Enhancer_ID chr start end center FANTOM5 associated_gene-FANTOM5 associated_gene-50Kb associated_gene-4DGenome Cell/Tissue Detection_method PMID closest_gene distance 1 chr1 113391429 113393900 113392805 N NA NA FAM19A3,PPM1J IMR90 Hi-C 24141950 RBM15 2509484 2 chr1 118319099 118321383 118319370 N NA NA NA NA NA NA ATP1A1 1403304 3 chr1 121483782 121485547 121485098 Y NA NA NA NA NA NA PHGDH 1229363 4 chr1 13346322 13346728 13346579 N NA NA NA NA NA NA SPEN 2827631 5 chr1 143672060 143676111 143673492 N NA NA NA NA NA NA SRGAP2P2 239637 6 chr1 145073148 145077477 145075415 N NA SEC22B NOTCH2NL,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9,LOC728875 IMR90 Hi-C 24141950 SEC22B 18930 7 chr1 145137730 145142903 145139496 N NA SEC22B NA NA NA NA SEC22B 41323 8 chr1 145394632 145397903 145395705 N NA NA PDE4DIP,SEC22B,HFE2,GNRHR2,LIX1L,RBM8A,PIAS3,POLR3C,NUDT17,ANKRD35,TXNIP,ANKRD34A,POLR3GL,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEC22B 298225 9 chr1 145398591 145400008 145399040 N NA NA LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,ANKRD34A,RBM8A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEC22B 302184 10 chr1 146554085 146558529 146556398 N NA NA CHD1L,LOC728989,PRKAB2,FMO5 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SEC22B 1457678 11 chr1 147509922 147513184 147510669 N NA NA NA NA NA NA SEC22B 2413515 12 chr1 147717158 147719732 147718938 N NA NA NA NA NA NA SEC22B 2620751 13 chr1 147732649 147738044 147737462,147735606 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SEC22B 2636242 14 chr1 147804813 147809424 147807033 Y NA NA NA NA NA NA SEC22B 2708406 15 chr1 147859573 147863082 147861016 N NA NA NA NA NA NA SEC22B 2763166 16 chr1 148239350 148243414 148241283 N NA NA NA NA NA NA PIP5K1A 2927607 17 chr1 148246718 148249050 148248113 N NA NA NA NA NA NA PIP5K1A 2921971 18 chr1 149214141 149216969 149215592 Y NA NA NA NA NA NA PIP5K1A 1954052 19 chr1 149222970 149226802 149224309 N NA NA NBPF10,SEC22B,NBPF15 MCF7 ChIA-PET 22265404 PIP5K1A 1944219 20 chr1 150857922 150858242 150858117 N NA NA ARNT K562 ChIA-PET 22265404 PIP5K1A 312779 21 chr1 152160204 152163098 152161770 N NA NA NA NA NA NA PSMB4 788163 22 chr1 15928562 15929914 15929301 N NA NA DDI2,DNAJC16,AGMAT,FBLIM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPEN 244445 23 chr1 161359168 161361121 161359913 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COPA 1045814 24 chr1 161368418 161371552 161369442 Y NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COPA 1055064 25 chr1 16831844 16834003 16832887 N NA NA NECAP2,SPATA21,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 SPEN 657485 26 chr1 16839510 16843380 16840988 N NA NA NECAP2,SPATA21,CROCCP3,NBPF1,CROCC,CROCCP2,MST1P2,MIR3675,ESPNP,ARHGEF19,C1orf144,FBXO42 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPEN 665151 27 chr1 17219605 17223724 17222233 N NA NA CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPEN 1045246 28 chr1 17229420 17234095 17231516 Y PADI4,PADI2 NA CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPEN 1055061 29 chr1 173975175 173994061 173991576,173986908 N,N NA;NA NA LOC100506023,PRDX6,GAS5,SNORD75,SNORD81,SNORD47,SNORD78,SNORD79,SNORD77,SNORD44,SNORD76,SNORD80,ZBTB37,RABGAP1L,RC3H1 IMR90 Hi-C 24141950 GAS5 138050 30 chr1 200456865 200457541 200457022 N NA NA C1orf98,NR5A2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF281 77699 31 chr1 201137693 201141679 201140406 N NA NA CACNA1S,KIF21B,TMEM9,IGFN1,PKP1,TNNT2,LAD1,TNNI1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF281 758527 32 chr1 204462385 204464761 204464003 N NA NA PIK3C2B,PPP1R15B,LOC127841 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BTG2 1187721 33 chr1 204475505 204476696 204475938 N NA NA PPP1R15B,MDM4,PIK3C2B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BTG2 1200841 34 chr1 220472501 220475675 220473982 N NA NA RAB3GAP2,MARC2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FBXO28 3826116 35 chr1 224178835 224198276 224180405 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 103515 36 chr1 232759298 232768339 232766317 N NA NA TSNAX-DISC1,SIPA1L2,PCNXL2,DISC2,NTPCR IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BP2 1976932 37 chr1 234747415 234751514 234748684 Y IRF2BP2 IRF2BP2 LINC00184,LOC100506810,ARID4B IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BP2 2144 38 chr1 236548255 236549359 236548564 N NA NA NA NA NA NA ERO1LB 102916 39 chr1 238662281 238663071 238662539 N NA NA NA NA NA NA MTR 1703700 40 chr1 25033783 25035712 25034545 N NA NA SRRM1,CLIC4,RUNX3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRRM1 64189 41 chr1 26824809 26829881 26827536 Y PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A NA HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NUDC 418343 42 chr1 26945105 26949532 26947774,26947122 Y,Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1;CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A NA RPS6KA1,ARID1A,GPN2,GPATCH3,ZDHHC18,DHDDS,HMGN2,SFN,PIGV,NUDC,NR0B2,C1orf172 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NUDC 298692 43 chr1 31626631 31627313 31626660 N NA NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA6 946331 44 chr1 39246756 39251154 39249770 N NA NA NA NA NA NA PPIEL 774216 45 chr1 40263725 40264070 40263857 N NA NA HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1 IMR90 Hi-C 24141950 PPIEL 238355 46 chr1 47973277 47975470 47974389 N NA NA NA NA NA NA UQCRH 1203897 47 chr1 52599827 52601574 52600666 N NA NA NA NA NA NA FAF1 1173891 48 chr1 53044098 53044576 53044413 N NA NA GPX7,ZCCHC11,ZFYVE9,FAM159A,ZYG11A,CC2D1B,ZYG11B,ORC1,BTF3L4,ECHDC2 IMR90 Hi-C 24141950 FAF1 1618162 49 chr1 53167908 53171181 53168738 Y NA NA SELRC1,CPT2 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAF1 1741972 50 chr1 564343 570424 568256,565617,570302 N,N,N NA;NA;NA NA NA NA NA NA ISG15 378423 51 chr1 65467586 65469801 65468643 N NA NA JAK1 IMR90 Hi-C 24141950 SERBP1 2426322 52 chr1 65529443 65534441 65533384 N NA NA AK4,LEPR,DNAJC6,JAK1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SERBP1 2361682 53 chr1 67615799 67616898 67616145 N NA NA MIER1 IMR90 Hi-C 24141950 SERBP1 279225 54 chr1 70034871 70036946 70035921 Y NA NA NA NA NA NA WLS 1336642 55 chr1 73180924 73181957 73181403 N NA NA ZRANB2-AS2 IMR90 Hi-C 24141950 WLS 4482695 56 chr1 8882564 8883609 8883462 N NA RERE ERRFI1,RERE,ENO1,ENO1-AS1,SLC2A5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RERE 