi-C 24141950 INSIG1 128836 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr7 154999343 155001070 155000829 Y NA NA INSIG1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 INSIG1 86416 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 155049368 155049519 155049432 Y NA INSIG1 NA NA NA NA INSIG1 37967 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr7 157072331 157072686 157072549 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 53389 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 157131379 157131690 157131421 Y NA DNAJB6 NA NA NA NA DNAJB6 5304 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr7 158167398 158167566 158167494 Y NA NA NA NA NA NA PTPRN2 210914 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr7 158224670 158224991 158224878 Y NA NA NA NA NA NA PTPRN2 153489 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.77944795702319 chr7 158301130 158301237 158301184 Y NA NA NA NA NA NA PTPRN2 77243 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 158410794 158411171 158410984 Y NA PTPRN2 NA NA NA NA PTPRN2 32314 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr7 158656529 158657066 158657015 Y NA ESYT2,WDR60 NA NA NA NA WDR60 9260 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr8 1693574 1694042 1693752 Y CLN8 CLN8,CTD-2336O2.1 ARHGEF10,CLN8,MIR596,KBTBD11,ZNF596 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLN8 7902 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 1911297 1911510 1911444 Y NA KBTBD11 NA NA NA NA KBTBD11 8534 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr8 6405382 6405492 6405403 Y NA NA NA NA NA NA RP11-115C21.2 142719 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 6490542 6490767 6490601 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2541M15.1 72963 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr8 6518047 6518428 6518274 Y NA CTD-2541M15.1,AGPAT5 NA NA NA NA CTD-2541M15.1 45302 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 6536860 6537447 6537204 Y NA CTD-2541M15.1,AGPAT5 LOC100287015,MCPH1,ANGPT2 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2541M15.1 26283 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr8 8153597 8154098 8153801 Y NA NA MFHAS1,SGK223,CLDN23,FLJ10661 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SGK223 87910 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 8203793 8204189 8204138 Y NA SGK223 NA NA NA NA SGK223 37819 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 8878847 8879137 8878870 Y NA ERI1 NA NA NA NA ERI1 21190 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 9978890 9979101 9978960 Y MSRA NA NA NA NA NA MSRA 69112 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 10187572 10187859 10187580 Y NA NA NA NA NA NA MSRA 277794 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 10305932 10306275 10305955 Y NA NA NA NA NA NA SOX7 389082 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 10676875 10677241 10677058 Y NA SOX7,PINX1 NA NA NA NA SOX7 18116 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 10764620 10764860 10764740 Y NA NA NA NA NA NA PINX1 69226 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 10873844 10874251 10874241 Y NA NA NA NA NA NA PINX1 178450 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 11001237 11001609 11001584 Y NA NA NA NA NA NA XKR6 55266 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 11013396 11013600 11013498 Y NA XKR6 NA NA NA NA XKR6 43275 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 11312887 11313950 11313920 Y NA FAM167A NA NA NA NA FAM167A 16274 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 11314255 11315026 11314813 Y XKR6,MTMR9,FAM167A FAM167A NA NA NA NA FAM167A 15198 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 11337266 11337614 11337440 Y FAM167A FAM167A C8orf12,BLK IMR90 Hi-C 24141950 FAM167A 7042 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 11373324 11373814 11373559 Y FAM167A FAM167A NA NA NA NA FAM167A 43100 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 11749167 11749418 11749260 Y CTSB CTSB CTSB,FAM167A,BLK,NEIL2,GATA4,FDFT1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTSB 24210 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 13224231 13224684 13224410 Y NA NA NA NA NA NA DLC1 146483 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr8 15443006 15443379 15443076 Y NA NA NA NA NA NA TUSC3 170282 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 16280941 16281214 16281102 Y MSR1 NA NA NA NA NA ZDHHC2 730324 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 16898778 16899115 16898947 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC2 112423 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 16965727 16966045 16965748 Y NA ZDHHC2 NA NA NA NA ZDHHC2 45493 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 17893767 17894158 17893964 Y NAT1,ASAH1,ASAH1 CTD-2547L16.1,ASAH1 NA NA NA NA CTD-2547L16.1 46219 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 18704322 18704730 18704574 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 235510 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 18722659 18722821 18722740 Y PSD3 NA NA NA NA NA PSD3 217419 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 18768857 18769292 18769046 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 170948 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 18836263 18836433 18836318 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 103807 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 18854306 18854486 18854451 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 85754 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 18940211 18940624 18940314 Y NA NA LOC100128993,PSD3,SH2D4A IMR90 Hi-C 24141950 PSD3 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 18953463 18953695 18953605 Y NA PSD3 LOC100128993,CSGALNACT1,PSD3,SH2D4A IMR90 Hi-C 24141950 PSD3 13223 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 19243434 19243614 19243539 Y NA NA NA NA NA NA SH2D4A 74306 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 19522969 19523285 19523139 Y NA NA NA NA NA NA CSGALNACT1 90255 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 19944306 19944529 19944412 Y ATP6V1B2 NA NA NA NA NA ATP6V1B2 108349 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 20125746 20125979 20125927 Y NA LZTS1 DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1 IMR90 Hi-C 24141950 LZTS1 33495 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 20126353 20126692 20126612 Y NA LZTS1 DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1 IMR90 Hi-C 24141950 LZTS1 32782 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 21867707 21867918 21867811 Y PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2 NA NA NA NA NA FAM160B2 76752 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 21999982 22000221 22000101 Y POLR3D NUDT18,HR,REEP4,LGI3,BMP1 NA NA NA NA REEP4 2518 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 22300361 22300587 22300487 Y BIN3,PPP3CC PPP3CC,RP11-382J24.2 NA NA NA NA PPP3CC 4029 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 22516346 22516607 22516450 Y NA BIN3,EGR3 NA NA NA NA BIN3 8054 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 22522684 22522941 22522886 Y NA BIN3,EGR3 NA NA NA NA BIN3 1720 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 22551843 22553123 22552848 Y PPP3CC,PDLIM2,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10C,EGR3 BIN3,EGR3 NA NA NA NA EGR3 3028 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 23075543 23075864 23075687 Y TNFRSF10B,ENTPD4,ENTPD4 CHMP7,R3HCC1 NA NA NA NA CHMP7 23286 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 23138717 23138953 23138815 Y LOXL2 CHMP7,R3HCC1 NA NA NA NA R3HCC1 13084 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 23202733 23203217 23203148 Y LOXL2 NA NA NA NA NA R3HCC1 77100 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 23203813 23204244 23204131 Y LOXL2 NA NA NA NA NA LOXL2 76597 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr8 23211536 23211676 23211614 Y TNFRSF10D,LOXL2 NA NA NA NA NA LOXL2 69165 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 23245818 23245947 23245883 Y NA LOXL2 NA NA NA NA LOXL2 34894 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 23396383 23397127 23396699 Y TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4,SLC25A37 SLC25A37 NA NA NA NA SLC25A37 12065 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 23710742 23711028 23710888 Y STC1 STC1 NA NA NA NA STC1 422 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 24799462 24799718 24799592 Y NEFL NA NA NA NA NA DOCK5 240520 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 24857844 24858008 24857898 Y NA NA NA NA NA NA DOCK5 182230 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 24858208 24858485 24858356 Y NA NA NA NA NA NA DOCK5 181753 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 26306627 26307336 26307213 Y NA NA BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PNMA2 62272 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr8 26429509 26429959 26429867 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL2 59718 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 26466894 26467238 26467101 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL2 97103 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 26468935 26469319 26469207 Y DPYSL2 NA NA NA NA NA DPYSL2 99144 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 27209291 27209793 27209526 Y PTK2B,PTK2B TRIM35 NA NA NA NA TRIM35 42455 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 27464961 27465271 27465267 Y NA CLU,SCARA3 NA NA NA NA CLU 5277 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 27517363 27517693 27517481 Y NA CLU,SCARA3 NA NA NA NA SCARA3 27978 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr8 27694349 27694720 27694534 Y NA PBK NA NA NA NA PBK 737 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 28258528 28258941 28258737 Y HMBOX1,HMBOX1 ZNF395 ZNF395,FBXO16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF395 310 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 28269273 28269920 28269515 Y ZNF395 ZNF395 NA NA NA NA ZNF395 11055 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr8 28562756 28562912 28562834 Y EXTL3 EXTL3-AS1 NA NA NA NA EXTL3-AS1 5775 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 28930417 28930501 28930459 Y NA CTD-2647L4.4 NA NA NA NA CTD-2647L4.4 18965 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 29230784 29230978 29230896 Y KIF13B,DUSP4 DUSP4 C8orf75,LOC286135,MIR3148,MIR548O2,TMEM66,LEPROTL1,DUSP4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 24599 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 29595040 29595214 29595121 Y KIF13B,DUSP4,DUSP4,TMEM66,LEPROTL1 NA NA NA NA NA TMEM66 343509 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 30363851 30364149 30364000 Y NA NA NA NA NA NA RBPMS-AS1 122934 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 30580467 30580796 30580574 Y GSR GSR,UBXN8 NA NA NA NA GSR 2647 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr8 30892930 30893420 30892948 Y NA WRN NA NA NA NA WRN 3613 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 32174217 32174584 32174401 Y NA NA NA NA NA NA NRG1 679315 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 32191944 32192171 32192069 Y NRG1 NA NA NA NA NA NRG1 697042 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 32603273 32603561 32603417 Y NA NA NA NA NA NA FUT10 725379 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 32642880 32643214 32643047 Y NA NA NA NA NA NA FUT10 685726 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 35119361 35119644 35119503 Y UNC5D NA NA NA NA NA LSM12P1 261637 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA LSM12P1 NA NA NA NA LSM12P1 1527 CAGE T98G hg19 FANTOM5 3.95432879338486 chr8 37000181 37000618 37000483 Y NA NA KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-150O12.1 409083 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 37002327 37002551 37002443 Y NA NA KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-150O12.1 407150 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr8 37643587 37643772 37643645 Y NA PROSC,GPR124 NA NA NA NA GPR124 3878 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 37679848 37680132 37679943 Y RAB11FIP1 GPR124,BRF2 NA NA NA NA BRF2 25290 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 37889292 37889604 37889448 Y NA EIF4EBP1 NA NA NA NA EIF4EBP1 3433 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 38242599 38242872 38242674 Y TACC1,WHSC1L1,LETM2,LETM2 WHSC1L1,LETM2 NA NA NA NA LETM2 874 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 38312135 38312514 38312441 Y NA FGFR1 NA NA NA NA FGFR1 11838 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 38313401 38313535 38313485 Y NA FGFR1 NA NA NA NA FGFR1 10817 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 38330883 38331237 38331060 Y NA FGFR1 NA NA NA NA FGFR1 6531 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 38794203 38794537 38794324 Y TACC1,PLEKHA2 PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 37450 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr8 