Enhancer_ID chr start end center FANTOM5 associated_gene-FANTOM5 associated_gene-50Kb associated_gene-4DGenome Cell/Tissue Detection_method PMID closest_gene distance 1 chr1 101643867 101646475 101644949 N NA NA S1PR1 IMR90 Hi-C 24141950 S1PR1 55830 2 chr1 101755844 101779148 101775426,101773414 Y,N S1PR1;NA NA SLC30A7,DPH5 IMR90 Hi-C 24141950 S1PR1 53539 3 chr1 101821844 101824494 101823123 N NA NA NA NA NA NA S1PR1 119539 4 chr1 101835020 101877311 101845642,101836929,101839427,101864655,101874912 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA S1PR1 132715 5 chr1 101899520 101906314 101903210 N NA NA NA NA NA NA S1PR1 197215 6 chr1 104057101 104060846 104060444 N NA RNPC3 NA NA NA NA RNPC3 7732 7 chr1 110068638 110072048 110070048 N NA ATXN7L2,CYB561D1,AMIGO1,GNAI3 AMIGO1,CYB561D1,ATXN7L2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AMIGO1 16302 8 chr1 110073903 110076796 110075402 N NA ATXN7L2,CYB561D1,AMIGO1,GNAI3 CYB561D1,ATXN7L2,AMIGO1,SARS,PSMA5 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 GNAI3 14390 9 chr1 110448139 110450400 110448968 Y GNAI3,AMPD2 CSF1 NA NA NA NA CSF1 2833 10 chr1 110626135 110628100 110627014 Y NA FAM40A ALX3,FAM40A,AHCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM40A 48894 11 chr1 111328441 111331090 111330312 N NA NA KCNA2 IMR90 Hi-C 24141950 CD53 82731 12 chr1 111604398 111606342 111604925 N NA NA NA NA NA NA CEPT1 75907 13 chr1 111754906 111766506 111758708,111763621 Y,N CD53,RAP1A,CEPT1,DENND2D,CHI3L2;NA DENND2D,CHI3L2 WDR77,OVGP1,C1orf88,CEPT1,PGCP1,RAP1A,DRAM2,CHI3L2,CHIA IMR90 Hi-C 24141950 CHI3L2 3775 14 chr1 117279221 117283022 117280814 Y ATP1A1,CD2 NA CD101,TTF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD58 165506 15 chr1 117368229 117370715 117369847 N NA NA PTGFRN K562 ChIA-PET 22265404 TTF2 232234 16 chr1 117419327 117424004 117421780 Y TTF2 NA PTGFRN,TTF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TTF2 178945 17 chr1 118319145 118321585 118320459 N NA NA NA NA NA NA GDAP2 150717 18 chr1 119540807 119545483 119544772 N NA TBX15 NA NA NA NA TBX15 8628 19 chr1 119855245 119862715 119861113,119862595 N,N NA;NA NA SPAG17 IMR90 Hi-C 24141950 TBX15 323066 20 chr1 119866861 119871537 119870220 N NA NA NA NA NA NA ZNF697 318853 21 chr1 119883033 119885069 119884184 N NA NA NA NA NA NA ZNF697 305321 22 chr1 121483964 121485543 121484751 N NA NA NA NA NA NA HIST2H2BA 577930 23 chr1 142889624 142891917 142891069 N NA NA NA NA NA NA LOC100286793 852670 24 chr1 143281533 143284430 143283024 N NA NA NA NA NA NA LOC100286793 460157 25 chr1 143456632 143468755 143467657 N NA NA NA NA NA NA LOC100286793 275832 26 chr1 143671716 143673460 143672966 N NA NA NA NA NA NA LOC100286793 71127 27 chr1 144532828 144535423 144533875 Y PDE4DIP LOC728875 PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE,LOC728875 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LOC728875 10859 28 chr1 145137652 145140609 145139490 N NA SEC22B NA NA NA NA SEC22B 41245 29 chr1 145394433 145398202 145395604,145397479 N,N NA;NA TXNIP PDE4DIP,SEC22B,HFE2,GNRHR2,LIX1L,RBM8A,PIAS3,POLR3C,NUDT17,ANKRD35,TXNIP,ANKRD34A,POLR3GL,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TXNIP 40260 30 chr1 145967724 145971152 145969547 N NA NA NA NA NA NA GPR89C 83856 31 chr1 145990572 145995408 145991626 N NA NA NA NA NA NA GPR89C 106704 32 chr1 146007853 146010271 146009188 N NA NA NA NA NA NA GPR89C 123985 33 chr1 146368493 146371542 146370048 N NA NA NA NA NA NA PRKAB2 272587 34 chr1 146554622 146558303 146556428 N NA NA CHD1L,LOC728989,PRKAB2,FMO5 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 PRKAB2 85826 35 chr1 147509458 147512914 147511287 N NA NA NA NA NA NA GPR89B 108952 36 chr1 147734501 147737336 147735859 N NA NA NA NA NA NA FLJ39739 194644 37 chr1 147789581 147791327 147790655 Y NA NA NA NA NA NA FLJ39739 140653 38 chr1 147805526 147808933 147807015 Y NA NA NA NA NA NA FLJ39739 123047 39 chr1 147873024 147876363 147874658 N NA NA NA NA NA NA FLJ39739 55617 40 chr1 148175920 148180032 148176692 N NA NA NA NA NA NA FLJ39739 243940 41 chr1 148240077 148243185 148241364 N NA NA NA NA NA NA FLJ39739 308097 42 chr1 148246949 148249170 148248089 N NA NA NA NA NA NA NBPF15 309018 43 chr1 14841280 14851145 14843918,14847318,14849430 Y,Y,N KAZN;NA;NA NA KAZN IMR90 Hi-C 24141950 PRDM2 814545 44 chr1 149222471 149226218 149224341,149223654 N,N NA;NA NA NBPF10,SEC22B,NBPF15 MCF7 ChIA-PET 22265404 LOC388692 53258 45 chr1 149512724 149516420 149514386 N NA NA NA NA NA NA FAM91A2 59842 46 chr1 152018850 152021702 152020713 N NA S100A11 NA NA NA NA S100A11 9339 47 chr1 154357876 154363069 154359266 Y GATAD2B,DENND4B,CRTC2,RPS27,UBAP2L,ATP8B2 NA IL6R,ATP8B2,UBE2Q1 IMR90 Hi-C 24141950 ATP8B2 57600 48 chr1 156064856 156070453 156067378 N NA UBQLN4,LAMTOR2,MEX3A,LMNA,SEMA4A LMNA,MEX3A K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 MEX3A 13067 49 chr1 158117964 158120965 158119517 Y NA NA LOC646268,KIRREL,AIM2 IMR90 Hi-C 24141950 FCRL5 595654 50 chr1 15928467 15933217 15930142 N NA AGMAT,DDI2 DDI2,DNAJC16,AGMAT,FBLIM1,PLEKHM2,SLC25A34,TMEM82 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDI2 10736 51 chr1 160419311 160427128 160422561 N NA NA NA NA NA NA SLAMF6 65924 52 chr1 160428893 160432168 160430206 N NA NA NA NA NA NA SLAMF6 60884 53 chr1 160694252 160700265 160696106 Y CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7 CD48,SLAMF7 CD48,SLAMF7 IMR90 Hi-C 24141950 SLAMF7 8812 54 chr1 160749583 160753271 160751568 N NA SLAMF7,LY9 CD48,LY9 IMR90 Hi-C 24141950 LY9 12657 55 chr1 160758728 160761860 160760129 N NA SLAMF7,LY9 NA NA NA NA LY9 4068 56 chr1 161357758 161365167 161359916 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 73592 57 chr1 161367838 161393135 161369640,161391947 Y,N NA;NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 83672 58 chr1 161396858 161401485 161397857 N NA NA APOA2,TOMM40L,NDUFS2 IMR90 Hi-C 24141950 SDHC 112692 59 chr1 161412985 161413960 161413402 N NA NA NDUFS2,DUSP12 IMR90 Hi-C 24141950 SDHC 128819 60 chr1 162595656 162598875 162596308 N NA NA NA NA NA NA UAP1 64360 61 chr1 165566344 165569380 165567546 N NA MGST3 RXRG,LOC400794,UCK2,LOC440700,ALDH9A1,MGST3 IMR90 Hi-C 24141950 MGST3 30730 62 chr1 166140107 166142474 166141387 N NA FAM78B NA NA NA NA FAM78B 4149 63 chr1 166455273 166461351 166459247 N NA NA NA NA NA NA FAM78B 319315 64 chr1 167582968 167587678 167586407 N NA RCSD1 RCSD1 IMR90 Hi-C 24141950 RCSD1 11796 65 chr1 16823846 16827440 16826229 Y NA NA SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 56679 66 chr1 16839126 16843086 16840911 N NA NA NECAP2,SPATA21,CROCCP3,NBPF1,CROCC,CROCCP2,MST1P2,MIR3675,ESPNP,ARHGEF19,C1orf144,FBXO42 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NECAP2 71959 67 chr1 168434913 168437305 168435751 N NA NA NA NA NA NA XCL1 108406 68 chr1 16846416 16848345 16846977 N NA NA CROCC,CROCCP3,NBPF1,ESPNP IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 79249 69 chr1 168477272 168481565 168479537 N NA NA C1orf114,BLZF1 IMR90 Hi-C 24141950 XCL1 64146 70 chr1 168521878 168525597 168523391 N NA XCL1 NA NA NA NA XCL1 20114 71 chr1 168890108 168892198 168891306 N NA NA ATP1B1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP1B1 183749 72 chr1 168960203 168962739 168961292 N NA NA ATP1B1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP1B1 113208 73 chr1 168978276 168983840 168979100,168981915 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ATP1B1 92107 74 chr1 168991664 168999295 168994373,168997263 Y,N XCL2,XCL1;NA NA DPT,ATP1B1,NME7 IMR90 Hi-C 24141950 ATP1B1 76652 75 chr1 169014373 169019491 169018647 N NA NA NME7 IMR90 Hi-C 24141950 ATP1B1 56456 76 chr1 169058748 169062278 169060592 N NA ATP1B1 NME7,XCL1,ATP1B1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP1B1 13669 77 chr1 171639234 171640011 171639779 N NA NA DNM3,VAMP4 IMR90 Hi-C 24141950 VAMP4 71368 78 chr1 17187868 17189522 17188440 N NA NA NA NA NA NA CROCC 58923 79 chr1 17215122 17216917 17216281 N NA CROCC NBPF1,MIR3675,CROCC,ESPNP IMR90 Hi-C 24141950 CROCC 31528 80 chr1 17220263 17224133 17222324 N NA CROCC CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CROCC 24312 81 chr1 17229672 17233044 17231524 Y PADI4,PADI2 CROCC CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CROCC 15401 82 chr1 173985074 173994761 173990918 N NA RC3H1 ZBTB37,RC3H1,GAS5 IMR90 Hi-C 24141950 RC3H1 22864 83 chr1 175177825 175179836 175178415 N NA KIAA0040 NA NA NA NA KIAA0040 15596 84 chr1 175199156 175200264 175199666 N NA KIAA0040 PAPPA2,KIAA0040 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0040 36927 85 chr1 177761682 177765002 177763629 N NA NA NA NA NA NA C1orf220 746929 86 chr1 177766835 177769276 177767918 N NA NA ASTN1 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf220 742655 87 chr1 178542141 178552458 178545017,178549742 N,N NA;NA C1orf220 C1orf220,MIR4424,RALGPS2,ANGPTL1,FAM20B IMR90 Hi-C 24141950 C1orf220 30210 88 chr1 178573590 178580895 178575254,178577422 Y,N TOR3A,RALGPS2;NA NA RALGPS2,ANGPTL1,FAM20B,C1orf220 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf220 61659 89 chr1 181095888 181119286 181099462,181104245,181110792 N,N,Y NA;NA;STX6,MR1,IER5 IER5 KIAA1614,IER5,STX6,ACBD6,MR1,XPR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 38250 90 chr1 181397324 181402309 181399477 N NA NA NA NA NA NA CACNA1E 50377 91 chr1 183566633 183569241 183567900 N NA NCF2,ARPC5,RGL1 DKFZP564C196,SMG7,NCF2,RGL1,ARPC5,LAMC1,NMNAT2 IMR90 Hi-C 24141950 NCF2 6577 92 chr1 185528415 185530703 185529323 Y NA NA LOC100288079,IVNS1ABP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IVNS1ABP 241954 93 chr1 185662324 185664526 185663298 N NA NA IVNS1ABP,SWT1,MIR548F1,HMCN1 IMR90 Hi-C 24141950 IVNS1ABP 375863 94 chr1 192484246 192489921 192486970 N NA NA RGS2,RGS1,UCHL5 IMR90 Hi-C 24141950 RGS1 54936 95 chr1 192497743 192501252 192499562 N NA RGS1 UCHL5,RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 RGS1 43605 96 chr1 192507260 192509959 192508162 Y NA RGS1 UCHL5,RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 RGS1 34898 97 chr1 192511302 192516531 192514894 N NA RGS1 RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 RGS1 28326 98 chr1 192517346 192530881 192519952,192524071 Y,N RGS2,RGS1;NA RGS1 RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 RGS1 13976 99 chr1 192577096 192580880 192578450 Y TROVE2,TROVE2,RGS1,RGS2 RGS1 UCHL5,RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 RGS1 32239 100 chr1 198564291 198572187 198567524,198571503 N,N NA;NA PTPRC NA NA NA NA PTPRC 35950 101 chr1 198589304 198592275 198590539 Y NEK7,PTPRC PTPRC NA NA NA NA PTPRC 15862 102 chr1 198602238 198604591 198602979 N NA PTPRC PTPRC IMR90 Hi-C 24141950 PTPRC 3546 103 chr1 200269733 200272550 200271568 N NA NA NR5A2,C1orf98 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF281 106616 104 chr1 200383398 200387232 200385009 N NA ZNF281 ZNF281,C1orf98 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF281 4232 105 chr1 200441820 200444191 200443202 N NA NA NR5A2,C1orf98 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF281 62654 106 chr1 201134207 201142074 201140082,201137682 Y,N NA;NA TMEM9 CACNA1S,KIF21B,TMEM9,IGFN1,PKP1,TNNT2,LAD1,TNNI1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM9 10575 107 chr1 202047688 202049041 202047936 N NA NA NA NA NA NA ARL8A 64830 108 chr1 203235551 203246251 203242819 N NA LOC730227,BTG2 PPFIA4,ADORA1,ATP2B4,TMEM183A,BTG2,FMOD,LOC401980,MYBPH,CHI3L1,MYOG,CHIT1,LOC730227,PRELP,OPTC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC730227 28202 109 chr1 203349019 203350973 203350210 N NA NA FMOD,ATP2B4,CHIT1,PRELP,LAX1,ZC3H11A IMR90 Hi-C 24141950 BTG2 74355 110 chr1 204475057 204476914 204475950 N NA PIK3C2B,MDM4 PPP1R15B,MDM4,PIK3C2B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 MDM4 8593 111 chr1 204547404 204550773 204548294 N NA NA NA NA NA NA MDM4 61897 112 chr1 206302796 206308019 206305383 N NA C1orf186 PM20D1,C1orf186,SLC41A1,AVPR1B,MFSD4,NUCKS1,LOC284581,SLC26A9,CTSE IMR90 Hi-C 24141950 C1orf186 14149 113 chr1 206844960 206846890 206846093 N NA DYRK3,MAPKAPK2 MAPKAPK2 MCF7 ChIA-PET 22265404 MAPKAPK2 11475 114 chr1 207584387 207599963 207586896,207597907 N,N NA;NA CR2 C4BPA,PFKFB2,C4BPB,CR1,CR2 IMR90 Hi-C 24141950 CR2 27682 115 chr1 207605854 207608459 207607317 N NA CR2 PFKFB2,C4BPA,C4BPB,CR1 IMR90 Hi-C 24141950 CR2 19186 116 chr1 209160971 209163492 209162256 N NA NA NA NA NA NA TRAF3IP3 765902 117 chr1 209276261 209285083 209278733 N NA NA NA NA NA NA TRAF3IP3 644311 118 chr1 211768465 211781993 211779959 N NA SLC30A1 SLC30A1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC30A1 16366 119 chr1 211868662 211873922 211868762,211871742 N,N NA;NA NEK2 LPGAT1,INTS7 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEK2 19690 120 chr1 212414560 212416849 212416077 N NA PPP2R5A PPP2R5A,DTL IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2R5A 42030 121 chr1 212728103 212733845 212732353 Y NA ATF3 ATF3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATF3 4831 122 chr1 213092804 213094873 213093726 N NA VASH2 NA NA NA NA VASH2 29014 123 chr1 213100946 213103384 213102191 Y VASH2 VASH2 FLVCR1,VASH2,TATDN3,NSL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 VASH2 20503 124 chr1 219595190 219598670 219596631 N NA NA RRP15,LOC728463,TGFB2 IMR90 Hi-C 24141950 LYPLAL1 247998 125 chr1 221927696 221937802 221929481,221934978 N,N NA;NA DUSP10 DUSP10 K562 ChIA-PET 22265404 DUSP10 12180 126 chr1 221944179 221954387 221950491 Y DUSP10 DUSP10 DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 28663 127 chr1 221965597 221969438 221967461 N NA NA NA NA NA NA DUSP10 50081 128 chr1 221981483 221984226 221983113 Y DUSP10,DUSP10 NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 65967 129 chr1 221995747 221999924 221997340 N NA NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 80231 130 chr1 222012525 222015030 222013986 N NA NA MIA3,DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 97009 131 chr1 222166296 222169522 222167926 Y DUSP10 NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 250780 132 chr1 222638189 222639483 222638790 Y NA NA DUSP10,MIA3,AIDA,BROX IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF1A 123792 133 chr1 224178069 224198536 224180393 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 103255 134 chr1 224684790 224686689 224685769 N NA NA WDR26,CNIH3 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 62789 135 chr1 224690208 224692647 224691217 Y NA NA WDR26,CNIH3 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 68207 136 chr1 22503239 22508038 22504010 Y NA NA ZBTB40,C1QC,C1QA,WNT4,EPHA8,C1QB,EPHB2 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42 124119 137 chr1 225621414 225624864 225623546 N NA LBR LBR,TMEM63A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LBR 4857 138 chr1 225628890 225634019 225629662,225632726 N,N NA;NA LBR TMEM63A,LBR,ENAH,SRP9,EPHX1,PYCR2,LEFTY2,C1orf55 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LBR 12333 139 chr1 226083639 226086069 226085015 Y LBR,H3F3A,C1orf55,TMEM63A TMEM63A,PYCR2 TMEM63A,LEFTY1,PYCR2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM63A 13219 140 chr1 226189543 226191452 226190038 Y H3F3A,C1orf55 C1orf55 NA NA NA NA C1orf55 2477 141 chr1 226296513 226300362 226298091 Y NA H3F3A ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H3F3A 46105 142 chr1 227728460 227731291 227730425 N NA ZNF678 WNT9A,ZNF678 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF678 19929 143 chr1 228961039 228963500 228962403 N NA NA NA NA NA NA RNF187 285971 144 chr1 228972803 228974719 228973885 Y RHOU NA RHOU,RAB4A IMR90 Hi-C 24141950 RNF187 297735 145 chr1 230701818 230705254 230703486 N NA NA URB2 IMR90 Hi-C 24141950 COG2 72948 146 chr1 233594783 233597378 233595526 N NA NA NA NA NA NA KCNK1 152372 147 chr1 233723176 233724608 233724133 N NA KCNK1 NA NA NA NA KCNK1 25142 148 chr1 233732788 233737339 233733592,233735661 N,N NA;NA KCNK1 KCNK1 MCF7 ChIA-PET 22265404 KCNK1 12411 149 chr1 234826371 234833457 234832195 N NA NA LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2BP2 81100 150 chr1 234835006 234837640 234836159 N NA NA IRF2BP2,LINC00184,LOC100506810 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRF2BP2 89735 151 chr1 234906326 234910035 234908541,234908127 Y,N IRF2BP2;NA NA LOC100506810,IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,TOMM20,RBM34 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2BP2 161055 152 chr1 234976244 234981640 234978854,234980403 Y,Y IRF2BP2;IRF2BP2 NA LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2 IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BP2 230973 153 chr1 235068112 235070855 235069302 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B NA LINC00184,IRF2BP2,TARBP1,LOC100506795,LOC100506810 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 221401 154 chr1 235088247 235093859 235090579 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B NA IRF2BP2,LOC100506810,TARBP1,LINC00184 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 198397 155 chr1 235096233 235100484 235098545 N NA NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 191772 156 chr1 235112913 235118962 235115729 N NA NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 173294 157 chr1 235144174 235150015 235148230 N NA NA LINC00184,TARBP1,LOC100506795,IRF2BP2,LOC100506810 IMR90 Hi-C 24141950 TOMM20 142241 158 chr1 235242108 235248787 235242647,235246801 N,Y NA;ARID4B,ARID4B TOMM20 IRF2BP2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TOMM20 43469 159 chr1 23902644 23905940 23904354 N NA E2F2,ID3 ID3,MDS2,E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 16359 160 chr1 23917219 23921352 23919250 N NA ID3 E2F2,ID3,ASAP3,MDS2,TCEB3,HNRNPR IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID3 30934 161 chr1 23944385 23947495 23946501 N NA NA E2F2,MDS2,ID3,RPL11 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID3 58100 162 chr1 24044924 24048324 24047052 N NA RPL11,TCEB3 RPL11 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TCEB3 21532 163 chr1 244010294 244015962 244013689 N NA AKT3 LOC339529 IMR90 Hi-C 24141950 AKT3 3710 164 chr1 244353638 244357133 244355173 Y ZNF238,ZNF238 NA AKT3 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF238 139077 165 chr1 244396153 244404598 244402940 N NA NA SDCCAG8,LOC339529,AKT3,ZNF238 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF238 181592 166 chr1 244454139 244464399 244462949 Y AKT3,AKT3,ADSS NA SDCCAG8,AKT3,LOC339529,ADSS,C1orf100 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ADSS 151037 167 chr1 244473230 244489781 244483244,244487715 Y,N AKT3,AKT3,ADSS;NA NA SDCCAG8,AKT3,LOC339529,C1orf100,ADSS,C1orf101 IMR90 Hi-C 24141950 ADSS 125655 168 chr1 245103450 245105565 245104183 N NA EFCAB2 HNRNPU,EFCAB2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EFCAB2 27719 169 chr1 248595021 248598021 248595609 N NA NA NA NA NA NA OR2T4 70138 170 chr1 249166021 249169572 249167997 N NA SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2 ZNF692,PGBD2,MIR3124,SH3BP5L K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF692 12706 171 chr1 25297562 25300709 25298942 Y C1orf63 RUNX3 CLIC4,RUNX3,SYF2 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX3 6061 172 chr1 25343960 25351672 25349339 N NA NA RUNX3,CLIC4,C1orf63,SYF2 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX3 52459 173 chr1 25352647 25367191 25353496,25358978 N,N NA;NA NA RUNX3,C1orf63,SYF2,CLIC4,C1orf130 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX3 61146 174 chr1 25453726 25456373 25454564 N NA NA RUNX3,CLIC4,TMEM57 IMR90 Hi-C 24141950 SYF2 102640 175 chr1 25464790 25468573 25466866 Y RUNX3 NA RUNX3,GRHL3 IMR90 Hi-C 24141950 SYF2 90440 176 chr1 25579764 25596007 25594215 N NA SYF2,C1orf63 C1orf63 MCF7 ChIA-PET 22265404 C1orf63 5779 177 chr1 26945522 26949566 26947869 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,GPN2,GPATCH3,ZDHHC18,DHDDS,HMGN2,SFN,PIGV,NUDC,NR0B2,C1orf172 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72956 178 chr1 28014850 28017757 28016299 N NA IFI6,FAM76A WASF2,PPP1R8,FAM76A,IFI6,STX12 IMR90 Hi-C 24141950 IFI6 16126 179 chr1 31866572 31868633 31867773 N NA SERINC2 ZCCHC17,FABP3,SERINC2,LOC284551 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERINC2 13779 180 chr1 31942919 31952594 31945076,31950091 N,Y NA;NA LOC149086,LOC284551 SERINC2,SNRNP40,NKAIN1,ZCCHC17,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1,PEF1,SPOCD1,HCRTR1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC149086 19245 181 chr1 32013902 32016172 32015764 N NA LOC149086,LOC284551 FABP3,SERINC2,LOC284551,PEF1,HCRTR1,NKAIN1,TINAGL1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC284551 29866 182 chr1 32408618 32411827 32410091 N NA PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1 IMR90 Hi-C 24141950 PTP4A2 4630 183 chr1 32450247 32452293 32450850 N NA PTP4A2,KHDRBS1 SPOCD1,KHDRBS1,BAI2,COL16A1,TMEM39B,PTP4A2 IMR90 Hi-C 24141950 KHDRBS1 27198 184 chr1 33442235 33448555 33446264,33446925 N,Y NA;RNF19B RNF19B RNF19B,AK2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF19B 11949 185 chr1 33523556 33526096 33524097 N NA AK2 AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC IMR90 Hi-C 24141950 AK2 21044 186 chr1 34994553 34997516 34996077 N NA NA CSMD2 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf212 327901 187 chr1 38517559 38531960 38519270,38528005 N,N NA;NA FHL3,UTP11L,POU3F1 POU3F1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 POU3F1 5109 188 chr1 38616441 38621280 38619382 N NA NA POU3F1 IMR90 Hi-C 24141950 POU3F1 103991 189 chr1 38637629 38641201 38639109 N NA NA LOC339442,RRAGC IMR90 Hi-C 24141950 POU3F1 125179 190 chr1 38938846 38949304 38940865,38942769 N,N NA;NA NA NA NA NA NA RRAGC 376036 191 chr1 38992397 38994500 38993196 N NA NA NA NA NA NA RRAGC 330840 192 chr1 39023419 39032966 39024981 N NA NA NA NA NA NA RRAGC 292374 193 chr1 39278583 39283618 39281758 N NA RRAGC LOC339442,POU3F1,RRAGC IMR90 Hi-C 24141950 RRAGC 41722 194 chr1 40263697 40266356 40265011 Y NA NA HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1,NT5C1A,TRIT1,MYCL1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPIE 59180 195 chr1 40806539 40811591 40807793,40810442 N,N NA;NA SMAP2 SMAP2,CAP1,RLF,PPT1,ZMPSTE24,COL9A2,ZNF643 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAP2 27787 196 chr1 41830562 41841127 41832009 N NA NA NA NA NA NA SCMH1 122747 197 chr1 42486223 42499998 42499477 N NA NA HIVEP3,CCDC30 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIVEP3 101845 198 chr1 4332691 4335234 4333805 N NA NA NA NA NA NA LOC100133612 515723 199 chr1 4403264 4405655 4404493 N NA NA NA NA NA NA LOC100133612 586296 200 chr1 46008125 46013043 46009676,46011432 Y,N IPP,GPBP1L1,TOE1,TESK2;NA CCDC163P,MMACHC,PRDX1,AKR1A1,NASP PRDX1,AKR1A1,NASP,CCDC17 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AKR1A1 3412 201 chr1 46621722 46634335 46625057,46632425 N,N NA;NA PIK3R3 PIK3R3,MAST2,POMGNT1,LURAP1,TSPAN1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIK3R3 23014 202 chr1 51990613 51996950 51991859 N NA EPS15 OSBPL9,EPS15 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPS15 5618 203 chr1 52041070 52045237 52041693 N NA OSBPL9 OSBPL9 IMR90 Hi-C 24141950 OSBPL9 37309 204 chr1 53168041 53170364 53168819 Y NA SELRC1,ZYG11B SELRC1,CPT2 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SELRC1 4003 205 chr1 53832112 53834562 53833839 N NA LRP8 GLIS1,LRP8,FLJ40434,YIPF1,LOC100507564,MAGOH,TMEM48 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRP8 38291 206 chr1 54954131 54959268 54954618 N NA NA TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP3 82039 207 chr1 564331 570424 567477 N NA NA NA NA NA NA LINC00115 192478 208 chr1 56591797 56599940 56599044 N NA NA PPAP2B IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507634 910716 209 chr1 59387029 59388876 59388247 N NA NA LOC100131060,JUN,HSD52,FGGY,MIR4711 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100131060 136206 210 chr1 59433255 59435297 59434268 N NA NA FGGY,LOC100131060,JUN,MIR4711 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100131060 182432 211 chr1 59476089 59481042 59479164 Y NA NA FGGY,LOC100131060,JUN,HSD52,MIR4711 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100131060 225266 212 chr1 59484214 59515977 59486011,59491844,59512264 N,N,N NA;NA;NA NA FGGY,LOC100131060,JUN,HSD52,MIR4711 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100131060 233391 213 chr1 59614765 59617854 59616724 Y NA NA HSD52,FGGY,JUN,LOC100131060,MIR4711 IMR90 Hi-C 24141950 FGGY 144771 214 chr1 59730597 59734092 59732455 N NA FGGY FGGY,LOC100131060,HSD52 IMR90 Hi-C 24141950 FGGY 28533 215 chr1 65531866 65535063 65533920 N NA NA AK4,DNAJC6,LEPR,JAK1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AK4 78169 216 chr1 66901558 66904127 66902241 N NA NA PDE4B IMR90 Hi-C 24141950 MIER1 486451 217 chr1 66908137 66912963 66911308 Y MIER1,PDE4B NA PDE4B,SGIP1 IMR90 Hi-C 24141950 MIER1 477615 218 chr1 69519197 69522844 69521183 N NA NA NA NA NA NA DEPDC1 556398 219 chr1 69535940 69538531 69536836 N NA NA NA NA NA NA DEPDC1 573141 220 chr1 77165437 77166793 77166352 N NA NA ST6GALNAC3 IMR90 Hi-C 24141950 MSH4 902881 221 chr1 8013530 8015727 8014330 N NA TNFRSF9,PARK7 NA NA NA NA PARK7 5987 222 chr1 8156083 8159200 8158049 N NA NA ERRFI1,RERE,PARK7,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERRFI1 69690 223 chr1 8228691 8231694 8229840 N NA NA ERRFI1,SLC45A1,PARK7 IMR90 Hi-C 24141950 ERRFI1 142298 224 chr1 82616811 82621303 82618680 N NA NA NA NA NA NA PRKACB 1922442 225 chr1 82625647 82628847 82627547 N NA NA NA NA NA NA PRKACB 1914898 226 chr1 82685705 82694137 82692971 N NA NA NA NA NA NA PRKACB 1849608 227 chr1 8341715 8345087 8342889 N NA NA PARK7,ERRFI1,SLC45A1,RERE IMR90 Hi-C 24141950 ERRFI1 255322 228 chr1 83870056 83872780 83871868 N NA NA NA NA NA NA PRKACB 670965 229 chr1 83950560 83955412 83953871 N NA NA NA NA NA NA PRKACB 588333 230 chr1 83964701 83966970 83966153 N NA NA NA NA NA NA PRKACB 576775 231 chr1 84736389 84738220 84737397 N NA NA LPAR3,DNASE2B,UOX,SAMD13,SSX2IP IMR90 Hi-C 24141950 PRKACB 192644 232 chr1 85164804 85166796 85165984 N NA SSX2IP SSX2IP,UOX IMR90 Hi-C 24141950 SSX2IP 8564 233 chr1 87914083 87917421 87915321,87916712 N,N NA;NA NA LMO4 IMR90 Hi-C 24141950 LMO4 119932 234 chr1 89111661 89115520 89113206 N NA PKN2 NA NA NA NA PKN2 34402 235 chr1 89126470 89128587 89127641 N NA PKN2 GTF2B IMR90 Hi-C 24141950 PKN2 21335 236 chr1 9134778 9140520 9135819 N NA SLC2A5,GPR157 NA NA NA NA SLC2A5 4891 237 chr1 9255037 9259066 9256696 N NA H6PD SLC2A7,SLC25A33,SPSB1,H6PD,TMEM201,MIR34A,GPR157,PIK3CD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H6PD 35797 238 chr1 93506962 93509364 93508110 N NA MTF2 MTF2,CCDC18,TMED5,FAM69A,RPL5,BCAR3 IMR90 Hi-C 24141950 MTF2 35428 239 chr1 9472210 9476896 9473762 Y NA NA SPSB1,H6PD,SLC25A33 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 122632 240 chr1 9487497 9490855 9489118 Y NA NA H6PD,SPSB1,SLC25A33,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 108673 241 chr1 96207359 96210777 96208707 N NA NA NA NA NA NA TMEM56-RWDD3 623880 242 chr1 96417751 96423448 96419750 N NA NA NA NA NA NA PTBP2 763727 243 chr1 96458986 96461848 96460951 N NA NA NA NA NA NA PTBP2 725327 244 chr1 96466334 96469722 96468561 N NA NA NA NA NA NA PTBP2 717453 245 chr1 96482003 96489733 96484235,96488776 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PTBP2 697442 246 chr1 96494657 96517552 96506662,96515072 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PTBP2 669623 247 chr1 96524491 96530995 96526141 Y NA NA NA NA NA NA PTBP2 656180 248 chr1 96535943 96562708 96538871,96558939,96555944,96560614 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA PTBP2 624467 249 chr1 96564303 96584238 96566644,96574164 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PTBP2 602937 250 chr1 96688034 96690512 96689052 N NA NA NA NA NA NA PTBP2 496663 251 chr1 96692703 96694848 96694111 N NA NA NA NA NA NA PTBP2 492327 252 chr1 96953568 96955503 96954533 N NA NA NA NA NA NA PTBP2 231672 253 chr10 101002796 101004357 101002946 N NA NA HPSE2,HPS1 IMR90 Hi-C 24141950 GOT1 186173 254 chr10 101772804 101775335 101774213 Y NA NA CUTC,COX15,ABCC2,DNMBP,DNMBP-AS1,CPN1 IMR90 Hi-C 24141950 ERLIN1 170479 255 chr10 109184740 109187060 109186020 N NA NA NA NA NA NA XPNPEP1 2496251 256 chr10 109795931 109802169 109799529 N NA NA NA NA NA NA XPNPEP1 1881142 257 chr10 110356348 110364106 110359417,110362653 N,N NA;NA NA NA NA NA NA XPNPEP1 1319205 258 chr10 112082553 112090798 112084465,112087518 N,N NA;NA SMNDC1 DUSP5,SMC3,RBM20,SMNDC1 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 17846 259 chr10 112112308 112119618 112116460 Y DUSP5,MXI1 SMNDC1 SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMNDC1 47601 260 chr10 112145787 112150434 112147950 N NA NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 81080 261 chr10 112153210 112156687 112155772 Y DUSP5 NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 88503 262 chr10 112168345 112176326 112170823,112173594 N,N NA;NA NA DUSP5,SMC3,SMNDC1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 81299 263 chr10 112184541 112193347 112186451 N NA NA SMNDC1,DUSP5,SMC3 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 64278 264 chr10 112200921 112202802 112201746 N NA NA DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 54823 265 chr10 113971812 113976779 113975529 N NA GPAM TECTB IMR90 Hi-C 24141950 GPAM 28275 266 chr10 115717117 115722646 115720294 N NA NA ADRB1,NHLRC2,DCLRE1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ADRB1 81160 267 chr10 115741850 115744003 115743022 N NA NA DCLRE1A,NHLRC2,ADRB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ADRB1 59803 268 chr10 115782719 115787402 115784941,115786431 N,N NA;NA ADRB1 NHLRC2 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB1 16404 269 chr10 115793647 115797110 115795580 N NA ADRB1 ADRB1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ADRB1 6696 270 chr10 116760906 116766240 116761905 N NA NA NA NA NA NA TRUB1 62954 271 chr10 11721868 11728437 11727144,11725678 N,N NA;NA NA USP6NL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ECHDC3 55919 272 chr10 119183987 119187007 119185826 N NA PDZD8 NA NA NA NA PDZD8 49050 273 chr10 121463732 121466357 121464566 N NA NA INPP5F,MCMBP,SEC23IP IMR90 Hi-C 24141950 TIAL1 107191 274 chr10 123207379 123210540 123209200 N NA NA NA NA NA NA ATE1 477006 275 chr10 125149833 125154936 125152087 N NA NA NA NA NA NA BUB3 236073 276 chr10 125160675 125163666 125162339 Y NA NA NA NA NA NA BUB3 246915 277 chr10 125973254 125980955 125974728,125979177 N,Y NA;CHST15 NA CPXM2,CHST15 IMR90 Hi-C 24141950 CHST15 121324 278 chr10 126028043 126030713 126029854 Y CHST15 NA CHST15,HMX3 IMR90 Hi-C 24141950 OAT 76832 279 chr10 126599629 126603594 126602513 N NA ZRANB1 ZRANB1,CTBP2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZRANB1 27098 280 chr10 135460187 135464015 135462382 N NA NA NA NA NA NA MTG1 252566 281 chr10 17247742 17249043 17248601 N NA VIM VIM,TRDMT1,CUBN K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 VIM 21215 282 chr10 22517407 22519010 22518436 N NA NA COMMD3-BMI1,LOC100499489,PIP4K2A,ARMC3,MSRB2,LOC100130992,DNAJC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COMMD3-BMI1 86302 283 chr10 23651415 23654144 23652363 N NA NA NA NA NA NA OTUD1 74054 284 chr10 23656858 23659187 23657511 N NA NA NA NA NA NA OTUD1 69011 285 chr10 26623304 26627331 26624578 N NA NA NA NA NA NA APBB1IP 99935 286 chr10 26656572 26663723 26657643,26661940 N,N NA;NA NA NA NA NA NA APBB1IP 63543 287 chr10 26717695 26723418 26719740 N NA APBB1IP NA NA NA NA APBB1IP 3848 288 chr10 27608095 27609693 27608918 Y ABI1,MASTL,ACBD5 NA PDSS1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ACBD5 77027 289 chr10 27633632 27637972 27634406 N NA NA NA NA NA NA ACBD5 102564 290 chr10 27642817 27644477 27643574 N NA NA NA NA NA NA ACBD5 111749 291 chr10 29094424 29100989 29096029 N NA NA BAMBI,LYZL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BAMBI 128000 292 chr10 29336692 29340598 29338951 N NA NA BAMBI,LYZL1,WAC IMR90 Hi-C 24141950 LOC387647 357903 293 chr10 30817536 30819463 30818631 Y MAP3K8,ZNF438 NA MAP3K8,KIAA1462,MTPAP,LOC729668,LYZL2 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K8 94586 294 chr10 30986325 30996654 30990966,30994897 N,N NA;NA NA ZEB1,ARHGAP12,ZEB1-AS1,SVIL,KIF5B IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K8 263375 295 chr10 31038063 31042375 31040058 N NA NA ZEB1,ARHGAP12,ZEB1-AS1,KIF5B,ZNF438 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 278491 296 chr10 31070067 31075473 31073107 N NA NA ARHGAP12,ZEB1-AS1,ZEB1,ZNF438 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 245393 297 chr10 31387921 31391092 31390176 N NA NA ZEB1-AS1,ZEB1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 67055 298 chr10 31419850 31424538 31422741 Y ZNF438,ZNF438 NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 98984 299 chr10 31994605 31998380 31996387 N NA NA ZEB1,ARHGAP12 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP12 219390 300 chr10 32044411 32051089 32049195 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 166681 301 chr10 32640637 32669683 32667781 N NA EPC1 EPC1,C10orf68 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPC1 4524 302 chr10 32733939 32736751 32735037 N NA NA C10orf68 MCF7 ChIA-PET 22265404 EPC1 97826 303 chr10 33268725 33270569 33269612 Y C10orf68 ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 21432 304 chr10 33991699 33995129 33992989 N NA NA PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB1 744406 305 chr10 34022271 34025936 34023919 N NA NA NA NA NA NA ITGB1 774978 306 chr10 35124598 35126336 35125289 N NA PARD3 PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 PARD3 20345 307 chr10 36108495 36112264 36110322 N NA NA NA NA NA NA FZD8 178133 308 chr10 36359004 36363094 36359434 N NA NA NA NA NA NA FZD8 428642 309 chr10 3664183 3666888 3665370 N NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 KLF6 160585 310 chr10 3781844 3784787 3782673,3784734 N,N NA;NA KLF6 LOC338588,LOC100216001,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 42686 311 chr10 3845588 3850400 3848116,3846475 Y,Y KLF6;KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 18115 312 chr10 3876194 3879839 3878283 Y KLF6 KLF6 KLF6,LOC100216001,LOC338588 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF6 48721 313 chr10 3891928 3896224 3894301 N NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 64455 