4865 57 chr1 9235727 9246095 9241997,9236571 N,N NA;NA NA SLC2A7,SLC25A33,GPR157,MIR34A,H6PD,SPSB1,TMEM201 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ENO1 296576 58 chr1 9488007 9490858 9489075 Y NA NA H6PD,SPSB1,SLC25A33,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 ENO1 548856 59 chr10 109673272 109673564 109673409 Y NA NA NA NA NA NA GBF1 5668017 60 chr10 115752727 115753369 115752990 N NA NA NA NA NA NA EMX2 3548587 61 chr10 126604650 126608183 126605669 N NA NA ZRANB1,CTBP2,METTL10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKI67 3316285 62 chr10 130164475 130165033 130164619 N NA NA NA NA NA NA MKI67 240007 63 chr10 23524732 23525335 23525187 N NA NA KIAA1217 IMR90 Hi-C 24141950 YME1L1 3918014 64 chr10 27861112 27862447 27861549 N NA NA MPP7 IMR90 Hi-C 24141950 YME1L1 417763 65 chr10 28589933 28593462 28592112 N NA NA MPP7,MKX IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YME1L1 1146584 66 chr10 28754413 28754625 28754545 N NA NA NA NA NA NA YME1L1 1311064 67 chr10 30380521 30381117 30380817 N NA NA KIAA1462,MTPAP IMR90 Hi-C 24141950 YME1L1 2937172 68 chr10 32258524 32259138 32258994 N NA NA KIF5B,ARHGAP12 IMR90 Hi-C 24141950 YME1L1 4815175 69 chr10 32661791 32668988 32667727 N NA NA EPC1 IMR90 Hi-C 24141950 YME1L1 5218442 70 chr10 32733946 32737909 32735449 N NA NA C10orf68 MCF7 ChIA-PET 22265404 YME1L1 5290597 71 chr10 33264273 33264441 33264276 N NA NA ITGB1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 YME1L1 5820924 72 chr10 3893377 3896534 3894676 N NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GDI2 1958978 73 chr10 43914840 43918410 43916263 N NA NA ZNF487P K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 YME1L1 16471491 74 chr10 46193663 46196226 46194131 N NA NA NA NA NA NA YME1L1 18750314 75 chr10 52037441 52038247 52037830 N NA NA SGMS1 IMR90 Hi-C 24141950 DDX50 18622787 76 chr10 66167058 66167485 66167222 N NA NA NA NA NA NA DDX50 4493549 77 chr10 69522514 69525448 69524042 Y NA NA NA NA NA NA DDX50 1135586 78 chr10 69608555 69611756 69609313 Y NA NA SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 DDX50 1049278 79 chr10 74018879 74022197 74020671 Y C10orf54,PSAP,DNAJB12,DDIT4 DDIT4 DNAJB12 K562 ChIA-PET 22265404 DDIT4 11480 80 chr10 78582164 78582604 78582452 N NA NA NA NA NA NA POLR3A 1206694 81 chr10 8314106 8315192 8314413 N NA NA NA NA NA NA IL2RA 2209773 82 chr10 91847162 91847445 91847289 N NA NA NA NA NA NA FRA10AC1 3614884 83 chr10 92919696 92926983 92923482 N NA NA ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FRA10AC1 2535346 84 chr10 955139 981823 977846,958496 N,Y NA;NA NA IDI2-AS1,IDI1,DIP2C,LARP4B,GTPBP4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GDI2 4873689 85 chr11 112151172 112152128 112151549 N NA NA BCO2,PTS IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MLL 6155077 86 chr11 134720988 134723351 134721791 N NA NA NA NA NA NA H2AFX 15754811 87 chr11 17227343 17231128 17229590 N NA NA NA NA NA NA EIF4G2 6396761 88 chr11 24158647 24158928 24158789 N NA NA NA NA NA NA NAT10 9968183 89 chr11 4337807 4338628 4337982 N NA NA NA NA NA NA RPLP2 3527871 90 chr11 45424886 45425392 45425061 N NA NA CHST1,SYT13 IMR90 Hi-C 24141950 NAT10 11297775 91 chr11 46263455 46267614 46264381 N NA NA DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNKS1BP1 10824799 92 chr11 47894308 47895493 47894599 N NA NA PTPRJ IMR90 Hi-C 24141950 TNKS1BP1 9196920 93 chr11 65242304 65246105 65245049 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 NA SCYL1,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NEAT1 52035 94 chr11 73489069 73491410 73490603 Y UCP2 NA MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS3 1619125 95 chr11 75945796 75947401 75946765 N NA NA C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS3 835261 96 chr11 91962513 91963265 91962991 N NA NA FAT3 IMR90 Hi-C 24141950 PCF11 9094376 97 chr11 9384449 9387374 9386009 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 NA ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTRNR2L8 1143349 98 chr11 9634362 9637232 9635352 N NA NA WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MTRNR2L8 893491 99 chr12 105350053 105353753 105352154 N NA NA CHST11,SLC41A2,TXNRD1,C12orf45,ALDH1L2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HSP90B1 1025864 100 chr12 105955161 105957121 105956248 N NA NA NUAK1,CKAP4 IMR90 Hi-C 24141950 HSP90B1 1630972 101 chr12 120728490 120731685 120730610 N NA NA PXN,GCN1L1,LOC100506649,RPLP0,RAB35,SIRT4,CCDC64,DYNLL1,SRSF9,RNF10,COX6A1,PLA2G1B,MSI1,LOC100506668,COQ5,TRIAP1,GATC IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPLP0 89476 102 chr12 125540524 125541556 125541279 N NA NA AACS,DHX37,BRI3BP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBC 140937 103 chr12 125669380 125671449 125670829 N NA NA NA NA NA NA UBC 269793 104 chr12 1714416 1715824 1715290 N NA FBXL14 FBXL14,RAD52,ERC1,WNT5B,WNK1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FBXL14 11085 105 chr12 25536180 25541101 25539229 Y NA NA BCAT1,CASC1,KRAS,LYRM5,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM60A 5938058 106 chr12 27030778 27031172 27031031 N NA NA ITPR2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM60A 4447987 107 chr12 28337686 28345291 28343349 N NA NA KLHDC5,CCDC91 IMR90 Hi-C 24141950 FAM60A 3133868 108 chr12 29298994 29307210 29302261 N NA NA NA NA NA NA FAM60A 2171949 109 chr12 31767676 31768599 31768038 N NA NA DENND5B IMR90 Hi-C 24141950 FAM60A 288517 110 chr12 46775552 46780308 46777214,46779855,46777316 N,N,N NA;NA;NA SLC38A2 SLC38A1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC38A2 8907 111 chr12 51308796 51309433 51308951 N NA NA TMPRSS12,ATF1,METTL7A IMR90 Hi-C 24141950 TMBIM6 1173503 112 chr12 55116940 55117508 55117282 N NA NA KIAA0748 IMR90 Hi-C 24141950 PCBP2 1271054 113 chr12 57711268 57712002 57711746 N NA NA NDUFA4L2,R3HDM2,STAC3,INHBE,ARHGAP9,GLI1,INHBC IMR90 Hi-C 24141950 DDIT3 202298 114 chr12 65174465 65176705 65175025 N NA NA NA NA NA NA RAB21 6971953 115 chr12 66122262 66125210 66123207 N NA NA MSRB3,RPSAP52,HMGA2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB21 6023448 116 chr12 67459428 67465534 67463231 N NA NA CAND1 MCF7 ChIA-PET 22265404 RAB21 4683124 117 chr12 70239439 70239967 70239722 N NA NA NA NA NA NA RAB21 1908691 118 chr12 77347447 77347738 77347587 N NA NA E2F7 IMR90 Hi-C 24141950 RAB21 5198789 119 chr12 8176540 8180620 8179305 Y NA NA PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHB2 1096624 120 chr12 84918669 84919157 84918914 N NA NA NA NA NA NA LOC144486 9934622 121 chr12 856697 857713 857391 N NA WNK1 NINJ2,B4GALNT3 IMR90 Hi-C 24141950 WNK1 4376 122 chr12 91466070 91466485 91466223 N NA NA NA NA NA NA LOC144486 3387294 123 chr13 112754894 112755178 112755058 N NA NA NA NA NA NA STK24 13525498 124 chr13 35165851 35166155 35166006 N NA NA NA NA NA NA TPT1 10749142 125 chr13 44714021 44717922 44716300 N NA NA TSC22D1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TPT1 1197375 126 chr13 57239276 57239579 57239441 N NA NA NA NA NA NA HNRNPA1L2 4047671 127 chr13 59980677 59981069 59980825 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPA1L2 6789072 128 chr13 62577143 62577453 62577312 N NA NA NA NA NA NA HNRNPA1L2 9385538 129 chr13 64511192 64511469 64511331 N NA NA NA NA NA NA HNRNPA1L2 11319587 130 chr13 64647971 64651654 64649673 N NA NA NA NA NA NA HNRNPA1L2 11456366 131 chr13 73742194 73742524 73742358 N NA NA NA NA NA NA KCTD12 3718016 132 chr13 79239315 79239961 79239455 N NA NA RNF219 K562 ChIA-PET 22265404 KCTD12 1778775 133 chr13 80863773 80864407 80864143 N NA NA NA NA NA NA KCTD12 3403233 134 chr13 95200790 95203444 95201939 Y NA TGDS NA NA NA NA TGDS 45067 135 chr14 100436902 100442274 100438055 N NA NA EML1,EVL,DEGS2,YY1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 262828 136 chr14 100657721 100661211 100659401 Y NA YY1 DEGS2,YY1,EVL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 43891 137 chr14 100677118 100682999 100681015 N NA YY1 DEGS2,YY1,EVL IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 22103 138 chr14 105557669 105562403 105559711 N NA NA BTBD6,BRF1,JAG2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTA1 323783 139 chr14 19651493 19667787 19651969,19652758 N,N NA;NA NA NA NA NA NA SUPT16H 2184638 140 chr14 19923197 19923561 19923402 N NA NA NA NA NA NA SUPT16H 1928864 141 chr14 21081016 21083660 21082155 N NA NA KLHL33,TMEM55B,PARP2,RPPH1,RNASE4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SUPT16H 768765 142 chr14 32669307 32672341 32671070 Y NA NA NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPTSSA 2259127 143 chr14 38934052 38934652 38934197 N NA NA NA NA NA NA SPTSSA 4002584 144 chr14 39693952 39694995 39694578 N NA NA NA NA NA NA SPTSSA 4762484 145 chr14 50328229 50331422 50328921,50329638 Y,Y NA;NA NA SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS29 275135 146 chr14 56792537 56793296 56792943 N NA NA NA NA NA NA RPS29 6739443 147 chr14 77435148 77436192 77435686 N NA NA IRF2BPL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GTF2A1 4251383 148 chr14 85441353 85442055 85441701 N NA NA NA NA NA NA GTF2A1 3753778 149 chr14 90846760 90852710 90849661 N NA CALM1 C14orf102,CALM1,TTC7B,EFCAB11,TDP1,PSMC1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALM1 10617 150 chr14 97797134 97797407 97797219 N NA NA NA NA NA NA GLRX5 1795811 151 chr14 99438974 99439930 99439528 Y NA NA NA NA NA NA YY1 1265172 152 chr15 102284238 102288114 102285996 N NA NA NA NA NA NA PCSK6 254051 153 chr15 26326640 26328610 26327529 Y NA NA LOC100128714,ATP10A IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP11B 4590269 154 chr15 28832234 28839849 28834590 N NA NA NA NA NA NA ARHGAP11B 2079030 155 chr15 30762041 30768207 30763175 N NA NA NA NA NA NA ARHGAP11B 150672 156 chr15 41911814 41916039 41913749 N NA NA RTF1,RPAP1,TYRO3,MGA,MAPKBP1,SPTBN5,EHD4 IMR90 Hi-C 24141950 EIF3J 2913227 157 chr15 42781970 42784763 42783392 N NA NA NA NA NA NA EIF3J 2044503 158 chr15 44522056 44522689 44522330 N NA NA CTDSPL2,FRMD5,WDR76,CASC4 IMR90 Hi-C 24141950 EIF3J 306577 159 chr15 46162390 46162685 46162531 N NA NA NA NA NA NA B2M 1158705 160 chr15 62679192 62684132 62682730 N NA NA TLN2,MGC15885 IMR90 Hi-C 24141950 OAZ2 2311330 161 chr15 65587994 65589584 65588495 N NA NA MTFMT,IGDCC4,PDCD7,RASL12,IGDCC3,OSTBETA,CILP,PARP16,CLPX,UBAP1L,DPP8,PTPLAD1,SPG21,KBTBD13 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 OAZ2 592532 162 chr15 65595308 65598166 65596891 Y DENND4A NA PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OAZ2 599846 163 chr15 66089470 66089955 66089612 N NA NA DENND4A MCF7 ChIA-PET 22265404 SNAPC5 700191 164 chr15 69542788 69543750 69543100 N NA NA PAQR5,MIR548H4 IMR90 Hi-C 24141950 RPLP1 201409 165 chr15 72928431 72936466 72929316 N NA NA CELF6 IMR90 Hi-C 24141950 LOC100287559 138710 166 chr15 74387859 74394090 74392639 N NA NA NA NA NA NA COX5A 836405 167 chr15 75168845 75169384 75169209 N NA NA NA NA NA NA COX5A 61111 168 chr15 78233304 78237699 78236972 N NA NA TBC1D2B,DNAJA4,IDH3A,CIB2,IREB2,LOC91450,SH2D7,WDR61,LOC645752,ACSBG1 IMR90 Hi-C 24141950 WDR61 354241 169 chr15 79151523 79153644 79152754 Y IREB2 MORF4L1 MORF4L1,ADAMTS7 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MORF4L1 11528 170 chr15 80036764 80037309 80037032 N NA NA NA NA NA NA MORF4L1 871592 171 chr15 89316173 89316360 89316334 N NA NA ACAN IMR90 Hi-C 24141950 MRPL46 305540 172 chr15 93373031 93376771 93375234 Y NA NA LOC100507217,CHD2,ASB9P1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CHD2 66780 173 chr15 96098567 96102142 96100695 N NA NA NR2F2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CHD2 2655016 174 chr15 99089980 99092758 99091726 Y NA NA IGF1R,SYNM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PCSK6 2937429 175 chr16 16665182 16669453 16665530 N NA NA NA NA NA NA RPS15A 2132203 176 chr16 22388888 22389601 22389051 N NA NA CDR2 K562 ChIA-PET 22265404 SLC7A5P2 857123 177 chr16 2917277 2919845 2918248 Y NA NA PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TCEB2 89980 178 chr16 29950361 29950908 29950776 N NA NA MVP,KCTD13 IMR90 Hi-C 24141950 INO80E 56623 179 chr16 30643177 30650803 30645823 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 NA PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHKG2 108817 180 chr16 30816117 30821822 30819758,30816951 N,N NA;NA NA C16orf93,PHKG2,RNF40,ZNF629,MIR762,BCL7C,CTF1,MIR4519,FBXL19-AS1,FBXL19,SRCAP IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHKG2 56497 181 chr16 3233056 3235426 3234245 N NA NA ZNF263,ZNF200 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TCEB2 405759 182 chr16 3237168 3240609 3238033,3239583 Y,N NA;NA NA ZNF200 K562 ChIA-PET 22265404 TCEB2 409871 183 chr16 3243573 3244414 3243858 N NA NA NA NA NA NA TCEB2 416276 184 chr16 49883537 49890578 49889654 N NA NA ZNF423 IMR90 Hi-C 24141950 CMTM4 16840032 185 chr16 56080791 56081475 