38794582 38795442 38794757 Y TACC1,PLEKHA2 PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 37829 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 38856419 38857534 38856583 Y NA TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA ADAM9 4031 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr8 39797063 39797940 39797610 Y NA IDO1 NA NA NA NA IDO1 39269 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 39912317 39912749 39912459 Y C8orf4 NA C8orf4,ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 96240 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 39964053 39964403 39964231 Y NA C8orf4 C8orf4 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 44586 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 40049035 40049230 40049136 Y NA C8orf4 GOLGA7,C8orf4,ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 40046 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 40207660 40208018 40207838 Y NA NA ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 198671 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 41146046 41146081 41146065 Y SFRP1 SFRP1 NA NA NA NA SFRP1 18935 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 41819161 41819283 41819222 Y POLB NA NA NA NA NA KAT6A 88225 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 41894654 41895622 41895417 Y NA KAT6A NA NA NA NA KAT6A 11886 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 41908079 41908836 41908505 Y POLB,IKBKB,IKBKB,AP3M2,AGPAT6,MYST3 KAT6A NA NA NA NA KAT6A 571 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 41997279 41998522 41997937 Y NA AP3M2 KAT6A,ANK1,POLB,AP3M2,VDAC3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP3M2 9942 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 42053833 42054135 42053951 Y NA AP3M2,PLAT NA NA NA NA PLAT 9107 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 42072486 42072556 42072531 Y NA PLAT AP3M2,IKBKB IMR90 Hi-C 24141950 PLAT 9244 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 43092918 43093442 43093017 Y HOOK3 NA NA NA NA NA HGSNAT 99362 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 43093596 43094096 43093640 Y NA NA NA NA NA NA HGSNAT 100040 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr8 47914802 47915044 47914853 Y NA NA NA NA NA NA RPL10AP2 151697 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 48242793 48242802 48242797 Y NA NA PRKDC IMR90 Hi-C 24141950 NDUFA5P12 168300 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 48295911 48296182 48296008 Y NA NA NA NA NA NA RP11-697N18.2 206989 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 48343978 48344357 48344119 Y CEBPD NA NA NA NA NA RP11-697N18.2 158814 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 48350721 48350922 48350822 Y NA NA NA NA NA NA RP11-697N18.2 152249 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 48424795 48425379 48425168 Y NA NA NA NA NA NA RP11-697N18.2 77792 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 48513197 48513620 48513373 Y KIAA0146,CEBPD RP11-697N18.2 NA NA NA NA RP11-697N18.2 10026 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 48580617 48580970 48580793 Y NA NA NA NA NA NA CEBPD 68678 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 49320367 49320668 49320511 Y NA RPL29P19 SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 25217 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr8 49321087 49321473 49321210 Y NA RPL29P19 SNAI2,MCM4,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 25937 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 50968903 50969278 50969091 Y NA NA NA NA NA NA SNAI2 1136604 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr8 52809491 52809887 52809877 Y PCMTD1 NA NA NA NA NA PCMTD1,RP11-110G21.1 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 53625473 53626379 53625848 Y RB1CC1 RB1CC1 NA NA NA NA RB1CC1 30024 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr8 54256811 54256964 54256882 Y NA NA NA NA NA NA RP11-400K9.4 177527 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr8 54798731 54798762 54798749 Y NA ATP6V1H,RGS20 NA NA NA NA RGS20 36363 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 54932125 54932445 54932251 Y NA TCEA1 NA NA NA NA TCEA1 644 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 56362318 56362387 56362358 Y NA NA NA NA NA NA TGS1 321314 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 57360424 57360919 57360645 Y SDR16C5,PENK,PENK NA NA NA NA NA LINC00968 109463 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 57389900 57390701 57390447 Y NA NA NA NA NA NA LINC00968 79681 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 57594764 57594896 57594825 Y NA NA NA NA NA NA RP11-17A4.1 95820 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 59470194 59470547 59470220 Y NA SDCBP NA NA NA NA SDCBP 6711 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 59499727 59499886 59499762 Y UBXN2B,NSMAF,NSMAF,SDCBP SDCBP NA NA NA NA SDCBP 36244 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 59713339 59713715 59713527 Y TOX NA NA NA NA NA NSMAF 142936 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 59849492 59849915 59849740 Y NA NA NA NA NA NA RP11-25K19.1 179684 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 61564243 61564650 61564285 Y CA8,CHD7 CHD7 CHD7,RAB2A MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD7 24687 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr8 61660299 61660611 61660357 Y CHD7 NA NA NA NA NA CHD7 70962 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 61824212 61824789 61824465 Y CHD7 NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 234875 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 61850490 61850754 61850677 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261153 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr8 61850776 61851191 61851141 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261439 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr8 62385898 62385985 62385942 Y CLVS1 NA NA NA NA NA ASPH 239170 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 62427686 62427987 62427837 Y NA NA NA NA NA NA ASPH 197168 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 62445230 62445580 62445420 Y CLVS1,ASPH NA NA NA NA NA ASPH 179575 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 62534300 62534453 62534449 Y NA NA NA NA NA NA ASPH 90702 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr8 62600598 62600698 62600684 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA ASPH 24457 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 62606389 62606706 62606619 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA ASPH 18449 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr8 62620817 62621622 62621526 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA ASPH 3533 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr8 62624516 62625412 62625017 Y ASPH NA NA NA NA NA ASPH,MIR4470 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr8 62631895 62632623 62632238 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA MIR4470 6548 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 62634023 62634407 62634126 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA MIR4470 8676 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr8 62634431 62634735 62634612 Y ASPH ASPH,MIR4470 NA NA NA NA MIR4470 9084 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr8 62646245 62646286 62646251 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA MIR4470 20898 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 62679636 62680132 62679874 Y NA NA ASPH,MIR4470 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MIR4470 54289 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 64133013 64133210 64133061 Y NA NA NA NA NA NA YTHDF3 53901 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr8 65716004 65716285 65716147 Y NA NA NA NA NA NA ARMC1 828157 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 66615323 66615688 66615531 Y NA NA NA NA NA NA MTFR1 60354 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 66641187 66641625 66641410 Y PDE7A NA NA NA NA NA MTFR1 86218 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 66934530 66934705 66934628 Y PDE7A NA NA NA NA NA AC084082.3 88197 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 67419818 67420060 67419977 Y NA NA NA NA NA NA ADHFE1 79398 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 67433991 67434613 67434592 Y NA NA NA NA NA NA MYBL1 89869 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 67434763 67435122 67434951 Y NA NA NA NA NA NA MYBL1 89360 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 68075038 68075412 68075329 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 81020 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 69094354 69094545 69094486 Y NA NA NA NA NA NA PREX2 232001 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 71124105 71124438 71124275 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 109691 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 71188678 71189062 71188836 Y NA NA NA NA NA NA NCOA2 124978 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 71503238 71503393 71503365 Y NA TRAM1,RP11-382J12.1 NA NA NA NA TRAM1 15229 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 72743502 72744020 72743667 Y NA RP11-383H13.1,MSC NA NA NA NA RP11-383H13.1 5100 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr8 72753377 72753463 72753388 Y NA RP11-383H13.1,MSC NA NA NA NA MSC 1240 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr8 72769938 72770232 72770085 Y NA RP11-383H13.1,MSC NA NA NA NA MSC 15235 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 72770493 72770720 72770591 Y MSC RP11-383H13.1,MSC NA NA NA NA MSC 15790 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 72835218 72835410 72835314 Y NA NA NA NA NA NA MSC 80515 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 72839217 72839615 72839291 Y NA NA NA NA NA NA MSC 84514 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 72880263 72880309 72880290 Y NA NA NA NA NA NA TRPA1 105543 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 72917567 72918022 72917791 Y NA NA NA NA NA NA TRPA1 67830 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 73230861 73231003 73230932 Y NA NA NA NA NA NA TRPA1 245009 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 73690966 73691186 73691160 Y NA NA NA NA NA NA TERF1 227913 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 73798520 73798610 73798565 Y NA NA NA NA NA NA TERF1 120489 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 74625237 74625516 74625377 Y NA STAU2 NA NA NA NA STAU2 32427 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 74792402 74792821 74792506 Y NA UBE2W NA NA NA NA UBE2W 3257 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 75578837 75579082 75578960 Y NA NA NA NA NA NA RP11-730G20.2 64358 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr8 75748881 75749089 75748985 Y NA PI15 NA NA NA NA PI15 14109 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 78067256 78067767 78067611 Y NA NA NA NA NA NA PEX2 155976 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 79661368 79661417 79661393 Y NA NA NA NA NA NA IL7 54341 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 79663656 79664006 79663831 Y NA NA NA NA NA NA IL7 51752 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 79670742 79671103 79670995 Y NA IL7 NA NA NA NA IL7 44655 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 79674578 79674862 79674701 Y NA IL7 NA NA NA NA IL7 40896 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 79675234 79675631 79675433 Y NA IL7 NA NA NA NA IL7 40127 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr8 79678624 79678939 79678782 Y NA IL7 NA NA NA NA IL7 36819 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 80705910 80706255 80706054 Y HEY1 HEY1 HEY1,MRPS28 IMR90 Hi-C 24141950 HEY1 27812 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr8 81615108 81615487 81615408 Y ZNF704 NA NA NA NA NA ZBTB10 219254 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 81893837 81894122 81894063 Y PAG1 NA NA NA NA NA PAG1 128181 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 81962809 81963138 81963038 Y PAG1 NA NA NA NA NA PAG1 59165 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 81993720 81993926 81993821 Y PAG1 PAG1 NA NA NA NA PAG1 28377 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 82167350 82167604 82167486 Y NA NA ZNF704,PAG1,FABP12 IMR90 Hi-C 24141950 PAG1 145047 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 87444767 87445117 87444942 Y WWP1 CPNE3 NA NA NA NA CPNE3 49942 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 87484005 87484360 87484214 Y NA CPNE3,SLC2A3P4 NA NA NA NA CPNE3 10699 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 90776453 90776674 90776498 Y OSGIN2,RIPK2 RP11-37B2.1,RIPK2 NA NA NA NA RIPK2 8478 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 92128196 92128480 92128215 Y NA GS1-251I9.4,OTUD6B NA NA NA NA OTUD6B 47772 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 94850724 94850939 94850832 Y GEM PDP1 NA NA NA NA PDP1 17096 