314 chr10 3909418 3912785 3910988,3910838 N,N NA;NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 81945 315 chr10 3914901 3920161 3916328,3918063 Y,Y NA;KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 87428 316 chr10 3928235 3931519 3929893 N NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 100762 317 chr10 4092926 4094578 4093690 N NA NA LOC338588,LOC100216001,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 KLF6 265453 318 chr10 43852045 43859172 43857792 N NA HNRNPF HNRNPF,FXYD4,ZNF487P MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HNRNPF 45524 319 chr10 43914634 43917806 43915980 N NA HNRNPF,ZNF487P ZNF487P K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 HNRNPF 9938 320 chr10 44501844 44508207 44506539,44504189,44506569 N,N,N NA;NA;NA NA TMEM72-AS1,C10orf136,LOC100506835,LOC283033,CXCL12 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF32 357518 321 chr10 44514992 44518006 44516015 N NA NA LOC100506835 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF32 370666 322 chr10 45142158 45144818 45143878 Y NA NA TMEM72-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM72-AS1 310319 323 chr10 46204615 46207308 46205568 N NA ZFAND4,FAM21C NA NA NA NA FAM21C 15340 324 chr10 47564367 47567122 47565594 N NA NA LOC643650,ANXA8 IMR90 Hi-C 24141950 FAM21B 326901 325 chr10 47624672 47641956 47640362 N NA NA SYT15,PPYR1,LOC643650,GPRIN2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM21B 252067 326 chr10 49513139 49556247 49514619 N NA FRMPD2 FRMPD2,ARHGAP22,MAPK8 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FRMPD2 30198 327 chr10 49874254 49883087 49876176,49880284 Y,N WDFY4;NA WDFY4 ARHGAP22,WDFY4,C10orf71,ERCC6 IMR90 Hi-C 24141950 WDFY4 10431 328 chr10 52406427 52409420 52407661 N NA SGMS1 SGMS1 IMR90 Hi-C 24141950 SGMS1 22690 329 chr10 54723157 54727401 54725873 N NA NA NA NA NA NA CSTF2T 1263802 330 chr10 60726086 60730213 60727524 Y PHYHIPL,PHYHIPL,FAM13C,FAM13C NA NA NA NA NA PHYHIPL 206135 331 chr10 60744331 60747121 60745125 N NA NA NA NA NA NA PHYHIPL 189227 332 chr10 60751585 60759422 60753401,60756756 N,N NA;NA NA NA NA NA NA PHYHIPL 176926 333 chr10 60760539 60764101 60762099 N NA NA NA NA NA NA PHYHIPL 172247 334 chr10 60794854 60801667 60796523 N NA NA NA NA NA NA PHYHIPL 134681 335 chr10 60806796 60835353 60828264,60820779,60833121,60808302 N,Y,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA PHYHIPL 100995 336 chr10 60839666 60843180 60840964 N NA NA NA NA NA NA PHYHIPL 93168 337 chr10 60884666 60894314 60886383 N NA PHYHIPL NA NA NA NA PHYHIPL 42034 338 chr10 6110232 6112238 6110913 N NA IL2RA,RBM17 IL2RA,LOC399715,RBM17 IMR90 Hi-C 24141950 IL2RA 5899 339 chr10 6112742 6116311 6114585 Y IL2RA,RBM17,RBM17 IL2RA,RBM17 IL2RA,LOC399715,RBM17 IMR90 Hi-C 24141950 IL2RA 8409 340 chr10 64468909 64470317 64470067 Y NRBF2,EGR2,EGR2 NA ZNF365 IMR90 Hi-C 24141950 ADO 94199 341 chr10 64494413 64496941 64495723 Y NRBF2,EGR2,EGR2 NA EGR2,ZNF365,JMJD1C IMR90 Hi-C 24141950 ADO 67575 342 chr10 64668106 64672914 64671977 N NA NA ZNF365 IMR90 Hi-C 24141950 ADO 103590 343 chr10 64675845 64678137 64677461 N NA NA ZNF365 IMR90 Hi-C 24141950 ADO 111329 344 chr10 64751273 64753819 64752297 N NA NA ZNF365 IMR90 Hi-C 24141950 NRBF2 139188 345 chr10 67329147 67333099 67330664 N NA NA NA NA NA NA ANXA2P3 743862 346 chr10 67632169 67650115 67648622 N NA NA NA NA NA NA ANXA2P3 1046884 347 chr10 69523066 69525456 69524233 Y NA NA NA NA NA NA SIRT1 118971 348 chr10 69608712 69612247 69609602 N NA SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 SIRT1 32180 349 chr10 6969094 6971234 6969909 N NA NA LOC100507127,SFMBT2 IMR90 Hi-C 24141950 SFMBT2 482214 350 chr10 70802659 70806989 70804825 N NA SRGN DDX21,KIAA1279,VPS26A,SRGN,HKDC1 IMR90 Hi-C 24141950 SRGN 40839 351 chr10 70810271 70831014 70812790,70816814,70821526,70825588 N,N,Y,Y NA;NA;DDX21,VPS26A,SRGN;HK1,VPS26A,SRGN SRGN KIAA1279,SRGN,DDX21,VPS26A,SUPV3L1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRGN 16814 352 chr10 74017873 74024432 74020550,74023384 Y,N C10orf54,PSAP,DNAJB12,DDIT4;NA ANAPC16,ASCC1,DDIT4 DNAJB12 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 DDIT4 9245 353 chr10 7510548 7515407 7513879 N NA NA NA NA NA NA SFMBT2 57100 354 chr10 7532722 7535856 7534324 N NA NA NA NA NA NA SFMBT2 79274 355 chr10 75715524 75718542 75716818 N NA PLAU CAMK2G,PLAU,C10orf55,VCL,AP3M1,LOC100507331,KIAA0913,NDST2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLAU 44662 356 chr10 76497579 76500513 76498967 N NA NA ADK,KAT6B,DUPD1,DUSP13,SAMD8 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KAT6B 85658 357 chr10 77035212 77036959 77035996 N NA COMTD1 NA NA NA NA COMTD1 39442 358 chr10 77359300 77378505 77365623,77371213,77374485 N,N,N NA;NA;NA NA KCNMA1,C10orf11 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf11 164014 359 chr10 79441967 79444825 79443066 N NA NA KCNMA1 IMR90 Hi-C 24141950 DLG5 241523 360 chr10 80061615 80063746 80062904 N NA NA ZMIZ1,RPS24,LOC283050,LOC100132987,POLR3A IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 268097 361 chr10 81569108 81571846 81570455 N NA LOC642361 NA NA NA NA LOC642361 13812 362 chr10 81574184 81577212 81574802 N NA LOC642361 NA NA NA NA LOC642361 8446 363 chr10 82006237 82007980 82006939 N NA ANXA11 NA NA NA NA ANXA11 40909 364 chr10 82866649 82869507 82868548 N NA NA NA NA NA NA SH2D4B 568991 365 chr10 86322819 86324489 86323581 N NA NA GRID1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM190B 234409 366 chr10 88133456 88154440 88151043 N NA NA FAM190B,GRID1 IMR90 Hi-C 24141950 WAPAL 127101 367 chr10 88158139 88164243 88160798 Y OPN4,GRID1 NA WAPAL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WAPAL 117298 368 chr10 88169868 88174812 88171378,88173012 Y,Y NA;NA NA NA NA NA NA WAPAL 106729 369 chr10 89821274 89833151 89825784,89822731 N,N NA;NA NA RNLS,KLLN,PTEN IMR90 Hi-C 24141950 PTEN 198079 370 chr10 89838423 89843857 89841404 N NA NA PTEN,RNLS,KLLN IMR90 Hi-C 24141950 PTEN 215228 371 chr10 89865595 89884389 89870663,89868048,89873545,89877078 N,Y,N,N NA;KLLN,PTEN;NA;NA NA PTEN,KLLN,RNLS,CFL1P1,ATAD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTEN 242400 372 chr10 92736520 92739238 92737363 N NA NA PCGF5,ANKRD1 IMR90 Hi-C 24141950 RPP30 104811 373 chr10 92755049 92771985 92758592 Y NA NA ANKRD1,PCGF5,RPP30 IMR90 Hi-C 24141950 RPP30 123340 374 chr10 92918092 92952357 92923133 N NA PCGF5 ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PCGF5 27551 375 chr10 96943058 96944696 96943715 N NA NA SORBS1,C10orf129 IMR90 Hi-C 24141950 PDLIM1 106085 376 chr10 970954 987126 976140,977822 Y,N NA;NA LARP4B,GTPBP4 LARP4B,DIP2C,GTPBP4,IDI1,IDI2-AS1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LARP4B 39252 377 chr10 98045152 98052484 98047071,98050751 N,N NA;NA BLNK LOC728558,CC2D2B,DNTT,BLNK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BLNK 13819 378 chr10 989132 991921 989992 N NA GTPBP4 LARP4B,DIP2C,GTPBP4,IDI2-AS1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTPBP4 42428 379 chr11 102415496 102426349 102417486,102423774 N,N NA;NA NA TMEM123,MMP20,BIRC2,MMP7 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 91721 380 chr11 10387088 10394979 10388247 Y ADM NA SBF2,ADM,LOC283104,AMPD3,MRVI1,MRVI1-AS1,CTR9,SWAP70,LOC440028,RNF141 IMR90 Hi-C 24141950 ADM 60446 381 chr11 107603064 107603891 107603221 N NA NA NA NA NA NA SLC35F2 126023 382 chr11 107733990 107738266 107735080 N NA SLC35F2 SLC35F2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC35F2 4076 383 chr11 109815664 109819623 109817068 N NA NA DDX10,ZC3H12C,FDX1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZC3H12C 144464 384 chr11 109842584 109844658 109843302 N NA NA NA NA NA NA ZC3H12C 119429 385 chr11 109853641 109857170 109855381 N NA NA ZC3H12C IMR90 Hi-C 24141950 ZC3H12C 106917 386 chr11 109896658 109899945 109899333 N NA NA ZC3H12C IMR90 Hi-C 24141950 ZC3H12C 64142 387 chr11 109946660 109948975 109948063 N NA ZC3H12C ZC3H12C MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZC3H12C 15112 388 chr11 110197503 110218019 110199357 N NA RDX C11orf53,RDX IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RDX 30066 389 chr11 110218784 110228360 110219875 N NA NA C11orf53,RDX IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RDX 51347 390 chr11 110821025 110823567 110822738 N NA NA ARHGAP20,FDX1,POU2AF1 IMR90 Hi-C 24141950 POU2AF1 426590 391 chr11 111031792 111043112 111041586 N NA NA ARHGAP20,FDX1 IMR90 Hi-C 24141950 POU2AF1 207045 392 chr11 111046868 111049551 111048522,111048023 N,N NA;NA NA ARHGAP20,FDX1,C11orf53 IMR90 Hi-C 24141950 POU2AF1 200606 393 chr11 11190581 11194820 11191910,11192689 N,N NA;NA NA GALNTL4 IMR90 Hi-C 24141950 LOC729013 310817 394 chr11 115634923 115638925 115636763 Y NA NA CADM1 IMR90 Hi-C 24141950 BUD13 1004789 395 chr11 115787001 115804327 115799084,115790325 N,N NA;NA NA CADM1,LOC283143 IMR90 Hi-C 24141950 BUD13 839387 396 chr11 115812791 115813969 115812875 N NA NA CADM1 IMR90 Hi-C 24141950 BUD13 829745 397 chr11 115844399 115847604 115846269 N NA NA CADM1 IMR90 Hi-C 24141950 BUD13 796110 398 chr11 115942917 115947032 115945097 N NA NA CADM1 IMR90 Hi-C 24141950 BUD13 696682 399 chr11 117814854 117817129 117815605 N NA IL10RA DSCAML1,TMPRSS13,TMPRSS4,LOC100526771,FXYD6-FXYD2 IMR90 Hi-C 24141950 IL10RA 39977 400 chr11 118689672 118692894 118691085 N NA DDX6 DDX6,PHLDB1,UPK2,TREH,CXCR5,BCL9L,MIR4492,FOXR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDX6 27700 401 chr11 118708833 118711033 118709599 N NA DDX6 DDX6,UPK2,FOXR1,TREH,PHLDB1,BCL9L,CXCR5,MIR4492,RPS25,SLC37A4,TRAPPC4,CCDC84,RPL23AP64 IMR90 Hi-C 24141950 DDX6 46861 402 chr11 119620712 119718453 119692476,119623834 N,N NA;NA PVRL1 PVRL1,TRIM29,LOC100499227,GRIK4 IMR90 Hi-C 24141950 PVRL1 21277 403 chr11 120482576 120489804 120484295 N NA NA GRIK4 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF12 274958 404 chr11 121105856 121110517 121108224 N NA NA SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SC5DL 52871 405 chr11 121242054 121244478 121243864 N NA NA SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 78434 406 chr11 123172173 123175409 123174119,123172192 N,N NA;NA NA CLMP IMR90 Hi-C 24141950 HSPA8 239272 407 chr11 123299915 123303672 123301392 N NA NA CLMP IMR90 Hi-C 24141950 ZNF202 308691 408 chr11 124587033 124590092 124587846 N NA SIAE,NRGN,VSIG2,ESAM NA NA NA NA NRGN 19737 409 chr11 124593211 124597224 124595061 N NA SIAE,NRGN,VSIG2,ESAM NA NA NA NA NRGN 12605 410 chr11 127493580 127496992 127494933 N NA NA NA NA NA NA FLI1 1066819 411 chr11 128158769 128170772 128161055,128168730 N,N NA;NA NA ETS1,FLI1,LOC100507392,KCNJ1 IMR90 Hi-C 24141950 FLI1 393039 412 chr11 128281695 128297212 128285655,128282952 N,N NA;NA NA ETS1,FLI1 IMR90 Hi-C 24141950 FLI1 266599 413 chr11 128477369 128482966 128481023 Y ETS1,FLI1,FLI1 NA ETS1 IMR90 Hi-C 24141950 FLI1 80845 414 chr11 128492299 128501951 128495009,128498469,128500770 N,N,N NA;NA;NA NA ETS1,FLI1,KCNJ1 IMR90 Hi-C 24141950 FLI1 61860 415 chr11 130961168 130978679 130972723,130965142 N,N NA;NA NA NTM IMR90 Hi-C 24141950 SNX19 174786 416 chr11 131037122 131042599 131041004 N NA NA NTM IMR90 Hi-C 24141950 SNX19 250740 417 chr11 1403336 1405573 1404635 Y DUSP8,BRSK2 NA TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOLLIP 72444 418 chr11 17228241 17231871 17229584 N NA PIK3C2A NA NA NA NA PIK3C2A 36887 419 chr11 1850148 1852687 1852066 N NA LSP1 NA NA NA NA LSP1 21513 420 chr11 18841137 18844676 18842765 N NA NA SERGEF IMR90 Hi-C 24141950 SPTY2D1 185117 421 chr11 22677463 22682671 22678924 N NA FANCF,GAS2 NA NA NA NA GAS2 5489 422 chr11 27228838 27236048 27231421,27234655 N,N NA;NA NA LGR4,LIN7C,CCDC34,BDNF-AS1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIN7C 292278 423 chr11 33933334 33936066 33934157 N NA NA LMO2 IMR90 Hi-C 24141950 CAPRIN1 137164 424 chr11 35056588 35059837 35058118 N NA NA CD44,SLC1A2,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 CD44 100580 425 chr11 35060767 35063371 35062059 Y CD44 NA CD44,SLC1A2,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 CD44 97046 426 chr11 35069639 35073144 35071853 N NA NA CD44,PDHX,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 CD44 87273 427 chr11 35098026 35106575 35099734,35104683 N,Y NA;CD44 NA CD44,PDHX,APIP,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 CD44 53842 428 chr11 35108143 35114061 35110409 N NA CD44 CD44,PDHX,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 CD44 46356 429 chr11 35146433 35155864 35148105 N NA CD44 PDHX,APIP,CD44,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 CD44 4553 430 chr11 354233 356986 355805 N NA IFITM2,IFITM1,IFITM3 SIRT3,RIC8A,SCGB1C1,ODF3,BET1L,PSMD13,NLRP6,ATHL1,IFITM1,SIGIRR,ANO9,PKP3,IFITM2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFITM3 33319 431 chr11 41809980 41812883 41811171 N NA NA NA NA NA NA API5 1520622 432 chr11 42823539 42825317 42824286 N NA NA NA NA NA NA API5 508188 433 chr11 43165584 43169030 43167336 N NA NA NA NA NA NA API5 164475 434 chr11 43544075 43545471 43545342 N NA NA NA NA NA NA HSD17B12 156672 435 chr11 43665013 43673844 43665753 N NA HSD17B12 HSD17B12 IMR90 Hi-C 24141950 HSD17B12 28299 436 chr11 44580030 44584045 44581280 Y CD82 CD82 EXT2,ALX4,CD82,TSPAN18,TP53I11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD82 3096 437 chr11 45376242 45380683 45376975 N NA NA CHST1,PRDM11,SYT13,EXT2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC35C1 444940 438 chr11 46263269 46267111 46265004 Y NA NA DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DGKZ 87344 439 chr11 46286688 46290042 46287718 N NA NA CREB3L1,DGKZ IMR90 Hi-C 24141950 DGKZ 64413 440 chr11 47410714 47418682 47412829,47416665 Y,N MADD,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1;NA SPI1,SLC39A13,PSMC3 SPI1,SLC39A13 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SPI1 10587 441 chr11 50261847 50263037 50262358 N NA NA NA NA NA NA NUP160 2391790 442 chr11 5591893 5593870 5592843 N NA TRIM6-TRIM34 NA NA NA NA TRIM6-TRIM34 23995 443 chr11 5829300 5831400 5829763,5830251 N,N NA;NA NA OR51B5,TRIM6-TRIM34,UBQLN3,OR52N2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIM22 118483 444 chr11 58421919 58423673 58422643 N NA NA NA NA NA NA ZFP91-CNTF 75332 445 chr11 58863760 58870983 58869940,58865659 N,N NA;NA FAM111B,FAM111A FAM111B IMR90 Hi-C 24141950 FAM111B 3675 446 chr11 59050194 59053740 59051837 N NA NA NA NA NA NA MPEG1 69700 447 chr11 65241738 65246724 65244974 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 MALAT1,SCYL1 SCYL1,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 18509 448 chr11 65253834 65257588 65255712 N NA MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612,POLA2,DPF2,SLC25A45,TIGD3,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 7645 449 chr11 6754473 6768900 6767382 N NA MRPL17,GVINP1 APBB1,TRIM3,NLRP14,SYT9 IMR90 Hi-C 24141950 GVINP1 11363 450 chr11 68048625 68055748 68049755 Y NA C11orf24 NDUFS8,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,C11orf24,LRP5,PPP6R3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C11orf24 9156 451 chr11 68922208 68935952 68923882,68934137 N,N NA;NA NA ORAOV1,CCND1,FGF19,MYEOV IMR90 Hi-C 24141950 TPCN2 105858 452 chr11 68976197 68979176 68977947 N NA NA ORAOV1,MYEOV,CCND1,FGF19 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TPCN2 159847 453 chr11 70962220 70965518 70964188 N NA NA FLJ42102,SHANK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHCR7 193959 454 chr11 72862616 72868819 72864766,72868240 N,N NA;NA FCHSD2 STARD10,FCHSD2,ATG16L2,ARAP1,MIR4692,P2RY2,P2RY6,ARHGEF17 IMR90 Hi-C 24141950 FCHSD2 9473 455 chr11 73489278 73492175 73490620 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 6742 456 chr11 74758399 74762827 74760581 N NA NA SLCO2B1,SPCS2,XRRA1,OR2AT4 IMR90 Hi-C 24141950 NEU3 58449 457 chr11 74810765 74813003 74811541 N NA SLCO2B1 XRRA1,LOC100507050,OR2AT4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLCO2B1 49029 458 chr11 75945791 75947690 75946754 N NA WNT11 C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WNT11 28217 459 chr11 80525664 80528878 80527069 N NA NA NA NA NA NA PRCP 2082679 460 chr11 85825910 85833431 85827537,85832073 N,N NA;NA PICALM PICALM,C11orf73,CCDC83,EED IMR90 Hi-C 24141950 PICALM 44987 461 chr11 85848992 85851420 85850069 Y PICALM,PICALM NA PICALM,EED IMR90 Hi-C 24141950 PICALM 68069 462 chr11 85912187 85914627 85913485 N NA EED PICALM,CCDC83,EED IMR90 Hi-C 24141950 EED 41179 463 chr11 88089641 88096777 88090337,88092673 N,N NA;NA CTSC CTSC,GRM5 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CTSC 18700 464 chr11 9383697 9387381 9386092 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 TMEM41B,IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 18788 465 chr11 94985828 94991518 94987691,94989701 Y,N NA;NA NA NA NA NA NA ENDOD1 162854 466 chr11 95069730 95072000 95070855 N NA NA SESN3 IMR90 Hi-C 24141950 ENDOD1 246756 467 chr11 95432490 95434666 95433456 N NA NA SESN3,SRSF8,ENDOD1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM76B 88288 468 chr11 95443049 95445689 95444845 N NA NA SESN3,SRSF8,ENDOD1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM76B 77265 469 chr11 95446959 95449966 95449117 Y FAM76B NA SESN3,ENDOD1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM76B 72988 470 chr11 9634319 9637543 9635303 N NA WEE1,SWAP70 WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WEE1 39091 471 chr11 9649440 9651358 9650626 N NA SWAP70 SBF2,SWAP70,WEE1,ADM IMR90 Hi-C 24141950 SWAP70 34270 472 chr12 102247731 102253643 102249655,102252204 N,Y NA;DRAM1 GNPTAB,DRAM1 GNPTAB,DRAM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DRAM1 17462 473 chr12 102876725 102881185 102878027 N NA IGF1 NA NA NA NA IGF1 2347 474 chr12 102906453 102908079 102906822 N NA IGF1 IGF1 IMR90 Hi-C 24141950 IGF1 32075 475 chr12 103128236 103129593 103129151 N NA NA IGF1 IMR90 Hi-C 24141950 IGF1 253858 476 chr12 103495258 103497793 103496343 Y NA NA NA NA NA NA IGF1 620880 477 chr12 103536847 103539470 103538274 N NA NA NA NA NA NA IGF1 662469 478 chr12 105343393 105353623 105352164 N NA SLC41A2,C12orf45 CHST11,SLC41A2,TXNRD1,C12orf45,ALDH1L2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC41A2 20921 479 chr12 105685181 105694108 105692481 N NA C12orf75 C12orf75,APPL2,KIAA1033 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf75 30306 480 chr12 110516466 110519521 110517780 Y GIT2,RAD9B,C12orf76 C12orf76,IFT81 C12orf76 K562 ChIA-PET 22265404 C12orf76 10966 481 chr12 111027699 111031898 111028822 Y ARPC3,PPTC7,HVCN1 PPTC7,TCTN1 GPN3,FAM216A,RAD9B,VPS29,PPTC7,TCTN1,PPP1CC IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPTC7 6635 482 chr12 111042725 111045625 111043720 Y ARPC3,PPTC7,HVCN1,HVCN1 PPTC7,TCTN1 GPN3,FAM216A,RAD9B,PPTC7,C12orf76,TCTN1,ARPC3,VPS29,HVCN1,PPP1CC IMR90 Hi-C 24141950 TCTN1 6207 483 chr12 115791187 115793257 115792542 N NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00173 1177983 484 chr12 115812508 115813755 115813106 N NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00173 1157485 485 chr12 120728254 120731165 120730474 N NA SIRT4 PXN,GCN1L1,LOC100506649,RPLP0,RAB35,SIRT4,CCDC64,DYNLL1,SRSF9,RNF10,COX6A1,PLA2G1B,MSI1,LOC100506668,COQ5,TRIAP1,GATC IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIRT4 8959 486 chr12 12131836 12136664 12134505 N NA NA ETV6,GPR19,LOC338817 IMR90 Hi-C 24141950 BCL2L14 87214 487 chr12 121496131 121499477 121497957 N NA C12orf43,OASL SPPL3,UNC119B,ACADS,C12orf43,HNF1A,OASL,LOC100506668,DYNLL1,MLEC,P2RX7,P2RX4,CAMKK2,RNF10,POP5,CABP1,HNF1A-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 OASL 19351 488 chr12 121529993 121531343 121530682 N NA NA MLEC,CAMKK2,P2RX4,ACADS,RNF10,CABP1,POP5,UNC119B,SPPL3,C12orf43,P2RX7,OASL IMR90 Hi-C 24141950 OASL 53213 489 chr12 12159994 12166791 12163133 Y ETV6,BCL2L14 NA ETV6,LOC338817,CDKN1B IMR90 Hi-C 24141950 BCL2L14 57087 490 chr12 12175384 12179970 12178209 N NA BCL2L14 ETV6,LOC338817,CDKN1B IMR90 Hi-C 24141950 BCL2L14 43908 491 chr12 12183799 12190778 12185606,12189182 N,N NA;NA BCL2L14 ETV6,LOC338817,CDKN1B,BCL2L14,MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1,GPR19 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCL2L14 33100 492 chr12 122026750 122049717 122028622 Y RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1 KDM2B,ORAI1 KDM2B,ANAPC5,CAMKK2,ORAI1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KDM2B 7830 493 chr12 122123558 122126321 122124934 Y P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3 TMEM120B MORN3,LOC338799,SETD1B,RHOF K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM120B 24337 494 chr12 125196758 125199666 125198454 Y NCOR2,UBC NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 NCOR2 144748 495 chr12 125357717 125359555 125359141 N NA SCARB1,UBC SCARB1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SCARB1 9198 496 chr12 125532687 125535668 125534240 Y NA AACS AACS,DHX37,BRI3BP K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AACS 14257 497 chr12 12734060 12737577 12735384,12736178 N,Y NA;NA DUSP16,CREBL2 LOH12CR1,LOH12CR2,DUSP16,GPR19,CDKN1B,CREBL2,APOLD1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP16 18612 498 chr12 127567547 127569061 127568069 Y NA NA NA NA NA NA SLC15A4 1739480 499 chr12 127609606 127612013 127610366 N NA NA NA NA NA NA SLC15A4 1696528 500 chr12 131722618 131725941 131724381 N NA NA LOC116437 IMR90 Hi-C 24141950 RAN 366001 501 chr12 132087843 132089189 132088163 N NA NA GPR133 IMR90 Hi-C 24141950 SFSWAP 106446 502 chr12 132090923 132093540 132092292 N NA NA GPR133 IMR90 Hi-C 24141950 SFSWAP 102095 503 chr12 14372867 14374218 14374026 N NA NA GUCY2C IMR90 Hi-C 24141950 ATF7IP 144393 504 chr12 14391377 14395121 14393242 N NA NA ATF7IP,GUCY2C,PLBD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATF7IP 123490 505 chr12 14408559 14411962 14410065 N NA NA PLBD1,ATF7IP IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATF7IP 106649 506 chr12 14425898 14428269 14426705 N NA NA NA NA NA NA ATF7IP 90342 507 chr12 14435086 14450258 14437013 N NA NA NA NA NA NA ATF7IP 68353 508 chr12 16863533 16910951 16910013 N NA NA NA NA NA NA LMO3 102385 509 chr12 16923445 16967370 16951970 N NA NA NA NA NA NA LMO3 162297 510 chr12 16973502 17021553 16985842,17011850,17001443,17015752,16990669 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA SKP1P2 120128 511 chr12 17102050 17104188 17103284 N NA SKP1P2 NA NA NA NA SKP1P2 37493 512 chr12 1710290 1713409 1710866 N NA FBXL14,WNT5B FBXL14,RAD52,ERC1,WNT5B,WNK1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FBXL14 6959 513 chr12 1713922 1717680 1715310 N NA FBXL14,WNT5B FBXL14,RAD52,ERC1,WNT5B,WNK1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WNT5B 8542 514 chr12 17322186 17323591 17323002 N NA NA NA NA NA NA SKP1P2 180505 515 chr12 19584198 19586035 19585068 N NA AEBP2 AEBP2 IMR90 Hi-C 24141950 AEBP2 6573 516 chr12 22576178 22577956 22577493 N NA NA NA NA NA NA KIAA0528 119496 517 chr12 25536491 25540962 25539224 Y NA NA BCAT1,CASC1,KRAS,LYRM5,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 132637 518 chr12 26308135 26311305 26309601 N NA BHLHE41 ITPR2,BHLHE41,SSPN IMR90 Hi-C 24141950 BHLHE41 30132 519 chr12 26423754 26429022 26424930,26427754 N,Y NA;NA NA SSPN,BHLHE41,ITPR2 IMR90 Hi-C 24141950 BHLHE41 145751 520 chr12 27313125 27318564 27314678,27317538 N,N NA;NA NA STK38L,TM7SF3,ARNTL2,C12orf71,MED21 IMR90 Hi-C 24141950 STK38L 78514 521 chr12 27330584 27334762 27332451 N NA NA STK38L,MED21,TM7SF3,REP15,PPFIBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STK38L 62316 522 chr12 27337670 27339745 27338522 N NA NA STK38L,MED21,TM7SF3,REP15,PPFIBP1,C12orf71 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STK38L 57333 523 chr12 27358138 27362766 27360739 N NA STK38L STK38L IMR90 Hi-C 24141950 STK38L 34312 524 chr12 27372029 27378576 27373300,27375262 N,N NA;NA STK38L STK38L,ARNTL2,PPFIBP1,REP15,MED21 IMR90 Hi-C 24141950 STK38L 18502 525 chr12 27390243 27392720 27391403 Y ITPR2,STK38L STK38L STK38L IMR90 Hi-C 24141950 STK38L 4358 526 chr12 28341414 28349400 28343325 N NA NA KLHDC5,CCDC91 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC91 60733 527 chr12 29299188 29310618 29302242 N NA NA FAR2 IMR90 Hi-C 24141950 ERGIC2 223525 528 chr12 31404228 31405640 31405181 N NA NA LOC100506660 IMR90 Hi-C 24141950 FLJ13224 71610 529 chr12 31768443 31770072 31769358 N NA METTL20 DENND5B IMR90 Hi-C 24141950 METTL20 30022 530 chr12 31954590 31966296 31957569,31961064,31964387 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA AMN1 72482 531 chr12 32026425 32030376 32028426 N NA NA NA NA NA NA C12orf35 81977 532 chr12 32047520 32053030 32049242 N NA NA AMN1 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf35 59323 533 chr12 32080297 32083136 32082009 N NA C12orf35 NA NA NA NA C12orf35 29217 534 chr12 34357028 34358269 34357657 N NA NA NA NA NA NA ALG10 181812 535 chr12 34369491 34372406 34371902 N NA NA NA NA NA NA ALG10 194275 536 chr12 40551639 40553735 40552560 Y NA NA LRRK2 GM12878 5C 22955621 LRRK2 65078 537 chr12 40585494 40588882 40586841 N NA LRRK2 NA NA NA NA LRRK2 29931 538 chr12 40953270 40960075 40955044 N NA NA NA NA NA NA LRRK2 334457 539 chr12 4243926 4247437 4245814 N NA NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 CCND2 135465 540 chr12 4248552 4257741 4252211,4255663,4257641 Y,Y,Y EFCAB4B,PARP11,CCND2,C12orf4;CCND2;PARP11,C12orf4 NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 CCND2 125161 541 chr12 4260558 4264107 4262811 Y EFCAB4B,PARP11,C12orf4 NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 CCND2 118795 542 chr12 4272507 4275737 4274218 Y CCND2 NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 CCND2 107165 543 chr12 4323337 4326566 4324863 N NA NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 CCND2 56336 544 chr12 4369143 4371984 4371088 N NA CCND2 NA NA NA NA CCND2 10918 545 chr12 46459056 46460496 46459614 N NA NA NA NA NA NA SCAF11 74655 546 chr12 46783945 46789691 46785093 N NA SLC38A2 NA NA NA NA SLC38A2 17300 547 chr12 47784200 47787036 47785074 N NA NA AMIGO2,RPAP3 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100233209 173974 548 chr12 49625768 49629984 49628382 Y LMBR1L,TUBA1A TUBA1A,TUBA1C RHEBL1,DHH,LMBR1L,TUBA1A,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1C 28881 549 chr12 52507634 52515184 52512849 N NA C12orf44 ACVR1B,NR4A1,GRASP,KRT8 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C12orf44 43876 550 chr12 53266584 53269879 53268053 Y PFDN5 NA KRT18,KRT8,LOC283403,KRT80,EIF4B,LOC283404 MCF7 ChIA-PET 22265404 EIF4B 130183 551 chr12 53763945 53767660 53765119 Y CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13 AAAS,SP1 SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP1 6319 552 chr12 54144122 54156847 54145239,54150419 Y,N NA;NA CALCOCO1 ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5,HOXC8,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,HNRNPA1,HOXC10,HOXC11,HOXC13,HOTAIR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALCOCO1 22815 553 chr12 55383673 55386429 55385111 N NA KIAA0748 NA NA NA NA KIAA0748 5217 554 chr12 56768064 56770988 56769330 N NA PAN2,IL23A,STAT2 COQ10A,ANKRD52,CS,PAN2,STAT2,APOF,MIP,TIMELESS IMR90 Hi-C 24141950 STAT2 14027 555 chr12 58291057 58293720 58293001 N NA LOC100506844,XRCC6BP1 CTDSP2,METTL1,CYP27B1,METTL21B,AVIL,TSFM,TSPAN31,CDK4,MARCH9,AGAP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100506844 36227 556 chr12 59989796 60001537 59990859 N NA NA NA NA NA NA LRIG3 675534 557 chr12 62640664 62646033 62645288 N NA USP15 USP15 MCF7 ChIA-PET 22265404 USP15 8088 558 chr12 63693567 63700085 63698788,63696417 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TMEM5 473552 559 chr12 6387112 6388132 6387656 N NA NA VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFRSF1A 63151 560 chr12 65549589 65550903 65550379 N NA LEMD3 LEMD3 MCF7 ChIA-PET 22265404 LEMD3 12448 561 chr12 68381246 68424929 68384097,68406615 N,N NA;NA NA IFNG IMR90 Hi-C 24141950 MDM1 301232 562 chr12 68434514 68443716 68436289 N NA NA NA NA NA NA MDM1 282445 563 chr12 68810543 68813444 68812587 N NA NA NA NA NA NA MDM1 84382 564 chr12 68831604 68846869 68836476,68845229,68833811,68841359 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA RAP1B,SNORA70G,LOC100507250,NUP107 IMR90 Hi-C 24141950 MDM1 105443 565 chr12 68848546 68850593 68849582 N NA NA NUP107,LOC100507250 IMR90 Hi-C 24141950 MDM1 122385 566 chr12 68874153 68878776 68875916 N NA NA LOC100507250 IMR90 Hi-C 24141950 RAP1B 125843 567 chr12 68889514 68891514 68890954 N NA NA RAP1B,IL26 IMR90 Hi-C 24141950 RAP1B 113105 568 chr12 69723924 69725489 69724824 N NA YEATS4 CPSF6,YEATS4 K562 ChIA-PET 22265404 YEATS4 28043 569 chr12 70862645 70872725 70863372 N NA NA NA NA NA NA CNOT2 225871 570 chr12 76370407 76373881 76372637 N NA NA OSBPL8,PHLDA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHLDA1 51675 571 chr12 76374857 76377442 76376204 Y NA PHLDA1 PHLDA1,KRR1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PHLDA1 48114 572 chr12 781054 788437 781392,783353,786568,788336 N,Y,N,Y NA;NA;NA;NA NINJ2 CCDC77,NINJ2,B4GALNT3,WNK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NINJ2 8299 573 chr12 793409 795712 794649 Y CCDC77,KDM5A NINJ2 NINJ2,WNK1,B4GALNT3 IMR90 Hi-C 24141950 NINJ2 20654 574 chr12 8110255 8115478 8113466 N NA SLC2A3 SLC2A3 K562 ChIA-PET 22265404 SLC2A3 21363 575 chr12 8117869 8125752 8123677,8125137 Y,N CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3;NA SLC2A3 SLC2A3,FOXJ2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC2A3 28977 576 chr12 8177569 8180925 8179287 Y NA FOXJ2 PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 4434 577 chr12 827132 830368 828877 N NA WNK1 NINJ2,WNK1,B4GALNT3 IMR90 Hi-C 24141950 WNK1 31721 578 chr12 85862738 85863798 85863208 N NA NA NTS IMR90 Hi-C 24141950 C12orf29 2565470 579 chr12 90159375 90161405 90160158 N NA NA LOC338758,C12orf37 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LOC338758 56643 580 chr12 90255463 90259191 90257153 N NA NA LOC338758 IMR90 Hi-C 24141950 LOC338758 152731 581 chr12 90273513 90277255 90274707,90276000 Y,N POC1B,ATP2B1;NA NA LOC338758 IMR90 Hi-C 24141950 LOC338758 170781 582 chr12 90352181 90357505 90353823 N NA NA ATP2B1,LOC338758,C12orf37 IMR90 Hi-C 24141950 LOC338758 249449 583 chr12 92170900 92174252 92172714 N NA NA LOC256021 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC256021 362195 584 chr12 92542210 92553771 92552896,92543417 N,N NA;NA LOC256021 CLLU1OS,CLLU1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC256021 5763 585 chr12 92563921 92569550 92563970,92566196 N,N NA;NA LOC256021 LOC256021 K562 ChIA-PET 22265404 LOC256021 27474 586 chr12 92600533 92603960 92602421 N NA NA LOC256021 K562 ChIA-PET 22265404 LOC256021 64086 587 chr12 92755301 92759905 92756991 N NA NA NA NA NA NA CLLU1OS 62019 588 chr12 92854181 92892045 92855894,92861091,92864354,92880425,92883124 N,N,Y,N,N NA;NA;BTG1,C12orf74,CLLU1OS;NA;NA CLLU1OS NA NA NA NA CLLU1OS 32257 589 chr12 92894103 92901970 92897314,92899237 Y,N BTG1,CLLU1;NA NA LOC256021 MCF7 ChIA-PET 22265404 CLLU1OS 72179 590 chr12 92922768 92925088 92923886 N NA NA NA NA NA NA CLLU1OS 100844 591 chr12 92930918 92971625 92931306,92933861,92940812,92937885,92946785,92955582,92964064,92950903 N,N,Y,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA LOC256021 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLLU1OS 108994 592 chr12 92986242 93011499 92987090 N NA NA DCN,LOC256021 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C12orf74 85120 593 chr12 93333634 93349164 93335268 N NA EEA1 EEA1,UBE2N,LOC643339,NUDT4 IMR90 Hi-C 24141950 EEA1 10527 594 chr12 94033582 94035625 94034525 N NA NA SOCS2,LOC144481,CRADD IMR90 Hi-C 24141950 LOC144481 68408 595 chr12 9513362 9519306 9514521,9517372 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LOC642846 77109 596 chr12 95185813 95213873 95209881 N NA NA TMCC3,PLXNC1,NDUFA12 IMR90 Hi-C 24141950 TMCC3 141489 597 chr12 95267650 95270454 95269540 N NA NA NA NA NA NA NDUFA12 127057 598 chr12 96894464 96897863 96895537 N NA NA ELK3,CDK17,LTA4H,AMDHD1,CCDC38 IMR90 Hi-C 24141950 CDK17 100098 599 chr12 96965585 96968359 96966446 N NA NA NA NA NA NA CDK17 171219 600 chr12 97113075 97117868 97113959 N NA NA NA NA NA NA NEDD1 183133 601 chr12 9916289 9919235 9917431 Y KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D,OLR1,KLRF1,GABARAPL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CD69 CLECL1,CD69 NA NA NA NA CD69 2792 602 chr13 100071382 100079057 100072709,100077783 Y,N GPR18,GPR183;NA NA UBAC2,MIR548AN,GPR18,DOCK9,UBAC2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TM9SF2 74671 603 chr13 100084093 100090061 100085119,100086684 Y,Y GPR183;GPR183 NA MIR548AN,UBAC2,DOCK9,UBAC2-AS1,TM9SF2,GPR18 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM9SF2 63667 604 chr13 103092233 103093483 103092664 N NA LOC283481 NA NA NA NA LOC283481 45305 605 chr13 103243308 103246333 103244692 N NA TPP2 TPP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TPP2 2953 606 chr13 103657400 103663625 103659600,103660245 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SLC10A2 55571 607 chr13 103781526 103788312 103783326,103784948 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SLC10A2 62330 608 chr13 105791085 105793621 105792347 N NA NA NA NA NA NA ARGLU1 1426893 609 chr13 109227329 109229349 109227910 N NA NA NA NA NA NA TNFSF13B 305352 610 chr13 111570790 111573767 111573389 N NA ANKRD10 ANKRD10 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ANKRD10 3374 611 chr13 111580644 111582409 111581583 N NA ANKRD10 ARHGEF7 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 13228 612 chr13 19184882 19187567 19186070 N NA NA NA NA NA NA ANKRD26P3 731546 613 chr13 20152902 20162692 20161212 N NA MPHOSPH8 NA NA NA NA MPHOSPH8 45096 614 chr13 20175090 20195832 20175999 N NA MPHOSPH8 MPHOSPH8,ZMYM5 MCF7 ChIA-PET 22265404 MPHOSPH8 11956 615 chr13 21648794 21651381 21649932 N NA NA LATS2,SAP18 IMR90 Hi-C 24141950 SAP18 63272 616 chr13 21870857 21876410 21872243 N NA NA ZDHHC20 MCF7 ChIA-PET 22265404 SKA3 120116 617 chr13 21899548 21902597 21901431 N NA NA ZDHHC20 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC20 130911 618 chr13 21918442 21920000 21918971 N NA NA ZDHHC20 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC20 113508 619 chr13 22634213 22638300 22636404 Y EFHA1 NA NA NA NA NA EFHA1 455858 620 chr13 22687668 22691169 22688969 Y NA NA FGF9 IMR90 Hi-C 24141950 EFHA1 509313 621 chr13 23488759 23491517 23490150 N NA NA NA NA NA NA SPATA13 1243344 622 chr13 24539961 24542813 24541107 N NA NA SPATA13 