56081327 N NA NA GNAO1,LOC283856 IMR90 Hi-C 24141950 CMTM4 10649135 186 chr16 57334128 57334757 57334483 N NA NA NLRC5,CPNE2,PLLP,CIAPIN1,FAM192A,RSPRY1,ARL2BP,CCL17,COQ9,CX3CL1,CCL22,POLR2C,GPR114,CCDC102A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CMTM4 9395853 187 chr16 72696053 72700382 72698953 N NA NA ZFHX3 IMR90 Hi-C 24141950 RFWD3 2000397 188 chr16 79802820 79805489 79804484 N NA NA WWOX IMR90 Hi-C 24141950 RFWD3 5102041 189 chr16 84542465 84542910 84542624 N NA NA NA NA NA NA COX4I1 1290263 190 chr17 19014613 19017794 19015301 N NA NA NA NA NA NA USP22 1928558 191 chr17 20433974 20439837 20435470 N NA NA NA NA NA NA USP22 506515 192 chr17 20811146 20812857 20812022 N NA NA USP22 IMR90 Hi-C 24141950 USP22 133495 193 chr17 21177990 21180831 21179202 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 NA MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP22 231638 194 chr17 3514839 3515870 3515327 N NA NA TRPV3 IMR90 Hi-C 24141950 PAFAH1B1 1017916 195 chr17 39833695 39834649 39834489 N NA EIF1 SMARCE1,KRT222,KRT28,KRT26,KRT27,TMEM99,KRT10,KRT20,KRTAP3-2,KRTAP3-3,EIF1,KRT19,HAP1,JUP IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EIF1 10478 196 chr17 41393034 41395272 41393445 N NA NA BRCA1,NBR2,NBR1,RND2,VAT1,IFI35,RPL27,TMEM106A,LOC100130581 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LOC100130581 70994 197 chr17 41399991 41401687 41401179 N NA NA IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581,DHX8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LOC100130581 64579 198 chr17 46714708 46726070 46724859 N NA NA HOXB8,HOXB9,COPZ2,CBX1,SNX11,SKAP1,HOXB6,HOXB-AS3,HOXB7,MIR3185,PRAC,HOXB13,HOXB-AS5,TTLL6,CALCOCO2 IMR90 Hi-C 24141950 IGF2BP1 348704 199 chr17 51183035 51183867 51183689 N NA NA NA NA NA NA IGF2BP1 4108261 200 chr17 63116662 63120982 63119562 Y GNA13 NA RGS9,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDX5 614178 201 chr17 66014911 66019178 66016182 Y NA NA BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSMD12 652190 202 chr17 66177535 66178119 66177735 N NA NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 PSMD12 814814 203 chr17 67321095 67324578 67323397 N NA NA KCNJ16,UNK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSMD12 1958374 204 chr17 70025084 70028618 70026727 N NA NA NA NA NA NA RPL38 2171177 205 chr17 71102450 71103237 71102765 N NA NA SLC39A11,LINC00511,COG1,FAM104A,C17orf80 IMR90 Hi-C 24141950 RPL38 1096558 206 chr17 72975654 72980435 72978474 Y KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L NA CDR2L,C17orf28,ICT1,ATP5H,KCTD2,HN1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HN1 170340 207 chr17 75954549 75968773 75954985 N NA NA TNRC6C,LOC100507351,FLJ45079,TK1,SEPT9,LOC100131096 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TK1 214512 208 chr18 19927221 19930027 19928718 N NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF521 3002187 209 chr18 33161223 33166925 33161852 N NA NA NA NA NA NA ZNF521 10229009 210 chr18 37377827 37380792 37379992,37379699 N,N NA;NA NA NA NA NA NA C18orf25 6373196 211 chr18 44949035 44949335 44949199 N NA NA NA NA NA NA C18orf25 1195047 212 chr18 57636642 57640673 57639887 N NA NA PMAIP1 IMR90 Hi-C 24141950 PMAIP1 69450 213 chr18 69304168 69304900 69304572 N NA NA NA NA NA NA PMAIP1 11736976 214 chr18 8705459 8710101 8705858,8707670 N,N NA;NA NA CCDC165,NDUFV2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP4R1 904499 215 chr18 9443994 9444274 9444133 N NA NA ANKRD12,TWSG1,RALBP1,PPP4R1 IMR90 Hi-C 24141950 PPP4R1 170326 216 chr18 9901 12382 11384 N NA NA NA NA NA NA CBX3P2 2643012 217 chr19 12349618 12350905 12350404 N NA NA ZNF564,ZNF442 IMR90 Hi-C 24141950 FBXW9 456550 218 chr19 1727127 1727890 1727742 N NA NA TCF3,C19orf25,ONECUT3,PLK5,UQCR11,ATP8B3,LOC100288123,REXO1,ADAMTSL5 IMR90 Hi-C 24141950 SCAMP4 177483 219 chr19 20161495 20164644 20163043 Y ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682 NA ZNF682,LOC284440 MCF7 ChIA-PET 22265404 UBA52 1478881 220 chr19 20960127 20966528 20960291 N NA NA ZNF486 IMR90 Hi-C 24141950 UBA52 2277513 221 chr19 24216820 24219184 24217327 N NA NA NA NA NA NA UBA52 5534206 222 chr19 30335693 30337348 30336432 N NA NA NA NA NA NA ZNF507 2499166 223 chr19 30817566 30820568 30817738 N NA NA NA NA NA NA ZNF507 2015946 224 chr19 32725484 32725850 32725669 N NA NA NA NA NA NA ZNF507 110664 225 chr19 34624534 34627930 34625395 N NA NA CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD IMR90 Hi-C 24141950 UBA2 291338 226 chr19 35210877 35211527 35211432 N NA ZNF302 SCGB2B3P,ZNF181 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF302 42310 227 chr19 37805770 37822297 37808737 N NA NA NA NA NA NA ZNF793 175544 228 chr19 44709254 44713867 44711611 Y NA NA ZFP112,ZNF180 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF155 220899 229 chr19 47361882 47371549 47363875 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 NA SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SAE1 262531 230 chr19 47387624 47387970 47387786 N NA NA ARHGAP35,SAE1,SLC1A5,AP2S1,ZC3H4,NPAS1,TMEM160 IMR90 Hi-C 24141950 SAE1 246110 231 chr19 48101496 48105919 48103730 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLTSCR2 142874 232 chr19 48407839 48408746 48408001 N NA NA NA NA NA NA SEPW1 125997 233 chr19 486778 491671 489083 N NA NA ODF3L2,SHC2,TPGS1,MADCAM1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CIRBP 777596 234 chr19 50871328 50874046 50872465 N NA NA NA NA NA NA C19orf48 433928 235 chr19 51421096 51421867 51421400 N NA NA NA NA NA NA C19orf48 113122 236 chr19 53833136 53834439 53833669 N NA NA NA NA NA NA RPS9 870287 237 chr19 54163281 54163639 54163386 N NA NA NA NA NA NA RPS9 541087 238 chr19 6525656 6526591 6526285 N NA NA NA NA NA NA LONP1 805480 239 chr2 118941623 118945794 118943622 N NA NA NA NA NA NA ANKRD30BL 14069748 240 chr2 133023798 133031027 133030055,133026125 Y,N NA;NA ANKRD30BL