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 95271404 95271652 95271620 Y GEM GEM NA NA NA NA GEM 926 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 95896385 95896691 95896542 Y NA CCNE2 NA NA NA NA CCNE2 10215 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 95974189 95974483 95974287 Y TP53INP1 TP53INP1 C8orf69 IMR90 Hi-C 24141950 TP53INP1 14550 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 96129740 96130058 96129951 Y PLEKHF2 PLEKHF2 PLEKHF2,C8orf38,C8orf69,C8orf37,MIR3150B,MIR3150A MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PLEKHF2 13974 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 96133166 96133378 96133300 Y PLEKHF2 PLEKHF2 C8orf38,C8orf69,C8orf37,PLEKHF2,MIR3150B,MIR3150A IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHF2 10654 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 97350195 97350563 97350444 Y NA NA NA NA NA NA PTDSS1 78252 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 97410655 97411012 97410831 Y NA NA CPQ,TSPYL5,PTDSS1 IMR90 Hi-C 24141950 SDC2 92567 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 101731045 101731633 101731441 Y NA PABPC1 NA NA NA NA PABPC1 1404 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr8 101894360 101894526 101894414 Y ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ NA YWHAZ,ZNF706 IMR90 Hi-C 24141950 YWHAZ 69090 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 101920723 101921107 101920870 Y NA YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 42509 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr8 102038562 102039020 102038731 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 74946 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 102103047 102103317 102103255 Y YWHAZ NA NA NA NA NA ZNF706 113104 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 102110720 102110996 102110973 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA FLJ42969 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF706 105425 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 102120764 102121998 102120921 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA YWHAZ,FLJ42969,ZNF706 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF706 94423 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr8 102513804 102514123 102513992 Y NA NA NA NA NA NA NACAP1 141782 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 103422542 103423104 103422992 Y NA NA NA NA NA NA UBR5 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 103486772 103487100 103486937 Y NA NA ODF1 IMR90 Hi-C 24141950 UBR5 63703 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 103549220 103549421 103549330 Y NA NA UBR5,ODF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF10 116709 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chr8 103669513 103669869 103669680 Y AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10 KLF10 NA NA NA NA KLF10 3383 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr8 103669922 103670289 103670129 Y ATP6V1C1,KLF10,KLF10 KLF10 NA NA NA NA KLF10 3792 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 103740665 103741062 103740742 Y NA NA KLF10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF10 74535 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 103741796 103742226 103742065 Y NA NA KLF10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF10 75666 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr8 103757592 103757997 103757773 Y NA NA KLF10,UBR5 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF10 91462 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 103801151 103801773 103801337 Y NA NA KLF10,UBR5,ODF1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KB-1507C5.2 72755 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr8 103858397 103858789 103858587 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 NA NA NA NA KB-1507C5.2 15739 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 103918538 103918841 103918687 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 ATP6V1C1,AZIN1 IMR90 Hi-C 24141950 AZIN1 14446 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 103922083 103922307 103922186 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 AZIN1 IMR90 Hi-C 24141950 AZIN1 17991 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 103933096 103933543 103933196 Y NA AZIN1 AZIN1,ATP6V1C1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AZIN1 29004 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 104043647 104043928 104043793 Y KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1 ATP6V1C1 NA NA NA NA ATP6V1C1 12356 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 104059632 104059708 104059689 Y NA ATP6V1C1 NA NA NA NA ATP6V1C1 28341 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 104117409 104117806 104117725 Y KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1,SLC25A32 BAALC FZD6,BAALC,SLC25A32,LOC100499183,ATP6V1C1,C8orf56,DCAF13,RIMS2,CTHRC1 IMR90 Hi-C 24141950 BAALC 33132 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 104121309 104121576 104121444 Y KLF10,KLF10,ATP6V1C1,BAALC BAALC BAALC,FZD6,CTHRC1,RIMS2 IMR90 Hi-C 24141950 BAALC 29362 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 105290785 105291073 105290860 Y LRP12 NA RIMS2 IMR90 Hi-C 24141950 LRP12 308179 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 105487204 105487256 105487230 Y NA NA NA NA NA NA LRP12 111996 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 105523001 105523289 105523222 Y NA NA NA NA NA NA LRP12 75963 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 105598029 105598284 105598149 Y TM7SF4,LRP12 LRP12 NA NA NA NA LRP12 968 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 105655226 105655568 105655399 Y TM7SF4,LRP12 NA LRP12 IMR90 Hi-C 24141950 LRP12 55974 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 105677496 105678173 105677683 Y TM7SF4,LRP12 NA LRP12 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRP12 78244 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 106582164 106582354 106582260 Y NA NA NA NA NA NA ZFPM2 253244 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 106764019 106764032 106764026 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152P17.2 306720 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr8 106878097 106878155 106878126 Y NA NA OXR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-152P17.2 192597 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 107054607 107054687 107054647 Y OXR1 RP11-152P17.2 OXR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-152P17.2 16065 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 107603836 107604153 107603995 Y NA NA NA NA NA NA TAGLN2P1 104088 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 107614798 107614912 107614855 Y OXR1,OXR1 NA NA NA NA NA TAGLN2P1 93329 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 107740443 107740789 107740616 Y NA TAGLN2P1 NA NA NA NA TAGLN2P1 32202 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 108235435 108235863 108235712 Y NA NA ANGPT1 IMR90 Hi-C 24141950 ANGPT1 272420 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 108314571 108314619 108314595 Y NA NA NA NA NA NA ANGPT1 193664 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 108317294 108317670 108317585 Y NA NA NA NA NA NA ANGPT1 190613 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 108452941 108453080 108453009 Y NA NA NA NA NA NA ANGPT1 55203 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr8 108508143 108508403 108508294 Y ANGPT1 NA NA NA NA NA ANGPT1 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 108508665 108508809 108508737 Y NA ANGPT1 NA NA NA NA ANGPT1 382 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 109132004 109132262 109132106 Y NA RSPO2 NA NA NA NA RSPO2 38091 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 109222483 109222836 109222544 Y NA NA NA NA NA NA RSPO2 128570 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 109455148 109455290 109455182 Y NA EIF3E NA NA NA NA EIF3E 9586 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 109647939 109647957 109647950 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 202377 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 114266349 114266595 114266472 Y NA NA NA NA NA NA RP11-709P2.1 120303 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 116068457 116069128 116068655 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 750771 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 116463689 116463880 116463766 Y TRPS1 NA NA NA NA NA TRPS1 356019 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 116756032 116756330 116756181 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 63569 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 117456775 117457003 117456919 Y NA RP11-536K17.1 TRPS1,LINC00536 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-536K17.1 42780 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 117529764 117530094 117529930 Y C8orf85 NA NA NA NA NA RP11-536K17.1 115769 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 117711370 117711748 117711590 Y NA NA NA NA NA NA UTP23 64994 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 117883999 117884137 117884073 Y UTP23,RAD21 MIR3610,RAD21 NA NA NA NA MIR3610 902 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 118743302 118743393 118743321 Y NA NA EXT1,MED30,SAMD12 IMR90 Hi-C 24141950 MED30 212350 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 118776615 118776789 118776702 Y NA NA MED30,EXT1,SAMD12 IMR90 Hi-C 24141950 MED30 245663 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 118801002 118801354 118801210 Y NA NA NA NA NA NA MED30 270050 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 118859857 118860327 118860104 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 261765 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 118958698 118959000 118958912 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 163092 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 119023512 119024035 119023740 Y EXT1 NA NA NA NA NA EXT1 98057 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 119047899 119048328 119048216 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 73764 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 119068312 119068746 119068717 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 53346 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 119345117 119345386 119345219 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 223025 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 119485123 119485454 119485409 Y NA NA NA NA NA NA SAMD12 146780 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr8 120656261 120656532 120656398 Y NA ENPP2 ENPP2 IMR90 Hi-C 24141950 ENPP2 27161 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 121574734 121575043 121574888 Y NA NA NA NA NA NA MRPL13 119092 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 121822442 121823157 121823030 Y NA SNTB1 NA NA NA NA SNTB1 356 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 122157265 122157468 122157378 Y NA NA NA NA NA NA SNTB1 333752 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 122176324 122176668 122176537 Y NA NA HAS2 IMR90 Hi-C 24141950 SNTB1 352811 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 124179869 124179997 124179932 Y NA NA NA NA NA NA C8orf76 71641 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 124248679 124249062 124248866 Y NA C8orf76,ZHX1 NA NA NA NA C8orf76 2576 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 124524433 124524792 124524749 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 26654 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 124529265 124529734 124529486 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 21712 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 124549741 124550229 124550044 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 1217 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 124552481 124552488 124552485 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 1035 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 124645197 124645433 124645315 Y NA NA NA NA NA NA FBXO32 93751 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 124665857 124666229 124666132 Y NA NA NA NA NA NA FAM91A1 112467 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr8 124934433 124934622 124934528 Y NA NA NA NA NA NA FAM91A1 155737 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 125193673 125194016 125193878 Y NA ARF1P3 TMEM65,FER1L6,FER1L6-AS1,FAM91A1,TRMT12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARF1P3 31509 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 125275002 125275221 125275161 Y RNF139 NA FER1L6,FER1L6-AS1,TMEM65,FAM91A1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM65 107712 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 125302460 125302812 125302637 Y TMEM65,RNF139 NA NA NA NA NA TMEM65 80121 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 125698372 125698715 125698641 Y NA NA NA NA NA NA RP11-1082L8.4 127209 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 126193275 126193543 126193371 Y NA NA TRIB1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0196 91193 