IMR90 Hi-C 24141950 SPATA13 192048 623 chr13 24552310 24555711 24553912 N NA NA SPATA13 IMR90 Hi-C 24141950 SPATA13 179150 624 chr13 24578929 24581856 24580020 N NA NA SPATA13 IMR90 Hi-C 24141950 SPATA13 153005 625 chr13 25591503 25593935 25592266 N NA NA NA NA NA NA PABPC3 76341 626 chr13 25754865 25756255 25755756 N NA NA NA NA NA NA PABPC3 84589 627 chr13 29096618 29100251 29098549 N NA FLT1 FLT1,PAN3,POMP IMR90 Hi-C 24141950 FLT1 27353 628 chr13 29104228 29109081 29106156 Y NA FLT1 FLT1,PAN3,POMP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FLT1 34963 629 chr13 29113797 29116395 29114530 N NA FLT1 FLT1,POMP,PAN3 IMR90 Hi-C 24141950 FLT1 44532 630 chr13 30718811 30722210 30720371 N NA NA UBL3,KATNAL1,HMGB1,USPL1,ALOX5AP,LINC00426,TEX26-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00426 225826 631 chr13 30967417 30971298 30969408 N NA LINC00426 LINC00426,KATNAL1,HMGB1,USPL1,UBL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00426 19381 632 chr13 31003327 31007536 31005403 N NA HMGB1 KATNAL1,LINC00426,HMGB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HMGB1 32545 633 chr13 31369397 31371700 31370816 N NA NA ALOX5AP,USPL1,KATNAL1,HMGB1,UBL3,TEX26-AS1,C13orf33,TEX26 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USPL1 177567 634 chr13 31647175 31650300 31648741 N NA NA ALOX5AP,TEX26,HSPH1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HSPH1 85817 635 chr13 34301151 34305595 34302674 N NA NA NA NA NA NA STARD13 50219 636 chr13 34361140 34362243 34361704 N NA RFC3 NBEA IMR90 Hi-C 24141950 RFC3 29963 637 chr13 35323343 35326700 35324944 N NA NA NA NA NA NA RFC3 931137 638 chr13 42927738 42930670 42928907 Y TNFSF11,TNFSF11,DGKH,AKAP11 NA AKAP11 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP11 81449 639 chr13 42942899 42945466 42943395 N NA NA NA NA NA NA AKAP11 96610 640 chr13 42950111 42956877 42953744 N NA NA NA NA NA NA AKAP11 103822 641 chr13 42967322 42974432 42969828,42972674 Y,N TNFSF11,TNFSF11,DGKH,AKAP11;NA NA NA NA NA NA AKAP11 121033 642 chr13 42975601 42999221 42979985,42986689,42976359 Y,N,N TNFSF11,TNFSF11,AKAP11;NA;NA NA NA NA NA NA AKAP11 129312 643 chr13 43097579 43100852 43098836 N NA TNFSF11 ENOX1 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF11 36020 644 chr13 45341602 45343761 45342342 N NA NA TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1,LINC00330 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1-AS1 191570 645 chr13 45682077 45683951 45683042 N NA GTF2F2 GTF2F2,KCTD4 IMR90 Hi-C 24141950 GTF2F2 10680 646 chr13 46261204 46273903 46269572,46271303 N,N NA;NA SPERT NA NA NA NA SPERT 2543 647 chr13 46784896 46786808 46786007 N NA LCP1 NA NA NA NA LCP1 28437 648 chr13 49142199 49147399 49145210 N NA RCBTB2 RB1,LPAR6,RCBTB2,ITM2B IMR90 Hi-C 24141950 RCBTB2 34883 649 chr13 49151197 49167160 49153343,49161221,49165076 Y,N,N FNDC3A,ITM2B,RB1,LPAR6,RCBTB2;NA;NA RCBTB2 ITM2B,RB1,FNDC3A IMR90 Hi-C 24141950 RCBTB2 43881 650 chr13 49226823 49234758 49227952 N NA NA CYSLTR2 IMR90 Hi-C 24141950 RCBTB2 119507 651 chr13 51167287 51171683 51168686 Y RNASEH2B NA DLEU1,DLEU2,DLEU7 IMR90 Hi-C 24141950 RNASEH2B 312131 652 chr13 51465333 51468450 51467129 N NA RNASEH2B DLEU2,GUCY1B2,DLEU1 IMR90 Hi-C 24141950 RNASEH2B 15364 653 chr13 56545644 56546344 56545828 N NA NA NA NA NA NA SUGT1 3318813 654 chr13 59928111 59929858 59929011 N NA NA NA NA NA NA DIAPH3 808261 655 chr13 62781911 62784830 62783819 N NA NA NA NA NA NA TDRD3 1811320 656 chr13 65727208 65730572 65728797 N NA NA NA NA NA NA TDRD3 4756617 657 chr13 66027252 66030187 66028498 N NA NA NA NA NA NA TDRD3 5056661 658 chr13 69860690 69864624 69861413 N NA NA NA NA NA NA MZT1 3437314 659 chr13 75660692 75667520 75666006 N NA NA NA NA NA NA TBC1D4 388730 660 chr13 77911820 77921215 77913690,77919462 N,N NA;NA MYCBP2 MYCBP2 K562 ChIA-PET 22265404 MYCBP2 10643 661 chr13 78001420 78015958 78003652,78007212 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MYCBP2 100243 662 chr13 78051170 78053608 78052464 N NA NA NA NA NA NA MYCBP2 149993 663 chr13 80935205 80937178 80936139 Y NA SPRY2 SPRY2 K562 ChIA-PET 22265404 SPRY2 20119 664 chr13 81980591 81982317 81981094 N NA NA NA NA NA NA SPRY2 1065505 665 chr13 90557539 90559072 90558181 N NA NA NA NA NA NA MIR17HG 1441002 666 chr13 91708089 91710372 91709155 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 289702 667 chr13 91806299 91808461 91807838 N NA NA NA NA NA NA MIR17HG 191613 668 chr13 91964517 91967396 91965649 N NA MIR17HG NA NA NA NA MIR17HG 32678 669 chr13 95200428 95203283 95201855 Y NA TGDS NA NA NA NA TGDS 45228 670 chr13 96054871 96056860 96056275 N NA NA ABCC4,CLDN10 IMR90 Hi-C 24141950 ABCC4 101184 671 chr14 100657932 100660952 100659406 Y NA YY1 DEGS2,YY1,EVL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 44150 672 chr14 100676692 100682276 100680982 N NA YY1 DEGS2,YY1,EVL IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 22826 673 chr14 100684028 100691007 100689339 N NA YY1 DEGS2,YY1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 14095 674 chr14 101586338 101589061 101587529 N NA NA DIO3OS,LINC00523,MIR127,MIR433,MIR337,MIR432,MIR665,RTL1,MIR136,MEG8,MIR493,MIR431,MIR412,MIR541,MIR409,MIR410,MIR369,MIR656 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00239 607713 675 chr14 102989501 102992835 102991577 N NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 13373 676 chr14 103219313 103239662 103221087,103230890,103234591 N,N,N NA;NA;NA TRAF3 TECPR2,RCOR1,TRAF3,CDC42BPB,AMN,SYBU IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323,22265404 TRAF3 4154 677 chr14 103783955 103786853 103785904 Y NA EIF5 RCOR1,EIF5,CDC42BPB,LOC100131366,TNFAIP2,MARK3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EIF5 13640 678 chr14 104885161 104887811 104886494 N NA NA NA NA NA NA INF2 268132 679 chr14 105113201 105115891 105114238 N NA INF2 INF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 INF2 40052 680 chr14 105534840 105544934 105543278 N NA CDCA4,GPR132 AHNAK2,GPR132,BTBD6,BRF1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPR132 3086 681 chr14 105550766 105564271 105553627,105559686 N,N NA;NA GPR132 BTBD6,BRF1,AHNAK2,JAG2,NUDT14 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPR132 19012 682 chr14 106019255 106029087 106024076,106027684 N,N NA;NA NA NA NA NA NA C14orf80 63063 683 chr14 106030944 106035733 106033564 N NA NA NA NA NA NA C14orf80 74752 684 chr14 106037631 106041747 106039366 N NA NA NA NA NA NA C14orf80 81439 685 chr14 106047800 106055605 106050380,106053567,106055479 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA C14orf80 91608 686 chr14 106056166 106060239 106057595 N NA NA NA NA NA NA C14orf80 99974 687 chr14 106141972 106176743 106144490,106149438,106147379,106153450,106162048,106158235,106172383 N,N,N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA C14orf80 185780 688 chr14 106325945 106330577 106326692,106329460 N,N NA;NA NA NA NA NA NA C14orf80 369753 689 chr14 106451563 106455250 106452741 N NA NA NA NA NA NA C14orf80 495371 690 chr14 106538480 106540185 106539424 N NA NA NA NA NA NA C14orf80 582288 691 chr14 106667461 106670673 106668037 N NA NA NA NA NA NA C14orf80 711269 692 chr14 106688788 106693797 106691857 N NA NA NA NA NA NA C14orf80 732596 693 chr14 106788790 106791804 106790698 N NA NA NA NA NA NA C14orf80 832598 694 chr14 106813995 106816807 106815411 N NA NA NA NA NA NA C14orf80 857803 695 chr14 107150009 107152018 107150855 N NA NA NA NA NA NA C14orf80 1193817 696 chr14 107153853 107156208 107155038 N NA NA KIAA0125 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf80 1197661 697 chr14 107170658 107172730 107170752 N NA NA LINC00221 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf80 1214466 698 chr14 107174810 107184993 107176765,107179764,107184098 N,N,N NA;NA;NA NA LINC00221 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf80 1218618 699 chr14 107200215 107202089 107200909 N NA NA NA NA NA NA C14orf80 1244023 700 chr14 107237895 107240548 107239206 N NA NA NA NA NA NA C14orf80 1281703 701 chr14 107244595 107266066 107253058,107259572,107256828 Y,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA C14orf80 1288403 702 chr14 107279805 107284991 107280882 N NA NA NA NA NA NA C14orf80 1323613 703 chr14 21080466 21083305 21081752 N NA NA KLHL33,TMEM55B,PARP2,RPPH1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNASE4 69067 704 chr14 21084638 21087560 21086123 N NA NA KLHL33,PARP2,RPPH1,RNASE4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNASE4 64812 705 chr14 22848252 22856025 22851365,22849193,22851985,22854366 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA OXA1L,SLC7A7,RBM23,DAD1,REM2,LRP10 IMR90 Hi-C 24141950 DAD1 202118 706 chr14 23181732 23183681 23182417 N NA NA OXA1L,SLC7A7,DAD1,RBM23 IMR90 Hi-C 24141950 OXA1L 52050 707 chr14 23215869 23222262 23220579,23220777 N,N NA;NA OXA1L SLC7A7 IMR90 Hi-C 24141950 OXA1L 13469 708 chr14 23293222 23295003 23294349 Y RBM23,C14orf119,SLC7A7,SLC7A7 SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10 REM2 MCF7 ChIA-PET 22265404 MRPL52 4089 709 chr14 24073711 24077313 24075479 Y NA JPH4 C14orf167 IMR90 Hi-C 24141950 JPH4 25702 710 chr14 24100094 24103046 24101425 N NA NA NA NA NA NA JPH4 52085 711 chr14 25142316 25144755 25143388 N NA NA NA NA NA NA SDR39U1 230309 712 chr14 31317895 31319443 31318557 N NA COCH,LOC100506071 NA NA NA NA COCH 24298 713 chr14 32670955 32673696 32672390 Y ARHGAP5 NA NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP5 124460 714 chr14 34482059 34484813 34483082 Y NA NA EGLN3 IMR90 Hi-C 24141950 EGLN3 61775 715 chr14 34520776 34522723 34521318 N NA NA NA NA NA NA EGLN3 100492 716 chr14 34527623 34531085 34529683 Y EGLN3 NA EGLN3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 EGLN3 107339 717 chr14 34800300 34803193 34801253 N NA NA SPTSSA MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 128275 718 chr14 35370440 35373917 35372524 N NA BAZ1A IGBP1P1,BAZ1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BAZ1A 25587 719 chr14 35884157 35887309 35885940 N NA NFKBIA PSMA6,NFKBIA,KIAA0391,PPP2R3C,FAM177A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFKBIA 10197 720 chr14 39916155 39920249 39917264 Y NA FBXO33 NA NA NA NA FBXO33 14451 721 chr14 40343681 40347322 40345271 N NA NA NA NA NA NA FBXO33 441977 722 chr14 44582030 44584048 44583227 N NA NA NA NA NA NA C14orf28 782459 723 chr14 50326069 50336594 50330302,50328389,50334984 N,N,Y NA;NA;RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 6530 724 chr14 50396494 50398725 50397465 N NA ARF6 NA NA NA NA ARF6 36758 725 chr14 50496216 50516076 50506305,50512720 N,N NA;NA C14orf182,C14orf183 C14orf182,SOS2,C14orf183,ARF6,METTL21D IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C14orf182 21978 726 chr14 51324572 51327594 51326297 N NA NIN ATL1,NIN,PYGL,ABHD12B IMR90 Hi-C 24141950 NIN 26733 727 chr14 51668184 51673107 51669539 N NA TMX1 GNG2,TRIM9,PYGL,ABHD12B IMR90 Hi-C 24141950 TMX1 33779 728 chr14 51765112 51773207 51765870 N NA NA FRMD6,GNG2,C14orf166,LOC283553,FRMD6-AS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMX1 58226 729 chr14 52311872 52316590 52314195 N NA GNG2 GNG2,FRMD6,C14orf166 IMR90 Hi-C 24141950 GNG2 10432 730 chr14 53683591 53686934 53684359 N NA NA NA NA NA NA DDHD1 63545 731 chr14 55563930 55566512 55565231 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L MAPK1IP1L,LGALS3 LGALS3,DLGAP5 IMR90 Hi-C 24141950 LGALS3 29423 732 chr14 55567831 55571508 55570018 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L MAPK1IP1L,LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 24427 733 chr14 56012430 56016471 56013993 N NA KTN1-AS1,KTN1 ATG14,KTN1 IMR90 Hi-C 24141950 KTN1-AS1 30339 734 chr14 59260719 59266709 59263914,59265026 N,N NA;NA NA KIAA0586,DACT1 IMR90 Hi-C 24141950 DACT1 159933 735 chr14 59436038 59438137 59437200 N NA NA NA NA NA NA DAAM1 217262 736 chr14 60430650 60433038 60432153 N NA NA DHRS7 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf135 125591 737 chr14 60669516 60677536 60672565 N NA DHRS7,PPM1A NA NA NA NA PPM1A 34934 738 chr14 60678966 60690340 60688297,60681470 N,N NA;NA DHRS7,PPM1A PPM1A K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 PPM1A 22130 739 chr14 60793594 60800140 60794477,60798390 N,N NA;NA NA C14orf39,SIX6,TMEM30B IMR90 Hi-C 24141950 PPM1A 81124 740 chr14 64211787 64217916 64213063,64215530 N,N NA;NA SGPP1 NA NA NA NA SGPP1 17031 741 chr14 65636532 65640240 65637550 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAX 67305 742 chr14 65668077 65676226 65673737 N NA NA LOC645431,FUT8 IMR90 Hi-C 24141950 MAX 98850 743 chr14 65837091 65855222 65838617,65844778 N,N NA;NA FUT8,LOC645431 MIR4708,FUT8,LOC645431 IMR90 Hi-C 24141950 FUT8 22088 744 chr14 66523008 66524642 66523963 N NA NA NA NA NA NA GPHN 449483 745 chr14 69128514 69131931 69130476 N NA NA RAD51B,ZFP36L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L1 131029 746 chr14 69271633 69291823 69282429,69288661 N,N NA;NA ZFP36L1 RAD51B,ZFP36L1,ZFYVE26 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L1 8673 747 chr14 71282942 71289506 71284443,71288770 N,N NA;NA MAP3K9 MAP3K9,PCNX MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAP3K9 7054 748 chr14 71352473 71355174 71353725 Y MED6,PCNX PCNX MAP3K9 IMR90 Hi-C 24141950 PCNX 18948 749 chr14 71785361 71834184 71791716,71787088,71788965,71825335 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA SIPA1L1,PCNX,LOC145474,SNORD56B IMR90 Hi-C 24141950 LOC145474 120394 750 chr14 72322334 72324122 72323029 N NA NA PCNX,SIPA1L1 IMR90 Hi-C 24141950 SIPA1L1 326292 751 chr14 75688212 75690566 75689097 Y DLST,FOS TMED10 PGF,NEK9,TMED10,FOS,LOC731223,BATF IMR90 Hi-C 24141950 TMED10 44863 752 chr14 75723498 75726697 75725876 N NA FOS TMED10,RPS6KL1,EIF2B2,NEK9,LOC731223,FOS,JDP2,BATF,PGF IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOS 18784 753 chr14 75800054 75802187 75801102 Y FOS,JDP2,FLVCR2,BATF NA JDP2,BATF IMR90 Hi-C 24141950 FOS 54573 754 chr14 75962251 75965512 75963785 Y C14orf1,BATF BATF TMED10,NEK9,LOC731223,JDP2,BATF,FLVCR2,C14orf1 IMR90 Hi-C 24141950 BATF 23272 755 chr14 76586604 76589335 76587729 N NA C14orf118 C14orf118,ESRRB,IFT43 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf118 28924 756 chr14 76733336 76735136 76734261 N NA NA NA NA NA NA C14orf118 115077 757 chr14 77419204 77427680 77423014,77425591 N,N NA;NA NA IRF2BPL,KIAA1737 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2BPL 67354 758 chr14 77442300 77446423 77444483 Y NA IRF2BPL IRF2BPL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2BPL 48611 759 chr14 77504902 77509384 77506277 N NA IRF2BPL IRF2BPL IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BPL 9868 760 chr14 77545232 77549427 77547913 N NA KIAA1737 KIAA1737,C14orf166B,IRF2BPL,ZDHHC22,ANGEL1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1737 15151 761 chr14 78106934 78109664 78108238 N NA SPTLC2 NA NA NA NA SPTLC2 23824 762 chr14 82480853 82483185 82482409 N NA NA NA NA NA NA SEL1L 480648 763 chr14 82588847 82591203 82590035 N NA NA NA NA NA NA SEL1L 588642 764 chr14 87204518 87207167 87206589 N NA NA NA NA NA NA GALC 1252842 765 chr14 88222823 88223825 88223147 N NA NA NA NA NA NA GALC 236184 766 chr14 90847528 90851628 90849660 N NA C14orf102,CALM1 C14orf102,CALM1,TTC7B,EFCAB11,TDP1,PSMC1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALM1 11699 767 chr14 93226399 93233071 93227971,93230592 N,N NA;NA LGMN,GOLGA5 SLC24A4,LGMN,TRIP11,RIN3 IMR90 Hi-C 24141950 LGMN 11352 768 chr14 93233754 93241169 93237442,93234884 N,Y NA;NA LGMN,GOLGA5 LGMN,SLC24A4,TRIP11,RIN3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGMN 18707 769 chr14 95792839 95795307 95794361 N NA CLMN CLMN,GSC IMR90 Hi-C 24141950 CLMN 6594 770 chr14 96042286 96045453 96043318 N NA SNHG10,GLRX5 C14orf132,LOC100507043,GLRX5 IMR90 Hi-C 24141950 GLRX5 40963 771 chr14 96191594 96194686 96192467 N NA TCL1A TCL1B IMR90 Hi-C 24141950 TCL1A 11061 772 chr14 97058233 97062453 97059060 N NA NA NA NA NA NA PAPOLA 89520 773 chr14 97571611 97573711 97572871 N NA NA NA NA NA NA VRK1 307927 774 chr14 97684567 97687257 97685405 N NA NA NA NA NA NA VRK1 420883 775 chr14 97796437 97800912 97798618 N NA NA NA NA NA NA VRK1 532753 776 chr14 97816201 97819791 97817576 N NA NA NA NA NA NA VRK1 552517 777 chr14 97834800 97842522 97839594 N NA NA BCL11B IMR90 Hi-C 24141950 VRK1 571116 778 chr14 97853753 97857363 97854571 N NA NA NA NA NA NA VRK1 590069 779 chr14 97866407 97870430 97868151 N NA NA NA NA NA NA VRK1 602723 780 chr14 97873030 97881786 97876973 N NA NA NA NA NA NA VRK1 609346 781 chr14 97906774 97913357 97910431 N NA NA NA NA NA NA VRK1 643090 782 chr14 97921987 97946284 97925332 N NA NA VEZT MCF7 ChIA-PET 19890323 VRK1 658303 783 chr14 98673118 98677716 98674127,98676933 N,Y NA;NA NA CMTM7 MCF7 ChIA-PET 19890323 SETD3 1269510 784 chr15 100025155 100030066 100026771 Y MEF2A,MEF2A NA MEF2A,LRRC28,LYSMD4 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 76067 785 chr15 100030930 100055550 100043998,100050157,100054763 N,N,N NA;NA;NA NA MEF2A,LRRC28,LYSMD4,TTC23 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 50583 786 chr15 101666008 101669633 101667396 Y NA NA CHSY1,LRRK1,SELS IMR90 Hi-C 24141950 CHSY1 122504 787 chr15 102283871 102293511 102285960 N NA TARSL2 NA NA NA NA TARSL2 19226 788 chr15 20976996 20980952 20978691 N NA NA NF1P2,NBEAP1 IMR90 Hi-C 24141950 TUBGCP5 1852443 789 chr15 20993269 20996044 20994322 N NA NA NBEAP1,POTEB,LOC348120,NF1P2 IMR90 Hi-C 24141950 TUBGCP5 1837351 790 chr15 21983777 21989425 21985375 N NA NA NA NA NA NA TUBGCP5 843970 791 chr15 22458844 22462587 22460384 N NA NA HERC2P3,CHEK2P2 IMR90 Hi-C 24141950 TUBGCP5 370808 792 chr15 22465542 22466748 22466159 N NA NA HERC2P3,CHEK2P2,POTEB,LOC348120,NBEAP1 IMR90 Hi-C 24141950 TUBGCP5 366647 793 chr15 26326161 26328478 26327521 Y NA NA LOC100128714,ATP10A IMR90 Hi-C 24141950 UBE3A 641986 794 chr15 30336529 30338291 30337441 N NA NA TJP1,FAM189A1,APBA2 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP11B 580588 795 chr15 31546500 31550836 31548576 N NA LOC283710 LOC283710,OTUD7A,KLF13 IMR90 Hi-C 24141950 LOC283710 23450 796 chr15 31553466 31561218 31557152 N NA LOC283710 LOC283710,OTUD7A,KLF13 IMR90 Hi-C 24141950 LOC283710 30416 797 chr15 31577385 31579461 31578270 N NA KLF13 OTUD7A IMR90 Hi-C 24141950 KLF13 39622 798 chr15 31725303 31735304 31728576,31733160 N,Y NA;MTMR10,KLF13 NA KLF13,OTUD7A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF13 106220 799 chr15 31749539 31753112 31751454 Y NA NA KLF13,OTUD7A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF13 130456 800 chr15 34787284 34789335 34788183 N NA NA NA NA NA NA GOLGA8A 57617 801 chr15 38364583 38366160 38365002 N NA NA SPRED1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM98B 380168 802 chr15 38914047 38917923 38916777 Y NA NA RASGRP1,FAM98B IMR90 Hi-C 24141950 RASGRP1 57040 803 chr15 38921858 38925541 38923832 N NA NA RASGRP1,C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf53 63258 804 chr15 38941704 38947137 38944092 Y RASGRP1,C15orf53 C15orf53 RASGRP1,FAM98B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C15orf53 41662 805 chr15 38957212 38960617 38959209 N NA C15orf53 RASGRP1,FAM98B IMR90 Hi-C 24141950 C15orf53 28182 806 chr15 38961967 38966618 38964364 N NA C15orf53 RASGRP1,FAM98B IMR90 Hi-C 24141950 C15orf53 22181 807 chr15 38973996 38976458 38975585 N NA C15orf53 RASGRP1,FAM98B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C15orf53 12341 808 chr15 40406340 40410474 40408180 N NA BMF,BUB1B SRP14,LOC100131089,BMF,BUB1B,PAK6,PLCB2,ANKRD63 IMR90 Hi-C 24141950 BMF 5265 809 chr15 40798341 40802032 40800954 N NA CHST14 BAHD1,CHST14 K562 ChIA-PET 22265404 CHST14 35181 810 chr15 42775424 42785231 42783396 N NA ZFP106,SNAP23 LRRC57,HAUS2,VPS39,TMEM87A,SNAP23,ZFP106 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNAP23 2273 811 chr15 43413875 43416921 43415446 Y NA UBR1,TMEM62 NA NA NA NA TMEM62 8801 812 chr15 44971741 44977862 44975571 N NA SPG11,PATL2,B2M B2M MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PATL2 2655 813 chr15 45111606 45115015 45114745 N NA NA SORD IMR90 Hi-C 24141950 TRIM69 83046 814 chr15 45150381 45156976 45154548,45154645 N,N NA;NA NA SORD IMR90 Hi-C 24141950 TRIM69 121821 815 chr15 45164381 45177083 45174208 N NA NA SORD IMR90 Hi-C 24141950 TRIM69 135821 816 chr15 49257797 49259694 49258732 N NA NA NA NA NA NA SECISBP2L 79066 817 chr15 51170766 51176699 51173445,51171310 Y,N USP8,SPPL2A;NA AP4E1 TRPM7,USP50,SPPL2A,AP4E1,ASB18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323,22265404 AP4E1 24170 818 chr15 52296681 52304452 52300001 Y NA LEO1,MAPK6 TMOD3,LEO1,MAPK6,BCL2L10,GNB5,MYO5C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAPK6 6959 819 chr15 58623458 58626425 58624814 N NA NA LIPC,ADAM10,FAM63B,SLTM IMR90 Hi-C 24141950 ADAM10 415752 820 chr15 58701154 58703559 58702846 N NA NA LIPC,ADAM10,FAM63B IMR90 Hi-C 24141950 ADAM10 338618 821 chr15 58710517 58715213 58712941 Y NA NA LIPC,ADAM10,FAM63B,SLTM IMR90 Hi-C 24141950 ADAM10 326964 822 chr15 59272064 59274528 59274209 N NA SLTM,RNF111 FAM81A,RNF111 IMR90 Hi-C 24141950 RNF111 5337 823 chr15 59690428 59706374 59691724,59703939 N,N NA;NA MYO1E MYO1E,LDHAL6B,FAM81A,CCNB2 IMR90 Hi-C 24141950 MYO1E 25357 824 chr15 62520461 62520678 62520512 N NA NA NA NA NA NA VPS13C 167797 825 chr15 62677961 62685525 62682686,62684542 N,Y NA;NA NA TLN2,MGC15885 IMR90 Hi-C 24141950 VPS13C 325297 826 chr15 63764892 63769000 63766863 N NA USP3 APH1B,RAB8B,FBXL22,LOC100130855,USP3,CA12,HERC1,FAM96A,SNX1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP3 27710 827 chr15 64172403 64174668 64173195 N NA HERC1 DAPK2,HERC1,FAM96A IMR90 Hi-C 24141950 HERC1 46256 828 chr15 65586901 65589860 65588289 N NA PARP16 MTFMT,IGDCC4,PDCD7,RASL12,IGDCC3,OSTBETA,CILP,PARP16,CLPX,UBAP1L,DPP8,PTPLAD1,SPG21,KBTBD13 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PARP16 7883 829 chr15 65595106 65598675 65596891 Y DENND4A PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 16088 830 chr15 66124223 66127443 66125603 N NA DENND4A,RAB11A SLC24A1,DENND4A,PTPLAD1,C15orf44,RAB11A,MEGF11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB11A 34354 831 chr15 66661131 66664341 66662434 Y MAP2K1 TIPIN,MAP2K1 RPL4,SNORD18C,SNORD18B,SNORD16,SNAPC5,ZWILCH IMR90 Hi-C 24141950 TIPIN 12077 832 chr15 68153862 68157551 68155540 N NA NA PIAS1,CLN6,CALML4,C15orf61,LOC100506686 IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 189021 833 chr15 68176459 68178114 68177217 N NA NA PIAS1,CLN6,C15orf61,LOC100506686,CALML4 IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 168458 834 chr15 68237702 68240208 68239135 N NA NA PIAS1,CALML4,CLN6,C15orf61,LOC100506686 IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 106364 835 chr15 68259837 68262140 68260591 Y C15orf61 NA PIAS1,LOC100506686,C15orf61,IQCH IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 84432 836 chr15 69046483 69048884 69047268 Y NA NA ITGA11,CORO2B,MIR4312,ANP32A,MIR548H4 IMR90 Hi-C 24141950 ANP32A 64377 837 chr15 69957803 69963137 69959554,69961480 N,Y NA;TLE3 NA TLE3,C15orf50,LOC145837 IMR90 Hi-C 24141950 RPLP1 212644 838 chr15 70040346 70047331 70043401 N NA NA TLE3,C15orf50 IMR90 Hi-C 24141950 RPLP1 295187 839 chr15 70172518 70175291 70174012 N NA NA C15orf50,TLE3,LOC145837 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 214965 840 chr15 70271447 70274871 70272914 N NA NA LOC145837,C15orf50,TLE3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TLE3 115385 841 chr15 70279990 70283705 70282256 N NA NA C15orf50,TLE3,LOC145837 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 106551 842 chr15 70305609 70310945 70308057 N NA NA C15orf50 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 79311 843 chr15 70431086 70434505 70433191 Y TLE3 TLE3 LOC145837,TLE3,C15orf50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TLE3 40830 844 chr15 70486217 70490559 70489223 N NA NA TLE3,LOC145837,C15orf50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TLE3 95961 845 chr15 70610705 70612778 70612019 Y NA NA C15orf50,TLE3,LOC145837 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 220449 846 chr15 70753339 70757523 70755255 N NA NA TLE3,C15orf50,KIF23,LOC145837 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 363083 847 chr15 70774658 70799494 70779311,70785558,70796498 Y,Y,N TLE3;TLE3;NA NA KIF23,LOC145837,TLE3,C15orf50,UACA,RPLP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TLE3 384402 848 chr15 72752822 72755172 72754392 N NA ARIH1 CELF6,TMEM202,HEXA,C15orf34,ARIH1,PARP6,BBS4,HIGD2B,GOLGA6B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARIH1 11495 849 chr15 72928079 72932306 72929334 N NA BBS4 CELF6 IMR90 Hi-C 24141950 BBS4 46214 850 chr15 74389949 74394155 74392625 N NA NA NA NA NA NA PML 102935 851 chr15 77193973 77198403 77197749 N NA RCN2 ETFA IMR90 Hi-C 24141950 RCN2 25559 852 chr15 77279566 77282075 77281057 Y PSTPIP1 NA PSTPIP1,RCN2,TSPAN3 IMR90 Hi-C 24141950 RCN2 55604 853 chr15 78176849 78185474 78178431,78182781 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TBC1D2B 184520 854 chr15 78234423 78238464 78237007 N NA NA TBC1D2B,DNAJA4,IDH3A,CIB2,IREB2,LOC91450,SH2D7,WDR61,LOC645752,ACSBG1 IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D2B 131530 855 chr15 79122357 79124007 79123274 N NA ADAMTS7,MORF4L1 NA NA NA NA ADAMTS7 18584 856 chr15 79133851 79136586 79134674 N NA ADAMTS7,MORF4L1 NA NA NA NA MORF4L1 28586 857 chr15 79151703 79154095 79152771 Y IREB2 ADAMTS7,MORF4L1 MORF4L1,ADAMTS7 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MORF4L1 11077 858 chr15 82171477 82174209 82172828 N NA NA EFTUD1 IMR90 Hi-C 24141950 EFTUD1 380895 859 chr15 85278872 85280499 85280330 N NA SEC11A,ZNF592 SEC11A,ZNF592 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF592 11319 860 chr15 85775467 85779627 85778018 N NA NA NA NA NA NA AKAP13 144244 861 chr15 85855093 85858245 85856017 N NA NA AKAP13 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP13 65626 862 chr15 85871478 85875891 85873730 N NA AKAP13 AKAP13 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP13 47980 863 chr15 90708105 90710309 90709178 Y NA SEMA4B CIB1,C15orf58,SEMA4B,ZNF710,IDH2,TTLL13,NGRN IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEMA4B 17843 864 chr15 91226931 91231357 91229709 N NA BLM BLM,CRTC3,IQGAP1,ZNF774 IMR90 Hi-C 24141950 BLM 29222 865 chr15 93361606 93365896 93363749 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 NA ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507217 60177 866 chr15 93373331 93377755 93375067,93375148 Y,Y NA;NA LOC100507217 CHD2,LOC100507217,ASB9P1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LOC100507217 48318 867 chr15 93391464 93393678 93392674 N NA LOC100507217,CHD2 LOC100507217 K562 ChIA-PET 22265404 LOC100507217 32395 868 chr15 94772896 94786494 94773880 N NA NA MCTP2 IMR90 Hi-C 24141950 MCTP2 54936 869 chr15 94805476 94819964 94806882 N NA MCTP2 NA NA NA NA MCTP2 21466 870 chr15 94830307 94831283 94831167 Y MCTP2 MCTP2 MCTP2,NMUR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 MCTP2 10147 871 chr15 97685845 97689102 97687719 N NA NA NA NA NA NA LRRC28 2102550 872 chr15 97834458 97836543 97834609 N NA NA NA NA NA NA LRRC28 1955109 873 chr15 99991159 99994198 99993291 Y MEF2A,MEF2A NA MEF2A,LRRC28 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 111935 874 chr16 10389983 10393754 10391051 N NA NA NA NA NA NA ATF7IP2 86158 875 chr16 10924204 10928931 10926616 Y NA CIITA CIITA IMR90 Hi-C 24141950 CIITA 42124 876 chr16 10934347 10939876 10937007 Y NUBP1,SOCS1,FAM18A,CIITA CIITA TEKT5,NUBP1,FAM18A,CIITA IMR90 Hi-C 24141950 CIITA 31179 877 chr16 10960135 10964357 10962669 Y NUBP1,SOCS1,CIITA CIITA CIITA IMR90 Hi-C 24141950 CIITA 6698 878 chr16 11317410 11322239 11318753 N NA SOCS1 CLEC16A,SOCS1,RMI2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SOCS1 27800 879 chr16 11390252 11393489 11391779 N NA SOCS1,RMI2 SOCS1,DEXI,CLEC16A,PRM2,PRM3,TNP2,RMI2,ZC3H7A,BCAR4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SOCS1 40213 880 chr16 11404362 11406739 11405209 N NA RMI2 CLEC16A,TNP2,RMI2,ZC3H7A,BCAR4 IMR90 Hi-C 24141950 RMI2 32572 881 chr16 11419839 11423917 11422049 N NA RMI2 CLEC16A,PRM2,PRM3,TNP2,RMI2,TXNDC11 IMR90 Hi-C 24141950 RMI2 15394 882 chr16 11472720 11476336 11473448 Y ZC3H7A,TXNDC11,SNN,LITAF,LITAF,CLEC16A,SOCS1 RMI2 NA NA NA NA RMI2 33409 883 chr16 13482337 13486766 13484826,13482485 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ERCC4 527248 884 chr16 1352635 1356105 1354486 N NA UBE2I,C16orf42,GNPTG UNKL K562 ChIA-PET 22265404 UBE2I 3049 885 chr16 13528495 13538128 13530340,13535713 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ERCC4 475886 886 chr16 14447963 14454040 14449296 N NA NA PARN,ERCC4,MIR365A,MIR193B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARN 270088 887 chr16 14498310 14500783 14499928 N NA NA PARN,MIR193B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARN 223345 888 chr16 15455092 15458278 15456712 N NA NA NA NA NA NA RRN3 266934 889 chr16 15990971 15992924 15991837 N NA FOPNL MYH11,FOPNL,ABCC1,ABCC6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOPNL 8524 890 chr16 17105867 17122809 17107707,17121313 N,N NA;NA NA NA NA NA NA XYLT1 441929 891 chr16 18942381 18946812 18943223 N NA SMG1 NA NA NA NA SMG1 4655 892 chr16 18967143 18968990 18968016 N NA SMG1 SMG1,ITPRIPL2 IMR90 Hi-C 24141950 SMG1 29417 893 chr16 21862060 21871017 21864842 N NA RRN3P1 NA NA NA NA RRN3P1 31565 894 chr16 22199265 22204939 22202617,22200960 Y,N POLR3E,CDR2;NA EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 12653 895 chr16 22205858 22208109 22207043 Y NA EEF2K POLR3E,EEF2K,UQCRC2,PDZD9,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 9483 896 chr16 22208788 22213006 22210772 N NA EEF2K POLR3E,EEF2K K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 EEF2K 4586 897 chr16 24429903 24433046 24431046 N NA NA CACNG3,PRKCB IMR90 Hi-C 24141950 RBBP6 117862 898 chr16 25077172 25082637 25078275 N NA LOC554206,LCMT1 LCMT1,LOC100506655,TNRC6A,ARHGAP17,SLC5A11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC554206 34110 899 chr16 25115928 25120876 25118451 N NA LCMT1 ARHGAP17,LCMT1,ZKSCAN2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LCMT1 2171 900 chr16 28827012 28830274 28827886 N NA ATXN2L,TUFM,SH2B1 RABEP2,ATP2A1,SH2B1,NFATC2IP,ATXN2L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATXN2L 4140 901 chr16 2916872 2919554 2918407 N NA ZG16B,FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FLYWCH2 13642 902 chr16 29653810 29659538 29656124 N NA SPN,QPRT SPN K562 ChIA-PET 22265404 SPN 14762 903 chr16 30465244 30472457 30470498,30468136,30465926 N,N,N NA;NA;NA ZNF771,DCTPP1,SEPHS2,ITGAL SEPHS2,ZNF771,DCTPP1,ZNF688,PRR14,ZNF764,ITGAL,ZNF689,ZNF747,ZNF785,ZNF768,SRCAP MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SEPHS2 8020 904 chr16 30642581 30647609 30645754 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF785,ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRR14 14632 905 chr16 30816152 30822941 30816940 N NA RNF40,ZNF629 C16orf93,PHKG2,RNF40,ZNF629,MIR762,BCL7C,CTF1,MIR4519,FBXL19-AS1,FBXL19,SRCAP IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF629 17629 906 chr16 30824179 30829304 30825775 Y NA ZNF629 ZNF629,RNF40,MIR4519 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF629 25656 907 chr16 3236900 3240690 3239519,3238078 N,Y NA;NA ZNF200 ZNF200 K562 ChIA-PET 22265404 ZNF200 44767 908 chr16 33499144 33504177 33502991 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 1614065 909 chr16 34870710 34874586 34871604 N NA NA NA NA NA NA ZNF267 2985631 910 chr16 4189833 4192349 4190830 N NA NA CREBBP,ADCY9,SRL,TRAP1,CORO7-PAM16,PAM16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100507501 111441 911 chr16 4350263 4359693 4357753 Y CORO7 LOC100507501,TFAP4,PAM16 ADCY9,TFAP4,CREBBP,VASN,CORO7-PAM16,LOC100507501 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 27262 912 chr16 4363333 4366825 4365163 N NA TFAP4,PAM16 TFAP4,SRL,LOC100507501,CORO7-PAM16,VASN,PAM16 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PAM16 34548 913 chr16 47048693 47052554 47050768,47052260 N,N NA;NA DNAJA2 ABCC12,ABCC11,DNAJA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAJA2 41068 914 chr16 47080034 47082792 47081179 N NA NA ABCC11,DNAJA2,NETO2,ITFG1,PHKB,ABCC12 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJA2 72409 915 chr16 47812805 47815147 47813659 N NA NA ITFG1,NETO2 IMR90 Hi-C 24141950 PHKB 317595 916 chr16 48655927 48659039 48657408,48657412 N,N NA;NA N4BP1 ABCC11,SIAH1,MIR548AE2,N4BP1 IMR90 Hi-C 24141950 N4BP1 11807 917 chr16 48940636 48943367 48942288 N NA NA C16orf78 IMR90 Hi-C 24141950 N4BP1 296516 918 chr16 50299500 50307435 50300418 N NA ADCY7 PAPD5,BRD7,ADCY7 IMR90 Hi-C 24141950 ADCY7 14388 919 chr16 51146511 51148742 51147723 N NA NA LOC388276 IMR90 Hi-C 24141950 CYLD 370550 920 chr16 51217107 51221109 51219075 N NA NA NA NA NA NA CYLD 441146 921 chr16 5207142 5215370 5209585 N NA NA NA NA NA NA FAM86A 59353 922 chr16 5254731 5258127 5255620 N NA NA NA NA NA NA FAM86A 106942 923 chr16 53411328 53425805 53412215 N NA RBL2 NA NA NA NA RBL2 42546 924 chr16 53551706 53554257 53552885 Y LOC643802,RBL2,AKTIP AKTIP NA NA NA NA AKTIP 14536 925 chr16 53567664 53569861 53568954 N NA AKTIP FTO IMR90 Hi-C 24141950 AKTIP 30494 926 chr16 57333272 57335164 57334195 N NA NA NLRC5,CPNE2,PLLP,CIAPIN1,FAM192A,POLR2C,DOK4,CCDC102A,RSPRY1,ARL2BP,CCL17,COQ9,CX3CL1,CCL22,GPR114 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARL2BP 54234 927 chr16 57336745 57338149 57336794 N NA NA NLRC5,CPNE2,PLLP,CIAPIN1,FAM192A,RSPRY1,ARL2BP,COQ9,CX3CL1,CCL22,POLR2C,GPR114,CCDC102A IMR90 Hi-C 24141950 CCL22 54546 928 chr16 57372596 57376251 57374253 N NA CCL22,CX3CL1 POLR2C,COQ9,CCL17,PLLP,CIAPIN1,CCDC102A,FAM192A,RSPRY1,ARL2BP IMR90 Hi-C 24141950 CCL22 16444 929 chr16 57381505 57386077 57383310 N NA CCL22,CX3CL1 NA NA NA NA CCL22 6618 930 chr16 57634101 57636598 57636003 Y GPR114 NA NA NA NA NA GPR114 57500 931 chr16 57642180 57646684 57643573 N NA NA GPR56 K562 ChIA-PET 22265404 GPR114 65579 932 chr16 57843036 57846286 57844413 N NA NA NA NA NA NA KATNB1 73376 933 chr16 58269644 58271994 58270536 N NA CSNK2A2 CSNK2A2,CCDC113,PRSS54 IMR90 Hi-C 24141950 CSNK2A2 37862 934 chr16 64248167 64252287 64251859 N NA NA NA NA NA NA DYNC1LI2 2533238 935 chr16 64296212 64305285 64301190,64303625 N,N NA;NA NA CDH11 IMR90 Hi-C 24141950 DYNC1LI2 2480240 936 chr16 64480103 64483485 64481806 N NA NA CDH11 IMR90 Hi-C 24141950 DYNC1LI2 2302040 937 chr16 68503228 68506477 68504563 Y DPEP2 NA PRMT7,SMPD3 