GPR39,ANKRD30BL,CEP68,STAMBP,NRXN1,KCNIP3,ADCY3,EML4,DDX1,MIR4778,STARD7,TGOLN2,MAP3K2,RNU4ATAC,GCC2,CNNM3,LHCGR,LOC100189589,CLASP1,GMCL1,SULT6B1,ANKRD20A8P,MRPS9,NMS,RHOQ,CAPG,DGUOK,SMYD5,MPHOSPH10,ARID5A,HAAO,RMND5A,LOC440905,LIMS2,FOXN2,GPAT2,CIB4,LOC100216479,FEZ2,LOC729121,TTC7A,RTKN,CDKL4,POLR2D,LOC339803,EMILIN1,LYG1,MYCNOS,STEAP3,FAM49A,CKAP2L,EFR3B,OTOF,HK2,CNGA3,GEMIN6,ALK,SPR,LOC440895,IL18RAP,LOC375190,PTRHD1,C2orf81,MATN3,PEX13,FABP1,NPHP1,FAM161A,DDX18,ADRA2B,KRCC1,BIRC6,CCDC74B,C2orf49,THNSL2,ST3GAL5,NAT8B,ERCC3,CCDC88A,QPCT,LOC100506123,TLX2,REG1A,LOC284950,CHCHD5,SMC6,LOC254128,PNPT1,DBI,LOC100505716,LOC285103,TMSB10,RAD51AP2,MGAT4A,PLEKHH2,ELMOD3,PKDCC,GALM,GLI2,LIMS3-LOC440895,RPL31,ASXL2,LOC100132215,SMEK2,FBLN7,EPT1,SRSF7,DUSP2,CYP4F30P,LOC100131320,LOC388948,ATOH8,GCFC2,ACTR2,C2orf27B,IWS1,GPR17,MTIF2,LBX2,POU3F3,SUPT7L,SPDYA,TEKT4,ANKRD39,WDR54,RAB1A,IL36A,FAM123C,LOC285000,REV1,GPR148,MRPL33,EPB41L5,RPS27A,CEBPZ,EHBP1,RALB,APOB,DUSP11,LOC400958,CRIPT,CYP1B1-AS1,CHAC2,GFPT1,NPAS2,PTCD3,LOC389023,TRIM54,SFXN5,MALL,NT5C1B-RDH14,LOC100507334,POLE4,C2orf18,IL1A,C2orf73,CD8A,ATL2,LOC654342,UNC50,ITPRIPL1,HADHB,IL1R1,ZFP36L2,MAP4K3,FIGLA,LOC440900,ZNF512,POTEE,PDCL3,ABCG8,CCDC142,MYADML,MIR4783,PCBP1-AS1,PFN4,LOC150568,SEMA4F,TMEM177,LOC401010,MRPL19,GCKR,TTC32,GGCX,LOC151009,THUMPD2,LOC728537,IL36B,PCDP1,VAMP5,LRRTM4,SF3B14,SULT1C2,RGPD4,MCEE,AAK1,SFTPB,SLC5A7,SCTR,ACTR1B,CIAO1,DNAJC5G,SIX3,SERTAD2,PIGF,CD8B,GGT8P,SLC9A2,NFU1,SNAR-H,POTEKP,VWA3B,SH3RF3,FAHD2B,UBXN2A,LOC284998,MEIS1,FAM98A,LOC90784,LAPTM4A,CCDC104,LOC100499194,MAPRE3,PPP1R21,ANXA4,LOC440910,LOC100506421,FAM84A,GKN2,TMEM185B,RASGRP3,ABHD1,AFF3,CRIM1,MOGS,BOLA3,DNAJC27,MZT2B,MAL,NRBP1,UXS1,PRKD3,SOCS5,FLJ30838,TTC31,RNF103-CHMP3,HADHA,MIR4435-1,NOTO,RPL23AP7,C1QL2,CHMP3,RNF149,AUP1,TBC1D8,AGBL5,GYPC,MSH6,LOC728730,VPS54,EIF5B,GALNT14,PLEK,GEN1,LOC100505876,MIR4432,VAMP8,ST6GAL2,C2orf91,KIAA1841,MORN2,LOC100128590,IL1RL2,BMP10,EIF2B4,ARHGEF4,REG3A,SULT1C3,ADD2,TSN,IFT172,TSGA10,HNRPLL,DPY30,LGALSL,ZNF2,ZNF638,IMP4,CCDC138,INSIG2,ACOXL,FBXO41,DYSF,C2orf51,TMEM214,TMEM127,ALMS1P,CDC42EP3,MZT2A,TMEM150A,EGR4,FOXI3,C2orf16,FOSL2,OR7E91P,UGGT1,TMEM87B,TXNDC9,NBAS,CREG2,RGPD6,ABCG5,PUM2,RNF181,LINC00116,LOC646743,MIR4757,C2orf78,MRPL35,LOC541471,INHBB,RHOB,LOC388942,STON1-GTF2A1L,DCTN1,CCDC115,LOC100129726,KCNS3,UNQ6975,ZAP70,NAGK,C2orf53,MIR4436A,C2orf76,THADA,VRK2,SLC5A6,RABL2A,CCDC75,PLEKHB2,MXD1,ANKRD36BP2,REG1P,MIR217,C2orf63,ASTL,WDR33,NLRC4,XPO1,RETSAT,TUBA3E,TRIM43B,CAMKMT,BCL2L11,PUS10,PAIP2B,RPIA,SH2D6,PCBP1,USP39,REG3G,FSHR,MYCN,SEMA4C,ANKRD23,C1D,IL1R2,MKI67IP,MOB1A,LOC389043,ACTR3BP2,EPCAM,MAT2A,PCGF1,RGPD2,BIN1,KANSL3,LOC100287010,LOXL3,CD207,DPYSL5,VAX2,PPP1CB,POLR1A,LOC644838,BCL11A,SULT1C4,ANKRD36,DBIL5P2,B3GNT2,LINC00309,ARHGEF33,TFCP2L1,C2orf89,IL1F10,OTX1,PPM1B,GKN1,ANTXR1,FKBP1B,ATP6V1B1,CCT7,CCDC74A,TEX261,MTA3,MFSD9,COX5B,RGPD1,FOXD4L1,FLJ42351,EFEMP1,SLC30A6,FAM168B,GDF7,NEURL3,TUBA3D,POLR1B,USP34,MSH2,MFSD2B,EXOC6B,RANBP2,LRRTM1,LOC100286979,C2orf84,KCNK12,MIR4267,CAD,FAM138B,SPRED2,HTRA2,ACTG2,AHSA2,SLC30A3,RBKS,NCK2,MIR548AD,FLJ16341,TRMT61B,SLC1A4,PROKR1,ATAD2B,LOC100630918,LCLAT1,CAPN14,LMAN2L,C2orf65,CTNNA2,SRD5A2,MIR4265,CCT4,INPP4A,SLC20A1,COX7A2L,SNRNP27,TMEM178,MIR4266,SULT1C2P1,MIR4436B1,MRPS5,IMMT,ALMS1,CYP27C1,HS6ST1,LOC728819,WTH3DI,CHST10,LOC375196,SMPD4,OSR1,PAPOLG,KRTCAP3,EPAS1,MDH1,C2orf74,IL18R1,LOC1720,CCDC164,LOC285074,VIT,PLGLB2,C2orf61,LONRF2,CCDC85A,UCN,C2orf28,DQX1,FAM178B,CENPA,MRPL30,MERTK,TCF23,DNAJC27-AS1,FAM176A,IL36G,IL1B,LIPT1,ZNF513,COA5,CLEC4F,PPP3R1,BRE,C2orf15,RAB6C,DOK1,PLGLA,GPR45,MIR4780,TMEM131,CBWD2,TSPYL6,LOC388946,CLIP4,C2orf42,SNRPG,LOC654433,LOC100505624,PTPN18,C2orf71,POMC,EML6,KIF3C,WASH2P,LOC150776,GTF3C2,WDR43,MEMO1,ETAA1,TRIM43,MRPL53,CAPN13,MIR4264,TIA1,SPTBN1,CENPO,C2orf55,FLJ12334,HS1BP3,COMMD1,IL1RN,LOC285033,ANKRD36B,LOC440894,PRADC1,C2orf68,TCF7L1,TMEM37,ATP6V1E2,SIX2,REG1B,CYP26B1,PREPL,WDR35,PAX8,OST4,CGREF1,PELI1,REL,POTEF,ZC3H8,KLHL29,DHX57,C2orf40,CNTNAP5,C2orf44,TGFBRAP1,PRKCE,LRPPRC,SLC35F5,FBXO48,GPR113,SUCLG1,LOC100288911,NCAPH,WDR92,TACR1,MARCO,MIR216A,CALM2,BUB1,ANKRD53,SLC4A1AP,DDX11L2,LOC100134259,FANCL,ACYP2,ITSN2,DNMT3A,PROM2,LYG2,LOC100287216,GPR75-ASB3,PCYOX1,MAP4K4,PNO1,LOC151534,YIPF4,PREB,ANAPC1,EMX1,REEP1,GPN1,PRORSD1P,ZNF514,WDPCP,KDM3A,NAT8,KCMF1,YPEL5,C2orf27A,LIMS1,EDAR,DYNC2LI1,LOC339807,SEPT10,FUNDC2P2,EHD3,SLC9A4,RAB10,FAM179A,HEATR5B,IL37,OXER1,SOWAHC,AFTPH,LOC389033,LOC729234,DNAH6,TET3,SMYD1,RGPD8,UGP2,LOC442028,STRN,CFC1B,LTBP1,FNDC4,MIR3682,MYO7B,ZC3H6,SNX17,TGFA,C2orf56,TPRKB,TMEM17,SAP130,FBXO11,AMMECR1L,RFX8,EIF2AK3,GNLY,PLB1,MSGN1,SLC3A1,TMEM182,C2orf29,LINC00486,FAM59B,PTPN4,CNNM4,RTN4,ACTR3,MITD1,LOC645949,IL1RL1,PPM1G,ASB3,INO80B-WBP1,CNRIP1,XDH,LBH,IL36RN,SLC8A1,PROC,LINC00152,KHK,EN1,NCOA1,FAM82A1,KCNK3,FAM136A,FER1L5,PSD4,SNORD89,SLC4A5,MPV17,SDC1,SPAST,VSNL1,ERLEC1,MIR216B,SRBD1,APLF,CCDC93,LOC84931,CCDC121,C2orf43,SFT2D3,DTNB,RGPD3,TTL,FHL2,LOC100133985,SOS1,TP53I3,RAB11FIP5,ARHGAP25,MTHFD2,BOLA3-AS1,KCNG3,EIF2AK2,DPP10,CYP1B1,C2orf70,TTC27,SNRNP200,PSME4,FAHD2A,MCFD2 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD30BL 8256 241 chr2 133102779 133107992 133104947 N NA NA NA NA NA NA ANKRD30BL 87237 242 chr2 137078797 137079170 137079006 N NA NA NA NA NA NA ANKRD30BL 4063255 243 chr2 157195716 157201626 157198240 N NA NR4A2 GPD2,GALNT5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NR4A2 6429 244 chr2 157257197 157257878 157257495 N NA NA NR4A2,GALNT5,GPD2 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NR4A2 67910 245 chr2 188463716 188464493 188463999 N NA NA GULP1 IMR90 Hi-C 24141950 ZC3H15 1112831 246 chr2 196964719 196965260 196965120 N NA NA HECW2,STK17B IMR90 Hi-C 24141950 PGAP1 826194 247 chr2 204479413 204480947 204480195 N NA NA RAPH1,CYP20A1,CD28,ABI2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM117B 979512 248 chr2 20545083 20551620 20550708 N NA NA HS1BP3,PUM2 IMR90 Hi-C 24141950 RHOB 95215 249 chr2 206748316 206748841 206748455 N NA NA PARD3B,NRP2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM117B 3248415 250 chr2 232530110 232532391 232531433 N NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 40844 251 chr2 240344878 240345373 240345260 N NA NA NDUFA10,HDAC4,LOC150935 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 7771643 252 chr2 27040162 27040490 27040306 N NA NA NA NA NA NA AGBL5 234001 253 chr2 29323998 29324315 29324159 N NA NA CLIP4,FAM179A,ALK IMR90 Hi-C 24141950 AGBL5 2049507 254 chr2 38151039 38154683 38152606 N NA NA CDC42EP3,PRKG2,CYP1B1-AS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 SRSF7 823953 255 chr2 39349614 39353149 39351460 N NA NA NA NA NA NA SRSF7 370978 256 chr2 46681711 46682079 46681915 N NA NA EPAS1,PRKCE,PIGF,CRIPT,LOC388948 IMR90 Hi-C 24141950 CALM2 721661 257 chr2 47518002 47518489 47518157 N NA NA TTC7A,CALM2,MCFD2,C2orf61 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALM2 114262 258 chr2 48407654 48408248 48408008 N NA NA FOXN2 IMR90 Hi-C 24141950 CALM2 1003914 259 chr2 49456645 