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 126231490 126231859 126231657 Y MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 129408 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr8 126238973 126239274 126239019 Y NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 136891 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 126286229 126286368 126286299 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 154195 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 126290719 126290948 126290836 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 149615 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.3840150776847 chr8 126335524 126335526 126335525 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 105037 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 126399593 126399657 126399625 Y NA TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 40906 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 126441416 126441734 126441625 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 853 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr8 126446642 126447323 126446973 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 6079 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 126451967 126452238 126452064 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 11404 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 126452500 126452812 126452633 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 11937 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 126525260 126525748 126525427 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 84697 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 126649729 126649959 126649891 Y TRIB1 NA NSMCE2,KIAA0196,TRIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 209166 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 127837362 127837443 127837401 Y FAM84B NA PVT1,MYC,LOC727677 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM84B 268724 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 128099457 128099542 128099514 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 129791 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 128306934 128307283 128307196 Y MYC NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 77601 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 128519696 128520090 128519909 Y NA NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 225590 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 128680816 128681380 128681307 Y MYC NA MYC,PVT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 MYC 64300 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 128772812 128773062 128772941 Y NA MYC,PVT1 NA NA NA NA MYC 27132 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr8 128822019 128822203 128822035 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 17240 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 128835085 128835527 128835341 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 30306 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 128843918 128844302 128844002 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 39139 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 128865187 128865467 128865327 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 60408 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 128888391 128888698 128888485 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 83612 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 128923296 128923609 128923453 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 97248 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 129036981 129037022 129036995 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 16124 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 129115789 129116244 129116059 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 94932 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 129188825 129189407 129189075 Y NA NA MYC,PVT1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-25P 167968 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 129569050 129569202 129569118 Y NA NA MYC,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 548193 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr8 130897837 130898360 130898140 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 129015 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 130907129 130907396 130907263 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 119979 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 130983929 130984348 130984047 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 43027 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 130996669 130996803 130996748 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 30572 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 130997889 130997894 130997892 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 29481 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 131012344 131012436 131012358 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 14939 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 131024148 131024528 131024501 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 2847 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 131054431 131054834 131054758 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 27056 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 131114299 131114376 131114317 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 86924 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 131218440 131218995 131218822 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 191065 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 131260848 131261137 131260957 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 192769 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 131271304 131271556 131271460 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 182350 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 131271729 131272058 131271952 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 181848 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 131289962 131290145 131290029 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 163761 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 131354482 131354860 131354810 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 99046 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 131364558 131364729 131364627 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 89177 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 131456841 131457348 131457080 Y NA ASAP1 NA NA NA NA ASAP1 2935 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 132828459 132829599 132829218 Y EFR3A NA ADCY8 IMR90 Hi-C 24141950 EFR3A 84736 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 132868655 132869774 132869195 Y EFR3A EFR3A ADCY8 IMR90 Hi-C 24141950 EFR3A 44561 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 133562041 133562364 133562205 Y HHLA1,KCNQ3,KCNQ3 NA NA NA NA NA TMEM71 208594 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 134103972 134104984 134104568 Y ST3GAL1,TG,SLA NA NA NA NA NA WISP1 96298 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 134118212 134118588 134118377 Y NA NA NA NA NA NA WISP1 82694 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 134143122 134143607 134143263 Y ST3GAL1,NDRG1,PHF20L1 NA NA NA NA NA WISP1 57675 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 134206657 134207025 134206839 Y NA WISP1 NA NA NA NA WISP1 5375 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 134230111 134230161 134230154 Y ST3GAL1 WISP1 NA NA NA NA WISP1 28829 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 134233745 134234256 134234169 Y NA WISP1 NA NA NA NA WISP1 32463 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 134315401 134315895 134315622 Y ST3GAL1 NDRG1,CTC-458A3.1 TG,NDRG1,ST3GAL1 IMR90 Hi-C 24141950 NDRG1 3136 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 134368494 134368766 134368633 Y NDRG1 CTC-458A3.1,ST13P6 WISP1,NDRG1,TG,ST3GAL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTC-458A3.1 32254 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 134453521 134453599 134453592 Y SLA ST13P6 NA NA NA NA ST13P6 35272 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr8 134513057 134513519 134513217 Y SLA,ST3GAL1 NA NA NA NA NA ST3GAL1 68664 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 134552406 134552812 134552641 Y ST3GAL1 ST3GAL1 NA NA NA NA ST3GAL1 29371 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 134572976 134573374 134573175 Y ST3GAL1 ST3GAL1 NA NA NA NA ST3GAL1 8809 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 134580779 134581429 134580915 Y ST3GAL1 ST3GAL1 NA NA NA NA ST3GAL1 754 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 134592913 134593176 134593079 Y ST3GAL1 ST3GAL1 ST3GAL1,ZFAT IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL1 10730 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 135842490 135842788 135842753 Y NA NA ZFAT IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFAT 119198 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 135843585 135843751 135843688 Y ZFAT NA ZFAT,MIR30D,MIR30B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFAT 120293 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr8 136587606 136587905 136587756 Y NA NA NA NA NA NA KHDRBS3 119906 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 141172181 141172567 141172375 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 294111 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 141189770 141190115 141189943 Y TRAPPC9,TRAPPC9 NA NA NA NA NA TRAPPC9 276563 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 141598802 141599709 141599120 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 79405 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 141707505 141707982 141707957 Y NA NA NA NA NA NA CHRAC1 188108 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 141886994 141887102 141887066 Y PTK2 NA NA NA NA NA PTK2 123213 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 141972530 141972881 141972765 Y NA PTK2 NA NA NA NA PTK2 37434 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 142550661 142551112 142550824 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPA1P38 83486 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 143696778 143697162 143696893 Y NA ARC NA NA NA NA ARC 1945 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 143757526 143757895 143757616 Y NA PSCA,JRK,LY6K NA NA NA NA JRK 3491 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 143897219 143897551 143897306 Y LY6E,GLI4 NA LY6D,LYNX1,PSCA,JRK,C8orf55,LOC100288181,SLURP1,LY6E,LOC100133669 MCF7 ChIA-PET 22265404 LY6K 117690 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 144094701 144094997 144094860 Y LY6K,C8orf55 LY6E,RP11-273G15.2,C8orf31 NA NA NA NA LY6E 2402 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 144302525 144302816 144302585 Y LY6H,LY6H,LY6H ZFP41,GLI4 NA NA NA NA ZFP41 24464 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 144360422 144361034 144360946 Y ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696 NA NA NA NA RP13-582O9.5 826 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr8 144629463 144629732 144629564 Y SPATC1,GRINA ZC3H3,GSDMD,TIGD5,EEF1D NA NA NA NA GSDMD 3645 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr8 145022492 145023108 145022824 Y PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 25794 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr8 145025737 145026802 145026365 Y ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10 PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 22100 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr8 145040615 145041072 145040959 Y GSDMD,EEF1D,PARP10 PLEC,GRINA,PARP10 NA NA NA NA PLEC 7830 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 145070098 145070262 145070188 Y NA PLEC,GRINA,PARP10,OPLAH NA NA NA NA GRINA 7872 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 145088816 145089042 145088955 Y PLEC,GRINA,SPATC1 PLEC,GRINA,PARP10,OPLAH,EXOSC4,CTD-3065J16.9,GPAA1 NA NA NA NA PARP10 3876 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 145549095 145549459 145549304 Y NA BOP1,HSF1,DGAT1,FBXL6,ADCK5 NA NA NA NA DGAT1 522 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 145995593 145996127 145996081 Y COMMD5,COMMD5,COMMD5,ZNF34 ZNF251,ZNF34,RPL8 NA NA NA NA ZNF34 14603 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 146010487 146010786 146010731 Y NA ZNF251,RPL8,ZNF7 NA NA NA NA ZNF34 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr8 146125688 146125902 146125777 Y ZNF250 COMMD5,ZNF250,ZNF16 NA NA NA NA ZNF250 135 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 545729 545758 545741 Y NA NA NA NA NA NA KANK1 77438 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 621241 622073 621461 Y DOCK8,C9orf66,KANK1 NA NA NA NA NA KANK1 152950 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 708345 708423 708359 Y KANK1 NA NA NA NA NA KANK1 240054 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 755797 756516 755921 Y NA NA NA NA NA NA KANK1 287506 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 758228 758480 