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP90 67184 938 chr16 69429790 69431772 69430811 N NA TMED6,TERF2,CYB5B NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TERF2 9916 939 chr16 69553905 69556539 69554938 N NA NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2 IMR90 Hi-C 24141950 NFAT5 43330 940 chr16 71849416 71862690 71851486 N NA AP1G1,ATXN1L AP1G1,ATXN1L,ZNF821,PKD1L3,IST1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AP1G1 6440 941 chr16 72695206 72703677 72698947 N NA NA ZFHX3 IMR90 Hi-C 24141950 TXNL4B 566991 942 chr16 73321746 73325308 73323842 N NA NA HP,HPR,LOC100506172 IMR90 Hi-C 24141950 PSMD7 1005365 943 chr16 75793981 75797199 75795373 N NA NA KARS,ADAT1,TERF2IP,SYCE1L IMR90 Hi-C 24141950 TERF2IP 112346 944 chr16 79877042 79880379 79879433 N NA NA NA NA NA NA CENPN 1159724 945 chr16 81770534 81777025 81772478 N NA PLCG2 CMIP,PKD1L2,GAN,ATMIN,GCSH,MIR4720,BCMO1 IMR90 Hi-C 24141950 PLCG2 35874 946 chr16 81784499 81791187 81786038 Y PLCG2,CMIP,CMIP PLCG2 ATMIN,PKD1L2,GAN,BCMO1,MIR4720 IMR90 Hi-C 24141950 PLCG2 21712 947 chr16 84547215 84550433 84548744 Y COTL1 KIAA1609 COTL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 KIAA1609 8927 948 chr16 85259193 85263109 85261223 N NA NA LOC400548,KIAA0513,FAM92B,LINC00311,LOC727710,KIAA0182 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC7 214052 949 chr16 85398004 85401442 85399016 N NA NA LOC727710,LOC400548,KIAA0182,GINS2,FAM92B,LINC00311 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA0182 243587 950 chr16 85582425 85609139 85587775,85590055,85591870 N,N,N NA;NA;NA KIAA0182 GINS2,KIAA0182,LINC00311,LOC400548,FAM92B,KIAA0513,LOC727710,C16orf74,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA0182 35890 951 chr16 85789044 85790796 85789927 N NA COX4NB,COX4I1 NA NA NA NA COX4NB 42352 952 chr16 85979440 85984918 85981896 N NA IRF8 COX4I1,IRF8,COX4NB,MTHFSD IMR90 Hi-C 24141950 IRF8 46666 953 chr16 86020973 86024254 86022676 N NA NA COX4NB,COX4I1,MTHFSD,LOC400550,FLJ30679,IRF8,C16orf74,LOC146513 IMR90 Hi-C 24141950 IRF8 88199 954 chr16 86697090 86699695 86698790 N NA NA FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,FOXC2,C16orf95,FBXO31 IMR90 Hi-C 24141950 FLJ30679 108164 955 chr16 87810504 87815046 87812798,87814212 Y,Y NA;NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 10906 956 chr16 88485966 88489837 88489023 N NA ZFPM1 NA NA NA NA ZFPM1 30177 957 chr16 89047710 89051444 89050104 N NA CBFA2T3 NA NA NA NA CBFA2T3 4206 958 chr16 89125663 89136428 89126795 Y CBFA2T3 ACSF3 CBFA2T3,ACSF3,CDH15,PIEZO1,LOC400558,SLC22A31 IMR90 Hi-C 24141950 ACSF3 23789 959 chr17 1118693 1137096 1127390,1127360,1132192 N,N,N NA;NA;NA ABR ABR,INPP5K,PITPNA,SLC43A2,YWHAE,LOC100306951,BHLHA9,MYO1C,CRK,RILP,SCARF1 IMR90 Hi-C 24141950 ABR 28077 960 chr17 12331327 12337610 12332617,12334672 N,Y NA;NA NA FLJ34690,MYOCD IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K4 407192 961 chr17 12974764 12977962 12976508 N NA NA CDRT7,COX10 IMR90 Hi-C 24141950 ELAC2 53383 962 chr17 16307090 16316595 16311640,16308428 N,N NA;NA UBB,TRPV2,C17orf76-AS1 TRPV2,C17orf76-AS1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TRPV2 2261 963 chr17 16888627 16894792 16892263 N NA TNFRSF13B MPRIP,FLCN IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF13B 13225 964 chr17 18963912 18966907 18965050 N NA GRAP NA NA NA NA GRAP 13576 965 chr17 19014297 19016112 19015288 N NA GRAPL NA NA NA NA GRAPL 14670 966 chr17 19092124 19095335 19093726 N NA EPN2 NA NA NA NA EPN2 45355 967 chr17 19349167 19350137 19349698 N NA NA NA NA NA NA B9D1 67672 968 chr17 21002634 21004173 21003008 N NA DHRS7B USP22,C17orf103 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHRS7B 26068 969 chr17 21177580 21180899 21179199 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 7069 970 chr17 25674779 25682201 25680967 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 53673 971 chr17 26132371 26139908 26132979,26135509,26137698 N,N,N NA;NA;NA NA NOS2 IMR90 Hi-C 24141950 C17orf108 80501 972 chr17 27528506 27530180 27528828 N NA MYO18A MYO18A,TAOK1,NUFIP2 IMR90 Hi-C 24141950 MYO18A 21099 973 chr17 28876838 28882907 28878178 N NA LRRC37BP1 CPD,GOSR1,LRRC37BP1,TMIGD1,SUZ12P IMR90 Hi-C 24141950 LRRC37BP1 20576 974 chr17 28993736 29000235 28995038 N NA SUZ12P NA NA NA NA SUZ12P 36391 975 chr17 30406246 30408791 30406942 N NA NA NA NA NA NA LRRC37B 58091 976 chr17 30409321 30418349 30411159 N NA NA RHOT1 IMR90 Hi-C 24141950 RHOT1 51124 977 chr17 33639373 33641953 33640395 Y CCT6B,ZNF830,SLFN12L,SLFN5 NA PEX12,SLFN14,SLC35G3,SLFN12L,SLFN12,SNORD7,AP2B1,SLFN5,SLFN13 IMR90 Hi-C 24141950 SLFN11 58767 978 chr17 33823501 33829360 33828283 N NA SLFN13,SLFN12L NLE1,UNC45B,SLC35G3 IMR90 Hi-C 24141950 SLFN12L 8743 979 chr17 35077320 35083406 35078677 Y NA NA LHX1,AATF,ACACA,MRM1,DHRS11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRM1 119295 980 chr17 36178570 36181617 36180153 N NA NA NA NA NA NA HNF1B 73474 981 chr17 36441100 36444227 36442677 N NA LOC440434,MRPL45 NA NA NA NA MRPL45 8762 982 chr17 38752061 38757297 38754666 N NA CCR7,SMARCE1 KRT14,KRT42P,KRT26,GJD3,TOP2A,TNS4,KRT27,KRT28,RARA,CDC6,IGFBP4,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT9,LOC147093,KRT17,KRT33A,KRT33B IMR90 Hi-C 24141950 CCR7 30325 983 chr17 39820629 39824986 39822868 Y NA EIF1 KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 20141 984 chr17 40214620 40217679 40215983 Y ATP6V0A1 NKIRAS2,DNAJC7,DHX58 RAB5C IMR90 Hi-C 24141950 DNAJC7 44905 985 chr17 41391786 41402135 41393269,41400629,41392531 N,N,N NA;NA;NA TMEM106A BRCA1,NBR2,NBR1,RND2,VAT1,IFI35,RPL27,TMEM106A,LOC100130581,DHX8 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TMEM106A 27892 986 chr17 41654988 41657655 41656233 N NA ETV4 DHX8,MIR2117,MPP2 IMR90 Hi-C 24141950 ETV4 31226 987 chr17 41670305 41672805 41670966 N NA ETV4 LOC100130581,ARL4D,DHX8,ETV4,DUSP3,SOST,C17orf105,MEOX1 IMR90 Hi-C 24141950 ETV4 46543 988 chr17 41796131 41803013 41797742 N NA NA LOC100130581,MPP3,DUSP3,DHX8,ETV4,MEOX1,C17orf105,SOST,CD300LG,HDAC5,ARL4D,PYY IMR90 Hi-C 24141950 DUSP3 53355 989 chr17 4298175 4302010 4300045 N NA UBE2G1 UBE2G1,SPNS3,ANKFY1,ZZEF1,CYB5D2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2G1 28206 990 chr17 43279744 43281907 43281586 N NA HEXIM2,FMNL1,LOC100133991 HEXIM1,ACBD4,PLCD3,HEXIM2,MAP3K14,LOC100133991,TEX34,NMT1,FMNL1,ARHGAP27 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FMNL1 17385 991 chr17 43405873 43408401 43406973 N NA MAP3K14 MAP3K14,FMNL1,LOC100133991,HEXIM1,ARHGAP27,TEX34 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K14 11459 992 chr17 44336331 44338599 44337196 N NA KANSL1,LRRC37A MAPT,KANSL1 IMR90 Hi-C 24141950 KANSL1 33591 993 chr17 44342807 44346220 44344340 Y NA KANSL1,LRRC37A KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LRRC37A 26277 994 chr17 45099271 45102496 45100104 N NA NA NA NA NA NA GOSR2 98785 995 chr17 45126238 45131705 45129928 N NA NA NA NA NA NA GOSR2 125752 996 chr17 45277024 45279676 45277631 Y NA CDC27 CDC27,MYL4,ITGB3,C17orf57,NPEPPS IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC27 10359 997 chr17 45280184 45283734 45282364 N NA CDC27,ITGB3 MYL4,ITGB3,CDC27,C17orf57 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC27 13519 998 chr17 45579011 45581430 45579876 N NA MRPL45P2,NPEPPS NPEPPS IMR90 Hi-C 24141950 MRPL45P2 9025 999 chr17 46515816 46519996 46518824,46517919 Y,N CDK5RAP3,SKAP1;NA SKAP1 SKAP1,HOXB3,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB6,MIR10A,HOXB4,HOXB8,TTLL6 IMR90 Hi-C 24141950 SKAP1 8222 1000 chr17 46568997 46571346 46570026 N NA NA HOXB3,HOXB-AS3,HOXB6,HOXB5,SKAP1,HOXB2,HOXB4,HOXB9 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HOXB2 51047 1001 chr17 48905207 48907760 48906059 N NA LOC400604,TOB1 TOB1,LOC400604,SPAG9,LINC00483 IMR90 Hi-C 24141950 LOC400604 36280 1002 chr17 51183035 51183868 51183555 N NA NA NA NA NA NA UTP18 1845138 1003 chr17 53314770 53316746 53315789 Y HLF NA STXBP4,HLF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MMD 182595 1004 chr17 53509867 53516569 53514293 N NA MMD MMD,TMEM100,PCTP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MMD 10526 1005 chr17 53521008 53525170 53522595 N NA MMD PCTP IMR90 Hi-C 24141950 MMD 21667 1006 chr17 56308595 56312001 56310939 N NA MKS1 LPO,MKS1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKS1 11629 1007 chr17 60174985 60177403 60176089 N NA MED13 MED13 IMR90 Hi-C 24141950 MED13 32342 1008 chr17 62979590 62983801 62981829 N NA AMZ2P1 AMZ2P1,GNA13 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 AMZ2P1 7887 1009 chr17 63095412 63102366 63096542 N NA GNA13,RGS9 RGS9,LRRC37A3,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RGS9 31090 1010 chr17 63117227 63120904 63119530 Y GNA13 RGS9 RGS9,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RGS9 12552 1011 chr17 66014944 66017721 66016144 Y NA KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 14127 1012 chr17 66755100 66756472 66755903 N NA NA FAM20A,ABCA10,ABCA9,ABCA8,PRKAR1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKAR1A 246990 1013 chr17 66790243 66793754 66791134 N NA NA FAM20A,ABCA10,ABCA9,ABCA8,ABCA6 IMR90 Hi-C 24141950 PRKAR1A 282133 1014 chr17 67300040 67325067 67323385 N NA NA KCNJ16,UNK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ABCA10 59084 1015 chr17 67602550 67604198 67603536 Y NA NA KCNJ16,KCNJ2,KCNJ2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K6 191712 1016 chr17 68197925 68205929 68201829,68204543 N,N NA;NA KCNJ2-AS1,KCNJ2 MAP2K6 IMR90 Hi-C 24141950 KCNJ2 32249 1017 chr17 68293502 68296686 68294651 N NA NA MAP2K6 IMR90 Hi-C 24141950 KCNJ2 127826 1018 chr17 68302365 68307626 68304244 N NA NA MAP2K6 IMR90 Hi-C 24141950 KCNJ2 136689 1019 chr17 68347475 68349635 68348280 N NA NA MAP2K6 IMR90 Hi-C 24141950 KCNJ2 181799 1020 chr17 6838609 6841984 6839882 Y XAF1,GPS2,GABARAP,EIF5A,ACAP1,RNASEK,C17orf49 NA ASGR1,LOC100506713,MED31,C17orf100,MIR4520A,ALOX15P1,MIR4520B,ALOX12P2,ALOX12 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100506713 73669 1021 chr17 69970492 69972717 69971738 N NA NA NA NA NA NA SOX9 144444 1022 chr17 69999515 70003280 70001706 N NA NA LOC100499467 IMR90 Hi-C 24141950 SOX9 113881 1023 chr17 70023861 70029057 70026478 N NA NA NA NA NA NA SOX9 88104 1024 chr17 7033856 7038037 7035165 N NA NA CLEC10A,SLC16A13,MIR497HG,BCL6B,ASGR1,ASGR2 IMR90 Hi-C 24141950 ACADVL 85116 1025 chr17 71151322 71157064 71153101 N NA SSTR2,COG1 SLC39A11,COG1 IMR90 Hi-C 24141950 SSTR2 4096 1026 chr17 74240118 74244058 74242741 N NA RNF157,FAM100B MRPL38,SRP68,GALR2,ZACN,EXOC7,RNF157,FAM100B,QRICH2,PRPSAP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF157 3728 1027 chr17 74992797 74995840 74994530 Y SRSF2 NA MFSD11,MGAT5B,SEC14L1 IMR90 Hi-C 24141950 SEC14L1 88885 1028 chr17 76310479 76314589 76311867 N NA SOCS3 PGS1,DNAH17,SOCS3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SOCS3 41569 1029 chr17 79314235 79320231 79319513 Y FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1 SLC38A10 SLC38A10,LINC00482,TMEM105,MIR4740,BAHCC1,C17orf70,FSCN2,ACTG1,C17orf56,C17orf89,MIR3186,NPLOC4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 45139 1030 chr17 8887153 8889880 8888791 Y PIK3R5 PIK3R5 STX8 IMR90 Hi-C 24141950 PIK3R5 18124 1031 chr18 11632866 11636956 11635062 N NA NA NA NA NA NA MPPE1 271840 1032 chr18 11946049 11949784 11947570 Y CHMP1B MPPE1 IMPA2,GNAL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MPPE1 37253 1033 chr18 14392357 14396150 14394186 N NA NA NA NA NA NA CYP4F35P 54935 1034 chr18 14939067 14952196 14951177,14942315 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CYP4F35P 601645 1035 chr18 14965138 14973087 14968088 N NA NA NA NA NA NA CYP4F35P 627716 1036 chr18 19915596 19916844 19916540 N NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 MIB1 594051 1037 chr18 20363563 20364954 20364234 N NA NA RBBP8,TMEM241 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 148341 1038 chr18 20649925 20652058 20651504 Y C18orf8 NA RIOK3,CABLES1,TMEM241 IMR90 Hi-C 24141950 CABLES1 62470 1039 chr18 23793674 23796725 23795791 Y NA TAF4B NA NA NA NA TAF4B 9684 1040 chr18 28823057 28825424 28824663 N NA NA DSC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 DSG2 252603 1041 chr18 31140179 31142535 31140886 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE2 1414357 1042 chr18 37701673 37705740 37704277 N NA NA NA NA NA NA PIK3C3 1829459 1043 chr18 37706340 37713092 37709230 N NA NA NA NA NA NA PIK3C3 1822107 1044 chr18 43354033 43359910 43355341,43355128 N,N NA;NA NA SLC14A1,EPG5,SIGLEC15 IMR90 Hi-C 24141950 EPG5 187395 1045 chr18 45896492 45898714 45897773 N NA NA NA NA NA NA CTIF 166713 1046 chr18 4598086 4601075 4598595,4599141 N,N NA;NA NA NA NA NA NA DLGAP1 142820 1047 chr18 4638426 4641880 4640720 N NA NA NA NA NA NA DLGAP1 183160 1048 chr18 46499594 46505073 46501914 N NA SMAD7 SMAD7,CTIF MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SMAD7 22513 1049 chr18 47832781 47842870 47834756,47839307,47841892 Y,N,N NA;NA;NA MBD1,CXXC1 CCDC11,CXXC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXXC1 18089 1050 chr18 47882226 47884042 47882938 N NA SKA1 NA NA NA NA SKA1 17350 1051 chr18 49180410 49182632 49181913,49181517 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MEX3C 456359 1052 chr18 49253398 49255741 49254308 N NA NA NA NA NA NA MEX3C 529347 1053 chr18 49468190 49470528 49469309 N NA NA NA NA NA NA MEX3C 744139 1054 chr18 5058263 5060024 5058926 N NA NA NA NA NA NA LINC00526 178004 1055 chr18 51771934 51775169 51773608 Y NA MBD2,POLI POLI MCF7 ChIA-PET 22265404 POLI 20680 1056 chr18 517874 520416 519065 N NA NA COLEC12,CLUL1 IMR90 Hi-C 24141950 TYMS 137188 1057 chr18 54744534 54745955 54745186 Y NA NA NA NA NA NA TXNL1 438614 1058 chr18 55512122 55512711 55512265 N NA NA ATP8B1,NEDD4L,ALPK2 IMR90 Hi-C 24141950 NARS 222945 1059 chr18 56316370 56319646 56317127 N NA MALT1 ALPK2,MALT1 IMR90 Hi-C 24141950 MALT1 18972 1060 chr18 57550673 57556293 57552654 N NA PMAIP1 PMAIP1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PMAIP1 10899 1061 chr18 57593306 57598956 57594755 Y NA PMAIP1 PMAIP1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PMAIP1 26114 1062 chr18 57636933 57639284 57637386 N NA NA PMAIP1 IMR90 Hi-C 24141950 PMAIP1 69741 1063 chr18 60086916 60089312 60088052 Y KIAA1468,ZCCHC2 NA PHLPP1,ZCCHC2,TNFRSF11A,BCL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZCCHC2 101346 1064 chr18 60169569 60174623 60173392 N NA ZCCHC2 ZCCHC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZCCHC2 16035 1065 chr18 61694549 61696780 61695433 N NA NA NA NA NA NA SERPINB8 57286 1066 chr18 68675849 68680655 68678738,68679530 Y,N NA;NA NA NA NA NA NA SOCS6 719712 1067 chr18 68702607 68705756 68703789 N NA NA NA NA NA NA SOCS6 746470 1068 chr18 68741863 68746017 68744707 N NA NA NA NA NA NA SOCS6 785726 1069 chr18 69139064 69140378 69139562 N NA NA NA NA NA NA SOCS6 1182927 1070 chr18 74920009 74925199 74921021 N NA NA MBP IMR90 Hi-C 24141950 MBP 75235 1071 chr18 77384549 77386657 77385421 Y PQLC1,ADNP2,NFATC1,NFATC1,CTDP1 NA NFATC1,ATP9B IMR90 Hi-C 24141950 CTDP1 53144 1072 chr18 8600468 8605826 8601844,8604329 N,N NA;NA RAB12 NA NA NA NA RAB12 3617 1073 chr18 9060632 9063352 9062264 N NA NDUFV2 CCDC165,NDUFV2,ANKRD12,PPP4R1,RALBP1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 39276 1074 chr18 9065767 9072164 9067006,9069788 Y,Y NA;ANKRD12,ANKRD12 NDUFV2 CCDC165,NDUFV2,ANKRD12,PPP4R1,RALBP1,RAB12,TWSG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NDUFV2 30464 1075 chr18 9094334 9096355 9095464 Y RALBP1,ANKRD12,ANKRD12 NDUFV2,ANKRD12 RALBP1,TWSG1,NDUFV2,CCDC165,ANKRD12 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NDUFV2 6273 1076 chr19 12353449 12360735 12359650 N NA ZNF44 ZNF564,ZNF442,ZNF20,ZNF625-ZNF20,ZNF136,ZNF563,ZNF799 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF44 44979 1077 chr19 12604880 12607501 12606198 N NA ZNF709 ZNF709,ZNF823,ZNF491,ZNF441,ZNF439,ZNF433,ZNF878,ZNF788,ZNF844,ZNF20,ZNF625-ZNF20,ZNF44,ZNF563,ZNF442,ZNF443,ZNF564 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF709 9248 1078 chr19 14125101 14129267 14126439 Y NANOS3,IL27RA RFX1,IL27RA RFX1 K562 ChIA-PET 22265404 RFX1 7967 1079 chr19 14357978 14362547 14359643 N NA NA LOC100507373 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507373 110014 1080 chr19 14460752 14468436 14466866 Y ZNF333,EMR2,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,DDX39A,CD97 CD97 LPHN1,ASF1B,LOC100507373,DDX39A,CD97 IMR90 Hi-C 24141950 CD97 23520 1081 chr19 14472089 14482959 14474408,14480978 N,Y NA;ZNF333,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,DDX39A,CD97 CD97,DDX39A LPHN1,ASF1B,LOC100507373,DDX39A,CD97 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD97 8997 1082 chr19 14485035 14487685 14486408 Y NA CD97,DDX39A DDX39A K562 ChIA-PET 22265404 CD97 4271 1083 chr19 16111385 16113925 16112913 N NA NA NA NA NA NA RAB8A 108565 1084 chr19 1666716 1671830 1668408,1671809 N,N NA;NA TCF3 TCF3,ONECUT3,REXO1,LOC100288123,ATP8B3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TCF3 14388 1085 chr19 20069438 20070579 20069648 N NA NA NA NA NA NA ZNF93 57716 1086 chr19 20161391 20165347 20163273 N NA NA ZNF682,LOC284440 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF486 112676 1087 chr19 20613398 20615927 20614650 N NA NA NA NA NA NA ZNF737 132699 1088 chr19 22071636 22073439 22072419 N NA ZNF43 NA NA NA NA ZNF43 36766 1089 chr19 23449629 23458820 23457024 N NA ZNF724P NA NA NA NA ZNF724P 16457 1090 chr19 24217853 24224564 24218212 N NA ZNF254 NA NA NA NA ZNF254 45412 1091 chr19 2460917 2466685 2461842 N NA TIMM13,LMNB2,GADD45B LMNB2,GADD45B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 LMNB2 3959 1092 chr19 28557577 28563575 28558165 N NA NA NA NA NA NA LOC148189 272729 1093 chr19 28614421 28616629 28615145 N NA NA NA NA NA NA LOC148189 329573 1094 chr19 28954304 28958139 28956145 N NA NA NA NA NA NA LOC148189 669456 1095 chr19 28968384 28975759 28972602 N NA NA NA NA NA NA LOC148189 683536 1096 chr19 29024659 29027755 29026320 N NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 676381 1097 chr19 29031273 29038036 29033946,29032329 N,N NA;NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 666100 1098 chr19 29077485 29110812 29081155,29091931,29097454,29106324 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA LOC284395 IMR90 Hi-C 24141950 UQCRFS1 593324 1099 chr19 29120626 29125668 29123332 N NA NA LOC284395 IMR90 Hi-C 24141950 UQCRFS1 578468 1100 chr19 30295147 30296589 30295670 N NA CCNE1 CCNE1 K562 ChIA-PET 22265404 CCNE1 6312 1101 chr19 30335960 30338029 30336423 N NA CCNE1 NA NA NA NA CCNE1 33059 1102 chr19 32396433 32398799 32397643 N NA NA NA NA NA NA ZNF507 437715 1103 chr19 34624901 34626977 34625436 N NA LSM14A CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD IMR90 Hi-C 24141950 LSM14A 36375 1104 chr19 36086312 36088809 36087760 N NA TMEM147,LOC100506469,HAUS5,RBM42,ETV2 FFAR1,HAUS5,ATP4A IMR90 Hi-C 24141950 HAUS5 14837 1105 chr19 36190744 36196071 36193439 Y USF2,CD22,FFAR1,HAUS5,ETV2,WDR62,HCST,ZBTB32,U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,ARHGAP33 UPK1A,ZBTB32,MLL4,IGFLR1,U2AF1L4,PSENEN,LIN37 MLL4,ZBTB32 K562 ChIA-PET 22265404 ZBTB32 7759 1106 chr19 40444964 40452408 40447591,40450129 Y,N SERTAD1,ZNF546,FCGBP;NA PSMC4 LEUTX,FCGBP,ZNF780B IMR90 Hi-C 24141950 PSMC4 24665 1107 chr19 40641351 40651470 40649694 Y NA ZNF780A,MAP3K10 FCGBP,TTC9B,CNTD2,MAP3K10,ZNF546,ZNF780A,AKT2,ZNF780B,SPTBN4 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF780A 44506 1108 chr19 42025836 42029349 42028311 N NA NA CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 CEACAM21 53182 1109 chr19 42040710 42049956 42041815 N NA CEACAM21 LOC100505495,B3GNT8,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 CEACAM21 32575 1110 chr19 42051345 42067309 42052503,42055812,42058502 N,N,N NA;NA;NA CEACAM21 C19orf69,ATP5SL,LOC100505495,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 CEACAM21 15222 1111 chr19 44205106 44207358 44205560 N NA NA SMG9,LYPD5,PLAUR,IRGC,KCNN4 IMR90 Hi-C 24141950 SMG9 51784 1112 chr19 44710529 44713758 44711610 Y NA ZNF226,ZNF227 NA NA NA NA ZNF227 2933 1113 chr19 45942382 45949371 45947666,45943336 N,Y NA;GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,ERCC1,FOSB ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP,FOSB,CD3EAP,PPP1R13L,LOC100287177,EML2 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ERCC1 15205 1114 chr19 45951193 45955636 45953546 Y GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,PPM1N,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,ERCC1,FOSB,RTN2,PPM1N FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 15617 1115 chr19 46633858 46638422 46636601,46637914 N,N NA;NA NA NOVA2,IGFL3,IGFL2,DKFZp434J0226,IGFL1,LOC100506012 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC61 135519 1116 chr19 48102134 48105924 48103726 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 GLTSCR1 SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLTSCR1 5529 1117 chr19 484587 491585 489103 N NA TPGS1,CDC34 ODF3L2,SHC2,TPGS1,MADCAM1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TPGS1 15912 1118 chr19 56742448 56746386 56746166 N NA NA NA NA NA NA ZNF444 89913 1119 chr19 6518983 6519677 6519545 N NA DENND1C,TNFSF9 NA NA NA NA TNFSF9 11333 1120 chr19 6521065 6524062 6522145 N NA DENND1C,TNFSF9 TNFSF9 K562 ChIA-PET 22265404 TNFSF9 6948 1121 chr19 7397663 7398926 7398295 N NA NA INSR,ZNF557 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 61073 1122 chr19 7400888 7408101 7402660,7406076 N,N NA;NA NA INSR,ZNF557 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 51898 1123 chr19 7408810 7425299 7410234,7423421,7414653 N,N,Y NA;NA;NA ARHGEF18 ZNF557,INSR,ARHGEF18,PNPLA6,MCOLN1,ZNF358,C19orf45,CD209,CLEC4G IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 34700 1124 chr19 7879552 7882337 7880384 N NA EVI5L ARHGEF18,CAMSAP3,CD209,CLEC4GP1,EVI5L,LRRC8E IMR90 Hi-C 24141950 EVI5L 12824 1125 chr19 8257231 8261684 8259719,8257904 N,N NA;NA CERS4 TIMM44,FBN3,ELAVL1,CCL25 IMR90 Hi-C 24141950 CERS4 12533 1126 chr19 9418542 9421769 9420482 N NA ZNF699,ZNF559-ZNF177 NA NA NA NA ZNF699 2747 1127 chr19 9893988 9897896 9896485 Y ZNF266,COL5A3,ZNF846 ZNF846,FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA ZNF846 14578 1128 chr2 10168928 10170608 10169679 N NA CYS1 TAF1B,GRHL1,RRM2,KLF11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYS1 49930 1129 chr2 10228851 10236221 10231488 N NA CYS1,RRM2,C2orf48 GRHL1,HPCAL1,NOL10,YWHAQ,RRM2,ODC1,KLF11,ATP6V1C2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYS1 8313 1130 chr2 102719611 102722201 102721027 N NA NA IL1RL2,MAP4K4,IL1R2,IL1R1 IMR90 Hi-C 24141950 MFSD9 631136 1131 chr2 111450708 111456104 111453195 N NA BUB1,ACOXL ACOXL IMR90 Hi-C 24141950 BUB1 15024 1132 chr2 111473548 111478081 111475527 N NA BUB1,ACOXL MALL,NPHP1,ACOXL IMR90 Hi-C 24141950 ACOXL 12069 1133 chr2 113447841 113452176 113450253,113448574 Y,N IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A;NA FLJ42351,SLC20A1 SLC20A1,FLJ42351,POLR1B,CHCHD5,CKAP2L MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC20A1 44407 1134 chr2 113462117 113468549 113463969,113464785 N,N NA;NA NA FLJ42351,SLC20A1,IL37,POLR1B,CHCHD5,CKAP2L,IL1B IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CKAP2L 53705 1135 chr2 113550048 113554615 113550969 Y IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L,IL1B CKAP2L,IL37,IL1A,IL1B,CHCHD5 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CKAP2L 27794 1136 chr2 113560574 113565672 113562232 N NA CKAP2L,IL1B CKAP2L IMR90 Hi-C 24141950 IL1B 28684 1137 chr2 113597735 113601110 113599176 N NA IL1B IL1B K562 ChIA-PET 22265404 IL1B 3379 1138 chr2 113636217 113644670 113638287,113642691 Y,N IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B;NA IL1B CKAP2L,IL1A,IL1B,IL37 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IL1B 41861 1139 chr2 113657727 113663859 113659455 N NA NA CKAP2L,IL1A,IL37,IL1B IMR90 Hi-C 24141950 IL1B 63371 1140 chr2 113914232 113917559 113915092 N NA PSD4 IL1RN,LOC654433,PAX8,PSD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSD4 14001 1141 chr2 114086894 114088907 114087874 N NA NA PAX8,LOC654433,IL1RN IMR90 Hi-C 24141950 CBWD2 106361 1142 chr2 118942725 118945018 118943564 N NA NA NA NA NA NA INSIG2 96675 1143 chr2 118980172 118985376 118981828 N NA NA EN1 IMR90 Hi-C 24141950 INSIG2 134122 1144 chr2 119065371 119070065 119067793 Y NA NA NA NA NA NA INSIG2 219321 1145 chr2 123462325 123466335 123464741 N NA NA NA NA NA NA TSN 949204 1146 chr2 123501754 123514615 123503222 N NA NA NA NA NA NA TSN 988633 1147 chr2 125841672 125846528 125844949 N NA NA NA NA NA NA GYPC 1566983 1148 chr2 126154267 126157611 126154991,126157175 N,N NA;NA NA NA NA NA NA GYPC 1255900 1149 chr2 126399136 126402127 126401051 Y NA NA NA NA NA NA GYPC 1011384 1150 chr2 130630174 130636396 130635227 N NA NA NA NA NA NA RAB6C 100839 1151 chr2 131554623 131557317 131555138 N NA NA PLEKHB2,FAM168B K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM168B 293687 1152 chr2 132439100 132447739 132440061 N NA C2orf27A NA NA NA NA C2orf27A 32325 1153 chr2 13648633 13665583 13662089,13659003 N,N NA;NA NA NA NA NA NA NBAS 2035871 1154 chr2 136807522 136810928 136809171 N NA NA NA NA NA NA DARS 64300 1155 chr2 136812792 136817580 136816875,136815871 Y,N NA;NA NA CXCR4 IMR90 Hi-C 24141950 CXCR4 58145 1156 chr2 136822167 136824839 136823296 N NA NA NA NA NA NA CXCR4 50886 1157 chr2 13688257 13696523 13690158 N NA NA NA NA NA NA NBAS 2004931 1158 chr2 136963685 136966351 136964998 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 NA NA NA NA NA CXCR4 87960 1159 chr2 136995310 136997924 136996622 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 NA NA NA NA NA CXCR4 119585 1160 chr2 137003085 137004939 137003958 Y CXCR4,CXCR4 NA NA NA NA NA CXCR4 127360 1161 chr2 137137934 137141744 137139972 Y CXCR4,CXCR4 NA NA NA NA NA CXCR4 262209 1162 chr2 13805162 13808862 13806859 N NA NA NA NA NA NA NBAS 1892592 1163 chr2 139054945 139058034 139056519,139056187 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SPOPL 201316 1164 chr2 143629795 143633089 143631591 Y KYNU KYNU NA NA NA NA KYNU 2106 1165 chr2 148392677 148395253 148393620 N NA NA NA NA NA NA MBD5 383327 1166 chr2 151383804 151386724 151385582 Y RND3 RND3 RND3,RBM43 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RND3 39595 1167 chr2 151428276 151431021 151429742 N NA NA RND3 IMR90 Hi-C 24141950 RND3 84067 1168 chr2 152620130 152629303 152628282 Y NA NA ARL5A,NEB K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARL5A 55706 1169 chr2 155351369 155362427 155352509 N NA NA NA NA NA NA ARL6IP6 1776962 1170 chr2 157195834 157201282 157198355 N NA NR4A2 GPD2,GALNT5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NR4A2 6547 1171 chr2 157256586 157258136 157257455 N NA GPD2 NR4A2,GALNT5,GPD2 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GPD2 33829 1172 chr2 157519443 157521070 157520516,157520483 N,N NA;NA NA NA NA NA NA GPD2 227478 1173 chr2 158101654 158104416 158103159 Y NA NA NR4A2,GALNT5 IMR90 Hi-C 24141950 CYTIP 196188 1174 chr2 158308598 158311709 158310145 Y CYTIP CYTIP NA NA NA NA CYTIP 7994 1175 chr2 158323747 158331368 158323777,158326467 N,N NA;NA CYTIP NA NA NA NA CYTIP 23143 1176 chr2 158334743 158343648 158336839 N NA CYTIP ACVR1C,UPP2 IMR90 Hi-C 24141950 CYTIP 34139 1177 chr2 161933110 161936322 161934612 Y TANK,TANK NA ITGB6 IMR90 Hi-C 24141950 TANK 57144 1178 chr2 161945990 161948184 161947351 N NA TANK PLA2R1,RBMS1,TANK,ITGB6 IMR90 Hi-C 24141950 TANK 45282 1179 chr2 163940720 163944413 163942105 N NA NA NA NA NA NA GCA 740137 1180 chr2 168148234 168149715 168149161 N NA NA NA NA NA NA CERS6 1163044 1181 chr2 171608600 171609611 171609511 N NA LOC100505695 NA NA NA NA LOC100505695 17993 1182 chr2 171618531 171622610 171621451 N NA LOC100505695 NA NA NA NA LOC100505695 4994 1183 chr2 172365856 172369009 172366565 N NA CYBRD1 CYBRD1 K562 ChIA-PET 22265404 CYBRD1 9857 1184 chr2 173396830 173402772 173402022 N NA PDK1 NA NA NA NA PDK1 18007 1185 chr2 175357486 175360375 175358485 N NA GPR155 GPR155,WIPF1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GPR155 5675 1186 chr2 177533351 177535271 177534286 N NA NA HOXD-AS1,HOXD1,MIR10B,HOXD-AS2,HOXD8,HOXD4,MIR1246 IMR90 Hi-C 24141950 MTX2 399228 1187 chr2 178028217 178032747 178030586 N NA HNRNPA3 HOXD-AS2,LOC100130691,AGPS,PDE11A,NFE2L2,HNRNPA3,TTC30A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HNRNPA3 44675 1188 chr2 178033306 178036168 178034832 N NA HNRNPA3 HOXD-AS2,LOC100130691,AGPS,PDE11A,NFE2L2,HNRNPA3,TTC30A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HNRNPA3 41254 1189 chr2 181988263 182001150 181989355 N NA NA ITGA4 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E3 143151 1190 chr2 182006088 182015934 182007451 Y ITGA4 NA ITGA4,CERKL IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E3 160976 1191 chr2 182175420 182180307 182177348,182178218 Y,N ITGA4;NA NA NA NA NA NA ITGA4 141312 1192 chr2 182643861 182646773 182644849 N NA NA SSFA2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SSFA2 109699 1193 chr2 182654727 182657517 182655865 N NA NA SSFA2,PPP1R1C MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SSFA2 98955 1194 chr2 191446578 191451573 191448435 N NA TMEM194B TMEM194B,NAB1,INPP1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TMEM194B 47110 1195 chr2 191582324 191588863 191583638,191587114 Y,N STAT4,NAB1;NA NA NAB1,GLS,PMS1,MFSD6,TMEM194B,STAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NAB1 68476 1196 chr2 192530046 192532261 192531979 N NA OBFC2A OBFC2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OBFC2A 10537 1197 chr2 194423415 194425475 194424274 N NA NA NA NA NA NA OBFC2A 1880617 1198 chr2 196396333 196400702 196398448 N NA NA SLC39A10 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC39A10 120830 1199 chr2 196423052 196428897 196426356 N NA NA SLC39A10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC39A10 92635 1200 chr2 196513877 196515888 196514883 N NA SLC39A10 SLC39A10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC39A10 5644 1201 chr2 20344317 20346744 20345827 N NA NA PUM2,WDR35,MATN3,SDC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDC1 78450 1202 chr2 204547893 204549620 204548907 Y NA NA RAPH1,CD28 IMR90 Hi-C 24141950 ABI2 354890 1203 chr2 204553553 204555919 204554624 N NA NA RAPH1,CD28 IMR90 Hi-C 24141950 ABI2 360550 1204 chr2 20540597 20552343 20550700 N NA PUM2 PUM2,HS1BP3 IMR90 Hi-C 24141950 PUM2 13453 1205 chr2 20563976 20566776 20565184 Y TTC32,HS1BP3 PUM2 PUM2,HS1BP3 IMR90 Hi-C 24141950 PUM2 36832 1206 chr2 20623440 20625640 20624795 Y HS1BP3 RHOB HS1BP3,RHOB,PUM2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOB 21195 1207 chr2 206831465 206834161 206832796 N NA NA NA NA NA NA INO80D 116745 1208 chr2 20687468 20689762 20688704 N NA RHOB RHOB,HS1BP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOB 40633 1209 chr2 20723606 20726500 20724912 N NA NA HS1BP3,RHOB,PUM2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOB 76771 1210 chr2 20729376 20730053 20729829 N NA NA HS1BP3,RHOB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOB 82541 1211 chr2 20774059 20778542 20776651,20776719 Y,N HS1BP3;NA NA HS1BP3,RHOB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HS1BP3 72322 1212 chr2 208146746 208155389 208148075,208150962,208153549 N,Y,Y NA;NA;NA NA KLF7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF7 116132 1213 chr2 208174402 208177741 208176308 Y CREB1,CCNYL1 NA KLF7,CREB1 IMR90 Hi-C 24141950 KLF7 143788 1214 chr2 208192412 208203681 208199706,208202013,208193993 Y,N,N KLF7;NA;NA NA KLF7,CREB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF7 161798 1215 chr2 211114412 211125013 211117999 N NA NA NA NA NA NA KANSL1L 78361 1216 chr2 21322854 21331418 21324695 N NA NA NA NA NA NA C2orf43 300027 1217 chr2 213589427 213592293 213591665 N NA NA IKZF2 IMR90 Hi-C 24141950 IKZF2 424040 1218 chr2 213593018 213596996 213595360 N NA NA IKZF2 IMR90 Hi-C 24141950 IKZF2 419337 1219 chr2 214093479 214096119 214094604 N NA NA NA NA NA NA IKZF2 77146 1220 chr2 214098989 214111755 214103202,214108425 N,Y NA;IKZF2 NA ABCA12,IKZF2,BARD1,SPAG16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IKZF2 82656 1221 chr2 216005268 216006913 216006562 N NA NA NA NA NA NA ATIC 169766 1222 chr2 217465958 217473933 217471589 N NA NA DIRC3,MARCH4,RPL37A,IGFBP2,TNS1,PKI55 IMR90 Hi-C 24141950 RPL37A 102438 1223 chr2 220548399 220552276 220549966 N NA NA INHA,OBSL1,SLC4A3,STK11IP,EPHA4,DES,SPEG,GMPPA,ACCN4 IMR90,HELA,K562,GM12878,H1ESC,MCF7 Hi-C,5C,ChIA-PET 24141950,22955621,22265404 STK11IP 85803 1224 chr2 222201894 222203852 222202382 N NA NA NA NA NA NA SGPP2 1085470 1225 chr2 224068218 224068700 224068370 N NA NA NA NA NA NA ACSL3 342486 1226 chr2 225502647 225504076 225503130 N NA NA FAM124B,SERPINE2,CUL3 IMR90 Hi-C 24141950 CUL3 52537 1227 chr2 228274682 228278062 228275779 N NA NA C2orf83,AGFG1 IMR90 Hi-C 24141950 AGFG1 58826 1228 chr2 228324680 228330346 228325199,228328160 N,N NA;NA AGFG1 AGFG1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AGFG1 6542 1229 chr2 228646825 228649776 228648347 Y AGFG1,CCL20 NA DNER,AGFG1 IMR90 Hi-C 24141950 AGFG1 309937 1230 chr2 231441395 231452253 231447867 N NA NA SP140,SP140L,SP100,CAB39,FBXO36,SLC16A14,SP110 IMR90 Hi-C 24141950 CAB39 125304 1231 chr2 231462977 231468287 231465353,231467542 N,Y NA;GPR55,SP110,SP110,SP140,SP140L,SP100,SP100 NA SP140,SP110,CAB39,SP100,SP140L IMR90 Hi-C 24141950 CAB39 109270 1232 chr2 231478506 231481551 231479433 N NA NA CAB39,SP140,FBXO36,SLC16A14,SP110,SP140L,SP100,ITM2C,SPATA3,LOC348761,LOC151475 IMR90 Hi-C 24141950 CAB39 96006 1233 chr2 231507048 231511387 231508575 N NA NA CAB39,LOC151475,SP140L,SP110 IMR90 Hi-C 24141950 CAB39 66170 1234 chr2 231517467 231535369 231523822,231530016,231532838 N,N,N NA;NA;NA CAB39 CAB39,SP110,LOC151475 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CAB39 42188 1235 chr2 232506608 232511622 232507723 Y NA NA PDE6D IMR90 Hi-C 24141950 PTMA 61613 1236 chr2 232525076 232541118 232527108,232531203,232536825,232537917,232540066 Y,Y,N,Y,N DIS3L2;NA;NA;NA;NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 32117 1237 chr2 232543297 232547784 232545729 Y COPS7B PTMA PTMA,PDE6D K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTMA 25451 1238 chr2 232551360 232553311 232552065 Y NPPC PTMA PTMA,PDE6D K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTMA 19924 1239 chr2 235197492 235202455 235201206,235198904 N,N NA;NA NA TRPM8,ARL4C IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 