49457138 49456882 N NA NA NA NA NA NA CALM2 2052905 260 chr2 61988856 61994827 61991510 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCT4 120979 261 chr2 64994940 64997024 64995720 Y SERTAD2 NA SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCT4 2879134 262 chr2 65661805 65664289 65663459 N NA NA SPRED2,CEP68,ACTR2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCT4 3545999 263 chr2 69878800 69879142 69878954 N NA NA AAK1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PCBP1 435443 264 chr2 74207984 74215613 74212215 N NA NA DGUOK,TET3,C2orf78,STAMBP,BOLA3,MOB1A,MTHFD2,BOLA3-AS1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TEX261 2985983 265 chr2 85644780 85647604 85645756 N NA NA ELMOD3,GGCX,MAT2A MCF7 ChIA-PET 22265404 TEX261 14422779 266 chr2 92314745 92318588 92317719 Y NA NA LOC654342 IMR90 Hi-C 24141950 TEX261 21092744 267 chr2 95871570 95874758 95873233 N NA NA ZNF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TEX261 24649569 268 chr2 96655626 96659278 96658023 N NA NA NA NA NA NA TEX261 25433625 269 chr20 19860716 19861045 19860729 N NA NA SLC24A3,RIN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00493 1312643 270 chr20 2504909 2507678 2506449 N NA NA TMC2 IMR90 Hi-C 24141950 NOP56 125500 271 chr20 39943879 39947945 39946341 N NA NA ZHX3,IQGAP1,PLCG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404,19890323 RPN2 4136423 272 chr20 52211393 52214102 52211534,52213546 N,N NA;NA NA BMP7,ZMYND8,SULF2,SUMO1P1,BCAS1,CYP24A1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SNAI1 3611880 273 chr20 58009062 58009352 58009201 N NA NA NA NA NA NA STX16-NPEPL1 782753 274 chr20 8986155 8986461 8986273 N NA NA PLCB4 IMR90 Hi-C 24141950 NOP56 6352977 275 chr21 15399127 15404421 15402023,15399687 N,N NA;NA NA NA NA NA NA CCT8 15041589 276 chr21 22347231 22347946 22347582 N NA NA NA NA NA NA CCT8 8098064 277 chr21 28114278 28115045 28114629 N NA NA NA NA NA NA CCT8 2330965 278 chr21 29660888 29661380 29661053 N NA NA ADAMTS1,ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 CCT8 784630 279 chr21 38934116 38938142 38936268 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSMG1 1617298 280 chr21 47392576 47395249 47393803 N NA NA COL6A1 K562 ChIA-PET 22265404 C21orf58 348536 281 chr22 16188488 16191227 16191068 N NA NA NA NA NA NA GNB1L 3651235 282 chr22 17848318 17857907 17850135 Y NA NA NA NA NA NA GNB1L 1984555 283 chr22 17883914 17884604 17884262 N NA NA NA NA NA NA GNB1L 1957858 284 chr22 32374928 32376378 32375614 N NA NA NA NA NA NA TUG1 1009294 285 chr22 41046791 41052082 41047804 Y NA NA ST13,MKL1,MCHR1,ADSL,SLC25A17,DNAJB7,XPNPEP3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EP300 436532 286 chr22 41415930 41419763 41418265 Y MKL1,EP300 NA ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EP300 68851 287 chr22 46972672 46975047 46973194 N NA NA TRMU,GRAMD4,CELSR1 IMR90 Hi-C 24141950 TUBGCP6 3708353 288 chr3 104287626 104287901 104287764 N NA NA ALCAM IMR90 Hi-C 24141950 RPL24 2882063 289 chr3 111392570 111395946 111393441 N NA NA CD96,PHLDB2 IMR90 Hi-C 24141950 FSTL1 8773972 290 chr3 128397472 128403607 128401231,128403201,128399693 N,N,N NA;NA;NA NA RAB7A,RPN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H1FX 631513 291 chr3 136755356 136755629 136755492 N NA NA NA NA NA NA ATP1B3 4839841 292 chr3 138544722 138545771 138545393 N NA NA PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 ATP1B3 3049699 293 chr3 138551664 138555161 138553808 N NA NA PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 ATP1B3 3040309 294 chr3 142864256 142864540 142864396 N NA NA NA NA NA NA ATP1B3 1268786 295 chr3 155705908 155707408 155706073 N NA NA NA NA NA NA SERP1 5441480 296 chr3 156891472 156896204 156892836 N NA NA CCNL1,VEPH1,PTX3,LEKR1,LOC339894,LOC100498859 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERP1 6627044 297 chr3 179367263 179368428 179368009 N NA NA NA NA NA NA AP2M1 4524206 298 chr3 181537411 181537795 181537579 N NA NA NA NA NA NA AP2M1 2354839 299 chr3 18483980 18495436 18485807 N NA NA NA NA NA NA RPL32 5600899 300 chr3 186540751 186544855 186543439 N NA EIF4A2 EIF4A2,RFC4,FETUB,ST6GAL1,DNAJB11,TBCCD1,ADIPOQ IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EIF4A2 39390 301 chr3 195360405 195373455 195361908 N NA NA NA NA NA NA HES1 1506474 302 chr3 20074815 20075371 20074971 N NA NA KAT2B K562 ChIA-PET 22265404 RPL32 7191734 303 chr3 25212800 25213285 25212965 N NA NA NA NA NA NA RPL32 12329719 304 chr3 27515718 27520646 27519995 N NA NA SLC4A7 IMR90 Hi-C 24141950 RPSA 11927558 305 chr3 44549673 44553926 44552180 N NA NA ZNF445 K562 ChIA-PET 22265404 GPX1 4841865 306 chr3 56539212 56539917 56539370 N NA NA NA NA NA NA SLMAP 1203257 307 chr3 96335926 96337466 96336754 N NA NA NA NA NA NA MINA 1353829 308 chr4 113707271 113707883 113707526 N NA NA NA NA NA NA SNHG8 5492034 309 chr4 123073188 123074935 123073929 N NA NA KIAA1109 K562 ChIA-PET 22265404 CCNA2 328100 310 chr4 124429532 124430213 124429848 N NA NA LOC285419,SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 CCNA2 1684444 311 chr4 12641806 12642380 12642104 Y NA NA NA NA NA NA SLIT2 7612855 312 chr4 140096581 140100767 140098178,140099065 N,N NA;NA NA ELF2,NAA15,C4orf49 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS3A 11919987 313 chr4 144756166 144756818 144756499 N NA NA NA NA NA NA RPS3A 7263936 314 chr4 152242724 152243737 152243580 N NA NA NA NA NA NA RPS3A 221970 315 chr4 160116894 160117705 160117050 N NA NA FNIP2,PPID,ETFDH,C4orf45 IMR90 Hi-C 24141950 RPS3A 8096140 316 chr4 175373369 175374436 175373701 N NA NA NA NA NA NA SAP30 1081276 317 chr4 180059293 180059604 180059456 N NA NA NA NA NA NA SAP30 5767200 318 chr4 24054344 24054901 24054499 N NA NA NA NA NA NA SLIT2 3799109 319 chr4 24469287 24476057 24473223 Y NA NA CCDC149,PPARGC1A,DHX15,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS IMR90 Hi-C 24141950 SLIT2 4214052 320 chr4 27062312 27063299 27062564 N NA NA NA NA NA NA SLIT2 6807077 321 chr4 32518269 32518980 32518418 N NA NA NA NA NA NA PDS5A 7460596 322 chr4 38324255 38324772 38324658 N NA NA KLF3,FLJ13197,TBC1D1,TLR10,PGM2,TLR6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDS5A 1654804 323 chr4 4762765 4763573 4763045 N NA NA LOC100507266,STX18 IMR90 Hi-C 24141950 SLIT2 15491662 324 chr4 9152082 9158300 9155362 N NA NA NA NA NA NA SLIT2 11096935 325 chr5 102088433 102100018 102093825,102091414 N,N NA;NA NA PAM,PPIP5K2 IMR90 Hi-C 24141950 RASA1 