758338 Y KANK1 NA NA NA NA NA KANK1 289937 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 762342 762602 762461 Y KANK1 NA NA NA NA NA KANK1 294051 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 972038 972418 972053 Y NA NA NA NA NA NA KANK1 503747 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 2875811 2876206 2875956 Y NA KIAA0020 NA NA NA NA KIAA0020 33570 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 3879857 3880094 3879976 Y NA NA NA NA NA NA RP11-509J21.1 355134 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 4042913 4043209 4043135 Y NA NA NA NA NA NA GLIS3 303183 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 4137159 4137519 4137339 Y NA NA NA NA NA NA GLIS3 208873 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 4530559 4530733 4530650 Y NA SLC1A1 NA NA NA NA SLC1A1 42115 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 4656742 4656927 4656747 Y PPAPDC2,CDC37L1,C9orf68 PPAPDC2,CDC37L1 NA NA NA NA PPAPDC2 3371 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 4738592 4738723 4738708 Y NA AK3 NA NA NA NA AK3 1320 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 5269155 5269233 5269193 Y NA NA C9orf46 IMR90 Hi-C 24141950 CD274 179270 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 5509549 5510003 5509837 Y C9orf46,CD274,PDCD1LG2 PDCD1LG2 NA NA NA NA PDCD1LG2 1004 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 5627107 5627559 5627241 Y CD274,RANBP6,KIAA2026,KIAA1432 KIAA1432 NA NA NA NA KIAA1432 82 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 5901129 5901190 5901160 Y NA NA NA NA NA NA ERMP1 70012 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 6488249 6488567 6488283 Y NA NA NA NA NA NA UHRF2 77098 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 6680895 6681975 6681336 Y UHRF2,KDM4C RP11-106A1.2,KDM4C KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 36888 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr9 7320258 7320407 7320333 Y NA NA NA NA NA NA RPL4P5 155913 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 12699213 12699340 12699226 Y TYRP1 NA NA NA NA NA RP11-3L8.3 113004 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 12784417 12784967 12784682 Y C9orf150 RP11-3L8.3 NA NA NA NA RP11-3L8.3 27377 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 14229495 14229796 14229646 Y NA NA NA NA NA NA NFIB 167186 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 14322295 14322910 14322674 Y ZDHHC21,NFIB NA NA NA NA NA NFIB 74072 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr9 15306066 15306408 15306119 Y NA TTC39B NA NA NA NA TTC39B 708 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 16985936 16986021 16986007 Y NA NA BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 BNC2 117095 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 17018101 17018829 17018153 Y NA NA C9orf93,BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 CNTLN 114151 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 17520540 17520838 17520658 Y NA NA NA NA NA NA CNTLN 387560 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 18490587 18490949 18490797 Y ADAMTSL1 NA NA NA NA NA RP11-296P7.4 533941 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 18718417 18718817 18718751 Y NA NA NA NA NA NA RP11-296P7.4 306073 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr9 21576231 21576644 21576439 Y NA MIR31HG MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MIR31HG 18563 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 21695810 21696232 21696052 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 104310 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 21696521 21696698 21696606 Y IFNA6,IFNA1 NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 103844 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 21696721 21697113 21696912 Y IFNA8 NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 103429 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 21699320 21699393 21699347 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 101149 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 21832056 21832478 21832164 Y NA MTAP NA NA NA NA MTAP 31514 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 21836477 21836868 21836612 Y NA MTAP NA NA NA NA MTAP 35935 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr9 21996110 21996456 21996153 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 2810 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 21996542 21996712 21996656 Y MTAP,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2B CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 3242 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 22103396 22103678 22103511 Y MTAP,CDKN2A,CDKN2B NA NA NA NA NA UBA52P6 93242 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 22216803 22217265 22216812 Y NA NA CDKN2B,CDKN2B-AS1,MTAP,MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 UBA52P6 206649 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.988582198346214 chr9 27155069 27155179 27155099 Y TEK NA NA NA NA NA PLAA 209608 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr9 27518919 27519184 27519052 Y NA MOB3B NA NA NA NA MOB3B 8595 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 27586293 27586753 27586494 Y C9orf72,C9orf72 C9orf72 NA NA NA NA C9orf72 14429 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 32461734 32461764 32461747 Y DDX58 NA NA NA NA NA DDX58 62558 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 32535412 32535514 32535462 Y NA DDX58,TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 11090 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 33028063 33028460 33028077 Y NA APTX,DNAJA1,SMU1 NA NA NA NA DNAJA1 4854 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 33160944 33161390 33161236 Y DNAJA1,SMU1,B4GALT1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 3964 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr9 33165457 33166051 33165900 Y DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 103 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 33329062 33329543 33329355 Y NA NFX1 NA NA NA NA NFX1 40553 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 33350411 33350624 33350531 Y NA NA NA NA NA NA NFX1 61902 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 33942829 33943199 33943013 Y NA NA NA NA NA NA UBAP2 103748 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 34158490 34158839 34158617 Y NA DCAF12,UBAP1 DCAF12,UBAP1,KIF24,NUDT2,PRSS3,UBAP2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBAP1 18164 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 34681857 34682174 34682025 Y ARID3C,IL11RA,IL11RA SIGMAR1,GALT,IL11RA,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5 NA NA NA NA RP11-195F19.5 17748 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr9 35114116 35114547 35114222 Y DNAJB5,KIAA1539 VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B NA NA NA NA FAM214B 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 35490989 35491345 35491127 Y NA RUSC2 NA NA NA NA RUSC2 2865 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 35518041 35518590 35518314 Y CREB3,VCP,STOML2,RUSC2 RUSC2 NA NA NA NA RUSC2 29917 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr9 35520478 35520852 35520494 Y NA RUSC2 NA NA NA NA RUSC2 32354 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.08744041818084 chr9 35603992 35604628 35604112 Y TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2 TESK1 NA NA NA NA TESK1 625 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.18629863801546 chr9 35726275 35726587 35726326 Y NA TPM2,CREB3,TLN1,RGP1,GBA2 NA NA NA NA CREB3 3745 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 35924357 35924707 35924422 Y NA HRCT1,YBX1P10 NA NA NA NA HRCT1 20168 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 35971862 35972364 35972237 Y NA YBX1P10 C9orf128,HRCT1,LOC158376,FP588,RECK IMR90 Hi-C 24141950 YBX1P10 1547 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 36232002 36232125 36232063 Y GNE CLTA,GNE NA NA NA NA GNE 42928 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 36232965 36233105 36233040 Y NA CLTA,GNE NA NA NA NA GNE 41948 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr9 36471008 36471193 36471156 Y NA RNF38 RNF38,MELK IMR90 Hi-C 24141950 RNF38 14352 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 36731654 36731802 36731717 Y NA NA MELK IMR90 Hi-C 24141950 MELK 160795 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 36924974 36925090 36925030 Y MELK NA NA NA NA NA ZCCHC7 193446 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 37773119 37773290 37773253 Y FRMPD1 DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA DCAF10 25209 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 37835930 37836292 37836154 Y NA DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA EXOSC3 36496 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 38066980 38067628 38067261 Y SHB RP11-613M10.9 NA NA NA NA SHB 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 38437570 38437747 38437611 Y NA ALDH1B1 TOMM5,IGFBPL1,ALDH1B1 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1B1 46909 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 68419808 68420298 68419990 Y NA NA NA NA NA NA PGM5 2520926 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 71728196 71728449 71728285 Y NA TJP2 NA NA NA NA TJP2 5760 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 73021440 73021667 73021582 Y NA KLF9 NA NA NA NA KLF9 5873 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 73025885 73026723 73026293 Y KLF9 KLF9 NA NA NA NA KLF9 817 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE T98G hg19 FANTOM5 2.57031371570016 chr9 73035561 73035945 73035863 Y KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8021 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.3840150776847 chr9 73100288 73100509 73100429 Y KLF9 NA SMC5,KLF9,TRPM3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF9 72748 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 73178748 73179070 73178790 Y SMC5 NA NA NA NA NA KLF9 151208 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr9 73215942 73217043 73216172 Y KLF9 NA NA NA NA NA KLF9 188402 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.48287329751932 chr9 73701762 73702162 73701962 Y TRPM3 NA NA NA NA NA RPL35AP21 500355 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 74293239 74293379 74293310 Y TMEM2 NA NA NA NA NA RPL35AP21 90722 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 74371995 74372048 74372016 Y NA NA NA NA NA NA TMEM2 57558 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 75747117 75747734 75747349 Y ANXA1 ANXA1 ANXA1 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA1 16939 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.28515685785008 chr9 79257487 79257560 79257491 Y NA NA NA NA NA NA AL161626.1 72756 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 79383801 79384093 79383990 Y PRUNE2 NA NA NA NA NA PRUNE2 134910 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 80911003 80911373 80911119 Y PSAT1 PSAT1 NA NA NA NA PSAT1 944 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr9 82185317 82185693 82185378 Y NA TLE4 NA NA NA NA TLE4 629 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 82213229 82213622 82213243 Y NA TLE4 NA NA NA NA TLE4 28541 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 83412048 83412181 83412140 Y NA NA NA NA NA NA TLE1 890039 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 87466967 87467081 87467024 Y NA NA NA NA NA NA SLC28A3 513295 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 89626902 89626982 89626949 Y NA CDC20P1 NA NA NA NA CDC20P1 2335 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr9 89699545 89699882 89699714 Y NA NA NA NA NA NA CDC20P1 74978 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 90326659 90327327 90326985 Y DAPK1,CTSL1 NA CTSL1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-40C6.2 188442 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 90328172 90328868 90328486 Y DAPK1,CTSL1 NA CTSL1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-40C6.2 189955 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 91381840 91381977 91381906 Y NA NA SHC3,MIR4289,LOC286238,SPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 S1PR3 222385 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 91795136 91795669 91795494 Y C9orf47,SHC3 NA NA NA NA NA CKS2 128444 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.28515685785008 chr9 93893646 93894080 93893930 Y NA NA LOC100129316,AUH IMR90 Hi-C 24141950 AUH 228115 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 93955243 93955725 93955362 Y SYK,SYK,NFIL3 NA NA NA NA NA AUH 166470 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 93955991 93956732 93956142 Y NA NA NA NA NA NA AUH 165463 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 94181531 94181930 94181720 Y NFIL3 NFIL3 NA NA NA NA NFIL3 2214 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 95452860 95453088 95452974 Y NA IPPK NA NA NA NA IPPK 22313 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 95845794 95846166 95845981 Y NINJ1,C9orf89 C9orf89,NINJ1 NA NA NA NA