203238 1240 chr2 237444982 237474707 237460629,237455536,237448055 N,N,N NA;NA;NA CXCR7 IQCA1,CXCR7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXCR7 3673 1241 chr2 237770880 237773318 237771765 N NA NA NA NA NA NA COPS8 220766 1242 chr2 237963495 237968908 237967330 N NA COPS8 IQCA1,AGAP1,ASB18,CXCR7 IMR90 Hi-C 24141950 COPS8 25176 1243 chr2 238062962 238065486 238064223 N NA NA COL6A3,COPS8,MLPH,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 COPS8 68878 1244 chr2 238504413 238510648 238509064 Y RAB17,LRRFIP1 LRRFIP1 MLPH,LRRFIP1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LRRFIP1 25576 1245 chr2 242804986 242808494 242806038 N NA PDCD1 PDCD1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 PDCD1 3928 1246 chr2 242907516 242910678 242908479 N NA NA LOC728323 IMR90 Hi-C 24141950 PDCD1 106458 1247 chr2 24711905 24716525 24713949 N NA NA CENPO,NCOA1 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA1 90821 1248 chr2 2616309 2618902 2617332 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 762751 1249 chr2 26250852 26252499 26251199 N NA RAB10 RAB10 MCF7 ChIA-PET 22265404 RAB10 4230 1250 chr2 26979036 26982459 26980901 Y C2orf18 C2orf18,CENPA OTOF,CENPA,C2orf70,CIB4,KCNK3,DPYSL5,MAPRE3,C2orf18 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C2orf18 4683 1251 chr2 2904349 2906729 2905258 N NA NA MYT1L IMR90 Hi-C 24141950 TSSC1 474924 1252 chr2 30447676 30449446 30448279 Y YPEL5,LBH NA LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 YPEL5 77926 1253 chr2 30558604 30562333 30559539 N NA NA LCLAT1,LBH IMR90 Hi-C 24141950 LCLAT1 107790 1254 chr2 32036025 32038081 32037465 N NA NA NA NA NA NA MEMO1 197617 1255 chr2 34921397 34952500 34921879 N NA NA NA NA NA NA FAM98A 1097035 1256 chr2 36285797 36288154 36287028 N NA NA NA NA NA NA CRIM1 295216 1257 chr2 36466453 36469358 36467858 N NA NA NA NA NA NA CRIM1 114012 1258 chr2 37770383 37774355 37772604 N NA NA CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 124971 1259 chr2 37781325 37791089 37785990,37783070 N,Y NA;NA NA CDC42EP3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 108237 1260 chr2 37796598 37805089 37798553,37801398 N,N NA;NA NA CDC42EP3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 94237 1261 chr2 37811360 37815432 37813067 N NA NA CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 83894 1262 chr2 38079007 38080666 38079224 N NA NA CDC42EP3,QPCT,PRKD3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 179681 1263 chr2 38100302 38109548 38101857,38103969 N,N NA;NA NA CDC42EP3,QPCT,PRKD3,SULT6B1,EIF2AK2 IMR90 Hi-C 24141950 CYP1B1 193775 1264 chr2 38149495 38157827 38152602 N NA NA CDC42EP3,PRKG2,CYP1B1-AS1,FAM82A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 CYP1B1 145496 1265 chr2 38325220 38327042 38326483 N NA CYP1B1 CYP1B1,FAM82A1,CYP1B1-AS1,HNRPLL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CYP1B1 21897 1266 chr2 38335301 38338510 38336516 N NA CYP1B1 FAM82A1,CYP1B1,CYP1B1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 CYP1B1 31978 1267 chr2 42327157 42334974 42329549,42333000 Y,N NA;NA NA EML4,LOC388942 IMR90 Hi-C 24141950 EML4 61516 1268 chr2 42354210 42356147 42354748 N NA EML4 EML4,COX7A2L,LOC388942 IMR90 Hi-C 24141950 EML4 40343 1269 chr2 43034660 43039116 43037928 Y NA OXER1,HAAO THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO,PLEKHH2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HAAO 14909 1270 chr2 43384649 43387225 43386231 Y OXER1,ZFP36L2 NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 66520 1271 chr2 43393601 43394824 43393962 N NA NA LOC100129726,ZFP36L2,THADA IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 58921 1272 chr2 43400321 43403041 43401755 Y OXER1,THADA,THADA,ZFP36L2 NA LOC100129726,ZFP36L2,THADA IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 50704 1273 chr2 43419866 43423850 43421875 N NA ZFP36L2,LOC100129726 ZFP36L2,LOC100129726,THADA K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFP36L2 29895 1274 chr2 45059188 45062235 45060718 N NA NA CAMKMT IMR90 Hi-C 24141950 PREPL 470187 1275 chr2 46455223 46458427 46457021 N NA NA PRKCE,EPAS1,PIGF IMR90 Hi-C 24141950 ATP6V1E2 288669 1276 chr2 46760494 46763489 46762374 N NA ATP6V1E2,RHOQ PIGF,CRIPT,RHOQ IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOQ 6378 1277 chr2 46764223 46766585 46765725 Y TTC7A,MCFD2,RHOQ ATP6V1E2,RHOQ PIGF,CRIPT,RHOQ IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOQ 3282 1278 chr2 47526844 47530314 47528323 N NA NA TTC7A,CALM2,MCFD2,C2orf61,EPCAM IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MSH2 99949 1279 chr2 47535005 47537861 47537022 N NA NA TTC7A,CALM2,MCFD2,C2orf61,CRIPT,PIGF IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MSH2 92402 1280 chr2 47881198 47884470 47882451 N NA NA MSH2,EPCAM,KCNK12 IMR90 Hi-C 24141950 MSH6 125751 1281 chr2 47949841 47953540 47951560 N NA NA KCNK12,MSH2 IMR90 Hi-C 24141950 MSH6 56681 1282 chr2 48337868 48340372 48338978 N NA NA FOXN2,FBXO11,PPP1R21,STON1-GTF2A1L,MSH6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXN2 201423 1283 chr2 49456649 49457491 49456891 N NA NA NA NA NA NA PPP1R21 788741 1284 chr2 54324874 54326124 54325030 N NA NA SPTBN1,RTN4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 PSME4 126897 1285 chr2 58248073 58252513 58251171 N NA VRK2 VRK2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 VRK2 21264 1286 chr2 60277933 60280817 60279175 N NA NA NA NA NA NA PAPOLG 702548 1287 chr2 60330889 60333210 60332060 N NA NA NA NA NA NA PAPOLG 650155 1288 chr2 60577262 60584195 60581715 N NA NA NA NA NA NA PAPOLG 399170 1289 chr2 61897472 61899074 61898309 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90 Hi-C 24141950 XPO1 132054 1290 chr2 61984611 61993174 61991537 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCT4 122632 1291 chr2 62535538 62540460 62537073 Y NA NA COMMD1 IMR90 Hi-C 24141950 B3GNT2 112276 1292 chr2 64449478 64463415 64450468,64455596,64462076 Y,N,N SERTAD2,AFTPH,PELI1;NA;NA LINC00309 LINC00309,PELI1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00309 16859 1293 chr2 64487136 64503845 64488154 Y PELI1,SERTAD2,AFTPH NA LINC00309,PELI1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00309 54517 1294 chr2 64551906 64556946 64554567 N NA NA PELI1,AFTPH,LINC00309 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00309 119287 1295 chr2 64922215 64928496 64926664 N NA SERTAD2 SERTAD2 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 41169 1296 chr2 64942889 64959411 64954842,64957770 N,Y NA;NA NA SERTAD2,AFTPH,LOC339807 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SERTAD2 61843 1297 chr2 64976275 64978535 64978143 N NA NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 95229 1298 chr2 64993153 64997476 64995097 Y SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2 NA SERTAD2,LOC339807 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 112107 1299 chr2 65051964 65060567 65058861 Y AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807 IMR90 Hi-C 24141950 LOC400958 99014 1300 chr2 65062560 65068571 65067298 N NA NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 LOC400958 91010 1301 chr2 65163144 65168835 65165768 N NA LOC400958,SLC1A4 LOC400958,SLC1A4,CEP68,SERTAD2 IMR90 Hi-C 24141950 LOC400958 3563 1302 chr2 65171804 65175622 65173592 Y AFTPH,SERTAD2 LOC400958,SLC1A4 SERTAD2,AFTPH,LOC339807,LOC400958,SLC1A4,CEP68,ACTR2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC400958 12223 1303 chr2 68652080 68655842 68654446 Y FBXO48,APLF,PLEK FBXO48 NA NA NA NA FBXO48 38548 1304 chr2 69134474 69136986 69135749 Y NA NA ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO48 440084 1305 chr2 69875085 69877425 69875601 N NA AAK1 NA NA NA NA AAK1 4108 1306 chr2 69919669 69921734 69920759 N NA AAK1,ANXA4 AAK1,ANXA4,NFU1,GMCL1,GFPT1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANXA4 47393 1307 chr2 69960859 69964126 69961933 N NA ANXA4 AAK1,ANXA4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANXA4 5001 1308 chr2 71502472 71506214 71503742 N NA NA NA NA NA NA ZNF638 52671 1309 chr2 74411392 74420874 74412826 N NA BOLA3,BOLA3-AS1,MOB1A,MTHFD2 SLC4A5,MOB1A,BOLA3,BOLA3-AS1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTHFD2 4816 1310 chr2 75537025 75538955 75538204 N NA NA NA NA NA NA MRPL19 334954 1311 chr2 75638005 75644860 75644192 N NA NA TACR1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL19 229049 1312 chr2 75656261 75661480 75660043 N NA NA TACR1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL19 212429 1313 chr2 76015328 76048657 76018144,76022542,76019212,76027147,76032298 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA GCFC2 77217 1314 chr2 76122193 76124897 76124039 N NA NA NA NA NA NA GCFC2 184082 1315 chr2 81432356 81436824 81433658 N NA NA NA NA NA NA SUCLG1 3249762 1316 chr2 81473289 81478634 81475015 N NA NA NA NA NA NA SUCLG1 3207952 1317 chr2 81531233 81532697 81531780 N NA NA NA NA NA NA SUCLG1 3153889 1318 chr2 82849338 82855651 82850740,82852582 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SUCLG1 1830935 1319 chr2 85115258 85118307 85116031 Y C2orf89,TMSB10 TMSB10 TMSB10,DNAH6 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TMSB10 14456 1320 chr2 85124723 85126590 85125709 N NA TMSB10 DNAH6,TMSB10,C2orf89,KCMF1 IMR90 Hi-C 24141950 TMSB10 6173 1321 chr2 85644159 85649151 85645782,85647838 N,N NA;NA NA ELMOD3,GGCX,MAT2A MCF7 ChIA-PET 22265404 ELMOD3 62316 1322 chr2 8624374 8630077 8628396 Y NA NA LOC100506274,LOC339788,LINC00299 IMR90 Hi-C 24141950 ID2 192036 1323 chr2 8653324 8657729 8655833 N NA NA LOC100506274,LINC00299,ID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID2 164384 1324 chr2 8681682 8687006 8684491 N NA NA LOC100506274,ID2,LOC339788,LINC00299 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID2 135107 1325 chr2 88628663 88633160 88629851 Y NA NA NA NA NA NA KRCC1 273415 1326 chr2 89151054 89160079 89152256 N NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 85635 1327 chr2 89512322 89515831 89513313 N NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 446903 1328 chr2 90282366 90285415 90283940 N NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 1216947 1329 chr2 9157597 9160031 9158839 N NA MBOAT2 MBOAT2 IMR90 Hi-C 24141950 MBOAT2 13721 1330 chr2 9231859 9235271 9233279 N NA NA MBOAT2 IMR90 Hi-C 24141950 MBOAT2 87983 1331 chr2 9238312 9241998 9239592 N NA NA MBOAT2,ASAP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MBOAT2 94436 1332 chr2 95618792 95619133 95618956 N NA NA NA NA NA NA MAL 72346 1333 chr2 96185110 96210333 96192536,96196642,96205579 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA FAHD2A 116662 1334 chr2 96650471 96659540 96657682 N NA LOC729234 NA NA NA NA LOC729234 16759 1335 chr2 96815140 96826717 96822058,96824536 N,N NA;NA ASTL,DUSP2,LOC285033,STARD7 ASTL,DUSP2,STARD7,LOC285033,ADRA2B,SNRNP200,TMEM127,CIAO1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP2 3961 1336 chr2 9794691 9797972 9796774,9796206 N,N NA;NA YWHAQ YWHAQ,GRHL1,ADAM17,KLF11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAQ 23585 1337 chr2 9877438 9880689 9878964 Y ADAM17,KLF11,KLF11 NA ADAM17,YWHAQ,IAH1,KLF11,ITGB1BP1 IMR90 Hi-C 24141950 TAF1B 102882 1338 chr2 9890100 9898346 9893704 N NA NA YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1,KLF11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF1B 85225 1339 chr2 9937879 9942822 9939706 N NA TAF1B YWHAQ,KLF11,CYS1,TAF1B,ADAM17,ODC1,RRM2,GRHL1,HPCAL1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF1B 40749 1340 chr20 11358491 11363804 11360558 N NA NA JAG1,LOC339593,C20orf94,MKKS IMR90 Hi-C 24141950 BTBD3 507673 1341 chr20 11381207 11383700 11382871 N NA NA MKKS,C20orf94,JAG1 IMR90 Hi-C 24141950 BTBD3 487777 1342 chr20 11386681 11389708 11387309 N NA NA JAG1,C20orf94 IMR90 Hi-C 24141950 BTBD3 481769 1343 chr20 11425876 11429697 11428536 N NA NA C20orf94,JAG1 IMR90 Hi-C 24141950 BTBD3 441780 1344 chr20 11431712 11442568 11434688 N NA NA C20orf94,JAG1 IMR90 Hi-C 24141950 BTBD3 428909 1345 chr20 11523712 11526156 11524721 N NA NA C20orf94,MKKS,LOC339593,SNAP25,JAG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BTBD3 345321 1346 chr20 11959241 11962330 11960338 N NA NA NA NA NA NA BTBD3 87764 1347 chr20 11973530 11978351 11974906 N NA NA NA NA NA NA BTBD3 102053 1348 chr20 13315838 13320829 13317832 N NA NA TASP1 IMR90 Hi-C 24141950 TASP1 298754 1349 chr20 1701665 1703828 1702743 N NA NA PDYN IMR90 Hi-C 24141950 NSFL1C 253328 1350 chr20 1824659 1826457 1825553 Y SIRPB2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA NA STK35,LOC100289473,SIRPA,PDYN IMR90 Hi-C 24141950 STK35 256071 1351 chr20 19054786 19056674 19055835 N NA NA SLC24A3 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100270804 280093 1352 chr20 21077410 21086043 21081890 N NA PLK1S1 PLK1S1,NKX2-2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLK1S1 20581 1353 chr20 21528357 21530961 21529562,21529097 N,N NA;NA NA NA NA NA NA XRN2 244415 1354 chr20 21539039 21543952 21540458 N NA NA NA NA NA NA XRN2 255097 1355 chr20 22885038 22888128 22886588 N NA NA NA NA NA NA NXT1 443245 1356 chr20 22896261 22947268 22899368,22906050 N,N NA;NA NA THBD,NXT1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NXT1 384105 1357 chr20 23128112 23129918 23128709 N NA NA CD93,THBD K562 ChIA-PET 22265404 NXT1 201455 1358 chr20 29522788 29532201 29524672 N NA NA NA NA NA NA FRG1B 79678 1359 chr20 32469722 32474464 32471465 N NA NA ZNF341,CHMP4B,RALY,EIF2S2,PXMP4,E2F1 IMR90 Hi-C 24141950 CHMP4B 70612 1360 chr20 32924933 32929411 32926195 N NA ITCH NCOA6,ITCH,DYNLRB1,AHCY,TP53INP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITCH 21651 1361 chr20 34641002 34644613 34642407 N NA LOC647979 NA NA NA NA LOC647979 2120 1362 chr20 34651197 34654857 34652705 Y NA LOC647979 LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LOC647979 12315 1363 chr20 35905081 35907529 35905598 Y SAMHD1,SRC,MANBAL MANBAL RPN2,NNAT,BLCAP,MANBAL,GHRH,SRC,LOC100287792,VSTM2L,TTI1,RPRD1B IMR90 Hi-C 24141950 MANBAL 10522 1364 chr20 38406134 38408367 38407685 N NA NA NA NA NA NA DHX35 815153 1365 chr20 38424663 38431055 38427056,38429347 N,N NA;NA NA NA NA NA NA DHX35 833682 1366 chr20 38456734 38461337 38458818 N NA NA NA NA NA NA DHX35 865753 1367 chr20 39618772 39622427 39619711 N NA TOP1 TOP1,PLCG1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOP1 35035 1368 chr20 39942637 39948298 39946378 N NA NA PLCG1,ZHX3,EMILIN3,LPIN3,IQGAP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404,19890323 PLCG1 176476 1369 chr20 39957191 39959237 39958403 Y NA NA PLCG1,ZHX3,LPIN3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLCG1 191030 1370 chr20 4004460 4005343 4005219 N NA RNF24 CDC25B,PANK2,MIR103B2,RNF24,SMOX,HSPA12B,CENPB,MAVS IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF24 8244 1371 chr20 40320263 40323822 40321951 N NA NA CHD6 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD6 73130 1372 chr20 42379968 42382923 42380706 N NA NA TOX2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 84259 1373 chr20 42526411 42527075 42526912 N NA TOX2 TOX2,MYBL2,JPH2 IMR90 Hi-C 24141950 TOX2 16417 1374 chr20 44735985 44738332 44737192 Y ZNF335,CD40 NCOA5,CD40 SLC12A5,CD40 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD40 8574 1375 chr20 45988016 45991505 45989559 Y SULF2 ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZMYND8 2542 1376 chr20 46036160 46046644 46037895,46043424 N,N NA;NA NA ZMYND8,LOC100131496,NCOA3,SULF2,EYA2 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 50686 1377 chr20 46079436 46083853 46082368 Y NA NCOA3 NCOA3,ZMYND8,LOC100131496,EYA2 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA3 46748 1378 chr20 46095867 46104745 46097211,46102153 Y,N NA;NA NCOA3 NCOA3,ZMYND8,EYA2,LOC100131496 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA3 25856 1379 chr20 46114538 46124320 46116334,46122729 N,N NA;NA NCOA3 NCOA3,ZMYND8,EYA2 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA3 6281 1380 chr20 47087838 47090653 47089304 N NA NA SULF2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00494 99184 1381 chr20 47116426 47119756 47117239 N NA NA SULF2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00494 127772 1382 chr20 47447824 47450183 47448693 Y PREX1,ZNFX1 PREX1 PREX1,ARFGEF2 IMR90 Hi-C 24141950 PREX1 3404 1383 chr20 47461582 47465693 47463573 Y ZNFX1 PREX1 PREX1 IMR90 Hi-C 24141950 PREX1 17162 1384 chr20 47491671 47494096 47492689 N NA PREX1,ARFGEF2 PREX1 IMR90 Hi-C 24141950 ARFGEF2 44179 1385 chr20 48366436 48369002 48367614 N NA B4GALT5 B4GALT5 IMR90 Hi-C 24141950 B4GALT5 36015 1386 chr20 48417545 48420310 48417688,48419180 N,N NA;NA SLC9A8 SLC9A8,B4GALT5,KCNB1,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC9A8 8940 1387 chr20 48779927 48787104 48782795 N NA UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,CEBPB TMEM189-UBE2V1,SNAI1,RNF114,UBE2V1,PTPN1,CEBPB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM189-UBE2V1 9592 1388 chr20 49097132 49102149 49100217 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 24742 1389 chr20 49103829 49106282 49105209 N NA PTPN1 LOC284751,MIR645,FAM65C,PARD6B,PTPN1,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,SNAI1,CEBPB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 20609 1390 chr20 49113162 49115969 49114564 N NA PTPN1 PARD6B,TMEM189-UBE2V1,PTPN1,SNAI1,FAM65C,CEBPB,LOC284751,MIR645 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 10922 1391 chr20 52210910 52219042 52215376,52212595,52217839 N,N,N NA;NA;NA ZNF217 SUMO1P1,BCAS1,BMP7,SULF2,ZMYND8,CYP24A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 11274 1392 chr20 52223973 52229644 52227454 N NA ZNF217 SUMO1P1,ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 24337 1393 chr20 52237569 52241676 52239277 N NA ZNF217 SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 37933 1394 chr20 52258755 52261572 52259654 N NA NA SUMO1P1,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 59119 1395 chr20 52268310 52274142 52269586,52273082 N,N NA;NA NA SUMO1P1,BCAS1,BMP7,ZNF217,SULF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 68674 1396 chr20 52275506 52280608 52277539 N NA NA SUMO1P1,ZNF217,SULF2,BMP7,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 75870 1397 chr20 52293690 52295702 52294671 N NA NA BCAS1,SUMO1P1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 94054 1398 chr20 52322046 52326514 52325032,52323283 N,Y NA;NA NA SUMO1P1,ZNF217 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 122410 1399 chr20 52345091 52348396 52345896 N NA NA ZNF217 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 145455 1400 chr20 52351763 52353128 52352278 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 152127 1401 chr20 52354955 52358925 52356591 N NA NA ZNF217,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 155319 1402 chr20 52369165 52372578 52371094 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 169529 1403 chr20 52444657 52448191 52446314 Y ZNF217 NA ZNF217,SUMO1P1,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 245021 1404 chr20 52506912 52513566 52510394 N NA NA BCAS1,SUMO1P1,ZNF217,BMP7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 307276 1405 chr20 53597702 53602396 53600244 N NA NA NA NA NA NA PFDN4 773200 1406 chr20 53732281 53735308 53733824 N NA NA NA NA NA NA PFDN4 907779 1407 chr20 5624142 5628936 5626734 N NA GPCPD1 GPCPD1,C20orf196,TRMT6 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 32470 1408 chr20 57738181 57758982 57739892 Y ZNF831 NA ZNF831,SLMO2-ATP5E,GNAS-AS1,GNAS IMR90 Hi-C 24141950 SLMO2-ATP5E 120280 1409 chr20 61076247 61079665 61077193 Y DPH3P1,OGFR,DIDO1 NA NA NA NA NA CABLES2 93908 1410 chr20 6808707 6811527 6810160 N NA NA HAO1 IMR90 Hi-C 24141950 BMP2 59962 1411 chr20 6815305 6949794 6819369,6897702,6901941,6836803,6906955 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA HAO1 IMR90 Hi-C 24141950 BMP2 66560 1412 chr21 10181905 10209824 10199982,10184219 N,N NA;NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 213312 1413 chr21 10492765 10493163 10492964 N NA NA NA NA NA NA TEKT4P2 524172 1414 chr21 15398338 15401141 15399690 N NA NA NA NA NA NA HSPA13 354368 1415 chr21 15823943 15828594 15824099,15826446 N,N NA;NA NA NA NA NA NA HSPA13 68434 1416 chr21 16058477 16061028 16059138 N NA NA NA NA NA NA HSPA13 302968 1417 chr21 16132813 16136360 16135373 N NA NA NA NA NA NA NRIP1 300766 1418 chr21 16235995 16238177 16236908 N NA NA NRIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NRIP1 198949 1419 chr21 20832390 20837465 20834008,20836119 N,N NA;NA NA NA NA NA NA C21orf91 1640687 1420 chr21 20866703 20868585 20867729 N NA NA NA NA NA NA C21orf91 1675000 1421 chr21 25799771 25838722 25801074 N NA NA NA NA NA NA LINC00158 965291 1422 chr21 26524679 26527024 26525887 N NA NA NA NA NA NA LINC00158 276989 1423 chr21 26822101 26839284 26830377,26835223,26837218 N,N,N NA;NA;NA LINC00158 MIR155HG IMR90 Hi-C 24141950 LINC00158 18088 1424 chr21 26855445 26866762 26862954,26859154 N,N NA;NA NA NA NA NA NA LINC00158 51432 1425 chr21 26875240 26886027 26880397 N NA MIR155HG LINC00515,MRPL39 IMR90 Hi-C 24141950 MIR155HG 48430 1426 chr21 33006309 33021232 33007768 N NA SOD1 NA NA NA NA SOD1 10703 1427 chr21 34574152 34580449 34576988 N NA IFNAR2 IL10RB,TMEM50B,IFNAR1,IFNGR2,IFNAR2,LOC100288432,C21orf119,URB1,GART,SON,DONSON,CRYZL1 IMR90,GM12878,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 IFNAR2 21782 1428 chr21 34586178 34589903 34588312 Y NA IFNAR2,IL10RB IFNAR1,TMEM50B,IFNGR2,IFNAR2,LOC100288432,IL10RB,CRYZL1 IMR90,K562,GM12878 Hi-C,5C 24141950,22955621 IFNAR2 12328 1429 chr21 35388282 35393972 35391408 N NA NA MRPS6,ATP5O,LOC100506334 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS6 51851 1430 chr21 35401772 35404249 35402427 N NA MRPS6 MRPS6,LOC100506334 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS6 41574 1431 chr21 36900603 36901824 36901334 N NA NA RUNX1,LOC100506385 IMR90 Hi-C 24141950 SETD4 530995 1432 chr21 38927619 38938753 38929718,38936570 N,N NA;NA NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 187760 1433 chr21 39612666 39618322 39614736,39616397 N,N NA;NA KCNJ15 KCNJ6,KCNJ15,DSCR10 IMR90 Hi-C 24141950 KCNJ15 10342 1434 chr21 44779625 44783345 44781839 N NA NA HSF2BP,SIK1,LINC00319,CRYAA,LINC00313,RRP1B IMR90 Hi-C 24141950 SIK1 63657 1435 chr21 45273622 45278500 45275100 N NA AGPAT3 AGPAT3,PDXK,LOC284837,TRAPPC10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AGPAT3 6616 1436 chr21 45591493 45605841 45592823,45595004 Y,N PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG;NA C21orf33 PWP2,ICOSLG,DNMT3L,PFKL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C21orf33 37999 1437 chr21 46968514 46972723 46970541 N NA SLC19A1 SLC19A1,LOC100129027,PCBP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC19A1 6129 1438 chr21 47034565 47037318 47035276 Y NA NA PCBP3,POFUT2,SLC19A1,COL18A1,LOC100129027,ADARB1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC19A1 72180 1439 chr21 47051864 47054577 47052488 N NA NA PCBP3,LOC100129027 IMR90 Hi-C 24141950 SLC19A1 89479 1440 chr21 47058116 47062581 47060471 N NA NA PCBP3,LOC100129027 IMR90 Hi-C 24141950 SLC19A1 95731 1441 chr21 48117689 48119099 48118603 N NA NA NA NA NA NA PRMT2 62182 1442 chr22 17697075 17702541 17698259,17700407 N,N NA;NA CECR3 NA NA NA NA CECR3 45082 1443 chr22 17760738 17762084 17761435 N NA CECR3 NA NA NA NA CECR3 13115 1444 chr22 17783688 17786458 17785470 N NA CECR3 NA NA NA NA CECR3 36065 1445 chr22 20977968 20981114 20979111 N NA NA PI4KA,MED15,KLHL22,SERPIND1,SCARF2,ZNF74 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM191A 74288 1446 chr22 22379429 22381669 22380726 N NA TOP3B VPREB1 IMR90 Hi-C 24141950 TOP3B 42282 1447 chr22 22383027 22387690 22385626 N NA TOP3B VPREB1 IMR90 Hi-C 24141950 TOP3B 45880 1448 chr22 22396085 22398116 22396717 Y NA NA NA NA NA NA TOP3B 58938 1449 chr22 22451370 22454556 22453143 N NA NA LOC96610,VPREB1 IMR90 Hi-C 24141950 TOP3B 114223 1450 chr22 22463635 22467543 22465531 N NA NA VPREB1 IMR90 Hi-C 24141950 TOP3B 126488 1451 chr22 22510502 22512468 22511516 N NA NA NA NA NA NA LOC96610 139995 1452 chr22 22516022 22519596 22516498 N NA NA VPREB1,LOC96610 IMR90 Hi-C 24141950 LOC96610 132867 1453 chr22 22520622 22524531 22522783 N NA NA VPREB1,LOC96610 IMR90 Hi-C 24141950 LOC96610 127932 1454 chr22 22548931 22557177 22550457,22556518 N,N NA;NA NA VPREB1,LOC96610 IMR90 Hi-C 24141950 LOC96610 95286 1455 chr22 22561961 22565952 22562620,22564495 N,N NA;NA NA VPREB1,LOC96610 IMR90 Hi-C 24141950 LOC96610 86511 1456 chr22 22804053 22806035 22804728 N NA NA PRAME,IGLL5 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF280B 57470 1457 chr22 22945397 22949978 22947381 N NA NA PRAME,LOC648691 K562 ChIA-PET 22265404 ZNF280B 81892 1458 chr22 23027273 23032206 23027760,23029086 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZNF280B 163768 1459 chr22 23037938 23041014 23040367 N NA NA NA NA NA NA ZNF280B 174433 1460 chr22 23062712 23064958 23063373 N NA NA ZNF280B,GNAZ,RTDR1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF280B 199207 1461 chr22 23271100 23287965 23272695,23277628,23281646,23285234 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA MIR650,IGLL5,GNAZ,RTDR1,BCR IMR90 Hi-C 24141950 BCR 234587 1462 chr22 24267832 24273852 24272862 N NA LOC284889,DDTL,DDT DDT,DDTL K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 LOC284889 26715 1463 chr22 25795249 25803988 25801433 N NA LRP5L,CRYBB2P1 LRP5L,ADRBK2,SEZ6L,CRYBB2P1,MYO18B IMR90 Hi-C 24141950 LRP5L 17705 1464 chr22 25815931 25816884 25816695 N NA LRP5L,CRYBB2P1 MYO18B,CRYBB2P1,LRP5L,SEZ6L,KIAA1671 IMR90 Hi-C 24141950 CRYBB2P1 27170 1465 chr22 29810164 29812731 29811074 N NA AP1B1 THOC5 IMR90 Hi-C 24141950 AP1B1 25592 1466 chr22 32036571 32044726 32042922 N NA PISD PISD,SFI1,EIF4ENIF1,DEPDC5,YWHAH,C22orf24,C22orf28,LOC339666,RFPL3-AS1,PRR14L MCF7,GM12878,K562,IMR90 ChIA-PET,5C,Hi-C 22265404,22955621,24141950 PISD 9761 1467 chr22 35418248 35422378 35420611 N NA NA NA NA NA NA HMGXB4 231067 1468 chr22 35440547 35445675 35442724 N NA NA ISX IMR90 Hi-C 24141950 HMGXB4 207770 1469 chr22 35446640 35452071 35449800 N NA NA ISX IMR90 Hi-C 24141950 HMGXB4 201374 1470 chr22 35541689 35547213 35546025 N NA NA LARGE IMR90 Hi-C 24141950 HMGXB4 106232 1471 chr22 35859181 35862260 35859568 N NA NA RASD2 IMR90 Hi-C 24141950 MCM5 63065 1472 chr22 36023124 36024837 36023735 N NA APOL6 MB MCF7 ChIA-PET 22265404 APOL6 19587 1473 chr22 36804501 36809307 36806228 Y NA MYH9 MYH9,FOXRED2,TXN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYH9 20438 1474 chr22 36821229 36823574 36822162 N NA MYH9 MYH9,FOXRED2,TXN2 IMR90 Hi-C 24141950 MYH9 37166 1475 chr22 36830963 36833896 36831757 N NA MYH9,TXN2 TXN2,MYH9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TXN2 43791 1476 chr22 37295181 37299917 37297277 N NA NCF4,CSF2RB NA NA NA NA CSF2RB 9758 1477 chr22 37650271 37653767 37652548 N NA SSTR3,RAC2,CYTH4 CARD10,C1QTNF6,CYTH4,ELFN2 IMR90 Hi-C 24141950 RAC2 9966 1478 chr22 39337032 39339003 39337826 Y DDX17,JOSD1,GTPBP1,SUN2,APOBEC3A APOBEC3A NPTXR,MGAT3,APOBEC3A,CBX6,CBX7,APOBEC3H IMR90 Hi-C 24141950 APOBEC3A 14524 1479 chr22 39649732 39652959 39651101 Y ATF4,SUN2,SUN2,APOBEC3A NA CBX7,RNU86,RPL3,SNORD83A,PDGFB IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL3 62711 1480 chr22 39659627 39664249 39662544 Y ATF4,APOBEC3A NA PDGFB,RPL3,SNORD83B IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL3 51421 1481 chr22 41046370 41056428 41047881 Y NA MKL1 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL,SLC25A17,DNAJB7,XPNPEP3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 13680 1482 chr22 41415504 41419650 41418098 Y MKL1,EP300 NA ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBX1 68153 1483 chr22 42696086 42697886 42696951 Y NA LOC388906 TCF20,NFAM1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC388906 30327 1484 chr22 42834596 42859278 42835956,42840171 Y,Y POLDIP3,ARFGAP3,NFAM1;POLDIP3,C22orf32,TCF20,RRP7A,NFAM1 NFAM1 WBP2NL,TCF20,LOC388906,SERHL,MEI1,LOC100132273,NFAM1,NDUFA6,C22orf32,CYP2D6,RNU12,POLDIP3,FAM109B,NAGA,SERHL2,RRP7B,SEPT3,CYP2D7P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFAM1 6195 1485 chr22 42932573 42936488 42933176,42935538 N,N NA;NA RRP7A,RRP7B NA NA NA NA RRP7A 16744 1486 chr22 43057276 43063962 43058093,43061276 N,N NA;NA POLDIP3,CYB5R3 A4GALT,CYB5R3,ARFGAP3,POLDIP3,RNU12 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYB5R3 11871 1487 chr22 43164155 43167304 43165992 Y NFAM1,ARFGAP3 A4GALT ARFGAP3,PACSIN2,CYB5R3 IMR90 Hi-C 24141950 A4GALT 47279 1488 chr22 45078386 45083036 45081649 N NA PRR5-ARHGAP8 PARVB,KIAA1644,SAMM50,PRR5-ARHGAP8 IMR90 Hi-C 24141950 PRR5-ARHGAP8 15346 1489 chr22 47007850 47011270 47010053 N NA NA NA NA NA NA CERK 122882 1490 chr22 47148237 47151480 47150375 Y NA CERK,TBC1D22A CERK MCF7 ChIA-PET 22265404 TBC1D22A 7038 1491 chr22 48492755 48496498 48494739 N NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 1334237 1492 chr22 50221125 50226733 50222694 N NA BRD1,ZBED4 BRD1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BRD1 2673 1493 chr22 50229943 50234116 50232629 Y TUBGCP6,BRD1,ZBED4,CRELD2 BRD1,ZBED4 ZBED4 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BRD1 11491 1494 chr22 50454147 50460648 50455656 N NA NA IL17REL,ZBED4,ALG12,PIM3,CRELD2,PANX2,TRABD,MOV10L1,MLC1,SELO MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PIM3 100004 1495 chr3 100320811 100323675 100322543 N NA NA TFG MCF7 ChIA-PET 22265404 TFG 104459 1496 chr3 1003266 1004655 1004505 N NA NA NA NA NA NA CHL1 764987 1497 chr3 103694550 103697573 103696159 N NA NA NA NA NA NA ALCAM 1387984 1498 chr3 104220247 104222206 104221886 N NA NA NA NA NA NA ALCAM 863351 1499 chr3 104231845 104246743 104241919,104238175,104245794 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA ALCAM 838814 1500 chr3 105965864 105985926 105975268 Y NA NA CBLB IMR90 Hi-C 24141950 CBLB 377977 1501 chr3 106019625 106022873 106021392 N NA NA CBLB IMR90 Hi-C 24141950 CBLB 431738 1502 chr3 107148149 107151382 107150155 N NA NA LOC344595,BBX,LOC100302640 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BBX 90401 1503 chr3 111392614 111397417 111393493 N NA NA CD96,PHLDB2,ZBED2 IMR90 Hi-C 24141950 ZBED2 78432 1504 chr3 112020672 112023552 112021926 N NA CD200 CD200,BTLA,ATG3,SLC35A5,C3orf52 IMR90 Hi-C 24141950 CD200 28364 1505 chr3 112414179 112416556 112415155 N NA NA CD200R1L,CCDC80 IMR90 Hi-C 24141950 SLC35A5 133284 1506 chr3 112797924 112800005 112798535 N NA NA WDR52,BOC IMR90 Hi-C 24141950 C3orf17 59369 1507 chr3 117203569 117207525 117205406 N NA NA NA NA NA NA B4GALT4 1752227 1508 chr3 118523772 118528722 118527713 N NA NA NA NA NA NA B4GALT4 431030 1509 chr3 118975530 118978361 118976737 N NA B4GALT4,ARHGAP31 ARHGAP31 IMR90 Hi-C 24141950 B4GALT4 15778 1510 chr3 119415589 119417942 119416459 N NA POPDC2,COX17 NA NA NA NA COX17 19346 1511 chr3 11951909 11954105 11952822 N NA NA NA NA NA NA TAMM41 63557 1512 chr3 125914619 125918790 125916844 N NA NA ALDH1L1,CCDC37,ZXDC IMR90 Hi-C 24141950 ZXDC 275972 1513 chr3 126913045 126967330 126933345,126927934,126925060,126936287,126946109,126939879,126966743,126960587 N,N,N,N,Y,N,N,N NA;NA;NA;NA;MCM2;NA;NA;NA NA NUP210P1,CHCHD6 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNA1 205608 1514 chr3 127549736 127557357 127554716 Y NA MGLL MGLL,MCM2,PODXL2,KBTBD12 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MGLL 7643 1515 chr3 128397048 128405055 128399690 N NA RPN1,RAB7A RAB7A,RPN1,LOC653712,ACAD9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPN1 27329 1516 chr3 128956769 128961474 128959854 N NA COPG1,C3orf37 KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COPG1 6979 1517 chr3 129897765 129902051 129898277 N NA NA NA NA NA NA FAM86HP 67489 1518 chr3 13151274 13153764 13152365 Y NUP210,IQSEC1 IQSEC1 LOC285375,NUP210,HDAC11 IMR90 Hi-C 24141950 IQSEC1 36657 1519 chr3 133223745 133226740 133225416 Y CDV3,CDV3 NA BFSP2,TOPBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CDV3 65694 1520 chr3 13492389 13494940 13493371 Y NA NUP210 IQSEC1,NUP210 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NUP210 30580 1521 chr3 137044517 137056921 137048055 N NA NA NA NA NA NA IL20RB 367810 1522 chr3 138542099 138544903 138544209 N NA NA PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 63898 1523 chr3 138551994 138555295 138553841 N NA NA PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 73793 1524 chr3 140441904 140447319 140444216,140447239 Y,N NA;NA NA NA NA NA NA SLC25A36 213343 1525 chr3 141405006 141407169 141405799 N NA RNF7 RASA2,ATP1B3,RNF7,GRK7 IMR90 Hi-C 24141950 RNF7 49882 1526 chr3 142895956 142898170 142897590 N NA NA CHST2,SLC9A9 IMR90 Hi-C 24141950 CHST2 57338 1527 chr3 144156271 144158311 144156770 N NA NA NA NA NA NA C3orf58 465631 1528 chr3 147428945 147432268 147430979 N NA NA NA NA NA NA PLSCR1 1166317 1529 chr3 147588588 147592015 147590597 N NA NA NA NA NA NA GYG1 1117180 1530 chr3 147630701 147633954 147632918 N NA NA NA NA NA NA GYG1 1075241 1531 chr3 147662256 147665631 147663780 N NA NA NA NA NA NA GYG1 1043564 1532 chr3 150100728 150104732 150103317 N NA TSC22D2 PFN2,RNF13,TSC22D2,SERP1,EIF2A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 22056 1533 chr3 151910183 151927354 151911650,151915355,151918884,151922042 N,Y,N,N NA;NA;NA;NA NA MBNL1,LOC401093 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MBNL1 58475 1534 chr3 152313041 152317002 152314060 Y NA NA NA NA NA NA P2RY1 235734 1535 chr3 153606375 153609241 153608010 N NA NA NA NA NA NA DHX36 433045 1536 chr3 153612443 153616735 153615153 N NA NA NA NA NA NA DHX36 425551 1537 chr3 156322131 156325549 156323757 N NA SSR3 TIPARP-AS1,TIPARP,CCNL1,SSR3,LOC339894,LOC100498859 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SSR3 49158 1538 chr3 156360248 156362482 156361778 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1 TIPARP,TIPARP-AS1 LOC339894,TIPARP,TIPARP-AS1,LEKR1,LOC100498859 IMR90 Hi-C 24141950 TIPARP 29723 1539 chr3 156891068 156907585 156892900 N NA CCNL1 CCNL1,VEPH1,PTX3,LEKR1,LOC339894,LOC100498859 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCNL1 12586 1540 chr3 16184890 16190937 16188304,16186374 N,N NA;NA NA GALNTL2,ANKRD28,BTD,DPH3,OXNAD1 IMR90 Hi-C 24141950 DPH3 115559 1541 chr3 161882870 161883835 161883508 N NA NA NA NA NA NA NMD3 943771 1542 chr3 162314323 162318993 162316529,162314792 N,N NA;NA NA NA NA NA NA NMD3 1375224 1543 chr3 16883042 16885213 16884300 Y RFTN1,PLCL2,PLCL2 PLCL2 TBC1D5 IMR90 Hi-C 24141950 PLCL2 41239 1544 chr3 172193604 172196514 172195133 N NA