15524363 326 chr5 118403132 118403829 118403578 N NA NA NA NA NA NA UQCRQ 13798490 327 chr5 138895686 138898997 138897689 Y MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2 UBE2D2 DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,MZB1,TMEM173,ECSCR,CXXC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2D2 41754 328 chr5 139090233 139091053 139090667 Y MATR3,MATR3,CXXC5 NA CXXC5 K562 ChIA-PET 22265404 UBE2D2 149482 329 chr5 139483888 139489869 139487270,139488908 N,Y NA;NA PURA CYSTM1,NRG2,PSD2,IGIP IMR90 Hi-C 24141950 PURA 3839 330 chr5 161058721 161059791 161059427 N NA NA NA NA NA NA CCNG1 1804786 331 chr5 172921210 172921453 172921331 Y NA NA STC2,LOC285593,BNIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 723007 332 chr5 180523384 180524941 180524379 N NA NA NA NA NA NA GNB2L1 145965 333 chr5 180528369 180529869 180529069 N NA NA MGAT1 IMR90 Hi-C 24141950 GNB2L1 141037 334 chr5 18286671 18287322 18286999 N NA NA LOC285696,BASP1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF622 1820777 335 chr5 27249765 27250332 27249906 N NA NA NA NA NA NA SUB1 5335273 336 chr5 34243841 34246326 34244699 N NA NA NA NA NA NA SUB1 1658236 337 chr5 62415373 62415657 62415517 N NA NA NA NA NA NA ZSWIM6 1787273 338 chr5 67367229 67367692 67367357 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM6 6739129 339 chr5 67713443 67714443 67713700 N NA NA NA NA NA NA ZSWIM6 7085343 340 chr5 69138817 69145658 69140401 N NA NA NA NA NA NA ZSWIM6 8510717 341 chr5 69694791 69703299 69697171 N NA NA NA NA NA NA ZSWIM6 9066691 342 chr5 70583933 70587630 70585747 N NA NA NA NA NA NA ZSWIM6 9955833 343 chr5 81147358 81149502 81147979 Y NA NA ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS23 424733 344 chr5 87318511 87319173 87319022 N NA NA NA NA NA NA RASA1 754441 345 chr5 90565005 90565962 90565617 N NA NA ARRDC3,LOC100129716,GPR98 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RASA1 4000935 346 chr5 95044812 95049500 95047427 N NA NA RHOBTB3,ARSK,SPATA9,RFESD IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RASA1 8480742 347 chr5 99381557 99384045 99382109 N NA NA NA NA NA NA RASA1 12817487 348 chr5 99386635 99390178 99388667 Y NA NA NA NA NA NA RASA1 12822565 349 chr6 101543626 101544289 101543761 N NA NA NA NA NA NA CCNC 1526936 350 chr6 105400272 105402515 105401277 N NA NA NA NA NA NA SEC63 2876967 351 chr6 138705864 138706488 138706130 N NA NA NA NA NA NA RPS12 5570156 352 chr6 142157062 142157351 142157214 N NA NA NA NA NA NA KATNA1 7812589 353 chr6 144604791 144610197 144607348 N NA NA UTRN IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KATNA1 5359743 354 chr6 157006958 157009632 157008196 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 89432 355 chr6 158650851 158657864 158653054 N NA NA TULP4,TMEM181,DYNLT1,SYTL3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAGAP 808320 356 chr6 159289548 159294164 159293730,159290801 N,N NA;NA NA OSTCP1,C6orf99,EZR K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TAGAP 172020 357 chr6 19801102 19801412 19801277 N NA NA NA NA NA NA SOX4 1792560 358 chr6 19802761 19806509 19804987 N NA NA ID4 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 1787463 359 chr6 21585442 21591056 21588390 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2916 360 chr6 26321314 26324123 26322873 Y NA NA HIST1H1D,HIST1H4F,ABT1,HIST1H4G,HMGN4,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2BI,HIST1H3G,HCG11,HIST1H4I,HIST1H2BK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HCG11 197811 361 chr6 26328220 26328989 26328966 N NA NA HIST1H1D,HIST1H4F,ABT1,HIST1H4G,HMGN4,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BH,HIST1H3F,HIST1H4H,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A3P,BTN3A1,BTN1A1,HIST1H2AE,HIST1H2BG,HIST1H2AG,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,MIR3143,LOC285819,BTN2A1,HCG11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HCG11 192945 362 chr6 27200231 27201303 27200571 N NA NA LOC100507173,OR2B2,ZNF184,LOC100131289,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AG,HIST1H2BJ IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BK 85594 363 chr6 27203022 27203924 27203354 Y NA NA OR2B2,LOC100131289,ZNF184 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BK 88385 364 chr6 27247321 27248712 27248143 N NA NA LOC100507173 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BK 132684 365 chr6 27511623 27514349 27513438 Y NA NA HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AM,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2BL,HIST1H3H,HIST1H2AI,ZNF391,ZNF184 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H2BK 396986 366 chr6 27515200 27515921 27515640 N NA NA HIST1H2AM,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2BL,HIST1H3H,HIST1H2AI,ZNF391,ZNF184 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HIST1H2BK 400563 367 chr6 27568877 27569390 27569217 N NA NA PRSS16 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BK 454240 368 chr6 28557367 28558114 28557665 N NA NA NA NA NA NA HIST1H2BK 1442730 369 chr6 28709939 28710544 28710352 N NA NA NA NA NA NA HIST1H2BK 1595302 370 chr6 28725024 28728095 28725847 N NA NA NA NA NA NA HIST1H2BK 1610387 371 chr6 28834323 28836798 28835341 N NA NA NA NA NA NA HIST1H2BK 1719686 372 chr6 28908661 28909559 28909110 N NA NA TRIM27,LOC401242,ZNF311 IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R10 1675461 373 chr6 3068206 3072507 3069223 N NA NA LOC100507194,WRNIP1 K562 ChIA-PET 22265404 TXNDC5 4838540 374 chr6 42748304 42760412 42750072,42755983 N,N NA;NA NA KIAA0240,UBR2,RPL7L1,PTCRA,KLHDC3,MEA1,PPP2R5D,PRPH2,TBCC,ATP6V0CP3,C6orf226,TRERF1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C6orf108 436799 375 chr6 53225428 53225894 53225832 N NA NA ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 VEGFA 9487482 376 chr6 54707859 54708568 54708116 N NA NA NA NA NA NA VEGFA 10969913 377 chr6 58773510 58780273 58777754,58773648 Y,N NA;NA NA NA NA NA NA VEGFA 15035564 378 chr6 63922364 63923089 63922534 N NA NA NA NA NA NA EEF1A1 10307666 379 chr6 67593875 67594494 67594225 N NA NA NA NA NA NA EEF1A1 6636261 380 chr6 6906571 6906907 6906757 N NA NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 TXNDC5 1004140 381 chr6 70335588 70336381 70335786 N NA NA NA NA NA NA EEF1A1 3894374 382 chr6 85479860 85486761 85484051 N NA NA TBX18 IMR90 Hi-C 24141950 SNHG5 901690 383 chr7 100433626 100436418 100434715 N NA TRIP6 