C9orf89 10334 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 95878204 95878686 95878424 Y IPPK,PHF2,FAM120A,C9orf89,NINJ1 C9orf89,NINJ1 NA NA NA NA NINJ1 15884 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 95878926 95879215 95879071 Y IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1 C9orf89,NINJ1 NA NA NA NA NINJ1 15355 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 95882095 95882646 95882428 Y IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1 C9orf89,NINJ1 NA NA NA NA NINJ1 11924 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 95894467 95895029 95894875 Y IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1 C9orf89 NA NA NA NA NINJ1 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 96434811 96435085 96434948 Y PHF2 NA NA NA NA NA PHF2 98122 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 96928143 96928630 96928259 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 10486 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 9706 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.889723978511593 chr9 97273853 97274253 97274073 Y NA NA NA NA NA NA HIATL1 139020 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 97590305 97590486 97590422 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 103322 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 97629577 97629759 97629671 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 142594 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 97630074 97630491 97630387 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 143091 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 97684288 97685133 97684708 Y NA NA FANCC IMR90 Hi-C 24141950 C9orf3 197305 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr9 98054647 98055067 98054952 Y NA FANCC NA NA NA NA FANCC 22924 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 98262009 98262267 98262138 Y PTCH1,PTCH1,PTCH1 PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 15072 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 98273818 98274186 98273872 Y NA PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 3153 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 98744078 98744248 98744144 Y NA NA NA NA NA NA LINC00476 107819 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 99106686 99107122 99106995 Y NA SLC35D2 NA NA NA NA SLC35D2 36870 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 99132173 99132333 99132255 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367 NA NA NA NA SLC35D2 11659 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 100985595 100985973 100985751 Y TBC1D2 CORO2A,TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 29942 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr9 100994380 100994637 100994474 Y TBC1D2 CORO2A,TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 21278 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr9 101002580 101002910 101002849 Y C9orf156,NANS,TBC1D2 CORO2A,TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 13005 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 101016338 101016489 101016414 Y NA TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 423 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 101372669 101373069 101372768 Y NA NA NA NA NA NA ANKS6 184178 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 101630117 101630425 101630271 Y NA NA NA NA NA NA GALNT12 62136 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 101868249 101868435 101868378 Y NA TGFBR1 NA NA NA NA TGFBR1 3929 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 104248590 104248780 104248669 Y C9orf125 RNF20 NA NA NA NA RNF20 45353 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 107730510 107730878 107730708 Y SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1 ABCA1 ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA1 41992 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr9 107890213 107890474 107890393 Y ABCA1 NA ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC44A1 114429 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 108058871 108059613 108059363 Y ABCA1,TMEM38B,FSD1L,FSD1L NA NA NA NA NA SLC44A1 53968 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 110310627 110311050 110310826 Y KLF4 NA KLF4 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLF4 59864 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 110512153 110512586 110512216 Y KLF4 NA KLF4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF4 261390 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr9 110811401 110811623 110811540 Y NA NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 KLF4 560638 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 111773643 111773659 111773652 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 150 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 111774521 111775173 111774726 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 712 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chr9 112578765 112579213 112578950 Y PALM2 PALM2-AKAP2,AKAP2 NA NA NA NA AKAP2 37996 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 112730714 112730897 112730789 Y NA NA NA NA NA NA RP11-151F5.2 54741 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 113014576 113014999 113014920 Y AKAP2,TXN TXN NA NA NA NA TXN 1921 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 113413222 113413721 113413633 Y LPAR1 NA LPAR1,KIAA0368,SVEP1,MUSK,OR2K2,DNAJC25-GNG10 IMR90 Hi-C 24141950 LPAR1 385260 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 113515103 113515367 113515167 Y NA NA NA NA NA NA LPAR1 283614 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 114111620 114111657 114111640 Y OR2K2 NA NA NA NA NA KIAA0368 133368 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 114364049 114364191 114364143 Y KIAA0368,GNG10 PTGR1,DNAJC25,DNAJC25-GNG10 NA NA NA NA PTGR1 3914 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 114389379 114389396 114389388 Y NA PTGR1,DNAJC25,DNAJC25-GNG10,GNG10 DNAJC25-GNG10 MCF7 ChIA-PET 22265404 DNAJC25 2236 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 114505631 114505796 114505739 Y NA NA NA NA NA NA GNG10 84016 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 114678571 114678728 114678577 Y NA UGCG NA NA NA NA UGCG 21525 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 114707434 114708001 114707643 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 50388 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 114720285 114720825 114720474 Y UGCG NA C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGCG 63239 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 114774761 114774976 114774762 Y UGCG NA NA NA NA NA UGCG 117715 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 114811444 114811737 114811486 Y UGCG NA NA NA NA NA SUSD1 123951 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 114821548 114821936 114821739 Y GNG10,SUSD1 NA NA NA NA NA SUSD1 113752 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 115071018 115071139 115071076 Y NA PTBP3 NA NA NA NA PTBP3 22808 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 115258728 115258879 115258816 Y SNX30,SUSD1,ROD1 KIAA1958,C9orf147 NA NA NA NA C9orf147 11244 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 115509312 115509740 115509544 Y KIAA1958,ZNF883,ZFP37,SNX30 RP11-276E15.4,SNX30 C9orf80,SNX30,KIAA1958 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-276E15.4 996 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 116036635 116036980 116036798 Y SLC31A2,FKBP15,RGS3 PRPF4,CDC26 NA NA NA NA CDC26 766 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 116341254 116341479 116341362 Y RGS3 NA NA NA NA NA RGS3 136243 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 116648716 116649282 116648886 Y NA ZNF618 NA NA NA NA ZNF618 12154 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 116918999 116919461 116919193 Y NA COL27A1 NA NA NA NA COL27A1 3159 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr9 117077279 117077734 117077603 Y AMBP,ORM2,ORM1 NA NA NA NA NA AKNA 76951 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 117351016 117351370 117351316 Y TNFSF8,AKNA,DFNB31,DFNB31,ATP6V1G1 ATP6V1G1,C9orf91 NA NA NA NA ATP6V1G1 2990 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 117647197 117647589 117647272 Y ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8 NA NA NA NA NA TNC 230947 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 117657108 117657611 117657338 Y DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8 NA NA NA NA NA TNC 220925 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 118358577 118359027 118358666 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 480041 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 118367467 118367735 118367565 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 488931 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 118378080 118378500 118378342 Y NA NA PAPPA,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 499544 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 118430899 118431573 118430988 Y NA NA PAPPA,ASTN2,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 482510 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 118434933 118435213 118435118 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 478870 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr9 118435271 118435690 118435488 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 478393 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 118453042 118453852 118453530 Y NA NA PAPPA,ASTN2,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 460231 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 118706424 118707025 118706637 Y NA NA ASTN2,LINC00474,PAPPA IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 207058 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 119055041 119055304 119055148 Y PAPPA NA NA NA NA NA PAPPA 140958 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 119084686 119084813 119084781 Y NA NA NA NA NA NA PAPPA 170603 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 120487715 120488143 120488025 Y TLR4 TLR4 NA NA NA NA TLR4 23105 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 123346430 123346633 123346540 Y TRAF1 CDK5RAP2 CDK5RAP2 K562 ChIA-PET 22265404 CDK5RAP2 5982 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 123393159 123393348 123393336 Y TRAF1,MEGF9 NA NA NA NA NA CDK5RAP2 52711 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 123455501 123455738 123455670 Y NA MEGF9 NA NA NA NA MEGF9 19010 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 123478444 123478636 123478538 Y NA MEGF9 NA NA NA NA MEGF9 3696 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 123653794 123654121 123654065 Y NA PHF19,TRAF1 NA NA NA NA PHF19 16188 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 123681389 123681583 123681539 Y NA PHF19,TRAF1 NA NA NA NA TRAF1 7868 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 123877856 123878087 123877972 Y NA CNTRL NA NA NA NA CNTRL 42715 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 123878647 123878673 123878659 Y NA CNTRL NA NA NA NA CNTRL 43506 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 124031340 124031517 124031432 Y GSN RAB14 NA NA NA NA RAB14 48048 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr9 124034360 124034626 124034492 Y GSN NA NA NA NA NA RAB14 51068 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 124040831 124041134 124040970 Y GSN NA NA NA NA NA RAB14 57539 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 124161523 124161647 124161545 Y NA STOM GSN,RAB14,GGTA1P,CNTRL,STOM IMR90 Hi-C 24141950 STOM 30992 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 124318942 124319249 124319097 Y NA DAB2IP DAB2IP,TTLL11,MIR4478 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2IP 8087 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 125578475 125578645 125578596 Y NA PDCL NA NA NA NA PDCL 10265 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 125811144 125811514 125811213 Y NA NA MIR600HG IMR90 Hi-C 24141950 RABGAP1 110032 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 126003896 126004111 126004004 Y NA STRBP NA NA NA NA STRBP 24744 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 127018843 127019044 127018944 Y NA NEK6 NA NA NA NA NEK6 958 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 127040505 127040685 127040582 Y NEK6,NEK6 NEK6 NA NA NA NA NEK6 22620 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 127059883 127060148 127059983 Y NA NEK6 NA NA NA NA NEK6 41998 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 127110676 127110867 127110772 Y NA NA NA NA NA NA PSMB7 64856 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 127161847 127162149 127162003 Y NA PSMB7 NA NA NA NA PSMB7 13574 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 127424345 127424738 127424542 Y NA MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 5599 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 127433186 127433516 127433351 Y NR6A1 MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 14440 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 127519728 127520109 127519909 Y NA NR6A1,OLFML2A NA NA