TNFSF10 NCEH1,FNDC3B,TNFSF10,ECT2,GHSR IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF10 44783 1545 chr3 172308590 172316605 172310199,172313787 N,N NA;NA NA TNFSF10,FNDC3B,NCEH1 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF10 67293 1546 chr3 177388048 177389021 177388206 N NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 473000 1547 chr3 17806273 17808488 17807586 N NA TBC1D5 NA NA NA NA TBC1D5 22033 1548 chr3 178230757 178244237 178234055,178240727 N,N NA;NA KCNMB2 KCNMB2 IMR90 Hi-C 24141950 KCNMB2 9987 1549 chr3 179983988 179986050 179985149 N NA NA NA NA NA NA TTC14 333868 1550 chr3 180045503 180048222 180047467 N NA NA PEX5L IMR90 Hi-C 24141950 TTC14 271696 1551 chr3 180049031 180054882 180050982 N NA NA PEX5L IMR90 Hi-C 24141950 TTC14 265036 1552 chr3 182433557 182435237 182434513 N NA NA SOX2-OT IMR90 Hi-C 24141950 ATP11B 76054 1553 chr3 182447015 182449425 182448298 N NA NA ATP11B IMR90 Hi-C 24141950 ATP11B 61866 1554 chr3 184242654 184246146 184243548 N NA NA CHRD,PSMD2,ECE2,EIF4G1,CLCN2,POLR2H,FAM131A,THPO,EPHB3,VPS8 IMR90 Hi-C 24141950 POLR2H 161460 1555 chr3 185276286 185278197 185277187 N NA SENP2 LIPH,TMEM41A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SENP2 25834 1556 chr3 186226382 186231967 186230547 N NA CRYGS DGKG,LOC344887,LOC253573 IMR90 Hi-C 24141950 CRYGS 30200 1557 chr3 186899686 186902611 186901215 Y NA RPL39L LOC100131635 IMR90 Hi-C 24141950 RPL39L 42423 1558 chr3 189111157 189114917 189112444 Y TP63 NA NA NA NA NA TP63 234299 1559 chr3 189121775 189123923 189123122 N NA NA NA NA NA NA TP63 225293 1560 chr3 189280884 189288096 189281858,189285747 N,N NA;NA NA TPRG1,TP63 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TP63 61120 1561 chr3 191675879 191678414 191676956 N NA NA NA NA NA NA CCDC50 629005 1562 chr3 191780035 191782691 191781551 Y NA NA NA NA NA NA CCDC50 733161 1563 chr3 193559109 193561349 193560022 N NA NA HES1,LOC100131551 IMR90 Hi-C 24141950 OPA1 248176 1564 chr3 193774328 193777965 193776032 N NA NA LOC647323 IMR90 Hi-C 24141950 HES1 75966 1565 chr3 193787537 193789890 193788734 N NA NA LOC647323,HES1,LOC100131551 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HES1 64041 1566 chr3 193845562 193849964 193849292 N NA HES1 LOC100131551,LOC647323,HES1 IMR90 Hi-C 24141950 HES1 3967 1567 chr3 194276569 194278483 194277550 Y NA NA ATP13A3,TMEM44,LRRC15,CPN2,FLJ34208,GP5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FLJ34208 68700 1568 chr3 195360485 195382750 195361854 N NA SDHAP2 NA NA NA NA SDHAP2 2160 1569 chr3 195641190 195643442 195641963 N NA TNK2 TNK2,MUC20,MIR570,SDHAP2,MUC4 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TNK2 5310 1570 chr3 195822225 195825946 195823395 N NA TFRC LOC401109,TFRC,PCYT1A,LRRC33 IMR90 Hi-C 24141950 TFRC 13193 1571 chr3 195841600 195843717 195842770 N NA TFRC TFRC,LRRC33,LOC401109,RNF168,C3orf43 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFRC 32568 1572 chr3 196164281 196171062 196167772 N NA UBXN7 PCYT1A,TCTEX1D2,TM4SF19-TCTEX1D2,UBXN7,RNF168,C3orf43,WDR53 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBXN7 4936 1573 chr3 196254975 196257317 196255763 Y NA RNF168,WDR53,FBXO45 UBXN7,MUC20,RNF168,C3orf43,PCYT1A,TM4SF19-TCTEX1D2,WDR53,FBXO45,CEP19 IMR90 Hi-C 24141950 RNF168 24336 1574 chr3 196355998 196362633 196359503,196361273 N,N NA;NA LRRC33 SENP5,FBXO45,C3orf43,PAK2,LRRC33,CEP19 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRRC33 4023 1575 chr3 197119184 197123283 197121388 N NA NA DLG1,LOC100507086,BDH1 IMR90 Hi-C 24141950 DLG1 93737 1576 chr3 197181928 197185781 197183354 N NA NA BDH1,DLG1,LOC100507086 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BDH1 114413 1577 chr3 23201952 23206634 23204092 N NA UBE2E2 UBE2E1,UBE2E2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E2 38150 1578 chr3 23694542 23707982 23700913,23695371 Y,N NA;NA NA UBE2E2,UBE2E1,RPL15,NKIRAS1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 139402 1579 chr3 23801673 23805938 23803913 N NA UBE2E1 UBE2E1,UBE2E2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 41446 1580 chr3 26145064 26150704 26147565 N NA NA NA NA NA NA OXSM 313501 1581 chr3 27514264 27527992 27526039,27524733,27524724 N,Y,Y NA;NA;NA SLC4A7 SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 16019 1582 chr3 27673901 27677546 27674669 Y NA NA SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 EOMES 86239 1583 chr3 27768995 27771526 27769941 N NA EOMES EOMES,CMC1,AZI2 IMR90 Hi-C 24141950 EOMES 5210 1584 chr3 27922497 27924305 27923271 N NA NA NA NA NA NA EOMES 158712 1585 chr3 28048004 28050485 28049874 Y EOMES,CMC1 NA NA NA NA NA CMC1 232639 1586 chr3 28076324 28085282 28078540,28080613,28076801,28083948,28081166 Y,N,N,Y,N ZCWPW2,EOMES;NA;NA;EOMES;NA NA NA NA NA NA CMC1 197842 1587 chr3 28168410 28172970 28170864 N NA NA NA NA NA NA CMC1 110154 1588 chr3 28178746 28186233 28179426 N NA NA NA NA NA NA CMC1 96891 1589 chr3 31285870 31291773 31288172 N NA NA GADL1 IMR90 Hi-C 24141950 STT3B 282718 1590 chr3 3707288 3709758 3708322 N NA NA NA NA NA NA CRBN 485887 1591 chr3 39334580 39339294 39336873 N NA CCR8 WDR48,GORASP1,TTC21A,CSRNP1,XIRP1 IMR90 Hi-C 24141950 CCR8 31903 1592 chr3 39402004 39405296 39403191 Y WDR48,XIRP1,XIRP1,CCR8,SLC25A38 CCR8,SLC25A38,RPSA NA NA NA NA SLC25A38 19519 1593 chr3 42049397 42064476 42054784,42056641 N,N NA;NA NA TRAK1,ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 68270 1594 chr3 43220645 43223135 43221783 Y CCDC13,SNRK NA SNRK,ANO10,FAM198A,ABHD5 IMR90 Hi-C 24141950 SNRK 104869 1595 chr3 44037100 44039026 44038086 N NA NA NA NA NA NA ABHD5 304725 1596 chr3 44098857 44102430 44100095 N NA NA FAM198A,ANO10 IMR90 Hi-C 24141950 C3orf23 277514 1597 chr3 44545731 44553483 44552139 N NA ZNF445,ZNF167 ZNF445 K562 ChIA-PET 22265404 ZNF445 26569 1598 chr3 45899579 45908063 45902983,45906472 Y,N NA;NA LZTFL1 SLC6A20,CCR9,CCR2,LZTFL1,SACM1L,FYCO1,LARS2 IMR90 Hi-C 24141950 LZTFL1 15958 1599 chr3 45908754 45918376 45915203,45910238 N,N NA;NA LZTFL1 CCR9,CCR2,LZTFL1,SLC6A20,SACM1L,FYCO1,LARS2,CLEC3B,CCR5 IMR90 Hi-C 24141950 LZTFL1 25133 1600 chr3 46138363 46143077 46139754 Y CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1 NA CXCR6,FYCO1,CCR5,SACM1L,SLC6A20,CCR1,CCR3,CCRL2 IMR90 Hi-C 24141950 FYCO1 101047 1601 chr3 46150345 46154963 46151018,46152678 Y,Y SACM1L,CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR3,CCR2,CCR1;CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR3,CCR1 NA CCR5,FYCO1,CCR1,CCR2 IMR90 Hi-C 24141950 FYCO1 113029 1602 chr3 49498506 49500720 49499256 N NA RHOA,TCTA,NICN1,DAG1 DAG1 MCF7 ChIA-PET 22265404 DAG1 5416 1603 chr3 5066566 5071171 5068311 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40 45469 1604 chr3 51569374 51572157 51570054 N NA VPRBP,RAD54L2 VPRBP,RAD54L2 IMR90 Hi-C 24141950 RAD54L2 3439 1605 chr3 5469338 5471803 5470849 Y NA NA NA NA NA NA EDEM1 239979 1606 chr3 5530004 5532378 5531397 N NA NA NA NA NA NA EDEM1 300645 1607 chr3 57944355 57947221 57945705 Y PDE12 NA FLNB,ARF4 IMR90 Hi-C 24141950 SLMAP 201181 1608 chr3 57968228 57971958 57969678 Y PDE12,PXK NA ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 SLMAP 225054 1609 chr3 59436127 59437959 59437147 N NA NA FHIT IMR90 Hi-C 24141950 KCTD6 958304 1610 chr3 6721159 6723709 6721974 N NA NA NA NA NA NA EDEM1 1491800 1611 chr3 6757351 6760988 6759442 N NA NA NA NA NA NA EDEM1 1527992 1612 chr3 72031967 72036310 72034513,72032144 N,N NA;NA NA SHQ1 IMR90 Hi-C 24141950 RYBP 459464 1613 chr3 72148044 72152111 72150099 N NA NA SHQ1,RYBP IMR90 Hi-C 24141950 RYBP 343663 1614 chr3 72598553 72600079 72599577 N NA NA RYBP,SHQ1 IMR90 Hi-C 24141950 RYBP 102779 1615 chr3 73159604 73160429 73159921 Y EBLN2 NA PDZRN3,CACNA1D IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP4R2 113485 1616 chr3 75224864 75231793 75226204,75229769 N,Y NA;NA NA NA NA NA NA FAM86DP 252473 1617 chr3 75444180 75446180 75444714 N NA FAM86DP NA NA NA NA FAM86DP 38086 1618 chr3 76091649 76092289 76091844 N NA NA NA NA NA NA ZNF717 257394 1619 chr3 76355203 76376121 76361434,76373323 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZNF717 520948 1620 chr3 76417135 76444919 76418150 N NA NA NA NA NA NA ZNF717 582880 1621 chr3 76533945 76592739 76547161,76551104,76577464,76585218,76588712 N,N,N,N,N NA;NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA ZNF717 699690 1622 chr3 76613197 76619568 76615260 N NA NA NA NA NA NA ZNF717 778942 1623 chr3 81042861 81045210 81043254 N NA NA NA NA NA NA GBE1 765740 1624 chr3 81825121 81827310 81826038 N NA GBE1 GBE1 IMR90 Hi-C 24141950 GBE1 14171 1625 chr3 81864771 81867630 81866086 N NA NA NA NA NA NA GBE1 53821 1626 chr3 83982630 83985655 83983907 N NA NA NA NA NA NA GBE1 2171680 1627 chr3 84968438 84969299 84968974 N NA NA NA NA NA NA CHMP2B 2307114 1628 chr3 86437373 86440976 86438921 N NA NA NA NA NA NA CHMP2B 835437 1629 chr3 8698671 8701322 8700062 N NA NA C3orf32,RAD18,CAV3 IMR90 Hi-C 24141950 OXTR 109978 1630 chr3 8705106 8708788 8707344 N NA NA RAD18,C3orf32,CAV3,SRGAP3 IMR90 Hi-C 24141950 OXTR 102512 1631 chr3 87137519 87139823 87138626 N NA NA NA NA NA NA CHMP2B 136590 1632 chr3 87997661 87999430 87999117 N NA NA NA NA NA NA ZNF654 188832 1633 chr3 89747135 89748938 89748536 N NA NA NA NA NA NA CGGBP1 1548119 1634 chr3 9385962 9391789 9390387 N NA THUMPD3,LOC440944,SETD5 RAD18,THUMPD3,SETD5,LOC440944 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THUMPD3 12928 1635 chr3 94866377 94868361 94867301 N NA NA NA NA NA NA DHFRL1 1084310 1636 chr3 95074123 95079540 95076176,95078424 N,N NA;NA NA NA NA NA NA DHFRL1 1292056 1637 chr3 97539425 97557156 97540799,97541648 N,N NA;NA NA GABRR3,CPOX,MINA IMR90 Hi-C 24141950 MINA 134139 1638 chr3 98163312 98165616 98164920 N NA NA NA NA NA NA CLDND1 76294 1639 chr3 98360509 98362189 98361270 N NA CPOX NA NA NA NA CPOX 48054 1640 chr3 99135646 99140244 99137621 Y NA NA MIR548G,COL8A1 IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL6 684074 1641 chr3 99223990 99226458 99224932 N NA NA MIR548G,COL8A1 IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D23 753228 1642 chr4 101016295 101018756 101017438 N NA NA NA NA NA NA DDIT4L 92899 1643 chr4 10702858 10706179 10704075 N NA CLNK CLNK,HS3ST1 IMR90 Hi-C 24141950 CLNK 16472 1644 chr4 10727373 10736541 10731845,10735142,10729304 N,N,N NA;NA;NA CLNK NA NA NA NA CLNK 40987 1645 chr4 10740647 10764357 10742928,10748915 N,N NA;NA NA CLNK IMR90 Hi-C 24141950 CLNK 54261 1646 chr4 109385940 109390262 109387927 N NA NA LEF1,LOC641518,HADH IMR90 Hi-C 24141950 RPL34 151460 1647 chr4 111787381 111789764 111788771 N NA NA NA NA NA NA ELOVL6 667561 1648 chr4 115067628 115069766 115068454 N NA NA NA NA NA NA CAMK2D 384545 1649 chr4 116870494 116881577 116874353,116872351,116877973,116880227 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA NA NA NA NA CAMK2D 2187411 1650 chr4 116890010 116891081 116891025 N NA NA NA NA NA NA CAMK2D 2206927 1651 chr4 119337756 119341671 119338813,119340854 N,N NA;NA NA PRSS12 IMR90 Hi-C 24141950 CEP170P1 95824 1652 chr4 119511096 119515135 119512782 N NA NA NA NA NA NA CEP170P1 73601 1653 chr4 119770836 119775610 119771796 N NA SEC24D SYNPO2,SEC24D IMR90 Hi-C 24141950 SEC24D 13510 1654 chr4 120583936 120586482 120584700 N NA NA MAD2L1,PDE5A,LOC645513 IMR90 Hi-C 24141950 LOC645513 207998 1655 chr4 123071731 123076940 123072238,123073495 Y,N NA;NA KIAA1109 KIAA1109 K562 ChIA-PET 22265404 KIAA1109 14818 1656 chr4 124364136 124367172 124365657 N NA SPRY1 SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY1 46180 1657 chr4 124508273 124510745 124509680 N NA NA NA NA NA NA SPRY1 190317 1658 chr4 126650466 126651907 126651304 N NA NA FAT4 IMR90 Hi-C 24141950 HSPA4L 2051546 1659 chr4 128775067 128778601 128778051 N NA PLK4 NA NA NA NA PLK4 23415 1660 chr4 129161854 129163443 129162476 N NA PGRMC2 LARP1B,PGRMC2,PHF17 IMR90 Hi-C 24141950 PGRMC2 46541 1661 chr4 129165989 129170128 129166584 N NA PGRMC2 NA NA NA NA PGRMC2 39856 1662 chr4 129472823 129475712 129474389 Y NA NA LARP1B,PGRMC2,PHF17 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHF17 255067 1663 chr4 129578468 129581697 129579639 N NA NA PHF17,LARP1B IMR90 Hi-C 24141950 PHF17 149082 1664 chr4 132268191 132270327 132269640 N NA NA NA NA NA NA C4orf33 2253362 1665 chr4 140095442 140102129 140098531 N NA ELF2 ELF2,NAA15,C4orf49,NDUFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ELF2 34836 1666 chr4 140345731 140358474 140355387,140348372 N,N NA;NA RAB33B ELF2,NAA15,SETD7,RAB33B IMR90 Hi-C 24141950 RAB33B 16487 1667 chr4 146366167 146368129 146367493 N NA SMAD1 NA NA NA NA SMAD1 34822 1668 chr4 146943408 146949705 146944833 N NA NA NA NA NA NA ZNF827 83801 1669 chr4 146977864 146982716 146980685 N NA NA LSM6 IMR90 Hi-C 24141950 LSM6 114119 1670 chr4 147080213 147081228 147081017 N NA LSM6 TTC29,LOC100505545 IMR90 Hi-C 24141950 LSM6 15607 1671 chr4 14856372 14859913 14858102 Y CPEB2 NA CPEB2,LOC441009 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CPEB2 144385 1672 chr4 14868971 14871452 14870022 N NA NA CPEB2,LOC441009 MCF7 ChIA-PET 22265404 CPEB2 132846 1673 chr4 15150110 15153083 15151673 Y NA NA CPEB2 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB2 145812 1674 chr4 153198059 153201858 153199951 N NA NA PET112,FAM160A1 IMR90 Hi-C 24141950 FBXW7 101806 1675 chr4 153481634 153486749 153482753 N NA FBXW7,DKFZP434I0714 TMEM154 IMR90 Hi-C 24141950 DKFZP434I0714 24218 1676 chr4 153504890 153508711 153506240 N NA FBXW7,DKFZP434I0714 TMEM154 IMR90 Hi-C 24141950 DKFZP434I0714 47474 1677 chr4 153616809 153619877 153618345 N NA TMEM154 NA NA NA NA TMEM154 15492 1678 chr4 154358900 154363219 154361174 N NA KIAA0922 MND1,TRIM2,KIAA0922 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA0922 24279 1679 chr4 156894547 156897537 156895654 N NA CTSO PDGFC IMR90 Hi-C 24141950 CTSO 19499 1680 chr4 15769560 15775831 15773216,15775044 Y,N FBXL5,CD38;NA CD38 CD38,BST1,CC2D2A IMR90 Hi-C 24141950 CD38 4100 1681 chr4 159971470 159974627 159973283 N NA NA C4orf45,FNIP2 IMR90 Hi-C 24141950 RAPGEF2 214371 1682 chr4 170214357 170215697 170214954 N NA SH3RF1 NEK1,SH3RF1 IMR90 Hi-C 24141950 SH3RF1 22108 1683 chr4 17093110 17097462 17094925 N NA NA LDB2 IMR90 Hi-C 24141950 QDPR 416395 1684 chr4 17336432 17339677 17338469 N NA NA LDB2 IMR90 Hi-C 24141950 QDPR 174180 1685 chr4 182938420 182942082 182940421 N NA NA NA NA NA NA DCTD 896548 1686 chr4 185183327 185191148 185186423,185189469 N,Y NA;IRF2,CASP3 NA IRF2,ENPP6,LOC728175,CASP3,ACSL1,CCDC111,MLF1IP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC728175 83982 1687 chr4 185199600 185212306 185204235,185209478 N,N NA;NA NA IRF2,LOC728175,CASP3,CCDC111,MLF1IP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC728175 62824 1688 chr4 185456280 185458768 185458695 N NA NA IRF2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 IRF2 60554 1689 chr4 185775440 185778807 185776119 Y IRF2,ACSL1 ACSL1,LOC731424 LOC731424 K562 ChIA-PET 22265404 LOC731424 7240 1690 chr4 185779337 185782301 185781446 Y IRF2,ACSL1 ACSL1,LOC731424 NA NA NA NA LOC731424 11137 1691 chr4 188140508 188141325 188140896 N NA NA LOC339975,FAT1 IMR90 Hi-C 24141950 CYP4V2 1027834 1692 chr4 189659531 189663248 189662174 N NA NA NA NA NA NA HSP90AA4P 731051 1693 chr4 190968347 190972373 190970759 N NA NA NA NA NA NA FRG1 106373 1694 chr4 22596206 22597494 22597109 N NA NA GPR125 IMR90 Hi-C 24141950 GPR125 78534 1695 chr4 22599967 22610589 22601684 N NA NA GPR125 IMR90 Hi-C 24141950 GPR125 82295 1696 chr4 25879148 25880261 25880004 N NA SEL1L3,C4orf52 C4orf52,SEL1L3 IMR90 Hi-C 24141950 SEL1L3 14538 1697 chr4 2765287 2767542 2766075 Y NA TNIP2,SH3BP2 TNIP2,NOP14-AS1,NOP14,MFSD10 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TNIP2 7184 1698 chr4 2786370 2790973 2789657,2788543 N,N NA;NA TNIP2,SH3BP2 SH3BP2,NOP14-AS1,MFSD10 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SH3BP2 3777 1699 chr4 31433168 31436224 31434246 N NA NA NA NA NA NA ARAP2 4809755 1700 chr4 3293278 3296736 3294644 N NA C4orf44 RGS12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C4orf44 42511 1701 chr4 33746716 33750443 33749032 N NA NA NA NA NA NA ARAP2 2495536 1702 chr4 35662 37233 36923 N NA ZNF718 ZNF718 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF718 16044 1703 chr4 36256452 36259763 36257820 N NA ARAP2 ARAP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 ARAP2 10473 1704 chr4 38319166 38323416 38320636,38321495 Y,N NA;NA NA FLJ13197,KLF3,TBC1D1,TLR10,PGM2,TLR6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF3 342374 1705 chr4 39038118 39040009 39038857 N NA TMEM156,KLHL5 NA NA NA NA TMEM156 4077 1706 chr4 39166793 39170051 39168314 N NA NA RFC1,KLHL5,WDR19,KLB IMR90 Hi-C 24141950 KLHL5 120342 1707 chr4 40191717 40194400 40191864 N NA RHOH NA NA NA NA RHOH 4127 1708 chr4 40302225 40314051 40303569,40307106,40311740 N,N,N NA;NA;NA NA N4BP2,LOC344967,RHOH,RBM47,NSUN7,CHRNA9 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RHOH 103698 1709 chr4 40318139 40322638 40318890 N NA NA N4BP2,RHOH,RBM47,LOC344967,NSUN7,CHRNA9 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOH 119612 1710 chr4 40657668 40660633 40658800 N NA RBM47 RBM47 IMR90 Hi-C 24141950 RBM47 25785 1711 chr4 40668621 40670094 40669201 N NA RBM47 RBM47 IMR90 Hi-C 24141950 RBM47 36738 1712 chr4 40723488 40726649 40724916 Y RBM47 NA CHRNA9,RBM47,NSUN7,N4BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBM47 91605 1713 chr4 43765063 43767162 43765412 N NA NA NA NA NA NA GUF1 913271 1714 chr4 4853786 4857069 4855059 N NA MSX1 MSX1 K562 ChIA-PET 22265404 MSX1 4323 1715 chr4 49198822 49205247 49200518 N NA NA NA NA NA NA OCIAD2 290007 1716 chr4 49276377 49278291 49276757 N NA NA NA NA NA NA OCIAD2 367562 1717 chr4 54518169 54521785 54520141 N NA NA LNX1,SCFD2,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 FIP1L1 274349 1718 chr4 54566451 54570544 54568812 N NA NA SCFD2,LNX1,PDGFRA,FIP1L1,RPL21P44,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL21P44 282905 1719 chr4 54957002 54959229 54958079 Y NA CHIC2 SCFD2,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 26187 1720 chr4 57623008 57625573 57624242 N NA NA PAICS,HOPX,THEGL IMR90 Hi-C 24141950 REST 148469 1721 chr4 63295138 63298909 63297400 N NA NA NA NA NA NA CENPC1 5112347 1722 chr4 64348609 64363417 64355945,64361325 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CENPC1 4047839 1723 chr4 68415167 68418602 68416324 N NA CENPC1,STAP1 CENPC1 K562 ChIA-PET 22265404 CENPC1 3911 1724 chr4 69440244 69442682 69442235 N NA UGT2B17 NA NA NA NA UGT2B17 5999 1725 chr4 69599516 69602494 69601404 N NA NA NA NA NA NA UGT2B17 165271 1726 chr4 69914684 69931319 69923814,69917076 N,N NA;NA NA UGT2B7 IMR90 Hi-C 24141950 UGT2B17 480439 1727 chr4 71540510 71550952 71544624 N NA IGJ,UTP3,RUFY3 NA NA NA NA UTP3 3244 1728 chr4 76105448 76107563 76106621 N NA NA NA NA NA NA RCHY1 332077 1729 chr4 76622295 76624835 76623889 Y RCHY1,G3BP2,G3BP2 G3BP2,USO1 NA NA NA NA G3BP2 23628 1730 chr4 78114109 78116080 78114762 N NA CCNG2 CCNI,CCNG2,SHROOM3 IMR90 Hi-C 24141950 CCNG2 35752 1731 chr4 79557533 79562332 79560003 Y NA NA FRAS1,BMP2K,LOC100505702 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BMP2K 135200 1732 chr4 79626893 79630254 79628975 N NA NA LOC100505702,BMP2K IMR90 Hi-C 24141950 BMP2K 67278 1733 chr4 84139792 84142371 84141076 N NA NA PLAC8,COPS4,COQ2 IMR90 Hi-C 24141950 PLAC8 103881 1734 chr4 89240562 89242790 89241966 N NA PPM1K NA NA NA NA PPM1K 34674 1735 chr4 90601333 90603649 90602563 N NA NA NA NA NA NA TIGD2 567365 1736 chr4 9152726 9158711 9154900 Y NA NA NA NA NA NA METTL19 710194 1737 chr4 9171058 9173968 9172151 N NA NA NA NA NA NA METTL19 728526 1738 chr4 9605291 9607102 9606028 N NA NA NA NA NA NA WDR1 511471 1739 chr5 100114621 100117654 100115968 Y ST8SIA4,ST8SIA4 NA NA NA NA NA ST8SIA4 121333 1740 chr5 102086538 102123212 102091436,102097953 N,N NA;NA NA PPIP5K2,PAM,GIN1 IMR90 Hi-C 24141950 PAM 78315 1741 chr5 103512992 103515468 103514535 N NA NA NA NA NA NA NUDT12 614502 1742 chr5 111856497 111878334 111858388 N NA NA NA NA NA NA APC 164868 1743 chr5 112263224 112267365 112264328 N NA REEP5,DCP2 REEP5 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 REEP5 5193 1744 chr5 1131392 1136548 1133797 N NA SLC12A7 BRD9,LOC100506688,TRIP13,SLC12A7,NKD2,SLC6A18,CLPTM1L,MIR4457,ZDHHC11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC12A7 19220 1745 chr5 115699772 115702723 115700963 N NA NA NA NA NA NA SEMA6A 207828 1746 chr5 115948664 115952070 115949850 N NA SEMA6A NA NA NA NA SEMA6A 38113 1747 chr5 115986065 115989569 115987593 N NA NA NA NA NA NA SEMA6A 75514 1748 chr5 116008788 116010713 116010109 N NA NA LOC728342 IMR90 Hi-C 24141950 SEMA6A 98237 1749 chr5 116016581 116020279 116017499 N NA NA LOC728342 IMR90 Hi-C 24141950 SEMA6A 106030 1750 chr5 116099958 116102786 116101371 N NA NA NA NA NA NA SEMA6A 189407 1751 chr5 116112923 116124387 116113725 N NA NA NA NA NA NA SEMA6A 202372 1752 chr5 116218793 116221174 116219338 N NA NA NA NA NA NA SEMA6A 308242 1753 chr5 116465587 116474413 116466878,116471858 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SEMA6A 555036 1754 chr5 116540727 116552595 116541825 N NA NA NA NA NA NA SEMA6A 630176 1755 chr5 118772622 118776898 118774881 N NA HSD17B4 NA NA NA NA HSD17B4 11240 1756 chr5 124255584 124259527 124257041 N NA NA NA NA NA NA ZNF608 174779 1757 chr5 124269715 124273291 124271482 N NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 188910 1758 chr5 124285851 124291780 124288309 N NA NA NA NA NA NA ZNF608 205046 1759 chr5 124340168 124343771 124342107 N NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 259363 1760 chr5 124747311 124749570 124747946 N NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 666506 1761 chr5 126083241 126086279 126083992 N NA LMNB1 MEGF10,LMNB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LMNB1 26036 1762 chr5 126096176 126101705 126098018 N NA LMNB1 LMNB1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 LMNB1 10610 1763 chr5 126564463 126566595 126565301 N NA NA LMNB1 IMR90 Hi-C 24141950 C5orf63 155279 1764 chr5 126919524 126927514 126921853,126925413 N,N NA;NA NA FBN2 IMR90 Hi-C 24141950 PRRC1 66215 1765 chr5 127155952 127157841 127156887 N NA NA SLC12A2 IMR90 Hi-C 24141950 FLJ33630 260925 1766 chr5 127300054 127326924 127325151 N NA NA SLC12A2,FLJ33630 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FLJ33630 91842 1767 chr5 133156018 133163131 133158952,133160889 N,N NA;NA NA FSTL4 IMR90 Hi-C 24141950 C5orf15 141275 1768 chr5 133261832 133267990 133265332 N NA C5orf15 FSTL4 IMR90 Hi-C 24141950 C5orf15 36416 1769 chr5 133365306 133368038 133366017 N NA VDAC1 TCF7,VDAC1,SKP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 VDAC1 24482 1770 chr5 133425827 133442482 133436332 Y PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7 TCF7 TCF7,SKP1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TCF7 7920 1771 chr5 133772023 133774496 133772888 N NA CDKN2AIPNL SKP1,CDKL3,UBE2B,CDKN2AIPNL,SAR1B,PHF15,SEC24A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 24425 1772 chr5 133800451 133803882 133802044 N NA NA PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 52853 1773 chr5 133837763 133840738 133839243 N NA PHF15 PHF15,UBE2B,PPP2CA,CDKL3,CDKN2AIPNL,SAR1B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHF15 21060 1774 chr5 137178577 137184540 137183623 N NA NA NPY6R IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPA0 88538 1775 chr5 138076887 138079924 138078139 Y NA CTNNA1 CTNNA1,SIL1,HSPA9,MATR3 IMR90 Hi-C 24141950 CTNNA1 9183 1776 chr5 138896430 138899693 138897679 Y MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2 TMEM173,UBE2D2 DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM173 34087 1777 chr5 139126094 139128300 139126834 N NA NA DNAJC18,UBE2D2,CXXC5 IMR90 Hi-C 24141950 CXXC5 97793 1778 chr5 139535761 139544468 139537025 N NA PURA,IGIP,CYSTM1 CYSTM1,NRG2,IGIP IMR90 Hi-C 24141950 CYSTM1 10185 1779 chr5 14107341 14111537 14108883 Y TRIO TRIO TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIO 32292 1780 chr5 141403731 141405437 141404672,141404665 Y,Y DIAPH1,FCHSD1;DIAPH1,FCHSD1 GNPDA1 GNPDA1,NDFIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNPDA1 11111 1781 chr5 141666605 141669961 141667701 N NA SPRY4 NA NA NA NA SPRY4 34659 1782 chr5 143184329 143187649 143186333 Y NR3C1,NR3C1,HMHB1 NA NR3C1,ARHGAP26 IMR90 Hi-C 24141950 YIPF5 362629 1783 chr5 149862960 149875160 149866599,149869573 N,N NA;NA RPS14,NDST1 NDST1,RBM22,MYOZ3,SYNPO,RPS14 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NDST1 12514 1784 chr5 149969239 149971672 149970101 N NA SYNPO NA NA NA NA SYNPO 8970 1785 chr5 150613300 150620324 150613921,150617920 N,N NA;NA CCDC69,GM2A ANXA6,CCDC69 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC69 9646 1786 chr5 151325988 151329131 151327833 N NA NA NA NA NA NA G3BP1 174512 1787 chr5 152731514 152733466 152732486 N NA NA NA NA NA NA FAM114A2 685031 1788 chr5 1535418 1538022 1536545 Y SLC12A7,LPCAT1 LPCAT1 LPCAT1,SLC6A3 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LPCAT1 11342 1789 chr5 153882196 153884640 153882962 N NA NA HAND1 IMR90 Hi-C 24141950 SAP30L 56679 1790 chr5 154061614 154075531 154062667 Y GEMIN5 LARP1 LARP1,C5orf4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LARP1 16931 1791 chr5 156305222 156311906 156306834,156310673 N,N NA;NA PPP1R2P3 NA NA NA NA PPP1R2P3 27673 1792 chr5 158530223 158534506 158532423 N NA EBF1 EBF1 IMR90 Hi-C 24141950 EBF1 3435 1793 chr5 159884487 159893456 159886357,159889420,159891542 Y,N,N SLU7;NA;NA SLU7,PTTG1 MIR3142 IMR90 Hi-C 24141950 PTTG1 35622 1794 chr5 161714733 161717445 161716021 N NA NA NA NA NA NA CCNG1 1147132 1795 chr5 162520996 162523268 162522347 N NA NA NA NA NA NA CCNG1 341309 1796 chr5 162620608 162627992 162627134,162621078 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CCNG1 236585 1797 chr5 162744673 162746976 162745922 N NA NA NA NA NA NA CCNG1 117601 1798 chr5 163341674 163344092 163342918 N NA NA NA NA NA NA MAT2B 411443 1799 chr5 163545567 163547841 163547025 N NA NA NA NA NA NA MAT2B 615336 1800 chr5 163722672 163725264 163723959 N NA NA NA NA NA NA MAT2B 792441 1801 chr5 163783625 163793992 163786824,163789165,163791736 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA MAT2B 853394 1802 chr5 172203084 172208950 172204679 N NA DUSP1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,ATP6V0E1,RPL26L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 4881 1803 chr5 172231942 172235778 172234389 Y NA DUSP1,ERGIC1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERGIC1 25445 1804 chr5 173115489 173117777 173116966 N NA NA CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 BOD1 71823 1805 chr5 173159751 173166309 173161231,173164352 N,N NA;NA NA CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 BOD1 116085 1806 chr5 173167477 173173718 173170464,173172375 N,N NA;NA NA CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 BOD1 123811 1807 chr5 173248988 173253111 173249812 N NA NA BOD1,CPEB4,C5orf47 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CPEB4 62220 1808 chr5 173310518 173313058 173311739 N NA CPEB4 BOD1,CPEB4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CPEB4 2273 1809 chr5 173699366 173701501 173700206 N NA NA NA NA NA NA CPEB4 384035 1810 chr5 173940623 173941524 173941090 N NA NA MSX2 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 625292 1811 chr5 175340560 175343544 175342288 N NA NA NA NA NA NA THOC3 52001 1812 chr5 178955853 178963321 178957835,178961749 N,N NA;NA RUFY1 RUFY1,ADAMTS2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RUFY1 14241 1813 chr5 179343380 179345135 179344340 N NA TBC1D9B TBC1D9B,RNF130 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBC1D9B 8524 1814 chr5 180523978 180524690 180524312 N NA NA NA NA NA NA TRIM41 125573 1815 chr5 180528690 180529532 180529081 N NA NA MGAT1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM41 120731 1816 chr5 180713660 180719994 180714590,180714542 N,N NA;NA GNB2L1,TRIM52,LOC100132062 NA NA NA NA TRIM52 25541 1817 chr5 18738898 18747812 18746012 N NA NA NA NA NA NA BASP1 1521148 1818 chr5 20729137 20735621 20729377 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 723968 1819 chr5 20972233 20974016 20972805 N NA NA NA NA NA NA GUSBP1 485573 1820 chr5 27402730 27404226 27403734 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 68173 1821 chr5 28705470 28708961 28708432 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 1233071 1822 chr5 28805499 28812002 28810109 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 1333100 1823 chr5 29168023 29171907 29168333 N NA NA NA NA NA NA LOC643401 1695624 1824 chr5 30196911 30199701 30198349 N NA NA NA NA NA NA DROSHA 1332581 1825 chr5 32530228 32565650 32532042,32542898 N,N NA;NA SUB1 SUB1,ZFR MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SUB1 19955 1826 chr5 34242201 34247362 34245037 N NA NA NA NA NA NA C1QTNF3-AMACR 117568 1827 chr5 37847205 37848923 37848182 N NA NA NA NA NA NA WDR70 467793 1828 chr5 40406272 40408168 40406871 N NA NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 TTC33 347904 1829 chr5 45793248 45795819 45794208 N NA NA NA NA NA NA MRPS30 984221 1830 chr5 5004843 5022419 5008443,5018491,5021831 N,N,N NA;NA;NA LOC340094 NA NA NA NA LOC340094 12053 1831 chr5 5023190 5028146 5025394 N NA LOC340094 NA NA NA NA LOC340094 6326 1832 chr5 53698601 53702900 53700521 N NA NA ARL15 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFS4 842136 1833 chr5 55707830 55712506 55709005,55711427 Y,Y MAP3K1;MAP3K1 NA MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP3K1 398394 1834 chr5 55775013 55777228 55775884 N NA NA MAP3K1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K1 333672 1835 chr5 55883629 55886094 55884918 N NA NA MAP3K1,SETD9 IMR90,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 MAP3K1 224806 1836 chr5 58182628 58185040 58183377 N NA NA PDE4D IMR90 Hi-C 24141950 PDE4D 1598885 1837 chr5 60495149 60497658 60496362 N NA C5orf43 NA NA NA NA C5orf43 36847 1838 chr5 6107027 6112199 6109411 N NA NA NA NA NA NA MED10 266440 1839 chr5 61519235 61521095 61519998 N NA NA NA NA NA NA KIF2A 80894 1840 chr5 61563118 61565524 61564296 N NA KIF2A KIF2A K562 ChIA-PET 22265404 KIF2A 36465 1841 chr5 6271738 6277544 6274285 N NA NA NA NA NA NA MED10 101095 1842 chr5 64398033 64400342 64398891 Y NA NA ADAMTS6,CWC27,PPWD1,CENPK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CWC27 333278 1843 chr5 66510942 66513402 66511854 Y NA CD180 MAST4,PIK3R1 MCF7 ChIA-PET 22265404 CD180 18325 1844 chr5 67433059 67438990 67436267 N NA NA NA NA NA NA PIK3R1 72594 1845 chr5 67442879 67446141 67444147 N NA NA NA NA NA NA PIK3R1 65443 1846 chr5 67726813 67732260 67730430 N NA NA PIK3R1 IMR90 Hi-C 24141950 PIK3R1 215229 1847 chr5 68338064 68339745 68338974 N NA NA NA NA NA NA SLC30A5 50031 1848 chr5 69138619 69170084 69140616 N NA NA NA NA NA NA SERF1A 150988 1849 chr5 70013736 70030843 70015738 N NA NA NA NA NA NA SERF1A 165647 1850 chr5 70392666 70397783 70396319 N NA NA NA NA NA NA SMN2 171898 1851 chr5 70402021 70426070 70406821,70408338 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SMN2 181253 1852 chr5 70583751 70587560 70585500 N NA NA NA NA NA NA BDP1 163882 1853 chr5 71175243 71177015 71175590 N NA NA MRPS27 IMR90 Hi-C 24141950 MCCC2 292128 1854 chr5 72021249 72022876 72021882 N NA NA ZNF366 IMR90 Hi-C 24141950 TNPO1 89542 1855 chr5 72682615 72684531 72683395 N NA NA TMEM171,FCHO2 IMR90 Hi-C 24141950 BTF3 109719 1856 chr5 73496328 73498750 73497558 N NA NA RGNEF,ENC1 IMR90 Hi-C 24141950 ENC1 438499 1857 chr5 75258834 75261255 75260090 N NA NA NA NA NA NA POC5 245521 1858 chr5 77174436 77177514 77175962 Y NA NA NA NA NA NA TBCA 102251 1859 chr5 77640271 77643618 77641634 N NA AP3B1,SCAMP1 LHFPL2,ARSB,AP3B1,SCAMP1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SCAMP1 12721 1860 chr5 78021584 78025620 78023970 Y NA NA ARSB,SCAMP1,LHFPL2 IMR90 Hi-C 24141950 LHFPL2 76936 1861 chr5 78458028 78460202 78459014 N NA NA HOMER1,DMGDH,JMY IMR90 Hi-C 24141950 JMY 71723 1862 chr5 79654171 79655336 79654766 N NA ZFYVE16 CMYA5 IMR90 Hi-C 24141950 ZFYVE16 48502 1863 chr5 81073898 81076654 81075206 N NA SSBP2 SSBP2,ZCCHC9,ATG10 IMR90 Hi-C 24141950 SSBP2 26826 1864 chr5 81146042 81150005 81147849 Y NA NA ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP2 98970 1865 chr5 81880208 81900486 81899178,81897093,81894060 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA ATP6AP1L 279042 1866 chr5 83139729 83144223 83140643 Y NA NA NA NA NA NA XRCC4 766412 1867 chr5 84940034 84944962 84943750 N NA NA NA NA NA NA COX7C 968822 1868 chr5 87797635 87799458 87798717 N NA NA NA NA NA NA LOC100505894 232936 1869 chr5 88365757 88369841 88367498 Y MEF2C NA NA NA NA NA MEF2C 165835 1870 chr5 88375399 88378011 88376921 N NA NA NA NA NA NA MEF2C 175477 1871 chr5 88594838 88600073 88598036 N NA NA MEF2C IMR90 Hi-C 24141950 MEF2C 394916 1872 chr5 88608367 88611997 88610155 N NA NA NA NA NA NA MEF2C 408445 1873 chr5 88636852 88639765 88638892 N NA NA NA NA NA NA MEF2C 436930 1874 chr5 88730023 88734280 88731333 N NA NA NA NA NA NA MEF2C 530101 1875 chr5 8952167 8954658 8953229 N NA NA SEMA5A IMR90 Hi-C 24141950 MTRR 1082950 1876 chr5 90484569 90486827 90485904 N NA NA GPR98,ARRDC3,LOC100129716 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100129716 189337 1877 chr5 91688812 91692121 91689998 N NA NA NA NA NA NA ARRDC3 1009663 1878 chr5 91698042 91703223 91701776 N NA NA NA NA NA NA ARRDC3 1018893 1879 chr5 91706873 91708601 91707416 N NA NA NA NA NA NA ARRDC3 1027724 1880 chr5 92711811 92719365 92717476 N NA NA FLJ42709 IMR90 Hi-C 24141950 FAM172A 728039 1881 chr5 95167984 95173540 95170679 N NA GLRX RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 9407 1882 chr5 96151680 96153763 96152280 Y LNPEP,ERAP1 ERAP1 ERAP1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ERAP1 7788 1883 chr5 961982 965714 964073 Y NA NKD2 SLC12A7,TRIP13,BRD9,LOC100506688 IMR90 Hi-C 24141950 NKD2 43454 1884 chr5 96527676 96529661 96528516 N NA RIOK2 FLJ35946,RGMB IMR90 Hi-C 24141950 RIOK2 8671 1885 chr5 97911970 97913227 97912703 N NA NA NA NA NA NA RGMB 191772 1886 chr5 99381949 99390552 99385176,99382162,99389138 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA FAM174A 480572 1887 chr6 100675888 100677788 100676956 Y NA NA SIM1 IMR90 Hi-C 24141950 ASCC3 651436 1888 chr6 105905041 105919067 105907184,105916990 Y,N NA;NA NA ATG5,PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 54042 1889 chr6 105929108 105935872 105932307 N NA NA ATG5,PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 78109 1890 