AGFG2,MOSPD3,PCOLCE,FBXO24,LOC100129845,POP7,EPO,GIGYF1,EPHB4,ZAN,SRRT,SLC12A9,TRIP6,SERPINE1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIP6 28532 384 chr7 111309282 111309874 111309631 N NA NA NA NA NA NA SLC26A3 3865604 385 chr7 128169020 128176378 128171279 Y NA NA METTL2B,IMPDH1,HILPDA IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNPO3 518849 386 chr7 129702582 129702858 129702702 N NA NA NA NA NA NA UBE2H 109782 387 chr7 148634794 148639445 148638425 Y NA NA EZH2,CUL1,ZNF786,ZNF398,ZNF425 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NOM1 8102972 388 chr7 149743901 149747535 149745870 N NA NA NA NA NA NA NOM1 6994882 389 chr7 152838321 152838611 152838472 N NA NA NA NA NA NA NOM1 3903806 390 chr7 25894846 25898119 25895844 N NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HNRNPA2B1 342294 391 chr7 2886489 2887054 2886560 N NA NA GNA12 MCF7 ChIA-PET 22265404 TTYH3 214886 392 chr7 5190961 5191234 5191114 N NA NA NA NA NA NA TTYH3 2519358 393 chr7 6120267 6122265 6121087 N NA NA EIF2AK1,USP42 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TTYH3 3448664 394 chr7 63766300 63768729 63767793 N NA NA NA NA NA NA VKORC1L1 1569528 395 chr7 65955346 65959976 65958644 N NA NA LINC00174,TPST1 IMR90 Hi-C 24141950 VKORC1L1 617089 396 chr7 66055183 66058991 66057392 N NA NA KCTD7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 VKORC1L1 716926 397 chr7 66145038 66149603 66147087 N NA NA KCTD7,LOC493754,RABGEF1 IMR90 Hi-C 24141950 VKORC1L1 806781 398 chr7 75794421 75797266 75795982 Y RHBDD2,POR NA SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 POR 250001 399 chr7 7962759 7963342 7962909 N NA NA GLCCI1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TTYH3 5291156 400 chr7 90227884 90228250 90228039 N NA NA FZD1,CDK14 IMR90,H1ESC,HELA,GM12878,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 SHFM1 6110953 401 chr7 97718970 97719580 97719319 N NA NA LMTK2 IMR90 Hi-C 24141950 SHFM1 1379767 402 chr7 98810561 98811337 98810931 N NA NA SMURF1,KPNA7,MYH16,ARPC1A IMR90 Hi-C 24141950 ZNF655 344708 403 chr8 102372098 102373046 102372746 N NA NA GRHL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PABPC1 637783 404 chr8 107951666 107951964 107951817 N NA NA ANGPT1 IMR90 Hi-C 24141950 UBR5 4526749 405 chr8 118786210 118788490 118788371 N NA NA EXT1,MED30,SAMD12 IMR90 Hi-C 24141950 UBR5 15361293 406 chr8 125184118 125184404 125184261 N NA NA TMEM65,FER1L6,FER1L6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 EIF2C2 16461242 407 chr8 145908888 145913979 145911343 N NA NA ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1,ZNF34 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF34 98746 408 chr8 16783918 16784455 16784312 N NA NA NA NA NA NA FAM160B2 5162259 409 chr8 20361054 20362282 20361338 N NA NA NA NA NA NA FAM160B2 1584432 410 chr8 20537666 20538748 20538151 N NA NA NA NA NA NA FAM160B2 1407966 411 chr8 37215217 37219801 37217479 N NA NA ERLIN2,LOC728024,ZNF703 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF703 333500 412 chr8 574143 583517 581175 N NA NA NA NA NA NA KBTBD11 1338527 413 chr8 61562118 61566458 61564927 N NA CHD7 CHD7,RAB2A MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD7 24866 414 chr8 7095230 7095969 7095531 N NA NA NA NA NA NA KBTBD11 5173186 415 chr8 7246310 7246595 7246448 N NA NA NA NA NA NA KBTBD11 5324266 416 chr8 73918524 73918824 73918666 N NA NA TERF1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SNX16 8835697 417 chr8 9067447 9068133 9067588 N NA NA NA NA NA NA KBTBD11 7145403 418 chr9 103188038 103193258 103189428 N NA NA C9orf30-TMEFF1,NR4A3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NANS 2369079 419 chr9 105966302 105968967 105967509 N NA NA NA NA NA NA NANS 5147343 420 chr9 110643853 110644430 110643967 N NA NA NA NA NA NA C9orf91 6729276 421 chr9 114596127 114596804 114596457 Y NA NA UGCG,MIR3134,HSDL2,SUSD1,C9orf84 IMR90 Hi-C 24141950 C9orf91 2776902 422 chr9 132174888 132177232 132176081 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOR1B 388200 423 chr9 134247150 134249770 134249442 N NA NA PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 TOR1B 1681718 424 chr9 134272816 134303358 134273016,134279645 N,N NA;NA NA PRRC2B,NUP214,FAM78A,PPAPDC3,POMT1,UCK1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOR1B 1707384 425 chr9 19226801 19234260 19230749 N NA NA DENND4C,PLIN2 IMR90 Hi-C 24141950 CDKN2A 2760230 426 chr9 30567450 30567733 30567589 N NA NA NA NA NA NA PTENP1 3109685 427 chr9 37063497 37064475 37063857 N NA NA ZCCHC7,PAX5 IMR90 Hi-C 24141950 MELK 490638 428 chr9 44242831 44246781 44245493 N NA NA NA NA NA NA MELK 7669972 429 chr9 45353017 45358433 45356551 N NA NA NA NA NA NA MELK 8780158 430 chr9 45439498 45451326 45449505,45442324 N,N NA;NA NA NA NA NA NA MELK 8866639 431 chr9 66454561 66461517 66458564 N NA NA LOC642236 IMR90 Hi-C 24141950 CKS2 25464596 432 chr9 66552355 66558158 66553904 N NA NA NA NA NA NA CKS2 25367955 433 chr9 6702753 6706001 6704288,6702781 N,N NA;NA NA KDM4C MCF7 ChIA-PET 22265404 CDKN2A 15288489 434 chr9 68376302 68378186 68377719 N NA NA NA NA NA NA CKS2 23547927 435 chr9 70644959 70648013 70645818 N NA NA NA NA NA NA CKS2 21278100 436 chr9 81498321 81498632 81498463 N NA NA TLE4 IMR90 Hi-C 24141950 CKS2 10427481 437 chrX 106918080 106922034 106920285 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3,PRPS1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RPL36A-HNRNPH2 6272202 438 chrX 110860324 110862818 110862308 N NA NA NA NA NA NA PGRMC1 7507393 439 chrX 125605601 125607375 125606264 N NA NA NA NA NA NA STAG2 2511126 440 chrX 129123287 129123916 129123532 N NA NA BCORL1,XPNPEP2,ZDHHC9,UTP14A IMR90 Hi-C 24141950 STAG2 6028812 441 chrX 138934484 138934768 138934628 N NA NA ATP11C IMR90 Hi-C 24141950 RBMX 2971545 442 chrX 33585299 33585921 33585528 N NA NA NA NA NA NA USP9X 7358967 443 chrX 3794677 3794955 3794857 N NA NA NA NA NA NA RBBP7 13093579 444 chrX 44310023 44310371 44310163 N NA NA NA NA NA NA CASK 2527736 445 chrX 45802428 45802900 45802582 N NA NA NA NA NA NA NDUFB11 1201709 446 chrX 48532445 48537865 48534938 N NA NA NA NA NA NA OTUD5 277783 447 chrX 48594285 48596809 48595760 N NA NA SUV39H1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OTUD5 218839 448 chrX 54664647 54668366 54665911 Y NA NA ITIH6,MAGED2 MCF7 ChIA-PET 22265404 MTRNR2L10 540578 449 chrY 16117826 16118432 16117966 N NA NA NA NA NA NA NA -1 450 chrY 17332597 17332907 17332755 N NA NA NA NA NA NA NA -1