NA NA NR6A1 11480 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 127944437 127944756 127944696 Y NR6A1,GOLGA1,PPP6C,GAPVD1 SCAI,PPP6C,RABEPK NA NA NA NA PPP6C 5462 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 127980597 127980978 127980790 Y NA PPP6C,RABEPK,HSPA5,RP11-65N13.8,GAPVD1 NA NA NA NA RABEPK 19776 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 129484571 129485188 129484881 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB43 80097 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 129485609 129485808 129485757 Y FAM125B,ZBTB34 NA NA NA NA NA ZBTB43 79477 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 130281582 130281994 130281773 Y TOR2A,SH2D3C,FAM129B,CDK9 NA NA NA NA NA FAM129B 57274 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 130319753 130319894 130319823 Y ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,FPGS,FPGS,FAM129B FAM129B NA NA NA NA FAM129B 19374 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 130329548 130329691 130329605 Y PTRH1,FPGS,FPGS,ENG,CDK9,FAM129B,FAM129B FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 9577 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr9 130718218 130718307 130718248 Y NA ST6GALNAC4,PIP5KL1,DPM2,FAM102A NA NA NA NA DPM2 19455 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 130764123 130764312 130764223 Y FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS FAM102A FAM102A,DPM2,PIP5KL1,SLC25A25,NAIF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM102A 23331 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 131908135 131908616 131908494 Y METTL11A PPP2R4,CRAT,IER5L NA NA NA NA IER5L 29924 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 131929415 131929566 131929473 Y METTL11A,C9orf106 IER5L NA NA NA NA IER5L 8974 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chr9 131930457 131930532 131930510 Y PRRX2 IER5L NA NA NA NA IER5L 8008 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 131936354 131936600 131936398 Y METTL11A,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4 IER5L NA NA NA NA IER5L 1940 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 67404 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chr9 132220495 132220692 132220545 Y FAM73B,USP20,USP20,C9orf78,ASB6 LINC00963 PPP2R4,CRAT,ASB6,METTL11A,IER5L,C9orf106,C9orf50,LOC100506190 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 23038 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 132223086 132223659 132223410 Y C9orf106,TOR1B LINC00963 PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106,C9orf50,METTL11A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 20071 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 132257886 132258547 132258348 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 14156 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 132319720 132320056 132319894 Y DOLPP1 NA FAM73B,DOLPP1,IER5L,LOC100506190,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 75990 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 132330921 132331424 132331168 Y IER5L,C9orf50 NA FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB6 71020 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 132949592 132949704 132949653 Y C9orf78 NCS1 NA NA NA NA NCS1 16735 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 133565449 133565699 133565571 Y NA RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1 NA NA NA NA EXOSC2 1409 CAGE T98G hg19 FANTOM5 13.6424343371778 chr9 133565926 133566149 133566038 Y NA RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1 NA NA NA NA EXOSC2 959 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr9 133736245 133736518 133736410 Y ABL1 NA NA NA NA NA FIBCD1 76155 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 134131602 134132161 134131829 Y RAPGEF1,PRRC2B,QRFP,NUP214,FAM78A PPAPDC3 NA NA NA NA PPAPDC3 30920 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.28515685785008 chr9 134953880 134954115 134953996 Y MED27 MED27 NA NA NA NA MED27 585 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 135226317 135226646 135226576 Y NA SETX NA NA NA NA SETX 1726 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 136009131 136009458 136009277 Y GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS RALGDS NA NA NA NA RALGDS 27843 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 136856624 136856782 136856656 Y VAV2 VAV2,LINC00094 NA NA NA NA VAV2 898 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 137367331 137367474 137367390 Y COL5A1 NA COL5A1 IMR90 Hi-C 24141950 RXRA 160387 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 137394714 137394986 137394879 Y NA NA COL5A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A1 136634 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 137535299 137535511 137535433 Y COL5A1 COL5A1 NA NA NA NA COL5A1 3679 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr9 137536549 137536868 137536739 Y COL5A1 COL5A1 NA NA NA NA COL5A1 4929 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.58173151735394 chr9 138884665 138885093 138884961 Y NA UBAC1 NA NA NA NA UBAC1 33439 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 139136338 139136616 139136467 Y QSOX2 QSOX2 NA NA NA NA QSOX2 651 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 139445894 139446087 139445949 Y SEC16A,NOTCH1 NOTCH1,RP11-611D20.2 MIR4674,NOTCH1 K562 ChIA-PET 22265404 RP11-611D20.2 7230 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chr9 139613892 139613944 139613895 Y NA AGPAT2,SNHG7 NA NA NA NA SNHG7 6692 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 139826661 139826850 139826762 Y NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2 FBXW5 NA NA NA NA FBXW5 10298 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7,MIR3621 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE T98G hg19 FANTOM5 6.72235894875426 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 15308 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.48287329751932 chr9 140134697 140134985 140134927 Y C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3 TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 1032 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chr9 140190695 140190800 140190760 Y NA NRARP NA NA NA NA NRARP 3903 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chr9 140306093 140306345 140306289 Y NRARP EXD3,NOXA1 NA NA NA NA EXD3 9369 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 3102520 3102927 3102578 Y NA NA CXorf28 IMR90 Hi-C 24141950 ARSE 218234 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 3263317 3263504 3263415 Y NA NA NA NA NA NA PRKX 366145 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 3437014 3437322 3437139 Y ARSF,MXRA5 NA ARSF IMR90 Hi-C 24141950 PRKX 192327 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 3732842 3733263 3733002 Y PRKX NA NA NA NA NA PRKX 103193 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chrX 3870962 3871082 3871022 Y NA NA NA NA NA NA PRKX 241313 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 9433838 9434425 9434365 Y TBL1X TBL1X NA NA NA NA TBL1X 4503 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 9786668 9786951 9786810 Y NA SHROOM2,RP11-98L4.1 NA NA NA NA RP11-98L4.1 1159 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 9896256 9896650 9896356 Y NA NA NA NA NA NA WWC3 84952 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 10586151 10586408 10586285 Y NA NA NA NA NA NA MID1 263365 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 10712546 10712862 10712704 Y NA NA NA NA NA NA MID1 136911 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 12228582 12228906 12228588 Y NA NA NA NA NA NA MSL3 454304 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chrX 12972600 12972806 12972677 Y NA TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 18421 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 13128879 13129151 13129129 Y NA NA TMSB4X MCF7 ChIA-PET 22265404 TMSB4X 137652 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 13711501 13711681 13711616 Y ATXN3L,RAB9A TCEANC,RAB9A,TRAPPC2,OFD1 NA NA NA NA RAB9A 6257 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 14262210 14262757 14262259 Y NA NA NA NA NA NA GEMIN8 216198 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chrX 14917883 14918076 14917977 Y PIGA,MOSPD2,MOSPD2 FANCB,MOSPD2 NA NA NA NA MOSPD2 28320 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 15383040 15383106 15383043 Y NA PIGA NA NA NA NA PIGA 31364 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 15769418 15769925 15769650 Y PIGA,CA5B,ZRSR2 ZRSR2 NA NA NA NA ZRSR2 36670 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chrX 15965843 15966073 15966050 Y NA NA CTPS2 IMR90 Hi-C 24141950 AP1S2 94789 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 18693104 18693424 18693141 Y PHKA2,CDKL5 NA NA NA NA NA CDKL5 251401 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 18904504 18904672 18904535 Y NA NA NA NA NA NA PHKA2 96044 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 18904688 18905149 18904995 Y PHKA2 NA NA NA NA NA PHKA2 95567 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 19893071 19893438 19893374 Y NA SH3KBP1 NA NA NA NA SH3KBP1 10281 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 20283183 20283718 20283506 Y SH3KBP1,RPS6KA3 NA NA NA NA NA RPS6KA3 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 21945015 21945333 21945248 Y NA SMS SMS,MBTPS2 IMR90 Hi-C 24141950 SMS 11358 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chrX 22708356 22708573 22708502 Y NA NA NA NA NA NA SMS 751665 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 23800091 23800377 23800148 Y NA ACOT9,SAT1 NA NA NA NA SAT1 801 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chrX 24027801 24028121 24027962 Y NA EIF2S3 NA NA NA NA EIF2S3 42712 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 25664451 25664736 25664645 Y MAGEB18 NA NA NA NA NA POLA1 954415 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 30319869 30320142 30320108 Y NA NA NA NA NA NA FTLP2 326273 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 36981340 36981727 36981708 Y PRRG1,PRRG1 NA NA NA NA NA PRRG1 224801 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 39612631 39612800 39612742 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 32590 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 39646201 39646652 39646229 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 811 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chrX 39871700 39871985 39871950 Y BCOR,BCOR NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 162597 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chrX 39873339 39874259 39873676 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 160323 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chrX 39950207 39950578 39950448 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 84004 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 39953251 39953461 39953335 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 81121 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 39953769 39954197 39953849 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 80385 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chrX 39965558 39965902 39965820 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 68680 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chrX 39968308 39968728 39968376 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65854 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chrX 40012729 40012965 40012840 Y BCOR,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 21617 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chrX 40034694 40035505 40035056 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 112 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chrX 40692126 40692324 40692241 Y NA NA NA NA NA NA RP11-77G22.2 72913 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 40869399 40869667 40869505 Y USP9X,ATP6AP2,CXorf38,MED14 NA MED14,USP9X IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP9X 73221 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 40869896 40870061 40869955 Y ATP6AP2 NA MED14,USP9X IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP9X 72827 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chrX 40943673 40944218 40943773 Y CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X USP9X NA NA NA NA USP9X 785 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chrX 41759638 41759871 41759773 Y NA CASK NA NA NA NA CASK 20845 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 43888590 43889088 43888779 Y EFHC2 NA NA NA NA NA NDP 57840 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 44733657 44734406 44734027 Y KDM6A KDM6A NA NA NA NA KDM6A 2900 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 44774748 44775132 44774822 Y NA KDM6A NA NA NA NA KDM6A 43991 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 45210801 45210962 45210882 Y NA NA NA NA NA NA MIR222 393568 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 45338516 45338773 45338583 Y NA NA MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 MIR222 265757 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 