chr6 106046091 106051349 106048769 N NA NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 195092 1891 chr6 106091208 106097047 106093207 N NA NA ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 240209 1892 chr6 106340028 106341756 106341013 Y PRDM1 NA PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 192439 1893 chr6 106438886 106445468 106441548 N NA NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 88727 1894 chr6 106587631 106595959 106589767,106593587 Y,N NA;NA NA PRDM1,ATG5,LIN28B IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 53436 1895 chr6 110360532 110361706 110361489 N NA NA FIG4,AKD1,PPIL6,MICAL1,SMPD2,DDO,METTL24 IMR90 Hi-C 24141950 CDC40 139918 1896 chr6 111390057 111391275 111391122 N NA SLC16A10 NA NA NA NA SLC16A10 17506 1897 chr6 113883587 113887192 113886000 Y MARCKS NA FLJ34503,MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 MARCKS 291335 1898 chr6 113943087 113958563 113944714,113952781,113955883,113957652,113947885,113949270 N,Y,Y,N,N,N NA;MARCKS;MARCKS;NA;NA;NA NA MARCKS,FLJ34503,LOC285758,HDAC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MARCKS 219964 1899 chr6 113961660 113974404 113964490,113969814,113972297 N,N,N NA;NA;NA NA MARCKS,FLJ34503,LOC285758,HDAC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MARCKS 204123 1900 chr6 114074888 114078523 114077099 N NA NA LAMA4 IMR90 Hi-C 24141950 MARCKS 100004 1901 chr6 114084323 114086772 114084893 N NA NA LAMA4 IMR90 Hi-C 24141950 MARCKS 91755 1902 chr6 11412088 11416623 11415030 Y TMEM170B,NEDD9 NEDD9 NEDD9,C6orf228 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD9 29507 1903 chr6 11427136 11430996 11429205 N NA NEDD9 NEDD9,C6orf228,SYCP2L,ELOVL2,ERVFRD-1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD9 44555 1904 chr6 11457859 11463831 11461119 N NA NA NEDD9,C6orf228,ERVFRD-1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM170B 74680 1905 chr6 115035205 115043833 115036501,115039554 Y,N NA;NA NA NA NA NA NA HDAC2 742846 1906 chr6 11784729 11787815 11786576 Y NA NA HIVEP1,ADTRP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIVEP1 224909 1907 chr6 11823885 11827761 11825447 N NA NA ADTRP,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 HIVEP1 184963 1908 chr6 11850525 11856458 11852481 N NA NA HIVEP1,ADTRP,TMEM170B,EDN1 IMR90 Hi-C 24141950 HIVEP1 156266 1909 chr6 11875511 11878796 11877363 Y TMEM170B NA ADTRP,TMEM170B,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 HIVEP1 133928 1910 chr6 11967531 11969326 11968548 N NA HIVEP1 ADTRP,TMEM170B,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 HIVEP1 43398 1911 chr6 12333356 12337859 12336312 N NA EDN1 EDN1,TMEM170B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EDN1 42827 1912 chr6 12354182 12361407 12356409,12360601 N,N NA;NA NA TMEM170B,EDN1 IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 63653 1913 chr6 12368222 12373662 12370924 N NA NA EDN1 IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 77693 1914 chr6 124090352 124093607 124091157 N NA NA NA NA NA NA RNF217 1210907 1915 chr6 12483130 12484820 12484057 N NA NA EDN1,TMEM170B,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 192601 1916 chr6 125666838 125668751 125667816 N NA HDDC2 HEY2 IMR90 Hi-C 24141950 HDDC2 43556 1917 chr6 12606503 12610433 12609091 N NA NA TMEM170B,EDN1,ADTRP,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 315974 1918 chr6 127723927 127726179 127725217 N NA NA ECHDC1 IMR90 Hi-C 24141950 ECHDC1 59173 1919 chr6 130068282 130071856 130070448 N NA ARHGAP18 ARHGAP18,L3MBTL3 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP18 36912 1920 chr6 130200825 130205148 130203811 N NA NA TMEM244 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP18 169455 1921 chr6 134693213 134696172 134694691 N NA NA ALDH8A1,SGK1,LOC154092 IMR90 Hi-C 24141950 TBPL1 419905 1922 chr6 134698963 134701548 134700308 Y SGK1,SGK1 NA ALDH8A1,LOC154092,SGK1,HBS1L,MIR3662 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBPL1 425655 1923 chr6 135190773 135192104 135191513 N NA NA SGK1,LOC154092,ALDH8A1,SLC2A12 IMR90 Hi-C 24141950 HBS1L 183932 1924 chr6 13527156 13527968 13527758 N NA GFOD1,SIRT5 GFOD1,SIRT5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GFOD1 39287 1925 chr6 135408371 135410518 135410120 Y NA HBS1L HBS1L,AHI1,MYB K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HBS1L 32335 1926 chr6 135482027 135487208 135483854,135486427 N,N NA;NA MYB AHI1,MYB,BCLAF1 IMR90 Hi-C 24141950 MYB 15245 1927 chr6 137414255 137420575 137417755 N NA NA NA NA NA NA IFNGR1 119992 1928 chr6 137421381 137425140 137424114 N NA NA IL20RA IMR90 Hi-C 24141950 IFNGR1 115427 1929 chr6 137441463 137444798 137443050 N NA NA NA NA NA NA IFNGR1 95769 1930 chr6 137967128 137971422 137969161 N NA NA NA NA NA NA TNFAIP3 217159 1931 chr6 137976501 137990637 137980464,137987806 N,N NA;NA NA IFNGR1 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 197944 1932 chr6 138006429 138021268 138013316 N NA NA IL20RA,TNFAIP3,IFNGR1,PERP IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 167313 1933 chr6 138025246 138030733 138028312 N NA NA TNFAIP3,PERP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 157848 1934 chr6 138110557 138114244 138112878 Y NA NA TNFAIP3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 74337 1935 chr6 138119885 138123784 138121816 N NA NA TNFAIP3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 64797 1936 chr6 138131193 138134981 138132813 Y TNFAIP3 NA TNFAIP3,PERP IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 53600 1937 chr6 138139296 138142768 138141191 Y TNFAIP3 TNFAIP3 TNFAIP3,PERP IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 45813 1938 chr6 138144104 138151634 138149180,138145231 Y,N OLIG3,TNFAIP3;NA TNFAIP3 TNFAIP3,PERP IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 36947 1939 chr6 138240205 138244903 138242379 N NA NA PERP,TNFAIP3,IFNGR1 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 51624 1940 chr6 138245576 138251063 138249390,138247639 N,N NA;NA NA TNFAIP3,IFNGR1 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 56995 1941 chr6 138259300 138268337 138261606,138261774,138266132 Y,N,N OLIG3,TNFAIP3;NA;NA NA TNFAIP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 70719 1942 chr6 138270232 138274012 138271834 N NA NA TNFAIP3,PERP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 81651 1943 chr6 140224124 140226297 140225036 N NA NA NA NA NA NA CITED2 528339 1944 chr6 14074625 14076080 14075657 Y RANBP9,CD83 CD83 DTNBP1,RNF182 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 41407 1945 chr6 14108504 14111690 14109250 Y CD83 CD83 RNF182,CD83 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD83 5797 1946 chr6 141215872 141220164 141219183 N NA NA LOC100132735,MIR3668 IMR90 Hi-C 24141950 VTA1 1248246 1947 chr6 141804981 141807093 141805658 N NA NA NA NA NA NA VTA1 661317 1948 chr6 144535494 144538322 144537480 Y NA NA STX11,SF3B5 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 STX11 63840 1949 chr6 145667487 145675952 145672636,145669322 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FBXO30 459969 1950 chr6 145810167 145824247 145819583,145810994,145819558 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA FBXO30 311674 1951 chr6 14734118 14737138 14735250 Y NA NA DTNBP1,JARID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JARID2 509389 1952 chr6 149021637 149023039 149022156 Y SASH1 NA LOC100128176,UST IMR90 Hi-C 24141950 TAB2 616397 1953 chr6 149460562 149462851 149461468 N NA NA NA NA NA NA TAB2 176585 1954 chr6 149531384 149532957 149532256 N NA NA TAB2 IMR90 Hi-C 24141950 TAB2 106479 1955 chr6 154924675 154929690 154927196 N NA NA NA NA NA NA CNKSR3 92922 1956 chr6 155654045 155666238 155654989 N NA TFB1M ARID1B,TFB1M,NOX3 IMR90 Hi-C 24141950 TFB1M 18428 1957 chr6 155672502 155677682 155673903 N NA TFB1M NOX3 IMR90 Hi-C 24141950 TFB1M 36885 1958 chr6 157006986 157010195 157008593 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88869 1959 chr6 15899941 15904057 15901762 N NA NA MYLIP K562 ChIA-PET 22265404 MYLIP 225260 1960 chr6 15961823 15963943 15962564 N NA NA NA NA NA NA MYLIP 165374 1961 chr6 15988565 15991140 15989795 N NA NA MYLIP K562 ChIA-PET 22265404 MYLIP 138177 1962 chr6 160349891 160353890 160351683 N NA IGF2R NA NA NA NA IGF2R 36241 1963 chr6 167373647 167379625 167378526 N NA RNASET2,FGFR1OP NA NA NA NA RNASET2 3570 1964 chr6 167503710 167509977 167507317 N NA CCR6 NA NA NA NA CCR6 15318 1965 chr6 17714535 17721776 17715510 Y NUP153 NUP153 NUP153,KIF13A IMR90 Hi-C 24141950 NUP153 7717 1966 chr6 187237 195751 190089,194225 N,N NA;NA NA IRF4,EXOC2,DUSP22 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP22 96350 1967 chr6 20319980 20320700 20320356 N NA NA E2F3 IMR90 Hi-C 24141950 E2F3 81437 1968 chr6 212534 233090 216976,220347,227435,230467 N,N,Y,N NA;NA;NA;NA NA DUSP22,EXOC2,IRF4 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP22 59011 1969 chr6 21437890 21439876 21438785 N NA NA CDKAL1 IMR90 Hi-C 24141950 SOX4 154096 1970 chr6 21586446 21591268 21588390 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2704 1971 chr6 22320749 22324555 22322601 N NA NA CDKAL1,SOX4,LINC00340,LOC729177,PRL IMR90 Hi-C 24141950 HDGFL1 245123 1972 chr6 22333448 22336123 22334877 N NA NA CDKAL1,SOX4,LINC00340,LOC729177,PRL IMR90 Hi-C 24141950 HDGFL1 233555 1973 chr6 22362655 22366700 22363516 N NA NA SOX4 IMR90 Hi-C 24141950 HDGFL1 202978 1974 chr6 22470199 22475229 22471177 N NA NA SOX4,LINC00340 IMR90 Hi-C 24141950 HDGFL1 94449 1975 chr6 233816 238216 236241 Y NA NA DUSP22,IRF4,EXOC2 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP22 53885 1976 chr6 24946326 24950311 24948968 N NA FAM65B FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 FAM65B 35131 1977 chr6 25026079 25044520 25035510,25042428,25027697 N,N,Y NA;NA;NA NA FAM65B,CMAHP IMR90 Hi-C 24141950 CMAHP 93531 1978 chr6 25053201 25056914 25054438 N NA NA FAM65B,GMNN IMR90 Hi-C 24141950 CMAHP 81137 1979 chr6 251056 254496 251981 Y DUSP22 DUSP22 IRF4 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP22 37605 1980 chr6 26295501 26296813 26295940 N NA NA HIST1H2AG,HIST1H2BJ,HIST1H2BE,HIST1H4D,HIST1H2BD,HIST1H2AE,HIST1H2BF,HIST1H3D,HIST1H2BG,HIST1H4E,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H4F,HIST1H4G,HIST1H3G,HIST1H2BI,HIST1H4H,BTN3A2,BTN2A1,LOC285819,BTN1A1,HMGN4,HCG11,HIST1H1D K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BTN3A2 68585 1981 chr6 26304553 26306436 26305528 N NA NA HCG11,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H2AE,HIST1H2BF,HIST1H2BG,HIST1H3D,HIST1H4E,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H4G,HIST1H2BI,HIST1H3G,HIST1H4H,BTN3A2,BTN2A2,BTN1A1,HMGN4,BTN3A3,HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,ABT1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BTN3A2 58962 1982 chr6 26329642 26333065 26330746 N NA BTN3A2 HIST1H1D,HIST1H4F,ABT1,HIST1H4G,HMGN4,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BH,HIST1H3F,HIST1H4H,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A3P,BTN3A1,BTN1A1,HIST1H2AE,HIST1H2BG,HIST1H2AG,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,MIR3143,LOC285819,BTN2A1,HCG11,HIST1H4D,HIST1H4E,HIST1H3E,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H3G,HIST1H2BI,BTN3A3,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H2BM,HIST1H4K,HIST1H2BO,HIST1H3J,HIST1H4L,HIST1H2AM,HIST1H3I IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BTN3A2 32333 1983 chr6 26341297 26343540 26342405 N NA BTN3A2,BTN2A2 HIST1H4F,HIST1H1D,ABT1,HMGN4,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AG,HIST1H2BJ,BTN2A2,HIST1H2AH,MIR3143,LOC285819,BTN2A1,HCG11,BTN3A3,BTN1A1,HIST1H2BI,HIST1H3G,BTN3A2,BTN2A3P,HIST1H4H,BTN3A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BTN3A2 21858 1984 chr6 26567845 26570053 26569316 N NA HCG11,HMGN4,ABT1 BTN2A1,LOC285819,HIST1H2AE,HIST1H2BG,ABT1,HCG11,HIST1H2BD,HIST1H1E,HMGN4,HIST1H2BF,HIST1H3D K562 ChIA-PET 22265404 ABT1 27118 1985 chr6 26571545 26573194 26572178 N NA HCG11,HMGN4,ABT1 BTN2A1,LOC285819,ABT1,HIST1H2AE,HIST1H2BG,HCG11,HIST1H2BD,HIST1H1E,HMGN4,HIST1H2BF,HIST1H3D,HIST1H4E,HIST1H2BK,HIST1H4I K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ABT1 23977 1986 chr6 27045389 27047267 27046639 N NA NA ZNF322,LINC00240,HIST1H2AG,HIST1H2BJ,HIST1H4I,ABT1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H2BK 67370 1987 chr6 27063019 27066140 27064991 N NA HIST1H2BK ZNF322,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H2BK 48497 1988 chr6 27155397 27157176 27156108 N NA HIST1H2BK HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H2BK 40760 1989 chr6 27445184 27447863 27447004 Y NA ZNF184 ZNF184,HIST1H2AG,MIR3143,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,PRSS16,LOC100131289,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,OR2B2,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2AM K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF184 4287 1990 chr6 27470134 27472144 27470762 N NA ZNF184 PRSS16,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BJ,HIST1H2BK,HIST1H2AH,MIR3143,ZNF184,LOC100507173,HIST1H2BM,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4K,HIST1H3I,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2BO,HIST1H3J,HIST1H2AM IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF184 29237 1991 chr6 27639096 27641211 27640306 N NA LOC100507173 ZNF391,PRSS16 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100507173 20603 1992 chr6 27647428 27649197 27648288 N NA LOC100507173 NA NA NA NA LOC100507173 12617 1993 chr6 27654964 27657063 27655918 Y NA LOC100507173 LOC100507173,ZNF184 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LOC100507173 4751 1994 chr6 27719867 27722682 27721280 N NA LOC100131289 HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AG,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,MIR3143,LOC100131289,POM121L2,ZNF184,LOC100507173,HIST1H2AM,HIST1H2BO,HIST1H3I,HIST1H4L IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100131289 6841 1995 chr6 28615619 28617218 28616148 N NA NA SCAND3,ZSCAN12 IMR90 Hi-C 24141950 ZSCAN23 204340 1996 chr6 28908252 28909954 28909134 N NA TRIM27 TRIM27,LOC401242,ZNF311 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM27 16484 1997 chr6 3065467 3070881 3069203 N NA RIPK1,BPHL NQO2,LOC100507194,WRNIP1 K562 ChIA-PET 22265404 RIPK1 6177 1998 chr6 30729731 30733085 30732073 Y NA MDC1,TUBB,FLOT1,IER3 DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A IMR90 Hi-C 24141950 IER3 17404 1999 chr6 31153122 31155553 31154040 N NA CCHCR1,TCF19,POU5F1,PSORS1C3,HCG27 NA NA NA NA PSORS1C3 7446 2000 chr6 31266916 31279454 31276496 N NA HLA-C,HLA-B MUC22,PSORS1C1,C6orf15,PSORS1C2,CCHCR1,HCG26 IMR90 Hi-C 24141950 HLA-C 27003 2001 chr6 31280274 31283714 31282578 N NA HLA-C,HLA-B MUC22,PSORS1C1,C6orf15,PSORS1C2,CCHCR1,HCG26,DPCR1,VARS2,SFTA2,HLA-B IMR90 Hi-C 24141950 HLA-C 40361 2002 chr6 31352834 31360143 31354890,31358371 N,N NA;NA HLA-B,MICA NA NA NA NA MICA 7418 2003 chr6 32211672 32213936 32212932 N NA NA HLA-DOB,NOTCH4 IMR90 Hi-C 24141950 PBX2 53709 2004 chr6 32222581 32224837 32223301 N NA NA C6orf10,HCG23,NOTCH4,BTNL2,ATF6B,AGER,PBX2,TNXB IMR90 Hi-C 24141950 PBX2 64618 2005 chr6 3231484 3233282 3231897 N NA TUBB2B,PSMG4 NA NA NA NA TUBB2B 3516 2006 chr6 32438330 32443995 32441477 N NA HLA-DRA HLA-DRB1 IMR90 Hi-C 24141950 HLA-DRA 30711 2007 chr6 32569538 32580059 32572059,32576771,32577663 N,N,Y NA;NA;GPSM3,HLA-DRA,HLA-DRB5,TAP2,TAP1,PSMB9,PSMB8,PSMB8,HLA-DQB2,HLA-DQA2,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DOB,HLA-DOA,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,HLA-DRB1,HLA-DQB1,HLA-DQA1 HLA-DRB6,HLA-DRB1,HLA-DQA1 NA NA NA NA HLA-DRB1 11925 2008 chr6 32656425 32659625 32657619 N NA HLA-DQB1,HLA-DQA2 NA NA NA NA HLA-DQB1 21959 2009 chr6 32984461 32988822 32986481 N NA BRD2,HLA-DOA HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DPB2,COL11A2,VPS52 IMR90 Hi-C 24141950 HLA-DOA 7072 2010 chr6 32994268 32999240 32997750,32995714 N,N NA;NA HLA-DOA,HLA-DPB1,HLA-DPA1 HLA-DPB2,VPS52,HLA-DPB1,BRD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HLA-DOA 16879 2011 chr6 34190121 34193825 34191866 Y C6orf1,HMGA1 HMGA1,C6orf1 RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1 MCF7 ChIA-PET 22265404 HMGA1 10752 2012 chr6 37482007 37488637 37484595 Y NA CCDC167 CCDC167,MDGA1,RNF8,FTSJD2,TBC1D22B,MIR4462,ZFAND3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC167 14307 2013 chr6 37671422 37674479 37673322 Y NA NA MDGA1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ZFAND3 112828 2014 chr6 37743591 37752389 37751196 N NA ZFAND3 BTBD9,ZFAND3,FTSJD2,MDGA1,CCDC167 IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND3 34918 2015 chr6 40105025 40117449 40115897,40106251 N,N NA;NA NA NA NA NA NA UNC5CL 889489 2016 chr6 41285474 41287825 41286776 Y NFYA,TFEB,TREML4,TREM1 NA C6orf130 K562 ChIA-PET 22265404 LOC221442 216701 2017 chr6 41454632 41457792 41456568 Y NA NA FOXP4,TFEB,MDFI IMR90,H1ESC,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 FOXP4 56372 2018 chr6 41497343 41501558 41499957 N NA FOXP4 FOXP4 IMR90,H1ESC,MCF7 Hi-C,5C,ChIA-PET 24141950,22955621,22265404 FOXP4 12606 2019 chr6 42472056 42476627 42474028 N NA NA TRERF1,GUCA1A IMR90 Hi-C 24141950 TRERF1 52273 2020 chr6 42737930 42763715 42743044,42738938,42751030 N,Y,N NA;CUL9,TRERF1,UBR2,TBCC,CNPY3,C6orf226;NA TBCC,KIAA0240 KIAA0240,GUCA1A,UBR2,ATP6V0CP3,PRPH2,RPL7L1,TBCC,C6orf226,TRERF1,PTCRA,PPP2R5D,KLHDC3,MEA1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBCC 24046 2021 chr6 43349791 43354338 43351526 Y NA ZNF318,ABCC10 TJAP1,TTBK1,DLK2,POLH,SLC22A7,ABCC10,C6orf108,CUL9,YIPF3,LRRC73,POLR1C,CRIP3,ZNF318,XPO5 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF318 12610 2022 chr6 433977 437110 434952 N NA IRF4 IRF4 IMR90 Hi-C 24141950 IRF4 42238 2023 chr6 43691254 43694839 43692363 N NA MRPS18A,VEGFA MRPS18A,LOC100132354,RSPH9,MRPL14,CAPN11,TMEM63B,POLH,VEGFA,XPO5,MAD2L1BP,GTPBP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPS18A 35705 2024 chr6 43700552 43704784 43702054 Y TJAP1,GTPBP2,MAD2L1BP MRPS18A,VEGFA TMEM63B,MRPS18A,LOC100132354,CAPN11,POLH,XPO5,RSPH9,VEGFA,C6orf223,MRPL14,SLC29A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 VEGFA 33162 2025 chr6 43943711 43947198 43945482 N NA C6orf223 MRPS18A,VEGFA,LOC100132354,POLH,MAD2L1BP,RSPH9,GTPBP2,C6orf223 IMR90 Hi-C 24141950 C6orf223 21139 2026 chr6 44006300 44053476 44026681,44033574,44041967,44044338,44044495,44050886 Y,Y,N,Y,Y,N NFKBIE,MAD2L1BP;NFKBIE,MAD2L1BP;NA;C6orf223,NFKBIE;C6orf223,NFKBIE;NA C6orf223,MRPL14,TMEM63B RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA,MAD2L1BP,C6orf223,MRPL14,HSP90AB1,CAPN11,TMEM63B IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C6orf223 37963 2027 chr6 44671546 44673604 44672298 Y NA NA CLIC5,SUPT3H,RUNX2 IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 316295 2028 chr6 52160383 52163829 52161635 N NA MCM3 TMEM14A,PAQR8,MCM3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MCM3 10801 2029 chr6 53222349 53226382 53224227 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 8372 2030 chr6 56722896 56731008 56730007 N NA NA DST,PRIM2,RAB23,BAG2,BEND6 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1586 180376 2031 chr6 56752963 56757499 56755792 N NA NA PRIM2,BAG2,BEND6,ZNF451,DST,RAB23,KIAA1586 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1586 153885 2032 chr6 63685655 63687564 63686145 N NA NA NA NA NA NA PTP4A1 594356 2033 chr6 63707876 63710551 63708719 N NA NA NA NA NA NA PTP4A1 571369 2034 chr6 64061919 64064559 64062480 N NA NA PTP4A1,EYS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A1 217361 2035 chr6 6683447 6686592 6684918 N NA NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 LY86 94513 2036 chr6 6810277 6812427 6811548 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 LY86 221343 2037 chr6 6855816 6858491 6856957 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 249339 2038 chr6 68947131 68949372 68948229 N NA NA NA NA NA NA LMBRD1 1557677 2039 chr6 70521983 70527707 70523745,70526029 N,N NA;NA LMBRD1,COL19A1 NA NA NA NA LMBRD1 14934 2040 chr6 710082 713479 711253 Y DUSP22,EXOC2 EXOC2 NA NA NA NA EXOC2 16973 2041 chr6 74097329 74100191 74098980 N NA NA MTO1 K562 ChIA-PET 22265404 MB21D1 61852 2042 chr6 78076771 78079554 78078660 N NA NA NA NA NA NA IRAK1BP1 1497635 2043 chr6 78270139 78273934 78271156 N NA NA NA NA NA NA IRAK1BP1 1303255 2044 chr6 78275249 78277079 78276161 N NA NA NA NA NA NA IRAK1BP1 1300110 2045 chr6 81253119 81255031 81254214 N NA NA BCKDHB IMR90 Hi-C 24141950 BCKDHB 436775 2046 chr6 82236633 82249396 82246138 N NA NA NA NA NA NA FAM46A 213032 2047 chr6 82468306 82471549 82469778 N NA FAM46A FAM46A MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM46A 5878 2048 chr6 82518133 82519541 82518901 N NA NA BCKDHB,FAM46A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM46A 55705 2049 chr6 82643805 82650163 82647468 N NA NA FAM46A IMR90 Hi-C 24141950 FAM46A 181377 2050 chr6 82704400 82708340 82707427 N NA NA BCKDHB IMR90 Hi-C 24141950 FAM46A 241972 2051 chr6 86113095 86117719 86115434 N NA NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 NT5E 41583 2052 chr6 86394391 86398905 86395617 N NA SYNCRIP,SNHG5 NA NA NA NA SNHG5 5940 2053 chr6 88441182 88443912 88442166 Y AKIRIN2 AKIRIN2-AS1,AKIRIN2 AKIRIN2,AKIRIN2-AS1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 AKIRIN2 29197 2054 chr6 88505703 88508570 88506560 N NA NA NA NA NA NA AKIRIN2 93718 2055 chr6 88540584 88544492 88542225 N NA NA NA NA NA NA AKIRIN2 128599 2056 chr6 88612715 88619120 88614877,88616788 N,N NA;NA NA ANKRD6 IMR90 Hi-C 24141950 AKIRIN2 200730 2057 chr6 88625470 88641835 88626790,88632229,88635115,88639705 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA RNGTT IMR90 Hi-C 24141950 AKIRIN2 213485 2058 chr6 88823714 88826087 88824823 N NA CNR1 NA NA NA NA CNR1 49680 2059 chr6 89201321 89206802 89204463 N NA NA NA NA NA NA CNR1 325554 2060 chr6 89208397 89211261 89209956 N NA NA NA NA NA NA CNR1 332630 2061 chr6 9519702 9521771 9521133 N NA NA LOC100130275,TFAP2A,LINC00518 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100130275 890780 2062 chr6 9760000 9765305 9764849 N NA NA NA NA NA NA LOC100130275 647246 2063 chr7 100433442 100437493 100435108 N NA SLC12A9,TRIP6,SRRT AGFG2,MOSPD3,PCOLCE,FBXO24,LOC100129845,POP7,EPO,GIGYF1,EPHB4,ZAN,SRRT,SLC12A9,TRIP6,SERPINE1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC12A9 12865 2064 chr7 100764378 100768347 100765678 Y TRIM56,SERPINE1 TRIM56,AP1S1 NA NA NA NA AP1S1 29339 2065 chr7 101383706 101387724 101384069 N NA NA CUX1,EMID2,SH2B2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUX1 71460 2066 chr7 102352964 102355366 102354125 N NA POLR2J2,FAM185A FBXL13,ARMC10 IMR90 Hi-C 24141950 FAM185A 34033 2067 chr7 102382388 102385588 102382992 N NA FAM185A NA NA NA NA FAM185A 3811 2068 chr7 104582483 104586970 104585649 Y MLL5 LOC723809,LOC100216546 LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC723809 15391 2069 chr7 105697006 105701060 105699039 N NA NA ATXN7L1,CDHR3,SYPL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SYPL1 51997 2070 chr7 105984293 105989187 105987821 N NA NA NAMPT,CCDC71L,PIK3CG K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NAMPT 58655 2071 chr7 105997062 106000722 105998883 Y NAMPT NA CCDC71L,NAMPT,PIK3CG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAMPT 71424 2072 chr7 106063260 106067517 106065799 Y NA NA NAMPT,CCDC71L,CDHR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAMPT 137622 2073 chr7 110164041 110176097 110174645 N NA NA NA NA NA NA ZNF277 1670546 2074 chr7 120566631 120568445 120567645 N NA ING3 NA NA NA NA ING3 22372 2075 chr7 121050337 121052799 121051494 N NA FAM3C FAM3C MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM3C 13915 2076 chr7 121169529 121172522 121170882 Y PTPRZ1 NA FAM3C,WNT16 IMR90 Hi-C 24141950 FAM3C 133107 2077 chr7 1214164 1216821 1215980 N NA C7orf50,ZFAND2A CYP2W1,C7orf50,ZFAND2A,UNCX,COX19,GPR146,GPER IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFAND2A 14309 2078 chr7 123902403 123905900 123903665 Y NA NA GPR37,LOC154872 IMR90 Hi-C 24141950 WASL 513287 2079 chr7 126050334 126052936 126051571 N NA NA NA NA NA NA ZNF800 979831 2080 chr7 128167082 128203533 128171317,128201593,128172025 Y,N,N NA;NA;NA NA METTL2B,IMPDH1,HILPDA IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 METTL2B 50299 2081 chr7 128553884 128557606 128555008 N NA LOC100130705,KCP,IRF5 TNPO3,TPI1P2,FAM71F1,KCP,TSPAN33,IRF5,LOC407835 IMR90 Hi-C 24141950 KCP 3111 2082 chr7 128734712 128735991 128735113 N NA TNPO3,TPI1P2,TSPAN33 TNPO3,AHCYL2,IRF5,TPI1P2,KCP,FAM71F1,LOC407835,TSPAN33,SMO,CCDC136,CALU,FAM40B IMR90 Hi-C 24141950 TPI1P2 39435 2083 chr7 131581488 131583566 131582623 N NA NA PLXNA4 IMR90 Hi-C 24141950 MKLN1 786633 2084 chr7 131603134 131608170 131605413 N NA NA PLXNA4 IMR90 Hi-C 24141950 MKLN1 808279 2085 chr7 131608970 131612313 131610229 N NA NA PLXNA4 IMR90 Hi-C 24141950 MKLN1 814115 2086 chr7 131621683 131626590 131624105 N NA NA PLXNA4 IMR90 Hi-C 24141950 MKLN1 826828 2087 chr7 144538986 144540488 144539599 Y TPK1 NA TPK1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 FAM115A 939708 2088 chr7 147578 151038 149221 N NA NA FAM20C IMR90 Hi-C 24141950 PDGFA 408443 2089 chr7 148636606 148639438 148638417 Y NA NA EZH2,CUL1,ZNF786,ZNF398,ZNF425 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EZH2 55165 2090 chr7 150364054 150366509 150365618 Y ACTR3C,GIMAP8,GIMAP7,GIMAP4,GIMAP6,LOC100128542,GIMAP5,GIMAP2,GIMAP1 GIMAP6,GIMAP2 NA NA NA NA GIMAP2 16285 2091 chr7 150593786 150595347 150594788 Y NA NA ATG9B,NOS3,KCNH2 IMR90 Hi-C 24141950 ABCB8 130163 2092 chr7 154982863 154985134 154983773 N NA NA INSIG1,HTR5A,LOC100128264 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 INSIG1 104352 2093 chr7 154988819 154991794 154990779 N NA NA INSIG1 IMR90 Hi-C 24141950 INSIG1 97692 2094 chr7 154996053 155001391 154997571 N NA NA INSIG1,LOC202781,PAXIP1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 INSIG1 88095 2095 chr7 157094229 157097128 157095299 N NA DNAJB6 UBE3C,DNAJB6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAJB6 32583 2096 chr7 158768755 158770903 158769631 N NA NA NCAPG2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR60 119486 2097 chr7 158989239 158992084 158990113 N NA NA VIPR2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR60 339970 2098 chr7 17164643 17168825 17165847 N NA NA NA NA NA NA AHR 169451 2099 chr7 17272816 17275394 17273951 Y AHR NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AHR 62882 2100 chr7 17421043 17424390 17422399 N NA NA NA NA NA NA AHR 82767 2101 chr7 17440835 17444321 17442634 N NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AHR 102559 2102 chr7 20274922 20283201 20277896,20280976 N,N NA;NA MACC1 MACC1 K562 ChIA-PET 22265404 MACC1 17909 2103 chr7 20308931 20312518 20310348 N NA NA NA NA NA NA MACC1 51918 2104 chr7 20320437 20326207 20323232 N NA ITGB8 MACC1,TMEM196 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ITGB8 44518 2105 chr7 20328692 20332868 20331087 N NA ITGB8 MACC1,TMEM196 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB8 37857 2106 chr7 20335544 20341468 20340096 N NA ITGB8 TMEM196,MACC1 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB8 29257 2107 chr7 20349912 20351377 20350775 N NA ITGB8 MACC1,TMEM196 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB8 19348 2108 chr7 22122272 22124016 22123052 Y NA NA RAPGEF5 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA7L 136730 2109 chr7 23273481 23275415 23274389 N NA NA NA NA NA NA NUPL2 52035 2110 chr7 25895512 25899036 25896755 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 292811 2111 chr7 25932692 25935501 25934717 N NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10,HOXA5,HOXA-AS3,HOXA7,HOXA6,LOC441204,MIR196B,HOXA3,HOXA4,HOTTIP,HOXA13,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOXA2,HOXA1,HOTAIRM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 256346 2112 chr7 26002402 26009844 26004411,26007549 Y,N NA;NA NA MIR148A MCF7 ChIA-PET 22265404 NFE2L3 182003 2113 chr7 26140495 26149498 26141259 Y SNX10,SNX10,SNX10,HNRNPA2B1 NFE2L3 NFE2L3,HOXA10-HOXA9,HOXA9 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NFE2L3 42349 2114 chr7 26436860 26439901 26438366 N NA NA LOC441204 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SNX10 105345 2115 chr7 2902023 2904959 2903011 N NA GNA12 GNA12,AMZ1,FOXK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GNA12 18064 2116 chr7 3102267 3103567 3102878 N NA CARD11 SDK1 IMR90 Hi-C 24141950 CARD11 18758 2117 chr7 35763188 35772251 35768967,35764703,35769060 Y,N,Y HERPUD2;NA;HERPUD2 HERPUD2 SEPT7 IMR90 Hi-C 24141950 HERPUD2 28416 2118 chr7 37630776 37633367 37632159 N NA NA ELMO1 IMR90 Hi-C 24141950 ELMO1 141881 2119 chr7 38055482 38057744 38056225 N NA NA NA NA NA NA EPDR1 95319 2120 chr7 38350540 38353002 38351084 N NA LOC100506776 LOC100506776 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100506776 28176 2121 chr7 38373726 38376247 38375318 N NA LOC100506776 LOC100506776 K562 ChIA-PET 22265404 LOC100506776 4931 2122 chr7 41141589 41143993 41143103 N NA NA LOC285954,INHBA,C7orf10 IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 598713 2123 chr7 41172421 41174721 41173769 N NA NA LOC285954,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 567985 2124 chr7 41244855 41247401 41245870 N NA NA C7orf10,LOC285954,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 495305 2125 chr7 41848492 41851798 41850002 N NA NA LOC285954,C7orf10 IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 105786 2126 chr7 41919643 41924017 41921885 N NA NA LOC285954,C7orf10,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 176937 2127 chr7 41968468 41972584 41971070 N NA NA LOC285954,C7orf10,GLI3 IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 225762 2128 chr7 43774274 43777590 43775656 Y NA C7orf44,BLVRA C7orf44,BLVRA K562 ChIA-PET 22265404 C7orf44 5191 2129 chr7 45033686 45037117 45034844 N NA MYO1G,SNHG15,CCM2 SNHG15 MCF7 ChIA-PET 22265404 CCM2 2228 2130 chr7 46329847 46332308 46330868 N NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 SEPT7P2 521230 2131 chr7 46635641 46670250 46666575 N NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 SEPT7P2 827024 2132 chr7 46677955 46694810 46686986 N NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 SEPT7P2 869338 2133 chr7 46720322 46725234 46722713 N NA NA TNS3,IGFBP1 IMR90 Hi-C 24141950 SEPT7P2 911705 2134 chr7 47091953 47092658 47092320 N NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 HUS1 926564 2135 chr7 50305542 50313986 50307291,50313150 N,N NA;NA IKZF1 IKZF1 IMR90 Hi-C 24141950 IKZF1 30392 2136 chr7 50320443 50324970 50321736,50323549 Y,N NA;NA IKZF1 NA NA NA NA IKZF1 19408 2137 chr7 5576084 5584954 5578544,5581459 N,N NA;NA FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216 IMR90 Hi-C 24141950 ACTB 5852 2138 chr7 5589879 5602933 5596429 Y CCZ1,ACTB FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 19647 2139 chr7 55953950 55957700 55955403 N NA NA NA NA NA NA MRPS17 61911 2140 chr7 5608957 5613838 5609931 Y SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FSCN1 18598 2141 chr7 6119835 6122420 6121185 N NA EIF2AK1,USP42 EIF2AK1,USP42 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 EIF2AK1 20975 2142 chr7 64460512 64468651 64467123 N NA ZNF117,CCT6P3 ZNF117,CCT6P3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF117 9098 2143 chr7 64733604 64736711 64734480 N NA NA NA NA NA NA ZNF92 102057 2144 chr7 65272866 65281005 65274830 N NA LOC441242 LOC441242,VKORC1L1,LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 LOC441242 37069 2145 chr7 65503104 65506104 65504519 N NA ASL ASL,CRCP,TPST1,KCTD7 IMR90 Hi-C 24141950 ASL 34672 2146 chr7 65508257 65510680 65509169 N NA ASL ASL,CRCP,TPST1,KCTD7 IMR90 Hi-C 24141950 ASL 30096 2147 chr7 65519209 65523060 65520538 N NA ASL KCTD7,ASL,TPST1,CRCP,LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 ASL 17716 2148 chr7 65956440 65969600 65958627 N NA NA LINC00174,TPST1 IMR90 Hi-C 24141950 LOC493754 73898 2149 chr7 66140729 66166864 66147063 N NA KCTD7,RABGEF1 KCTD7,ASL,CRCP,RABGEF1,LOC493754 IMR90 Hi-C 24141950 RABGEF1 38779 2150 chr7 7029414 7034530 7030391 N NA NA NA NA NA NA CCZ1B 163488 2151 chr7 73426485 73428796 73427462 N NA NA ELN,CLIP2,EIF4H,WBSCR28,VPS37D,WBSCR27,CLDN3,ABHD11-AS1,ABHD11,CLDN4,LIMK1 IMR90 Hi-C 24141950 LIMK1 69311 2152 chr7 74057328 74059439 74057711 Y LAT2 GTF2I GTF2I K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 GTF2I 12591 2153 chr7 75793849 75798300 75795970 Y RHBDD2,POR NA SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 MDH2 116456 2154 chr7 76571089 76576152 76574009 N NA DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11 NA NA NA NA DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11 33987 2155 chr7 7958647 7962639 7960298 N NA GLCCI1 GLCCI1 MCF7 ChIA-PET 22265404 GLCCI1 45735 2156 chr7 7982782 7986593 7984405 Y GLCCI1 GLCCI1 RPA3,LOC729852 IMR90 Hi-C 24141950 GLCCI1 21781 2157 chr7 81251788 81255071 81253220 N NA NA HGF IMR90 Hi-C 24141950 PHTF2 3823679 2158 chr7 81415647 81423206 81421771 N NA NA NA NA NA NA PHTF2 3987538 2159 chr7 81428931 81433873 81432279 N NA NA NA NA NA NA PHTF2 4000822 2160 chr7 81503744 81505626 81504882 N NA NA NA NA NA NA PHTF2 4075635 2161 chr7 90222957 90232314 90226027 N NA NA CDK14,MTERF,FZD1,STEAP2,C7orf63 IMR90,H1ESC,HELA,GM12878,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 CDK14 106398 2162 chr7 92490966 92497944 92491829 N NA CDK6 NA NA NA NA CDK6 25025 2163 chr7 92529483 92536087 92533771,92531306 Y,N SAMD9;NA NA FAM133B IMR90 Hi-C 24141950 CDK6 63542 2164 chr7 92665951 92667360 92666352 N NA NA CDK6,FAM133B IMR90 Hi-C 24141950 SAMD9 79976 2165 chr7 99888202 99889019 99888869 N NA GATS,PILRB,PMS2P1 NA NA NA NA GATS 18347 2166 chr8 101448050 101458801 101450419,101456697 Y,N RNF19A;NA NA SPAG1 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD46 113211 2167 chr8 102120512 102123442 102121506 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA YWHAZ,FLJ42969,ZNF706 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF706 94518 2168 chr8 102137080 102140300 102139118 N NA NA YWHAZ,FLJ42969,ZNF706,PABPC1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 77660 2169 chr8 102148961 102150832 102149660 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA YWHAZ,FLJ42969,ZNF706 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 67128 2170 chr8 103139460 103143571 103141157 N NA NCALD NA NA NA NA NCALD 2325 2171 chr8 103537304 103549852 103548302,103542154 N,N NA;NA ODF1 UBR5,ODF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ODF1 13996 2172 chr8 103611666 103614955 103613315 Y KLF10,KLF10 ODF1 UBR5,KLF10,ODF1,AZIN1,RRM2B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ODF1 47818 2173 chr8 10366959 10370541 10369089 N NA NA PRSS55 IMR90 Hi-C 24141950 PINX1 326758 2174 chr8 103784661 103787535 103786486 N NA NA UBR5,KLF10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AZIN1 88862 2175 chr8 103794314 103796780 103795106 Y NA NA UBR5,KLF10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AZIN1 79617 2176 chr8 103799763 103803279 103801429 Y NA NA UBR5,KLF10,ODF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AZIN1 73118 2177 chr8 103805857 103808948 103807947 N NA NA KLF10,UBR5,ODF1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AZIN1 67449 2178 chr8 103895963 103922469 103898238,103902389 N,N NA;NA AZIN1 KCNH5,ATP6V1C1,BAALC,AZIN1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 19890323,24141950,22265404 AZIN1 19566 2179 chr8 103936844 103939284 103937495 N NA NA AZIN1,ATP6V1C1 IMR90 Hi-C 24141950 AZIN1 60447 2180 chr8 103941350 103978667 103941900,103944001 N,N NA;NA NA AZIN1,ATP6V1C1,BAALC,CTHRC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP6V1C1 54581 2181 chr8 107098593 107100547 107099455 N NA NA NA NA NA NA EIF3E 2160412 2182 chr8 109337589 109340193 109338579 N NA NA NA NA NA NA EIF3E 76630 2183 chr8 110063319 110066218 110064612 N NA NA NA NA NA NA NUDCD1 280132 2184 chr8 111926359 111927821 111927376 N NA NA NA NA NA NA KCNV1 939400 2185 chr8 111930203 111932279 111930950 Y NA NA NA NA NA NA KCNV1 943244 2186 chr8 11338986 11342938 11341472 N NA FAM167A,BLK C8orf12,BLK IMR90 Hi-C 24141950 BLK 8583 2187 chr8 11734190 11737403 11735763 N NA CTSB CTSB,BLK,FDFT1,FAM167A,GATA4 IMR90 Hi-C 24141950 CTSB 8544 2188 chr8 11753310 11757398 11754586 Y CTSB CTSB CTSB,FAM167A,BLK,NEIL2,GATA4,FDFT1,C8orf12 IMR90 Hi-C 24141950 CTSB 27664 2189 chr8 119877550 119882842 119878947,119880746 N,N NA;NA NA TNFRSF11B,COLEC10 IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF11B 81541 2190 chr8 124624942 124627943 124626396 N NA NA FBXO32,ANXA13,KLHL38 IMR90 Hi-C 24141950 FAM91A1 152939 2191 chr8 125209179 125210918 125210219 Y FAM91A1,TMEM65,RNF139 NA TMEM65,FAM91A1,FER1L6,FER1L6-AS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRMT12 252130 2192 chr8 126590833 126593190 126591965 N NA NA NSMCE2,TRIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 148270 2193 chr8 126613095 126616301 126614381 N NA NA NSMCE2,KIAA0196,TRIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 170532 2194 chr8 126617216 126622822 126618733 N NA NA NSMCE2,TRIB1,KIAA0196 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 174653 2195 chr8 126648130 126651495 126649320 N NA NA NSMCE2,KIAA0196,TRIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 205567 2196 chr8 126659779 126663645 126660570 N NA NA NSMCE2,KIAA0196,TRIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 217216 2197 chr8 126709201 126712418 126710777 N NA NA NSMCE2,TRIB1,KIAA0196 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 266638 2198 chr8 127122185 127126146 127124134 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 679622 2199 chr8 128189535 128194923 128192033 N NA NA MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 POU5F1B 232934 2200 chr8 128197696 128202844 128200123 N NA NA NA NA NA NA POU5F1B 225013 2201 chr8 128206559 128211685 128209312,128207874 Y,N NA;NA NA LOC727677,MYC IMR90 Hi-C 24141950 POU5F1B 216172 2202 chr8 128217628 128230966 128221242,128228538 N,N NA;NA NA LOC727677,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 POU5F1B 196891 2203 chr8 128234235 128240759 128238266 N NA NA LOC727677,MYC,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 POU5F1B 187098 2204 chr8 128298800 128302876 128300784 N NA NA NA NA NA NA POU5F1B 124981 2205 chr8 128310841 128322370 128313583,128319558 Y,N NA;NA NA NA NA NA NA POU5F1B 105487 2206 chr8 128566573 128582440 128569024,128577656,128580977 N,N,N NA;NA;NA NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 POU5F1B 138716 2207 chr8 128650581 128652308 128651584 N NA NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 96007 2208 chr8 130557751 130561021 130560177 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 467876 2209 chr8 134439685 134442571 134440996 N NA NA NDRG1,TG,WISP1,PHF20L1,SLA IMR90 Hi-C 24141950 NDRG1 130138 2210 chr8 135730585 135733562 135731542 N NA ZFAT ST3GAL1,ZFAT IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFAT 5293 2211 chr8 141473488 141475674 141474929 Y NA TRAPPC9,CHRAC1 TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TRAPPC9 4810 2212 chr8 142103080 142108755 142106129 N NA DENND3 PTK2,DENND3 IMR90 Hi-C 24141950 DENND3 29965 2213 chr8 142112574 142133862 142114946,142117117,142124190,142129275 N,N,N,N NA;NA;NA;NA DENND3 PTK2,DENND3,SLC45A4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DENND3 4858 2214 chr8 142241530 142250004 142248995,142245441 Y,N DENND3,PTP4A3,SLC45A4;NA NA SLC45A4 MCF7 ChIA-PET 22265404 DENND3 102810 2215 chr8 142251505 142256839 142255381 Y DENND3,SLC45A4 NA NA NA NA NA DENND3 112785 2216 chr8 143895715 143898410 143897579 N NA NA LY6D,LYNX1,PSCA,JRK,C8orf55,LOC100288181,SLURP1,LY6E,LOC100133669 MCF7 ChIA-PET 22265404 C8orf55 87094 2217 chr8 16403122 16409861 16405246 N NA NA NA NA NA NA CNOT7 694526 2218 chr8 21215352 21217762 21217321 N NA NA NA NA NA NA DOK2 553443 2219 chr8 21332411 21346004 21336716,21343121 N,N NA;NA NA NA NA NA NA DOK2 425201 2220 chr8 22830220 22834491 22832321 N NA NA BIN3,PEBP4,LOC254896,TNFRSF10B,RHOBTB2,C8orf58,KIAA1967 IMR90 Hi-C 24141950 LOC286059 91251 2221 chr8 2508935 2513887 2512057 N NA NA NA NA NA NA CLN8 797065 2222 chr8 2567957 2573312 2571619 N NA NA NA NA NA NA CLN8 856087 2223 chr8 2589841 2595120 2591221 Y NA NA NA NA NA NA CLN8 877971 2224 chr8 26114567 26116600 26115704 N NA PPP2R2A PPP2R2A IMR90 Hi-C 24141950 PPP2R2A 32407 2225 chr8 26304920 26317414 26306444 N NA NA BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DPYSL2 54295 2226 chr8 28257221 28263441 28259090 N NA ZNF395 ZNF395,FBXO16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF395 13244 2227 chr8 29221943 29226549 29224323 N NA DUSP4 C8orf75,MIR3148,DUSP4,LOC286135,MIR548O2,TMEM66,LEPROTL1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 13676 2228 chr8 29258099 29261908 29259983 N NA DUSP4 C8orf75,DUSP4,LOC286135,MIR3148,MIR548O2,LEPROTL1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 49832 2229 chr8 29263563 29268370 29266694 N NA NA C8orf75,DUSP4,LOC286135,MIR3148,TMEM66,MIR548O2,LEPROTL1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 55296 2230 chr8 29346619 29350496 29348124 Y KIF13B,DUSP4,DUSP4 NA C8orf75,LOC286135,MIR3148,DUSP4,MIR548O2,TMEM66 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 138352 2231 chr8 29354395 29359129 29356743 N NA NA LOC286135,C8orf75,MIR3148,MIR548O2,TMEM66,DUSP4 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 146128 2232 chr8 29384059 29390366 29387087 N NA NA C8orf75,MIR3148,DUSP4,LOC286135 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 175792 2233 chr8 29409856 29416422 29411474,29413336 N,N NA;NA NA DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR3148,MIR548O2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 201589 2234 chr8 29450869 29453377 29452127 N NA NA LOC286135,DUSP4,C8orf75 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 242602 2235 chr8 29497703 29501634 29499156 N NA NA DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR3148 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 289436 2236 chr8 29522163 29523731 29522869 Y KIF13B NA C8orf75,LOC286135,MIR548O2,TMEM66,DUSP4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 313896 2237 chr8 29626188 29634389 29628049,29631814 N,Y NA;NA NA C8orf75,LOC286135 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM66 306260 2238 chr8 29846332 29851472 29848573,29850538 Y,N MBOAT4;NA NA LOC286135,DUSP4,C8orf75 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM66 89177 2239 chr8 30209736 30211264 30210913 N NA NA MIR548O2 IMR90 Hi-C 24141950 MIR548O2 101523 2240 chr8 327604 328517 328294 N NA FBXO25 FBXO25 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO25 28291 2241 chr8 36982901 36990850 36986269 N NA NA KCNU1,PROSC IMR90 Hi-C 24141950 ERLIN2 603247 2242 chr8 37000383 37003737 37002518 Y NA NA KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERLIN2 590360 2243 chr8 37272938 37275262 37274323 N NA NA KCNU1,ZNF703 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERLIN2 318835 2244 chr8 37347317 37352252 37350884 N NA NA ZNF703,KCNU1,LOC728024,ERLIN2 IMR90 Hi-C 24141950 ERLIN2 241845 2245 chr8 50061161 50064910 50063710 N NA NA NA NA NA NA UBE2V2 1140166 2246 chr8 50079962 50089241 50081106,50084257 N,N NA;NA NA NA NA NA NA UBE2V2 1158967 2247 chr8 53930652 53936665 53932657 N NA NA NA NA NA NA RB1CC1 303626 2248 chr8 54568394 54571721 54570155 N NA NA NA NA NA NA ATP6V1H 184129 2249 chr8 56773091 56774320 56773639 N NA LYN LYN IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LYN 18066 2250 chr8 61557548 61567574 61564923,61566062 N,N NA;NA CHD7 CHD7,RAB2A MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD7 23750 2251 chr8 61820674 61832483 61822333,61829243,61824821 N,Y,N NA;CHD7;NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 229350 2252 chr8 61852361 61853168 61852533 N NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261037 2253 chr8 62007070 62013525 62008318,62011317 N,N NA;NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 415746 2254 chr8 65721792 65730987 65729234 N NA NA NA NA NA NA BHLHE22 228997 2255 chr8 65773940 65778669 65776720 N NA NA NA NA NA NA BHLHE22 281145 2256 chr8 65793028 65796594 65794309 N NA NA NA NA NA NA BHLHE22 300233 2257 chr8 65826222 65831613 65828511 N NA NA NA NA NA NA BHLHE22 333427 2258 chr8 65970056 65974871 65972091 N NA NA NA NA NA NA BHLHE22 477261 2259 chr8 66782012 66798028 66791030,66787584,66784288 N,N,N NA;NA;NA PDE7A PDE7A K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PDE7A 28043 2260 chr8 66853338 66866172 66858345,66862343,66865645,66856984 N,Y,N,Y NA;PDE7A;NA;PDE7A NA PDE7A MCF7 ChIA-PET 22265404 PDE7A 99369 2261 chr8 66891942 66897289 66893739,66895621 Y,N PDE7A;NA NA DNAJC5B IMR90 Hi-C 24141950 PDE7A 137973 2262 chr8 72638142 72641275 72639771 N NA NA NA NA NA NA LOC100132891 114083 2263 chr8 72644994 72652014 72649831 N NA NA NA NA NA NA LOC100132891 103344 2264 chr8 76263416 76266002 76264881 N NA NA NA NA NA NA HNF4G 186201 2265 chr8 76315029 76325996 76316209,76320562 N,N NA;NA NA NA NA NA NA HNF4G 126207 2266 chr8 76544770 76549526 76545761 N NA NA NA NA NA NA HNF4G 92567 2267 chr8 76606797 76608059 76607420 N NA NA NA NA NA NA HNF4G 154594 2268 chr8 76661483 76669812 76665252,76662828 N,N NA;NA NA NA NA NA NA HNF4G 209280 2269 chr8 79766249 79790618 79766672,79768646 N,N NA;NA IL7 NA NA NA NA IL7 48491 2270 chr8 8024760 8027261 8025575 N NA NA NA NA NA NA FLJ10661 58831 2271 chr8 80651240 80653291 80652259 N NA HEY1 TPD52 IMR90 Hi-C 24141950 HEY1 26807 2272 chr8 80694197 80699415 80696115 N NA HEY1 MRPS28,HEY1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEY1 14099 2273 chr8 80801983 80805652 80803679 N NA NA HEY1,MRPS28 IMR90 Hi-C 24141950 HEY1 121885 2274 chr8 81152085 81153515 81152660 N NA NA TPD52,MRPS28,PAG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TPD52 68249 2275 chr8 82809638 82812545 82809956 N NA NA NA NA NA NA ZFAND1 176099 2276 chr8 8405595 8406856 8406148 N NA NA SGK223,FLJ10661 IMR90 Hi-C 24141950 SGK223 166338 2277 chr8 8471504 8478764 8473125,8476242 N,N NA;NA NA SGK223,FLJ10661 IMR90 Hi-C 24141950 SGK223 232247 2278 chr8 8851327 8853752 8852790 N NA ERI1 MFHAS1,SGK223,FLJ10661,CLDN23 IMR90 Hi-C 24141950 ERI1 6562 2279 chr8 90726536 90758393 90741833,90742022,90748643,90757994 N,N,N,N NA;NA;NA;NA RIPK2 RIPK2,NBN,DECR1,OSGIN2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RIPK2 11582 2280 chr8 90845195 90851115 90848958,90846062 N,Y NA;RIPK2,OSGIN2 NA RIPK2,OSGIN2,NBN,DECR1 IMR90 Hi-C 24141950 OSGIN2 62981 2281 chr8 95001647 95005310 95003761 Y NA NA LINC00535,RBM12B,RAD54B,CDH17,GEM IMR90 Hi-C 24141950 PDP1 72564 2282 chr8 96126374 96131142 96127914 N NA PLEKHF2 PLEKHF2,C8orf69,C8orf38,C8orf37,MIR3150A,MIR3150B,LOC100616530 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PLEKHF2 14807 2283 chr8 99376012 99378520 99377118 N NA NA STK3,NIPAL2,POP1,KCNS2 IMR90 Hi-C 24141950 NIPAL2 69391 2284 chr9 101942428 101945312 101944110 Y ALG2 ALG2,SEC61B ERP44,INVS,TEX10,NR4A3 IMR90 Hi-C 24141950 ALG2 38934 2285 chr9 102014644 102026297 102015854,102022052 Y,Y NA;NA ALG2,SEC61B ALG2,SEC61B,NR4A3,LOC441461,STX17,ERP44,TEX10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEC61B 30074 2286 chr9 102195150 102197208 102196033 Y TGFBR1,NR4A3 NA NA NA NA NA SEC61B 210580 2287 chr9 103172788 103175380 103174044 Y NA NA C9orf30-TMEFF1,TEX10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TEX10 57529 2288 chr9 104210943 104212208 104211676 N NA ZNF189 RNF20,ALDOB IMR90 Hi-C 24141950 ZNF189 49780 2289 chr9 105258022 105261164 105259454 N NA NA NA NA NA NA RNF20 961889 2290 chr9 105966518 105968934 105967392 N NA NA NA NA NA NA SMC2 887607 2291 chr9 110512722 110515900 110514175 Y KLF4 NA KLF4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RAD23B 467205 2292 chr9 113840141 113841761 113840844 Y KIAA0368 NA KIAA0368,LPAR1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0368 405264 2293 chr9 116384089 116387261 116385418 Y RGS3 NA NA NA NA NA RGS3 177078 2294 chr9 117750787 117752985 117751851 Y DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8 NA DFNB31,LOC100505478,TNFSF15,TNFSF8,C9orf91 IMR90 Hi-C 24141950 C9orf91 377081 2295 chr9 118705029 118707500 118706558 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 ASTN2 742042 2296 chr9 12314019 12316063 12314673 N NA NA NA NA NA NA ZDHHC21 2377417 2297 chr9 123833090 123835705 123834326 Y TRAF1,TRAF1,CNTRL CNTRL CNTRL,TRAF1,MEGF9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNTRL 14869 2298 chr9 123969208 123973409 123969859 N NA RAB14 RAB14,GSN,STOM IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB14 4843 2299 chr9 126083820 126086445 126085273 N NA NA STRBP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STRBP 52965 2300 chr9 126099906 126108132 126100104,126102207,126106200 N,N,N NA;NA;NA NA RC3H2,RABGAP1,MIR600HG,STRBP,CRB2,DENND1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STRBP 69051 2301 chr9 126758579 126761803 126759780 N NA NA DENND1A,LHX2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DENND1A 66162 2302 chr9 126897242 126902934 126899957,126901527 N,Y NA;NA NA DENND1A,NEK6,PSMB7,LOC100129034 IMR90 Hi-C 24141950 NEK6 116951 2303 chr9 126955027 126967446 126959858,126965160 Y,N DENND1A;NA NA NEK6,DENND1A,LOC100129034,PSMB7 IMR90 Hi-C 24141950 NEK6 52439 2304 chr9 126976655 126984524 126979285,126981057 N,Y NA;DENND1A,NEK6 NEK6 NEK6,LOC100129034,PSMB7,DENND1A,LHX2 IMR90 Hi-C 24141950 NEK6 35361 2305 chr9 127000281 127004862 127001630 Y DENND1A,NEK6,NEK6 NEK6 NEK6,DENND1A IMR90 Hi-C 24141950 NEK6 15023 2306 chr9 130006065 130010077 130007530 N NA GARNL3 NA NA NA NA GARNL3 16679 2307 chr9 130745007 130747427 130746314 N NA DPM2,FAM102A NA NA NA NA FAM102A 2195 2308 chr9 132174911 132178037 132176103 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 METTL11A 210398 2309 chr9 132221403 132224602 132222735 N NA NA PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106,C9orf50,METTL11A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 METTL11A 163833 2310 chr9 132341119 132351919 132342683 N NA METTL11A LOC100506190,METTL11A,IER5L,C9orf50 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 METTL11A 36516 2311 chr9 134246764 134250284 134248932 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B NA PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 55193 2312 chr9 134267884 134269208 134268577 N NA PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A,PPAPDC3 IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 36269 2313 chr9 135897514 135900227 135898687 N NA GTF3C5,CEL GTF3C5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTF3C5 5835 2314 chr9 13665910 13667056 13666017 N NA NA NA NA NA NA ZDHHC21 1026424 2315 chr9 137816132 137818665 137817200 N NA NA LOC100130954 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS2 573818 2316 chr9 137819808 137829634 137820950,137823165,137828741 N,N,N NA;NA;NA NA LOC100130954 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS2 562849 2317 chr9 139158443 139162600 139159146 N NA QSOX2 QSOX2,LHX3,C9orf69 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 QSOX2 20756 2318 chr9 139516450 139519064 139517775 N NA NA MIR4674,NOTCH1,INPP5E,SEC16A,C9orf163,EGFL7,GPSM1,DNLZ IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AGPAT2 62847 2319 chr9 139537388 139541348 139540348 N NA AGPAT2 SEC16A,C9orf163 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AGPAT2 40563 2320 chr9 139595112 139597439 139595712 N NA AGPAT2,SNHG7 SNORA43,SNHG7 MCF7 ChIA-PET 22265404 AGPAT2 13201 2321 chr9 15528330 15531754 15530196 N NA PSIP1 NA NA NA NA PSIP1 17327 2322 chr9 1758130 1762031 1759264 N NA NA NA NA NA NA SMARCA2 253311 2323 chr9 1872630 1882559 1880249,1876136 N,Y NA;SMARCA2 NA NA NA NA NA SMARCA2 132783 2324 chr9 19183453 19186287 19184425 Y PLIN2 NA HAUS6,ACER2,DENND4C,PLIN2 IMR90 Hi-C 24141950 PLIN2 55849 2325 chr9 19228993 19235979 19230752 N NA NA DENND4C,PLIN2 IMR90 Hi-C 24141950 DENND4C 54770 2326 chr9 1925475 1933075 1930152 N NA NA NA NA NA NA SMARCA2 82267 2327 chr9 1938075 1939827 1938833 N NA NA NA NA NA NA SMARCA2 75515 2328 chr9 20286336 20291335 20290153 N NA NA KIAA1797,MLLT3 IMR90 Hi-C 24141950 MLLT3 331179 2329 chr9 20639406 20641903 20640801 N NA MLLT3,KIAA1797 KIAA1797,IFNB1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1797 16406 2330 chr9 21094898 21098436 21096492 Y KIAA1797 NA MLLT3,KIAA1797 IMR90 Hi-C 24141950 PTPLAD2 63263 2331 chr9 21394722 21397300 21396289 N NA IFNA2 NA NA NA NA IFNA2 9326 2332 chr9 22912267 22915465 22913743 N NA NA NA NA NA NA CDKN2A 917777 2333 chr9 30628434 30630621 30629389 N NA NA NA NA NA NA DDX58 1895701 2334 chr9 33010970 33019413 33017595 Y NA APTX,DNAJA1 DNAJA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 DNAJA1 5796 2335 chr9 36464456 36471925 36468553,36471016 N,Y NA;NA NA RNF38,MELK IMR90 Hi-C 24141950 RNF38 63261 2336 chr9 36482109 36490818 36487841 N NA NA RNF38,MELK IMR90 Hi-C 24141950 RNF38 80914 2337 chr9 36764829 36767666 36766133 Y RNF38,RNF38 NA MELK IMR90 Hi-C 24141950 MELK 191970 2338 chr9 37380266 37384341 37382915 N NA GRHPR NA NA NA NA GRHPR 38366 2339 chr9 37398216 37406300 37403428 N NA GRHPR PAX5,LOC100506710,ZCCHC7,ZBTB5,GRHPR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GRHPR 16407 2340 chr9 38087768 38093563 38089962 N NA SHB SHB IMR90 Hi-C 24141950 SHB 18558 2341 chr9 38107357 38108967 38107852 N NA SHB MCART1,SHB IMR90 Hi-C 24141950 SHB 38147 2342 chr9 38317947 38319810 38319277 N NA NA MCART1,SHB IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1B1 72851 2343 chr9 38466729 38474914 38468105,38472615 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ALDH1B1 74068 2344 chr9 38686621 38692163 38687758,38690777 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ALDH1B1 293960 2345 chr9 44118260 44120512 44118817 N NA NA NA NA NA NA FAM27C 869724 2346 chr9 44244144 44247088 44245398 N NA NA NA NA NA NA FAM27C 743148 2347 chr9 4464188 4467450 4465267 N NA SLC1A1 SLC1A1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC1A1 22977 2348 chr9 44866890 44868703 44867473 N NA NA NA NA NA NA FAM27C 121533 2349 chr9 45354311 45359132 45356224 N NA NA NA NA NA NA FAM27C 364075 2350 chr9 45438313 45478492 45439328,45441772 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FAM27A 248537 2351 chr9 46111781 46160490 46113089 N NA NA NA NA NA NA FAM27A 384752 2352 chr9 46377406 46381472 46380599 N NA NA NA NA NA NA FAM27A 650377 2353 chr9 46389545 46393278 46391130 N NA NA NA NA NA NA FAM27A 662516 2354 chr9 4935386 4938186 4937200 N NA JAK2 RCL1,JAK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JAK2 47059 2355 chr9 4970641 4971842 4971301 N NA JAK2 RCL1,JAK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JAK2 13403 2356 chr9 5491154 5495718 5494236 N NA CD274,PDCD1LG2 NA NA NA NA PDCD1LG2 14827 2357 chr9 5874672 5877095 5876246 N NA ERMP1 NA NA NA NA ERMP1 41591 2358 chr9 6078888 6081471 6080399 N NA NA NA NA NA NA RANBP6 63248 2359 chr9 66454536 66461498 66455901,66458541 N,N NA;NA NA LOC642236 IMR90 Hi-C 24141950 FAM27B 1332691 2360 chr9 66552346 66555971 66553949 N NA NA NA NA NA NA FAM27B 1238218 2361 chr9 66674341 66675638 66674878 N NA NA NA NA NA NA FAM27B 1118551 2362 chr9 66694406 66698566 66697934,66694980 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FAM27B 1095623 2363 chr9 6679942 6685265 6681374,6682927 Y,N UHRF2,KDM4C;NA GLDC KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 GLDC 34250 2364 chr9 66857271 66863464 66862290,66858337 N,N NA;NA NA NA NA NA NA FAM27B 930725 2365 chr9 6691318 6708404 6693171,6704266 N,N NA;NA GLDC,KDM4C GLDC,KDM4C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLDC 45626 2366 chr9 6714396 6724545 6716350,6723578 N,N NA;NA KDM4C KDM4C MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 33096 2367 chr9 67299923 67302455 67301457 N NA NA NA NA NA NA FAM27B 491734 2368 chr9 6749111 6752620 6750885 N NA KDM4C KDM4C K562 ChIA-PET 22265404 KDM4C 5021 2369 chr9 68298789 68310498 68299610 Y NA NA NA NA NA NA LOC642236 143877 2370 chr9 68376276 68382221 68377514 N NA NA NA NA NA NA LOC642236 72154 2371 chr9 68394928 68397523 68396174 N NA NA LOC642236 IMR90 Hi-C 24141950 LOC642236 56852 2372 chr9 68512145 68514302 68513048 N NA NA NA NA NA NA LOC642236 57770 2373 chr9 68664062 68668225 68664671 N NA NA NA NA NA NA LOC100132352 58316 2374 chr9 68994612 69002845 68996219 N NA NA NA NA NA NA LOC100132352 268071 2375 chr9 69812243 69814583 69813046 N NA NA NA NA NA NA CBWD3 1042256 2376 chr9 70644956 70651852 70646539 N NA NA NA NA NA NA CBWD3 204987 2377 chr9 71257749 71261343 71259198 N NA NA PIP5K1B IMR90 Hi-C 24141950 PIP5K1B 59273 2378 chr9 73032797 73037647 73034146 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 3224 2379 chr9 75079061 75081536 75080130 N NA NA TMC1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND5 98898 2380 chr9 75086288 75091328 75088584 Y ZFAND5 NA TMC1,ZFAND5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFAND5 106125 2381 chr9 75123537 75125682 75124676 N NA NA TMC1,ZFAND5 IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND5 143374 2382 chr9 75746321 75748673 75747306 Y ANXA1 NA ANXA1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND5 766158 2383 chr9 75834244 75836750 75835294 Y NA NA RORB IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND5 854081 2384 chr9 90078185 90080820 90079084 N NA DAPK1 DAPK1 IMR90 Hi-C 24141950 DAPK1 31936 2385 chr9 92098966 92116055 92099137,92112096,92114136 N,N,N NA;NA;NA SEMA4D SEMA4D,SECISBP2 IMR90 Hi-C 24141950 SEMA4D 4355 2386 chr9 92133392 92135109 92134280 N NA SEMA4D SEMA4D IMR90 Hi-C 24141950 SEMA4D 38781 2387 chr9 92136783 92139506 92137313 Y SECISBP2 SEMA4D SEMA4D,SECISBP2 IMR90 Hi-C 24141950 SEMA4D 42172 2388 chr9 92443516 92448655 92445146 N NA NA NA NA NA NA GADD45G 223589 2389 chr9 92515218 92518953 92517535,92515912 Y,Y NA;NA NA UNQ6494 IMR90 Hi-C 24141950 GADD45G 295291 2390 chr9 93924118 93926147 93925195 N NA NA AUH,LOC100129316,NFIL3 IMR90 Hi-C 24141950 AUH 198059 2391 chr9 94948097 94951383 94950202 N NA LINC00475 NA NA NA NA LINC00475 44348 2392 chr9 97417076 97419876 97418711 N NA NA FBP1,FANCC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C9orf3 69075 2393 chr9 97430683 97433835 97431624 N NA NA FANCC,FBP1,C9orf3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C9orf3 55116 2394 chr9 99983233 99985098 99984189 N NA NA NA NA NA NA TDRD7 189204 2395 chrX 102658239 102663823 102659671 N NA WBP5 NGFRAP1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WBP5 46859 2396 chrX 106927270 106930029 106928409 Y NA NA NA NA NA NA PRPS1 55616 2397 chrX 108429760 108432555 108430904 N NA NA NA NA NA NA KCNE1L 435838 2398 chrX 109015868 109020126 109017394 Y NA ACSL4 NA NA NA NA ACSL4 39247 2399 chrX 109025088 109029098 109026810 Y NA ACSL4 ACSL4 IMR90 Hi-C 24141950 ACSL4 48467 2400 chrX 109072284 109076432 109074677 N NA NA ACSL4 IMR90 Hi-C 24141950 ACSL4 95663 2401 chrX 109087089 109093665 109088042,109091887 N,Y NA;NA NA ACSL4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACSL4 110468 2402 chrX 115072917 115087908 115085478 N NA NA NA NA NA NA WDR44 2392128 2403 chrX 115124044 115131789 115126596,115128826 N,N NA;NA NA NA NA NA NA WDR44 2348247 2404 chrX 116332758 116334358 116333396 N NA NA NA NA NA NA WDR44 1145678 2405 chrX 116911503 116913999 116911921 N NA NA NA NA NA NA WDR44 566037 2406 chrX 11749086 11763901 11757838,11754989,11751526,11762377 N,N,N,N NA;NA;NA;NA MSL3 ARHGAP6,MSL3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MSL3 12377 2407 chrX 119619055 119620897 119619700 Y ZBTB33,ZBTB33 LAMP2 LAMP2 K562 ChIA-PET 22265404 LAMP2 15851 2408 chrX 120498556 120500638 120499704 N NA NA NA NA NA NA GLUD2 317094 2409 chrX 121404760 121407400 121406248 N NA NA NA NA NA NA GRIA3 910696 2410 chrX 122897464 122900503 122899095 Y NA THOC2 NA NA NA NA THOC2 30560 2411 chrX 125605676 125607818 125606489 Y NA NA NA NA NA NA STAG2 2511201 2412 chrX 129089461 129092994 129091424 N NA UTP14A UTP14A K562 ChIA-PET 22265404 UTP14A 49364 2413 chrX 129094414 129097111 129095399 N NA NA UTP14A K562 ChIA-PET 22265404 UTP14A 54317 2414 chrX 129115129 129122217 129116480 N NA NA BCORL1,UTP14A,XPNPEP2,ZDHHC9 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UTP14A 75032 2415 chrX 12965430 12981411 12968493,12968303,12974608,12976387,12979922 Y,Y,Y,N,N TMSB4X,TLR7,TLR8;TMSB4X,TLR7,TLR8;TMSB4X,TLR7,TLR8;NA;NA TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 11815 2416 chrX 130351020 130353754 130351467 N NA NA NA NA NA NA LOC286467 610917 2417 chrX 13091387 13112806 13092941,13107525,13111941,13100684 N,N,N,N NA;NA;NA;NA NA TMSB4X,FAM9C MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TMSB4X 98161 2418 chrX 13270891 13275463 13272552 N NA NA TMSB4X IMR90 Hi-C 24141950 TMSB4X 277665 2419 chrX 13490480 13493726 13492108 N NA NA NA NA NA NA TCEANC 177581 2420 chrX 13503863 13507099 13505772 N NA NA TMSB4X,RAB9A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TCEANC 164208 2421 chrX 135990854 135994103 135991910 N NA RBMX RBMX K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RBMX 27915 2422 chrX 142063404 142067579 142065542 N NA NA NA NA NA NA UBE2NL 899594 2423 chrX 147461698 147463850 147462737 N NA NA NA NA NA NA FMR1 468229 2424 chrX 148200248 148203541 148202340 N NA NA NA NA NA NA IDS 383343 2425 chrX 148278767 148290990 148281062,148289992 N,N NA;NA NA AFF2 IMR90 Hi-C 24141950 IDS 295894 2426 chrX 148333479 148349061 148334568 N NA NA NA NA NA NA IDS 237823 2427 chrX 148957728 148961821 148959528 N NA NA NSMCE2 MCF7 ChIA-PET 19890323 HSFX2 102002 2428 chrX 150711356 150714757 150712381 N NA NA NA NA NA NA VMA21 145699 2429 chrX 15168465 15178381 15169875,15177060 N,N NA;NA NA GEMIN8 IMR90 Hi-C 24141950 PIGA 175295 2430 chrX 15206956 15218357 15216473 N NA NA NA NA NA NA PIGA 135319 2431 chrX 15220854 15223862 15222013 N NA NA NA NA NA NA PIGA 129814 2432 chrX 15920529 15922680 15921569 N NA AP1S2 CTPS2 IMR90 Hi-C 24141950 AP1S2 47429 2433 chrX 16041334 16043245 16042121 N NA NA CTPS2 IMR90 Hi-C 24141950 AP1S2 168234 2434 chrX 165742 171944 167639 N NA PLCXD1 NA NA NA NA PLCXD1 21047 2435 chrX 16900116 16901718 16901027 N NA RBBP7 RBBP7,TXLNG MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RBBP7 11582 2436 chrX 177940 184681 179408 N NA PLCXD1,GTPBP6 NA NA NA NA PLCXD1 8310 2437 chrX 19211208 19214821 19213243 N NA NA NA NA NA NA PDHA1 147190 2438 chrX 2016581 2019889 2018328 N NA NA NA NA NA NA ASMT 302233 2439 chrX 24259819 24264011 24261671 N NA NA ZFX,EIF2S3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFX 92057 2440 chrX 27932039 27937773 27933882,27936262 N,N NA;NA NA DCAF8L1 IMR90 Hi-C 24141950 CXorf21 2658260 2441 chrX 30609136 30613032 30611144 Y GK,CXorf21 CXorf21 NA NA NA NA CXorf21 13103 2442 chrX 30648289 30649105 30648981 N NA GK GK IMR90 Hi-C 24141950 GK 22371 2443 chrX 31110142 31112848 31111718 N NA NA NA NA NA NA TAB3 202631 2444 chrX 3821584 3838864 3838163 N NA NA NA NA NA NA LOC389906 59649 2445 chrX 38737323 38743549 38740716 N NA NA MID1IP1 IMR90 Hi-C 24141950 MID1IP1 76638 2446 chrX 38756873 38760699 38758687 N NA NA NA NA NA NA MID1IP1 96188 2447 chrX 38781998 38784847 38783381 N NA NA MID1IP1 IMR90 Hi-C 24141950 MID1IP1 121313 2448 chrX 38840765 38844076 38841865 N NA NA MID1IP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 MID1IP1 180080 2449 chrX 39033558 39036083 39034204 Y MID1IP1 NA NA NA NA NA MID1IP1 372873 2450 chrX 39053979 39057263 39056027 N NA NA NA NA NA NA MID1IP1 393294 2451 chrX 39298998 39301594 39300601 N NA NA NA NA NA NA MID1IP1 638313 2452 chrX 39472876 39475541 39473477 N NA NA NA NA NA NA BCOR 561041 2453 chrX 39645704 39647257 39646143 N NA NA NA NA NA NA BCOR 389325 2454 chrX 39703490 39716786 39713991 N NA NA BCOR IMR90 Hi-C 24141950 BCOR 319796 2455 chrX 39795355 39797436 39796526 N NA NA BCOR IMR90 Hi-C 24141950 BCOR 239146 2456 chrX 39871141 39875254 39872955 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 161328 2457 chrX 40126059 40127651 40126869 N NA NA BCOR K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 89477 2458 chrX 40397901 40400378 40399087 N NA ATP6AP2 NA NA NA NA ATP6AP2 39838 2459 chrX 40429326 40432567 40430201 N NA ATP6AP2 ATP6AP2 IMR90 Hi-C 24141950 ATP6AP2 7649 2460 chrX 40794119 40795425 40794155 N NA NA USP9X,MED14 IMR90 Hi-C 24141950 USP9X 149463 2461 chrX 40869088 40870531 40869674 N NA NA MED14,USP9X IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP9X 74357 2462 chrX 41133952 41137148 41135896 N NA NA USP9X,DDX3X IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDX3X 55503 2463 chrX 41952555 41955404 41953463 N NA NA NA NA NA NA CASK 170268 2464 chrX 42301688 42304011 42302444 N NA NA NA NA NA NA CASK 519401 2465 chrX 42792061 42794757 42794003 N NA NA NA NA NA NA CASK 1009774 2466 chrX 42800085 42807392 42804730 N NA NA NA NA NA NA CASK 1017798 2467 chrX 45623949 45631845 45629775,45631163 N,Y NA;NA NA MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF673 674779 2468 chrX 4625857 4630770 4628881 Y NA NA NA NA NA NA LOC389906 863922 2469 chrX 46762388 46764255 46763248 N NA NA PHF16 IMR90 Hi-C 24141950 RP2 66041 2470 chrX 47382387 47383892 47382929 Y SYN1,SPACA5,CFP,CFP ZNF41,ARAF UBA1,ZNF41,USP11,CDK16 IMR90 Hi-C 24141950 ARAF 36607 2471 chrX 48594573 48597491 48595700 N NA SUV39H1 SUV39H1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SUV39H1 39442 2472 chrX 49968355 49971768 49969237 N NA NA NA NA NA NA USP27X 323885 2473 chrX 52003342 52006561 52005009 Y NA NA NA NA NA NA MAGED1 457187 2474 chrX 53726620 53746649 53742698,53745842 N,N NA;NA HUWE1 HUWE1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HUWE1 12947 2475 chrX 53857406 53861034 53858668 N NA NA NA NA NA NA HUWE1 143733 2476 chrX 54664422 54667783 54666038 Y NA NA ITIH6,MAGED2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNL3L 107778 2477 chrX 55932145 55942435 55935101 N NA NA NA NA NA NA RRAGB 188035 2478 chrX 62518082 62519522 62518578 N NA NA NA NA NA NA SPIN4 51696 2479 chrX 65041234 65042757 65041972 N NA NA NA NA NA NA MSN 153723 2480 chrX 65143707 65148095 65146296 N NA NA VSIG4 K562 ChIA-PET 22265404 MSN 256196 2481 chrX 65292806 65296547 65294877 N NA NA NA NA NA NA MSN 405295 2482 chrX 6656067 6658182 6657324 N NA NA NA NA NA NA HDHD1 408049 2483 chrX 67969933 67973125 67972196 N NA NA NA NA NA NA YIPF6 251309 2484 chrX 75363882 75366917 75365239 N NA CXorf26 NA NA NA NA CXorf26 25854 2485 chrX 77346235 77349483 77347730 N NA PGK1,TAF9B NA NA NA NA PGK1 10183 2486 chrX 78177185 78181755 78179144 N NA P2RY10 NA NA NA NA P2RY10 19074 2487 chrX 78196139 78198650 78197117 N NA P2RY10 NA NA NA NA P2RY10 2179 2488 chrX 78391807 78415022 78394475,78397939,78400362,78403745 Y,N,N,N P2RY10,GPR174;NA;NA;NA GPR174 NA NA NA NA GPR174 11447 2489 chrX 93655572 93657206 93656214 N NA NA NA NA NA NA CSTF2 6418142 2490 chrX 949712 953953 951229 N NA NA NA NA NA NA SLC25A6 557086 2491 chrY 10012420 10015357 10013485 N NA NA NA NA NA NA PRKY 2870407 2492 chrY 115755 120245 117112 N NA PLCXD1 NA NA NA NA PLCXD1 22746 2493 chrY 127926 132740 129246 N NA PLCXD1,GTPBP6 NA NA NA NA PLCXD1 10251 2494 chrY 13367498 13371810 13370668 N NA NA NA NA NA NA TTTY15 1402488 2495 chrY 14416259 14418220 14417306 N NA NA NA NA NA NA TTTY15 356078 2496 chrY 15052749 15056015 15053454 N NA DDX3Y NA NA NA NA DDX3Y 36730 2497 chrY 15237979 15240483 15239260 N NA NA NA NA NA NA DDX3Y 221960 2498 chrY 15260381 15261498 15261042 N NA NA NA NA NA NA DDX3Y 244362 2499 chrY 15604056 15607083 15605611 N NA UTY NA NA NA NA UTY 11506 2500 chrY 15862066 15870185 15862808 N NA TMSB4Y NA NA NA NA TMSB4Y 46619 2501 chrY 16359557 16363133 16361808 N NA NA NA NA NA NA NLGN4Y 271355 2502 chrY 16366468 16371603 16367468 N NA NA NA NA NA NA NLGN4Y 262885 2503 chrY 16439303 16442253 16441083 N NA NA NA NA NA NA NLGN4Y 192235 2504 chrY 16451034 16459175 16452780,16456752 Y,Y NA;NA NA NA NA NA NA NLGN4Y 175313 2505 chrY 16472653 16475445 16473633 N NA NA NA NA NA NA NLGN4Y 159043 2506 chrY 1965508 1966149 1965675 N NA NA NA NA NA NA ASMT 301160 2507 chrY 23408899 23413919 23411264,23413655 N,N NA;NA NA NA NA NA NA EIF1AY 671288 2508 chrY 23463163 23465078 23464427 N NA NA NA NA NA NA EIF1AY 725552 2509 chrY 2387478 2391241 2389665 N NA DHRSX NA NA NA NA DHRSX 18463 2510 chrY 2459605 2470519 2469189 N NA CD99P1 NA NA NA NA CD99P1 6787 2511 chrY 2755072 2757461 2756129 N NA RPS4Y1,ZFY NA NA NA NA RPS4Y1 45449 2512 chrY 3076812 3088813 3086600,3088753 N,N NA;NA NA NA NA NA NA ZFY 273700 2513 chrY 7588515 7592491 7591753 N NA NA NA NA NA NA PRKY 446502 2514 chrY 7596030 7600855 7598195 N NA NA NA NA NA NA PRKY 454017 2515 chrY 8979384 8979691 8979537 N NA NA NA NA NA NA PRKY 1837371 2516 chrY 899694 903615 901228 N NA NA NA NA NA NA SLC25A6 557424 2517 chrY 94907 101071 98842 N NA PLCXD1 NA NA NA NA PLCXD1 41920 2518 chrY 9925320 9926925 9926138 N NA NA NA NA NA NA PRKY 2783307 2519 chrY 9928553 9930454 9929022 N NA NA NA NA NA NA PRKY 2786540