45374628 45375077 45374937 Y NA NA MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 MIR222 229453 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 45617544 45618196 45618069 Y NA MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR222 13014 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chrX 45626471 45627108 45626806 Y NA MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR222 21941 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 45667637 45667718 45667664 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 41202 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 45989834 45990282 45989950 Y NA NA NA NA NA NA PCNAP3 72871 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 46148096 46148185 46148140 Y NA RP1-30G7.2 NA NA NA NA RP1-30G7.2 36895 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 46278987 46279293 46279130 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 18856 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 46316161 46316444 46316394 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 18012 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 46989082 46989431 46989227 Y NA RBM10,NDUFB11 NA NA NA NA RBM10 12837 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chrX 47415526 47415793 47415667 Y NA ARAF,TIMP1 NA NA NA NA ARAF 2723 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 47701110 47701161 47701136 Y NA ZNF81 NA NA NA NA ZNF81 6809 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chrX 48571837 48572283 48571996 Y TBC1D25,PQBP1,PIM2,OTUD5,GRIPAP1 SUV39H1 NA NA NA NA SUV39H1 19892 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 49011448 49011844 49011738 Y GATA1,HDAC6,MAGIX GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP MAGIX,PLP2 IMR90 Hi-C 24141950 PLP2 14429 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 49012442 49012818 49012676 Y NA GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP MAGIX,PLP2 IMR90 Hi-C 24141950 PLP2 13455 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 49139256 49139619 49139438 Y FOXP3,PPP1R3F CCDC22,PPP1R3F NA NA NA NA PPP1R3F 14950 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 52964244 52964539 52964367 Y TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A NA NA NA NA NA EIF4A2P4 103295 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chrX 53155305 53155690 53155322 Y XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2 TSPYL2,LINC01155 KDM5C IMR90 Hi-C 24141950 LINC01155 33978 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 53292881 53293274 53292937 Y NA KDM5C NA NA NA NA KDM5C 40277 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 54207583 54207867 54207725 Y NA NA NA NA NA NA FAM120C 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 54665732 54666388 54666226 Y NA NA ITIH6,MAGED2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNL3L 111088 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 56269843 56269989 56269918 Y NA NA NA NA NA NA UBQLN2 318037 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chrX 56839801 56840427 56840156 Y NA NA NA NA NA NA UQCRBP1 77791 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 57420009 57420263 57420031 Y NA NA NA NA NA NA RP3-323P24.3 273914 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 57490949 57491197 57490977 Y NA NA NA NA NA NA RP3-323P24.3 344854 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 58292059 58292236 58292148 Y NA NA NA NA NA NA RP3-323P24.3 1145964 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chrX 64070524 64070939 64070785 Y MTMR8 NA NA NA NA NA ZC4H2 181654 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 64888338 64888720 64888577 Y MSN NA NA NA NA NA MSN 82081 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 64891840 64892073 64891978 Y NA NA NA NA NA NA MSN 85583 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 64898955 64899156 64899089 Y MSN NA NA NA NA NA MSN 92698 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 67352579 67352916 67352601 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 298839 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 68004355 68004677 68004478 Y NA EFNB1 NA NA NA NA EFNB1 42163 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.494291099173107 chrX 69653784 69653948 69653832 Y NA NA NA NA NA NA PDZD11 145420 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 69654278 69654566 69654417 Y DLG3 NA NA NA NA NA PDZD11 145914 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 69655002 69655313 69655257 Y DLG3 NA NA NA NA NA PDZD11 146638 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 70401853 70402134 70401993 Y IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO NA NA NA NA NA MED12 65447 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chrX 71785357 71785413 71785385 Y NA HDAC8 NA NA NA NA HDAC8 5540 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 73236075 73236382 73236224 Y CHIC1 NA NA NA NA NA JPX 73916 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 73237406 73237798 73237506 Y CHIC1 NA NA NA NA NA JPX 75247 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 73507125 73507445 73507287 Y NA FTX NA NA NA NA FTX 3964 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 73510244 73510542 73510484 Y RLIM FTX NA NA NA NA FTX 867 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chrX 73756210 73756567 73756298 Y NA NA NA NA NA NA RLIM 75885 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chrX 74960822 74961039 74960972 Y NA TTC3P1 NA NA NA NA TTC3P1 3710 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chrX 75368142 75368530 75368366 Y NA NA NA NA NA NA LDHBP2 185714 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 77908831 77908963 77908901 Y CYSLTR1 NA NA NA NA NA TAF9B 515628 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.395432879338486 chrX 82765698 82766098 82765859 Y POU3F4 NA NA NA NA NA ATG4AP1 513991 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 85339971 85340972 85340615 Y NA CHM NA NA NA NA CHM 39405 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.28515685785008 chrX 92479084 92479478 92479382 Y NA RP13-88F20.1 NA NA NA NA RP13-88F20.1 1070 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 96454742 96455056 96454899 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH2 517080 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 99672872 99672953 99672909 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN6 220035 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 100664036 100664412 100664274 Y NA RPL36A,GLA,HNRNPH2 NA NA NA NA HNRNPH2 2753 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 102063503 102063615 102063509 Y NA NA NA NA NA NA GPRASP2 98399 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 102820880 102821034 102820957 Y NA TCEAL4,TCEAL3 NA NA NA NA TCEAL4 8125 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chrX 106595212 106595632 106595477 Y NA NA NA NA NA NA RBM41 235155 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 106595667 106595822 106595802 Y NA NA NA NA NA NA RBM41 235610 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 106954265 106954667 106954451 Y TSC22D3,TSC22D3,ATG4A NA NA NA NA NA TSC22D3 63905 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.593149319007728 chrX 109083180 109083422 109083333 Y ACSL4 NA ACSL4 IMR90 Hi-C 24141950 ACSL4 108548 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 109330355 109330526 109330451 Y NA NA NA NA NA NA TMEM164 86496 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 109429267 109429621 109429491 Y AMMECR1 NA NA NA NA NA TMEM164 185408 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 109487499 109487581 109487556 Y AMMECR1 NA NA NA NA NA AMMECR1 193880 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 112084647 112084962 112084847 Y AMOT,AMOT AMOT NA NA NA NA AMOT 2604 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 114819160 114819326 114819285 Y NA PLS3 NA NA NA NA PLS3 25659 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 114849502 114849636 114849587 Y NA NA NA NA NA NA PLS3 56001 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 115083189 115083554 115083375 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 0 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 115239457 115239782 115239623 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 156035 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 117487110 117487426 117487273 Y DOCK11,WDR44 WDR44 NA NA NA NA WDR44 9074 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 117661937 117662181 117662084 Y LONRF3,IL13RA1,DOCK11 DOCK11 NA NA NA NA DOCK11 34076 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 119276319 119276451 119276385 Y FAM70A NA NA NA NA NA NKAPP1 100671 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 119385485 119385791 119385733 Y NA NKAPP1,ZBTB33 NA NA NA NA ZBTB33 2878 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 119619289 119619732 119619620 Y ZBTB33,ZBTB33 LAMP2 LAMP2 K562 ChIA-PET 22265404 LAMP2 18069 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 119619980 119620335 119620161 Y NA LAMP2 LAMP2 K562 ChIA-PET 22265404 LAMP2 18760 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 122898767 122899176 122898998 Y NA THOC2 NA NA NA NA THOC2 33861 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 123735078 123735231 123735154 Y NA NA NA NA NA NA STAG2 643016 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE T98G hg19 FANTOM5 1.68058973718856 chrX 129118011 129118370 129118054 Y NA BCORL1 BCORL1,UTP14A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCORL1 4928 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chrX 129216343 129216741 129216485 Y SASH3,ELF4,ELF4,BCORL1 ELF4 NA NA NA NA ELF4 25950 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 129255072 129255259 129255158 Y SASH3,ELF4,ELF4 ELF4,AIFM1,RAB33A ELF4 K562 ChIA-PET 22265404 ELF4 12381 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 129307329 129307713 129307433 Y NA AIFM1,RAB33A NA NA NA NA RAB33A 3706 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 129308130 129308357 129308196 Y ELF4,ELF4 AIFM1,RAB33A NA NA NA NA RAB33A 4507 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 129400519 129400680 129400638 Y NA ZNF280C NA NA NA NA ZNF280C 193 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chrX 130722065 130722519 130722153 Y NA NA NA NA NA NA IGSF1 190388 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 130880517 130880959 130880705 Y NA NA NA NA NA NA MST4 274334 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 132400242 132400521 132400363 Y NA RNU1-115P NA NA NA NA RNU1-115P 29398 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 133756354 133756493 133756422 Y NA NA MIR450A2,MGC16121,MIR450A1,LOC100506757,MIR450B,MIR542 IMR90 Hi-C 24141950 PLAC1 139859 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 134096434 134096824 134096629 Y NA MOSPD1 FAM127C IMR90 Hi-C 24141950 MOSPD1 49137 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 134138094 134138444 134138243 Y NA FAM127C,FAM127A,FAM127B NA NA NA NA FAM127C 16115 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 134485580 134485626 134485601 Y ZNF449,CT45A6 ZNF75D,ZNF449 NA NA NA NA ZNF449 8859 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 135252733 135252893 135252813 Y FHL1,FHL1 NA NA NA NA NA MAP7D3 83748 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 149533685 149533896 149533780 Y MAMLD1 MAMLD1 NA NA NA NA MAMLD1 5996 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chrX 149862815 149863170 149863006 Y MTMR1 MTMR1 NA NA NA NA MTMR1 3380 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 149863588 149863865 149863755 Y MTM1,MTMR1 MTMR1 NA NA NA NA MTMR1 4153 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 150152595 150153067 150152778 Y NA HMGB3,RPL19P21 NA NA NA NA HMGB3 5613 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.790865758676971 chrX 151149745 151149882 151149808 Y NA GABRE NA NA NA NA GABRE 8593 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chrX 153166203 153166850 153166548 Y ABCD1,PLXNB3,MECP2,ATP6AP1,RENBP L1CAM,ARHGAP4,NAA10 NA NA NA NA L1CAM 5827 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chrX 153596671 153598676 153598064 Y NA FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1 NA NA NA NA FLNA 2330 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.69200753884235 chrX 153755432 153755621 153755566 Y NA LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD FAM3A MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 IKBKG 11793 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864 chrX 153771070 153771275 153771201 Y IRAK1,MECP2,TEX28,TEX28,EMD,DNASE1L1,TAZ,ATP6AP1,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1,GAB3,IKBKG,IKBKG,IKBKG FAM3A,IKBKG,G6PD NA NA NA NA G6PD 2512 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.0988582198346214 chrX 154256125 154256514 154256179 Y IKBKG,IKBKG,IKBKG,GAB3,MPP1,LOC100132963,F8A1,F8A2 FUNDC2,BRCC3 NA NA NA NA FUNDC2 3870 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.197716439669243 chrY 15207344 15207441 15207401 Y NA NA NA NA NA NA UTY 383112 CAGE T98G hg19 FANTOM5 0.296574659503864